chr1	941791	942135	942082	Y	HES4	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	ISG15,AGRN	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ISG15	4668	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	1136075	1136463	1136398	Y	HES4,ISG15	TNFRSF18,TNFRSF4,SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	3608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	1343359	1343768	1343546	Y	NA	MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C	NA	NA	NA	NA	MRPL20	2666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	1978731	1978937	1978887	Y	NADK,PRKCZ	GABRD	NA	NA	NA	NA	GABRD	29951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	2231691	2232185	2232046	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	88961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	17731	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,FAM213B	NA	NA	NA	NA	HES5	18592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	3269112	3269418	3269330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	99572	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	3278962	3279359	3279242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	89631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	3325555	3326143	3325876	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	42847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	4697251	4697504	4697378	Y	NA	AJAP1	NPHP4	IMR90	Hi-C	24141950	AJAP1	15288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	5957166	5957512	5957348	Y	KCNAB2,KCNAB2,CHD5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	92014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	6221566	6221669	6221628	Y	PLEKHG5,CHD5	CHD5,RNF207,RPL22	NA	NA	NA	NA	CHD5	16514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	6301988	6302384	6302218	Y	NA	RNF207,RPL22,ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	HES3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr1	6336471	6336830	6336716	Y	ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	17436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	6337854	6338055	6337955	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	18819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	6370006	6370154	6370079	Y	NA	NA	HES3,ICMT,GPR153	IMR90	Hi-C	24141950	GPR153	50971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	7177733	7177848	7177794	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	334349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	7668972	7669194	7669115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	160135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.23065386548724
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	8215795	8215905	8215839	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1,PARK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	48752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8469706	8470061	8470001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	93820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	8999811	9000211	8999889	Y	NA	NA	SLC2A5,SLC2A7	IMR90	Hi-C	24141950	ENO1	62503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	9225492	9225752	9225745	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	14511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	9840833	9841244	9840865	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	41340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	10127211	10127315	10127266	Y	KIF1B	UBE4B	NA	NA	NA	NA	UBE4B	36321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	10496880	10497075	10496978	Y	KIF1B	PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	APITD1,APITD1-CORT	8721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	10558276	10558621	10558397	Y	NA	PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	DFFA	27693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	49706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	10821450	10821813	10821706	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	32894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	11410602	11410834	11410718	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	79339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	12046023	12046196	12046108	Y	FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2	MFN2,MIIP	NA	NA	NA	NA	MFN2	7785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	12126084	12126429	12126131	Y	MIIP,TNFRSF8	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	4650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	12127865	12128182	12128023	Y	MIIP,TNFRSF8	TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	TNFRSF8	6431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	31661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	12546528	12546819	12546674	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	128918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	12614115	12614248	12614183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	61489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	12717632	12717976	12717808	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	41895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	14590335	14590448	14590392	Y	NA	NA	KAZN	IMR90	Hi-C	24141950	KAZN	332752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	15119702	15119955	15119829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	196502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	15499033	15499473	15499185	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	22005	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	15664580	15664866	15664723	Y	FBLIM1	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	15835354	15835624	15835499	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	15405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	15946733	15946892	15946831	Y	EFHD2,CASP9,ZBTB17,SPEN,DDI2	AGMAT,RP4-680D5.2,CHCHD2P6,DDI2	NA	NA	NA	NA	DDI2	4738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	TMEM82,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	16158409	16158760	16158690	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	5685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	16227810	16227873	16227842	Y	C1orf64,SPEN	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	55168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	38733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16553276	16553594	16553536	Y	NA	RSG1	NA	NA	NA	NA	RSG1	8063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	17019394	17019738	17019426	Y	SPATA21,NBPF1	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	8844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	17020007	17020088	17020064	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	9457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.26990639445673
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	17796675	17796982	17796736	Y	NA	RCC2	RCC2,ARHGEF10L	IMR90	Hi-C	24141950	RCC2	32455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	18836920	18836958	18836939	Y	NA	KLHDC7A,RP1-8B22.1	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	19778785	19779174	19779108	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	30892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	19794978	19795283	19795050	Y	PLA2G2E,UBR4	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	14783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	20780827	20780970	20780908	Y	PLA2G2A	CAMK2N1	OTUD3,LOC339505	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2N1	29743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	20993397	20993558	20993485	Y	NA	PINK1,DDOST	NA	NA	NA	NA	DDOST	7397	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	21349725	21349786	21349755	Y	EIF4G3	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	21655798	21656254	21656078	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	13743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	21670382	21670956	21670695	Y	NA	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	61951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	22066009	22066225	22066117	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	41874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	22106565	22106957	22106761	Y	NA	USP48	NA	NA	NA	NA	USP48	1142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	23589856	23590232	23590037	Y	NA	NA	KDM1A,HTR1D,LUZP1,LOC729059,HNRNPR,TCEA3,E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPR	78597	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	23778586	23778784	23778678	Y	NA	TCEA3,ASAP3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	29353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	23839318	23839630	23839474	Y	HNRNPR,ZNF436	ASAP3,E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	E2F2	16082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	23901938	23902056	23901997	Y	NA	E2F2,ID3	ID3,MDS2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	17653	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	23916918	23917225	23917105	Y	HNRNPR	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	32633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	23918101	23918449	23918188	Y	SRSF10,CNR2,E2F2	ID3	E2F2,ID3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID3	33816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24237439	24237588	24237532	Y	RPL11,PNRC2,FUCA1,CNR2	FUCA1,RP11-4M23.4,CNR2	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	36285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24265492	24265740	24265616	Y	SRSF10	RP11-4M23.4,CNR2	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	8133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr1	24477754	24478041	24477856	Y	NA	NA	IL22RA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-4M23.7	144745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	24517528	24517868	24517690	Y	PNRC2,GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL3	125944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24518503	24518681	24518625	Y	PNRC2,GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL3	125131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24968619	24968979	24968799	Y	RUNX3,SRRM1	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	12412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	24970685	24970736	24970725	Y	NA	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	14478	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	25051605	25051987	25051744	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	17861	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	25095502	25095845	25095665	Y	NA	CLIC4	NA	NA	NA	NA	CLIC4	25654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	25237083	25237520	25237460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX3	52092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	25345809	25346202	25345889	Y	RUNX3	NA	RUNX3	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	56197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	25347909	25348138	25347985	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	58297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	25802039	25802147	25802084	Y	C1orf63	RHCE,TMEM57	NA	NA	NA	NA	TMEM57	46651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26003805	26004144	26003975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	120523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	ZNF593,RP11-96L14.7,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11,AIM1L	NA	NA	NA	NA	AIM1L	5066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26738740	26738942	26738863	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26739065	26739644	26739183	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	26907862	26908015	26907938	Y	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	27336678	27336931	27336804	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	27462835	27462988	27462889	Y	ARID1A,PIGV,ZDHHC18,WDTC1,WASF2,FGR,FGR,FGR,SLC9A1	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	28484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	28204631	28205027	28204647	Y	NA	PPP1R8,SCARNA1,RPA2	NA	NA	NA	NA	RPA2	34230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	28434285	28434594	28434341	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,DNAJC8,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	21078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	28813874	28814267	28814011	Y	EYA3	RCC1,SNHG3,SNORA73B	NA	NA	NA	NA	RCC1	16188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	29513219	29513546	29513454	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	6720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.10579393047323
chr1	29517304	29517322	29517313	Y	NA	SRSF4,MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	SRSF4	10805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	29598339	29598546	29598399	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	37311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	31220962	31221590	31221236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	158018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	SDC3	137328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	31360609	31360977	31360897	Y	NA	SDC3	NA	NA	NA	NA	SDC3	18631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	31504221	31504603	31504488	Y	NA	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	32235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	31602770	31603168	31602969	Y	NKAIN1	NA	PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40	IMR90	Hi-C	24141950	PUM1	65932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	31625313	31625543	31625426	Y	NA	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	84858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	31976608	31977048	31976952	Y	PUM1	NA	LOC284551	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	63068	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	33202470	33202806	33202641	Y	ZBTB8OS,RBBP4,RBBP4,KIAA1522	SYNC,KIAA1522	KIAA1522	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1522	2680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	33428474	33429020	33428770	Y	NA	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	33438571	33438703	33438616	Y	KIAA1522,ADC	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	10285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	34130973	34131088	34131031	Y	ZNF362	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	194727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	34462454	34462825	34462727	Y	CSMD2,HMGB4	NA	NA	NA	NA	NA	CSMD2	166618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	35394262	35394654	35394275	Y	NA	DLGAP3	NA	NA	NA	NA	DLGAP3	1076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	35935390	35935771	35935662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	85303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	TEKT2,ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	36715455	36715834	36715645	Y	EIF2C1,EIF2C3	THRAP3	NA	NA	NA	NA	THRAP3	27438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	36721428	36721771	36721600	Y	NA	THRAP3,SH3D21	NA	NA	NA	NA	THRAP3	33411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	36853020	36853462	36853143	Y	NA	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	3523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	37195884	37196007	37195923	Y	OSCP1	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	CSF3R	249005	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	37784198	37784531	37784441	Y	GRIK3,EPHA10	NA	GRIK3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01137	153481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	37885584	37885820	37885702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	52192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	37932554	37932910	37932770	Y	NA	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	5102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	37937293	37937526	37937471	Y	YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	LINC01137	486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	38134422	38134555	38134489	Y	NA	RSPO1,C1orf109,CDCA8	NA	NA	NA	NA	C1orf109	21359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	38203610	38203633	38203621	Y	NA	C1orf109,CDCA8,EPHA10	CDCA8,C1orf109	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA10	25172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	38311465	38311868	38311723	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	11424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	38739267	38739533	38739400	Y	NA	NA	POU3F1	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	228281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	39327096	39327575	39327204	Y	NA	RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP	NA	NA	NA	NA	RP5-864K19.4	3424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	39624919	39625154	39625144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	79931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	39662647	39663006	39662738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	117659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	39791626	39791706	39791638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	82445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	40818847	40819033	40818965	Y	NA	COL9A2,SMAP2	RLF,ZMPSTE24,PPT1,SMAP2,CAP1,COL9A2,ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	10325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	40954031	40954187	40954167	Y	ZNF684,DEM1	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	RP11-656D10.3	18146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	41825927	41826139	41826062	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	333	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	41914594	41914877	41914736	Y	HIVEP3,SCMH1,SCMH1	EDN2	SCMH1,EDN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EDN2	33467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	3671	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42071739	42071927	42071841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	123395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.94766329470735
chr1	42141163	42141343	42141258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	192819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42272535	42272820	42272654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	226776	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42363874	42364167	42364002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	135429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	43402778	43403133	43403049	Y	ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	19397	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	43427522	43427762	43427666	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	4802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	43429290	43429917	43429491	Y	CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	6570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	43432863	43433109	43432938	Y	CCDC30,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	10143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43471435	43471828	43471543	Y	SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	48715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	WDR65	NA	NA	NA	NA	WDR65	30600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43761236	43761355	43761298	Y	NA	TMEM125,EBNA1BP2,C1orf210,TIE1	NA	NA	NA	NA	TIE1	3309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43815718	43816062	43815943	Y	NA	RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2	NA	NA	NA	NA	RP1-92O14.3	6267	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43975817	43975939	43975873	Y	NA	PTPRF	SZT2,HYI,PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	12919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	43976930	43977350	43977026	Y	NA	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	11508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44011575	44011705	44011627	Y	NA	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	22717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	44331438	44331658	44331560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	65334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44962677	44962982	44962698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	93811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	44973431	44973656	44973576	Y	PTCH2,C1orf228,SLC6A9,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	104565	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	45192729	45193123	45192925	Y	NA	RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55	KIF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU5D-1	1719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	45286834	45287205	45286951	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	3165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	45746932	45746947	45746939	Y	NA	ZSWIM5,HPDL	ZSWIM5,UROD,HECTD3	IMR90	Hi-C	24141950	ZSWIM5	22934	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	45787067	45787234	45787139	Y	NA	ZSWIM5,HPDL,TOE1,MUTYH	NA	NA	NA	NA	HPDL	3311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	45860300	45860382	45860343	Y	IPP,TESK2,TOE1	NA	NA	NA	NA	NA	MUTYH	56158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	46528388	46528566	46528496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	110179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	46689426	46689696	46689549	Y	FAAH,C1orf190	PIK3R3,POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	POMGNT1	5449	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	46999025	46999241	46999126	Y	ATPAF1-AS1	NA	NA	NA	NA	NA	MKNK1	81274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	47699046	47699332	47699189	Y	NA	TAL1	NA	NA	NA	NA	TAL1	3154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	47718105	47718425	47718265	Y	NA	TAL1	TAL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAL1	22213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	47910443	47910471	47910460	Y	NA	FOXE3	NA	NA	NA	NA	FOXE3	30699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	49038282	49038602	49038503	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	102437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	50799292	50799453	50799422	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	DMRTA2	87719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	196779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51215461	51215472	51215465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	208463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51415396	51415400	51415398	Y	NA	FAF1	NA	NA	NA	NA	FAF1	8535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51454917	51455119	51455049	Y	NA	FAF1	NA	NA	NA	NA	FAF1	30982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	51886085	51886464	51886275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	77297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	52029722	52030067	52029870	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	10784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	52110368	52110491	52110430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	69517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	52132018	52132585	52132263	Y	TXNDC12,EPS15,NRD1,NRD1,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	91167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	52238666	52238881	52238774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRD1	103596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	52507951	52508154	52508101	Y	NA	KTI12,BTF3L4,TXNDC12	NA	NA	NA	NA	KTI12	10463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9	NA	NA	NA	NA	ZFYVE9	22143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	53020482	53020832	53020657	Y	BTF3L4,PRPF38A,ZYG11B,FAM159A,ZCCHC11	ZCCHC11,GPX7	NA	NA	NA	NA	ZCCHC11	3323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	53128711	53128834	53128721	Y	NA	FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	31695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	21373	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42,LDLRAD1	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	54696817	54697014	54696918	Y	YIPF1	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	33108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	54844378	54844570	54844456	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	32582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	54868582	54868776	54868642	Y	HEATR8,C1orf177	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	8376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	64624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	54956081	54956394	54956179	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	78929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	55279986	55280085	55280013	Y	NA	TTC22	NA	NA	NA	NA	TTC22	15046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	55678785	55679185	55678893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP24	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	55725974	55726130	55726052	Y	NA	USP24	USP24,LOC100507634,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	47188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	56184456	56184884	56184686	Y	NA	NA	PRKAA2,PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	505670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	56493890	56494034	56494033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	614940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	56919158	56919299	56919214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	189675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.0594390533982
chr1	57024882	57025247	57025166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	83727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	57297998	57298181	57298090	Y	NA	C1orf168	DAB1,C1orf168,C8A,C8B	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf168	14629	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	57854714	57855055	57855051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	571345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	57906316	57906442	57906379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	622947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	57988271	57988573	57988424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf168	704902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	58627790	58628022	58627831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB1	382384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	59083441	59083551	59083446	Y	NA	TACSTD2	TACSTD2,OMA1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TACSTD2	42275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	59478866	59479252	59479013	Y	NA	NA	FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	JUN	231081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	59910700	59911009	59910820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	150390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	60009140	60009290	60009214	Y	CYP2J2	NA	NA	NA	NA	NA	FGGY	248830	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	60062084	60062408	60062209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	216050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	60144543	60144796	60144669	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	133662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	81659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	62416847	62417238	62417043	Y	INADL,USP1,KANK4	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	210698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	62698531	62698618	62698572	Y	USP1,USP1,KANK4,L1TD1	L1TD1	NA	NA	NA	NA	L1TD1	40028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	62773248	62773553	62773401	Y	NA	KANK4	NA	NA	NA	NA	KANK4	9532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	63022251	63022602	63022448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	122283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	63492178	63492549	63492364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4C	244372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	63785369	63785450	63785384	Y	FOXD3	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	FOXD3	1280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	63807580	63807600	63807590	Y	NA	LINC00466,FOXD3,RP4-792G4.2,ALG6	NA	NA	NA	NA	RP4-792G4.2	19468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	63886654	63886800	63886727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG6	55393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65084994	65085109	65085052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	123669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65381647	65381826	65381744	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	48361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65383044	65383557	65383225	Y	JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	46630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65527577	65527856	65527728	Y	NA	RP4-535B20.1	AK4	K562	ChIA-PET	22265404	RP4-535B20.1	3564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	65639675	65639734	65639705	Y	NA	AK4	NA	NA	NA	NA	AK4	28443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	67883059	67883215	67883204	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	10883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	68041528	68041694	68041684	Y	GADD45A	NA	GADD45A,GNG12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	107050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	68101042	68101257	68101151	Y	NA	GADD45A	GADD45A	K562	ChIA-PET	22265404	GADD45A	47487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	68166463	68166766	68166597	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	17719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.66467272392746
chr1	68639460	68639856	68639657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	68945486	68945782	68945636	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	15122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	69667127	69667383	69667255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	706223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	7215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	70806613	70806974	70806794	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	11443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	74970988	74971139	74971082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TYW3	225697	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX8	206688	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	75972237	75972619	75972428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	215417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	76541670	76541922	76541777	Y	ST6GALNAC3	ST6GALNAC3	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	3266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr1	77399446	77399567	77399507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	68320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	77404135	77404353	77404238	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	73009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	77842116	77842473	77842156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	96380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	77879256	77879430	77879369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	133520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	77891343	77891690	77891394	Y	AK5,AK5,ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	145607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4,GIPC2	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	114120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	78561383	78561632	78561506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIPC2	118157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	79099852	79100232	79099854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTD1	370171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTD1	254271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	79518661	79518859	79518772	Y	NA	ELTD1	NA	NA	NA	NA	ELTD1	48258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	79668598	79668618	79668608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELTD1	198195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	81968642	81968976	81968811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	216402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	82026431	82026771	82026601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	158607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	83528650	83529168	83528896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL7	933665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	84844335	84844468	84844402	Y	SSX2IP,SSX2IP,GNG5,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B	NA	NA	NA	NA	NA	RPF1	98474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	84970111	84970722	84970500	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	GNG5	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	87166281	87166485	87166383	Y	NA	SH3GLB1	CLCA1,SH3GLB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SH3GLB1	1774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	87253936	87254322	87254171	Y	SH3GLB1	NA	SEP15	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GLB1	85677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	89382528	89382593	89382561	Y	NA	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	26901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	89535751	89536015	89535898	Y	GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2	GBP3	GBP1,GBP6	IMR90	Hi-C	24141950	GBP3	49174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	90226973	90227143	90227059	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	LRRC8C,LRRC8D	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8D	57430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	91185058	91185169	91185091	Y	BARHL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	130038	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	91322848	91323191	91323185	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	7641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	91478571	91478975	91478771	Y	ZNF644,ZNF644	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	6854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	91793812	91793887	91793849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HFM1	74539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	92255921	92256250	92256086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	113642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	92270160	92270686	92270504	Y	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	99206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	92668364	92668570	92668467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPAP2	93952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	94203705	94204234	94204026	Y	NA	RP11-488P3.1	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488P3.1	34766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94371317	94371601	94371445	Y	NA	DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	GCLM	1365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94429275	94429464	94429371	Y	GCLM	NA	ABCA4,ARHGAP29	IMR90	Hi-C	24141950	GCLM	56309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94676840	94677023	94676933	Y	NA	RP11-148B18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	34441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	9599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	NA	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	54183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	NA	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP29	56994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	97596064	97596178	97596116	Y	PTBP2	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP2	410843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	98403373	98403764	98403703	Y	DPYD	NA	DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	SEC63P1	394116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100512510	100512716	100512572	Y	HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	10857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100828525	100828922	100828611	Y	SASS6	CDC14A	NA	NA	NA	NA	CDC14A	19941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	104641680	104641698	104641690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNPC3	575367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	107891659	107891745	107891700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	211030	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	109079557	109079899	109079743	Y	NA	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	20812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	109928106	109928152	109928114	Y	NA	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	10421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	110160052	110160461	110160231	Y	GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	3326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	110175406	110175537	110175472	Y	NA	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	18680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	110895542	110895785	110895664	Y	NA	RBM15,LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	RBM15	16414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	110947330	110947681	110947535	Y	NA	LAMTOR5-AS1,SLC16A4	NA	NA	NA	NA	SLC16A4	15626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	111178912	111179243	111179089	Y	RBM15,CD53	NA	KCNA2	K562	ChIA-PET	22265404	CD53	234532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	111188051	111188448	111188135	Y	LRIF1,CD53	NA	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	CD53	225327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	111729234	111729498	111729366	Y	NA	CEPT1,DRAM2	NA	NA	NA	NA	DRAM2	48396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	111981832	111982198	111982008	Y	NA	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	ATP5F1	7288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	112058803	112059167	112059005	Y	C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	23673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	112078528	112078792	112078645	Y	NA	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	4048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	112135698	112135869	112135721	Y	C1orf183,DENND2D,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	52858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	112437663	112437858	112437845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM212B	141217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	113014906	113015158	113015047	Y	CAPZA1	WNT2B	NA	NA	NA	NA	WNT2B	7743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	114258659	114258989	114258824	Y	NA	PHTF1	NA	NA	NA	NA	PHTF1	41122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	114575620	114575801	114575630	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	OLFML3	55557	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	114576701	114577036	114576869	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	OLFML3	56638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	115445129	115445499	115445208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIKE1	123823	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	115615204	115615232	115615217	Y	NA	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	14889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	116920378	116921129	116920740	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	7088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	117422443	117422644	117422485	Y	NA	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28035	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	117533270	117533527	117533328	Y	CD58,CD101	NA	NA	NA	NA	NA	TTF2	67398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	117814674	117814878	117814758	Y	NA	NA	VTCN1,TTF2,TRIM45	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VTCN1	63118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	120188395	120188927	120188667	Y	NA	PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	120255895	120256325	120256050	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	55474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	144533627	144534178	144533764	Y	PDE4DIP	RNU1-59P	PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU1-59P	1589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	RNU2-38P	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	43743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	57405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	145067412	145067676	145067614	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	6510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	147012349	147012550	147012481	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	1167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-403I13.5	5589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	3037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11	NA	NA	NA	NA	MTMR11	4109	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P,CA14	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	150539630	150541082	150540777	Y	NA	ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	MCL1	8984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	150668096	150668276	150668180	Y	NA	GOLPH3L	NA	NA	NA	NA	GOLPH3L	466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151692599	151692830	151692715	Y	CELF3,CELF3,CELF3	RIIAD1,CELF3,MRPL9	NA	NA	NA	NA	CELF3	5309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	RIIAD1,CELF3,MRPL9	NA	NA	NA	NA	CELF3	9179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.55289696523662
chr1	151868154	151868386	151868273	Y	NA	THEM4	NA	NA	NA	NA	THEM4	11898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	121996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	153670755	153671012	153670885	Y	S100A9,S100A12	SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3	NA	NA	NA	NA	NPR1	21642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	153767353	153767730	153767624	Y	NA	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	22523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	154299137	154299452	154299353	Y	UBAP2L,ATP8B2,IL6R	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	3108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	154302207	154302441	154302288	Y	CHRNB2,ATP8B2	ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	6178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	154405181	154405498	154405310	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,IL6R,ADAR,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.67775690025062
chr1	154405619	154406249	154405788	Y	UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,IL6R,ADAR	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	29950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	154582047	154582244	154582145	Y	UBAP2L,ATP8B2,PBXIP1,ADAR,ADAR	CHRNB2,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	16231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	154720589	154720696	154720649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	122114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	154899922	154900189	154899933	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1	NA	NA	NA	NA	PMVK	7278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	155433776	155433971	155433878	Y	MTX1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1	POU5F1P4	NA	NA	NA	NA	POU5F1P4	32807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	POU5F1P4	NA	NA	NA	NA	POU5F1P4	42161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	11467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SEMA4A,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156249668	156250061	156249953	Y	NA	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	SMG5	559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	C1orf61,MEF2D	NA	NA	NA	NA	C1orf61	28438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156632199	156632473	156632320	Y	NA	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	2983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156634807	156635020	156634939	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	5591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	156645551	156645913	156645806	Y	NES	BCAN,RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	NES	362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	156663993	156664153	156664073	Y	TMEM79,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	NA	NA	NA	NA	CRABP2	9455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	156676478	156676824	156676750	Y	C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	2870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	157106691	157107326	157106962	Y	RRNAD1,ETV3,ETV3	ETV3L,ETV3	NA	NA	NA	NA	ETV3	425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	CD1D	28048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD1D	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	158255393	158256068	158255695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD1D	107656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	158983439	158983572	158983497	Y	NA	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	15681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	158994687	158995148	158994758	Y	OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,MNDA,IFI16,FCER1A	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	26929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	159158093	159158524	159158429	Y	NA	CADM3	NA	NA	NA	NA	CADM3	18694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	159878004	159878104	159878054	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	10051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	159886226	159886307	159886250	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	7215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160242090	160242278	160242184	Y	NA	RP11-574F21.2,DCAF8,PEX19,SUMO1P3	NA	NA	NA	NA	DCAF8	10642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160316870	160317108	160317002	Y	SLAMF7,CD48,TAGLN2,NCSTN	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1	NA	NA	NA	NA	COPA	5680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	SUMO1P3,NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	160376163	160376541	160376381	Y	NA	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	7787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160377718	160378261	160377994	Y	IGSF9	NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	9342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160407857	160407975	160407870	Y	SLAMF6,SLAMF1,LY9,CD48,DCAF8	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	39481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	134375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	160714037	160714549	160714116	Y	CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	116143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	ITLN2,F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr1	161170260	161170636	161170567	Y	PCP4L1,ADAMTS4,NDUFS2	UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,APOA2,TOMM40L,NR1I3	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	3414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	161321309	161321798	161321423	Y	ATF6,CD244,FCER1G	SDHC,C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	13866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	161324130	161324422	161324290	Y	NA	SDHC,C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	11242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	161356382	161356652	161356546	Y	FCRLB,ATF6,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NA	NA	NA	NA	C1orf192	20718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	98617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	161991847	161991976	161991911	Y	OLFML2B	OLFML2B,NOS1AP	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	164443331	164443344	164443338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	79477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	165868061	165868423	165868295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCO1	73069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	167322904	167323093	167323001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	134838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167419889	167420655	167420276	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	100349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167442775	167443139	167443045	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	77865	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167478725	167479215	167479067	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	41789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167586596	167587245	167587123	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	RCSD1	RCSD1	IMR90	Hi-C	24141950	RCSD1	10085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	167772811	167773182	167772825	Y	CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	14304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	168337258	168337475	168337348	Y	NA	NA	LOC100505918,MIR557	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	88980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	171189238	171189444	171189341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	263207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	171191543	171191565	171191554	Y	C1orf129,C1orf129	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	261086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	171404934	171405057	171404984	Y	FMO4,PRRC2C	PRRC2C	PRRC2C	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2C	47594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	171473011	171473311	171473138	Y	NA	PRRC2C	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	20360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	171832189	171832290	171832196	Y	DNM3	DNM3	NA	NA	NA	NA	DNM3	23568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	172324588	172324814	172324670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf105	63014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	172445364	172445579	172445472	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	34134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	173370600	173370810	173370705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	73595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	174061489	174061703	174061596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	64845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	174937322	174937525	174937409	Y	KIAA0040,KIAA0040	CACYBP	NA	NA	NA	NA	CACYBP	28775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	175003106	175003396	175003133	Y	NA	CACYBP,MRPS14	MRPS14	MCF7	ChIA-PET	22265404	MRPS14	12545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	175159885	175160247	175160001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	175571336	175571362	175571351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	317749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	175891419	175891824	175891531	Y	NA	RP11-318C24.1	RFWD2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-318C24.1	2308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr1	175902819	175902853	175902836	Y	NA	RP11-318C24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	13708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	176024233	176024593	176024503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	135122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	176244494	176244887	176244692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-195C7.1	69710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	177896186	177896486	177896298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	108599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	178207948	178208160	178207999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	147084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	178235815	178236162	178236004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	174951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	204551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	178379281	178379736	178379396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	130151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	178901109	178901308	178901215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	91631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	179110934	179111289	179111201	Y	AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	62422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	ABL2	NA	NA	NA	NA	ABL2	42910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	130771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	180200315	180200683	180200497	Y	LHX4	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	2894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	180250812	180250948	180250921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	53391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	180494187	180494417	180494302	Y	NA	ACBD6	XPR1,MR1,KIAA1614,STX6	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	24098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	180895607	180895967	180895721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	94080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	182070634	182071001	182070793	Y	NA	NA	CACNA1E	IMR90	Hi-C	24141950	GLUL	288340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	182228341	182228499	182228429	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RNASEL,RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	182643740	182644063	182644020	Y	RGS16	NA	NA	NA	NA	NA	RGS16	72197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	183776671	183777014	183776784	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	RGL1	173451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	183846576	183846867	183846649	Y	NMNAT2,RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	171944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	184421485	184421696	184421591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	67293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	184820980	184820991	184820986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	98933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	184924828	184925180	184925091	Y	IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	16502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	184929910	184930144	184930114	Y	TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	11538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	185370192	185370524	185370276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	85731	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	186728961	186729222	186729092	Y	NA	NA	PLA2G4A,PTGS2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS2	81402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PTGS2	287689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGS2	289339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	187181531	187181740	187181636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGS2	533972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	189756312	189756642	189756477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373J16.2	655889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	191536543	191536778	191536610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	1146535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	192583467	192583478	192583473	Y	RGS1	NA	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	99835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	193080839	193080969	193080896	Y	NA	GLRX2,CDC73	NA	NA	NA	NA	GLRX2	7595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	193284093	193284405	193284249	Y	NA	NA	CDC73,B3GALT2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC73	194946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	193647067	193647431	193647225	Y	NA	NA	CDC73,B3GALT2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC73	557920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	194724030	194724097	194724064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	1634883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	196317530	196317735	196317633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT2	258620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P32	173581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	198237796	198237952	198237874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	113703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	198979759	198979985	198979807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	374284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	199187777	199188161	199187969	Y	NA	NA	LOC100131234	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-104D3.2	166108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200076437	200076447	200076441	Y	NR5A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	300737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200401856	200401944	200401900	Y	NA	ZNF281	NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	24672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200448306	200448569	200448314	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2,ZNF281	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF281	71122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	200502246	200502265	200502256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF14	85597	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200622357	200622464	200622411	Y	NA	KIF14,DDX59	NA	NA	NA	NA	DDX59	14633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf106	74071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200862818	200862950	200862864	Y	NA	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	4642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	200865264	200865418	200865332	Y	C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	200865457	200866265	200866098	Y	TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106	C1orf106	NA	NA	NA	NA	C1orf106	7281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	TNNI1,PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201494461	201494578	201494476	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	17877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201618983	201619286	201619160	Y	NA	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28572	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	201864045	201864232	201864194	Y	NA	SHISA4,LMOD1	NA	NA	NA	NA	SHISA4	8237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	57435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202055098	202055409	202055277	Y	ELF3,GPR37L1	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	56460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	202161674	202161898	202161786	Y	NA	ARL8A,PTPN7,LGR6	NA	NA	NA	NA	LGR6	645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	202216987	202217221	202217073	Y	UBE2T	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	55958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202219033	202219251	202219134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	58004	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202872285	202872308	202872297	Y	NA	RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12	RABIF	MCF7	ChIA-PET	22265404	HNRNPA1P59	6632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	202937248	202937378	202937319	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	KLHL12,ADIPOR1,CYB5R1,TMEM183A	NA	NA	NA	NA	CYB5R1	2840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	203122696	203123081	203122889	Y	FMOD,ADORA1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA1	64914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203289937	203290406	203290261	Y	BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	17318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	24482	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	203489584	203489741	203489635	Y	BTG2	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	46628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	48055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	203619380	203619832	203619595	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	25691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203723839	203723956	203723897	Y	NA	LAX1,ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	LAX1	8348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203732858	203733184	203733007	Y	BTG2,SOX13,LAX1	LAX1,ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	LAX1	554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr1	204071387	204071653	204071532	Y	LAX1,PPP1R15B,SOX13	SOX13,ETNK2	NA	NA	NA	NA	SOX13	31144	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205094090	205094365	205094227	Y	TMEM81	RBBP5	NA	NA	NA	NA	RBBP5	4947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	205253892	205254222	205253971	Y	NUAK2	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	34661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205262860	205263030	205262955	Y	CNTN2,CDK18	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	25853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205267691	205267999	205267801	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	20884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	205270500	205270865	205270692	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	18018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	205283024	205283394	205283339	Y	RBBP5,NUAK2	NUAK2,SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	5489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205288770	205288915	205288818	Y	TMEM81,RBBP5,NUAK2	SNRPGP10	NA	NA	NA	NA	NUAK2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	205410761	205411314	205411209	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	11768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205418015	205418182	205418073	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	4900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	205640119	205640294	205640209	Y	NA	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	7293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	206260548	206260903	206260855	Y	C1orf186	NA	AVPR1B	IMR90	Hi-C	24141950	IKBKE	380888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	206754982	206755508	206755274	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	28396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	206955889	206956132	206956011	Y	IL19,IL10	NA	IL10,DYRK3,MAPKAPK2,IL19,FAIM3,EIF2D	IMR90	Hi-C	24141950	MAPKAPK2	99600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	207063537	207063710	207063660	Y	RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	5078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	207821800	207821952	207821876	Y	CR1L	CR1L	NA	NA	NA	NA	CR1L	5342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	209215272	209215534	209215454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	224034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	209331001	209331148	209331080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	108420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	209556903	209557123	209556922	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	43042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	209571959	209572357	209572220	Y	LAMB3	MIR205HG	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	27808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	209601291	209601611	209601405	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	1126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	209606620	209606963	209606837	Y	NA	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	6455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	210186039	210186345	210186192	Y	SYT14	NA	NA	NA	NA	NA	SYT14	76501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	210468396	210468551	210468467	Y	HHAT	HHAT	SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	HHAT	31045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH1	269924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	211084997	211085192	211085095	Y	NA	NA	HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	KCNH1	220265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211258865	211259253	211259186	Y	NA	KCNH1	NA	NA	NA	NA	KCNH1	46204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211349385	211349483	211349480	Y	NA	KCNH1,RP11-543B16.1	HHAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-543B16.1	4566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211662962	211663302	211663132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A1	86782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211841432	211841643	211841573	Y	NA	NEK2	NA	NA	NA	NA	NEK2	5317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	213088828	213089171	213088880	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	32691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	213090277	213090696	213090331	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	31166	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.75028012997198
chr1	213160414	213160619	213160568	Y	VASH2	VASH2,ANGEL2	NA	NA	NA	NA	ANGEL2	26549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	213605102	213605329	213605216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	382513	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	213901619	213901794	213901707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PROX1	252730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	214332608	214332757	214332710	Y	NA	NA	RPS6KC1	IMR90	Hi-C	24141950	SMYD2	119688	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	214490616	214490868	214490808	Y	SMYD2	SMYD2	NA	NA	NA	NA	SMYD2	38171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	214648804	214649025	214648867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	74767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	215132018	215132196	215132107	Y	KCNK2	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	89941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	215164018	215164287	215164098	Y	NA	NA	KCNK2,CENPF,PTPN14	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	121941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	216286476	216286776	216286627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD3	547741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	217046388	217046574	217046481	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	262523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	217247144	217247287	217247272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESRRG	61810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	218338759	218338973	218338866	Y	NA	NA	ESRRG	IMR90	Hi-C	24141950	RRP15	117656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	218774491	218774602	218774534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	256914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	219498496	219498646	219498574	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	153310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	219547203	219547495	219547349	Y	NA	NA	LOC728463,TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	202017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	219722653	219722988	219722821	Y	NA	NA	RRP15	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	377467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	219955751	219955972	219955860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPRS	262028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	220512278	220512401	220512362	Y	NA	NA	MARK1	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3GAP2	68482	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	221340978	221341184	221341062	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	382877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	221612801	221613016	221612980	Y	DUSP10,DUSP10	NA	C1orf140,HLX,MIA3	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	300502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	221631911	221632097	221631999	Y	NA	NA	DUSP10,HHIPL2	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	281421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	222060426	222060817	222060685	Y	NA	NA	DUSP10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP10	146908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222135050	222135329	222135215	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	221532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222142763	222142919	222142838	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	229245	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	222152569	222152616	222152593	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	239051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222156808	222157129	222156969	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	243290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222273748	222273768	222273757	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	360230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	223203713	223203863	223203798	Y	NA	NA	FAM177B	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	217307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	223204032	223204174	223204104	Y	NA	NA	FAM177B	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	217626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	223276523	223276867	223276768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD4	258677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	223326849	223326980	223326946	Y	NA	NA	TLR5,SUSD4,CAPN8	IMR90	Hi-C	24141950	SUSD4	208564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.02018652442871
chr1	224458940	224459060	224459002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NVL	57029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	CNIH3,WDR26	NA	NA	NA	NA	CNIH3	21944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	224685994	224686507	224686055	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	63259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	224688435	224688713	224688487	Y	NA	NA	WDR26,CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	65700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	225778250	225778416	225778333	Y	ENAH	NA	NA	NA	NA	NA	ENAH	60428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	226063760	226064118	226063778	Y	NA	TMEM63A,LEFTY1,PYCR2	NA	NA	NA	NA	TMEM63A	3951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3,MIXL1	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	226430284	226430401	226430343	Y	NA	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	20965	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	MIXL1	NA	NA	NA	NA	MIXL1	25811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	226592689	226592838	226592760	Y	PSEN2,PARP1	PARP1,RP11-118H4.1	NA	NA	NA	NA	PARP1	942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	228079986	228080118	228080041	Y	ZNF678,WNT9A	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	53481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	228274281	228274680	228274319	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	228848738	228848880	228848809	Y	NA	RHOU	NA	NA	NA	NA	RHOU	19944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	228962635	228963190	228962905	Y	RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	93811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229166537	229166799	229166668	Y	RAB4A,C1orf96	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	237976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	229307664	229307899	229307845	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	96876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	229326926	229327085	229327016	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	77690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229335784	229335916	229335795	Y	RHOU,C1orf96	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	68859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229366402	229366798	229366551	Y	C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	37977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229388898	229389111	229388968	Y	URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,NUP133,ABCB10	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	15664	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	229544503	229544714	229544606	Y	ACTA1	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	23131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229546455	229546768	229546488	Y	NA	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	21077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	229547907	229548085	229548007	Y	NA	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	19760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	229570562	229570652	229570607	Y	NA	ACTA1	NA	NA	NA	NA	ACTA1	2717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	230061007	230061186	230061097	Y	ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	130350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	230249347	230250007	230249645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	57811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	230463743	230463957	230463850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	272207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	231513422	231513769	231513758	Y	NA	EXOC8,EGLN1	NA	NA	NA	NA	EXOC8	41824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	231612238	231612337	231612289	Y	NA	RP11-295G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-295G20.2	49965	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	108200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	232466294	232466418	232466356	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	499515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	12.9285972901666
chr1	233234073	233234169	233234121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	149722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	233241853	233241955	233241904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	157502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	233250723	233251216	233250828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	166372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	233472763	233473058	233472911	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	PCNXL2	43304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	233619313	233619702	233619577	Y	NA	NA	SLC35F3	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK1	128048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234341903	234342254	234341929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.1	148633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234668185	234668630	234668443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARBP1	55336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234754264	234754665	234754337	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	10993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	234852227	234852379	234852265	Y	NA	NA	LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-781K5.4	72192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	234862200	234862535	234862470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	82165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	235151923	235152024	235152010	Y	ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	137228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	102303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr1	236284000	236284100	236284043	Y	NA	GPR137B	LGALS8,LGALS8-AS1,EDARADD,HEATR1,MTR	IMR90	Hi-C	24141950	GPR137B	19732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	236414606	236414689	236414648	Y	GPR137B	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	28630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	237508753	237509046	237508848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	305248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	237833544	237833823	237833684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RYR2	630039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	239877993	239878320	239878052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN2	297328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	240169714	240169802	240169754	Y	NA	FMN2	NA	NA	NA	NA	FMN2	5846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	241302172	241302404	241302286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	142078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	241693216	241693255	241693236	Y	KMO	FH	NA	NA	NA	NA	FH	12155	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	242611588	242611883	242611736	Y	PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	74115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	243476313	243476499	243476468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	58993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	243644284	243644683	243644595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	226964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	243654647	243654885	243654744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	237327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	199895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	203127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244417754	244418100	244418029	Y	AKT3,AKT3,ZNF238,ADSS	NA	LOC339529,AKT3,SDCCAG8,ZNF238	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	195336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244439620	244440012	244439977	Y	NA	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,ZNF238,ADSS,C1orf100	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	173424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	244895593	244895970	244895904	Y	ADSS,PPPDE1,EFCAB2	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	120829	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	244898732	244899130	244898941	Y	ADSS,PPPDE1	NA	PPPDE1,C1orf101,EFCAB2	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	117669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	245057262	245057513	245057307	Y	NA	HNRNPU-AS1,HNRNPU	EFCAB2,HNRNPU,C1orf101,COX20,SMYD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HNRNPU	31418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	245162358	245162654	245162559	Y	NA	EFCAB2	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	31351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	245255337	245255432	245255385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	60855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	245544255	245544624	245544440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	227968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr1	247295865	247296225	247296038	Y	ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	30191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	247325578	247326237	247325673	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	37125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr1	247381482	247381863	247381677	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	18120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr1	247511365	247511433	247511416	Y	NLRP3,NLRP3	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF496	18217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	247540028	247540387	247540122	Y	NA	ZNF496	AHCTF1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF496	46880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr1	247553531	247554143	247553893	Y	AHCTF1,NLRP3,NLRP3	NA	AHCTF1,ZNF496	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF496	60383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr10	1351911	1352187	1351989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	258433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	1374654	1374709	1374682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	281176	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	1390281	1390451	1390366	Y	ADARB2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	296803	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr10	3441336	3441600	3441518	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	228333	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	3868851	3869035	3868973	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	43378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	4358748	4358982	4358870	Y	NA	NA	KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	467839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	4775344	4775645	4775580	Y	NA	NA	LOC338588,LOC100216001,KLF6	MCF7	ChIA-PET	22265404	AKR1E2	51176	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	3494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	44811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	6095822	6096104	6096032	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	32846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	6237775	6238114	6237949	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	52894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	6440433	6440653	6440526	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	179610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	254215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	123471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	7583796	7584039	7583868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	122922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	7667725	7668107	7668024	Y	NA	ITIH5	NA	NA	NA	NA	ITIH5	38854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	7998591	7998768	7998645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	92736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	8262091	8262339	8262214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	168524	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	8899367	8899664	8899620	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	805800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	10754108	10754441	10754195	Y	CELF2,CELF2	NA	LOC254312,CELF2	IMR90	Hi-C	24141950	SFTA1P	80502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	11054573	11055101	11054777	Y	CELF2,CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	219630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	11077382	11077525	11077432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	242439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	11737081	11737223	11737138	Y	NA	ECHDC3	USP6NL	IMR90	Hi-C	24141950	ECHDC3	45142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	12791439	12791458	12791449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	347991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	13131256	13131517	13131341	Y	NA	OPTN,CCDC3	CDC123,CAMK1D	IMR90	Hi-C	24141950	OPTN	7932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	13800483	13800712	13800626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	173556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.36859797682441
chr10	13924181	13924825	13924574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	297254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	14217181	14217543	14217379	Y	FRMD4A	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	284598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	14438165	14438288	14438234	Y	NA	NA	FRMD4A,MIR1265	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	63853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	14931162	14931541	14931180	Y	NA	SUV39H2	NA	NA	NA	NA	SUV39H2	12343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	15165954	15166084	15166019	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	28636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	15306901	15307170	15307036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	98209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	15386960	15387149	15387011	Y	NMT2	FAM171A1	NA	NA	NA	NA	FAM171A1	23912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	16802586	16802595	16802591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	54932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	17456684	17457055	17456726	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	29749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLA	87612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	17652629	17652974	17652802	Y	NA	PTPLA,STAM	NA	NA	NA	NA	PTPLA	4402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	20841595	20841995	20841796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	619121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	24770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	21581688	21582509	21582285	Y	NA	NA	C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-275N1.1	77370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr10	21683965	21683997	21683982	Y	C10orf140	RP11-275N1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	24086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22039558	22039808	22039651	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	180264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.94766329470735
chr10	22265792	22265961	22265887	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	DNAJC1	24737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22625615	22626028	22625937	Y	DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	6371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG6	92932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG6	94412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	22890368	22890535	22890414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	110949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22894198	22894467	22894337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	107017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	25786270	25786305	25786288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR158	324279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	26775274	26775560	26775412	Y	APBB1IP,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	27069899	27070563	27070182	Y	MASTL,ACBD5,PDSS1,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	ABI1	77453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	27419520	27419901	27419745	Y	NA	ANKRD26,MASTL,YME1L1	NA	NA	NA	NA	MASTL	21852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	27669140	27669156	27669148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB18	122041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	28725980	28726021	28726001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	93401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	29449059	29449232	29449154	Y	NA	NA	WAC,LYZL1,BAMBI	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	247099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	29907407	29907668	29907538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	116042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	113795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	29922205	29922549	29922392	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	101161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	29944854	29945090	29945003	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	78620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	29948331	29948643	29948337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIL	75067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	SVIL	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SVIL	49497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	31805465	31805855	31805582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	198089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	32049659	32049685	32049672	Y	NA	NA	ZNF438,ZEB1,LYZL2	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	166057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	32301568	32301771	32301670	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	41588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	33798158	33798349	33798267	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	174968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	35059349	35059608	35059479	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	42645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	35070002	35070125	35070067	Y	CREM	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	32128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	35421114	35421320	35421181	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	7395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	35425292	35425645	35425387	Y	CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	35431185	35431238	35431212	Y	NA	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	17466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	35717658	35717859	35717796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	183705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	38149659	38150080	38149945	Y	ZNF248	RP11-162G10.1,ZNF248	NA	NA	NA	NA	ZNF248	4625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	42389884	42390116	42390007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00839	578875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	42398389	42399045	42398432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00839	569946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	42800348	42800675	42800512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00839	168316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr10	43817898	43817965	43817923	Y	NA	FXYD4	ZNF487P	IMR90	Hi-C	24141950	FXYD4	47125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	43936251	43936518	43936384	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	22065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	44806540	44806774	44806646	Y	NA	NA	TMEM72-AS1,LOC100506835,ZNF32-AS3,RASSF4,ZNF32,C10orf136,LOC283033,CXCL12	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL12	73167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	45914844	45915133	45915015	Y	NA	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	47183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	47008240	47008359	47008300	Y	GPRIN2	SYT15	NA	NA	NA	NA	SYT15	38840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	50008368	50008659	50008598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	146058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	50606394	50606776	50606708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	138310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	51039519	51039692	51039605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	71094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	51045236	51045418	51045327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGDHL	76811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	52082649	52082859	52082782	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	52085013	52085461	52085351	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	62275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	53798976	53799363	53799139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	272693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	53930569	53930919	53930744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	141137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	54737961	54738286	54738123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKK1	665905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	58240589	58240612	58240601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZWINT	121553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	59388391	59388635	59388513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPMK	637059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	1034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	63779948	63780456	63780395	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	120889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	64292101	64292416	64292208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	160150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65016713	65017097	65017085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	125663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	131614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65125268	65125651	65125502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	59406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65269177	65269730	65269542	Y	NA	JMJD1C,REEP3	REEP3,JMJD1C,LOC84989	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	REEP3	9393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	67154801	67155033	67154934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA2P3	571472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	68508958	68509004	68508981	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	174760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	68802540	68803252	68802892	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	118776	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	68832259	68832513	68832425	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	148495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	68843787	68844099	68844033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	160023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	69621525	69621936	69621738	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1,MYPN,HERC4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIRT1	20491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	80202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	69947860	69948185	69948022	Y	RUFY2,RUFY2,MYPN	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	114755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	70736024	70736384	70736191	Y	SRGN	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	35098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	70853829	70854114	70853839	Y	NA	VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	27154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	71328689	71329080	71328776	Y	NA	NEUROG3	NA	NA	NA	NA	NEUROG3	1914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	72202124	72202468	72202392	Y	EIF4EBP2,NODAL	EIF4EBP2,NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	3239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.2437380418104
chr10	72218739	72219166	72218841	Y	NA	NODAL	KIAA1274,SGPL1,EIF4EBP2,ADAMTS14,NODAL,C10orf27	IMR90	Hi-C	24141950	NODAL	13032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	72253805	72253950	72253868	Y	NA	NODAL	NA	NA	NA	NA	NODAL	48098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	74082335	74082540	74082412	Y	DDIT4	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	30448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	74544491	74544662	74544597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCU	94602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	74991679	74992005	74991988	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	14615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	75211378	75211476	75211427	Y	NA	ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-345K20.2	30924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	75349200	75349597	75349539	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	USP54	FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	34114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	USP54	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	USP54	22222	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	75725888	75726135	75726026	Y	NA	VCL	CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	VCL	29737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	75768391	75768772	75768419	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	12519	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	79268227	79268357	79268284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	127996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	79561522	79561805	79561686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	122573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	79633336	79633510	79633397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	50868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	79636555	79636603	79636579	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	47775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	79637463	79637788	79637654	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	79670022	79670276	79670149	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	14102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24	224207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	80684242	80684460	80684352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	142332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80917330	80917751	80917473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	90538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	80990068	80990387	80990161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	114838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	80997251	80997825	80997438	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	107400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	81010188	81010619	81010281	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	94606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	82211651	82212098	82211867	Y	SH2D4B	FAM213A	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	82214819	82214901	82214871	Y	TSPAN14	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	2897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	85324845	85324972	85324948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	514213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	85939285	85939414	85939359	Y	NA	GHITM,CDHR1	NA	NA	NA	NA	CDHR1	12996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	86152070	86152317	86152175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	165882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	88004394	88004782	88004588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRID1	119468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	SNCG,MMRN2,AGAP11	NA	NA	NA	NA	SNCG	2012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	88804079	88804159	88804119	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	FAM35A	47759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	88866849	88867228	88867039	Y	NA	FAM35A,GLUD1	NA	NA	NA	NA	GLUD1	14226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	89827526	89827767	89827673	Y	KLLN,PTEN	NA	PTEN,RNLS,KLLN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	124267	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	89870251	89870340	89870276	Y	PTEN	NA	PTEN,KLLN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	166992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	90620610	90621100	90621016	Y	IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	STAMBPL1	ACTA2,STAMBPL1,LIPA,CH25H,ANKRD22	IMR90	Hi-C	24141950	STAMBPL1	16391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	91199827	91200195	91200013	Y	NA	IFIT1,LIPA,IFIT5	NA	NA	NA	NA	IFIT5	27484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	93647022	93647304	93647153	Y	FGFBP3	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	FGFBP3	19936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	95032769	95033088	95033006	Y	NA	RP11-624L12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-624L12.1	9227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	95513454	95513618	95513536	Y	FRA10AC1,LGI1	LGI1	LGI1,O3FAR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LGI1	1948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	95851610	95851772	95851690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCE1	99864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	96130414	96130532	96130435	Y	TBC1D12	NOC3L,TBC1D12	PLCE1,NOC3L	IMR90	Hi-C	24141950	NOC3L	9698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	RP11-310E22.4,PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97205086	97205311	97205223	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	113860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97218383	97218641	97218563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	100530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97319295	97319590	97319525	Y	C10orf129,SORBS1,SORBS1	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97327639	97327692	97327665	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	8468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	97809290	97809583	97809571	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	8139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98308552	98308827	98308687	Y	LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3	TLL2,NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	NPM1P26	9115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	NPM1P26,TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98432353	98432529	98432425	Y	LCOR,PIK3AP1	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	45742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98464941	98465141	98465037	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	13130	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98468328	98468564	98468493	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	9707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	98507799	98508110	98507962	Y	LCOR,PIK3AP1	PIK3AP1	PIK3AP1,SLIT1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL13AP5	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	12406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	99165908	99166118	99166051	Y	C10orf12,ARHGAP19,FRAT1,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RRP12	6781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	99497485	99497673	99497579	Y	NA	MARVELD1,ZFYVE27,SFRP5	NA	NA	NA	NA	ZFYVE27	2607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	100019738	100019959	100019849	Y	C10orf28	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	6048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	ABCC2	583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	102030171	102030375	102030254	Y	SEC31B	CHUK,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2	NA	NA	NA	NA	CWF19L1	4734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	102949466	102949800	102949508	Y	NA	LBX1	BTRC,C10orf76,TLX1NB,FBXW4,POLL,DPCD	IMR90	Hi-C	24141950	LBX1	37751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.56598114155978
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr10	103539197	103539512	103539463	Y	NA	FGF8,NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	NPM3	1658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	103575139	103575373	103575256	Y	NA	FGF8,NPM3,MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	1323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr10	105014349	105014646	105014389	Y	NA	INA	NA	NA	NA	NA	INA	20274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	105409078	105409369	105409249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALHM2	198418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr10	105532054	105532211	105532109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	81090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr10	107870046	107870052	107870049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	425966	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	108152037	108152234	108152222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP5	707957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	111766410	111766784	111766651	Y	ADD3	ADD3	NA	NA	NA	NA	ADD3	12284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	111834173	111834352	111834276	Y	ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	80047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112401121	112401469	112401220	Y	SMC3,RBM20	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112402938	112403137	112402952	Y	NA	RBM20	NA	NA	NA	NA	RBM20	783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	112466316	112466772	112466606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM20	64161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112562548	112562691	112562671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	66874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	114109921	114110133	114110011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC6	94539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	114816164	114816362	114816263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	108155	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	115122408	115122600	115122509	Y	TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	314342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	116678132	116678409	116678271	Y	NA	TRUB1	NA	NA	NA	NA	TRUB1	17543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	119046334	119046783	119046648	Y	NA	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	47730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	120244875	120245269	120244982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLHR	107891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	138826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	121076325	121076636	121076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	139980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	121153244	121153752	121153743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	146468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	121446860	121447228	121446967	Y	NA	BAG3,INPP5F	NA	NA	NA	NA	INPP5F	36381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	86947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	123283349	123283529	123283438	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	FGFR2	72443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	123923874	123924133	123924069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	177185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	125730230	125730378	125730329	Y	NA	CPXM2	NA	NA	NA	NA	CPXM2	32447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	126139767	126140160	126139923	Y	NKX1-2	OAT,NKX1-2,LHPP,RPS10P18	NA	NA	NA	NA	NKX1-2	3014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr10	126359464	126359807	126359742	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	71031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	127576777	127576887	127576832	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr10	130440713	130441095	130440908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	518064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134330832	134331178	134331005	Y	NA	RP11-432J24.5,INPP5A	INPP5A,ADAM8,C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.5	1137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134349556	134349919	134349753	Y	JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134360968	134361428	134361255	Y	INPP5A	RP11-432J24.5,INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	11644	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134913452	134913599	134913525	Y	NA	GPR123	NA	NA	NA	NA	GPR123	31019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	134975074	134975296	134975198	Y	NA	KNDC1	NA	NA	NA	NA	KNDC1	3123	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr10	135048867	135049308	135048949	Y	TUBGCP2,ADAM8	UTF1,ADAM8	NA	NA	NA	NA	VENTX	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	333787	334164	333964	Y	NA	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM5,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8250	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM5,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr11	341474	341670	341587	Y	NA	IFITM5,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	RIC8A,SIRT3,BET1L,IFITM3,IFITM1,IFITM5,PSMD13,IFITM2,NLRP6,ATHL1,PTDSS2,SIGIRR,ANO9,B4GALNT4,PKP3,RNH1	IMR90	Hi-C	24141950	IFITM3	15937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	B4GALNT4	16705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	741538	741804	741722	Y	IRF7,IRF7	EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1	NA	NA	NA	NA	TALDO1	3525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	1245627	1245992	1245771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	82892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	1936655	1937042	1936845	Y	TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	29466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2082720	2083054	2082737	Y	NA	NA	MOB2,IGF2-AS1,IGF2,INS-IGF2,LSP1,TH,MIR4686	IMR90,K562,GM12878,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	H19	62020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2212480	2212615	2212548	Y	ASCL2,TH	IGF2,TH	NA	NA	NA	NA	TH	21373	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2238005	2238048	2238027	Y	NA	TH	KCNQ1	IMR90	Hi-C	24141950	TH	46898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2619837	2620105	2619972	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	99119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	2643075	2643474	2643317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	75750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	2705021	2705206	2705044	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	14018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2714612	2714953	2714746	Y	NA	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	4271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195,TSSC2	NA	NA	NA	NA	TSSC2	43548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	6290237	6290402	6290320	Y	NA	FAM160A2,CCKBR,PRKCDBP	NA	NA	NA	NA	CCKBR	11271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	6344620	6344857	6344735	Y	NA	PRKCDBP	NA	NA	NA	NA	PRKCDBP	4743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2,DNHD1	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2,DNHD1	NA	NA	NA	NA	DNHD1	6684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	6676048	6676412	6676073	Y	OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1	TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	DCHS1,MRPL17,GVINP1	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	7719377	7719648	7719531	Y	NA	CYB5R2	NA	NA	NA	NA	CYB5R2	22924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	8166799	8166849	8166831	Y	NA	RIC3	NA	NA	NA	NA	RIC3	21753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	8679125	8679412	8679143	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	22546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	8973817	8973979	8973898	Y	NA	ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2	C11orf16	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9B-AS1	10243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9023312	9023663	9023569	Y	ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	NRIP3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	SCUBE2	NA	NA	NA	NA	SCUBE2	27725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	9697347	9697585	9697499	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	13723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70,SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	45590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	10302186	10302573	10302380	Y	NA	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	SBF2	11181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	10373282	10373523	10373408	Y	ADM,AMPD3	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	10373632	10373924	10373723	Y	NA	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	10634601	10634999	10634904	Y	MRVI1,MRVI1,MRVI1	NA	NA	NA	NA	NA	MRVI1-AS1	73782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	11265782	11265931	11265843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBED5	387439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	12214399	12214709	12214476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	100856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	13283262	13283494	13283392	Y	NA	ARNTL	ARNTL	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	12705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	14354673	14355035	14354941	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	29017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	14362320	14362599	14362499	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	21453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1,CALCB	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	SNORD14A,RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	17164162	17164523	17164517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C2A	63007	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	17878699	17879035	17878754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERGEF	153674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	20618541	20618661	20618593	Y	NA	RP11-701I24.1	NA	NA	NA	NA	RP11-701I24.1	24809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	22219962	22220145	22220069	Y	NA	ANO5	NA	NA	NA	NA	ANO5	7240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	22362163	22362363	22362263	Y	FANCF,SLC17A6	SLC17A6	NA	NA	NA	NA	SLC17A6	4520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	22379505	22379838	22379672	Y	ANO5	SLC17A6	NA	NA	NA	NA	SLC17A6	21862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	22814174	22814335	22814255	Y	SVIP	SVIP	NA	NA	NA	NA	SVIP	35510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	25127401	25127422	25127412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP2	610885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	26594453	26594684	26594520	Y	SLC5A12,MUC15	MUC15	NA	NA	NA	NA	MUC15	2673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	27636401	27636479	27636450	Y	NA	RP11-587D21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	35174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	27657269	27657593	27657433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	56042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	28795482	28795636	28795549	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	667627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	28864582	28864807	28864697	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	736727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	29974880	29975070	29974975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	631349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	33200855	33201201	33201029	Y	HIPK3	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	18938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	33313001	33313236	33313097	Y	NA	HIPK3	NA	NA	NA	NA	HIPK3	36783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	33556123	33556337	33556230	Y	NA	NA	C11orf41	IMR90	Hi-C	24141950	CD59	199654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	33889104	33889440	33889281	Y	ABTB2,LMO2,LMO2	LMO2	NA	NA	NA	NA	LMO2	22396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	35395403	35395808	35395629	Y	SLC1A2	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	43802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	35409513	35409852	35409720	Y	CD44,SLC1A2,SLC1A2	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	29758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	35443384	35443774	35443615	Y	SLC1A2,SLC1A2	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	3774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9,PRR5L	NA	NA	NA	NA	PRR5L	15365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	36430795	36431099	36430893	Y	TRAF6,PRR5L,PRR5L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF6	98723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	36521882	36522155	36522112	Y	NA	TRAF6	NA	NA	NA	NA	TRAF6	7667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	2374491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	40302727	40302738	40302733	Y	LRRC4C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1255246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	43760547	43760939	43760743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	139422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	43773446	43773547	43773497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	126814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	44883806	44884166	44884088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	86674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	44884936	44885127	44885041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	85713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	45107723	45107880	45107802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	136883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	45685212	45685518	45685319	Y	SYT13,MAPK8IP1,CRY2,CRY2,CHST1	CHST1	NA	NA	NA	NA	CHST1	40	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	46004522	46004898	46004712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYLTL1B	63350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	47226153	47226377	47226265	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2	DDB2,PACSIN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	DDB2	8116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47252770	47253009	47252890	Y	NA	PACSIN3,DDB2,NR1H3,ACP2,MADD	NA	NA	NA	NA	NR1H3	14842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47867685	47867881	47867783	Y	OR4X1	NUP160	NA	NA	NA	NA	NUP160	226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47965488	47965599	47965552	Y	NA	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRJ	34514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	49873546	49873647	49873598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	1873433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,YPEL4,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	41033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	57801296	57801572	57801563	Y	OR9I1,OR1S1,OR5B12,OR6Q1	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND1	282581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	59544042	59544226	59544124	Y	OR4D6,PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	32119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	59651741	59651793	59651768	Y	NA	TCN1	NA	NA	NA	NA	TCN1	19693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	59963490	59963874	59963781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-736I10.2	120667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60871198	60871450	60871295	Y	CD6,SDHAF2,CD5	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	55639	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60930012	60930347	60930224	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60931528	60932206	60931841	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	4439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.40186867757628
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	LRRC10B	7635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr11	61434550	61434949	61434623	Y	NA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	61484059	61484366	61484213	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,DAGLA,FTH1	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	38154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,TMEM258,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	61762479	61762659	61762569	Y	C11orf9	FTH1	FADS3,FADS2,RAB3IL1,FADS1,BEST1,FTH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	29347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62143612	62143665	62143638	Y	NA	ASRGL1,RCC2P6	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	6994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	62267714	62268111	62267986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK	53596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62272728	62273223	62272788	Y	ROM1	AHNAK	NA	NA	NA	NA	AHNAK	48484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	9310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62324383	62324580	62324456	Y	WDR74,NXF1,EML3	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	2676	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,GNG3,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr11	62718302	62718551	62718368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	96784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	HRASLS5,LGALS12	NA	NA	NA	NA	LGALS12	27320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	53798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	44226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	63377121	63377300	63377211	Y	HRASLS5,LGALS12,LGALS12,PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	5055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	63377789	63377920	63377869	Y	PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	4435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65075657	65076292	65075967	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65076655	65076852	65076688	Y	EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65083603	65083722	65083697	Y	NA	CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65252951	65253044	65253026	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65257502	65257849	65257676	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.44112120654577
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65342581	65342818	65342732	Y	TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1	LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	EHBP1L1	1072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	65555605	65556077	65555902	Y	TSGA10IP,CATSPER1	OVOL1,SNX32	NA	NA	NA	NA	OVOL1	3112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	66659730	66659912	66659812	Y	CLCF1,RBM4	LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	37612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	67028976	67029390	67029158	Y	NA	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	2491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	67827034	67827402	67827396	Y	PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA	NDUFS8,TCIRG1	NA	NA	NA	NA	TCIRG1	22551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	68516686	68516842	68516764	Y	NA	MTL5	NA	NA	NA	NA	MTL5	190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	MRGPRF	2332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	NA	NA	NA	NA	MRGPRF	88	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	68808319	68808729	68808592	Y	IGHMBP2,TPCN2	MRGPRF,TPCN2	MTL5,CPT1A,IGHMBP2,MRPL21,MRGPRD,MRGPRF,TPCN2,CCND1,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	5636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	AP000439.1	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.1	2882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.1	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.1	19636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	69517228	69517437	69517319	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	FGF19	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	69586936	69586990	69586963	Y	FGF4	FGF4	NA	NA	NA	NA	FGF4	1181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	69794643	69794820	69794756	Y	FADD,ANO1	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	35162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	69809602	69809958	69809614	Y	NA	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	20024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	69811990	69812239	69812133	Y	FGF4	RP11-626H12.1	ANO1,ORAOV1,FGF4,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-626H12.1	17743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	69906060	69906083	69906072	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	16325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	69969786	69970187	69969839	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	47378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	70504156	70504231	70504194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	261562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF121	66878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	71780398	71780482	71780403	Y	IL18BP,IL18BP	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1,FOLR3	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	8900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	72381210	72381586	72381345	Y	NA	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	2049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	72447514	72448295	72447639	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	54349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	72462370	72462747	72462399	Y	NA	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	39897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARHGEF17	48709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	73180484	73180765	73180625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELT	95175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	73551141	73551517	73551329	Y	NA	PAAF1	NA	NA	NA	NA	PAAF1	34227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	74077556	74077917	74077717	Y	NA	PGM2L1	NA	NA	NA	NA	PGM2L1	29601	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	74176233	74176573	74176529	Y	KCNE3	KCNE3,AP001372.2,LIPT2,POLD3	NA	NA	NA	NA	KCNE3	201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75041361	75041638	75041486	Y	ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	19235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	75060567	75060771	75060596	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75060875	75061139	75061045	Y	UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	2	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	75080203	75080380	75080292	Y	ARRB1	ARRB1,RPS3,SNORD15B	RPS3,ARRB1,GDPD5,XRRA1,NEU3,SPCS2,SLCO2B1,LOC100507050,KLHL35,SERPINH1,MAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARRB1	19330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75312070	75312308	75312189	Y	MAP6	SERPINH1	NA	NA	NA	NA	SERPINH1	40969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75537561	75537829	75537710	Y	ARRB1,DGAT2,UVRAG	UVRAG	NA	NA	NA	NA	UVRAG	13349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75748582	75748924	75748753	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	170856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	163545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	138198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	76285451	76285730	76285592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC32	94061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	76883031	76883248	76883107	Y	NA	MYO7A	NA	NA	NA	NA	MYO7A	45721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	77696711	77696891	77696801	Y	NA	INTS4	C11orf67,RSF1	IMR90	Hi-C	24141950	INTS4	6833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	78050611	78050886	78050840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	76508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	83264586	83264960	83264849	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	269136	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	83396793	83397083	83396942	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	401343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	86792626	86792948	86792684	Y	NA	TMEM135	NA	NA	NA	NA	TMEM135	45740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	89027558	89027638	89027597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAALAD2	835045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	89937153	89937335	89937244	Y	NA	CHORDC1	NA	NA	NA	NA	CHORDC1	17197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	91980380	91980674	91980445	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	948456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	94383983	94384336	94384252	Y	NA	NA	AMOTL1	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	53261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr11	95940732	95941197	95941091	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	133147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	100547720	100547959	100547794	Y	ARHGAP42	ARHGAP42	ARHGAP42	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP42	8425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	102956908	102957200	102957055	Y	NA	DCUN1D5,DYNC2H1	NA	NA	NA	NA	DCUN1D5	3744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	103495901	103496466	103496275	Y	NA	NA	DYNC2H1,PDGFD	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	217516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	103504226	103504419	103504320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	225841	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	104128696	104129051	104128955	Y	NA	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFD	95589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	108487361	108487672	108487557	Y	EXPH5	EXPH5,DDX10	NPAT,EXPH5,ATM	IMR90	Hi-C	24141950	EXPH5	24896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	109899806	109900193	109900029	Y	NA	NA	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	61894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	110002516	110002895	110002708	Y	RDX	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	40429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	110581726	110581943	110581819	Y	ARHGAP20	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP20	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	111929773	111930099	111929899	Y	DIXDC1	DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD	NA	NA	NA	NA	C11orf57	12711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	111990651	111990899	111990830	Y	NA	C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18	NA	NA	NA	NA	SDHD	35024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	113708252	113709087	113708915	Y	CLDN25	USP28	NA	NA	NA	NA	USP28	35205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr11	113929515	113929738	113929537	Y	NA	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	1200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	17089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr11	114162667	114162750	114162694	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	114309073	114309125	114309098	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	965	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	115578281	115578591	115578457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-136I14.5	127266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	115945238	115945510	115945465	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-136I14.5	494223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	116310023	116310403	116310367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	331301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	116458442	116458607	116458525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUD13	183097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	116884410	116884712	116884644	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	20055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	117573445	117573815	117573739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	112425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	117679991	117680281	117680071	Y	IL10RA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	5959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	117685393	117685836	117685712	Y	IL10RA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	117687155	117687422	117687274	Y	NA	DSCAML1	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	117881559	117881948	117881858	Y	AMICA1,MPZL3,AMICA1,IL10RA	IL10RA	NA	NA	NA	NA	IL10RA	26496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46	NA	NA	NA	NA	IFT46	40065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46	NA	NA	NA	NA	IFT46	48483	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	10.2639245662391
chr11	118787524	118788054	118787588	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L,FOXR1	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L,FOXR1	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,BCL9L,FOXR1	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L,FOXR1	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr11	119598046	119598312	119598172	Y	USP2	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	120053242	120053546	120053328	Y	NA	TRIM29,OAF	POU2F3,LOC649133	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM29	691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	120363124	120363469	120363220	Y	NA	GRIK4	NA	NA	NA	NA	GRIK4	16999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	122311334	122311672	122311591	Y	NA	NA	SC5DL,MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	UBASH3B	212711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	122616909	122617169	122616983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	92526	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	122847536	122847832	122847753	Y	C11orf63,BSX	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	56743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr11	122949899	122950101	122950094	Y	CLMP	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	17961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	122956299	122956503	122956402	Y	NA	SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	24361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	123407861	123408201	123408031	Y	NA	GRAMD1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1B	13517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	123468998	123469339	123469251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN3B	54613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	123613222	123613605	123613414	Y	NA	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	2839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	123613702	123613859	123613783	Y	OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	3319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	125937888	125938141	125938004	Y	NA	CDON,NAP1L1P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L1P1	2454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	128373673	128373898	128373813	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	81555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARX2	315867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	129149922	129150564	129150218	Y	NA	NA	ARHGAP32	IMR90	Hi-C	24141950	BARX2	93271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	129239352	129239433	129239393	Y	NA	BARX2	TMEM45B	IMR90	Hi-C	24141950	BARX2	4402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr11	130767172	130767510	130767285	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	131300322	131300556	131300481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTM	61949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	132411283	132411428	132411357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPCML	988986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	132940132	132940357	132940242	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	OPCML	460057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	32664	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr11	133920876	133920983	133920947	Y	B3GAT1,SPATA19,JAM3	JAM3	NA	NA	NA	NA	JAM3	15837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	RP5-1154L15.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	13275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	690377	690646	690594	Y	NA	RP5-1154L15.2,RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1154L15.2	3006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	787625	787830	787738	Y	NA	RP11-218M22.1,NINJ2	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NINJ2	16680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	833741	833842	833785	Y	NA	WNK1	NINJ2,B4GALNT3,WNK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNK1	25917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	905489	905920	905534	Y	NA	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	45730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	1689303	1689433	1689367	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	11898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1717506	1717606	1717553	Y	NA	FBXL14	FBXL14,ERC1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	16175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1744932	1745222	1745077	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	43601	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1876861	1877254	1877034	Y	NA	RPS4XP14	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	11684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1921751	1922388	1921842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	56574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	1925056	1925234	1925157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP14	59879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	2307539	2307834	2307597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	195707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	2547305	2547477	2547330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1C-AS1	250889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	2893281	2893436	2893294	Y	NRIP2	CBX3P4,FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NRIP2,CACNA1C,FKBP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CBX3P4	8025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3011496	3011637	3011574	Y	NRIP2	FOXM1,TULP3	NA	NA	NA	NA	TULP3	27107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3108245	3108552	3108282	Y	NA	TEAD4	NA	NA	NA	NA	TEAD4	41749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3194969	3195128	3195057	Y	NA	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	10448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3226776	3227050	3226901	Y	TSPAN9	TSPAN9	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	42255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3334572	3334968	3334768	Y	NA	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	15476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	3420231	3420354	3420293	Y	PRMT8	NA	NA	NA	NA	NA	PRMT8	68161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	3913952	3914004	3913978	Y	NA	EFCAB4B	NA	NA	NA	NA	EFCAB4B	41967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4027276	4027298	4027287	Y	FGF23	PARP11	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	46668	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4131276	4131377	4131327	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	150668	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	4255485	4255796	4255604	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	125142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4333452	4333582	4333514	Y	EFCAB4B,PARP11	CCND2,CCND2-AS2	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	47356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4335261	4335485	4335373	Y	NA	CCND2,CCND2-AS2	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	45453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4406037	4406342	4406147	Y	PARP11,CCND2	CCND2,CCND2-AS2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	C12orf5	22029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4543974	4544184	4544124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf4	101490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	4770172	4770413	4770176	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	13911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6105913	6105932	6105923	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	52515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6163759	6163858	6163809	Y	SCNN1A,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	110361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	6304942	6305291	6305114	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	1590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6311406	6311775	6311432	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	4525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6335136	6335793	6335267	Y	SCNN1A	CD9,RP1-96H9.5	NA	NA	NA	NA	CD9	28255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	RP1-96H9.5,PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-96H9.5	10231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	RP1-96H9.5,PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6854848	6855156	6854990	Y	TAPBPL,VAMP1,CHD4,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4	COPS7A,PTMS,MLF2,CD4	NA	NA	NA	NA	PTMS	17526	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2,CD4	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,PTPN6,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	PTPN6	4475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	7736832	7737158	7736952	Y	PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	106339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	7781011	7781133	7781040	Y	SLC2A14	NA	NA	NA	NA	NA	GDF3	65239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr12	7790789	7791157	7790868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDF3	55215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	7865522	7865674	7865603	Y	DPPA3,SLC2A3,NANOG	GDF3,DPPA3	NA	NA	NA	NA	DPPA3	3472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	7987438	7987606	7987534	Y	SLC2A3,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A	NANOG	NA	NA	NA	NA	NANOG	49048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8013004	8013217	8013212	Y	NA	SLC2A14	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	28527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8058337	8058628	8058506	Y	NA	SLC2A14,SLC2A3	NA	NA	NA	NA	SLC2A14	16593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8112195	8112747	8112462	Y	NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3	K562	ChIA-PET	22265404	SLC2A3	25324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2,C3AR1	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	8605684	8606164	8606043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-113C12.4	134707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	8813796	8814159	8813977	Y	MFAP5	MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	MFAP5	312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	8828014	8828577	8828369	Y	NA	MFAP5,RIMKLB	NA	NA	NA	NA	RIMKLB	3619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	8966613	8966834	8966743	Y	CLEC6A,CLEC4E,PHC1,M6PR	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	14709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	8969039	8969453	8969246	Y	NA	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	12090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	8971788	8972170	8971968	Y	NA	A2ML1-AS1	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	A2ML1-AS1	9373	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	9059535	9059596	9059566	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	9060195	9060360	9060254	Y	PHC1	PHC1,M6PR	NA	NA	NA	NA	PHC1	4132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	9236028	9236753	9236097	Y	KLRG1	NA	NA	NA	NA	NA	M6PR	135477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	9491229	9491519	9491373	Y	NA	NA	C12orf33,LOC144571	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP4	100302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	KLRB1	NA	NA	NA	NA	KLRB1	44887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	9876419	9876688	9876554	Y	CLECL1	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	34809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	9929416	9929512	9929464	Y	NA	CD69	NA	NA	NA	NA	CD69	17919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD69	75086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	10116971	10117241	10117106	Y	OLR1,CLEC12A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC9A	64035	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	10272963	10273373	10273241	Y	NA	CLEC7A,OLR1	NA	NA	NA	NA	CLEC7A	7484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	10283748	10284076	10283919	Y	CD69,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,CLEC7A,OLR1	CLEC7A,OLR1	NA	NA	NA	NA	CLEC7A	2891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	RP11-277P12.20	NA	NA	NA	NA	RP11-277P12.20	3119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	11582484	11582789	11582637	Y	TAS2R50,TAS2R43,TAS2R42	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	217999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	11778051	11778121	11778086	Y	NA	ETV6	ETV6,MANSC1,BCL2L14	IMR90	Hi-C	24141950	ETV6	22667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	11851043	11851172	11851118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	50255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	11966137	11966507	11966203	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	165349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	12030986	12031138	12031062	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	230198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	12161273	12161524	12161399	Y	LOH12CR1	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	100573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	12162075	12162513	12162342	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	99584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	12298245	12298581	12298464	Y	LRP6	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	36148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	12425810	12426042	12425926	Y	NA	LRP6	BCL2L14,LRP6,MIR1244-2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP6	7864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	12711175	12711335	12711320	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	1982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	12711400	12711706	12711553	Y	BCL2L14,DUSP16	DUSP16	LOH12CR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	DUSP16	1611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	13408937	13409175	13409167	Y	NA	NA	HTR7P1,HEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	61287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	NA	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATF7IP	102685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	15110831	15110963	15110879	Y	NA	ERP27,ARHGDIB	ERP27	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGDIB	1699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	16125205	16125413	16125310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	63099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	19496981	19496995	19496989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEBP2	57984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	19550535	19550852	19550634	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	4127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	19557871	19558201	19558036	Y	NA	AEBP2	AEBP2	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	2892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	22662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	RP11-405A12.1	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-405A12.1	31854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	20193417	20193449	20193433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	100962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	20780077	20780376	20780084	Y	LST-3TM12,PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-405A12.1	687622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	20950319	20950359	20950339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	638190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	21625286	21625603	21625493	Y	NA	PYROXD1,TCEB1P31,RECQL,GOLT1B	NA	NA	NA	NA	TCEB1P31	26038	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	22654594	22654831	22654713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETNK1	121178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	22779557	22779668	22779574	Y	NA	ETNK1	NA	NA	NA	NA	ETNK1	3548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	23351745	23351772	23351759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114G22.1	500952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	23625293	23625709	23625512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	476257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	23738517	23738975	23738828	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	362991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	23804787	23805114	23804951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	296852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	24202643	24202921	24202736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX5	100677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	24414416	24414645	24414531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	298879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	24871584	24871922	24871669	Y	BCAT1	NA	SOX5,LINC00477	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	158060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	24972596	24972806	24972748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	127587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	24991472	24991796	24991668	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	108597	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	24992180	24992695	24992446	Y	BCAT1	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	107698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	25008843	25009219	25009048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	91174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	25086735	25086929	25086817	Y	NA	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	13464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	25380896	25381137	25381017	Y	NA	CASC1,LYRM5,KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	20733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	25537800	25538060	25537930	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	135930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.55289696523662
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	BHLHE41	8249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	26400740	26401146	26400920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	123190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26495152	26495452	26495369	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	217602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26522536	26522924	26522687	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	244986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26624362	26624835	26624675	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	346812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	325473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	27174273	27174510	27174392	Y	C12orf71	TM7SF3,MED21	NA	NA	NA	NA	MED21	794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	27379304	27379685	27379495	Y	NA	STK38L	STK38L,MED21,FGFR1OP2	IMR90	Hi-C	24141950	STK38L	15216	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	27513734	27513812	27513790	Y	NA	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	29947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	27565982	27566076	27566029	Y	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	82195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	29360104	29360380	29360183	Y	NA	NA	FAR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	60068	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	30575373	30575740	30575557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IPO8	271180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	31469690	31470116	31469962	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	7876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	2790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr12	31523933	31524084	31523973	Y	DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	3698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr12	31524246	31524432	31524371	Y	NA	FAM60A,RP11-771K4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-771K4.1	4011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	31671759	31672031	31671827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5B-AS1	68826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	31754010	31754391	31754188	Y	DENND5B,METTL20	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B	IMR90	Hi-C	24141950	DENND5B	11979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr12	31789524	31789538	31789533	Y	NA	DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20	DENND5B,METTL20	IMR90	Hi-C	24141950	METTL20	8556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	13.9155131138434
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	32405506	32405740	32405609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	147737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	32543557	32543792	32543676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	285788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	32559552	32559716	32559634	Y	BICD1	NA	BICD1,FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	270418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	32607110	32607326	32607203	Y	NA	NA	FGD4,DNM1L,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	222808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	32607967	32608138	32608054	Y	NA	NA	FGD4,BICD1	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	221996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	32742557	32742716	32742609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	87418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	34500403	34500725	34500579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	99987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	39008158	39008221	39008190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	291011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr12	39436965	39437093	39437022	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	137733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	39539251	39539539	39539453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	240019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	40596989	40597248	40597051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	99098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	41264985	41265046	41264997	Y	CNTN1	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	180741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	41680022	41680168	41680092	Y	PDZRN4	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	595778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	41849480	41849764	41849622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	686917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	42734111	42734478	42734288	Y	NA	ZCRB1	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	16191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	2545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	44910336	44910664	44910572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	402967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	44976377	44976736	44976725	Y	NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	336895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr12	45626822	45627300	45627014	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	18998	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	45628991	45629732	45629167	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	21167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	46636369	46636708	46636589	Y	SCAF11,SLC38A1	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	25092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	47185736	47186095	47186020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	285639	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	47612205	47612473	47612375	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	140471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	47613849	47614234	47614042	Y	FAM113B	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	142115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	47616513	47616764	47616594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	144779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	200081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3,ENDOU	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	48254260	48254459	48254349	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,RND1,FKBP11	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RND1	18626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49371065	49371287	49371156	Y	NA	ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1	NA	NA	NA	NA	RP11-386G11.5	18863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	49641026	49641246	49641136	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	43789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	PRPH	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRPH	38054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,SPATS2	NA	NA	NA	NA	C1QL4	10999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	49762011	49762098	49762055	Y	TUBA1A,PRPF40B	TROAP,C1QL4,SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	3644	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	49801773	49801917	49801846	Y	NA	SPATS2	NA	NA	NA	NA	SPATS2	43406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	FAIM2	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAIM2	43326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50555629	50555991	50555816	Y	ACCN2,DIP2B	CERS5	NA	NA	NA	NA	CERS5	3297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50788333	50788545	50788438	Y	DIP2B	LARP4	NA	NA	NA	NA	LARP4	4167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	51551925	51552239	51552062	Y	NA	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	12687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	4088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	51786511	51786834	51786676	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	1860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	51793762	51794009	51793886	Y	METTL7A,HIGD1C,SCN8A	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	9111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	51833393	51833425	51833407	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	48742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN8A	96609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	52146424	52146626	52146525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	133118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	52241099	52241559	52241297	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	38185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	37418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	52242460	52242886	52242778	Y	SLC4A8,ANKRD33	ANKRD33	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	36858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	52278286	52278855	52278613	Y	NR4A1	ANKRD33	NA	NA	NA	NA	ANKRD33	889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.36859797682441
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	52596076	52596423	52596243	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	49739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	110563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53338460	53338676	53338568	Y	KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	53340686	53341032	53340856	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	31	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53398446	53398634	53398511	Y	NA	EIF4B	NA	NA	NA	NA	EIF4B	504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53731844	53731991	53731931	Y	NA	PFDN5,C12orf10,RP11-680A11.5,AAAS,SP7,SP1	NA	NA	NA	NA	SP7	5108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP7,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	54145140	54145515	54145243	Y	NA	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	25611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	54149784	54149995	54149877	Y	PCBP2,ATP5G2,HOXC13,HOXC11	CALCOCO1,SNORD81	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5,HOXC8,MIR196A2,HOXC9,SMUG1,HNRNPA1,HOXC10,HOXC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	30255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	54254611	54254885	54254855	Y	NA	NA	HOXC13,HOXC12,HOTAIR,LOC100240735,FLJ12825	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNORD81	71522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	54745877	54746035	54745904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPZ1	52891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	54949338	54949510	54949424	Y	NA	PDE1B,PPP1R1A	NA	NA	NA	NA	PDE1B	8204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	55806634	55807051	55806823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	266279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	55807914	55808439	55808095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr12	56036628	56036862	56036687	Y	NA	METTL7B	NA	NA	NA	NA	METTL7B	36468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	56193144	56193361	56193252	Y	OR6C3,OR6C75	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	SARNP	16179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	56275045	56275257	56275151	Y	OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1	MMP19,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	MMP19	40295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	56474601	56474862	56474633	Y	SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3	RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1	NA	NA	NA	NA	ERBB3	2960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4,GLS2	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	56877461	56877501	56877482	Y	NA	TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2	NA	NA	NA	NA	GLS2	2697	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	8.29009291888544
chr12	57073427	57073817	57073648	Y	NA	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	6342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57079143	57079532	57079338	Y	NA	ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57557421	57557508	57557464	Y	NA	LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	STAT6	33499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57724914	57725046	57724980	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9,GLI1,MARS,NDUFA4L2,SHMT2,DDIT3,MBD6	IMR90	Hi-C	24141950	STAC3	81938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2,INHBE,GLI1	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,KIF5A,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,SLC26A10,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,TSFM	NA	NA	NA	NA	METTL1	4384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	59434557	59434696	59434648	Y	LRIG3,LRIG3	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	LRIG3	122254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	59717208	59717526	59717367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	270322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	60943768	60943906	60943837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC16A7	955920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	75708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63026443	63026842	63026744	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	30977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	56366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63067118	63067447	63067283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	71652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63094069	63094114	63094085	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	98603	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63126917	63127025	63126971	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	131451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63133542	63133622	63133582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	138076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	63149457	63149757	63149616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	153991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65005842	65006280	65005896	Y	GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	3549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65026482	65026674	65026578	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	24189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65065216	65065277	65065242	Y	LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	62923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65093624	65093852	65093697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	57375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65194398	65194833	65194618	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	TBC1D30,FLJ41278	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNS	43171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	65975670	65975966	65975841	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-230G5.2	58186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	66136008	66136292	66136116	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	79619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	66316992	66317322	66317175	Y	IRAK3	RP11-366L20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-366L20.2	43045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	67362694	67363196	67363004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	97746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	67363946	67364340	67364143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	96602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	89324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	67978910	67978924	67978917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	61194	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	68166573	68166761	68166704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK2	126455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	68750184	68750421	68750327	Y	IL22,RAP1B	MDM1	RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	26023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	68752517	68752875	68752786	Y	NA	MDM1	RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	28356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	68773026	68773359	68773243	Y	RAP1B	MDM1	RAP1B,LOC100507250	IMR90	Hi-C	24141950	MDM1	48865	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	68894598	68894866	68894732	Y	NA	NA	RAP1B,IL26,NUP107	IMR90	Hi-C	24141950	RAP1B	107753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	68953815	68954302	68954112	Y	CPM,RAP1B	RAP1B	MDM1	IMR90	Hi-C	24141950	RAP1B	48317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	69163885	69164101	69163897	Y	SLC35E3	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	25999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	81020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	71037443	71037574	71037509	Y	PTPRR,KCNMB4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	177583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	71770650	71771010	71770955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP2	283779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	72341450	72341874	72341635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	109963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	72430811	72430977	72430894	Y	TPH2,TRHDE	TRHDE	NA	NA	NA	NA	TRHDE	48069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	72875098	72875358	72875202	Y	TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE-AS1	208411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	75227810	75227882	75227846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3B	298259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	75872211	75872563	75872333	Y	GLIPR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	6495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	75900907	75901415	75901091	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	2001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-114H23.1	169070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	76256965	76257237	76257100	Y	NA	NA	PHLDA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-114H23.1	118558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	76338350	76338647	76338468	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-114H23.1	37148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	76364239	76364345	76364266	Y	GLIPR1,PHLDA1	RP11-114H23.1	OSBPL8,PHLDA1,KRR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-114H23.1	11450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	76811286	76811641	76811626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS10	71064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	77156465	77156658	77156516	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	1097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	77771188	77771377	77771281	Y	CSRP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	54767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79323956	79323978	79323967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	79324302	79324765	79324409	Y	SYT1,SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	68529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	79325321	79325633	79325477	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	69548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79341300	79341393	79341341	Y	SYT1,SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	85527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79356068	79356388	79356099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	100295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79363511	79363565	79363558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	107738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	322917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	79994209	79994302	79994256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	88575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	80133375	80133617	80133496	Y	NA	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	50498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	81171843	81172335	81171905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS3	157259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	82203982	82204364	82204153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	546220	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	83134280	83134513	83134356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	55621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	SLC6A15	NA	NA	NA	NA	SLC6A15	39492	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	85793012	85793355	85793084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALX1	121127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	87818479	87818840	87818660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf29	606783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	88527986	88528043	88528042	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	5950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	89579864	89580040	89579936	Y	NA	NA	DUSP6,POC1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	165008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	89637521	89637764	89637549	Y	POC1B,DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,DUSP6	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	107284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	89871085	89871278	89871183	Y	DUSP6,ATP2B1	POC1B,GALNT4	NA	NA	NA	NA	POC1B	46523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4	60306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	90065189	90065567	90065562	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	35510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	90091098	90091469	90091453	Y	NA	ATP2B1	ATP2B1,LOC338758	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B1	9608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	90125293	90125953	90125608	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	24216	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	90251511	90251925	90251741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	150434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	90500380	90500398	90500381	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1,POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	399303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	91972476	91973067	91972734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	561623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	92290576	92290698	92290637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	243992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	92419313	92419515	92419511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	115175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf79	60104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	92517420	92517830	92517671	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	C12orf79	16292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	93474339	93474443	93474391	Y	NA	AC138123.2	NA	NA	NA	NA	AC138123.2	1008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	94170549	94170892	94170731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	101398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	94827148	94827488	94827330	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	10403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	94954640	94954945	94954835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC3	87393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	95477787	95477978	95477880	Y	NA	NR2C1	NR2C1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NR2C1	12308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	95939436	95939751	95939594	Y	NA	USP44	NA	NA	NA	NA	USP44	3515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	USP44	104726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	96438108	96438277	96438222	Y	ELK3,LTA4H	LTA4H	NA	NA	NA	NA	LTA4H	2810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	96635574	96636027	96635766	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	49414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	96650909	96650966	96650937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	64749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	97917973	97918105	97918040	Y	NA	MIR1251,MIR135A2	NA	NA	NA	NA	MIR1251	34295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	98503598	98503623	98503612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	306193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	99250809	99251297	99251146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	213890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	100596885	100596960	100596910	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-175P13.3	5324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	101960112	101960355	101960249	Y	NA	NA	MYBPC1	IMR90	Hi-C	24141950	CHPT1	128370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	102169550	102169734	102169688	Y	NA	SYCP3	NA	NA	NA	NA	SYCP3	38300	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	102734344	102734692	102734517	Y	NA	NA	IGF1	IMR90	Hi-C	24141950	NUP37	222442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	102892301	102892634	102892501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	380399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	NA	NA	NA	NA	NA	NUP37	397706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	104301376	104301628	104301530	Y	NA	HSP90B1	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	20257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	104791559	104791875	104791716	Y	TXNRD1	NA	CHST11,SLC41A2,C12orf45	IMR90	Hi-C	24141950	CHST11	55198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	104846909	104846975	104846916	Y	NA	CHST11	NA	NA	NA	NA	CHST11	98	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	105035767	105036007	105035871	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	188694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	105043287	105043477	105043345	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	196214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	105043739	105043999	105043937	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	196666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	105486221	105486404	105486313	Y	NA	ALDH1L2,KIAA1033	ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1L2	9866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	106535331	106535540	106535446	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	3520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	108054058	108054330	108054150	Y	NA	PWP1	NA	NA	NA	NA	PWP1	23179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	1724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	109899131	109899209	109899162	Y	TRPV4,TRPV4,TRPV4	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	13998	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	110682622	110683080	110682796	Y	ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2A2	33481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	111015565	111016027	111015682	Y	PPTC7,ARPC3	PPTC7,TCTN1	NA	NA	NA	NA	PPTC7	3098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	111473237	111473713	111473408	Y	CUX2	CUX2	NA	NA	NA	NA	CUX2	3409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	112215177	112215502	112215206	Y	FAM109A,SH2B3,ALDH2	ALDH2	NA	NA	NA	NA	ALDH2	12486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	112566952	112567278	112567115	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	TRAFD1	5647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	113630509	113630869	113630677	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	DDX54	9225	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	113684297	113684702	113684391	Y	NA	TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	27398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	114025549	114025908	114025724	Y	NA	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDS	163443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDS	167165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.6515885476043
chr12	114101859	114102314	114102079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-438N16.1	107174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	115107232	115107509	115107392	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	12460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	116308098	116308555	116308414	Y	NA	NA	RBM19,TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	404588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	116602727	116603094	116602910	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	110049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	117255942	117256291	117256058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRK	60955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	117277511	117277610	117277564	Y	NOS1,RNFT2,HRK	HRK	NA	NA	NA	NA	HRK	39636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	118784975	118784984	118784980	Y	NA	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	TAOK3	23766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	118815733	118815925	118815736	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	SUDS3	3548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	119632995	119633391	119633197	Y	TMEM233	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	18548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	120450063	120450486	120450317	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	102820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	120666780	120666906	120666823	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	29686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	120851941	120852093	120852022	Y	NA	MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC	PLA2G1B,MSI1,GATC,COX6A1,TRIAP1,SRSF9,DYNLL1	IMR90	Hi-C	24141950	COX6A1	21800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	121038763	121038810	121038786	Y	CABP1,CABP1	POP5,RPL11P5,CABP1	POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL11P5	8412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	121245538	121245859	121245790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADS	84000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	121367131	121367281	121367257	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	C12orf43,SPPL3,POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL12P33	14583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	121841505	121841570	121841538	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	5661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	121864200	121864449	121864234	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	28356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	121968421	121968751	121968672	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	47946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	122006998	122007221	122007110	Y	P2RX4,SETD1B,RHOF	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	9476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	122014724	122015549	122015007	Y	NA	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	1148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.45420538286893
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.51364443626713
chr12	122020670	122020879	122020764	Y	KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.66467272392746
chr12	122086492	122086728	122086610	Y	KDM2B,SETD1B,ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	MORN3	21809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	122228443	122228705	122228504	Y	CAMKK2,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	10604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.35551380050125
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	123367402	123367963	123367875	Y	VPS37B	VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	11028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	123582236	123582631	123582307	Y	SNRNP35	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	49931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	123605358	123605647	123605454	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	MPHOSPH9,PITPNM2,OGFOD2,ABCB9,ARL6IP4,LOC100507091,VPS37B,C12orf65	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	26915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	123615846	123616275	123616026	Y	NA	PITPNM2	PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	16287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	123636095	123636496	123636485	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	3533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	124961644	124962003	124961833	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	88132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr12	125198204	125198603	125198442	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	148069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125229298	125229517	125229417	Y	NA	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	135697	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	125230587	125231048	125230629	Y	NCOR2,UBC	NA	NCOR2	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	134166	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC,RPL22P19	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,RPL22P19,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22P19	5636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125702978	125703342	125703032	Y	TMEM132B	TMEM132B	TMEM132B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM132B	33596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	125765176	125765295	125765221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	95794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-575F12.2	60963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	128055090	128055285	128055188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	406418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	129336764	129337118	129336941	Y	NA	SLC15A4,GLT1D1	NA	NA	NA	NA	GLT1D1	792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	129340998	129341268	129341241	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4,GLT1D1	NA	NA	NA	NA	GLT1D1	5026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	PIWIL1	4241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	131249995	131250369	131250318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-662M24.2	51169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	131272601	131272867	131272734	Y	NA	STX2	NA	NA	NA	NA	STX2	48944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr12	132221686	132221872	132221813	Y	NOC4L	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	28060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	132368164	132368433	132368235	Y	NA	ULK1,PUS1	SFSWAP,ULK1,EP400,PUS1	IMR90	Hi-C	24141950	ULK1	8763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	20284953	20285344	20285149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPC1	69798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	20546038	20546426	20546233	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	15228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21517643	21517924	21517794	Y	LATS2	XPO4	CRYL1,SKA3,MRP63,LATS2,SAP18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	XPO4	42456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21571909	21572149	21572029	Y	NA	RNU4-9P	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	38657	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	RNU4-9P,LATS2	NA	NA	NA	NA	RNU4-9P	3146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	22107257	22107449	22107379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	75748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	22249294	22249707	22249608	Y	FGF9	FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	5772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	22545143	22545315	22545232	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	FGF9	301621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	22583629	22583981	22583861	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	340107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	23455872	23456128	23456000	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	31662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	23733450	23734509	23733658	Y	NA	HMGA1P6	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	27137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	23973487	23973793	23973652	Y	NA	SACS-AS1,SACS	NA	NA	NA	NA	SACS-AS1	17317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	24148254	24148621	24148289	Y	SGCG,TNFRSF19	TNFRSF19	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	5745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	24191778	24192157	24192102	Y	NA	TNFRSF19	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	49269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-309I15.1	145054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-309I15.1	170978	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	25621314	25621890	25621623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPJ	126296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	26064571	26064915	26064659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A2	120362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	26456265	26456499	26456340	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	338292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	26551633	26551678	26551661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	243113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28621846	28622161	28622004	Y	FLT3	NA	NA	NA	NA	NA	FLT3	50568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28725313	28725682	28725498	Y	PAN3	PAN3	NA	NA	NA	NA	PAN3	14670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28882388	28882716	28882654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	95738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	28982673	28982916	28982780	Y	FLT1	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4A1P7	188054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	29290769	29291025	29290846	Y	POMP	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	82	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	29328831	29329051	29328862	Y	SLC46A3	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	37724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	29594016	29594197	29594075	Y	NA	MTUS2	NA	NA	NA	NA	MTUS2	2551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	30332929	30333348	30333111	Y	UBL3	NA	NA	NA	NA	NA	UBL3	89473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr13	31004513	31004723	31004587	Y	USPL1	LINC01058,UBE2L5P	KATNAL1,LINC00426,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2L5P	4429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	31308709	31309017	31308774	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	ALOX5AP	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	1064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5AP	175921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	31623581	31623925	31623587	Y	NA	NA	TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HSPH1	110600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	32690357	32690648	32690536	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	86920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	43828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	33051019	33051050	33051035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	50704	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	178022	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	33896698	33896851	33896775	Y	NA	STARD13	NA	NA	NA	NA	STARD13	25916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr13	37424486	37424865	37424682	Y	NA	RFXAP	NA	NA	NA	NA	RFXAP	33125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	38825601	38825615	38825608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	96371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	38874589	38874762	38874676	Y	NA	UFM1	NA	NA	NA	NA	UFM1	47224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	40272314	40272449	40272352	Y	NA	COG6	NA	NA	NA	NA	COG6	44550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	40435836	40436127	40435982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	208072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	41173351	41173594	41173358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	65140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	41226066	41226446	41226348	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	12288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	41229483	41229797	41229615	Y	NA	FOXO1	NA	NA	NA	NA	FOXO1	8937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	42140186	42140232	42140209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	256845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	42453037	42453433	42453235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	158743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	DGKH	NA	NA	NA	NA	DGKH	33825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	92924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	186161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	43410663	43410880	43410773	Y	NA	NA	CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	153527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	43617981	43618110	43618046	Y	TNFSF11	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	22642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.51364443626713
chr13	43635759	43636150	43635822	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	40420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr13	44620658	44620684	44620670	Y	ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DGKZP1	80098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	45211496	45211845	45211671	Y	NA	NA	NUFIP1,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	62213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	45711306	45711547	45711428	Y	NA	GTF2F2	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	18656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr13	46095529	46095772	46095647	Y	TPT1	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	58469	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	46724053	46724328	46724215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCP1	59678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	46736375	46736487	46736423	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	47519	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr13	46747616	46748160	46748034	Y	C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	35846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	46750972	46751177	46751169	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	32829	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	46752144	46752602	46752461	Y	C13orf18,LCP1	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	31404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	46761558	46761874	46761821	Y	SPERT	LCP1	NA	NA	NA	NA	LCP1	22132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	47129209	47129516	47129266	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	SUCLA2-AS1	109006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr13	48636284	48636323	48636312	Y	NA	NUDT15,SUCLA2,MED4	NA	NA	NA	NA	SUCLA2	26159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	49155067	49155378	49155252	Y	CYSLTR2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	49698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	49433672	49433840	49433729	Y	RCBTB2,FNDC3A	NA	FNDC3A,MLNR	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3A	114208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	49601050	49601794	49601184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	53002	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	49627008	49627200	49627078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	78960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	51743934	51744340	51744171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	50163	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	FAM124A	NA	NA	NA	NA	FAM124A	5614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr13	52505834	52506318	52505967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7B	77312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	53353272	53353380	53353291	Y	HNRNPA1L2,PCDH8	LECT1	NA	NA	NA	NA	LECT1	41325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	344744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	57309762	57309863	57309815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00458	2604761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	59980699	59980952	59980824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	755169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	60716670	60717071	60716778	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	19050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	61157781	61157905	61157871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	189190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr13	67674730	67675228	67675034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00383	2119250	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	72349266	72349293	72349278	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	90037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	73486233	73486587	73486410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3	131999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	73912389	73912832	73912741	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	148724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	73982945	73982960	73982953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	219280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	75800411	75800558	75800473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	253692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	76159377	76159493	76159435	Y	NA	COMMD6,UCHL3,LMO7	NA	NA	NA	NA	LMO7	33077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	77519546	77519717	77519632	Y	NA	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	34334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	77897670	77898015	77897832	Y	NA	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	1170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	79232403	79232753	79232546	Y	NA	RNF219	NA	NA	NA	NA	RNF219	1089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr13	80916799	80917232	80917156	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	80934191	80934539	80934365	Y	NA	SPRY2	SPRY2	K562	ChIA-PET	22265404	SPRY2	21105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	84515909	84516210	84516058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	61381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	93868426	93868831	93868563	Y	NA	GPC6	GPC6	IMR90	Hi-C	24141950	GPC6	8264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	94216006	94216018	94216012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	196793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	95749553	95749872	95749713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	201815	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	96164777	96165033	96164905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN10	80919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	99068008	99068369	99068130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	159825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	99128143	99128552	99128498	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	99473598	99473661	99473659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2P4	182105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	99772014	99772367	99772137	Y	GPR18	DOCK9	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK9	35135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	99934075	99934613	99934350	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	68063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	69832	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	99950103	99950501	99950500	Y	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	84091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	100154383	100154610	100154487	Y	GPR183	TM9SF2	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	2712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	100928465	100928851	100928516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	127119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	101041976	101042276	101042034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	240630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	465240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	106777477	106777605	106777541	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	440907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	106808885	106809142	106808998	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	ARGLU1	409370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	107124360	107124455	107124408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	94057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	205742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	108407171	108407488	108407466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	109595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	108428526	108428615	108428535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	88468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	108503880	108504176	108504028	Y	FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	12907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	108520964	108521235	108521194	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	110322109	110322425	110322268	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	83190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	110709567	110709794	110709737	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	COL4A2	246365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	110790027	110791241	110790617	Y	RAB20,IRS2	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	164918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111039905	111040155	111040082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	82409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111071465	111071591	111071508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	113969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111116620	111116952	111116704	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB20	95128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	111410023	111410076	111410050	Y	NA	ING1,CARS2	CARS2,LINC00346,ING1,COL4A2	IMR90	Hi-C	24141950	CARS2	46073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	111560939	111561133	111561094	Y	NA	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	4283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.67775690025062
chr13	112512598	112512723	112512697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD44	191669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	112628453	112628592	112628523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD44	75800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SOX1	6849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr13	112727649	112728064	112727870	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SOX1	7736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	113434951	113435188	113435090	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	92308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	106764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	113660175	113660436	113660306	Y	NA	MCF2L-AS1	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	39037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	38.391025541029
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	18592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114556439	114556767	114556713	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	8279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	114926752	114926846	114926794	Y	NA	RASA3	LOC100506394,GAS6,RASA3,CDC16,CHAMP1,FLJ44054,ATP4B	IMR90	Hi-C	24141950	RASA3	30666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	20905710	20905990	20905737	Y	NA	TEP1,OSGEP,APEX1,TMEM55B,PNP	NA	NA	NA	NA	OSGEP	15274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	21268104	21268276	21268208	Y	NA	RNASE1	NA	NA	NA	NA	RNASE1	1161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	21660147	21660368	21660311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	75285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10,REM2	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	24006568	24006872	24006716	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	16344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	24008139	24008541	24008214	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	14675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	24747075	24747483	24747259	Y	DCAF11,PSME1,IRF9,KHNYN,TINF2	NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	RABGGTA	8130	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	NFATC4,NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	NYNRIN	4274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	25148998	25149284	25149081	Y	CIDEB,KHNYN,GZMH,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	238887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	29228603	29228912	29228757	Y	FOXG1	FOXG1	NA	NA	NA	NA	FOXG1	4138	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	29345370	29345639	29345447	Y	FOXG1	CTD-2384A14.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2384A14.1	47920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	30739803	30740140	30739972	Y	PRKD1	NA	NA	NA	NA	NA	G2E3	286189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	31101250	31101606	31101429	Y	NA	SCFD1	NA	NA	NA	NA	SCFD1	11932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	COCH	NA	NA	NA	NA	COCH	18583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr14	32950745	32951147	32950873	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35090811	35090907	35090859	Y	NA	SNX6	NA	NA	NA	NA	SNX6	6482	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35235794	35235835	35235815	Y	FAM177A1,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	53765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35802936	35803364	35803178	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	52911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	35876265	35876636	35876451	Y	FAM177A1,FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	4310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	36778207	36778309	36778259	Y	NA	MBIP	NA	NA	NA	NA	MBIP	9573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	37134370	37134658	37134514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBIP	346488	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	174581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	38054173	38054544	38054319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	389055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2175434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	43420114	43420297	43420206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1944201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	50328882	50329315	50329091	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	50681069	50681448	50681362	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	14828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	51136928	51137372	51137340	Y	NA	SAV1	NA	NA	NA	NA	SAV1	3879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr14	51367871	51368235	51368053	Y	NA	ABHD12B,PYGL	NA	NA	NA	NA	ABHD12B	30993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr14	51410207	51410388	51410282	Y	NIN,PYGL	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	87834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	151000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	52331196	52331799	52331519	Y	NA	GNG2	NA	NA	NA	NA	GNG2	40283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	52733578	52733826	52733624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	279385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	53302326	53302477	53302407	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	45940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	53385393	53385542	53385402	Y	DDHD1	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	31611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	54810392	54810416	54810404	Y	NA	NA	DDHD1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	51151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	55439267	55439511	55439438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDHD1	52312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	55589903	55590059	55589993	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	1075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	55921336	55921695	55921412	Y	NA	ATG14	NA	NA	NA	NA	ATG14	44760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	58404418	58404760	58404612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	201237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	58449709	58450271	58450031	Y	NA	NA	C14orf37	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P3	155726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	59001974	59002022	59001998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACT1	96663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	JKAMP	87888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr14	61654939	61655124	61655060	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX4,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	2662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	61939634	61940081	61939867	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	193076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	190118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	62015577	62015884	62015776	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	144347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS1	9795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	64144701	64144896	64144792	Y	NA	WDR89,SGPP1	NA	NA	NA	NA	WDR89	38122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	64358003	64358294	64358235	Y	NA	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	40320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	64403874	64404095	64403883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE2	86191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	64670198	64670275	64670237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	133042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	64718005	64718040	64718032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-544I20.2	85277	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	64975156	64975343	64975202	Y	NA	AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	5225	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	65169606	65170310	65170032	Y	NA	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	65324744	65324966	65324847	Y	SPTB	SPTB	SPTB,CHURC1-FNTB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPTB	19635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	SPTB	2559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	65746592	65747003	65746788	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	128307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	65959136	65959304	65959206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	83826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	67735210	67735475	67735304	Y	NA	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	29384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	68281633	68281808	68281770	Y	PLEK2,ZFYVE26	ZFYVE26,RAD51B	NA	NA	NA	NA	ZFYVE26	326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68529528	68529897	68529655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	245032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68614207	68614598	68614344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68666573	68666719	68666628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	220194	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68699331	68699744	68699520	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	187169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	68846841	68847380	68847069	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	39533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	69235165	69235315	69235240	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	25875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	69246726	69246992	69246942	Y	DCAF5	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	14198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	69301401	69301774	69301727	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	40211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	69399139	69399257	69399202	Y	ZFP36L1	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	44900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	70251267	70251371	70251319	Y	SLC10A1	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	71955425	71955735	71955597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	170259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	72021176	72021324	72021237	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	236010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	72397692	72397730	72397711	Y	SIPA1L1,RGS6,RGS6,RGS6	RGS6	NA	NA	NA	NA	RGS6	536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	72667667	72667865	72667766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS6	270511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	73110081	73110359	73110171	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	248450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	73373247	73373392	73373372	Y	NA	DPF3,DCAF4,RP1-146I3.1	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPF3	14438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	73585185	73585324	73585255	Y	NA	PSEN1	NA	NA	NA	NA	PSEN1	15802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	74868763	74868996	74868887	Y	ABCD4,VRTN	SYNDIG1L	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1L	21809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	75087327	75087770	75087539	Y	PGF,EIF2B2,LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2207P18.2	5977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	75607767	75608156	75607957	Y	FOS	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK9	15720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	75688633	75689211	75688968	Y	DLST,FOS	TMED10,RP11-293M10.2,RP11-293M10.1	PGF,NEK9,TMED10,FOS,LOC731223,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	34903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	75697272	75697400	75697329	Y	NA	RP11-293M10.2,RP11-293M10.1,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	26714	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	76010953	76011159	76011009	Y	FOS,JDP2,BATF	FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	31801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77265287	77265548	77265418	Y	NA	VASH1,ANGEL1	NA	NA	NA	NA	ANGEL1	25041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77365860	77365973	77365943	Y	NA	RP11-488C13.1	C14orf166B,IRF2BPL,KIAA1737,ZDHHC22,TMED8,POMT2,GSTZ1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-488C13.1	14767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	77388817	77389330	77389083	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.7	34651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	1410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77423763	77424258	77424192	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	77428060	77428442	77428341	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.7	4079	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr14	77466876	77467234	77466958	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-7F17.7,RP11-7F17.1,IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	25800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	77503944	77504718	77504558	Y	NA	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	10910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL,RP11-7F17.3	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	RP11-7F17.3,TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-7F17.3	14002	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	78129695	78129950	78129826	Y	NA	SPTLC2,ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	42413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	78144886	78145071	78144891	Y	NA	ALKBH1,SLIRP	NA	NA	NA	NA	ALKBH1	27292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	78194844	78195080	78194962	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	22430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	78836271	78836672	78836374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	129537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	80308733	80308907	80308837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	543193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	81458739	81459018	81458756	Y	TSHR	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	34878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr14	81867255	81867616	81867435	Y	GTF2A1,GTF2A1,STON2	STON2,RP11-299L17.3	NA	NA	NA	NA	STON2	33193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	84176891	84176909	84176900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	1069927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	85021286	85021648	85021467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-406A9.2	1914322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	87706742	87707121	87707003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	750888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	88336279	88336528	88336449	Y	KCNK10,GPR65	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	121481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	88884161	88884478	88884321	Y	NA	SPATA7	NA	NA	NA	NA	SPATA7	34893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89742753	89743028	89742926	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	12910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89770346	89770725	89770409	Y	FOXN3,FOXN3	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	14408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89771520	89771819	89771727	Y	FOXN3,FOXN3	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	15582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	89772713	89772723	89772718	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr14	89887223	89887427	89887324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	131285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	89894528	89894709	89894622	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	138590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	141291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	89951733	89951858	89951747	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	131635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	90083771	90084428	90084236	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	90168731	90169025	90168878	Y	NA	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	85238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	91020743	91021035	91020793	Y	CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	159897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	91099269	91099599	91099455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	181224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	91863961	91864070	91864025	Y	C14orf159,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	18118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	93035062	93035389	93035185	Y	RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	56944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	93114264	93114489	93114415	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	LGMN	98558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	93499320	93499712	93499545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	80953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	94016026	94016414	94016228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX8C	204489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	SERPINA3	9392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	95691488	95691499	95691495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	69141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	95758765	95759186	95759057	Y	CLMN	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	25057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	97646734	97646983	97646791	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2506J14.1	276170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	97685606	97685621	97685614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2506J14.1	237532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	98676573	98676976	98676755	Y	NA	NA	CMTM7	MCF7	ChIA-PET	19890323	CTD-2506J14.1	753420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	99700697	99700801	99700734	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	244415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	99711955	99712816	99712233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	232400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	208740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	99827366	99827674	99827539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	117542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	99934490	99934508	99934499	Y	EML1	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	10708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	160315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	100687969	100688087	100687996	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	YY1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	YY1	14548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	100883887	100884104	100884057	Y	BEGAIN	WDR25,WARS	NA	NA	NA	NA	WARS	42745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	NA	DLK1	166480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	101143693	101144188	101144055	Y	NA	DLK1	NA	NA	NA	NA	DLK1	45854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	101151381	101151698	101151540	Y	RTL1,DLK1	DLK1	NA	NA	NA	NA	DLK1	38344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-1,SNORD114-13,SNORD114-14,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21,MIR543	NA	NA	NA	NA	SNORD114-21	8602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	101539526	101539734	101539702	Y	NA	MIR543,AL132709.1	NA	NA	NA	NA	AL132709.1	2513	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102227271	102227509	102227387	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	RP11-1029J19.5,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	1136	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102258119	102258367	102258242	Y	NA	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	31984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102292259	102292630	102292392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	66124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102340393	102340589	102340458	Y	PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	88276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102396001	102396203	102396103	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	32662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102438747	102439113	102438818	Y	PPP2R5C,DYNC1H1	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	9882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	102836975	102837187	102837062	Y	NA	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	9675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	102997284	102997579	102997375	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	MIR4309,RCOR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	23148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr14	103112299	103112666	103112355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCOR1	55301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	19538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	103710310	103710630	103710449	Y	NA	NA	LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4	IMR90	Hi-C	24141950	EIF5	87251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	103993761	103994083	103993826	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr14	104928387	104928555	104928492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM179	141429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	104993565	104993828	104993574	Y	NA	NA	KIF26A	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM179	76156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	105132512	105132664	105132612	Y	TMEM179,INF2	INF2	NA	NA	NA	NA	INF2	21279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	70050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105500263	105500628	105500453	Y	NA	CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	14778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105541748	105541955	105541831	Y	CRIP1,PLD4,GPR132	NA	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	56263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105546439	105546836	105546640	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA4	60954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	105603404	105603554	105603490	Y	BTBD6,BRF1	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	29607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr14	105760670	105760918	105760811	Y	C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1	BTBD6,PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	PACS2	3982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	20547295	20547641	20547374	Y	NA	NA	LOC348120,REREP3,POTEB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-603B24.2	1996448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	20596893	20597220	20597190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1946869	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr15	20612710	20612766	20612738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-603B24.2	1931323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	22927527	22927784	22927666	Y	CYFIP1	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	37522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	25587380	25587405	25587393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	94723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	25641447	25641749	25641585	Y	NA	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	40379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	26416756	26416952	26416854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	308439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	26487850	26488175	26488017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	379533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	26854717	26854952	26854835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	254558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	26958560	26958904	26958869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	150606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	26965581	26965938	26965866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	143572	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	27014024	27014086	27014055	Y	GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	95424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-680F8.1	57328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	30240816	30241083	30240944	Y	NA	TJP1	TJP1	IMR90	Hi-C	24141950	TJP1	17985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	31372759	31373034	31372889	Y	MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	90949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33004938	33004960	33004950	Y	NA	GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	3215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33028073	33028475	33028235	Y	NA	GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	19898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33111010	33111355	33111242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	102835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	115703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33135808	33135977	33135886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	127633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33153988	33154297	33154060	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	145813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	180428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33489811	33490123	33489967	Y	NA	FMN1	NA	NA	NA	NA	FMN1	4914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	FMN1	NA	NA	NA	NA	FMN1	9225	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	FMN1	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	FMN1	17244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	34983371	34983524	34983448	Y	NA	NA	AQR,ZNF770	IMR90	Hi-C	24141950	ACTC1	102816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	35354346	35354732	35354466	Y	NA	NA	ATPBD4,ZNF770	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	75858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	9.17831716019459
chr15	35376835	35377041	35376987	Y	NA	NA	ATPBD4,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	98347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	36897694	36898088	36897999	Y	C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	27882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	94654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	37883182	37883347	37883221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	491678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	38784019	38784367	38784201	Y	RASGRP1	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	39691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	40365860	40366125	40365905	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	32968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	40463815	40464014	40463832	Y	NA	BUB1B,PAK6	NA	NA	NA	NA	BUB1B	12591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	40781674	40781798	40781689	Y	BAHD1	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	20514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	40803219	40803626	40803467	Y	RHOV,BMF	CHST14	NA	NA	NA	NA	CHST14	42059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	42792289	42792533	42792361	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	10858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2,STARD9	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	19853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	44319631	44319819	44319725	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	39249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	47659982	47660177	47660079	Y	SEMA6D,SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA6D	185684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	48253775	48254090	48253870	Y	SEMA6D	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	MYEF2	214624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	48545288	48545650	48545469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUT	75558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	49217829	49218211	49218108	Y	SHC4	EID1	NA	NA	NA	NA	EID1	49746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	49598906	49599159	49599033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS2	153048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	24814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	50876708	50877085	50876843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM7	99927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	51369900	51370046	51369953	Y	NA	TNFAIP8L3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	25427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	51515990	51516083	51516067	Y	SPPL2A,TNFAIP8L3,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	112724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP19A1	68601	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	51921191	51921424	51921391	Y	NA	DMXL2	DMXL2,LYSMD2,TMOD2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DMXL2	8161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52228372	52228625	52228515	Y	NA	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	13678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52299898	52300006	52299952	Y	NA	LEO1	TMOD3,LEO1,MAPK6,BCL2L10,GNB5,MYO5C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LEO1	37895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52330351	52330361	52330356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	55131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52581885	52582216	52582049	Y	NA	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	3779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5C	98592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr15	52774147	52774333	52774216	Y	MAPK6,MYO5A	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	44914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	53029906	53030009	53029958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ONECUT1	51264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	53095650	53095970	53095786	Y	ONECUT1	ONECUT1,RP11-209K10.2	ONECUT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-209K10.2	511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	53942854	53943115	53943028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR72	109960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	55581016	55581448	55581368	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	27710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	58183047	58183076	58183062	Y	NA	NA	GCOM1	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2M	300816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	58606934	58606946	58606940	Y	NA	NA	LIPC,FAM63B,ADAM10	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM10	433231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	59019191	59019406	59019394	Y	NA	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	20771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	59158498	59158653	59158597	Y	ADAM10,RNF111,SLTM	ZNF444P1,RNF111	NA	NA	NA	NA	RNF111	3124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	59469975	59470287	59470131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	59646072	59646468	59646249	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	16424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	NA	NA	NA	NA	FAM81A	13122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	59862569	59862935	59862765	Y	NA	RP11-112N19.2	NA	NA	NA	NA	RP11-112N19.2	19277	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	60470845	60471146	60471133	Y	NA	NA	BNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXB1	176424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	60701970	60702307	60702139	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	8888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	61091060	61091341	61091119	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	321683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	61459603	61459724	61459664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	59794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	LACTB	38866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64057692	64057995	64057851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	66146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64185014	64185515	64185044	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	60873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64589107	64589162	64589135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	57280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64940943	64941327	64941079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	52153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	64991554	64991938	64991797	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	1542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65101103	65101281	65101196	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	14586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	65103266	65103574	65103420	Y	NA	RBPMS2,PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PIF1	12293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	65127928	65128208	65128016	Y	NA	PIF1,AC069368.3,PLEKHO2	PIF1	K562	ChIA-PET	22265404	AC069368.3	3874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	AC069368.3,PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	25424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65189466	65189943	65189728	Y	OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	ANKDD1A	SPG21	IMR90	Hi-C	24141950	ANKDD1A	12158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.3031770952086
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.40186867757628
chr15	65536787	65537132	65536963	Y	NA	CILP,RNU5A-1	NA	NA	NA	NA	CILP	34961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65657580	65657851	65657711	Y	NA	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	10527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65711297	65711582	65711440	Y	NA	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	1828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	65911878	65912241	65912183	Y	DENND4A	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	10174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	66060795	66060948	66060877	Y	NA	RAB11A,DENND4A	NA	NA	NA	NA	DENND4A	21683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr15	67287183	67287436	67287310	Y	NA	NA	SMAD3,IQCH,LOC100506686,SKOR1	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	66665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	33898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	RPS24P16,IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	5919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68207456	68207574	68207516	Y	NA	NA	CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	136943	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68238127	68238678	68238396	Y	NA	NA	PIAS1,CALML4,CLN6,C15orf61,LOC100506686	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	105839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68260561	68260756	68260687	Y	C15orf61	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	83761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68852393	68852527	68852460	Y	CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	16781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68894151	68894553	68894360	Y	CORO2B,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	24843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	68993008	68993104	68993034	Y	CORO2B,CORO2B	NA	NA	NA	NA	NA	SPESP1	115456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	69087536	69088004	69087836	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	SPESP1	20556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	69376017	69376173	69376096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	74750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	69382643	69382792	69382718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLCE	68131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	70059539	70059827	70059720	Y	TLE3	NA	TLE3,LOC145837,C15orf50	IMR90	Hi-C	24141950	RPLP1	316416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70391261	70391735	70391557	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	2746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr15	70452625	70452932	70452815	Y	TLE3	NA	NA	NA	NA	NA	TLE3	64110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70827382	70827642	70827515	Y	NA	NA	TLE3,LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	226290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70867778	70867861	70867857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UACA	186071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	70877631	70877741	70877691	Y	NA	NA	UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	176191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2E3	425243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2E3	78804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	72226785	72227154	72226872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2E3	143808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	72270951	72271133	72271042	Y	GRAMD2	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	133466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	CELF6,HEXA	NA	NA	NA	NA	CELF6	6901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	73137238	73137524	73137381	Y	NA	NA	NEO1	IMR90	Hi-C	24141950	ADPGK	61051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	74343707	74344076	74343754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PML	58693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	ISLR	50764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	74464511	74464760	74464636	Y	CD276,LOXL1,PML,UBL7,UBL7,ISLR,ISLR	ISLR,RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	ISLR	499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	74823971	74824076	74824015	Y	NA	ARID3B	ARID3B	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARID3B	7442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	74876114	74876298	74876206	Y	ULK3,CLK3	ARID3B,CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	12543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	77923178	77923295	77923290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	187947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	78037465	78037781	78037623	Y	LINGO1	NA	LINGO1,LOC253044	IMR90	Hi-C	24141950	LINGO1	73461	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr15	78476376	78476653	78476619	Y	ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	CIB2	54490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	78667581	78667654	78667595	Y	NA	CRABP1	CRABP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CRABP1	36915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	78754081	78754185	78754133	Y	ACSBG1	IREB2	NA	NA	NA	NA	IREB2	26308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	79153464	79153800	79153632	Y	RASGRF1	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	80828578	80828783	80828681	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	133886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	82050341	82050360	82050353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	286122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	82202578	82202690	82202619	Y	NA	NA	MEX3B	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	133792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83605762	83605980	83605871	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	46681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83722004	83722168	83722109	Y	NA	C15orf40,BTBD1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	11938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83778085	83778410	83778297	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	43722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83821433	83821717	83821575	Y	NA	TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	47274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	84040858	84041607	84041233	Y	NA	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	72373	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	85225191	85225385	85225287	Y	PDE8A,ZNF592	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	25397	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr15	85874454	85874742	85874552	Y	NA	AKAP13	AKAP13	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP13	47060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	85987048	85987479	85987219	Y	AKAP13,AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	65246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	86247990	86248195	86248102	Y	AKAP13	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	88066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	89156201	89156887	89156382	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	5640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG,LINC00925	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90436374	90436604	90436501	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90547619	90547737	90547660	Y	ANPEP,IQGAP1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	4995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90574620	90575072	90574763	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	31996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90590510	90590767	90590581	Y	ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	47886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	90649995	90650276	90650136	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	6259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90722818	90722829	90722824	Y	ZNF774	SEMA4B	SEMA4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEMA4B	20982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	90956663	90957019	90956743	Y	NA	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	27213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	91107423	91107655	91107549	Y	UNC45A,FES,FES,FES,CIB1,C15orf58,IQGAP1,CRTC3	CRTC3	NA	NA	NA	NA	CRTC3	36266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	91331328	91331736	91331526	Y	NA	CTD-3094K11.1	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	49218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	91373774	91374197	91373967	Y	IQGAP1,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	6757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93121727	93122011	93122001	Y	C15orf32	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-386M24.4	153414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	93365801	93366193	93365997	Y	NA	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	14687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	ASB9P1,FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93388455	93388698	93388628	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CHD2	35828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93424689	93424786	93424732	Y	CHD2	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	163	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93425040	93425223	93425112	Y	C15orf32	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	87773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr15	93611936	93612095	93612013	Y	RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA	RGMA	NA	NA	NA	NA	RGMA	18338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	93820840	93821077	93820958	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	190407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	99387614	99387887	99387660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	197414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	99943673	99944058	99943986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2A	71312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr15	101631799	101632179	101632024	Y	CHSY1	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	157958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr15	101834172	101834455	101834316	Y	TM2D3,TARSL2,SNRPA1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	124533	124922	124605	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	84	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	C16orf11,PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	C16orf11	32590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	C16orf11,PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	658205	658397	658303	Y	NA	C16orf11,PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	20848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	802051	802260	802100	Y	NA	FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL,MSLN,CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	MSLN	6502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1,GNG13	NA	NA	NA	NA	GNG13	10100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	1209498	1209681	1209611	Y	CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	8257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	1339188	1339523	1339417	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	UBE2I	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2I	14025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	1349375	1349723	1349678	Y	NA	UBE2I,BAIAP3	NA	NA	NA	NA	UBE2I	3825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	1381826	1382192	1381930	Y	UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3	UBE2I,BAIAP3,GNPTG	NA	NA	NA	NA	BAIAP3	224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	1585996	1586318	1586108	Y	NA	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	44651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	2175102	2175363	2175212	Y	NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2	RAB26,SNORD60,TRAF7	NA	NA	NA	NA	RAB26	13441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	2212881	2213081	2213004	Y	NA	RAB26,SNORD60,TRAF7,CASKIN1,MLST8,PGP	NA	NA	NA	NA	TRAF7	9182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS21,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	2955389	2955781	2955669	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	NA	NA	NA	NA	FLYWCH1	4157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3031604	3031823	3031757	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	3064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	4293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	3058105	3058264	3058160	Y	ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,NAT15,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1,SRRM2,PRSS33,MMP25	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	2193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	3114137	3114295	3114216	Y	ZNF263,ZNF205,PRSS41,ZSCAN10	TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25,IL32,ZSCAN10,ZNF205	NA	NA	NA	NA	IL32	839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr16	3145997	3146167	3146082	Y	NA	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZSCAN10	1151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3148559	3148729	3148623	Y	ZSCAN10,ZNF597,ZNF263,OR1F1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZSCAN10	1241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3221173	3221513	3221502	Y	NA	ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	43395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	3240888	3241090	3240973	Y	IL32,IL32,IL32,IL32,IL32,ZSCAN10,NLRC3,C16orf90	ZNF200	NA	NA	NA	NA	ZNF200	43131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr16	3512084	3512361	3512129	Y	OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1	ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1	NA	NA	NA	NA	NAA60	20473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3730332	3730635	3730484	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	34963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	3763227	3763392	3763351	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	2206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	4061559	4061871	4061733	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	102315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	4900331	4900638	4900507	Y	MGRN1,UBN1,UBN1	ROGDI,UBN1,GLYR1	NA	NA	NA	NA	GLYR1	4988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr16	5920372	5920634	5920563	Y	RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	774563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	7167298	7167326	7167312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1546214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	7355051	7355694	7355418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1357846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	8010227	8010459	8010246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	703081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	8015278	8015380	8015329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	698160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	8035197	8035214	8035207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	678326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	8139980	8140105	8140050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	573435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	8163053	8163492	8163342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	550048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr16	8232837	8233487	8232942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	480053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr16	8248200	8248245	8248223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	465295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	8615559	8615931	8615745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	97609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	8931520	8931573	8931545	Y	NA	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	29293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	9767919	9768425	9768098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C16orf72	584414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.77644848261831
chr16	9843836	9844157	9843968	Y	GRIN2A,GRIN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	574134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	10336686	10337073	10336907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	81218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	10363463	10363483	10363473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP2	54808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	10596760	10596940	10596850	Y	EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	75615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11086769	11086952	11086818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	50424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11405627	11405832	11405704	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	57591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11407202	11407368	11407306	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	59166	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	11409407	11409806	11409472	Y	NA	NA	CLEC16A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	61371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	11422943	11423238	11423117	Y	LITAF,CIITA,SOCS1	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	11484891	11485075	11484982	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	136855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11489659	11490054	11489857	Y	NA	NA	BCAR4,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	141623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11713232	11713400	11713276	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN	LITAF,SNN	TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	14837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	12541943	12542343	12542144	Y	RUNDC2A	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	353531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	12556614	12556995	12556828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	338879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	12700714	12700789	12700756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	195085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	13212195	13212542	13212369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHISA9	218718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14050567	14050869	14050623	Y	MKL2	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	38553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	14051699	14052037	14051838	Y	NA	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	39685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14088591	14088730	14088643	Y	NA	NA	PARN,MKL2	IMR90	Hi-C	24141950	MKL2	74448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14377810	14378205	14378026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	214632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.25682221813357
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14603035	14603210	14603110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	121375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	14621757	14621928	14621847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	102657	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	15238136	15238371	15238252	Y	NA	PKD1P6	NA	NA	NA	NA	PKD1P6	8050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	16070854	16071189	16071093	Y	NDE1	RPL15P20,ABCC1	NA	NA	NA	NA	ABCC1	29420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	16131643	16131874	16131759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	90209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	17249481	17249668	17249540	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	313070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	17451275	17451503	17451410	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	111235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	18153312	18153685	18153560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	590574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	19532119	19532450	19532314	Y	CCP110	RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62	NA	NA	NA	NA	GDE1	652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	19893504	19893863	19893602	Y	NA	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	1626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	21295163	21295477	21295440	Y	NA	CRYM-AS1,CRYM	NA	NA	NA	NA	CRYM-AS1	14693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr16	21637887	21638686	21638408	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	31348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	21662273	21662581	21662427	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	NA	NA	NA	NA	NA	METTL9	55734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	22211037	22211162	22211126	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EEF2K	4441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22227582	22228085	22227763	Y	EEF2K	EEF2K	NA	NA	NA	NA	EEF2K	11979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	22793806	22793984	22793891	Y	NA	HS3ST2	NA	NA	NA	NA	HS3ST2	29514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	23463654	23463771	23463713	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	1153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	23968296	23968621	23968461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	122974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	24150705	24150908	24150798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	305383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	26075935	26076263	26076099	Y	HS3ST4	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST4	374588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	26605065	26605255	26605131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	672860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	26609483	26609820	26609735	Y	NA	NA	HS3ST4	IMR90	Hi-C	24141950	NSMCE1	668295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	27334573	27334825	27334616	Y	NA	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	11584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	28169506	28169747	28169662	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	51494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	28186234	28186473	28186328	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	34768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	28629445	28629457	28629451	Y	SBK1,IL27	SULT1A2,SULT1A1	NA	NA	NA	NA	SULT1A1	3489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	RRN3P2	84240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	29712327	29712432	29712378	Y	HIRIP3,QPRT	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	39727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	29721114	29721129	29721122	Y	NA	QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	48514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	30458943	30459145	30459094	Y	SEPHS2	ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2,ITGAL	NA	NA	NA	NA	SEPHS2	3441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	30876491	30876606	30876548	Y	NA	BCL7C,CTF1	NA	NA	NA	NA	BCL7C	27675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	31264985	31265278	31265093	Y	STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM	NA	NA	NA	NA	NA	PYCARD	52214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	31887367	31887596	31887374	Y	NA	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	4288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	46671518	46671564	46671541	Y	NA	SHCBP1,VPS35,ORC6	NA	NA	NA	NA	SHCBP1	17980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	48091187	48091368	48091328	Y	ABCC11	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC12	96561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	48400459	48400723	48400564	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	79590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr16	48466132	48466242	48466189	Y	N4BP1,SIAH1	SIAH1	MIR548AE2,SIAH1,N4BP1	IMR90	Hi-C	24141950	SIAH1	14071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	48610830	48611144	48611073	Y	SIAH1,N4BP1	N4BP1	NA	NA	NA	NA	N4BP1	40915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	49317625	49318405	49317904	Y	NA	CBLN1	NA	NA	NA	NA	CBLN1	3883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	49656058	49656138	49656098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLN1	342316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	49888231	49888307	49888269	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	209545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	49910498	49910724	49910573	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	187128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	51670868	51671078	51670973	Y	NA	HNRNPA1P48	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P48	6589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	53089565	53089820	53089729	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	2620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	56406318	56406482	56406386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	50968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	56581201	56581558	56581471	Y	MT3,GNAO1,BBS2	BBS2,MT3	MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP	IMR90	Hi-C	24141950	BBS2	29006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr16	57164348	57164453	57164406	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	39899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	57294233	57294672	57294611	Y	CPNE2,GPR56	ARL2BP,PLLP	NA	NA	NA	NA	ARL2BP	17223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.21756968916408
chr16	57841964	57842337	57842236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIFC3	52620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	58061325	58061443	58061395	Y	NA	MMP15	NA	NA	NA	NA	MMP15	3855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	58460815	58461210	58460990	Y	NDRG4,NDRG4,NDRG4	NDRG4	NA	NA	NA	NA	NDRG4	33540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	60691914	60691948	60691931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	1376991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	62009181	62009277	62009229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	59662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	62712944	62713168	62713056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	644005	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	64377838	64377886	64377853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	780129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	67150652	67150777	67150712	Y	LRRC29,LRRC29,FHOD1,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70	C16orf70,FBXL8,TRADD,HSF4	NA	NA	NA	NA	C16orf70	8791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	67892470	67892795	67892734	Y	RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	EDC4	12131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	67993555	67993691	67993621	Y	NA	PSMB10,SLC12A4,DPEP3	NA	NA	NA	NA	SLC12A4	7813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	68039646	68040046	68039896	Y	SLC7A6OS,RANBP10,PSMB10,DPEP2,NFATC3,DDX28	SLC12A4,DPEP3,DDX28	DPEP3,DPEP2	IMR90	Hi-C	24141950	DDX28	15724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	68415381	68415552	68415488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	53949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr16	68765918	68766309	68765994	Y	NA	CDH1	CDH3,CDH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDH1	2819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	68818214	68818347	68818232	Y	CDH1	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	49086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	68824913	68825217	68824976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH1	55785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69106233	69106613	69106351	Y	NA	HAS3,CHTF8	NA	NA	NA	NA	HAS3	30854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69225511	69225823	69225667	Y	HAS3	SNTB2	NA	NA	NA	NA	SNTB2	6479	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69761641	69762033	69761837	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	2787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	70783169	70783447	70783290	Y	NA	VAC14	NA	NA	NA	NA	VAC14	49617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	71734305	71734386	71734346	Y	PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	22218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMFBP1	250381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	73053285	73053647	73053466	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	37950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	74901429	74901821	74901545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FA2H	94700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75290169	75290488	75290250	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	9463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75410566	75410863	75410755	Y	BCAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	54520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75594050	75594208	75594144	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2	CHST5,TMEM231	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GABARAPL2	4041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	75618166	75618518	75618190	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	GABARAPL2	19917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	75977962	75977979	75977971	Y	CHST5	NA	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	289542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	77511327	77511456	77511406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT7	242955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	77721999	77722135	77722067	Y	WWOX	NUDT7	VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	32276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	78029706	78030119	78030008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	101191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	78309369	78309676	78309602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	178059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	78325751	78325980	78325865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	194441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	78832287	78832508	78832373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	700977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	80694679	80694985	80694832	Y	CDYL2	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	141241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81311371	81311608	81311483	Y	NA	GAN	NA	NA	NA	NA	GAN	34949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81491583	81491773	81491678	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	14808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81666319	81666849	81666608	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	103853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81831224	81831380	81831299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	60522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81832236	81832757	81832339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	61534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81855087	81855491	81855343	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	84385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	81877175	81877498	81877479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	106473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	82685978	82686417	82686161	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	27570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	83159856	83159879	83159868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	501448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	83480656	83480733	83480694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	358715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	83715826	83716249	83715944	Y	HSBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	123199	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	83835897	83836084	83835978	Y	NA	HSBP1	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	3364	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	84029590	84029722	84029607	Y	DNAAF1,ADAD2	OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	NECAB2	29353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C,ADAD2	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	84305711	84305761	84305735	Y	NA	NA	ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609	IMR90	Hi-C	24141950	ADAD2	82967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	84548498	84548894	84548797	Y	COTL1	NA	NA	NA	NA	NA	COTL1	100789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	84784930	84785133	84785062	Y	KIAA0513,COTL1	NA	CRISPLD2,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	USP10	53346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	84788106	84788226	84788167	Y	COTL1	NA	NA	NA	NA	NA	USP10	56522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	85020713	85021068	85020917	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	22073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.21756968916408
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85368480	85368758	85368593	Y	NA	NA	KIAA0182,GINS2,LOC400548,LINC00311,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	309105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85751381	85751721	85751674	Y	NA	GINS2,C16orf74	NA	NA	NA	NA	GINS2	29702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85958354	85958601	85958447	Y	IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	27945	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	85987194	85987452	85987323	Y	IRF8	NA	IRF8,COX4NB,MTHFSD,COX4I1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	56785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	86016233	86016516	86016392	Y	COX4I1,IRF8	NA	COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	85824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	86312346	86312714	86312528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	274127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2	NA	NA	NA	NA	FOXC2	10642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	86653031	86653193	86653112	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	54174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	176264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXC2	366001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	87158204	87158531	87158278	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3B	257070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	36450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87609810	87610118	87609964	Y	NA	JPH3	MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A	IMR90	Hi-C	24141950	JPH3	23323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87840547	87840941	87840913	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	87856343	87856555	87856434	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	44539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	87878915	87879213	87879066	Y	NA	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	21881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	88102746	88103509	88103226	Y	BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	121896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	88448195	88448445	88448286	Y	NA	NA	CA5A,SLC7A5,BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	69280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	88988977	88989104	88989054	Y	NA	NA	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	52508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr16	89126677	89126907	89126800	Y	CBFA2T3	ACSF3	CBFA2T3,ACSF3,CDH15,PIEZO1,LOC400558,SLC22A31	IMR90	Hi-C	24141950	ACSF3	25876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	12.4351393783282
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	89879863	89880236	89880053	Y	NA	FANCA,SPIRE2	NA	NA	NA	NA	FANCA	829	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr16	90024486	90024764	90024610	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	DEF8	12153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	473610	473838	473725	Y	FAM101B	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	84949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	576455	576740	576580	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	17668	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	817943	818099	818016	Y	FAM57A	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	62911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	873777	873849	873813	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	1107024	1107388	1107281	Y	NA	AC016292.1,ABR	ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	22927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	1134847	1135025	1134980	Y	WDR81,WDR81,WDR81,SLC43A2,SCARF1,PITPNA,CRK	ABR	ABR,CRK,YWHAE,INPP5K,LOC100306951,PITPNA,SCARF1,RILP	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	4532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	1149347	1149718	1149533	Y	NA	ABR	ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,SLC43A2	IMR90	Hi-C	24141950	ABR	19032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	INPP5K	26399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.83588753601651
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	1626372	1626653	1626476	Y	CRK,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	7904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	1666519	1666783	1666685	Y	RTN4RL1,WDR81,WDR81,SERPINF1	WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	SERPINF1	3266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	61743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2075592	2075724	2075696	Y	HIC1	NA	NA	NA	NA	NA	HIC1	120144	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2163031	2163247	2163098	Y	SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	41430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2166387	2166805	2166676	Y	METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	37872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2241529	2241816	2241651	Y	NA	SRR,SMG6,SGSM2,TSR1	NA	NA	NA	NA	TSR1	2728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr17	2302108	2302510	2302261	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	NA	NA	NA	NA	NA	MNT	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2307798	2307958	2307865	Y	PAFAH1B1	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5386	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2397010	2397265	2397138	Y	NA	METTL16	LOC284009	IMR90	Hi-C	24141950	METTL16	15920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2409124	2409453	2409310	Y	NA	METTL16	NA	NA	NA	NA	METTL16	3732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	50253	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2751152	2751369	2751257	Y	PAFAH1B1,RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	72802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	2757819	2758227	2758154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	79469	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	2771532	2771614	2771573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	93182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	117610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	3289388	3289823	3289641	Y	SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,SPATA22,ASPA,ASPA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPV3	169466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	3453416	3453706	3453615	Y	OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3	TRPV3	NA	NA	NA	NA	TRPV3	5583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	4278382	4278689	4278533	Y	UBE2G1	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	10459	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4297300	4297441	4297368	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	4297689	4298014	4297723	Y	NA	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	29766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4299458	4299796	4299670	Y	MYBBP1A,UBE2G1	UBE2G1	UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2G1	31535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr17	4614568	4615368	4615020	Y	MINK1,C17orf107,ARRB2,ZMYND15,ZMYND15,CXCL16	PELP1,RP11-314A20.1,ARRB2,MED11,CXCL16	NA	NA	NA	NA	ARRB2	2784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4753672	4753828	4753714	Y	UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107	PLD2,MINK1,C17orf107	NA	NA	NA	NA	MINK1	18989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	C17orf107,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	C17orf107	10934	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr17	4812526	4812616	4812571	Y	SMTNL2,ZNF232,KIF1C	C17orf107,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1	NA	NA	NA	NA	C17orf107	11813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4934963	4935218	4935186	Y	NA	CAMTA2,KIF1C,ZFP3	NA	NA	NA	NA	KIF1C	35720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	4950916	4951277	4951137	Y	NA	ZFP3	NA	NA	NA	NA	ZFP3	28266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	ZFP3,AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr17	5430157	5430402	5430333	Y	NLRP1	MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	42026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	5813088	5813344	5813243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD1	139534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	6470839	6471155	6470959	Y	PITPNM3,TXNDC17	PITPNM3	PITPNM3	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM3	13025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	67699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	6839831	6840063	6839905	Y	XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49	NA	LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALOX12	57321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	7035868	7036444	7036277	Y	TNFSF12,SAT2,POLR2A,CD68,CD68,XAF1,GABARAP,EIF5A,ACAP1	NA	CLEC10A,SLC16A13,BCL6B,ASGR1,ASGR2	IMR90	Hi-C	24141950	ACADVL	82000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	7379219	7379555	7379279	Y	RNASEK,CLEC10A,GABARAP,EIF5A,WRAP53,SAT2,KDM6B,EIF4A1,CD68,CD68,TNFSF12,POLR2A	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	6027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	8517371	8517653	8517512	Y	NA	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	14426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	8531412	8531868	8531658	Y	NA	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	8600572	8600969	8600801	Y	MYH10	NA	MYH10,RPL26,RNF222	IMR90	Hi-C	24141950	MYH10	68493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	8762126	8762262	8762190	Y	PIK3R5,PIK3R6	PIK3R6	NA	NA	NA	NA	PIK3R6	6732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	8857526	8857964	8857839	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	9065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	9131847	9132010	9131919	Y	WDR16,NTN1	NA	NA	NA	NA	NA	NTN1	208988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	9267283	9267598	9267441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	210310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	9872259	9872671	9872460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	287408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	9875435	9875567	9875515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	284512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	9877746	9878167	9877897	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	281912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	9976120	9976268	9976237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	183811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	10029620	10029815	10029718	Y	MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	130264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	10031255	10031540	10031477	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	128539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	10053386	10053763	10053585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	106316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	10075775	10076068	10075982	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	84011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	10220640	10220911	10220834	Y	GAS7,MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	60561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	10237288	10237551	10237420	Y	MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	77209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1,TMEM220	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	11874981	11875002	11874992	Y	DNAH9	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	ZNF18	23825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	12719338	12719750	12719590	Y	NA	ARHGAP44	NA	NA	NA	NA	ARHGAP44	28482	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	12928606	12928939	12928835	Y	MYOCD	ELAC2	ELAC2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELAC2	9102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	13241219	13241377	13241298	Y	NA	NA	HS3ST3B1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	261867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	13463603	13463645	13463626	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	39599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	14736627	14737029	14736827	Y	NA	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005863.1	55107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	15153959	15154348	15154277	Y	NA	PMP22	NA	NA	NA	NA	PMP22	12295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	15363919	15364293	15364237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	111040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	16388389	16388725	16388555	Y	NA	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	4742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.84897171233967
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	16878291	16878630	16878396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRIP	65229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	17054009	17054176	17054093	Y	ZNF624,PEMT,COPS3,FLCN	NA	NA	NA	NA	NA	PLD6	53453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	17204544	17204774	17204670	Y	NA	COPS3	NA	NA	NA	NA	NT5M	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	17420385	17420786	17420623	Y	NA	MED9,RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	22676	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	17484274	17484547	17484424	Y	NA	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	8475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	17493657	17493822	17493814	Y	RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT	PEMT	NA	NA	NA	NA	PEMT	635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	17601204	17601406	17601306	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	18417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr17	17766830	17766899	17766864	Y	LLGL1	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	28505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	18128078	18128354	18128155	Y	NA	ALKBH5,LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	LLGL1	1177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	18204448	18204705	18204595	Y	LRRC48,C17orf39,SMCR8,TOP3A	FLII,TOP3A,SMCR8	NA	NA	NA	NA	TOP3A	11616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	18804175	18804500	18804326	Y	PRPSAP2	NA	NA	NA	NA	NA	PRPSAP2	62777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	18825562	18825708	18825647	Y	FAM83G,TRIM16L	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83G	80409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19147768	19147949	19147793	Y	PRPSAP2,RNF112	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK7	131085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	19273192	19273452	19273316	Y	FAM83G,MAPK7,MAPK7	MAPK7,B9D1,RNF112	NA	NA	NA	NA	MAPK7	5582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19398359	19398685	19398615	Y	NA	AC004448.5,SLC47A1	SLC47A2,B9D1,EPN2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	1661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.15813063576588
chr17	19411188	19411542	19411351	Y	NA	AC004448.5,SLC47A1	EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC47A1	14490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19834604	19834673	19834639	Y	NA	AKAP10	NA	NA	NA	NA	AKAP10	44983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19883392	19883621	19883525	Y	NA	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	AKAP10	3736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	19967569	19967807	19967644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	56912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	21416302	21416539	21416421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	59183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	21908682	21908761	21908685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	432960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr17	25659975	25660361	25659997	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	25833655	25833928	25833707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	51985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	26135195	26135302	26135249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS9	180371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	26552347	26552427	26552387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	91694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr17	26578258	26578420	26578387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM97	65701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	26827971	26828324	26828155	Y	TMEM97,SEBOX,UNC119,SPAG5,RPL23A	RPS7P1,UNC119	NA	NA	NA	NA	RPS7P1	35157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	26870881	26871048	26870951	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC	NA	NA	NA	NA	UNC119	6638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	27116093	27116114	27116106	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	47091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr17	27138672	27138846	27138777	Y	NA	ERAL1	NA	NA	NA	NA	ERAL1	41110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27299558	27299805	27299699	Y	NA	PIPOX,PHF12,SEZ6	NA	NA	NA	NA	PHF12	22769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	SEZ6	NA	NA	NA	NA	SEZ6	35837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27473466	27473709	27473569	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	31721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr17	27530741	27530989	27530946	Y	NA	MYO18A	MYO18A,TAOK1,NUFIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MYO18A	25311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	28031718	28032050	28032008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	83793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	28033849	28034236	28034039	Y	NUFIP2,TAOK1,SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	85924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	28533256	28533617	28533437	Y	SLC6A4	SNORD63	NA	NA	NA	NA	SNORD63	38221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	28687264	28687762	28687580	Y	NSRP1,CPD,CPD	CPD	NSRP1,CPD,GOSR1,BLMH,TMIGD1,SLC6A4	IMR90	Hi-C	24141950	CPD	16161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	ADAP2,TEFM	NA	NA	NA	NA	ADAP2	21200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	29334745	29335135	29334940	Y	RAB11FIP4,OMG	RNF135	NA	NA	NA	NA	RNF135	40942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	29759240	29759393	29759318	Y	NA	RAB11FIP4	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	42598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	29886835	29887094	29886884	Y	EVI2A	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	170193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	30070795	30071040	30070918	Y	NA	NA	MIR193A,UTP6,RAB11FIP4,C17orf79	IMR90	Hi-C	24141950	UTP6	155744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	30837973	30838187	30838080	Y	CDK5R1	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	26336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	30850461	30850579	30850547	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	38824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	30954292	30954689	30954451	Y	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	142655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	30986703	30987068	30986886	Y	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	175066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	31062983	31063086	31063034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	139109	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	31072918	31073214	31073077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	128981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	31200648	31200701	31200675	Y	NA	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	1494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	32349488	32349675	32349661	Y	ACCN1	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	230629	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	32426847	32427221	32427145	Y	TMEM132E,C17orf102,ACCN1	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	153083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	RASL10B	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	RASL10B	10853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	35281857	35282039	35281949	Y	LHX1	AATF	NA	NA	NA	NA	AATF	22136	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	35519679	35519723	35519693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	36102823	36103051	36102995	Y	ACACA,DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	101330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	36765523	36765920	36765825	Y	NA	SRCIN1	SRCIN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRCIN1	5340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	36996415	36996671	36996600	Y	SOCS7,FBXO47,C17orf98	PIP4K2B,CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1	NA	NA	NA	NA	SNORA21	10576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	37845270	37845675	37845499	Y	NA	PNMT,ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	ERBB2	3103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	38482426	38483282	38482568	Y	IKZF3,MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	18982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	38514847	38514935	38514891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RARA	51403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	38817101	38817471	38817286	Y	NA	SMARCE1	SMARCE1	IMR90	Hi-C	24141950	SMARCE1	14341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	39692337	39692600	39692431	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT19	KRT15,KRT19,KRT13,KRT36	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19	9777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	39956975	39957353	39957171	Y	KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	LEPREL4	9503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	40071903	40071935	40071919	Y	NA	ACLY,TTC25,CNP	NA	NA	NA	NA	ACLY	12860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	40163251	40163440	40163343	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	1851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	40438296	40438586	40438441	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	731	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3,PTRF	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	41017672	41017950	41017805	Y	NA	PSME3,BECN1,AOC3	NA	NA	NA	NA	AOC3	16471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	41173099	41173334	41173293	Y	NAGLU,VAT1	RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2	NA	NA	NA	NA	VAT1	1806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	41233585	41233852	41233719	Y	BRCA1	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	41648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	41324260	41324525	41324381	Y	TMEM106A	BRCA1,NBR2,NBR1,TMEM106A	NA	NA	NA	NA	NBR1	3762	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	41974490	41974868	41974680	Y	LSM12,MPP2	NA	CD300LG	IMR90	Hi-C	24141950	MPP3	65952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.84897171233967
chr17	42278333	42278607	42278473	Y	ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	2852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8,FZD2	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr17	42617265	42617502	42617370	Y	NA	GPATCH8,FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	15423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	42619909	42620020	42619938	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	42706147	42706421	42706320	Y	NA	C17orf104	GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2	IMR90	Hi-C	24141950	C17orf104	25341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43018379	43018606	43018493	Y	NA	CCDC103,EFTUD2,KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	KIF18B	4476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43061310	43061333	43061322	Y	C1QL1	KIF18B,C1QL1	EFTUD2,CCDC103,GFAP,KIF18B,DCAKD	IMR90	Hi-C	24141950	C1QL1	17871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43200086	43200194	43200154	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	ACBD4	7773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	43385085	43385291	43385153	Y	HEXIM1,FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14,ARHGAP27	MAP3K14	LOC100133991,FMNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	7123	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	43817871	43818233	43818138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRHR1	120604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44213270	44213366	44213318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	243522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44850644	44850747	44850696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	53111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	44896658	44896796	44896753	Y	WNT3,WNT9B	WNT9B	NA	NA	NA	NA	WNT9B	11771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2,RPRML	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	45725037	45725352	45725118	Y	SP2	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	45953013	45953226	45953169	Y	NA	MRPL10,LRRC46,SCRN2,SP6,SP2	SCRN2,MRPL10,LRRC46,SP6,SP2,CDK5RAP3	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	18290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	46605931	46606242	46606161	Y	TTLL6,HOXB1	HOXB1,HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB1	117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	RP11-357H14.17	19636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47092021	47092148	47092036	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	19247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47098330	47098693	47098445	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	25556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	ABI3	15080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr17	47290816	47291067	47290942	Y	GNGT2	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	GNGT2	4880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47586040	47586243	47586212	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	15385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47838770	47839156	47838963	Y	NA	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	KAT7	24761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47913501	47913854	47913589	Y	TMEM92	KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	42796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	47942337	47942718	47942546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	71632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	11463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SGCA,COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	48290532	48290619	48290576	Y	NA	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	13539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	11564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	49727164	49727246	49727242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	391275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	55501996	55502706	55502262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	170784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	55518270	55518753	55518516	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	187058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	55947370	55947506	55947438	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	21953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	55993641	55993992	55993778	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	36692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	56013342	56013699	56013370	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	16985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	56015325	56015755	56015655	Y	CUEDC1	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	14929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	56110025	56110231	56110193	Y	NA	VEZF1,SRSF1,DYNLL2	AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	SRSF1	27318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	56391648	56391970	56391957	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	36484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	56441767	56441894	56441848	Y	NA	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	13313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	57070105	57070503	57070406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM37	111779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	57502587	57502904	57502671	Y	NA	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57509065	57509242	57509141	Y	NA	NA	YPEL2,GDPD1,PRR11	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	102015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57869540	57869779	57869705	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	46848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	58228293	58228479	58228403	Y	CA4	CA4	NA	NA	NA	NA	CA4	2996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	58228760	58229091	58228985	Y	VMP1,USP32,PPM1D,CA4	CA4	NA	NA	NA	NA	CA4	3463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	58475654	58476033	58475933	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	USP32,PPM1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP32	21798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	AC005884.1	68115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	59328360	59328558	59328442	Y	NACA2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	146699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60247601	60248070	60247921	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	106958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	115348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60386945	60386953	60386949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	205175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60827722	60828206	60828004	Y	EFCAB3,MARCH10,MARCH10	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	124960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	KCNH6,DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	62066027	62066333	62066173	Y	SCN4A	NA	NA	NA	NA	NA	GH2	108732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	62138721	62138967	62138947	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,DDX5,ERN1	NA	NA	NA	NA	NA	ERN1	67212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	62169387	62169789	62169751	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	ICAM2,C17orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	36390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	63043139	63043174	63043152	Y	NA	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	7783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	63053851	63054126	63053975	Y	GNA13	GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	2894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	63140838	63141188	63141013	Y	NA	RGS9	NA	NA	NA	NA	RGS9	9289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	63179961	63180187	63180056	Y	NA	RGS9	NA	NA	NA	NA	RGS9	48412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr17	63646847	63647018	63646933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	91082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	133382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	64959449	64959766	64959607	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	64962057	64962755	64962345	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	3031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65318264	65318584	65318454	Y	NA	PSMD12	NA	NA	NA	NA	PSMD12	42159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	65394789	65395150	65395019	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	23214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	65484422	65484481	65484453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	112847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65485462	65485785	65485684	Y	HELZ,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	113887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65487114	65487504	65487449	Y	HELZ,PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	115539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65505765	65506408	65506331	Y	HELZ,PSMD12,BPTF	NA	NOL11	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNC1	134190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	66618888	66618909	66618898	Y	NA	FAM20A	ABCA10,ABCA8,ABCA9	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20A	23358	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20A	98800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	67270709	67270940	67270826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA5	50445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	67599219	67599477	67599295	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	190380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	69596730	69596951	69596781	Y	NA	LOC124685	NA	NA	NA	NA	LOC124685	18168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	69824557	69824843	69824637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	209438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	70374697	70374707	70374702	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	RPL32P33	246663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	70416079	70416357	70416132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	205013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70432780	70433062	70433017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	188308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70461830	70461987	70461862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	159383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70712408	70712674	70712489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	91038	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70779461	70779663	70779556	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70878609	70878955	70878782	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	207896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	70892078	70892260	70892135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	194591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	71160364	71160483	71160395	Y	SSTR2	SSTR2,COG1	NA	NA	NA	NA	SSTR2	1213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	71499846	71500069	71499928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	138159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	34258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	71898249	71898423	71898326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK2	260021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72247418	72247796	72247504	Y	NA	RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2	NA	NA	NA	NA	TTYH2	39765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72526011	72526288	72526108	Y	CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	107021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72565404	72566131	72565833	Y	TTYH2,TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	98586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72577397	72577458	72577422	Y	SLC9A3R1,RAB37,RAB37,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	RAB37	87259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	OTOP3,CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2,MYO15B	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73546030	73546166	73546084	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2,MYO15B	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26869	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,UNC13D,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	74025620	74025914	74025713	Y	H3F3B,TRIM47,EVPL	CDK3,EVPL,SRP68,GALR2	NA	NA	NA	NA	EVPL	4087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74116537	74116786	74116688	Y	NA	SRP68,GALR2,EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	EXOC7	880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	74186019	74186269	74186124	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	34618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	74337022	74337338	74337180	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	33327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr17	74359249	74359572	74359412	Y	RHBDF2,SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	PRPSAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK1	11093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr17	74511289	74512094	74511811	Y	QRICH2,SPHK1,SPHK1,SRSF2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	15417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74692944	74693312	74693210	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	11786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74723995	74724371	74724344	Y	FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	METTL23	3083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	74836829	74837207	74837140	Y	UBE2O,MGAT5B	MGAT5B	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5B	25331	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	75170939	75171192	75170955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	90141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	8052	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	10285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75386259	75386377	75386341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	111608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75417194	75417582	75417357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	142543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75429541	75429800	75429625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	154890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	187151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	75468767	75469129	75469011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	194116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	229848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	75553117	75553125	75553121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	278466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	75769300	75769393	75769353	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	144787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr17	75798844	75799281	75799210	Y	TNRC6C,TMEM235	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	114899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	39759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	60.3992484090225
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	41743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	76147929	76148019	76147974	Y	NA	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	14620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76154299	76154669	76154484	Y	C17orf99	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	7970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	76335027	76335218	76335120	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	18940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76338337	76338836	76338651	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr17	76361692	76362147	76361865	Y	NA	SOCS3,PGS1	PGS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	7534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77178498	77178880	77178689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77216681	77217055	77216976	Y	RBFOX3	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	147660	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77469645	77469864	77469711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	280067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	78008584	78008924	78008651	Y	TBC1D16,GAA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	CCDC40	149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	78023284	78023378	78023331	Y	NA	TBC1D16,CCDC40,GAA	NA	NA	NA	NA	CCDC40	14849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	78198081	78198434	78198366	Y	NA	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	SGSH	5359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	78304141	78304261	78304201	Y	NPTX1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF213	71476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.77644848261831
chr17	78500391	78500494	78500444	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	RPTOR,NPTX1,LOC100294362,ENDOV	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32P31	13509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79046413	79046604	79046526	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	39465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79064673	79065032	79064884	Y	BAIAP2,TMEM105	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	57725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79126074	79126501	79126440	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	AZI1	68298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	79228717	79229006	79228862	Y	NA	AZI1,C17orf89,SLC38A10	NA	NA	NA	NA	C17orf89	17678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79313114	79313481	79313281	Y	NA	SLC38A10,TMEM105	SLC38A10,LINC00482,TMEM105,MIR4740,BAHCC1,C17orf70,FSCN2,ACTG1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM105	10640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79318144	79318304	79318226	Y	TMEM105,BAHCC1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	79399752	79400128	79399940	Y	NPB	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	78945	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	27515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80104775	80104822	80104796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FASN	50567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	80132206	80132561	80132393	Y	NA	CCDC57	NA	NA	NA	NA	CCDC57	36145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80199457	80199968	80199484	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	15184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80328282	80328672	80328333	Y	NA	SECTM1,TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	13159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	21450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80840475	80841074	80840735	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	44021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	93162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	10894	11221	11019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP14	145162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	129016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr18	2223503	2223515	2223509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	345993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	2656589	2657177	2656999	Y	NA	SMCHD1	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	2852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	2908380	2908446	2908413	Y	SMCHD1,EMILIN2,LPIN2	NA	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	63352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	2916275	2916499	2916390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	71247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	2972158	2972493	2972361	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	38820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	2978254	2978441	2978377	Y	NA	LPIN2	NA	NA	NA	NA	LPIN2	32872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3213545	3213785	3213625	Y	NA	MYOM1,MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYOM1	4321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYOM1,MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3276279	3276423	3276302	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12B	16372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3612432	3612598	3612515	Y	DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	202826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3650005	3650381	3650193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	240399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	3798477	3798752	3798615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	388871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	4404011	4404377	4404194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	994405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	5318474	5318779	5318487	Y	ZFP161	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	309920	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr18	6355893	6356010	6355962	Y	ARHGAP28,L3MBTL4	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	57226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	7460129	7460467	7460298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRM	104313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	8661812	8662039	8661951	Y	NA	NA	ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	54369	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	9009931	9010219	9010076	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	90409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9017103	9017601	9017310	Y	ANKRD12	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	83027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9128926	9129321	9129124	Y	NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	ANKRD12	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD12	4905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9554563	9554587	9554575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	58651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9604214	9604566	9604459	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	8672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9643596	9643835	9643765	Y	NA	PPP4R1	PPP4R1,VAPA,ANKRD12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1	30358	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9812085	9812326	9812208	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	99673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9838439	9838883	9838628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	73116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr18	10528233	10528593	10528264	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	4331	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	10544333	10544521	10544427	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	20431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAL	254726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	11670053	11670285	11670217	Y	NA	GNAL	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	GNAL	16670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	11859926	11860218	11860181	Y	CHMP1B	CHMP1B,MPPE1	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	10531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	12076743	12076871	12076848	Y	NA	NA	GNAL	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	97719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	12092408	12092760	12092594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	113384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	CIDEA,TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	12347442	12347507	12347473	Y	CEP76,AFG3L2	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	27806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	12880036	12880906	12880743	Y	NA	PTPN2	NA	NA	NA	NA	PTPN2	46736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	13375364	13375636	13375393	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	349023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	13381993	13382212	13382131	Y	RNMT,PTPN2,CEP192,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	342447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	13452540	13452718	13452594	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	271941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	13470557	13470796	13470677	Y	MC5R,C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	253863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	19929586	19929820	19929712	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	182182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	20035500	20035848	20035676	Y	NA	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	288096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	20855209	20855599	20855401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	142681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	21153994	21154335	21154180	Y	NA	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	10527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA3	69932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	63897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	21824830	21825076	21824954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	107888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	21975077	21975273	21975220	Y	OSBPL1A	OSBPL1A,IMPACT	NA	NA	NA	NA	OSBPL1A	571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	23657156	23657540	23657507	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	11641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	23836366	23836416	23836389	Y	TAF4B	TAF4B	NA	NA	NA	NA	TAF4B	32466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	24537528	24537649	24537589	Y	KCTD1	NA	NA	NA	NA	NA	AQP4	93746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	26982645	26982654	26982650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	1227235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	27949188	27949221	27949205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSC2	731157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	29599439	29599921	29599769	Y	RNF138,RNF138,TRAPPC8,RNF125	RNF125	NA	NA	NA	NA	RNF125	3104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	32183267	32183349	32183326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	112013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	32399644	32399985	32399810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	154907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	32643962	32643991	32643977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	89070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	32674767	32675124	32674837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	119875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	33071303	33071471	33071398	Y	NA	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	4484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	35009721	35010039	35009931	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	133961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	35188178	35188197	35188187	Y	NA	CELF4	NA	NA	NA	NA	CELF4	44178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	39898716	39899231	39898870	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	365545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	42303381	42303748	42303450	Y	SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	45243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	42324731	42325124	42324894	Y	SETBP1,SETBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	66593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	43536054	43536394	43536224	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	8846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	43841732	43842044	43841747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	62728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	44451829	44452200	44451995	Y	NA	KATNAL2,PIAS2	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	43255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	45071192	45071545	45071369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	370447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	45353824	45354074	45353943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	101441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	45398335	45398609	45398472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	56906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46253142	46253362	46253168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	189725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46354445	46354549	46354497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	291028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46375185	46375303	46375244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	311768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	46486224	46486525	46486411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	422807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	46508713	46508838	46508774	Y	DYM,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	445296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46513452	46513832	46513642	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	450035	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	454769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	46519156	46519437	46519250	Y	DYM,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	455739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	46524155	46524830	46524741	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	460738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	DYM	437578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.35551380050125
chr18	46740928	46741364	46741195	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	244353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	47620136	47620367	47620252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	99096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	48274760	48275068	48274915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME2	128351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	48301659	48301815	48301762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ME2	101604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	51741820	51741880	51741850	Y	STARD6	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	7278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	51773425	51773767	51773527	Y	NA	MBD2,POLI	POLI	MCF7	ChIA-PET	22265404	POLI	20007	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	53355940	53355975	53355958	Y	NA	TCF4	TXNL1,TCF4	IMR90	Hi-C	24141950	TCF4	25922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	53815668	53815975	53815833	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	TCF4	485650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	54122368	54122661	54122581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR7	193913	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	55872819	55873190	55873005	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	163220	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	56188664	56188776	56188720	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	77087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	56206749	56207237	56207038	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	58626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	56514801	56515232	56515114	Y	NA	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	12600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	57531424	57531809	57531587	Y	NA	PMAIP1	PMAIP1,CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	PMAIP1	33371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	58951957	58952157	58952057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P14	118281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	64968652	64968919	64968666	Y	NA	NA	CCDC102B,TMX3	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	213298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	67069140	67069566	67069456	Y	DOK6	DOK6	NA	NA	NA	NA	DOK6	2849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	67713597	67713887	67713742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	157294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	67901995	67902279	67902045	Y	NA	RTTN	NA	NA	NA	NA	RTTN	30814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr18	68196083	68196104	68196093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	241946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	70536769	70537080	70536861	Y	CBLN2,NETO1,NETO1	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	3388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	70814652	70814839	70814746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	281271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	70998412	70998732	70998572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	465031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	71010965	71011298	71011132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO1	477584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr18	71910001	71910146	71910074	Y	NA	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	47105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	72501282	72501640	72501447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	238176	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	72683878	72684340	72684028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	72919000	72919372	72919172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	74399023	74399139	74399084	Y	NA	NA	LOC284276,ZNF516	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF236	133424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr18	74556264	74556608	74556436	Y	NA	ZNF236	NA	NA	NA	NA	ZNF236	23701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	74732491	74732837	74732665	Y	MBP,MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	199928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	74774000	74774964	74774473	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	241437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	75115540	75115770	75115653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	582977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr18	76574789	76574960	76574953	Y	SALL3	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	163315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr18	76617514	76617912	76617823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	120363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	76737711	76738510	76737981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	76740873	76741825	76741734	Y	NA	SALL3	NA	NA	NA	NA	SALL3	2598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	137452	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr19	380759	380771	380765	Y	NA	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	26368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	383028	383243	383101	Y	NA	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	23896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	384369	384669	384409	Y	SHC2,C2CD4C,MIER2	MIER2,C2CD4C	NA	NA	NA	NA	C2CD4C	22470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr19	461817	462164	462146	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1	NA	NA	NA	NA	SHC2	2821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	481673	481793	481759	Y	PALM,HCN2,FGF22	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	MADCAM1	5383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,GZMM,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.00710234810555
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	909116	909504	909461	Y	STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	1736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	928103	928378	928301	Y	SBNO2,MIDN,HMHA1,C19orf22,KISS1R,ARID3A	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	4322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	953220	953565	953383	Y	EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	27609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	954903	955312	954982	Y	KISS1R,ARID3A	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	25862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	958944	959162	959060	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	WDR18	22012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	1085284	1085426	1085350	Y	C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4	NA	NA	NA	NA	POLR2E	8172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1183874	1184237	1184064	Y	SBNO2	SBNO2,STK11	ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4	MCF7	ChIA-PET	22265404	STK11	3169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1632932	1633212	1633140	Y	STK11	MBD3,UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	17392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1654223	1654456	1654354	Y	NA	TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	3619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	1840916	1841078	1840939	Y	NA	REXO1,KLF16	NA	NA	NA	NA	REXO1	5374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	2162744	2162943	2162860	Y	CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2171641	2172019	2171832	Y	NA	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	9177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	2182828	2183132	2183005	Y	KLF16	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	20364	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2452794	2453150	2452981	Y	NA	TIMM13,LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	LMNB2	1844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	2478921	2479315	2479258	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	4801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2719845	2720284	2720049	Y	JSRP1,TLE6,AES,GNG7,DIRAS1	GNG7,DIRAS1,SLC39A3	NA	NA	NA	NA	DIRAS1	429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	2926811	2926963	2926923	Y	NA	ZNF57,ZNF77,TLE6	NA	NA	NA	NA	ZNF77	16006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.35551380050125
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	C19orf77,DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.11887810679639
chr19	3551628	3551981	3551925	Y	NA	FZR1,HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	HMG20B	18794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	3552794	3553085	3553017	Y	GNA15,C19orf28	FZR1,HMG20B,MFSD12	NA	NA	NA	NA	HMG20B	17690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	3683675	3684043	3683874	Y	NA	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	14434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	3923611	3923782	3923733	Y	ITGB1BP3	ATCAY,DAPK3	NA	NA	NA	NA	DAPK3	45339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4084320	4084813	4084566	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	19377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4375126	4375688	4375404	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	MIR7-3HG,MIR7-3,FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	4870294	4870493	4870397	Y	SEMA6B,TICAM1	TICAM1,PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	PLIN3	4514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5536566	5536826	5536635	Y	NA	NA	PTPRS,ZNRF4,PLAC2	IMR90	Hi-C	24141950	SAFB	84220	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr19	5585977	5586132	5586057	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	34914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5829202	5829624	5829506	Y	NA	DUS3L,FUT3	NA	NA	NA	NA	FUT3	19861	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5966194	5966581	5966386	Y	CAPS	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	9572	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6060958	6061480	6061122	Y	RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSBG2	71778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	6087956	6088249	6088075	Y	PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2	ACSBG2	RANBP3,LOC100128568	IMR90	Hi-C	24141950	ACSBG2	45009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	ACSBG2	NA	NA	NA	NA	ACSBG2	24336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6556475	6556744	6556665	Y	RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	27465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	6708735	6709024	6708902	Y	C3	GPR108,TRIP10	NA	NA	NA	NA	GPR108	26590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	7254620	7254884	7254780	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	37161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	7414639	7414850	7414793	Y	NA	ARHGEF18	ZNF557,INSR	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	43149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	PEX11G	NA	NA	NA	NA	PEX11G	34772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	11959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	7723326	7723586	7723448	Y	PEX11G,MCOLN1,C19orf59,LOC100131801,STXBP2	XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	20143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	8075966	8076193	8076120	Y	NA	ELAVL1,CCL25	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr19	8605873	8606246	8606065	Y	MARCH2,PRAM1,MYO1F	ZNF414,MYO1F	NA	NA	NA	NA	ZNF414	28825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	8638437	8638868	8638608	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	MYO1F	1593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	8676425	8676449	8676437	Y	NA	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	2805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	8989058	8989241	8989188	Y	ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1	ZNF558	NA	NA	NA	NA	ZNF558	48054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	9095662	9095964	9095813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	153092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF317	119941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9517572	9518021	9517955	Y	NA	ZNF266	NA	NA	NA	NA	ZNF266	26233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9758216	9758505	9758322	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	25271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22,ZNF812	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9919463	9919725	9919715	Y	ZNF846,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	16767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	10056236	10056512	10056406	Y	ZNF846,COL5A3,OLFM2	OLFM2	NA	NA	NA	NA	OLFM2	11008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	21415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	12270640	12270828	12270733	Y	NA	ZNF20,CTC-359D24.3,ZNF625,ZNF136,CTD-2666L21.1	NA	NA	NA	NA	ZNF136	1051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13006078	13006409	13006086	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A	NA	NA	NA	NA	GCDH	6238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13048278	13048689	13048364	Y	MAN2B1	GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5	NA	NA	NA	NA	CALR	886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13153458	13153528	13153499	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	49036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	59023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13188264	13188490	13188383	Y	ZNF490,PRDX2,KLF1,STX10,LYL1	TRMT1,NACC1	NA	NA	NA	NA	TRMT1	37891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13231642	13232105	13231971	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	4725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	13597293	13597592	13597549	Y	C19orf57,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1A	135212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13732373	13732509	13732441	Y	NA	CACNA1A	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1A	295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	14089228	14089566	14089336	Y	CCDC130,PKN1,CD97,RFX1	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	RFX1	26285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	14276845	14277176	14277145	Y	NA	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	31077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	14400310	14400612	14400461	Y	EMR2,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	NA	LPHN1	85311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	14404408	14404769	14404597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD97	84544	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	14414232	14414293	14414263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD97	75020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	14473667	14474081	14473883	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,PKN1,CD97	CD97	CD97,DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	15232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	14869692	14869911	14869839	Y	NA	EMR2,AC005255.3	NA	NA	NA	NA	EMR2	17442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3,EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	8499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	UCA1	NA	NA	NA	NA	UCA1	9846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	16205409	16205807	16205414	Y	EPS15L1,RAB8A,HSH2D	TPM4,RAB8A,HSH2D	NA	NA	NA	NA	RAB8A	14632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	16445319	16445495	16445399	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	11691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	16772555	16772747	16772653	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	2617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	17225282	17225997	17225467	Y	SIN3B,CPAMD8	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	40691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	17371801	17372164	17371849	Y	NXNL1,GTPBP3	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8	NR2F6	K562	ChIA-PET	22265404	BABAM1	3995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	18154526	18154804	18154610	Y	IFI30	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	44585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18155923	18156099	18156029	Y	NA	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	45982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	18382556	18382948	18382783	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	18625662	18626077	18625893	Y	UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL	ELL,FKBP8,KXD1	NA	NA	NA	NA	ELL	4860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	19504149	19504345	19504247	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	9514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	19977247	19977754	19977315	Y	PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253	ZNF506,ZNF253,ZNF93	NA	NA	NA	NA	ZNF253	2552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	21678211	21678382	21678297	Y	ZNF430,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	21689202	21689645	21689487	Y	ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429	ZNF429	NA	NA	NA	NA	ZNF429	11718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	21882044	21882358	21882227	Y	ZNF676,ZNF208	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	66072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	21891969	21892260	21892094	Y	ZNF100	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	56170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr19	22610267	22610542	22610420	Y	ZNF208,ZNF257,ZNF676,ZNF492,ZNF98	NA	NA	NA	NA	NA	RPL34P34	60513	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.75028012997198
chr19	22724616	22724856	22724736	Y	ZNF257,ZNF98,ZNF492	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	11329	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	23306377	23306770	23306574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	50365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF730	53433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	23416597	23416606	23416602	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	14586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	27733888	27734761	27733974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1967687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	28229266	28230821	28229614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1471627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	28265126	28266155	28265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1436293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	28274249	28275061	28274473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1427387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	28279937	28280239	28280146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1422209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	29210558	29210810	29210684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	491638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	29702850	29703471	29703365	Y	NA	UQCRFS1	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	30206961	30207337	30207149	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	2597	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	33841444	33841736	33841590	Y	NA	CEBPA,CEBPG	CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPG	20500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	34398114	34398257	34398186	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	113276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	35595565	35595951	35595710	Y	ZNF181,ZNF30	FXYD3,LGI4,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	8781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	35696373	35696472	35696417	Y	FFAR1,CD22,USF2	LSR	NA	NA	NA	NA	LSR	40761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	35808532	35808711	35808557	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	50651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	36274503	36274656	36274589	Y	GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,HSPB6,C19orf55,ARHGAP33	NA	NA	NA	NA	ARHGAP33	11069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	36345881	36346198	36346012	Y	FFAR2,TYROBP,NFKBID	APLP1,NFKBID	NA	NA	NA	NA	APLP1	10603	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	36404580	36404784	36404704	Y	FFAR2,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP	APLP1,NFKBID,TYROBP,LRFN3	NA	NA	NA	NA	TYROBP	7383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1	NA	NA	NA	NA	COX7A1	6618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr19	36863070	36863255	36863179	Y	NA	LINC00665,ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	4846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP82	15286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr19	37262228	37262609	37262419	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	2810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	37795242	37795359	37795301	Y	ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1	HKR1	NA	NA	NA	NA	HKR1	6380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.63850437128114
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569,ZNF793	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	38719187	38719304	38719247	Y	ZNF573,DPF1,PPP1R14A,DPF1	DPF1,SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	DPF1	833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	38727709	38727942	38727826	Y	NA	DPF1,SPINT2,PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	SPINT2	4733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39177340	39177518	39177421	Y	RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	41051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	39283371	39283483	39283427	Y	NA	CAPN12,LGALS4,ECH1	NA	NA	NA	NA	LGALS4	18521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	39453898	39453904	39453901	Y	NA	MRPS12,SARS2,FBXO17	NA	NA	NA	NA	FBXO17	10646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	39627416	39627544	39627474	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	13006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	39921308	39921946	39921495	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50	NA	NA	NA	NA	RPS16	2642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	40042107	40042358	40042233	Y	NA	EID2B,EID2	DLL3,EID2,LGALS17A	IMR90	Hi-C	24141950	EID2	13237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	42411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	41680959	41681276	41681150	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	7193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	RPL36P16	8178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr19	41695552	41695583	41695568	Y	NA	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	1371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	41701582	41701929	41701850	Y	CYP2A13,CYP2F1	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	4628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	41702138	41702290	41702230	Y	ADCK4,ITPKC,TGFB1,CCDC97	RPL36P16,CYP2S1,AXL	NA	NA	NA	NA	CYP2S1	5184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	41827649	41828097	41827915	Y	HNRNPUL1,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	13555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	CEACAM21	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	25521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	15573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.86205588866283
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	42964614	42965000	42964807	Y	CEACAM8,DEDD2	CXCL17	CXCL17,LIPE,CEACAM1,CEACAM8	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL17	19414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	43856277	43856677	43856430	Y	CD177	CD177	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	CD177	466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	43934404	43934558	43934468	Y	NA	LYPD3	NA	NA	NA	NA	LYPD3	33254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,LYPD5,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	44555398	44555498	44555444	Y	ZNF155,ZNF223	ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224	NA	NA	NA	NA	ZNF223	1878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	44616064	44616441	44616271	Y	KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284	ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234	NA	NA	NA	NA	ZNF225	1730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	44773096	44773391	44773244	Y	LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF233	20778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45100230	45100376	45100298	Y	NA	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	44722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45189303	45189576	45189367	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	44205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr19	45427550	45427884	45427705	Y	IGSF23,APOE,APOC1,APOC4,APOC2	TOMM40,APOE,CLPTM1	NA	NA	NA	NA	APOE	20539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	CKM,KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45944272	45944469	45944370	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	24784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	2576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46014236	46014617	46014413	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	6399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46104301	46104701	46104603	Y	NOVA2,GPR4	GPR4,OPA3,EML2	NA	NA	NA	NA	OPA3	831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	GPR4,OPA3,EML2,GIPR	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46853988	46854113	46854077	Y	PRKD2	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	5737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	46854568	46854669	46854639	Y	PPP5C	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	6317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46876247	46876539	46876393	Y	NA	PPP5C,CCDC8	NA	NA	NA	NA	PPP5C	27996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	47552678	47552827	47552750	Y	NA	NPAS1,TMEM160	NA	NA	NA	NA	TMEM160	2790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	47689758	47690163	47690151	Y	GLTSCR1,BBC3	MIR3191,BBC3	NA	NA	NA	NA	MIR3191	38036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	47814150	47814595	47814332	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,C5AR1,DHX34	NA	NA	NA	NA	C5AR1	22870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47886542	47886975	47886851	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	33805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47926520	47926706	47926665	Y	NA	MEIS3,SLC8A2	NA	NA	NA	NA	MEIS3	5740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	47961170	47962467	47962382	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	10958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	48017457	48017515	48017486	Y	NA	SLC8A2,KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	48293591	48293754	48293716	Y	CABP5,CRX	GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80,CRX	NA	NA	NA	NA	RPL23AP80	2393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	48625125	48625566	48625247	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	13051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	48648975	48649130	48649035	Y	SYNGR4,SPACA4	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	22730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	48832028	48832343	48832234	Y	CARD8,IZUMO1,EMP3	EMP3,TMEM143	NA	NA	NA	NA	EMP3	9262	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	48903450	48903602	48903513	Y	NA	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	48974873	48974967	48974920	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	4584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	NA	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPHK2	73642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	49577003	49577438	49577313	Y	SULT2B1,MAMSTR,KCNA7	CGB5,SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3	NA	NA	NA	NA	SNRNP70	9238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,FLT3LG,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,SNORD34,RPS11,SNORD35B,FCGRT,RCN3	NA	NA	NA	NA	FCGRT	3433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50116585	50116794	50116665	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1	NA	NA	NA	NA	PRR12	23685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1,SPIB	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50990086	50990332	50990328	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	12076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	FAM71E1	15670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	FAM71E1,JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9639	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2,LRRC4B	NA	NA	NA	NA	LRRC4B	9014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	51166998	51167396	51167198	Y	KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918	C19orf81,SYT3	NA	NA	NA	NA	SYT3	2255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	51182448	51182932	51182864	Y	NA	C19orf81,SYT3,CLEC11A	NA	NA	NA	NA	SYT3	12797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	51796169	51796569	51796297	Y	NA	IGLON5	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	IGLON5	16533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	51797467	51797679	51797598	Y	NA	IGLON5	CD33,IGLON5	IMR90	Hi-C	24141950	IGLON5	15423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	112596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	110859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	110104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	75547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	52323338	52323678	52323420	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	FPR1	NA	NA	NA	NA	FPR1	17975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	52734516	52734674	52734594	Y	ZNF610	PPP2R1A,ZNF766	NA	NA	NA	NA	ZNF766	36150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	52996616	52996734	52996658	Y	NA	ZNF578,ZNF808	NA	NA	NA	NA	ZNF808	32171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	53239075	53239317	53239102	Y	NA	ZNF83,ZNF611,ZNF600	NA	NA	NA	NA	ZNF611	2749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ERVV-2,ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53660263	53660559	53660411	Y	NA	ZNF415,ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF347	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	54098247	54098689	54098487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR526B	96958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	54168099	54168226	54168160	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813,DPRX	MIR526B	NA	NA	NA	NA	MIR526B	27421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr19	54286017	54286259	54286128	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF813	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr19	54288550	54288757	54288603	Y	ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	54291187	54291209	54291198	Y	BIRC8,ZNF845,ZNF765,ZNF761,ZNF813	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	54291781	54292027	54291904	Y	ZNF331,DPRX,NLRP12	AC008753.3,MIR371A,NLRP12	NA	NA	NA	NA	MIR371A	2852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	54548907	54549052	54548979	Y	NLRP12,NLRP12,VSTM1	NA	NA	NA	NA	NA	OSCAR	54948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	54772917	54773137	54772927	Y	NLRP12,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,LAIR1,LILRB3,LILRB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS9	70307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	54981954	54982383	54982298	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	28	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55464646	55464913	55464780	Y	EPS8L1,NLRP2,NLRP2	NCR1,NLRP2,NLRP7	NA	NA	NA	NA	NLRP2	2148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13,EPS8L1	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55629952	55630354	55629995	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	3025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55798938	55799371	55799231	Y	SYT5,SHISA7,BRSK1	PPP6R1,HSPBP1,BRSK1,SUV420H2	NA	NA	NA	NA	BRSK1	7498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55880979	55881171	55881094	Y	ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	IL11	1148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	55960580	55961094	55961009	Y	SYT5,BRSK1,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ISOC2	10616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55962647	55962935	55962813	Y	SYT5,BRSK1,ZNF580,SHISA7	UBE2S,ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ISOC2	8775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	55976006	55976393	55976362	Y	NA	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ISOC2	4296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.94766329470735
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56148080	56148375	56148228	Y	ZNF580	ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	CCDC106	2053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56169893	56170373	56169939	Y	NA	ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	U2AF2	6381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr19	56796830	56796936	56796883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	80532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	53470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	56831287	56831644	56831534	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	45824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	57125625	57125769	57125697	Y	ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,PEG3,ZNF71	ZNF470,ZNF71	NA	NA	NA	NA	ZNF71	20993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr19	58218479	58218613	58218485	Y	ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154	ZNF551,ZNF671,ZNF776	NA	NA	NA	NA	ZNF154	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	58317986	58318160	58318072	Y	NA	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	6121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZSCAN1	10870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG-AS1,A1BG,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr19	59078228	59078288	59078258	Y	CHMP2A,CHMP2A	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	CENPBD1P1	4582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	605283	605589	605326	Y	NA	NA	TPO,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM18	69850	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	915949	916124	916037	Y	NA	SNTG2	TPO,SNTG2,MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	SNTG2	28430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	1476597	1477084	1476655	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	150107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	1513036	1513399	1513056	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	113792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18973	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	1609558	1609866	1609667	Y	PXDN	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	17325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	1645391	1645516	1645454	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	31991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr2	1661359	1661779	1661556	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	34168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	3072634	3072961	3072804	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	306692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	3106532	3106816	3106764	Y	NA	NA	MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	272837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	3352595	3352738	3352719	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	26915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	6531945	6532260	6532103	Y	NA	NA	CMPK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF144A	523263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	7012587	7012814	7012739	Y	CMPK2,RSAD2	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	42709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	7068069	7068244	7068157	Y	NA	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	12546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	8019339	8019650	8019528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	797325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	8369680	8369964	8369925	Y	ID2	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	447011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	8532216	8532386	8532312	Y	NA	NA	LOC100506274,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	284589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	9922366	9922715	9922451	Y	NA	NA	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	58768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	10501440	10501782	10501611	Y	C2orf48	NA	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	60425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	10984211	10984590	10984279	Y	NA	PDIA6	C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDIA6	8108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	11270081	11270242	11270156	Y	KCNF1,C2orf50	PQLC3	NA	NA	NA	NA	PQLC3	23082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	11639355	11639445	11639424	Y	NA	E2F6	GREB1,MIR4429	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	35058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	11720189	11720409	11720300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	95312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	64464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	11890513	11890846	11890740	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	70927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	11893649	11894247	11893895	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC106875.1	74063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15154959	15155388	15155298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	384149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	429184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15445260	15445596	15445428	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	253858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15565715	15566065	15565846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	133389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15570627	15571117	15570982	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	128337	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	15949825	15950073	15949883	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	57990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	16149011	16149377	16149168	Y	NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	68640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	16219682	16220075	16219855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	139311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	16243100	16243429	16243303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYCNOS	162729	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	16639581	16639836	16639709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	205763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	16845411	16845884	16845697	Y	FAM49A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	159995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	17719194	17719451	17719323	Y	MSGN1	VSNL1	NA	NA	NA	NA	VSNL1	801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	19464609	19464927	19464768	Y	NA	NA	NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	OSR1	91487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	19628762	19628784	19628773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	72348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	20754464	20754475	20754470	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90	Hi-C	24141950	HS1BP3	94374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	20793103	20793496	20793437	Y	APOB	NA	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	55353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	21474623	21474859	21474741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	453741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	670733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	23631132	23631189	23631161	Y	NA	KLHL29	NA	NA	NA	NA	KLHL29	25044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	24238466	24238799	24238602	Y	NA	C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	C2orf44	31646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	24491623	24491942	24491630	Y	ATAD2B,NCOA1,ITSN2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	63439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	24495048	24495317	24495183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	60064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	POMC	NA	NA	NA	NA	POMC	37304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	POMC	NA	NA	NA	NA	POMC	49129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	POMC	83927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	25482494	25482888	25482692	Y	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	80571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	25514055	25514238	25514170	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	49221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	27557346	27557529	27557503	Y	DPYSL5,C2orf16	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513	NA	NA	NA	NA	MPV17	10799	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	NA	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL33	52800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	28120564	28120959	28120784	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	8599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	28183212	28183402	28183309	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	71247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	28492364	28492732	28492561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	120583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	28856660	28856889	28856764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	115617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	28953773	28954089	28953931	Y	NA	PPP1CB,SPDYA	PLB1,PPP1CB	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	18417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB,SPDYA	NA	NA	NA	NA	SPDYA	6313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	29173330	29173730	29173529	Y	PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	NA	WDR43	57821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	29485561	29485725	29485698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	166990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	29674441	29674554	29674498	Y	ALK	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	355870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	30231247	30231635	30231440	Y	NA	NA	ALK	IMR90	Hi-C	24141950	ALK	88815	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	30704285	30704557	30704478	Y	NA	LCLAT1	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	36193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	33435749	33436022	33435923	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	386427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	36980864	36981389	36981193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIT	59031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr2	37043619	37043714	37043667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIT	121786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37841378	37841620	37841452	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	121991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	37883470	37883595	37883540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	80016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	37989393	37989693	37989581	Y	QPCT,CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	25782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	38333760	38333892	38333836	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	1152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	38334903	38335105	38334999	Y	NA	NA	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CYP1B1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	38472288	38472516	38472419	Y	FAM82A1	RPL7P12	FAM82A1,CYP1B1-AS1,CYP1B1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P12	15578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	39079289	39079498	39079407	Y	SRSF7,ARHGEF33	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21577	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	39338546	39339120	39338978	Y	ARHGEF33	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	10366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	39340813	39341200	39341198	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	8286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	39695061	39695250	39695144	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	32608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	40147483	40147654	40147555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	143076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	40608600	40608944	40608858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	604193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	42167971	42168174	42168100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC013480.2	82268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	42182061	42182670	42182320	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	AC013480.2	67772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	42217488	42217883	42217564	Y	NA	AC013480.2	C2orf91,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	AC013480.2	32559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	43023531	43023735	43023679	Y	NA	HAAO	NA	NA	NA	NA	HAAO	5798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	43379449	43379628	43379558	Y	ZFP36L2,THADA,THADA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	72120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	43746950	43747270	43747109	Y	ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2	K562	ChIA-PET	22265404	THADA	73915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	45028438	45028723	45028579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	135615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	45030101	45030473	45030141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	133865	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	45160125	45160245	45160184	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	4093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	45176497	45176546	45176522	Y	NA	RP11-89K21.1,AC012354.8	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	12159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	46212455	46212485	46212471	Y	PRKCE	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	306321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	46456791	46456944	46456828	Y	NA	NA	PRKCE,EPAS1,PIGF	IMR90	Hi-C	24141950	EPAS1	61862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	46928465	46928698	46928588	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	SOCS5	NA	NA	NA	NA	SOCS5	4374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	46931823	46932125	46932006	Y	NA	SOCS5	NA	NA	NA	NA	SOCS5	7732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	47796567	47796699	47796698	Y	NA	KCNK12	NA	NA	NA	NA	KCNK12	489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	47946812	47947044	47946928	Y	NA	AC079250.1,MSH6	KCNK12	IMR90	Hi-C	24141950	MSH6	26143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	48118003	48118146	48118074	Y	NA	FBXO11	NA	NA	NA	NA	FBXO11	12786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	50701819	50701837	50701828	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	LHCGR	1720939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54796924	54797237	54797074	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	115502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	54806978	54807402	54807168	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	125556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	55346891	55347057	55346962	Y	NA	RTN4	RTN4,EML6,C2orf63	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	9134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	55360803	55361407	55361172	Y	SMEK2,CCDC88A,RTN4	RTN4	RTN4,C2orf63,EML6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RTN4	23046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	56344982	56345239	56345001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	195708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr2	56682750	56682916	56682833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	533476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	57579954	57580103	57580029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	552683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	58105448	58105884	58105678	Y	NA	VRK2	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	VRK2	26902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	58271974	58272513	58272036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	139188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	58334895	58335527	58335141	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	130980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	58339709	58340405	58340032	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	126102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	58347874	58348075	58347917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	118432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	60133192	60133207	60133200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	476533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	60228228	60228402	60228315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	381338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	60747849	60747913	60747881	Y	PEX13,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	30789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	61042064	61042390	61042227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	60699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	61466894	61467158	61467026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	64341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	61748471	61748954	61748828	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	14807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	61757728	61758222	61758112	Y	NA	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	5539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	62693263	62693492	62693331	Y	NA	NA	EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	205494	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	63961711	63961835	63961773	Y	NA	NA	UGP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC096664.1	52272	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64342969	64343339	64343172	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	25034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64367846	64368162	64368149	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64487793	64488354	64488032	Y	PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	PELI1	118205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64490373	64490733	64490649	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	120785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64502636	64502919	64502713	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	133048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64504356	64504878	64504479	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	134768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64540204	64540217	64540210	Y	NA	NA	LINC00309,PELI1,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	LGALSL	138886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64772977	64773339	64773158	Y	SLC1A4,AFTPH	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	23512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	66387873	66388127	66388063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	270457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.77644848261831
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	69578985	69578997	69578991	Y	NA	GFPT1	NA	NA	NA	NA	GFPT1	33385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	70226911	70227071	70226991	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	70331843	70331986	70331900	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	4160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	70335985	70336314	70336204	Y	AAK1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	8302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	71681748	71682153	71682029	Y	NA	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	2896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	71819414	71819502	71819458	Y	PAIP2B,DYSF	NA	NA	NA	NA	NA	DYSF	140562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	72936183	72936496	72936380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	114674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	74120962	74121385	74121058	Y	ACTG2	ACTG2,DGUOK	NA	NA	NA	NA	ACTG2	3521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	74408934	74409182	74409080	Y	NAT8B,TET3,MOBKL1B	BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MOB1A	4909	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	74766124	74766334	74766228	Y	NA	LBX2,PCGF1,DQX1,HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	DOK1	7819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75071156	75071353	75071277	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	12048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	AC104135.3,POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75836166	75836348	75836343	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	35561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	77063100	77063597	77063291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	949911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	77343577	77343605	77343592	Y	LRRTM4	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	78632836	78632912	78632895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	619328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	78683398	78683574	78683486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	80308072	80308323	80308198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	79938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	81107061	81107275	81107187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM1	577187	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chr2	82212744	82213103	82212921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM1	1682870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	83460597	83460801	83460699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	1224368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	83744068	83744130	83744079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	941039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	85057054	85057454	85057405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	73295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85362106	85362578	85362371	Y	NA	LSM3P3,TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	3573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	85404303	85404456	85404381	Y	NA	TCF7L1	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	45770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85505624	85505644	85505635	Y	SH2D6	TGOLN2	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	47904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	85932755	85933081	85932924	Y	SH2D6	SFTPB,RNU1-38P	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	20379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85943878	85943960	85943919	Y	SH2D6	RNU1-38P	ATOH8	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-38P	9500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	RNU1-38P	NA	NA	NA	NA	RNU1-38P	29253	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	85993562	85993638	85993601	Y	NA	RNU1-38P	NA	NA	NA	NA	RNU1-38P	40102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	86221169	86221618	86221314	Y	NA	NA	POLR1A,ST3GAL5,LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	107032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	88629818	88629863	88629841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI3	120268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	88988290	88988604	88988447	Y	NA	RPIA	NA	NA	NA	NA	RPIA	558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	91815672	91815808	91815787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	96871048	96871111	96871053	Y	ASTL,DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7	NA	NA	NA	NA	STARD7	1452	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	97472369	97472711	97472456	Y	ANKRD36,ARID5A,KIAA1310,CNNM3	CNNM4,CNNM3,ANKRD23,ANKRD39	CNNM3	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM3	7271	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	97540190	97540589	97540281	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	5696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	97547885	97548242	97548064	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	13391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	97561594	97561991	97561828	Y	FAM178B	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	27100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	97587789	97588030	97587916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	53295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	99121825	99122251	99122089	Y	INPP4A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	62508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	99213145	99213306	99213215	Y	INPP4A	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	COA5	9672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	99452356	99452772	99452668	Y	TSGA10,LIPT1,LIPT1,INPP4A,MGAT4A,MGAT4A	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	106767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	100082054	100082282	100082201	Y	NA	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	22215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	100323852	100324185	100324151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	219355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	101884483	101884674	101884578	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	TBC1D8,SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	SNORD89	2837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	102243895	102244327	102243955	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	NA	RFX8,MAP4K4,CREG2	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K4	66985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	102353138	102353817	102353456	Y	IL1R1,RNF149,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	41826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	102382879	102383094	102382925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	71567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	102712603	102712733	102712668	Y	IL1R1,MAP4K4,MAP4K4	IL1R1	IL1R2,MAP4K4,IL1RL2	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	33599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	102844003	102844653	102844435	Y	IL1R2,IL18RAP,IL1R1	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	164999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	103280963	103281189	103281017	Y	IL1RL2,SLC9A2	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD9	70158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	105129772	105130007	105129890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	522434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	105416853	105417228	105417041	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	235213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	105466558	105467231	105466773	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	185210	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	105676474	105676490	105676482	Y	NA	MRPS9,AC104655.2	NA	NA	NA	NA	MRPS9	24033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	105868744	105869077	105868909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBRAP1	75414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106370571	106370808	106370750	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	11217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106414093	106414226	106414159	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	54739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106415106	106415442	106415380	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	55752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	106545066	106545218	106545146	Y	NA	NA	LOC285000	IMR90	Hi-C	24141950	NCK2	185712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	106809174	106809856	106809272	Y	UXS1	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	109506497	109506716	109506551	Y	LIMS1,CCDC138,EDAR	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	105284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	109648298	109648660	109648428	Y	LIMS1,RANBP2	NA	MALL,EDAR	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC138	247085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	111446206	111446411	111446291	Y	NA	BUB1,ACOXL	ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	BUB1	12515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	111606246	111606509	111606357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACOXL	118096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	111615887	111616174	111616052	Y	RGPD5,BCL2L11	NA	NA	NA	NA	NA	ACOXL	127737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	113629155	113629320	113629193	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	NA	IL1B,CKAP2L,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1A	88988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	113643095	113643585	113643305	Y	IL1A,IL1B,IL36B,IL36RN,IL1RN,IL36G	NA	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL1A	102928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1A	117604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	114163815	114164191	114163891	Y	NA	IGKV1OR2-108	IL1RN	IMR90	Hi-C	24141950	IGKV1OR2-108	1842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	114652011	114652405	114652035	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	6474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	114653014	114653311	114653090	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	7477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	19353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	115944602	115944633	115944617	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	27682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	116799018	116799370	116799278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	882098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	118309015	118309417	118309218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	260809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	223627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	119076927	119077186	119077054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	232899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	119121251	119121438	119121319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	277223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	120905923	120906046	120905986	Y	EPB41L5,EPB41L5	NA	NA	NA	NA	NA	AC012363.4	66074	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	AC012363.4,TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBB	98648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	121495235	121495636	121495561	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	121495919	121496279	121496111	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	122313325	122313599	122313462	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	26868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	123587692	123588055	123587874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	1095013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	124260647	124260891	124260797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP5	519973	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	127006133	127006203	127006166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC023347.1	57884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	127840546	127840814	127840619	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	22117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	127915404	127915435	127915422	Y	NA	NA	CYP27C1,BIN1,MAP3K2	IMR90	Hi-C	24141950	BIN1	52473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	RNU4-48P,IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	128283052	128283292	128283172	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	128587553	128587803	128587688	Y	MAP3K2,WDR33	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	WDR33	20792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	129073927	129074235	129074112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	129901785	129902172	129901852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	793618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	131483096	131483424	131483352	Y	FAM123C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	365609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	131586593	131586950	131586772	Y	NA	NA	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM168B	262083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	131683053	131683224	131683139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	165809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	133025188	133025675	133025588	Y	NA	NA	GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	146472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	133029863	133030277	133030073	Y	NA	NA	GPR39,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,ANKRD30BL,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2	IMR90	Hi-C	24141950	GPR39	141870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	136772973	136773030	136773002	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	31303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	139464660	139464674	139464668	Y	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH2	71244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	143621913	143622291	143622202	Y	KYNU	KYNU	KYNU	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KYNU	10776	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	143852347	143852525	143852358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	219280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	144991861	144992184	144991938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	95951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	145420866	145421073	145420998	Y	ZEB2	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	140719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	145580675	145580804	145580747	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	300528	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	146317080	146317300	146317190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC1P2	1025712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	148394087	148394646	148394415	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	205440	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	148640468	148640547	148640483	Y	NA	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	40382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	149372340	149372450	149372396	Y	EPC2	EPC2	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	EPC2	27559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	149571188	149571523	149571357	Y	NA	NA	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	KIF5C	59296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	149634441	149634782	149634502	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	149819679	149819759	149819686	Y	KIF5C	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	72862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	150184579	150184898	150184643	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	80	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	150440132	150440521	150440417	Y	NA	AC144449.1,MMADHC	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	1189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	150971624	150972028	150971707	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	RND3	421497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	152209803	152209970	152209887	Y	TNFAIP6	TNFAIP6	TNFAIP6	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP6	2136	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	152735616	152735825	152735663	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	52610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	152899445	152899713	152899562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	130793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	152930991	152931406	152931212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	99100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	153261807	153262193	153261950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	72056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	153275296	153275683	153275311	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	85545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	153319384	153319598	153319488	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	129633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	153356449	153356753	153356698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	166698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	154335936	154336181	154336134	Y	RPRM	RPRM	NA	NA	NA	NA	RPRM	2614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	154446220	154446391	154446306	Y	NA	AC012501.2	NA	NA	NA	NA	AC012501.2	1410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	154903292	154903466	154903385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT13	176866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	157350071	157350391	157350185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	60269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	160100045	160100277	160100255	Y	NA	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	41033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	160371940	160372153	160372033	Y	MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	54173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	160858239	160858486	160858430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2R1	58635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	ITGB6	NA	NA	NA	NA	ITGB6	29547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	163477809	163478160	163477991	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH7	215080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	164286683	164286976	164286830	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	303546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	164530260	164530475	164530368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	60047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	165327196	165327565	165327381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB14	148793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	463227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	166821082	166821089	166821086	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12729	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	167070669	167070978	167070814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCN9A	159525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	168822360	168822564	168822456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	280087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	169219824	169220222	169219967	Y	NA	NA	CERS6	Islet	4C	24413736	CERS6	90150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	170441657	170442069	170441908	Y	NA	FASTKD1,PPIG	NA	NA	NA	NA	PPIG	2807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	171262568	171262953	171262761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP5	306908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	171865748	171866100	171865790	Y	TLK1	NA	NA	NA	NA	NA	GORASP2	82774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	173245614	173245743	173245678	Y	NA	ITGA6	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA6	44339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	173876038	173876102	173876070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	278036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	173941754	173942308	173942062	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	275240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	174888201	174889400	174889077	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	59771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	174896632	174897390	174896767	Y	SP3,SP3	NA	SP3,OLA1,CDCA7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	68202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	175762241	175762347	175762322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	179736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	176608884	176609040	176608962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	256527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	176846427	176846539	176846507	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	19028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	177047108	177047317	177047213	Y	NA	HOXD-AS2,AC009336.24,HOXD1,HOXD-AS1,AC016739.2	NA	NA	NA	NA	HOXD1	3990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	177628731	177629135	177629049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01116	128072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	178116726	178117036	178116927	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	1702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	178261376	178261686	178261570	Y	NA	AGPS,NFE2L2	NA	NA	NA	NA	NFE2L2	5951	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	179083118	179083236	179083178	Y	OSBPL6	OSBPL6	NA	NA	NA	NA	OSBPL6	25910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	179132542	179132630	179132587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL6	75334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	179692765	179693175	179692935	Y	NA	TTN	NA	NA	NA	NA	TTN	354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	179923228	179923504	179923450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	204013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	182494357	182494701	182494694	Y	NEUROD1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	174428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	185522686	185523010	185522766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBPP2	1051839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	185997791	185998168	185997977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	1350715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	186785756	186786079	186786020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	562804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	13410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	188463858	188463880	188463868	Y	TFPI	TFPI	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	TFPI	35371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	190729809	190730106	190729887	Y	OSGEPL1,PMS1	NA	NA	NA	NA	NA	AC019178.2	63630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	191104181	191104357	191104269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	101839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	191281859	191282262	191281977	Y	MFSD6	MFSD6	NA	NA	NA	NA	MFSD6	10778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	191659220	191659442	191659369	Y	GLS	NA	STAT1,MFSD6,GLS,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	GLS	84111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	192562556	192562918	192562693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	454645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	192893540	192893930	192893543	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	164505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	192966910	192967316	192967133	Y	TMEFF2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	91119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	193122230	193122619	193122425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	63795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	196547563	196547821	196547646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	108862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	196617949	196618273	196617953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	179248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	197779870	197780287	197779995	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	10233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	197962665	197962866	197962743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	162969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	199736102	199736481	199736292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	597508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	200579268	200579381	200579325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC073043.1	194501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	201991403	201992374	201991715	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	12576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	202837575	202837889	202837743	Y	NA	NA	CDK15,NOP58,ALS2,SUMO1,FZD7	IMR90	Hi-C	24141950	FZD7	59421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	329	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.84897171233967
chr2	203131534	203131826	203131673	Y	FAM117B,NOP58	SUMO1,NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	3095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	203159775	203160145	203159798	Y	NA	NOP58	NA	NA	NA	NA	NOP58	31336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	203292079	203292309	203292231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	52420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	203341668	203341778	203341723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	102009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	203726604	203726681	203726643	Y	FAM117B,CYP20A1,ABI2,ICA1L,ICA1L,ALS2CR8,ALS2CR8	KRT8P15,ICA1L	NA	NA	NA	NA	ICA1L	8027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	203830574	203830808	203830669	Y	NA	WDR12,NBEAL1	NA	NA	NA	NA	WDR12	46713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	206613471	206613845	206613585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	68757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.25682221813357
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	GPR1	NA	NA	NA	NA	GPR1	3982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr2	207663978	207664088	207664013	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	35707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	207669258	207669658	207669463	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	40987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	208942960	208943012	208942996	Y	NA	CRYGD,CRYGC	FZD5,CCNYL1,PLEKHM3,FASTKD2,METTL21A	IMR90	Hi-C	24141950	CRYGD	44213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.26990639445673
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	93874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	214053816	214053901	214053846	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	93212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	214054270	214054576	214054510	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	92537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	216483720	216484034	216483877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	87864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	216557446	216557685	216557585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC012668.2	161590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	216756224	216756565	216756395	Y	NA	NA	LOC646324,FN1,ATIC	IMR90	Hi-C	24141950	MREG	140254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	217181584	217181763	217181674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	93374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	217501395	217501614	217501574	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	5844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	60732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	62014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	217934616	217935002	217934772	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	439065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	218736007	218736119	218736065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	116691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	218782937	218783199	218783125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	82519	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	218799602	218799844	218799683	Y	TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	65874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	218953176	218953511	218953344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	87458	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219152622	219152760	219152751	Y	USP37,SLC11A1,PNKD	GPBAR1,AAMP,PNKD,TMBIM1	NA	NA	NA	NA	TMBIM1	2549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219188663	219189129	219189071	Y	ARPC2,ARPC2,TTLL4,CYP27A1,TMBIM1,PNKD,SLC11A1	TMBIM1,AC021016.7	NA	NA	NA	NA	AC021016.7	27669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	36595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	37503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6	NA	NA	NA	NA	WNT6	38501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1,AC009502.4	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.4	5650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr2	222890722	222890987	222890846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX3	270728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	223439256	223439394	223439332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	79662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	223447202	223447309	223447256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	71747	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	223643125	223643256	223643191	Y	NA	NA	ACSL3,MOGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL3	80396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	223654105	223654355	223654256	Y	SGPP2	NA	ACSL3,MOGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL3	69297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	223784632	223784923	223784806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	60980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	224477772	224478078	224477872	Y	NA	NA	AP1S3,KCNE4,SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	222666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	224564336	224564481	224564409	Y	NA	NA	SCG2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	136263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	224569350	224569680	224569515	Y	NA	NA	AP1S3	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S3	131064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	224774056	224774145	224774098	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	33959	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	225307433	225307612	225307516	Y	FAM124B	NA	FAM124B,CUL3,SERPINE2	IMR90	Hi-C	24141950	CUL3	140498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	432550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	227172292	227172683	227172618	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	489792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	227849549	227849707	227849645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	151252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	228236714	228236871	228236778	Y	CCL20,AGFG1	MFF	NA	NA	NA	NA	MFF	48847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	228522025	228522410	228522050	Y	CCL20,AGFG1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	58318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	228578021	228578290	228578242	Y	NA	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	2438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	228742760	228743014	228742884	Y	WDR69	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	162032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	228873880	228874070	228873976	Y	C2orf83,SPHKAP	NA	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	293152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	229922941	229923063	229923002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	210938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	230175161	230175497	230175399	Y	PID1	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	41160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	230319642	230320072	230319824	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	185641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	230823710	230823804	230823742	Y	FBXO36	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	TRIP12	37755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	231534770	231534898	231534834	Y	C2orf72	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	40662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	231965808	231966135	231965987	Y	NA	PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	46230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232032893	232033210	232033082	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	28050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232044610	232045091	232044820	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	16169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232046537	232047112	232046768	Y	NA	ARMC9	NA	NA	NA	NA	ARMC9	14148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	28137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr2	232479434	232479727	232479552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	86228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	232536483	232536778	232536606	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr2	232537656	232538064	232537748	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	31541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	232542757	232542767	232542764	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	26838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr2	232546670	232546982	232546826	Y	NA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	233252147	233252689	233252515	Y	NA	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPP	10903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	233279498	233279714	233279606	Y	NA	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	9945	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	233499533	233499991	233499677	Y	EFHD1	EFHD1	NA	NA	NA	NA	EFHD1	30766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	233563344	233563704	233563468	Y	NA	GIGYF2	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	3335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	43843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	233916070	233916578	233916265	Y	NA	NGEF	NA	NA	NA	NA	NGEF	40088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	233951283	233951765	233951418	Y	GIGYF2,DGKD,ATG16L1,INPP5D	NA	NA	NA	NA	NA	NGEF	75301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	234139282	234139520	234139401	Y	NEU2,INPP5D,USP40	ATG16L1,SCARNA5	GIGYF2,KCNJ13,C2orf82,NGEF,INPP5D,ATG16L1	IMR90	Hi-C	24141950	ATG16L1	22585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	234266690	234266835	234266770	Y	INPP5D,ATG16L1,DGKD	DGKD	NA	NA	NA	NA	DGKD	5537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP40	135151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	52659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	236514356	236514561	236514454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	113623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	236552972	236553189	236553098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	152239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	236886303	236886528	236886416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	187562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr2	237341356	237341565	237341461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	72620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	238507381	238507559	238507550	Y	NA	RAB17,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	RAB17	698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	239631175	239631419	239631288	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,LOC150935	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	123254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	239997480	239997793	239997637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST2	242807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	240168373	240168774	240168689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	152356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	240179337	240179507	240179411	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	141623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	107441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	53464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	240854377	240854983	240854483	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	107836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	NA	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYEOV2	116345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1,AC110619.2	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	241718828	241719056	241718959	Y	NA	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	241719463	241720148	241720097	Y	ANKMY1,AQP12B,AQP12A,KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	37577	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	241995888	241996280	241996083	Y	AQP12A,SNED1	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	43467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	382514	382753	382693	Y	CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1	TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	RBCK1	3389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	641092	641461	641194	Y	NA	SRXN1	SRXN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SRXN1	9078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	709042	709425	709354	Y	NA	NA	CSNK2A1,RSPO4,SRXN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRXN1	77028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	1804230	1804388	1804329	Y	SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	PDYN	168344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	1809297	1809437	1809336	Y	SDCBP2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	PDYN	163295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	2090589	2090758	2090698	Y	NA	STK35	NA	NA	NA	NA	STK35	10332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	2189828	2190037	2189979	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	PDYN,TGM3,TGM6	IMR90	Hi-C	24141950	STK35	109571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	2802059	2802221	2802148	Y	CPXM1	CPXM1,VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	VPS16	17128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	2964753	2965068	2964761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNRH2	57200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	2978820	2979208	2979015	Y	NA	GNRH2,MRPS26	NA	NA	NA	NA	GNRH2	43060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	3170247	3170648	3170474	Y	NA	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	DDRGK1	12683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	3779808	3780100	3779895	Y	PANK2,PANK2,CDC25B	C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	14230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr20	4018656	4019040	4018859	Y	PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	RNF24,CENPB,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	16104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4108169	4108199	4108184	Y	NA	SMOX	LOC728228,ADRA1D,SMOX,RNF24	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	8542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4198420	4198722	4198592	Y	SMOX,ADRA1D	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	28999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4493607	4493844	4493709	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP2	115021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4674724	4674919	4674762	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	9842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	4701383	4701758	4701518	Y	NA	PRNP	NA	NA	NA	NA	PRNP	36501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	4941641	4941708	4941700	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	47231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5155364	5155504	5155434	Y	NA	CDS2	NA	NA	NA	NA	CDS2	49932	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5553446	5553705	5553635	Y	NA	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	35967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5717960	5718260	5718168	Y	C20orf196	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	5741425	5741673	5741600	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	12386	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	5899454	5899753	5899716	Y	NA	RNU1-55P,TRMT6,MCM8	NA	NA	NA	NA	TRMT6	29429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	10280635	10280887	10280744	Y	PAK7,SNAP25,MKKS	NA	NA	NA	NA	NA	SNAP25	83157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	10307719	10307737	10307728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	105133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	10532947	10533172	10533034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAG1	91842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	12374037	12374068	12374053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	504666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	12734495	12734674	12734580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTLC3	252953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	13221839	13221847	13221843	Y	NA	ISM1	NA	NA	NA	NA	ISM1	21421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	13379016	13379145	13379075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	178598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	13678137	13678519	13678328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	60550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	13757612	13757978	13757886	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	5554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	13846581	13846836	13846730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	83049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	18276093	18276447	18276109	Y	CSRP2BP	ZNF133	NA	NA	NA	NA	ZNF133	8972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	18565876	18566072	18565973	Y	CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1	LINC00493,DTD1	NA	NA	NA	NA	DTD1	465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	18700394	18700719	18700556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	133857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	19737104	19737460	19737269	Y	NA	RP1-122P22.2	SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-122P22.2	752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	19983799	19983958	19983881	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	11802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	20344554	20345237	20344967	Y	NA	INSM1	INSM1	IMR90	Hi-C	24141950	INSM1	1528	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	20347223	20347613	20347293	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	458	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	20391161	20391545	20391351	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	44396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	20432950	20433312	20432989	Y	C20orf26,INSM1	NA	NA	NA	NA	NA	INSM1	86185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00237	1910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	21147247	21147656	21147458	Y	NA	PLK1S1	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	42623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	21170951	21171134	21171012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1S1	66327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	21576434	21576748	21576508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX1	107549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	22443763	22443812	22443788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX1	759466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	297273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	23067626	23068166	23067924	Y	GZF1,THBD,CD93	NA	NA	NA	NA	NA	NXT1	261207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	24510047	24510433	24510242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	62212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	24603017	24603374	24603110	Y	TMEM90B	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	155182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	25273617	25273934	25273643	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	46912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	25302337	25302549	25302435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	67070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	29649919	29650288	29650100	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	29650599	29650997	29650932	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	40742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30110463	30111086	30110768	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	10232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	30263216	30263335	30263276	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	31170393	31170766	31170763	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	31339575	31339797	31339687	Y	NA	COMMD7,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMT3B	8394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	31352490	31352753	31352633	Y	C20orf203,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	4299	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr20	31373290	31373636	31373312	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B,MAPRE1	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	25099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	6916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	33646463	33646512	33646488	Y	TP53INP2,MYH7B	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	32162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	34352431	34352602	34352468	Y	SPAG4,PHF20	RBM39,RPF2P1,PHF20	RBM39	K562	ChIA-PET	22265404	PHF20	5294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	34379775	34380017	34379908	Y	SPAG4,RBM39,PHF20	RPF2P1,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	21879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	34685769	34686042	34685906	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4	IMR90	Hi-C	24141950	SCAND1	140375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35112957	35113192	35113075	Y	TGIF2	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	54695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35172533	35172668	35172598	Y	MYL9	MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2	NA	NA	NA	NA	MYL9	4646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35213949	35214340	35214145	Y	NA	MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	TGIF2	14058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr20	35239893	35239986	35239939	Y	NA	RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	7756	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35305263	35305453	35305359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	67028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35603526	35603817	35603688	Y	RBL1,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	25280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35851515	35851770	35851561	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL,CTNNBL1	RPN2	NA	NA	NA	NA	RPN2	46702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35874402	35874620	35874497	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35922737	35923093	35922847	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	6696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35923453	35923684	35923588	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	MANBAL	7412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	35947612	35947897	35947800	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	23191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	36007590	36007925	36007762	Y	SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	36502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	36041191	36041579	36041445	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	30357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	36050245	36050646	36050634	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	21290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	NNAT,BLCAP	NA	NA	NA	NA	NNAT	11935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	NNAT,BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	36389387	36389716	36389551	Y	NA	NA	VSTM2L	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	68979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	ARHGAP40	1381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	NA	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR5	71619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr20	38844790	38845079	38844935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	470801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	38908222	38908337	38908279	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	407543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	38953913	38954078	38953962	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	361802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	39346769	39346927	39346856	Y	NA	MAFB	NA	NA	NA	NA	MAFB	30889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	39785946	39786458	39785968	Y	CHD6,PLCG1	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	22346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	40188226	40188487	40188477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD6	56646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	42137465	42137802	42137552	Y	NA	L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	L3MBTL1	3145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	43152518	43152864	43152699	Y	NA	TTPAL,SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	SERINC3	3768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	43181587	43181787	43181669	Y	NA	SERINC3,PKIG	NA	NA	NA	NA	PKIG	23161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43239191	43239604	43239345	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43272652	43273023	43272879	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	5851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	43607893	43608251	43608061	Y	NA	TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	STK4	14778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	KCNS1	NA	NA	NA	NA	KCNS1	17993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	43970100	43970351	43970215	Y	NA	MATN4,SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	4713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	23191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	46601191	46601469	46601377	Y	SULF2,SULF2	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	187831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	46924305	46924474	46924390	Y	NA	NA	SULF2,NCOA3,PREX1,ARFGEF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00494	62219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	47411311	47411704	47411554	Y	ZNFX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	30716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	47439402	47439940	47439658	Y	ZNFX1,STAU1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	2480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr20	47784409	47784640	47784548	Y	PREX1,ZNFX1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	18264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	48317822	48318037	48318021	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48381625	48382070	48381853	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	37246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr20	48617449	48617575	48617507	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	19913	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	48663510	48663968	48663673	Y	NA	NA	SNAI1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SNAI1	65974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	49487134	49487591	49487436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	57930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	49598879	49599145	49599015	Y	PTPN1	DPM1,MOCS3,KCNG1	NA	NA	NA	NA	MOCS3	25516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50017073	50017292	50017116	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	160078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50305128	50305301	50305215	Y	NA	RP5-827A12.2	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	43771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	SALL4	276	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	50416861	50417288	50417180	Y	ZFP64,SALL4	ATP9A	NA	NA	NA	NA	SALL4	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr20	50665033	50665229	50665099	Y	NA	NA	ATP9A,NFATC2,SALL4,ZFP64	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	153618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	52294676	52294905	52294769	Y	NA	NA	BMP7,SUMO1P1,BCAS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF217	70230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	52489475	52489586	52489523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	265029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	52530834	52531236	52530898	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	291150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	55264382	55264603	55264519	Y	NA	PTMAP6	BMP7,TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	9967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	55311396	55311684	55311475	Y	NA	PTMAP6	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	36826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.36859797682441
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMAP6	104986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	4345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	56355582	56355962	56355640	Y	NA	NA	PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PMEPA1	70990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	57300192	57300206	57300199	Y	NA	NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	38005	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	57586300	57586427	57586364	Y	NA	CTSZ,TUBB1,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	TUBB1	5882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	57596187	57596442	57596344	Y	NA	CTSZ,TUBB1,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	TUBB1	3878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	58784200	58784511	58784424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	270848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	59325352	59325574	59325428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	499908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	59601014	59601048	59601031	Y	CDH4	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	224434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60011356	60011607	60011563	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	185874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	60033866	60034028	60033960	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	208384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	60103711	60103923	60103817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	278229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr20	60758632	60758689	60758683	Y	GATA5,CABLES2	PSMA7,SS18L1,HRH3	NA	NA	NA	NA	HRH3	34634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	HRH3,OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60934143	60934390	60934309	Y	TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	5978	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	60943690	60943839	60943760	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2,GATA5	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	61285550	61285806	61285682	Y	BHLHE23	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	13753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr20	61553883	61554120	61553955	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	13184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	61554875	61554902	61554887	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	12402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr20	61646020	61646413	61646169	Y	C20orf11,YTHDF1	BHLHE23	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	9633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE23	51602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62026934	62027328	62027132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	74665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62456717	62456924	62456790	Y	NA	RP4-583P15.11,ZBTB46,TPD52L2	ZBTB46,MIR1914,UCKL1-AS1,ZNF512B,UCKL1,TPD52L2,ABHD16B,DNAJC5	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB46	3673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62460050	62460158	62460104	Y	CHRNA4,TCEA2,SOX18,SAMD10	RP4-583P15.11,ZBTB46,TPD52L2	PTK6,SLC2A4RG,ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB46	439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62709200	62709458	62709264	Y	GMEB2,ZGPAT,LIME1,PCMTD2,RGS19,RGS19,OPRL1	LINC00176,ZNF512B,SOX18,TCEA2	NA	NA	NA	NA	RGS19	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62820558	62820833	62820696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	64261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	11090314	11090328	11090319	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	6652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	11118249	11118623	11118434	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	21269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	11130122	11130404	11130162	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	33142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	16238708	16238887	16238795	Y	NRIP1	NA	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	196434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	17104761	17105053	17104812	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	4417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	17125389	17125620	17125425	Y	USP25	USP25	NA	NA	NA	NA	USP25	25045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	17924273	17924626	17924451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	269184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	19171826	19171995	19171943	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	17708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	19410366	19410536	19410451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37P3	145564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	2234105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	1241403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	26745282	26745696	26745293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	186525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	26834834	26835160	26834919	Y	MRPL39	NA	MIR155HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR155HG	97061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	26882215	26882658	26882608	Y	NA	MIR155HG	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	49563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	26932183	26932293	26932238	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	27353741	27354048	27353953	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	187398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	29476694	29476903	29476871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	778790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr21	30528025	30528174	30528089	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	22786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	30567218	30567411	30567380	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	2826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	30580275	30580423	30580358	Y	NA	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	15883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	30591516	30591874	30591674	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,LINC00189,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	27124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	30669074	30669451	30669267	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	104682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	30967382	30967686	30967533	Y	GRIK1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	402990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	31248571	31248641	31248639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	684179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	32532795	32532952	32532925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	397338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr21	32546701	32546751	32546739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	383539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	32662959	32662987	32662974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	267303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	32865746	32866005	32865892	Y	TIAM1	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	64285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	32868770	32868927	32868849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	61363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	32929453	32930069	32929726	Y	TIAM1	TIAM1	NA	NA	NA	NA	TIAM1	221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	33999841	34000172	33999850	Y	NA	C21orf59	NA	NA	NA	NA	C21orf59	16665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	34168110	34168127	34168119	Y	NA	C21orf49	NA	NA	NA	NA	C21orf49	25699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	34576237	34576546	34576341	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2	IFNAR2	IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	23660	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	34818143	34818502	34818323	Y	OLIG2,OLIG1	IFNGR2,TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	31816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.44112120654577
chr21	35918941	35919315	35919132	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	66126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36143971	36144119	36144107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	104283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36208387	36209191	36208566	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	168699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	178246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36336896	36337096	36337005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC6	297208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36511746	36511757	36511752	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,SETD4	IMR90	Hi-C	24141950	CLIC6	472058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	36599466	36599950	36599803	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	CLIC6	559778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	37222964	37223324	37223144	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	151641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	37694250	37694633	37694410	Y	NA	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	3763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	38069098	38069172	38069127	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	39430494	39430871	39430698	Y	DSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	DSCR4	60583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	39525413	39525769	39525570	Y	NA	DSCR4,DSCR8	NA	NA	NA	NA	DSCR8	33868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	39845079	39845092	39845088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	330139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	40476284	40476629	40476514	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114,ERG	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	77148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	40527943	40528201	40528072	Y	NA	PSMG1	NA	NA	NA	NA	PSMG1	25576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	41524041	41524191	41524116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCP4	286798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	42879173	42879227	42879200	Y	FAM3B,TMPRSS2,TMPRSS2	TMPRSS2,SNORA32	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	21816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	43431472	43431831	43431677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	59473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44091107	44091303	44091206	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	19361	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44278308	44278654	44278481	Y	NA	WDR4,NDUFV3	NA	NA	NA	NA	WDR4	19024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	44379846	44380185	44379931	Y	NA	ERVH48-1,PKNOX1	NDUFV3,PKNOX1,CBS,U2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	PKNOX1	12435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44614192	44614410	44614235	Y	NA	NA	HSF2BP,LINC00313,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	U2AF1	88495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	84095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44876530	44876883	44876692	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	31522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	44937659	44937875	44937741	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	SIK1	92651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	44988675	44988868	44988840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	88506	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10,H2AFZP1	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45558236	45558599	45558477	Y	PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45627966	45628150	45628090	Y	NA	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	30699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45662608	45662724	45662682	Y	TRAPPC10,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG,DNMT3L,AIRE	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	45683777	45683905	45683814	Y	KRTAP10-6,KRTAP10-11,KRTAP12-4,KRTAP10-12,KRTAP12-2,KRTAP12-1,KRTAP10-8,DNMT3L,AIRE,AIRE	ICOSLG,DNMT3L,AIRE,PFKL	NA	NA	NA	NA	DNMT3L	3678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	46122910	46123100	46123005	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	6395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr21	46124045	46124372	46124063	Y	DNMT3L,AIRE,AIRE,TSPEAR	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	5123	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr21	46127419	46127576	46127516	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	1919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr21	46128352	46128532	46128434	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr21	46389792	46390113	46389960	Y	POFUT2,ITGB2	ITGB2,FAM207A,LINC00162	NA	NA	NA	NA	FAM207A	31867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr21	46495480	46495526	46495490	Y	KRTAP10-12,ADARB1	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	3712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	46549530	46549961	46549631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	57762	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	46552843	46553033	46552936	Y	KRTAP10-11,KRTAP12-2,KRTAP12-1,ITGB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	61075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	46737459	46737695	46737585	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	31646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	46952785	46952947	46952858	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	9378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47370674	47370877	47370809	Y	NA	COL6A1	COL6A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A1	28774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47394721	47394936	47394787	Y	NA	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47395087	47395227	47395108	Y	COL6A2,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47637534	47637799	47637667	Y	NA	LSS,MCM3AP-AS1	NA	NA	NA	NA	LSS	8939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	47788931	47789078	47789007	Y	NA	C21orf58,PCNT	NA	NA	NA	NA	PCNT	46895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr21	48046497	48046712	48046597	Y	DIP2A,PRMT2	S100B,PRMT2	DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRMT2	6367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	17091097	17091180	17091141	Y	IL17RA	FABP5P11,TPTEP1	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	10320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	225517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	17715051	17715201	17715110	Y	GAB4,CECR5,CECR1	AC005300.5,CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	30422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	17722796	17723268	17723123	Y	CECR2,BCL2L13,IL17RA,CECR1	CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	22355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	17725724	17726042	17725884	Y	CECR2,BCL2L13,CECR1	CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	19581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	17745323	17745619	17745476	Y	NA	CECR3	NA	NA	NA	NA	CECR3	4	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	17850637	17851018	17850672	Y	NA	CECR2	NA	NA	NA	NA	CECR2	11800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18280978	18281337	18281098	Y	BID,BID	BID	NA	NA	NA	NA	BID	25442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18372617	18372984	18372801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BID	117081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	18919384	18919770	18919551	Y	PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	2296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	18921428	18921794	18921531	Y	MICAL3,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	272	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.0594390533982
chr22	19749283	19749521	19749403	Y	NA	SEPT5,GP1BB,TBX1	NA	NA	NA	NA	TBX1	7057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	19866426	19867011	19866578	Y	ZDHHC8,DGCR6L,COMT	C22orf29,GNB1L	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNB1L	25964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	20911751	20912048	20911845	Y	PI4KA,THAP7,PI4KA,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	63551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	21103174	21103455	21103372	Y	PI4KA,PI4KA	TMEM191A	NA	NA	NA	NA	TMEM191A	49954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	21131289	21131349	21131319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM191A	78069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	21925144	21925370	21925257	Y	NA	SCARNA17,UBE2L3	NA	NA	NA	NA	UBE2L3	23408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	22204010	22204393	22204300	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	15577	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23227695	23227842	23227769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAZ	182698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23528251	23528416	23528284	Y	BCR	RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	8360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23624437	23624690	23624563	Y	BCR	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	104546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23725705	23725832	23725738	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	17081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23743297	23743498	23743398	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	23876230	23876637	23876426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	133317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23888781	23888894	23888838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	145868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	23908349	23908676	23908605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP11	148867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	24767148	24767407	24767278	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	44440	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	25082452	25082825	25082629	Y	ADORA2A,GGT1	NA	PIWIL3	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	95277	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	25883503	25883619	25883561	Y	NA	CRYBB2P1	MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	CRYBB2P1	41431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	26967025	26967265	26967145	Y	TFIP11	TPST2	NA	NA	NA	NA	TPST2	23416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	27028638	27029036	27028851	Y	NA	TPST2,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	11356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	27038834	27039211	27039123	Y	NA	TPST2,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	1181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	28065247	28065726	28065530	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	129760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28113176	28113408	28113323	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	82078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	72244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28879777	28880035	28879909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	255984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	29471077	29471334	29471238	Y	KREMEN1	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	4011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	30096148	30096264	30096206	Y	NA	CABP7	NA	NA	NA	NA	CABP7	17809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	30604572	30605275	30604996	Y	NA	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIF	35565	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	30644816	30645407	30645321	Y	NA	LIF,GATSL3	NA	NA	NA	NA	LIF	3976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	30652191	30652351	30652329	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	31005316	31005631	31005442	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	GAL3ST1,TCN2,PES1,SLC35E4	NA	NA	NA	NA	PES1	4246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	31030399	31030736	31030505	Y	SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4	TCN2,PES1,SLC35E4,DUSP18	NA	NA	NA	NA	SLC35E4	760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	31219107	31219239	31219180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBP2	131338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	31639861	31640267	31640177	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	32440508	32440836	32440514	Y	RFPL2,SLC5A4,RFPL3,SLC5A1	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	7031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	33000436	33000667	33000542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	131773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	33164513	33164882	33164796	Y	BPIL2,SYN3,SYN3	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	30805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	33176423	33176673	33176603	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	19014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	33202022	33202333	33202121	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	6335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	34073272	34073505	34073390	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	25401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	34167018	34167152	34167086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	68112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	216506	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	34317541	34317731	34317667	Y	LARGE	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	218635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	35238816	35239159	35238991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-714B7.5	385890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	249530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36828742	36828858	36828800	Y	NA	MYH9,TXN2	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	46679	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	36855477	36855678	36855599	Y	NA	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	20399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	TXN2	17637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	36924116	36924377	36924195	Y	NA	TXN2,FOXRED2,EIF3D	NA	NA	NA	NA	EIF3D	633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	37307870	37308165	37308085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPST	105511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	37558444	37558999	37558665	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB	IL2RB,C1QTNF6	NA	NA	NA	NA	IL2RB	10095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	37655075	37655389	37655235	Y	NA	Z82188.1,RAC2	CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2	IMR90	Hi-C	24141950	RAC2	16587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	37731445	37731637	37731610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN2	89868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	38069633	38069980	38069807	Y	RAC2,CYTH4,GGA1,SH3BP1	SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	LGALS1	18	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38137969	38138286	38138127	Y	TRIOBP	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	46958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38292237	38292573	38292408	Y	CARD10,SH3BP1,MICALL1	EIF3L,ANKRD54,MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	7091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23,SOX10	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38705287	38705445	38705426	Y	NA	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	38247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	38857668	38857748	38857703	Y	NA	KDELR3,DDX17	KCNJ4	K562	ChIA-PET	22265404	KDELR3	4319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39231993	39232165	39232069	Y	NA	SUN2,DNAL4,NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	NPTXR	5822	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.26990639445673
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39660507	39661079	39660634	Y	ATF4,APOBEC3A	PDGFB	PDGFB	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFB	21751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39696256	39696487	39696398	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	17907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39698105	39698354	39698234	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	16040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39760819	39761142	39760964	Y	CBX7,SYNGR1	RPL3,SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	SYNGR1	16889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	39923809	39924011	39923907	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	2849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	40309233	40309614	40309424	Y	CACNA1I,GRAP2	UQCRFS1P1	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	UQCRFS1P1	39940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	40686331	40686363	40686350	Y	MKL1,GRAP2,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	ADSL	54144	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37,MCHR1	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	41080878	41081122	41080979	Y	NA	GAPDHP37,MCHR1	NA	NA	NA	NA	MCHR1	8124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.46728955919209
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	MCHR1	56097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	42008568	42008780	42008674	Y	NA	PMM1,XRCC6	NA	NA	NA	NA	XRCC6	6343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	42096331	42096684	42096508	Y	CHADL,WBP2NL,MEI1	C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	NHP2L1	11823	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	42485778	42486189	42485966	Y	CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32	NAGA,FAM109B,NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	NDUFA6	819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	42835802	42836124	42835869	Y	POLDIP3,ARFGAP3,NFAM1	NFAM1,CTA-126B4.7	MEI1,LOC100132273,TCF20,LOC388906,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-126B4.7	3773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.25682221813357
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	NFAM1,CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	7912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	42840483	42840921	42840577	Y	SEPT3	NFAM1,CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3,FAM109B,NAGA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	8454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43084467	43084751	43084635	Y	TSPO,MCAT,CYB5R3,A4GALT	CYB5R3,A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	30553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43116155	43116318	43116237	Y	CYB5R3,A4GALT	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43144166	43144283	43144173	Y	NA	A4GALT	CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT	IMR90	Hi-C	24141950	A4GALT	28862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	43233624	43233705	43233665	Y	NA	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	18407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43283489	43283802	43283626	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	31377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	43415245	43415535	43415390	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	6094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	44140171	44140361	44140266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	65856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	EFCAB6,SULT4A1	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	12505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	44503153	44503463	44503308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	110062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	44730251	44730590	44730516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	161588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	44731310	44731638	44731630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	160540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45402294	45403188	45402906	Y	NA	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45403389	45403735	45403573	Y	KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B	PHF21B	NA	NA	NA	NA	PHF21B	145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45553376	45553664	45553597	Y	NA	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	3998	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45626265	45626482	45626374	Y	NA	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	8168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45635319	45635444	45635382	Y	NA	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45664918	45665214	45665118	Y	NA	KIAA0930,FAM118A	LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0930	30268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	45899980	45900171	45900075	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	3862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	45900177	45900595	45900449	Y	FBLN1	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	4059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	46159997	46160538	46160082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	94319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	46285473	46285870	46285610	Y	NA	NA	FAM118A,SMC1B,ATXN10,FBLN1,WNT7B,PKDREJ,C22orf40	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7B	85139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	46676915	46677122	46676986	Y	TBC1D22A,CERK	TTC38,GTSE1,TRMU	NA	NA	NA	NA	GTSE1	13516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	47498614	47499010	47498804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	342096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	49546517	49546852	49546699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	502338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50004783	50004984	50004947	Y	NA	C22orf34	NA	NA	NA	NA	C22orf34	44206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50232497	50232886	50232656	Y	TUBGCP6,BRD1,ZBED4,CRELD2	BRD1,ZBED4	ZBED4	K562	ChIA-PET	22265404	ZBED4	12604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr22	50273824	50274276	50274235	Y	TUBGCP6,HDAC10,ZBED4	ZBED4,CRELD2,ALG12	NA	NA	NA	NA	ZBED4	28334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50330725	50331030	50330945	Y	MAPK12,MAPK11	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	20619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50549796	50549945	50549869	Y	C22orf41,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1	MLC1	NA	NA	NA	NA	MLC1	27465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50629840	50630128	50630062	Y	BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	SELO	7280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr22	51109717	51110004	51109850	Y	MAPK11,FAM116B,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,SHANK3	ARSA,SHANK3	SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHANK3	839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	571549	571718	571634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090043.1	1064211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	4516473	4516898	4516756	Y	NA	SUMF1,ITPR1-AS1,ITPR1	SUMF1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SUMF1	9508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	4763636	4764014	4763825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR1	230604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	7807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	5054958	5055470	5055112	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	BHLHE40-AS1	35312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	5065036	5065378	5065161	Y	BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	45390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	5145575	5145674	5145603	Y	NA	ARL8B	ITPR1,EGOT	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	16231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	6573697	6574039	6573711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM7	235649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	6741976	6742157	6742067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRM7	67531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	7836263	7836282	7836272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	705111	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	8502863	8503141	8502998	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	38252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	9006142	9006408	9006272	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	2685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	9165522	9165918	9165724	Y	LHFPL4,SRGAP3	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	162065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	9178010	9178181	9178119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	174553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	9904404	9904624	9904511	Y	OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE	NA	NA	NA	NA	RPUSD3	20118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10202652	10202802	10202719	Y	TATDN2,VHL,IRAK2	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	1747	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10246146	10246525	10246336	Y	NA	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	41182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10265421	10265646	10265492	Y	BRPF1,VHL,IRAK2,TATDN2,GHRL	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	22061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10276652	10276834	10276729	Y	NA	TATDN2	NA	NA	NA	NA	TATDN2	10873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	10744704	10745135	10744878	Y	NA	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC6A11	110750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	11632872	11633201	11633091	Y	SYN2,VGLL4	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	127019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	12137205	12137457	12137242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP4	61394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	12229937	12230151	12230065	Y	RAF1	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	31086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	12910559	12910807	12910643	Y	MKRN2	RPL32	CAND2,IQSEC1,RPL32	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL32	29472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.42803703022261
chr3	13062449	13062850	13062655	Y	RPL32,NUP210,IQSEC1	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	49767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	13257508	13257782	13257645	Y	NA	NA	LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	144891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	13452835	13453081	13452953	Y	IQSEC1,HDAC11,HDAC11	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	6728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr3	14457192	14457307	14457247	Y	NA	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	15116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	15060728	15061023	15060876	Y	NR2C2	MRPS25	NA	NA	NA	NA	MRPS25	43819	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	15358234	15358387	15358263	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	22488	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	15695837	15696119	15696028	Y	HACL1	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	54499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	15845201	15845372	15845268	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	203863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	16024262	16024670	16024542	Y	NA	NA	ANKRD28,GALNTL2,MIR563	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	279809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	16102393	16102705	16102619	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	201774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	700704	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	780292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	17650424	17650697	17650561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	808265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	17674085	17674191	17674137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	810118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	18005686	18005921	18005797	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	478388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	18278854	18279224	18279039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	205085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	18722396	18722640	18722477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	144231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	19379484	19379512	19379499	Y	KCNH8	NA	NA	NA	NA	NA	RAB5A	607059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	20012721	20012798	20012760	Y	NA	RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	26150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	19705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	20329736	20330068	20329903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL1	103952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	21623868	21623880	21623874	Y	NA	ZNF385D-AS1	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	41560	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	21654380	21654503	21654471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	72072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D-AS1	456738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	23787915	23788432	23788117	Y	UBE2E1	NA	UBE2E1,UBE2E2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	56962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	75330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	27448684	27449023	27448831	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	74888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	27595449	27595580	27595515	Y	NA	NA	SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	71538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr3	27707886	27708022	27707939	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	35419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	27971881	27971920	27971901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098614.2	299414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	28367464	28367703	28367584	Y	NA	AZI2,ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	AZI2	20915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	29983920	29984245	29984164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	661749	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	30377149	30377465	30377308	Y	NA	NA	TGFBR2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	268529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	31967720	31967825	31967773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	53438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	ZNF860	NA	NA	NA	NA	ZNF860	18462	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32412858	32413131	32413058	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	18032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32822383	32822764	32822428	Y	TRIM71	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	2374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	32836613	32836654	32836634	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	11475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr3	32863625	32863886	32863704	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	6115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	32877551	32877785	32877669	Y	NA	TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	20041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	32911916	32912083	32911961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM71	54406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	33002804	33002999	33002866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	70356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	33030821	33031046	33030985	Y	CCR4	SEC13P1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	42309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	33382066	33382350	33382208	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL2	65549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	33837400	33837658	33837523	Y	CLASP2,PDCD6IP	PDCD6IP	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	35105790	35105810	35105799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	1267946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	35554607	35554628	35554618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAC	865208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	226617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	TCEA1P2	NA	NA	NA	NA	TCEA1P2	29835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	38216296	38216490	38216393	Y	NA	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	11716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1,XIRP1	NA	NA	NA	NA	XIRP1	9434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	39372633	39372790	39372689	Y	MOBP,CCR8	CCR8	NA	NA	NA	NA	CCR8	3436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	CCR8,SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	39446360	39446713	39446516	Y	NA	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	RPSA	180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	42065241	42065265	42065254	Y	NA	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	11947	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	42122071	42122336	42122239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	68777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	42220925	42221235	42221114	Y	TRAK1	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	84464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	42237448	42237989	42237678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCK	67710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	43458781	43458976	43458878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	132777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45147419	45147607	45147508	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	45681547	45681721	45681608	Y	LIMD1	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	46827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	45684271	45684561	45684439	Y	NA	SACM1L	NA	NA	NA	NA	SACM1L	43987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46246833	46247045	46246952	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	NA	NA	NA	NA	FYCO1	211517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46332561	46332856	46332710	Y	NA	NA	CCR3	IMR90	Hi-C	24141950	TDGF1	281189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46341741	46342039	46341904	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR2	NA	SLC6A20,CCR9,CCR3,CCR5,LOC100132146,FYCO1	IMR90	Hi-C	24141950	TDGF1	272006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46587372	46587917	46587474	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	26128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	46591078	46591347	46591239	Y	CCR2	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	22698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	TDGF1	13826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr3	46616855	46617260	46617039	Y	NA	TDGF1,LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	2329	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	MYL3,NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	46995135	46995433	46995392	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	23740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	47000781	47001063	47000953	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	18110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	47004561	47004925	47004746	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	14248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	47120016	47120037	47120026	Y	SETD2,KLHL18,PRSS45,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	83420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	47134411	47134793	47134602	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	SETD2	68664	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	48330483	48330839	48330661	Y	PLXNB1	ZNF589,NME6	NA	NA	NA	NA	NME6	10336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	49171125	49171202	49171164	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B	NA	NA	NA	NA	LAMB2	2574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	49503154	49503264	49503210	Y	NA	AMT,NICN1,DAG1	NA	NA	NA	NA	DAG1	882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	50280308	50280577	50280437	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B,IFRD2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	18584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	53286308	53286764	53286678	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	1304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	53288705	53289353	53289077	Y	NA	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr3	53380883	53380907	53380896	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	1229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	54675181	54675533	54675345	Y	NA	RPS15P5	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	16939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	54686814	54686829	54686822	Y	NA	RPS15P5	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	28572	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	54734224	54734587	54734407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	75982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	54856337	54856720	54856396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	198095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	55319384	55319763	55319619	Y	WNT5A	NA	CACNA2D3,ERC2,WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	661142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	55398457	55398867	55398717	Y	NA	NA	CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	740215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	859259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	55518078	55518594	55518516	Y	WNT5A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	859836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	55707711	55707857	55707784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERC2	792534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57572232	57572342	57572306	Y	NA	DNAH12,PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	9605	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	RP11-755B10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-755B10.3	38852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57818713	57819025	57818868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLMAP	79536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	58162589	58162663	58162637	Y	KCTD6	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	58570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	58457172	58457525	58457255	Y	RPP14,RPP14,KCTD6	PDHB,KCTD6	PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD6	18316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	60062226	60062257	60062242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1028416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	60695765	60695821	60695814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	539312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	60745368	60745684	60745652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	489449	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	60777295	60777669	60777482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	457464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	61548977	61549431	61549203	Y	NA	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	3734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	62926615	62926793	62926705	Y	CADPS	LINC00698	NA	NA	NA	NA	LINC00698	7312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	64313187	64313399	64313330	Y	PRICKLE2	NA	PRICKLE2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-14D22.2	115753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	64317353	64317618	64317474	Y	NA	NA	PRICKLE2,PSMD6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-14D22.2	111534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	65013149	65013388	65013334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9	341473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	66021951	66022397	66022084	Y	NA	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	66547159	66547390	66547275	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	2297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	69134869	69134938	69134904	Y	TMF1	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	2774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	69337600	69337654	69337627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	205505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	69790676	69790712	69790690	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	4090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	71775445	71775695	71775661	Y	PROK2,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3	GPR27,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	GPR27	25506	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	72386025	72386536	72386317	Y	NA	NA	SHQ1,GXYLT2,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00877	96309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	73040663	73040928	73040772	Y	NA	PPP4R2	NA	NA	NA	NA	PPP4R2	3008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	75472638	75472968	75472803	Y	NA	FAM86DP	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	9293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	76160921	76161072	76160934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO2	207075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	76544086	76544385	76544235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	62917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	87101402	87101690	87101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL3	63133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	90132744	90133405	90132853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA3	978070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	95126685	95126804	95126745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	939594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr3	97508761	97509065	97508913	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	228974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	99596957	99597300	99597045	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	234057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	99749892	99750279	99749982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	81078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	100054250	100054545	100054496	Y	NA	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	2705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	101046086	101046265	101046174	Y	ZBTB11,SENP7,CEP97	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	183820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr3	101424395	101424716	101424556	Y	NA	ZBTB11,RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	16053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	103188921	103189148	103189133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	312117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	105416337	105416655	105416542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	169741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	106839867	106840135	106840037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	117404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	107802397	107802714	107802497	Y	MYH15,HHLA2	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	5158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	107841863	107841996	107841935	Y	NA	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	33991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	109074614	109074989	109074804	Y	NA	DPPA2,DPPA4	NA	NA	NA	NA	DPPA4	20195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	111289781	111290083	111289847	Y	CD96	ZBED2	NA	NA	NA	NA	ZBED2	22207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	111623667	111623869	111623803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	71988	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	8077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	111833246	111833569	111833411	Y	BTLA,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	111834106	111834381	111834309	Y	BTLA,C3orf52,GCET2	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	30924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112109657	112110558	112110278	Y	CD200	RP11-231E6.1	CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-231E6.1	15423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112117788	112118189	112117996	Y	ATG3	RP11-231E6.1	CD200,BTLA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-231E6.1	7792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112258715	112258936	112258847	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	19620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112436805	112436974	112436889	Y	NA	NA	CD200R1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	70428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	112652910	112653110	112653010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	54655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	113470106	113470294	113470144	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	6240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	113638745	113638778	113638762	Y	NA	RP11-435F17.3	NA	NA	NA	NA	RP11-435F17.3	36600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115137571	115137675	115137649	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	202496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115408740	115409042	115408891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	68569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115502758	115503253	115502970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	162587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	205542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	115548074	115548457	115548266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	207903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	115696572	115696769	115696673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	356401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115771171	115771507	115771363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	431000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115776361	115776759	115776562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	436190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	449903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	115831620	115831831	115831726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	491449	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	115843003	115843038	115843021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	502832	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	117299509	117299697	117299683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	414398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	117544256	117544286	117544271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	169809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	81662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	119314990	119315304	119315163	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH,COX17	ADPRH,RP11-190C22.1	NA	NA	NA	NA	ADPRH	18875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	120857899	120858271	120857953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	352686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	121450275	121450346	121450335	Y	NA	GOLGB1	NA	NA	NA	NA	GOLGB1	16256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	121539764	121539854	121539811	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	12072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	121933818	121933831	121933825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	108260	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	122208819	122209075	122208974	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	22717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	122486684	122487080	122486948	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	23591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	122493180	122493752	122493620	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	16919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	122787344	122787648	122787385	Y	SEMA5B,PDIA5	SEMA5B,PDIA5	NA	NA	NA	NA	PDIA5	3435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	123093901	123094149	123094025	Y	ADCY5,ADCY5	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22A	175127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	123165325	123165700	123165659	Y	ADCY5	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	136332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	123395755	123396140	123395948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	93366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	124531464	124532111	124531823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	84251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	NA	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	HEG1	191610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	125231315	125231583	125231558	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	5458	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	NA	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1L1	71428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	PLXNA1	240445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	127244302	127244595	127244437	Y	NA	NA	UROC1,CHST13,NUP210P1,CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	70471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr3	127494660	127494939	127494869	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	MGLL	NA	NA	NA	NA	MGLL	45112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	127729316	127729371	127729322	Y	DNAJB8	SEC61A1	SEC61A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SEC61A1	39113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	127795566	127796407	127795838	Y	GATA2,GATA2,GATA2,DNAJB8	SEC61A1	NA	NA	NA	NA	SEC61A1	27082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128214371	128214730	128214426	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	DNAJB8,DNAJB8-AS1,GATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA2	4343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128337505	128337705	128337543	Y	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	60213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	128838520	128838686	128838629	Y	MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43	RAB43,ISY1-RAB43,ISY1	NA	NA	NA	NA	RAB43	958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	129167159	129167354	129167260	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	10191	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	129295610	129296083	129295875	Y	RAB43,C3orf37,C3orf37,H1FX,MBD4	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	27578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	129318465	129318690	129318565	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	4971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	129352569	129352710	129352632	Y	NA	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	28908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	129543558	129543741	129543650	Y	MBD4,H1FOO,TMCC1,TMCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	66678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	131096350	131096447	131096399	Y	NA	NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16	NA	NA	NA	NA	RP11-933H2.4	1872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	132002464	132002523	132002494	Y	NA	RPL7P16,CPNE4,ACPP	NA	NA	NA	NA	CPNE4	210	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	132167229	132167399	132167330	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	32859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	133147395	133147694	133147637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDV3	142880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	134087826	134088207	134088017	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	4114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	134874627	134874847	134874784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KY	506149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	136466232	136466235	136466234	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	2985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	138410318	138410460	138410372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAIM	84870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	138565329	138565569	138565472	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	13549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	138581550	138581663	138581597	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr3	138581757	138582253	138582041	Y	NA	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	29977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141131172	141131505	141131226	Y	SLC25A36,RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	72384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141217752	141218175	141217834	Y	ATP1B3,RASA2	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	13863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141230074	141230471	141230125	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	26185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141396660	141396814	141396728	Y	ATP1B3	NA	RASA2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	58232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	141482175	141482451	141482314	Y	NA	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	27129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	141611491	141611772	141611584	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	18525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	142585828	142586021	142585923	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	20024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	142804014	142804376	142804307	Y	NA	CHST2	CHST2	K562	ChIA-PET	22265404	CHST2	31797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	142844486	142844557	142844519	Y	NA	CHST2,PBX2P1	NA	NA	NA	NA	CHST2	8313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	143352573	143352896	143352700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	212477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	143693787	143694146	143693885	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	5147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	143696383	143696503	143696442	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	7743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	PLSCR4	NA	NA	NA	NA	PLSCR4	35825	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	64833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	147072976	147073090	147073034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	809995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	148595334	148595685	148595388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYG1	111443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	148899476	148899525	148899501	Y	AGTR1,AGTR1,TM4SF4,CP	NA	NA	NA	NA	NA	HPS3	54105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	149151278	149151442	149151363	Y	NA	NA	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	57626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	149499134	149499345	149499187	Y	NA	WWTR1,COMMD2,RNF13	COMMD2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF13	29150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	17254	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	15530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	149669691	149669713	149669697	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	14459	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	150001972	150002287	150002130	Y	NA	NA	TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D2	121835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	150453151	150453509	150453478	Y	CLRN1	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2	25755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	150987276	150987626	150987385	Y	P2RY12,MED12L	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	45114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	151514227	151514622	151514246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1	444995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	151582597	151582803	151582700	Y	NA	NA	MED12L	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	376814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	152460711	152461076	152460968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	P2RY1	89660	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	153017510	153017568	153017539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2B	139481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	153720980	153721188	153721084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF26	115604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	155463707	155463869	155463800	Y	NA	PLCH1	NA	NA	NA	NA	PLCH1	2851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	156491591	156491826	156491709	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	34695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	157935893	157935900	157935896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSRC1	114249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	60098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1,RP11-379F4.4,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	158463445	158463640	158463543	Y	NA	MFSD1,RP11-379F4.4,RARRES1	NA	NA	NA	NA	RARRES1	14960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	379436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	159514645	159514911	159514780	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	40739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	159538960	159539273	159539207	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	160714920	160715128	160715024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMD3	105356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	161371327	161371329	161371328	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	550155	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	163939562	163939697	163939594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	3118390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1881401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1880791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	165217698	165218028	165217864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	1879106	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	ZBBX	84506	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	167699117	167699438	167699278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	112325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	169751384	169751667	169751487	Y	SKIL,SKIL,SEC62,GPR160	GPR160	SEC62,LOC100128164,GPR160	IMR90	Hi-C	24141950	GPR160	2050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	169762658	169762980	169762844	Y	SKIL,SKIL,GPR160	GPR160	NA	NA	NA	NA	GPR160	8941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	4090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171678764	171678932	171678818	Y	NA	NA	PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	76486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171708179	171708567	171708376	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	PLD1,FNDC3B,TMEM212	IMR90	Hi-C	24141950	FNDC3B	46851	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171855430	171855856	171855550	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	100012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171856568	171857271	171856877	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	101150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	171863188	171863575	171863224	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	107770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172280796	172281206	172280981	Y	TNFSF10,TNFSF10	NA	NCEH1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1P1	137917	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172298614	172298796	172298710	Y	TNFSF10,TNFSF10	NA	NCEH1,TNFSF10,FNDC3B,GHSR,ECT2	IMR90	Hi-C	24141950	NCEH1	128212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172304233	172304595	172304362	Y	TNFSF10,TNFSF10	NA	NCEH1,TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	NCEH1	122413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172366671	172366874	172366806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	60134	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172376302	172376661	172376383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCEH1	50347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	173212141	173212152	173212147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	100067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	174048960	174049199	174049115	Y	NA	RP11-393N4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	43835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	174257765	174258124	174258055	Y	NA	NA	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	103402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	176862590	176862993	176862904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	50268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	176988907	176989274	176989091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	75646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	177979552	177979945	177979765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	808122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	178671519	178671916	178671775	Y	NA	NA	KCNMB2	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT3	116151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	179471930	179472312	179472121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	103387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	USP13	318687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	180423868	180424167	180424040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	105950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	181419160	181419816	181419173	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	7898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr3	181537254	181537571	181537413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	109540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	181674999	181675167	181675083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX2	247285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	182928659	182929484	182928893	Y	ATP11B,DCUN1D1,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	LAMP3,B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	39548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	183250743	183250943	183250799	Y	HTR3D,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	100413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	183252064	183252271	183252179	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL24	99085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf65	53739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	185825302	185825582	185825395	Y	NA	ETV5	NA	NA	NA	NA	ETV5	525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	186001404	186001736	186001631	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	DGKG	76290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	186606472	186606663	186606569	Y	ST6GAL1,RTP4	RPS20P14,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	RPS20P14	9324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	186733684	186733815	186733810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	87410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	186745346	186745889	186745388	Y	TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	186784569	186784773	186784671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	111923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	186903601	186903921	186903764	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	6905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	186926447	186926523	186926484	Y	NA	RPL39L	NA	NA	NA	NA	RPL39L	29751	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187457681	187458370	187457991	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	3145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187574248	187574709	187574377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL6	112733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187690684	187690704	187690694	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	178368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187749863	187749880	187749872	Y	RTP2	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	119192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188017658	188018009	188017791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	147813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188035801	188035961	188035890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	165956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188276216	188276468	188276344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	406371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188667737	188668123	188668016	Y	NA	NA	LPP,BCL6,LPP-AS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TP63	679082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	188816884	188817275	188817066	Y	NA	NA	BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	TP63	529930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	191781460	191781643	191781536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	701910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	194058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	192315409	192315812	192315620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	167741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192369931	192370325	192369972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	113228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192428387	192428496	192428432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	55057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192561492	192561800	192561547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	72150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192608372	192608637	192608617	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	25313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	193590130	193590422	193590276	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-407B7.1	196337	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	193807302	193807696	193807488	Y	ATP13A3,HES1	RP11-407B7.1,HES1	HES1,LOC100131551,LOC647323	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-407B7.1	20543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	194210438	194211060	194210799	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	6033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	194341751	194341921	194341813	Y	NA	TMEM44-AS1,TMEM44,LSG1	NA	NA	NA	NA	TMEM44	10497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr3	194360985	194361172	194361065	Y	NA	TMEM44,LSG1,FAM43A	NA	NA	NA	NA	TMEM44	8567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	118403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	194898663	194899282	194898930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	90614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	195153778	195154174	195153996	Y	NA	ACAP2	NA	NA	NA	NA	ACAP2	7633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	195849521	195850263	195850145	Y	TFRC,TFRC	TFRC	LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFRC	42461	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	195906363	195907075	195906446	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,TNK2,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	99303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr3	195916495	195916669	195916549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	96159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	195919575	195919687	195919655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	93141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	195946520	195946837	195946671	Y	LRRC33,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	65991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196064212	196064579	196064504	Y	WDR53,ZDHHC19	TCTEX1D2,TM4SF19	NA	NA	NA	NA	TM4SF19	838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr3	196290932	196291284	196291114	Y	NA	FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	FBXO45	2198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196339004	196339201	196339061	Y	LRRC33	FBXO45,WDR53,LINC01063,PIGX	PCYT1A,TCTEX1D2,FBXO45,WDR53,CEP19,PIGX,LRRC33,PAK2,MFI2,MFI2-AS1,SENP5	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01063	18257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196694427	196694825	196694642	Y	NA	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr3	196784656	196784743	196784700	Y	CEP19,PIGX,PAK2	MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	29969	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	197036480	197036785	197036693	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	12309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	97355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr3	197439165	197439566	197439302	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	MIR922,FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	22484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	787901	788124	788010	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	14264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	789468	789689	789607	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	15831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	899253	899541	899397	Y	NA	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	GAK	24620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	1036795	1036974	1036954	Y	CRIPAK,SLC26A1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	1769544	1769746	1769644	Y	FGFR3	TMEM129,TACC3,FGFR3	FGFR3	MCF7	ChIA-PET	22265404	FGFR3	23288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	2780332	2780529	2780439	Y	NA	TNIP2,SH3BP2	NA	NA	NA	NA	SH3BP2	12221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	3203733	3204143	3203890	Y	SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	88612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	3485407	3485559	3485410	Y	DOK7	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	46727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	3784192	3784335	3784264	Y	OTOP1,RGS12	ADRA2C	NA	NA	NA	NA	ADRA2C	18117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	3931557	3931999	3931672	Y	NA	FAM86EP	NA	NA	NA	NA	FAM86EP	23147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr4	3936686	3936855	3936771	Y	NA	FAM86EP	NA	NA	NA	NA	FAM86EP	18291	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	4692859	4693117	4692937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18	150786	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6200459	6200744	6200584	Y	JAKMIP1	JAKMIP1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6223621	6224023	6223692	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1,WFS1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	23303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	6495576	6495698	6495612	Y	JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C,PPP2R2C	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2C	67629	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6889579	6890011	6889713	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	18958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6974782	6974959	6974886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	65813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	7123698	7124022	7123956	Y	NA	NA	ABLIM2,SORCS2,GRPEL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL1	55774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	7142827	7143002	7142919	Y	NA	SORCS2	SORCS2,AFAP1-AS1,AFAP1	IMR90	Hi-C	24141950	SORCS2	49263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	7649791	7650390	7650086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAPL1	215091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	7981410	7981607	7981517	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	41757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	8119010	8119317	8119178	Y	ABLIM2	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	39242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	8223394	8223615	8223527	Y	METTL19,SH3TC1	SH3TC1,HTRA3	NA	NA	NA	NA	SH3TC1	41595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	9605717	9605843	9605777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	452695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	9693091	9693174	9693121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	423399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	9999524	9999723	9999624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	116850	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	11428604	11428950	11428674	Y	NA	HS3ST1	NA	NA	NA	NA	HS3ST1	439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	NKX3-2	377756	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	14223789	14223802	14223796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKX3-2	679115	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	14346907	14347269	14347043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	655029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	15596739	15596980	15596942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	84305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	16003610	16004023	16003987	Y	NA	FGFBP2	NA	NA	NA	NA	FGFBP2	34678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	20627000	20627372	20627197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	68533	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	22636233	22636363	22636286	Y	NA	RP11-10G12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10G12.1	42414	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	24227575	24227894	24227795	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	PPARGC1A	323863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	24322640	24323331	24322979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	260842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	24332761	24333117	24332939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	251056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	ATP5LP3	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5LP3	2009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	SOD3	50864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	25828026	25828318	25828201	Y	NA	SEL1L3	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	35064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	26031795	26032283	26031985	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	130794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	26449466	26449471	26449469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D19	126588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	27085890	27086000	27085963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	225669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	28602494	28602613	28602520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O22.1	167423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	34734758	34735069	34734951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1509062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	36019806	36020078	36020073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	224053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	36314989	36315291	36315111	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	70858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	37668347	37668621	37668474	Y	NA	RELL1	NA	NA	NA	NA	RELL1	17377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	38001084	38001300	38001133	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	41028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	38281692	38282075	38281884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	321636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	38283120	38283331	38283203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	323064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	38793422	38793699	38793608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	73599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	39316114	39316675	39316347	Y	NA	RFC1	NA	NA	NA	NA	RFC1	49320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr4	40050527	40050740	40050634	Y	NA	N4BP2	NA	NA	NA	NA	N4BP2	5706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40564357	40564512	40564451	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	RBM47	66380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40589734	40590029	40589952	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	40863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	40620437	40620847	40620835	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	10045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	40623743	40623952	40623867	Y	RBM47	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	6940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	40628627	40628976	40628881	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	1916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	43686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	RBM47	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM47	44037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40684955	40685070	40685013	Y	NA	NA	RBM47,NSUN7	IMR90	Hi-C	24141950	RBM47	54063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40722899	40723292	40723210	Y	RBM47	NSUN7	CHRNA9,RBM47,NSUN7,N4BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NSUN7	26622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40803649	40803948	40803799	Y	APBB2,APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	53735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	42819226	42819612	42819419	Y	ATP8A1,GRXCR1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A1	162104	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	48229621	48229933	48229743	Y	CNGA1	TEC	NA	NA	NA	NA	TEC	39948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	53023897	53024042	53023970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA18	108400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	54137122	54137385	54137364	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	92857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	54568898	54569145	54569018	Y	CHIC2	NA	SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	FIP1L1	327088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	54825725	54826062	54825894	Y	GSX2	NA	RPL21P44,SCFD2,LNX1,FIP1L1,CHIC2,GSX2,PDGFRA	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	102795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr4	55578146	55578442	55578293	Y	KIT	NA	NA	NA	NA	NA	KIT	56061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	56178022	56178286	56178222	Y	TMEM165,SRD5A3	SRD5A3	KDR	IMR90	Hi-C	24141950	SRD5A3	31990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	57278248	57278433	57278373	Y	NA	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	PPAT	21348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	57313900	57314193	57314047	Y	NA	PPAT,PAICS,SRP72	NA	NA	NA	NA	PAICS	13993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	57740482	57740676	57740556	Y	PPAT,REST	REST	THEGL,SPINK2	IMR90	Hi-C	24141950	REST	31399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	58120421	58120667	58120607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	145870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	58131678	58131691	58131684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	157127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	58173398	58173407	58173403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	198847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	66960590	66960760	66960693	Y	NA	RP11-396M11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	2746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	68128399	68128586	68128524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	436311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	68266370	68266649	68266476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	298248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	69271604	69271998	69271802	Y	NA	TMPRSS11E	NA	NA	NA	NA	TMPRSS11E	39169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	71695000	71695080	71695041	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	8582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	72459056	72459408	72459224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPFFR2	436113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	209188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	75554137	75554451	75554233	Y	NA	NA	EREG,MTHFD2L	IMR90	Hi-C	24141950	PARM1	301854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	76750745	76750859	76750802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USO1	102968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77041502	77041599	77041551	Y	NA	NUP54	NA	NA	NA	NA	NUP54	26069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	77366246	77366349	77366298	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	11993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77367704	77367795	77367750	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	13451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77380282	77380659	77380469	Y	NA	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	26029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	77545422	77545888	77545544	Y	SCARB2	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	191169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77546849	77546886	77546883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	192596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77611633	77612016	77611712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	204986	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77724798	77724936	77724862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOWAHB	92066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	79473983	79474151	79474067	Y	ANXA3	ANXA3	NA	NA	NA	NA	ANXA3	3310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	79550555	79550802	79550658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	79882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	79859042	79859275	79859190	Y	PAQR3	PAQR3	NA	NA	NA	NA	PAQR3	450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	81199073	81199101	81199087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	154465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	82133438	82133457	82133448	Y	PRKG2	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	829940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	82342695	82343029	82342890	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	620368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	82566342	82566814	82566582	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	396583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	86647112	86647286	86647162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	252845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	87880821	87880990	87880863	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	11545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	87932880	87932928	87932888	Y	AFF1,AFF1	NA	NA	NA	NA	NA	TECRP1	63604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	88024894	88025201	88025055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL8	134265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	88474539	88474761	88474650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	132805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	89302401	89302730	89302543	Y	HERC6,HERC5	HERC6	NA	NA	NA	NA	HERC6	4510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	89438192	89438391	89438292	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	HERC3	1808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	89454373	89454723	89454658	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	PIGY	13433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	89534713	89535020	89534799	Y	PPM1K,HERC3	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	82366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	89885623	89885749	89885686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	268237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	93695522	93695754	93695563	Y	GRID2	NA	NA	NA	NA	NA	GRID2	471972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	95406092	95406259	95406175	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	35055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	102894116	102894225	102894174	Y	BANK1,BANK1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	456190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103089994	103090308	103090151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A8	260107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	103536028	103536474	103536149	Y	NHEDC1,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1	NA	NA	NA	NA	NA	NFKB1	115542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103673229	103673433	103673315	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	6718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103678847	103679008	103678977	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	1143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	37521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103781884	103782294	103782163	Y	MANBA	UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	UBE2D3	5759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	103967476	103967511	103967493	Y	NA	SLC9B1,SLC9B2	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	28580	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	104302340	104302484	104302413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPE	184774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	106390941	106391445	106391094	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	1793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	106391866	106392288	106392204	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	106887801	106887968	106887883	Y	NPNT	NA	NA	NA	NA	NA	INTS12	72658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	109513186	109513523	109513472	Y	NA	RPL34-AS1,RPL34	NA	NA	NA	NA	RPL34-AS1	26093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	110464231	110464470	110464351	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	14891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	111041485	111041815	111041651	Y	NA	RP11-115A14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	23715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	111085558	111085919	111085739	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	20028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,TIFA	NA	NA	NA	NA	TIFA	23753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21,MIR302A,MIR302C,MIR302B	NA	NA	NA	NA	MIR302B	3661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr4	113668186	113668486	113668348	Y	NA	RP11-148B6.2,RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	10358	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	113672704	113673017	113672851	Y	NA	RP11-148B6.2,RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	14876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	113680523	113680828	113680684	Y	NA	RP11-119H12.1,RPL7AP30	NA	NA	NA	NA	RP11-119H12.1	22695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	114104327	114104616	114104364	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	234863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	50831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	115198943	115199113	115199023	Y	NA	NA	ARSJ,ANK2	IMR90	Hi-C	24141950	ARSJ	300060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	116913207	116913277	116913242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	604040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	43041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr4	119115424	119115493	119115457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	82371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	119187150	119187543	119187362	Y	NA	SNHG8	NA	NA	NA	NA	SNHG8	10321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	119910469	119910954	119910765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNPO2	102473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	120130181	120130604	120130427	Y	NA	USP53	NA	NA	NA	NA	USP53	1138	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	123436599	123436634	123436617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN4P	214714	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	26306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	127699482	127699754	127699681	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	842672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	128894970	128895372	128895225	Y	NA	C4orf29,MFSD8	NA	NA	NA	NA	MFSD8	9820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	129088221	129088417	129088319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1B	107798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	129254148	129254471	129254310	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PHF17,LARP1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	42242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	129605409	129605648	129605529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420A23.1	393503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	130246111	130246411	130246262	Y	C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	233347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	131082218	131082340	131082279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1069454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	133266182	133266225	133266204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	802245	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	133292934	133293335	133293044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH10	775135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	134765849	134765984	134765917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PABPC4L	354919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	139320318	139320616	139320508	Y	SLC7A11	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	158815	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	139960222	139960706	139960403	Y	CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140035787	140036142	140035958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELF2	60230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140096766	140097018	140096889	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF2	394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	140292626	140292906	140292778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	70921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140794594	140794926	140794812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	209672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140967961	140968185	140967999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	105153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	141218386	141218686	141218436	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	143488504	143488630	143488569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	277955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr4	144280232	144280410	144280287	Y	USP38,SMARCA5,GAB1	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	24317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	144981582	144981869	144981726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP5	502957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	146408898	146409228	146409003	Y	OTUD4	SMAD1	NA	NA	NA	NA	SMAD1	8552	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	146725275	146725660	146725360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	132127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	146726845	146727018	146726937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	130769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	146833675	146833816	146833746	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	23971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	147379746	147379894	147379845	Y	LSM6	NA	NA	NA	NA	NA	SLC10A7	61229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	148426409	148426782	148426596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM184C	109752	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	148746659	148746986	148746792	Y	PRMT10,ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	95445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	150433766	150433919	150433843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	1069916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	150756513	150756641	150756613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	1178238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	151204830	151205055	151204941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	729824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	151264145	151264674	151264371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	670205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	151873741	151873900	151873783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	60979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	152047125	152047385	152047255	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	28400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152048107	152048440	152048274	Y	LRBA,LRBA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	29382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152105959	152106222	152106091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	87234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152143714	152143771	152143743	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	124989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	152406480	152406763	152406721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	78112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153180278	153180573	153180364	Y	NA	NA	PET112,FAM160A1,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	274680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	9125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153599392	153599746	153599719	Y	FBXW7,ARFIP1,TMEM154	TMEM154	NA	NA	NA	NA	TMEM154	75	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr4	153630965	153631147	153631056	Y	NA	TMEM154	TMEM154	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM154	31648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM2	83008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	154248193	154248592	154248328	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	15209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	154711358	154711691	154711551	Y	NA	RNF175,SFRP2	NA	NA	NA	NA	SFRP2	3086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	154711839	154712367	154712106	Y	SFRP2	RNF175,SFRP2	NA	NA	NA	NA	SFRP2	3567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	159742407	159742876	159742571	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	54117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	160191202	160191310	160191258	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	502912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-366M4.3	585367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	169371058	169372404	169371437	Y	DDX60,DDX60L	PALLD	NA	NA	NA	NA	PALLD	43813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	170548136	170548389	170548218	Y	NEK1,CLCN3	NEK1,CLCN3	C4orf27	IMR90	Hi-C	24141950	CLCN3	16352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	174112816	174113032	174112924	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	24013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	174399736	174400115	174399926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAP30	110616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	174738394	174738663	174738529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	184872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	174856893	174857258	174857076	Y	HAND2	NA	NA	NA	NA	NA	RANP6	303371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	175440867	175440935	175440897	Y	HPGD	HPGD	NA	NA	NA	NA	HPGD	1370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	177841897	177842103	177842000	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	130016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	178849873	178850023	178850005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	485740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	180585671	180585931	180585800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	2221538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	180624089	180624102	180624096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-130F10.1	2259956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	182439460	182439521	182439491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	624881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	183826285	183826336	183826311	Y	NA	DCTD	NA	NA	NA	NA	DCTD	10753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	184042355	184042696	184042526	Y	NA	WWC2	NA	NA	NA	NA	WWC2	23909	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC11	140467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	184910732	184910983	184910894	Y	C4orf41,IRF2	RP11-739P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	3901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	208523	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	185231317	185231632	185231620	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,LOC728175	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	162102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	185296048	185296446	185296396	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	97288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr4	185296800	185297408	185297103	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	96326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr4	186760271	186760668	186760511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	227638	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	186831211	186831564	186831371	Y	SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR3	156742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	187680620	187680766	187680713	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	34744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	188953266	188953567	188953377	Y	NA	ZFP42	ZFP42,TRIML1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP42	38341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr4	189029344	189029687	189029466	Y	ZFP42,TRIML2	TRIML2	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIML2	587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr4	189048639	189048958	189048819	Y	NA	TRIML2	NA	NA	NA	NA	TRIML2	19882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	189361062	189361328	189361166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	91884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	190592622	190592758	190592693	Y	FRG1	RNU1-51P	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	36110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	190678550	190678933	190678770	Y	NA	RNU1-51P	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	49682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	190708353	190708364	190708359	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79485	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr4	190942271	190942591	190942322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	82328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.86205588866283
chr5	333938	334337	334088	Y	NA	AHRR	NA	NA	NA	NA	AHRR	31647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	448928	449328	449227	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	523686	523917	523764	Y	SLC9A3	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	1239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	777448	777883	777776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	85938	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr5	1086141	1086649	1086569	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	23501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	1102623	1102762	1102676	Y	TPPP,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	7388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	1129967	1130071	1130019	Y	SLC12A7	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	19817	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	22581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	2669640	2670190	2669944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	80055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.46728955919209
chr5	5209907	5210282	5210095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2297D10.2	71740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	5376440	5376820	5376639	Y	NA	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	41957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	6592815	6592998	6592893	Y	PAPD7,SRD5A1	NSUN2,SRD5A1	NA	NA	NA	NA	NSUN2	38406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.80971918337018
chr5	10229611	10229778	10229690	Y	NA	FAM173B,CCT5	NA	NA	NA	NA	FAM173B	18231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	10309087	10309259	10309181	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	CMBL	2949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	10635345	10635740	10635585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	72903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	10857093	10857358	10857239	Y	NA	NA	ROPN1L,DAP,CTNND2,MARCH6,ANKRD33B	IMR90	Hi-C	24141950	DAP	97709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	11035965	11036506	11036174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	276581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	12099131	12099529	12099330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	196976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	12331154	12331499	12331312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	428999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	12658501	12658830	12658774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	756346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14251046	14251256	14251151	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	109235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	14937373	14937729	14937572	Y	FAM105A	NA	ANKH,FAM105B	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	67486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	15216648	15217026	15216659	Y	NA	NA	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL7	281279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	FBXL7	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL7	46389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	16736297	16736738	16736539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	121130	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	16740893	16741285	16741194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	125726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.76336430629515
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P10	102873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	18403562	18403676	18403619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP21	355903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	19929233	19929395	19929314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-774D14.1	680554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	25424909	25424931	25424920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	615319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	25438068	25438428	25438198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	628478	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	25443137	25443499	25443483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	633547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	25456035	25456404	25456210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	646445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr5	27309667	27310060	27309866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01021	160339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	29758752	29759069	29758903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	1292603	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	31511930	31511946	31511938	Y	NA	DROSHA,C5orf22	NA	NA	NA	NA	DROSHA	18357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	31894536	31894834	31894609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD2	257019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	32028303	32028410	32028357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	144046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	32274798	32274903	32274861	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	36212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	32446879	32447095	32446987	Y	NA	ZFR	NA	NA	NA	NA	ZFR	4012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	32592950	32593432	32593186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUB1	63211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr5	33770516	33770851	33770752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	119446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	34587608	34588326	34587915	Y	NA	NA	RAI14	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	66016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	34655418	34655812	34655539	Y	NA	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	1076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIX1	77788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	35817059	35817532	35817169	Y	SPEF2,IL7R	NA	NA	NA	NA	NA	UGT3A1	181598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	35853494	35854024	35853833	Y	SPEF2,IL7R	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	UGT3A1	145106	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	35859977	35860281	35860260	Y	SPEF2,IL7R	NA	NA	NA	NA	NA	UGT3A1	138849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	36274641	36274927	36274843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKP2	124550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	36553131	36553410	36553378	Y	NA	NA	SLC1A3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A3	51047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	36614653	36614946	36614866	Y	LMBRD2,RANBP3L,SLC1A3,SLC1A3	SLC1A3	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	10196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	36657665	36658163	36657813	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	53208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	36722958	36723309	36723211	Y	NIPBL	NA	NIPBL,LOC646719	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC1A3	118501	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPBL	154757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	37209037	37209204	37209072	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	38326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	37275525	37275858	37275640	Y	NA	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	27995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	37311676	37311784	37311730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP155	57499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	399651	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	NA	NA	NA	NA	NA	LIFR	159970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	38546436	38546759	38546707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIFR	59697	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	39025065	39025383	39025224	Y	NA	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	47127	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	40281597	40281809	40281703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGER4	395791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	40570659	40570764	40570714	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	106836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	40754670	40754884	40754791	Y	PTGER4	TTC33,PRKAA1	NA	NA	NA	NA	TTC33	593	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	40941168	40941181	40941175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37	107731	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	41465247	41465490	41465440	Y	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	403131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	43009341	43009652	43009530	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	6879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTD-2035E11.3	18328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	43632069	43632220	43632145	Y	NA	NNT,NNT-AS1	NA	NA	NA	NA	NNT-AS1	30737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	45793437	45793825	45793631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCN1	99184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	50263404	50263601	50263575	Y	ISL1	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	413320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	52155124	52155267	52155195	Y	NA	CTD-2207L17.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2207L17.1	42471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2	NA	NA	NA	NA	ITGA2	44436	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA2	50178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	52633703	52633938	52633784	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	FST	140301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	310514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	286546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	53466021	53466779	53466401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	137633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	53585796	53586153	53585818	Y	NA	ARL15,LINC01033	NA	NA	NA	NA	ARL15	18259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	54886412	54886788	54886737	Y	PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	57534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	54897039	54897427	54897238	Y	IL6ST,PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	68161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	55288370	55289209	55288952	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	55471391	55471677	55471521	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD55	55509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	55643078	55643375	55643183	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD55	115892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	55654713	55655022	55654890	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD55	127527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	58165920	58166304	58166218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	289872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	356835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	4.73719595364882
chr5	58243768	58244167	58243981	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	367720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	441843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	58359884	58360252	58360059	Y	RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	483836	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	58423022	58423147	58423096	Y	PDE4D,PDE4D,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	546974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	59045613	59045932	59045792	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	770015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	59183388	59183889	59183871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	632058	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	59618984	59619244	59619114	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	196703	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	60629089	60629454	60629159	Y	NA	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	2989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	64062726	64062917	64062822	Y	NA	SREK1IP1	NA	NA	NA	NA	CWC27	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	78260	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	64821420	64821488	64821458	Y	NA	CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	CENPK	35510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	65447669	65447962	65447814	Y	SREK1,SREK1	SREK1	NA	NA	NA	NA	SREK1	13870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	67069285	67069755	67069460	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	439793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	67410541	67410768	67410614	Y	PIK3R1,PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	98780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	67437910	67437942	67437925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	71606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	67770442	67770449	67770446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	260894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	365928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	68712626	68712834	68712773	Y	NA	RAD17,TAF9,MARVELD2	NA	NA	NA	NA	MARVELD2	3687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	71218510	71218673	71218589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	182388	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	71462643	71462861	71462688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP1B	61582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	71686761	71687006	71686884	Y	NA	NA	PTCD2,ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	72288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	71852331	71852540	71852377	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	237858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	72599094	72599410	72599166	Y	NA	NA	FCHO2,BTF3,FOXD1,TMEM171	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	142942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	72995047	72995144	72995131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	135536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	73330710	73331077	73330894	Y	NA	NA	FAM169A,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRA2	471199	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	FAM169A	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM169A	2863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	74616844	74617109	74616992	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	HMGCR	NA	NA	NA	NA	HMGCR	13045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	75206184	75206581	75206350	Y	IQGAP2,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP	NA	SV2C	IMR90	Hi-C	24141950	SV2C	170416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	75789158	75789213	75789186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQGAP2	92084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	76034658	76035100	76034908	Y	IQGAP2	F2R	NA	NA	NA	NA	F2R	24790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	76102045	76102389	76102284	Y	F2RL1	F2RL1,S100Z	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	10369	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	76103019	76103387	76103332	Y	F2RL1	F2RL1,S100Z	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	9371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.79663500704702
chr5	76103961	76104259	76104075	Y	NA	F2RL1,S100Z	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	8499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	76110007	76110333	76110205	Y	NA	F2RL1,S100Z	NA	NA	NA	NA	F2RL1	2425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	76928376	76928558	76928504	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	13940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	77026226	77026494	77026313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP2	52211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	77589539	77589820	77589680	Y	AP3B1	AP3B1	NA	NA	NA	NA	AP3B1	960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	77797282	77797316	77797309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	142943	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	77810178	77810481	77810268	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	155839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	77826174	77826769	77826484	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	171835	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	BHMT	NA	NA	NA	NA	BHMT	34298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	79421543	79422183	79421865	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	127715	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	79440817	79441220	79441029	Y	ZFYVE16,FAM151B,SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	108678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr5	79487807	79488093	79488033	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	61805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr5	80394008	80394030	80394018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2	133074	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	80416491	80416834	80416663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2	110270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	81465137	81465359	81465307	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23	107037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	81702078	81702394	81702360	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	129682	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	81934356	81934439	81934367	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	361960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	82005927	82005935	82005931	Y	ATP6AP1L	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	365382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	82154448	82154799	82154689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	216518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	82356692	82356869	82356781	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	14448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	82453115	82453241	82453191	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	81433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	188596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	82608517	82608916	82608727	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	156368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	3970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	78798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83219939	83220298	83220055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	122566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83583813	83583994	83583988	Y	EDIL3	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	94251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83604677	83605057	83605023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	73188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	86825396	86825519	86825458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	118560	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	280858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	88042920	88043139	88043027	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	367146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	88120689	88121105	88120942	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP22	444915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	89259292	89259660	89259475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	443943	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	89451450	89451878	89451685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CETN3	251725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	90673049	90673245	90673226	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	90686186	90686389	90686288	Y	NA	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	9010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P27	423389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	59046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	93316390	93316647	93316523	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	128757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	93323557	93323685	93323621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	121719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	93638641	93638753	93638697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	193237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	93697867	93698390	93698151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	252463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.3031770952086
chr5	93900444	93900820	93900632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD32	51232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	95170246	95170624	95170377	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	13537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	211903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	99389717	99390411	99390143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	478555	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	100175986	100176458	100176300	Y	ST8SIA4,ST8SIA4	NA	NA	NA	NA	NA	ST8SIA4	60512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	101404486	101404751	101404619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4C1	225502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	101577716	101577815	101577766	Y	SLCO6A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4C1	52438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	102304978	102305194	102305031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIP5K2	148659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	102682116	102682357	102682120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf30	89713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	105489939	105490092	105490081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6N13.1	763268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	105752390	105752961	105752697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6N13.1	1025719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	106314293	106314688	106314444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	689908	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr5	106837531	106838094	106837969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	166502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	107555103	107555441	107555272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	160358	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	108022286	108022631	108022483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	58892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr5	108329034	108329385	108329210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	247511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	109870902	109871116	109871008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	200721	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	111181854	111182145	111181999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	312078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	111535274	111535427	111535350	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	41051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	112628840	112629057	112628905	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	193470	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	TMED7-TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	115855956	115855969	115855965	Y	NA	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	40289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,CTB-118N6.2	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr5	115911792	115912152	115911976	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,CTB-118N6.2,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	3162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	116259364	116259561	116259432	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	209435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	116384111	116384324	116384221	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	334182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr5	118287967	118288290	118288148	Y	NA	PTMAP2,DTWD2	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	19201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	118320389	118320797	118320598	Y	NA	PTMAP2,DTWD2	NA	NA	NA	NA	DTWD2	1443	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	118453384	118453586	118453485	Y	NA	CTB-161M19.4,RP11-950K24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-950K24.2	8553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	118836565	118836574	118836570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	50427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	119016321	119016356	119016339	Y	NA	CTC-507E12.1	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	2429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	119576176	119576345	119576273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	221628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	122087226	122087448	122087366	Y	NA	SNX2	PRDM6	IMR90	Hi-C	24141950	SNX2	21243	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	122885327	122885717	122885442	Y	CEP120,CSNK1G3	CSNK1G3	NA	NA	NA	NA	CSNK1G3	39534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	123142909	123143354	123143175	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G3	297116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	123966351	123966687	123966497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	115813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-395C3.1	53916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr5	126087846	126088015	126087939	Y	NA	LMNB1	MEGF10,LMNB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNB1	22300	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	126181513	126181654	126181594	Y	MARCH3	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	71198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr5	126199771	126199925	126199848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNB1	89456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	129060395	129060594	129060495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS19	266437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	130715394	130715800	130715520	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	136208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	131641002	131641297	131641050	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	11994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	133331351	133332089	133331904	Y	NA	C5orf15,VDAC1	C5orf15	IMR90	Hi-C	24141950	VDAC1	6735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	133465566	133465711	133465642	Y	PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	17164	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,MIR3661,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	MIR3661	18431	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	133763329	133763680	133763576	Y	NA	CDKN2AIPNL	CDKN2AIPNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDKN2AIPNL	17740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.0594390533982
chr5	133775971	133776293	133776132	Y	NA	CDKN2AIPNL	PHF15,SKP1,UBE2B,CDKN2AIPNL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	30382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr5	133847692	133847829	133847767	Y	NA	NA	PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	102103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr5	134727973	134728292	134728105	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	5312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	136104885	136104913	136104899	Y	NA	NA	SPOCK1	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-1I21.2	86404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	136374592	136374995	136374792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	183275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	136450174	136450503	136450334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	258857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	137333439	137333810	137333723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13B	51840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	138058227	138058591	138058405	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	28407	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138078029	138078389	138078209	Y	NA	AC034243.1	CTNNA1,SIL1,HSPA9,MATR3	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	8609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	171619	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	238346	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	138397430	138397825	138397750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	209616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138838499	138838633	138838566	Y	TMEM173	ECSCR	NA	NA	NA	NA	ECSCR	1695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	139078128	139078514	139078502	Y	C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	53244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	139420805	139420894	139420865	Y	NRG2	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	64468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	139488718	139489038	139488945	Y	NA	PURA	NRG2,CYSTM1,IGIP	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	3356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	140381838	140382244	140382041	Y	DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	38018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	140457576	140457668	140457630	Y	NA	PCDHB2,PCDHB3,PCDHB4	NA	NA	NA	NA	PCDHB2	14559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	140648312	140648399	140648356	Y	NA	PCDHB14,PCDHB18,PCDHB15,TAF7	NA	NA	NA	NA	PCDHB15	25165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	12898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	30772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141054975	141055298	141055138	Y	PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4	HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3	NA	NA	NA	NA	ARAP3	4490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141209314	141209613	141209459	Y	NA	PCDH1	PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH1	47198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	141260592	141260733	141260664	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC3,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1	PCDH1,KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	3781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	141262176	141262446	141262287	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	PCDH1,KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	5365	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,PCDH12,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr5	141407173	141407212	141407192	Y	NA	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GNPDA1	16567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141576686	141576854	141576770	Y	PCDH1	NA	FGF1,GNPDA1,NDFIP1,SPRY4,ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	90616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141706626	141706892	141706857	Y	NA	AC005592.2,SPRY4	NA	NA	NA	NA	SPRY4	2606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	142321536	142321658	142321563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	173587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	142600445	142600900	142600783	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	109270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	142785420	142785784	142785543	Y	NR3C1	NR3C1	ARHGAP26	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	27293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146308158	146308454	146308355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	153893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R2B	83636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146831561	146831956	146831686	Y	PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146832241	146832308	146832261	Y	JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	55311	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146834939	146835189	146835093	Y	DPYSL3,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	52430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	146947412	146947925	146947557	Y	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	59793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	147234496	147234684	147234590	Y	JAKMIP2	SPINK1,C5orf46	SPINK1	IMR90	Hi-C	24141950	SPINK1	25147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	147248632	147248939	147248760	Y	NA	SPINK1,C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	35162	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	8.09270975415007
chr5	147253882	147254078	147253986	Y	NA	SPINK1,C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	30023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.67775690025062
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf46	179727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	147603808	147604119	147603866	Y	SPINK6,SPINK13	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	157227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	147605275	147606051	147605859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-373N22.3	155295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	148668144	148668260	148668168	Y	AFAP1L1	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	18710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	149110531	149110757	149110649	Y	PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.56598114155978
chr5	149111957	149112473	149112231	Y	AFAP1L1,IL17B,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	4096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	149456060	149456090	149456075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIGD6	77330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB,CDX1	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	150630662	150630980	150630918	Y	NA	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	CCDC69	28956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	151943818	151943842	151943829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	793725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	152822087	152822411	152822258	Y	NA	GRIA1	GRIA1	IMR90	Hi-C	24141950	GRIA1	44764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	HAND1	107503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	154071115	154071211	154071188	Y	NA	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	19251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	156471573	156471840	156471835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	96040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	156724834	156725095	156724964	Y	NA	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	33745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	32852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr5	159586814	159587463	159587155	Y	PWWP2A,FABP6	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	24911	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	159732256	159732561	159732409	Y	NA	RP11-34P1.2,CCNJL	FABP6	IMR90	Hi-C	24141950	CCNJL	37842	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	159904569	159904939	159904751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	57740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	159951614	159951766	159951649	Y	FABP6	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	104785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	164595581	164595748	164595665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P20	858568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	169130299	169130340	169130320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	68048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	127423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170103371	170103426	170103399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRP	84928	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170174489	170174734	170174652	Y	GABRP	GABRP	NA	NA	NA	NA	GABRP	13620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	RANBP17	NA	NA	NA	NA	RANBP17	2674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170552523	170552751	170552637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLX3	181537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLX3	71942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	170878093	170878163	170878150	Y	NA	FGF18	NA	NA	NA	NA	FGF18	33433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	171094849	171095086	171094946	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	FGF18	250189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	171298269	171298393	171298371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	133484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	171505010	171505317	171505162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	73133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr5	171605314	171605550	171605494	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	7840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr5	171606484	171606964	171606720	Y	UBTD2,STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	6426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	171834226	171834319	171834273	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	45208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	172064248	172064489	172064361	Y	NA	NEURL1B,CTB-79E8.3	NA	NA	NA	NA	NEURL1B	1780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	172127299	172127478	172127433	Y	NEURL1B	CTB-79E8.3	NA	NA	NA	NA	CTB-79E8.3	45583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr5	172305876	172306316	172306080	Y	NA	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	46598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	173169995	173170330	173170163	Y	NA	CTB-43E15.3	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-43E15.3	884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	173300199	173300299	173300265	Y	NA	CPEB4	BOD1,CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	12984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	173391031	173391183	173391109	Y	HMP19	C5orf47	NA	NA	NA	NA	C5orf47	7599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	174296434	174296699	174296567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSX2	146898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	175302369	175302773	175302579	Y	DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2	NA	NA	NA	NA	NA	HRH2	219336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	HRH2	264322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44,CDHR2	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	176187940	176187958	176187949	Y	NA	UNC5A	CDHR2,UNC5A,HK3	IMR90	Hi-C	24141950	UNC5A	47520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	176359562	176359884	176359876	Y	RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6	NA	NA	NA	NA	NA	UIMC1	87750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	177041998	177042331	177042024	Y	NSD1	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	16897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	177373047	177373130	177373089	Y	PROP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-889L3.1	107475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	177513304	177513421	177513395	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3,RMND5B	NHP2,RMND5B,HNRNPAB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	N4BP3	25023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	177542150	177542670	177542238	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	3706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr5	177607687	177607881	177607743	Y	NA	NHP2,HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	21627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr5	178003802	178003988	178003851	Y	ZNF454,ZFP2	COL23A1	NA	NA	NA	NA	COL23A1	11568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	COL23A1,CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	178069436	178069827	178069736	Y	NA	CLK4	ZFP2,COL23A1,ZNF879,AACSP1,GRM6	IMR90	Hi-C	24141950	CLK4	13820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	178323440	178323622	178323554	Y	NA	ZNF354B,RNU1-39P,ZFP2,ZNF454	NA	NA	NA	NA	ZFP2	2545	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	178729378	178729778	178729559	Y	NA	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	40653	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	179510185	179510353	179510296	Y	NA	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	13067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	179512852	179513059	179513042	Y	MAML1,LTC4S	RNF130	NA	NA	NA	NA	RNF130	15734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	179770152	179770325	179770205	Y	NA	GFPT2	NA	NA	NA	NA	GFPT2	8062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr5	180541875	180541994	180541989	Y	OR2Y1	NA	BTNL8,MGAT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-338M12.5	74930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	297557	297773	297630	Y	DUSP22	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	7927	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	319799	320052	319899	Y	DUSP22,IRF4	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	30169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	393896	394326	394097	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	IRF4	NA	NA	NA	NA	IRF4	4157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	422827	423098	422962	Y	DUSP22,IRF4	IRF4	NA	NA	NA	NA	IRF4	33088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	541825	541828	541827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	149289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	542839	543066	543064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	148051	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	1388566	1388906	1388736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	219775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2849123	2849376	2849246	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	8883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	2853307	2853467	2853442	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	13067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2875221	2875651	2875270	Y	SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	25863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2877769	2878087	2877933	Y	SERPINB9,NQO2,SERPINB1	SERPINB1,SERPINB9	NA	NA	NA	NA	SERPINB9	23427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2901720	2902211	2901908	Y	NA	SERPINB9	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	206	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2902288	2902696	2902436	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB9	MGC39372,MIR4645,SERPINB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	2919194	2919590	2919380	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9	SERPINB9	SERPINB1,MGC39372,SERPINB9,DKFZP686I15217	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	17680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	2921060	2921305	2921156	Y	NA	SERPINB9,SERPINB6	SERPINB9,SERPINB6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERPINB9	19546	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	3052992	3053074	3053033	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1	MYLK4,WRNIP1,DKFZP686I15217,NQO2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RIPK1	9151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	3177072	3177481	3177192	Y	NA	TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	21312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	3511713	3512018	3511866	Y	NA	NA	PXDC1,SLC22A23	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A23	56457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	343868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	3687	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	7074033	7074425	7074227	Y	LY86,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	31405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr6	7324752	7324983	7324884	Y	RREB1,RREB1	RP11-69L16.5,SSR1	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	12818	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	7591248	7591486	7591394	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	2816	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	7673327	7673604	7673437	Y	NA	NA	MUTED-TXNDC5,BMP6	IMR90	Hi-C	24141950	BMP6	51426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	8182620	8183022	8182908	Y	NA	NA	EEF1E1-MUTED	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1E1	81809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	8283102	8283467	8283280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	150327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	9037386	9037741	9037564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HULC	387016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	9156165	9156451	9156310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HULC	505795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	GCNT2	97330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	10592093	10592386	10592236	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	100542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	11243333	11243432	11243383	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	ERVFRD-1	133368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	11331718	11332104	11332092	Y	NA	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	48477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	11855229	11855371	11855273	Y	TMEM170B,HIVEP1	NA	HIVEP1,ADTRP,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	HIVEP1	151624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	12359398	12359540	12359483	Y	HIVEP1	NA	TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	70802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	65249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	13373745	13373768	13373757	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	46930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	13462093	13462464	13462300	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	23430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	13766479	13766874	13766549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	56683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14121845	14123283	14121874	Y	NA	CD83	NA	NA	NA	NA	CD83	5973	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14277047	14277501	14277394	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	161175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	14283985	14284180	14284073	Y	CD83	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	168113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14312400	14312611	14312511	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	196528	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14596764	14596944	14596823	Y	CD83	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	480892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14638705	14639298	14639002	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	522833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14642464	14642575	14642557	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	526592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14716675	14716945	14716802	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	527582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	14725890	14726226	14726089	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	518301	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14732820	14733791	14733202	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	510736	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	14766593	14766865	14766789	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	477662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14777704	14777964	14777898	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	466563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	14782035	14782178	14782107	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	462349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14826835	14827098	14826967	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	417429	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14910842	14911169	14911097	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	333358	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14921244	14921932	14921499	Y	JARID2	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	322595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14945973	14946248	14946214	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	298279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	14966546	14966931	14966759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	277596	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	14975849	14976030	14975884	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	268497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	14984607	14984854	14984731	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	259673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	15021707	15021883	15021795	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222644	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	15022090	15022421	15022413	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222106	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.03327070075187
chr6	15199575	15199598	15199586	Y	NA	JARID2,JARID2-AS1	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	44929	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	15206545	15206759	15206651	Y	JARID2	JARID2,JARID2-AS1	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	37768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	118745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	15436683	15436898	15436793	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2-AS1	189818	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	15474239	15474654	15474451	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	186635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	15555860	15556076	15555941	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	105213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16181886	16182201	16182062	Y	NA	NA	DTNBP1,MYLIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYLIP	54530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16215873	16216103	16215954	Y	MYLIP	GMPR	GMPR,JARID2,DTNBP1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GMPR	20708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16636472	16636800	16636538	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	122569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16669504	16669854	16669679	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	89515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16684658	16685097	16684682	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	74272	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16724246	16724395	16724344	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	34974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	16771345	16771373	16771363	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATXN1	11623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	17473157	17473283	17473220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	56600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	17496190	17496270	17496230	Y	NA	RPL7P26	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	33613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	17703484	17703614	17703560	Y	KDM1B,FAM8A1,NUP153	NUP153	NA	NA	NA	NA	NUP153	1042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.26990639445673
chr6	18150871	18151234	18151053	Y	NUP153,KDM1B	NHLRC1,TPMT,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	2071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	18153083	18153444	18153238	Y	RNF144B,NHLRC1,KDM1B	NHLRC1,KDM1B	NA	NA	NA	NA	TPMT	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	18263099	18263635	18263391	Y	RNF144B,DEK	DEK	NA	NA	NA	NA	DEK	45	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	18406770	18407159	18406964	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	39991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	18741782	18741870	18741788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	375003	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	19449826	19449949	19449869	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-625H18.2	353034	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	20174199	20174610	20174442	Y	MBOAT1	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	36060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	20404913	20405227	20404970	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	4515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	20418274	20418752	20418425	Y	NA	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	17876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	21383430	21383704	21383606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	208268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	21738487	21738974	21738702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	146515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	21740205	21740397	21740265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	148233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr6	21765300	21765398	21765349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	173328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	21808482	21808727	21808539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	216510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	21997954	21998076	21998022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	405982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	22024666	22024942	22024815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	432694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	22072015	22072158	22072069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	480043	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	22475595	22475903	22475749	Y	NA	NA	SOX4,LINC00340	IMR90	Hi-C	24141950	HDGFL1	91775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	22718056	22718333	22718272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDGFL1	150378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	24799813	24800204	24799968	Y	DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1	GMNN	NA	NA	NA	NA	GMNN	26654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	24926891	24927058	24926968	Y	TDP2	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	47589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	24981053	24981388	24981201	Y	NA	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	6406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	25034556	25034972	25034914	Y	C6orf62	FAM65B	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM65B	5266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	25193718	25194203	25194002	Y	NA	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC16A	83103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	25525007	25525226	25525060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AA	199564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	7.99401817178239
chr6	26006011	26006046	26006038	Y	HIST1H4G,HIST1H2AA,HIST1H2BA,HIST1H1T	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	9994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr6	26219063	26219301	26219164	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AE	3898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	26537641	26538043	26537718	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	1008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	27145729	27146130	27146023	Y	ZNF184	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	30893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	27513313	27513537	27513433	Y	NA	NA	HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF184	74416	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	27640311	27640352	27640335	Y	NA	NA	ZNF391,PRSS16	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H2BL	133357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	27838810	27838848	27838829	Y	NA	HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H4L	441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN12P1,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	28188130	28188520	28188276	Y	ZNF193	ZKSCAN4,NKAPL	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	36491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23,COX11P1	NA	NA	NA	NA	COX11P1	44475	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	13.5207467843727
chr6	28565127	28565440	28565259	Y	NA	SCAND3	SCAND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SCAND3	16549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	28601930	28602271	28602104	Y	NA	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	19941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	93748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	28822567	28822754	28822660	Y	OR2J3,OR14J1,OR2B3	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	17784	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	28956602	28956848	28956725	Y	NA	HCG15,ZNF311	NA	NA	NA	NA	HCG15	4622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	29521167	29521548	29521446	Y	NA	UBD	NA	NA	NA	NA	UBD	4154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	UBD,GABBR1	NA	NA	NA	NA	GABBR1	31112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30247447	30247451	30247450	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	22086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	30604064	30604457	30604261	Y	NA	MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18	NA	NA	NA	NA	PTMAP1	4655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30731781	30732171	30732168	Y	NA	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	21450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	30746716	30747579	30747014	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,DDR1,CDSN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	36385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30774085	30774428	30774395	Y	NA	XXbac-BPG27H4.8	FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	XXbac-BPG27H4.8	39508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30796195	30796565	30796398	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	XXbac-BPG27H4.8,DDR1	IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	XXbac-BPG27H4.8	17371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30910531	30910726	30910623	Y	NA	GTF2H4,VARS2,SFTA2	NA	NA	NA	NA	SFTA2	12579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2,SFTA2	NA	NA	NA	NA	SFTA2	25489	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	31140737	31140986	31140881	Y	NA	CCHCR1,TCF19,POU5F1,HCG27	NA	NA	NA	NA	POU5F1	5522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5,SAPCD1	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8	NA	NA	NA	NA	TNXB	541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8,AGPAT1,RNF5,AGER,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	32913033	32913520	32913400	Y	HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DOA,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2	HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1	HLA-DMB	IMR90	Hi-C	24141950	HLA-DMB	6186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	6949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	33546480	33546561	33546538	Y	LEMD2,B3GALT4,RGL2,TAPBP,PHF1	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	461	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33558672	33558897	33558785	Y	NA	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	LINC00336	218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,LINC00336,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	33781645	33781809	33781745	Y	LEMD2,LEMD2	LEMD2,MLN	IP6K3,LEMD2,LOC100507584,MIR1275,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,MLN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLN	11857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2,MLN	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	MLN	22588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	33818239	33818267	33818253	Y	NA	MLN	GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	MLN	48451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	34060373	34060777	34060697	Y	LEMD2,LEMD2	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	124439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.26990639445673
chr6	34099261	34099385	34099317	Y	GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	85831	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	34110371	34110716	34110594	Y	PACSIN1,GRM4	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP55	74500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	34112239	34112588	34112446	Y	PACSIN1,GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	72628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	34202925	34203288	34202990	Y	NA	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	NA	NA	NA	NA	HMGA1	275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr6	34341997	34342182	34342078	Y	HMGA1	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	16269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35016451	35016706	35016532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS1A	161409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35017720	35018080	35017831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	162110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	35453228	35453566	35453395	Y	NA	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	9287	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35457906	35458213	35458053	Y	TEAD3	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	TEAD3	4640	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	35532430	35532714	35532506	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	10780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	35561770	35562146	35562007	Y	NA	RP3-340B19.2	NA	NA	NA	NA	RP3-340B19.2	40120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36005886	36006030	36005958	Y	NA	SLC26A8,MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	12398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36089275	36089599	36089442	Y	SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,PXT1,KCTD20,BRPF3	MAPK13	NA	NA	NA	NA	MAPK13	3987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36399958	36400295	36400126	Y	NA	KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	8249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36547678	36548077	36547769	Y	PI16,MTCH1	STK38,SRSF3	STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRSF3	12068	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	LAP3P2	10591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LAP3P2	4370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	36802429	36803020	36802653	Y	PI16,CPNE5	C6orf89,PPIL1	NA	NA	NA	NA	C6orf89	34626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37019695	37020025	37019928	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2	NA	CPNE5,C6orf89,FGD2,PIM1,TMEM217,TBC1D22B	IMR90	Hi-C	24141950	MTCH1	67621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	37094186	37094408	37094276	Y	PPIL1	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	41571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	37104071	37104158	37104105	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	31821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr6	37109258	37109689	37109648	Y	PI16	PIM1	PIM1,C6orf89,FGD2,PPIL1,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,TMEM217	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	26290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37529793	37530180	37530041	Y	NA	NA	CCDC167,TBC1D22B,RNF8,FTSJD2,MIR4462,MDGA1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC167	64095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37751286	37751497	37751341	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	33778	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	37752102	37752667	37752552	Y	MDGA1	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	32608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	38185251	38185625	38185371	Y	BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	399976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	39249172	39249431	39249304	Y	KCNK5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	53946	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	39317410	39317439	39317426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK5	122184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	40965087	40965613	40965406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	41244772	41245078	41245061	Y	NA	TREM1	NA	NA	NA	NA	TREM1	7379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	14248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	41546441	41546593	41546496	Y	FRS3	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	32082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	41612844	41613289	41612975	Y	NA	MDFI	NA	NA	NA	NA	MDFI	10224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	41907242	41907431	41907365	Y	TAF8,TFEB,CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	41996341	41996754	41996467	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	19341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42283170	42283354	42283262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	99567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42390239	42390257	42390249	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	27532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42678244	42678442	42678368	Y	PRPH2	ATP6V0CP3,TBCC	NA	NA	NA	NA	ATP6V0CP3	14530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	42898508	42898648	42898552	Y	NA	C6orf226,CNPY3,RPL24P4,PEX6	NA	NA	NA	NA	CNPY3	3570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	42944777	42944970	42944923	Y	NA	CNPY3,RPL24P4,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36	NA	NA	NA	NA	PEX6	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	42982951	42983183	42983012	Y	NA	PEX6,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2	NA	NA	NA	NA	KLHDC3	3000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	43058034	43058580	43058415	Y	NA	CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	16028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	CRIP3,ZNF318	NA	NA	NA	NA	CRIP3	21064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	43351423	43351855	43351784	Y	NA	ZNF318,ABCC10	TJAP1,TTBK1,DLK2,POLH,SLC22A7,ABCC10,C6orf108,CUL9,YIPF3,LRRC73,POLR1C,CRIP3,ZNF318,XPO5	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF318	16207	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	43505816	43505905	43505861	Y	ABCC10,TJAP1	POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH	NA	NA	NA	NA	YIPF3	23088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	43635973	43636240	43636108	Y	NA	GTPBP2,MAD2L1BP,RSPH9,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	MRPS18A	17288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	43767552	43768173	43767868	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	31631	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	42884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	44011469	44011879	44011690	Y	NA	C6orf223	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	45152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	44043583	44043857	44043624	Y	SLC35B2	TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63B	48794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44185571	44185900	44185742	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	329	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44186277	44186510	44186378	Y	SLC29A1	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	1035	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44396303	44396427	44396307	Y	NA	CDC5L	NA	NA	NA	NA	CDC5L	43041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44618318	44618334	44618326	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	265056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	44628436	44628745	44628591	Y	NA	NA	CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	275174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44634916	44635472	44635214	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	281654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	44924205	44924374	44924290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	419316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	45301191	45301441	45301316	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	42249	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	47074438	47074572	47074520	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	66339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	47105709	47106057	47105986	Y	PLA2G7,PLA2G7	NA	TNFRSF21	IMR90	Hi-C	24141950	GPR110	97610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	100665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	49138743	49138828	49138786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	290076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	50643793	50644039	50643916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	179336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	50818020	50818494	50818241	Y	NA	RPS17P5	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	4881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	RP3-437C15.1	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	1925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	52255288	52255470	52255373	Y	NA	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	27636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	52382425	52382779	52382512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	56934	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	52463140	52463494	52463299	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	23427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53036859	53037076	53036958	Y	NA	GCM1,RNU1-136P	GCLC,KLHL31	IMR90	Hi-C	24141950	GCM1	25232	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53175462	53175877	53175681	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	36070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53195071	53195341	53195324	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	16606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	54604535	54604549	54604543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	105020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	56315031	56315399	56315215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL21A1	58139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	273867	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	56578288	56578394	56578341	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	239379	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	56779787	56780031	56779873	Y	NA	BEND6	BAG2,ZNF451,BEND6,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	37742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BEND6	5740	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57046105	57046302	57046204	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	10981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57122777	57122910	57122847	Y	BAG2,RAB23,RAB23	RAB23	RAB23,ZNF451,BAG2,PRIM2,KIAA1586,BEND6	IMR90	Hi-C	24141950	RAB23	37699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57288314	57288720	57288442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	110711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57381063	57381299	57381127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	203460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	57396616	57396964	57396757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	219013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	69390302	69390390	69390344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	1114613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	69896068	69896326	69896076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	608677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL9A1	201795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	71798002	71798222	71798082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	198284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	72178822	72179167	72178995	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30C2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	50350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	72683550	72683736	72683643	Y	RIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19P1	391126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDC1L	65595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74194767	74195136	74194952	Y	NA	MB21D1,MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5	NA	NA	NA	NA	MTO1	25466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-505P4.5	55167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74290752	74291151	74290952	Y	CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-505P4.5	56150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-505P4.5	60647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74295823	74296227	74295840	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-505P4.5	61221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	75341134	75341498	75341316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL12A1	572269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	75977936	75978331	75978062	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	14353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	79597447	79597572	79597510	Y	NA	IRAK1BP1	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	22258	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	79758680	79758772	79758726	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	27181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	79862008	79862376	79862212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	76055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	80838245	80838506	80838365	Y	NA	BCKDHB	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	23881	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	81197510	81197656	81197595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	383146	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	81348599	81348680	81348638	Y	NA	NA	BCKDHB	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	534235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	81848833	81849226	81849030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	611265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	82631547	82631830	82631690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	171056	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	84917634	84917758	84917696	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	17595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	85334002	85334301	85334152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	398649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	85705228	85705597	85705413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NT5E	452212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	86074188	86074341	86074265	Y	NA	NA	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	83468	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	88414970	88415193	88415174	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	5043	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	89090505	89090612	89090559	Y	CNR1	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	105797	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	89577904	89578284	89578094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	93064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	90527291	90527624	90527395	Y	NA	CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	MDN1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	90619987	90620233	90620110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	82374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	90774597	90775020	90774993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	229607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	90778063	90778292	90778178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	226335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	91121051	91121489	91121257	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,MIR4464	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	116424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	93036003	93036032	93036018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-127B16.1	395515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	94545083	94545465	94545274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	417818	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	95244699	95244909	95244803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	778510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	97925618	97925934	97925776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	196525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	98336263	98336652	98336458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	607170	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	98489059	98489205	98489133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	759966	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	100008682	100008928	100008805	Y	NA	USP45,CCNC,PRDM13	NA	NA	NA	NA	CCNC	5921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	100657588	100657811	100657700	Y	NA	NA	ASCC3,SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	318341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	105214871	105215235	105215053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	90559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	105388915	105389637	105389155	Y	HACE1	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	13286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	105401566	105401766	105401705	Y	LIN28B	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	1157	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	105402548	105402641	105402597	Y	NA	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	282	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	105443315	105443377	105443346	Y	HACE1,LIN28B	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	40392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	106416219	106416368	106416315	Y	PRDM1	NA	PRDM1	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	115827	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	107150270	107150783	107150511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRSL1	74817	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	108133649	108133998	108133824	Y	PDSS2	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	143395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63	107484	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	108440032	108440340	108440122	Y	NA	OSTM1	LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	44718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	109100819	109101213	109100913	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC2	66406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	109102631	109102946	109102736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC2	64673	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	110018501	110018834	110018668	Y	NA	FIG4	NA	NA	NA	NA	FIG4	8002	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	110502951	110503352	110503102	Y	FIG4,CDC40	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	CDC40	3607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	111551650	111551849	111551726	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	26702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	111727743	111727975	111727836	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	74739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	111925507	111925888	111925538	Y	REV3L,TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	26	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	114131008	114131408	114131371	Y	NA	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	45133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	114662111	114662444	114662262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	114664746	114665107	114665068	Y	NA	HS3ST5	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	2537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	115064151	115064163	115064157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	401942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	115163170	115163515	115163320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	500961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	116469368	116469398	116469382	Y	NA	NT5DC1	NA	NA	NA	NA	NT5DC1	49356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	116745242	116745485	116745336	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	35048	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	118008335	118008695	118008355	Y	NA	NUS1	NA	NA	NA	NA	NUS1	13670	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	119131601	119131904	119131835	Y	C6orf204,MCM9,C6orf204	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	81480	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr6	122990249	122990620	122990435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	117695	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	123154348	123154672	123154568	Y	SERINC1,CLVS2,FABP7	SMPDL3A	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	46033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	123160043	123160346	123160190	Y	CLVS2,FABP7	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	51728	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	124126884	124127258	124127027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	1018569	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	125952344	125952361	125952353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY2	114449	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	126108316	126108682	126108499	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	8009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	126197747	126198095	126197755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HINT3	77832	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	127653585	127653894	127653740	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	8860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	128747260	128747445	128747404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	92425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	128847994	128848227	128848111	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	8124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	LAMA2	NA	NA	NA	NA	LAMA2	48235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	130513480	130513753	130513616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	171126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	131350914	131351060	131350987	Y	AKAP7	EPB41L2	NA	NA	NA	NA	EPB41L2	31402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	131480053	131480064	131480059	Y	NA	AKAP7	NA	NA	NA	NA	AKAP7	25247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	131594186	131594488	131594335	Y	AKAP7,MED23,AKAP7	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	139380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	131644422	131644782	131644602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP7	189616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	133839183	133839299	133839241	Y	EYA4	NA	NA	NA	NA	NA	EYA4	279447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	134395597	134395721	134395640	Y	NA	SLC2A12	TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A12	23823	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	134622486	134622615	134622584	Y	SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	14635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	134761528	134761869	134761739	Y	SGK1,SGK1	NA	NA	NA	NA	NA	SGK1	124278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	135346100	135346282	135346249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	75912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	136788990	136789214	136789102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	80743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	137109342	137109643	137109396	Y	IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5	MAP3K5,PEX7	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	2013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	137310723	137310892	137310775	Y	IL20RA,SLC35D3	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	169006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	138022263	138022940	138022489	Y	IFNGR1,OLIG3,TNFAIP3	NA	TNFAIP3,IFNGR1,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	163411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	138184436	138184726	138184672	Y	TNFAIP3	TNFAIP3	NA	NA	NA	NA	TNFAIP3	1625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	138786189	138786282	138786236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	63521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	138914342	138914559	138914540	Y	NA	NA	HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906	IMR90	Hi-C	24141950	NHSL1	97149	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr6	139899473	139899647	139899531	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	205716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	140029935	140030328	140030123	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	336178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	140161065	140161313	140161148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	467308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	140392756	140393018	140392887	Y	NA	NA	CITED2	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	698999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	151328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	144015519	144015660	144015590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	146821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr6	144064569	144064840	144064663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	97641	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	144067695	144068059	144067958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	94422	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	144279957	144280354	144280096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	103381	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	148424761	148425105	148424843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	166335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	148823673	148823949	148823781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	149368124	149368336	149368236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	169441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	149657882	149658028	149657899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	120105	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	149778914	149779207	149779154	Y	TAB2,ZC3H12D	NA	NA	NA	NA	NA	PPIL4	85967	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP2,ULBP1,RAET1K	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	150739160	150739823	150739483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-7P	93261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	153919839	153920046	153919943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475C16.1	317971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	154664890	154665258	154665161	Y	IPCEF1	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	164535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	155509471	155509833	155509659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	66025	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	155593046	155593119	155593050	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	17188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	156600917	156600980	156600950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	496083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	158398935	158399083	158399028	Y	NA	SYNJ2	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	1805	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	158670119	158670409	158670245	Y	NA	NA	TULP4,TMEM181	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	82735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	158808734	158809093	158808911	Y	TMEM181	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	146375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159268112	159268313	159268204	Y	NA	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	20658	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr6	159284894	159285253	159285074	Y	NA	EZR,C6orf99	OSTCP1	K562	ChIA-PET	22265404	C6orf99	3718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159315379	159315577	159315478	Y	NA	C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	26408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159360638	159360649	159360643	Y	TAGAP	NA	EZR	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	58570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159416474	159416597	159416565	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	2622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	159434370	159434675	159434475	Y	TAGAP	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	15151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	160427336	160427466	160427400	Y	NA	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	39205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161571430	161571737	161571637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	121356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161620136	161620467	161620302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	72626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161659544	161659874	161659709	Y	AGPAT4	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	33219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161693137	161693518	161693484	Y	NA	AGPAT4	MAP3K4	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT4	44	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161791976	161792215	161792098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	98883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	161794970	161795177	161795007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	101877	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	48834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	163972161	163972427	163972234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	139129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	165837337	165837347	165837342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	560744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	166912856	166913088	166912972	Y	PRR18,SFT2D1	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	158777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	167001220	167001407	167001338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	247141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	167372859	167373027	167372950	Y	GPR31,RNASET2	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	RNASET2	4180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	167468441	167468774	167468681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCR6	54521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	167576774	167577183	167576967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCR6	53479	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	167837583	167837890	167837668	Y	FGFR1OP,UNC93A,MLLT4	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	UNC93A	154926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	167854632	167854836	167854718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC93A	171975	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr6	169278156	169278506	169278379	Y	NA	NA	WDR27,LINC00574	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	373633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	342873	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr6	169495883	169496177	169495989	Y	NA	NA	PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	155962	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	NA	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	THBS2	83634	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr6	170773633	170773746	170773666	Y	NA	NA	C6orf70,FAM120B,TCTE3,LINC00574,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB1	86683	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	525455	525590	525542	Y	GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	32343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	555332	555565	555456	Y	GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	2368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1037816	1038118	1037953	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	24581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1066965	1067028	1066969	Y	NA	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	15184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1125303	1125884	1125584	Y	GPER,GPER	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	43091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1139272	1139516	1139401	Y	SUN1,TMEM184A	C7orf50	NA	NA	NA	NA	C7orf50	36380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1198505	1198792	1198744	Y	NA	C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1270215	1270604	1270440	Y	UNCX	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND2A	71820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	1616013	1616182	1616098	Y	ELFN1	MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	TFAMP1	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	7372	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	325159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2063741	2064015	2063879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	206863	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2154470	2154643	2154557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	116235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2306623	2306831	2306646	Y	MAD1L1	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	26766	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.72411177732566
chr7	2351826	2352447	2352374	Y	SNX8	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	39274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	2551232	2551336	2551252	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	1069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	2561604	2562123	2561810	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	11441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2569854	2570215	2570046	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	2647516	2647699	2647608	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	21886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2800822	2801226	2800961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	72029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2812534	2812892	2812775	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	60363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	2960647	2961036	2960906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	78689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	3018099	3018595	3018309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD11	62984	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	3885202	3885340	3885271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	546122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	3955874	3956076	3956015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	616794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	4746884	4747018	4746986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	65496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	5490349	5490801	5490564	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	27304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr7	5634980	5635411	5634989	Y	AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FSCN1	4541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	5638553	5639025	5638653	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	8114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	5731889	5732558	5731976	Y	CCZ1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	86812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	6467944	6468137	6468104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLB	53684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	7139165	7139472	7139292	Y	NA	NA	C1GALT1,LOC100131257	K562	ChIA-PET	22265404	C1GALT1	55093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	7199160	7199187	7199178	Y	NA	C1GALT1	COL28A1	IMR90	Hi-C	24141950	C1GALT1	4595	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	7249464	7249811	7249639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	54899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	7268746	7268912	7268835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1	74181	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	8168743	8169144	8168949	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	130719	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	8175214	8175426	8175339	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	124437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	8550473	8550803	8550530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	250156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	9561904	9562245	9562075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8P8	926693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	11606918	11607025	11606951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	595419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	328060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	13758700	13759051	13758876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	269999	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	139100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	14042792	14042945	14042854	Y	NA	ETV1	NA	NA	NA	NA	ETV1	13742	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr7	16095120	16095542	16095311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISPD	363405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	17082630	17082968	17082726	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	253278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	17722333	17722641	17722455	Y	AHR	NA	HDAC9	IMR90	Hi-C	24141950	AC019117.2	224037	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	18575593	18575869	18575740	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	451021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	18583507	18583829	18583636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC9	458935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	19146147	19146774	19146493	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	8521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	20059372	20059444	20059408	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	19026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	20070639	20070953	20070726	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	30293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	20160280	20160875	20160444	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	17201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	AC005062.2	NA	NA	NA	NA	AC005062.2	13968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8,LINC01162	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chr7	20993749	20993911	20993806	Y	SP8	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	120699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr7	21120779	21120894	21120878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01162	247729	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	22742818	22742960	22742910	Y	NA	IL6,AC073072.5	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	22742975	22743282	22743130	Y	NA	IL6,AC073072.5	FAM126A,LOC100506178	IMR90	Hi-C	24141950	IL6	20221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	23061903	23062212	23061975	Y	IL6	FAM126A	LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM126A	10154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	23375804	23376081	23376055	Y	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	102218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr7	24438416	24438737	24438577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP6	172150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	24861129	24861331	24861204	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	26193570	26193972	26193862	Y	SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	3710	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	27876967	27877264	27877116	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	98953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	28094781	28094986	28094893	Y	HIBADH	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	122955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	28175314	28175565	28175485	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	42376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	28548927	28549168	28548984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	211987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	28666375	28666568	28666485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIL	329366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	28733136	28733327	28733267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIL	262607	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	29294942	29295238	29295004	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	61875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	29304486	29305146	29304785	Y	CHN2	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	71419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	29951912	29952143	29952027	Y	ZNRF2,C7orf41	NA	NA	NA	NA	NA	SCRN1	75762	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	30265497	30265992	30265714	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	55931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	30956234	30956541	30956398	Y	NA	GHRHR	NA	NA	NA	NA	GHRHR	19743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.13196228311956
chr7	32546004	32546038	32546035	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	12966	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	32551548	32551619	32551584	Y	NA	LSM5,AVL9	NA	NA	NA	NA	AVL9	18510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	33766388	33766503	33766462	Y	NA	NA	BMPER,BBS9	IMR90	Hi-C	24141950	BMPER	176020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	34529792	34529930	34529861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPSR1	165921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	215061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	35629037	35629048	35629043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	104133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	35768741	35769300	35769082	Y	HERPUD2	HERPUD2	SEPT7	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD2	35560	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	36776109	36776821	36776493	Y	ELMO1,AOAH	NA	ELMO1	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	79743	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	37429930	37430114	37430020	Y	GPR141	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	56738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	37706109	37706403	37706265	Y	GPR141	GPR141,EPDR1	NA	NA	NA	NA	GPR141	14996	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	37726522	37726811	37726756	Y	GPR141,STARD3NL,ELMO1,ELMO1,ELMO1	GPR141,EPDR1	NA	NA	NA	NA	EPDR1	5076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	38664238	38664553	38664451	Y	POU6F2	AMPH	NA	NA	NA	NA	AMPH	4614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	38695355	38695603	38695479	Y	NA	AMPH	AMPH	IMR90	Hi-C	24141950	AMPH	26188	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	38750267	38750277	38750273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMPH	81100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	39454182	39454306	39454268	Y	POU6F2	NA	NA	NA	NA	NA	YAE1D1	149669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	40580986	40581112	40581049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	593350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	40706026	40706047	40706035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	718390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr7	40952368	40952631	40952468	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	CDK13	964732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	41406895	41407296	41407096	Y	NA	NA	C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	GLI3	868173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	42026442	42026777	42026611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	248692	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	42145452	42145673	42145563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	129796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	42533163	42533415	42533331	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	GLI3	257694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	32566	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	44127636	44127736	44127679	Y	YKT6,AEBP1	DBNL,PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2	PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B	IMR90	Hi-C	24141950	POLM	7497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	NPC1L1,DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	44654798	44655022	44654925	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	10627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	44658456	44658730	44658526	Y	PURB,TMED4,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	14285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	44679392	44679514	44679453	Y	ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	35221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	MYO1G,SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	MYO1G	2527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	45040907	45041213	45041027	Y	DDX56,OGDH,MYO1G,CCM2	MYO1G,SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	CCM2	3833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	45633722	45633912	45633893	Y	ADCY1	ADCY1	NA	NA	NA	NA	ADCY1	21983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	45718311	45718329	45718320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT7P2	88288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	46920965	46921354	46921105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	698802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	47533820	47533921	47533853	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	86235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47573930	47574208	47574136	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	45948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47604317	47604552	47604435	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	15604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47610205	47610436	47610283	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	9720	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	7283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	48031393	48031616	48031481	Y	HUS1	HUS1,SUN3,C7orf57	HUS1	K562	ChIA-PET	22265404	HUS1	14215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	48126389	48126700	48126545	Y	NA	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	164	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	48127053	48127182	48127123	Y	HUS1,UPP1,UPP1	UPP1	NA	NA	NA	NA	UPP1	828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	49177785	49177982	49177884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCA13	968730	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	50189067	50189392	50189241	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	326696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	50306514	50306844	50306594	Y	IKZF1,FIGNL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	209244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	50426559	50426564	50426562	Y	IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	89524	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	50461623	50461903	50461710	Y	FIGNL1,IKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	54185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	50769181	50769534	50769358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	50948563	50948792	50948678	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	89404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	51292328	51292397	51292330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBL	90118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	51382954	51383359	51383079	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	439	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	51395107	51395355	51395171	Y	NA	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	12592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	53466177	53466481	53466431	Y	NA	RNU1-14P	NA	NA	NA	NA	RNU1-14P	34426	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	54731630	54731797	54731714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-745C15.2	93321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	55576915	55577332	55577184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	61349	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	55600779	55601841	55601199	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	36840	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	55638699	55638887	55638779	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	18	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	55641818	55642122	55641930	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	3137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2,NUPR1L	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	56606357	56606502	56606382	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	NUPR1L	424264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	ZNF716	NA	NA	NA	NA	ZNF716	35912	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	57577552	57577783	57577653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	69669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	198551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.17121481208904
chr7	64196878	64197130	64197096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF138	55636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	65761130	65761447	65761274	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	92944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	65790150	65790379	65790243	Y	RABGEF1,KCTD7,TPST1	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	121964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	66159622	66159870	66159746	Y	NA	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	14471	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	68132850	68133026	68132938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	928879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	70358448	70358664	70358566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	236491	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	70359236	70359526	70359309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	235629	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	70931578	70931697	70931638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	336423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	70953472	70953588	70953527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR17	358317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	73037168	73037552	73037436	Y	MLXIPL	TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	MLXIPL	25140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	73156040	73156347	73156148	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	4843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	73785571	73785673	73785623	Y	CLIP2	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	80447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	73915723	73915843	73915806	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	49603	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	73983073	73983199	73983128	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	86795	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	74001829	74001994	74001904	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	68000	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	74020929	74021149	74021053	Y	NA	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	48845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	75522158	75522529	75522343	Y	RHBDD2	POR	NA	NA	NA	NA	POR	3989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	75563701	75564093	75563872	Y	POR	POR	NA	NA	NA	NA	POR	37183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	75793189	75793404	75793365	Y	NA	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	117820	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	75833146	75833486	75833315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB1	96375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	75993825	75994303	75994024	Y	NA	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	YWHAG	MCF7	ChIA-PET	22265404	YWHAG	7477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	77029125	77029387	77029219	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	135205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	77039475	77039927	77039691	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	124665	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	77086113	77086340	77086227	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	NA	PTPN12,PION,PHTF2,CCDC146	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN12	78252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	77201219	77201434	77201295	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	36627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	838141	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	79803492	79803786	79803598	Y	NA	GNAI1	NA	NA	NA	NA	GNAI1	42221	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	81553797	81553880	81553856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	517234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	81655164	81655347	81655329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	415767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	83081582	83081807	83081725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3E	194519	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	83089748	83090034	83089772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3E	186292	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	84165433	84165798	84165584	Y	NA	SEMA3A	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	45393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	86637666	86638039	86637853	Y	NA	KIAA1324L	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	48976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	90033847	90034185	90034017	Y	STEAP2	CLDN12	NA	NA	NA	NA	CLDN12	22812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	90331258	90331430	90331344	Y	NA	NA	CDK14,STEAP1	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002456.2	106591	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	92290698	92291011	92290856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	72990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	CALCR	NA	NA	NA	NA	CALCR	29233	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI2	91903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	94557636	94557931	94557784	Y	PPP1R9A	PPP1R9A	NA	NA	NA	NA	PPP1R9A	23122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	94799053	94799326	94799190	Y	PPP1R9A,PPP1R9A	AC002429.5	NA	NA	NA	NA	AC002429.5	42318	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	96482190	96482573	96482196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	144987	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	98099989	98100186	98100071	Y	TMEM130	NA	TMEM130	IMR90	Hi-C	24141950	BAIAP2L1	71609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr7	98724585	98724789	98724635	Y	ZNF394,SMURF1	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	14934	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	98970307	98970479	98970399	Y	PTCD1,CPSF4	ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	99094567	99094648	99094634	Y	NA	PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5	NA	NA	NA	NA	ZNF394	1299	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	99178135	99178365	99178354	Y	ZNF789	ZNF655,FAM200A	NA	NA	NA	NA	FAM200A	23976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100140069	100140501	100140294	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	5235	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100144113	100144628	100144364	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,LRCH4,PCOLCE,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	LRCH4	13587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	100752309	100752636	100752570	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	15734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	100809834	100810470	100810178	Y	NA	SERPINE1,AP1S1,VGF,MOGAT3,ZNHIT1,PLOD3	NA	NA	NA	NA	VGF	2960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	100937395	100937799	100937579	Y	NA	FIS1,RP11-132A1.3,RABL5	NA	NA	NA	NA	RP11-132A1.3	3095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RP11-132A1.3,RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	101062164	101062286	101062177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	99060	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chr7	101377148	101377442	101377338	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	79517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	101384323	101384583	101384424	Y	NA	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	72376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	101609189	101609564	101609377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	152230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.52672861259029
chr7	101930729	101931104	101930861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	71215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	102464517	102464880	102464701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185A	77099	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	104844953	104845066	104844998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	192689	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	104884738	104885065	104884890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	152690	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	EFCAB10	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	16028	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	105329677	105330033	105329813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	90355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr7	105416484	105416867	105416678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	98183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	105766301	105766504	105766403	Y	NA	SYPL1	CDHR3,ATXN7L1,SYPL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	15279	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	106206962	106207238	106207108	Y	NA	NA	CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC71L	92204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	108043445	108043540	108043488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	51621	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	111971895	111972278	111972086	Y	NA	RN7SKP187	NA	NA	NA	NA	RN7SKP187	45217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	114018736	114018896	114018817	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	541313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	114301114	114301124	114301119	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	259085	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	114677768	114677789	114677777	Y	MDFIC	NA	NA	NA	NA	NA	MDFIC	117559	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	115873924	115874179	115873941	Y	TES	TES	NA	NA	NA	NA	TES	25377	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	116202174	116202561	116202326	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	39335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	116595969	116596160	116596016	Y	NA	ST7,ST7-AS1	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	3581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	120056829	120057182	120057001	Y	KCND2	NA	NA	NA	NA	NA	KCND2	145107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	120723269	120723399	120723324	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	134466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	121120093	121120403	121120217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	85675	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	121783025	121783385	121783205	Y	PTPRZ1,AASS	AASS	NA	NA	NA	NA	AASS	691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	126806014	126806101	126806058	Y	GRM8	NA	NA	NA	NA	NA	GRM8	85247	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC4	137256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.07252322972136
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	FAM71F1,CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	128958632	128958719	128958676	Y	NA	NA	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	89492	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-305M3.2	33486	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129418602	129418801	129418733	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.62542019495798
chr7	129420694	129421120	129420768	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	169669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129465628	129465864	129465722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	124925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129469996	129470292	129470140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	120497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	129508183	129508482	129508331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	82307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	129598516	129598781	129598654	Y	NRF1,UBE2H,UBE2H	UBE2H	UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UBE2H	7727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130552122	130552429	130552276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPG2	200524	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	216343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	NA	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	196939	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	NA	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MKLN1	190892	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	158985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	130735932	130736596	130736429	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	56259	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	131289586	131289917	131289766	Y	PODXL	PODXL	PODXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PODXL	48610	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	131581821	131581890	131581855	Y	NA	AC009518.4	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009518.4	1421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	131806652	131806768	131806697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009518.4	226252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	131872857	131873222	131873095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC009518.4	292457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	132362237	132362256	132362247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	402592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	132441115	132441141	132441128	Y	NA	NA	FLJ40288	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD3	323707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	132505379	132505401	132505390	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	259447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	94774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	48086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	134862087	134862457	134862329	Y	NA	C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	8540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	134994024	134994387	134994210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR91	99708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	SLC13A4	NA	NA	NA	NA	SLC13A4	18579	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	SLC13A4	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC13A4	31434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	135734772	135735380	135735066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	74671	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	135809318	135809401	135809360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPN	149217	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	136582219	136582518	136582369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	444093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	137673807	137674359	137674139	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	10454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	138250447	138250496	138250473	Y	AKR1D1,TRIM24	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	107368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	138858843	138859133	138858995	Y	SVOPL	TTC26	NA	NA	NA	NA	TTC26	42353	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	CLEC2L,ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	139498127	139498170	139498155	Y	TBXAS1	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	22550	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	140188165	140188433	140188299	Y	NA	MKRN1	NA	NA	NA	NA	MKRN1	10796	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	140262789	140263047	140262916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	85420	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	140267387	140267618	140267517	Y	DENND2A	NA	NA	NA	NA	NA	MKRN1	90018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	140497709	140498045	140497887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	109132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	141501394	141501805	141501703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	65273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	141574657	141574825	141574769	Y	TAS2R38,CLEC5A	NA	MGAM	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP1	138536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	144539832	144539937	144539881	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPK1	8344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	145492630	145492774	145492702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	318679	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	145860816	145861156	145860986	Y	CNTNAP2	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	49363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	145932628	145933064	145932806	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	145933200	145933594	145933373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	121747	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr7	145934224	145934573	145934546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	122771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	145940282	145940834	145940467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	128829	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	146573041	146573429	146573238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	761588	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	148093179	148093348	148093211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	182145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	148334506	148334940	148334775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL1	58066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	149191913	149192296	149192075	Y	SSPO,ZNF746	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	150075425	150075527	150075503	Y	NA	RARRES2,REPIN1,ZNF775,RP4-584D14.5,RP4-584D14.6	NA	NA	NA	NA	RP4-584D14.6	3446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	150327635	150327757	150327712	Y	GIMAP8,NOS3,GIMAP6	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-584D14.6	248662	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	150691752	150691942	150691795	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542	KCNH2,NOS3,ATG9B,ABCB8	NA	NA	NA	NA	NOS3	5669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	150896725	150896924	150896825	Y	NA	GBX1,ABCF2,CHPF2	NA	NA	NA	NA	ABCF2	25392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151284346	151284467	151284405	Y	SMARCD3,SMARCD3,WDR86	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	69140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151440004	151440519	151440140	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	CRYGN,RHEB	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAG2-AS1	131608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151453235	151453789	151453377	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	118338	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	151541110	151541904	151541747	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	PRKAG2-AS1,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	30223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	25886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr7	152111667	152111916	152111792	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	20064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	8705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	87147	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr7	152235560	152235891	152235729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	103580	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	153876218	153876403	153876311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	916391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	154036651	154036737	154036694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	756057	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	154420857	154421050	154420896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	371744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	155105447	155105513	155105480	Y	NA	INSIG1	NA	NA	NA	NA	INSIG1	17961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	155247602	155247748	155247675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	160116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	155744375	155744769	155744531	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHH	141408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157103071	157103446	157103266	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	22629	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr7	157131379	157131690	157131421	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	5304	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157255834	157256209	157256022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	129759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157378993	157379067	157379007	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	252918	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157629246	157629505	157629365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	503171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157840945	157841296	157841083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	654224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	157956905	157957265	157957085	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	538255	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	158110398	158110735	158110581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	384785	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr7	158357376	158357683	158357548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	137837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	158493510	158493807	158493659	Y	NCAPG2	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	1713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	479972	480137	480087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO25	125544	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	786605	786748	786705	Y	FBXO25	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	100499	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	841612	841879	841708	Y	C8orf42	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	155506	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr8	842852	842925	842889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	156746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	1736486	1736690	1736554	Y	NA	CLN8,CTD-2336O2.1,ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	CTD-2336O2.1	25818	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	1765271	1765682	1765322	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	4460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.77644848261831
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr8	1836847	1837132	1836956	Y	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	66705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	3004715	3004983	3004847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	1234573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	3643658	3643668	3643663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	999186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	4848301	4848393	4848346	Y	CSMD1	NA	NA	NA	NA	NA	PAICSP4	205447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	6405382	6405492	6405403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCPH1	143269	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	6455509	6456036	6456003	Y	ANGPT2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	107694	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	6490542	6490767	6490601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	72963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG1L13P	53408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	8241572	8241733	8241653	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	275	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	8247461	8247709	8247494	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	5453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr8	8267771	8268089	8267930	Y	NA	SGK223,CTA-398F10.2	SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	25763	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	8742026	8742246	8742225	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	6909	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	8951012	8951396	8951204	Y	NA	RP11-10A14.3	ERI1,TNKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-10A14.3	45538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	8991645	8992043	8991844	Y	NA	RP11-10A14.3,PPP1R3B,RP11-10A14.4	NA	NA	NA	NA	RP11-10A14.3	4891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	8992774	8993100	8992937	Y	NA	RP11-10A14.3,PPP1R3B,RP11-10A14.4	NA	NA	NA	NA	RP11-10A14.3	3834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	9040807	9041224	9041065	Y	NA	RP11-10A14.3,PPP1R3B,RP11-10A14.4,RP11-10A14.5	NA	NA	NA	NA	RP11-10A14.5	3297	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.41495285389945
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	9764051	9764441	9764391	Y	MSRA	LINC00599	NA	NA	NA	NA	LINC00599	3175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	9912937	9913246	9913138	Y	NA	MSRA	NA	NA	NA	NA	MSRA	3159	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	9978890	9979101	9978960	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	69112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	10659261	10659473	10659367	Y	NA	SOX7,PINX1	NA	NA	NA	NA	SOX7	35884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	10770133	10770731	10770512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	74739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	10860741	10861140	10860750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	165347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	10873844	10874251	10874241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	178450	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	11735335	11735756	11735393	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	10378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	15443006	15443379	15443076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	170282	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	19058200	19058838	19058472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	110290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	33495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	20345349	20345374	20345363	Y	NA	NA	LOC286114,GFRA2	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	185875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	20365880	20366059	20365989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LZTS1	206406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2,FGF17	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	21999982	22000221	22000101	Y	POLR3D	NUDT18,HR,REEP4,BMP1	NA	NA	NA	NA	REEP4	2518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	22439546	22439823	22439672	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	5754	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	22441359	22441704	22441532	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	PDLIM2	7567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.76336430629515
chr8	23075543	23075864	23075687	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	TNFRSF10A,CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF10A	4775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	23308133	23308499	23308237	Y	TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	LOXL2,ENTPD4	NA	NA	NA	NA	ENTPD4	4709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	23353842	23353942	23353892	Y	TNFRSF10C,SLC25A37	ENTPD4,SLC25A37	NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A37	30376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	23385278	23385670	23385399	Y	SLC25A37	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	960	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	24624446	24624496	24624472	Y	NEFM,NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	NEFM	144029	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EBF2	108016	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	26162518	26162881	26162571	Y	NA	PPP2R2A	NA	NA	NA	NA	PPP2R2A	15511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	27119314	27119699	27119379	Y	NA	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	TRIM35	47137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	27219743	27220043	27219778	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	52744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	27221120	27221544	27221428	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	54121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	27387404	27387600	27387502	Y	PTK2B,PTK2B,EPHX2	EPHX2	NA	NA	NA	NA	EPHX2	41108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	27730121	27730534	27730322	Y	ELP3,PBK	PBK	NA	NA	NA	NA	PBK	36509	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	27794107	27794493	27794301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBK	100495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chr8	28352811	28353080	28352947	Y	HMBOX1,HMBOX1,FZD3	FBXO16,FZD3	NA	NA	NA	NA	FZD3	3082	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	28562756	28562912	28562834	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	5775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	12839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr8	28890628	28890717	28890674	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	20735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	29026095	29026361	29026229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13B	92280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	29316675	29316889	29316765	Y	KIF13B,DUSP4	NA	C8orf75	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	110490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	29412862	29413263	29412985	Y	DUSP4,DUSP4	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	206677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	29705863	29706038	29705974	Y	MBOAT4	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM66	232685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	29938783	29938843	29938811	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	TMEM66	60	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	40702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	30358644	30358942	30358767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBPMS	118700	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	30462940	30463157	30463081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	50611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	30506010	30506203	30506101	Y	NA	GTF2E2	NA	NA	NA	NA	GTF2E2	7565	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	30666266	30666462	30666364	Y	NA	PPP2CB	NA	NA	NA	NA	PPP2CB	3368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.38168215314757
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	30907025	30907279	30907152	Y	LOC100507341,TEX15,PURG	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	17708	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	35102956	35103087	35103023	Y	NA	UNC5D	NA	NA	NA	NA	UNC5D	11981	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	UNC5D	NA	NA	NA	NA	UNC5D	28386	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	35270986	35270995	35270991	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	110286	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.56598114155978
chr8	36468751	36468988	36468860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF703	1082281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37643587	37643772	37643645	Y	NA	PROSC,GPR124	NA	NA	NA	NA	GPR124	3878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37678678	37679141	37678937	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	26281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37679848	37680132	37679943	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	25290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	37739186	37739703	37739509	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	15282	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37754518	37754975	37754800	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	10	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	37757888	37758317	37758017	Y	WHSC1L1,RAB11FIP1	RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	2903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	38035023	38035257	38035173	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4	BAG4,LSM1,DDHD2	NA	NA	NA	NA	LSM1	2775	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	38296830	38297166	38296953	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	27186	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	38312135	38312514	38312441	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	11838	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	38862169	38862388	38862283	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	9781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	38867572	38867594	38867583	Y	C8orf86	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	15184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	18935	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41153046	41153278	41153162	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	11738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	4367	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	41570603	41570760	41570682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-360L9.4	136716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41628099	41628173	41628135	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	124107	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41674575	41674631	41674603	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	ANK1	77649	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	41757818	41757921	41757853	Y	NA	ANK1	NA	NA	NA	NA	ANK1	5538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	RP11-589C21.2,AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	42370484	42370865	42370805	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	24204	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	42398083	42398473	42398470	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	3014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	42951870	42952118	42951994	Y	FNTA	HGSNAT	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	41438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	47962058	47962075	47962067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	104666	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	48242793	48242802	48242797	Y	NA	NA	PRKDC	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA5P12	168300	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	48350721	48350922	48350822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	276228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	48853752	48854057	48853918	Y	NA	PRKDC,MCM4	NA	NA	NA	NA	PRKDC	16686	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	50653553	50653944	50653741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL29P19	1358403	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	50969485	50969741	50969613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-119N19.1	1376421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	51847143	51847430	51847428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-119N19.1	498732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	52797055	52797111	52797083	Y	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	12624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM150A	287193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	53291191	53291577	53291547	Y	ST18	NA	NA	NA	NA	NA	FAM150A	184490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	54256811	54256964	54256882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPRK1	94554	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	54658367	54658716	54658684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	95402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	54884595	54884649	54884642	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	48440	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	55018716	55018874	55018809	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	LYPLA1,MRPL15	LYPLA1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LYPLA1	6139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	55053670	55053988	55053859	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	LYPLA1,MRPL15	NA	NA	NA	NA	MRPL15	7900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56282047	56282150	56282095	Y	XKR4	NA	NA	NA	NA	NA	XKR4	269098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56684291	56684685	56684461	Y	NA	TGS1,TMEM68	NA	NA	NA	NA	TMEM68	325	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	33131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56796346	56796794	56796413	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	5974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	56903187	56904166	56903812	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	80294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	56919441	56919801	56919730	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	64659	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	59470194	59470547	59470220	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	6711	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	59491466	59491801	59491581	Y	UBXN2B,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	27983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	59529081	59529390	59529262	Y	SDCBP	NSMAF	NA	NA	NA	NA	NSMAF	41013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	59786438	59786547	59786493	Y	UBXN2B	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	61327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	60154501	60154880	60154691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOX	124734	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	60832747	60832939	60832831	Y	NA	NA	TOX	IMR90	Hi-C	24141950	CA8	359032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-91I20.2	52350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	61664874	61665035	61664955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	75537	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CLVS1	116963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CLVS1	116526	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	63162204	63162589	63162538	Y	NA	NKAIN3	NA	NA	NA	NA	NKAIN3	3054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	65282966	65283235	65283141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	426083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	65589993	65590291	65590142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	119027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	65758514	65758852	65758664	Y	NA	CYP7B1	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	49196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	66663796	66664162	66663979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	88395	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	66742209	66742357	66742281	Y	NA	PDE7A	NA	NA	NA	NA	PDE7A	10200	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	88197	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	67425057	67425564	67425100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	84637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	67565254	67565409	67565332	Y	NA	MYBL1,VCPIP1,C8orf44	NA	NA	NA	NA	VCPIP1	12043	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	67566708	67566914	67566811	Y	NA	MYBL1,VCPIP1,C8orf44	NA	NA	NA	NA	VCPIP1	10538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	67668655	67668834	67668702	Y	ADHFE1,SGK3,SGK3	SGK3,PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	9406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	67694398	67694637	67694506	Y	VCPIP1,SGK3,SGK3	PTTG3P	NA	NA	NA	NA	PTTG3P	16158	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	68097028	68097398	68097213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	103010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf34	431118	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	70982774	70982831	70982803	Y	PRDM14	PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	PRDM14	846	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	70985003	70985175	70985161	Y	NA	PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	PRDM14	3075	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	17495	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	109691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	71158637	71159069	71158929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	144223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1,RP11-382J12.1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	72187885	72188197	72188041	Y	EYA1	NA	NA	NA	NA	NA	EYA1	84270	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	72194927	72195300	72195185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA1	77167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	72469578	72469890	72469801	Y	EYA1,EYA1	RP11-1102P16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1102P16.1	32370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	72668111	72668208	72668160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1144P22.1	82576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	72843451	72843829	72843757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	88748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	TRPA1	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	TRPA1	22382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	74926613	74926741	74926708	Y	UBE2W,TMEM70,LY96	TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96	NA	NA	NA	NA	LY96	25026	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	75418171	75418548	75418360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	95931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	75574618	75574942	75574782	Y	GDAP1,GDAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	60139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	75576382	75576715	75576543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	61903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	75748881	75749089	75748985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	145661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr8	76316572	76316672	76316622	Y	HNF4G	HNF4G	NA	NA	NA	NA	HNF4G	1477	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	77128503	77128819	77128661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	462635	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	77480724	77480996	77480860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	110458	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	79000264	79000479	79000281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	425895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	80216218	80216356	80216290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	304693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	80251129	80251474	80251433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	269575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr8	80275634	80276026	80275830	Y	STMN2	NA	NA	NA	NA	NA	STMN2	245023	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	81059132	81059394	81059212	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	82073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	81261345	81261481	81261420	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	119878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	81263563	81263790	81263701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	122096	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	81962809	81963138	81963038	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	59165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	85296015	85296611	85296285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALYL	202993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59,CA13	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	87444767	87445117	87444942	Y	WWP1	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	49942	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3,SLC2A3P4	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A3P4	160140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	88655608	88655638	88655622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	682616	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	90213226	90213534	90213296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	554421	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	90479154	90479488	90479317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	288467	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	91064955	91065319	91065136	Y	NA	CALB1	NA	NA	NA	NA	CALB1	40384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	91913461	91913473	91913467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM64	111601	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	93037158	93037539	93037349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-100L22.2	850326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	LINC00535	17696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	95132318	95132456	95132369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	80824	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	96805008	96805462	96805317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	440400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	97171094	97171453	97171221	Y	GDF6	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRB	74409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	97873455	97873860	97873757	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	369876	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	98045362	98045723	98045714	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	242453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	98795675	98796209	98795739	Y	NA	LAPTM4B	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	10390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	98843865	98843962	98843914	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	31320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	RPS23P1,MATN2	NA	NA	NA	NA	RPS23P1	9042	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	99526737	99526942	99526761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	222116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	100808377	100808591	100808586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX6C	95699	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101385316	101385524	101385421	Y	NA	RNF19A,KB-1991G8.1	MIR4471	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1991G8.1	37493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1991G8.1	80089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1991G8.1	80586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101444913	101445066	101444990	Y	RGS22	NA	RNF19A,SPAG1,MIR4471	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1991G8.1	97090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101455424	101455703	101455525	Y	PABPC1,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	KB-1991G8.1	107601	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	SNX31	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	SNX31	6131	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	101821654	101822280	101821977	Y	RNF19A,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ	NA	SNX31,PABPC1,ANKRD46	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	88617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	101912406	101912993	101912785	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	50623	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	102015928	102016078	102016021	Y	NA	NA	FLJ42969,YWHAZ,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	52312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	102075998	102076526	102076187	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	112382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102092753	102093116	102092848	Y	GRHL2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF706	123305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102110720	102110996	102110973	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	FLJ42969	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF706	105425	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	102135026	102135273	102135149	Y	NA	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	81148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102149452	102149813	102149564	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	66608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102167683	102167913	102167765	Y	NA	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	48508	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102171817	102172037	102171960	Y	YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102449376	102449720	102449428	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	52940	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102467254	102467614	102467418	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	35046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	102543448	102543645	102543547	Y	NA	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	40788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	103639654	103639717	103639685	Y	NA	KLF10	UBR5,ODF1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	26413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103743323	103743460	103743418	Y	NA	NA	KLF10	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	77193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	100344	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103918538	103918841	103918687	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	ATP6V1C1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	14446	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	103939794	103939949	103939858	Y	NA	AZIN1	AZIN1,ATP6V1C1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	35702	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	104130599	104130764	104130682	Y	NA	BAALC	NA	NA	NA	NA	BAALC	20174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	104553511	104553813	104553575	Y	NA	RP11-1C8.4,RP11-5A11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	15804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	105087342	105087776	105087510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	511476	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	105743615	105743833	105743724	Y	NA	NA	LRP12	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	144363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	107633742	107634133	107633852	Y	OXR1	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	74108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	107740443	107740789	107740616	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	32202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	107775174	107775515	107775345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	66933	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	107870700	107870850	107870776	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	162459	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	108287452	108287481	108287467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	579211	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	108457055	108457376	108457218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	748814	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	109230205	109230491	109230349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	215071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	115227918	115228008	115227963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267L5.1	64288	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	115707569	115707650	115707588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-267L5.1	415273	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	116858854	116859170	116859022	Y	TRPS1	TRPS1	NA	NA	NA	NA	TRPS1	38955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	116988617	116988643	116988632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	168718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	117711370	117711748	117711590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	64994	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	117889939	117890223	117890034	Y	RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	RAD21	4834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	117990895	117991108	117991002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD21	105790	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	118894000	118894167	118894051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	227925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	119781554	119781682	119781618	Y	NA	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	9114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	119921281	119921551	119921414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P35	148841	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	120063756	120064086	120063927	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	MAL2	111187	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	120547207	120547221	120547214	Y	NA	NA	ENPP2	IMR90	Hi-C	24141950	NOV	120661	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	120593887	120594019	120593985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENPP2	89674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	COL14A1	74856	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	121060310	121060648	121060608	Y	NA	COL14A1	NA	NA	NA	NA	COL14A1	9371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	304196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	123106451	123106468	123106460	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	454821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	123801301	123801636	123801353	Y	ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	9668	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	123811167	123811696	123811506	Y	C8orf76,ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	19534	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	125447179	125447220	125447200	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	FER1L6,FER1L6-AS1,ANXA13,FAM91A1,KLHL38,TMEM65,FBXO32	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT12	13828	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	125466570	125466668	125466619	Y	NA	TRMT12,RNF139-AS1,RNF139	NA	NA	NA	NA	TRMT12	5522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	125659031	125659039	125659035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	79691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	125764120	125764533	125764318	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTSS1	25390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	125984707	125984742	125984718	Y	ZNF572	ZNF572,SQLE	NA	NA	NA	NA	ZNF572	1167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	126353679	126353867	126353799	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	86696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	126399072	126399443	126399281	Y	NA	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	41120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	127325042	127325066	127325054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	243054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	127422712	127423196	127422971	Y	NA	NA	FAM84B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-89K10.1	144924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	127592246	127592475	127592298	Y	NA	RP11-89K10.1,FAM84B	FAM84B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	23608	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	127829528	127829825	127829677	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	260890	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	127908732	127908971	127908856	Y	NA	NA	MYC,LOC727677,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	340094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr8	127938432	127938773	127938643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	369794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	127950397	127950550	127950437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	381759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr8	128068284	128068629	128068554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	355906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	353906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	324993	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	311340	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128179610	128179821	128179807	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	244714	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128185119	128185731	128185383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	238804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	164617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128264964	128265070	128265034	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	159465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	117252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	128309901	128310145	128310009	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	114390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128407875	128408267	128408231	Y	NA	POU5F1B	NA	NA	NA	NA	POU5F1B	16268	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128579214	128579541	128579451	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	POU5F1B	154679	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128736210	128736278	128736243	Y	NA	MYC	NA	NA	NA	NA	MYC	9402	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	128879185	128879808	128879466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	74406	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128944008	128944415	128944139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	76442	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128948050	128948240	128948055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	72617	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129036981	129037022	129036995	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	16124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	129205979	129206284	129206246	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	185122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129252743	129253109	129252782	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	231886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129370322	129370485	129370393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	349465	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129539101	129539374	129539248	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	518244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129563997	129564224	129564200	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	543140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129609920	129610230	129610055	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	589063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129626202	129626412	129626297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	605345	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr8	129655139	129655338	129655239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	634282	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	129659601	129660006	129659683	Y	NA	NA	MYC	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU4-25P	638744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	129706266	129706412	129706340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	685409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130461810	130462206	130462131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	565169	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130702467	130702491	130702479	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM49B	324884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	119979	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130975001	130975392	130975263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	51983	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130983929	130984348	130984047	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	43027	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	130996080	130996422	130996182	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30953	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	131011351	131011453	131011402	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	15922	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	131024148	131024528	131024501	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	2847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	156620	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	131354482	131354860	131354810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	99046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	133257165	133257466	133257335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	342830	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	134532639	134533046	134532970	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	49137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	134905620	134906007	134905914	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	323437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	135493726	135493930	135493821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	229362	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	135512580	135513062	135513051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	210230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	135570853	135571245	135571049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	152047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	136247051	136247262	136247121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	220438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	136476552	136476867	136476709	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	8852	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	136587606	136587905	136587756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	119906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	136936407	136936454	136936431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	183669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	139293707	139293714	139293711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	630535	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	139299523	139299711	139299616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	624538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	139925414	139925432	139925424	Y	NA	COL22A1	NA	NA	NA	NA	COL22A1	1165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	140161601	140161615	140161608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	237352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	140710203	140710577	140710390	Y	KCNK9	KCNK9	NA	NA	NA	NA	KCNK9	2722	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	141110302	141110773	141110688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	355905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	142036879	142037195	142037043	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	26564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	142046833	142047172	142047003	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	36518	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	142129714	142130013	142129874	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	4337	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	142182442	142182863	142182588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	57065	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	19.343550144066
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	3.0594390533982
chr8	142247795	142248221	142248078	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	68183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr8	142248811	142249092	142249020	Y	DENND3,PTP4A3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	67312	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	142255319	142255549	142255470	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A4	60855	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.57906531788294
chr8	142425618	142425919	142425790	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25525	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	143282498	143282660	143282564	Y	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	199941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	143403466	143403590	143403541	Y	TSNARE1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	79011	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	143479468	143479691	143479580	Y	NA	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	2910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	143869768	143870087	143870041	Y	PSCA,SLURP1,LYNX1,LY6D	LYNX1,LY6D	NA	NA	NA	NA	LY6D	3760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	144106773	144106936	144106849	Y	NA	LY6E,RP11-273G15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-273G15.2	8919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E,RP11-273G15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-273G15.2	9678	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	144328155	144328364	144328211	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	875	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	11039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H-AS1	28716	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	144959402	144959607	144959478	Y	C8orf73,MAPK15,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	PLEC,NRBP2,PUF60	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	8770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	144960453	144960673	144960604	Y	C8orf73,TIGD5,FAM83H,PLEC,PLEC,EPPK1	NRBP2,EPPK1	PLEC	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	9821	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145847503	145847804	145847651	Y	SCRT1,KIFC2,ZNF34,ARHGAP39	NA	ARHGAP39,ZNF251	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	61390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145887419	145887725	145887588	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP39	21469	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr8	145938520	145938651	145938564	Y	NA	ARHGAP39,ZNF251	NA	NA	NA	NA	ARHGAP39	29326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	225416	225914	225497	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	12562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	226208	226591	226300	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	13354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	1759075	1759256	1759136	Y	SMARCA2	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	254086	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	2241493	2241738	2241696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228151	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	2279055	2279418	2279226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	265713	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	2281532	2281772	2281628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	268190	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	2613992	2614264	2614088	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	5570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	2655543	2655805	2655674	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	35709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	3507863	3508210	3507917	Y	RFX3	RFX3,RP11-509J21.1	NA	NA	NA	NA	RFX3	15794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	4086123	4086410	4086330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	259982	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	4829866	4830028	4829909	Y	NA	RCL1,MIR101-2	NA	NA	NA	NA	MIR101-2	18263	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	4936470	4936655	4936528	Y	JAK2	JAK2	RCL1,JAK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JAK2	46378	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	5596043	5596612	5596374	Y	C9orf46,CD274,KIAA1432	KIAA1432	INSL6,JAK2	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1432	30413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	6564380	6564534	6564488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-106A1.2	72605	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	7320258	7320407	7320333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	155913	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	8495779	8496144	8495966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	215167	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	9842303	9842691	9842629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	753427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	10094485	10094558	10094522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	516165	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	454302	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	13237438	13237544	13237492	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	40045	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	13248843	13249002	13248988	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	28587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	14349817	14350014	14349895	Y	NA	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	46968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	14547369	14547550	14547460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	143919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	15513029	15513231	15513175	Y	NA	PSIP1,FTH1P12	NA	NA	NA	NA	PSIP1	4012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	16025511	16025884	16025698	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93,CNTLN	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	499830	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	16100753	16101130	16100880	Y	NA	NA	C9orf93,BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	575072	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	16515842	16516452	16516406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	208360	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	16709928	16710291	16710201	Y	NA	RP11-62F24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-62F24.2	14521	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	16985936	16986021	16986007	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	BNC2	117095	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	17742097	17742364	17742226	Y	SH3GL2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	609117	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	19252213	19252529	19252372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLIN2	104925	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	19322727	19322852	19322790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6	55400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	20215261	20215478	20215462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	405064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	20532398	20532530	20532463	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	88012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	21016783	21016802	21016795	Y	IFNA1,IFNA6,IFNA5,IFNW1	PTPLAD2	NA	NA	NA	NA	PTPLAD2	12833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	21809706	21810111	21809856	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	9164	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	21817235	21817446	21817291	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	16693	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	22103396	22103678	22103511	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2B	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	93242	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	22117547	22117648	22117588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	107393	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	23622735	23622745	23622740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	201590	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	27434079	27434197	27434145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	93582	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	27512798	27513102	27512950	Y	NA	MOB3B	NA	NA	NA	NA	MOB3B	14677	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	32183281	32183478	32183392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	199140	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	32535412	32535514	32535462	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11090	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	32535541	32535857	32535751	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	11219	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33375284	33375639	33375462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQP3	69970	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33436336	33436688	33436507	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	8921	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33458514	33458840	33458724	Y	NA	AQP3,NOL6	NA	NA	NA	NA	AQP3	12905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33770440	33770694	33770558	Y	NA	UBE2R2	NA	NA	NA	NA	UBE2R2	44871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	35153448	35153469	35153459	Y	NA	FAM214B,UNC13B	UNC13B,ATP8B5P	IMR90	Hi-C	24141950	UNC13B	6530	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,SIT1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	35971862	35972364	35972237	Y	NA	YBX1P10	C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK	IMR90	Hi-C	24141950	YBX1P10	1547	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	36039800	36039974	36039887	Y	OR2S2,RECK	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36040345	36040403	36040371	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36164977	36165259	36165107	Y	NA	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	23594	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36621370	36621719	36621545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELK	50511	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	107013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	36951908	36952256	36952225	Y	ZCCHC7,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	PAX5	79847	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37035251	37035762	37035526	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3148	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37035783	37036025	37035954	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3680	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	37197241	37197478	37197431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37270797	37270994	37270913	Y	PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	149669	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37295997	37296383	37296038	Y	PAX5,ZCCHC7,FRMPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	124280	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	38016375	38016730	38016641	Y	NA	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	49954	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	38074399	38074817	38074731	Y	NA	RP11-613M10.9,SHB	DCAF10,MCART1,SHB	IMR90	Hi-C	24141950	SHB	7189	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	68377347	68377469	68377407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	75906	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	68410626	68410725	68410676	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	42650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71734977	71735184	71735061	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	768	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71784003	71784073	71784064	Y	TJP2	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	49794	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	71793410	71793781	71793424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	59201	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	61347	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71922503	71922965	71922747	Y	NA	NA	FAM189A2	IMR90	Hi-C	24141950	TJP2	188294	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	71991675	71991950	71991811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	257466	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	72390890	72391274	72391082	Y	NA	PTAR1,C9orf135	LOC100507299,SMC5,C9orf135	IMR90	Hi-C	24141950	PTAR1	18015	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	72805213	72805492	72805447	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	66445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	72837972	72838313	72838181	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	33624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	72923580	72923722	72923651	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	51643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.46728955919209
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	74056463	74056568	74056515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	145949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	74515794	74516103	74515949	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	8323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	74581601	74581796	74581711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf85	57175	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	75088538	75088711	75088620	Y	ZFAND5	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	110375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	75106254	75106475	75106392	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	128091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	75124677	75124777	75124727	Y	NA	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	146514	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	75125387	75125400	75125394	Y	TMC1	NA	TMC1,ZFAND5	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND5	147224	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	75155526	75155660	75155598	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	177363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	75978047	75978446	75978247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	213374	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	76299237	76299618	76299309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	534564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	79183642	79183976	79183814	Y	NA	AL161626.1	PRUNE2	IMR90	Hi-C	24141950	AL161626.1	755	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr9	79350296	79350357	79350327	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	165565	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	PRUNE2	134910	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	80354506	80354684	80354595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA14	93283	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	81329740	81329936	81329769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAT1	419681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	81586798	81586848	81586823	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	417371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	81600122	81600487	81600176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	403732	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	81641483	81641834	81641545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	362385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	84174793	84174913	84174853	Y	NA	NA	TLE1	IMR90	Hi-C	24141950	TLE1	127307	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	84236979	84237179	84237078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLE1	65041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	85478657	85478918	85478814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	197174	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr9	85498647	85499068	85498841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	177024	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chr9	87466967	87467081	87467024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC28A3	513295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	88264467	88264715	88264594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	90229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	88298792	88299000	88298900	Y	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	55944	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	88902044	88902242	88902143	Y	NA	ISCA1	NA	NA	NA	NA	ISCA1	6368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	88935508	88935794	88935577	Y	NA	ISCA1,ZCCHC6	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	31575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	90094812	90095059	90094937	Y	CTSL1,DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	15084	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	90179803	90180066	90179945	Y	DAPK1,CTSL1	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	41586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	90216174	90216503	90216403	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	77957	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	90226779	90227017	90226862	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	88562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	91096507	91096802	91096655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	95173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NA	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	123807	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	91762072	91762095	91762084	Y	NA	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	29587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chr9	91841165	91841448	91841286	Y	NA	SHC3	SHC3,LOC286238	IMR90	Hi-C	24141950	SHC3	49483	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	92050487	92050811	92050719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA4D	60234	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	92296049	92296284	92296165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	78121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	93833669	93833838	93833696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYK	271600	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	94296561	94296715	94296638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIL3	112417	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	94442528	94442868	94442728	Y	NA	NA	SYK,AUH,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-2,MIR3910-1,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	NFIL3	258384	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	94773036	94773407	94773223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	62592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	94834730	94835154	94834963	Y	OGN	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	40512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	95452860	95453088	95452974	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	22313	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	95732704	95733017	95732861	Y	NINJ1,C9orf89,FGD3	FGD3	NA	NA	NA	NA	FGD3	24971	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	96723182	96723238	96723197	Y	NA	BARX1,RP11-231K24.2	BARX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-231K24.2	7303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.888224241309154
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.18429898841221
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	98054647	98055067	98054952	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	22924	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	98210362	98210561	98210462	Y	PTCH1	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	23284	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	98533065	98533456	98533266	Y	NA	NA	LOC158435,LINC00476,C9orf102,FANCC,LINC00092	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00476	102803	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	98583076	98583344	98583210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	52915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	98931605	98932004	98931930	Y	NA	EIF4BP3	FBP1,FANCC,LOC158435,LOC100507346,PTCH1,LOC158434	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4BP3	25316	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	98979716	98980057	98980045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	73427	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	HSD17B3,SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	99976780	99977107	99976893	Y	NA	ZNF322P1,RP11-498P14.5	NA	NA	NA	NA	ZNF322P1	16870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	FOXE1	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	FOXE1	47272	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	100669809	100670115	100670053	Y	C9orf156	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	12737	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	14046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	100908591	100908763	100908677	Y	NA	TRIM14,CORO2A	TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM14	29097	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	101322182	101322489	101322456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS6	234758	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	102569580	102569664	102569622	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	ALG2,SEC61B,NR4A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-554F20.1	10507	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	103544281	103544296	103544289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-394D2.1	52759	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	104717224	104717241	104717233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	423091	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	105966405	105966781	105966517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	887760	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	107723549	107723790	107723714	Y	NIPSNAP3A,ABCA1	ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	35031	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ABCA1	66894	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	107983498	107983520	107983511	Y	NA	SLC44A1	SLC44A1,ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A1	21383	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr9	108005367	108005618	108005429	Y	NA	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	464	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	108114005	108114151	108114071	Y	FSD1L,FSD1L,SLC44A1	NA	NA	NA	NA	NA	FSD1L	93926	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	108621964	108622364	108622354	Y	NA	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	167139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	32044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	109714113	109714149	109714131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF462	90735	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	110437099	110437420	110437250	Y	KLF4	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-438P9.1	142428	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-438P9.1	217482	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	112076384	112076614	112076499	Y	NA	EPB41L4B	NA	NA	NA	NA	EPB41L4B	4630	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	112809593	112809859	112809726	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	23955	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	112827825	112828236	112827913	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	42187	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	112905689	112906067	112905829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	110853	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	113195641	113195768	113195705	Y	SVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	144392	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	114292075	114292469	114292256	Y	NA	KIAA0368,ZNF483	NA	NA	NA	NA	ZNF483	6636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.36859797682441
chr9	114748589	114748829	114748711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	91543	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	114790542	114790702	114790622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133496	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	114857747	114857987	114857843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	77701	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	115071018	115071139	115071076	Y	NA	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	22808	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	115258728	115258879	115258816	Y	SNX30,SUSD1,ROD1	KIAA1958,C9orf147	NA	NA	NA	NA	C9orf147	11244	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	115527127	115527401	115527315	Y	NA	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	16009	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	115757286	115757809	115757590	Y	NA	ZNF883	NA	NA	NA	NA	ZNF883	14698	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	76776	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	180266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	22455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117152820	117152929	117152875	Y	NA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	1756	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117171817	117171955	117171874	Y	TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	17132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	117566825	117567042	117566994	Y	TNFSF15	TNFSF15	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	419	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	104870	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	117883580	117883602	117883591	Y	TNFSF15,TNC,DEC1	TNC	TNC,DEC1	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	5044	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	117942308	117942603	117942434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	63772	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chr9	119228607	119228748	119228704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	218833	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	120176306	120176455	120176377	Y	NA	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	958	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	121918529	121918824	121918789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1421624	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	122135998	122136186	122136092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1204262	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	122914670	122914945	122914761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	425503	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	122984020	122984078	122984028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	356370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	123652168	123652528	123652495	Y	NA	PSMD5,PHF19	PHF19	IMR90	Hi-C	24141950	PHF19	14562	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	124260871	124261375	124261091	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	65961	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	124499221	124499709	124499392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	2.66467272392746
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	125654025	125654372	125654281	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	11248	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	125956223	125956395	125956307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72460	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126003896	126004111	126004004	Y	NA	STRBP	NA	NA	NA	NA	STRBP	24744	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126291594	126291648	126291621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	262739	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126895140	126895472	126895256	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	122413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126901442	126901607	126901525	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,PSMB7,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	116278	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	126964717	126965059	126964872	Y	NA	NA	DENND1A,NEK6,LOC100129034,PSMB7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	52826	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	127267013	127267383	127267321	Y	NR5A1	NR5A1	NA	NA	NA	NA	NR5A1	326	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	128170862	128170906	128170878	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	148789	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	128433867	128434078	128433973	Y	NA	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	33435	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	128597374	128597723	128597549	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	89750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	129263295	129263658	129263477	Y	FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B	NA	NA	NA	NA	NA	LMX1B	111064	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	129483874	129484165	129483990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	81120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	PIP5KL1,DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	130844598	130844860	130844677	Y	NA	SLC25A25,NAIF1,PTGES2	NA	NA	NA	NA	NAIF1	16113	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	131007254	131007504	131007363	Y	URM1,CERCAM,FPGS,FPGS,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,PIP5KL1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	SWI5	28154	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	131545917	131546049	131545985	Y	NA	ZER1,TBC1D13,ENDOG,C9orf114	NA	NA	NA	NA	TBC1D13	1434	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	131645612	131645749	131645679	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,PHYHD1	NA	NA	NA	NA	CCBL1	2839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	RP11-344B5.2	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-344B5.2	1769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132115283	132115797	132115318	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	22704	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132236208	132236504	132236334	Y	NA	LINC00963	LOC100506190,PPP2R4,IER5L,METTL11A,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	7226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132319720	132320056	132319894	Y	DOLPP1	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	75990	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	132321078	132321454	132321255	Y	NA	NA	FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	77348	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42780	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	132359774	132359922	132359814	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	42522	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132494076	132494377	132494232	Y	NA	PTGES	NA	NA	NA	NA	PTGES	18949	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	132802902	132803300	132803100	Y	ASB6,USP20,USP20,FNBP1	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	173	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.67775690025062
chr9	134258707	134258891	134258799	Y	NA	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	8589	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	134573283	134574205	134573669	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	39256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	134652581	134652848	134652715	Y	NA	RAPGEF1	MED27,NTNG2,SETX	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	39120	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	135059697	135059990	135059854	Y	NA	NTNG2	SETX	IMR90	Hi-C	24141950	NTNG2	24363	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	135231921	135232175	135232157	Y	NA	SETX,TTF1	NA	NA	NA	NA	SETX	3549	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chr9	135287067	135287190	135287129	Y	NA	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	C9orf171	3637	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	136282042	136282102	136282072	Y	NA	SURF4,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	878	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	136746393	136746610	136746453	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	109116	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	136823955	136824162	136824035	Y	ADAMTSL2,SARDH,VAV2	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	31564	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	137302036	137302210	137302202	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	95092	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	137550194	137550363	137550309	Y	NA	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	18574	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	137598866	137599219	137599002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	67246	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	138233554	138233668	138233594	Y	NA	NA	OLFM1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R26	135257	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	138796932	138797111	138797062	Y	CAMSAP1	RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139237317	139237472	139237398	Y	GPSM1	GPSM1,DNLZ	NA	NA	NA	NA	GPSM1	17385	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139428801	139428944	139428850	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	9370	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	139608810	139609132	139608936	Y	SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3788	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	5.32934544785492
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	15308	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.690841076573786
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chr9	140169154	140169348	140169240	Y	NA	TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	25355	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140199547	140199668	140199608	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	4844	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140205114	140205300	140205216	Y	PNPLA7,NOXA1,NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	10411	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140205908	140206072	140205991	Y	NRARP	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	11205	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chr9	140655578	140655793	140655680	Y	PNPLA7	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1B	114448	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	2719389	2719617	2719532	Y	NA	GYG2	NA	NA	NA	NA	GYG2	25212	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chrX	3591324	3591658	3591618	Y	NA	PRKX	NA	NA	NA	NA	PRKX	37991	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.08560740604452
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	10135057	10135251	10135239	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	12033	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	38639	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	10585706	10585772	10585735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	264001	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	12272654	12272870	12272762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	118069	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	13069635	13069825	13069771	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	FAM9C	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM9C	8834	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	13809735	13809880	13809737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OFD1	58903	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	23320949	23320962	23320957	Y	NA	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	29171	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	23368174	23368523	23368350	Y	NA	PTCHD1	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	18041	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	23448720	23448865	23448793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	98587	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	23470262	23470555	23470409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD1	120129	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	25664451	25664736	25664645	Y	MAGEB18	NA	NA	NA	NA	NA	ARX	632386	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	31848875	31849137	31848986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB3	857674	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	36981340	36981727	36981708	Y	PRRG1,PRRG1	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG1	224801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	37613614	37613928	37613771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XK	70602	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	38729564	38730030	38729639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	70879	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39018621	39018929	39018842	Y	MID1IP1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	359936	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39036200	39036629	39036274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	377515	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.97383164735368
chrX	39670526	39670931	39670833	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	25136	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39949495	39949781	39949700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84801	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	39950207	39950578	39950448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84004	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	39961698	39961932	39961714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	72650	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40015911	40016135	40015987	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	18447	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40016662	40016910	40016734	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	17672	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	MKRN4P	NA	NA	NA	NA	MKRN4P	2252	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	40726668	40726852	40726751	Y	ATP6AP2,MED14	MKRN4P,RP11-77G22.2	USP9X,CXorf38,MED14,LOC100132831	IMR90	Hi-C	24141950	MKRN4P	34930	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	41242516	41242827	41242698	Y	DDX3X	NA	DDX3X,USP9X	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDX3X	51865	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	41413588	41413590	41413589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	222937	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	43579100	43579475	43579156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	65633	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	362298	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	45663739	45663972	45663886	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	44948	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	45767495	45767762	45767629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	58575	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	47175541	47175936	47175853	Y	NA	NA	USP11,CDK16,UBA1	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	85452	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	47180934	47181052	47180967	Y	ELK1,CDK16	NA	UBA1,USP11	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	90845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	47438054	47438403	47438273	Y	CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1,SYN1	NA	NA	NA	NA	TIMP1	1309	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	47701110	47701161	47701136	Y	NA	ZNF81	NA	NA	NA	NA	ZNF81	6809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	48748167	48748450	48748403	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	4745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XAGE2B	105049	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4A2P4	89047	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4A2P4	103295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	53759976	53760018	53759996	Y	NA	HUWE1	HUWE1	IMR90	Hi-C	24141950	HUWE1	48303	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	55355292	55355323	55355308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEH1	121215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	55844311	55844333	55844322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-188A5.1	88223	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	KLF8	NA	NA	NA	NA	KLF8	12989	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	56791132	56791384	56791234	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	29122	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	110745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	64148338	64148413	64148376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	104180	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	64520324	64520642	64520384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	232013	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chrX	64627187	64627345	64627245	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	125310	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	64891840	64892073	64891978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	85583	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	64926114	64926664	64926355	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	119857	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	67870380	67870574	67870477	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	4872	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chrX	68776201	68776510	68776416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDA	57401	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	69295623	69295923	69295773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGBP1	55376	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	GDPD2,DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	RP5-1091N2.9	NA	NA	NA	NA	RP5-1091N2.9	13891	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chrX	70411067	70411368	70411206	Y	TEX11	RP5-1091N2.9	NA	NA	NA	NA	RP5-1091N2.9	4657	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	71091842	71092192	71092139	Y	NA	NHSL2	NA	NA	NA	NA	NHSL2	36746	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.986915823676838
chrX	71768805	71768968	71768887	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	21985	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	73236075	73236382	73236224	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	73916	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	73338057	73338325	73338191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	53400	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	73352212	73352497	73352336	Y	NA	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	39228	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	74266683	74266817	74266750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	107750	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	78205501	78205882	78205598	Y	P2RY10	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR4	204295	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.48037373551526
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	RP5-961K14.1	NA	NA	NA	NA	RP5-961K14.1	1625	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	96641794	96641810	96641802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	704132	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	96701855	96702106	96701982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	764193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.592149494206103
chrX	96737764	96737861	96737813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	800102	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	97535019	97535198	97535109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	1597357	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	BTK,RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	102063503	102063615	102063509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHB9	89887	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	103019589	103020004	103019883	Y	NA	PLP1	LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1	IMR90	Hi-C	24141950	PLP1	6643	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.87514006498599
chrX	103570216	103570358	103570287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	160915	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	103597874	103598258	103598063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	188573	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	103628998	103629151	103629075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAPL2	179845	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	107441665	107441898	107441782	Y	COL4A5	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4A	108767	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	107639720	107640073	107639886	Y	COL4A6	COL4A6,COL4A5	NA	NA	NA	NA	COL4A6	40654	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	KCNE1L	NA	NA	NA	NA	KCNE1L	17150	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109073937	109074572	109074260	Y	NXT2,NXT2	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	99305	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109083180	109083422	109083333	Y	ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	108548	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109083708	109084134	109083977	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	109076	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109085106	109085401	109085292	Y	NXT2,NXT2,ACSL4	NA	ACSL4	IMR90	Hi-C	24141950	ACSL4	110474	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109429267	109429621	109429491	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	185408	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	109645744	109645944	109645869	Y	NA	AMMECR1	TMEM164	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMMECR1	35517	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	113170298	113170599	113170449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTR2C	645952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	113834296	113834714	113834606	Y	NA	HTR2C	NA	NA	NA	NA	HTR2C	17745	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	115083189	115083554	115083375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	0	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	115238483	115238690	115238635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	155061	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	115415637	115415812	115415646	Y	NA	NA	SLC6A14	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-761E20.1	332215	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	117499894	117500112	117500003	Y	NA	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	21858	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	117635665	117635786	117635726	Y	DOCK11	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	7804	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	117654579	117654738	117654653	Y	LONRF3	DOCK11	NA	NA	NA	NA	DOCK11	26718	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	118407628	118408020	118407835	Y	NA	PGRMC1,RP5-1139I1.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1139I1.1	15472	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	123350562	123350843	123350703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	258500	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	125489807	125490070	125489939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	114798	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.67775690025062
chrX	128225148	128225423	128225251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	430054	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	6.80971918337018
chrX	128942088	128942398	128942239	Y	ELF4,ELF4,XPNPEP2	ZDHHC9	NA	NA	NA	NA	ZDHHC9	33487	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	129216343	129216741	129216485	Y	SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	25950	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	129226171	129226435	129226352	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	16256	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	129966535	129966828	129966682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	68380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	130698816	130699203	130699008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	167139	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	130706744	130706880	130706830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF1	175067	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	130880517	130880959	130880705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	274334	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	132400242	132400521	132400363	Y	NA	RNU1-115P	NA	NA	NA	NA	RNU1-115P	29398	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	132588536	132588894	132588715	Y	NA	GPC4	NA	NA	NA	NA	GPC4	41018	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	133847905	133848292	133848163	Y	NA	NA	LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM122C	80527	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.493457911838419
chrX	133952675	133952993	133952834	Y	NA	FAM122C,FAM122B	NA	NA	NA	NA	FAM122B	23413	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	134096434	134096824	134096629	Y	NA	MOSPD1	FAM127C	IMR90	Hi-C	24141950	MOSPD1	49137	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	134485580	134485626	134485601	Y	ZNF449,CT45A6	ZNF75D,ZNF449	NA	NA	NA	NA	ZNF449	8859	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	135275239	135275595	135275317	Y	CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D3	61046	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	136632347	136632538	136632444	Y	ZIC3	RP1-137H15.2,ZIC3	NA	NA	NA	NA	RP1-137H15.2	12008	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	RP1-137H15.2,ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.394766329470735
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	87202	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	138277070	138277325	138277232	Y	NA	FGF13	NA	NA	NA	NA	FGF13	25614	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	139521736	139522104	139521978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX3	63121	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	139793034	139793280	139793108	Y	CDR1	NA	NA	NA	NA	NA	SOX3	207809	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	139855409	139855570	139855490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX3	270184	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	148595188	148595518	148595383	Y	IDS,CXorf40A	IDS,CXorf40A,LINC00893	NA	NA	NA	NA	IDS	17952	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	150047001	150047063	150047035	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	18226	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	150071015	150071211	150071113	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	5726	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	150071678	150071798	150071740	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	6389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	1.28299057077989
chrX	152075667	152076216	152075921	Y	GABRQ	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	78156	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	152648727	152649001	152648990	Y	SLC6A8,ZNF275	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF275	51114	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SRPK3,SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368
chrX	153093734	153093743	153093739	Y	NA	SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	277	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.296074747103051
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.78953265894147
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrX	154023434	154023601	154023487	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	GAB3,DKC1,MPP1	NA	NA	NA	NA	MPP1	23681	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrY	10023047	10023682	10023281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	5566871	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.0986915823676838
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTY	383112	CAGE	ITO-II	hg19	FANTOM5	0.197383164735368