chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17,PLEKHN1	NA	NA	NA	NA	SAMD11	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr1	993498	993878	993664	Y	NA	ISG15,AGRN,RP11-465B22.3,RNF223	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	384	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RNF223	2701	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	1014834	1015095	1014859	Y	NA	RP11-465B22.3,RNF223,C1orf159	RNF223	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	RNF223	7147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1124600	1124942	1124659	Y	HES4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	40469	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1144376	1144549	1144449	Y	NA	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	20862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	TAS1R3	983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,MRPL20,VWA1,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1708824	1709349	1708980	Y	NA	SLC35E2,NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	19954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2068660	2068858	2068763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	73301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2135885	2136186	2135927	Y	NA	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	5973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	2406489	2406881	2406723	Y	PLCH2	PANK4	NA	NA	NA	NA	PANK4	49158	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2505035	2505361	2505108	Y	SKI,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,RP3-395M20.8,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	10569	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	3398864	3399114	3399029	Y	NA	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	ARHGEF16	29874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	3463934	3464260	3464145	Y	ARHGEF16	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	61799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	5483188	5483543	5483374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNAB2	565983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	6894689	6894717	6894703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	51305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.04602406908344
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8724042	8724475	8724233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	151227	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	3383	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	9318130	9318195	9318182	Y	NA	H6PD,SPSB1	NA	NA	NA	NA	H6PD	25296	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	9535183	9535425	9535306	Y	NA	NA	SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	62116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	9885367	9885695	9885655	Y	NA	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	2783	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	9889535	9889880	9889709	Y	KIF1B	CLSTN1	NA	NA	NA	NA	CLSTN1	6951	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	12193120	12193399	12193251	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	31661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	12579035	12579403	12579221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	96334	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	15415174	15415506	15415314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM51	61522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	15519488	15519688	15519655	Y	NA	TMEM51	NA	NA	NA	NA	TMEM51	42460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	16156384	16156536	16156435	Y	EFHD2,CASP9,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	3660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16209325	16209770	16209445	Y	NA	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	36683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	16438237	16438733	16438326	Y	NA	FAM131C,RP11-276H7.2,EPHA2	FAM131C,CLCNKB	IMR90	Hi-C	24141950	FAM131C	40110	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	16499761	16499895	16499826	Y	SPEN,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	19179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16511251	16511623	16511321	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	30669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr1	16826315	16826438	16826391	Y	C1orf64,FAM131C,NBPF1	RNU1-1	NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr1	17578205	17578469	17578334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-380J14.1	63927	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	17896198	17896624	17896362	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	31868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	18884159	18884499	18884233	Y	NA	RP1-8B22.1	NA	NA	NA	NA	RP1-8B22.1	46547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	19264079	19264209	19264144	Y	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	16971	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	19794978	19795283	19795050	Y	PLA2G2E,UBR4	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	14783	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	19796024	19796128	19796080	Y	NA	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	13938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	20780827	20780970	20780908	Y	PLA2G2A	CAMK2N1	OTUD3,LOC339505	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2N1	29743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	21348947	21349299	21348998	Y	CDA,ECE1,ECE1	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	48947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21401731	21402159	21402110	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	3485	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21406931	21406946	21406939	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	8685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21588176	21588724	21588522	Y	ECE1,ECE1	NA	NA	NA	NA	NA	ECE1	81273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21724067	21724372	21724186	Y	NA	NBPF3	ECE1,NBPF3,RAP1GAP,ALPL,USP48	IMR90	Hi-C	24141950	NBPF3	40249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21966400	21966607	21966504	Y	NA	RAP1GAP	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	27194	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	21967959	21968010	21967985	Y	NA	RAP1GAP	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP	25791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	22260274	22260656	22260512	Y	HSPG2	HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	1134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	22836447	22836690	22836500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	60103	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	24691833	24692082	24691893	Y	PNRC2,GRHL3	GRHL3,NIPAL3	NA	NA	NA	NA	GRHL3	48021	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	25823926	25824130	25824028	Y	NA	LDLRAP1	LDLRAP1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	43941	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	26249033	26249281	26249192	Y	EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1	MIR3917,STMN1	STMN1,PAFAH2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STMN1	17551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	26613887	26614371	26614050	Y	FAM54B,PDIK1L,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,CD52	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	10220	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	26683687	26684084	26683890	Y	CNKSR1,AIM1L	CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	UBXN11	40833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27893464	27893671	27893490	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	35271	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	27926165	27926491	27926331	Y	NA	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	2451	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1,FGR	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	28189568	28190269	28189912	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	34279	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	29504261	29504387	29504317	Y	YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	29565762	29566055	29565979	Y	SRSF4,PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	4734	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	31430605	31430735	31430670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	50997	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	32405536	32405898	32405618	Y	NA	PTP4A2	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	2559	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	33225777	33226084	33225890	Y	TMEM54,KIAA1522	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	20291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	33454783	33455472	33455325	Y	RNF19B	RNF19B	NA	NA	NA	NA	RNF19B	26497	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	33564918	33565286	33565197	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	ADC	20213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	33802277	33802571	33802529	Y	NA	AL513327.1	NA	NA	NA	NA	AL513327.1	39302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	34628613	34629024	34628705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GJB5	589624	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	35892196	35892421	35892350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCDN	128653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	36877889	36878288	36878089	Y	NA	STK40,LSM10,OSCP1,MRPS15	NA	NA	NA	NA	LSM10	16396	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	37942874	37943354	37943027	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	4721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	37944084	37944971	37944382	Y	YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A	LINC01137,ZC3H12A,MEAF6	NA	NA	NA	NA	ZC3H12A	5931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	38285621	38285821	38285720	Y	ZC3H12A,MTF1	MANEAL,C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	YRDC	13764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	39516193	39516422	39516273	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	26203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	39629010	39629413	39629213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	84022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	40005546	40005959	40005647	Y	NA	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	34503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	33711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr1	40841336	40841595	40841379	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	32814	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	41994633	41994922	41994778	Y	SCMH1,HIVEP3	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	46289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	42073844	42074019	42073961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	125500	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	42367142	42367456	42367439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	42934748	42935131	42934805	Y	CCDC30,RIMKLA	PPCS,ZMYND12,CCDC30,TMSB4XP1	NA	NA	NA	NA	CCDC30	7747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	43405621	43405821	43405630	Y	CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	16709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	43884019	43884040	43884030	Y	ST3GAL3,MPL,SZT2	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	SZT2	30466	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	43901568	43901739	43901659	Y	NA	MED8,SZT2,HYI	NA	NA	NA	NA	HYI	15921	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	44984751	44985020	44984777	Y	C1orf228,RNF220	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	115885	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	45283789	45284126	45283958	Y	NA	RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2	NA	NA	NA	NA	RNU5E-6P	120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	45875042	45875301	45875196	Y	IPP,TESK2	NA	NA	NA	NA	NA	MUTYH	70900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	46575103	46575175	46575140	Y	PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	63570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	46689426	46689696	46689549	Y	FAAH,C1orf190	PIK3R3,POMGNT1,RAD54L	NA	NA	NA	NA	POMGNT1	5449	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	47055088	47055141	47055115	Y	NA	MKNK1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	25374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	47910443	47910471	47910460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK1	112974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51056997	51057361	51057215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	169825	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRTA2	196779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	51245588	51245972	51245952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	177963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51261727	51261870	51261800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	162065	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51442122	51442408	51442227	Y	NA	FAF1,CDKN2C	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	17705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51703075	51703494	51703244	Y	OSBPL9	RNF11	NA	NA	NA	NA	RNF11	3132	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51809780	51810107	51809799	Y	NA	TTC39A	NA	NA	NA	NA	TTC39A	992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	51886085	51886464	51886275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39A	77297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	52029722	52030067	52029870	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15,OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL9	10784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	52033462	52033748	52033585	Y	NA	OSBPL9	OSBPL9,EPS15,NRD1,TTC39A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL9	7103	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	52999324	52999688	52999506	Y	NA	ZCCHC11	PRPF38A,ORC1	IMR90	Hi-C	24141950	ZCCHC11	17471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	53703343	53703361	53703351	Y	NA	CPT2,C1orf123,MAGOH	NA	NA	NA	NA	MAGOH	1061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	54586706	54586840	54586800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL37	60874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	54808081	54808294	54808188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	68858	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	55594097	55594408	55594328	Y	NA	NA	PCSK9	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	84378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	55894779	55895033	55894906	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	USP24	215993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	58969564	58969575	58969570	Y	NA	DAB1,OMA1	NA	NA	NA	NA	DAB1	40831	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	59509588	59509786	59509693	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	250524	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	59616706	59617089	59616861	Y	NA	NA	HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	143221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HOOK1	121127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	61579491	61579639	61579512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	250560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	61918819	61919182	61919004	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	TM2D1	269913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	62726098	62726337	62726314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK4	56748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	64127998	64128504	64128154	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB3BP	70606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	65510370	65510451	65510413	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	20969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	65946781	65947169	65947001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPROT	62511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	68285768	68286070	68285946	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	11080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	68647153	68647165	68647159	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	49638	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	70017370	70017628	70017440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	651675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	70034819	70036254	70034877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	633049	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	430509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	70418678	70418852	70418759	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC40	250451	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	70709017	70709466	70709138	Y	NA	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	39652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	72696545	72696864	72696705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	871611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	818684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	73066346	73066731	73066539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT8P21	501744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	77595980	77596376	77595997	Y	NA	RP4-706A16.3	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	3212	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	77986592	77986666	77986629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	160438	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	78021710	78022056	78021808	Y	AK5,AK5,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	125048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	78067790	78068312	78068066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	78792	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	78703686	78703842	78703764	Y	NEXN	RP11-183M13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-183M13.1	10403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr1	82796843	82797145	82796994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	611465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	83506477	83506486	83506482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	818220	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	83528650	83529168	83528896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	795538	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	83530346	83530531	83530439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	794175	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-290M5.2	10071	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61,RP11-290M5.2	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290M5.2	14764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	88081374	88081620	88081497	Y	NA	NA	LOC339524	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	289223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	89466934	89467175	89467138	Y	GTF2B,GBP2,GBP3	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	10291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	90100291	90100368	90100330	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	3660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	90321378	90321621	90321467	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	36805	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	91361231	91361653	91361295	Y	NA	RP4-665J23.1	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	46024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	92184014	92184251	92184134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	185641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	92201825	92202076	92201951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	92781340	92781526	92781459	Y	TGFBR3,RPAP2	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	GLMN	18796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	53229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93032261	93032386	93032324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	81828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93270252	93270588	93270467	Y	NA	EVI5,RPL5	EVI5	IMR90	Hi-C	24141950	EVI5	14291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93324554	93324784	93324669	Y	NA	RPL5	NA	NA	NA	NA	RPL5	28972	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93408847	93409156	93409003	Y	NA	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	15901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93634565	93634982	93634927	Y	MTF2	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	CCDC18	8494	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	93660433	93660767	93660600	Y	NA	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	16148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93812976	93813243	93813111	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	RP4-717I23.3	3394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	94007993	94008357	94008092	Y	FNBP1L,BCAR3	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	96305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	94125861	94126246	94126059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	184460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr1	94498977	94498999	94498988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	126011	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	95155573	95156005	95155685	Y	NA	NA	F3,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	127832	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	25216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	95388205	95388608	95388523	Y	NA	CNN3	NA	NA	NA	NA	CNN3	2226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	97731783	97731967	97731875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	277290	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	98070725	98071007	98070866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	61468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	98177967	98178251	98178164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	168710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	221450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	100113534	100114036	100113879	Y	AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	4035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	100138206	100138591	100138311	Y	AGL,AGL,AGL,AGL,PALMD	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	28707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr1	100502622	100502881	100502754	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	101202267	101202571	101202418	Y	NA	VCAM1	NA	NA	NA	NA	VCAM1	18969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	101392986	101393260	101393033	Y	S1PR1,SLC30A7,SLC30A7	EXTL2,SLC30A7	NA	NA	NA	NA	SLC30A7	33354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	103126263	103126396	103126338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556K13.1	874204	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	104824576	104824584	104824580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-364B6.2	210944	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	382711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	108132692	108133060	108132878	Y	NTNG1,NTNG1,VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	372706	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	108175822	108176099	108175961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	329667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	108484494	108484671	108484559	Y	NA	VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3	21095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	108673419	108673672	108673564	Y	FAM102B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	67799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	110151943	110152270	110152107	Y	NA	AMPD2,GSTM4	NA	NA	NA	NA	AMPD2	4456	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	110334849	110335164	110334977	Y	NA	NA	CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GSTM3	52465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	4.18828309498973
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	110435112	110435421	110435324	Y	SORT1,SORT1	CSF1	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,AHCYL1,GNAI3,GSTM4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	15443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	110454846	110455290	110455005	Y	GSTM2,CSF1	CSF1	NA	NA	NA	NA	CSF1	3982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	110879130	110879445	110879277	Y	CSF1	RBM15,LAMTOR5-AS1	NA	NA	NA	NA	RBM15	2	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	112013331	112014031	112013881	Y	C1orf183,C1orf183,RAP1A,C1orf162	ATP5F1,WDR77	NA	NA	NA	NA	WDR77	23333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	113072370	113072489	113072380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	87306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	113734243	113734639	113734494	Y	NA	RP11-389O22.4	NA	NA	NA	NA	RP11-389O22.4	24627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	113932415	113932748	113932683	Y	NA	MAGI3	NA	NA	NA	NA	MAGI3	1044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	113949729	113949849	113949733	Y	NA	MAGI3,RP11-512F24.1	NA	NA	NA	NA	MAGI3	18358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	114245723	114246101	114246018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	116291091	116291334	116291215	Y	CASQ2	NA	NA	NA	NA	NA	VANGL1	108517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	116321345	116321551	116321511	Y	NA	NA	CASQ2	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	138771	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	117051576	117051921	117051802	Y	CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58	NAP1L4P1	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	22793	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	117359174	117359463	117359379	Y	TTF2,CD2	FTH1P22	NA	NA	NA	NA	FTH1P22	42929	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	120147764	120147961	120147863	Y	HSD3B1	GAPDHP33,ZNF697	NA	NA	NA	NA	GAPDHP33	9962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	120530218	120530524	120530431	Y	NOTCH2,FCGR1B,ZNF697	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	79716	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMBP1	225939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	142536204	142536464	142536463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417J8.3	80305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	144986415	144987071	144986860	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	87115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	80942	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	145000077	145000849	145000623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	73337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	145036432	145036531	145036463	Y	NA	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	37655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	145044480	145044713	145044599	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	29473	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	145627337	145627622	145627480	Y	NA	NUDT17,POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	18301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMO5	62289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.23640057340116
chr1	147825273	147825748	147825617	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	20387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H3A	1229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H3A	534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	150735950	150736336	150736255	Y	TNFAIP8L2,CDC42SE1,PRPF3,MCL1,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS	CTSS	NA	NA	NA	NA	CTSS	97	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	150949569	150950014	150949933	Y	ZNF687,TNFAIP8L2,SELENBP1,RFX5,POGZ,POGZ,PI4KB,PI4KB,CDC42SE1,MCL1,CTSS,ARNT,SETDB1,LASS2,PRUNE,FAM63A,FAM63A,FAM63A	CERS2,ANXA9,FAM63A,PRUNE	NA	NA	NA	NA	ANXA9	2479	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	151913815	151914271	151914054	Y	S100A10	THEM4	S100A10,CELF3,THEM4,RORC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	33531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	RPTN,FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A5,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	153767353	153767730	153767624	Y	NA	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	22523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	154577703	154577929	154577737	Y	NA	UBE2Q1,ADAR	NA	NA	NA	NA	ADAR	20546	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L	87295	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	33586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	155535083	155535193	155535176	Y	HCN3	ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L	4485	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	155916072	155916212	155916141	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	13881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	156118146	156118395	156118328	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	43485	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	CD1D	28048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	159851477	159851987	159851825	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	NA	NA	NA	NA	CCDC19	15966	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9,LINC01133	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	160379189	160379307	160379249	Y	NA	VANGL2	NA	NA	NA	NA	VANGL2	10813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	222772	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	160696081	160696317	160696161	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-312J18.5	166453	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	161847357	161847565	161847361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF6	113273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	161892699	161893027	161892754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	98617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	161973003	161973384	161973069	Y	NA	OLFML2B	NA	NA	NA	NA	OLFML2B	18260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	162129294	162129634	162129458	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOS1AP	91730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	165635693	165636148	165635824	Y	NA	MGST3,ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	29952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	165674774	165675083	165674866	Y	NA	ALDH9A1	NA	NA	NA	NA	ALDH9A1	8674	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	166828089	166828463	166828188	Y	POU2F1,POGK	POGK,TADA1	NA	NA	NA	NA	TADA1	15101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	167192959	167193266	167193111	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	4893	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	167322904	167323093	167323001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU2F1	134838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	168050664	168051125	168050872	Y	SFT2D2	NA	NA	NA	NA	NA	GPR161	53696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	168483874	168484202	168483927	Y	NA	NA	C1orf114,BLZF1	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	235596	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	168526950	168527356	168527080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	278672	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	172507125	172507604	172507262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	95895	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	173091914	173092434	173092232	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023	IMR90	Hi-C	24141950	PRDX6	351971	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	173816933	173817269	173817101	Y	NA	DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	NA	NA	NA	NA	ZBTB37	17951	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	173958715	173958784	173958750	Y	NA	RC3H1,RP11-160H22.3	NA	NA	NA	NA	RC3H1	30651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	176174471	176174980	176174673	Y	RFWD2	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2,RP11-195C7.1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	178121154	178121309	178121232	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	60290	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	178207948	178208160	178207999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	147084	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	178901109	178901308	178901215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20B	91631	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	180100723	180101052	180100780	Y	NA	QSOX1	NA	NA	NA	NA	QSOX1	20917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	180613229	180613603	180613357	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	14089	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	183386078	183386213	183386099	Y	NA	NMNAT2	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	341	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	184421485	184421696	184421591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	67293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	184773428	184773803	184773695	Y	SWT1,SWT1,RNF2,FAM129A,EDEM3	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	51381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	184810330	184810429	184810414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM3	88283	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185250433	185250655	185250484	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	33806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	185253692	185254037	185253865	Y	HMCN1,RNF2,SWT1,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	30424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185536131	185536449	185536350	Y	NA	NA	IVNS1ABP,SWT1,MIR548F1,HMCN1	IMR90	Hi-C	24141950	HMCN1	165234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185537736	185537864	185537792	Y	SWT1,SWT1	NA	SWT1,IVNS1ABP,MIR548F1,HMCN1	IMR90	Hi-C	24141950	HMCN1	163819	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185615541	185615870	185615591	Y	NA	NA	SWT1,LOC100288079,IVNS1ABP	IMR90	Hi-C	24141950	HMCN1	85813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	185771429	185771809	185771446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	69746	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	185796352	185796554	185796468	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	HMCN1	94669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	186042920	186043354	186043253	Y	HMCN1,OCLM	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	299471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	186052629	186052877	186052681	Y	HMCN1,PDC	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	289948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	186069411	186069628	186069551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	273197	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	190286298	190286417	190286358	Y	FAM5C	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	2396896	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	192481549	192481949	192481720	Y	RGS2,RGS1	NA	RGS2,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	201364	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	192485848	192486563	192486155	Y	RGS2,RGS1	NA	RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	196750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	192507991	192508486	192508241	Y	NA	NA	UCHL5,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	174827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	192508796	192509150	192509060	Y	NA	NA	UCHL5,RGS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	174163	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	192549613	192549895	192549754	Y	TROVE2,TROVE2,RGS1,RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	133418	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	192577525	192577907	192577716	Y	NA	NA	UCHL5	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	105406	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	194828218	194828283	194828245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC73	1739071	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	197530309	197530378	197530355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	212448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	197908297	197908430	197908355	Y	NA	C1orf53,LHX9	NA	NA	NA	NA	LHX9	29260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHX9	85857	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	198136529	198137056	198136658	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	12436	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	198465277	198465448	198465363	Y	NA	NA	PTPRC,ATP6V1G3	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	341184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	201494461	201494578	201494476	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	17877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	201500233	201500477	201500437	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	23649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	201613549	201613726	201613638	Y	NA	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAV1	23138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	201987611	201988279	201987793	Y	ELF3,LGR6	RNPEP,ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	12538	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	201992149	201992501	201992334	Y	NA	RNPEP,ELF3	NA	NA	NA	NA	ELF3	17076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	202737599	202737762	202737681	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	RP11-480I12.2	3053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	203101073	203101246	203101163	Y	NA	ADORA1	NA	NA	NA	NA	ADORA1	43291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	111155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	87185	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	105786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	204317952	204318184	204318134	Y	ETNK2,PIK3C2B	PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	26609	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	204358316	204358342	204358328	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PLEKHA6	13523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	204388302	204388627	204388415	Y	NA	PLEKHA6,PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	9383	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	205263599	205264019	205263855	Y	NA	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	24864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	205510005	205510378	205510192	Y	CNTN2,TMEM81,CDK18	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	38282	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	205512470	205512827	205512691	Y	NA	CDK18	NA	NA	NA	NA	CDK18	40747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	206235589	206236018	206235781	Y	NA	AVPR1B	NA	NA	NA	NA	AVPR1B	13613	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	206751685	206751882	206751743	Y	IKBKE,RASSF5,IL19,MAPKAPK2,FAIM3,FAIM3,RASSF5	EIF2D	NA	NA	NA	NA	EIF2D	32022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	206918122	206918360	206918230	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	61833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	207069223	207069337	207069332	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	207265739	207265906	207265769	Y	NA	PFKFB2,YOD1,C4BPB	NA	NA	NA	NA	C4BPB	5552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	208267767	208267971	208267827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	147694	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	208349565	208349646	208349606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	66019	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	208357514	208358085	208357775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	57580	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	209528830	209529176	209528970	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR205HG	70989	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	209585617	209585757	209585708	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	MIR205HG	NA	NA	NA	NA	MIR205HG	14408	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	212182782	212182853	212182818	Y	NA	INTS7,DTL,RPL21P28	NA	NA	NA	NA	INTS7	24031	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	212659054	212659720	212659497	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	54825	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	213443269	213443475	213443372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KC1	220680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	214614073	214614284	214614198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	218553747	218554148	218553928	Y	NA	RP11-224O19.2,TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	36170	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	218758903	218759111	218758977	Y	NA	NA	TGFB2	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	241326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	221270955	221271464	221271176	Y	HLX	NA	MARC1,HLX,DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	HLX	221256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	221904432	221904724	221904722	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	8794	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	222144602	222144957	222144787	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	231084	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HHIPL2	80241	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	224012866	224013246	224013103	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	18428	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	224026476	224026743	224026681	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	4931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	224032316	224032686	224032418	Y	CAPN2,FBXO28,TP53BP2	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr1	224690718	224691054	224690869	Y	WDR26	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	67983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	227002760	227003096	227002965	Y	NA	NA	ITPKB,C1orf95	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSEN2	52789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	227315962	227315970	227315966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	188205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	227751865	227752213	227752044	Y	ZNF678	ZNF678	NA	NA	NA	NA	ZNF678	2621	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	227976197	227976490	227976208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	55085	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	227982614	227983033	227982728	Y	CDC42BPA,ZNF678,WNT9A,C1orf35	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD4	61502	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228073191	228073261	228073226	Y	WNT9A	NA	NA	NA	NA	NA	WNT9A	60338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228079986	228080118	228080041	Y	ZNF678,WNT9A	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	53481	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228124828	228124930	228124870	Y	ARF1,ARF1	WNT9A	NA	NA	NA	NA	WNT9A	8669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228350789	228351109	228350864	Y	JMJD4	GUK1,IBA57,C1orf145	NA	NA	NA	NA	IBA57	407	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	228633222	228633907	228633608	Y	TRIM11,TRIM17,HIST3H2A	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	9653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	228686214	228686407	228686300	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	13452	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	228945464	228945740	228945561	Y	RHOU	NA	RHOU,NUP133,RAB4A	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	76640	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	229163343	229163424	229163384	Y	NA	NA	RHOU,NUP133	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	241351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	230220475	230220731	230220560	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	28939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	4.75941260794288
chr1	233234073	233234169	233234121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	149722	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	233811305	233811449	233811378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK1	63555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234163168	234163347	234163228	Y	SLC35F3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	124489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234559176	234559516	234559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	51837	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	RP4-781K5.4	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-781K5.4	32032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234852227	234852379	234852265	Y	NA	NA	LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP4-781K5.4	72192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	16481	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	7398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235133014	235133422	235133155	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	18463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235134086	235134438	235134232	Y	NA	RP11-443B7.3	LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	19535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235242252	235242564	235242410	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOMM20	47687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235267591	235267744	235267678	Y	NA	TOMM20	NA	NA	NA	NA	TOMM20	22507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235390754	235391125	235391097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM34	67982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235468267	235468477	235468372	Y	NA	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	20188	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	38803	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	236323296	236323699	236323519	Y	LYST,GPR137B,LGALS8	GPR137B	NA	NA	NA	NA	GPR137B	19464	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	236858712	236859062	236858844	Y	ACTN2	NA	NA	NA	NA	NA	HEATR1	92908	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	237007861	237008154	237008008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	51251	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	242068662	242068804	242068733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXO1	59393	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	118396	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	C1orf100	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf100	1058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF26B	654826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246249452	246249819	246249636	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	418795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr1	246297322	246297388	246297355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	371226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246317158	246317459	246317368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	351155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246751015	246751281	246751184	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	23269	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246760708	246760962	246760810	Y	SMYD3,CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	32962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	246772310	246772610	246772421	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	44564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	247521124	247521311	247521171	Y	NA	ZNF496	NA	NA	NA	NA	ZNF496	27976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	247522246	247522745	247522536	Y	NA	ZNF496	ZNF496	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF496	29098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	224300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	5.90167163384917
chr1	249099326	249099454	249099407	Y	NA	SH3BP5L,ZNF672	NA	NA	NA	NA	SH3BP5L	19378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3028046	3028193	3028123	Y	NA	NA	LINC00200	IMR90	Hi-C	24141950	PFKP	78332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3497590	3497951	3497729	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	284587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	3513215	3513223	3513219	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	300212	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3542742	3543014	3542849	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	282459	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3690587	3690963	3690655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	134510	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3697757	3697968	3697863	Y	KLF6	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	127505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	3893365	3894190	3893886	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	67892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3932191	3932411	3932301	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	106718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3948614	3948936	3948805	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	123141	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-433J20.1	106355	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	12.9456022936046
chr10	3987998	3988450	3988285	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-433J20.1	103468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	4895704	4895738	4895721	Y	NA	AKR1C1	NA	NA	NA	NA	AKR1C1	37058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	4989909	4990226	4990068	Y	AKR1C3,AKR1C1	NA	tAKR,AKR1C2,AKR1C3,UCN3,NET1,TUBAL3	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1C1	57113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	5105953	5106270	5106114	Y	NA	AKR1C2,AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	30407	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	5113786	5114179	5114065	Y	AKR1C1,AKR1C2,AKR1C3	AKR1C3	NA	NA	NA	NA	AKR1C3	38240	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	45786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	5590959	5591270	5591035	Y	NET1	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	44811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	5888274	5888577	5888395	Y	PFKFB3,PFKFB3,IL15RA,GDI2	GDI2,FBXO18,ANKRD16	NA	NA	NA	NA	GDI2	6179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr10	6343712	6343937	6343834	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	158831	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	6443408	6443712	6443449	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKFB3	258527	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	7583205	7583490	7583242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITIH5	123471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr10	7667725	7668107	7668024	Y	NA	ITIH5	NA	NA	NA	NA	ITIH5	38854	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	7709539	7709689	7709614	Y	ITIH5	ITIH5	NA	NA	NA	NA	ITIH5	2578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	568594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	8898873	8899238	8899165	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	805306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	8899367	8899664	8899620	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	805800	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	8909152	8909331	8909243	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	815585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	8915965	8916215	8916048	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GATA3	822398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	9052186	9052462	9052283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	958619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	9058876	9059174	9059118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	965309	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	9076423	9076646	9076599	Y	NA	NA	GATA3,FLJ45983,TAF3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATA3	982856	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	9139521	9139818	9139671	Y	NA	NA	TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	GATA3	1045954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr10	9281291	9281530	9281414	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3,TAF3	IMR90	Hi-C	24141950	GATA3	1187724	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	11211427	11212417	11211529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	376484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	11652835	11653073	11652954	Y	CELF2,USP6NL	USP6NL	NA	NA	NA	NA	USP6NL	1082	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC3	53588	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	11940492	11940889	11940732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	142280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	12455599	12455959	12455812	Y	SEC61A2,CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	66118	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	12749537	12749904	12749742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	360056	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	12958424	12958724	12958629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPTN	180725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	13388296	13388525	13388411	Y	NA	PHYH	NA	NA	NA	NA	SEPHS1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	14175548	14175585	14175560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	326556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	15165954	15166084	15166019	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	RPP38	28775	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	15300658	15300993	15300826	Y	ACBD7,FAM171A1	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	91966	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	15481671	15481810	15481693	Y	NA	NA	ITGA8,FAM188A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171A1	70610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	20389150	20389455	20389350	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	285982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	20518444	20518755	20518482	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	415276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	21218309	21218697	21218504	Y	C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	242419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	21436057	21436346	21436225	Y	C10orf113,NEBL	NEBL	NA	NA	NA	NA	NEBL	24770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	21716825	21717072	21716945	Y	MLLT10,MLLT10	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-275N1.1	56946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	21991974	21992366	21992143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	170880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	22555688	22555894	22555791	Y	NA	COMMD3	NA	NA	NA	NA	COMMD3	47009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	25201195	25201516	25201227	Y	NA	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	38017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	25815030	25815346	25815189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	511443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	26289899	26290095	26289999	Y	GAD2	NA	NA	NA	NA	NA	PDSS1	694493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	27814920	27815352	27814981	Y	MASTL,ACBD5,RAB18	RAB18	NA	NA	NA	NA	RAB18	23723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	28957755	28957993	28957831	Y	BAMBI	BAMBI	BAMBI	K562	ChIA-PET	22265404	BAMBI	6278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	29420684	29421072	29420878	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	456413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	32598255	32598442	32598434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	67284	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	32607439	32608014	32607606	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	57712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	33541909	33542109	33542065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	81081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	34439638	34439951	34439795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	511078	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	35028968	35029134	35029048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3	73119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	35258130	35258295	35258186	Y	CREM,CREM	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	SS18L2P1	95992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	35668149	35668482	35668241	Y	CREM,CREM	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	134196	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	35848460	35848836	35848737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	314507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	43248764	43248842	43248800	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	27407	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	43249715	43249807	43249770	Y	NA	BMS1	NA	NA	NA	NA	BMS1	26442	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	45868742	45869084	45868822	Y	ANUBL1,OR13A1,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	1081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	47080536	47081217	47080878	Y	GPRIN2	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	111136	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	47092142	47092537	47092340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	122742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	47113842	47114070	47114068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	144442	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	47149103	47149407	47149372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT15	179703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	48323344	48323752	48323648	Y	NA	ZNF488	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	29272	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	50742859	50743547	50743006	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	PGBD3	1539	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	52092316	52092324	52092320	Y	FAM21A,SGMS1	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	69578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	728672	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	63663540	63663817	63663641	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	4481	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	167274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	64024468	64024613	64024559	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	1853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	65149197	65149230	65149214	Y	NA	PRELID1P3	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	35827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	69796463	69796828	69796573	Y	HERC4	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	36277	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	72082681	72083053	72082867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC20	57329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	72433363	72433696	72433541	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	NA	NA	NA	NA	ADAMTS14	2804	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	73109189	73109511	73109382	Y	SLC29A3	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	32174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	73519261	73519537	73519421	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	11718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74091361	74091474	74091418	Y	SPOCK2,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	21514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74836640	74837022	74836864	Y	NA	P4HA1	NA	NA	NA	NA	P4HA1	17710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	74990824	74990933	74990931	Y	NA	DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5	NA	NA	NA	NA	DNAJC9	15687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	76916394	76916800	76916595	Y	MYST4,SAMD8	NA	NA	NA	NA	NA	VDAC2	51112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	77022416	77022492	77022443	Y	NA	COMTD1	COMTD1,ZNF503-AS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COMTD1	28628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	77189888	77190112	77189953	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	30224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	78192206	78192310	78192258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	833208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	78753303	78753527	78753361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	930851	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	79314756	79315094	79314952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLG5	369284	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	80516479	80516892	80516667	Y	ZMIZ1	NA	LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMIZ1	309900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	80841621	80841843	80841705	Y	NA	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	14829	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81005366	81005598	81005460	Y	PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	99627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81028676	81029041	81028720	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	76184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81042130	81042560	81042322	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	62665	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81045880	81046806	81046457	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	58419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81059255	81059879	81059575	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	45346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	85324845	85324972	85324948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2P8	514213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	86104605	86104727	86104619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDHR1	152195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	88713984	88714363	88714198	Y	SNCG	SNCG,AGAP11	NA	NA	NA	NA	SNCG	2012	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	91096650	91097012	91096836	Y	IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1	IFIT2,IFIT3	NA	NA	NA	NA	IFIT3	10999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	91939509	91939869	91939615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPD2P1	203035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	94195534	94195885	94195710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IDE	135948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	94459466	94459797	94459609	Y	HHEX	HHEX	NA	NA	NA	NA	HHEX	13521	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	94831659	94831948	94831694	Y	CYP26A1,CYP26A1	CYP26A1	NA	NA	NA	NA	CYP26A1	427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	95224149	95224369	95224367	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	97024100	97024800	97024493	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	23981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	97026412	97026787	97026670	Y	NA	PDLIM1	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	21994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	99096745	99096901	99096835	Y	NA	ARHGAP19,FRAT1,FRAT2	NA	NA	NA	NA	FRAT2	4287	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	102284617	102284981	102284927	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	103453403	103453880	103453587	Y	LDB1,BTRC,MGEA5	FBXW4	NA	NA	NA	NA	FBXW4	351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr10	104892620	104892981	104892840	Y	C10orf32,NT5C2	NA	NA	NA	NA	NA	NT5C2	58075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	104909684	104910071	104909878	Y	NA	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	40985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	105452274	105452407	105452303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	160894	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	110360095	110360471	110360395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPNPEP1	1320840	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	111846788	111847153	111846925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADD3	92662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	112220227	112220521	112220467	Y	SMC3,DUSP5	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	35075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	112670931	112671385	112671330	Y	NA	PDCD4,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	5647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	114847181	114847492	114847280	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	139172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	114940347	114940490	114940443	Y	CASP7,TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	232338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	115251940	115252325	115252226	Y	NA	NA	GUCY2GP,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	184617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr10	116080506	116080782	116080645	Y	AFAP1L2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L2	81733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	116556570	116556696	116556633	Y	NA	FAM160B1	AFAP1L2,ABLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM160B1	22807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	119019345	119019394	119019369	Y	KCNK18,SLC18A2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	113584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	120458241	120458267	120458251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NANOS1	328961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	121655971	121656303	121656057	Y	NA	MCMBP,SEC23IP	NA	NA	NA	NA	SEC23IP	5748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1	146542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	124067478	124067825	124067684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	64387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	126811654	126811843	126811733	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	35896	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	127472572	127472831	127472732	Y	NA	UROS,BCCIP	NA	NA	NA	NA	UROS	36986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	127576052	127576450	127576389	Y	NA	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	RNU2-42P	797	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr10	127583558	127583978	127583747	Y	MMP21	RNU2-42P,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	FANK1	450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr10	128595349	128595449	128595411	Y	DOCK1	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	3371	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	129787766	129788203	129788000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRE	84441	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	131644019	131644215	131644117	Y	EBF3	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	115890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	132099901	132100191	132100002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX3	167238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DPYSL4	118880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	PWWP2B	26035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	51669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr10	135074691	135075148	135074934	Y	TUBGCP2,ADAM8	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	44831	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	269337	269903	269511	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	ATHL1	17232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	150475	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1536608	1536918	1536802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP8	54232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1804182	1804577	1804353	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1	IFITM10,RP11-295K3.1,CTSD,AC068580.7,AC139143.2	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2,IGF2-AS1,INS-IGF2,KRTAP5-4,SYT8	IMR90,GM12878,H1ESC,HELA,K562,MCF7	Hi-C,5C,ChIA-PET	24141950,22955621,22265404	AC068580.7	6564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	1988846	1989279	1989052	Y	IGF2,TH,IGF2,IGF2,SYT8,TNNI2,TNNI2,TNNT3	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	19871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2008416	2008795	2008568	Y	NA	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	355	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23,MRPL23-AS1,H19	NA	NA	NA	NA	MRPL23-AS1	510	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	2598295	2598461	2598377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	120763	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2624209	2624341	2624275	Y	TRPM5	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	94883	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2633332	2633679	2633509	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	85545	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2643944	2644417	2644202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	74807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	3021368	3021548	3021402	Y	NA	NAP1L4,RNU1-91P	NAP1L4	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4	9761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	RNU1-91P,CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	3190882	3191107	3191009	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	4913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	5401217	5401226	5401222	Y	OR51T1,OR51G2,OR51G1,MMP26,OR51L1,OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52D1,OR52N5,OR52N1,OR51M1,OR51I1,OR51Q1	OR51B5	NA	NA	NA	NA	OR51B5	38408	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	5504793	5505065	5505006	Y	NA	HBE1	NA	NA	NA	NA	HBE1	19782	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	6489893	6490567	6490471	Y	OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	TRIM3	3122	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	6676048	6676412	6676073	Y	OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1	TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUB	235013	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	9240746	9240917	9240841	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	44020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	9310546	9310889	9310715	Y	ZNF143,NRIP3,DENND5A,TMEM41B	DENND5A,TMEM41B	NA	NA	NA	NA	TMEM41B	23438	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	9587499	9588027	9587720	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1	ZNF143,LOC644656	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	WEE1	5201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	9907928	9908258	9908093	Y	NA	NA	SWAP70,LOC440028,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	SWAP70	224304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	309512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	10955665	10956051	10955935	Y	NA	CTD-2003C8.2	EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2003C8.2	36796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	30248	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12132692	12132808	12132735	Y	MICAL2	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12188567	12188982	12188726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	75024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	12438419	12438761	12438595	Y	NA	PARVA	NA	NA	NA	NA	PARVA	41687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	12973520	12973623	12973568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-497E21.3	55083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	13327996	13328024	13328011	Y	NA	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	31797	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	13373049	13373395	13373164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	76850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	16001674	16002038	16001856	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	630641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	16073747	16074032	16073896	Y	SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	558647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	16392942	16393234	16393088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	239445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC8	120749	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	18444585	18444736	18444661	Y	SAAL1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	AC084117.3	19429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2-AS2	111425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	26610693	26610982	26610833	Y	ANO3,BBOX1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBIN	402646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	28853592	28853798	28853653	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	131430	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	33012698	33013071	33012885	Y	NA	DEPDC7,TCP11L1	NA	NA	NA	NA	DEPDC7	22339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	104890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	35066599	35067152	35066916	Y	NA	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	90427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr11	35132711	35132959	35132793	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	PDHX,CD44,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	24620	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35186946	35187176	35187019	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35370897	35371125	35371047	Y	SLC1A2,SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PAMR1	178723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35395403	35395808	35395629	Y	SLC1A2	NA	NA	NA	NA	NA	PAMR1	154040	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	PAMR1	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	PAMR1	25596	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	35825533	35825614	35825574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	137917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	39065264	39065315	39065290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-313M3.1	115688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	39183372	39183493	39183434	Y	NA	RP11-313M3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-313M3.1	2369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.99790659067202
chr11	43569506	43569887	43569721	Y	C11orf96	HSD17B12	NA	NA	NA	NA	HSD17B12	6099	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	43757440	43757801	43757621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	142560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	43779324	43779404	43779364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALKBH3	120957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	44306158	44306224	44306191	Y	ALX4	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	191059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	45680274	45680465	45680372	Y	NA	CHST1	NA	NA	NA	NA	CHST1	4707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	46015298	46015560	46015479	Y	NA	NA	GYLTL1B,PEX16	K562	ChIA-PET	22265404	GYLTL1B	74126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	46963806	46964041	46963934	Y	NA	LRP4,C11orf49	NA	NA	NA	NA	C11orf49	7566	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	47109490	47109615	47109553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	87061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	48004294	48004631	48004323	Y	CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	4181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	57324540	57324747	57324726	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,SERPING1	SLC43A1,TIMM10,UBE2L6,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	9010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	57546018	57546724	57546105	Y	MED19,C11orf31	C11orf31,CTNND1	NA	NA	NA	NA	CTNND1	27303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr11	59582834	59583156	59582993	Y	NA	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	6489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	59894907	59895094	59895001	Y	OR10V1,STX3,MS4A13,MS4A2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL16	318562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	59941614	59941716	59941665	Y	MS4A7,MS4A4A,MS4A6A,MS4A6A	NA	NA	NA	NA	NA	MS4A13	339170	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	60871198	60871450	60871295	Y	CD6,SDHAF2,CD5	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37C	55639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	60877687	60877932	60877809	Y	CD6,CD5	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	49157	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	60930012	60930347	60930224	Y	SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2923	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	60932642	60932735	60932710	Y	GPR44,SLC15A3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	5553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.23640057340116
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	33166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	DAK	23280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	61456345	61456647	61456520	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	10440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	62441871	62442205	62442039	Y	NXF1	GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2	NA	NA	NA	NA	UBXN1	2362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,HRASLS2,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	HRASLS2	8867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	64146714	64147096	64146808	Y	NA	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	22094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr11	65234874	65235172	65234954	Y	SNX32	NEAT1,MALAT1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	28061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	MALAT1	23363	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.04602406908344
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65582060	65582341	65582183	Y	NA	SNX32,MUS81,CFL1	NA	NA	NA	NA	SNX32	16771	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr11	66801218	66801427	66801323	Y	SYT12,SYT12	SYT12,RHOD	NA	NA	NA	NA	RHOD	20862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	66845381	66845631	66845497	Y	TMEM134,SSH3,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	66845907	66846062	66845990	Y	PITPNM1,CLCF1,CLCF1,RBM4,KDM2A,ADRBK1,RHOD	RHOD,KDM2A	NA	NA	NA	NA	RHOD	23618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	67253659	67253853	67253760	Y	PTPRCAP,NUDT8,AIP	CORO1B,TMEM134,AIP,PITPNM1,CDK2AP2	NA	NA	NA	NA	AIP	5147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	67955066	67955423	67955397	Y	TCIRG1,SUV420H1	SUV420H1	NA	NA	NA	NA	SUV420H1	23872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	68387136	68387210	68387173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAL	62037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	68847694	68848091	68847776	Y	IGHMBP2,TPCN2	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	33329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	70079442	70079825	70079633	Y	ANO1,CTTN,FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1	FADD,PPFIA1,ORAOV1,ANO1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FADD	32173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	70090856	70091139	70091025	Y	NA	FADD,PPFIA1	PPFIA1,FADD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPFIA1	23667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	70413927	70414164	70414002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	171333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	FOLR1,INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	73731710	73731974	73731870	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	39358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	76480789	76480971	76480905	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	B3GNT6,TSKU,GUCY2E,ACER3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSKU	10324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	76721586	76721786	76721728	Y	ACER3	NA	NA	NA	NA	NA	CAPN5	54193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	76802149	76802401	76802277	Y	NA	CAPN5	NA	NA	NA	NA	CAPN5	26170	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	77271215	77271363	77271291	Y	NA	AQP11	MYO7A,GDPD4,CAPN5,PAK1,AQP11	IMR90	Hi-C	24141950	AQP11	27073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	78000759	78000964	78000861	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	102891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	85160814	85160851	85160833	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	176778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	91958948	91959142	91959077	Y	FAT3	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	969988	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	95610217	95610530	95610374	Y	NA	MTMR2	NA	NA	NA	NA	MTMR2	45949	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	95963875	95964372	95964111	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	109972	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	95987343	95987574	95987537	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	86770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	96006843	96007267	96007082	Y	FAM76B,MAML2,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	67077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	96071900	96072294	96072196	Y	MAML2,JRKL,CCDC82	MAML2,CCDC82,JRKL	NA	NA	NA	NA	MAML2	2050	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	100590591	100590889	100590693	Y	NA	ARHGAP42	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	34207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	102296028	102296376	102296245	Y	NA	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	42739	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP10,MMP1	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	103281581	103281752	103281672	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	3196	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	103316988	103317242	103317115	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	38603	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	91330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	105090888	105091203	105091058	Y	CASP4,CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	120730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	105513261	105513284	105513272	Y	GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	180076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	106239516	106239921	106239716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KBTBD3	293024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	107885190	107885220	107885205	Y	NA	CUL5	NA	NA	NA	NA	CUL5	7731	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	108600247	108600616	108600285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	66495	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	108679072	108679281	108679081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	145320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	110067293	110067585	110067439	Y	NA	NA	ZC3H12C,RDX,FDX1	IMR90	Hi-C	24141950	RDX	97862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	IL18,BCO2	NA	NA	NA	NA	IL18	16061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	115017644	115017889	115017764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	355786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	115093237	115093486	115093408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CADM1	280189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	115360673	115361056	115361024	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	12619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF259	133906	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF259	145469	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	30812	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	10939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	118799839	118800231	118800031	Y	C2CD2L	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	118800245	118800827	118800413	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	120218040	120218378	120218085	Y	NA	TMEM136,ARHGEF12	NA	NA	NA	NA	ARHGEF12	12253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	120895811	120895984	120895886	Y	GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA	TBCEL	NA	NA	NA	NA	TBCEL	3030	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	122936469	122936659	122936561	Y	NA	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	4531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	124062644	124062948	124062749	Y	OR6X1,OR6M1,OR8D4,OR4D5,OR6T1,OR10G4,OR10G7,VWA5A,OR8D2,OR8B12,OR8A1,OR8D1,OR8B8,TBRG1,OR8G2,OR8G1	NA	NA	NA	NA	NA	VWA5A	78575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	124403880	124404281	124404167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBRG1	86451	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	126084365	126084425	126084397	Y	NA	FAM118B,RPUSD4	NA	NA	NA	NA	RPUSD4	4778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	128294765	128294892	128294836	Y	NA	NA	ETS1,FLI1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	160561	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	128927593	128927968	128927781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARX2	315867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	129282439	129282677	129282511	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	38604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	129317318	129317884	129317614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARX2	73483	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	130113792	130113937	130113867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB44	68644	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	130321179	130321606	130321259	Y	ADAMTS15	ADAMTS15	NA	NA	NA	NA	ADAMTS15	4310	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr11	130743628	130743895	130743754	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	40509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr11	133804654	133804943	133804849	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	19937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr11	133814977	133815479	133815368	Y	NCAPD3,IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	9401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	398927	399098	399013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC77	97341	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	680187	680377	680237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	57680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	2893281	2893436	2893294	Y	NRIP2	FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NRIP2,CACNA1C,FKBP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FKBP4	8683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	4313058	4313407	4313227	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	67531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	5542952	5543350	5543174	Y	NTF3,NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	3674	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6193943	6194225	6194059	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	112656	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6202352	6202551	6202452	Y	CD9,ANO2	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	104330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6325035	6325634	6325452	Y	NA	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	18154	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6389072	6389528	6389363	Y	CD9,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6	VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLEKHG6	28074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6403662	6404056	6403860	Y	PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	13546	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	PLEKHG6,TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHG6	12935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,LPAR5	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,LPAR5,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	7034730	7034838	7034794	Y	ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	3104	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	7058106	7058233	7058157	Y	ACSM4,VAMP1,ZNF384,ZNF384,CD4,CD4,LRRC23,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	C12orf57	7965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	7058563	7058923	7058712	Y	PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6	ENO2,ATN1,C12orf57,EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S	NA	NA	NA	NA	C12orf57	8422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	9515823	9516058	9515941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	82767	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	11909552	11909810	11909712	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	108764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	12038206	12038369	12038301	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L14	162409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	12605511	12605890	12605533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	97498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	46037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	14420572	14420772	14420650	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-134N1.2	53048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	16125205	16125413	16125310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERA	63099	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	24868118	24868494	24868393	Y	BCAT1	NA	SOX5,LINC00477	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-444D3.1	154594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	24952536	24952732	24952634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	147661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	24972596	24972806	24972748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	127587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	24993015	24993329	24993020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	107064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	25008843	25009219	25009048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAT1	91174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr12	25058340	25058627	25058484	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	41766	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	25075175	25075409	25075293	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1	BCAT1,RP11-662I13.1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	24984	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr12	25402760	25403150	25403054	Y	LRMP,CASC1,KRAS	KRAS	NA	NA	NA	NA	KRAS	890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	9.13807220725033
chr12	25611028	25611430	25611226	Y	NA	NA	RASSF8,LOC100506451,IFLTD1,MIR4302	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-67P	55666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	26142824	26143171	26142998	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	32126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26392228	26392317	26392290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	78336	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26400740	26401146	26400920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	69507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26427494	26428032	26427844	Y	NA	RP11-283G6.5	SSPN,BHLHE41,ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-283G6.5	42621	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26495152	26495452	26495369	Y	ITPR2	RP11-283G6.5	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	24499	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26522536	26522924	26522687	Y	ITPR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	51883	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	26538001	26538320	26538173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	67348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	26624362	26624835	26624675	Y	FGFR1OP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	153709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26658315	26658658	26658486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-283G6.5	187662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	26805266	26805775	26805502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	178356	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	26945295	26945340	26945320	Y	C12orf71,ITPR2	ITPR2	NA	NA	NA	NA	ITPR2	38791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	27006268	27006662	27006518	Y	NA	ITPR2	ITPR2,TM7SF3	IMR90	Hi-C	24141950	ITPR2	22137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	27557115	27557162	27557139	Y	C12orf71,KLHDC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	73328	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	27678444	27678624	27678473	Y	PPFIBP1	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	4080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	27746027	27746077	27746069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	71663	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	28024037	28024193	28024103	Y	NA	NA	MRPS35,PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	99445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28119724	28120118	28120115	Y	MANSC4,PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	3520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28126453	28126843	28126791	Y	PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	2815	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	28127967	28128359	28128243	Y	PTHLH,PTHLH	PTHLH	NA	NA	NA	NA	PTHLH	4329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28141959	28142165	28142081	Y	NA	PTHLH	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	18321	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	PTHLH	56117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28221546	28221662	28221604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC91	62520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	28433746	28433796	28433771	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	36600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	29317763	29317994	29317897	Y	NA	FAR2	NA	NA	NA	NA	FAR2	17727	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	29473475	29473492	29473484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	58630	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	31080908	31080945	31080927	Y	TSPAN11	TSPAN11	NA	NA	NA	NA	TSPAN11	3546	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	31126084	31126427	31126256	Y	NA	TSPAN11,RP11-551L14.4	NA	NA	NA	NA	RP11-551L14.4	30511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	5.71129512953145
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	32465088	32465196	32465142	Y	FGD4,BICD1	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	207319	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	32688261	32688652	32688566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	141482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	33072560	33072656	33072597	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	24786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	34846341	34846449	34846401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-7D7.1	445925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	43671335	43671523	43671452	Y	NA	NA	PRICKLE1,YAF2	IMR90	Hi-C	24141950	PUS7L	479097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	45654086	45654401	45654190	Y	NA	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	46262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	46571353	46571525	46571439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	90275	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	47058808	47059020	47058972	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	283346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	47294477	47294629	47294480	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	177105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	47670448	47670925	47670783	Y	NA	NA	AMIGO2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMIGO2	198714	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	47702305	47702647	47702429	Y	NA	NA	AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B	IMR90	Hi-C	24141950	AMIGO2	230571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	48204446	48204457	48204451	Y	NA	RAPGEF3,HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	20458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	48254260	48254459	48254349	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	29345	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	49678404	49678529	49678467	Y	NA	TROAP	NA	NA	NA	NA	TROAP	36490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	49866902	49867154	49867028	Y	PRPF40B,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH3	63786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	50019907	50020190	50020017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	59906	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	50020601	50020960	50020800	Y	FMNL3,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	60600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	50924450	50924587	50924549	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	27682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	51035200	51035582	51035391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATF1	119911	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	51177941	51178161	51178051	Y	POU6F1,FAM186A,LARP4,DIP2B,HIGD1C	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	22448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	51765347	51765619	51765517	Y	FIGNL2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A8	17482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52364914	52365223	52365052	Y	GRASP	ACVR1B,GRASP,NR4A1	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	21463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52525424	52525587	52525584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT80	58197	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	52571070	52571435	52571234	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12349	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52588132	52588259	52588205	Y	FIGNL2,GRASP,NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	4348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	52890343	52890794	52890475	Y	C12orf44,KRT7,KRT18,KRT18,KRT6A,KRT5	KRT6B,KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT6A	5302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52915277	52915747	52915499	Y	C12orf44	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	2806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	52916140	52916794	52916224	Y	KRT76,KRT1,KRT75,KRT6B,KRT6C,KRT6A,KRT5	KRT6A,KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	3669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53253974	53254173	53254090	Y	RARG,KRT6A,KRT5	KRT4	KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4	IMR90	Hi-C	24141950	KRT4	47639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53261473	53261693	53261598	Y	KRT2,KRT1,KRT77	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85	IMR90	Hi-C	24141950	KRT4	55138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT4	58707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT4	61446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53284889	53285178	53285173	Y	ZNF740,SP1,KRT8,KRT18,KRT18	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	55477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53365695	53366044	53365885	Y	NA	KRT18,KRT8,EIF4B	NA	NA	NA	NA	KRT8	23957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,ITGB7,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	90	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC11,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	54444172	54444407	54444311	Y	ATF7,ATP5G2,HOXC12,HOXC11	HOXC8,HOXC5,HOXC4	FLJ12825	IMR90	Hi-C	24141950	HOXC4	1254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54700865	54701198	54701063	Y	NCKAP1L,NFE2,NFE2,ZNF385A	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	COPZ1,CBX5,HNRNPA1,NFE2,ITGA5,ZNF385A	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPZ1	7879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	30433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54770417	54770796	54770608	Y	NA	ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	12286	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	55435077	55435406	55435254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R1A	454634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	56729298	56729459	56729406	Y	NA	RP11-977G19.11,CS,RP11-977G19.10,CNPY2,PAN2,IL23A,STAT2	NA	NA	NA	NA	IL23A	1204	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	8.7573191986149
chr12	58281637	58282038	58281777	Y	CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	CTDSP2,RP11-620J15.3	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	43115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	58283417	58283685	58283602	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2	CTDSP2,RP11-620J15.3,XRCC6BP1	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-620J15.3	44273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	57300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	63091878	63091979	63091882	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	97346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	64850943	64851361	64850994	Y	NA	TBK1	NA	NA	NA	NA	TBK1	7283	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	65019058	65019979	65019210	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	16765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	65074143	65074354	65074186	Y	RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	71850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2	NA	NA	NA	NA	HMGA2	22022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	67361974	67362194	67362149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	98748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	67363946	67364340	67364143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	96602	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	67371255	67371618	67371453	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	89324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	67392180	67392257	67392219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	68685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	67396755	67396891	67396823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	64051	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	69150078	69150205	69150130	Y	NA	SLC35E3,MDM2	NA	NA	NA	NA	SLC35E3	12192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	69797421	69797731	69797518	Y	NA	YEATS4	NA	NA	NA	NA	YEATS4	45938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	75885817	75885886	75885852	Y	KRR1	GLIPR1,KRR1	NA	NA	NA	NA	GLIPR1	13357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	75983166	75983173	75983170	Y	NA	NA	PHLDA1,OSBPL8,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	79750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	79279208	79279511	79279476	Y	NA	SYT1	NA	NA	NA	NA	SYT1	23435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	79462781	79463098	79462967	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	207008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	79759610	79759960	79759786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	135216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	79804284	79804517	79804401	Y	PAWR	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-78O14.1	90659	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	79941021	79941361	79941199	Y	PAWR	RP1-78O14.1	SYT1,PAWR,PPP1R12A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP1-78O14.1	45845	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	80032366	80032529	80032417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	50348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	82155346	82155393	82155380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	595191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	83082881	83083305	83083086	Y	NA	TMTC2	NA	NA	NA	NA	TMTC2	4222	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	85344886	85345065	85345044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN19	82990	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	89573766	89574183	89574007	Y	POC1B,DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,DUSP6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP6	170865	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	90484866	90485476	90485213	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	383789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	92469930	92470196	92470132	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	67153	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	92484962	92485088	92485023	Y	BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	52261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	93002299	93002373	93002366	Y	NA	NA	LOC256021	IMR90	Hi-C	24141950	EEA1	318734	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	93757893	93758168	93758031	Y	NA	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	11491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	120294	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	94919144	94919451	94919150	Y	NA	NA	PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC41	67380	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	95492031	95492186	95492111	Y	NA	NR2C1	NA	NA	NA	NA	NR2C1	26552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	96438108	96438277	96438222	Y	ELK3,LTA4H	LTA4H	NA	NA	NA	NA	LTA4H	2810	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	99264133	99264356	99264245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	227214	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	104225376	104225573	104225475	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	7402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	104252933	104253121	104253026	Y	NA	NT5DC3	NA	NA	NA	NA	NT5DC3	19958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	104997803	104998291	104998125	Y	TXNRD1,TXNRD1,CHST11	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	150730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	105061987	105062372	105062098	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	214914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	107377522	107377900	107377585	Y	RFX4,RIC8B,MTERFD3	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	1044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	108699402	108699607	108699511	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD2	178154	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	108700100	108700298	108700252	Y	CORO1C,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	WSCD2	178852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	108761286	108761499	108761386	Y	SSH1,CORO1C,SELPLG,SELPLG	NA	CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	145463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	109010746	109010939	109010889	Y	USP30,SSH1,CMKLR1,SELPLG,SELPLG	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	14796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	110567516	110567657	110567554	Y	NA	IFT81	NA	NA	NA	NA	IFT81	7376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	110687741	110688014	110687886	Y	TRPV4,ATP2A2	ATP2A2	ATP2A2,C12orf76,IFT81,ANAPC7,ANKRD13A,GIT2,ARPC3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ATP2A2	28547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	112363158	112363241	112363200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	85376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	113490228	113490419	113490324	Y	DTX1	NA	NA	NA	NA	NA	OAS2	76028	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	113798034	113798144	113798106	Y	SLC24A6,PLBD2,SDSL,SDS	PLBD2	SDS,SDSL	IMR90	Hi-C	24141950	PLBD2	3663	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr12	115103963	115104215	115104201	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	15754	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	115791856	115792156	115792052	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	671887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	116570796	116571229	116571121	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	141914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr12	116872040	116872309	116872217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00173	96918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	116946674	116946880	116946778	Y	NA	LINC00173	LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	22347	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	117375665	117375672	117375669	Y	NA	FBXW8	NA	NA	NA	NA	FBXW8	28904	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	120524802	120525368	120525019	Y	CCDC64	RAB35	NA	NA	NA	NA	RAB35	27938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	120689817	120690140	120689965	Y	CCDC64,RAB35,RNF10,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	11434	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	121019899	121020145	121020000	Y	NA	COQ5,POP5,RPL11P5	NA	NA	NA	NA	POP5	2698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	121533843	121533975	121533917	Y	NA	P2RX7	ACADS,UNC119B,P2RX4,POP5,CABP1,MLEC,SPPL3,C12orf43,OASL,P2RX7,CAMKK2	IMR90	Hi-C	24141950	P2RX7	34647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	121904317	121904475	121904368	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B	NA	RNF34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF34	68473	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	122020670	122020879	122020764	Y	KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	122224293	122224471	122224351	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	14838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	5.52091862521374
chr12	123233355	123233499	123233417	Y	CLIP1,HCAR2,HCAR3	HCAR2,DENR	CCDC62	IMR90	Hi-C	24141950	DENR	1822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	123872201	123872612	123872414	Y	NA	hsa-mir-8072,SBNO1,SETD8,RILPL2	NA	NA	NA	NA	SETD8	5881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	124108091	124108301	124108196	Y	NA	TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2	NA	NA	NA	NA	EIF2B1	8012	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	124937911	124938596	124938282	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	111539	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	124963399	124963744	124963551	Y	UBC	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	86391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	46301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	22142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125030582	125031087	125030838	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	19048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125049011	125049349	125049112	Y	NA	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr12	125110878	125111184	125111029	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	60743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125117108	125117622	125117163	Y	NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	66973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125149282	125149430	125149311	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	99147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125169582	125169721	125169665	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	119447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125204801	125205082	125204928	Y	UBC	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	154666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125395122	125395522	125395138	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	4392	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr12	129054843	129055190	129054997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	251338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	130824673	130824982	130824768	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	373844	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr12	132089084	132089245	132089164	Y	SFSWAP	NA	GPR133	IMR90	Hi-C	24141950	SFSWAP	104381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132345340	132345736	132345589	Y	SFSWAP,ULK1	MMP17,ULK1	NA	NA	NA	NA	ULK1	31460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132647278	132647407	132647355	Y	SFSWAP,ULK1,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	NOC4L	20285	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr12	132663524	132663727	132663659	Y	SFSWAP,EP400,FBRSL1	DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2	NA	NA	NA	NA	RP13-977J11.2	8513	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132903795	132904258	132904060	Y	GALNT9	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT9	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	132904307	132904701	132904477	Y	NA	GALNT9	NA	NA	NA	NA	GALNT9	372	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT9	66152	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.23640057340116
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr12	133065143	133065512	133065289	Y	NA	FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	1006	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	133069115	133069562	133069360	Y	ZNF26,FBRSL1	FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	4978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	133414550	133414990	133414881	Y	NA	RPS11P5,GOLGA3	GOLGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GOLGA3	11106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	20137811	20138146	20137910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH8	67642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	20284953	20285344	20285149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPC1	69798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	20704420	20704798	20704605	Y	NA	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	28390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	20735697	20735843	20735813	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3,GJB2	NA	NA	NA	NA	GJA3	2509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr13	21398890	21399124	21398998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	52793	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	21400254	21400509	21400379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT2	54157	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	21748962	21749145	21749040	Y	NA	SAP18,SKA3,MRP63	NA	NA	NA	NA	MRP63	178	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	22009901	22010336	22010211	Y	NA	ZDHHC20	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	21173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	22107257	22107449	22107379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	75748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	22243438	22243610	22243458	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	42284	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	12616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr13	23539399	23539627	23539538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	51609	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	10686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	24440474	24440724	24440677	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	20304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEP	235445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	25115809	25116061	25115886	Y	RNF17	PARP4	NA	NA	NA	NA	PARP4	30861	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	25485313	25485583	25485398	Y	PARP4,PABPC3,NUPL1,MTMR6	CENPJ	NA	NA	NA	NA	CENPJ	9435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	25691354	25691814	25691656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR6	168333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr13	25880585	25880813	25880618	Y	MTMR6,NUPL1	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	6923	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	25886402	25886789	25886419	Y	NA	MTMR6,NUPL1	NA	NA	NA	NA	NUPL1	12740	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	26948386	26948578	26948482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK8	122110	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	27572004	27572077	27572041	Y	NA	NA	RASL11A,USP12,MTIF3,RPL21	IMR90	Hi-C	24141950	USP12	171956	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	28006253	28006341	28006297	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	9572	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr13	28882388	28882716	28882654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	95738	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	29293854	29294204	29294003	Y	NA	SLC46A3	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	2747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	30867525	30867802	30867626	Y	KATNAL1	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	31407198	31407336	31407268	Y	HSPH1	NA	USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX5AP	99553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	32470605	32470630	32470618	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	51627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	43828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	33412765	33412780	33412773	Y	NA	NA	KL,PDS5B,STARD13	IMR90	Hi-C	24141950	KL	175427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	33781660	33782051	33781892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	140716	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr13	34304425	34304581	34304508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	85605	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	34731212	34731445	34731362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	341026	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	35817825	35818146	35817986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAB21L1	230686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	35887010	35887329	35887304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAB21L1	161503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	40615098	40615335	40615215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	387334	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	42646001	42646399	42646206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	197890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	42683498	42683540	42683519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	160749	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	42855017	42855240	42855076	Y	AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	10728	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	42967379	42967658	42967522	Y	TNFSF11,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	123090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr13	43378134	43378246	43378162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	186161	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	43451555	43451845	43451701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	112562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	43865785	43866112	43865949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	270446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	44028316	44028697	44028507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	330347	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	44201276	44201468	44201373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	157576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	44379216	44379443	44379336	Y	ENOX1	ENOX1	ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ENOX1	20172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	DGKZP1	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	DGKZP1	2172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	45492137	45492940	45492235	Y	TSC22D1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	68678	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	45752820	45753055	45752934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	60170	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH3	179155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	48478393	48478707	48478627	Y	RB1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	130996	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	49757640	49757959	49757800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	62088	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	EBPL	NA	NA	NA	NA	EBPL	46274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	50796509	50797212	50796853	Y	NA	NA	DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	DLEU2	98653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	51167597	51167659	51167628	Y	RNASEH2B	NA	DLEU2,DLEU1,DLEU7	IMR90	Hi-C	24141950	RPL34P26	233698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	51210187	51210463	51210320	Y	NA	NA	DLEU2	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	271351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	51466138	51466579	51466443	Y	RNASEH2B	RNASEH2B	DLEU2,GUCY1B2,DLEU1	IMR90	Hi-C	24141950	RNASEH2B	15235	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	51641920	51642198	51642053	Y	INTS6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM124A	152305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	52218212	52218391	52218309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	61568	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	52218923	52219366	52219003	Y	WDFY2,DHRS12,DHRS12	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	62279	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	344744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	55958757	55958898	55958823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	2537982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	59432708	59433064	59432886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	1303057	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	64448428	64448510	64448470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2P10	64687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	64508473	64508866	64508848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2P10	124732	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	64563606	64563820	64563696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	84324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	64589476	64589676	64589576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00355	58468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	64623751	64624068	64623941	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	24076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	64652316	64652644	64652373	Y	NA	LINC00355	NA	NA	NA	NA	LINC00355	4172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	74228674	74228703	74228690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	465009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	75965393	75965547	75965541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	88703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	75966064	75966537	75966363	Y	TBC1D4	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	87713	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	76138851	76139260	76139031	Y	NA	COMMD6,UCHL3	NA	NA	NA	NA	UCHL3	17232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	76279599	76280073	76279764	Y	LMO7	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	87029	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	77881758	77881859	77881809	Y	SLAIN1	MYCBP2	NA	NA	NA	NA	MYCBP2	17326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	81622662	81622676	81622669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	709576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	81824429	81824558	81824494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	911343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	81840178	81840277	81840228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	927092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	81913928	81913973	81913949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	1000842	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr13	84480650	84480755	84480723	Y	NA	SLITRK1	NA	NA	NA	NA	SLITRK1	26122	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	15.9916263626881
chr13	87414604	87414810	87414734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1042981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	87444403	87444606	87444585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1072780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	94913778	94913870	94913813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	332641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	95926561	95926799	95926680	Y	ABCC4	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	24888	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	96350660	96350996	96350828	Y	NA	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	23267	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	97636174	97636720	97636457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	234968	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	98082020	98082299	98082214	Y	MBNL2,RAP2A	RAP2A	RAP2A	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2A	2177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99128638	99129073	99128919	Y	STK24	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	99121	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	99278853	99278891	99278872	Y	NA	CALM2P4	STK24,FARP1	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2P4	12602	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99737310	99737596	99737454	Y	DOCK9	DOCK9	NA	NA	NA	NA	DOCK9	431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99772014	99772367	99772137	Y	GPR18	DOCK9	MIR548AN,UBAC2	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK9	35135	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99880215	99880463	99880360	Y	GPR183	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	14203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	99957500	99957664	99957598	Y	DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91488	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	100013491	100013836	100013585	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF2	137835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	100614141	100614172	100614147	Y	NA	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	7991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	106753025	106753272	106753030	Y	ARGLU1	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	273639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	107070030	107070366	107070265	Y	NA	LINC00460	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	43119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	107569449	107569874	107569676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G1P5	255664	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	108181035	108181120	108181078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	335963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	205742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	628940	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	514704	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	110401088	110401398	110401243	Y	NA	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	35517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	111544033	111544176	111544105	Y	ING1,ING1	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	21240	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	111597919	111598063	111597990	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	32503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	111843624	111843915	111843820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	78718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	53642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	NA	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	CUL4A	51806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	114064803	114065029	114064948	Y	NA	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	48357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	114065698	114065892	114065794	Y	MCF2L,ADPRHL1	GRTP1	NA	NA	NA	NA	GRTP1	49252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	RNU1-16P,DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	RNU1-16P	11444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	21151333	21151694	21151411	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	997	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	21175884	21176052	21175958	Y	NA	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	25548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANG	138277	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	21540493	21540634	21540528	Y	RNASE6,TOX4,HNRNPC,ARHGEF40	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	4064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	21684818	21685080	21685024	Y	OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPC	50573	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,RBM23,PRMT5-AS1,PRMT5	NA	NA	NA	NA	LRP10	19383	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	24016944	24017157	24017064	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	6059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	24018554	24018930	24018908	Y	NA	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	4286	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	24894575	24894716	24894646	Y	PSME1,IRF9,TINF2,KHNYN	NYNRIN,KHNYN,SDR39U1	NA	NA	NA	NA	KHNYN	1776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	25140073	25140450	25140257	Y	CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-104E19.1	77144	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	25397817	25398161	25397990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP6	119342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	27997396	27997715	27997579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3006G17.2	314777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	28109127	28109447	28109287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-3006G17.2	203045	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	30663023	30663420	30663280	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	3919	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	33151520	33151608	33151564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	199514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	34479811	34480147	34480032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	449415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	34966252	34966485	34966304	Y	NA	SPTSSA,EGLN3,EAPP	NA	NA	NA	NA	EGLN3	36272	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	35805683	35806194	35806003	Y	BAZ1A,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	50081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	38965761	38966052	38965907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSTR1	290557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	39892906	39893200	39893154	Y	FBXO33	FBXO33	NA	NA	NA	NA	FBXO33	6504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	41099089	41099243	41099183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	1199385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	43816626	43817007	43816818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1547491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	44762944	44763158	44763051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	601340	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	44804196	44804463	44804330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	560035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	RP11-58E21.3	37101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER2	156301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	53385393	53385542	53385402	Y	DDHD1	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	31611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	54649490	54649642	54649566	Y	NA	NA	BMP4	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN3	211925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	54833964	54834357	54834051	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	27210	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	55120784	55121076	55120951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	88969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	55589429	55589640	55589507	Y	NA	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	601	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	55592226	55592437	55592322	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	3398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	57459148	57459304	57459264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	274422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	59768078	59768328	59768116	Y	RTN1,DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	114714	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	61571196	61571403	61571326	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	125120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	294774	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	65710565	65711133	65711131	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	143152	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	65959136	65959304	65959206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	83826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	67416708	67417057	67416792	Y	GPHN	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	288769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	67763359	67763655	67763501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	57533	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	68033590	68034347	68033627	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B,PIGH	NA	NA	NA	NA	PIGH	30657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr14	68529528	68529897	68529655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	245032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	68555905	68556402	68556038	Y	PIGH	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	271409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	68850156	68850330	68850199	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	36583	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	68925660	68925982	68925837	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	38747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	69417780	69418181	69417964	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	25976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	69576488	69576915	69576681	Y	NA	DCAF5	NA	NA	NA	NA	DCAF5	40952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	70844763	70845165	70845114	Y	NA	COX16,SYNJ2BP-COX16,SYNJ2BP	NA	NA	NA	NA	COX16	20315	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	71996595	71997083	71996703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	210064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	72602663	72602717	72602690	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	756092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	74981330	74981609	74981543	Y	NPC2	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	NPC2	22450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	75125565	75125963	75125764	Y	NA	LTBP2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	48259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	76446236	76446389	76446309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT43	79757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	77639599	77639692	77639653	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63C	58688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	78031949	78032369	78032266	Y	SNW1,SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	48747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	79432037	79432160	79432099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	725303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	81036045	81036252	81036151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	183945	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	82001912	82002020	82001966	Y	NA	SEL1L	NA	NA	NA	NA	SEL1L	3707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89257931	89258017	89257974	Y	NA	EML5,TTC8	NA	NA	NA	NA	EML5	835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	84032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89895882	89896217	89896119	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	139944	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89925437	89925732	89925559	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	157761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	89951733	89951858	89951747	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	131635	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	90081839	90081992	90081916	Y	FOXN3,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	1501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	90909944	90910315	90910244	Y	NA	CALM1	CALM1,TTC7B	MCF7	ChIA-PET	22265404	CALM1	49098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	90988934	90989119	90989019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM1	128088	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91134460	91134696	91134603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	146127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91488828	91489143	91489063	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	35534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91724533	91724847	91724784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	157341	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91727497	91727640	91727579	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	154548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91734470	91734656	91734563	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	147532	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	93018523	93018873	93018560	Y	NA	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	40405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	93509801	93510236	93510094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	70429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	93511721	93512085	93511905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPK1	68580	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	94735054	94735340	94735197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	119690	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	94804515	94804967	94804759	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINA1	50063	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	96012218	96012367	96012292	Y	GLRX5	GLRX5,SCARNA13,SNHG10	NA	NA	NA	NA	SNHG10	13009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	97043507	97043643	97043575	Y	NA	RP11-433J8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-433J8.1	13427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	97646734	97646983	97646791	Y	NA	NA	C14orf177	IMR90	Hi-C	24141950	VRK1	385093	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	100256117	100256421	100256129	Y	NA	NA	EML1,CYP46A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EML1	54087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	101020509	101020866	101020628	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25,BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	30884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	101023349	101023562	101023455	Y	BEGAIN	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	28188	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	27329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	102258119	102258367	102258242	Y	NA	PPP2R5C	NA	NA	NA	NA	PPP2R5C	31984	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	102429527	102429743	102429691	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103266656	103267057	103266785	Y	NA	TRAF3	CDC42BPB,AMN	IMR90	Hi-C	24141950	TRAF3	24843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103537585	103537989	103537775	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	15786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr14	103539359	103539722	103539623	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42BPB	17560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	103540554	103540738	103540645	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-736N17.8	18322	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	103541337	103541574	103541446	Y	NA	CDC42BPB,RP11-736N17.8,TNFAIP2	CDC42BPB,EIF5	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-736N17.8	17486	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	RP11-736N17.8,TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103672309	103672597	103672449	Y	EXOC3L4	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	84530	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr14	103828242	103828602	103828384	Y	TNFAIP2,EIF5,EIF5,MARK3	EIF5,MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	21127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103878784	103878999	103878892	Y	NA	MARK3	NA	NA	NA	NA	MARK3	29055	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	104356058	104356494	104356205	Y	TRMT61A,PPP1R13B	PPP1R13B,C14orf2	PPP1R13B,LOC145216	MCF7	ChIA-PET	22265404	C14orf2	36112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	MIR203	1311	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr14	104616017	104616378	104616259	Y	NA	MIR203,KIF26A	NA	NA	NA	NA	KIF26A	12957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	RP11-982M15.6,INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	RP11-982M15.6	528	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105368048	105368162	105368106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	74532	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105435117	105435479	105435281	Y	KIAA0284	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	7215	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105538797	105539160	105538945	Y	NA	NA	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	53312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr14	105653618	105653649	105653635	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	NUDT14	7958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr14	105949862	105949973	105949911	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	1563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr14	105950488	105950604	105950502	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	21905791	21906130	21906013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP5	925265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	5.33054212089602
chr15	23841916	23842255	23842027	Y	MKRN3	MKRN3	NA	NA	NA	NA	MKRN3	33462	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25554216	25554517	25554319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	127611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25563100	25563402	25563110	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	118726	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	25646289	25646668	25646556	Y	SNURF,SNRPN,UBE3A	UBE3A	NA	NA	NA	NA	UBE3A	35460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	26030419	26030730	26030600	Y	ATP10A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	348291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	26965581	26965938	26965866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	1283453	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	29363933	29364047	29363990	Y	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	195986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	31639578	31639745	31639679	Y	KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	22520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33032997	33033143	33033070	Y	GREM1	GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	24822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33120518	33121018	33120854	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	112343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33124594	33124991	33124793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	116419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33158575	33159178	33158960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	150400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33172991	33173188	33173143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	164816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	33188603	33188636	33188634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	180428	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	NA	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	106465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	36910960	36911073	36911017	Y	MEIS2,C15orf41	C15orf41	NA	NA	NA	NA	C15orf41	41148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	37207397	37207450	37207424	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS2	184054	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	38820654	38820765	38820702	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	35011	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	39420923	39421276	39421056	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	565147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	39432291	39432412	39432368	Y	THBS1	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	576515	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	39559889	39560120	39560079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR176	650973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	40162582	40162954	40162766	Y	NA	GPR176	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	48139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	42463402	42463616	42463499	Y	EHD4	PLA2G4F,VPS39	NA	NA	NA	NA	PLA2G4F	16563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	42547123	42547182	42547153	Y	NA	VPS39,GANC,TMEM87A	NA	NA	NA	NA	GANC	16249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	43361299	43361456	43361377	Y	TP53BP1	UBR1	NA	NA	NA	NA	UBR1	34855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	45004703	45005017	45004887	Y	CASC4,CTDSPL2,SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	3028	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	48104672	48105061	48104769	Y	NA	NA	SEMA6D	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2270N23.1	83540	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	48847218	48847569	48847520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	88477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	51413367	51413627	51413497	Y	NA	TNFAIP8L3	TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP8L3	17894	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	51479240	51479465	51479382	Y	SPPL2A,DMXL2	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	83767	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	51560081	51560206	51560144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L3	164608	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	52042383	52042759	52042492	Y	LYSMD2	TMOD2,LYSMD2	NA	NA	NA	NA	LYSMD2	601	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	CTD-2184D3.1,BCL2L10	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2184D3.1	15864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRTG	94234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	56341448	56341541	56341527	Y	NA	NA	NEDD4	IMR90	Hi-C	24141950	NEDD4	57504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	56452441	56452566	56452504	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	80917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	56475345	56475479	56475412	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	58004	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	56940397	56940741	56940580	Y	ZNF280D,TCF12	NA	NA	NA	NA	NA	MNS1	185062	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	57323913	57324233	57324065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	115092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	57465140	57465369	57465208	Y	ZNF280D,TCF12	NA	LOC283663	IMR90	Hi-C	24141950	CGNL1	200796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	57529031	57529296	57529123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGNL1	136869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	58798212	58798631	58798460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPC	97444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	58807975	58808464	58808137	Y	AQP9,SLTM,RNF111,ADAM10	NA	NA	NA	NA	NA	LIPC	107207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	59467276	59467383	59467330	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	71999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	60883059	60884017	60883872	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	113682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	63894930	63894962	63894946	Y	FBXL22	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	3142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	64043759	64043975	64043867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	80166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	64919514	64919887	64919625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	73593	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	64920832	64921228	64921023	Y	ZNF609,OAZ2	NA	NA	NA	NA	NA	OAZ2	72252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	25424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr15	66866083	66866388	66866213	Y	NA	NA	ZWILCH,SNORD16,SNORD18C,SNORD18B,RPL4,LCTL,SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	RPL4	51213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67095524	67095803	67095671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD6	102958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr15	67373443	67373710	67373534	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	19342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	45002	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	86574	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67468171	67468380	67468281	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	76758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	68588456	68588855	68588647	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20315	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	70785060	70785587	70785260	Y	TLE3	NA	KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	268345	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	70800143	70800820	70800577	Y	NA	NA	KIF23,RPLP1,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	253112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	72198564	72199008	72198773	Y	PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	205591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	72617371	72617435	72617389	Y	MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6	HEXA	NA	NA	NA	NA	HEXA	49382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	74412993	74413248	74413104	Y	STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	79798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	74536866	74536980	74536923	Y	NA	RP11-60L3.1,STRA6	NA	NA	NA	NA	STRA6	34258	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3	NA	NA	NA	NA	EDC3	32032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75328661	75328897	75328778	Y	MAN2C1,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	14765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75404629	75405178	75404816	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,C15orf39	NA	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	80806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75449127	75449383	75449255	Y	NA	C15orf39	PPCDC,SCAMP5	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	36601	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	81099060	81099288	81099113	Y	NA	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	29376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	81207632	81207924	81207778	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	72295	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	81217313	81217615	81217464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	62604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	82061645	82062005	82061987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	274477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	124646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	86267591	86267810	86267701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL25	68451	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr15	89675943	89676620	89676217	Y	ISG20,ABHD2	ABHD2,HMGB1P8	NA	NA	NA	NA	HMGB1P8	1106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	23323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	90951105	90951410	90951208	Y	FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	21655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2	NA	NA	NA	NA	CHD2	33516	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	96896232	96896529	96896359	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	27642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	99090927	99091248	99091140	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr15	99943673	99944058	99943986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2A	71312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr15	99973623	99973819	99973721	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	41551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	99975346	99975780	99975666	Y	NA	MEF2A	LRRC28,LYSMD4,MEF2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2A	39590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	101499118	101499600	101499493	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	41698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	101783359	101783726	101783540	Y	CHSY1	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	6411	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	101807515	101807673	101807594	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	17378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	101818299	101818511	101818407	Y	NA	CHSY1,SNRPA1	NA	NA	NA	NA	SNRPA1	14976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	154913	155267	155125	Y	NHLRC4,HBQ1,HBM	RHBDF1,MPG,NPRL3	NA	NA	NA	NA	MPG	29907	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr16	1132307	1132794	1132674	Y	RAB40C,RAB40C,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr16	1232339	1232689	1232437	Y	NA	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	31098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	1587113	1587406	1587251	Y	CLCN7	TELO2	NA	NA	NA	NA	TELO2	45768	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	2065446	2065768	2065545	Y	NA	TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	RAB26	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A3R2	7589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	2885761	2886144	2885824	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2	NA	NA	NA	NA	PRSS22	20027	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	PRSS22,FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRSS22	11760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr16	3221173	3221513	3221502	Y	NA	ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	43395	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	3796349	3796366	3796358	Y	NA	TRAP1	NA	NA	NA	NA	TRAP1	30751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	4403644	4403691	4403668	Y	CORO7	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	PAM16	36	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	4422682	4422871	4422704	Y	NA	PAM16,VASN	NA	NA	NA	NA	VASN	2833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr16	8159340	8159643	8159579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	553897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	8950746	8950997	8950816	Y	NA	CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	9869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	9171086	9171431	9171335	Y	C16orf72,USP7	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	12074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	10759043	10759292	10759209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUBP1	76351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11345704	11346020	11345999	Y	NA	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	SOCS1	2016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11473379	11473565	11473516	Y	ZC3H7A,TXNDC11,SNN,LITAF,LITAF,CLEC16A,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS1	125343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11633611	11633797	11633714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	94440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	12008398	12008797	12008598	Y	NA	GSPT1	NA	NA	NA	NA	GSPT1	459	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	14050567	14050869	14050623	Y	MKL2	ERCC4	NA	NA	NA	NA	ERCC4	38553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	14423689	14423899	14423743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	14472258	14472411	14472327	Y	NA	NA	PARN,MIR365A,MIR193B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PARN	252174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	19221625	19221975	19221736	Y	SMG1,COQ7	SYT17	NA	NA	NA	NA	SYT17	44332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	22201170	22202123	22201439	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13480	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	23431856	23432257	23432204	Y	USP31,COG7	COG7	SCNN1B	IMR90	Hi-C	24141950	COG7	30244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	23516061	23516396	23516252	Y	PRKCB,GGA2	GGA2,UBFD1	NA	NA	NA	NA	GGA2	14920	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	25344649	25344994	25344822	Y	ZKSCAN2	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	77397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	27242037	27242327	27242262	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	35788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr16	28176884	28177249	28177153	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	43992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	31129616	31130225	31129940	Y	ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS	ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS36	NA	NA	NA	NA	KAT8	4541	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.99790659067202
chr16	34377841	34378195	34377988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2494762	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	35029860	35030042	35030005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3146781	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	47208056	47208220	47208138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJA2	202357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	48592202	48592453	48592359	Y	SIAH1,N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	59606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	CBLN1	NA	NA	NA	NA	CBLN1	2519	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	50718777	50719003	50718904	Y	ADCY7,NOD2,CYLD,CYLD,SNX20	NOD2	NA	NA	NA	NA	NOD2	6511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	57125471	57125887	57125617	Y	NA	CPNE2	NA	NA	NA	NA	CPNE2	1022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	61901951	61902129	61902040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3135690	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	66508767	66508904	66508846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	68340	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	66709355	66709374	66709366	Y	DYNC1LI2	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	19236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr16	66962213	66962449	66962329	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	FAM96B	3877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	66993598	66994056	66993790	Y	NA	RRAD,FAM96B,CES2,CES4A	NA	NA	NA	NA	CES4A	26436	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	68268995	68269119	68269015	Y	NA	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	69019845	69020210	69019891	Y	NA	NA	CHTF8,HAS3	IMR90	Hi-C	24141950	HAS3	117257	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69225511	69225823	69225667	Y	HAS3	SNTB2	NA	NA	NA	NA	SNTB2	6479	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69351854	69351929	69351891	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	8595	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69477830	69478460	69477879	Y	NA	TERF2,CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	21402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69751128	69751528	69751345	Y	PDF,TERF2,NQO1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NQO1	7326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr16	70356792	70356812	70356803	Y	NA	AARS,DDX19B,DDX19A	NA	NA	NA	NA	DDX19A	21920	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	70740989	70741599	70741286	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	23020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	70973998	70974194	70974080	Y	VAC14	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	140934	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	72671878	72672163	72672013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	419434	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	73461043	73461303	73461173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	369446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	74774732	74775110	74775064	Y	FA2H	MLKL	NA	NA	NA	NA	MLKL	41874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	74777612	74777799	74777727	Y	NA	MLKL	NA	NA	NA	NA	MLKL	44754	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	75108938	75109127	75108974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP1	71263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	75496858	75497008	75496924	Y	NA	CFDP1,TMEM170A,CHST6	NA	NA	NA	NA	TMEM170A	387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	78802745	78802853	78802799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	671435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	79623380	79623748	79623651	Y	NA	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	8863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	81439497	81439896	81439576	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	36879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	81935127	81935346	81935237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDR42E1	107747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr16	85586399	85586765	85586561	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	85758517	85758802	85758746	Y	NA	GINS2,C16orf74	GINS2,KIAA0182	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	23933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87292504	87292593	87292549	Y	NA	NA	MTHFSD,FBXO31,FOXL1,FOXC2,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	56429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87607297	87607309	87607303	Y	NA	JPH3	MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A	IMR90	Hi-C	24141950	JPH3	26132	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87759379	87759621	87759456	Y	C16orf95,FBXO31,ZCCHC14,JPH3	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	37977	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	87773499	87773902	87773849	Y	NA	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	23696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	87997747	87997931	87997804	Y	BANP	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	16897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	88338212	88338634	88338285	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	88612474	88612771	88612623	Y	NA	ZC3H18	ZC3H18	IMR90	Hi-C	24141950	ZC3H18	22018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	88831388	88831665	88831630	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	17954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr16	88835950	88836275	88836191	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	RNF166,CTU2	K562	ChIA-PET	22265404	PIEZO1	13344	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	88837093	88837695	88837443	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	11924	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	88991704	88992157	88991819	Y	NA	CBFA2T3	TRAPPC2L,GALNS	MCF7	ChIA-PET	22265404	CBFA2T3	49455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr16	89468980	89469266	89469225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	85703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	198472	198837	198612	Y	RPH3AL	RPH3AL	NA	NA	NA	NA	RPH3AL	35208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	595370	595681	595607	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	873777	873849	873813	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7161	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	1014015	1014933	1014151	Y	PITPNA,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	ABR	115382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	2095819	2096093	2095903	Y	WDR81	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	108584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	117610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	4064613	4064785	4064717	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20151	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	4125491	4125809	4125534	Y	NA	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	39465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	4204226	4204625	4204419	Y	CAMKK1	ANKFY1	NA	NA	NA	NA	ANKFY1	38952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	5140050	5140412	5140231	Y	NA	ZNF594,RABEP1	NA	NA	NA	NA	RABEP1	43146	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	6541812	6541912	6541862	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEK	122861	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEK	91900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEK	90864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEK	90471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	7389589	7389989	7389739	Y	C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A	CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	POLR2A	3904	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4693	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	8029074	8029494	8029268	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	3664	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	ALOX12B,HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	HES7	4224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr17	8056609	8057167	8057155	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	8090795	8091158	8090849	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	406	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	8268468	8268891	8268818	Y	SPDYE4,MFSD6L,CCDC42,CNTROB,ODF4	KRBA2,RPL26,NDEL1	NA	NA	NA	NA	KRBA2	9138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	8315497	8315747	8315606	Y	PIK3R6,CNTROB,PER1,C17orf59,NDEL1	KRBA2,RPL26,NDEL1	NDEL1,CCDC42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDEL1	1048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	9877746	9878167	9877897	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	281912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	10220640	10220911	10220834	Y	GAS7,MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	60561	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	10581804	10582199	10582113	Y	MYH4	SCO1,TMEM220	NA	NA	NA	NA	SCO1	17493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	15393997	15394379	15394217	Y	PMP22,FAM18B2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA74	80954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	15895023	15895192	15895111	Y	NA	ADORA2B,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	TTC19	5502	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	15925706	15925935	15925791	Y	FAM18B2,PIGL,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	17439265	17439511	17439439	Y	NA	RASD1	NA	NA	NA	NA	RASD1	41556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	17766830	17766899	17766864	Y	LLGL1	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	28505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	19268894	19269122	19269008	Y	NA	MAPK7,B9D1	NA	NA	NA	NA	MAPK7	9912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	21070786	21070950	21070861	Y	NA	DHRS7B,AC087294.2,TMEM11	NA	NA	NA	NA	AC087294.2	44694	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr17	21272298	21272502	21272399	Y	KCNJ18	KCNJ12	C17orf51,KCNJ12	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	5007	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	21314266	21314623	21314560	Y	NA	KCNJ12	NA	NA	NA	NA	KCNJ12	36757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	21416302	21416539	21416421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C17orf51	59183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	25415234	25415538	25415430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	25415760	25416041	25415903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	203061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25416172	25416581	25416426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	202521	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	109.085736974051
chr17	25479961	25480088	25479965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	139014	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25534144	25534507	25534454	Y	WSB1,LGALS9	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90	Hi-C	24141950	WSB1	84595	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25572576	25572861	25572643	Y	WSB1	WSB1	WSB1,KSR1,MIR4522	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	46241	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	25805507	25805777	25805623	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	23837	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25821729	25821988	25821800	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	40059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	25981784	25982180	25981982	Y	NA	LGALS9	NA	NA	NA	NA	LGALS9	26960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	26135195	26135302	26135249	Y	NA	NOS2	NA	NA	NA	NA	NOS2	9670	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	26368091	26368384	26368254	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	1328	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,CTB-96E2.2,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27100910	27101180	27101019	Y	NA	NEK8,TLCD1,TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	31908	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27429797	27430178	27430111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO18A	75252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	28009923	28010244	28010118	Y	SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	61998	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	ADAP2,TEFM	NA	NA	NA	NA	ADAP2	21200	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	29212303	29212381	29212342	Y	OMG,NF1,C17orf42	ADAP2,TEFM	NA	NA	NA	NA	ADAP2	18981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	29423002	29423667	29423241	Y	NA	NF1	NA	NA	NA	NA	NF1	3057	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	79002	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	32365538	32365912	32365713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL2	214392	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	33787408	33787803	33787736	Y	ZNF830,SLFN5,CCL5,SLFN12L	SLFN12	NA	NA	NA	NA	SLFN12	29106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	33841707	33842053	33841976	Y	SLFN5,SLFN12L,CCL5	NA	UNC45B,SLFN13	IMR90	Hi-C	24141950	AP2B1	61012	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	34875469	34875747	34875679	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	13100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	35446954	35447324	35447190	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	142779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	36721617	36722002	36721810	Y	ARHGAP23,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	38181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	36748013	36748410	36748212	Y	NA	SRCIN1	ARHGAP23	IMR90	Hi-C	24141950	SRCIN1	11773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38263317	38263642	38263602	Y	NA	MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	8339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38463315	38463694	38463488	Y	RARA	CDC6	NA	NA	NA	NA	RARA	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38477236	38480096	38479169	Y	IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	13792	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38630978	38631299	38631288	Y	NA	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	24550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	38674878	38675250	38674921	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	19029	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	38677736	38678132	38678052	Y	KRT24,TNS4	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TOP2A,TNS4,RAPGEFL1,WIPF2,CDC6,RARA,GJD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	21887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT36,KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT36,KRT13,KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT13,KRT15,KRT19,KRT14	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	39782029	39782271	39782148	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT14,KRT16,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT17	2935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT16,KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	39949116	39949497	39949168	Y	KRT14,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	7933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	39949517	39949745	39949566	Y	KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP	JUP,LEPREL4,FKBP10	NA	NA	NA	NA	JUP	8334	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	41410079	41410140	41410127	Y	NA	TMEM106A	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM106A	48225	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	41421158	41421352	41421255	Y	NA	NA	NBR1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4D	52975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	41546132	41546290	41546231	Y	NA	DHX8	LOC100130581,ARL4D,DHX8	IMR90	Hi-C	24141950	DHX8	12943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	42004756	42004966	42004912	Y	C17orf105,CD300LG,LSM12	MPP2	NA	NA	NA	NA	MPP2	19688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	42173326	42173627	42173470	Y	NA	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	43951029	43951274	43951198	Y	NA	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	18474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	44198056	44198387	44198212	Y	STH,KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	RPRML	89541	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	45282976	45283116	45283053	Y	NA	CDC27,ITGB3	MYL4	K562	ChIA-PET	22265404	CDC27	18188	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	45343380	45343597	45343479	Y	TBKBP1	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	14117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1,TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	37143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	29822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	46080436	46080890	46080812	Y	CDK5RAP3	CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	32502	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	110410	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	46377133	46377263	46377218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SKAP1	128374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	47049793	47049986	47049890	Y	IGF2BP1,SNF8	SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1	IGF2BP1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IGF2BP1	22788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	48136569	48136863	48136794	Y	NA	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	5237	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	48716257	48716537	48716480	Y	NA	ABCC3	NA	NA	NA	NA	ABCC3	6119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	84749	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	88299	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1225629	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	50795913	50796132	50795928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1460024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr17	50838489	50838508	50838499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1502600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	53171922	53172041	53171982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX11	127776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	53535750	53535979	53535892	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	38397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	55970352	55970806	55970481	Y	SUPT4H1,VEZF1	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	44935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	56020686	56021039	56020762	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	9645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57853705	57854627	57854148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	62000	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	57922999	57923843	57923122	Y	PTRH2,TUBD1,RPS6KB1,HEATR6	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	6372	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	58470515	58470600	58470558	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	27231	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	59018495	59018735	59018604	Y	NA	NA	TBX2,C17orf82	IMR90	Hi-C	24141950	BCAS3	265681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	453103	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	60780424	60780717	60780568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	77662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	61352706	61353153	61352892	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	168586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	61779039	61779508	61779383	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	2507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	62169387	62169789	62169751	Y	MAP3K3,LIMD2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	ICAM2,C17orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ERN1	36390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	63624560	63624814	63624604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	68795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	64128284	64128318	64128301	Y	CEP112,CEP112	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	57884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	64370414	64370595	64370515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	73660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	64690651	64690854	64690753	Y	PRKCA,CACNG4	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	268172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	66322964	66323100	66323038	Y	SLC16A6	SLC16A6	NA	NA	NA	NA	SLC16A6	37556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	70432780	70433062	70433017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	188308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	70483632	70483939	70483786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	137431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	70878407	70878514	70878507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	208337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	71007352	71007521	71007427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	79330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73007918	73008254	73008160	Y	RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	1153	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73074678	73074996	73074848	Y	LLGL2,C17orf28,ARMC7	KCTD2,ATP5H,SLC16A5,ARMC7	NA	NA	NA	NA	SLC16A5	6826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73133469	73133809	73133510	Y	NA	ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2	NA	NA	NA	NA	NT5C	7579	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73293570	73293940	73293624	Y	NA	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	9979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73304838	73305233	73305159	Y	UNK,SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	8177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	73718198	73718514	73718306	Y	NA	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	2790	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr17	73719261	73719909	73719549	Y	MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4	ITGB4,GALK1	NA	NA	NA	NA	ITGB4	3853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	73860608	73860975	73860910	Y	NA	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	UNC13D,UNK,WBP2	IMR90	Hi-C	24141950	WBP2	10020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	UNC13D,WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	74413626	74413718	74413672	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1,UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	33570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	75282703	75283463	75282995	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201905	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr17	75385660	75386043	75385777	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	304862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	75504499	75504824	75504660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	409356	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	39759	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P,TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.61715358203659
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77803693	77803802	77803748	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	7426	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77814369	77814482	77814427	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	3141	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77815304	77815490	77815418	Y	NA	CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX4	4076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	78864265	78865139	78864341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	98259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79018501	79018654	79018571	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	11553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	95398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	4473	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80164087	80164383	80164236	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,SECTM1,NARF,CSNK1D,C17orf62,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	NA	NA	NA	NA	CCDC57	4323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	113806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	81063257	81063563	81063336	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	27690	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr17	81143253	81144043	81143500	Y	NA	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	107686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	2056727	2056859	2056778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	512649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	2653655	2653795	2653729	Y	NA	CBX3P2	NA	NA	NA	NA	SMCHD1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3383416	3383792	3383691	Y	TGIF1,TGIF1	TGIF1	TGIF1	K562	ChIA-PET	22265404	TGIF1	25814	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL4	517433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	8803155	8803225	8803221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	195712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	9743544	9744009	9743684	Y	VAPA,RAB31	RAB31	NA	NA	NA	NA	RAB31	37382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	9762577	9762794	9762699	Y	RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	56415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	9829152	9829470	9829321	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	82529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr18	10372349	10372498	10372437	Y	NA	NA	APCDD1,NAPG	IMR90	Hi-C	24141950	APCDD1	80127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	12059774	12060081	12059918	Y	NA	NA	GNAL,IMPA2	IMR90	Hi-C	24141950	IMPA2	80750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	12763760	12763785	12763774	Y	CEP192,C18orf1	NA	PTPN2	IMR90	Hi-C	24141950	CEP76	62984	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr18	12808880	12809062	12808971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP76	108104	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	13137958	13138425	13138153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	148597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	13382338	13382799	13382497	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	341860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr18	13539098	13539457	13539245	Y	RNMT,C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	185202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	14098918	14099026	14098932	Y	NA	ZNF519	NA	NA	NA	NA	ZNF519	31463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	19457629	19457900	19457765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	174711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	20402088	20402300	20402139	Y	NA	RBBP8	RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	25864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	28786845	28787168	28787084	Y	DSC3,DSC2,DSG3,DSG2,DSG1,DSC1	NA	DSC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	DSC2	106467	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr18	35024297	35024529	35024426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	617139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	38400153	38400634	38400214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1132537	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	38446239	38446490	38446414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1086681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr18	38655284	38655543	38655423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	877628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	39021552	39021652	39021602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	511519	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	42857952	42858246	42858076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC14A1	443846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	44392877	44393138	44393020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNAL2	102317	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	125048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46375185	46375303	46375244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	99778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	46382446	46382625	46382534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	92456	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	SMAD7	7077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46518186	46518409	46518369	Y	NA	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	43105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46543550	46543788	46543750	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	68469	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	46547875	46548139	46548027	Y	NA	NA	SMAD7	MCF7	ChIA-PET	22265404	SMAD7	72794	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	7.23430716407317
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	48616016	48616044	48616031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD4	123606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	48721492	48722312	48721913	Y	SMAD4,MEX3C	MEX3C	NA	NA	NA	NA	MEX3C	20362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	49556425	49556602	49556514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3C	813751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	51447036	51447236	51447153	Y	STARD6,C18orf54	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	301922	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	53200351	53200719	53200535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	129299	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	55893671	55893850	55893725	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	184072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	72262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	61549883	61550442	61550030	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12957	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	61642248	61642613	61642430	Y	NA	SERPINB8	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	7089	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr18	67506387	67506771	67506648	Y	DOK6	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	364410	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	67682034	67682164	67682099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	189017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr18	68004496	68004658	68004562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	50359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	72424911	72425171	72425041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF407	161805	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr18	72919537	72919929	72919697	Y	ZADH2	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF516	72093	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74732235	74732272	74732254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	199672	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74767591	74768136	74768025	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	235028	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74779066	74780013	74779875	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	246503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	74808374	74808713	74808562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	275811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	76807542	76807844	76807575	Y	NA	ATP9B	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	ATP9B	19441	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	6.09204813816688
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	76884362	76884757	76884560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	57077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	76955177	76955415	76955295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	127892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr18	77218531	77218849	77218576	Y	NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	64675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr18	77245359	77245518	77245445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	91503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	290136	290651	290316	Y	RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	555976	556322	556024	Y	NA	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	12975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	678997	679265	679214	Y	HCN2,PALM	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	FSTL3	4605	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	752652	753043	752777	Y	PPAP2C,PPAP2C,FSTL3,C19orf21	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	42032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	778993	779222	779048	Y	GPX4,BSG,CNN2	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	15853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	10.2803312331566
chr19	789308	789721	789469	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1	NA	NA	NA	NA	PTBP1	5354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	1189532	1189666	1189566	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26	NA	NA	NA	NA	STK11	2126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	4.94978911226059
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1632932	1633212	1633140	Y	STK11	MBD3,UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	17392	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2049976	2050209	2050080	Y	OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2168890	2169464	2169082	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	6426	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2489253	2489454	2489354	Y	BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	15133	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF556,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	3131132	3131258	3131157	Y	NA	GNA11,GNA15	NA	NA	NA	NA	GNA15	2933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	3154006	3154458	3154241	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	19815	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	3570616	3571018	3570829	Y	C19orf28,HMG20B,GIPC3	MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	4456035	4456301	4456168	Y	NA	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	5336072	5336705	5336347	Y	PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	2109	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	6062045	6062746	6062500	Y	TNFSF9,DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	85892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	6579838	6580006	6579922	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	22108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	7456481	7456588	7456536	Y	LRRC8E,ARHGEF18	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	1411	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	C19orf45	7486	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	7559450	7559827	7559455	Y	NA	C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	7701239	7701460	7701364	Y	NA	CAMSAP3,XAB2,STXBP2,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	1472	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	8426850	8427217	8427032	Y	LOC645781,ANGPTL4	RPS28,NDUFA7,ANGPTL4,RAB11B,MARCH2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL4	677	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	8607140	8607451	8607227	Y	RAB11B,PRAM1,MYO1F	ZNF414	NA	NA	NA	NA	ZNF414	30092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	9095662	9095964	9095813	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	5644	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	9120594	9120838	9120762	Y	MUC16	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	30576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	9128934	9129115	9129008	Y	NA	MUC16	NA	NA	NA	NA	MUC16	38916	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	9895815	9895899	9895870	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	40593	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	10865897	10866291	10865968	Y	ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,PDE4A,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2,C19orf38,DNM2	DNM2	NA	NA	NA	NA	DNM2	39142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	11202963	11203178	11203054	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	11253991	11254271	11254206	Y	PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	10213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	21415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	11878639	11879058	11878901	Y	NA	ZNF823,ZNF441,ZNF491,ZNF440	NA	NA	NA	NA	ZNF441	2824	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr19	12889371	12889726	12889619	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	12894545	12895330	12894818	Y	ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	4980	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	13024998	13025376	13025029	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1	NA	NA	NA	NA	SYCE2	2714	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	9626	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	13266326	13267156	13266576	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	7097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13267779	13268208	13267877	Y	MAN2B1,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	8550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr19	14617819	14618098	14617969	Y	IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	7799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	14670632	14670897	14670765	Y	NA	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	9977	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr19	15283162	15283418	15283290	Y	NA	ILVBL,NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	26374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	17190539	17191239	17190954	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	5948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	17578706	17578913	17578810	Y	NA	TMEM221,SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	SLC27A1	1128	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr19	18211545	18211814	18211678	Y	NA	MAST3,IL12RB1	NA	NA	NA	NA	IL12RB1	3791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18214987	18215493	18215283	Y	NA	MAST3,IL12RB1,PIK3R2	NA	NA	NA	NA	IL12RB1	7233	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	18439179	18439536	18439334	Y	NA	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1,GDF15	PGPEP1	K562	ChIA-PET	22265404	LSM4	7095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18528819	18529396	18529072	Y	ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18625662	18626077	18625893	Y	UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL	ELL,FKBP8,KXD1	NA	NA	NA	NA	ELL	4860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	19027750	19028071	19027900	Y	MAU2	GDF1,CERS1,COPE,DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	COPE	135	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	19078398	19078892	19078760	Y	ELL,GATAD2A,HOMER3	DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	HOMER3	28328	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	19560401	19560757	19560579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	63788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	19562909	19563265	19563209	Y	RFXANK,MEF2BNB,MAU2,GATAD2A,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	61280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	21497472	21497811	21497647	Y	ZNF430,ZNF429,ZNF100,ZNF708,ZNF493	ZNF708,ZNF738	NA	NA	NA	NA	ZNF708	12416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	21882044	21882358	21882227	Y	ZNF676,ZNF208	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF100	66072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	23732304	23732710	23732386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF675	135312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	27732067	27732764	27732500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1969684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	28138773	28139078	28139011	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1563370	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28197525	28198373	28198039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1504075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	28208615	28209033	28208726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1493415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28211511	28212598	28211607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1489850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28232001	28232276	28232191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1470172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28234447	28234748	28234598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467700	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28234930	28234990	28234960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1467458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28252920	28253113	28253061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1449335	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	28508249	28508335	28508293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1194113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28518502	28518514	28518508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1183934	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	28914991	28915131	28915061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	787317	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	29104448	29104951	29104611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	597497	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	32754044	32754196	32754068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF507	80304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	33784292	33784447	33784359	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	7023	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	33996867	33997517	33996997	Y	LRP3	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	13183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	34398114	34398257	34398186	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	113276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	34724001	34724111	34724046	Y	NA	KIAA0355	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	19331	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	35100505	35100815	35100739	Y	ZNF302	NA	NA	NA	NA	NA	AC020910.2	65671	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	35661278	35661320	35661299	Y	FFAR2	FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	17645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	35712850	35713011	35712931	Y	NA	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	LSR	24222	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	35808532	35808711	35808557	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	50651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr19	35927378	35927883	35927593	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR3,U2AF1L4,TYROBP,NFKBID,HCST,FFAR2	FFAR2	NA	NA	NA	NA	FFAR2	4926	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	36020756	36020837	36020796	Y	NA	DMKN,SBSN,TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	SBSN	3503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	36648389	36648571	36648491	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	19912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	37262228	37262609	37262419	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	37822125	37822150	37822138	Y	NA	HKR1,ZNF527	NA	NA	NA	NA	HKR1	20386	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	38186506	38186731	38186619	Y	ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573	ZFP30,ZNF607	NA	NA	NA	NA	ZFP30	5268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	38524876	38525374	38525157	Y	GGN,CATSPERG,ZNF540,ZNF607,WDR87	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	129008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	38791297	38791661	38791416	Y	C19orf33	PPP1R14A,C19orf33,YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	C19orf33	1140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	39152764	39152958	39152839	Y	NA	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	16475	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	39175000	39175365	39175141	Y	NFKBIB,HNRNPL,EIF3K	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	38711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	39479991	39480220	39480106	Y	NA	SARS2,FBXO17,FBXO27	FBXO17	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO17	15441	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	40923099	40923282	40923196	Y	SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	PRX	5826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	41169097	41169273	41169245	Y	NA	NUMBL	NA	NA	NA	NA	NUMBL	25604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	41681944	41682199	41682187	Y	NA	CYP2S1,AXL	CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8	IMR90	Hi-C	24141950	CYP2S1	14755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	41819266	41819494	41819482	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	5172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	41831643	41832527	41831971	Y	CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA	NA	NA	NA	NA	CCDC97	17549	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	NA	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	92120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	42429105	42429824	42429205	Y	DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	31718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42430880	42431141	42430883	Y	NA	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	30401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	DEDD2	29017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	42711906	42712521	42712423	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,POU2F2,DEDD2	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	DEDD2	9771	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	42722677	42722859	42722787	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC	NA	NA	NA	NA	ZNF526	254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	44773096	44773391	44773244	Y	LYPD5,ZNF221,ZNF284,ZNF224,ZNF234,ZNF226,ZNF226,ZNF226,ZNF285,ZFP112,ZNF227,ZNF233,ZNF233,ZNF235	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF233	20778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	44825986	44826083	44826035	Y	ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	18787	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45195366	45195649	45195556	Y	RELB,CLASRP,BCL3	NA	NA	NA	NA	NA	PVR	50268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45228436	45228775	45228695	Y	IGSF23,RELB,APOE,APOC4,APOC2,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	20187	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45844650	45844836	45844820	Y	FBXO46,PPP1R13L	KLC3,ERCC2	NA	NA	NA	NA	KLC3	9958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	45995542	45995743	45995643	Y	NANOS2,NKPD1,EXOC3L2	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	PPM1N	5507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2,IGFL1	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr19	46698925	46699055	46698990	Y	NA	IGFL1	IGFL3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFL1	31954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	46877153	46877367	46877269	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	28902	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3	NA	NA	NA	NA	CALM3	39864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	47269374	47269772	47269575	Y	LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5	FKRP,STRN4,SLC1A5	NA	NA	NA	NA	SLC1A5	20079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	47367294	47367354	47367334	Y	NA	AP2S1	SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	15045	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47599577	47599849	47599731	Y	NA	TMEM160,SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	SAE1	14682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	4795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47792934	47793257	47793053	Y	NA	CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	16792	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	47818553	47819137	47818792	Y	ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77	PRR24,DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	31401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47926520	47926706	47926665	Y	NA	MEIS3,SLC8A2	NA	NA	NA	NA	MEIS3	5740	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	48076356	48076760	48076653	Y	SLC8A2,ZNF541	NA	GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541	IMR90	Hi-C	24141950	NAPA	59859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	48101913	48102072	48101991	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHD2	62472	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	EHD2,GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	EHD2	7762	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	49521043	49521282	49521101	Y	NA	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	23859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	49524183	49524468	49524237	Y	CGB5	GYS1,RUVBL2,CGB5	NA	NA	NA	NA	CGB5	20673	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	49924099	49924476	49924276	Y	TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1	ALDH16A1,PIH1D1	NA	NA	NA	NA	ALDH16A1	29950	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	50825197	50825861	50825498	Y	NA	NR1H2,KCNC3	NA	NA	NA	NA	NR1H2	5049	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	51010284	51010518	51010437	Y	KLK4,ACPT,SYT3,SHANK1,LOC342918	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	2092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	51166998	51167396	51167198	Y	KLK4,KLK6,KLK14,SYT3,LOC342918	C19orf81,SYT3	NA	NA	NA	NA	SYT3	2255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	51224129	51224276	51224235	Y	C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A	SHANK1	NA	NA	NA	NA	SHANK1	3422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48,KLK1	NA	NA	NA	NA	KLK1	14212	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	51944053	51944530	51944252	Y	SIGLEC9,SIGLEC7,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC10	NA	NA	NA	NA	NA	ETFB	76381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	120291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	52303612	52304072	52303819	Y	SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF649	102221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	53129559	53129725	53129643	Y	ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF83	62024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	53173643	53173679	53173660	Y	ZNF83	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	18070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,AC008753.6,PRKCG	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	3374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	54433325	54433420	54433359	Y	TARM1,ZNF813,DPRX,CACNG7	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCG	52881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCG	84799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	55582606	55582776	55582718	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	RDH13	1947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	55977615	55977883	55977735	Y	NLRP8,NLRP9,NLRP11,SGK110	ISOC2,ZNF628,NAT14	ISOC2,UBE2S,SSC5D,NAT14	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ISOC2	5905	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr19	56061327	56061704	56061673	Y	NA	SBK2,ZNF579,ZNF524,FIZ1	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	SBK2	14871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	57349423	57349757	57349684	Y	ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF71	244791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr19	58175767	58176046	58175802	Y	ZNF460,ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,ZNF772,ZNF549,ZSCAN18,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF776,ZNF671,ZNF586,ZNF418,ZNF417,ZNF256,ZNF135,ZNF550,ZNF211,ZNF551	ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF551	15291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	58237757	58238155	58237774	Y	NA	ZNF551,ZNF776,ZNF586	ZNF154	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF776	18009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	58532436	58532530	58532517	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	19719	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	528553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	3226385	3226781	3226690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	152872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	3508183	3508316	3508315	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	13191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	7571177	7571382	7571249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	515654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	7935930	7936061	7935999	Y	NA	NA	LOC339788,LINC00299	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	785861	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	8317157	8317412	8317175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	404510	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	9894353	9894610	9894569	Y	ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	86873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	10153127	10153217	10153171	Y	NA	KLF11	NA	NA	NA	NA	KLF11	27759	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	10418251	10419155	10418675	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	21860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	10471190	10471549	10471320	Y	HPCAL1,HPCAL1	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	30175	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	11514785	11514933	11514926	Y	NA	ROCK2	ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	28329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	154584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	12308947	12309431	12309189	Y	LPIN1	NA	TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	493226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	13447993	13448374	13448173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB2	592978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	15464031	15464396	15464252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	235058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	20624612	20624982	20624777	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	19853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	20638245	20638508	20638456	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,GDF7	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	6327	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	20825545	20825949	20825765	Y	RHOB	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	22900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	21518335	21518607	21518471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	497453	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	21691615	21691861	21691725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	670733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	24495048	24495317	24495183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	86266	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	25021346	25021618	25021482	Y	NA	CENPO,PTRHD1	NA	NA	NA	NA	PTRHD1	7095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	25701614	25701880	25701747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	138155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	26521727	26522029	26521734	Y	NA	EPT1	NA	NA	NA	NA	EPT1	7386	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	26980806	26981182	26980970	Y	C2orf18	CENPA	OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CENPA	3975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	27574731	27574755	27574743	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,FTH1P3	NA	NA	NA	NA	AC074117.10	2358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	27614467	27614499	27614483	Y	EIF2B4,EIF2B4	AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	FTH1P3	233	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL33	33886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	28134368	28134411	28134390	Y	NA	BRE,RBKS	NA	NA	NA	NA	RBKS	22403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	28659517	28659673	28659646	Y	NA	FOSL2	FOSL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSL2	46202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	28844259	28844848	28844625	Y	FOSL2,TRMT61B,PPP1CB,PPP1CB	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	127658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29055098	29055343	29055221	Y	SPDYA	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	35824	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29223437	29223646	29223521	Y	NA	FAM179A	C2orf71	IMR90	Hi-C	24141950	FAM179A	45960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29331222	29331429	29331307	Y	NA	CLIP4	CLIP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CLIP4	12651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	29339148	29339698	29339489	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	20577	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29349196	29349466	29349333	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	30625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29435309	29435425	29435367	Y	SPDYA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	116738	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	29783332	29783373	29783353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALK	359059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	30391485	30391578	30391503	Y	YPEL5	YPEL5	NA	NA	NA	NA	YPEL5	23678	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	30788063	30788262	30788163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	119971	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	33163246	33163288	33163260	Y	NA	LTBP1	LTBP1	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP1	6751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2,AC007390.4	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193745	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	37858321	37858709	37858681	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	104902	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	38340220	38340542	38340303	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP1B1	5176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	38356620	38356932	38356711	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	21576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	38422036	38422352	38422194	Y	FAM82A1,CYP1B1	RPL7P12,AC009229.5	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	34358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	39078847	39079086	39078967	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	21989	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	39334876	39335293	39335230	Y	NA	SOS1	NA	NA	NA	NA	SOS1	14193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	42952930	42953056	42952997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTA3	233221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	43401535	43402035	43401733	Y	OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	49713	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	43437815	43438151	43437904	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	13597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	45237112	45237533	45237325	Y	SIX2	AC012354.8,SIX2	NA	NA	NA	NA	SIX2	2543	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	46586439	46586863	46586504	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	67633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47031260	47031826	47031474	Y	NA	NA	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS5	107169	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47094106	47094283	47094195	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	47013	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47214273	47214540	47214407	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	47279	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47306951	47307378	47307182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	94362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	47569796	47569847	47569822	Y	NA	AC073283.4,EPCAM	EPCAM,MSH2	IMR90	Hi-C	24141950	AC073283.4	366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	48941628	48941642	48941634	Y	STON1-GTF2A1L,STON1,STON1-GTF2A1L,LHCGR	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	187106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	50267276	50267578	50267576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	787238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	51438169	51438482	51438325	Y	NA	NA	NRXN1	IMR90	Hi-C	24141950	AC007560.1	383353	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	57623387	57623716	57623641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	509070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	61766465	61766637	61766569	Y	AHSA2,USP34	XPO1	NA	NA	NA	NA	XPO1	2704	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	62519354	62519381	62519368	Y	NA	NA	COMMD1,B3GNT2	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	98106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	63411576	63411965	63411771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	136384	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	64360908	64361228	64361132	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	7145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	64364775	64365257	64365170	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	3116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	64368431	64369198	64368837	Y	NA	AC074289.1,PELI1	NA	NA	NA	NA	AC074289.1	58	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	65303160	65303240	65303200	Y	SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A	CEP68	NA	NA	NA	NA	CEP68	21660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	69390293	69390547	69390355	Y	ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	151983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70000495	70000634	70000556	Y	MXD1	NA	NA	NA	NA	NA	GMCL1	54140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70048617	70048893	70048741	Y	ANXA4	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	5881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70057532	70057914	70057667	Y	C2orf42,AAK1,GMCL1	GMCL1	NA	NA	NA	NA	GMCL1	2758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70160460	70161117	70160745	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	PCBP1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ASPRV1	26280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70229859	70229868	70229864	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	42462	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70270545	70270983	70270722	Y	MXD1,ASPRV1,C2orf42,PCBP1	PCBP1,PCBP1-AS1	NA	NA	NA	NA	PCBP1	41602	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	71228347	71228418	71228366	Y	ANKRD53	TEX261	TEX261	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TEX261	8272	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	72416850	72417011	72416931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	634159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	72732418	72732763	72732614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	318407	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	72774678	72774916	72774797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	276254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	73233755	73233809	73233782	Y	NA	NA	EMX1	IMR90	Hi-C	24141950	SFXN5	66938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	73774930	73775287	73775109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALMS1	164044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	74722835	74723021	74722928	Y	NA	INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,LBX2,PCGF1,TLX2,HTRA2,AUP1	NA	NA	NA	NA	LBX2	5422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	75071156	75071353	75071277	Y	LBX2,HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	12048	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	75427361	75427621	75427415	Y	TACR1	NA	NA	NA	NA	NA	POLE4	243742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	75498571	75498680	75498627	Y	NA	NA	TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	POLE4	314952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	78328146	78328439	78328293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	314638	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	78478830	78479153	78479031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	465322	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr2	78486500	78486864	78486682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	472992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	78525487	78525634	78525561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	511979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	78631329	78631672	78631604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	617821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	80261096	80261278	80261177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	126983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	81781528	81781694	81781559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1261561	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	81820947	81821308	81821128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC098817.3	1221947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	84299529	84299779	84299675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG1	385390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	85066726	85066734	85066730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMSB10	64015	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	85267777	85267839	85267811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM3P3	59978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	86225783	86226050	86225999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	86284876	86285205	86285126	Y	NA	POLR1A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	POLR1A	46073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	90485310	90485405	90485339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	1496148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	95925847	95925871	95925861	Y	NA	NA	PROM2	IMR90	Hi-C	24141950	AC092835.2	54564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	96190968	96191044	96191006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	124499	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	96823532	96823852	96823717	Y	TMEM127,KIAA1310,ARID5A,ASTL,DUSP2	DUSP2,AC012307.2,STARD7	DUSP2,STARD7,LOC285033,ADRA2B,SNRNP200,TMEM127,CIAO1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC012307.2	12781	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	19761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	97428705	97428844	97428785	Y	NA	LMAN2L,CNNM4	NA	NA	NA	NA	CNNM4	4066	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	98367978	98368166	98368128	Y	TMEM131,ANKRD36B,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	88784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	99118904	99119212	99119061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4A	59587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	99268200	99268767	99268592	Y	NA	COA5,UNC50	NA	NA	NA	NA	UNC50	45158	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	99287467	99287477	99287472	Y	CNGA3	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT4A	58112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	101872333	101872649	101872491	Y	RNF149	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	TBC1D8	5005	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	102134407	102134716	102134504	Y	NA	NA	MAP4K4,RFX8,CREG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREG2	132350	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	102333492	102333834	102333706	Y	IL1R1,RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	22180	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	102382879	102383094	102382925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	71567	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr2	102478902	102479140	102479043	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	167590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	102515032	102515286	102515160	Y	IL1R2	NA	NA	NA	NA	NA	IL1R1	163718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	102918428	102918763	102918475	Y	IL1RL1	NA	IL1R2,IL1RL1	IMR90	Hi-C	24141950	IL1R1	239424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	105676474	105676490	105676482	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	24033	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	106444120	106444569	106444380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	84766	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	106712278	106712621	106712354	Y	NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	UXS1	96174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	109789769	109790041	109789880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	388556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	109859358	109859584	109859496	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	458145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	110871797	110872011	110872000	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	132	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr2	111879046	111879315	111879118	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	4091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	112463608	112463919	112463793	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANAPC1	176348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	113292630	113292957	113292832	Y	IL1A	POLR1B,CHCHD5	NA	NA	NA	NA	POLR1B	4535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	114014908	114015299	114015271	Y	NA	PAX8-AS1	NA	NA	NA	NA	PAX8-AS1	47809	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	PAX8-AS1	115350	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	SLC35F5	NA	NA	NA	NA	SLC35F5	42570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	114672841	114673224	114672915	Y	NA	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	27304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	118847045	118847263	118847087	Y	INSIG2	INSIG2	NA	NA	NA	NA	INSIG2	3017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	119426780	119427028	119426904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	484818	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	120891923	120892273	120892121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	86711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	121040381	121040601	121040491	Y	NA	RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	44741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	121155649	121155973	121155708	Y	INHBB	NA	LOC84931,INHBB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INHBB	53930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	121650745	121651146	121650942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	159546	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	122297511	122297730	122297621	Y	NA	RNU4ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	11054	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	122480192	122480543	122480332	Y	NA	TSN	NA	NA	NA	NA	TSN	12136	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	127824493	127824859	127824771	Y	MAP3K2,IWS1,BIN1	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	38072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	129994679	129994961	129994820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	700829	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	494673	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	131793734	131793916	131793828	Y	TUBA3D,FAM123C,FAM123C,FAM123C	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168B	55117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	16838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2,CCNT2-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNT2-AS1	26936	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	136720209	136720558	136720339	Y	NA	DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	21112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	7.99581318134404
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	146447883	146448001	146447923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	355085	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	146450569	146451281	146450882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	357771	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	146508188	146508841	146508406	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	415390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	148671388	148671433	148671412	Y	ORC4,ORC4,ORC4,ORC4,ORC4	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	71302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	149566291	149566547	149566419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPC2	166282	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	151022837	151023057	151022971	Y	NA	NA	RND3	MCF7	ChIA-PET	22265404	RND3	370468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr2	152930991	152931406	152931212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAM2	99100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	153347389	153347769	153347704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	157638	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	153356449	153356753	153356698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	166698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP281	85665	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	160371940	160372153	160372033	Y	MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B	NA	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	54173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	160804631	160804934	160804783	Y	NA	LY75-CD302,LY75	NA	NA	NA	NA	LY75	45371	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	NA	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4785	163770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	161177458	161178011	161177649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	84382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	163376672	163376691	163376681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GCA	203322	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	164518951	164519177	164519064	Y	FIGN	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	71345	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	GRB14	NA	NA	NA	NA	GRB14	45927	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	166779898	166780276	166780103	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	28077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	168977927	168978148	168978038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	124503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	169347640	169347834	169347737	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	37268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	170219794	170220267	170220091	Y	LRP2	LRP2	NA	NA	NA	NA	LRP2	2599	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	170684911	170685465	170685124	Y	PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3	SSB,METTL5,UBR3	NA	NA	NA	NA	UBR3	2943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	171977769	171978174	171977980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLK1	107650	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	172621126	172621511	172621230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	79207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	172628972	172629294	172629196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	87053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	173647954	173648254	173648105	Y	NA	RAPGEF4	NA	NA	NA	NA	RAPGEF4	49952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	174518967	174519016	174518991	Y	NA	NA	OLA1,CIR1	IMR90	Hi-C	24141950	CDCA7	301419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	174899943	174900225	174900070	Y	SP3	NA	SP3,CDCA7,OLA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP3	71513	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	175700542	175700958	175700833	Y	CHRNA1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	118037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3AP4	125918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD11,HOXD8	NA	NA	NA	NA	HOXD11	2917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	178100990	178101571	178101482	Y	NA	HNRNPA3,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	17167	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128,AC079305.10	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	180585338	180585678	180585637	Y	ZNF385B,ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	284162	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	187015061	187015446	187015349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	333437	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	187420042	187420288	187420183	Y	ITGAV,ITGAV,ZC3H15	ITGAV	ZC3H15,ITGAV	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	32504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	188326523	188326725	188326579	Y	NA	CALCRL	NA	NA	NA	NA	CALCRL	15336	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr2	189392634	189392951	189392670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GULP1	238238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	190739727	190739922	190739832	Y	NA	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	2413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr2	191825811	191826187	191826065	Y	NAB1,GLS,STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	30106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	191861736	191862119	191861929	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	192170125	192170408	192170266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	62214	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	192500525	192500897	192500643	Y	NA	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	209084	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	HECW2,CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECW2	9764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	198834136	198834535	198834225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL1	166710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	202102159	202102434	202102342	Y	NA	CASP8	NA	NA	NA	NA	CASP8	5993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr2	203520524	203520862	203520558	Y	NA	FAM117B	NA	NA	NA	NA	FAM117B	22623	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	205595294	205595620	205595457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	186778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	206205217	206205608	206205348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	339106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	206439575	206439768	206439663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	104946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	206564438	206564682	206564481	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	19724	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	206596215	206596601	206596444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	51501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	206944485	206944991	206944704	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	AC007383.3	2338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	208472249	208472458	208472354	Y	NA	METTL21A	NA	NA	NA	NA	METTL21A	16194	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	213185826	213186073	213186055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	961040	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	213401643	213402097	213401658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG16	745016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	216224117	216224404	216224261	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	49577	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	216614389	216614747	216614614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	282072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	216876845	216877231	216877087	Y	MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	19588	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	217312390	217312696	217312543	Y	NA	SMARCAL1,RPL37A,AC098820.3	NA	NA	NA	NA	SMARCAL1	37253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	218261138	218261287	218261221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	604431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	218703637	218703700	218703669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	162018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	218953176	218953511	218953344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	87458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	17960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	222305020	222305156	222305087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	131766	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	222435699	222436339	222436058	Y	EPHA4	EPHA4	NA	NA	NA	NA	EPHA4	583	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr2	223170887	223171031	223170916	Y	NA	PAX3	NA	NA	NA	NA	PAX3	9172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	223429708	223429962	223429836	Y	FARSB	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	89094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	24291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	226547513	226547628	226547579	Y	NA	NA	RHBDD1,IRS1,COL4A4	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK10	642351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	226895670	226896158	226895921	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	766317	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	228437239	228437625	228437329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGFG1	102371	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	229407284	229407450	229407381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	726551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	233283707	233283952	233283753	Y	ALPPL2	ALPP,AC068134.8,ALPPL2	NA	NA	NA	NA	ALPPL2	14154	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr2	234764859	234765061	234764972	Y	HJURP	HJURP,MSL3P1	NA	NA	NA	NA	HJURP	3647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	235242895	235243257	235243020	Y	ARL4C	NA	SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	160440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	235748055	235748426	235748121	Y	NA	NA	TRPM8,SH3BP4	IMR90	Hi-C	24141950	SH3BP4	110191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	235863329	235863490	235863430	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	4712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	236489079	236489125	236489102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	88346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	236568663	236568900	236568814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	167930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	236698901	236699175	236699041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	298168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBX2	407971	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	237677514	237677881	237677605	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	314074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	237678524	237678883	237678772	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	313072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	305881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	237881431	237881780	237881646	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	110175	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	238036930	238037258	238037105	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	44470	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	238038460	238038824	238038818	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	46000	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	238131951	238132217	238132070	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	139491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	238136450	238136659	238136506	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	143990	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	238383141	238383356	238383272	Y	NA	AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MLPH	8715	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr2	238585463	238585872	238585569	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	51244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	238598036	238598427	238598303	Y	ESPNL,UBE2F,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	63817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	239085902	239086198	239086162	Y	NA	KLHL30,FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	20279	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	239545160	239545510	239545294	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,HDAC4,MIR4440	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	211777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	239593183	239593431	239593307	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	ASB1	259800	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	240134215	240134581	240134421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	186767	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	240196255	240196671	240196554	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124677	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124012	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	240199614	240199929	240199643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	121419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	240854377	240854983	240854483	Y	NA	NA	LOC150935,MIR4786	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFA10	107836	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	241190569	241190767	241190645	Y	NA	AC124861.1	GPC1,ANKMY1,PP14571	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC124861.1	2685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	241366341	241366661	241366471	Y	GPR35,GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	6427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr2	241719064	241719393	241719333	Y	KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	241719463	241720148	241720097	Y	ANKMY1,AQP12B,AQP12A,KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	37577	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242030281	242030580	242030300	Y	SNED1,PASK	MTERFD2	NA	NA	NA	NA	MTERFD2	9167	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242304310	242304654	242304483	Y	FARP2	HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	10652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242500447	242500594	242500505	Y	NEU4,BOK	BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	4311	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr2	242549642	242550327	242549774	Y	ATG4B	ATG4B,THAP4	NA	NA	NA	NA	ATG4B	24301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	447394	447636	447634	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	6197	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	1154843	1155127	1154985	Y	FAM110A,SIRPB2,SIRPB1	TMEM74B	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	8932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1168274	1168908	1168417	Y	NA	TMEM74B	NA	NA	NA	NA	TMEM74B	4215	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1307828	1308261	1308086	Y	SDCBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SNPH	62868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	32886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	2090589	2090758	2090698	Y	NA	STK35	NA	NA	NA	NA	STK35	10332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	2295693	2295966	2295830	Y	SIRPA,SIRPA,SIRPA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPB	153533	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	3538229	3538411	3538318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATRN	88542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMOX	103496	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	5816621	5816994	5816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-55P	51707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	6015657	6015992	6015825	Y	NA	CRLS1,LRRN4	NA	NA	NA	NA	LRRN4	16703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	6678677	6678999	6678684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	67312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	9100209	9100421	9100248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	52799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	9254416	9254452	9254434	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	207006	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	9479194	9479413	9479304	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	431784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	10466571	10466854	10466711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	53701	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	10652083	10652420	10652292	Y	JAG1	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	27069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	13142278	13142281	13142280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	58137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	13317482	13317575	13317520	Y	ESF1	NA	NA	NA	NA	NA	ISM1	117064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	17554539	17554936	17554702	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	6031	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	BFSP1,DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	19235104	19235354	19235238	Y	NA	SLC24A3	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	43814	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	19408281	19408453	19408368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	216991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	19783112	19783320	19783290	Y	NA	RP1-122P22.2	RIN2,SLC24A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	46760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	20605285	20605597	20605591	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	85534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	23075489	23075921	23075757	Y	THBD,CD93,GZF1	THBD	SSTR4	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	47111	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	23347147	23347295	23347221	Y	THBD,CD93,GZF1	NXT1,GZF1	NA	NA	NA	NA	GZF1	6360	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	24608551	24608896	24608878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	160716	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	25227906	25228088	25227908	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	1201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	25305837	25305970	25305904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	63649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	25445422	25445550	25445504	Y	ACSS1,ABHD12	NA	NA	NA	NA	NA	GINS1	59059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	29636705	29636738	29636722	Y	NA	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	26848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30255856	30255976	30255884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	53816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30260311	30260679	30260495	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	49113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30303594	30303801	30303667	Y	TTLL9,DUSP15	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	5991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	30700574	30701059	30700820	Y	HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	5265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	32282473	32282574	32282524	Y	NA	NECAB3,E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	E2F1	10263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	32694090	32694253	32694172	Y	NA	EIF2S2	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	3885	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	34379775	34380017	34379908	Y	SPAG4,RBM39,PHF20	PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	21879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	34804384	34804527	34804456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLGAP4	87731	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	18651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	36618785	36619379	36619133	Y	RALGAPB,RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	40491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	37280609	37280856	37280791	Y	SLC32A1	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR5	94229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	39631777	39632207	39632178	Y	NA	TOP1	PLCG1,TOP1,ZHX3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	23251	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	39762558	39762863	39762778	Y	NA	PLCG1	NA	NA	NA	NA	PLCG1	737	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	42780306	42780638	42780459	Y	NA	JPH2	NA	NA	NA	NA	JPH2	33580	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WFDC5	51465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	43709360	43709760	43709560	Y	NA	WFDC5	NA	NA	NA	NA	WFDC5	32053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	WFDC5,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	WFDC5	25519	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43972821	43973151	43973055	Y	SYS1,SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	1913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	43974041	43974470	43974334	Y	NA	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	44139141	44139436	44139290	Y	SYS1,ZNF335	WFDC2	NA	NA	NA	NA	WFDC2	42795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	45988883	45989283	45988988	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5316	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	46320177	46320280	46320230	Y	SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	93080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	46420724	46421103	46420967	Y	NA	SULF2	SULF2,PREX1,ARFGEF2	IMR90	Hi-C	24141950	SULF2	7364	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	46438543	46438763	46438619	Y	SULF2,SULF2	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	25183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	7.23430716407317
chr20	46700957	46701130	46701044	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00494	285563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	47339273	47339687	47339536	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	102733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	47372882	47372931	47372907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	69489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	47443501	47443751	47443699	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	1081	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	47455528	47455923	47455726	Y	NA	PREX1	PREX1,ARFGEF2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PREX1	13108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	47796581	47796870	47796726	Y	NA	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	6034	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48113589	48113975	48113763	Y	NA	KCNB1	NA	NA	NA	NA	KCNB1	16405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48158294	48158522	48158408	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	24161	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	48165703	48166239	48166052	Y	PTGIS	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	16444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr20	48168443	48168863	48168748	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	13820	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	48174087	48174267	48174236	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	8416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	48179009	48179108	48179059	Y	NA	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	3575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48201281	48201539	48201531	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	18598	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	48212349	48213057	48212923	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	29666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	48236919	48237304	48237112	Y	SPATA2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGIS	54236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48295598	48295872	48295769	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	32543	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48311078	48311758	48311363	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	16657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48467762	48467975	48467793	Y	NA	SLC9A8	NA	NA	NA	NA	SLC9A8	40512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48533898	48534043	48533948	Y	B4GALT5,SLC9A8,CEBPB,SPATA2,SNAI1,RNF114	SPATA2,RNF114	NA	NA	NA	NA	SPATA2	3818	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48598723	48598794	48598730	Y	B4GALT5,SLC9A8,TMEM189,CEBPB,RNF114,SNAI1	RNF114,SNAI1	NA	NA	NA	NA	SNAI1	1187	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48902426	48902799	48902722	Y	CEBPB	NA	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	97050	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48924890	48925591	48925260	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	119514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPB	146419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	49133154	49133451	49133362	Y	CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	8263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	FAM65C,PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49516325	49516426	49516399	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	29095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	49524499	49524706	49524614	Y	ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	20815	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	6423	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49574418	49574471	49574465	Y	PTPN1,ADNP	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	MOCS3	1055	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	49982226	49982434	49982404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	50252715	50253081	50252915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	95991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	50272756	50273155	50272761	Y	ATP9A	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	75917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	52380425	52380741	52380578	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	155979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	52452051	52452403	52452283	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	227605	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	52482655	52483054	52482957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	258209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	52533564	52534521	52533763	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	253991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	88897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	55403523	55403730	55403625	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTMAP6	128953	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38	NA	NA	NA	NA	RBM38	4345	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	56592800	56593208	56592856	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP4R1L	289287	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	57018014	57018479	57018179	Y	STX16	NA	NA	NA	NA	NA	VAPB	55836	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	57198784	57199334	57199089	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16	24994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	57300192	57300206	57300199	Y	NA	NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	38005	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	57557787	57558211	57558054	Y	ZNF831,STX16	CTSZ,ATP5E	NA	NA	NA	NA	CTSZ	22091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58436515	58436843	58436553	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,SYCP2,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	69867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58437773	58438005	58437846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	68705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58451421	58451787	58451564	Y	SYCP2,PPP1R3D,C20orf177,C20orf177	NA	NA	NA	NA	NA	SYCP2	54923	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58459134	58459312	58459218	Y	PHACTR3,PHACTR3,PHACTR3,C20orf177	SYCP2	NA	NA	NA	NA	SYCP2	47398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58784200	58784511	58784424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	123305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	142529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	58836675	58836957	58836817	Y	CDH26	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	175780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58885670	58885801	58885736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1043L13.1	224775	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58955192	58955446	58955319	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	294297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	58957250	58957289	58957270	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1043L13.1	296355	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60328357	60328661	60328509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	310205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	60874912	60875240	60875071	Y	NA	MIR4758	NA	NA	NA	NA	ADRM1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60924549	60924827	60924688	Y	TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5	ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21	NA	NA	NA	NA	LAMA5	15541	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	60944265	60944566	60944463	Y	NA	MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	3897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	C20orf166-AS1	NA	NA	NA	NA	C20orf166-AS1	45872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	61306804	61307048	61306918	Y	OGFR	SLCO4A1,NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	31141	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	61371540	61371927	61371747	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	NTSR1	NA	NA	NA	NA	NTSR1	33351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	61505589	61505880	61505712	Y	BHLHE23,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCFL5	14474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	61506279	61506510	61506352	Y	BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11	TCFL5	TCFL5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TCFL5	15164	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr20	61514139	61514234	61514187	Y	NA	TCFL5	NA	NA	NA	NA	TCFL5	23024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	43476	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	61822824	61823015	61822948	Y	NA	YTHDF1,BIRC7	NA	NA	NA	NA	YTHDF1	22571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62456717	62456924	62456790	Y	NA	RP4-583P15.11,ZBTB46,TPD52L2	ZBTB46,MIR1914,UCKL1-AS1,ZNF512B,UCKL1,TPD52L2,ABHD16B,DNAJC5	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB46	3673	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr20	62527317	62528264	62527831	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,LIME1,TPD52L2,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	DNAJC5	2799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62545436	62545544	62545492	Y	NA	DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1	NA	NA	NA	NA	RNU1-134P	7128	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62676779	62676921	62676850	Y	SLC2A4RG,UCKL1,TCEA2,SOX18	ZNF512B,SOX18,TCEA2	NA	NA	NA	NA	ZNF512B	1192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	11063933	11064260	11064086	Y	NA	TPTE,BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	32720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	11095741	11096142	11095942	Y	BAGE2,BAGE	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	11099662	11099866	11099764	Y	NA	BAGE2	NA	NA	NA	NA	BAGE2	2682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	11109153	11109188	11109171	Y	NA	BAGE2	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	BAGE2	12173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	16288603	16288806	16288642	Y	NA	NA	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	NRIP1	146515	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	17276028	17276063	17276046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	175684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	19171826	19171995	19171943	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	17708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	20089064	20089357	20089211	Y	NA	AL109763.2	NA	NA	NA	NA	AL109763.2	40964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	23121365	23121760	23121563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	1657688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	1241403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	27242944	27243154	27243052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	136960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr21	27335144	27335525	27335335	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	APP	205921	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	28219280	28219541	28219411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	677834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	28943005	28943182	28943085	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	475551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	28945118	28945334	28945247	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	473399	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	28962741	28962988	28962847	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	455745	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	29461833	29462120	29461977	Y	NA	AL035610.1	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	43100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	29476694	29476903	29476871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	57961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	29656574	29656747	29656720	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	237841	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	AL035610.1	242067	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL035610.1	346961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr21	30133752	30133937	30133845	Y	C21orf7,USP16,N6AMT1	NA	LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	121756	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr21	30754427	30754628	30754578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	190035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	32545126	32545440	32545280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIAM1	384850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	34020244	34020455	34020360	Y	SYNJ1,SYNJ1	C21orf59	NA	NA	NA	NA	C21orf59	37068	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	34752926	34753284	34753094	Y	IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2	IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNGR2	19918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	35891449	35891717	35891494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	93724	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	67464	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	36219873	36220239	36220187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	234432	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr21	36227422	36227493	36227482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	241981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	341245	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	36349860	36350141	36349984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	364419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	36379576	36379916	36379746	Y	RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	394135	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	38074425	38074708	38074699	Y	NA	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	4992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	38839400	38839766	38839583	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	103308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr21	40277371	40277733	40277541	Y	NA	NA	ETS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ETS2	102140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	40860443	40860729	40860586	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	44662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	52202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43084419	43084601	43084468	Y	ZNF295	NA	LINC00111	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIPK4	100665	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43174806	43174946	43174886	Y	NA	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	10320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43181534	43181711	43181623	Y	MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr21	43372239	43372638	43372317	Y	C2CD2	C2CD2	NA	NA	NA	NA	C2CD2	240	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	43647963	43648761	43648270	Y	C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	30164	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44499901	44500036	44499938	Y	NA	CBS,U2AF1	NA	NA	NA	NA	CBS	4848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44752617	44753007	44752874	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	2698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44753292	44753457	44753456	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	3744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr21	44760713	44760913	44760830	Y	NA	LINC00322	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00322	10794	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr21	44830426	44830842	44830489	Y	SIK1	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	SIK1	14166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44867284	44867543	44867469	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	LINC00319	2803	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	44876530	44876883	44876692	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	LINC00319	12049	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	44876908	44877060	44877025	Y	NA	SIK1,LINC00319	NA	NA	NA	NA	LINC00319	12427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr21	44908266	44908370	44908324	Y	NA	LINC00319	LINC00319,SIK1	MCF7	ChIA-PET	22265404	LINC00319	43785	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00319	48991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00319	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00319	49985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	45358133	45358224	45358178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	71976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	AP001065.15,C21orf90	NA	NA	NA	NA	C21orf90	8679	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	46737459	46737695	46737585	Y	COL18A1	POFUT2	COL18A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	POFUT2	31646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr21	46823895	46824295	46824014	Y	COL18A1	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	46894520	46894647	46894596	Y	COL18A1	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	67678	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47167832	47168236	47167895	Y	NA	NA	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	106224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47191109	47191365	47191237	Y	NA	NA	LOC100129027,SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	129501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47312098	47312312	47312190	Y	SLC19A1,SLC19A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	87339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47395087	47395227	47395108	Y	COL6A2,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	4424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr22	19433007	19433028	19433018	Y	NA	MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45	NA	NA	NA	NA	HIRA	196	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	19811643	19811941	19811792	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	C22orf29	28478	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.66527106044801
chr22	24080371	24080411	24080401	Y	NA	GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1	NA	NA	NA	NA	ZNF70	10868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	24536526	24536664	24536595	Y	LOC391322,C22orf13	SUSD2	NA	NA	NA	NA	SUSD2	38563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	24796747	24798216	24797446	Y	GGT1	ADORA2A	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	13631	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	27872779	27873029	27872871	Y	NA	NA	PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	254091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	29548778	29549084	29549009	Y	XBP1,KREMEN1	NA	NA	NA	NA	NA	EMID1	50756	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	29600744	29600965	29600829	Y	CHEK2,EWSR1,EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	904	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	29705410	29705600	29705517	Y	GAS2L1	EWSR1,RHBDD3,GAS2L1,RASL10A	NA	NA	NA	NA	GAS2L1	4838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	30279863	30280214	30279898	Y	NA	ASCC2,MTMR3	NA	NA	NA	NA	MTMR3	2719	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSL3	90072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	81517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	30646485	30646883	30646861	Y	SEC14L2,RNF215,LIF	GATSL3	NA	NA	NA	NA	GATSL3	36733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	GATSL3	29305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	33202022	33202333	33202121	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	6335	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	33248825	33249077	33248981	Y	SYN3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	5343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	34167018	34167152	34167086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	912598	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	34265977	34266148	34266046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	1011557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	35983528	35983815	35983759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOL6	58627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	36765300	36765605	36765487	Y	APOL3,NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	16458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	36766615	36766810	36766723	Y	NCF4,MYH9	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	15253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr22	36815362	36815553	36815536	Y	NA	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	33299	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	39091291	39091422	39091336	Y	NA	CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1	NA	NA	NA	NA	JOSD1	4139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	39231993	39232165	39232069	Y	NA	SUN2,DNAL4,NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	NPTXR	5822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	39695935	39696099	39695991	Y	ATF4,APOBEC3A	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	18295	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	39698105	39698354	39698234	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	16040	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	41294862	41295130	41294948	Y	NA	ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	43781	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	42327988	42328313	42328152	Y	NA	CENPM,SEPT3	TNFRSF13C	MCF7	ChIA-PET	22265404	CENPM	12855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	43315293	43315433	43315381	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	63181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	43333511	43333722	43333661	Y	POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	75429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	43409761	43409918	43409853	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	44218722	44218869	44218865	Y	NA	EFCAB6,SULT4A1	NA	NA	NA	NA	EFCAB6	12505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	44705061	44705332	44705192	Y	PARVB,PARVG,PARVG	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1L	186846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	45624322	45624510	45624404	Y	KIAA0930	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	10140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46028588	46028889	46028879	Y	WNT7B	ATXN10	NA	NA	NA	NA	ATXN10	36789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46137558	46137905	46137731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	71880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	46330758	46331082	46331012	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	39927	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46432742	46433091	46432929	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	14494	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46676915	46677122	46676986	Y	TBC1D22A,CERK	TTC38,GTSE1,TRMU	NA	NA	NA	NA	GTSE1	13516	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	46935060	46935431	46935290	Y	CELSR1	CELSR1,GRAMD4	NA	NA	NA	NA	CELSR1	3993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	48035641	48035928	48035744	Y	NA	RP11-191L9.4	TBC1D22A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-191L9.4	10218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr22	48146543	48146838	48146641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	121120	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	48184441	48184585	48184513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	159018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	48185959	48186142	48186052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-191L9.4	160536	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	49157619	49157940	49157765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	1061220	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	449189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	50342658	50342932	50342773	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	9229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	50977955	50978429	50978214	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,ODF3B,CTA-384D8.31,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	CTA-384D8.31	4415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr22	51060079	51060266	51060136	Y	TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,SBF1,NCAPH2,CHKB,ARSA	CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	4341	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	4866672	4866828	4866731	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	60149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	5027453	5027635	5027574	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	8652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	40765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	6741976	6742157	6742067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDEM1	1514645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	8445070	8445302	8445186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	96091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	8781836	8782151	8782020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	221306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	9755464	9755857	9755670	Y	LOC401052,C3orf24	BRPF1,OGG1	NA	NA	NA	NA	BRPF1	15556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	11314967	11316155	11315793	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	2972	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	12567743	12567843	12567793	Y	NA	TSEN2,MKRN2	NA	NA	NA	NA	MKRN2	28670	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr3	13555627	13555924	13555826	Y	NA	HDAC11,FBLN2	NA	NA	NA	NA	FBLN2	15900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr3	14413329	14413583	14413465	Y	C3orf19,SLC6A6	SLC6A6	SLC6A6,LSM3,XPC,GRIP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC6A6	28493	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	14692297	14692322	14692310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	250221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	14848047	14848355	14848186	Y	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	138736	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	15105615	15105982	15105798	Y	NA	MRPS25,ZFYVE20	NA	NA	NA	NA	MRPS25	773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	15338366	15338748	15338633	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	42127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	17441926	17442172	17442040	Y	PLCL2	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	1042137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	977463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	17542863	17543019	17542979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	941290	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	17622451	17622654	17622556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	861655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	610204	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	20200050	20200329	20200065	Y	NA	SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1	25455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	23431263	23431479	23431424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	188752	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	23432118	23432366	23432242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2E2	189607	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NEK10	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	NEK10	39509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	28078428	28078736	28078583	Y	ZCWPW2,EOMES	NA	NA	NA	NA	NA	CMC1	202339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	28367464	28367703	28367584	Y	NA	AZI2,ZCWPW2	NA	NA	NA	NA	AZI2	20915	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	30700179	30700500	30700249	Y	TGFBR2	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	54185	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	31584966	31585359	31585050	Y	NA	STT3B	NA	NA	NA	NA	STT3B	12836	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	33837400	33837658	33837523	Y	CLASP2,PDCD6IP	PDCD6IP	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	186	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	61236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	37494825	37495146	37494985	Y	ITGA9	ITGA9	NA	NA	NA	NA	ITGA9	3219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	40665124	40665471	40665257	Y	ZNF619,ZNF619	EEF1GP3	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1GP3	28139	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	41725291	41725392	41725346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ULK4	276530	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	42062353	42062651	42062504	Y	NA	TRAK1	TRAK1,ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	9059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	42078040	42078206	42078049	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	24746	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	42113196	42113588	42113376	Y	CCK	NA	NA	NA	NA	NA	TRAK1	59902	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	42514954	42515471	42515310	Y	NA	RP11-219I21.1,VIPR1	TRAK1,VIPR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-219I21.1	5822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3,CLEC3B	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	5163	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	45068504	45068742	45068611	Y	NA	CLEC3B	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	27464	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45103596	45103920	45103694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC3B	62556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45138887	45139080	45139004	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	46834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45141662	45142027	45141978	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45142532	45142787	45142664	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	43127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	45906642	45906905	45906858	Y	XCR1,LZTFL1,CCR9	LZTFL1	CCR9,CCR2,LZTFL1,SLC6A20,SACM1L,FYCO1,LARS2	IMR90	Hi-C	24141950	LZTFL1	48629	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	46988775	46989017	46988932	Y	SETD2,KLHL18,KIF9,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	30156	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	46989533	46989702	46989634	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	29471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	46989736	46990203	46989983	Y	SETD2,KLHL18,NBEAL2,CCDC12	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28970	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	46990572	46990937	46990863	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	28236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	47898226	47898293	47898260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX30	55827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	49389809	49389972	49389904	Y	ARIH2,DALRD3,RHOA,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	GPX1	4061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	49696171	49696492	49696217	Y	NA	APEH,RNF123,MST1	APEH,MST1,RNF123	IMR90	Hi-C	24141950	APEH	12943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	50354393	50354598	50354449	Y	MST1R	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	HYAL2	3739	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	50377372	50377700	50377536	Y	NA	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	52334165	52334539	52334405	Y	NA	GLYCTK,WDR82	NA	NA	NA	NA	WDR82	14129	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	52590623	52590962	52590793	Y	NA	NT5DC2	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	23553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	55194265	55194440	55194343	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	327533	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	56665346	56665542	56665444	Y	C3orf63	FAM208A	NA	NA	NA	NA	FAM208A	49723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	56925207	56925322	56925265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF3	186035	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	57562103	57562255	57562188	Y	SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	19692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	57564978	57565360	57565163	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	16587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57566206	57566518	57566262	Y	NA	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	ARF4	15429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57945627	57945950	57945779	Y	PDE12	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	46177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57958534	57958833	57958768	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	33294	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57995654	57995894	57995762	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3527	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	60392594	60392829	60392710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	842304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	61579072	61579152	61579112	Y	PTPRG	PTPRG	NA	NA	NA	NA	PTPRG	33829	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	61667893	61667951	61667922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	58829	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	69281059	69281347	69281182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	148964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	69826244	69826723	69826526	Y	MITF	MITF	NA	NA	NA	NA	MITF	39658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	70085218	70085447	70085333	Y	NA	RP11-460N16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-460N16.1	38490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	71031841	71032211	71032107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	598929	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	71441439	71441788	71441676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	189352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	71509041	71509324	71509198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	121816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	72445751	72445968	72445860	Y	NA	RYBP	NA	NA	NA	NA	RYBP	48101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	77239163	77239286	77239225	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	757994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	80100853	80101105	80100983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	285888	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.42677707771887
chr3	80630991	80631014	80631005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	816026	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	80819406	80819881	80819642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	989431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	17.1338853885944
chr3	80820355	80820528	80820440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GBE1	988784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	97508761	97509065	97508913	Y	NA	ARL6	NA	NA	NA	NA	ARL6	27396	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223831	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	99584293	99584813	99584482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	228974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	99909937	99910189	99910085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	67655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	100482455	100482783	100482461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	56250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	100516379	100516430	100516403	Y	ABI3BP	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	90174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	101609607	101609840	101609738	Y	ZBTB11,NFKBIZ,NFKBIZ	NA	FAM55C	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	64772	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	101899188	101899342	101899284	Y	NA	NA	FAM55C,LOC152225,NFKBIZ	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	354353	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105416337	105416655	105416542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	169741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107148336	107148412	107148401	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	91371	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107148837	107149015	107148915	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	90768	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107318808	107318949	107318879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	79025	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107348544	107348833	107348648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	108761	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	107705661	107706042	107705959	Y	CD47	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101830	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	112274528	112274888	112274746	Y	SLC35A5,ATG3	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	SLC35A5	3668	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	112537180	112537558	112537325	Y	ATG3,SLC35A5	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	170207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	112543206	112543267	112543237	Y	C3orf17	NA	NA	NA	NA	NA	GTPBP8	164498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	113078924	113079182	113079053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BOC	151074	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	114144881	114145214	114145066	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	371421	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	114271834	114271933	114271884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	498374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	114289543	114289832	114289667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	516083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	114500516	114500693	114500605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	363425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	114858726	114858764	114858745	Y	NA	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	5354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	115324002	115324153	115324014	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	459884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	115790074	115790198	115790193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	925956	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	119144576	119144994	119144966	Y	ARHGAP31,COX17,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	40683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	119147570	119147724	119147648	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	37953	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	119157549	119157626	119157588	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	28051	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	119758013	119758347	119758179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	52917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr3	121149194	121149225	121149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP11	61732	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	121520314	121520680	121520641	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	31246	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	121638049	121638246	121638101	Y	CSTA,ILDR1	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	86019	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr3	121783086	121783706	121783373	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	231056	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	122151664	122151964	122151814	Y	NA	WDR5B	NA	NA	NA	NA	WDR5B	18782	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	EIF4BP8,PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	122463361	122463618	122463490	Y	NA	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	47053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	122464996	122465160	122465078	Y	PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,PARP14,HSPBAP1,DIRC2	HSPBAP1,DIRC2	NA	NA	NA	NA	HSPBAP1	45511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	123379811	123380137	123379976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	77422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	124419861	124420177	124419915	Y	KALRN	UMPS	NA	NA	NA	NA	UMPS	27036	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	124698484	124698857	124698671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	73945	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	124708345	124708776	124708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	64026	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	124779995	124780351	124780112	Y	ITGB5,HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	7193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr3	124781797	124782117	124781832	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	8995	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	124964412	124964802	124964608	Y	NA	SLC12A8	SLC12A8	IMR90	Hi-C	24141950	SLC12A8	31219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	125200225	125200611	125200423	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	36430	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	126292509	126292856	126292714	Y	NA	TXNRD3NB	NA	NA	NA	NA	TXNRD3NB	32542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	148482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	126630341	126630598	126630469	Y	ZXDC	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	209278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	126945431	126945830	126945484	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	369236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	126945882	126946306	126946211	Y	MCM2	NA	NUP210P1	IMR90	Hi-C	24141950	MCM2	368760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	127470580	127470980	127470857	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	69071	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	127472997	127473428	127473061	Y	TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	66623	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	128312973	128313336	128313155	Y	NA	NA	EEFSEC,GATA2,LOC90246	IMR90	Hi-C	24141950	RPN1	84582	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	128947996	128948470	128948199	Y	MBD4,KIAA1257,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43,ISY1,CNBP	CNBP	KIAA1257,CCDC48,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1,GP9,C3orf37	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	47231	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	128958880	128959235	128959095	Y	H1FOO	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	58115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	129245456	129245718	129245564	Y	RHO	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	77943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	129519745	129520139	129519943	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	90280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	134068231	134068586	134068519	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	4817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	134309763	134310161	134310078	Y	CEP63,CEP63,CEP63	EPHB1	NA	NA	NA	NA	EPHB1	4482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	136327517	136327655	136327647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG1	141565	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	138109159	138109469	138109274	Y	NA	MRAS,ESYT3	NA	NA	NA	NA	ESYT3	41959	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	141126018	141126305	141126087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	77584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	141204930	141205324	141205031	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	1041	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	141758240	141758617	141758356	Y	NA	RP11-343B5.1	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	2423	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	145546772	145546788	145546780	Y	NA	RPL21P39	NA	NA	NA	NA	RPL21P39	6246	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	148963630	148964002	148963862	Y	NA	NA	GYG1,HPS3,CP,TM4SF18,HLTF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPS3	118259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	149330317	149330600	149330464	Y	WWTR1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	119870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	149333585	149333911	149333859	Y	TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	118590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	149669691	149669713	149669697	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	14459	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	150329194	150329427	150329421	Y	NA	SELT,SERP1	NA	NA	NA	NA	SERP1	10179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	150990274	150990572	150990423	Y	NA	GPR87	NA	NA	NA	NA	GPR87	42168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	152215203	152215520	152215350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	229859	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156453441	156453522	156453482	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	63274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156491591	156491826	156491709	Y	NA	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	34695	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	156530301	156530778	156530576	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	LINC00886	2073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	158435101	158435147	158435125	Y	NA	LXN,MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	12840	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	158447066	158447110	158447086	Y	NA	MFSD1,RARRES1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	158491929	158492257	158492161	Y	NA	MFSD1,RARRES1	RARRES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RARRES1	43444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	475914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	159532172	159532274	159532246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	409149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	400946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	368503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	159597816	159598076	159597925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	343347	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	160949185	160949470	160949344	Y	OTOL1	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT1	128013	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	165215973	165216343	165216172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	336917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	167376206	167376511	167376359	Y	NA	WDR49	NA	NA	NA	NA	WDR49	6435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	167751925	167752226	167752094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	59537	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	169508571	169508792	169508647	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	19952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	169941070	169941418	169941334	Y	MYNN,MYNN,LRRIQ4,PHC3	PHC3,PRKCI	NA	NA	NA	NA	PRKCI	2917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	170795068	170795319	170795194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	170586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	170807604	170807852	170807633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	183122	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171075070	171075360	171075215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	100837	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171522372	171522650	171522540	Y	TNIK,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	4090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171529898	171530084	171530030	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	NA	NA	NA	NA	PLD1	3158	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171826024	171826613	171826515	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	70606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171897555	171897878	171897648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	142137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	171935922	171936083	171936003	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	180504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	172035782	172036031	172035880	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	203266	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	172038895	172038985	172038971	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	200312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	172234609	172234750	172234680	Y	FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10	TNFSF10	NA	NA	NA	NA	TNFSF10	4547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	172416643	172417031	172416658	Y	NA	NCEH1,ECT2	NA	NA	NA	NA	NCEH1	9977	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	173650294	173650720	173650491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	442314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	174987266	174987320	174987290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	337947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	176080356	176080644	176080432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P2	645898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	177383116	177383499	177383118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	469855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	179122098	179122379	179122239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFN1	58618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	182642205	182642465	182642335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	59276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	182962465	182962759	182962526	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	82838	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	182980670	182980835	182980709	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	101043	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	NA	NA	NA	NA	NA	LAMP3	123952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	186926447	186926523	186926484	Y	NA	RPL39L	NA	NA	NA	NA	RPL39L	29751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	187529493	187529917	187529708	Y	RTP4,BCL6	NA	LPP,BCL6,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	67978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	187607399	187607588	187607479	Y	BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	BCL6	145884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	188002342	188002742	188002584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	132497	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188012018	188012343	188012183	Y	LPP,LPP	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142173	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188109409	188109680	188109621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	239564	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188374364	188374933	188374638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	288070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188405130	188405536	188405435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	257467	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	188993718	188993931	188993836	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1	330715	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	189022377	189022942	189022424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	324263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	189240469	189240487	189240479	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	106718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	189284341	189284455	189284398	Y	NA	NA	TPRG1,TP63	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TP63	62750	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr3	189503725	189504099	189503909	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	156520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr3	189524070	189524362	189524216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	176865	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	189544866	189545241	189545054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	197661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	189569925	189569928	189569927	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	TP63	222720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	189654011	189654252	189654134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	182501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	191781460	191781643	191781536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC50	736594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr3	193587539	193587846	193587782	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-135A1.3	219504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	193588375	193588843	193588631	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-135A1.3	218507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	193989061	193989396	193989144	Y	NA	NA	HES1,LOC647323,LOC100131551	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LRRC15	99076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194040514	194040910	194040840	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	47562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194048965	194049014	194048990	Y	NA	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	39458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194153543	194153935	194153911	Y	ATP13A3	NA	NA	NA	NA	NA	ATP13A3	63158	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194296552	194296878	194296640	Y	HES1,ATP13A3	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	5862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194360985	194361172	194361065	Y	NA	AC046143.3,TMEM44,LSG1,FAM43A	NA	NA	NA	NA	TMEM44	8567	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5275	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr3	197478210	197478491	197478305	Y	IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3	FYTTD1,KIAA0226,LRCH3	NA	NA	NA	NA	KIAA0226	3612	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	1037465	1037841	1037534	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	35741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	1170900	1171323	1171147	Y	GAK,DGKQ,KIAA1530	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	29427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	1184509	1184886	1184846	Y	RNF212,CRIPAK	SPON2	NA	NA	NA	NA	SPON2	15864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	1760039	1760352	1760159	Y	FGFR3	SLBP,TMEM129,TACC3,FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	32682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	2063376	2063744	2063670	Y	FGFR3,NAT8L	C4orf48,NAT8L	NA	NA	NA	NA	NAT8L	4137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	72879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	3463022	3463837	3463465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK7	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	3483238	3483365	3483266	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	20205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	3484611	3485071	3484896	Y	NA	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	21578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	3485407	3485559	3485410	Y	DOK7	DOK7,LRPAP1	NA	NA	NA	NA	DOK7	22374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	4272259	4272533	4272507	Y	ZBTB49	TMEM128,LYAR,ZBTB49	NA	NA	NA	NA	LYAR	17363	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	S100P,MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	6919401	6919899	6919549	Y	MAN2B2,KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	10432	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	6928884	6929127	6929009	Y	KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	19915	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	7962509	7962775	7962724	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	22856	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	7999396	7999553	7999475	Y	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	59743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	8074403	8074521	8074462	Y	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	84038	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	13483063	13483398	13483224	Y	NA	RAB28	NA	NA	NA	NA	RAB28	591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01085	188667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	15594702	15595080	15594956	Y	FBXL5	NA	NA	NA	NA	NA	FAM200B	86205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	15757957	15758240	15758119	Y	FBXL5,TAPT1,CD38	RP11-115L11.1,CD38	C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CD38	19658	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	15781600	15782008	15781690	Y	FBXL5,BST1,CD38	CD38	NA	NA	NA	NA	CD38	3702	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	15783833	15784027	15783892	Y	CD38	CD38	NA	NA	NA	NA	CD38	5935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	15820988	15821366	15820993	Y	NA	CD38	NA	NA	NA	NA	CD38	43090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	15922988	15923279	15923080	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	15084	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	16750260	16750546	16750403	Y	LDB2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS21P4	494082	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	17642152	17642177	17642165	Y	CLRN2	MED28	NA	NA	NA	NA	MED28	27898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	17829390	17829398	17829394	Y	CLRN2,NCAPG	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	18865	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	19572039	19572379	19572208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3J1.1	115422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr4	19620943	19621209	19621076	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3J1.1	164326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	23890124	23890507	23890316	Y	PPARGC1A	PPARGC1A	NA	NA	NA	NA	PPARGC1A	13205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	24407095	24407488	24407238	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	176685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	36314989	36315291	36315111	Y	ARAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	70858	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	39894546	39894889	39894718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	82687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	40533771	40533999	40533881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA9	198425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	40803649	40803948	40803799	Y	APBB2,APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	53735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	40997224	40997582	40997567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	219149	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	41000829	41000972	41000906	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	215759	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	41148833	41148910	41148907	Y	LIMCH1,LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	67821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	41936193	41936441	41936268	Y	TMEM33	TMEM33	NA	NA	NA	NA	TMEM33	1056	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr4	48125578	48125743	48125738	Y	TEC	NA	NA	NA	NA	NA	CNGA1	108889	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	48195485	48195896	48195611	Y	SLAIN2	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	73985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	52873079	52873103	52873091	Y	NA	SGCB	NA	NA	NA	NA	SGCB	29545	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	53023897	53024042	53023970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCB	121249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	54172916	54173263	54173102	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	56979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AASDH	119273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	57905676	57905866	57905771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOA1	62687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	57985357	57985541	57985449	Y	IGFBP7	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	10806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	61590476	61590574	61590525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1048994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	66107153	66107671	66107555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-204H9.2	812526	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	7.42468366839089
chr4	67438719	67438955	67438878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-396M11.1	480875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	68487662	68488005	68487834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	76892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	73673744	73673875	73673808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX18	259597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	74680452	74680792	74680616	Y	NA	NA	MTHFD2L,CXCL1	IMR90	Hi-C	24141950	CXCL1	52318	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EREG	180987	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	76611672	76611775	76611733	Y	RCHY1	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	35934	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	77041502	77041599	77041551	Y	NA	NUP54	NA	NA	NA	NA	NUP54	26069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	77522680	77522954	77522817	Y	SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	168427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	79859042	79859275	79859190	Y	PAQR3	PAQR3	NA	NA	NA	NA	PAQR3	450	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	80900549	80900754	80900650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	143854	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	87881950	87882282	87882116	Y	NA	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	C4orf36	26596	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	89922113	89922454	89922284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM13A	108095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	91453996	91454262	91454133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	696530	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	92985275	92985297	92985287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	2141465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	95373822	95374139	95373960	Y	PDLIM5	PDLIM5	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	2785	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	96345355	96345692	96345542	Y	UNC5C	NA	NA	NA	NA	NA	BMPR1B	668236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	99009822	99009923	99009829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	170612	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	102093748	102093766	102093752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	173171	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	102113415	102113532	102113437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	153405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	102131266	102131303	102131283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	135634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	102173679	102174077	102173884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	92860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	102237823	102238346	102238192	Y	NA	AP001816.1,PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	28591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	103360821	103361254	103361183	Y	SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA	SLC39A8	NFKB1,SLC9B1,UBE2D3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A8	10406	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	103679962	103680312	103680150	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	110464231	110464470	110464351	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	14891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	113181018	113181306	113181029	Y	AP1AR,TIFA	AP1AR,ALPK1,TIFA	NA	NA	NA	NA	ALPK1	23359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	113985460	113985726	113985592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	248195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	15766	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	120432594	120432728	120432661	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	58648	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr4	120444503	120444790	120444647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	70557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr4	120476359	120476426	120476393	Y	PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE5A	71720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	120493215	120493297	120493256	Y	C4orf3	NA	NA	NA	NA	NA	PDE5A	54849	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	120511055	120511277	120511169	Y	NA	PDE5A	NA	NA	NA	NA	PDE5A	36869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	124621616	124621886	124621708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	305666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	127966730	127967007	127966867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	575419	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	129965980	129966229	129966106	Y	NA	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	C4orf33	46243	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	134046475	134046584	134046530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-400D2.2	1200044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	135338942	135339299	135339295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-400D2.2	92314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	139903137	139903538	139903344	Y	NA	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	31405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	140727942	140728268	140728103	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	143020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	141021103	141021485	141021348	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	51853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	141217539	141217769	141217667	Y	NA	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41099	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	141581582	141581699	141581656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	93575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	141801657	141801765	141801711	Y	RNF150	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9	126383	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	143012897	143013276	143013057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	457145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	143059861	143060134	143059998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	504109	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	143185718	143186074	143185891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	580511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr4	146015172	146015244	146015208	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	1840	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	146024258	146024314	146024286	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ANAPC10	6565	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	146655718	146656086	146655845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	146674591	146674889	146674740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	137176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	148746659	148746986	148746792	Y	PRMT10,ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	95445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	148754528	148754793	148754631	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	103314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	148990734	148991081	148990908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	339520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	149109723	149110098	149109949	Y	NR3C2	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	253752	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	151314417	151314500	151314459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	620379	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	152033251	152033470	152033361	Y	NA	RPS3A	NA	NA	NA	NA	RPS3A	14526	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	152105959	152106222	152106091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	87234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	152246032	152246165	152246086	Y	FAM160A1	NA	FAM160A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-610P16.1	81822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	152405859	152406228	152406131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	77491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	153384076	153384094	153384085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW7	71159	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	153717992	153718074	153718038	Y	NA	TIGD4,ARFIP1	NA	NA	NA	NA	ARFIP1	18903	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	154244307	154244410	154244359	Y	NA	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	19391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	154248193	154248592	154248328	Y	TRIM2,TRIM2,RNF175	MND1	NA	NA	NA	NA	MND1	15209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	154584497	154584872	154584724	Y	NA	TLR2	NA	NA	NA	NA	TLR2	35780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	157811355	157811573	157811537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFC	78973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	157867687	157867968	157867878	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	157869778	157870097	157870082	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	20449	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	157870715	157871133	157870964	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	19413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	159015926	159016366	159016169	Y	NA	NA	FAM198B	MCF7	ChIA-PET	22265404	ETFDH	574911	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	159722307	159722497	159722450	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	34017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	160552495	160552686	160552591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	864205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	200219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	201617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	164583865	164584289	164584179	Y	MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	319881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	164876357	164876532	164876526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPY1R	612373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	165210734	165210789	165210744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA3P	651653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	166315734	166315907	166315821	Y	NA	CPE	NA	NA	NA	NA	CPE	35388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	166425804	166425997	166425901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	145458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	169791118	169791499	169791286	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	137927	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	169849945	169850177	169850075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	79249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	170023521	170023783	170023621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	94095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	170553392	170553568	170553508	Y	NEK1	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	21608	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	178229393	178229664	178229462	Y	NA	NEIL3	NA	NA	NA	NA	NEIL3	403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	179336968	179337246	179337206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	300953	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	184718887	184719489	184719407	Y	NA	NA	ENPP6,CASP3	IMR90	Hi-C	24141950	STOX2	53095	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	185189191	185189340	185189323	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	204394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	185296048	185296446	185296396	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	97288	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	185298493	185298859	185298858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	94875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	185744961	185745284	185745261	Y	NA	ACSL1,RP11-701P16.5	NA	NA	NA	NA	ACSL1	688	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	186432179	186432538	186432506	Y	NA	RP11-279O9.4,CCDC110,PDLIM3	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	22228	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	187371571	187371697	187371634	Y	NA	F11-AS1	NA	NA	NA	NA	F11-AS1	48454	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	187543398	187543695	187543547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	102181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr4	187766570	187766763	187766651	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAT1	120694	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	187834148	187834163	187834155	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	188272	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	188590659	188590926	188590793	Y	NA	RP11-565A3.2	FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-565A3.2	869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA4P	194302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	190448892	190449070	190448980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AA4P	56773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	333938	334337	334088	Y	NA	AHRR	NA	NA	NA	NA	AHRR	31647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	378611	379250	378849	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	62008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	389983	390379	390026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	50879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	426647	427011	426980	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	14247	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr5	486422	486571	486496	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5,SLC9A3	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	15209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	544264	544432	544333	Y	NA	SLC9A3	NA	NA	NA	NA	SLC9A3	21817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	757060	757343	757251	Y	TPPP	NA	ZDHHC11,SLC9A3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	65550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr5	758121	758535	758359	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,BRD9,CEP72,TRIP13	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TPPP	66611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	64078	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	37.8849243592253
chr5	834911	835305	835108	Y	NA	ZDHHC11	NA	NA	NA	NA	ZDHHC11	13796	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	957591	958302	957640	Y	NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	RP11-43F13.3	37121	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	1007986	1008378	1008075	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	1042	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	9.51882521588576
chr5	1080709	1080898	1080802	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	29252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	1564127	1564592	1564359	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1,SDHAP3	NA	NA	NA	NA	SDHAP3	28143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	1725421	1725568	1725519	Y	NA	NA	MIR4277	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL36	73912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.61715358203659
chr5	3595085	3595457	3595281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRX2	844116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS16	112080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	6373242	6373393	6373318	Y	NA	MED10	NA	NA	NA	NA	MED10	3314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	5.52091862521374
chr5	9263136	9263299	9263224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	280888	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	9547741	9548115	9547963	Y	NA	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	3429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	10626840	10627122	10626983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	64398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	12060867	12061015	12060936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1301483	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	12246135	12246533	12246334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1486751	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	12314219	12314247	12314235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	1554835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	14639692	14640047	14639871	Y	NA	EEF1A1P13,FAM105B	TRIO,FAM105A	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P13	11391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	14739809	14739939	14739877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	56570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	16733521	16733894	16733888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	118354	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	17302170	17302536	17302353	Y	BASP1	RN7SKP133	BASP1,LOC285696	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	41189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	23303766	23303789	23303778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH10	1339298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	32283224	32283342	32283283	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	27773	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	32366924	32367006	32366965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR12	55809	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	34715239	34715402	34715248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	60897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	35220570	35220626	35220598	Y	AGXT2,PRLR	PRLR	NA	NA	NA	NA	PRLR	8168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	35405015	35405048	35405025	Y	NA	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	PRLR	176221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	35924372	35924674	35924571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL7R	73575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	36425659	36425959	36425758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3L	125443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	36657665	36658163	36657813	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	53208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPBL	154757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	37209037	37209204	37209072	Y	C5orf42	C5orf42	NA	NA	NA	NA	C5orf42	38326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	37615302	37615631	37615482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	237988	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3650	109177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	38680372	38680698	38680535	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90	Hi-C	24141950	LIFR	73916	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	38968924	38969094	38969009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	103416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	39077105	39077361	39077230	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	4595	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	43061828	43062062	43061945	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	1216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	44805965	44806268	44806131	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	53293727	53293898	53293842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2081C10.1	180211	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	53496834	53497083	53496859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	107329	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	54715918	54716192	54716055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	108337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	54886412	54886788	54886737	Y	PPAP2A	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2A	57534	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	55643078	55643375	55643183	Y	NA	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	155524	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	56738135	56738571	56738168	Y	ACTBL2	ACTBL2	PLK2,ACTBL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	38065	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	57479551	57479905	57479697	Y	NA	NA	PLK2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLK2	274182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58165920	58166304	58166218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	289872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	356835	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	9.13807220725033
chr5	58314415	58314788	58314579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	438367	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58317891	58318186	58317997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	441843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58400134	58400374	58400226	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	524086	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58423311	58423752	58423511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	547263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	58575824	58576193	58576112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	699776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	940884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	58874550	58874813	58874554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4D	941134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	60626321	60626538	60626370	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	61917589	61917885	61917879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKS1B	111280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	64727937	64728302	64728145	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	128696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	65220429	65221204	65220462	Y	NA	ERBB2IP	NA	NA	NA	NA	ERBB2IP	126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	66145750	66145926	66145797	Y	NA	NA	CD180	IMR90	Hi-C	24141950	MAST4-AS1	151855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	66187482	66187743	66187625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	110038	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	66306628	66307107	66306725	Y	NA	MAST4-AS1	NA	NA	NA	NA	MAST4-AS1	8847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	67437910	67437942	67437925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	71606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr5	71404360	71404518	71404455	Y	MAP1B	MAP1B	NA	NA	NA	NA	MAP1B	3299	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	71896178	71896784	71896469	Y	NA	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNPO1	213355	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	72234221	72234359	72234290	Y	FCHO2	FCHO2	NA	NA	NA	NA	FCHO2	15449	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	73114160	73114455	73114328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	254649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	73330710	73331077	73330894	Y	NA	NA	FAM169A,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRA2	471199	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	74020638	74021005	74020822	Y	NA	NSA2,GFM2	NA	NA	NA	NA	NSA2	39812	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	74883919	74884208	74884013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	77956	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	76102045	76102389	76102284	Y	F2RL1	F2RL1	F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R	IMR90	Hi-C	24141950	F2RL1	10369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	77374282	77374304	77374295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCA	211678	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	78435267	78435371	78435319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMGDH	94490	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	78520885	78521246	78521066	Y	NA	DMGDH,JMY	NA	NA	NA	NA	DMGDH	8615	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	78612719	78612843	78612781	Y	JMY	NA	NA	NA	NA	NA	JMY	82707	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	78990549	78990790	78990669	Y	THBS4,CMYA5	NA	NA	NA	NA	NA	PAPD4	84606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	79376408	79376431	79376418	Y	THBS4	NA	NA	NA	NA	NA	MTX3	91326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	79422868	79423198	79423038	Y	ZFYVE16,FAM151B	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	126700	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	79480253	79480678	79480326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	69220	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	80989989	80990372	80990282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	55244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	82235322	82235569	82235447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC4	135748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	82327653	82327993	82327823	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	43324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	82453115	82453241	82453191	Y	TMEM167A,XRCC4,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	81433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	188596	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	82770174	82770695	82770300	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	4890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83140507	83140806	83140549	Y	NA	RNU4-11P	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	43134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83214867	83215139	83214962	Y	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	117494	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83221150	83221158	83221154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	123777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83266909	83267113	83267063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	169536	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83545538	83546053	83545791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	132192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	83585889	83586179	83586107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	92066	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83668796	83668857	83668813	Y	NA	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	9388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	83674189	83674553	83674373	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	3692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	85654132	85654483	85654435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	257238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	85833622	85833763	85833693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX7C	77958	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	86619927	86620237	86620117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58222	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	86663167	86663443	86663248	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	43393	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	86673186	86673474	86673330	Y	CCNH,CCNH	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	33362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	87553177	87553334	87553293	Y	NA	TMEM161B-AS1,TMEM161B	NA	NA	NA	NA	TMEM161B-AS1	9378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	90680524	90680637	90680608	Y	ARRDC3	ARRDC3	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	3348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	91571858	91572108	91571983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	894682	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	92074962	92075351	92075244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR2F1	841692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	92593669	92593984	92593827	Y	NA	NA	FLJ42709	IMR90	Hi-C	24141950	NR2F1	323059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	93304446	93304744	93304683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	140660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	93434612	93434657	93434635	Y	NA	FAM172A	NA	NA	NA	NA	FAM172A	10747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	95048086	95048445	95048385	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RHOBTB3	860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	95053997	95054284	95054091	Y	ELL2,RHOBTB3	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	RHOBTB3,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB3	6771	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	95507678	95508048	95507916	Y	NA	NA	ELL2,MIR583	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2	211903	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	98197255	98197391	98197342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	65484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	108251515	108251852	108251684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	169992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	108391550	108391948	108391605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	310027	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	109207541	109207704	109207623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	184474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	110252904	110253068	110253014	Y	NA	NA	TSLP	IMR90	Hi-C	24141950	TSLP	150692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	110563061	110563453	110563180	Y	CAMK4	AC010468.1,CAMK4	NA	NA	NA	NA	CAMK4	5710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	110790342	110790723	110790533	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	55565	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	111110231	111110436	111110341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	263943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	111734624	111734920	111734701	Y	APC	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	240401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	111809915	111810119	111810017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	315692	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	112509140	112509432	112509369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	198741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	112628840	112629057	112628905	Y	MCC,MCC	NA	NA	NA	NA	NA	MCC	193470	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	FEM1C	35009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr5	115205022	115205387	115205036	Y	FEM1C	AP3S1,ATG12	NA	NA	NA	NA	ATG12	29467	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115276815	115277206	115277011	Y	LOC644100	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	101260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115374685	115374950	115374799	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	CTD-2287O16.1	11036	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115721196	115721558	115721420	Y	NA	NA	SEMA6A	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-118N6.1	174700	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	116384111	116384324	116384221	Y	SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	RPS17P2	334182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	119016321	119016356	119016339	Y	NA	CTC-507E12.1	NA	NA	NA	NA	CTC-507E12.1	2429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	119573403	119573585	119573488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	224388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	121425326	121425585	121425567	Y	NA	LOX,ZNF474	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841,LOX	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	13346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	121435613	121435728	121435671	Y	NA	LOX,ZNF474	ZNF474,LOC100505841,LOX,SRFBP1	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	23633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	122690309	122690381	122690346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP120	66905	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	123738017	123738276	123738143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	344224	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	123739028	123739231	123739141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	343269	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	123935187	123935581	123935384	Y	NA	NA	ZNF608	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF608	146919	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	123997171	123997561	123997207	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	84939	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	124029260	124029627	124029444	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	52873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	127575847	127576121	127575984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A2	158389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	130970028	130970178	130970095	Y	FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6	RAPGEF6	NA	NA	NA	NA	RAPGEF6	1099	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131561409	131561561	131561506	Y	PDLIM4,P4HA2,P4HA2	PDLIM4	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	29803	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131594769	131595694	131595371	Y	PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	3405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	131595834	131595951	131595900	Y	KIF3A,PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	4470	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	131603786	131604244	131603934	Y	NA	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	12422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56,AC116366.5,AC116366.6	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	AC116366.5	4524	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131802496	131802987	131802660	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.5,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	3748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131810095	131810374	131810235	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.5,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	3360	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	132576270	132576709	132576388	Y	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA4	190616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	132792857	132792990	132792924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSTL4	153265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133435759	133436442	133436277	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	11960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133455254	133455613	133455348	Y	NA	TCF7	NA	NA	NA	NA	TCF7	6852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133463735	133464046	133463858	Y	PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7,SKP1	NA	NA	NA	NA	TCF7	15333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	133540709	133541017	133540863	Y	NA	SKP1,PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	18816	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	133562679	133563046	133562870	Y	NA	PPP2CA	NA	NA	NA	NA	PPP2CA	2846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	38489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.2	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	37651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	AC005355.2	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.2	839	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	22887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	AC005355.2	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	23873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	50351	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	AC005355.2	51369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	135341804	135342193	135341990	Y	FBXL21,TGFBI	TGFBI	TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	20391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	135356057	135356513	135356322	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	6071	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	135373156	135373467	135373188	Y	NA	TGFBI	NA	NA	NA	NA	TGFBI	10572	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	136482104	136482426	136482383	Y	SPOCK1	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	290787	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	137001251	137001596	137001494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	69183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137237773	137238021	137237897	Y	WNT8A	PKD2L2,RP11-381K20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-381K20.2	14748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137370531	137370718	137370637	Y	PKD2L2,KDM3B,FAM53C,FAM53C,FAM13B,NME5	FAM13B	PKD2L2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM13B	14932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137785775	137785891	137785836	Y	WNT8A,NME5,LRRTM2,REEP2	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	REEP2	13069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr5	137815410	137815785	137815600	Y	BRD8,HSPA9	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	16231	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	137822279	137822351	137822306	Y	NA	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	23100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	137833063	137833252	137833158	Y	FAM53C,EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	33884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	296743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	138248139	138248403	138248239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	303483	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	138258617	138258897	138258757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	313961	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	138911278	138911653	138911466	Y	NA	UBE2D2	SPATA24,DNAJC18,ECSCR,TMEM173,UBE2D2	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2D2	7262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	CTB-35F21.2	NA	NA	NA	NA	CTB-35F21.2	46540	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	CTB-35F21.2	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-35F21.2	32974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	CTB-35F21.2	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CTB-35F21.2	32684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139464204	139464218	139464211	Y	NA	NRG2,PURA	CYSTM1,NRG2	IMR90	Hi-C	24141950	PURA	21144	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139631101	139631601	139631302	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	49105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	139638984	139639383	139639269	Y	C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	41323	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	140381838	140382244	140382041	Y	DND1,PCDHAC1,PCDHAC2,PCDHAC2	PCDHAC2	NA	NA	NA	NA	PCDHAC2	38018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	12898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	25768	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	30772	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	PCDHGC4	NA	NA	NA	NA	PCDHGC4	47397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	141394614	141394984	141394650	Y	PCDH12	GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	4008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	142624650	142624850	142624748	Y	ARHGAP26,NR3C1,NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	85320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	144920892	144921143	144921082	Y	NA	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	291789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	145499175	145499563	145499369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	60660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	147463828	147464105	147463998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK5	60582	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	147580878	147580957	147580917	Y	JAKMIP2,FBXO38	NA	NA	NA	NA	NA	SPINK7	109025	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	147777538	147777934	147777556	Y	NA	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	16040	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	148349939	148350092	148350025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3TC2	90634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	148835583	148835880	148835720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	93127	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	148836415	148836621	148836572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	92386	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	149522462	149523132	149522666	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	10303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	149979570	149980059	149979818	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	150108879	150109189	150109172	Y	SYNPO	RBM22,DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	27482	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	150462985	150463261	150463131	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	7877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	150637373	150638284	150637416	Y	NA	GM2A,CCDC69	NA	NA	NA	NA	CCDC69	35667	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	151017311	151017607	151017366	Y	FAT2	SPARC	SLC36A1,FAT2,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	47119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	151801718	151801905	151801770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	651625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	153963327	153963532	153963423	Y	MRPL22,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	NA	HAND1	107503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	156540141	156540423	156540353	Y	NIPAL4,ADAM19,HAVCR2	HAVCR2,MED7	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	27457	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	157097652	157097963	157097872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THG1L	58242	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	158260214	158260321	158260268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	264448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	158478339	158478495	158478452	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	46274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	158489129	158489509	158489418	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	35260	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	159658144	159658427	159658268	Y	SLU7	FABP6,RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	24833	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	159688113	159688294	159688164	Y	CCNJL	RP11-34P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-34P1.2	4853	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	159815159	159815328	159815245	Y	NA	CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1	NA	NA	NA	NA	C5orf54	9776	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	167298999	167299254	167299082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	417402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	169180786	169180969	169180879	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI1	349932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	169232585	169232701	169232645	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI1	298200	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXI1	132448	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	170024399	170024639	170024519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP1	245908	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	170134160	170134177	170134169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	152697	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	170179191	170179549	170179383	Y	GABRP	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	107325	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	170662332	170662346	170662338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1	149774	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	171601698	171602038	171601921	Y	NA	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	11352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	172193800	172194232	172193914	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	1966	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr5	172350033	172350394	172350214	Y	NA	RPL26L1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	33338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	172463160	172463425	172463226	Y	NA	NA	C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V0E1	54400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	172730964	172731211	172731128	Y	NA	STC2	NA	NA	NA	NA	STC2	23295	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	173193377	173193650	173193560	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	119633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	173346462	173346760	173346662	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	33179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	173347710	173348091	173347729	Y	NA	CPEB4	NA	NA	NA	NA	CPEB4	34427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	173957114	173957459	173957290	Y	NA	NA	MSX2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MSX2	192077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	176337374	176337559	176337468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5A	101896	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	178259703	178260206	178260005	Y	ZNF879	ZNF354B,RNU1-39P	ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF354B	24748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	179399876	179400065	179399971	Y	RNF130,RASGEF1C	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D9B	67017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	179718006	179718384	179718320	Y	NA	MAPK9	NA	NA	NA	NA	MAPK9	907	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	180085881	180086092	180086053	Y	NA	NA	BTNL8	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT1	154560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	180253184	180253441	180253311	Y	NA	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	LINC00847	2516	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	180616521	180617006	180616799	Y	ZFP62,TRIM52,TRIM41	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	180633694	180634117	180633980	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	3401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	320653	321052	320689	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	31023	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	472688	472701	472695	Y	HUS1B,EXOC2	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP22	183058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	1869270	1869328	1869296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXC1	260589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	1966788	1967127	1966958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	276799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	2952080	2952258	2952142	Y	SERPINB1,RIPK1,SERPINB9,NQO2	SERPINB6,NQO2	NA	NA	NA	NA	SERPINB6	17832	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	3069574	3070273	3069674	Y	NA	HTATSF1P2,RIPK1,BPHL	LOC100507194,WRNIP1	K562	ChIA-PET	22265404	RIPK1	7349	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	3160462	3160701	3160583	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	4702	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	3166310	3166878	3166542	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	10550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	4728304	4728573	4728482	Y	NA	CDYL	NA	NA	NA	NA	CDYL	23911	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRN1	343868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	5997075	5997523	5997169	Y	NRN1	NRN1	NA	NA	NA	NA	NRN1	7677	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr6	6702168	6702420	6702249	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	403410	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	6707572	6707761	6707694	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	398069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	7618671	7618993	7618833	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	30239	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	9710906	9711148	9711028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	706744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	MAK	NA	NA	NA	NA	MAK	11369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11144047	11144288	11144135	Y	TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	236293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11229489	11229708	11229675	Y	TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	150873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	11236748	11236970	11236788	Y	TMEM170B,MAK,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	143611	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11321238	11321480	11321378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	59101	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	11414898	11415336	11414989	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NEDD9,C6orf228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	34317	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11428073	11428442	11428380	Y	NA	NEDD9	NEDD9,C6orf228,SYCP2L,ELOVL2,ERVFRD-1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEDD9	47492	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	11523168	11523305	11523200	Y	TMEM170B,HIVEP1	TMEM170B	NEDD9,SYCP2L,C6orf228,ELOVL2,LOC100506409,GCM2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	12633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11730766	11731308	11730965	Y	TMEM170B,HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	194828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	11921182	11921467	11921322	Y	NA	NA	ADTRP,HIVEP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIVEP1	85528	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	12288026	12288260	12288136	Y	NA	EDN1	NA	NA	NA	NA	EDN1	336	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	12288471	12288892	12288524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	12324386	12324755	12324542	Y	NA	EDN1	EDN1	MCF7	ChIA-PET	22265404	EDN1	35790	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	441158	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	13597663	13598060	13597862	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	15499	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	14211875	14212265	14212161	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	96003	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	14271187	14271701	14271310	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	155315	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	14725890	14726226	14726089	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	518301	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	14759070	14759272	14759192	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	485255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	15022090	15022421	15022413	Y	JARID2	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	222106	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	15313668	15313748	15313709	Y	DTNBP1,JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	69141	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	15365610	15365867	15365688	Y	JARID2,DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	121083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	16413735	16414124	16414005	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	176924	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	16422379	16422759	16422608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	185568	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	16474193	16474630	16474472	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	237382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	16607418	16607798	16607611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	151571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	16673403	16673483	16673443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	85886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	16766520	16766751	16766672	Y	NA	RP1-151F17.1,ATXN1	ATXN1	K562	ChIA-PET	22265404	ATXN1	6798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	17430018	17430227	17430123	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	38571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	17910535	17910706	17910642	Y	RNF144B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	75148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	18778775	18778874	18778845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144B	411996	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	19819390	19819399	19819395	Y	NA	RP4-625H18.2,ID4	ID4	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID4	16218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr6	21028713	21029000	21028890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	496025	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	21264288	21264471	21264361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	327501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr6	21589338	21589711	21589681	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	24743891	24744276	24743998	Y	TDP2,C6orf62	C6orf62,GMNN	GMNN,CMAHP,C6orf62	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C6orf62	24827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	25405177	25405324	25405251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	127871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	25406864	25407254	25406949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	129558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	25630252	25630438	25630350	Y	SCGN	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM38	330592	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr6	26006011	26006046	26006038	Y	HIST1H4G,HIST1H2AA,HIST1H2BA,HIST1H1T	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	9994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	26016753	26016987	26016816	Y	HIST1H1A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	713	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	26034352	26034599	26034546	Y	NA	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AB	2556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr6	26266741	26266990	26266911	Y	NA	HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H3G	2622	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	26283996	26284379	26284279	Y	NA	HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	NA	NA	NA	NA	HIST1H4H	234	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27156271	27156423	27156401	Y	NA	HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	20600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27416333	27416557	27416445	Y	NA	ZNF184	NA	NA	NA	NA	ZNF184	22340	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27686942	27687278	27687069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	86431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2BPS2,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	28080593	28080792	28080693	Y	NA	ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9546	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	28715387	28715696	28715451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXbac-BPG308K3.5	89087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11,RNF39	NA	NA	NA	NA	RNF39	26974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	30276337	30276699	30276532	Y	ATAT1,ATAT1	TRIM39,HCG18,RPP21	NA	NA	NA	NA	TRIM39	15557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	30923441	30923743	30923649	Y	GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1	GTF2H4,VARS2	NA	NA	NA	NA	VARS2	49422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	31334700	31334921	31334854	Y	NFKBIL1,C6orf27,ATP6V1G2	HLA-B,HCP5,MICA	HCG27	MCF7	ChIA-PET	22265404	HLA-B	11735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	32051111	32051460	32051307	Y	NA	TNXB,ATF6B,FKBPL	NA	NA	NA	NA	TNXB	29651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	TNXB	4932	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	32114130	32114430	32114186	Y	GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL	TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,XXbac-BPG300A18.13,PBX2	NA	NA	NA	NA	PPT2	4788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.28451805181258
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	HLA-DRA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRA	22124	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	33396313	33396709	33396628	Y	SYNGAP1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	10466	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	35185451	35185811	35185631	Y	NA	SCUBE3,ZNF76	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	5261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	35632268	35633036	35633003	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP5	61324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	35875551	35875739	35875654	Y	SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1	SRPK1	NA	NA	NA	NA	SRPK1	11380	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	36005886	36006030	36005958	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	12398	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	36010041	36010276	36010159	Y	NA	MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	16553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	ETV7,KCTD20	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	36656050	36656213	36656132	Y	ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	13745	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	38229881	38230014	38229948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	375910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	39171657	39171958	39171719	Y	NA	KCNK5	NA	NA	NA	NA	KCNK5	23268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73866	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	42086253	42086632	42086383	Y	NA	C6orf132	NA	NA	NA	NA	C6orf132	21725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	42255073	42255501	42255249	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	71470	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	42258421	42258504	42258463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	74818	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	42306418	42306926	42306742	Y	UBR2,TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	110863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	42413186	42413554	42413522	Y	NA	TRERF1	GUCA1B,MRPS10	IMR90	Hi-C	24141950	TRERF1	4235	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	142576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	44823725	44823846	44823786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC5L	470463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	44949602	44949944	44949774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	393746	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	45302184	45302302	45302245	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	41388	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	45322073	45322342	45322124	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	21348	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	45391331	45391628	45391429	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47641	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	45503698	45503963	45503769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	160008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	45645081	45645602	45645424	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	301391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	46628141	46628475	46628252	Y	NA	CYP39A1,SLC25A27	NA	NA	NA	NA	SLC25A27	9463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	47105709	47106057	47105986	Y	PLA2G7,PLA2G7	NA	TNFRSF21	IMR90	Hi-C	24141950	GPR110	97610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	47214948	47215452	47215060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	60189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	47275760	47275938	47275849	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	119	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	47550559	47550935	47550672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	100665	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	47618805	47618920	47618863	Y	OPN5	GPR115	NA	NA	NA	NA	GPR115	32680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	47831581	47831627	47831604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR115	179981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	49138743	49138828	49138786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	290076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	51275260	51275721	51275608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P5	396291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	56297273	56297383	56297328	Y	NA	COL21A1	NA	NA	NA	NA	COL21A1	40381	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	57313567	57313842	57313733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	135964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	57327654	57327860	57327770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	150051	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr6	65390704	65390953	65390803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	1046979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	66497701	66498057	66497748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	2153976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	71958276	71958301	71958290	Y	NA	OGFRL1	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	38205	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	72034617	72034728	72034673	Y	NA	OGFRL1	NA	NA	NA	NA	OGFRL1	38111	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	72055906	72056381	72056246	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	59400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr6	73975471	73975797	73975634	Y	NA	KHDC1L,RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	4533	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	74289769	74290568	74290415	Y	MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	58249	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	74295249	74295764	74295450	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	63729	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	74295823	74296227	74295840	Y	MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1	64303	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	74307690	74308056	74307857	Y	KHDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC17A5	53822	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	75917428	75917795	75917727	Y	NA	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	3661	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	76367901	76367953	76367944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP6	58676	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	77981127	77981489	77981308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO6	1524218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	79718228	79718616	79718429	Y	PHIP	NA	NA	NA	NA	NA	PHIP	67337	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	81048044	81048318	81048128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	233680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	82956000	82956181	82956090	Y	NA	IBTK	NA	NA	NA	NA	IBTK	529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	84101816	84101824	84101820	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	36973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	84131430	84131508	84131469	Y	NA	ME1	NA	NA	NA	NA	ME1	7289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	85087981	85088261	85088229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	152628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	85258714	85258725	85258720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	323361	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	85334002	85334301	85334152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	398649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	89759996	89760376	89760109	Y	PNRC1	PNRC1	NA	NA	NA	NA	PNRC1	28094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	89796215	89796534	89796231	Y	NA	PNRC1,SRSF12	NA	NA	NA	NA	PNRC1	7745	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	91168030	91168508	91168309	Y	NA	NA	BACH2,MDN1,CASP8AP2,GJA10	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K7	126256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	92185644	92186055	92185825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K7	890880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	97632369	97632997	97632691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMS22L	96096	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	100584000	100584312	100584155	Y	NA	NA	SIM1,ASCC3	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-121G13.3	391840	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	102471700	102472091	102472046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	1144452	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	106414401	106414697	106414568	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	117498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	91524	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PRDM1	89017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	106582399	106582514	106582457	Y	AIM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	50204	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	108954654	108955002	108954825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	75616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	109059217	109059645	109059338	Y	FOXO3	NA	FOXO3,LINC00222	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARMC2	107974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	109755732	109756057	109756030	Y	CD164	SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24	NA	NA	NA	NA	SMPD2	3909	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	111720734	111721265	111721077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV3L	81653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	111758931	111759246	111759206	Y	NA	REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	43672	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	111873587	111873978	111873729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	51503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	111889822	111890007	111889856	Y	REV3L	TRAF3IP2	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2	35474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	113388033	113388045	113388040	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-124C6.1	364578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	113680929	113681231	113681080	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-124C6.1	71392	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	113966975	113967088	113966980	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-367G18.1	2188	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	113975639	113976185	113975774	Y	MARCKS	RP11-367G18.1	MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-367G18.1	6363	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	116767554	116767785	116767590	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	NA	NA	NA	NA	NA	FAM26E	63024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	117914764	117915043	117914904	Y	NA	GOPC	NA	NA	NA	NA	GOPC	6648	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	118191790	118192030	118191974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-632C17__A.1	126108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	119151345	119151482	119151449	Y	MCM9	NA	NA	NA	NA	NA	ASF1A	61902	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	119214275	119214495	119214295	Y	C6orf204,C6orf204,FAM184A,MCM9,ASF1A	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	122664813	122664822	122664818	Y	FABP7	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2	53869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	125952984	125953298	125953141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY2	113512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	126112858	126113033	126112985	Y	TRMT11,HINT3,NCOA7	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	NCOA7	12551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	126197747	126198095	126197755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HINT3	77832	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	126271537	126271736	126271680	Y	NA	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	4191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226557	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	128496365	128496708	128496537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	343162	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	128675135	128675339	128675237	Y	PTPRK,PTPRK	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	164531	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	132811280	132811490	132811390	Y	VNN2,VNN2,VNN2,VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	20847	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	136807435	136807796	136807768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	62161	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	136908722	136909081	136908931	Y	NA	MAP7	NA	NA	NA	NA	MAP7	38765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	137082760	137083090	137082822	Y	MAP3K5	MAP3K5	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	28566	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	137227679	137227915	137227797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	85962	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	139304978	139305148	139305081	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	2250	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	140069895	140070090	140070024	Y	NA	NA	CITED2,LOC645434	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	376138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	140926275	140926589	140926526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1232518	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143143599	143143667	143143633	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	120671	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143163714	143164598	143164218	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	99740	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143178456	143178847	143178800	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	85491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143234166	143234456	143234293	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	29882	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	143503002	143503176	143503018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	123369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	143994840	143994998	143994919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	138858	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	144668159	144668272	144668217	Y	PLAGL1,STX11	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	148057	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	145147432	145147802	145147573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	627330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	150076607	150076998	150076645	Y	KATNA1,LATS1	LATS1,PCMT1,NUP43	NA	NA	NA	NA	NUP43	7806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	150183311	150183513	150183478	Y	NA	LRP11,RAET1E	NA	NA	NA	NA	LRP11	686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	150286198	150286452	150286311	Y	ULBP1	RAET1G,ULBP2,ULBP1,RAET1K	NA	NA	NA	NA	ULBP1	3055	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	151815811	151815987	151815867	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	44389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	154486740	154486949	154486839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	342844	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	154753926	154754309	154754118	Y	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	75484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	155193821	155194059	155193913	Y	NA	TIAM2	TIAM2,TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	TIAM2	41990	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	155438419	155438575	155438497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFB1M	195052	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	155526313	155526389	155526351	Y	NA	NA	TFB1M,CLDN20	IMR90	Hi-C	24141950	TFB1M	107238	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157411919	157412211	157412008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	314856	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157421397	157421571	157421514	Y	ARID1B	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	321062	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157639062	157639495	157639253	Y	C6orf35	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	103138	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	158185393	158186221	158185862	Y	SNX9	NA	SNX9,TMEM242,SYNJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNX9	56075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	158987674	158988091	158987879	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	32206	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	159195572	159195684	159195582	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	42760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	159273925	159274893	159274526	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	14078	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	159383408	159383511	159383422	Y	NA	RSPH3	NA	NA	NA	NA	RSPH3	35708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	159495451	159495612	159495554	Y	SYTL3,TAGAP	NA	TAGAP	IMR90	Hi-C	24141950	RSPH3	76232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	160532967	160533203	160533063	Y	NA	NA	SLC22A1	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2R	144836	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	161450213	161450498	161450260	Y	NA	MAP3K4	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	39454	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	161545851	161546111	161545978	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	135092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	161607618	161607817	161607715	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	85276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	48834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	163881453	163881850	163881463	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	48421	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	166078176	166078539	166078376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE10A	319552	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	168216462	168216639	168216532	Y	NA	MLLT4	NA	NA	NA	NA	MLLT4	8963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr6	168356861	168357132	168356996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT4	131259	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	169556642	169556776	169556709	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	4243	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	169569548	169569688	169569622	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	8529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	169827902	169828288	169828095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-417E7.1	266883	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	170089976	170090376	170090176	Y	NA	WDR27,C6orf120,PHF10	NA	NA	NA	NA	WDR27	9783	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr6	170364764	170365251	170365177	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	215109	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135677	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	170463024	170463652	170463502	Y	PHF10,TCTE3,C6orf70,FAM120B	NA	LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	133909	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	170468202	170468424	170468316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	AC093627.10	57935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	90161	90450	90245	Y	FAM20C	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	AC093627.10	57147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	AC093627.10,FAM20C,AC093627.12	NA	NA	NA	NA	AC093627.12	309	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	209915	210076	210006	Y	NA	FAM20C,AC093627.12	NA	NA	NA	NA	AC093627.12	17735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	373094	373351	373247	Y	PRKAR1B	NA	FLJ44511,PDGFA	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC093627.12	180914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	475920	475996	475984	Y	NA	NA	HEATR2,PRKAR1B	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDGFA	81937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	556288	556672	556400	Y	LOC100288524,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	1261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	652642	652893	652768	Y	PRKAR1B,ADAP1	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	94709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	655576	655910	655797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	97643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	658155	658418	658267	Y	COX19	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	100222	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	965289	965600	965408	Y	ZFAND2A,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	27443	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1013884	1014155	1013955	Y	NA	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	COX19	649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1456103	1456158	1456132	Y	NA	MICALL2	NA	NA	NA	NA	MICALL2	40980	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	1501148	1501314	1501260	Y	NA	MICALL2,INTS1	NA	NA	NA	NA	MICALL2	4010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1560213	1560697	1560426	Y	C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	7653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	1945683	1945719	1945693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	165756	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2058997	2060327	2059312	Y	SNX8,MAFK	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	210551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2063741	2064015	2063879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	206863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2185604	2185706	2185655	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	85172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2548054	2548433	2548213	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	2575019	2575461	2575251	Y	NA	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	BRAT1	17900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3,AMZ1	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	2838950	2839257	2839071	Y	SNX8,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	33998	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	3603136	3603457	3603297	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	264056	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	4660172	4660397	4660258	Y	NA	FOXK1	SDK1,FOXK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	20991	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	4755132	4755354	4755253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	73744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	4765280	4765661	4765569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83892	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5002733	5003319	5002998	Y	NA	RNF216P1	NA	NA	NA	NA	RNF216P1	8300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5231323	5231672	5231498	Y	WIPI2	WIPI2	NA	NA	NA	NA	WIPI2	3504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5469639	5470034	5469987	Y	NA	TNRC18	TNRC18,FBXL18,ACTB	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TNRC18	6594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5488496	5488516	5488506	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	25451	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5609221	5609424	5609333	Y	FBXL18	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	7806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	5733172	5733453	5733321	Y	CCZ1,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85917	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	6145406	6145878	6145682	Y	USP42	EIF2AK1,USP42	NA	NA	NA	NA	USP42	2891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	7984284	7984579	7984481	Y	GLCCI1	GLCCI1	RPA3,LOC729852	IMR90	Hi-C	24141950	GLCCI1	21846	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	12759260	12759464	12759402	Y	NA	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	13085757	13085829	13085793	Y	NA	NA	ARL4A	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4A	361276	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	13512547	13512927	13512737	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	516123	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	13553275	13553295	13553283	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	475755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr7	13592138	13592417	13592278	Y	NA	NA	DGKB	IMR90	Hi-C	24141950	ETV1	436633	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	13694099	13694114	13694107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	334936	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	13700759	13700990	13700876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	328060	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	13797003	13797366	13797185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	231684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	13818689	13818849	13818801	Y	ETV1	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	210201	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AGR3	109980	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	17412000	17412058	17412028	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	75019	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	AC017060.1	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC017060.1	31959	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	20070639	20070953	20070726	Y	NA	RPL21P75	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	30293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	20386006	20386499	20386153	Y	ITGB8	ITGB8	NA	NA	NA	NA	ITGB8	17681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	23168039	23168122	23168081	Y	NA	KLHL7-AS1,KLHL7	NA	NA	NA	NA	KLHL7	24686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	GPNMB	74454	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	23501559	23501943	23501874	Y	NUPL2,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	6143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	24739704	24740021	24739930	Y	DFNA5,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	67223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	24828501	24828972	24828786	Y	C7orf31,DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	21257	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	24947142	24947425	24947387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	71828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	25896245	25896461	25896419	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	293399	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	26220261	26220628	26220627	Y	CBX3	NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	CBX3	18154	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	27573880	27573985	27573933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4HP1	77412	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1	141190	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	29382815	29383281	29382928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPVL	149748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	29951912	29952143	29952027	Y	ZNRF2,C7orf41	NA	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	74073	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	AC007285.6,SCRN1	NA	NA	NA	NA	AC007285.6	20523	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30208837	30209260	30209012	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	112663	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30222465	30222780	30222592	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	99143	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30257510	30257901	30257519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	64022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30636092	30636194	30636111	Y	NA	GGCT,GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	3795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30933146	30933539	30933344	Y	ADCYAP1R1	AQP1	AQP1	IMR90	Hi-C	24141950	AQP1	42136	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	30954838	30955088	30954912	Y	AQP1	NA	NA	NA	NA	NA	AQP1	63828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	33079333	33079582	33079400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP9	67431	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	34529792	34529930	34529861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	761828	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	36305265	36305717	36305464	Y	AOAH,SEPT7,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	EEPD1	114507	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	36331807	36331936	36331811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	95479	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	36938916	36939307	36939244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	511182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	37156989	37157298	37157171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	329554	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	40129508	40130170	40129872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	141872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	43652779	43653072	43652905	Y	POLM,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	32422	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	43732901	43733056	43732913	Y	DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	63223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	43740255	43740653	43740556	Y	GCK	NA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	55626	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	43912365	43912715	43912516	Y	NA	MRPS24	NA	NA	NA	NA	MRPS24	4873	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	43996825	43996925	43996859	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	UBE2D4	32788	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	45019224	45019585	45019470	Y	OGDH,ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G	MYO1G,SNHG15,CCM2	NA	NA	NA	NA	MYO1G	2527	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr7	45963987	45964294	45964096	Y	NA	IGFBP1,IGFBP3	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	4514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	46597190	46597387	46597291	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	409913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	46803788	46804144	46803966	Y	NA	NA	IGFBP1,IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	AC004870.4	203156	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	46839094	46839193	46839144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	168107	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr7	46842508	46842579	46842545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	164721	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chr7	46920965	46921354	46921105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	85946	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	45.6903610362516
chr7	47293209	47293414	47293276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004870.4	285909	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47391456	47391672	47391564	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	228484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	47542893	47543371	47543076	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	76785	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47675013	47675155	47675094	Y	TNS3	NA	TNS3,C7orf69,PKD1L1,C7orf65,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	54857	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	49177785	49177982	49177884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPP1	1051560	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	50615386	50615579	50615483	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	99298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	50695565	50695835	50695829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRB10	163324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	51370562	51370701	51370648	Y	COBL	COBL	NA	NA	NA	NA	COBL	11814	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	53791556	53791934	53791745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-14P	359805	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	55253994	55254266	55254079	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	169280	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	55436942	55437154	55437048	Y	NA	LANCL2	NA	NA	NA	NA	LANCL2	5801	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr7	55599813	55600074	55599902	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	38607	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	57471842	57471971	57471867	Y	NA	ZNF716	NA	NA	NA	NA	ZNF716	35912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr7	57639323	57639702	57639567	Y	ZNF479,ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	131440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr7	57706434	57706786	57706770	Y	ZNF716	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF716	198551	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	65746929	65747210	65746989	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	TPST1	78743	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	65762762	65763060	65762890	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	NA	NA	NA	NA	TPST1	94576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	69213443	69213490	69213467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	151538	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	73015142	73015298	73015257	Y	NA	BCL7B,TBL2,MLXIPL	NA	NA	NA	NA	MLXIPL	21575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	73133049	73133354	73133303	Y	NA	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	STX1A	1047	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	73983073	73983199	73983128	Y	NA	NA	GTF2I	IMR90	Hi-C	24141950	GTF2I	86795	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	73987997	73988205	73988054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	81789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	74050043	74050194	74050049	Y	GTF2IRD2B	GTF2I	GTF2IRD1,GTF2I	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTF2I	19800	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	75546128	75546229	75546156	Y	NA	POR	STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	POR	19610	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	75573320	75573489	75573400	Y	POR	POR,TMEM120A	NA	NA	NA	NA	POR	46802	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3,SRCRB4D	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	78947044	78947146	78947095	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2	133744	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	79050066	79050245	79050154	Y	MAGI2	MAGI2	NA	NA	NA	NA	MAGI2	30645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	80399893	80400101	80400015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	149574	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	81108173	81108384	81108283	Y	NA	NA	SEMA3C,CACNA2D1	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA3C	558498	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	81927516	81927685	81927601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	143429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	83662977	83663317	83663147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	456723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	83688045	83688341	83688303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	431699	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	84119513	84119698	84119606	Y	NA	SEMA3A	NA	NA	NA	NA	SEMA3A	342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	86948267	86948659	86948457	Y	CROT	TP53TG1,CROT	NA	NA	NA	NA	TP53TG1	24172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	87453552	87453801	87453676	Y	NA	DBF4,SLC25A40	NA	NA	NA	NA	DBF4	49730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	87555987	87556252	87556130	Y	NA	ADAM22	NA	NA	NA	NA	ADAM22	5206	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	88207618	88207818	88207718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP4	273412	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	90861359	90861732	90861539	Y	NA	FZD1	NA	NA	NA	NA	FZD1	30051	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	91456025	91456190	91456079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTERF	51844	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92125304	92125376	92125308	Y	NA	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	PEX1	30469	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92227351	92227620	92227450	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562	ChIA-PET	22265404	FAM133B	9643	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92262528	92262734	92262631	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44820	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92263416	92263696	92263624	Y	SAMD9,CDK6	FAM133B	FAM133B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	45708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92282305	92282698	92282463	Y	LRRD1,KRIT1,KRIT1,KRIT1,SAMD9L,SAMD9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	64597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	GNG11	317504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	94286949	94287416	94287082	Y	PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10	SGCE,PEG10,RPS3AP25	NA	NA	NA	NA	PEG10	3312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	95238124	95238400	95238252	Y	PON1,PON3	PDK4	NA	NA	NA	NA	PDK4	14321	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	95877265	95877280	95877275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	72179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	97994295	97994325	97994312	Y	BAIAP2L1	RPS3AP26,BAIAP2L1	BRI3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS3AP26	19571	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	98724585	98724789	98724635	Y	ZNF394,SMURF1	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	14934	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	99000499	99000617	99000560	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	3647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	99785086	99785350	99785241	Y	ZKSCAN1,MCM7,GATS	C7orf43,GAL3ST4,GPC2,STAG3	NA	NA	NA	NA	STAG3	11900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	99961767	99962035	99961969	Y	NA	PILRB,PMS2P1	PILRA	IMR90	Hi-C	24141950	PMS2P1	24236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	101045498	101045795	101045583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABL5	82394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	101567515	101567769	101567671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	110556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	101690848	101690892	101690861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	233889	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.4748945561303
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	102522047	102522376	102522212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE4	89593	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	102958965	102959200	102958983	Y	NA	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	23096	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	RP11-325F22.2,LINC01004	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	28600	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	104771248	104771300	104771252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	119757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	105449570	105449934	105449707	Y	ATXN7L1,ATXN7L1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	65116	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	106358724	106358979	106358846	Y	NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	54478	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	106838325	106838672	106838499	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	30919	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	107142222	107142266	107142244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	59663	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	107606262	107606577	107606420	Y	NRCAM	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	35123	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	107935130	107935280	107935250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	159881	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	3772	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	145495	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	111024464	111024780	111024739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	175793	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	111396932	111397360	111397129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	196359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	113233852	113234207	113234027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00998	477184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr7	115326798	115327008	115326857	Y	NA	NA	FOXP2	IMR90	Hi-C	24141950	TES	521539	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CAV2	31798	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	116058055	116058274	116058222	Y	NA	NA	CAV2,TES,MET,CAV1	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	AC002066.1	79245	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	116651956	116652355	116652105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	59568	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	119269873	119270211	119270042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	275218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	119342265	119342557	119342442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	202872	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	119435371	119435694	119435534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-328J2.1	109735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	121951914	121952318	121952125	Y	NA	FEZF1-AS1	NA	NA	NA	NA	FEZF1-AS1	10202	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	123903491	123903761	123903674	Y	NA	NA	GPR37,LOC154872	IMR90	Hi-C	24141950	GPR37	499920	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	125443892	125444229	125444219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-420H19.3	504960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	127663304	127663714	127663503	Y	IMPDH1,GCC1,LRRC4	NA	NA	NA	NA	NA	RBM28	318248	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	RBM28	174034	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.04602406908344
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	129419118	129419176	129419138	Y	NA	NA	UBE2H,NRF1	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	169563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr7	129589680	129589810	129589737	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	979	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130606000	130606565	130606293	Y	NA	MIR29A	LOC646329	MCF7	ChIA-PET	22265404	MIR29A	9931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	37404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130665753	130666114	130665990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	69684	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130695403	130695870	130695708	Y	MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	96985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130741821	130742227	130742136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	50628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130910382	130910723	130910553	Y	MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	14626	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	130920397	130920794	130920689	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	4555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	131152589	131152603	131152595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PODXL	88373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	132607236	132607300	132607268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	157548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	133092941	133093104	133093022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	157112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	133148039	133148314	133148177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	212210	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	134677531	134677740	134677636	Y	AGBL3	AGBL3	NA	NA	NA	NA	AGBL3	8272	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	134835200	134835725	134835320	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49	NA	NA	NA	NA	TMEM140	4376	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	TMEM140,C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	134939025	134939170	134939094	Y	TMEM140,CNOT4,WDR91	WDR91	NA	NA	NA	NA	WDR91	44709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	138796651	138797059	138797024	Y	UBN2,ZC3HAV1	ZC3HAV1,TTC26	NA	NA	NA	NA	ZC3HAV1	4186	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	138917056	138917428	138917261	Y	ZC3HAV1,UBN2	UBN2	NA	NA	NA	NA	UBN2	3954	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	9.13807220725033
chr7	139616229	139616509	139616457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	140652	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	139930863	139931473	139931211	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	LOC100134229,JHDM1D	MCF7	ChIA-PET	22265404	PARP12	169342	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	140613036	140613224	140613135	Y	NA	BRAF	NA	NA	NA	NA	BRAF	9340	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	140774728	140775101	140774915	Y	NA	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	24679	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	142554207	142554559	142554324	Y	EPHB6	EPHB6	NA	NA	NA	NA	EPHB6	3415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	144473103	144473255	144473180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPK1	58233	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	148027495	148027904	148027865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	247589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	148824928	148825234	148824952	Y	NA	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF398	3420	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	149413428	149413754	149413591	Y	NA	KRBA1	NA	NA	NA	NA	KRBA1	3556	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	151157060	151157432	151157203	Y	NA	NA	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	57774	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	151184518	151184840	151184768	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	30366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	151193551	151193826	151193799	Y	NA	RHEB	NA	NA	NA	NA	RHEB	21380	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	151386683	151387049	151386915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	171477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	151493401	151493985	151493754	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	78142	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	151823102	151823484	151823293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	102343	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	151986893	151987163	151987026	Y	MLL3	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT11	266134	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	247975	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	210057	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	152219127	152219295	152219254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	151955	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr7	153105018	153105427	153105361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	650184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	153585684	153585818	153585716	Y	DPP6,DPP6,DPP6	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3B	1130850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	154730644	154730988	154730877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	61806	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	RBM33	158338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	155580383	155580450	155580415	Y	NA	SHH	NA	NA	NA	NA	SHH	22517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	155627034	155627046	155627041	Y	NA	SHH	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	SHH	24067	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	155744220	155744341	155744281	Y	NA	NA	LOC285889,SHH,LMBR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SHH	141253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	155754558	155754796	155754722	Y	NA	NA	LOC285889	IMR90	Hi-C	24141950	SHH	151591	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	156409241	156409518	156409427	Y	NA	RNF32,C7orf13	NA	NA	NA	NA	RNF32	21457	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157034052	157034373	157034213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	50990	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157069496	157069783	157069568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	56292	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157082177	157082296	157082243	Y	NA	DNAJB6	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	43779	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr7	157092515	157093215	157092989	Y	DNAJB6,DNAJB6	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB6	32860	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157112606	157112849	157112710	Y	NA	DNAJB6	UBE3C,DNAJB6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAJB6	13226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157225296	157225625	157225465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	99221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	157405982	157406183	157406105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	279907	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr7	157956905	157957265	157957085	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	538255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	158224670	158224991	158224878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	270529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr7	158609735	158609944	158609833	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	11000	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	638062	638589	638348	Y	ZNF596,ZNF596,ERICH1	ERICH1	NA	NA	NA	NA	ERICH1	47517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	1765271	1765682	1765322	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	4460	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	6481206	6481441	6481325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	82289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	8143963	8144303	8144234	Y	NA	NA	SGK223,CLDN23,MFHAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	97705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	8340993	8341010	8341002	Y	NA	NA	SGK223	IMR90	Hi-C	24141950	SGK223	98985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	10187572	10187859	10187580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	277794	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	10193189	10193473	10193425	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	283411	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	10228323	10228440	10228417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	318545	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	10591008	10591121	10591065	Y	RP1L1,SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	SOX7	104236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	11538128	11538263	11538240	Y	GATA4	GATA4	GATA4	IMR90	Hi-C	24141950	GATA4	5660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	534277	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	16554450	16554835	16554744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	456703	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	19518773	19518959	19518866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	94581	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	73475	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	21425650	21425756	21425703	Y	GFRA2	NA	NA	NA	NA	NA	XPO7	349424	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	22068132	22068339	22068246	Y	NA	BMP1,MIR320A,POLR3D	NA	NA	NA	NA	MIR320A	32217	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	22808149	22808394	22808223	Y	NA	RHOBTB2	PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB2	34536	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	22854119	22854395	22854224	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	11189	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	23210314	23210863	23210698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	25242857	25243137	25242939	Y	NA	NA	KCTD9	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD9	70855	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	26232086	26232281	26232177	Y	NA	BNIP3L,SDAD1P1	NA	NA	NA	NA	BNIP3L	6133	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	27474556	27474730	27474657	Y	NA	CLU,SCARA3	SCARA3,TRIM35,CLU,CCDC25,ESCO2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CLU	4008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	28859805	28860025	28859905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	51427	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	28890628	28890717	28890674	Y	KIF13B	CTD-2647L4.4	NA	NA	NA	NA	CTD-2647L4.4	20735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	30580467	30580796	30580574	Y	GSR	GSR,UBXN8	NA	NA	NA	NA	GSR	2647	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	31068137	31068428	31068254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	178820	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	32191944	32192171	32192069	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	1136769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	33245630	33245874	33245728	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	83066	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	33579772	33580017	33579844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP26	124148	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	11.0418372504275
chr8	33668021	33668356	33668148	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	47385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	33718252	33718557	33718395	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	2511	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	33747203	33747216	33747209	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	31462	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	34908939	34908961	34908949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	472320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	4.94978911226059
chr8	37755287	37755548	37755453	Y	NA	BRF2,RAB11FIP1	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP1	302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	37928414	37928535	37928451	Y	ADRB3,WHSC1L1	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	32225	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	38762883	38763134	38762941	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	6130	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	39918999	39919284	39919148	Y	C8orf4	NA	C8orf4,ZMAT4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-359E19.2	50886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	41649689	41649828	41649744	Y	NKX6-3	NA	NA	NA	NA	NA	NKX6-3	142834	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	43092918	43093442	43093017	Y	HOOK3	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	99362	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	10.4707077374743
chr8	43093596	43094096	43093640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	100040	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	4.18828309498973
chr8	43097072	43097415	43097345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HGSNAT	103516	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	48311654	48311845	48311740	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	191326	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	48910578	48910837	48910684	Y	NA	PRKDC,MCM4,UBE2V2	NA	NA	NA	NA	UBE2V2	8123	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	49606082	49606224	49606171	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	226075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	53013780	53014013	53013897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	203895	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	54636276	54636450	54636366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1H	117668	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	59821707	59822062	59821885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	96596	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	61511489	61511770	61511631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	77567	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	61850490	61850754	61850677	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261153	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CHD7	261439	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr8	62644264	62644344	62644304	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	19109	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	63602684	63603084	63602782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	346646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	65176402	65176460	65176431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	532858	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	65182391	65182571	65182457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	526747	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	66652181	66652518	66652302	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	97212	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	68105132	68105308	68105276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	111114	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	334080	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	72753377	72753463	72753388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	1038512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	72880263	72880309	72880290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	911666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr8	72947235	72947530	72947318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-1145L24.1	844445	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	75515244	75515546	75515314	Y	NA	RP11-730G20.2	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	765	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	76035291	76035498	76035400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRISPLD1	140541	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	76148779	76148868	76148824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	169281	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	79597617	79597771	79597694	Y	PKIA,FAM164A	NA	NA	NA	NA	NA	IL7	117987	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	80216218	80216356	80216290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEY1	461742	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr8	80859511	80859794	80859653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	80730	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	81478227	81478459	81478343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	82373	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	81699574	81699876	81699725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	303720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	82673208	82673424	82673316	Y	NA	CHMP4C,ZFAND1	NA	NA	NA	NA	ZFAND1	30070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	86378354	86378674	86378384	Y	LRRCC1,CA2	CA2	NA	NA	NA	NA	CA2	4273	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	87475103	87475472	87475288	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	19587	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	87673960	87674305	87674138	Y	CNGB3	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE3	178901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	88655608	88655638	88655622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AF121898.3	110308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	89352633	89352940	89352786	Y	NA	MMP16	NA	NA	NA	NA	MMP16	14379	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	90942619	90942853	90942786	Y	RIPK2,NBN,OSGIN2	OSGIN2	NA	NA	NA	NA	OSGIN2	30532	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	95786265	95786660	95786406	Y	RAD54B,KIAA1429	INTS8	NA	NA	NA	NA	INTS8	36879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	96180882	96181195	96181039	Y	PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	36850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	96197025	96197314	96197170	Y	NA	NA	PLEKHF2,C8orf69	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHF2	52993	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	97272793	97273157	97272974	Y	NA	UQCRB,MTERFD1,PTDSS1	NA	NA	NA	NA	PTDSS1	850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	97934277	97934647	97934426	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	430698	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	103639654	103639717	103639685	Y	NA	KLF10	UBR5,ODF1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	26413	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	103740665	103741062	103740742	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	74535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	103757592	103757997	103757773	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	91462	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	103766474	103766656	103766574	Y	NA	NA	KLF10,UBR5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF10	100344	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	NA	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1507C5.2	72755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	105374220	105374445	105374333	Y	TM7SF4	NA	NA	NA	NA	NA	LRP12	224807	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	106172584	106172814	106172681	Y	NA	NA	ZFPM2	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	573332	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	106878097	106878155	106878126	Y	NA	NA	OXR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-152P17.2	192597	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	110564309	110564669	110564608	Y	NA	EBAG9	NA	NA	NA	NA	EBAG9	14369	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	110647152	110647483	110647459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	54537	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	111947421	111947490	111947466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	1245401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	113791450	113791716	113791698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	595182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	114257291	114257677	114257549	Y	CSMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	129221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	116641527	116641923	116641875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	177976	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	116678291	116678885	116678654	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	141014	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	117456775	117457003	117456919	Y	NA	NA	TRPS1,LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	319739	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr8	117466702	117466888	117466786	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	309854	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	117664096	117664364	117664167	Y	RAD21	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	117664503	117664654	117664532	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	112088	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	118894000	118894167	118894051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	227925	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	119264701	119264795	119264748	Y	SAMD12	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	142609	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119319913	119320138	119320129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	197821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119485123	119485454	119485409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	146780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119536200	119536581	119536442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	95653	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	122157265	122157468	122157378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	494162	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	122315722	122315778	122315750	Y	NA	NA	HAS2,HAS2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	HAS2	335852	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	123845065	123845251	123845073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	207412	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	124301303	124301534	124301414	Y	NA	C8orf76,ZHX1	ATAD2,ZHX1-C8ORF76	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZHX1	15522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	124665857	124666229	124666132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM91A1	112467	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr8	125638890	125639286	125639200	Y	NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	89191	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	125683084	125683301	125683193	Y	MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	55429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126193275	126193543	126193371	Y	NA	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	91193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	126286229	126286368	126286299	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	154195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126290719	126290948	126290836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	149615	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126317403	126317692	126317515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	122871	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126446642	126447323	126446973	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	6079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	126710957	126711330	126711190	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	270394	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	127387635	127388005	127387836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K10.1	180115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	127829528	127829825	127829677	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM84B	260890	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	127837362	127837443	127837401	Y	FAM84B	NA	PVT1,MYC,LOC727677	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM84B	268724	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128112845	128113195	128113019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	544207	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	128182729	128182789	128182759	Y	NA	NA	PCAT1,POU5F1B,LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	562891	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128258299	128258698	128258657	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	486982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128259400	128259918	128259781	Y	MYC	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	485762	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	128260594	128261000	128260832	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	484680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128680816	128681380	128681307	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	64300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128822019	128822203	128822035	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17240	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128871975	128872421	128872033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	67196	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	128973364	128973763	128973565	Y	MYC	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	47094	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	129002909	129003328	129003001	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	17529	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	130595828	130596191	130596024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	431184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	131058084	131058195	131058140	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131204007	131204378	131204106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	176632	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131206055	131206375	131206165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	178680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr8	131245360	131245556	131245456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	208350	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	131264949	131265429	131265208	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	188477	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131271304	131271556	131271460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	182350	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	131296989	131297286	131297259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	156620	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	134065970	134066513	134066049	Y	TMEM71,PHF20L1,TG	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	245752	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	134233745	134234256	134234169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	78009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	134258134	134258466	134258300	Y	PHF20L1,NDRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG1	53799	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	135842490	135842788	135842753	Y	NA	MIR30D	ZFAT	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	27302	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	137554492	137554791	137554642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	801754	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	137765888	137765903	137765896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	1013150	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141475903	141476104	141476028	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	9225	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	141707505	141707982	141707957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	188108	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	141849368	141849592	141849371	Y	TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	160723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	141920743	141920803	141920776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	89512	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.85564756476573
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	142386413	142386490	142386444	Y	GPR20	PTP4A3	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	13603	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	142413850	142414371	142414167	Y	DENND3,SLC45A4	PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	13757	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	143311933	143312112	143312023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	170489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	JRK,LY6K	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	144106773	144106936	144106849	Y	NA	LY6E,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	9374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E,C8orf31	NA	NA	NA	NA	LY6E	10133	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr8	144328155	144328364	144328211	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	875	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr8	144629463	144629732	144629564	Y	SPATC1,GRINA	ZC3H3,GSDMD,TIGD5,EEF1D	NA	NA	NA	NA	GSDMD	3645	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	144950990	144951185	144951055	Y	C8orf73,NAPRT1,FAM83H,EXOSC4,CYC1,SCRIB,PUF60,PUF60,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2,PLEC,LOC100128338,FAM83H	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	358	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	144959402	144959607	144959478	Y	C8orf73,MAPK15,EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	PLEC,NRBP2,PUF60	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPPK1	8770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.8075300863543
chr8	144960453	144960673	144960604	Y	C8orf73,TIGD5,FAM83H,PLEC,PLEC,EPPK1	NRBP2,EPPK1	PLEC	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	9821	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	145909522	145909717	145909620	Y	NA	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	328	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	145909879	145909957	145909931	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ARHGAP39,ZNF517,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF7,C8orf77,ZNF252,TMED10P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	685	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr8	146010487	146010786	146010731	Y	NA	ZNF251,RPL8,ZNF7	NA	NA	NA	NA	ZNF34	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	545729	545758	545741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	77438	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	751014	751390	751179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	282723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	1665313	1665337	1665325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	348005	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	2279055	2279418	2279226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	265713	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	2281532	2281772	2281628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	268190	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	2632517	2632641	2632572	Y	KCNV2	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	12683	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	3450123	3450354	3450276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	73650	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	4042913	4043209	4043135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	303183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	RP11-39K24.14	NA	NA	NA	NA	RP11-39K24.14	9863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	11018357	11018684	11018521	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1793660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	11065025	11065362	11065124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	1746982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.23640057340116
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	74072	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	14575436	14575689	14575562	Y	ZDHHC21	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	115780	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDHAP4	71848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	19322727	19322852	19322790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6	55400	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	21096394	21096639	21096525	Y	KIAA1797	NA	MLLT3,KIAA1797	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLAD2	66759	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	21832056	21832478	21832164	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	31514	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	22216803	22217265	22216812	Y	NA	NA	CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	UBA52P6	206649	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	22408637	22408662	22408639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	398483	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	23452489	23452846	23452665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	371489	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	27155069	27155179	27155099	Y	TEK	TEK	NA	NA	NA	NA	TEK	47930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	29826427	29826586	29826507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860517	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	31966420	31966696	31966558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	415922	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32004800	32005157	32005020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	377461	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32429787	32430147	32430005	Y	NA	ACO1	NA	NA	NA	NA	ACO1	47169	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	32437038	32437275	32437091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	54420	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32461734	32461764	32461747	Y	DDX58	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	62558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32524178	32524624	32524592	Y	DDX58	TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	DDX58	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32556634	32556872	32556767	Y	NA	DDX58,TOPORS,NDUFB6	NA	NA	NA	NA	TOPORS	6083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	32701589	32701944	32701680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB6	130429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	33028063	33028460	33028077	Y	NA	APTX,DNAJA1,SMU1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	4854	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	33160944	33161390	33161236	Y	DNAJA1,SMU1,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	3964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	33165457	33166051	33165900	Y	DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	103	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	33233885	33234477	33234128	Y	NA	SPINK4,BAG1,CHMP5	NA	NA	NA	NA	SPINK4	17522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	33655943	33656079	33656011	Y	NA	ANXA2P2	NA	NA	NA	NA	ANXA2P2	33720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	33953868	33954185	33954034	Y	UBE2R2,UBAP1	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	92762	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	34375136	34375287	34375212	Y	NA	KIF24,NUDT2,KIAA1161	NA	NA	NA	NA	KIAA1161	285	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	34454815	34455060	34454916	Y	NA	DNAI1	NA	NA	NA	NA	DNAI1	352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	35924357	35924707	35924422	Y	NA	HRCT1,YBX1P10	NA	NA	NA	NA	HRCT1	20168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	33655	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	36294075	36294254	36294162	Y	OR13J1,OR2S2	RNU4-53P,GNE	RNF38,CLTA,GNE	IMR90	Hi-C	24141950	GNE	19022	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	36924974	36925090	36925030	Y	MELK	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	193446	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	37037734	37038057	37038046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	80479	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	37198449	37198887	37198604	Y	ZBTB5,ZCCHC7	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	79913	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	37270797	37270994	37270913	Y	PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	GRHPR	149669	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	37908726	37909073	37908864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	109292	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	37963992	37964293	37964120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	102391	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	66825190	66825317	66825256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1628058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	68410626	68410725	68410676	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	42650	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.61715358203659
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72669308	72669598	72669510	Y	NA	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	12811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72695513	72695798	72695599	Y	SMC5	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	39016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72717148	72717358	72717253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	60651	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72721676	72721958	72721700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	65179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72725457	72725742	72725656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	68960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72731610	72732001	72731807	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAMDC2	75113	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72776297	72776502	72776400	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	95435	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72779994	72780167	72780104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	91770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	72801648	72801771	72801710	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	70166	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.90376504317715
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	73100288	73100509	73100429	Y	KLF9	NA	SMC5,KLF9,TRPM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF9	72748	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	73196795	73197009	73196903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	169255	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	73701762	73702162	73701962	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	500355	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	74293239	74293379	74293310	Y	TMEM2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL35AP21	90722	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	74371995	74372048	74372016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	57558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	74823247	74823495	74823337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-63P12.6	94851	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	74849498	74849569	74849533	Y	GDA,GDA,TMC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-63P12.6	68777	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	75744933	75745164	75744974	Y	ANXA1	ANXA1	NA	NA	NA	NA	ANXA1	19509	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	77854155	77854441	77854300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	152696	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	78507446	78507579	78507560	Y	PCSK5	PCSK5	NA	NA	NA	NA	PCSK5	3886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	79018113	79018533	79018297	Y	NA	RFK,GCNT1	NA	NA	NA	NA	RFK	10680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	79303501	79303668	79303622	Y	GCNT1	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	118770	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	81480672	81480887	81480778	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	PSAT1	570613	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	85629516	85629601	85629559	Y	NA	RASEF	NA	NA	NA	NA	RASEF	46491	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	89990510	89990850	89990781	Y	NA	NA	DAPK1	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	119293	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	90131164	90131697	90131347	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	6520	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	91096507	91096802	91096655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXNL2	51214	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	91125141	91125399	91125267	Y	NA	NXNL2	SPIN1,SHC3,SECISBP2,CKS2	IMR90	Hi-C	24141950	NXNL2	22617	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	91762072	91762095	91762084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	S1PR3	157710	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	92762358	92762553	92762476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	544430	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	93823339	93823577	93823437	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	298618	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	93833669	93833838	93833696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	288357	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	94668024	94668724	94668369	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	41720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	94968812	94969005	94968908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00475	67232	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	95055002	95055331	95055316	Y	IPPK	IARS,CENPP,NOL8	NA	NA	NA	NA	IARS	964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	95442702	95442889	95442796	Y	IPPK	IPPK	IPPK	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPPK	12155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	95882095	95882646	95882428	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	11924	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	95894467	95895029	95894875	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89	NA	NA	NA	NA	NINJ1	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	97273853	97274253	97274073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBP1	126278	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97288097	97288106	97288102	Y	FBP1,FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FBP1	112425	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	97629577	97629759	97629671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	142594	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97630074	97630491	97630387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	143091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	97631649	97631973	97631839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	144666	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	97672080	97672130	97672087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	185097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	97685167	97685467	97685319	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	198184	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97688379	97688667	97688436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	201396	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97770536	97771110	97770577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf3	283553	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97839686	97839862	97839737	Y	PTCH1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	238129	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	97852724	97853044	97852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	224947	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	97853945	97854061	97854005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	223930	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	98173547	98173783	98173614	Y	NA	RP11-435O5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-435O5.2	13295	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	HSD17B3,SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	99535821	99536158	99535990	Y	NA	ZNF510	NA	NA	NA	NA	ZNF510	2253	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100454693	100454853	100454773	Y	TSTD2,XPA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100667728	100667773	100667740	Y	NA	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	15079	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	101630117	101630425	101630271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT12	62136	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	1145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	102646895	102646933	102646914	Y	NA	STX17	NA	NA	NA	NA	STX17	19982	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	104185147	104185490	104185310	Y	NA	MRPL50,ZNF189	NA	NA	NA	NA	ZNF189	25992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	104248590	104248780	104248669	Y	C9orf125	RNF20	NA	NA	NA	NA	RNF20	45353	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	105248809	105248820	105248818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF20	954676	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	106761923	106761996	106761959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC2	92545	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	107597613	107597745	107597668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3B	73175	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.2,ABCA1	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	ABCA1	41992	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	110109718	110109795	110109757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	66300	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	27708	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	46195	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	113113544	113113865	113113705	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	96624	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114389379	114389396	114389388	Y	NA	PTGR1,DNAJC25,DNAJC25-GNG10,GNG10	DNAJC25-GNG10	MCF7	ChIA-PET	22265404	DNAJC25	2236	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114505631	114505796	114505739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG10	84016	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114585349	114585680	114585428	Y	NA	NA	MIR3134,C9orf84,SUSD1,UGCG	IMR90	Hi-C	24141950	UGCG	71366	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	115470219	115470249	115470232	Y	ROD1,HSDL2,C9orf80	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	40869	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	115527127	115527401	115527315	Y	NA	SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	16009	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	115657106	115657497	115657253	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF883	115010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	117671276	117671580	117671329	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFSF15	104870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117720208	117721654	117720651	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,DFNB31,C9orf91,TNFSF15,TNFSF8,TNC	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF15	153802	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117730994	117731461	117731152	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	LOC100505478,TNFSF15,DFNB31,TNFSF8,AKNA,C9orf91	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	147075	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117762269	117762816	117762619	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	115720	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117778655	117778961	117778811	Y	ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	99575	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117829850	117830096	117830062	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	48440	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117845711	117845781	117845750	Y	TNFSF15	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	32755	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117878279	117878434	117878355	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	102	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	117967486	117967725	117967595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	88950	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	6.47280114680231
chr9	118350454	118350525	118350489	Y	DEC1	NA	ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	471918	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118367467	118367735	118367565	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	488931	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118436011	118436199	118436119	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	557475	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	118473939	118474297	118474118	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	595403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118496415	118496674	118496563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	617879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	118634403	118634418	118634411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	755867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	745887	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	118758811	118759033	118758921	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM32	688548	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	120175638	120175763	120175745	Y	ASTN2	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	290	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	120490105	120490229	120490115	Y	NA	TLR4	NA	NA	NA	NA	TLR4	25495	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	123243513	123243809	123243661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	96639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	124363625	124363839	124363710	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	36289	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	125578475	125578645	125578596	Y	NA	PDCL	NA	NA	NA	NA	PDCL	10265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	125811144	125811514	125811213	Y	NA	NA	MIR600HG	IMR90	Hi-C	24141950	RABGAP1	110032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126028834	126029635	126029406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	0	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126126718	126127057	126126872	Y	CRB2	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	97863	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	126160444	126160608	126160526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	131589	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126200869	126200875	126200873	Y	RABGAP1,GPR21,DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	172014	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126468286	126468378	126468332	Y	STRBP,STRBP	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	222053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126644407	126644614	126644564	Y	LHX2	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	45817	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	126683805	126684169	126683927	Y	NA	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	6262	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	127040505	127040685	127040582	Y	NEK6,NEK6	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	22620	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	127509473	127509808	127509481	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	NR6A1	21781	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	128274126	128274455	128274251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	193058	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	128275898	128276280	128276126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	191233	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	128422195	128422516	128422378	Y	HSPA5	MAPKAP1	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	44997	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	129481833	129482256	129482109	Y	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	83029	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	129862611	129862888	129862750	Y	NA	ANGPTL2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL2	20274	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	130319753	130319894	130319823	Y	ST6GALNAC6,ST6GALNAC4,FPGS,FPGS,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	19374	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	130788612	130788994	130788712	Y	CDK9,SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A	FAM102A,SLC25A25,NAIF1	SLC25A25,NAIF1,FAM102A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC25A25	39486	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	131936354	131936600	131936398	Y	METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1940	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	132221518	132221749	132221614	Y	USP20,USP20,C9orf78	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	21981	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	132464908	132465166	132465090	Y	C9orf50,PRRX2	PRRX2,PTGES	NA	NA	NA	NA	PRRX2	38988	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	132757819	132758165	132758070	Y	TOR1B,FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	45308	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	132807262	132807460	132807345	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	3789	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	132847110	132847326	132847217	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	GPR107	33405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	133321021	133321306	133321114	Y	ASS1	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	2705	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	134131602	134132161	134131829	Y	RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A	NA	NA	NA	NA	NA	NUP214	132654	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.33263553022401
chr9	134583624	134583883	134583876	Y	NA	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	29578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	134600757	134600889	134600837	Y	RAPGEF1,NTNG2	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	12572	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	134602820	134603314	134602971	Y	PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	10147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	134608936	134609538	134609242	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3923	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	134609553	134609906	134609765	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	135016724	135016887	135016786	Y	NA	NTNG2	MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX	IMR90	Hi-C	24141950	NTNG2	18447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136008698	136009031	136008833	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	28270	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136010510	136011124	136011032	Y	RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	26177	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136327922	136327947	136327935	Y	RALGDS,RALGDS,ADAMTSL2,SLC2A6	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	14312	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	26298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136688455	136688774	136688542	Y	RPL7A,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	85378	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136739075	136739598	136739373	Y	VAV2	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116128	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	137268460	137268716	137268601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	61516	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	137285570	137286195	137285918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	78626	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	137536549	137536868	137536739	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	4929	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chr9	137718262	137718824	137718799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A1	186642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	138666183	138666357	138666270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNT1	74152	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	138764440	138764927	138764627	Y	NA	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	32147	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	138884665	138885093	138884961	Y	NA	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	33439	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chr9	139120043	139120348	139120196	Y	NOTCH1	QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	15339	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	FBXW5,LCN12,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.99790659067202
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.14225902590629
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chr9	140303397	140303743	140303573	Y	NA	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	11971	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	140341522	140341675	140341601	Y	EHMT1,ANAPC2,NELF	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	ENTPD8	7254	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	54216	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chr9	140526461	140526811	140526551	Y	NA	ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	EHMT1	15017	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	38639	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSL3	454304	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	13170049	13170410	13170120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM9C	109248	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	3.42677707771887
chrX	13665848	13666134	13665956	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	TCEANC	3091	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	17856457	17856771	17856610	Y	NA	RAI2	NA	NA	NA	NA	RAI2	20686	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	23971140	23971524	23971479	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	47083	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN7	79634	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	39018443	39018533	39018484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	359758	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	41182589	41182765	41182693	Y	NA	DDX3X	DDX3X	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDX3X	7886	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	43562549	43562948	43562749	Y	MAOA	MAOA	NA	NA	NA	NA	MAOA	49082	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.52301203454172
chrX	44173548	44173763	44173665	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	27155	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	45493055	45493058	45493057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	110636	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	45648299	45648762	45648585	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43769	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	46148096	46148185	46148140	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	36895	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	46182516	46182747	46182636	Y	NA	RP1-30G7.2	NA	NA	NA	NA	RP1-30G7.2	2333	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	48348956	48349364	48349102	Y	PORCN,PORCN,FTSJ1	FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	15986	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	48782253	48782568	48782411	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1	NA	NA	NA	NA	PIM2	7952	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	49011448	49011844	49011738	Y	GATA1,HDAC6,MAGIX	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	14429	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	53398923	53399250	53399087	Y	NA	RIBC1,SMC1A	NA	NA	NA	NA	RIBC1	48389	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	56269843	56269989	56269918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBQLN2	318037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	58057411	58058106	58058008	Y	NA	KRT8P17	NA	NA	NA	NA	KRT8P17	48291	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145420	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145914	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	71325311	71325671	71325539	Y	CXCR3,FLJ44635	RGAG4	NA	NA	NA	NA	RGAG4	24087	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	71402877	71403170	71402921	Y	NA	PIN4	NA	NA	NA	NA	PIN4	3674	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	71768805	71768968	71768887	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	21985	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	71785357	71785413	71785385	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	5540	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	72786594	72786762	72786676	Y	NAP1L2,CDX4,CHIC1	CHIC1	NA	NA	NA	NA	CHIC1	5558	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	73507125	73507445	73507287	Y	NA	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	3964	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	74143858	74143903	74143869	Y	KIAA2022	NA	NA	NA	NA	NA	ABCB7	230664	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chrX	87351155	87351521	87351339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL4	580403	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	100792680	100793554	100793013	Y	NA	ARMCX1	NA	NA	NA	NA	ARMCX1	9960	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	102880714	102880758	102880737	Y	PLP1,PLP1	TCEAL3,TCEAL1	NA	NA	NA	NA	TCEAL1	874	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	103953879	103954145	103953966	Y	IL1RAPL2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM199X	544578	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	120331489	120331718	120331553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	569484	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chrX	122465358	122465414	122465386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRFP1	215724	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	123144517	123144692	123144607	Y	XIAP,XIAP,STAG2,STAG2	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	52455	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	123606177	123606254	123606218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAG2	514115	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.951882521588576
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	2.09414154749487
chrX	128656237	128656454	128656444	Y	NA	SMARCA1,OCRL	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	760	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.571129512953145
chrX	130952432	130952771	130952603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	202522	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC160	62912	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	134096434	134096824	134096629	Y	NA	MOSPD1	FAM127C	IMR90	Hi-C	24141950	MOSPD1	49137	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	65638	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	135927542	135927922	135927796	Y	NA	RBMX	ARHGEF6	IMR90	Hi-C	24141950	RBMX	33001	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	148684727	148685116	148684922	Y	NA	TMEM185A	NA	NA	NA	NA	TMEM185A	26452	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	149201039	149201275	149201132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXorf40B	96010	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	149996146	149996459	149996317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD99L2	68830	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.38075300863543
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	1.71338853885944
chrX	152753051	152753292	152753194	Y	NA	TREX2,BGN,HAUS7	BGN	MCF7	ChIA-PET	22265404	BGN	5105	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrX	153829365	153829583	153829391	Y	NA	AF277315.19	NA	NA	NA	NA	AF277315.19	2528	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.761506017270861
chrY	13484567	13484797	13484656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	3264179	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1541535	CAGE	MKN1	hg19	FANTOM5	0.190376504317715