chr1 839741 840250 839788 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 52439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 840753 841210 840812 Y NA NA NA NA NA NA NOC2L 51479 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 918449 918555 918505 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN NA NA NA NA HES4 14997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 941791 942135 942082 Y HES4 NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN ISG15,AGRN K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ISG15 4668 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 994198 994452 994303 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223 NA NA NA NA RP11-465B22.3 1084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159 NA NA NA NA RNF223 2701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 1265677 1265980 1265829 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1 NA NA NA NA GLTPD1 7541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA AURKAIP1 12543 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,RP4-758J18.7,VWA1 NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 1706859 1707124 1707007 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 2772 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 6336471 6336830 6336716 Y ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 GPR153 K562 ChIA-PET 22265404 GPR153 17436 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 6341896 6342142 6342067 Y GPR153,ACOT7 ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 22861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 6360191 6360625 6360507 Y PLEKHG5,PLEKHG5,HES2 GPR153 NA NA NA NA GPR153 41156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 6362597 6362955 6362820 Y ZBTB48,GPR153,ACOT7 GPR153 NA NA NA NA GPR153 43562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 7177733 7177848 7177794 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 334349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 7461964 7462325 7462107 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 367004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 7531062 7531540 7531160 Y PARK7 NA NA NA NA NA VAMP3 297789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8107848 8108157 8108001 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 23050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 8154517 8154933 8154754 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 69719 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 8156648 8157003 8156918 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 71850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 72619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 8181009 8181247 8181098 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 83410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8198088 8198334 8198235 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 66323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA RNU1-7P ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 9750 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 RNU1-7P ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 2116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr1 8272041 8272390 8272277 Y NA RNU1-7P ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 7384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-7P 205049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA RNU1-7P 222999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1-IT1 2141 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 9223907 9224260 9224149 Y SPSB1 GPR157 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 GPR157 36678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 9335683 9335930 9335747 Y SLC25A33 H6PD,SPSB1 NA NA NA NA SPSB1 15009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 9885367 9885695 9885655 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 2783 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 10723795 10723954 10723885 Y NA NA NA NA NA NA CASZ1 130753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 11122928 11123178 11122962 Y NA SRM,EXOSC10 NA NA NA NA SRM 4847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 11798918 11799121 11798987 Y FBXO6,AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2,MTHFR,CLCN6 MAD2L2,AGTRAP,C1orf167 NA NA NA NA AGTRAP 4777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 11968510 11969143 11969021 Y MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1 NA NA NA NA RNU5E-1 2301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 15209205 15209454 15209330 Y NA NA NA NA NA NA TMEM51 267574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 15738661 15738986 15738829 Y SPEN,PLEKHM2,DDI2,EFHD2,CASP9,CASP9 EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 4270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 15743639 15744318 15744205 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 9248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 16479299 16479465 16479382 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16489021 16489207 16489116 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,C1orf64,HSPB7,FAM131C,CLCNKB,EPHA2,ARHGEF19,RSG1,SPATA21,C1orf144 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA2 8439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 16499761 16499895 16499826 Y SPEN,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 19179 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16511251 16511623 16511321 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 30669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16669074 16669169 16669123 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 7780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 17454855 17455288 17455072 Y PADI4 NA PADI2,PADI1,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI1 74333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 17518130 17518260 17518142 Y NA PADI1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI1 11361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 PADI1 NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI1 10483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA PADI1 NA NA NA NA PADI1 5066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr1 18186786 18187057 18186877 Y NA NA ARHGEF10L,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL8 106978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 19253034 19253391 19253292 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH4A1 25759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 19926811 19926972 19926927 Y TMCO4 MINOS1,RPS14P3,NBL1 NA NA NA NA MINOS1 5334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 21349725 21349786 21349755 Y EIF4G3 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48460 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 21475659 21476054 21476002 Y EIF4G3,EIF4G3 EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 25323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.23596112195723 chr1 21650806 21651685 21651350 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 18312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 22076024 22076450 22076245 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 31649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 23912037 23912393 23912293 Y PNRC2,RPL11 ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 27752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 23918101 23918449 23918188 Y SRSF10,CNR2,E2F2 ID3 E2F2,ID3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID3 33816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 24680333 24680598 24680466 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL3 59686 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 24722613 24722643 24722628 Y NA NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 17641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 24736156 24736250 24736199 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 4034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 25095502 25095845 25095665 Y NA CLIC4 NA NA NA NA CLIC4 25654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 25281668 25281921 25281754 Y NA NA NA NA NA NA CLIC4 211820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 26615016 26615421 26615346 Y SH3BGRL3,ARID1A,UBXN11,UBXN11 SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA SH3BGRL3 11349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 26678060 26678317 26678200 Y CNKSR1,AIM1L UBXN11 NA NA NA NA UBXN11 35206 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.09931721479732 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 27468191 27468425 27468281 Y NA SLC9A1 NA NA NA NA SLC9A1 23047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 27849341 27849620 27849479 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 34672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 27986111 27986384 27986268 Y EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR IFI6 NA NA NA NA IFI6 10345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 28216942 28217199 28217071 Y NA RPA2,SMPDL3B NA NA NA NA RPA2 22058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 28318645 28318992 28318812 Y FAM76A XKR8 NA NA NA NA XKR8 34672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 28495580 28496044 28495868 Y STX12,C1orf38,EYA3,SESN2,MED18,GMEB1,PTAFR,PTAFR,DNAJC8 NA NA NA NA NA DNAJC8 61492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 28776524 28777127 28776532 Y NA NA NA NA NA NA RCC1 53328 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 29104880 29105053 29104930 Y NA YTHDF2 NA NA NA NA YTHDF2 43747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 31218107 31218539 31218451 Y LAPTM5 NA NA NA NA NA SDC3 161069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 31231730 31232072 31231886 Y NA NA NA NA NA NA SDC3 147536 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 31483120 31483355 31483250 Y NA NA NA NA NA NA PUM1 53483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 31944306 31944695 31944578 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63894 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 NA SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 75791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 32701561 32701886 32701724 Y NA CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B NA NA NA NA MTMR9LP 3335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 KIAA1522 SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1522 22973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 33227148 33227387 33227320 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 21662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33232248 33232565 33232367 Y NA KIAA1522,S100PBP,YARS NA NA NA NA KIAA1522 26762 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33378487 33378646 33378567 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA TMEM54 13448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 33447667 33447707 33447675 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 19381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 33450112 33450483 33450353 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19B 21826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 33454783 33455472 33455325 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 26497 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 33457406 33457727 33457615 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33458800 33459074 33458865 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 30514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 36721428 36721771 36721600 Y NA THRAP3,SH3D21 NA NA NA NA THRAP3 33411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 39633654 39634014 39633702 Y BMP8A NA NA NA NA NA MACF1 88666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 39857791 39857995 39857869 Y NA KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 16156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 40264988 40265120 40265045 Y NA BMP8B HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BMP8B 12455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 40283075 40283206 40283146 Y PABPC4,RLF,MFSD2A BMP8B MYCL1 K562 ChIA-PET 22265404 BMP8B 30542 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 40442472 40442624 40442548 Y NA MFSD2A NA NA NA NA MFSD2A 23670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 40841336 40841595 40841379 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 ZNF643 IMR90 Hi-C 24141950 SMAP2 32814 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 40847285 40847634 40847387 Y NA SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 38763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 41501908 41501999 41501966 Y SCMH1 NA NA NA NA NA CITED4 175890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 41650800 41651168 41651109 Y KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 54658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 41989637 41990001 41989819 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 164043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 42248889 42249252 42248981 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 423295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 42328578 42328878 42328730 Y NA NA NA NA NA NA FOXJ3 470670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 43402778 43403133 43403049 Y ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 19397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 5856 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 43432863 43433109 43432938 Y CCDC30,SLC2A1 SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 10333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 44240162 44240471 44240217 Y ATP6V0B NA NA NA NA NA ST3GAL3 70667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 44354357 44354471 44354414 Y SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13 NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 55752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 44692988 44693156 44693052 Y ATP6V0B DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 15861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 45376274 45376331 45376304 Y NA CCNB1IP1P1 NA NA NA NA CCNB1IP1P1 45898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA ZSWIM5,HPDL ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 ZSWIM5 22934 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 48224075 48224507 48224159 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 426606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 50890174 50890356 50890265 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 533579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 51102056 51102361 51102067 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 321574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 52033462 52033748 52033585 Y NA OSBPL9 OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL9 7103 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 52238666 52238881 52238774 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 103596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 52341008 52341095 52341052 Y CC2D1B,OSBPL9 NRD1 NA NA NA NA NRD1 1382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 52628189 52628583 52628480 Y NA ZFYVE9 NA NA NA NA ZFYVE9 22143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 52999324 52999688 52999506 Y NA ZCCHC11 PRPF38A,ORC1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC11 17471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 59039624 59039692 59039640 Y NA DAB1,OMA1,TACSTD2 NA NA NA NA TACSTD2 1474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 59083441 59083551 59083446 Y NA TACSTD2 TACSTD2,OMA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TACSTD2 42275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 59221049 59221462 59221387 Y NA JUN,LINC01135 FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JUN 26323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 59280364 59280505 59280397 Y NA JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 31950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN,LINC01135 NA NA NA NA LINC01135 33050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA LINC01135 120226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA FGGY 384233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 61522505 61523042 61522705 Y NFIA,NFIA,NFIA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 193574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 64417224 64417447 64417336 Y ROR1 NA NA NA NA NA CFL1P3 109868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 64496116 64496488 64496302 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 188760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA JAK1 137153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 65510370 65510451 65510413 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 20969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 65924548 65924883 65924716 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 40278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 66760490 66760861 66760661 Y NA NA NA NA NA NA PDE4B 504293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 66815726 66816360 66815919 Y PDE4B NA NA NA NA NA PDE4B 559529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 66862994 66863164 66863108 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 525406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA WDR78 358223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.50924893627706 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 68657070 68657479 68657271 Y NA WLS,RPS7P4 NA NA NA NA WLS 39324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 68663588 68663867 68663728 Y NA WLS,RPS7P4 NA NA NA NA WLS 32936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 68849988 68850367 68850179 Y NA NA LOC100289178,WLS,RPE65 IMR90 Hi-C 24141950 DEPDC1 110537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 61288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 70807938 70808237 70808103 Y NA ANKRD13C,HHLA3 NA NA NA NA ANKRD13C 10180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 70877943 70877992 70877968 Y CTH CTH NA NA NA NA CTH 3042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 75798807 75799079 75799068 Y NA NA NA NA NA NA ACADM 388957 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 78019403 78019530 78019478 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 127574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr1 79506230 79506516 79506373 Y IFI44 NA NA NA NA NA IFI44 392749 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 84966686 84966774 84966730 Y NA RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 3474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85744584 85744829 85744751 Y BCL10 C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 3811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85763626 85763846 85763779 Y NA C1orf52,BCL10 NA NA NA NA BCL10 22853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85791287 85791404 85791348 Y NA NA NA NA NA NA BCL10 50514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 85794698 85795078 85794848 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 53925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 85795855 85796291 85796120 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 87253936 87254322 87254171 Y SH3GLB1 NA SEP15 IMR90 Hi-C 24141950 SH3GLB1 85677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 89149109 89149398 89149189 Y NA PKN2 NA NA NA NA PKN2 1204 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 89167079 89167239 89167155 Y GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1 PKN2 NA NA NA NA PKN2 19174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 89339924 89340210 89340169 Y PKN2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 15417 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr1 89739985 89740544 89740197 Y GTF2B,GBP3,GBP1,GBP2,LRRC8C,GBP4,GBP5 NA NA NA NA NA GBP2 125846 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 90101821 90102213 90101853 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 5190 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 90137741 90138074 90137909 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 41110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 90167146 90167167 90167157 Y NA NA NA NA NA NA LRRC8C 70515 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 90190139 90190909 90190374 Y GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326 NA NA NA NA NA LRRC8C 93508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 90221284 90221408 90221335 Y GBP5,LRRC8C,ZNF326 NA LRRC8C IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8D 63165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 92021775 92022091 92021979 Y NA RP11-91I11.1 TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91I11.1 41637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 92198149 92198440 92198227 Y TGFBR3 NA NA NA NA NA RP11-91I11.1 134421 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 92269494 92269966 92269778 Y TGFBR3,RPAP2,GLMN NA NA NA NA NA TGFBR3 99926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 93032261 93032386 93032324 Y NA NA NA NA NA NA EVI5 223575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 93812976 93813243 93813111 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA RP4-717I23.3 3394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94021310 94021626 94021469 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 109622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 112015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 149285 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 110974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94128177 94128297 94128262 Y NA NA NA NA NA NA RP11-488P3.1 110703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94158127 94158185 94158167 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 80815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 79662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.51541489379509 chr1 94161111 94161471 94161388 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 77529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 71480 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 94168203 94168325 94168229 Y NA NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 70675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94169341 94169462 94169391 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 69538 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94169670 94169961 94169880 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 69039 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94201362 94201612 94201551 Y NA RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 37388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94224546 94224929 94224684 Y DNTTIP2 RP11-488P3.1 MIR760,BCAR3,LOC100129046,FNBP1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-488P3.1 14071 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 RP11-488P3.1 BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488P3.1 5939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 49762 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 94992236 94992413 94992325 Y NA F3 NA NA NA NA F3 12943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 95080073 95080238 95080157 Y NA NA F3,LOC729970,SLC44A3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 74717 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95179307 95179605 95179478 Y F3 NA F3,ABCD3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 104232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 95258204 95258621 95258355 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,LOC729970 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 25216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95484238 95484316 95484279 Y NA NA NA NA NA NA ALG14 52185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 95593826 95594157 95593992 Y NA TMEM56 NA NA NA NA TMEM56 12932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 96827006 96827340 96827080 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P11 83146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 98315619 98315765 98315702 Y DPYD NA NA NA NA NA DPYD 68840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 404365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 98789496 98789901 98789701 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 DPYD 404891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 100494312 100494735 100494498 Y CDC14A,HIAT1 HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 6918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 101485385 101485713 101485528 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 101725356 101725679 101725470 Y SLC30A7,SLC30A7 RP4-575N6.4,S1PR1 NA NA NA NA S1PR1 24912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 104016419 104016646 104016533 Y NA RNPC3 NA NA NA NA RNPC3 49667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 105320877 105321094 105320986 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 1254564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 108479405 108480123 108479634 Y VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 261348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 108634261 108634637 108634400 Y NA NA VAV3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A24 106834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 108650339 108650754 108650436 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 90717 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 109079557 109079899 109079743 Y NA FAM102B NA NA NA NA FAM102B 20812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 109788948 109789150 109789063 Y GSTM3 SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 1491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 110160052 110160461 110160231 Y GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2 AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 3326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 110438276 110438910 110438607 Y NA CSF1 CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 11954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 110502633 110502891 110502762 Y NA AHCYL1 CYB561D1,GNAI3,MIR197,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM3,EPS8L3,CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 22417 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 110694968 110695154 110695000 Y KCNA2,SLC6A17 NA NA NA NA NA KCNC4 56811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 4371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 110947330 110947681 110947535 Y NA LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 23889 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 111735691 111736003 111735892 Y CD53,LRIF1,RAP1A,C1orf162 NA NA NA NA NA DRAM2 54853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA OVGP1,ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 112013331 112014031 112013881 Y C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162 OVGP1,ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA WDR77 23333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 112918897 112919196 112919049 Y NA CTTNBP2NL WNT2B,ST7L,DDX20 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 17607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 87306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 113525578 113525919 113525789 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 SLC16A1,AKR7A2P1,LRIG2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC16A1 27943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 115296637 115296935 115296808 Y NA NRAS,CSDE1,SIKE1 NA NA NA NA CSDE1 2362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 115873164 115873576 115873409 Y NGF NA NA NA NA NA VANGL1 308998 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 116087444 116087828 116087621 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 94746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 116923407 116923493 116923480 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 10117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 117047053 117047428 117047164 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NA NA NA NA NA CD58 64233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 117100772 117101124 117100940 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 10537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 117112460 117112738 117112567 Y TTF2,CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 117619913 117620299 117620136 Y CD101 RP11-27K13.3,TTF2,TRIM45 NA NA NA NA TTF2 18988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA RP4-712E4.1 NA NA NA NA RP4-712E4.1 35513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA NA NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 120692453 120692808 120692620 Y NBPF7,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 82213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr1 145701524 145701615 145701570 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 92488 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.55274158615768 chr1 147825273 147825748 147825617 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 20387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 149222771 149223127 149223106 Y NA RNVU1-17 NBPF10,SEC22B,NBPF15 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNVU1-17 30502 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2BC,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H2BC,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 149957680 149957694 149957685 Y NA OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 22931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 150231710 150231944 150231778 Y ECM1,CA14 ANP32E,RNU2-17P,APH1A,C1orf51,MRPS21 NA NA NA NA APH1A 8036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA CERS2 4090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151255796 151256115 151256047 Y NA PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB NA NA NA NA RP11-126K1.2 3391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151809390 151809745 151809546 Y RORC,C2CD4D RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2 NA NA NA NA AL450992.2 2608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151868154 151868386 151868273 Y NA THEM4 NA NA NA NA THEM4 11898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 151918898 151919222 151919024 Y S100A10 THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 38614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 151943125 151943453 151943289 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 21413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151949461 151949565 151949513 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 15301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 152022022 152022514 152022379 Y SNX27,S100A10,S100A11 S100A11 THEM4 MCF7 ChIA-PET 22265404 S100A11 3639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 152878475 152878651 152878603 Y NA NA NA NA NA NA SPRR2D 133756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 153510895 153511054 153510975 Y NA S100A6,S100A5,S100A4,S100A2 NA NA NA NA S100A5 1187 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 153549643 153549828 153549736 Y PGLYRP3,S100A7L2 S100A6,S100A5,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14 S100A14,S100A13,S100A16,CHTOP,S100A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 S100A2 11277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 153583449 153583810 153583692 Y PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13 S100A2,S100A14,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A2,S100A16,S100A14,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 154391539 154392211 154392184 Y GATAD2B,CRTC2,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 15870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 154395894 154396284 154395999 Y UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 20225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 154397743 154397997 154397805 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 22074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 154978035 154978657 154978307 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 4908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA KRTCAP2,MUC1,MTX1,GBAP1,GBA NA NA NA NA MUC1 3476 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 155620238 155620623 155620432 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA DAP3 35128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 155944562 155945214 155944815 Y C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 NA NA NA NA ARHGEF2 29647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 155951073 155951535 155951364 Y NA KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 23326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 156251648 156251762 156251690 Y RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44 BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85 NA NA NA NA TMEM79 922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr1 156468556 156468776 156468632 Y MEF2D NA NA NA NA NA MEF2D 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 156541089 156541488 156541192 Y NA IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4 MEF2D,C1orf61 IMR90 Hi-C 24141950 IQGAP3 693 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 157964633 157965029 157964831 Y OR10T2 KIRREL NA NA NA NA KIRREL 3570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA NA NA NA NA NA KIRREL 185636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 159819832 159820037 159819980 Y SLAMF9,SLAMF8,TAGLN2 VSIG8,CCDC19 NA NA NA NA VSIG8 10410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 VSIG8,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 VSIG8,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 159961374 159961617 159961522 Y SLAMF8,SLAMF9 SLAMF9,LINC01133,PIGM NA NA NA NA LINC01133 32366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 160182240 160182579 160182410 Y NA PEA15,RP11-574F21.2 NA NA NA NA PEA15 9113 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 161052363 161052546 161052461 Y F11R,PVRL4 TSTD1,USF1,NIT1,PFDN2,DEDD NA NA NA NA NIT1 33330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 161348767 161349231 161349047 Y NDUFS2 NA NA NA NA NA SDHC 66720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 161582212 161582506 161582417 Y HSPA6,FCGR3A NA NA NA NA NA HSPA6 90176 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 161892699 161893027 161892754 Y NA NA NA NA NA NA NOS1AP 144537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 162659800 162660152 162659976 Y NA NA NA NA NA NA DDR2 60637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 165674774 165675083 165674866 Y NA ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 8674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 165700999 165701037 165701018 Y NA ALDH9A1,RP11-466F5.8 NA NA NA NA ALDH9A1 34899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 166102836 166102913 166102873 Y NA NA NA NA NA NA RP11-9L18.2 141921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA RP11-277B15.2,POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 167683554 167683813 167683605 Y POU2F1,CREG1 MPZL1 NA NA NA NA MPZL1 4616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 168440429 168440721 168440575 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 192151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 168531443 168531650 168531547 Y NA NA LOC100505918,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 283165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 169229816 169229911 169229864 Y NA NA NA NA NA NA NME7 105294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 169452813 169453010 169452905 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 172078699 172079070 172078885 Y NA NA C1orf105 IMR90 Hi-C 24141950 DNM3 270078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 172418117 172418641 172418353 Y NA PIGC NA NA NA NA PIGC 6887 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 172608229 172608375 172608255 Y NA NA C1orf9,FASLG IMR90 Hi-C 24141950 PIGC 196999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 172972573 172972790 172972603 Y PRDX6 NA NA NA NA NA PRDX6 471615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 173816933 173817269 173817101 Y NA DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5 NA NA NA NA ZBTB37 17951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 176235705 176235715 176235710 Y NA NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 60921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 176750451 176750537 176750521 Y PAPPA2 NA NA NA NA NA RP11-195C7.1 575667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 178121154 178121309 178121232 Y RASAL2 NA NA NA NA NA RASAL2 60290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 179110934 179111289 179111201 Y AXDND1,SOAT1,TOR3A,ABL2 NA NA NA NA NA TOR3A 62422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 179187224 179187335 179187262 Y AXDND1,ABL2,SOAT1 ABL2 NA NA NA NA ABL2 9484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 180250812 180250948 180250921 Y NA NA NA NA NA NA LHX4 53391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 181069151 181069617 181069305 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 13513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 181104473 181105818 181105427 Y STX6,MR1,IER5 IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48835 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 183129116 183129507 183129296 Y LAMC2 LAMC2 LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 23866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 19594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 183149947 183150219 183150157 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 3154 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 183171353 183171815 183171539 Y LAMC2 LAMC2 NA NA NA NA LAMC2 17980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 183562649 183562759 183562701 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2,ARPC5 SMG7 IMR90 Hi-C 24141950 NCF2 4638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 183577563 183577895 183577671 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NCF2 19552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA NCF2,ARPC5 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 184812869 184813180 184813057 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 90822 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 185250433 185250655 185250484 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 33806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 185253692 185254037 185253865 Y HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP NA NA NA NA IVNS1ABP 30424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 191536543 191536778 191536610 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 1146535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA MIR4426 466737 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 192485848 192486563 192486155 Y RGS2,RGS1 NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4426 196750 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP126 72343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 192921207 192921501 192921311 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 78092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 197908297 197908430 197908355 Y NA C1orf53 NA NA NA NA C1orf53 38520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 198712497 198712942 198712717 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 588404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 503631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 449335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 199730970 199731311 199731141 Y NA NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 376701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 200323350 200323623 200323553 Y DDX59,ZNF281 NA NA NA NA NA ZNF281 53561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 200831452 200831819 200831500 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 124766 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 200862818 200862950 200862864 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 156132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA TMEM9 97304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 201494461 201494578 201494476 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 17877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 112029 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 201883288 201883655 201883472 Y NA TIMM17A IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 TIMM17A 38964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 202214153 202214446 202214299 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 94662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 202219033 202219251 202219134 Y NA NA NA NA NA NA UBE2T 89857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 202823240 202823502 202823372 Y NA KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-480I12.5 5246 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 23709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA GOLT1A 74778 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 204363456 204363666 204363499 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 15253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 12504 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 205415918 205416307 205416148 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 6775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 205638734 205639222 205638979 Y SLC45A3 ELK4,SLC45A3 NA NA NA NA SLC45A3 8365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 206668423 206669203 206668750 Y NA IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4 NA NA NA NA RASSF5 9676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206677196 206677895 206677559 Y NA IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4 NA NA NA NA RASSF5 984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 206748926 206749451 206749084 Y IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 34453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206752030 206752370 206752201 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 31534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206754982 206755508 206755274 Y IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3 EIF2D NA NA NA NA EIF2D 28396 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206807155 206807335 206807245 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 274 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 206859748 206860259 206859963 Y IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 3459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206910483 206910789 206910591 Y RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 54194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 206947317 206947651 206947547 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK2 91028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 207063537 207063710 207063660 Y RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL24 IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 5078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr1 207079196 207079569 207079501 Y NA IL24,RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 207414217 207414394 207414309 Y CD55 NA CD55 MCF7 ChIA-PET 22265404 CD55 78459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 207921430 207921703 207921565 Y CR1L CD46 CR1L IMR90 Hi-C 24141950 CD46 1699 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 208021631 208021781 208021738 Y CR1,CD46,PLXNA2,CD34 C1orf132 CD34 IMR90 Hi-C 24141950 C1orf132 18714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 208418631 208418859 208418806 Y PLXNA2 PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 2966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 209279666 209279995 209279816 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 159573 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 209783856 209783983 209783869 Y NA LAMB3 NA NA NA NA LAMB3 39828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 209798058 209798744 209798639 Y NA LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 25067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 209820544 209820823 209820626 Y G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 2988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 LAMB3,G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 LAMB3 803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 209829183 209829498 209829302 Y IRF6,G0S2,LAMB3,LAMB3,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 5372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 209830400 209831026 209830727 Y TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3 LAMB3,G0S2 NA NA NA NA LAMB3 6589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 209934463 209934573 209934515 Y LAMB3,G0S2 RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 21331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 DIEXF 58708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 211590216 211590571 211590445 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 36071 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 212780782 212781279 212780943 Y NA ATF3 NA NA NA NA ATF3 44106 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 212844659 212845312 212845163 Y RPS6KC1,BATF3,ATF3 BATF3 NA NA NA NA BATF3 26015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 212926000 212926318 212926233 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 36806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 215006647 215006892 215006866 Y KCNK2,KCNK2 GAPDHP24 KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP24 35185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 215130656 215131050 215130800 Y KCNK2,KCNK2 NA KCNK2 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP24 88579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 218382752 218383112 218382930 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 73517 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 218546684 218546887 218546789 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 29107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 218636802 218637167 218637004 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 119225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 218847947 218848245 218848113 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 330370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 219433064 219433395 219433229 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 87878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 219498496 219498646 219498574 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 153310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 220189685 220189943 220189814 Y NA EPRS NA NA NA NA EPRS 28057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 221209079 221209530 221209425 Y HLX NA NA NA NA NA MARC1 250978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 221612801 221613016 221612980 Y DUSP10,DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 300502 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 221613404 221613745 221613476 Y NA NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 299773 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 221614030 221614267 221614237 Y DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 299251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr1 222000173 222000483 222000346 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 86655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222002644 222003471 222003177 Y DUSP10,DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 89126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222060426 222060817 222060685 Y NA NA DUSP10 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP10 146908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222135050 222135329 222135215 Y DUSP10 NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 221532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 222142763 222142919 222142838 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 229245 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222144602 222144957 222144787 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 231084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr1 222829045 222829186 222829145 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 39617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 224026476 224026743 224026681 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 4931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.55274158615768 chr1 224240602 224240763 224240683 Y TP53BP2 NA NVL IMR90 Hi-C 24141950 FBXO28 59026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 224393253 224393414 224393305 Y NA RP11-365O16.1,DEGS1 NA NA NA NA DEGS1 31795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 225613143 225613456 225613257 Y LBR,LBR LBR,RP11-496N12.6 NA NA NA NA LBR 1171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 225780677 225780772 225780725 Y NA NA NA NA NA NA ENAH 58072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226014145 226014403 226014226 Y EPHX1,EPHX1 EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 18351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226288544 226288864 226288784 Y C1orf55,H3F3A H3F3A C1orf55,H3F3A,ACBD3 IMR90 Hi-C 24141950 H3F3A 40992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr1 227002760 227003096 227002965 Y NA NA ITPKB,C1orf95 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSEN2 52789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 227730002 227730151 227730029 Y NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 228640073 228640088 228640081 Y NA TRIM11,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 3472 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 NA NA NA NA NA NUP133 94961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 230031091 230031621 230031339 Y NA NA GALNT2 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT2 159915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 230203814 230204638 230204330 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 12278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 230249347 230250007 230249645 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 57811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 230463743 230463957 230463850 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 272207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 231944869 231945038 231944953 Y EXOC8 NA NA NA NA NA DISC1 184308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 NTPCR 318224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 233811305 233811449 233811378 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 63555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 327540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 236240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr1 234792654 234793437 234793098 Y NA IRF2BP2 IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 49383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA NA LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 68796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 115572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 164880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 17696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 235390754 235391125 235391097 Y NA NA NA NA NA NA RBM34 67982 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 236022682 236022818 236022763 Y GPR137B,LYST LYST NA NA NA NA LYST 22122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB NA NA NA NA NA ENO1P1 213222 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.27945377183786 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 240476321 240476487 240476382 Y GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 144866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 241320009 241320104 241320058 Y NA NA NA NA NA NA RP11-435F13.2 159915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 241804319 241804678 241804577 Y NA CHML,OPN3 NA NA NA NA CHML 7087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 243451071 243451374 243451087 Y CEP170,SDCCAG8 CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA SDCCAG8 33751 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 401492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr1 244763140 244763529 244763408 Y ADSS,EFCAB2 NA NA NA NA NA ADSS 149704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr1 246129057 246129404 246129358 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 539210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr1 247507326 247507475 247507401 Y NA ZNF496 ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF496 14178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 2992232 2992361 2992295 Y NA NA WDR37,LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 114164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 3852273 3852886 3852712 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 26800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 3889000 3889222 3889111 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF6 63527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 3985648 3985956 3985684 Y KLF6 NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 160175 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 4386754 4387085 4386858 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 102650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 112070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA NA NA NA NA NA AKR1C1 227013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 4712833 4713220 4712996 Y NA NA NA NA NA NA AKR1C1 219576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA NA NA NA NA NA AKR1C1 218923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 5577499 5577735 5577573 Y NA NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 73021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 5587810 5588190 5587923 Y NA NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 62566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 5588881 5589169 5589084 Y NET1,CALML3 NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 61587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 5590010 5590295 5590293 Y NET1,CALML3 NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 60461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 5883027 5883237 5883157 Y NA GDI2,FBXO18,ANKRD16 NA NA NA NA GDI2 932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 6296306 6296528 6296431 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 111425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 6764164 6764384 6764289 Y NA RP11-554I8.2 LOC100507127,SFMBT2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554I8.2 12960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 6915397 6915415 6915406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-554I8.2 138053 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA USP6NL 184200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA UPF2 165082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 11924114 11924319 11924232 Y C10orf47 NA NA NA NA NA UPF2 158850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 12762455 12762628 12762543 Y NA NA NA NA NA NA OPTN 376821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr10 14231808 14231900 14231854 Y FRMD4A NA NA NA NA NA FRMD4A 270241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 15158719 15159034 15158939 Y NA RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA C10orf111 21401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 16481463 16481634 16481561 Y NA PTER NA NA NA NA PTER 4521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 17116431 17116714 17116628 Y VIM NA NA NA NA NA TRDMT1 125339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 17390739 17391085 17390858 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA6 103244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 17569630 17569764 17569656 Y VIM NA PTPLA IMR90 Hi-C 24141950 ST8SIA6 75301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 22046684 22046874 22046779 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP37 173198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22242936 22243341 22243231 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA RN7SKP37 22864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22622234 22622399 22622330 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 10000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22623174 22623719 22623448 Y COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 8680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22624164 22624549 22624505 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 7850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 6371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 92932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22904639 22904845 22904818 Y PIP4K2A NA NA NA NA NA PIP4K2A 96639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 22932994 22933290 22933224 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 23721651 23721890 23721808 Y OTUD1 OTUD1 OTUD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 OTUD1 4308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 24858253 24858468 24858359 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 152129 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 25155940 25156492 25156271 Y ARHGAP21 NA NA NA NA NA PRTFDC1 83041 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 26289899 26290095 26289999 Y GAD2 NA NA NA NA NA PDSS1 694493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 27069899 27070563 27070182 Y MASTL,ACBD5,PDSS1,ABI1 NA NA NA NA NA ABI1 77453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr10 28366743 28367106 28366855 Y ARMC4 NA NA NA NA NA MPP7 254309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 29755539 29755855 29755808 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 59208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 75067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 30092989 30093361 30093263 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 69279 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 30096449 30096548 30096521 Y NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SVIL 72739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 30138445 30138751 30138559 Y NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 SVIL 114735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 30756708 30756891 30756779 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 35842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 31204241 31204373 31204282 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA NA NA NA NA ZNF438 114493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 31364412 31364707 31364567 Y NA ZNF438 ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 45546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 31870933 31871207 31871087 Y NA NA ZNF438,ARHGAP12,ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 263557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 32626420 32626786 32626539 Y NA EPC1 NA NA NA NA EPC1 38940 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA RP11-462L8.1,ITGB1 NA NA NA NA RP11-462L8.1 5078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr10 33272272 33272613 33272373 Y ITGB1,ITGB1,ITGB1 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 33299093 33299340 33299217 Y NA ITGB1 ITGB1,C10orf68,PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 6373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 33422989 33423776 33423207 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 130269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 33503049 33503394 33503286 Y ITGB1 NA NA NA NA NA NRP1 119796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 33654373 33654479 33654393 Y NA NRP1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 31183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 33654776 33655204 33655009 Y NA NRP1 PARD3,NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 31586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 34421241 34421398 34421321 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 529631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 35717658 35717859 35717796 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 183705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 35848460 35848836 35848737 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 314507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr10 43761301 43761565 43761418 Y RASGEF1A NA NA NA NA NA CSGALNACT2 129367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 43782816 43783033 43782934 Y CSGALNACT2 NA NA NA NA NA HNRNPF 119581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 43800197 43800376 43800318 Y CSGALNACT2,HNRNPF,HNRNPF NA ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPF 102238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 45445885 45445945 45445917 Y RASSF4 RASSF4,C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA RASSF4 6910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 46053091 46053211 46053151 Y NA MARCH8 NA NA NA NA MARCH8 35143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 49542005 49542407 49542075 Y NA MAPK8 ARHGAP22,MAPK8 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 29307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 50580112 50580444 50580220 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 164642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 50742859 50743547 50743006 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA PGBD3 1539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 50776206 50776746 50776485 Y PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3 PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 30622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 50791340 50791620 50791497 Y NA PGBD3,ERCC6 NA NA NA NA ERCC6 45756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 51039519 51039692 51039605 Y NA NA NA NA NA NA OGDHL 71094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 52037840 52038115 52037944 Y SGMS1 DYNC1I2P1 SGMS1 IMR90 Hi-C 24141950 DYNC1I2P1 15102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 52079574 52079882 52079666 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 56836 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 52085013 52085461 52085351 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 62275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 54078781 54079176 54078966 Y NA DKK1 NA NA NA NA DKK1 6725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 60090277 60090586 60090450 Y IPMK,UBE2D1 UBE2D1 UBE2D1 MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2D1 2149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 61580750 61581126 61580938 Y NA NA NA NA NA NA CCDC6 83288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 63658924 63659147 63659031 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 64300187 64300318 64300222 Y EGR2,EGR2 NA NA NA NA NA ADO 262198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 59406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 65128612 65128923 65128710 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 56134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 65231848 65231938 65231929 Y NA PRELID1P3,JMJD1C,REEP3 NA NA NA NA JMJD1C 8126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 69523880 69524330 69524240 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC12 71594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 69578155 69578433 69578238 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 17491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 69579652 69579872 69579788 Y DNAJC12 DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 16052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 69778500 69778679 69778642 Y NA NA NA NA NA NA HERC4 54426 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 69854882 69855277 69855187 Y HERC4 HERC4,MYPN ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYPN 8635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 69856894 69857171 69856968 Y NA HERC4,MYPN MYPN,HERC4,PBLD,HNRNPH3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYPN 6741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 MYPN NA NA NA NA MYPN 49395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,HKDC1 NA NA NA NA HKDC1 627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 72124245 72124646 72124446 Y NA LRRC20,EIF4EBP2 NA NA NA NA LRRC20 15736 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 72253805 72253950 72253868 Y NA NA NA NA NA NA EIF4EBP2 91670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 73313455 73313899 73313820 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 217356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 73725868 73726411 73726297 Y C10orf105,CHST3 CHST3 NA NA NA NA CHST3 3745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 73746692 73746892 73746791 Y C10orf105,CHST3 CHST3 NA NA NA NA CHST3 24569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 RP11-570G20.1,ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 74174604 74174793 74174677 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB12 61616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,FAM149B1,ECD NA NA NA NA P4HA1 23026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.86952205035813 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 75987927 75988078 75987990 Y KIAA0913,NDST2,CAMK2G,ADK NA NA NA NA NA ADK 78967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79265772 79266169 79265902 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 418209 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79291052 79291779 79291330 Y KCNMA1 NA NA NA NA NA DLG5 392599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 146007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 79633336 79633510 79633397 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 50868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79636555 79636603 79636579 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 47775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79731077 79731252 79731165 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 46699 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 79822421 79822811 79822453 Y NA POLR3A,RPS24 NA NA NA NA RPS24 30903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 80015725 80016226 80016048 Y RPS24 NA NA NA NA NA RPS24 224207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 80023350 80023581 80023481 Y NA NA NA NA NA NA RPS24 231832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 81088418 81088982 81088641 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 16243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 81091409 81091966 81091732 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 13259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 81956011 81956585 81956252 Y ANXA11 ANXA11,EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 6743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 82207287 82207512 82207367 Y NA FAM213A,TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 4410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 86089822 86090305 86090054 Y FAM190B NA NA NA NA NA GHITM 192626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 86104605 86104727 86104619 Y NA NA NA NA NA NA GHITM 207409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA NA WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 WAPAL 119278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 89322777 89322992 89322885 Y NA NA NA NA NA NA MINPP1 60145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 89875844 89876042 89875925 Y NA NA PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 172585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 89912666 89913039 89912909 Y NA NA KLLN,PTEN,RNLS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 209407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 90495559 90495751 90495657 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 141740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 90689067 90689322 90689158 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 51576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 90791932 90792275 90792106 Y NA FAS NA NA NA NA FAS 43518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 90844295 90844413 90844369 Y NA NA FAS,LIPA,CH25H IMR90 Hi-C 24141950 FAS 95881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 92974122 92974225 92974155 Y NA PCGF5 NA NA NA NA PCGF5 3683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 93241945 93242217 93242081 Y NA NA NA NA NA NA HECTD2 73849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 93300438 93300742 93300617 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R3C 90069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 93373148 93373298 93373228 Y NA PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 17513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.09931721479732 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NA NA NA NA NA CPEB3 57392 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 94001133 94001473 94001377 Y CPEB3,CPEB3 CPEB3,MARCH5 NA NA NA NA CPEB3 47371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 95136235 95136595 95136450 Y MYOF NA NA NA NA NA MYOF 103479 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 95145053 95145431 95145242 Y NA NA NA NA NA NA MYOF 94643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 95197787 95197992 95197919 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr10 96795212 96795351 96795282 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM1 253430 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 97120063 97120328 97120194 Y SORBS1 NA NA NA NA NA PDLIM1 71282 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 97148349 97148600 97148588 Y NA NA PDLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 99568 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 97591958 97592428 97592230 Y ENTPD1 NA NA NA NA NA TCTN3 140058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 99167112 99167183 99167148 Y NA RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 EXOSC1,ZDHHC16,PGAM1,RRP12 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RRP12 7985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 99408797 99409067 99408957 Y NA MORN4,AVPI1 NA NA NA NA MORN4 17453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 99449337 99449738 99449607 Y C10orf28,RRP12,PI4K2A AVPI1,MARVELD1,ZFYVE27 NA NA NA NA AVPI1 4257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 100153138 100153356 100153248 Y NA PYROXD2 NA NA NA NA PYROXD2 19585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 101736797 101737134 101736959 Y BLOC1S2,BLOC1S2,DNMBP DNMBP NA NA NA NA DNMBP 30542 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 101765990 101766360 101766233 Y NA DNMBP NA NA NA NA DNMBP 1316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 101944283 101944461 101944347 Y DNMBP,CWF19L1,CHUK,BLOC1S2,BLOC1S2,ERLIN1,ERLIN1 ERLIN1,CHUK,RP11-316M21.6 NA NA NA NA ERLIN1 1630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 102140082 102140467 102140275 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 8710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 102490692 102490976 102490862 Y NA NA NA NA NA NA FAM178A 179350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 102618433 102618807 102618490 Y NA NA NA NA NA NA FAM178A 51519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 103514539 103514868 103514704 Y NA NPM3 NA NA NA NA NPM3 26302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 103708018 103708327 103708173 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 105623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 103937930 103938271 103938070 Y NA PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA NOLC1 27997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 104102854 104103008 104102931 Y ACTR1A NFKB2 PSD,FBXL15,NFKB2 IMR90 Hi-C 24141950 NFKB2 48859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 104196250 104196338 104196269 Y NA NFKB2,FBXL15,CUEDC2,TMEM180 NA NA NA NA CUEDC2 5832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 104364219 104364413 104364273 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 37840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 104473144 104473537 104473339 Y NA ARL3,SFXN2 NA NA NA NA SFXN2 849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 104892620 104892981 104892840 Y C10orf32,NT5C2 NA NA NA NA NA NT5C2 58075 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 104909684 104910071 104909878 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 40985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 105208274 105208534 105208404 Y NA NA NA NA NA NA PDCD11 53869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 94147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK SH3PXD2A,OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 105654409 105654593 105654518 Y NA SH3PXD2A,OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 21370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 105667581 105667905 105667745 Y NA OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 8058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr10 105869782 105869970 105869884 Y GSTO1,GSTO1,CCDC147,SLK,MEIR5,MEIR5 COL17A1,SFR1 NA NA NA NA SFR1 9846 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 106094943 106095283 106095247 Y NA ITPRIP,CCDC147-AS1 NA NA NA NA ITPRIP 879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP,CCDC147-AS1 ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 109306918 109307188 109307036 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2374123 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 111834173 111834352 111834276 Y ADD3,SMNDC1,MXI1,MXI1 NA NA NA NA NA ADD3 80047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 111981639 111982026 111981734 Y ADD3,MXI1,MXI1 MXI1 SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 MXI1 16276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 112051912 112052490 112052119 Y ADD3,MXI1 SMNDC1 NA NA NA NA SMNDC1 10219 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 112116359 112116685 112116467 Y DUSP5,MXI1 NA SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMNDC1 53650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 112155518 112156031 112155808 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 92809 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 112169656 112169922 112169805 Y SMC3 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr10 112174147 112174523 112174256 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 112533972 112534336 112534061 Y PDCD4 NA NA NA NA NA PDCD4 95229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 114139786 114140040 114139910 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 8010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 114148894 114149633 114149365 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 17118 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 114292106 114292272 114292196 Y ZDHHC6,VTI1A NA NA NA NA NA VTI1A 87350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 115251940 115252325 115252226 Y NA NA GUCY2GP,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 CASP7 184617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 116080506 116080782 116080645 Y AFAP1L2 NA NA NA NA NA C10orf118 148527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA ABLIM1 187173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 120429091 120429309 120429186 Y NA NA NA NA NA NA FAM204A 329251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 120850460 120850786 120850708 Y NA EIF3A,FAM45A EIF3A,PRDX3,SFXN4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM45A 10812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 94093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 121075171 121075335 121075278 Y NA NA NA NA NA NA PRDX3 138826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 121412148 121412380 121412196 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 3266 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 121417930 121418047 121417978 Y BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 9048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 121682284 121682432 121682358 Y NA MCMBP,SEC23IP NA NA NA NA SEC23IP 32061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr10 122270774 122271036 122270905 Y NA NA NA NA NA NA RP11-572P18.1 158056 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 123197092 123197323 123197208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 305855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 123526019 123526096 123526058 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 159731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 123822805 123823045 123822957 Y ATE1,DMBT1 NA NA NA NA NA TACC2 76116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 123900798 123900950 123900924 Y TACC2 NA NA NA NA NA TACC2 154109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 125754916 125755682 125755196 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 95524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 126410085 126410502 126410408 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 20336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 126748587 126748846 126748786 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 127535706 127535819 127535763 Y MMP21 UROS,BCCIP,RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA BCCIP 25591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 127751033 127751319 127751198 Y NA NA NA NA NA NA FANK1 167925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 128258462 128258762 128258558 Y NA NA FANK1,DHX32,ADAM12 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 333216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 133454610 133454819 133454663 Y NA NA NA NA NA NA BNIP3 338616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 133776164 133776302 133776237 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 17133 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 134124952 134125064 134125008 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4,LRRC27,STK32C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK32C 18287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 134234707 134235257 134234764 Y STK32C,PWWP2B PWWP2B C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PWWP2B 26035 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 NA NA NA NA NA PWWP2B 51669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr10 134549634 134549842 134549793 Y KNDC1,GPR123,NKX6-2 NA NA NA NA NA INPP5A 200310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr10 135072735 135073128 135072895 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511 NA NA NA NA ADAM8 15244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr10 135074691 135075148 135074934 Y TUBGCP2,ADAM8 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 13224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 316246 316608 316492 Y TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1 RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3 NA NA NA NA IFITM1 4740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7,SCT NA NA NA NA SCT 4049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 1039894 1040259 1040094 Y MUC6 MUC6 AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 MUC6 5188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 1053255 1053594 1053287 Y NA MUC6 MUC5B,MOB2,AP2A2 IMR90 Hi-C 24141950 MUC6 18549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A MUC6 NA NA NA NA MUC6 38663 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA MUC5AC MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 MUC5AC 1423 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 1773349 1773482 1773395 Y IFITM10 RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 NA NA NA NA RP11-295K3.1 4799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 1794819 1794975 1794880 Y NA RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 11597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 3035655 3035952 3035816 Y MRGPRG NAP1L4,RNU1-91P,CARS NA NA NA NA NAP1L4 24048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 5647526 5647619 5647574 Y OR51B2,OR51Q1,OR56B4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR52N4,TRIM34,TRIM5,TRIM22 TRIM6,TRIM6-TRIM34,TRIM34 NA NA NA NA TRIM34 8532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 6699628 6699937 6699850 Y OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2 MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 2695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 8632537 8632549 8632543 Y ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 69409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 8889520 8889803 8889779 Y ST5 ST5,AKIP1 NA NA NA NA ST5 40695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 9422844 9423055 9422950 Y NRIP3,IPO7 IPO7,SNORA23 NA NA NA NA IPO7 18675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 10619660 10619757 10619708 Y NA NA NA NA NA NA MRVI1-AS1 58841 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 10921943 10922208 10922068 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,EIF4G2,ZBED5 ZBED5,CTD-2003C8.2 NA NA NA NA CTD-2003C8.2 3074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 10938352 10938640 10938494 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 CTD-2003C8.2 EIF4G2,LOC729013,ZBED5,USP47,DKK3,CTR9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 19483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 11171786 11172049 11171935 Y EIF4G2 NA GALNTL4 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2003C8.2 252917 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 11864878 11865300 11864975 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 3908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 11998818 11999068 11999003 Y MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 114475 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 12065635 12065803 12065720 Y NA MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 47740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12218036 12218499 12218053 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 104493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 12701917 12702070 12702017 Y TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 7948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12772830 12773175 12773002 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 78861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 13359856 13360227 13360061 Y ARNTL NA NA NA NA NA ARNTL 63657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 13961618 13961770 13961694 Y RRAS2 NA SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 FAR1 273401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 14785995 14786323 14786008 Y NA NA NA NA NA NA PDE3B 122726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 17099866 17100401 17100030 Y NA SNORD14A,RPS13 NA NA NA NA RPS13 2532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA,AC084117.3 NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 18649925 18650050 18650045 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 4288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 19081495 19081694 19081555 Y MRGPRX2 NA NA NA NA NA E2F8 179473 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 20134058 20134420 20134284 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 248811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF NA NA NA NA NA RP11-587D21.1 138674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 28063321 28063497 28063482 Y NA NA NA NA NA NA METTL15 64298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 28701449 28701661 28701530 Y NA RP11-115J23.1 BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 20501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 28792909 28793103 28792913 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 70747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 28831581 28831914 28831617 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 109419 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 28853592 28853798 28853653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 131430 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 28856336 28856685 28856610 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 134174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 29302148 29302272 29302237 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 579986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 31165521 31165554 31165538 Y IMMP1L,ELP4,DNAJC24 NA NA NA NA NA DNAJC24 223833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 31819497 31819881 31819763 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA RCN1 12058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 33342450 33342853 33342574 Y NA NA NA NA NA NA HIPK3 66232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 33711808 33712191 33712002 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 43800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 33723473 33723762 33723676 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 32229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 34236527 34236812 34236617 Y ABTB2 NA NA NA NA NA NAT10 111378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 EHF NA NA NA NA EHF 34939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35029453 35029465 35029458 Y NA NA NA NA NA NA APIP 93407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 CD44 105728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35345585 35345958 35345764 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 187168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35358493 35359078 35358891 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 200076 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35360567 35360777 35360690 Y CD44 NA NA NA NA NA CD44 202150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35395403 35395808 35395629 Y SLC1A2 NA NA NA NA NA CD44 236986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 35840381 35840713 35840619 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 122818 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 43473758 43474114 43473936 Y NA NA NA NA NA NA TTC17 95276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 44221715 44221986 44221792 Y NA NA NA NA NA NA EXT2 106616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 45122042 45122442 45122242 Y PRDM11 NA NA NA NA NA SYT13 183428 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 45922261 45922718 45922513 Y DGKZ,MAPK8IP1 MAPK8IP1,PEX16 NA NA NA NA PEX16 15645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 47168963 47169205 47169084 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 27471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 47173206 47173550 47173416 Y NA ARFGAP2,PACSIN3 NA NA NA NA ARFGAP2 23126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 57045764 57045851 57045815 Y NA TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 44575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 57549936 57550183 57550060 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 31221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 58399673 58399754 58399714 Y OR9Q2,OR1S2,OR1S1,OR10Q1,OR10W1,OR5B3,OR5B2,OR5B12 NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 55028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 59323878 59323962 59323920 Y NA NA NA NA NA NA OSBP 57655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 59893766 59893910 59893838 Y PATL1,STX3 NA NA NA NA NA TCN1 261718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 61065380 61065516 61065448 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 61270255 61270376 61270301 Y NA NA NA NA NA NA SDHAF2 74741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK 73208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 62310227 62311393 62310863 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA AHNAK 10314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA AHNAK 9310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 62321348 62321821 62321541 Y NA EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 63328335 63328557 63328446 Y NA RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 26054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 63744435 63744483 63744459 Y KCNK4 NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA AP000721.4 4343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 64125464 64125650 64125510 Y MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4 TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 64625998 64626454 64626155 Y CDC42EP2,RASGRP2,SF1,SF1,FAU,BATF2,EHD1 MEN1,EHD1 NA NA NA NA EHD1 27314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 65075657 65076292 65075967 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.73287814319822 chr11 65238917 65239096 65239037 Y CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198 MALAT1 TIGD3 K562 ChIA-PET 22265404 MALAT1 24137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 MALAT1 23363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 65259930 65260851 65260542 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 2382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 12.0246638300721 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 65656792 65657262 65656985 Y NA MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA CCDC85B 917 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.55274158615768 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 9.42842959403384 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CATSPER1 8651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 66094685 66094783 66094735 Y CFL1,FIBP,DRAP1,YIF1A,CD248 YIF1A,RIN1,BRMS1,B3GNT1,SLC29A2 NA NA NA NA RIN1 7528 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 66717584 66717809 66717709 Y CLCF1,ADRBK1 PC NA NA NA NA PC 6038 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 66845381 66845631 66845497 Y TMEM134,SSH3,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 66845907 66846062 66845990 Y PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD RHOD,KDM2A NA NA NA NA RHOD 23618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 68981040 68981260 68981150 Y NA NA ORAOV1,MYEOV,CCND1,FGF19 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 78345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 69069179 69069344 69069260 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 69794643 69794820 69794756 Y FADD,ANO1 NA ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 127588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 70079442 70079825 70079633 Y ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1 FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FADD 32173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 70162610 70162835 70162663 Y PPFIA1 PPFIA1 NA NA NA NA PPFIA1 47804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 70483542 70483760 70483651 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 240948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 70575636 70576014 70576009 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 333042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 71702677 71703050 71702869 Y FOLR3,IL18BP,IL18BP NA NA NA NA NA RNF121 64930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA NA NA NA NA NA RNF121 66878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 71780398 71780482 71780403 Y IL18BP,IL18BP LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1 NA NA NA NA LRTOMT 8900 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 72351414 72351690 72351438 Y NA PDE2A NA NA NA NA PDE2A 31945 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 72449101 72449742 72449392 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA STARD10 52984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 72555518 72555570 72555544 Y ATG16L2 ATG16L2 NA NA NA NA ATG16L2 32165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 72854261 72854849 72854638 Y PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2 FCHSD2 NA NA NA NA FCHSD2 2955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 73097153 73097443 73097265 Y FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT RELT NA NA NA NA RELT 11844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.86952205035813 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 75755875 75756235 75755993 Y UVRAG NA NA NA NA NA RP11-535A19.2 231424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 NA NA NA NA NA PRKRIR 169769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 143692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 75946917 75947052 75946991 Y NA NA C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKRIR 142963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 3883 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 78000759 78000964 78000861 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 102891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 78001305 78001608 78001428 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 103437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 78777919 78778268 78778094 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 494000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 82781050 82781223 82781203 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 85 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 82961020 82961401 82961211 Y NA RP11-727A23.1,CCDC90B NA NA NA NA CCDC90B 34049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 86185128 86185335 86185247 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 173875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 86381936 86382132 86382071 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 86803275 86803509 86803398 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 56389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 87871692 87871803 87871780 Y NA RAB38 NA NA NA NA RAB38 34832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 88340070 88340128 88340099 Y GRM5 NA NA NA NA NA CTSC 271115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 94336010 94336194 94336103 Y PANX1,ANKRD49,FUT4 NA NA NA NA NA FUT4 60993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 96047326 96047750 96047695 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 26594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 102231981 102232209 102232014 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 16039 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 102631066 102631384 102631342 Y BIRC2 MMP10,MMP1 NA NA NA NA MMP10 17975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 105115100 105115515 105115329 Y CASP4,CASP5,CARD16,CARD17 NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP5 223205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 105579191 105579256 105579211 Y KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA AASDHPPT 364972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 105590287 105590591 105590439 Y GRIA4,GRIA4 NA NA NA NA NA AASDHPPT 353637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 107187292 107187599 107187573 Y NA NA NA NA NA NA CWF19L2 138973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 108487361 108487672 108487557 Y EXPH5 EXPH5,DDX10 NPAT,EXPH5,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 24896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 108600247 108600616 108600285 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 66495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 109965770 109966113 109965869 Y RDX,FDX1,ZC3H12C ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 3683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 111929773 111930099 111929899 Y DIXDC1 DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA C11orf57 12711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 IL18 NA NA NA NA IL18 16061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 112028082 112028533 112028265 Y IL18 IL18 NA NA NA NA IL18 4307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 114056235 114056576 114056319 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 69933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 116722234 116722744 116722542 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 65468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 116741935 116742274 116742188 Y NA NA NA NA NA NA ZNF259 85169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA AP000936.1 102088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 118112268 118112532 118112411 Y IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D MPZL3,MPZL2 NA NA NA NA MPZL3 8533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 118146006 118146232 118146062 Y FXYD6,MPZL2 MPZL3,MPZL2 MPZL2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MPZL2 12755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 118148186 118148361 118148275 Y MPZL2 MPZL3,MPZL2 MPZL2,LOC100526771,TMPRSS4,SCN4B,SCN2B,MPZL3,CD3E,AMICA1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MPZL2 14935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.73287814319822 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 9059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 119612950 119613345 119613188 Y NA PVRL1 PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 15156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 120083069 120083545 120083438 Y GRIK4,ARHGEF12,OAF OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 3594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 120089762 120089841 120089801 Y NA OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 10287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 120218040 120218378 120218085 Y NA TMEM136,ARHGEF12 NA NA NA NA ARHGEF12 12253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 120302835 120303154 120303088 Y OAF,ARHGEF12 NA NA NA NA NA ARHGEF12 97048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 122311334 122311672 122311591 Y NA RP11-820L6.1 SC5DL,MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-820L6.1 19755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 122936469 122936659 122936561 Y NA RPL34P23,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 4531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 122989373 122989577 122989478 Y NA NA NA NA NA NA HSPA8 57435 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123001197 123001518 123001329 Y NA NA NA NA NA NA CLMP 62471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123275970 123276355 123275979 Y NA AP000783.1,LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 22703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123327975 123328380 123328056 Y NA AP000783.1,LINC01059 CLMP,HSPA8 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 4869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 123343327 123343490 123343416 Y BSX AP000783.1,LINC01059 HSPA8,CLMP,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 20221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123345048 123345386 123345163 Y NA AP000783.1,LINC01059 CLMP,MIR4493 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 21942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123350505 123350682 123350594 Y NA LINC01059 CLMP,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 27399 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123352361 123352657 123352509 Y OR8D4,OR6M1 LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 29255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123353850 123354009 123353930 Y NA LINC01059 CLMP IMR90 Hi-C 24141950 LINC01059 30744 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 123397233 123397392 123397331 Y SCN3B,GRAMD1B NA NA NA NA NA LINC01059 74127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 123414630 123415056 123414666 Y NA NA NA NA NA NA LINC01059 91524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123471620 123471812 123471715 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 52140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 123519920 123520232 123520133 Y OR8D4,SCN3B SCN3B NA NA NA NA SCN3B 3720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA ESAM NA NA NA NA ESAM 38702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 95571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 126209269 126209556 126209430 Y NA DCPS,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 128352415 128352744 128352497 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 102709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 128366966 128367159 128367092 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 88294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 128376227 128376457 128376317 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 78996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 129013172 129013631 129013445 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP32 133588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 129102482 129102753 129102618 Y NA ARHGAP32 NA NA NA NA ARHGAP32 44466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 129508234 129508346 129508288 Y NA NA BARX2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM45B 175368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 129716429 129716681 129716540 Y TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 32715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr11 129993921 129994394 129994167 Y PRDM10,APLP2 ST14 NA NA NA NA ST14 33063 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr11 130767172 130767510 130767285 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16894 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 133814977 133815479 133815368 Y NCAPD3,IGSF9B IGSF9B NA NA NA NA IGSF9B 9401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8,GLB1L3 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 GLB1L2 508318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 690377 690646 690594 Y NA RP11-218M22.1 NA NA NA NA RP11-218M22.1 47411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 1583254 1583583 1583419 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL14 117748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA NA NA NA NA NA C12orf5 479758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 C12orf5 287556 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 5589537 5589706 5589616 Y NA NA NA NA NA NA CD9 717175 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6280499 6281236 6280879 Y NA CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 25645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6304942 6305291 6305114 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 1590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6389072 6389528 6389363 Y CD9,PLEKHG6,PLEKHG6 NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 59752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 44613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 16636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6526261 6526580 6526421 Y ZNF384,ZNF384,CHD4 LTBR,RP1-102E24.9,TAPBPL NA NA NA NA RP1-102E24.9 19084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6663248 6663743 6663420 Y GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1 SCARNA10,GAPDH,NOP2 NA NA NA NA NOP2 12114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6684613 6684668 6684641 Y NA GAPDH,NOP2,CHD4 NA NA NA NA NOP2 8756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,LPAR5 NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2,CD4 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 7100414 7100432 7100423 Y NA RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 6063 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 8797579 8797828 8797667 Y NA SCARNA11,MFAP5,RIMKLB NA NA NA NA MFAP5 15656 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 8813796 8814159 8813977 Y MFAP5 MFAP5,RIMKLB NA NA NA NA MFAP5 312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB MFAP5,RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 9491229 9491519 9491373 Y NA NA C12orf33,LOC144571 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP4 100302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 9797730 9798098 9797800 Y NA NA NA NA NA NA DDX12P 198905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA CLEC2B NA NA NA NA CLEC2B 33813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 10409972 10410105 10410016 Y NA GABARAPL1 NA NA NA NA GABARAPL1 46915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 10794413 10794704 10794528 Y NA MAGOHB NA NA NA NA MAGOHB 30191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 68935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 105076 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 11867581 11867722 11867638 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 66793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 88880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 12425810 12426042 12425926 Y NA LRP6 BCL2L14,LRP6,MIR1244-2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP6 7864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 12592534 12593034 12592768 Y BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA NA NA NA NA LOH12CR1 84521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 12602381 12602995 12602706 Y BCL2L14,DUSP16 NA NA NA NA NA LOH12CR1 94368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 12872470 12873013 12872652 Y MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1 CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 6478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 12957478 12957757 12957559 Y GPRC5A DDX47 NA NA NA NA DDX47 6493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 62.0363338505995 chr12 13034551 13034650 13034602 Y DDX47,GPRC5A RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 13332644 13332915 13332868 Y NA EMP1 EMP1,KIAA1467 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 14735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 13359236 13359687 13359415 Y EMP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 11586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 15841016 15841330 15841173 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 191933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 19842357 19842456 19842392 Y NA NA NA NA NA NA RP11-841C19.1 182519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.24212707947527 chr12 20004635 20004650 20004642 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 87805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 20047049 20047293 20047237 Y NA RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 45162 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 20061866 20062155 20061952 Y NA RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 30300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 20076637 20076989 20076813 Y PDE3A RP11-405A12.1 NA NA NA NA RP11-405A12.1 15466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 20975224 20975562 20975349 Y NA NA NA NA NA NA RP11-284H19.1 454028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 24753984 24754298 24754172 Y BCAT1 NA SOX5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-662I13.1 364140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 9.15514177971402 chr12 25768042 25768407 25768182 Y NA NA NA NA NA NA RASSF8 341555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA RP11-283G6.3 NA NA NA NA RP11-283G6.3 9739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 27332593 27333057 27332936 Y STK38L NA STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK38L 61844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 27484254 27484540 27484416 Y FGFR1OP2,STK38L ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 467 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 27702695 27702969 27702865 Y NA PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 28331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 28127967 28128359 28128243 Y PTHLH,PTHLH NA NA NA NA NA CCDC91 155823 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 28275745 28275985 28275876 Y NA CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 8197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 28283625 28284072 28283761 Y PTHLH,PTHLH CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 29581721 29581917 29581813 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 49599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 30570849 30571198 30571024 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 275722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 30949517 30949896 30949519 Y CAPRIN2 CAPRIN2,RP11-77I22.2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 3540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A NA NA NA NA FAM60A 45033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 70000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 31899631 31900083 31899901 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 19523 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr12 31905440 31905706 31905591 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C NA NA NA NA AMN1 25332 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 31909925 31910440 31910295 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 29817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 32263319 32263494 32263407 Y NA BICD1 NA NA NA NA BICD1 5550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 39808802 39808894 39808882 Y NA KIF21A NA NA NA NA KIF21A 26298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 42537125 42537342 42537234 Y NA GXYLT1 NA NA NA NA GXYLT1 444 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46380247 46380714 46380477 Y SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 3189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 46571692 46571878 46571769 Y SLC38A1 NA NA NA NA NA SLC38A1 89922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 46797992 46798094 46798088 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 22530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr12 46845656 46846014 46845792 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 70194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.37260502911714 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 47053760 47053887 47053821 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 278298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 47058808 47059020 47058972 Y SLC38A2 NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 283346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 47074564 47074850 47074707 Y NA NA SLC38A1,SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 299102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 47191369 47191677 47191464 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 280057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.83219535799554 chr12 47476610 47477096 47476829 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 4876 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 47606052 47606349 47606300 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 134318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA AMIGO2 140471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 47671815 47672221 47672059 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 200081 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 49508076 49508435 49508256 Y NA RHEBL1,LMBR1L,RP11-386G11.10,TUBA1B NA NA NA NA LMBR1L 5393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,C1QL4,SPATS2 NA NA NA NA C1QL4 10999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 50020601 50020960 50020800 Y FMNL3,PRPF40B NA NA NA NA NA PRPF40B 60600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 50339326 50339779 50339533 Y NA AQP5,RP11-469H8.6 AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AQP5 13874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 50926707 50927114 50926974 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 29939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 51180627 51180997 51180727 Y SMAGP ATF1 TMPRSS12 IMR90 Hi-C 24141950 ATF1 25134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA NA NA NA NA NA SLC11A2 92566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 51551925 51552239 51552062 Y NA TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 12687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 51720540 51720949 51720738 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6 NA NA NA NA NA SMAGP 57866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 51787794 51788248 51788116 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6 GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 3143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 52279748 52280043 52279838 Y NR4A1 NA NA NA NA NA ACVR1B 63408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 52525424 52525587 52525584 Y NA NA NA NA NA NA KRT80 58197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.23596112195723 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 52545730 52546132 52545994 Y KRT6A,C12orf44 KRT80 NA NA NA NA KRT80 37652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr12 52835077 52835369 52835228 Y NA KRT6B KRT75 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT6B 8541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53338460 53338676 53338568 Y KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr12 54017367 54017528 54017445 Y NA ATF7,RP11-972K6.1 NA NA NA NA ATF7 671 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC11,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 12047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr12 54810296 54811355 54811225 Y GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5 NA ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 56132069 56132385 56132308 Y OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4 BLOC1S1,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 2679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.32911237923652 chr12 57494239 57494362 57494284 Y MBD6,STAT6 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA NAB2 13562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 57512672 57512926 57512798 Y NAB2 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 TMEM194A,STAT6,LRP1,STAC3,SHMT2,NDUFA4L2 IMR90 Hi-C 24141950 LRP1 7350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 57672745 57672985 57672868 Y NA NDUFA4L2 NA NA NA NA NDUFA4L2 40247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 57986482 57986782 57986634 Y R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25 DCTN2,PIP4K2C,DTX3,B4GALNT1 NA NA NA NA PIP4K2C 3525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 58281637 58282038 58281777 Y CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM CTDSP2 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 43115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 58283417 58283685 58283602 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2 CTDSP2,XRCC6BP1 CTDSP2,TSFM,AVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTDSP2 44895 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 58337769 58337952 58337777 Y NA XRCC6BP1 NA NA NA NA XRCC6BP1 4445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 59449084 59449472 59449406 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA LRIG3 136781 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 62650628 62651393 62650813 Y C12orf61,USP15 USP15,FAM19A2 NA NA NA NA USP15 726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,C12orf61 NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 63126917 63127025 63126971 Y C12orf61 NA NA NA NA NA C12orf61 131703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA C12orf61 154243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 64312639 64312950 64312683 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA SRGAP1 76566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 64414724 64414736 64414730 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 178651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 64544712 64545066 64544890 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA C12orf66 69010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 64574864 64574988 64574911 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 39088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 64575299 64575468 64575384 Y NA C12orf66,RPS11P6 NA NA NA NA C12orf66 38608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 65013818 65014124 65014036 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 11525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 65176068 65176517 65176160 Y TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS GNS NA NA NA NA GNS 24841 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 65997532 65998101 65997899 Y HMGA2 RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 2883 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 66004084 66004433 66004259 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 9435 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 66008791 66009141 66009009 Y NA RP11-221N13.3 RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-221N13.3 14142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2,RPSAP52 NA NA NA NA RPSAP52 23936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RP11-366L20.3 53986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 66319590 66319707 66319630 Y IRAK3 RP11-366L20.3 NA NA NA NA RP11-366L20.3 20552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr12 69401246 69401453 69401353 Y RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM CPM CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 37896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 69418832 69418872 69418851 Y NUP107,SLC35E3,MDM2,YEATS4,FRS2,CPSF6 NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 55482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 69462130 69462730 69462407 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM IMR90 Hi-C 24141950 CPM 98780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 70382625 70382986 70382644 Y CCT2,CCT2,RAB3IP NA CNOT2,KCNMB4,PTPRB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT2 251788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 70648828 70649035 70648891 Y RAB3IP,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 13688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 70650618 70650832 70650694 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 15478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 71085208 71085379 71085280 Y NA NA NA NA NA NA KCNMB4 327152 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 72236663 72237026 72236820 Y NA TBC1D15 NA NA NA NA TBC1D15 5176 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 74257635 74257658 74257647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-81H3.2 536657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 75877380 75877665 75877492 Y GLIPR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 4920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 13357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76053870 76054229 76054024 Y NA NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 150454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76183993 76184325 76184134 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1,KRR1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 241387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 205760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr12 76329256 76329552 76329445 Y NA NA KRR1 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA1 96160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76337836 76338217 76338130 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr12 76345818 76345948 76345927 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 79764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 76347823 76348161 76347983 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 77551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 76373014 76373318 76373236 Y GLIPR1,PHLDA1 NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 52394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76414095 76414311 76414227 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 11401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 76751627 76751939 76751780 Y NA BBS10 NA NA NA NA BBS10 11405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 76949947 76950382 76950258 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 1207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 79670829 79671264 79670913 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 411613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 80305277 80305475 80305376 Y NA PPP1R12A NA NA NA NA PPP1R12A 21765 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 88692589 88692733 88692660 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 158516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 89529729 89530218 89529963 Y DUSP6 NA DUSP6,POC1B IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 214830 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 89575359 89575615 89575472 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,POC1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 169433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 89727563 89727887 89727725 Y ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 17161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 90123502 90123898 90123698 Y NA ATP2B1 NA NA NA NA ATP2B1 22425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr12 92446330 92446640 92446498 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 90709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 92458847 92459245 92459094 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 78104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA RP11-796E2.4 67153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 93805604 93805748 93805676 Y CRADD NUDT4,UBE2N NA NA NA NA UBE2N 28290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 94170549 94170892 94170731 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 101398 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 94178297 94178734 94178344 Y CRADD NA NA NA NA NA CRADD 109146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 138437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 95609786 95609977 95609896 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA VEZT 264 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 95840387 95840581 95840484 Y METAP2 METAP2 VEZT,FGD6 IMR90 Hi-C 24141950 METAP2 24715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96027120 96027372 96027186 Y LTA4H NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 NTN4 155558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA NTN4 134714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96438108 96438277 96438222 Y ELK3,LTA4H LTA4H NA NA NA NA LTA4H 2810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 96627830 96628313 96628063 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 41670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 96664847 96665248 96665048 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 78687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 97355714 97355975 97355919 Y NA NA NA NA NA NA NEDD1 56713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 99043983 99044295 99044139 Y NA IKBIP,APAF1 NA NA NA NA APAF1 7064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH NA NA NA NA NA NUP37 397706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 EID3 96042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA SLC41A2 284678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 105177272 105177383 105177327 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 173139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 106694592 106694855 106694698 Y NA TCP11L2,CKAP4 NA NA NA NA TCP11L2 885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 107001353 107001364 107001359 Y NA NA NA NA NA NA RIC8B 165009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 107638872 107639144 107639008 Y NA NA BTBD11 IMR90 Hi-C 24141950 CRY1 153265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG NA NA NA NA UNG 37197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 110315331 110315497 110315413 Y MYO1H,GLTP GLTP,TCHP NA NA NA NA GLTP 796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 111016111 111016444 111016311 Y PPTC7,ARPC3 PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA PPTC7 2681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 111019873 111020249 111019900 Y MYL2,ATP2A2,PPTC7 PPTC7,TCTN1 RAD9B IMR90 Hi-C 24141950 PPTC7 748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 112920682 112921011 112920993 Y NA NA NA NA NA NA RPL6 66040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 113652796 113652994 113652903 Y OAS1,OAS3,OAS2,SLC24A6,SDSL,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA TPCN1 3861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 920987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 117478325 117478369 117478352 Y NA NA NA NA NA NA TESC 56915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 117480044 117480441 117480323 Y TESC NA NA NA NA NA TESC 54843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 118795182 118795561 118795499 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA TAOK3 13189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 119632995 119633391 119633197 Y TMEM233 NA NA NA NA NA SNORA38 308626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr12 120675783 120676003 120675893 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 GCN1L1,RPLP0,LOC100506649 K562 ChIA-PET 22265404 PXN 25571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120700086 120700381 120700233 Y RAB35,PXN,PXN PXN,NME2P1,RNU4-2 NA NA NA NA PXN 1193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 120700935 120701192 120701121 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2 NA NA NA NA PXN 382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-2 825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 120967554 120967708 120967668 Y NA RNF10,COQ5,POP5 NA NA NA NA RNF10 1575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 121367131 121367281 121367257 Y NA SPPL3,RPL12P33 C12orf43,SPPL3,POP5 IMR90 Hi-C 24141950 RPL12P33 14583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 121581639 121581946 121581768 Y P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7 P2RX7 NA NA NA NA P2RX7 13017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 23540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 122224293 122224471 122224351 Y CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,SETD1B NA NA NA NA RHOF 14838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.68938549331759 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 123933894 123934077 123934000 Y C12orf65,RILPL2 RILPL2,SNRNP35 NA NA NA NA SNRNP35 6111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 124009741 124009949 124009845 Y NA RILPL1 NA NA NA NA RILPL1 6316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 124926088 124926324 124926239 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 123811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 22142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125049011 125049349 125049112 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 786 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 125110878 125111184 125111029 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 60743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr12 125259292 125259624 125259541 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 105590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125346086 125346324 125346188 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 18890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125404545 125404922 125404790 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 4631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 12507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr12 131249995 131250369 131250318 Y NA NA NA NA NA NA STX2 71442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr12 133021534 133022956 133022670 Y POLE,DDX51,FBRSL1 FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FBRSL1 41181 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA ZNF605 NA NA NA NA ZNF605 2535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 20555489 20555876 20555683 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 24679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 31088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 20704420 20704798 20704605 Y NA GJA3 NA NA NA NA GJA3 28390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 20711185 20711522 20711354 Y NA GJA3 NA NA NA NA GJA3 21666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 20993930 20994321 20994126 Y NA NA NA NA NA NA CRYL1 103675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 21127500 21127725 21127613 Y CRYL1,IL17D CRYL1,IFT88 CRYL1,IFT88,IL17D,N6AMT2 IMR90 Hi-C 24141950 IFT88 10860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 21632492 21632727 21632640 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 22111458 22111566 22111512 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 79949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 22249979 22250230 22250030 Y NA RPS7P10,FGF9 NA NA NA NA FGF9 6457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 23458655 23458830 23458775 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 189942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 23485782 23486124 23485811 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P7 217069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA NA MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SACS 127281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr13 24289001 24289462 24289192 Y PCOTH NA NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 171566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 24423021 24423155 24423076 Y NA C1QTNF9B-AS1,MIPEP NA NA NA NA C1QTNF9B-AS1 37873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH NA SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEP 66738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIPEP 261369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 24854044 24854200 24854080 Y PARP4 NA NA NA NA NA PARP4 230748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 25115809 25116061 25115886 Y RNF17 PARP4 NA NA NA NA PARP4 30861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 26475840 26476144 26475975 Y CDK8 NA NA NA NA NA RNF6 318647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 26948386 26948578 26948482 Y NA NA NA NA NA NA CDK8 122110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,SNORD102,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr13 28167075 28167372 28167253 Y NA LNX2,POLR1D NA NA NA NA LNX2 25169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 30060513 30060580 30060547 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A1 107245 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 31308709 31309017 31308774 Y USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP ALOX5AP NA NA NA NA ALOX5AP 1064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 31619955 31620221 31620066 Y ALOX5AP NA TEX26-AS1,USPL1,ALOX5AP,HSPH1,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HSPH1 114304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 32470605 32470630 32470618 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 51627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 32664585 32664831 32664706 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 222780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 32956405 32956487 32956432 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 68794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr13 34296005 34296236 34296099 Y NA NA STARD13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RFC3 93950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 34653156 34653775 34653442 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 262970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 37881013 37881265 37881086 Y POSTN NA LINC00547 IMR90 Hi-C 24141950 ALG5 308615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr13 40677084 40677323 40677230 Y NA NA NA NA NA NA COG6 449320 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 40738384 40738430 40738407 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 500304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41175520 41175699 41175610 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 63035 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41187555 41187952 41187790 Y ELF1,ELF1,FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 50782 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41226066 41226446 41226348 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 12288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41560539 41560879 41560717 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1P3 66629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41581586 41581700 41581679 Y NA NA NA NA NA NA WBP4 51710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 42222511 42222753 42222632 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 339170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA NAA16 385716 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 42370920 42370928 42370925 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 473361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 43467454 43467751 43467677 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 127588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 43952045 43952412 43952203 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 356706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 605541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44765408 44765809 44765737 Y NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 383474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44811516 44811943 44811701 Y NA NA TSC22D1,SERP2,NUFIP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TSC22D1 337340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44818555 44818615 44818583 Y C13orf31,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2,LINC00284 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TSC22D1 330668 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44845135 44845603 44845341 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,TSC22D1,NUFIP1,LINC00284 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 303680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 44846792 44847050 44846982 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 302233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 44848357 44848873 44848719 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 300410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44866763 44867044 44866942 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA NUFIP1,TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 282239 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 44875300 44875802 44875641 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 273481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.64589284343697 chr13 44882133 44882330 44882202 Y NA NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 266953 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 44884974 44885381 44885134 Y CCDC122,TSC22D1 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 263902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr13 44887042 44887399 44887172 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 261884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr13 45338378 45338728 45338554 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1,LINC00330 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 189095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 45496701 45496835 45496770 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP1 64783 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 45629728 45629998 45629866 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 62652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 46869807 46870189 46870040 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA LCP1 85801 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 SUCLA2-AS1 109006 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 49563041 49563333 49563220 Y RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 14993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13 NA NA NA NA TRIM13 29452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50675373 50675756 50675618 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 21066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50696626 50696754 50696746 Y NA DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU2 1102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50715348 50715462 50715407 Y NA DLEU2 DLEU7,DLEU2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DLEU2 17492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 51034237 51034585 51034411 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 100338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 51641920 51642198 51642053 Y INTS6 NA NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 159072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 52009334 52009441 52009388 Y NA RPS4XP16,INTS6 NA NA NA NA RPS4XP16 16859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 52218212 52218391 52218309 Y NA NA NA NA NA NA WDFY2 61568 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 52220633 52220708 52220687 Y INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 63989 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 52769647 52769861 52769811 Y NA NEK3 NA NA NA NA NEK3 37651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 52923212 52923413 52923314 Y NA NA THSD1 IMR90 Hi-C 24141950 VPS36 99350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 60033102 60033487 60033176 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 702634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 2053037 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 64536046 64536314 64536270 Y NA NA NA NA NA NA TDRD3 3567455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA DACH1 4977604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 73985614 73985783 73985667 Y NA NA NA NA NA NA FABP5P1 312491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr13 74184794 74185193 74184838 Y NA NA PIBF1 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5P1 511671 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 74276580 74276751 74276632 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 429643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 75933518 75933672 75933595 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 120578 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 75939887 75940324 75940051 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 113926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 76159377 76159493 76159435 Y NA COMMD6,UCHL3,LMO7 NA NA NA NA LMO7 33077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr13 76290964 76291186 76291007 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 98394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr13 76336754 76337033 76336914 Y COMMD6,LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 144184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 77519546 77519717 77519632 Y NA RPL7P44,CLN5 NA NA NA NA RPL7P44 34334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 78090399 78090658 78090529 Y NA SCEL NA NA NA NA SCEL 17151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr13 78227370 78227383 78227376 Y NA SLAIN1 NA NA NA NA SLAIN1 42640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 80412301 80412453 80412388 Y NA NA NA NA NA NA NDFIP2 359014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 80611659 80611975 80611764 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 301111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 80705470 80705610 80705560 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 207476 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 80822359 80822707 80822533 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 90379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 80916799 80917232 80917156 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr13 90486324 90486483 90486404 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 1511591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 92294972 92294984 92294978 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 296898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 92871734 92872145 92872019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 161637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 92874267 92874578 92874398 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 164170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 92900985 92901044 92901015 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 190888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 93001340 93001722 93001531 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 291243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 93083293 93083662 93083475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 373196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 93096966 93097333 93097096 Y NA NA NA NA NA NA RNU4ATAC3P 386869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 93361116 93361155 93361136 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 515940 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 94891482 94891695 94891602 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 354816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 94913778 94913870 94913813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 332641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 96424038 96424083 96424061 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 96645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 97188079 97188190 97188135 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 484343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr13 99772014 99772367 99772137 Y GPR18 DOCK9 MIR548AN,UBAC2 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK9 35135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 99934888 99935365 99935021 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 22294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 99935844 99936009 99935907 Y GPR183 GPR183 NA NA NA NA GPR183 21650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA GPR183 NA NA NA NA GPR183 33863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA GPR183 55832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 100306063 100306155 100306109 Y NA CLYBL NA NA NA NA CLYBL 49144 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 101075706 101076016 101075848 Y NA NA NA NA NA NA TMTC4 249331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 106803810 106804031 106803901 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 222880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 106808885 106809142 106808998 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 217769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 107173594 107173915 107173796 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 44597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 107182699 107183083 107182911 Y EFNB2 ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 35429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 109115794 109116062 109115942 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 ABHD13 247067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 109576446 109576812 109576641 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 707719 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 109847392 109847697 109847628 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 557918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 109852673 109853050 109852860 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 552565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 110337257 110337548 110337429 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 68067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 110493008 110493234 110493120 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 56093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 110521819 110522258 110522077 Y NA NA MYO16,IRS2,COL4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 84904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr13 110631754 110631774 110631764 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 194839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 110790027 110791241 110790617 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 164918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 110950675 110951614 110951198 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A2 4545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 111040636 111040786 111040716 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 83140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 111616634 111616920 111616701 Y NA NA LINC00346,ING1,ANKRD10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD10 51218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr13 113393010 113393289 113393150 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 50367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 113549464 113549664 113549543 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 71474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 113661985 113662203 113662095 Y NA MCF2L-AS1 F10,F7 IMR90 Hi-C 24141950 MCF2L-AS1 40847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 113677034 113677374 113677296 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 55896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.27945377183786 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A NA PROZ IMR90 Hi-C 24141950 CUL4A 53642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114065698 114065892 114065794 Y MCF2L,ADPRHL1 GRTP1 NA NA NA NA GRTP1 49252 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 114127046 114127213 114127130 Y GRTP1,DCUN1D2 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 16054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.652058800955 chr13 114263717 114263872 114263757 Y DCUN1D2,TMCO3 TFDP1 NA NA NA NA TFDP1 26704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 114270892 114271213 114271013 Y DCUN1D2,TMCO3 TFDP1 NA NA NA NA TFDP1 33879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114301802 114302224 114301872 Y GAS6 NA NA NA NA NA TFDP1 64789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114462767 114463040 114462971 Y FAM70B NA NA NA NA NA GAS6 102006 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114565478 114566323 114565869 Y GAS6,GAS6,GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 432 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr13 114743258 114743566 114743511 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 152520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114890433 114890784 114890662 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 5302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr13 114927536 114927629 114927597 Y RASA3 RASA3 RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA3 31450 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 21660147 21660368 21660311 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPC 75285 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 23158454 23158656 23158578 Y SLC7A7 CTD-2555K7.1 DAD1,OXA1L,SLC7A7,ABHD4,REM2,LRP10 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2555K7.1 3088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 23320228 23321035 23320800 Y RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 16462 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 24006568 24006872 24006716 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 16344 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 24016944 24017157 24017064 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 6059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 34774 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 24934340 24934390 24934365 Y NA KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA SDR39U1 24229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 27311220 27311475 27311345 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 246260 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 31559968 31560471 31560185 Y SCFD1,GPR33,STRN3 NA NA NA NA NA STRN3 66361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 31698850 31699225 31699035 Y STRN3 HECTD1 AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 23840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 32976944 32977104 32977024 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 24938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 34162040 34162301 34162172 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 767261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 35666202 35666508 35666414 Y BAZ1A,FAM177A1,NFKBIA NA NA NA NA NA KIAA0391 76447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 35805683 35806194 35806003 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 50081 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 35853509 35853868 35853721 Y FAM177A1,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA RP11-561B11.1 2407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 37445830 37445969 37445900 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 194102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 38054173 38054544 38054319 Y NA FOXA1 NA NA NA NA FOXA1 12701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 40868175 40868547 40868288 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 968471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 42297588 42297942 42297766 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2397884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 45721298 45721397 45721336 Y KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1 MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr14 45723245 45723364 45723320 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 2502 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA C14orf182 NA NA NA NA C14orf182 32371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D C14orf182 NA NA NA NA C14orf182 3392 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 50511824 50512400 50511896 Y RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182 C14orf182 C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C14orf182 39586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 50648447 50648735 50648723 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 47541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 50988191 50988449 50988343 Y NA MAP4K5 NA NA NA NA MAP4K5 37395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 51142431 51142560 51142495 Y NA SAV1 ATL1,SAV1,CDKL1,NIN,PYGL IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAV1 9382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 RP11-255G12.3 LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-255G12.3 3789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 52547300 52547782 52547649 Y NA NA NID2,C14orf166,TXNDC16 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 93107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr14 55109619 55109800 55109713 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 77804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 55538737 55539349 55538846 Y FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 22388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 55544097 55544118 55544108 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 55544307 55544654 55544518 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr14 55564563 55564801 55564723 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L MAPK1IP1L,LGALS3 LGALS3,DLGAP5 IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 24027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr14 55574465 55575376 55574639 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 13452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 57047832 57047974 57047932 Y PELI2,C14orf101 NA NA NA NA NA PELI2 465300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 57227025 57227386 57227204 Y C14orf101,OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 506340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 PRKCH SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 39952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 61652622 61652735 61652681 Y NA PRKCH SLC38A6,SIX4,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 61822624 61823005 61822699 Y PRKCH RP11-902B17.1 NA NA NA NA RP11-902B17.1 35088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 61904242 61904399 61904321 Y NA NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 116706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-902B17.1 181993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 62130240 62130667 62130544 Y HIF1A HIF1A,HIF1A-AS1 NA NA NA NA HIF1A 29564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64180685 64181078 64180882 Y NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 11679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64324216 64324732 64324422 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 6533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64584533 64584935 64584736 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 218382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64718005 64718040 64718032 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 85277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 64720777 64720916 64720847 Y NA NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 82401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 65231601 65231863 65231701 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 62781 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 65512172 65512469 65512321 Y NA NA NA NA NA NA MAX 54944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 67809024 67809296 67809169 Y RDH12,MPP5,PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 15418 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 67998625 67999040 67998762 Y NA PLEKHH1 NA NA NA NA PLEKHH1 607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 68644384 68644906 68644390 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 242007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 68884830 68884917 68884875 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 1996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69013502 69013901 69013730 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 126589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69014304 69014714 69014453 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 127391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr14 69014972 69015327 69015083 Y ACTN1 NA NA NA NA NA PPIAP6 128059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69022058 69022216 69022137 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2325P2.3 128066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69169939 69170184 69170014 Y NA CTD-2325P2.3 ZFP36L1,RAD51B IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2325P2.3 19657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69251306 69251504 69251405 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 9686 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69851262 69851639 69851451 Y NA SLC39A9,ERH NA NA NA NA SLC39A9 11093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 69913588 69913836 69913761 Y NA NA NA NA NA NA ERH 50244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 70020113 70020453 70020282 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0247 55860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 70110235 70110559 70110279 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 33922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 70152055 70152259 70152141 Y KIAA0247,SRSF5,SRSF5 SRSF5 NA NA NA NA SRSF5 39358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 70464665 70464959 70464731 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 145817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 71022218 71022570 71022394 Y ADAM20 MED6 NA NA NA NA MED6 42814 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 71109519 71109752 71109636 Y MED6,TTC9 MED6,TTC9 NA NA NA NA TTC9 3015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 71164534 71164679 71164625 Y MED6 RP6-65G23.1 NA NA NA NA RP6-65G23.1 1119 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 SIPA1L1 11927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 73585185 73585324 73585255 Y NA PSEN1 NA NA NA NA PSEN1 15802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 73931867 73932085 73931964 Y NA RP1-240K6.3,NUMB,C14orf169 NA NA NA NA NUMB 3519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 74224542 74224784 74224663 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45414 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 74224982 74225468 74225101 Y NA PNMA1 NA NA NA NA PNMA1 45854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 74607211 74607609 74607410 Y NA NA VSX2 IMR90 Hi-C 24141950 LIN52 57712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 75033495 75033781 75033700 Y NA LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 43525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 38286 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF LTBP2,CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 5059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 75087327 75087770 75087539 Y PGF,EIF2B2,LTBP2 LTBP2,CTD-2207P18.2 YLPM1,NPC2,ISCA2,LTBP2,KIAA0317,FCF1 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2207P18.2 5977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 75448208 75448549 75448379 Y NA PGF,EIF2B2 MLH3,ZC2HC1C,NEK9,PGF,EIF2B2,ACYP1,RPS6KL1,DLST IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF2B2 19065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 2790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 75764194 75764310 75764255 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 5087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 76002139 76002648 76002337 Y FOS,BATF BATF,FLVCR2 NA NA NA NA BATF 15371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 76243945 76244101 76244023 Y TGFB3 NA NA NA NA NA C14orf1 118413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 76342346 76342569 76342455 Y BATF,TGFB3 IFT43 TGFB3 IMR90 Hi-C 24141950 IFT43 23910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 77422240 77422571 77422458 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL RP11-7F17.7,RP11-7F17.1 IRF2BPL,KIAA1737 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.7 1410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 78121399 78121579 78121501 Y NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 40283 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 80161976 80161991 80161984 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 1261870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr14 86053629 86053936 86053651 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2341M24.1 345118 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 87930298 87930498 87930398 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1152H15.1 406137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 89493430 89493694 89493607 Y NA NA EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8 IMR90 Hi-C 24141950 TTC8 204933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 201352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 91454457 91454803 91454684 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 69874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA5 158324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 92446493 92446853 92446680 Y SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3 NA NA NA NA NA TRIP11 58387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 92451454 92451633 92451538 Y SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3 NA NA NA NA NA TRIP11 53607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 93698124 93698181 93698153 Y NA MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 95946356 95946810 95946552 Y NA NA NA NA NA NA GLRX5 51030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 97647218 97647514 97647331 Y NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 385577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 99726837 99727734 99727584 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 217482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 100804523 100804880 100804765 Y NA SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 26085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 100807709 100808060 100808026 Y WDR25,WDR25,WARS,WARS SLC25A29,RP11-638I2.10,WDR25,WARS NA NA NA NA RP11-638I2.10 22905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 101020509 101020866 101020628 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN NA NA NA NA NA WARS 179367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA NA NA NA NA NA WARS 188653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA NA NA NA NA NA SNORD114-19 280944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr14 101454914 101455185 101454975 Y DLK1,RTL1 SNORD114-19 NA NA NA NA SNORD114-19 14100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 101539526 101539734 101539702 Y NA NA NA NA NA NA SNORD114-19 98712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C RP11-1029J19.5,PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102292259 102292630 102292392 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 66124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 102544859 102545271 102545048 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 58569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102971480 102971658 102971568 Y NA ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 2478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 102993844 102994139 102994010 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANKRD9 19708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 102997284 102997579 102997375 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 MIR4309,RCOR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 23148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr14 103828242 103828602 103828384 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 EIF5,MARK3 NA NA NA NA MARK3 21127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 103889614 103889901 103889771 Y TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3 MARK3 NA NA NA NA MARK3 39885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1 NA NA NA NA RP11-982M15.6 528 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105368048 105368162 105368106 Y NA NA NA NA NA NA AHNAK2 74532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105433766 105434012 105433864 Y KIAA0284,JAG2,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8682 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr14 105435117 105435479 105435281 Y KIAA0284 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 7215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105438668 105438757 105438725 Y KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA AHNAK2 3937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105537136 105537487 105537333 Y NA NA AHNAK2,GPR132 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA4 51651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 105625647 105625988 105625853 Y NA JAG2,NUDT14 NA NA NA NA JAG2 7173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 106324206 106324758 106324477 Y TEX22 NA NA NA NA NA C14orf80 370014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA C14orf80 1298739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 22927527 22927784 22927666 Y CYFIP1 CYFIP1 NA NA NA NA CYFIP1 37522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 25608093 25608225 25608159 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 73903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 25624061 25624357 25624209 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 57771 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 25625771 25626455 25625879 Y SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 55673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 28494622 28494982 28494802 Y NA NA NA NA NA NA RPL41P2 63816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 31215782 31215951 31215851 Y FAN1,FAN1,MTMR10 FAN1 NA NA NA NA FAN1 21727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 34597819 34597943 34597881 Y NA SLC12A6,NOP10 NA NA NA NA SLC12A6 30318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 34983371 34983524 34983448 Y NA NA AQR,ZNF770 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA8A,GOLGA8B 104667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 35788754 35789006 35788880 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 510266 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 35803904 35804280 35804092 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 525416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 37278170 37278456 37278428 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 113048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr15 38814347 38814382 38814365 Y C15orf53,RASGRP1 RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 41394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 38820654 38820765 38820702 Y NA RASGRP1 NA NA NA NA RASGRP1 35011 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 39420923 39421276 39421056 Y NA NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 450004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 421205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 39668694 39669075 39668948 Y NA NA THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 202205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 39921500 39921920 39921800 Y NA NA NA NA NA NA THBS1 50220 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 40803808 40804249 40803896 Y NA CHST14,RP11-64K12.1 NA NA NA NA RP11-64K12.1 32294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 41264604 41264924 41264664 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 21444 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 41741039 41741403 41741222 Y NA NDUFAF1,RTF1,ITPKA NA NA NA NA ITPKA 42188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr15 42083275 42083582 42083459 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA MAPKBP1 18643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 42232566 42232958 42232887 Y EHD4 EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 29818 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 42327713 42327843 42327787 Y MAPKBP1,PLA2G4B NA EHD4 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 64937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 42463402 42463616 42463499 Y EHD4 VPS39 NA NA NA NA VPS39 34898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 42833928 42834273 42834101 Y NA LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 4727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 43361299 43361456 43361377 Y TP53BP1 UBR1 NA NA NA NA UBR1 34855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44073726 44074107 44073917 Y NA PDIA3,CATSPER2P1,SERF2,ELL3,MFAP1,WDR76 NA NA NA NA ELL3 5985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44186295 44186523 44186409 Y NA NA NA NA NA NA WDR76 69134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44760894 44761150 44760908 Y NA CTDSPL2 NA NA NA NA CTDSPL2 43462 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44901910 44902120 44902015 Y NA NA NA NA NA NA SPG11 51756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 45004703 45005017 45004887 Y CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 45340934 45341315 45341066 Y SPG11,B2M,SPATA5L1 SORD NA NA NA NA SORD 27632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 45737363 45738279 45737765 Y SQRDL,PLDN,SPATA5L1,C15orf48 SPATA5L1,RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 48687688 48687982 48687829 Y FBN1 NA NA NA NA NA RP11-154J22.1 65635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 48975243 48975418 48975260 Y NA NA FBN1,SHC4,CEP152 IMR90 Hi-C 24141950 CEP152 125925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 49598906 49599159 49599033 Y NA NA NA NA NA NA COPS2 153048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 50358473 50358749 50358576 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 113644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 50633863 50634132 50634006 Y ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1 GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 11393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr15 51173397 51173629 51173520 Y USP8,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr15 51358266 51358334 51358300 Y GLDN TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 37139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 51481875 51482198 51481995 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 86402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 51595036 51595426 51595331 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 199563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 51598187 51598615 51598465 Y CYP19A1 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 202714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 51911355 51912275 51911714 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 52148809 52148818 52148812 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 28984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 52545063 52545254 52545150 Y MAPK6 MYO5C NA NA NA NA MYO5C 40741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 53010328 53010576 53010452 Y NA NA MYO5C,FAM214A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARPP19 150248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 53034525 53034782 53034651 Y NA NA NA NA NA NA ARPP19 174445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 55095328 55096039 55095750 Y RAB27A,RSL24D1 NA NA NA NA NA RSL24D1 391226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 55487267 55487658 55487506 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 2 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 55571935 55572134 55572019 Y RAB27A,PIGB PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 37024 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 56331775 56332089 56331933 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 47831 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 229958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 57465140 57465369 57465208 Y ZNF280D,TCF12 NA LOC283663 IMR90 Hi-C 24141950 TCF12 256319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 58761932 58762090 58762054 Y NA NA ADAM10 IMR90 Hi-C 24141950 ADAM10 278087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 154856 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59023904 59024166 59024035 Y RNF111 ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 16011 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59467276 59467383 59467330 Y ADAM10,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 71999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 59478138 59478489 59478268 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 82861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59566542 59566544 59566543 Y MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 96348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 59587320 59587393 59587357 Y NA NA NA NA NA NA FAM81A 75499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59592534 59592835 59592690 Y BNIP2,RNF111,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 70057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr15 59646649 59647004 59646975 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 15888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59649595 59649770 59649683 Y NA FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1 NA NA NA NA FAM81A 13122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59848106 59848258 59848124 Y GCNT3 RP11-112N19.2 NA NA NA NA RP11-112N19.2 4814 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 59862569 59862935 59862765 Y NA RP11-112N19.2 NA NA NA NA RP11-112N19.2 19277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 60757802 60757969 60757886 Y NA NARG2,RP11-219B17.1 NA NA NA NA NARG2 11390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 60835043 60835413 60835301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 65666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 62411576 62411892 62411783 Y NA NA NA NA NA NA C2CD4A 54400 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63034731 63035286 63034964 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 208086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63296233 63296451 63296342 Y NA TPM1 NA NA NA NA TPM1 36380 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 63439577 63439949 63439764 Y NA LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 8271 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63602976 63602991 63602984 Y NA NA NA NA NA NA CA12 69369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63664402 63664810 63664706 Y LACTB,CA12 CA12 NA NA NA NA CA12 7550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63792570 63793348 63792650 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 1445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.55274158615768 chr15 64385169 64385477 64385384 Y NA DAPK2,FAM96A,SNX1 NA NA NA NA SNX1 847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 64722485 64722825 64722650 Y NA KIAA0101,TRIP4,ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 28116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 NA NA NA NA NA OAZ2 72252 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 65189466 65189943 65189728 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 NA SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHO2 57378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 65403116 65403434 65403296 Y ANKDD1A,PDCD7 PDCD7 UBAP1L,KBTBD13,OSTBETA,RASL12 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD7 20740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 65589242 65589632 65589437 Y NA RNU5A-1,PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 1324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 65716164 65716565 65716475 Y NA NA NA NA NA NA DPP8 91477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 66870695 66870962 66870743 Y MAP2K1 NA ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6 IMR90 Hi-C 24141950 RPL4 55825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA RPS24P16 79620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 67467751 67468085 67467918 Y NA NA NA NA NA NA RPS24P16 54699 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 33898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 RPS24P16 NA NA NA NA RPS24P16 32338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA RPS24P16,IQCH,AAGAB NA NA NA NA RPS24P16 5919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 67716264 67716618 67716446 Y NA NA NA NA NA NA C15orf61 94788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67867550 67867820 67867663 Y NA MAP2K5 NA NA NA NA MAP2K5 34503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 68176779 68177152 68176934 Y NA NA PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4 IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 167365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 69063538 69063566 69063553 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 44994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 69114506 69114876 69114758 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA ANP32A 3270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 69650842 69650990 69650924 Y NA NA NA NA NA NA KIF23 53595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 69771851 69772087 69771969 Y NA RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 28728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 69948905 69949301 69949066 Y NA NA TLE3,C15orf50,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 205782 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70006588 70006856 70006758 Y TLE3 NA C15orf50,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 263465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70391261 70391735 70391557 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 2746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr15 70392397 70392607 70392502 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 70679327 70679587 70679457 Y NA NA NA NA NA NA TLE3 290812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 70785060 70785587 70785260 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 268345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 70787270 70787553 70787302 Y TLE3 NA TLE3,KIF23,LOC145837,C15orf50,UACA,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 266379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70797214 70797333 70797235 Y TLE3 NA TLE3,KIF23,RPLP1 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 256599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 70801545 70802091 70801763 Y TLE3 NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 251841 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70850665 70850865 70850772 Y NA NA KIF23 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 203067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 70877631 70877741 70877691 Y NA NA UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 176191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 71126164 71126470 71126369 Y NA LRRC49,LARP6 NA NA NA NA LRRC49 17108 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 71409431 71409745 71409525 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 226307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 72041767 72041974 72041871 Y SENP8 NA NA NA NA NA SENP8 362625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 72124774 72125030 72124885 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 279569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 72318611 72318818 72318715 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 85781 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 GRAMD2 NA NA NA NA GRAMD2 30488 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 73488522 73488835 73488645 Y NA NA NA NA NA NA NEO1 146471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 73926570 73926835 73926736 Y PML NPTN,CD276 C15orf60 IMR90 Hi-C 24141950 NPTN 2095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr15 74346326 74346621 74346416 Y NA NA NA NA NA NA PML 61312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA PML 127979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74677413 74677899 74677622 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A SEMA7A K562 ChIA-PET 22265404 SEMA7A 46909 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr15 74688835 74689193 74688950 Y SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74689389 74689592 74689450 Y SEMA7A,SEMA7A SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 35216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74693129 74693507 74693351 Y SEMA7A,SEMA7A,ARID3B SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 31301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74693719 74694069 74694004 Y NA SEMA7A NA NA NA NA SEMA7A 30739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 74801015 74801389 74801202 Y NA UBL7,ARID3B NA NA NA NA ARID3B 30129 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 75328661 75328897 75328778 Y MAN2C1,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 14765 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 75460054 75460405 75460311 Y NA C15orf39 SCAMP5,PPCDC,C15orf39 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 25579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.41609767899777 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 75939210 75939595 75939262 Y NA SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4 NA NA NA NA CSPG4 47614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 76543637 76543996 76543963 Y NA NA C15orf27 IMR90 Hi-C 24141950 ETFA 57817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 77785821 77785911 77785867 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 75067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 78356048 78356390 78356219 Y NA TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 11676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 79280826 79281229 79281127 Y CTSH CTSH NA NA NA NA CTSH 40910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 79635470 79635474 79635472 Y NA TMED3 NA NA NA NA TMED3 34066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 80194397 80194544 80194472 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 6676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 80881213 80881527 80881378 Y MESDC1 NA NA NA NA NA KIAA1199 188157 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr15 81069569 81069760 81069666 Y MESDC1,KIAA1199 NA NA NA NA NA KIAA1199 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81099060 81099288 81099113 Y NA KIAA1199 NA NA NA NA KIAA1199 29376 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81156027 81156230 81156065 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1199 86343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81197356 81197718 81197537 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 82501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81219891 81220152 81220022 Y STARD5 NA NA NA NA NA MESDC2 60067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 81291796 81292315 81292076 Y NA MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 83817881 83818018 83817954 Y NA NA NA NA NA NA BTBD1 83775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 85361646 85361991 85361963 Y ALPK3 ALPK3 NA NA NA NA ALPK3 3735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 85725231 85725336 85725284 Y NA NA NA NA NA NA AKAP13 196466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 85951204 85951442 85951357 Y AKAP13,PDE8A,AKAP13 AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 29402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr15 86130202 86130404 86130208 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 205857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 86131454 86131632 86131493 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 204629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 86267591 86267810 86267701 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 86337060 86337529 86337372 Y NA KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 89027924 89028249 89027989 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 19240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA POLG 129754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 90419728 90419914 90419806 Y ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 15660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA NA NA NA NA NA C15orf38 93730 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 90708840 90709227 90709106 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 7004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 90955763 90956502 90956124 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 26313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 91412875 91413318 91412960 Y IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES FURIN,MAN2A2 NA NA NA NA FURIN 3053 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 93344993 93345488 93345070 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 69568 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-386M24.4 71631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 NA ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 CHD2 60372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD2 48928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 93424689 93424786 93424732 Y CHD2 CHD2 NA NA NA NA CHD2 163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 96103160 96103444 96103266 Y NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 763723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr15 96886247 96886633 96886548 Y NA NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 19080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 33020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2 NA NA NA NA NR2F2 33341 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 98047383 98047776 98047510 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 413008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99394824 99395158 99395067 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 204624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99395486 99396002 99395689 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 205286 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99411740 99412504 99411960 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 221540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99559007 99559192 99559062 Y NA NA PGPEP1L MCF7 ChIA-PET 22265404 SYNM 77228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99661093 99661479 99661184 Y NA SYNM NA NA NA NA SYNM 24673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD4 379529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 101711330 101711507 101711419 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 78630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 130955 131250 131103 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 5949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 374933 375274 375175 Y RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 25399 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 377235 377950 377755 Y SOLH,RHOT2,NHLRC4,AXIN1,LUC7L AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 22723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.55274158615768 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 NA NA NA NA NA SOX8 102499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr16 1133120 1133226 1133175 Y RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5 NA NA NA NA NA SOX8 103312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr16 2065446 2065768 2065545 Y NA TBL3,GFER,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 RAB26 MCF7 ChIA-PET 22265404 NPW 7519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 2743231 2743530 2743363 Y NA ERVK13-1,KCTD5 NA NA NA NA KCTD5 12755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2 NA NA NA NA ZG16B 7591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 2910811 2910988 2910899 Y ZNF200,ZNF200,ZNF200,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,PDPK1,SRRM2 ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 NA NA NA NA PRSS22 4640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRSS22 11760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 3202363 3202472 3202417 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 24585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 3221173 3221513 3221502 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 43395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 4102835 4103049 4102865 Y CORO7 NA NA NA NA NA ADCY9 61137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 4349200 4349352 4349284 Y NA TFAP4 ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 28124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 4587360 4587817 4587427 Y HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5 NMRAL1 NA NA NA NA NMRAL1 43596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500 NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPL 15012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 7355051 7355694 7355418 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1357846 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 8726526 8727136 8726655 Y USP7,C16orf72,METTL22 METTL22 NA NA NA NA METTL22 12986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 8950746 8950997 8950816 Y NA CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 9869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 9171086 9171431 9171335 Y C16orf72,USP7 C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 12074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 10922717 10923252 10923012 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 45803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 10926179 10926902 10926382 Y NA CIITA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 CIITA 42153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 10965041 10965252 10965110 Y NUBP1,SOCS1,CIITA CIITA NA NA NA NA CIITA 3803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 11277053 11277355 11277217 Y LITAF NA NA NA NA NA RMI2 64121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 11946483 11946539 11946512 Y NA RSL1D1 NA NA NA NA RSL1D1 3041 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 11955170 11955449 11955310 Y NA RSL1D1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 11728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 14423320 14423633 14423477 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 14603035 14603210 14603110 Y NA NA NA NA NA NA PARN 121375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 15583408 15583655 15583541 Y NDE1,C16orf45 NA KIAA0430 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf45 57256 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 16097959 16098303 16098187 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 56525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 20908672 20908960 20908809 Y CRYM,LYRM1,DCUN1D3 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 230 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 22211037 22211162 22211126 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 EEF2K 4441 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 24619135 24619479 24619307 Y SLC5A11 NA TNRC6A,RBBP6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP6 72121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 24855986 24856230 24856033 Y NA NA NA NA NA NA TNRC6A 116970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 24863023 24863279 24863154 Y NA NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 124007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 27737057 27737407 27737240 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0556 177603 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 28108728 28108802 28108745 Y APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 112439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 29283104 29283213 29283156 Y SPNS1 NA NA NA NA NA SPNS1 299562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 29954900 29955228 29955066 Y NA SEZ6L2,ASPHD1,KCTD13,TMEM219,TAOK2,INO80E MVP,KCTD13,ZG16,PRRT2,MAZ,KIF22,C16orf54,LOC440356,ASPHD1,SEZ6L2,CDIPT,TMEM219,TAOK2,HIRIP3,INO80E,ALDOA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM219 4694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 30458943 30459145 30459094 Y SEPHS2 ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SEPHS2 3441 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr16 30713870 30713962 30713916 Y NA FBRS,SRCAP,PHKG2 NA NA NA NA SRCAP 6340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 30994228 30994553 30994360 Y VKORC1,HSD3B7 ORAI3,SETD1A,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 31139989 31140736 31140371 Y ARMC5,PRR14,FBRS,PHKG2,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,FUS NA NA NA NA PRSS8 4347 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 31887367 31887596 31887374 Y NA ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 4288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 46683529 46683842 46683691 Y NA SHCBP1,VPS35,ORC6 NA NA NA NA SHCBP1 29991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 47176557 47176930 47176742 Y NETO2 NETO2 NA NA NA NA NETO2 649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 47765433 47765682 47765558 Y NA NA ITFG1,ABCC12,NETO2,ABCC11,DNAJA2,PHKB IMR90 Hi-C 24141950 ITFG1 269373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 47974477 47974681 47974602 Y NA NA ABCC12,ITFG1 IMR90 Hi-C 24141950 LONP2 301526 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 47999365 47999586 47999511 Y NA NA ITFG1,NETO2,ABCC12 IMR90 Hi-C 24141950 LONP2 276621 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 48631315 48631363 48631339 Y NA N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 20696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 49056369 49056621 49056485 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 404310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 50313130 50313496 50313255 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 35082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 50424981 50425490 50425226 Y NKD1 BRD7 NA NA NA NA BRD7 24136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 51909181 51909528 51909355 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 231514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 53095278 53095286 53095282 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 8333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 56406318 56406482 56406386 Y NA NA NA NA NA NA AMFR 50968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 56640479 56640669 56640573 Y NA MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 56813469 56813757 56813613 Y NA NA MIR138-2 IMR90 Hi-C 24141950 NUP93 51452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 57350531 57350815 57350676 Y NA PLLP,CCL22 CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17 IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 33932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 58492451 58492829 58492668 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 54554 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 58493284 58493520 58493447 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 53863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA SETD6 NA NA NA NA SETD6 8570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 63294066 63294457 63294335 Y NA NA NA NA NA NA LINC00920 3145970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66555983 66556387 66556198 Y CKLF TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1 NA NA NA NA TK2 28060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66719308 66719396 66719350 Y NA CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 9214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA RRAD,FAM96B,CES2 NA NA NA NA CES2 21759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 67345616 67346198 67345888 Y RRAD,CBFB,FAM65A,FHOD1,PLEKHG4 PLEKHG4 NA NA NA NA PLEKHG4 36203 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 67538327 67538734 67538468 Y NA ATP6V0D1,FAM65A AGRP,TSNAXIP1,GFOD2,RANBP10,PSKH1,CTCF,RLTPR,CTRL IMR90 Hi-C 24141950 FAM65A 11587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 4999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr16 69444205 69444538 69444372 Y NA TERF2,CYB5B NFAT5,CYB5B,TERF2,COG8,NIP7,TMED6,MIR1538,NQO1,WWP2,NOB1 IMR90 Hi-C 24141950 TERF2 3731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 69761641 69762033 69761837 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 2787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 70464772 70465160 70465031 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 5980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 70749058 70749400 70749223 Y NA MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 31089 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 71046758 71046771 71046763 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 213694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 71828659 71828769 71828714 Y NA SNORD71,AP1G1,ATXN1L,IST1 NA NA NA NA AP1G1 12335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 72671878 72672163 72672013 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 419434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 72897745 72898023 72897884 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 193574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 73099840 73099940 73099875 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 8243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 73102955 73103191 73103082 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 11358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 74772099 74772485 74772392 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 34244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 31619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr16 75283958 75284369 75284078 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 15582 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 75410566 75410863 75410755 Y BCAR1 NA NA NA NA NA CFDP1 54520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 75604496 75604511 75604504 Y NA TMEM231,GABARAPL2 NA NA NA NA GABARAPL2 6247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 75618166 75618518 75618190 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA GABARAPL2 19917 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 75636745 75636762 75636754 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS NA NA NA NA ADAT1 18436 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 77217218 77217275 77217245 Y NA MON1B,SYCE1L NA NA NA NA MON1B 5457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 776970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 82686651 82686853 82686732 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 484820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA NA HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 485636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 82733427 82733620 82733554 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH6 531596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 83111437 83111826 83111632 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 727622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 83988181 83988500 83988282 Y NA OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA OSGIN1 8294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 84208911 84209121 84208992 Y OSGIN1,COTL1,HSDL1,TAF1C HSDL1,TAF1C NA NA NA NA TAF1C 9548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 84390991 84391238 84391128 Y OSGIN1,COTL1 NA ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TAF1C 172322 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr16 84393830 84394115 84393945 Y OSGIN1,CRISPLD2,COTL1 NA ATP2C2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TAF1C 175161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 84624738 84624752 84624744 Y HSDL1,COTL1 COTL1 NA NA NA NA COTL1 24931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 85648720 85648939 85648787 Y NA NA NA NA NA NA GINS2 72740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 22658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 86619952 86620235 86620073 Y FOXC2 MTHFSD NA NA NA NA MTHFSD 33111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 86698129 86698417 86698281 Y NA NA FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 111288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr16 86698644 86698785 86698699 Y FOXL1 NA FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 111803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 86775121 86775409 86775225 Y NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 188280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 378017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf95 363255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 87498995 87499259 87499135 Y BANP,BANP,MAP1LC3B,ZCCHC14 NA NA NA NA NA FBXO31 75247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 87759379 87759621 87759456 Y C16orf95,FBXO31,ZCCHC14,JPH3 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 37977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.73287814319822 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 87878915 87879213 87879066 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 21881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 88275964 88276225 88276145 Y NA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 241500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 88448195 88448445 88448286 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 69280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 88520905 88521327 88521137 Y ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 3180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr16 88988977 88989104 88989054 Y NA NA TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNS 67599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr16 89241276 89241597 89241419 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA CDH15 5101 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89382399 89382987 89382651 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ZNF778 100281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr16 89424659 89424716 89424712 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 130253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 89488709 89489334 89489046 Y ZNF276,TCF25,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 65635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr16 89683162 89683271 89683207 Y DPEP1,C16orf55 CPNE7,CHMP1A NA NA NA NA CHMP1A 38982 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr16 90087429 90087721 90087595 Y TUBB3,DBNDD1,PRDM7 GAS8,DBNDD1 NA NA NA NA DBNDD1 2893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 200517 200885 200707 Y RPH3AL RPH3AL NA NA NA NA RPH3AL 33160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 438529 438886 438717 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP17 119901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 508147 508415 508281 Y NA NA NA NA NA NA RPS4XP17 50372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 693293 693510 693390 Y RNMTL1 DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GLOD4 9712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 990722 991295 990801 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 92365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 1267059 1267122 1267091 Y NA YWHAE NA NA NA NA YWHAE 34550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 1533068 1533815 1533453 Y CRK,INPP5K,WDR81,WDR81,WDR81,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 2888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 2082960 2083277 2083133 Y NA NA NA NA NA NA SRR 121400 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 2087949 2088276 2088112 Y NA NA NA NA NA NA SRR 116401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 2291927 2292298 2292113 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 10114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 2397010 2397265 2397138 Y NA METTL16 LOC284009 IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 15920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 2757819 2758227 2758154 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 79469 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 3453416 3453706 3453615 Y OR1G1,OR1A2,OR1A1,OR1E2,TRPV3 TRPV3 NA NA NA NA TRPV3 5583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 6814987 6815378 6815170 Y DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 98290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 9.15514177971402 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.32911237923652 chr17 7781804 7782205 7782005 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1 NA NA NA NA CHD3 3919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 7784207 7784538 7784352 Y POLR2A,CD68,CD68,ATP1B2,WRAP53,VAMP2 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA CHD3 1586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 9155924 9156306 9156115 Y PIK3R5 NA NA NA NA NA STX8 321602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 13249594 13249869 13249742 Y HS3ST3A1 NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 ELAC2 330090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 13689783 13689996 13689890 Y NA NA NA NA NA NA COX10-AS1 280816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10 134195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 15153959 15154348 15154277 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 12295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA SNORA74 80954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 15869590 15869983 15869922 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 23359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 15925706 15925935 15925791 Y FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 16191035 16191327 16191109 Y TRPV2 NA CENPV IMR90 Hi-C 24141950 CENPV 63643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV FAM211A NA NA NA NA FAM211A 17496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 45443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17054009 17054176 17054093 Y ZNF624,PEMT,COPS3,FLCN NA NA NA NA NA PLD6 53453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17163211 17163219 17163215 Y NA FLCN,COPS3,NT5M NA NA NA NA COPS3 19388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17311865 17312094 17311980 Y FLCN RPL13P12 NA NA NA NA RPL13P12 26539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17566702 17566984 17566789 Y NA RAI1 RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAI1 15803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 18200436 18200727 18200570 Y SMCR8,TOP3A FLII,TOP3A,SMCR8 NA NA NA NA TOP3A 15594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 20690369 20690534 20690439 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 4411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 25572576 25572861 25572643 Y WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 25680204 25680481 25680340 Y LGALS9,WSB1 NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.86952205035813 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 27264479 27264617 27264556 Y UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12 FLOT2,DHRS13,PHF12 NA NA NA NA PHF12 12172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 28031718 28032050 28032008 Y NA NA NA NA NA NA CORO6 83793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 28533256 28533617 28533437 Y SLC6A4 SNORD63 NA NA NA NA SNORD63 38221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 29210096 29210162 29210129 Y NA TEFM NA NA NA NA TEFM 21676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 29212303 29212381 29212342 Y OMG,NF1,C17orf42 TEFM NA NA NA NA TEFM 19457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 29599453 29600092 29599789 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 39038 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 1490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 29759240 29759393 29759318 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 112338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA EVI2A 229790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 29923737 29923924 29923895 Y EVI2A NA NA NA NA NA EVI2A 276835 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 33383216 33383365 33383329 Y SLFN5,RFFL RFFL NA NA NA NA RFFL 30973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 34948982 34949076 34949029 Y DHRS11 DHRS11,MRM1 NA NA NA NA DHRS11 2754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 35288156 35288415 35288296 Y LHX1 RP11-445F12.1,AATF AATF K562 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 3545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 36585417 36585600 36585486 Y ARHGAP23 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 2755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 37621502 37621553 37621528 Y NA MED1,CDK12 NA NA NA NA CDK12 5738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 38085522 38085789 38085697 Y ERBB2,IKZF3,ORMDL3 ORMDL3,PSMD3 NA NA NA NA ORMDL3 3668 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38226807 38227182 38226872 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 11339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38254249 38254664 38254597 Y GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr17 38263980 38264229 38263993 Y RARA,RARA,MSL1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9002 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 38440755 38440955 38440855 Y NA CDC6,RARA NA NA NA NA CDC6 930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 38470934 38471197 38471090 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 7490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38514847 38514935 38514891 Y NA NA NA NA NA NA RARA 51403 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38607821 38607996 38607876 Y NA TOP2A,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA IGFBP4 10119 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 38630978 38631299 38631288 Y NA IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA TNS4 24550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 38655848 38656036 38655907 Y GJD3,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA NA TNS4 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 38666550 38666883 38666717 Y TNS4 TNS4 CDC6,TOP2A,IGFBP4,TNS4,CCR7,KRT42P IMR90 Hi-C 24141950 TNS4 10701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38677736 38678132 38678052 Y KRT24,TNS4 TNS4 IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS4 21887 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 38699205 38699580 38699386 Y RARA,CCR7 TNS4 NA NA NA NA TNS4 43356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 38705273 38706158 38705806 Y GJD3,IGFBP4 TNS4 NA NA NA NA TNS4 49424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 40628029 40628344 40628111 Y NA ATP6V0A1 NA NA NA NA ATP6V0A1 19167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 15359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA NAGLU 14871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 41324260 41324525 41324381 Y TMEM106A BRCA1,NBR2,NBR1,TMEM106A NA NA NA NA NBR1 3762 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 41723669 41723803 41723747 Y TMEM106A,DUSP3 NA NA NA NA NA ETV4 68681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 41827198 41827473 41827372 Y NA SOST,DUSP3 NA NA NA NA SOST 6683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 HDAC5 16402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 42872286 42872458 42872432 Y FMNL1,GRN GJC1 NA NA NA NA GJC1 33726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 43201428 43201633 43201517 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA ACBD4 6334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 43221862 43221955 43221890 Y ACBD4,HEXIM1 ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM1 729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 43230123 43230516 43230320 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 5551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 43302645 43302970 43302880 Y NA FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 5834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.68938549331759 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr17 43370974 43371161 43371063 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 MAP3K14 NA NA NA NA MAP3K14 21253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 45317390 45317724 45317566 Y TBKBP1 ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 11539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 45515544 45515843 45515768 Y NA NA NA NA NA NA NPEPPS 82465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 46314423 46314444 46314434 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 135704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 46605931 46606242 46606161 Y TTLL6,HOXB1 NA NA NA NA NA HOXB6 74112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 46664992 46665342 46665097 Y NA HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 15012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 46680378 46680812 46680678 Y NA HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB6 24 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 46767725 46768126 46768067 Y NA HOXB13 NA NA NA NA HOXB13 36414 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 48136569 48136863 48136794 Y NA ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 5237 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 53535750 53535979 53535892 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 38397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 54669912 54670125 54669969 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 852 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 54674985 54675165 54675040 Y NA NOG NA NA NA NA NOG 5925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 54864431 54864801 54864568 Y TRIM25,SCPEP1 C17orf67 NA NA NA NA C17orf67 49333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 54876339 54876519 54876454 Y DGKE C17orf67 NA NA NA NA C17orf67 37615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 54987224 54987877 54987630 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 1522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr17 55101345 55101678 55101512 Y NA SCPEP1 NA NA NA NA SCPEP1 47879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 55979553 55979719 55979663 Y NA NA NA NA NA NA CUEDC1 50965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 56161643 56161969 56161895 Y VEZF1,MTMR4 DYNLL2 NA NA NA NA DYNLL2 2867 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 56628647 56628916 56628782 Y NA MTMR4 NA NA NA NA MTMR4 35381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 56696420 56696582 56696517 Y NA RNU1-60P C17orf47,SEPT4 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-60P 38084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57839956 57840355 57840071 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 56969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 58470515 58470600 58470558 Y RNFT1 USP32 NA NA NA NA USP32 27231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 59018495 59018735 59018604 Y NA NA TBX2,C17orf82 IMR90 Hi-C 24141950 BCAS3 265681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 59329573 59329874 59329791 Y NACA2 NA NA NA NA NA TBX2 145383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 59645902 59646266 59646152 Y NA NACA2 NA NA NA NA NACA2 20297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 61538235 61538385 61538330 Y NA CYB561,ACE CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CYB561 16496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 62154723 62155082 62154942 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 51097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr17 62409252 62409599 62409468 Y ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 62409604 62410133 62409977 Y ICAM2,ERN1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.87568800787616 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 62586168 62586194 62586181 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 69992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 62705157 62705447 62705234 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 48971 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 102432 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 64690651 64690854 64690753 Y PRKCA,CACNG4 NA NA NA NA NA PRKCA 393897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 65394789 65395150 65395019 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 23214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 65418011 65418377 65418257 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1,BPTF PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 46436 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 65471645 65472025 65471701 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 100070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 65708047 65708170 65708124 Y NA NOL11 NA NA NA NA NOL11 3779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 66694330 66694724 66694542 Y NA NA NA NA NA NA PRKAR1A 188409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 67139403 67139524 67139506 Y NA NA NA NA NA NA ABCA5 181861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 67753778 67754160 67754025 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA5 432393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 69068010 69068257 69068112 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 546862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 70499253 70499546 70499535 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 121824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 70585200 70585480 70585419 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 35890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 70610080 70610203 70610142 Y NA RPL32P33 LOC100499467 MCF7 ChIA-PET 22265404 RPL32P33 11167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 70706379 70706638 70706553 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 85009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 71304431 71304616 71304518 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 1698 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,ARMC7,NT5C NA NA NA NA ARMC7 16218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 19943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73805010 73805399 73805102 Y NA GALK1,UNK,H3F3B,WBP2 NA NA NA NA H3F3B 25036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73860608 73860975 73860910 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 UNC13D,UNK,WBP2 IMR90 Hi-C 24141950 WBP2 10020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr17 74368264 74368743 74368490 Y SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 1922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 74496600 74496786 74496748 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 74664017 74664029 74664023 Y NA ST6GALNAC1,MXRA7 NA NA NA NA ST6GALNAC1 26097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA NA SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00338,SEC14L1 170636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 201013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr17 75312591 75312808 75312697 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 231793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 238230 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 303838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 75853799 75854208 75853860 Y NA NA NA NA NA NA TNRC6C 144041 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 75883563 75884329 75884163 Y TNRC6C,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1 NA NA NA NA NA TNRC6C 113920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.2856197293559 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76254688 76254992 76254867 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,C17orf99,SOCS3,PGS1 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 46421 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76313584 76313890 76313792 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76325206 76325964 76325662 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 28194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76330688 76331173 76330803 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 22985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76335027 76335218 76335120 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 18940 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76377337 76378350 76377903 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 4616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76382008 76383398 76383057 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 9287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76529146 76529333 76529216 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 RN7SL454P NA NA NA NA RN7SL454P 2009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76588219 76588768 76588537 Y NA NA DNAH17,CYTH1,USP36 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SL454P 61082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76731686 76732147 76732043 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 CYTH1 NA NA NA NA CYTH1 44232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 76919844 76920193 76919970 Y CYTH1,CANT1 TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 77032690 77033106 77032818 Y CYTH1,ENGASE CANT1,ENGASE NA NA NA NA CANT1 28741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,ENGASE NA NA NA NA CANT1 30716 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr17 78198081 78198434 78198366 Y NA SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA SGSH 5359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr17 78725388 78725609 78725479 Y AATK NA NA NA NA NA RPTOR 208769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 78901796 78901941 78901869 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 61457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 79011145 79011369 79011293 Y BAIAP2 CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA NA SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC38A10 72354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 97713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr17 80068190 80068440 80068326 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 13982 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80104775 80104822 80104796 Y NA NA NA NA NA NA FASN 50567 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80164087 80164383 80164236 Y SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 NA NA NA NA CCDC57 4323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80214734 80215057 80214944 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SECTM1 CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80330864 80331011 80330938 Y NA SECTM1,HEXDC NA NA NA NA SECTM1 40914 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 221277 221425 221379 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 44625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr18 668283 668526 668405 Y THOC1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2516331 2516615 2516492 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 52893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2797990 2798254 2798233 Y NA NA NA NA NA NA SMCHD1 144253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2897860 2897994 2897926 Y NA NA NA NA NA NA LPIN2 113319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 2981236 2981736 2981487 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,MYL12B,SMCHD1,EMILIN2,LPIN2 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 29577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3276279 3276423 3276302 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12B 16372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3305401 3305555 3305478 Y MYL12B,TGIF1 MYL12B DLGAP1,TGIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYL12B 45494 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3490071 3490183 3490142 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 80465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.8260294004775 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr18 3741003 3741403 3741194 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 331397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 4003748 4003994 4003928 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 594142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 9128926 9129321 9129124 Y NDUFV2,ANKRD12,ANKRD12 NDUFV2,ANKRD12 ANKRD12 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD12 4905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 9219810 9220134 9219877 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD12 85584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 9742137 9742641 9742378 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 35975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 9742767 9742849 9742828 Y VAPA,RAB31 RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 36605 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr18 9824351 9824715 9824532 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 87284 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 9828298 9828524 9828428 Y RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 83475 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 11431991 11432229 11432112 Y NA NA NA NA NA NA CHMP1B 417166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 11846235 11846388 11846281 Y GNAL,GNAL CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 3007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr18 11859926 11860218 11860181 Y CHMP1B CHMP1B,MPPE1 NA NA NA NA CHMP1B 10531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA SPIRE1 48865 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 12679329 12679437 12679359 Y NA SPIRE1,PSMG2,CEP76 NA NA NA NA CEP76 21339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 13369777 13369964 13369871 Y MC5R NA NA NA NA NA RNMT 354695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 13446691 13446974 13446907 Y NA NA NA NA NA NA RNMT 277685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 20131932 20132167 20132050 Y NA NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 244057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 30501581 30501946 30501766 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 831763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 32558962 32559433 32559316 Y ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2 MAPRE2 NA NA NA NA MAPRE2 4070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 34813677 34814006 34813844 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 406519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 37033966 37034182 37034037 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 120327 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 38446239 38446490 38446414 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 1086681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 43874380 43874525 43874458 Y NA RNF165 RNF165,LOXHD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF165 30247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 45454827 45455289 45455128 Y NA SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 45472001 45472124 45472045 Y NA SMAD2 SMAD2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD2 16486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 45479794 45480168 45480059 Y SMAD2,SMAD2 SMAD2 NA NA NA NA SMAD2 24279 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr18 45534549 45534809 45534718 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 79034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 46547875 46548139 46548027 Y NA NA SMAD7 MCF7 ChIA-PET 22265404 SMAD7 72794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 47216686 47217049 47216797 Y NA NA MYO5B IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 121281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr18 47325286 47325511 47325399 Y NA ACAA2 NA NA NA NA ACAA2 12819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr18 49479835 49480219 49480027 Y NA NA NA NA NA NA MEX3C 737161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 55267032 55267261 55267214 Y NEDD4L FECH,NARS NA NA NA NA FECH 15028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 55929917 55930363 55930116 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4L 220318 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 60087446 60087621 60087533 Y ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF11A 96926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 60903713 60904052 60903857 Y VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 81309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 66405862 66406252 66406056 Y NA CCDC102B,TMX3 NA NA NA NA TMX3 25327 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 67506387 67506771 67506648 Y DOK6 NA NA NA NA NA RTTN 364410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 67862254 67862313 67862284 Y NA RTTN NA NA NA NA RTTN 8868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 67901995 67902279 67902045 Y NA RTTN NA NA NA NA RTTN 30814 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr18 68001159 68001386 68001197 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 47022 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr18 68087534 68087889 68087601 Y CD226,SOCS6 NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 133397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 68088825 68088985 68088877 Y SOCS6 NA RTTN,SOCS6 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 134688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 72694471 72694659 72694499 Y ZNF407 NA NA NA NA NA ZADH2 224644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr18 74804015 74805088 74804856 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 271452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 74826312 74827078 74826635 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 293749 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 77267133 77267456 77267187 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 113277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr18 77327843 77328066 77328013 Y NA NA NFATC1,ATP9B IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 109735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 485856 486161 485966 Y PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2 MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 511222 511648 511350 Y RNF126,GZMM MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA TPGS1 5923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3 NA NA NA NA RNF126 133 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3 NA NA NA NA RNF126 939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 751766 752111 751822 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PTBP1 NA NA NA NA PTBP1 42964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 753188 753320 753238 Y C19orf20 PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 41755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 908605 908810 908775 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A NA NA NA NA R3HDM4 2430 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,HMHA1,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1161691 1161983 1161922 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 10299 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 1175432 1175562 1175482 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 3150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1214932 1215433 1215243 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 20593 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr19 1280981 1281104 1281044 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA MUM1 2786 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 1669192 1669298 1669247 Y C19orf26,EFNA2,APC2,TCF3,TCF3 TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90 Hi-C 24141950 TCF3 18588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1672372 1672532 1672504 Y NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 21768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 1755338 1755626 1755509 Y NA ONECUT3 NA NA NA NA ONECUT3 4966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 2056461 2056895 2056707 Y OAZ1,C19orf35,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 7218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 2391233 2391395 2391314 Y NA TIMM13 NA NA NA NA TIMM13 34497 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2503555 2504136 2503623 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 29435 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2549602 2550221 2549903 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 75482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 2627461 2627884 2627646 Y DOT1L,OAZ1,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 72823 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr19 3222791 3223093 3222942 Y NA NCLN NA NA NA NA NCLN 39230 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 3360896 3361804 3361247 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 3335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 3387730 3388119 3388011 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 30169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 3555158 3555442 3555300 Y C19orf28 HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 15333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 3562421 3562565 3562489 Y NA HMG20B,MFSD12 NA NA NA NA HMG20B 8210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 3923611 3923782 3923733 Y ITGB1BP3 DAPK3 NA NA NA NA DAPK3 45339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4051584 4052099 4051914 Y CCDC94 PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4057405 4058198 4058044 Y CCDC94,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 6745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 4059877 4060289 4060128 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 4654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4634649 4634985 4634807 Y CCDC94,SEMA6B,TICAM1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 2545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 NA NA NA NA NA SLC25A23 124060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 6639523 6639784 6639643 Y TNFSF9,TNFSF14 NA NA NA NA NA C3 88789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 6674780 6675150 6675080 Y DENND1C,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 NA NA NA NA NA C3 53423 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 6766042 6766297 6766158 Y NA C3,GPR108,TRIP10,SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 6801116 6801467 6801221 Y SH2D3A,VAV1 SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 35517 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 36848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 7456481 7456588 7456536 Y LRRC8E,ARHGEF18 ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 1411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 8426850 8427217 8427032 Y LOC645781,ANGPTL4 RPS28,NDUFA7,ANGPTL4,RAB11B,MARCH2 NA NA NA NA ANGPTL4 677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 9128934 9129115 9129008 Y NA NA NA NA NA NA ZNF317 119941 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 9757386 9757713 9757550 Y NA ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 26063 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 9776683 9777096 9776903 Y OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA PIN1 112303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 10519571 10519867 10519659 Y P2RY11,ICAM3,S1PR5,C19orf38,ATG4D,TYK2,PDE4A,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 CDC37 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MIR1181 7357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 11642939 11643084 11643012 Y CCDC159 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ECSIT 4950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 11679134 11679427 11679281 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CTC-398G3.2,ECSIT,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 10945 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 11804467 11804940 11804795 Y ZNF878,ZNF823,ZNF491 HNRNPA1P10,ZNF823 NA NA NA NA HNRNPA1P10 28622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 12065633 12065838 12065735 Y NA ZNF700,ZNF763 NA NA NA NA ZNF763 31743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr19 12895349 12896178 12895559 Y ZNF563,JUNB ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 4132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13143095 13143350 13143204 Y WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2 NFIX NA NA NA NA NFIX 38673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13231642 13232105 13231971 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 4725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.86952205035813 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13955108 13955589 13955298 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 NA NA NA NA NA ZSWIM4 50834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 14189294 14189532 14189398 Y CCDC130,ZSWIM4,NANOS3,DCAF15,RFX1,PKN1,DNAJB1,CD97 IL27RA,EEF1DP1,SAMD1,PRKACA NA NA NA NA EEF1DP1 10140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 14616908 14617174 14617017 Y GIPC1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 8723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 17442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 14880267 14880429 14880348 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 6924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NA NA NA NA NA ILVBL 86486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NA NA NA NA NA ILVBL 99498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 16181046 16181841 16181607 Y OR10H2,OR10H3,OR10H4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 5215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr19 16445319 16445495 16445399 Y NA KLF2 NA NA NA NA KLF2 11691 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 16452764 16452992 16452877 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 17220741 17221250 17221017 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 36150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 17604234 17604409 17604322 Y NA SLC27A1,PGLS NA NA NA NA PGLS 16029 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 17791017 17791370 17791235 Y MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2 UNC13A,MAP1S NA NA NA NA UNC13A 6031 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA MAST3 73294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18162301 18162691 18162523 Y NA MAST3 NA NA NA NA MAST3 43912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 18401020 18401539 18401437 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,LRRC25,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 10133 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 18430446 18430898 18430653 Y ARRDC2,IL12RB1,IFI30,LRRC25 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 1186 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 19192588 19193136 19192878 Y NA SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SLC25A42 19780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 19248583 19248716 19248628 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 1261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 19432680 19432782 19432710 Y NA MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 3027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 19483893 19484092 19484012 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 10543 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 19504149 19504345 19504247 Y NA GATAD2A NA NA NA NA GATAD2A 9514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 22787306 22787691 22787499 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P34 237552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF254 481566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 28208615 28209033 28208726 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1493415 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 28219787 28220540 28220091 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1481908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28225585 28226223 28225838 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1476225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28231226 28231711 28231495 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1470737 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28234930 28234990 28234960 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1467458 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28244004 28244439 28244017 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1458009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28248561 28250861 28250165 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1451587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28252920 28253113 28253061 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1449335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 29702850 29703471 29703365 Y NA UQCRFS1 NA NA NA NA UQCRFS1 402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 31371885 31372199 31372043 Y NA NA NA NA NA NA URI1 959334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 31705006 31705320 31705186 Y NA NA TSHZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF507 1129180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 32866000 32866258 32866129 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA DPY19L3 28191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 33841444 33841736 33841590 Y NA CEBPA,CEBPG CEBPA,CEBPG,WDR88,LRP3,SLC7A10,LOC80054,PEPD,CHST8 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPG 20500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 34301645 34301872 34301668 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 16807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr19 34724001 34724111 34724046 Y NA KIAA0355 NA NA NA NA KIAA0355 19331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA NA NA NA NA NA UBA2 75456 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 35100505 35100815 35100739 Y ZNF302 NA NA NA NA NA AC020910.2 65671 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 35636009 35636339 35636175 Y NA FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 7294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 35763871 35764402 35764192 Y FXYD1,FXYD1,HAMP LSR,USF2 NA NA NA NA USF2 5990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 ZBTB32 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 36202440 36202452 36202444 Y CD22,FFAR1,NFKBID,ZBTB32,U2AF1L4 ZBTB32,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55 NA NA NA NA ZBTB32 9011 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 36274503 36274656 36274589 Y GAPDHS,ETV2,WDR62,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37,C19orf55 NA NA NA NA C19orf55 27459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 36404580 36404784 36404704 Y FFAR2,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP NFKBID,LRFN3 NA NA NA NA NFKBID 13375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 37156610 37156902 37156838 Y ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461 AC074138.3,ZNF567 NA NA NA NA AC074138.3 19449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 38186506 38186731 38186619 Y ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573 ZNF607 NA NA NA NA ZNF607 21960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 38791297 38791661 38791416 Y C19orf33 C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG NA NA NA NA C19orf33 1140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 38916087 38916199 38916146 Y RINL,NFKBIB,RASGRP4 GGN,FAM98C NA NA NA NA FAM98C 24312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 39171828 39172087 39171896 Y FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 35539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39564346 39564568 39564426 Y ZFP36,HNRNPL,NFKBIB PAK4 PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1 IMR90 Hi-C 24141950 PAK4 49842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39863077 39863463 39863179 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 NA NA NA NA PAF1 16372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 39919610 39919819 39919723 Y NA PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 4769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 40413949 40414284 40414119 Y SUPT5H,SUPT5H CTC-471F3.4 NA NA NA NA CTC-471F3.4 33350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 40725827 40726069 40725973 Y NA MAP3K10 NA NA NA NA MAP3K10 30176 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA PRX 5826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 40969437 40969789 40969613 Y BLVRB SERTAD1,SERTAD3 NA NA NA NA BLVRB 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 12817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 41814398 41814719 41814610 Y HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2 HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 41834727 41835191 41834967 Y CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 19625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,ARHGEF1 NA NA NA NA ARHGEF1 5368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42440713 42441005 42440837 Y ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 20537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 NA NA NA NA NA RABAC1 53077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA DEDD2 29017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42711906 42712521 42712423 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 9771 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 42750338 42750718 42750490 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA GSK3A 5561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42756581 42756634 42756608 Y ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 14986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 17070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA ERF 18683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 43267088 43267316 43267247 Y CEACAM1,PSG5 NA NA NA NA NA CEACAM1 203702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 LYPD3 131970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 44137942 44138031 44138016 Y ZNF575,ZNF221,LYPD5,ZNF428,CADM4 IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA CADM4 3960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 44179506 44179853 44179716 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 44261449 44261664 44261525 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 4307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 44267676 44267996 44267772 Y TEX101,LYPD3,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 10534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 44269192 44269953 44269534 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 12050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 44281524 44282142 44281780 Y IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 1267 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 44283400 44283793 44283490 Y TEX101,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4 SMG9,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 45100230 45100376 45100298 Y NA PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 44722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45189303 45189576 45189367 Y RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 PVR NA NA NA NA PVR 44205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45195366 45195649 45195556 Y RELB,CLASRP,BCL3 NA NA NA NA NA PVR 50268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 45231729 45232033 45231881 Y IGSF23,CLASRP,APOC2 BCL3,CBLC NA NA NA NA BCL3 16929 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA CBLC NA NA NA NA BCL3 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3,CBLC NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45905744 45905944 45905844 Y EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1 ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA CD3EAP 1523 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45931993 45932316 45932152 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 NA NA NA NA PPP1R13L 24386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45943163 45943490 45943268 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 25763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 46133845 46134220 46134022 Y NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2 OPA3,EML2,GIPR NA NA NA NA EML2 12667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 46385401 46385465 46385433 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1911 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr19 46504246 46504437 46504355 Y EML2,PNMAL2,PNMAL1,NOVA2 CCDC61 NA NA NA NA CCDC61 7907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 46698925 46699055 46698990 Y NA IGFL1 IGFL3 IMR90 Hi-C 24141950 IGFL1 31954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 47662714 47662828 47662771 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA ZC3H4 47705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 47783225 47783533 47783379 Y ZNF541 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 7083 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 47805638 47805769 47805718 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,GPR77,C5AR1 CCDC9,PRR24,DHX34 PRR24,DHX34,SLC8A2,MEIS3,GLTSCR2,GLTSCR1,EHD2 IMR90 Hi-C 24141950 PRR24 29496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 47818553 47819137 47818792 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,DHX34 NA NA NA NA DHX34 31401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 47886542 47886975 47886851 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 36004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 47890403 47890638 47890521 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 39865 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 48102180 48102576 48102418 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 48642255 48642637 48642446 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA LIG1 29223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2,LHB NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 49590520 49590786 49590652 Y NA SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 3844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 49832847 49832906 49832877 Y PTH2 CTC-301O7.4,TEAD2 NA NA NA NA CTC-301O7.4 8959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 50004159 50004640 50004502 Y PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11 ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,SNORD34,SNORD35A,RPS11,SNORD35B,FCGRT NA NA NA NA FCGRT 3433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 50116585 50116794 50116665 Y NA NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1 NA NA NA NA PRR12 23685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr19 50414628 50414884 50414779 Y RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15075 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA NA NA NA NA NA ZNF765 163185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 10858 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 54981954 54982383 54982298 Y NA LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5 NA NA NA NA CDC42EP5 28 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 55034604 55034910 55034757 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP5 52193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55546101 55546409 55546255 Y NA RDH13 NA NA NA NA RDH13 34250 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA NA NA NA NA NA PPP6R1 68082 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55721470 55721547 55721521 Y NA PPP6R1 NA NA NA NA PPP6R1 46816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55787779 55788010 55787914 Y KIR3DL1,KIR2DS4,KIR3DL2,NCR1,ZNF628,SUV420H2,EPN1,PPP6R1 PPP6R1,HSPBP1 NA NA NA NA HSPBP1 1739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55977615 55977883 55977735 Y NLRP8,NLRP9,NLRP11,SGK110 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ISOC2,UBE2S,SSC5D,NAT14 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ISOC2 5905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 55983917 55984059 55984005 Y RDH13,HSPBP1,ISOC2 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D ZNF628,ISOC2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF628 1640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.01233191503607 chr19 56031210 56031577 56031512 Y TMEM150B,SGK110 ZNF628,NAT14,SSC5D,SBK2 NA NA NA NA SBK2 14879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 56060798 56061018 56060898 Y NA SBK2,ZNF579,ZNF524 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 SBK2 14342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 SBK2 14871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.8260294004775 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 56795373 56795512 56795477 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN5A 82240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZSCAN5A 69725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 57944833 57945004 57944919 Y NA ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772 NA NA NA NA ZNF749 136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 58217187 58217439 58217313 Y NA ZNF551,ZNF776 NA NA NA NA ZNF551 25850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF417 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 58742086 58742094 58742090 Y NA ZNF274,ZNF544,ZNF8 NA NA NA NA ZNF544 4126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 58788473 58788748 58788728 Y NA ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22 NA NA NA NA ZNF8 155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 1725053 1725311 1725239 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 21313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 20764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 8456047 8456179 8456122 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 265743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9692579 9693026 9692911 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 895 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 9893339 9893657 9893442 Y ADAM17,KLF11,KLF11 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 87826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 9894353 9894610 9894569 Y ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 86873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 NA NA NA NA NA RRM2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr2 10261505 10261712 10261609 Y NA RRM2 NA NA NA NA RRM2 1050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 10430004 10430228 10430116 Y NA HPCAL1 HPCAL1,C2orf48,CYS1,RRM2,MIR4261,ODC1,NOL10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 10787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10501440 10501782 10501611 Y C2orf48 NA NA NA NA NA HPCAL1 60425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10549320 10549595 10549372 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 NA NA NA NA ODC1 37035 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 10633765 10634017 10633925 Y NOL10 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1,HPCAL1,NOL10,CYS1,RRM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-320M2.1 46945 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16464 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 11977030 11977330 11977180 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 9418 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 12460124 12460450 12460316 Y TRIB2 NA LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 394565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 12703835 12703993 12703936 Y NA NA TRIB2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 151022 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr2 13793212 13793312 13793262 Y NA NA NA NA NA NA TRIB2 938197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 16219682 16220075 16219855 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 211619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 16807698 16808010 16807940 Y FAM49A NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 799635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA VSNL1 106096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr2 17999208 17999271 17999240 Y NA SMC6 NA NA NA NA SMC6 19699 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 20624612 20624982 20624777 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 20638245 20638508 20638456 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,GDF7 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 6327 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr2 20709880 20710074 20709978 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 65045 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 20795868 20796230 20795893 Y RHOB,HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 52619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 24047559 24047784 24047672 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 100200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 24552849 24553177 24552876 Y NA ITSN2 NA NA NA NA ITSN2 28406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 26919291 26919602 26919376 Y NA AC015977.5 NA NA NA NA AC015977.5 19913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27631105 27631216 27631160 Y C2orf16 EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA PPM1G 551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 27960575 27961156 27960621 Y RBKS MRPL33 BRE,PLB1,MRPL33,RBKS,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL33 31428 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 28400759 28401210 28400868 Y RBKS,BRE,BRE,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 212105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 28582195 28582710 28582283 Y NA FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 30605 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 28586671 28586953 28586834 Y RBKS,FOSL2 FOSL2 SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2 IMR90 Hi-C 24141950 FOSL2 26362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 18760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 28767576 28768254 28768064 Y WDR43,TRMT61B,SPDYA NA NA NA NA NA FOSL2 154261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr2 28806831 28807046 28806964 Y FOSL2 NA NA NA NA NA PPP1CB 165460 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 28833397 28833696 28833546 Y NA NA NA NA NA NA PPP1CB 138810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B PPP1CB SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB NA NA NA NA PPP1CB 37190 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 SNORD53 NA NA NA NA SNORD53 25397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 29435309 29435425 29435367 Y SPDYA NA NA NA NA NA CLIP4 116738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 30887906 30888094 30887998 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 219814 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 30889265 30889652 30889547 Y NA NA YPEL5,LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 221173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 33702756 33702976 33702846 Y RASGRP3,RASGRP3 RASGRP3 NA NA NA NA RASGRP3 43365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 37491311 37491687 37491498 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 34455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37760471 37760598 37760536 Y SULT6B1,FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 190754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 37763005 37763322 37763129 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 15.7140493233897 chr2 37811087 37811457 37811150 Y NA NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 152154 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37813379 37813644 37813592 Y EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 149967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37851755 37851898 37851787 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 111713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37852383 37852553 37852466 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 111058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37883470 37883595 37883540 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 80016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37884022 37884434 37884213 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP3 79177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 37893644 37893973 37893812 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 69638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 38315585 38315885 38315608 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 CYP1B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYP1B1 19159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 38369402 38369882 38369670 Y NA CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 34358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 38375670 38375904 38375803 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 NA NA NA NA CYP1B1 40626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 38401547 38402107 38401851 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P12 54603 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 38949741 38950194 38950072 Y HNRPLL,SRSF7 SRSF7,GEMIN6 NA NA NA NA SRSF7 26442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr2 39719153 39719730 39719398 Y MAP4K3 NA NA NA NA NA MAP4K3 56700 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 40260196 40260378 40260267 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 255789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,MTA3 NA NA NA NA MTA3 22745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 43144669 43144850 43144755 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 306898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 43302253 43302513 43302383 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 149235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 43396497 43396745 43396689 Y OXER1,ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2,THADA IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 55003 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 43630412 43630826 43630435 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 178664 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 43650897 43651024 43650952 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 170161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 44577605 44577885 44577745 Y NA PREPL,CAMKMT NA NA NA NA PREPL 9116 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 45161073 45161475 45161220 Y SIX3 RP11-89K21.1 NA NA NA NA RP11-89K21.1 2863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 45955611 45956065 45955689 Y NA NA NA NA NA NA PRKCE 79127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46212455 46212485 46212471 Y PRKCE NA NA NA NA NA EPAS1 306321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46452124 46452363 46452229 Y RHOQ NA PRKCE,EPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 66443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 46525633 46526278 46526263 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 6827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46542843 46542999 46542890 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 24037 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 46554101 46554217 46554159 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 35295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46784048 46784469 46784214 Y NA RHOQ,ATP6V1E2 NA NA NA NA ATP6V1E2 16352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 46825586 46825695 46825639 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA CRIPT 15860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 47199058 47199402 47199110 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 32064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 47212237 47212567 47212294 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 45243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 47282124 47282371 47282214 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 115130 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 47499706 47499760 47499719 Y C2orf61 NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 70453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 47926766 47926950 47926857 Y NA AC079250.1,MSH6 KCNK12 IMR90 Hi-C 24141950 MSH6 6097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 52975138 52975144 52975141 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1017785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 54165408 54165630 54165519 Y NA ACYP2,PSME4 NA NA NA NA ACYP2 30345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 54751942 54752182 54752042 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 70520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 54801406 54802103 54801693 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 119984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 54900806 54901065 54900960 Y NA EML6 NA NA NA NA EML6 47571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 55193261 55193511 55193360 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 144246 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 55378440 55378607 55378524 Y NA RTN4 NA NA NA NA RTN4 40683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 55767070 55767336 55767332 Y NA CCDC104 NA NA NA NA CCDC104 22330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 58339709 58340405 58340032 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 126102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 61428317 61428371 61428344 Y USP34,AHSA2 AHSA2 NA NA NA NA AHSA2 25764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 61464355 61464721 61464539 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 61802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 61766465 61766637 61766569 Y AHSA2,USP34 XPO1 NA NA NA NA XPO1 2704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 15600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 65065938 65066285 65066136 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 89799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 65086460 65086681 65086529 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 66801899 66802241 66801940 Y MEIS1 NA NA NA NA NA MEIS1-AS3 143297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 68732919 68733244 68733084 Y NA FBXO48,APLF NA NA NA NA APLF 40226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA NA ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 APLF 442907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 69997386 69997753 69997552 Y PCBP1,MXD1 NA NA NA NA NA GMCL1 57021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70144957 70145388 70145176 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr2 70154281 70154743 70154417 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 31461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70160460 70161117 70160745 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 PCBP1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ASPRV1 26280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70173540 70174234 70173890 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 13163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr2 70174757 70175015 70174885 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 12382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70216700 70217012 70216811 Y NA ASPRV1 NA NA NA NA ASPRV1 29303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 70608938 70609447 70609175 Y TGFA NA NA NA NA NA FAM136A 81716 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr2 73318348 73318566 73318457 Y NA SFXN5 NA NA NA NA SFXN5 17601 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 74060180 74060503 74060342 Y NA STAMBP NA NA NA NA STAMBP 6094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 74258403 74258434 74258418 Y NA AC073046.25 DGUOK,STAMBP,ACTG2,TET3,BOLA3,BOLA3-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC073046.25 48144 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 74968770 74968998 74968973 Y TLX2,HK2 AC007387.2 HK2,SEMA4F IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007387.2 10948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 75072652 75072899 75072736 Y HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 13544 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 75103488 75103536 75103515 Y LBX2,HK2 HK2 NA NA NA NA HK2 44380 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 75141745 75142080 75142074 Y NA POLE4 NA NA NA NA POLE4 41539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr2 85160217 85160224 85160221 Y NA TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 29468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 85726317 85726428 85726373 Y CAPG,VAMP8 MAT2A TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAT2A 37860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 85887180 85887589 85887391 Y SH2D6,SFTPB C2orf68 NA NA NA NA C2orf68 49991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 85932755 85933081 85932924 Y SH2D6 RNU1-38P ATOH8 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 20379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 86048153 86048345 86048249 Y ATOH8 NA NA NA NA NA ST3GAL5 65792 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 86284876 86285205 86285126 Y NA POLR1A,PTCD3 NA NA NA NA POLR1A 46073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 86722014 86722392 86722297 Y RMND5A NA NA NA NA NA KDM3A 56244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 86922220 86922584 86922381 Y NA RMND5A,CHMP3,RNF103-CHMP3 NA NA NA NA RMND5A 22712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 87020980 87021190 87021027 Y CD8B,CD8A,CD8A NA NA NA NA NA CHMP3,RNF103-CHMP3 74735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 88353539 88354148 88353800 Y KRCC1 RNU2-63P,KRCC1 NA NA NA NA KRCC1 291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 88959127 88959352 88959240 Y NA EIF2AK3,RPIA EIF2AK3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPIA 29810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA NEURL3 19761 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 97211723 97211896 97211824 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,CNNM3,ARID5A NEURL3,ARID5A NA NA NA NA ARID5A 11243 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 89408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA ACTR1B 164641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 98485830 98486136 98485916 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 124252 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 99213145 99213306 99213215 Y INPP4A COA5,UNC50 NA NA NA NA COA5 9672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 99723014 99723348 99723222 Y TSGA10 C2orf15,LIPT1,TSGA10 NA NA NA NA C2orf15 32600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA REV1 525815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA NA NA NA NA NA PDCL3 269207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 101397207 101397582 101397418 Y C2orf29 NPAS2 NPAS2,RPL31,TBC1D8 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS2 37032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 101790359 101790618 101790446 Y RNF149 NA TBC1D8,RPL31 IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D8 76710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 101922561 101923216 101923063 Y NA NA NA NA NA NA RNF149 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102134407 102134716 102134504 Y NA NA MAP4K4,RFX8,CREG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREG2 132350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102241918 102242303 102242103 Y RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4 NA RFX8,MAP4K4,CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 69009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102246727 102247245 102246928 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 NA RFX8,MAP4K4,CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 MAP4K4 64067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102516830 102516950 102516890 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 205518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102549846 102550051 102549852 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 238534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 102698208 102698334 102698269 Y IL1R1,MAP4K4,MAP4K4 NA IL1R2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1RL2 103099 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102867550 102867715 102867627 Y NA NA NA NA NA NA IL1RL1 58247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 102874948 102875482 102875196 Y NA NA NA NA NA NA IL1RL1 50480 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 108841436 108841459 108841449 Y NA NA SULT1C2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GCC2 221558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 109211421 109211903 109211563 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 62564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 109229262 109229375 109229308 Y NA NA NA NA NA NA LIMS1 80405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 109648298 109648660 109648428 Y LIMS1,RANBP2 NA MALL,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 247085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 109859358 109859584 109859496 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 458145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 110871797 110872011 110872000 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 111941595 111941939 111941767 Y NA NA NA NA NA NA BCL2L11 66640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 111958967 111959175 111959071 Y BCL2L11 NA BCL2L11 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L11 84012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 112375521 112375561 112375551 Y NA NA NA NA NA NA ANAPC1 264706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 112420062 112420336 112420200 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 219931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 112428952 112429342 112429151 Y MERTK NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 210925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 112462014 112462125 112462055 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 178142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 113448371 113448563 113448450 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 46937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 113569466 113569945 113569683 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 22535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 113570329 113570602 113570498 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 21878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 113634636 113634920 113634776 Y IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B IL1B IL1B,CKAP2L,IL1A,IL37 IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 42156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 113635122 113635394 113635287 Y NA IL1B IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 42642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 113811675 113812041 113811939 Y IL1A,IL1B,IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN NA NA NA NA NA IL1B 219195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 113835949 113836406 113836219 Y IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN NA NA NA NA NA IL1B 243469 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 114046330 114046643 114046448 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 293021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 114457868 114458149 114458009 Y ACTR3 MIR4782 NA NA NA NA MIR4782 18796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 118578074 118578451 118578195 Y CCDC93,DDX18 DDX18 NA NA NA NA DDX18 7848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 118741787 118742055 118741993 Y CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 27654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 119989660 119989833 119989766 Y NA STEAP3 NA NA NA NA STEAP3 10276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 122132591 122132855 122132729 Y CLASP1 NA NA NA NA NA AC013399.3 67020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 122536391 122536587 122536559 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 43712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 128173465 128174362 128173731 Y SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2,PROC MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 29424 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 130928401 130928722 130928538 Y NA MZT2B,SMPD4 NA NA NA NA MZT2B 8588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 131582042 131582382 131582235 Y NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM168B 266651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 131586593 131586950 131586772 Y NA NA ARHGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 FAM168B 262083 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 131863489 131864378 131863990 Y PLEKHB2 FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA PLEKHB2 3069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 133319536 133319741 133319639 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 147389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 133407314 133407482 133407398 Y LYPD1,LYPD1 NA NA NA NA NA GPR39 235167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 261568 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr2 136996318 136996892 136996519 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 122583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 139112246 139112514 139112380 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 144754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 139198512 139198615 139198564 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 58653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 140977991 140978216 140978106 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 1720620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 143625721 143626570 143625926 Y KYNU KYNU KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 KYNU 6497 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 143628214 143628759 143628425 Y NA KYNU NA NA NA NA KYNU 4308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr2 143695947 143696225 143696015 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 62880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 143699726 143700104 143699915 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 66659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 143756654 143756995 143756685 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 123587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 143841282 143841488 143841338 Y KYNU,ARHGAP15 NA NA NA NA NA KYNU 208215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 144941420 144941641 144941519 Y GTDC1,ZEB2,GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 146494 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 145282878 145283078 145283058 Y ZEB2 NA NA NA NA NA GTDC1 194743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 150440132 150440521 150440417 Y NA MMADHC NA NA NA NA MMADHC 1809 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 150999106 150999378 150999253 Y RND3 NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 394147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 151537937 151538357 151538169 Y NA NA RBM43,RND3,MMADHC IMR90 Hi-C 24141950 RND3 144412 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 153057173 153057360 153057266 Y FMNL2 STAM2 FMNL2 IMR90 Hi-C 24141950 STAM2 26667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 153275296 153275683 153275311 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 85545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 153277978 153278373 153278235 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 88227 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 153309679 153309745 153309721 Y CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6 NA NA NA NA NA FMNL2 119928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 153311931 153312064 153312029 Y FMNL2 NA NA NA NA NA FMNL2 122180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 153356449 153356753 153356698 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 166698 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM NA NA NA NA NA PRPF40A 763425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 157147606 157147983 157147795 Y NA NR4A2 NA NA NA NA NR4A2 48877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 158030373 158030519 158030484 Y NA NA NR4A2,GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT5 81591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr2 158039321 158039798 158039630 Y NA NA NR4A2,GALNT5,GPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GALNT5 72312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 44105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr2 158084243 158084386 158084315 Y NA GALNT5 GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT5 27724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 158102968 158103210 158103130 Y NA GALNT5 NR4A2,GALNT5 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT5 8900 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 158117931 158118105 158118018 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 5821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 158118717 158119062 158118890 Y GALNT5 GALNT5 NA NA NA NA GALNT5 6607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 158658740 158658947 158658861 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 71427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 158712267 158712700 158712451 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 17674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4785 197513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 162727867 162728162 162727919 Y NA NA NA NA NA NA DPP4 200890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 164991272 164991524 164991400 Y FIGN NA NA NA NA NA FIGN 400750 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 166011683 166012027 166011915 Y NA NA NA NA NA NA GRB14 535325 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 166649551 166649790 166649651 Y GALNT3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 166671246 166671486 166671366 Y CSRNP3 GALNT3 NA NA NA NA GALNT3 22054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 167269953 167270071 167269980 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 461600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 169409032 169409398 169409117 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 98660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 169677226 169677236 169677231 Y NA NOSTRIN NA NA NA NA NOSTRIN 36177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 172621126 172621511 172621230 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 79207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 173117910 173118399 173118084 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 152282 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 173306862 173307108 173306983 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 16780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 173316258 173316587 173316571 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 26176 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 173544545 173544661 173544603 Y NA NA PDK1,RAPGEF4 IMR90 Hi-C 24141950 AC093818.1 125221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 173966331 173966790 173966623 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 250758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 174016358 174016802 174016556 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 200746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 174800246 174800560 174800554 Y NA SP3 NA NA NA NA SP3 27870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 175459812 175460479 175460357 Y CIR1,GPR155,WIPF1 NA NA NA NA NA WIPF1 85165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 177628731 177629135 177629049 Y NA NA NA NA NA NA LINC01117 128293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 178100990 178101571 178101482 Y NA HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 17167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 178176683 178176989 178176836 Y NA NA NA NA NA NA MIR3128 57945 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 179471296 179471384 179471314 Y TTN NA NA NA NA NA TTN-AS1 87386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 182655515 182655597 182655556 Y NA NA SSFA2,PPP1R1C MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SSFA2 98963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 182741385 182741846 182741532 Y SSFA2 SSFA2 PPP1R1C IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 12714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 184619513 184619865 184619689 Y NA NA NA NA NA NA CACYBPP2 148666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 188404228 188404596 188404560 Y TFPI TFPI NA NA NA NA TFPI 23891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 1064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 191583583 191583867 191583725 Y STAT4,NAB1 NA PMS1,MFSD6,TMEM194B,NAB1,GLS,STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NAB1 74111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 191706618 191706816 191706674 Y GLS GLS,AC005540.3 GLS,STAT1,NAB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLS 36737 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA AC098617.1 164033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 192707967 192708344 192708338 Y NA AC098617.1,SDPR NA NA NA NA AC098617.1 921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 192775335 192775569 192775423 Y OBFC2A,SDPR NA NA NA NA NA SDPR 65354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 192870555 192870805 192870799 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 160574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 192915570 192915970 192915770 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 205589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 197097649 197097961 197097892 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 58422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 225712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 198350765 198350931 198350852 Y NA COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1 NA NA NA NA HSPE1 11787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 200839985 200840279 200840201 Y NA C2orf47,TYW5 NA NA NA NA TYW5 21526 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 200850363 200850607 200850485 Y NA C2orf47,TYW5 SPATS2L,KCTD18 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TYW5 31904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 201995421 201995893 201995513 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA CFLAR 16594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 202104378 202104489 202104432 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 CASP8 NA NA NA NA CASP8 8212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 202109391 202109622 202109507 Y NA CASP8 NA NA NA NA CASP8 13225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 202560879 202561324 202561082 Y NA NA NA NA NA NA TMEM237 54586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 202897639 202898135 202897874 Y FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 203176830 203176888 203176863 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 48391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 203815351 203815558 203815462 Y NA NA NA NA NA NA WDR12 61963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 204288063 204288423 204288243 Y NA NA NA NA NA NA ABI2 97121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 34893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 204448549 204448751 204448649 Y NA NA CD28,RAPH1,CTLA4,ABI2,CYP20A1 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 50416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 204548440 204549024 204548878 Y NA NA RAPH1,CD28 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 150307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 206613471 206613845 206613585 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 68757 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208176046 208176541 208176319 Y CREB1,CCNYL1 NA KLF7,CREB1 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 215920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208195614 208195873 208195761 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 196588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208198321 208198507 208198422 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 193954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 192605 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 208200012 208200111 208200057 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB1 192350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208259563 208259980 208259919 Y NA NA KLF7 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 132481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 214566774 214567035 214566903 Y LOC100130451 NA NA NA NA NA SPAG16 419661 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 216867934 216868318 216868147 Y TMEM169 MREG NA NA NA NA MREG 28501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 216948718 216948931 216948849 Y NA TMEM169,PECR,XRCC5 NA NA NA NA PECR 3040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 217180784 217180970 217180877 Y NA NA NA NA NA NA MARCH4 53780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 219750853 219751263 219750987 Y RQCD1,WNT10A NA NA NA NA NA CDK5R2 71114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA CHPF 6038 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 223824867 223825201 223825044 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 89331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 224871549 224871941 224871745 Y NA SERPINE2 NA NA NA NA SERPINE2 30095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 224951199 224951592 224951399 Y NA SERPINE2 NA NA NA NA SERPINE2 49163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 225010758 225010857 225010808 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 108722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 225340678 225341017 225340847 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 107093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 225641346 225641365 225641350 Y CUL3,DOCK10 NA NA NA NA NA CUL3 193236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227276579 227276895 227276743 Y NA NA NYAP2,IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 385580 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 227292366 227292516 227292441 Y NA NA IRS1,LOC646736,RHBDD1 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 369959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227427883 227428152 227428018 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 234323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 227580904 227581301 227581103 Y NA NA NA NA NA NA IRS1 81174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227781487 227781745 227781553 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 83190 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 227822351 227822632 227822559 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 124054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 228253438 228253721 228253534 Y CCL20,AGFG1 NA TM4SF20,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 MFF 65571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 228473163 228473433 228473298 Y NA NA NA NA NA NA SLC19A3 107295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 230273013 230273684 230273347 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 139012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 232026724 232026986 232026907 Y NA ARMC9 NA NA NA NA ARMC9 34274 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 43843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 233926628 233927080 233926856 Y NA NA NA NA NA NA NGEF 50646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 234322287 234322459 234322373 Y SAG NA NA NA NA NA DGKD 61134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 234330770 234331121 234330825 Y INPP5D,ATG16L1 NA USP40 IMR90 Hi-C 24141950 DGKD 69617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 130399 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 235160532 235160873 235160730 Y NA NA TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 242824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 235330824 235331180 235331104 Y ARL4C NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 72517 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr2 235959667 235960159 235959834 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 101050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 236886303 236886528 236886416 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 485570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA COPS8 508840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 237654357 237654656 237654652 Y CXCR7 NA CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COPS8 337299 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 238092955 238093156 238093082 Y NA NA COL6A3,MLPH,LRRFIP1,RAB17,PRLH IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 100495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 238320410 238321055 238320789 Y COL6A3 NA NA NA NA NA MLPH 71016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 238611190 238611575 238611206 Y LRRFIP1 NA NA NA NA NA LRRFIP1 76971 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 FAM132B NA NA NA NA FAM132B 14795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr2 239078028 239078257 239078143 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 12405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.92534661527482 chr2 239552819 239552999 239552910 Y PER2 NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 ASB1 219436 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 239870450 239870747 239870599 Y NA NA LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4 IMR90 Hi-C 24141950 AC062017.1 450383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 240145548 240145836 240145702 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 175294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 240186875 240187303 240186998 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 133827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 240866823 240867270 240867165 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA10 95549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 241366341 241366661 241366471 Y GPR35,GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 6427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 241373489 241373922 241373594 Y GPC1 GPC1 NA NA NA NA GPC1 401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 241519364 241519647 241519506 Y NA DUSP28,RNPEPL1,ANKMY1,CAPN10 NA NA NA NA CAPN10 4486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 242455386 242455795 242455485 Y NEU4,C2orf85 STK25,BOK NA NA NA NA STK25 8241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr2 242710043 242710405 242710079 Y NA D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 38049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr2 243028160 243028467 243028224 Y ATG4B NA NA NA NA NA D2HGDH 356166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 447394 447636 447634 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 6197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 1097798 1098000 1097899 Y NA PSMF1 NA NA NA NA PSMF1 5892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 1307828 1308261 1308086 Y SDCBP2 NA NA NA NA NA FKBP1A 63545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 1396685 1396983 1396828 Y SDCBP2,SIRPA FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 24879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 2090589 2090758 2090698 Y NA STK35 NA NA NA NA STK35 10332 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 4018656 4019040 4018859 Y PANK2,PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 RNF24,CENPB,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 16104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 4090299 4090467 4090408 Y SMOX SMOX LOC728228,PANK2,MIR103B2,ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 9160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 4108169 4108199 4108184 Y NA SMOX LOC728228,ADRA1D,SMOX,RNF24 IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 8542 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D NA NA NA NA NA SMOX 98793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr20 4203123 4203484 4203336 Y NA NA NA NA NA NA SMOX 103496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 5042007 5042186 5042103 Y PRNP,PRNP,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA-AS1,PCNA IMR90 Hi-C 24141950 PCNA 63086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 PCNA 58359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 5127563 5128387 5127720 Y GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA CDS2 22131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5155364 5155504 5155434 Y NA CDS2 NA NA NA NA CDS2 49932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 5588948 5589498 5589341 Y CDS2,TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr20 5635212 5635550 5635485 Y TRMT6,GPCPD1 GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 45540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 5717960 5718260 5718168 Y C20orf196 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5825010 5825403 5825098 Y NA NA NA NA NA NA CHGB 64673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5899454 5899753 5899716 Y NA CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 9378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 5900000 5900262 5900165 Y GPCPD1,TRMT6 CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 9924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 6015657 6015992 6015825 Y NA CRLS1 NA NA NA NA CRLS1 30921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 7479812 7480195 7480004 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 518281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 8173456 8173854 8173482 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 62632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 10224599 10224683 10224625 Y NA SNAP25 NA NA NA NA SNAP25 27121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 10655214 10655688 10655561 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 30200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 11831025 11831188 11831107 Y BTBD3 BTBD3 NA NA NA NA BTBD3 38183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 17593106 17593506 17593263 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 44598 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr20 18779270 18779601 18779408 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 212733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 19574578 19574842 19574710 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 161510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 19716018 19716528 19716293 Y NA RP1-122P22.2 NA NA NA NA RP1-122P22.2 19824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 19804713 19804972 19804782 Y NA NA RIN2,SLC24A3,NAA20 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 68361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,C20orf26,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 20605285 20605597 20605591 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 85534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 21147247 21147656 21147458 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 42623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 21417020 21417216 21417107 Y NA NKX2-4 XRN2 IMR90 Hi-C 24141950 NKX2-4 40354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 21486506 21486611 21486559 Y NA NA NA NA NA NA NKX2-4 109840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 283878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 22776496 22776845 22776664 Y NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 251533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 23031353 23032100 23031620 Y GZF1,THBD,CD93 THBD NA NA NA NA THBD 2975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 23123782 23124035 23123853 Y NA NA LOC200261 IMR90 Hi-C 24141950 THBD 95404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 108207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 23140057 23140426 23140138 Y THBD,CD93,NXT1,GZF1 NA NA NA NA NA THBD 111679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA NA NA NA NA NA ENTPD6 204226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 25227906 25228088 25227908 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 1201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 25440750 25441053 25440935 Y NA NA NA NA NA NA GINS1 54387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 25720350 25720533 25720473 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 44873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 30175524 30175854 30175562 Y NA ID1 NA NA NA NA ID1 15232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 30190743 30190994 30190797 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 92 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 30263216 30263335 30263276 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr20 30621646 30621751 30621709 Y TM9SF4,PLAGL2,C20orf112,HCK NA NA NA NA NA TM9SF4 73558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 32694090 32694253 32694172 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 3885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH,CDC42P1 NA NA NA NA CDC42P1 1169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33491673 33492056 33491689 Y TP53INP2,ACSS2 ACSS2,GSS NA NA NA NA ACSS2 33724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33723601 33723932 33723853 Y EDEM2 TRPC4AP,PROCR NA NA NA NA PROCR 33944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 33803083 33803443 33803260 Y NA PROCR,MT1P3 TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MT1P3 369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33899361 33899545 33899443 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 28573 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 34127589 34128004 34127717 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC3 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 34330989 34331372 34331294 Y SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39 ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA RBM39 2755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 34463368 34463773 34463624 Y NFS1 RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 9808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 34471781 34472424 34472101 Y NA RNU4-40P NA NA NA NA RNU4-40P 1157 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 35362274 35362463 35362369 Y NA NDRG3,DSN1 NA NA NA NA NDRG3 10018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 35887668 35888008 35887942 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 28033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 35923453 35923684 35923588 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL NA NA NA NA MANBAL 7412 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 18651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 36796708 36797026 36796907 Y CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI TGM2 TGM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TGM2 3728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 37229958 37230063 37230010 Y ARHGAP40 ARHGAP40 NA NA NA NA ARHGAP40 1381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 37398577 37398739 37398665 Y NA ACTR5 NA NA NA NA ACTR5 23492 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 37626282 37626666 37626585 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 37340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 39135119 39135769 39135457 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 180111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 39339297 39339534 39339402 Y NA MAFB MAFB IMR90 Hi-C 24141950 MAFB 23417 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 39346769 39346927 39346856 Y NA MAFB NA NA NA NA MAFB 30889 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 39631777 39632207 39632178 Y NA TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 23251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 39632234 39632572 39632465 Y MAFB,TOP1 TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 22886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr20 42545648 42546044 42545953 Y NA NA NA NA NA NA MYBL2 251894 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 42828501 42828745 42828623 Y NA OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 8855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 42948601 42948866 42948737 Y NA FITM2 GDAP1L1,FITM2,C20orf111,LOC100505783,RIMS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FITM2 10792 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 43272135 43272561 43272438 Y C20orf111,STK4 ADA NA NA NA NA ADA 6313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 43569969 43570092 43570031 Y RBPJL,TP53TG5,STK4 PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 17035 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 43876988 43877346 43877094 Y NA SLPI NA NA NA NA SLPI 3859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 43965327 43965544 43965453 Y SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 9520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT,WFDC2 NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 44139141 44139436 44139290 Y SYS1,ZNF335 WFDC2 NA NA NA NA WFDC2 42795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 44410242 44410504 44410445 Y NA DNTTIP1,UBE2C,SNX21 NA NA NA NA DNTTIP1 8072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA ZMYND8 113049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 38884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 37086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA ZMYND8 NA NA NA NA ZMYND8 20353 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 46438543 46438763 46438619 Y SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA NCOA3 309942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 47750965 47751079 47750977 Y ZNFX1 NA NA NA NA NA STAU1 51825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48236919 48237304 48237112 Y SPATA2 NA NA NA NA NA B4GALT5 91111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 48334324 48334539 48334447 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 B4GALT5 K562 ChIA-PET 22265404 B4GALT5 5909 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr20 48533898 48534043 48533948 Y B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 3818 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48763277 48763795 48763638 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 4379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 48838079 48838414 48838219 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB CEBPB PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 32703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48950504 48950697 48950581 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 145128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 146419 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 49057048 49057261 49057196 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 49157621 49157908 49157761 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 32730 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 49345638 49345902 49345710 Y MOCS3,PARD6B PARD6B NA NA NA NA PARD6B 179 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 49406894 49407134 49407016 Y NA BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 2297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA NA KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MOCS3 76973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 50366318 50366439 50366379 Y NA RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 16734 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 ATP9A 143970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 52238141 52238435 52238216 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 13695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr20 52390351 52390640 52390407 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 165905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 52516053 52516507 52516332 Y ZNF217 NA ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 291607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 256247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 52740107 52740637 52740253 Y NA NA DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 81749 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 55264382 55264603 55264519 Y NA PTMAP6 BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 9967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 55362710 55362938 55362792 Y AURKA,TFAP2C NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr20 55363467 55363682 55363577 Y NA NA TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 88897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 56194057 56194266 56194203 Y ZBP1 NA NA NA NA NA PMEPA1 90326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 56251701 56252046 56251896 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 32546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 56270075 56270492 56270216 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 14100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 56273255 56273697 56273462 Y PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 10895 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 60803093 60803442 60803179 Y NA OSBPL2 NA NA NA NA OSBPL2 8138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 60933408 60933760 60933692 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 6608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr20 60944265 60944566 60944463 Y NA MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 3897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 61076779 61077313 61077048 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 NA NA NA NA NA CABLES2 96438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr20 61371540 61371927 61371747 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR NTSR1 NA NA NA NA NTSR1 33351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr20 61425509 61425950 61425706 Y DPH3P1,DIDO1,OGFR OGFR,COL9A3 NA NA NA NA OGFR 8237 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr20 62527317 62528264 62527831 Y PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5 TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA DNAJC5 2799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr21 16064365 16064765 16064448 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA HSPA13 310560 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 16594224 16594634 16594357 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 158903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 16595049 16595428 16595334 Y NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 159728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17103695 17103792 17103750 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 3351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17104761 17105053 17104812 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 4417 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17681993 17682347 17682285 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 26904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 18443678 18443955 18443817 Y NA NA NA NA NA NA CXADR 438745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 18886111 18886899 18886569 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 3411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 22545026 22545343 22545185 Y NA NA NA NA NA NA TUBAP 2234105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 28207147 28207505 28207325 Y NA ADAMTS1 NA NA NA NA ADAMTS1 8223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 29476694 29476903 29476871 Y NA NA NA NA NA NA AF131217.1 568267 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 29660800 29661042 29660922 Y NA NA ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 384128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 29765694 29766009 29765812 Y NA NA NA NA NA NA AF131217.1 279161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 30006167 30006692 30006407 Y NA AF131217.1 ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 38478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 30009367 30009732 30009551 Y NA AF131217.1 ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 35438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 30009773 30009970 30009799 Y NA AF131217.1 ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 AF131217.1 35200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 30191610 30191885 30191792 Y C21orf7 NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 63808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.73287814319822 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 30567218 30567411 30567380 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 2826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 30580486 30581464 30581071 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 16094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 464653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 32546701 32546751 32546739 Y NA NA NA NA NA NA TIAM1 383539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 33870747 33870982 33870865 Y NA NA NA NA NA NA C21orf119 107308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 34383763 34384240 34383948 Y IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG2,OLIG1 NA OLIG1 IMR90 Hi-C 24141950 IFNAR2 215966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 34733678 34734189 34733958 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART IFNAR1,IFNGR2 NA NA NA NA IFNAR1 38944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 34752926 34753284 34753094 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 19918 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 35570503 35571291 35570720 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 126633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 130159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 35976444 35976765 35976605 Y NA RCAN1 NA NA NA NA RCAN1 8676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 194238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 200486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 235308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 36222572 36222954 36222768 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 237131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 238290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 247775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 36423642 36423856 36423739 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 438201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 37485408 37485566 37485491 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 19644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 37670543 37670742 37670650 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 19745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 37843578 37844008 37843756 Y NA AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 42920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 37850474 37850838 37850572 Y NA AP000695.6 NA NA NA NA AP000695.6 49816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 37909542 37909917 37909766 Y NA NA NA NA NA NA AP000695.6 108884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 38346647 38347014 38346835 Y NA AP000704.5,HLCS NA NA NA NA AP000704.5 9835 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 39649239 39650359 39649644 Y KCNJ15,KCNJ15,KCNJ15 NA NA NA NA NA ETS2 524872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 40159439 40159794 40159507 Y NA ETS2 ETS2,LINC00114 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETS2 15437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 40176258 40176616 40176368 Y NA ETS2 NA NA NA NA ETS2 1027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 40278958 40279421 40279192 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 103727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 40393264 40393350 40393326 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 160427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 42485232 42485526 42485376 Y NA NA NA NA NA NA BACE2 52202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 42543184 42543509 42543444 Y BACE2 BACE2 NA NA NA NA BACE2 5456 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr21 43431472 43431831 43431677 Y NA NA NA NA NA NA C2CD2 59473 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44355985 44356328 44356154 Y NA PKNOX1 U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 PKNOX1 36292 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44614192 44614410 44614235 Y NA NA HSF2BP,LINC00313,SIK1 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 88495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44727003 44727328 44727122 Y RRP1,HSF2BP LINC00322 LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 LINC00322 22591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 44819081 44819261 44819206 Y NA SIK1,LINC00319 NA NA NA NA SIK1 25747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1,LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr21 44860778 44861412 44860950 Y SIK1 SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 3069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr21 44862613 44862764 44862681 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 1717 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44867284 44867543 44867469 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 2803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 44876908 44877060 44877025 Y NA SIK1,LINC00319,LINC00313 NA NA NA NA LINC00319 12427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 LINC00319,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 17052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 20588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 39370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44937921 44938237 44938215 Y NA LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 40507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 44942511 44942810 44942777 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 45097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr21 45023085 45023419 45023272 Y TRAPPC10,PDXK,CSTB,U2AF1 NA NA NA NA NA HSF2BP 53955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 45117744 45118082 45118052 Y NA HSF2BP,RRP1B,PDXK PDXK IMR90 Hi-C 24141950 PDXK 18893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 45590858 45591062 45590983 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 C21orf33,PWP2,ICOSLG K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C21orf33 39371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 45662608 45662724 45662682 Y TRAPPC10,C21orf2,ICOSLG ICOSLG NA NA NA NA ICOSLG 3759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46298625 46298957 46298811 Y ITGB2 PTTG1IP PTTG1IP K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTTG1IP 6873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46971386 46971506 46971439 Y POFUT2,SLC19A1 SLC19A1 SLC19A1,LOC100129027,PCBP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 9061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 46982041 46982418 46982230 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 19716 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 47012173 47012565 47012399 Y NA SLC19A1 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2,COL18A1-AS1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC19A1 49848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA NA NA NA NA NA LSS 82499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 47935050 47935239 47935141 Y NA NA NA NA NA NA DIP2A 58238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 47968526 47968894 47968542 Y NA NA NA NA NA NA PRMT2 84185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 NA NA NA NA NA PRMT2 59185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr21 48003626 48004009 48003657 Y S100B,PRMT2 PRMT2 NA NA NA NA PRMT2 49070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr21 48046497 48046712 48046597 Y DIP2A,PRMT2 PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRMT2 6367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 17306294 17306463 17306397 Y IL17RA,CECR1 NA NA NA NA NA IL17RA 257381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 17568441 17568522 17568513 Y NA IL17RA NA NA NA NA IL17RA 4597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 21132162 21132336 21132252 Y NA NA NA NA NA NA SNAP29 78935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 22205229 22205454 22205405 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 14516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 23338343 23338736 23338580 Y NA NA RTDR1,GNAZ,ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 BCR 181155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 23923554 23923700 23923627 Y IGLL1 NA NA NA NA NA GUSBP11 133843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr22 24799556 24799967 24799568 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1L-ADORA2A 134690 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24833641 24833901 24833753 Y NA NA NA NA NA NA SNRPD3 115570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24878539 24879065 24878732 Y GGT1 NA NA NA NA NA SNRPD3 70406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24882484 24882627 24882564 Y GGT1 NA NA NA NA NA SNRPD3 66844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 24948988 24949121 24949055 Y ADORA2A SNRPD3 NA NA NA NA SNRPD3 350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 25390259 25390306 25390285 Y NA NA KIAA1671 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNORD56 95078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP1-40G4P.1 227479 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MN1 322457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 28065247 28065726 28065530 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 129760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr22 28114157 28114741 28114406 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 80745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr22 28122669 28123242 28122949 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA MN1 72244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 29339124 29339474 29339174 Y NA NA KREMEN1,C22orf31 IMR90 Hi-C 24141950 ZNRF3 61544 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 30604572 30605275 30604996 Y NA LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIF 35565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF NA NA NA NA LIF 2940 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF NA NA NA NA LIF 8356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 30651841 30652045 30651989 Y RNF215 LIF LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 11001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 30653574 30654311 30654075 Y RNF215,GAL3ST1 LIF LIF IMR90 Hi-C 24141950 LIF 12734 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr22 30664436 30664582 30664509 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 23596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 30801557 30801812 30801706 Y OSM,CCDC157,SF3A1 SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA SEC14L2 10711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 31229455 31229575 31229536 Y NA NA NA NA NA NA TUG1 135088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 31294163 31294373 31294268 Y OSBP2 NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 70290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 31609195 31609531 31609513 Y RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 2970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 31639418 31639541 31639442 Y NA LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 33193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA NA NA NA NA NA LIMK2 59770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 32048774 32049039 32049031 Y NA PISD SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L GM12878,K562,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 PISD 7379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr22 32614060 32614086 32614078 Y DEPDC5,SLC5A1,SLC5A4 RP1-90G24.10 NA NA NA NA RP1-90G24.10 14958 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 36767098 36767482 36767405 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 14581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 37484097 37484413 37484195 Y IL2RB NA NA NA NA NA TST 70416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 37585028 37585323 37585113 Y NA C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 8102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 37624836 37624960 37624904 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,RAC2 NA NA NA NA Z82188.1 4801 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr22 37948648 37948841 37948736 Y NA CARD10,CDC42EP1 NA NA NA NA CDC42EP1 5613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 38198030 38198142 38198086 Y NA H1F0,GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54 NA NA NA NA H1F0 972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 38568765 38569142 38568994 Y PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA MAFF 26747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 38624836 38625209 38625138 Y JOSD1,GTPBP1,CSNK1E,MAFF MAFF,PLA2G6,TMEM184B NA NA NA NA PLA2G6 25139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr22 38705287 38705445 38705426 Y NA TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 38247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 38847286 38847612 38847528 Y NA KDELR3 NA NA NA NA KDELR3 14455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 39091291 39091422 39091336 Y NA CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1 NA NA NA NA JOSD1 4139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 39608827 39609203 39608881 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 29553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 39650923 39651173 39651026 Y ATF4,SUN2,SUN2,APOBEC3A PDGFB CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 12167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 39673318 39673703 39673519 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDGFB 34562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 39693596 39693744 39693670 Y MGAT3 RPL3 NA NA NA NA RPL3 20650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 39923809 39924011 39923907 Y NA ATF4,RPS19BP1 NA NA NA NA RPS19BP1 2849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 41963002 41963015 41963009 Y NA POLR3H,PMM1 NA NA NA NA PMM1 20879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 42839941 42840323 42840234 Y POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1 CTA-126B4.7 MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-126B4.7 7912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 43100819 43101017 43100994 Y NA A4GALT NA NA NA NA A4GALT 14287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 43178512 43178746 43178699 Y NA NA NA NA NA NA A4GALT 63208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 43369643 43369761 43369702 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 39390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 43500072 43500319 43500196 Y NA TTLL1,BIK,MCAT,TSPO MCAT,BIK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BIK 4435 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 43740111 43740598 43740319 Y NA NA NA NA NA NA Z99756.1 70150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 44705061 44705332 44705192 Y PARVB,PARVG,PARVG NA NA NA NA NA LDOC1L 186846 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 44756999 44757252 44757125 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134926 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr22 44757371 44757617 44757493 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 134561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 45624322 45624510 45624404 Y KIAA0930 KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 10140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA NA NA NA NA NA CTA-941F9.9 53914 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3157 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 46970983 46971382 46971054 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 1074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 47149923 47150411 47150155 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 47363549 47363576 47363563 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 207031 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 47525665 47525872 47525801 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 369147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 450168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr22 50364171 50364294 50364188 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr22 50496914 50497067 50497001 Y NA NA NA NA NA NA PANX2 110093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50680113 50680250 50680180 Y SELO SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 1171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50976592 50977006 50976816 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 7583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 3639816 3640081 3639965 Y NA NA NA NA NA NA CRBN 420422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA NA NA NA NA NA SETMAR 488335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 4871506 4871670 4871602 Y ITPR1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA AC018816.3 55307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 5036570 5037120 5036867 Y NA BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 16924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 5058332 5058543 5058409 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BHLHE40-AS1 38686 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 5059566 5059965 5059743 Y ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 39920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 5063521 5063694 5063575 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 43875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 45390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr3 5157481 5157555 5157517 Y NA ARL8B NA NA NA NA ARL8B 4350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 5191163 5191386 5191276 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA ARL8B 29258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 5539274 5539498 5539388 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 311943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 8335682 8335807 8335745 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 205586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 8783302 8783537 8783436 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 219920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 9287603 9287640 9287617 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD3 114886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 10240437 10240684 10240523 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 35888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 11316376 11316801 11316733 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 4381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 11332891 11333370 11333202 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 20896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 11812040 11812191 11812115 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 51820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 NA NA NA NA NA NR2C2 271895 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 15847096 15847637 15847448 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 51641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 16379433 16379643 16379566 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 74727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 16380469 16380852 16380674 Y DPH3 NA NA NA NA NA OXNAD1 75763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 18140643 18140862 18140682 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 343447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 18782585 18783290 18782757 Y SATB1 NA NA NA NA NA RAD23BP1 204420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 23155387 23155542 23155465 Y UBE2E2 NA NA NA NA NA UBE2E2 86969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 23431263 23431479 23431424 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 188752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 23432118 23432366 23432242 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 189607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 23782023 23782329 23782145 Y NR1D2,UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 63065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 24340917 24341295 24341106 Y NA NA NA NA NA NA THRB 193478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr3 27719100 27719312 27719216 Y NA AC098614.2 NEK10,SLC4A7 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 46633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 30269318 30269730 30269646 Y NA NA TGFBR2,GADL1 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 376264 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 30723230 30723490 30723363 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 77236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32434248 32434406 32434345 Y NA CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 3085 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 33190938 33191178 33190994 Y NA CRTAP NA NA NA NA CRTAP 37467 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 33638872 33639200 33639124 Y NA NA NA NA NA NA CLASP2 118648 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 37011455 37011827 37011685 Y LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11 NA NA NA NA EPM2AIP1 20968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 37164159 37164535 37164493 Y NA NA MLH1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRFIP2 58645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 37519285 37519417 37519356 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC097359.1 235599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 38193404 38193826 38193575 Y VILL,ACAA1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 OXSR1 IMR90 Hi-C 24141950 OXSR1 10754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 40665124 40665471 40665257 Y ZNF619,ZNF619 EEF1GP3 ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1GP3 28139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 41020127 41020439 41020283 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 213889 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 41158856 41159369 41159156 Y NA NA ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNB1 74959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 41201399 41201578 41201489 Y NA CTNNB1 ULK4,CTNNB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTNNB1 32750 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 8.06199052243474 chr3 42108875 42109165 42109003 Y ULK4 NA NA NA NA NA TRAK1 55581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 42514598 42514851 42514767 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 42531634 42531985 42531932 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 NA NA NA NA VIPR1 2843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3 NA NA NA NA ZDHHC3 20058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 79456 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 45109274 45109492 45109385 Y NA NA NA NA NA NA CDCP1 76422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45138887 45139080 45139004 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 46834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45147419 45147607 45147508 Y TMEM158,CDCP1 CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 38307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 20102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45208648 45208845 45208728 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 8981 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 46989533 46989702 46989634 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 29471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 46989736 46990203 46989983 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 28970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 47078393 47078462 47078449 Y NA NA NA NA NA NA CCDC12 56893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 47879431 47879730 47879653 Y SPINK8 DHX30 NA NA NA NA DHX30 37032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 48330483 48330839 48330661 Y PLXNB1 ZNF589,NME6 NA NA NA NA NME6 10336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 49358291 49358883 49358713 Y ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA USP4 17262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 49938038 49938186 49938111 Y TUSC2,APEH,GMPPB,SEMA3F,MST1R,MON1A,IFRD2,C3orf54 TRAIP,MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MST1R 1113 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 50194710 50194859 50194796 Y TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 4232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 50208155 50208394 50208279 Y MAPKAPK3,RBM5,GNAI2 SEMA3F GNAT1,SLC38A3,GNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3F 17677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 50246310 50246610 50246523 Y HYAL1,SEMA3B GNAI2 NA NA NA NA GNAI2 15114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 50354393 50354598 50354449 Y MST1R IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA HYAL2 3739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 50627976 50628161 50628029 Y RASSF1,MAPKAPK3,CISH HEMK1,MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA MAPKAPK3 18790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 51728520 51728585 51728552 Y NA TEX264 NA NA NA NA TEX264 33811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 52079728 52079827 52079778 Y DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 8739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 52091161 52091675 52091445 Y TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 2595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 52926819 52927340 52927162 Y PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110 TMEM110-MUSTN1,TMEM110 NA NA NA NA TMEM110-MUSTN1 2238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 53200960 53201293 53201179 Y PBRM1,GLT8D1,TKT,DCP1A,PRKCD RFT1,PRKCD NA NA NA NA PRKCD 12935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 706329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 56106137 56106188 56106158 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 483001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 56788241 56788289 56788257 Y ARHGEF3 NA NA NA NA NA FAM208A 72976 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57051619 57051945 57051783 Y NA SPATA12 NA NA NA NA SPATA12 40524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 57874517 57874643 57874579 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 117484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57958534 57958833 57958768 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 33294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57963451 57963815 57963633 Y NA FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 28312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57964155 57964263 57964209 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 27864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57969350 57969849 57969627 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 22278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 58159699 58160034 58159862 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 61199 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 58168035 58168365 58168200 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 52868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 58192298 58192649 58192549 Y NA ABHD6 NA NA NA NA ABHD6 28584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr3 58984210 58984527 58984399 Y NA C3orf67 NA NA NA NA C3orf67 49283 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 59545502 59545850 59545701 Y NA NA FAM3D,FHIT,C3orf67 IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 511692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 60695765 60695821 60695814 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 539312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 62052710 62052952 62052831 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 249696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 62590103 62590230 62590174 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 237098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 62926615 62926793 62926705 Y CADPS LINC00698 NA NA NA NA LINC00698 7312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 65950044 65950258 65950163 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 72251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 67295440 67295652 67295546 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 407386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 69789363 69789667 69789441 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 2777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 71150221 71150629 71150383 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 480511 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 71538205 71538976 71538530 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 92164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 71628462 71628802 71628743 Y NA FOXP1 NA NA NA NA FOXP1 2338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 72132186 72132563 72132457 Y RYBP,FOXP1,EIF4E3,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,PROK2 NA NA NA NA NA EIF4E3 330262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA NA NA NA NA NA CCDC75P1 467172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 74439527 74439583 74439555 Y NA NA NA NA NA NA FAM86DP 1042678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 80239226 80239506 80239338 Y ROBO1 NA NA NA NA NA ROBO1 424261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 CHMP2B 431149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B NA NA NA NA NA CHMP2B 275121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr3 98497288 98497481 98497360 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 121052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 98509261 98509585 98509483 Y NA NA NA NA NA NA DCBLD2 108948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 98685741 98686133 98685825 Y NA LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 11769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 8.06199052243474 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 99224992 99225368 99225241 Y NA NA MIR548G,COL8A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL8A1 129951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 99262027 99262447 99262268 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 92872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.37260502911714 chr3 99356024 99356457 99356227 Y NA COL8A1 NA NA NA NA COL8A1 705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99581173 99581391 99581282 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 225854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99584293 99584813 99584482 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 228974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99600050 99600430 99600273 Y FILIP1L,C3orf26 NA NA NA NA NA COL8A1 244731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 264726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 212844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 101645465 101645839 101645546 Y NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 100630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.92534661527482 chr3 101682865 101682979 101682914 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 138030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 101737560 101737901 101737647 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NA NA NA NA NA NFKBIZ 192725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 105316935 105317233 105317084 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 233182 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 105395533 105395739 105395657 Y NA NA NA NA NA NA CBLB 190657 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 105549302 105549342 105549320 Y CBLB CBLB NA NA NA NA CBLB 37054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 107705661 107706042 107705959 Y CD47 NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101830 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 107850030 107850463 107850156 Y MYH15,CD47 CD47 CD47,IFT57,MYH15 IMR90 Hi-C 24141950 CD47 42158 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 111521164 111521550 111521388 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA PHLDB2 71820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.23596112195723 chr3 111943889 111944218 111944054 Y NA NA NA NA NA NA C3orf52 140707 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 112095802 112096161 112095994 Y CD200 NA NA NA NA NA SLC35A5 182395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 112351265 112351470 112351440 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 14907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 114257066 114257260 114257069 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 483606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 114271834 114271933 114271884 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 498374 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 114577698 114578255 114577941 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 285863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 114681173 114681431 114681302 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 182687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 114813239 114813371 114813303 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 50747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 118561016 118561389 118561159 Y NA NA NA NA NA NA B4GALT4 396561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 119142297 119142580 119142348 Y ARHGAP31,NR1I2,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 43097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 119644387 119644860 119644721 Y NA NA NA NA NA NA GSK3B 166404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 119809073 119809433 119809278 Y NA GSK3B,RP11-18H7.1 NA NA NA NA GSK3B 1831 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 121638049 121638246 121638101 Y CSTA,ILDR1 NA NA NA NA NA EAF2 86019 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 EIF4BP8,PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 122486684 122487080 122486948 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2 HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 23591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 122651416 122651525 122651470 Y SEMA5B NA NA NA NA NA PDIA5 132384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 123324068 123324437 123324253 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 21679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 123740748 123740806 123740777 Y NA NA KALRN IMR90 Hi-C 24141950 CCDC14 62184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 124605050 124605342 124605178 Y ITGB5 ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 12923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 125712652 125712829 125712741 Y NA NA NA NA NA NA FAM86JP 79189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 126074775 126075511 126074965 Y ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15 KLF15 NA NA NA NA KLF15 490 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 239994 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 240445 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 127487223 127487760 127487461 Y TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL NA NA NA NA NA MGLL 52291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr3 127536409 127536633 127536521 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL,KBTBD12 MGLL NA NA NA NA MGLL 3418 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 127539467 127539812 127539513 Y MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 239 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 127729316 127729371 127729322 Y DNAJB8 SEC61A1 SEC61A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SEC61A1 39113 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 128366732 128367045 128366901 Y NA RPN1 NA NA NA NA RPN1 30873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 128831103 128831496 128831287 Y NA RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 8148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 128958880 128959235 128959095 Y H1FOO NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 58115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 131961835 131962144 131961940 Y UBA5 RPL7P16 CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 133295128 133295300 133295215 Y NA CDV3 NA NA NA NA CDV3 4554 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 133537876 133537890 133537883 Y NA SRPRB NA NA NA NA SRPRB 36999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 134051149 134051359 134051254 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 20731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 135897983 135898047 135898015 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 16036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 136067042 136067151 136067097 Y NA NA NA NA NA NA PCCB 99894 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 136420425 136420819 136420623 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 48401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 136448168 136448437 136448423 Y NA STAG1 NA NA NA NA STAG1 20783 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 136563637 136563997 136563817 Y NA RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 14899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 137768870 137769254 137769106 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 63406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 137938227 137938395 137938336 Y ARMC8 DBR1,ARMC8 NA NA NA NA ARMC8 34118 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 82539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 139064285 139064552 139064299 Y NA COPB2,RP11-319G6.1 NA NA NA NA COPB2 42022 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141050524 141051086 141050761 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 9469 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr3 141126018 141126305 141126087 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 77584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 141133650 141133961 141133787 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 69928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141175186 141175511 141175311 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 28378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 141240287 141240651 141240396 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 36398 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 141758636 141758867 141758743 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 2173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 143164009 143164340 143164242 Y NA NA NA NA NA NA PBX2P1 270882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 145164438 145164687 145164563 Y NA NA NA NA NA NA RPL21P39 375839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 146031799 146032049 146031857 Y PLSCR4 NA PLOD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLSCR4 64833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 35798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA CP NA NA NA NA CP 5001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr3 148963630 148964002 148963862 Y NA CP GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CP 25788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA TM4SF1 NA NA NA NA TM4SF1 35671 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 149099928 149100323 149100052 Y TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 6276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.8260294004775 chr3 149108520 149108892 149108690 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 WWTR1,HLTF,HPS3,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 14868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr3 149225895 149226130 149226044 Y RNF13 RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 15448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 149229459 149229794 149229606 Y NA RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 19012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 149271786 149271997 149271800 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 61339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 149297469 149297617 149297606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 87022 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr3 149330317 149330600 149330464 Y WWTR1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 119870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 149533104 149533741 149533325 Y RNF13 RNF13 NA NA NA NA RNF13 4609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 149665230 149665637 149665395 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 149669691 149669713 149669697 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 14459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr3 150417166 150417289 150417212 Y NA RP11-103G8.2,FAM194A NA NA NA NA RP11-103G8.2 2062 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr3 150453151 150453509 150453478 Y CLRN1 RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2 NA NA NA NA SIAH2-AS1 24215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 151486383 151486557 151486470 Y NA AADAC NA NA NA NA AADAC 43268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 151507223 151507685 151507381 Y NA AADAC NA NA NA NA AADAC 22140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 151738872 151739003 151738949 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 AADAC 209047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 151739734 151740181 151739895 Y NA NA MBNL1 IMR90 Hi-C 24141950 AADAC 209909 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr3 151993494 151994006 151993570 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 8150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 151996540 151996946 151996646 Y NA MBNL1,MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 11196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152120876 152121103 152120983 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 135532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152215203 152215520 152215350 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 229859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152856443 152856813 152856615 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 21216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr3 153002176 153002347 153002282 Y P2RY1,RAP2B NA RAP2B IMR90 Hi-C 24141950 RAP2B 124147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 153017510 153017568 153017539 Y NA NA NA NA NA NA RAP2B 139481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 155316441 155316741 155316588 Y NA NA NA NA NA NA PLCH1 144115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 156202207 156202259 156202239 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,LEKR1,LEKR1 NA NA NA NA NA SSR3 68714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 156229646 156229758 156229715 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 41215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA RP11-6F2.5,CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.09931721479732 chr3 158048767 158049059 158048913 Y NA NA NA NA NA NA RSRC1 227123 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 158491929 158492257 158492161 Y NA MFSD1 RARRES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MFSD1 43942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA NMD3 128701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 165215447 165215733 165215492 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 337527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 166686803 166687129 166686941 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 763598 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 167369160 167369394 167369277 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 81333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 167376206 167376511 167376359 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 74216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 169172792 169172932 169172865 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 206474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 169482089 169482431 169482154 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA TERC 1241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 169502698 169502873 169502785 Y GPR160,MYNN,LRRC34 TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 14079 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 169508571 169508792 169508647 Y NA TERC,MYNN,LRRC34 NA NA NA NA MYNN 19952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 NA CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 140452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 170712510 170712744 170712722 Y SLC2A2 NA NA NA NA NA EIF5A2 88028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171078129 171078522 171078326 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 97675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171146057 171146176 171146159 Y NA TNIK NA NA NA NA TNIK 30021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 171594447 171594730 171594655 Y NA NA NA NA NA NA PLD1 67707 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.68938549331759 chr3 171678764 171678932 171678818 Y NA NA PLD1,FNDC3B,TMEM212,TNIK IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 76486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr3 171684878 171685278 171685188 Y PLD1,FNDC3B NA PLD1,FNDC3B,TMEM212 IMR90 Hi-C 24141950 FNDC3B 70140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 171792323 171792831 171792493 Y PLD1,FNDC3B FNDC3B NA NA NA NA FNDC3B 36905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171853185 171854055 171853751 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 97767 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 171863188 171863575 171863224 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 107770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 171878014 171878468 171878150 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 122596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 172234609 172234750 172234680 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 4547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 172325180 172325357 172325227 Y NA NA TNFSF10 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 85883 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 174493498 174493729 174493615 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2 339135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 174652666 174653024 174652845 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2 498303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 174868634 174868952 174868706 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 565506 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 175056588 175056892 175056754 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 377566 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 175695899 175696046 175695968 Y NA NA NLGN1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V1P2 261441 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 177075253 177075542 177075439 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 161992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 178236576 178236655 178236649 Y KCNMB2 NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 551412 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 178423779 178424120 178423952 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 363947 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 178755149 178755598 178755383 Y NA ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 32469 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr3 179049621 179049719 179049674 Y NA ZNF639,MFN1 NA NA NA NA ZNF639 10842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 8912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 181437056 181437346 181437302 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 9342 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 14555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr3 182550667 182550775 182550721 Y ATP11B ATP11B NA NA NA NA ATP11B 41379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 182973152 182973434 182973425 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 4120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 182980670 182980835 182980709 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr3 183088664 183088916 183088772 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA B3GNT5 119632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 183098974 183099227 183099069 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA B3GNT5 129942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 183251473 183251828 183251763 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 99528 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA VPS8 199839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 185050290 185050463 185050301 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K13 51561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 185905496 185905742 185905693 Y NA NA NA NA NA NA ETV5 79389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 187459288 187459644 187459469 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 1871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 187467867 187468249 187468141 Y BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 6352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 188014586 188014976 188014809 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 144741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 188035801 188035961 188035890 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 165956 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 188103161 188103345 188103235 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 233316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 188291512 188291633 188291575 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 371795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 189022377 189022942 189022424 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 358949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr3 189559377 189559697 189559485 Y CLDN1,TP63 NA NA NA NA NA CLDN1 478567 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 189626513 189626760 189626607 Y TP63 NA NA NA NA NA CLDN1 411504 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr3 190284228 190284576 190284349 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 54388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 88360 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 192289148 192289495 192289213 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 344455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 192604773 192605048 192605023 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 28902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 192608372 192608637 192608617 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 25313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 264088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 193590130 193590422 193590276 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HES1 261512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr3 193983162 193983541 193983368 Y TMEM44 NA LOC647323,OPA1 IMR90 Hi-C 24141950 LRRC15 104931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 193988501 193988592 193988547 Y FAM43A NA HES1,LOC647323,LOC100131551 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC15 99880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 193989061 193989396 193989144 Y NA NA HES1,LOC647323,LOC100131551 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LRRC15 99076 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr3 194227767 194228126 194227819 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 10674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA AC046143.3 9731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A NA NA NA NA NA FAM43A 57068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194820742 194820949 194820800 Y PPP1R2,ACAP2 NA NA NA NA NA XXYLT1 168947 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194871039 194871493 194871089 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 118403 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr3 194875742 194876159 194875826 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 113737 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194909017 194909237 194909137 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 80659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 194973636 194973680 194973658 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 16216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 195073897 195074088 195073990 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 84001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2-AS1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr3 197007663 197007913 197007866 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 16258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 197121526 197121880 197121703 Y DLG1 NA DLG1,LOC100507086,BDH1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG1 97355 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 197264445 197264691 197264611 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 33503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 197335598 197335855 197335727 Y NA BDH1,AC024560.3 NA NA NA NA AC024560.3 16922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 924714 925388 925028 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK GAK,TMEM175 NA NA NA NA TMEM175 539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 1874737 1875082 1874826 Y WHSC1 LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 3586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 1875191 1875366 1875328 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 4040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA NA NA NA NA NA C4orf48 71009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 2185494 2185628 2185619 Y NA NA NA NA NA NA POLN 56220 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr4 2805465 2805723 2805581 Y ZFYVE28,LOC402160,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2 TNIP2,SH3BP2,ADD1 NA NA NA NA SH3BP2 12715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 3488499 3488826 3488767 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 43460 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 7209017 7209262 7209117 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 16752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 7651364 7651970 7651802 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1-AS1 101847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 11696419 11696433 11696426 Y NA NA CLNK,HS3ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST1 267030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA RAB28 201297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 13483063 13483398 13483224 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 14809578 14809765 14809678 Y NA NA BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 192533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 15651682 15652058 15651870 Y NA FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 29227 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 17495942 17496188 17496050 Y MED28,LAP3 QDPR NA NA NA NA QDPR 15669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 17581888 17582305 17582055 Y LAP3,MED28 LAP3,MED28 NA NA NA NA LAP3 5073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 17642152 17642177 17642165 Y CLRN2 MED28 NA NA NA NA MED28 27898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 21173357 21173594 21173476 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 477452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 21368541 21368959 21368808 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 672636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 22636795 22637032 22636911 Y GBA3 RP11-10G12.1 NA NA NA NA RP11-10G12.1 42976 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 23335645 23335866 23335720 Y NA NA NA NA NA NA CDC42P6 608072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 23947088 23947695 23947571 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 636478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 24579124 24579339 24579231 Y NA DHX15 NA NA NA NA DHX15 4834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 25815962 25816321 25816294 Y SEL1L3 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 47061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 25828026 25828318 25828201 Y NA SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 35064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 26087064 26087357 26087217 Y NA NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 75720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 26090058 26090547 26090383 Y RBPJ,RBPJ NA RBPJ,TBC1D19 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 72530 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 26198985 26199293 26199235 Y RBPJ,RBPJ RBPJ RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 35908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D19 126588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 28761802 28762128 28761877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1901581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 34183539 34183770 34183747 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2060361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 37668347 37668621 37668474 Y NA RELL1 NA NA NA NA RELL1 17377 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 38320550 38320897 38320770 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 38607589 38607693 38607690 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 56124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 38674773 38675062 38674906 Y KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 10269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 1315 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 12.7078833658717 chr4 38950892 38951246 38951151 Y KLF3 NA NA NA NA NA TMEM156 81296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 39152863 39152994 39152905 Y NA WDR19 TLR10,FAM114A1,KLB IMR90 Hi-C 24141950 WDR19 29030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 39285630 39285978 39285919 Y RFC1 NA NA NA NA NA RFC1 80017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 40747894 40747905 40747900 Y NA NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 2009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 40910052 40910602 40910542 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 160138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr4 40943410 40943552 40943502 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 193496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 41569423 41569466 41569445 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 209799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 48339625 48339996 48339981 Y NA SLAIN2 TEC,SLAIN2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SLAIN2 1343 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 48532180 48532355 48532269 Y NA NA NA NA NA NA SLAIN2 190841 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 48757987 48758274 48758261 Y NA FRYL,OCIAD1 NA NA NA NA FRYL 22065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 54890749 54890967 54890889 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 37890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr4 55093024 55093294 55093182 Y PDGFRA NA NA NA NA NA PDGFRA 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 68394565 68394648 68394607 Y NA NA NA NA NA NA RP11-584P21.4 84580 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 71677284 71677574 71677429 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 26088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 72978297 72978597 72978489 Y NA NA NA NA NA NA COX18 954875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 74765097 74765490 74765273 Y IL8,CXCL6,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1 CXCL1 RASSF6,IL8,CXCL6,PF4V1,PF4,PPBP,CXCL5,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL1 31987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 74974850 74975280 74974976 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 2611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr4 74977575 74978125 74977847 Y NA CXCL2 RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75096380 75097063 75096677 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA EPGN 75127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 75097904 75098121 75097961 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA EPGN 74069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75137698 75138053 75137885 Y NA EPGN NA NA NA NA EPGN 34137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75228037 75228384 75228211 Y NA EREG NA NA NA NA EREG 476 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75276037 75276405 75276221 Y AREG EREG NA NA NA NA EREG 47177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75409847 75410209 75409849 Y NA NA EREG MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EREG 180987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.91918065775679 chr4 75550011 75550323 75550221 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EREG 321151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75554137 75554451 75554233 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 EREG 325277 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 75557908 75558335 75558035 Y EREG,AREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 EREG 329048 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.50924893627706 chr4 75585032 75585282 75585171 Y NA NA EREG,MTHFD2L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EREG 356172 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 76611672 76611775 76611733 Y RCHY1 G3BP2,USO1 NA NA NA NA G3BP2 35934 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 77041502 77041599 77041551 Y NA NUP54 NA NA NA NA NUP54 26069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 77133814 77134170 77133987 Y NAAA,CXCL10,CXCL11 SCARB2 NA NA NA NA SCARB2 768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SEPT11 116541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 77974492 77974926 77974738 Y CCNI CCNI NA NA NA NA CCNI 20232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 78571860 78572194 78572027 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 166575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 NA NA NA NA NA MRPL1 196220 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 80900549 80900754 80900650 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR2 143854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 80991308 80991698 80991476 Y PRDM8,ANTXR2 NA NA NA NA NA ANTXR2 52910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 80997440 80997711 80997566 Y PRDM8,ANTXR2 ANTXR2 NA NA NA NA ANTXR2 46897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 80999967 81000197 81000082 Y NA ANTXR2 NA NA NA NA ANTXR2 44411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 81048415 81048773 81048660 Y ANTXR2,PRDM8 ANTXR2 PAQR3,ANTXR2,PRDM8,FGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANTXR2 3807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr4 81093417 81093540 81093479 Y NA ANTXR2 NA NA NA NA ANTXR2 48809 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 84237643 84238153 84237819 Y THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE COQ2,HPSE NA NA NA NA HPSE 16153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 84469544 84469879 84469660 Y PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9 FAM175A,AGPAT9 NA NA NA NA AGPAT9 14477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 84773321 84773491 84773400 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 318254 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 88128179 88128500 88128218 Y NA KLHL8 NA NA NA NA KLHL8 30966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 88817372 88817671 88817543 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 77148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 89885623 89885749 89885686 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 144800 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 1423447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 95270442 95270604 95270537 Y PDLIM5,HPGDS NA NA NA NA NA PDLIM5 100433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 96100940 96101127 96101035 Y BMPR1B NA NA NA NA NA BMPR1B 423821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 101269712 101269900 101269796 Y LAMTOR3 NA NA NA NA NA DDIT4L 159773 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 101440272 101440596 101440446 Y NA NA NA NA NA NA DDIT4L 330333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 102093748 102093766 102093752 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 173171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 102113415 102113532 102113437 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 153405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 102121858 102122120 102121969 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 144817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 102237823 102238346 102238192 Y NA AP001816.1,PPP3CA NA NA NA NA AP001816.1 28591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 103520132 103520300 103520232 Y NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA,NFKB1 NA NA NA NA NA NFKB1 99646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 103596395 103596588 103596491 Y NA NA NA NA NA NA MANBA 83563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 103673229 103673433 103673315 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA MANBA NA NA NA NA MANBA 6718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 103750426 103750532 103750434 Y NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3 RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA RP11-10L12.4 3214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 103937289 103937350 103937320 Y NA SLC9B1 NA NA NA NA SLC9B1 1546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 108821168 108821439 108821243 Y NA NA NA NA NA NA SGMS2 77449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 109513186 109513523 109513472 Y NA RPL34-AS1,RPL34 NA NA NA NA RPL34-AS1 26093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 111041485 111041815 111041651 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL6 76540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 113004366 113004696 113004523 Y NA RP11-269F21.3 NA NA NA NA RP11-269F21.3 12512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 113095488 113095850 113095539 Y NA C4orf32 NA NA NA NA C4orf32 30935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr4 113172339 113172711 113172527 Y NEUROG2 AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA AP1AR 21446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 113201272 113201525 113201422 Y TIFA ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 3140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 113547591 113547910 113547748 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA LARP7 8210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21 NA NA NA NA C4orf21 16717 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 49946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 120024463 120024846 120024696 Y NA NA SYNPO2,USP53,MYOZ2 IMR90 Hi-C 24141950 USP53 106896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 120432594 120432728 120432661 Y PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 58648 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 120476359 120476426 120476393 Y PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 102413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 122609803 122610189 122610094 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 6079 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 123776087 123776259 123776177 Y NA FGF2 NA NA NA NA FGF2 30224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 123792983 123793156 123793069 Y NA FGF2,NUDT6,SPATA5 NA NA NA NA FGF2 47120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 124373851 124374047 124373905 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 57901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 124398959 124399392 124399124 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 83009 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 125224483 125224496 125224490 Y NA NA NA NA NA NA TECRP2 158449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 127699482 127699754 127699681 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 842672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.69555145083563 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 129088221 129088417 129088319 Y NA NA NA NA NA NA LARP1B 107798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 139313832 139314247 139314105 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 152329 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 140727942 140728268 140728103 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 143020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 140793640 140793753 140793693 Y MAML3 NA NA NA NA NA MGST2 208718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 141016837 141017139 141016990 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 56199 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 141017143 141017617 141017414 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 55721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 141071159 141071540 141071326 Y NA MAML3 NA NA NA NA MAML3 1798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 141640362 141640569 141640401 Y NA TBC1D9 NA NA NA NA TBC1D9 34705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 142564611 142565296 142564927 Y ZNF330,IL15 IL15 NA NA NA NA IL15 8859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 143012897 143013276 143013057 Y NA NA NA NA NA NA IL15 457145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 143162001 143162155 143162078 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 604430 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 143185718 143186074 143185891 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 580511 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 143393475 143393485 143393480 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 373100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 143608710 143609035 143608873 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 157550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 146101946 146102251 146102199 Y NA OTUD4 ABCE1 K562 ChIA-PET 22265404 OTUD4 2633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 146703198 146703494 146703347 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 154293 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C EDNRA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 EDNRA 25070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 151873741 151873900 151873783 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 60979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 152127737 152127987 152127916 Y NA NA NA NA NA NA RPS3A 109012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr4 153023305 153023605 153023314 Y NA NA SH3D19,FBXW7,RPS3A,PET112 IMR90 Hi-C 24141950 PET112 343130 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA ARFIP1 NA NA NA NA ARFIP1 18903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 157866755 157867028 157866930 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 23518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 157867687 157867968 157867878 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22578 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.83219535799554 chr4 158125886 158126027 158125941 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 130677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 RP11-366M4.2,NACA3P NA NA NA NA NACA3P 19861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 169408175 169408648 169408311 Y DDX60,DDX60L PALLD,DDX60L DDX60,DDX60L,PALLD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PALLD 7569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 170548136 170548389 170548218 Y NEK1,CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 16352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 175501777 175502117 175501960 Y HPGD NA NA NA NA NA FBXO8 298362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 181844755 181844937 181844843 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 1992152 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 183826285 183826336 183826311 Y NA DCTD NA NA NA NA DCTD 10753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 183897058 183897307 183897172 Y NA NA WWC2,FAM92A3 IMR90 Hi-C 24141950 DCTD 59969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr4 184256615 184256836 184256706 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 106908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 185296048 185296446 185296396 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 97288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr4 186022699 186022728 186022714 Y NA SLC25A4 SLC25A4,LOC100506229 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 39667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 187762182 187762435 187762391 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 116306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.41609767899777 chr4 190534349 190534813 190534562 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 94055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 400756 401055 400906 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40203 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 777448 777883 777776 Y NA NA NA NA NA NA TRIP13 112875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 964244 964536 964396 Y NKD2 NKD2 SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688 IMR90 Hi-C 24141950 NKD2 42408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 1139780 1140172 1139929 Y NA SLC12A7 BRD9,LOC100506688,SLC12A7,TRIP13,ZDHHC11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A7 29630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 43124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 1782613 1782742 1782678 Y TERT MRPL36,NDUFS6 NA NA NA NA MRPL36 16738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 4565513 4565575 4565544 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 572868 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 10743646 10743952 10743932 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 15432 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 11524882 11524979 11524955 Y CTNND2 NA NA NA NA NA DAP 765498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 13591800 13592064 13591902 Y NA NA NA NA NA NA DNAH5 350588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 14109130 14109647 14109337 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 32164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14208272 14208510 14208423 Y FAM105B NA NA NA NA NA TRIO 66461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 14666216 14666664 14666270 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 3443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 14668408 14668752 14668531 Y FAM105A,FAM105B EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 5635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14809867 14810211 14810035 Y FAM105A,FAM105B RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 13358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 14872714 14873077 14873012 Y NA ANKH NA NA NA NA ANKH 2827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 14937373 14937729 14937572 Y FAM105A NA ANKH,FAM105B IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 67486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 19929233 19929395 19929314 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2023M8.1 1184951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 21539943 21540207 21540075 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 200001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1100991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 26017692 26017938 26017815 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1208102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 2037529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32083300 32083310 32083305 Y PDZD2 NA NA NA NA NA GOLPH3 89146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32283224 32283342 32283283 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 27773 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32592950 32593432 32593186 Y NA NA NA NA NA NA SUB1 63211 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 32768263 32768639 32768422 Y SUB1 NA NA NA NA NA SUB1 238524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 33789074 33789288 33789217 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA AMACR 216932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 34586139 34586737 34586416 Y NA NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 67605 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 34856339 34856427 34856383 Y NA NA NA NA NA NA BRIX1 57054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 34877157 34877486 34877355 Y NA BRIX1,RAD1 NA NA NA NA BRIX1 35995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 35797370 35797672 35797610 Y SPEF2,IL7R NA NA NA NA NA IL7R 53125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 36109062 36109362 36109328 Y NA LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 40701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 36174356 36174616 36174412 Y SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 24265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 36277104 36277309 36277165 Y NA NA NA NA NA NA SKP2 127013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 36277859 36278299 36278119 Y NA NA NA NA NA NA SKP2 127768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 39395044 39395463 39395161 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 322534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 40447095 40447379 40447222 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 230221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 40688188 40688473 40688414 Y PRKAA1,PTGER4 PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 10588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 40689630 40689893 40689724 Y NA PTGER4 NA NA NA NA PTGER4 12030 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 43009341 43009652 43009530 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 6879 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 3627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 44875784 44875973 44875831 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 68757 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 52168603 52169046 52168938 Y PELO,ITGA1 NA NA NA NA NA PELO 86829 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 44436 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA NA NA NA NA NA ITGA2 50178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 52693799 52694135 52693979 Y NA NA ARL15,LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 FST 80104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 52714720 52715039 52714904 Y NA NA ARL15 IMR90 Hi-C 24141950 FST 59200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 53293727 53293898 53293842 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 310514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 55288370 55289209 55288952 Y IL6ST NA NA NA NA NA IL6ST,CTD-2031P19.3 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 55830072 55830234 55830153 Y NA AC022431.1 MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 31173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 1114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 26296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA RP11-266N13.2 NA NA NA NA RP11-266N13.2 42236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 84792 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58508843 58508938 58508881 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 175255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 242236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58798066 58798450 58798258 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 464478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 483344 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 540962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58926109 58926323 58926216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 592521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 58952543 58952885 58952791 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 618955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 59041159 59041490 59041319 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 707571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 59057056 59057135 59057102 Y NA NA NA NA NA NA RP11-266N13.2 723468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 59086263 59086677 59086406 Y PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 729270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr5 59492329 59492580 59492443 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 323367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 60751661 60751965 60751750 Y ZSWIM6 NA NA NA NA NA RPL3P6 65963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 60930420 60930711 60930566 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 244722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 61661747 61661797 61661772 Y NA DIMT1,IPO11 NA NA NA NA DIMT1 35969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 61843905 61844215 61843940 Y NA CKS1B NA NA NA NA CKS1B 37596 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 64328123 64328532 64328278 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA CWC27 265366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 66306628 66307107 66306725 Y NA MAST4-AS1 NA NA NA NA MAST4-AS1 8847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 66786490 66786676 66786582 Y NA NA NA NA NA NA MAST4-AS1 488709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 67294770 67295126 67294965 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 214422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 67752610 67752698 67752666 Y PIK3R1 NA PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIK3R1 243062 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 67875476 67875860 67875665 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 365928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MCCC2 337395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA PTCD2 107973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 71785493 71785739 71785612 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 171020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72218346 72218584 72218427 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 31224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72234221 72234359 72234290 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 15449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 RP11-60A8.1 FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-60A8.1 4210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr5 72512311 72512636 72512493 Y FOXD1 RP11-60A8.1 FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-60A8.1 4537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 72659896 72660226 72660062 Y NA NA FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 82126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72672825 72672912 72672868 Y NA NA FOXD1,FCHO2,TMEM171,TMEM174 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 69440 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 72715317 72715478 72715398 Y NA FOXD1 FCHO2,TMEM171,TMEM174,FOXD1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXD1 26874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 72950370 72950710 72950420 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 90859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 72995047 72995144 72995131 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 135536 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 73439577 73439790 73439675 Y ENC1 NA RGNEF,ENC1 IMR90 Hi-C 24141950 HEXB 494058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 73612322 73612454 73612340 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321394 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 73839049 73839165 73839086 Y NA NA CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 HEXB 94683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 74997783 74997822 74997793 Y COL4A3BP,COL4A3BP POC5 NA NA NA NA POC5 13491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 76086859 76087104 76086921 Y F2R,F2RL1 F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77289736 77289928 77289813 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 127132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77779546 77779957 77779719 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 125207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77807354 77807759 77807583 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 153015 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77814404 77814787 77814528 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 160065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 77974245 77974379 77974312 Y NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LHFPL2 89465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 78355695 78355721 78355708 Y NA NA NA NA NA NA ARSB 75785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 78520885 78521246 78521066 Y NA DMGDH,JMY NA NA NA NA DMGDH 8615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 78585055 78585206 78585119 Y NA CTC-451P13.1 NA NA NA NA CTC-451P13.1 6314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 78744780 78744887 78744834 Y NA NA NA NA NA NA RP11-342F17.1 59370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 80055694 80056072 80055883 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 106892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 43441 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 81653126 81653457 81653257 Y RPS23 NA ATP6AP1L,XRCC4,VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 80730 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr5 81701396 81701769 81701673 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 81702078 81702394 81702360 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 129682 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 82224684 82224708 82224696 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 146609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 82339174 82339396 82339285 Y NA XRCC4,TMEM167A NA NA NA NA XRCC4 31921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 82608517 82608916 82608727 Y TMEM167A,XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 156368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 4586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 82771448 82771603 82771549 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 6164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 41796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 86417910 86418259 86418047 Y NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 143446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 86610420 86610785 86610768 Y NA RASA1 NA NA NA NA RASA1 48715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 86653612 86653965 86653789 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 52871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 86662563 86662890 86662661 Y RASA1,RASA1 CCNH NA NA NA NA CCNH 43946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 86663167 86663443 86663248 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 43393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 86667091 86667409 86667357 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 39427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 90458384 90458975 90458686 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA LUCAT1 149244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 90604425 90604632 90604611 Y NA LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 3587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NA NA NA NA NA NPM1P27 77023 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 93323557 93323685 93323621 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 121719 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 93758562 93758770 93758652 Y FAM172A,KIAA0825 NA NA NA NA NA ANKRD32 193282 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 94395359 94395872 94395571 Y NA NA NA NA NA NA MCTP1 222407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 94406912 94407086 94407076 Y NA NA NA NA NA NA MCTP1 211193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 94412847 94413065 94412956 Y MCTP1 NA NA NA NA NA MCTP1 205214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX,C5orf27 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA C5orf27 54222 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 95403711 95404019 95403912 Y ELL2 NA ELL2,CAST,MIR583,C5orf27 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELL2 107936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 95414896 95415105 95415065 Y GLRX,ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 119121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 95416336 95416571 95416427 Y GLRX,ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 120561 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 96028306 96028536 96028386 Y CAST,CAST NA NA NA NA NA ERAP1 113267 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 105404906 105404960 105404933 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1599636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 105733568 105733839 105733591 Y NA NA EFNA5 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 1270757 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 105752390 105752961 105752697 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1251635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 106637772 106638015 106637896 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 366581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 106724874 106725113 106725059 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 279483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 106862612 106863005 106862809 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 141591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 107555103 107555441 107555272 Y NA NA NA NA NA NA FBXL17 160358 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 108170397 108170414 108170406 Y FER NA NA NA NA NA FER 88874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 111502817 111502914 111502867 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 8594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 111528702 111529013 111528858 Y EPB41L4A EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 34479 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 111535274 111535427 111535350 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 EPB41L4A-AS1 NA NA NA NA EPB41L4A-AS1 41051 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 112251574 112251628 112251601 Y NA REEP5 NA NA NA NA REEP5 4608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 112628840 112629057 112628905 Y MCC,MCC NA NA NA NA NA MCC 193470 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 113140755 113140845 113140783 Y NA NA NA NA NA NA YTHDC2 293375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 114797286 114797501 114797397 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA NA NA NA NA FEM1C 81090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 114812358 114812481 114812371 Y CCDC112,CCDC112 NA FEM1C,CCDC112,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 66110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 114881094 114881387 114881239 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 2503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 15.5774054162298 chr5 114913600 114913827 114913746 Y NA FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2 NA NA NA NA AC010226.4 21927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 115860298 115860305 115860302 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA CTB-118N6.1 35953 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 118399353 118399657 118399513 Y NA DMXL1,CTB-161M19.4 DMXL1 K562 ChIA-PET 22265404 CTB-161M19.4 4928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 118609146 118609633 118609193 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 6759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 118659966 118660476 118660173 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 57579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 119488072 119488536 119488287 Y NA NA PRR16 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-507E12.1 474180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 122181959 122182300 122182177 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 4825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 122765811 122765999 122765906 Y NA CEP120 CEP120 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CEP120 8525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 125704201 125704675 125704554 Y C5orf48 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 10377 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 125709518 125709709 125709633 Y GRAMD3 GRAMD3 NA NA NA NA GRAMD3 15694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 125779791 125780174 125779834 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 85967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 126847905 126848122 126848004 Y NA PRRC1 PRRC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PRRC1 3179 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 129563384 129563648 129563470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-114H7.1 759942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 130739357 130739526 130739407 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 160171 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 130971517 130972046 130971999 Y NA RAPGEF6 NA NA NA NA RAPGEF6 2588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131015627 131015946 131015841 Y FNIP1,CDC42SE2 RAPGEF6 RAPGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF6 46698 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131422074 131422446 131422224 Y NA CSF2 NA NA NA NA CSF2 14591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131430055 131430830 131430575 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 22572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 131431180 131431494 131431281 Y RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1 CSF2 NA NA NA NA CSF2 23697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 11247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131800033 131800450 131800090 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 6285 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131833002 131833333 131833168 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 132137425 132137486 132137431 Y SEPT8,SEPT8 SEPT8,SHROOM1 NA NA NA NA SEPT8 3447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 133470244 133470404 133470305 Y NA TCF7,SKP1 NA NA NA NA TCF7 21842 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.1,AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.1 31064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA AC005355.2 PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA AC005355.2 51369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 134471631 134472059 134471710 Y C5orf20,PITX1 NA PCBD2,LOC340073,CATSPER3,H2AFY,PITX1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 103128 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 134475601 134475808 134475692 Y PITX1 NA LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 107098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 135347789 135348106 135347904 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 14478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 135353008 135353244 135353057 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 9340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 135885544 135885599 135885577 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 305718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr5 135955852 135956149 135955964 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 235168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 136940488 136940640 136940554 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA0 147399 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr5 137810438 137810840 137810496 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 11259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137822279 137822351 137822306 Y NA EGR1 NA NA NA NA EGR1 23100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 137833063 137833252 137833158 Y FAM53C,EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 33884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 137991577 137991739 137991658 Y NA CTNNA1 SIL1,MATR3,CTNNA1,HSPA9,LRRTM2 IMR90 Hi-C 24141950 CTNNA1 46921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA AC034243.1 190951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SPATA24 NA NA NA NA SPATA24 10439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 138838499 138838633 138838566 Y TMEM173 ECSCR,TMEM173 NA NA NA NA ECSCR 1695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 139022530 139022885 139022670 Y NA CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 1999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139167686 139167904 139167758 Y NA NA CXXC5,UBE2D2,DNAJC18,NRG2,PSD2,CYSTM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC5 142802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139570156 139570435 139570301 Y NA NA NA NA NA NA IGIP 66635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139629538 139629745 139629587 Y NA NA NA NA NA NA PFDN1 50961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr5 139690215 139690793 139690721 Y NA PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 9509 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139691635 139691999 139691907 Y HBEGF PFDN1,HBEGF NA NA NA NA PFDN1 10929 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 139724210 139724515 139724457 Y SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA HBEGF 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 140376000 140376321 140376119 Y PCDHGA8,PCDHGC4,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA6,PCDHB16,PCDHB15,PCDHB12,PCDHA1,PCDHA2,PCDHA3,PCDHA4,PCDHA5,PCDHA6,PCDHA7,PCDHA10,PCDHA13 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 32180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 140381128 140381335 140381222 Y NA PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 37308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 140464698 140465034 140464866 Y SLC25A2,PCDHGC4,PCDHGC3,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGB6,PCDHGA9,PCDHGA7,PCDHGA2,PCDHB7,PCDHB6,PCDHB15,PCDHB12,PCDHB10,PCDHAC1,PCDHB1,PCDHB4 PCDHB2 PCDHB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 7193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 141394614 141394984 141394650 Y PCDH12 GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 4008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 141684732 141684818 141684775 Y PCDH1,SPRY4 AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA AC005592.2 18040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr5 141805995 141806051 141806008 Y NA NA SPRY4,FGF1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 101975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 141824245 141824298 141824272 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 120225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr5 142024486 142024769 142024581 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 123180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142105384 142105400 142105392 Y FGF1 ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP26 42549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142174878 142175359 142175023 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 26929 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142219370 142219769 142219465 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 71421 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142221928 142222177 142222053 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 73979 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142305329 142305654 142305542 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 157380 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 142339728 142340345 142340014 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 191779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 142356404 142356953 142356617 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 208455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 142362111 142362403 142362189 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 214162 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr5 142378250 142378447 142378318 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 230301 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142383259 142383413 142383268 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 235310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 142388287 142389194 142388887 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 240338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 142415813 142416201 142415818 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 267864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 142444859 142445221 142444946 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 264949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142461616 142461728 142461672 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 248442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142504289 142504528 142504400 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 205642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142524956 142525203 142525103 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 184967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142597366 142597816 142597499 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 112354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 142625760 142626024 142625785 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 84146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142642050 142642362 142642163 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 67808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 142974978 142975222 142975128 Y NR3C1,NR3C1 NA ARHGAP26,NR3C1,KCTD16,YIPF5,HMHB1 IMR90 Hi-C 24141950 NR3C1 161901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 143569314 143569909 143569557 Y KCTD16 YIPF5 NA NA NA NA YIPF5 21036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 144741919 144742138 144742043 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 470794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 145094622 145094634 145094628 Y GRXCR2 NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 118298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 145499175 145499563 145499369 Y NA NA NA NA NA NA LARS 60660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA STK32A 139246 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA STK32A 171107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 147751867 147752022 147751945 Y ADRB2,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA RP11-373N22.3 9324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 147782971 147782994 147782983 Y ADRB2,SPINK14,FBXO38 RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 21473 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 148292484 148292904 148292843 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 88328 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 148293572 148293925 148293745 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 89416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA ADRB2 148427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 148533618 148533717 148533668 Y NA ABLIM3 NA NA NA NA ABLIM3 14572 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 149379132 149379170 149379142 Y NA SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 402 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 149422019 149422297 149422100 Y NA HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA TIGD6 43289 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 149789263 149789759 149789627 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74 CD74,RPS14 NA NA NA NA CD74 733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150108879 150109189 150109172 Y SYNPO RBM22,DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 27482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150159490 150160262 150159991 Y CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62 DCTN4 NA NA NA NA DCTN4 22819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150403259 150403641 150403341 Y NA GPX3 NA NA NA NA GPX3 5135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150447679 150448189 150447894 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 GPX3,TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 22949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 151097773 151098033 151097910 Y SPARC RP11-54C4.1 SPARC,SLC36A1,ATOX1,G3BP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 45906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 151108065 151108456 151108379 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 35483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L NA NA NA NA SAP30L-AS1 13813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 154219246 154219480 154219363 Y NA CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 15633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 155906894 155907163 155907007 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R2P3 368386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 156527508 156527705 156527630 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2 NA NA NA NA HAVCR2 40175 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 157298654 157298775 157298715 Y NIPAL4,ADAM19 CLINT1 CLINT1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 14471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 158303194 158303489 158303342 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 221280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 28531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 22663 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 158938695 158938959 158938847 Y EBF1 NA ADRA1B,LOC285627,TTC1 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 250606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159355194 159355367 159355277 Y NA NA NA NA NA NA TTC1 78753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159471418 159471693 159471487 Y SLU7 TTC1 NA NA NA NA TTC1 37298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159480874 159481257 159481243 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 46754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 159637065 159637397 159637293 Y FABP6 FABP6,RP11-34P1.2 NA NA NA NA FABP6 24691 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 163787570 163787906 163787815 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 859450 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 169113502 169113626 169113564 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 1072185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 65973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 171879589 171880295 171879961 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 62 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 172257827 172258390 172258174 Y DUSP1,C5orf41,ERGIC1 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 172262088 172262814 172262509 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 2810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 172880266 172880558 172880434 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 161105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 172881373 172881649 172881564 Y CPEB4 NA LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 160014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 172882283 172882785 172882503 Y NA NA LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BOD1 158878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 173191567 173191754 173191643 Y CPEB4 NA CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 121529 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr5 173888869 173889090 173888998 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 575586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr5 176245417 176245632 176245534 Y EIF4E1B,UNC5A UNC5A NA NA NA NA UNC5A 9939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr5 176699119 176699281 176699198 Y NSD1 RAB24,PRELID1 NA NA NA NA RAB24 29464 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 176972522 176972758 176972729 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 6784 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 179532958 179533118 179533038 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 35840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 179718006 179718384 179718320 Y NA MAPK9 NA NA NA NA CTB-129O4.1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 179859627 179859895 179859761 Y NA CTC-573N18.1 NA NA NA NA CTC-573N18.1 6664 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 180244883 180245420 180245077 Y MGAT1,MGAT1 MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA MGAT1 4231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 180473265 180473624 180473271 Y BTNL9 NA NA NA NA NA CTC-338M12.5 143300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 293338 293822 293579 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 3708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 387336 387726 387531 Y DUSP22 NA IRF4,DUSP22 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP22 97706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 399829 400349 400039 Y DUSP22,IRF4,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 110199 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA DUSP22 183058 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 1311143 1311466 1311342 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 1311552 1311897 1311757 Y NA FOXQ1 NA NA NA NA FOXQ1 877 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 1335859 1336005 1335918 Y NA FOXQ1 LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 25184 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 1869270 1869328 1869296 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 260589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 2029223 2029245 2029234 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 214681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 2684459 2684567 2684519 Y SERPINB9,SERPINB1,NQO2 NA NA NA NA NA C6orf195 51622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 2818084 2818421 2818253 Y SERPINB9 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 21819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 3069574 3070273 3069674 Y NA HTATSF1P2,RIPK1,BPHL LOC100507194,WRNIP1 K562 ChIA-PET 22265404 RIPK1 7349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 3160462 3160701 3160583 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 4702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 9108 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4 NA NA NA NA PSMG4 30302 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 4931719 4931926 4931911 Y NA NA NA NA NA NA RPP40 70371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 5266800 5267044 5266922 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 7523 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 5724236 5724398 5724319 Y NA NA NA NA NA NA FARS2 464959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6467672 6467854 6467760 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 637976 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 447821 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6678540 6678781 6678655 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 427049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 6694635 6694734 6694680 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 411096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6702168 6702420 6702249 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 403410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6742676 6742724 6742701 Y NA NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 363106 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 6750084 6750462 6750414 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 355368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 13.5277468088312 chr6 6803868 6804205 6804018 Y RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 301625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr6 6811454 6812228 6812086 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 293602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 6825409 6825642 6825558 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 280188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr6 6826283 6826384 6826333 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 279446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 6826619 6826698 6826659 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 279132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 6851413 6851674 6851488 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 254156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 6856813 6857789 6856950 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 248041 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 6881148 6881243 6881200 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 224587 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6885637 6886125 6885854 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 219705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr6 6890950 6891223 6891087 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 214607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 6940785 6941121 6940953 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 164709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 7058764 7058925 7058840 Y DSP RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7143191 7143555 7143322 Y NA RREB1 NA NA NA NA RREB1 37361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 7166669 7166920 7166778 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 60839 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7505623 7505742 7505694 Y RREB1,DSP DSP DSP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DSP 34066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7692548 7692711 7692643 Y NA BMP6 PIP5K1P1,MUTED-TXNDC5,BMP6,TXNDC5,EEF1E1-MUTED,SSR1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP6 32319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 7731119 7731407 7731310 Y TXNDC5,TXNDC5,BMP6 BMP6 NA NA NA NA BMP6 6089 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 10383571 10383981 10383824 Y TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 33911 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A,GCNT2 NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 11344526 11344935 11344784 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NA NA NA NA NEDD9 35646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 11769423 11769725 11769659 Y HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 237270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 11772710 11773287 11772940 Y NEDD9,TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA HIVEP1 233708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 12183004 12183212 12183108 Y HIVEP1,EDN1 NA NA NA NA NA EDN1 105384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 12209013 12209223 12209145 Y HIVEP1,EDN1 NA HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 79373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 13300304 13300532 13300414 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 26283 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 13597663 13598060 13597862 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 15499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 13630387 13630831 13630754 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 16828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 13766479 13766874 13766549 Y NA NA NA NA NA NA RANBP9 56683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 14271187 14271701 14271310 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 155315 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 14638705 14639298 14639002 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 522833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 14676415 14676598 14676507 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 560543 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 14733801 14734229 14733883 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 510298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr6 14744083 14744613 14744392 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 499914 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 14884214 14884345 14884265 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 360182 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 15589107 15589675 15589446 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 71614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16218769 16218941 16218854 Y NA NA GMPR,JARID2,DTNBP1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYLIP 91413 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16420932 16421664 16421198 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA MYLIP 293576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16669504 16669854 16669679 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 89515 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16684094 16684384 16684208 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 16714644 16714961 16714802 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 44408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 18263099 18263635 18263391 Y RNF144B,DEK DEK NA NA NA NA DEK 45 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 20604004 20604027 20604016 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 71316 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 21129910 21130117 21129994 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 461855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 21771871 21772218 21771976 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 179899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 23682082 23682309 23682196 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 718844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 24228927 24229160 24229097 Y NA NA NA NA NA NA MRS2 171993 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 24743523 24743742 24743610 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24459 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 24743891 24744276 24743998 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 24796841 24796939 24796881 Y NA GMNN NA NA NA NA GMNN 23682 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 25365155 25365324 25365182 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 87849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 25525007 25525226 25525060 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 247701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.27945377183786 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 26266741 26266990 26266911 Y NA HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H3G 2622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 26522673 26522990 26522813 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 2597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 27136362 27136689 27136526 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 23501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 27585757 27586130 27585944 Y NA NA NA NA NA NA ZNF184 146860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 27640311 27640352 27640335 Y NA NA ZNF391,PRSS16 IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H2BL 133357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 27686942 27687278 27687069 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 86431 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr6 28080593 28080792 28080693 Y NA ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 28099505 28099599 28099552 Y OR2B2,OR2B6,ZNF187,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 9167 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 28180543 28180884 28180590 Y NA ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 44127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 12.5712394587118 chr6 28565127 28565440 28565259 Y NA SCAND3 SCAND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 SCAND3 16549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 28601930 28602271 28602104 Y NA SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 19941 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 128816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 133398 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 29829189 29829211 29829201 Y NA HLA-H,HCG4P7 ZNRD1-AS1,HLA-J,HCG9 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-H 24139 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 29935319 29935652 29935489 Y NA HLA-K,HLA-A NA NA NA NA HLA-A 28282 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 26974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39 NA NA NA NA RNF39 28146 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA TRIM39,HCG18 NA NA NA NA TRIM39 37784 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 30434534 30434831 30434712 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 RANP1,HLA-E PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANP1 16886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30495647 30495976 30495809 Y PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 26687 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30604064 30604457 30604261 Y NA MRPS18B,PPP1R10,ATAT1,PTMAP1,C6orf136,DHX16,PPP1R18 NA NA NA NA PTMAP1 4655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 30716024 30716359 30716084 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 5693 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 30748126 30748169 30748148 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,PRRC2A,C6orf15,MUC22,DHX16,PPP1R18,TUBB,MDC1,IER3,NRM IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 15524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 53305 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 31352932 31353063 31352998 Y MCCD1,HSPA1L,GPANK1,BAG6,CCHCR1,CCHCR1 HLA-B,HCP5,MICA NA NA NA NA HCP5 13416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 31391390 31391544 31391474 Y NA HCP5,MICA NA NA NA NA MICA 22034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr6 32075999 32076179 32076125 Y LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB ATF6B,FKBPL,PPT2 NA NA NA NA ATF6B 17851 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 32325803 32326070 32325937 Y NA NA NA NA NA NA HLA-DRA 79549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 32577297 32577935 32577770 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DQA1 16021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 32582541 32582735 32582646 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMA,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB1,HLA-DQA1 NA NA NA NA HLA-DQA1 11221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 32653438 32653801 32653767 Y HLA-DRA,HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,TAP2,PSMB9,PSMB8,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DQB2,HLA-DQA2 HLA-DQB1 NA NA NA NA HLA-DQB1 19278 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 32789030 32789171 32789101 Y HSD17B8,PSMB8 HLA-DOB,TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA HLA-DOB 6205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1,HLA-DOA NA NA NA NA HLA-DOA 19118 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 32986611 32987175 32986859 Y HLA-DRB5,HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,TAPBP,PHF1,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DOA HLA-DOA HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2,COL11A2,VPS52 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-DOA 11222 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 33029858 33030076 33029983 Y HLA-DRB1,HLA-DQA1,HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,HLA-DOB,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DOA,TAPBP,HLA-DPB1,HLA-DPA1 HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DPB2 NA NA NA NA HLA-DPB1 11627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 33129390 33129479 33129402 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 36743 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 33158336 33158731 33158575 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 7491 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 33538378 33538887 33538702 Y LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 7132 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 12653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 33581625 33581918 33581825 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 33590898 33591125 33590902 Y ITPR3 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 34341997 34342182 34342078 Y HMGA1 NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 16269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 34760607 34760986 34760926 Y UHRF1BP1 SNRPC,UHRF1BP1 NA NA NA NA UHRF1BP1 2750 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 35185451 35185811 35185631 Y NA ZNF76 NA NA NA NA ZNF76 38875 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 35331114 35331538 35331252 Y PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 22779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 35336371 35336758 35336422 Y NA PPARD NA NA NA NA PPARD 28036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 35866676 35867072 35866874 Y NA SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 20047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 MAPK13 NA NA NA NA MAPK13 6845 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 36321421 36321620 36321472 Y CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7 NA NA NA NA NA KCTD20 86924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 LAP3P2 10591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 36736958 36737143 36737020 Y NA NA NA NA NA NA CDKN1A 94653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CDKN1A 95453 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TMEM217 3126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 37673638 37673745 37673684 Y NA MDGA1 MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 MDGA1 8556 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 38185251 38185625 38185371 Y BTBD9 NA NA NA NA NA ZFAND3 399976 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 39393880 39394120 39394000 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 198654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 41286601 41286824 41286755 Y NFYA,TFEB,TREML4,TREM1 TREM1 C6orf130 K562 ChIA-PET 22265404 TREM1 34144 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 41506487 41506686 41506561 Y NFYA,TREML4,TREM1,TFEB FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 5478 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 41612844 41613289 41612975 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 10224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 21224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA MRPS10 122815 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 42372266 42372455 42372353 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 157345 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 108733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 108038 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 42898508 42898648 42898552 Y NA C6orf226,CNPY3,RPL24P4,GNMT,PEX6 NA NA NA NA CNPY3 3570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 43767552 43768173 43767868 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 31631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA C6orf223 71592 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 43975133 43975197 43975165 Y CDC5L,C6orf223 C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 8816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 43977606 43978027 43977822 Y NA C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 11289 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 12122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 13503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 43990134 43990470 43990221 Y NFKBIE,MAD2L1BP C6orf223,RP5-1120P11.3 NA NA NA NA C6orf223 23817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 C6orf223,RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 35732 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 44004425 44004647 44004557 Y NFKBIE C6orf223,RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 35003 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 C6orf223,RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 29897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223,RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.3 27165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 44026121 44027353 44026480 Y NFKBIE,MAD2L1BP RP5-1120P11.3 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.3 12297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.3,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 44610699 44610959 44610866 Y NFKBIE NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 257437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 8290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 45322073 45322342 45322124 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 21348 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 45404651 45404813 45404715 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 60961 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 45413515 45413853 45413708 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 69825 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 46628141 46628475 46628252 Y NA CYP39A1,SLC25A27 NA NA NA NA SLC25A27 9463 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 46640633 46640732 46640698 Y NA CYP39A1,SLC25A27 NA NA NA NA SLC25A27 21955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 48794608 48794845 48794713 Y NA NA NA NA NA NA MUT 634059 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 49524322 49524464 49524384 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 8209 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 49533704 49534052 49533813 Y C6orf141 C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 17591 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr6 52255288 52255470 52255373 Y NA PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 27636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 52431726 52432083 52432005 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAM2 7630 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 52439625 52439825 52439764 Y TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 53225493 53225821 53225675 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 54604535 54604549 54604543 Y NA NA NA NA NA NA LRRC1 947240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 56239637 56240034 56239826 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 BEND6 577739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 521205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 56594458 56594846 56594652 Y NA NA DST,BEND6,KIAA1586,PRIM2 IMR90 Hi-C 24141950 BEND6 222927 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 57004936 57005232 57005084 Y NA BAG2 NA NA NA NA BAG2 29892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 57046105 57046302 57046204 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 10981 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 57395913 57396073 57396021 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 218310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 57408924 57409255 57409252 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 231321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 64055548 64055769 64055667 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1C 136197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 64057545 64057895 64057656 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1C 138194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 64062508 64062954 64062798 Y NA NA PTP4A1,EYS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FKBP1C 143157 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 64150073 64150241 64150156 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 79425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 13.1178150873514 chr6 64299850 64300199 64300025 Y NA PHF3 NA NA NA NA PHF3 43526 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 70885390 70885484 70885437 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 235160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 71548622 71548700 71548661 Y FAM135A NA NA NA NA NA SMAP1 173143 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 72010402 72010735 72010435 Y NA OGFRL1 NA NA NA NA OGFRL1 13896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 72092992 72093394 72093291 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 17930 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 72103028 72103231 72103130 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 8093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MB21D1,MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 79718228 79718616 79718429 Y PHIP NA NA NA NA NA PHIP 67337 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 80777050 80777287 80777243 Y NA BCKDHB NA NA NA NA BCKDHB 37077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 82953012 82953093 82953052 Y NA IBTK NA NA NA NA IBTK 2378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 83449136 83449335 83449235 Y NA NA UBE3D IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 326050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 83756669 83757034 83756938 Y PGM3,DOPEY1 DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 18351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 83935269 83935637 83935453 Y NA RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA PGM3 33614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 85484432 85484730 85484624 Y TBX18 TBX18 TBX18 IMR90 Hi-C 24141950 TBX18 12195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 85834833 85835082 85834958 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 322727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr6 86174491 86174911 86174693 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 16682 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr6 86175561 86175746 86175667 Y NA NT5E NA NA NA NA NT5E 17752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 88213981 88214157 88214070 Y GJB7 SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 35640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 88408243 88408692 88408556 Y AKIRIN2 AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 1235 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 89470471 89470676 89470540 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 200672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 89591363 89591365 89591364 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 79983 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 105743987 105744339 105744163 Y NA NA NA NA NA NA PREP 104620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 106589360 106589531 106589446 Y NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 182135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 106970547 106970941 106970751 Y PRDM1,PRDM1,ATG5 AIM1 NA NA NA NA AIM1 12817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA AIM1 56310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 107437804 107438343 107438064 Y NA NA NA NA NA NA C6orf203 90397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 108951509 108952142 108951722 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 72471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 109059217 109059645 109059338 Y FOXO3 NA FOXO3,LINC00222 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARMC2 107974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 109217323 109217611 109217483 Y FOXO3,CD164 ARMC2,RP11-249L21.4 NA NA NA NA RP11-249L21.4 9465 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 109755732 109756057 109756030 Y CD164 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA SMPD2 3909 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 109852596 109852917 109852757 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB24 50156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 110094103 110094197 110094150 Y CD164,MICAL1 NA NA NA NA NA FIG4 83604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 110606267 110606424 110606326 Y WASF1,CDC40 NA NA NA NA NA CDC40 106923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111382725 111382978 111382849 Y AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10 NA NA NA NA NA RPF2 81507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111733320 111733976 111733973 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 68738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111739300 111739614 111739444 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 63100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111744480 111744594 111744536 Y SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L NA NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 58120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 111776910 111777281 111777179 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 25433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 112294288 112295069 112294499 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN NA FYN,TRAF3IP2,TRAF3IP2-AS1,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 FYN 101633 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 112525181 112525504 112525289 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 48637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 113673815 113673995 113673934 Y NA NA LAMA4,FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 295281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 113955337 113956547 113956265 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS,FLJ34503,LOC285758,HDAC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-367G18.1 12729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 114015292 114015315 114015304 Y NA RP11-367G18.1 MARCKS MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-367G18.1 46016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 114040344 114040537 114040454 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 71068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 114318333 114318559 114318390 Y NA RP3-399L15.3,HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 11913 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 114391441 114391608 114391525 Y HS3ST5 NA NA NA NA NA HDAC2 60969 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 116706605 116706866 116706798 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 107539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 116708158 116708375 116708238 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109092 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 116708579 116708861 116708730 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 117785630 117785714 117785673 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 12650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 119029991 119030657 119030634 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 CEP85L NA NA NA NA CEP85L 753 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 119468463 119468799 119468540 Y FAM184A NA NA NA NA NA MCM9 214136 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1 NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 124280417 124280574 124280496 Y NKAIN2 NA NA NA NA NA RNF217 1001117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 125426714 125426967 125426959 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 11228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 126068034 126068254 126068125 Y HEY2 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA HEY2 1224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 127805440 127805627 127805534 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 50659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 128754727 128754989 128754858 Y PTPRK,PTPRK NA NA NA NA NA PTPRK 84881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 128830157 128830356 128830243 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 9514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 130008447 130008678 130008538 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 20692 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 130018003 130018247 130018173 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 11123 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 130069572 130069764 130069691 Y NA ARHGAP18 ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 40202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA L3MBTL3 180636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 133070302 133070479 133070392 Y STX7,VNN2,VNN2,VNN2 VNN3 NA NA NA NA VNN3 16398 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 331043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 134026254 134026532 134026380 Y NA NA MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 244776 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 134072842 134073074 134072958 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 198234 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 134085872 134085913 134085879 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 185395 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 135636764 135637196 135637190 Y NA NA NA NA NA NA MYB 136311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136227219 136227382 136227241 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 56385 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136278220 136278515 136278405 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 107386 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 136293369 136293422 136293396 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 122535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 136336050 136336507 136336258 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 165216 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136372344 136372809 136372483 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 201510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136390405 136390550 136390494 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 218439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136434966 136435173 136435049 Y BCLAF1 NA NA NA NA NA BCLAF1 173816 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 136455870 136456219 136456181 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 152770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 136528020 136528260 136528195 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 80729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 138129336 138129581 138129459 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 56770 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 138150613 138151141 138151010 Y OLIG3,TNFAIP3 TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 35210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr6 138153323 138153539 138153451 Y NA TNFAIP3 TNFAIP3 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP3 32812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 138216222 138216422 138216312 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 29871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 138225639 138226065 138225836 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 39288 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 138226179 138226660 138226368 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 39828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 138421052 138421264 138421123 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 5384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 138426575 138426770 138426671 Y PERP NA NA NA NA NA PERP 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC28A 178098 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 139656661 139656994 139656829 Y NA CITED2 ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 36763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 139852407 139852567 139852460 Y HECA NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 158650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 139860975 139861228 139861133 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 140085604 140086085 140085978 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 391847 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 141171716 141171869 141171793 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 1294498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 141804737 141805118 141804969 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 661249 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 141873662 141873944 141873832 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 592423 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 143166332 143166721 143166456 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 97617 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 143174967 143175237 143175142 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 89101 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 143192899 143193375 143193200 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 70963 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 143200640 143200895 143200768 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 63443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 143223836 143224147 143224035 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 40191 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr6 144064569 144064840 144064663 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 97641 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 145618136 145618517 145618327 Y NA NA NA NA NA NA EPM2A 436643 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 149380711 149381067 149380832 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 156710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 149382626 149382831 149382713 Y NA NA NA NA NA NA TAB2 154946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 149554491 149554815 149554668 Y ZC3H12D TAB2 UST,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 16714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 151246480 151246919 151246675 Y ZBTB2 NA NA NA NA NA MTHFD1L 61795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 152606341 152606739 152606594 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 350197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 155526313 155526389 155526351 Y NA NA TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TFB1M 107238 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158034114 158034488 158034146 Y NA NA NA NA NA NA SNX9 207808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 158184460 158184689 158184561 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,ZDHHC14,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 57607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158185393 158186221 158185862 Y SNX9 NA SNX9,TMEM242,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 56075 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158375265 158375579 158375328 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 25309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158640222 158640658 158640460 Y SNX9 NA NA NA NA NA GTF2H5 52838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158808734 158809093 158808911 Y TMEM181 NA NA NA NA NA GTF2H5 221350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158896747 158897140 158897018 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 166631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81905 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA NA NA NA NA NA DYNLT1 81306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 159141436 159141829 159141621 Y TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR NA NA NA NA NA DYNLT1 77665 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr6 159211450 159211647 159211549 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 26797 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 159268112 159268313 159268204 Y NA EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 20658 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 17645 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 16971 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 159383408 159383511 159383422 Y NA RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 35708 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 159434370 159434675 159434475 Y TAGAP RSPH3 NA NA NA NA RSPH3 15151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 160599554 160599954 160599575 Y NA NA NA NA NA NA RP1-276N6.2 91695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 163833338 163833600 163833428 Y QKI QKI NA NA NA NA QKI 306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr6 163950759 163951099 163950781 Y NA NA NA NA NA NA QKI 117727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 165988383 165988522 165988473 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 409569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr6 166077084 166077462 166077274 Y PDE10A,PDE10A NA NA NA NA NA PDE10A 320629 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 166078176 166078539 166078376 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 319552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 166364914 166365167 166365041 Y T PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 32924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr6 166385606 166385834 166385795 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 12257 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 166398427 166398527 166398479 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA PDE10A 336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 166420168 166420416 166420184 Y T PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 20632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A,LINC00473 NA NA NA NA LINC00473 22766 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 166754936 166755437 166755076 Y SFT2D1 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 166970262 166970784 166970543 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 216183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr6 167069842 167070191 167069884 Y PRR18 NA NA NA NA NA RPS6KA2 247748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 168356861 168357132 168356996 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 131259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 168408262 168408655 168408498 Y NA NA SMOC2,KIF25 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT4 182660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 169588480 169588865 169588804 Y NA NA WDR27,THBS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR27 511294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 271871 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr6 170753168 170753555 170753371 Y NA NA FAM120B,LINC00574,LINC00242,C6orf70 IMR90 Hi-C 24141950 PSMB1 106874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM20C 182125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 579426 579712 579625 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 21493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 964406 964697 964471 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 COX19 NA NA NA NA COX19 48538 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2,AC102953.4 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 1500451 1500958 1500750 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1 NA NA NA NA AC102953.4 2878 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 1571848 1572026 1571934 Y ZFAND2A,TMEM184A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.0558245649167 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr7 1574153 1574602 1574313 Y NA INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5803 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 1990940 1991132 1991045 Y SNX8,MAFK NA NA NA NA NA AC074389.9 211013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2081068 2081519 2081307 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 189359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2306623 2306831 2306646 Y MAD1L1 MAD1L1,FTSJ2,NUDT1 NA NA NA NA NUDT1 26766 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2569854 2570215 2570046 Y LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1 LFNG,BRAT1,IQCE NA NA NA NA LFNG 19691 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2750956 2751140 2751041 Y LFNG,LFNG,CARD11 NA NA NA NA NA TTYH3 81371 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2861620 2861774 2861696 Y LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 11481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2875013 2875360 2875015 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 1758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.27945377183786 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr7 4723112 4724257 4723950 Y NA FOXK1 NA NA NA NA FOXK1 41724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 5458136 5458686 5458477 Y FBXL18,TNRC18 TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 4359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 5634980 5635411 5634989 Y AIMP2,FBXL18,ACTB,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 4541 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.14280986467795 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 7440005 7440326 7440141 Y NA NA NA NA NA NA AC005532.5 147220 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 7984706 7984926 7984839 Y GLCCI1 GLCCI1 RPA3,LOC729852 IMR90 Hi-C 24141950 GLCCI1 21499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 12624573 12625024 12624751 Y NA NA NA NA NA NA ARL4A 99457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 12759659 12759934 12759702 Y ARL4A,ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 35178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 13057101 13057487 13057331 Y NA NA ARL4A IMR90 Hi-C 24141950 ARL4A 332620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 13694099 13694114 13694107 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 334936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 13758700 13759051 13758876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 269999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 13797003 13797366 13797185 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 231684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 13818689 13818849 13818801 Y ETV1 NA NA NA NA NA ETV1 210201 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 16961680 16961908 16961842 Y NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 AGR2 90623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 17081003 17081300 17081099 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 209946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.18630251455857 chr7 17314276 17314419 17314335 Y AHR AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AHR 21827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr7 17412000 17412058 17412028 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 75019 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr7 17729678 17729968 17729803 Y AHR NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 133145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 18548166 18548343 18548284 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 570042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 18560411 18560650 18560558 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 582287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 18828374 18828759 18828502 Y NA NA NA NA NA NA SNX13 850250 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 20197239 20197492 20197368 Y NA NA NA NA NA NA MACC1 57535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 20447290 20447655 20447472 Y ITGB8 NA NA NA NA NA ITGB8 78965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 RPL23P8 27126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 22011633 22011901 22011770 Y NA CDCA7L NA NA NA NA CDCA7L 27931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 22122992 22123068 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 139290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 22614875 22615270 22614981 Y IL6 AC002480.4 NA NA NA NA AC002480.4 12054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA AC002480.4,STEAP1B NA NA NA NA AC002480.4 4120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 22626962 22627257 22627168 Y NA AC002480.4,STEAP1B NA NA NA NA AC002480.4 67 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 22640442 22640878 22640827 Y IL6 AC002480.4,STEAP1B LOC100506178,IL6,KLHL7 IMR90 Hi-C 24141950 AC002480.4 13118 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 22757674 22758207 22757934 Y NA IL6,AC073072.5 NA NA NA NA IL6 5296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23061903 23062212 23061975 Y IL6 FAM126A LOC100506178,IL6,SNORD93,TOMM7,FAM126A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM126A 10154 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23084280 23084501 23084407 Y NA FAM126A SNORD93,LOC100506178,TOMM7 IMR90 Hi-C 24141950 FAM126A 32531 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 23346374 23346675 23346525 Y NA NA NA NA NA NA GPNMB 72788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 23375804 23376081 23376055 Y IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 102218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23488792 23489118 23488955 Y KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 18968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 23853769 23853785 23853777 Y NPY NA NA NA NA NA AC006026.13 135364 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 24813861 24813988 24813926 Y OSBPL3 NA DFNA5,OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 MPP6 202974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 24824166 24824267 24824230 Y DFNA5 NA NA NA NA NA OSBPL3 194986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 24860577 24860798 24860662 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA OSBPL3 158455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA OSBPL3 157922 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr7 24950753 24950942 24950870 Y CYCS,OSBPL3 NA NA NA NA NA OSBPL3 68311 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 25010250 25010501 25010375 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 8752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 25071903 25072051 25071977 Y NA NA OSBPL3 IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL3 52650 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 26361230 26361345 26361289 Y SNX10,SNX10,SNX10 AC010677.5 NA NA NA NA AC010677.5 47415 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 26589150 26589521 26589235 Y SNX10 NA LOC441204,KIAA0087 IMR90 Hi-C 24141950 AC004540.5 152937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 27642128 27642466 27642297 Y NA NA NA NA NA NA HIBADH 58148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 259768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 29645878 29645994 29645936 Y NA AC007255.8,PRR15 PRR15 MCF7 ChIA-PET 22265404 PRR15 44451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 30005426 30005693 30005606 Y NA AC007285.6,SCRN1 NA NA NA NA AC007285.6 20523 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS,AC005154.6 NA NA NA NA AC005154.6 3667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS,AC005154.6 NA NA NA NA AC005154.6 26339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 32546004 32546038 32546035 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 12966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 32551548 32551619 32551584 Y NA LSM5,AVL9 NA NA NA NA AVL9 18510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 32715865 32716012 32715940 Y NA NA NA NA NA NA ZNRF2P1 50169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr7 38371416 38371642 38371578 Y STARD3NL,TARP NA NA NA NA NA STARD3NL 155592 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 39629281 39629774 39629554 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 25306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 39632170 39632581 39632314 Y RALA YAE1D1,RALA NA NA NA NA YAE1D1 28195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 39641991 39642218 39642176 Y RALA YAE1D1,RALA LINC00265 IMR90 Hi-C 24141950 RALA 18864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 39644763 39645050 39644891 Y RALA YAE1D1,RALA LINC00265 IMR90 Hi-C 24141950 RALA 16032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr7 39660879 39661112 39661042 Y NA NA NA NA NA NA RALA 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 39695521 39695649 39695585 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 34439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 40007110 40007159 40007135 Y NA CDK13 NA NA NA NA CDK13 19474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 40584238 40584551 40584395 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 596602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 40756959 40757193 40757114 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 769323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 41136491 41136863 41136697 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 603843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr7 43625293 43625372 43625313 Y URGCP,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 4936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43625905 43626316 43625996 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 5548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43683947 43684262 43684105 Y POLM,DBNL,STK17A NA NA NA NA NA STK17A 63590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 44677628 44678244 44677873 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH ZMIZ2 IMR90 Hi-C 24141950 OGDH 33457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 44775082 44775384 44775244 Y OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2 ZMIZ2 DDX56,TMED4,OGDH,PPIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ2 10796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 44845785 44846169 44845977 Y DDX56 PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 11506 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 45442455 45442729 45442646 Y MYO1G NA NA NA NA NA TBRG4 292809 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 46691155 46691159 46691157 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 316141 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 46691314 46691685 46691473 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 315615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 46920965 46921354 46921105 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 85946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 46972513 46972753 46972628 Y NA AC004870.4 IGFBP3,IGFBP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 34547 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 47475545 47475747 47475668 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 144409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 47641950 47642196 47642073 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 21794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 48126389 48126700 48126545 Y NA UPP1 NA NA NA NA UPP1 164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50249173 50249488 50249339 Y FIGNL1 NA NA NA NA NA FIGNL1 266600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 28268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 50603281 50603405 50603343 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 27749 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 DDC NA NA NA NA DDC 15575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 35697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 50682806 50683075 50682899 Y DDC NA NA NA NA NA DDC 51652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50859334 50859716 50859525 Y NA GRB10 NA NA NA NA GRB10 175 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 50889237 50889584 50889351 Y NA GRB10 COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 30078 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 50905745 50905993 50905866 Y GRB10 GRB10 COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 46586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 50937136 50937349 50937243 Y NA NA COBL,DDC,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 77977 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 51382954 51383359 51383079 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 51417920 51418197 51418059 Y NA COBL NA NA NA NA COBL 35405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 55063666 55063958 55063856 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 20756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr7 55142882 55143327 55143024 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 58168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA CHCHD2 71255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA CHCHD2 1534165 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 64295695 64295915 64295830 Y ZNF680 ZNF138,ZNF273 NA NA NA NA ZNF273 32635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 66040596 66040908 66040816 Y NA NA NA NA NA NA KCTD7 50960 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 66159622 66159870 66159746 Y NA RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 14471 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 66184244 66184571 66184390 Y NA RABGEF1 LOC493754,RABGEF1,LOC729156 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 39093 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 73002313 73002519 73002399 Y BCL7B BCL7B,TBL2,MLXIPL TBL2 K562 ChIA-PET 22265404 TBL2 11192 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 73132412 73132545 73132481 Y LAT2,BCL7B WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11 NA NA NA NA STX1A 410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 73512377 73512557 73512465 Y NA CTB-51J22.1,LIMK1 NA NA NA NA LIMK1 17114 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 75573320 75573489 75573400 Y POR POR,TMEM120A NA NA NA NA POR 46802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 AC005077.12 59736 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 76052692 76053023 76052931 Y NA ZP3 NA NA NA NA ZP3 27857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 77038853 77039042 77038951 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 125550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 77199277 77199536 77199359 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 34685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA GNAI1 838141 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 81233474 81233832 81233648 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 683799 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 81234008 81234151 81234026 Y NA NA HGF,CACNA2D1 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3C 684333 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 83866816 83867276 83866988 Y NA NA SEMA3A,SEMA3D IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3A 252764 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 89802453 89802721 89802550 Y NA STEAP1,STEAP2 NA NA NA NA STEAP2 7549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 90033847 90034185 90034017 Y STEAP2 CLDN12 NA NA NA NA CLDN12 22812 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92279692 92280069 92279965 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 61984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92282305 92282698 92282463 Y LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 64597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92290698 92291011 92290856 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 72990 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92383173 92383232 92383216 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 80565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 92533719 92534002 92533863 Y SAMD9 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 CDK6 69811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 93204906 93205045 93204997 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 313258 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 91903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 93812688 93813130 93812921 Y NA NA TFPI2,BET1,GNGT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC003092.1 162543 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 95070230 95070589 95070236 Y PON1,PON3,PDK4 PON1,PON3,PON2 PON2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PON2 7720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 95867967 95868008 95867988 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 81451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 97913424 97913987 97913861 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 33733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 97915595 97916070 97915699 Y LMTK2,BRI3 TECPR1,BRI3 NA NA NA NA BRI3 35904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 98048213 98048460 98048408 Y BRI3 RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 19833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 98383358 98383761 98383522 Y NA NA NA NA NA NA TRRAP 89795 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 98650927 98651298 98651264 Y NA NA NA NA NA NA SMURF1 88425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 98871923 98872129 98871984 Y NA ARPC1A NA NA NA NA ARPC1A 49392 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 99684818 99685168 99684993 Y TSC22D4,PILRB,PILRA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA COPS6 241 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,MOSPD3 NA NA NA NA RP11-44M6.3 2103 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 101372678 101373024 101372861 Y NA NA CUX1,EMID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUX1 83935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 101600316 101600568 101600442 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 143357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 101789481 101789757 101789558 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 212562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr7 102056938 102057102 102057040 Y ORAI2 ORAI2,ALKBH4,LRWD1 NA NA NA NA ORAI2 14451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102452256 102452586 102452421 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 64838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102464517 102464880 102464701 Y NA NA NA NA NA NA FAM185A 77099 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102773056 102773346 102773244 Y NA RPL19P12,NAPEPLD ARMC10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL19P12 7040 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102790674 102790901 102790766 Y NAPEPLD RPL19P12,NAPEPLD NA NA NA NA NAPEPLD 2667 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 NA LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01004 65367 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 104854124 104854334 104854271 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 183421 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 105602769 105602970 105602871 Y NA NA NA NA NA NA CDHR3 87527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 105705488 105705603 105705542 Y NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45419 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106005704 106006316 106005855 Y FLJ36031,NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 80932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106057745 106058020 106057851 Y NA NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 132973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106058630 106058799 106058684 Y NAMPT,PIK3CG,FLJ36031 NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 133858 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 107205466 107205592 107205534 Y COG5 DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA COG5 2507 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 107567511 107567568 107567540 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 107594636 107594797 107594717 Y NA LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 46903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 108118010 108118358 108118206 Y NA RPL7P32 NA NA NA NA RPL7P32 30319 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 108139925 108140311 108140116 Y PNPLA8,DNAJB9 RPL7P32 NA NA NA NA RPL7P32 8366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 110723657 110723799 110723727 Y LRRN3 NA NA NA NA NA IMMP2L 476774 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 391947 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 111024464 111024780 111024739 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 175793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111156714 111156954 111156834 Y NA IMMP2L NA NA NA NA IMMP2L 43619 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 111396932 111397360 111397129 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 196359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111625951 111626060 111625989 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 218406 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111627210 111627406 111627307 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 217060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111641194 111641556 111641398 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 202910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr7 111720320 111721594 111721184 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 122872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 111721905 111722337 111722086 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 122129 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111745442 111745761 111745634 Y ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 98705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 111754573 111754855 111754765 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 89611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 111971895 111972278 111972086 Y NA RN7SKP187 NA NA NA NA RN7SKP187 45217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 114459820 114459999 114459910 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 MDFIC 100210 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 114570083 114570518 114570369 Y MDFIC MDFIC NA NA NA NA MDFIC 9874 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 115873924 115874179 115873941 Y TES TES NA NA NA NA TES 25377 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 31798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 116152142 116152412 116152205 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1 CAV1 CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV1 10427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 116202174 116202561 116202326 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 39335 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 116271021 116271344 116271193 Y NA MET TES,CAV1,MET,CAPZA2 IMR90,H1ESC,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 MET 39100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 116319612 116319902 116319758 Y NA MET NA NA NA NA MET 9168 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 116328034 116328226 116328184 Y ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET MET NA NA NA NA MET 17590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr7 116332814 116332936 116332875 Y CAPZA2,TES MET NA NA NA NA MET 22370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 116356493 116356879 116356812 Y NA MET NA NA NA NA MET 46049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 116523983 116524309 116524052 Y NA NA NA NA NA NA ST7 66983 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 121008996 121009049 121009023 Y NA FAM3C NA NA NA NA FAM3C 25369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 121170486 121170616 121170551 Y NA NA FAM3C,WNT16 IMR90 Hi-C 24141950 FAM3C 136068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 123284312 123284364 123284338 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 88003 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 127876972 127877440 127877187 Y IMPDH1,LRRC4 NA PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM28 104522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA CALU NA NA NA NA CALU 5826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 128696279 128696583 128696469 Y NA TNPO3 NA NA NA NA TNPO3 3081 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 129078824 129079119 129078920 Y NA RP11-305M3.2,RNU1-72P NA NA NA NA RP11-305M3.2 30613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr7 129421490 129421976 129421792 Y FAM40B NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 168813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA MIR335 NA NA NA NA MIR335 17840 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 43640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130581597 130582393 130581985 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 13676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130583676 130584341 130584164 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 11728 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130606000 130606565 130606293 Y NA MIR29A LOC646329 MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR29A 9931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130633473 130633870 130633858 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 37404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr7 130735932 130736596 130736429 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 56259 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 130873403 130873921 130873619 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA AC009362.2 51428 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 131010342 131010498 131010376 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1-AS NA NA NA NA MKLN1-AS 483 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 131105085 131105454 131105312 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1-AS 94104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 131271012 131271384 131271093 Y NA PODXL NA NA NA NA PODXL 30036 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 131314351 131314532 131314442 Y NA NA PODXL,MKLN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PODXL 73375 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PODXL 678640 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 132488555 132488726 132488642 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 276122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 225554 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B4 293105 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 135395183 135395352 135395286 Y NA C7orf73 NA NA NA NA C7orf73 49939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A NA C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 98196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 135664784 135664953 135664862 Y CNOT4 MTPN NA NA NA NA MTPN 4683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 297196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 137457622 137457847 137457706 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 226966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 137715600 137715833 137715719 Y NA CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 30787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 138802981 138803298 138803094 Y UBN2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3HAV1 10516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 139365521 139365926 139365718 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 109651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 139410403 139410671 139410537 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 64906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 139577679 139577876 139577701 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 102102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 139899867 139900246 139899982 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 138346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 140024684 140024714 140024699 Y NA NA NA NA NA NA SLC37A3 77519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 140271542 140271796 140271668 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 94173 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 141512676 141512822 141512821 Y TAS2R38,OR9A4,WEE2,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 76555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 142505354 142505882 142505518 Y GSTK1,CASP2 TRBJ2-1,TRBJ2-2P,TRBJ2-3,TRBJ2-4,TRBJ2-5,TRBJ2-6,TRBJ2-7,EPHB6 NA NA NA NA TRBJ2-7 12214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 142519257 142519562 142519385 Y TAS2R39,OR9A2 TRBJ2-1,TRBJ2-2P,TRBJ2-3,TRBJ2-4,TRBJ2-5,TRBJ2-6,TRBJ2-7,EPHB6 EPHB6,TRPV5 IMR90 Hi-C 24141950 TRBJ2-7 26117 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 142903719 142904064 142903958 Y NA GSTK1 NA NA NA NA GSTK1 35122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 143072489 143072836 143072701 Y GSTK1,FAM115C AC093673.5,ZYX NA NA NA NA AC093673.5 2752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 144223556 144223561 144223559 Y NA NA NA NA NA NA OR2A20P 275506 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 144473103 144473255 144473180 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 58233 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 148269293 148269443 148269383 Y NA AC005229.5 NA NA NA NA AC005229.5 6050 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 148637842 148638122 148637883 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 148824928 148825234 148824952 Y NA ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF398 3420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 150944094 150944397 150944255 Y NA ABCF2,CHPF2 NA NA NA NA CHPF2 16519 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 150944441 150944847 150944697 Y ASB10,SMARCD3 ABCF2,CHPF2 NA NA NA NA CHPF2 16866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 151442202 151442898 151442523 Y NA NA CRYGN,RHEB IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2-AS1 129229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 151493401 151493985 151493754 Y RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2-AS1 78142 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 153962360 153962659 153962529 Y NA NA NA NA NA NA PAXIP1 830135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 154743291 154743691 154743552 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49103 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 155744220 155744341 155744281 Y NA AC021218.2 LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC021218.2 8985 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr7 155744375 155744769 155744531 Y NA AC021218.2 LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC021218.2 8557 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA AC021218.2 LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC021218.2 1232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr7 157054104 157054271 157054188 Y NA NA NA NA NA NA RP4-814D15.2 71042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr7 158301130 158301237 158301184 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 194283 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 158656529 158657066 158657015 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA WDR60 9260 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr7 158808159 158808606 158808258 Y VIPR2 NA NA NA NA NA WDR60 160890 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 582547 582966 582856 Y ERICH1 NA NA NA NA NA ERICH1 103140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr8 880803 881088 881029 Y NA NA NA NA NA NA ERICH1 194697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 1386881 1387011 1386929 Y NA NA NA NA NA NA CLN8 314933 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 1694228 1694696 1694461 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 ARHGEF10,CLN8,ZNF596 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLN8 7248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 1702764 1703414 1703177 Y CLN8 CLN8,CTD-2336O2.1 NA NA NA NA CLN8 820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 1897074 1897760 1897667 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 22284 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA MCPH1 60983 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 6431105 6431496 6431367 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 132234 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 6455509 6456036 6456003 Y ANGPT2 NA NA NA NA NA CTD-2541M15.1 107694 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 8147008 8147233 8147135 Y NA NA SGK223,MFHAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 94775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 8939736 8940088 8939838 Y CLDN23,ERI1,PPP1R3B NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 66996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 8992774 8993100 8992937 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA PPP1R3B 13984 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 9219931 9220273 9220102 Y PPP1R3B NA NA NA NA NA TNKS 191151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 10009702 10010057 10009864 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 99924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 10117948 10118255 10118046 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 208170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 10187572 10187859 10187580 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 277794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 10240341 10240349 10240345 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 330563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 10591008 10591121 10591065 Y RP1L1,SOX7 NA NA NA NA NA SOX7 104236 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA NA NA NA NA NA MTMR9 107393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.91301470023875 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 11337266 11337614 11337440 Y FAM167A FAM167A C8orf12,BLK IMR90 Hi-C 24141950 FAM167A 7042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 11368445 11368737 11368558 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 38221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 11373324 11373814 11373559 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 43100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 11734631 11734824 11734746 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 9674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA LONRF1 612649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 13393176 13393534 13393351 Y DLC1 NA DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 LONRF1 781594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 15503132 15503306 15503219 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 1508232 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 16280941 16281214 16281102 Y MSR1 NA NA NA NA NA ZDHHC2 730324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 16629867 16630175 16630011 Y ZDHHC2 NA TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 381363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 17194213 17194219 17194216 Y SLC7A2,SLC7A2 NA NA NA NA NA CNOT7 91826 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 18704322 18704730 18704574 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 235510 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 18985501 18986149 18985818 Y NA PSD3 LOC100128993,PSD3 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 45261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 18991999 18992391 18992140 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 51759 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 18998257 18998415 18998308 Y NA NA PSD3,LOC100128993 IMR90 Hi-C 24141950 PSD3 58017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 19028579 19029034 19028823 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 88339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19058200 19058838 19058472 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 110290 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 19066932 19067320 19067099 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 101808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 19075736 19075934 19075838 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 93194 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr8 19236420 19236600 19236592 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 67292 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19293000 19293226 19293113 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 123872 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 19332797 19333402 19333164 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 163669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19414490 19414802 19414647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1105O14.1 119281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19436473 19436611 19436572 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1105O14.1 97472 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 19518773 19518959 19518866 Y NA RP11-1105O14.1 NA NA NA NA RP11-1105O14.1 15124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA RP11-1105O14.1 NA NA NA NA RP11-1105O14.1 10798 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 19533548 19533780 19533688 Y CSGALNACT1 RP11-1105O14.1 NA NA NA NA RP11-1105O14.1 303 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 19562281 19562595 19562501 Y ATP6V1B2 RP11-1105O14.1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1105O14.1 28198 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 19566953 19567512 19567287 Y NA RP11-1105O14.1,CSGALNACT1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1105O14.1 32870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 21817623 21817860 21817686 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 42443 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22516346 22516607 22516450 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 8054 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22522684 22522941 22522886 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 1720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22561043 22561327 22561142 Y PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 12228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA EGR3 161586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 NA NA NA NA NA TNFRSF10B 70297 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 22855581 22855914 22855756 Y EGR3,EGR3,EGR3 NA NA NA NA NA TNFRSF10B 68778 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23016406 23016568 23016458 Y ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 2975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23034603 23034952 23034670 Y TNFRSF10B,TNFRSF10D TNFRSF10D,TNFRSF10A NA NA NA NA TNFRSF10D 15060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 23308133 23308499 23308237 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 LOXL2,ENTPD4 NA NA NA NA ENTPD4 4709 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23390028 23390384 23390041 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 5710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 23613077 23613131 23613104 Y ENTPD4,ENTPD4 NA SLC25A37,STC1 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 74637 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 23655999 23656321 23656218 Y STC1 NA STC1,SLC25A37 IMR90 Hi-C 24141950 STC1 53999 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 23710742 23711028 23710888 Y STC1 STC1 NA NA NA NA STC1 422 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 23844518 23844653 23844586 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-148P 88018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 24013716 24014104 24013764 Y STC1 NA STC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-148P 81045 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr8 24206605 24207043 24206844 Y ADAM28,ADAMDEC1 NA NA NA NA NA ADAM28 57052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 25092167 25092564 25092364 Y NA NA NA NA NA NA DOCK5 51929 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 26008929 26009154 26009015 Y NA NA PPP2R2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R2A 137853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DPYSL2 62455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 26447042 26447356 26447232 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 77251 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 26453595 26453975 26453687 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 83804 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 27198229 27198437 27198331 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 31230 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 27219305 27219672 27219420 Y PTK2B,PTK2B NA NA NA NA NA PTK2B 52306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 27474556 27474730 27474657 Y NA CLU SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CLU 4008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr8 27972693 27972953 27972823 Y NA ELP3 NA NA NA NA ELP3 27503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 28565617 28566294 28565942 Y EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 8636 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 28635981 28636227 28636104 Y EXTL3 NA NA NA NA NA EXTL3-AS1 79000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 28637206 28637596 28637433 Y EXTL3,KIF13B NA NA NA NA NA EXTL3-AS1 80225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 28884105 28884486 28884217 Y HMBOX1,HMBOX1 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 26966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 28934607 28934767 28934687 Y NA CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 23155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29198749 29199265 29198931 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 6920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29202154 29202365 29202273 Y DUSP4,DUSP4 DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 3820 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29204481 29204724 29204678 Y NA DUSP4 NA NA NA NA DUSP4 1461 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 29412862 29413263 29412985 Y DUSP4,DUSP4 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 206677 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29413574 29413927 29413748 Y DUSP4 NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR548O2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 207389 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29495067 29495424 29495202 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 288882 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr8 29498284 29498389 29498338 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 292099 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 29513029 29513506 29513190 Y KIF13B NA DUSP4,MIR3148,C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 306844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 29526859 29527039 29527017 Y NA NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 320674 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 8.33527833675456 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 30462940 30463157 30463081 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 50611 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 30666266 30666462 30666364 Y NA PPP2CB NA NA NA NA PPP2CB 3368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 31040746 31040774 31040760 Y NA NA NA NA NA NA WRN 151429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 33287156 33287526 33287341 Y NA FUT10 NA NA NA NA FUT10 41414 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 33291442 33291793 33291639 Y MAK16,FUT10,C8orf41,C8orf41 FUT10,MAK16 NA NA NA NA FUT10 37147 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 37929132 37929304 37929218 Y NA EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 31456 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 38077409 38077725 38077419 Y NA BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B DDHD2 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD2 3011 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 38160807 38161004 38160956 Y NA PPAPDC1B NA NA NA NA PPAPDC1B 36046 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 38647998 38648343 38648132 Y LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 NA NA NA NA NA TACC1 64294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 39865066 39865447 39865202 Y NA NA NA NA NA NA C8orf4 143542 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 39918999 39919284 39919148 Y C8orf4 NA C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 89705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 41649689 41649828 41649744 Y NKX6-3 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 215802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 41882456 41882591 41882524 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 24917 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 221418 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 224269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 48746170 48746340 48746217 Y MCM4 NA NA NA NA NA CEBPD 96522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 48903451 48903743 48903597 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 15217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 53607875 53608327 53608179 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 48076 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 55088607 55088824 55088716 Y NA MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 42837 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 55304769 55304781 55304775 Y NA NA NA NA NA NA RP11-53M11.3 160140 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 56798106 56798776 56798363 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 7734 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 57122742 57122884 57122813 Y NA PLAG1,CHCHD7 NA NA NA NA CHCHD7 497 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 59499727 59499886 59499762 Y UBXN2B,NSMAF,NSMAF,SDCBP SDCBP NA NA NA NA SDCBP 36244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 59710658 59710976 59710817 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 14135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.01233191503607 chr8 61660299 61660611 61660357 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 70962 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 61821464 61821801 61821596 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 232127 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 61825257 61825601 61825298 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 235920 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 62385898 62385985 62385942 Y CLVS1 NA NA NA NA NA ASPH 239170 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 62600598 62600698 62600684 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 24457 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 62646245 62646286 62646251 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 20898 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 62647103 62647241 62647155 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 21756 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 62679636 62680132 62679874 Y NA NA ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4470 54289 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 63162204 63162589 63162538 Y NA NA NA NA NA NA MIR4470 536857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 65284864 65285259 65285053 Y BHLHE22 NA NA NA NA NA YTHDF3 1205752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66652181 66652518 66652302 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 97212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66856759 66857100 66856934 Y PDE7A NA NA NA NA NA PDE7A 104202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66934530 66934705 66934628 Y PDE7A NA NA NA NA NA AC084082.3 88197 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 66935018 66935363 66935175 Y PDE7A NA NA NA NA NA AC084082.3 87539 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 67035997 67036639 67036283 Y NA AC084082.3 NA NA NA NA AC084082.3 13095 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 67433991 67434613 67434592 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 67434763 67435122 67434951 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 89360 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 67565254 67565409 67565332 Y NA MYBL1,VCPIP1,C8orf44 NA NA NA NA VCPIP1 12043 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 67694398 67694637 67694506 Y VCPIP1,SGK3,SGK3 PTTG3P NA NA NA NA PTTG3P 16158 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 68075038 68075412 68075329 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 81020 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 68097028 68097398 68097213 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 103010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 71158637 71159069 71158929 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 144223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA NA NA NA NA NA XKR9 1163902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA NA TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 TERF1 910666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 74926613 74926741 74926708 Y UBE2W,TMEM70,LY96 TCEB1,TMEM70,RP11-367E12.4,LY96 NA NA NA NA LY96 25026 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA NA NA NA NA NA PKIA 248204 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 NA NA NA NA NA MRPS28 259346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 NA MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS28 243974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 80701258 80701483 80701350 Y HEY1 NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 239041 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 NA HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS28 234269 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 21.5897373312659 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 89124026 89124433 89124347 Y MMP16 NA NA NA NA NA AF121898.3 358080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 92045909 92045927 92045918 Y TMEM55A TMEM55A,GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA TMEM55A 5365 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA RBM12B 22588 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 94928107 94928427 94928252 Y NA NA NA NA NA NA PDP1 60072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 95429933 95430227 95430143 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 55110 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 97177762 97178066 97177912 Y GDF6 NA NA NA NA NA UQCRB 67796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 98865970 98866240 98866105 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 9042 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 99952283 99952358 99952318 Y OSR2 STK3 NA NA NA NA STK3 697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 99952429 99952792 99952702 Y NA STK3 NA NA NA NA STK3 263 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3 NA NA NA NA STK3 247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 101880714 101880933 101880768 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 82683 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 101912406 101912993 101912785 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA NA NA NA NA YWHAZ 50623 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 101914244 101914460 101914402 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 49156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 102110720 102110996 102110973 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF706 105425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 NA NA NA NA NA NACAP1 144968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 13972 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA KB-1732A1.1 NA NA NA NA KB-1732A1.1 6885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 12356 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 104088692 104088862 104088809 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32 NA NA NA NA NA ATP6V1C1 57401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 107770186 107770567 107770447 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 61945 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 109455148 109455290 109455182 Y NA EIF3E NA NA NA NA EIF3E 9586 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA NA TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 319739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr8 117476077 117476257 117476175 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 300485 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 117481258 117481269 117481264 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 295473 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 117664096 117664364 117664167 Y RAD21 NA NA NA NA NA UTP23 112378 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 117664503 117664654 117664532 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 112088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 119339236 119339376 119339324 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 217144 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 119345117 119345386 119345219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 223025 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 120063756 120064086 120063927 Y NA NA SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 101317 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 120217398 120217670 120217528 Y MAL2 MAL2 NA NA NA NA MAL2 42125 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 120476528 120476692 120476610 Y NA NOV NA NA NA NA NOV 49982 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr8 121409658 121410211 121409711 Y NA MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MTBP 45429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 122335950 122336427 122336136 Y NA NA HAS2,HAS2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 315203 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 122755244 122755615 122755430 Y NA NA NA NA NA NA HAS2 103614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 124462485 124463022 124462596 Y NA ATAD2,WDYHV1 NA NA NA NA WDYHV1 35520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 125539571 125539718 125539637 Y RNF139 NDUFB9,TATDN1 RNF139 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NDUFB9 9626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 125878645 125879203 125878949 Y RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196 NA MTSS1,NDUFB9,TATDN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1082L8.4 52721 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 126083515 126083743 126083629 Y NA NSMCE2,KIAA0196 NA NA NA NA NSMCE2 18178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 126353679 126353867 126353799 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 86696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 126452500 126452812 126452633 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127445250 127445715 127445335 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 122405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127574722 127575027 127574875 Y NA RP11-89K10.1,FAM84B NA NA NA NA FAM84B 6084 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127732344 127732562 127732346 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 163706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 127840242 127840498 127840319 Y NA NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 271604 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127844573 127844851 127844712 Y FAM84B NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 FAM84B 275935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127927068 127927434 127927240 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 301899 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 127928770 127929133 127928805 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 300200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 127950397 127950550 127950437 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 278783 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128048074 128048382 128048201 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 180951 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr8 128068284 128068629 128068554 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 160704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 8.74521005823429 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 116138 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 128134721 128135121 128135085 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 94212 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr8 128167127 128167527 128167484 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 61806 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 128171088 128171312 128171255 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 58021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 128176067 128176333 128176204 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 53000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr8 128179610 128179821 128179807 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 49512 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.96267330763741 chr8 128182261 128182424 128182343 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 46909 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 128182729 128182789 128182759 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 46544 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128185119 128185731 128185383 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 43602 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 128193341 128193750 128193748 Y NA CCAT1 MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 CCAT1 35583 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 32205 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 128203137 128203490 128203390 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 25843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr8 128208934 128209645 128209301 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 19688 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 9.56507350119375 chr8 128219153 128219489 128219426 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 9844 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.50308297875902 chr8 128222835 128223182 128223058 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 6151 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr8 128227053 128227754 128227491 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1579 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr8 128227982 128228299 128228180 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.32294642171848 chr8 128231853 128232218 128232163 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 2520 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 128237300 128237732 128237515 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 7967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.41609767899777 chr8 128239593 128240207 128240123 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10260 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128253341 128253569 128253504 Y NA CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 24008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.04965860739866 chr8 128257606 128258262 128257899 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28273 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr8 128258299 128258698 128258657 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 28966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 5.32911237923652 chr8 128259400 128259918 128259781 Y MYC CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 30067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 4.78253675059688 chr8 128260594 128261000 128260832 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 31261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr8 128264964 128265070 128265034 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 35631 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.77637079307884 chr8 128265922 128266338 128266337 Y NA CCAT1 PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 36589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr8 128276351 128276739 128276546 Y NA CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 47018 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr8 128277603 128277799 128277701 Y MYC CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr8 128282226 128282505 128282442 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 52893 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.27945377183786 chr8 128306934 128307283 128307196 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 77601 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 7.78870270811491 chr8 128309901 128310145 128310009 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 80568 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128319902 128320220 128320122 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 90569 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128352367 128352670 128352528 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 123034 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 128630700 128630869 128630842 Y NA NA MYC MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 114811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128678694 128678799 128678726 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 66881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128680816 128681380 128681307 Y MYC NA MYC,PVT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MYC 64300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 128811691 128811973 128811933 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 6912 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 128821272 128821652 128821500 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 16493 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128822019 128822203 128822035 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128835085 128835527 128835341 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 30306 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128871975 128872421 128872033 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 67196 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128888912 128889201 128889088 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 84133 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128910613 128910985 128910818 Y MYC NA NA NA NA NA PVT1 105834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128911546 128911899 128911640 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 106767 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128923296 128923609 128923453 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 97248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128961875 128962320 128962073 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 58537 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 128988975 128989172 128989023 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 31685 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128993662 128993919 128993808 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 128999913 129000275 129000158 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 20582 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 129053712 129054462 129054053 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 32855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 129114844 129115073 129114937 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 93987 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129115789 129116244 129116059 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94932 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 129139934 129140421 129140284 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 119077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 129180743 129180870 129180780 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr8 129185963 129186138 129186049 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 165106 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 129186526 129186768 129186668 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 165669 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.36643907159911 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 129205979 129206284 129206246 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 185122 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129279863 129280046 129279972 Y NA NA MYC,MIR1208 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-25P 259006 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129339245 129339624 129339435 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 318388 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129373096 129373322 129373148 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 352239 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 130248733 130249143 130248913 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 547991 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 130276048 130276167 130276108 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 520967 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA GSDMC 100703 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131027030 131027189 131027125 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 186 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131204007 131204378 131204106 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 176632 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr8 131264949 131265429 131265208 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 188477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131364558 131364729 131364627 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 89177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 131456841 131457348 131457080 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 2935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 131467153 131467172 131467163 Y NA ASAP1 ASAP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASAP1 13247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 134387761 134388081 134387916 Y NA NA TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTC-458A3.1 51521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 134664147 134664493 134664336 Y ST3GAL1 NA ST3GAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST3GAL1 81964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 134919002 134919092 134919047 Y NA NA ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL1 336819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 137225928 137226328 137226138 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 758228 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 137554492 137554791 137554642 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1086792 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 137765888 137765903 137765896 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1298188 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 141608422 141608817 141608788 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 89025 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141655804 141656158 141655981 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 136407 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141804565 141804680 141804623 Y NA NA NA NA NA NA PTK2 205635 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141849368 141849592 141849371 Y TRAPPC9 NA NA NA NA NA PTK2 160723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 141972530 141972881 141972765 Y NA PTK2 NA NA NA NA PTK2 37434 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 142036879 142037195 142037043 Y NA PTK2 PTK2,DENND3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTK2 26564 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3 NA NA NA NA DENND3 38363 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 142182442 142182863 142182588 Y NA NA NA NA NA NA DENND3 57065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 142216641 142216829 142216751 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 91264 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 142275441 142276204 142275736 Y NA SLC45A4 PTK2,DENND3,SLC45A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC45A4 40200 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 142412543 142413026 142412776 Y DENND3,SLC45A4 PTP4A3,CTD-3064M3.4 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-3064M3.4 11869 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 143926112 143926283 143926201 Y NA NA NA NA NA NA LY6D 60104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 26152 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 144301806 144302247 144302025 Y MAFA ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 25033 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 144785317 144785390 144785376 Y NA ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA ZNF707 20695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 144799188 144799437 144799334 Y MAPK15 ZNF707,FAM83H,FAM83H-AS1 NA NA NA NA FAM83H 14534 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 145002494 145002937 145002709 Y SPATC1,PLEC PLEC NA NA NA NA PLEC 45965 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr8 145088816 145089042 145088955 Y PLEC,GRINA,SPATC1 PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1 NA NA NA NA PARP10 3876 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 145863462 145863727 145863548 Y NA ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,LRRC14,RECQL4,LRRC24,ZNF250 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP39 45467 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 2279055 2279418 2279226 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 265713 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 4241498 4241696 4241599 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 104696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1 NA NA NA NA RCL1 44350 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 4939146 4939407 4939322 Y JAK2 JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 43626 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 5449112 5449361 5449141 Y NA CD274 NA NA NA NA CD274 609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 5459353 5459726 5459436 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 PDCD1LG2 IMR90 Hi-C 24141950 CD274 10850 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 5478337 5478574 5478428 Y JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274 CD274 NA NA NA NA CD274 29834 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA NA CD274 61046 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 5777401 5777564 5777483 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 53553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 13034069 13034552 13034397 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-3L8.3 221725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 13084176 13084414 13084323 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 271832 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 14251419 14251628 14251514 Y NA NA NA NA NA NA NFIB 145354 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 15477137 15477463 15477300 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 31554 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 16062752 16063225 16063009 Y NA NA CNTLN,C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 537071 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 16344409 16344763 16344480 Y NA NA BNC2,C9orf93 IMR90 Hi-C 24141950 CNTLN 788217 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 173182 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 IFNB1 MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 IFNB1 20451 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 21479977 21480007 21479992 Y NA MIR31 NA NA NA NA MIR31 30177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21576231 21576644 21576439 Y NA MIR31HG MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 18563 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 21674915 21675193 21674990 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 117247 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 21677834 21678156 21678014 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MIR31HG 120166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21685022 21685416 21685227 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 115126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21688773 21688952 21688863 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 111590 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21744905 21745181 21745043 Y IFNA5,IFNA6,IFNA1 NA NA NA NA NA MTAP 55361 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 31514 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22040932 22041035 22040938 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA UBA52P6 30778 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22084782 22085031 22084907 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 74628 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 22117547 22117648 22117588 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 107393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 22148170 22148538 22148388 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2B,CDKN2A IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 138016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr9 22240757 22240884 22240825 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2A,C9orf53,CDKN2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 203956 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22310596 22310829 22310637 Y NA NA MTAP,DMRTA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 134011 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22389357 22389650 22389489 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA1 55190 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 22408637 22408662 22408639 Y NA DMRTA1 NA NA NA NA DMRTA1 36178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 27117778 27117984 27117879 Y NA NA NA NA NA NA PLAA 172317 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 27460604 27461032 27460875 Y C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 66747 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 29940600 29940947 29940774 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 746156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 32437038 32437275 32437091 Y NA NA NA NA NA NA ACO1 54420 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 32443270 32443461 32443367 Y TOPORS,DDX58 NA NA NA NA NA ACO1 60652 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 33159013 33159478 33159222 Y DNAJA1,NFX1,CHMP5,B4GALT1,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 5876 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 33160944 33161390 33161236 Y DNAJA1,SMU1,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 3964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 33770440 33770694 33770558 Y NA PRSS3,UBE2R2 NA NA NA NA PRSS3 21925 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34016159 34016420 34016379 Y NA UBAP2 NA NA NA NA UBAP2 30527 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34179799 34180083 34180009 Y UBE2R2,UBAP1 UBAP1,RP11-571F15.3 NA NA NA NA UBAP1 2796 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34193349 34193568 34193460 Y NA UBAP1,RP11-571F15.3 NA NA NA NA UBAP1 16346 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34352304 34352500 34352353 Y NA KIF24,NUDT2,KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 22351 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34575663 34576052 34575846 Y ARID3C,KIAA1045,DNAJB5,DNAJB5,C9orf25,ENHO,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 12069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34577617 34577859 34577738 Y ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 10262 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34588619 34588889 34588721 Y NA CNTFR,DCTN3,SIGMAR1 NA NA NA NA CNTFR 498 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34630838 34631031 34630927 Y ENHO,CNTFR,CNTFR,KIAA1045,DNAJB5 CNTFR,DCTN3,SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA SIGMAR1 4775 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 110762 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 NA NA NA NA NA TESK1 84777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.2297951644392 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 38035956 38036107 38036020 Y NA RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 30577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 71393578 71393897 71393631 Y FAM122A FAM122A NA NA NA NA FAM122A 614 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 71413577 71413589 71413582 Y NA FAM122A NA NA NA NA FAM122A 20613 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA NA NA NA NA NA FXN 80021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 71795556 71796114 71795819 Y TJP2 NA NA NA NA NA FXN 147381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.45959032887839 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 75791521 75791823 75791639 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 26848 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 77948563 77948787 77948675 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 247104 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 79350296 79350357 79350327 Y PRUNE2 NA NA NA NA NA AL161626.1 165565 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 85888522 85888919 85888721 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 212430 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 88298792 88299000 88298900 Y AGTPBP1 NA NA NA NA NA AGTPBP1 55944 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 89381829 89382120 89381981 Y ZCCHC6 NA ZCCHC6,GAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC6 414460 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 90407699 90408115 90407854 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA CDK20 179553 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 91538614 91539111 91538717 Y SECISBP2,S1PR3,C9orf47 NA LOC286238,S1PR3,SHC3 IMR90 Hi-C 24141950 SHC3 252571 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.86952205035813 chr9 92057511 92057673 92057630 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 126090 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 92515795 92516064 92515808 Y NA NA NA NA NA NA SECISBP2 584374 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 93823339 93823577 93823437 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 298618 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 93833669 93833838 93833696 Y NA NA NA NA NA NA AUH 288357 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 93880356 93880696 93880620 Y NA NA LOC100129316,AUH,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 241499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 93893646 93894080 93893930 Y NA NA LOC100129316,AUH IMR90 Hi-C 24141950 AUH 228115 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA AUH 146794 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 95388417 95388814 95388616 Y FGD3,CENPP IPPK NA NA NA NA IPPK 41733 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 95716430 95716630 95716571 Y SUSD3,FAM120AOS,FGD3 NA NA NA NA NA ZNF484 78126 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 95878204 95878686 95878424 Y IPPK,PHF2,FAM120A,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 15884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 95894467 95895029 95894875 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89 NA NA NA NA NINJ1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 96723182 96723238 96723197 Y NA NA BARX1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTPDC1 67838 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 96901972 96902054 96902023 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 37062 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 6.55890754367572 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 97631649 97631973 97631839 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 144666 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 98744078 98744248 98744144 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 107819 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 99051538 99051687 99051623 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D2 92305 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 99132173 99132333 99132255 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367 NA NA NA NA SLC35D2 11659 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 99535821 99536158 99535990 Y NA ZNF510 NA NA NA NA ZNF510 2253 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 99977715 99977938 99977827 Y NA ZNF322P1 NA NA NA NA ZNF322P1 17805 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 100432763 100433089 100432926 Y TSTD2,XPA NCBP1,TSTD2,XPA NA NA NA NA XPA 24550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 100548546 100549029 100548790 Y FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 90907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 100667728 100667773 100667740 Y NA C9orf156 NA NA NA NA C9orf156 15079 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 101002580 101002910 101002849 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 13005 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 101011075 101011589 101011252 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 4326 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 101572840 101572995 101572898 Y GALNT12 ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 4859 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 102006739 102006945 102006777 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24393 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 102007294 102007527 102007424 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24948 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 102395675 102395876 102395737 Y ERP44,NR4A3 NA SEC61B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554F20.1 184295 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 103029299 103029483 103029391 Y NA NA NA NA NA NA TEX10 83738 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA NA C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TEX10 60609 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 103317087 103317229 103317158 Y C9orf30-TMEFF1,TMEFF1,LPPR1 NA NA NA NA NA TEX10 203866 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 103544281 103544296 103544289 Y NA NA NA NA NA NA TEX10 431060 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 104185147 104185490 104185310 Y NA MRPL50,ZNF189 NA NA NA NA ZNF189 25992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 105188189 105188275 105188232 Y NA NA NA NA NA NA RNF20 894056 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 105957487 105957816 105957647 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 896725 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 RP11-217B7.2,ABCA1 NA NA NA NA RP11-217B7.2 18109 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 107723549 107723790 107723714 Y NIPSNAP3A,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 35031 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 108474101 108474491 108474408 Y TMEM38B TMEM38B NA NA NA NA TMEM38B 19276 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 108623002 108623305 108623152 Y FSD1L,FSD1L,TAL2 NA MIR548Q,ZNF462 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM38B 168177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 15956 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chr9 110514044 110514454 110514287 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 219373 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 110517575 110517896 110517754 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 222904 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 110811401 110811623 110811540 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 516730 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 110819751 110819910 110819831 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-438P9.1 525080 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 111003656 111003963 111003923 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 383150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 111305633 111306048 111305864 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 81065 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 111759404 111759745 111759575 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 14064 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 112547899 112548110 112547990 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 7130 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 112578765 112579213 112578950 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 112831833 112832445 112832154 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 46195 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN C9orf152,TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 113020211 113020679 113020386 Y AKAP2 TXN NA NA NA NA TXN 3291 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 113515835 113516213 113516024 Y NA NA NA NA NA NA LPAR1 282768 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA NA NA NA NA NA GNG10 84016 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 114774761 114774976 114774762 Y UGCG NA NA NA NA NA UGCG 117715 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 114805021 114805139 114805071 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 130549 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 115031676 115032066 115031959 Y KIAA1958 NA NA NA NA NA PTBP3 61881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 115067475 115067560 115067518 Y SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2 PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 26387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 115981344 115981857 115981657 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 NA NA NA NA NA FKBP15,SLC31A1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 116031847 116032083 116031965 Y NA PRPF4,CDC26 NA NA NA NA PRPF4 3540 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117080236 117080340 117080297 Y TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1 NA NA NA NA NA COL27A1 164396 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117481130 117481475 117481264 Y TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 84931 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 117647197 117647589 117647272 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 80791 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 17.6270640236285 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 117689832 117690184 117690062 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 123426 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117690349 117690800 117690390 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 123943 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117691412 117691904 117691627 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 125006 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117720208 117721654 117720651 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA LOC100505478,DFNB31,C9orf91,TNFSF15,TNFSF8,TNC IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF15 153802 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 117757881 117758377 117758257 Y NA NA TNFSF8,TNFSF15 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 120159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117762269 117762816 117762619 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 115720 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 117878279 117878434 117878355 Y NA TNC NA NA NA NA TNC 102 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 118353952 118354125 118354022 Y TNC NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 475416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 118403305 118403595 118403372 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 524769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556397 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 118758811 118759033 118758921 Y NA NA PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 688548 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 118789906 118790104 118789991 Y NA NA LINC00474,PAPPA,ASTN2 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 657477 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 123237192 123237494 123237347 Y MEGF9,FBXW2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 102954 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 123243513 123243809 123243661 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 96639 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 123393159 123393348 123393336 Y TRAF1,MEGF9 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 52711 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 2.5962342360383 chr9 125109314 125109437 125109338 Y NA PTGS1 TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL IMR90 Hi-C 24141950 PTGS1 21387 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 125654025 125654372 125654281 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 11248 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 126291594 126291648 126291621 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 262739 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 126695812 126695993 126695905 Y PSMB7 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 5381 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 127466904 127467345 127467172 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 48158 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 127468042 127468336 127468195 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 49296 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 127475055 127475439 127475319 Y NA NA NA NA NA NA NR6A1 56150 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 127947242 127947259 127947251 Y NA SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 2959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 128298527 128298744 128298662 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168769 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 128299092 128299304 128299184 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 168209 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 128408655 128409172 128408692 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 58341 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 130304237 130304411 130304308 Y FAM129B,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 34857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 130319753 130319894 130319823 Y ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B FAM129B NA NA NA NA FAM129B 19374 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 130336494 130336746 130336628 Y TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 2522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 130590782 130591142 130590862 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,AK1 NA NA NA NA FPGS 35906 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,AK1 NA NA NA NA AK1 36777 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 130718218 130718307 130718248 Y NA ST6GALNAC4,PIP5KL1,DPM2,FAM102A NA NA NA NA DPM2 19455 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 131673839 131674187 131673982 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,LRRC8A,LRRC8A LRRC8A,CCBL1,DOLK,NUP188 NA NA NA NA CCBL1 31066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 131908135 131908616 131908494 Y METTL11A PPP2R4,CRAT,IER5L NA NA NA NA IER5L 29924 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.63972688591893 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 40833 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA NA NA NA NA NA PTGES 53678 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132494076 132494377 132494232 Y NA PTGES NA NA NA NA PTGES 18949 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132539303 132540203 132539702 Y C9orf106,FNBP1,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOR1B 23229 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 132579299 132579626 132579554 Y ASB6,USP20,USP20,C9orf78 TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78 NA NA NA NA TOR1A 4787 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132757819 132758165 132758070 Y TOR1B,FNBP1 FNBP1 NA NA NA NA FNBP1 45308 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 133721311 133721454 133721341 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 91219 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134113096 134113636 134113575 Y PRRC2B,NUP214,FAM78A NA NA NA NA NA NUP214 114148 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.956507350119375 chr9 134510539 134511032 134510903 Y RAPGEF1,RAPGEF1 NA NA NA NA NA RAPGEF1 102429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134773213 134773507 134773412 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 159752 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134821616 134821991 134821804 Y RAPGEF1 NA NA NA NA NA MED27 131304 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 134908976 134909021 134908999 Y NA MED27 NA NA NA NA MED27 44274 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 135818615 135818626 135818622 Y RALGDS,C9orf96 TSC1 NA NA NA NA TSC1 595 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 136010510 136011124 136011032 Y RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS NA NA NA NA RALGDS 26177 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 136236880 136237291 136237149 Y NA SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SNORD36C,SURF2,SURF1,SURF4,REXO4 NA NA NA NA SURF4 3679 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 138796932 138797111 138797062 Y CAMSAP1 RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 139120043 139120348 139120196 Y NOTCH1 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 15339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 139136338 139136616 139136467 Y QSOX2 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 651 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5 NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 140022067 140022152 140022137 Y EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 14438 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 9.56507350119375 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chr9 140306093 140306345 140306289 Y NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 9369 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chr9 140388730 140388770 140388753 Y FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1 NA NA NA NA NA MRPL41 54881 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 140463644 140464019 140463889 Y FAM166A,C9orf173 MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA ZMYND19 18923 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 140523205 140523460 140523276 Y ANAPC2,NDOR1,EHMT1 ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 11761 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 140526461 140526811 140526551 Y NA ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1 NA NA NA NA EHMT1 15017 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA RP11-98L4.1 84120 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 10547215 10547494 10547354 Y NA NA NA NA NA NA MID1 302279 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 10712546 10712862 10712704 Y NA NA NA NA NA NA MID1 136911 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 12973794 12974181 12973922 Y ATXN3L,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 17046 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 13002969 13003378 13003273 Y TLR7,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 11742 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 128697 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 13282012 13282232 13282116 Y TLR7 GS1-600G8.5 LOC100133123 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-600G8.5 37339 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 14014915 14015109 14015012 Y GPM6B,GPM6B GEMIN8 NA NA NA NA GEMIN8 30903 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 15852343 15852548 15852528 Y NA ZRSR2,AP1S2 NA NA NA NA AP1S2 18506 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 16042754 16042895 16042804 Y AP1S2 NA CTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S2 171700 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 259691 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 19859063 19859320 19859184 Y SH3KBP1 SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 44399 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 20283183 20283718 20283506 Y SH3KBP1,RPS6KA3 NA NA NA NA NA RPS6KA3 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 22538340 22538693 22538516 Y NA NA NA NA NA NA SMS 581649 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 23806806 23807042 23806932 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,ACOT9,SAT1 ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 7516 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 29681325 29681360 29681343 Y NA NA NA NA NA NA FTLP2 965055 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA RPGR 153975 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 39732085 39732610 39732601 Y BCOR NA NA NA NA NA GAPDHP1 86695 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 39767458 39767957 39767519 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 122068 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 39963931 39964200 39963990 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 70382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 40017598 40017727 40017669 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 16855 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 40841745 40842012 40841881 Y NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 76508 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA RP11-245M24.1 121237 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45338516 45338773 45338583 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 23860 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45366261 45366615 45366438 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 3628 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA RP11-245M24.1 MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-245M24.1 11995 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45617544 45618196 45618069 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 13014 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 47415526 47415793 47415667 Y NA ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 2723 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 47467971 47468313 47468102 Y NA ARAF,TIMP1,SYN1,ELK1,UXT NA NA NA NA SYN1 8939 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 48345811 48346195 48345963 Y WAS,RBM3,PQBP1,PQBP1,PQBP1,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA FTSJ1 13270 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 48348956 48349364 48349102 Y PORCN,PORCN,FTSJ1 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 15986 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 48350817 48351213 48350906 Y WAS,RBM3,PORCN,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 14137 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 48938465 48938570 48938518 Y NA TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW NA NA NA NA PRAF2 8735 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 53467183 53467489 53467297 Y FAM156A,TSPYL2,IQSEC2 SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 7863 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 53741584 53742291 53741941 Y KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8 HUWE1 HUWE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 HUWE1 29911 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 54207248 54207470 54207359 Y NA FAM120C NA NA NA NA FAM120C 244 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 57420009 57420263 57420031 Y NA NA NA NA NA NA FAAH2 108870 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 57490949 57491197 57490977 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 125072 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 57927530 57927661 57927604 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 311261 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 64898955 64899156 64899089 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 92698 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 67914058 67914579 67914414 Y STARD8 STARD8 NA NA NA NA STARD8 48550 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.546575628639643 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 73916 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA NA NA NA NA NA UPRT 468902 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 75368142 75368530 75368366 Y NA NA NA NA NA NA LDHBP2 185714 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.819863442959465 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 515628 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA NA NA NA NA NA ARMCX6 77437 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 104559193 104559437 104559342 Y NA NA NA NA NA NA FAM199X 1149892 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 106448636 106449011 106448824 Y NA NUP62CL NA NA NA NA NUP62CL 966 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 106917807 106918338 106918010 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 48070 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 106919078 106919623 106919349 Y TSC22D3,TSC22D3 PRPS1 TSC22D3,PRPS1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 49341 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 1.09315125727929 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 107639720 107640073 107639886 Y COL4A6 COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA COL4A6 40654 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 109330355 109330526 109330451 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 86496 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 125406399 125406559 125406479 Y NA NA NA NA NA NA MTND4P24 198309 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 3.00616595751804 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 3706 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 130706744 130706880 130706830 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 175067 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 130952432 130952771 130952603 Y NA NA NA NA NA NA MST4 202522 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.273287814319822 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 139809387 139809785 139809560 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 459525 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 149084401 149084780 149084588 Y NA LINC00894,CXorf40B NA NA NA NA LINC00894 20066 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 149186886 149187270 149187078 Y NA NA NA NA NA NA CXorf40B 81857 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 5996 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 149534295 149534593 149534360 Y MAMLD1 MAMLD1 NA NA NA NA MAMLD1 6606 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 152065195 152065303 152065205 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 67684 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 152066086 152066201 152066144 Y NA NA CETN2,NSDHL MCF7 ChIA-PET 22265404 NSDHL 68575 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 153084450 153084610 153084498 Y NA SRPK3,SSR4,IDH3G,CYCSP45 NA NA NA NA CYCSP45 20096 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 153308986 153309188 153309114 Y NA IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 25555 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.683219535799554 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 DKC1 NA NA NA NA DKC1 32521 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.409931721479732 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE LU65 hg19 FANTOM5 0.136643907159911