chr1 868565 868684 868625 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,C1orf170 NA NA NA NA NOC2L 24005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN C1orf170,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1005293 1005547 1005421 Y HES4 RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1173386 1173736 1173661 Y PLEKHN1 TNFRSF4,SDF4,B3GALT6,UBE2J2 NA NA NA NA B3GALT6 7757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1 NA NA NA NA GLTPD1 7541 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1286847 1286913 1286880 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 4117 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1294735 1294982 1294877 Y NA CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 175 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 1368471 1368786 1368620 Y RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1 CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B NA NA NA NA VWA1 230 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 2068660 2068858 2068763 Y NA NA NA NA NA NA C1orf86 73301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 2501788 2502413 2502094 Y SKI,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA FAM213B 13517 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 3227700 3227783 3227742 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 141207 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 136124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 3267475 3267612 3267544 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 101378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 3325555 3326143 3325876 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 42847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 3463934 3464260 3464145 Y ARHGEF16 NA NA NA NA NA MEGF6 61799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 4079242 4079460 4079359 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 264385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 8054249 8054565 8054423 Y NA PARK7,ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 29803 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 8173446 8173525 8173493 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 ERRFI1 89078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 9241165 9241560 9241362 Y NA RP3-510D11.2 SLC2A7,SLC25A33,GPR157,MIR34A,H6PD,SPSB1,TMEM201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP3-510D11.2 902 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 9960528 9960713 9960585 Y NA CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1 NA NA NA NA CTNNBIP1 7681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 10726049 10726261 10726116 Y CASZ1 NA NA NA NA NA CASZ1 128446 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 10959985 10960148 10960064 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105278 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 11798209 11798600 11798405 Y FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6 MAD2L2,AGTRAP,C1orf167 NA NA NA NA AGTRAP 4068 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 11798918 11799121 11798987 Y FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6 MAD2L2,AGTRAP,C1orf167 NA NA NA NA AGTRAP 4777 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 11942925 11943217 11943160 Y NPPB,MFN2 NPPA,NPPB,KIAA2013,PLOD1 CLCN6,MTHFR,NPPB,NPPA,MFN2,PLOD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NPPB 25937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA KIAA2013 15342 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 12493313 12493712 12493478 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 182025 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 15575633 15576067 15575825 Y PLEKHM2,EFHD2,TMEM51,TMEM51,FHAD1 NA NA NA NA NA TMEM51 98605 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 SLC25A34,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16158409 16158760 16158690 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 5685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17,C1orf64 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16438237 16438733 16438326 Y NA FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2 FAM131C,CLCNKB IMR90 Hi-C 24141950 FAM131C 40110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 16553276 16553594 16553536 Y NA RSG1 NA NA NA NA RSG1 8063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 17020007 17020088 17020064 Y NA EIF1AXP1 NA NA NA NA EIF1AXP1 9457 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr1 17454855 17455288 17455072 Y PADI4 PADI2 PADI2,PADI1,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI2 10907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 25.3508039929128 chr1 17896198 17896624 17896362 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 31868 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 19333976 19334220 19334098 Y NA NA UBR4,IFFO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 52796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 21406931 21406946 21406939 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 8685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 21931612 21931850 21931825 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 61951 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 22002610 22002786 22002701 Y NA RAP1GAP RAP1GAP K562 ChIA-PET 22265404 RAP1GAP 8809 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 22235836 22236001 22235899 Y HSPG2 HSPG2 NA NA NA NA HSPG2 25789 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 22468030 22468558 22468270 Y NA NA NA NA NA NA WNT4 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 23912037 23912393 23912293 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 27752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 24680333 24680598 24680466 Y NA GRHL3 NA NA NA NA GRHL3 36521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 25823926 25824130 25824028 Y NA LDLRAP1 LDLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 43941 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 26642014 26642169 26642069 Y FAM54B,SH3BGRL3,RPS6KA1,HMGN2,UBXN11,UBXN11,CD52 SH3BGRL3,CD52,UBXN11,AIM1L NA NA NA NA CD52 279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA DHDDS 20518 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,FCN3,CD164L2,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 27762936 27763307 27763206 Y WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38 GPR3 NA NA NA NA GPR3 45788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 27849341 27849620 27849479 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 34672 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 27924204 27924421 27924302 Y XKR8,AHDC1 AHDC1,FGR NA NA NA NA AHDC1 4521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 28152962 28153213 28153036 Y NA PPP1R8 NA NA NA NA PPP1R8 2076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 29565515 29565732 29565598 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4487 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 9.19314870072661 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA SNRNP40 29711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TINAGL1 24526 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 32701561 32701886 32701724 Y NA CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B NA NA NA NA MTMR9LP 3335 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 33227148 33227387 33227320 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 21662 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33433896 33434020 33433958 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 5610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33438571 33438703 33438616 Y KIAA1522,ADC RNF19B NA NA NA NA RNF19B 10285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33596124 33596280 33596183 Y NA TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 49380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33622437 33622835 33622675 Y PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 22825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33645848 33646140 33645995 Y HPCA,PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 188 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 33685276 33685676 33685470 Y NA TRIM62,ZNF362 TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF362 34470 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 36428229 36428381 36428320 Y STK40,EIF2C4,THRAP3,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA ADPRHL2 124095 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA TRAPPC3 20544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 36641160 36641451 36641218 Y NA TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3 NA NA NA NA MAP7D1 21980 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 39357087 39357474 39357146 Y MACF1,GJA9 RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA MYCBP 11798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 39598673 39599090 39598722 Y MACF1 NA NA NA NA NA MACF1 53685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 40006104 40006751 40006634 Y MFSD2A,PABPC4 PPIEL,PABPC4 NA NA NA NA PPIEL 15628 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 41365158 41365531 41365407 Y NA CITED4 CITED4,CTPS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 39140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 13581 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 43250353 43250859 43250610 Y ZMYND12,WDR65,YBX1 LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23 NA NA NA NA C1orf50 19413 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 44232152 44232509 44232262 Y SLC6A9,IPO13,ST3GAL3 NA NA NA NA NA ST3GAL3 62657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 45670767 45670868 45670821 Y PTCH2,ZSWIM5 NA NA NA NA NA ZSWIM5 99013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA ZSWIM5,HPDL ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM5 22934 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 45990749 45991039 45990946 Y NA TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1 NA NA NA NA PRDX1 4030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA TMEM69 48076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA2 196779 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 51198410 51198537 51198468 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 225398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 51245588 51245972 51245952 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 177963 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 51997947 51998232 51998197 Y NA RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9 OSBPL9,EPS15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS15 14947 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 52193179 52193464 52193255 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 149013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 52193707 52193852 52193763 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 148625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42,LDLRAD1 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 58900423 58900575 58900499 Y NA NA DAB1,CYP2J2,OMA1,FGGY IMR90 Hi-C 24141950 DAB1 109831 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 58969564 58969575 58969570 Y NA DAB1,OMA1 NA NA NA NA DAB1 40831 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA JUN 121264 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 62208815 62209373 62208933 Y NA TM2D1,INADL NA NA NA NA INADL 2666 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 62307827 62308113 62307970 Y NA NA NA NA NA NA INADL 101678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 62362299 62362490 62362395 Y NA NA NA NA NA NA INADL 156150 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 62416847 62417238 62417043 Y INADL,USP1,KANK4 NA NA NA NA NA INADL 210698 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 65307822 65308022 65307967 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 99044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 65383044 65383557 65383225 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 46630 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 65758796 65759173 65758995 Y NA DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 46894 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 68215256 68215932 68215330 Y NA NA NA NA NA NA GADD45A 66512 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 32936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 70040211 70040399 70040305 Y LRRC7 NA NA NA NA NA LRRC40 628904 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11 NA NA NA NA SRSF11 39652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 72686486 72686621 72686551 Y NEGR1 NA NA NA NA NA NEGR1 59796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 72696545 72696864 72696705 Y NA NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 49553 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 72931284 72931506 72931356 Y NA NA NA NA NA NA NEGR1 184867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 78561383 78561632 78561506 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 118524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 79668598 79668618 79668608 Y NA NA NA NA NA NA ELTD1 198195 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 82168687 82169067 82168779 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 16311 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 82172386 82172576 82172503 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 12802 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 203892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 85667688 85667915 85667906 Y NA SYDE2 NA NA NA NA SYDE2 2959 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 85737728 85738105 85737917 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 2668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 86000890 86001115 86001087 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 40818 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 87203929 87204214 87204072 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 35670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 87258759 87259068 87258988 Y SH3GLB1 NA NA NA NA NA SH3GLB1 90500 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 89382528 89382593 89382561 Y NA GTF2B NA NA NA NA GTF2B 26901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 90274070 90274340 90274210 Y NA LRRC8D GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRRC8D 10233 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 91478571 91478975 91478771 Y ZNF644,ZNF644 ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 6854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 92184014 92184251 92184134 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 185641 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 92201825 92202076 92201951 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 167816 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 92202579 92202753 92202666 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 167139 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 92242645 92243003 92242791 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 126889 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 93660433 93660767 93660600 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 16148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA BCAR3 182680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 94128177 94128297 94128262 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 182409 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA BCAR3 164588 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 100494312 100494735 100494498 Y CDC14A,HIAT1 HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 6918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 100820585 100820838 100820683 Y HIAT1,CDC14A CDC14A NA NA NA NA CDC14A 12001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 101485385 101485713 101485528 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3721 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 108122481 108123055 108122789 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 382711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 108132692 108133060 108132878 Y NTNG1,NTNG1,VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 372706 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 108169181 108169438 108169310 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 336328 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 108199393 108199592 108199493 Y VAV3 NA NA NA NA NA VAV3 306174 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 109159407 109159722 109159520 Y NA HENMT1 NA NA NA NA HENMT1 42426 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 110548379 110548612 110548408 Y NA AHCYL1 NA NA NA NA AHCYL1 23071 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 111729234 111729498 111729366 Y NA CEPT1,DRAM2,CHI3L2 NA NA NA NA CHI3L2 11895 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 CHI3L2 NA NA NA NA CHI3L2 4074 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 112058341 112058601 112058437 Y RAP1A,C1orf162,ADORA3 C1orf162,RAP1A NA NA NA NA RAP1A 24239 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 112058803 112059167 112059005 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162,ADORA3 C1orf162,RAP1A NA NA NA NA RAP1A 23673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 112163412 112163797 112163622 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 112196411 112196803 112196596 Y C1orf183,RAP1A NA NA NA NA NA DDX20 99064 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 114244987 114245321 114245197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54790 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 114566071 114566240 114566155 Y NA OLFML3 SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 46008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 114576701 114577036 114576869 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 56638 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 117130518 117130699 117130624 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 18857 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 117814674 117814878 117814758 Y NA NA VTCN1,TTF2,TRIM45 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VTCN1 63118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 118302292 118302520 118302372 Y NA NA GDAP2,FAM46C,MAN1A2,TRIM45 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46C 155736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 120180868 120181132 120181082 Y NBPF7,ZNF697 ZNF697,PHGDH NA NA NA NA ZNF697 7264 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H3DP1 582407 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 144987154 144987391 144987382 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 86795 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 85772 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 145005016 145005394 145005195 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 68792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,HFE2,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HFE2 13897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP HFE2,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 151485676 151485841 151485746 Y C2CD4D,CGN,TUFT1 CGN,SNORA44,TUFT1 NA NA NA NA CGN 4690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 151945068 151945221 151945146 Y TUFT1,S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 19645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 151962641 151962839 151962740 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 2027 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153095466 153095607 153095484 Y NA NA NA NA NA NA SPRR1B 93788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153929776 153930098 153929954 Y NA GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CRTC2 675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 154986150 154986272 154986211 Y NA SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3 NA NA NA NA ZBTB7B 13023 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 155052148 155052357 155052334 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1 NA NA NA NA EFNA3 17924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 155757099 155757186 155757142 Y NA NA NA NA NA NA GON4L 70005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA LMNA,SEMA4A NA NA NA NA SEMA4A 19976 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 156249668 156250061 156249953 Y NA BGLAP,PAQR6,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA SMG5 559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 156478154 156478558 156478328 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 9534 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1,CD1D NA NA NA NA CD1D 668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 160072097 160072234 160072133 Y C1orf204,KCNJ10,KCNJ9,ATP1A2 IGSF8,ATP1A2 NA NA NA NA IGSF8 5364 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 160182240 160182579 160182410 Y NA CASQ1,PEA15,RP11-574F21.2 NA NA NA NA PEA15 9113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 160881277 160881698 160881498 Y NA ITLN1 CD244,ITLN1 IMR90 Hi-C 24141950 ITLN1 28317 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1,ARHGAP30 NA NA NA NA F11R 243 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 161177017 161177202 161177106 Y HSPA6,ADAMTS4,APOA2 USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,FCER1G,APOA2,TOMM40L NA NA NA NA FCER1G 5822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 161847357 161847565 161847361 Y NA NA NA NA NA NA ATF6 113273 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 162604417 162604795 162604606 Y NA DDR2 NA NA NA NA DDR2 5254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 163598073 163598159 163598113 Y NA NA NA NA NA NA RGS5 308496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 164685981 164686133 164686057 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163160 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 164736884 164737252 164737025 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 214063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 167313306 167313474 167313390 Y MAEL,POU2F1 NA NA NA NA NA POU2F1 125240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 167486210 167486705 167486392 Y POU2F1,RCSD1,CD247 CREG1 NA NA NA NA CREG1 34299 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 167772811 167773182 167772825 Y CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 14304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 169860308 169860488 169860348 Y KIFAP3,SCYL3 SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 172142638 172142648 172142642 Y DNM3,FASLG MIR199A2,DNM3OS NA NA NA NA DNM3OS 30704 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 172418117 172418641 172418353 Y NA C1orf105,PIGC NA NA NA NA PIGC 6887 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 172500351 172500710 172500527 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 89121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 173382392 173382663 173382522 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 61742 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 173384654 173384941 173384742 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 59464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 174220636 174220943 174220783 Y RABGAP1L NA NA NA NA NA RABGAP1L 94088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 174365403 174365798 174365601 Y NA NA NA NA NA NA RABGAP1L 238855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 175158150 175158288 175158209 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 1847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 175160901 175161109 175161018 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 244190 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 179606990 179607135 179607063 Y NA TDRD5 NA NA NA NA TDRD5 48242 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 180237101 180237317 180237140 Y NA NA NA NA NA NA QSOX1 115132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 181096103 181096331 181096188 Y NA IER5 KIAA1614,IER5,STX6 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 40465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 183239968 183240242 183240112 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 86595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 184794829 184794875 184794854 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 72782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 184812869 184813180 184813057 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 90822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 184885517 184885894 184885706 Y NA NA NA NA NA NA FAM129A 55788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 185264835 185265233 185265202 Y NA IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 19228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 185308384 185308771 185308525 Y FAM129A,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 23923 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 186445429 186445441 186445438 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA C1orf27 102539 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 186535382 186535615 186535499 Y NA NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 PTGS2 111944 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 186935248 186935528 186935344 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 139163 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 192490879 192491144 192491120 Y RGS1 NA RGS1,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 51713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 192569418 192569748 192569583 Y RGS1 RGS1 RGS1,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 26561 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 193180704 193180924 193180776 Y NA B3GALT2 NA NA NA NA B3GALT2 26920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 193655157 193655512 193655302 Y NA NA CDC73,B3GALT2 IMR90 Hi-C 24141950 B3GALT2 501373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 198127475 198127965 198127580 Y NA NEK7 NA NA NA NA NEK7 3382 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 198237796 198237952 198237874 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 113703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 198591244 198591462 198591360 Y PTPRC PTPRC NA NA NA NA PTPRC 14339 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 198845240 198845523 198845521 Y NA NA NA NA NA NA PTPRC 239439 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 198889384 198889935 198889528 Y PTPRC NA NA NA NA NA PTPRC 283583 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 199120976 199121206 199121091 Y NA NA NA NA NA NA PTPRC 515175 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 200862818 200862950 200862864 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 4642 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 201277329 201277484 201277406 Y PKP1 NA NA NA NA NA TNNT2 67406 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 201717986 201718364 201718179 Y NA NA IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 77905 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 201864045 201864232 201864194 Y NA SHISA4,LMOD1 NA NA NA NA SHISA4 8237 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 202016172 202016526 202016316 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ELF3,RP11-465N4.4 ELF3,NAV1 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-465N4.4 38691 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 202217450 202217807 202217629 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 91301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 202781525 202781905 202781812 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5 NA NA NA NA PCAT6 3443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 203061576 203061925 203061715 Y NA ADORA1 NA NA NA NA ADORA1 3794 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 203244129 203244381 203244323 Y BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 28056 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 LINC01136,BTG2 NA NA NA NA LINC01136 12452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 203965652 203965916 203965843 Y NA NA ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 74327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 204053773 204053963 204053834 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 13530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 204389721 204389989 204389958 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 10802 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 204395183 204395520 204395303 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 16264 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 204432329 204432499 204432494 Y SOX13,PIK3C2B PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 29353 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 204916243 204916629 204916322 Y NA NA NA NA NA NA NFASC 120464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 205474556 205474866 205474575 Y NA CDK18 NA NA NA NA CDK18 2833 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 205638734 205639222 205638979 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 8365 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 206642854 206643037 206642964 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE IKBKE,RASSF5 NA NA NA NA IKBKE 1063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 206861410 206861458 206861434 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 5121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2,IL10 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 207203424 207203586 207203506 Y C1orf116 C1orf116,PFKFB2,YOD1 NA NA NA NA C1orf116 515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 207489914 207490291 207489981 Y CR1,CD46,CD55 CD55 CD55,YOD1,PFKFB2,CR2,CR1 IMR90 Hi-C 24141950 CD55 2562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 208314292 208314663 208314422 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 101002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 208349565 208349646 208349606 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 66019 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 208381145 208381344 208381321 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 34321 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 208387951 208388224 208388088 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 27441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 208412497 208412696 208412591 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 209538127 209538433 209538258 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR205HG 61732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 209606620 209606963 209606837 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 6455 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 209798058 209798744 209798639 Y NA LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 25067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 209915892 209916078 209915980 Y NA C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 39826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 211084997 211085192 211085095 Y NA NA HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-543B16.1 259627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 211258865 211259253 211259186 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 85566 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr1 213443269 213443475 213443372 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KC1 220680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1 NA NA NA NA PROX1 8304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 214614073 214614284 214614198 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109508 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 215198285 215198630 215198297 Y KCNK2,KCNK2 NA NA NA NA NA GAPDHP24 156208 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 219433064 219433395 219433229 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 87878 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 220359525 220359939 220359742 Y NA NA NA NA NA NA MORF4L1P1 64973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN8,CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 224023477 224023773 224023693 Y CAPN2,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 7901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.01444474585088 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226187685 226188168 226187763 Y TMEM63A,H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 59384 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226443007 226443187 226443097 Y NA NA NA NA NA NA LIN9 52383 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226864749 226865297 226865095 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 3981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr1 228921739 228922035 228921884 Y NA NA RHOU,NUP133 IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 52915 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 228972324 228972426 228972361 Y RHOU NA RHOU,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 103500 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 ACTA1 NA NA NA NA ACTA1 20703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 230289705 230290142 230289903 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 98169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 230643766 230644066 230643893 Y NA NA URB2 IMR90 Hi-C 24141950 COG2 132169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 232117893 232118046 232117970 Y TSNAX NA NA NA NA NA DISC1 357332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 294048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 10.3074697553601 chr1 233241853 233241955 233241904 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 157502 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 233750790 233751092 233750957 Y KCNK1 KCNK1 NA NA NA NA KCNK1 3040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.2 236105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 234668185 234668630 234668443 Y NA NA NA NA NA NA TARBP1 55336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 236764383 236764568 236764551 Y NA HEATR1 NA NA NA NA HEATR1 1236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 236853510 236853749 236853569 Y NA ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 5756 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 237206585 237207004 237206623 Y ACTN2,RYR2 RYR2 NA NA NA NA RYR2 3080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 237207715 237208218 237207860 Y NA RYR2 NA NA NA NA RYR2 4210 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 237316905 237317075 237316908 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 113400 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 237833544 237833823 237833684 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 630039 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 238106545 238106849 238106747 Y NA NA NA NA NA NA RYR2 903040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 243431437 243431793 243431509 Y NA CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 14117 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 243894639 243895081 243894755 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 117300 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 245162358 245162654 245162559 Y NA EFCAB2 NA NA NA NA EFCAB2 31351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 245958364 245958743 245958685 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 642077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 246749077 246749442 246749258 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 21331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 246862505 246862699 246862612 Y SCCPDH SCCPDH NA NA NA NA SCCPDH 22650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 247038123 247038250 247038187 Y NA NA NA NA NA NA AHCTF1 55030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr1 247297966 247298129 247298007 Y NA ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 32292 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr1 247553531 247554143 247553893 Y AHCTF1,NLRP3,NLRP3 NA AHCTF1,ZNF496 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF496 60383 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 516106 516519 516355 Y ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,ZMYND11,DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 217164 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 725947 726341 726240 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 7342 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 3568141 3568290 3568192 Y NA NA NA NA NA NA KLF6 257183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 3850308 3850795 3850409 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 24835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 4248027 4248358 4248250 Y NA LINC00702 LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 35746 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 4895704 4895738 4895721 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 37058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 4910442 4910783 4910685 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 22013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 5535635 5536039 5535950 Y NA CALML5 NA NA NA NA CALML5 3494 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 6162113 6162335 6162224 Y NA RBM17,PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 22546 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 6213842 6214122 6214025 Y IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 28961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 6449763 6450038 6449901 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PRKCQ 170225 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA ITIH5 344611 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 8145104 8145382 8145246 Y GATA3 NA NA NA NA NA GATA3 51537 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 11205067 11205773 11205317 Y CELF2 NA NA NA NA NA CELF2 159808 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 13932168 13932481 13932420 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 305241 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 14066158 14066580 14066511 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 435561 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 17755362 17755412 17755398 Y SLC39A12 NA NA NA NA NA STAM 71238 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 18567945 18568427 18568205 Y NSUN6,ARL5B NA NA NA NA NA CACNB2 140339 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 18670937 18671238 18671078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-499P20.2 161342 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 20388455 20388625 20388609 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 285287 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 21799318 21799715 21799601 Y C10orf113 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21379 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 22053811 22054026 22053942 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP37 166046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 23138140 23138676 23138512 Y PIP4K2A,ARMC3 NA ARMC3,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 PIP4K2A 136656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 24746901 24747210 24747047 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 263387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 25357102 25357468 25357353 Y NA NA ARHGAP21 IMR90 Hi-C 24141950 THNSL1 53515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 28432154 28432413 28432284 Y NA NA NA NA NA NA MPP7 189002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 28891962 28892254 28892152 Y NA NA NA NA NA NA BAMBI 72017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 29845509 29845894 29845702 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 149178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 29907407 29907668 29907538 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 116042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 98304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 29932081 29932201 29932141 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 91509 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 29944854 29945090 29945003 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 78620 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-472N13.3 54556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 32598255 32598442 32598434 Y NA NA NA NA NA NA EPC1 67284 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 35028968 35029134 35029048 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 73119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 35755393 35755512 35755453 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 221440 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 43249715 43249807 43249770 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 26442 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 43905259 43905708 43905446 Y HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF FXYD4,HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA HNRNPF 2645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 44046358 44046416 44046387 Y NA ZNF239 NA NA NA NA ZNF239 21650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 44185196 44185271 44185205 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 42892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 47092142 47092537 47092340 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 122742 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 47093518 47093811 47093665 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 124118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 47113842 47114070 47114068 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 144442 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 47128793 47129187 47128991 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 159393 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 47149103 47149407 47149372 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 179703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF488 29272 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 50519665 50520208 50519779 Y C10orf128 C10orf71 NA NA NA NA C10orf71 14478 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 50536610 50536839 50536655 Y NA C10orf71 NA NA NA NA C10orf71 31423 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 50787572 50787883 50787845 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 41988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 54212412 54212659 54212464 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 140356 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 54224630 54224737 54224684 Y NA NA DKK1,LOC100506939 IMR90 Hi-C 24141950 DKK1 152574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 61665210 61665415 61665365 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 63697847 63698199 63697988 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 38788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 64380271 64380763 64380533 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 181753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 65078745 65079133 65078939 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 105924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA PRELID1P3 11753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 650987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 68718064 68718186 68718126 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA DNAJC12 877738 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 70805220 70805884 70805439 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 39978 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 70817174 70817630 70817194 Y NA SRGN KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRGN 28232 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 71172232 71172485 71172352 Y SRGN,VPS26A TACR2,TSPAN15 NA NA NA NA TACR2 2138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 71198445 71198595 71198514 Y NA TACR2,TSPAN15 HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSPAN15 10634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 71355649 71355822 71355737 Y NA C10orf35 HK1,TSPAN15,NEUROG3,COL13A1,HKDC1 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf35 32185 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 73103146 73103452 73103170 Y NA SLC29A3 NA NA NA NA SLC29A3 26131 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 73126563 73126688 73126624 Y PSAP,C10orf54 SLC29A3,CDH23 NA NA NA NA CDH23 28003 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 73840531 73840743 73840590 Y ASCC1,ASCC1,SPOCK2 SPOCK2 NA NA NA NA SPOCK2 6047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 73954988 73955333 73955161 Y NA ANAPC16,ASCC1 NA NA NA NA ANAPC16 18454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 74174604 74174793 74174677 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB12 61616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 74925047 74925060 74925055 Y ANXA7,ECD FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 76985148 76985510 76985329 Y NA VDAC2,COMTD1,HMGA1P5 NA NA NA NA COMTD1 8278 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 77290134 77290404 77290261 Y SAMD8 NA C10orf11 IMR90 Hi-C 24141950 C10orf11 68594 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 78792238 78792506 78792372 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 603847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 81042130 81042560 81042322 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 62665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 81158970 81159167 81159085 Y NA ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 44216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 81946319 81946704 81946639 Y ANXA11 ANXA11 NA NA NA NA ANXA11 16624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 81959510 81960003 81959818 Y TSPAN14,SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 3325 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 81960969 81961796 81961521 Y SH2D4B,ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 1532 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 19.5006184560867 chr10 88455880 88456202 88455894 Y NA LDB3 NA NA NA NA LDB3 29674 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 88571811 88572082 88571947 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1A 57404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 89990044 89990113 89990079 Y LIPK NA PTEN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 286785 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 91199827 91200195 91200013 Y NA IFIT1,LIPA,IFIT5 NA NA NA NA IFIT5 27484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 93254153 93254526 93254340 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 86057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 95136235 95136595 95136450 Y MYOF NA NA NA NA NA MYOF 103479 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 95193537 95193891 95193765 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 46183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95197787 95197992 95197919 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95200243 95200778 95200520 Y CYP26C1,MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 39296 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95201631 95201931 95201645 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 38143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 95222493 95222944 95222696 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 17130 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 95223953 95224101 95224023 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95224699 95224811 95224754 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15263 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 95766976 95767368 95767096 Y NA PLCE1 NA NA NA NA PLCE1 15230 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 95851610 95851772 95851690 Y NA NA NA NA NA NA PLCE1 99864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 95873448 95873628 95873536 Y NA NA NA NA NA NA PLCE1 121702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97038434 97038774 97038645 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 10007 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97120063 97120328 97120194 Y SORBS1 NA NA NA NA NA PDLIM1 71282 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97128395 97128611 97128526 Y NA NA PDLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 79614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97236202 97236532 97236382 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 82639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97239155 97239567 97239500 Y SORBS1,SORBS1 NA NA NA NA NA SORBS1 79604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97302511 97302656 97302624 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 16515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97313430 97313789 97313690 Y NA SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 5382 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 97319295 97319590 97319525 Y C10orf129,SORBS1,SORBS1 SORBS1 NA NA NA NA SORBS1 124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 98956083 98956405 98956104 Y C10orf62 NA NA NA NA NA ARHGAP19 94008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 99172845 99172912 99172879 Y C10orf12,ZFYVE27,ZFYVE27,FRAT2 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 11005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 99401742 99402052 99401841 Y C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 10398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 100020230 100020246 100020237 Y NA LOXL4 NA NA NA NA LOXL4 5761 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 100153906 100154210 100154161 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 18731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101425049 101425416 101425233 Y NA SLC25A28,ENTPD7,CUTC NA NA NA NA ENTPD7 7786 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101873975 101874319 101874110 Y NA NA CPN1,ERLIN1,CHUK IMR90 Hi-C 24141950 ERLIN1 71772 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 101908352 101908679 101908530 Y DNMBP,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1 NA NA NA NA ERLIN1 37412 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 103453403 103453880 103453587 Y LDB1,BTRC,MGEA5 FBXW4 NA NA NA NA FBXW4 351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 104504643 104504897 104504711 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 32348 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 104556220 104556459 104556323 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 55521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 INA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INA 33467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 105427179 105427487 105427329 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 185814 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 105436153 105436400 105436275 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 176901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK SH3PXD2A,OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 105654409 105654593 105654518 Y NA SH3PXD2A,OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 21370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 108342157 108342240 108342208 Y NA NA NA NA NA NA ITPRIP 2245995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 110138864 110139232 110139127 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 1542079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 110699041 110699062 110699052 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 982249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 111766410 111766784 111766651 Y ADD3 ADD3 NA NA NA NA ADD3 12284 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 112402938 112403137 112402952 Y NA RBM20 NA NA NA NA RBM20 783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 114385835 114385842 114385839 Y GPAM,TECTB NA NA NA NA NA VTI1A 181079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 115070178 115070533 115070251 Y TCF7L2 NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 HABP2 238063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 116282298 116282595 116282502 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 119783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 116303427 116303555 116303470 Y ABLIM1 NA NA NA NA NA ABLIM1 139207 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 116392908 116393338 116393223 Y ABLIM1 ABLIM1 NA NA NA NA ABLIM1 49424 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 116561110 116561522 116561275 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 17981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 116582671 116583074 116582920 Y NA FAM160B1 NA NA NA NA FAM160B1 3168 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 119069713 119069747 119069730 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 63231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 119294820 119294982 119294904 Y EMX2 NA NA NA NA NA PDZD8 161842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 121065390 121065964 121065436 Y NA NA NA NA NA NA GRK5 100289 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 121452837 121453189 121453108 Y NA BAG3,INPP5F NA NA NA NA INPP5F 30420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 122836934 122837187 122837105 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 54050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 123822805 123823045 123822957 Y ATE1,DMBT1 NA NA NA NA NA TACC2 76116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 124133234 124133500 124133290 Y NA PLEKHA1 NA NA NA NA PLEKHA1 1022 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 124636899 124637143 124637021 Y NA FAM24B,RP11-564D11.3 NA NA NA NA FAM24B 14 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 125730230 125730378 125730329 Y NA CPXM2 NA NA NA NA CPXM2 32447 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CPXM2 57133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 125974313 125974551 125974472 Y CHST15 NA CPXM2,CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 CHST15 123107 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 126338756 126339243 126338968 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 91595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 126349618 126349650 126349637 Y NA NA NA NA NA NA FAM53B 81188 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 126773443 126773862 126773517 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 73877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 127583558 127583978 127583747 Y MMP21 RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 127591696 127592016 127591824 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA FANK1 8588 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 128943463 128943803 128943552 Y NA NA NA NA NA NA DOCK1 351485 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 129704108 129704655 129704249 Y PTPRE PTPRE NA NA NA NA PTPRE 783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 129742865 129742981 129742943 Y NPS PTPRE NA NA NA NA PTPRE 39540 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 130017279 130017540 130017352 Y PTPRE NA EBF3,MGMT,LOC387723,GLRX3,CTAGE7P IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 94630 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 130875080 130875084 130875082 Y NA NA NA NA NA NA MGMT 388364 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 131436691 131436981 131436883 Y MGMT NA NA NA NA NA MGMT 173243 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 133742915 133743140 133742982 Y NA NA NA NA NA NA BNIP3 50295 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr10 134142326 134142616 134142473 Y NA STK32C,LRRC27 LRRC27 K562 ChIA-PET 22265404 STK32C 735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8895 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 134221970 134222202 134222031 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr10 134225356 134225596 134225555 Y NA PWWP2B,RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 4991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 134234707 134235257 134234764 Y STK32C,PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2 C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.2 4120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr10 134235789 134236113 134236058 Y NA PWWP2B,RP11-432J24.2 C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.2 5202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 RP11-432J24.2 NA NA NA NA RP11-432J24.2 29754 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr10 134373708 134374041 134373810 Y PWWP2B,INPP5A RP11-432J24.5,INPP5A NA NA NA NA INPP5A 24384 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 738048 738285 738171 Y PKP3,SIGIRR EPS8L2,TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1 NA NA NA NA TALDO1 7044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 1870283 1870513 1870420 Y CTSD,MOB2 NA NA NA NA NA TNNT3 68279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 1936655 1937042 1936845 Y TSSC4,TSPAN32,C11orf21,TNNI2,LSP1 TNNT3,MRPL23 NA NA NA NA TNNT3 1750 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 1938897 1938966 1938954 Y NA TNNT3,MRPL23 NA NA NA NA TNNT3 105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 23329 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 1991146 1991394 1991373 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 24638 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 2619837 2620105 2619972 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 99119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 2655024 2655339 2655183 Y TRPM5,KCNQ1 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 63885 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 2883658 2883963 2883768 Y NA CDKN1C,SLC22A18 NA NA NA NA CDKN1C 21148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 2933631 2934118 2933874 Y NA CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 14567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,RNU1-91P,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 5504793 5505065 5505006 Y NA NA NA NA NA NA TRIM6 110274 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 6564206 6564247 6564227 Y NA NA NA NA NA NA RRP8 58603 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 12184848 12185162 12185016 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 71305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 13405133 13405443 13405288 Y ARNTL NA NA NA NA NA BTBD10 77401 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 13468446 13468721 13468666 Y NA BTBD10 NA NA NA NA BTBD10 14123 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 15219194 15219222 15219209 Y INSC NA NA NA NA NA CALCA 227294 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 16924689 16924921 16924805 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 69639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 17008586 17008989 17008853 Y PLEKHA7 RP11-466H18.1,OR7E14P,PLEKHA7 NA NA NA NA RP11-466H18.1 14026 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 20053197 20053569 20053404 Y NA NAV2-AS2 NA NA NA NA NAV2-AS2 15280 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 27657269 27657593 27657433 Y NA NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 56042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 81474 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 31630096 31630156 31630127 Y PAX6 NA NA NA NA NA ELP4 100799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 34183211 34183613 34183509 Y NA NA NA NA NA NA NAT10 58062 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 35395403 35395808 35395629 Y SLC1A2 NA NA NA NA NA PAMR1 154040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 35401982 35402383 35402345 Y NA NA NA NA NA NA PAMR1 147465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 38654382 38654744 38654563 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 2040331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 45000515 45000921 45000720 Y SYT13,TSPAN18 TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 29675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 46015298 46015560 46015479 Y NA NA GYLTL1B,PEX16 K562 ChIA-PET 22265404 GYLTL1B 74126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 46753121 46753488 46753304 Y F2 ARHGAP1,ZNF408 NA NA NA NA ZNF408 32753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1,P2RX3 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 60843253 60843606 60843384 Y SLC15A3,TMEM138 NA CD5 IMR90 Hi-C 24141950 VPS37C 83483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 60871198 60871450 60871295 Y CD6,SDHAF2,CD5 NA NA NA NA NA VPS37C 55639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 60917835 60918043 60917849 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 9046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 60926054 60926399 60926274 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 11.700371073652 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 61788241 61788385 61788315 Y DAGLA,FTH1 NA FADS1,BEST1,FTH1,FADS3,FADS2,RAB3IL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 55109 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 62264935 62265137 62265063 Y WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3 NA NA NA NA NA AHNAK 56570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 62267714 62268111 62267986 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK 53596 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr11 62305940 62306223 62306072 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3 AHNAK,EEF1G NA NA NA NA AHNAK 15484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,LRRN4CL,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63328335 63328557 63328446 Y NA RARRES3,HRASLS2 NA NA NA NA HRASLS2 298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3,HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA HRASLS2 5663 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,HRASLS2,PLA2G16 NA NA NA NA HRASLS2 8867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr11 63639638 63639903 63639715 Y NA MARK2,RCOR2 NA NA NA NA MARK2 35238 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 63687620 63687907 63687858 Y LGALS12,RCOR2 RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 5304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63846659 63847077 63846694 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 84501 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 63954598 63954956 63954814 Y FERMT3,CCDC88B,OTUB1 MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4,RP11-783K16.14,VEGFB NA NA NA NA STIP1 3854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 64205023 64205244 64205073 Y CDC42BPG,RPS6KA4 NA NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,PYGM IMR90,K562,H1ESC,HELA,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 80403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 64629180 64629438 64629292 Y TIGD3,CDC42EP2,RASGRP2,RASGRP2,SF1,SF1,SF1,MAP4K2,FAU,EHD1,ATG2A CDC42BPG,EHD1 NA NA NA NA CDC42BPG 19139 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65184888 65185395 65184991 Y FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 2850 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.85018553682602 chr11 65238917 65239096 65239037 Y CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1 TIGD3 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.62154342755897 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 65263684 65264604 65263856 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.7358644821925 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CST6,SF3B2 NA NA NA NA CST6 5662 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 65905081 65905308 65905252 Y NA NA NA NA NA NA PACS1 69247 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 66511038 66511198 66511076 Y KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 NA NA NA NA C11orf80 1116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 66845381 66845631 66845497 Y TMEM134,SSH3,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 66845907 66846062 66845990 Y PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 67103841 67103862 67103852 Y NA ANKRD13D,SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 18581 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 67144956 67145205 67145097 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 5901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 67895703 67896078 67896017 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 8792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68110280 68110464 68110374 Y NA LRP5 PPP6R3 IMR90 Hi-C 24141950 LRP5 32203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68270416 68270689 68270553 Y MRGPRD PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 44230 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68776292 68776545 68776410 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 MRGPRD IMR90 Hi-C 24141950 MRGPRF 2332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68778534 68778789 68778694 Y MRGPRF MRGPRF,TPCN2 NA NA NA NA MRGPRF 88 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 68873890 68874116 68874013 Y NA NA NA NA NA NA TPCN2 59525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 69042063 69042459 69042261 Y NA MYEOV MYEOV,CCND1,ORAOV1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 17146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 69251942 69252241 69252024 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 192337 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 70107513 70107580 70107548 Y NA PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 7226 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 70155804 70155966 70155885 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 40998 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 70367951 70368077 70368014 Y SHANK2 NA NA NA NA NA AP000487.5 125357 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 70483542 70483760 70483651 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 240948 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 71702677 71703050 71702869 Y FOLR3,IL18BP,IL18BP IL18BP NA NA NA NA IL18BP 4537 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 71769812 71769929 71769891 Y NA LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 19453 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 72455084 72455310 72455221 Y STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 47334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 72462370 72462747 72462399 Y NA ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 39897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 72498496 72498726 72498679 Y STARD10 ARAP1,STARD10,ATG16L2 NA NA NA NA ARAP1 3918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 72662392 72662530 72662447 Y ARAP1,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT NA ATG16L2 IMR90 Hi-C 24141950 ATG16L2 139039 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 72808468 72808618 72808564 Y NA FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 42688 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 72915825 72916228 72915957 Y NA P2RY2 FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT IMR90 Hi-C 24141950 P2RY2 11115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 73095869 73096760 73096281 Y FCHSD2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 10560 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 75748582 75748924 75748753 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 170856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 76379578 76379896 76379659 Y NA RP11-672A2.5 NA NA NA NA LRRC32 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 77898869 77899120 77899016 Y RSF1,INTS4 USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 1001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr11 78003105 78003596 78003355 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 105237 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 78029499 78029864 78029682 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 97530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 78048124 78048554 78048530 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 78840 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 78060066 78060579 78060413 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 66815 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 78073883 78074276 78074154 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 53118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 85463912 85464270 85464111 Y CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2 NA CCDC89 IMR90 Hi-C 24141950 SYTL2 55914 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 86025840 86026030 86025935 Y NA C11orf73 NA NA NA NA C11orf73 14587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 86804343 86804452 86804398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 57457 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr11 92083144 92083535 92083339 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 845595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 94317425 94317695 94317494 Y PANX1,ANKRD49,FUT4 FUT4 NA NA NA NA FUT4 42408 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 95745158 95745721 95745455 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 88679 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 95886290 95886343 95886317 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 188001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 95901866 95902123 95902033 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 172221 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 95996412 95996766 95996624 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 77578 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 96071900 96072294 96072196 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 2050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 100043788 100043797 100043793 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 512587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 106220892 106221244 106221068 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD3 274400 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 107187292 107187599 107187573 Y NA NA NA NA NA NA CWF19L2 138973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 109961258 109961641 109961417 Y ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 446 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 110326620 110326859 110326678 Y NA FDX1 NA NA NA NA FDX1 28013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 113936589 113937256 113936682 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 8274 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 113970182 113970266 113970224 Y NA ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 41867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 113999597 113999969 113999698 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB16 71282 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 114031661 114032121 114031976 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 94388 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 88293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA APOC3,APOA1 NA NA NA NA APOA1 15568 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 116867531 116867975 116867966 Y NA NA NA NA NA NA SIK3 99178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 116884410 116884712 116884644 Y NA NA NA NA NA NA SIK3 82441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 116909494 116909823 116909659 Y NA NA NA NA NA NA SIK3 57330 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118051304 118051408 118051361 Y DSCAML1,FXYD6,FXYD6,TMEM25,SCN4B,SCN4B,SCN2B SCN4B,SCN2B NA NA NA NA SCN2B 5916 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118740767 118741727 118741016 Y MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6 MIR4492 DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4492 37690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118763139 118763505 118763387 Y NA MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 15912 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 10.0288894917018 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA UPK2 1525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 119554350 119554716 119554654 Y TRIM29,PVRL1 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 43078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr11 119612950 119613345 119613188 Y NA PVRL1 PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 15156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 122727425 122727730 122727613 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P23 176845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 123015903 123016112 123016008 Y NA CLMP NA NA NA NA CLMP 47877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 124587333 124587525 124587429 Y NA SPA17,SIAE,NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA NRGN 20217 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA ESAM 38702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 125696963 125697011 125697006 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 54498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 125697407 125697462 125697419 Y NA NA NA NA NA NA HYLS1 54047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr11 128387749 128388099 128387998 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 67354 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129315060 129315380 129315220 Y BARX2 NA NA NA NA NA BARX2 71225 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129317318 129317884 129317614 Y NA NA NA NA NA NA BARX2 73483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129723853 129724184 129723902 Y NFRKB TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 39301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129730176 129730501 129730339 Y TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 32984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 130016455 130016576 130016492 Y NA ST14 NA NA NA NA ST14 10881 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 131630069 131630486 131630160 Y NA NA NA NA NA NA SNX19 845665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr11 133820960 133821043 133820967 Y IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 3837 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 574296 574697 574406 Y B4GALNT3 B4GALNT3 NA NA NA NA B4GALNT3 6766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 825731 826001 825891 Y B4GALNT3 WNK1 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 WNK1 33758 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.01444474585088 chr12 864034 864343 864158 Y CCDC77,KDM5A WNK1 NA NA NA NA WNK1 4275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 1698978 1699322 1699295 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2175107 2175395 2175116 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 63406 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2364427 2364812 2364581 Y LRTM2 NA NA NA NA NA DCP1B 252726 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2445525 2445973 2445758 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 333824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2451063 2451405 2451244 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 339362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2454250 2454342 2454280 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 342549 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2547305 2547477 2547330 Y NA NA NA NA NA NA CBX3P4 353984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 2555271 2555641 2555456 Y NA NA NA NA NA NA CBX3P4 345820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 3180278 3180396 3180348 Y NA TSPAN9 TSPAN9 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN9 4125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 3361586 3361942 3361797 Y NA RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 42490 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 6183650 6183782 6183713 Y VWF VWF NA NA NA NA VWF 48154 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 6193943 6194225 6194059 Y NA VWF NA NA NA NA VWF 37711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 6202352 6202551 6202452 Y CD9,ANO2 VWF NA NA NA NA VWF 29385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 7058106 7058233 7058157 Y ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA C12orf57 7965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 8.63598817340984 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 8763701 8764050 8764012 Y AICDA RP11-561P12.5,SCARNA11,MFAP5 NA NA NA NA SCARNA11 15596 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 8797579 8797828 8797667 Y NA SCARNA11,MFAP5,RIMKLB NA NA NA NA MFAP5 15656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 8813796 8814159 8813977 Y MFAP5 MFAP5,RIMKLB NA NA NA NA MFAP5 312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 8828014 8828577 8828369 Y NA MFAP5,RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 3619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP A2M NA NA NA NA A2M 42107 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 9802084 9802505 9802358 Y CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D NA NA NA NA NA CD69 108992 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 9855016 9855380 9855049 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2B,CLECL1,CD69 NA NA NA NA NA CD69 56117 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr12 11986979 11987463 11987102 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 186191 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 12592534 12593034 12592768 Y BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA NA NA NA NA LOH12CR1 84521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 12663035 12663537 12663259 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 49780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 12838362 12838488 12838431 Y KIAA1467,GSG1 CDKN1B,APOLD1 NA NA NA NA CDKN1B 27504 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 15315937 15316391 15316153 Y NA NA NA NA NA NA RERG 183218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 20047799 20048015 20047920 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 172430 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 20069508 20069793 20069676 Y PDE3A NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 194139 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A NA LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-146P 224306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 22428776 22428931 22428867 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA1 159044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr12 24414416 24414645 24414531 Y NA NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 298879 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 24860265 24860471 24860427 Y BCAT1 NA NA NA NA NA RP11-444D3.1 146741 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr12 26130090 26130317 26130202 Y NA RASSF8,RASSF8-AS1 NA NA NA NA RASSF8-AS1 19392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 26484826 26485166 26485077 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 207276 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 244986 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 26921613 26921734 26921675 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 62397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 27593588 27593602 27593594 Y C12orf71 NA NA NA NA NA PPFIBP1 80762 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 29844514 29844723 29844664 Y NA NA NA NA NA NA TMTC1 90969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 31524246 31524432 31524371 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 46254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 31899631 31900083 31899901 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 19523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 31909925 31910440 31910295 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 29817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA FGD4 123503 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 32842101 32842415 32842258 Y NA DNM1L NA NA NA NA DNM1L 11967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 39539251 39539539 39539453 Y NA NA NA NA NA NA CPNE8 240019 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 40382618 40382994 40382971 Y LRRK2 NA NA NA NA NA SLC2A13 114897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 42470575 42470704 42470641 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 65977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 45627812 45628672 45628351 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 19988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 45703000 45703363 45703138 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 95176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46380247 46380714 46380477 Y SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 3189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46832663 46832984 46832824 Y NA NA SLC38A2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 57201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46887386 46887956 46887679 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 111924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 46949340 46949533 46949437 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 173878 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 49762011 49762098 49762055 Y TUBA1A,PRPF40B TROAP,C1QL4,SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 3644 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 49866902 49867154 49867028 Y PRPF40B,PRPF40B NA NA NA NA NA KCNH3 63786 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 50019010 50019299 50019155 Y FMNL3 NA NA NA NA NA PRPF40B 59009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 50913232 50913640 50913328 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 16464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 51177941 51178161 51178051 Y POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 22448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA METTL7A NA NA NA NA METTL7A 12329 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 51551925 51552239 51552062 Y NA TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 12687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 51768324 51768713 51768389 Y NA SLC4A8,GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A8 14388 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52146424 52146626 52146525 Y NA NA NA NA NA NA ACVRL1 152066 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 52438176 52438423 52438378 Y NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 22607 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 52438699 52439014 52438738 Y ACVR1B,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 22016 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 52629756 52630207 52629959 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 5452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7 NA NA NA NA KRT7 49739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr12 52888449 52888608 52888529 Y C12orf44,KRT6A,KRT5 KRT6A NA NA NA NA KRT6A 3408 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 53261473 53261693 53261598 Y KRT2,KRT1,KRT77 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85 IMR90 Hi-C 24141950 KRT4 55138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT4 58707 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 61446 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 53270322 53270511 53270351 Y RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78 NA EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 63987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.29302500950926 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 54372759 54373189 54372957 Y HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10 HOXC13,HOXC13-AS,HOXC12,HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1 NA NA NA NA HOXC10 3660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 11.9789513373104 chr12 57462088 57462242 57462164 Y R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6 TAC3,MYO1A,TMEM194A,NAB2 TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194A 17604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 57751585 57751906 57751872 Y R3HDM2 NA INHBC IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 70882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 62983522 62983540 62983531 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 10992 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 63096065 63096306 63096205 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 100599 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 64349679 64350074 64349795 Y TBK1 NA NA NA NA NA SRGAP1 113606 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 64401221 64401399 64401310 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 165148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 64574864 64574988 64574911 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 39088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 65076423 65076649 65076481 Y NA NA NA NA NA NA RASSF3 74130 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr12 69070582 69070990 69070845 Y MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2 RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA NUP107 7524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 69316243 69316419 69316405 Y RAP1B,CPM,CPM CPM NA NA NA NA CPM 46931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 69593360 69593487 69593424 Y NA CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 37830 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA NA NA NA NA NA LYZ 53247 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 69806775 69807146 69806965 Y NA NA NA NA NA NA FRS2 54983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 70007126 70007281 70007265 Y LRRC10 CCT2,LRRC10 NA NA NA NA LRRC10 4184 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 70937766 70937789 70937778 Y NA NA NA NA NA NA PTPRB 91431 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 76215246 76215339 76215312 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,KRR1,GLIPR1,OSBPL8 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PHLDA1 210373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 78314644 78314773 78314679 Y NA NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 598223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 79363511 79363565 79363558 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 719312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 80085577 80085980 80085873 Y NA PAWR NA NA NA NA PAWR 2700 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 80098707 80098999 80098853 Y NA PAWR SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 15830 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 80327802 80327850 80327826 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 81096686 81096945 81096788 Y MYF5 NA NA NA NA NA ACSS3 232649 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 81271643 81271697 81271669 Y LIN7A NA NA NA NA NA ACSS3 57897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 82350374 82350688 82350420 Y CCDC59 NA NA NA NA NA CCDC59 399896 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 89630105 89630296 89630227 Y DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 114752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 90065963 90066366 90066126 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 34711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 92341288 92341601 92341484 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 193089 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 92427755 92427874 92427825 Y CLLU1,BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 106816 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 64494 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 92941921 92942046 92942003 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 379061 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 93770329 93770575 93770474 Y NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 94439564 94439856 94439735 Y SOCS2 NA CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNC1 100643 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 95939436 95939751 95939594 Y NA USP44 NA NA NA NA USP44 3515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 96627830 96628313 96628063 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 41670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 96637849 96638243 96638007 Y LTA4H,ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 51689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 97355714 97355975 97355919 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 56713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 97881336 97881621 97881374 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 582335 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 98487338 98487732 98487536 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-41P 322084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 99768760 99769016 99768892 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 731841 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 102854134 102854528 102854507 Y NA IGF1 NA NA NA NA IGF1 17895 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 EID3 96042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 105038686 105039023 105038871 Y CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA SLC41A2 311499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 105812004 105812354 105812179 Y NA NA NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 APPL2 183988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 107856980 107857227 107857220 Y NA NA NA NA NA NA BTBD11 146790 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA DAO NA NA NA NA DAO 30 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 110735237 110735389 110735298 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 18676 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 111001824 111001977 111001904 Y NA PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 17148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr12 112363158 112363241 112363200 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK5 85376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 113911337 113912000 113911521 Y NA SDS NA NA NA NA SDS 49231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr12 120433844 120433899 120433873 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 119407 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 120445148 120445418 120445237 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 107888 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 121968421 121968751 121968672 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B NA NA NA NA RP13-941N14.1 47946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 122224293 122224471 122224351 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 14838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 122771781 122771848 122771815 Y NA VPS33A NA NA NA NA VPS33A 22713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 123367402 123367963 123367875 Y VPS37B VPS37B NA NA NA NA VPS37B 11028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 123963389 123963624 123963440 Y RILPL1 RILPL2,SNRNP35 NA NA NA NA SNRNP35 23201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 41116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 132203397 132203510 132203472 Y ULK1 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 9771 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 22135396 22135683 22135678 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 65471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 23973487 23973793 23973652 Y NA SACS NA NA NA NA SACS 32048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 24365850 24365860 24365855 Y NA NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 95168 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH SPATA13 SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 23252 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 24701250 24701640 24701393 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 149306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 27834117 27834352 27834235 Y USP12 RPL21,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 8112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 28762730 28762825 28762778 Y NA EEF1A1P3 NA NA NA NA EEF1A1P3 23825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 29106909 29107160 29107135 Y NA FLT1 FLT1,PAN3,POMP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FLT1 39644 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 30415465 30415864 30415857 Y NA UBL3 NA NA NA NA UBL3 6957 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.85018553682602 chr13 31783320 31783649 31783428 Y C13orf26,B3GALTL HSPH1,B3GALTL NA NA NA NA B3GALTL 11247 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 32501315 32501650 32501483 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 82337 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 33051019 33051050 33051035 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2L1 50704 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 33698210 33698586 33698501 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 224181 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 33728009 33728149 33728045 Y STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 194618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 36630888 36631287 36631099 Y DCLK1 NA NA NA NA NA DCLK1 72156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 40139698 40140018 40139948 Y NA LHFP NA NA NA NA LHFP 35647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 40331110 40331478 40331245 Y NA NA NA NA NA NA COG6 103346 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41519573 41519973 41519773 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25663 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41554566 41554842 41554704 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 60656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41574237 41574406 41574394 Y FOXO1,NAA16,ELF1,ELF1 NA NA NA NA NA WBP4 59004 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 41581586 41581700 41581679 Y NA NA NA NA NA NA WBP4 51710 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41589057 41589218 41589148 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 44192 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 42162855 42163294 42163201 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 279514 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 42188044 42188379 42188211 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 304703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 42219317 42219744 42219583 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 335976 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 42225921 42226073 42225966 Y NAA16,C13orf15 NA NA NA NA NA NAA16 342580 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 42422497 42422720 42422629 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 421569 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 42453037 42453433 42453235 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 390856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 45774024 45774110 45774098 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 81374 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 46082201 46082375 46082214 Y NA COG3 NA NA NA NA COG3 45141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 46709325 46709604 46709495 Y NA NA NA NA NA NA LCP1 74402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr13 50094191 50094472 50094332 Y CAB39L,SETDB2,PHF11,PHF11 PHF11 NA NA NA NA PHF11 26445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 50216185 50216584 50216280 Y CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11 EBPL NA NA NA NA EBPL 47027 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 51210187 51210463 51210320 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RNASEH2B 271351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 52505834 52506318 52505967 Y NA NA NA NA NA NA ALG11 78216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 52572353 52572390 52572372 Y NA ALG11,UTP14C NA NA NA NA ALG11 12144 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 53028749 53028807 53028779 Y NA VPS36,CKAP2 NA NA NA NA CKAP2 1185 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 60207741 60207943 60207842 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 528178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 60338539 60338813 60338676 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 397308 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 60580804 60581154 60581101 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 154967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 67168022 67168413 67168283 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 634055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 127240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr13 72316062 72316072 72316067 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 123258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 74326809 74326882 74326846 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 379512 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 74377303 74377556 74377430 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 328838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 74706134 74706569 74706487 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 75904010 75904233 75904150 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 150017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 75966064 75966537 75966363 Y TBC1D4 NA NA NA NA NA TBC1D4 87713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 76159377 76159493 76159435 Y NA COMMD6,UCHL3,LMO7 NA NA NA NA LMO7 33077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 76390114 76390391 76390144 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 197544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 77166796 77167041 77166918 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 291499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 77599424 77599520 77599503 Y NA RPL7P44,DHX9P1,CLN5,FBXL3 NA NA NA NA FBXL3 94 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr13 78114380 78114627 78114504 Y NA SCEL NA NA NA NA SCEL 6571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 78158324 78158538 78158433 Y MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB NA NA NA NA NA SCEL 50515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 80078013 80078214 80078058 Y NA NDFIP2 NA NA NA NA NDFIP2 24726 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 80122895 80122985 80122937 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 69608 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 92871734 92872145 92872019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 161637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 373196 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 96164777 96165033 96164905 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1 129924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 96350660 96350996 96350828 Y NA DNAJC3-AS1,DNAJC3 NA NA NA NA DNAJC3 23267 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 99403586 99403810 99403698 Y SLC15A1 SLC15A1 NA NA NA NA SLC15A1 678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 99698656 99698961 99698809 Y DOCK9 DOCK9 NA NA NA NA DOCK9 37918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 99930007 99930140 99930028 Y GPR183 NA NA NA NA NA UBAC2 78979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 100008605 100009044 100008755 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 142627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 101046682 101046918 101046816 Y A2LD1 NA NA NA NA NA RPS26P47 143610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 102627010 102627363 102627187 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 417506 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 109115794 109116062 109115942 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD13 247067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 109847392 109847697 109847628 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 557918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr13 111022548 111022884 111022711 Y ING1 NA NA NA NA NA COL4A1 65052 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 111623981 111624100 111624039 Y ING1,C13orf16 NA ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 58565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 113179985 113180373 113180107 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP3 60108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 113597069 113597276 113597160 Y MCF2L MCF2L-AS1 MCF2L,MCF2L-AS1,F10,F7,CUL4A H1ESC,HELA,K562,IMR90,MCF7 5C,Hi-C,ChIA-PET 22955621,24141950,22265404 MCF2L-AS1 23862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 113870568 113870732 113870682 Y MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10 CUL4A,PCID2 NA NA NA NA PCID2 9539 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr13 113928610 113928824 113928747 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 20732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE6,RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 19176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA RNASE2,METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 23581955 23582147 23582068 Y CEBPE C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 19132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 23879213 23879548 23879409 Y MYH6,MYH7 EFS,MYH6,CTD-2201G16.1,MIR208B,MYH7 NA NA NA NA CTD-2201G16.1 3000 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 23912649 23912990 23912825 Y MYH6,MYH7 MYH6,CTD-2201G16.1,MIR208B,MYH7,NGDN IL25,CMTM5,MYH7,MYH6 IMR90 Hi-C 24141950 MYH7 9722 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA AP1G2 128484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 24755187 24755313 24755250 Y DHRS4L1 TINF2,TGM1,RABGGTA,DHRS1,CIDEB,LTB4R,ADCY4 NA NA NA NA DHRS1 11726 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 27376789 27377008 27376899 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 1580108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 32261719 32262250 32261957 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5 281070 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr14 33093045 33093198 33093106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 141039 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 33106586 33106949 33106623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 154580 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 33776924 33777310 33777048 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 824918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 34504920 34505230 34505078 Y NA NA EGLN3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 424332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 34532843 34533079 34532927 Y EGLN3 NA NA NA NA NA SPTSSA 396483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 35090811 35090907 35090859 Y NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 6482 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 35325148 35325514 35325424 Y PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA RP11-73E17.2 16035 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 35562791 35563105 35562948 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA PPP2R3C 26618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 35860207 35860491 35860330 Y SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 11464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 37134370 37134658 37134514 Y NA PAX9 NA NA NA NA PAX9 9597 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 37785804 37785829 37785809 Y NA NA NA NA NA NA MIPOL1 120686 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 38057887 38058022 38057995 Y FOXA1 RP11-356O9.1,RP11-356O9.2,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 5030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 39664073 39664414 39664121 Y SIP1,PNN TRAPPC6B,PNN NA NA NA NA PNN 21686 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 39900071 39900466 39900211 Y PNN,CTAGE5,FBXO33 FBXO33 NA NA NA NA FBXO33 367 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 41662407 41662459 41662451 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1762703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 45483090 45483569 45483224 Y NA KLHL28 NA NA NA NA KLHL28 25956 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 45554390 45554749 45554468 Y NA KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM NA NA NA NA PRPF39 3088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RPS29 687333 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50237132 50237443 50237218 Y KLHDC2 KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 4806 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA NA NA NA NA NA RP11-58E21.3 66080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 37101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 50531720 50532221 50531875 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 25773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 50926261 50926342 50926322 Y MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1 CDKL1 NA NA NA NA CDKL1 45082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 41219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 52499515 52499529 52499523 Y NA C14orf166,NID2 NA NA NA NA NID2 34183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55035984 55036343 55036300 Y SAMD4A SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 4169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55073001 55073254 55073103 Y NA SAMD4A NA NA NA NA SAMD4A 41186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55115744 55116109 55115959 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 83929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55116749 55117607 55117330 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 84934 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55173516 55173842 55173679 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 141701 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 11.4217908099937 chr14 55589429 55589640 55589507 Y NA LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 601 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 55921336 55921695 55921412 Y NA ATG14 NA NA NA NA ATG14 44760 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 57316970 57317076 57317023 Y OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 416650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 59001974 59002022 59001998 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96663 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 61946614 61946719 61946667 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 159078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 61960753 61960767 61960760 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 173217 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 61983792 61983968 61983885 Y SYT16 NA NA NA NA NA HIF1A 176263 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 63983921 63984319 63984190 Y NA PPP2R5E NA NA NA NA PPP2R5E 23773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64170371 64170528 64170450 Y NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 22229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64185455 64185764 64185678 Y PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1 SGPP1,RP11-804M7.2 NA NA NA NA SGPP1 6993 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 64342094 64342269 64342170 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 24411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64358003 64358294 64358235 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 40320 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64403874 64404095 64403883 Y NA NA NA NA NA NA SYNE2 86191 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 64584533 64584935 64584736 Y NA NA NA NA NA NA SYNE2 266850 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA MTHFD1 147420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 65256809 65256946 65256906 Y NA NA PLEKHG3 IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 87655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 67478288 67478352 67478320 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 227474 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68033590 68034347 68033627 Y NA PLEKHH1,TMEM229B,PIGH NA NA NA NA PIGH 30657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 68712620 68712855 68712738 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 174058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 69065409 69066172 69065453 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 178496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 69544472 69544808 69544638 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 73059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 70251267 70251371 70251319 Y SLC10A1 NA NA NA NA NA SRSF5 59650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 NA NA NA NA NA TTC9 58030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 52112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 72050156 72050543 72050232 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 263625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 72083404 72083762 72083537 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 296873 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 74207610 74207866 74207660 Y C14orf43 PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 28482 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 74949377 74949710 74949544 Y NA MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA MIR4709 4470 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 75607767 75608156 75607957 Y FOS RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NEK9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK9 15720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 75920164 75920191 75920178 Y JDP2 JDP2,RP11-293M10.6 NA NA NA NA RP11-293M10.6 27720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 76234838 76235006 76234846 Y NA NA TGFB3,IFT43 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf1 109306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 76401422 76401643 76401519 Y ESRRB,TGFB3 IFT43,TGFB3 NA NA NA NA IFT43 34943 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 77591216 77591790 77591612 Y TMED8,NGB TMEM63C NA NA NA NA TMEM63C 10305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 78144886 78145071 78144891 Y NA ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 27292 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 NA NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 STON2 NA NA NA NA STON2 33193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 81977973 81978150 81978054 Y NA SEL1L NA NA NA NA SEL1L 20055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 90761350 90761506 90761428 Y NA PSMC1 NA NA NA NA PSMC1 40511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 90875651 90876041 90875751 Y NA RPL21P11,CALM1 NA NA NA NA CALM1 14805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 91144906 91145003 91144959 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 135820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 91423143 91423331 91423289 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA C14orf159 101346 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 91454457 91454803 91454684 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 69874 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA GPR68 NA NA NA NA GPR68 34727 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 91734470 91734656 91734563 Y NA GPR68 GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 GPR68 16201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 92996224 92996503 92996297 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 18106 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 93190849 93191078 93190938 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 21969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 94431614 94431935 94431778 Y SERPINA1,ASB2 ASB2 NA NA NA NA ASB2 9202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 95724003 95724377 95724190 Y DICER1,DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 59866 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 95981456 95981771 95981695 Y NA GLRX5,SCARNA13,SNHG10 NA NA NA NA GLRX5 16069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 99503090 99503470 99503396 Y CCNK NA NA NA NA NA SETD3 441746 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,HHIPL1 NA NA NA NA CCDC85C 3288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 100448901 100449138 100448963 Y NA EVL EML1,EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 EVL 13115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA DEGS2,YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DEGS2 34673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr14 100768169 100768349 100768287 Y NA SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 2535 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 100807709 100808060 100808026 Y WDR25,WDR25,WARS,WARS SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 22905 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 102277268 102277494 102277347 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA PPP2R5C 51133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 103112299 103112666 103112355 Y NA NA NA NA NA NA RCOR1 55301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 103541337 103541574 103541446 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 19538 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 104315137 104315546 104315446 Y NA PPP1R13B NA NA NA NA PPP1R13B 3210 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr14 104582105 104582467 104582315 Y NA ASPG,MIR203,KIF26A NA NA NA NA MIR203 363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 104583053 104583460 104583371 Y NA ASPG,MIR203,KIF26A NA NA NA NA MIR203 1311 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 16.1576552921862 chr14 105148231 105148612 105148591 Y INF2 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 5331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 105191285 105191466 105191451 Y NA INF2,ADSSL1,SIVA1 NA NA NA NA ADSSL1 2762 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 105294003 105294327 105294166 Y NA AKT1 NA NA NA NA AKT1 33915 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr14 106164516 106164556 106164555 Y NA IGHG1 NA NA NA NA IGHG1 42852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA IGHV2-70 75593 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 25587380 25587405 25587393 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 94723 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 25641447 25641749 25641585 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 40379 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 25646289 25646668 25646556 Y SNURF,SNRPN,UBE3A UBE3A NA NA NA NA UBE3A 35460 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 26104619 26105255 26104951 Y UBE3A,ATP10A NA NA NA NA NA UBE3A 422491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA TJP1 236254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 30128383 30128423 30128398 Y NA NA NA NA NA NA TJP1 130645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 35014105 35014549 35014217 Y NA GJD2 AQR,GJD2 IMR90 Hi-C 24141950 GJD2 30617 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 36897694 36898088 36897999 Y C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 27882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 38784019 38784367 38784201 Y RASGRP1 FAM98B NA NA NA NA FAM98B 39691 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 39110575 39110868 39110718 Y NA NA THBS1,FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 366247 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 39120412 39120746 39120579 Y C15orf54 NA THBS1,FSIP1,C15orf53,C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 376084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 40339886 40340243 40340062 Y PLCB2,BMF,BMF,BMF SRP14 NA NA NA NA SRP14 10497 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B,PAK6 NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 41852021 41852342 41852130 Y MAPKBP1,JMJD7,ITPKA,TYRO3 RPAP1,TYRO3 NA NA NA NA TYRO3 4148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 42213328 42213713 42213448 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 49063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 42220921 42221174 42221042 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 41602 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 42232566 42232958 42232887 Y EHD4 EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 29818 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 42652869 42653169 42653037 Y ZFP106,STARD9,CAPN3 NA NA NA NA NA TMEM87A 89008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 43361299 43361456 43361377 Y TP53BP1 UBR1 NA NA NA NA UBR1 34855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48,RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 28588 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 55514036 55514211 55514088 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 26771 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 110027 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 59688558 59688897 59688728 Y NA FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1 MYO1E,LDHAL6B,FAM81A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-356M20.1 9456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 60818402 60818756 60818740 Y RORA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA RP11-219B17.1 49025 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 60865969 60866384 60866286 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 96592 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 61051185 61051571 61051320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 281808 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 63483586 63483819 63483690 Y NA RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RAB8B 3918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 63789918 63790251 63790145 Y HERC1,LACTB,RAB8B,APH1B,USP3 USP3 NA NA NA NA USP3 4542 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64397616 64397971 64397713 Y SNX1 DAPK2,FAM96A,SNX1,SNX22 NA NA NA NA SNX1 13294 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64754012 64754177 64754162 Y NA ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 3071 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 64997362 64997587 64997475 Y MTFMT OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 3882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 65054489 65054592 65054541 Y NA RBPMS2 NA NA NA NA RBPMS2 11194 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr15 65403116 65403434 65403296 Y ANKDD1A,PDCD7 RASL12,PDCD7 UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD7 20740 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 68657439 68657730 68657635 Y NA NA NA NA NA NA ITGA11 64771 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 69490173 69490404 69490203 Y NA GLCE NA NA NA NA GLCE 39250 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 70101259 70101454 70101340 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 287061 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 70771310 70771756 70771622 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 282176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 70787270 70787553 70787302 Y TLE3 NA TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 266379 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 71406673 71406868 71406715 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 223549 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 564145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA SENP8 205591 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 73032689 73032951 73032815 Y PARP6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 43236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 73061587 73061861 73061724 Y PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 14326 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 73939698 73939908 73939794 Y NA NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 15223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr15 73978221 73978605 73978367 Y NA CD276 NA NA NA NA CD276 3914 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 74688835 74689193 74688950 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35615 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 75081771 75082003 75081872 Y ARID3B,CLK3,C15orf39,CSK CSK,LMAN1L NA NA NA NA CSK 9373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 76543637 76543996 76543963 Y NA NA C15orf27 IMR90 Hi-C 24141950 ETFA 57817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 76658083 76658321 76658202 Y NA ISL2 NA NA NA NA ISL2 31018 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 77785821 77785911 77785867 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 75067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 85361646 85361991 85361963 Y ALPK3 ALPK3 NA NA NA NA ALPK3 3735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 85711891 85712151 85712051 Y NA NA PDE8A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE8A 190220 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 86020857 86021180 86020870 Y KLHL25 NA NA NA NA NA AKAP13 99055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 86267980 86268030 86268003 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 89664635 89664981 89664666 Y NA ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 12745 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG,LINC00925 NA NA NA NA POLG 18820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 90402022 90402269 90402146 Y NA ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 33305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA NA NA NA NA NA C15orf38 93730 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 90608117 90608795 90608159 Y ANPEP,ZNF710,IQGAP1,CIB1 IDH2 NA NA NA NA IDH2 34941 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 90951105 90951410 90951208 Y FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 21655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.34296316390058 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr15 92486040 92486252 92486096 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 92491615 92492039 92491744 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 96690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 93864881 93865242 93865107 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 234448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 95029258 95029308 95029272 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 256491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 96703320 96703585 96703453 Y NA NA LOC400456,NR2F2 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 163582 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA NA PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 SYNM 77228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr15 100243855 100244145 100244036 Y NA LYSMD4 NA NA NA NA LYSMD4 27621 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS17 228628 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 101690019 101690289 101690153 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 99848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr15 101986303 101986813 101986523 Y CHSY1,TM2D3 NA NA NA NA NA PCSK6 76592 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 615969 616302 616108 Y RGS11,NHLRC4 PIGQ,NHLRC4,RAB40C NA NA NA NA NHLRC4 973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr16 1963457 1963729 1963593 Y HS3ST6 HS3ST6,RPL3L,NDUFB10,RPS2,SNHG9 C16orf73,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 2712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 HS3ST6,RPL3L,NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 13288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 2845811 2846048 2845884 Y OR1F1,ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 SRRM2,TCEB2 NA NA NA NA TCEB2 20513 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 2910811 2910988 2910899 Y ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA PRSS22 4640 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA CLDN9 6232 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA SRL 55999 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 4582537 4582680 4582608 Y NA NMRAL1 HMOX2,NMRAL1 IMR90 Hi-C 24141950 NMRAL1 38773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr16 4880649 4880773 4880729 Y NA ROGDI,UBN1,GLYR1 NA NA NA NA UBN1 13893 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 6353433 6353832 6353638 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1207624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 8931520 8931573 8931545 Y NA TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 29293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 9221431 9221974 9221622 Y USP7,C16orf72 C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 37926 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 11654480 11655021 11654741 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 73216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 11705983 11706695 11706338 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF LITAF,TXNDC11,SNN,CLEC16A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 21542 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 12214197 12214304 12214287 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 145603 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 12224376 12224580 12224411 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 155782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 12700714 12700789 12700756 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 195085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 12761788 12762198 12762001 Y NA NA NA NA NA NA CPPED1 133676 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 14424623 14424858 14424825 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 261445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 15140552 15140757 15140655 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 7164 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 17685725 17686159 17686027 Y NA NA NA NA NA NA RPS15A 1113546 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 21620302 21620588 21620483 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 13763 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 22406960 22407340 22407096 Y NA CDR2,RRN3P3 POLR3E,CDR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDR2 39146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 25005690 25005854 25005767 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 19133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 25121755 25122029 25121858 Y SLC5A11 LCMT1 NA NA NA NA LCMT1 705 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 27275592 27275718 27275658 Y NA NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 2397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 28204572 28204722 28204690 Y CCDC101,APOBR,XPO6,SBK1 XPO6 NA NA NA NA XPO6 16519 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 29150851 29151075 29150925 Y NA NA SPNS1 IMR90 Hi-C 24141950 SPNS1 167309 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT QPRT NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 46671518 46671564 46671541 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 17980 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 46780849 46781142 46780994 Y MYLK3 MYLK3 NA NA NA NA MYLK3 41177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 46792369 46792477 46792422 Y MYLK3 MYLK3 MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 MYLK3 29842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 49888231 49888307 49888269 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 209545 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 412080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 52643083 52643359 52643113 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 443586 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 53086726 53087108 53087065 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 57125471 57125887 57125617 Y NA CPNE2 NA NA NA NA CPNE2 1022 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 57682541 57682687 57682607 Y GPR114,C16orf80 GPR56 NA NA NA NA GPR56 39977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 57860886 57861304 57861251 Y NA KIFC3 CNGB1,KATNB1,KIFC3 IMR90 Hi-C 24141950 KIFC3 33653 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 58451447 58451830 58451588 Y GOT2,NDRG4 NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 42920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 58455011 58455230 58455100 Y NA NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 39520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 58460815 58461210 58460990 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NDRG4 NA NA NA NA NDRG4 33540 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 62925701 62925982 62925842 Y NA NA NA NA NA NA CDH5 3472551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 66937613 66937811 66937712 Y NOL3,NOL3,RRAD NAE1,PDP2,RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 19736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 66939054 66939376 66939271 Y NA NAE1,PDP2,RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 18171 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 67561753 67561884 67561820 Y HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A ATP6V0D1,FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 11432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 68794775 68795028 68794920 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 25647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 68804487 68804868 68804749 Y NA CDH1 NA NA NA NA CDH1 35359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 68818214 68818347 68818232 Y CDH1 CDH1 NA NA NA NA CDH1 49086 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 68824913 68825217 68824976 Y NA NA NA NA NA NA CDH1 55785 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 69548359 69548541 69548428 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2 IMR90 Hi-C 24141950 NFAT5 48456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 72882732 72883050 72882991 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 208547 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 74539925 74540002 74539964 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 99010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 75420812 75420988 75420900 Y NA CFDP1 CTRB1,BCAR1,CTRB2 IMR90 Hi-C 24141950 CFDP1 44395 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 78325751 78325980 78325865 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 194441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 78565966 78565983 78565974 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 434656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 81842710 81842821 81842738 Y PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 72008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 83480656 83480733 83480694 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 358715 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 83960761 83960901 83960832 Y NA MLYCD,OSGIN1 NA NA NA NA OSGIN1 18986 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr16 84130238 84130438 84130330 Y NA MBTPS1,HSDL1,DNAAF1 NA NA NA NA MBTPS1 18073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85387544 85387685 85387655 Y NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA0513 328169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85558121 85558453 85558347 Y KIAA0182,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 163226 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85591342 85591727 85591695 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 129952 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 85780154 85780247 85780189 Y NA C16orf74,COX4I1 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 2488 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA MAP1LC3B 36450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 87759379 87759621 87759456 Y C16orf95,FBXO31,ZCCHC14,JPH3 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 37977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 87875229 87875683 87875262 Y CA5A SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 25411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 87904170 87904524 87904347 Y FBXO31 SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 3076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 88063556 88063600 88063578 Y BANP,BANP,BANP NA NA NA NA NA BANP 82706 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 88831388 88831665 88831630 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 17954 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 89475542 89475927 89475838 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 79042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr16 89573610 89573931 89573734 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 18285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 209872 210104 209987 Y VPS53 RPH3AL,C17orf97 NA NA NA NA RPH3AL 23941 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA HIC1 70567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 2385753 2385870 2385809 Y SMG6,SMG6,MNT,RAP1GAP2,METTL16 METTL16 SGSM2,MNT IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 27315 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 2771532 2771614 2771573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 93182 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 2863545 2863659 2863602 Y OR3A2,OR1G1 NA NA NA NA NA RAP1GAP2 185195 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 3453416 3453706 3453615 Y OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3 TRPV3 NA NA NA NA TRPV3 5583 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 3653999 3654456 3654363 Y OR3A2,OR1E2,ATP2A3 GSG2,ITGAE NA NA NA NA GSG2 28788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 4297300 4297441 4297368 Y NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29377 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 4297689 4298014 4297723 Y NA UBE2G1 UBE2G1,SPNS3,ANKFY1,ZZEF1,CYB5D2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2G1 29766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 4386875 4387235 4387089 Y NA SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 12898 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 4430442 4430571 4430507 Y ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2 SPNS2,MYBBP1A,GGT6 NA NA NA NA MYBBP1A 26355 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 4752478 4752731 4752552 Y ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 17795 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 4753672 4753828 4753714 Y UBE2G1,ARRB2,CXCL16,ZMYND15,ZMYND15,MINK1,RNF167,C17orf107 PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 18989 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 5448398 5448614 5448506 Y NLRP1 NA MIS12,DERL2 IMR90 Hi-C 24141950 DERL2 60267 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 6822879 6823265 6823073 Y NA NA NA NA NA NA RNASEK 90471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.34296316390058 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 6.12876580048441 chr17 7784207 7784538 7784352 Y POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2 KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA CHD3 1586 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8803810 8804043 8803964 Y NDEL1,PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA PIK3R5 62986 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8857526 8857964 8857839 Y PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 9065 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 8869986 8870720 8870441 Y PIK3R5,PIK3R5 PIK3R5 NA NA NA NA PIK3R5 2957 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 9133558 9133821 9133662 Y NA NA NA NA NA NA NTN1 210699 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 13575065 13575361 13575332 Y NA NA NA NA NA NA COX10-AS1 395451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 15141283 15141756 15141580 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 24887 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 16310492 16310776 16310647 Y NA UBB,TRPV2 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 6080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 16922074 16922240 16922157 Y NA MPRIP FLCN,MPRIP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MPRIP 21619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 17439265 17439511 17439439 Y NA RASD1 NA NA NA NA RASD1 41556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 17470517 17470759 17470631 Y LRRC48 PEMT RASD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PEMT 22263 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 17874756 17875050 17874778 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA LRRC48 629 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 18153652 18153819 18153756 Y NA LLGL1,FLII NA NA NA NA FLII 6411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 20690369 20690534 20690439 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 4411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 21070786 21070950 21070861 Y NA DHRS7B,AC087294.2,TMEM11 NA NA NA NA AC087294.2 44694 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25568498 25568933 25568830 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 50169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 10.5860500190185 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25833655 25833928 25833707 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 51985 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25858035 25858294 25858209 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 76365 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 25981784 25982180 25981982 Y NA LGALS9 NA NA NA NA LGALS9 26960 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 26216019 26216352 26216295 Y NA NA NA NA NA NA NLK 150411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 26368091 26368384 26368254 Y NA NLK NA NA NA NA NLK 1328 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 27429797 27430178 27430111 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 75252 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 28019224 28019454 28019389 Y NSRP1,NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 71299 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 28050852 28051063 28050953 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 102927 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 28053660 28054255 28054185 Y NUFIP2,TAOK1 NA NA NA NA NA CORO6 105735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 28210608 28210734 28210655 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 44560 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2A NA NA NA NA EVI2A 9262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 33383216 33383365 33383329 Y SLFN5,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 30973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 33391990 33392005 33391998 Y NA RFFL NA NA NA NA RFFL 22333 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 12852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA MMP28,TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 38084566 38084955 38084762 Y NA ORMDL3 NA NA NA NA ORMDL3 2712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 38085522 38085789 38085697 Y ERBB2,IKZF3,ORMDL3 ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 3668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 38480180 38480741 38480429 Y IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 16736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 38502716 38503032 38502793 Y NA RARA NA NA NA NA RARA 39272 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 39662733 39662908 39662821 Y JUP,KRTAP3-1,KRT9,KRT36,KRT13,KRT19 KRT13,KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT13 2776 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 39682585 39682843 39682821 Y JUP,KRTAP4-11,KRT19 KRT13,KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 25 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT13,KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 39685394 39685532 39685463 Y KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9 KRT13,KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 2834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 39686458 39686891 39686666 Y KRT19 KRT13,KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 3898 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 39802138 39802335 39802276 Y NKIRAS2,NKIRAS2,DHX58,EIF1 KRT16,EIF1 KRT19,KRT15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT16 31987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 39807728 39808143 39807934 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093 MCF7 ChIA-PET 22265404 EIF1 34994 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 39810156 39810822 39810530 Y JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17 KRT16,EIF1 KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 32315 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 40559988 40560462 40560227 Y RAMP2,CNP STAT3,PTRF,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 13073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 40573451 40573881 40573544 Y AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF STAT3,ATP6V0A1 NA NA NA NA PTRF 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 40628029 40628344 40628111 Y NA ATP6V0A1,AC067852.1 NA NA NA NA ATP6V0A1 19167 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF AC067852.1,NAGLU,HSD17B1,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 417 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 40748943 40749226 40749085 Y STAT5B,STAT3,STAT3 HSD17B1,COASY,MLX,PSMC3IP,TUBG1,FAM134C NA NA NA NA TUBG1 10468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 40816292 40816343 40816318 Y NA TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 6969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 41410079 41410140 41410127 Y NA TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 48225 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 ASB16,TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.90012369121735 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 43919032 43919225 43919129 Y STH NA NA NA NA NA MAPT 50523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 44261899 44262225 44262045 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 292151 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 45277552 45277907 45277885 Y NA CDC27,MYL4 CDC27,MYL4,ITGB3,C17orf57,NPEPPS IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL4 1740 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1,TBX21 NA NA NA NA TBX21 37143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 46644443 46644754 46644601 Y HOXB9,HOXB8,HOXB6 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6 NA NA NA NA HOXB4 10719 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB4,HOXB6,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 47966905 47967224 47967101 Y DLX4,DLX3,TAC4 NA LOC284080,ITGA3,SPOP,NXPH3,SLC35B1,DLX3,NGFR,FAM117A,KAT7,FLJ45513,TAC4,DLX4,PDK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLX4 77110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 57830594 57831044 57830806 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 47607 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 57869540 57869779 57869705 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 46848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 33945 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 57932450 57932798 57932624 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 15823 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA CA4 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CA4 12892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 58977545 58977928 58977702 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 224731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 59213347 59213460 59213422 Y TBX4,TBX2 NA NA NA NA NA TBX2 261797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2,C17orf82 NA NA NA NA C17orf82 1105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 59786803 59787088 59786946 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 120240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 62586168 62586194 62586181 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 69992 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 62958497 62958860 62958615 Y NA LRRC37A3,AMZ2P1 NA NA NA NA AMZ2P1 10834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 63759124 63759374 63759249 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 203359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 64499082 64499411 64499095 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 202328 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 64962057 64962755 64962345 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 3031 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 64963064 64963179 64963122 Y NA CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 4038 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr17 66193656 66193741 66193699 Y NA AMZ2 NA NA NA NA AMZ2 47974 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 66597881 66598319 66598164 Y FAM20A FAM20A NA NA NA NA FAM20A 2351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 66599244 66599673 66599435 Y NA FAM20A NA NA NA NA FAM20A 3714 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 66618888 66618909 66618898 Y NA FAM20A ABCA10,ABCA8,ABCA9 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20A 23358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 66680223 66680499 66680398 Y NA NA FAM20A IMR90 Hi-C 24141950 FAM20A 84693 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 67315191 67315526 67315500 Y NA ABCA5 NA NA NA NA ABCA5 5859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 77797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 71200352 71200549 71200451 Y NA SSTR2,COG1,C17orf80,FAM104A NA NA NA NA COG1 13223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 73073656 73074040 73073685 Y RAB37,RAB37,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 7782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73091198 73091317 73091257 Y TSEN54,LLGL2 SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 9376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73426423 73426691 73426652 Y MRPS7 GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 8549 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 73456096 73456218 73456157 Y KIAA0195 KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 20856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 73545364 73545732 73545559 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2,MYO15B NA NA NA NA LLGL2 26203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73546030 73546166 73546084 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2,MYO15B NA NA NA NA LLGL2 26869 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73691946 73692277 73692043 Y NA SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 23131 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 74128444 74128992 74128680 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1 EXOC7 NA NA NA NA EXOC7 12787 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 74415585 74415933 74415760 Y MFSD11,RNF157 SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 31355 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 74481730 74482020 74481883 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 13852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 74696685 74696955 74696820 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 8143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75086431 75086552 75086490 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 5633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75096190 75096538 75096428 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 15392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75103651 75103906 75103737 Y JMJD6,SRSF2 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 22853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75118026 75118235 75118074 Y NA LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 37228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75338504 75338763 75338659 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 63853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75775282 75775552 75775395 Y TMEM235 NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6C 222697 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43945 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 6.68592632780117 chr17 76169246 76169385 76169328 Y PGS1,SYNGR2 TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 6607 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76247657 76247919 76247750 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 39390 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76268764 76268973 76268872 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,SOCS3,PGS1 NA TK1,AFMID,CYTH1,TMC6,LOC100131096,TNRC6C,SOCS3,DNAH17,PGS1 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 60497 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr17 76361692 76362147 76361865 Y NA SOCS3,PGS1 PGS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 7534 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 76409170 76409735 76409347 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 36449 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76434499 76434541 76434520 Y TMEM235 NA NA NA NA NA PGS1 61778 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 76764263 76764724 76764556 Y SOCS3,PGS1,USP36,CANT1,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 11655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76767876 76768189 76768026 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 8190 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 76919844 76920193 76919970 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 375 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 77018441 77018844 77018601 Y C1QTNF1 LGALS3BP,CANT1,C1QTNF1 NA NA NA NA C1QTNF1 1545 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 77776510 77776898 77776679 Y CCDC40 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 3028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 77952311 77952542 77952488 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 55105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78098181 78098723 78098426 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 20259 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78232717 78232863 78232812 Y NA SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 52 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr17 78652497 78652856 78652573 Y SGSH,RNF213 NA NA NA NA NA RPTOR 135878 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78756741 78756888 78756815 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 206510 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78835173 78835495 78835379 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 127903 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 78847470 78847710 78847638 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 115688 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79011145 79011369 79011293 Y BAIAP2 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4197 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 79024187 79024380 79024262 Y BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 17239 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79064673 79065032 79064884 Y BAIAP2,TMEM105 NA NA NA NA NA BAIAP2 57725 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38277 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA LINC00482 79360 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 84012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79546845 79547000 79546944 Y PCYT2 C17orf70 NA NA NA NA C17orf70 27858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 79950743 79950987 79950865 Y SLC25A10,GCGR,DCXR,PCYT2 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 18060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 80453708 80453979 80453866 Y LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2 C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 21610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr17 80594524 80594906 80594740 Y UTS2R,WDR45L NA NA NA NA NA RAB40B 59698 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 80817363 80817528 80817446 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 20909 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr17 80833209 80833609 80833394 Y ZNF750 ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 36755 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr17 80834580 80834819 80834710 Y NA ZNF750 NA NA NA NA ZNF750 38126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr17 81049749 81049909 81049815 Y NA B3GNTL1,METRNL NA NA NA NA METRNL 14182 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.62154342755897 chr17 81058904 81059222 81058949 Y METRNL METRNL NA NA NA NA METRNL 23337 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 106616 106942 106784 Y NA ROCK1P1,USP14 NA NA NA NA ROCK1P1 123 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.57160527316764 chr18 679559 679568 679564 Y NA TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 23219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 2056727 2056859 2056778 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 512649 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 3385002 3385317 3385084 Y NA TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 24289 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 7950764 7950916 7950843 Y NA NA NA NA NA NA PTPRM 385984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 8803155 8803225 8803221 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 195712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9711641 9712077 9711750 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 5479 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9812085 9812326 9812208 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA NA NA NA NA VAPA 99673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9835366 9835644 9835528 Y NA NA NA NA NA NA VAPA 76355 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9849459 9849859 9849589 Y PPP4R1,RAB31,VAPA NA NA NA NA NA VAPA 62140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr18 9850282 9850437 9850360 Y PPP4R1,RAB31,VAPA NA NA NA NA NA VAPA 61562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9869849 9870152 9869995 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 41847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr18 12839100 12839985 12839163 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 87657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 13382338 13382799 13382497 Y RNMT,PTPN2,CEP192 NA NA NA NA NA RNMT 341860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 19746222 19746392 19746310 Y GATA6 GATA6 NA NA NA NA GATA6 1012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 20131932 20132167 20132050 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 244057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 21336252 21336608 21336275 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD29 95403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 21415229 21415459 21415332 Y C18orf8,NPC1 NA NA NA NA NA TTC39C 155278 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 21440084 21440297 21440180 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 130440 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 21780839 21781231 21781002 Y OSBPL1A NA NA NA NA NA CABYR 63897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 22864731 22865080 22865053 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 65074 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 25691984 25692409 25692174 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 63001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr18 28734237 28734361 28734251 Y DSC3,DSC1 NA NA NA NA NA DSC2 53859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 29228956 29229096 29229026 Y RNF125 NA NA NA NA NA TTR 59267 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 32414940 32415436 32415021 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 139456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 34152288 34152711 34152516 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1328 254358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 34258485 34258689 34258587 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 148380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 39965392 39965594 39965467 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 432221 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 42262294 42262512 42262376 Y SETBP1,SETBP1 NA NA NA NA NA EPG5 1282728 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 42794877 42795253 42795143 Y NA NA NA NA NA NA EPG5 749987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 43363455 43363582 43363533 Y NA NA SIGLEC15,EPG5,SLC14A1,SLC14A2 IMR90 Hi-C 24141950 EPG5 181658 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 43732950 43733330 43733193 Y RNF165,C18orf25 C18orf25 NA NA NA NA C18orf25 18189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 44392877 44393138 44393020 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA5 55657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 45420480 45420806 45420653 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 34709 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 45915673 45915749 45915744 Y NA ZBTB7C NA NA NA NA ZBTB7C 19374 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 402091 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 51447036 51447236 51447153 Y STARD6,C18orf54 NA NA NA NA NA MBD2 301922 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 53167517 53167871 53167822 Y TCF4 NA NA NA NA NA TCF4 162147 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 55381917 55382196 55382152 Y NEDD4L NA NA NA NA NA ATP8B1 86137 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 55756032 55756268 55756150 Y NA NEDD4L NA NA NA NA NEDD4L 46433 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 56291277 56291473 56291345 Y ALPK2 SNORD28,MALT1 NA NA NA NA SNORD28 25414 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 59766177 59766307 59766242 Y NA NA NA NA NA NA PIGN 86044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 59968434 59968761 59968590 Y NA TNFRSF11A NA NA NA NA TNFRSF11A 21759 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 59997447 59997624 59997536 Y NA TNFRSF11A NA NA NA NA TNFRSF11A 6927 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 60445199 60445356 60445226 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 64527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 60973604 60973976 60973940 Y NA BCL2 NA NA NA NA BCL2 11385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 61046049 61046189 61046119 Y NA KDSR,VPS4B NA NA NA NA KDSR 13306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 61565801 61566233 61565950 Y NA SERPINB2,HMSD NA NA NA NA SERPINB2 28875 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 67924186 67924498 67924352 Y SOCS6 SOCS6 SOCS6,RTTN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 29639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 71819121 71819367 71819268 Y C18orf55 TIMM21 NA NA NA NA TIMM21 5375 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr18 72779359 72779673 72779506 Y NA NA NA NA NA NA ZADH2 139630 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 74600603 74600897 74600750 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 68040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 74852759 74853059 74852827 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 ZNF236 320196 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 75803264 75803274 75803269 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 1024011 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 77163451 77163662 77163546 Y ATP9B,CTDP1,NFATC1,NFATC1 NFATC1 NA NA NA NA NFATC1 9595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 77479390 77479421 77479406 Y NA CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 41589 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 77713083 77713430 77713261 Y NA PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA PQLC1 3419 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr18 77723013 77723575 77723504 Y HSBP1L1 PQLC1,HSBP1L1 NA NA NA NA HSBP1L1 452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 289700 289869 289784 Y C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 307 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA MADCAM1 5383 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 675402 675838 675677 Y FSTL3 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 1010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 6.12876580048441 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 909116 909504 909461 Y STK11,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7,C19orf22 MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 1736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 953220 953565 953383 Y EFNA2,MADCAM1,KISS1R,ARID3A R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 27609 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 954903 955312 954982 Y KISS1R,ARID3A R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 25862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 958944 959162 959060 Y NA R3HDM4,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA WDR18 22012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr19 1126082 1126504 1126271 Y MIDN,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 24146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 1658049 1658081 1658059 Y EFNA2,ONECUT3 TCF3 TCF3 MCF7 ChIA-PET 22265404 TCF3 7445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 2162744 2162943 2162860 Y CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 280 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2186180 2186319 2186250 Y NA DOT1L,AP3D1,SF3A2,PLEKHJ1 NA NA NA NA AP3D1 23716 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2528875 2529093 2529033 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 54755 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 2529574 2529858 2529677 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 55454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2620825 2621136 2620936 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 79571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2624614 2624929 2624757 Y GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA GNG7 75778 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2627461 2627884 2627646 Y DOT1L,OAZ1,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 72823 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2719845 2720284 2720049 Y JSRP1,TLE6,AES,GNG7,DIRAS1 GNG7,DIRAS1,SLC39A3 NA NA NA NA DIRAS1 429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 2770206 2770498 2770360 Y DIRAS1,AES SLC39A3,SGTA,THOP1,ZNF554 NA NA NA NA SGTA 10871 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr19 2974450 2974580 2974523 Y NFIC,TLE2,TLE2 ZNF77,TLE6 NA NA NA NA TLE6 864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 3369394 3369884 3369615 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 11833 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 3398670 3398894 3398830 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 41109 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 3548609 3549021 3548873 Y GNA15,S1PR4,FZR1,PIAS4 DOHH,FZR1,HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 21754 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 4008398 4008778 4008498 Y MATK,ZFR2,ATCAY DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4 NA NA NA NA PIAS4 2754 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 4061318 4061457 4061400 Y SEMA6B,PLIN5,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 3486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 4379386 4379764 4379673 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 18780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 5046594 5046918 5046679 Y NA NA NA NA NA NA KDM4B 79469 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 5536566 5536826 5536635 Y NA NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 84220 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3 NA NA NA NA CAPS 31142 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 5966194 5966581 5966386 Y CAPS RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 9572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6062045 6062746 6062500 Y TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 85892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6105811 6106211 6106011 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 91372 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 6238228 6238618 6238539 Y RFX2 RFX2,MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 39341 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6273754 6274259 6273940 Y VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 3700 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6462383 6462634 6462493 Y RFX2 KHSRP,CRB3,SLC25A23,DENND1C NA NA NA NA SLC25A23 580 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6738802 6739114 6738954 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA TRIP10 2866 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A,VAV1 NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr19 7547395 7547510 7547453 Y STXBP2,EVI5L,ARHGEF18,PNPLA6,PEX11G PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA PEX11G 12825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 7665007 7665263 7665135 Y INSR,PNPLA6,FLJ22184,KIAA1543 CAMSAP3,XAB2,STXBP2 NA NA NA NA CAMSAP3 6219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 46913 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 8989058 8989241 8989188 Y ZNF177,ACTL9,MUC16,OR7G1 ZNF558 NA NA NA NA ZNF558 48054 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 9120594 9120838 9120762 Y MUC16 MUC16 NA NA NA NA MUC16 30576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA MUC16 NA NA NA NA MUC16 38916 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 10581724 10581982 10581852 Y NA KEAP1,S1PR5 NA NA NA NA KEAP1 30435 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 10713789 10714290 10714179 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,AP1M2,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 2656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 10987245 10987998 10987563 Y NA TMED1,C19orf38,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 7056 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 11925678 11926080 11925867 Y NA ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439 NA NA NA NA ZNF440 2579 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 12270640 12270828 12270733 Y NA ZNF136,CTD-2666L21.1 NA NA NA NA ZNF136 1051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13959901 13960035 13959978 Y CCDC130,RFX1,ZSWIM4 NA NA NA NA NA CC2D1A 54979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 14172809 14173223 14173004 Y NA IL27RA,EEF1DP1,SAMD1 NA NA NA NA EEF1DP1 5931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.90012369121735 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NOTCH3,EPHX3 NA NA NA NA NOTCH3 11290 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F2 58811 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A,HSH2D NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 16394356 16394632 16394513 Y NWD1,KLF2 KLF2 EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 38996 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 16479678 16480242 16479985 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 46050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 16557779 16558043 16557912 Y RAB8A,HSH2D,KLF2,MED26,EPS15L1 EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 22853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 17131732 17132248 17131919 Y NA NA NA NA NA NA HAUS8 52187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 19488658 19488936 19488750 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 5699 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 19514283 19514636 19514393 Y HOMER3,RFXANK,GMIP,GATAD2A GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 19648 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 19589693 19590012 19589853 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 34533 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P34 165441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 27739791 27740195 27739990 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1962253 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 29652723 29653023 29652873 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 49425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 31843033 31843344 31843257 Y NA TSHZ3 NA NA NA NA TSHZ3 4580 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 33541924 33542310 33542117 Y NA RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 11484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 34398114 34398257 34398186 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 113276 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 34760936 34761338 34761013 Y LSM14A,KIAA0355 KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 17494 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 34841130 34841321 34841272 Y LSM14A,KIAA0355 GPI NA NA NA NA GPI 7064 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 35494139 35494542 35494364 Y NA ZNF792,GRAMD1A,SCN1B,HPN NA NA NA NA GRAMD1A 10451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 35605566 35605978 35605759 Y MAG,FFAR1,LGI4 FXYD3,FXYD1,LGI4,FXYD5 NA NA NA NA FXYD3 834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 35838526 35838887 35838790 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA HAMP 68907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1,UPK1A NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1,COX7A1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 36666444 36666524 36666464 Y NA CAPNS1,COX7A1,ZNF146 NA NA NA NA COX7A1 24673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 36748454 36748637 36748519 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 13295 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.34296316390058 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 38807798 38808031 38807971 Y MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA KCNK6 453 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 MAP4K1,EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 39801345 39801461 39801375 Y NA GMFG,SAMD4B NA NA NA NA GMFG 29551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 40751869 40752087 40752041 Y NA AKT2 NA NA NA NA AKT2 37356 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA PRX 5826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 40942693 40943017 40942855 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 5595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 41226531 41226793 41226653 Y PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B NA NA NA NA ADCK4 4419 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA,MIA-RAB4B 8162 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41289050 41289265 41289158 Y SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2 SNRPA,C19orf54,MIA,MIA-RAB4B,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA RAB4B 6929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA RPL36P16,CYP2S1,AXL CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 RPL36P16 8178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA CEACAM21 CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 25521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 CEACAM21 LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 CEACAM21 15573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 42634554 42634824 42634791 Y POU2F2 NA NA NA NA NA POU2F2 63913 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 CXCL17 CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 CXCL17 41987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 42948068 42948265 42948167 Y NA CXCL17 NA NA NA NA CXCL17 2868 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA CD177 TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 CD177 19969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 44288540 44288860 44288798 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 5131 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45129392 45129792 45129578 Y PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR PVR NA NA NA NA PVR 15306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45279679 45279961 45279836 Y CEACAM19,CBLC,BCAM BCL3,CBLC,BCAM NA NA NA NA CBLC 553 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 45344497 45344782 45344640 Y CEACAM16,NKPD1,CLASRP BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 2650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 9.19314870072661 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE,APOC4 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 45826869 45827146 45827057 Y DMPK,RTN2,CKM CKM,KLC3,ERCC2 NA NA NA NA CKM 2634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L CKM,KLC3,ERCC2 NA NA NA NA KLC3 9958 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45906934 45907335 45907067 Y NA ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.29302500950926 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr19 45954905 45955186 45955133 Y GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB IMR90 Hi-C 24141950 FOSB 14067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA PPM1N 2708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 46698925 46699055 46698990 Y NA NA IGFL3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFL2 54562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 47299930 47299995 47299963 Y NA SLC1A5 FKRP,STRN4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A5 10079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr19 47600896 47601033 47600983 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 13498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47613894 47614902 47614503 Y PTGIR,PRKD2,NAPA,GPR77,GLTSCR1,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 47783225 47783533 47783379 Y ZNF541 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 7083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47814150 47814595 47814332 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,C5AR1,DHX34 NA NA NA NA C5AR1 22870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47867147 47867265 47867191 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 16609 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47892475 47892975 47892646 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA MEIS3 27805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 47950200 47950556 47950503 Y SLC8A2 MEIS3,KPTN NA NA NA NA MEIS3 29420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 48016569 48017036 48016994 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 72 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.7358644821925 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 48166987 48167048 48167018 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 47552 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 48642255 48642637 48642446 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 29223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49057128 49057239 49057162 Y NA SULT2B1 NA NA NA NA SULT2B1 3796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SULT2B1,SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49151515 49151640 49151575 Y NA SPHK2,RPL18,DBP,CA11,FUT2 NA NA NA NA CA11 3946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49315464 49315783 49315738 Y NA BCAT2,HSD17B14 NA NA NA NA BCAT2 3178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49482120 49482542 49482303 Y FUT1,C19orf73 DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 12025 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49482691 49482925 49482812 Y NA DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 11642 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49486890 49487028 49486959 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 7539 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 49493898 49494273 49494153 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 294 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 49698080 49698342 49698211 Y NA HRC,TRPM4 NA NA NA NA TRPM4 39082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 50362574 50362883 50362717 Y PRRG2,MYH14,PNKP FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1 NA NA NA NA PNKP 6283 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 50718001 50718188 50718073 Y NA MYH14 NA NA NA NA MYH14 28558 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 50833837 50834367 50834143 Y MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3 NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA KCNC3 405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.29302500950926 chr19 50835948 50836015 50835982 Y IL4I1,NR1H2,KCNC3 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA KCNC3 1176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 50990086 50990332 50990328 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 12076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 50993276 50993671 50993522 Y MYH14,MYBPC2 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15266 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA FAM71E1 15670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 51012062 51012382 51012222 Y KLK6,SYT3,SHANK1 FAM71E1,JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 51989599 51989897 51989716 Y NA NA NA NA NA NA SIGLEC10 70542 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA FPR2 60512 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 53449736 53449992 53449814 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83 ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 5882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ERVV-2,ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 53635063 53635358 53635174 Y ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347 ZNF160,ZNF415,ZNF347 NA NA NA NA ZNF415 733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665 NA NA NA NA ZNF665 32764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr19 54288550 54288757 54288603 Y ZNF765,ZNF813,ZNF331,DPRX AC008753.3,NLRP12 NA NA NA NA AC008753.3 11697 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 54548907 54549052 54548979 Y NLRP12,NLRP12,VSTM1 NA NA NA NA NA OSCAR 54948 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9,LILRA6,LILRB5 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr19 55546101 55546409 55546255 Y NA RDH13,EPS8L1 NA NA NA NA RDH13 34250 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 55582606 55582776 55582718 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA EPS8L1 1218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 55600172 55600429 55600236 Y NA RDH13,EPS8L1,PPP1R12C NA NA NA NA EPS8L1 18784 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,EPS8L1,PPP1R12C,TNNT1,TNNI3 NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 55787779 55788010 55787914 Y KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1 PPP6R1,HSPBP1,BRSK1 NA NA NA NA HSPBP1 1739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14,SSC5D,SBK2 NA NA NA NA SBK2 14879 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 SBK2 14871 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 56823857 56823998 56823922 Y ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 53470 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 58886804 58887095 58886950 Y ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584 NA NA NA NA ZNF837 3332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA MGC2752 3527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 1590812 1591204 1590899 Y NA AC144450.2 PXDN,MYT1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC144450.2 35987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 1608037 1608218 1608215 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 18973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA AC144450.2 NA NA NA NA AC144450.2 31991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 8621577 8621887 8621772 Y NA NA LOC100506274,LOC339788,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 100035 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.7 52792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 10153127 10153217 10153171 Y NA KLF11 NA NA NA NA KLF11 27759 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 10984211 10984590 10984279 Y NA PDIA6 C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 8108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 11343595 11343995 11343855 Y E2F6 NA NA NA NA NA PQLC3 50271 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 15633080 15633249 15633163 Y NBAS NA NA NA NA NA NBAS 66205 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 106096 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 19340591 19340734 19340664 Y OSR1 NA OSR1,MIR4757 IMR90 Hi-C 24141950 OSR1 215680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 19548078 19548301 19548191 Y NA OSR1 NA NA NA NA OSR1 8113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 19766934 19767238 19767086 Y NA NA NA NA NA NA OSR1 210520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 19985229 19985530 19985434 Y NA NA NA NA NA NA TTC32 114217 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 20407883 20408194 20408074 Y RHOB,SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 15000 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 20412962 20413136 20413039 Y SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 10058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 23923305 23923445 23923375 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 224539 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 25676180 25676345 25676260 Y NA NA NA NA NA NA DNMT3A 112721 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr2 26567616 26567683 26567653 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA GPR113 2 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 26605539 26605826 26605756 Y RAB10 GPR113 NA NA NA NA GPR113 37854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,KCNK3,CENPA NA NA NA NA KCNK3 33315 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 27939397 27939784 27939607 Y TRIM54 NA RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL33 52800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 28024813 28024890 28024852 Y IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33 MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 32229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 28621403 28621758 28621597 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 8088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 28856660 28856889 28856764 Y NA NA NA NA NA NA AC097724.3 100182 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 29026080 29026331 29026243 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB SPDYA NA NA NA NA SPDYA 22697 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 29060448 29060640 29060540 Y PPP1CB,PPP1CB TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 30527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 29174818 29175149 29175047 Y NA FAM179A NA NA NA NA FAM179A 2328 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 30440662 30440911 30440739 Y NA LBH LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 11486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 30458307 30458498 30458425 Y YPEL5,LBH LBH NA NA NA NA LBH 5910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 33435749 33436022 33435923 Y FAM98A,LTBP1 NA NA NA NA NA RASGRP3 223369 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37103475 37103824 37103655 Y NA NA NA NA NA NA STRN 87791 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37383262 37383336 37383288 Y NA EIF2AK2 NA NA NA NA EIF2AK2 1054 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37851057 37851610 37851419 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 112001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37868257 37868517 37868387 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 95094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37879485 37879782 37879514 Y EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 83829 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 38599092 38599284 38599189 Y FAM82A1 ATL2 NA NA NA NA ATL2 3143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 38762228 38762367 38762309 Y NA NA ATL2,HNRPLL,GALM,SRSF7,DHX57 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPLP0P6 55308 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 39356052 39356306 39356192 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 6566 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 40563137 40563534 40563392 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 272659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 40608600 40608944 40608858 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 227249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 40647677 40648234 40647999 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 187959 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 40722806 40722875 40722849 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 113318 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 42481657 42481775 42481735 Y EML4 NA NA NA NA NA EML4 87167 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 43265724 43265951 43265843 Y NA AC016735.2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 AC016735.2 1038 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 43355395 43355512 43355444 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.2 90709 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 43685237 43685474 43685356 Y NA NA NA NA NA NA THADA 135711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 43692800 43693176 43692988 Y NA NA NA NA NA NA THADA 128009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 44007303 44007575 44007439 Y NA DYNC2LI1 NA NA NA NA DYNC2LI1 8125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 44944979 44944991 44944986 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K21.1 219347 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 46452124 46452363 46452229 Y RHOQ NA PRKCE,EPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 66443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 46561811 46562247 46561970 Y SOCS5,SOCS5 EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 43005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 46586439 46586863 46586504 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 67633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 46614603 46614745 46614671 Y RHOQ NA NA NA NA NA EPAS1 95797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 47199058 47199402 47199110 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 32064 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 47214273 47214540 47214407 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 47279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 47282124 47282371 47282214 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 115130 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 48416951 48417276 48417215 Y FOXN2 NA NA NA NA NA FOXN2 122500 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 54111882 54111915 54111897 Y NA GPR75-ASB3,ASB3 NA NA NA NA ASB3 26585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 54647230 54647455 54647369 Y NA SPTBN1 ACYP2,SPTBN1 IMR90 Hi-C 24141950 SPTBN1 33967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 55193261 55193511 55193360 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 144246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 58117718 58117918 58117846 Y VRK2,VRK2,VRK2 VRK2 NA NA NA NA VRK2 14868 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 61133049 61133418 61133217 Y NA REL,RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 3020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 61165363 61165465 61165452 Y NA RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 28925 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.62154342755897 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 64925964 64926159 64926058 Y SLC1A4,RAB1A,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 49980 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 66673073 66673647 66673570 Y NA MEIS1 NA NA NA NA MEIS1 14489 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 67272127 67272355 67272336 Y NA NA LOC644838 IMR90 Hi-C 24141950 AC009474.2 165773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 68593534 68593956 68593557 Y C1D,PPP3R1,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25,APLF,PLEK CNRIP1,PLEK NA NA NA NA PLEK 3229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 69775512 69775573 69775543 Y MXD1,GMCL1,ASPRV1,AAK1 NA NA NA NA NA ANXA4 93984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 70205559 70206094 70205928 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 18162 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 70226911 70227071 70226991 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 39514 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 71944095 71944430 71944253 Y NA NA DYSF IMR90 Hi-C 24141950 DYSF 265243 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 72416850 72417011 72416931 Y NA CYP26B1 NA NA NA NA CYP26B1 43683 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA CYP26B1 53078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 72732418 72732763 72732614 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 318407 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 72774678 72774916 72774797 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 276254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 72980109 72980387 72980306 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 70783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 74060180 74060503 74060342 Y NA STAMBP NA NA NA NA STAMBP 6094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 76357037 76357141 76357089 Y NA NA NA NA NA NA GCFC2 420922 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 77488333 77488701 77488549 Y LRRTM4 NA NA NA NA NA AC105399.2 524807 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 83058262 83058376 83058322 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG1 1626793 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 85442728 85442944 85442894 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L1 84195 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 85641965 85642472 85642157 Y TGOLN2,VAMP8,CAPG CAPG NA NA NA NA CAPG 1083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 85997454 85997768 85997517 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 20987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 86388217 86388607 86388413 Y NA IMMT,MRPL35 NA NA NA NA IMMT 32286 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 86562971 86563338 86563025 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA REEP1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 86722014 86722392 86722297 Y RMND5A NA NA NA NA NA KDM3A 56244 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 88899554 88899981 88899832 Y EIF2AK3 EIF2AK3 NA NA NA NA EIF2AK3 25113 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD36BP2 2872873 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA FER1L5 14466 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 100104968 100105518 100105262 Y REV1 REV1 NA NA NA NA REV1 471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 101220085 101220198 101220126 Y NA PDCL3 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 PDCL3 42933 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,SNORD89,RNF149 NA NA NA NA SNORD89 2837 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 102654225 102654461 102654316 Y NA IL1R2,IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 24543 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 103104673 103104833 103104753 Y IL1R2,IL1R1,IL18R1,IL18RAP NA NA NA NA NA IL18RAP 71524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 105430210 105430587 105430504 Y NA NA NA NA NA NA MRPS9 221854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 105460930 105461348 105461055 Y GPR45,POU3F3 NA NA NA NA NA MRPS9 191093 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 105676474 105676490 105676482 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 24033 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 106026144 106026496 106026333 Y GPR45,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 26474 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 SULT1C4 150908 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 109201604 109202307 109201998 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 52747 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 109789769 109790041 109789880 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 388556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 111829364 111829577 111829485 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 45378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 113562551 113562581 113562567 Y IL1A CKAP2L,IL1B CKAP2L IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 29899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 113638257 113639193 113638961 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B CKAP2L,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 45777 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 113837856 113838205 113837994 Y IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN NA NA NA NA NA PAX8-AS1 128894 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 114615220 114615283 114615253 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3 30254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA AC012363.4,TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA TFCP2L1 415703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 127836525 127836721 127836623 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 26210 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 127838302 127838430 127838354 Y MAP3K2 BIN1 NA NA NA NA BIN1 24501 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 128136277 128136580 128136554 Y NA MAP3K2 CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 7461 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 128143711 128144108 128144023 Y SFT2D3,MAP3K2 NA CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1 NA NA NA NA IWS1 590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 128617356 128617514 128617464 Y NA POLR2D NA NA NA NA POLR2D 3625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 129038080 129038421 129038313 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 35730 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 129074706 129075071 129074888 Y NA HS6ST1 NA NA NA NA HS6ST1 555 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 129252189 129252574 129252389 Y HS6ST1 NA NA NA NA NA HS6ST1 178038 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 133025188 133025675 133025588 Y NA NA GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR39 146472 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 261568 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 135931129 135931440 135931285 Y NA NA NA NA NA NA RAB3GAP1 123294 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 136504457 136504522 136504461 Y NA UBXN4 NA NA NA NA UBXN4 7268 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 136765824 136766130 136765891 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 AC093391.2,DARS NA NA NA NA DARS 24154 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 139198512 139198615 139198564 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 58653 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 139260181 139260311 139260246 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 2810 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 140977991 140978216 140978106 Y NA NA NA NA NA NA NXPH2 1442073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 143628214 143628759 143628425 Y NA KYNU NA NA NA NA KYNU 4308 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 149527542 149527937 149527740 Y EPC2 NA NA NA NA NA KIF5C 102882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 157293916 157294289 157294044 Y NA GPD2 NA NA NA NA GPD2 4114 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 157350071 157350391 157350185 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 60269 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA CYTIP 275468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 160100045 160100277 160100255 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 41033 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 160646880 160647090 160646985 Y NA CD302 NA NA NA NA CD302 5663 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 160804631 160804934 160804783 Y NA LY75-CD302,LY75 NA NA NA NA LY75 45371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr2 165508598 165508853 165508726 Y COBLL1 GRB14 GRB14 MCF7 ChIA-PET 22265404 GRB14 32240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA AC019181.2,COBLL1 NA NA NA NA AC019181.2 11972 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 169434382 169434732 169434541 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 124010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 169894823 169895302 169894971 Y DHRS9,DHRS9 DHRS9 ABCB11 K562 ChIA-PET 22265404 DHRS9 23997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 170218108 170218468 170218381 Y NA LRP2 NA NA NA NA LRP2 913 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 173306862 173307108 173306983 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 16780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 174007383 174007707 174007544 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 209841 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 174800246 174800560 174800554 Y NA SP3 NA NA NA NA SP3 27870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 175069870 175070170 175070019 Y WIPF1,SP3,SP3 OLA1 NA NA NA NA OLA1 41256 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD13,HOXD11,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.34296316390058 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8 NA NA NA NA AC079305.8 25600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8 NA NA NA NA AC079305.8 29254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr2 180724883 180725244 180725071 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 144596 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 183876955 183877317 183877185 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 24269 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 187420042 187420288 187420183 Y ITGAV,ITGAV,ZC3H15 ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 32504 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 190324760 190324912 190324838 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 20601 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 192069255 192069475 192069372 Y STAT4 MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 38436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 197195800 197196140 197196081 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 156573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 198834136 198834535 198834225 Y NA NA NA NA NA NA PLCL1 166710 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 202522160 202522705 202522330 Y NA TMEM237 NA NA NA NA TMEM237 15867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA DAZAP2P1 165924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 203239784 203239912 203239798 Y NA BMPR2 NA NA NA NA BMPR2 125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 203520524 203520862 203520558 Y NA FAM117B NA NA NA NA FAM117B 22623 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 203830057 203830223 203830140 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 47298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 203830574 203830808 203830669 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 46713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 204499475 204499823 204499577 Y NA NA ABI2,RAPH1 IMR90 Hi-C 24141950 CD28 69375 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208007936 208008436 208008192 Y METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 21555 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 208380269 208380775 208380611 Y METTL21A,CREB1 CREB1 KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 11686 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208749045 208749238 208749090 Y NA NA NA NA NA NA FZD5 116758 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 208791202 208791275 208791238 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHM3 97009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 210935617 210935943 210935781 Y C2orf67,ACADL NA NA NA NA NA RPE 70328 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 211032670 211033036 211032982 Y NA NA NA NA NA NA ACADL 55179 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 212897670 212897774 212897723 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 503791 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 213185826 213186073 213186055 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 215492 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 213242050 213242407 213242229 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 159158 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 213339164 213339568 213339278 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 61997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 213340230 213340572 213340527 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 60993 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 213401643 213402097 213401658 Y NA ERBB4 NA NA NA NA ERBB4 78 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 215735917 215736192 215736055 Y NA NA NA NA NA NA BARD1 63489 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 216290729 216290756 216290730 Y FN1 FN1 NA NA NA NA FN1 8139 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 216782951 216783107 216783015 Y NA NA FN1,LOC646324,ATIC,MREG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MREG 113712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 216869710 216869915 216869809 Y MREG MREG NA NA NA NA MREG 26904 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 218038981 218039219 218039100 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,TNP1,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 480733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 218330199 218330382 218330291 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 535336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 218698867 218699220 218699042 Y PNKD NA NA NA NA NA TNS1 166498 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 218767248 218767888 218767577 Y TMBIM1,SLC11A1,PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 97830 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 218785631 218785811 218785787 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 79907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr2 218800054 218800255 218800170 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 65463 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 AC021016.6,SLC11A1,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 AC021016.6,SLC11A1,CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 219759139 219759434 219759370 Y WNT6,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 16054 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr2 223170887 223171031 223170916 Y NA NA NA NA NA NA SGPP2 116205 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 223823432 223823602 223823532 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 90930 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 225340678 225341017 225340847 Y NA NA NA NA NA NA FAM124B 75876 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 225792499 225793034 225792841 Y CUL3,DOCK10 NA NA NA NA NA CUL3 344389 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 228280402 228280578 228280475 Y CCL20,AGFG1 NA C2orf83,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 AGFG1 54290 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 230166079 230166484 230166243 Y PID1 PID1 DNER IMR90 Hi-C 24141950 PID1 32078 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 231649547 231649844 231649697 Y NA NA NA NA NA NA BANF1P3 61429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 231821302 231821686 231821316 Y NA NA NA NA NA NA C2orf72 78519 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 232485741 232486244 232485851 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 83361 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 232505425 232505799 232505482 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 63806 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 233096331 233096791 233096507 Y NA NA NA NA NA NA ALPP 144453 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 233250431 233250842 233250658 Y NA ALPP,ALPPL2 NA NA NA NA ALPP 9187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 233252147 233252689 233252515 Y NA ALPP,ALPPL2 NA NA NA NA ALPP 10903 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 233563344 233563704 233563468 Y NA GIGYF2 NA NA NA NA GIGYF2 3335 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 233703407 233703613 233703510 Y NEU2 NA NA NA NA NA KCNJ13 64129 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 234322287 234322459 234322373 Y SAG NA NA NA NA NA DGKD 61134 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 236453392 236453640 236453439 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 52659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 237246448 237246491 237246461 Y IQCA1 NA NA NA NA NA IQCA1 167694 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 237885369 237885886 237885488 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 106069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238317023 238317337 238317240 Y COPS8,COL6A3 COL6A3,AC112721.2 NA NA NA NA COL6A3 3681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238391204 238391436 238391383 Y LRRFIP1,MLPH AC112721.2,MLPH NA NA NA NA MLPH 635 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238421741 238422134 238421894 Y MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 29670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 238876433 238876638 238876539 Y LRRFIP1,UBE2F UBE2F NA NA NA NA UBE2F 2964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 239085902 239086198 239086162 Y NA KLHL30,ILKAP NA NA NA NA ILKAP 24172 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA HDAC4 240095 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 240250439 240250711 240250592 Y NA NA NA NA NA NA HDAC4 70637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA HDAC4 53682 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 241395144 241395496 241395485 Y NA GPC1,AC110619.2 NA NA NA NA AC110619.2 1013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 242698564 242698745 242698671 Y THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH,GAL3ST2 NA NA NA NA GAL3ST2 15495 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 242702443 242702859 242702736 Y ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH,GAL3ST2 NA NA NA NA GAL3ST2 11381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr2 242801923 242802843 242802016 Y NA PDCD1,AC131097.3 NA NA NA NA PDCD1 2863 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 321375 321752 321587 Y NA ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3 NA NA NA NA NRSN2 3674 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 351057 351207 351131 Y NA SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 8054 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 483361 483443 483402 Y NA TBC1D20,CSNK2A1 NA NA NA NA CSNK2A1 39022 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1167289 1167675 1167648 Y NA RAD21L1 NA NA NA NA RAD21L1 37025 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH,SDCBP2 FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 24402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA SDCBP2,FKBP1A NA NA NA NA SDCBP2 25126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1396685 1396983 1396828 Y SDCBP2,SIRPA FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 24879 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 1801326 1801756 1801551 Y SDCBP2,NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 71398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 2671963 2672026 2672004 Y NA NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,EBF4 NA NA NA NA EBF4 439 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 5899454 5899753 5899716 Y NA RNU1-55P,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 29429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 9733190 9733588 9733389 Y NA NA NA NA NA NA SNAP25 463890 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 13142278 13142281 13142280 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 154651 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 13221839 13221847 13221843 Y NA NA NA NA NA NA SPTLC3 234212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 13311967 13312338 13312291 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 305249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 13380021 13380161 13380091 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 237426 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 13427146 13427424 13427285 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 190163 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 13705752 13706023 13705888 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 57509 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 16331149 16331548 16331320 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 220530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 19204310 19204662 19204489 Y SLC24A3 SLC24A3 NA NA NA NA SLC24A3 13020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 19737104 19737460 19737269 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RIN2 60193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 20069823 20070239 20070039 Y NA CRNKL1 NA NA NA NA CRNKL1 35133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 20590950 20591282 20591151 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 99849 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 23117564 23117783 23117655 Y NA NA NA NA NA NA CD93 52587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1,COX4I2 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1,COX4I2 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1,COX4I2 NA NA NA NA ID1 764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1,COX4I2 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 30255856 30255976 30255884 Y NA COX4I2 NA NA NA NA COX4I2 32165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 COX4I2,BCL2L1 NA NA NA NA COX4I2 38984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 30807220 30807332 30807276 Y NA TSPY26P,PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA POFUT1 13537 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31170393 31170766 31170763 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31269107 31269491 31269215 Y C20orf185,C20orf203 NA NA NA NA NA COMMD7 60312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 33150860 33150919 33150894 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA MAP1LC3A 18202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 33263826 33263865 33263846 Y MYH7B PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA PIGU 916 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 33491673 33492056 33491689 Y TP53INP2,ACSS2 ACSS2,GGT7,GSS NA NA NA NA GGT7 33010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 33769921 33770187 33770054 Y NA PROCR,MT1P3 NA NA NA NA PROCR 12045 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA FER1L4,SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 34685769 34686042 34685906 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 8343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 34803190 34803436 34803313 Y NA NA NA NA NA NA DLGAP4 88822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35102828 35103254 35103050 Y NA NA NA NA NA NA MYL9 64633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35112957 35113192 35113075 Y TGIF2 NA NA NA NA NA MYL9 54695 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35172533 35172668 35172598 Y MYL9 MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2 NA NA NA NA MYL9 4646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr20 35616902 35617278 35617001 Y GHRH,RBL1,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 38656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 35976271 35976569 35976418 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 5183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 36042310 36042952 36042529 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 28984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 14724 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP NNAT,BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 36339461 36339780 36339670 Y GHRH,CTNNBL1 CTNNBL1 NA NA NA NA CTNNBL1 19053 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 36722822 36723019 36722924 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI NA NA NA NA NA RPRD1B 62874 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5,PPP1R16B NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 39221402 39221512 39221504 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 94368 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 39661985 39662084 39662008 Y NA RNU2-52P,TOP1 NA NA NA NA TOP1 6527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 39939044 39939335 39939233 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 4977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 40188226 40188487 40188477 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 56646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 40862916 40863147 40863031 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 617783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 42809563 42809791 42809669 Y FITM2,JPH2 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA JPH2 4427 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 42938917 42939166 42938990 Y NA FITM2 GDAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 FITM2 1108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43970100 43970351 43970215 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 4713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 43974041 43974470 43974334 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 594 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,DBNDD2,TP53TG5,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA DBNDD2,TP53TG5,PIGT,WFDC2 NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 44622132 44622355 44622242 Y CD40,ZNF335 ZNF335,MMP9,SLC12A5 ZNF335,MMP9,SLC12A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 MMP9 13192 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 44632907 44633142 44632963 Y PCIF1,CD40,ZNF335 ZNF335,MMP9,SLC12A5 SLC12A5,NCOA5 IMR90 Hi-C 24141950 MMP9 2405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 45787211 45787318 45787265 Y EYA2 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 191987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 46082300 46082410 46082355 Y NA NCOA3 NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 46191 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 46122337 46122452 46122395 Y NA NCOA3 NA NA NA NA NCOA3 6149 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 47393475 47393771 47393686 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 48649 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 47407398 47407765 47407606 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 34655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 47443501 47443751 47443699 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 1081 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 47784409 47784640 47784548 Y PREX1,ZNFX1 STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 18264 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 47796581 47796870 47796726 Y NA STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 6034 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48381625 48382070 48381853 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 37246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48383666 48383949 48383788 Y ZNFX1,B4GALT5,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 39287 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48753681 48754062 48753956 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4 NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 14112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 48965840 48966026 48966001 Y SPATA2,CEBPB,PTPN1 NA CEBPB,LOC284751 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-290F20.3 83817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49067387 49067853 49067497 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B IMR90 Hi-C 24141950 PTPN1 57038 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 49358421 49358698 49358635 Y NA PARD6B NA NA NA NA PARD6B 12340 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49378032 49378227 49378094 Y PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 31204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP ADNP NA NA NA NA ADNP 29532 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49524499 49524706 49524614 Y ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 21252 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA ADNP 6860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 50141744 50142683 50142582 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 34687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 50692863 50693237 50693120 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 125610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52271592 52271787 52271702 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 47146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA SUMO1P1 NA NA NA NA SUMO1P1 7042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 52531977 52532203 52532002 Y NA SUMO1P1 SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUMO1P1 41881 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 55379556 55380011 55379738 Y TFAP2C NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2C 177198 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 55780606 55780977 55780774 Y NA NA NA NA NA NA BMP7 58708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 57018014 57018479 57018179 Y STX16 NA NA NA NA NA VAPB 55836 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 57186271 57186506 57186395 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 37822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 57596187 57596442 57596344 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA ATP5E 8995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 57698182 57698583 57698410 Y STX16,ZNF831 NA GNAS,GNAS-AS1,ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 82218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 58436515 58436843 58436553 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 69867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 58437773 58438005 58437846 Y NA NA NA NA NA NA SYCP2 68705 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 58451421 58451787 58451564 Y SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177 NA NA NA NA NA SYCP2 54923 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 58459134 58459312 58459218 Y PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177 SYCP2 NA NA NA NA SYCP2 47398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 58629735 58630279 58629955 Y PPP1R3D,C20orf177,C20orf197 RP5-1043L13.1 NA NA NA NA RP5-1043L13.1 30616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 58957250 58957289 58957270 Y NA NA LOC284757 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1043L13.1 296355 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 60561621 60561764 60561683 Y GATA5,CABLES2 NA NA NA NA NA TAF4 77102 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf166-AS1 54146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 61641732 61642015 61641970 Y DIDO1,BHLHE23 NA NA NA NA NA SLC17A9 59680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr20 61646020 61646413 61646169 Y C20orf11,YTHDF1 NA NA NA NA NA SLC17A9 63968 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr20 61903396 61903541 61903451 Y NKAIN4 ARFGAP1 NA NA NA NA ARFGAP1 1259 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr20 62170184 62170345 62170251 Y YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195 EEF1A2,PPDPF,PTK6 NA NA NA NA PTK6 3461 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr21 11128400 11128724 11128645 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1161815 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 15940274 15940507 15940416 Y HSPA13,NRIP1,SAMSN1 SAMSN1 NA NA NA NA SAMSN1 13216 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 16222795 16222981 16222977 Y NA NA NRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRIP1 212340 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 17656088 17656430 17656111 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 215246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 2257 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA MIRLET7C NA NA NA NA MIRLET7C 49257 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 18919922 18920266 18920094 Y CXADR CXADR NA NA NA NA CXADR 37222 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 19151902 19152070 19151981 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 37633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr21 19156522 19156877 19156578 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 32826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 19157127 19157381 19157167 Y BTG3,C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 32322 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr21 19171826 19171995 19171943 Y C21orf91 C21orf91 NA NA NA NA C21orf91 17708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 19463041 19463055 19463048 Y NA NA NA NA NA NA C21orf91 273338 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 27488837 27488970 27488850 Y NA NA NA NA NA NA APP 52476 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 28082884 28083006 28082945 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS1 132722 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 28219280 28219541 28219411 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 3552 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 29656574 29656747 29656720 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 598946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr21 30451583 30451905 30451778 Y USP16,BACH1,BACH1,C21orf7 CCT8 NA NA NA NA CCT8 7465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30591516 30591874 30591674 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 27124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30603394 30603504 30603466 Y USP16,BACH1,BACH1 LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 39002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30617454 30617803 30617527 Y USP16,BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 53062 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 30802537 30802636 30802587 Y NA NA C21orf7 IMR90 Hi-C 24141950 BACH1 238145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 32265922 32266021 32265970 Y KRTAP13-4,KRTAP15-1,KRTAP19-4,KRTAP6-3,KRTAP21-3 NA NA NA NA NA AP000251.3 663537 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 33999841 34000172 33999850 Y NA C21orf59 NA NA NA NA C21orf59 16665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 34451403 34451550 34451500 Y SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1 NA NA NA NA NA IFNAR2 148656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 34718616 34718973 34718794 Y OLIG2,OLIG1 IFNAR1 NA NA NA NA IFNAR1 23882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 35578437 35578606 35578522 Y MRPS6,SLC5A3 NA NA NA NA NA SLC5A3 134567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 36074753 36075133 36074820 Y KCNE2 CLIC6 NA NA NA NA CLIC6 35065 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 193528 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 218223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 36475401 36475555 36475452 Y NA NA RUNX1,SETD4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC6 435713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 37694250 37694633 37694410 Y NA MORC3 NA NA NA NA MORC3 3763 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 39618516 39618880 39618566 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA KCNJ6,KCNJ15,DSCR10 IMR90 Hi-C 24141950 ERG 412824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 39654732 39655403 39655082 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA NA NA NA NA ERG 376301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 39661705 39662059 39661845 Y KCNJ15 NA NA NA NA NA ERG 369645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40182920 40183779 40183392 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 7689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40386657 40387043 40386856 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 166734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40410057 40410205 40410134 Y ETS2 NA ETS2,LINC00114,ERG IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 143572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40527943 40528201 40528072 Y NA PSMG1 NA NA NA NA PSMG1 25576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 40691878 40692008 40691991 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 393 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr21 41787815 41788020 41787918 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 749708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 42536793 42536989 42536826 Y BACE2 BACE2,PLAC4 NA NA NA NA BACE2 739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 42883845 42884151 42884093 Y NA TMPRSS2,SNORA32 NA NA NA NA TMPRSS2 16892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 43331076 43331447 43331406 Y NA PRDM15,C2CD2 NA NA NA NA PRDM15 33485 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 43372239 43372638 43372317 Y C2CD2 C2CD2 NA NA NA NA C2CD2 240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 44469974 44470172 44470008 Y CBS CBS NA NA NA NA CBS 24881 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr21 44867284 44867543 44867469 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 2803 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45337582 45337952 45337767 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT3 54515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45573584 45574271 45573954 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 22097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA AP001065.15,C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 31919 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr21 46295070 46295864 46295519 Y ITGB2 PTTG1IP NA NA NA NA PTTG1IP 3318 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 46742697 46743154 46742972 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 36884 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 46831544 46831752 46831652 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 8492 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 47008132 47008435 47008135 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 45807 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 48142 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr21 47212658 47212880 47212769 Y NA NA ADARB1,SLC19A1,PCBP3 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 151050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 47543656 47544056 47543951 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 27645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr21 48003626 48004009 48003657 Y S100B,PRMT2 S100B,PRMT2 NA NA NA NA S100B 19112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 17091097 17091180 17091141 Y IL17RA NA NA NA NA NA IL17RA 472664 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 17306294 17306463 17306397 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA IL17RA 257381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 18921428 18921794 18921531 Y MICAL3,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH NA NA NA NA PRODH 272 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 20923375 20923909 20923414 Y THAP7,MED15 NA NA NA NA NA MED15 75175 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 23528251 23528416 23528284 Y BCR RTDR1,RAB36,BCR NA NA NA NA BCR 8360 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 24756229 24756614 24756466 Y NA NA NA NA NA NA ADORA2A 55233 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 13631 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 25349333 25349980 25349695 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 54152 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 25463741 25463900 25463813 Y NA NA NA NA NA NA SNORD56 168560 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 25587613 25587664 25587639 Y NA NA NA NA NA NA LRP5L 211680 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 25883503 25883619 25883561 Y NA CRYBB2P1 MYO18B,LRP5L,CRYBB2P1,ADRBK2,SEZ6L IMR90 Hi-C 24141950 CRYBB2P1 41431 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 26150935 26151135 26151006 Y NA MYO18B NA NA NA NA MYO18B 14824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 26311120 26311482 26311301 Y NA NA NA NA NA NA MYO18B 175009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 29188218 29188399 29188309 Y NA CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 NA NA NA NA XBP1 6186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 29467563 29467858 29467701 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 497 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 30096148 30096264 30096206 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT5 64736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 64094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 31631095 31631484 31631184 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 24870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 31639861 31640267 31640177 Y NA LIMK2,PIK3IP1 NA NA NA NA LIMK2 33636 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 32027602 32027834 32027718 Y NA PISD NA NA NA NA PISD 28584 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 32291389 32291694 32291650 Y RFPL2,SFI1,PRR14L,DEPDC5 YWHAH NA NA NA NA YWHAH 46753 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 33023085 33023421 33023227 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3 NA NA NA NA NA FBXO7 154422 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 33131563 33131860 33131765 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 63827 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 34062900 34062913 34062907 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 867213 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36009004 36009234 36009123 Y MB,MB,MB MB,APOL6 NA NA NA NA MB 22764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36245846 36246212 36246206 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 176261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36325608 36325959 36325784 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 96514 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP4-633O19__A.1 23476 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 36855477 36855678 36855599 Y NA TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 20399 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 37942978 37943343 37943114 Y NA CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 11111 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 37948648 37948841 37948736 Y NA CARD10,CDC42EP1 NA NA NA NA CDC42EP1 5613 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 38750839 38750902 38750852 Y NA CSNK1E NA NA NA NA CSNK1E 41625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 39349987 39350551 39350215 Y DDX17,JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3A APOBEC3A,APOBEC3B CBX6 IMR90 Hi-C 24141950 APOBEC3A 3241 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 39377467 39377527 39377498 Y DNAL4,CBX6,APOBEC3B APOBEC3A,APOBEC3B,APOBEC3C,APOBEC3D NA NA NA NA APOBEC3B 1115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr22 39637977 39638270 39638005 Y MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB PDGFB NA NA NA NA PDGFB 486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 39869379 39869438 39869422 Y NA MGAT3,ATF4 ATF4,SMCR7L IMR90 Hi-C 24141950 MGAT3 18030 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 40888295 40888668 40888528 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 123700 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA SHISA8,CENPM NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 42527695 42528060 42527840 Y CYP2D6 NDUFA6 NA NA NA NA NDUFA6 42736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 43072276 43072640 43072458 Y NFAM1,ARFGAP3 CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA CYB5R3 28702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 43116155 43116318 43116237 Y CYB5R3,A4GALT A4GALT NA NA NA NA A4GALT 851 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 43387243 43387305 43387274 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 21846 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 45080339 45080681 45080664 Y PRR5 PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 15432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 45081354 45081559 45081463 Y NA PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8 PARVB,KIAA1644,SAMM50 IMR90 Hi-C 24141950 PRR5-ARHGAP8 14554 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 45254258 45254434 45254345 Y PHF21B NA NA NA NA NA PHF21B 149446 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr22 46442068 46442299 46442118 Y NA C22orf26 NA NA NA NA C22orf26 5725 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 46771050 46771392 46771204 Y NA TRMU NA NA NA NA TRMU 46278 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 46928379 46928595 46928487 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 2472 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 46970983 46971382 46971054 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 1074 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 46983627 46984120 46983763 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 TRMU,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 13718 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 47128172 47128501 47128260 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 3657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 47134957 47135355 47135288 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 2799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 47498045 47498267 47498202 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 341527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 47525665 47525872 47525801 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 369147 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 48185959 48186142 48186052 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 1029441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 453587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 50242140 50242406 50242374 Y MLC1,HDAC10 BRD1,ZBED4 ZBED4,BRD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZBED4 3084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 50342658 50342932 50342773 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 9229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 50344780 50345228 50344944 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 6933 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CPT1B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr22 51109040 51109307 51109069 Y SHANK3 ARSA,SHANK3 SHANK3,LMF2,NCAPH2,MAPK8IP2,CHKB-CPT1B,ARSA,SBF1,PPP6R2,ODF3B,SYCE3,KLHDC7B,TYMP,LOC100144603 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHANK3 1536 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 3202241 3202572 3202332 Y NA TRNT1,CRBN NA NA NA NA CRBN 16822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 4462883 4463183 4463026 Y NA SUMF1 NA NA NA NA SUMF1 43782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 9733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 7177749 7177779 7177764 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 1363614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 8906303 8906783 8906429 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 96674 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 9755464 9755857 9755670 Y LOC401052,C3orf24 BRPF1,OGG1 NA NA NA NA BRPF1 15556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 10236121 10236711 10236339 Y NA IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 31572 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr3 13062449 13062850 13062655 Y RPL32,NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 49767 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 13305478 13305792 13305632 Y NA NA NUP210 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 154017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 15329162 15329412 15329246 Y NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 NA NA NA NA NA SH3BP5 51463 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 15335582 15336799 15336677 Y NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 44076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 15343024 15343227 15343058 Y NA SH3BP5 NA NA NA NA SH3BP5 37648 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 15695837 15696119 15696028 Y HACL1 NA NA NA NA NA HACL1 54499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 16429150 16429271 16429247 Y RFTN1 NA NA NA NA NA RFTN1 124262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 16565294 16565593 16565411 Y DPH3 RFTN1 RFTN1,OXNAD1,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 RFTN1 11761 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 17404652 17404912 17404782 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 562493 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 17542863 17543019 17542979 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 700704 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 17650424 17650697 17650561 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 808265 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 23432118 23432366 23432242 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 189607 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 87236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 30700179 30700500 30700249 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 54185 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 31149741 31150063 31149903 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 422067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 31737462 31737733 31737598 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 165332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 33081513 33081785 33081661 Y NA SEC13P1 NA NA NA NA SEC13P1 8158 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 33837400 33837658 33837523 Y CLASP2,PDCD6IP PDCD6IP NA NA NA NA PDCD6IP 186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 37221290 37221535 37221382 Y NA LRRFIP2 LRRFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 1645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 37304089 37304216 37304152 Y GOLGA4 GOLGA4,AC097359.1 NA NA NA NA AC097359.1 20403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 37495440 37496065 37495716 Y ITGA9 ITGA9 NA NA NA NA ITGA9 3834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1,XIRP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1,XIRP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 39399859 39400185 39399921 Y CCR8,SLC25A38 SLC25A38,RPSA NA NA NA NA SLC25A38 22654 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 42108875 42109165 42109003 Y ULK4 NA NA NA NA NA TRAK1 55581 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA CCK 84464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 42518371 42518582 42518469 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 9239 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 42736762 42737356 42737132 Y FAM198A,KBTBD5,ZNF662,ZNF662,HHATL RP4-613B23.1,HHATL NA NA NA NA HHATL 4963 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 42781527 42781699 42781652 Y HHATL HHATL,CCDC13 NA NA NA NA CCDC13 31046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 44036592 44036799 44036686 Y NA NA NA NA NA NA ANO10 305506 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr3 44654573 44654874 44654724 Y ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 30193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 45185924 45186005 45185965 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 46116798 46117095 46116948 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1,LIMD1 NA FYCO1,CCR9,XCR1,SLC6A20,CXCR6,CCR5,SACM1L,LZTFL1 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 81482 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 46546407 46546628 46546504 Y CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2 NA NA NA NA NA LRRC2 72961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 46687602 46687990 46687796 Y NA ALS2CL NA NA NA NA ALS2CL 45204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 50040739 50040850 50040788 Y SEMA3B NA NA NA NA NA RBM6 65299 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 50292420 50292632 50292507 Y RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B-AS1,SEMA3B,IFRD2,NAT6,HYAL3 C3orf45,SEMA3B IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3B-AS1 10171 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 50638353 50638905 50638586 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 8046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 50642550 50642869 50642710 Y NA HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 4082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 50643029 50643593 50643387 Y MAPKAPK3,CISH HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 3358 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 51728520 51728585 51728552 Y NA TEX264 NA NA NA NA TEX264 33811 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 53342432 53342824 53342628 Y NA DCP1A NA NA NA NA DCP1A 36830 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 53723669 53724036 53723853 Y NA NA NA NA NA NA CHDH 154381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 53897423 53897785 53897604 Y NA CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA ACTR8 16444 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 55319384 55319763 55319619 Y WNT5A NA CACNA2D3,ERC2,WNT5A IMR90 Hi-C 24141950 CACNA2D3 1164810 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57194526 57194869 57194698 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 7465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 57637831 57638080 57637955 Y SLMAP,FAM116A,PDE12 NA NA NA NA NA ARF4 55884 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7,ATXN7 NA NA NA NA ATXN7 41 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 65006245 65006269 65006257 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 334569 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 65939140 65939412 65939262 Y MAGI1 NA NA NA NA NA MAGI1 83097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 70175230 70175612 70175604 Y NA NA NA NA NA NA MITF 388644 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 71031841 71032211 71032107 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 598929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 71298409 71298581 71298470 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 332559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 71493467 71493739 71493621 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 137401 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 72263935 72263948 72263940 Y NA NA SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 RYBP 230121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 87871242 87871381 87871312 Y HTR1F NA NA NA NA NA C3orf38 325512 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 223910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 99600050 99600430 99600273 Y FILIP1L,C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 230927 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA FILIP1L 62255 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 101046086 101046265 101046174 Y ZBTB11,SENP7,CEP97 NA NA NA NA NA SENP7 183820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 106146787 106146897 106146851 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 CBLB 560391 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 107106402 107106700 107106604 Y NA NA NA NA NA NA BBX 133083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 107376610 107376921 107376801 Y NA NA NA NA NA NA BBX 136827 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 107802397 107802714 107802497 Y MYH15,HHLA2 CD47 NA NA NA NA CD47 5158 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 111265245 111265633 111265405 Y NA NA NA NA NA NA PLCXD2 125890 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 111816359 111816505 111816432 Y C3orf52 C3orf52 NA NA NA NA C3orf52 13177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 115831620 115831831 115831726 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 911714 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119039607 119039839 119039731 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH ARHGAP31 NA NA NA NA ARHGAP31 28387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119042640 119043071 119042746 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH ARHGAP31 NA NA NA NA ARHGAP31 31420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119613107 119613331 119613219 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 197933 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119866352 119866515 119866428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 54610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 119876721 119876867 119876800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 64979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 121550824 121551193 121550988 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 121791947 121792054 121791993 Y HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86 CD86 NA NA NA NA CD86 19734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 122013970 122014538 122014305 Y CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DTX3L,DIRC2,CSTA CSTA NA NA NA NA CSTA 27553 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 122208819 122209075 122208974 Y NA KPNA1 NA NA NA NA KPNA1 22717 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 123125578 123125733 123125655 Y ADCY5,ADCY5 ADCY5 NA NA NA NA ADCY5 40872 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr3 123131610 123131782 123131703 Y MYLK,ADCY5,ADCY5 ADCY5 NA NA NA NA ADCY5 34823 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 124235482 124235658 124235570 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 211555 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA RP11-124N2.1 91582 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 128831103 128831496 128831287 Y NA RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 8148 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 128957834 128958071 128957930 Y NA NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 57069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 131056791 131057139 131056963 Y NA NUDT16P1,RP11-933H2.4,NUDT16 NA NA NA NA NUDT16P1 21603 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 133147395 133147694 133147637 Y NA NA NA NA NA NA CDV3 142880 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 134050159 134050571 134050486 Y AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 19741 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 20731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 141102647 141102881 141102782 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 61592 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 141131755 141132151 141131882 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 71738 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 141173878 141174028 141173977 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 29861 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 141174545 141175038 141174891 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28851 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 141659994 141660128 141660061 Y NA NA NA NA NA NA ATP1B3 67028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 143693787 143694146 143693885 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 5147 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 694953 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 150348986 150349006 150348996 Y CLRN1 SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 29971 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 24215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 150456267 150456381 150456351 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 21343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 151016558 151016712 151016648 Y MED12L,P2RY12,GPR87 GPR87,P2RY13 NA NA NA NA GPR87 16028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 152236739 152236782 152236761 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 251395 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 156506552 156506943 156506814 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 19578 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 156852547 156853124 156852850 Y NA CCNL1,RP11-550I24.2 NA NA NA NA CCNL1 23425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 158070419 158070585 158070503 Y MFSD1 NA NA NA NA NA MLF1 216367 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 158435101 158435147 158435125 Y NA LXN,MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 12840 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 159123796 159123957 159123826 Y NA NA NA NA NA NA SCHIP1 431693 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 159540179 159540477 159540438 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 15173 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 159542121 159542517 159542198 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 13133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr3 159597816 159598076 159597925 Y NA SCHIP1 NA NA NA NA SCHIP1 42166 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 100432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 160267928 160268193 160268163 Y NA SCARNA7,KPNA4 NA NA NA NA KPNA4 13183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 163939562 163939697 163939594 Y NA NA NA NA NA NA RP11-85M11.2 983051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 164046280 164046469 164046468 Y NA NA NA NA NA NA RP11-85M11.2 876279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 169051059 169051429 169051244 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 327977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA TERC 1241 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 140452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 170579509 170579531 170579522 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 6741 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 170712510 170712744 170712722 Y SLC2A2 NA NA NA NA NA EIF5A2 88028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 170841724 170842009 170841889 Y NA NA NA NA NA NA EIF5A2 217242 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171519572 171519961 171519854 Y NA PLD1 NA NA NA NA PLD1 6779 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171708179 171708567 171708376 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 46851 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171789788 171790157 171789907 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 34370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171878014 171878468 171878150 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 122596 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 199108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 172086059 172086253 172086084 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF10 153044 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 172416643 172417031 172416658 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 9977 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 174652666 174653024 174652845 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2 498303 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 174868634 174868952 174868706 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 456315 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 175204149 175204623 175204405 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-91P 120644 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 177297513 177297662 177297588 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 384252 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 179431401 179431712 179431563 Y NA NA NA NA NA NA USP13 62858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 179685404 179685725 179685692 Y NA NA NA NA NA NA USP13 316861 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 180137302 180137353 180137328 Y NA NA NA NA NA NA TTC14 180565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 181419160 181419816 181419173 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 7898 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.34296316390058 chr3 181456298 181456477 181456331 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 28584 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 181473928 181474194 181474085 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 46214 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 181857684 181857696 181857690 Y SOX2 NA NA NA NA NA SOX2 429970 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 181876844 181877235 181877011 Y NA NA NA NA NA NA SOX2 449130 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 182613640 182613943 182613809 Y MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 87798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 182642205 182642465 182642335 Y NA NA NA NA NA NA DCUN1D1 59276 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11885 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 183726020 183726143 183726081 Y NA ABCC5,EEF1A1P8 PARL IMR90 Hi-C 24141950 ABCC5 7660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 184503800 184503841 184503824 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 24090 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA C3orf70 93351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185034789 185035224 185034953 Y NA EHHADH,MAP3K13 NA NA NA NA MAP3K13 36060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185215412 185215562 185215482 Y NA TMEM41A NA NA NA NA TMEM41A 567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185339016 185339200 185339107 Y NA SENP2 NA NA NA NA SENP2 40732 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185533882 185534105 185533994 Y NA IGF2BP2 SENP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2BP2 6739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185759811 185760041 185759926 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 66066 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 187901313 187901616 187901372 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 31468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 188139673 188140134 188139816 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 269828 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 188149383 188149832 188149544 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 279538 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 188156976 188157533 188157052 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 287131 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 189524070 189524362 189524216 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1 313864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 191873125 191873377 191873252 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 610176 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 192289148 192289495 192289213 Y NA NA NA NA NA NA FGF12 194058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr3 192997761 192997785 192997774 Y NA HRASLS NA NA NA NA HRASLS 40847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr3 194029385 194029774 194029648 Y NA NA NA NA NA NA HES1 177451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 194041526 194041906 194041553 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 175187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr3 194048965 194049014 194048990 Y NA NA NA NA NA NA ATP13A3 168079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 194821602 194822296 194821841 Y PPP1R2,ACAP2 NA NA NA NA NA XXYLT1 167600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195073897 195074088 195073990 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 84001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195531239 195531516 195531404 Y NA NA NA NA NA NA MUC20 85486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195854063 195854320 195854202 Y TFRC,TFRC TFRC LOC401109,PCYT1A,TFRC,MIR570,MUC20,UBXN7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFRC 47003 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195871770 195871934 195871856 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 64710 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195891844 195892227 195892035 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 84784 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr3 195897824 195897955 195897893 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,TNK2,TM4SF19,PCYT1A NA NA NA NA NA TFRC 90764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 195919575 195919687 195919655 Y NA NA NA NA NA NA PCYT1A 93141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 196761683 196762044 196761813 Y NA MFI2-AS1,MFI2 MFI2-AS1,MFI2 IMR90 Hi-C 24141950 MFI2 6996 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 197216995 197217339 197217145 Y DLG1 NA NA NA NA NA BDH1 80855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 683740 684022 683889 Y GAK,MYL5,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,MFSD7,PCGF3 NA NA NA NA MFSD7 2510 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 1710531 1710811 1710671 Y NA SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 1471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 1769544 1769746 1769644 Y FGFR3 TMEM129,TACC3,FGFR3 FGFR3 MCF7 ChIA-PET 22265404 FGFR3 23288 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 1796551 1796852 1796752 Y NA FGFR3 NA NA NA NA FGFR3 3517 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 1972677 1973039 1972858 Y WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 1324 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 5587454 5587568 5587511 Y NA NA NA NA NA NA EVC2 121707 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 6437206 6437596 6437541 Y JAKMIP1,PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA PPP2R2C 125731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 8421251 8421740 8421359 Y SH3TC1,ACOX3 ACOX3 NA NA NA NA ACOX3 18710 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 10034211 10034588 10034478 Y SLC2A9 NA NA NA NA NA WDR1 81985 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 12189077 12189099 12189089 Y NA NA NA NA NA NA RP11-352E6.2 451162 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 201297 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 13623241 13623510 13623376 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 139252 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 14439704 14439728 14439717 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 562570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 17829390 17829398 17829394 Y CLRN2,NCAPG DCAF16,NCAPG NA NA NA NA NCAPG 18865 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 21568981 21569135 21569128 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 873076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 23936573 23936821 23936709 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 32861 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA NA CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 75834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 27012249 27012271 27012260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 152028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 36078000 36078189 36078065 Y DTHD1,ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 165942 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 36131031 36131404 36131217 Y ARAP2 NA NA NA NA NA ARAP2 112727 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 36210207 36210423 36210315 Y NA ARAP2 NA NA NA NA ARAP2 33708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 38697805 38697826 38697816 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 33301 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1 2696 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 39316114 39316675 39316347 Y NA RFC1 NA NA NA NA RFC1 49320 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 39619957 39620342 39620150 Y NA RP11-539G18.2 NA NA NA NA RP11-539G18.2 18418 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 40185572 40185863 40185723 Y RBM47 NA RHOH IMR90 Hi-C 24141950 N4BP2 129126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 40519982 40520039 40520011 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 110853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 42073690 42073968 42073740 Y NA NA NA NA NA NA SLC30A9 83201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 45914442 45914779 45914611 Y NA NA NA NA NA NA RAC1P2 809846 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 48125578 48125743 48125738 Y TEC NA NA NA NA NA CNGA1 108889 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 53985720 53986039 53985931 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 244203 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 54055240 54055561 54055400 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 174681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 54928262 54928437 54928381 Y NA CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 54929171 54929915 54929573 Y CHIC2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 314 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 55097338 55097659 55097499 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 4074 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 56901915 56901931 56901923 Y KIAA1211 NA NA NA NA NA CEP135 88878 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 57048653 57048701 57048677 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP31 171600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 70625186 70625316 70625246 Y SULT1B1 NA NA NA NA NA SULT1E1 98554 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74055104 74055142 74055123 Y ANKRD17,ALB,AFM NA NA NA NA NA ANKRD17 67373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74516492 74516522 74516507 Y NA RASSF6 CXCL5,RASSF6,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 32144 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr4 74527283 74527866 74527619 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 RASSF6 CXCL5,RASSF6,CXCL2,ANKRD17,IL8,PF4V1,CXCL3,CXCL6,PPBPL2,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 42935 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 74529339 74529639 74529482 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 RASSF6 CXCL2,RASSF6,PF4V1,CXCL6,CXCL3,PPBPL2,IL8,CXCL5,CXCL1,PF4,PPBP,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 RASSF6 44991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74545430 74545943 74545736 Y CXCL6,CXCL1 NA CXCL2,CXCL5,PPBP,PPBPL2,PF4 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 58280 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74548303 74548577 74548471 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 55646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74549349 74549563 74549470 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 54660 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74575200 74575450 74575368 Y ANKRD17,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 28773 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74584369 74584648 74584565 Y ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 MTHFD2L,CXCL3 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 19575 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74596602 74597090 74596757 Y ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IL8 7133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74600074 74600136 74600093 Y MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8 IL8 IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL8 4087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 74881912 74882135 74882023 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2 PF4,PPBP,CXCL5,CXCL3 NA NA NA NA CXCL5 19416 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 75257879 75258118 75257951 Y CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG NA NA NA NA NA MTHFD2L 279988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 76487136 76487403 76487267 Y NA THAP6,RCHY1 NA NA NA NA RCHY1 49162 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 77522680 77522954 77522817 Y SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 168427 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 77931984 77932418 77932077 Y NA NA NA NA NA NA CCNI 62740 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 78823537 78823752 78823560 Y NA MRPL1 NA NA NA NA MRPL1 41863 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA FRAS1 107114 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 82388876 82389215 82389175 Y NA NA NA NA NA NA BMP3 438757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 83681282 83681423 83681411 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 36587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84034119 84034423 84034342 Y THAP9,LIN54,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,COQ2,PLAC8,PLAC8 PLAC8 NA NA NA NA PLAC8 21805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84111590 84111978 84111921 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,PLAC8 NA PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 55362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84119050 84119584 84119323 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,PLAC8 NA COPS4,COQ2,PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 PLAC8 62822 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84152800 84153100 84153049 Y THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2 NA PLAC8,COPS4 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 50967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84153273 84153480 84153394 Y THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2 NA PLAC8,COPS4 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 50587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84196492 84196601 84196547 Y NA COQ2 NA NA NA NA COQ2 7466 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 84469544 84469879 84469660 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 14477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 86410493 86410688 86410582 Y NA ARHGAP24 NA NA NA NA ARHGAP24 16226 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr4 86927841 86928538 86928361 Y MAPK10,MAPK10,MAPK10 NA NA NA NA NA ARHGAP24 533574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 87615730 87616123 87615813 Y PTPN13,SLC10A6 NA NA NA NA NA PTPN13 102262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 87839773 87840193 87839957 Y HSD17B11 AFF1,C4orf36 NA NA NA NA AFF1 13961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 88128695 88128755 88128733 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 89377235 89377564 89377513 Y HERC6,HERC5 HERC5 NA NA NA NA HERC5 967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 89922113 89922454 89922284 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 108095 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.85018553682602 chr4 91746125 91746495 91746310 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 988659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 92218724 92218762 92218742 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 1461258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 95406092 95406259 95406175 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 35055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 95457390 95457546 95457468 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM5 86353 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 99496519 99496626 99496526 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 81154 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 99845137 99845196 99845164 Y NA AC019131.1,EIF4E NA NA NA NA AC019131.1 3942 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 102756760 102756924 102756822 Y NA NA NA NA NA NA PPP3CA 489325 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 106112779 106113198 106113105 Y TET2,TET2 TET2 NA NA NA NA TET2 47747 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 106305912 106306089 106306001 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 87149 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 108760061 108760236 108760128 Y NA SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 16342 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 108885395 108885483 108885439 Y NA CYP2U1,HADH NA NA NA NA HADH 23387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 110320309 110320596 110320490 Y LRIT3 SEC24B,SEC24B-AS1 OSTC,AGXT2L1,COL25A1,CFI IMR90 Hi-C 24141950 SEC24B 32332 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 111085558 111085919 111085739 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 32436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 113205194 113205406 113205300 Y NA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 135 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 120205306 120205694 120205553 Y NA C4orf3 NA NA NA NA C4orf3 17906 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 120439031 120439404 120439161 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 65085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 120531384 120531610 120531497 Y NA PDE5A NA NA NA NA PDE5A 16536 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 122313649 122313906 122313729 Y NA NA NA NA NA NA ANXA5 302362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 122606332 122606884 122606598 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 9384 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 124706683 124706991 124706838 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 390733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 124709037 124709145 124709084 Y SPRY1 NA NA NA NA NA SPRY1 393087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 129088221 129088417 129088319 Y NA NA NA NA NA NA LARP1B 107798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 129275726 129275798 129275762 Y NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 63820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 130012970 130013118 130013063 Y PHF17,SCLT1,C4orf33 C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA SCLT1 206 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 130246111 130246411 130246262 Y C4orf33 NA NA NA NA NA SCLT1 233347 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 139300997 139301320 139301159 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 139494 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 140292626 140292906 140292778 Y NA NA NA NA NA NA NDUFC1 70921 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 140334690 140334958 140334824 Y ELF2 RAB33B NA NA NA NA RAB33B 37428 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 140886001 140886373 140886187 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 186965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 141659330 141659616 141659485 Y ZNF330,TBC1D9 TBC1D9 NA NA NA NA TBC1D9 15658 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 143325385 143325488 143325414 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 441097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 144277775 144277945 144277866 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 21860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 144401789 144402147 144401968 Y NA SMARCA5 NA NA NA NA SMARCA5 30469 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 145498597 145498714 145498656 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 518370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 146098272 146098411 146098334 Y MMAA,ANAPC10,OTUD4 OTUD4 NA NA NA NA OTUD4 902 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 147192653 147192904 147192792 Y ZNF827,SLC10A7 NA NA NA NA NA LSM6 97816 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 147379746 147379894 147379845 Y LSM6 NA NA NA NA NA SLC10A7 61229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 148981855 148982042 148981912 Y PRMT10,NR3C2 NA NA NA NA NA ARHGAP10 330641 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 151241204 151241585 151241396 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 243778 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 151564216 151564527 151564372 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 370352 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 152127737 152127987 152127916 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 109012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 SH3D19 FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 SH3D19 1248 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 152367520 152367754 152367585 Y NA RP11-610P16.1,FAM160A1 NA NA NA NA FAM160A1 39152 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 152406480 152406763 152406721 Y NA NA NA NA NA NA FAM160A1 78112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 153265183 153265560 153265526 Y FBXW7 NA NA NA NA NA FBXW7 189693 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 153424227 153424394 153424311 Y NA FBXW7 NA NA NA NA FBXW7 30859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 153445736 153446128 153446118 Y NA FBXW7 NA NA NA NA FBXW7 9125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA TIGD4,ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 154235645 154236052 154235798 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 27749 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 154269495 154269528 154269512 Y TRIM2,MND1 MND1 NA NA NA NA MND1 5694 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA TLR2 72171 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 157866755 157867028 157866930 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 23518 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 157889828 157890031 157889884 Y PDGFC PDGFC NA NA NA NA PDGFC 515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 157893618 157893834 157893797 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 3072 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 159101630 159101785 159101708 Y NA RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144 NA NA NA NA FAM198B 9160 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 159641149 159641258 159641192 Y NA ETFDH,C4orf46,PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 1290 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 159731152 159732543 159732097 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 42862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 160191202 160191310 160191258 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 502912 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 160195976 160196239 160196029 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 507686 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 NACA3P,TRIM61 NA NA NA NA TRIM61 14196 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 166331391 166331603 166331463 Y C4orf39,CPE NA NA NA NA NA CPE 51045 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 168818156 168818524 168818473 Y NA NA NA NA NA NA DDX60 419434 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169595912 169596309 169596196 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 138975 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169658786 169659496 169659136 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 201849 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169662986 169663338 169663111 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA DDX60L 206049 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169705913 169706245 169706080 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 223181 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169737785 169738127 169737934 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 191299 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 169991170 169991417 169991322 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 61744 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 170026437 170026753 170026620 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 97011 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 170096424 170096523 170096474 Y NA NA NA NA NA NA SH3RF1 93733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 170132939 170133158 170133049 Y SH3RF1 NA NA NA NA NA SH3RF1 57098 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 170788484 170788546 170788528 Y MFAP3L NA NA NA NA NA C4orf27 111380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 170934636 170934767 170934702 Y NA MFAP3L NA NA NA NA MFAP3L 17415 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 174112816 174113032 174112924 Y NA GALNT7,RP11-10K16.1 NA NA NA NA RP11-10K16.1 24013 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 174439063 174439445 174439212 Y NA HAND2-AS1,HAND2 NA NA NA NA HAND2-AS1 6976 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr4 174620122 174620295 174620211 Y NA NA NA NA NA NA RANP6 66600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr4 175281816 175282139 175281824 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 78401 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 176814255 176814522 176814389 Y GPM6A,GPM6A NA NA NA NA NA WDR17 170463 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 181045421 181045488 181045454 Y NA NA NA NA NA NA AGA 2683764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 183133398 183133793 183133630 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 703296 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 184390171 184390713 184390483 Y NA CDKN2AIP,ING2 NA NA NA NA CDKN2AIP 26427 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 185269961 185270243 185270083 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 123491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 185331149 185331516 185331503 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 62218 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.62154342755897 chr4 185740732 185741181 185740991 Y NA RP11-701P16.2,ACSL1 NA NA NA NA ACSL1 4791 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 186594730 186595126 186594900 Y SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SNX25 NA NA NA NA NA PDLIM3 139964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 186823839 186824139 186824048 Y CCDC110,SORBS2 NA NA NA NA NA SORBS2 51667 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 187027199 187027350 187027289 Y SORBS2,FAM149A TLR3,FAM149A NA NA NA NA FAM149A 3626 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr4 187597728 187597911 187597833 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 47965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr5 175502 175522 175512 Y NA PLEKHG4B,LRRC14B,CCDC127,SDHA NA NA NA NA LRRC14B 14104 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 392668 393182 392808 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 48076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 523686 523917 523764 Y SLC9A3 NA NA NA NA NA CTD-2228K2.5 52473 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.62154342755897 chr5 1102623 1102762 1102676 Y TPPP,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 7388 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 1504118 1504272 1504189 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 17820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 1514952 1515327 1515072 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 6765 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 1516282 1516761 1516468 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 5331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.17870395487573 chr5 7397224 7397590 7397441 Y C5orf49,ADCY2 NA NA NA NA NA MTRR 451709 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 10578225 10578424 10578340 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 15783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 14251046 14251256 14251151 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 109235 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 14666216 14666664 14666270 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 3443 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 14739809 14739939 14739877 Y NA NA NA NA NA NA RBBP4P1 56570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 17177639 17177702 17177672 Y NA NA NA NA NA NA BASP1 113932 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 17181604 17182061 17181749 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 117897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1100991 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 29758752 29759069 29758903 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 1771234 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 32164142 32164348 32164245 Y ZFR GOLPH3 NA NA NA NA GOLPH3 8108 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 36030784 36031024 36030904 Y UGT3A2 UGT3A2 NA NA NA NA UGT3A2 38436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 38551608 38551876 38551742 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 3787 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 39185861 39186166 39186014 Y NA NA NA NA NA NA FYB 86464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 39721328 39721512 39721418 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 260926 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 40485241 40485566 40485308 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 192034 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 40502915 40503143 40503055 Y NA NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 174457 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 41497221 41497345 41497332 Y NA PLCXD3 NA NA NA NA PLCXD3 11385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 42465969 42466319 42466144 Y GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR GHR NA NA NA NA GHR 44090 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 42837776 42837985 42837885 Y GHR,SEPP1 SEPP1 NA NA NA NA SEPP1 47509 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA AC025171.1,ZNF131 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 43636380 43636584 43636517 Y NA NNT,NNT-AS1 NA NA NA NA NNT-AS1 35048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 44405989 44406097 44406043 Y NA NA NA NA NA NA RP11-53O19.1 400782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 45570738 45571122 45570930 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 763711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 310514 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 53309437 53310024 53309694 Y ARL15 NA NA NA NA NA ARL15 294388 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 53358665 53359272 53358974 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 245140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 54715918 54716192 54716055 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 108337 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 55288370 55289209 55288952 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 621737 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58395760 58396044 58395902 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 641673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 664293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58426345 58426806 58426483 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 672258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58497739 58497828 58497784 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 743652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 754756 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 821737 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 59171284 59171310 59171298 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 822707 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 59834380 59834549 59834441 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 159468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 60921621 60921766 60921694 Y C5orf64 NA NA NA NA NA RPL3P6 235923 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 61917589 61917885 61917879 Y NA NA NA NA NA NA CKS1B 111280 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 64062726 64062917 64062822 Y NA SREK1IP1 NA NA NA NA CWC27 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 64224703 64224806 64224755 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 161946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA CENPK,PPWD1 NA NA NA NA CENPK 47046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 66786490 66786676 66786582 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 488709 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 68823946 68824105 68824026 Y NA OCLN NA NA NA NA OCLN 37827 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 75796812 75797204 75796850 Y IQGAP2,S100Z NA NA NA NA NA F2RL2 120055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 76103961 76104259 76104075 Y NA F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 8499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 78843402 78843606 78843502 Y CMYA5,HOMER1 RP11-342F17.1,HOMER1,RP11-342F17.2 THBS4,BHMT2,HOMER1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-342F17.2 20277 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 78843882 78844075 78843988 Y NA RP11-342F17.1,HOMER1,RP11-342F17.2 THBS4,BHMT2,HOMER1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-342F17.2 20757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 78990549 78990790 78990669 Y THBS4,CMYA5 CMYA5 NA NA NA NA CMYA5 6849 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 78993167 78993488 78993350 Y THBS4,CMYA5 CMYA5 NA NA NA NA CMYA5 9467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 79480253 79480678 79480326 Y NA NA NA NA NA NA SERINC5 69220 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 79531979 79532366 79532173 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 17532 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 80055694 80056072 80055883 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 106892 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 80705760 80705793 80705777 Y ACOT12 NA NA NA NA NA ZCCHC9 110351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 81630753 81631047 81630851 Y NA NA NA NA NA NA RPS23 58357 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 82664194 82664491 82664355 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 100793 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 83933466 83933504 83933476 Y NA NA NA NA NA NA EDIL3 254855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 86617714 86617757 86617736 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 56009 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 86653612 86653965 86653789 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 52871 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 94843632 94843977 94843805 Y NA TTC37,ARSK NA NA NA NA TTC37 44734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22760 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 95360201 95360335 95360279 Y NA NA ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 64426 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 95676015 95676411 95676184 Y ELL2 NA ELL2,C5orf27,MIR583,CAST IMR90 Hi-C 24141950 PCSK1 91436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 96902008 96902041 96902023 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2278B20.1 231264 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr5 99389717 99390411 99390143 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 478555 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 101134919 101134927 101134923 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4C1 495326 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 102847325 102847595 102847369 Y NA NUDT12 NA NA NA NA NUDT12 48899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 106699543 106699944 106699621 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 304652 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 106907307 106907511 106907485 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 106908701 106908838 106908775 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 95758 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 108251515 108251852 108251684 Y NA NA NA NA NA NA FER 169992 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 108329034 108329385 108329210 Y NA NA NA NA NA NA FER 247511 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 111502817 111502914 111502867 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 8594 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 111523730 111523898 111523814 Y NA EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 29507 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 111528702 111529013 111528858 Y EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 34479 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 AC010226.4,TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2,TICAM2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 115157919 115158169 115158044 Y LOC644100 CDO1,AP3S1,ATG12 NA NA NA NA CDO1 7268 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 115855956 115855969 115855965 Y NA CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 40289 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 118659966 118660476 118660173 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 57579 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 118747776 118748171 118748023 Y NA HSD17B4 NA NA NA NA HSD17B4 37967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 120004624 120004640 120004633 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 206651 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 122181959 122182300 122182177 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 4825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 155387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 133455254 133455613 133455348 Y NA TCF7 NA NA NA NA TCF7 6852 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 133466882 133467138 133467027 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 18480 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 133681629 133682059 133681927 Y NA CDKL3,UBE2B NA NA NA NA CDKL3 22679 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIPNL 117541 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.50722237292544 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr5 135359253 135359579 135359414 Y NA TGFBI LECT2,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 3005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.90012369121735 chr5 137826508 137826985 137826545 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 27329 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 182646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 329197 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 138541195 138541588 138541435 Y NA NA SIL1,HSPA9,CTNNA1,LRRTM2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MATR3 65853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr5 138608448 138608665 138608563 Y LRRTM2,MATR3,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA MATR3 1007 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 141151294 141151412 141151353 Y NA NA LOC729080,KIAA0141 IMR90 Hi-C 24141950 ARAP3 91506 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 141201064 141201327 141201197 Y PCDH1 NA PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 55484 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 141262176 141262446 141262287 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 PCDH1,KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 5365 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 141311332 141311399 141311366 Y NA KIAA0141,RNF14,PCDH12 NA NA NA NA KIAA0141 9959 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 141394614 141394984 141394650 Y PCDH12 PCDH12,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 4008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 142361615 142361922 142361810 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 213666 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 142597366 142597816 142597499 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 112354 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 142965486 142966022 142965783 Y NR3C1,NR3C1 NA NR3C1,ARHGAP26 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 152409 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 145447855 145448292 145447919 Y NA NA NA NA NA NA LARS 111931 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 146378574 146378711 146378699 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R2B 83636 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 103475 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 148505231 148505419 148505389 Y NA ABLIM3 ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 13627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 149533722 149534084 149534015 Y SYNPO,SYNPO,PDGFRB CSF1R,PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 287 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 149989582 149989693 149989611 Y GPX3 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 10940 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 149999061 149999403 149999234 Y C5orf62,SYNPO,SYNPO SYNPO NA NA NA NA SYNPO 20419 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 150004824 150005027 150004948 Y SYNPO,MYOZ3 SYNPO NA NA NA NA SYNPO 26182 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA GPX3 NA NA NA NA GPX3 5135 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 150593680 150594043 150593885 Y DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 3969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 151017311 151017607 151017366 Y FAT2 SPARC SLC36A1,FAT2,ATOX1 IMR90 Hi-C 24141950 SPARC 47119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 153807428 153807565 153807497 Y NA SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L 15952 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L 13920 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 153855980 153856061 153856023 Y HAND1 SAP30L,HAND1 NA NA NA NA HAND1 156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA SGCD 423306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr5 155107244 155107656 155107286 Y NA NA PPP1R2P3,TIMD4,SGCD IMR90 Hi-C 24141950 SGCD 187698 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 157521038 157521096 157521067 Y NA NA EBF1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 236855 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 158136422 158136652 158136537 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 388117 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 159200778 159201137 159200921 Y NA NA ADRA1B,LOC285627 IMR90 Hi-C 24141950 TTC1 232983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 159496389 159496537 159496463 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 47893 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 167752204 167752623 167752553 Y PANK3 WWC1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 WWC1 35548 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 167909535 167909826 167909541 Y NA RARS RARS IMR90 Hi-C 24141950 RARS 1624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 168503083 168503413 168503326 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 222720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 170177072 170177289 170177179 Y GABRP GABRP NA NA NA NA GABRP 11065 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 171600987 171601129 171601000 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 12261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 172663658 172663862 172663754 Y NA NKX2-5 NA NA NA NA NKX2-5 3298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 172695992 172696368 172696187 Y NKX2-5 NKX2-5 ATP6V0E1,NKX2-5,BNIP1,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-5 35632 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA CTB-43E15.4 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.4 40392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 174906234 174906555 174906308 Y NA SFXN1 NA NA NA NA SFXN1 4169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 175116445 175116962 175116612 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 33412 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 176337374 176337559 176337468 Y NA HK3 NA NA NA NA HK3 13041 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 HK3 NA NA NA NA HK3 35229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 177910614 177910888 177910852 Y AGXT2L2,COL23A1,CLK4 NA NA NA NA NA COL23A1 104668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 179159137 179159324 179159233 Y RNF130,RUFY1,SQSTM1,HNRNPH1,MAML1 MAML1 NA NA NA NA MAML1 1286 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 180472837 180473231 180473040 Y BTNL9 BTNL9 NA NA NA NA BTNL9 7612 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 180473265 180473624 180473271 Y BTNL9 BTNL9 NA NA NA NA BTNL9 8040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 180527494 180527529 180527504 Y NA NA MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 BTNL9 62269 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 393896 394326 394097 Y DUSP22,IRF4,EXOC2 IRF4 NA NA NA NA IRF4 4157 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 1641578 1641903 1641733 Y NA FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 32897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 2763022 2763072 2763047 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 2818912 2819151 2819031 Y SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21089 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 3308463 3308483 3308477 Y NA NA NA NA NA NA PSMG4 78826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 3385907 3386183 3386010 Y SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 69073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 3389811 3390490 3390264 Y SERPINB6,SLC22A23,C6orf145 NA NA NA NA NA SLC22A23 64766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 3403581 3403822 3403689 Y BPHL,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 51434 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 3516507 3516602 3516555 Y RIPK1 NA SLC22A23,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A23 61251 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 3876469 3876663 3876636 Y NA FAM50B PXDC1,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 28849 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 4603647 4603982 4603794 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 100411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 6151506 6151793 6151650 Y F13A1 NA NA NA NA NA NRN1 146306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 LY86 100799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 7480187 7480515 7480351 Y DSP NA DSP MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DSP 59293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 8083649 8083837 8083720 Y NA EEF1E1 NA NA NA NA EEF1E1 16974 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 10520494 10520618 10520557 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 102602 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 10587786 10588136 10587948 Y TMEM14B,GCNT2 NA NA NA NA NA PAK1IP1 104792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA ELOVL2 154456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11270585 11270869 11270602 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 109712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11374970 11375161 11375093 Y NA NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 5420 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 11609469 11609947 11609818 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 73531 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 11651155 11651370 11651270 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 115217 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 12472967 12473281 12473124 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 184371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 12546211 12546443 12546327 Y NA NA EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 PHACTR1 169450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 14556348 14556398 14556373 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 440476 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 14929648 14930020 14929845 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 314507 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 15474239 15474654 15474451 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 186635 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 15589107 15589675 15589446 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 71614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 16684658 16685097 16684682 Y ATXN1 NA NA NA NA NA ATXN1 74625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 ATXN1 NA NA NA NA ATXN1 35327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 17280388 17280785 17280395 Y CAP2,RBM24,RBM24,RBM24 RBM24 NA NA NA NA RBM24 811 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 17418097 17418389 17418210 Y NA CAP2 NA NA NA NA CAP2 26650 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 17932767 17932988 17932837 Y RNF144B,KDM1B NA NA NA NA NA KIF13A 52866 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 18308493 18308879 18308567 Y NA DEK RNF144B IMR90 Hi-C 24141950 DEK 45439 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 18434796 18435132 18434964 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B NA NA NA NA NA RNF144B 68017 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 19514678 19515039 19515010 Y NA NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 287944 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 19805542 19805809 19805569 Y NA RP4-625H18.2,ID4 ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP4-625H18.2 2559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 799 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 20444927 20445761 20445060 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 44529 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 21740205 21740397 21740265 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 148233 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 22148644 22148866 22148767 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 556672 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 25034556 25034972 25034914 Y C6orf62 FAM65B FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 FAM65B 5266 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 25089428 25090170 25089848 Y TDP2,C6orf62 FAM65B NA NA NA NA FAM65B 49190 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 54475 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr6 25098063 25098345 25098205 Y NA NA NA NA NA NA FAM65B 57825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 25352378 25352572 25352400 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 75072 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr6 26006419 26006453 26006436 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 9587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 27146789 27146995 27146901 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30028 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 27637197 27637397 27637297 Y OR2B6,OR2B2 NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 27637652 27637706 27637685 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 136003 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 5674 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 89087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 28985048 28985267 28985158 Y NA HCG15,ZNF311 TRIM27,LOC401242 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZNF311 13955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 29935319 29935652 29935489 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 28282 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 26974 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30497378 30497566 30497432 Y PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E,PRR3 RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 25097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30703511 30703691 30703651 Y NA PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 NA NA NA NA FLOT1 4819 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 30774085 30774428 30774395 Y NA NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,TUBB,DDR1,VARS2,DHX16,SFTA2,PPP1R18,NRM,IER3,MUC22 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 63754 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr6 31276281 31276390 31276356 Y NA HLA-C,RPL3P2,HLA-B MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26 IMR90 Hi-C 24141950 RPL3P2 30187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,C6orf25,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,C6orf25,LY6G6C,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr6 32050642 32051035 32051003 Y LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL NA NA NA NA TNXB 30076 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 32430540 32430779 32430657 Y PSMB8,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DMB,HLA-DMA,STK19,HLA-DRA,HLA-DRB5 HLA-DRA NA NA NA NA HLA-DRA 24921 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA HLA-DOA 19118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 34521580 34522143 34521703 Y NA RP3-391O22.3 NA NA NA NA SPDEF 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 35228332 35228733 35228603 Y PPARD,ZNF76 SCUBE3,ZNF76,DEF6 NA NA NA NA ZNF76 3646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 35632268 35633036 35633003 Y NA NA NA NA NA NA FKBP5 61324 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 35693475 35694027 35693643 Y PPARD,FKBP5,FKBP5 FKBP5 NA NA NA NA FKBP5 333 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 36302760 36303107 36302825 Y NA NA NA NA NA NA ETV7 51057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 36786044 36786391 36786334 Y NA CPNE5 NA NA NA NA CPNE5 19387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 36802429 36803020 36802653 Y PI16,CPNE5 CPNE5,C6orf89,PPIL1 NA NA NA NA CPNE5 2758 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 36812029 36812445 36812409 Y NA CPNE5,C6orf89,PPIL1 NA NA NA NA CPNE5 6251 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 7.52166711877632 chr6 37067331 37067581 37067437 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90 Hi-C 24141950 PIM1 68398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 38450593 38450822 38450666 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 155102 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 38514218 38514357 38514288 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 91567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 38605801 38606040 38606032 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 39061184 39061194 39061189 Y GLP1R SAYSD1 NA NA NA NA SAYSD1 19771 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 40965087 40965613 40965406 Y NA NA NA NA NA NA APOBEC2 53430 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 41608113 41608435 41608156 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 5493 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 41696174 41696539 41696421 Y TFEB TFEB,PRICKLE4 NA NA NA NA TFEB 5458 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 42300744 42300888 42300812 Y UBR2 NA NA NA NA NA TRERF1 116901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 44031882 44032664 44032378 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,C6orf223,MRPS18A,VEGFA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 59987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 44044328 44044673 44044418 Y C6orf223,NFKBIE TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 47978 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 44052522 44052743 44052633 Y NA TMEM63B,MRPL14 MAD2L1BP,GTPBP2,RSPH9,POLH,VEGFA,MRPS18A,XPO5,LOC100132354,TMEM63B,CAPN11,MRPL14,HSP90AB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM63B 39908 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 44894432 44894504 44894470 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 449186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 46891394 46891478 46891435 Y NA GPR116 NA NA NA NA GPR116 29202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 47550559 47550935 47550672 Y NA NA NA NA NA NA GPR115 100665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 52261634 52261809 52261784 Y EFHC1 PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 21297 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 53449658 53449861 53449725 Y GCLC GCLC NA NA NA NA GCLC 29907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 54027576 54027936 54027713 Y KLHL31,MLIP NA NA NA NA NA MLIP 234796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 54845767 54846152 54846043 Y GFRAL NA NA NA NA NA FAM83B 136198 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA COL21A1 NA NA NA NA COL21A1 39521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 57514718 57514824 57514771 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 337115 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 70591824 70592000 70591893 Y COL19A1 COL19A1 NA NA NA NA COL19A1 17361 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 72294841 72295504 72295148 Y NA KRT19P1 RIMS1 IMR90 Hi-C 24141950 KRT19P1 2417 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 73504067 73504420 73504243 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 466518 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 73981759 73981798 73981779 Y NA RP11-398K22.12 NA NA NA NA RP11-398K22.12 10821 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 74432369 74432753 74432573 Y MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109 CD109 NA NA NA NA CD109 28861 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 76467215 76467333 76467230 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 10306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 80302449 80302781 80302615 Y NA SH3BGRL2 NA NA NA NA SH3BGRL2 36219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 80838245 80838506 80838365 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 23881 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 81348599 81348680 81348638 Y NA NA BCKDHB IMR90 Hi-C 24141950 BCKDHB 534235 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 84101816 84101824 84101820 Y NA ME1 NA NA NA NA ME1 36973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 87881047 87881581 87881092 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 20496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 88183289 88183642 88183572 Y NA SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 4948 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 88398633 88398672 88398653 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 11255 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 88889388 88889661 88889633 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 95047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 90774597 90775020 90774993 Y NA NA NA NA NA NA CASP8AP2 236984 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 95887569 95887862 95887716 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 135557 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 99901572 99901766 99901669 Y NA RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 30365 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 100008682 100008928 100008805 Y NA USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 5921 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 101211686 101211775 101211752 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 115473 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 106430993 106431324 106431143 Y PRDM1 NA PRDM1 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 100871 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 106616078 106616322 106616199 Y NA NA NA NA NA NA PRDM1 83883 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 108954654 108955002 108954825 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 75616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 108961437 108961619 108961493 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 82399 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 109102631 109102946 109102736 Y NA NA NA NA NA NA ARMC2 64673 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 111265873 111266130 111266017 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 GTF3C6,RPF2 CDK19,AMD1,SLC22A16 IMR90 Hi-C 24141950 GTF3C6 11633 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 111758931 111759246 111759206 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 43468 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 112358882 112359559 112359206 Y TRAF3IP2 TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 47173 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 113988036 113988158 113988108 Y HS3ST5,MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 18760 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 114391441 114391608 114391525 Y HS3ST5 NA NA NA NA NA HDAC2 60969 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 114478315 114478345 114478330 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 147843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 114664746 114665107 114665068 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 2537 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 116345065 116345141 116345103 Y NA FRK NA NA NA NA FRK 34780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 116469368 116469398 116469382 Y NA NT5DC1 NA NA NA NA NT5DC1 49356 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 116550472 116550927 116550585 Y KPNA5,TSPYL4,TSPYL1 TSPYL4,DSE,TSPYL1 NA NA NA NA TSPYL4 22334 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 117937053 117937396 117937164 Y NA GOPC ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 GOPC 15362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr6 118008335 118008695 118008355 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 13670 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 119082982 119083196 119083043 Y NA NA SLC35F1,CEP85L IMR90 Hi-C 24141950 CEP85L 53744 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 119210409 119210579 119210468 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 2805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 119764172 119764289 119764182 Y MAN1A1 NA NA NA NA NA MAN1A1 95246 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 121399720 121399938 121399829 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 354900 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 121759226 121759877 121759689 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 4388 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 125952344 125952361 125952353 Y NA NA NA NA NA NA HEY2 114449 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 128577381 128577403 128577392 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 262467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr6 129455076 129455285 129455181 Y LAMA2 NA NA NA NA NA LAMA2 252734 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 130992314 130992487 130992401 Y NA NA TMEM200A IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L2 389975 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 135346100 135346282 135346249 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 75912 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 136788990 136789214 136789102 Y NA NA NA NA NA NA MAP7 80743 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 137546255 137546371 137546263 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 7669 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 140075983 140076182 140076083 Y NA NA TXLNB,CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-899B16.1 97805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 140400470 140400745 140400517 Y NA NA NA NA NA NA RP5-899B16.1 226483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 143117753 143118019 143117854 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 146319 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 143130260 143130659 143130530 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 133679 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 143150171 143150307 143150239 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 114031 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 143171849 143172301 143172148 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 92037 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 143234166 143234456 143234293 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29882 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 143888226 143888435 143888369 Y NA PHACTR2 NA NA NA NA PHACTR2 32244 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 144053697 144053884 144053799 Y STX11,PLAGL1 NA NA NA NA NA LTV1 108597 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 144279957 144280354 144280096 Y NA NA NA NA NA NA PLAGL1 103381 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 144384858 144385125 144384924 Y NA PLAGL1,SF3B5 NA NA NA NA PLAGL1 1123 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 144675203 144675442 144675288 Y UTRN NA NA NA NA NA UTRN 70366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 145131744 145132215 145131879 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 526907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 148595298 148595608 148595453 Y NA SASH1 SASH1 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 3858 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 148834877 148835159 148834957 Y UST NA NA NA NA NA UST 231305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 149657882 149658028 149657899 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 120105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 149829691 149830032 149829852 Y LATS1,KATNA1,TAB2,SUMO4,ZC3H12D,PPIL4 PPIL4 NA NA NA NA PPIL4 35142 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 150176203 150176399 150176290 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 7800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 150200694 150201094 150200866 Y NA LRP11,RAET1G NA NA NA NA LRP11 16495 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 150944036 150944676 150944139 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 25037 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 151005861 151006093 151005994 Y PLEKHG1 NA NA NA NA NA PLEKHG1 86862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA ESR1 109319 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 154914262 154914493 154914392 Y CNKSR3 RPS4XP8 NA NA NA NA RPS4XP8 18819 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 155510213 155510600 155510317 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 65258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 155521276 155521494 155521385 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 54364 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 156139110 156139232 156139181 Y NA NA NA NA NA NA TFB1M 505483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 157110744 157110907 157110826 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 13681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 157274060 157274135 157274104 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 176997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 158314373 158314686 158314419 Y SNX9 NA NA NA NA NA SNX9 72077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 158670119 158670409 158670245 Y NA NA TULP4,TMEM181 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2H5 82735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 159124281 159124647 159124464 Y TULP4,SYTL3 NA NA NA NA NA DYNLT1 60510 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 159211450 159211647 159211549 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 26797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 159229924 159230242 159230166 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 8202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 35481 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr6 160083070 160083297 160083182 Y NA NA NA NA NA NA WTAP 61320 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 160136031 160136425 160136369 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8192 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 160179285 160179503 160179396 Y NA WTAP,SOD2,TCP1,MRPL18 NA NA NA NA ACAT2 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 160837218 160837569 160837394 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A1 296397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 161536644 161536718 161536688 Y AGPAT4 NA NA NA NA NA MAP3K4 125885 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 162477618 162478021 162477976 Y NA NA NA NA NA NA PACRG 668143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 163684251 163684452 163684429 Y NA NA NA NA NA NA CAHM 148540 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 164526889 164526985 164526921 Y NA NA NA NA NA NA QKI 693857 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr6 166078176 166078539 166078376 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 319552 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 166754936 166755437 166755076 Y SFT2D1 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 857 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 167372859 167373027 167372950 Y GPR31,RNASET2 RP11-514O12.4,RNASET2,FGFR1OP NA NA NA NA RNASET2 4180 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 168198261 168198623 168198456 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 26979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 168216462 168216639 168216532 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 8963 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 170054470 170055295 170054892 Y TCTE3 WDR27,C6orf120 NA NA NA NA WDR27 44864 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 170364764 170365251 170365177 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 TCTE3 215109 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 170403251 170403438 170403365 Y TCTE3,FAM120B NA NA NA NA NA DLL1 194123 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129626 129879 129753 Y NA NA NA NA NA NA FAM20C 61090 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 657520 657797 657766 Y CYP2W1 NA NA NA NA NA PDGFA 99587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 946891 947297 947190 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 32702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 1139272 1139516 1139401 Y SUN1,TMEM184A C7orf50 NA NA NA NA C7orf50 36380 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 1282050 1282079 1282065 Y UNCX NA NA NA NA NA ZFAND2A 83655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 1495047 1495214 1495102 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA MICALL2 1924 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 1598591 1598955 1598779 Y NA MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA TMEM184A 134 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 1983409 1983820 1983695 Y SNX8 NA NA NA NA NA MAD1L1 287058 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 2048581 2048903 2048796 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 221975 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 2551232 2551336 2551252 Y LFNG,LFNG,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 1069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 2836098 2836460 2836342 Y SNX8,LFNG AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 36795 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 2842322 2842519 2842421 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 30736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 4773909 4774305 4774006 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 92521 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 5710055 5710429 5710241 Y WIPI2,WIPI2,TNRC18,FBXL18,USP42,RNF216,EIF2AK1 NA NA NA NA NA FSCN1 79616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 6296618 6296924 6296769 Y CCZ1 CYTH3 NA NA NA NA CYTH3 13351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 6319055 6319208 6319146 Y NA CYTH3 USP42 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH3 8780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 7481152 7481527 7481340 Y NA NA NA NA NA NA MIOS 122976 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 7604061 7604281 7604173 Y MIOS MIOS NA NA NA NA MIOS 222 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.22864210926706 chr7 7984706 7984926 7984839 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 8295276 8295343 8295310 Y NA AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA AC007009.1 4520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 11827353 11827497 11827425 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 42327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 11867283 11867421 11867420 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 2403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 14702275 14702543 14702458 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 673225 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 16060900 16061318 16061010 Y NA NA NA NA NA NA AC005550.4 334897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 16095120 16095542 16095311 Y NA NA NA NA NA NA ISPD 363405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 16302411 16302620 16302516 Y NA NA NA NA NA NA ISPD 156327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 16751358 16751548 16751453 Y NA TSPAN13 NA NA NA NA TSPAN13 39612 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 20228342 20228547 20228441 Y TWISTNB,ITGB8 MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 26480 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 20242848 20242947 20242898 Y NA MACC1,AC005083.1 NA NA NA NA MACC1 12080 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 20386006 20386499 20386153 Y ITGB8 ITGB8 NA NA NA NA ITGB8 17681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 47340 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 24828501 24828972 24828786 Y C7orf31,DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 21257 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 26523285 26523306 26523295 Y NA NA NA NA NA NA SNX10 193744 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 29534563 29534631 29534599 Y WIPF3 NA NA NA NA NA AC007255.8 66655 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 29645878 29645994 29645936 Y NA AC007255.8,PRR15 PRR15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRR15 44451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 30803690 30803872 30803774 Y NA INMT-FAM188B,FAM188B NA NA NA NA FAM188B 5161 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 34529792 34529930 34529861 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 694004 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 36698240 36698520 36698401 Y AOAH NA NA NA NA NA AOAH 63634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 36776109 36776821 36776493 Y ELMO1,AOAH AOAH ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 AOAH 13955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 36843340 36843728 36843600 Y ELMO1 NA NA NA NA NA AOAH 81186 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 37255343 37255621 37255439 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 231231 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 39695521 39695649 39695585 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 34439 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 41099054 41099343 41099161 Y NA NA LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 641363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 42174635 42174902 42174765 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 433929 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr7 43683947 43684262 43684105 Y POLM,DBNL,STK17A NA NA NA NA NA STK17A 63590 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 43714128 43714419 43714274 Y NA NA NA NA NA NA BLVRA 81860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 44426024 44426371 44426281 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 53848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 64510 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 44658456 44658730 44658526 Y PURB,TMED4,OGDH DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA OGDH 14285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 47092629 47092731 47092679 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 527425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 47505797 47506192 47505996 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 113964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 53130490 53130791 53130640 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 300960 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 55142882 55143327 55143024 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 58168 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 55506510 55507071 55506539 Y NA NA NA NA NA NA LANCL2 75369 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,PHKG1,CHCHD2,NUPR1L NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA NA NA NA NA NA NUPR1L 1289749 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 64072607 64072919 64072776 Y NA NA NA NA NA NA ZNF680 51123 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 65762762 65763060 65762890 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 94576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 66040596 66040908 66040816 Y NA NA NA NA NA NA KCTD7 50960 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 71870457 71870875 71870589 Y TYW1B NA NA NA NA NA TYW1B 425902 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 73156040 73156347 73156148 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 4843 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 73157180 73157738 73157420 Y FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 5983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 73869724 73869891 73869863 Y GTF2IRD1 GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 3604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 75267820 75268040 75267850 Y POR NA NA NA NA NA HIP1 98240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 75563701 75564093 75563872 Y POR POR NA NA NA NA POR 37183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 75922960 75923105 75923022 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 6756 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 77344619 77344946 77344783 Y RSBN1L RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L 20859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 157068 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 80360559 80360752 80360740 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3C 188923 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 81655164 81655347 81655329 Y NA NA NA NA NA NA HGF 257410 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 84248657 84248668 84248663 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3A 128617 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 87571513 87571795 87571654 Y NA ADAM22 NA NA NA NA ADAM22 10055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 90250368 90250899 90250569 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 25701 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 90637974 90638276 90638003 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 253507 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 90711391 90711663 90711528 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 180120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 92277080 92277232 92277129 Y ANKIB1,GATAD1,CDK6 NA NA NA NA NA FAM133B 59372 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 92382003 92382200 92382102 Y CDK6 NA NA NA NA NA CDK6 81708 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 93930998 93931300 93931121 Y NA NA COL1A2,GNG11 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A2 90573 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 94280099 94280356 94280228 Y NA SGCE,PEG10 NA NA NA NA SGCE 3165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 94557636 94557931 94557784 Y PPP1R9A PPP1R9A NA NA NA NA PPP1R9A 23122 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 95320009 95320109 95320059 Y PON1 NA ASB4 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I1 79757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 95807779 95807791 95807785 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 141668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 96482190 96482573 96482196 Y NA NA NA NA NA NA SHFM1 144987 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 98048213 98048460 98048408 Y BRI3 RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 19833 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99785086 99785350 99785241 Y ZKSCAN1,MCM7,GATS C7orf43,GAL3ST4,GPC2,STAG3 NA NA NA NA STAG3 11900 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1,PILRA NA NA NA NA PILRA 4899 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1,PILRA PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PILRA 1118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1,PILRA PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PILRA 194 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,RP11-758P17.2,PPP1R35,TSC22D4 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 101590034 101590314 101590170 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 133075 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.29302500950926 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 RP11-325F22.2 NA NA NA NA RP11-325F22.2 18121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104603312 104603563 104603438 Y MLL5 RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 23802 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.2 28600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA RP11-325F22.2,LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 104771634 104771765 104771700 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 120143 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104854124 104854334 104854271 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 183421 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104857177 104857523 104857432 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 180232 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 105329677 105330033 105329813 Y NA NA NA NA NA NA RINT1 159145 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 105447208 105447599 105447347 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 67451 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 105449570 105449934 105449707 Y ATXN7L1,ATXN7L1 NA NA NA NA NA ATXN7L1 65116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 105714190 105714395 105714300 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 36627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 106061873 106062291 106062158 Y NAMPT,PIK3CG,FLJ36031 NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 137101 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 106360961 106361340 106361088 Y NA NA CCDC71L,NAMPT IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 61519 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA GPR22 81598 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA GPR22 NA NA NA NA GPR22 8159 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 110723657 110723799 110723727 Y LRRN3 NA NA NA NA NA IMMP2L 476774 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 110849154 110849473 110849333 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 351100 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 343487 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 110956734 110956926 110956906 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 243647 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 112404343 112404501 112404446 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 24146 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 113233852 113234207 113234027 Y NA NA NA NA NA NA LINC00998 477184 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 113772890 113773070 113772980 Y NA FOXP2 NA NA NA NA FOXP2 48508 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr7 114301114 114301124 114301119 Y FOXP2 NA NA NA NA NA MDFIC 259085 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 114408811 114408841 114408826 Y NA NA NA NA NA NA MDFIC 151368 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 114459820 114459999 114459910 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 MDFIC 100210 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 115887290 115887609 115887434 Y NA TES,CAV2 NA NA NA NA CAV2 37825 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 116152142 116152412 116152205 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1 CAV1 CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV1 10427 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 120703433 120703512 120703470 Y NA NA NA NA NA NA ING3 114630 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 120724784 120725242 120725000 Y C7orf58 NA NA NA NA NA ING3 135981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 120841632 120841687 120841660 Y NA NA NA NA NA NA FAM3C 192731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 128473236 128473666 128473355 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4805 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129010616 129010786 129010717 Y NA RP11-305M3.2 FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 37425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129418602 129418801 129418733 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169047 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 129609674 129609888 129609791 Y NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 18885 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA MEST NA NA NA NA MEST 27780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 206421 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 147396 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 130735932 130736596 130736429 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 56259 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA4 109668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 132656149 132656423 132656408 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 108425 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 134862087 134862457 134862329 Y NA TMEM140,C7orf49,WDR91 NA NA NA NA C7orf49 8540 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA FAM180A C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 FAM180A 27530 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 136924573 136924814 136924694 Y PTN NA NA NA NA NA PTN 101797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 137418965 137419308 137419135 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 265505 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 137544616 137544738 137544677 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 140075 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 138403353 138403545 138403448 Y ZC3HAV1 AC020983.5 NA NA NA NA AC020983.5 31628 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 138779904 138780459 138780182 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 12006 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 139358057 139358402 139358214 Y NA NA NA NA NA NA TBXAS1 116448 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 139431881 139432226 139432135 Y TBXAS1,JHDM1D,HIPK2 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA TBXAS1 42624 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 139930411 139930852 139930521 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 168890 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 140024684 140024714 140024699 Y NA NA NA NA NA NA RAB19 77129 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 141660382 141660901 141660703 Y CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 224261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,TMEM139,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 147206169 147206552 147206257 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 1186454 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 149471511 149471709 149471700 Y ATP6V0E2,SSPO ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 2943 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 150520183 150520563 150520402 Y REPIN1,ABP1 TMEM176A,TMEM176B NA NA NA NA TMEM176B 23735 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 150948540 150948854 150948603 Y NA ABCF2,CHPF2,SMARCD3 NA NA NA NA CHPF2 20965 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 151386683 151387049 151386915 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 171477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 151823102 151823484 151823293 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 102343 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr7 152235560 152235891 152235729 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 135359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 154250985 154251004 154250995 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 541790 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 154999343 155001070 155000829 Y NA NA INSIG1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 INSIG1 86416 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA NA NA NA NA NA INSIG1 81060 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 156792805 156792864 156792835 Y NA MNX1 NA NA NA NA MNX1 8481 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 157034052 157034373 157034213 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 50990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 157071910 157072285 157071928 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53790 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 157082177 157082296 157082243 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43779 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr7 157082402 157082699 157082633 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 43376 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 157085416 157085724 157085621 Y DNAJB6,DNAJB6 DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 40351 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 158110398 158110735 158110581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRN2 267745 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr7 158357376 158357683 158357548 Y NA PTPRN2 NA NA NA NA PTPRN2 20797 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 158387429 158387829 158387629 Y WDR60 PTPRN2 PTPRN2 K562 ChIA-PET 22265404 PTPRN2 8949 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr7 158527660 158527846 158527783 Y NA NCAPG2 NA NA NA NA NCAPG2 32140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 2079243 2079548 2079396 Y NA NA NA NA NA NA MYOM2 88088 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 60983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 6536860 6537447 6537204 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 LOC100287015,MCPH1,ANGPT2 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2541M15.1 26283 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 6722894 6722949 6722922 Y NA XKR5,DEFB1 NA NA NA NA DEFB1 10595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 8935191 8935379 8935249 Y NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 71705 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 11286873 11287154 11286982 Y FAM167A NA NA NA NA NA AF131216.5 83862 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 11349402 11349607 11349481 Y DEFB136 NA NA NA NA NA AF131216.5 146391 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 28107 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 13562833 13563206 13563027 Y NA NA NA NA NA NA C8orf48 140481 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 17464056 17464363 17464257 Y MTUS1,MTUS1,MTUS1 PDGFRL NA NA NA NA PDGFRL 32114 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 17553591 17554013 17553880 Y NA NA NA NA NA NA MTUS1 102413 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 17708923 17709156 17709065 Y MTMR7,MTUS1 NA NA NA NA NA RP11-156K13.1 52069 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 19797796 19798054 19797934 Y LPL LPL NA NA NA NA LPL 40568 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2,PEBP4 NA NA NA NA PEBP4 1118 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 22858849 22858903 22858877 Y NA RHOBTB2,PEBP4 NA NA NA NA PEBP4 3336 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 23396383 23397127 23396699 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 12065 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 25059177 25059384 25059268 Y DOCK5 DOCK5 NA NA NA NA DOCK5 18939 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 25306430 25306773 25306665 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA KCTD9 7219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 27138634 27138989 27138722 Y PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA TRIM35 27847 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 29028606 29028803 29028712 Y NA NA NA NA NA NA KIF13B 89838 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 29097584 29097960 29097935 Y HMBOX1,HMBOX1,KIF13B KIF13B NA NA NA NA KIF13B 20681 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 29144637 29144837 29144777 Y NA KIF13B KIF13B IMR90 Hi-C 24141950 KIF13B 25996 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 29914930 29915195 29915084 Y NA TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA TMEM66 23528 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 30015593 30015700 30015665 Y NA RPS15AP24,DCTN6 NA NA NA NA DCTN6 3780 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 30280646 30281238 30280961 Y MBOAT4 RBPMS NA NA NA NA RBPMS 40702 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 31068137 31068428 31068254 Y NA NA NA NA NA NA WRN 178820 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 31115048 31115061 31115052 Y NA NA NRG1 IMR90 Hi-C 24141950 WRN 225731 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr8 37448492 37448795 37448657 Y RAB11FIP1,ZNF703 NA ZNF703 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF703 102474 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 37449026 37449149 37449088 Y RAB11FIP1,ZNF703 NA ZNF703 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF703 102120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 37740422 37740703 37740667 Y WHSC1L1,RAB11FIP1,BAG4 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 14282 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 37755287 37755548 37755453 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 37760968 37761285 37761070 Y RAB11FIP1 RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 5983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 37761676 37761790 37761689 Y NA RAB11FIP1 RAB11FIP1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RAB11FIP1 6691 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 38077409 38077725 38077419 Y NA BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B DDHD2 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD2 3011 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 38219963 38220671 38220346 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 DDHD2,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 WHSC1L1 17119 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 42370484 42370865 42370805 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 24204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 42749479 42749732 42749583 Y NA MIR4469,HOOK3,RNF170 NA NA NA NA MIR4469 61 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 67961 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 48746170 48746340 48746217 Y MCM4 NA NA NA NA NA CEBPD 96522 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 48853752 48854057 48853918 Y NA PRKDC,MCM4 NA NA NA NA PRKDC 16686 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 54396239 54396755 54396564 Y NA RP11-400K9.4 NA NA NA NA RP11-400K9.4 37736 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr8 54636276 54636450 54636366 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 117668 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 57389900 57390701 57390447 Y NA NA NA NA NA NA SDR16C5 158565 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 59470194 59470547 59470220 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 6711 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 59491466 59491801 59491581 Y UBXN2B,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 27983 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 59983682 59983838 59983818 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 45761 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 60158285 60158455 60158370 Y TOX NA NA NA NA NA TOX 128518 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 60746258 60746448 60746353 Y NA NA NA NA NA NA CA8 445523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 61821464 61821801 61821596 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 232127 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 63051600 63051694 63051612 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 426445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 65589993 65590291 65590142 Y NA NA NA NA NA NA ARMC1 954151 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 67425057 67425564 67425100 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 84637 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 67626224 67626609 67626278 Y SGK3,VCPIP1,SGK3 VCPIP1,C8orf44,SGK3 NA NA NA NA SGK3 3571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 67668655 67668834 67668702 Y ADHFE1,SGK3,SGK3 SGK3 NA NA NA NA SGK3 46002 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 68499569 68499804 68499684 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 245657 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 69672075 69672426 69672227 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 704433 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 71031909 71031920 71031915 Y NA RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA RP11-152C15.1 17495 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96 NA NA NA NA LY96 25026 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 75135577 75135926 75135753 Y NA NA NA NA NA NA GDAP1 95439 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 186542 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 80996547 80996769 80996670 Y TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 56023 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 81035979 81036376 81036336 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 95455 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 81041762 81041917 81041834 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 99550 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 81615108 81615487 81615408 Y ZNF704 NA NA NA NA NA ZBTB10 219254 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 81815309 81815511 81815410 Y NA NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 206792 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 82673208 82673424 82673316 Y NA CHMP4C,ZFAND1 NA NA NA NA ZFAND1 30070 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 94850124 94850307 94850200 Y PDP1,PDP1,PDP1,PDP1,GEM PDP1 NA NA NA NA PDP1 17728 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 95031220 95031355 95031288 Y NA NA CDH17,RAD54B,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 163185 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 95219115 95219484 95219300 Y NA KB-1247B1.1 NA NA NA NA KB-1247B1.1 5835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 96146998 96147210 96147103 Y TP53INP1,PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 2966 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr8 96180882 96181195 96181039 Y PLEKHF2 PLEKHF2 NA NA NA NA PLEKHF2 36850 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 97177762 97178066 97177912 Y GDF6 NA NA NA NA NA UQCRB 67796 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 97410655 97411012 97410831 Y NA NA CPQ,TSPYL5,PTDSS1 IMR90 Hi-C 24141950 SDC2 92567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 98841899 98841938 98841919 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 33344 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 99021655 99021985 99021673 Y NA RPL30 NA NA NA NA RPL30 34712 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 99526737 99526942 99526761 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 222116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 99643221 99643590 99643555 Y NA NA NA NA NA NA STK3 309465 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 99658802 99659210 99659171 Y NA NA NA NA NA NA STK3 293845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 100461450 100461455 100461453 Y NA NA NA NA NA NA VPS13B 437956 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 100594115 100594434 100594137 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 309856 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 101222720 101222891 101222806 Y NA NA NA NA NA NA SPAG1 54586 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 101385316 101385524 101385421 Y NA RNF19A MIR4471 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19A 38870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 101444913 101445066 101444990 Y RGS22 NA RNF19A,SPAG1,MIR4471 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF19A 98467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ RPS26P6,YWHAZ NA NA NA NA RPS26P6 21757 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 102075998 102076526 102076187 Y GRHL2 NA NA NA NA NA YWHAZ 112382 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 102185716 102186115 102186035 Y NA ZNF706 YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 30306 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 102344838 102345360 102345078 Y NA NACAP1 GRHL2,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NACAP1 26662 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 4.45728421853411 chr8 102513804 102514123 102513992 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 11144 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 14330 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 102543448 102543645 102543547 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 40788 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.39290131829191 chr8 102842210 102842224 102842217 Y NA NA NA NA NA NA NCALD 292911 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 13972 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 104553511 104553813 104553575 Y NA RP11-1C8.4,RP11-5A11.1 NA NA NA NA RP11-5A11.1 15804 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 114266349 114266595 114266472 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 120303 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 119071597 119071694 119071650 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 50398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 120288665 120289048 120288857 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 113392 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 121628287 121628559 121628462 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 172645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 121702901 121703232 121703165 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 120281 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 122157265 122157468 122157378 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 333752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 123845065 123845251 123845073 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 53432 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 6.12876580048441 chr8 125304968 125305098 125305033 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 77835 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr8 125468258 125468440 125468349 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 NA NA NA NA TRMT12 7210 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 125638890 125639286 125639200 Y NSMCE2 NA NA NA NA NA TATDN1 89191 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 126193275 126193543 126193371 Y NA NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 91193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 126245115 126245425 126245196 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 143033 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 126984156 126984525 126984411 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 543593 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 479436 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA FAM84B 501690 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 530819 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 128239593 128240207 128240123 Y NA NA LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 MYC 505473 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 128910613 128910985 128910818 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 105834 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 129251528 129251800 129251626 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 230671 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131080516 131080850 131080671 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 53141 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131204007 131204378 131204106 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 176632 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131269679 131269819 131269766 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 184087 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131271729 131272058 131271952 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 181848 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 131354482 131354860 131354810 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 99046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 134387761 134388081 134387916 Y NA NA TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NDRG1 75496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 134453521 134453599 134453592 Y SLA NA NA NA NA NA ST3GAL1 128584 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 134552406 134552812 134552641 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 29371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 141190446 141190798 141190723 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 275880 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 142106680 142106937 142106833 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 18440 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 142275441 142276204 142275736 Y NA SLC45A4 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 40200 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 142403963 142404243 142404183 Y PTP4A3 GPR20,PTP4A3 FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 3870 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 143353648 143353818 143353814 Y TSNARE1,BAI1 NA NA NA NA NA TSNARE1 128783 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 143758809 143759081 143758941 Y NA PSCA,JRK,LY6K NA NA NA NA JRK 2305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 143837804 143838151 143837954 Y NA LYPD2,RP11-706C16.7,LYNX1 NA NA NA NA RP11-706C16.7 4383 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 144072877 144073072 144072963 Y LYPD2,C8orf31 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 24327 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA RP11-273G15.2 9678 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 GPIHBP1,ZFP41,GLI4 NA NA NA NA GPIHBP1 7669 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr8 144629463 144629732 144629564 Y SPATC1,GRINA ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,TIGD5,EEF1D NA NA NA NA GSDMD 3645 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA MAPK15 2759 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr8 144843026 144843252 144843141 Y NA MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1 SCRIB,PUF60 IMR90 Hi-C 24141950 FAM83H-AS1 28716 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr8 145847503 145847804 145847651 Y SCRT1,KIFC2,ZNF34,ARHGAP39 NA ARHGAP39,ZNF251 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 61390 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 145887419 145887725 145887588 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,RECQL4,LRRC24,LRRC14,MFSD3,PPP1R16A,GPT,RPL8,ZNF34,ZNF517,ZNF250,TMED10P1,ZNF252,COMMD5 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP39 21469 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 145995593 145996127 145996081 Y COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34 ZNF251,ZNF34,RPL8 NA NA NA NA ZNF34 14603 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1 NA NA NA NA RCL1 44350 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 13237438 13237544 13237492 Y NA MPDZ NA NA NA NA MPDZ 40045 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 14263032 14263410 14263221 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 51674 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 14271164 14271559 14271500 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 43525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA BNC2 352389 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 16710736 16710820 16710819 Y NA NA NA NA NA NA BNC2 158021 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 22012524 22012846 22012594 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 2370 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 22310596 22310829 22310637 Y NA NA MTAP,DMRTA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 134011 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 22815363 22815696 22815663 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA1 370523 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 26946072 26946289 26946254 Y PLAA,IFT74,IFT74 IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 611 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 32395934 32396350 32396089 Y NA ACO1 NA NA NA NA ACO1 13316 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 32429787 32430147 32430005 Y NA ACO1 NA NA NA NA ACO1 47169 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 33229414 33229715 33229547 Y NA BAG1,CHMP5 NFX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 BAG1 33046 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 33231410 33231538 33231469 Y NA BAG1,CHMP5 NA NA NA NA BAG1 31223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 34375136 34375287 34375212 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161,C9orf24 NA NA NA NA KIAA1161 285 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 35232989 35233276 35233133 Y DNAJB5 NA NA NA NA NA UNC13B 72990 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 FAM166B,TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 36294075 36294254 36294162 Y OR13J1,OR2S2 GNE RNF38,CLTA,GNE IMR90 Hi-C 24141950 GNE 19022 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 66843628 66843847 66843730 Y NA NA LOC642236 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-764K9.4 1609528 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr9 71567236 71567601 71567286 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 80574 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 71789916 71790363 71790201 Y TJP2 NA NA NA NA NA TJP2 55707 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 72360056 72360394 72360281 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 12481 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 72805213 72805492 72805447 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 66445 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 2.78580263658382 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 74292775 74292963 74292884 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90258 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 75200734 75200878 75200827 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 222571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 174251 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A1 143739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 75797609 75797655 75797632 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 32936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 80559906 80560072 80560021 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 84302 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 86238855 86239256 86239056 Y UBQLN1,GKAP1 NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 81253 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 86990965 86991174 86991070 Y NA SLC28A3 AGTPBP1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC28A3 37293 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 88298792 88299000 88298900 Y AGTPBP1 NA NA NA NA NA AGTPBP1 55944 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 88329158 88329382 88329166 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 25562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 88974167 88974346 88974269 Y ZCCHC6 ZCCHC6 ZCCHC6,DAPK1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZCCHC6 6798 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 89020840 89021025 89020931 Y ZCCHC6 NA GAS1,DAPK1,ZCCHC6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZCCHC6 53471 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 90115567 90115708 90115625 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 5424 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 90131164 90131697 90131347 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 6520 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 90133886 90134005 90133888 Y NA DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 4212 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr9 90216174 90216503 90216403 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 77957 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 91150927 91151269 91151097 Y NA NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 2911 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 92000635 92001001 92000890 Y C9orf47,SEMA4D,SECISBP2 NA NA NA NA NA SECISBP2 69214 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 92762358 92762553 92762476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-389K14.3 431234 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 93880356 93880696 93880620 Y NA NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 241499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1,LINC00475 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 95388417 95388814 95388616 Y FGD3,CENPP IPPK NA NA NA NA IPPK 41733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 96072126 96072271 96072199 Y NA NA NA NA NA NA FAM120A 139733 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 97893656 97893882 97893768 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 184109 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 98768233 98768612 98768423 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 131974 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 FOXE1 FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 FOXE1 47272 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 101572840 101572995 101572898 Y GALNT12 ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 4859 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 101871896 101872113 101872024 Y TGFBR1 TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 7576 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 102015806 102016715 102016602 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 33460 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 108623002 108623305 108623152 Y FSD1L,FSD1L,TAL2 NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 168177 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 KLF4 560638 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 112238648 112239006 112238827 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 19584 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 112827825 112828236 112827913 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 42187 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 112864001 112864218 112864083 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151F5.2 78363 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 113806466 113806843 113806655 Y NA LPAR1 OR2K2,KIAA0368 IMR90 Hi-C 24141950 LPAR1 7485 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 114790542 114790702 114790622 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 133496 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 114857747 114857987 114857843 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 77701 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 SNX30 NA NA NA NA SNX30 40869 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 115893924 115894286 115894056 Y SNX30,RGS3,SLC31A2 SLC31A2 NA NA NA NA SLC31A2 16936 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 116250853 116251013 116250930 Y NA RGS3 NA NA NA NA RGS3 45842 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 118473939 118474297 118474118 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 595403 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 124035384 124035709 124035520 Y NA NA NA NA NA NA RAB14 52092 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr9 124383753 124383935 124383823 Y DAB2IP NA NA NA NA NA DAB2IP 56417 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 126029655 126030141 126030108 Y NA STRBP NA NA NA NA STRBP 800 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 126119304 126119701 126119598 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 90449 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 126124461 126124723 126124613 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 95606 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 127424345 127424738 127424542 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 5599 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 127458498 127458770 127458741 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 39752 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 127466904 127467345 127467172 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 48158 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA WDR38,RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 128396600 128396979 128396804 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 70534 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 128597374 128597723 128597549 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 89750 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 129483874 129484165 129483990 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 81120 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 129484571 129485188 129484881 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB43 80097 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 130743802 130743907 130743855 Y FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 3010 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 132040752 132040968 132040856 Y NA RP11-344B5.2 C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7,HELA,K562 Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-344B5.2 1769 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 132505331 132505539 132505390 Y PTGES PTGES NA NA NA NA PTGES 7787 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 132512351 132512751 132512561 Y PTGES PTGES NA NA NA NA PTGES 575 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chr9 132514052 132514155 132514104 Y NA PTGES,TOR1B NA NA NA NA PTGES 726 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 132785309 132785843 132785545 Y USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 17630 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr9 134258707 134258891 134258799 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 8589 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 134278219 134278688 134278276 Y NA PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A,PPAPDC3 IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 10739 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 134770006 134770262 134770128 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 156545 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 135226317 135226646 135226576 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 1726 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1,C9orf171 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 136012982 136013095 136013034 Y RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 24206 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 136022907 136023306 136022967 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 13995 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 5.01444474585088 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 137247900 137248164 137247916 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 40956 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.95006184560867 chr9 137259692 137260046 137259796 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 52748 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 137367331 137367474 137367390 Y COL5A1 NA COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 RXRA 160387 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 139237317 139237472 139237398 Y GPSM1 GPSM1,DNLZ NA NA NA NA GPSM1 17385 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 139613892 139613944 139613895 Y NA AGPAT2,FAM69B,SNHG7,LCN10,LCN6 NA NA NA NA SNHG7 6692 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 139892330 139892637 139892567 Y EGFL7,EGFL7,C9orf142,ABCA2 PTGDS,C9orf142,CLIC3,ABCA2,NPDC1 NA NA NA NA CLIC3 3075 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 3.0643829002422 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chr9 140143070 140143291 140143174 Y LCNL1,ABCA2,SLC34A3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 9405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA C9orf169,TUBB4B,NRARP NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140199547 140199668 140199608 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 4844 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140205908 140206072 140205991 Y NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 11205 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140274735 140275080 140274933 Y CACNA1B,PTGDS,ABCA2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 40634 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 1367285 1367756 1367429 Y P2RY8,IL3RA,ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL,CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA CRLF2,CSF2RA NA NA NA NA CSF2RA 17937 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 1480354 1481325 1480771 Y NA IL3RA,SLC25A6 NA NA NA NA IL3RA 26845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 1514556 1514901 1514870 Y ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL SLC25A6 NA NA NA NA SLC25A6 4939 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.67148158195029 chrX 1524384 1524716 1524554 Y CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL SLC25A6,ASMTL NA NA NA NA SLC25A6 14767 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 2301315 2301326 2301321 Y NA NA NA NA NA NA ZBED1 115682 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 2439339 2439693 2439640 Y NA ZBED1,DHRSX NA NA NA NA DHRSX 20493 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 2614779 2615043 2614931 Y ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99 CD99 NA NA NA NA CD99 7559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 2626302 2626463 2626390 Y ZBED1,ZBED1,DHRSX CD99,XG NA NA NA NA CD99 19082 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 2626782 2627186 2626915 Y ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99 CD99,XG NA NA NA NA CD99 19562 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chrX 3870962 3871082 3871022 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 241313 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 9929375 9929481 9929417 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 52121 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 10051581 10051674 10051600 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 69979 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 10166361 10166552 10166496 Y WWC3 NA NA NA NA NA WWC3 184759 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 11722971 11723163 11723070 Y NA ARHGAP6 ARHGAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP6 41150 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chrX 13687345 13687715 13687534 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA RAB9A 17529 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 15695028 15695432 15695331 Y ZRSR2,AP1S2,PIGA CA5BP1,CA5B NA NA NA NA CA5BP1 3973 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 18488966 18489254 18489110 Y NA CDKL5 NA NA NA NA CDKL5 47263 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 18637228 18637392 18637280 Y NA NA NA NA NA NA CDKL5 195525 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 18904688 18905149 18904995 Y PHKA2 NA NA NA NA NA PHKA2 95567 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 128434 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 22152966 22153318 22153142 Y NA NA NA NA NA NA SMS 196275 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 22346680 22346767 22346724 Y NA NA PHEX IMR90 Hi-C 24141950 SMS 389989 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 23368174 23368523 23368350 Y NA PTCHD1 NA NA NA NA PTCHD1 18041 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 23448720 23448865 23448793 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD1 98587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 29610847 29611180 29610948 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 1007331 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 37605291 37605973 37605549 Y CYBB CYBB NA NA NA NA CYBB 31291 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 40011614 40011816 40011787 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 22766 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 43844766 43845116 43844971 Y NA NA NA NA NA NA MAOB 105073 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 44834978 44835378 44835063 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 104221 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA CXorf36 183056 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 45488077 45488123 45488115 Y NA NA NA NA NA NA MIR222 116407 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 46120012 46120235 46120091 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 64845 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 46316161 46316444 46316394 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18012 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 47366580 47367047 47366746 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41 CDK16,USP11,UBA1,ARAF,SYN1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 26235 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 47467971 47468313 47468102 Y NA ARAF,TIMP1,SYN1,CFP,ELK1,UXT NA NA NA NA SYN1 8939 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 48643715 48644055 48643827 Y NA HDAC6,PCSK1N NA NA NA NA HDAC6 13729 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 53398923 53399250 53399087 Y NA SMC1A NA NA NA NA SMC1A 48427 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 58057411 58058106 58058008 Y NA KRT8P17 NA NA NA NA KRT8P17 48291 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 7398 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 87933813 87933823 87933818 Y NA NA NA NA NA NA RP3-452M16.1 583587 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.557160527316764 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA BHLHB9 89887 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chrX 106943627 106943904 106943732 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 NA NA NA NA NA PRPS1 73890 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 109315579 109315956 109315731 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 71720 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 115004721 115004876 115004807 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 78546 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 123128662 123128935 123128809 Y XIAP,XIAP,STAG2 STAG2 NA NA NA NA STAG2 36600 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 124193844 124193851 124193848 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 1101782 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 7.8002473824347 chrX 128238716 128238747 128238732 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 416730 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 128892181 128892423 128892313 Y ELF4,ELF4,SASH3 SASH3 SASH3 IMR90 Hi-C 24141950 SASH3 19532 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 129848088 129848429 129848259 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 186779 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA DDX26B 65638 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 410547 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 141932956 141933305 141933131 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 1663646 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 152970892 152971012 152970949 Y AVPR2,SRPK3 SLC6A8,PNCK,BCAP31,ABCD1 NA NA NA NA BCAP31 17140 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.835740790975146 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 0.278580263658382 chrX 153963988 153964279 153964176 Y F8 GAB3,DKC1 CTAG2 IMR90 Hi-C 24141950 GAB3 13579 CAGE JHUS-nk1 hg19 FANTOM5 1.11432105463353