chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 993498 993878 993664 Y NA ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA RP11-465B22.3 384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-465B22.3 21720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 1063914 1064111 1063979 Y AGRN,VWA1 C1orf159 B3GALT6,SDF4,C1orf159,TNFRSF18,TTLL10,TNFRSF4,LOC254099,ACAP3,UBE2J2,SCNN1D,PLEKHN1,C1orf170,AGRN,ISG15,RNF223 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1orf159 14173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 1456676 1456699 1456688 Y NA ATAD3A NA NA NA NA ATAD3A 11145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 1714020 1714715 1714566 Y SKI,CDK11B,CDK11A,NADK,GNB1 SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 4124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 2059932 2059994 2059963 Y HES5 NA NA NA NA NA C1orf86 82165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 7107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B NA NA NA NA TNFRSF14 6261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 3086923 3087330 3087113 Y PRDM16 NA NA NA NA NA PRDM16 103191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 138833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 136124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 3237165 3237518 3237290 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 131472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 3325555 3326143 3325876 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 42847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 3398864 3399114 3399029 Y NA ARHGEF16 NA NA NA NA ARHGEF16 29874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 6354110 6354322 6354254 Y ZBTB48,GPR153,ACOT7 GPR153 NA NA NA NA GPR153 35075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 6402298 6402445 6402360 Y NA NA GPR153,HES3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ACOT7 50006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 7359415 7359679 7359556 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 469650 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 7656791 7657175 7656983 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 172154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr1 8054249 8054565 8054423 Y NA PARK7,ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 29803 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8107848 8108157 8108001 Y NA ERRFI1,RP11-431K24.1 ERRFI1,RERE,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 23050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8121436 8121582 8121497 Y ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 RERE,ERRFI1,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 36638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr1 8137301 8137521 8137361 Y NA NA ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 52503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr1 8154517 8154933 8154754 Y VAMP3 NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 69719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8157417 8157780 8157543 Y NA NA ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 72619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 8181009 8181247 8181098 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 96211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8214748 8215059 8214907 Y ERRFI1 NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 129950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8215795 8215905 8215839 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 130997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8229904 8230047 8229996 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-431K24.1 145106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8254637 8254907 8254798 Y NA NA ERRFI1,PARK7,RERE,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 169839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8257762 8258040 8257906 Y NA NA ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 172964 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 NA ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-431K24.1 177425 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr1 8445817 8446112 8445964 Y RERE NA NA NA NA NA RP11-431K24.1 361019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8450820 8451072 8450834 Y RERE,RERE NA NA NA NA NA RP11-431K24.1 366022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA RP11-431K24.1 384908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA RERE 387785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 3383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 9335683 9335930 9335747 Y SLC25A33 H6PD,SPSB1 NA NA NA NA SPSB1 15009 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 9760502 9760837 9760631 Y NA RP11-558F24.4 NA NA NA NA RP11-558F24.4 14889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 9885367 9885695 9885655 Y NA CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 2783 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 10057852 10058069 10058032 Y NA RBP7,UBE4B NA NA NA NA RBP7 2588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 10447707 10448369 10448247 Y NA PGD,APITD1,APITD1-CORT NA NA NA NA PGD 8280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 12046023 12046196 12046108 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 7785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 12050736 12051137 12050880 Y NPPA,NPPB,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 12498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 12589452 12589763 12589585 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 85974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 15572643 15572853 15572733 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1 FHAD1 NA NA NA NA FHAD1 875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 38733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 16470181 16470602 16470563 Y NA RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 9104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 16508402 16508642 16508565 Y FBLIM1 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA EPHA2 27820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 16670445 16670837 16670642 Y SPEN,C1orf64,FBXO42 FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 6112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr1 17229862 17230229 17230053 Y NA RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 15718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 17417123 17417163 17417153 Y NA SDHB NA NA NA NA SDHB 38458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr1 17896198 17896624 17896362 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 31868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 19264079 19264209 19264144 Y IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 ALDH4A1 IMR90 Hi-C 24141950 IFFO2 16971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 19280139 19280583 19280395 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 19283819 19283997 19283911 Y NA IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 2639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 19333976 19334220 19334098 Y NA NA UBR4,IFFO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 52796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr1 19780234 19780551 19780381 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 29515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 20091332 20091506 20091448 Y PLA2G2A,TMCO4 TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 32932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 20806851 20807214 20807064 Y NA CAMK2N1,MUL1 NA NA NA NA CAMK2N1 3499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 21476251 21476624 21476546 Y NA EIF4G3 NA NA NA NA EIF4G3 24753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 21650806 21651685 21651350 Y EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 18312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 21660622 21661187 21660789 Y EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1 ECE1 NA NA NA NA ECE1 8810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 21670382 21670956 21670695 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 21724067 21724372 21724186 Y NA HS6ST1P1,NBPF3 ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1P1 28424 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 21931612 21931850 21931825 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 61951 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 21965161 21965473 21965377 Y RAP1GAP RAP1GAP NA NA NA NA RAP1GAP 28328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 22692086 22692330 22692263 Y NA NA C1QC,C1QB,EPHB2,EPHA8,WNT4,C1QA IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB40 84014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 23448967 23449247 23449107 Y NA NA NA NA NA NA LUZP1 53054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 23542417 23542518 23542468 Y HTR1D LUZP1 KDM1A,LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 LUZP1 40116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 24833128 24833464 24833216 Y RUNX3,NIPAL3,SRRM1,RCAN3 RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 5741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 25559638 25560067 25559796 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 SYF2 NA NA NA NA SYF2 2645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 25802039 25802147 25802084 Y C1orf63 RHCE,TMEM57 NA NA NA NA TMEM57 46651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 26120852 26121165 26120974 Y NA SEPN1 SEPN1 IMR90 Hi-C 24141950 SEPN1 3502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 26337765 26338024 26337895 Y PAQR7,ZNF683 PAFAH2 PAQR7,STMN1,EXTL1 IMR90 Hi-C 24141950 PAFAH2 15117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr1 27175784 27176273 27175984 Y C1orf172,AIM1L,ZNF683,RPS6KA1,SFN ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 11360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr1 27289282 27289295 27289289 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA RP11-344H11.4 15361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27462835 27462988 27462889 Y ARID1A,PIGV,ZDHHC18,WDTC1,WASF2,FGR,FGR,FGR,SLC9A1 SLC9A1 NA NA NA NA SLC9A1 28484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 27762936 27763307 27763206 Y WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38 GPR3 NA NA NA NA GPR3 45788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 27957478 27958684 27958177 Y EYA3,SLC9A1,WASF2,XKR8,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR AHDC1,IFI6 NA NA NA NA AHDC1 28536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 28143878 28144081 28143936 Y NA STX12,PPP1R8 NA NA NA NA PPP1R8 11208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 28970474 28970729 28970677 Y NA TAF12,RNU11,GMEB1 NA NA NA NA RNU11 2383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 29104880 29105053 29104930 Y NA YTHDF2,OPRD1 NA NA NA NA OPRD1 31601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 29214759 29214998 29214903 Y GMEB1,EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 3156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 29253461 29253677 29253525 Y EPB41 EPB41 NA NA NA NA EPB41 41858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 29517304 29517322 29517313 Y NA SRSF4,MECR,PTPRU NA NA NA NA SRSF4 10805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 31504221 31504603 31504488 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 32235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 31643824 31643962 31643871 Y NA NA NA NA NA NA NKAIN1 66439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA NKAIN1 27517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 31944306 31944695 31944578 Y NA NA SERINC2,SNRNP40,NKAIN1,ZCCHC17,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1,PEF1,SPOCD1,HCRTR1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 63894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 32015159 32015590 32015321 Y NA TINAGL1 FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 TINAGL1 24526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 32421622 32422096 32421696 Y MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 13165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 32656692 32656709 32656701 Y ZBTB8A TXLNA,CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP NA NA NA NA CCDC28B 7278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,HDAC1 NA NA NA NA HDAC1 23004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33131314 33131452 33131383 Y NA ZBTB8OS,RBBP4,SYNC NA NA NA NA RBBP4 16571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33203093 33203146 33203106 Y NA SYNC KIAA1522 K562 ChIA-PET 22265404 SYNC 35896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 NA NA NA NA NA S100PBP 54284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 33378487 33378646 33378567 Y RNF19B FNDC5,TMEM54,RNF19B NA NA NA NA TMEM54 13448 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 33438571 33438703 33438616 Y KIAA1522,ADC RNF19B NA NA NA NA RNF19B 10285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33446816 33447482 33446950 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 18530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 33448758 33448929 33448798 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF19B 20472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33450600 33450837 33450735 Y RNF19B RNF19B RNF19B,AK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF19B 22314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 36817040 36817280 36817137 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 SH3D21,FAM176B K562 ChIA-PET 22265404 STK40 32217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 36839449 36839891 36839558 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 9606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 37944084 37944971 37944382 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 5931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 38466019 38466413 38466271 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2 NA NA NA NA FHL3 2865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 38495782 38495936 38495884 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1,RP5-884C9.2 NA NA NA NA POU3F1 14514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 40005546 40005959 40005647 Y NA PABPC4 NA NA NA NA PABPC4 34503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 40853198 40853308 40853253 Y NA SMAP2 NA NA NA NA SMAP2 44676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 40860574 40860824 40860661 Y NFYC,NFYC,CAP1,PPT1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 NA NA NA NA NA SMAP2 52052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41622480 41622650 41622563 Y NA NA CTPS,LOC100507178 IMR90 Hi-C 24141950 SCMH1 83176 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41825927 41826139 41826062 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41826642 41826952 41826745 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 1048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41828934 41829164 41829075 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 3340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 42934748 42935131 42934805 Y CCDC30,RIMKLA PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1 NA NA NA NA CCDC30 7747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 43250353 43250859 43250610 Y ZMYND12,WDR65,YBX1 LEPRE1,C1orf50,ERMAP,CCDC23 NA NA NA NA C1orf50 19413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 43988888 43989038 43988936 Y PTPRF PTPRF PTPRF IMR90 Hi-C 24141950 PTPRF 30 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44302297 44302456 44302338 Y NA NA NA NA NA NA RP11-7O11.3 107767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 44495684 44496307 44495779 Y NA CCDC24,SLC6A9 B4GALT2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC6A9 545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44887961 44887973 44887968 Y RNF220 RNF220 NA NA NA NA RNF220 19095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44950888 44951090 44950987 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 82022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44973431 44973656 44973576 Y PTCH2,C1orf228,SLC6A9,RNF220 NA NA NA NA NA RNF220 104565 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 44999581 44999933 44999757 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 130715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 45875042 45875301 45875196 Y IPP,TESK2 NA NA NA NA NA MUTYH 70900 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 45990749 45991039 45990946 Y NA TESK2,MMACHC,CCDC163P,PRDX1,AKR1A1 NA NA NA NA PRDX1 4030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 46268583 46268737 46268651 Y NA MAST2 NA NA NA NA MAST2 17924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN1 110179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 46575103 46575175 46575140 Y PIK3R3,PIK3R3 NA NA NA NA NA TSPAN1 63570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 46955737 46955918 46955906 Y DMBX1 NA FAAH,DMBX1,MKNK1 IMR90 Hi-C 24141950 FAAH 97800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 48024290 48024572 48024431 Y NA NA NA NA NA NA CMPK1 226821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 48935854 48936015 48935919 Y NA RP11-329A14.1,SPATA6 NA NA NA NA SPATA6 9 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 803780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 51302197 51302583 51302391 Y FAF1 NA NA NA NA NA FAF1 121352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA EPS15 NA NA NA NA EPS15 47408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 52110368 52110491 52110430 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 69517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 52193707 52193852 52193763 Y NA NA NA NA NA NA NRD1 148625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 53385696 53386052 53386029 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA ECHDC2 4832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 53702100 53702340 53702220 Y NA CPT2,C1orf123 NA NA NA NA MAGOH 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 54744858 54745090 54744974 Y NA NA CYB5RL,MRPL37 IMR90 Hi-C 24141950 CYB5RL 81149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 55418708 55418921 55418811 Y NA NA DHCR24,TMEM61,USP24,PCSK9,TTC22,C1orf177,BSND IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHCR24 67817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 55894779 55895033 55894906 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 USP24 215993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 56733795 56734079 56733937 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 374895 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 59232576 59232611 59232594 Y NA JUN NA NA NA NA JUN 15174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 61522505 61523042 61522705 Y NFIA,NFIA,NFIA NA INADL,NFIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIA 193574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 137543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 66877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 61784447 61784809 61784578 Y NA NA NA NA NA NA RP5-833A20.1 67265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 62928310 62928608 62928459 Y KANK4,USP1,USP1,ATG4C USP1 NA NA NA NA USP1 28342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 65387772 65388547 65388120 Y JAK1 JAK1 NA NA NA NA JAK1 41640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 65421731 65422136 65422135 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 8051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 65510370 65510451 65510413 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 20969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 68027599 68027762 68027652 Y NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 120982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 68166463 68166766 68166597 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 17719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68189225 68189635 68189533 Y NA GADD45A NA NA NA NA GADD45A 40481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68234822 68235039 68234951 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 62111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68314949 68315302 68315127 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 17799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 68364057 68364377 68364218 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 66907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 70017370 70017628 70017440 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 14453 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.47420208952672 chr1 70034819 70036254 70034877 Y NA LRRC7 NA NA NA NA LRRC7 2738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 75168986 75169131 75169081 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 27705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 75694572 75694736 75694622 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 380065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 75798807 75799079 75799068 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 275722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 75972237 75972619 75972428 Y NA NA NA NA NA NA SLC44A5 102182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 76080988 76081082 76081040 Y NA SLC44A5 NA NA NA NA SLC44A5 6187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 78171350 78171363 78171357 Y NA ZZZ3 NA NA NA NA ZZZ3 24246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 78348123 78348428 78348274 Y ZZZ3,FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 3770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 78441093 78441406 78441347 Y NA FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA FUBP1 1388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 78469106 78469287 78469191 Y DNAJB4 FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA GIPC2 25880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 114120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 82026431 82026771 82026601 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 158607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 82798183 82798427 82798305 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 612805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 83479623 83479625 83479624 Y NA NA NA NA NA NA TTLL7 983208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 84284633 84284926 84284781 Y NA NA NA NA NA NA TTLL7 177907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 84744562 84744926 84744685 Y PRKACB,SAMD13,SAMD13 NA DNASE2B,SAMD13,UOX,PRKACB IMR90 Hi-C 24141950 RPF1 198016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 84970111 84970722 84970500 Y NA RPF1 NA NA NA NA GNG5 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr1 85034322 85034489 85034405 Y CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 3674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 85038681 85038996 85038864 Y MCOLN2,GNG5,CTBS CTBS NA NA NA NA CTBS 518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr1 85643319 85643587 85643547 Y NA SYDE2 MIR4423 IMR90 Hi-C 24141950 SYDE2 21142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 86000890 86001115 86001087 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 40818 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 86049987 86050100 86050044 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA CYR61 5543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 87082786 87082842 87082814 Y NA NA NA NA NA NA SH3GLB1 85417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 87240012 87240427 87240202 Y SH3GLB1 NA HS2ST1,SEP15,SH3GLB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SH3GLB1 71753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 89466934 89467175 89467138 Y GTF2B,GBP2,GBP3 CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA RBMXL1 10291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 89581205 89581610 89581506 Y NA GBP2 NA NA NA NA GBP2 32529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 89594590 89594813 89594736 Y GTF2B,GBP3,GBP5,GBP4,GBP1,GBP2 GBP2 NA NA NA NA GBP2 19326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 90321378 90321621 90321467 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 36805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 85151 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 91361231 91361653 91361295 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 46024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 92184014 92184251 92184134 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 185641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA NA NA NA NA NA GLMN 144948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 93270252 93270588 93270467 Y NA EVI5,RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 EVI5 14291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 47399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94023703 94024059 94023930 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 31697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94089710 94089715 94089713 Y NA RP5-1033H22.2 NA NA NA NA RP5-1033H22.2 33954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA RP5-1033H22.2 72033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94234014 94234407 94234233 Y NA NA BCAR3,FNBP1L,LOC100129046 IMR90 Hi-C 24141950 BCAR3 76299 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94429275 94429464 94429371 Y GCLM NA ABCA4,ARHGAP29 IMR90 Hi-C 24141950 GCLM 56309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 94527681 94527931 94527843 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 154715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94535371 94535770 94535449 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 162405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 94560274 94560395 94560335 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 178229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94621912 94621923 94621919 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP29 116701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP29 26007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 49762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 94891778 94892070 94891849 Y NA ABCD3 NA NA NA NA ABCD3 9845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 95221261 95221551 95221307 Y NA NA F3,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 62286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 95249173 95249377 95249275 Y NA LINC01057,SLC44A3 ABCD3,F3,ALG14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 34460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 95263833 95264301 95264195 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 19536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 95331900 95332266 95332157 Y NA LINC01057,SLC44A3 CNN3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC44A3 48002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 97291085 97291340 97291213 Y NA NA NA NA NA NA PTBP2 105864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 97596064 97596178 97596116 Y PTBP2 NA NA NA NA NA PTBP2 410843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 97656052 97656450 97656352 Y NA NA NA NA NA NA SEC63P1 352807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 98499783 98500490 98500262 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 115178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1070A16.1 67841 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 100505302 100505632 100505358 Y NA HIAT1 NA NA NA NA HIAT1 3649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 101202267 101202571 101202418 Y NA VCAM1 NA NA NA NA VCAM1 18969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 109104473 109104583 109104556 Y PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 3762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 109127044 109127234 109127073 Y STXBP3,PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 26333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 109159407 109159722 109159520 Y NA NA NA NA NA NA FAM102B 58696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 109790443 109790471 109790466 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 NA NA NA NA CELSR2 170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 110141142 110141149 110141146 Y NA AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 15577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA EPS8L3 CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPS8L3 30200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr1 110406868 110407271 110407021 Y GNAI3,CSF1 CSF1 CSF1,GSTM2,GSTM4,GNAI3,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 43593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 110420039 110420145 110420092 Y UBL4B CSF1 CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CSF1 30719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 110502633 110502891 110502762 Y NA AHCYL1 CYB561D1,GNAI3,MIR197,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM3,EPS8L3,CSF1,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 AHCYL1 22417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 110927812 110928210 110927883 Y CD53,FAM40A,RBM15 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA LAMTOR5-AS1 4371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 113045318 113045599 113045574 Y NA WNT2B NA NA NA NA WNT2B 38155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA WNT2B 65207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 114245723 114246101 114246018 Y NA NA NA NA NA NA PHTF1 54010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 114575620 114575801 114575630 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1073O3.7 105506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 115968975 115969167 115969071 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 NGF 90118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 116321345 116321551 116321511 Y NA NA CASQ2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 138771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L3 63630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 116923407 116923493 116923480 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 10117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 117032033 117032296 117032175 Y ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 ATP1A1,SLC22A15,MAB21L3,ATP1A1OS,CD58 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 NAP1L4P1 42418 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 117047053 117047428 117047164 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1 NA NA NA NA NAP1L4P1 27286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 117082797 117083071 117083005 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA NAP1L4P1 8083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 117100772 117101124 117100940 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 NAP1L4P1,CD58 NA NA NA NA CD58 10537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 117363043 117363386 117363270 Y NA FTH1P22 NA NA NA NA FTH1P22 46798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 117367696 117367920 117367797 Y NA NA NA NA NA NA FTH1P22 51451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 117368438 117368774 117368618 Y NA NA PTGFRN K562 ChIA-PET 22265404 FTH1P22 52193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr1 118194205 118194506 118194368 Y MAN1A2 FAM46C FAM46C K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46C 47649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 119450998 119451282 119451141 Y NA NA NA NA NA NA TBX15 78897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 119503304 119503581 119503430 Y NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 26598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 23677 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120180868 120181132 120181082 Y NBPF7,ZNF697 GAPDHP33,ZNF697,PHGDH NA NA NA NA ZNF697 7264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120255895 120256325 120256050 Y ADAM30 NA NA NA NA NA HMGCS2 53203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120525502 120525838 120525670 Y NOTCH2,ZNF697,NBPF7 NA NA NA NA NA NOTCH2 84402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120530787 120531205 120531127 Y NOTCH2,ZNF697 NA NA NA NA NA NOTCH2 79035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120608824 120609208 120608880 Y NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 1032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 120692453 120692808 120692620 Y NBPF7,NOTCH2 NA NA NA NA NA NOTCH2 82213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 144927217 144927550 144927432 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 NA NA NA NA NA NBPF9 117473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 144986415 144987071 144986860 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 87115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 85772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 73337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 145005016 145005394 145005195 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 68792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 145032376 145032564 145032466 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 41622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 147012349 147012550 147012481 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 1167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 149821015 149821647 149821349 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H3A 534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4 NA NA NA NA SF3B4 12664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 149957680 149957694 149957685 Y NA OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 22931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr1 150154529 150154860 150154771 Y SV2A,MCL1 PLEKHO1 HIST2H2AB,HIST2H2BE,HIST2H2AC MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 35156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 150592182 150592667 150592572 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 7421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 150949569 150950014 150949933 Y ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE NA NA NA NA ANXA9 2479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 151284018 151284391 151284246 Y FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5 NA NA NA NA PI4KB 13800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 151909443 151909536 151909490 Y S100A10 THEM4 THEM4,S100A10,CELF3,RORC IMR90 Hi-C 24141950 THEM4 29159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 151943125 151943453 151943289 Y NA S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 21413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10,NBPF18P NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153505144 153505346 153505245 Y NA BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4 NA NA NA NA BX470102.3 1065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153841080 153841191 153841137 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 52260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153929776 153930098 153929954 Y NA GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CRTC2 675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 154391539 154392211 154392184 Y GATAD2B,CRTC2,UBAP2L,ADAR,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 15870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 154392646 154393050 154392862 Y CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R IL6R NA NA NA NA IL6R 16977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 154584095 154584221 154584156 Y NA CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 14254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr1 154978035 154978657 154978307 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 4908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 154979104 154979305 154979208 Y ADAR,ADAR,MTX1,PBXIP1,SHC1,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 5977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 155757099 155757186 155757142 Y NA NA NA NA NA NA GON4L 70005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 155951073 155951535 155951364 Y NA KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 23326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 156089405 156089622 156089466 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 39041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 156541089 156541488 156541192 Y NA IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4 MEF2D,C1orf61 IMR90 Hi-C 24141950 IQGAP3 693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 156634807 156635020 156634939 Y NES RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 5591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 156895977 156896091 156896003 Y LRRC71 NA NA NA NA NA ARHGEF11 117071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 157076072 157076782 157076408 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 KRT8P45,ETV3 NA NA NA NA ETV3 29484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA ELL2P1 LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2P1 25856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 159878004 159878104 159878054 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 10051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 159887185 159887340 159887284 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 6182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 159892447 159892988 159892803 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 159961374 159961617 159961522 Y SLAMF8,SLAMF9 IGSF9,PIGM NA NA NA NA PIGM 38166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 160182240 160182579 160182410 Y NA PEA15,RP11-574F21.2 NA NA NA NA PEA15 9113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 160332348 160332525 160332392 Y SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2 SUMO1P3,NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA COPA 21158 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 160510042 160510238 160510216 Y DCAF8,SLAMF1,CD48,SLAMF6 NA NA NA NA NA VANGL2 141666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A NA NA NA NA NA DUSP12 216649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 162129294 162129634 162129458 Y NA NA NA NA NA NA NOS1AP 91730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 164389251 164389388 164389267 Y NA NA NA NA NA NA HMGB3P6 65247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 164580985 164581415 164581219 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 58164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 164736884 164737252 164737025 Y PBX1 NA NA NA NA NA PBX1 214063 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 165204752 165205122 165204813 Y RXRG NA NA NA NA NA MGST3 392976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 166139268 166139609 166139458 Y NA FAM78B NA NA NA NA FAM78B 5062 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 167602083 167602470 167602201 Y POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1 NA NA NA NA NA CREG1 81079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 161349 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 168446219 168446589 168446402 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 197941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 168483874 168484202 168483927 Y NA NA C1orf114,BLZF1 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 235596 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 168526950 168527356 168527080 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 278672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 168531443 168531650 168531547 Y NA NA LOC100505918,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 283165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 168787153 168787165 168787159 Y NA NA NA NA NA NA ATP1B1 285770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 169464285 169464545 169464529 Y BLZF1,SLC19A2 SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA AL021068.1 10905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 169532682 169533387 169533357 Y NA F5 NA NA NA NA F5 20439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 172327070 172327187 172327139 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 84043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 174132741 174133010 174132876 Y NA RABGAP1L NA NA NA NA RABGAP1L 6193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 174788416 174788807 174788447 Y NA NA NA NA NA NA CACYBP 177493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 174937322 174937525 174937409 Y KIAA0040,KIAA0040 CACYBP NA NA NA NA CACYBP 28775 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 178231351 178231525 178231428 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 170487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 178305054 178305336 178305195 Y RASAL2 NA NA NA NA NA C1orf220 204551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 178995927 178996290 178996175 Y AXDND1,RALGPS2,TOR3A FAM20B NA NA NA NA FAM20B 2988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 179187224 179187335 179187262 Y AXDND1,ABL2,SOAT1 ABL2 NA NA NA NA ABL2 9484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 179290775 179290979 179290800 Y NA SOAT1 NA NA NA NA SOAT1 29850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 180895607 180895967 180895721 Y NA NA NA NA NA NA STX6 94080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181042855 181043067 181042961 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 12571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181046810 181047186 181046999 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 8452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181060502 181060611 181060567 Y STX6,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 4864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181081690 181081905 181081806 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 26052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181096103 181096331 181096188 Y NA IER5 KIAA1614,IER5,STX6 IMR90 Hi-C 24141950 IER5 40465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 181104265 181104352 181104277 Y NA IER5 STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER5 48627 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 183009080 183009399 183009240 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 18485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183178797 183178927 183178861 Y NA NA NA NA NA NA LAMC1 188202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183237084 183237447 183237420 Y NA NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 SMG7 201904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183594812 183595033 183594923 Y NA ARPC5,RGL1 NA NA NA NA ARPC5 7859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183854555 183854702 183854673 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 164109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183855028 183855346 183855094 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 163465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 183877295 183877615 183877384 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA TSEN15 141196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 184828541 184828899 184828707 Y IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA EDEM3 106494 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 184924828 184925180 184925091 Y IVNS1ABP,FAM129A FAM129A NA NA NA NA FAM129A 16502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 185408687 185409225 185409010 Y NA NA IVNS1ABP,LOC100288079 IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 124226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 186525885 186526258 186526039 Y OCLM NA PLA2G4A IMR90 Hi-C 24141950 C1orf27 182995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 186728961 186729222 186729092 Y NA NA PLA2G4A,PTGS2 IMR90 Hi-C 24141950 PLA2G4A 66863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA RGS13 386699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 192458942 192459176 192459156 Y RGS2,RGS13,RGS1 NA RGS1,RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 144099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 192485848 192486563 192486155 Y RGS2,RGS1 NA RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 116712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 192490879 192491144 192491120 Y RGS1 NA RGS1,UCHL5 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 112131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192508796 192509150 192509060 Y NA NA UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS13 94125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192608900 192609547 192609291 Y RGS1,RGS2,RGS13 RGS13 NA NA NA NA RGS13 5625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192914637 192914772 192914747 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA RN7SKP126 71522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP126 72343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192923906 192924334 192924233 Y NA NA RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 80791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 192953303 192953614 192953465 Y RGS2,CDC73,TROVE2,TROVE2 NA NA NA NA NA TROVE2 72938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 196317530 196317735 196317633 Y NA NA NA NA NA NA KCNT2 258620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 197513718 197513772 197513745 Y CRB1,DENND1B NA NA NA NA NA DENND1B 229054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 197739507 197739631 197739601 Y NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 3195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 197964894 197965254 197965077 Y NA NA NA NA NA NA LHX9 85857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 198087299 198087585 198087454 Y NEK7 NEK7 PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 36508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 198090244 198090551 198090353 Y NA NEK7 PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9 IMR90 Hi-C 24141950 NEK7 33542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 198124316 198124670 198124458 Y C1orf53,NEK7 NEK7 NA NA NA NA NEK7 223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 198850238 198850638 198850585 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 503631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 449335 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 199436119 199436458 199436291 Y NA NA PTPRC,LOC100131234 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-104D3.2 81850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200076437 200076447 200076441 Y NR5A2 NA NA NA NA NA NR5A2 81707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200379777 200379959 200379899 Y NA ZNF281 NA NA NA NA ZNF281 2593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200481491 200481643 200481567 Y NA NA NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 104307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200839315 200839533 200839446 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 18643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200862818 200862950 200862864 Y NA C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 4642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 200865264 200865418 200865332 Y C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 C1orf106 NA NA NA NA C1orf106 7281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201139670 201140154 201139905 Y NA TMEM9,IGFN1 KIF21B,IGFN1,LAD1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9 968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201236006 201236165 201236054 Y LAD1,C1orf106,PKP1 NA NA NA NA NA IGFN1 78053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201426190 201426373 201426369 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7 NA NA NA NA PHLDA3 9992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201431088 201431253 201431176 Y NA PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA PHLDA3 5112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201449602 201449822 201449716 Y LAD1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 PHLDA3 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDA3 13237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201463619 201463933 201463776 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 10436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr1 201682596 201682901 201682784 Y ARL8A NA NA NA NA NA NAV1 92185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA NAV1 93346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201864045 201864232 201864194 Y NA SHISA4 NA NA NA NA SHISA4 8237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 201987611 201988279 201987793 Y ELF3,LGR6 RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 10130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr1 201992149 201992501 201992334 Y NA RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 14668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3,RP11-465N4.4 NA NA NA NA RP11-465N4.4 26403 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 202027341 202027750 202027511 Y NA RP11-465N4.4 RNPEP,ELF3,NAV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-465N4.4 49860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr1 203259429 203259985 203259729 Y RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2 BTG2 NA NA NA NA BTG2 12634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 203296328 203297068 203296686 Y LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2 BTG2,FMOD NA NA NA NA FMOD 21549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 203506114 203506504 203506389 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B4 87185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 204071387 204071653 204071532 Y LAX1,PPP1R15B,SOX13 SOX13,ETNK2 NA NA NA NA SOX13 31144 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 57427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 204254999 204255106 204255048 Y PIK3C2B,PLEKHA6 NA NA NA NA NA GOLT1A 73779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 204255998 204256379 204256352 Y NA NA NA NA NA NA GOLT1A 74778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 204358316 204358342 204358328 Y NA PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 20577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr1 204422279 204422591 204422449 Y NA PPP1R15B,PIK3C2B NA NA NA NA PIK3C2B 39261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 204531285 204531644 204531490 Y MDM4 MDM4 NA NA NA NA MDM4 47774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 204976101 204976640 204976291 Y LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC NA NA NA NA NA RBBP5 112503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 205267691 205267999 205267801 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 20884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 205270500 205270865 205270692 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 18018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA NA CDK18 61145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 205475126 205475451 205475289 Y NA CDK18 NA NA NA NA CDK18 3403 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 205510005 205510378 205510192 Y CNTN2,TMEM81,CDK18 CDK18 NA NA NA NA CDK18 38282 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18 NA NA NA NA CDK18 40747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206736469 206736632 206736474 Y NA RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA RP11-534L20.4 36221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206748515 206748888 206748591 Y RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5 RP11-534L20.4,EIF2D NA NA NA NA EIF2D 35016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206892674 206892943 206892811 Y NA MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 36385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206910483 206910789 206910591 Y RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 54194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206916099 206916418 206916260 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAPK2 59810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 206918122 206918360 206918230 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 61833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 207025140 207025456 207025298 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,MAPKAPK2,CD55,IL19 NA IL20 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-564A8.4 53508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA RP11-564A8.4 NA NA NA NA RP11-564A8.4 14535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 207203424 207203586 207203506 Y C1orf116 C1orf116,PFKFB2,YOD1 NA NA NA NA C1orf116 515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 208267767 208267971 208267827 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 147694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 208388887 208389573 208389450 Y NA PLXNA2 NA NA NA NA PLXNA2 26092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 211590216 211590571 211590445 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 36071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 211988342 211989080 211989063 Y PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1 LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 13034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 211998326 211998558 211998442 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 3556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212261904 212262125 212262011 Y PPP2R5A RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 38533 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212311960 212312104 212312056 Y PPP2R5A NA PPP2R5A,NENF,DTL,TMEM206 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL21P28 88589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 212669050 212669444 212669231 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,NSL1,BATF3,TATDN3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 64821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214157858 214157941 214157900 Y PROX1 PROX1 PROX1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 PROX1 3334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214162828 214163073 214162948 Y PROX1 PROX1 NA NA NA NA PROX1 8304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214163432 214163790 214163677 Y NA PROX1 NA NA NA NA PROX1 8908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214512112 214512120 214512117 Y NA NA NA NA NA NA SMYD2 59667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214612784 214613126 214613017 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 110666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 1028139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 218758903 218759111 218758977 Y NA NA TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 241326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 219224399 219224689 219224618 Y NA NA TGFB2,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 120497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 219455848 219455941 219455895 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 110662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 219498496 219498646 219498574 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 153310 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 220093194 220093327 220093261 Y NA SLC30A10 NA NA NA NA SLC30A10 36662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 220868801 220868862 220868831 Y C1orf115,MOSC2,MOSC1 C1orf115 NA NA NA NA C1orf115 7614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221135331 221135824 221135593 Y HLX NA NA NA NA NA HLX 85632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221536365 221536752 221536519 Y HLX NA NA NA NA NA DUSP10 376766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221862665 221862854 221862747 Y DUSP10,DUSP10 NA NA NA NA NA DUSP10 50664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221881394 221881826 221881629 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 31692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 221913881 221914483 221914426 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-378J18.3 121963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 222830626 222830783 222830705 Y TAF1A,MIA3 MIA3 NA NA NA NA MIA3 41198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 223907308 223907681 223907376 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 20013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 223925260 223925580 223925340 Y NA CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 37965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 224019430 224020596 224019827 Y FBXO28,TP53BP2 TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 11078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr1 224691192 224691563 224691423 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 68457 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR NA NA NA NA LBR 40279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 225721902 225722011 225721957 Y NA NA NA NA NA NA LBR 107275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 225778250 225778416 225778333 Y ENAH NA NA NA NA NA ENAH 60428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 225881856 225882162 225882024 Y ACBD3 ENAH ENAH,EPHX1,C1orf55,SRP9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENAH 43012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 226005413 226005573 226005512 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 9619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226063760 226064118 226063778 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 NA NA NA NA TMEM63A 3951 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226084943 226085104 226084975 Y LBR,H3F3A,C1orf55,TMEM63A TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LEFTY1 11978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr1 226370122 226370365 226370224 Y C1orf55,H3F3A,ACBD3 ACBD3 NA NA NA NA ACBD3 2066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 227405146 227405174 227405158 Y NA NA NA NA NA NA CDC42BPA 99001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 227751865 227752213 227752044 Y ZNF678 ZNF678 NA NA NA NA ZNF678 2621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 228273480 228273740 228273633 Y ARF1,ARF1 ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 228274281 228274680 228274319 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 5920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 229825145 229825279 229825212 Y NA NA TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 65164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 230220475 230220731 230220560 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 230240540 230240902 230240735 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 49004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 230248068 230248475 230248108 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 56532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA AGT NA NA NA NA AGT 41278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 231025619 231025725 231025648 Y NA C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 22284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 231513422 231513769 231513758 Y NA EXOC8,EGLN1 NA NA NA NA EXOC8 41824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 294048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 232725638 232725888 232725699 Y SIPA1L2 NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 240045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 232735038 232735290 232735230 Y NA NA TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 230643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 31.3081725943958 chr1 232840612 232840778 232840695 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 125155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 233809261 233809638 233809364 Y KCNK1 NA NA NA NA NA KCNK1 61511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234250535 234250574 234250556 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 240313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234254353 234254647 234254499 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 236240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234548581 234548830 234548706 Y NA RP5-827C21.4 NA NA NA NA RP5-827C21.4 41242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234680207 234680593 234680360 Y NA NA LOC100506795,IRF2BP2 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 62678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 234736336 234736615 234736485 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 6656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 234737347 234737653 234737498 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 5618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr1 234749342 234749645 234749570 Y IRF2BP2 IRF2BP2 LINC00184,LOC100506810,ARID4B IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BP2 6071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA LINC01132 LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01132 45575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 234908151 234908764 234908277 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 50362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr1 235094853 235095190 235094881 Y RBM34,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 195061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 235096560 235096855 235096619 Y ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 193396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 192181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 183098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 235108971 235109355 235109264 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 180896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 235114050 235115068 235114636 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 175183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 235122652 235122939 235122843 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 167312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 156829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr1 235267591 235267744 235267678 Y NA TOMM20 NA NA NA NA TOMM20 22507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 235835688 235836968 235835896 Y NA GNG4 NA NA NA NA GNG4 23634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236080566 236081247 236080933 Y LYST,GPR137B LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 35626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236082498 236082788 236082539 Y LYST,GPR137B,EDARADD LYST LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 37558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236179538 236179652 236179595 Y NA NID1 NA NA NA NA NID1 46810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236230188 236230739 236230327 Y LYST,LGALS8,GPR137B NID1 NID1 IMR90 Hi-C 24141950 NID1 3726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236323296 236323699 236323519 Y LYST,GPR137B,LGALS8 GPR137B NA NA NA NA GPR137B 19464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 241771916 241772216 241772151 Y KMO CHML NA NA NA NA CHML 25016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 241781298 241781471 241781421 Y NA CHML NA NA NA NA CHML 15761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 243487001 243487352 243487082 Y CEP170,SDCCAG8 NA NA NA NA NA SDCCAG8 69681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 243644284 243644683 243644595 Y NA NA NA NA NA NA SDCCAG8 226964 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr1 244466323 244466598 244466461 Y NA NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADSS 146838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 244763140 244763529 244763408 Y ADSS,EFCAB2 NA NA NA NA NA ADSS 149704 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 245217556 245217830 245217613 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB2 86549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 245939665 245940062 245939864 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 728552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 246743297 246743408 246743371 Y CNST TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 15551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 247295865 247296225 247296038 Y ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669 NA NA NA NA ZNF669 30191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 247315116 247315371 247315289 Y OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669 ZNF669,MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 47991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 361512 361916 361783 Y NA NA NA NA NA NA ZMYND11 183107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 438578 438619 438599 Y DIP2C NA NA NA NA NA ZMYND11 260173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 903940 904213 904109 Y NA NA NA NA NA NA LARP4B 71351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 1112826 1113160 1112997 Y WDR37 IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 19348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3088088 3088382 3088199 Y NA PFKP PFKP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKP 18143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 3145163 3145536 3145437 Y PFKP PFKP NA NA NA NA PFKP 38638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 3528683 3528786 3528735 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 KLF6 296687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3797195 3797502 3797389 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 27971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3811743 3812009 3811888 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 13464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3845250 3845852 3845788 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 3846443 3847038 3846804 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 20970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3848037 3849536 3848891 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 22564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 3850308 3850795 3850409 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 24835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3852273 3852886 3852712 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 26800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 4394953 4395258 4395067 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 110849 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 4396174 4396330 4396296 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 112070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 12563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr10 4812953 4813314 4813133 Y NA NA KLF6,PITRM1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00704 94607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 4891874 4892173 4892030 Y NA AKR1C1 NA NA NA NA AKR1C1 40623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 4983862 4984222 4983900 Y NA NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 51066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 4989909 4990226 4990068 Y AKR1C3,AKR1C1 NA tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 57113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 5045021 5045414 5045392 Y AKR1C2 AKR1C2,AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C2 12809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr10 5113786 5114179 5114065 Y AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3 AKR1C3 NA NA NA NA AKR1C3 38240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr10 5190490 5190854 5190731 Y NA AKR1C4 NA NA NA NA AKR1C4 44571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5314439 5314551 5314462 Y NA NA NA NA NA NA AKR1CL1 71990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5316994 5317070 5317001 Y NA NA tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1CL1 74545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1CL1 91195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5334474 5334640 5334544 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1CL1 92025 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5336164 5336286 5336241 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 AKR1CL1 93715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5504427 5504665 5504478 Y NA NA NA NA NA NA NET1 51913 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5590507 5590769 5590638 Y NA NA NA NA NA NA RP11-336A10.5 59987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 5986377 5986825 5986602 Y NA IL15RA NA NA NA NA IL15RA 31325 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 6013642 6013801 6013714 Y PFKFB3,PFKFB3,IL15RA IL15RA NA NA NA NA IL15RA 4349 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 6183553 6183785 6183703 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 1096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 6321537 6321781 6321618 Y NA NA NA NA NA NA PFKFB3 136656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 6343712 6343937 6343834 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 158831 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 7235109 7235366 7235309 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 471595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 7277177 7277507 7277289 Y ITIH2 NA NA NA NA NA ITIH5 429454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 7362038 7362350 7362337 Y SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA ITIH5 344611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 7452405 7452746 7452437 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 254215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 7583205 7583490 7583242 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 123471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 7583796 7584039 7583868 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 122922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 7667725 7668107 7668024 Y NA ITIH5 NA NA NA NA ITIH5 38854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 7709539 7709689 7709614 Y ITIH5 ITIH5,ITIH2 NA NA NA NA ITIH5 2578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 11211427 11212417 11211529 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 439336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA USP6NL 184200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 11969895 11970071 11969983 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 113098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 12307693 12308050 12307912 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 71550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 13390886 13391219 13391148 Y NA PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 2589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 13785282 13785678 13785616 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 158355 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 13807715 13808056 13807951 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 180788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 13831161 13831325 13831243 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 204234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14031797 14031930 14031864 Y FRMD4A NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 82353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14051386 14052060 14051814 Y PRPF18 NA NA NA NA NA RP11-397C18.2 62223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 54683 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14628830 14629278 14629071 Y HSPA14 NA NA NA NA NA FRMD4A 126689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 15481671 15481810 15481693 Y NA NA ITGA8,FAM188A IMR90 Hi-C 24141950 FAM171A1 70610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 16802586 16802595 16802591 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 54932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 17707752 17708081 17707913 Y VIM,ST8SIA6,STAM STAM NA NA NA NA STAM 23628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 17755362 17755412 17755398 Y SLC39A12 NA NA NA NA NA STAM 71238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 20126415 20126499 20126449 Y NA PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 23247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 20203114 20203263 20203197 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 99946 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 20219970 20220256 20220113 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 116802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 20517791 20518055 20517886 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 414623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 20841595 20841995 20841796 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 619121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21241912 21242237 21242078 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 218879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21243289 21243672 21243624 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 217444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21317807 21317920 21317859 Y C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 143196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21333319 21333508 21333415 Y NEBL,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 127608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-275N1.1 77370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 21816987 21817223 21817104 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 3871 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr10 22726811 22727194 22727116 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 118671 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 22870490 22870524 22870509 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 130960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 22894974 22895386 22895290 Y PIP4K2A NA NA NA NA NA PIP4K2A 106098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 22961361 22961802 22961720 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 39682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 27419520 27419901 27419745 Y NA ANKRD26,MASTL,YME1L1 NA NA NA NA MASTL 21852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 29420684 29421072 29420878 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 PTCHD3P1 275259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29556183 29556410 29556298 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 139921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 228375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29944854 29945090 29945003 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 248523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 252000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29966336 29966345 29966343 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD3P1 270005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 29970673 29971027 29970896 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 274342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 29978009 29978233 29978173 Y SVIL NA NA NA NA NA PTCHD3P1 281678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL NA SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 328815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 30092989 30093361 30093263 Y SVIL NA SVIL,KIAA1462,MIR604 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 309062 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 30096449 30096548 30096521 Y NA NA SVIL,KIAA1462 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 305875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 30782963 30783595 30783168 Y MAP3K8 NA MAP3K8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 62097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 30841226 30841478 30841347 Y NA NA MAP3K8,LOC729668 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 120360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 31036627 31036865 31036760 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1,KIF5B,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 282001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 31289701 31290078 31290005 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 28788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 31805465 31805855 31805582 Y NA NA NA NA NA NA ZEB1-AS1 198089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 32606832 32606984 32606880 Y CCDC7,C10orf68,EPC1 NA NA NA NA NA EPC1 58742 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA RP11-462L8.1,ITGB1 NA NA NA NA RP11-462L8.1 5078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr10 33272272 33272613 33272373 Y ITGB1,ITGB1,ITGB1 RP11-462L8.1,ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 20107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 33422989 33423776 33423207 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 130269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33503049 33503394 33503286 Y ITGB1 NA NA NA NA NA NRP1 119796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 33541909 33542109 33542065 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 81081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33560971 33561296 33561097 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 61894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33562254 33562552 33562425 Y ITGB1,ITGB1,NRP1 NA NA NA NA NA NRP1 60638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr10 33621123 33621423 33621243 Y NRP1 NRP1 NA NA NA NA NRP1 1767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33670298 33670810 33670413 Y NA NRP1 PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 47108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 33773823 33773922 33773871 Y NA NA NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 150633 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 34439638 34439951 34439795 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 511078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 35080769 35081009 35080876 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 21244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 35848460 35848836 35848737 Y NA NA NA NA NA NA MIR4683 79344 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 38418230 38418599 38418292 Y NA ZNF37A NA NA NA NA ZNF37A 36966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 43248764 43248842 43248800 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 27407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 43249715 43249807 43249770 Y NA BMS1 NA NA NA NA BMS1 26442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 45434472 45434743 45434608 Y OR13A1,ALOX5 TMEM72,RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 18112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 45461973 45462312 45462295 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA RASSF4 9118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 45464299 45464380 45464314 Y ZNF22,C10orf25 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 7878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 45491838 45491921 45491882 Y C10orf10 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA ZNF22 2002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 45927566 45927962 45927775 Y FAM21C,ANUBL1,ALOX5 NA NA NA NA NA ALOX5 59905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA FAM21C 917101 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF488 29272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 50604736 50605039 50604888 Y DRGX NA NA NA NA NA PGBD3 140047 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 52154516 52154956 52154688 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 131778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 131012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 59388391 59388635 59388513 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 637059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 59452175 59452288 59452232 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 573406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 59696319 59696691 59696505 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 329003 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 60421235 60421505 60421242 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 150335 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 60674120 60674133 60674127 Y BICC1 NA NA NA NA NA PHYHIPL 260217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 60796573 60796761 60796671 Y NA NA NA NA NA NA PHYHIPL 137589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 62174641 62174784 62174750 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 361305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 62185134 62185430 62185353 Y NA NA NA NA NA NA CDK1 350659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 63823957 63824187 63824054 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 164898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 63842469 63842743 63842551 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 183410 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 63859069 63859192 63859131 Y ARID5B NA NA NA NA NA RTKN2 167274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65016713 65017097 65017085 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 125663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65026237 65026642 65026597 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 135187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65196810 65197156 65196994 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA PRELID1P3 11753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65274637 65275000 65274913 Y NA REEP3 JMJD1C,REEP3 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 4123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 65467084 65467405 65467282 Y JMJD1C NA JMJD1C,NRBF2,REEP3,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 REEP3 187961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 67154801 67155033 67154934 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 571472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 69550767 69550960 69550901 Y NA DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 44964 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 69579652 69579872 69579788 Y DNAJC12 DNAJC12 NA NA NA NA DNAJC12 16052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 69913307 69913725 69913572 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 NA NA NA NA NA HERC4 80202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 70736024 70736384 70736191 Y SRGN DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,HKDC1 NA NA NA NA HKDC1 627 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 71222784 71222894 71222858 Y HK1 TSPAN15 NA NA NA NA TSPAN15 13555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 71283312 71283690 71283502 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN15 74083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA H2AFY2 183712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B NA NA NA NA UNC5B 3461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73519261 73519537 73519421 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 11718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73528339 73528873 73528813 Y CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 2382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73529064 73529499 73529394 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 1756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 73627974 73628371 73628194 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 18848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 74020239 74021717 74020385 Y C10orf54,PSAP,DNAJB12,DDIT4 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 DNAJB12 K562 ChIA-PET 22265404 DDIT4 9961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 74085147 74085316 74085305 Y NA DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 27672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 74850921 74850988 74850953 Y ANXA7,ECD P4HA1 NA NA NA NA P4HA1 3744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75004761 75005017 75004932 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 1603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75253773 75253975 75253905 Y NA RP11-137L10.6 NA NA NA NA PPP3CB 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75716399 75716797 75716501 Y FUT11,NDST2 PLAU,VCL CAMK2G,PLAU,C10orf55,VCL,AP3M1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VCL 39075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 75725888 75726135 75726026 Y NA VCL CAMK2G,AP3M1,VCL,NDST2,C10orf55,PLAU,ADK IMR90 Hi-C 24141950 VCL 29737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 75805462 75805520 75805491 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 49590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 77533067 77533251 77533127 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 174069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 77533288 77533636 77533475 Y NA NA NA NA NA NA C10orf11 174290 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 79006844 79007202 79006984 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 677176 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 79465060 79465341 79465251 Y NA NA KCNMA1 IMR90 Hi-C 24141950 DLG5 219037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 79538272 79538371 79538344 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 146007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr10 80091311 80091643 80091437 Y NA NA LOC100132987,LOC283050,ZMIZ1,RPS24 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 299793 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 80734291 80734943 80734463 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 91849 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 80897644 80897901 80897807 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 70852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 81080868 81081434 81081104 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 23791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 81086644 81087006 81086940 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 18219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 81088418 81088982 81088641 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 16243 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 81138677 81139093 81139046 Y NA PPIF NA NA NA NA PPIF 33452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 81962798 81963579 81963388 Y SH2D4B,ANXA11 EIF5AP4 NA NA NA NA ANXA11 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 82257950 82258092 82258025 Y NA TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 35606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 83712370 83712377 83712374 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 79300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 83724255 83724618 83724338 Y NRG3,NRG3 NA NA NA NA NA NRG3 91185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 83813687 83814033 83813708 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 180617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 84417350 84417459 84417363 Y NA NA NA NA NA NA NRG3 784280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88004394 88004782 88004588 Y NA NA NA NA NA NA GRID1 119468 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88160347 88160841 88160714 Y OPN4,GRID1 GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 36097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88171108 88171487 88171271 Y NA GRID1 NA NA NA NA GRID1 46858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 88622539 88622751 88622747 Y NA NA NA NA NA NA SNCG 93624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 89602886 89603081 89603056 Y NA CFL1P1,ATAD1,PTEN NA NA NA NA ATAD1 3786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 89856855 89857187 89857031 Y KLLN,PTEN NA RNLS,PTEN,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 153596 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 89922654 89923094 89922746 Y NA NA PTEN,RNLS,KLLN,ATAD1,CFL1P1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 219395 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 RP11-149I23.3,IFIT2 NA NA NA NA RP11-149I23.3 21045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 92676361 92676755 92676735 Y NA RPP30,ANKRD1 NA NA NA NA ANKRD1 2278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 94195534 94195885 94195710 Y NA NA NA NA NA NA IDE 135948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 94353992 94354203 94354151 Y MARCH5 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 2949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 94460544 94460634 94460589 Y CYP26C1 HHEX NA NA NA NA HHEX 14599 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 94520397 94520594 94520523 Y NA NA EXOC6,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOC6 68341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 95193537 95193891 95193765 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 46183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 95195782 95196689 95196040 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 43385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr10 95222493 95222944 95222696 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 17130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 95224149 95224369 95224367 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 15705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr10 95226262 95226423 95226291 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 13651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 95327729 95327872 95327806 Y O3FAR1 RBP4 NA NA NA NA RBP4 31629 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 97640254 97640658 97640438 Y ENTPD1,ENTPD1 NA NA NA NA NA RP11-248J23.5 117342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 98433072 98433822 98433312 Y LCOR,PIK3AP1,TM9SF3 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 44449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr10 98436417 98436554 98436424 Y NA PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 41717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 98468328 98468564 98468493 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 9707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 100019738 100019959 100019849 Y C10orf28 LOXL4 NA NA NA NA LOXL4 6048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 101300631 101300706 101300670 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A28 77660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 101381465 101381554 101381515 Y NA SLC25A28,ENTPD7 NA NA NA NA SLC25A28 3099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 101537826 101537964 101537919 Y ABCC2 COX15,ABCC2 NA NA NA NA ABCC2 2525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 101543856 101543953 101543936 Y COX15,ABCC2 ABCC2 NA NA NA NA ABCC2 3367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 101666342 101666477 101666411 Y NA NA NA NA NA NA DNMBP 101199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 102130336 102130669 102130535 Y NA SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 102130783 102131327 102130955 Y CWF19L1 SCD,AL139819.1,LINC00263 NA NA NA NA LINC00263 45 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 102490299 102490653 102490523 Y PAX2 NA NA NA NA NA FAM178A 179673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 102490692 102490976 102490862 Y NA NA NA NA NA NA FAM178A 179350 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 103051353 103051800 103051498 Y NA NA BTRC,FLJ41350,FBXW4,LBX1,POLL,DPCD,MIR3158-2,MGEA5,NPM3,FGF8,LOC100289509 IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 60020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 103538980 103539052 103538998 Y NA NPM3,MGEA5 NA NA NA NA NPM3 2118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 103878662 103879287 103878814 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 104238092 104238376 104238328 Y NA CUEDC2,TMEM180,ACTR1A,SUFU NA NA NA NA TMEM180 18943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 104387544 104387817 104387672 Y GBF1,CUEDC2,ACTR1A TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 14436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 104909684 104910071 104909878 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 40985 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 104956992 104957240 104957082 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 5936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2 SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 105001224 105001453 105001331 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 105001544 105001968 105001663 Y C10orf32,NT5C2 NA INA,PCGF6,NT5C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 50488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 105650011 105650288 105650237 Y GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK OBFC1 SH3PXD2A IMR90 Hi-C 24141950 OBFC1 25675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 105667994 105668449 105668210 Y GSTO1,GSTO1,SLK OBFC1 NA NA NA NA OBFC1 7514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 106020526 106021193 106020581 Y SLK,MEIR5,MEIR5,ITPRIP,CCDC147,GSTO1,GSTO1 WDR96,GSTO1,MIR4482-1 NA NA NA NA MIR4482-1 4984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 106065321 106065564 106065443 Y NA MIR4482-1,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA MIR4482-1,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 106096287 106096870 106096611 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP ITPRIP,GSTO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITPRIP 125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 112123790 112124003 112123953 Y MXI1 NA SMC3,DUSP5,RBM20 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 61081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 112170161 112170538 112170357 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 85058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr10 112174147 112174523 112174256 Y SMC3,DUSP5 NA DUSP5,SMC3,SMNDC1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 81073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112207134 112207519 112207380 Y NA DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 48077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112220227 112220521 112220467 Y SMC3,DUSP5 DUSP5 DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 35075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr10 112259301 112259712 112259445 Y MXI1,PDCD4,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 3705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr10 112272592 112272848 112272747 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 16996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr10 112290201 112290297 112290249 Y NA DUSP5,SMC3 NA NA NA NA DUSP5 34605 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112295745 112296221 112296000 Y SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5 DUSP5,SMC3 SMNDC1,DUSP5,SMC3 IMR90 Hi-C 24141950 SMC3 29228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 112617518 112617573 112617534 Y ADRA2A,PDCD4 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 11992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112624355 112624707 112624540 Y SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1 PDCD4,PDCD4-AS1 NA NA NA NA PDCD4 4858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 112670931 112671385 112671330 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 5647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 114531236 114531374 114531260 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 176635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 114693939 114693964 114693952 Y NA TCF7L2 TCF7L2,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 14045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 114745782 114746117 114745950 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 37773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 114823270 114823456 114823363 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 115261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 116161021 116161267 116161255 Y NA AFAP1L2 NA NA NA NA AFAP1L2 1248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 116259358 116259612 116259525 Y C10orf118,ABLIM1 NA NA NA NA NA AFAP1L2 96843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 116394389 116394785 116394496 Y ABLIM1 ABLIM1 NA NA NA NA ABLIM1 47977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 116561110 116561522 116561275 Y NA FAM160B1 AFAP1L2,ABLIM1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM160B1 17981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 116582671 116583074 116582920 Y NA FAM160B1 NA NA NA NA FAM160B1 3168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 116678132 116678409 116678271 Y NA TRUB1 NA NA NA NA TRUB1 17543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 117468082 117468283 117468150 Y NA NA NA NA NA NA GFRA1 562696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 118656077 118656284 118656258 Y NA ENO4,RP11-539I5.1 NA NA NA NA RP11-539I5.1 48361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 118714609 118714623 118714617 Y NA NA NA NA NA NA RP11-539I5.1 106893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 119019345 119019394 119019369 Y KCNK18,SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 113584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 119046334 119046783 119046648 Y NA NA NA NA NA NA PDZD8 86195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 120553145 120553353 120553220 Y NA NA NA NA NA NA NANOS1 233875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 120591750 120591972 120591861 Y NA NA C10orf46 IMR90 Hi-C 24141950 NANOS1 195256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 121161203 121161864 121161442 Y EIF3A NA NA NA NA NA RGS10 138356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 121415317 121415432 121415359 Y GRK5,BAG3 RP11-179H18.5,BAG3 NA NA NA NA BAG3 6435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 123283349 123283529 123283438 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 NA NA NA NA NA FGFR2 72443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 123483664 123483774 123483720 Y NA NA NA NA NA NA FGFR2 127692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 123526019 123526096 123526058 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 159731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 123539603 123539774 123539689 Y TACC2,ATE1 NA NA NA NA NA ATE1-AS1 146053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 123822805 123823045 123822957 Y ATE1,DMBT1 NA NA NA NA NA TACC2 76116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr10 123914446 123914761 123914722 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 167757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 125756933 125757735 125757580 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 93471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 125795335 125795932 125795563 Y CHST15 NA NA NA NA NA CHST15 55274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126315526 126315929 126315823 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 114909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126339460 126339914 126339618 Y ZRANB1,FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 90924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126349618 126349650 126349637 Y NA NA NA NA NA NA FAM53B 81188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126403847 126404241 126404043 Y NA FAM53B NA NA NA NA FAM53B 26597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126406559 126407126 126406852 Y ZRANB1,FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 23712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 126413244 126413567 126413371 Y FAM53B FAM53B NA NA NA NA FAM53B 17271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126490996 126491131 126491100 Y NA METTL10,FAM175B NA NA NA NA FAM175B 2642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126749212 126749581 126749525 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98158 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 126749775 126749930 126749890 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 97809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 127813462 127813834 127813648 Y ADAM12 NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 FANK1 230354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 131765501 131765764 131765633 Y NA EBF3 NA NA NA NA EBF3 5396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.95001018366647 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 134124952 134125064 134125008 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4,LRRC27,STK32C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STK32C 18287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 134221496 134221692 134221620 Y PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91 NA NA NA NA RP11-432J24.2 8895 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 134234707 134235257 134234764 Y STK32C,PWWP2B PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91 C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.2 4120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 RP11-432J24.2,C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 4510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA RP11-432J24.5,INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-432J24.5 1137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A RP11-432J24.5,INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr10 135118820 135119258 135118896 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2,PRAP1 NA NA NA NA ZNF511 721 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr10 135191872 135192182 135191943 Y NA PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1 NA NA NA NA PAOX 1177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 268826 269269 268945 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 269337 269903 269511 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 353403 353830 353519 Y CEND1,B4GALNT4 IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 B4GALNT4 13966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7,CDHR5 NA NA NA NA CDHR5 5114 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 749835 750077 749967 Y IFITM2,IRF7,IRF7,TMEM80,DEAF1,TALDO1 DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,SLC25A22 NA NA NA NA TALDO1 4506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,EFCAB4A,CD151,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1073369 1073545 1073512 Y DRD4,EFCAB4A MUC6 NA NA NA NA MUC6 38663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 1144773 1145129 1144879 Y NA MUC5AC MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 MUC5AC 4451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1147842 1148157 1148045 Y NA MUC5AC MUC5B MCF7 ChIA-PET 22265404 MUC5AC 1423 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1331682 1331784 1331733 Y NA TOLLIP NA NA NA NA TOLLIP 2798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1568333 1568421 1568379 Y BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 22729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1569740 1569888 1569766 Y TNNT3,TNNI2,TNNI2,DUSP8 DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 21262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1768025 1768222 1768084 Y IFITM10 RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 NA NA NA NA RP11-295K3.1 10059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1793842 1794035 1793938 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2 RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2 IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 10620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 1794819 1794975 1794880 Y NA RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2,KRTAP5-5,KRTAP5-6,FAM99B IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 11597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 1804182 1804577 1804353 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1 RP11-295K3.1,CTSD,RPL36AP39,SYT8 MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8 IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7 Hi-C,5C,ChIA-PET 24141950,22955621,22265404 RPL36AP39 7206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 1865419 1866172 1865684 Y C11orf21,TNNI2,LSP1 SYT8 NA NA NA NA SYT8 18710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 1991146 1991394 1991373 Y TH,IGF2,IGF2 MRPL23,MRPL23-AS1 NA NA NA NA MRPL23-AS1 17756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 2008416 2008795 2008568 Y NA MRPL23,MRPL23-AS1 NA NA NA NA MRPL23-AS1 355 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 2009660 2010154 2009976 Y IGF2,IGF2,SYT8 MRPL23,MRPL23-AS1 NA NA NA NA MRPL23-AS1 510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 2619837 2620105 2619972 Y TRPM5 NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 99119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 2705021 2705206 2705044 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 14018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 2714612 2714953 2714746 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 4271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr11 2954251 2954383 2954325 Y KCNQ1 SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 5566 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 3090855 3091125 3090991 Y NA RNU1-91P,CARS NA NA NA NA CARS 14012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 6224718 6224948 6224898 Y TPP1,FAM160A2 FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 28993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 6290237 6290402 6290320 Y NA FAM160A2 NA NA NA NA FAM160A2 36296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 HPX,TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 6676048 6676412 6676073 Y OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1 TAF10,TPP1,MRPL17 NA NA NA NA MRPL17 26220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 8834179 8834314 8834219 Y NA NA NA NA NA NA ST5 96184 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 9310546 9310889 9310715 Y ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B DENND5A,TMEM41B NA NA NA NA TMEM41B 23438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 9760793 9761081 9760939 Y NA SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 16758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 10246047 10246060 10246054 Y NA NA NA NA NA NA SBF2 67694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 10388178 10388602 10388329 Y ADM NA SBF2,ADM,LOC283104,AMPD3,MRVI1,MRVI1-AS1,CTR9,SWAP70,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 63951 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 10541440 10541628 10541530 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 MTRNR2L8,RNF141 NA NA NA NA MTRNR2L8 12717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA RP13-631K18.5,MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 12458488 12458795 12458642 Y NA NA NA NA NA NA PARVA 61756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 13161981 13162352 13162107 Y NA NA LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 133847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 14559062 14559108 14559085 Y PSMA1 COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 19172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 14561753 14561926 14561853 Y NA COPB1,PSMA1 NA NA NA NA PSMA1 21863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 14600110 14600431 14600207 Y CYP2R1,PSMA1,PDE3B NA NA NA NA NA PSMA1 60220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr11 14910529 14910668 14910599 Y NA CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 1130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 14916687 14916856 14916788 Y CYP2R1 CYP2R1,CALCB NA NA NA NA CYP2R1 4889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 15837558 15838109 15837858 Y NA NA C11orf58 IMR90 Hi-C 24141950 C11orf58 794570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 16625688 16626709 16626131 Y SOX6,SOX6 C11orf58 SOX6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C11orf58 5970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 16762334 16762684 16762509 Y NA SOX6 NA NA NA NA SOX6 3196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 16819555 16819819 16819584 Y NA NA NA NA NA NA SOX6 60417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 16886034 16886231 16886142 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 108329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 KCNJ11 NA NA NA NA KCNJ11 33178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA,AC084117.3,LDHC NA NA NA NA AC084117.3 1256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 18646989 18647318 18647154 Y NA UEVLD,SPTY2D1 NA NA NA NA SPTY2D1 7020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 20024358 20024601 20024461 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 358630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 20046945 20047208 20047086 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 336023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 20072115 20072502 20072253 Y NA NA NA NA NA NA HTATIP2 310729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 26610693 26610982 26610833 Y ANO3,BBOX1 NA NA NA NA NA RP11-1L12.3 628678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 26969207 26969439 26969286 Y NA NA FIBIN,BBOX1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1L12.3 270221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27023421 27023808 27023612 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1L12.3 215852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27140468 27140646 27140558 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1L12.3 99014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27223366 27223795 27223565 Y NA RP11-1L12.3 LGR4,LIN7C IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1L12.3 15865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27255317 27255369 27255343 Y NA RP11-1L12.3 NA NA NA NA RP11-1L12.3 15657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27419147 27419279 27419213 Y NA CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 35732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27451921 27452137 27452029 Y NA LGR4 NA NA NA NA LGR4 40185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 27481800 27481840 27481820 Y NA LGR4,LIN7C NA NA NA NA LGR4 10482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 28831581 28831914 28831617 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 109419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 29974880 29975070 29974975 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115J23.1 1252718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 32109882 32110285 32110029 Y NA NA NA NA NA NA PAX6 272373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 33096691 33097088 33096864 Y NA TCP11L1 NA NA NA NA TCP11L1 37728 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 33427027 33427076 33427050 Y NA NA C11orf41,C11orf91 IMR90 Hi-C 24141950 HIPK3 150809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 33723473 33723762 33723676 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 32229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 34084271 34084310 34084291 Y NA CAPRIN1,NAT10 NA NA NA NA CAPRIN1 13041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34265315 34265482 34265399 Y ABTB2 NA NA NA NA NA RP1-145M24.1 90068 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34356172 34356320 34356246 Y NA RP1-145M24.1,ABTB2 NA NA NA NA RP1-145M24.1 622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34393112 34393337 34393189 Y ABTB2 RP1-145M24.1,ABTB2 ABTB2,ELF5,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 ABTB2 15557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34622320 34622551 34622432 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF EHF APIP,EHF,SLC1A2,ELF5,CD44 IMR90 Hi-C 24141950 EHF 18089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 EHF NA NA NA NA EHF 34939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 34847243 34847532 34847469 Y ELF5,ELF5,EHF,EHF NA NA NA NA NA PDHX 87844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34919844 34920223 34920054 Y ELF5,EHF PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 15153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 35105542 35105874 35105596 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 52543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 35165614 35166208 35165794 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 7197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 36730903 36730935 36730919 Y PRR5L NA NA NA NA NA C11orf74 116852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 43360196 43360553 43360375 Y TTC17 API5,TTC17 NA NA NA NA TTC17 17929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 44547557 44547712 44547661 Y NA CD82 EXT2,CHST1,ACCS,CD82,TSPAN18 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 36265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 45000515 45000921 45000720 Y SYT13,TSPAN18 TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 29675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 231118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr11 46135373 46135563 46135504 Y PHF21A,AMBRA1 PHF21A NA NA NA NA PHF21A 5422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 46410888 46411787 46411136 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 10582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 46444740 46444848 46444831 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 44434 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 46497144 46497389 46497267 Y NA NA NA NA NA NA MDK 96838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr11 47799022 47799247 47799135 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 12027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 47939528 47939960 47939626 Y OR4B1,OR4S1,NUP160 RP11-793I11.1 PTPRJ,NUP160 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-793I11.1 14369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 48063635 48064268 48063917 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 63522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 48069279 48069643 48069343 Y NA NA NA NA NA NA PTPRJ 69166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 56677602 56677921 56677758 Y NA NA NA NA NA NA RP11-100N3.2 175664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr11 56717332 56717681 56717506 Y NA NA LRRC55 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-100N3.2 215394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 57045764 57045851 57045815 Y NA TNKS1BP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 44575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 57232201 57232685 57232388 Y NA RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 6179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10,SERPING1 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 58399673 58399754 58399714 Y OR9Q2,OR1S2,OR1S1,OR10Q1,OR10W1,OR5B3,OR5B2,OR5B12 NA NA NA NA NA ZFP91-CNTF 55028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 59868075 59868428 59868178 Y MRPL16,MS4A3 NA NA NA NA NA TCN1 236027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 60789194 60789499 60789348 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 99259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 60877687 60877932 60877809 Y CD6,CD5 VPS37C NA NA NA NA VPS37C 49157 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 60906916 60907198 60907057 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 19891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 60929738 60929978 60929839 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 2649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 61064926 61064998 61064962 Y NA DAK,DDB1 NA NA NA NA DAK 33684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA SYT7,RPLP0P2 NA NA NA NA RPLP0P2 13755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 61434550 61434949 61434623 Y NA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 10956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,TMEM258,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.61614151546212 chr11 61565191 61565522 61565357 Y NA FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS2 6739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 61742606 61743000 61742909 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 9474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 61880097 61880151 61880125 Y FADS2,FADS3,RAB3IL1 INCENP FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 INCENP 9294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62143612 62143665 62143638 Y NA ASRGL1,CTD-2531D15.4 NA NA NA NA ASRGL1 40692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62305940 62306223 62306072 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3 AHNAK,EEF1G NA NA NA NA AHNAK 15484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62320057 62320478 62320186 Y NA AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 1229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 63775286 63775368 63775342 Y KCNK4 COX8A,AP000721.4,OTUB1,RP11-21A7A.2 NA NA NA NA OTUB1 23961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA RP11-21A7A.2 57125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr11 64102702 64102834 64102750 Y NA ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4 NA NA NA NA PRDX5 19142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65042835 65043130 65042858 Y EHD1,C11orf85,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2 NA NA NA NA POLA2 15602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65059026 65059409 65059335 Y EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65059737 65059988 65059827 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65075657 65076292 65075967 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.42581827780622 chr11 65238917 65239096 65239037 Y CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198 AP000769.1,MALAT1 TIGD3 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr11 65246279 65246484 65246387 Y SCYL1,LTBP3,EFEMP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 16749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65259217 65259522 65259389 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 3711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.56775770374163 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1,LTBP3 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 65537213 65537543 65537499 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2C 50795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 65739201 65739551 65739464 Y NA SART1,BANF1,EIF1AD NA NA NA NA SART1 12041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 65852297 65852657 65852298 Y TMEM151A,CNIH2 SF3B2,PACS1 NA NA NA NA PACS1 16463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 66374477 66374855 66374526 Y NA CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4 RBM14-RBM4 IMR90 Hi-C 24141950 RBM14 7198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 NA NA NA NA NA RCE1 51424 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 66717584 66717809 66717709 Y CLCF1,ADRBK1 PC NA NA NA NA PC 6038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 67121988 67122388 67122127 Y POLD4,CLCF1 POLD4,AP003419.11,RAD9A NA NA NA NA POLD4 55 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 67895703 67896078 67896017 Y CHKA CHKA CHKA,SUV420H1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHKA 8792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 68065646 68065898 68065824 Y CHKA,LRP5 C11orf24,LRP5 SUV420H1,C11orf24,LRP5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP5 12179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr11 68140094 68140551 68140382 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 62017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 68141745 68141881 68141821 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 63668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 68147876 68148306 68148095 Y NA NA NA NA NA NA LRP5 69799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 68387136 68387210 68387173 Y NA NA NA NA NA NA GAL 62037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 68883107 68883355 68883302 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1,FADD,ANO1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TPCN2 68742 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 68981040 68981260 68981150 Y NA NA ORAOV1,MYEOV,CCND1,FGF19 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 78345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69042063 69042459 69042261 Y NA MYEOV MYEOV,CCND1,ORAOV1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 17146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 69067534 69068152 69067999 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 7929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69069179 69069344 69069260 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 69069522 69069665 69069598 Y TPCN2 MYEOV NA NA NA NA MYEOV 9917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 69182957 69183170 69183095 Y ORAOV1,CCND1,MYEOV NA CCND1,MYEOV MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MYEOV 123352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69251942 69252241 69252024 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV 192337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69295400 69295605 69295545 Y NA NA CCND1,TPCN2,MYEOV IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCND1 158250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.04517180249442 chr11 69586936 69586990 69586963 Y FGF4 FGF4,FGF3 NA NA NA NA FGF4 1181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 69632815 69633180 69632998 Y NA FGF4,FGF3 NA NA NA NA FGF3 1023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 69809602 69809958 69809614 Y NA NA ANO1,ORAOV1,FGF19,FGF4 IMR90 Hi-C 24141950 ANO1 112450 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69912681 69912792 69912736 Y NA ANO1 NA NA NA NA ANO1 9616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 69969786 69970187 69969839 Y NA ANO1 NA NA NA NA ANO1 47378 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 70005779 70006157 70005922 Y ANO1,CTTN,PPFIA1,FADD FADD NA NA NA NA FADD 41112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 70400886 70401022 70400954 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 158292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 70413927 70414164 70414002 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 171333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 70483542 70483760 70483651 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 240948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 71658678 71659025 71658708 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NA NA NA NA RNF121 20931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 70390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 72985787 72986008 72985881 Y FCHSD2,RELT,RELT,P2RY6 ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 31326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 73240043 73240049 73240046 Y NA NA NA NA NA NA FAM168A 67185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 74176233 74176573 74176529 Y KCNE3 AP001372.2,LIPT2,POLD3 NA NA NA NA AP001372.2 25838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 74609863 74609988 74609926 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48257 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 74742390 74742651 74742474 Y ARRB1 NEU3 XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEU3 45211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 75946917 75947052 75946991 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 27137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr11 76463883 76464042 76463970 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 ACER3,TSKU,B3GNT6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 13225 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 76480789 76480971 76480905 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 3522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 20.8403945233212 chr11 76483483 76483778 76483631 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-21L23.4 6216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 76510532 76510646 76510589 Y NA RP11-21L23.4,TSKU,RP11-21L23.3 NA NA NA NA RP11-21L23.3 18426 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 3883 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 78000759 78000964 78000861 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA KCTD21 102891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 78051625 78051814 78051807 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 75580 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 78091808 78092073 78091933 Y GAB2,GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 35321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 78798308 78798462 78798392 Y NA NA NA NA NA NA NARS2 514389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 84641385 84641714 84641549 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 695915 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 85419491 85419865 85419792 Y SYTL2 CREBZF,CCDC89 NA NA NA NA CCDC89 24171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 85768953 85769276 85769115 Y NA PICALM NA NA NA NA PICALM 9648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86195168 86195425 86195393 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 183915 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 86214866 86215096 86214981 Y NA NA NA NA NA NA ME3 166582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA ME3 159315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 86355497 86355659 86355578 Y NA ME3 NA NA NA NA ME3 26019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86452946 86453377 86453076 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 46724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr11 86527382 86527750 86527626 Y FZD4,PRSS23 PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 27281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 86664236 86664677 86664307 Y NA NA NA NA NA NA FZD4,RP11-736K20.6 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 87139431 87139805 87139524 Y NA NA GRM5 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM135 392545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 88276753 88276819 88276788 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 207798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 88288248 88288652 88288406 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 219293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 90016507 90016673 90016590 Y NA RP11-121L10.3 NA NA NA NA RP11-121L10.3 2779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 90822237 90822333 90822285 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 808509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 91252482 91252645 91252564 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 1238754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 91958948 91959142 91959077 Y FAT3 NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 969988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 91979590 91979911 91979751 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 949219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 91980380 91980674 91980445 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 948456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 92001294 92001526 92001411 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 927604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 92081309 92081315 92081312 Y NA NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 847815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 92083144 92083535 92083339 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 845595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 92555481 92555703 92555592 Y FAT3 NA NA NA NA NA SLC36A4 373427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 93446176 93446355 93446266 Y NA SCARNA9,SNORD5,C11orf54 NA NA NA NA SCARNA9 6324 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 95745158 95745721 95745455 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 88679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 96024131 96024308 96024240 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 50036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 100590591 100590889 100590693 Y NA ARHGAP42 NA NA NA NA ARHGAP42 34207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 100596808 100596968 100596888 Y NA ARHGAP42 NA NA NA NA ARHGAP42 40424 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 102867069 102867245 102867157 Y NA MMP13 MMP13,DCUN1D5,MMP3 IMR90 Hi-C 24141950 MMP13 42606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 102915030 102915337 102915161 Y NA DCUN1D5 NA NA NA NA DCUN1D5 45607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 102956908 102957200 102957055 Y NA DCUN1D5,DYNC2H1 NA NA NA NA DCUN1D5 3744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 104579946 104579965 104579955 Y NA NA GRIA4 IMR90 Hi-C 24141950 CASP12 187432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 105513261 105513284 105513272 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA AASDHPPT 430944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 106220892 106221244 106221068 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD3 274400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 107187292 107187599 107187573 Y NA NA NA NA NA NA CWF19L2 138973 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 110067293 110067585 110067439 Y NA NA ZC3H12C,RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 97862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 111191582 111191686 111191634 Y NA NA NA NA NA NA C11orf53 66875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 111205448 111205684 111205566 Y NA NA NA NA NA NA C11orf53 80741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 111990651 111990899 111990830 Y NA C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD,IL18 NA NA NA NA SDHD 35024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 ZBTB16 NA NA NA NA ZBTB16 17089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 92348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 114309073 114309125 114309098 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 115017644 115017889 115017764 Y NA NA NA NA NA NA CADM1 355786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 116873672 116874047 116873840 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 30720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 118187372 118187677 118187544 Y DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D CD3G,UBE4A NA NA NA NA CD3G 25382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 118481750 118482023 118481896 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 6595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 119239128 119239276 119239217 Y NA MCAM,RNF26,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 11160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr11 120089762 120089841 120089801 Y NA OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 10287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 120218040 120218378 120218085 Y NA TMEM136,ARHGEF12 NA NA NA NA ARHGEF12 12253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 121330249 121330515 121330350 Y SORL1 SORL1 NA NA NA NA SORL1 9337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 121526794 121527145 121526879 Y NA NA NA NA NA NA SORL1 205882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 125036511 125036895 125036831 Y NA NA NA NA NA NA TMEM218 56852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 125560855 125560979 125560917 Y NA NA NA NA NA NA CHEK1 67819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 125904022 125904031 125904027 Y NA CDON,NAP1L1P1 NA NA NA NA CDON 27199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON,NAP1L1P1 NA NA NA NA NAP1L1P1 2454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 125983623 125983738 125983673 Y CDON NAP1L1P1 HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 48189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr11 125985079 125985242 125985162 Y CDON,ST3GAL4 NAP1L1P1 HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 49645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 50489 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr11 125992920 125993185 125993052 Y NA NA CDON,DDX25 IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L1P1 57486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 126209269 126209556 126209430 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 128078462 128078679 128078487 Y NA NA FLI1,ETS1,KCNJ1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 376774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 129717042 129717234 129717138 Y ST14,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA TMEM45B 33328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 134688539 134688830 134688760 Y NA NA NA NA NA NA ACAD8 567150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 ACAD8 586697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 289742 289883 289807 Y SLC6A12 RP11-598F7.6 NA NA NA NA RP11-598F7.6 177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 RP11-598F7.6 NA NA NA NA RP11-598F7.6 8799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA B4GALNT3 112657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 831737 831923 831794 Y NA WNK1 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNK1 27836 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 1029926 1030313 1030120 Y WNK1 NA NA NA NA NA RAD52 66906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1157508 1157869 1157627 Y ERC1 NA NA NA NA NA ERC1 59833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1583254 1583583 1583419 Y NA NA LOC100292680 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 53474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1643252 1643620 1643470 Y NA WNT5B ERC1,LOC100292680,FBXL14 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5B 6195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 1689303 1689433 1689367 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 11898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1699844 1700200 1699934 Y NA FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 1131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1769649 1770205 1769686 Y NA ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 25535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 1876861 1877254 1877034 Y NA RPS4XP14 NA NA NA NA RPS4XP14 11684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 3340124 3340182 3340154 Y NRIP2 RP11-543P15.1 NA NA NA NA RP11-543P15.1 21028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 3913952 3914004 3913978 Y NA NA NA NA NA NA PARP11 66604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 13546 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA PLEKHG6 14713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 6454526 6454970 6454793 Y CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 5246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 6539566 6540029 6539921 Y NA RP1-102E24.9,CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1 NA NA NA NA RP1-102E24.9 5635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 6684613 6684668 6684641 Y NA GAPDH,IFFO1,NOP2,CHD4 NA NA NA NA NOP2 8756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 6717352 6717716 6717682 Y SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP NOP2,CHD4,ACRBP NA NA NA NA CHD4 2710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 9308932 9309318 9309073 Y KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP A2M NA NA NA NA A2M 42107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 9917181 9917686 9917498 Y KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D,OLR1,KLRF1,GABARAPL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CD69 CD69 NA NA NA NA CD69 5684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 10538589 10538605 10538596 Y KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4 RP11-277P12.20 NA NA NA NA RP11-277P12.20 24221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 10833157 10833219 10833190 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 8240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 11486966 11487331 11487130 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 164794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 11582484 11582789 11582637 Y TAS2R50,TAS2R43,TAS2R42 NA NA NA NA NA ETV6 217999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 11989252 11989963 11989497 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 188464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12016846 12017194 12017120 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA BCL2L14 183584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12162075 12162513 12162342 Y ETV6,LOH12CR1,BCL2L14 BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 38265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12164191 12164556 12164498 Y NA BCL2L14 ETV6,LOC338817,CDKN1B IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L14 36222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12255233 12255559 12255327 Y BCL2L14 RP11-267J23.4 NA NA NA NA RP11-267J23.4 6538 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12504083 12504386 12504252 Y BCL2L14,MANSC1 MANSC1,LOH12CR1 NA NA NA NA MANSC1 2608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12646905 12646967 12646936 Y LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B NA LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 66350 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12663035 12663537 12663259 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP16 49780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 12735834 12736179 12735985 Y NA DUSP16,CREBL2 LOH12CR1,LOH12CR2,DUSP16,GPR19,CDKN1B,CREBL2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP16 22517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 12775556 12775830 12775680 Y LOH12CR1,CDKN1B,APOLD1,DUSP16 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 12795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 13124934 13124993 13124963 Y NA RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1 GPRC5D IMR90 Hi-C 24141950 HTR7P1 25819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 13376138 13376415 13376269 Y HEBP1 EMP1 NA NA NA NA EMP1 28488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 15287124 15287167 15287146 Y NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 174462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 15305858 15306077 15306005 Y NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 193196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 15782024 15782386 15782102 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6K23.1 191563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 15841016 15841330 15841173 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 191933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 18511225 18511610 18511392 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA5 769038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 19284166 19284563 19284310 Y NA PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 3518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 19496981 19496995 19496989 Y NA NA NA NA NA NA AEBP2 57984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 20069508 20069793 20069676 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 22662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 31854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 20365637 20365979 20365748 Y NA NA NA NA NA NA PDE3A 154200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 20746479 20746810 20746645 Y LST-3TM12 NA NA NA NA NA RP11-284H19.1 225283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 25537800 25538060 25537930 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 135930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr12 25768042 25768407 25768182 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP262 162096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 26268989 26269114 26269047 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 3810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 26512613 26512980 26512754 Y NA NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 235063 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 244986 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 27593588 27593602 27593594 Y C12orf71 NA NA NA NA NA PPFIBP1 80762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 27931494 27931809 27931627 Y MANSC4 NA NA NA NA NA MRPS35 69788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 29256492 29256711 29256590 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC2 275411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 29581721 29581917 29581813 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 49599 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 30575373 30575740 30575557 Y NA NA NA NA NA NA IPO8 271180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 2790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 31523933 31524084 31523973 Y DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A,RP11-771K4.1 NA NA NA NA RP11-771K4.1 3698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 31602301 31602617 31602553 Y NA NA NA NA NA NA RP11-771K4.1 82066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B 62855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr12 31899631 31900083 31899901 Y AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C METTL20,AMN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMN1 19523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 32405506 32405740 32405609 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 147737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 39297687 39297825 39297799 Y NA CPNE8 NA NA NA NA CPNE8 1407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 40467954 40468269 40468112 Y NA SLC2A13 NA NA NA NA SLC2A13 29622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 42470575 42470704 42470641 Y NA NA NA NA NA NA GXYLT1 65977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 42598855 42599145 42599001 Y YAF2,YAF2,YAF2 YAF2,PPHLN1 NA NA NA NA YAF2 31006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 45626822 45627300 45627014 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 18998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 45644542 45644793 45644668 Y ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 36718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 45654086 45654401 45654190 Y NA ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 46262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 45820263 45820702 45820515 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA8P1 212439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 46381876 46382270 46382256 Y SLC38A2,SCAF11 SCAF11 NA NA NA NA SCAF11 1633 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46571353 46571525 46571439 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 90275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 46603605 46603977 46603918 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A1 57823 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46949340 46949533 46949437 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 173878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 47596373 47596459 47596419 Y NA NA NA NA NA NA AMIGO2 124639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 47670448 47670925 47670783 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 198714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 48100473 48100834 48100653 Y VDR,ASB8 RPAP3,RP1-197B17.3,SLC48A1 NA NA NA NA RP1-197B17.3 2605 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 48431282 48431505 48431439 Y NA COL2A1 NA NA NA NA COL2A1 35013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC65 18267 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 49739029 49739393 49739097 Y PRPF40B,C1QL4,DNAJC22 TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 50460197 50460562 50460363 Y NA RACGAP1,SMARCD1,GPD1 NA NA NA NA SMARCD1 16193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 50932147 50932418 50932300 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 35379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 51327584 51327783 51327682 Y NA METTL7A NA NA NA NA METTL7A 12329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 51551925 51552239 51552062 Y NA TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 12687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52184760 52184919 52184839 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1B 158532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVR1B 101125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52364914 52365223 52365052 Y GRASP ACVR1B,GRASP,NR4A1 NA NA NA NA ACVR1B 21463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52419301 52419935 52419633 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52423514 52423824 52423679 Y NA GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 8898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 52426305 52426422 52426334 Y NR4A1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52438699 52439014 52438738 Y ACVR1B,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA C12orf44 22016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 52557711 52558022 52557822 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 25762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT86 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT86,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT86,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 53253974 53254173 53254090 Y RARG,KRT6A,KRT5 KRT4 KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4 IMR90 Hi-C 24141950 KRT4 47639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 53265042 53265518 53265316 Y PFDN5,KRT2 NA KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRT4 58707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 53266859 53267080 53267047 Y NA NA KRT18,KRT8,LOC283403,KRT80,EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 60524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 61446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.95001018366647 chr12 53270322 53270511 53270351 Y RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78 NA EIF4B,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT4 63987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT4 66934 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 53281915 53282052 53282044 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 58603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 53284889 53285178 53285173 Y ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18 NA NA NA NA NA KRT18 55477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 53301815 53302147 53302072 Y KRT1,KRT76,KRT8 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 38508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 53340686 53341032 53340856 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 31 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA MFSD5 27213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 53885903 53886227 53886219 Y NA MAP3K12,TARBP2 NA NA NA NA MAP3K12 5620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 53969356 53969561 53969448 Y NA ATF7 NA NA NA NA ATF7 48638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 54293361 54293678 54293520 Y NA HOXC13,HOXC13-AS NA NA NA NA HOXC13 36857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 54391907 54392298 54392098 Y ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9 HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC5 NA NA NA NA HOXC-AS1 113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14 NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 56275045 56275257 56275151 Y OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1 DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 43846 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 56474601 56474862 56474633 Y SLC39A5,APOF,OR10P1,METTL7B,ERBB3,ERBB3 RPS26,ERBB3,PA2G4,RPL41,ZC3H10,ESYT1 NA NA NA NA ERBB3 2960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 56614575 56614693 56614609 Y NA SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,SLC39A5,ANKRD52,COQ10A NA NA NA NA RNF41 858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.85324256022548 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 57812894 57812946 57812929 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 9842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 57813803 57814254 57814252 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1 NA NA NA NA R3HDM2 8534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 57822292 57822475 57822384 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS NA NA NA NA R3HDM2 313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 58271285 58271589 58271437 Y NA CTDSP2 AVIL,CTDSP2 IMR90 Hi-C 24141950 CTDSP2 32763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3,RP11-150C16.1 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 59434557 59434696 59434648 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-150C16.1 122137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 62575569 62575732 62575651 Y USP15,FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 76387 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 64349679 64350074 64349795 Y TBK1 NA NA NA NA NA SRGAP1 113606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 64850943 64851361 64850994 Y NA TBK1 NA NA NA NA TBK1 7283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 64855437 64855720 64855602 Y C12orf66,TBK1 TBK1 NA NA NA NA TBK1 11777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 65037414 65037710 65037562 Y NA RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 35121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 65065216 65065277 65065242 Y LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 62923 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 65074143 65074354 65074186 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 71850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 67752733 67753007 67752863 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 CAND1 91672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 67828762 67829103 67828960 Y NA NA DYRK2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CAND1 167701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68221654 68222227 68222103 Y NA NA DYRK2 IMR90 Hi-C 24141950 DYRK2 181536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68705071 68705359 68705215 Y IL22 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68752517 68752875 68752786 Y NA MDM1 RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 28356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68799801 68800197 68799999 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 RP11-81H14.2 NA NA NA NA RP11-81H14.2 43246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68894598 68894866 68894732 Y NA NA RAP1B,IL26,NUP107 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-81H14.2 51155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 68959428 68959486 68959457 Y NA RAP1B NA NA NA NA RAP1B 43133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr12 69150078 69150205 69150130 Y NA SLC35E3,MDM2 NA NA NA NA SLC35E3 12192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69180946 69181662 69181342 Y NA SLC35E3,MDM2 SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM2 18294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 69446892 69447106 69446965 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPM 83542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6,RP11-1143G9.2 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69724869 69725108 69724964 Y LYZ RP11-1143G9.2,LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 15013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 69726696 69726959 69726870 Y NA LYZ,RP11-1143G9.4,YEATS4 YEATS4 K562 ChIA-PET 22265404 LYZ 13162 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 70626158 70626373 70626266 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 8401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 72165791 72165958 72165868 Y NA RAB21 NA NA NA NA RAB21 19137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 72700873 72701321 72700945 Y TPH2 NA NA NA NA NA TRHDE 221827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 74668744 74669132 74668938 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 260419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 75877380 75877665 75877492 Y GLIPR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 4920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76272060 76272354 76272328 Y PHLDA1 NA NA NA NA NA PHLDA1 153358 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76283192 76283327 76283260 Y NA NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 142385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76347823 76348161 76347983 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 77551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76362994 76363361 76363159 Y GLIPR1,PHLDA1 NA OSBPL8,PHLDA1,KRR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 62351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76371613 76372127 76371872 Y NA NA OSBPL8,PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 53585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 76414095 76414311 76414227 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 11401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 77251083 77251471 77251277 Y NA CSRP2 NA NA NA NA CSRP2 19369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 78134909 78135174 78135084 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 87511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 78551172 78551540 78551259 Y NA NA NA NA NA NA NAV3 328487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 78940817 78940832 78940824 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 314941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 79759610 79759960 79759786 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 322917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 79803401 79803717 79803562 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 279160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 234316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 79918085 79918441 79918422 Y NA NA SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 PAWR 164436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 141516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 79994209 79994302 79994256 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 88575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 80032366 80032529 80032417 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 50348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 80098707 80098999 80098853 Y NA PAWR SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 15830 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 81156248 81156255 81156252 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 173339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 81171843 81172335 81171905 Y NA NA NA NA NA NA ACSS3 157259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr12 85793012 85793355 85793084 Y NA NA NA NA NA NA ALX1 121127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 86051841 86052071 86051956 Y NA NA NA NA NA NA RASSF9 176277 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 87130786 87131140 87131095 Y MGAT4C NA NA NA NA NA NTS 864713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 88692589 88692733 88692660 Y NA NA KITLG IMR90 Hi-C 24141950 TMTC3 158516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr12 89586195 89586617 89586426 Y DUSP6,ATP2B1 NA DUSP6,POC1B IMR90 Hi-C 24141950 DUSP6 158431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 89630105 89630296 89630227 Y DUSP6,ATP2B1 NA POC1B,LOC728084,DUSP6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP6 114752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 89740084 89740418 89740292 Y POC1B,ATP2B1,DUSP6 DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 4630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 89960420 89960675 89960548 Y NA POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 GALNT4,POC1B-GALNT4 42381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 90091098 90091469 90091453 Y NA ATP2B1 ATP2B1,LOC338758 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 9608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 90253705 90254009 90253874 Y POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B1 152628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 90345013 90345239 90345184 Y POC1B,ATP2B1 NA LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 243936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 90371593 90371911 90371750 Y NA NA NA NA NA NA ATP2B1 270516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 90484866 90485476 90485213 Y ATP2B1 NA NA NA NA NA ATP2B1 383789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 92415461 92415779 92415694 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 118911 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 92424488 92424877 92424862 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 109813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92445353 92445553 92445454 Y NA NA NA NA NA NA C12orf79 89137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92446330 92446640 92446498 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 88050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 92469930 92470196 92470132 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 64494 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 92474192 92474586 92474423 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 60104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92500767 92501208 92501155 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 33482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 92505299 92505700 92505686 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 28990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 92528487 92528918 92528861 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 5772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92896154 92896581 92896501 Y BTG1,CLLU1 NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 BTG1 358481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92897281 92898057 92897626 Y BTG1,CLLU1 NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 BTG1 359608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 92899278 92900031 92899712 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA BTG1 361605 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92910105 92910423 92910265 Y EEA1,BTG1,CLLU1OS NA LOC256021 MCF7 ChIA-PET 22265404 BTG1 372432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92923889 92924225 92924058 Y NA NA NA NA NA NA BTG1 386216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92932983 92933476 92933230 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 387631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92941921 92942046 92942003 Y EEA1,BTG1 NA NA NA NA NA EEA1 379061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 92947125 92947543 92947361 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 373564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 92955380 92955568 92955421 Y NA NA LOC256021 IMR90 Hi-C 24141950 EEA1 365539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 92995849 92996628 92996444 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 324479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 93561648 93561951 93561715 Y NA RP11-511B23.2 NA NA NA NA RP11-511B23.2 45504 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 93709037 93709216 93709174 Y NA NA NA NA NA NA NUDT4 60443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 93767024 93767186 93767090 Y CRADD,NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 2473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 94428471 94428481 94428476 Y NA NA CRADD IMR90 Hi-C 24141950 PLXNC1 112018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 94539021 94539385 94539203 Y NA PLXNC1 PLXNC1,CCDC41 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNC1 1114 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 94696122 94696451 94696433 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA RBMS2P1 120294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 95043067 95043319 95043087 Y TMCC3 TMCC3 NA NA NA NA TMCC3 729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 95609786 95609977 95609896 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA VEZT 264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 96027120 96027372 96027186 Y LTA4H NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 USP44 83854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 96027575 96027687 96027629 Y NA NA NTN4 IMR90 Hi-C 24141950 USP44 84309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 96047992 96048216 96048102 Y METAP2,LTA4H NA NA NA NA NA USP44 104726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 96635574 96636027 96635766 Y CDK17 ELK3 NA NA NA NA ELK3 49414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 96648142 96648594 96648361 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 61982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 96649758 96650321 96650168 Y ELK3,CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 63598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 96659033 96659395 96659303 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 72873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 96794959 96795305 96795211 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 2621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 98793447 98793582 98793503 Y NA RNU4-41P NA NA NA NA RNU4-41P 16234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 99524955 99525202 99525103 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 488036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 99541793 99542207 99542018 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 504874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 99768760 99769016 99768892 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1B 607416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 99878188 99878563 99878529 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1B 497869 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 100970454 100970954 100970686 Y NA GAS2L3 NA NA NA NA RP11-575G13.2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 102187051 102187461 102187342 Y DRAM1,GNPTAB GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 35255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 102220478 102220758 102220699 Y NA GNPTAB,DRAM1 NA NA NA NA GNPTAB 1958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 102269445 102269658 102269578 Y DRAM1 GNPTAB,DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 104252933 104253121 104253026 Y NA NT5DC3 NA NA NA NA NT5DC3 19958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 104671230 104671489 104671317 Y TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 1011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr12 104791559 104791875 104791716 Y TXNRD1 NA CHST11,SLC41A2,C12orf45 IMR90 Hi-C 24141950 CHST11 55198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 104925240 104925499 104925325 Y CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 78167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 217498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 105066347 105066673 105066397 Y TXNRD1,TXNRD1,EID3,CHST11,SLC41A2,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 219274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 105122015 105122177 105122066 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 228345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 105177272 105177383 105177327 Y NA NA NA NA NA NA SLC41A2 173139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 105711063 105711549 105711425 Y C12orf75 RP11-474B16.1 C12orf75,APPL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-474B16.1 7246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 105948050 105948070 105948060 Y NA NA NUAK1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-474B16.1 229255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 106515905 106516067 106515985 Y NA NUAK1 NA NA NA NA NUAK1 15744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 106682328 106682503 106682422 Y NA TCP11L2,CKAP4 CKAP4,NUAK1,TCP11L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCP11L2 11204 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 106694592 106694855 106694698 Y NA TCP11L2,CKAP4 NA NA NA NA TCP11L2 885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 107473112 107473328 107473221 Y NA CRY1 NA NA NA NA CRY1 12279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 107856980 107857227 107857220 Y NA NA NA NA NA NA BTBD11 146790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109003329 109003729 109003508 Y NA ISCU NA NA NA NA ISCU 48971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109023569 109024011 109023688 Y SSH1,SELPLG,SELPLG NA NA NA NA NA ISCU 69211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 109030971 109031245 109031128 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 76613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109036250 109036518 109036431 Y NA NA NA NA NA NA ISCU 81892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 109061186 109061401 109061295 Y SELPLG,SELPLG,SSH1 NA NA NA NA NA CORO1C 61971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109084686 109085066 109084867 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 38306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109209396 109209677 109209591 Y NA SSH1,DAO NA NA NA NA SSH1 39689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1,DAO NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1,DAO NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1,DAO NA NA NA NA SSH1 709 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1,DAO NA NA NA NA DAO 30 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 110567516 110567657 110567554 Y NA IFT81 NA NA NA NA IFT81 7376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 110687741 110688014 110687886 Y TRPV4,ATP2A2 ATP2A2 ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATP2A2 28547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr12 110694570 110694771 110694670 Y PPTC7,ARPC3 ATP2A2 ATP2A2,IFT81,ANKRD13A,GIT2,C12orf76,ANAPC7,ARPC3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2A2 21790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 110931784 110931990 110931887 Y NA ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29 NA NA NA NA VPS29 5932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.37904047069877 chr12 111847309 111847501 111847415 Y ALDH2,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111847615 111848064 111847953 Y ALDH2,FAM109A,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111866764 111867021 111866784 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 25012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111868510 111869152 111868792 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 26758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111875686 111876044 111875771 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 33934 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111881338 111881509 111881420 Y ALDH2,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 39586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 112545862 112545946 112545885 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 1036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 113630509 113630869 113630677 Y NA DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA DDX54 9225 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 113684297 113684702 113684391 Y NA TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 27398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 113851482 113851626 113851554 Y NA SDSL,SDS SDS IMR90 Hi-C 24141950 SDSL 6416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 113925032 113925100 113925066 Y NA NA RBM19,DTX1 IMR90 Hi-C 24141950 SDS 62926 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 116383050 116383163 116383141 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 329980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 116561417 116561596 116561452 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 151547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 116990477 116990812 116990735 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 NA NA NA NA LINC00173 21250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 118466445 118466738 118466629 Y NA RFC5,WSB2 NA NA NA NA RFC5 17052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 118497859 118498236 118498048 Y NA RFC5 NA NA NA NA WSB2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 118632324 118632442 118632383 Y NA RPS2P5 PEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P5 49435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 119618645 119618705 119618687 Y HSPB8 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 4198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 119632995 119633391 119633197 Y TMEM233 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 18548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 119648635 119648890 119648691 Y CCDC60 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 34188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120453080 120453507 120453184 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 99799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120672500 120673016 120672699 Y PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 28558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-1 337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120803895 120804280 120803957 Y NA MSI1,RPS27P25 NA NA NA NA MSI1 703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 120967554 120967708 120967668 Y NA RNF10,COQ5,POP5 NA NA NA NA RNF10 1575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 120976448 120976663 120976550 Y PXN,RNF10 RNF10,COQ5,POP5 NA NA NA NA COQ5 6211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 121019899 121020145 121020000 Y NA COQ5,POP5,RPL11P5 NA NA NA NA POP5 2698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121402785 121402795 121402791 Y HNF1A HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43 NA NA NA NA HNF1A 11551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 121425440 121425755 121425495 Y NA HNF1A,HNF1A-AS1,C12orf43,OASL NA NA NA NA HNF1A-AS1 8672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 121888305 121888670 121888535 Y NA NA NA NA NA NA RNF34 52461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 121904317 121904475 121904368 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B NA RNF34 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF34 68473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM120B 23540 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122518432 122518585 122518507 Y MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 3804 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122519763 122520228 122519936 Y ZCCHC8,RSRC2,ORAI1,SETD1B,MLXIP AC156455.1,MLXIP NA NA NA NA MLXIP 5135 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122897459 122897572 122897541 Y NA CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 7607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 14.7500509183324 chr12 123218047 123218405 123218295 Y CLIP1,RSRC2,HCAR2,HCAR3,VPS37B,C12orf65 HCAR3,HCAR1,DENR NA NA NA NA HCAR1 4657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 123320749 123321200 123320858 Y NA HIP1R NA NA NA NA HIP1R 3749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 123387713 123388070 123387892 Y NA VPS37B NA NA NA NA VPS37B 8722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 123636095 123636496 123636485 Y NA PITPNM2 NA NA NA NA PITPNM2 3533 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 124937911 124938596 124938282 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA NCOR2 111539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 125003619 125003834 125003727 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 46301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 22142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 125160747 125161145 125161022 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 110612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125165952 125166242 125166057 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1 IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 115817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 125204801 125205082 125204928 Y UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 154666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125332280 125332520 125332389 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 32694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 12507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 125425237 125425455 125425374 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 25323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr12 125565000 125565015 125565008 Y AACS AACS NA NA NA NA AACS 17075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 128823822 128824230 128823901 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 482298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 130947882 130948028 130947955 Y NA NA NA NA NA NA STX2 373783 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 132203397 132203510 132203472 Y ULK1 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 9771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr12 132315038 132315239 132315115 Y MMP17 MMP17 NA NA NA NA MMP17 4100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 20137811 20138146 20137910 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 67642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 20419964 20420131 20420036 Y PSPC1,ZMYM5 ZMYM5 NA NA NA NA ZMYM5 15645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 20546038 20546426 20546233 Y NA ZMYM2 NA NA NA NA ZMYM2 15228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr13 20694627 20695029 20694906 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 38159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 31088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 21893563 21893874 21893643 Y NA MIPEPP3 ZDHHC20 IMR90 Hi-C 24141950 MIPEPP3 23285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-309I15.1 170978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 24835829 24835982 24835890 Y NA NA NA NA NA NA PARP4 248966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 26558733 26558979 26558920 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 235812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 28025291 28025563 28025486 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 2552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr13 28534904 28535178 28535096 Y LNX2,FLT3,PRHOXNB PDX1,CDX2 NA NA NA NA CDX2 8098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 29291126 29291443 29291386 Y SLC46A3 SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 19 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 29327742 29327905 29327792 Y NA SLC46A3 NA NA NA NA SLC46A3 36635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 30407984 30408178 30408116 Y UBL3 UBL3 NA NA NA NA UBL3 14643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 30808946 30809107 30809021 Y KATNAL1 NA NA NA NA NA PRDX2P1 59177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058,UBE2L5P LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 32501315 32501650 32501483 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 82337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 32664585 32664831 32664706 Y NA NA NA NA NA NA FRY 61148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 32725009 32725223 32725116 Y NA NA NA NA NA NA FRY 121572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 32956405 32956487 32956432 Y NA N4BP2L1 NA NA NA NA N4BP2L1 43828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 34730516 34730744 34730573 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 340330 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 37424486 37424865 37424682 Y NA RFXAP NA NA NA NA RFXAP 33125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 40690248 40690533 40690364 Y NA NA FOXO1 IMR90 Hi-C 24141950 COG6 462484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 41229483 41229797 41229615 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 8937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 41519573 41519973 41519773 Y NA SUGT1P3 NA NA NA NA SUGT1P3 25663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 41586512 41586699 41586606 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 46711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 41624170 41624528 41624466 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 ELF1,MTRF1,NAA16 IMR90 Hi-C 24141950 WBP4 8882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 42269057 42269475 42269218 Y C13orf15,DGKH NA NA NA NA NA DGKH 342701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 42370920 42370928 42370925 Y NA NA NA NA NA NA DGKH 241248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 42970625 42970891 42970777 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 NA NA NA NA NA AKAP11 126336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 43387110 43387283 43387178 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 177124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 43635759 43636150 43635822 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 40420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 44165760 44165919 44165882 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 193125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 44359761 44360131 44359976 Y ENOX1,ENOX1 ENOX1 NA NA NA NA ENOX1 717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00284 61882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 44686894 44687068 44686966 Y NA NA TSC22D1,SERP2,LACC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00284 206044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 44833229 44833563 44833337 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 315720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 44875300 44875802 44875641 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 273481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 44880536 44881091 44880742 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA TSC22D1,LACC1,SERP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D1 268192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr13 45428744 45428990 45428867 Y NA NA TSC22D1,LINC00330,NUFIP1,TSC22D1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 NUFIP1 132628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 45752820 45753055 45752934 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 60170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 45928010 45928281 45928087 Y NA TPT1-AS1,TPT1 NA NA NA NA TPT1 14505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 46747616 46748160 46748034 Y C13orf18,LCP1 NA NA NA NA NA CPB2 70405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 NA NA NA NA NA NUDT15 83568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 49123931 49124043 49124005 Y FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2 RCBTB2 RCBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 18562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 49761885 49761908 49761899 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 58139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 50534396 50534668 50534593 Y NA SPRYD7 NA NA NA NA SPRYD7 25770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 50661413 50661685 50661628 Y NA MIR16-1,DLEU1,DLEU2 NA NA NA NA DLEU1 7106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 50897882 50898235 50898046 Y NA RPL34P26 DLEU2,DLEU1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 35664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 51034237 51034585 51034411 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 100338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 51200392 51200766 51200454 Y NA NA NA NA NA NA RPL34P26 266493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 51288107 51288409 51288197 Y NA NA NA NA NA NA RNASEH2B 193405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 51902603 51902909 51902835 Y NA NA DHRS12 IMR90 Hi-C 24141950 FAM124A 108100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 52572353 52572390 52572372 Y NA ATP7B,ALG11,UTP14C NA NA NA NA ATP7B 11240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 127240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr13 68776977 68777004 68776989 Y NA NA NA NA NA NA PCDH9 974509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 71362393 71362632 71362470 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 884567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 72438548 72439003 72438895 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 NA NA NA NA NA FABP5P1 1036364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 76138851 76139260 76139031 Y NA COMMD6,UCHL3 NA NA NA NA UCHL3 17232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 76256605 76256814 76256659 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 64035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 76279599 76280073 76279764 Y LMO7 NA NA NA NA NA LMO7 87029 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 77166796 77167041 77166918 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P44 387010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 77899332 77899971 77899636 Y KCTD12,FBXL3,MYCBP2 MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 147 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 78227370 78227383 78227376 Y NA SLAIN1 NA NA NA NA SLAIN1 42640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 80705470 80705610 80705560 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 207476 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 80916799 80917232 80917156 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 80934191 80934539 80934365 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 21105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 80936113 80936309 80936180 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 23027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 87444403 87444606 87444585 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 1072780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 88384592 88384886 88384741 Y NA NA NA NA NA NA SLITRK6 2012969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 94297506 94297518 94297511 Y GPC6 NA NA NA NA NA GPC6 420411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 94762314 94762622 94762468 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 483889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 94785518 94785984 94785813 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 460527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr13 94891482 94891695 94891602 Y NA NA NA NA NA NA TGDS 354816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 95128334 95128746 95128451 Y DCT NA NA NA NA NA TGDS 117765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 96262046 96262201 96262124 Y DZIP1 DZIP1 NA NA NA NA DZIP1 32756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 97890366 97890711 97890515 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 18678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 97912286 97912462 97912389 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 40598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 99033515 99033578 99033537 Y NA NA NA NA NA NA STK24 194616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 99121203 99121258 99121231 Y NA NA NA NA NA NA STK24 106936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 99130571 99130717 99130631 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 97477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 99737310 99737596 99737454 Y DOCK9 NA NA NA NA NA UBAC2-AS1 113368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 100613415 100613606 100613513 Y NA ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 8557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 100620497 100620786 100620718 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 1377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 100644149 100644384 100644267 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC2 12123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 100886726 100886738 100886732 Y NA NA A2LD1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P18 85380 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 101041976 101042276 101042034 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 240630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 103557671 103557972 103557679 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 62477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 104663923 104664083 104664030 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1168729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 106751889 106752019 106751954 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00460 274892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 107624035 107624287 107624161 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 310250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA ABHD13 699317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr13 109572126 109572187 109572157 Y MYO16,MYO16 NA NA NA NA NA ABHD13 703399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 110337257 110337548 110337429 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 68067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 110352571 110352699 110352636 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 52916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 AL162497.1 MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL162497.1 45982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 AL162497.1,IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 110746992 110747342 110747118 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 COL4A2 208817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 110850022 110850027 110850025 Y NA NA NA NA NA NA COL4A2 106132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 110956468 110956902 110956701 Y COL4A2,COL4A1 COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A2 309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111013776 111014136 111013979 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 56280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111049993 111050394 111050073 Y NA NA NA NA NA NA COL4A1 92497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111174336 111174835 111174468 Y ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 37245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111176913 111177121 111177092 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 34959 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111212014 111212166 111212090 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 NA COL4A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB20 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr13 111212967 111213224 111213111 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 COL4A2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RAB20 887 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr13 111607450 111607830 111607755 Y RAB20,ING1,ING1,ANKRD10 ANKRD10 ARHGEF7,ANKRD10 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 42034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 113704885 113705219 113705051 Y NA NA NA NA NA NA F7 52886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 113806516 113806910 113806731 Y ATP11A,CUL4A F7,F10 PROZ IMR90 Hi-C 24141950 F10 31388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 113870568 113870732 113870682 Y MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10 CUL4A,PCID2 NA NA NA NA PCID2 9539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr13 114270892 114271213 114271013 Y DCUN1D2,TMCO3 TFDP1 NA NA NA NA TFDP1 33879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114459608 114459701 114459670 Y NA NA NA NA NA NA GAS6 105345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114740287 114740680 114740494 Y NA NA NA NA NA NA RASA3 155406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114834440 114834743 114834634 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 61343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114864762 114865011 114864824 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 31075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr13 114881275 114881557 114881414 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 14529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 21154551 21154914 21154765 Y NDRG2 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 4215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 21522548 21522854 21522702 Y NA ARHGEF40,NDRG2,ZNF219 NA NA NA NA ARHGEF40 13575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23357263 23357473 23357436 Y NA LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA REM2 6889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23358205 23358555 23358381 Y NA LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA REM2 7831 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 23367708 23367835 23367778 Y NA LRP10,REM2,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1 NA NA NA NA REM2 17334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr14 23466095 23466339 23466236 Y CDH24,ACIN1 MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 11036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 24016944 24017157 24017064 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2 NA NA NA NA THTPA 6059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 24891908 24892270 24892086 Y NA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA KHNYN 4222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 27311220 27311475 27311345 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 246260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 28846944 28847285 28847115 Y FOXG1 NA NA NA NA NA RPL26P3 109831 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 31165114 31165442 31165278 Y NA NA NA NA NA NA SCFD1 75796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 31360303 31360625 31360494 Y NA COCH NA NA NA NA COCH 18583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 31478440 31478826 31478753 Y NA AP4S1,STRN3 NA NA NA NA AP4S1 13486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 31559968 31560471 31560185 Y SCFD1,GPR33,STRN3 NA NA NA NA NA STRN3 66361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 31698850 31699225 31699035 Y STRN3 HECTD1 AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HECTD1 23840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr14 32420109 32420203 32420156 Y NA RP11-187E13.1 AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-187E13.1 8050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr14 32976944 32977104 32977024 Y NA RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 24938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 27001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 33041637 33041800 33041733 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 89631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 35325148 35325514 35325424 Y PSMA6,PPP2R3C,BAZ1A RP11-73E17.2,BAZ1A NA NA NA NA RP11-73E17.2 16035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 35805683 35806194 35806003 Y BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA RP11-561B11.1 50081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 35834310 35835208 35834855 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 21067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 36073737 36073816 36073791 Y NA NA NA NA NA NA NFKBIA 201782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 37233433 37233885 37233827 Y NA NA NA NA NA NA PAX9 108660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 37317346 37317701 37317507 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA PAX9 192573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 37445830 37445969 37445900 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21-AS1 193124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 38052089 38052429 38052199 Y NA RP11-356O9.1,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 10623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 38052956 38053419 38053189 Y FOXA1 RP11-356O9.1,TTC6,FOXA1 NA NA NA NA TTC6 9633 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 39453128 39453325 39453253 Y NA NA NA NA NA NA SEC23A 123525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 39737909 39738305 39738022 Y NA MIA2,CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 5421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 39768270 39768447 39768359 Y PNN,MIA2 CTAGE5 NA NA NA NA CTAGE5 35782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 45554390 45554749 45554468 Y NA KLHL28,PRPF39,FKBP3,FANCM NA NA NA NA PRPF39 3088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50090977 50091033 50091007 Y METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2 RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2 NA NA NA NA MGAT2 5488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50213261 50213687 50213459 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 18639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50237132 50237443 50237218 Y KLHDC2 KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 4806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50256678 50256775 50256761 Y NA KLHDC2 NA NA NA NA KLHDC2 24352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50328432 50328642 50328440 Y METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 50328882 50329315 50329091 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 10961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA C14orf182 NA NA NA NA C14orf182 32371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr14 51460024 51460383 51460203 Y TRIM9 NA NA NA NA NA PYGL 50570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 51837532 51837771 51837653 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 116047 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 PTGER2 156301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 53269343 53269708 53269600 Y PTGER2 GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 12957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr14 54900763 54901015 54900977 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 39196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 55116749 55117607 55117330 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 84934 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr14 55596570 55597156 55596587 Y NA LGALS3 NA NA NA NA LGALS3 7742 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 56677019 56677095 56677057 Y NA NA NA NA NA NA PELI2 94487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 56733293 56733420 56733313 Y PELI2 NA NA NA NA NA PELI2 150761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 57343255 57343511 57343375 Y OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 390215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 59216036 59216189 59216096 Y ARID4A RP11-112J1.1 DACT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-112J1.1 43183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 59768078 59768328 59768116 Y RTN1,DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 114714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 59908838 59908842 59908840 Y NA GPR135,JKAMP NA NA NA NA GPR135 21218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 GPR135,JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr14 60074995 60075284 60075140 Y NA NA NA NA NA NA JKAMP 125834 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 60629133 60629293 60629144 Y NA DHRS7 NA NA NA NA DHRS7 5281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 61108188 61108290 61108236 Y NA SIX1 NA NA NA NA SIX1 14687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 61456427 61456721 61456474 Y SLC38A6 RP11-193F5.4,SLC38A6,TRMT5 NA NA NA NA TRMT5 10351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA TRMT5 124189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 220856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr14 61946856 61947374 61946994 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 212857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 61978878 61979019 61978952 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 181212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 61983792 61983968 61983885 Y SYT16 NA NA NA NA NA HIF1A 176263 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 62026213 62026731 62026533 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 133500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr14 62157799 62158071 62157921 Y HIF1A HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1 NA NA NA NA HIF1A 2160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 64705009 64705329 64705170 Y PLEKHG3,SYNE2 NA NA NA NA NA RP11-544I20.2 97988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 65231601 65231863 65231701 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG3 62781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 65524481 65524844 65524562 Y PLEKHG3 MAX NA NA NA NA MAX 42569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 65705887 65706189 65706012 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 138474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 65722117 65722532 65722424 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FUT8 152778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 67751261 67751573 67751281 Y RDH12,PLEKHH1,PIGH MPP5 NA NA NA NA MPP5 45435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr14 67998625 67999040 67998762 Y NA PLEKHH1 NA NA NA NA PLEKHH1 607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.90323237655901 chr14 68407691 68408026 68407854 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68409175 68409464 68409327 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 124679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68420679 68421053 68420830 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 136183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 68555311 68555805 68555391 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 270815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr14 68571232 68571846 68571404 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 286736 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68604521 68604895 68604639 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 282018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 68607037 68607479 68607161 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 279434 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68610058 68610732 68610311 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 276181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68634149 68634509 68634347 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 252404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 68699331 68699744 68699520 Y ZFYVE26 NA NA NA NA NA PPIAP6 187169 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 68903483 68903615 68903549 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 16570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68925660 68925982 68925837 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 38747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 68943032 68943562 68943135 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 56119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 68961774 68962026 68961864 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 74861 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 68987766 68987894 68987825 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 100853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 69010932 69011443 69011159 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 124019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69019496 69019664 69019580 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 132583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69047219 69047274 69047247 Y ZFP36L1 NA NA NA NA NA PPIAP6 160306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69076965 69077322 69077310 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L1 183868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69216365 69216576 69216463 Y NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 44614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 69246726 69246992 69246942 Y DCAF5 ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 14198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 69251306 69251504 69251405 Y NA ZFP36L1 NA NA NA NA ZFP36L1 9686 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 69281323 69281785 69281441 Y DCAF5 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 20133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr14 69301401 69301774 69301727 Y DCAF5,ZFP36L1 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 40211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 69361596 69361764 69361692 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 82393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69377319 69377610 69377464 Y NA NA NA NA NA NA ACTN1 66547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69417780 69418181 69417964 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 25976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69425235 69425583 69425528 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 18574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 69434857 69435075 69434960 Y DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 9082 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 70110235 70110559 70110279 Y DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247 KIAA0247 NA NA NA NA KIAA0247 33922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 70251267 70251371 70251319 Y SLC10A1 NA NA NA NA NA SRSF5 59650 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 70464665 70464959 70464731 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 145817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 70465984 70466470 70466191 Y NA NA NA NA NA NA SMOC1 147136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 72083404 72083762 72083537 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 296873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 72650490 72650870 72650581 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 707939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 73695241 73695452 73695329 Y ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf169 PAPLN NA NA NA NA PAPLN 6753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 74208106 74208498 74208298 Y C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA PNMA1 28978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 74229197 74229543 74229334 Y NUMB,ZNF410,C14orf43 RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 22520 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 74607211 74607609 74607410 Y NA NA VSX2 IMR90 Hi-C 24141950 LIN52 57712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 76342346 76342569 76342455 Y BATF,TGFB3 IFT43 TGFB3 IMR90 Hi-C 24141950 IFT43 23910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77265287 77265548 77265418 Y NA VASH1,ANGEL1 NA NA NA NA ANGEL1 25041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77300761 77300827 77300798 Y ESRRB,C14orf166B ANGEL1 NA NA NA NA ANGEL1 10172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77591216 77591790 77591612 Y TMED8,NGB NA NA NA NA NA RP11-7F17.3 50529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 77871382 77871440 77871411 Y NA SAMD15,TMED8 NA NA NA NA TMED8 29930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 78144886 78145071 78144891 Y NA ALKBH1,SLIRP NA NA NA NA ALKBH1 27292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 78196199 78196534 78196363 Y NA ALKBH1,SLIRP,SNW1 NA NA NA NA SLIRP 23785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr14 84176891 84176909 84176900 Y NA NA NA NA NA NA RP11-789A21.1 1526909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 85881762 85881957 85881956 Y FLRT2 NA NA NA NA NA RP11-789A21.1 177944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr14 89881748 89882141 89882044 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA CAP2P1 125810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 90000319 90000400 90000398 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 83093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 90988934 90989119 90989019 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 128088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 91069038 91069054 91069046 Y NA NA NA NA NA NA CALM1 208192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 91090658 91091172 91090732 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 189651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 91863961 91864070 91864025 Y C14orf159,CCDC88C CCDC88C NA NA NA NA CCDC88C 18118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 93192576 93192808 93192662 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 20239 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 93697718 93697880 93697787 Y ITPK1,MOAP1 MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 94808145 94809286 94808819 Y SERPINA1 SERPINA6,SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA6 20414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 94851152 94851609 94851362 Y SERPINA1 SERPINA1 NA NA NA NA SERPINA1 3421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 94860948 94861396 94861133 Y SERPINA1 SERPINA1 SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINA1 5918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 94862196 94862528 94862354 Y SERPINA11,SERPINA1 SERPINA1 SERPINA1 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINA1 7166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 95068378 95068532 95068464 Y NA SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3 NA NA NA NA SERPINA3 8182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 97465115 97465271 97465193 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 203474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 97685606 97685621 97685614 Y NA NA NA NA NA NA VRK1 423965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 100264706 100265066 100264858 Y NA NA NA NA NA NA EML1 62676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 100687969 100688087 100687996 Y NA YY1,RP11-638I2.4 YY1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 YY1 14548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 101020509 101020866 101020628 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 30884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 102394756 102394884 102394784 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 33981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr14 102429527 102429743 102429691 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 RP11-736N17.8,TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFAIP2 85648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 103710310 103710630 103710449 Y NA NA LOC100131366,EIF5,TNFAIP2,CDC42BPB,RCOR1,EXOC3L4 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 87251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 103726827 103727460 103727139 Y MARK3,TRAF3,TNFAIP2,EIF5,EIF5 NA EIF5,CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,LOC100131366 IMR90 Hi-C 24141950 EIF5 70421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 105327046 105327788 105327205 Y NA NA NA NA NA NA AKT1 66958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr14 107252931 107253417 107253022 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1261991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 107253494 107254031 107253700 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1262554 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr14 107254436 107254688 107254673 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1263496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 22897960 22898211 22898128 Y CYFIP1,CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 7955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25554216 25554517 25554319 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 127611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25563100 25563402 25563110 Y SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 118726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25586903 25587047 25586976 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 95081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25597069 25597306 25597188 Y SNRPN,SNURF,SNRPN NA NA NA NA NA UBE3A 84822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 25678066 25678357 25678212 Y NA UBE3A NA NA NA NA UBE3A 3771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 26864879 26864942 26864916 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 1182751 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 27662282 27662368 27662325 Y NA NA NA NA NA NA OCA2 680136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 29631690 29632071 29631913 Y NA NA NA NA NA NA NDNL2 71657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 29949236 29949642 29949365 Y NA RP11-680F8.1 NA NA NA NA RP11-680F8.1 15552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA RP11-680F8.1 57328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 31556077 31556632 31556358 Y MTMR10,KLF13 RP11-16E12.1 LOC283710,OTUD7A,KLF13 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-16E12.1 49854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 32964268 32964677 32964326 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 43498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 33212194 33212596 33212424 Y GREM1 NA NA NA NA NA GREM1 204019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 33502141 33502453 33502281 Y NA NA TMCO5B IMR90 Hi-C 24141950 GREM1 493966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 34290038 34290177 34290053 Y NA AVEN NA NA NA NA AVEN 39200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 35599049 35599138 35599102 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 320561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 35840171 35840395 35840294 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 561683 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 36897694 36898088 36897999 Y C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 27882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 37046763 37047120 37046943 Y C15orf41 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 61540 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 37169508 37169702 37169583 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 60848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 37203314 37203431 37203373 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 94654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 98737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 37249666 37249815 37249741 Y NA NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 141006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 37261192 37261563 37261502 Y NA NA NA NA NA NA MEIS2 129941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39174117 39174200 39174140 Y C15orf53 NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 429789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39175462 39175521 39175492 Y NA NA FSIP1,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM98B 431134 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 355219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 284984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr15 39432449 39432903 39432696 Y C15orf54 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 284493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39447330 39447720 39447666 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 269676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39449850 39450075 39449963 Y NA NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 267321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39458213 39458321 39458267 Y THBS1 NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 259075 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39527316 39527429 39527373 Y NA NA C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 189967 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39650604 39651044 39650772 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 66352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39668694 39669075 39668948 Y NA RP11-624L4.1 THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 48321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39683457 39683798 39683639 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 33598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39684245 39684484 39684421 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 32912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39696909 39697463 39697288 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,C15orf53 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 19933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 39702122 39702492 39702291 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 14904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 39703846 39704297 39704020 Y NA RP11-624L4.1 THBS1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-624L4.1 13099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 39722195 39722553 39722498 Y THBS1,C15orf54 RP11-624L4.1 C15orf53,FSIP1,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-624L4.1 4799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 39866856 39867109 39867069 Y FSIP1 THBS1 THBS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 THBS1 4171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 39985163 39985564 39985388 Y NA NA NA NA NA NA FSIP1 87467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 40180090 40180249 40180216 Y NA GPR176,EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 30844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 40361212 40361596 40361446 Y NA SRP14,BMF NA NA NA NA SRP14 31823 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 40365860 40366125 40365905 Y NA SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 32968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr15 40390220 40390395 40390296 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 8698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 40803808 40804249 40803896 Y NA CHST14 NA NA NA NA CHST14 42648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 41138213 41138409 41138269 Y RHOV,SPINT1,SPINT1 ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 26078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 24693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 42220921 42221174 42221042 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 41602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 43081091 43081306 43081168 Y NA NA NA NA NA NA CDAN1 53767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 44760894 44761150 44760908 Y NA CTDSPL2 NA NA NA NA CTDSPL2 43462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 45005185 45005759 45005376 Y CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 3510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 45746745 45747578 45747238 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 26018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 45938532 45938945 45938638 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 17186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 48311619 48311717 48311668 Y NA NA SEMA6D,SLC12A1 IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 156997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 48821826 48821860 48821843 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 114186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 48847218 48847569 48847520 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 88477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 48884247 48884306 48884277 Y NA NA NA NA NA NA FBN1 51740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 49189398 49189493 49189438 Y SECISBP2L EID1 NA NA NA NA EID1 21315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 49217829 49218211 49218108 Y SHC4 EID1,SHC4 NA NA NA NA SHC4 35430 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 49739111 49739383 49739247 Y NA NA NA NA NA NA DTWD1 171794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 50793550 50793719 50793635 Y USP8,TRPM7 NA NA NA NA NA USP8 78973 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 51212270 51212627 51212449 Y NA AP4E1 NA NA NA NA AP4E1 13401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 51481875 51482198 51481995 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 86402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 51535974 51536234 51536151 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 140501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 51595036 51595426 51595331 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 199563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 51598187 51598615 51598465 Y CYP19A1 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 202714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 51628727 51629122 51629096 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA TNFAIP8L3 233254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 51881201 51881478 51881419 Y MAPK6,DMXL2 DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 31552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 51909690 51910017 51909879 Y NA DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 3013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 51921191 51921424 51921391 Y NA DMXL2 DMXL2,LYSMD2,TMOD2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DMXL2 8161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52024012 52024470 52024199 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 17288 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52122599 52122915 52122757 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 2774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52235970 52236006 52235989 Y DMXL2,MAPK6 MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 6297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 52273738 52273979 52273778 Y NA MAPK6,LEO1 MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LEO1 11735 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 52369278 52369628 52369325 Y MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 GNB5,BCL2L10,MYO5C IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2184D3.1 15864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52385766 52385957 52385877 Y DMXL2,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.1 274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr15 52395777 52396019 52395882 Y DMXL2,TMOD3,MAPK6 CTD-2184D3.1,CTD-2184D3.5 NA NA NA NA CTD-2184D3.5 5057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52438848 52438958 52438938 Y NA CTD-2184D3.5,GNB5 NA NA NA NA GNB5 42608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52545063 52545254 52545150 Y MAPK6 MYO5C NA NA NA NA MYO5C 40741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 52580530 52580869 52580787 Y ARPP19,MYO5C MYO5C NA NA NA NA MYO5C 5126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 53010328 53010576 53010452 Y NA FAM214A MYO5C,FAM214A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM214A 10314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 53095650 53095970 53095786 Y ONECUT1 ONECUT1 ONECUT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ONECUT1 14377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 53804819 53805218 53805019 Y NA NA NA NA NA NA WDR72 247857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 55581016 55581448 55581368 Y RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1 PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 27710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 55614631 55614957 55614885 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA RP11-139H15.1 5272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 56162319 56162688 56162565 Y NA NA NA NA NA NA NEDD4 121256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 56201661 56201754 56201731 Y NEDD4 NA NA NA NA NA NEDD4 82190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 56475850 56476168 56476009 Y MNS1 NA NA NA NA NA RFX7 57315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 57465140 57465369 57465208 Y ZNF280D,TCF12 NA LOC283663 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 200796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 57814441 57814703 57814560 Y CGNL1 NA NA NA NA NA GCOM1 67403 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 58307957 58308317 58308137 Y NA NA NA NA NA NA LIPC 392451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 58621992 58622651 58622224 Y ADAM10,AQP9 NA LIPC,ADAM10,FAM63B IMR90 Hi-C 24141950 LIPC 78117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 58732356 58732646 58732550 Y NA LIPC NA NA NA NA LIPC 31588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 58751372 58751614 58751455 Y AQP9,SLTM,ADAM10 ALDH1A2 NA NA NA NA ALDH1A2 36451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 59194300 59194605 59194559 Y NA RNF111,SLTM NA NA NA NA SLTM 29247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 59576201 59576407 59576333 Y GCNT3,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 86485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 59592534 59592835 59592690 Y BNIP2,RNF111,MYO1E NA NA NA NA NA FAM81A 70057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 59642348 59642705 59642508 Y BNIP2,RNF111 FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 20187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 61406057 61406438 61406248 Y NA NA NA NA NA NA RORA 113080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 62130295 62130308 62130301 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 220364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 62207321 62207567 62207441 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 143105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 62215780 62216024 62215899 Y NA NA NA NA NA NA VPS13C 134648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 62405210 62405473 62405223 Y NA C2CD4A NA NA NA NA C2CD4A 48034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 62685382 62685737 62685634 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 4657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63372629 63373133 63372992 Y NA TPM1,RP11-244F12.3,LACTB NA NA NA NA RP11-244F12.3 33043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63386917 63387072 63386993 Y RPS27L,TPM1 RP11-244F12.3,LACTB NA NA NA NA LACTB 24927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63432131 63432432 63432186 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RPS27L 15788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63483586 63483819 63483690 Y NA RPS27L,RAB8B NA NA NA NA RAB8B 3918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63664402 63664810 63664706 Y LACTB,CA12 CA12 NA NA NA NA CA12 7550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 63765155 63765456 63765306 Y NA USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 29337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63766170 63766327 63766326 Y HERC1,USP3 USP3 APH1B,RAB8B,FBXL22,LOC100130855,USP3,CA12,HERC1,FAM96A,SNX1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP3 28466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr15 63789918 63790251 63790145 Y HERC1,LACTB,RAB8B,APH1B,USP3 USP3 NA NA NA NA USP3 4542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr15 63803463 63803731 63803481 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 8670 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 63871063 63871418 63871089 Y NA USP3-AS1 NA NA NA NA USP3-AS1 20370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 64188807 64189333 64189164 Y USP3,HERC1 NA NA NA NA NA HERC1 64666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 64538820 64539298 64539122 Y NA NA NA NA NA NA PPIB 85416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 65165332 65165600 65165447 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 PIF1,PLEKHO2,ANKDD1A NA NA NA NA PLEKHO2 33244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr15 65344740 65344762 65344754 Y NA MTFMT NA NA NA NA MTFMT 24763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 65589242 65589632 65589437 Y NA RNU5A-1,PARP16 MTFMT,IGDCC4,PDCD7,RASL12,IGDCC3,OSTBETA,CILP,PARP16,CLPX,UBAP1L,DPP8,PTPLAD1,SPG21,KBTBD13 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PARP16 1324 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 65911878 65912241 65912183 Y DENND4A SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 10174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 65951559 65951691 65951625 Y NA SLC24A1 NA NA NA NA SLC24A1 49855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 66446289 66446658 66446570 Y DIS3L,DIS3L NA NA NA NA NA MEGF11 97427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr15 67348530 67348587 67348559 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-798K3.2 1004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr15 67378105 67378547 67378289 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 24004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 67385827 67386130 67385989 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 31726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 47790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 67409139 67409556 67409296 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 55038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 67423316 67423661 67423503 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 69215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 67440675 67441024 67440815 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 86574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr15 67467751 67468085 67467918 Y NA NA NA NA NA NA IQCH 77053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA IQCH,AAGAB NA NA NA NA IQCH 28273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 SKOR1 NA NA NA NA SKOR1 22345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 68132952 68133362 68133003 Y PIAS1,CALML4 SKOR1 NA NA NA NA SKOR1 22910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 68207456 68207574 68207516 Y NA NA CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 SKOR1 97414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA CALML4 54729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 68657439 68657730 68657635 Y NA NA NA NA NA NA ITGA11 64771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 69090153 69090340 69090256 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 18220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 69114506 69114876 69114758 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA ANP32A 3270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr15 69385602 69385765 69385704 Y NA LINC00277 NA NA NA NA LINC00277 22336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 69490173 69490404 69490203 Y NA GLCE NA NA NA NA GLCE 39250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 69650842 69650990 69650924 Y NA NA NA NA NA NA KIF23 53595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 69866659 69866776 69866722 Y NA NA NA NA NA NA RP11-279F6.1 113294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr15 70392960 70393272 70393150 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 4445 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 70433556 70433653 70433637 Y TLE3 TLE3 LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 45041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 70435216 70435495 70435418 Y TLE3 TLE3 LOC145837,TLE3,C15orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TLE3 46701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 70641269 70641570 70641504 Y TLE3 NA TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 252754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 70779021 70779387 70779167 Y TLE3 NA KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UACA 274545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 70800143 70800820 70800577 Y NA NA KIF23,RPLP1,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 253112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 71126164 71126470 71126369 Y NA LRRC49,LARP6 NA NA NA NA LRRC49 17108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 71144876 71145062 71144944 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 378 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 71571969 71572363 71572175 Y NA NA NA NA NA NA THAP10 388845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 72124774 72125030 72124885 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 279569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 GRAMD2 NA NA NA NA GRAMD2 30488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 72832767 72832969 72832868 Y PKM2,CELF6,CELF6,ADPGK,ARIH1 NA NA NA NA NA ARIH1 68100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74221354 74221537 74221415 Y NA LOXL1 NA NA NA NA LOXL1 5024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74289381 74289564 74289454 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 4367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA STRA6 89360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74492868 74493054 74492979 Y NA STRA6,CCDC33 NA NA NA NA STRA6 9554 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 74930641 74931010 74930809 Y ARID3B,CSK CLK3 NA NA NA NA CLK3 41800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 75339281 75339878 75339595 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39 PPCDC NA NA NA NA PPCDC 25385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 75400106 75401427 75400997 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39 NA C15orf39,SCAMP5,PPCDC MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C15orf39 84557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75430605 75430778 75430735 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,C15orf39 NA PPCDC,RPP25,C15orf39,SCAMP5 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf39 55206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75470847 75471095 75470955 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39 C15orf39 C15orf39 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C15orf39 14889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 75495544 75495835 75495599 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 9560 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 75939210 75939595 75939262 Y NA SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 76218014 76218024 76218019 Y NA FBXO22 NA NA NA NA FBXO22 23814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 76639629 76639850 76639740 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 76658083 76658321 76658202 Y NA ISL2 NA NA NA NA ISL2 31018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 77579824 77580262 77579914 Y NA NA NA NA NA NA PEAK1 130224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 77785821 77785911 77785867 Y NA NA NA NA NA NA HMG20A 75067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 78110584 78110799 78110731 Y LINGO1 LINGO1 NA NA NA NA LINGO1 443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 79973105 79973417 79973260 Y NA NA TMED3,KIAA1024 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFS 214304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80194397 80194544 80194472 Y ZFAND6,ST20,BCL2A1,ST20-MTHFS MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA MTHFS 6676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80697752 80697924 80697805 Y ARNT2 ARNT2 NA NA NA NA ARNT2 3060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80789855 80790023 80789938 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 95163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 80880322 80880600 80880404 Y ARNT2 NA NA NA NA NA ARNT2 185630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 81217313 81217615 81217464 Y NA NA NA NA NA NA MESDC2 62604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 81590185 81590430 81590333 Y MESDC1,IL16,STARD5 STARD5 NA NA NA NA STARD5 24094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 82398110 82398459 82398277 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 61628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3926 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 83857860 83858021 83857985 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 83862328 83862648 83862488 Y NA HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 12122 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 83992236 83992397 83992320 Y BNC1 NA NA NA NA NA HDGFRP3 117466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 85547085 85547484 85547285 Y NA PDE8A NA NA NA NA PDE8A 25414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 85951204 85951442 85951357 Y AKAP13,PDE8A,AKAP13 AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 29402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 85956762 85957097 85956878 Y AKAP13,PDE8A AKAP13 NA NA NA NA AKAP13 34960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 86088256 86088945 86088625 Y NA RP11-815J21.2 NA NA NA NA RP11-815J21.2 32464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 86111518 86111581 86111550 Y NA RP11-815J21.2 NA NA NA NA RP11-815J21.2 9828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 86247990 86248195 86248102 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 88066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 86267591 86267810 86267701 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 68451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 86547032 86547326 86547179 Y AGBL1 NA NA NA NA NA KLHL25 210771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 89532902 89533939 89533555 Y NA NA MFGE8,ABHD2 IMR90 Hi-C 24141950 MFGE8 78260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 89675943 89676620 89676217 Y ISG20,ABHD2 ABHD2 NA NA NA NA ABHD2 47253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 90402022 90402269 90402146 Y NA ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA AP3S2 33305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90547918 90548344 90548145 Y NA ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 5294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90581471 90581912 90581727 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 38847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90701535 90701765 90701609 Y ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 SEMA4B IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 71 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1,TTLL13 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 91190174 91190180 91190177 Y NA NA NA NA NA NA RP11-387D10.2 68192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 91394443 91394654 91394577 Y CRTC3,VPS33B,UNC45A MAN2A2 BLM,CRTC3,FURIN,FES IMR90 Hi-C 24141950 MAN2A2 48794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA MAN2A2 NA NA NA NA MAN2A2 25604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 92464513 92465010 92464828 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 69588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 92497568 92497970 92497770 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 102643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 92644782 92645127 92644848 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P5 181944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 93347056 93347810 93347183 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 95387780 95387932 95387839 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1479235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 95388455 95388700 95388578 Y NA NA NA NA NA NA NR2F2 1478467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 31918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 99259262 99259477 99259337 Y SYNM NA NA NA NA NA IGF1R 69062 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 99387029 99387216 99387183 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 196829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.42581827780622 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 99914657 99915195 99914962 Y NA NA NA NA NA NA MEF2A 100175 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 100243855 100244145 100244036 Y NA LYSMD4 NA NA NA NA LYSMD4 27621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr15 101631799 101632179 101632024 Y CHSY1 NA NA NA NA NA CHSY1 157958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101711330 101711507 101711419 Y NA NA NA NA NA NA CHSY1 78630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101748030 101748406 101748268 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 41731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101807515 101807673 101807594 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA VIMP 8032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101818299 101818511 101818407 Y NA CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA VIMP 2594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr15 101945887 101945918 101945891 Y OR4F6,OR4F15,PCSK6 NA NA NA NA NA SNRPA1 112400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr15 101979646 101980007 101979833 Y PCSK6 NA NA NA NA NA PCSK6 83398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 124533 124922 124605 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 84 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 154913 155267 155125 Y NHLRC4,HBQ1,HBM RHBDF1,MPG,NPRL3 NA NA NA NA MPG 29907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr16 891857 892147 892002 Y NA NA NA NA NA NA RPUSD1 55460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 1132307 1132794 1132674 Y RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5 SSTR5 NA NA NA NA SSTR5 11551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr16 1232339 1232689 1232437 Y NA CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 31098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 1349375 1349723 1349678 Y NA UBE2I,BAIAP3 NA NA NA NA UBE2I 3825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 1696376 1696557 1696439 Y NA IFT140,CRAMP1L,HN1L NA NA NA NA HN1L 29700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 HS3ST6,NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST6 13288 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 2057211 2057401 2057386 Y NA NDUFB10,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598 423 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA FLYWCH2 NA NA NA NA FLYWCH2 45043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr16 3055976 3056164 3056082 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 10282 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 3058105 3058264 3058160 Y ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,NAT15,MEFV,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1,SRRM2,PRSS33,MMP25 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA TNFRSF12A 8182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 3730332 3730635 3730484 Y NA TRAP1 NA NA NA NA TRAP1 34963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 4422682 4422871 4422704 Y NA PAM16,VASN NA NA NA NA VASN 2833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 4460708 4460927 4460812 Y CORO7 VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA CORO7 12779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 4993356 4993730 4993477 Y PPL PPL UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPL 15012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 7700164 7700333 7700250 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1013207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 8159340 8159643 8159579 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 553897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 8939360 8939674 8939516 Y USP7 TMEM186,CARHSP1 NA NA NA NA CARHSP1 21192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 9208363 9208890 9208559 Y NA C16orf72 NA NA NA NA C16orf72 24858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 10713350 10713596 10713516 Y NUBP1 EMP2 NA NA NA NA EMP2 40795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 11407202 11407368 11407306 Y NA NA CLEC16A IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 59166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11590987 11591512 11591296 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11662178 11662507 11662365 Y NA NA NA NA NA NA LITAF 65730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11677764 11678427 11678146 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF LITAF NA NA NA NA LITAF 49810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 11691003 11692063 11691252 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF LITAF MCF7 ChIA-PET 22265404 LITAF 36174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11707277 11708060 11707802 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF TXNDC11,CLEC16A,LITAF,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 20177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr16 11764274 11764504 11764414 Y ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN NA NA NA NA SNN 4004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 14050567 14050869 14050623 Y MKL2 ERCC4 NA NA NA NA ERCC4 38553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 14051699 14052037 14051838 Y NA ERCC4 NA NA NA NA ERCC4 39685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 14107471 14107706 14107529 Y NA NA MKL2,ERCC4,MIR365A,MIR193B IMR90 Hi-C 24141950 MKL2 55472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 14395683 14396371 14395873 Y MKL2 NA NA NA NA NA MKL2 232505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 14423320 14423633 14423477 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 14424623 14424858 14424825 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 261445 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 15576237 15576428 15576343 Y NA NA NA NA NA NA C16orf45 50085 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 15979661 15979785 15979715 Y NA FOPNL,RPL15P20 NA NA NA NA FOPNL 697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 16070854 16071189 16071093 Y NDE1 RPL15P20,ABCC1 NA NA NA NA ABCC1 29420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr16 16214595 16215019 16214906 Y NDE1,ABCC1 NA ABCC6 IMR90 Hi-C 24141950 NOMO3 109333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 17270464 17270719 17270563 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 946112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 16555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 19532119 19532450 19532314 Y CCP110 RNU4-46P,GDE1,CCP110,C16orf62 NA NA NA NA GDE1 652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 19707699 19708034 19707815 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 17744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 19894494 19895110 19894762 Y CCP110,GPRC5B GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 20863043 20863195 20863109 Y NA LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA LYRM1 45995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1,CRYM NA NA NA NA CRYM 634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 21611842 21611954 21611919 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 5303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 22201170 22202123 22201439 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr16 22203475 22203890 22203761 Y POLR3E EEF2K UQCRC2,POLR3E,EEF2K,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 11713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 22211037 22211162 22211126 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 EEF2K 4441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 24595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 23419986 23420351 23420270 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 42150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 23473263 23473545 23473445 Y SCNN1G,GGA2 COG7 NA NA NA NA COG7 10762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 24363109 24363426 24363114 Y CACNG3 NA NA NA NA NA RBBP6 183588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 25565030 25565326 25565178 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 297778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 27242037 27242327 27242262 Y NA NSMCE1 NA NA NA NA NSMCE1 35788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 27532420 27532769 27532492 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 26465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 28543579 28543953 28543732 Y EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27 CLN3,NUPR1,CCDC101 IL27 IMR90 Hi-C 24141950 NUPR1 4542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 28860977 28861369 28861174 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 5056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 28871082 28871475 28871117 Y NA ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA SH2B1 15161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 29304451 29304624 29304528 Y NA NA NA NA NA NA RRN3P2 220288 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.09355561421491 chr16 30726552 30726958 30726731 Y ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93 RNF40,PHKG2,C16orf93 IMR90 Hi-C 24141950 SRCAP 19022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 30825606 30826012 30825883 Y NA ZNF629 ZNF629,RNF40,MIR4519 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF629 29083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 30994228 30994553 30994360 Y VKORC1,HSD3B7 ORAI3,SETD1A,STX4 NA NA NA NA SETD1A 27613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM NA NA NA NA NA PYCARD 52214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 46863838 46864241 46863904 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 47175603 47175949 47175815 Y NETO2 NA NA NA NA NA NETO2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 47526942 47527306 47527022 Y PHKB PHKB,ITFG1 NA NA NA NA ITFG1 30882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 47669133 47669265 47669199 Y NA NA NA NA NA NA ITFG1 173073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 49542422 49542557 49542490 Y ZNF423 NA NA NA NA NA CBLN1 228680 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 49656058 49656138 49656098 Y NA NA NA NA NA NA CBLN1 342316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 49803426 49803551 49803489 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 294301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 52489873 52490156 52490047 Y NA NA NA NA NA NA TOX3 89558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 52526808 52526987 52526898 Y TOX3,TOX3 NA NA NA NA NA TOX3 52727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr16 52564240 52564587 52564414 Y TOX3 TOX3 NA NA NA NA TOX3 15127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 52579555 52579603 52579574 Y NA TOX3 NA NA NA NA TOX3 111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 53075249 53075847 53075790 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 11098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 53077641 53077824 53077723 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 9121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 53915459 53915524 53915492 Y NA NA NA NA NA NA FTO 179584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 56985400 56985562 56985481 Y NA HERPUD1,NLRC5 CETP IMR90 Hi-C 24141950 HERPUD1 21440 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 57338123 57338348 57338237 Y NA PLLP NLRC5,CPNE2,PLLP,CIAPIN1,FAM192A,RSPRY1,ARL2BP,COQ9,CX3CL1,CCL22,POLR2C,GPR114,CCDC102A IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 21524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 57622732 57623027 57622920 Y GPR114 GPR56 NA NA NA NA GPR56 19537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 57927623 57928192 57928041 Y GPR97,ZNF319 KIFC3 NA NA NA NA KIFC3 32666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 58159860 58159971 58159905 Y C16orf80 C16orf80 NA NA NA NA C16orf80 1383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 58555953 58556233 58556187 Y NA NA NA NA NA NA CNOT1 105557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 66709355 66709374 66709366 Y DYNC1LI2 CMTM4 NA NA NA NA CMTM4 19236 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2,CDH16 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 66988106 66988414 66988274 Y NA CDH16,RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA CES3 4726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 67011641 67011860 67011695 Y NA FAM96B,CES2,CES3,CBFB NA NA NA NA CES3 18501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 4999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8,TMED6 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TMED6,TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 69506405 69506529 69506498 Y NA CYB5B NA NA NA NA CYB5B 49977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.85484856483852 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr16 70464772 70465160 70465031 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 5980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 70467076 70467247 70467197 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 3893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 70759138 70759547 70759396 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L,IL34 IMR90 Hi-C 24141950 MTSS1L 41169 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 70783169 70783447 70783290 Y NA VAC14 NA NA NA NA VAC14 49617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 71734305 71734386 71734346 Y PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 22218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA PMFBP1 250381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 72882732 72883050 72882991 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 208547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 73090044 73090191 73090091 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 1406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 73102477 73102709 73102578 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 10880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 74772099 74772485 74772392 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 34244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 74774732 74775110 74775064 Y FA2H MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 31619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 74777612 74777799 74777727 Y NA MLKL,FA2H NA NA NA NA FA2H 28930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 75034712 75035106 75034867 Y NA ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 78199099 78199491 78199298 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 67789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 78564720 78564924 78564822 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 433410 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 78565966 78565983 78565974 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 434656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 80648932 80649251 80648956 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 76301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 80971971 80972227 80972105 Y CENPN NA NA NA NA NA CENPN 65876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81026963 81027197 81027054 Y NA CENPN,ATMIN NA NA NA NA CENPN 10906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81693209 81693442 81693326 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 77260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81732062 81732263 81732080 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 38439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 82071348 82071461 82071424 Y HSD17B2 HSD17B2 NA NA NA NA HSD17B2 4739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 82172740 82172851 82172799 Y SDR42E1 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 28980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr16 82229421 82230075 82229754 Y PLCG2,MPHOSPH6 MPHOSPH6 HSD17B2 IMR90 Hi-C 24141950 MPHOSPH6 27590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 83029672 83029964 83029912 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 371264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 83988181 83988500 83988282 Y NA OSGIN1 NA NA NA NA OSGIN1 8294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 84130238 84130438 84130330 Y NA MBTPS1,HSDL1 NA NA NA NA MBTPS1 18073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 84785578 84785829 84785712 Y KIAA0513,COTL1 NA CRISPLD2,ZDHHC7 IMR90 Hi-C 24141950 USP10 53994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 84855927 84856178 84856013 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 4337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.56936370835467 chr16 85415557 85415973 85415759 Y NA NA LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 305706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85557334 85557622 85557547 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 164057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 85569070 85569366 85569223 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 152313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85569816 85569916 85569832 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 151763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 85570517 85570742 85570617 Y NA NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 150937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr16 85600571 85600865 85600718 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 120814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85603305 85603679 85603564 Y KIAA0182 NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 118000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 85606114 85606473 85606294 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 115206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 86609499 86609840 86609550 Y FOXC2 MTHFSD,FOXC2 NA NA NA NA FOXC2 10642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 364029 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 386553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 87428114 87428209 87428177 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 4366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87843209 87843416 87843290 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 45611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87889826 87890140 87890011 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 10954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 88366840 88367234 88367013 Y BANP,BANP,ZC3H18,CYBA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 150491 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 88836450 88836610 88836518 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 13009 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr16 88839181 88839507 88839410 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 10112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 88991704 88992157 88991819 Y NA CBFA2T3 TRAPPC2L,GALNS MCF7 ChIA-PET 22265404 CBFA2T3 49455 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89086731 89086969 89086798 Y NA CBFA2T3 ACSF3,CBFA2T3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CBFA2T3 45119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89474257 89474602 89474526 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 80367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 89557852 89558189 89558050 Y NA ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 2527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 473610 473838 473725 Y FAM101B NA NA NA NA NA RPS4XP17 84949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 818912 819288 819089 Y NA NA NA NA NA NA NXN 61722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 990722 991295 990801 Y NA NA NA NA NA NA TIMM22 92365 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF2,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 1986889 1987344 1987111 Y MNT,SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 31441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 2074761 2075171 2074968 Y NA NA NA NA NA NA HIC1 119313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2075592 2075724 2075696 Y HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 120144 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2078039 2078451 2078156 Y TSR1,HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA HIC1 122591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2439333 2439522 2439421 Y NA METTL16 PAFAH1B1,METTL16,LOC284009 IMR90 Hi-C 24141950 METTL16 26148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 2614073 2614260 2614119 Y KIAA0664 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 119569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 2771532 2771614 2771573 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 277028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 3504662 3504760 3504711 Y NA SHPK,CTNS TRPV3 IMR90 Hi-C 24141950 SHPK 32856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 3534813 3534835 3534825 Y OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2 SHPK,CTNS,TAX1BP3 TRPV1 IMR90 Hi-C 24141950 SHPK 2781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 3706608 3706865 3706766 Y NA ITGAE,C17orf85 NA NA NA NA ITGAE 4071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 4386875 4387235 4387089 Y NA SPNS2 NA NA NA NA SPNS2 12898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 4437372 4437692 4437444 Y NA SPNS2,MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 19234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 5245508 5245890 5245691 Y NA NA NA NA NA NA RABEP1 61950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 5623535 5623758 5623647 Y NA NA LOC339166,AIPL1 IMR90 Hi-C 24141950 DERL2 235404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 6829288 6829561 6829425 Y SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1 NA ALOX12P2,ASGR1 IMR90 Hi-C 24141950 AC027763.2 84107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 7607455 7607852 7607490 Y NA WRAP53,TP53,EFNB3 NA NA NA NA EFNB3 935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.71130313429008 chr17 7781804 7782205 7782005 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1 NA NA NA NA CHD3 3919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 8029074 8029494 8029268 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 3664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 8095551 8095762 8095658 Y KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2 PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 3987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 8649167 8649702 8649446 Y ODF4,SPDYE4,MFSD6L,CCDC42 NA NA NA NA NA MYH10 117088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 9967021 9967410 9967262 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 192669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 13835210 13835376 13835282 Y HS3ST3B1 NA NA NA NA NA COX10-AS1 135436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 14206578 14206754 14206653 Y NA HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 4178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 14651633 14651936 14651698 Y NA RPS18P12 HS3ST3B1,HS3ST3A1,COX10 IMR90 Hi-C 24141950 RPS18P12 44782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 15869590 15869983 15869922 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 23359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 16189250 16189597 16189494 Y NCOR1,TRPV2 NA NA NA NA NA CENPV 65373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 16191035 16191327 16191109 Y TRPV2 NA CENPV IMR90 Hi-C 24141950 CENPV 63643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 16249780 16250130 16249956 Y CENPV CENPV,UBB NA NA NA NA CENPV 4840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 16275124 16275367 16275237 Y NA CENPV,UBB,TRPV2 NA NA NA NA UBB 6745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A NA NA NA NA FAM211A 45443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17098696 17098916 17098799 Y MPRIP,RAI1,PEMT,NT5M,MED9,COPS3,PLD6,FLCN PLD6,FLCN NA NA NA NA PLD6 8713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17163211 17163219 17163215 Y NA FLCN,COPS3,NT5M NA NA NA NA COPS3 19388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17208754 17209324 17209000 Y PLD6,COPS3,COPS3,NT5M COPS3,NT5M NA NA NA NA NT5M 4105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 17617254 17617499 17617388 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 34467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17644687 17645051 17644950 Y TOM1L2,LRRC48,LLGL1 NA NA NA NA NA RAI1 61900 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17654001 17654381 17654093 Y NA NA NA NA NA NA RAI1 71214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 17752508 17752712 17752608 Y RASD1,PEMT SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 14183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 18825562 18825708 18825647 Y FAM83G,TRIM16L NA NA NA NA NA FAM83G 80409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 19268894 19269122 19269008 Y NA MAPK7,B9D1,MFAP4 NA NA NA NA MAPK7 9912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 ALDH3A1 NA NA NA NA ALDH3A1 6134 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 19834604 19834673 19834639 Y NA AKAP10 NA NA NA NA AKAP10 44983 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 19994905 19995311 19995047 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 84248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 25572576 25572861 25572643 Y WSB1 WSB1 WSB1,KSR1,MIR4522 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 46241 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 25620233 25620423 25620280 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 1131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 25659360 25659787 25659571 Y LGALS9,WSB1 WSB1 NA NA NA NA WSB1 40258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 25821729 25821988 25821800 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 40059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 25823612 25823763 25823676 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 41942 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 25856308 25856397 25856353 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 74638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 25858035 25858294 25858209 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 76365 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 26216019 26216352 26216295 Y NA NA NA NA NA NA NLK 150411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 26929593 26929935 26929764 Y TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119 PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100 NA NA NA NA SPAG5 5296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27405810 27406234 27406188 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 99196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27439260 27439514 27439393 Y NA NA NA NA NA NA MYO18A 65916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 27966112 27966641 27966332 Y NA GIT1,CORO6 NA NA NA NA CORO6 18187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 28049478 28050072 28049903 Y NUFIP2,TAOK1,SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 101553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 28431711 28432027 28431733 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 8512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 28672650 28672985 28672901 Y NSRP1,CPD,CPD CPD NSRP1,TMIGD1,GOSR1,CPD,EFCAB5,MIR3184,SLC6A4,BLMH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPD 30938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 79002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 29820298 29820473 29820377 Y EVI2B,EVI2A,SUZ12 NA NA NA NA NA RAB11FIP4 103656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 175492 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 30723443 30723679 30723561 Y NA C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 45600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 30726822 30727202 30727012 Y NA PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 42077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 33373543 33373969 33373834 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830 RFFL NA NA NA NA RFFL 40369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 33577736 33577912 33577824 Y ZNF830,RFFL,SLFN5 SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 9681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 33786708 33787098 33786905 Y NA SLFN12,SLFN13 NA NA NA NA SLFN13 12852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 35492690 35492856 35492817 Y NA NA NA NA NA NA AATF 188515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 36062721 36062883 36062777 Y DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 40323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 36073088 36073441 36073335 Y ACACA,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 29765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 36102823 36103051 36102995 Y ACACA,DDX52,HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA RP11-115K3.1 155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr17 36103612 36103841 36103732 Y HNF1B RP11-115K3.1,HNF1B NA NA NA NA HNF1B 375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.90323237655901 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 37024501 37024874 37024707 Y NA CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19,STAC2 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 37831191 37831499 37831297 Y GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2 STARD3,PNMT,ERBB2,PGAP3 NA NA NA NA PNMT 8957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 37896808 37897181 37897022 Y GRB7,GRB7,GRB7,GRB7 PGAP3,MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 4628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1,GRB7 NA NA NA NA GRB7 18231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 38227745 38227903 38227871 Y NEUROD2,THRA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 12277 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38229285 38229466 38229392 Y GSDMB THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 13817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38264417 38264842 38264667 Y WIPF2,RARA,RARA,NR1D1 MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 9439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38464298 38464708 38464402 Y MSL1,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38466457 38466702 38466562 Y IKZF3 CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 3013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38470934 38471197 38471090 Y IKZF3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA,GJD3 NA NA NA NA RARA 7490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38488015 38488253 38488146 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA,GJD3 NA NA NA NA RARA 24571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 38509274 38509600 38509311 Y NA RARA,GJD3 NA NA NA NA GJD3 8467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 38705273 38706158 38705806 Y GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA SMARCE1 96602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 39091937 39092186 39091988 Y KRTAP2-1 KRT23 NA NA NA NA KRT23 51 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 39703962 39704520 39704217 Y NA KRT15,KRT19 NA NA NA NA KRT19 21402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 39832714 39833014 39832798 Y RAB5C,NKIRAS2,DNAJC7,DHX58,EIF1 EIF1 SMARCE1,KRT222,KRT28,KRT26,KRT27,TMEM99,KRT10,KRT20,KRTAP3-2,KRTAP3-3,EIF1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF1 10123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 40071903 40071935 40071919 Y NA ACLY,TTC25,CNP NA NA NA NA ACLY 12860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 40628029 40628344 40628111 Y NA ATP6V0A1,AC067852.1 NA NA NA NA ATP6V0A1 19167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 41441650 41441788 41441734 Y NA ARL4D NA NA NA NA ARL4D 32539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 41686923 41687254 41687162 Y NA ETV4 DHX8,MEOX1,SOST IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 31935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 41974490 41974868 41974680 Y LSM12,MPP2 MPP2 CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 MPP2 10200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42061095 42061375 42061233 Y NA TMEM101 NA NA NA NA TMEM101 37939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,ASB16,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,ASB16,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA ASB16 73 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 ASB16,TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42861642 42861917 42861696 Y NA GJC1 NA NA NA NA GJC1 44267 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 42919802 42920006 42919936 Y NA GJC1 NA NA NA NA GJC1 13618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 43230123 43230516 43230320 Y NA ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2 NA NA NA NA HEXIM2 5551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 43249989 43250354 43250021 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1 NA NA NA NA HEXIM2 13922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 43370974 43371161 43371063 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 MAP3K14 NA NA NA NA MAP3K14 21253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44135698 44135955 44135827 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 165950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44198056 44198387 44198212 Y STH,KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 228308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44232468 44232502 44232485 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 262720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 45282976 45283116 45283053 Y NA CDC27,ITGB3 MYL4 K562 ChIA-PET 22265404 CDC27 18188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 TBX21 NA NA NA NA TBX21 29822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 PRR15L,CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA AC090627.1 80297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 46643791 46644035 46643913 Y NA HOXB-AS1,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 11438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46644443 46644754 46644601 Y HOXB9,HOXB8,HOXB6 HOXB-AS1,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 10719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46647653 46647800 46647722 Y HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3 HOXB-AS1,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 7673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS1,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 46696942 46697254 46696999 Y NA HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 4585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 47465642 47465862 47465766 Y ZNF652,ZNF652,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 24384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 47738461 47738630 47738545 Y NA SPOP,SLC35B1 NA NA NA NA SPOP 14966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 DLX3,ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 48716691 48717083 48716761 Y CHAD,SPAG9 ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 48726648 48726741 48726695 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 16510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 48908408 48908498 48908454 Y NA TOB1 TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483 IMR90 Hi-C 24141950 TOB1 34841 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 48942663 48943085 48943016 Y NA TOB1 NA NA NA NA TOB1 254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 48981540 48981884 48981711 Y RSAD1 TOB1,RP11-700H6.1 TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-700H6.1 38190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 49027288 49027482 49027366 Y NA RP11-700H6.1 NA NA NA NA RP11-700H6.1 7214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53047778 53047982 53047880 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA COX11 3632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53494121 53494283 53494202 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 3070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53497797 53498268 53498065 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53502563 53502763 53502677 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 5210 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 53654184 53654435 53654393 Y NA NA PCTP IMR90 Hi-C 24141950 MMD 156831 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 54997241 54997360 54997297 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 7842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 55456674 55456859 55456690 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 125462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 55504815 55504992 55504904 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 173603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 55568668 55569013 55568840 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 237456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 55749375 55749748 55749439 Y NA NA NA NA NA NA MRPS23 175669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 55763716 55764071 55763861 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 161346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56015325 56015755 56015655 Y CUEDC1 CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 14929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 36484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56468859 56469318 56469005 Y RNF43 SUPT4H1,RNF43 NA NA NA NA RNF43 23638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 57698412 57698732 57698592 Y YPEL2,RNFT1,VMP1 CLTC NA NA NA NA CLTC 3193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 57839956 57840355 57840071 Y RNFT1 NA NA NA NA NA PTRH2 56969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 57862470 57862813 57862554 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 53814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr17 57866887 57867071 57866969 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 49556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57881973 57882438 57882250 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 34189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 33945 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 57904186 57904344 57904253 Y VMP1,CA4 MIR21 NA NA NA NA MIR21 12283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.80646475311803 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 57922999 57923843 57923122 Y PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6 MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 6372 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 57925185 57925429 57925290 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 8558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 57930626 57931026 57930760 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 13999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 57932982 57933345 57933242 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 16355 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 58220284 58220524 58220391 Y VMP1,USP32,PPM1D,CA4 CA4 HEATR6,PPM1D,USP32,APPBP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CA4 4773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 58228293 58228479 58228403 Y CA4 CA4 NA NA NA NA CA4 2996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 59434096 59434461 59434196 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 40796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 60058924 60058941 60058933 Y NA NA NA NA NA NA INTS2 55547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 60247601 60248070 60247921 Y MED13 NA NA NA NA NA MED13 106958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 60856273 60856623 60856561 Y EFCAB3 NA NA NA NA NA MRC2 153511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 60869162 60869387 60869275 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 166400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 61352706 61353153 61352892 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 168586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 61748394 61748578 61748486 Y NA LIMD2 NA NA NA NA LIMD2 27954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 62102264 62102610 62102504 Y MAP3K3,LIMD2,DDX5,CEP95,ICAM2 ICAM2 NA NA NA NA ICAM2 6270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 62151740 62151983 62151921 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,C17orf60,DDX5,ERN1 NA NA NA NA NA ERN1 54196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 62174589 62174791 62174690 Y NA ERN1,SNORD104 ICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 ERN1 31388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 62201742 62201923 62201916 Y DDX5,ERN1 ERN1,SNORD104 NA NA NA NA ERN1 4256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 62409604 62410133 62409977 Y ICAM2,ERN1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 62484790 62485162 62485096 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 5992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 62491373 62491767 62491605 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 63043139 63043174 63043152 Y NA GNA13 NA NA NA NA GNA13 7783 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 63044063 63044405 63044261 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 6552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 63060882 63060952 63060917 Y GNA13 GNA13 GNA13,RGS9 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 9925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 63624560 63624814 63624604 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 68795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr17 64128284 64128318 64128301 Y CEP112,CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 57884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64380133 64380302 64380218 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 83379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64544411 64544774 64544437 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 247657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64544919 64545280 64544935 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 248165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64646348 64646488 64646431 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 312538 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 64669772 64670163 64669988 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 288863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 64947420 64948018 64947947 Y NA CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 11008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 64948296 64948612 64948339 Y CACNG4 CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 10414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 65130860 65131108 65130984 Y NA NA NA NA NA NA HELZ 108997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 65487114 65487504 65487449 Y HELZ,PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA NA PITPNC1 115539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 65525014 65525424 65525241 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 153439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 65897183 65897370 65897273 Y NA NA NA NA NA NA BPTF 77543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 66041204 66041633 66041268 Y NA KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 11569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 66301406 66301537 66301464 Y BPTF,SLC16A6 ARSG,SLC16A6 WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A6 15998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 66314385 66314893 66314731 Y BPTF,SLC16A6 SLC16A6 NA NA NA NA SLC16A6 28977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 66382740 66382853 66382787 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 68801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 66434083 66434422 66434387 Y NA WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 17232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 67139403 67139524 67139506 Y NA ABCA6 NA NA NA NA ABCA6 3374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 67270709 67270940 67270826 Y NA ABCA10 NA NA NA NA ABCA10 31722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 67463547 67463710 67463574 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 54708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 69260870 69260872 69260871 Y NA NA NA NA NA NA LOC124685 354247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70122851 70122907 70122879 Y NA SOX9 NA NA NA NA SOX9 7690 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70147771 70147892 70147832 Y NA SOX9 SOX9,LOC100499467 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOX9 32610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70395717 70396043 70395724 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 225327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70398105 70398184 70398145 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 223186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70416079 70416357 70416132 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 205013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr17 70421948 70422074 70421986 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 199296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70426216 70426228 70426222 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 195142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 70443498 70443728 70443613 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 177642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70462396 70462597 70462589 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 158773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70497980 70498445 70498203 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 122925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 70511484 70511781 70511663 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 109589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70514986 70515384 70515137 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 105986 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70577972 70578326 70578149 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 43044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70585924 70586379 70586141 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 34991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70628447 70628581 70628499 Y NA RPL32P33,LINC00511 NA NA NA NA LINC00511 6030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA LINC00511 77797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 70939903 70940361 70940187 Y SSTR2,C17orf80 NA NA NA NA NA SLC39A11 146490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 71024945 71025268 71025108 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 61583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 71301216 71301553 71301269 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 4761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 71305759 71306422 71306099 Y NA NA NA NA NA NA CDC42EP4 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 72189661 72189728 72189666 Y KIF19 RPL38,CTD-2514K5.2,TTYH2 NA NA NA NA RPL38 7993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 72426026 72426159 72426078 Y DNAI2,GPRC5C GPRC5C NA NA NA NA GPRC5C 7036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 72745955 72746124 72746086 Y NA CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 73009835 73009966 73009891 Y NA CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 3070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 73074678 73074996 73074848 Y LLGL2,C17orf28,ARMC7 KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7 NA NA NA NA SLC16A5 6826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 5634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 73120387 73120767 73120528 Y GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1 NA NA NA NA NT5C 5123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73304838 73305233 73305159 Y UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 8177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73426423 73426691 73426652 Y MRPS7 GRB2,KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 8549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73456096 73456218 73456157 Y KIAA0195 KIAA0195 NA NA NA NA KIAA0195 20856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73545364 73545732 73545559 Y NA CASKIN2,TSEN54,LLGL2 NA NA NA NA LLGL2 26203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 74134600 74134832 74134764 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr17 74230873 74231079 74230976 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 3375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.37743446608573 chr17 74526422 74526750 74526585 Y CYGB RHBDF2,CYGB,SNORD1B NA NA NA NA CYGB 18507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 74664017 74664029 74664023 Y NA ST6GALNAC1,MXRA7 NA NA NA NA ST6GALNAC1 26097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 74713062 74713219 74713141 Y NA MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA JMJD6 7647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 75170939 75171192 75170955 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 90141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75251434 75251777 75251766 Y NA SEPT9 SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEPT9 22874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75278845 75279720 75279369 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 4194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 75281264 75281453 75281354 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 6613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 8052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 75284936 75285118 75285041 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 10285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 75318206 75318391 75318316 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 43555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75318595 75318736 75318679 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 43944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr17 75370768 75371003 75370901 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 96117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 75388510 75388802 75388677 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 113859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75453817 75454002 75453871 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 179166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75461366 75461740 75461543 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 186715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA NA TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMC6 171692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 12.7516569229454 chr17 76254688 76254992 76254867 Y TNRC6C,TMC6,TMC8,TMC6,C17orf99,SOCS3,PGS1 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 46421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 76312866 76313241 76313131 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 SOCS3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 40917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 76409170 76409735 76409347 Y CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1 PGS1 NA NA NA NA PGS1 36449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 76929562 76929807 76929665 Y CANT1 TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 76930060 76930674 76930419 Y NA TIMP2,LGALS3BP TIMP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TIMP2 10591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 77342987 77343267 77343127 Y RBFOX3 NA NA NA NA NA ENGASE 273966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr17 77784894 77785612 77785337 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 11412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr17 77803693 77803802 77803748 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 7426 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 77817686 77818105 77817998 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 6458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 77905324 77905507 77905415 Y NA NA NA NA NA NA CBX4 94096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 77952311 77952542 77952488 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 55105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 77965696 77966573 77966281 Y CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 41074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr17 77970749 77971301 77971166 Y CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 36346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 77979653 77979899 77979776 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 27748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78121490 78121818 78121740 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA EIF4A3 2508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78228476 78228940 78228764 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 3725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 78289864 78290143 78290056 Y NPTX1 NA LOC100294362,ENDOV IMR90 Hi-C 24141950 RNF213 57199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr17 78459744 78459968 78459843 Y RPTOR NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 10101 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78734428 78734929 78734574 Y C17orf56 NA NA NA NA NA RPTOR 217809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 78747875 78748340 78748187 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 215058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78844194 78844503 78844331 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 118895 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 78864265 78865139 78864341 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 98259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79011561 79011905 79011851 Y NA CHMP6,BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 4613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79126074 79126501 79126440 Y C17orf56 NA NA NA NA NA AZI1 68298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10,LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 35205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 36737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 79318144 79318304 79318226 Y TMEM105,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 37096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38277 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79339701 79340108 79339894 Y NA NA SLC38A10,NPLOC4 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00482 58653 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA LINC00482 79360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 79365060 79367456 79365203 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 84012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79369574 79370687 79370597 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 88526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 89706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr17 79397073 79397461 79397298 Y MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS NA NA NA NA NA ACTG1 91412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79401220 79401344 79401240 Y NA NA NA NA NA NA ACTG1 87529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 ACTG1 NA NA NA NA ACTG1 37315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 79779684 79779899 79779792 Y NA GCGR,FAM195B,P4HB,ARHGDIA NA NA NA NA FAM195B 9279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 79949658 79950000 79949804 Y SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1 NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR NA NA NA NA ASPSCR1 16975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80245965 80246238 80246057 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 CSNK1D CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1D 16358 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80255299 80255755 80255478 Y SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 25692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 80296831 80297318 80297085 Y NA TEX19 SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TEX19 17805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr17 80546229 80546455 80546368 Y NA NA NA NA NA NA FOXK2 70640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80594524 80594906 80594740 Y UTS2R,WDR45L NA NA NA NA NA RAB40B 59698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr17 80834580 80834819 80834710 Y NA NA NA NA NA NA TBCD 126640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr17 80845276 80845458 80845382 Y C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL NA NA NA NA NA TBCD 137336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 235900 236290 236249 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 29760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 908602 908952 908777 Y NA NA NA NA NA NA YES1 98055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 2031840 2031857 2031849 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 537651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 2223503 2223515 2223509 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 345993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 2897860 2897994 2897926 Y NA NA NA NA NA NA EMILIN2 52832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 2979905 2979994 2979950 Y SMCHD1 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 31319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 3015219 3015501 3015351 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,METTL4,EMILIN2 LPIN2 LPIN2 K562 ChIA-PET 22265404 LPIN2 3906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYOM1,MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 3385002 3385317 3385084 Y NA TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 24289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 3650005 3650381 3650193 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 240399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 3665613 3666165 3665884 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 256007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr18 3816827 3817202 3817015 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 407221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 8661812 8662039 8661951 Y NA NA ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 54369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 8704091 8704364 8704199 Y CCDC165 NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 96648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 8730480 8730718 8730581 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 123037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 8803155 8803225 8803221 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 195712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9612296 9612535 9612373 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9711641 9712077 9711750 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 5479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9742767 9742849 9742828 Y VAPA,RAB31 RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 36605 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 9824351 9824715 9824532 Y PPP4R1,VAPA,RAB31 NA TXNDC2,VAPA IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 87284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9899069 9899359 9899167 Y NA VAPA NA NA NA NA VAPA 12640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 10057757 10058101 10057857 Y NAPG,RAB31,VAPA NA APCDD1,VAPA,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 145758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 10141033 10141178 10141087 Y NA NA APCDD1,NAPG IMR90 Hi-C 24141950 VAPA 229034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr18 11995516 11995787 11995574 Y NA IMPA2 NA NA NA NA IMPA2 16492 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 12059774 12060081 12059918 Y NA NA GNAL,IMPA2 IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 80750 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 12306995 12307375 12307158 Y CHMP1B TUBB6 NA NA NA NA TUBB6 1327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 12408700 12408821 12408736 Y NA AFG3L2,SLMO1 SPIRE1 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO1 2805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 12606965 12607268 12607096 Y PTPN2,SPIRE1 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 48774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr18 12763760 12763785 12763774 Y CEP192,C18orf1 NA PTPN2 IMR90 Hi-C 24141950 CEP76 62984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 13137958 13138425 13138153 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 148597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr18 13217020 13217525 13217240 Y NA NA NA NA NA NA CEP192 227659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 20046739 20046926 20046743 Y GATA6 NA GATA6,CTAGE1 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 299335 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 20263132 20263811 20263406 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 112413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 20291430 20291660 20291501 Y NA NA GATA6,CABLES1 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 84564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 21002815 21003000 21002900 Y RBBP8,RBBP8,NPC1,C18orf8 TMEM241,RIOK3 NA NA NA NA TMEM241 12925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 21165246 21165762 21165429 Y C18orf8,NPC1 NPC1 NA NA NA NA NPC1 384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 21198837 21198991 21198936 Y NA NPC1,ANKRD29 NA NA NA NA NPC1 33975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 21463540 21463749 21463607 Y NA NA NA NA NA NA TTC39C 106988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 24120849 24120961 24120907 Y NA NA NA NA NA NA KCTD1 114404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 24536394 24536497 24536444 Y KCTD1,KCTD1,AQP4,AQP4,CHST9 NA NA NA NA NA CHST9 226784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 28786845 28787168 28787084 Y DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1 NA DSC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 DSC2 106467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr18 28981595 28981685 28981659 Y NA NA NA NA NA NA DSG2 94321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr18 32291109 32291369 32291156 Y MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 219855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 32399644 32399985 32399810 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 154907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 32558962 32559433 32559316 Y ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2 MAPRE2 NA NA NA NA MAPRE2 4070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr18 33275532 33275916 33275719 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 116451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 33311016 33311295 33311162 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 151935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 33577061 33577192 33577127 Y NA C18orf21 NA NA NA NA C18orf21 27015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 34160410 34160525 34160482 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 246544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 37629293 37629563 37629339 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 715654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 39840158 39840520 39840205 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 306987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 42419261 42419416 42419316 Y NA NA NA NA NA NA SETBP1 161123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 42864917 42865132 42865025 Y NA NA NA NA NA NA SLC14A1 436960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 43266827 43267110 43266932 Y NA SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 34982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 5511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 43407687 43408063 43407797 Y PSTPIP2,EPG5 NA NA NA NA NA SLC14A1 105595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 44370223 44370563 44370393 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA PIAS2 127560 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 44372138 44372406 44372272 Y RNF165,PIAS2 NA NA NA NA NA PIAS2 125717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 45353824 45354074 45353943 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 101441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr18 46072108 46072320 46072224 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 8691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46253142 46253362 46253168 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 189725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46259226 46259357 46259315 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 195809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46461141 46461770 46461393 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 13311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 9139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 46523478 46523814 46523611 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 48397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46740928 46741364 46741195 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 244353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 46946352 46946456 46946404 Y NA DYM NA NA NA NA DYM 39261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 47824396 47824519 47824438 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC1 11722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 47834061 47834491 47834223 Y CCDC11,MBD1,MBD1 CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21387 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 47834587 47834811 47834691 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 CCDC11,CXXC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CXXC1 21913 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 51736292 51736523 51736417 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 12635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 54122368 54122661 54122581 Y NA NA NA NA NA NA WDR7 193913 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 55095005 55095410 55095044 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 5507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr18 55101559 55101949 55101758 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 55102016 55102207 55102112 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 1099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 55108186 55108329 55108231 Y NA ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr18 55108837 55109086 55108936 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 7920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 55109141 55109496 55109318 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 8224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr18 55250571 55250884 55250819 Y FECH FECH,NARS NA NA NA NA FECH 1120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 55890970 55891630 55891068 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 181371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 56194097 56194141 56194127 Y NEDD4L,MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 71722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 56208933 56209328 56209119 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 56535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 56537923 56538093 56537956 Y ZNF532 ZNF532 NA NA NA NA ZNF532 10091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 56579254 56579314 56579284 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 51422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 60118389 60118639 60118544 Y KIAA1468,ZCCHC2 NA PHLPP1,ZCCHC2 IMR90 Hi-C 24141950 ZCCHC2 69601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 60864948 60865713 60864996 Y PHLPP1,VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 119648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 60877535 60878009 60877922 Y SERPINB12,BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 107352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 60905272 60905593 60905493 Y NA NA NA NA NA NA BCL2 79768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 65434285 65434424 65434346 Y NA NA NA NA NA NA CDH19 1164910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 67616100 67616494 67616353 Y CD226 NA NA NA NA NA RTTN 254687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 68044126 68044452 68044254 Y NA NA RTTN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 89989 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 71681167 71681534 71681419 Y CNDP2 NA NA NA NA NA TIMM21 132212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 72452985 72453338 72453047 Y C18orf63 NA NA NA NA NA ZNF407 189879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 72676291 72676559 72676424 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 242744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 72706567 72706772 72706660 Y ZNF407,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 212531 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74767033 74767545 74767189 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 234470 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74779066 74780013 74779875 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 246503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74803559 74803662 74803615 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 270996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74829789 74830209 74830033 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 74841905 74842663 74842144 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 309342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 76955177 76955415 76955295 Y NA NA NA NA NA NA ATP9B 127892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr18 77616666 77616803 77616722 Y NA NA KCNG2,CTDP1,PQLC1 IMR90 Hi-C 24141950 PQLC1 92861 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C NA NA NA NA NA MIER2 52147 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 675402 675838 675677 Y FSTL3 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA FSTL3 1010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 752652 753043 752777 Y PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21 PALM,PTBP1,MIR4745 NA NA NA NA PTBP1 42032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 8.65970731334351 chr19 925071 925217 925123 Y NA MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A NA NA NA NA ARID3A 1290 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 934999 935434 935086 Y MIDN,CIRBP MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A,WDR18 NA NA NA NA ARID3A 11218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1085284 1085426 1085350 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2 ABCA7,POLR2E,GPX4 NA NA NA NA POLR2E 8172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1101850 1102062 1101942 Y C19orf6,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E NA NA NA NA GPX4 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1126082 1126504 1126271 Y MIDN,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 24146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr19 1400453 1400832 1400746 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA GAMT 884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 1672372 1672532 1672504 Y NA TCF3 TCF3,ONECUT3,REXO1,LOC100288123,ATP8B3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TCF3 21768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1725719 1725877 1725796 Y C19orf26,MUM1,APC2 ONECUT3 TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1 IMR90 Hi-C 24141950 ONECUT3 24495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2032329 2032652 2032524 Y LINGO3,C19orf35 BTBD2,MKNK2 NA NA NA NA BTBD2 228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 2059605 2060167 2060113 Y REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 10362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 2094360 2094773 2094654 Y GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A MKNK2 NA NA NA NA MOB3A 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2168890 2169464 2169082 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 6426 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 2189110 2189498 2189160 Y NA DOT1L,AP3D1,SF3A2,PLEKHJ1 NA NA NA NA AP3D1 26646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 2391233 2391395 2391314 Y NA TIMM13 NA NA NA NA TIMM13 34497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 2507206 2507458 2507335 Y DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B GADD45B NA NA NA NA GADD45B 33086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 2543618 2543970 2543682 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GADD45B 69498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 2578988 2579272 2579256 Y TMPRSS9 NA NA NA NA NA GADD45B 104868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2588002 2588286 2588143 Y LINGO3,GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA GADD45B 113882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 2599036 2599584 2599134 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA DIRAS1 119832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 2624614 2624929 2624757 Y GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA DIRAS1 94487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 3338656 3338812 3338733 Y NA NFIC ZNF77,CELF5,NFIC,DOHH,FZR1,C19orf77,C19orf29-AS1,GIPC3,TBXA2R,C19orf29,PIP5K1C,APBA3,MRPL54 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFIC 18749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 3367171 3367852 3367502 Y NFIC,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 9610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 3603456 3603548 3603535 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 1290 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 3607748 3607951 3607883 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 2910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4051584 4052099 4051914 Y CCDC94 PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4088191 4088358 4088250 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 23248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4575288 4575908 4575613 Y CCDC94,TICAM1,SEMA6B PLIN5,LRG1 EBI3,CCDC94,ANKRD24,TNFAIP8L1,C19orf10 IMR90 Hi-C 24141950 LRG1 36802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 MIR7-3HG,FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 5880679 5880918 5880789 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC NA NA NA NA FUT5 20880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 6062045 6062746 6062500 Y TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 85892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 6087956 6088249 6088075 Y PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2 NA RANBP3,LOC100128568 IMR90 Hi-C 24141950 RFX2 109334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 6092440 6092966 6092758 Y RFX2 NA NA NA NA NA RFX2 104617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 6108691 6108922 6108748 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 7756040 7757119 7756175 Y ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2 TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 12311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 7893818 7893973 7893891 Y NA EVI5L NA NA NA NA EVI5L 699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 8426850 8427217 8427032 Y LOC645781,ANGPTL4 RPS28,NDUFA7,ANGPTL4,RAB11B,MARCH2 NA NA NA NA ANGPTL4 677 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 9.32583864513916 chr19 8676425 8676449 8676437 Y NA ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 2805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 9120594 9120838 9120762 Y MUC16 NA NA NA NA NA ZNF317 128218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 9783821 9783976 9783959 Y NA ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 45 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 9895815 9895899 9895870 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 40593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 10024468 10024837 10024779 Y OLFM2 OLFM2 PIN1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 OLFM2 20391 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 OLFM2 NA NA NA NA OLFM2 11008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 10148101 10148280 10148177 Y NA COL5A3,C3P1,C19orf66 NA NA NA NA C3P1 1622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 10346765 10347120 10347031 Y TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4 NA NA NA NA DNMT1 6803 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 11202963 11203178 11203054 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 11206953 11207150 11207057 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 8915 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 11253262 11253482 11253341 Y TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 11002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,CCDC151,ELAVL3,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ELAVL3 3043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 11641329 11641510 11641441 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627,ACP5 NA NA NA NA ECSIT 3340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 12065633 12065838 12065735 Y NA ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2 NA NA NA NA CTD-2006C1.2 30594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 12131760 12131812 12131786 Y NA CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878,ZNF844 NA NA NA NA ZNF433 12744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 12404552 12404928 12404719 Y ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44 CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563 NA NA NA NA ZNF44 850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 12844296 12844608 12844453 Y NA FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1 NA NA NA NA C19orf43 707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1 NA NA NA NA JUNB 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 13094405 13094796 13094616 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX NA NA NA NA NFIX 9626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13129050 13129163 13129107 Y MAST1,NFIX,CACNA1A NFIX NA NA NA NA NFIX 24628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13153458 13153528 13153499 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 49036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr19 13231642 13232105 13231971 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 4725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.09355561421491 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 14617819 14618098 14617969 Y IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 7799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 14708441 14708780 14708610 Y PRKACA,CD97,PKN1,OR7A17,OR1I1,ZNF333,EMR3 NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 27567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 15310768 15311119 15311001 Y NA NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 11290 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA CYP4F11 95558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr19 16205409 16205807 16205414 Y EPS15L1,RAB8A,HSH2D TPM4,RAB8A NA NA NA NA RAB8A 14632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 16403791 16404489 16404426 Y NA KLF2 AP1M1,KLF2,EPS15L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF2 29139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 16462018 16462188 16462137 Y CIB3 KLF2 NA NA NA NA KLF2 28390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 16480475 16480862 16480751 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 46847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 16482225 16482879 16482589 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 48597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17188668 17188879 17188834 Y HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 4077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17224246 17224646 17224434 Y MED26,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 39655 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 17604234 17604409 17604322 Y NA TMEM221,SLC27A1,PGLS NA NA NA NA PGLS 16029 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 18414244 18414595 18414365 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 17489 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr19 18512599 18512849 18512719 Y IFI30,UBA52,LRRC25 GDF15,SSBP4,ISYNA1 LRRC25 K562 ChIA-PET 22265404 SSBP4 14825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 18625662 18626077 18625893 Y UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL ELL,FKBP8,KXD1 NA NA NA NA ELL 4860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF724P 121713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 23855421 23855665 23855541 Y NA ZNF675 NA NA NA NA ZNF675 12357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28208615 28209033 28208726 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1493415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28217479 28217822 28217621 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1484626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28219787 28220540 28220091 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1481908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28231226 28231711 28231495 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1470737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28265126 28266155 28265940 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1436293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 28914991 28915131 28915061 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 787317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 29210558 29210810 29210684 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 491638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 30718140 30718340 30718240 Y NA NA NA NA NA NA URI1 305589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 33532238 33532582 33532339 Y RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 21212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr19 33750621 33750673 33750623 Y CEBPA SLC7A10,CEBPA CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA IMR90 Hi-C 24141950 SLC7A10 35865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 33789888 33790286 33790087 Y NA CEBPA NA NA NA NA CEBPA 1184 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 33888059 33888360 33888231 Y CEBPA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 25823 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 33894583 33894808 33894696 Y CEBPA CEBPG NA NA NA NA CEBPG 32347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 36193251 36193562 36193412 Y USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33 IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37 MLL4,ZBTB32 K562 ChIA-PET 22265404 IGFLR1 37792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 36406458 36406557 36406515 Y FFAR2,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP APLP1,NFKBID,TYROBP,LRFN3 TYROBP K562 ChIA-PET 22265404 TYROBP 9261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 36618643 36619171 36618835 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 9306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 36720266 36720641 36720459 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 14518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 37156610 37156902 37156838 Y ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461 ZNF461,AC074138.3,ZNF567 NA NA NA NA ZNF461 855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF570,ZNF569,ZNF793 NA NA NA NA ZNF570 3160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 38721338 38721526 38721432 Y NA DPF1 NA NA NA NA DPF1 2984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39148533 39148920 39148613 Y C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 39149253 39149575 39149354 Y SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4 EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 12964 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39175000 39175365 39175141 Y NFKBIB,HNRNPL,EIF3K ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 38711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr19 39177340 39177518 39177421 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 41051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 39453898 39453904 39453901 Y NA MRPS12,SARS2,FBXO17 NA NA NA NA FBXO17 10646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 39891902 39892845 39892340 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 2608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 39921308 39921946 39921495 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 2642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 40441958 40442162 40442060 Y FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA CTC-471F3.4 5472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 40930264 40930817 40930514 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD1 332 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 40969437 40969789 40969613 Y BLVRB SERTAD1,SERTAD3,SPTBN4 NA NA NA NA BLVRB 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 41109606 41110134 41110046 Y SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1 SHKBP1 NA NA NA NA SHKBP1 28849 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 41152132 41152466 41152220 Y NA NUMBL NA NA NA NA NUMBL 42411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41289050 41289265 41289158 Y SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA RAB4B 6929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41304071 41304255 41304136 Y SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1 SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA EGLN2 1170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 41795419 41795640 41795447 Y CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 18454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41819266 41819494 41819482 Y NA CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 5172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 41849661 41849907 41849784 Y HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA TMEM91 4909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL,C19orf69 NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42028325 42028365 42028354 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 C19orf69 81262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 42379575 42379860 42379642 Y ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RPS19,CD79A,ARHGEF1 NA NA NA NA CD79A 385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 42381967 42382342 42382197 Y CEACAM21,CEACAM4,CEACAM3,POU2F2,DEDD2,CD79A,ARHGEF1 RPS19,CD79A,ARHGEF1 NA NA NA NA CD79A 2777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42419916 42420316 42420067 Y ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 CD79A,ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA ARHGEF1 34688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42429105 42429824 42429205 Y DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1 CD79A,ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 31718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42514619 42514744 42514681 Y ATP1A3 ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 14970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42710307 42710321 42710316 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF NA NA NA NA DEDD2 11971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 42750338 42750718 42750490 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC NA NA NA NA GSK3A 5561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 42774379 42774759 42774668 Y CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 3690 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 42913594 42913985 42913852 Y NA NA NA NA NA NA MEGF8 85833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 44137942 44138031 44138016 Y ZNF575,ZNF221,LYPD5,ZNF428,CADM4 IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA CADM4 3960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 44165978 44166186 44166121 Y NA ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA PLAUR 6513 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 44178912 44179361 44178991 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 CADM4,PLAUR PLAUR MCF7 ChIA-PET 22265404 PLAUR 6213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 44200509 44200722 44200618 Y IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61 PLAUR SMG9,LYPD5,PLAUR,IRGC,KCNN4 IMR90 Hi-C 24141950 PLAUR 27810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 44257292 44257551 44257463 Y NA SMG9,KCNN4 NA NA NA NA SMG9 150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr19 44749585 44749846 44749685 Y LYPD5,ZNF221,ZNF223,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZNF229,ZFP112,ZNF227,ZNF235,ZNF233,ZNF233 ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 39885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 45228436 45228775 45228695 Y IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 20187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 45242034 45242469 45242251 Y RELB,CLASRP,BCL3 BCL3 BCL3 K562 ChIA-PET 22265404 BCL3 6493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 45256546 45257099 45256742 Y ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3 BCL3 NA NA NA NA BCL3 7584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45344497 45344782 45344640 Y CEACAM16,NKPD1,CLASRP BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 2650 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.14033342132237 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr19 45844650 45844836 45844820 Y FBXO46,PPP1R13L ERCC2 NA NA NA NA ERCC2 27340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 45879605 45879880 45879744 Y NA ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L NA NA NA NA ERCC2 7429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45943163 45943490 45943268 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP,FOSB,CD3EAP,PPP1R13L K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 25763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1 ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,RTN2,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 45980345 45980732 45980359 Y GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 45987073 45987327 45987197 Y NOVA2,RELB,CLASRP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA ERCC1 6987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 45999277 45999601 45999579 Y NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2 FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA RTN2 958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr19 46803943 46804533 46804229 Y IRF2BP1,MYPOP,HIF3A,HIF3A,HIF3A,CCDC8 PPP5C NA NA NA NA PPP5C 43718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 46877153 46877367 46877269 Y NA PPP5C NA NA NA NA PPP5C 28902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 46907328 46907649 46907570 Y NA NA NA NA NA NA PPP5C 59077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 46930027 46930174 46930086 Y NA PNMAL1 CCDC8,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 PNMAL1 42646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 47394206 47394341 47394251 Y NA AP2S1 ARHGAP35,SAE1,NPAS1,TMEM160,ZC3H4,FKRP,STRN4,PRKD2,SLC1A5,SNAR-E,AP2S1 IMR90 Hi-C 24141950 AP2S1 41957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47448240 47448462 47448420 Y PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1 NA NA NA NA NA AP2S1 95991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47458912 47459233 47458939 Y ZC3H4,CCDC9 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 90655 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47487878 47488175 47487946 Y ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1 NA NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM160 61713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 47600896 47601033 47600983 Y NA SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 13498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 BBC3,CCDC9,C5AR1 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,C5AR1 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,C5AR1 NA NA NA NA C5AR1 14311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,C5AR1 NA NA NA NA C5AR1 1654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 47890403 47890638 47890521 Y ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 39865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 48016569 48017036 48016994 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 72 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA EHD2 62472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 48903450 48903602 48903513 Y NA TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 49057128 49057239 49057162 Y NA NA NA NA NA NA SPHK2 63309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 49386525 49386775 49386581 Y CD37,PPP1R15A HSD17B14,PLEKHA4,PPP1R15A,NUCB1,DHDH NA NA NA NA PPP1R15A 12876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.90162637194598 chr19 49466802 49467527 49467169 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 5.99518198616089 chr19 49482120 49482542 49482303 Y FUT1,C19orf73 DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 12025 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 49836983 49837445 49837293 Y SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37 CTC-301O7.4,TEAD2 NA NA NA NA CTC-301O7.4 4420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 SLC17A7,ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA SLC17A7 19141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 50116585 50116794 50116665 Y NA NOSIP,PRR12,RRAS,SCAF1 NA NA NA NA PRR12 23685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 50413852 50414197 50414025 Y LOC645971,NR1H2 PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 15762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 50426616 50426838 50426710 Y NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5 TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751 NA NA NA NA ATF5 3121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 50825197 50825861 50825498 Y NA NR1H2,KCNC3 NA NA NA NA NR1H2 5049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 50860908 50861268 50861186 Y PNKP,VRK3,NR1H2 NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 24193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 50993680 50994951 50994565 Y NA JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 17659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 51010284 51010518 51010437 Y KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918 JOSD2 NA NA NA NA JOSD2 2092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 51224129 51224276 51224235 Y C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA NA C19orf48 81910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48,KLK1 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48,KLK1 NA NA NA NA KLK1 14212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 51815926 51816289 51816251 Y NA VSIG10L NA NA NA NA VSIG10L 27089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr19 52192842 52193550 52192951 Y ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 120291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 52586676 52587051 52586863 Y NA ZNF432,ZNF841 NA NA NA NA ZNF432 9940 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 52734516 52734674 52734594 Y ZNF610 PPP2R1A,ZNF766 NA NA NA NA ZNF766 36150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665 NA NA NA NA ZNF665 32764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr19 53917190 53917573 53917346 Y NA ZNF765,ZNF761 NA NA NA NA ZNF761 15654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 54355100 54355465 54355199 Y VSTM1,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM MYADM,AC008753.6,PRKCG CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7 HELA,K562,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MYADM 12012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA OSCAR 80219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9,AC012314.19 NA NA NA NA AC012314.19 2182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9,AC012314.19 NA NA NA NA AC012314.19 3434 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 54936601 54936866 54936734 Y NA LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5 NA NA NA NA LENG8 21199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA SYT5,PTPRH,TMEM86B NA NA NA NA SYT5 10159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 55721470 55721547 55721521 Y NA SYT5,PTPRH,TMEM86B,PPP6R1 NA NA NA NA PTPRH 2596 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 55917170 55917359 55917333 Y U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA UBE2S 25 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr19 56061327 56061704 56061673 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1 SGK110 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF579 28507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr19 56117286 56117783 56117722 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 5950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 56118803 56119132 56118967 Y COX6B2 ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 7467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56148080 56148375 56148228 Y ZNF580 ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1 NA NA NA NA CCDC106 2053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 56796830 56796936 56796883 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 80532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 69441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 56831287 56831644 56831534 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 45824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58175767 58176046 58175802 Y ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551 ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF551 15291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF776 NA NA NA NA ZNF551 27142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58415823 58415990 58415970 Y NA ZNF417,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 9988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58532436 58532530 58532517 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 19719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58784706 58785064 58784920 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 NA NA NA NA ZNF8 3254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58824678 58824957 58824818 Y ZNF256 ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG,ZNF497 NA NA NA NA ERVK3-1 9963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr19 59058033 59058475 59058195 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA TRIM28 4575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr19 59078228 59078288 59078258 Y CHMP2A,CHMP2A ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA CENPBD1P1 4582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1,MGC2752 NA NA NA NA MGC2752 3527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8369680 8369964 8369925 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 351958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8391335 8391635 8391477 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 330287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8439017 8439275 8439185 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 282647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8532216 8532386 8532312 Y NA NA LOC100506274,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 189536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 8641337 8641489 8641413 Y ID2 NA LOC100506274,LOC339788,LINC00299,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 80433 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8691975 8692185 8692079 Y NA AC011747.4 LOC100506274,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 29737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 8773908 8774094 8774001 Y NA ID2 LINC00299,LOC339788,LOC100506274,ID2 IMR90 Hi-C 24141950 ID2 42881 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9347909 9348072 9347942 Y NA ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 3015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9411571 9411694 9411610 Y ADAM17 NA NA NA NA NA ASAP2 66677 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 9686288 9686554 9686518 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 7367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 9795695 9795818 9795794 Y NA YWHAQ,RP11-521D12.1 YWHAQ,GRHL1,ADAM17,KLF11 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-521D12.1 18794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 10258344 10258406 10258377 Y NA CYS1,RRM2 NA NA NA NA RRM2 2049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr2 10423423 10423670 10423576 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 17345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 10425680 10425925 10425803 Y HPCAL1 HPCAL1 HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 15090 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 10950898 10951279 10951023 Y NA PDIA6 ATP6V1C2 IMR90 Hi-C 24141950 PDIA6 24824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 11076268 11076628 11076485 Y NA KCNF1 KCNF1,FLJ33534,PDIA6 IMR90 Hi-C 24141950 KCNF1 26205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 11343595 11343995 11343855 Y E2F6 NA NA NA NA NA PQLC3 50271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 154415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 154584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 16112792 16113149 16112940 Y NA MYCN NA NA NA NA MYCN 34106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 16149011 16149377 16149168 Y NBAS NA NA NA NA NA MYCN 70325 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 16807698 16808010 16807940 Y FAM49A NA NA NA NA NA MYCN 729012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 16835049 16835704 16835307 Y FAM49A NA NA NA NA NA MYCN 756363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 18249281 18249546 18249363 Y NA NA KCNS3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNS3 192167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 20171563 20171753 20171690 Y TTC32 WDR35,MATN3 NA NA NA NA WDR35 16139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 20407883 20408194 20408074 Y RHOB,SDC1,SDC1 SDC1 NA NA NA NA SDC1 15000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 20784084 20784557 20784460 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 64292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 20793103 20793496 20793437 Y APOB NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 55353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 20817015 20817334 20817182 Y RHOB,GDF7 HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 31515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 24238466 24238799 24238602 Y NA C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA C2orf44 31646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 24713346 24713697 24713476 Y DNAJC27,ITSN2 NA CENPO,NCOA1 IMR90 Hi-C 24141950 ITSN2 131763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 25789731 25789834 25789815 Y RAB10 NA NA NA NA NA DTNB 104669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr2 26235500 26235661 26235564 Y RAB10 KIF3C,RAB10 FAM59B,KIF3C,RAB10,ASXL2,HADHA,HADHB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 19315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 26241064 26241266 26241191 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,HADHB,KIF3C,HADHA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAB10 13710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,KCNK3,CENPA NA NA NA NA KCNK3 33315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA SLC30A3,TRIM54,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 27557346 27557529 27557503 Y DPYSL5,C2orf16 MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513 NA NA NA NA MPV17 10799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 27988549 27989353 27988873 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 3231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28077414 28077634 28077524 Y ZNF513,ZNF513,RBKS BRE,RBKS MRPL33 IMR90 Hi-C 24141950 BRE 33174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28303771 28304058 28303879 Y NA NA NA NA NA NA RBKS 191806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28496743 28497020 28496828 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 116295 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28567642 28567818 28567722 Y NA FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 45497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28582195 28582710 28582283 Y NA FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 30605 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28589661 28589896 28589794 Y FOSL2 FOSL2 BRE,RBKS,FOSL2,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSL2 23419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 28621403 28621758 28621597 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2 NA NA NA NA FOSL2 8088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 28806831 28807046 28806964 Y FOSL2 NA NA NA NA NA AC097724.3 150025 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 28833397 28833696 28833546 Y NA NA NA NA NA NA AC097724.3 123375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 28844259 28844848 28844625 Y FOSL2,TRMT61B,PPP1CB,PPP1CB NA NA NA NA NA AC097724.3 112223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 28976141 28976573 28976382 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B AC097724.3,PPP1CB SPDYA IMR90 Hi-C 24141950 PPP1CB 3635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 29055098 29055343 29055221 Y SPDYA TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 35824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 29075660 29075992 29075826 Y TRMT61B TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA TRMT61B 15175 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 SNORD53 NA NA NA NA SNORD53 25397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr2 29439591 29440302 29440265 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 121020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 30644745 30644849 30644777 Y NA LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 23243 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 30644994 30645276 30645103 Y LBH LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 22816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 32166229 32166498 32166237 Y NA NA NA NA NA NA MEMO1 67801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 33515180 33515450 33515221 Y NA NA NA NA NA NA RASGRP3 143941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 33702756 33702976 33702846 Y RASGRP3,RASGRP3 RASGRP3 NA NA NA NA RASGRP3 43365 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr2 34215610 34215617 34215614 Y NA NA NA NA NA NA FAM98A 393161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 36791809 36792197 36792002 Y CRIM1 NA NA NA NA NA FEZ2 79033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 37116938 37117262 37117216 Y NA NA NA NA NA NA STRN 74353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37489254 37489354 37489306 Y NA CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 32398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37576725 37576898 37576775 Y STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 7008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37851057 37851610 37851419 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 112001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37858321 37858709 37858681 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 104902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 37897080 37897760 37897461 Y QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 65851 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 38265442 38265742 38265584 Y CDC42EP3 NA NA NA NA NA RPL7P12 190968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 38323202 38323810 38323564 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL7P12 132900 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 38538303 38538646 38538475 Y NA NA NA NA NA NA ATL2 63781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 38724832 38725088 38724960 Y ARHGEF33 RPLP0P6 ATL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP0P6 17912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 39695061 39695250 39695144 Y NA MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 32608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 39732092 39732298 39732165 Y MAP4K3 NA NA NA NA NA MAP4K3 69639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 40328052 40328434 40328415 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD2 323645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 40563137 40563534 40563392 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 272659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 9163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 42157961 42158315 42158139 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42190702 42191089 42190887 Y NA AC104654.2 C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 AC104654.2 31839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42278314 42278459 42278342 Y NA PKDCC NA NA NA NA PKDCC 5154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42355776 42356012 42355884 Y NA EML4 EML4,COX7A2L,LOC388942 IMR90 Hi-C 24141950 EML4 38478 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42363980 42364100 42364040 Y NA EML4 EML4,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 30390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 42368874 42369229 42369001 Y EML4 EML4 EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 EML4 25261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 42567305 42567366 42567336 Y EML4 NA NA NA NA NA COX7A2L 82862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 43020336 43020977 43020619 Y HAAO HAAO NA NA NA NA HAAO 2603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 43205442 43205824 43205685 Y MTA3,HAAO AC016735.1 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 25376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43206770 43207218 43206984 Y HAAO AC016735.1 ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC016735.1 23982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 43385938 43386506 43386186 Y OXER1,ZFP36L2 NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 65242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 43390138 43390489 43390286 Y NA NA THADA,LOC100129726,ZFP36L2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 61259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43532812 43532954 43532932 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 81064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43653578 43653957 43653847 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 167228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 43942410 43942694 43942547 Y PLEKHH2 NA NA NA NA NA DYNC2LI1 56484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 44514582 44514974 44514779 Y NA SLC3A1 NA NA NA NA SLC3A1 13983 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr2 44518633 44519032 44518761 Y NA SLC3A1 NA NA NA NA SLC3A1 18034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr2 44542790 44543096 44543052 Y SLC3A1 SLC3A1,PREPL,CAMKMT NA NA NA NA SLC3A1 42191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr2 45968952 45969144 45969027 Y PRKCE NA NA NA NA NA PRKCE 92468 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 46456791 46456944 46456828 Y NA NA PRKCE,EPAS1,PIGF IMR90 Hi-C 24141950 EPAS1 61862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 46536857 46537129 46536993 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 18051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 46542401 46542637 46542520 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 23595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 46997897 46997963 46997932 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 NA NA NA NA NA SOCS5 73806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 47213827 47213985 47213928 Y NA MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 46833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 47282124 47282371 47282214 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 115130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 47297632 47297822 47297725 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 103918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2,AC106869.2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 47420372 47420663 47420518 Y NA CALM2,AC106869.2 EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 18632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 48118003 48118146 48118074 Y NA FBXO11 NA NA NA NA FBXO11 12786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 54019039 54019374 54019207 Y ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 6858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 54054125 54054397 54054212 Y NA ERLEC1,GPR75-ASB3,ASB3 NA NA NA NA GPR75-ASB3 30773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 54270419 54270555 54270547 Y GPR75,ACYP2 NA SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2 IMR90 Hi-C 24141950 PSME4 74442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 54330282 54330384 54330333 Y NA NA SPTBN1,RTN4,EML6,ACYP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSME4 134305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 55212013 55212317 55212165 Y CCDC88A NA NA NA NA NA RTN4 125440 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 55327778 55327923 55327859 Y NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 9834 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr2 55346891 55347057 55346962 Y NA RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 9134 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 55360803 55361407 55361172 Y SMEK2,CCDC88A,RTN4 RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 23046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 58002154 58002414 58002211 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 130372 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 60228228 60228402 60228315 Y NA NA NA NA NA NA BCL11A 550300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 61207503 61207627 61207564 Y NA PEX13,PUS10 NA NA NA NA PEX13 34733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 61466894 61467158 61467026 Y NA NA NA NA NA NA AHSA2 64341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 61698926 61699282 61699220 Y PUS10,AHSA2,USP34 USP34 NA NA NA NA USP34 3022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr2 62805190 62805410 62805295 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 68161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 62806044 62806443 62806244 Y NA NA EHBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 69015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 63601034 63601048 63601041 Y NA NA NA NA NA NA MDH1 212695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 65058327 65058875 65058618 Y AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2 IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 82188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 65086968 65087262 65087080 Y AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2 NA SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 SERTAD2 110829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 65093958 65094266 65094153 Y NA NA SERTAD2,AFTPH,LOC339807 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SERTAD2 117819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 65328578 65328848 65328754 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 26392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 65609993 65610402 65610168 Y NA SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 47369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr2 65716936 65717140 65717038 Y NA NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 59165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr2 68099152 68099495 68099246 Y NA NA MEIS1,C1D IMR90 Hi-C 24141950 C1D 236585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 68278313 68278683 68278526 Y NA NA NA NA NA NA C1D 57397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 69135600 69135857 69135778 Y NA GKN2 ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10 IMR90 Hi-C 24141950 GKN2 42245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr2 69481133 69481450 69481229 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 130932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 69750715 69750748 69750731 Y NA NA NA NA NA NA NFU1 87955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 69989990 69990667 69990520 Y NA NA GMCL1 IMR90 Hi-C 24141950 GMCL1 64107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 70294861 70295138 70295000 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA PCBP1 17447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 7633 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4,AC016700.3 NA NA NA NA AC016700.3 34707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 72372444 72372716 72372574 Y CYP26B1 NA NA NA NA NA EXOC6B 678454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 75090921 75091085 75091029 Y NA HK2 NA NA NA NA HK2 31813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 75172635 75172664 75172650 Y NA POLE4 POLE4,TACR1,HK2 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POLE4 10955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 75498571 75498680 75498627 Y NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 TACR1 73745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 75798121 75798484 75798332 Y NA NA NA NA NA NA MRPL19 73425 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 75894065 75894458 75894192 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 22156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 78632836 78632912 78632895 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 619328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 81709176 81709459 81709306 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 1320915 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 85093452 85093824 85093680 Y NA TMSB10 NA NA NA NA TMSB10 36925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr2 85673142 85673285 85673214 Y NA CAPG NA NA NA NA CAPG 29587 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 85726317 85726428 85726373 Y CAPG,VAMP8 MAT2A TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAT2A 37860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85812721 85813054 85812974 Y VAMP5 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68 NA NA NA NA VAMP5 3190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85932755 85933081 85932924 Y SH2D6 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 20379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 85956315 85956539 85956423 Y SH2D6 RNU1-38P,ATOH8 ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 2855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 86103135 86103528 86103332 Y NA ST3GAL5 NA NA NA NA ST3GAL5 10609 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 86121717 86122002 86121863 Y NA ST3GAL5 ST3GAL5,POLR1A IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 7580 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 86262986 86263343 86263241 Y GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3 NA NA NA NA NA POLR1A 67935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 86761300 86761347 86761323 Y REEP1,REEP1 NA NA NA NA NA RNF103 87642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 87831317 87831559 87831445 Y NA NA NA NA NA NA LINC00152 78430 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA AC096579.7 2596219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 91960340 91960566 91960493 Y NA NA NA NA NA NA AC096579.7 2796687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 95972113 95972447 95972295 Y KCNIP3 KCNIP3 NA NA NA NA KCNIP3 11061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 96782666 96782871 96782861 Y NA DUSP2 NA NA NA NA DUSP2 26308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 97291626 97292008 97291852 Y NA FER1L5,KANSL3 NA NA NA NA FER1L5 14466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 97554359 97554681 97554500 Y NA ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C NA NA NA NA SEMA4C 19865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 98367978 98368166 98368128 Y TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70 NA NA NA NA NA ACTR1B 89408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 100576722 100576856 100576853 Y NA NA NA NA NA NA LONRF2 360339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA LONRF2 306582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 100654601 100654935 100654768 Y NA NA NA NA NA NA LONRF2 282260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 100907600 100907945 100907823 Y NA LONRF2 NA NA NA NA LONRF2 29250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 LONRF2 NA NA NA NA LONRF2 139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 101435496 101435968 101435616 Y NPAS2 NPAS2 NA NA NA NA NPAS2 882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 101587758 101587775 101587767 Y NA RPL31 NA NA NA NA RPL31 28402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 102730911 102731144 102731033 Y IL1R1,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4 NA IL1RL2,IL1R1,IL1R2 IMR90 Hi-C 24141950 IL1R1 51907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 102844003 102844653 102844435 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL18R1 81336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr2 102854655 102855173 102854991 Y IL1R1 NA NA NA NA NA IL18R1 70816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 102857184 102857493 102857313 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL18R1 68496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 105973379 105973614 105973553 Y NA TGFBRAP1,C2orf49 NA NA NA NA C2orf49 21563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 106008939 106009297 106009286 Y NA FHL2 NA NA NA NA FHL2 43673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 106415106 106415442 106415380 Y NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 55752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 106474357 106474542 106474414 Y NA NA NA NA NA NA NCK2 115003 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 106809174 106809856 106809272 Y UXS1 UXS1 NA NA NA NA UXS1 379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 109686360 109686496 109686432 Y NA NA MALL,SEPT10,SH3RF3,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 EDAR 82532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 109864376 109864774 109864388 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA EDAR 260548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 110402204 110402551 110402400 Y NA SEPT10,SOWAHC SEPT10,SOWAHC IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHC 32293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 112417011 112417329 112417184 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 222938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 112420062 112420336 112420200 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 219931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 112462014 112462125 112462055 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 178142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 113448603 113448987 113448785 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1,NT5DC4 POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 28076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 113450039 113450435 113450231 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1,NT5DC4 SLC20A1,FLJ42351 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5DC4 26628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A,IL1B CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1A,IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 114039556 114039944 114039632 Y NA NA NA NA NA NA IL36RN 225341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 IL36RN 268234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 114457868 114458149 114458009 Y ACTR3 NA NA NA NA NA SLC35F5 54251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 SLC35F5 NA NA NA NA SLC35F5 42570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 114615220 114615283 114615253 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 ACTR3,SLC35F5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTR3 30254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 114649026 114649412 114649076 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 3489 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 114672841 114673224 114672915 Y NA ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 27304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 118722673 118722961 118722817 Y NA CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 46748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 120887789 120888032 120887910 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 90952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 120891923 120892273 120892121 Y NA NA NA NA NA NA TMEM185B 86711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 120971736 120972136 120971936 Y NA TMEM185B,RALB NA NA NA NA TMEM185B 6848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 121943239 121943562 121943401 Y NA NA NA NA NA NA TFCP2L1 97221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 122132591 122132855 122132729 Y CLASP1 NA NA NA NA NA AC013399.3 67020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 128266210 128266439 128266348 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1 IWS1,MYO7B NA NA NA NA IWS1 16023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1,MYO7B NA NA NA NA IWS1 590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 NA NA NA NA NA CCDC115 50893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 131555592 131555820 131555689 Y CCDC115 NA PLEKHB2,FAM168B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FAM168B 293213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 133011418 133011623 133011538 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 160524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA NA NA NA NA NA GPR39 261568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 135691118 135691392 135691265 Y TMEM163,ACMSD,CCNT2 CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 16838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 135701216 135701448 135701313 Y NA CCNT2,CCNT2-AS1 NA NA NA NA CCNT2-AS1 26936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 139342135 139342417 139342276 Y NA NA NA NA NA NA SPOPL 84764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 143611653 143611718 143611684 Y NA KYNU KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 KYNU 21349 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 143625721 143626570 143625926 Y KYNU KYNU KYNU MCF7 ChIA-PET 22265404 KYNU 6497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 143630782 143631707 143631171 Y KYNU KYNU NA NA NA NA KYNU 1360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr2 143697269 143697638 143697450 Y KYNU NA NA NA NA NA KYNU 64202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 143699726 143700104 143699915 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 66659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 145821367 145821376 145821372 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 271422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 148671388 148671433 148671412 Y ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4 NA NA NA NA NA ACVR2A 71302 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 149372340 149372450 149372396 Y EPC2 EPC2 KIF5C IMR90 Hi-C 24141950 EPC2 27559 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 149925246 149925613 149925433 Y NA LYPD6B NA NA NA NA LYPD6B 32625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 150999673 151000010 150999769 Y NA NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 393515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 151330104 151330756 151330441 Y NA NA NA NA NA NA RND3 62769 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 152493697 152493937 152493847 Y RBM43,NMI NA NA NA NA NA ARL5A 189069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 153309848 153310421 153310088 Y CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6 NA NA NA NA NA FMNL2 120097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA NA NA NA NA NA AC012501.2 68220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 158309744 158310453 158309937 Y CYTIP CYTIP NA NA NA NA CYTIP 33020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 158658740 158658947 158658861 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 71427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 158687871 158687996 158687910 Y ACVR1,ACVR1 ACVR1 NA NA NA NA ACVR1 42378 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 159951081 159951241 159951194 Y NA NA NA NA NA NA TANC1 127935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 159994086 159994676 159994284 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 146634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 160059380 160059738 160059444 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 81572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 160095412 160095531 160095474 Y NA WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 45779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 160219490 160219798 160219643 Y MARCH7,CD302 NA NA NA NA NA WDSUB1 78180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 160411225 160411529 160411489 Y NA NA NA NA NA NA AC009506.1 58278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ITGB6 61519 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 ITGB6 RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB6 47886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 161080666 161080905 161080769 Y NA ITGB6 ITGB6,RBMS1,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB6 45494 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 ITGB6 TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB6 27776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161155946 161156394 161156280 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 29547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161607616 161608069 161607675 Y TANK,TANK NA RBMS1,ITGB6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 259311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161979819 161979978 161979936 Y TANK,TANK TANK PLA2R1,RBMS1,LY75-CD302,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TANK 11441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161995122 161995254 161995230 Y TANK,TANK TANK NA NA NA NA TANK 3703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 161995715 161996095 161995826 Y TANK,TANK TANK NA NA NA NA TANK 4296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 163035525 163035776 163035654 Y NA NA NA NA NA NA EIF3EP2 92756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 165371083 165371396 165371192 Y NA NA NA NA NA NA GRB14 104962 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 165635333 165635585 165635456 Y NA NA NA NA NA NA AC019181.2 59674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 166705742 166705996 166705870 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 102357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 168150182 168150557 168150197 Y NA AC074363.1 NA NA NA NA AC074363.1 2501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 168263159 168263570 168263327 Y NA NA NA NA NA NA AC074363.1 115478 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 168291941 168292335 168292012 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA AC074363.1 144260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 168714852 168714864 168714859 Y B3GALT1 NA NA NA NA NA STK39 387787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 168994093 168994243 168994234 Y NA NA NA NA NA NA STK39 108408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 169203110 169203445 169203278 Y NA NA ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402 IMR90,Islet Hi-C,4C 24141950,24413736 STK39 100459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 169434382 169434732 169434541 Y NA NA NA NA NA NA CERS6 124010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 173942556 173942831 173942720 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7 274717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 174022636 174022916 174022677 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 194632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 174129335 174129853 174129516 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 87695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 175069870 175070170 175070019 Y WIPF1,SP3,SP3 OLA1 NA NA NA NA OLA1 41256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 175540530 175540594 175540562 Y CIR1,GPR155,WIPF1,WIPF1 WIPF1,H3F3AP4 NA NA NA NA WIPF1 5050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA H3F3AP4 125918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 176969861 176970296 176970124 Y HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10 HOXD11,HOXD9,HOXD3,HOXD-AS2,HOXD4 NA NA NA NA HOXD11 2917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 178030872 178031290 178031011 Y NFE2L2,NFE2L2 HNRNPA3,AC079305.8 HOXD-AS2,LOC100130691,AGPS,PDE11A,NFE2L2,HNRNPA3,TTC30A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HNRNPA3 44001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 178261376 178261686 178261570 Y NA AGPS,AC074286.1,NFE2L2 NA NA NA NA NFE2L2 5951 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 180044911 180045098 180045020 Y SESTD1 NA NA NA NA NA SESTD1 82419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 180116495 180116858 180116779 Y SESTD1 SESTD1 NA NA NA NA SESTD1 10659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 182418889 182419281 182419085 Y NEUROD1,CERKL NA NA NA NA NA SSFA2 335279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 183626884 183626903 183626894 Y NA DNAJC10 NA NA NA NA DNAJC10 47885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 183877830 183878146 183878099 Y NA NCKAP1 NA NA NA NA NCKAP1 23440 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 186616540 186616923 186616825 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 731960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 186638782 186639016 186638929 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 709867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 187390995 187391341 187391159 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 42112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 187409105 187409391 187409239 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ITGAV MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGAV 43401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 187440118 187440385 187440293 Y ITGAV,ITGAV ITGAV ZC3H15,ITGAV IMR90 Hi-C 24141950 ITGAV 12407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 187455745 187456210 187455889 Y NA ITGAV NA NA NA NA ITGAV 2953 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 187601377 187601405 187601389 Y ZSWIM2,FAM171B FAM171B NA NA NA NA FAM171B 44679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 188326523 188326725 188326579 Y NA NA NA NA NA NA TFPI 101762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr2 188340607 188340894 188340852 Y NA NA NA NA NA NA TFPI 87593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 188347584 188347786 188347681 Y NA NA NA NA NA NA TFPI 80701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 188389811 188390126 188390006 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 38361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 189155414 189155583 189155499 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 1018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 189653445 189653579 189653502 Y NA NA NA NA NA NA COL5A2 389026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 190075572 190075716 190075672 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 32967 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 190399515 190399898 190399767 Y NA SLC40A1 SLC40A1,WDR75 IMR90 Hi-C 24141950 SLC40A1 46586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 191030826 191031069 191031046 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 175127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 191075616 191075973 191075872 Y NA NA NA NA NA NA INPP1 130223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 191711355 191711777 191711579 Y GLS GLS GLS,STAT1,NAB1 IMR90 Hi-C 24141950 GLS 31776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 191825811 191826187 191826065 Y NAB1,GLS,STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 30106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 192112527 192112680 192112632 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 4616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192123995 192124097 192124046 Y NA MYO1B NA NA NA NA MYO1B 16084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 192170125 192170408 192170266 Y NA NA NA NA NA NA MYO1B 62214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192447130 192447364 192447247 Y NA NA OBFC2A K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC098617.1 261901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192489815 192490209 192490062 Y STAT4,OBFC2A NA OBFC2A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC098617.1 219056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA AC098617.1 164033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192709927 192710444 192710339 Y SDPR AC098617.1 NA NA NA NA SDPR 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192717272 192717408 192717316 Y NA AC098617.1,SDPR NA NA NA NA SDPR 7291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 192870555 192870805 192870799 Y NA NA NA NA NA NA SDPR 160574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 196617949 196618273 196617953 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 179248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 197195800 197196140 197196081 Y NA NA NA NA NA NA STK17B 156573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr2 197686451 197686687 197686569 Y PGAP1,C2orf66 GTF3C3 NA NA NA NA GTF3C3 24002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 197936511 197936873 197936784 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 145991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 200839985 200840279 200840201 Y NA C2orf47,TYW5 NA NA NA NA TYW5 21526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 201172384 201172536 201172446 Y NA SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 3780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 201777095 201777270 201777183 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA NIF3L1 25045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 32977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr2 203231501 203231745 203231624 Y NA BMPR2 BMPR2,NOP58 IMR90 Hi-C 24141950 BMPR2 7914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 204315265 204315638 204315451 Y NA NA NA NA NA NA RAPH1 82495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 204393119 204393487 204393303 Y NA RAPH1 NA NA NA NA RAPH1 4646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 205318547 205318821 205318681 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 89695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 205960134 205960186 205960160 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 551618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 206005178 206005232 206005204 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 539482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 207550708 207550719 207550714 Y NA NA NA NA NA NA FASTKD2 77362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 208041079 208041402 208041259 Y CREB1 KLF7 KLF7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 11088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 208602415 208602802 208602609 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA CCNYL1 28151 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 208609048 208609450 208609191 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 22837 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 208622865 208623146 208623006 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA FZD5 9141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 210233724 210233884 210233805 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 52898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 210377827 210378108 210377968 Y NA NA NA NA NA NA MAP2 91045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 210429278 210429418 210429290 Y MAP2,MAP2 NA NA NA NA NA MAP2 142496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 210547424 210547820 210547680 Y MAP2,MAP2,UNC80 NA NA NA NA NA MAP2 260642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 210580281 210580584 210580403 Y NA NA NA NA NA NA RPE 284705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA CPS1 64529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 213770329 213770669 213770422 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 376444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 214448685 214449058 214448872 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 301572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 216636605 216637052 216636855 Y NA NA NA NA NA NA MREG 259767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr2 216638374 216638853 216638649 Y FN1 NA NA NA NA NA MREG 257966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 216695142 216695306 216695226 Y NA NA NA NA NA NA MREG 201513 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 216698635 216698894 216698754 Y NA NA NA NA NA NA MREG 197925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr2 216847055 216847597 216847305 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 49222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 216867934 216868318 216868147 Y TMEM169 MREG NA NA NA NA MREG 28501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr2 218330199 218330382 218330291 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 535336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 219155683 219156025 219155719 Y CXCR2,CXCR2,ARPC2,ARPC2,ZNF142,USP37,SLC11A1,PNKD AAMP,PNKD,TMBIM1 NA NA NA NA TMBIM1 374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 219177286 219177625 219177456 Y NA AAMP,PNKD,TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA TMBIM1 21977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1,VIL1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1,VIL1 NA NA NA NA VIL1 9441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 220374836 220375176 220374958 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF NA NA NA NA GMPPA 13247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC4A3 603383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 FARSB 691645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 223922386 223922775 223922580 Y KCNE4 KCNE4 NA NA NA NA KCNE4 7854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 225075172 225075344 225075265 Y NA NA SERPINE2 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINE2 173136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 225638281 225638283 225638282 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 190171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 226983767 226984186 226983892 Y NA NA IRS1,LOC646736 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRS1 678289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 227517160 227517436 227517301 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 145039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 227822351 227822632 227822559 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 124054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 228253438 228253721 228253534 Y CCL20,AGFG1 TM4SF20 TM4SF20,AGFG1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF20 8727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 228270733 228271155 228270942 Y NA TM4SF20 C2orf83,AGFG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF20 26022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 228331050 228331499 228331159 Y NA AGFG1 AGFG1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGFG1 3369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 228437239 228437625 228437329 Y NA NA NA NA NA NA AGFG1 102371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 228578021 228578290 228578242 Y NA SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 2438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA DNER 267281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 231227266 231227536 231227388 Y NA SP140L NA NA NA NA SP140L 37367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 231378000 231378359 231378191 Y NA NA NA NA NA NA SP100 99343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 231915077 231915290 231915200 Y C2orf72 C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 4288 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 232106599 232106881 232106746 Y B3GNT7 ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 11929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA LINC00471 91838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA PTMA 90748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 233180259 233180746 233180485 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E2 232016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 233703407 233703613 233703510 Y NEU2 C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 16367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 233763823 233764207 233764133 Y EFHD1,NGEF C2orf82 NA NA NA NA C2orf82 43843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 233876295 233876308 233876302 Y NEU2,NGEF NA NA NA NA NA C2orf82 156315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 234357256 234357513 234357369 Y NA NA NA NA NA NA DGKD 96103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 234608579 234609196 234608912 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 10326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 16624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 234615498 234615635 234615567 Y NA UGT1A6 NA NA NA NA UGT1A6 17245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 234670163 234670438 234670239 Y NA UGT1A1 NA NA NA NA UGT1A1 3269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 234673088 234673246 234673167 Y NA UGT1A1 NA NA NA NA UGT1A1 6194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 235239661 235239923 235239798 Y NA NA SPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 163774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 235336071 235336661 235336603 Y ARL4C NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 67036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 235748055 235748426 235748121 Y NA NA TRPM8,SH3BP4 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 110191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 236547901 236548387 236548201 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1-IT1 135506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 236698901 236699175 236699041 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1-IT1 286506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 237678524 237678883 237678772 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IQCA1 264339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 237685373 237686074 237685499 Y CXCR7 NA IQCA1,CXCR7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IQCA1 271188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr2 237876867 237877033 237876943 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 114922 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 238036930 238037258 238037105 Y NA COPS8 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 44975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 238391204 238391436 238391383 Y LRRFIP1,MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 238398938 238399241 238399144 Y NA MLPH NA NA NA NA MLPH 6867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 239050654 239050828 239050729 Y KLHL30 FAM132B NA NA NA NA FAM132B 14795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 239078028 239078257 239078143 Y NA FAM132B,ILKAP NA NA NA NA FAM132B 12405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr2 239367827 239368002 239367915 Y NA ASB1 NA NA NA NA ASB1 34444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 239552819 239552999 239552910 Y PER2 NA LOC151171 IMR90 Hi-C 24141950 ASB1 219436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 240144687 240145031 240144830 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 176099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr2 241960934 241960944 241960939 Y AQP12A,PASK SNED1 NA NA NA NA SNED1 24679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 242300434 242300614 242300524 Y NA SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 6776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 242698564 242698745 242698671 Y THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 26570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 242714145 242714474 242714395 Y NEU4,D2HGDH,GAL3ST2 D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 42151 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 242791150 242791474 242791404 Y NA AC131097.3 NA NA NA NA AC131097.3 30040 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr2 242805912 242805984 242805949 Y ATG4B,ING5,GAL3ST2,PDCD1 AC131097.3 PDCD1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC131097.3 15530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.90323237655901 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 453687 453779 453733 Y NA TBC1D20 NA NA NA NA TBC1D20 12490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 623135 623319 623297 Y NA SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 NA NA NA NA NA PSMF1 62937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 1168274 1168908 1168417 Y NA NA NA NA NA NA SNPH 76052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 1310858 1311228 1310987 Y SDCBP2,SDCBP2,SIRPG NA NA NA NA NA FKBP1A 60578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 1333009 1333271 1333126 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 38535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 1333597 1333845 1333762 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 37961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 1372355 1372517 1372472 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 1757792 1758093 1758078 Y NA NA NA NA NA NA SIRPA 115061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 2280034 2280402 2280127 Y SIRPA,SIRPA,SIRPA NA NA NA NA NA SNRPB 169097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 2812856 2812910 2812883 Y NA CPXM1,VPS16,PTPRA NA NA NA NA VPS16 6439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 2978820 2979208 2979015 Y NA MRPS26 NA NA NA NA MRPS26 45383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 3155446 3155862 3155811 Y EBF4,PTPRA,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 16604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 3159596 3159937 3159912 Y PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 20754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 3200687 3201082 3200885 Y NA DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA ITPA 13173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4072203 4072410 4072307 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 27217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4198420 4198722 4198592 Y SMOX,ADRA1D ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 28999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4395682 4395963 4395822 Y NA NA ADRA1D,LOC728228,PRNP IMR90 Hi-C 24141950 ADRA1D 167961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4906931 4907179 4907055 Y NA NA NA NA NA NA SNORA31 59301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 5059148 5059500 5059412 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 45772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 5512444 5512652 5512587 Y CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1 NA NA NA NA NA GPCPD1 77020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 5825010 5825403 5825098 Y NA NA NA NA NA NA CHGB 64673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 5900000 5900262 5900165 Y GPCPD1,TRMT6 CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 9924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 6594261 6594618 6594466 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 151693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 6684913 6685132 6685035 Y NA NA NA NA NA NA BMP2 61179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr20 6802700 6802711 6802706 Y NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2 56389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 7905442 7905630 7905536 Y HAO1 HAO1 NA NA NA NA HAO1 13491 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 8210701 8210953 8210827 Y NA NA NA NA NA NA PLCB1 99877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 8380615 8380981 8380808 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 269791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 8435134 8435511 8435284 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 324310 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 8437471 8437869 8437556 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 326647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 10197196 10197344 10197281 Y SNAP25 SNAP25 NA NA NA NA SNAP25 134 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 10238596 10238857 10238656 Y NA SNAP25 NA NA NA NA SNAP25 41118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 10299398 10299502 10299451 Y MKKS NA NA NA NA NA SNAP25 101920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 10486121 10486184 10486148 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 73251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 10585324 10585599 10585462 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 39415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr20 10692033 10692226 10692094 Y MKKS NA NA NA NA NA JAG1 67019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr20 10735371 10735385 10735378 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 110357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 13035099 13035480 13035216 Y SPTLC3 SPTLC3 NA NA NA NA SPTLC3 47472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 15282242 15282264 15282251 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 965980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 17440988 17441274 17441131 Y PCSK2 NA NA NA NA NA BFSP1 106591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 17554539 17554936 17554702 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 6031 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 17557154 17557457 17557241 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA DSTN 8646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 17946136 17946538 17946496 Y SNX5,SNX5 SNORD17,SNX5,PTMAP3 NA NA NA NA SNX5 1085 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr20 20033883 20033924 20033904 Y NA NAA20,C20orf26,CRNKL1 NA NA NA NA CRNKL1 766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 20196841 20197160 20196898 Y NA NA NA NA NA NA CRNKL1 162151 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 21058164 21058497 21058329 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 46127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22339404 22339728 22339566 Y NA NA NA NA NA NA LINC00261 217552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22392618 22392869 22392732 Y NA NA NA NA NA NA LINC00261 164411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22471596 22471813 22471642 Y FOXA2,FOXA2 NA NA NA NA NA LINC00261 85467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr20 22558447 22558719 22558568 Y FOXA2,FOXA2 LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA LINC00261 1167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr20 22567524 22567732 22567628 Y NA LINC00261,FOXA2 NA NA NA NA FOXA2 3431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 180073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22776496 22776845 22776664 Y NA NA GZF1,NXT1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 212403 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 22788362 22788588 22788490 Y NA NA NXT1,THBD IMR90 Hi-C 24141950 FOXA2 224269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 23132994 23133379 23133148 Y THBD,CD93,GZF1,CST3 NA THBD K562 ChIA-PET 22265404 NXT1 195994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 23136585 23137102 23136883 Y THBD,CD93,GZF1 NA NA NA NA NA NXT1 192271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 24802781 24802981 24802881 Y NA NA FLJ33581,SYNDIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 234635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 24969855 24970103 24969979 Y NA NA NA NA NA NA ACSS1 67513 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 25047846 25048544 25048538 Y NA ACSS1 ACSS1 IMR90 Hi-C 24141950 ACSS1 10230 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 25214082 25214352 25214216 Y ENTPD6,PYGB ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 12353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr20 25227226 25227454 25227251 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 521 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 25267859 25268242 25268026 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 41154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 25291624 25291957 25291812 Y NA NA NA NA NA NA PYGB 64919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 25305115 25305524 25305270 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 64095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 25305837 25305970 25305904 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 63649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 30263480 30263875 30263840 Y NA BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 45917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 30298803 30298834 30298814 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 10958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 30303594 30303801 30303667 Y TTLL9,DUSP15 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 5991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 30793339 30793589 30793452 Y HCK,TM9SF4,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 5 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr20 31171182 31171312 31171248 Y DNMT3B,C20orf203 C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 31352490 31352753 31352633 Y C20orf203,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 4299 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 31687729 31687935 31687834 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE1 282030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 32400902 32401106 32400958 Y CHMP4B CHMP4B NA NA NA NA CHMP4B 3792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 32623943 32624156 32623948 Y NA RALY,RP5-1125A11.1 NA NA NA NA RP5-1125A11.1 43780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 32690137 32690399 32690268 Y NA EIF2S2,RPS2P1 NA NA NA NA EIF2S2 7739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 32783228 32783544 32783386 Y NA NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr20 33055325 33055363 33055345 Y NA DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 46851 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 33861234 33861630 33861491 Y NA EIF6 NA NA NA NA EIF6 9158 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 34330989 34331372 34331294 Y SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39 ROMO1,NFS1,RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA RBM39 2755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr20 34678196 34678453 34678371 Y SPAG4,PHF20 EPB41L1 LOC647979,PHF20,EPB41L1,SCAND1,C20orf152,C20orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPB41L1 770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 34681523 34681969 34681863 Y EPB41L1,DLGAP4,EPB41L1 EPB41L1 LOC647979,PHF20,EPB41L1,C20orf4,C20orf152 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPB41L1 4097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 34685769 34686042 34685906 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1,DLGAP4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L1 8343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 35874402 35874620 35874497 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 41421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 36007590 36007925 36007762 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC SRC NA NA NA NA SRC 36502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 36042310 36042952 36042529 Y NA RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 28984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 36048250 36048624 36048494 Y VSTM2L RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 23312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 36542426 36542653 36542463 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 12927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 36915599 36915947 36915773 Y KIAA1755 NA LOC100287792,RPRD1B,TTI1,TGM2,KIAA1755,BPI IMR90 Hi-C 24141950 TGM2 122619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 37280609 37280856 37280791 Y SLC32A1 NA NA NA NA NA ACTR5 94229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 37603521 37603525 37603523 Y NA DHX35 NA NA NA NA DHX35 14579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 38908222 38908337 38908279 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 407543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 39632234 39632572 39632465 Y MAFB,TOP1 TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOP1 22886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 39762558 39762863 39762778 Y NA PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 42096541 42096705 42096586 Y NA SRSF6,L3MBTL1 NA NA NA NA SRSF6 11973 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 42189975 42190335 42190153 Y SGK2,SGK2 SGK2,IFT52 NA NA NA NA SGK2 4367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 RPL27AP,MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL27AP 6898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr20 42833040 42833424 42833233 Y C20orf111 JPH2,OSER1-AS1 NA NA NA NA OSER1-AS1 4176 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43239191 43239604 43239345 Y C20orf111,STK4,ADA ADA NA NA NA NA ADA 39270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43271158 43271637 43271427 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 7237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43596220 43596403 43596301 Y SERINC3,YWHAB,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 3105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43598276 43598454 43598400 Y SERINC3,ADA,SYS1,STK4 TOMM34,STK4 NA NA NA NA STK4 5161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43972131 43972359 43972259 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 2705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 43974041 43974470 43974334 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 44056635 44056652 44056644 Y NA PIGT NA NA NA NA PIGT 13918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 44062032 44062200 44062120 Y KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6 PIGT NA NA NA NA PIGT 19315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 44136889 44137182 44137082 Y NA NA NA NA NA NA PIGT 94172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 45324546 45324927 45324721 Y TP53RK TP53RK SLC13A3,SLC2A10,C20orf123,EYA2,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 TP53RK 8128 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 18929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 45988883 45989283 45988988 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr20 46420724 46421103 46420967 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 7364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12B,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48200728 48200848 48200788 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNB1 103544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48207635 48208270 48207977 Y PTGIS NA ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 KCNB1 110451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48311078 48311758 48311363 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 16657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48313235 48313496 48313350 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 14919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48315836 48316073 48315912 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 12342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 48384741 48385230 48384965 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNRPFP1 40362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr20 48532841 48533167 48533004 Y SPATA2,SPATA2 SPATA2,RNF114 NA NA NA NA SPATA2 2761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48646361 48646933 48646559 Y NA SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 48825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 48717588 48717974 48717858 Y NA UBE2V1 NA NA NA NA UBE2V1 12522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48810888 48811172 48811109 Y B4GALT5,SLC9A8,SPATA2,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4,CEBPB NA NA NA NA CEBPB 5512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48889915 48890435 48890271 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290F20.3 7892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48900220 48901229 48900600 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 18197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 48922474 48922671 48922573 Y NA RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 40451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.90323237655901 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA RP11-290F20.3 69772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 48990561 48990720 48990640 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 108538 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 49055532 49055924 49055757 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 68967 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 49057048 49057261 49057196 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 49058248 49058472 49058381 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 66419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr20 49134968 49135201 49135019 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 10077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 49272019 49272462 49272221 Y NA NA PTPN1,PARD6B,FAM65C,BCAS4,ADNP IMR90 Hi-C 24141950 PARD6B 73619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 49378032 49378227 49378094 Y PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 31204 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.56936370835467 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50072988 50073809 50073517 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 103561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50100584 50100753 50100686 Y NFATC2 NA NA NA NA NA NFATC2 76617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NFATC2 NA NA NA NA NFATC2 713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 70300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 50323593 50323814 50323640 Y NA RP5-827A12.2 NA NA NA NA RP5-827A12.2 25258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50361169 50361338 50361278 Y NA RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA RP5-827A12.2 12097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50366318 50366439 50366379 Y NA RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 16734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.90323237655901 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 276 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 51611135 51611148 51611142 Y TSHZ2 TSHZ2 NA NA NA NA TSHZ2 24189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 51648602 51648709 51648656 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 61656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 51694232 51694450 51694303 Y TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 107286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 51775056 51775397 51775227 Y TSHZ2,TSHZ2 NA NA NA NA NA TSHZ2 188110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 51779015 51779124 51779066 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 192069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr20 51855373 51855391 51855382 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ2 268427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 51962199 51962423 51962230 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 262023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 52268867 52269118 52269044 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 44421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr20 52356771 52357178 52357063 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 132325 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52380425 52380741 52380578 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 155979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 52445043 52445455 52445100 Y NA NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 220597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 NA NA NA NA NA ZNF217 255975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52482655 52483054 52482957 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 258209 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52532315 52532889 52532591 Y ZNF217 NA SUMO1P1,BMP7,ZNF217 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 289497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA PFDN4 278815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52570477 52570680 52570623 Y NA NA NA NA NA NA PFDN4 251706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52684102 52684485 52684350 Y PFDN4 NA NA NA NA NA PFDN4 137901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 52740107 52740637 52740253 Y NA NA DOK5,SULF2,ZMYND8,BMP7,PTPRT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFDN4 81749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 55964119 55964506 55964297 Y ZBP1,MTRNR2L3,RBM38 RAE1,MTRNR2L3 NA NA NA NA RBM38 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 56010646 56011025 56010972 Y NA RBM38 NA NA NA NA RBM38 46183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 56157531 56157671 56157617 Y NA NA NA NA NA NA HMGB1P1 95448 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 56323662 56324029 56323724 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 39070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 57670365 57670649 57670522 Y NA NA ZNF831 IMR90 Hi-C 24141950 SLMO2 54401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61076779 61077313 61077048 Y DPH3P1,OGFR,DIDO1 GATA5 NA NA NA NA GATA5 27753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61514139 61514234 61514187 Y NA TCFL5 NA NA NA NA TCFL5 23024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 61585167 61585546 61585389 Y NA DIDO1,SLC17A9 NA NA NA NA SLC17A9 3115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 62085174 62085706 62085468 Y BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2 KCNQ2,EEF1A2 NA NA NA NA KCNQ2 16287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17125389 17125620 17125425 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 25045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA LINC00478 164779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 17656088 17656430 17656111 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17906909 17907886 17907248 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 251820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 304311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 23435216 23435382 23435330 Y NA NA NA NA NA NA NCAM2 1066583 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr21 26762963 26763092 26762975 Y NA NA NA NA NA NA MRPL39 214737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr21 27242944 27243154 27243052 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 136960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 27285950 27286116 27286033 Y APP NA NA NA NA NA ATP5J 179966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 27353741 27354048 27353953 Y APP NA NA NA NA NA APP 187398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 30191610 30191885 30191792 Y C21orf7 NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 63808 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr21 30543403 30543636 30543483 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 7324 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 30555048 30555502 30555259 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,BACH1 NA NA NA NA U3 4088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 30802537 30802636 30802587 Y NA NA C21orf7 IMR90 Hi-C 24141950 BACH1 238145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 31029045 31029571 31029224 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 464653 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 32781181 32781372 32781277 Y NA NA NA NA NA NA SOD1 248563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 34659541 34659728 34659635 Y NA IL10RB,IFNAR1 NA NA NA NA IL10RB 22878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 104283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36174477 36174817 36174756 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 134789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36185927 36186112 36186038 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 146239 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 168699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.56936370835467 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 175099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr21 36216696 36217156 36217046 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 177008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 36219873 36220239 36220187 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 180185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 181061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36223731 36223900 36223856 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 184043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 36227422 36227493 36227482 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 187734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 36233216 36233747 36233583 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 193528 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 194865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 36257911 36258724 36258067 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA CLIC6 218223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 37222368 37222731 37222491 Y MORC3 NA RUNX1,LOC100506385,LINC00160,CLIC6 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX1 152234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr21 38189032 38189251 38189142 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 119599 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 38349168 38349478 38349323 Y TTC3,DYRK1A,HLCS AP000704.5,HLCS NA NA NA NA HLCS 11058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 40159439 40159794 40159507 Y NA ETS2 ETS2,LINC00114 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ETS2 15437 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 40338093 40338255 40338153 Y NA NA ETS2,LINC00114,PSMG1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 162862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 40753076 40753485 40753292 Y WRB HMGN1,WRB NA NA NA NA WRB 2906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 43885293 43886049 43885531 Y ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 28069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr21 43887564 43887652 43887608 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA SLC37A1 26466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 43944597 43944892 43944856 Y NA SLC37A1,RSPH1 NA NA NA NA RSPH1 30133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44072717 44073208 44072832 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 NA NA NA NA NA U2AF1 71459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44631329 44631684 44631488 Y NA NA LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319 IMR90 Hi-C 24141950 U2AF1 105632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44753292 44753457 44753456 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr21 44760713 44760913 44760830 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 84095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44831131 44831382 44831257 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 13626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44850435 44851222 44850996 Y CBS SIK1,LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 5427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr21 44914466 44914931 44914660 Y PDXK,U2AF1,SIK1 LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 17052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA LINC00313 CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00313 20588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44936784 44937143 44936907 Y PDXK LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 39370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 44937921 44938237 44938215 Y NA LINC00313 NA NA NA NA LINC00313 40507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 44951247 44951619 44951433 Y NA NA NA NA NA NA LINC00313 53833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 45029471 45029828 45029593 Y PDXK HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA HSF2BP 47546 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 45426552 45426831 45426638 Y NA TRAPPC10,H2AFZP1 NA NA NA NA TRAPPC10 3369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 45441566 45441868 45441701 Y C21orf2,TRAPPC10 TRAPPC10,H2AFZP1 PWP2,C21orf33 IMR90 Hi-C 24141950 TRAPPC10 11366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 45563949 45564214 45564057 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 12462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 46749941 46750271 46750188 Y NA POFUT2 COL18A1,LINC00315,LOC642852,POFUT2,COL18A1-AS1,LOC100129027,PCBP3,ADARB1,SLC19A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 POFUT2 44128 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr21 46786853 46787266 46786994 Y COL18A1,POFUT2 COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 35786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 47167832 47168236 47167895 Y NA NA PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 106224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 47442529 47442669 47442610 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 42878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 47480637 47481027 47480832 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 34984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 47563985 47564239 47564071 Y NA COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 47974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr21 47993556 47993894 47993723 Y DIP2A,S100B,PRMT2 NA NA NA NA NA PRMT2 59185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 48042238 48042469 48042310 Y DIP2A,PRMT2 PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRMT2 10610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr21 48046497 48046712 48046597 Y DIP2A,PRMT2 PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRMT2 6367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 17697692 17697885 17697853 Y BCL2L13,IL17RA,CECR1 AC005300.5 NA NA NA NA AC005300.5 25866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 177574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr22 19400101 19400223 19400162 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 17202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 19433007 19433028 19433018 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 20258205 20258516 20258358 Y NA RTN4R,DGCR6L NA NA NA NA RTN4R 10253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 21117223 21117320 21117272 Y AIFM3 SERPIND1 NA NA NA NA SERPIND1 8847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 22186398 22186549 22186531 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 33421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 22603390 22603658 22603457 Y TOP3B,VPREB1 NA NA NA NA NA TOP3B 268177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 24234499 24234593 24234547 Y NA SLC2A11,MIF NA NA NA NA MIF 308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr22 24594084 24594331 24594185 Y DDTL,GGT1 SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 18857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 24603797 24604355 24604162 Y GGT1,ADORA2A SUSD2 NA NA NA NA SUSD2 28570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 24752898 24753006 24752951 Y UPB1 NA NA NA NA NA ADORA2A 58841 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 24870306 24870552 24870389 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 58459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 24878539 24879065 24878732 Y GGT1 NA NA NA NA NA ADORA2A 66692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 24882484 24882627 24882564 Y GGT1 NA NA NA NA NA SNRPD3 66844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 25354945 25355076 25355012 Y NA NA KIAA1671,SGSM1,TMEM211 IMR90 Hi-C 24141950 SGSM1 154709 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 26921035 26921055 26921043 Y TPST2 HPS4,SRRD,TFIP11 NA NA NA NA TFIP11 14564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 26967025 26967265 26967145 Y TFIP11 TPST2 NA NA NA NA TPST2 23416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27415901 27416173 27415987 Y NA NA NA NA NA NA RP1-40G4P.1 134390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27503626 27504166 27503976 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 114522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 27509734 27509987 27509841 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 108701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 27637752 27637979 27637866 Y NA RP5-1172A22.1,CTA-929C8.5 MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 19064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 29215471 29215733 29215666 Y XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,CHEK2,HSCB,C22orf31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 20800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 29218930 29219398 29218977 Y NA XBP1,CTA-292E10.6 TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 24259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 29280564 29280869 29280661 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 2984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 29319930 29320200 29320120 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 42350 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 20486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30440424 30440670 30440589 Y MTMR3,OSM,CCDC157 NA NA NA NA NA MTMR3 163280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30584123 30584251 30584196 Y NA NA NA NA NA NA LIF 56589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 30648392 30648767 30648580 Y SF3A1 LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 7552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30649196 30649657 30649496 Y MTMR3,TBC1D10A,SF3A1,DUSP18,LIF,OSM LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 8356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr22 30808332 30808723 30808528 Y NA SEC14L2,RNF215,MTFP1 NA NA NA NA RNF215 7037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 30938421 30938985 30938910 Y LIF,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18 SIRPAP1 NA NA NA NA SIRPAP1 1898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 31291343 31291446 31291429 Y SEC14L4,OSBP2 NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 73217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 31294163 31294373 31294268 Y OSBP2 NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 70290 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 31617973 31618078 31618026 Y RNF185,SFI1,EIF4ENIF1,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 11748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 31665995 31666466 31666007 Y NA PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 20054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 33277060 33277478 33277268 Y NA NA NA NA NA NA TIMP3 81373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 34238519 34238784 34238666 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 139613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 34265977 34266148 34266046 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 167071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 34315412 34315698 34315644 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 216506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 34317541 34317731 34317667 Y LARGE NA NA NA NA NA SNORA76 218635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 35708559 35708961 35708654 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 15291 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 35983528 35983815 35983759 Y NA RASD2 NA NA NA NA RASD2 48613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 36149671 36149849 36149827 Y NA NA APOL5 IMR90 Hi-C 24141950 APOL6 107229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 36385915 36386246 36386112 Y NA RBFOX2 NA NA NA NA RBFOX2 36227 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 36815362 36815553 36815536 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-633O19__A.1 32691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 36829412 36829614 36829519 Y FOXRED2,FOXRED2 MYH9,RP4-633O19__A.1,RP5-1119A7.14,TXN2 TXN2,MYH9 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1119A7.14 19377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 36847830 36847945 36847861 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4,CSF2RB RP5-1119A7.14,TXN2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 1046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 9245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 RAC2 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 24738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 37731445 37731637 37731610 Y NA NA NA NA NA NA RP1-63G5.5 89843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 37937864 37938255 37937972 Y SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1 CARD10,CDC42EP1 CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 16199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr22 37997690 37997947 37997695 Y GGA1,GGA1 CDC42EP1,GGA1,SH3BP1 CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GGA1 4534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 38599886 38600218 38600032 Y NA MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 38859370 38859653 38859488 Y NA KDELR3,DDX17 NA NA NA NA KDELR3 2414 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 39154682 39154985 39154835 Y APOBEC3G,APOBEC3D,JOSD1,SUN2,SUN2 SUN2,DNAL4 NA NA NA NA SUN2 33163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 39705997 39706111 39706064 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 8283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 39801832 39802048 39801979 Y NA TAB1 NA NA NA NA TAB1 8086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 41003149 41003516 41003333 Y NA MKL1 NA NA NA NA MKL1 27190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr22 41128851 41129054 41128911 Y NA NA XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17 IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP37 60396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 42257974 42258323 42258180 Y CENPM SREBF2 NA NA NA NA SREBF2 30865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43084467 43084751 43084635 Y TSPO,MCAT,CYB5R3,A4GALT CYB5R3,A4GALT NA NA NA NA A4GALT 30553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43178512 43178746 43178699 Y NA NA NA NA NA NA A4GALT 63208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43233624 43233705 43233665 Y NA ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 18407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43327460 43327806 43327638 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA ARFGAP3 75348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 43415245 43415535 43415390 Y NA PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 6094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 45554826 45555155 45554995 Y KIAA0930 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 2507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 45615470 45615494 45615482 Y NA KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 19156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 45624322 45624510 45624404 Y KIAA0930 KIAA0930 NA NA NA NA KIAA0930 10140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930 LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 30268 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 45944996 45945587 45945178 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 48878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3157 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763 NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr22 47045339 47045722 47045527 Y PPARA,TTC38 NA NA NA NA NA GRAMD4 75430 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 47149923 47150411 47150155 Y NA CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 6107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 47150443 47150659 47150583 Y CERK,TBC1D22A CERK,TBC1D22A CERK MCF7 ChIA-PET 22265404 TBC1D22A 5859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 48146543 48146838 48146641 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 121120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 450168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 50105800 50106184 50105992 Y NA NA NA NA NA NA BRD1 112976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50262824 50262951 50262946 Y TUBGCP6,MLC1 BRD1,ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 17334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50273824 50274276 50274235 Y TUBGCP6,HDAC10,ZBED4 ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 28334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50327730 50328489 50328002 Y TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 17624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr22 50414821 50415138 50414874 Y BRD1,TUBGCP6,TRABD,PANX2,HDAC10,PIM3 NA NA NA NA NA PIM3 62660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50680113 50680250 50680180 Y SELO SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 1171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr22 50891150 50891343 50891221 Y MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2 SBF1,ADM2 NA NA NA NA SBF1 20111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B NA NA NA NA CTA-384D8.31 4415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr22 51051274 51051666 51051314 Y NA CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA NA NA NA NA ARSA 12941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 4561829 4562207 4561897 Y BHLHE40,ITPR1 ITPR1 NA NA NA NA ITPR1 28797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B NA NA NA NA NA BHLHE40 235106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 4863691 4864149 4863808 Y BHLHE40 NA NA NA NA NA BHLHE40 154652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 5027453 5027635 5027574 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 8652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 5028057 5028369 5028268 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 9256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 9733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 5030402 5030899 5030722 Y NA BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 11601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 5058332 5058543 5058409 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BHLHE40 39531 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 5065036 5065378 5065161 Y BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 46235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40 49173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 5237403 5237551 5237430 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 10072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1346366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 8524896 8525313 8525187 Y LMCD1 LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 16080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 8540908 8541201 8541046 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 8544131 8544195 8544133 Y NA LMCD1 NA NA NA NA LMCD1 2738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 8783302 8783537 8783436 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 219920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 9287603 9287640 9287617 Y NA NA NA NA NA NA THUMPD3 114886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 10157932 10158133 10158106 Y NA BRK1,VHL,IRAK2 NA NA NA NA BRK1 2656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 10395342 10395455 10395399 Y NA SEC13 NA NA NA NA SEC13 34480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 11688028 11688035 11688032 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 72185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 12163583 12163954 12163774 Y SYN2 TIMP4 NA NA NA NA TIMP4 34897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 12345089 12345969 12345668 Y RAF1,PPARG,PPARG,PPARG PPARG NA NA NA NA PPARG 18222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 12398616 12399008 12398699 Y RAF1,PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 71749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 13455554 13455885 13455702 Y NUP210 NUP210 NA NA NA NA NUP210 3924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 14466133 14466429 14466346 Y C3orf19,XPC,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 24057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 14495430 14495824 14495495 Y NR2C2,C3orf19,XPC,SLC6A6 NA NA NA NA NA SLC6A6 53354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 15704167 15704382 15704274 Y ANKRD28,CAPN7 NA NA NA NA NA HACL1 62829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 16381472 16381685 16381579 Y NA NA NA NA NA NA OXNAD1 76766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 17378312 17378639 17378476 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 536153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 17913596 17913897 17913750 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 570412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 18403160 18403568 18403352 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 80741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 18624230 18624279 18624270 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 46065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 23700744 23701062 23700980 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 144332 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 24370369 24370393 24370381 Y NA NA NA NA NA NA THRB 164380 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 24459735 24459834 24459785 Y NA NA NA NA NA NA THRB 74939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 25494741 25494759 25494749 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 209639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 25623618 25623990 25623898 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 80408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 26688087 26688474 26688152 Y LRRC3B NA NA NA NA NA NEK10 720477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 27448684 27449023 27448831 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr3 27756583 27756832 27756794 Y EOMES EOMES NA NA NA NA EOMES 5374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 28049666 28050044 28049928 Y EOMES,CMC1 NA NA NA NA NA CMC1 231031 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 30327576 30327949 30327658 Y TGFBR2 NA TGFBR2 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBR2 318045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 32002546 32002801 32002555 Y NA ZNF860 NA NA NA NA ZNF860 18462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 32463504 32463726 32463567 Y CMTM6 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 32341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 32534481 32534843 32534759 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 8057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 33478074 33478410 33478365 Y NA UBP1 NA NA NA NA UBP1 2453 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 34811902 34812223 34812063 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6IP 974058 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 37904355 37904605 37904570 Y NA AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 2904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 38227489 38227608 38227524 Y NA MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 22909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 39191403 39191804 39191748 Y NA TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 2249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 39192381 39192719 39192586 Y WDR48,CSRNP1 TTC21A,GORASP1,CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 1334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 RNU4-78P NA NA NA NA RNU4-78P 40097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 42601905 42602046 42601976 Y NA SS18L2,NKTR,SEC22C NA NA NA NA SS18L2 19286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 43368782 43368949 43368860 Y NA SNRK NA NA NA NA SNRK 42778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 87790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45164613 45164770 45164669 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 21144 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 20102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45512532 45512880 45512706 Y NA NA NA NA NA NA LIMD1 82006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45609249 45609611 45609389 Y LIMD1 LIMD1 NA NA NA NA LIMD1 14363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45657242 45657607 45657425 Y NA NA NA NA NA NA LIMD1 62356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 45688648 45689066 45688756 Y LIMD1 SACM1L SACM1L,LOC644714 IMR90 Hi-C 24141950 SACM1L 39482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 46036343 46036779 46036493 Y CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1 FYCO1 NA NA NA NA FYCO1 1027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 46152557 46153082 46152773 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1 NA CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 117241 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 46989736 46990203 46989983 Y SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12 NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 28970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 47204029 47204492 47204291 Y NA SETD2,KIF9-AS1 NA NA NA NA KIF9-AS1 42 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 47420724 47420876 47420775 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 48330483 48330839 48330661 Y PLXNB1 ZNF589,NME6 NA NA NA NA NME6 10336 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 48332679 48332937 48332732 Y SPINK8 NME6 NA NA NA NA NME6 8238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 48734201 48734270 48734236 Y NA NCKIPSD,IP6K2 NA NA NA NA NCKIPSD 12404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 49105949 49106080 49106015 Y ARIH2 DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS NA NA NA NA QRICH1 23716 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 49286239 49286578 49286497 Y ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4 NA NA NA NA NA KLHDC8B 79195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 49910212 49910542 49910377 Y ZMYND10,NAT6,HYAL3,GNAI2 TRAIP CAMKV K562 ChIA-PET 22265404 TRAIP 18205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 50204844 50205012 50204945 Y NA SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 14366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 51377903 51378233 51378113 Y NA MANF,RBM15B NA NA NA NA MANF 42245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 51506153 51506528 51506417 Y VPRBP,RAD54L2,GPR62 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 25482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 51573530 51573858 51573781 Y VPRBP,RAD54L2 VPRBP NA NA NA NA VPRBP 41520 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 52009750 52010220 52010093 Y NA RRP9,PARP3,PCBP4,ABHD14A,ABHD14A-ACY1,ACY1,ABHD14B,RPL29 NA NA NA NA ABHD14A-ACY1,ACY1 2684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 52235110 52235291 52235183 Y PBRM1,PBRM1,GLYCTK,DNAH1 POC1A,ALAS1,RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M NA NA NA NA ALAS1 5008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 53283824 53284319 53284192 Y PRKCD,DCP1A TKT NA NA NA NA TKT 3749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 53876999 53877298 53877116 Y CHDH CHDH,IL17RB,ACTR8,SELK NA NA NA NA CHDH 1119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 56443112 56443203 56443174 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 145986 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 56925207 56925322 56925265 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF3 186035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 57566206 57566518 57566262 Y NA DNAH12,PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 15429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 57937235 57937402 57937348 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 54725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 57945627 57945950 57945779 Y PDE12 FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 46177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 57963451 57963815 57963633 Y NA FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 28312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 57969350 57969849 57969627 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 22278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 57995654 57995894 57995762 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 58029786 58030054 58029903 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 37659 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 58162589 58162663 58162637 Y KCTD6 NA NA NA NA NA ABHD6 58570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 58457172 58457525 58457255 Y RPP14,RPP14,KCTD6 PDHB,KCTD6 PXK,RPP14,KCTD6,ACOX2,PDHB IMR90 Hi-C 24141950 KCTD6 18316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 58984210 58984527 58984399 Y NA C3orf67 NA NA NA NA C3orf67 49283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 61828479 61828865 61828501 Y PTPRG NA NA NA NA NA RPL10AP6 101699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 62214246 62214436 62214339 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 88212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 64626762 64626883 64626823 Y ADAMTS9 ADAMTS9 NA NA NA NA ADAMTS9 44793 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 65045774 65045784 65045779 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 374098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 66547159 66547390 66547275 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 2297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 69228052 69228449 69228187 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 95957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71222111 71222440 71222307 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 408700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71478043 71478236 71478134 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 152904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71493467 71493739 71493621 Y EIF4E3 NA NA NA NA NA FOXP1 137401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 71494304 71494367 71494336 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 136773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 72536556 72536893 72536709 Y RYBP RYBP PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RYBP 42487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 72640026 72640175 72640110 Y NA NA NA NA NA NA RYBP 145957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 72936024 72936237 72936180 Y RYBP,EBLN2 SHQ1,GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA GXYLT2 800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 73049169 73049333 73049244 Y PPP4R2,EBLN2 PPP4R2 NA NA NA NA PPP4R2 5233 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 81766105 81766391 81766248 Y NA GBE1 NA NA NA NA GBE1 42921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 98497288 98497481 98497360 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 121052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 98505158 98505735 98505540 Y ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 112798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 98572463 98572830 98572744 Y NA DCBLD2,CTD-2021J15.1 NA NA NA NA DCBLD2 45703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 99570772 99571127 99571120 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 260230 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 99575221 99575605 99575379 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 255752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 99579229 99579736 99579484 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 251621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 99587238 99587483 99587373 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 243874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 99766371 99766625 99766459 Y NA NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 64732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 100482455 100482783 100482461 Y NA NA NA NA NA NA TFG 56250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 100492916 100493238 100493125 Y NA NA NA NA NA NA TFG 66711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 101555569 101555949 101555674 Y ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 10734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 101899188 101899342 101899284 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 354353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 101901132 101901377 101901290 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFKBIZ 356297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 103710556 103710861 103710689 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1372892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 103861090 103861239 103861165 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 1222514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr3 105087916 105088171 105088021 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 4163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 111420857 111420932 111420895 Y NA PLCXD2,PHLDB2 PHLDB2,CD96,ABHD10 IMR90 Hi-C 24141950 PHLDB2 28412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 111480028 111480653 111480348 Y NA PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 30684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 111583903 111584464 111583984 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA ABHD10 111393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 111589313 111589732 111589431 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 106125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 111866338 111866609 111866454 Y NA NA NA NA NA NA C3orf52 63156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112395778 112395997 112395824 Y CCDC80 CCDC80 CCDC80 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC80 29401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112404368 112404581 112404378 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 37991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112436805 112436974 112436889 Y NA NA CD200R1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 70428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112465605 112465931 112465711 Y CCDC80,CD200R1 NA CD200R1,CCDC80,CD200R1L,GTPBP8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 99228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112966345 112966604 112966475 Y NA BOC NA NA NA NA BOC 38495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 112994855 112995215 112995035 Y NA NA NA NA NA NA BOC 67005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 113078924 113079182 113079053 Y NA NA NA NA NA NA BOC 151074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 113502348 113502517 113502411 Y KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NAA50,ATP6V1A,GRAMD1C NA NA NA NA ATP6V1A 38482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA RP11-435F17.3 NA NA NA NA RP11-435F17.3 36600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 113704407 113704728 113704558 Y SIDT1,KIAA2018,KIAA1407,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 17952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114146274 114146539 114146501 Y ZDHHC23,ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 372814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114212122 114212387 114212225 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 438662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114246828 114247170 114246841 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 473368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114257066 114257260 114257069 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 483606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114261968 114262342 114261973 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 488508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114289290 114289509 114289367 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 515830 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 114354102 114354718 114354116 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA ZBTB20 509400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 114374818 114375057 114374945 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 489061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 638640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 115545713 115545826 115545800 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 681595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 115696572 115696769 115696673 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 832454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 116118770 116119229 116119052 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 624316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 119157549 119157626 119157588 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 28051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 119866352 119866515 119866428 Y NA NA NA NA NA NA RP11-18H7.1 54610 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 120344562 120344833 120344698 Y NA NDUFB4 NA NA NA NA NDUFB4 31406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 120355972 120356358 120356256 Y NA NDUFB4,HGD NA NA NA NA NDUFB4 42816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 120361404 120361730 120361550 Y NA NDUFB4,HGD NA NA NA NA HGD 37688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA HGD NA NA NA NA HGD 1730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 121933818 121933831 121933825 Y NA NA NA NA NA NA CSTA 108260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 122485125 122485355 122485240 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 25316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA ADCY5 63017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123355394 123355731 123355464 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 53005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 123388051 123388291 123388171 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 85662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123391718 123392030 123392015 Y ADCY5,MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 89329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 123476863 123477567 123477241 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK 123611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr3 124419861 124420177 124419915 Y KALRN UMPS NA NA NA NA UMPS 27036 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 124531464 124532111 124531823 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 84251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr3 124564415 124564677 124564502 Y HEG1,ITGB5 NA NA NA NA NA ITGB5 53588 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 124605050 124605342 124605178 Y ITGB5 ITGB5 NA NA NA NA ITGB5 12923 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 124781797 124782117 124781832 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 8995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 126569545 126569928 126569643 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA1 135509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 126680194 126680270 126680232 Y NA PLXNA1 NA NA NA NA PLXNA1 25167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 127404993 127405883 127405741 Y MGLL ABTB1 NA NA NA NA ABTB1 15215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 127465577 127465875 127465733 Y NA NA NA NA NA NA MGLL 74176 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 127494660 127494939 127494869 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 45112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 127539467 127539812 127539513 Y MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 239 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 127813021 127813267 127813144 Y NA SEC61A1 NA NA NA NA SEC61A1 44537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 127831332 127831517 127831439 Y GATA2,GATA2 EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA EEFSEC 38780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 128831103 128831496 128831287 Y NA RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 8148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 128838520 128838686 128838629 Y MBD4,C3orf37,C3orf37,RAB7A,KIAA1257,ISY1,CNBP,GP9,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 128946609 128946967 128946881 Y MBD4,KIAA1257,GP9,RAB43,ISY1,CNBP CNBP KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 45844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 129167159 129167354 129167260 Y NA MBD4,IFT122 NA NA NA NA IFT122 10191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 129244298 129244494 129244413 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 79167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 129315034 129315445 129315335 Y COPG,PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 8216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 129315678 129315871 129315798 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 7790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 131056791 131057139 131056963 Y NA NUDT16 NA NA NA NA NUDT16 41376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 134067109 134067364 134067237 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 6039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 134357896 134357929 134357912 Y NA EPHB1 NA NA NA NA EPHB1 43253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 134866609 134866740 134866714 Y NA NA NA NA NA NA EPHB1 551966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 135828343 135828732 135828538 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 85351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 136571906 136572239 136572061 Y TMEM22 RP11-85F14.5,NCK1 NA NA NA NA RP11-85F14.5 6657 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 137707770 137708146 137707919 Y NA NA NA NA NA NA DZIP1L 124514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 138438822 138439037 138438988 Y PRR23C NA NA NA NA NA PIK3CB 112743 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 141129371 141129776 141129494 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 74113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 141131755 141132151 141131882 Y NA NA NA NA NA NA RASA2 71738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 141217752 141218175 141217834 Y ATP1B3,RASA2 RASA2 NA NA NA NA RASA2 13863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 142580771 142580984 142580878 Y NA RP11-372E1.1,PCOLCE2 NA NA NA NA PCOLCE2 25061 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 143696383 143696503 143696442 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 7743 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 143705621 143705974 143705695 Y C3orf58,C3orf58 C3orf58 NA NA NA NA C3orf58 16981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 35798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 148318861 148319089 148318964 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 388039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 148320086 148320294 148320209 Y NA NA NA NA NA NA GYG1 386834 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 148781933 148782210 148782183 Y NA HLTF NA NA NA NA HLTF 20131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 148942843 148943311 148943144 Y NA CP NA NA NA NA CP 5001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA TM4SF18,TM4SF1 NA NA NA NA TM4SF18 7548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149104739 149105065 149104981 Y COMMD2,TM4SF1 TM4SF1 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TM4SF1 11087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr3 149119420 149119639 149119543 Y NA TM4SF1 WWTR1,ANKUB1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 25768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA TM4SF4 GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF4 38319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149194266 149194620 149194394 Y CP,TM4SF4 TM4SF4,RP11-278L15.6 NA NA NA NA TM4SF4 4505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149225388 149225682 149225672 Y RNF13 TM4SF4,RP11-278L15.6 NA NA NA NA RP11-278L15.6 14941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149265788 149265935 149265852 Y WWTR1 NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 55341 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149361418 149361700 149361559 Y WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 90801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149592323 149592638 149592448 Y RNF13 NA NA NA NA NA RNF13 63828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr3 149669691 149669713 149669697 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 14459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 149902049 149902225 149902137 Y NA NA PFN2,LOC646903,TSC22D2,RNF13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 135474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 151507223 151507685 151507381 Y NA RP11-64D22.2,AADAC NA NA NA NA RP11-64D22.2 21007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 151582597 151582803 151582700 Y NA SUCNR1 MED12L IMR90 Hi-C 24141950 SUCNR1 6628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 151593609 151593922 151593765 Y NA SUCNR1 NA NA NA NA SUCNR1 4178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 151923088 151923367 151923343 Y MBNL1 MBNL1 MBNL1,LOC401093 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MBNL1 36250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152030036 152030551 152030147 Y MBNL1,MBNL1 MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 44692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152100220 152100544 152100298 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 114876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152120876 152121103 152120983 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 135532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152215203 152215520 152215350 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 229859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152236739 152236782 152236761 Y NA NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 251395 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152856443 152856813 152856615 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 21216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 155705974 155706059 155706016 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 119649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 156252887 156253352 156253202 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 17621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 156432757 156433079 156432845 Y CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP,TIPARP-AS1 NA NA NA NA TIPARP-AS1 42590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 156837520 156837824 156837670 Y NA CCNL1 NA NA NA NA CCNL1 38725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA GFM1 133213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 158463445 158463640 158463543 Y NA MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 15458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 159572503 159572920 159572729 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 131617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 159765726 159765787 159765757 Y NA NA IQCJ-SCHIP1 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 61189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 163153271 163153291 163153281 Y NA NA NA NA NA NA SI 1640992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 163200280 163200389 163200295 Y NA NA NA NA NA NA SI 1593894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 168449002 168449381 168449192 Y NA NA NA NA NA NA EGFEM1P 483692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 168788746 168789150 168788947 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 590256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 168930237 168930275 168930257 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 449131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr3 169075984 169076327 169076322 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 303079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 169300300 169300658 169300540 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 78748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 169376089 169376313 169376201 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 3093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 170187041 170187306 170187175 Y NA KRT8P13 NA NA NA NA KRT8P13 24110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 117203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 170584649 170585013 170584680 Y NA RPL22L1,EIF5A2 NA NA NA NA RPL22L1 1259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 170841724 170842009 170841889 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A2 99185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 170883066 170883220 170883212 Y TNIK NA NA NA NA NA SLC2A2 140527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 170957638 170957941 170957717 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A2 215099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 170966636 170966947 170966845 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 209250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171175851 171176236 171176082 Y TNIK NA NA NA NA NA TNIK 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171176900 171177208 171176991 Y TNIK TNIK NA NA NA NA TNIK 703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 171270994 171271171 171271126 Y PLD1,FNDC3B NA SLC2A2,TNIK,EIF5A2,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 TNIK 94797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171543191 171543627 171543455 Y FNDC3B,PLD1 PP13439,PLD1 FNDC3B,PLD1,TMEM212 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLD1 16451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171825348 171825521 171825406 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 69930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171826024 171826613 171826515 Y FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 70606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 171853185 171854055 171853751 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 97767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 171863188 171863575 171863224 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 107770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA BZW1P1 188097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 172086059 172086253 172086084 Y NA NA NA NA NA NA BZW1P1 56626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 172229975 172230511 172230380 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 8786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 172280796 172281206 172280981 Y TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NCEH1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF10 41499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 172416643 172417031 172416658 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 9977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2 NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2 NA NA NA NA ECT2 43612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 174652666 174653024 174652845 Y NA NA NA NA NA NA NAALADL2 498303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 175150931 175151331 175151195 Y NA NA NA NA NA NA UBE2V1P2 283127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 177018025 177018414 177018104 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 104764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 177315732 177315915 177315819 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 216738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 177623365 177623625 177623388 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 90712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 177719503 177719830 177719752 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91K9.1 186850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 178236932 178237225 178237103 Y KCNMB2,KCNMB2 NA KCNMB2 IMR90 Hi-C 24141950 ZMAT3 550842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 182980917 182981737 182981029 Y NA B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 11885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr3 183024720 183025033 183024891 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA B3GNT5 55688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 184078263 184078665 184078465 Y NA EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,THPO,CHRD NA NA NA NA POLR2H 757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 184775166 184775451 184775309 Y VPS8 NA NA NA NA NA EIF2S2P2 186778 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 185008125 185008353 185008229 Y NA EIF2S2P2,EHHADH,MAP3K13 NA NA NA NA MAP3K13 9396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 185034789 185035224 185034953 Y NA EHHADH,MAP3K13 NA NA NA NA MAP3K13 36060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 185036051 185036269 185036182 Y NA EHHADH,MAP3K13 NA NA NA NA MAP3K13 37322 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 185484664 185484670 185484667 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 56174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 185825302 185825582 185825395 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr3 186733684 186733815 186733810 Y NA NA NA NA NA NA ST6GAL1 87410 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 187467867 187468249 187468141 Y BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 6352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 187574248 187574709 187574377 Y NA NA NA NA NA NA BCL6 112733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 187754201 187754558 187754362 Y NA NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 LPP 114514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 187904912 187905263 187905013 Y BCL6,BCL6 LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 35067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 187980692 187981197 187980748 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 110847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 187983465 187984215 187983993 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 113620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 188012691 188013249 188012784 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 142846 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188017658 188018009 188017791 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 147813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188035801 188035961 188035890 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 165956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188118346 188118612 188118425 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 248501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188151524 188151812 188151760 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 281679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188312026 188312153 188312088 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 442181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 188406951 188407256 188407141 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 537106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 188668723 188669229 188668886 Y NA NA LPP,BCL6,LPP-AS2,LOC100131635 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LPP-AS2 798878 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1 885200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 189006455 189006689 189006536 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1 831537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 189022377 189022942 189022424 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1 815284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 189029389 189029728 189029564 Y NA NA NA NA NA NA LEPREL1 808498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 189842010 189842154 189842110 Y TMEM207 LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1 3784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 190336230 190336434 190336308 Y IL1RAP NA NA NA NA NA IL1RAP 106390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 239725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 NA NA NA NA NA HES1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194040514 194040910 194040840 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 176183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194041526 194041906 194041553 Y HES1 NA NA NA NA NA ATP13A3 175187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194212902 194213208 194212990 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 3885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194227767 194228126 194227819 Y ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 10674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr3 194341751 194341921 194341813 Y NA TMEM44-AS1,AC046143.3,TMEM44,LSG1 NA NA NA NA AC046143.3 9731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 194881062 194881476 194881270 Y FAM43A,C3orf21 NA NA NA NA NA XXYLT1 108420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA NA NA NA NA NA XXYLT1 90614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 194973636 194973680 194973658 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 16216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 195034615 195034891 195034753 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 44719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 195542423 195542578 195542499 Y MUC20,MUC4 NA NA NA NA NA APOD 233347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 195632869 195633225 195632990 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2 NA NA NA NA NA TFRC 173835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 195891844 195892227 195892035 Y NA NA NA NA NA NA TFRC 84784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 196757369 196757726 196757658 Y LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2 AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 2682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr3 197247664 197248059 197247722 Y NA NA NA NA NA NA AC024560.3 104718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr3 197301708 197302062 197301885 Y NA NA NA NA NA NA AC024560.3 50715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 50610 50903 50681 Y NA NA NA NA NA NA ABCA11P 415015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 991255 991645 991565 Y ZNF721,PDE6B,CPLX1,TMEM175 DGKQ,IDUA,SLC26A1,FGFRL1 NA NA NA NA SLC26A1 6027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1035263 1035607 1035280 Y FGFRL1,FGFRL1 FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 33539 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1710531 1710811 1710671 Y NA SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 1471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1796551 1796852 1796752 Y NA FGFR3 NA NA NA NA FGFR3 3517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 1970462 1970680 1970571 Y NA SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 3683 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 3026 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 3389642 3390154 3389980 Y HTT,RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 96887 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 3493312 3493795 3493528 Y NA LRPAP1 NA NA NA NA LRPAP1 38491 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 5671799 5672167 5671822 Y CRMP1 EVC NA NA NA NA EVC 38757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 6511373 6511666 6511520 Y PPP2R2C,PPP2R2C NA NA NA NA NA PPP2R2C 51661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,AC093323.3,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 S100P,MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 6895356 6895637 6895499 Y KIAA0232 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 13332 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 6919401 6919899 6919549 Y MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 10432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 6920106 6920340 6920183 Y MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 11137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 7807485 7807548 7807490 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 132105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 7972368 7972631 7972565 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 32715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 7978189 7978377 7978271 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 38536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 8254530 8254695 8254600 Y NA HTRA3 NA NA NA NA HTRA3 14797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 10040752 10040894 10040815 Y NA RP11-448G15.1 NA NA NA NA RP11-448G15.1 34646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 10116801 10117310 10116981 Y WDR1 WDR1 NA NA NA NA WDR1 228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 12189077 12189099 12189089 Y NA NA NA NA NA NA RP11-352E6.2 451162 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 13329661 13329866 13329822 Y NA HSP90AB2P HSP90AB2P IMR90 Hi-C 24141950 HSP90AB2P 3172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 13623241 13623510 13623376 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 8713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 AC006445.7 290207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 14809578 14809765 14809678 Y NA NA BOD1L IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 192533 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15036867 15037072 15036952 Y NA CPEB2 NA NA NA NA CPEB2 34569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15074859 15075210 15075035 Y NA NA NA NA NA NA CPEB2 72561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15151544 15151754 15151565 Y NA NA CPEB2 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB2 149246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15533007 15533164 15533086 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 63518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15536628 15536631 15536630 Y NA NA FBXL5 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 67139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 15553738 15553982 15553851 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 84249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 16003610 16004023 16003987 Y NA NA NA NA NA NA PROM1 79978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 17495942 17496188 17496050 Y MED28,LAP3 QDPR NA NA NA NA QDPR 15669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 17642152 17642177 17642165 Y CLRN2 MED28 NA NA NA NA MED28 27898 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 19825132 19825140 19825136 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 368515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 22636795 22637032 22636911 Y GBA3 RP11-10G12.1 NA NA NA NA RP11-10G12.1 42976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 23879721 23879980 23879976 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 23732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 25536997 25537326 25537166 Y NA NA NA NA NA NA SLC34A2 117597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 25808541 25808922 25808732 Y NA NA NA NA NA NA SEL1L3 54460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 25867382 25867475 25867429 Y SLC34A2 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 4000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 25881877 25882168 25881954 Y RBPJ,SLC34A2,SEL1L3 SEL1L3 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 18495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 25972032 25972237 25972135 Y NA NA RBPJ,C4orf52,TBC1D19,STIM2,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 108650 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 26347905 26348036 26347971 Y NA NA NA NA NA NA CCKAR 142048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 26449466 26449471 26449469 Y NA CCKAR NA NA NA NA CCKAR 40613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 28621646 28621809 28621725 Y NA NA NA NA NA NA STIM2 1764346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 30954313 30954516 30954336 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 234276 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 37668347 37668621 37668474 Y NA RELL1 NA NA NA NA RELL1 17377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38159115 38159505 38159287 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 199059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38162520 38162833 38162765 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 202464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 38281500 38281609 38281534 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 321444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38320550 38320897 38320770 Y NA NA FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF3 342920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3 NA NA NA NA KLF3 4800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38673994 38674276 38674074 Y NA KLF3 NA NA NA NA KLF3 10177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38735219 38735515 38735398 Y NA NA KLF3,TBC1D1,FLJ13197 IMR90 Hi-C 24141950 KLF3 71402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,TLR6,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1,TLR6 2696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 39045588 39045914 39045752 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 39152863 39152994 39152905 Y NA WDR19 TLR10,FAM114A1,KLB IMR90 Hi-C 24141950 WDR19 29030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 39503771 39503950 39503862 Y NA RPL9,LIAS,UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH-AS1 23689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 39548258 39548506 39548382 Y KLHL5 UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH 20327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 39894546 39894889 39894718 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 82687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 39935708 39936100 39935904 Y NA PDS5A NA NA NA NA PDS5A 41476 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 40050527 40050740 40050634 Y NA N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 5706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 40220241 40220518 40220360 Y NA RHOH NA NA NA NA RHOH 29568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 40578690 40579499 40579160 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 51393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 RBM47 RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 44037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NA NA NA NA NA RBM47 161001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 40998550 40998604 40998585 Y NA NA NA NA NA NA APBB2 218127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 41454099 41454301 41454195 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 94475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 41469951 41470276 41469966 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 110327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 41936193 41936441 41936268 Y TMEM33 TMEM33 NA NA NA NA TMEM33 1056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 48125578 48125743 48125738 Y TEC NA NA NA NA NA CNGA1 108889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 48532180 48532355 48532269 Y NA SLC10A4 NA NA NA NA SLC10A4 48820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 52725801 52726193 52725998 Y NA DCUN1D4 NA NA NA NA DCUN1D4 18635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 53725752 53726074 53725904 Y NA RASL11B NA NA NA NA RASL11B 383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 54338842 54339193 54339023 Y NA NA NA NA NA NA FIP1L1 97032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 54794044 54794386 54794192 Y NA NA SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 134471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 58015152 58015220 58015173 Y SPINK2 IGFBP7-AS1,IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 40601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 62212497 62212753 62212605 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 426815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 62697127 62697420 62697274 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 57559 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 66107153 66107671 66107555 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 812526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 66899965 66900079 66900021 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 57765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 66960590 66960760 66960693 Y NA RP11-396M11.1 NA NA NA NA RP11-396M11.1 2746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 69598714 69599110 69598795 Y UGT2B10,UGT2B7,UGT2A3 NA NA NA NA NA UGT2B15 64368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 70698476 70698796 70698636 Y UGT2A2 SULT1B1,SULT1E1 NA NA NA NA SULT1E1 25074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 71677284 71677574 71677429 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 26088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 72559235 72559359 72559297 Y NA NA SLC4A4 IMR90 Hi-C 24141950 GC 108399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 72637368 72637579 72637457 Y GC,GC GC NA NA NA NA GC 30179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 73887463 73887489 73887476 Y NA COX18 ADAMTS3 IMR90 Hi-C 24141950 COX18 45983 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74464812 74465326 74464976 Y RASSF6,RASSF6 RASSF6 NA NA NA NA RASSF6 19022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74549349 74549563 74549470 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 NA CXCL5,IL8,CXCL6,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 IL8 54660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74765097 74765490 74765273 Y IL8,CXCL6,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1 CXCL1 RASSF6,IL8,CXCL6,PF4V1,PF4,PPBP,CXCL5,CXCL3,CXCL2 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL1 31987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74783021 74783195 74783091 Y IL8,MTHFD2L,EREG,CXCL3,CXCL2,CXCL1 CXCL1 RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 CXCL1 49911 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 74974850 74975280 74974976 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 2611 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L CXCL2,MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 75070819 75070991 75070879 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 92928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 75557908 75558335 75558035 Y EREG,AREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 BTC 159561 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 76980027 76980257 76980159 Y NA CXCL10 NA NA NA NA CXCL10 37377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 77522680 77522954 77522817 Y SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 168427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 77543952 77543974 77543961 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 189699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 77752154 77752315 77752229 Y NA NA SHROOM3,SEPT11,SOWAHB IMR90 Hi-C 24141950 SOWAHB 64687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 77868010 77868840 77868612 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 16 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 77974492 77974926 77974738 Y CCNI CCNI NA NA NA NA CCNI 20232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78016666 78016743 78016704 Y CCNG2 CCNI SHROOM3,CCNG2 IMR90 Hi-C 24141950 CCNI 21508 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78571860 78572194 78572027 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 166575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78656019 78656351 78656260 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6L 82418 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78823537 78823752 78823560 Y NA MRPL1 NA NA NA NA MRPL1 41863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 79083838 79083918 79083865 Y NA NA NA NA NA NA FRAS1 107114 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 79550555 79550802 79550658 Y NA LINC01094 NA NA NA NA LINC01094 14255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 84133552 84133853 84133829 Y LIN54,HELQ,PLAC8 NA COPS4,COQ2,PLAC8 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 70214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 86623240 86623457 86623398 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3 737696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 86927841 86928538 86928361 Y MAPK10,MAPK10,MAPK10 NA NA NA NA NA MAPK10 584746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 87048261 87048368 87048363 Y NA NA NA NA NA NA MAPK10 464916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 87838829 87839174 87839055 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 14980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 88446974 88447282 88447233 Y MEPE,SPARCL1 SPARCL1 NA NA NA NA SPARCL1 2931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 88787227 88787597 88787501 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 107222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 89202679 89202817 89202765 Y NA PPM1K NA NA NA NA PPM1K 1104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 89677444 89677595 89677520 Y FAM13A NA NA NA NA NA PIGY 236504 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 89726737 89726837 89726787 Y NA NA NA NA NA NA PIGY 285797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 282601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 89922113 89922454 89922284 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 108095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 90174156 90174307 90174302 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 52854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 90226723 90227111 90227016 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 50 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 90473389 90473466 90473428 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 246228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 92218724 92218762 92218742 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 1461258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 95374521 95374795 95374668 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 3484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 95406092 95406259 95406175 Y NA PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 35055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 95527874 95528162 95527964 Y NA NA NA NA NA NA BMPR1B 148957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 102200557 102200885 102200839 Y PPP3CA NA NA NA NA NA AP001816.1 66052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 103678847 103679008 103678977 Y NA MANBA NA NA NA NA MANBA 1143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 104302340 104302484 104302413 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 184774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 106226051 106226420 106226239 Y TET2,TET2 NA NA NA NA NA TET2 161019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 106324406 106324791 106324687 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 68447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 106390941 106391445 106391094 Y TET2,TET2 PPA2,EEF1A1P9 NA NA NA NA PPA2 1793 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 108758517 108758852 108758585 Y SGMS2,SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 14798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 108819119 108819373 108819246 Y NA CYP2U1 NA NA NA NA CYP2U1 31152 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 111549500 111549935 111549649 Y PITX2 NA NA NA NA NA RP11-433B3.1 365327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 112913088 112913237 112913174 Y TIFA,AP1AR NA NA NA NA NA C4orf32 151316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 113205194 113205406 113205300 Y NA ALPK1,TIFA NA NA NA NA TIFA 135 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 325456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 114367129 114367387 114367298 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 313696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 114820974 114821152 114821063 Y NA NA NA NA NA NA ARSJ 77731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.71290913890311 chr4 119910469 119910954 119910765 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 152631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 120962747 120963053 120963021 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NA NA NA NA RP11-679C8.2 23060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 121010657 121011025 121010845 Y NA RP11-679C8.2,MAD2L1 NDNF IMR90 Hi-C 24141950 MAD2L1 24428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 122611926 122612330 122612120 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 3938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 CETN4P,BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 124225969 124226069 124226019 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 89881 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 124272958 124273104 124273084 Y NA SPRY1 LOC285419,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY1 42846 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 124373851 124374047 124373905 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 57901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 124661039 124661237 124661155 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 345089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 124764674 124764868 124764687 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 448724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 124981401 124981797 124981539 Y NA NA SPATA5,LOC285419 IMR90 Hi-C 24141950 TECRP2 401148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 125224483 125224496 125224490 Y NA NA NA NA NA NA TECRP2 158449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 125339057 125339480 125339252 Y NA TECRP2 NA NA NA NA TECRP2 43465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr4 125354669 125354869 125354769 Y NA TECRP2 ANKRD50 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECRP2 28076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 125399641 125399657 125399649 Y NA TECRP2 NA NA NA NA TECRP2 16696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 128752654 128753022 128752839 Y HSPA4L PLK4 NA NA NA NA PLK4 46994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 177787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 129438976 129439122 129439055 Y NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 227070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 129474102 129474409 129474120 Y NA NA PGRMC2,PHF17,LARP1B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-420A23.1 262196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA C4orf33 278551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 134046475 134046584 134046530 Y NA PCDH10 NA NA NA NA PCDH10 21886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 139067903 139068306 139067999 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 93197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 139326439 139326794 139326543 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 164936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 139831999 139832463 139832295 Y NA NA LOC641365,SLC7A11,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 102480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140787614 140787718 140787639 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 202692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140850270 140850709 140850607 Y MAML3,CLGN NA NA NA NA NA MAML3 222629 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140891718 140892054 140891918 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 181284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 140897225 140897350 140897279 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 175988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 140924986 140925148 140925064 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 148190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 140970177 140970718 140970535 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 102620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr4 141017143 141017617 141017414 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 55721 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 141021103 141021485 141021348 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 51853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 141163698 141163887 141163736 Y NA SCOC MAML3,SCOC,LOC100129858,MGST2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 12553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 141164479 141164682 141164571 Y MAML3 SCOC MAML3,MGST2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SCOC 11758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 141207513 141207988 141207940 Y MAML3,SCOC SCOC NA NA NA NA SCOC 31073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 141209212 141209581 141209237 Y NA SCOC NA NA NA NA SCOC 32772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 142250253 142250616 142250501 Y ZNF330,IL15 RP11-362F19.1 IL15,INPP4B,ZNF330 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-362F19.1 1156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 142564611 142565296 142564927 Y ZNF330,IL15 IL15 NA NA NA NA IL15 8859 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 143471391 143471615 143471483 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 294970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 143622283 143622423 143622353 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 144162 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA GAB1 NA NA NA NA GAB1 15379 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 147196519 147196807 147196609 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 101682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 147250249 147250611 147250430 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 155412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 149364278 149364693 149364534 Y NR3C2 NR3C2 NA NA NA NA NR3C2 428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 149709037 149709300 149709169 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 345187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr4 149756405 149756578 149756515 Y NA NA NA NA NA NA NR3C2 392555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr4 152090134 152090652 152090546 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 71409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3A 227307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 153190429 153190517 153190474 Y NA NA FAM160A1,PET112,FBXW7 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4453 264899 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 153717992 153718074 153718038 Y NA NA NA NA NA NA TMEM154 118675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA TLR2 72171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 39810 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 155577667 155577895 155577781 Y NA FGG FGB IMR90 Hi-C 24141950 FGG 45548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 157718385 157718680 157718607 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 171866 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 157868046 157868334 157868214 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 159742407 159742876 159742571 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 54117 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 164464203 164464350 164464219 Y NPY1R,NPY5R,MARCH1 NA NA NA NA NA NPY1R 200219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 164471489 164471679 164471583 Y NA NA NA NA NA NA NPY1R 207505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169375795 169375933 169375918 Y NA PALLD NA NA NA NA PALLD 40284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169555491 169556032 169555691 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 98554 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169646285 169646357 169646330 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 189348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169791118 169791499 169791286 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 137927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 169849945 169850177 169850075 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 79249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169868186 169868202 169868194 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 61224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 169992046 169992220 169992129 Y NA NA SH3RF1,NEK1 IMR90 Hi-C 24141950 CBR4 62620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 170026437 170026753 170026620 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 97011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 170172551 170172946 170172870 Y NA SH3RF1 NA NA NA NA SH3RF1 17310 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 173889872 173890124 173889998 Y NA NA NA NA NA NA GALNT7 197780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 174210504 174211007 174210885 Y GALNT7 HMGB2 NA NA NA NA HMGB2 43269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 175501777 175502117 175501960 Y HPGD NA NA NA NA NA HPGD 59472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 183568083 183568352 183568218 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 268737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 184208528 184208558 184208557 Y NA NA NA NA NA NA CDKN2AIP 155186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 184270201 184270461 184270317 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 93283 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr4 184330014 184330225 184330125 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 33519 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 184718887 184719489 184719407 Y NA NA ENPP6,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 STOX2 53095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 184910732 184910983 184910894 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 3901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 185214730 185214925 185214872 Y IRF2 NA IRF2,CCDC111,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 178809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 185269961 185270243 185270083 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 123491 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 185304654 185305034 185304819 Y ACSL1,IRF2 NA NA NA NA NA IRF2 88700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 185382837 185383066 185382954 Y NA IRF2 NA NA NA NA IRF2 10668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 186037213 186037356 186037285 Y NA SLC25A4 LOC100506229,ACSL1,KIAA1430,SLC25A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A4 25039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 186481104 186481365 186481225 Y NA PDLIM3 PDLIM3,SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM3 26338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 186495067 186495245 186495187 Y NA PDLIM3 NA NA NA NA PDLIM3 40301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 187491323 187491675 187491487 Y NA NA NA NA NA NA FAT1 154201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 187614690 187615080 187614853 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 30796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 189361062 189361328 189361166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219G10.1 91884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr4 190197516 190197817 190197669 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 431051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 190708637 190708848 190708802 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 79769 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr4 190937232 190937266 190937251 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 77289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 325619 325847 325735 Y NA AHRR NA NA NA NA AHRR 23328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 448605 448866 448667 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7332 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 557070 557448 557336 Y NA NA SLC9A3,TPPP,CEP72 IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 52939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 1155287 1155504 1155358 Y NA SLC12A7,SLC6A19 SLC12A7,TRIP13,SLC6A18,BRD9 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A19 44206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 1182870 1183091 1183042 Y SLC6A19,SLC6A18 SLC6A19,SLC6A18 LOC100506688,TERT,SLC6A19,TRIP13 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC6A19 16619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr5 1200004 1200495 1200211 Y NA SLC6A19,SLC6A18 NA NA NA NA SLC6A19 294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr5 1313264 1313453 1313378 Y NA TERT,CLPTM1L NA NA NA NA TERT 20080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 1315765 1316275 1315843 Y TERT TERT,CLPTM1L TERT IMR90 Hi-C 24141950 TERT 22581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 1497353 1497517 1497465 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 24575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 1501941 1502569 1502322 Y LPCAT1 LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 19523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 3188206 3188572 3188389 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 1388692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS16 112080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 5351586 5351742 5351664 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 67035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 5423578 5423857 5423693 Y KIAA0947 KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 4801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.37743446608573 chr5 7879383 7879659 7879544 Y NA MTRR,C5orf49,FASTKD3 NA NA NA NA FASTKD3 12233 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 9547741 9548115 9547963 Y NA NA NA NA NA NA FAM173B 699894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 10270287 10270466 10270406 Y NA FAM173B,CCT5,CMBL NA NA NA NA CCT5 22254 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA ROPN1L,RPL30P7,RP11-1C1.4 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10578225 10578424 10578340 Y NA ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 15783 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10626840 10627122 10626983 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 64398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10632197 10632744 10632366 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33B 69755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 10759548 10759882 10759715 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 11487050 11487322 11487183 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 414833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 11591848 11592143 11592119 Y CTNND2 NA NA NA NA NA CTNND2 310012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 13580191 13580395 13580319 Y NA NA DNAH5 IMR90 Hi-C 24141950 DNAH5 362257 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 14038478 14038912 14038655 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 95826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 14186205 14186627 14186374 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 44394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 14719922 14720222 14720072 Y NA NA NA NA NA NA FAM105B 57149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 14817188 14817452 14817373 Y NA RBBP4P1 NA NA NA NA RBBP4P1 20679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 185222 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA CTB-55B8.1 164012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 21539943 21540207 21540075 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 200001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 25438068 25438428 25438198 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 249303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr5 27962368 27962591 27962475 Y NA NA NA NA NA NA LINC01021 491969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 30099812 30100097 30099950 Y NA NA NA NA NA NA RPL19P11 951575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 31459519 31459540 31459530 Y NA NA NA NA NA NA DROSHA 70763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 32083300 32083310 32083305 Y PDZD2 NA NA NA NA NA GOLPH3 89146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 33807297 33807469 33807384 Y ADAMTS12 NA NA NA NA NA ADAMTS12 82828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 34001406 34001643 34001533 Y AMACR AMACR NA NA NA NA AMACR 4577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 34525926 34526105 34525960 Y NA NA RAI14,RAD1,BRIX1,TTC23L,DNAJC21 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 128237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 34856339 34856427 34856383 Y NA TTC23L NA NA NA NA TTC23L 19401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 35857994 35858411 35858032 Y IL7R NA NA NA NA NA SPEF2 242048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 37029618 37029862 37029736 Y NA NA NA NA NA NA NIPBL 154757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 37209037 37209204 37209072 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 38326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 38538245 38538619 38538432 Y LIFR MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 17044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 38546436 38546759 38546707 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 8904 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 38650799 38651230 38651069 Y NA LIFR EGFLAM,LIFR,OSMR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 44343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr5 38672702 38672722 38672712 Y NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 66246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 38968924 38969094 38969009 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 103416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 39014770 39014929 39014863 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 57581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 39256594 39256894 39256792 Y RICTOR,FYB NA NA NA NA NA C9 166076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 39543496 39543808 39543708 Y FYB NA DAB2,FYB,C9,PRKAA1,TTC33,RPL37,CARD6 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 83094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 39606080 39606287 39606184 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 145678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 39713773 39713912 39713841 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 253371 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 39716547 39716931 39716737 Y NA NA TTC33,PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 256145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 40360914 40361005 40360961 Y PTGER4 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 316595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 40410103 40410947 40410540 Y PTGER4,PRKAA1 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 PTGER4 266653 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 41113994 41114275 41114076 Y NA NA C7,C6 IMR90 Hi-C 24141950 C6 145265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 41288648 41289018 41288835 Y NA C6 NA NA NA NA C6 29108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 41497221 41497345 41497332 Y NA PLCXD3 NA NA NA NA PLCXD3 11385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43009341 43009652 43009530 Y ZNF131,C5orf39 AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 30025 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43020158 43020617 43020275 Y C5orf28,ZNF131,C5orf39 AC025171.1,ZNF131 NA NA NA NA AC025171.1 19060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA AC025171.1,ZNF131 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF131 42606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43303282 43303485 43303367 Y NA HMGCS1 NA NA NA NA HMGCS1 8129 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 52168603 52169046 52168938 Y PELO,ITGA1 NA NA NA NA NA PELO 86829 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 52319874 52320078 52320019 Y NA ITGA2 LOC257396 IMR90 Hi-C 24141950 ITGA2 36718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 44436 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 52332019 52332357 52332083 Y FST,ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 48863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA NA NA NA NA NA ITGA2 50178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 52545484 52545615 52545603 Y ITGA2,FST NA ARL15,FST IMR90 Hi-C 24141950 MOCS2 141591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 53298305 53298413 53298402 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 305999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 53879713 53879860 53879787 Y NA NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 68124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 53886377 53886761 53886569 Y SNX18,SNX18 NA SNX18 IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 74788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 54622279 54622499 54622328 Y NA DHX29,SKIV2L2 NA NA NA NA SKIV2L2 20691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 54964345 54964561 54964453 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A9 102461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST NA NA NA NA IL6ST 784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 55397309 55397683 55397496 Y NA CTD-2227I18.1 NA NA NA NA CTD-2227I18.1 44432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 55654713 55655022 55654890 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 55655118 55655221 55655151 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 143678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 55708850 55709112 55709020 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 89787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 55724940 55725264 55725061 Y NA NA MAP3K1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC022431.1 73635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 55756528 55756674 55756600 Y NA AC022431.1 MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 42225 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 55934809 55935027 55934889 Y MAP3K1 NA MAP3K1 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 135910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr5 56704615 56704811 56704720 Y NA NA PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 71825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 56731620 56731973 56731778 Y NA ACTBL2 PLK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTBL2 44663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 56738135 56738571 56738168 Y ACTBL2 ACTBL2 PLK2,ACTBL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 38065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 335279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 57537303 57537570 57537449 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 216517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 578199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 58343486 58343717 58343566 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 589399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58375824 58376057 58376052 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 621737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58420146 58420252 58420199 Y PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 666059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 669224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 821737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58616191 58616562 58616377 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 862104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA PART1 964250 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PART1 906727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PART1 829526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 59492329 59492580 59492443 Y NA NA NA NA NA NA PART1 288960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 59618984 59619244 59619114 Y PDE4D NA NA NA NA NA PART1 162296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60258688 60258981 60258835 Y NA ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 19732 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60526663 60526879 60526778 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM6 99221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 60625710 60626179 60625844 Y ELOVL7,ZSWIM6 NA ZSWIM6 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZSWIM6 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 60736184 60736544 60736365 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 50486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 64056126 64056496 64056311 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 6016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 64778400 64778738 64778694 Y NA NA NA NA NA NA CENPK 78260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 64796548 64796879 64796719 Y PPWD1,CENPK NA NA NA NA NA CENPK 60119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr5 65329982 65330329 65330156 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 103470 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 65529315 65529329 65529322 Y NA NA NA NA NA NA SREK1 95516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 65878342 65878574 65878477 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 11602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 66178568 66178972 66178612 Y NA NA NA NA NA NA MAST4 288392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.28387885187082 chr5 66510755 66511249 66511045 Y NA NA MAST4,PIK3R1 MCF7 ChIA-PET 22265404 MAST4 620579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 67561361 67561424 67561384 Y PIK3R1,PIK3R1,PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 51813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 67639455 67639512 67639485 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 129907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 67806918 67806931 67806925 Y NA CTC-537E7.2 NA NA NA NA CTC-537E7.2 20426 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr5 71045616 71045849 71045733 Y NA NA MCCC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MCCC2 164501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 71505945 71506221 71506083 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 104884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 71748206 71748633 71748536 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 133733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 72138720 72138932 72138785 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 28581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 72218346 72218584 72218427 Y NA FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 31224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 72234221 72234359 72234290 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 15449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 72235988 72236210 72236099 Y FCHO2 FCHO2 NA NA NA NA FCHO2 13598 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 72511984 72512100 72512037 Y FOXD1 RP11-60A8.1 FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-60A8.1 4210 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 73798290 73798691 73798490 Y NA CTC-419K13.1 RGNEF IMR90 Hi-C 24141950 CTC-419K13.1 32110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 73839049 73839165 73839086 Y NA CTC-419K13.1 CTIF,RGNEF,ENC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 19890323,24141950 CTC-419K13.1 8248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 76086859 76087104 76086921 Y F2R,F2RL1 F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77792703 77793028 77792954 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 138364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77797282 77797316 77797309 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 142943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77802337 77802767 77802745 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 147998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77810178 77810481 77810268 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 155839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 77826174 77826769 77826484 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 171835 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77829299 77829474 77829415 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 174960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77835986 77836955 77836241 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 181647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77888034 77888302 77888035 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 175542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 77934857 77935090 77934974 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL2 128754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 78439900 78440059 78439990 Y NA NA NA NA NA NA BHMT2 76360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr5 78686873 78686981 78686927 Y NA NA NA NA NA NA RP11-342F17.1 117276 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 79418428 79418727 79418619 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 131171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 79487807 79488093 79488033 Y SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 61805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 79531979 79532366 79532173 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 17532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr5 79695212 79695829 79695740 Y ZFYVE16,FAM151B ZFYVE16 THBS4,ZFYVE16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 6003 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 79863969 79864090 79864030 Y ANKRD34B NA NA NA NA NA RPL7P24 69818 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 80097001 80097162 80097082 Y NA NA NA NA NA NA DHFR 148199 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 80316439 80316828 80316634 Y RASGRF2 NA NA NA NA NA RASGRF2 61948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 80551638 80551938 80551834 Y NA CKMT2,CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2 24534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 80705760 80705793 80705777 Y ACOT12 NA NA NA NA NA ZCCHC9 110351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 NA NA NA NA NA ZCCHC9 112242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 81148608 81149026 81148707 Y SSBP2 CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 82636435 82636494 82636447 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA VCAN 128790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 83588624 83588917 83588807 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 89328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 84744146 84744237 84744174 Y NA NA NA NA NA NA EDIL3 1065535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 84859384 84859724 84859554 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 1051997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 85303843 85303915 85303880 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 607806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 85654132 85654483 85654435 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 257238 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr5 85789046 85789185 85789116 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 122536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 85833622 85833763 85833693 Y NA NA NA NA NA NA COX7C 77958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 86437073 86437444 86437266 Y NA NA RASA1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA1 124261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C CTC-467M3.1 NA NA NA NA CTC-467M3.1 12867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 87985363 87985679 87985523 Y MEF2C CTC-467M3.1 LINC00461 K562 ChIA-PET 22265404 CTC-467M3.1 15327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 88109262 88109325 88109294 Y MEF2C,MEF2C NA NA NA NA NA MEF2C-AS1 67820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C-AS1,MEF2C NA NA NA NA MEF2C-AS1 5689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 89259292 89259660 89259475 Y NA NA NA NA NA NA CETN3 443943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90174732 90174912 90174751 Y NA NA NA NA NA NA LYSMD3 351331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 90236488 90236655 90236581 Y NA NA NA NA NA NA LUCAT1 371564 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90354334 90354731 90354568 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA LUCAT1 253488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90428420 90428552 90428486 Y ARRDC3 NA NA NA NA NA LUCAT1 179667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90700877 90700891 90700884 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 23701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 92940140 92940350 92940245 Y NR2F1 NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 23097 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 93256507 93256894 93256879 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 188510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 93304446 93304744 93304683 Y NA NA NA NA NA NA FAM172A 140660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 93434612 93434657 93434635 Y NA FAM172A NA NA NA NA FAM172A 10747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95094861 95094991 95094889 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 GLRX IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2154I11.2 28862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95157129 95157323 95157255 Y NA GLRX NA NA NA NA GLRX 420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95170246 95170624 95170377 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 13537 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 95179469 95179934 95179619 Y NA GLRX GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 22760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95199166 95199388 95199264 Y GLRX,ELL2 GLRX NA NA NA NA GLRX 42457 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 95240158 95240487 95240414 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1 55218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95298372 95298734 95298686 Y ELL2 CTD-2337A12.1,ELL2 NA NA NA NA ELL2 2597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 95360201 95360335 95360279 Y NA RP11-254I22.1 ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 23484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95562741 95563074 95562934 Y NA RP11-254I22.3 ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.3 13962 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 95845653 95846023 95845804 Y NA CAST NA NA NA NA CAST 12948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 96142552 96142955 96142798 Y CAST,CAST,LNPEP ERAP1 NA NA NA NA ERAP1 749 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 105752390 105752961 105752697 Y NA NA NA NA NA NA RP11-6N13.1 1025719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 106632102 106632323 106632213 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 372273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 106700369 106701196 106700617 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 303400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 106724874 106725113 106725059 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 279483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 106802102 106802350 106802226 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 202246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 106823409 106823505 106823457 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 181091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 106862612 106863005 106862809 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 141591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 107179705 107179785 107179745 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 175109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 109125780 109125881 109125831 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 102713 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 109689305 109689319 109689312 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 382518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 110830968 110831101 110831035 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 15187 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 110838164 110838531 110838380 Y WDR36,CAMK4,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 7757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 110846985 110847356 110847238 Y WDR36,STARD4 STARD4 NA NA NA NA STARD4 697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 114913600 114913827 114913746 Y NA FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2 NA NA NA NA AC010226.4 21927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 118257403 118257748 118257576 Y NA PTMAP2 NA NA NA NA PTMAP2 49743 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 119016321 119016356 119016339 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 230183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 119940626 119940961 119940736 Y NA NA NA NA NA NA HSD17B4 1154488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 122322384 122322589 122322416 Y NA PPIC NA NA NA NA PPIC 47847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 122542890 122543069 122542980 Y NA NA NA NA NA NA PRDM6 120074 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 123909192 123909435 123909314 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 173065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 123935187 123935581 123935384 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 146919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 124029260 124029627 124029444 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 52873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr5 124593106 124593253 124593226 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 450180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 124748569 124748778 124748675 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-436H11.1 605643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 124911723 124911866 124911795 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 768797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 125686848 125687181 125687011 Y GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3,ALDH7A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 6643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 126149471 126149945 126149720 Y NA RP11-434D11.4,LMNB1 NA NA NA NA LMNB1 39156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 126367022 126367218 126367207 Y NA MARCH3,C5orf63 NA NA NA NA MARCH3 2522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 130693580 130694145 130693755 Y FNIP1,CDC42SE2 NA NA NA NA NA CDC42SE2 114394 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 130718102 130718482 130718270 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 138916 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 130824249 130824445 130824350 Y FNIP1 NA NA NA NA NA RAPGEF6 144484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131450160 131450175 131450167 Y NA NA IL3,ACSL6,CSF2,LOC553103,SLC22A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC22A4 177961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA SLC22A4 26354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 131763542 131763915 131763870 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC116366.5 3136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131774835 131775712 131775188 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.5 14429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 11247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 131810095 131810374 131810235 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.5,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 3360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 132115740 132115939 132115852 Y SHROOM1,ANKRD43,KIF3A,SEPT8,SEPT8 KIF3A,SEPT8,SOWAHA,SHROOM1 SEPT8 MCF7 ChIA-PET 22265404 SEPT8 24994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 132581339 132581487 132581431 Y ANKRD43 NA NA NA NA NA HSPA4 195685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 133460352 133460406 133460379 Y UBE2B,PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 NA NA NA NA TCF7 11950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA MIR3661 18431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 38489 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 37651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA AC005355.2 PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 133847692 133847829 133847767 Y NA AC005355.2 PHF15,CDKN2AIPNL,CDKL3,UBE2B,SKP1,PPP2CA IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.2 7449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 49918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 134451996 134452165 134452096 Y NA NA H2AFY,PCBD2,CATSPER3,LOC340073 IMR90 Hi-C 24141950 PITX1 83493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 134527149 134527274 134527245 Y NA NA CATSPER3,PCBD2,H2AFY,PITX1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITX1 158646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 134727973 134728292 134728105 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 5312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 134879348 134879728 134879405 Y NA NA NA NA NA NA H2AFY 145744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 135538532 135538688 135538610 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 71998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 136727566 136727823 136727577 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 204245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA KLHL3,HNRNPA0 NA NA NA NA KLHL3 6194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 137173834 137173986 137173921 Y KLHL3 NPY6R,PKD2L2,RP11-381K20.2 NPY6R IMR90 Hi-C 24141950 NPY6R 38952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 137333439 137333810 137333723 Y NA NA NA NA NA NA FAM13B 51840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 137370531 137370718 137370637 Y PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5 FAM13B PKD2L2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM13B 14932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 182646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 138248139 138248403 138248239 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 303483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 317510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 138277949 138278244 138278038 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 329197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 138325344 138325620 138325482 Y NA NA NA NA NA NA MATR3 281821 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 138608448 138608665 138608563 Y LRRTM2,MATR3,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA MATR3 1007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 138727034 138727338 138727139 Y LOC389333 SLC23A1,SPATA24 NA NA NA NA SLC23A1 8792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139015811 139016118 139015905 Y MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 8766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139017086 139017541 139017145 Y CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 7343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139017934 139018665 139018227 Y MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 6219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139049454 139050310 139049802 Y MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 24570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139090940 139091124 139091019 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 66056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 139309520 139309650 139309579 Y NA NA NA NA NA NA NRG2 111234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139598972 139599011 139598993 Y ANKHD1 NA NA NA NA NA PFDN1 81695 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 139629538 139629745 139629587 Y NA NA NA NA NA NA PFDN1 50961 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 139631101 139631601 139631302 Y SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 49105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 139633683 139634086 139633757 Y SRA1,IK,HBEGF,EIF4EBP3,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 46620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139724210 139724515 139724457 Y SRA1,CD14,CD14,APBB3,HBEGF,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA HBEGF 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.52097989663417 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.14033342132237 chr5 140381128 140381335 140381222 Y NA PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 37308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 140381838 140382244 140382041 Y DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2 PCDHAC2 NA NA NA NA PCDHAC2 38018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 140457576 140457668 140457630 Y NA PCDHB2,PCDHB4 NA NA NA NA PCDHB2 14559 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 140875639 140876085 140875835 Y PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 22059 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 141684732 141684818 141684775 Y PCDH1,SPRY4 AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA AC005592.2 18040 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 141917041 141917377 141917209 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 FGF1 158240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 142105384 142105400 142105392 Y FGF1 FGF1,ARHGAP26 ARHGAP26,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 FGF1 29767 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142157420 142157683 142157517 Y NA ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 9471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 142174275 142174448 142174377 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 26326 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142219370 142219769 142219465 Y ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 71421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 142341115 142341252 142341163 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP26 193166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142384131 142384662 142384553 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 236182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142534225 142534485 142534355 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 175685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 142596602 142597132 142596750 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 113038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 142600445 142600900 142600783 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 109270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 142630802 142631029 142631019 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 79141 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 143361363 143361664 143361514 Y NA NA ARHGAP26,YIPF5 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 186614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 143578105 143578377 143578180 Y YIPF5 YIPF5 NA NA NA NA YIPF5 29827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 144741919 144742138 144742043 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 470794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 145447855 145448292 145447919 Y NA NA NA NA NA NA LARS 111931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 145455339 145455700 145455520 Y NA NA NA NA NA NA LARS 104523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 145498086 145498488 145498483 Y NA NA NA NA NA NA LARS 61735 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 146200379 146200464 146200463 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 115216 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 147218600 147219023 147218871 Y SPINK1 SPINK1 JAKMIP2 IMR90 Hi-C 24141950 SPINK1 9251 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 147283651 147283737 147283694 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA C5orf46 179727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 148540754 148540865 148540805 Y ABLIM3 ABLIM3 AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 21708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 148976397 148976488 148976443 Y NA CSNK1A1,ARHGEF37 NA NA NA NA ARHGEF37 46887 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149318595 149318961 149318771 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2 NA NA NA NA SLC26A2 19339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149902198 149902484 149902343 Y NA NDST1,CTC-367J11.1 NA NA NA NA CTC-367J11.1 38667 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149979570 149980059 149979818 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 149985154 149985492 149985203 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 6512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 150021479 150021575 150021527 Y NA SYNPO NA NA NA NA SYNPO 42837 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 150086779 150087134 150086956 Y RBM22,DCTN4,DCTN4 RBM22,DCTN4 MYOZ3,RBM22 IMR90 Hi-C 24141950 RBM22 8110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 150593680 150594043 150593885 Y DCTN4,DCTN4,TNIP1,SLC36A1,CCDC69 GM2A,CCDC69 NA NA NA NA GM2A 3969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 150625199 150625215 150625207 Y NA GM2A,CCDC69 ANXA6,CCDC69 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC69 23493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 150873344 150873758 150873456 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A1 58737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 151307213 151307514 151307357 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 157120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 154062607 154063000 154062805 Y GEMIN5 LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP1 27462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr5 156718541 156718931 156718583 Y HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2 CYFIP2 NA NA NA NA CYFIP2 27452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 156994129 156994375 156994248 Y HAVCR2,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2,NIPAL4,ADAM19 ADAM19 NA NA NA NA ADAM19 6408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 157297918 157298287 157298172 Y NA CLINT1 CLINT1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 13735 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 158201990 158201999 158201995 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 322770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 158248563 158248909 158248669 Y EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 275860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 158366953 158367057 158367005 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 157712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 158380752 158381154 158381061 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B,EBF1 NA NA NA NA NA EBF1 143615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 158394581 158395139 158394894 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 129630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 158489129 158489509 158489418 Y NA EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 35260 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 158605991 158606398 158606265 Y NA RNF145 NA NA NA NA RNF145 28663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19947 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 159688113 159688294 159688164 Y CCNJL RP11-34P1.2 NA NA NA NA RP11-34P1.2 4853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr5 159737535 159737889 159737653 Y NA CCNJL NA NA NA NA CCNJL 32514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 159815159 159815328 159815245 Y NA CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA C5orf54 9776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA PTTG1 104785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 164595581 164595748 164595665 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 858568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 165423416 165423425 165423421 Y NA RPL7P20 NA NA NA NA RPL7P20 30891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 168588352 168588495 168588423 Y NA NA NA NA NA NA SLIT3 137638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 170134160 170134177 170134169 Y NA NA NA NA NA NA RANBP17 152697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 170289548 170289859 170289780 Y NA RANBP17 NA NA NA NA RANBP17 2674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172064248 172064489 172064361 Y NA NEURL1B,CTB-79E8.3 NA NA NA NA NEURL1B 1780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172160207 172160396 172160286 Y NA DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 172193800 172194232 172193914 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 1966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 172208951 172208972 172208964 Y UBTD2 DUSP1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 12753 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172209593 172209865 172209663 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 13395 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 172216221 172216413 172216309 Y C5orf41,DUSP1 DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 20023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr5 172283530 172283741 172283563 Y NA ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 24252 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172304783 172305546 172305102 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 45505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172308731 172309533 172309021 Y DUSP1,C5orf41 ERGIC1 NA NA NA NA ERGIC1 49453 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 172328085 172328386 172328247 Y DUSP1 NA NA NA NA NA RPL26L1 55346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 172915268 172915394 172915342 Y NA NA STC2 IMR90 Hi-C 24141950 BOD1 126269 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173153574 173153834 173153704 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 17380 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 173169045 173169768 173169685 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 1446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173169995 173170330 173170163 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr5 173191567 173191754 173191643 Y CPEB4 CTB-43E15.3 CPEB4,C5orf47 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 20353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CTB-43E15.3 22163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr5 173252274 173252478 173252451 Y NA NA BOD1,CPEB4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CPEB4 60805 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173293319 173293521 173293407 Y CPEB4 CPEB4 CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 19762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173346462 173346760 173346662 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 33179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173347710 173348091 173347729 Y NA CPEB4 NA NA NA NA CPEB4 34427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 NA NA NA NA NA CPEB4 78111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 175347355 175347516 175347492 Y NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 CPLX2 126042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44,CDHR2 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 175974830 175975038 175974917 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,C5orf25,RNF44,CDHR2 RNF44,CDHR2 NA NA NA NA CDHR2 7318 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 176526460 176526848 176526554 Y FGFR4,FGFR4 FGFR4,NSD1 NA NA NA NA FGFR4 14573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 177041998 177042331 177042024 Y NSD1 TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 16897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr5 177607687 177607881 177607743 Y NA NHP2,HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 21627 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 177645267 177645446 177645363 Y N4BP3,CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15759 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 177645477 177646261 177645593 Y NA HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 15969 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 177647239 177647603 177647383 Y CLK4,AGXT2L2 HNRNPAB NA NA NA NA HNRNPAB 17731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr5 178255974 178256130 178256077 Y NA ZNF354B ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 28824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 179038504 179038699 179038602 Y NA HNRNPH1 NA NA NA NA HNRNPH1 21086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 179532958 179533118 179533038 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 35840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 180256099 180256444 180256228 Y MGAT1,MGAT1 MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA LINC00847 142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 180371458 180371675 180371567 Y OR2Y1,BTNL8,OR2V2,BTNL3 NA NA NA NA NA ZFP62 85172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 4148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 290595 290748 290658 Y IRF4,DUSP22 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 320653 321052 320689 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 31023 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 472688 472701 472695 Y HUS1B,EXOC2 NA NA NA NA NA IRF4 82949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 501922 502087 502051 Y NA NA NA NA NA NA IRF4 112183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 1131986 1132306 1132130 Y NA NA LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 178369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 1250840 1251149 1250977 Y NA NA EXOC2,LOC285768 IMR90 Hi-C 24141950 FOXQ1 59526 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 1379891 1379916 1379904 Y NA FOXF2 LOC285768,FOXF2,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF2 8153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 2038182 2038509 2038345 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 205417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 2081468 2081822 2081645 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 162104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 2763251 2763536 2763387 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 2853307 2853467 2853442 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB1 13067 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 2872631 2873198 2872915 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB9 28316 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 2877769 2878087 2877933 Y SERPINB9,NQO2,SERPINB1 SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB9 23427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 2980500 2980669 2980575 Y SERPINB1,RIPK1,SERPINB9 SERPINB6,NQO2,HTATSF1P2 WRNIP1,MYLK4,MIR4645,MGC39372,SERPINB1,DKFZP686I15217,SERPINB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NQO2 5552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3308463 3308483 3308477 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 78499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr6 3385907 3386183 3386010 Y SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 69073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3403581 3403822 3403689 Y BPHL,SLC22A23 NA NA NA NA NA SLC22A23 51434 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 3777287 3777695 3777692 Y NA PXDC1 SLC22A23,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 27027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3789456 3789809 3789635 Y NA PXDC1 SLC22A23,PXDC1,FAM50B IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 39196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 4688350 4688741 4688427 Y NA CDYL CDYL,FAM217A,C6orf201,ECI2 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 15652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 4728304 4728573 4728482 Y NA CDYL NA NA NA NA CDYL 23911 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 4990656 4990905 4990781 Y NA RPP40 NA NA NA NA RPP40 11392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 5190782 5191184 5190977 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 67988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 6970116 6970321 6970219 Y NA NA LY86 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 135509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7043208 7043422 7043355 Y NA NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 62408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7143191 7143555 7143322 Y NA RREB1 NA NA NA NA RREB1 37361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 7731119 7731407 7731310 Y TXNDC5,TXNDC5,BMP6 NA NA NA NA NA SNRNP48 142687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 7996922 7997003 7996963 Y BMP6,TXNDC5,TXNDC5 TXNDC5 NA NA NA NA TXNDC5 27643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 10520494 10520618 10520557 Y NA GCNT2 NA NA NA NA GCNT2 30038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 10552532 10552740 10552636 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 62076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10587786 10588136 10587948 Y TMEM14B,GCNT2 NA NA NA NA NA GCNT2 97330 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10589491 10589864 10589781 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 99035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10719904 10720278 10720060 Y NA PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA TMEM14C 870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10968528 10968697 10968612 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 73850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 10970926 10971179 10971053 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 71368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 11144047 11144288 11144135 Y TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA ELOVL2 101500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 11270585 11270869 11270602 Y TMEM170B,MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 109712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 11299498 11299626 11299552 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 80955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 11414898 11415336 11414989 Y TMEM170B,NEDD9 NEDD9 NEDD9,C6orf228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD9 34317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 12250724 12250902 12250828 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 TMEM170B,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 37694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 12332214 12332482 12332362 Y NA EDN1 EDN1,TMEM170B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EDN1 43618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr6 12371691 12372070 12371982 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 83095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 12484193 12484504 12484246 Y EDN1 RPL15P3 EDN1,TMEM170B,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 27838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 12573441 12573699 12573559 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 61099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 12592849 12593177 12593094 Y EDN1 NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 80507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 12595340 12595665 12595564 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 82998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 12602137 12602410 12602274 Y EDN1 NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 89795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 12602673 12603131 12602821 Y NA NA TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 90331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 13391107 13391478 13391293 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D7 64292 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 13404217 13404579 13404523 Y GFOD1 NA NA NA NA NA TBC1D7 77402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 13597663 13598060 13597862 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 15499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 13630387 13630831 13630754 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 16828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 13651430 13651585 13651505 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 37871 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 14273453 14273611 14273548 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 157581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 14719569 14719813 14719716 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 524714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 15299924 15300312 15299931 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 55397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 15542142 15542162 15542152 Y JARID2 NA NA NA NA NA DTNBP1 119127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16319874 16320274 16319989 Y MYLIP NA NA NA NA NA GMPR 83063 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16342665 16342812 16342725 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 105854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16413735 16414124 16414005 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 176924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16422379 16422759 16422608 Y NA NA NA NA NA NA GMPR 185568 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 16488193 16488587 16488526 Y MYLIP NA NA NA NA NA GMPR 251382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16684094 16684384 16684208 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74985 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 16684658 16685097 16684682 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16687739 16687973 16687884 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 71396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 16690098 16690263 16690180 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 69106 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 16766520 16766751 16766672 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562 ChIA-PET 22265404 ATXN1 6798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 17312081 17312238 17312192 Y RBM24 NA NA NA NA NA CAP2 79209 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 SUMO2P13,FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 18343795 18344357 18344138 Y RNF144B RNF144B RNF144B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNF144B 22422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 18365705 18366033 18365869 Y RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 19819390 19819399 19819395 Y NA RP4-625H18.2 ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP4-625H18.2 16407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20206748 20206864 20206806 Y MBOAT1 MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 3806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20326479 20326699 20326599 Y MBOAT1 NA E2F3 IMR90 Hi-C 24141950 E2F3 73699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 20877706 20877968 20877723 Y CDKAL1 NA NA NA NA NA CDKAL1 345018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 21022706 21023638 21022736 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 490018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 21258987 21259049 21259040 Y NA NA CDKAL1 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 332923 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 21273280 21273316 21273298 Y SOX4 NA NA NA NA NA SOX4 318656 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 21603523 21603934 21603831 Y SOX4 SOX4 NA NA NA NA SOX4 11551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 22024666 22024942 22024815 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 432694 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 22229364 22229373 22229369 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 637392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 22475595 22475903 22475749 Y NA NA SOX4,LINC00340 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 883623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 22718056 22718333 22718272 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 1126084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 24168850 24169077 24168970 Y NA NA NA NA NA NA DCDC2 187203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 24302656 24303033 24302868 Y NA NA NA NA NA NA DCDC2 53247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 24310560 24310668 24310614 Y NA DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 45612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 24341517 24341649 24341583 Y DCDC2,KAAG1,DCDC2 DCDC2 NA NA NA NA DCDC2 14631 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 24584505 24584676 24584669 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0319 59707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 24659946 24660207 24660006 Y TDP2,C6orf62 KIAA0319,TDP2,ACOT13 NA NA NA NA TDP2 5054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 24743891 24744276 24743998 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 24927472 24927654 24927651 Y ALDH5A1,TDP2,C6orf62 PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 46993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 24929581 24929797 24929724 Y NA PPIAP29 FAM65B IMR90 Hi-C 24141950 PPIAP29 44850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.42581827780622 chr6 26025834 26026125 26026038 Y BTN2A1,BTN2A1,TRIM38 HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 26223563 26223671 26223616 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI NA NA NA NA HIST1H3E 180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 26322637 26323123 26322876 Y NA HIST1H4H,BTN3A2 HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK IMR90 Hi-C 24141950 HIST1H4H 38875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 15427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF204P,ZNF391 NA NA NA NA ZNF204P 36278 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr6 27655152 27655475 27655306 Y FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM NA LOC100507173,ZNF184 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HIST1H2BL 118234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 27720726 27720895 27720796 Y NA NA HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AG,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,MIR3143,LOC100131289 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H2BL 52814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 28102608 28102781 28102677 Y ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 12270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12 NA NA NA NA ZSCAN12 49442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA NA NA NA NA NA ZSCAN12 91714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 28603148 28603326 28603259 Y NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3 SCAND3 NA NA NA NA SCAND3 21159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 128816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA NA NA NA NA NA HCG14 56889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 29521167 29521548 29521446 Y NA UBD NA NA NA NA UBD 4154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 29829189 29829211 29829201 Y NA HLA-H,HCG4P7 ZNRD1-AS1,HLA-J,HCG9 IMR90 Hi-C 24141950 HLA-H 24139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.37743446608573 chr6 29933738 29934144 29933980 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 26701 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 29935319 29935652 29935489 Y NA HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 28282 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39,TRIM31 NA NA NA NA TRIM31 8845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 30495647 30495976 30495809 Y PPP1R11,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3,FLOT1,HLA-E RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 26687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30519269 30519607 30519590 Y NA PRR3,GNL1,ABCF1 NA NA NA NA PRR3 3056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30716024 30716359 30716084 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 5693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr6 30717441 30717627 30717503 Y RPP21,SFTA2,PSORS1C1 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 7110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 30731311 30731508 30731442 Y VARS2,VARS2 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 HCG20 1094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 30731781 30732171 30732168 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 HCG20 431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 30796195 30796565 30796398 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 DDR1 IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDR1 45633 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 31140737 31140986 31140881 Y NA CCHCR1,TCF19,HCG27 NA NA NA NA TCF19 16418 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,AGER,XXbac-BPG300A18.13,PBX2 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 32956037 32956271 32956088 Y NA HLA-DMB,BRD2,HLA-DMA,BRD2-IT1 NA NA NA NA BRD2-IT1 20028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 33159164 33159383 33159309 Y NA SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1 NA NA NA NA SLC39A7 6839 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 33392796 33393285 33393082 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9 NA NA NA NA SYNGAP1 6949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 33558672 33558897 33558785 Y NA BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 12653 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 33950913 33951144 33951041 Y NA NA NA NA NA NA LEMD2 196000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 34624445 34624747 34624649 Y TAF11 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 34631608 34631780 34631736 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 30856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 35017720 35018080 35017831 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 162678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 35170056 35170397 35170225 Y NA NA TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF76 54289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 35561770 35562146 35562007 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 40120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 36010041 36010276 36010159 Y NA MAPK14 NA NA NA NA MAPK14 16553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 MAPK13 NA NA NA NA MAPK13 6845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 36321421 36321620 36321472 Y CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7 NA NA NA NA NA KCTD20 86924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20,PXT1 NA NA NA NA PXT1 591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 36547678 36548077 36547769 Y PI16,MTCH1 STK38,SRSF3 STK38,SRSF3,KCTD20,PXT1,MIR3925 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SRSF3 12068 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 36634782 36635224 36635042 Y MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LAP3P2 4370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 37102324 37102775 37102642 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 33204 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37159773 37160042 37159866 Y TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1 PIM1 NA NA NA NA PIM1 23794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37210217 37210497 37210343 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 13051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37212541 37212901 37212835 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 10647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37673638 37673745 37673684 Y NA MDGA1 MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 MDGA1 8556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 37879889 37880256 37879963 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 94614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 38450593 38450822 38450666 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 155102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 39061184 39061194 39061189 Y GLP1R GLP1R,SAYSD1 NA NA NA NA SAYSD1 19771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 40964511 40964818 40964666 Y NA UNC5CL NA NA NA NA UNC5CL 40110 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 41472054 41472459 41472263 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 39705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 41512989 41513289 41513139 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA FOXP4 825 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 42219475 42219699 42219588 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 35872 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 42361651 42361664 42361659 Y TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 56125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 3619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 43766474 43766976 43766784 Y NFKBIE,MAD2L1BP VEGFA NA NA NA NA VEGFA 30553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA C6orf223 87630 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP C6orf223 NA NA NA NA C6orf223 13503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 42884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA C6orf223 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 45629 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 44020614 44020967 44020695 Y NFKBIE NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MRPS18A,MAD2L1BP,VEGFA,C6orf223 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf223 54297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 44205272 44205504 44205346 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 7320 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr6 44205807 44206020 44205896 Y NA SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA HSP90AB1 6804 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 45313959 45314320 45314140 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 29370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 45322073 45322342 45322124 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 21348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 45503698 45503963 45503769 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 160008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 45575518 45575910 45575680 Y NA NA RUNX2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SUPT3H 231828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 47041238 47041252 47041245 Y NA NA TNFRSF21 IMR90 Hi-C 24141950 GPR116 120558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 47102503 47102708 47102571 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF21 172933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 47214948 47215452 47215060 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 60189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 47263537 47263554 47263549 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 12087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr6 47275760 47275938 47275849 Y NA TNFRSF21 NA NA NA NA TNFRSF21 119 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 47382599 47382792 47382666 Y NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 60733 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 49533704 49534052 49533813 Y C6orf141 C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 17591 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA RP3-437C15.1 NA NA NA NA RP3-437C15.1 1925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 51642474 51642504 51642490 Y NA NA NA NA NA NA PKHD1 307919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 52382425 52382779 52382512 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 56934 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 52591404 52591712 52591556 Y NA GSTA2 NA NA NA NA GSTA2 34655 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 53348299 53348382 53348306 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 131386 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 53660581 53660848 53660781 Y LRRC1 LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 3286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 56459514 56459884 56459699 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 357889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 56543882 56543906 56543894 Y NA NA DST IMR90 Hi-C 24141950 BEND6 273867 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 56811664 56812033 56811848 Y NA BEND6 BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BEND6 5740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 57004936 57005232 57005084 Y NA BAG2 NA NA NA NA BAG2 29892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 57354557 57355032 57354719 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 176954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 57389697 57390070 57389732 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 212094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 64398084 64398491 64398303 Y PHF3 NA NA NA NA NA PHF3 54359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 72103736 72104124 72104114 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 7200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA MIR30A,LINC00472 NA NA NA NA MIR30A 3049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RPL39P3 213088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 74186150 74186447 74186193 Y MTO1 MTO1,EEF1A1 NA NA NA NA MTO1 16849 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 76367901 76367953 76367944 Y NA NA NA NA NA NA SENP6 58676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 82247797 82248117 82247957 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 212374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 82554529 82554698 82554614 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 94038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 82648128 82648420 82648330 Y NA NA NA NA NA NA FAM46A 187637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 82854780 82854947 82854862 Y NA NA NA NA NA NA IBTK 100524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 82956000 82956181 82956090 Y NA IBTK NA NA NA NA IBTK 529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 83745270 83745402 83745336 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 29983 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 84139998 84140114 84140099 Y ME1 ME1 NA NA NA NA ME1 1201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 84931248 84931348 84931298 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 4005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E RP11-30P6.6,NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-30P6.6 16592 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 86377022 86377042 86377037 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 9409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 88160287 88160298 88160293 Y NA C6orf165,SLC35A1 NA NA NA NA SLC35A1 18043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 88433013 88433258 88433054 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2-AS1,AKIRIN2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 23086 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 89315918 89316052 89315985 Y NA NA NA NA NA NA ACTBP8 331210 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 89744158 89744669 89744587 Y UBE2J1,RRAGD,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 43801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 90550185 90550523 90550354 Y NA MDN1,CASP8AP2 NA NA NA NA CASP8AP2 12572 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 90820775 90820949 90820871 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 183678 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 90860237 90860588 90860527 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 144039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 91121051 91121489 91121257 Y BACH2,BACH2 NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 116424 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 96304846 96305132 96304924 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 281427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 99382979 99383150 99383065 Y NA FBXL4 NA NA NA NA FBXL4 10699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 99995359 99995841 99995579 Y PNISR USP45,CCNC NA NA NA NA CCNC 19008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 101311437 101311450 101311446 Y NA ASCC3 NA NA NA NA ASCC3 15798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 106047524 106047990 106047829 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 198565 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 106048262 106048533 106048347 Y NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 199303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 91524 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 106591976 106592274 106592125 Y NA NA ATG5,PRDM1,LIN28B IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 59781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 107209131 107209144 107209138 Y BEND3 RP1-60O19.1 NA NA NA NA RP1-60O19.1 24272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 107216864 107217098 107216981 Y NA RP1-60O19.1 NA NA NA NA RP1-60O19.1 16318 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 107230465 107230834 107230696 Y NA RP1-60O19.1 NA NA NA NA RP1-60O19.1 2582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1,NR2E1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr6 108574394 108574619 108574507 Y NA SNX3,LACE1 NA NA NA NA SNX3 5845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr6 108895400 108895781 108895496 Y NA FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 16362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 108961437 108961619 108961493 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 82399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 109558807 109559007 109558956 Y SMPD2,MICAL1,CD164 NA CD164,CCDC162P K562 ChIA-PET 22265404 CD164 142755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 109602805 109602853 109602823 Y NA NA CCDC162P IMR90 Hi-C 24141950 CD164 98909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 109637041 109637243 109637127 Y NA NA NA NA NA NA CD164 64519 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 109680867 109680881 109680874 Y SMPD2 CD164 NA NA NA NA CD164 20881 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 109780095 109780443 109780296 Y CD164,SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA MICAL1 4728 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 110418117 110418342 110418281 Y NA NA NA NA NA NA WASF1 80865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111194680 111194889 111194745 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 AMD1 NA NA NA NA AMD1 707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111255245 111255563 111255437 Y SLC16A10,AMD1,AMD1 GTF3C6,RPF2 GTF3C6,CDK19 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 GTF3C6 22200 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111551650 111551849 111551726 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 26702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111614404 111614762 111614615 Y NA KIAA1919 NA NA NA NA KIAA1919 35853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111808995 111809308 111809091 Y REV3L,FYN,TRAF3IP2 TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA REV3L 6077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 112097804 112098263 112098017 Y NA NA NA NA NA NA FYN 94392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 112134730 112134859 112134835 Y NA NA NA NA NA NA FYN 57796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 112449250 112449618 112449554 Y NA TUBE1 NA NA NA NA TUBE1 42518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 112535932 112536093 112536020 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 38048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 113975639 113976185 113975774 Y MARCKS RP11-367G18.1 MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 6363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA RP11-367G18.1 NA NA NA NA RP11-367G18.1 36530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 114056297 114056582 114056455 Y MARCKS NA MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 RP11-367G18.1 87021 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 114318333 114318559 114318390 Y NA RP3-399L15.3,HDAC2 NA NA NA NA HDAC2 11913 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 117722961 117723078 117723022 Y ROS1 DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 49902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 117761832 117762028 117761987 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 10952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 117769226 117769320 117769257 Y NA DCBLD1 DCBLD1,GOPC,ROS1 IMR90 Hi-C 24141950 DCBLD1 3660 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 117819510 117819668 117819589 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 46530 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 118009013 118009297 118009155 Y NA NUS1 NA NA NA NA NUS1 14348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 118759105 118759218 118759162 Y NA NA NA NA NA NA CEP85L 270020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1,PKIB NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 123074884 123075101 123074982 Y NA SMPDL3A NA NA NA NA SMPDL3A 33214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 125523153 125523251 125523202 Y NA NA NA NA NA NA TPD52L1 84958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 125579970 125580036 125580003 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 41246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 126068034 126068254 126068125 Y HEY2 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA HEY2 1224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 126112858 126113033 126112985 Y TRMT11,HINT3,NCOA7 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 12551 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 126621398 126621727 126621563 Y NA CENPW NA NA NA NA CENPW 37593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 127618608 127618885 127618797 Y NA RNF146,ECHDC1 NA NA NA NA RNF146 32853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA ECHDC1 318120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 128637396 128637725 128637581 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 202145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 128816273 128816626 128816620 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 23244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 128830157 128830356 128830243 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 9514 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 128840669 128840970 128840936 Y PTPRK,PTPRK PTPRK NA NA NA NA PTPRK 799 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 129855341 129855708 129855581 Y ARHGAP18 NA NA NA NA NA ARHGAP18 173662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 130069572 130069764 130069691 Y NA ARHGAP18 ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 40202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 NA NA NA NA NA ARHGAP18 312842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 133059787 133059954 133059917 Y NA VNN1,VNN3,VNN2 NA NA NA NA VNN3 5883 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 133077969 133078324 133078200 Y NA VNN1,VNN3,VNN2 NA NA NA NA VNN2 4274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 133839183 133839299 133839241 Y EYA4 NA NA NA NA NA TCF21 368977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TCF21 317367 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr6 134085872 134085913 134085879 Y NA NA TCF21,MGC34034 IMR90 Hi-C 24141950 TCF21 122363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 134264415 134264799 134264607 Y NA TBPL1 TBPL1,SLC2A12 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TBPL1 6509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 135611032 135611105 135611069 Y ALDH8A1 NA NA NA NA NA MYB 110579 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 136316549 136316741 136316613 Y NA NA NA NA NA NA PDE7B 145715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 136702762 136702864 136702842 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 93773 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 136907576 136907759 136907659 Y NA MAP7 NA NA NA NA MAP7 37619 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 137244333 137244577 137244412 Y SLC35D3 NA NA NA NA NA PEX7 102616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 137555218 137555651 137555304 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 16632 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 137558650 137558845 137558763 Y MAP3K5,IFNGR1 IFNGR1 IFNGR1,OLIG3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IFNGR1 20064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 137988139 137988331 137988320 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP3 198020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138027517 138027801 138027604 Y NA NA TNFAIP3,PERP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 158550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138777270 138777670 138777656 Y NA NA NA NA NA NA HEBP2 54602 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 139625000 139625014 139625006 Y NA NA TXLNB,HECA IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 68743 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 139854911 139854985 139854931 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 139860975 139861228 139861133 Y CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 139861409 139861802 139861629 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA CITED2,LOC100132735 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 167652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 139909356 139909574 139909434 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 215599 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 140075983 140076182 140076083 Y NA NA TXLNB,CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 382226 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 140860203 140860346 140860259 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1166446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 141873662 141873944 141873832 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 592423 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 142290502 142290595 142290549 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 175772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 142648297 142648491 142648394 Y NA GPR126 NA NA NA NA GPR126 27306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 143140738 143141058 143140895 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 123280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143141084 143141442 143141235 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 122896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143171849 143172301 143172148 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 92037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143192899 143193375 143193200 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 70963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 143206296 143206927 143206703 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 57411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr6 143221710 143222285 143222093 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 42053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143234166 143234456 143234293 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29882 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143234736 143235083 143235000 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 29255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143248323 143248614 143248469 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 15724 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 143718495 143718881 143718689 Y NA NA AIG1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAT2 50929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 144468300 144468310 144468305 Y NA STX11 NA NA NA NA STX11 1353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA UTRN UTRN IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 19137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 144587251 144587368 144587331 Y NA UTRN UTRN,STX11 IMR90 Hi-C 24141950 UTRN 17469 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 144644192 144644433 144644313 Y NA UTRN NA NA NA NA UTRN 39355 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 144657152 144657284 144657222 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 52315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 144975415 144975576 144975532 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 370578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 144982592 144982877 144982735 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 377755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 145131744 145132215 145131879 Y NA NA NA NA NA NA UTRN 526907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 148443958 148444368 148444103 Y NA NA SAMD5 IMR90 Hi-C 24141950 SASH1 147072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 148823673 148823949 148823781 Y NA NA NA NA NA NA SASH1 232233 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 150482510 150482848 150482609 Y NA PPP1R14C NA NA NA NA PPP1R14C 20298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 150739160 150739823 150739483 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHG1 179176 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 150944036 150944676 150944139 Y PLEKHG1 PLEKHG1 NA NA NA NA PLEKHG1 25037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 151366767 151366942 151366858 Y NA NA NA NA NA NA RP1-292B18.1 51723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 151990047 151990437 151990162 Y NA NA ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf211 218625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 152583976 152584217 152584151 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 372719 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 154676071 154676546 154676403 Y NA IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 154858221 154858762 154858474 Y CNKSR3 CNKSR3,RPS4XP8 IPCEF1,OPRM1,CNKSR3 IMR90 Hi-C 24141950 CNKSR3 28428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 154914262 154914493 154914392 Y CNKSR3 RPS4XP8 NA NA NA NA RPS4XP8 18819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 155193821 155194059 155193913 Y NA TIAM2 TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 41990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 155306251 155306499 155306375 Y TIAM2 NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 154420 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 155332515 155332889 155332702 Y NA NA TIAM2 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 180684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 155492232 155492854 155492387 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 83004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 155739222 155739872 155739692 Y CLDN20 NA NA NA NA NA TFB1M 105595 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 156748534 156748826 156748680 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 348237 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 156758659 156759033 156758861 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 338030 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr6 157144043 157144235 157144146 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 46980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157160663 157161314 157160954 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 63600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157173280 157173444 157173363 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 76217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157267788 157267851 157267817 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 170725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 157299126 157299275 157299174 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 202063 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157726321 157726550 157726459 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 16083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 157942604 157942859 157942786 Y SNX9 NA NA NA NA NA ZDHHC14 142439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158034114 158034488 158034146 Y NA NA NA NA NA NA SNX9 207808 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158375265 158375579 158375328 Y NA SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 25309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr6 158452388 158452885 158452569 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 51500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr6 158525965 158526121 158526043 Y NA NA NA NA NA NA SERAC1 61191 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158640222 158640658 158640460 Y SNX9 NA NA NA NA NA GTF2H5 52838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158702253 158702563 158702348 Y TMEM181 NA TMEM181,TULP4,SYTL3,GTF2H5,DYNLT1 IMR90 Hi-C 24141950 GTF2H5 114869 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158808734 158809093 158808911 Y TMEM181 NA NA NA NA NA TMEM181 146375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158895983 158896180 158896053 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 59288 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 159237852 159238517 159238245 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR NA NA NA NA NA EZR 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR,C6orf99 NA NA NA NA C6orf99 14078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 160137124 160138386 160137829 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 6231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 160144181 160144267 160144224 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 NA NA NA NA WTAP 350 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 160399624 160399885 160399732 Y SOD2,WTAP,WTAP,MAS1 IGF2R NA NA NA NA IGF2R 11493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 160837218 160837569 160837394 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A3 69918 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 160839575 160839730 160839653 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A3 72275 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 161646912 161646998 161646955 Y NA AGPAT4 NA NA NA NA AGPAT4 46095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 163784160 163784198 163784179 Y NA CAHM,QKI PACRG IMR90 Hi-C 24141950 CAHM 48794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr6 163881453 163881850 163881463 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 48421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 163976539 163976874 163976679 Y NA NA NA NA NA NA QKI 143507 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 165696140 165696152 165696147 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 701939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 166067950 166069085 166068916 Y NA NA NA NA NA NA PDE10A 329006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 166765505 166765751 166765595 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 11426 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA WDR27 271871 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 170208297 170208700 170208496 Y NA NA NA NA NA NA TCTE3 58642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 170363631 170364652 170364054 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 TCTE3 213976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 543299 543586 543435 Y GET4,CYP2W1,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 14347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 577876 578141 578015 Y PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 19943 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 655576 655910 655797 Y NA NA NA NA NA NA PDGFA 97643 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1017371 1017727 1017512 Y PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,CYP2W1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA COX19 4136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 1274384 1274791 1274446 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND2A 75989 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1456103 1456158 1456132 Y NA MICALL2 NA NA NA NA MICALL2 40980 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1553000 1553189 1553120 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A MICALL2,INTS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 INTS1 9511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.42742428241926 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 1706379 1706695 1706444 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908,PSMG3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMG3 97738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 2063741 2064015 2063879 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 206863 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 2362962 2363263 2363259 Y AMZ1 EIF3B,SNX8 KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 28458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 2657383 2657705 2657445 Y IQCE,TTYH3 TTYH3 NA NA NA NA TTYH3 11880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 2744937 2745164 2745051 Y NA AMZ1 NA NA NA NA AMZ1 27781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 2842322 2842519 2842421 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 30736 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 3603136 3603457 3603297 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 264056 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr7 4765280 4765661 4765569 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 83892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 4778448 4778853 4778548 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 97060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr7 4779326 4779630 4779587 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 97938 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 5039702 5040026 5039789 Y NA RNF216P1,RBAK NA NA NA NA RNF216P1 28083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 5452779 5453024 5452968 Y NA TNRC18 NA NA NA NA TNRC18 10021 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 5469639 5470034 5469987 Y NA TNRC18 TNRC18,FBXL18,ACTB MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TNRC18 6594 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 5490349 5490801 5490564 Y NA TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 27304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 5492663 5492953 5492758 Y MMD2,SLC29A4 TNRC18 TNRC18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TNRC18 29618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 5578052 5578271 5578166 Y NA FBXL18,ACTB RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 ACTB 23144 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 6145406 6145878 6145682 Y USP42 EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA USP42 2891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 6296618 6296924 6296769 Y CCZ1 CYTH3 NA NA NA NA CYTH3 13351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 6422514 6422839 6422633 Y CCZ1 RAC1 NA NA NA NA RAC1 10360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 8016516 8016759 8016566 Y GLCCI1 GLCCI1 NA NA NA NA GLCCI1 10091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 8482629 8482725 8482675 Y NXPH1 NXPH1 NA NA NA NA NXPH1 11044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 8530046 8530057 8530051 Y NA NA NA NA NA NA NXPH1 58461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 11827353 11827497 11827425 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 42327 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 11832549 11832888 11832860 Y NA THSD7A NA NA NA NA THSD7A 36936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 11859641 11859960 11859801 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 9864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 11860647 11861050 11860853 Y THSD7A THSD7A NA NA NA NA THSD7A 8774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 12582030 12582229 12582042 Y NA SCIN SCIN IMR90 Hi-C 24141950 SCIN 25974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 12624573 12625024 12624751 Y NA SCIN NA NA NA NA SCIN 16370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 13700759 13700990 13700876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 328060 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 13818689 13818849 13818801 Y ETV1 NA NA NA NA NA ETV1 210201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 14345684 14345947 14345816 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P21 236679 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 16707771 16707941 16707875 Y NA ANKMY2,BZW2 NA NA NA NA BZW2 24015 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 16961680 16961908 16961842 Y NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 AGR2 90623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 158534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17082630 17082968 17082726 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AGR2 211573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17139132 17139382 17139242 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 196864 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17170041 17170200 17170099 Y AHR NA NA NA NA NA AHR 166046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17314276 17314419 17314335 Y AHR AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AHR 21827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17315787 17316189 17315986 Y NA AHR,AC003075.4 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 20057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 17360383 17360757 17360401 Y NA AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AC003075.4 23402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA AC017060.1 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 31959 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 17729678 17729968 17729803 Y AHR NA HDAC9 IMR90 Hi-C 24141950 AC017060.1 133145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 18442328 18442677 18442600 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 317756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 18483962 18483986 18483974 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 359390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 18828374 18828759 18828502 Y NA NA NA NA NA NA HDAC9 703802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 20239036 20239390 20239182 Y TWISTNB NA NA NA NA NA ITGB8 128935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 22122614 22122929 22122771 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 138912 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 22398962 22399217 22399216 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 150401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 22757674 22758207 22757934 Y NA IL6 NA NA NA NA IL6 5296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 23410116 23410259 23410188 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 97827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 24739704 24740021 24739930 Y DFNA5,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 67223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 26220261 26220628 26220627 Y CBX3 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA CBX3 18154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 27152655 27152825 27152741 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7 NA NA NA NA HOXA-AS2 7259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 27386345 27386573 27386562 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P4 79048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 27531639 27532015 27531830 Y NA EIF4HP1 NA NA NA NA EIF4HP1 35171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 27642128 27642466 27642297 Y NA NA NA NA NA NA HIBADH 58148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 27717680 27717897 27717733 Y NA HIBADH HOTTIP,HOXA13,HIBADH,TAX1BP1,JAZF1 IMR90 Hi-C 24141950 HIBADH 17066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 27876967 27877264 27877116 Y CREB5 NA NA NA NA NA AC004549.6 98953 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1 141190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 28175314 28175565 28175485 Y NA JAZF1 NA NA NA NA JAZF1 42797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 28450839 28451193 28451101 Y CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 113899 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 28471608 28471631 28471619 Y CREB5,CREB5 NA NA NA NA NA CREB5 134668 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 29217860 29218383 29218096 Y CHN2,CPVL CPVL CHN2 IMR90 Hi-C 24141950 CPVL 14684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 29294942 29295238 29295004 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 61875 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 29304486 29305146 29304785 Y CHN2 NA NA NA NA NA CPVL 71419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 29310713 29310833 29310750 Y NA NA NA NA NA NA CPVL 77646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 29486224 29486601 29486413 Y CHN2 NA NA NA NA NA AC007255.8 114685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 30227972 30228314 30228124 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 93609 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 30387689 30388072 30387783 Y NOD1,ZNRF2 AC006978.6 NA NA NA NA AC006978.6 20915 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 505745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 32090584 32090879 32090675 Y NA NA NA NA NA NA LSM5 442016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 33762230 33762341 33762268 Y NA NA BMPER,BBS9 IMR90 Hi-C 24141950 BMPER 180182 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA HERPUD2 656484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr7 36325961 36326134 36326050 Y AOAH,SEPT7,EEPD1 NA NA NA NA NA ANLN 101281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 36331807 36331936 36331811 Y NA NA NA NA NA NA ANLN 95479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 36640799 36641036 36640908 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 213065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 36696772 36696990 36696866 Y ELMO1,AOAH NA NA NA NA NA NPM1P18 159574 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 36785983 36786266 36786088 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P18 70298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 36787255 36787404 36787327 Y NA NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P18 69160 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 36787487 36788062 36787733 Y AOAH NA AOAH IMR90 Hi-C 24141950 NPM1P18 68502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 36885113 36885488 36885361 Y KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895,KIAA0895 NPM1P18 NA NA NA NA NPM1P18 28549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 37023926 37024076 37024004 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA NPM1P18 167362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 39695521 39695649 39695585 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 34439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 40007110 40007159 40007135 Y NA CDK13 NA NA NA NA CDK13 19474 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 40138099 40138142 40138120 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 150463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 41025919 41026252 41026112 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 714454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 42120488 42120725 42120693 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 154744 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43612098 43612408 43612297 Y DBNL STK17A NA NA NA NA STK17A 7949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43626451 43626626 43626528 Y URGCP,STK17A STK17A C7orf44 IMR90 Hi-C 24141950 STK17A 6094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43658377 43658532 43658408 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 38020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 43676905 43677264 43677045 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP NA NA NA NA NA STK17A 56548 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 43835897 43835899 43835898 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 39618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2B 64510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 44678622 44679047 44678972 Y ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 34451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 44775082 44775384 44775244 Y OGDH,PURB,MYO1G,ZMIZ2,ZMIZ2 ZMIZ2 DDX56,TMED4,OGDH,PPIA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ2 10796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 44845785 44846169 44845977 Y DDX56 PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 11506 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 45040907 45041213 45041027 Y DDX56,OGDH,MYO1G,CCM2 CCM2 NA NA NA NA CCM2 3833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 46597190 46597387 46597291 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 409913 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 46803788 46804144 46803966 Y NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 203156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 285909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47302239 47302434 47302368 Y C7orf65 NA NA NA NA NA AC004870.4 294939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47510195 47510559 47510444 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 109597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47534455 47534849 47534744 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 85307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47610205 47610436 47610283 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 9720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 47641076 47641289 47641172 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 20920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47641950 47642196 47642073 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 21794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47675013 47675155 47675094 Y TNS3 NA TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 54857 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA NA NA NA NA NA HUS1 190582 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 50602565 50602886 50602809 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 28268 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 50666851 50666964 50666921 Y NA DDC NA NA NA NA DDC 35697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 50682806 50683075 50682899 Y DDC NA NA NA NA NA DDC 51652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 50807671 50808051 50807982 Y IKZF1 NA NA NA NA NA GRB10 51108 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 50889237 50889584 50889351 Y NA GRB10 COBL,GRB10 IMR90 Hi-C 24141950 GRB10 30078 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 55576461 55576688 55576528 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 61993 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 56173322 56173423 56173410 Y NA SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 1053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA RP4-725G10.3 1410485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPCP7 1989473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 65613460 65613645 65613556 Y ASL,ASL CRCP NA NA NA NA CRCP 35869 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66015251 66015629 66015440 Y NA NA NA NA NA NA GS1-124K5.4 58558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66095598 66095867 66095736 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA KCTD7 3730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 66343310 66343680 66343495 Y NA NA C7orf42 IMR90 Hi-C 24141950 TYW1 114480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 68171287 68171584 68171440 Y NA NA NA NA NA NA RP5-859M6.1 67502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 70358448 70358664 70358566 Y NA NA NA NA NA NA TYW1B 1938113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 70363018 70363036 70363028 Y NA NA NA NA NA NA TYW1B 1933741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73015142 73015298 73015257 Y NA BCL7B,TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 21575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73037168 73037552 73037436 Y MLXIPL TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 295 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr7 73180066 73180446 73180256 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4 NA NA NA NA CLDN3 2154 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73236868 73237278 73236968 Y CLDN3,CLDN4 CLDN4,WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 17587 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 73265870 73266203 73266092 Y BCL7B WBSCR27 NA NA NA NA WBSCR27 11005 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73547862 73548178 73548020 Y NA EIF4H NA NA NA NA EIF4H 38397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 73897037 73897256 73897156 Y NA GTF2IRD1 NA NA NA NA GTF2IRD1 30917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 73989785 73989913 73989858 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 80081 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 74001829 74001994 74001904 Y NA NA GTF2I IMR90 Hi-C 24141950 GTF2I 68000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 74020286 74020548 74020393 Y NA GTF2I NA NA NA NA GTF2I 49446 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 74050043 74050194 74050049 Y GTF2IRD2B GTF2I GTF2IRD1,GTF2I IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTF2I 19800 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr7 75916837 75917122 75916978 Y NA HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 12739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 75948116 75948327 75948250 Y RHBDD2 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 18255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 75993529 75993613 75993570 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7181 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 76002661 76002791 76002762 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA YWHAG 16313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 76627484 76628238 76628092 Y NA NA NA NA NA NA PTPN12 536354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 77038853 77039042 77038951 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 125550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 77039475 77039927 77039691 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 124665 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 77177634 77177834 77177685 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 13042 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 77316787 77316835 77316811 Y NA RSBN1L-AS1,RSBN1L NA NA NA NA RSBN1L-AS1 6747 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 83081582 83081807 83081725 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 194519 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 83092459 83092603 83092529 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 183723 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 90305838 90306207 90306023 Y NA NA NA NA NA NA AC002456.2 81171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 91456025 91456190 91456079 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 51844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 91466585 91467314 91466893 Y NA MTERF NA NA NA NA MTERF 40720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 92156983 92157235 92157087 Y CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64 PEX1,RBM48 NA NA NA NA RBM48 896 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 92263416 92263696 92263624 Y SAMD9,CDK6 FAM133B FAM133B MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 45708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 93231275 93231507 93231391 Y CCDC132 NA NA NA NA NA TFPI2 286796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 91903 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON1,PON3,PON2 NA NA NA NA PON3 6674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 95238124 95238400 95238252 Y PON1,PON3 PDK4 NA NA NA NA PDK4 14321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 95320009 95320109 95320059 Y PON1 NA ASB4 IMR90 Hi-C 24141950 PDK4 96206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 95546532 95546890 95546577 Y NA NA NA NA NA NA PDK4 322729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 95867967 95868008 95867988 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 81451 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 96719258 96719641 96719450 Y NA ACN9 NA NA NA NA ACN9 24261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 98048213 98048460 98048408 Y BRI3 RPS3AP26,BAIAP2L1 BAIAP2L1,TRRAP,TMEM130 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BAIAP2L1 19833 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 98809347 98809684 98809536 Y ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7 NA SMURF1 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF1 69624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 98990795 98991133 98991082 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 13131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 99020392 99020577 99020441 Y OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789 BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789 NA NA NA NA CPSF4 13968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 99785086 99785350 99785241 Y ZKSCAN1,MCM7,GATS C7orf43,GPC2 NA NA NA NA GPC2 12091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 99942530 99942666 99942614 Y OR2AE1,ZCWPW1,MEPCE,PILRA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 4999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 100042030 100042585 100042239 Y COPS6,EPHB4 MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4,NYAP1 NA NA NA NA PPP1R35 9842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 100142246 100142436 100142312 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 7412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 100144113 100144628 100144364 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 9279 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,PCOLCE,PCOLCE-AS1,MOSPD3 NA NA NA NA RP11-44M6.3 2103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr7 100772573 100772742 100772614 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 4203 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 100776070 100776161 100776131 Y SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 7700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 101566593 101566799 101566736 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 109634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.61614151546212 chr7 102104317 102104602 102104460 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA LRWD1 941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 102514621 102514825 102514690 Y NA LRRC17 FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC17 36613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 LRRC17 FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC17 34819 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 102959356 102959407 102959404 Y PMPCB,DNAJC2 DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PSMC2 23294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104482374 104482754 104482692 Y NA NA NA NA NA NA RP11-325F22.5 82323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 RP11-325F22.5 LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-325F22.5 20381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA RP11-325F22.5,LINC01004 NA NA NA NA RP11-325F22.5 43033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104612836 104613032 104612935 Y NA RP11-325F22.5,LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 38459 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104771634 104771765 104771700 Y NA NA NA NA NA NA LINC01004 120143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA CTA-351J1.1 NA NA NA NA CTA-351J1.1 1950 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 105705488 105705603 105705542 Y NA SYPL1 ATXN7L1,SYPL1,CDHR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 45419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 105856842 105857229 105857099 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 105857491 105857771 105857742 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 67001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 106018568 106018864 106018729 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 93796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 106058630 106058799 106058684 Y NAMPT,PIK3CG,FLJ36031 NA NAMPT,CCDC71L,CDHR3 IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 133858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107116622 107117169 107116900 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 84760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107554407 107554624 107554481 Y DLD DLD NA NA NA NA DLD 24992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 107555392 107555607 107555420 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 25977 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 107784751 107785008 107784880 Y NA NA NA NA NA NA LAMB1 143051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107875663 107876003 107875815 Y NRCAM NA NA NA NA NA NRCAM 219158 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 107939769 107940082 107939931 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 155079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 107949313 107949798 107949569 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 145363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 107952376 107952906 107952758 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 142255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 108046989 108047316 108047161 Y NA NRCAM NA NA NA NA NRCAM 47845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 402356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 110326819 110326998 110326909 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 402064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 110470494 110470759 110470627 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 258303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 110732834 110733321 110733005 Y NA LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 3772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 110808410 110808626 110808556 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 79348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 110856868 110857086 110856977 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 127806 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 145495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 111455220 111455605 111455549 Y NA NA NA NA NA NA IMMP2L 254647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 111671285 111671420 111671354 Y IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 173046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 111724432 111725068 111724745 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 119398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 111762700 111763025 111763010 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 81441 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 112062066 112062509 112062349 Y DOCK4,ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1 IFRD1 NA NA NA NA IFRD1 1043 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 112404343 112404501 112404446 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 24146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 114056337 114056620 114056363 Y NA NA NA NA NA NA FOXP2 331955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chr7 115873924 115874179 115873941 Y TES TES NA NA NA NA TES 25377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 116271021 116271344 116271193 Y NA MET TES,CAV1,MET,CAPZA2 IMR90,H1ESC,GM12878 Hi-C,5C 24141950,22955621 MET 39100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 116292970 116293085 116293033 Y NA MET MET IMR90 Hi-C 24141950 MET 17359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 116452966 116453226 116453141 Y CAPZA2 CAPZA2 NA NA NA NA CAPZA2 3842 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 117290130 117290152 117290141 Y NA NA NA NA NA NA CTTNBP2 222041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 119269873 119270211 119270042 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 275218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 261423 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 120589568 120589730 120589649 Y ING3 ING3 NA NA NA NA ING3 765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 123284312 123284364 123284338 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5 88003 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 123903491 123903761 123903674 Y NA NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 GPR37 499920 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 124402716 124403225 124402962 Y GPR37 GPR37 NA NA NA NA GPR37 456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.33065665897827 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr7 129460659 129460706 129460683 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 130083 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 129508183 129508482 129508331 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 82307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130005430 130005716 130005580 Y TMEM209 NA NA NA NA NA CPA4 74456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 130005893 130006126 130006010 Y MEST NA NA NA NA NA CEP41 74148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 130013597 130013906 130013823 Y CPA2,CPA1 NA NA NA NA NA CEP41 66368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 130575591 130576512 130576394 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 19557 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130583676 130584341 130584164 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 11728 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 130588239 130588699 130588531 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 7370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130593505 130595916 130594870 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130644314 130644883 130644570 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48245 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130763104 130763469 130763293 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA MKLN1 29386 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130795999 130796263 130796171 Y MKLN1,MKLN1 MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 3064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 130916172 130916668 130916569 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 8681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 132441115 132441141 132441128 Y NA NA FLJ40288 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD3 323707 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr7 134287776 134287871 134287820 Y NA BPGM AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 BPGM 41689 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr7 134836004 134836265 134836096 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 137685065 137685809 137685664 Y TRIM24,CREB3L2 CREB3L2 NA NA NA NA CREB3L2 252 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 137928273 137928746 137928445 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.2 52483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 138001269 138001637 138001460 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 20040 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 138662189 138662362 138662288 Y NA KIAA1549 NA NA NA NA KIAA1549 1702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 138791748 138791993 138791908 Y UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 138803807 138803918 138803839 Y UBN2,ZC3HAV1 ZC3HAV1,TTC26 KIAA1549,ZC3HAV1L,ZC3HAV1,TTC26,LUC7L2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZC3HAV1 11342 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 139227178 139227349 139227257 Y NA ERHP1 NA NA NA NA ERHP1 10192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.18871723304287 chr7 139333682 139334086 139333875 Y TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA NA ERHP1 116696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 139498127 139498170 139498155 Y TBXAS1 TBXAS1,HIPK2 NA NA NA NA HIPK2 22550 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 139616229 139616509 139616457 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 140652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 140774728 140775101 140774915 Y NA NA NA NA NA NA MRPS33 61700 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 140880261 140880624 140880319 Y LOC100131199 NA NA NA NA NA MRPS33 167233 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 141380130 141380660 141380538 Y NA KIAA1147 NA NA NA NA KIAA1147 19293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 143155352 143155545 143155483 Y NA NA NA NA NA NA ZYX 79179 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 146573041 146573429 146573238 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 1702064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 148685182 148685277 148685231 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 38456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA RARRES2,REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 150482077 150482267 150482158 Y GIMAP8,GIMAP2,GIMAP5,SMARCD3,SMARCD3,SLC4A2,AGAP3,TMEM176B,TMEM176B,TMEM176A TMEM176A,TMEM176B NA NA NA NA TMEM176A 13224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 57774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 151198552 151198933 151198803 Y AGAP3,PRKAG2,PRKAG2 RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 16273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 151442202 151442898 151442523 Y NA NA CRYGN,RHEB IMR90 Hi-C 24141950 PRKAG2-AS1 129229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 151823102 151823484 151823293 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 102343 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 CNPY1 NA NA NA NA CNPY1 47750 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA SHH NA NA NA NA SHH 22517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 155744220 155744341 155744281 Y NA NA LOC285889,SHH,LMBR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SHH 141253 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 156444597 156444947 156444772 Y NA RNF32,C7orf13 NA NA NA NA C7orf13 13249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 157064608 157064951 157064706 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 61124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr7 157070019 157070314 157070105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 55761 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 270529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 269521 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr7 158990200 158990517 158990421 Y ESYT2 NA VIPR2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 342931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 998832 999081 998894 Y NA NA ZNF596 IMR90 Hi-C 24141950 ERICH1 312726 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 6323096 6323426 6323195 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115C21.2 60433 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 6443237 6443295 6443265 Y NA ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 24307 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 8153597 8154098 8153801 Y NA NA MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SGK223 87910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 8742026 8742246 8742225 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 6909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 8932382 8932915 8932599 Y CLDN23,PPP1R3B NA PPP1R3B,ERI1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PPP1R3B 74169 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 8939736 8940088 8939838 Y CLDN23,ERI1,PPP1R3B NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 66996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 8992774 8993100 8992937 Y NA PPP1R3B,RP11-10A14.4 NA NA NA NA PPP1R3B 13984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 10009702 10010057 10009864 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 99924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 10305932 10306275 10305955 Y NA NA NA NA NA NA SOX7 389082 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 11310026 11310392 11310209 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 19832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.04677780710746 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 11315246 11315781 11315560 Y XKR6,MTMR9 FAM167A NA NA NA NA FAM167A 14443 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 11322764 11323135 11322939 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 7089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 11562739 11563084 11562994 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 30271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 13219594 13219925 13219803 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 151242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 15395546 15395769 15395644 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 1615769 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 15503132 15503306 15503219 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 1508232 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 17165650 17166030 17165840 Y PDGFRL NA NA NA NA NA CNOT7 63263 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 17355613 17356072 17355737 Y NA SLC7A2 NA NA NA NA SLC7A2 3016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 17465660 17466084 17465890 Y MTUS1 PDGFRL NA NA NA NA PDGFRL 33718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 17708923 17709156 17709065 Y MTMR7,MTUS1 NA NA NA NA NA RP11-156K13.1 52069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 17893767 17894158 17893964 Y NAT1,ASAH1,ASAH1 CTD-2547L16.1,ASAH1 NA NA NA NA CTD-2547L16.1 46219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 18854306 18854486 18854451 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 85754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 19066932 19067320 19067099 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 101808 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA RP11-1105O14.1 NA NA NA NA RP11-1105O14.1 10798 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 19555269 19555638 19555536 Y NA RP11-1105O14.1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1105O14.1 21186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 19566953 19567512 19567287 Y NA RP11-1105O14.1,CSGALNACT1 CSGALNACT1,SH2D4A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1105O14.1 32870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22222955 22223268 22223121 Y EPB49,SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22227261 22227593 22227504 Y SLC39A14,SLC39A14 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 4499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 22300361 22300587 22300487 Y BIN3,PPP3CC PPP3CC,RP11-382J24.2 NA NA NA NA PPP3CC 4029 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22441359 22441704 22441532 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 7567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22468597 22468907 22468752 Y TNFRSF10C,EGR3,PDLIM2,PDLIM2,BIN3 PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13483 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22469003 22469432 22469219 Y NA PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13889 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 22551843 22553123 22552848 Y PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3 BIN3,EGR3 NA NA NA NA EGR3 3028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 22854119 22854395 22854224 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 11189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 22858322 22858618 22858470 Y EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2 RHOBTB2 NA NA NA NA RHOBTB2 15392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23014689 23015093 23014900 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 4450 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23016406 23016568 23016458 Y ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 2975 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23203813 23204244 23204131 Y LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 76597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 23382805 23383060 23382915 Y TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 1258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 23396383 23397127 23396699 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 12065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 24152439 24152589 24152514 Y ADAM28 ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 2886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 24194480 24194906 24194724 Y NA ADAM28 NA NA NA NA ADAM28 44927 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 24205082 24205515 24205207 Y ADAM28 NA NA NA NA NA ADAM28 55529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 24857844 24858008 24857898 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45220 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 25284653 25284746 25284700 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA KCTD9 29246 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 25356816 25356840 25356828 Y NA KCTD9,CDCA2 NA NA NA NA CDCA2 42303 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 26433425 26433611 26433473 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 63634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 27138634 27138989 27138722 Y PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA TRIM35 27847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 27192227 27192436 27192262 Y PTK2B,PTK2B TRIM35,PTK2B NA NA NA NA PTK2B 25228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 27730121 27730534 27730322 Y ELP3,PBK PBK NA NA NA NA PBK 36509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 28004860 28005043 28004968 Y NA NA NA NA NA NA ELP3 59670 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 28355222 28355409 28355286 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FZD3 5493 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 28893958 28894419 28894304 Y KIF13B CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 17033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 29316675 29316889 29316765 Y KIF13B,DUSP4 NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 110490 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 29412011 29412162 29412114 Y NA NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 205826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 29522725 29523096 29522814 Y KIF13B NA LOC286135,DUSP4,C8orf75 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 316540 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 29631647 29631969 29631808 Y NA NA C8orf75,LOC286135 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM66 306754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 29914930 29915195 29915084 Y NA TMEM66,LEPROTL1 NA NA NA NA TMEM66 23528 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 30280646 30281238 30280961 Y MBOAT4 RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 39729 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 30435369 30435466 30435408 Y NA NA NA NA NA NA GTF2E2 78302 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 30594719 30594985 30594839 Y NA GSR,UBXN8 UBXN8 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBXN8 6955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 30666266 30666462 30666364 Y NA PPP2CB NA NA NA NA PPP2CB 3368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA DUSP26 124148 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr8 33718252 33718557 33718395 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 2511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 33747203 33747216 33747209 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 31462 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 35119361 35119644 35119503 Y UNC5D NA NA NA NA NA LSM12P1 261637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 4.37743446608573 chr8 36441429 36441454 36441442 Y NA NA NA NA NA NA RP11-962G15.1 193228 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 365499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 367645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 37005639 37005772 37005739 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-962G15.1 370957 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 37159589 37159912 37159750 Y NA NA ZNF703,KCNU1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-150O12.3 295464 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 37773592 37773777 37773685 Y NA RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 18607 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 38077409 38077725 38077419 Y NA BAG4,LSM1,DDHD2,PPAPDC1B DDHD2 IMR90 Hi-C 24141950 DDHD2 3011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 38531693 38532032 38531863 Y NA NA C8orf86,FGFR1,RNF5P1,PPAPDC1B,DDHD2,WHSC1L1,LETM2 IMR90 Hi-C 24141950 TACC1 51672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 38624356 38624716 38624649 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1 TACC1 NA NA NA NA TACC1 40652 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 38856419 38857534 38856583 Y NA TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 4031 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 39801503 39801850 39801608 Y NA IDO1 NA NA NA NA IDO1 43709 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 40049035 40049230 40049136 Y NA C8orf4 GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 40046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 41462271 41462436 41462354 Y NA AGPAT6,RP11-360L9.4 NA NA NA NA RP11-360L9.4 28384 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 41542963 41543213 41543110 Y GOLGA7,GOLGA7,AGPAT6 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 109076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 41570603 41570760 41570682 Y NA NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 136716 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 41886687 41887061 41886965 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 20447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 42338924 42339272 42339098 Y NA NA NA NA NA NA SLC20A2 55797 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA5P12 168300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 48265920 48266584 48265994 Y NA NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 48343978 48344357 48344119 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 158814 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 77792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 48438620 48439345 48439203 Y CEBPD NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 63826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 48910578 48910837 48910684 Y NA PRKDC,MCM4,UBE2V2 NA NA NA NA UBE2V2 8123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 49086776 49087078 49086884 Y NA NA SNAI2,EFCAB1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2V2 167816 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 49701443 49701572 49701502 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SNAI2 130727 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 56362318 56362387 56362358 Y NA NA NA NA NA NA TGS1 321314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 56756553 56757241 56756740 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 33131 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 59710658 59710976 59710817 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 140255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA NA NA NA NA NA NSMAF 192966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 59849492 59849915 59849740 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 179684 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 59878188 59878486 59878337 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 151113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 59949464 59949741 59949603 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 79858 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 61708880 61709194 61708899 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 119543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 62385898 62385985 62385942 Y CLVS1 NA NA NA NA NA ASPH 239170 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 62534300 62534453 62534449 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 90702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 62566892 62567143 62567071 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 58012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 62600598 62600698 62600684 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 24457 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 62620817 62621622 62621526 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA ASPH 3533 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 62630891 62631364 62631206 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 5544 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 62634023 62634407 62634126 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 8676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr8 62634431 62634735 62634612 Y ASPH ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 9084 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 62647103 62647241 62647155 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 21756 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 62647717 62647991 62647767 Y NA ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 22370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 62679636 62680132 62679874 Y NA NA ASPH,MIR4470 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MIR4470 54289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 64799410 64799591 64799501 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 720298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 66862327 66863132 66862741 Y PDE7A NA PDE7A MCF7 ChIA-PET 22265404 PDE7A 109770 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 66893726 66894034 66893791 Y PDE7A NA DNAJC5B IMR90 Hi-C 24141950 AC084082.3 128868 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 66934530 66934705 66934628 Y PDE7A NA NA NA NA NA AC084082.3 88197 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 67131951 67132306 67132129 Y NA NA DNAJC5B,CRH IMR90 Hi-C 24141950 AC084082.3 109049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 68090392 68090564 68090531 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 96374 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 68097028 68097398 68097213 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 103010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 68105132 68105308 68105276 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 111114 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 69175197 69175408 69175303 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 921285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 71129648 71130032 71129927 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 115234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 71522610 71523035 71522826 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 3988 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 241832 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 72836370 72836680 72836477 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 149172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 72880263 72880309 72880290 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 105543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 72917567 72918022 72917791 Y NA NA NA NA NA NA TRPA1 67830 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 359731 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 73799378 73799441 73799410 Y KCNB2 NA NA NA NA NA TERF1 119658 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 74282734 74282969 74282907 Y NA NA STAU2,LOC100128126,RDH10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 76710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 75418171 75418548 75418360 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 95931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 75748881 75749089 75748985 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 234402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 282651 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA HNF4G 186542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 77589671 77589739 77589705 Y NA ZFHX4 NA NA NA NA ZFHX4 1715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 80659403 80659613 80659502 Y NA HEY1 NA NA NA NA HEY1 18485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 81059132 81059394 81059212 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 82073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 81782792 81783006 81782996 Y ZBTB10,ZNF704 NA NA NA NA NA PAG1 239297 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 81831009 81831253 81831114 Y ZBTB10,PAG1 NA ZNF704 IMR90 Hi-C 24141950 PAG1 191050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 82203488 82203770 82203698 Y PAG1 FABP5,RP11-363E6.3 NA NA NA NA RP11-363E6.3 11807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 86199814 86200087 86199951 Y NA NA NA NA NA NA CA13 68998 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 86378354 86378674 86378384 Y LRRCC1,CA2 CA2 NA NA NA NA CA2 4273 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA CPNE3 178901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 90443511 90443699 90443605 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 324256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90740659 90741027 90740842 Y NA RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90776453 90776674 90776498 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 8478 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90794286 90794738 90794600 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 NA NA NA NA RIPK2 26311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90849173 90849652 90849503 Y RIPK2,OSGIN2 NA OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1 IMR90 Hi-C 24141950 OSGIN2 62435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 90942619 90942853 90942786 Y RIPK2,NBN,OSGIN2 OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 30532 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 94728357 94728657 94728477 Y NA FAM92A1,LINC00535,RBM12B,TMEM67 NA NA NA NA LINC00535 17696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 94835578 94835753 94835625 Y NA PDP1 NA NA NA NA PDP1 32282 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 95132318 95132456 95132369 Y NA NA NA NA NA NA KB-1247B1.1 80824 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 95254172 95254606 95254439 Y GEM KB-1247B1.1,CDH17,GEM CDH17 IMR90 Hi-C 24141950 GEM 17972 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 95896385 95896691 95896542 Y NA CCNE2 NA NA NA NA CCNE2 10215 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 95943173 95943450 95943312 Y NA CCNE2,TP53INP1,RP11-347C18.3 NA NA NA NA TP53INP1 16189 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 97801629 97801768 97801699 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 298050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 97869514 97869680 97869584 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 365935 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 97918773 97918994 97918966 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 415194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 98892233 98892331 98892282 Y NA RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA MATN2 13165 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 99637150 99637421 99637401 Y NA NA NA NA NA NA STK3 315634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 99643221 99643590 99643555 Y NA NA NA NA NA NA STK3 309465 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 100803946 100804239 100804046 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 100051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 101476271 101476730 101476459 Y YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1 IMR90 Hi-C 24141950 KB-1615E4.2 9173 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr8 101484105 101484411 101484224 Y NA KB-1615E4.2 SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 1492 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 101486265 101486558 101486389 Y SPAG1,SPAG1,RNF19A KB-1615E4.2 SPAG1,RNF19A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 362 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 101500158 101500422 101500292 Y NA KB-1615E4.2 RNF19A,GRHL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 14255 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 101502356 101502514 101502451 Y SPAG1,SPAG1 KB-1615E4.2 RNF19A,GRHL2,SPAG1,ANKRD46 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1615E4.2 16453 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 101512336 101512720 101512423 Y SPAG1,SPAG1 KB-1615E4.2 NA NA NA NA KB-1615E4.2 26433 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 101912406 101912993 101912785 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA NA NA NA NA YWHAZ 50623 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 102161878 102162231 102162054 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 54190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 102168240 102168326 102168276 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48095 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 102191448 102191797 102191796 Y NA ZNF706 NA NA NA NA ZNF706 24624 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 102373140 102373427 102373201 Y NA NACAP1 GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NACAP1 1118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 102388506 102388737 102388522 Y NA NACAP1 NA NA NA NA NACAP1 16484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 102516990 102517159 102517011 Y GRHL2 NA NA NA NA NA NACAP1 144968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 103249003 103249378 103249091 Y UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B KB-431C1.4 NA NA NA NA RRM2B 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 103422542 103423104 103422992 Y NA NA NA NA NA NA UBR5 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr8 103740665 103741062 103740742 Y NA NA KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 74535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 103750893 103751082 103750980 Y AZIN1,KLF10,KLF10 NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 84763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 103795045 103795342 103795198 Y NA NA UBR5,KLF10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KB-1507C5.2 79186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 103803215 103803631 103803453 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 70897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.61774752007516 chr8 103806867 103807011 103806958 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 67517 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 103822630 103823284 103823186 Y NA NA NA NA NA NA KB-1507C5.2 51244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 103910563 103910945 103910847 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 6471 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 104043647 104043928 104043793 Y KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1 ATP6V1C1,KB-1639H6.2 NA NA NA NA KB-1639H6.2 11991 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 104308052 104308138 104308090 Y NA FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA FZD6 523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,RP11-318M2.2 NA NA NA NA RP11-318M2.2 22705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 104406173 104406574 104406390 Y NA DCAF13,SLC25A32 NA NA NA NA DCAF13 18368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 105212578 105212580 105212579 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 386672 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 105374220 105374445 105374333 Y TM7SF4 NA NA NA NA NA LRP12 224807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 105523001 105523289 105523222 Y NA NA NA NA NA NA LRP12 75963 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 106671593 106671660 106671627 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 399092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 106764019 106764032 106764026 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 306720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr8 106878097 106878155 106878126 Y NA NA OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 192597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 107054607 107054687 107054647 Y OXR1 RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 16065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 107059911 107060047 107059923 Y NA RP11-152P17.2 OXR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-152P17.2 10705 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 107603836 107604153 107603995 Y NA NA NA NA NA NA TAGLN2P1 104088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 108235435 108235863 108235712 Y NA NA ANGPT1 IMR90 Hi-C 24141950 TAGLN2P1 527194 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 117664503 117664654 117664532 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 112088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 117889939 117890223 117890034 Y RAD21 MIR3610,RAD21 NA NA NA NA RAD21 4834 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 118527671 118527987 118527829 Y NA MED30 NA NA NA NA MED30 2965 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 118801002 118801354 118801210 Y NA NA NA NA NA NA MED30 270050 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 118958698 118959000 118958912 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 163092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.23710104476336 chr8 118969079 118969407 118969255 Y MED30 NA NA NA NA NA EXT1 152685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 119013126 119013396 119013387 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 108696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 119047899 119048328 119048216 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 73764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 119117518 119117887 119117807 Y NA EXT1 NA NA NA NA EXT1 4205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 119313185 119313253 119313219 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 191093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 120995010 120995163 120995088 Y DEPTOR NA NA NA NA NA COL14A1 74856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR COL14A1 DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 COL14A1 22869 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 121442839 121443137 121442988 Y NA MTBP,MRPL13 NA NA NA NA MTBP 12503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 121628287 121628559 121628462 Y NA NA NA NA NA NA MRPL13 172645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 121798029 121798317 121798256 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 25196 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 121822442 121823157 121823030 Y NA SNTB1 NA NA NA NA SNTB1 356 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 122157265 122157468 122157378 Y NA NA NA NA NA NA RP11-369K17.1 233960 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 122176324 122176668 122176537 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-369K17.1 253019 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 123317783 123317849 123317816 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01151 386496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 123811167 123811696 123811506 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 19534 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 123983848 123983920 123983884 Y NA NA NA NA NA NA DERL1 68743 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 124179869 124179997 124179932 Y NA NA NA NA NA NA C8orf76 71641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124547812 124548082 124548041 Y NA FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 3364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124552481 124552488 124552485 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124889263 124889525 124889394 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 110567 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124934433 124934622 124934528 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 155737 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 124965382 124965556 124965469 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 186686 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125212215 125212575 125212395 Y NA NA TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARF1P3 50051 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 125249599 125249607 125249603 Y NA RP11-383J24.1 TMEM65,FER1L6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 32317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 125267263 125267302 125267281 Y FAM91A1,RNF139 RP11-383J24.1 TMEM65,FER1L6,FER1L6-AS1,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 14622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 125273752 125273910 125273831 Y NA RP11-383J24.1 FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 8014 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125274514 125274782 125274739 Y RNF139 RP11-383J24.1 FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 7142 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125275002 125275221 125275161 Y RNF139 RP11-383J24.1 FER1L6,FER1L6-AS1,TMEM65,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-383J24.1 6703 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 20536 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr8 125304968 125305098 125305033 Y NA RP11-383J24.1 NA NA NA NA RP11-383J24.1 23044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125357334 125357543 125357438 Y NA TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 25390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125447179 125447220 125447200 Y NA TRMT12,RNF139-AS1,RNF139 FER1L6,FER1L6-AS1,ANXA13,FAM91A1,KLHL38,TMEM65,FBXO32 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT12 13828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 125683084 125683301 125683193 Y MTSS1 NA NA NA NA NA MTSS1 55429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 3.04517180249442 chr8 126232175 126232753 126232302 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130093 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 126232781 126233016 126232896 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 130699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 126283499 126283849 126283769 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 156714 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr8 126446642 126447323 126446973 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 6079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 126451967 126452238 126452064 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 11404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 127325042 127325066 127325054 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 243054 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 127387635 127388005 127387836 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 180115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128070328 128070629 128070508 Y FAM84B NA NA NA NA NA CCAT1 158704 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 129791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128134721 128135121 128135085 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 94212 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128176067 128176333 128176204 Y NA NA PCAT1,POU5F1B,LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 53000 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128180134 128180587 128180334 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 48746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128182261 128182424 128182343 Y NA CCAT1 PCAT1,POU5F1B,LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 46909 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128196669 128197128 128196955 Y NA CCAT1 NA NA NA NA CCAT1 32205 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128208934 128209645 128209301 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 19688 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128218099 128218752 128218687 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 10581 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 128219153 128219489 128219426 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 9844 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128227982 128228299 128228180 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128352367 128352670 128352528 Y MYC NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 123034 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128744100 128744550 128744397 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 1130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128772812 128773062 128772941 Y NA MYC,PVT1 NA NA NA NA MYC 27132 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 128843918 128844302 128844002 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 39139 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128883085 128883449 128883196 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 78306 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 128888912 128889201 128889088 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 84133 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 128930937 128931257 128931067 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 89600 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 128989961 128990273 128990255 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 30584 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129129719 129130040 129129840 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 108862 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129139934 129140421 129140284 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 119077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129180743 129180870 129180780 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129209230 129209523 129209417 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 188373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 129569050 129569202 129569118 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 548193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr8 129593885 129594223 129593976 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 573028 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 129942288 129942645 129942469 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 921431 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 130315048 130315337 130315217 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 712038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 130651209 130651494 130651319 Y FAM49B NA NA NA NA NA FAM49B 375881 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 130720341 130720558 130720412 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 306817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 130907129 130907396 130907263 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 119979 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 131024148 131024528 131024501 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 2847 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 131027030 131027189 131027125 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 186 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 131269679 131269819 131269766 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 184087 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 131467153 131467172 131467163 Y NA ASAP1 ASAP1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ASAP1 13247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 132826560 132827195 132826776 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 87140 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr8 132928633 132929053 132928845 Y NA EFR3A NA NA NA NA EFR3A 14298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 134233745 134234256 134234169 Y NA WISP1 NA NA NA NA WISP1 32463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 134532639 134533046 134532970 Y ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 49137 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 134538889 134539172 134539021 Y SLA,ST3GAL1 ST3GAL1 NA NA NA NA ST3GAL1 43011 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 135469388 135469911 135469674 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 253381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 135635794 135636288 135636020 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 87004 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 135747055 135747062 135747059 Y NA ZFAT ZFAT MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFAT 23763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 137765888 137765903 137765896 Y NA NA NA NA NA NA KHDRBS3 1298188 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 141102173 141102317 141102281 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 364361 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 141189770 141190115 141189943 Y TRAPPC9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 276563 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr8 141190446 141190798 141190723 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 275880 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 141212639 141212826 141212733 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 253852 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 141604721 141605198 141605144 Y EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 85324 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 141606825 141607480 141607253 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 87428 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr8 141655804 141656158 141655981 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 136407 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 141800912 141801386 141801027 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA PTK2 208929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142099799 142100197 142100108 Y EIF2C2,SLC45A4,DENND3 DENND3 PTK2,DENND3 IMR90 Hi-C 24141950 DENND3 25180 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142163740 142163864 142163753 Y NA DENND3 NA NA NA NA DENND3 38363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142255319 142255549 142255470 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA SLC45A4 60855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142411426 142411896 142411690 Y DENND3,SLC45A4,PTP4A3 GPR20,PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 11333 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 142425618 142425919 142425790 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 25525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 143696778 143697162 143696893 Y NA ARC NA NA NA NA ARC 1945 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 143813380 143813410 143813405 Y GPIHBP1 NA NA NA NA NA JRK 51994 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 144032047 144032423 144032233 Y NA NA NA NA NA NA LY6E 64976 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 144611629 144611857 144611767 Y ZC3H3 ZC3H3,GSDMD RHPN1,C8orf51 IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H3 9766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 144684263 144684410 144684337 Y NA TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623 NA NA NA NA EEF1D 4552 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.14193942593541 chr8 145909879 145909957 145909931 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 685 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr8 146058579 146058595 146058588 Y ARHGAP39 ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5 NA NA NA NA ZNF7 7730 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 545729 545758 545741 Y NA NA NA NA NA NA KANK1 77438 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 616775 617021 616903 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 148484 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 677967 678108 678032 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 209676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 758228 758480 758338 Y KANK1 NA NA NA NA NA DMRT2 289874 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 1917403 1917482 1917443 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 95860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 2018040 2018611 2018274 Y SMARCA2 SMARCA2 NA NA NA NA SMARCA2 4698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 3470131 3470258 3470195 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 53746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 3848588 3848740 3848655 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 323865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 4042913 4043209 4043135 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 303183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 4086123 4086410 4086330 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 259982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 4210549 4210554 4210552 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 135838 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 4241498 4241696 4241599 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 104696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 4283058 4283285 4283172 Y GLIS3,GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 63107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 4296901 4297617 4297146 Y GLIS3 GLIS3 NA NA NA NA GLIS3 48775 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 4939146 4939407 4939322 Y JAK2 JAK2 RCL1,JAK2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JAK2 43626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 5490099 5490497 5490304 Y KIAA1432,CD274 CD274,PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 18048 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 5844710 5844756 5844733 Y RANBP6 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 13593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 5901129 5901190 5901160 Y NA NA NA NA NA NA ERMP1 70012 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 6788210 6788382 6788241 Y NA NA NA NA NA NA KDM4C 69347 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 8675420 8675557 8675548 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 35754 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 8771816 8771826 8771822 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 60505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 11065025 11065362 11065124 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3L8.3 1746982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr9 12784417 12784967 12784682 Y C9orf150 RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 27377 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 12818643 12818927 12818803 Y NA RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 6299 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 13082855 13083077 13082983 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 194512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 14096603 14096776 14096679 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 218308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 14147587 14147657 14147622 Y NFIB NA NA NA NA NA RP11-120J1.1 167427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 14316018 14316353 14316263 Y NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 934 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 14320331 14320603 14320385 Y NA RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 5247 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB RP11-120J1.1 NA NA NA NA RP11-120J1.1 7211 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 14992180 14992514 14992235 Y NA NA NA NA NA NA LDHAP4 71848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 616528 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 17580370 17580488 17580383 Y NA NA NA NA NA NA CNTLN 447390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 306073 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 19184256 19184894 19184463 Y PLIN2 PLIN2 HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 36968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 21016783 21016802 21016795 Y IFNA1,IFNA6,IFNA5,IFNW1 NA NA NA NA NA KLHL9 316577 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL9 236740 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313456 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 22084782 22085031 22084907 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 74628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 22103396 22103678 22103511 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2B NA NA NA NA NA UBA52P6 93242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr9 22117547 22117648 22117588 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 107393 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 22240757 22240884 22240825 Y NA NA MTAP,CDKN2B-AS1,CDKN2A,C9orf53,CDKN2B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DMRTA1 203956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 22408637 22408662 22408639 Y NA DMRTA1 NA NA NA NA DMRTA1 36178 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 22468825 22468905 22468865 Y NA DMRTA1 NA NA NA NA DMRTA1 23985 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 22815363 22815696 22815663 Y NA NA NA NA NA NA DMRTA1 370523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 26921358 26921728 26921543 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA IFT74 23309 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 27564116 27564302 27564198 Y C9orf72,C9orf72 MOB3B,C9orf72 NA NA NA NA C9orf72 7562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 31347195 31347362 31347281 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P2 516972 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 32524178 32524624 32524592 Y DDX58 TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 33033161 33033386 33033274 Y TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1 APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 9952 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33159013 33159478 33159222 Y DNAJA1,NFX1,CHMP5,B4GALT1,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 5876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33164497 33164994 33164772 Y APTX,APTX,APTX,SMU1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 360 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chr9 33233885 33234477 33234128 Y NA BAG1,CHMP5 NA NA NA NA BAG1 28284 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33446270 33446740 33446527 Y SMU1,BAG1,NFX1,AQP3 AQP3,NOL6 NA NA NA NA AQP3 661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33931170 33931493 33931332 Y UBAP1,UBE2R2 NA NA NA NA NA UBAP2 115454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1,AL353662.2 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 34233080 34233513 34233116 Y NA AL353662.2,RP11-571F15.3 NA NA NA NA RP11-571F15.3 10454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 34394792 34394981 34394887 Y NA KIAA1161,C9orf24 NA NA NA NA C9orf24 849 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 29917 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.75968694601057 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 35914292 35914707 35914657 Y NA NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 10103 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 35924004 35924206 35924105 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 19815 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 37036641 37037011 37036829 Y ZCCHC7,ZBTB5,PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 81525 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 37270797 37270994 37270913 Y PAX5 NA NA NA NA NA GRHPR 149669 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 37914600 37914735 37914730 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 115166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 37954084 37954355 37954258 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 112329 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 38008217 38008489 38008387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 58195 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 38144521 38144744 38144579 Y NA NA MCART1,SHB IMR90 Hi-C 24141950 SHB 77311 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 161.10862067572 chr9 38478725 38478769 38478747 Y ANKRD18A NA NA NA NA NA IGFBPL1 56281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 71336446 71336479 71336451 Y NA PIP5K1B NA NA NA NA PIP5K1B 17871 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 71734977 71735184 71735061 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 768 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 72344996 72345326 72345161 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 27549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 72360056 72360394 72360281 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 12481 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 2.85484856483852 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 73085472 73085592 73085532 Y NA NA TRPM3,SMC5,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 KLF9 57932 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 73184013 73184209 73184105 Y SMC5 NA NA NA NA NA KLF9 156473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 74292775 74292963 74292884 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90258 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 74318584 74318670 74318629 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 110936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 75155526 75155660 75155598 Y ZFAND5 NA NA NA NA NA ZFAND5 177363 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 75172533 75172850 75172692 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND5 194370 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 75511457 75511847 75511682 Y NA RP11-151D14.1 NA NA NA NA RP11-151D14.1 24432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr9 75518800 75519107 75519099 Y NA RP11-151D14.1 NA NA NA NA RP11-151D14.1 31775 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 75549526 75549619 75549601 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151D14.1 62501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 75562890 75563230 75563163 Y NA NA NA NA NA NA RP11-151D14.1 75865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 75612572 75612897 75612823 Y NA NA ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 80461 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 75791521 75791823 75791639 Y NA ANXA1 NA NA NA NA ANXA1 26848 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 77588894 77589149 77589022 Y NA RP11-197P3.1,C9orf40 NA NA NA NA C9orf40 23092 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 77927689 77927701 77927695 Y NA NA NA NA NA NA OSTF1 226230 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 80548294 80548580 80548559 Y NA NA NA NA NA NA GNAQ 95794 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 81131124 81131152 81131138 Y CEP78 NA NA NA NA NA PSAT1 221065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 81329740 81329936 81329769 Y NA NA NA NA NA NA PSAT1 419681 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 81977149 81977423 81977213 Y NA CHCHD2P9 NA NA NA NA CHCHD2P9 26796 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 84270722 84271111 84271084 Y NA TLE1,RP11-154D17.1 NA NA NA NA TLE1 31109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 88294983 88295025 88294997 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 59919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 88357534 88357780 88357692 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 2590 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 88474562 88474738 88474650 Y NA NA NA NA NA NA NAA35 79323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 89952631 89952908 89952845 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 157235 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 89990510 89990850 89990781 Y NA NA DAPK1 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 119293 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 90115567 90115708 90115625 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 5424 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 90166692 90166955 90166778 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 28475 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 90326659 90327327 90326985 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 188442 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.99839399538696 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 92218967 92219282 92219262 Y NA GADD45G NA NA NA NA GADD45G 1039 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 92276961 92277319 92277054 Y NA NA NA NA NA NA GADD45G 59033 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 92762010 92762340 92762146 Y NA NA NA NA NA NA RP11-389K14.3 431447 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 92762358 92762553 92762476 Y NA NA NA NA NA NA RP11-389K14.3 431234 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 93029524 93029856 93029690 Y NA NA NA NA NA NA RP11-389K14.3 163931 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 93168912 93169286 93169099 Y NA RP11-389K14.3 NA NA NA NA RP11-389K14.3 24501 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 93823339 93823577 93823437 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 298618 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 93833669 93833838 93833696 Y NA NA NA NA NA NA AUH 288357 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 93862627 93863018 93862659 Y SYK,SYK,NFIL3 NA AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2 IMR90 Hi-C 24141950 AUH 259177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 93959484 93959867 93959681 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 162328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 94068286 94068635 94068479 Y NA NA NA NA NA NA AUH 53560 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 94671066 94671340 94671201 Y NA ROR2 NA NA NA NA ROR2 39104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 94866274 94866418 94866346 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 9248 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 94968812 94969005 94968908 Y NA BEND3P2 NA NA NA NA BEND3P2 37289 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 95029374 95029660 95029516 Y NA IARS NA NA NA NA IARS 24378 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 95383874 95384172 95384023 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 46375 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 95882095 95882646 95882428 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 11924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 95980208 95980347 95980278 Y ZNF484,ZNF484 NA NA NA NA NA NINJ1 85638 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 96335202 96335517 96335360 Y NA PHF2 NA NA NA NA PHF2 1172 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr9 97505796 97506082 97505939 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 105265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 97590305 97590486 97590422 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 189774 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 97624826 97625112 97624969 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 224295 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 229046 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 229543 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 97631649 97631973 97631839 Y NA NA NA NA NA NA FBP1 231118 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 97881296 97881429 97881363 Y FBP1 NA NA NA NA NA FANCC 196562 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 97895370 97895760 97895554 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 182231 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 97950881 97951234 97951005 Y NA NA NA NA NA NA FANCC 126757 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98075518 98075673 98075591 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 2318 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98237628 98237804 98237716 Y NA PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 39535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98912982 98913200 98913110 Y NA EIF4BP3 FBP1,FANCC,PTCH1,LOC158435,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 6693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 98979716 98980057 98980045 Y NA NA NA NA NA NA EIF4BP3 73427 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 99051538 99051687 99051623 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D2 92305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 100454693 100454853 100454773 Y TSTD2,XPA XPA NA NA NA NA XPA 2786 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 100667728 100667773 100667740 Y NA C9orf156 NA NA NA NA C9orf156 15079 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 101015938 101016120 101016078 Y C9orf156,NANS,TBC1D2 TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 23 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 101630117 101630425 101630271 Y NA NA NA NA NA NA GALNT12 62136 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 101973951 101974336 101974174 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA ALG2 7902 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 102391563 102391903 102391698 Y ERP44,NR4A3 NA SEC61B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-554F20.1 188268 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 102580616 102580992 102580865 Y NA RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA RP11-554F20.1 445 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 102767343 102767551 102767505 Y NA NA NA NA NA NA ERP44 91771 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 103641019 103641318 103641311 Y TMEFF1 NA NA NA NA NA RP11-394D2.1 149497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 103929326 103929494 103929410 Y LPPR1 NA NA NA NA NA MRPL50 229402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 104185147 104185490 104185310 Y NA MRPL50,ZNF189,ALDOB NA NA NA NA ALDOB 10615 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 105957487 105957816 105957647 Y NA NA NA NA NA NA SMC2 896725 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 107597613 107597745 107597668 Y NA NA NA NA NA NA NIPSNAP3B 73175 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 107628415 107628839 107628708 Y ABCA1 NA NA NA NA NA RP11-217B7.2 58995 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 107668768 107669725 107669153 Y SLC44A1,OR13C3 RP11-217B7.2,ABCA1 NA NA NA NA RP11-217B7.2 18109 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 RP11-217B7.2,ABCA1 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 41992 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 107816840 107817157 107817097 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 128322 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 107954000 107954398 107954183 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC44A1 50505 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 108675156 108675451 108675279 Y NA NA NA NA NA NA TMEM38B 220331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 110109718 110109795 110109757 Y NA NA NA NA NA NA RAD23B 66300 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 110266981 110267369 110267173 Y NA KLF4,RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLF4 16218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 15956 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.52258590124721 chr9 110514044 110514454 110514287 Y KLF4 NA KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 219373 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 111034300 111034792 111034481 Y NA NA KLF4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-220D10.1 352321 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 111759404 111759745 111759575 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 14064 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 112091755 112092133 112091802 Y PTPN3 EPB41L4B EPB41L4B MCF7 ChIA-PET 22265404 EPB41L4B 10511 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 112262069 112262452 112262225 Y PTPN3 PTPN3 NA NA NA NA PTPN3 3479 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112543534 112543655 112543595 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 2765 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112547899 112548110 112547990 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 7130 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112578765 112579213 112578950 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37996 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr9 112580267 112580505 112580395 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 39498 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 112789976 112790235 112790005 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 4338 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112809593 112809859 112809726 Y NA RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 23955 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112827300 112827392 112827326 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 41662 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 112885616 112885820 112885688 Y AKAP2 NA NA NA NA NA C9orf152 82649 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112905689 112906067 112905829 Y NA NA NA NA NA NA C9orf152 62402 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 112937115 112937268 112937191 Y NA C9orf152 NA NA NA NA C9orf152 31201 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN C9orf152,TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 114111620 114111657 114111640 Y OR2K2 NA NA NA NA NA KIAA0368 133368 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 114364049 114364191 114364143 Y KIAA0368,GNG10 PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10 NA NA NA NA PTGR1 3914 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 114784464 114784581 114784539 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 127418 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 114792518 114792641 114792625 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 135472 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 114821548 114821936 114821739 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 113752 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 114831912 114832228 114831995 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 103460 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 115470219 115470249 115470232 Y ROD1,HSDL2,C9orf80 RP11-276E15.4,SNX30 NA NA NA NA RP11-276E15.4 40487 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 115757286 115757809 115757590 Y NA ZNF883 NA NA NA NA ZNF883 14698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 116281787 116282895 116282664 Y NA NA NA NA NA NA RGS3 76776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 180266 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 116728685 116728905 116728795 Y AMBP NA NA NA NA NA ZNF618 92123 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117080236 117080340 117080297 Y TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1 NA NA NA NA NA COL27A1 164396 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 117125723 117126093 117125808 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 139637 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117131457 117132230 117131898 Y DFNB31,DFNB31,AKNA NA NA NA NA NA DFNB31 133500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117134599 117134885 117134873 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 130845 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 117152820 117152929 117152875 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 112801 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117159955 117160026 117159991 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 105704 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117247262 117247587 117247370 Y TNFSF8,TNFSF15,ATP6V1G1,DFNB31 DFNB31 NA NA NA NA DFNB31 18143 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117566825 117567042 117566994 Y TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 419 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117569170 117569337 117569236 Y DFNB31,DEC1,TNFSF15 TNFSF15 NA NA NA NA TNFSF15 2764 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117647197 117647589 117647272 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 80791 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 117657108 117657611 117657338 Y DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNFSF15 90702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117845711 117845781 117845750 Y TNFSF15 TNC NA NA NA NA TNC 32755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 117878279 117878434 117878355 Y NA TNC NA NA NA NA TNC 102 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 117883580 117883602 117883591 Y TNFSF15,TNC,DEC1 TNC TNC,DEC1 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 5044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 118024698 118025071 118024956 Y NA NA NA NA NA NA TNC 146162 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556397 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 556735 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 745887 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 TRIM32 740556 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 119311432 119311888 119311785 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 135693 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 119329308 119329509 119329406 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 118072 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 58746 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 120613271 120613631 120613451 Y NA NA NA NA NA NA TLR4 148661 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 123237192 123237494 123237347 Y MEGF9,FBXW2 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 102954 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 123283577 123283819 123283724 Y NA NA NA NA NA NA CDK5RAP2 56629 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 123346430 123346633 123346540 Y TRAF1 CDK5RAP2 CDK5RAP2 K562 ChIA-PET 22265404 CDK5RAP2 5982 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 123446824 123446976 123446902 Y TRAF1,TRAF1 MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 27772 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 123455501 123455738 123455670 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 19010 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 123477335 123478104 123478033 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 2587 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 123478444 123478636 123478538 Y NA MEGF9 NA NA NA NA MEGF9 3696 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 123658471 123658684 123658522 Y TRAF1,TRAF1 PHF19,TRAF1 NA NA NA NA PHF19 20865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.80807075773106 chr9 124383753 124383935 124383823 Y DAB2IP NA NA NA NA NA DAB2IP 56417 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 125811144 125811514 125811213 Y NA NA MIR600HG IMR90 Hi-C 24141950 RABGAP1 110032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 126154038 126154354 126154284 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 37589 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 126291594 126291648 126291621 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 175145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 126297071 126297260 126297221 Y NA NA NA NA NA NA CRB2 180622 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 126683805 126684169 126683927 Y NA DENND1A NA NA NA NA DENND1A 6262 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127156535 127156658 127156597 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 19065 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127457265 127457441 127457351 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 38519 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127466904 127467345 127467172 Y NA MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 48158 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127509473 127509808 127509481 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 21781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1 NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127976903 127977044 127976974 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 16082 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 128276459 128276912 128276764 Y NA NA NA NA NA NA MAPKAP1 190601 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 128433867 128434078 128433973 Y NA MAPKAP1 NA NA NA NA MAPKAP1 33435 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 129380057 129380208 129380164 Y NA LMX1B NA NA NA NA LMX1B 5335 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130335827 130336224 130335842 Y TOR2A,CDK9,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 3044 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130461605 130461892 130461787 Y GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16 MIR3911,PTRH1,TOR2A NA NA NA NA MIR3911 10531 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130590782 130591142 130590862 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS CDK9,FPGS,AK1 NA NA NA NA FPGS 35906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130681632 130682091 130681875 Y FAM129B,TOR2A,CDK9 AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,DPM2 NA NA NA NA ST6GALNAC4 4315 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 130817970 130818290 130818247 Y C9orf117,TTC16,SH2D3C,SH2D3C,DPM2,FAM102A SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA SLC25A25 10190 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130834459 130834744 130834726 Y NA SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 5974 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130834970 130835273 130835056 Y FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25 SLC25A25,NAIF1 NA NA NA NA NAIF1 6485 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 131316865 131317367 131316977 Y NA RP11-216B9.6,SPTAN1 NA NA NA NA SPTAN1 3999 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chr9 132171147 132171349 132171255 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 72381 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.666131331795655 chr9 132176730 132177172 132176936 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 66558 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 132321078 132321454 132321255 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 77348 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 132705367 132705623 132705495 Y C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA FNBP1 97850 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132772679 132773108 132773032 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 30365 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132800329 132800698 132800514 Y NA FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 2775 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 132807262 132807460 132807345 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA FNBP1 3789 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 1.33226266359131 chr9 133565926 133566149 133566038 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 959 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 133711348 133711666 133711497 Y NA NA NA NA NA NA FIBCD1 101007 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A NA NA NA NA NA NUP214 132654 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chr9 134608249 134608835 134608704 Y FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 4626 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 134609553 134609906 134609765 Y FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 3555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 134610888 134611363 134611119 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 2098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 136753303 136753756 136753577 Y C9orf7,VAV2 NA SARDH IMR90 Hi-C 24141950 VAV2 101970 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 137040428 137040559 137040494 Y SARDH,SARDH,RXRA WDR5 NA NA NA NA WDR5 41941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 137221069 137221192 137221119 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 14125 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 137267558 137268069 137267755 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 60614 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 138808024 138808108 138808066 Y GLT6D1 CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1 NA NA NA NA RP11-432J22.2 10366 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 138915703 138915918 138915811 Y NA NA NA NA NA NA UBAC1 64477 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 139420614 139420765 139420738 Y PTGDS,LCNL1,C9orf172 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 17549 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 139590539 139590822 139590769 Y FUT7,C9orf142,ABCA2 MIR126,AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA AGPAT2 10664 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,C8G,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 139860664 139860836 139860756 Y NA FBXW5,C8G,PTGDS,C9orf142 NA NA NA NA PTGDS 9120 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 5.13872741670934 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA RNF208 3555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chr9 140143070 140143291 140143174 Y LCNL1,ABCA2,SLC34A3 TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 9405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA RNF208,TUBB4B,NRARP NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 140190695 140190800 140190760 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 3903 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chr9 140200054 140200221 140200146 Y EXD3,NRARP NRARP NA NA NA NA NRARP 5351 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chr9 140412995 140413413 140413155 Y CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7 PNPLA7,MRPL41 NA NA NA NA PNPLA7 29573 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 2816950 2817136 2817043 Y ARSH,ARSE ARSD NA NA NA NA ARSD 28256 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 9700566 9700851 9700709 Y LOC100288814 NA NA NA NA NA SHROOM2 51645 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 9701264 9701389 9701313 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM2 51107 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 9979967 9980360 9980271 Y NA WWC3 NA NA NA NA WWC3 1242 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 10587173 10587276 10587225 Y MID1 NA NA NA NA NA MID1 262497 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 10712546 10712862 10712704 Y NA NA NA NA NA NA MID1 136911 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 10851081 10851118 10851099 Y NA MID1 NA NA NA NA MID1 1308 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 11722971 11723163 11723070 Y NA NA ARHGAP6 IMR90 Hi-C 24141950 MSL3 51115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 73997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 12974854 12975280 12975169 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 15947 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 12989837 12990050 12989934 Y TLR7,TLR8,TMSB4X TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 1177 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 13097151 13097463 13097240 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA NA NA NA NA TMSB4X 105924 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 13119924 13120175 13120039 Y NA NA TMSB4X MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB4X 128697 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 13138325 13138351 13138340 Y NA NA FAM9C,LOC100133123,TMSB4X IMR90 Hi-C 24141950 TMSB4X 147098 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 13275429 13275630 13275533 Y TLR7 GS1-600G8.5 NA NA NA NA GS1-600G8.5 43941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 13318186 13318365 13318276 Y NA GS1-600G8.5 NA NA NA NA GS1-600G8.5 1206 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 13665848 13666134 13665956 Y TCEANC,RAB9A TCEANC,RAB9A NA NA NA NA TCEANC 3091 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 13709946 13709989 13709968 Y RAB9A TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 4702 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 15383040 15383106 15383043 Y NA PIGA NA NA NA NA PIGA 31364 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 16680488 16680840 16680664 Y NA CTPS2 NA NA NA NA CTPS2 48219 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 17415371 17415448 17415410 Y NA NHS NA NA NA NA NHS 23828 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 112388 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA MAP7D2,EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 22708356 22708573 22708502 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD1 641560 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 23817688 23817829 23817775 Y NA ACOT9,SAT1,RPL9P7 NA NA NA NA SAT1 18398 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 24027801 24028121 24027962 Y NA EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 42712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 25664451 25664736 25664645 Y MAGEB18 NA NA NA NA NA ARX 632386 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 647376 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN7 79634 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 39018443 39018533 39018484 Y NA NA NA NA NA NA MID1IP1 359758 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 39619041 39619197 39619186 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 26193 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 39871700 39871985 39871950 Y BCOR,BCOR NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 162597 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 39872499 39873023 39872596 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 161559 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 39963931 39964200 39963990 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 70382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 40012729 40012965 40012840 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 21617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 40017598 40017727 40017669 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 16855 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 40031344 40032243 40032130 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 2339 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 41242516 41242827 41242698 Y DDX3X NA DDX3X,USP9X MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDX3X 51865 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 41413588 41413590 41413589 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 222937 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 41538171 41538545 41538500 Y CASK NA NA NA NA NA CASK 242171 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 41594711 41594837 41594774 Y NA NA NA NA NA NA CASK 185879 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 42574181 42574201 42574191 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P4 617755 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 43562549 43562948 43562749 Y MAOA MAOA NA NA NA NA MAOA 49082 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 43871885 43872371 43872246 Y NA NA NA NA NA NA MAOB 132192 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chrX 44877456 44877597 44877527 Y NA NA NA NA NA NA KDM6A 146699 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 45241202 45241396 45241250 Y NA NA NA NA NA NA MIR221 362298 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 45374628 45375077 45374937 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 228617 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46338861 46339028 46338937 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 40712 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46487332 46487848 46487692 Y RP2,ZNF674,CHST7 NA NA NA NA NA CHST7 56113 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46524990 46525241 46525097 Y NA NA NA NA NA NA SLC9A7 91249 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46773328 46773680 46773526 Y NA NA NA NA NA NA RP2 78953 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 47221089 47221361 47221213 Y NA NA USP11,ZNF157,UBA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF41 118984 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 47492098 47492440 47492261 Y ARAF,CFP,CFP SYN1,ELK1,UXT NA NA NA NA SYN1 14846 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 48390158 48390246 48390210 Y NA PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3 NA NA NA NA TBC1D25 5599 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 48571549 48571765 48571661 Y NA SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19604 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 48571837 48572283 48571996 Y TBC1D25,PQBP1,PIM2,OTUD5,GRIPAP1 SUV39H1 NA NA NA NA SUV39H1 19892 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 48794892 48795256 48795094 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,WDR45,TFE3,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1 NA NA NA NA OTUD5 18392 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 51633926 51634124 51634025 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 89823 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 53172968 53173150 53172985 Y NA NA NA NA NA NA LINC01155 51641 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 53468564 53468782 53468716 Y IQSEC2 RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA HSD17B10 9244 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 54207583 54207867 54207725 Y NA NA NA NA NA NA FAM120C 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA NA NA NA NA NA UBQLN2 318037 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 56791132 56791384 56791234 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA UQCRBP1 29122 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 282939 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 64821176 64821755 64821551 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 14919 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 64898955 64899156 64899089 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 92698 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO GJB1 NA NA NA NA GJB1 30910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 71635914 71636037 71635976 Y HDAC8 NA NA NA NA NA CITED1 110877 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73272054 73272428 73272273 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 109895 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73338544 73338621 73338582 Y NA NA NA NA NA NA USMG5P1 53104 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73340869 73341139 73340910 Y RLIM NA NA NA NA NA USMG5P1 50586 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73756739 73756964 73756863 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75488 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 74259170 74259182 74259176 Y NA NA NA NA NA NA ABCB7 115385 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA TTC3P1 NA NA NA NA TTC3P1 3710 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 515628 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.856454569451556 chrX 95228939 95229189 95229110 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 708473 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 NA NA NA NA NA GPRASP2 50168 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 106448636 106449011 106448824 Y NA NUP62CL NA NA NA NA NUP62CL 966 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.475808094139753 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 106928255 106928525 106928381 Y NA NA NA NA NA NA PRPS1 58518 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 107070299 107070693 107070500 Y MID2 MID2 NA NA NA NA MID2 3314 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 107552407 107552661 107552546 Y COL4A6,COL4A6,COL4A5 NA NA NA NA NA COL4A6 128066 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 109016670 109016888 109016809 Y ACSL4 ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 42038 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 109073937 109074572 109074260 Y NXT2,NXT2 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 99305 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 109083708 109084134 109083977 Y NXT2,NXT2,ACSL4 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 109076 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 118149361 118149839 118149621 Y LONRF3 LONRF3 NA NA NA NA LONRF3 42780 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 119619980 119620335 119620161 Y NA LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.380646475311803 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 123735078 123735231 123735154 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 643016 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901 chrX 129065451 129065820 129065554 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 27354 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 130706744 130706880 130706830 Y NA NA NA NA NA NA RP1-305B16.3 556500 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 130880517 130880959 130880705 Y NA NA NA NA NA NA RP1-305B16.3 382421 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 130952432 130952771 130952603 Y NA NA NA NA NA NA RP1-305B16.3 310609 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA GPC3 187840 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 135927542 135927922 135927796 Y NA RBMX ARHGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RBMX 33001 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 410547 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 149863588 149863865 149863755 Y MTM1,MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 4153 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 149865562 149865927 149865671 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 6127 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.570969712967704 chrX 151149745 151149882 151149808 Y NA GABRE NA NA NA NA GABRE 8593 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA NSDHL 129860 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 152812807 152812922 152812865 Y SLC6A8 NA NA NA NA NA FAM58A 50578 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 152951257 152951653 152951455 Y NA DUSP9,RPL18AP16,BCAP31,ABCD1 NA NA NA NA SLC6A8 0 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 153093734 153093743 153093739 Y NA SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45 NA NA NA NA PDZD4 277 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 153265554 153265740 153265647 Y NA HCFC1,TMEM187,IRAK1 NA NA NA NA IRAK1 17691 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.761292950623605 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrX 153771070 153771275 153771201 Y IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG FAM3A,IKBKG,G6PD NA NA NA NA G6PD 2512 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.951616188279507 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,F8,BRCC3 NA NA NA NA F8 2910 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.285484856483852 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.0951616188279507 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 11806207 CAGE Li-7 hg19 FANTOM5 0.190323237655901