chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	855764	856157	855856	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	2103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	868565	868684	868625	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	10305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	936652	937138	936860	Y	NA	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN	C1orf170	K562	ChIA-PET	22265404	HES4	3100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	994198	994452	994303	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	1084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.20946914215275
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159,TNFRSF18	NA	NA	NA	NA	TNFRSF18	41170	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	2190530	2190674	2190620	Y	TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	48371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	21376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.2804122852138
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,FAM213B	NA	NA	NA	NA	PANK4	22237	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	3582035	3582407	3582251	Y	WRAP73,TP73	TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	14710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	6760819	6760983	6760901	Y	NA	DNAJC11	NA	NA	NA	NA	DNAJC11	835	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	7137904	7138115	7138010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	294520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	8070132	8070398	8070299	Y	PER3,SLC45A1,ERRFI1	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	13970	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8121436	8121582	8121497	Y	ERRFI1	ERRFI1	RERE,ERRFI1,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	37068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8257762	8258040	8257906	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-7P	6617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8488165	8488317	8488222	Y	TNFRSF9,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	112279	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	195750	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	8762126	8762475	8762428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	113227	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	9222919	9223181	9223073	Y	SPSB1	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A,GPR157	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	17082	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr1	9223692	9223875	9223840	Y	NA	GPR157,RP3-510D11.2	SLC2A7,SLC25A33,MIR34A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.2	16388	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	9856786	9856983	9856885	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	25601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	10695291	10695734	10695495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	158973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	10726049	10726261	10726116	Y	CASZ1	NA	NA	NA	NA	NA	CASZ1	128446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	10926873	10927035	10926954	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72166	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	12485613	12485784	12485698	Y	PRAMEF1,AADACL4	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	189953	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	12518050	12518251	12518128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	157486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	14467397	14467540	14467499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	442704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	15041115	15041310	15041140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	117915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAZN	188072	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	15539906	15540096	15539975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	62878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM2	78362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	16292565	16293101	16292653	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17,C1orf64	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	7526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	16339360	16339596	16339414	Y	NA	ZBTB17,C1orf64	NA	NA	NA	NA	C1orf64	10629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFAP2	73626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	MFAP2	64547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr1	17746173	17746585	17746297	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	17635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	19614370	19614635	19614441	Y	ALDH4A1,AKR7A3	MRTO4,AKR7A2,PQLC2	NA	NA	NA	NA	AKR7A2	22005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	20091332	20091506	20091448	Y	PLA2G2A,TMCO4	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	32932	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	20358851	20359226	20358857	Y	PLA2G2A	NA	VWA5B1,PLA2G2C,UBXN10	IMR90	Hi-C	24141950	OTUD3	151845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	20693127	20693202	20693146	Y	KIF17,PINK1	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	117511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21406931	21406946	21406939	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	8685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	21475659	21476054	21476002	Y	EIF4G3,EIF4G3	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	25323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21510856	21510968	21510912	Y	ECE1,ECE1	EIF4G3	EIF4G3,DDOST,KIF17,HP1BP3,SH2D5	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF4G3	9479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21664947	21665143	21665070	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	4854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	21931612	21931850	21931825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF3	166991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	22002610	22002786	22002701	Y	NA	NA	RAP1GAP	K562	ChIA-PET	22265404	USP48	105313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	23748973	23749126	23749052	Y	NA	TCEA3	NA	NA	NA	NA	TCEA3	107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	24229023	24229388	24229190	Y	NA	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	FUCA1	36239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	24235925	24236209	24236107	Y	RPL11,PNRC2,CNR2	FUCA1,RP11-4M23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-4M23.4	37664	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	24519628	24519970	24519647	Y	GRHL3	NA	MYOM3,IL22RA1,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS,C1orf130	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL3	123842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	25361269	25361784	25361393	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	195209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr1	27337570	27337809	27337727	Y	NA	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	NA	NA	NA	NA	FAM46B	243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	27353661	27353962	27353706	Y	TMEM222,MAP3K6,TRNP1	RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B	FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46B	16334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	FAM46B	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM46B	46630	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	27468191	27468425	27468281	Y	NA	SLC9A1	NA	NA	NA	NA	SLC9A1	23047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	27922522	27922947	27922946	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	5995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	28152962	28153213	28153036	Y	NA	PPP1R8	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	2076	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	28216942	28217199	28217071	Y	NA	RPA2,SMPDL3B	NA	NA	NA	NA	RPA2	22058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr1	28576012	28576248	28576109	Y	STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	7790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	29565515	29565732	29565598	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	31251697	31252042	31251870	Y	NA	RP1-65J11.1	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-65J11.1	43033	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.95608999935122
chr1	32001284	32001534	32001384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	106963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	32166698	32166999	32166824	Y	COL16A1	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	58201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	33220297	33220575	33220521	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	14811	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	33220963	33221073	33221021	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	15477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	33446816	33447482	33446950	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	18530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	33447667	33447707	33447675	Y	RNF19B	RNF19B	RNF19B,AK2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19B	19381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	33463131	33463490	33463269	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	34845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	33622437	33622835	33622675	Y	PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	22825	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	35891843	35891965	35891904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	129109	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	36397577	36397741	36397665	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	154735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	36489072	36489418	36489191	Y	NA	NA	COL8A2,TEKT2,ADPRHL2	IMR90	Hi-C	24141950	ADPRHL2	63058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	36715455	36715834	36715645	Y	EIF2C1,EIF2C3	THRAP3	NA	NA	NA	NA	THRAP3	27438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	37169397	37169618	37169483	Y	OSCP1,GRIK3	NA	NA	NA	NA	NA	CSF3R	222518	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	38391752	38391859	38391812	Y	NA	INPP5B	NA	NA	NA	NA	INPP5B	18870	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	38922036	38922121	38922079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-334L9.1	250482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	39598673	39599090	39598722	Y	MACF1	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	53685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	34503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	NA	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIT1	82063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	NA	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	TRIT1	63977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr1	40504860	40505165	40505013	Y	ZNF684,ZNF642,DEM1,BMP8B,PPT1,CAP1	CAP1	NA	NA	NA	NA	CAP1	955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	40606256	40606595	40606426	Y	NA	PPT1,RP11-115D7.3,RLF	RLF,PPT1,SMAP2,COL9A2,ZMPSTE24,CAP1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115D7.3	9820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	40841336	40841595	40841379	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	32814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	210006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	41915297	41915638	41915514	Y	HIVEP3	EDN2	EDN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN2	32706	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.44933171374815
chr1	41961925	41962146	41962029	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	13581	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	41962532	41962651	41962593	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	14188	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	41966127	41966464	41966357	Y	NA	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	17783	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	42071739	42071927	42071841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	123395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	42230379	42230587	42230470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	269009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	42372562	42373017	42372843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	126579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	43997843	43998152	43997977	Y	PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	8985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	44299891	44300630	44300422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	96362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	44430681	44431060	44430788	Y	NA	ARTN,RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24	NA	NA	NA	NA	DPH2	2612	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	44689979	44690114	44690071	Y	NA	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	12852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	44764661	44765046	44764854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERI3	53886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,RNU5E-6P	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	46555686	46555960	46555823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	82785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	46637172	46637331	46637258	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	1414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	46637652	46637852	46637691	Y	NA	TSPAN1,PIK3R3,POMGNT1	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	50902653	50903020	50902837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL4	415068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	51034551	51034734	51034643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	389201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	51757763	51757925	51757844	Y	TTC39A,OSBPL9	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	50863	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	51823993	51824400	51824363	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	15205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	52035422	52035744	52035601	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	5107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	52088228	52088763	52088412	Y	NA	OSBPL9	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	47377	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	53559901	53560045	53560040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPT2	100056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.74326057016808
chr1	53566298	53566719	53566319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPT2	93382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	53576083	53576397	53576240	Y	NA	NA	PODN,SCP2	IMR90	Hi-C	24141950	CPT2	83704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	54808081	54808294	54808188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	68858	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	RP11-67L3.5,DHCR24	NA	NA	NA	NA	RP11-67L3.5	23062	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	59039624	59039692	59039640	Y	NA	DAB1,OMA1,TACSTD2	NA	NA	NA	NA	TACSTD2	1474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	59280364	59280505	59280397	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	59479443	59479773	59479608	Y	NA	NA	FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01135	230620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	59509588	59509786	59509693	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	250524	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	61039424	61039611	61039555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	289320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	61333622	61333797	61333765	Y	NA	NFIA	INADL	IMR90	Hi-C	24141950	NFIA	4691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	61549054	61549253	61549232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	220123	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	61649786	61650305	61649984	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	320855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	61768031	61768305	61768169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	420790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	62307827	62308113	62307970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INADL	101678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	62605206	62605403	62605332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP1	294565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	62928310	62928608	62928459	Y	KANK4,USP1,USP1,ATG4C	USP1	NA	NA	NA	NA	USP1	28342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	66782459	66782839	66782588	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	526262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	66800202	66800555	66800228	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4B	544005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	67867795	67868154	67868057	Y	NA	SERBP1	NA	NA	NA	NA	SERBP1	25944	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	68215256	68215932	68215330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45A	66512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	68257818	68258216	68258148	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	38934	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	24311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	70807938	70808237	70808103	Y	NA	ANKRD13C,HHLA3	NA	NA	NA	NA	ANKRD13C	10180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	76231463	76231678	76231570	Y	NA	ACADM,RABGGTB	NA	NA	NA	NA	RABGGTB	18201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	78298815	78299027	78298921	Y	NA	NA	NEXN	IMR90	Hi-C	24141950	FAM73A	55506	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	78350506	78350835	78350671	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	91959	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	84127102	84127325	84127214	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	197381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	85248638	85248992	85248815	Y	NA	NA	GNG5,MCOLN2,TTLL7,LPAR3,PRKACB	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	94152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	NA	NA	NA	NA	NA	MCOLN2	111376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	85744584	85744829	85744751	Y	BCL10	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	3811	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	85763626	85763846	85763779	Y	NA	C1orf52,BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	22853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	86989178	86989418	86989299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLCA2	101409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	89303069	89303193	89303134	Y	GBP4,GBP2,GTF2B	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2B	52434	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	89581205	89581610	89581506	Y	NA	GBP2	NA	NA	NA	NA	GBP2	32529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	89887466	89887838	89887537	Y	GBP3,GBP1,GBP2,GBP4,GBP5,LRRC8C,LRRC8B	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	100557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	89942348	89942369	89942360	Y	NA	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	46026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	91478571	91478975	91478771	Y	ZNF644,ZNF644	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	6854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	92255921	92256250	92256086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	113642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLMN	144948	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	94021310	94021626	94021469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	109622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	94371317	94371601	94371445	Y	NA	DNTTIP2,GCLM	NA	NA	NA	NA	GCLM	1365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	94450262	94450661	94450462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	77296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	94621912	94621923	94621919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	116701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	36759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	372241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	100555117	100555459	100555393	Y	NA	SASS6	NA	NA	NA	NA	SASS6	41052	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL2	156983	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	104105795	104105973	104105867	Y	NA	RNPC3	NA	NA	NA	NA	RNPC3	39482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	382010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	108231996	108232161	108232053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	272904	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	108478963	108479298	108479233	Y	VAV3	VAV3-AS1,VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	25767	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	108479405	108480123	108479634	Y	VAV3	VAV3-AS1,VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	24942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	108584121	108584359	108584206	Y	VAV3	NA	VAV3	IMR90	Hi-C	24141950	VAV3	78355	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	108606399	108606634	108606531	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	100633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	109691933	109691941	109691937	Y	NA	KIAA1324	NA	NA	NA	NA	KIAA1324	37632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109754796	109754995	109754880	Y	NA	SARS,CELSR2	NA	NA	NA	NA	SARS	256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	109800134	109800539	109800492	Y	AKNAD1,C1orf194	SARS,CELSR2,PSRC1	NA	NA	NA	NA	CELSR2	9493	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109841804	109842152	109841978	Y	SORT1	PSRC1	NA	NA	NA	NA	PSRC1	17996	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	110537379	110537528	110537454	Y	GSTM5,AHCYL1	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	12071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	110927812	110928210	110927883	Y	CD53,FAM40A,RBM15	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	LAMTOR5-AS1	4371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	114245723	114246101	114246018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	116923407	116923493	116923480	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	10117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	117080047	117080432	117080232	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	31229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	117100772	117101124	117100940	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	10537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	117422443	117422644	117422485	Y	NA	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.54730799922146
chr1	118197868	118198044	118197956	Y	NA	NA	FAM46C	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM46C	51312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	279620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	120607153	120607333	120607254	Y	ZNF697,NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	2907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BA	581054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	145058996	145059322	145059204	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDE4DIP	14864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	145519496	145519624	145519499	Y	NBPF10,TXNIP	LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B	NA	NA	NA	NA	PEX11B	5244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.54730799922146
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	149222771	149223127	149223106	Y	NA	NA	NBPF10,SEC22B,NBPF15	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNVU1-19	289129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	149853331	149853687	149853509	Y	PLEKHO1	HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB,SF3B4	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BE	2545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	149910900	149911536	149911461	Y	NA	SF3B4	NA	NA	NA	NA	SF3B4	12664	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	151168297	151168505	151168391	Y	BNIPL,TUFT1,SCNM1	SCNM1,LYSMD1,VPS72	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151344220	151344519	151344431	Y	NA	PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4	NA	NA	NA	NA	SELENBP1	1011	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	151418157	151418544	151418397	Y	NA	PSMB4,POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	11397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151422102	151422465	151422287	Y	NA	POGZ	NA	NA	NA	NA	POGZ	7476	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151485676	151485841	151485746	Y	C2CD4D,CGN,TUFT1	CGN,TUFT1	NA	NA	NA	NA	CGN	4690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151696469	151696693	151696535	Y	NA	MRPL9	NA	NA	NA	NA	MRPL9	37347	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.61825114228251
chr1	151809390	151809745	151809546	Y	RORC,C2CD4D	RP11-98D18.9,TDRKH,RORC,AL450992.2	NA	NA	NA	NA	AL450992.2	2608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151892722	151892912	151892811	Y	NA	THEM4	THEM4,S100A10	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	THEM4	12438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	151945068	151945221	151945146	Y	TUFT1,S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	19645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	10326	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	152116191	152116374	152116281	Y	LCE3A	NA	NA	NA	NA	NA	S100A11	97808	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	153337774	153338142	153337963	Y	S100A8,S100A9,S100A12	S100A9,S100A8	NA	NA	NA	NA	S100A9	9444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	153583449	153583810	153583692	Y	PGLYRP3,PGLYRP4,S100A7A,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13	S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	153715466	153715694	153715559	Y	PGLYRP3,INTS3	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	16923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.89866342749631
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	154978035	154978657	154978307	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B,DCST1	PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	4908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	155064132	155064186	155064153	Y	NA	ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3	NA	NA	NA	NA	EFNA3	29908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	155098409	155098801	155098460	Y	PKLR,PKLR,EFNA4,EFNA1	EFNA1,SLC50A1,DPM3,KRTCAP2	NA	NA	NA	NA	EFNA1	473	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	155620238	155620623	155620432	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	DAP3	35128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	155703696	155704096	155703788	Y	NA	DAP3,YY1AP1	NA	NA	NA	NA	YY1AP1	46905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	156462474	156462813	156462575	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	5807	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	156468556	156468776	156468632	Y	MEF2D	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2D	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	156662788	156663099	156662881	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	BCAN,NES	IMR90	Hi-C	24141950	CRABP2	10509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	156663993	156664153	156664073	Y	TMEM79,CRABP2,CRABP2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24	NA	NA	NA	NA	CRABP2	9455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI16	820689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	159852272	159852569	159852526	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	159914077	159914586	159914278	Y	NHLH1,VANGL2,IGSF9	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	160182240	160182579	160182410	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2	NA	NA	NA	NA	PEA15	9113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161002043	161002401	161002222	Y	NA	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	TSTD1	4379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161324130	161324422	161324290	Y	NA	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	42083	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161329163	161329482	161329254	Y	FCRLB,ATF6,CD244,FCER1G	SDHC	NA	NA	NA	NA	SDHC	47116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	66720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	161360317	161360802	161360606	Y	NA	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,NDUFS2,ADAMTS4,SDHC,UFC1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	78270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr1	161500608	161500899	161500816	Y	USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A	HSPA6	NA	NA	NA	NA	HSPA6	8572	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	161706477	161706712	161706625	Y	HSPA6,FCRLB,ATF6	DUSP12,ATF6	DUSP12	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP12	10836	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	161973588	161973892	161973770	Y	FCGR2A,FCGR3A,OLFML2B	OLFML2B	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	17752	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	130477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	164686304	164686686	164686418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	163483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	164723371	164723492	164723438	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	200550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	164750243	164750515	164750387	Y	PBX1	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	227422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	164753581	164753588	164753585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	230760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	167486210	167486705	167486392	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	34299	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	167630871	167631089	167630883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL1	57340	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	167683554	167683813	167683605	Y	POU2F1,CREG1	MPZL1	NA	NA	NA	NA	MPZL1	4616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	168876326	168876730	168876527	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	196205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	168961520	168961569	168961544	Y	NA	NA	ATP1B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1B1	111366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	169452813	169453010	169452905	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	231	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	170042588	170042670	170042627	Y	C1orf112	KIFAP3	NA	NA	NA	NA	KIFAP3	9679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	172466564	172466703	172466653	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	55334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	172468818	172469289	172468991	Y	NA	NA	DNM3,DARS2,CENPL,C1orf9,C1orf105,FASLG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIGC	57588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	173909740	173909938	173909924	Y	RC3H1,ZBTB37	NA	NA	NA	NA	NA	GAS5	73720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	173984193	173984403	173984298	Y	GPR52,ZBTB37,RC3H1	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	5032	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	174220636	174220943	174220783	Y	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	94088	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	174503176	174503233	174503205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	376628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	175145439	175145838	175145619	Y	KIAA0040,KIAA0040	KIAA0040	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	14297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	178298668	178299096	178298877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf220	210791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	179290775	179290979	179290800	Y	NA	SOAT1	NA	NA	NA	NA	SOAT1	29850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	180251899	180252130	180252121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX4	54478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	186567965	186567976	186567970	Y	NA	NA	PLA2G4A	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf27	225075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	186728961	186729222	186729092	Y	NA	NA	PLA2G4A,PTGS2	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf27	386071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	190138488	190138695	190138592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-547I7.2	306986	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-547I7.2	159264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	192458942	192459176	192459156	Y	RGS2,RGS13,RGS1	NA	RGS1,RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	224137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	192757327	192757592	192757471	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	18577	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	192953303	192953614	192953465	Y	RGS2,CDC73,TROVE2,TROVE2	NA	NA	NA	NA	NA	TROVE2	72938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	197482296	197482309	197482303	Y	F13B,ZBTB41	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	260517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	197530309	197530378	197530355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	212448	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	197739507	197739631	197739601	Y	NA	DENND1B	NA	NA	NA	NA	DENND1B	3195	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	198840125	198840497	198840438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	513772	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	198845240	198845523	198845521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	508746	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	198888798	198889070	198888879	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	465199	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	198893258	198893473	198893399	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	460796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	198894891	198894966	198894922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	459303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104D3.2	449335	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	201122119	201122123	201122121	Y	NA	TMEM9	NA	NA	NA	NA	TMEM9	16579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	201277004	201277220	201277102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAD1	89516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	201277329	201277484	201277406	Y	PKP1	NA	NA	NA	NA	NA	LAD1	89252	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	201469668	201470038	201469853	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	4331	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	201717986	201718364	201718179	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	77905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	14668	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	202003479	202003610	202003599	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	25998	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	202003884	202004146	202004054	Y	NA	ELF3,RP11-465N4.4	NA	NA	NA	NA	RP11-465N4.4	26403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	202016172	202016526	202016316	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ELF3,RP11-465N4.4	ELF3,NAV1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-465N4.4	38691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	202027341	202027750	202027511	Y	NA	RP11-465N4.4	RNPEP,ELF3,NAV1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-465N4.4	49860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	202823240	202823502	202823372	Y	NA	KDM5B,PCAT6,RP11-480I12.5,RABIF	PPP1R12B,KDM5B,LOC641515,KLHL12,ADIPOR1,LOC148709,RABIF,CYB5R1,TMEM183A,LOC401980,SYT2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-480I12.5	5246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	203289937	203290406	203290261	Y	BTG2	CHIT1,BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	BTG2	17318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	203294985	203295146	203295066	Y	NA	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	BTG2	22366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	204049581	204049822	204049645	Y	LAX1,PIK3C2B,SOX13	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	9338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	204098794	204099127	204098964	Y	NA	ETNK2	NA	NA	NA	NA	ETNK2	20180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	204254999	204255106	204255048	Y	PIK3C2B,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	73779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	204386444	204387188	204386898	Y	PPP1R15B	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	7525	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	205645820	205646052	205645945	Y	DSTYK,TMCC2,CDK18,MFSD4,SLC45A3	ELK4,SLC45A3	NA	NA	NA	NA	SLC45A3	1535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	206608344	206608425	206608385	Y	NA	IKBKE	NA	NA	NA	NA	IKBKE	33366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	206748926	206749451	206749084	Y	IKBKE,RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	RP11-534L20.4,EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	34453	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	206754982	206755508	206755274	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,RASSF5,DYRK3	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	28396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	206916099	206916418	206916260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	59810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	207998055	207998202	207998154	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	42293	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	207999163	207999611	207999292	Y	CR1,CD46	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	40884	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	209393390	209393475	209393433	Y	NA	ATP5G2P1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	46093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212102475	212102639	212102508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	100361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212261904	212262125	212262011	Y	PPP2R5A	RPL21P28	NA	NA	NA	NA	RPL21P28	38533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	212484976	212485048	212485012	Y	NA	PPP2R5A,RP11-384C4.3	TMEM206	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-384C4.3	4116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	212643548	212643711	212643612	Y	NA	NENF	ATF3	K562	ChIA-PET	22265404	NENF	39319	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212661846	212662402	212662104	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	57617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	215481885	215482223	215482013	Y	NA	NA	CENPF	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	256512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	215655448	215655678	215655614	Y	NA	NA	CENPF,KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD3	83057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	216823711	216823952	216823948	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	978472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	216938634	216938811	216938777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	863613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	217105953	217106090	217106023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	696334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	217306758	217307045	217306902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	495379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	218553747	218554148	218553928	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	36170	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	218649784	218650063	218649859	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	132207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	218654144	218654396	218654237	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,LOC643723	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TGFB2	136567	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	218833571	218833974	218833885	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463,RRP15,LYPLAL1,LOC643723	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	315994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	219224399	219224689	219224618	Y	NA	NA	TGFB2,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	LYPLAL1	120497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	220868801	220868862	220868831	Y	C1orf115,MOSC2,MOSC1	C1orf115	NA	NA	NA	NA	C1orf115	7614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	221209079	221209530	221209425	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	159380	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	221877654	221878134	221877871	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	35384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	221904432	221904724	221904722	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	8794	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr1	222502119	222502129	222502124	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-378J18.3	259038	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	222828361	222828786	222828451	Y	TLR5	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	38933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	222830626	222830783	222830705	Y	TAF1A,MIA3	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	41198	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	223362227	223362396	223362336	Y	NA	TLR5	CAPN8,SUSD4	IMR90	Hi-C	24141950	TLR5	47603	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	224014874	224015267	224015181	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	16407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	224026476	224026743	224026681	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	4931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.89866342749631
chr1	224545542	224546006	224545661	Y	FBXO28,CNIH4	NVL,CNIH4	NA	NA	NA	NA	CNIH4	2990	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	225845408	225845613	225845516	Y	ENAH	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	6564	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	226014145	226014403	226014226	Y	EPHX1,EPHX1	EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	18351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	226320775	226321123	226320910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	51308	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226842752	226843521	226843149	Y	ITPKB	ITPKB-IT1	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	17247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226890098	226890374	226890232	Y	NA	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	29330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.44933171374815
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	19.4257342814509
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	229206013	229206222	229206093	Y	RHOU	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	198553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	229229415	229229758	229229591	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	175017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	229357329	229357959	229357668	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,C1orf96	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	46816	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	229409656	229409997	229409713	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	NA	NA	NA	NA	RAB4A	4834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	229601636	229601883	229601761	Y	NA	NUP133,RP4-613A2.1	NA	NA	NA	NA	NUP133	40220	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	230248068	230248475	230248108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	56532	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	230645276	230645765	230645542	Y	NA	NA	URB2	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	130470	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	230887462	230887658	230887571	Y	NA	AGT	NA	NA	NA	NA	AGT	39419	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	AGT	NA	NA	NA	NA	AGT	41278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	231025619	231025725	231025648	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	22284	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	231913853	231914038	231913997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	153292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	232671774	232671885	232671830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-74P	294048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	232714427	232714703	232714513	Y	NA	NA	SIPA1L2,TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	251230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	232726243	232726385	232726324	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	239548	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	232726496	232726761	232726608	Y	SIPA1L2	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	239172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	27.7872459939015
chr1	233234073	233234169	233234121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	149722	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	233248043	233248219	233248131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	163692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	233750790	233751092	233750957	Y	KCNK1	KCNK1	NA	NA	NA	NA	KCNK1	3040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	11.1486822832675
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr1	234721506	234721689	234721614	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	21582	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr1	234736336	234736615	234736485	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	6656	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	234737347	234737653	234737498	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	5618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr1	234752255	234752429	234752320	Y	NA	IRF2BP2	ARID4B,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	8984	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	49383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	NA	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	50663	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LINC01132	50362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235094853	235095190	235094881	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1	IRF2BP2,LOC100506810,TARBP1,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	8619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	6.50339799857268
chr1	235096560	235096855	235096619	Y	ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	6954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	5739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	9.03718942658802
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.1	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	7025	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235122652	235122939	235122843	Y	NA	RP11-443B7.1	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	18843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	RP11-443B7.1	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.1	29205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr1	235186710	235186949	235186846	Y	ARID4B	NA	LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-443B7.1	82901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	46688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235242792	235242999	235242934	Y	NA	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	46253	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	SNORA14B,TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SNORA14B	42395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235644219	235644255	235644237	Y	NA	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	21526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	241693216	241693255	241693236	Y	KMO	FH,KMO	NA	NA	NA	NA	KMO	179	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	241705436	241706018	241705703	Y	KMO	FH,KMO	NA	NA	NA	NA	KMO	12002	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPN3	57207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	242068662	242068804	242068733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXO1	59393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	397535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	150337	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	244486299	244486688	244486462	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	SDCCAG8,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	126748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	246751015	246751281	246751184	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	23269	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	246862505	246862699	246862612	Y	SCCPDH	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	22650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	247093396	247093478	247093437	Y	NA	AHCTF1	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	247336409	247336734	247336572	Y	NLRP3,NLRP3,AHCTF1	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	26628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	247507326	247507475	247507401	Y	NA	ZNF496	ZNF670-ZNF695,AHCTF1,ZNF669,ZNF496	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF496	14178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	557102	557353	557317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	176330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	725947	726341	726240	Y	NA	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	7342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	903940	904213	904109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP4B	71351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	1100843	1101035	1100898	Y	NA	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	7365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	1531414	1531624	1531519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	437936	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	1989680	1990030	1989855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	896202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	3524547	3524820	3524727	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	300653	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	3808656	3808872	3808754	Y	KLF6	KLF6	NA	NA	NA	NA	KLF6	16601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	3893365	3894190	3893886	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	67892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	5530637	5531333	5530982	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	8200	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	5535635	5536039	5535950	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	3494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr10	5577499	5577735	5577573	Y	NA	CALML5	NA	NA	NA	NA	CALML5	37966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	CALML5	50477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	5596279	5596669	5596478	Y	NA	NA	NET1,ASB13	IMR90	Hi-C	24141950	CALML5	56746	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	6171883	6172155	6171968	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	RBM17,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	12726	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6242613	6242903	6242648	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	57732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr10	6296306	6296528	6296431	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	111425	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6298563	6298686	6298625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	113682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6333794	6333936	6333889	Y	PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	148913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6340083	6340359	6340284	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	155202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6440433	6440653	6440526	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	179610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKCQ	176551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr10	7223481	7223753	7223543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	227697	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	7228549	7229134	7228725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	222316	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	7248434	7248663	7248594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	202787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	7275320	7275743	7275581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	175707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	7449149	7449274	7449212	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	2176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	7449887	7450154	7450051	Y	TAF3,SFMBT2,SFMBT2	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	1296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	8088862	8088888	8088874	Y	ITIH5,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	2616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	8089680	8090146	8089800	Y	ITIH5	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	1358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	8090455	8090655	8090575	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	RP11-379F12.4	849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	8098275	8098603	8098313	Y	NA	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	4708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	8098940	8099487	8099174	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	5373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	8103293	8103465	8103334	Y	TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	9726	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	RP11-379F12.4,GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	10052	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	8899367	8899664	8899620	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	805800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	8903701	8904023	8903876	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	810134	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	8909152	8909331	8909243	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	815585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	8927492	8927792	8927642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	833925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	8931286	8931468	8931377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	837719	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	9017648	9017767	9017731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	924081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	9042425	9042760	9042593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	948858	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	9052186	9052462	9052283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	958619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr10	9058876	9059174	9059118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	965309	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	9076423	9076646	9076599	Y	NA	NA	GATA3,FLJ45983,TAF3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATA3	982856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	13390886	13391219	13391148	Y	NA	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	2589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	13391797	13392252	13392084	Y	SEPHS1	PHYH,SEPHS1	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	3500	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	17429922	17430093	17430002	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	2987	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	17430166	17430520	17430415	Y	NA	ST8SIA6-AS1	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	3231	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	17456684	17457055	17456726	Y	NA	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6-AS1	29749	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	17470783	17471060	17470983	Y	TRDMT1,STAM,ST8SIA6	ST8SIA6-AS1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	23269	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	18860767	18861138	18861132	Y	NA	RP11-499P20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-499P20.2	28187	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	127608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	21389618	21389984	21389801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	71132	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	21430870	21431276	21431139	Y	NEBL,C10orf113	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	29840	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	22025175	22025497	22025336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	194575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	22053811	22054026	22053942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	166046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	22242936	22243341	22243231	Y	NA	RN7SKP37,DNAJC1	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	22864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	22870490	22870524	22870509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	130960	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	24498955	24499204	24499146	Y	KIAA1217	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	511393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	24772710	24773084	24772822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	237513	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	25602421	25602556	25602489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	298834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	26625520	26625572	26625546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	359016	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	28700580	28701041	28700796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP7	79165	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	29228763	29229094	29228981	Y	NA	NA	BAMBI,LOC100507605,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	264492	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	213186	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	29970673	29971027	29970896	Y	SVIL	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	274342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	30073207	30073608	30073571	Y	SVIL	NA	SVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	376876	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	30092989	30093361	30093263	Y	SVIL	NA	SVIL,KIAA1462,MIR604	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	396658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	30096449	30096548	30096521	Y	NA	NA	SVIL,KIAA1462	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTCHD3P1	400118	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	30338036	30338318	30338293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPAP	323059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.2804122852138
chr10	32215994	32216410	32215998	Y	NA	ARHGAP12	NA	NA	NA	NA	ARHGAP12	252	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	32233498	32233707	32233615	Y	NA	ARHGAP12	ARHGAP12,KIF5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	17756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	32460264	32460451	32460341	Y	NA	NA	ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	70043	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	32621222	32621521	32621374	Y	ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	44205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	32626420	32626786	32626539	Y	NA	EPC1	NA	NA	NA	NA	EPC1	38940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr10	33537661	33538041	33537751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	85149	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	33562254	33562552	33562425	Y	ITGB1,ITGB1,NRP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	60638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	34421241	34421398	34421321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	529631	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	34815006	34815362	34815018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	135667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	35080769	35081009	35080876	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	21244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	35424812	35424825	35424819	Y	CCNY	CUL2,CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	11093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	35640077	35640405	35640144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	106124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	37595882	37596202	37595976	Y	ANKRD30A	VN1R53P	NA	NA	NA	NA	VN1R53P	39342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	38325428	38325718	38325598	Y	ZNF25,ZNF37A	ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF33A	27850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	43761301	43761565	43761418	Y	RASGEF1A	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	129367	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	43872885	43873113	43872972	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	29501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	50595145	50595278	50595227	Y	C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	149808	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	50604736	50605039	50604888	Y	DRGX	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	140047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	52037840	52038115	52037944	Y	SGMS1	DYNC1I2P1	SGMS1	IMR90	Hi-C	24141950	DYNC1I2P1	15102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	52270106	52270351	52270231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	112572	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	52613516	52613853	52613685	Y	A1CF	NA	NA	NA	NA	NA	ASAH2B	116438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	59976925	59976941	59976933	Y	NA	IPMK,CISD1	NA	NA	NA	NA	IPMK	48753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	60949726	60949909	60949819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	171030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	61019605	61019954	61019626	Y	PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13C	100985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	61580750	61581126	61580938	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	83288	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	61664562	61664999	61664893	Y	CCDC6	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	148	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	61808152	61808409	61808281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	143738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63703432	63703559	63703511	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	44373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63736420	63736602	63736437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	77361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	63752119	63752912	63752632	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	93060	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	63803306	63803648	63803427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	144247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	63814731	63815034	63814907	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	155672	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63839926	63839992	63839961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	180867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	63913852	63914076	63913964	Y	NA	NA	RTKN2,ARID5B,ZNF365	IMR90	Hi-C	24141950	RTKN2	112390	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	64449585	64449837	64449638	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	112679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	65078433	65078736	65078637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	106321	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	35827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	69523317	69523417	69523404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	72507	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	71077076	71077284	71077148	Y	DDX21,HK1	HK1	NA	NA	NA	NA	HK1	49336	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	TACR2	NA	NA	NA	NA	TACR2	29256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TACR2,TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	TYSND1,CALM2P2	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	74037393	74037499	74037446	Y	NA	DDIT4	DNAJB12	IMR90	Hi-C	24141950	DDIT4	5715	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	74070583	74070739	74070681	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	38905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74076833	74077036	74076912	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	35952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74078612	74078870	74078849	Y	PSAP,DDIT4,CBARA1,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	34118	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74086996	74087315	74087159	Y	NA	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	25673	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	74091361	74091474	74091418	Y	SPOCK2,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	21514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	74850921	74850988	74850953	Y	ANXA7,ECD	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	3744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	75004761	75005017	75004932	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	1603	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	75361338	75361489	75361457	Y	NA	NA	USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP5	94150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	9.96624628352697
chr10	75386298	75386455	75386385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP5	69184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78641476	78641804	78641730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	754549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	78698062	78698447	78698255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	697906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	78784039	78784371	78784322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	611982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	78792238	78792506	78792372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	603847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78826666	78827029	78826848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	569324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78857417	78857654	78857522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	538699	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78858331	78858440	78858373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	537913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	78886447	78886645	78886557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	509708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78939227	78939377	78939300	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	456976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	78954967	78955278	78955208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	441075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	79019003	79019258	79019131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	377095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79069997	79070387	79070206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	325966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79119995	79120222	79120109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	276131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	79176142	79176460	79176291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	219893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79254650	79254953	79254867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141400	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79346819	79347304	79347005	Y	KCNMA1	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	49049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	79378417	79378570	79378502	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	17783	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79538272	79538371	79538344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	141919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79637463	79637788	79637654	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	46590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	80062995	80063366	80063293	Y	NA	NA	ZMIZ1,RPS24,LOC283050,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	271477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	80166856	80166996	80166943	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	RPS24	375338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	80806888	80807057	80806949	Y	NA	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	19735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	81008258	81008603	81008380	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	96622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	81088418	81088982	81088641	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	16243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	81116031	81116092	81116064	Y	NA	PPIF	ZCCHC24	IMR90	Hi-C	24141950	PPIF	10806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	81138677	81139093	81139046	Y	NA	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	33452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	82299421	82299771	82299678	Y	SH2D4B,SH2D4B	RP11-137H2.4	NA	NA	NA	NA	RP11-137H2.4	5723	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	83712370	83712377	83712374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	79300	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	84158355	84158705	84158530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRG3	525285	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	85609014	85609374	85609152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	229811	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	89836681	89836877	89836779	Y	NA	NA	PTEN,RNLS,KLLN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	133422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	89912666	89913039	89912909	Y	NA	NA	KLLN,PTEN,RNLS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	209407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	90597409	90597808	90597517	Y	LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22	ANKRD22,STAMBPL1	NA	NA	NA	NA	ANKRD22	11767	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr10	95205346	95205630	95205524	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	34444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	95327729	95327872	95327806	Y	O3FAR1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP55	73340	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	97054774	97055369	97055126	Y	ENTPD1,PDLIM1	PDLIM1	PDLIM1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PDLIM1	5993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-248J23.5	117342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	101780024	101780319	101780173	Y	CUTC,WNT8B	DNMBP	DNMBP	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNMBP	12348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	102030171	102030375	102030254	Y	SEC31B	CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2	NA	NA	NA	NA	CWF19L1	4734	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	102393526	102393544	102393535	Y	WNT8B,SEMA4G	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB8	105769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	NA	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM178A	181343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr10	102831127	102831150	102831139	Y	NA	PDZD7,SFXN3,KAZALD1	NA	NA	NA	NA	KAZALD1	11529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	103514539	103514868	103514704	Y	NA	NPM3	NA	NA	NA	NA	NPM3	26302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	103591495	103591519	103591507	Y	BTRC,KCNIP2,KCNIP2	MGEA5	NA	NA	NA	NA	MGEA5	14799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	104196250	104196338	104196269	Y	NA	NFKB2,FBXL15,CUEDC2,C10orf95,TMEM180	NA	NA	NA	NA	CUEDC2	5832	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	104238092	104238376	104238328	Y	NA	CUEDC2,C10orf95,TMEM180,ACTR1A,SUFU	NA	NA	NA	NA	TMEM180	18943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	104473144	104473537	104473339	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	105650011	105650288	105650237	Y	GSTO2,GSTO1,MEIR5,MEIR5,COL17A1,SLK	OBFC1	SH3PXD2A	IMR90	Hi-C	24141950	OBFC1	25675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	106085298	106085504	106085412	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	10658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112272592	112272848	112272747	Y	SHOC2,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	16996	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112510754	112511032	112510934	Y	ADRA2A	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD4	118533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112582466	112582715	112582708	Y	SMC3,ADRA2A	PDCD4,PDCD4-AS1	NA	NA	NA	NA	PDCD4	46850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	112668861	112669237	112669049	Y	PDCD4,SHOC2,BBIP1,BBIP1	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	7795	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	114570405	114570790	114570582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	137219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	114709018	114709405	114709296	Y	TCF7L2	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	1009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	116255200	116255589	116255576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	187173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	116582671	116583074	116582920	Y	NA	FAM160B1	NA	NA	NA	NA	FAM160B1	3168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	119021882	119022152	119021944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	110826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	119113606	119113787	119113696	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	19191	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	129045	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	121412148	121412380	121412196	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	3266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	123313040	123313152	123313149	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	FGFR2	NA	NA	NA	NA	FGFR2	42820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	146053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	125993764	125994022	125993889	Y	CHST15,FAM175B	NA	NA	NA	NA	NA	OAT	111523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	126213697	126214091	126213879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHPP	65294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	126749212	126749581	126749525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98158	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	126768245	126768621	126768433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	79118	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	2683	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	127576777	127576887	127576832	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	360	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	127591696	127592016	127591824	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	8588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	133793049	133793425	133793362	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	10	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	133836748	133836839	133836756	Y	STK32C,DPYSL4,JAKMIP3	BNIP3	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	43313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	12824	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	134221970	134222202	134222031	Y	PWWP2B	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	13298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.44933171374815
chr10	134361912	134362323	134362096	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	12588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	134385594	134385710	134385631	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	36270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr10	134388036	134388182	134388143	Y	JAKMIP3,DPYSL4,C10orf92	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	38712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	134388737	134389185	134389009	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	39413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr10	135071993	135072118	135072056	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511	NA	NA	NA	NA	ZNF511	47861	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr10	135092117	135092276	135092147	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27703	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	ANO9,PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	1053255	1053594	1053287	Y	NA	NA	MUC5B,MOB2,AP2A2	IMR90	Hi-C	24141950	AP2A2	130361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	1523761	1524132	1523960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP8	67018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr11	1595832	1596187	1595959	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	4682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	2212480	2212615	2212548	Y	ASCL2,TH	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P30	142391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P30	131026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	234875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	2933631	2934118	2933874	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18AS	10661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr11	3533400	3533573	3533457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF195	134952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	3833340	3833454	3833393	Y	RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1	NA	NA	NA	NA	NUP98	16318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	HPX,TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	7624372	7624649	7624458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP2	91843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	7636630	7636941	7636786	Y	PPFIBP2,OR5P3	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP2	104101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	8730669	8730993	8730843	Y	NA	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	28711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	9590279	9590748	9590469	Y	WEE1,WEE1	WEE1	LOC644656,ZNF143	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	WEE1	2480	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr11	9697347	9697585	9697499	Y	NA	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	13723	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	9997247	9997641	9997474	Y	AMPD3	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	313623	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	10862862	10862982	10862965	Y	NA	SNORD97,EIF4G2,ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	15361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	10948299	10948671	10948479	Y	NA	NA	EIF4G2,MICALCL,LOC729013,ZBED5,CTR9,GALNTL4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBED5	69956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	11641691	11641934	11641813	Y	GALNTL4	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	219036	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	12821812	12822118	12821851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	127843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	16945489	16945781	16945647	Y	NA	RP11-466H18.1	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	48779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	18122825	18123020	18122943	Y	UEVLD,TSG101,HPS5,GTF2H1	SAAL1	NA	NA	NA	NA	SAAL1	2618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	18426412	18426598	18426470	Y	NA	LDHA,AC084117.3,LDHC	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	1256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	20053197	20053569	20053404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	329662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	27715832	27716154	27716086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-587D21.1	114605	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	28776161	28776492	28776325	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	648306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	29323978	29324331	29324155	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1196123	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	31450770	31450827	31450799	Y	PAX6,PAX6,IMMP1L,ELP4,DNAJC24	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC24	61383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	32442373	32442742	32442611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3M	160602	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	32728667	32728946	32728768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG4	120543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	32913428	32913828	32913453	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	34125347	34125667	34125520	Y	NA	NAT10	NA	NA	NA	NA	NAT10	198	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	34661390	34661585	34661450	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,EHF,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	20750	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	34939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	34676467	34676782	34676555	Y	ABTB2,ELF5,ELF5,CD44,EHF	EHF	NA	NA	NA	NA	EHF	35827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	34706877	34707176	34707110	Y	ABTB2,EHF	NA	NA	NA	NA	NA	EHF	66237	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	34919844	34920223	34920054	Y	ELF5,EHF	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	15153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	35028328	35028731	35028507	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	APIP	92282	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	35296640	35296760	35296715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FJX1	340975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	35966511	35966551	35966528	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	2980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	36171228	36171637	36171430	Y	TRAF6,COMMD9	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD9	137362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9	NA	NA	NA	NA	COMMD9	22204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	43167343	43167567	43167455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	API5	163946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	44221715	44221986	44221792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	106616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	44239965	44240168	44240067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	124866	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	44633503	44633675	44633616	Y	PRDM11	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	49526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	45000515	45000921	45000720	Y	SYT13,TSPAN18	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	29675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr11	45685212	45685518	45685319	Y	SYT13,MAPK8IP1,CRY2,CRY2,CHST1	CHST1	NA	NA	NA	NA	CHST1	40	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	45864713	45865116	45864826	Y	NA	SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1	NA	NA	NA	NA	CRY2	1553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	44434	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	47531687	47531996	47531879	Y	SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1	NA	RAPSN	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS3	52892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	48063635	48064268	48063917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	63522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	57083068	57083441	57083322	Y	NA	TNKS1BP1,SSRP1	NA	NA	NA	NA	TNKS1BP1	6985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	57242995	57243389	57243187	Y	OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6	SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	16973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	57333685	57333973	57333758	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr11	59331910	59331948	59331929	Y	OR5AN1,OR4D6,OR4D11	OSBP	NA	NA	NA	NA	OSBP	49669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	60917835	60918043	60917849	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	9046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	60926054	60926399	60926274	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	SYT7	NA	NA	NA	NA	SYT7	47643	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	62202402	62202418	62202410	Y	WDR74	NA	NA	NA	NA	NA	RCC2P6	65784	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	62248272	62248499	62248283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	62972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	62413039	62413428	62413234	Y	NA	MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1	NA	NA	NA	NA	GANAB	935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	62588127	62588383	62588260	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	63298876	63299223	63298998	Y	OTUB1,MARK2,RARRES3	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	83132	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	63328335	63328557	63328446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	53798	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	63777072	63777136	63777104	Y	NA	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	25747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	64637838	64638320	64638071	Y	RASGRP2,SF1,SF1,EHD1,ATG2A	CDC42BPG,EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	15448	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.12500942788558
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.2804122852138
chr11	65234874	65235172	65234954	Y	SNX32	NEAT1,AP000769.1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	AP000769.1	14146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	56.3346294162075
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr11	65559034	65559399	65559282	Y	NA	OVOL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	6541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	65581703	65581968	65581801	Y	CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198	OVOL1,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	OVOL1	29210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	65849089	65849462	65849117	Y	KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,SIPA1,RELA,DKFZp761E198,CTSW,PACS1	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	13255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	65905081	65905308	65905252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACS1	69247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	66374477	66374855	66374526	Y	NA	CTSF,CCS,CCDC87,RBM14,RBM14-RBM4,RBM4	RBM14-RBM4	IMR90	Hi-C	24141950	RBM14	7198	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	21940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr11	67895703	67896078	67896017	Y	CHKA	CHKA	CHKA,SUV420H1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHKA	8792	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	68270416	68270689	68270553	Y	MRGPRD	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	44230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTL5	129822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	68611298	68611611	68611498	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	68847694	68848091	68847776	Y	IGHMBP2,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	33329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	68924761	68925032	68924956	Y	TPCN2	NA	ORAOV1,CCND1,MYEOV	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	110396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	69257578	69257894	69257648	Y	NA	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	34814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.3	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	34276	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	69332480	69332708	69332641	Y	NA	AP000439.3	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.3	39772	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.2804122852138
chr11	69894907	69895080	69894991	Y	ANO1	ANO1	ANO1,FADD,FGF4	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	27328	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	69969786	69970187	69969839	Y	NA	ANO1	NA	NA	NA	NA	ANO1	47378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	70159213	70159451	70159301	Y	PPFIA1	PPFIA1	NA	NA	NA	NA	PPFIA1	44407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	70339442	70339588	70339533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	96848	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	70483542	70483760	70483651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	240948	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	70575636	70576014	70576009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	333042	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	71493756	71493898	71493829	Y	NA	FAM86C1	NA	NA	NA	NA	FAM86C1	2658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	71702677	71703050	71702869	Y	FOLR3,IL18BP,IL18BP	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	4537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	71704625	71704847	71704670	Y	NA	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	2740	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr11	72003135	72003262	72003223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	70390	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	72904950	72905270	72905106	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	22073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	72906397	72906513	72906453	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,P2RY2,STARD10,MIR4692,RELT	IMR90,MCF7	Hi-C,3C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	P2RY2	20830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	73722792	73723138	73723056	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	K562	ChIA-PET	22265404	UCP2	30440	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	74814562	74814987	74814735	Y	ARRB1	NA	XRRA1,LOC100507050	IMR90	Hi-C	24141950	NEU3	117383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	75883349	75883640	75883491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	206375	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIR	169769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	76534548	76534939	76534880	Y	GDPD4	TSKU,RP11-21L23.3,ACER3	ACER3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACER3	34972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	77938673	77938848	77938785	Y	NA	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	40805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	78512207	78512629	78512463	Y	GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	228288	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	80239490	80239499	80239495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1955571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	82918019	82918384	82918270	Y	PCF11,ANKRD42	ANKRD42,RP11-727A23.5,RP11-727A23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-727A23.1	3663	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	83278002	83278167	83278160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	282552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr11	85491016	85491055	85491036	Y	SYTL2,SYTL2,SYTL2	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	29129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	87149211	87149297	87149219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM135	402325	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	88041244	88041443	88041379	Y	NA	CTSC	NA	NA	NA	NA	CTSC	27512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	89988834	89989089	89988962	Y	NA	CHORDC1,RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	24639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	93446176	93446355	93446266	Y	NA	SCARNA9,C11orf54	NA	NA	NA	NA	SCARNA9	6324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1,RP11-867G2.8	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-867G2.8	8970	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	94882788	94883137	94883023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENDOD1	61814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	102317826	102318238	102318123	Y	BIRC3,BIRC2,TMEM123	TMEM123	NA	NA	NA	NA	TMEM123	20877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	103117200	103117534	103117367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC2H1	139040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	106138718	106139012	106138865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	192226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	106629947	106630142	106630045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUCY1A2	257108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	109855730	109855951	109855840	Y	ZC3H12C	NA	ZC3H12C	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H12C	106136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	111692318	111692670	111692505	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	C11orf1	54989	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	111849134	111849433	111849303	Y	SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1	DLAT	NA	NA	NA	NA	DLAT	44105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	USP28	201112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	115017644	115017889	115017764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	115360673	115361056	115361024	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	12619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	116867531	116867975	116867966	Y	NA	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	36792	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	117050933	117051273	117050997	Y	SIDT2	PAFAH1B2,SIDT2,PCSK7	NA	NA	NA	NA	SIDT2	3484	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	118065939	118066307	118065952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPZL3	54758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	118112268	118112532	118112411	Y	IL10RA,AMICA1,AMICA1,UBE4A,MPZL3,CD3G,CD3E,CD3D	MPZL3,MPZL2	NA	NA	NA	NA	MPZL3	8533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT46	52164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	118740767	118741727	118741016	Y	MLL,VPS11,RPS25,CXCR5,CXCR5,CCDC84,CCDC153,CBL,DDX6	MIR4492	DDX6,CXCR5,BCL9L,MIR4492	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4492	37690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.0405497136184
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	2978	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	UPK2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,UPK2,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	119540378	119540644	119540511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL1	57150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	120079363	120079802	120079708	Y	NA	POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	122586858	122587235	122586954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	62475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	124587586	124587756	124587671	Y	ROBO4,NRGN,ESAM	SPA17,SIAE,NRGN,RP11-677M14.3,ESAM	NA	NA	NA	NA	NRGN	19986	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	126571241	126571490	126571472	Y	ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	347706	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	727665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP32	219251	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	129716429	129716681	129716540	Y	TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	32715	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr11	129717042	129717234	129717138	Y	ST14,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	TMEM45B	33328	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	129723853	129724184	129723902	Y	NFRKB	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	39301	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr11	129731747	129732130	129731880	Y	ST14,NFRKB,TMEM45B	TMEM45B,NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	31355	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.36487199948098
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	133919324	133919581	133919497	Y	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	94444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	133969165	133969269	133969217	Y	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	NA	VPS26B	123270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	723643	724040	723947	Y	NA	RP11-218M22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	14017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	864034	864343	864158	Y	CCDC77,KDM5A	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	4275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1024438	1024795	1024721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	72424	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1428527	1428661	1428594	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	272670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL14	189971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1640952	1641788	1641475	Y	NA	NA	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL14	59543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	1699844	1700200	1699934	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	1131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	3239416	3239801	3239467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN9	54895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	717175	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr12	6332021	6332332	6332117	Y	LPAR5	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	25140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	6387822	6388153	6388049	Y	NA	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	29449	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6432315	6432644	6432443	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	PLEKHG6	14713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	6454526	6454970	6454793	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	5246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	RNU7-1	7127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	LPCAT3	19454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	7736832	7737158	7736952	Y	PEX5,SLC2A3,NECAP1,C3AR1	NA	NA	NA	NA	NA	CD163L1	106339	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	59553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	8123968	8124323	8124120	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	58976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	8971788	8972170	8971968	Y	NA	NA	A2ML1	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	92322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	9802084	9802505	9802358	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	203259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	11221356	11221421	11221389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	100751	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	11963262	11963646	11963299	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	162474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	12255233	12255559	12255327	Y	BCL2L14	RP11-267J23.4	NA	NA	NA	NA	RP11-267J23.4	6538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	12408234	12408471	12408413	Y	NA	LRP6	NA	NA	NA	NA	LRP6	9475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	12556548	12557081	12556810	Y	CDKN1B,LOH12CR1	LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	48535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	12594845	12595716	12595015	Y	LOH12CR1,GPR19,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	86832	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	12708006	12708373	12708190	Y	NA	DUSP16	NA	NA	NA	NA	DUSP16	4944	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	14926467	14926701	14926675	Y	NA	HIST4H4,H2AFJ,WBP11,C12orf60	NA	NA	NA	NA	H2AFJ	1197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	15841016	15841330	15841173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	191933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	19566135	19566181	19566158	Y	NA	AEBP2	NA	NA	NA	NA	AEBP2	11156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	24752569	24752849	24752709	Y	BCAT1	NA	SOX5	IMR90	Hi-C	24141950	CASC1	593247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.36487199948098
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	26142824	26143171	26142998	Y	NA	RASSF8	NA	NA	NA	NA	RASSF8	32862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	26495152	26495452	26495369	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	217602	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	26626326	26626794	26626426	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.3	348776	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	26889779	26890108	26889932	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	94023	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	27745630	27745707	27745691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	29581721	29581917	29581813	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	49599	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	29844514	29844723	29844664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	90969	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	29872942	29873140	29873086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC1	62552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	31464460	31464546	31464537	Y	NA	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	13446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	31899631	31900083	31899901	Y	AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	METTL20,AMN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMN1	19523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	31989978	31990366	31990172	Y	NA	H3F3C	NA	NA	NA	NA	H3F3C	46803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	32405506	32405740	32405609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	147737	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	395685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	SLC2A13	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	29622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	42074614	42074792	42074703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	461889	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	44983046	44983051	44983049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO6	624719	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	46380247	46380714	46380477	Y	SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	3189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	46571692	46571878	46571769	Y	SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	89922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	46798246	46798498	46798428	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	22784	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	46809510	46809878	46809694	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	34048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	46844808	46845174	46844835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	69346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr12	47671815	47672221	47672059	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	200081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	48076459	48076736	48076534	Y	NA	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	21108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	48294417	48294695	48294497	Y	OR10AD1,ZNF641,ZNF641,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	40136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	48579978	48580344	48580161	Y	OR8S1,OR10AD1	ASB8	NA	NA	NA	NA	ASB8	6982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	49276307	49276420	49276362	Y	OR8S1,RND1	DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11	RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RND1	18626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	49449678	49450138	49449974	Y	CCDC65,DHH	PRKAG1,RHEBL1	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	11670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	49452736	49452852	49452791	Y	NA	PRKAG1,RHEBL1,LMBR1L	NA	NA	NA	NA	RHEBL1	8956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	50860078	50860266	50860172	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	36502	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	50902358	50902765	50902415	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	5590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	50913232	50913640	50913328	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	16464	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	50931365	50931732	50931390	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	34597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	51057988	51058419	51058261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	97074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	51762689	51763227	51762914	Y	SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6,BIN2	GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT6	21424	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	51783532	51783718	51783602	Y	NA	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	51786511	51786834	51786676	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6	GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	1860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	52419301	52419935	52419633	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	4685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	52426305	52426422	52426334	Y	NR4A1,GRASP,NR4A1	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7,KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8237	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	53253974	53254173	53254090	Y	RARG,KRT6A,KRT5	NA	KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT18	86482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr12	53885903	53886227	53886219	Y	NA	MAP3K12,TARBP2	NA	NA	NA	NA	MAP3K12	5620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	53955466	53955638	53955506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7	62561	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	SNORD81	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD81	15886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54400746	54401119	54400931	Y	NA	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	8952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOTAIR,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	12047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54433983	54434162	54434078	Y	NA	HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	9346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54563652	54563918	54563802	Y	NA	RP11-834C11.4,SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	16860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	58595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7B	264450	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	56132069	56132385	56132308	Y	OR6C4,OR10P1,SMARCC2,IKZF4	BLOC1S1,RP11-644F5.10,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	2679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	56275045	56275257	56275151	Y	OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1	RNU1-69P,DGKA,WIBG	NA	NA	NA	NA	RNU1-69P	8583	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	24.4933171374815
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	57402902	57402987	57402944	Y	NA	ZBTB39	NA	NA	NA	NA	ZBTB39	4672	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57462088	57462242	57462164	Y	R3HDM2,MBD6,ARHGAP9,ARHGAP9,ARHGAP9,BAZ2A,STAT6,STAT6	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	17604	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57494239	57494362	57494284	Y	MBD6,STAT6	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	NAB2	13562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57520981	57521279	57521090	Y	NA	TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6	NA	NA	NA	NA	LRP1	705	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	57986482	57986782	57986634	Y	R3HDM2,AGAP2,KIF5A,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25	DCTN2,PIP4K2C,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1	NA	NA	NA	NA	PIP4K2C	3525	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	62998747	62999127	62998791	Y	NA	RP11-631N16.2,MIRLET7I	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	3281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	63118880	63119001	63118911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIRLET7I	123414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	63179567	63180349	63179723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1H	146468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	111271	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	NA	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	MSRB3	288991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	NA	NA	NA	NA	NA	HELB	65035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	67404997	67405349	67405173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	55593	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr12	69070582	69070990	69070845	Y	MDM1,SLC35E3,NUP107,MDM2	RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RPL7P42	5385	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	69686526	69686874	69686654	Y	NA	RP11-1143G9.2	NA	NA	NA	NA	RP11-1143G9.2	10349	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	70329390	70329536	70329438	Y	NA	NA	PTPRB,KCNMB4	IMR90	Hi-C	24141950	RAB3IP	198929	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr12	70360347	70360458	70360404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3IP	229886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	75878955	75879237	75879096	Y	NA	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	24179	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	17530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	279160	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	NA	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	141516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	79943391	79943637	79943513	Y	NA	NA	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	139240	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	80085577	80085980	80085873	Y	NA	PAWR	NA	NA	NA	NA	PAWR	2700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	80098707	80098999	80098853	Y	NA	PAWR	SYT1,PPP1R12A,PAWR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAWR	15830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-84G21.1	106540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr12	89619217	89620117	89619718	Y	DUSP6,ATP2B1	NA	DUSP6,LOC728084,POC1B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP6	124931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	89871085	89871278	89871183	Y	DUSP6,ATP2B1	POC1B,GALNT4,POC1B-GALNT4	NA	NA	NA	NA	POC1B	46523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4,POC1B-GALNT4	60306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	90150470	90150910	90150738	Y	NA	ATP2B1	LOC338758	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP2B1	49393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	90354567	90354976	90354683	Y	POC1B,ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	80125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	90494294	90494625	90494521	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	219852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	90498149	90498315	90498232	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1,POC1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	223707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	90918093	90918302	90918198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-654D12.2	643651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	91775053	91775433	91775292	Y	NA	NA	LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-796E2.4	761916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92172749	92173207	92172879	Y	BTG1	NA	LOC256021	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-796E2.4	364142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92415461	92415779	92415694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	121570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92431355	92431571	92431463	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	105778	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	67153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	92474192	92474586	92474423	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	62763	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	36141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92509431	92509711	92509674	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	27638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92517420	92517830	92517671	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	19519	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	93709037	93709216	93709174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT4	60443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	93805604	93805748	93805676	Y	CRADD	NUDT4,UBE2N	NA	NA	NA	NA	UBE2N	28290	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	93949724	93949882	93949803	Y	NA	SOCS2,SOCS2-AS1	NA	NA	NA	NA	SOCS2	11708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	94153192	94153314	94153253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	84041	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	94681590	94681805	94681698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	134940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	94773845	94774167	94774046	Y	PLXNC1,TMCC3	RBMS2P1	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	42578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	96631530	96631765	96631742	Y	CDK17	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	45370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	96637849	96638243	96638007	Y	LTA4H,ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	51689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	96648142	96648594	96648361	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	61982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	96752607	96752772	96752695	Y	CDK17	CDK17	NA	NA	NA	NA	CDK17	39566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CDK17	17879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	97935318	97935689	97935593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD1	636317	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	99541793	99542207	99542018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	504874	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	99768760	99769016	99768892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	731841	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	100628061	100628323	100628191	Y	NA	ACTR6,RP11-175P13.3,SCYL2	NA	NA	NA	NA	SCYL2	30595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	101692271	101692665	101692300	Y	NA	UTP20	NA	NA	NA	NA	UTP20	20384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	102187051	102187461	102187342	Y	DRAM1,GNPTAB	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	104330398	104330552	104330475	Y	NA	HSP90B1,C12orf73,TDG	NA	NA	NA	NA	HSP90B1	8513	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	104872178	104872670	104872343	Y	HCFC2,EID3,CHST11	CHST11	NA	NA	NA	NA	CHST11	25105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	104912129	104912512	104912321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	65056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	105032549	105032903	105032843	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	185476	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	249009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	109248007	109248657	109248411	Y	SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	709	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	109300500	109300763	109300632	Y	SVOP,DAO	NA	NA	NA	NA	NA	SSH1	51134	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG	NA	NA	NA	NA	UNG	37197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	110735237	110735389	110735298	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	18676	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	111019873	111020249	111019900	Y	MYL2,ATP2A2,PPTC7	PPTC7,TCTN1	RAD9B	IMR90	Hi-C	24141950	PPTC7	748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	111870317	111870607	111870392	Y	NA	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	28565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	111939312	111939650	111939575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN2	95830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	112363158	112363241	112363200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	85376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	112464061	112464211	112464136	Y	NA	TMEM116,ERP29	NA	NA	NA	NA	ERP29	14941	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	112741741	112742068	112741904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	112087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	112908037	112908227	112908154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6	53395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	113644189	113644365	113644286	Y	NA	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	TPCN1	12490	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	115124772	115125182	115125089	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	4803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	116572704	116573066	116572889	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	140077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	118605193	118605499	118605376	Y	NA	PEBP1,VSIG10	NA	NA	NA	NA	VSIG10	33362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	119824446	119824698	119824572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	278860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	121021309	121021477	121021390	Y	NA	POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	4108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	121841505	121841570	121841538	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	5661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	121904317	121904475	121904368	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	NA	RNF34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF34	68473	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	121968421	121968751	121968672	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	47946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.29392885641993
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	226810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	124866398	124866679	124866460	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	183456	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	23630	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	154666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	125288540	125288810	125288726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	76404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	125395122	125395522	125395138	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	4392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125400956	125401141	125401046	Y	UBC	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	1042	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125550830	125551017	125550923	Y	NA	AACS	NA	NA	NA	NA	AACS	2905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	125992487	125992751	125992619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM132B	323105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	127721490	127721936	127721873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	72818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr12	133602699	133602978	133602704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF140	51446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	20271500	20271544	20271543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	65712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	20419964	20420131	20420036	Y	PSPC1,ZMYM5	ZMYM5	NA	NA	NA	NA	ZMYM5	15645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	20555489	20555876	20555683	Y	NA	ZMYM2	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	24679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	162595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT88	102933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	21405905	21405971	21405953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	59808	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	21607254	21607660	21607524	Y	NA	LATS2	NA	NA	NA	NA	LATS2	26026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	22000564	22000681	22000573	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	30828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	22545143	22545315	22545232	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	FGF9	301621	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	205469	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	23973487	23973793	23973652	Y	NA	SACS	NA	NA	NA	NA	SACS	32048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr13	24290088	24290194	24290124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	147579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	24528296	24528692	24528455	Y	PCOTH	NA	SPATA13,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	66738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	24722927	24723324	24723037	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIPEP	261369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	26456265	26456499	26456340	Y	CDK8	NA	NA	NA	NA	NA	RNF6	338292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	27843033	27843378	27843206	Y	NA	RPL21,SNORD102,RASL11A	NA	NA	NA	NA	RASL11A	569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	28010544	28010826	28010685	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	11913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.13852599909171
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	29327742	29327905	29327792	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	36635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr13	29638535	29638553	29638543	Y	MTUS2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	240362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	30415465	30415864	30415857	Y	NA	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	6957	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr13	30879792	30879814	30879803	Y	NA	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	KATNAL1	171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	LINC01058,UBE2L5P	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01058	24557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	31370248	31370547	31370398	Y	ALOX5AP	NA	ALOX5AP,USPL1,KATNAL1,HMGB1,UBL3,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USPL1	180418	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr13	32719251	32719642	32719447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	115814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	34736232	34736738	34736429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	346046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	35080715	35081091	35080903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	433333	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	35322323	35322497	35322408	Y	NBEA	NA	NA	NA	NA	NA	NBEA	191927	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	38740377	38740756	38740564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFM1	181230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	40450520	40450761	40450584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	222756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	41052248	41052639	41052450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	186095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	41589057	41589218	41589148	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	44192	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	41651625	41651882	41651685	Y	NA	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	ELF1	18049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42137571	42138044	42137923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	254230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	342701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	241248	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	42397573	42397928	42397750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	214248	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	DGKH	NA	NA	NA	NA	DGKH	33825	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	92924	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	42721459	42721826	42721635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	109283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	143494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr13	43570775	43570983	43570833	Y	EPSTI1	DNAJC15	EPSTI1,ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC15	24356	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	271418	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	43947076	43947305	43947191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	351737	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	44028316	44028697	44028507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	330347	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	44620658	44620684	44620670	Y	ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC122	168831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	44884974	44885381	44885134	Y	CCDC122,TSC22D1	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	263902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	44924960	44925274	44925109	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	224009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr13	44978399	44978598	44978577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D1	170685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	45333095	45333256	45333140	Y	NA	NA	TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D1	183812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	45783444	45783799	45783571	Y	TPT1,COG3	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	90794	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	46339630	46339901	46339775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	284993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	46696032	46696143	46696084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	71138	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	46709325	46709604	46709495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC63	74479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	6.25001885577115
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	47152736	47153076	47152881	Y	NA	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	27433	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	48636284	48636323	48636312	Y	NA	NUDT15,SUCLA2,MED4	NA	NA	NA	NA	SUCLA2	26159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	49563041	49563333	49563220	Y	RCBTB2,CYSLTR2,SETDB2,SETDB2,CDADC1,FNDC3A	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	14993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50534396	50534668	50534593	Y	NA	SPRYD7,TRIM13	NA	NA	NA	NA	SPRYD7	25770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	29452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13	NA	NA	NA	NA	TRIM13	34850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	50671086	50671325	50671206	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	16779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50696626	50696754	50696746	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU2	1102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	50704264	50704590	50704561	Y	NA	DLEU1,DLEU2	DLEU7,DLEU1,DLEU2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DLEU2	6408	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	540675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	53814883	53815070	53814977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	590039	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	53910959	53911050	53911005	Y	PCDH8	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	686115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	56150088	56150466	56150451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	2925244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	72359501	72359862	72359720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	79468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	72424218	72424283	72424251	Y	NA	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	15047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	72437849	72438027	72438023	Y	NA	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	1303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr13	72439142	72439615	72439332	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	72701161	72701484	72701277	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	261831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	78911933	78912082	78912037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF219	319232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	87776313	87776722	87776395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1404690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	97991476	97991911	97991864	Y	MBNL2	NA	NA	NA	NA	NA	RAP2A	92565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	99931812	99933023	99932107	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	65800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	99933643	99933940	99933792	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	67631	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	99956842	99956954	99956899	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	90830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	114512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	101163000	101163083	101163042	Y	NA	RPS26P47	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	27445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	104371816	104371919	104371873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC5	876622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	107186008	107186474	107186341	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	32038	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	110181276	110181465	110181371	Y	IRS2	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	255450	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	111212014	111212166	111212090	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	NA	COL4A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB20	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	111212967	111213224	111213111	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20	COL4A2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RAB20	887	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr13	113421890	113422034	113421962	Y	C13orf35	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	79247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	113870568	113870732	113870682	Y	MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	PCID2	9539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr13	113946276	113946648	113946334	Y	NA	LAMP1	LAMP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LAMP1	2908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	16054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.40542171309937
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	22080552	22080764	22080649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL2	77202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5,RP11-298I3.1	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	23611395	23611621	23611510	Y	SLC7A8	C14orf119,ACIN1,SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	39262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	23614733	23614770	23614752	Y	NA	SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	36113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	23643589	23643907	23643656	Y	NA	SLC7A8	NA	NA	NA	NA	SLC7A8	6976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	24016944	24017157	24017064	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	6059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,TGM1,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	24861663	24861718	24861669	Y	IPO4,RABGGTA,RABGGTA	KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	KHNYN	34774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	24934340	24934390	24934365	Y	NA	KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	24229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	25476676	25476861	25476696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P6	257681	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	27631441	27631502	27631472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOVA1	566481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	30318632	30318957	30318868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	340147	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	31055388	31055443	31055417	Y	NA	G2E3,SCFD1	NA	NA	NA	NA	G2E3	29059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	31559968	31560471	31560185	Y	SCFD1,GPR33,STRN3	NA	NA	NA	NA	NA	STRN3	66361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP5-AS1	128213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr14	34162040	34162301	34162172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	767261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	34339517	34339744	34339631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	589818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	34407262	34407567	34407424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	521995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	34409916	34410012	34409947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	519550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	35274619	35275001	35274810	Y	PPP2R3C,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73E17.2	66548	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	36235126	36235268	36235197	Y	NA	RALGAPA1	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	41242	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	37233433	37233885	37233827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAX9	108660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	37785804	37785829	37785809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIPOL1	120686	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	38057887	38058022	38057995	Y	FOXA1	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	5030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	6.92569656990857
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	39958924	39958943	39958934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	59220	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	44072704	44073040	44072872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1291458	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	44120052	44120074	44120065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1244424	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	45505148	45505421	45505276	Y	NA	KLHL28,PRPF39	NA	NA	NA	NA	KLHL28	4104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	49375724	49376075	49375898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	675222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	50016855	50017158	50017090	Y	NA	RN7SL1,RPS29,LRR1	NA	NA	NA	NA	RN7SL1	34139	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	50090977	50091033	50091007	Y	METTL21D,ARF6,RPS29,NEMF,KLHDC2,RPL36AL,MGAT2,KLHDC1,DNAAF2	RN7SL1,RPS29,LRR1,RPL36AL,MGAT2,DNAAF2	NA	NA	NA	NA	MGAT2	5488	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	50237132	50237443	50237218	Y	KLHDC2	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	4806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	50328432	50328642	50328440	Y	METTL21D,ARF6,RPL36AL,DNAAF2	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	10511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr14	50439731	50439867	50439806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	81921	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	NA	NA	NA	NA	NA	ARF6	109565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	50497743	50497949	50497828	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	C14orf182,SOS2,C14orf183,ARF6,METTL21D	IMR90	Hi-C	24141950	ARF6	139933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	51074312	51074388	51074350	Y	TRIM9,ATL1	MAP4K5	SAV1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP4K5	48468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	51203796	51203912	51203861	Y	ATL1	NA	NA	NA	NA	NA	SAV1	70747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	51830897	51831022	51831007	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	122796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	53257268	53257587	53257438	Y	NA	GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	GNPNAT1	882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	54758286	54758405	54758397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN3	103162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr14	54954614	54954684	54954648	Y	NA	GMFB,CGRRF1	NA	NA	NA	NA	GMFB	700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	55104908	55105113	55104939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGRRF1	130378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	55302493	55302656	55302575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCH1	64914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	56047594	56047945	56047904	Y	NA	KTN1,KTN1-AS1	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	2766	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	56274024	56274269	56274148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KTN1-AS1	229196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	56437208	56437549	56437278	Y	NA	NA	PELI2,LINC00520,RPL13AP3	IMR90	Hi-C	24141950	PELI2	144983	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	56733293	56733420	56733313	Y	PELI2	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	150761	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	57372112	57372414	57372261	Y	OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	361312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	58637905	58638297	58638125	Y	NA	UBA52P3,ACTR10	NA	NA	NA	NA	ACTR10	26501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	58705309	58705629	58705462	Y	ARID4A	ACTR10,PSMA3	NA	NA	NA	NA	PSMA3	3920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	58726838	58727438	58727133	Y	NA	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	PSMA3	17289	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	59001974	59002022	59001998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM9	109642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr14	59861080	59861273	59861260	Y	DAAM1,RTN1	NA	DAAM1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR135	68787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	60166051	60166469	60166339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	169215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	60189263	60189533	60189522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	146151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	60330001	60330562	60330397	Y	NA	RTN1	NA	NA	NA	NA	RTN1	5122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	60388442	60388458	60388449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN1	52758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr14	61188472	61188761	61188676	Y	PPM1A	SIX4,MNAT1	NA	NA	NA	NA	SIX4	305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	61822624	61823005	61822699	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	35088	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	150732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	61948602	61948733	61948613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	161066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	61978878	61979019	61978952	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	181212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	61993253	61993443	61993274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	166788	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	CHURC1	31613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65469693	65469823	65469758	Y	NA	RAB15	NA	NA	NA	NA	RAB15	32199	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65637410	65637773	65637587	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	69997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65710565	65711133	65711131	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	143152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	65722117	65722532	65722424	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FUT8	152778	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr14	66104549	66104610	66104580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	229239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	66394661	66394897	66394828	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	519351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	66516389	66516661	66516525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	455464	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr14	68408350	68408505	68408421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68409175	68409464	68409327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	124679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	68607037	68607479	68607161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	279434	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	68613334	68613955	68613742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	272958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68634149	68634509	68634347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	252404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr14	68658646	68658820	68658748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	228093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68850156	68850330	68850199	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	36583	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	68864511	68864831	68864664	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	22082	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	68961774	68962026	68961864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	74861	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	69171999	69172408	69172198	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2325P2.4	78837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	69241519	69241814	69241672	Y	NA	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	19376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr14	69247587	69247770	69247677	Y	DCAF5,ZFP36L1	ZFP36L1	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	13420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	69274132	69274272	69274201	Y	NA	ZFP36L1	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	12942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	69481669	69481898	69481808	Y	NA	ACTN1	ACTN1,DCAF5	IMR90	Hi-C	24141950	ACTN1	37512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr14	69824337	69824587	69824470	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	38145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	70081383	70081681	70081508	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	5070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	70099072	70099485	70099117	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	22759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	70105047	70105358	70105300	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	28734	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	70110235	70110559	70110279	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	33922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	70251545	70251918	70251732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	59928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	70464665	70464959	70464731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF5	273048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	71109519	71109752	71109636	Y	MED6,TTC9	MED6,CTD-2540L5.6,TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	3015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	71132254	71132379	71132336	Y	TTC9	CTD-2540L5.6,TTC9,RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	TTC9	25750	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr14	71158950	71159205	71159125	Y	NA	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	4210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	RP6-65G23.1	NA	NA	NA	NA	RP6-65G23.1	1119	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	72083404	72083762	72083537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	296873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	73391030	73391383	73391207	Y	NA	DPF3,RP1-146I3.1	NA	NA	NA	NA	DCAF4	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	73824884	73825148	73825019	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,NUMB	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	103200	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	73826978	73827275	73827127	Y	ZFYVE1,ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf43	NA	NA	NA	NA	NA	NUMB	101073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	74224542	74224784	74224663	Y	NA	PNMA1,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1021I20.1	27279	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	74741846	74742137	74741995	Y	FCF1	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	75592667	75593037	75593004	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	NEK9	620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	75638580	75638649	75638615	Y	NA	RP11-950C14.7,NEK9,TMED10	NA	NA	NA	NA	TMED10	2685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	75649674	75650038	75649826	Y	FOS	TMED10	TMED10,LOC731223,FOS,RPS6KL1,NEK9	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMED10	8340	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	75721756	75722023	75721798	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	TMED10,RPS6KL1,EIF2B2,NEK9,LOC731223,FOS,JDP2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-293M10.2	2091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	2790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	75765697	75765964	75765861	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	6590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	76015506	76015808	76015611	Y	BATF	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	27152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	76032638	76033032	76032887	Y	FOS,BATF,FLVCR2	BATF,FLVCR2,RP11-507E23.1	NA	NA	NA	NA	FLVCR2	9928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	76395057	76395394	76395222	Y	ESRRB,TGFB3	IFT43	NA	NA	NA	NA	IFT43	28578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	76444839	76444980	76444910	Y	ESRRB,TGFB3	TGFB3	NA	NA	NA	NA	TGFB3	2354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr14	76446236	76446389	76446309	Y	NA	TGFB3	NA	NA	NA	NA	TGFB3	945	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr14	76513976	76514095	76514005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	66642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	76564687	76564726	76564707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB3	117353	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	77431067	77431579	77431238	Y	NA	RP11-7F17.1	IRF2BPL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	1447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	77551854	77552174	77552096	Y	NA	TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63C	28737	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	TMEM63C	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM63C	26014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63C	59122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	78836271	78836672	78836374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	571845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.46284828495429
chr14	85398952	85399308	85399126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALC	3058701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	84032	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	89680457	89680908	89680785	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	75030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	89925437	89925732	89925559	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	169499	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	91020743	91021035	91020793	Y	CALM1	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	159897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	91393752	91394149	91393951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3035D6.2	101280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	91529481	91529737	91529617	Y	SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	4501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	91668719	91669035	91668930	Y	SMEK1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	143739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	91827435	91827790	91827659	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	54398	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	92297060	92297402	92297266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	207838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	95596986	95597082	95597060	Y	NA	DICER1	NA	NA	NA	NA	DICER1	25265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	95731733	95732288	95732036	Y	DICER1,CLMN	NA	NA	NA	NA	NA	CLMN	51955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr14	96012218	96012367	96012292	Y	GLRX5	RP11-1070N10.3,GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	SNHG10	13009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	96550045	96550377	96550264	Y	NA	C14orf132	NA	NA	NA	NA	C14orf132	46384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100045606	100045757	100045663	Y	CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	22606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100478682	100479045	100478865	Y	NA	NA	EVL	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	145455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100486645	100486967	100486738	Y	NA	NA	EVL,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	DEGS2	137533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100495518	100495795	100495680	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	128705	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	100899876	100900012	100899943	Y	WARS,WARS	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	58734	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102089844	102089938	102089891	Y	NA	NA	MEG8,LINC00523,MIR381,MIR376C,MIR654,MIR1185-1,MIR539,MIR376B,MIR495,MIR889,MIR1185-2,MIR300,MIR376A2,MIR376A1,MIR655,MIR487B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R5C	136197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102226478	102227031	102226824	Y	HSP90AA1	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.71622742775582
chr14	102415545	102415736	102415629	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	103299136	103299384	103299260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3	57323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	55407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	103929089	103929460	103929098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKB	57988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	104228992	104229118	104229080	Y	NA	XRCC3,ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	ZFYVE21	48925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.63176771348864
chr14	104601589	104601707	104601649	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	1353	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr14	105154013	105154712	105154273	Y	ADSSL1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	70	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	105294003	105294327	105294166	Y	NA	AKT1,RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	1181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	31538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	105330138	105330246	105330192	Y	NA	RPS26P49	NA	NA	NA	NA	RPS26P49	34630	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.61825114228251
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	20858746	20859095	20858885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	1972300	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	21914435	21914569	21914482	Y	OR4N4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	916826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	22897960	22898211	22898128	Y	CYFIP1,CYFIP1	CYFIP1	NIPA2	IMR90	Hi-C	24141950	CYFIP1	7955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	22927527	22927784	22927666	Y	CYFIP1	CYFIP1	NA	NA	NA	NA	CYFIP1	37522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	23041896	23042224	23042060	Y	NA	NIPA2	NA	NA	NA	NA	NIPA2	9469	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	25209245	25209272	25209252	Y	NA	SNURF,SNHG14	NA	NA	NA	NA	SNURF	11064	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	25555752	25555966	25555813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	126162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	25564293	25564526	25564383	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	117602	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	UBE3A	645321	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	27014024	27014086	27014055	Y	GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1331896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	30240816	30241083	30240944	Y	NA	TJP1	TJP1	IMR90	Hi-C	24141950	TJP1	17985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	32140399	32140767	32140585	Y	NA	OTUD7A	NA	NA	NA	NA	OTUD7A	20225	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1P1	94654	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	37249666	37249815	37249741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-128A17.1	139725	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	38546643	38547172	38546943	Y	NA	SPRED1	NA	NA	NA	NA	SPRED1	4116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-624L4.1	355219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	39474254	39474447	39474377	Y	THBS1	NA	C15orf53,THBS1,FSIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-624L4.1	242949	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	39561378	39561942	39561743	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-624L4.1	155454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	39866856	39867109	39867069	Y	FSIP1	THBS1	THBS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	THBS1	4171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	40164744	40164978	40164948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF2AK4	59369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	41138213	41138409	41138269	Y	RHOV,SPINT1,SPINT1	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	3997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	41158071	41158384	41158228	Y	RHOV	SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	RHOV	6103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	41254301	41254691	41254494	Y	NA	DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	11141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	41788010	41788393	41788374	Y	NA	ITPKA,RPAP1	NA	NA	NA	NA	ITPKA	4419	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3,MGA	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	42221521	42221787	42221671	Y	MGA	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	40989	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	42349424	42349982	42349743	Y	MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23	NA	PLA2G4E	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	86648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	42535686	42535733	42535710	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	27698	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	42814906	42815063	42814960	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	NA	NA	NA	NA	LRRC57	23937	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	43135579	43135976	43135778	Y	TGM7	NA	NA	NA	NA	NA	TTBK2	75031	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,RPS3AP47,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr15	44289112	44289501	44289307	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	8730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	44837233	44837387	44837300	Y	CTDSPL2,PATL2	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	9978	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	44838663	44839045	44838853	Y	NA	EIF3J-AS1,EIF3J	NA	NA	NA	NA	EIF3J	11408	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	44901910	44902120	44902015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPG11	51756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr15	45340934	45341315	45341066	Y	SPG11,B2M,SPATA5L1	SORD	NA	NA	NA	NA	SORD	27632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	46758762	46759114	46758953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQRDL	837416	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	47821798	47822190	47821994	Y	SEMA6D	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	198942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	50140337	50140734	50140509	Y	FGF7,DTWD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647E9.1	55894	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	50551577	50551761	50551665	Y	ATP8B4,GABPB1,SLC27A2,HDC	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	79184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	50633863	50634132	50634006	Y	ATP8B4,HDC,USP8,GABPB1	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	11393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	51535974	51536234	51536151	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	337105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	52122599	52122915	52122757	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	2774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	52349753	52350120	52349937	Y	NA	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	35372	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	52580530	52580869	52580787	Y	ARPP19,MYO5C	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	5126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5C	98592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	56717939	56718122	56718071	Y	RFX7,ZNF280D,MNS1,TEX9	MNS1	NA	NA	NA	NA	MNS1	37213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	57798359	57798473	57798399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	83758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr15	58797096	58797251	58797174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	242926	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	59467791	59468085	59467937	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	72514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	59687013	59687166	59687070	Y	NA	FAM81A,MYO1E,RP11-356M20.1	MYO1E,LDHAL6B,FAM81A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356M20.1	11187	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	60835043	60835413	60835301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	65666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	60860287	60860764	60860653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	90910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	60861865	60862603	60862448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	92488	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	61051185	61051571	61051320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	281808	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	61191372	61191904	61191714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	421995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-219B17.1	495550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	61329284	61329972	61329593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	559907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	61501689	61502023	61501856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	503347	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	61520020	61520614	61520340	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	484756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	61947141	61947301	61947208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	58069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	62042724	62043095	62042895	Y	NA	RP11-507B12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-507B12.1	37354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	62207321	62207567	62207441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	143105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	62405210	62405473	62405223	Y	NA	C2CD4A	NA	NA	NA	NA	C2CD4A	48034	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	62896766	62896914	62896838	Y	NA	NA	TLN2	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	216041	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	63372629	63373133	63372992	Y	NA	TPM1,RP11-244F12.3,LACTB	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.3	33043	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	63602976	63602991	63602984	Y	NA	APH1B	NA	NA	NA	NA	APH1B	36759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	63782902	63783064	63782983	Y	HERC1,LACTB,RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,LOC100130855,FBXL22	IMR90	Hi-C	24141950	USP3	11729	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	63803463	63803731	63803481	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	8670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	64540216	64540468	64540344	Y	HERC1,ZNF609	NA	NA	NA	NA	NA	PPIB	86812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	64754012	64754177	64754162	Y	NA	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	3071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	72252	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr15	65596266	65596532	65596409	Y	NA	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	65596702	65597188	65596889	Y	DENND4A	RNU5A-1,PARP16	PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARP16	5746	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	65713781	65714189	65713985	Y	IGDCC3,IGDCC4	NA	NA	NA	NA	NA	DPP8	93853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	66177095	66177419	66177152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	94464	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	79620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	RPS24P16	NA	NA	NA	NA	RPS24P16	32338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	67926783	67927143	67926830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	93736	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	69063538	69063566	69063553	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	SPESP1	44994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1,RP11-279F6.1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	69916364	69916890	69916682	Y	TLE3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-279F6.1	162999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	70289516	70289879	70289625	Y	NA	NA	LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	98636	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	71344757	71344812	71344802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	161633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	71363973	71364162	71364068	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90	Hi-C	24141950	THAP10	180849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	71406673	71406868	71406715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	223549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	71571390	71571701	71571551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	71571969	71572363	71572175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	388845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	474411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	72003894	72004173	72003980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	400426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	72124774	72125030	72124885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	279569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	72448533	72448632	72448574	Y	TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A,GRAMD2	NA	NA	NA	NA	GRAMD2	39494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	73435699	73435965	73435801	Y	NEO1,HCN4	NA	NA	NA	NA	NA	NEO1	93648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	74899091	74899429	74899332	Y	PPCDC,CLK3,CLK3	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	10250	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1,CYP1A2	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	75160479	75160721	75160578	Y	NA	CPLX3,ULK3,SCAMP2,MPI	NA	NA	NA	NA	SCAMP2	2985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	75867013	75867354	75867182	Y	C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	2276	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	RPL21P116	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPL21P116	1171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	79381600	79382164	79381699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSH	141684	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	79767814	79767956	79767881	Y	BCL2A1	NA	NA	NA	NA	NA	TMED3	166410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	80192489	80192729	80192669	Y	ZFAND6,ST20,BCL2A1,MTHFS,MTHFS,ST20-MTHFS	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	MTHFS	4768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	80211933	80212232	80212185	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	80453068	80453275	80453180	Y	BCL2A1,ZFAND6	FAH	NA	NA	NA	NA	FAH	10236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	81291796	81292315	81292076	Y	NA	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	81596403	81597133	81596761	Y	MESDC1,STARD5	STARD5,RP11-761I4.3	NA	NA	NA	NA	STARD5	17391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	83879617	83879962	83879641	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	4847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF592	168420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	86192682	86192944	86192801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	143317	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	87244660	87245052	87244738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	873108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr15	88801535	88801887	88801766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL46	206763	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	89672226	89672631	89672291	Y	ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	5095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG,LINC00925	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	89923171	89923194	89923182	Y	NA	POLG,LINC00925	NA	NA	NA	NA	LINC00925	20361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	90578178	90578635	90578479	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	35554	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	90944087	90944636	90944284	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	14637	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	93131436	93131762	93131609	Y	RGMA,C15orf32,FAM174B	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	121215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	93180228	93180540	93180295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN1P38	72437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	93573195	93573591	93573395	Y	RGMA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	148669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	94868456	94868585	94868521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	1443930	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F2	1478467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	21858	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	96895727	96895870	96895799	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	27137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	27642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	31597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	31918	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99395486	99396002	99395689	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	205286	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99403545	99404056	99403701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	213345	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	99408611	99408985	99408683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	218411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	99409255	99409515	99409377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	219055	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr15	99410702	99410893	99410822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	220502	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	99823818	99824190	99823994	Y	MEF2A,MEF2A	TTC23,LRRC28,HSP90B2P	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	27981	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr16	151121	151408	151265	Y	NA	POLR3K,RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	26115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	651803	652154	651979	Y	NA	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	14446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	ZG16B	7591	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	2924940	2925188	2925019	Y	NA	ZG16B,PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,FLYWCH1,PRSS41,PRSS33,TCEB2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21,FLYWCH2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FLYWCH2	5999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr16	3060017	3060177	3060084	Y	NAT15,PRSS22,CCDC64B,THOC6,CLDN9	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	6269	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	3156056	3156304	3156227	Y	PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	4257	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr16	3207486	3207903	3207712	Y	SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	29708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	3345455	3345619	3345522	Y	OR1F1,SLX4,CLUAP1,C16orf90,OR2C1	ZNF263,ZNF75A,TIGD7	NA	NA	NA	NA	ZNF75A	7787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	4464344	4465352	4464553	Y	NUDT16L1,CORO7	VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	CORO7	8354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr16	4900331	4900638	4900507	Y	MGRN1,UBN1,UBN1	ROGDI,UBN1,GLYR1	NA	NA	NA	NA	GLYR1	4988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	SEC14L5,PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEC14L5	12588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	6415499	6415992	6415721	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1269690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	7473619	7473766	7473686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1239774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	8041589	8041898	8041750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	671642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	8163053	8163492	8163342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	550048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	9147014	9147397	9147240	Y	ABAT	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	36108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	9208363	9208890	9208559	Y	NA	C16orf72	NA	NA	NA	NA	C16orf72	24858	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	10672618	10672930	10672712	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	63	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	10688488	10688836	10688661	Y	NA	EMP2	EMP2,TEKT5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP2	15933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	10710369	10710537	10710438	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	37814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	10746944	10747196	10747087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	74389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	11058771	11058999	11058871	Y	CIITA,SOCS1,CLEC16A	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	CLEC16A	22426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	11397402	11397565	11397484	Y	NA	SOCS1	CLEC16A,TNP2,RMI2,ZC3H7A,BCAR4,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS1	49366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	11662178	11662507	11662365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	65730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	11677764	11678427	11678146	Y	SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	LITAF	NA	NA	NA	NA	LITAF	49810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	11955170	11955449	11955310	Y	NA	RSL1D1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	11728	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	13158639	13159033	13158826	Y	SHISA9	NA	NA	NA	NA	NA	SHISA9	165162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	14326449	14326637	14326520	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	163271	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	14395683	14396371	14395873	Y	MKL2	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	232505	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	14599774	14599935	14599866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	124650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr16	16097959	16098303	16098187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	56525	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	16115976	16116215	16116101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	74542	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	17270464	17270719	17270563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOMO3	946112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	19103583	19103758	19103655	Y	NA	COQ7,ITPRIPL2	NA	NA	NA	NA	ITPRIPL2	19496	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	19302824	19302976	19302897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT17	125531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	19710173	19710469	19710241	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	15309	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	20729381	20729771	20729568	Y	LYRM1,DCUN1D3	THUMPD1	NA	NA	NA	NA	THUMPD1	21635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	21661880	21662110	21662071	Y	CRYM,METTL9,IGSF6	NA	NA	NA	NA	NA	METTL9	55341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	22421466	22421891	22421890	Y	NA	CDR2,RRN3P3	NA	NA	NA	NA	CDR2	24595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	23419986	23420351	23420270	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	42150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	23473263	23473545	23473445	Y	SCNN1G,GGA2	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	10762	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	24863023	24863279	24863154	Y	NA	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	124007	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	27247570	27247639	27247606	Y	IL4R,IL21R,JMJD5,JMJD5	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	30476	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	28108728	28108802	28108745	Y	APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	112439	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	28169506	28169747	28169662	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	51494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	28176884	28177249	28177153	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	43992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	28871082	28871475	28871117	Y	NA	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	SH2B1	15161	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF688	2212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	7.26353542697728
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	31139989	31140736	31140371	Y	ARMC5,PRR14,FBRS,PHKG2,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8,FUS	NA	NA	NA	NA	PRSS8	4347	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	31223480	31223547	31223514	Y	ZNF629	FUS,PYCARD	NA	NA	NA	NA	PYCARD	10709	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	33952235	33952334	33952272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	33959236	33959284	33959270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2076157	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	47669133	47669265	47669199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFG1	173073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	47765433	47765682	47765558	Y	NA	NA	ITFG1,ABCC12,NETO2,ABCC11,DNAJA2,PHKB	IMR90	Hi-C	24141950	ITFG1	269373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	47999365	47999586	47999511	Y	NA	NA	ITFG1,NETO2,ABCC12	IMR90	Hi-C	24141950	LONP2	276621	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	49893175	49893278	49893262	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	204574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	50554457	50554868	50554623	Y	BRD7,NKD1	NKD1	NKD1	IMR90	Hi-C	24141950	NKD1	25373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	53075249	53075847	53075790	Y	NA	CHD9	CHD9	IMR90	Hi-C	24141950	CHD9	11098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	53134908	53135206	53135001	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	47963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	53810167	53810347	53810243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTO	74292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	54114585	54114959	54114772	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	203716	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr16	54128589	54128847	54128718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX3	189828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	54961070	54961275	54961203	Y	NA	IRX5,CTD-3032H12.1	NA	NA	NA	NA	CRNDE	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.12500942788558
chr16	55470362	55470729	55470665	Y	NA	NA	SLC6A2,CES1P1	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT2	70181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	55471492	55471915	55471743	Y	NA	NA	SLC6A2,CES1P1	IMR90	Hi-C	24141950	LPCAT2	68995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	56406318	56406482	56406386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	50968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1E,MT1A,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	57422451	57422745	57422598	Y	CCL17	CCL22	NA	NA	NA	NA	CCL22	31767	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	57428268	57428658	57428438	Y	GPR56	CCL22	NA	NA	NA	NA	CCL22	37584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	57655846	57656393	57655974	Y	FAM192A,COQ9,CIAPIN1,GPR56	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC135	70312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	57682541	57682687	57682607	Y	GPR114,C16orf80	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	44018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	58160772	58161211	58161024	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	58445622	58445902	58445848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD6	101481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	65346122	65346220	65346171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	1094207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	65378012	65378388	65378200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	1062039	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	65978164	65978247	65978206	Y	NA	NA	C5orf56	MCF7	ChIA-PET	19890323	LINC00920	462180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	66988106	66988414	66988274	Y	NA	FAM96B,CES2,CES3,CES4A	NA	NA	NA	NA	CES3	4726	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	67278264	67278626	67278472	Y	RRAD,C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,ACD,LRRC29,LRRC29,PLEKHG4,FHOD1	ELMO3,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1,PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	FHOD1	935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr16	67278684	67278969	67278832	Y	C16orf70,FAM65A,ATP6V0D1,LRRC29,LRRC29,FHOD1	ELMO3,LRRC29,TMEM208,SLC9A5,FHOD1,PLEKHG4	NA	NA	NA	NA	FHOD1	592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr16	67689330	67689673	67689514	Y	NA	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	3040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.0405497136184
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	68451680	68452082	68451889	Y	PSMB10,DPEP2,NFATC3,SLC7A6,SLC7A6OS,ZFP90,TMCO7	SMPD3	NA	NA	NA	NA	SMPD3	28509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	68779434	68779559	68779497	Y	NA	CDH1	NA	NA	NA	NA	CDH1	10306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	69506405	69506529	69506498	Y	NA	CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	49977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	69603393	69603628	69603450	Y	NA	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	6396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr16	70779915	70780216	70780046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52848	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	70973998	70974194	70974080	Y	VAC14	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	140934	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	72912475	72912642	72912542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	178955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr16	74353064	74353398	74353241	Y	FA2H	PSMD7,RP11-252A24.2	NA	NA	NA	NA	PSMD7	24391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	75283958	75284369	75284078	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	15582	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	80769912	80770006	80769968	Y	DYNLRB2,C16orf46	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	66220	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	81434776	81434850	81434813	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	41925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	81436864	81437191	81437044	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	39584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	182643	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	81701284	81701528	81701406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	224509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	83766101	83766468	83766285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	72980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	83835897	83836084	83835978	Y	NA	HSBP1	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	3364	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	83988181	83988500	83988282	Y	NA	OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	8294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	84130238	84130438	84130330	Y	NA	MBTPS1,HSDL1	NA	NA	NA	NA	MBTPS1	18073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	84548498	84548894	84548797	Y	COTL1	NA	NA	NA	NA	NA	COTL1	100789	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	85387544	85387685	85387655	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	328169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85405119	85405354	85405237	Y	NA	NA	KIAA0513,FAM92B,LINC00311,LOC727710,KIAA0182	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	316325	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85418434	85418651	85418593	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	303028	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr16	85450092	85450367	85450166	Y	NA	NA	LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	271312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	85456219	85456617	85456516	Y	FAM92B	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710,C16orf74	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	265062	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr16	85601000	85601159	85601100	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85763697	85763906	85763854	Y	IRF8	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	18829	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	86587305	86587716	86587504	Y	NA	MTHFSD	NA	NA	NA	NA	MTHFSD	464	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	86890972	86891338	86891155	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	304131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	87823236	87823449	87823367	Y	FBXO31,CA5A	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87823592	87823837	87823720	Y	NA	KLHDC4	JPH3,KLHDC4,ZCCHC14,SLC7A5,CA5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	25994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87889826	87890140	87890011	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	10954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87980577	87980839	87980700	Y	NA	BANP	CA5A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	11	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	87997747	87997931	87997804	Y	BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	16897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	88082514	88082829	88082672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	101664	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	88557943	88558427	88558193	Y	FAM38A,CBFA2T3,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	40218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr16	89424659	89424716	89424712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	130253	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89579992	89580270	89580045	Y	ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7	ANKRD11,SPG7,RPL13	NA	NA	NA	NA	SPG7	24667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr16	90087429	90087721	90087595	Y	TUBB3,DBNDD1,PRDM7	GAS8,DBNDD1	NA	NA	NA	NA	DBNDD1	2893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	990722	991295	990801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	92365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr17	1863470	1863779	1863610	Y	SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	62860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	1926930	1927151	1927006	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2	NA	NA	NA	NA	OVCA2	9740	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	2026015	2026378	2026080	Y	SERPINF2,SERPINF2	NA	NA	NA	NA	NA	OVCA2	82688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr17	2612424	2612524	2612493	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	117920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr17	4430442	4430571	4430507	Y	ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,C17orf107,ARRB2	SPNS2,MYBBP1A,GGT6	NA	NA	NA	NA	MYBBP1A	26355	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	4552128	4552263	4552196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PELP1	53369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	4704497	4704876	4704590	Y	ZNF232,KIF1C	VMO1,PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	PLD2	3515	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	4811647	4812042	4811731	Y	NA	RNF167,SLC25A11,PFN1	NA	NA	NA	NA	RNF167	29261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12P2	59807	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	6842907	6843154	6843090	Y	NA	NA	ALOX12,LOC100506713	K562	ChIA-PET	22265404	AC027763.2	70514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	MIR497HG	4174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	7607455	7607852	7607490	Y	NA	WRAP53,TP53,EFNB3	NA	NA	NA	NA	EFNB3	935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.13852599909171
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	8407322	8407642	8407416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-713H12.1	54906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	12928606	12928939	12928835	Y	MYOCD	ELAC2	ELAC2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ELAC2	9102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.23650228456502
chr17	13445928	13446299	13446210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	524513	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	13835210	13835376	13835282	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	COX10-AS1	135436	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	14650142	14650419	14650281	Y	HS3ST3B1	RPS18P12	HS3ST3B1,HS3ST3A1,COX10	IMR90	Hi-C	24141950	RPS18P12	43291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	16035892	16036125	16036009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGL	82380	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	16440164	16440317	16440266	Y	ZNF624,CCDC144A	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	30203	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	17054009	17054176	17054093	Y	ZNF624,PEMT,COPS3,FLCN	NA	NA	NA	NA	NA	PLD6	53453	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	17348587	17348892	17348689	Y	NA	MED9,RASD1	MED9,PEMT	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MED9	29408	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	17470517	17470759	17470631	Y	LRRC48	PEMT	RASD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PEMT	22263	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	17677876	17678068	17678030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	60257	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	17874756	17875050	17874778	Y	NA	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	LRRC48	629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	18032331	18032623	18032472	Y	TOM1L2,MYO15A	DRG2	NA	NA	NA	NA	DRG2	43131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	18153652	18153819	18153756	Y	NA	LLGL1,FLII	NA	NA	NA	NA	FLII	6411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	18204448	18204705	18204595	Y	LRRC48,C17orf39,SMCR8,TOP3A	FLII,TOP3A,SMCR8	NA	NA	NA	NA	TOP3A	11616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	18825562	18825708	18825647	Y	FAM83G,TRIM16L	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83G	80409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3A	52233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	20688064	20688832	20688343	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	2106	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	25568498	25568933	25568830	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	50169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	25676124	25676302	25676192	Y	LGALS9,WSB1	NA	KSR1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	57022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	26216019	26216352	26216295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	150411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27072804	27073286	27072989	Y	TRAF4	PROCA1,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	3802	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27255195	27255444	27255376	Y	PHF12,NUFIP2,UNC119,SDF2,PROCA1,NEK8,FLOT2	FLOT2,DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	21345	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27264479	27264617	27264556	Y	UNC119,SDF2,FLOT2,TIAF1,TAOK1,NUFIP2,PHF12	FLOT2,DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	12172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27273335	27273648	27273499	Y	PHF12	DHRS13,PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	3141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	27387642	27387771	27387728	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	PHF12	110853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	27824938	27824945	27824941	Y	TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I13	66125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	119610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	29599453	29600092	29599789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	116550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	29886835	29887094	29886884	Y	EVI2A	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	170193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP4	171280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	29923737	29923924	29923895	Y	EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	207095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	30170148	30170249	30170215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP6	56535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	30253386	30253637	30253512	Y	NA	UTP6,SUZ12	SUZ12	K562	ChIA-PET	22265404	SUZ12	8400	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	30907001	30907345	30907172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	95364	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	30923806	30924081	30923942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	112169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	33373543	33373969	33373834	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	40369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	33383216	33383365	33383329	Y	SLFN5,RFFL	RFFL	NA	NA	NA	NA	RFFL	30973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	33407531	33407770	33407731	Y	NA	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	6568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	33414530	33415581	33415167	Y	SLFN5,ZNF830,RFFL	RFFL,RAD51D	NA	NA	NA	NA	RFFL	192	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12,SLFN13	NA	NA	NA	NA	SLFN13	13552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	34948982	34949076	34949029	Y	DHRS11	DHRS11,MRM1	NA	NA	NA	NA	DHRS11	2754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	35236064	35236105	35236085	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-445F12.1	55855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	35296825	35297078	35296886	Y	LHX1	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	4865	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	36717036	36717303	36717215	Y	SOCS7,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	42880	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	SRCIN1	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	SRCIN1	11773	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	37831191	37831499	37831297	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	10668	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr17	37832582	37832871	37832624	Y	NA	STARD3,ERBB2,PGAP3	NA	NA	NA	NA	ERBB2	9296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	37862068	37862252	37862166	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2	ERBB2,PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	PGAP3	11018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.95608999935122
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	39066622	39066986	39066860	Y	IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5	KRT23	NA	NA	NA	NA	KRT23	24900	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	39692337	39692600	39692431	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT15,KRT19	KRT15,KRT19,KRT13,KRT36	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19	9777	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	39695431	39695775	39695718	Y	NA	KRT15,KRT19	KRT19	K562	ChIA-PET	22265404	KRT19	12871	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	40539110	40539537	40539349	Y	NA	STAT3	NA	NA	NA	NA	STAT3	524	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	40748943	40749226	40749085	Y	STAT5B,STAT3,STAT3	COASY,MLX,PSMC3IP,TUBG1,FAM134C	NA	NA	NA	NA	TUBG1	10468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH8	55222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B	NA	NA	NA	NA	DBF4B	14005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	43230123	43230516	43230320	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	5551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	45021726	45021957	45021796	Y	NA	GOSR2	NA	NA	NA	NA	GOSR2	23243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	NA	NA	NA	NA	NA	KPNB1	53430	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	45814083	45814467	45814294	Y	NA	NA	OSBPL7,MRPL10,SCRN2,LRRC46	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL7	82733	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2	NA	NA	NA	NA	HOXB2	22350	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	47017432	47017466	47017449	Y	NA	ATP5G1,UBE2Z,SNF8,RNU1-42P	NA	NA	NA	NA	SNF8	3013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	48066634	48067004	48066930	Y	NA	DLX4,DLX3	NA	NA	NA	NA	DLX3	3584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	48205107	48205461	48205260	Y	SAMD14	PDK2,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	SAMD14	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr17	48338432	48338651	48338443	Y	EPN3	TMEM92	LOC284080,ITGA3,PDK2,SAMD14,PPP1R9B,COL1A1,HILS1,SGCA,TMEM92	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM92	8116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.46284828495429
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	48726648	48726741	48726695	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	16510	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1,RP11-700H6.1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-700H6.1	38190	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	RP11-700H6.1	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	22709	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	49008376	49008926	49008868	Y	NA	RP11-700H6.1	WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-700H6.1	11148	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	49027288	49027482	49027366	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	7214	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	RP11-700H6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	8014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	49075036	49075414	49075227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-700H6.1	54962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	49983117	49983475	49983437	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	647228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	55434822	55435211	55435067	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	103610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	55523126	55523573	55523446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	191914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	55763716	55764071	55763861	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	161346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	56311784	56312133	56311958	Y	NA	MKS1	MKS1	K562	ChIA-PET	22265404	MKS1	16818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	56468859	56469318	56469005	Y	RNF43	SUPT4H1,RNF43	NA	NA	NA	NA	RNF43	23638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	56701235	56701661	56701522	Y	OR4D1,BZRAP1	RNU1-60P,RNU1-108P	NA	NA	NA	NA	RNU1-60P	33005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57231102	57231481	57231293	Y	C17orf71	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	242	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57787983	57788139	57788057	Y	DHX40,CA4,VMP1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	4996	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57902814	57903248	57902913	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	13379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	58804933	58805128	58805031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAS3	52119	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	59391895	59392060	59391978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	274503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	59434096	59434461	59434196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	232102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	178035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	59784149	59784411	59784258	Y	BRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	117586	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	60085676	60086036	60086030	Y	NACA2,MED13	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	54607	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	60557252	60557333	60557299	Y	NA	RP11-464D20.2	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	34795	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	188296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-464D20.2	450993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	21.7906062809319
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	62487438	62487665	62487534	Y	ICAM2	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	3489	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	62744260	62744559	62744528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1P	86713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	63019276	63019534	63019390	Y	RGS9,GNA13	AMZ2P1,GNA13	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	31423	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	63624560	63624814	63624604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	561388	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	545803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	64918437	64918756	64918597	Y	NA	CACNG4	HELZ,PRKCA,CACNG4,CACNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CACNG4	40270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	64947420	64948018	64947947	Y	NA	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	11008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr17	64948296	64948612	64948339	Y	CACNG4	CACNG4	CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNG4	10414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	64962057	64962755	64962345	Y	NA	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	3031	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	65437128	65437554	65437154	Y	HELZ,PITPNC1,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	65553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	65611157	65611527	65611357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOL11	100422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	65990543	65990874	65990748	Y	AMZ2,BPTF,C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	2778	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	27.6183265653671
chr17	65991434	65991739	65991543	Y	C17orf58	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	3669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	65991969	65992126	65992052	Y	NA	C17orf58,KPNA2	NA	NA	NA	NA	C17orf58	4204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr17	66016382	66016768	66016696	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	12867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	66308597	66309089	66308898	Y	BPTF,PRKAR1A,PRKAR1A,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	23189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	66314385	66314893	66314731	Y	BPTF,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	28977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	66315636	66315845	66315767	Y	BPTF,SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	30228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	66374219	66374806	66374507	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76848	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	66380161	66380700	66380381	Y	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	WIPI1	70954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	66421215	66421317	66421250	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	30337	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr17	72775758	72775904	72775844	Y	CD300A,CD300LB,CD300C,CD300LF	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	5136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	72837172	72837380	72837244	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	29776	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr17	72989354	72989561	72989458	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	7627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.61825114228251
chr17	73007918	73008254	73008160	Y	RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	1153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.57434114163373
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	73032786	73033119	73032977	Y	TSEN54,GGA3	ICT1,KCTD2,ATP5H,SLC16A5	NA	NA	NA	NA	KCTD2	6116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73073656	73074040	73073685	Y	RAB37,RAB37,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	7782	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr17	73087456	73087829	73087515	Y	NA	ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	5634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73091198	73091317	73091257	Y	TSEN54,LLGL2	SLC16A5,ARMC7,NT5C	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	9376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73167917	73168048	73167983	Y	NA	NT5C,HN1,SUMO2,NUP85	HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HN1	5541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73319762	73319905	73319788	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	6352	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	73337527	73337917	73337722	Y	NA	AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	24117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73641652	73641951	73641723	Y	CASKIN2,LLGL2,FOXJ1,EVPL,LOC100130933	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	SAP30BP	19245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74237406	74237676	74237541	Y	NA	ATF4P3	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	16519	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74248222	74248574	74248373	Y	ST6GALNAC2,RHBDF2,RHBDF2,JMJD6,H3F3B,UNC13D,WBP2,ACOX1,SPHK1,FAM100B	ATF4P3	RNF157	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF4P3	27335	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	43539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74415585	74415933	74415760	Y	MFSD11,RNF157	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	31355	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	74444372	74444742	74444506	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	2546	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	74954315	74954497	74954426	Y	AANAT,MGAT5B	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	126301	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75096190	75096538	75096428	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	15392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75233775	75234023	75233900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	152977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75278845	75279720	75279369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	198047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	231793	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	75359988	75360125	75360083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	279190	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75461366	75461740	75461543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	380568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	19.9324925670539
chr17	76111171	76111634	76111306	Y	TNRC6C,TMEM235	TMC6	NA	NA	NA	NA	TMC6	14854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	76346001	76346457	76346186	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	7701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr17	76377337	76378350	76377903	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	4616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76384421	76384943	76384751	Y	USP36,CYTH1,TMC6,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	11700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76775899	76776536	76776049	Y	USP36,ENGASE,CYTH1	NA	NA	NA	NA	NA	CYTH1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	76992140	76992468	76992317	Y	NA	LGALS3BP,CANT1	NA	NA	NA	NA	CANT1	11481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77178893	77179196	77179046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENGASE	109872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77481345	77481685	77481515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX2	268246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77730841	77731207	77731024	Y	CBX8,CBX2	CBX2,CBX8	NA	NA	NA	NA	CBX2	18724	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77788517	77788922	77788877	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	15035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	77965696	77966573	77966281	Y	CBX2,CBX8,CBX4,CCDC40	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	41074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	78098181	78098723	78098426	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	20259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	78289864	78290143	78290056	Y	NPTX1	NA	LOC100294362,ENDOV	IMR90	Hi-C	24141950	RNF213	57199	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr17	79011145	79011369	79011293	Y	BAIAP2	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	4197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79046413	79046604	79046526	Y	NA	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	39465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	15311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	16851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	LINC00482,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	57934	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	60271	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	67100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	68280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79399158	79399431	79399295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	79789691	79790066	79789800	Y	NA	FAM195B,P4HB,ARHGDIA	NA	NA	NA	NA	FAM195B	513	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	79886802	79887109	79886903	Y	NA	ANAPC11,ALYREF,PCYT2,SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	NA	NA	NA	NA	MAFG-AS1	3097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80029941	80030069	80030002	Y	HEXDC	STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	DUS1L	8178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr17	80060759	80061000	80060880	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	6551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CCDC57	20044	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	80239829	80239997	80239937	Y	NA	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	10222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	26191	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80292742	80293207	80293087	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	SECTM1,TEX19	NA	NA	NA	NA	SECTM1	2792	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr17	80342594	80342740	80342634	Y	NA	TEX19,HEXDC	NA	NA	NA	NA	TEX19	27471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr17	80494129	80494268	80494139	Y	NA	FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	18540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80712796	80713169	80712899	Y	ZNF750,TBCD	FN3KRP,FN3K,TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	4856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80832515	80832930	80832613	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36061	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr17	80833209	80833609	80833394	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36755	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.81420371322913
chr17	80834043	80834346	80834307	Y	ZNF750	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	37589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr17	80834580	80834819	80834710	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	38126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	679559	679568	679564	Y	NA	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	23219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	3509218	3509430	3509419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99612	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	4368151	4368526	4368370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	958545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	9219810	9220134	9219877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	85584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	9375216	9375438	9375327	Y	NA	TWSG1	NA	NA	NA	NA	TWSG1	42451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	9612296	9612535	9612373	Y	NA	PPP4R1	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	703	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	10458574	10458933	10458647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	64969	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	10708268	10708433	10708298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	184366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	10852460	10852708	10852534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	328558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr18	11108988	11109042	11109015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	585086	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	11431991	11432229	11432112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	417166	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	AFG3L2	NA	NA	NA	NA	AFG3L2	44069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	12777545	12777688	12777651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	76769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr18	13418060	13418088	13418062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	306571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	13501125	13501479	13501273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr18	13539098	13539457	13539245	Y	RNMT,C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	185202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	13542199	13542509	13542255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	182150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	10.6419239976644
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr18	18942831	18943125	18942978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREB1L	122628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	19279600	19279639	19279620	Y	NA	ABHD3,MIB1	NA	NA	NA	NA	ABHD3	3127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	20035500	20035848	20035676	Y	NA	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	288096	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	20138967	20139156	20139093	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	237068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	20247997	20248388	20248215	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	127836	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	20835223	20835287	20835255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CABLES1	122695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	20913960	20914007	20913982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM241	101918	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	23624852	23624978	23624915	Y	NA	SS18	NA	NA	NA	NA	SS18	44203	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	29897352	29897676	29897515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	227534	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	29952485	29952862	29952679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138	282667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	32106446	32106756	32106602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	448136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	32300943	32301117	32301030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	253775	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	32399644	32399985	32399810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	154907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	32925283	32925658	32925513	Y	MAPRE2,MAPRE2,MAPRE2,ZNF397,ZNF24	ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	1837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr18	33275532	33275916	33275719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	116451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	33389735	33389972	33389879	Y	ZNF24,ZNF396,INO80C	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf21	160074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	33577061	33577192	33577127	Y	NA	C18orf21	NA	NA	NA	NA	C18orf21	27015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	33878609	33878753	33878681	Y	FHOD3	NA	NA	NA	NA	NA	MOCOS	113127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	34813677	34814006	34813844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	406519	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	36850987	36851328	36851158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	62311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	37033966	37034182	37034037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	120327	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	37101421	37101610	37101545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	187782	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	38655284	38655543	38655423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	877628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	39755452	39755827	39755639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	222281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	39840158	39840520	39840205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	306987	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	42262294	42262512	42262376	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	4156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	42305633	42305950	42305768	Y	SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	47495	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	43210324	43210708	43210352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	334532	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	43542357	43542726	43542619	Y	PSTPIP2,C18orf25,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	2514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	43830546	43830877	43830624	Y	EPG5,PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF165	73895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	44931810	44931838	44931816	Y	TCEB3B	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	231065	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	45353824	45354074	45353943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	101441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	46204089	46204193	46204141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	140672	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	46461141	46461770	46461393	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	13311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	46465508	46465942	46465798	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	9139	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr18	46946352	46946456	46946404	Y	NA	DYM	NA	NA	NA	NA	DYM	39261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPG	240217	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPG	272128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	171361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	47626417	47626670	47626561	Y	MYO5B,MBD1,MBD1	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	92793	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr18	47688363	47688450	47688407	Y	NA	MYO5B	NA	NA	NA	NA	MYO5B	31013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	47839738	47839893	47839823	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC1	27064	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	48541861	48541894	48541878	Y	NA	ELAC1,SMAD4	NA	NA	NA	NA	SMAD4	49451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	51699489	51699550	51699520	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	49608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	52274779	52275056	52274934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	108035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr18	52549117	52549282	52549200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	166026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	52613483	52613779	52613741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB27B	230392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	53925444	53925759	53925631	Y	NA	NA	TCF4,LOC100505474	IMR90	Hi-C	24141950	WDR7	390815	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	55890970	55891630	55891068	Y	NEDD4L,NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	181371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr18	56208513	56208704	56208597	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	57159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	60172936	60173272	60173091	Y	NA	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	14968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr18	60456322	60456424	60456373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	75650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	61046049	61046189	61046119	Y	NA	KDSR,VPS4B	NA	NA	NA	NA	KDSR	13306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	66366333	66366541	66366437	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	13905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	68288865	68289228	68288977	Y	RTTN	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	334728	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO15	1276828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	71950185	71950349	71950304	Y	NA	CYB5A	NA	NA	NA	NA	CYB5A	6902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	72424911	72425171	72425041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	161805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	188995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	283297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	77220515	77220732	77220603	Y	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	CTDP1	217069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr18	77713083	77713430	77713261	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	3419	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	488227	488667	488380	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1051	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	567332	567750	567473	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	1547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	800594	800755	800691	Y	NA	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	MIR4745	2185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	1262305	1262850	1262469	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	4921	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	1658049	1658081	1658059	Y	EFNA2,ONECUT3	TCF3	TCF3	MCF7	ChIA-PET	22265404	TCF3	7445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	1909763	1910077	1909925	Y	KLF16	KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	NA	NA	NA	NA	ADAT3	6386	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2032329	2032652	2032524	Y	LINGO3,C19orf35	BTBD2,MKNK2	NA	NA	NA	NA	BTBD2	228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	2051815	2052053	2051955	Y	NA	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	2572	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2171641	2172019	2171832	Y	NA	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	9177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	2507206	2507458	2507335	Y	DOT1L,OAZ1,C19orf35,GADD45B	GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	33086	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	2629688	2630134	2629953	Y	DOT1L,OAZ1,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A3	108016	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	3131132	3131258	3131157	Y	NA	GNA11	NA	NA	NA	NA	GNA11	38724	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	3344211	3344472	3344340	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,GNA11,PIP5K1C,DOHH,DOHH,NFIC,NFIC	NFIC	NFIC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	NFIC	13089	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	3404098	3404373	3404237	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	46537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	3428769	3429112	3428821	Y	TLE2,NFIC	NA	NA	NA	NA	NA	DOHH	69826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	3555158	3555442	3555300	Y	C19orf28	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	15333	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	3969049	3969183	3969116	Y	NA	SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	DAPK3	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	4008398	4008778	4008498	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4	NA	NA	NA	NA	PIAS4	2754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	4064154	4064453	4064218	Y	SEMA6B,MATK	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	490	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	4379386	4379764	4379673	Y	NA	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	18780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	5046594	5046918	5046679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	79469	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	5578316	5578496	5578453	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	42550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	5585977	5586132	5586057	Y	NA	SAFB,SAFB2	NA	NA	NA	NA	SAFB	34914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	5953003	5953253	5953208	Y	SAFB2,FUT5	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	22900	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	5968077	5968307	5968208	Y	NA	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	7846	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	6423549	6423953	6423663	Y	NA	GTF2F1,KHSRP,CRB3,SLC25A23	NA	NA	NA	NA	KHSRP	744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	6766042	6766297	6766158	Y	NA	GPR108,TRIP10,SH2D3A	NA	NA	NA	NA	SH2D3A	443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	7254620	7254884	7254780	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	37161	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	7701239	7701460	7701364	Y	NA	CAMSAP3,XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	1472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.44933171374815
chr19	7714356	7714558	7714452	Y	NA	XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	14589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	12311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	7907381	7907869	7907475	Y	PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1	EVI5L,LRRC8E	NA	NA	NA	NA	EVI5L	14262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	8051436	8051456	8051449	Y	NA	TIMM44,ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	17087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	9684452	9684634	9684543	Y	NA	ZNF426,ZNF121,ZNF561	NA	NA	NA	NA	ZNF121	8575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	9903168	9903577	9903239	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	32915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	10337076	10337216	10337146	Y	NA	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1	NA	NA	NA	NA	S1PR2	2732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	10352370	10352740	10352555	Y	KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1	S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1	MRPL4,ICAM1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL4	7837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	10999263	10999360	10999313	Y	SMARCA4	CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	19074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11248443	11248964	11248826	Y	NA	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	15520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	11269215	11269426	11269321	Y	SMARCA4,SMARCA4,C19orf39	SPC24,KANK2	NA	NA	NA	NA	SPC24	4731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11375157	11375492	11375297	Y	DOCK6	DOCK6	TSPAN16	MCF7	ChIA-PET	22265404	DOCK6	4000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF823	30815	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.40542171309937
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	12896870	12897372	12897198	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	2938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	13129050	13129163	13129107	Y	MAST1,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	24628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.70271085654969
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	13944151	13944331	13944193	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	39877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	13995440	13995781	13995611	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	19233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	14172809	14173223	14173004	Y	NA	IL27RA,EEF1DP1,SAMD1	NA	NA	NA	NA	EEF1DP1	5931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	14229419	14229865	14229637	Y	CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97	SAMD1,PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	PRKACA	2523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	14597679	14597949	14597721	Y	NA	GIPC1,TECR,DNAJB1	NA	NA	NA	NA	GIPC1	6995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	14661096	14661426	14661346	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	19448	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	6.92569656990857
chr19	14664309	14664503	14664361	Y	OR7C2	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	16371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	15310768	15311119	15311001	Y	NA	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4F11	95558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	16181046	16181841	16181607	Y	OR10H2,OR10H3,OR10H4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	5215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	17200566	17201240	17200825	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	18264934	18265291	18265179	Y	NA	PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	PIK3R2	2966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	18365499	18365609	18365555	Y	B3GNT3	KIAA1683,JUND,MIR3188	NA	NA	NA	NA	KIAA1683	17710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	18533547	18533601	18533574	Y	ARRDC2,IL12RB1	SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	5873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	18585956	18586192	18586035	Y	ARRDC2,IL12RB1,JUND,KLHL26,ELL,SSBP4	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ISYNA1	38845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	18874702	18875152	18875024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF1	65595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	19488658	19488936	19488750	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	5699	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90,AC006539.2	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-260E6.2	104385	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	21511296	21511520	21511376	Y	NA	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	1069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	ZNF98	NA	NA	NA	NA	ZNF98	1908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	23309445	23309479	23309469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	121713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	23310606	23310980	23310793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	120212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	23971294	23971621	23971458	Y	NA	ZNF681,RPSAP58	NA	NA	NA	NA	RPSAP58	27487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	24216985	24217321	24217111	Y	ZNF254	ZNF254	NA	NA	NA	NA	ZNF254	2709	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	27732785	27733191	27732992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1969257	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	28225401	28225557	28225460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1476891	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	28335206	28335537	28335292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1366911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	30718140	30718340	30718240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	305589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	992173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	33532238	33532582	33532339	Y	RHPN2,GPATCH1,PDCD5,ANKRD27,NUDT19,CEP89,C19orf40	RHPN2,GPATCH1	NA	NA	NA	NA	RHPN2	21212	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	33875552	33875576	33875564	Y	NA	CEBPG	NA	NA	NA	NA	CEBPG	13316	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	34301645	34301872	34301668	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	16807	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	35491833	35492367	35492256	Y	FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	ZNF792,GRAMD1A,HPN	NA	NA	NA	NA	GRAMD1A	8145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	35605566	35605978	35605759	Y	MAG,FFAR1,LGI4	FXYD3,LGI4,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD3	834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	36030863	36031038	36030900	Y	NA	DMKN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	3459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1,UPK1A,UPK1A-AS1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	UPK1A,UPK1A-AS1,IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	UPK1A-AS1	31058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	37830170	37830469	37830239	Y	NA	HKR1,ZNF527	ZNF527	IMR90	Hi-C	24141950	HKR1	28431	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	37953316	37953327	37953324	Y	NA	ZNF570,ZNF569,ZNF793	NA	NA	NA	NA	ZNF570	3160	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	39167742	39168127	39167771	Y	NA	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	31453	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	39645312	39645609	39645461	Y	LGALS7B	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	30902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	40543471	40543758	40543711	Y	SPTBN4,ZNF546,ZNF780B	ZNF780B	NA	NA	NA	NA	ZNF780B	16358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	40725827	40726069	40725973	Y	NA	MAP3K10,CNTD2	NA	NA	NA	NA	CNTD2	4528	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	28849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	41289050	41289265	41289158	Y	SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,RAB4B,EGLN2,EGLN2	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	RAB4B	6929	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41304071	41304255	41304136	Y	SERTAD1,SERTAD3,SHKBP1,ADCK4,ADCK4,RAB4B,HNRNPUL1	SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	EGLN2	1170	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41802534	41802970	41802553	Y	B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	11124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	41814398	41814719	41814610	Y	HNRNPUL1,TMEM91,TGFB1,CCDC97,B9D2	HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1	NA	NA	NA	NA	CCDC97	304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41834727	41835191	41834967	Y	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	TMEM91	19625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,B3GNT8,ATP5SL	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	NA	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	92120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.46284828495429
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.48988142736655
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	42710307	42710321	42710316	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	11971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	42913594	42913985	42913852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	85833	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	42924318	42924497	42924408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	96557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	42925830	42926271	42926103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	98069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	45221919	45222313	45222185	Y	NA	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	26649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3,CBLC	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45279679	45279961	45279836	Y	CEACAM19,CBLC,BCAM	BCL3,CBLC,BCAM	NA	NA	NA	NA	CBLC	553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.3209619988322
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	45620495	45620703	45620563	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	27841	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	45663964	45664347	45664315	Y	NA	TRAPPC6A,BLOC1S3	NA	NA	NA	NA	TRAPPC6A	15148	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.63176771348864
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr19	45954905	45955186	45955133	Y	GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB	IMR90	Hi-C	24141950	FOSB	14067	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	45987073	45987327	45987197	Y	NOVA2,RELB,CLASRP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	2708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,DACT3	NA	NA	NA	NA	DACT3	19419	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47324064	47324441	47324224	Y	NA	SLC1A5,AP2S1	NA	NA	NA	NA	AP2S1	27808	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	47487878	47488175	47487946	Y	ZC3H4,DHX34,CCDC9,C5AR1	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	61713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47610820	47611121	47611012	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	47611153	47611400	47611382	Y	NA	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	3131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	47744387	47744529	47744512	Y	SLC8A2	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	10364	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr19	47854917	47855115	47854986	Y	ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	4379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	29420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	10.3885448548629
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr19	49046614	49046906	49046677	Y	NA	SULT2B1	SULT2B1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULT2B1	6426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	49057128	49057239	49057162	Y	NA	SULT2B1	NA	NA	NA	NA	SULT2B1	3796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	49482691	49482925	49482812	Y	NA	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	11642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	26338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50090402	50090603	50090503	Y	NA	PRRG2,NOSIP,PRR12	NA	NA	NA	NA	NOSIP	916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50092384	50092705	50092545	Y	BCL2L12	PRRG2,NOSIP,PRR12,RRAS	NA	NA	NA	NA	PRR12	195	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50276330	50276635	50276461	Y	VRK3,BCL2L12,AP2A1,MED25	AP2A1,FUZ,MED25	NA	NA	NA	NA	AP2A1	8105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50640094	50640250	50640214	Y	KCNC3	MYH14	NA	NA	NA	NA	MYH14	49193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2	NA	NA	NA	NA	NR1H2	2927	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	50835948	50836015	50835982	Y	IL4I1,NR1H2,KCNC3	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5038	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50839026	50839389	50839371	Y	ACPT,SYT3,LOC342918,KCNC3	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	NR1H2	8116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr19	50993276	50993671	50993522	Y	MYH14,MYBPC2	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	18939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	51059089	51059663	51059341	Y	KLK4,KLK6,ACPT,SYT3,LOC342918,LRRC4B	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	46479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	51182448	51182932	51182864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C19orf48	123254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	1272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	489	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr19	52193633	52193945	52193814	Y	ZNF836,ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	94	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	17	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	555	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	MIRLET7E	NA	NA	NA	NA	MIRLET7E	35277	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	52674093	52674226	52674127	Y	ZNF836	ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF836	1197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF347	67075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr19	54352555	54352808	54352773	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM	MYADM,AC008753.6,PRKCG	CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7	HELA,K562,H1ESC,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	MYADM	14669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,AC008753.6,PRKCG	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	3374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	54981954	54982383	54982298	Y	NA	LENG8,LENG8-AS1,LENG9,CDC42EP5	NA	NA	NA	NA	CDC42EP5	28	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	1218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	55600172	55600429	55600236	Y	NA	RDH13,EPS8L1,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	EPS8L1	18784	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,IL11,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr19	55909655	55909755	55909754	Y	PPP1R12C,TMEM150B	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	7390	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.12500942788558
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	56673673	56673939	56673846	Y	NA	ZNF787,ZNF444	GALP	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF444	31705	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	53754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr19	57965552	57965851	57965609	Y	NA	ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF749	20855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.2804122852138
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	1476597	1477084	1476655	Y	TPO,TPO	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	150107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	1608037	1608218	1608215	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	18973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	1659182	1659769	1659438	Y	NA	AC144450.2	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	31991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	1679499	1679591	1679561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC144450.2	52308	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	3226385	3226781	3226690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	3487019	3487372	3487201	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	34135	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	6091756	6092149	6091862	Y	NA	LINC01105	NA	NA	NA	NA	LINC01105	20937	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	8712183	8712281	8712245	Y	NA	NA	LINC00299,LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	104694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.72974399896195
chr2	8713737	8713978	8713829	Y	NA	NA	LOC100506274,ID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ID2	102997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	8767111	8767480	8767322	Y	NA	ID2	LINC00299,LOC339788,LOC100506274	IMR90	Hi-C	24141950	ID2	49495	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	8816590	8817048	8816915	Y	NA	AC011747.7	NA	NA	NA	NA	ID2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	9922366	9922715	9922451	Y	NA	NA	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,GRHL1,RRM2,TAF1B	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	58768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	10258344	10258406	10258377	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	2049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	11560928	11560984	11560935	Y	NA	E2F6	NA	NA	NA	NA	E2F6	43313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	11884050	11884543	11884432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	68329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	11893649	11894247	11893895	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	77928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	11894336	11894526	11894507	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	78615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	12842829	12843040	12842916	Y	NA	TRIB2	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	11975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	15049487	15049566	15049527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	278677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84A	429184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	20407883	20408194	20408074	Y	RHOB,SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	15000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr2	20412962	20413136	20413039	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	10058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB,AC023137.2	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	20674316	20674523	20674398	Y	NA	RHOB,AC023137.2	RHOB,HS1BP3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC023137.2	25513	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	23923305	23923445	23923375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	224539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	24122171	24122336	24122254	Y	NA	ATAD2B,UBXN2A,SDHCP3	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	25648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL36AP13	62972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	154309	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	25193628	25193634	25193631	Y	NA	DNAJC27-AS1,DNAJC27	NA	NA	NA	NA	DNAJC27	665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	25352140	25352468	25352150	Y	DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3B	89141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	25496302	25496542	25496380	Y	DNAJC27	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	66917	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	25676180	25676345	25676260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	112721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	26567616	26567683	26567653	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	2	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr2	27432989	27433207	27433072	Y	NA	SLC5A6,CAD	NA	NA	NA	NA	SLC5A6	619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	28124092	28124474	28124302	Y	FOSL2,RBKS	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	12127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2,AC104695.3	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC104695.3	43978	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	28731273	28731592	28731424	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	115734	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	29009696	29009902	29009742	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	37190	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	30391485	30391578	30391503	Y	YPEL5	YPEL5	NA	NA	NA	NA	YPEL5	23678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	30440662	30440911	30440739	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL5	72855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	30850038	30850385	30850172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	181946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	31145047	31145178	31145113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN13	103639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	33295461	33295712	33295665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	125422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	33435749	33436022	33435923	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	LTBP1	265710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	33567334	33567407	33567353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98A	255042	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	37813379	37813644	37813592	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	149967	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	38049848	38050212	38050057	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,LOC100505876,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	86237	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	38323202	38323810	38323564	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	CYP1B1,FAM82A1,CYP1B1-AS1,HNRPLL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYP1B1	11234	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	38418747	38419129	38419037	Y	NA	RPL7P12	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	37581	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	42046531	42047126	42046845	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	347364	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	42053679	42053991	42053965	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	340499	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	42193606	42193918	42193678	Y	PKDCC	NA	C2orf91	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	200572	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	42332532	42332812	42332662	Y	EML4	NA	EML4,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	61678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	43434759	43434952	43434875	Y	OXER1	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	16796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	43530162	43530544	43530351	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	78414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	43653578	43653957	43653847	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	THADA	167228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	43672480	43672679	43672609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	148506	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	43705862	43706134	43705998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	115051	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	43908548	43908922	43908739	Y	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	87363	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	44471855	44471912	44471885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1B	78747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	45237112	45237533	45237325	Y	SIX2	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	SIX2	2543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr2	45486924	45487080	45487002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIX2	252355	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	47210404	47210621	47210509	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	43410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	47420372	47420663	47420518	Y	NA	CALM2	EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	18632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	50951878	50951957	50951935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	2197356	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	54019039	54019374	54019207	Y	ACYP2,ASB3,ASB3,GPR75	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	6858	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	54022416	54022710	54022562	Y	NA	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	ERLEC1	10235	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	54270419	54270555	54270547	Y	GPR75,ACYP2	NA	SPTBN1,EML6,PSME4,ACYP2	IMR90	Hi-C	24141950	PSME4	74442	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	56298220	56298424	56298323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007743.1	112481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	58336722	58337105	58336916	Y	VRK2,VRK2,VRK2	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	129402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	61464355	61464721	61464539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHSA2	61802	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	61698926	61699282	61699220	Y	PUS10,AHSA2,USP34	USP34	NA	NA	NA	NA	USP34	3022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr2	62534127	62534336	62534147	Y	NA	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	112879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	63446182	63446204	63446197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	170990	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	63601034	63601048	63601041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	212695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	64207040	64207416	64207228	Y	NA	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	36790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	64620642	64621030	64620818	Y	HSPC159	NA	NA	NA	NA	NA	LGALSL	58073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	65173308	65173867	65173558	Y	AFTPH,SERTAD2	SLC1A4	SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC1A4	39744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	65609993	65610402	65610168	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	47369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.11149285667944
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	63250	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.36487199948098
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	68780015	68780176	68780096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APLF	87322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	69750715	69750748	69750731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFU1	87955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	69989990	69990667	69990520	Y	NA	NA	GMCL1	IMR90	Hi-C	24141950	GMCL1	64107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	70296121	70296604	70296392	Y	GMCL1,MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	PCBP1	15981	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	70608938	70609447	70609175	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM136A	81716	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr2	72732418	72732763	72732614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	318407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	74152201	74152400	74152268	Y	NA	DGUOK	NA	NA	NA	NA	DGUOK	248	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	75043732	75043824	75043778	Y	NA	HK2	HK2,SEMA4F	IMR90	Hi-C	24141950	HK2	15284	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	75102185	75102665	75102322	Y	HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	40610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	75172635	75172664	75172650	Y	NA	AC104135.3,POLE4	POLE4,TACR1,HK2	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	POLE4	10955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	85624104	85624259	85624204	Y	NA	ELMOD3,RETSAT,CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	19296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr2	85817156	85817274	85817185	Y	VAMP5	GGCX,VAMP8,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68	NA	NA	NA	NA	RNF181	3574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	85887180	85887589	85887391	Y	SH2D6,SFTPB	C2orf68	NA	NA	NA	NA	C2orf68	49991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	85993562	85993638	85993601	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	17095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	86299445	86299644	86299569	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	31634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	86562971	86563338	86563025	Y	REEP1,REEP1	NA	NA	NA	NA	NA	REEP1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2770710	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	95925847	95925871	95925861	Y	NA	PROM2	PROM2	IMR90	Hi-C	24141950	PROM2	12330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	96923964	96924135	96924075	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	5597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	89408	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	111005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	99064911	99065194	99064955	Y	MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	5594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	99551773	99552038	99551906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf15	203910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	101923239	101923757	101923472	Y	RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149	SNORD89,RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	76	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	101944860	101945306	101945135	Y	MAP4K4,MAP4K4,RNF149	RNF149	NA	NA	NA	NA	RNF149	21697	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	102649919	102650192	102650054	Y	IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2	IL1R1	NA	NA	NA	NA	IL1R1	28812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	102775841	102776136	102775926	Y	MAP4K4,MAP4K4,IL1R1	IL1RL2	NA	NA	NA	NA	IL1RL2	25297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	102825978	102826306	102826015	Y	NA	IL1RL2	NA	NA	NA	NA	IL1RL2	24545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	102842017	102842078	102842043	Y	NA	IL1RL2	NA	NA	NA	NA	IL1RL2	40584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	105430210	105430587	105430504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	221854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	105459435	105459826	105459464	Y	GPR45,POU3F3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS9	192615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	105676474	105676490	105676482	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	24033	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	106419035	106419424	106419178	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	59681	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	109514642	109514975	109514799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	113429	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	113458686	113458909	113458737	Y	NA	NA	FLJ42351,SLC20A1,IL37,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	SLC20A1	57252	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	113916006	113916157	113916098	Y	IL1B,IL36G,IL36B,IL1RN	NA	IL1RN,LOC654433,PAX8,PSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CKAP2L	395752	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	118878005	118878382	118878180	Y	DDX18,CCDC93	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	33977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	119076927	119077186	119077054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG2	232899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	120039875	120040023	120039961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	60491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	86711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	121155649	121155973	121155708	Y	INHBB	NA	LOC84931,INHBB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INHBB	53930	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	121156856	121157127	121156991	Y	INHBB	NA	INHBB,LOC84931	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INHBB	55137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	121200367	121200763	121200697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBB	98648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr2	121334562	121334634	121334591	Y	NA	NA	LOC84931	IMR90	Hi-C	24141950	INHBB	232843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.20946914215275
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	122656153	122656341	122656293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSN	163474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	128258405	128258697	128258648	Y	NA	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	23765	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	128266210	128266439	128266348	Y	MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L,IWS1	IWS1	NA	NA	NA	NA	IWS1	16023	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	128617356	128617514	128617464	Y	NA	POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	3625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	129816667	129816796	129816732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	742516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	131058181	131058640	131058440	Y	NA	AC068137.13,IMP4,CCDC115	NA	NA	NA	NA	AC068137.13	8786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	131555592	131555820	131555689	Y	CCDC115	NA	PLEKHB2,FAM168B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FAM168B	293213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	133319536	133319741	133319639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	107411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	133449369	133449654	133449512	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	22217	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	133737397	133737586	133737506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD1	310245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	137511013	137511026	137511020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	637278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	139260506	139260990	139260920	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	3135	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	139289140	139289372	139289256	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	31769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	139342135	139342417	139342276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	84764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	140977991	140978216	140978106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	1720620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	141284265	141284563	141284414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1602707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	141613060	141613069	141613065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1274201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	141813454	141813825	141813640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1073445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	141844279	141844394	141844337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1042876	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	141930622	141930813	141930718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	956457	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	142137791	142137799	142137795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	749471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	142150307	142150490	142150399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	736780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	142222584	142223129	142223081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	664141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr2	142254464	142254720	142254592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	632550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	142314861	142315203	142315061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	572067	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	142343061	142343470	142343446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	543800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr2	142358125	142358173	142358149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	529097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	142385646	142386021	142386018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	501249	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	142404808	142405288	142404942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	481982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	142426940	142427341	142427318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	459929	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	142449001	142449164	142449004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	438106	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	142471212	142471452	142471332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	415818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	142490523	142490867	142490695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	396403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr2	142647536	142647619	142647564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	239651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	142708846	142709417	142709132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	177853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	142874625	142874987	142874896	Y	LRP1B	LRP1B,AC078882.1	NA	NA	NA	NA	LRP1B	12283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	142886868	142887183	142887052	Y	LRP1B	LRP1B,AC078882.1	NA	NA	NA	NA	LRP1B	87	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	144499811	144499873	144499842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	588262	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	145078226	145078371	145078292	Y	ZEB2,GTDC1,GTDC1,GTDC1	GTDC1	NA	NA	NA	NA	GTDC1	9764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	149634441	149634782	149634502	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	149925246	149925613	149925433	Y	NA	LYPD6B	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	32625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	152627978	152628361	152628290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	54645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	152971717	152971973	152971845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	58533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	153311931	153312064	153312029	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	122180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	158719491	158719881	158719651	Y	ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	10493	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	159581549	159581597	159581577	Y	NA	NA	CCDC148,LOC554201,PKP4,UPP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DAPL1	68232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	160219490	160219798	160219643	Y	MARCH7,CD302	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	78180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	161014381	161014772	161014663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB6	111627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	161079390	161079792	161079655	Y	ITGB6	ITGB6	RBMS1,ITGB6,TANK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB6	46607	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	ITGB6	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB6	27776	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	162482624	162482768	162482667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD14	320075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	165683192	165683287	165683237	Y	NA	AC019181.2,COBLL1	NA	NA	NA	NA	AC019181.2	11972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	170219794	170220267	170220091	Y	LRP2	NA	NA	NA	NA	NA	BBS5	113421	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	173126098	173126272	173126185	Y	ITGA6	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	160470	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	173796243	173796588	173796342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093818.1	376919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	173908830	173909139	173908955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	308409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	173966331	173966790	173966623	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	250758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	209841	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	176846427	176846539	176846507	Y	NA	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	19028	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	183839050	183839414	183839395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	62172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	187318926	187319192	187319071	Y	NA	ZC3H15	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	29691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR75	260332	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	191876125	191876480	191876302	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	STAT1	7206	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	192082382	192082563	192082473	Y	MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	25348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	437071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	192707967	192708344	192708338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	600056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	193013468	193013788	193013628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	905557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	199736102	199736481	199736292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	597508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	200912605	200912617	200912611	Y	NA	NA	SPATS2L,KCTD18	IMR90	Hi-C	24141950	TYW5	94146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	202078581	202078959	202078777	Y	CASP10	NA	NA	NA	NA	NA	CFLAR	99754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	202079360	202079680	202079556	Y	CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	NA	CFLAR	100533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	202897639	202898135	202897874	Y	FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA2P3	143335	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	203341668	203341778	203341723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR2	102009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	204570146	204570432	204570186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	172013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	204816181	204816619	204816422	Y	CD28,ICOS	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	418048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	207669258	207669658	207669463	Y	NA	FASTKD2,MDH1B	NA	NA	NA	NA	MDH1B	40987	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	208154070	208154333	208154202	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	238128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	208609048	208609450	208609191	Y	NA	CCNYL1,FZD5	NA	NA	NA	NA	FZD5	22837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	212361261	212361269	212361265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	1020885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	213339164	213339568	213339278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	61997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	213402193	213402489	213402443	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	215554872	215555197	215555035	Y	NA	ENSAP3	NA	NA	NA	NA	ENSAP3	5254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	215971469	215971483	215971476	Y	NA	ABCA12	NA	NA	NA	NA	ABCA12	29668	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	216158816	216158951	216158871	Y	NA	ATIC	ATIC,ABCA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATIC	15589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	216847055	216847597	216847305	Y	NA	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	49222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	60072	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	AC007563.5	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	AC007563.5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	AC007563.5,IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr2	217797120	217797464	217797294	Y	NA	NA	DIRC3,TNP1,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	238872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	218113105	218113304	218113205	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2,TNP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DIRC3	506012	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	218518007	218518420	218518200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	100896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	218521142	218521493	218521318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	97823	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	218549825	218550302	218550107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	69014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr2	218571910	218572214	218572013	Y	NA	DIRC3	NA	NA	NA	NA	DIRC3	47102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	219861860	219861953	219861873	Y	USP37,ZNF142,FEV,CRYBA2,CRYBA2	CDK5R2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	AC097468.4	2984	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	220007031	220007174	220007103	Y	NA	NHEJ1,FAM134A,CNPPD1	NA	NA	NA	NA	NHEJ1	16413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	220374836	220375176	220374958	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	13247	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	220400310	220400471	220400469	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,INHA,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	5914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	222312152	222312375	222312261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	124547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	222382501	222382744	222382664	Y	EPHA4	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	54178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	223757137	223757389	223757313	Y	NA	ACSL3	NA	NA	NA	NA	ACSL3	33485	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	223823432	223823602	223823532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	99780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	223824867	223825201	223825044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	101215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	225774741	225775150	225774924	Y	CUL3,DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	326631	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	226983767	226984186	226983892	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRS1	678289	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	227514922	227515156	227515015	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	147319	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	227580904	227581301	227581103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS1	81174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	227781487	227781745	227781553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	83190	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	228327180	228327582	228327275	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	7286	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	228331050	228331499	228331159	Y	NA	AGFG1	AGFG1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGFG1	3369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCL	116235	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	232566219	232566469	232566340	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	3136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	233499533	233499991	233499677	Y	EFHD1	EFHD1	NA	NA	NA	NA	EFHD1	30766	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	234322287	234322459	234322373	Y	SAG	NA	NA	NA	NA	NA	DGKD	61134	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	234608579	234609196	234608912	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	10326	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	234614877	234615153	234615015	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	16624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	234615498	234615635	234615567	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	17245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	UGT1A6	NA	NA	NA	NA	UGT1A6	32501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	235457689	235457991	235457840	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4,SPP2,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	53992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	235542442	235542778	235542606	Y	NA	NA	SH3BP4,AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	138745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr2	235872484	235872869	235872649	Y	NA	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	13867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	236404372	236404974	236404689	Y	AGAP1	AGAP1,AGAP1-IT1	NA	NA	NA	NA	AGAP1	3639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	236453392	236453640	236453439	Y	NA	AGAP1-IT1	NA	NA	NA	NA	AGAP1-IT1	40997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	236886303	236886528	236886416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	187562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	237117535	237117935	237117735	Y	NA	AC079135.1	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	43445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	408893	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	237654357	237654656	237654652	Y	CXCR7	NA	CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	337299	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238018538	238018666	238018550	Y	NA	COPS8,AC105760.2	NA	NA	NA	NA	AC105760.2	26078	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238391204	238391436	238391383	Y	LRRFIP1,MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr2	238392046	238392381	238392184	Y	LRRFIP1,MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	MLPH	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr2	238396973	238397455	238397139	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	4902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238411273	238411418	238411341	Y	NA	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	19202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	MLPH	NA	NA	NA	NA	MLPH	29670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr2	238694351	238694559	238694455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	160132	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	238854258	238854421	238854312	Y	NA	UBE2F	ILKAP,RBM44,UBE2F-SCLY,RAMP1,RAB17,LRRFIP1,KLHL30,ESPNL,HES6,LOC643387,LOC151174,PER2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2F	19048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	239194414	239194788	239194667	Y	NA	HES6,PER2,TRAF3IP1	LOC643387,LOC151174,HES6	IMR90	Hi-C	24141950	PER2	1955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr2	239290977	239291159	239291031	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	42224	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	239367827	239368002	239367915	Y	NA	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	34444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	240145548	240145836	240145702	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	175294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	240321591	240321797	240321685	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	AC005237.4,MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	242679689	242679905	242679763	Y	ATG4B,D2HGDH	ING5,D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	7695	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr2	242698564	242698745	242698671	Y	THAP4,ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	26570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.46284828495429
chr2	242714145	242714474	242714395	Y	NEU4,D2HGDH,GAL3ST2	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	42151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr2	242791150	242791474	242791404	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	30040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	242833644	242833731	242833683	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	12130	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr2	242911452	242911734	242911512	Y	NA	NA	LOC728323	IMR90	Hi-C	24141950	AC131097.3	89938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	351057	351207	351131	Y	NA	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	8054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr20	352488	352859	352625	Y	SRXN1,FAM110A,RBCK1	SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	6402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	453687	453779	453733	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	12490	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	823028	823308	823133	Y	FAM110A	FAM110A	NA	NA	NA	NA	FAM110A	10670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr20	1167289	1167675	1167648	Y	NA	TMEM74B,RAD21L1	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	3230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	1310858	1311228	1310987	Y	SDCBP2,SDCBP2,SIRPG	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	60578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	3377596	3377907	3377772	Y	C20orf194	C20orf194	NA	NA	NA	NA	C20orf194	8365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	5826892	5827249	5827089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf196	97853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	9100209	9100421	9100248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	52799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	9291356	9291748	9291412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	243946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	9384292	9384675	9384295	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	336882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	9476940	9477296	9477117	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	429530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	9479194	9479413	9479304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	431784	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	10482481	10482747	10482670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	69611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	11098477	11098718	11098579	Y	NA	NA	C20orf94	IMR90	Hi-C	24141950	JAG1	473463	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	12250218	12250236	12250226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	380847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	13379016	13379145	13379075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	238442	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	14769224	14769434	14769329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	452962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	15282242	15282264	15282251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	965980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr20	17519291	17519778	17519563	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	28087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	17538189	17538505	17538334	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	BFSP1	9360	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	17591305	17591483	17591343	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	42797	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5,PTMAP3	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	19194656	19195454	19194994	Y	NA	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	3366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr20	19293639	19293701	19293669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	102349	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	19408281	19408453	19408368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	216991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	19638978	19639033	19639006	Y	C20orf26	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-122P22.2	97319	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	20009163	20009558	20009361	Y	NA	NAA20,C20orf26,CRNKL1	NA	NA	NA	NA	NAA20	13403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	20391161	20391545	20391351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	299586	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	24451680	24451884	24451790	Y	TMEM90B	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD6	722445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	24510047	24510433	24510242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD6	663896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	24709936	24710315	24710275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENTPD6	464014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	25071819	25071933	25071899	Y	GINS1	NA	ACSS1,VSX1,ENTPD6,PYGB	IMR90	Hi-C	24141950	ENTPD6	102396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	25227226	25227454	25227251	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	521	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	25229395	25229593	25229494	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	2690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	25372319	25372345	25372332	Y	NA	ABHD12,GINS1	NA	NA	NA	NA	ABHD12	2700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	166731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF337	170704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30482952	30483213	30483055	Y	NA	TTLL9	NA	NA	NA	NA	TTLL9	26447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30595687	30595958	30595823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDRG1	57792	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30623316	30623619	30623410	Y	PLAGL2,HCK	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	71690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	30705137	30705472	30705281	Y	HCK,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	9828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	31045263	31045487	31045417	Y	KIF3B	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	101108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	31350973	31351317	31351235	Y	C20orf185,DNMT3B,DNMT3B	COMMD7,DNMT3B	MAPRE1	IMR90	Hi-C	24141950	DNMT3B	2782	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	31597104	31597733	31597394	Y	BPIL1	BPIFB2,BPIFB6	NA	NA	NA	NA	BPIFB2	3698	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	32142835	32143155	32142948	Y	C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B	NA	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	66954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	33055325	33055363	33055345	Y	NA	DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	46851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	33646463	33646512	33646488	Y	TP53INP2,MYH7B	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	32162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	34479476	34479734	34479606	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	5895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	35251667	35252083	35251778	Y	NA	C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	19530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	35489284	35489554	35489419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	88692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	35723463	35723698	35723601	Y	NA	RBL1	NA	NA	NA	NA	RBL1	1275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	37499452	37499626	37499537	Y	RALGAPB,ACTR5,PPP1R16B,DHX35	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83D	53329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	39878072	39878223	39878164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX3	66089	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	42096541	42096705	42096586	Y	NA	SRSF6,L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	SRSF6	11973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr20	42648340	42648654	42648497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	188946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	56962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	42833040	42833424	42833233	Y	C20orf111	OSER1-AS1	NA	NA	NA	NA	OSER1-AS1	4176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr20	43972131	43972359	43972259	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	2705	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	44622132	44622355	44622242	Y	CD40,ZNF335	ZNF335	ZNF335,MMP9,SLC12A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF335	23299	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	45411853	45412169	45412011	Y	NA	NA	EYA2,ZMYND8,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A10	75727	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	45599929	45600258	45600137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A10	263803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	113049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	45943818	45944172	45944095	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	39395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	46067688	46067974	46067774	Y	NCOA3	NA	NCOA3,ZMYND8	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	60627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	171015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	46618615	46619022	46618889	Y	NA	NA	SULF2,CMTM7,BCAS1	MCF7	ChIA-PET	22265404,19890323	NCOA3	490014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	47544338	47544681	47544534	Y	DDX27	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	7911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	47803381	47804147	47803544	Y	PREX1,STAU1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	NA	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	B4GALT5	107000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	48533898	48534043	48533948	Y	B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	3818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	48809447	48810205	48810164	Y	B4GALT5,SPATA2,SPATA2,CEBPB	TMEM189-UBE2V1,TMEM189,CEBPB	NA	NA	NA	NA	CEBPB	4071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	48922474	48922671	48922573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	117098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	49137019	49137081	49137050	Y	PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	12128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	49170357	49170595	49170426	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	45466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	49358421	49358698	49358635	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	12340	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	49378032	49378227	49378094	Y	PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	31204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	49378305	49378754	49378413	Y	DPM1,PARD6B,BCAS4	PARD6B,BCAS4	NA	NA	NA	NA	BCAS4	30677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52271592	52271787	52271702	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	47146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	255975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52481702	52482101	52481977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	257256	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	52514730	52515023	52514955	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BMP7,SUMO1P1,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	290284	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52523670	52524265	52523914	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,ZNF217,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	298121	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	289497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	56270075	56270492	56270216	Y	PMEPA1,PMEPA1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	14100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	57186271	57186506	57186395	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	37822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	57585788	57586041	57585915	Y	NA	CTSZ,ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	5486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	57670365	57670649	57670522	Y	NA	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	54401	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	57699228	57699623	57699600	Y	ZNF831	NA	GNAS,GNAS-AS1,ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	83264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	57760235	57760388	57760320	Y	ZNF831	NA	NA	NA	NA	NA	SLMO2	144271	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	58436515	58436843	58436553	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	69867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.37838857068711
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr20	60803093	60803442	60803179	Y	NA	OSBPL2	NA	NA	NA	NA	OSBPL2	8138	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.0405497136184
chr20	60914790	60915105	60914838	Y	NA	ADRM1,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	25263	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	60933408	60933760	60933692	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	6608	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	60939635	60939778	60939673	Y	SLCO4A1,NTSR1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	61001783	61002051	61001918	Y	NA	RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	CABLES2	21442	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr20	61267975	61268016	61267996	Y	NA	SLCO4A1,RP11-93B14.5	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	3781	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr20	61514139	61514234	61514187	Y	NA	TCFL5	NA	NA	NA	NA	TCFL5	23024	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,PTK6	NA	NA	NA	NA	PTK6	3461	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	RTEL1,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	ZGPAT	22592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.36487199948098
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	62676233	62676312	62676273	Y	SLC2A4RG,TCEA2,SOX18	ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19	NA	NA	NA	NA	ZNF512B	1801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr20	62908248	62908643	62908435	Y	NA	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	23154	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	11109153	11109188	11109171	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1142568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	16345757	16346184	16346094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	89137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD74	304311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	22545026	22545343	22545185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	176393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	22572618	22572960	22572789	Y	NCAM2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	203985	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	26882215	26882658	26882608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL39	95171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	26980548	26980842	26980671	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	2719	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	27275894	27276232	27276045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	169910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	27370700	27370785	27370725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	170661	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS1	581339	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	30009367	30009732	30009551	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	245961	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr21	30751100	30751464	30751308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	186708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr21	30758449	30758782	30758692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	194057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr21	31781146	31781491	31781278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLDN8	194755	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	33999841	34000172	33999850	Y	NA	C21orf59	NA	NA	NA	NA	C21orf59	16665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	34836293	34836479	34836379	Y	OLIG2,OLIG1,CRYZL1,TMEM50B	TMEM50B,DNAJC28	NA	NA	NA	NA	TMEM50B	13839	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	35508184	35508396	35508291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	64314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	35574029	35574459	35574413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	130159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	35863434	35863747	35863591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	121694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	229346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	36216696	36217156	36217046	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	231255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	36217934	36218360	36217961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	232493	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	19644	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	SETD4,CBR3,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	CBR3	18991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	37670543	37670742	37670650	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	19745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	DSCR9,AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	450920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	40338093	40338255	40338153	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	162862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	40689481	40689668	40689601	Y	BRWD1	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	40690087	40690386	40690238	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	1099	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr21	41872740	41872794	41872767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAM-AS1	119730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	42857771	42858171	42857971	Y	NA	TMPRSS2	NA	NA	NA	NA	TMPRSS2	42872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ABCG1	140441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr21	43657721	43658000	43657891	Y	PRDM15,PRDM15,C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	39922	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr21	44764269	44764611	44764455	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319,CRYAA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	14350	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	SIK1	91776	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	45485183	45485767	45485497	Y	TRAPPC10,C21orf2	PWP2	NA	NA	NA	NA	PWP2	39404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	45790273	45790500	45790387	Y	TRAPPC10,ICOSLG,TRPM2	C21orf2	NA	NA	NA	NA	C21orf2	32988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	46172768	46173172	46172977	Y	NA	UBE2G2	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	46762	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	46295070	46295864	46295519	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	3318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	47411286	47411466	47411356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSS	235272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr21	48003626	48004009	48003657	Y	S100B,PRMT2	PRMT2	NA	NA	NA	NA	PRMT2	49070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	18372617	18372984	18372801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BID	117081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	18404666	18404945	18404902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	100380	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	18538907	18539143	18539025	Y	NA	MICAL3,PEX26	NA	NA	NA	NA	PEX26	19546	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr22	18919384	18919770	18919551	Y	PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH	NA	NA	NA	NA	PRODH	2296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr22	18921428	18921794	18921531	Y	MICAL3,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH	NA	NA	NA	NA	PRODH	272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr22	19072724	19073088	19073012	Y	NA	DGCR2	NA	NA	NA	NA	DGCR2	34879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.61825114228251
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	19703205	19703405	19703340	Y	NA	SEPT5	NA	NA	NA	NA	SEPT5	3218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	19972525	19972715	19972620	Y	NA	COMT,TXNRD2,ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	29616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	19983308	19983423	19983389	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	19983834	19983932	19983883	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	18399	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	USP41,ZNF74	NA	NA	NA	NA	ZNF74	26142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.47636485616042
chr22	22290676	22291029	22290778	Y	MAPK1,PPM1F	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	PPM1F	14180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	22334723	22335115	22334952	Y	NA	PPM1F,TOP3B	NA	NA	NA	NA	TOP3B	98	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	23528251	23528416	23528284	Y	BCR	RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	8360	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	23731897	23732182	23732040	Y	NA	ZDHHC8P1	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	10731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr22	24603179	24603438	24603254	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	27952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr22	24603797	24604355	24604162	Y	GGT1,ADORA2A	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	28570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	24747750	24748005	24747878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	63842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	24821513	24821637	24821577	Y	GGT1,ADORA2A	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	9666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	24907169	24907526	24907423	Y	GGT1	SNRPD3	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	41945	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM211B	361556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	FAM211B	394665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	25458331	25458606	25458444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5L	340738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	26967025	26967265	26967145	Y	TFIP11	HMGB1P10,TPST2	NA	NA	NA	NA	HMGB1P10	12533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	24982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	27816576	27816924	27816809	Y	NA	NA	MIAT,MN1,PITPNB,TTC28,TTC28-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MN1	378562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	28261904	28262359	28262203	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	51005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	28314180	28314595	28314448	Y	PITPNB	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	PITPNB	58	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	29194018	29194404	29194339	Y	NA	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	NA	NA	NA	NA	XBP1	181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr22	29215471	29215733	29215666	Y	XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,CHEK2,HSCB,C22orf31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	20800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	29218930	29219398	29218977	Y	NA	XBP1,CTA-292E10.6	TTC28-AS1,TTC28,ZNRF3,EMID1,CCDC117,XBP1,KREMEN1,HSCB,CHEK2,C22orf31	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	24259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	29605025	29605391	29605212	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	5185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	29730982	29731069	29731026	Y	NA	GAS2L1,RASL10A	NA	NA	NA	NA	RASL10A	17314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	30096148	30096264	30096206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT5	64736	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	30671325	30671531	30671354	Y	NA	LIF,GATSL3,TBC1D10A	LIF,OSM	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	12085	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	30721148	30721367	30721290	Y	MTMR3,OSM,SLC35E4,TBC1D10A	GATSL3,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1	NA	NA	NA	NA	TBC1D10A	113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	31291343	31291446	31291429	Y	SEC14L4,OSBP2	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	70838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MORC2	64094	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	31639418	31639541	31639442	Y	NA	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	33193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	31645719	31645849	31645807	Y	LIMK2	LIMK2,PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	LIMK2	39494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	31665995	31666466	31666007	Y	NA	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	20054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	31689398	31689773	31689585	Y	SMTN,DEPDC5	PIK3IP1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	2878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	31692333	31692587	31692466	Y	SMTN,RNF185	PIK3IP1,PATZ1,AC005003.1	NA	NA	NA	NA	PIK3IP1	5813	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	31854917	31854933	31854925	Y	NA	SFI1,EIF4ENIF1	NA	NA	NA	NA	SFI1	27741	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	31945272	31945635	31945454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4ENIF1	55178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	32027602	32027834	32027718	Y	NA	PISD	NA	NA	NA	NA	PISD	28584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	RP1-90G24.10	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-90G24.10	15949	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	32819656	32819735	32819695	Y	RFPL3,TIMP3	FBXO7	NA	NA	NA	NA	FBXO7	48928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	32970558	32970778	32970668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	101895	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	34055725	34056096	34055879	Y	NA	SNORA76	NA	NA	NA	NA	SNORA76	42810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	34263249	34263475	34263362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	164343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	34315412	34315698	34315644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA76	216506	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	35674868	35675158	35675013	Y	NA	HMGXB4,TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	18110	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM5	189472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	272624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	RBFOX2	249530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	36621171	36621450	36621368	Y	NA	APOL2	NA	NA	NA	NA	APOL2	12550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	36748222	36748386	36748297	Y	NA	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	33677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36755336	36755467	36755407	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	26596	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	36858236	36858440	36858372	Y	MYH9	RP5-1119A7.14,TXN2,FOXRED2	NA	NA	NA	NA	RP5-1119A7.14	9245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	37338744	37339097	37338873	Y	IL2RB	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-833B7.2	74261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	NA	NA	NA	NA	NA	TMPRSS6	134725	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	37937864	37938255	37937972	Y	SH3BP1,LGALS2,GGA1,GGA1	CARD10,CDC42EP1	CARD10,MFNG,LGALS2,PDXP,TRIOBP,ELFN2,CDC42EP1,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	16199	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	37957606	37958042	37957847	Y	NA	CARD10,CDC42EP1,GGA1	NA	NA	NA	NA	CDC42EP1	3152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38003646	38003923	38003656	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1,PDXP	NA	NA	NA	NA	GGA1	1165	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38351215	38351232	38351224	Y	NA	POLR2F,C22orf23	NA	NA	NA	NA	C22orf23	3539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38572177	38572681	38572373	Y	DDX17,EIF3L,PLA2G6,PLA2G6,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	MAFF	23208	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	39091291	39091422	39091336	Y	NA	CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1	NA	NA	NA	NA	JOSD1	4139	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	39610460	39610820	39610697	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	27936	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	39635222	39635426	39635287	Y	SUN2,SUN2,CBX7,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	3330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	39635664	39635940	39635710	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	2816	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	39637977	39638270	39638005	Y	MGAT3,MGAT3,SUN2,SUN2,NPTXR,CBX7,SYNGR1,PDGFB	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	39696256	39696487	39696398	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	17907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	39705997	39706111	39706064	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	8283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	39844645	39844964	39844816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB1	50899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	40589903	40590338	40589971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	88833	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	40888295	40888668	40888528	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	123700	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	40958851	40958976	40958969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	71730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	42257974	42258323	42258180	Y	CENPM	SREBF2	NA	NA	NA	NA	SREBF2	30865	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	42345357	42345934	42345409	Y	NA	TNFRSF13C,CENPM,SEPT3,WBP2NL	TNFRSF13C	K562	ChIA-PET	22265404	CENPM	4189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	42485778	42486189	42485966	Y	CCDC134,CENPM,NFAM1,C22orf32	NAGA,FAM109B,NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	NDUFA6	819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	42527695	42528060	42527840	Y	CYP2D6	NDUFA6,OLA1P1	NA	NA	NA	NA	OLA1P1	24738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	42867366	42867483	42867394	Y	NA	CTA-126B4.7,RRP7A	WBP2NL,SEPT3	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-126B4.7	35337	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	43369643	43369761	43369702	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39390	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr22	43415245	43415535	43415390	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	6094	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	43740111	43740598	43740319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL12	158972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	44140171	44140361	44140266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	65856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	44757371	44757617	44757493	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	134561	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	45254258	45254434	45254345	Y	PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21B	149446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	45525658	45525880	45525792	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	31782	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	45635319	45635444	45635382	Y	NA	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	46041491	46041960	46041628	Y	NA	ATXN10	ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATXN10	23718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WI2-85898F10.1,WNT7B	NA	NA	NA	NA	WI2-85898F10.1	43738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	46441533	46441708	46441621	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	46442068	46442299	46442118	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	5286	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	46455003	46455485	46455192	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	C22orf26	6979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	46462776	46462894	46462836	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr22	46957537	46957704	46957620	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr22	46970983	46971382	46971054	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	1074	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr22	46973801	46973805	46973803	Y	NA	CELSR1,GRAMD4	TRMU,GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	3892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr22	46988577	46988710	46988625	Y	NA	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	18668	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	47525665	47525872	47525801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	369147	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50324610	50324932	50324739	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	14504	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50344780	50345228	50344944	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	6933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr22	50346860	50347243	50347174	Y	BRD1,PANX2,HDAC10,PIM3	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	4918	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr22	50741799	50742849	50742615	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	1207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.0405497136184
chr22	50764173	50764461	50764208	Y	NA	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	15272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	8946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr22	50982591	50982963	50982680	Y	NA	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	13582	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	4575529	4575739	4575617	Y	NA	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	42497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	4783422	4783695	4783523	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	143282	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	4790332	4790663	4790474	Y	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	136314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	4801058	4801218	4801184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	125759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	4870806	4870892	4870849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	56085	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	4870922	4871280	4871101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55697	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	4871506	4871670	4871602	Y	ITPR1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	55307	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	4881719	4881745	4881731	Y	ITPR1	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	45232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	NA	NA	NA	NA	BHLHE40-AS1	8888	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40,BHLHE40-AS1	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40-AS1	48328	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	5182623	5182897	5182737	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	20718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	8781836	8782151	8782020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	221306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	9995528	9995903	9995716	Y	NA	IL17RC,CRELD1,PRRT3-AS1,PRRT3,EMC3-AS1	NA	NA	NA	NA	PRRT3	3450	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr3	13042124	13042470	13042313	Y	RAF1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	70147	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	13152253	13152557	13152379	Y	NUP210,IQSEC1	IQSEC1	LOC285375,NUP210,HDAC11	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	39636	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	13153064	13153212	13153138	Y	RPL32,IQSEC1	IQSEC1	LOC285375,NUP210,HDAC11	IMR90	Hi-C	24141950	IQSEC1	40447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	13575229	13575656	13575462	Y	NA	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	55676	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	14863685	14864013	14863849	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	123078	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	15334615	15334919	15334862	Y	NR2C2,SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	45956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	15337572	15337812	15337795	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	43063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	16550067	16550455	16550405	Y	PLCL2,OXNAD1,RFTN1	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	3078	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	17378312	17378639	17378476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	824779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	17661435	17661830	17661633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	822479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	20082717	20083237	20083200	Y	RAB5A,KAT2B	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	3202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	34599	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	24492184	24492324	24492254	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	42449	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	25790563	25790933	25790768	Y	NA	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	31475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	EOMES	87236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr3	31967720	31967825	31967773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF860	53438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	ZNF860	NA	NA	NA	NA	ZNF860	18462	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	NA	NA	NA	NA	NA	CMTM6	99345	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	33590851	33591213	33591209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBP1	109988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	33758685	33758853	33758767	Y	UBP1,UBP1,CLASP2	CLASP2	NA	NA	NA	NA	CLASP2	837	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	34543919	34544003	34543961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	706075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRANK1	178370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	37011455	37011827	37011685	Y	LRRFIP2,ITGA9,GOLGA4,MLH1,MLH1,EPM2AIP1	TRANK1,EPM2AIP1,MLH1,RPL29P11	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	20968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	37805955	37806276	37805982	Y	ITGA9	NA	NA	NA	NA	NA	AC093415.2	94995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr3	37904355	37904605	37904570	Y	NA	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	2904	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	39191403	39191804	39191748	Y	NA	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	2249	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	39192381	39192719	39192586	Y	WDR48,CSRNP1	TTC21A,GORASP1,CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	1334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr3	39214123	39214320	39214188	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	20070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	40249342	40249773	40249550	Y	EIF1B	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1B	99402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	42514598	42514851	42514767	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	42518371	42518582	42518469	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	9239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	42531634	42531985	42531932	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	NA	NA	NA	NA	VIPR1	2843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	43220536	43220835	43220673	Y	CCDC13	NA	SNRK,ANO10,FAM198A,ABHD5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRK	105169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	97126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	43435481	43435714	43435568	Y	SNRK,ABHD5	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	89658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	43437259	43437582	43437422	Y	ZNF662,ZNF662,FAM198A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-353H3.1	87790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	44036592	44036799	44036686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	305506	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3,CLEC3B	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	5163	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45146738	45147081	45147019	Y	TMEM158,CDCP1	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	38833	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45185924	45186005	45185965	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45512532	45512880	45512706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	82006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	45594952	45595331	45595047	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	66	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	46036343	46036779	46036493	Y	CCR5,CCR2,SACM1L,CXCR6,FYCO1	FYCO1	NA	NA	NA	NA	FYCO1	1027	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	46152557	46153082	46152773	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR1	NA	CCR5,FYCO1,CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	117241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr3	46174126	46174379	46174260	Y	SACM1L,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR2,CCR1	NA	CCR1,CCR2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	138810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	46971519	46971826	46971651	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	47347	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	47421570	47421869	47421711	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	1069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	47466111	47466297	47466204	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	45610	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	49286239	49286578	49286497	Y	ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4	NA	NA	NA	NA	NA	KLHDC8B	79195	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	49389809	49389972	49389904	Y	ARIH2,DALRD3,RHOA,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	GPX1	4061	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	SEMA3F	4232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	50638353	50638905	50638586	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	8046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	50639096	50639152	50639124	Y	NA	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	51628881	51628909	51628894	Y	GPR62	NA	NA	NA	NA	NA	TEX264	65800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	52168814	52168827	52168821	Y	NA	POC1A	NA	NA	NA	NA	POC1A	17879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	52652258	52652629	52652403	Y	GLYCTK,MUSTN1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	NA	GNL3	60543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	53106812	53106929	53106871	Y	TMEM110,SFMBT1	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	53107324	53107487	53107433	Y	TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	53342432	53342824	53342628	Y	NA	DCP1A	NA	NA	NA	NA	DCP1A	36830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	53568043	53568300	53568167	Y	SFMBT1	CACNA1D	NA	NA	NA	NA	CACNA1D	41360	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS15P5	859259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	186035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	58168035	58168365	58168200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	52868	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	59437282	59437448	59437328	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	403472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	59544094	59544290	59544192	Y	NA	NA	FAM3D,FHIT,C3orf67	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	510284	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	60301241	60301550	60301396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	933583	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	60777295	60777669	60777482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	457464	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	60804439	60804744	60804592	Y	FHIT	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	430389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	64330217	64330685	64330502	Y	NA	NA	PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2	98467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	65694421	65694810	65694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	327699	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	65831008	65831290	65831149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	191219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	65939140	65939412	65939262	Y	MAGI1	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	83097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66467141	66467203	66467172	Y	LRIG1	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	82484	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66491612	66491762	66491706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG1	57925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	66503172	66503179	66503176	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	46508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66507485	66507541	66507513	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	42146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66543351	66543557	66543448	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	6130	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	66549724	66550124	66549864	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	37	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	69218338	69218527	69218433	Y	FRMD4B	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	86243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	69789363	69789667	69789441	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	2777	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71116020	71116294	71116249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	514846	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71447361	71447554	71447492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	183586	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71564915	71565059	71565002	Y	PROK2,GPR27,FOXP1,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	66081	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	72263935	72263948	72263940	Y	NA	NA	SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	230121	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	72359769	72360170	72359863	Y	RYBP	NA	SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	RYBP	133899	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	85930839	85930993	85930916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM2	924707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	88255753	88255858	88255769	Y	HTR1F	NA	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	58718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	98044011	98044208	98044126	Y	NA	NA	GABRR3	IMR90	Hi-C	24141950	CLDND1	195702	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	99114245	99114616	99114431	Y	NA	NA	MIR548G,COL8A1	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD2	495712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	99570772	99571127	99571120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	406717	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	99761045	99761306	99761215	Y	TMEM45A	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	216538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	100028092	100028475	100028284	Y	TBC1D23	NIT2	NA	NA	NA	NA	NIT2	23070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	101046086	101046265	101046174	Y	ZBTB11,SENP7,CEP97	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	183820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	103522825	103523125	103522973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-43P	646021	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	110587612	110587624	110587618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVRL3	199294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	111420857	111420932	111420895	Y	NA	PLCXD2,PHLDB2	PHLDB2,CD96,ABHD10	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB2	28412	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	111943889	111944218	111944054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf52	140707	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	112866931	112867023	112866972	Y	BOC	NA	BOC,WDR52	IMR90	Hi-C	24141950	BOC	60827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	113254837	113255012	113254902	Y	NA	SPICE1,SIDT1	NA	NA	NA	NA	SIDT1	5694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr3	113293012	113293390	113293190	Y	SPICE1,SIDT1	SIDT1	NA	NA	NA	NA	SIDT1	43869	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	114998646	114998840	114998743	Y	NA	NA	GAP43	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1407	1225186	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	115918215	115918449	115918332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	825096	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	117568330	117568637	117568613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	824785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	120397142	120397339	120397236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	62145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	120397505	120397688	120397597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2E1	61796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	121676624	121676834	121676729	Y	HCLS1,EAF2,CSTA,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	ILDR1	62217	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	121785309	121785676	121785328	Y	EAF2,CD86,CD86	ILDR1	NA	NA	NA	NA	ILDR1	46258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	122787344	122787648	122787385	Y	SEMA5B,PDIA5	PDIA5	NA	NA	NA	NA	PDIA5	3435	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	123351425	123351671	123351446	Y	ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	49036	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	123356199	123356268	123356234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX4	183151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr3	126259496	126259659	126259567	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	65739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	126292509	126292856	126292714	Y	NA	TXNRD3NB	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	32542	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	TXNRD3,CHCHD6	NA	NA	NA	NA	TXNRD3	19613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	127266508	127266786	127266647	Y	KBTBD12	MCM2,TPRA1	CHCHD6	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	48280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	128054461	128054660	128054529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475N22.4	151395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.3209619988322
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-475N22.4	10465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	128310952	128311168	128311056	Y	DNAJB8,RAB7A,GATA2,GATA2,GATA2	NA	EEFSEC,GATA2,LOC90246	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	86750	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	128366732	128367045	128366901	Y	NA	RPN1	NA	NA	NA	NA	RPN1	30873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	128446542	128446927	128446583	Y	NA	RPN1,RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	RAB7A	3577	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	129204579	129204997	129204770	Y	NA	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	47611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	129245456	129245718	129245564	Y	RHO	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	77943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	129313710	129313984	129313815	Y	H1FOO	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	9677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	129572979	129573244	129573238	Y	NA	TMCC1	NA	NA	NA	NA	TMCC1	37175	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	133747879	133748000	133747885	Y	C3orf36,SLCO2A1	SLCO2A1	NA	NA	NA	NA	SLCO2A1	21028	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	134100770	134101008	134100801	Y	NA	RPL39P5,AMOTL2	AMOTL2,MIR4788,ANAPC13,CEP63	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL2	8449	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	135827453	135827844	135827484	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	86239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	135828343	135828732	135828538	Y	PPP2R3A	NA	NA	NA	NA	NA	MSL2	85351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK1	52601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	270282	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	140186013	140186197	140186105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A36	472475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	141047061	141047339	141047200	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	6006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	141130337	141130617	141130393	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	73272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	141173878	141174028	141173977	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	29861	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	16.3007248535653
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	148781933	148782210	148782183	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20131	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149119420	149119639	149119543	Y	NA	TM4SF1	WWTR1,ANKUB1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	25768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149284462	149284628	149284613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	74015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	149533104	149533741	149533325	Y	RNF13	RNF13	NA	NA	NA	NA	RNF13	4609	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	101365	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	149666531	149666918	149666689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	99657	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	149668313	149668642	149668480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFN2	97933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	150456267	150456381	150456351	Y	NA	RP11-103G8.2,FAM194A,SIAH2-AS1,SIAH2	NA	NA	NA	NA	SIAH2-AS1	21343	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr3	155382767	155382896	155382833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCH1	77960	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC4	100432	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	161086549	161087201	161086872	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	161087231	161087661	161087620	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1007	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	161125031	161125340	161125185	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	36363	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	161133387	161133714	161133484	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	44719	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	161133836	161133975	161133914	Y	NA	SPTSSB	NMD3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	45168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	161138601	161138921	161138632	Y	NMD3,C3orf57	SPTSSB	NMD3,PPM1L,B3GALNT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	49933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr3	161139893	161140384	161140069	Y	NA	NA	NMD3,PPM1L,B3GALNT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSB	51225	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	167861793	167862038	167861919	Y	NA	NA	GOLIM4	IMR90	Hi-C	24141950	GOLIM4	50030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	169494029	169494036	169494033	Y	NA	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	5410	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	292977	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	172229975	172230511	172230380	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	8786	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	172238180	172238555	172238252	Y	NA	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	742	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2	NA	NA	NA	NA	ECT2	43612	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	173197299	173197871	173197356	Y	NLGN1	NA	NA	NA	NA	NA	ECT2	730827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	174257765	174258124	174258055	Y	NA	NA	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	103402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	174949564	174949783	174949705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	484675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	174991972	174992412	174992335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	442046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	175695899	175696046	175695968	Y	NA	NA	NLGN1	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V1P2	261441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	176276751	176276920	176276836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	636341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	176774167	176774584	176774367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	138677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	176916249	176916425	176916364	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	2988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	176917124	176917355	176917241	Y	NA	TBL1XR1	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	3863	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	177076157	177076922	177076435	Y	TBL1XR1	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	162896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	177434552	177434810	177434802	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	97843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	179049621	179049719	179049674	Y	NA	ZNF639,MFN1	NA	NA	NA	NA	ZNF639	10842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	180040639	180040822	180040650	Y	NA	NA	PEX5L	IMR90	Hi-C	24141950	TTC14	277096	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	182550667	182550775	182550721	Y	ATP11B	ATP11B	NA	NA	NA	NA	ATP11B	41379	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	182642205	182642465	182642335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	59276	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	182825824	182825958	182825903	Y	NA	MCCC1	NA	NA	NA	NA	MCCC1	5905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr3	183024720	183025033	183024891	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	55688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	183684356	183684550	183684447	Y	NA	ABCC5	NA	NA	NA	NA	ABCC5	49253	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	183726020	183726143	183726081	Y	NA	ABCC5,EEF1A1P8	PARL	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC5	7660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	183980250	183980567	183980542	Y	CAMK2N2,ECE2	ALG3,ECE2,CAMK2N2,PSMD2,EIF4G1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N2	2999	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	184078263	184078665	184078465	Y	NA	EIF4G1,FAM131A,CLCN2,POLR2H,CHRD	NA	NA	NA	NA	POLR2H	757	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	187467867	187468249	187468141	Y	BCL6	BCL6	NA	NA	NA	NA	BCL6	6352	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	187636889	187637150	187637085	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	175374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	187904912	187905263	187905013	Y	BCL6,BCL6	LPP,LPP-AS2	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	35067	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	188109949	188110178	188110065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	240104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	188986096	188986296	188986196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	323093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	359374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	189025742	189026175	189025816	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	362739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	189029389	189029728	189029564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	366386	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr3	189034066	189034494	189034299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	371063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.96960657055735
chr3	189428483	189428800	189428617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	765480	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	194058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr3	192997761	192997785	192997774	Y	NA	HRASLS	NA	NA	NA	NA	HRASLS	40847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.78717057081686
chr3	193988501	193988592	193988547	Y	FAM43A	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99880	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	194022185	194022450	194022442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC15	66022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	195531239	195531516	195531404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	101431	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	195628817	195629072	195628853	Y	NA	TNK2-AS1	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	3875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	195632869	195633225	195632990	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr3	196047617	196047878	196047747	Y	NA	PCYT1A,TCTEX1D2	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D2	4447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	196244998	196245175	196245085	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	NA	NA	NA	NA	RNF168	16359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	196255741	196255873	196255820	Y	NA	RNF168,FBXO45,WDR53	UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19	IMR90	Hi-C	24141950	RNF168	27102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	196377844	196378239	196377963	Y	NA	LINC01063,PIGX	NA	NA	NA	NA	PIGX	13198	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	196437709	196437842	196437776	Y	NA	CEP19,PAK2	NA	NA	NA	NA	CEP19	545	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	196757369	196757726	196757658	Y	LRRC33,SENP5,MFI2,MFI2	AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2	NA	NA	NA	NA	MFI2	2682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	196995168	196995509	196995411	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	28662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	197007663	197007913	197007866	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	16258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr3	197153931	197154131	197153988	Y	MFI2,MFI2	NA	BDH1,DLG1,LOC100507086	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	129760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	751950	752022	752014	Y	NA	RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	21615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr4	789468	789689	789607	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	15831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	1535396	1535629	1535516	Y	NA	RP11-1398P2.1	KIAA1530	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1398P2.1	44351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	1712467	1712893	1712787	Y	WHSC1	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	2403922	2404158	2403968	Y	ZFYVE28	ZFYVE28	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	14232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	2764467	2764789	2764630	Y	LOC402160	TNIP2,SH3BP2	TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TNIP2	8364	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	3469404	3469760	3469670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	62526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	3625478	3625822	3625684	Y	NA	NA	FLJ35424,LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	LRPAP1	93192	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	3872963	3873310	3873200	Y	NA	NA	LOC100133461,FAM86EP,FLJ35424,ADRA2C	IMR90	Hi-C	24141950	FAM86EP	81836	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	6918330	6918775	6918508	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	9361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	8411022	8411421	8411226	Y	NA	ACOX3	NA	NA	NA	NA	ACOX3	29029	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	9693091	9693174	9693121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	312932	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	10053251	10053319	10053285	Y	NA	RP11-448G15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-448G15.1	47145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	13193944	13194185	13194064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	138853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	13250215	13250573	13250395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	82465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	14534686	14534846	14534766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	467452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	14780950	14781106	14781029	Y	NA	NA	LOC441009	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	221192	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	15074859	15075210	15075035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB2	72561	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	24159507	24159811	24159735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	424362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	24471215	24471562	24471389	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	24474307	24474984	24474891	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	109189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	24599702	24600087	24599863	Y	NA	DHX15	SOD3,CCDC149	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	15529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	24840398	24840758	24840578	Y	NA	NA	SOD3	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC149	139068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	24913671	24913932	24913802	Y	CCDC149	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	65894	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	24975738	24976056	24975826	Y	DHX15,CCDC149,CCDC149	CCDC149	NA	NA	NA	NA	CCDC149	3770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr4	25876466	25876513	25876490	Y	SEL1L3	SEL1L3	C4orf52	IMR90	Hi-C	24141950	SEL1L3	13084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	26082532	26082681	26082657	Y	NA	NA	RBPJ,TBC1D19	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	80396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	26449466	26449471	26449469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D19	126588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	28460749	28460765	28460756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1600528	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	36183139	36183486	36183313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	60645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	36191564	36191723	36191675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	52408	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	37477962	37478211	37478180	Y	C4orf19	C4orf19	NA	NA	NA	NA	C4orf19	24399	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	37568600	37568635	37568618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf19	115037	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	37956443	37956472	37956456	Y	NA	PTTG2	NA	NA	NA	NA	PTTG2	3584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	38567143	38567404	38567260	Y	NA	NA	KLF3,FLJ13197,TBC1D1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	96413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr4	38607589	38607693	38607690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF3	56124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	504	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	38787045	38787364	38787204	Y	TLR6,TLR1,KLF3	NA	TLR10	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-617D20.1	122541	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	39038547	39038755	39038651	Y	NA	KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	5904	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	39541890	39542238	39542037	Y	NA	UGDH-AS1,UGDH	NA	NA	NA	NA	UGDH	13959	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	39614591	39614990	39614756	Y	NA	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	23770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	39638477	39638619	39638541	Y	C4orf34	RP11-539G18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-539G18.2	141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	40628320	40628499	40628391	Y	NA	RBM47	NA	NA	NA	NA	RBM47	2393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	40791893	40792102	40791997	Y	NSUN7	NSUN7	NA	NA	NA	NA	NSUN7	41979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr4	41384257	41384615	41384267	Y	NA	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	24633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	42819226	42819612	42819419	Y	ATP8A1,GRXCR1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A1	162104	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	54890749	54890967	54890889	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	37890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	57254661	57255026	57254688	Y	CEP135	AASDH,PPAT,PAICS	NA	NA	NA	NA	AASDH	2995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	65473910	65474488	65474148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	179283	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	66516104	66516284	66516196	Y	NA	RP11-807H7.1,EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	17395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	66899965	66900079	66900021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	365752	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	68281708	68281730	68281719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	283167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr4	76487136	76487403	76487267	Y	NA	THAP6,RCHY1	NA	NA	NA	NA	RCHY1	49162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	77868010	77868840	77868612	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	16	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	77869090	77869312	77869177	Y	NA	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	234	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	77931984	77932418	77932077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNI	62740	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	78016666	78016743	78016704	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	21508	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	78067816	78068100	78067958	Y	CCNI,CCNG2	CCNG2	CCNI	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCNG2	8204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	78977065	78977655	78977359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	195391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	84359899	84360122	84360011	Y	NA	HELQ,MRPS18C	NA	NA	NA	NA	HELQ	14887	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	85873236	85873576	85873407	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	11962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	86242920	86243264	86243093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	151003	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	86410493	86410688	86410582	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	16226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	87048261	87048368	87048363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN13	465100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	87838829	87839174	87839055	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	14980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	88443267	88443740	88443428	Y	DSPP,SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	101533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	89713529	89713901	89713721	Y	HERC6,HERC5	NA	FAM13A-AS1,NAP1L5,HERC3	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L5	96143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1019048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.37838857068711
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	1423447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr4	95374521	95374795	95374668	Y	NA	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	3484	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	99443713	99444102	99443889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	133678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	100861794	100861850	100861822	Y	NA	LAMTOR3,DNAJB14,RP11-15B17.1,H2AFZ	NA	NA	NA	NA	DNAJB14	4033	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	102254048	102254281	102254164	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	12656	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	103701783	103702159	103702029	Y	NA	MANBA,RP11-10L12.4	NA	NA	NA	NA	MANBA	21632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	103750426	103750532	103750434	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3	RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2	NA	NA	NA	NA	RP11-10L12.4	3214	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	106188694	106188879	106188779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TET2	123662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	106324406	106324791	106324687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPA2	68447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr4	106635528	106635690	106635582	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	7593	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	NPNT,INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	106887801	106887968	106887883	Y	NPNT	NA	NA	NA	NA	NA	INTS12	72658	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	108783895	108784172	108784033	Y	SGMS2	SGMS2	NA	NA	NA	NA	SGMS2	40176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	111023992	111024272	111024132	Y	NA	RP11-115A14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	41258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	111041485	111041815	111041651	Y	NA	RP11-115A14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	23715	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr4	111116750	111117174	111116883	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	1181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	118953861	118954102	118953937	Y	NDST3	NA	NA	NA	NA	NA	SNHG8	243762	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	120476359	120476426	120476393	Y	PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE5A	71720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	120493215	120493297	120493256	Y	C4orf3	NA	NA	NA	NA	NA	PDE5A	54849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	123074024	123074337	123074286	Y	KIAA1109,IL21,IL2	KIAA1109	KIAA1109	K562	ChIA-PET	22265404	KIAA1109	2536	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	124373851	124374047	124373905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	57901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	125634465	125634726	125634691	Y	NA	ANKRD50	NA	NA	NA	NA	ANKRD50	2578	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr4	128752654	128753022	128752839	Y	HSPA4L	PLK4	NA	NA	NA	NA	PLK4	46994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	129088221	129088417	129088319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP1B	107798	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	130505538	130505741	130505620	Y	C4orf33	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	492774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr4	139833159	139833355	139833260	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	101588	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140096766	140097018	140096889	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF2	394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140235316	140235657	140235500	Y	ELF2,RAB33B	NAA15,NDUFC1	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	13611	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	140334690	140334958	140334824	Y	ELF2	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	37428	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	140696118	140696274	140696196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	111196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140727942	140728268	140728103	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	143020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140897225	140897350	140897279	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	175988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	140982751	140983079	140982915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	90259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	141164479	141164682	141164571	Y	MAML3	SCOC	MAML3,MGST2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCOC	11758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	142559455	142559780	142559588	Y	ZNF330,IL15	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-362F19.1	307683	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	144276815	144277022	144276900	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	20900	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr4	144401789	144402147	144401968	Y	NA	SMARCA5	NA	NA	NA	NA	SMARCA5	30469	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	146655718	146656086	146655845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	146764373	146764705	146764540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	93082	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	148654111	148654384	148654270	Y	PRMT10	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	2897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	149364278	149364693	149364534	Y	NR3C2	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NR3C2	428	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	151557010	151557332	151557171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	377547	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	151956610	151956785	151956696	Y	NA	LRBA	LRBA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRBA	21731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	152406480	152406763	152406721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	78112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	153190429	153190517	153190474	Y	NA	NA	FAM160A1,PET112,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-18H21.1	170523	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	153412522	153412921	153412842	Y	NA	FBXW7,MIR4453	NA	NA	NA	NA	FBXW7	42332	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr4	154598070	154598582	154598380	Y	TLR2	TLR2	TLR2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TLR2	22070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	157869778	157870097	157870082	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	20449	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr4	159112760	159112996	159112870	Y	TMEM144	RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	7760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	159130594	159130739	159130610	Y	TMEM144	RP11-597D13.9,FAM198B,TMEM144	NA	NA	NA	NA	TMEM144	9838	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	159451512	159451881	159451714	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	139396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	159748095	159748254	159748211	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	59805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	160605526	160605775	160605746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	917236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	7.68583399831317
chr4	161769764	161769816	161769790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	2081474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	163021917	163022313	163022263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	1063760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	200219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169509077	169509260	169509148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	52140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169514585	169514902	169514734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	57648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169705913	169706245	169706080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	223181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169853850	169854103	169853858	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	75323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169991170	169991417	169991322	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	61744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr4	170030173	170030283	170030178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	100747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	174112212	174112389	174112298	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	23409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	174185845	174186217	174186078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB2	68059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr4	175148409	175148685	175148547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP44	54143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr4	176340534	176340934	176340734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA4	773888	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	176796113	176796315	176796215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA4	318507	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	176918206	176918483	176918345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA4	196339	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	177715411	177715680	177715585	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	3530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	178849873	178850023	178850005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	488216	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	183418367	183418505	183418425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	418584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	185189191	185189340	185189323	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	204394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	185279028	185279188	185279108	Y	ACSL1,IRF2	NA	LOC728175,IRF2	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2	114546	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	185613623	185613900	185613762	Y	CCDC111	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	44960	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	185744961	185745284	185745261	Y	NA	ACSL1	NA	NA	NA	NA	ACSL1	688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	186495067	186495245	186495187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-279O9.4	104397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	186621921	186622234	186622189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-279O9.4	231251	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr4	187648916	187649309	187649113	Y	NA	FAT1	FAT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	FAT1	3040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr5	394851	394874	394864	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	46384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	486422	486571	486496	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	15209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.05406628482453
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	1080709	1080898	1080802	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	29252	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	1129967	1130071	1130019	Y	SLC12A7	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	19817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	1130725	1130985	1130924	Y	NA	SLC12A7	BRD9,LOC100506688,TRIP13,SLC12A7,NKD2,SLC6A18,CLPTM1L,MIR4457,ZDHHC11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC12A7	20575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr5	1315765	1316275	1315843	Y	TERT	CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	CLPTM1L	26939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	CLPTM1L	26332	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	2694499	2694872	2694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	55373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	4949257	4949492	4949391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	469285	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	5361249	5361374	5361312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	57403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.15204257029784
chr5	7397224	7397590	7397441	Y	C5orf49,ADCY2	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	2903	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr5	7421559	7421813	7421686	Y	NA	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	27238	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	7662909	7663198	7663053	Y	ADCY2,C5orf49	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	186101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	7784884	7784893	7784889	Y	ADCY2	NA	NA	NA	NA	NA	MTRR	64406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	10270287	10270466	10270406	Y	NA	FAM173B,CCT5,CMBL	NA	NA	NA	NA	CCT5	22254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr5	10371627	10371888	10371758	Y	NA	MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	19812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	11312366	11312746	11312566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	552982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	19315150	19315342	19315248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2023M8.1	570868	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	33688737	33688976	33688873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TARS	249935	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	34037436	34037722	34037670	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	31216	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	TTC23L	NA	NA	NA	NA	TTC23L	1245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	35136467	35136726	35136597	Y	PRLR	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	92068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	35159419	35159781	35159689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRLR	69013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	35220570	35220626	35220598	Y	AGXT2,PRLR	PRLR	NA	NA	NA	NA	PRLR	8168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	35797370	35797672	35797610	Y	SPEF2,IL7R	NA	NA	NA	NA	NA	CAPSL	139209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	35884312	35884698	35884400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPSL	52183	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	36030784	36031024	36030904	Y	UGT3A2	NA	NA	NA	NA	NA	CAPSL	93903	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	36898243	36898633	36898363	Y	NIPBL	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NIPBL	23382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3650	109177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	39713773	39713912	39713841	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	253371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	39716547	39716931	39716737	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	256145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	260926	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	40522086	40522320	40522223	Y	PTGER4,CARD6	NA	NA	NA	NA	NA	PTGER4	155280	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	40967939	40968194	40968008	Y	C6,C7	NA	NA	NA	NA	NA	RPL37	134502	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	42505068	42505257	42505244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHR	83189	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43038627	43038828	43038720	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	AC025171.1	849	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	49660016	49660402	49660209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMB	76680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	52662185	52662487	52662317	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFS4	191976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	53482707	53482721	53482714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	121691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	101396	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	54759780	54760082	54759933	Y	NA	NA	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	64447	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	56060040	56060308	56060136	Y	NA	MAP3K1	MAP3K1	MCF7,IMR90,HELA	ChIA-PET,Hi-C,5C	22265404,24141950,22955621	MAP3K1	49093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	56731620	56731973	56731778	Y	NA	NA	PLK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPBP1	263845	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	57389991	57390128	57390060	Y	NA	NA	PLK2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLK2	363959	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	59041159	59041490	59041319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	740050	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	59171284	59171310	59171298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	610230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	64062726	64062917	64062822	Y	NA	SREK1IP1	NA	NA	NA	NA	CWC27	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	145831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	64796548	64796879	64796719	Y	PPWD1,CENPK	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	60119	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	28070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	65932774	65933082	65932801	Y	NA	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	42598	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	66016454	66016847	66016518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4	126278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	66114936	66115229	66115083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	182552	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	66188697	66188845	66188789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	108936	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	66500752	66500937	66500779	Y	NA	NA	MAST4,CD180	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAST4-AS1	202971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	66510755	66511249	66511045	Y	NA	NA	MAST4,PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAST4-AS1	212974	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	66518350	66518491	66518422	Y	CD180	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	220569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	67752610	67752698	67752666	Y	PIK3R1	NA	PIK3R1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CTC-537E7.2	74659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr5	68608364	68608565	68608447	Y	CCDC125	CCDC125,CHCHD2P2	NA	NA	NA	NA	CCDC125	18071	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	68627457	68627610	68627506	Y	NA	CCDC125,CHCHD2P2,RAD17,TAF9	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P2	146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	71045616	71045849	71045733	Y	NA	NA	MCCC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MCCC2	164501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	72792808	72793048	72792966	Y	NA	BTF3	NA	NA	NA	NA	BTF3	575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	73612322	73612454	73612340	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321394	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	77765293	77765351	77765322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	110954	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	77779546	77779957	77779719	Y	AP3B1	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	125207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	77791213	77791569	77791505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	136874	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	78439900	78440059	78439990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	89802	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	78843402	78843606	78843502	Y	CMYA5,HOMER1	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	78843882	78844075	78843988	Y	NA	RP11-342F17.1,HOMER1	THBS4,BHMT2,HOMER1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOMER1	35842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	78886263	78886493	78886377	Y	NA	PAPD4	NA	NA	NA	NA	PAPD4	19450	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	80707651	80707683	80707665	Y	SSBP2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC9	112242	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	83018086	83018575	83018426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	646404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	88053730	88053941	88053836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	83694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	92913655	92914013	92913834	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	3030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr5	92932960	92933102	92933051	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	15917	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	94033836	94034405	94034124	Y	KIAA0825,ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	81527	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	94412847	94413065	94412956	Y	MCTP1	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	205214	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	94843632	94843977	94843805	Y	NA	TTC37,ARSK	NA	NA	NA	NA	TTC37	44734	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	95199166	95199388	95199264	Y	GLRX,ELL2	GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42457	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	95227563	95227763	95227704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1	67942	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	96902008	96902041	96902023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2278B20.1	231264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	102728995	102729017	102729006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf30	136592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	106724874	106725113	106725059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	279483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	106908701	106908838	106908775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	95758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	106931094	106931453	106931417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	73143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	107272988	107273215	107273140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	268392	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	107555103	107555441	107555272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXL17	160358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	108022286	108022631	108022483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	58892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	110838164	110838531	110838380	Y	WDR36,CAMK4,STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	7757	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	111018976	111019194	111019085	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	172688	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	111342511	111342737	111342622	Y	STARD4	NA	NREP,LOC100505678	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L4A-AS1	151486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	111502817	111502914	111502867	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	8594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr5	111528702	111529013	111528858	Y	EPB41L4A	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	34479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	111734624	111734920	111734701	Y	APC	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	18093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	111742657	111742758	111742708	Y	NA	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	10255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	118257403	118257748	118257576	Y	NA	PTMAP2	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	49743	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	118592872	118593203	118593036	Y	NA	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	9184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	118678067	118678220	118678144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	75680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	118679433	118679692	118679586	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	77046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	120004624	120004640	120004633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	990732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	124178131	124178310	124178211	Y	NA	RP11-436H11.1	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	35205	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	126087846	126088015	126087939	Y	NA	RP11-434D11.4,LMNB1	MEGF10,LMNB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-434D11.4	22163	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	127295109	127295375	127295239	Y	NA	NA	SLC12A2,FLJ33630,PRRC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC12A2	122083	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	127421091	127421133	127421112	Y	NA	SLC12A2	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	3633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	130718102	130718482	130718270	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	138916	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	130739357	130739526	130739407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	160171	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	131074214	131074509	131074363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP1	56201	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	131603786	131604244	131603934	Y	NA	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A4	23892	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	20602	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	132581339	132581487	132581431	Y	ANKRD43	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	195685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	133455254	133455613	133455348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKP1	55116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	133463735	133464046	133463858	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	SKP1	NA	NA	NA	NA	SKP1	46683	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	133681629	133682059	133681927	Y	NA	CDKL3,UBE2B	NA	NA	NA	NA	CDKL3	22679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	6.41893828430551
chr5	137810438	137810840	137810496	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	11259	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	137826508	137826985	137826545	Y	NA	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	27329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr5	137868208	137868538	137868536	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	8451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	AC034243.1	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	40304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC034243.1	154401	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138277949	138278244	138278038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	190951	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138319677	138319832	138319813	Y	DNAJC18,LRRTM2	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	232679	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138727034	138727338	138727139	Y	LOC389333	MZB1,SPATA24	NA	NA	NA	NA	MZB1	3264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	139049454	139050310	139049802	Y	MATR3,MZB1,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	24570	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	139464204	139464218	139464211	Y	NA	PURA	CYSTM1,NRG2	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	21144	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	139568486	139568801	139568644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PURA	83124	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	139629538	139629745	139629587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN1	50961	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	139988439	139988554	139988499	Y	HBEGF,ANKHD1,SRA1,APBB3,IK,HARS2,CD14,CD14	SLC35A4,APBB3,TMCO6,IK,NDUFA2,MIR3655	NA	NA	NA	NA	APBB3	17102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	9421	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	140894023	140894210	140894163	Y	NA	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	40443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	140899669	140900070	140899720	Y	PCDH12,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	46089	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	141256552	141256862	141256814	Y	PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1	KIAA0141	NA	NA	NA	NA	PCDH1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	141407173	141407212	141407192	Y	NA	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GNPDA1	16567	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	AC005592.2,SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr5	142105384	142105400	142105392	Y	FGF1	ARHGAP26	ARHGAP26,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP26	42549	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	142216734	142217104	142216831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	68785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	142305329	142305654	142305542	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	157380	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	142362111	142362403	142362189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	214162	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	142541504	142541934	142541585	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	168236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	142580387	142580630	142580509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	129540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	142609232	142609364	142609290	Y	NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	100806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	146268013	146268084	146268061	Y	STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P48	182850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	146887479	146887544	146887495	Y	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P48	802316	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	346281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	148505231	148505419	148505389	Y	NA	ABLIM3	ADRB2,AFAP1L1,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	13627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr5	148540754	148540865	148540805	Y	ABLIM3	ABLIM3	AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ABLIM3	21708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	148738164	148738422	148738235	Y	PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	NA	NA	NA	NA	PCYOX1L	2594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	148836415	148836621	148836572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	92386	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	149111581	149111664	149111645	Y	NA	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	3720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	149838456	149838698	149838517	Y	SYNPO,ZNF300,SLC6A7	RPS14,NDST1	NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS14	11137	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	149989582	149989693	149989611	Y	GPX3	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	10940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	150474739	150475397	150475230	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	3601	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	151129219	151129502	151129338	Y	SLC36A1	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	14437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	153939934	153940118	153940082	Y	NA	NA	FAM114A2,MFAP3,SAP30L	IMR90	Hi-C	24141950	SAP30L	116417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr5	156694779	156695141	156694960	Y	NA	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	3690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	156700202	156700407	156700238	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	9113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	158938695	158938959	158938847	Y	EBF1	NA	ADRA1B,LOC285627,TTC1	IMR90	Hi-C	24141950	UBLCP1	250606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.19595257094662
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	159480874	159481257	159481243	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	46754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	159837617	159837836	159837727	Y	NA	C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	SLU7	8882	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	162507124	162507145	162507136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNG1	355430	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	162811410	162811429	162811421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNG1	51146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	167558741	167558830	167558746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	157826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	RANBP17	NA	NA	NA	NA	RANBP17	2674	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	170378492	170378604	170378547	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	91618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	171600987	171601129	171601000	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	12261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	171709316	171709633	171709569	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	171847636	171847998	171847816	Y	NA	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	31529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr5	172264744	172264958	172264926	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	5466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	172329840	172330200	172330006	Y	DUSP1,C5orf41,ATP6V0E1,ERGIC1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	53532	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	172451248	172451363	172451250	Y	NA	ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E1	42488	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	173153574	173153834	173153704	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	BOD1	111911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr5	173251298	173251668	173251379	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	61615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	173252274	173252478	173252451	Y	NA	NA	BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPEB4	60805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	175347355	175347516	175347492	Y	NA	NA	CPLX2	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP148	294164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	176421508	176421945	176421807	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6,HK3	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	25689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	176422952	176423155	176423071	Y	HK3,UIMC1,UIMC1,UIMC1,RAB24,GRK6	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	24479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	176526460	176526848	176526554	Y	FGFR4,FGFR4	FGFR4,NSD1	NA	NA	NA	NA	FGFR4	14573	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.61825114228251
chr5	176782864	176783054	176782988	Y	NA	MXD3,LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	6011	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	176790168	176790403	176790363	Y	DOK3,RGS14	LMAN2,GRK6	NA	NA	NA	NA	LMAN2	13315	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	177508624	177508880	177508650	Y	NA	RP11-889L3.1,N4BP3,RMND5B	N4BP3,GMCL1P1,NHP2,AGXT2L2,HNRNPAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-889L3.1	28019	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	177541057	177541427	177541157	Y	N4BP3	N4BP3,RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	N4BP3	2613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	177647239	177647603	177647383	Y	CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	17731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	179399876	179400065	179399971	Y	RNF130,RASGEF1C	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	67017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	317745	318083	317920	Y	DUSP22,IRF4	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	28115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	393896	394326	394097	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	104266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	297215	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	1641578	1641903	1641733	Y	NA	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	32897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	1702305	1702315	1702310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	93624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	2038182	2038509	2038345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	205417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4	NA	NA	NA	NA	PSMG4	30302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	3356099	3356749	3356628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	98507	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	3371068	3371359	3371318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	83897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	3427913	3428207	3428060	Y	SLC22A23	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	27049	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	4447290	4447339	4447314	Y	NA	NA	CDYL	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	257054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	6407628	6407920	6407729	Y	LY86	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	697910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	7532623	7532708	7532667	Y	NA	DSP	CAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	DSP	7100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	8545597	8545822	8545710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B3	111803	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	10315279	10315501	10315368	Y	PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	102391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	10771427	10771996	10771700	Y	ELOVL2,MAK	TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	SYCP2L	25400	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	11263609	11264019	11263885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	116562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	11277838	11278167	11278081	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	102414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	12234649	12234812	12234726	Y	HIVEP1,EDN1	NA	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	53784	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	12287477	12287842	12287503	Y	NA	EDN1	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	754	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr6	12291396	12291672	12291434	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	2800	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr6	12328741	12329205	12329092	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	40145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	12332214	12332482	12332362	Y	NA	EDN1	EDN1,TMEM170B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EDN1	43618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr6	12602673	12603131	12602821	Y	NA	NA	TMEM170B,EDN1,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	90331	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13597663	13598060	13597862	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	15499	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13602068	13602103	13602086	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	11456	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13651430	13651585	13651505	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	37871	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	13662469	13662838	13662724	Y	NA	NOL7,RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	46958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	13712805	13713056	13713043	Y	NA	RANBP9	NA	NA	NA	NA	RANBP9	3009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RANBP9	501265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	15516223	15516554	15516389	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	144735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	15535179	15535578	15535319	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	125711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	15542142	15542162	15542152	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	119127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	15622564	15622845	15622741	Y	JARID2	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	38444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16151584	16151748	16151704	Y	NA	MYLIP	NA	NA	NA	NA	MYLIP	24228	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16342665	16342812	16342725	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	105854	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	16439523	16439703	16439580	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	202712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16477089	16477316	16477218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	240278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16481928	16482422	16482245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	245117	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16588159	16588355	16588257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	171014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16668776	16668955	16668866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	90414	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16690265	16690543	16690477	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	68826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	16699529	16700051	16699938	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	59318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16741302	16741617	16741570	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	17752	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	16849710	16850068	16849769	Y	ATXN1	NA	ATXN1	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	89988	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	17496190	17496270	17496230	Y	NA	RPL7P26	NA	NA	NA	NA	RPL7P26	33613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	17614611	17614952	17614695	Y	KIF13A,NUP153,FAM8A1	FAM8A1	NA	NA	NA	NA	FAM8A1	16025	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	18413524	18414034	18413760	Y	KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	46745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	20211469	20211688	20211565	Y	NA	MBOAT1	NA	NA	NA	NA	MBOAT1	799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	20642705	20642902	20642804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	110017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	21603523	21603934	21603831	Y	SOX4	SOX4	NA	NA	NA	NA	SOX4	11551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	21738487	21738974	21738702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	146515	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	24302656	24303033	24302868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRS2	98120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	24698648	24698887	24698768	Y	NA	TDP2,ACOT13,C6orf62	NA	NA	NA	NA	C6orf62	20177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	24926284	24926609	24926580	Y	ALDH5A1,TDP2	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	GMNN	153125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	24926891	24927058	24926968	Y	TDP2	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	GMNN	153732	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25089428	25090170	25089848	Y	TDP2,C6orf62	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	187136	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	182565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25352378	25352572	25352400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	75072	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25458860	25459089	25458879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	181554	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25836224	25836451	25836337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	182267	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	26029019	26029363	26029242	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H3B	925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr6	26169489	26169538	26169514	Y	BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BE	12420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	26219063	26219301	26219164	Y	NA	HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AE	3898	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	26232920	26233434	26233137	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	26233560	26233958	26233761	Y	NA	HIST1H4D,HIST1H1PS1,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H1D	344	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2APS4,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr6	26322637	26323123	26322876	Y	NA	HIST1H4H	HIST1H1D,HIST1H4F,ABT1,HIST1H4G,HMGN4,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2BI,HIST1H3G,HCG11,HIST1H4I,HIST1H2BK	IMR90	Hi-C	24141950	HIST1H4H	38875	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN3A3,BTN2A1,HCG11	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	27740489	27740807	27740621	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	32902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	27798416	27798741	27798578	Y	NA	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H4K	1111	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	28180543	28180884	28180590	Y	NA	ZKSCAN4	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN4	44127	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	28834475	28834586	28834545	Y	NA	XXbac-BPG308K3.5,HCG14	NA	NA	NA	NA	HCG14	27721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	30010922	30011054	30010960	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	13622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	30019374	30019509	30019439	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	ZNRD1	5167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.60473457107638
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	28146	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	30254050	30254472	30254356	Y	NA	HLA-L,TRIM39,HCG18	NA	NA	NA	NA	HLA-L	28689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	30651242	30651620	30651357	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2052	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	30716597	30717062	30716912	Y	IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1	IMR90	Hi-C	24141950	IER3	6266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	30720004	30720713	30720325	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20	DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	9673	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	30796195	30796565	30796398	Y	HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3	DDR1	IER3,FLOT1,DDR1,VARS2,GTF2H4,C6orf136,DHX16,C6orf15,PSORS1C1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDR1	45633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr6	32050642	32051035	32051003	Y	LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB	ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	ATF6B	42995	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	32819276	32819643	32819486	Y	HLA-DRA,HLA-DRB5,TAPBP,RGL2,HLA-DPA1,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9	TAP2,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP1	112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	33159164	33159383	33159309	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1	NA	NA	NA	NA	SLC39A7	6839	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	33216178	33216307	33216243	Y	NA	SLC39A7,RXRB,HSD17B8,RING1,HCG25,RPS18,VPS52,B3GALT4,PFDN6,WDR46,RGL2	NA	NA	NA	NA	HCG25	867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	33392796	33393285	33393082	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	8702	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	CUTA	12219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	33950913	33951144	33951041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEMD2	196000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr6	34062369	34062554	34062462	Y	GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	122662	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	34099261	34099385	34099317	Y	GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	85831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	34102440	34102470	34102458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP55	82746	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	34110371	34110716	34110594	Y	PACSIN1,GRM4	NA	NA	NA	NA	NA	CYCSP55	74500	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr6	34112239	34112588	34112446	Y	PACSIN1,GRM4	NA	MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	CYCSP55	72628	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	34512763	34512881	34512822	Y	SPDEF	SPDEF	NA	NA	NA	NA	SPDEF	9229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr6	34514432	34514838	34514655	Y	NA	SPDEF	NA	NA	NA	NA	SPDEF	7272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	34521580	34522143	34521703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPDEF	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr6	34522619	34522917	34522660	Y	SPDEF	SPDEF	NA	NA	NA	NA	SPDEF	509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	35270455	35270931	35270541	Y	TAF11,ANKS1A,ZNF76,DEF6,PPARD	ZNF76,DEF6,PPARD	NA	NA	NA	NA	DEF6	6860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	35445364	35445634	35445501	Y	RPL10A	FANCE,RPL10A,TEAD3	NA	NA	NA	NA	RPL10A	11179	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	36628616	36629003	36628769	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN1A	13302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	36997320	36997527	36997354	Y	STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,C6orf89,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2	MTCH1	NA	NA	NA	NA	MTCH1	45246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	37212541	37212901	37212835	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	10647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	38514218	38514357	38514288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	91567	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73866	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	41929474	41929675	41929644	Y	NA	MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	42548	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	41995989	41996337	41996109	Y	NA	CCND3,TAF8	NA	NA	NA	NA	CCND3	19758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	42090479	42090803	42090657	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	17554	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	42219475	42219699	42219588	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	35872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	ATP6V0CP3,TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	43766474	43766976	43766784	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	30553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1120P11.3	29897	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	44029482	44029781	44029724	Y	NFKBIE,MAD2L1BP	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,MAD2L1BP,VEGFA,XPO5,MRPS18A,C6orf223,MRPL14	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.3	9869	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	44044328	44044673	44044418	Y	C6orf223,NFKBIE	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1120P11.1	3939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.3,RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	44186277	44186510	44186378	Y	SLC29A1	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	1035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	44929943	44930213	44930183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	413477	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	45319946	45320392	45320176	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	23298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	45503698	45503963	45503769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	160008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr6	46640633	46640732	46640698	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	21955	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR110	94404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	100665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	50785208	50785298	50785212	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	772	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	9.96624628352697
chr6	50787533	50788503	50788259	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	3097	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr6	50818020	50818494	50818241	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	4881	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr6	51084563	51084693	51084631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	261188	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	451885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	52217307	52217701	52217502	Y	NA	PAQR8	PAQR8,MCM3,EFHC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PAQR8	6518	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	52505026	52505217	52505106	Y	NA	TMEM14A	EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM14A	28690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53175462	53175877	53175681	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	36070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53348299	53348382	53348306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	131386	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53376137	53376766	53376496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	103002	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	53412768	53413364	53413026	Y	GCLC	NA	NA	NA	NA	NA	GCLC	66404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53660581	53660848	53660781	Y	LRRC1	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	3286	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	53678166	53678361	53678262	Y	NA	LRRC1	NA	NA	NA	NA	LRRC1	20871	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	54027576	54027936	54027713	Y	KLHL31,MLIP	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	370281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	57267458	57267955	57267680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	89855	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	57292576	57292862	57292719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	114973	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	64299850	64300199	64300025	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	43526	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	64771855	64771881	64771868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	428130	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	69803382	69803773	69803578	Y	BAI3	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	701230	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	74194767	74195136	74194952	Y	NA	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	25466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	79597447	79597572	79597510	Y	NA	IRAK1BP1	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	22258	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	82648128	82648420	82648330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	187637	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	83931407	83931579	83931543	Y	UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	RWDD2A,PGM3	IMR90	Hi-C	24141950	PGM3	29752	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	86178039	86178499	86178211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX14	123375	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	88183289	88183642	88183572	Y	NA	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	4948	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	88416343	88416722	88416531	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	6416	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	88433013	88433258	88433054	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	AKIRIN2-AS1,AKIRIN2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AKIRIN2	23086	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	90596283	90596734	90596349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	58670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	90885505	90885892	90885812	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	118735	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	91134952	91135221	91135020	Y	NA	NA	BACH2	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	130325	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	100007525	100007878	100007702	Y	LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	6971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	100676865	100677032	100676949	Y	NA	NA	SIM1	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	299120	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	101204667	101204976	101204826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	122272	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	106054753	106054940	106054882	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	205794	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	106057484	106057635	106057546	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	208525	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	106537985	106538349	106538117	Y	PRDM1,PRDM1	PRDM1	NA	NA	NA	NA	PRDM1	5790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	107216864	107217098	107216981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	130309	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	107773333	107773402	107773368	Y	SOBP	PDSS2	NA	NA	NA	NA	PDSS2	5366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	107774853	107775271	107775085	Y	BEND3	PDSS2	NA	NA	NA	NA	PDSS2	3497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	108972074	108972278	108972175	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	93036	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	109035823	109035995	109035909	Y	NA	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90	Hi-C	24141950	ARMC2	131624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	109268721	109269067	109268913	Y	NA	RP11-249L21.4	SESN1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-249L21.4	41645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	109381114	109381226	109381160	Y	NA	SESN1,CEP57L1	NA	NA	NA	NA	SESN1	32796	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	25433	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	111924339	111924647	111924531	Y	TRAF3IP2	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	834	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	114005806	114006016	114005966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	170525	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	116988703	116988966	116988944	Y	DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	ZUFSP	746	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	117069916	117070184	117070134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KPNA5	69566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	119217591	119217640	119217616	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	4207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	121396728	121397112	121396920	Y	C6orf170	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-18P	1133682	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	124478305	124478669	124478487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF217	803022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	125052883	125053191	125053068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF217	228500	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	128816273	128816626	128816620	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	23244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	130576545	130576804	130576675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	243701	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	132972348	132972541	132972445	Y	NA	NA	STX7,TAAR6,TAAR3,VNN1,VNN3,C6orf192,TAAR9	IMR90	Hi-C	24141950	STX7	140011	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	133133336	133133580	133133458	Y	NA	SNORD101	NA	NA	NA	NA	RPS12	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	133837061	133837238	133837150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBPL1	434070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TBPL1	380399	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	134943068	134943371	134943223	Y	NA	NA	LOC154092,SGK1,ALDH8A1,HMGA1P7	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	305818	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr6	136293369	136293422	136293396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	315567	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	136434966	136435173	136435049	Y	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	173816	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	136657752	136658013	136658001	Y	NA	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	48763	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	136688131	136688248	136688227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	79142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	136691586	136691742	136691665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	82597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	136839838	136840084	136840036	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	29873	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	137227679	137227915	137227797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	85962	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	137517813	137517908	137517861	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	20678	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	137545116	137545441	137545236	Y	MAP3K5,IFNGR1	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	6530	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	137558937	137559207	137559098	Y	NA	IFNGR1	IFNGR1,OLIG3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IFNGR1	20351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	138350085	138350335	138350173	Y	PERP	NA	KIAA1244,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PERP	76313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	138421052	138421264	138421123	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	5384	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	138821349	138821443	138821380	Y	REPS1,NHSL1	NA	NA	NA	NA	NA	HEBP2	98681	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	139300314	139300341	139300327	Y	NHSL1	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	7057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	139697079	139697371	139697327	Y	NA	CITED2	NA	NA	NA	NA	CITED2	3322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	140075983	140076182	140076083	Y	NA	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	382226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	140085604	140086085	140085978	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	TXLNB,CITED2,LOC645434,LOC100132735	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	391847	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	142508557	142508921	142508635	Y	NA	VTA1	NA	NA	NA	NA	VTA1	42190	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	142644630	142644955	142644766	Y	NA	GPR126	NA	NA	NA	NA	GPR126	23639	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	143234736	143235083	143235000	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	144996503	144996745	144996624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	476401	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	145136843	145137199	145137021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	616741	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	148424761	148425105	148424843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	166335	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	148628020	148628101	148628061	Y	NA	SASH1	SASH1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SASH1	36580	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	148823673	148823949	148823781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	148879188	148879351	148879251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UST	187113	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	149352415	149352625	149352483	Y	ZC3H12D,TAB2,SUMO4	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	185152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	149693406	149693750	149693583	Y	NA	NA	ZC3H12D	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	155629	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	149744636	149745011	149744913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIL4	120163	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	150259749	150260211	150260119	Y	NA	RAET1G,ULBP2,ULBP1	NA	NA	NA	NA	ULBP2	925	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	151373285	151373500	151373395	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	45165	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	151770191	151770744	151770510	Y	NA	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	RMND1	515	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	313723	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr6	153358098	153358156	153358117	Y	SYNE1,RGS17	MTRF1L	NA	NA	NA	NA	MTRF1L	36278	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	NA	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	SCAF8	141362	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	156758659	156759033	156758861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	338030	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	157936149	157936334	157936215	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC14	135984	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	158702253	158702563	158702348	Y	TMEM181	NA	TMEM181,TULP4,SYTL3,GTF2H5,DYNLT1	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2H5	114869	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159237852	159238517	159238245	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159383408	159383511	159383422	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	35708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	159445065	159445260	159445163	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	25846	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	160399624	160399885	160399732	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	11493	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	160409606	160409719	160409663	Y	IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	21475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	160837218	160837569	160837394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2R	449087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	161450213	161450498	161450260	Y	NA	MAP3K4	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	39454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	161796504	161796762	161796717	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	385745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	162572071	162572234	162572145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARK2	574569	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	163817744	163818245	163818151	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	14787	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	164572657	164572833	164572684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	739625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	168250541	168251043	168250675	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	24939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	168789584	168789819	168789635	Y	NA	NA	CCR6	IMR90	Hi-C	24141950	MLLT4	563982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.35135542827484
chr6	169260852	169260926	169260885	Y	NA	NA	WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	839233	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr6	170654095	170654292	170654195	Y	FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	56304	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	1125303	1125884	1125584	Y	GPER,GPER	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	43091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.09797628547331
chr7	2551232	2551336	2551252	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	1069	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2561604	2562123	2561810	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	11441	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2729556	2729797	2729642	Y	LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	59971	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2733557	2733913	2733713	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	TTYH3	63972	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2842322	2842519	2842421	Y	NA	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	30736	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	5488496	5488516	5488506	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	25451	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	5492663	5492953	5492758	Y	MMD2,SLC29A4	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	29618	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	5571967	5572766	5572739	Y	RBAK,RBAK	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	20538	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	5718052	5718263	5718155	Y	USP42	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	101107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	5739659	5740040	5739772	Y	USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	79330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	6425136	6425343	6425226	Y	CCZ1,USP42	RAC1	NA	NA	NA	NA	RAC1	12982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	7604061	7604281	7604173	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.36487199948098
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.20946914215275
chr7	7608686	7608956	7608841	Y	MIOS	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	4183	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	8165403	8166093	8165752	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	133770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	8218168	8218233	8218201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	81630	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM106B	387817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	13889552	13889950	13889896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P21	219055	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	16707771	16707941	16707875	Y	NA	ANKMY2,BZW2	NA	NA	NA	NA	BZW2	24015	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	16886935	16887473	16887050	Y	NA	AGR2	NA	NA	NA	NA	AGR2	15878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR2	158534	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	17170041	17170200	17170099	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	166046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	17315787	17316189	17315986	Y	NA	AHR,AC003075.4	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AHR	20057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20163699	20164108	20163996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	90919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20197239	20197492	20197368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	57535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr7	20202226	20202605	20202544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACC1	52422	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20217388	20217681	20217578	Y	TWISTNB,MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	37346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	15637	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20254261	20255002	20254926	Y	MACC1	MACC1,AC005083.1	NA	NA	NA	NA	MACC1	25	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	20638818	20638965	20638895	Y	ITGB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL23P8	225980	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	158455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	24924727	24925102	24925076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	94151	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	25299375	25299555	25299465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYCS	136395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	25872655	25872829	25872766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	317031	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	27231816	27231998	27231907	Y	HOXA10,HOXA11,HOXA13	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P4	75299	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	27386345	27386573	27386562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35P4	79048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	28243549	28243770	28243627	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	25187	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	29534563	29534631	29534599	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	AC007255.8	66655	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr7	29835746	29835982	29835865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	190234	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	30188805	30188913	30188846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8	123785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	30203047	30203422	30203138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	118501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	30264220	30264659	30264440	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	57264	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	30265497	30265992	30265714	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	55931	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	30387689	30388072	30387783	Y	NOD1,ZNRF2	AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	20915	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	30505141	30505406	30505161	Y	NA	NOD1	NA	NA	NA	NA	NOD1	10994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	32026855	32027150	32027002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	505745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	37465448	37465531	37465509	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	750293	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	39774001	39774145	39774098	Y	CDK13,RALA	LINC00265	NA	NA	NA	NA	LINC00265	2770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	801617	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	41048804	41049055	41048930	Y	NA	NA	LOC285954,INHBA,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	691651	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	41952797	41953130	41952994	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	212091	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	42047614	42048012	42047844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI3	227457	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	42533163	42533415	42533331	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	GLI3	257694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	44674941	44675231	44675112	Y	PURB,MYO1G,CCM2,DDX56,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	30770	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	44855333	44855416	44855373	Y	TBRG4,H2AFV	PPIA,H2AFV	NA	NA	NA	NA	PPIA	21054	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	47631233	47631542	47631345	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	11077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	56173322	56173423	56173410	Y	NA	SUMF2,CHCHD2,NUPR1L	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	1053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	NUPR1L	1524341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1796107	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	64295695	64295915	64295830	Y	ZNF680	ZNF138,ZNF273	NA	NA	NA	NA	ZNF273	32635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	64353047	64353418	64353232	Y	NA	ZNF273	NA	NA	NA	NA	ZNF273	24497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.0405497136184
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	66159622	66159870	66159746	Y	NA	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	14471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	66783772	66783944	66783858	Y	NA	STAG3L4,PMS2P4	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	17878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	67069957	67070055	67070006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	304063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	68877694	68877897	68877796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	184008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	73078661	73079023	73078813	Y	NA	WBSCR22,DNAJC30	NA	NA	NA	NA	WBSCR22	16332	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	73915723	73915843	73915806	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	49603	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	74074203	74074528	74074318	Y	LAT2,GTF2I	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	4209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75701168	75701283	75701226	Y	NA	STYXL1,MDH2,AC005077.12	NA	NA	NA	NA	MDH2	25799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	AC005077.12	59736	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	77043308	77044194	77043379	Y	PTPN12,PTPN12,PION	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN12	120398	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	77316787	77316835	77316811	Y	NA	RSBN1L-AS1,RSBN1L	NA	NA	NA	NA	RSBN1L-AS1	6747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	79844591	79844960	79844776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	83320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	80337478	80337851	80337650	Y	NA	NA	SEMA3C	IMR90	Hi-C	24141950	GNAT3	198142	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	92384322	92384817	92384698	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	166614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	92463754	92464079	92463922	Y	CDK6,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	246046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	94140158	94140537	94140353	Y	CASD1	CASD1	NA	NA	NA	NA	CASD1	3627	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr7	95030354	95030375	95030365	Y	NA	PON2	NA	NA	NA	NA	PON2	32135	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	95861904	95862185	95862172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	87274	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	98809347	98809684	98809536	Y	ZNF655,ZNF655,ZKSCAN5,PTCD1,PDAP1,FAM200A,CPSF4,BUD31,ATP5J2,ARPC1A,SMURF1,KPNA7	NA	SMURF1	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF1	69624	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	99551289	99551506	99551376	Y	ZCWPW1,PILRA,MEPCE,C7orf59,ZNF655,ZNF655	TRIM4,AZGP1,AZGP1P1	NA	NA	NA	NA	AZGP1	20274	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	101775527	101775981	101775908	Y	CUX1,CUX1,SH2B2,ORAI2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	226338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr7	102941984	102942200	102942104	Y	NA	PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	6115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	104612836	104613032	104612935	Y	NA	LINC01004	NA	NA	NA	NA	LINC01004	38459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	107116622	107117169	107116900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	84760	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	116452966	116453226	116453141	Y	CAPZA2	CAPZA2	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	3842	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	117953120	117953279	117953191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA38	131034	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	120938122	120938485	120938307	Y	FAM3C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	95933	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	121008996	121009049	121009023	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	25369	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	123843194	123843309	123843252	Y	TMEM229A	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	WASL	456073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	124419446	124419631	124419539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POT1	148406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	127775885	127775901	127775893	Y	NA	NA	SND1,MIR129-1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC4	105725	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	127876972	127877440	127877187	Y	IMPDH1,LRRC4	NA	PAX4,FSCN3,SND1,LEP,RBM28	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM28	104522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.39190514189324
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	129410177	129410359	129410300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	160622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr7	129420694	129421120	129420768	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	169669	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	129508183	129508482	129508331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	82307	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	130013597	130013906	130013823	Y	CPA2,CPA1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP41	66368	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	COPG2	179013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	130675334	130675529	130675395	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	117326	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	131919616	131920007	131919874	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	678640	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	94774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC083875.2	225554	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	133706471	133706698	133706584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRGUK	103354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35B4	117353	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	134469498	134469802	134469635	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	BPGM	139938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	NA	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf73	113880	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	137402741	137402885	137402822	Y	DGKI	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	281928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	138143570	138143814	138143720	Y	NA	TRIM24	NA	NA	NA	NA	TRIM24	491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	138588804	138589334	138589100	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	74730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	138643234	138643648	138643551	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	20416	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	138779904	138780459	138780182	Y	NA	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	12006	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	138791748	138791993	138791908	Y	UBN2,LUC7L2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	472	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	139420496	139420947	139420749	Y	TBXAS1,JHDM1D,HIPK2	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	54630	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	139588015	139588387	139588262	Y	JHDM1D,TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	112438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	142823985	142823994	142823990	Y	NA	PIP	NA	NA	NA	NA	PIP	3176	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	142936809	142937123	142937021	Y	NA	GSTK1,CASP2	NA	NA	NA	NA	GSTK1	2063	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX,EPHA1	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	145933200	145933594	145933373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	1401712	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr7	148685182	148685277	148685231	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	38456	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	149413428	149413754	149413591	Y	NA	KRBA1	NA	NA	NA	NA	KRBA1	3556	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr7	149471511	149471709	149471700	Y	ATP6V0E2,SSPO	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	2943	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	149745351	149745623	149745500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2-AS1	169652	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	151199311	151199621	151199557	Y	NA	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	15585	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	151479942	151479960	151479953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	92167	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	151986893	151987163	151987026	Y	MLL3	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	266134	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr7	152111667	152111916	152111792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	259334	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	152160343	152160554	152160402	Y	ACTR3B	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210696	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	154742897	154743129	154742996	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49665	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	154743291	154743691	154743552	Y	NA	PAXIP1	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	49103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	156792805	156792864	156792835	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	8481	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	157071910	157072285	157071928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	53790	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	158603982	158604371	158604316	Y	NA	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	16573	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	2263330	2263439	2263406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	493188	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	648687	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	6274860	6275007	6274938	Y	MCPH1	MCPH1	NA	NA	NA	NA	MCPH1	12747	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	6481206	6481441	6481325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	82289	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	8203793	8204189	8204138	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	37819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	10305932	10306275	10305955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	389119	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	10676875	10677241	10677058	Y	NA	PINX1	NA	NA	NA	NA	PINX1	18153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	17888641	17888793	17888717	Y	NAT1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	51584	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	17893767	17894158	17893964	Y	NAT1,ASAH1,ASAH1	CTD-2547L16.1,ASAH1	NA	NA	NA	NA	CTD-2547L16.1	46219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	19120111	19120389	19120229	Y	NA	SH2D4A	PSD3,LOC100128993,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	SH2D4A	48739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	20294602	20294707	20294648	Y	NA	NA	ATP6V1B2	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	241724	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	21624397	21624558	21624547	Y	NPM2,GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	150622	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr8	21804083	21804253	21804128	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	28903	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	21817623	21817860	21817686	Y	NA	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	42443	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	22551843	22553123	22552848	Y	PPP3CC,PDLIM2,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10C,EGR3	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	EGR3	3028	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	22626037	22626421	22626168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGR3	77222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	23415988	23416142	23416060	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	31670	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	24013716	24014104	24013764	Y	STC1	NA	STC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-148P	81045	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	25133664	25134104	25133793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	93426	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	25284653	25284746	25284700	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	KCTD9	29246	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	27208490	27208766	27208628	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	41491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	29144637	29144837	29144777	Y	NA	KIF13B	KIF13B	IMR90	Hi-C	24141950	KIF13B	25996	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	29198749	29199265	29198931	Y	KIF13B,DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	6920	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	29204481	29204724	29204678	Y	NA	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	1461	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	30892930	30893420	30892948	Y	NA	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	3613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	33265826	33266145	33265940	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	62795	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-84O15.1	1203648	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	37738160	37738666	37738484	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	16319	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	37748183	37748461	37748291	Y	WHSC1L1,RAB11FIP1,LETM2,LETM2	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	6524	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	37749222	37749683	37749580	Y	WHSC1L1,LETM2,LETM2,RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	5302	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	37760968	37761285	37761070	Y	RAB11FIP1	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	5983	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	37761676	37761790	37761689	Y	NA	RAB11FIP1	RAB11FIP1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RAB11FIP1	6691	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	37961561	37961954	37961758	Y	NA	ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	38313401	38313535	38313485	Y	NA	FGFR1	NA	NA	NA	NA	FGFR1	10817	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	38647998	38648343	38648132	Y	LETM2,LETM2,PLEKHA2,TACC1	NA	NA	NA	NA	NA	TACC1	64294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	40032102	40032537	40032342	Y	IDO1	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT4	720815	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	40049035	40049230	40049136	Y	NA	NA	GOLGA7,C8orf4,ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	ZMAT4	704122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	40698186	40698285	40698236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMAT4	55067	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	41733569	41733873	41733722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	173635	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	42383718	42383741	42383730	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	11328	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	MIR4469,HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	MIR4469	61	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	48282787	48283030	48282901	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	208294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	48853752	48854057	48853918	Y	NA	PRKDC,MCM4	NA	NA	NA	NA	PRKDC	16686	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	49638531	49638925	49638704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	193374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	130727	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	58862148	58862160	58862155	Y	NA	FAM110B	NA	NA	NA	NA	FAM110B	42908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	59995784	59996163	59995974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMAF	425381	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.94257342814509
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	62634431	62634735	62634612	Y	ASPH	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	9084	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	66615323	66615688	66615531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	60354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	66663796	66664162	66663979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	88395	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	88197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	87539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	AC084082.3	NA	NA	NA	NA	AC084082.3	13095	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	70310732	70311124	70310931	Y	NA	NA	C8orf34	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-159H10.3	433222	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	70596467	70596635	70596551	Y	SLCO5A1,SLCO5A1,SLCO5A1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H10.3	147711	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	71031909	71031920	71031915	Y	NA	RNU1-101P,RP11-152C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	17495	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	71158637	71159069	71158929	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	144223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2,XKR9	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	73008234	73008433	73008334	Y	NA	NA	TRPA1,LOC100132891	IMR90	Hi-C	24141950	TERF1	910666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	74544159	74544287	74544223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	113656	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	79578942	79579038	79579012	Y	IL7,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	136720	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	80996547	80996769	80996670	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	56023	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	81041762	81041917	81041834	Y	TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	TPD52	99550	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	81615108	81615487	81615408	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	219254	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	81695028	81695405	81695288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	299174	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	239297	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	87404027	87404214	87404101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP1	51060	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	90740659	90741027	90740842	Y	NA	RP11-37B2.1,RIPK2	DECR1,NBN,RIPK2,OSGIN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-37B2.1	26928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	90776453	90776674	90776498	Y	OSGIN2,RIPK2	RP11-37B2.1,RIPK2	NA	NA	NA	NA	RIPK2	8478	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	90838382	90838725	90838688	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK2	70407	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	90849173	90849652	90849503	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	62435	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	97494117	97494415	97494266	Y	NA	SDC2	NA	NA	NA	NA	SDC2	9164	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	99637150	99637421	99637401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	315634	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr8	101475207	101475346	101475256	Y	YWHAZ,YWHAZ,SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	94666	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	101476271	101476730	101476459	Y	YWHAZ,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD46	93282	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	101500158	101500422	101500292	Y	NA	NA	RNF19A,GRHL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD46	69590	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr8	101527632	101527771	101527702	Y	RNF19A,RNF19A	ANKRD46	NA	NA	NA	NA	ANKRD46	42241	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	101679774	101679926	101679916	Y	NA	NA	FLJ42969,SNX31,PABPC1	IMR90	Hi-C	24141950	PABPC1	53111	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	102135026	102135273	102135149	Y	NA	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	81148	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	102449376	102449720	102449428	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	52940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	102450789	102450808	102450799	Y	GRHL2	NA	NACAP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	51852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.68919428534355
chr8	102516990	102517159	102517011	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	14330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	104090039	104090169	104090107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	58748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	104196928	104197190	104197047	Y	AZIN1,DCAF13	NA	NA	NA	NA	NA	FZD6	111471	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	104457896	104458033	104457972	Y	NA	DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	SLC25A32	32479	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	107870700	107870850	107870776	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	162459	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	109647939	109647957	109647950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	202377	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	183721	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	935761	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	116439816	116440252	116439936	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	379647	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	116441706	116441935	116441732	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	377964	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	116450341	116450508	116450425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	369391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	116454411	116454736	116454628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	365163	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr8	116507305	116507631	116507503	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	312268	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	116641527	116641923	116641875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	177976	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.87163028508404
chr8	116990613	116990894	116990712	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	170714	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	117000021	117000603	117000221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	180122	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	117366472	117366785	117366629	Y	NA	NA	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	409957	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	117484091	117484236	117484201	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	292506	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	119189481	119189499	119189490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	67389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	120995010	120995163	120995088	Y	DEPTOR	NA	NA	NA	NA	NA	DEPTOR	111053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	FAM83A	NA	NA	NA	NA	FAM83A	19539	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	124549741	124550229	124550044	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1217	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	124552481	124552488	124552485	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	1035	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	124608792	124609080	124608936	Y	FBXO32	NA	ANXA13,FBXO32,KLHL38	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO32	57346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	124665857	124666229	124666132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	112467	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	126112372	126112753	126112532	Y	TRIB1,NSMCE2	NSMCE2,KIAA0196	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	10290	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	126268557	126268681	126268622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	166475	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	126285545	126285900	126285649	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154663	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	126296437	126296656	126296547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	143907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	126451967	126452238	126452064	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	11404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	127829528	127829825	127829677	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	260890	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	128070328	128070629	128070508	Y	FAM84B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	501690	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	544207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128171088	128171312	128171255	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	574368	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128313576	128313848	128313696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	431832	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128403573	128403875	128403698	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	341805	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128407875	128408267	128408231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	337413	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr8	128435102	128435271	128435258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	310409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128680448	128680536	128680487	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	65144	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128811691	128811973	128811933	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	6912	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128835085	128835527	128835341	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	30306	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	128879185	128879808	128879466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	74406	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	129047466	129047656	129047576	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	26609	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	129139934	129140421	129140284	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	119077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	129981605	129981909	129981758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	960748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	130176726	130177115	130176951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	850260	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	130947350	130947645	130947497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	79730	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131080516	131080850	131080671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	53141	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131269679	131269819	131269766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	184087	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	131495645	131495684	131495664	Y	NA	ASAP1	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	41739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	133689212	133689471	133689356	Y	PHF20L1	LRRC6	NA	NA	NA	NA	LRRC6	3374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	134046532	134048654	134047578	Y	TMEM71,PHF20L1,TG	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	260914	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	134089498	134089860	134089633	Y	TG,SLA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	222405	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	134258134	134258466	134258300	Y	PHF20L1,NDRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	53799	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	49483	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	ST13P6	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	30168	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	134552406	134552812	134552641	Y	ST3GAL1	ST3GAL1	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	29371	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	134904629	134905458	134904900	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL1	322446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	139925414	139925432	139925424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	787867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141172181	141172567	141172375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	294111	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141179581	141179847	141179769	Y	EIF2C2,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	286831	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141189770	141190115	141189943	Y	TRAPPC9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	276563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	141604721	141605198	141605144	Y	EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	85324	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	141945462	141945818	141945641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	64497	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	142278857	142279200	142279029	Y	NA	SLC45A4	DENND3,SLC45A4,PTK2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC45A4	37204	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	BAI1	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAI1	5207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,SLURP1	NA	NA	NA	NA	SLURP1	11901	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr8	144094701	144094997	144094860	Y	LY6K,C8orf55	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	2402	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	144112654	144112974	144112830	Y	CYP11B2	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	15255	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	144609980	144610203	144610126	Y	NA	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1	NA	NA	NA	NA	ZC3H3	11420	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr8	144820199	144820570	144820386	Y	RHPN1,C8orf73,FAM83H	FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	FAM83H-AS1	5889	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr8	144843026	144843252	144843141	Y	NA	FAM83H,FAM83H-AS1	SCRIB,PUF60	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83H-AS1	28716	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr8	145070098	145070262	145070188	Y	NA	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH	NA	NA	NA	NA	GRINA	7872	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	145088816	145089042	145088955	Y	PLEC,GRINA,SPATC1	PLEC,GRINA,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1	NA	NA	NA	NA	PARP10	3876	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	145118322	145118976	145118932	Y	LOC100130274,SPATC1	PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	NA	NA	NA	NA	OPLAH	1587	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr8	145549095	145549459	145549304	Y	NA	BOP1,HSF1,DGAT1,FBXL6,ADCK5	NA	NA	NA	NA	DGAT1	522	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr8	145995593	145996127	145996081	Y	COMMD5,COMMD5,COMMD5,ZNF34	ZNF251,ZNF34,RPL8	NA	NA	NA	NA	ZNF34	14603	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	225416	225914	225497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	242377	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	825642	825932	825803	Y	NA	NA	DOCK8,DMRT1	IMR90	Hi-C	24141950	KANK1	357351	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	NA	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A1	148013	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	5843832	5844207	5843936	Y	NA	ERMP1	ERMP1	IMR90	Hi-C	24141950	ERMP1	12715	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	6488249	6488567	6488283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	77098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr9	9469595	9469625	9469608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	380719	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	10027810	10028140	10027960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	938934	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	5.06758285603066
chr9	14233168	14233395	14233282	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	81689	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	14263032	14263410	14263221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	51674	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	14316018	14316353	14316263	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	934	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	7211	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chr9	14343303	14343452	14343378	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	28219	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	14343788	14343918	14343814	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	28704	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	14344703	14345053	14344877	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	29619	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	32909	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	4.5608245704276
chr9	14349817	14350014	14349895	Y	NA	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	34733	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	306073	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	23850835	23851256	23851099	Y	NA	ELAVL2	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	26500	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	27333351	27333416	27333383	Y	IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	194363	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	27599212	27599659	27599311	Y	C9orf72,C9orf72	C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	27348	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	33033161	33033386	33033274	Y	TOPORS,DNAJA1,NFX1,SMU1	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	9952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	33159697	33160189	33160012	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5165	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chr9	33162668	33163130	33162954	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	2224	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.01351657120613
chr9	33931170	33931493	33931332	Y	UBAP1,UBE2R2	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	115454	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	34193349	34193568	34193460	Y	NA	UBAP1,RP11-571F15.3	NA	NA	NA	NA	UBAP1	16346	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	84777	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TESK1	82515	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr9	35603577	35603740	35603659	Y	RECK	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	210	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chr9	36231547	36231666	36231607	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	CLTA	42694	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37924173	37924321	37924247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	124739	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37930298	37930375	37930337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	130864	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37954084	37954355	37954258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	112329	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	38008217	38008489	38008387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	58195	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1B1	46909	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	7.51691456977882
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	71567236	71567601	71567286	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	FXN	80574	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	72552552	72552866	72552709	Y	NA	NA	FAM189A2,APBA1,MAMDC2,LOC100507299,SMC5,LOC100507244	IMR90	Hi-C	24141950	PTAR1	179677	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	75200734	75200878	75200827	Y	ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	222571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	199070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	87466967	87467081	87467024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	873341	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	88184194	88184649	88184621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	170295	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.77365399961073
chr9	93683361	93683758	93683679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	438437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	94660957	94661066	94661012	Y	NA	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	49378	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	95452860	95453088	95452974	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	22313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	97679079	97679413	97679326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	192096	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	98218146	98218184	98218162	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	31068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr9	99408748	99408964	99408853	Y	C9orf21	RP11-535M15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-535M15.1	38374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	100981172	100981639	100981390	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	28250	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	101973951	101974336	101974174	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	ALG2	7902	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	102015806	102016715	102016602	Y	NA	ALG2,SEC61B	NA	NA	NA	NA	SEC61B	33460	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	108052780	108053053	108052862	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	SLC44A1	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	47877	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	108166209	108166576	108166239	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	41501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	109932773	109933133	109932953	Y	NA	NA	ZNF462,MIR548Q,RAD23B	IMR90	Hi-C	24141950	RAD23B	110285	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	111063260	111063480	111063351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	323633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	111313727	111314112	111313882	Y	NA	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-220D10.1	73001	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	112951364	112951513	112951412	Y	NA	C9orf152	NA	NA	NA	NA	C9orf152	16956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	114111620	114111657	114111640	Y	OR2K2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0368	133368	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	115625683	115626114	115625766	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	114565	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	116281787	116282895	116282664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLE3	110835	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	117249092	117249487	117249472	Y	NA	DFNB31	NA	NA	NA	NA	DFNB31	16243	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	117647197	117647589	117647272	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	80791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	117785314	117785612	117785505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	92924	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	117878279	117878434	117878355	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	102	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	119404408	119404429	119404420	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	43152	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	119451109	119451442	119451274	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	3528	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	119466124	119466469	119466162	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	18543	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	120162627	120162904	120162792	Y	NA	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	12444	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr9	120175638	120175763	120175745	Y	ASTN2	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	290	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr9	120507373	120507587	120507563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	332025	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	348008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	122486410	122486633	122486522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	853815	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	122984020	122984078	122984028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	356370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	123661924	123662231	123662224	Y	NA	PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	24318	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	124121200	124121289	124121241	Y	NA	STOM	GSN	IMR90	Hi-C	24141950	STOM	9242	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	124134922	124135274	124134953	Y	NA	STOM	GSN	MCF7	ChIA-PET	22265404	STOM	4391	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	3.63176771348864
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	56417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	126632279	126632299	126632291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	58132	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	126983428	126983685	126983554	Y	DENND1A	NEK6	DENND1A,NEK6,PSMB7,LHX2,LOC100129034	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	34200	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chr9	127267802	127268125	127267965	Y	NR5A1	NA	NA	NA	NA	NA	PSMB7	92079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	127837483	127837706	127837595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAI	66079	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	129590383	129590427	129590410	Y	ZBTB43	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	25098	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	129951111	129951299	129951234	Y	NA	GARNL3	NA	NA	NA	NA	GARNL3	33245	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130328926	130329278	130329070	Y	FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9990	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130373507	130373780	130373645	Y	GARNL3,SLC25A25,FAM102A,STXBP1	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	STXBP1	963	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	130770213	130770372	130770289	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	FAM102A	FAM102A,SLC25A25,NAIF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM102A	29421	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	131637939	131638335	131638137	Y	NA	C9orf114,LRRC8A,CCBL1	C9orf114,ENDOG	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8A	4056	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	C9orf106	64562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr9	132247452	132247693	132247545	Y	C9orf106	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	3722	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132249112	132249430	132249268	Y	CRAT,IER5L,PRRX2	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	5382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132460473	132461091	132460806	Y	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGES	52235	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132707337	132707718	132707526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	95755	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132769657	132769989	132769916	Y	NA	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	33484	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chr9	134316967	134317380	134317020	Y	NA	PRRC2B	NA	NA	NA	NA	PRRC2B	49487	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	134510539	134511032	134510903	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	102429	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	134608249	134608835	134608704	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	4626	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS	NA	NA	NA	NA	RALGDS	38153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.53379142801533
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr9	136779643	136779949	136779796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	75777	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136801856	136801932	136801893	Y	SARDH,SARDH	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	53794	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	136999790	136999893	136999856	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	WDR5	1303	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU6ATAC	2809	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	137247900	137248164	137247916	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	40956	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr9	137252796	137253042	137252967	Y	NA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	45852	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	137257724	137257990	137257923	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	50780	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	137259692	137260046	137259796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	52748	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chr9	137267558	137268069	137267755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	60614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	137302036	137302210	137302202	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	95092	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	137305745	137306050	137305907	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	98801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.675677714137422
chr9	137667512	137667789	137667676	Y	OLFM1,OLFM1	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	460568	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	137670812	137671011	137670912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	463868	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	138287033	138287362	138287321	Y	NA	NA	OLFM1,LOC100506599	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP1R26	81563	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	138370318	138370583	138370451	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	1393	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	139427023	139427107	139427058	Y	NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	11207	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	139428801	139428944	139428850	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	9370	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	139466507	139466851	139466737	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-611D20.2	27843	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	32.6014497071306
chr9	140067700	140068118	140068026	Y	LCNL1,C9orf142,CLIC3,ABCA2,FUT7	MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169	NA	NA	NA	NA	LRRC26	5197	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	140101916	140102100	140102008	Y	C9orf172,FUT7	MIR3621,LRRC26,ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	NDOR1	3769	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.87163028508404
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.760137428404599
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	RNF208,C9orf169,TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.844597142671777
chr9	140301516	140301688	140301630	Y	CACNA1B,NRARP	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	14026	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	140487255	140487495	140487481	Y	CACNA1B,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	4313	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.43581514254202
chr9	140523205	140523460	140523276	Y	ANAPC2,NDOR1,EHMT1	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	11761	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chr9	140526461	140526811	140526551	Y	NA	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	15017	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chr9	140565381	140565755	140565635	Y	NRARP	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	53937	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	1479744	1480128	1479953	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	29489	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	1480354	1481325	1480771	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	28292	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	1514556	1514901	1514870	Y	ASMTL,ASMT,AKAP17A,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	4939	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	1524384	1524716	1524554	Y	CRLF2,CRLF2,CSF2RA,CSF2RA,P2RY8,ASMTL,ASMT,AKAP17A,IL3RA,SLC25A6,ASMTL	SLC25A6,ASMTL	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	14767	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	2626782	2627186	2626915	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99	CD99	NA	NA	NA	NA	CD99	19562	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.26689571400767
chrX	9509355	9509595	9509475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	80020	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	9700566	9700851	9700709	Y	LOC100288814	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM2	51645	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	9896256	9896650	9896356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	84952	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	10051581	10051674	10051600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	69979	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120D5.1	540853	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	11722971	11723163	11723070	Y	NA	NA	ARHGAP6	IMR90	Hi-C	24141950	MSL3	51115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	14040371	14040544	14040433	Y	NA	GEMIN8	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	5468	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	14917883	14918076	14917977	Y	PIGA,MOSPD2,MOSPD2	FANCB,MOSPD2	NA	NA	NA	NA	MOSPD2	28320	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	19792866	19793266	19793149	Y	RPS6KA3,SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	110453	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	22152966	22153318	22153142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	196275	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	24044003	24044417	24044292	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1	EIF2S3	NA	NA	NA	NA	EIF2S3	26416	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	29496854	29497166	29496936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GK	1172310	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	168684	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	162597	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.591217999870244
chrX	39949495	39949781	39949700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	84801	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	39951266	39951579	39951437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	83003	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39958407	39958722	39958627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	75860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	39972723	39972902	39972813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	61680	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	40693990	40694519	40694253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	70718	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	41192009	41192079	41192030	Y	NA	DDX3X	NA	NA	NA	NA	DDX3X	1358	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	41780048	41780299	41780162	Y	CASK	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	417	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	511159	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	46773328	46773680	46773526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP2	78953	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	47221453	47221809	47221639	Y	USP11,ZNF81,SYN1	NA	UBA1,USP11	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF41	118536	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	49108550	49108714	49108667	Y	PIM2,PPP1R3F,FOXP3	HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F	NA	NA	NA	NA	PPP1R3F	15592	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	53467183	53467489	53467297	Y	FAM156A,TSPYL2,IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	7863	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	54668047	54668238	54668126	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	113403	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	56839801	56840427	56840156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRBP1	77791	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	57634372	57634764	57634423	Y	NA	ZXDB	NA	NA	NA	NA	ZXDB	18103	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	57669883	57670259	57670071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDB	53614	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	58057411	58058106	58058008	Y	NA	KRT8P17	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	48291	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	63554308	63554471	63554461	Y	MTMR8	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR8	58862	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	64683455	64683784	64683516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAS1L	68871	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8145	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.506758285603066
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	73350281	73350820	73350789	Y	RLIM	USMG5P1	JPX	IMR90	Hi-C	24141950	USMG5P1	40905	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	73791399	73791714	73791557	Y	RLIM	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	40738	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	74033137	74033450	74033294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	109832	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	74143243	74143469	74143354	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	0	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.337838857068711
chrX	75368142	75368530	75368366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGEE1	277516	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	77226253	77226302	77226278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP7A	62059	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	79828855	79829064	79828956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	234123	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	79830053	79830147	79830110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	233040	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1P1	476336	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	102820880	102821034	102820957	Y	NA	TCEAL4,TCEAL3	NA	NA	NA	NA	TCEAL4	8125	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	106247149	106247504	106247327	Y	CLDN2	MORC4	MORC4	IMR90	Hi-C	24141950	MORC4	5675	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	2.02703314241227
chrX	106922076	106922520	106922399	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	IMR90	Hi-C	24141950	PRPS1	52339	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	106928255	106928525	106928381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	58518	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	106944916	106945406	106945227	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	73166	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	106970108	106970471	106970179	Y	NA	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	48101	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.18243599974049
chrX	108605389	108605613	108605516	Y	NXT2,NXT2	NA	NA	NA	NA	NA	NXT2	171397	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	118816365	118816526	118816445	Y	NKRF,RPL39,RNF113A,SEPT6	SEPT6	NA	NA	NA	NA	SEPT6	8807	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	124339178	124339332	124339255	Y	NA	RP1-161N10.1	NA	NA	NA	NA	RP1-161N10.1	2991	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.85811371387791
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	1.5202748568092
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	136647486	136647742	136647575	Y	NA	ZIC3	NA	NA	NA	NA	ZIC3	1185	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	138002307	138002505	138002406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	300434	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	138215503	138215737	138215513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF13	87202	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chrX	140000500	140000988	140000725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	268322	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chrX	149863588	149863865	149863755	Y	MTM1,MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	4153	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.929056856938955
chrX	152064300	152064566	152064432	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	66789	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	129860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.422298571335889
chrX	152645473	152645760	152645615	Y	ZNF275	ZNF275	ZNF275	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF275	47860	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	152997096	152997386	152997147	Y	TMEM187,MECP2,ARHGAP4,ABCD1	SLC6A8,BCAP31,ABCD1,PLXNB3	NA	NA	NA	NA	ABCD1	8773	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.253379142801533
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.168919428534355
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	MDA-MB-453	hg19	FANTOM5	0.0844597142671777