chr1 839741 840250 839788 Y NA SAMD11 NA NA NA NA SAMD11 18010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.43430115850482 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-465B22.3 21720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 1744250 1744609 1744432 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 34354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1 NA NA NA NA GNB1 19954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 2177615 2177829 2177732 Y NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 35456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 2232428 2232896 2232683 Y SKI,TNFRSF14 NA NA NA NA NA MORN1 88250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 3420761 3421065 3420920 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 104994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 3459907 3460197 3460078 Y NA NA NA NA NA NA MEGF6 65862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 4079242 4079460 4079359 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 264385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 4728864 4729054 4728975 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 914007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 4729528 4729775 4729656 Y AJAP1 NA NA NA NA NA C1orf174 914671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,TAS1R1,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 7461964 7462325 7462107 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 367004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 7558449 7558725 7558667 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 270604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERRFI1 52933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 8194345 8194402 8194374 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 109977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 93820 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8488165 8488317 8488222 Y TNFRSF9,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 112279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 8686491 8686867 8686745 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 188835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8721734 8722143 8721896 Y NA NA NA NA NA NA RERE 153559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 8875055 8875165 8875110 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 537 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 9222919 9223181 9223073 Y SPSB1 GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 17082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 9223692 9223875 9223840 Y NA GPR157,RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 16388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 9293549 9293739 9293591 Y H6PD H6PD NA NA NA NA H6PD 715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 9298798 9298942 9298853 Y NA H6PD NA NA NA NA H6PD 5964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 9473687 9473864 9473791 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33 IMR90 Hi-C 24141950 SPSB1 122748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 11218028 11218196 11218080 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC10 60090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 12046023 12046196 12046108 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 7785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 12127865 12128182 12128023 Y MIIP,TNFRSF8 NA NA NA NA NA MIIP 50342 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 12237719 12238747 12238362 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D NA NA NA NA TNFRSF1B 12659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 12238984 12239461 12239321 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 13924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 12509354 12509466 12509435 Y DHRS3 NA NA NA NA NA DHRS3 166271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 12599928 12600179 12600028 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 75558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 12600525 12600853 12600637 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 DHRS3 74884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 13917058 13917313 13917229 Y PRDM2,PDPN PDPN NA NA NA NA PDPN 9098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 13920056 13920639 13920195 Y NA PDPN NA NA NA NA PDPN 12096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 13931629 13932064 13931884 Y PRDM2,PDPN PDPN NA NA NA NA PDPN 23669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 15041115 15041310 15041140 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 117915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 15587144 15587415 15587307 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1 FHAD1 NA NA NA NA FHAD1 15376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 15587806 15588435 15587851 Y NA FHAD1 NA NA NA NA FHAD1 16038 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 16030221 16030623 16030258 Y NA PLEKHM2 NA NA NA NA PLEKHM2 21394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 16339773 16339933 16339866 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 39146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16478939 16479163 16479034 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16489021 16489207 16489116 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA2 8439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16500084 16500309 16500220 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA RNU1-1 SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-1 12489 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr1 17494378 17494745 17494634 Y NA RP11-380J14.1 PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 19533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 17495208 17495390 17495300 Y NA RP11-380J14.1 PADI2,PADI1,PADI3,PADI6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 18888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 17525310 17525501 17525406 Y NA RP11-380J14.1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380J14.1 11032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA RP11-380J14.1 NA NA NA NA RP11-380J14.1 20409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 17865185 17865523 17865202 Y ARHGEF10L ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 17887951 17888293 17888247 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 23621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 17896198 17896624 17896362 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 31868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 19274997 19275345 19275068 Y IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 5835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 19276270 19276542 19276361 Y AKR7A2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 4638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 19278388 19278892 19278719 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 2288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 20930711 20931037 20930891 Y CDA PINK1 PINK1 IMR90 Hi-C 24141950 PINK1 26911 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 21655798 21656254 21656078 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 13743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 21660622 21661187 21660789 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 8810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 21664400 21664833 21664668 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 5164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA NA RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 USP48 105313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 22375194 22375332 22375261 Y CDC42 LINC00339,CDC42 CDC42 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 1788 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 22692086 22692330 22692263 Y NA NA C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 84014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 23357547 23357765 23357628 Y NA KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 13606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 23426690 23427100 23426944 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 75201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 23849183 23849405 23849280 Y PNRC2,RPL11 ASAP3,E2F2,ID3 NA NA NA NA E2F2 6307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr1 23903714 23904323 23904234 Y ID3 E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 19429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 23912037 23912393 23912293 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 27752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 24058728 24059093 24059048 Y PNRC2 RPL11,TCEB3,PITHD1 RPL11,TCEB3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCEB3 8552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 24518503 24518681 24518625 Y PNRC2,GRHL3 NA MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-4M23.7 185494 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 25281668 25281921 25281754 Y NA NA NA NA NA NA CLIC4 211820 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25348659 25349200 25348944 Y SRRM1,RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 207793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25353540 25353869 25353759 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 203124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25357149 25357829 25357484 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 SYF2 199164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 26616270 26616483 26616360 Y SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 12603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA ZDHHC18 24583 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 27848725 27849287 27848935 Y WDTC1,SYTL1,FAM76A WASF2 NA NA NA NA WASF2 34056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27869425 27869556 27869494 Y NA NA NA NA NA NA WASF2 54756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27871123 27871471 27871363 Y NA NA NA NA NA NA WASF2 56454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 27935491 27936061 27935916 Y EYA3,SLC9A1,SYTL1,WASF2,XKR8,C1orf38,FGR,FGR,FGR AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 6549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 28201800 28202156 28201857 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,XKR8 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA RPA2 37101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 28454216 28454379 28454304 Y FGR,STX12,C1orf38,XKR8,EYA3,SESN2,MED18,PTAFR,PTAFR,DNAJC8 EYA3 NA NA NA NA EYA3 41009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 30998869 30999184 30999083 Y NA NA NA NA NA NA LAPTM5 229483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 31430605 31430735 31430670 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 50997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 31643824 31643962 31643871 Y NA NA NA NA NA NA NKAIN1 66439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA NKAIN1 27517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 31770743 31770927 31770835 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 2901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 NA SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 75791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 32002783 32002833 32002806 Y NA NA NA NA NA NA PEF1 105664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 32166698 32166999 32166824 Y COL16A1 NA NA NA NA NA PEF1 58201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 32405536 32405898 32405618 Y NA PTP4A2 NA NA NA NA PTP4A2 2559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr1 33405191 33405597 33405376 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA RNF19B 22689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 33450112 33450483 33450353 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19B 21826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33511476 33511644 33511552 Y PHC2,RNF19B AK2,ADC AK2,TMEM54,FNDC5,RNF19B,HPCA,ADC,S100PBP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AK2 32953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 33804359 33804743 33804679 Y RNF19B,TRIM62,PHC2 AL513327.1 NA NA NA NA AL513327.1 41384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 35309235 35309522 35309475 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP3 83664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 35811471 35811605 35811502 Y SFPQ NA NA NA NA NA ZMYM4 78903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 36431149 36431388 36431272 Y STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 121088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 37169397 37169618 37169483 Y OSCP1,GRIK3 NA NA NA NA NA MRPS15 241359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 38010731 38010979 38010768 Y ZC3H12A,MTF1 MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 6924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 38308355 38308564 38308401 Y ZC3H12A,SNIP1,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 14728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 38311465 38311868 38311723 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 11424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 38317043 38317898 38317556 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 5394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 38466019 38466413 38466271 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1 NA NA NA NA FHL3 2865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 39662647 39663006 39662738 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 117659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 39857791 39857995 39857869 Y NA KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 16156 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA NA HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIT1 82063 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 120816 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA SCMH1 276005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 42036839 42037120 42036980 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 331013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 42071739 42071927 42071841 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 365913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 42073844 42074019 42073961 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 368018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 42092770 42093067 42092919 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 386944 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 42126621 42126978 42126699 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 372618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 370805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.43724598345503 chr1 42204198 42204327 42204253 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 295269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 42204580 42205516 42204895 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 294080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 42367142 42367456 42367439 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43250353 43250859 43250610 Y ZMYND12,WDR65,YBX1 LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23 NA NA NA NA C1orf50 19413 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43407355 43407700 43407616 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 14830 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43839359 43839523 43839441 Y NA RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2 NA NA NA NA ELOVL1 7663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 44299891 44300630 44300422 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 109593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 111594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 46555686 46555960 46555823 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 84200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 46573980 46574380 46574180 Y TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA PIK3R3 65780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 46637172 46637331 46637258 Y NA PIK3R3,POMGNT1 NA NA NA NA PIK3R3 2829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 48224075 48224507 48224159 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 426606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 48935854 48936015 48935919 Y NA RP11-329A14.1,SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 9 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 50890174 50890356 50890265 Y NA NA NA NA NA NA AGBL4 402589 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 51056997 51057361 51057215 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 366574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 52628189 52628583 52628480 Y NA ZFYVE9,RP4-800M22.2 NA NA NA NA RP4-800M22.2 1491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 54052889 54052991 54052940 Y NA NA NA NA NA NA LRP8 261147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 54163740 54163856 54163800 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 190551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 54358495 54358647 54358571 Y YIPF1 YIPF1 NA NA NA NA YIPF1 4088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 54941159 54941412 54941231 Y TCEANC2,SSBP3,SSBP3 NA TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 64007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 55431735 55431939 55431831 Y NA NA TMEM61,HEATR8-TTC4,BSND,PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 80844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 56797894 56798374 56798151 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 310600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 56974162 56974535 56974381 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 134439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 57887813 57887926 57887901 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 778818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 58613652 58613771 58613712 Y DAB1 NA NA NA NA NA DAB1 396635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 58898385 58898660 58898607 Y NA NA DAB1,CYP2J2,OMA1,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 DAB1 111746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59083966 59084335 59084186 Y NA NA TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OMA1 73492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59221049 59221462 59221387 Y NA JUN FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 59228706 59229186 59229035 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 18599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59509588 59509786 59509693 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 25529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 59537686 59537803 59537744 Y FGGY NA MIR4711,FGGY,JUN,LOC100131060,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 53627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 59629518 59629774 59629646 Y NA NA LOC100131060,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 130536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 59758328 59758666 59758447 Y FGGY FGGY NA NA NA NA FGGY 1644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 60087129 60087147 60087138 Y CYP2J2 NA NA NA NA NA FGGY 326819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 384233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 60157078 60157331 60157204 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 396768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 60172811 60173111 60172976 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 412501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 61549054 61549253 61549232 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 220123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 61784447 61784809 61784578 Y NA NA NA NA NA NA TM2D1 404286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 62726098 62726337 62726314 Y NA NA NA NA NA NA USP1 173631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 62948948 62949316 62949132 Y KANK4,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 48980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 64051806 64051915 64051861 Y NA PGM1,ITGB3BP NA NA NA NA PGM1 5032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 64223023 64223051 64223037 Y NA ROR1 ROR1 IMR90 Hi-C 24141950 ROR1 14642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 64558632 64559006 64558819 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 251276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 65307822 65308022 65307967 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 99044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 65364183 65364439 65364282 Y JAK1 NA NA NA NA NA JAK1 65748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 65383044 65383557 65383225 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 46630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 65398951 65399446 65399123 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 30741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 65888047 65888596 65888066 Y LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 3777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 66782459 66782839 66782588 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 214227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 66800202 66800555 66800228 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 196511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 66815726 66816360 66815919 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 180706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 66822714 66822988 66822804 Y NA NA NA NA NA NA SGIP1 174078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 66850101 66850481 66850273 Y PDE4B NA NA NA NA NA SGIP1 146585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 67029191 67029437 67029359 Y NA SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B SGIP1 NA NA NA NA SGIP1 32873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 68077196 68077460 68077328 Y NA NA GADD45A,GNG12 IMR90 Hi-C 24141950 GADD45A 71284 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr1 68257818 68258216 68258148 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 38934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 68647153 68647165 68647159 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 49638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr1 70237887 70238124 70238005 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC7 205806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 70507902 70508588 70508230 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 160715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 39652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA ANKRD13C 71377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 71413812 71414188 71413950 Y NA RP3-333A15.1 NA NA NA NA RP3-333A15.1 2750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 71444985 71444992 71444989 Y NA RP3-333A15.1 NA NA NA NA RP3-333A15.1 33923 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 72108174 72108241 72108208 Y NA NA NA NA NA NA ZRANB2-AS2 563167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 72493439 72493635 72493537 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 252782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 72656240 72656592 72656532 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 89825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 72715442 72715840 72715642 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 30577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr1 72750417 72750888 72750606 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 4000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 73033126 73033389 73033258 Y NA NA ZRANB2-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 NEGR1 286709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 75628708 75628719 75628713 Y NA LHX8,RP11-510C10.3 NA NA NA NA RP11-510C10.3 32447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA RP11-510C10.3 98311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 76541670 76541922 76541777 Y ST6GALNAC3 ST6GALNAC3 NA NA NA NA ST6GALNAC3 3266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 77385063 77385511 77385240 Y ST6GALNAC5 NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 53937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 77511618 77511728 77511673 Y NA NA NA NA NA NA RP4-706A16.3 81040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 77522365 77522872 77522625 Y NA NA NA NA NA NA RP4-706A16.3 69896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 77842116 77842473 77842156 Y NA NA NA NA NA NA AK5 96380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 82168687 82169067 82168779 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 16311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 84966686 84966774 84966730 Y NA RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 3474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 85349108 85349420 85349289 Y LPAR3 NA NA NA NA NA WDR63 113410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 85744584 85744829 85744751 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 3811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 85796595 85797055 85796822 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 85836666 85837017 85836916 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 95893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 85968002 85968172 85968087 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 73761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 85991291 85991622 85991523 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 50311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 86077140 86077408 86077190 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 32696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 87203929 87204214 87204072 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 35670 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 87253936 87254322 87254171 Y SH3GLB1 NA SEP15 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GLB1 85677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 88292387 88292883 88292561 Y NA NA LMO4 IMR90 Hi-C 24141950 LMO4 500236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr1 89475726 89475778 89475752 Y NA CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA GBP3 10799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 89739985 89740544 89740197 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 GBP5 NA NA NA NA GBP5 3441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 90204490 90205244 90205062 Y LRRC8C,ZNF326,LRRC8D NA NA NA NA NA LRRC8D 79329 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 91478571 91478975 91478771 Y ZNF644,ZNF644 ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 6854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 92218581 92218971 92218958 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 150921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 92270160 92270686 92270504 Y RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99206 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA RNU4-59P 160446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 93032261 93032386 93032324 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-59P 132105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 93669062 93669462 93669176 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 24777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 93812976 93813243 93813111 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA RP4-717I23.3 3394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 172648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA BCAR3 182680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 164588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 151368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 94161111 94161471 94161388 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 149235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94203705 94204234 94204026 Y NA NA BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 106472 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94371317 94371601 94371445 Y NA DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA GCLM 1365 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94527681 94527931 94527843 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 154715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94583651 94584037 94583923 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 154587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94991460 94991992 94991709 Y NA F3 NA NA NA NA F3 13364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 94992236 94992413 94992325 Y NA F3 NA NA NA NA F3 12943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 95008693 95008821 95008774 Y NA F3 NA NA NA NA F3 3337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95060137 95060382 95060260 Y NA NA F3,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 54781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95063321 95063608 95063418 Y NA NA F3,ALG14,SLC44A3,CNN3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 57965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 95155573 95156005 95155685 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 127832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 104232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95191212 95191391 95191280 Y F3 NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 92446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95258204 95258621 95258355 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,LOC729970 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 25216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 95267524 95267667 95267664 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 16170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 96525307 96525707 96525578 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 384779 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 97025730 97026190 97025816 Y NA NDUFS5P2 NA NA NA NA NDUFS5P2 22100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 97549999 97550397 97550198 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 364778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 97679239 97679556 97679405 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 329701 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 98111566 98111887 98111829 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 102309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98232940 98233333 98233137 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 151272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98408796 98409171 98408982 Y NA DPYD DPYD,MIR137HG IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 24191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 98414430 98414798 98414662 Y NA DPYD NA NA NA NA DPYD 29825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98437572 98437739 98437700 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 52967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 98459458 98459857 98459685 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 53562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 18761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98499783 98500490 98500262 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 12929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA MIR137HG NA NA NA NA MIR137HG 5127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 92636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 129290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98677142 98677181 98677162 Y NA NA NA NA NA NA MIR137HG 163723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 MIR137HG 275551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 98789496 98789901 98789701 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 MIR137HG 276077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 100138206 100138591 100138311 Y AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD PALMD NA NA NA NA PALMD 28707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 100138994 100139323 100139068 Y NA PALMD NA NA NA NA PALMD 29495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 100512510 100512716 100512572 Y HIAT1 HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 10857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 101758840 101759229 101759010 Y NA NA SLC30A7,DPH5 IMR90 Hi-C 24141950 DPH5 269196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 103126263 103126396 103126338 Y NA NA NA NA NA NA COL11A1 445656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 103572619 103572906 103572682 Y COL11A1 COL11A1 NA NA NA NA COL11A1 567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 107623686 107623858 107623772 Y NA PRMT6 NA NA NA NA PRMT6 26419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 108650339 108650754 108650436 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 90717 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 109188271 109188477 109188414 Y NA HENMT1,PRPF38B NA NA NA NA HENMT1 13671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 110363861 110364229 110364029 Y GNAI3,AMPD2 NA CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 GSTM3 81477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 110778589 110778756 110778673 Y NA KCNC4 NA NA NA NA KCNC4 26624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 4371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 111182665 111183078 111182779 Y LRIF1,CD53 NA KCNA3 IMR90 Hi-C 24141950 LAMTOR5-AS1 259224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 111186366 111186880 111186713 Y NA NA KCNA3 IMR90 Hi-C 24141950 LAMTOR5-AS1 262925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 111758440 111759106 111758811 Y CD53,RAP1A,CEPT1,DENND2D,CHI3L2 CHI3L2 WDR77,OVGP1,C1orf88 IMR90 Hi-C 24141950 CHI3L2 17047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 112050044 112050594 112050328 Y C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3 RAP1A NA NA NA NA RAP1A 32246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 112286281 112286588 112286521 Y C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 9279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 114245723 114246101 114246018 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 NA NA NA NA NA NGF 273246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 NGF 156359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 116920378 116921129 116920740 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 7088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 117047053 117047428 117047164 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA CD58 64233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 117051576 117051921 117051802 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA CD58 59740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 117132073 117132239 117132154 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 20412 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 117363043 117363386 117363270 Y NA FTH1P22 NA NA NA NA FTH1P22 46798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 117421623 117422020 117421974 Y TTF2 PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 117424835 117425013 117424940 Y PTGFRN PTGFRN PTGFRN MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 25666 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 117493512 117493635 117493571 Y NA PTGFRN CD101 IMR90 Hi-C 24141950 PTGFRN 42833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 118174879 118175156 118175081 Y NA FAM46C NA NA NA NA FAM46C 28323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 118415993 118416217 118416147 Y NA NA NA NA NA NA GDAP2 54036 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 120026458 120026860 120026657 Y NA HSD3B1 NA NA NA NA HSD3B1 20961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 120607153 120607333 120607254 Y ZNF697,NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 2907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 120608824 120609208 120608880 Y NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 1032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 581054 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 144908312 144908601 144908436 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 98568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 144908806 144909147 144908897 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 99062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 144927217 144927550 144927432 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 117473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 85772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 144993199 144993244 144993232 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 80942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 73337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145009158 145009716 145009503 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 64470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 145023690 145024549 145024240 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 49637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 145032376 145032564 145032466 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 41622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145054975 145055306 145055182 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 18880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145058996 145059322 145059204 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 14864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 145090155 145090603 145090483 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 3617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145092450 145092883 145092733 Y SEC22B,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 SEC22B 1337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 145093258 145093700 145093462 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145106553 145106772 145106662 Y NA PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 12333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145433530 145433648 145433615 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10 TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L NA NA NA NA TXNIP 2821 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145640932 145641287 145641091 Y NBPF10 POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 31896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 145701524 145701615 145701570 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 92488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 147012349 147012550 147012481 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 1167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 147825273 147825748 147825617 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 20387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA RNU1-92P NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-92P 9471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 150510569 150510713 150510587 Y NA ECM1,ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA ADAMTSL4 9171 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 151168297 151168505 151168391 Y BNIPL,TUFT1,SCNM1 SCNM1,LYSMD1,VPS72 NA NA NA NA PIP5K1A 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 152140379 152140745 152140485 Y NA NA NA NA NA NA S100A11 121996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 152878925 152879083 152878954 Y NA NA NA NA NA NA SPRR2D 133324 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A6,S100A3,S100A2,S100A16 NA NA NA NA S100A2 2652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 153824989 153825297 153825210 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 68154 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 ASH1L 38313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155916072 155916212 155916141 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 13881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 155951073 155951535 155951364 Y NA KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 23326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 156403490 156403714 156403646 Y NA NA IQGAP3,RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2D 64906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 156468556 156468776 156468632 Y MEF2D NA NA NA NA NA MEF2D 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 156541089 156541488 156541192 Y NA IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4 MEF2D,C1orf61 IMR90 Hi-C 24141950 IQGAP3 693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 156679562 156679883 156679727 Y NA CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 5954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 156966343 156966626 156966486 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 46536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 157076072 157076782 157076408 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 29484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1,CD1D NA NA NA NA CD1D 668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA CD1D 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 158982200 158982857 158982480 Y AIM2,PYHIN1,IFI16 IFI16 NA NA NA NA IFI16 14442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 159142876 159143043 159143018 Y OR10J5,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,CADM3,CADM3,DARC CADM3 NA NA NA NA CADM3 3477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 159158093 159158524 159158429 Y NA CADM3 NA NA NA NA CADM3 18694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,SLAMF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,SLAMF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 160316870 160317108 160317002 Y SLAMF7,CD48,TAGLN2,NCSTN SUMO1P3,NCSTN,COPA NA NA NA NA COPA 5680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 160345693 160345986 160345917 Y NA NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA VANGL2 22390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA SLAMF7 67039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 160877833 160878093 160877963 Y SLAMF7 ITLN1,RP11-312J18.5 CD48 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-312J18.5 15063 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 161170933 161171185 161171002 Y ADAMTS4,NDUFS2 USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,TOMM40L NA NA NA NA NDUFS2 6039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 161352257 161352597 161352426 Y NA NA NA NA NA NA SDHC 70210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 162518132 162518252 162518187 Y HSD17B7,SH2D1B,UHMK1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 11071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 162729988 162730048 162730018 Y NOS1AP,UHMK1 NA NA NA NA NA C1orf110 106557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 163005587 163006022 163005933 Y UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 NA C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf110 168982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 164723371 164723492 164723438 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 200550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 164734934 164735098 164735029 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 212113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 165635693 165636148 165635824 Y NA MGST3,ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 29952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 165868061 165868423 165868295 Y NA NA NA NA NA NA TMCO1 73069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 167419889 167420655 167420276 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 100349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 167766380 167766616 167766548 Y SFT2D2,CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 20870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 168050664 168051125 168050872 Y SFT2D2 NA NA NA NA NA GPR161 53696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 168594082 168594481 168594282 Y NA NA DPT,F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 345804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 170638824 170639138 170638981 Y NA PRRX1 NA NA NA NA PRRX1 8955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 171255417 171255820 171255657 Y PRRC2C,FMO4 FMO4 NA NA NA NA FMO4 25527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 171407653 171408026 171407772 Y FMO4,PRRC2C PRRC2C PRRC2C IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2C 44625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 172305839 172305991 172305915 Y DNM3 NA NA NA NA NA PIGC 105239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 172324588 172324814 172324670 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 86416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 84043 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 172903010 172903534 172903241 Y TNFSF18,TNFSF4 NA TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF4 270918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 173398914 173399297 173399234 Y NA PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 45108 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 179144823 179145001 179144950 Y NA NA NA NA NA NA ABL2 51818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 180100723 180101052 180100780 Y NA QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 20917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 180120187 180120425 180120330 Y TOR1AIP1,CEP350 QSOX1 NA NA NA NA QSOX1 1544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 180727103 180727211 180727157 Y NA NA NA NA NA NA XPR1 127963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 181042855 181043067 181042961 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 12571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 181110732 181111003 181110864 Y STX6,MR1,IER5 NA STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 55094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 182643740 182644063 182644020 Y RGS16 NA NA NA NA NA RGS16 72197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183009080 183009399 183009240 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 18485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 159352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183178797 183178927 183178861 Y NA NA NA NA NA NA LAMC1 188202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183237084 183237447 183237420 Y NA NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 NMNAT2 148290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 NMNAT2 143870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA NMNAT2 136283 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 183310808 183311127 183310994 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT2 74610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183567713 183567879 183567843 Y NCF2,NCF2 ARPC5,RGL1 DKFZP564C196,SMG7,NCF2,LAMC1,NMNAT2,ARPC5,RGL1 IMR90 Hi-C 24141950 ARPC5 35013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 184265554 184265938 184265708 Y NA NA C1orf21,EDEM3,TSEN15 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf21 88254 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 185250433 185250655 185250484 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 33806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 185344563 185345243 185344914 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 60102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 186587444 186588060 186587743 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 59499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 186612873 186613046 186612917 Y PTGS2,PLA2G4A PTGS2 NA NA NA NA PTGS2 34513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 186627866 186627981 186627924 Y PTGS2,PLA2G4A,C1orf27 PTGS2 NA NA NA NA PTGS2 19578 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 186788311 186788564 186788477 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 7521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 186799738 186800031 186799804 Y PTGS2,PLA2G4A PLA2G4A NA NA NA NA PLA2G4A 3653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 186936898 186937303 186937025 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 140813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 186947742 186948198 186947923 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 151657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 187181531 187181740 187181636 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 385446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 187235320 187235513 187235392 Y NA NA NA NA NA NA PLA2G4A 439235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 192139487 192139804 192139659 Y RGS18 RGS18 NA NA NA NA RGS18 13900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 192446152 192446393 192446247 Y RGS2,RGS1 NA UCHL5,RGS1,RGS13,RGS2,TROVE2,GLRX2 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 96464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 192924608 192924823 192924716 Y NA NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 81493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 193226500 193227132 193226836 Y RGS2 NA NA NA NA NA CDC73 137353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 526837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 726145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 779842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200321353 200321596 200321470 Y DDX59,ZNF281 RP11-532L16.1 NA NA NA NA RP11-532L16.1 25064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 200323350 200323623 200323553 Y DDX59,ZNF281 RP11-532L16.1 NA NA NA NA RP11-532L16.1 27061 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200750000 200750140 200750089 Y NA CAMSAP2 NA NA NA NA CAMSAP2 43314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200831452 200831819 200831500 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 124766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 NA NA NA NA NA KIF21B 124563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201160901 201161255 201161022 Y IGFN1 TMEM9 NA NA NA NA TMEM9 22199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA TMEM9 97304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201244405 201244769 201244526 Y PKP1 NA PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2 IMR90 Hi-C 24141950 TNNT2 100121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 201280694 201280963 201280829 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA TNNT2 63927 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 201494461 201494578 201494476 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 17877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 201572031 201572237 201572112 Y NA NAV1 NAV1,IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 NAV1 18174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201682596 201682901 201682784 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 92185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 201739210 201739573 201739298 Y CSRP1,CSRP1,CSRP1,NAV1,NAV1,SHISA4 NA NA NA NA NA IPO9 56696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 201743848 201744120 201743952 Y CSRP1,CSRP1,NAV1 NA NA NA NA NA IPO9 52149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 25998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 26403 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 202214153 202214446 202214299 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 94662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 203101073 203101246 203101163 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 43291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 203489584 203489741 203489635 Y BTG2 NA NA NA NA NA ATP2B4 103948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 203661733 203662076 203661795 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B4 68044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 205265235 205265548 205265359 Y TMEM81,KLHDC8A NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 23335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206751685 206751882 206751743 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 32022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206754982 206755508 206755274 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 28396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206763465 206763687 206763565 Y MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D,DYRK3 NA NA NA NA EIF2D 20217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206807155 206807335 206807245 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206916099 206916418 206916260 Y NA IL10 NA NA NA NA IL10 27421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 206921953 206922243 206922101 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 IL10 NA NA NA NA IL10 21596 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 206939730 206940044 206939954 Y NA IL10 NA NA NA NA IL10 3795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207025140 207025456 207025298 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL19 IL24 IL20 IMR90 Hi-C 24141950 IL24 43332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr1 207069223 207069337 207069332 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 207079196 207079569 207079501 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207080273 207080661 207080467 Y FAIM3,FAIM3,IL19 IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 1309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207265739 207265906 207265769 Y NA PFKFB2,YOD1,C4BPB NA NA NA NA C4BPB 5552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207551040 207551052 207551045 Y NA NA NA NA NA NA CD55 58187 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 207997315 207997832 207997786 Y CR1,CD46 C1orf132 NA NA NA NA C1orf132 42663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 G0S2,HSD11B1 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 G0S2 23757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 209833148 209833823 209833488 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 G0S2,HSD11B1 NA NA NA NA G0S2 12942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 209938931 209939742 209939534 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74 C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 16162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 210056461 210057439 210056772 Y NA NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 52099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 SYT14 51246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 269924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 211210840 211210858 211210848 Y NA NA NA NA NA NA KCNH1 94599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 211551491 211551678 211551580 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 2467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 211754949 211755173 211755061 Y NA SLC30A1 NA NA NA NA SLC30A1 4865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 211786767 211786829 211786805 Y NA SLC30A1,RP11-354K1.1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-354K1.1 24208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 212643548 212643711 212643612 Y NA NENF ATF3 K562 ChIA-PET 22265404 NENF 39319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr1 212780782 212781279 212780943 Y NA ATF3 NA NA NA NA ATF3 44106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 212809966 212810356 212810074 Y RPS6KC1,ATF3,ATF3,ATF3 RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 26420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 212840606 212841015 212840787 Y C1orf227,BATF3,PPP2R5A,ATF3,FAM71A RP11-338C15.3 NA NA NA NA RP11-338C15.3 3830 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 215130656 215131050 215130800 Y KCNK2,KCNK2 KCNK2 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK2 46068 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 215198285 215198630 215198297 Y KCNK2,KCNK2 KCNK2 NA NA NA NA KCNK2 21167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 216286476 216286776 216286627 Y NA NA NA NA NA NA KCTD3 547741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 218375582 218375888 218375735 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 80741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 218523725 218524123 218523798 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 6148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 218758903 218759111 218758977 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 241326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 218996564 218996649 218996607 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 348537 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 219514172 219514180 219514178 Y NA NA RRP15,TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 168986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 221270955 221271464 221271176 Y HLX NA MARC1,HLX,DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 HLX 221256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 221613404 221613745 221613476 Y NA NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 299773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 221872429 221872689 221872559 Y DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 40829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 221881394 221881826 221881629 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 31692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 221887766 221888016 221887890 Y DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 25502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 222000173 222000483 222000346 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 86655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 222011312 222011511 222011431 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 97794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 222142763 222142919 222142838 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 229245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 222163243 222163609 222163382 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 249725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 222828361 222828786 222828451 Y TLR5 MIA3 NA NA NA NA MIA3 38933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224019430 224020596 224019827 Y FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 11078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.87449196691006 chr1 224393253 224393414 224393305 Y NA RP11-365O16.1,DEGS1 NA NA NA NA DEGS1 31795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 224528791 224528972 224528907 Y NA NVL,CNIH4 FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26 IMR90 Hi-C 24141950 NVL 12702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 WDR26 NA NA NA NA WDR26 24317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224691192 224691563 224691423 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 68457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 224811590 224812043 224811760 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L21.2 104321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 224914627 224914789 224914675 Y NA RP11-3L21.2 NA NA NA NA RP11-3L21.2 1575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 227499470 227499818 227499796 Y NA CDC42BPA NA NA NA NA CDC42BPA 4357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 NA NA NA NA NA NUP133 94961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 230220164 230220401 230220223 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28628 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 230249347 230250007 230249645 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 57811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr1 230595195 230595532 230595329 Y NA NA NA NA NA NA COG2 180703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 231513422 231513769 231513758 Y NA EXOC8,EGLN1 NA NA NA NA EXOC8 41824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 231799080 231799260 231799182 Y EXOC8 DISC1 NA NA NA NA DISC1 38519 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 231944869 231945038 231944953 Y EXOC8 NA NA NA NA NA DISC1 184308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 232270206 232270383 232270300 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 509645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 232725638 232725888 232725699 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 240045 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 18.2793448759127 chr1 233619313 233619702 233619577 Y NA NA SLC35F3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNK1 128048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 233811305 233811449 233811378 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 63555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 233856724 233857076 233856900 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 108974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 236240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 234752255 234752429 234752320 Y NA IRF2BP2 ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 8984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 234767593 234767925 234767750 Y TARBP1 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 24322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 234891292 234891478 234891345 Y IRF2BP2 NA NA NA NA NA IRF2BP2 148021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 234987212 234987644 234987394 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 126907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 7398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 235110834 235111403 235111103 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 3148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 236021417 236021780 236021768 Y NA LYST NA NA NA NA LYST 23160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 236135691 236135959 236135881 Y GPR137B NA LYST IMR90 Hi-C 24141950 LYST 90751 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 239877993 239878320 239878052 Y NA CHRM3-AS2 NA NA NA NA CHRM3-AS2 13445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 240405898 240406270 240405998 Y NA NA NA NA NA NA ADH5P3 74443 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 241191454 241191834 241191645 Y RGS7 RP11-435F13.2 NA NA NA NA RP11-435F13.2 31360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 241775803 241776227 241776010 Y KMO NA NA NA NA NA OPN3 62451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 242609605 242610011 242609798 Y PLD5,PLD5 NA NA NA NA NA PLD5 75987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 243644284 243644683 243644595 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 226964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 243788022 243788404 243788357 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 223977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 243806306 243806448 243806376 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 205933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 243893800 243893985 243893919 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 118396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr1 243894639 243895081 243894755 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 117300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 243997018 243997244 243997154 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 15137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr1 244212276 244213430 244213047 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 199895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 244267717 244267933 244267824 Y NA NA SDCCAG8,LOC339529,AKT3,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 AKT3 255336 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 244401957 244402060 244402016 Y NA NA SDCCAG8,AKT3,LOC339529,ZNF238 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 211376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 244512430 244512879 244512496 Y ADSS NA C1orf100,ADSS,AKT3 IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 100557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 244517098 244517541 244517376 Y ADSS NA NA NA NA NA ADSS 95895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 245255337 245255432 245255385 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 60855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 245971113 245971386 245971357 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 654826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246038342 246038749 246038555 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 629865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr1 246387027 246387389 246387208 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 281225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246432471 246432772 246432681 Y SMYD3,CNST NA NA NA NA NA SMYD3 235842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 246730569 246731007 246730621 Y AHCTF1,CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 2823 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246772310 246772610 246772421 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 44564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 247297966 247298129 247298007 Y NA ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 32292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 49442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr1 247336409 247336734 247336572 Y NLRP3,NLRP3,AHCTF1 NA NA NA NA NA ZNF669 70735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.32351725016595 chr10 384217 384634 384602 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 205812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 644331 644586 644526 Y NA NA NA NA NA NA DIP2C 89097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 2249906 2250005 2249935 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 856520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 2992232 2992361 2992295 Y NA NA WDR37,LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 114164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 3239590 3239795 3239693 Y NA PITRM1 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 26587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 3511181 3511689 3511507 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 298178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 3808656 3808872 3808754 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 16601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 3856317 3856712 3856416 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6,AKR1E2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 30844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 3929991 3930887 3930290 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 104518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 4358748 4358982 4358870 Y NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 74644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 4989909 4990226 4990068 Y AKR1C3,AKR1C1 NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 57113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 5314439 5314551 5314462 Y NA NA NA NA NA NA NET1 137963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 6051095 6051553 6051345 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17 IL15RA NA NA NA NA IL15RA 32945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 6074786 6074988 6074887 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA NA NA NA NA NA RBM17 53962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 6078858 6079339 6079180 Y PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA RBM17 NA NA NA NA RBM17 49611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 6333794 6333936 6333889 Y PFKFB3,PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 148913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 6343712 6343937 6343834 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 158831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 6389510 6390540 6390147 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 204629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 10631619 10631869 10631724 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 203074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA CELF2 NA NA NA NA CELF2 27158 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 11077382 11077525 11077432 Y NA CELF2 NA NA NA NA CELF2 32123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 13142941 13143287 13143115 Y NA OPTN,CCDC3 NA NA NA NA CCDC3 3289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 13200624 13201003 13200885 Y NA MCM10 NA NA NA NA MCM10 551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 13754952 13755339 13755135 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 128025 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 205805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 14003091 14003406 14003339 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 110877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 14032375 14032782 14032539 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 81501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14053069 14053428 14053261 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 60855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14064122 14064423 14064398 Y NA RP11-397C18.2 NA NA NA NA RP11-397C18.2 49860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14083240 14083439 14083425 Y NA RP11-397C18.2 NA NA NA NA RP11-397C18.2 30844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 14131369 14132062 14131667 Y NA RP11-397C18.2 PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-397C18.2 17086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 14175548 14175585 14175560 Y NA NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 61265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14417107 14417451 14417285 Y NA NA FRMD4A,FAM107B,PRPF18 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 84690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14438165 14438288 14438234 Y NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 63853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 54683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 14594148 14594360 14594257 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 92007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 17264441 17264580 17264545 Y VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 VIM,CUBN,RSU1,TRDMT1 IMR90 Hi-C 24141950 VIM 3678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 17470783 17471060 17470983 Y TRDMT1,STAM,ST8SIA6 ST8SIA6-AS1,ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6 23269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 17707752 17708081 17707913 Y VIM,ST8SIA6,STAM STAM NA NA NA NA STAM 23628 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 18452837 18453129 18452983 Y CACNB2,CACNB2 NA NA NA NA NA RP11-499P20.2 379451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20114711 20115092 20114787 Y PLXDC2 PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 11543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20126415 20126499 20126449 Y NA PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 23247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20292651 20293410 20292825 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 189483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20388455 20388625 20388609 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 285287 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20450242 20450397 20450276 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 347074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20517791 20518055 20517886 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 414623 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 20518444 20518755 20518482 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 415276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 21318909 21319293 21319209 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 141823 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 21390009 21390197 21390106 Y MLLT10,MLLT10,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 70919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22026318 22026683 22026671 Y EBLN1 NA NA NA NA NA RN7SKP37 193389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 22242936 22243341 22243231 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA RN7SKP37 22864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22817226 22817294 22817260 Y EBLN1 NA NA NA NA NA PIP4K2A 184190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 22970665 22970972 22970902 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 30512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 23801336 23801634 23801483 Y OTUD1 NA NA NA NA NA OTUD1 75138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 23845968 23846451 23845996 Y NA NA NA NA NA NA OTUD1 119770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 24917417 24917574 24917542 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 93023 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 26775274 26775560 26775412 Y APBB1IP,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA APBB1IP 50142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 26775885 26776759 26776046 Y APBB1IP,ABI1 NA NA NA NA NA APBB1IP 50753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 26780350 26780530 26780413 Y APBB1IP,ABI1 NA NA NA NA NA APBB1IP 55218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 28366743 28367106 28366855 Y ARMC4 NA NA NA NA NA ARMC4 80766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.43724598345503 chr10 29043838 29044173 29044078 Y NA NA LOC100507605,LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 79567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 29909517 29909915 29909733 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 113795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 101161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 30096449 30096548 30096521 Y NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 72739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 30471133 30471514 30471212 Y KIAA1462 NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 68710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 30471622 30471929 30471877 Y KIAA1462 NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 69199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 30736122 30736481 30736327 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 15256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 30818244 30819051 30818562 Y MAP3K8,ZNF438 NA MAP3K8,KIAA1462,MTPAP,LOC729668,LYZL2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 97378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 30876225 30877110 30876753 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA LOC729668,MAP3K8 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 155359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 31025766 31026097 31025992 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 292769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 31106973 31107176 31107079 Y NA NA ZEB1,ARHGAP12,ZNF438,KIF5B,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 211690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 31278125 31278259 31278204 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 40607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 31986692 31987073 31986913 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP12 228669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 32702583 32702830 32702714 Y NA EPC1,CCDC7 NA NA NA NA CCDC7 30238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 33422989 33423776 33423207 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 130269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33425212 33425871 33425404 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 132492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 33522627 33522949 33522766 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 100241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33621123 33621423 33621243 Y NRP1 NRP1 NA NA NA NA NRP1 1767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33654776 33655204 33655009 Y NA NRP1 PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 31586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 33701574 33701923 33701712 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 78384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 34815006 34815362 34815018 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 135667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 35755393 35755512 35755453 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 221440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr10 43913618 43913796 43913710 Y CSGALNACT2,HNRNPF HNRNPF,RP11-517P14.2 ZNF487P K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-517P14.2 390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 44100382 44100859 44100681 Y CSGALNACT2 ZNF239,CAP1P2,ZNF485,ZNF32 NA NA NA NA ZNF485 527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 44289212 44289448 44289386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF32 146908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 45927566 45927962 45927775 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5 NA NA NA NA NA MARCH8 160392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA RP11-38L15.3 180022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-463P17.1 674126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 48577583 48577860 48577722 Y NA NA SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-463P17.1 247386 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 50347958 50348271 50348062 Y C10orf128 VSTM4 NA NA NA NA VSTM4 26404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 50377282 50377414 50377372 Y C10orf128 NA NA NA NA NA VSTM4 55728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 50385443 50385844 50385615 Y C10orf128 NA NA NA NA NA VSTM4 63889 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 50462696 50462912 50462787 Y C10orf128 NA WDFY4,VSTM4 IMR90 Hi-C 24141950 VSTM4 141142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 50606394 50606776 50606708 Y NA NA NA NA NA NA PGBD3 138310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 50776206 50776746 50776485 Y PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3 PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 30622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52081951 52082279 52082036 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 59213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52154516 52154956 52154688 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 131778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52167205 52167434 52167402 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 144467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52751732 52752116 52752062 Y PRKG1 PRKG1 NA NA NA NA PRKG1 2787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 52753196 52753414 52753311 Y PRKG1 PRKG1 NA NA NA NA PRKG1 4251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 53406907 53407200 53407014 Y NA NA NA NA NA NA CSTF2T 50155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 54412187 54412602 54412476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-556E13.1 100567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 59607173 59607244 59607231 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 418450 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 60333947 60334347 60334030 Y BICC1 NA NA NA NA NA BICC1 63047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 60422217 60422354 60422286 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 151317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 60674120 60674133 60674127 Y BICC1 NA NA NA NA NA PHYHIPL 260217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 60935384 60935742 60935425 Y NA PHYHIPL NA NA NA NA PHYHIPL 1034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 61860000 61860017 61860008 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 195586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 63752119 63752912 63752632 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 93060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64291559 64291877 64291687 Y ZNF365 NA NA NA NA NA ZNF365 159608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64378382 64379331 64378832 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 183185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64441011 64441399 64441189 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 121117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64492733 64493095 64492919 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA EGR2 IMR90 Hi-C 24141950 ADO 69421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64495564 64495934 64495778 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA ZNF365,EGR2,JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 ADO 66582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 64502250 64502733 64502570 Y NRBF2,EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 59783 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 64875678 64875783 64875732 Y NA NRBF2 ZNF365,ADO,NRBF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBF2 15267 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 65033384 65033629 65033527 Y NRBF2,JMJD1C NA NA NA NA NA NRBF2 142334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 65460115 65460254 65460185 Y NA NA JMJD1C IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 180992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4 ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HERC4 21777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 NA NA NA NA NA HERC4 80202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 71405104 71405302 71405203 Y NA C10orf35 NA NA NA NA C10orf35 17097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 71769073 71769400 71769235 Y NA H2AFY2 NA NA NA NA H2AFY2 41152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1,CALM2P2 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 72413009 72413391 72413116 Y ADAMTS14 ADAMTS14 ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADAMTS14 17168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 72416244 72416577 72416419 Y ADAMTS14 ADAMTS14 ADAMTS14,PRF1,KIAA1274,C10orf27,SGPL1,PCBD1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS14 13982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 72424506 72424875 72424691 Y ADAMTS14 ADAMTS14 KIAA1274,PRF1,ADAMTS14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADAMTS14 5684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 72433363 72433696 72433541 Y ADAMTS14 ADAMTS14 NA NA NA NA ADAMTS14 2804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr10 73357359 73357803 73357564 Y C10orf105 NA NA NA NA NA C10orf54 173452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 73526896 73527242 73527133 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 73529949 73530323 73530195 Y NA C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 73595852 73596345 73596141 Y C10orf54,PSAP PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 12781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 73734357 73734754 73734458 Y NA CHST3 NA NA NA NA CHST3 12234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 74037393 74037499 74037446 Y NA DDIT4 DNAJB12 IMR90 Hi-C 24141950 DDIT4 5715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74055686 74056073 74056016 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 24008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr10 74068319 74068595 74068530 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ASCC1,ANAPC16 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDIT4 36641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74070583 74070739 74070681 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDIT4 38905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 74082335 74082540 74082412 Y DDIT4 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 30448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74085147 74085316 74085305 Y NA DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 27672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74327257 74327510 74327437 Y DDIT4,DNAJB12 NA NA NA NA NA MICU1 56389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 74385233 74385288 74385261 Y NA MICU1,HMGN2P34 NA NA NA NA MICU1 1334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 75211378 75211476 75211427 Y NA ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-345K20.2 30924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 75654322 75654573 75654437 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G NA NA NA NA CAMK2G 21979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 77290134 77290404 77290261 Y SAMD8 NA C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 68594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 77300831 77301201 77300915 Y NA NA KCNMA1,C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 57797 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 78974815 78975138 78974939 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 709240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 79152642 79152983 79152827 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 531395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 418209 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 146007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 80023350 80023581 80023481 Y NA LINC00856 NA NA NA NA LINC00856 16845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 80303504 80303921 80303741 Y NA NA RPS24,LOC283050,POLR3A,ZMIZ1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00856 296999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.43724598345503 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 80997251 80997825 80997438 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 107400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81077317 81078576 81077648 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 26649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 81080868 81081434 81081104 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 23791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81083033 81083464 81083190 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 21761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81091409 81091966 81091732 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81138677 81139093 81139046 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 33452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 81191596 81191949 81191846 Y NA ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 11434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 81248199 81248547 81248259 Y NA ZCCHC24 ZCCHC24,PPIF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC24 44816 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 85609014 85609374 85609152 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P8 229811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 87752944 87753321 87753210 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 370929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 89519838 89520126 89519981 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 55559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 89823712 89823913 89823807 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 120453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 89856855 89857187 89857031 Y KLLN,PTEN NA RNLS,PTEN,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 153596 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 90527399 90527667 90527447 Y ANKRD22,LIPN LIPN NA NA NA NA LIPN 8236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 90552469 90552762 90552637 Y FAS,ANKRD22,LIPN LIPN NA NA NA NA LIPN 33306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.5480298917939 chr10 90844295 90844413 90844369 Y NA NA FAS,LIPA,CH25H IMR90 Hi-C 24141950 ACTA2 95148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 91055339 91055739 91055572 Y NA RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3 IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFIT2 3973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 91127158 91127607 91127378 Y NA IFIT3,IFIT1,LIPA,IFIT5 LIPA,IFIT2,IFIT1B,SLC16A12,PANK1 IMR90 Hi-C 24141950 IFIT1 22696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 92792748 92792914 92792813 Y NA NA ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 113715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 92928766 92928934 92928784 Y NA PCGF5 RPP30 IMR90 Hi-C 24141950 PCGF5 48974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr10 95040458 95040930 95040561 Y NA RP11-624L12.1 NA NA NA NA RP11-624L12.1 1385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 95224699 95224811 95224754 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 96143397 96143573 96143482 Y TBC1D12 NOC3L,TBC1D12 NOC3L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D12 16688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 97048077 97048324 97048201 Y SORBS1 PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 97218383 97218641 97218563 Y NA NA NA NA NA NA SORBS1 100530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 99172845 99172912 99172879 Y C10orf12,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 11005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 100076038 100076149 100076110 Y C10orf28 NA LOXL4,C10orf28,PYROXD2,HPS1,HPSE2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PYROXD2 96792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 100120877 100121283 100120897 Y PYROXD2,LOXL4 NA PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1 IMR90 Hi-C 24141950 PYROXD2 51658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 101736797 101737134 101736959 Y BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP DNMBP NA NA NA NA DNMBP 30542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 101767938 101768201 101768028 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 104364219 104364413 104364273 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 37840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 104387544 104387817 104387672 Y GBF1,CUEDC2,ACTR1A TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 14436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 104956992 104957240 104957082 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 5936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 105610087 105610227 105610144 Y NA NA NA NA NA NA OBFC1 65736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 105630915 105631032 105630972 Y GSTO2,COL17A1,SH3PXD2A OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 44931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1 NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 111666185 111666517 111666351 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 14794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 112185759 112186089 112185825 Y SHOC2,DUSP5,BBIP1,BBIP1 NA SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 69507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 112668861 112669237 112669049 Y PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1 PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 7795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 114816164 114816362 114816263 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 108155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 114853789 114854299 114853993 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 145780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 116298178 116298480 116298375 Y FAM160B1,C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 135663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 116678132 116678409 116678271 Y NA TRUB1 NA NA NA NA TRUB1 17543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 116902844 116903191 116903017 Y ATRNL1 NA NA NA NA NA ATRNL1 51720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 118154890 118154986 118154939 Y NA NA NA NA NA NA HSPA12A 345099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 119069713 119069747 119069730 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 63231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 119107774 119108099 119107936 Y NA PDZD8 NA NA NA NA PDZD8 24879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 120552081 120552439 120552233 Y FAM204A,C10orf46 NA C10orf46 IMR90 Hi-C 24141950 NANOS1 234789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 121161203 121161864 121161442 Y EIF3A NA NA NA NA NA RGS10 138356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 121415317 121415432 121415359 Y GRK5,BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 6435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 121682284 121682432 121682358 Y NA MCMBP,SEC23IP NA NA NA NA SEC23IP 32061 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 122836934 122837187 122837105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 54050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 123208681 123208950 123208816 Y NA NA NA NA NA NA FGFR2 147022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 123900074 123900243 123900143 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 153385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 124228546 124229001 124228737 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 9505 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr10 125047496 125047735 125047709 Y NA NA NA NA NA NA BUB3 135703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 125204221 125204417 125204319 Y NA NA NA NA NA NA BUB3 292428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 127741185 127741430 127741403 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 FANK1 158077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 127751033 127751319 127751198 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 167925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 127752206 127752491 127752329 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 169098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 127813462 127813834 127813648 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 FANK1 230354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 127822846 127823186 127823128 Y MMP21 NA NA NA NA NA FANK1 239738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 127860130 127860500 127860453 Y ADAM12 NA NA NA NA NA ADAM12 214524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 127936160 127936570 127936368 Y NA NA NA NA NA NA ADAM12 138454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 128075178 128075883 128075417 Y ADAM12 ADAM12,LINC00601 NA NA NA NA ADAM12 154 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 128079863 128080136 128080091 Y NA ADAM12,LINC00601 FANK1,ADAM12,C10orf90 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM12 4839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 128258462 128258762 128258558 Y NA NA FANK1,DHX32,ADAM12 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00601 150014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 128327008 128327383 128327196 Y NA NA NA NA NA NA LINC00601 218560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 128351863 128352142 128352116 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 239836 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129706206 129706827 129706528 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 215822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr10 129707008 129707239 129707127 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 215410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129721316 129721687 129721518 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 200962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS NA NA NA NA NA MKI67 179668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129774599 129774927 129774767 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 147722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 129775759 129776314 129776065 Y PTPRE,PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 146335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr10 129787766 129788203 129788000 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 134446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129828153 129828186 129828170 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 94463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129851192 129851341 129851267 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 71308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 129862087 129863410 129862652 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 59239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr10 129893841 129894010 129893942 Y NA MKI67 NA NA NA NA MKI67 28639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 132011680 132011894 132011722 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 79017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 133836748 133836839 133836756 Y STK32C,DPYSL4,JAKMIP3 BNIP3 BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 43313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr10 134124952 134125064 134125008 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4,LRRC27,STK32C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK32C 18287 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 134549634 134549842 134549793 Y KNDC1,GPR123,NKX6-2 NA NA NA NA NA INPP5A 200310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr10 135329777 135330170 135329974 Y NA NA LOC619207,SYCE1 IMR90 Hi-C 24141950 MTG1 124179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2 NA NA NA NA ATHL1 17232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 IFITM3 30340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 589256 589485 589371 Y SIGIRR RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7 NA NA NA NA PHRF1 14770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA NA MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 180727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 1751706 1752102 1751905 Y KRTAP5-1,KRTAP5-3,KRTAP5-5,KRTAP5-6 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD NA NA NA NA IFITM10 17719 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 1768025 1768222 1768084 Y IFITM10 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD NA NA NA NA IFITM10 1599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 1791889 1792111 1791952 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1 IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD IGF2,INS-IGF2,IGF2-AS1,TH,MIR4686,MOB2,IFITM10 H1ESC,GM12878,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,3C,ChIA-PET 22955621,24141950,19890323,22265404 CTSD 8667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 1847921 1848122 1848046 Y KRTAP5-3 NA H19 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTSD 64699 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 2611537 2611733 2611635 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 107491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 2705021 2705206 2705044 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 14018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 2746958 2747301 2747029 Y TSSC4 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 27734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 2988914 2989223 2989024 Y MRGPRG,SLC22A18 PHLDA2,NAP1L4 NA NA NA NA NAP1L4 22384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 3190411 3190716 3190538 Y NA OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 4442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 3855847 3856061 3855976 Y NUP98,STIM1,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,MIR4687 NA NA NA NA RHOG 4152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 4111553 4111947 4111636 Y STIM1 RRM1 NA NA NA NA RRM1 1990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 6222729 6223104 6222932 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 30837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 8889520 8889803 8889779 Y ST5 AKIP1 NA NA NA NA AKIP1 40883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9294937 9295497 9295430 Y ZNF143,TMEM9B,NRIP3,TMEM41B,IPO7,DENND5A DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA DENND5A 10000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9588297 9588534 9588393 Y NA WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 4694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 10323282 10323617 10323398 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3 NA NA NA NA RP11-351I24.1 31 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 10350347 10350728 10350538 Y NA SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3 NA NA NA NA AMPD3 22487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM,AMPD3 SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 AMPD3 45422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 10545162 10545253 10545208 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 15524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 10681207 10681687 10681411 Y ADM,MRVI1,MRVI1 NA LYVE1,MRVI1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CTR9 88847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12097914 12098716 12098251 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 14827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12133218 12133350 12133292 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 12186762 12187077 12186920 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 73219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 12199343 12199732 12199431 Y NA NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 85800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 12222498 12222995 12222733 Y MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 108955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 12306799 12307179 12306992 Y MICAL2,PARVA NA NA NA NA NA PARVA 89553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 RP11-140L24.3 RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-140L24.3 16273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 16924689 16924921 16924805 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 69639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA AC084117.3 1256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 19440729 19441084 19440796 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 70458 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 25098156 25098313 25098276 Y NA NA NA NA NA NA SVIP 2248311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27255766 27256168 27256011 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 127247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27263345 27263487 27263411 Y NA NA LGR4 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC34 119928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27683148 27683223 27683174 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27725050 27725226 27725138 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 16379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 27948556 27948905 27948731 Y NA RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 37976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 27955713 27956134 27955920 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 28701449 28701661 28701530 Y NA RP11-115J23.1 BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 20501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA RP11-115J23.1 BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 42589 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 28779294 28779601 28779473 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 57132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 28792909 28793103 28792913 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 70747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.32351725016595 chr11 31946597 31946955 31946776 Y NA NA ELP4,IMMP1L IMR90 Hi-C 24141950 ELP4 417300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 32109882 32110285 32110029 Y NA NA NA NA NA NA EIF3M 493059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 33146392 33146678 33146610 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 35239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 33742880 33743486 33743237 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 12505 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 34331523 34331863 34331783 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 23687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 34621875 34622041 34621973 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,CAT,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 EHF NA NA NA NA EHF 34939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA EHF 66237 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35028328 35028731 35028507 Y CD44 NA NA NA NA NA APIP 92282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35051463 35051997 35051695 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 105582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 35057314 35058112 35057719 Y CD44 NA CD44,SLC1A2,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 99467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 52068 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 24620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35187357 35188072 35187739 Y NA RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 35309902 35310085 35310021 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 151485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 37809838 37809966 37809929 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 1195787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 37978500 37978723 37978612 Y NA NA NA NA NA NA RP11-313M3.1 1202280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 39183372 39183493 39183434 Y NA RP11-313M3.1 NA NA NA NA RP11-313M3.1 2369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 17.3930736092018 chr11 40212803 40212875 40212839 Y NA NA NA NA NA NA RP11-313M3.1 1031800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 43757440 43757801 43757621 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 142560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 43779324 43779404 43779364 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 120957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 44123492 44123510 44123502 Y NA ACCS,EXT2 NA NA NA NA EXT2 8393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 44590064 44591217 44590888 Y CD82 CD82 NA NA NA NA CD82 6087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 45069975 45070079 45070038 Y PRDM11 NA SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 TP53I11 99135 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-430H10.1 172317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 45873552 45873871 45873819 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 6883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46094625 46094954 46094790 Y NA PHF21A NA NA NA NA PHF21A 46031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 28900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CTD-2589M5.4,CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2589M5.4 23631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 46312210 46312394 46312323 Y NA CTD-2589M5.4,CREB3L1,DGKZ NA NA NA NA CREB3L1 14998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46379063 46379180 46379102 Y NA DGKZ,MDK NA NA NA NA MDK 21126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46706691 46706778 46706735 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ARHGAP1 13387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 46732586 46732756 46732638 Y NA ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ZNF408 12218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 47252770 47253009 47252890 Y NA PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD NA NA NA NA NR1H3 14842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 48102794 48103200 48102989 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 102681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 57045764 57045851 57045815 Y NA TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 44575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 57173048 57173332 57173170 Y ZDHHC5,UBE2L6,SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3 NA NA NA NA SLC43A3 19721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.5480298917939 chr11 57224938 57225034 57225001 Y SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3 SLC43A3,RTN4RL2 NA NA NA NA RTN4RL2 988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 58263109 58263497 58263385 Y LPXN,LPXN,OR5B21 NA NA NA NA NA LPXN 80196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr11 59315294 59315558 59315429 Y MPEG1,OR4D6,STX3,PATL1 NA NA NA NA NA OSBP 66059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 59323878 59323962 59323920 Y NA NA NA NA NA NA OSBP 57655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 59941614 59941716 59941665 Y MS4A7,MS4A4A,MS4A6A,MS4A6A NA NA NA NA NA MS4A7 202239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 60134562 60134814 60134697 Y MS4A6A,MS4A6A,MS4A4A,MS4A7 MS4A7,MS4A14 NA NA NA NA MS4A7 9141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 60858994 60859090 60859005 Y CPSF7,CPSF7,CD5 NA CD5 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37C 67999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33166 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 61146248 61146454 61146376 Y SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7 DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2 NA NA NA NA TMEM216 10705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 61319246 61319400 61319342 Y NA SYT7 NA NA NA NA SYT7 27220 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA SYT7,RPLP0P2 NA NA NA NA RPLP0P2 13755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr11 61780516 61780626 61780618 Y NA FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr11 61788241 61788385 61788315 Y DAGLA,FTH1 NA FADS1,BEST1,FTH1,FADS3,FADS2,RAB3IL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 55109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 61792928 61793609 61793204 Y DAGLA,FTH1 NA FADS3,FADS2,FTH1,BEST1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 59796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2531D15.4 56076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65042835 65043130 65042858 Y EHD1,C11orf85,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2 NA NA NA NA POLA2 15602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 65083603 65083722 65083697 Y NA CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr11 65220740 65221001 65220852 Y NA NEAT1,AP000769.1,MALAT1 NA NA NA NA AP000769.1 12 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 65234874 65235172 65234954 Y SNX32 NEAT1,AP000769.1,MALAT1 NA NA NA NA AP000769.1 14146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 65249962 65250245 65250146 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 12988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65256318 65257363 65256982 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 5870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.10489425843844 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 65492459 65492791 65492625 Y NA KAT5,RNASEH2C RNASEH2C MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RNASEH2C 6041 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 37612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 67037275 67037527 67037373 Y TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D ADRBK1,ANKRD13D,SSH3 NA NA NA NA ADRBK1 5394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 68049630 68050030 68049692 Y NA C11orf24,LRP5 NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf24 12161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 68829234 68829348 68829304 Y NA TPCN2 NA NA NA NA TPCN2 14869 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 70090856 70091139 70091025 Y NA FADD,PPFIA1 PPFIA1,FADD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPFIA1 23667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 72447514 72448295 72447639 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 54349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 72686902 72687109 72687004 Y RELT,RELT NA NA NA NA NA ATG16L2 163549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 73036125 73036359 73036193 Y NA ARHGEF17,RELT NA NA NA NA ARHGEF17 18791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 73874303 73874639 73874471 Y NA PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 5505 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr11 73989657 73990002 73989928 Y NA P4HA3 PPME1 IMR90 Hi-C 24141950 P4HA3 30700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 74382761 74383066 74382912 Y NA NA POLD3,CHRDL2,RNF169 IMR90 Hi-C 24141950 CHRDL2 57364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 CHRDL2,RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 74742390 74742651 74742474 Y ARRB1 NEU3 XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEU3 45211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 75270235 75270345 75270334 Y NA GDPD5,SERPINH1 NA NA NA NA SERPINH1 756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 75482683 75483095 75482909 Y UVRAG,DGAT2 DGAT2,UVRAG NA NA NA NA DGAT2 14126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA TSKU B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSKU 10324 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 77156016 77156186 77156101 Y PAK1 PAK1 NA NA NA NA PAK1 27494 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 77762280 77762565 77762352 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 26346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 77797839 77798046 77797943 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2 8574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 78130392 78130692 78130610 Y GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 2998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 78131805 78132171 78132034 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 4411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 78728809 78729043 78728943 Y ODZ4 NA NA NA NA NA NARS2 444890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 85160814 85160851 85160833 Y DLG2 NA NA NA NA NA TMEM126B 176778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF NA NA NA NA CREBZF 27540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 85494941 85495133 85495025 Y SYTL2 NA NA NA NA NA AP000974.1 68853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 85702937 85703343 85703240 Y NA NA NA NA NA NA PICALM 75581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 85884942 85885680 85885222 Y NA NA PICALM,CCDC83,EED,C11orf73 IMR90 Hi-C 24141950 EED 67906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 88153223 88153558 88153356 Y NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 CTSC 84268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 88288248 88288652 88288406 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 219293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 95778897 95779169 95779022 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 122418 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 95890101 95890693 95890420 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 183651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 95990308 95990455 95990418 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 83889 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 96071900 96072294 96072196 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 2050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 96072423 96072630 96072557 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 1714 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 99419104 99419503 99419204 Y NA NA NA NA NA NA CNTN5 529421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 99462687 99463068 99462783 Y NA NA NA NA NA NA CNTN5 573004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 102296028 102296376 102296245 Y NA TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 42739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 102670354 102670642 102670492 Y MMP1 MMP10,MMP1,MMP3 NA NA NA NA MMP1 3463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 104565898 104566071 104565977 Y CARD17,CASP5,CARD16,CASP4 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP4 272092 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 105090888 105091203 105091058 Y CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA NA NA NA NA CARD16,CASP1 120730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 105115100 105115515 105115329 Y CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CARD16,CASP1 144942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 105579191 105579256 105579211 Y KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA AASDHPPT 364972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 107540149 107540363 107540256 Y NA NA NA NA NA NA ELMOD1 80332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 108600247 108600616 108600285 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 66495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 108679072 108679281 108679081 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 145320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 109957593 109958086 109957862 Y FDX1,ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3H12C 4001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 7.75487358372056 chr11 109990513 109990553 109990536 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 28426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 110182967 110183228 110183174 Y ZC3H12C,FDX1,RDX RDX RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 17520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 110361694 110361932 110361872 Y ZC3H12C,RDX,FDX1 NA NA NA NA NA FDX1 63087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 111402540 111402739 111402658 Y NA NA NA NA NA NA SIK2 68376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 111853928 111854208 111854100 Y NA DLAT NA NA NA NA DLAT 39330 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 112655698 112656077 112655902 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 173920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 112843716 112843883 112843800 Y NA NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 13719 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 113375857 113376013 113375967 Y CLDN25 DRD2 TTC12,DRD2 IMR90 Hi-C 24141950 DRD2 31444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 113970182 113970266 113970224 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 156243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 92348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 114152118 114152374 114152253 Y ZBTB16,NNMT NNMT NNMT IMR90 Hi-C 24141950 NNMT 25609 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 114192650 114192891 114192769 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 66141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 115636671 115636982 115636754 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 262996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 115801811 115802176 115802022 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 428136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 115945238 115945510 115945465 Y NA NA CADM1 IMR90 Hi-C 24141950 CADM1 571563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 116679644 116679851 116679748 Y APOC3,APOA1 BUD13,ZNF259 APOA5,ZNF259 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF259 22878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 118489703 118490017 118489779 Y NA ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 14548 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 118493108 118493651 118493460 Y NA PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 17953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 119239478 119239727 119239579 Y ABCG4,C1QTNF5,USP2 MCAM,RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 10709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 120078906 120079218 120079100 Y NA OAF,POU2F3 LOC100499227,TMEM136,POU2F3 IMR90 Hi-C 24141950 OAF 257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 120079363 120079802 120079708 Y NA POU2F3 NA NA NA NA OAF 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 121288008 121288281 121288156 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 32631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 121699845 121700197 121699934 Y BLID NA MIR100HG,MIR125B1,BLID IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 268355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 121712728 121712747 121712738 Y NA NA MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR125B1 255805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 122052220 122052515 122052369 Y NA MIRLET7A2 NA NA NA NA MIRLET7A2 36919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 122086038 122086153 122086090 Y NA NA SORL1,BLID,MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 MIRLET7A2 70737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 122177708 122178168 122177914 Y NA NA NA NA NA NA RP11-820L6.1 113411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 122727425 122727730 122727613 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P23 176845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 123468998 123469339 123469251 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 54613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 124351758 124352356 124352073 Y NA NA OR10G9,PANX3,TBRG1 IMR90 Hi-C 24141950 TBRG1 138376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 124403880 124404281 124404167 Y NA NA NA NA NA NA TBRG1 86451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 124939817 124940091 124939961 Y TBRG1,SLC37A2 SLC37A2,TMEM218 NA NA NA NA SLC37A2 8854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 125037243 125037532 125037366 Y NA PKNOX2 NA NA NA NA PKNOX2 4660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 125145861 125146105 125145988 Y PKNOX2,FEZ1 NA NA NA NA NA PKNOX2 113278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 6658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 126554448 126554559 126554501 Y NA NA NA NA NA NA KIRREL3 316796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 126838913 126839134 126839118 Y KIRREL3 KIRREL3 NA NA NA NA KIRREL3 32221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 127859699 127859802 127859739 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 595651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128098978 128099361 128099192 Y NA NA FLI1,ETS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 356092 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128318387 128318699 128318622 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 136754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128335578 128335794 128335665 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 119659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 128344618 128344676 128344650 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 110777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128367325 128367539 128367441 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 87914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr11 128376227 128376457 128376317 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 78996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128385518 128386026 128385881 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 69427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 128388897 128389626 128389454 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 65827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 129717042 129717234 129717138 Y ST14,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 46251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 129723853 129724184 129723902 Y NFRKB NFRKB NA NA NA NA NFRKB 39301 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 131922402 131922802 131922508 Y NTM NA NA NA NA NA AP004372.1 157400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 131934936 131935322 131935091 Y NTM NA NA NA NA NA AP004372.1 169934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 132409803 132410133 132410132 Y NA NA NA NA NA NA AP004372.1 644801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr11 132502586 132503019 132502881 Y NA NA NA NA NA NA AP004372.1 737584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 586697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 1261364 1261638 1261529 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 163689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 1532185 1532472 1532256 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 104585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 2364427 2364812 2364581 Y LRTM2 NA NA NA NA NA DCP1B 252726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 262453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr12 2378088 2378425 2378378 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 266387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 2445525 2445973 2445758 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 333824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 2467250 2467467 2467306 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 355549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 356114 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr12 3226381 3226449 3226415 Y TSPAN9 TSPAN9 NA NA NA NA TSPAN9 41860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 3226776 3227050 3226901 Y TSPAN9 TSPAN9 NA NA NA NA TSPAN9 42255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 3563518 3563854 3563701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543P15.1 244422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 48957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 5915509 5915755 5915702 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF1A 533525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 6276820 6277298 6277162 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL NA VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 171982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 6454526 6454970 6454793 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 5246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 6713710 6714101 6713905 Y PTPN6,ZNF384,LPAR5,CHD4 NOP2,CHD4 NA NA NA NA CHD4 541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 7781011 7781133 7781040 Y SLC2A14 NA NA NA NA NA CD163L1 150518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 9803369 9803672 9803507 Y KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA DDX12P 204544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 9804148 9804385 9804240 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA DDX12P 205323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 9946454 9946723 9946606 Y OLR1,CLEC7A,CLEC2B,CD69 NA CD69,CLEC7A K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLEC2B 74012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 11716028 11716373 11716142 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 84415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 11898142 11898564 11898233 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 97354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11933482 11933754 11933622 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 132694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11950553 11950830 11950618 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 149765 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11975144 11975300 11975239 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 174356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 11987514 11987811 11987531 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 186726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12162075 12162513 12162342 Y ETV6,LOH12CR1,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 99584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12164191 12164556 12164498 Y NA NA ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 97541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12185852 12185959 12185898 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-267J23.4 76138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12592534 12593034 12592768 Y BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA NA NA NA NA LOH12CR1 84521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12654210 12654272 12654270 Y NA NA NA NA NA NA DUSP16 59045 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12766295 12766634 12766503 Y DUSP16,CREBL2 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 3534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 12911881 12912260 12911941 Y NA CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 45889 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 13145446 13145954 13145521 Y DUSP16,EMP1 HTR7P1,HEBP1,KIAA1467 NA NA NA NA HTR7P1 4858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 14735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 13376138 13376415 13376269 Y HEBP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 28488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 14112244 14112326 14112257 Y GRIN2B GRIN2B NA NA NA NA GRIN2B 18727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA NA ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL30P11 102512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 14420572 14420772 14420650 Y PLBD1 NA ATF7IP IMR90 Hi-C 24141950 RPL30P11 95665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 14426552 14426694 14426609 Y PLBD1,ATF7IP NA NA NA NA NA RPL30P11 89743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 19260911 19261231 19261176 Y NA PLEKHA5 PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 19417 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 20004635 20004650 20004642 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.2 78250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 20076637 20076989 20076813 Y PDE3A RP11-405A12.1 NA NA NA NA RP11-405A12.1 15466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 31854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 21162401 21162431 21162416 Y SLCO1B3,SLCO1B1,LST-3TM12 NA NA NA NA NA PYROXD1 426118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 21625286 21625603 21625493 Y NA PYROXD1,TCEB1P31,RECQL,GOLT1B NA NA NA NA TCEB1P31 26038 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 22428776 22428931 22428867 Y NA NA NA NA NA NA CMAS 231668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 23195038 23195059 23195050 Y NA NA NA NA NA NA ETNK1 419029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 24952536 24952732 24952634 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 147661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 25062577 25063016 25062829 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 37377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1,RP11-662I13.1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr12 25768042 25768407 25768182 Y NA NA NA NA NA NA RASSF8 341555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA BHLHE41 8249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 26309144 26309464 26309365 Y NA BHLHE41,RP11-283G6.3 BHLHE41,ITPR2,SSPN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 31594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 26495152 26495452 26495369 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 217602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 244986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 26864607 26864808 26864708 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 119323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 27174273 27174510 27174392 Y C12orf71 TM7SF3,MED21 NA NA NA NA MED21 794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 27346815 27347118 27346987 Y NA STK38L STK38L,REP15,PPFIBP1,C12orf71 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 47783 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 27430817 27431042 27430895 Y NA STK38L NA NA NA NA STK38L 35916 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 28179755 28179885 28179817 Y PTHLH,PTHLH NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 104297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 28433746 28433796 28433771 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 36600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 28933073 28933289 28933191 Y NA NA NA NA NA NA FAR2 366747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 29581721 29581917 29581813 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 49599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 29793130 29793229 29793210 Y NA NA NA NA NA NA TMTC1 142463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 31754010 31754391 31754188 Y DENND5B,METTL20 DENND5B,METTL20 DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 11979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 44976377 44976736 44976725 Y NELL2,NELL2,NELL2 NA NA NA NA NA NELL2 336895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 46845656 46846014 46845792 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 70194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.32351725016595 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.10489425843844 chr12 47787801 47788194 47788086 Y NA NA AMIGO2,RPAP3 IMR90 Hi-C 24141950 RPAP3 309650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 48282882 48283045 48282955 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR NA NA NA NA NA VDR 51786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 48285250 48285393 48285329 Y OR10AD1,ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR VDR NA NA NA NA VDR 49438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 48297772 48297979 48297886 Y ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR VDR NA NA NA NA VDR 36852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 19761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 49801773 49801917 49801846 Y NA SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 43406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 50067341 50067888 50067543 Y TUBA1A,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 31620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 50507967 50508334 50508141 Y NA SMARCD1 NA NA NA NA SMARCD1 31212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 50911573 50911988 50911666 Y SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 14805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 50926707 50927114 50926974 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 29939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 51768324 51768713 51768389 Y NA SLC4A8 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A8 14388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 51986166 51986575 51986504 Y NA SCN8A NA NA NA NA SCN8A 4116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 52279748 52280043 52279838 Y NR4A1 NA NA NA NA NA ACVR1B 63408 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52299499 52299740 52299665 Y NA ACVR1B NA NA NA NA ACVR1B 43711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52366669 52367046 52366914 Y NR4A1,GRASP ACVR1B,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 23218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52571070 52571435 52571234 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 12349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52575658 52575765 52575707 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 8019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52583620 52584080 52583828 Y NA KRT7 NA NA NA NA KRT80 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7 NA NA NA NA KRT7 49739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 52889322 52889458 52889391 Y KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5 NA NA NA NA NA KRT7 265018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53229830 53230092 53229928 Y PFDN5 NA NA NA NA NA KRT18 110563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT18 75137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 53368339 53368600 53368386 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT8 26601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53398446 53398634 53398511 Y NA EIF4B,TENC1 NA NA NA NA EIF4B 504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53611077 53612140 53611274 Y PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 12624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53612468 53612778 53612580 Y TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 11986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 53627985 53628353 53628269 Y NA RARG,MFSD5,ESPL1 MFSD5 K562 ChIA-PET 22265404 RARG 3221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 54700865 54701198 54701063 Y NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A CBX5,HNRNPA1,COPZ1 COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 COPZ1 7879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 GPR84 NA NA NA NA GPR84 2387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 54815757 54815842 54815802 Y GPR84,ZNF385A,ITGA5,NCKAP1L ITGA5,GTSF1 ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 4513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 56023054 56023078 56023066 Y OR9K2,OR6C74,OR6C6,OR6C1,OR6C3,OR6C75,OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,ZC3H10,MMP19,OR10P1 NA NA NA NA NA METTL7B 50252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 56150085 56150369 56150213 Y OR6C6,IKZF4 BLOC1S1,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 15021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.76665288352141 chr12 57458942 57459239 57459094 Y NA TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 20607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 57746067 57746152 57746110 Y NA NA R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 76636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 58187748 58188085 58187957 Y DDIT3,OS9 MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,RP11-571M6.15,TSFM NA NA NA NA TSFM 13376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2,RP11-620J15.3 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 59478007 59478346 59478177 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 165704 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 62998747 62999127 62998791 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 3281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 63025271 63025629 63025492 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 29805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr12 63026443 63026842 63026744 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 30977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 63091878 63091979 63091882 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 96412 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 63096065 63096306 63096205 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 100599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 63096618 63097002 63096657 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 101152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 63097406 63097648 63097535 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 101940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 63242425 63242574 63242486 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 84243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 63738861 63739061 63739005 Y DPY19L2,AVPR1A NA NA NA NA NA RPL14P1 381766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 64310301 64310738 64310490 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 74228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 64386107 64386411 64386216 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 150034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 65930655 65931175 65930934 Y HMGA2 NA MSRB3,HMGA2,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 63474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 65959414 65959817 65959668 Y NA RP11-221N13.3 HMGA2,MSRB3,RPSAP52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 34832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 66050559 66051086 66050841 Y LEMD3 NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 55910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 66051570 66051762 66051716 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 56921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 23936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 67274459 67274765 67274734 Y GRIP1 NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 186177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 67363946 67364340 67364143 Y NA NA NA NA NA NA RP11-123O10.4 96602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 67752733 67753007 67752863 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 CAND1 91672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 68221654 68222227 68222103 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 181536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 68758917 68759565 68759229 Y IFNG,RAP1B MDM1 RAP1B,NUP107,LOC100507250 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MDM1 34756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr12 69150078 69150205 69150130 Y NA SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 12192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69403025 69403359 69403177 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 39675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69462130 69462730 69462407 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 98780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 70388549 70388859 70388715 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA PTPRB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320P7.2 183259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 71042778 71042865 71042804 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 182918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 71055637 71055848 71055742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 195777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 71770650 71771010 71770955 Y NA NA NA NA NA NA LGR5 60540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 73639499 73639785 73639508 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 1289766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 74257635 74257658 74257647 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 671893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 74668744 74669132 74668938 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 260419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 77005504 77005696 77005596 Y OSBPL8 NA ZDHHC17,CSRP2 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL8 53915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 77425555 77425931 77425698 Y OSBPL8 E2F7 NA NA NA NA E2F7 31429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr12 77771188 77771377 77771281 Y CSRP2 NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 54767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 78061184 78061442 78061321 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 161243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 78338246 78338645 78338266 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 115561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA RP1-78O14.1 SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-78O14.1 48215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 80219716 80220141 80220058 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R12A 107099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 83082881 83083305 83083086 Y NA TMTC2 NA NA NA NA TMTC2 4222 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 87657900 87657914 87657909 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 767709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 87724582 87724754 87724682 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 700869 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 13.8479885423581 chr12 87822808 87822965 87822871 Y NA NA NA NA NA NA C12orf29 602658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 89630105 89630296 89630227 Y DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 114752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 89740427 89740813 89740638 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 89960420 89960675 89960548 Y NA POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNT4,POC1B-GALNT4 42381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90065189 90065567 90065562 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 35510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90065963 90066366 90066126 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 34711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90124876 90125258 90125114 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 23799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 90125293 90125953 90125608 Y DUSP6,ATP2B1 ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 24216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 90150470 90150910 90150738 Y NA ATP2B1 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2B1 49393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90403694 90404042 90403890 Y NA NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-753N8.1 268629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA RP11-753N8.1 187195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 91527742 91527993 91527846 Y NA LUM,DCN NA NA NA NA LUM 24134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DCN 200153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 92436632 92436991 92436801 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 100358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 92500767 92501208 92501155 Y NA RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 36141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 92932983 92933476 92933230 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 387631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 92995849 92996628 92996444 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 324479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 93320988 93321201 93321103 Y EEA1 NA NA NA NA NA EEA1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 94172136 94172517 94172167 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 102985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 94681590 94681805 94681698 Y NA NA NA NA NA NA RBMS2P1 134940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 95037595 95038737 95038539 Y PLXNC1,TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 3601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 95083150 95083327 95083262 Y NA TMCC3 TMCC3 IMR90 Hi-C 24141950 TMCC3 40812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 95597894 95598075 95597980 Y NA FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 11183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 96027575 96027687 96027629 Y NA NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 NTN4 155243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17,RN7SKP11 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 96819131 96819446 96819342 Y NA CDK17 CDK17,ELK3,LTA4H IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 96839212 96840356 96839676 Y NEDD1,NEDD1,CDK17 CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 19948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 96842223 96842407 96842329 Y NA CDK17,RN7SKP11 CDK17 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP11 22959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 99021055 99021169 99021113 Y NA SLC25A3,IKBIP,APAF1 NA NA NA NA IKBIP 15722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 99786605 99786971 99786790 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA UHRF1BP1L 747655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 102250819 102251404 102251014 Y DRAM1 GNPTAB,DRAM1 GNPTAB,DRAM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DRAM1 17725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 102269445 102269658 102269578 Y DRAM1 GNPTAB,DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 102285250 102285626 102285359 Y DRAM1 DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 16121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 102329942 102330412 102330197 Y DRAM1 NA NA NA NA NA DRAM1 60813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 102734344 102734692 102734517 Y NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF1 137731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 3495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 104846909 104846975 104846916 Y NA CHST11 NA NA NA NA CHST11 98 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 104997803 104998291 104998125 Y TXNRD1,TXNRD1,CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 150730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 105032549 105032903 105032843 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 185476 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 105061987 105062372 105062098 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 214914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 105066347 105066673 105066397 Y TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 219274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 106381323 106381559 106381463 Y NA NA NUAK1,C12orf75 IMR90 Hi-C 24141950 NUAK1 150252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 108699402 108699607 108699511 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA FICD 207355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 108700100 108700298 108700252 Y CORO1C,SELPLG NA NA NA NA NA FICD 206664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 108761286 108761499 108761386 Y SSH1,CORO1C,SELPLG,SELPLG NA CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 FICD 145463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 109061186 109061401 109061295 Y SELPLG,SELPLG,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 61971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 109084686 109085066 109084867 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 38306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.88038161681049 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5 NA NA NA NA RP11-968O1.5 23553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 113652796 113652994 113652903 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA TPCN1 3861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr12 115865739 115865767 115865753 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 745770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 115889491 115890073 115889778 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 769522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 116561417 116561596 116561452 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 151547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 116776120 116776308 116776214 Y MAP1LC3B2,MED13L NA MED13L IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 62977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 116958826 116959052 116958939 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 LINC00173,MED13L,MIR4472-2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 10175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 117498032 117498586 117498265 Y NA TESC NA NA NA NA TESC 36698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 118263351 118263381 118263366 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 186012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-1 337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 121021309 121021477 121021390 Y NA POP5,RPL11P5 NA NA NA NA POP5 4108 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 121402785 121402795 121402791 Y HNF1A C12orf43 NA NA NA NA C12orf43 49510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 121581639 121581946 121581768 Y P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7 NA NA NA NA NA P2RX4 63714 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 122517490 122517922 122517629 Y RSRC2,KDM2B,SETD1B,MLXIP MLXIP NA NA NA NA MLXIP 2862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr12 123233355 123233499 123233417 Y CLIP1,HCAR2,HCAR3 HCAR3,HCAR1,DENR CCDC62 IMR90 Hi-C 24141950 DENR 1822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 123619465 123619743 123619466 Y C12orf65,C12orf65,C12orf65 PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 12819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 262533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124721310 124721532 124721425 Y NA NA NA NA NA NA CCDC92 265932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124811433 124811602 124811518 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 238533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124889485 124889845 124889665 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 160290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 124926476 124926613 124926576 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr12 125258641 125259012 125258790 Y NCOR2,UBC NA NA NA NA NA SCARB1 106202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 125395122 125395522 125395138 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 4392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 127208914 127209015 127208965 Y NA LINC00944 NA NA NA NA LINC00944 45942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 127243720 127244099 127243910 Y NA LINC00944 NA NA NA NA LINC00944 10858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 127421224 127421361 127421312 Y NA NA NA NA NA NA LINC00944 166267 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 127567979 127568114 127568034 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 80558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 127715364 127715787 127715548 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 66692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 127742241 127742510 127742359 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 93569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr12 127752744 127753145 127752867 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 104072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr12 127754808 127755172 127754990 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 106136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr12 127770941 127771084 127771022 Y NA NA NA NA NA NA AC079949.1 122269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 130604079 130604318 130604215 Y NA FZD10 NA NA NA NA FZD10 40686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 NA NA NA NA NA ULK1 61957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr12 133081785 133082122 133081909 Y FBRSL1 FBRSL1 NA NA NA NA FBRSL1 17648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA ZMYM2 113459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 NA NA NA NA NA GJB2 71493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 21398890 21399124 21398998 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 52793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 22636222 22636574 22636412 Y EFHA1 NA NA NA NA NA FGF9 392700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 22688764 22689136 22688963 Y NA NA NA NA NA NA FGF9 445242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 23471356 23471597 23471410 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 202643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 23733450 23734509 23733658 Y NA NA NA NA NA NA SACS 271332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 23895900 23896291 23896206 Y NA NA NA NA NA NA SACS 109550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH RP11-309I15.1 SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-309I15.1 23257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr13 24567849 24568139 24567952 Y NA RP11-309I15.1 SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-309I15.1 15900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-309I15.1 145054 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 25880585 25880813 25880618 Y MTMR6,NUPL1 MTMR6,NUPL1 NA NA NA NA NUPL1 6923 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 29232247 29232368 29232342 Y NA POMP NA NA NA NA POMP 1006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 29290769 29291025 29290846 Y POMP SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 82 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 30332929 30333348 30333111 Y UBL3 NA NA NA NA NA UBL3 89473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 30717135 30717194 30717166 Y NA NA UBL3,KATNAL1,HMGB1,USPL1,ALOX5AP,LINC00426,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 KATNAL1 162427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 30867525 30867802 30867626 Y KATNAL1 KATNAL1 NA NA NA NA KATNAL1 11819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 31264554 31264674 31264586 Y USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP ALOX5AP HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ALOX5AP 42971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 31472880 31473382 31473215 Y C13orf33 NA NA NA NA NA ALOX5AP 165235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 31478262 31478584 31478425 Y C13orf33 NA NA NA NA NA ALOX5AP 170617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 32052041 32052268 32052184 Y NA NA RXFP2 IMR90 Hi-C 24141950 RXFP2 259406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 32324057 32324474 32324315 Y NA RXFP2 NA NA NA NA RXFP2 12383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 32620673 32620873 32620777 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY FRY NA NA NA NA FRY 17236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 32689338 32689467 32689381 Y NA NA NA NA NA NA FRY 85901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 32690357 32690648 32690536 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 86920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 32699240 32700118 32699476 Y N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2 NA NA NA NA NA FRY 95803 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 32700400 32700741 32700556 Y N4BP2L2,N4BP2L2 NA NA NA NA NA FRY 96963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 33758061 33758236 33758137 Y STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 164531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 33762622 33762899 33762709 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 159868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 33778763 33779029 33778994 Y STARD13,STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 143738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 33781660 33782051 33781892 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 140716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 34069113 34069239 34069161 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 146346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 34296005 34296236 34296099 Y NA NA STARD13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC3 93950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 34781635 34781805 34781767 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 391449 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 37473939 37474133 37474036 Y C13orf36,SMAD9 LAMTOR3P1 NA NA NA NA LAMTOR3P1 20543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 37881013 37881265 37881086 Y POSTN NA LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 POSTN 289716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr13 38067112 38067171 38067141 Y POSTN NA CSNK1A1L IMR90 Hi-C 24141950 POSTN 103810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 38192754 38192981 38192894 Y NA POSTN NA NA NA NA POSTN 21773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 40139698 40140018 40139948 Y NA LHFP NA NA NA NA LHFP 35647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 42188044 42188379 42188211 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 304703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 42228867 42229175 42229114 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 345526 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 385716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 43392565 43392759 43392664 Y EPSTI1 NA CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 171648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 43393954 43394179 43394038 Y NA NA CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 170228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 43410663 43410880 43410773 Y NA NA CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 153527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 43656094 43656342 43656191 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 60755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 43727960 43728297 43728107 Y NA NA ENOX1,DNAJC15,CCDC122,LACC1 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJC15 132621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 43912615 43912772 43912726 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 317276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 44115188 44115336 44115262 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA ENOX1 243708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 44165760 44165919 44165882 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 193125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 44379216 44379443 44379336 Y ENOX1 ENOX1 ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENOX1 20172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 44420814 44421049 44420930 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 30371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 44811516 44811943 44811701 Y NA NA TSC22D1,SERP2,NUFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TSC22D1 337340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 44833229 44833563 44833337 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 315720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr13 44834615 44834626 44834621 Y NA NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 314657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 44838473 44838853 44838527 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 310430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 44842198 44842383 44842274 Y NA NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 306900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 44875300 44875802 44875641 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 273481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr13 44887042 44887399 44887172 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 261884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 45030393 45030697 45030548 Y NA NA NA NA NA NA TSC22D1 118586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 45496701 45496835 45496770 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP1 64783 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 46913143 46913601 46913410 Y LCP1 NA NA NA NA NA KIAA0226L,PPP1R2P4 96724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 46929409 46929462 46929429 Y LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA KIAA0226L,PPP1R2P4 80863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 46943616 46943890 46943786 Y LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA KIAA0226L,PPP1R2P4 66435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 47242224 47242549 47242263 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 NA NA NA NA NA LRCH1 116921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 48478393 48478707 48478627 Y RB1 NA NA NA NA NA SUCLA2-AS1 94818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 49074869 49075392 49075112 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 29977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 49136516 49136688 49136661 Y FNDC3A,ITM2B,RB1,LPAR6,CYSLTR2,RCBTB2 RCBTB2 NA NA NA NA RCBTB2 31147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 49615947 49616340 49616144 Y SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A NA NA NA NA NA FNDC3A 67899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13 NA NA NA NA TRIM13 29452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 50783828 50784088 50783957 Y NA NA DLEU2,DLEU7 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DLEU2 85972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL34P26 169381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 51204178 51204550 51204306 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 270279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 51209543 51210059 51209810 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 51210187 51210463 51210320 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 51288107 51288409 51288197 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 193405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 51464273 51464487 51464380 Y NA RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 17327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 51466138 51466579 51466443 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 DLEU2,GUCY1B2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 15235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 51815944 51816141 51816055 Y INTS6 FAM124A NA NA NA NA FAM124A 21441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr13 55958757 55958898 55958823 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 2733913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 60338539 60338813 60338676 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 397308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 61157781 61157905 61157871 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 189190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 64491531 64491783 64491579 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R2P10 107790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 24076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.65881380013276 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 3026586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 67722025 67722418 67722226 Y PCDH9 NA NA NA NA NA LINC00355 3073881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 74228674 74228703 74228690 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 477691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 74276580 74276751 74276632 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 429643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 75800411 75800558 75800473 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 253692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77078666 77078696 77078681 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 379844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77304352 77304607 77304501 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 153933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 77338551 77338941 77338664 Y NA NA KCTD12 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD12 119599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77453598 77454010 77453765 Y FBXL3,KCTD12 KCTD12 NA NA NA NA KCTD12 4530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77516606 77516723 77516665 Y KCTD12 RPL7P44,DHX9P1,CLN5 NA NA NA NA RPL7P44 37328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77599424 77599520 77599503 Y NA RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3 NA NA NA NA FBXL3 94 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 77919513 77919679 77919640 Y FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 20328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 80350805 80350890 80350848 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 297518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 80412301 80412453 80412388 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 359014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 81913928 81913973 81913949 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 1000842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 84480650 84480755 84480723 Y NA SLITRK1 NA NA NA NA SLITRK1 26122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.54214024189347 chr13 84711549 84711699 84711638 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK1 257021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 85779521 85779874 85779724 Y NA NA NA NA NA NA LINC00351 155862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 87444403 87444606 87444585 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1072780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr13 90053531 90053928 90053634 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1944146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 90167002 90167321 90167160 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1830753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 90568619 90568996 90568823 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1429078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 90634693 90634897 90634785 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1363177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 93899040 93899272 93899121 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 21945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr13 93915220 93915506 93915338 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 38125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 93947360 93947697 93947394 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 70265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 94297506 94297518 94297511 Y GPC6 NA NA NA NA NA SNORD22 278293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 94472931 94472950 94472936 Y NA NA NA NA NA NA SNORD22 453718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 94644641 94644702 94644672 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 601809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 94762314 94762622 94762468 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 483889 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr13 94913778 94913870 94913813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 332641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 94976151 94976227 94976185 Y SOX21 NA NA NA NA NA TGDS 270284 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 95919951 95920261 95920073 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 31426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 95938060 95938332 95938319 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 13355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 96243281 96243667 96243475 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1 51290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 96376622 96376681 96376676 Y DNAJC3 DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 49229 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 98082020 98082299 98082214 Y MBNL2,RAP2A RAP2A RAP2A IMR90 Hi-C 24141950 RAP2A 2177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 98599587 98599881 98599659 Y NA IPO5 NA NA NA NA IPO5 4031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr13 99130571 99130717 99130631 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 97477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 99135278 99135706 99135580 Y NA NA NA NA NA NA STK24 92488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 99223213 99223429 99223417 Y STK24 STK24 NA NA NA NA STK24 4765 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA GPR18 62547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 100008214 100008389 100008314 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR18 96216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 100026921 100028247 100027781 Y UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA GPR18 114923 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 100084902 100085483 100085174 Y GPR183 NA MIR548AN,UBAC2,DOCK9,UBAC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM9SF2 66188 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 103412083 103412182 103412091 Y C13orf27,C13orf40 KDELC1,BIVM NA NA NA NA KDELC1 37175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 106751889 106752019 106751954 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 466493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 106808885 106809142 106808998 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 409370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr13 107001723 107002064 107002003 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 216448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 107160222 107160504 107160362 Y NA NA NA NA NA NA ARGLU1 58008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 107188808 107188962 107188940 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 29550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 108103235 108103615 108103559 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 413468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr13 108153519 108153767 108153691 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 363316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 108238726 108238999 108238876 Y FAM155A NA NA NA NA NA FAM155A 278084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 109595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 108428526 108428615 108428535 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 88468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 108520131 108520835 108520801 Y LIG4,FAM155A FAM155A NA NA NA NA FAM155A 3048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 109597213 109597584 109597276 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 695625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 905919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 109847392 109847697 109847628 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 945804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 109852673 109853050 109852860 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 951085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF13B 994185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF13B 1007706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF13B 1020216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr13 110037722 110037884 110037788 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 918275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 110132729 110132862 110132798 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 823297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 110352571 110352699 110352636 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 603460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 433901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr13 110522374 110522680 110522537 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 433479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 291312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 286075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 110780432 110780795 110780703 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 175364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111013776 111014136 111013979 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 56280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 111048888 111049110 111049017 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 91392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 111049993 111050394 111050073 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 92497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111061947 111062361 111062286 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 104451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111172874 111173635 111173314 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 38445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 111174336 111174835 111174468 Y ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 37245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 111188602 111188989 111188936 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB20 23091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111212967 111213224 111213111 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB20 887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 111568618 111569036 111568957 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 3202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111607450 111607830 111607755 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 42034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 111609846 111610157 111610005 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 44430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 111881085 111881388 111881198 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 116179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr13 113514166 113514374 113514224 Y NA MCF2L NA NA NA NA MCF2L 32318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 114611317 114611637 114611421 Y NA GAS6 NA NA NA NA GAS6 46271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr13 114810103 114810577 114810313 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 85509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.5480298917939 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr13 114871084 114871554 114871378 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 24532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr14 23308431 23309148 23308805 Y NA SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 4665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr14 23322319 23322495 23322408 Y NA SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA LRP10 16327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 23584186 23584501 23584299 Y C14orf119 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 21363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 24716186 24716316 24716212 Y NA TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA NA NA NA NA TINF2 6306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 28109127 28109447 28109287 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3006G17.2 203045 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 31559968 31560471 31560185 Y SCFD1,GPR33,STRN3 NA NA NA NA NA STRN3 66361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 281070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr14 34504920 34505230 34505078 Y NA NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 424332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35090811 35090907 35090859 Y NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 6482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35120187 35120582 35120411 Y SNX6,SNX6 SNX6 SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C IMR90 Hi-C 24141950 SNX6 22798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35575000 35575033 35575017 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA PPP2R3C 14690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35835253 35835895 35835561 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 20380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35853509 35853868 35853721 Y FAM177A1,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 2407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35854902 35855043 35854959 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 1232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 35876265 35876636 35876451 Y FAM177A1,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 4310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1199385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr14 42286206 42286221 42286213 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 2386502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 43420114 43420297 43420206 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1944201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 44804196 44804463 44804330 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 560035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RN7SL1 675222 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 50988191 50988449 50988343 Y NA ATL1,MAP4K5 NA NA NA NA ATL1 8778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 51144322 51144826 51144405 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,NIN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 11273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 51794326 51794480 51794403 Y NA NA NA NA NA NA TMX1 89446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 51915852 51916182 51915957 Y NA FRMD6 FRMD6,LOC283553,GNG2,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 37636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 52074354 52074735 52074485 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 120536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52076708 52076858 52076794 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 122890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 52104818 52105424 52105148 Y NA NA NA NA NA NA FRMD6 151000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52350999 52351848 52351141 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA GNG2 60086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52492753 52493004 52492825 Y NA C14orf166,NID2 NA NA NA NA C14orf166 38560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 52733578 52733826 52733624 Y NA PTGDR,PTGER2 NA NA NA NA PTGDR 1147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.76959770847163 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 55302493 55302656 55302575 Y NA NA NA NA NA NA GCH1 64914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 55574465 55575376 55574639 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 13452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 55584452 55585250 55584591 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 3578 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 57459148 57459304 57459264 Y NA NA NA NA NA NA EXOC5 274422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 58726838 58727438 58727133 Y NA PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA PSMA3 17289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 59106687 59106948 59106735 Y NA DACT1 NA NA NA NA DACT1 8002 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 59216036 59216189 59216096 Y ARID4A RP11-112J1.1 DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-112J1.1 43183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 59800555 59800809 59800631 Y GPR135 NA NA NA NA NA GPR135 129251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 59861080 59861273 59861260 Y DAAM1,RTN1 NA DAAM1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR135 68787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 60074995 60075284 60075140 Y NA NA NA NA NA NA JKAMP 125834 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 60618583 60618767 60618659 Y PPM1A,C14orf135,DHRS7 DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 15807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr14 61188145 61188381 61188263 Y NA SIX4,MNAT1 NA NA NA NA SIX4 685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61547219 61547605 61547412 Y NA NA NA NA NA NA TRMT5 101143 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 61568840 61569300 61569092 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 82977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 81318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 PRKCH SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 39952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 61645426 61645731 61645594 Y NA PRKCH SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 6546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61822624 61823005 61822699 Y PRKCH RP11-902B17.1 NA NA NA NA RP11-902B17.1 35088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61933004 61933260 61933132 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 101998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 61937176 61937384 61937282 Y NA NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 97874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 95883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 65145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 61978357 61978646 61978426 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 56612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 56239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr14 62015577 62015884 62015776 Y PRKCH RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 19374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 62032593 62032996 62032785 Y HIF1A RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 2262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 62040859 62041355 62041035 Y NA RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 5601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr14 62052734 62053075 62053015 Y SYT16 RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 17476 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 62053265 62053527 62053394 Y NA RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 18007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 62070604 62070799 62070701 Y HIF1A RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 35346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 62082808 62083073 62082921 Y SYT16 RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 47550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 64670198 64670275 64670237 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1 182474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 65293635 65294075 65293719 Y NA NA NA NA NA NA CHURC1 85004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 65705887 65706189 65706012 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 138474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 65717940 65718310 65718036 Y NA NA LOC645431,FUT8 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 150527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 67735210 67735475 67735304 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 29384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 67998625 67999040 67998762 Y NA TMEM229B NA NA NA NA TMEM229B 169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 68610058 68610732 68610311 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 276181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 187169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 68717033 68717146 68717097 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 169767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 68925660 68925982 68925837 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 38747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr14 68943032 68943562 68943135 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 56119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 69161300 69161452 69161356 Y NA NA ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 99738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 69377319 69377610 69377464 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 69472543 69472713 69472613 Y NA ACTN1 DCAF5,ACTN1 IMR90 Hi-C 24141950 ACTN1 28386 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 69533449 69533600 69533523 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 84267 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr14 70183177 70183631 70183340 Y KIAA0247,SRSF5,SRSF5 SRSF5 NA NA NA NA SRSF5 7986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 70186093 70186928 70186364 Y KIAA0247,SRSF5,SRSF5 SRSF5 NA NA NA NA SRSF5 4689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 71349940 71350165 71350035 Y MED6,PCNX PCNX NA NA NA NA PCNX 21957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 71711284 71711362 71711294 Y NA NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 73804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 71811948 71812060 71812004 Y NA SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 25417 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 71870372 71870659 71870456 Y PCNX,SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 83841 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 72377642 72377923 72377783 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 591111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 73373247 73373392 73373372 Y NA DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1 RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPF3 14438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 73695241 73695452 73695329 Y ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf169 PAPLN NA NA NA NA PAPLN 6753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 74220065 74220506 74220203 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 40937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 74237437 74237571 74237504 Y ZNF410,C14orf43 NA NA NA NA NA PNMA1 58309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 74918684 74918707 74918696 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 VRTN IMR90 Hi-C 24141950 MIR4709 26200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST CTD-2207P18.2 NA NA NA NA CTD-2207P18.2 42330 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 75492523 75492557 75492545 Y NA EIF2B2,MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 23678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 75649674 75650038 75649826 Y FOS TMED10 TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TMED10 8340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 75986801 75987047 75986915 Y BATF NA NA NA NA NA FLVCR2 55913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 76026175 76026384 76026299 Y NA FLVCR2,RP11-507E23.1 NA NA NA NA FLVCR2 16576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 10455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr14 77498012 77498283 77498148 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 4978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr14 78447305 78447552 78447446 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 182879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 79748672 79748684 79748678 Y NRXN3 NA NA NA NA NA NRXN3 1041938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 80050129 80050354 80050306 Y NRXN3 NA NA NA NA NA DIO2 801746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 80241894 80242194 80242045 Y DIO2 NA NA NA NA NA DIO2 609906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 81588946 81589112 81589029 Y GTF2A1,GTF2A1 RP11-114N19.3 NA NA NA NA RP11-114N19.3 45646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr14 81867886 81868104 81867969 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA RP11-299L17.1 70181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 85021286 85021648 85021467 Y NA NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 972684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 86053629 86053936 86053651 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 59141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 86066316 86066619 86066414 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 71828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 86073952 86074255 86074109 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 79464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 89466992 89467193 89467101 Y FOXN3 NA EFCAB11,FOXN3,PRO1768,EML5,TTC8,LOC400236,TDP1 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 178495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 89739645 89739700 89739695 Y NA CAP2P1 NA NA NA NA CAP2P1 16238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 89897229 89897488 89897403 Y FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 141291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 89976845 89976992 89976928 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 106501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 91529481 91529737 91529617 Y SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5 C14orf159,RPS6KA5 NA NA NA NA RPS6KA5 4501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 91697855 91698086 91698043 Y C14orf159,SMEK1,GPR68 GPR68 NA NA NA NA GPR68 20183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 92571362 92571371 92571367 Y NA ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 397 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 92939984 92940195 92940107 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA RIN3 IMR90 Hi-C 24141950 LGMN 272852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 NA NA NA NA NA LGMN 242514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr14 93252078 93252440 93252261 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN,GOLGA5 GOLGA5 K562 ChIA-PET 22265404 GOLGA5 6136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 93540322 93540650 93540529 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 40015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 93776910 93777138 93777024 Y PRIMA1 BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 20300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 94748201 94748526 94748499 Y SERPINA6,SERPINA5,SERPINA4,SERPINA3,SERPINA11,SERPINA1,SERPINA10,SERPINA10 SERPINA6 NA NA NA NA SERPINA6 39205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 96718007 96718377 96718192 Y BDKRB1 BDKRB2,RP11-404P21.8,BDKRB1 NA NA NA NA BDKRB1 1784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 97645135 97645426 97645272 Y NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 383494 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 98559516 98559667 98559576 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 1297875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 99382985 99383133 99383054 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 562083 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 101151381 101151698 101151540 Y RTL1,DLK1 DLK1 NA NA NA NA DLK1 38344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 101454914 101455185 101454975 Y DLK1,RTL1 NA NA NA NA NA MEG3 211167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102001660 102001854 102001726 Y PPP2R5C,PPP2R5C,DYNC1H1 NA NA NA NA NA PPP2R5C 224281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102188292 102188876 102188640 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C LINC00239 K562 ChIA-PET 22265404 PPP2R5C 37259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr14 102277268 102277494 102277347 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 51133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 103577820 103578081 103577991 Y MARK3,BAG5,BAG5,TRAF3,EIF5,EIF5,TNFAIP2 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 9698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 103726827 103727460 103727139 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr14 105554572 105554923 105554752 Y NA NA BTBD6,BRF1,AHNAK2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 69087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr14 106857348 106857526 106857389 Y NA NA NA NA NA NA LINC00221 78919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr15 20599040 20599336 20599188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 1944753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA RP11-603B24.2 637959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 6.20389886697644 chr15 24114794 24115156 24114976 Y NA NA NA NA NA NA NDN 184344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 25123469 25123644 25123557 Y SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN NA NA NA NA NA SNRPN 56675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 25587380 25587405 25587393 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 94723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25604152 25604594 25604190 Y SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 77534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25634776 25635000 25634877 Y SNURF,SNRPN UBE3A NA NA NA NA UBE3A 47128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 25641447 25641749 25641585 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 40379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 26030419 26030730 26030600 Y ATP10A NA NA NA NA NA ATP10A 77587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 29949236 29949642 29949365 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 309426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 32962221 32962756 32962661 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 45419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 32974763 32975144 32974961 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 33031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 33120518 33121018 33120854 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 112343 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 33122479 33122828 33122652 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 114304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 33153988 33154297 33154060 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 145813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 34639079 34639478 34639279 Y NA SLC12A6,NOP10,LPCAT4 NA NA NA NA NOP10 5701 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 35931462 35931854 35931625 Y NA NA NA NA NA NA RP11-323I15.2 548780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 38823791 38823961 38823868 Y NA RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 31815 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 38828822 38829084 38828901 Y RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 26692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr15 39371433 39371559 39371496 Y NA NA C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 345837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 39425474 39425830 39425675 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 291566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 39683457 39683798 39683639 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 33598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 39720042 39720248 39720109 Y NA RP11-624L4.1 C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 2646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 39722195 39722553 39722498 Y THBS1,C15orf54 RP11-624L4.1 C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 4799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 40337433 40337595 40337464 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 8044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 41185333 41185514 41185432 Y INO80,CHP,VPS18 RHOV,VPS18,DLL4 NA NA NA NA VPS18 705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 41233721 41234461 41233781 Y C15orf57,VPS18 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 8699 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 42327713 42327843 42327787 Y MAPKBP1,PLA2G4B NA EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 64937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 43081091 43081306 43081168 Y NA NA NA NA NA NA CDAN1 53767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 44073726 44074107 44073917 Y NA PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76 NA NA NA NA ELL3 5985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 45004703 45005017 45004887 Y CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48,RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 45784407 45784611 45784453 Y C15orf48,SQRDL,PLDN RP11-519G16.3,SLC30A4 NA NA NA NA SLC30A4 28394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 45929603 45930187 45929917 Y C15orf48,PLDN,SQRDL SQRDL NA NA NA NA SQRDL 8257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 46528514 46528549 46528532 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 607168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 48647753 48647896 48647834 Y FBN1 DUT,RP11-154J22.1 NA NA NA NA RP11-154J22.1 25700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr15 48975243 48975418 48975260 Y NA FBN1 FBN1,SHC4,CEP152 IMR90 Hi-C 24141950 FBN1 39197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 48985825 48986062 48985871 Y FBN1 FBN1 FBN1,CEP152,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 FBN1 49779 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 49785048 49785439 49785238 Y NA NA NA NA NA NA FGF7 71755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 50347446 50348347 50347721 Y USP8,GABPB1 NA NA NA NA NA SLC27A2 124046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr15 50429549 50429984 50429688 Y USP8,GABPB1 SLC27A2 ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC27A2 42409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 51668213 51668584 51668408 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA DMXL2 244446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 51868984 51870333 51869210 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 42697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr15 51912435 51913121 51913004 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 NA NA NA NA NA DMXL2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 52028351 52028526 52028483 Y MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 13232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 52330351 52330361 52330356 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2184D3.1 55131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 52385766 52385957 52385877 Y DMXL2,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 52395777 52396019 52395882 Y DMXL2,TMOD3,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.5 5057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 56127522 56127639 56127539 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 94234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 56201661 56201754 56201731 Y NEDD4 NA NA NA NA NA NEDD4 82190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 56330366 56330465 56330418 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 46422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 56419675 56420043 56419859 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 113440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 57465140 57465369 57465208 Y ZNF280D,TCF12 NA LOC283663 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 200796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 57853638 57853874 57853726 Y NA GCOM1,MYZAP,POLR2M NA NA NA NA GCOM1 28232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 58761932 58762090 58762054 Y NA ALDH1A2 ADAM10 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 25975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 96873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 59530226 59530327 59530289 Y BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA FAM81A 132565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA FAM81A 75499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 59649595 59649770 59649683 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 13122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 60699729 60699909 60699819 Y NA ANXA2 NA NA NA NA ANXA2 6647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 60818402 60818756 60818740 Y RORA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA RP11-219B17.1 49025 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 60839009 60839501 60839122 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 69632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 60881604 60881753 60881652 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 112227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 60883059 60884017 60883872 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 113682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 61051185 61051571 61051320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 281808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 61091060 61091341 61091119 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 321683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 62405210 62405473 62405223 Y NA NA NA NA NA NA C2CD4B 50009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 62410713 62410981 62410834 Y NA C2CD4B NA NA NA NA C2CD4B 44501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 62411576 62411892 62411783 Y NA C2CD4B NA NA NA NA C2CD4B 43590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 62574155 62574333 62574245 Y NA NA NA NA NA NA TLN2 106392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 63663812 63664001 63663921 Y LACTB,RAB8B CA12 NA NA NA NA CA12 8359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 63794488 63794915 63794759 Y NA NA NA NA NA NA USP3 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 65135268 65135743 65135404 Y TRIP4,ZNF609,OAZ2,SPG21,SPG21,PLEKHO2 PIF1,AC069368.3,PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 3180 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 65176143 65176677 65176391 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 AC069368.3,PLEKHO2 NA NA NA NA PLEKHO2 44055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 66923146 66923585 66923353 Y NA NA SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 68981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 67436996 67437215 67437119 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 82895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 67468171 67468380 67468281 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 76758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 68579972 68580192 68580087 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 11831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr15 68589122 68589626 68589166 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr15 68641532 68641916 68641757 Y NA NA NA NA NA NA FEM1B 73391 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 68652766 68652805 68652797 Y NA NA FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 ITGA11 69696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 68771712 68772048 68771882 Y ITGA11 ITGA11 ITGA11,CORO2B,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA11 49211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 68777268 68777651 68777548 Y NA NA CORO2B,ITGA11,MIR548H4,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 ITGA11 54767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 68818732 68818982 68818861 Y ITGA11 NA ITGA11,FEM1B,ANP32A,MIR548H4 IMR90 Hi-C 24141950 CORO2B 50326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 68820991 68821248 68821120 Y NA CORO2B ITGA11,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 CORO2B 48060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 68821473 68821531 68821481 Y NA CORO2B ITGA11,FEM1B IMR90 Hi-C 24141950 CORO2B 47777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 69771851 69772087 69771969 Y NA RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 28728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70051353 70051726 70051572 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 308230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70052375 70052953 70052736 Y TLE3 NA TLE3,LOC145837,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 309252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70452625 70452932 70452815 Y TLE3 NA NA NA NA NA TLE3 64110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70559114 70559449 70559284 Y TLE3 NA LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 170599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70641269 70641570 70641504 Y TLE3 NA TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 252754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 70785060 70785587 70785260 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 268345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 71406673 71406868 71406715 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 223549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 71571390 71571701 71571551 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 72213908 72214290 72214099 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 190309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 74223574 74223817 74223712 Y LOXL1 LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 7244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 74289381 74289564 74289454 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 4367 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 74661495 74661657 74661620 Y NA NA NA NA NA NA SEMA7A 63151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75398506 75398605 75398540 Y MAN2C1,CLK3,C15orf39 NA C15orf39 MCF7 ChIA-PET 22265404 PPCDC 84610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75400106 75401427 75400997 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf39 84557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75404629 75405178 75404816 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 80806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA NA NA NA NA NA UBE2Q2 82544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 78953383 78953770 78953429 Y MORF4L1 CHRNA3,RPL18P11 CHRNA5,CHRNB4,LOC729911 IMR90 Hi-C 24141950 RPL18P11 1465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 79216586 79216987 79216944 Y RASGRF1 CTSH NA NA NA NA CTSH 22929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80126746 80127013 80126880 Y NA NA NA NA NA NA MTHFS 60708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80164886 80165472 80165199 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS,MTHFS,MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 22249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 80258107 80258932 80258427 Y MTHFS,MTHFS,ST20,ST20-MTHFS,ST20,ZFAND6,BCL2A1 C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA BCL2A1 2856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80734118 80734355 80734237 Y NA ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 39426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80772387 80772765 80772517 Y ARNT2,KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 77695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 80773280 80773702 80773515 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 78588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 80841630 80841706 80841692 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 146938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA ARNT2 186521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 81125183 81125474 81125331 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 55499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 81156027 81156230 81156065 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 86343 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 81207632 81207924 81207778 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA MESDC2 72295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 82156047 82156216 82156161 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 180266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 43979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 83956370 83956763 83956596 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 81600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 85227339 85227652 85227485 Y PDE8A,ZNF592,SEC11A WDR73,NMB,SEC11A NA NA NA NA NMB 27545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 196466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr15 89595180 89595429 89595286 Y NA ABHD2 ABHD2,RLBP1,MFGE8,HAPLN3 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD2 33261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 89648424 89648609 89648517 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA ABHD2 19734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90223736 90224077 90223949 Y NA PEX11A,WDR93 NA NA NA NA PEX11A 7937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90325168 90325324 90325249 Y POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP MESP1,ANPEP NA NA NA NA ANPEP 31309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90366635 90367145 90366908 Y NA ANPEP NA NA NA NA ANPEP 10002 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 90950706 90950784 90950761 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 91107423 91107655 91107549 Y UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3 CRTC3 NA NA NA NA CRTC3 36266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA MAN2A2 NA NA NA NA MAN2A2 25604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 92464513 92465010 92464828 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 69588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 92486040 92486252 92486096 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 92491090 92491332 92491214 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 96165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 92509194 92509613 92509420 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 114269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 92612839 92613223 92613006 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 213848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 69568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 60372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD2 48928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 93571843 93572426 93572107 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 147317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 94717689 94718013 94717847 Y NA NA MCTP2 IMR90 Hi-C 24141950 MCTP2 54754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 94746622 94746847 94746732 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 25920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 94815502 94815543 94815523 Y NA MCTP2 NA NA NA NA MCTP2 42735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 95038030 95038277 95038153 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 265263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 95050162 95050468 95050315 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 277395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 95370202 95370491 95370347 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 597435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 95847774 95848063 95847919 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1019104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 96103160 96103444 96103266 Y NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 763723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 96871345 96871608 96871517 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA NR2F2-AS1 2755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 10985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr15 96890448 96891058 96890571 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4408 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 96896232 96896529 96896359 Y NR2F2,NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 5042 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 97129304 97129480 97129390 Y NA NA NR2F2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-522B15.3 233838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 98957223 98957617 98957414 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 232583 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 98964843 98965105 98964974 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 225095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99223373 99223476 99223421 Y NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 33173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99342514 99342944 99342658 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 152314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99358585 99358846 99358731 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 168385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr15 99410702 99410893 99410822 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 220502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99416036 99416369 99416103 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 220051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99444571 99445210 99444854 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 191210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99450086 99450215 99450157 Y IGF1R NA NA NA NA NA SYNM 186205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 99665380 99665686 99665571 Y NA SYNM NA NA NA NA SYNM 28960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99864304 99864757 99864539 Y NA NA NA NA NA NA HSP90B2P 68467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr15 100026499 100026994 100026794 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 11129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD4 379529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 100782475 100782658 100782574 Y NA NA NA NA NA NA ASB7 358081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 101261253 101261648 101261594 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 119818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 101783359 101783726 101783540 Y CHSY1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 6411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr15 101790495 101790968 101790609 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA CHSY1 17378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr15 101860934 101861170 101861021 Y CHSY1,TM2D3 SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 27447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 575519 575832 575766 Y NHLRC4 PIGQ NA NA NA NA PIGQ 39163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr16 1052842 1052973 1052908 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1H 148268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 2104972 2105164 2105052 Y NA ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA NTHL1 9105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA TBC1D24 4456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2844544 2844902 2844723 Y MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 SRRM2,TCEB2 PRSS41 K562 ChIA-PET 22265404 TCEB2 19246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2845811 2846048 2845884 Y OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 SRRM2,TCEB2 NA NA NA NA TCEB2 20513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA FLYWCH2 NA NA NA NA FLYWCH2 45043 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3309129 3309539 3309316 Y MMP25,NAT15,NAT15,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV ZNF200,MEFV,ZNF263,ZNF75A,TIGD7 NA NA NA NA ZNF263 2204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 3889135 3889287 3889211 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 39440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3931357 3931444 3931401 Y C16orf90 CREBBP NA NA NA NA CREBBP 2630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 3996199 3996445 3996330 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 67472 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4063476 4063638 4063556 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 100548 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4420946 4421237 4421026 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 1097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 4422682 4422871 4422704 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 2833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4424244 4424335 4424249 Y CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2 PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 4395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL NA UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG1 87973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 5110961 5110972 5110967 Y NA ALG1,NAGPA,FAM86A NA NA NA NA NAGPA 28819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 7414574 7414954 7414765 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1298586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 9277609 9277994 9277792 Y NA NA ATF7IP2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 94104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 9912515 9912659 9912587 Y GRIN2A,GRIN2A,GRIN2A NA NA NA NA NA GRIN2A 361952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11024597 11024619 11024608 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 9698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11194136 11194543 11194329 Y NA NA NA NA NA NA RMI2 146933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11198828 11199160 11198954 Y LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 NA NA NA NA NA RMI2 142316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11277053 11277355 11277217 Y LITAF NA NA NA NA NA RMI2 64121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr16 11776552 11776999 11776845 Y SOCS1,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN NA NA NA NA SNN 16282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11955170 11955449 11955310 Y NA RSL1D1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 11728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 12088692 12088866 12088774 Y LITAF,LITAF,SNN,TXNDC11,ZC3H7A,RUNDC2A RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 20098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 12769820 12770024 12769919 Y CPPED1 NA NA NA NA NA CPPED1 125850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 14051699 14052037 14051838 Y NA ERCC4 NA NA NA NA ERCC4 39685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 15140552 15140757 15140655 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 7164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 16092294 16092782 16092512 Y NDE1 NA NA NA NA NA ABCC1 50860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 19707699 19708034 19707815 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 17744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 5.09605978358779 chr16 20877631 20877934 20877768 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 31256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 20910424 20910792 20910538 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 23455511 23455803 23455657 Y SCNN1G COG7 NA NA NA NA COG7 6698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 25121755 25122029 25121858 Y SLC5A11 LCMT1 NA NA NA NA LCMT1 705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 27257147 27257547 27257426 Y IL4R NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 20568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 28179891 28180117 28180009 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 41124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 28545865 28546104 28546001 Y EIF3CL,EIF3C,SULT1A1,SPNS1,APOBR,IL27 CLN3,NUPR1,CCDC101 NA NA NA NA NUPR1 2391 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 29311378 29311751 29311549 Y C16orf54,SPNS1 NA NA NA NA NA RP11-345J4.8 292644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.76959770847163 chr16 30927821 30927845 30927833 Y NA BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1,ORAI3,SETD1A NA NA NA NA FBXL19 4531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 31083220 31083516 31083291 Y NA STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA ZNF646 227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA RNA5SP413 1469605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr16 33948799 33949141 33948910 Y NA NA NA NA NA NA RNA5SP413 1030262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 34377841 34378195 34377988 Y NA NA NA NA NA NA RNA5SP413 601208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr16 34441880 34442279 34442062 Y NA NA NA NA NA NA RNA5SP413 537124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr16 34979653 34980053 34979874 Y NA RNA5SP413 NA NA NA NA RNA5SP413 250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 35029860 35030042 35030005 Y NA NA NA NA NA NA RNA5SP413 50457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 49316261 49316466 49316357 Y CBLN1,C16orf78 NA NA NA NA NA N4BP1 664202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 53124874 53125001 53124924 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 37929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 55521029 55521357 55521152 Y MMP2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 19553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 55544017 55544378 55544293 Y MMP2,LPCAT2 LPCAT2 NA NA NA NA LPCAT2 3107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr16 56640479 56640669 56640573 Y NA MT2A,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT2A,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr16 56645516 56645845 56645554 Y MT2A,MT1M,MT1E,MT1A MT2A,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 5405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 56944688 56944705 56944692 Y HERPUD1 HERPUD1,CETP NA NA NA NA HERPUD1 19255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 57073128 57073339 57073201 Y FAM192A,NLRC5 NA NA NA NA NA CPNE2 51110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 57294233 57294672 57294611 Y CPNE2,GPR56 ARL2BP,PLLP NA NA NA NA ARL2BP 17223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 57825562 57825816 57825638 Y NA NA NA NA NA NA KATNB1 57920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 57924208 57924586 57924493 Y NA KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 29251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 57927623 57928192 57928041 Y GPR97,ZNF319 KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 32666 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 64944348 64944657 64944578 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 213358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 65036446 65036851 65036669 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 121164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 65047832 65047877 65047854 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 110138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 65105283 65105525 65105355 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 52490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr16 65154285 65154635 65154564 Y NA CDH11 NA NA NA NA CDH11 3380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 65337559 65337576 65337568 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 179544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 66416297 66416567 66416426 Y CDH5 LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 23860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 66962213 66962449 66962329 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA FAM96B 3877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 67186810 67187094 67186952 Y NA C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4,NOL3,KIAA0895L,E2F4 NA NA NA NA B3GNT9 3693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 67538327 67538734 67538468 Y NA ATP6V0D1,FAM65A AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL IMR90 Hi-C 24141950 FAM65A 11587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.43724598345503 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 70727989 70728270 70728171 Y NA MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 10020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 70909910 70910012 70909961 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 76846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 70973998 70974194 70974080 Y VAC14 NA NA NA NA NA VAC14 140934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 70980057 70980287 70980181 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 146993 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 237648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 238992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA PMFBP1 250381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 72966138 72966319 72966212 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 125278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 73102477 73102709 73102578 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 10880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 73102955 73103191 73103082 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 11358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr16 73558765 73558950 73558947 Y NA NA HP,HPR IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 467168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL NA NA NA NA MLKL 44754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 75045854 75046060 75045918 Y TMEM170A,MLKL ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 13783 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 75288221 75288577 75288338 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 11374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 75294692 75295061 75294835 Y TERF2IP,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 4890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 75411958 75412267 75412159 Y NA NA NA NA NA NA CFDP1 53116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 78325751 78325980 78325865 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 194441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 79414931 79415415 79415101 Y MAF NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 217196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 79623380 79623748 79623651 Y NA MAF NA NA NA NA MAF 8863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 79635433 79635866 79635594 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 2822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 81038389 81038511 81038494 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 81465654 81465943 81465745 Y PLCG2,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 10832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 81491583 81491773 81491678 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 14808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 81512608 81512902 81512703 Y PLCG2,CMIP,CMIP CMIP NA NA NA NA CMIP 35833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 81871176 81871311 81871248 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 100474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 82226148 82226756 82226513 Y PLCG2,MPHOSPH6 MPHOSPH6 HSD17B2 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 24317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 28731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr16 82733427 82733620 82733554 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 75019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 84633108 84633501 84633306 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 16182 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 84633541 84633938 84633771 Y NA COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 15745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 84784930 84785133 84785062 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 84866899 84867167 84866969 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 15309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 85424430 85424739 85424585 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 296940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85428961 85429169 85429067 Y NA NA LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 292510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85548685 85548970 85548791 Y NA NA KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 172709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85617282 85617663 85617577 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 104016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 86421149 86421325 86421222 Y FOXF1,FOXC2 NA LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 165516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 86499961 86500190 86500098 Y FOXF1 NA NA NA NA NA MTHFSD 86651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 86698129 86698417 86698281 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 99272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 86775121 86775409 86775225 Y NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 176264 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 366001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 386553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA MAP1LC3B 36450 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 87498995 87499259 87499135 Y BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14 NA NA NA NA NA FBXO31 75247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 87823592 87823837 87823720 Y NA KLHDC4 JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 25994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 87888208 87888468 87888297 Y KLHDC4,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 12626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 87904170 87904524 87904347 Y FBXO31 SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 3076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88337697 88337985 88337883 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88340379 88340720 88340472 Y NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 177005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88829964 88830251 88830166 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 19368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 88847421 88847701 88847601 Y CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166 PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 1918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 89086731 89086969 89086798 Y NA NA ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACSF3 65814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 574639 574965 574941 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 15852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 1100738 1101160 1100939 Y SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK ABR YWHAE,ABR,BHLHA9,TUSC5,CRK,PITPNA,LOC100306951,INPP5K,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 29155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1267059 1267122 1267091 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 34550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1358484 1358816 1358590 Y NA CRK,MYO1C NA NA NA NA CRK 5640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA OVCA2 82688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2126107 2126815 2126522 Y NA NA NA NA NA NA SRR 77862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 2167377 2167408 2167381 Y NA SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2299235 2299531 2299372 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 117610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 3706173 3706587 3706405 Y NA ITGAE,C17orf85 NA NA NA NA ITGAE 3636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 4615866 4616105 4615999 Y MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16 PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16,ZMYND15 NA NA NA NA ARRB2 4082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 7380968 7381115 7381038 Y EIF5A TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 4467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.65881380013276 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 8407322 8407642 8407416 Y NA NA NA NA NA NA NDEL1 92873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 8600572 8600969 8600801 Y MYH10 NA MYH10,RPL26,RNF222 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 68493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 8649167 8649702 8649446 Y ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42 NA NA NA NA NA MYH10 117088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 8825548 8827035 8825911 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA NTN1 95824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 8850448 8850862 8850791 Y PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA NTN1 71997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 8857526 8857964 8857839 Y PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA NTN1 64895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 9772002 9772101 9772006 Y NA NA NA NA NA NA STX8 294094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 9924626 9924875 9924814 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 235204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 10023147 10023510 10023462 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 136569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 13249594 13249869 13249742 Y HS3ST3A1 NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 253375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 13412933 13413137 13413069 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 90107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 13444400 13444811 13444590 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 58433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 13575065 13575361 13575332 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 71821 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 14206970 14207459 14207274 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 4570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 14648424 14648714 14648547 Y HS3ST3B1 RPS18P12 HS3ST3B1,HS3ST3A1,COX10 IMR90 Hi-C 24141950 RPS18P12 41573 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 15153959 15154348 15154277 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 12295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 15850564 15850918 15850801 Y ADORA2B ADORA2B,TTC19 NA NA NA NA ADORA2B 4333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 16275124 16275367 16275237 Y NA CENPV,UBB NA NA NA NA UBB 6745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL FAM211A NA NA NA NA FAM211A 37772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr17 16948336 16948515 16948428 Y ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP MPRIP NA NA NA NA MPRIP 4477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 17054985 17055159 17055015 Y NA NA NA NA NA NA PLD6 52470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 17302391 17302480 17302436 Y NA RPL13P12 MED9,SMCR9,SREBF1,TOM1L2,PEMT,RAI1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL13P12 17065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17319893 17320013 17319952 Y FLCN RPL13P12 NA NA NA NA RPL13P12 34567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17336290 17336547 17336436 Y FLCN MED9 NA NA NA NA MED9 41753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17338782 17338902 17338881 Y NA MED9 NA NA NA NA MED9 39398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 17397062 17397447 17397255 Y NA MED9,RASD1 NA NA NA NA RASD1 262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 17641556 17641857 17641643 Y MYO15A NA NA NA NA NA RAI1 58769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 17752508 17752712 17752608 Y RASD1,PEMT SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 14183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 19207556 19207821 19207642 Y MAPK7 NA NA NA NA NA MAPK7 71213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 19630628 19631028 19630955 Y MAPK7,MAPK7 ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 19228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 6134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 20057823 20057990 20057893 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 147166 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 20204150 20204477 20204216 Y NA NA NA NA NA NA MEIS3P2 285894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 20690369 20690534 20690439 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 4411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.10489425843844 chr17 21515861 21516199 21516031 Y NA C17orf51 CCDC144NL K562 ChIA-PET 22265404 C17orf51 40139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 21908682 21908761 21908685 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 432960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.54214024189347 chr17 25571981 25572190 25572120 Y LGALS9,WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA LGALS9 NA NA NA NA LGALS9 26960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 26718724 26718918 26718801 Y FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1 POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1 NA NA NA NA SLC46A1 13297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 27367295 27367696 27367449 Y TAOK1 NA NA NA NA NA PHF12 90506 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 27918652 27918967 27918817 Y GIT1,EFCAB5,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 27972817 27973010 27972914 Y NA CORO6 NA NA NA NA CORO6 24892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 28037853 28038223 28038205 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 89928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 28672650 28672985 28672901 Y NSRP1,CPD,CPD CPD NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 30938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 28690653 28690812 28690780 Y SSH2,NSRP1,GOSR1,CPD,CPD CPD NSRP1,CPD,GOSR1,BLMH,TMIGD1,SLC6A4 IMR90 Hi-C 24141950 CPD 13111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 29334745 29335135 29334940 Y RAB11FIP4,OMG RNF135 NA NA NA NA RNF135 40942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 29821482 29821571 29821529 Y EVI2B,EVI2A,SUZ12 NA NA NA NA NA EVI2A 174580 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 229790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr17 29886835 29887094 29886884 Y EVI2A NA MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 EVI2A 239933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 245232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr17 29895600 29896010 29895781 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 248698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 29907482 29908002 29907782 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 260580 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 29920789 29921150 29921018 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 273887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 276835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 30005450 30005718 30005584 Y NA NA RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 UTP6 221066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 30253386 30253637 30253512 Y NA UTP6,SUZ12 SUZ12 K562 ChIA-PET 22265404 SUZ12 8400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 30603137 30603481 30603311 Y RHBDL3 NA NA NA NA NA C17orf75 71561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 31072918 31073214 31073077 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 128981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 31155018 31155230 31155072 Y MYO1D MYO1D NA NA NA NA MYO1D 46965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32575355 32576152 32575913 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL7,CCL11 CCL2,CCL11,CCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 4152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL7,CCL11 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32586301 32586443 32586414 Y NA CCL2,CCL7,CCL11 NA NA NA NA CCL2 5997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32633545 32633691 32633601 Y NA CCL7,CCL11,CCL8 NA NA NA NA CCL8 10364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32635447 32635773 32635526 Y CCL7 CCL7,CCL11,CCL8 NA NA NA NA CCL8 8282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 32940308 32940705 32940417 Y TMEM132E NA NA NA NA NA CCL8 296253 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr17 34045470 34045815 34045642 Y NA NA RASL10B IMR90 Hi-C 24141950 TAF15 88644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38096378 38096540 38096465 Y IKZF3 ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 14524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 38170793 38171091 38171022 Y CSF3 PSMD3,CSF3,THRA,MED24 NA NA NA NA CSF3 1179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38254249 38254664 38254597 Y GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38480180 38480741 38480429 Y IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 16736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38480804 38481074 38481013 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 17360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38488015 38488253 38488146 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 24571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38496652 38496786 38496719 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA RARA NA NA NA NA RARA 33208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38602883 38603101 38603015 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 5181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 38708057 38709216 38708396 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 93544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 39108843 39109211 39109026 Y KRTAP9-2,KRTAP2-1,KRTAP3-2 KRT23 KRT23 IMR90 Hi-C 24141950 KRT23 16957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 39110175 39110404 39110304 Y KRTAP3-2 KRT23 NA NA NA NA KRT23 18289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 39113005 39113367 39113263 Y NA KRT23 NA NA NA NA KRT23 21119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 39218168 39218609 39218458 Y NA KRTAP1-5,KRTAP1-1 NA NA NA NA KRTAP1-1 22455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 NA NA NA NA NA KRT16 83260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA NA NA NA NA NA KRT16 65631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 39782029 39782271 39782148 Y JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,KRT17 NA NA NA NA KRT17 2935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 39835188 39835696 39835517 Y RAB5C,NKIRAS2,DHX58,EIF1 EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,KRT19,EIF1,HAP1,JUP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 7441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 40517094 40517456 40517393 Y NA STAT3 NA NA NA NA STAT3 21130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 40608913 40609089 40609017 Y NA PTRF,ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 51 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 40689876 40689925 40689901 Y NA AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX,PSMC3IP NA NA NA NA NAGLU 3686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 41478754 41478975 41478864 Y ARL4D ARL4D NA NA NA NA ARL4D 4427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 41669625 41669874 41669775 Y NA ETV4 LOC100130581,ARL4D,DHX8,ETV4,DUSP3,SOST,C17orf105,MEOX1 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 14637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr17 42357085 42357361 42357237 Y TMUB2,TMUB2,GPATCH8,GRN SLC25A39 SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A39 42877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 42416163 42416367 42416282 Y TMUB2,TMUB2,GRN SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA GRN 4247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 42624253 42624886 42624582 Y TMUB2,TMUB2,GRN GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD2 8039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 43253543 43253622 43253574 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 17476 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 44268679 44268848 44268762 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 298931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 45021726 45021957 45021796 Y NA GOSR2,RPRML NA NA NA NA GOSR2 23243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 45333109 45333278 45333129 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 3846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 45343380 45343597 45343479 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 14117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 45344750 45345107 45344929 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 15487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 45356357 45357027 45356891 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 27094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA NFE2L1 NA NA NA NA NFE2L1 20861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 46334759 46335012 46334885 Y OSBPL7,SKAP1 NA NA NA NA NA SNX11 156040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB6,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 17123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB6,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 47857403 47857727 47857543 Y NA KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 FAM117A,ZNF652,KAT7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KAT7 6190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr17 48105546 48105721 48105634 Y ITGA3 ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 25611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 48288364 48288588 48288396 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 11371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 48299652 48299873 48299807 Y NA COL1A1 PPP1R9B,HILS1,SGCA,COL1A1,TMEM92 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 22659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B NA NA NA NA NA XYLT2 53639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA NA WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 65037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 49031638 49031879 49031784 Y NA NA NA NA NA NA TOB1 88299 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 49075036 49075414 49075227 Y NA NA NA NA NA NA SPAG9 120812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 49182545 49182921 49182907 Y NA SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2 NA NA NA NA SPAG9 13305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 53171922 53172041 53171982 Y NA NA NA NA NA NA COX11 127776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 DGKE,C17orf67 NA NA NA NA DGKE 44659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 55655246 55655454 55655378 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 269963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 56413212 56413667 56413409 Y VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 14787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 56701235 56701661 56701522 Y OR4D1,BZRAP1 RNU1-60P NA NA NA NA RNU1-60P 33005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 57841314 57841767 57841379 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 58327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 57902814 57903248 57902913 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 13379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 16355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 59232853 59233252 59232919 Y NA NA NA NA NA NA TBX2 242005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 59328360 59328558 59328442 Y NACA2 NA NA NA NA NA TBX2 146699 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 60856273 60856623 60856561 Y EFCAB3 NA NA NA NA NA MRC2 153511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 60897286 60897580 60897414 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 194524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 61352706 61353153 61352892 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 168586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 61357224 61357494 61357377 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 164245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 62151740 62151983 62151921 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,C17orf60,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 54196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 62403904 62404562 62404234 Y ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 65243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 62675748 62676312 62676051 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2,LOC146880 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMURF2 19562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 62744260 62744559 62744528 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM1P 86713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 63308534 63308549 63308540 Y NA NA CEP112,AXIN2 IMR90 Hi-C 24141950 AXIN2 247216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 64544919 64545280 64544935 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 248165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 64566647 64567007 64566809 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 269893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 64695504 64695853 64695677 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 398750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 65418011 65418377 65418257 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 46436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 65487114 65487504 65487449 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA NA PITPNC1 115539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 65525014 65525424 65525241 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 153439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 65991969 65992126 65992052 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA C17orf58 4204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 66308597 66309089 66308898 Y BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6 SLC16A6 NA NA NA NA SLC16A6 23189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 66379549 66379922 66379702 Y SLC16A6,WIPI1 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 71732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66419326 66419636 66419592 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 32018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66434083 66434422 66434387 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 17232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 66694330 66694724 66694542 Y NA NA NA NA NA NA FAM20A 98800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 67729924 67730199 67729927 Y NA NA KCNJ2-AS1,KCNJ2,KCNJ16 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K6 321085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 68750412 68750565 68750489 Y NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 KCNJ2 587598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70335121 70335458 70335290 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 219960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 225327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 70878407 70878514 70878507 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 208337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 71603632 71603970 71603800 Y NA SDK2 NA NA NA NA SDK2 34258 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 72278744 72279201 72278906 Y TMEM104,CD300LF,CD300LD,CD300LB,CD300E,CD300C,CD300A,TTYH2,TTYH2,DNAI2 NA NA NA NA NA TTYH2 71091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 72601624 72601903 72601704 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A3R1 140888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 72627955 72628575 72628190 Y TTYH2,TTYH2,CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LD,TMEM104,SLC16A5,CD300E,CD300LF NA GPRC5C,C17orf77,CD300LD,RAB37,CD300E IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A3R1 114216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr17 73007152 73007476 73007237 Y RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 73032786 73033119 73032977 Y TSEN54,GGA3 ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA KCTD2 6116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 73684314 73684419 73684412 Y NA SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 23045 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 73689850 73690283 73690148 Y KIAA0195,CASKIN2,WBP2 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 28581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5 NA NA NA NA RECQL5 35261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 73992927 73993207 73992957 Y NA TEN1,ACOX1,CDK3 NA NA NA NA CDK3 1780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 74248222 74248574 74248373 Y ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B ATF4P3,RNF157 RNF157 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF157 13768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 74368264 74368743 74368490 Y SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 1922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 74494294 74494838 74494393 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 1034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 74511289 74512094 74511811 Y QRICH2,SPHK1,SPHK1,SRSF2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2 RHBDF2,SNORD1B NA NA NA NA RHBDF2 15417 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 74593962 74594390 74594127 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6 SNORD1B,ST6GALNAC2 ST6GALNAC2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ST6GALNAC2 12924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 74664017 74664029 74664023 Y NA MXRA7 NA NA NA NA MXRA7 41069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 74713062 74713219 74713141 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA JMJD6 7647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75041584 75041844 75041683 Y SEPT9 LINC00338,SEC14L1 MGAT5B,SRSF2,MFSD11,METTL23,SEC14L1,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00338,SEC14L1 38954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 75321712 75322201 75321955 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 240914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75361925 75362048 75361987 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 281127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 307111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 321249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 336396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 340504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 75451587 75451956 75451821 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 370789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 8.97349657544807 chr17 76154299 76154669 76154484 Y C17orf99 SYNGR2,TK1,AFMID NA NA NA NA SYNGR2 7970 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 76339301 76339497 76339364 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 14661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76347582 76348110 76347694 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 6048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 76371853 76372298 76372087 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 SOCS3 K562 ChIA-PET 22265404 PGS1 423 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76409170 76409735 76409347 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 36449 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 76412850 76413399 76413170 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 40129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 76438570 76439399 76439026 Y USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 NA NA NA NA NA PGS1 65849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76879876 76880180 76879977 Y NA USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 77022886 77023125 77023007 Y C1QTNF1 LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 5990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 15794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr17 78102448 78102482 78102466 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 16500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 80060759 80061000 80060880 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 6551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 80239829 80239997 80239937 Y NA CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 10222 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 80845276 80845458 80845382 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 137336 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 81033239 81033614 81033398 Y NA B3GNTL1,METRNL B3GNTL1 K562 ChIA-PET 22265404 METRNL 1953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 81038687 81040054 81039707 Y B3GNTL1,METRNL B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA METRNL 3120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr17 81057799 81057924 81057864 Y METRNL METRNL NA NA NA NA METRNL 22232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 81063257 81063563 81063336 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 27690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr17 81103238 81103635 81103449 Y METRNL NA METRNL MCF7 ChIA-PET 22265404 METRNL 67671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 336673 336972 336812 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 70623 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 379694 380112 379776 Y NA NA NA NA NA NA THOC1 113644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr18 394915 395311 395219 Y NA NA NA NA NA NA COLEC12 103411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 781638 782117 782009 Y NA YES1 NA NA NA NA YES1 28430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 1888648 1888915 1888782 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP72 566562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 2031840 2031857 2031849 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 537651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 2056727 2056859 2056778 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 512649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 2096653 2096904 2096779 Y NA NA ADCYAP1 IMR90 Hi-C 24141950 METTL4 472604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 2223503 2223515 2223509 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 345993 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 2515543 2515690 2515617 Y EMILIN2 NA NA NA NA NA METTL4 53818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 2875334 2875786 2875693 Y NA EMILIN2 NA NA NA NA EMILIN2 30306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 3305401 3305555 3305478 Y MYL12B,TGIF1 MYL12B DLGAP1,TGIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 45494 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 3490071 3490183 3490142 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 80465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 3650005 3650381 3650193 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 240399 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 3794813 3795294 3795021 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 385207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 3806540 3806805 3806758 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 396934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 5509992 5510526 5510282 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 118173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 5542461 5543034 5542604 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 85665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 5583376 5583748 5583658 Y EPB41L3 EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 44951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 6624543 6624930 6624551 Y NA NA LOC100130480,ARHGAP28 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP28 102787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 7512213 7512497 7512355 Y NA NA PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 PTPRM 52283 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 8140065 8140370 8140233 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 467073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 8730480 8730718 8730581 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 123037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 8948545 8948913 8948824 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 151715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9017601 9018155 9017805 Y NA NA CCDC165,ANKRD12,RALBP1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 82473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9740935 9741067 9741006 Y VAPA,RAB31 RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 34773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr18 9762577 9762794 9762699 Y RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 56415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9812085 9812326 9812208 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA NA NA NA NA VAPA 99673 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 9869849 9870152 9869995 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 41847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr18 10057757 10058101 10057857 Y NAPG,RAB31,VAPA NA APCDD1,VAPA,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 145758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 10072767 10073149 10072986 Y NAPG,RAB31,VAPA NA APCDD1,NAPG,RAB31 IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 160768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 11431991 11432229 11432112 Y NA NA NA NA NA NA CHMP1B 417166 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr18 12048672 12049055 12049000 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 69648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 12455577 12455852 12455727 Y NA SLMO1 NA NA NA NA SLMO1 49682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 48774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 12837862 12838421 12838235 Y PTPN2 NA NA NA NA NA PTPN2 89221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 13175824 13176186 13176005 Y C18orf1 NA NA NA NA NA CEP192 186463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 13500609 13500835 13500766 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 13501125 13501479 13501273 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 223180 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 13609005 13609489 13609376 Y C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 115170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 18512291 18512341 18512327 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 177471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 20254145 20254527 20254453 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 121697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 20807173 20807418 20807275 Y NPC1,C18orf8,RBBP8,RBBP8 NA NA NA NA NA CABLES1 94645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 21153994 21154335 21154180 Y NA NPC1 NA NA NA NA NPC1 10527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 21173695 21174031 21173886 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 8833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 22813900 22814028 22813957 Y ZNF521 NA NA NA NA NA ZNF521 116126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 23624852 23624978 23624915 Y NA SS18 NA NA NA NA SS18 44203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 24120849 24120961 24120907 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 114404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 25536974 25537193 25537082 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 218217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 25645418 25645770 25645581 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 109640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 25674451 25674773 25674612 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 80637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 25691984 25692409 25692174 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 63001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 27516319 27516434 27516379 Y NA NA NA NA NA NA DSG2 1559572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 29232383 29232901 29232639 Y NA B4GALT6 NA NA NA NA B4GALT6 30898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 29665661 29665831 29665728 Y NA RNF138 NA NA NA NA RNF138 3987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 31460453 31460828 31460641 Y NOL4,NOL4,NOL4 NA NA NA NA NA DTNA 610426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 32622568 32623026 32622758 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 67676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 32674767 32675124 32674837 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 119875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 33389735 33389972 33389879 Y ZNF24,ZNF396,INO80C NA NA NA NA NA C18orf21 160074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 33711406 33711801 33711526 Y NA SLC39A6,ELP2 NA NA NA NA ELP2 3999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 33878609 33878753 33878681 Y FHOD3 FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 2932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 34160410 34160525 34160482 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 246544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 34813677 34814006 34813844 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 329994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 35024297 35024529 35024426 Y NA NA NA NA NA NA CELF4 119471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 38447528 38447658 38447616 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1085513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 42295257 42295574 42295401 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 37119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 42686338 42686675 42686545 Y NA NA SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 SETBP1 428200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 43542357 43542726 43542619 Y PSTPIP2,C18orf25,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 2514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 43632002 43632343 43632207 Y PSTPIP2,EPG5 PSTPIP2,HAUS1,ATP5A1 NA NA NA NA PSTPIP2 17895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 44372138 44372406 44372272 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA KATNAL2 123049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 45479794 45480168 45480059 Y SMAD2,SMAD2 SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 24279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 45530162 45530545 45530368 Y SMAD2,SMAD2 NA SMAD2,ZBTB7C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD2 74647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr18 46254756 46255278 46254982 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 191339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 46259226 46259357 46259315 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 195809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 125048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46365443 46365671 46365554 Y SMAD7 NA NA NA NA NA SMAD7 109410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46394966 46395089 46394987 Y SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA SMAD7 79992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46428346 46428737 46428479 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 46344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 46479420 46479772 46479694 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 4339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46482158 46482454 46482304 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46482815 46483020 46482939 Y NA SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46582084 46582553 46582428 Y SMAD7,DYM NA NA NA NA NA SMAD7 107003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 46739298 46739521 46739417 Y NA NA NA NA NA NA DYM 246196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 47216686 47217049 47216797 Y NA NA MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 121281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 47357197 47357543 47357370 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 18867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 47548085 47548102 47548094 Y NA NA NA NA NA NA MYO5B 171361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 52401143 52401540 52401489 Y NA RAB27B RAB27B,WDR7,CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 18052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 52409898 52410241 52410083 Y NA RAB27B WDR7,CCDC68,RAB27B IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 26807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 52473282 52473502 52473359 Y NA NA CCDC68 IMR90 Hi-C 24141950 RAB27B 90191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 52490491 52490717 52490508 Y RAB27B NA RAB27B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAB27B 107400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 52786792 52787169 52787029 Y NA NA NA NA NA NA CCDC68 162053 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 53177007 53177126 53177058 Y TCF4 NA NA NA NA NA TCF4 152892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 53180110 53180413 53180343 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 149605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 53332836 53333181 53332979 Y NA TCF4 NA NA NA NA TCF4 2818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr18 53355940 53355975 53355958 Y NA TCF4 TXNL1,TCF4 IMR90 Hi-C 24141950 TCF4 25922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 54070241 54070409 54070308 Y NA NA TCF4,LOC100505474 IMR90 Hi-C 24141950 WDR7 246165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 54557947 54558232 54558038 Y WDR7,ST8SIA3 NA NA NA NA NA TXNL1 241116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55095005 55095410 55095044 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 5507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr18 55098490 55098766 55098627 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 2151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 55101559 55101949 55101758 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55104670 55104954 55104730 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 3753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 55105190 55105288 55105239 Y ST8SIA3,ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 4273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55108186 55108329 55108231 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55108837 55109086 55108936 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55448232 55448442 55448350 Y NA ATP8B1 NA NA NA NA ATP8B1 19891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55872819 55873190 55873005 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 163220 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55880754 55881007 55880894 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr18 55881305 55881780 55881408 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 171706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 56012421 56012506 56012466 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 253357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 ALPK2,MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 56631378 56631745 56631564 Y NA NA NA NA NA NA SEC11C 172964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 56663357 56663639 56663444 Y NA NA NA NA NA NA SEC11C 141070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 56701404 56701604 56701510 Y ALPK2 NA NA NA NA NA SEC11C 103105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 57230799 57230985 57230899 Y NA NA NA NA NA NA CCBE1 131627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 57552932 57553277 57553219 Y PMAIP1 PMAIP1 PMAIP1 K562 ChIA-PET 22265404 PMAIP1 11903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 59393407 59393809 59393637 Y NA NA NA NA NA NA RNF152 165671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 60117911 60118106 60117979 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 70134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 60118389 60118639 60118544 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 69601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 60119520 60119795 60119627 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 68445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 60263992 60264160 60264076 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC2 75752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr18 61046049 61046189 61046119 Y NA KDSR,VPS4B NA NA NA NA KDSR 13306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 61350519 61350880 61350698 Y SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11 SERPINB4,SERPINB3 SERPINB10,SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB3 23322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 61545693 61545873 61545822 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB10,SERPINB2 SERPINB2 HMSD,SERPINB8 HELA 5C 22955621 SERPINB2 8767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 61549169 61549580 61549348 Y VPS4B,SERPINB8,SERPINB2 SERPINB2 SERPINB7 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINB2 12243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 61565801 61566233 61565950 Y NA SERPINB2 NA NA NA NA SERPINB2 28875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 65027496 65027665 65027594 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 154552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 65434285 65434424 65434346 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 252068 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 67711885 67712217 67712098 Y NA NA NA NA NA NA RTTN 158964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 68001159 68001386 68001197 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 47022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr18 68089361 68089784 68089523 Y SOCS6 NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 135224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 70814652 70814839 70814746 Y NA NA NA NA NA NA NETO1 281271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 72501282 72501640 72501447 Y NA NA NA NA NA NA ZNF407 238176 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 72916177 72916455 72916218 Y NA ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 2848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 73944750 73944917 73944845 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 260560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 73966259 73966767 73966600 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 238710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 76617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 74767591 74768136 74768025 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 75503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74775208 74775557 74775363 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 68082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr18 74779066 74780013 74779875 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 63626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr18 74783964 74784198 74784017 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 59441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr18 74793525 74793679 74793600 Y MBP MBP NA NA NA NA MBP 49960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA MBP NA NA NA NA MBP 34926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74813361 74814191 74813850 Y MBP MBP NA NA NA NA MBP 29448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA MBP NA NA NA NA MBP 16561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74840150 74840705 74840388 Y MBP MBP NA NA NA NA MBP 2934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 74921028 74921148 74921053 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 MBP 77389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 76635414 76635813 76635492 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 191472 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr18 77551694 77552094 77551810 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 113893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr18 77552344 77552827 77552464 Y NA NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 114543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr19 485856 486161 485966 Y PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2 SHC2,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TPGS1 19138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 532930 533293 533259 Y C19orf6,C19orf22,ARID3A TPGS1,CDC34,GZMM,BSG NA NA NA NA CDC34 3216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 675402 675838 675677 Y FSTL3 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 1010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,AZU1 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,AZU1 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,AZU1 NA NA NA NA AZU1 560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 908605 908810 908775 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 2430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 933164 933556 933549 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 9383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 1213863 1214369 1213961 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 21657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 1265810 1266064 1265967 Y C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA APC2 982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 2168320 2168637 2168529 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 5856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 2330710 2331138 2330903 Y NA SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 4091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 2478921 2479315 2479258 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 4801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 2549602 2550221 2549903 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 75482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 2770206 2770498 2770360 Y DIRAS1,AES SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 10871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3177322 3177366 3177344 Y AES,S1PR4 NCLN NA NA NA NA NCLN 6195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3404656 3404792 3404728 Y TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 47095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3405079 3405252 3405203 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 47518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 3450938 3451227 3451079 Y GNA15 DOHH NA NA NA NA DOHH 47711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3548609 3549021 3548873 Y GNA15,S1PR4,FZR1,PIAS4 DOHH,FZR1,HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 21754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 3607748 3607951 3607883 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 2910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 4936813 4936840 4936828 Y NA UHRF1,KDM4B NA NA NA NA KDM4B 30285 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 5048305 5048678 5048483 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 81180 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 5968077 5968307 5968208 Y NA RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 7846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6062045 6062746 6062500 Y TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 85892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6076501 6076965 6076757 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3 100348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6132012 6132373 6132181 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 65210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr19 6273754 6274259 6273940 Y VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 3700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 6516969 6517178 6517079 Y NA TNFSF9 TNFSF9 K562 ChIA-PET 22265404 TNFSF9 11832 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 6659886 6659977 6659931 Y TNFSF9,TNFSF14 NA NA NA NA NA CD70 57772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6674780 6675150 6675080 Y DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 NA NA NA NA NA C3 53423 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 6801116 6801467 6801221 Y SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA NA TRIP10 65180 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 7427436 7427895 7427614 Y ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 30104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 8580278 8580518 8580443 Y PRAM1,MYO1F ZNF414 NA NA NA NA ZNF414 3230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 8634080 8634404 8634151 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 39216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 8635978 8636196 8636014 Y MARCH2,PRAM1,MYO1F ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 37424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 9902440 9902843 9902543 Y ZNF699,ZNF266,ICAM1,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 33649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 OLFM2 NA NA NA NA OLFM2 11008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 10317020 10317257 10317138 Y NA S1PR2,DNMT1,MRPL4 DNMT1 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR2 22691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 11679134 11679427 11679281 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 10945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 12896372 12896781 12896659 Y ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 3529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 12901644 12901726 12901699 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 1334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 12929124 12929310 12929217 Y NA JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA MAST1 13455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13048278 13048689 13048364 Y MAN2B1 GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA CALR 886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13137197 13137461 13137217 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 32775 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13147424 13147812 13147700 Y WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2 NFIX NA NA NA NA NFIX 43002 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 47005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.43430115850482 chr19 13267779 13268208 13267877 Y MAN2B1,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 8550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 14126359 14126500 14126444 Y NANOS3,IL27RA RFX1,IL27RA NA NA NA NA RFX1 10508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 15666666 15666804 15666739 Y NA NA NA NA NA NA WIZ 107904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F11 95558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 16403791 16404489 16404426 Y NA KLF2 AP1M1,KLF2,EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 29139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 16557779 16558043 16557912 Y RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1 EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 22853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 16573693 16573897 16573763 Y HSH2D EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 6999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17124642 17124654 17124646 Y NA NA NA NA NA NA HAUS8 59781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17208293 17208806 17208572 Y NA HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 23702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17218539 17219391 17218963 Y MED26,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 33948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17307223 17307519 17307336 Y MYO9B USE1,OCEL1,NR2F6 NA NA NA NA USE1 16636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 MAP1S NA NA NA NA MAP1S 36681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 18131991 18132570 18132392 Y MAP1S,FCHO1,KCNN1,PGPEP1,LRRC25,JUND,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 22050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 18264934 18265291 18265179 Y NA PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA PIK3R2 2966 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 18439179 18439536 18439334 Y NA JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15 PGPEP1 K562 ChIA-PET 22265404 LSM4 7095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr19 18589714 18590055 18589946 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25 ELL NA NA NA NA ELL 40882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 20128543 20128860 20128736 Y NA ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 19455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 1908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 22724616 22724856 22724736 Y ZNF257,ZNF98,ZNF492 ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 11329 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 5.64997932528212 chr19 27733398 27733788 27733670 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1968660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 35464346 35464465 35464376 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF30,ZNF792,GRAMD1A GRAMD1A,LOC100128675,ZNF599,ZNF30,ZNF792,HPN,SCN1B,FXYD1,FXYD3,FXYD7,LGI4,FXYD5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF792 11393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 35494139 35494542 35494364 Y NA ZNF792,GRAMD1A,SCN1B NA NA NA NA GRAMD1A 10451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD7,FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 35927378 35927883 35927593 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,HCST,FFAR2 NA NA NA NA NA DMKN 74677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 36879565 36879874 36879872 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 11464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 38791297 38791661 38791416 Y C19orf33 C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA C19orf33 1140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 39564346 39564568 39564426 Y ZFP36,HNRNPL,NFKBIB PAK4 PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1 IMR90 Hi-C 24141950 PAK4 49842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 40447509 40447978 40447857 Y SERTAD1,ZNF546,FCGBP PSMC4,ZNF546 LEUTX IMR90 Hi-C 24141950 CTC-471F3.4 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 41289050 41289265 41289158 Y SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA RAB4B 6929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 42027706 42027846 42027786 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 42036742 42037668 42037272 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1 NA CEACAM21,LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 92120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 42404902 42404963 42404932 Y NA RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 19674 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42444727 42445027 42444981 Y NA RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42711906 42712521 42712423 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2 POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 9771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 42789863 42790090 42789919 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA PRR19 14160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 43241725 43242137 43241944 Y NA PSG3 NA NA NA NA PSG3 584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 43267088 43267316 43267247 Y CEACAM1,PSG5 PSG3 NA NA NA NA PSG3 24367 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr19 43525971 43526126 43526036 Y NA NA NA NA NA NA PSG1 143997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 44066872 44067293 44067141 Y ZNF230,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF575,ETHE1,XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5 NA NA NA NA XRCC1 15332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 44152096 44152277 44152103 Y ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ ZNF428,CADM4,PLAUR CADM4 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 CADM4 10105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 44308607 44308871 44308732 Y CADM4 KCNN4,LYPD5,ZNF283 NA NA NA NA LYPD5 20487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 44440425 44440707 44440629 Y NA ZNF45,ZNF221,ZNF155 NA NA NA NA ZNF45 2995 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 45129392 45129792 45129578 Y PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR PVR NA NA NA NA PVR 15306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 45189303 45189576 45189367 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 PVR NA NA NA NA PVR 44205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 45240026 45240191 45240078 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 8771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr19 45242034 45242469 45242251 Y RELB,CLASRP,BCL3 BCL3 BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 6493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA IGFL2 NA NA NA NA IGFL2 39593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 46688176 46688573 46688180 Y PTGIR IGFL2 NA NA NA NA IGFL2 43813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 46708652 46708841 46708747 Y NA NA NA NA NA NA IGFL2 64289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3 NA NA NA NA CALM3 39864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47220951 47221042 47220998 Y ZC3H4,PRKD2 PRKD2,FKRP,STRN4 NA NA NA NA PRKD2 2567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 90655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 61713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47611153 47611400 47611382 Y NA SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 3131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47729030 47729228 47729064 Y NA MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA MIR3191 831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr19 47783225 47783533 47783379 Y ZNF541 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 7083 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 47833817 47834081 47833932 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 C5AR1,DHX34 NA NA NA NA DHX34 16457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 48167427 48167718 48167620 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 46882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 49430301 49430612 49430410 Y IZUMO1,PPP1R15A,FTL NUCB1,BAX,FTL NA NA NA NA BAX 25460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 49710890 49711280 49711224 Y IZUMO1,PPP1R15A,RPS11,FCGRT,CD37 NA NA NA NA NA TRPM4 51892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 50276330 50276635 50276461 Y VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25 AP2A1,FUZ,MED25 NA NA NA NA AP2A1 8105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 51069538 51069758 51069663 Y KLK6,KCNC3,SYT3,SYT3,LRRC4B NA NA NA NA NA JOSD2 56928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 51149630 51149985 51149809 Y NA NA NA NA NA NA JOSD2 137020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 52075080 52075242 52075159 Y ZNF615,ZNF614,ZNF613,SIGLEC7,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175 ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 2529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 489 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 17 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 52229316 52229816 52229631 Y HAS1 MIRLET7E,FPR2 NA NA NA NA FPR2 23463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 52239330 52239749 52239573 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR2,FPR2,FPR1 MIRLET7E,FPR2 NA NA NA NA FPR2 13530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 52310413 52310785 52310550 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR1 NA NA NA NA FPR1 5050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 52325587 52325991 52325777 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR1 NA NA NA NA FPR1 20224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr19 54048513 54048640 54048574 Y NA ZNF331 NA NA NA NA ZNF331 26278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54049099 54049989 54049424 Y ZNF160,ZNF845,ZNF761,ZNF813,NLRP12,ZNF331,ZNF331 ZNF331 NA NA NA NA ZNF331 26864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54052581 54053344 54052712 Y NA ZNF331 NA NA NA NA ZNF331 30346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54355100 54355465 54355199 Y VSTM1,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NLRP12,MYADM,AC008753.6,PRKCG CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7 HELA,K562,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MYADM 12012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 54433325 54433420 54433359 Y TARM1,ZNF813,DPRX,CACNG7 CACNG7 NA NA NA NA CACNG7 22736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA CACNG7 54654 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA OSCAR 80219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55885541 55885905 55885786 Y NA SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 5710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55977615 55977883 55977735 Y NLRP8,NLRP9,NLRP11,SGK110 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ISOC2,UBE2S,SSC5D,NAT14 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ISOC2 5905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 56823857 56823998 56823922 Y ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 53470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 57020241 57020583 57020445 Y ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28 ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471 NA NA NA NA ZNF471 3029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551,ZNF154 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr2 1608919 1609202 1609060 Y PXDN NA NA NA NA NA PXDN 137422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 1719023 1719384 1719170 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 27240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 1735614 1736022 1735851 Y PXDN PXDN NA NA NA NA PXDN 10602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 3046756 3047034 3046895 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 332619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 3528781 3528909 3528848 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 7274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA RNASEH1-AS1 20224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 5514907 5514927 5514917 Y NA NA LOC100505964 IMR90 Hi-C 24141950 RSAD2 1489010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 5650103 5650571 5650382 Y NA NA NA NA NA NA RSAD2 1353366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 6998422 6998819 6998665 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 5118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 7100927 7101152 7100993 Y NA RNF144A NA NA NA NA RNF144A 45404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8216670 8216804 8216737 Y NA NA NA NA NA NA ID2 600171 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8231020 8231604 8231329 Y NA NA NA NA NA NA ID2 585371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 8259720 8260124 8259943 Y NA NA NA NA NA NA ID2 556851 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8360084 8360256 8360151 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 456719 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8369680 8369964 8369925 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 447011 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8379767 8380302 8380034 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 436673 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8382974 8383224 8383128 Y ID2 NA NA NA NA NA ID2 433751 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 8627879 8628725 8628434 Y NA NA LOC339788,LOC100506274,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 188250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA ID2 55810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 9250452 9250643 9250523 Y NA NA MBOAT2,ASAP2,KIDINS220 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASAP2 94251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 9428594 9428712 9428653 Y NA NA NA NA NA NA ASAP2 83700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 10261505 10261712 10261609 Y NA CYS1,RRM2 NA NA NA NA RRM2 1050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 10430004 10430228 10430116 Y NA HPCAL1 HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 10787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 10489892 10489997 10489924 Y HPCAL1 HPCAL1 NA NA NA NA HPCAL1 48877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 10633765 10634017 10633925 Y NOL10 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M2.1 46945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 11483029 11483376 11483266 Y NA ROCK2 NA NA NA NA ROCK2 3080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 12309855 12310149 12310048 Y LPIN1 NA TRIB2,LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 LPIN1 494134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 12633247 12633315 12633291 Y NA NA TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 221700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 15199994 15200355 15200088 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 429184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 15309828 15310293 15310034 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 389161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 18811449 18811776 18811476 Y NA NA OSR1,NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 RDH14 71503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 19547126 19547267 19547173 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 9147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 19811541 19811934 19811810 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 255127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 19985229 19985530 19985434 Y NA NA NA NA NA NA TTC32 114217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 20341243 20341467 20341355 Y NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 81727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 20624612 20624982 20624777 Y HS1BP3 RHOB,AC023137.2 HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 20848318 20848468 20848370 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 21553806 21554151 21553979 Y NA NA NA NA NA NA AC067959.1 111759 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 21691615 21691861 21691725 Y NA NA NA NA NA NA AC067959.1 249568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 24512394 24512744 24512638 Y NA NA NA NA NA NA ITSN2 68839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 25554693 25554929 25554813 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 8530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 26241064 26241266 26241191 Y RAB10 KIF3C,UQCRHP2,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 13710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,KHK,CGREF1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 27942982 27943239 27943170 Y RBKS MRPL33 RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 49345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28182324 28182658 28182394 Y FOSL2,GCKR,RBKS NA NA NA NA NA RBKS 70359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28215985 28216067 28216026 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 104020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 28319174 28319559 28319300 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 207209 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28629645 28630316 28629830 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 14106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28806831 28807046 28806964 Y FOSL2 NA NA NA NA NA PPP1CB 165460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28833397 28833696 28833546 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 138810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28838669 28838944 28838799 Y TRMT61B NA NA NA NA NA PPP1CB 133562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28903940 28904347 28904218 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB NA PPP1CB,SPDYA,PLB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP1CB 68159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 28939068 28939564 28939261 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 32942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB,SPDYA NA NA NA NA SPDYA 6313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 30594059 30594375 30594217 Y NA NA LBH,LCLAT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LCLAT1 73717 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 30887906 30888094 30887998 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 219814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 33333903 33334283 33334018 Y NA NA NA NA NA NA LTBP1 163864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 33383509 33383834 33383717 Y FAM98A NA NA NA NA NA LTBP1 213470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 34912280 34912507 34912394 Y NA NA NA NA NA NA FAM98A 1089831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 36654413 36654491 36654452 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 73344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 36665586 36666219 36665918 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 84517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 37043619 37043714 37043667 Y NA NA NA NA NA NA STRN 147901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37763005 37763322 37763129 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 37843563 37844180 37844009 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 119431 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 37847073 37847432 37847190 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 116179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37851057 37851610 37851419 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 112001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37881606 37881960 37881783 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 81651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37885188 37885619 37885408 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 77992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38003207 38003253 38003231 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 39596 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38049848 38050212 38050057 Y QPCT,CDC42EP3 NA CDC42EP3,LOC100505876,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 86237 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38212559 38212760 38212660 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 243950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38265039 38265434 38265056 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 191276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 38265442 38265742 38265584 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA RPL7P12 190968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38356620 38356932 38356711 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 99778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 82480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 38375670 38375904 38375803 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 80806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 38380770 38381135 38380953 Y CDC42EP3,FAM82A1,CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 75575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38395987 38396176 38396066 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA RPL7P12 60534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 38398414 38398595 38398505 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 58115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.09900460853801 chr2 38405386 38405542 38405477 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 51168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 38409612 38409978 38409795 Y NA RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 46732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38414893 38415136 38415061 Y NA RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 41574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 38422036 38422352 38422194 Y FAM82A1,CYP1B1 RPL7P12,AC009229.5 NA NA NA NA RPL7P12 34358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38491745 38491933 38491807 Y NA RPL7P12,AC009229.5 CYP1B1-AS1,CYP1B1,FAM82A1 IMR90 Hi-C 24141950 AC009229.5 27013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 38496135 38496328 38496259 Y CYP1B1 RPL7P12,AC009229.5 CYP1B1-AS1,CYP1B1,FAM82A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC009229.5 31403 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 39719153 39719730 39719398 Y MAP4K3 NA NA NA NA NA MAP4K3 56700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 40662022 40662435 40662315 Y NA NA LOC100128590 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 173758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 42360195 42360705 42360352 Y EML4 EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 33785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC025750.7 278642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 43063239 43063414 43063325 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,ABCG8 IMR90 Hi-C 24141950 AC025750.7 304657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 44601254 44601363 44601309 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA CAMKMT 14165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 44718441 44718530 44718486 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 131352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 45405025 45405418 45405218 Y NA NA NA NA NA NA AC012354.8 183473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 46404703 46404889 46404799 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 113917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 46406206 46406535 46406438 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 112271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 46557036 46557117 46557077 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 38230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 46586439 46586863 46586504 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 67633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 46614603 46614745 46614671 Y RHOQ NA NA NA NA NA EPAS1 95797 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 46636668 46636826 46636747 Y NA NA EPAS1,PRKCE,RHOQ,PIGF,CRIPT IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 117862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 46797577 46797967 46797772 Y NA RHOQ,ATP6V1E2,CRIPT,PIGF NA NA NA NA ATP6V1E2 29881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 47075244 47075442 47075379 Y MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 65854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 NA NA NA NA NA TTC7A 63875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 47210404 47210621 47210509 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 43410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 47298687 47298930 47298712 Y TTC7A,MCFD2 NA NA NA NA NA CALM2 102810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1-GTF2A1L NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54270419 54270555 54270547 Y GPR75,ACYP2 NA SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 74442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 54800045 54800558 54800206 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 118623 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54816609 54817000 54816923 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA EML6 131636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA EML6 86481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 55329161 55329446 55329300 Y NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 8311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 55687761 55687975 55687969 Y NA CCDC88A NA NA NA NA CCDC88A 42704 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 56083172 56083316 56083296 Y EFEMP1 NA NA NA NA NA EFEMP1 65958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 56099404 56099776 56099646 Y NA EFEMP1 NA NA NA NA EFEMP1 49498 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 60779041 60779656 60779263 Y REL,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr2 62375163 62375426 62375211 Y B3GNT2 B3GNT2 NA NA NA NA B3GNT2 45822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 62519354 62519381 62519368 Y NA NA COMMD1,B3GNT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 98106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 62531997 62532204 62532030 Y B3GNT2 NA COMMD1 IMR90 Hi-C 24141950 B3GNT2 110749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 64291243 64291430 64291349 Y NA VPS54 LINC00309,PELI1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS54 47037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 64360908 64361228 64361132 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 7145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 64368431 64369198 64368837 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 58 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 64879120 64879608 64879340 Y NA NA LOC339807 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 96531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 66306594 66306908 66306751 Y NA NA NA NA NA NA MEIS1 351676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 67730161 67730513 67730267 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 107710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 67744212 67744599 67744410 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 121761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 67751414 67751623 67751484 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 128963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 67876596 67876952 67876755 Y NA NA MEIS1,ETAA1,LOC644838 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 254145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 68110791 68110816 68110804 Y NA NA NA NA NA NA C1D 225264 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 68499892 68500037 68499965 Y NA PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 18523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR1 102453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 69163712 69163881 69163761 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 74429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69241314 69241782 69241454 Y ANTXR1 ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 3004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 69250610 69250802 69250769 Y NA ANTXR1 NA NA NA NA ANTXR1 12300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69390293 69390547 69390355 Y ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 151983 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69424670 69425029 69424849 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 186360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 69469857 69470021 69469934 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 142361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69481133 69481450 69481229 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 130932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69533320 69533461 69533391 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 69533941 69534050 69534019 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 70161598 70161791 70161659 Y PCBP1,C2orf42,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 70212443 70213458 70213040 Y PCBP1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 25046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 70823463 70823663 70823562 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 70823866 70823963 70823915 Y TGFA TGFA NA NA NA NA TGFA 44541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 71050473 71050659 71050592 Y FIGLA,NAGK NA NA NA NA NA TEX261 169416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 72058319 72058599 72058494 Y NA NA EXOC6B,DYSF,CYP26B1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF638 556628 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 72416850 72417011 72416931 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 634159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 624767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 72789461 72789923 72789792 Y EXOC6B NA NA NA NA NA EXOC6B 261247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 75071156 75071353 75071277 Y LBX2,HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 12048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr2 75103488 75103536 75103515 Y LBX2,HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 44380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 75141745 75142080 75142074 Y NA POLE4 NA NA NA NA POLE4 41539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 75834246 75834589 75834429 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 37320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 81781528 81781694 81781559 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1393267 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 81820947 81821308 81821128 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1432686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 85160217 85160224 85160221 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 29468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85505624 85505644 85505635 Y SH2D6 TGOLN2 NA NA NA NA TGOLN2 47904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85567649 85568034 85567918 Y NA TGOLN2,ELMOD3,RETSAT TGOLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ELMOD3 11483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85632531 85633066 85632892 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG NA NA NA NA NA RETSAT 52788 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 85969500 85969917 85969748 Y VAMP5,TMEM150A,ATOH8 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 6550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 88959127 88959352 88959240 Y NA EIF2AK3,RPIA EIF2AK3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPIA 29810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 91954549 91954973 91954634 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2965387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 95925847 95925871 95925861 Y NA NA PROM2 IMR90 Hi-C 24141950 AC092835.2 54564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 96190968 96191044 96191006 Y NA NA NA NA NA NA FAHD2A 124499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA NEURL3 19761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 97222458 97223029 97222771 Y DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 21978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 97554359 97554681 97554500 Y NA ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 19865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 98364129 98364314 98364298 Y TMEM131,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 85559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 98598628 98598759 98598694 Y NA TMEM131 NA NA NA NA TMEM131 11629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 99125275 99125485 99125370 Y INPP4A NA NA NA NA NA INPP4A 65958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100061589 100061940 100061765 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 42557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 100496681 100496959 100496872 Y NA NA NA NA NA NA REV1 392184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA LONRF2 306582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 100908504 100908788 100908727 Y NA LONRF2 NA NA NA NA LONRF2 28407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102058393 102058806 102058576 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 RFX8 NA NA NA NA RFX8 30359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102133779 102134093 102133972 Y MAP4K4,MAP4K4 RFX8 MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFX8 44614 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102327240 102327383 102327307 Y NA MAP4K4 NA NA NA NA MAP4K4 15928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102643904 102644218 102643997 Y NA IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 34786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 102649919 102650192 102650054 Y IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2 IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 28812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 102666464 102666883 102666683 Y IL1R1,IL18RAP,IL18R1,IL1R2 IL1R1 IL1R2,IL1R1,IL1RL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 12121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102738657 102738854 102738721 Y IL1R1 NA IL1RL2,IL1R2,IL1R1,IL1RL1,IL18RAP IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 59653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102844003 102844653 102844435 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL1RL1 81309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 102854655 102855173 102854991 Y IL1R1 NA NA NA NA NA IL1RL1 70789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 102857184 102857493 102857313 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL1RL1 68469 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 102874948 102875482 102875196 Y NA NA NA NA NA NA IL1RL1 50480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 106009982 106010344 106010250 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 42626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 106020631 106021071 106020783 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 31899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 109211421 109211903 109211563 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 62564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 109228635 109228941 109228810 Y GCC2,RANBP2,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 79778 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 109514642 109514975 109514799 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 113429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 109830137 109830521 109830352 Y RANBP2 NA NA NA NA NA CCDC138 428924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 109855106 109855410 109855221 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 453893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 109934621 109934818 109934675 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 434965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 111976914 111977297 111977138 Y BCL2L11 NA NA NA NA NA BCL2L11 101959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113008998 113009283 113009141 Y ZC3H6 ZC3H8,ZC3H6 NA NA NA NA ZC3H8 1430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113384986 113385271 113385131 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 7242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113398370 113398650 113398523 Y NA AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA SLC20A1 2784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 113448371 113448563 113448450 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 46937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC20A1 47169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113550957 113551489 113551296 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 10790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113552525 113552798 113552647 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 12358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 113556767 113557612 113557074 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B IL37,CKAP2L,CHCHD5,IL1A,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 16600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 113571813 113572166 113571903 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 20314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 18730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr2 113637417 113638142 113637790 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 44937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr2 113649129 113649319 113649248 Y TTL,IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G NA CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 56649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 113693868 113694223 113694055 Y IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G IL36G NA NA NA NA IL36G 34557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 113881199 113882653 113881886 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN NA NA NA NA NA IL36RN 66984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 114039556 114039944 114039632 Y NA NA NA NA NA NA PAX8-AS1 72457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr2 114126317 114126521 114126419 Y IL1F10,IL1F10 NA PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 159218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 114644100 114644364 114644199 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 1173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 114652011 114652405 114652035 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 6474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 118738362 118738806 118738651 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 30903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 118774480 118774964 118774685 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 4771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 118878005 118878382 118878180 Y DDX18,CCDC93 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 33977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 119576873 119577223 119577048 Y NA EN1 NA NA NA NA EN1 26031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 119731021 119731371 119731347 Y NA NA NA NA NA NA EN1 127767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 120041416 120041980 120041717 Y DBI NA NA NA NA NA STEAP3 62032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 120905923 120906046 120905986 Y EPB41L5,EPB41L5 NA NA NA NA NA TMEM185B 72938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 121279822 121279965 121279895 Y NA NA RALB IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 211234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 121299175 121299329 121299252 Y NA NA RALB,GLI2,INHBB,LOC84931 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLI2 191870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 121355369 121355762 121355569 Y NA NA LOC84931,EPB41L5,RALB,INHBB IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 135437 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 121523492 121523901 121523763 Y GLI2 GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 32293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 122405703 122406017 122405860 Y NA CLASP1,NIFK-AS1 NA NA NA NA NIFK-AS1 477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 122456992 122457582 122457167 Y CLASP1 TSN NA NA NA NA TSN 35097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 127006133 127006203 127006166 Y NA NA NA NA NA NA AC023347.1 57884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 127772292 127772580 127772500 Y MAP3K2 NA NA NA NA NA BIN1 90351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 127824493 127824859 127824771 Y MAP3K2,IWS1,BIN1 BIN1 NA NA NA NA BIN1 38072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 128119420 128119722 128119576 Y NA MAP3K2 IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 24319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 128169566 128169991 128169902 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 25525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 128171512 128171657 128171580 Y SFT2D3,IWS1,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 27471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 129074706 129075071 129074888 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 130928401 130928722 130928538 Y NA MZT2B,SMPD4 NA NA NA NA MZT2B 8588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 132511121 132511398 132511143 Y TUBA3D NA NA NA NA NA AC093838.4 262735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 133025188 133025675 133025588 Y NA NA GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR39 146472 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 133407314 133407482 133407398 Y LYPD1,LYPD1 LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 19670 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 133593617 133593946 133593782 Y NA NA NA NA NA NA LYPD1 166465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 134575786 134576043 134575915 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5 299511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 140168949 140169074 140169000 Y NA NA NA NA NA NA NXPH2 633031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 6.86860231700963 chr2 142404808 142405288 142404942 Y NA NA NA NA NA NA LRP1B 481982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 143598133 143598299 143598260 Y KYNU KYNU KYNU IMR90 Hi-C 24141950 KYNU 34768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 145122623 145122802 145122719 Y GTDC1,ZEB2 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 34488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 145215157 145215664 145215657 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 64483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 145794026 145794356 145794065 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 298442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 146410714 146411026 146410899 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 317916 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 146447883 146448001 146447923 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 355085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 146450569 146451281 146450882 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 357771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 146502726 146503022 146502851 Y NA NA DKFZp686O1327,ZEB2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL6P5 409928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 148296630 148296767 148296652 Y NA NA NA NA NA NA ACVR2A 303319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3,AC104777.2 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3,AC104777.2 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 151477368 151477581 151477492 Y RND3 NA RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 AC104777.2 50633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr2 151500998 151501151 151501067 Y NA NA MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 AC104777.2 74263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 151537937 151538357 151538169 Y NA NA RBM43,RND3,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 AC104777.2 111202 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 152182104 152182519 152182297 Y RBM43,NMI,TNFAIP6 NMI,TNFAIP6 RIF1,NMI IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP6 29587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 153302279 153302595 153302384 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 112528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 153599082 153599296 153599189 Y NA ARL6IP6,PRPF40A NA NA NA NA PRPF40A 26571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 157314368 157314516 157314443 Y NR4A2,GPD2 GPD2 NA NA NA NA GPD2 24566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158030373 158030519 158030484 Y NA NA NR4A2,GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP281 123151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158039321 158039798 158039630 Y NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RN7SKP281 113872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP281 85665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158118717 158119062 158118890 Y GALNT5 RN7SKP281 NA NA NA NA RN7SKP281 34608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 158252873 158253255 158253244 Y NA NA NA NA NA NA CYTIP 90218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158277241 158277773 158277564 Y CYTIP NA NA NA NA NA CYTIP 65700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158297125 158298434 158297713 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 45039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158325907 158326296 158326106 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 17177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 159855059 159855514 159855150 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 31913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 160411225 160411529 160411489 Y NA NA NA NA NA NA AC009506.1 58278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 147543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 161065805 161066369 161066265 Y CD302 NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 148684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161071101 161071394 161071301 Y ITGB6 NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 PLA2R1 153980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 161141907 161142179 161141926 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 120214 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161150962 161151085 161151045 Y CD302 NA NA NA NA NA MIR4785 111308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 105999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 161201536 161201707 161201641 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 60686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161208357 161208687 161208675 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 53706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 161244338 161244737 161244615 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 17656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr2 162932296 162932524 162932410 Y NA DPP4,EIF3EP2 NA NA NA NA DPP4 3244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 267758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA COBLL1 NA NA NA NA COBLL1 14902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3,AC009495.2 NA NA NA NA AC009495.2 21885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 166982475 166982914 166982672 Y SCN1A,SCN1A NA NA NA NA NA SCN1A 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 166983519 166983786 166983732 Y NA SCN1A NA NA NA NA SCN1A 996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr2 169402356 169402715 169402396 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 91984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 169677226 169677236 169677231 Y NA NA NA NA NA NA SPC25 90645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 171112437 171112843 171112772 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 430469 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.87743679186028 chr2 172101085 172101413 172101325 Y NA TLK1 METTL8,TLK1 IMR90 Hi-C 24141950 TLK1 15261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 172621126 172621511 172621230 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 79207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 173557830 173558066 173557982 Y ZAK NA RAPGEF4,PDK1 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 138506 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 174776201 174776462 174776332 Y NA NA NA NA NA NA SP3 51968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 175069870 175070170 175070019 Y WIPF1,SP3,SP3 OLA1 NA NA NA NA OLA1 41256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA CHRNA1 73342 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 175837054 175837318 175837218 Y NA CHN1 NA NA NA NA CHN1 30779 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 184392405 184392418 184392412 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 78429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 185595976 185596316 185596146 Y ZNF804A NA NA NA NA NA CACYBPP2 1125129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 185997791 185998168 185997977 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 1350715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 186638782 186639016 186638929 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 709867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 188112953 188113150 188112989 Y NA NA NA NA NA NA CALCRL 198037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 188214138 188214480 188214300 Y NA NA NA NA NA NA CALCRL 96707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 15336 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 189391407 189391613 189391501 Y GULP1 NA NA NA NA NA GULP1 237011 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 189392634 189392951 189392670 Y NA NA NA NA NA NA GULP1 238238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 189653445 189653579 189653502 Y NA NA NA NA NA NA COL3A1 183467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 189957665 189957918 189957859 Y COL3A1,COL5A2 NA NA NA NA NA COL5A2 84687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 189973214 189973535 189973374 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 69070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 190235497 190235832 190235693 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 191512036 191512188 191512066 Y INPP1,STAT1,GLS,NAB1 NAB1 NA NA NA NA NAB1 2564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 191876857 191877189 191877023 Y NA AC067945.3,STAT1 NA NA NA NA STAT1 6497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 192066963 192067214 192067088 Y STAT4,MYO1B,MYO1B MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 40697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 192067598 192067966 192067844 Y NA MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 39945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 192112527 192112680 192112632 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 4616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 192465695 192466166 192465978 Y NA NA OBFC2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 357784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 192529976 192530334 192530120 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYO1B 422065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 192562556 192562918 192562693 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 454645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 193054279 193054640 193054459 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 946368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 194428592 194428916 194428605 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 2009785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 197023417 197023933 197023871 Y NA STK17B NA NA NA NA STK17B 15294 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 197188373 197188663 197188518 Y NA NA NA NA NA NA AC020571.3 65625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 197195800 197196140 197196081 Y NA NA NA NA NA NA AC020571.3 73052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 197986813 197986938 197986876 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 138897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 198158784 198159350 198159060 Y SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44 ATP5G2P3,ANKRD44 NA NA NA NA ANKRD44 14547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 200168536 200168843 200168690 Y NA NA NA NA NA NA SATB2-AS1 151580 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 200209653 200209909 200209897 Y SATB2,SATB2,SATB2 NA NA NA NA NA SATB2-AS1 110514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr2 201995421 201995893 201995513 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA CFLAR 16594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 202092113 202092210 202092162 Y CLK1,CLK1,CASP10 CASP10,CASP8 NA NA NA NA CASP8 3956 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 202204679 202205066 202204873 Y NA STRADB NA NA NA NA STRADB 45515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 202517448 202517800 202517452 Y NA TMEM237,MPP4 NA NA NA NA TMEM237 11155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 202522160 202522705 202522330 Y NA TMEM237,MPP4 NA NA NA NA TMEM237 15867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.65881380013276 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 204288063 204288423 204288243 Y NA NA NA NA NA NA ABI2 97121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 34893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 204393119 204393487 204393303 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 4646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 204547424 204547617 204547518 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 149291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 204548440 204549024 204548878 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 150307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 204667019 204667435 204667267 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 268886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 204667512 204667772 204667687 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 269379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 204676480 204676691 204676598 Y NA NA RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 278347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 205655879 205656255 205656067 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 247363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 206571507 206572136 206571741 Y NRP2,INO80D NRP2 NA NA NA NA NRP2 26793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 206596215 206596601 206596444 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 51501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208176046 208176541 208176319 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 AC007879.7 73672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 208195614 208195873 208195761 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 93240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208198321 208198507 208198422 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 95947 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 213823472 213823706 213823593 Y IKZF2 NA NA NA NA NA IKZF2 191445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 213842063 213842076 213842069 Y IKZF2,IKZF2 NA NA NA NA NA IKZF2 173075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 37890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 216223263 216223304 216223303 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216224117 216224404 216224261 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 49577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 216402536 216402702 216402564 Y FN1 NA LOC646324,FN1 IMR90 Hi-C 24141950 AC012462.1 103560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216483720 216484034 216483877 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 184744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216529638 216529897 216529693 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 230662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216649222 216649408 216649315 Y NA NA NA NA NA NA MREG 247411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216695142 216695306 216695226 Y NA NA NA NA NA NA MREG 201513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 216764920 216765387 216765135 Y NA NA LOC646324,FN1,ATIC IMR90 Hi-C 24141950 MREG 131432 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 216767989 216768230 216768091 Y NA NA LOC646324,FN1,ATIC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MREG 128589 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 217400220 217400574 217400443 Y NA RPL37A,AC098820.3 DIRC3,XRCC5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AC098820.3 38736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 217557565 217558269 217557956 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 217929014 217929457 217929116 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 370766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 218027339 218027548 218027469 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 469091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.32646207511617 chr2 218258363 218258761 218258688 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 606957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 218477691 218477907 218477799 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 387811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 218576069 218576235 218576145 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 289483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 218701196 218701490 218701305 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 164228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 218714903 218715515 218715204 Y PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 150203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 218785631 218785811 218785787 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 79907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 219188663 219189129 219189071 Y ARPC2,ARPC2,TTLL4,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1 TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA AC021016.7 27669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 219598381 219598949 219598614 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 24813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 17960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A WNT10A,CDK5R2 NA NA NA NA WNT10A 30430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 223292241 223292356 223292299 Y NA SGPP2 NA NA NA NA SGPP2 5005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 223656731 223656843 223656768 Y SGPP2 NA ACSL3,MOGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL3 66809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 223784632 223784923 223784806 Y NA NA NA NA NA NA ACSL3 60980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 224325508 224325708 224325596 Y WDFY1 NA SCG2,AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 139513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 224334117 224334308 224334166 Y NA NA SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 130913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 224761528 224761781 224761678 Y WDFY1 WDFY1 NA NA NA NA WDFY1 46323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 224804297 224804525 224804424 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 3579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 225086402 225086641 225086508 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 184366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 225392496 225392764 225392746 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 55346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 226859582 226859764 226859704 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 188323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 226979861 226980232 226980018 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC068138.1 67855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 244279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 227331006 227331180 227331162 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 282919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 227525366 227525547 227525486 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 136928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 228253438 228253721 228253534 Y CCL20,AGFG1 NA TM4SF20,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 MFF 65571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 228670402 228670815 228670563 Y AGFG1,CCL20 CCL20 NA NA NA NA CCL20 5743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 229808053 229808441 229808330 Y NA NA NA NA NA NA PID1 325560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 229887916 229887920 229887918 Y NA NA NA NA NA NA PID1 246081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230008208 230008295 230008257 Y NA NA NA NA NA NA PID1 125706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230106282 230106638 230106611 Y NA PID1 NA NA NA NA PID1 27363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230118973 230119267 230119206 Y NA PID1 NA NA NA NA PID1 14734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 230165553 230165942 230165696 Y PID1 PID1 DNER IMR90 Hi-C 24141950 PID1 31552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230204501 230204669 230204582 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 70500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230280795 230281434 230280933 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 146794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 230319642 230320072 230319824 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 185641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 231822084 231822525 231822233 Y GPR55 NA NA NA NA NA ITM2C 94730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 231838825 231839283 231839059 Y NA NA NA NA NA NA PSMD1 80295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 231901045 231901225 231901135 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 18353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 232042131 232042529 232042280 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 18731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 232044610 232045091 232044820 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 16169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 232046537 232047112 232046768 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 14148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 232054877 232055306 232054968 Y HTR2B,ARMC9 ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 5954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 232055335 232055819 232055722 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 5441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 46389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 232582048 232582308 232582138 Y NCL,PTMA PTMA NA NA NA NA PTMA 12443 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 233181304 233181393 233181324 Y NA NA NA NA NA NA ALPP 59851 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 233766797 233767190 233766879 Y NA NA NA NA NA NA NGEF 108792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234074569 234074943 234074824 Y NA ATG16L1 NA NA NA NA ATG16L1 41754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234322287 234322459 234322373 Y SAG NA NA NA NA NA DGKD 61134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA UGT1A7,UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 17245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA UGT1A1 NA NA NA NA UGT1A1 3269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA UGT1A1 NA NA NA NA UGT1A1 6194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 234882556 234882776 234882660 Y TRPM8 NA NA NA NA NA MSL3P1 107466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 235160532 235160873 235160730 Y NA NA TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 242824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 235166155 235166362 235166255 Y NA NA SH3BP4,TRPM8,ARL4C,AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 237335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235194826 235195253 235194996 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 208444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 235198516 235198843 235198584 Y ARL4C NA TRPM8,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 204854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr2 235200452 235200981 235200578 Y ARL4C NA TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 202716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 235216457 235217017 235216837 Y ARL4C NA ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 186680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235239661 235239923 235239798 Y NA NA SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 163774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235242895 235243257 235243020 Y ARL4C NA SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 160440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 235244091 235244800 235244645 Y ARL4C NA SPP2,ARL4C IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 158897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 235311738 235312040 235311967 Y ARL4C NA NA NA NA NA ARL4C 91657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr2 235353626 235353934 235353758 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 49763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235360536 235360912 235360678 Y NA ARL4C TRPM8,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 42785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 235372630 235373257 235372862 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 30440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235388083 235388436 235388365 Y NA ARL4C NA NA NA NA ARL4C 15261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 235392262 235392984 235392812 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 10713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235397514 235398106 235397828 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 5591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235400661 235400783 235400733 Y ARL4C ARL4C NA NA NA NA ARL4C 2914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235872484 235872869 235872649 Y NA SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 13867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235952893 235953060 235952916 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 94276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 236172421 236172477 236172436 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP1 228256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 236299191 236299376 236299366 Y NA NA AGAP1 IMR90 Hi-C 24141950 AGAP1 101357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 236404372 236404974 236404689 Y AGAP1 AGAP1 NA NA NA NA AGAP1 3639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 236489079 236489125 236489102 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 88346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 508840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 237640726 237641053 237640951 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 350902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 237652147 237652530 237652442 Y NA NA CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 339425 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr2 237677514 237677881 237677605 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 314074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr2 237678524 237678883 237678772 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 313072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 237742324 237742707 237742487 Y NA NA IQCA1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 249248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 44470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238122137 238122516 238122344 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 129677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238136450 238136659 238136506 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 143990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238188791 238189175 238189021 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3,COPS8 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A3 131843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 238292882 238293292 238292932 Y COPS8,LRRFIP1,COL6A3 COL6A3 NA NA NA NA COL6A3 27726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238382776 238383011 238382901 Y LRRFIP1 MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 9060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 239078028 239078257 239078143 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 12405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr2 239426928 239427234 239427055 Y TWIST2 NA NA NA NA NA ASB1 93545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 239545160 239545510 239545294 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,HDAC4,MIR4440 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 209163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 239597207 239597573 239597401 Y NA NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 157100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 239758150 239758505 239758333 Y NA TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 3477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr2 239870450 239870747 239870599 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 TWIST2 115777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 240387329 240387689 240387460 Y NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 65981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 241309624 241309945 241309791 Y GPC1 NA PP14571,GPC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPC1 63143 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 241313615 241314182 241313884 Y NA NA GPC1 IMR90 Hi-C 24141950 GPC1 58906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr2 241860652 241861096 241860920 Y GPC1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 SNED1 75159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 241960934 241960944 241960939 Y AQP12A,PASK SNED1 NA NA NA NA SNED1 24679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 242455386 242455795 242455485 Y NEU4,C2orf85 STK25,BOK NA NA NA NA STK25 8241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr2 242500447 242500594 242500505 Y NEU4,BOK BOK NA NA NA NA BOK 4311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr2 243028160 243028467 243028224 Y ATG4B AC093642.5 NA NA NA NA AC093642.5 317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 268547 268840 268655 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12 NA NA NA NA C20orf96 550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 353974 354548 354311 Y SRXN1,FAM110A SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 4713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 478652 479003 478850 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA TBC1D20 37455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 652993 653392 653352 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 20979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 810241 810511 810380 Y SDCBP2,SDCBP2,SRXN1,FAM110A,FAM110A,FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 1847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 810836 811112 810991 Y SDCBP2,SRXN1,FAM110A,FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 1246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 823028 823308 823133 Y FAM110A FAM110A NA NA NA NA FAM110A 10670 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA NA NA NA NA NA SNPH 76052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1259137 1259285 1259212 Y C20orf46,C20orf202 SNPH NA NA NA NA SNPH 14177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG NA NA NA NA NA FKBP1A 60578 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1372569 1372994 1372930 Y PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1744868 1745008 1744937 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 128146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 1790289 1790734 1790591 Y NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 82420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1793760 1794139 1793988 Y NA NA STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 79015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 1869680 1870159 1869931 Y NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA SIRPA NA NA NA NA SIRPA 2995 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 1925678 1926256 1925964 Y SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SIRPA 52524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr20 2295693 2295966 2295830 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 153533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4063526 4063882 4063813 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 35745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4070458 4070670 4070629 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 28957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 4071915 4072059 4071990 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 27568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 4148418 4148828 4148571 Y NA SMOX NA NA NA NA SMOX 48791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D NA NA NA NA NA SMOX 98793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA NA NA NA NA NA SMOX 107018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4931181 4931354 4931276 Y SLC23A2 NA NA NA NA NA SLC23A2 57585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr20 5053777 5054341 5054121 Y PRNP,PRNP,RASSF2,SLC23A2 NA NA NA NA NA PCNA 50931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 5059148 5059500 5059412 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 45772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 5060940 5061369 5061194 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 43903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 5900000 5900262 5900165 Y GPCPD1,TRMT6 TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 28920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 7676323 7676671 7676477 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 321805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 7723192 7723495 7723380 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 274981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 7724927 7725300 7725200 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 273176 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 7741380 7741717 7741518 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 256759 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 7822678 7823042 7822860 Y NA NA BMP2,HAO1,FERMT1 IMR90 Hi-C 24141950 TMX4 175434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 7905442 7905630 7905536 Y HAO1 NA NA NA NA NA TMX4 92846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 8057856 8057913 8057886 Y NA NA PLCB1,TMX4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB1 52911 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 8408277 8408546 8408511 Y TMX4 NA NA NA NA NA PLCB1 297453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 8456566 8456979 8456777 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 345742 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 8509253 8509664 8509321 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 398429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 8737014 8737369 8737294 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 310041 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 9065873 9065924 9065899 Y NA PLCB4 NA NA NA NA PLCB4 18463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 336882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 9439217 9439498 9439406 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 391807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 9480861 9480978 9480968 Y NA NA NA NA NA NA PLCB4 433451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 10280635 10280887 10280744 Y PAK7,SNAP25,MKKS NA NA NA NA NA SNAP25 83157 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 10585324 10585599 10585462 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 39415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 12152924 12153154 12153036 Y NA NA NA NA NA NA BTBD3 283553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 13846581 13846836 13846730 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 83049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 14036151 14036406 14036253 Y NA NA NA NA NA NA MACROD2 62136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 15962081 15962360 15962221 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 589718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 16562251 16562551 16562401 Y NA KIF16B KIF16B K562 ChIA-PET 22265404 KIF16B 10173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 17816995 17817233 17817164 Y DSTN NA BANF2,RRBP1,BFSP1 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 124356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 17830512 17830807 17830760 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 17830949 17831353 17831268 Y NA NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 110236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 18683386 18683430 18683408 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 116849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 18686203 18686430 18686281 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 119666 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 19194656 19195454 19194994 Y NA SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 3366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 19202967 19203160 19203066 Y SLC24A3 SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 11677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19293639 19293701 19293669 Y NA NA NA NA NA NA SLC24A3 102349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19414673 19414939 19414806 Y NA NA NA NA NA NA SLC24A3 223383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19796265 19796476 19796342 Y RIN2,RIN2 NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 59913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19837391 19837690 19837414 Y NA NA RIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 101039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 19860938 19861220 19861002 Y NA NA SLC24A3,RIN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 124586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,C20orf26,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 22392618 22392869 22392732 Y NA NA NA NA NA NA THBD 635509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 22743134 22743499 22743315 Y NA NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 284879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 283878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 23174478 23174828 23174732 Y CD93 NA NA NA NA NA THBD 146100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 23226243 23226447 23226434 Y NAPB NA THBD IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 102926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 23347147 23347295 23347221 Y THBD,CD93,GZF1 NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1 NA NA NA NA GZF1 6360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 23360936 23361138 23361045 Y SSTR4,NAPB NXT1,RP3-322G13.7,RP3-322G13.5,GZF1,NAPB NA NA NA NA GZF1 20149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 24931632 24932032 24931708 Y CST7,C20orf3 CST7 NA NA NA NA CST7 3766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 25226687 25226893 25226791 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA MIR663A 113396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 29637104 29637239 29637172 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 27247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 30194967 30195344 30195216 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 3881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30622441 30622925 30622709 Y TM9SF4,PLAGL2,C20orf112,HCK HCK NA NA NA NA HCK 15066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 30624710 30624829 30624798 Y PLAGL2,C20orf112,HCK HCK NA NA NA NA HCK 13162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30656632 30657209 30656801 Y TM9SF4,PLAGL2,C20orf112,HCK HCK,TM9SF4 NA NA NA NA HCK 18641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 31872886 31873050 31872953 Y BPIL1,PLUNC,C20orf114 NA NA NA NA NA CDK5RAP1 114317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 32400902 32401106 32400958 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 3792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 32425244 32425406 32425325 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 28134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH,CDC42P1 NA NA NA NA CDC42P1 1169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 33896147 33896435 33896303 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 25359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 34303643 34304038 34303890 Y NA ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1 NA NA NA NA NFS1 18362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 35612420 35612442 35612434 Y RBL1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 34174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 35964135 35964688 35964336 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 6400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 35964748 35965459 35965134 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 5629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36046410 36046637 36046524 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 25299 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36056702 36057072 36056829 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 14864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36339461 36339780 36339670 Y GHRH,CTNNBL1 CTNNBL1 NA NA NA NA CTNNBL1 19053 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36363012 36363293 36363171 Y GHRH,CTNNBL1 CTNNBL1 NA NA NA NA CTNNBL1 42604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36389387 36389716 36389551 Y NA NA VSTM2L IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 68979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36722822 36723019 36722924 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI NA NA NA NA NA RPRD1B 62874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 36772576 36772945 36772677 Y RPRD1B,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 20035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 36780859 36781241 36781066 Y RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 NA NA NA NA TGM2 11739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 36796708 36797026 36796907 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 TGM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TGM2 3728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 36986320 36986515 36986447 Y BPI LBP NA NA NA NA LBP 13561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 37603521 37603525 37603523 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 14579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 37606792 37607147 37606919 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 17850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39093469 39093767 39093632 Y MAFB NA MAFB MCF7 ChIA-PET 22265404 MAFB 222113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39661985 39662084 39662008 Y NA TOP1 NA NA NA NA TOP1 6527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39762558 39762863 39762778 Y NA PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39787054 39787387 39787188 Y NA PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 23454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39878072 39878223 39878164 Y NA NA NA NA NA NA ZHX3 66089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39938508 39938643 39938544 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 5669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 39958158 39958419 39958360 Y NA ZHX3,LPIN3 PLCG1,ZHX3,LPIN3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPIN3 9141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 42381187 42381490 42381296 Y C20orf111 NA TOX2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 87433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 42847207 42847559 42847248 Y NA JPH2,OSER1-AS1,GDAP1L1 NA NA NA NA OSER1-AS1 9607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 43321614 43322020 43321838 Y WISP2,KCNK15 ADA,WISP2 LOC79015,YWHAB,WISP2,SERINC3,TTPAL,PKIG,ADA,KCNK15,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WISP2 19465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA KCNS1 NA NA NA NA KCNS1 37405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 44062032 44062200 44062120 Y KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6 PIGT,WFDC2 NA NA NA NA PIGT 19315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 44135747 44136004 44135876 Y ZNF335 WFDC2 NA NA NA NA WFDC2 39401 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 44136889 44137182 44137082 Y NA WFDC2 NA NA NA NA WFDC2 40543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 44139141 44139436 44139290 Y SYS1,ZNF335 WFDC2 NA NA NA NA WFDC2 42795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA DNTTIP1 8072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA CD40 110419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 45028892 45029133 45029011 Y CD40 SLC35C2,ELMO2 NA NA NA NA ELMO2 30571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 45324546 45324927 45324721 Y TP53RK TP53RK,SLC2A10 SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 TP53RK 8128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 23191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 20353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 45988883 45989283 45988988 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 46394797 46395044 46394952 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 18316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 46396946 46397288 46397164 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 16072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 46419082 46419263 46419121 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 5722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 46420724 46421103 46420967 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 7364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 46641368 46641640 46641447 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 228008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 13.5156368173415 chr20 46924305 46924474 46924390 Y NA NA SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SULF2 510945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 47470610 47470767 47470691 Y NA PREX1 PREX1 IMR90 Hi-C 24141950 PREX1 28190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 47796581 47796870 47796726 Y NA STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 6034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 47803381 47804147 47803544 Y PREX1,STAU1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 47961628 47961789 47961714 Y NA NA B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD12 66408 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48075755 48075909 48075852 Y KCNB1 KCNB1 NA NA NA NA KCNB1 21275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48190419 48190797 48190608 Y PTGIS NA KCNB1,PTGIS,SLC9A8,B4GALT5,ZNFX1-AS1,ZNFX1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNB1 93235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 48201281 48201539 48201531 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNB1 104097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48212349 48213057 48212923 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNB1 115165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48295598 48295872 48295769 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 32543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr20 48406651 48406821 48406652 Y B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SLC9A8 KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 20429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48619796 48620156 48619863 Y B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1 SNAI1 NA NA NA NA SNAI1 22260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48646361 48646933 48646559 Y NA SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 48825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr20 48650281 48650896 48650575 Y NA NA TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 52745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr20 48664895 48665291 48665189 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2V1 65205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 48726581 48727101 48726820 Y SPATA2,SPATA2 UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189 NA NA NA NA UBE2V1 3395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48760872 48761304 48761158 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 6870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48809447 48810205 48810164 Y B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 4071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 48810888 48811172 48811109 Y B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 5512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48838079 48838414 48838219 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB,RP11-290F20.3 PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 32703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 48841053 48841720 48841386 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB,RP11-290F20.3 PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 35677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 48865015 48865181 48865091 Y NA RP11-290F20.3 PTPN1,CEBPB,FAM65C,MIR645,LOC284751,PARD6B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 16842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 48922474 48922671 48922573 Y NA RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 40451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr20 48938558 48938763 48938674 Y NA NA NA NA NA NA RP11-290F20.3 56535 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48950504 48950697 48950581 Y NA NA NA NA NA NA RP11-290F20.3 68481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 48956071 48956427 48956269 Y NA NA LOC284751,PTPN1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 74048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48990561 48990720 48990640 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 108538 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 48995783 48996016 48995938 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 113760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.5480298917939 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 49057048 49057261 49057196 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 49067387 49067853 49067497 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90 Hi-C 24141950 PTPN1 57038 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr20 49068016 49068199 49068168 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90 Hi-C 24141950 PTPN1 56692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 49114687 49115016 49114805 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 PARD6B,TMEM189-UBE2V1,PTPN1,SNAI1,FAM65C,CEBPB,LOC284751,MIR645 IMR90 Hi-C 24141950 PTPN1 9875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 49130261 49130753 49130448 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 5370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49157621 49157908 49157761 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 32730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49341306 49341865 49341532 Y NA FAM65C,PARD6B NCOA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 PARD6B 4216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49596851 49597164 49596956 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 23488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 49598879 49599145 49599015 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 25516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49807490 49807790 49807591 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 169824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49943865 49944229 49943998 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 306199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 310181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 49963208 49963745 49963374 Y NFATC2 NA KCNG1,ATP9A,NFATC2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 325542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 49967560 49968079 49967777 Y NA NA NA NA NA NA KCNG1 329894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA KCNG1 339252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr20 49982226 49982434 49982404 Y NA NA NA NA NA NA KCNG1 344560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 275263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 170758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 5.76076323362098 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 95991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr20 50272756 50273155 50272761 Y ATP9A NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 75917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 50366318 50366439 50366379 Y NA RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 16734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA RP5-1112F19.2 ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1112F19.2 49692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 50601567 50601698 50601647 Y NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1112F19.2 124116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 50664352 50664405 50664395 Y NA NA ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP64 154442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 51027531 51027754 51027643 Y NA NA NA NA NA NA RP4-723E3.1 202347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 51071156 51071538 51071347 Y NA NA BCAS1,TSHZ2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-723E3.1 245972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 51077599 51077838 51077759 Y NA NA BCAS1,TSHZ2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-723E3.1 252415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 51110040 51110185 51110129 Y NA NA NA NA NA NA RP4-723E3.1 284856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 51110889 51111034 51110969 Y NA NA NA NA NA NA RP4-723E3.1 285705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52195343 52195714 52195527 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 28732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52238141 52238435 52238216 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 13695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 52294676 52294905 52294769 Y NA NA BMP7,SUMO1P1,BCAS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 70230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52323078 52323315 52323172 Y NA NA SUMO1P1,ZNF217 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 98632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52353948 52354213 52354172 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 129502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr20 52407558 52407732 52407573 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 183112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52444580 52444892 52444748 Y NA NA ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 52516990 52517464 52517242 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 292544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52533564 52534521 52533763 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 287865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52732445 52732648 52732547 Y NA NA CYP24A1,DOK5,BMP7,SULF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 89738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52738821 52739082 52738998 Y NA NA DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 83304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52740107 52740637 52740253 Y NA NA DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 81749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52749215 52749597 52749386 Y NA NA DOK5 IMR90 Hi-C 24141950 PFDN4 72789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA NA NA NA NA NA PFDN4 72102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 52753645 52754029 52753762 Y NA NA NA NA NA NA PFDN4 68357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 55264382 55264603 55264519 Y NA PTMAP6 BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 9967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 55968808 55969481 55968821 Y ZBP1,PMEPA1 RAE1,MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 4345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 11805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 56251701 56252046 56251896 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 32546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 56323662 56324029 56323724 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 39070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 56592321 56592469 56592395 Y PMEPA1,PMEPA1 NA ZBP1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1L 290026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 56881907 56882420 56882011 Y STX16,RAB22A PPP4R1L,RAB22A NA NA NA NA PPP4R1L 75 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 57975904 57976026 57975986 Y EDN3 NA NA NA NA NA EDN3 102422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 58955192 58955446 58955319 Y NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1043L13.1 294297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 59108376 59108395 59108387 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1043L13.1 447481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 59325352 59325574 59325428 Y NA NA NA NA NA NA CDH4 499908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 59601014 59601048 59601031 Y CDH4 NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 224434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 60011356 60011607 60011563 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 185874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 60095984 60096281 60096088 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 270502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 60943690 60943839 60943760 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 60944265 60944566 60944463 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 61076779 61077313 61077048 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 GATA5 NA NA NA NA GATA5 27753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA GATA5 143579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 GATA5 151853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NA NA NA NA NA OGFR 62260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 62276090 62276438 62276124 Y CHRNA4,KCNQ2,EEF1A2,ABHD16B,STMN3 GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1 NA NA NA NA STMN3 6342 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA ZGPAT 22592 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr20 62461535 62461811 62461587 Y NA ZBTB46,TPD52L2 PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,ABHD16B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBTB46 938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr20 62609214 62609358 62609321 Y SAMD10 UCKL1,PRPF6 NA NA NA NA PRPF6 1130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 11063933 11064260 11064086 Y NA TPTE,BAGE2 NA NA NA NA BAGE2 32720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 11095741 11096142 11095942 Y BAGE2,BAGE BAGE2 NA NA NA NA BAGE2 838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 11099662 11099866 11099764 Y NA BAGE2 NA NA NA NA BAGE2 2682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 11128400 11128724 11128645 Y NA BAGE2 BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 31420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 77534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 16251857 16252256 16251994 Y SAMSN1,NRIP1 NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 183065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA USP25 859056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA USP25 860323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 18123083 18123468 18123447 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 759232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 18919922 18920266 18920094 Y CXADR CXADR NA NA NA NA CXADR 37222 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 19151902 19152070 19151981 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 37633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 21964766 21965142 21964954 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP22 1736669 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 22555444 22555624 22555534 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 2223824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 27275894 27276232 27276045 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 169910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 28206130 28206252 28206191 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 9476 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 28218728 28219247 28219071 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 28288547 28289033 28288781 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS5 NA NA NA NA ADAMTS5 47799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 28300536 28300937 28300780 Y ADAMTS5,ADAMTS1 ADAMTS5 NA NA NA NA ADAMTS5 35895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.20978851687687 chr21 28796596 28796902 28796773 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 459764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 28797067 28797570 28797293 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 460235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 28942187 28942353 28942343 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 605355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 28962741 28962988 28962847 Y NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 625909 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 29476694 29476903 29476871 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 778790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 29660800 29661042 29660922 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 594651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 489684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 29817449 29817753 29817663 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 437940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30009367 30009732 30009551 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 245961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30276081 30276287 30276184 Y C21orf7 N6AMT1 NA NA NA NA N6AMT1 20388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chr21 30580486 30581464 30581071 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 16094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30669074 30669451 30669267 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 104682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30802537 30802636 30802587 Y NA NA C21orf7 IMR90 Hi-C 24141950 BACH1 238145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30924978 30925301 30925140 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 360586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 464653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 32878321 32878337 32878329 Y TIAM1,SOD1 NA NA NA NA NA TIAM1 51953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 33670455 33670601 33670551 Y NA MIS18A NA NA NA NA MIS18A 21075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 33822696 33822707 33822702 Y C21orf63,C21orf62 NA NA NA NA NA C21orf119 59257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 33836273 33836551 33836412 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 72834 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 34075111 34075304 34075194 Y NA SYNJ1 NA NA NA NA SYNJ1 23055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 34431694 34432299 34432033 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG1 NA OLIG1 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 167907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 34659541 34659728 34659635 Y NA IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IL10RB 22878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 34752926 34753284 34753094 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 19918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 34773380 34773606 34773471 Y OLIG2,OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 35925582 35925949 35925790 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 59492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 36174477 36174817 36174756 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 189036 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 194238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36181032 36181199 36181134 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 195591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 36207924 36208159 36208081 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 36216696 36217156 36217046 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 231255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36222572 36222954 36222768 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 237131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 36263020 36263336 36263172 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 277579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 36342558 36342757 36342568 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 357117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36349860 36350141 36349984 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 364419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36379576 36379916 36379746 Y RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 394135 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36419290 36419780 36419662 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 433849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 36796080 36796340 36796246 Y RUNX1 NA CLIC6,RUNX1,LOC100506385 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 578625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 36848062 36848516 36848174 Y NA NA RUNX1,LOC100506385,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 526449 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 37529889 37530052 37529971 Y DOPEY2 CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA DOPEY2 2809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 38235070 38235202 38235136 Y TTC3,HLCS NA NA NA NA NA AP000704.5 101610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 38500086 38500176 38500125 Y NA NA NA NA NA NA TTC3 56560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr21 38986410 38986680 38986546 Y KCNJ6 NA NA NA NA NA DYRK1A 250318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39120305 39120635 39120470 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ6 166114 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 39135127 39135274 39135173 Y KCNJ6 NA NA NA NA NA KCNJ6 151475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39593313 39593902 39593631 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 101768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39616792 39617335 39616969 Y KCNJ15 NA KCNJ6,KCNJ15,DSCR10 IMR90 Hi-C 24141950 DSCR8 125247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr21 39630445 39631374 39631216 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 138900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 39638764 39638897 39638765 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 147219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39658761 39658879 39658842 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 167216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 39661705 39662059 39661845 Y KCNJ15 NA NA NA NA NA DSCR8 170160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 39675119 39675662 39675396 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 183574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39678263 39678712 39678528 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 186718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr21 39678794 39679150 39678924 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 187249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr21 39680166 39680215 39680191 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 188621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 39682559 39682791 39682680 Y ETS2 NA NA NA NA NA DSCR8 191014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr21 39683665 39683952 39683860 Y ETS2,KCNJ15 NA NA NA NA NA DSCR8 192120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 39715625 39715930 39715831 Y ERG NA KCNJ15,KCNJ6,DSCR8 IMR90 Hi-C 24141950 DSCR8 224080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 39722623 39722941 39722785 Y ETS2 NA NA NA NA NA DSCR8 231078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 39723755 39724311 39724014 Y ETS2 NA NA NA NA NA DSCR8 232210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr21 40211972 40212276 40212079 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 36741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 42485232 42485526 42485376 Y NA NA NA NA NA NA MIR3197 51958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 MIR3197,BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 42598872 42599018 42598944 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 61144 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 42857771 42858171 42857971 Y NA TMPRSS2 NA NA NA NA TMPRSS2 42872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 43181534 43181711 43181623 Y MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 43467986 43468177 43468082 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 95987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 43500906 43501194 43501017 Y ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ZNF295 NA NA NA NA NA ABCG1 116605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 43835171 43835549 43835341 Y C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A TMPRSS3 NA NA NA NA TMPRSS3 20216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 44499901 44500036 44499938 Y NA U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 25661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 44796506 44796705 44796660 Y NA SIK1 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 48303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 44913472 44913707 44913565 Y PDXK LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 16058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 17052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 20588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 45065485 45065706 45065596 Y NA HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA HSF2BP 11668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45154719 45155048 45154820 Y NA PDXK,CSTB NA NA NA NA PDXK 17744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45601467 45601803 45601706 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 ICOSLG,PWP2,DNMT3L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 49980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45604332 45605113 45604833 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG NA ICOSLG,PWP2,DNMT3L,PFKL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C21orf33 52845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45640329 45640509 45640452 Y TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG ICOSLG C21orf33 IMR90 Hi-C 24141950 ICOSLG 18340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 45790273 45790500 45790387 Y TRAPPC10,ICOSLG,TRPM2 C21orf2,TRPM2 NA NA NA NA TRPM2 22227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 46274069 46274460 46274264 Y KRTAP12-4,UBE2G2,SUMO3 SUMO3,PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 17292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 46302536 46302756 46302646 Y NA PTTG1IP PTTG1IP MCF7 ChIA-PET 22265404 PTTG1IP 10784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 46550297 46550615 46550364 Y ITGB2 NA NA NA NA NA ADARB1 58529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 47038276 47038513 47038446 Y NA PCBP3 PCBP3,ADARB1,LOC100129027,LOC642852,LINC00315,POFUT2,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 23095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr21 47266684 47266899 47266840 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 132752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr21 47370674 47370877 47370809 Y NA COL6A1 COL6A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A1 28774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr21 47469357 47469652 47469491 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 46359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 17305568 17305779 17305755 Y NA NA NA NA NA NA IL17RA 258065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 18043890 18044097 18044033 Y CECR6,CECR6,MICAL3,SLC25A18 NA NA NA NA NA ATP6V1E1 65487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 18056540 18056875 18056678 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1E1 52709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 18155331 18155602 18155421 Y NA ATP6V1E1,BCL2L13 NA NA NA NA BCL2L13 45710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 18264435 18264847 18264620 Y CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID BID NA NA NA NA BID 8899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 20287043 20287283 20287165 Y NA XXbac-B444P24.10,DGCR6L NA NA NA NA XXbac-B444P24.10 1760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 20886351 20886470 20886411 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 38151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr22 23178819 23179026 23178901 Y NA NA NA NA NA NA GNAZ 231514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 24470506 24470556 24470531 Y NA NA NA NA NA NA CABIN1 64864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 24795656 24796304 24795694 Y NA ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 15543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 24833641 24833901 24833753 Y NA ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 21794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 58459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 24878539 24879065 24878732 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 66692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 25373601 25373706 25373654 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 78420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 25381840 25382180 25381995 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 86659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr22 25463993 25464364 25464309 Y NA NA NA NA NA NA SNORD56 168812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 27109967 27110337 27110138 Y NA CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 43237 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 27525231 27525565 27525473 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 93123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 27816576 27816924 27816809 Y NA NA MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 197888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 29261004 29261197 29261109 Y ZNRF3 ZNRF3 TTC28,ZNRF3,KREMEN1,C22orf31,EMID1,EWSR1,RHBDD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF3 16383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 30096148 30096264 30096206 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT5 64736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,OSM,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,OSM,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 30657088 30657478 30657295 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,OSM,GATSL3 LIF IMR90 Hi-C 24141950 OSM 3351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 30666798 30667328 30667040 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM LIF,OSM,GATSL3 NA NA NA NA OSM 5969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 30675496 30675796 30675596 Y MTMR3,OSM,SLC35E4,DUSP18,TBC1D10A,SF3A1,CCDC157 LIF,OSM,GATSL3,TBC1D10A LIF,OSM IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 7820 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 30708168 30708313 30708241 Y MTMR3,TBC1D10A,CCDC157 OSM,GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1 NA NA NA NA TBC1D10A 12722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 30721148 30721367 30721290 Y MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1 NA NA NA NA TBC1D10A 113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 31626331 31627201 31626769 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 20106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 31631095 31631484 31631184 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 24870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.10489425843844 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 35708559 35708961 35708654 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 15291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 35709404 35709640 35709485 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 16136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36621171 36621450 36621368 Y NA APOL2,APOL1 NA NA NA NA APOL2 12550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36755336 36755467 36755407 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 26596 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-633O19__A.1 32691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36866824 36867261 36867092 Y NA RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 8816 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 36924116 36924377 36924195 Y NA TXN2,FOXRED2,EIF3D NA NA NA NA EIF3D 633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA RP1-63G5.5 182529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 37897761 37897917 37897872 Y NA CARD10 NA NA NA NA CARD10 15632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 38458818 38459072 38458999 Y SOX10,PLA2G6,PLA2G6,PICK1,SLC16A8 PICK1 NA NA NA NA PICK1 8500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 38568765 38569142 38568994 Y PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 26747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 38572177 38572681 38572373 Y DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 23208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 39277533 39277801 39277644 Y NA NPTXR,CBX6 CBX6,APOBEC3A,APOBEC3H,APOBEC3G,CBX7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBX6 11214 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 39673318 39673703 39673519 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 34562 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41079087 41079368 41079234 Y MCHR1 MKL1,GAPDHP37 NA NA NA NA GAPDHP37 10632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 41798116 41798195 41798164 Y CHADL,TOB2,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TEF 36779 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 41839332 41839605 41839469 Y TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 1422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 42679264 42679621 42679518 Y NA NA NA NA NA NA Z83851.1 83621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 43072276 43072640 43072458 Y NFAM1,ARFGAP3 CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA CYB5R3 28702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 43076677 43076928 43076817 Y NFAM1,ARFGAP3 CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA CYB5R3 33103 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 43144166 43144283 43144173 Y NA A4GALT CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 28862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 44947082 44947372 44947286 Y PARVG,PARVG NA PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 54904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr22 46008367 46008678 46008581 Y NA CTA-941F9.9 NA NA NA NA CTA-941F9.9 8866 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 46393370 46393721 46393470 Y C22orf26 WNT7B C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7B 22361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 46745093 46745309 46745201 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 20321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 283617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 280198 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 36.2263380268089 chr22 49769098 49769971 49769308 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 279219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 991989 992283 992135 Y NA NA NA NA NA NA AC090044.1 416075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 2199191 2199396 2199294 Y NA NA NA NA NA NA AC090043.1 563262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 3219649 3219829 3219819 Y NA CRBN NA NA NA NA CRBN 255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 3532969 3532987 3532979 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 306134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 4468384 4468713 4468579 Y NA SUMF1 NA NA NA NA SUMF1 38252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 4782990 4783362 4783182 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 4867902 4868594 4868233 Y NA NA NA NA NA NA AC018816.3 58383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 55307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 7807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr3 5035978 5036317 5036132 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 5059566 5059965 5059743 Y ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 39920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 48328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 5182623 5182897 5182737 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 20718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 235649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 6741976 6742157 6742067 Y NA NA NA NA NA NA GRM7 67531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 8500443 8500771 8500604 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 40622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 8524896 8525313 8525187 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 16080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 8544131 8544195 8544133 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 2738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 8978841 8979048 8978945 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 24409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 10215234 10216150 10215734 Y NA VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 10685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr3 10234749 10235085 10234824 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 30200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr3 10247090 10247317 10247193 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA TATDN2 40390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 11138272 11138477 11138338 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 11237617 11237805 11237677 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 60838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 11314967 11316155 11315793 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 2972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 11535651 11535676 11535665 Y NA NA NA NA NA NA ATG7 223656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 12211698 12212069 12211921 Y PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 114798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 13083903 13084071 13084052 Y NA IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 28546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 13580930 13581161 13581030 Y FBLN2 NA HDAC11,FBLN2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HDAC11 61706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 14246419 14246703 14246618 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 28136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 NA NA NA NA NA NR2C2 271895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 14848047 14848355 14848186 Y SLC6A6 NA NA NA NA NA NR2C2 138736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 15341871 15342528 15342442 Y ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 38347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 15450643 15451124 15450971 Y ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 15738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 15453852 15454017 15453935 Y NA EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 12845 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 15677848 15678314 15678139 Y ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1 BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 36510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 16280641 16280873 16280792 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA DPH3 23606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 16440818 16441233 16441127 Y DPH3,RFTN1 NA NA NA NA NA OXNAD1 136112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 16565294 16565593 16565411 Y DPH3 NA RFTN1,OXNAD1,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 OXNAD1 260588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 17248138 17248312 17248225 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 943432 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 95933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 19648890 19649201 19649045 Y NA NA NA NA NA NA EFHB 337316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 20201632 20201832 20201780 Y KAT2B SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 23952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 22168485 22168771 22168598 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 244041 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 23818113 23818374 23818285 Y UBE2E1 UBE2E1 UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 27020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 23946487 23946815 23946592 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA RPL15 9221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NA NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 74888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 27585968 27586230 27586099 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A7 62057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 5.20684369192666 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA AC098614.2 NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 46633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 28078428 28078736 28078583 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 202339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 28178906 28179294 28179100 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 101781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 28367464 28367703 28367584 Y NA AZI2,ZCWPW2 NA NA NA NA AZI2 20915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 29365730 29366225 29365913 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 45257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 404564 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 29736457 29736614 29736535 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 415984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 29800986 29801236 29801157 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 480513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 30269318 30269730 30269646 Y NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 376264 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 32506024 32506133 32506068 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 36767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 33089398 33089551 33089467 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE,GLB1 NA NA NA NA SEC13P1 16043 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 35105790 35105810 35105799 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 1267946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 36536348 36536512 36536414 Y MLH1,MLH1,EPM2AIP1 NA NA NA NA NA STAC 116512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 36953847 36954333 36954176 Y TRANK1,MLH1,LRRFIP2,GOLGA4,EPM2AIP1 TRANK1 NA NA NA NA TRANK1 30215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 36999426 36999810 36999630 Y LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 TRANK1,EPM2AIP1,MLH1 EPM2AIP1,MLH1 K562 ChIA-PET 22265404 TRANK1 14878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 38046580 38046956 38046768 Y SLC22A14 NA NA NA NA NA ACAA1 129777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 38209266 38209592 38209336 Y VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 4686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 38210566 38210752 38210690 Y VILL,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 5986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 39712999 39713450 39713220 Y NA NA NA NA NA NA RPSA 266819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 40665124 40665471 40665257 Y ZNF619,ZNF619 EEF1GP3 ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1GP3 28139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 41158856 41159369 41159156 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 74959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 42078040 42078206 42078049 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 24746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 42514598 42514851 42514767 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.5480298917939 chr3 42518371 42518582 42518469 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 9239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 42566341 42566482 42566400 Y NKTR,CCDC13 VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 37550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 43427917 43428246 43428244 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 101913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 43458781 43458976 43458878 Y NA NA NA NA NA NA SNRK 132777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45068504 45068742 45068611 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC3 52827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 79456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45142532 45142787 45142664 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 43127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45146738 45147081 45147019 Y TMEM158,CDCP1 CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 38833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 45155178 45155398 45155286 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 30516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45164613 45164770 45164669 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 21144 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 20102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45165992 45166137 45166089 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 19777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 45185924 45186005 45185965 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 46130670 46131183 46130920 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 95354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 46185573 46185609 46185591 Y NA NA CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 150257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 46274760 46275094 46274895 Y CCR3,CCR2 NA SLC6A20,FYCO1,CCR1,CCR3,CCR5,CCR2,CCRL2,LTF IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 239444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 46354449 46354761 46354695 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA CCR3,CCR9,CCR2,CCR5,LTF IMR90 Hi-C 24141950 LTF 169963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 LTF NA NA NA NA LTF 21683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 47000781 47001063 47000953 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 18110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 48651627 48651919 48651775 Y TREX1,DALRD3,ARIH2 COL7A1,UQCRC1,SLC26A6,CELSR3 NA NA NA NA UQCRC1 5218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 49171125 49171202 49171164 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B NA NA NA NA LAMB2 2574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 4232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 50208155 50208394 50208279 Y MAPKAPK3,RBM5,GNAI2 SEMA3F GNAT1,SLC38A3,GNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3F 17677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 50280819 50280975 50280878 Y RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,UBA7,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B,IFRD2 NA NA NA NA GNAI2 19095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 50302065 50302532 50302296 Y SEMA3B GNAI2,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3 NA NA NA NA SEMA3B 458 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 50639346 50639782 50639525 Y C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 7169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 50664800 50665228 50664999 Y GNAI2,MAPKAPK3 MAPKAPK3,CISH,MIR4787,DOCK3 NA NA NA NA CISH 17538 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 51377903 51378233 51378113 Y NA MANF,RBM15B NA NA NA NA MANF 42245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 52532822 52533186 52532863 Y TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1 NISCH,NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 33884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 52926819 52927340 52927162 Y PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110 TMEM110-MUSTN1,TMEM110 NA NA NA NA TMEM110-MUSTN1 2238 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 55194265 55194440 55194343 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 327533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr3 55194450 55194988 55194909 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 326985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 55203569 55203824 55203706 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,LRTM1,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 318149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55232673 55232906 55232681 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 289067 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 55363946 55364201 55364163 Y WNT5A NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 157772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55505173 55505349 55505275 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 16624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55516458 55517187 55517061 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 4786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55517501 55517653 55517577 Y NA WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 4320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55518078 55518594 55518516 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 3379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 55601569 55601909 55601898 Y NA NA NA NA NA NA RP11-875H7.5 64280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 55658337 55658755 55658490 Y NA NA WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-875H7.5 121048 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 56873709 56874050 56874038 Y NA NA NA NA NA NA FAM208A 158444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 57937235 57937402 57937348 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 54725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58038147 58038335 58038213 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 46020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58335663 58335765 58335715 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58336517 58336871 58336595 Y PXK RPP14,PXK NA NA NA NA PXK 19910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 58390134 58390421 58390274 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 27163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 58984210 58984527 58984399 Y NA C3orf67 NA NA NA NA C3orf67 49283 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 59320352 59320846 59320638 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 286542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 62052710 62052952 62052831 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 249696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 62214246 62214436 62214339 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 88212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr3 62590103 62590230 62590174 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 237098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 62802316 62802326 62802325 Y NA NA NA NA NA NA CADPS 56728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 62926615 62926793 62926705 Y CADPS NA NA NA NA NA CADPS 67561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 64136720 64136844 64136782 Y THOC7,PSMD6 NA NA NA NA NA PSMD6 129062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 64147375 64147623 64147507 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 139717 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 64176913 64177146 64177006 Y NA NA LOC100652759 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 169255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 64200446 64200649 64200513 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 192788 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 64251870 64252260 64252194 Y NA NA PRICKLE2,LOC100652759 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE2 176892 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 65006245 65006269 65006257 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 334569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 65181490 65181728 65181609 Y NA NA ADAMTS9-AS2,ADAMTS9 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS9 509814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 65831008 65831290 65831149 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 191219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 66295672 66296073 66295873 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A26 178387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 66467141 66467203 66467172 Y LRIG1 NA NA NA NA NA LRIG1 82484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 66543351 66543557 66543448 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 6130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 66547159 66547390 66547275 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 2297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 68183215 68183532 68183374 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A1 131856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 69131956 69132274 69132164 Y TMF1,ARL6IP5 TMF1,UBA3 NA NA NA NA ARL6IP5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 69790676 69790712 69790690 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 4090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 70881667 70881911 70881828 Y NA NA FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 749229 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 71099698 71099964 71099817 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 531176 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71137411 71137566 71137489 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71222111 71222440 71222307 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 408700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 71298409 71298581 71298470 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 332559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71389278 71389380 71389331 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 241760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71445520 71445701 71445627 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 185439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71478043 71478236 71478134 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 152904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71490469 71490633 71490551 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 140507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 71553174 71553740 71553492 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 77400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 72397214 72397486 72397325 Y RYBP NA SHQ1,RYBP,GXYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 96583 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 72536556 72536893 72536709 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 42487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 72940180 72940555 72940311 Y GXYLT2 SHQ1,GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA GXYLT2 4956 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 73022372 73022552 73022446 Y PPP4R2,EBLN2 FTH1P23,PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 21384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 73049169 73049333 73049244 Y PPP4R2,EBLN2 PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 5233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 75765975 75766371 75766287 Y NA NA NA NA NA NA ZNF717 66363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 76023479 76023788 76023634 Y NA NA NA NA NA NA ZNF717 190745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 78867121 78867519 78867219 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 947446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 79667523 79667843 79667648 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 147122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 80100853 80101105 80100983 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 285888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr3 80630991 80631014 80631005 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 816026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 18.8332644176071 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.76959770847163 chr3 81541330 81541813 81541427 Y GBE1 NA NA NA NA NA GBE1 267499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 81766105 81766391 81766248 Y NA GBE1 NA NA NA NA GBE1 42921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 83266585 83266839 83266721 Y NA NA NA NA NA NA RP11-260O18.1 1233296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 194997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 87022678 87022843 87022761 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 15426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 87045521 87045845 87045651 Y VGLL3 VGLL3 VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 7252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr3 98255377 98255965 98255704 Y NA CLDND1,GPR15 NA NA NA NA GPR15 6634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98257458 98257775 98257645 Y OR5K4,ST3GAL6,CPOX,GPR15 CLDND1,GPR15 NA NA NA NA GPR15 8715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 98270793 98270966 98270897 Y CPOX,CLDND1,GPR15 CLDND1,GPR15,CPOX NA NA NA NA GPR15 22050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98272798 98273262 98273095 Y OR5H6,OR5H2,GPR15 CLDND1,GPR15,CPOX NA NA NA NA GPR15 24055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 98273466 98273625 98273512 Y GPR15 CLDND1,GPR15,CPOX NA NA NA NA GPR15 24723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 98282496 98282734 98282630 Y CLDND1,GPR15 CLDND1,GPR15,CPOX NA NA NA NA CPOX 27833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 55645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA ST3GAL6 56078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98544884 98545154 98545150 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 73379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2,CTD-2021J15.1 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 CTD-2021J15.1 5909 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 98848000 98848317 98848116 Y DCBLD2 NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 150098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 99114245 99114616 99114431 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-779P15.2 129341 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99201113 99201346 99201253 Y NA RP11-779P15.2 NA NA NA NA RP11-779P15.2 42611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99262027 99262447 99262268 Y NA RP11-779P15.2 NA NA NA NA RP11-779P15.2 18070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99377938 99378211 99378054 Y COL8A1 COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 22619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99381280 99381540 99381410 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 25961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99555247 99555560 99555404 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 199928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 219902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99664130 99664284 99664246 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 167073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99751196 99751332 99751292 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 80025 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 100028092 100028475 100028284 Y TBC1D23 NIT2 NA NA NA NA NIT2 23070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 101598551 101599071 101598955 Y NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 53716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 101637736 101637924 101637829 Y FAM55C NA NA NA NA NA NFKBIZ 92901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 101669653 101669734 101669694 Y NA NA NA NA NA NA NFKBIZ 124818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 103710556 103710861 103710689 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 833752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 105625722 105626117 105625911 Y NA CBLB NA NA NA NA CBLB 39326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 105626736 105626952 105626872 Y NA CBLB NA NA NA NA CBLB 40340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 105716646 105717231 105716913 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 130250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 106253153 106253480 106253317 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 666757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 106407541 106407884 106407714 Y NA NA NA NA NA NA LINC00883 549655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 106926972 106927298 106927135 Y NA LINC00883 NA NA NA NA LINC00883 30241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 106988130 106988332 106988158 Y NA LINC00883 NA NA NA NA LINC00883 30591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 107148837 107149015 107148915 Y NA NA LOC344595,BBX,LOC100302640 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BBX 90768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 110545896 110546080 110545988 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 240838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 110559654 110560043 110559944 Y NA NA PVRL3,PVRL3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL3 226875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 110587612 110587624 110587618 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 199294 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 110688601 110689002 110688903 Y NA NA NA NA NA NA PVRL3 97916 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr3 111289781 111290083 111289847 Y CD96 NA NA NA NA NA PLCXD2 101440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 111583903 111584464 111583984 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA ABHD10 111393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 111723588 111723714 111723651 Y SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3 ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 27731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 112109657 112110558 112110278 Y CD200 NA CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A5 167998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 112274528 112274888 112274746 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 3668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 112348564 112348626 112348595 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 17751 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 112362530 112362627 112362586 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 3750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 112366095 112366266 112366169 Y NA CCDC80 CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC80 111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 112390838 112391135 112390988 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 24461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 112960908 112961353 112961141 Y NA BOC NA NA NA NA BOC 33058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 113502348 113502517 113502411 Y KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NAA50,ATP6V1A,GRAMD1C NA NA NA NA ATP6V1A 38482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F17.1 71167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 114100743 114101091 114100917 Y ZBTB20,ZBTB20 ZBTB20-AS1 NA NA NA NA ZBTB20-AS1 32085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA ZBTB20-AS1 NA NA NA NA ZBTB20-AS1 34518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 114231020 114231412 114231084 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20-AS1 162362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 114287427 114287687 114287530 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20-AS1 218769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 114813239 114813371 114813303 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 50747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 114998646 114998840 114998743 Y NA NA GAP43 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB20 134528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639719 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 117441757 117441996 117441951 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 698212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 117632292 117632433 117632362 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 888747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 119142297 119142580 119142348 Y ARHGAP31,NR1I2,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 43097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 119315385 119315520 119315495 Y TMEM39A,POGLUT1,CD80,ADPRH,COX17 CD80,ADPRH,RP11-190C22.1 NA NA NA NA ADPRH 19270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 119356620 119357543 119356968 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH,COX17 RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 3623 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 119758013 119758347 119758179 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 52917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123371138 123371512 123371325 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 68749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 123388051 123388291 123388171 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 85662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr3 123478378 123478570 123478420 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 175989 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123587912 123588093 123588031 Y ADCY5 NA NA NA NA NA CCDC14 90471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123662416 123662605 123662519 Y NA CCDC14 NA NA NA NA CCDC14 15959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123757264 123757578 123757422 Y NA NA KALRN,CCDC14 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 78700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 123824591 123825032 123824690 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 146027 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.76959770847163 chr3 124786089 124786383 124786283 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 13287 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 124823348 124823728 124823623 Y OSBPL11 NA HEG1 IMR90 Hi-C 24141950 HEG1 50546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA RP11-124N2.1 91582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 126126680 126126867 126126779 Y NA NA NA NA NA NA KLF15 52395 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 126630827 126630882 126630855 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA1 74555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 126652133 126652518 126652326 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA1 52919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 PLXNA1 NA NA NA NA PLXNA1 15639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 126939428 126939807 126939619 Y NA NA NUP210P1,CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 233991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 239994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 127453672 127453937 127453742 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA ABTB1 63894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 127469268 127470071 127469577 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 69980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 127799227 127799458 127799344 Y GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8 SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 30743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 128337505 128337705 128337543 Y KIAA1257,GP9 NA NA NA NA NA RPN1 60213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 128417695 128417825 128417815 Y NA RPN1,RAB7A RAB7A,LOC653712,RPN1,KIAA1257 IMR90 Hi-C 24141950 RPN1 19777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 128957834 128958071 128957930 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 57069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 128964355 128964687 128964560 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 63590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 129204579 129204997 129204770 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 47611 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 129335456 129335900 129335710 Y MBD4 PLXND1 RPL32P3,C3orf25,IFT122,MBD4,H1FOO,PLXND1,TMCC1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXND1 11795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 131056791 131057139 131056963 Y NA NUDT16P1,NUDT16 NA NA NA NA NUDT16P1 21603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 132164768 132165015 132164817 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 30398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 133132587 133132784 133132642 Y SRPRB,TMEM108 NA NA NA NA NA CDV3 157790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 27353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 134262801 134263184 134262890 Y CEP63,CEP63,CEP63 NA NA NA NA NA EPHB1 51459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 138109159 138109469 138109274 Y NA MRAS NA NA NA NA MRAS 44620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 138552268 138552612 138552378 Y MRAS PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 139633599 139633968 139633784 Y NA CLSTN2 CLSTN2 IMR90 Hi-C 24141950 CLSTN2 18059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 139922309 139922336 139922321 Y CLSTN2 NA NA NA NA NA CLSTN2 270282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 140186013 140186197 140186105 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A36 472475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 141050524 141051086 141050761 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 9469 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 141056151 141056465 141056211 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 15096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 141129371 141129776 141129494 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 74113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr3 141130337 141130617 141130393 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 73272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 141131172 141131505 141131226 Y SLC25A36,RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 72384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 141994757 141995052 141994916 Y NA NA GK5,TFDP2,ATP1B3,XRN1,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 GK5 52308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 141995622 141995984 141995903 Y ATP1B3,GK5,XRN1 NA GK5,TFDP2,ATP1B3,XRN1,GRK7 IMR90 Hi-C 24141950 GK5 53173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 142800993 142801468 142801180 Y NA CHST2 CHST2 K562 ChIA-PET 22265404 CHST2 34705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 142886908 142887049 142886974 Y NA NA SLC9A9,CHST2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHST2 50735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 143026592 143026945 143026781 Y CHST2 NA NA NA NA NA CHST2 190419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 143853302 143853504 143853403 Y NA NA NA NA NA NA C3orf58 164662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 145959602 145959992 145959865 Y PLSCR4 PLSCR4 NA NA NA NA PLSCR4 6974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA NA NA NA NA NA HPS3 97472 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 148963630 148964002 148963862 Y NA NA GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPS3 118259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149527606 149527898 149527672 Y RNF13 RNF13 RNF13 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF13 597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149901549 149901792 149901671 Y NA NA PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 134974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 149966255 149966555 149966407 Y NA NA TSC22D2,RNF13,PFN2,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903,EIF2A,SERP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D2 157567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 150417166 150417289 150417212 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A NA NA NA NA RP11-103G8.2 2062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 151839053 151839312 151839161 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 MBNL1 120305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 152215203 152215520 152215350 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 229859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 154782785 154783047 154782891 Y NA MME MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 42872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 154788699 154789128 154788815 Y NA MME MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 48786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 155464601 155464622 155464613 Y NA NA NA NA NA NA C3orf33 57518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 155905021 155905068 155905045 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 318696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156206621 156206945 156206715 Y NA NA NA NA NA NA SSR3 64028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr3 156403084 156403595 156403347 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 12917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 156444390 156444661 156444493 Y NA NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 54223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 156453441 156453522 156453482 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 63274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156480605 156480801 156480703 Y NA PA2G4P4 NA NA NA NA PA2G4P4 45720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 156491591 156491826 156491709 Y NA PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 34695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156506058 156506346 156506123 Y SSR3 PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 20175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 3780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr3 156538683 156538849 156538764 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 PA2G4P4,LEKR1 NA NA NA NA LEKR1 2421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156784451 156784922 156784633 Y PTX3,C3orf55 RP11-6F2.5 NA NA NA NA RP11-6F2.5 12708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 156822906 156823344 156823241 Y NA RP11-6F2.5 NA NA NA NA RP11-6F2.5 25276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 156846039 156846735 156846192 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1,CCNL1 RP11-6F2.5,CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 29814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 157248921 157249245 157249148 Y NA VEPH1,C3orf55 C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1 IMR90 Hi-C 24141950 VEPH1 163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 159514645 159514911 159514780 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 40739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 159847336 159847699 159847492 Y KPNA4 NA C3orf80,IFT80 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf80 93724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 159902453 159902788 159902672 Y NA C3orf80 C3orf80 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf80 38635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 170446657 170446914 170446737 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 10240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 170807604 170807852 170807633 Y NA NA NA NA NA NA EIF5A2 183122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA EIF5A2 258584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171092657 171092985 171092739 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 83212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171543191 171543627 171543455 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 FNDC3B,PLD1,TMEM212 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 16451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 171820468 171820770 171820540 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 65050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 171859893 171860698 171860535 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 104475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 171927297 171927567 171927433 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 171879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 171935922 171936083 171936003 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 180504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 172086059 172086253 172086084 Y NA NA NA NA NA NA BZW1P1 56626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 172229975 172230511 172230380 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 NA NA NA NA NA BZW1P1 87096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 172366671 172366874 172366806 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 60134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 172376302 172376661 172376383 Y NA NA NA NA NA NA NCEH1 50347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 174157357 174157932 174157609 Y NA NAALADL2 NAALADL2 IMR90 Hi-C 24141950 NAALADL2 2994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 176079538 176079932 176079735 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 645080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 176916249 176916425 176916364 Y NA TBL1XR1 NA NA NA NA TBL1XR1 2988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 177075253 177075542 177075439 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 177167081 177167399 177167234 Y NA NA TBL1XR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBL1XR1 253820 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 177170399 177170552 177170483 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 257138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 177548160 177548535 177548360 Y NA RP11-91K9.1 TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 15507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 90712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 179372057 179372188 179372123 Y NA USP13 NA NA NA NA USP13 3514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 179471930 179472312 179472121 Y NA NA NA NA NA NA USP13 103387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 738842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 181537254 181537571 181537413 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 831692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 182969922 182970295 182970062 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 182973593 182973879 182973736 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 183079075 183079309 183079198 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L2 65257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 183088664 183088916 183088772 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 55650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 184504548 184504615 184504585 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 23316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 185034789 185035224 185034953 Y NA EHHADH,MAP3K13 NA NA NA NA MAP3K13 36060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 185374091 185374577 185374335 Y NA NA NA NA NA NA SENP2 75807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 77293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 NA NA NA NA NA RTP4 79497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 RP11-211G3.2,BCL6 NA NA NA NA RP11-211G3.2 1104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 187458720 187459019 187458856 Y LPP,BCL6,BCL6,BCL6 RP11-211G3.2,BCL6 NA NA NA NA RP11-211G3.2 455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA RP11-211G3.2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr3 187574248 187574709 187574377 Y NA NA NA NA NA NA BCL6 112733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187686706 187686977 187686870 Y BCL6,BCL6 NA BCL6,LPP,LPP-AS2 IMR90 Hi-C 24141950 LPP 182095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188014586 188014976 188014809 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 144741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 188139673 188140134 188139816 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 269828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188149383 188149832 188149544 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 279538 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188151524 188151812 188151760 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 281679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188155903 188156126 188156022 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 286058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188296495 188296603 188296541 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 426650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188406951 188407256 188407141 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 537106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 188506419 188506821 188506595 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 636574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 1083170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr3 193207892 193208001 193207949 Y NA NA NA NA NA NA OPA1 100932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-135A1.3 219504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-135A1.3 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 RP11-135A1.3 NA NA NA NA HES1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr3 193988501 193988592 193988547 Y FAM43A NA HES1,LOC647323,LOC100131551 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 136567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 194277383 194277706 194277514 Y NA NA ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP13A3 60290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 194296552 194296878 194296640 Y HES1,ATP13A3 NA ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 AC046143.3 54774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 194298758 194299295 194298977 Y NA NA ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 AC046143.3 52357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr3 194299958 194300402 194300090 Y NA NA ATP13A3,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 AC046143.3 51250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr3 194319358 194319899 194319518 Y LRRC15 AC046143.3,TMEM44 NA NA NA NA AC046143.3 31753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 194925332 194925664 194925571 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 64232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 195542423 195542578 195542499 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA TFRC 264482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 195946209 195946432 195946330 Y UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19 NA NA NA NA NA PCYT1A 66396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 195946520 195946837 195946671 Y LRRC33,PCYT1A NA NA NA NA NA PCYT1A 65991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 196064212 196064579 196064504 Y WDR53,ZDHHC19 TCTEX1D2,TM4SF19 NA NA NA NA TM4SF19 838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 196068097 196068272 196068177 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,PCYT1A,TM4SF19 TCTEX1D2,TM4SF19 NA NA NA NA TM4SF19 4723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 196377844 196378239 196377963 Y NA LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 13198 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 196381001 196381149 196381075 Y PCYT1A,TM4SF19,SENP5,MFI2,MFI2,LRRC33 LINC01063,PIGX NA NA NA NA PIGX 16355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr3 197190389 197190580 197190458 Y NA NA DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 BDH1 107614 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr3 197214864 197215009 197214889 Y NA NA DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 BDH1 83185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 50610 50903 50681 Y NA ZNF595 NA NA NA NA ZNF595 276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 924714 925388 925028 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 1170900 1171323 1171147 Y GAK,DGKQ,KIAA1530 NA NA NA NA NA CTBP1 70418 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 NA NA NA NA NA C4orf48 73060 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 2389037 2389223 2389089 Y LOC402160 ZFYVE28 NA NA NA NA ZFYVE28 29167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 3026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 2415721 2415975 2415729 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 2415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 3438789 3438989 3438900 Y NA NA NA NA NA NA LRPAP1 93297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 4855584 4855774 4855697 Y NA MSX1 MSX1 K562 ChIA-PET 22265404 MSX1 3619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 5039798 5040187 5040096 Y NA STK32B STK32B,EVC2,EVC IMR90 Hi-C 24141950 STK32B 10982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 5054462 5054541 5054502 Y NA STK32B NA NA NA NA STK32B 3293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 6887984 6888235 6888115 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 20734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 6895356 6895637 6895499 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 13332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 6940825 6940952 6940860 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 31856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 7209017 7209262 7209117 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 16752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 7648496 7648718 7648592 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 290935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 7649791 7650390 7650086 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 289263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 7651364 7651970 7651802 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 287683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 7654451 7654682 7654596 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 284971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 7807485 7807548 7807490 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 132105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 7905982 7906260 7906100 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 33393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 8254530 8254695 8254600 Y NA NA NA NA NA NA SH3TC1 72731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 10034211 10034588 10034478 Y SLC2A9 NA NA NA NA NA WDR1 81985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 10182011 10182277 10182105 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 65438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 12731127 12731400 12731265 Y NA NA LOC285547,LOC285548,NKX3-2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-352E6.2 90866 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 13329661 13329866 13329822 Y NA HSP90AB2P HSP90AB2P IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AB2P 3172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 AC006445.7 290207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr4 13981901 13982273 13982087 Y NA NA LOC441009,CPEB2,BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 AC006445.7 349678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 14833004 14833350 14833280 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 168948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 15235793 15235968 15235850 Y CPEB2,FBXL5,BST1 NA PROM1,C1QTNF7,FBXL5,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 233495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115L11.1 26707 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr4 16544160 16544423 16544292 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 287982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 16609824 16610000 16609962 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 288432 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 16892563 16892848 16892840 Y LDB2 LDB2 NA NA NA NA LDB2 5584 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 20340711 20340985 20340805 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 87828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 22636233 22636363 22636286 Y NA RP11-10G12.1 NA NA NA NA RP11-10G12.1 42414 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 22669102 22669338 22669220 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 58235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr4 23936573 23936821 23936709 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 32861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 23947088 23947695 23947571 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 43376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 23958561 23958931 23958759 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 54849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 24057283 24057564 24057438 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1A 153571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 24079320 24079729 24079712 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 175608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 24107474 24107652 24107563 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 203762 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 24227575 24227894 24227795 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 323863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 24262994 24263251 24263044 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 320922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 24322640 24323331 24322979 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 260842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 24324929 24325054 24324992 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 259119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 24332761 24333117 24332939 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 251056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 25861466 25861639 25861549 Y RBPJ,ANAPC4,SEL1L3 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 1743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 26090058 26090547 26090383 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 72530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 27012249 27012271 27012260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 152028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 28389459 28389747 28389625 Y NA RP11-180C1.1 NA NA NA NA RP11-180C1.1 12739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 28621646 28621809 28621725 Y NA NA NA NA NA NA RP11-180C1.1 219160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 33723904 33724162 33724014 Y NA NA NA NA NA NA RP11-734I18.1 1726885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr4 35022631 35023155 35023089 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1220976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 35027106 35027343 35027234 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 1216788 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 37074925 37075290 37075112 Y NA NA NA NA NA NA C4orf19 378273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 38069769 38070051 38069856 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 109713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38080568 38081008 38080843 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 120512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38083648 38084173 38083860 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 123592 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38101433 38101948 38101596 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 141377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 38162192 38162313 38162253 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202136 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38162520 38162833 38162765 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38525630 38525737 38525685 Y NA NA FLJ13197,KLF3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF3 138080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 7536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr4 39045588 39045914 39045752 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 39285630 39285978 39285919 Y RFC1 NA NA NA NA NA RFC1 80017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40181948 40182292 40182189 Y RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 125502 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40519982 40520039 40520011 Y RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 463536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40564357 40564512 40564451 Y RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 507911 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40609271 40609510 40609444 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 552825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40943410 40943552 40943502 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 273179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 40994779 40995404 40995184 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 221327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 41365078 41365459 41365240 Y NA LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 5454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 41384257 41384615 41384267 Y NA LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 24633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 41434914 41435283 41435075 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 75290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 41509451 41509766 41509557 Y LIMCH1 NA NA NA NA NA LIMCH1 149827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 41569423 41569466 41569445 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 209799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 41936193 41936441 41936268 Y TMEM33 TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 1056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 42073690 42073968 42073740 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A9 83201 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 44712631 44712762 44712670 Y NA GUF1,GNPDA2 NA NA NA NA GNPDA2 13850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 48131569 48131907 48131778 Y TXK NA NA NA NA NA CNGA1 114880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 53985720 53986039 53985931 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 244203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 54137122 54137385 54137364 Y SCFD2 NA NA NA NA NA SCFD2 92857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54542644 54542861 54542728 Y CHIC2 NA LNX1,FIP1L1,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 300834 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 54554362 54554806 54554503 Y CHIC2 NA LNX1,CHIC2,FIP1L1,SCFD2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 312552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 NA SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 FIP1L1 327088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 54600901 54601043 54600966 Y CHIC2 NA NA NA NA NA CHIC2 327814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 54771921 54772318 54772120 Y NA NA FIP1L1,LNX1,SCFD2,RPL21P44,CHIC2,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 156539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54780399 54780822 54780654 Y CHIC2 NA LNX1,SCFD2,PDGFRA,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 148035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54798924 54799227 54799060 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,LNX1,RPL21P44,FIP1L1,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 129630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54866446 54866641 54866544 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 62216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 54886131 54886730 54886449 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 42127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 55097338 55097659 55097499 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 4074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.88038161681049 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 55943638 55944019 55943822 Y NA KDR NA NA NA NA KDR 45737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 57313900 57314193 57314047 Y NA PPAT,PAICS,SRP72 NA NA NA NA PAICS 13993 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 57985357 57985541 57985449 Y IGFBP7 IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 10806 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 66107153 66107671 66107555 Y NA NA NA NA NA NA RP11-807H7.1 426008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.43430115850482 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA RP11-396M11.1 NA NA NA NA RP11-396M11.1 2746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 73634227 73634562 73634459 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS3 201711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 73762328 73762436 73762384 Y NA NA NA NA NA NA COX18 171036 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 74527283 74527866 74527619 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,RASSF6,CXCL2,ANKRD17,IL8,PF4V1,CXCL3,CXCL6,PPBPL2,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 76357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 74591640 74592145 74591915 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 12078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 74596111 74596370 74596188 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 7853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 74596602 74597090 74596757 Y ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 7133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 74600296 74600729 74600594 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL8 3494 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 74641927 74642201 74642034 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 CXCL6,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 37704 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 75557908 75558335 75558035 Y EREG,AREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 PARM1 297970 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 77928518 77929121 77928831 Y CCNI,CCNG2 NA NA NA NA NA SEPT11 59662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 79264997 79265051 79265025 Y NA NA NA NA NA NA ANXA3 205622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 80900549 80900754 80900650 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 143854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 81229160 81229644 81229481 Y NA FGF5,C4orf22 NA NA NA NA C4orf22 25230 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 82133438 82133457 82133448 Y PRKG2 PRKG2 NA NA NA NA PRKG2 761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 88074850 88075090 88074969 Y DSPP NA NA NA NA NA KLHL8 84376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 88130914 88131113 88130991 Y AFF1,HSD17B11 KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 28353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 89438192 89438391 89438292 Y NA HERC3,PIGY NA NA NA NA HERC3 1808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 90212945 90213002 90212979 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 14159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 90238207 90238483 90238316 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 11046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 696530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 92985275 92985297 92985287 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2141465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 93103612 93103785 93103627 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022977 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2022184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 96071597 96071692 96071645 Y NA NA NA NA NA NA UNC5C 396665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 99469455 99469759 99469656 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 108021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 100305157 100305451 100305304 Y ADH5 NA ADH4,LOC100507053,ADH1A IMR90 Hi-C 24141950 ADH5 297205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 101977991 101978172 101977999 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 288765 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 102131266 102131303 102131283 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 135634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr4 102254048 102254281 102254164 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 12656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 103536028 103536474 103536149 Y NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 115542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 103541931 103542312 103542286 Y NA NA NA NA NA NA NFKB1 121445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 103605742 103606270 103606017 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA NA NA NA NA NA MANBA 73881 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 103937289 103937350 103937320 Y NA SLC9B1 NA NA NA NA SLC9B1 1546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 106064596 106064807 106064750 Y NA TET2 TET2 K562 ChIA-PET 22265404 TET2 225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 106227483 106227804 106227645 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 162451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 107597706 107597974 107597859 Y AIMP1 NA NA NA NA NA TBCK 357054 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA RP11-115A14.1 21210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 113067380 113067784 113067656 Y LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32 C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 2827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 113852159 113852312 113852236 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RPL7AP30 144125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 291278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA NA NA NA NA NA TRAM1L1 484131 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 120020297 120020647 120020592 Y USP53 MYOZ2 SYNPO2,USP53 IMR90 Hi-C 24141950 MYOZ2 34292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 120493215 120493297 120493256 Y C4orf3 NA NA NA NA NA PDE5A 54849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 122487638 122487728 122487683 Y NA NA NA NA NA NA ANXA5 128540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 124073506 124073670 124073588 Y NUDT6 NA NA NA NA NA SPATA5 231277 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 124907430 124907717 124907574 Y NA NA LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 TECRP2 475228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 125354669 125354869 125354769 Y NA TECRP2 ANKRD50 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECRP2 28076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 128083998 128084288 128084127 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 458138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 129088221 129088417 129088319 Y NA NA NA NA NA NA LARP1B 107798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 133266182 133266225 133266204 Y NA NA NA NA NA NA PCDH10 802245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 139182736 139183009 139182873 Y SLC7A11 SLC7A11 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 21233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140017684 140017800 140017744 Y RAB33B,ELF2 NA NA NA NA NA ELF2 78572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140278994 140279360 140279178 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 57289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140708283 140708341 140708312 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 123361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 140737173 140737338 140737263 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 152251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 141019887 141020108 141020058 Y MAML3 NA NA NA NA NA SCOC 156332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 141640892 141641150 141641076 Y TBC1D9 TBC1D9 NA NA NA NA TBC1D9 34124 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 142196982 142197372 142197125 Y NA NA NA NA NA NA ZNF330 56941 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 142566860 142567240 142566949 Y ZNF330,IL15 IL15 NA NA NA NA IL15 11108 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 144276815 144277022 144276900 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 20900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 149467274 149467593 149467420 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 103424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 152406480 152406763 152406721 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 78112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 153190429 153190517 153190474 Y NA NA FAM160A1,PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4453 264899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA MIR4453 189856 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 154598070 154598582 154598380 Y TLR2 NA TLR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 KIAA0922 212572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 155148499 155148707 155148553 Y NA NA NA NA NA NA PLRG1 320880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 157692679 157692824 157692748 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 197722 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 157718385 157718680 157718607 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 171866 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 157863056 157863372 157863345 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 27174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr4 157973833 157974145 157973989 Y NA GLRB PDGFC IMR90 Hi-C 24141950 GLRB 21064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 159082542 159083127 159082686 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA RP11-597D13.9 6777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 159083815 159084086 159083970 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA RP11-597D13.9 5818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 159084460 159084729 159084595 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA RP11-597D13.9 5175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 159730667 159731144 159730850 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 160199508 160199928 160199727 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 511218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 164085826 164086168 164085931 Y NAF1 NA NA NA NA NA NAF1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 164543460 164543823 164543698 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 279476 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 166247009 166247140 166247075 Y NA MSMO1,CPE NA NA NA NA MSMO1 234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 166603847 166604073 166603959 Y NA NA NA NA NA NA TLL1 188337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 166874416 166874673 166874545 Y NA NA NA NA NA NA TLL1 82006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 168818156 168818524 168818473 Y NA NA NA NA NA NA DDX60 419434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 173077271 173077317 173077294 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 1010587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 174856893 174857258 174857076 Y HAND2 NA NA NA NA NA CEP44 345570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 176349248 176349641 176349474 Y NA NA NA NA NA NA WDR17 635344 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 177191849 177192202 177191988 Y ASB5 ASB5,SPCS3,RP11-87F15.2 SPATA4 IMR90 Hi-C 24141950 ASB5 4520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 177760403 177760587 177760468 Y NA VEGFC VEGFC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VEGFC 48522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 178229393 178229664 178229462 Y NA NEIL3 NA NA NA NA NEIL3 403 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 179336968 179337246 179337206 Y NA NA NA NA NA NA AGA 975311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 180979072 180979692 180979379 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2084710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 180979740 180980372 180979835 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2084030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 183110695 183110955 183110887 Y NA AC108142.1 NA NA NA NA AC108142.1 46293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 183397757 183397986 183397872 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 333355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 183418367 183418505 183418425 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 353965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 183730445 183730610 183730498 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 106479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr4 184916743 184916943 184916831 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 9912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 185296800 185297408 185297103 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 96326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 185304654 185305034 185304819 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 88700 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 185770455 185770749 185770632 Y IRF2,ACSL1 ACSL1,RP11-701P16.5 LOC731424 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-701P16.5 4156 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 187597728 187597911 187597833 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 47965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 187614690 187615080 187614853 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 30796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 187621819 187622251 187622136 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 23625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 187810272 187810501 187810328 Y NA NA FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 164396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 11.521526467242 chr4 189048639 189048958 189048819 Y NA RP11-366H4.1 NA NA NA NA RP11-366H4.1 30261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 190285262 190285611 190285472 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 106508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.65881380013276 chr4 190485123 190485226 190485156 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 93004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 190489859 190490580 190490206 Y FRG1 NA NA NA NA NA HSP90AA4P 97740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr4 190534349 190534813 190534562 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 94055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 175502 175522 175512 Y NA CCDC127,SDHA NA NA NA NA CCDC127 40808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.66175862508298 chr5 378611 379250 378849 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 62008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 379590 379862 379712 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 61396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 395451 395827 395512 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 45431 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr5 400756 401055 400906 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 402925 403258 403130 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 38000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 413817 414070 413960 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 27188 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 424842 424963 424905 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 16295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 426647 427011 426980 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA C5orf55 14247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA TPPP 85938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 957095 957485 957381 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA RP11-43F13.3 37938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 964858 965249 965055 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 SLC12A7,TRIP13,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-43F13.3 30174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 1564127 1564592 1564359 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1,SDHAP3 NA NA NA NA SDHAP3 28143 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 3311711 3311862 3311757 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1512197 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 3595085 3595457 3595281 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 1542986 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 5209907 5210282 5210095 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 71464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 5311411 5311643 5311527 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 107134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 5351586 5351742 5351664 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 67035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 6449899 6450414 6450093 Y UBE2QL1 NA NA NA NA NA MED10 73192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 6.31468277531531 chr5 6927514 6927543 6927527 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 296058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 6961316 6961478 6961397 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 329860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 7397224 7397590 7397441 Y C5orf49,ADCY2 ADCY2 NA NA NA NA ADCY2 2903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 9544480 9544834 9544772 Y SEMA5A SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 9547741 9548115 9547963 Y NA SEMA5A,SNHG18 NA NA NA NA SNHG18 3429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 9888689 9888977 9888832 Y TAS2R1 NA NA NA NA NA SNHG18 344377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA ROPN1L,RPL30P7 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 10562652 10562841 10562738 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 11283783 11284165 11283974 Y NA NA NA NA NA NA DAP 524399 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 12060867 12061015 12060936 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 158712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 14582921 14583040 14582953 Y FAM105A FAM105A NA NA NA NA FAM105A 3037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 14809867 14810211 14810035 Y FAM105A,FAM105B RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 13358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 14926139 14926359 14926282 Y NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 56252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16723637 16724009 16723823 Y BASP1 NA NA NA NA NA FAM134B 108470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 17118695 17119132 17119047 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 54988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 17177639 17177702 17177672 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 113932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 17184758 17185051 17184904 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 121051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 17359663 17360122 17359876 Y BASP1 RN7SKP133,FTH1P10 NA NA NA NA FTH1P10 6930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 18697987 18698184 18698066 Y NA CTD-2023M8.1 NA NA NA NA CTD-2023M8.1 46098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 18960607 18960877 18960742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124N3.3 179578 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 19288299 19288682 19288500 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124N3.3 147844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 21551190 21551442 21551193 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 211248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 24155781 24155941 24155882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1032824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 1658354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2134P3.1 951396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 30104227 30104618 30104445 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 947054 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 30694167 30694547 30694365 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 357125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 31511930 31511946 31511938 Y NA DROSHA,C5orf22 NA NA NA NA DROSHA 18357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 32582779 32582965 32582856 Y SUB1 NA ZFR,SUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUB1 53040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 32760271 32760413 32760371 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 230532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 32768263 32768639 32768422 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 238524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 33312073 33312323 33312255 Y NA NA NPR3,LOC340113 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2203K17.1 126402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 33671500 33671855 33671579 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 218442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 33688737 33688976 33688873 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 201321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 33781524 33781664 33781594 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 108633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 33789074 33789288 33789217 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 101009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr5 33805217 33805258 33805238 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 85039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 33807297 33807469 33807384 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 82828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr5 33808872 33808964 33808905 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 81333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 33854695 33855218 33854933 Y NA ADAMTS12 NA NA NA NA ADAMTS12 35079 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 34564903 34565130 34565039 Y RAI14,RAI14 NA RAI14,TTC23L,RAD1,BRIX1 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 89212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 34571249 34571361 34571303 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 34571432 34571721 34571601 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 34658306 34658537 34658364 Y RAI14,RAI14 RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 3964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 34715239 34715402 34715248 Y NA NA NA NA NA NA RAI14 60897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 34717862 34718081 34717968 Y RAI14,RAI14 NA NA NA NA NA RAI14 63520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 34835599 34835693 34835610 Y NA NA NA NA NA NA BRIX1 77788 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 35212336 35212576 35212457 Y PRLR PRLR NA NA NA NA PRLR 16218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 35405015 35405048 35405025 Y NA NA SPEF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRLR 176221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.65292415023233 chr5 35430770 35431227 35431122 Y NA NA SPEF2,CAPSL,UGT3A1 IMR90 Hi-C 24141950 SPEF2 184719 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 35822621 35822984 35822929 Y IL7R IL7R NA NA NA NA IL7R 27813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 35884312 35884698 35884400 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 33515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 35924372 35924674 35924571 Y NA NA NA NA NA NA IL7R 73575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 36277859 36278299 36278119 Y NA RANBP3L NA NA NA NA RANBP3L 21917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 36665318 36665543 36665428 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A3 60861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 36677971 36678086 36678034 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 73514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP6 53296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 37717466 37717611 37717526 Y NA NA NA NA NA NA GDNF 120177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 38446340 38446486 38446390 Y EGFLAM CTD-2263F21.1 NA NA NA NA CTD-2263F21.1 19955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 38514652 38514707 38514680 Y NA CTD-2263F21.1,MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 40956 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA C9 NA NA NA NA C9 27507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 39399549 39400018 39399831 Y NA C9 NA NA NA NA C9 22952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 39411101 39411451 39411362 Y NA C9,DAB2 NA NA NA NA C9 11519 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 39519768 39520016 39519839 Y DAB2 NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 59366 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 39713773 39713912 39713841 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 253371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40224075 40224396 40224233 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 453204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 40410103 40410947 40410540 Y PTGER4,PRKAA1 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 40411118 40411409 40411246 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40447095 40447379 40447222 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 230221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40486540 40486993 40486708 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 190607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 40487144 40487367 40487248 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 190233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40490442 40491221 40490632 Y PTGER4,CARD6 NA NA NA NA NA PTGER4 186379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40492231 40492441 40492353 Y PTGER4,CARD6 NA NA NA NA NA PTGER4 185159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40754670 40754884 40754791 Y PTGER4 TTC33,PRKAA1 NA NA NA NA TTC33 593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40796420 40796758 40796693 Y NA TTC33,RPL37,CARD6 NA NA NA NA PRKAA1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 40967939 40968194 40968008 Y C6,C7 NA NA NA NA NA C7 60585 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 43009341 43009652 43009530 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 6879 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 43303282 43303485 43303367 Y NA HMGCS1 NA NA NA NA HMGCS1 8129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 43773427 43773527 43773474 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 172095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 43945591 43945673 43945632 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 344259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 44483168 44483474 44483321 Y NA NA NA NA NA NA FGF10 95360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 45599934 45599939 45599937 Y HCN1 NA NA NA NA NA HCN1 94314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 50677492 50677845 50677668 Y NA ISL1 NA NA NA NA ISL1 571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 52023689 52023809 52023721 Y NA NA NA NA NA NA ITGA1 57921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 52094372 52094720 52094546 Y NA ITGA1,PELO NA NA NA NA PELO 12598 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52145845 52146161 52146003 Y NA NA NA NA NA NA PELO 64071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52155124 52155267 52155195 Y NA NA NA NA NA NA PELO 73350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52168603 52169046 52168938 Y PELO,ITGA1 NA NA NA NA NA PELO 86829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52319874 52320078 52320019 Y NA ITGA2,CTD-2175A23.1 LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2175A23.1 35766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 43484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 49226 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 52545484 52545615 52545603 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 141591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 52693799 52694135 52693979 Y NA NA ARL15,LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 FST 80104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 59200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr5 52715258 52715483 52715372 Y FST NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 58756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 53466021 53466779 53466401 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 137633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 53967032 53967422 53967225 Y SNX18,SNX18 NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 155443 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 53969444 53970118 53969706 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 157855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 53972314 53972697 53972490 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA CDC20B,HSPB3,SNX18,GPX8 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 160725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 53998804 53998843 53998825 Y NA NA HSPB3,SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 187215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 54033914 54034212 54034128 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 222325 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 54039991 54040439 54040234 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 228402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 54132867 54133361 54133072 Y SNX18,SNX18,CDC20B NA SNX18,ARL15,HSPB3 IMR90 Hi-C 24141950 ESM1 183138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr5 54197279 54197516 54197431 Y NA NA SNX18,HSPB3,ARL15,CDC20B,GPX8,GZMK,CCNO,ESM1 IMR90 Hi-C 24141950 ESM1 118983 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 55457979 55458137 55458083 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 168984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 55461813 55461854 55461833 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 172818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 55555067 55555385 55555210 Y NA NA ANKRD55,IL6ST,MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 243514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 55934809 55935027 55934889 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 135910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 56737388 56737596 56737493 Y NA ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 39040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 56738135 56738571 56738168 Y ACTBL2 ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 38065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 56784239 56784594 56784302 Y GPBP1,ACTBL2 ACTBL2 PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 7603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 56790461 56790772 56790742 Y NA ACTBL2 ACTBL2,PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 13825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 58232883 58233370 58233101 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 478796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 6.9793862253485 chr5 58255899 58256231 58256006 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 501812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 58317891 58318186 58317997 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 563804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 621737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 58400134 58400374 58400226 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 646047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 668935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59041159 59041490 59041319 Y NA NA NA NA NA NA PART1 740050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59173236 59173442 59173374 Y NA NA NA NA NA NA PART1 608098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 59183388 59183889 59183871 Y NA NA NA NA NA NA PART1 597651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59492329 59492580 59492443 Y NA NA NA NA NA NA PART1 288960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59630308 59630442 59630415 Y NA NA NA NA NA NA PART1 151098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59735221 59735571 59735396 Y PDE4D PART1 NA NA NA NA PART1 45969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59834380 59834549 59834441 Y NA NA NA NA NA NA PART1 52840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 59836852 59837180 59836950 Y ELOVL7 NA NA NA NA NA PART1 55312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 60625710 60626179 60625844 Y ELOVL7,ZSWIM6 NA ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 60751661 60751965 60751750 Y ZSWIM6 NA NA NA NA NA RPL3P6 65963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 63506762 63506909 63506842 Y NA RNF180 NA NA NA NA RNF180 47091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 64309059 64309061 64309060 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 246302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 64372191 64372464 64372338 Y FAM159B NA CWC27,ADAMTS6 IMR90 Hi-C 24141950 CWC27 309434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 64423186 64423354 64423272 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 352393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 64727937 64728302 64728145 Y NA ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 47445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 65918246 65918267 65918259 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 28070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 66016454 66016847 66016518 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 126278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 66114936 66115229 66115083 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 224760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 66117932 66118220 66117961 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 227756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 66178568 66178972 66178612 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 288392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 66187482 66187743 66187625 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 297306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 66188697 66188845 66188789 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 298521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67066519 67066839 67066639 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 442709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67069285 67069755 67069460 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 439793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67294770 67295126 67294965 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 214422 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67625455 67625703 67625570 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 115907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67639455 67639512 67639485 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 129907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67670563 67670948 67670789 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 161015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 67875476 67875860 67875665 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 365928 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 71481497 71481884 71481610 Y MAP1B NA NA NA NA NA MAP1B 80436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 71643596 71644131 71643868 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 29123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 71896178 71896784 71896469 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 213355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM171 97865 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 72607592 72607820 72607706 Y NA NA FCHO2,FOXD1,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 134532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 72672825 72672912 72672868 Y NA NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 69440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 73926262 73926632 73926507 Y FAM169A HEXB,ENC1 NA NA NA NA HEXB 7216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 73981736 73982008 73981951 Y HEXB HEXB,ENC1 NA NA NA NA ENC1 46487 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 74805918 74806308 74805968 Y NA POLK NA NA NA NA COL4A3BP 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R NA NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2R 76646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 76086859 76087104 76086921 Y F2R,F2RL1 NA NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2R 76991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 NA F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2R 92177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 77589539 77589820 77589680 Y AP3B1 AP3B1 NA NA NA NA AP3B1 960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77800435 77801147 77800993 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 146096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77807354 77807759 77807583 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 153015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77809306 77809707 77809506 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 154967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77814404 77814787 77814528 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 160065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 77819717 77819752 77819740 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 165378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 77825252 77825732 77825631 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 170913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 77826174 77826769 77826484 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 171835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 77833920 77834065 77833967 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 179581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77882234 77882399 77882291 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 181445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77883814 77884068 77883938 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 179776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77934857 77935090 77934974 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 128754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 77974245 77974379 77974312 Y NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LHFPL2 89465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 78095218 78095295 78095257 Y NA LHFPL2 NA NA NA NA LHFPL2 31374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 78203184 78203323 78203251 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 76587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 78525358 78525750 78525524 Y NA DMGDH,JMY NA NA NA NA DMGDH 4111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 79695212 79695829 79695740 Y ZFYVE16,FAM151B ZFYVE16 THBS4,ZFYVE16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 6003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 80416491 80416834 80416663 Y NA NA NA NA NA NA CKMT2-AS1 178545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 81692717 81693105 81692928 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 120321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 82005927 82005935 82005931 Y ATP6AP1L NA NA NA NA NA XRCC4 365382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 4586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr5 82771448 82771603 82771549 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 6164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 41796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 82952253 82952601 82952427 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 62831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA HAPLN1 NA NA NA NA HAPLN1 2654 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83140507 83140806 83140549 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 125075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 83219939 83220298 83220055 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 204507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83221150 83221158 83221154 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 205718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83266909 83267113 83267063 Y NA NA NA NA NA NA HAPLN1 251477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 83583813 83583994 83583988 Y EDIL3 NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 94251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 83585889 83586179 83586107 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 92066 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 83588624 83588917 83588807 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 89328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr5 83668796 83668857 83668813 Y NA CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 9388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86275506 86275814 86275708 Y CCNH,CCNH NA NA NA NA NA CTD-2161E19.1 96808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 86417910 86418259 86418047 Y NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 143446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86524222 86524964 86524759 Y RASA1,RASA1 RASA1 MIR4280,RASA1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 36741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86611168 86611502 86611258 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 49463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86620547 86620785 86620574 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 58842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86653612 86653965 86653789 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 52871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 87662538 87662727 87662633 Y NA NA NA NA NA NA TMEM161B 99245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 87983386 87983674 87983530 Y MEF2C NA LINC00461 K562 ChIA-PET 22265404 MEF2C-AS1 193471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 88120689 88121105 88120942 Y MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 56040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 89259292 89259660 89259475 Y NA NA NA NA NA NA CETN3 443943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 90579794 90579971 90579883 Y ARRDC3 RNU4-90P,LUCAT1 ARRDC3,LOC100129716,GPR98 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-90P 15250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 90604425 90604632 90604611 Y NA RNU4-90P,LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 3587 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 90680524 90680637 90680608 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 90765478 90765836 90765795 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 88302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 93304446 93304744 93304683 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 140660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 93316390 93316647 93316523 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 128757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 93768342 93768439 93768383 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD32 183613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 94072643 94072953 94072798 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0825 120334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95007981 95008178 95008080 Y NA RFESD,RHOBTB3 NA NA NA NA RFESD 27523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 95053997 95054284 95054091 Y ELL2,RHOBTB3 RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB3 6771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 2102 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95094861 95094991 95094889 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 GLRX IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2154I11.2 28862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA CTD-2154I11.2,GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX,AC008592.5 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95178953 95179190 95179087 Y GLRX,ELL2 GLRX,AC008592.5 GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC008592.5 16300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX,AC008592.5 GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC008592.5 15556 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 95199166 95199388 95199264 Y GLRX,ELL2 GLRX,AC008592.5 NA NA NA NA AC008592.5 3676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95207014 95207210 95207113 Y ELL2 AC008592.5 NA NA NA NA AC008592.5 11524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95227563 95227763 95227704 Y NA AC008592.5 NA NA NA NA AC008592.5 32073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA AC008592.5 NA NA NA NA AC008592.5 44668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 RP11-254I22.1 NA NA NA NA RP11-254I22.1 31077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 98565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95507678 95508048 95507916 Y NA NA ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 123859 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 95562741 95563074 95562934 Y NA NA ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 178922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 95571032 95571517 95571164 Y GLRX NA ELL2,RHOBTB3,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 187213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 95633075 95633361 95633245 Y GLRX NA ELL2,RHOBTB3,MIR583,GLRX,C5orf27,CAST IMR90 Hi-C 24141950 PCSK1 134486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 95845653 95846023 95845804 Y NA CAST NA NA NA NA CAST 12948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 96022483 96022592 96022538 Y NA NA NA NA NA NA ERAP1 119211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 97445347 97445652 97445445 Y NA NA FLJ35946,RGMB IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 226796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 102194504 102194814 102194701 Y NA NA NA NA NA NA PAM 106819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 102847325 102847595 102847369 Y NA NUDT12 NA NA NA NA NUDT12 48899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 104727804 104727950 104727869 Y NA RP11-6N13.1 NA NA NA NA RP11-6N13.1 1133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 106802102 106802350 106802226 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 202246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 106822252 106822471 106822392 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 182125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 106823409 106823505 106823457 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 181091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 106931094 106931453 106931417 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 73143 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 107896272 107896622 107896503 Y NA NA PJA2 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL17 180473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 108747394 108747617 108747516 Y MAN2A1 PJA2 NA NA NA NA PJA2 3699 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 110252904 110253068 110253014 Y NA NA TSLP IMR90 Hi-C 24141950 WDR36 172346 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 110790342 110790723 110790533 Y NA NA NA NA NA NA STARD4 55565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 110830968 110831101 110831035 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 15187 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 110865894 110866475 110866210 Y STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 19606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 111018976 111019194 111019085 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 172688 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 111342511 111342737 111342622 Y STARD4 NA NREP,LOC100505678 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L4A-AS1 151486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 111482049 111482383 111482271 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 11840 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 111502817 111502914 111502867 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 8594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 111528702 111529013 111528858 Y EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 34479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 112488509 112488542 112488526 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 178110 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 114786469 114786715 114786546 Y NA NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 91876 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 115276815 115277206 115277011 Y LOC644100 NA NA NA NA NA ATG12 101260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4,RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118605337 118605637 118605457 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 2950 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 118609146 118609633 118609193 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 6759 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118659966 118660476 118660173 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 57579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 118733226 118733719 118733474 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA HSD17B4 52419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 118734927 118735157 118735058 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 NA NA NA NA NA HSD17B4 50981 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118742371 118742700 118742646 Y TNFAIP8,TNFAIP8 HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 43438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 118747047 118747470 118747128 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 38668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 123935187 123935581 123935384 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 146919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 124178131 124178310 124178211 Y NA RP11-436H11.1 NA NA NA NA RP11-436H11.1 35205 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 124271562 124271936 124271758 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 128636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 10377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 125709518 125709709 125709633 Y GRAMD3 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 15694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 125721947 125722154 125722072 Y NA GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 28123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 125779791 125780174 125779834 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 85967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 126217588 126217612 126217598 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 107273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 126255338 126255585 126255451 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 108915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 126367022 126367218 126367207 Y NA MARCH3,C5orf63 NA NA NA NA MARCH3 2522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 126738712 126738949 126738790 Y MEGF10 NA NA NA NA NA PRRC1 112352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 129563384 129563648 129563470 Y NA NA NA NA NA NA CHSY3 325219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 130715394 130715800 130715520 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 136208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 130970028 130970178 130970095 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 1099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 22572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 131431180 131431494 131431281 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 23697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131439036 131439325 131439215 Y NA CSF2 PDLIM4,IL3 IMR90 Hi-C 24141950 CSF2 31553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 131560740 131561286 131561173 Y IL3,CSF2,PDLIM4,P4HA2,P4HA2 NA NA NA NA NA SLC22A4 66850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 131561409 131561561 131561506 Y PDLIM4,P4HA2,P4HA2 NA NA NA NA NA SLC22A4 66575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA SLC22A4 26354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 131604535 131604860 131604707 Y NA SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA SLC22A4 23276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 131633963 131634368 131634191 Y IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 4955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 11247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 131800033 131800450 131800090 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 6285 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131802496 131802987 131802660 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 3748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 131833441 131833717 131833513 Y IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 131833993 131834254 131834119 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 9503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 133460893 133461176 133461013 Y PHF15,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 12491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133470244 133470404 133470305 Y NA TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 21842 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA MIR3661 18431 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 93721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 133880902 133881116 133881009 Y PCBD2,CDKL3,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 101363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133890594 133890960 133890666 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 91519 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 103128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 134824618 134825007 134824746 Y NA NA NA NA NA NA CXCL14 87962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 134879348 134879728 134879405 Y NA CXCL14 NA NA NA NA CXCL14 33241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 135335114 135335504 135335269 Y NA TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 27080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 135356057 135356513 135356322 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 6071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 136477732 136478020 136477766 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 286415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 136478407 136478752 136478599 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 287090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 136592978 136593359 136593358 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 338709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 136797859 136797994 136797927 Y KLHL3 NA NA NA NA NA SPOCK1 134074 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr5 137001727 137002094 137002034 Y FAM13B NA NA NA NA NA KLHL3 67685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA KLHL3,HNRNPA0 NA NA NA NA KLHL3 6194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 137797072 137797362 137797204 Y FAM53C,ETF1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.32351725016595 chr5 137810438 137810840 137810496 Y NA REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 11259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 TMEM173 NA NA NA NA TMEM173 21887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139015811 139016118 139015905 Y MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 8766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139017934 139018665 139018227 Y MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 6219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139070074 139070356 139070181 Y NA CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 45190 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139090940 139091124 139091019 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 66056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139677985 139678148 139678067 Y NA PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 2558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 139968065 139968565 139968419 Y HBEGF,ANKHD1,CD14,CD14,SRA1,APBB3,SLC35A4 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6 NA NA NA NA APBB3 2772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 139975060 139975424 139975289 Y HBEGF,ANKHD1,ZMAT2,IK,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2 SRA1,APBB3,HARS,SLC35A4 IMR90 Hi-C 24141950 APBB3 3723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 139982562 139982853 139982674 Y HBEGF,ANKHD1,CD14,CD14,SRA1,APBB3,SLC35A4 SRA1,SLC35A4,APBB3,CD14,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655 HARS,SLC35A4,APBB3,ANKHD1-EIF4EBP3,SRA1 IMR90 Hi-C 24141950 APBB3 11225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 140457576 140457668 140457630 Y NA PCDHB2,PCDHB3,PCDHB4 NA NA NA NA PCDHB2 14559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 140888509 140888855 140888756 Y PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 34929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 140899669 140900070 140899720 Y PCDH12,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 46089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 140900821 140901187 140900923 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 47241 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 141824245 141824298 141824272 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 120225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142024486 142024769 142024581 Y NA NA NA NA NA NA FGF1 50848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142182965 142183820 142183151 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 35016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142318662 142319068 142318747 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 170713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142381384 142382030 142381741 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 233435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142383259 142383413 142383268 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 235310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142415813 142416201 142415818 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 267864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142444859 142445221 142444946 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 264949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142534225 142534485 142534355 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 175685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142562980 142563339 142563259 Y NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 146831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142580387 142580630 142580509 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 129540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142584878 142585235 142585051 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 124935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142597366 142597816 142597499 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 112354 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr5 142624650 142624850 142624748 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 85320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142641413 142641758 142641553 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 68412 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 142642050 142642362 142642163 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 67808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 142690864 142691375 142691192 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 18795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 142721389 142721627 142721517 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 11219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 142785420 142785784 142785543 Y NR3C1 NR3C1 ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 27293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142956241 142956608 142956394 Y NR3C1,NR3C1 NA HMHB1,NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 143164 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 142961745 142962148 142962010 Y NA NA HMHB1,NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 148668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 143567299 143567675 143567503 Y NA YIPF5,KCTD16 NA NA NA NA KCTD16 18903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 143569314 143569909 143569557 Y KCTD16 YIPF5,KCTD16 NA NA NA NA KCTD16 20918 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 145094622 145094634 145094628 Y GRXCR2 NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 118298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 135754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 103475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146832241 146832308 146832261 Y JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 146861527 146861726 146861596 Y NA DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 25893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146887479 146887544 146887495 Y DPYSL3 DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 75 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 146890135 146890280 146890247 Y NA DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 2516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 147073908 147073968 147073938 Y SPINK14,JAKMIP2 NA NA NA NA NA JAKMIP2 86370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 147248632 147248939 147248760 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 35162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 147266523 147266583 147266553 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 17518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 147283651 147283737 147283694 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 147605275 147606051 147605859 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 155295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148170785 148171258 148171072 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 32898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 31391 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 148174541 148175122 148174999 Y NA ADRB2 SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 29034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148293572 148293925 148293745 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 89416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148533618 148533717 148533668 Y NA ABLIM3 NA NA NA NA ABLIM3 14572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148788188 148788451 148788258 Y NA MIR143HG NA NA NA NA MIR143HG 3936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 148869266 148869383 148869317 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1 59624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149319494 149320025 149319793 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 18275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA NA NA NA NA NA TIGD6 139516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149658643 149658710 149658677 Y SYNPO,SLC6A7,CAMK2A NA NA NA NA NA TCOF1 76492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149696810 149697163 149696894 Y SYNPO,PDGFRB TCOF1 SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 TCOF1 38039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 149857006 149857314 149857147 Y NA RPS14,NDST1,CTC-367J11.1 SYNPO,MYOZ3,C5orf62,NDST1,RBM22,TCOF1 IMR90 Hi-C 24141950 NDST1 6067 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150006488 150006837 150006695 Y SYNPO,MYOZ3 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 27846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 150163031 150163501 150163387 Y TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 26360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150169826 150170319 150169982 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 33155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA NA NA NA NA NA TNIP1 67497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 150403932 150404163 150404140 Y NA NA NA NA NA NA TNIP1 66975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150447679 150448189 150447894 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 22949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 150461516 150462400 150461744 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 8738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 150468607 150468833 150468706 Y RBM22,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 2305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 150477506 150477962 150477585 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 6368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 151078700 151079028 151078874 Y ATOX1,SPARC SPARC SPARC,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 13974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 151129219 151129502 151129338 Y SLC36A1 RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 14437 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 152822087 152822411 152822258 Y NA NA GRIA1 IMR90 Hi-C 24141950 MFAP3 594055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 153903267 153903411 153903357 Y HAND1 NA NA NA NA NA SAP30L 79750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 154071115 154071211 154071188 Y NA LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 19251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA SGCD 423306 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 156540141 156540423 156540353 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2,MED7 NA NA NA NA HAVCR2 27457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 157809601 157809759 157809678 Y NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 525418 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 158325217 158325461 158325285 Y EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 199308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 158385170 158385443 158385354 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 139326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 158448175 158448456 158448348 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 76313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 RNF145 NA NA NA NA RNF145 22795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 158839407 158839958 158839513 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA ADRA1B,IL12B,LOC285627 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 151318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 47677 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 48187 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 159714411 159714605 159714509 Y NA RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 31151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 159720972 159721325 159721087 Y PWWP2A,SLU7,CCNJL RP11-34P1.2,CCNJL FABP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-34P1.2 37712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 159886073 159886498 159886331 Y SLU7 SLU7,PTTG1,MIR146A MIR3142 IMR90 Hi-C 24141950 MIR146A 6777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 159932805 159932943 159932874 Y NA MIR146A NA NA NA NA MIR146A 39530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 163344786 163345107 163345001 Y NA NA NA NA NA NA CTC-340A15.2 376595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 164595581 164595748 164595665 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 858568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167001995 167002057 167002026 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 144311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 167011273 167011672 167011457 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 134696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 167034408 167034621 167034436 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 111747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 167066911 167067143 167066981 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 79225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167122315 167122715 167122515 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 23653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 10720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 167178299 167178628 167178439 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 31931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167200740 167200856 167200798 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 54372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 78551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr5 167298999 167299254 167299082 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 152631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167320595 167320600 167320598 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 174227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167372516 167372785 167372694 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 226148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 167439777 167440090 167439882 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 276566 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167558741 167558830 167558746 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 157826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 167704511 167704517 167704515 Y NA WWC1 NA NA NA NA WWC1 12139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 137638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 169398141 169398453 169398335 Y NA FAM196B NA NA NA NA FAM196B 7291 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 169733349 169733836 169733608 Y NA NA LCP2,KCNIP1,C5orf58 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf58 75898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 170024399 170024639 170024519 Y NA NA NA NA NA NA RANBP17 262235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 170103371 170103426 170103399 Y NA NA NA NA NA NA RANBP17 183448 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 170763835 170763948 170763895 Y NA NPM1 KCNIP1,GABRP,RANBP17 IMR90 Hi-C 24141950 NPM1 48172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 171298269 171298393 171298371 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 133484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 171702162 171702431 171702281 Y DUSP1,UBTD2,STK10 UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 6644 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 171839597 171840252 171839919 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 39275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 171845132 171845429 171845292 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 34098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 171847636 171847998 171847816 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 31529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 171870556 171870796 171870680 Y DUSP1,STK10,UBTD2 SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 8731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 171879589 171880295 171879961 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 62 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 171882832 171882998 171882915 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 3305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172160207 172160396 172160286 Y NA DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 172202171 172203025 172202666 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 5973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 172203413 172203849 172203459 Y UBTD2,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 7215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172226784 172227709 172227394 Y ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 30586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172257827 172258390 172258174 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172288216 172288483 172288386 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 28938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172313877 172314602 172314167 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 54599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172329840 172330200 172330006 Y DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1 NA NA NA NA NA RPL26L1 53532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172380663 172381064 172380838 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 2668 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr5 172729503 172729731 172729610 Y NA STC2 NA NA NA NA STC2 24775 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172761341 172761739 172761505 Y STC2 STC2 NA NA NA NA STC2 6835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr5 172879193 172879453 172879250 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 124687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172881373 172881649 172881564 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 126867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 127777 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 172883833 172884047 172883943 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STC2 129327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr5 172899322 172899544 172899428 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 142119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 172901872 172902293 172901982 Y ATP6V0E1 NA LOC285593,STC2,BOD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 139370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr5 172921295 172921366 172921331 Y NA NA STC2,LOC285593,BNIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 120297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 173191567 173191754 173191643 Y CPEB4 NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 121529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 173208911 173209406 173209234 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 103877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173251298 173251668 173251379 Y NA NA BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 61615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173252274 173252478 173252451 Y NA NA BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 60805 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 173285551 173285919 173285810 Y NA CPEB4 BOD1,C5orf47,CPEB4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 27364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173586705 173586920 173586830 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 174378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173764742 173765021 173764892 Y NA RP11-267A15.1 HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 3444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 173765324 173765497 173765445 Y MSX2 RP11-267A15.1 HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 4026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr5 173811612 173811806 173811713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267A15.1 50314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.32646207511617 chr5 173888869 173889090 173888998 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267A15.1 127571 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 173956576 173956772 173956664 Y HMP19 NA MSX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 192764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 175026340 175026569 175026454 Y NA RN7SKP148 NA NA NA NA RN7SKP148 26622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 175098063 175098392 175098192 Y HRH2 RN7SKP148,HRH2 NA NA NA NA HRH2 15030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 178034122 178034420 178034258 Y ZNF354B,AGXT2L2,CLK4 CLK4 NA NA NA NA CLK4 21196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 178698075 178698460 178698284 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS2 71971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 178729378 178729778 178729559 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 40653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 178820200 178820548 178820392 Y SQSTM1,RUFY1,MAML1,HNRNPH1 ADAMTS2 ADAMTS2,CLK4,ZNF454 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS2 49769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 179188972 179189165 179189138 Y NA MAML1,LTC4S,SQSTM1,MGAT4B NA NA NA NA LTC4S 29816 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 179398044 179398477 179398178 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA TBC1D9B 65185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 179770152 179770325 179770205 Y NA GFPT2 NA NA NA NA GFPT2 8062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 179894931 179895217 179894999 Y NA CTC-573N18.1,CNOT6 GFPT2,MAPK9,CNOT6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT6 24195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr5 180615428 180615595 180615512 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 1329 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 180616521 180617006 180616799 Y ZFP62,TRIM52,TRIM41 TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A NA NA NA NA CTC-338M12.5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 235986 236322 236025 Y NA NA DUSP22,IRF4,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 53308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 387336 387726 387531 Y DUSP22 NA IRF4,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 97706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3389811 3390490 3390264 Y SERPINB6,SLC22A23,C6orf145 NA NA NA NA NA SLC22A23 64766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr6 3516507 3516602 3516555 Y RIPK1 NA SLC22A23,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 61251 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3592685 3593043 3592856 Y NA NA SLC22A23 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 137429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 3789456 3789809 3789635 Y NA PXDC1 SLC22A23,PXDC1,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 39196 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 NA SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 76012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 3913172 3913519 3913429 Y NA NA SLC22A23,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 105982 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 4189159 4189278 4189216 Y C6orf201,C6orf146 RP3-400B16.2 CDYL IMR90 Hi-C 24141950 RP3-400B16.2 1809 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 RP3-400B16.2 129738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 4613428 4613746 4613742 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 90647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 5031190 5031205 5031197 Y NA RPP40 RPP40 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPP40 28893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 6005714 6006036 6005928 Y NRN1 NA NA NA NA NA F13A1 313210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 6890950 6891223 6891087 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 214607 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 HULC 866157 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 9710906 9711148 9711028 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 706744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 9839255 9839267 9839261 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 578625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.77254253342184 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,GCNT2 NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 10589491 10589864 10589781 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 99035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11270585 11270869 11270602 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 109712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11414036 11414330 11414188 Y TMEM170B,LOC221710,NEDD9 NEDD9 NEDD9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 33455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11592688 11592910 11592756 Y NA NA NA NA NA NA TMEM170B 56750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11615625 11615765 11615678 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 79687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11732067 11732789 11732417 Y NEDD9,NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 196129 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11772710 11773287 11772940 Y NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 233708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 12208445 12208821 12208625 Y HIVEP1,EDN1 NA HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 79775 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12265595 12266493 12265688 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 22103 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 12595340 12595665 12595564 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 82998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12729754 12730156 12729835 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P3 217412 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12757628 12757881 12757647 Y PHACTR1 NA NA NA NA NA RPL15P3 245286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12903491 12903822 12903657 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 308466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 12948801 12948938 12948870 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 263350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13009334 13009508 13009424 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 202780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13261916 13262190 13262091 Y RANBP9,GFOD1,GFOD1,TBC1D7 RNU1-11P NA NA NA NA RNU1-11P 49628 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13383914 13384048 13383981 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,GFOD1 NA NA NA NA NA TBC1D7 57099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 13662469 13662838 13662724 Y NA NOL7,RANBP9 NA NA NA NA RANBP9 46958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 14211875 14212265 14212161 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 96003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 14311227 14311573 14311408 Y CD83 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 195355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 14865991 14866350 14866175 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 378177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 15485085 15485275 15485180 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 176014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 15555860 15556076 15555941 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 105213 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 16439523 16439703 16439580 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA MYLIP 312167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 16481404 16481763 16481500 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 277606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 16488193 16488587 16488526 Y MYLIP NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 270782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 16684094 16684384 16684208 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74985 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 17016303 17016440 17016335 Y NA NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 ATXN1 256581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 17033300 17033417 17033356 Y RBM24 NA ATXN1,GMPR IMR90 Hi-C 24141950 RBM24 246160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 18263099 18263635 18263391 Y RNF144B,DEK DEK NA NA NA NA DEK 45 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 18432400 18432879 18432647 Y KDM1B,RNF144B NA NA NA NA NA RNF144B 65621 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 18833535 18833568 18833552 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 466756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 18836304 18836461 18836383 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 469525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 20239709 20240042 20239874 Y E2F3 MBOAT1 MBOAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MBOAT1 29039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 20910575 20910817 20910696 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 377887 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 20994795 20995087 20994932 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 462107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 21887910 21888037 21887975 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 295938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 22145253 22145497 22145375 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 553281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 22149387 22149566 22149505 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 557415 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 24686171 24686408 24686290 Y DCDC2 TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA ACOT13 20908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 24698648 24698887 24698768 Y NA TDP2,ACOT13,C6orf62 NA NA NA NA C6orf62 20177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 24743523 24743742 24743610 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24459 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 24957525 24957747 24957638 Y TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 16900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 25009821 25010191 25010012 Y NA PPIAP29,FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 30047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 54475 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 25193718 25194203 25194002 Y NA NA FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 83103 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 25597775 25597986 25597875 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2AA 126804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.65586897518255 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 26169489 26169538 26169514 Y BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1 HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE NA NA NA NA HIST1H2BE 12420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 27136362 27136689 27136526 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 23501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 27686942 27687278 27687069 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 86431 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 133398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 29521167 29521548 29521446 Y NA UBD NA NA NA NA UBD 4154 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30019374 30019509 30019439 Y NA HLA-J,ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 5167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 30434534 30434831 30434712 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 RANP1,HLA-E PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANP1 16886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 30651242 30651620 30651357 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr6 30731781 30732171 30732168 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 21450 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 26519 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 27125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 30746716 30747579 30747014 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,DDR1,CDSN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 36385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 30748515 30748873 30748611 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM,MRPS18B,PPP1R10,DDR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 38184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30755729 30756010 30755821 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,IER3,MDC1,DDR1,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 45398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chr6 30761567 30761766 30761739 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 51236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 55704 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 30845366 30845734 30845666 Y PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1,GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA DDR1 3168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 31789098 31789184 31789146 Y TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 4328 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1L,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 31942054 31942322 31942254 Y NA CFB,SKIV2L,STK19 NA NA NA NA STK19 5186 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 32051111 32051460 32051307 Y NA ATF6B,FKBPL NA NA NA NA ATF6B 42570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 32819276 32819643 32819486 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 112 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 32952668 32952702 32952685 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA BRD2-IT1 16659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 33087772 33087979 33087940 Y NA HLA-DPB1,HLA-DPA1 NA NA NA NA HLA-DPA1 41220 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 33216178 33216307 33216243 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,PFDN6,WDR46,RGL2 NA NA NA NA HCG25 867 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 33581625 33581918 33581825 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 34521580 34522143 34521703 Y NA RP3-391O22.3 NA NA NA NA RP3-391O22.3 20290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 35201491 35201602 35201547 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 23084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 35445364 35445634 35445501 Y RPL10A FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA RPL10A 11179 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 NA NA NA NA NA BRPF3 75780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 36325840 36326033 36325939 Y CPNE5 NA NA NA NA NA KCTD20 82511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 36326450 36326703 36326560 Y CPNE5 NA NA NA NA NA KCTD20 81841 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 37178650 37178811 37178707 Y NA PIM1,TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA PIM1 42671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 37212541 37212901 37212835 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 10647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 39886697 39886822 39886760 Y NA MOCS1,RP1-278E11.3 NA NA NA NA MOCS1 13468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 41150451 41150957 41150548 Y TREML4,TREML2,TREM1,NFYA TREM2 NA NA NA NA TREM2 21527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 41995989 41996337 41996109 Y NA CCND3,TAF8 NA NA NA NA CCND3 19758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 42067343 42067714 42067701 Y NA NA NA NA NA NA TAF8 51092 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA MRPS10 122815 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 42488672 42489031 42488808 Y CNPY3 UBR2 TRERF1,GUCA1A,GUCA1B,MRPS10,TAF8 IMR90 Hi-C 24141950 UBR2 40769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 42944777 42944970 42944923 Y NA CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43084087 43084410 43084171 Y PTK7 PTK7 NA NA NA NA PTK7 42081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43977606 43978027 43977822 Y NA NA NA NA NA NA TMEM63B 114624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE NA NA NA NA NA TMEM63B 113750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA NA NA NA NA TMEM63B 112442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 90272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 82898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 80772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 80166 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 44021972 44022127 44022048 Y SLC35B2 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 70524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 44025238 44025386 44025330 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 67265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 65298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 44029482 44029781 44029724 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,VEGFA,XPO5,MRPS18A,C6orf223,MRPL14 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 62870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44031882 44032664 44032378 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 59987 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr6 44039522 44039890 44039644 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,MRPS18A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 52761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 44205807 44206020 44205896 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B NA NA NA NA HSP90AB1 6804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,TMEM151B,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44458019 44458222 44458132 Y NA NA SUPT3H,RUNX2,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 104757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44594803 44595107 44595003 Y AARS2 NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 241541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44630454 44631299 44630653 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 277192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44924205 44924374 44924290 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 369520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 44934544 44934781 44934652 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 359113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45092657 45092762 45092710 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 201132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45299468 45299716 45299591 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 5574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 20065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45317803 45318343 45317888 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 23909 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45322073 45322342 45322124 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 21348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45372080 45372159 45372107 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 28390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 45391331 45391628 45391429 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47641 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.10489425843844 chr6 45633739 45634017 45633866 Y NA NA RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 290049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 45649659 45650055 45649841 Y NA NA RUNX2,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 305969 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 45678135 45678537 45678416 Y NA NA RUNX2,CDC5L,SUPT3H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 334445 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 46259169 46259392 46259281 Y ENPP4,SLC25A27 NA NA NA NA NA ENPP5 122461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 46628141 46628475 46628252 Y NA CYP39A1,SLC25A27 NA NA NA NA SLC25A27 9463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 46738555 46739161 46738809 Y PLA2G7,PLA2G7 NA NA NA NA NA SLC25A27 119877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 47618805 47618920 47618863 Y OPN5 GPR115 NA NA NA NA GPR115 32680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 47637505 47637670 47637588 Y OPN5,GPR111 GPR115 GPR115 IMR90 Hi-C 24141950 GPR115 13930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 49524322 49524464 49524384 Y NA NA NA NA NA NA CENPQ 95231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 52382425 52382779 52382512 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 56934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 52404444 52404567 52404560 Y NA TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 35146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 52461371 52461586 52461469 Y NA TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 21658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 52952230 52952503 52952367 Y NA FBXO9,ICK NA NA NA NA ICK 27630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 53167531 53167800 53167691 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 44147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 53191249 53191636 53191614 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 20311 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 53297739 53297913 53297859 Y NA NA GCM1,FBXO9,ELOVL5 IMR90 Hi-C 24141950 ELOVL5 85792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 53381866 53382077 53382067 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 97691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 53678166 53678361 53678262 Y NA LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 20871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 56573677 56574046 56573938 Y NA NA DST,BEND6,ZNF451 IMR90 Hi-C 24141950 BEND6 243727 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA RAB23 NA NA NA NA RAB23 32348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 64308595 64308777 64308676 Y NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 34948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 66497701 66498057 66497748 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2153976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr6 66637182 66637579 66637401 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2293457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 66708902 66709242 66709074 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2365177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 72640618 72640942 72640781 Y NA RIMS1 NA NA NA NA RIMS1 46212 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 72683550 72683736 72683643 Y RIMS1 NA NA NA NA NA RIMS1 89144 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 72712491 72712880 72712684 Y RIMS1 NA NA NA NA NA RIMS1 118085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 64303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 74585822 74585900 74585861 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 182314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 74779845 74780097 74779933 Y NA NA COL12A1,CD109 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 376337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 74785141 74785313 74785227 Y NA NA COL12A1,CD109 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 381633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 74861347 74861685 74861516 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 457839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 75325664 75325910 75325787 Y NA NA CD109,COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL12A1 587857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 75853490 75853812 75853630 Y COL12A1 NA NA NA NA NA COL12A1 59955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 75906514 75906841 75906796 Y NA COL12A1 NA NA NA NA COL12A1 6926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 75914223 75914620 75914578 Y COL12A1 COL12A1,COX7A2 NA NA NA NA COL12A1 456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 75997264 75997445 75997280 Y NA COX7A2,TMEM30A NA NA NA NA TMEM30A 4580 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 79748011 79748153 79748082 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 37800 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 83590354 83590694 83590676 Y NA NA NA NA NA NA DOPEY1 184691 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 84917634 84917758 84917696 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 17595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 85705228 85705597 85705413 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 232991 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr6 86174491 86174911 86174693 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 16682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 88499265 88499658 88499500 Y AKIRIN2 NA ORC3 IMR90 Hi-C 24141950 AKIRIN2 89338 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 89744158 89744669 89744587 Y UBE2J1,RRAGD,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 43801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr6 89758081 89758394 89758222 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 30076 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 90619987 90620233 90620110 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 82374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 90695509 90695956 90695679 Y BACH2,BACH2 NA NA NA NA NA CASP8AP2 157896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 90820775 90820949 90820871 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 183678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 90914790 90915015 90914903 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 89612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 90983807 90984597 90984358 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 20030 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 91078844 91079184 91078980 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BACH2 74217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 91320632 91321099 91320814 Y MAP3K7,MAP3K7 MAP3K7 NA NA NA NA MAP3K7 25868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 91655857 91655883 91655870 Y MAP3K7,MAP3K7 NA NA NA NA NA MAP3K7 361093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 93381785 93382032 93381909 Y NA RP11-127B16.1 NA NA NA NA RP11-127B16.1 49515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 94860177 94860339 94860258 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 732912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 101862927 101863147 101863037 Y NA GRIK2 NA NA NA NA GRIK2 18263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 104462253 104462528 104462438 Y NA NA NA NA NA NA HACE1 843266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 105540278 105540291 105540285 Y HACE1,LIN28B NA NA NA NA NA HACE1 234484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 105907845 105908047 105907966 Y NA NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 58886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106048262 106048533 106048347 Y NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 199303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 106217867 106218170 106217999 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 314025 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106327703 106328607 106328107 Y PRDM1 NA ATG5,PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 203588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106369673 106369731 106369703 Y PRDM1 NA ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 162464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr6 106389460 106389820 106389604 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 142375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106412802 106413161 106413018 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 119034 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106442778 106443178 106442990 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 89017 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 106511410 106511721 106511566 Y NA PRDM1 ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 20474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 106532439 106532606 106532449 Y PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 106537985 106538349 106538117 Y PRDM1,PRDM1 PRDM1 NA NA NA NA PRDM1 5790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 108019411 108019664 108019473 Y NA NA NA NA NA NA SOBP 210249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 108951509 108952142 108951722 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 72471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 109059217 109059645 109059338 Y FOXO3 NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 107974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 110094407 110094557 110094483 Y NA NA NA NA NA NA FIG4 83908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 110415658 110415810 110415734 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 83397 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 110858540 110858785 110858603 Y NA NA AMD1,RPF2,GTF3C6,CDK19,SLC16A10 IMR90 Hi-C 24141950 DDO 123775 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 110938341 110938479 110938410 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 NA NA NA NA NA CDK19 196682 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 111748625 111749047 111748803 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 53667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 111925507 111925888 111925538 Y REV3L,TRAF3IP2 TRAF3IP2 NA NA NA NA TRAF3IP2 26 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 112097804 112098263 112098017 Y NA NA NA NA NA NA FYN 94392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112110533 112110931 112110911 Y NA NA NA NA NA NA FYN 81724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112116190 112116657 112116390 Y NA NA NA NA NA NA FYN 75998 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112145008 112145393 112145362 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 47262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112335734 112335952 112335843 Y NA NA FYN,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 70780 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112356617 112357007 112356811 Y TRAF3IP2 TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 49725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112358882 112359559 112359206 Y TRAF3IP2 TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 47173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 112570641 112571001 112570894 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 3140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113505450 113505765 113505678 Y NA NA FLJ34503,MARCKS,HDAC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 463511 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 295281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113770240 113770449 113770392 Y MARCKS NA MARCKS,FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 198827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113951649 113952852 113952545 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 16424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113966016 113966399 113966296 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113966975 113967088 113966980 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 2188 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 6363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 114167209 114167452 114167327 Y MARCKS MARCKS NA NA NA NA MARCKS 9089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 116706605 116706866 116706798 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 107539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 116707738 116708095 116707832 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 108672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 116708579 116708861 116708730 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109513 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 116767554 116767785 116767590 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA FAM26E 63024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 117722961 117723078 117723022 Y ROS1 ROS1,DCBLD1 NA NA NA NA ROS1 21940 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 117761832 117762028 117761987 Y NA ROS1,DCBLD1 DCBLD1,GOPC IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 10952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 118241546 118241910 118241839 Y NA SLC35F1 NA NA NA NA SLC35F1 14857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 119131601 119131904 119131835 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 NA NA NA NA NA ASF1A 81480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 119366243 119366474 119366359 Y NA NA NA NA NA NA FAM184A 102078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 119477899 119478044 119477972 Y NA FAM184A NA NA NA NA FAM184A 9347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 119523776 119524187 119523976 Y FAM184A NA NA NA NA NA FAM184A 55224 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 119896932 119897123 119897095 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 228006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr6 120445667 120446036 120445852 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 776741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 121843500 121843932 121843669 Y GJA1 NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 70233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1,PKIB NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 126112858 126113033 126112985 Y TRMT11,HINT3,NCOA7 NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 12551 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 127436334 127436441 127436391 Y RNF146 RSPO3 TRMT11,RSPO3 IMR90 Hi-C 24141950 RSPO3 1308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 127481688 127482073 127481881 Y RNF146,C6orf174,RSPO3 RSPO3 NA NA NA NA RSPO3 43939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA SOGA3 142728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA SOGA3 143192 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 128830157 128830356 128830243 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 9514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 129816833 129816992 129816913 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 212378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 130030425 130030727 130030721 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 1055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 133070302 133070479 133070392 Y STX7,VNN2,VNN2,VNN2 VNN1,VNN3,VNN2 NA NA NA NA VNN2 12119 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA EYA4 279447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 331043 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 134669516 134669878 134669820 Y NA SGK1 SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 32266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 134679459 134679725 134679553 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 42209 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 134840674 134840895 134840768 Y SGK1,SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 203424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 135344059 135344242 135344151 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 77952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 179293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 135647254 135647460 135647355 Y MYB,AHI1 NA NA NA NA NA LINC00271 169029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 135707385 135707414 135707388 Y NA NA NA NA NA NA LINC00271 109075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 135859214 135859375 135859362 Y PDE7B LINC00271,AHI1 NA NA NA NA AHI1 42300 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 136133495 136133602 136133548 Y NA PDE7B PDE7B,LINC00271 IMR90 Hi-C 24141950 PDE7B 37232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 136227219 136227382 136227241 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 56385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 136293369 136293422 136293396 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 122535 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 136372344 136372809 136372483 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 201510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 136390405 136390550 136390494 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 218439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 136492327 136492682 136492505 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 116307 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 136528020 136528260 136528195 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 80729 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 136912004 136912367 136912204 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 42047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 137109342 137109643 137109396 Y IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5 MAP3K5,PEX7 NA NA NA NA MAP3K5 2013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 137517813 137517908 137517861 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 20678 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 137538142 137538256 137538167 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 330 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 137545116 137545441 137545236 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 6530 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 137558650 137558845 137558763 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 20064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 137558937 137559207 137559098 Y NA IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 20351 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 138049891 138050457 138050087 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 135894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 138053118 138053503 138053361 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 132848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138053751 138053959 138053916 Y PBOV1,TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 132392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 138133089 138133355 138133227 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 52996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 138231733 138231922 138231805 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 45382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138291437 138291772 138291605 Y PBOV1 NA NA NA NA NA TNFAIP3 105086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC28A 178098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 139656661 139656994 139656829 Y NA TXLNB,CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 36763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 139697079 139697371 139697327 Y NA CITED2 NA NA NA NA CITED2 3322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 139861409 139861802 139861629 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 139909356 139909574 139909434 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 215599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 140299062 140299512 140299364 Y NA NA CITED2,HECA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 605305 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr6 140361637 140361784 140361751 Y NA NA CITED2,TXLNB,HECA,LOC645434,LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 667880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 140400470 140400745 140400517 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 706713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143154152 143154557 143154355 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 109781 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143178456 143178847 143178800 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 85491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 143192899 143193375 143193200 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 70963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr6 143223836 143224147 143224035 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 40191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr6 143248323 143248614 143248469 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 15724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143516746 143517148 143516792 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 137113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 143994840 143994998 143994919 Y NA NA NA NA NA NA RP3-468K18.5 131231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA NA UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 TPT1P4 67149 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 146866760 146867250 146866919 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 3931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 147217441 147217852 147217780 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 305709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 148822303 148822649 148822378 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 230863 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 148879188 148879351 148879251 Y NA NA NA NA NA NA UST 187113 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 151178145 151178545 151178467 Y MTHFD1L MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 6140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 151990047 151990437 151990162 Y NA NA ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf211 218625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 152492317 152492580 152492431 Y SYNE1 NA NA NA NA NA SYNE1 464356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 155306251 155306499 155306375 Y TIAM2 NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 154420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 155739222 155739872 155739692 Y CLDN20 NA NA NA NA NA TFB1M 105595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 155850166 155850642 155850364 Y NA NA NA NA NA NA TFB1M 216539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 157097774 157098131 157097933 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr6 157137665 157137911 157137871 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 40602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 157297453 157297730 157297519 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 200390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 157639062 157639495 157639253 Y C6orf35 NA NA NA NA NA TMEM242 103138 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 158463343 158463878 158463391 Y SNX9,SYNJ2 NA NA NA NA NA SYNJ2 62455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 158595666 158595874 158595793 Y NA SERAC1,GTF2H5 NA NA NA NA GTF2H5 8282 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 160083070 160083297 160083182 Y NA NA NA NA NA NA WTAP 61320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr6 160137124 160138386 160137829 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 6231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 160374399 160374641 160374517 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R IGF2R,TCP1,MRPL18 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 13490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 160395204 160395414 160395271 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 7073 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 160402732 160403272 160403091 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 14601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 160411002 160411087 160411045 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1 IGF2R NA NA NA NA IGF2R 22871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 160699946 160700334 160700305 Y LPA RP1-276N6.2,SLC22A2 NA NA NA NA SLC22A2 3276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr6 161394419 161394560 161394490 Y NA MAP3K4 AGPAT4,MAP3K4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K4 16199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 161838884 161839117 161839007 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 145791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 161855973 161856365 161856002 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 163098494 163098513 163098505 Y PARK2,PACRG,PACRG PARK2 NA NA NA NA PARK2 48290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 163775171 163775345 163775277 Y QKI NA NA NA NA NA CAHM 57647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 163817744 163818245 163818151 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA CAHM 14747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 163976539 163976874 163976679 Y NA NA NA NA NA NA QKI 143507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 164088799 164089067 164088975 Y QKI NA NA NA NA NA QKI 255767 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 164535814 164535945 164535880 Y NA NA NA NA NA NA QKI 702782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 164758879 164759308 164759212 Y NA NA PARK2,DKFZp451B082,PACRG IMR90 Hi-C 24141950 QKI 925847 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr6 166077084 166077462 166077274 Y PDE10A,PDE10A NA NA NA NA NA PDE10A 320629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 166121234 166121494 166121453 Y NA NA PDE10A IMR90 Hi-C 24141950 PDE10A 276597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 22766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 166672303 166672771 166672615 Y NA PRR18 NA NA NA NA PRR18 47165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 166970262 166970784 166970543 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 216183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 167001220 167001407 167001338 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 247141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 167038809 167038976 167038893 Y RPS6KA2 NA NA NA NA NA RPS6KA2 278963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 167043156 167043511 167043367 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 274428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 167150244 167150530 167150439 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 167409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 168408262 168408655 168408498 Y NA NA SMOC2,KIF25 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 182660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 168533513 168533636 168533561 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 307911 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 168558082 168558596 168558447 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 332480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 168813720 168814071 168813897 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 588118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.65881380013276 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 251753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 169556642 169556776 169556709 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 4243 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 169568038 169568505 169568172 Y NA RP11-417E7.1 C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 7019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA RP11-417E7.1 WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 27461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr6 170364764 170365251 170365177 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 TCTE3 215109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 170449336 170449548 170449442 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 148013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57147 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C AC093627.10,FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 309 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 AC093627.12 180914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 555332 555565 555456 Y GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 2368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 556288 556672 556400 Y LOC100288524,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 1261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 1500451 1500958 1500750 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA AC102953.4 2878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 1706379 1706695 1706444 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908,PSMG3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC074389.9 73232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2569438 2569603 2569498 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2657383 2657705 2657445 Y IQCE,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11880 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2673416 2673872 2673677 Y NA TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 3831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 2729556 2729797 2729642 Y LFNG,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA TTYH3 59971 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2738537 2739051 2738765 Y LFNG,CARD11 NA GNA12 IMR90 Hi-C 24141950 TTYH3 68952 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr7 3307587 3307977 3307629 Y NA SDK1 SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 SDK1 31103 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 7268746 7268912 7268835 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 74181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 8663784 8663976 8663856 Y NXPH1 NA NA NA NA NA NXPH1 192199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 11211603 11211773 11211701 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 200104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 12297328 12297575 12297487 Y ARL4A TMEM106B NA NA NA NA TMEM106B 48461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 12759260 12759464 12759402 Y NA ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34779 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 13021746 13022072 13021909 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 297265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 13057101 13057487 13057331 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 332620 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 13592138 13592417 13592278 Y NA NA DGKB IMR90 Hi-C 24141950 ETV1 436633 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 306321 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 17314276 17314419 17314335 Y AHR AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AHR 21827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 17360383 17360757 17360401 Y NA AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AC003075.4 23402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 17402534 17402650 17402592 Y NA NA NA NA NA NA AC003075.4 65553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 17721637 17721811 17721724 Y NA NA HDAC9,AGR2,AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 256313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 18357088 18357290 18357157 Y SNX13 NA NA NA NA NA HDAC9 232516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 18611788 18612131 18611882 Y HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 487216 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 18865089 18865093 18865091 Y HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA HDAC9 740517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 19017733 19017917 19017790 Y TWIST1 NA NA NA NA NA TWISTNB 728793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB NA NA NA NA NA ITGB8 128935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 20263019 20263230 20263186 Y NA NA ITGB8 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 105095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 20330382 20330655 20330511 Y NA ITGB8 TMEM196,MACC1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 37670 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 20582388 20582432 20582424 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 214063 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 22130088 22130317 22130208 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 146386 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 22609345 22610034 22609690 Y IL6 AC002480.4 NA NA NA NA AC002480.4 17290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 22616988 22617783 22617407 Y IL6 AC002480.4 NA NA NA NA AC002480.4 9541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 22626962 22627257 22627168 Y NA AC002480.4,STEAP1B NA NA NA NA AC002480.4 67 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 22640948 22641489 22641159 Y IL6 AC002480.4,STEAP1B LOC100506178,IL6,KLHL7 IMR90 Hi-C 24141950 AC002480.4 13624 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 22687053 22687419 22687223 Y IL6 STEAP1B LOC100506178,SNORD93,TOMM7,IL6,FAM126A IMR90 Hi-C 24141950 STEAP1B 16509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 22757674 22758207 22757934 Y NA IL6,AC073072.5 NA NA NA NA IL6 5296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 22762845 22763243 22763158 Y IL6 IL6,AC073072.5 NA NA NA NA IL6 260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 22851635 22851773 22851763 Y NA TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA TOMM7 8697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 23289024 23289054 23289046 Y NA GPNMB NA NA NA NA GPNMB 15438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 24818395 24818855 24818677 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 11151 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 24963944 24964392 24964187 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 54861 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 25002827 25003181 25002973 Y C7orf31,OSBPL3 OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 16072 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 25886406 25886699 25886443 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,HOXA3,HOXA4,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 NFE2L3 303161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 28122864 28123088 28122980 Y NA NA NA NA NA NA JAZF1 95274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 28127846 28128022 28127898 Y NA NA NA NA NA NA JAZF1 90340 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 28239024 28239196 28239110 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 20662 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 28398288 28398440 28398364 Y NA NA NA NA NA NA CREB5 61348 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 28823277 28823529 28823406 Y NA NA NA NA NA NA CHN2 336361 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 29217860 29218383 29218096 Y CHN2,CPVL CPVL CHN2 IMR90 Hi-C 24141950 CPVL 14684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 29288404 29288769 29288539 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 55337 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 29310713 29310833 29310750 Y NA NA NA NA NA NA CPVL 77646 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 29628381 29628403 29628392 Y NA AC007255.8 NA NA NA NA AC007255.8 27095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 30264220 30264659 30264440 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 57264 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 31923409 31923701 31923603 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 413240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 309791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 32289957 32290285 32290103 Y NA PDE1C NA NA NA NA PDE1C 46656 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 34026970 34027411 34027080 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 84447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 34135793 34136189 34135904 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 193270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr7 34173056 34173436 34173156 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 230533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 34175041 34175328 34175241 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 232518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 34316740 34316919 34316850 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 374217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 34394594 34394965 34394781 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 452071 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.55097471674411 chr7 36698240 36698520 36698401 Y AOAH NA NA NA NA NA KIAA0895 270506 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 36785983 36786266 36786088 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 358249 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 36787255 36787404 36787327 Y NA NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 359521 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 36787487 36788062 36787733 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 359753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 36903591 36903813 36903689 Y AOAH,ELMO1 NA NA NA NA NA KIAA0895 475857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 37071492 37071821 37071657 Y AOAH,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 415031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 37729641 37730111 37730020 Y GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1 EPDR1 NA NA NA NA EPDR1 8195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 37866533 37866785 37866612 Y NA NA NA NA NA NA EPDR1 145087 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 38696707 38696840 38696781 Y STARD3NL AMPH AMPH IMR90 Hi-C 24141950 AMPH 27540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 39115268 39115275 39115272 Y NA NA NA NA NA NA VPS41 145274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 39632170 39632581 39632314 Y RALA YAE1D1,AC004837.3,RALA NA NA NA NA AC004837.3 14735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 39641991 39642218 39642176 Y RALA YAE1D1,AC004837.3,RALA LINC00265 IMR90 Hi-C 24141950 AC004837.3 5098 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 40585377 40585721 40585560 Y NA AC004988.1 NA NA NA NA AC004988.1 850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 40591236 40591497 40591392 Y NA AC004988.1 NA NA NA NA AC004988.1 6709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 40611677 40611985 40611889 Y NA AC004988.1 NA NA NA NA AC004988.1 27150 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 40755655 40755948 40755803 Y NA NA NA NA NA NA AC004988.1 171128 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41025919 41026252 41026112 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 AC004988.1 441392 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41136491 41136863 41136697 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 AC004988.1 551964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 41738328 41738691 41738507 Y INHBA INHBA NA NA NA NA INHBA 2015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41919848 41920138 41920006 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 179142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41924805 41925034 41925028 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 184099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41926602 41926763 41926636 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 185896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 41927130 41927355 41927263 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 186424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 41951393 41951863 41951630 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 210687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43608248 43608485 43608352 Y NA STK17A NA NA NA NA STK17A 11872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43625293 43625372 43625313 Y URGCP,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 4936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43796405 43796790 43796474 Y BLVRA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 44127636 44127736 44127679 Y YKT6,AEBP1 DBNL,POLM,POLD2 PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B IMR90 Hi-C 24141950 POLM 7497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 44775082 44775384 44775244 Y OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2 ZMIZ2 DDX56,TMED4,OGDH,PPIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ2 10796 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 45040907 45041213 45041027 Y DDX56,OGDH,MYO1G,CCM2 SNHG15,CCM2 NA NA NA NA CCM2 3833 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 45963987 45964294 45964096 Y NA IGFBP3 NA NA NA NA IGFBP3 4514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 46186122 46186484 46186177 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 226649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 46186512 46186858 46186578 Y IGFBP3 NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP3 227039 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 47037255 47037600 47037428 Y NA AC004870.4 NA NA NA NA AC004870.4 29955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 285909 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47390589 47390737 47390670 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 229419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr7 47518819 47519136 47519085 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 101020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 47553531 47553930 47553845 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 66226 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47554592 47554957 47554775 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 65199 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47559918 47560313 47560101 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 59843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 47641076 47641289 47641172 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 20920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 47644474 47644665 47644612 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 24318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 47645534 47645685 47645627 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 25378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 47688297 47688502 47688400 Y NA NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 68141 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 86477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA NA NA NA NA NA FIGNL1 150763 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 53557235 53557239 53557237 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 125484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 55063452 55063479 55063466 Y NA EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 21235 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 55436942 55437154 55437048 Y NA LANCL2 NA NA NA NA LANCL2 5801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 55506510 55507071 55506539 Y NA NA NA NA NA NA LANCL2 75369 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA ZNF716 NA NA NA NA ZNF716 35912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA ZNF716 131440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 65715824 65716062 65715909 Y RABGEF1,KCTD7 TPST1 NA NA NA NA TPST1 47638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 65746929 65747210 65746989 Y RABGEF1,KCTD7 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 78743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 65761130 65761447 65761274 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 92944 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 66159622 66159870 66159746 Y NA RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 14471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 70937935 70938309 70938174 Y NA NA NA NA NA NA GS1-111G14.1 466935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 71336027 71336353 71336220 Y CALN1 NA NA NA NA NA GS1-111G14.1 68891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 73132412 73132545 73132481 Y LAT2,BCL7B WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 73686776 73686884 73686792 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 73702546 73702842 73702658 Y NA RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75247024 75247489 75247190 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 91546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 CCL26,RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75479654 75479859 75479743 Y POR RHBDD2,POR HIP1,STYXL1,CCL24,POR,CCL26,RHBDD2,TMEM120A,MDH2 IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 9734 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75599122 75599360 75599199 Y NA TMEM120A NA NA NA NA TMEM120A 22617 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75926781 75926853 75926816 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 3008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA ZP3 NA NA NA NA ZP3 27857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 77039475 77039927 77039691 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 124665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 77199277 77199536 77199359 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 34685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 78947044 78947146 78947095 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 133052 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 79050066 79050245 79050154 Y MAGI2 MAGI2-AS3,MAGI2 NA NA NA NA MAGI2-AS3 29953 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 80270298 80270436 80270331 Y CD36 NA NA NA NA NA CD36 273407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 80571600 80571811 80571745 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 21925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163922 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 HGF 163603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 86601476 86601934 86601661 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 85081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 87918906 87919150 87919043 Y SRI STEAP4 NA NA NA NA STEAP4 15056 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 89852350 89852687 89852439 Y NA C7orf63 NA NA NA NA C7orf63 19801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 90711391 90711663 90711528 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 180120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 91142488 91142502 91142497 Y MTERF NA NA NA NA NA FZD1 250705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92053507 92053858 92053662 Y NA GATAD1 GATAD1,ANKIB1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GATAD1 20909 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92261903 92262272 92262087 Y CDK6,CDK6 FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 44195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92279692 92280069 92279965 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 61984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 162543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA CASD1 114586 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 95129824 95130260 95130025 Y ASB4 NA NA NA NA NA PON2 67314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 95238124 95238400 95238252 Y PON1,PON3 PDK4,AC002451.3 NA NA NA NA AC002451.3 14130 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 97763424 97763629 97763532 Y BRI3,LMTK2 LMTK2 NA NA NA NA LMTK2 29227 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1,PILRA PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PILRA 1118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 99969754 99970252 99970079 Y OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1,PILRA NA NA NA NA PILRA 6601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 100772917 100773243 100773005 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 100809834 100810470 100810178 Y NA SERPINE1,AP1S1,VGF,ZNHIT1,PLOD3 NA NA NA NA VGF 2960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 101377148 101377442 101377338 Y NA NA CUX1,EMID2,SH2B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 79517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr7 101930729 101931104 101930861 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 71215 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 102512857 102513072 102512991 Y NA NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 125439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 36764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 104771248 104771300 104771252 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 119757 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 104854124 104854334 104854271 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 183421 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 105857491 105857771 105857742 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 105922869 105923204 105923197 Y NA NAMPT NA NA NA NA NAMPT 1568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 105998601 105999042 105998811 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 73829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 106061873 106062291 106062158 Y NAMPT,PIK3CG,FLJ36031 NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 137101 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 106062610 106062971 106062823 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 137838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr7 106280912 106281173 106281054 Y NAMPT,PIK3CG AC004917.1,CCDC71L NA NA NA NA AC004917.1 18169 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 106413227 106413352 106413289 Y FLJ36031 RP5-884M6.1 CCDC71L,HBP1,NAMPT,CBLL1,PIK3CG,PRKAR2B IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-884M6.1 105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 108056534 108056914 108056866 Y PNPLA8,DNAJB9 NRCAM NA NA NA NA NRCAM 38247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 108118010 108118358 108118206 Y NA NRCAM NA NA NA NA NRCAM 22849 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 110753766 110754103 110753883 Y LRRN3 NA NA NA NA NA IMMP2L 446470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 110778379 110778523 110778435 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 422050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 111720320 111721594 111721184 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 122872 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 111722371 111722702 111722539 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 121764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 111724432 111725068 111724745 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 119398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 31798 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 116217100 116217359 116217210 Y CAV1,CAV1 NA NA NA NA NA CAV1 54261 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 116624131 116624531 116624374 Y NA ST7,ST7-AS1 NA NA NA NA ST7-AS1 31743 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 116699859 116700243 116700052 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 107471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 119269873 119270211 119270042 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 275218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 261423 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 119300626 119300913 119300840 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 244516 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 119692917 119693243 119693083 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 147488 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 121116174 121116412 121116295 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 81756 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 123283866 123284127 123283979 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 87557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 123284312 123284364 123284338 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 88003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 124419446 124419631 124419539 Y NA NA NA NA NA NA POT1-AS1 148296 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 127663304 127663714 127663503 Y IMPDH1,GCC1,LRRC4 NA NA NA NA NA RBM28 318248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 127857172 127857463 127857244 Y IMPDH1 NA NA NA NA NA RBM28 124499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA MIR29A LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR29A 9931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48245 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130665753 130666114 130665990 Y NA NA NA NA NA NA MIR29A 69684 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130735932 130736596 130736429 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 56259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130756735 130757090 130757043 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 35765 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130875085 130875581 130875276 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 49768 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 130910382 130910723 130910553 Y MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 14626 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 131152589 131152603 131152595 Y NA NA NA NA NA NA PODXL 88373 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PLXNA4 411440 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 132087476 132087865 132087714 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA4 243582 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 132340200 132340344 132340290 Y NA PLXNA4 NA NA NA NA PLXNA4 8753 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134144888 134145050 134144951 Y AKR1B1 AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 2852 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 134378159 134378392 134378229 Y AKR1B1,CALD1 BPGM,CALD1 NA NA NA NA BPGM 48599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134397020 134397253 134397193 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 29750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134422783 134423192 134423006 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 3811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 134469498 134469802 134469635 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 42495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134475089 134475514 134475151 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 48086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 134498976 134499173 134499074 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 71973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 134521262 134521714 134521389 Y NA NA NA NA NA NA CALD1 94259 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 134540961 134541304 134541061 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 113958 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134571220 134571518 134571300 Y NA NA NA NA NA NA AGBL3 97741 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr7 134677531 134677740 134677636 Y AGBL3 AGBL3 NA NA NA NA AGBL3 8272 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 134845913 134846266 134846037 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 7281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 137529511 137529967 137529736 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 154846 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 137646084 137646360 137646126 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 38453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 137715600 137715833 137715719 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 30787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 137942214 137942717 137942409 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 38512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 138035380 138035759 138035568 Y CREB3L2,SVOPL,TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.1 51509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 140880261 140880624 140880319 Y LOC100131199 NA NA NA NA NA MRPS33 167233 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 140947588 140947591 140947590 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 234560 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147,RNU1-82P NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 143589612 143589642 143589628 Y OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A FAM115A NA NA NA NA FAM115A 7649 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 149413428 149413754 149413591 Y NA KRBA1 NA NA NA NA KRBA1 3556 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 150137170 150137441 150137307 Y TMEM176B,GIMAP5,GIMAP8 LINC00996 NA NA NA NA LINC00996 8428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr7 150317630 150317699 150317665 Y NA GIMAP6 NA NA NA NA GIMAP6 9774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 150452624 150452940 150452812 Y GIMAP8,GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,SLC4A2,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542 GIMAP1,GIMAP5,TMEM176A,TMEM176B NA NA NA NA GIMAP5 35283 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 150520183 150520563 150520402 Y REPIN1,ABP1 TMEM176A,TMEM176B NA NA NA NA TMEM176B 23735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 151629318 151629666 151629588 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA PRKAG2,LOC100505483 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRKAG2 57108 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 151823102 151823484 151823293 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 102343 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 153105018 153105427 153105361 Y NA NA NA NA NA NA ACTR3B 650184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 155049368 155049519 155049432 Y NA INSIG1 NA NA NA NA INSIG1 37967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 155744375 155744769 155744531 Y NA AC021218.2 LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC021218.2 8557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA AC021218.2 LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC021218.2 1232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 156409241 156409518 156409427 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA RNF32 21457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 157092515 157093215 157092989 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB6 32860 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 327954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr7 158452829 158453067 158452948 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 42453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 603336 603665 603448 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 82441 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 1693574 1694042 1693752 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,MIR596,KBTBD11,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 1694228 1694696 1694461 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 1736486 1736690 1736554 Y NA CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10 NA NA NA NA CTD-2336O2.1 25818 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 6405382 6405492 6405403 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 143269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 6481206 6481441 6481325 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 82289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 8992774 8993100 8992937 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA PPP1R3B 13984 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 10659261 10659473 10659367 Y NA PINX1 NA NA NA NA PINX1 35921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 10860741 10861140 10860750 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 165347 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 10872577 10873059 10872733 Y XKR6,MTMR9 NA NA NA NA NA PINX1 177183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 10922710 10923064 10922845 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 133811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11001237 11001609 11001584 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 55266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11036366 11036550 11036458 Y MTMR9,XKR6 XKR6 NA NA NA NA XKR6 20325 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 11322764 11323135 11322939 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 7089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11538128 11538263 11538240 Y GATA4 GATA4 GATA4 IMR90 Hi-C 24141950 GATA4 5660 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11562739 11563084 11562994 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 30271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 11734631 11734824 11734746 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 9674 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 12975034 12975328 12975181 Y NA NA NA NA NA NA LONRF1 363452 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 16609902 16609923 16609912 Y VPS37A NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 401615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 16613104 16613477 16613307 Y NA NA TUSC3,MSR1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 398061 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 17194213 17194219 17194216 Y SLC7A2,SLC7A2 NA NA NA NA NA CNOT7 91826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 17583613 17583759 17583634 Y NA NA NA NA NA NA RP11-156K13.1 73095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 17893767 17894158 17893964 Y NAT1,ASAH1,ASAH1 CTD-2547L16.1,ASAH1 NA NA NA NA CTD-2547L16.1 46219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 18424432 18424631 18424532 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 398446 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 18585215 18585382 18585299 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 354858 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 18722659 18722821 18722740 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 217419 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 18768857 18769292 18769046 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 170948 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 18874321 18874582 18874494 Y PSD3 NA NA NA NA NA PSD3 65658 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr8 18884209 18884230 18884220 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 56010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 18951503 18951869 18951728 Y NA PSD3 LOC100128993,CSGALNACT1,INTS10,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 11263 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 19028579 19029034 19028823 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 88339 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 19066932 19067320 19067099 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 101808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 19266409 19266742 19266623 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA SH2D4A 97281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 90255 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA CSGALNACT1 79760 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 19566953 19567512 19567287 Y NA CSGALNACT1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT1 46028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 19576483 19576522 19576494 Y NA CSGALNACT1 CSGALNACT1,SH2D4A,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 CSGALNACT1 37018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 19944306 19944529 19944412 Y ATP6V1B2 NA NA NA NA NA ATP6V1B2 108349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 20055803 20056436 20056187 Y ATP6V1B2 ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 2925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 20167372 20167597 20167485 Y NA LZTS1 ATP6V1B2,LZTS1,SLC18A1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 7898 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 22048643 22048944 22048828 Y DOK2 BMP1 NA NA NA NA BMP1 28394 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr8 22068132 22068339 22068246 Y NA BMP1,MIR320A,POLR3D NA NA NA NA MIR320A 32217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22227261 22227593 22227504 Y SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 4499 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22301187 22301546 22301465 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22573211 22573477 22573404 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 24396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 11189 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 23203813 23204244 23204131 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 78180 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr8 23210314 23210863 23210698 Y NA NA NA NA NA NA R3HCC1 84681 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 23308133 23308499 23308237 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 ENTPD4 NA NA NA NA ENTPD4 4709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 23390028 23390384 23390041 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 5710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 23397982 23398147 23398067 Y TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 13664 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 23401814 23402175 23401976 Y TNFRSF10B SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 17496 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 23405243 23405645 23405476 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 20925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 23832365 23832575 23832443 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-148P 100096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 25059177 25059384 25059268 Y DOCK5 DOCK5 NA NA NA NA DOCK5 18939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 25092167 25092564 25092364 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 51929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 25133664 25134104 25133793 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 93426 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 28637206 28637596 28637433 Y EXTL3,KIF13B NA NA NA NA NA EXTL3-AS1 80225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29204481 29204724 29204678 Y NA DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 1461 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29316675 29316889 29316765 Y KIF13B,DUSP4 NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 110490 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29357586 29357867 29357737 Y KIF13B NA LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 151401 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 29595040 29595214 29595121 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4,TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA NA TMEM66 343509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 29631359 29631483 29631421 Y DUSP4 NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 307240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 29631647 29631969 29631808 Y NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 306754 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 29705863 29706038 29705974 Y MBOAT4 NA NA NA NA NA TMEM66 232685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 32191944 32192171 32192069 Y NRG1 NA NA NA NA NA NRG1 697042 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 32572764 32572916 32572840 Y NA NA NA NA NA NA FUT10 756024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chr8 36136186 36136422 36136302 Y NA NA NA NA NA NA RP11-962G15.1 498260 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 367645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 37678678 37679141 37678937 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 26281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 37679848 37680132 37679943 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 25290 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 37929132 37929304 37929218 Y NA EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 31456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38216773 38217155 38217067 Y WHSC1L1,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA WHSC1L1 20635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38384926 38385302 38385064 Y HTRA4,TACC1,PLEKHA2,C8orf86 NA NA NA NA NA FGFR1 60574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38791407 38791790 38791499 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 34654 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 IDO1 515705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr8 42270426 42270603 42270558 Y NA VDAC3 NA NA NA NA VDAC3 23284 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 221418 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 269485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 224269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 214438 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 48581816 48581989 48581954 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 67659 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 48814148 48814416 48814291 Y NA NA NA NA NA NA PRKDC 56327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 49215627 49215840 49215734 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 79310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 49229155 49229573 49229245 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 65577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 49321087 49321473 49321210 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25937 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 49321645 49321846 49321764 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 26495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 49321878 49322114 49322046 Y NA RPL29P19 SNAI2,MCM4,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 26728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 49448389 49448771 49448580 Y NA NA SNAI2,MCM4,UBE2V2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 153239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 49467466 49467648 49467542 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 172316 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 49835974 49836286 49836197 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 3675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 50653553 50653944 50653741 Y NA NA NA NA NA NA C8orf22 688683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA C8orf22 1004033 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr8 54256811 54256964 54256882 Y NA NA NA NA NA NA RP11-400K9.4 177527 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 54720057 54720661 54720376 Y ATP6V1H,ATP6V1H ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA ATP6V1H 33457 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 55065365 55066496 55065716 Y ATP6V1H,ATP6V1H MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 19595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 56791431 56791783 56791438 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 1059 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 56903187 56904166 56903812 Y LYN NA NA NA NA NA SNORD54 80294 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 56916302 56916441 56916350 Y LYN NA NA NA NA NA SNORD54 68019 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 58774570 58774942 58774736 Y NA NA NA NA NA NA FAM110B 130126 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 59529081 59529390 59529262 Y SDCBP NSMAF NA NA NA NA NSMAF 41013 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 59713339 59713715 59713527 Y TOX RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 11396 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RNU4-50P 234385 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 61819241 61819611 61819429 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 229904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 62146139 62146518 62146329 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 478637 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 63934936 63935021 63934979 Y NA GGH NA NA NA NA GGH 14709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 63945359 63945546 63945425 Y YTHDF3 GGH NA NA NA NA GGH 4184 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 65716004 65716285 65716147 Y NA CYP7B1 NA NA NA NA CYP7B1 6686 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 66738971 66739362 66739211 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 13195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 66742209 66742357 66742281 Y NA PDE7A NA NA NA NA PDE7A 10200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 13095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 67045701 67045983 67045786 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 22799 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA RRS1 80555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 67424340 67424761 67424541 Y C8orf45 NA NA NA NA NA RRS1 85077 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 67435383 67435523 67435453 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 88959 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 67454365 67454567 67454497 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 69915 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 68418389 68418528 68418467 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 164477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 90572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 69765670 69765946 69765808 Y NA RP11-865I6.2 SULF1,C8orf34,LOC100505718 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-865I6.2 2672 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 69837388 69837920 69837570 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 74390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 69879881 69880245 69880105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 116883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 69902361 69902629 69902513 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 139363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 70033144 70033349 70033247 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 270146 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA RP11-865I6.2 279380 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 71968659 71968838 71968749 Y NA NA NA NA NA NA LACTB2 389250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 72741414 72742172 72741688 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 3012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 72743005 72743258 72743225 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 4603 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 5100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.87743679186028 chr8 72745133 72745517 72745318 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 6731 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 72752786 72752941 72752932 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 1762 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 72757668 72757969 72757918 Y MSC RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA MSC 2965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 72836370 72836680 72836477 Y NA NA NA NA NA NA MSC 81667 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 72839217 72839615 72839291 Y NA NA NA NA NA NA MSC 84514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 105543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.10783908338865 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 67830 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 72947235 72947530 72947318 Y NA TRPA1 NA NA NA NA TRPA1 38322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 73492870 73493054 73492949 Y NA KCNB2 NA NA NA NA KCNB2 45244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 73690966 73691186 73691160 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 100789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 74276592 74276996 74276782 Y C8orf84,RDH10 NA STAU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 70568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 74432524 74433240 74432853 Y C8orf84,RDH10 NA NA NA NA NA STAU2 224703 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 74792402 74792821 74792506 Y NA UBE2W,GYG1P1 NA NA NA NA UBE2W 3257 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 75179617 75179845 75179716 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 51520 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 75221301 75221616 75221459 Y NA GDAP1,JPH1 NA NA NA NA GDAP1 9749 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 75494116 75494334 75494225 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 20145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 80032626 80032752 80032689 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1114I9.1 175200 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 80216218 80216356 80216290 Y NA RP11-1114I9.1 NA NA NA NA RP11-1114I9.1 8266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 81776862 81777324 81777099 Y PAG1,ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 244979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 81933989 81934508 81934361 Y NA NA NA NA NA NA PAG1 87795 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 81938706 81938999 81938911 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 83304 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 81962809 81963138 81963038 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 59165 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 81993720 81993926 81993821 Y PAG1 PAG1 NA NA NA NA PAG1 28377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 82019096 82019493 82019305 Y PAG1 PAG1,RP11-1149M10.2 NA NA NA NA PAG1 2810 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 82263227 82263471 82263347 Y NA NA NA NA NA NA FABP5 72629 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 86168048 86168180 86168124 Y NA C8orf59,CA13 NA NA NA NA CA13 37232 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 91479808 91480381 91480048 Y NA NA NA NA NA NA TMEM64 321479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 93086953 93087351 93087249 Y NA RUNX1T1 NA NA NA NA RUNX1T1 26163 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 94410297 94410678 94410357 Y NA NA NA NA NA NA FAM92A1 298111 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 94850124 94850307 94850200 Y PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 94850724 94850939 94850832 Y GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17096 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 94892570 94892797 94892694 Y NA PDP1 TMEM67,PDP1,MIR378D2 IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 24535 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 94950843 94950973 94950908 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 82808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 94971751 94971853 94971800 Y GEM NA RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDP1 103716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 96960626 96960710 96960668 Y NA NA NA NA NA NA UQCRB 285152 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 97319675 97319761 97319753 Y NA MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 47732 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 97801629 97801768 97801699 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 298050 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 97866979 97867264 97866987 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 363400 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 97921730 97922056 97921913 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL5 366120 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 100803946 100804239 100804046 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 100051 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 102149452 102149813 102149564 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 103741796 103742226 103742065 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1732A1.1 73519 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr8 103743323 103743460 103743418 Y NA NA KLF10 IMR90 Hi-C 24141950 KB-1732A1.1 72285 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 103757592 103757997 103757773 Y NA NA KLF10,UBR5 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 57748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 13972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA KB-1732A1.1 NA NA NA NA KB-1732A1.1 6885 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 104134901 104135154 104135028 Y BAALC NA NA NA NA NA ATP6V1C1 103610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 104196928 104197190 104197047 Y AZIN1,DCAF13 NA NA NA NA NA FZD6 111471 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 104197283 104197454 104197448 Y NA NA NA NA NA NA FZD6 111207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 104406173 104406574 104406390 Y NA CTHRC1,DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA DCAF13 18368 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 105373466 105373825 105373604 Y LRP12,TM7SF4 NA NA NA NA NA LRP12 225427 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 105655226 105655568 105655399 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 55974 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 105760007 105760242 105760125 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 160755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 106172584 106172814 106172681 Y NA NA ZFPM2 IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM2 156106 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA ZFPM2 253244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 108452941 108453080 108453009 Y NA NA NA NA NA NA ANGPT1 55203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 110589431 110589605 110589518 Y NA EBAG9 NA NA NA NA EBAG9 39491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 113558737 113559137 113558937 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 827761 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 114058689 114058941 114058782 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 327957 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 116474696 116474834 116474765 Y NA NA NA NA NA NA TRPS1 345065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 116507305 116507631 116507503 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 312268 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 117049380 117049760 117049565 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 229481 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 117510988 117511103 117511046 Y NA NA NA NA NA NA RP11-536K17.1 96993 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA RP11-536K17.1 115769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 117664096 117664364 117664167 Y RAD21 NA NA NA NA NA UTP23 112378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 119049251 119049636 119049444 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 72456 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 119443463 119443781 119443622 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 188453 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 119808728 119809168 119808881 Y TNFRSF11B NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 153271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr8 119917519 119917835 119917587 Y NA TNFRSF11B NA NA NA NA TNFRSF11B 44604 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 120063756 120064086 120063927 Y NA NA SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 101317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR COL14A1 DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 COL14A1 22869 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 121619256 121619602 121619580 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 163614 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 121737162 121737328 121737239 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 86185 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 121839869 121840146 121840008 Y NA SNTB1 SNTB1 IMR90 Hi-C 24141950 SNTB1 16356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 122335950 122336427 122336136 Y NA NA HAS2,HAS2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 315203 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 123106451 123106468 123106460 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-94A24.1 332322 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 123882951 123883328 123883140 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 91318 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 123883965 123883977 123883971 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 92332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 124337288 124337362 124337325 Y NA NA NA NA NA NA ZHX1 51507 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 124934433 124934622 124934528 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 155737 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 125193673 125194016 125193878 Y NA ARF1P3 TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1,TRMT12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 31509 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 125282085 125282316 125282201 Y NA RP11-383J24.1 FAM91A1,TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 161 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 20536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr8 125304968 125305098 125305033 Y NA RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 23044 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 125466570 125466668 125466619 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 5522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 125606714 125607135 125606910 Y ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA TATDN1 57015 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 125638890 125639286 125639200 Y NSMCE2 NA NA NA NA NA TATDN1 89191 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 125656235 125656588 125656492 Y ZNF572,RNF139,MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 82142 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 125878645 125879203 125878949 Y RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196 NA MTSS1,NDUFB9,TATDN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1082L8.4 52721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126187682 126188060 126187888 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA NA NA NA NA KIAA0196 85600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126232175 126232753 126232302 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126322031 126322772 126322054 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 117791 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 126372255 126372562 126372409 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 68001 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126525260 126525748 126525427 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 84697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 126649729 126649959 126649891 Y TRIB1 NA NSMCE2,KIAA0196,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 209166 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 479436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128182729 128182789 128182759 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 562891 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 128988975 128989172 128989023 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 31685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 129279863 129280046 129279972 Y NA NA MYC,MIR1208 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-25P 259006 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 129527030 129527320 129527153 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 506173 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 130577240 130577439 130577294 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 219695 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 130996669 130996803 130996748 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30572 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 131089372 131089764 131089568 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 61997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 131206055 131206375 131206165 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 178680 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 188477 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 131526952 131527117 131527035 Y NA NA ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 73046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 132826560 132827195 132826776 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 87140 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr8 132839746 132840116 132840009 Y NA NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 74219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 132868655 132869774 132869195 Y EFR3A EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 44561 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 132870393 132870759 132870576 Y HHLA1 EFR3A ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 43576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 133220166 133220184 133220177 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 305831 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 133689212 133689471 133689356 Y PHF20L1 LRRC6 NA NA NA NA LRRC6 3374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 133780870 133781061 133780972 Y TMEM71,PHF20L1 TMEM71,PHF20L1 TMEM71,PHF20L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHF20L1 4557 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134103972 134104984 134104568 Y ST3GAL1,TG,SLA NA NA NA NA NA WISP1 96298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr8 134104989 134105333 134105063 Y ST3GAL1,TG NA NA NA NA NA WISP1 95949 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134142239 134142509 134142325 Y NA NA NA NA NA NA WISP1 58773 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134143122 134143607 134143263 Y ST3GAL1,NDRG1,PHF20L1 NA NA NA NA NA WISP1 57675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr8 134230111 134230161 134230154 Y ST3GAL1 WISP1 NA NA NA NA WISP1 28829 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134287657 134287800 134287798 Y NA NDRG1,CTC-458A3.1 NA NA NA NA NDRG1 24465 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134532639 134533046 134532970 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 49137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134552406 134552812 134552641 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 29371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134592913 134593176 134593079 Y ST3GAL1 ST3GAL1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 10730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 134911440 134912130 134911799 Y ST3GAL1 RP11-157E21.1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-157E21.1 14701 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT NA ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFAT 120293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 141454964 141454973 141454969 Y NA TRAPPC9 NA NA NA NA TRAPPC9 11705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 141555144 141555348 141555233 Y EIF2C2,CHRAC1 CHRAC1 NA NA NA NA CHRAC1 35747 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 142128241 142128488 142128412 Y NA DENND3 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 2864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3 NA NA NA NA DENND3 38363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 143757526 143757895 143757616 Y NA JRK NA NA NA NA JRK 3491 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 144609980 144610203 144610126 Y NA ZC3H3,GSDMD,NAPRT1 NA NA NA NA ZC3H3 11420 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 144611629 144611857 144611767 Y ZC3H3 ZC3H3,GSDMD,NAPRT1 RHPN1,C8orf51 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H3 9766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 144629463 144629732 144629564 Y SPATC1,GRINA ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D NA NA NA NA GSDMD 3645 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA NAPRT1,TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr8 145088816 145089042 145088955 Y PLEC,GRINA,SPATC1 PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1 NA NA NA NA PARP10 3876 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145549095 145549459 145549304 Y NA BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5 NA NA NA NA DGAT1 522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145826020 145826191 145826170 Y NA NA NA NA NA NA C8orf82 73504 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 614528 614756 614656 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 146237 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 631583 631920 631840 Y KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 163292 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 3863148 3863487 3863216 Y NA GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 33155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 3865342 3865632 3865553 Y NA GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 31010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 3877182 3877575 3877493 Y GLIS3 GLIS3-AS1 NA NA NA NA GLIS3-AS1 19067 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3-AS1 75195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3-AS1 146271 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 4083576 4083986 4083877 Y GLIS3,GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3-AS1 186934 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 4241498 4241696 4241599 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 104696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 4296901 4297617 4297146 Y GLIS3 GLIS3 NA NA NA NA GLIS3 48775 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1 NA NA NA NA RCL1 38997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 5580709 5581016 5580868 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 46009 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 5777401 5777564 5777483 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 53553 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 5851473 5851729 5851648 Y C9orf46,CD274,KIAA1432 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 20356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA PTPRD 454302 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 12818643 12818927 12818803 Y NA RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 6299 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 13278024 13278458 13278161 Y NA MPDZ NFIB IMR90 Hi-C 24141950 MPDZ 435 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 14096603 14096776 14096679 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 218308 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 14992180 14992514 14992235 Y NA NA NA NA NA NA LDHAP4 71848 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 15999707 15999922 15999846 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 474026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 16236430 16236757 16236598 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 488055 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 16236967 16237218 16237086 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 487594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 16337405 16337786 16337534 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 387026 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 16344409 16344763 16344480 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-62F24.2 380049 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 198319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 18437501 18437903 18437771 Y NA ADAMTSL1 FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 33989 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 19124098 19124309 19124196 Y ACER2,PLIN2 HAUS6,PLIN2 NA NA NA NA PLIN2 22979 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 19184256 19184894 19184463 Y PLIN2 PLIN2 HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 36968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 173182 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 236740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 22148170 22148538 22148388 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 138016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 23555614 23555627 23555620 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL2 268708 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 26500 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 28932604 28932646 28932625 Y NA NA NA NA NA NA C9orf72 1360740 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 30078257 30078387 30078322 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 608716 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 33164497 33164994 33164772 Y APTX,APTX,APTX,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 360 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr9 34577617 34577859 34577738 Y ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 10262 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,MSMP NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 37197498 37198123 37197885 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC7 78962 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 37954084 37954355 37954258 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 112329 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 38008217 38008489 38008387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 58195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 38017265 38017614 38017440 Y SHB RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 49070 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 38035956 38036107 38036020 Y NA RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 30577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 38388338 38388577 38388438 Y ALDH1B1 ALDH1B1,IGFBPL1 NA NA NA NA ALDH1B1 2084 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 68423908 68424365 68424207 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 29010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 68436364 68436652 68436508 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 16723 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 13.4048529090027 chr9 71336446 71336479 71336451 Y NA NA NA NA NA NA FAM122A 56485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 73007611 73008045 73007709 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 19495 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 73021810 73022419 73022127 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.99411035009957 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.87449196691006 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 73085472 73085592 73085532 Y NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 KLF9 57932 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 73100288 73100509 73100429 Y KLF9 NA SMC5,KLF9,TRPM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF9 72748 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 73155558 73155931 73155729 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 128018 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.32351725016595 chr9 73178223 73178568 73178449 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 150683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr9 73178748 73179070 73178790 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 151208 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.43724598345503 chr9 73219456 73219798 73219627 Y TRPM3,KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 191916 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 73224625 73224828 73224734 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 197085 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 75155526 75155660 75155598 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 177363 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 75172533 75172850 75172692 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND5 194370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 77854155 77854441 77854300 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 152696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 78511057 78511456 78511257 Y NA PCSK5 NA NA NA NA PCSK5 7497 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 79350296 79350357 79350327 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA AL161626.1 165565 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 79383801 79384093 79383990 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA PRUNE2 134910 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 80354506 80354684 80354595 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 289690 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 365973 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 81704987 81705355 81705134 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 298864 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 81804624 81804840 81804732 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 199379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 81807982 81808307 81808129 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 195912 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 83116655 83116891 83116780 Y NA NA NA NA NA NA TLE4 931967 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 89366066 89366516 89366184 Y NA NA NA NA NA NA GAS1 193588 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 89953262 89953308 89953285 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 156835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 89990510 89990850 89990781 Y NA NA DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 119293 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 90326659 90327327 90326985 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 188442 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 90329827 90330158 90329945 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 191610 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 91125141 91125399 91125267 Y NA NA SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2 IMR90 Hi-C 24141950 SPIN1 123807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 91364331 91364616 91364445 Y NA NA MIR4289 IMR90 Hi-C 24141950 S1PR3 239746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 3.10194943348822 chr9 92037669 92038073 92037727 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 72972 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 93683361 93683758 93683679 Y NA NA NA NA NA NA DIRAS2 279975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 93754369 93754628 93754484 Y NA NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3 IMR90 Hi-C 24141950 DIRAS2 350983 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 93822540 93822977 93822872 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 299218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 93823339 93823577 93823437 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 298618 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 93833669 93833838 93833696 Y NA NA NA NA NA NA AUH 288357 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 93847721 93848063 93847983 Y NA NA LOC100129316,ROR2,AUH IMR90 Hi-C 24141950 AUH 274132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 93862627 93863018 93862659 Y SYK,SYK,NFIL3 NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 259177 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 93893646 93894080 93893930 Y NA NA LOC100129316,AUH IMR90 Hi-C 24141950 AUH 228115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr9 93913194 93913593 93913428 Y SYK,SYK,NFIL3 NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 208602 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 93960145 93960482 93960197 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 161713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 94182259 94182597 94182338 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 1547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 94660957 94661066 94661012 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 49378 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 94671066 94671340 94671201 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 39104 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 94714041 94714284 94714157 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 3597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 94773036 94773407 94773223 Y NA NA NA NA NA NA ROR2 62592 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 94993084 94993195 94993158 Y NA NA NA NA NA NA IARS 60843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 95878926 95879215 95879071 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 15355 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 95882095 95882646 95882428 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 11924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 95894467 95895029 95894875 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89 NA NA NA NA NINJ1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 96335202 96335517 96335360 Y NA PHF2 NA NA NA NA PHF2 1172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 97411409 97411895 97411585 Y ZNF169,HIATL1,FBP1,C9orf3 NA FBP1,FANCC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C9orf3 75088 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 97966578 97966817 97966786 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 111174 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 99408748 99408964 99408853 Y C9orf21 CDC14B,RP11-535M15.1 NA NA NA NA CDC14B 28636 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 100994380 100994637 100994474 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 21278 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 101015938 101016120 101016078 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 23 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 101802012 101802125 101802080 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR1 62195 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 101883874 101884261 101884068 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 19554 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 102015806 102016715 102016602 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 33460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 103029299 103029483 103029391 Y NA NA NA NA NA NA TEX10 83738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 103192373 103192745 103192675 Y C9orf30 TMEFF1 C9orf30-TMEFF1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEFF1 9815 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 105248809 105248820 105248818 Y NA NA NA NA NA NA RNF20 954676 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 107597613 107597745 107597668 Y NA NA NA NA NA NA NIPSNAP3B 73175 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 107613144 107613436 107613262 Y NA NA NA NA NA NA ABCA1 75082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 107628415 107628839 107628708 Y ABCA1 NA NA NA NA NA ABCA1 59679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 ABCA1 NA NA NA NA ABCA1 18793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 107825868 107826462 107826154 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 137350 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 107917036 107917165 107917091 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1,FSD1L IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A1 87738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 108058871 108059613 108059363 Y ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L NA NA NA NA NA SLC44A1 53968 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 108284643 108284789 108284719 Y NA FKTN NA NA NA NA FKTN 33622 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 110514044 110514454 110514287 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 219373 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 111482488 111482546 111482517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 95375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 112262069 112262452 112262225 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 3479 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 112578765 112579213 112578950 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37996 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 112579595 112579724 112579673 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 38826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 112580267 112580505 112580395 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 39498 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 112789976 112790235 112790005 Y NA NA NA NA NA NA TXN 226685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 204314 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 112813346 112813601 112813470 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 203319 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 112858157 112858314 112858244 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 158606 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 112878723 112879133 112878887 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 137787 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 112903621 112903940 112903708 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 112980 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 113202507 113202544 113202523 Y NA NA NA NA NA NA SVEP1 137616 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 113413222 113413721 113413633 Y LPAR1 NA LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10 IMR90 Hi-C 24141950 SVEP1 73062 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 113507067 113507395 113507232 Y NA NA NA NA NA NA SVEP1 166907 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 113515103 113515367 113515167 Y NA NA NA NA NA NA SVEP1 174943 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 113709585 113709745 113709665 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 89236 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 113840694 113840910 113840855 Y KIAA0368 LPAR1 KIAA0368,LPAR1 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 41713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114596249 114596662 114596321 Y NA NA UGCG,MIR3134,HSDL2,SUSD1,C9orf84 IMR90 Hi-C 24141950 UGCG 60384 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114678571 114678728 114678577 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 21525 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114700203 114700566 114700273 Y DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2 UGCG NA NA NA NA UGCG 43157 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114705587 114705765 114705623 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 48541 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 114723325 114723781 114723480 Y NA NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 66279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114729315 114729452 114729372 Y NA NA UGCG,MIR3134,SUSD1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UGCG 72269 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114808602 114808743 114808666 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 126945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 114809786 114810087 114810015 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 125601 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114811444 114811737 114811486 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 123951 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 114812315 114812544 114812429 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 123144 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114821548 114821936 114821739 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 113752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 114825806 114826033 114825918 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 109655 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 114828005 114828556 114828288 Y UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 107132 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 114835497 114835862 114835756 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 99826 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 114836654 114837091 114837061 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 98597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 115067475 115067560 115067518 Y SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2 PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 26387 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 115624285 115624808 115624606 Y SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2 NA NA NA NA NA SNX30 113167 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 115757286 115757809 115757590 Y NA ZNF883 NA NA NA NA ZNF883 14698 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 76776 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 180266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 116457844 116457994 116457920 Y BSPRY,ZNF618 NA ZNF618,COL27A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF618 178568 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 117351016 117351370 117351316 Y TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2990 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118028504 118028557 118028531 Y NA NA NA NA NA NA DEC1 126407 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 118353952 118354125 118354022 Y TNC NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 DEC1 451855 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 DEC1 456480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.2156781667773 chr9 118367467 118367735 118367565 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 DEC1 465370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118395472 118395834 118395653 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 DEC1 493375 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 501323 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.44019080840525 chr9 118413110 118413431 118413289 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 500652 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118430899 118431573 118430988 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 482510 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 118436011 118436199 118436119 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 477884 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118453042 118453852 118453530 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 460231 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 212389 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 207058 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 118849643 118849804 118849724 Y NA NA PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 64279 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118914445 118914679 118914506 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 362 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 3771 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 119466124 119466469 119466162 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 18543 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 120481913 120482131 120481990 Y TLR4 TLR4 NA NA NA NA TLR4 17303 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 58746 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 121771632 121771910 121771804 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 1307022 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 122984020 122984078 122984028 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 356370 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 123237192 123237494 123237347 Y MEGF9,FBXW2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 102954 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 123446824 123446976 123446902 Y TRAF1,TRAF1 MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 27772 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 123681612 123681912 123681860 Y TRAF1,TRAF1 PHF19,TRAF1 NA NA NA NA TRAF1 7539 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 124125049 124125440 124125316 Y NA STOM NA NA NA NA STOM 5091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 124463473 124463936 124463619 Y TTLL11,DAB2IP NA NA NA NA NA STOM 332942 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 124664946 124665174 124665060 Y DAB2IP NA NA NA NA NA TTLL11 188711 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 125578475 125578645 125578596 Y NA PDCL NA NA NA NA PDCL 10265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 125811144 125811514 125811213 Y NA NA MIR600HG IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1 110032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 126291594 126291648 126291621 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 262739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 126302696 126302988 126302896 Y LHX2 NA NA NA NA NA STRBP 273841 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 126690123 126690365 126690192 Y DENND1A DENND1A NA NA NA NA DENND1A 66 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 126760925 126761520 126761186 Y NA LHX2 DENND1A,LHX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LHX2 429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127029560 127030143 127029899 Y DENND1A NEK6 NA NA NA NA NEK6 11675 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127045133 127045416 127045344 Y NEK6,NEK6 NEK6 NA NA NA NA NEK6 27248 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 127165878 127166187 127166033 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 9536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127943373 127943395 127943384 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 6823 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 127976903 127977044 127976974 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 16082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr9 128927254 128927412 128927327 Y NA NA MAPKAP1,FAM125B IMR90 Hi-C 24141950 PBX3 419630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 130281582 130281994 130281773 Y TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9 NA NA NA NA NA FAM129B 57274 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chr9 130341922 130342377 130342071 Y NA FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2654 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 13790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 130681632 130682091 130681875 Y FAM129B,TOR2A,CDK9 AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,DPM2 NA NA NA NA ST6GALNAC4 4315 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 130743802 130743907 130743855 Y FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 3010 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 130834970 130835273 130835056 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 6485 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 131900982 131901116 131901071 Y ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA CRAT 29514 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.886271266710921 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 30379 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 132385793 132386123 132385875 Y C9orf106,TOR1B,PRRX2 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 14632 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132464908 132465166 132465090 Y C9orf50,PRRX2 PTGES NA NA NA NA PTGES 48160 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 132535885 132536300 132536143 Y FNBP1,USP20,USP20,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTGES 22559 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132693131 132693319 132693235 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 96989 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132705367 132705623 132705495 Y C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 97850 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132712659 132713039 132713009 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 90434 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132754435 132754683 132754561 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 48790 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 132758529 132758977 132758901 Y FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 44496 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132814142 132814504 132814316 Y TOR1B FNBP1,GPR107 NCS1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR107 437 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132835796 132835981 132835917 Y TOR1B,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 22091 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 132949592 132949704 132949653 Y C9orf78 NCS1 NA NA NA NA NCS1 16735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.87449196691006 chr9 133711348 133711666 133711497 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 101007 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 91219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133721974 133722320 133722184 Y NA NA QRFP,FIBCD1 IMR90 Hi-C 24141950 FIBCD1 90353 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133733743 133734142 133733821 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 78531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 134157961 134158264 134158112 Y NA PPAPDC3 NUP214,FAM78A,PPAPDC3,PRRC2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAPDC3 4817 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 134608936 134609538 134609242 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3923 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 134770006 134770262 134770128 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 156545 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 135089544 135089849 135089761 Y NTNG2 NA NA NA NA NA NTNG2 54210 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136075454 136075720 136075558 Y NA RALGDS NA NA NA NA RALGDS 38153 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136236880 136237291 136237149 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA SURF4 3679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136284309 136284583 136284382 Y C9orf96 SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 3145 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136387799 136387823 136387811 Y NA SLC2A6 NA NA NA NA SLC2A6 45540 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 136579870 136580130 136580087 Y NA SARDH NA NA NA NA SARDH 22947 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136580491 136580641 136580566 Y NA SARDH NA NA NA NA SARDH 22436 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 136679470 136679736 136679603 Y NA NA NA NA NA NA SARDH 76393 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 136690997 136691266 136691141 Y RPL7A,SLC2A6 NA NA NA NA NA SARDH 87920 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 137230447 137230827 137230522 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 23503 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 137264490 137265116 137264820 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 57546 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 137348030 137348540 137348200 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 141086 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 137384089 137384391 137384235 Y COL5A1 NA COL5A1,RNU6ATAC,WDR5 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 147229 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 137483960 137484781 137484422 Y NA COL5A1 RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 46839 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 137494646 137494892 137494734 Y NA COL5A1 RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 36728 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 137535299 137535511 137535433 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 3679 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 186642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 139462526 139462651 139462613 Y C9orf69 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 23862 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 139514178 139514562 139514471 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7 NA MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT2 65313 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 139892330 139892637 139892567 Y EGFL7,EGFL7,C9orf142,ABCA2 PTGDS,LCNL1,C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1 NA NA NA NA CLIC3 3075 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 7.09017013368736 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 MIR3621,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.32940690006638 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 3102520 3102927 3102578 Y NA NA CXorf28 IMR90 Hi-C 24141950 MXRA5 159755 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 3263317 3263504 3263415 Y NA MXRA5 NA NA NA NA MXRA5 635 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 2.76959770847163 chrX 3437014 3437322 3437139 Y ARSF,MXRA5 NA ARSF IMR90 Hi-C 24141950 MXRA5 174332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 3444229 3444319 3444293 Y MXRA5 NA ARSF IMR90 Hi-C 24141950 MXRA5 181547 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 3467093 3467466 3467182 Y MXRA5 NA ARSF,MXRA5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKX 162183 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 4628683 4629054 4628903 Y NA NA NA NA NA NA RP11-555H23.1 594115 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2 NA NA NA NA SHROOM2 34172 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 9929375 9929481 9929417 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 52121 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 10079384 10079999 10079621 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 97782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 10167232 10167620 10167424 Y WWC3,CLCN4 NA NA NA NA NA WWC3 185630 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 73997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chrX 12388684 12389044 12388773 Y FRMPD4 NA NA NA NA NA FRMPD4 234099 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chrX 12390298 12390694 12390463 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 235713 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chrX 12859907 12859927 12859917 Y ATXN3L TLR7 NA NA NA NA TLR7 23275 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 12996273 12996492 12996427 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5046 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chrX 12996986 12997135 12997061 Y TLR8,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5759 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13097151 13097463 13097240 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA NA NA NA NA TMSB4X 105924 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 13106166 13106719 13106370 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA FAM9C IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 114939 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 128697 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 13146320 13146550 13146426 Y NA NA NA NA NA NA TMSB4X 155093 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13306086 13306254 13306170 Y NA GS1-600G8.5 TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GS1-600G8.5 13317 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13318186 13318365 13318276 Y NA GS1-600G8.5 NA NA NA NA GS1-600G8.5 1206 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13414990 13415289 13415163 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 19531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 13687345 13687715 13687534 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA RAB9A 17529 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 14040371 14040544 14040433 Y NA GEMIN8 NA NA NA NA GEMIN8 5468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 15787454 15787695 15787561 Y NA ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 18900 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 15929905 15930246 15930039 Y ZRSR2,AP1S2 NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 58851 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 16900871 16900973 16900947 Y TXLNG RBBP7 RBBP7,TXLNG MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBBP7 14334 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 18445170 18445478 18445437 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 3467 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 19701008 19701387 19701257 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 202332 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 19734259 19734420 19734314 Y CXorf23,SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 169299 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 19743756 19744188 19744006 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 159531 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 21945015 21945333 21945248 Y NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 11358 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 23817688 23817829 23817775 Y NA ACOT9,RP13-314C10.5,SAT1,RPL9P7 NA NA NA NA SAT1 18398 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 23902825 23903036 23902985 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 RPL9P7,APOO NA NA NA NA APOO 21021 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 30717069 30717144 30717107 Y CXorf21,GK GK NA NA NA NA GK 47593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 35643916 35644051 35643969 Y MAGEB16 NA NA NA NA NA RPS15AP40 747247 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 4.32057242521574 chrX 38206429 38206721 38206558 Y MID1IP1,RPGR RPGR NA NA NA NA RPGR 21612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA RPGR 153975 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chrX 39951266 39951579 39951437 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 83003 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA MKRN4P NA NA NA NA MKRN4P 32 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 40726668 40726852 40726751 Y ATP6AP2,MED14 MKRN4P,RP11-77G22.2 USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831 IMR90 Hi-C 24141950 MKRN4P 34930 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 40749971 40750359 40750172 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 RP11-77G22.2 USP9X,MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 14878 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 40841745 40842012 40841881 Y NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 76508 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 42806241 42806405 42806338 Y NA NA NA NA NA NA RP3-326I13.1 227838 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.775487358372056 chrX 44927976 44928345 44928046 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 197219 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 45631125 45631239 45631172 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 26595 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA NA NA NA NA NA MIR222 63107 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 47221453 47221809 47221639 Y USP11,ZNF81,SYN1 NA UBA1,USP11 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF41 118536 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 47360973 47361468 47361218 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41,NUS1P1 ZNF41,ARAF,SYN1,TIMP1,MIR4769 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUS1P1 9414 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 47366580 47367047 47366746 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41,NUS1P1 CDK16,USP11,UBA1,ARAF,SYN1 IMR90 Hi-C 24141950 NUS1P1 3835 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 47374044 47374207 47374095 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41,NUS1P1,ARAF UBA1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 NUS1P1 3162 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 48345811 48346195 48345963 Y WAS,RBM3,PQBP1,PQBP1,PQBP1,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA FTSJ1 13270 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 48350817 48351213 48350906 Y WAS,RBM3,PORCN,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 14137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 48938465 48938570 48938518 Y NA TFE3,PRAF2,WDR45,GPKOW NA NA NA NA PRAF2 8735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.66470345003319 chrX 53292881 53293274 53292937 Y NA KDM5C NA NA NA NA KDM5C 40277 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 53467837 53468052 53468003 Y KDM5C RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 8517 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 57421884 57422193 57422039 Y FAAH2 NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 275789 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 58114899 58115216 58115119 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 968804 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 64464605 64464940 64464771 Y ZC4H2,ZC3H12B NA NA NA NA NA ZC4H2 212012 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 64683455 64683784 64683516 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 68871 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 64821176 64821755 64821551 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 14919 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 64894043 64894537 64894384 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 87786 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 64926114 64926664 64926355 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 119857 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 67624994 67625390 67625192 Y NA OPHN1 NA NA NA NA OPHN1 26365 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 146638 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.332351725016595 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 74033137 74033450 74033294 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 200685 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 74266683 74266817 74266750 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 107750 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 79828855 79829064 79828956 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 234123 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 79830053 79830147 79830110 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 233040 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.44313563335546 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 99900251 99900361 99900308 Y SRPX2 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 3036 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA ARMCX1 NA NA NA NA ARMCX1 9960 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 103120032 103120203 103120118 Y TCEAL1,ZCCHC18,RAB9B NA NA NA NA NA TMSB15B 51276 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 104969379 104969454 104969447 Y NA NA NA NA NA NA NRK 95082 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 105065481 105065866 105065484 Y NRK NRK NA NA NA NA NRK 945 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 109017105 109017471 109017326 Y NA ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 42473 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 109017803 109018393 109018148 Y NA ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 43171 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 109315579 109315956 109315731 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 71720 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 114602209 114602595 114602402 Y NA NA PLS3 IMR90 Hi-C 24141950 LRCH2 135574 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 114925070 114925398 114925234 Y NA EEF1GP5 NA NA NA NA EEF1GP5 9733 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 117896439 117896822 117896632 Y NA IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 36904 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 119276319 119276451 119276385 Y FAM70A NA NA NA NA NA NKAPP1 100671 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.88332644176071 chrX 122000427 122000713 122000570 Y NA NA NA NA NA NA MRRFP1 248921 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 124193844 124193851 124193848 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 1101782 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 1.21862299172752 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 129255072 129255259 129255158 Y SASH3,ELF4,ELF4 ELF4,AIFM1 ELF4 K562 ChIA-PET 22265404 ELF4 12381 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 129961561 129961881 129961697 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 73327 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 129982936 129983220 129983074 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 51988 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 130013053 130013179 130013116 Y NA ENOX2 NA NA NA NA ENOX2 22029 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA PHF6 199118 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 134096434 134096824 134096629 Y NA MOSPD1 FAM127C IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD1 49137 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 151149745 151149882 151149808 Y NA GABRE NA NA NA NA GABRE 8593 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 152742295 152742894 152742640 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 HAUS7,ATP2B3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TREX2 8250 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 152753051 152753292 152753194 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 BGN MCF7 ChIA-PET 22265404 BGN 5105 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 153308447 153308946 153308655 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1 IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 25016 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 153308986 153309188 153309114 Y NA IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 25555 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 153309720 153309889 153309786 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1 IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 26289 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 153311757 153312308 153312067 Y NA IRAK1,MECP2 NA NA NA NA IRAK1 28326 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.997055175049786 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.553919541694325 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 153771070 153771275 153771201 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2512 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 153829365 153829583 153829391 Y NA AF277315.19 NA NA NA NA AF277315.19 2528 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.22156781667773 chrX 153962169 153963128 153962765 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 14730 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrX 154365480 154365529 154365504 Y NA MTCP1 NA NA NA NA MTCP1 8683 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrY 13488641 13488888 13488688 Y NA NA NA NA NA NA GYG2P1 1041367 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA GYG2P1 677089 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrY 23337444 23337868 23337600 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 6588468 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 11806207 CAGE HuH-28 hg19 FANTOM5 0.110783908338865