chr1	839741	840250	839788	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	18010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	840753	841210	840812	Y	NA	SAMD11	NA	NA	NA	NA	SAMD11	17050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr1	845485	845678	845582	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17	NA	NA	NA	NA	SAMD11	12582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.25966287985625
chr1	855764	856157	855856	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17	NA	NA	NA	NA	SAMD11	2103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	856539	856757	856714	Y	NA	SAMD11,NOC2L,KLHL17	NA	NA	NA	NA	SAMD11	1503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	858256	858648	858448	Y	SAMD11	NOC2L,KLHL17	NA	NA	NA	NA	SAMD11	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	918449	918555	918505	Y	NA	NOC2L,KLHL17,HES4,ISG15,AGRN	NA	NA	NA	NA	HES4	14997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr1	1098630	1098901	1098641	Y	NA	C1orf159	NA	NA	NA	NA	C1orf159	48889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	1136667	1137146	1136877	Y	HES4,MIB2	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	28265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	21213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	1173386	1173736	1173661	Y	PLEKHN1	SDF4,B3GALT6,UBE2J2,SCNN1D	NA	NA	NA	NA	B3GALT6	7757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	1283060	1283625	1283139	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2	NA	NA	NA	NA	DVL1	330	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1294735	1294982	1294877	Y	NA	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	DVL1	12005	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	AURKAIP1	12543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	1368471	1368786	1368620	Y	RNF223,DVL1,NADK,LOC441869,TMEM88B,VWA1	CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,RP4-758J18.7,ANKRD65,TMEM88B,VWA1,ATAD3C,ATAD3B	NA	NA	NA	NA	VWA1	230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	1609619	1609864	1609850	Y	NA	MMP23B,CDK11B,CDK11A	NA	NA	NA	NA	CDK11B	21146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1744250	1744609	1744432	Y	NA	NADK	NA	NA	NA	NA	NADK	34354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	1814762	1815124	1815035	Y	SKI,C1orf86,MIB2	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	GNB1	5371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	2172142	2172385	2172270	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,PANK4,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	29983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	2231691	2232185	2232046	Y	SKI,TNFRSF14	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	88961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	2509702	2510198	2509855	Y	SKI,TNFRSF14	TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	FAM213B	5732	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	2574079	2574144	2574101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	3514172	3514403	3514294	Y	TP73,MEGF6	MEGF6,RP11-46F15.2,TPRG1L	NA	NA	NA	NA	MEGF6	11656	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	3573384	3573559	3573472	Y	WRAP73,TP73	MEGF6,RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	WRAP73	6059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	3581269	3581645	3581600	Y	WRAP73,TP73	RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	RP5-1092A11.5	1691	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	3582035	3582407	3582251	Y	WRAP73,TP73	RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	RP5-1092A11.5	929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	3594206	3594277	3594248	Y	MEGF6,WRAP73,TP73,TP73	TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	RP5-1092A11.5	10870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	3607916	3608261	3608216	Y	CEP104,WRAP73,TP73	TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	RP5-1092A11.5	24580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	13.2875693806895
chr1	3609276	3609439	3609360	Y	DFFB,CEP104,WRAP73,TP73,TP73,TP73	TP73,WRAP73,RP5-1092A11.5	NA	NA	NA	NA	RP5-1092A11.5	25940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.35300707783043
chr1	3634737	3634863	3634787	Y	WRAP73,TP73	TP73-AS1	NA	NA	NA	NA	TP73-AS1	27037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	7.05902123349128
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	3844625	3844991	3844786	Y	WRAP73,TP73,CEP104,DFFB	C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	29768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	9.41202831132171
chr1	4004990	4005219	4005105	Y	WRAP73,TP73	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	190133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	4729528	4729775	4729656	Y	AJAP1	AJAP1	NA	NA	NA	NA	AJAP1	16736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6053603	6054107	6053839	Y	CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2	KCNAB2,NPHP4	NA	NA	NA	NA	NPHP4	3070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	6301988	6302384	6302218	Y	NA	RPL22,ICMT,GPR153	NA	NA	NA	NA	HES3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6319998	6320272	6320169	Y	NA	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	6321567	6321961	6321896	Y	THAP3,THAP3,GPR153	ICMT,HES3,GPR153	NA	NA	NA	NA	GPR153	2532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	6336471	6336830	6336716	Y	ZBTB48,PHF13,GPR153,ACOT7	ICMT,HES3,GPR153	GPR153	K562	ChIA-PET	22265404	GPR153	17436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6373523	6373899	6373721	Y	ZBTB48,GPR153,ACOT7	NA	HES3,ICMT,GPR153	IMR90	Hi-C	24141950	GPR153	54488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6760819	6760983	6760901	Y	NA	DNAJC11	NA	NA	NA	NA	DNAJC11	835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6779783	6779914	6779849	Y	NOL9,DNAJC11	DNAJC11	CAMTA1,DNAJC11	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJC11	19799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	6943772	6944262	6943813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	100388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	7207208	7207593	7207350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMTA1	363824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	7531062	7531540	7531160	Y	PARK7	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	297789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	7538871	7539273	7539100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	290056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	7551468	7551846	7551701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	277483	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	7728673	7728970	7728748	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	100359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	7729547	7729971	7729640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	99358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	17.4399348121549
chr1	8076289	8076986	8076888	Y	NA	ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	7382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8173446	8173525	8173493	Y	NA	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	ERRFI1	89078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	RNU1-7P	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-7P	34610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	8445817	8446112	8445964	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	69931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8487656	8487917	8487791	Y	RERE	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	111770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	8499087	8499228	8499177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	123201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8721734	8722143	8721896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	153559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8810273	8810466	8810370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	65236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8933581	8933925	8933847	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1-IT1	2141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	8953388	8953557	8953428	Y	NA	ENO1-IT1,ENO1	NA	NA	NA	NA	ENO1	16080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	9111078	9111104	9111091	Y	RERE	SLC2A7,SLC2A5	NA	NA	NA	NA	SLC2A7	26674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10269964	10270260	10269995	Y	RBP7,PGD,KIF1B	KIF1B	NA	NA	NA	NA	KIF1B	1101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10359215	10359483	10359349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF1B	90352	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10496880	10497075	10496978	Y	KIF1B	PGD,APITD1,APITD1-CORT,PEX14,DFFA	NA	NA	NA	NA	APITD1,APITD1-CORT	8721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10557233	10557456	10557348	Y	NA	PEX14,DFFA	CASZ1	IMR90	Hi-C	24141950	DFFA	26650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10849807	10850141	10849963	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	4566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	10851136	10851604	10851471	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	3103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	10853772	10853865	10853819	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	10853986	10854555	10854168	Y	ANGPTL7,CASZ1	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	10960432	10960567	10960498	Y	NA	NA	PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASZ1	105725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	11122928	11123178	11122962	Y	NA	SRM,EXOSC10	NA	NA	NA	NA	SRM	4847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	11415566	11415939	11415808	Y	NA	NA	FBXO2,FBXO44,UBIAD1	IMR90	Hi-C	24141950	UBIAD1	84303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	11753086	11753651	11753386	Y	TNFRSF1B,MTHFR,CLCN6	FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	MAD2L2	3379	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	11761755	11762049	11761783	Y	PTCHD2,FBXO44,FBXO44,MAD2L2,C1orf187	FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP	NA	NA	NA	NA	MAD2L2	12048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	RNU5E-1,KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	RNU5E-1	2301	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	12245348	12245387	12245369	Y	AGTRAP,MTHFR,TNFRSF8,TNFRSF1B	TNFRSF1B,VPS13D	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1B	20288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	12406013	12406127	12406056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13D	117889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	12513404	12513748	12513535	Y	AADACL4,VPS13D	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	161989	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	12609717	12610039	12609907	Y	DHRS3	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	65698	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	12675687	12675874	12675779	Y	VPS13D	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	15111272	15111486	15111395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	622905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	15415174	15415506	15415314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	318885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	15572643	15572853	15572733	Y	PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51,FHAD1	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	161538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	15786440	15786713	15786642	Y	PLEKHM2,CTRC,CELA2A,CELA2B	NA	NA	NA	NA	NA	EFHD2	52049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	15827976	15828116	15828046	Y	NA	CASP9,DNAJC16	NA	NA	NA	NA	CASP9	22913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	16176617	16176801	16176705	Y	RSC1A1,C1orf64,SPEN	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3975	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16366462	16366839	16366644	Y	FAM131C	FAM131C	NA	NA	NA	NA	FAM131C	31288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16669074	16669169	16669123	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	7780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16670445	16670837	16670642	Y	SPEN,C1orf64,FBXO42	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	6112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16677236	16677843	16677569	Y	ZBTB17,FBXO42	FBXO42	RSG1	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO42	287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	RNU1-1	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.15236543146546
chr1	16826315	16826438	16826391	Y	C1orf64,FAM131C,NBPF1	RNU1-1	NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-1	12342	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	17027024	17027386	17027173	Y	NA	EIF1AXP1,CROCC	NA	NA	NA	NA	EIF1AXP1	16474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	NA	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MFAP2	73626	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.87554106936776
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	NA	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	MFAP2	64547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	11.6266232081033
chr1	17253207	17253541	17253218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFAP2	51789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	17865185	17865523	17865202	Y	ARHGEF10L	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	19803336	19803680	19803404	Y	TMCO4,UBR4	CAPZB,RNU4-28P	NA	NA	NA	NA	CAPZB	6386	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	20204786	20204981	20204970	Y	OTUD3	OTUD3	NA	NA	NA	NA	OTUD3	2025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	21149682	21149798	21149749	Y	CAMK2N1,EIF4G3	HP1BP3	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	37866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	21194399	21194490	21194445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HP1BP3	82583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	21660622	21661187	21660789	Y	EIF4G3,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1,ALPL,ECE1	ECE1	NA	NA	NA	NA	ECE1	8810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	22076024	22076450	22076245	Y	NA	USP48	RAP1GAP	IMR90	Hi-C	24141950	USP48	31649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	22467332	22467678	22467505	Y	CELA3B,CELA3A	WNT4	NA	NA	NA	NA	WNT4	784	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	22468030	22468558	22468270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT4	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	22647063	22647428	22647272	Y	NA	NA	C1QC,C1QB,WNT4,CDC42,C1QA,EPHA8	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB40	128916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	22829217	22829453	22829426	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	52873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	22863291	22863389	22863341	Y	LOC729059	EPHA8	NA	NA	NA	NA	EPHA8	24668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23039517	23039656	23039587	Y	NA	EPHB2	NA	NA	NA	NA	EPHB2	4185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23113356	23113555	23113472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHB2	78024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23357547	23357765	23357628	Y	NA	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	13606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23387479	23387794	23387637	Y	ZNF436	KDM1A	LUZP1	IMR90	Hi-C	24141950	KDM1A	43538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23426690	23427100	23426944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	75201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr1	23882500	23882866	23882600	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	1419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	25237596	25238132	25237861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIC4	167748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	25247095	25247311	25247210	Y	NA	NA	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	CLIC4	177247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	26081315	26081453	26081406	Y	STMN1,STMN1,STMN1,PDIK1L,GRRP1	SEPN1	NA	NA	NA	NA	SEPN1	43214	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	26249033	26249281	26249192	Y	EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1	MIR3917,STMN1	STMN1,PAFAH2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STMN1	17551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	26490998	26491259	26491133	Y	NA	FAM110D,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	3103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	26495448	26495637	26495606	Y	NA	FAM110D,ZNF593,CNKSR1	NA	NA	NA	NA	ZNF593	1086	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.59871670727006
chr1	26613887	26614371	26614050	Y	FAM54B,PDIK1L,RPS6KA1,HMGN2,ARID1A,CD52	SH3BGRL3,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	10220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	26738740	26738942	26738863	Y	NA	LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4	NA	NA	NA	NA	LIN28A	3471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	26907360	26907709	26907546	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,PIGV	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN2	110419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.56760197461201
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.3980750609051
chr1	27244420	27244792	27244551	Y	NA	GPN2,NUDC,GPATCH3,NR0B2,C1orf172	NA	NA	NA	NA	NR0B2	5963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	27383957	27384315	27384137	Y	GPR3	NA	C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2	IMR90	Hi-C	24141950	TRNP1	65759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,CD164L2,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	27762936	27763307	27763206	Y	WASF2,STX12,FGR,FGR,FGR,C1orf38	GPR3	NA	NA	NA	NA	GPR3	45788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	27775351	27775365	27775358	Y	GPR3	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	27848725	27849287	27848935	Y	WDTC1,SYTL1,FAM76A	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	27849341	27849620	27849479	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	34672	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	27853337	27854089	27853858	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	38668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	27854575	27854919	27854692	Y	SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	39906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	27916292	27916674	27916513	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	12268	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	27926165	27926491	27926331	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	2451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	27926949	27927449	27927117	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	1493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	27986111	27986384	27986268	Y	EYA3,SYTL1,WASF2,XKR8,STX12,FAM76A,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	10345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	28011929	28012287	28012105	Y	NA	IFI6,FAM76A	STX12,FAM76A,PPP1R8,WASF2,IFI6	IMR90	Hi-C	24141950	IFI6	15200	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	28143878	28144081	28143936	Y	NA	STX12,PPP1R8,SCARNA1	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	11208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	28268335	28268431	28268383	Y	NA	RPA2,SMPDL3B,XKR8	NA	NA	NA	NA	SMPDL3B	8831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	28431716	28431884	28431798	Y	FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3	EYA3	PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EYA3	18509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	28970474	28970729	28970677	Y	NA	TAF12,RNU11,GMEB1	NA	NA	NA	NA	RNU11	2383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	29214759	29214998	29214903	Y	GMEB1,EPB41	EPB41	NA	NA	NA	NA	EPB41	3156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	29564766	29564995	29564881	Y	NA	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	3738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31220962	31221590	31221236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	158018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31222458	31222949	31222817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	156659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31223594	31223943	31223836	Y	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	155665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31231730	31232072	31231886	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	147536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31232736	31232923	31232807	Y	PUM1,LAPTM5	NA	NA	NA	NA	NA	SDC3	146685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31251287	31251533	31251452	Y	NA	NA	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC3	128075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.22854814719819
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr1	31737918	31737951	31737935	Y	NA	NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	27517	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31904621	31905133	31905124	Y	NA	SERINC2	NA	NA	NA	NA	SERINC2	24209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	31950057	31950263	31950160	Y	NA	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	69645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	NA	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	SERINC2	75791	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	32002783	32002833	32002806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCRTR1	78454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	NA	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	HCRTR1	65697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	32250836	32250955	32250895	Y	IQCC	BAI2	NA	NA	NA	NA	BAI2	22342	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	33089029	33089046	33089038	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	25458	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	33094923	33095323	33095277	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	19181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	33182280	33182513	33182368	Y	KIAA1522	SYNC,KIAA1522	SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNC	15083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	33225056	33225508	33225256	Y	NA	KIAA1522	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	19570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	33232248	33232565	33232367	Y	NA	KIAA1522,S100PBP,YARS	NA	NA	NA	NA	KIAA1522	26762	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	33500817	33500865	33500842	Y	NA	AK2,ADC	NA	NA	NA	NA	AK2	43732	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	33645848	33646140	33645995	Y	HPCA,PHC2,TRIM62	TRIM62	NA	NA	NA	NA	TRIM62	188	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	33829513	33829825	33829684	Y	FNDC5,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	NA	PHC2	64828	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.81331160405164
chr1	33926622	33926854	33926826	Y	RNF19B	PHC2,ZSCAN20	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	9392	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	34059848	34060096	34059972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	123602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	34130973	34131088	34131031	Y	ZNF362	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN20	194727	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	36351655	36352020	36351717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSPN	118087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT2	116288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	36641160	36641451	36641218	Y	NA	TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	21980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	36877889	36878288	36878089	Y	NA	STK40,LSM10,OSCP1,MRPS15	NA	NA	NA	NA	LSM10	16396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	37169397	37169618	37169483	Y	OSCP1,GRIK3	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS15	241359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	37721552	37721986	37721683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01137	216026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	38009784	38010404	38010149	Y	SNIP1,MTF1,ZC3H12A	MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2	MEAF6	IMR90	Hi-C	24141950	SNIP1	7499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	38308355	38308564	38308401	Y	ZC3H12A,SNIP1,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	14728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	38317043	38317898	38317556	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	5394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	38591881	38592061	38591968	Y	C1orf122,POU3F1	NA	LOC339442	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-884C9.2	80895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	39509536	39509726	39509631	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	19546	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40006104	40006751	40006634	Y	MFSD2A,PABPC4	PPIEL,PABPC4	NA	NA	NA	NA	PPIEL	15628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40081061	40081282	40081172	Y	BMP8A	PABPC4	NA	NA	NA	NA	PABPC4	40599	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1,RP1-118J21.5	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40426190	40426638	40426252	Y	MFSD2A	MFSD2A	NA	NA	NA	NA	MFSD2A	7388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	40628781	40629153	40628997	Y	NA	RLF	NA	NA	NA	NA	RLF	3736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40805764	40805964	40805875	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	COL9A2,SMAP2	SMAP2,CAP1,RLF,PPT1,ZMPSTE24,COL9A2,ZNF643	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAP2	2558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40841336	40841595	40841379	Y	RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	ZNF643	IMR90	Hi-C	24141950	SMAP2	32814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	40851431	40851768	40851472	Y	CAP1,RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	42909	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	40954031	40954187	40954167	Y	ZNF684,DEM1	RP11-656D10.3,ZNF684	NA	NA	NA	NA	RP11-656D10.3	18146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	41119684	41120000	41119793	Y	NA	RIMS3,NFYC	NA	NA	NA	NA	RIMS3	9329	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	41120137	41120355	41120181	Y	RIMS3	RIMS3,NFYC	NA	NA	NA	NA	RIMS3	8974	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	41495531	41495820	41495676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	169513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	41501908	41501999	41501966	Y	SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	1048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr1	41828934	41829164	41829075	Y	NA	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	3340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	41831444	41831806	41831485	Y	SCMH1	FOXO6	NA	NA	NA	NA	FOXO6	5850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	41994633	41994922	41994778	Y	SCMH1,HIVEP3	EDN2	NA	NA	NA	NA	EDN2	46289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	179507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.59871670727006
chr1	42192975	42193489	42193266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	244631	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	42217644	42218002	42217854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN2	269300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	43428386	43429108	43428580	Y	CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	5666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	43473183	43473398	43473279	Y	C1orf210,C1orf210,SLC2A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A1-AS1	50463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	44015731	44016125	44016031	Y	CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF	PTPRF	NA	NA	NA	NA	PTPRF	26873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	44333703	44334024	44333769	Y	SZT2,ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	62968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	44692988	44693156	44693052	Y	ATP6V0B	DMAP1	NA	NA	NA	NA	DMAP1	15861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	44729368	44729720	44729427	Y	ATP6V0B	NA	NA	NA	NA	NA	DMAP1	52241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	45195062	45195154	45195109	Y	RNF220	RNU5F-1,RNU5D-1,KIF2C,RPS8,SNORD55,RPS15AP11	NA	NA	NA	NA	RNU5D-1	220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	45376274	45376331	45376304	Y	NA	CCNB1IP1P1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1P1	45898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	46555686	46555960	46555823	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN1	82785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	47102400	47102701	47102616	Y	NA	MKNK1,ATPAF1	NA	NA	NA	NA	MKNK1	21885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	48290650	48291031	48290841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXE3	410906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	49038282	49038602	49038503	Y	SPATA6,BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA6	102437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	49518033	49518044	49518039	Y	BEND5	NA	NA	NA	NA	NA	BEND5	277392	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	49902417	49902596	49902507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL4	584989	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	50488527	50488851	50488838	Y	NA	AGBL4,ELAVL4	NA	NA	NA	NA	AGBL4	942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	50580035	50580167	50580147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL4	68349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	50798792	50798875	50798836	Y	NA	NA	AGBL4	IMR90	Hi-C	24141950	ELAVL4	287106	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	50902653	50903020	50902837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL4	390967	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	51083951	51084011	51083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	339924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	51102056	51102361	51102067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	321574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	51935246	51935592	51935567	Y	NA	RP11-191G24.1,EPS15	NA	NA	NA	NA	RP11-191G24.1	46389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	GPX7,FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	3985	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	53128711	53128834	53128721	Y	NA	FAM159A	NA	NA	NA	NA	FAM159A	31695	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	53566298	53566719	53566319	Y	NA	PODN	NA	NA	NA	NA	PODN	40444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	53875866	53875973	53875946	Y	NA	NA	LRP8,GLIS1	IMR90	Hi-C	24141950	LRP8	84124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54700132	54700688	54700499	Y	NA	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	36423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	54713635	54713793	54713710	Y	YIPF1	CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	49926	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54749325	54749366	54749346	Y	NA	NA	CYB5RL,MRPL37	IMR90	Hi-C	24141950	CYB5RL	85616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54804829	54805209	54805022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	71943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54842500	54842749	54842625	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	34403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54844378	54844570	54844456	Y	NA	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	32582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	54873075	54873515	54873406	Y	SSBP3,SSBP3	SSBP3	NA	NA	NA	NA	SSBP3	3637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	54940444	54940824	54940607	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	63292	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	54941159	54941412	54941231	Y	TCEANC2,SSBP3,SSBP3	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	64007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	54941776	54941995	54941811	Y	NA	NA	TMEM59,TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2	IMR90	Hi-C	24141950	ACOT11	63935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACOT11	51605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr1	57873517	57873674	57873652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	646478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	57998549	57998703	57998624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	521449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	31950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	LINC01135	33050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	59369049	59370138	59369602	Y	FGGY	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01135	120226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	61516303	61516687	61516329	Y	NA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	187372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	61522505	61523042	61522705	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	INADL,NFIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFIA	193574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	61543611	61543877	61543752	Y	NFIA,NFIA,NFIA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	214680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	61583915	61584228	61583999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	254984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	61662774	61662930	61662815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	333843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	61707460	61707670	61707565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	378529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	63682107	63682117	63682112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXD3	104613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	65363729	65364057	65363938	Y	JAK1	NA	NA	NA	NA	NA	JAK1	66130	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	65517662	65517702	65517682	Y	NA	RP4-535B20.1	NA	NA	NA	NA	RP4-535B20.1	13718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	65534177	65534450	65534358	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	RP4-535B20.1	AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-535B20.1	2757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	65775838	65775991	65775933	Y	PDE4B,DNAJC6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	63936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	66537394	66537579	66537468	Y	SGIP1,PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	459487	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66724177	66724356	66724261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	272710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66724458	66724790	66724562	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	272276	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66740731	66741065	66740898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	256001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66814347	66814689	66814449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	182377	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66819100	66819322	66819204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	177744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	66867932	66868143	66868076	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	128923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	68118588	68118809	68118774	Y	GADD45A	GADD45A	GADD45A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	29935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	68640572	68640736	68640689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WLS	56067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	68657070	68657479	68657271	Y	NA	WLS	NA	NA	NA	NA	WLS	39324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	70034819	70036254	70034877	Y	NA	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	2738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	70635460	70635702	70635581	Y	NA	LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4	NA	NA	NA	NA	LRRC40	33601	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	70746826	70747040	70746993	Y	ANKRD13C	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-677H15.4	62120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	74970988	74971139	74971082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf173	166283	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	75798807	75799079	75799068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACADM	388957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	76197113	76197244	76197179	Y	NA	ACADM	NA	NA	NA	NA	ACADM	9077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	76645391	76645540	76645467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC3	106987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	77031647	77031976	77031767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPI1P1	131498	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	77385063	77385511	77385240	Y	ST6GALNAC5	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC5	53937	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	77522365	77522872	77522625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-706A16.3	69896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	77713696	77713788	77713742	Y	NA	PIGK,AK5	PIGK,AK5,ZZZ3	IMR90	Hi-C	24141950	PIGK	30581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	77944616	77944628	77944624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	198880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	78171350	78171363	78171357	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	24246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	78348123	78348428	78348274	Y	ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	94366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	78423142	78423521	78423473	Y	NA	FUBP1	NA	NA	NA	NA	FUBP1	19273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	114552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	772978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	81344955	81344988	81344971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	327265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	81843973	81844266	81844258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	171720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	83153203	83153587	83153396	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-147G16.1	428386	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	84120524	84120814	84120773	Y	PRKACB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	203892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	84289121	84289390	84289361	Y	SAMD13,SAMD13	RP11-475O6.1	NA	NA	NA	NA	RP11-475O6.1	35316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	85143846	85143980	85143979	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,LPAR3,SSX2IP,SSX2IP	RP11-484D4.3,SSX2IP	NA	NA	NA	NA	SSX2IP	10506	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	85225280	85225579	85225427	Y	SAMD13,SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,WDR63,LPAR3	NA	SSX2IP,GNG5,CTBS,DNASE2B,TTLL7,UOX,MCOLN2,PRKACB,C1orf180,LPAR3	IMR90	Hi-C	24141950	SSX2IP	70794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	85313015	85313206	85313127	Y	GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	43690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	SYDE2	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	SYDE2	21142	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	85667688	85667915	85667906	Y	NA	SYDE2	NA	NA	NA	NA	SYDE2	2959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	86091549	86091558	86091554	Y	NA	DDAH1,CYR61	ZNHIT6,DDAH1,CYR61	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	47105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	87799623	87799998	87799801	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	7472	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	89459818	89459853	89459836	Y	NA	CCBL2,RBMXL1	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	3175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	89942348	89942369	89942360	Y	NA	LRRC8B	NA	NA	NA	NA	LRRC8B	46026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	91183313	91183764	91183661	Y	BARHL2	BARHL2	NA	NA	NA	NA	BARHL2	2519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.29077761251431
chr1	92218581	92218971	92218958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	150921	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	92255921	92256250	92256086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	113642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	92725087	92725311	92725273	Y	RPAP2,GLMN	RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	RPAP2	37211	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	92907492	92907607	92907552	Y	NA	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	42826	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr1	92947789	92948106	92947980	Y	GFI1,GFI1	GFI1	NA	NA	NA	NA	GFI1	2327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	93003662	93004045	93003868	Y	RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1	NA	NA	NA	NA	NA	GFI1	53229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	93324554	93324784	93324669	Y	NA	RPL5	NA	NA	NA	NA	RPL5	28972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	93427945	93428408	93428079	Y	MTF2,DR1,FAM69A	FAM69A	NA	NA	NA	NA	FAM69A	2888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	93914812	93914954	93914881	Y	FNBP1L	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	3124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR760	65079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	94557832	94558157	94557998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP29	180467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	94891778	94892070	94891849	Y	NA	ABCD3	NA	NA	NA	NA	ABCD3	9845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	94937052	94937396	94937225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCD3	55119	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	25216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	95326006	95326167	95326065	Y	NA	LINC01057,SLC44A3	CNN3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC44A3	42108	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	96208080	96208328	96208204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-286B14.1	234408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	96476779	96477021	96476900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	433465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	96541224	96541649	96541417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P11	368837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	98459458	98459857	98459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	53562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	98606055	98606462	98606113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR137HG	92636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	100512510	100512716	100512572	Y	HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	10857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	100678369	100678762	100678562	Y	NA	DBT	NA	NA	NA	NA	DBT	34628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	101485385	101485713	101485528	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	102279829	102279837	102279833	Y	NA	RP11-556K13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-556K13.1	27770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108122481	108123055	108122789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	382010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108175822	108176099	108175961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	328966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108439709	108440134	108439910	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	64931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108441090	108441173	108441132	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	63892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108478963	108479298	108479233	Y	VAV3	VAV3-AS1,VAV3	NA	NA	NA	NA	VAV3-AS1	25767	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	108741685	108742156	108741931	Y	FAM102B	SLC25A24	NA	NA	NA	NA	SLC25A24	214	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	109800134	109800539	109800492	Y	AKNAD1,C1orf194	SARS,CELSR2,PSRC1,MYBPHL	NA	NA	NA	NA	CELSR2	9493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	110778589	110778756	110778673	Y	NA	KCNC4	NA	NA	NA	NA	KCNC4	26624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	111209000	111209250	111209208	Y	NA	KCNA2,KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	6405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	111745467	111745610	111745539	Y	CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2	NA	NA	NA	NA	NA	DRAM2	64629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	111764327	111764759	111764457	Y	CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	NA	C1orf88,DRAM2,CEPT1,RAP1A,CHI3L2,WDR77	IMR90	Hi-C	24141950	DRAM2	83489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	112618733	112618998	112618894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCND3	88956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	113394964	113395159	113395070	Y	NA	RP3-522D1.1,RP11-426L16.8	FAM19A3,PPM1J	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-426L16.8	3699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr1	113468568	113468671	113468620	Y	NA	SLC16A1-AS1,SLC16A1	NA	NA	NA	NA	SLC16A1-AS1	28366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	114244987	114245321	114245197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	54790	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	115052481	115052766	115052572	Y	BCAS2,TRIM33	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	700	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2,RP4-666F24.3	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	115615204	115615232	115615217	Y	NA	TSPAN2,RP4-666F24.3	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	14889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	115873164	115873576	115873409	Y	NGF	NGF	NA	NA	NA	NA	NGF	5281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	116370977	116371565	116371162	Y	SLC22A15	NHLH2	NA	NA	NA	NA	NHLH2	12973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	116694646	116694883	116694753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	177527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	116878887	116879201	116879105	Y	ATP1A1	ATP1A1	ATP1A1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP1A1	34089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	116918925	116919548	116919274	Y	SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1	ATP1A1,ATP1A1OS	NA	NA	NA	NA	ATP1A1	5635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	117089417	117089635	117089469	Y	NA	NAP1L4P1,CD58	NA	NA	NA	NA	NAP1L4P1	14703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	117367696	117367920	117367797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTGFRN	82759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	117368438	117368774	117368618	Y	NA	NA	PTGFRN	K562	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	81905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	117493512	117493635	117493571	Y	NA	PTGFRN	CD101	IMR90	Hi-C	24141950	PTGFRN	42833	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	120180868	120181132	120181082	Y	NBPF7,ZNF697	GAPDHP33,ZNF697,PHGDH	NA	NA	NA	NA	ZNF697	7264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	120255895	120256325	120256050	Y	ADAM30	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	55474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-439A17.7	648739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	117473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	145437595	145437817	145437681	Y	CD160,TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A	TXNIP,POLR3GL,LIX1L	NA	NA	NA	NA	TXNIP	1126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	145526126	145526326	145526236	Y	PDE4DIP,ITGA10	RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,PIAS3	NA	NA	NA	NA	PEX11B	11874	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	145526651	145526817	145526757	Y	NA	RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,PIAS3	NA	NA	NA	NA	PEX11B	12399	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	147011538	147012039	147011713	Y	NA	BCL9	ACP6	IMR90	Hi-C	24141950	BCL9	356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	149816287	149817606	149817166	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2BC	2733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H2AA4	372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	149981648	149981889	149981683	Y	ANP32E,OTUD7B	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	1023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	150600412	150600701	150600561	Y	CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	151172620	151173197	151172669	Y	TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	4195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	151255796	151256115	151256047	Y	NA	PSMD4,ZNF687,RP11-126K1.2,PI4KB	NA	NA	NA	NA	RP11-126K1.2	3391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	151445792	151446161	151446000	Y	C1orf56,RIIAD1,OAZ3	POGZ,CGN	RIIAD1,LOC100132111,TUFT1,CGN,SNX27,POGZ,PI4KB,PSMB4,CELF3,OAZ3,TDRKH,MRPL9,RORC,C2CD4D	IMR90,MCF7,HELA,H1ESC,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	POGZ	15851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	152006910	152007460	152006991	Y	SNX27,S100A11	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	42044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	152007615	152008057	152007721	Y	THEM4	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	42749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	152025147	152025277	152025212	Y	NA	NA	THEM4,S100A11,TCHH,TCHHL1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	S100A10	60281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	153510895	153511054	153510975	Y	NA	BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	S100A6	4175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	BX470102.3,S100A6,S100A4,S100A2,S100A16,S100A14	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	153704694	153704943	153704839	Y	NA	INTS3,SLC27A3	NA	NA	NA	NA	INTS3	6151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153762591	153763309	153762932	Y	NPR1	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	17761	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153818420	153818667	153818544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	73590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	153853385	153853782	153853590	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	39669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	154302207	154302441	154302288	Y	CHRNB2,ATP8B2	AQP10,ATP8B2	NA	NA	NA	NA	ATP8B2	6178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	7.05902123349128
chr1	154728745	154728994	154728977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN3	111762	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	154957258	154957622	154957425	Y	NA	PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B	NA	NA	NA	NA	FLAD1	3444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	154972628	154972915	154972668	Y	CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	154973036	154973200	154973120	Y	CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	154973335	154973935	154973656	Y	ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B	PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	154986150	154986272	154986211	Y	NA	SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3	NA	NA	NA	NA	ZBTB7B	13023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.56760197461201
chr1	155496665	155497012	155496914	Y	DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L	ASH1L-AS1,ASH1L	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	32809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	155830201	155830522	155830413	Y	ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2	GON4L,SYT11,RIT1	ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907	IMR90	Hi-C	24141950	SYT11	2901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	155904830	155905033	155904931	Y	NA	RIT1,KIAA0907	NA	NA	NA	NA	KIAA0907	2639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	155944562	155945214	155944815	Y	C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	NA	NA	NA	NA	ARHGEF2	29647	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.59871670727006
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	156067665	156067930	156067834	Y	NA	UBQLN4,LAMTOR2,RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,MEX3A	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	LMNA	17301	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	156073142	156073699	156073532	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	22778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	RAB25,MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA	NA	NA	NA	NA	LMNA	44669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	156103413	156103690	156103594	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA	NA	NA	NA	NA	NA	LMNA	53049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156134935	156135401	156135063	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2	SLC25A44,PMF1-BGLAP,PMF1	NA	NA	NA	NA	SLC25A44	26479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156251648	156251762	156251690	Y	RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44	BGLAP,SMG5,TMEM79,C1orf85	NA	NA	NA	NA	TMEM79	922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156405790	156406311	156406022	Y	NA	NA	RHBG,C1orf182,C1orf61,CCT3,TTC24,MEF2D,IQGAP3,BCAN,APOA1BP,GPATCH4,HAPLN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MEF2D	62309	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	156461502	156461819	156461755	Y	MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	156480721	156480806	156480764	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	12101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156629760	156630406	156629967	Y	PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2	RP11-284F21.7,NES,CRABP2	NA	NA	NA	NA	RP11-284F21.7	544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156677217	156677612	156677436	Y	NA	RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC	NA	NA	NA	NA	CRABP2	3609	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156719450	156719815	156719708	Y	ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	1048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	156966343	156966626	156966486	Y	NA	ARHGEF11	NA	NA	NA	NA	ARHGEF11	46536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	157964633	157965029	157964831	Y	OR10T2	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	3570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	157990877	157991211	157991044	Y	NA	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	29814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159515755	159515769	159515762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-419N10.5	211191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159793141	159793292	159793217	Y	SLAMF8	DUSP23,C1orf204	NA	NA	NA	NA	C1orf204	29845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	159794345	159794712	159794511	Y	OR10J5,SLAMF9,SLAMF8	DUSP23,C1orf204	NA	NA	NA	NA	C1orf204	28425	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159829428	159829783	159829606	Y	OR10J5,KCNJ9	C1orf204,CCDC19	NA	NA	NA	NA	C1orf204	6291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159892447	159892988	159892803	Y	NCSTN,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159910997	159911192	159911068	Y	CCDC19,ATP1A4	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	2194	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	159914077	159914586	159914278	Y	NHLH1,VANGL2,IGSF9	CCDC19,TAGLN2,IGSF9	NA	NA	NA	NA	IGSF9	691	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.64378469034473
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8	NA	NA	NA	NA	RP11-574F21.2	25495	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	160332348	160332525	160332392	Y	SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	2332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr1	160344568	160344717	160344643	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	9711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	160345693	160345986	160345917	Y	NA	NCSTN,COPA,NHLH1,VANGL2	NA	NA	NA	NA	NHLH1	10836	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	160714037	160714549	160714116	Y	CD48,FCER1G,CD244,ARHGAP30,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	F11R	274589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	160807359	160807588	160807459	Y	SLAMF6,CD48,USF1,CD244,ARHGAP30,LY9	NA	NA	NA	NA	NA	F11R	181550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	160989381	160990254	160990012	Y	NDUFS2,ADAMTS4,F11R	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	243	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	C1orf192	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	24002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	C1orf192	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf192	33409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	81735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	163844797	163845064	163844971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB3P6	478940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	164580985	164581415	164581219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	58164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	164753581	164753588	164753585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	230760	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	165204752	165205122	165204813	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	RXRG	207311	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	165205285	165205518	165205385	Y	RXRG	NA	NA	NA	NA	NA	RXRG	206915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	165345662	165345996	165345868	Y	NA	NA	LRRC52,LOC400794	IMR90	Hi-C	24141950	RXRG	66437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	167191021	167191933	167191618	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	2955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	167438624	167439122	167438966	Y	RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	81882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	167469653	167470005	167469884	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	50999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	167602083	167602470	167602201	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	81079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	168338134	168338331	168338175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	89856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	168355862	168356010	168355936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	107584	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	168409627	168409736	168409651	Y	NA	NA	F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	161349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	168531443	168531650	168531547	Y	NA	NA	LOC100505918,NME7	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	283165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	168594082	168594481	168594282	Y	NA	NA	DPT,F5	IMR90	Hi-C	24141950	TBX19	345804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2,AL021068.1	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	172327070	172327187	172327139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGC	84043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	173382392	173382663	173382522	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	61742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	174122877	174123205	174123041	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	3343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	174974831	174975127	174974979	Y	NA	CACYBP,MRPS14	NA	NA	NA	NA	CACYBP	8531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	175659647	175659870	175659824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNR	51036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	178305054	178305336	178305195	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	244190	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	179098871	179099008	179098957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	50359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	179115539	179115872	179115703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	67027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	179153644	179153909	179153868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	105132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	179997226	179997609	179997386	Y	TOR1AIP1,CEP350	NA	NA	NA	NA	NA	CEP350	75353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	180200686	180200867	180200752	Y	NA	LHX4	NA	NA	NA	NA	LHX4	3265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	180371123	180371295	180371283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD6	98794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	180389473	180389640	180389557	Y	NA	NA	LHX4,LOC100527964	IMR90	Hi-C	24141950	ACBD6	80449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	180613229	180613603	180613357	Y	NA	XPR1	NA	NA	NA	NA	XPR1	14089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	180895607	180895967	180895721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	94080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	180921044	180921090	180921069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX6	68957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	181069151	181069617	181069305	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	13513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	181149230	181149365	181149283	Y	NA	NA	MR1,XPR1,KIAA1614,ACBD6,STX6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	93592	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	181454376	181454805	181454502	Y	CACNA1E	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1E	74138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	182228543	182228906	182228715	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	182248717	182248735	182248728	Y	NA	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	110606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	182580570	182580950	182580946	Y	NA	RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	9027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	182585205	182585710	182585424	Y	NA	RGS16	NA	NA	NA	NA	RGS16	13662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	182998797	182999044	182998924	Y	NA	LAMC1	NA	NA	NA	NA	LAMC1	8202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	183237084	183237447	183237420	Y	NA	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	83711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	183310808	183311127	183310994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT2	74610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	183877295	183877615	183877384	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	141196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	184357629	184357933	184357738	Y	EDEM3	C1orf21	NA	NA	NA	NA	C1orf21	3437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	184506061	184506260	184506127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf21	151869	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	184924828	184925180	184925091	Y	IVNS1ABP,FAM129A	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	16502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	184945083	184945319	184945179	Y	NA	FAM129A	NA	NA	NA	NA	FAM129A	3401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	185129185	185129369	185129253	Y	NA	TRMT1L,SWT1	NA	NA	NA	NA	SWT1	4973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	185298342	185298619	185298496	Y	FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP	IVNS1ABP	IVNS1ABP	MCF7	ChIA-PET	22265404	IVNS1ABP	13881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	193226500	193227132	193226836	Y	RGS2	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	72716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	193726401	193726456	193726429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	572617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	194047687	194047732	194047710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	893903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	229054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	198903935	198904934	198904858	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	779842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	200076437	200076447	200076441	Y	NR5A2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	300737	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	200341273	200341515	200341438	Y	NA	ZNF281	NA	NA	NA	NA	ZNF281	35669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	200457893	200457983	200457938	Y	NA	NA	C1orf98,NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	80709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	200783735	200784105	200783920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	77049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	200839315	200839533	200839446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	132629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr1	201515368	201515617	201515551	Y	LAD1	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	38784	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	201613135	201613506	201613321	Y	GPR37L1	NAV1	NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAV1	22724	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	201618983	201619286	201619160	Y	NA	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28572	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.18348016412352
chr1	201639932	201640262	201640169	Y	PTPN7	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	49521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	202054141	202054434	202054309	Y	NA	NA	ELF3,IPO9,RNPEP,ARL8A,GPR37L1,TIMM17A,LGR6,NAV1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARL8A	57435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	202075010	202075191	202075097	Y	PPP1R12B,ELF3,LGR6	ARL8A	RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL8A	36678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	202077636	202077876	202077756	Y	ELF3,LGR6	ARL8A	NAV1,ARL8A,GPR37L1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ARL8A	33993	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	202216987	202217221	202217073	Y	UBE2T	NA	NA	NA	NA	NA	LGR6	55958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	11.4882110270544
chr1	203247590	203248072	203247769	Y	BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	24365	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	203258547	203259334	203258830	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	13103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	12452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	203265047	203265161	203265104	Y	BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	LINC01136	7276	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	203289937	203290406	203290261	Y	BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	17318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	203294160	203294623	203294393	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	21541	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	LINC01136,BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	24482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	203398304	203398692	203398536	Y	NA	NA	PRELP,ATP2B4,FMOD,PPFIA4,BTG2,LOC730227,CHIT1	IMR90	Hi-C	24141950	BTG2	125685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	203491011	203491485	203491466	Y	PPFIA4,SNRPE	NA	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	102204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	203624863	203625211	203625050	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	31174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	203747441	203747547	203747494	Y	SOX13,LAX1	ZC3H11A	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	15235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	203965652	203965916	203965843	Y	NA	NA	ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13	IMR90	Hi-C	24141950	SOX13	74327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	204044571	204044810	204044641	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	4328	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	204238647	204239007	204238820	Y	GOLT1A,PLEKHA6	NA	NA	NA	NA	NA	GOLT1A	57427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	204430759	204431008	204430941	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	30844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	204432329	204432499	204432494	Y	SOX13,PIK3C2B	PIK3C2B	NA	NA	NA	NA	PIK3C2B	29353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	204653343	204653636	204653438	Y	PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2	NA	NA	NA	NA	NA	NFASC	142143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NFASC	NA	NA	NA	NA	NFASC	4697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	204961641	204962301	204961818	Y	MDM4,RBBP5,NUAK2	CNTN2	NA	NA	NA	NA	CNTN2	48024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205017484	205017845	205017563	Y	NFASC,NFASC,TMCC2,DSTYK,CDK18,CNTN2,TMEM81	CNTN2	NA	NA	NA	NA	CNTN2	7159	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205090261	205090406	205090392	Y	NA	RBBP5	CNTN2	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP5	1118	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205179753	205180065	205179802	Y	NA	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	DSTYK	1026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205257253	205257766	205257562	Y	RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	31117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205329070	205329482	205329431	Y	NA	NUAK2,SNRPGP10,KLHDC8A	LOC284576	IMR90	Hi-C	24141950	KLHDC8A	4852	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	12504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	205413132	205413367	205413271	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	9715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	205413830	205414535	205414383	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	8547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	205420910	205421289	205421224	Y	NA	LEMD1	NA	NA	NA	NA	LEMD1	1793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	205423770	205424352	205424110	Y	NA	LEMD1,CDK18	LOC284576,LEMD1	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD1	688	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	206640538	206640724	206640631	Y	NA	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	207079196	207079569	207079501	Y	NA	RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	208377298	208378003	208377521	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	37662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	208418631	208418859	208418806	Y	PLXNA2	PLXNA2	NA	NA	NA	NA	PLXNA2	2966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	209942657	209943400	209942924	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3	C1orf74,IRF6	NA	NA	NA	NA	C1orf74	12504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	SERTAD4	NA	NA	NA	NA	SERTAD4	21827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	210812063	210812447	210812256	Y	HHAT,HHAT,KCNH1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU5A-8P	266452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	211976591	211977124	211977068	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	24990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	211998326	211998558	211998442	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	3556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	212458080	212458253	212458113	Y	INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A	PPP2R5A,RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	PPP2R5A	1201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr1	212923712	212923837	212923822	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	39287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	212926000	212926318	212926233	Y	NA	NSL1,TATDN3	NA	NA	NA	NA	NSL1	36806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	213090277	213090696	213090331	Y	VASH2,FLVCR1	VASH2	NA	NA	NA	NA	VASH2	31166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	214126796	214127172	214127111	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	27352	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	214162828	214163073	214162948	Y	PROX1	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr1	214163432	214163790	214163677	Y	NA	PROX1	NA	NA	NA	NA	PROX1	8908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	216099547	216099924	216099737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD3	360812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	216286476	216286776	216286627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USH2A	307962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr1	216402261	216402628	216402445	Y	USH2A	NA	NA	NA	NA	NA	USH2A	192110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	USH2A	179266	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	216823711	216823952	216823948	Y	ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	USH2A	228973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	217308487	217308861	217308605	Y	ESRRG	ESRRG	NA	NA	NA	NA	ESRRG	236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	218667919	218668153	218668036	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	150342	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	220189685	220189943	220189814	Y	NA	EPRS	NA	NA	NA	NA	EPRS	28057	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	220399770	220399931	220399853	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	24981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	221048646	221048850	221048821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARC1	90545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	221271745	221272272	221272045	Y	HLX	NA	MARC1,HLX,DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	MARC1	313644	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	221882292	221882723	221882499	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	30795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	223095586	223095912	223095632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	109180	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	223147896	223148076	223147937	Y	DISP1	NA	NA	NA	NA	NA	DISP1	161490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	223363832	223364028	223363934	Y	TLR5	NA	CAPN8,SUSD4	IMR90	Hi-C	24141950	DISP1	377426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	224024642	224024959	224024902	Y	NA	TP53BP2	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	6715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.32189234517237
chr1	224528791	224528972	224528907	Y	NA	NVL,CNIH4	FBXO28,DEGS1,NVL,CNIH4,WDR26	IMR90	Hi-C	24141950	NVL	12702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	224691192	224691563	224691423	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	68457	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	226187685	226188168	226187763	Y	TMEM63A,H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	59384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	226189681	226190319	226189910	Y	H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	57233	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	226190534	226190731	226190643	Y	H3F3A,C1orf55	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3A	56821	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	226315308	226315548	226315420	Y	PARP1	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	226315631	226315825	226315781	Y	PARP1,LIN9,PYCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ACBD3	56606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	226361229	226361382	226361305	Y	NA	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	11049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	226841173	226841776	226841263	Y	ITPKB	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKB	83248	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	227128899	227129131	227129032	Y	ADCK3	ADCK3	NA	NA	NA	NA	ADCK3	45662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	227405146	227405174	227405158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42BPA	99001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	228074836	228075224	228075030	Y	NA	NA	PRSS38	IMR90	Hi-C	24141950	WNT9A	58375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	229125950	229125993	229125972	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	257126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	229546455	229546768	229546488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	95335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	229546837	229547142	229546975	Y	C1orf96,ACTA1	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	94961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	229570562	229570652	229570607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP133	71451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	229601636	229601883	229601761	Y	NA	NUP133,RP4-613A2.1	NA	NA	NA	NA	NUP133	40220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	230089577	230089803	230089690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	101733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	230561990	230562633	230562303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	213602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	230692328	230692442	230692414	Y	TTC13	NA	AGT	IMR90	Hi-C	24141950	COG2	83793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	230887462	230887658	230887571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	111227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	230889321	230889962	230889601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG2	113086	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr1	231347338	231347496	231347363	Y	C1orf124	C1orf131,GNPAT	NA	NA	NA	NA	C1orf131	27437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	232454898	232455086	232454992	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2	IMR90	Hi-C	24141950	DISC1-IT1	395318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	16.3326373637641
chr1	233409089	233409391	233409240	Y	NA	RPS7P3,PCNXL2	NA	NA	NA	NA	RPS7P3	13802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	233856724	233857076	233856900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	181603	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234658291	234658851	234658374	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	45442	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234680207	234680593	234680360	Y	NA	NA	LOC100506795,IRF2BP2	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	62678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234728712	234729023	234728867	Y	NA	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	14248	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr1	234812067	234812214	234812141	Y	NA	NA	LOC100506810,IRF2BP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BP2	68796	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	115572	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	234862200	234862535	234862470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	118929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234918221	234918587	234918404	Y	NA	NA	IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BP2	174950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	234981045	234981471	234981275	Y	IRF2BP2,RBM34	NA	LOC100506810,IRF2BP2,LINC00184	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	237774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235090546	235090894	235090695	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	199357	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOMM20	183098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235460869	235461278	235461096	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	GGPS1,ARID4B	NA	NA	NA	NA	GGPS1	27387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235486836	235487237	235487205	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	1428	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235644219	235644255	235644237	Y	NA	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	21526	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	235805098	235806119	235805875	Y	LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	5935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	GNG4	NA	NA	NA	NA	GNG4	38803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	236431064	236431243	236431072	Y	LGALS8,ERO1LB	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	12076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	239474777	239474787	239474782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FMN2	700861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240306165	240306375	240306208	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	25080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr1	240433849	240434175	240434014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	102394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	241320009	241320104	241320058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-435F13.2	159915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	242627058	242627162	242627110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	58836	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	242686520	242686699	242686610	Y	NA	PLD5	NA	NA	NA	NA	PLD5	522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	42384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr1	244212276	244213430	244213047	Y	NA	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	40898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	244215508	244215901	244215527	Y	AKT3,ZNF238,ZNF238	RP11-278H7.4	NA	NA	NA	NA	RP11-278H7.4	38427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr1	244462616	244463099	244462949	Y	AKT3,AKT3,ADSS	NA	AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	150337	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	244894306	244894456	244894354	Y	C1orf100,C1orf101	NA	PPPDE1,C1orf101	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPU-AS1	122343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	245162358	245162654	245162559	Y	NA	EFCAB2	NA	NA	NA	NA	EFCAB2	31351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	246061196	246061440	246061372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	607174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	246323685	246324051	246324002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	344563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	246845240	246845409	246845305	Y	NA	SCCPDH	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	39940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	246948292	246948613	246948340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	62943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	246958730	246958915	246958757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCCPDH	73381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr1	247206107	247206337	247206222	Y	NA	ZNF695,ZNF670	NA	NA	NA	NA	ZNF670	33776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr1	248894360	248894532	248894495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3124	224044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	6213842	6214122	6214025	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	84892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	6341993	6342400	6342249	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3,PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	RBM17	213043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	8103619	8104019	8103811	Y	KIN,TAF3,GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	245152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	8373481	8373809	8373699	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	515014	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	8662161	8662543	8662250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	803694	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	8897116	8897206	8897161	Y	NA	NA	TAF3,GATA3,FLJ45983	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF3	1038649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	9017648	9017767	9017731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF3	1159181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	11112343	11112864	11112373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	538889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	12527553	12527985	12527598	Y	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	138072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	13131256	13131517	13131341	Y	NA	OPTN,CCDC3	CDC123,CAMK1D	IMR90	Hi-C	24141950	OPTN	7932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	13200624	13201003	13200885	Y	NA	MCM10	NA	NA	NA	NA	MCM10	551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	14131369	14132062	14131667	Y	NA	NA	PRPF18	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF18	504442	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	14215783	14216000	14215795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	588856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	14689846	14690850	14690697	Y	RPP38,HSPA14,DCLRE1C,CDNF,C10orf111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM107B	124046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	15157630	15158203	15157954	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111	NA	NA	NA	NA	C10orf111	20312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	18550812	18550951	18550882	Y	CACNB2,CACNB2,CACNB2,CACNB2	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB2	123206	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	18578722	18579070	18578781	Y	SLC39A12,CACNB2,CACNB2,CACNB2,CACNB2	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB2	151116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	18579741	18580614	18579827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNB2	152135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr10	21809167	21809536	21809441	Y	C10orf114,C10orf140	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	11558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	21816987	21817223	21817104	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3871	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	22623174	22623719	22623448	Y	COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	8680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	22624164	22624549	22624505	Y	DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	7850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	22625615	22626028	22625937	Y	DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	6371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG6	92932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr10	22726811	22727194	22727116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG6	94412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	22853668	22853687	22853679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	147797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	23344774	23344811	23344800	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	37624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	25240272	25240935	25240716	Y	ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1	PRTFDC1	NA	NA	NA	NA	PRTFDC1	739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	25640550	25640656	25640570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPR158	178559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	26223879	26224018	26223959	Y	GAD2,MYO3A	MYO3A	NA	NA	NA	NA	MYO3A	2683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr10	29254247	29254334	29254291	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	WAC-AS1	434575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	29470741	29471159	29470915	Y	NA	NA	LYZL1,BAMBI,LOC100507605	IMR90	Hi-C	24141950	PTCHD3P1	225172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	29761620	29761743	29761682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	65289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	29909517	29909915	29909733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTCHD3P1	213186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	30338036	30338318	30338293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1462	64105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	30441068	30441357	30441150	Y	NA	KIAA1462	MTPAP,KIAA1462	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	38645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	31422679	31422989	31422772	Y	ZNF438,ZNF438	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	103813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	31986198	31986456	31986355	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	229286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	32047879	32048374	32048138	Y	ZEB1	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	167368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	33547800	33548221	33548104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	74969	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	35438214	35438795	35438573	Y	CREM,CREM	CREM	NA	NA	NA	NA	CREM	24495	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	42400063	42400397	42400233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37BP	645873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr10	43905259	43905708	43905446	Y	HNRNPF,HNRNPF,HNRNPF	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	2645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	48279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	44363607	44363971	44363643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA3P1	79742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	45470476	45470795	45470517	Y	NA	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	C10orf10	1463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	45868742	45869084	45868822	Y	ANUBL1,OR13A1,ALOX5	ALOX5	NA	NA	NA	NA	ALOX5	1081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF488	696953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	50008368	50008659	50008598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf128	385971	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	50579263	50579390	50579333	Y	C10orf128	DRGX	NA	NA	NA	NA	DRGX	22107	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	50595145	50595278	50595227	Y	C10orf128	DRGX	NA	NA	NA	NA	DRGX	6219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	50604736	50605039	50604888	Y	DRGX	DRGX	NA	NA	NA	NA	DRGX	3239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr10	50606394	50606776	50606708	Y	NA	DRGX	NA	NA	NA	NA	DRGX	4897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	19.3777053468388
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	52153406	52153805	52153735	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	130668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	52434661	52434802	52434754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	51738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	60935384	60935742	60935425	Y	NA	PHYHIPL	NA	NA	NA	NA	PHYHIPL	1034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	63596779	63597177	63597154	Y	NA	NA	RHOBTB1,C10orf107,ARID5B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID5B	61882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	63979384	63979550	63979547	Y	NA	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	46916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	64004719	64005076	64004899	Y	ARID5B	RTKN2	NA	NA	NA	NA	RTKN2	21390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	64301106	64301210	64301177	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	261306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	64420095	64420329	64420212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	142187	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	65274637	65275000	65274913	Y	NA	REEP3	JMJD1C,REEP3	IMR90	Hi-C	24141950	REEP3	4123	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	650987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	68676498	68676693	68676596	Y	NA	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	7071	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	68690818	68690961	68690956	Y	NA	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	LRRTM3	7054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	69523880	69524330	69524240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	71594	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr10	69658139	69658146	69658142	Y	HNRNPH3,SIRT1,SIRT1	SIRT1	HERC4	IMR90	Hi-C	24141950	SIRT1	15712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	70735854	70735920	70735884	Y	CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21	DDX21,KIAA1279	KIAA1279	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1279	10567	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	71984000	71984297	71984282	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	7370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	72165059	72165574	72165379	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	2924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	73039102	73039294	73039207	Y	NA	SLC29A3	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	37721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	73109189	73109511	73109382	Y	SLC29A3	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	32174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	73124315	73124355	73124335	Y	NA	SLC29A3,CDH23	NA	NA	NA	NA	CDH23	30336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	73843647	73844125	73844033	Y	ANAPC16,SPOCK2	SPOCK2	NA	NA	NA	NA	SPOCK2	2665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	74327257	74327510	74327437	Y	DDIT4,DNAJB12	NA	NA	NA	NA	NA	MICU1	56389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	74917588	74917679	74917634	Y	NA	NUDT13,FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	8245	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	75253773	75253975	75253905	Y	NA	RP11-137L10.6	NA	NA	NA	NA	PPP3CB	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	75408900	75409185	75408963	Y	CAMK2G,TTC18,PPP3CB,USP54	AGAP5	NA	NA	NA	NA	AGAP5	46454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	76985148	76985510	76985329	Y	NA	VDAC2,COMTD1,HMGA1P5	NA	NA	NA	NA	COMTD1	8278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	77189888	77190112	77189953	Y	NA	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	30224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	77418041	77418318	77418185	Y	C10orf11	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF503	258377	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	78698062	78698447	78698255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	697906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	78753303	78753527	78753361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	642826	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	78790288	78790415	78790352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	605938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	78792238	78792506	78792372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	603847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	79002896	79003188	79003042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	393165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79006844	79007202	79006984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	389151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79098837	79098943	79098890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	297410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79261142	79261358	79261250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	134995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79284063	79284455	79284320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	111898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79311987	79312330	79312106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	84023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79313411	79313746	79313629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	82607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79383458	79383833	79383807	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	12520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79389440	79389814	79389806	Y	NA	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	6539	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79651191	79651354	79651229	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	33024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	80830818	80831199	80831077	Y	ZMIZ1	ZMIZ1	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	4026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	80981088	80981226	80981157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	123999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	81946319	81946704	81946639	Y	ANXA11	ANXA11	NA	NA	NA	NA	ANXA11	16624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	82224459	82224735	82224582	Y	NA	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	12537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	82237584	82237869	82237663	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	25662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	88160347	88160841	88160714	Y	OPN4,GRID1	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	36097	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	89519838	89520126	89519981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P1	55559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	90145688	90145942	90145819	Y	LIPK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-380G5.3	442429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr10	94367821	94367909	94367865	Y	CYP26C1,KIF11	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	16778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	94608884	94609046	94608952	Y	NA	EXOC6	NA	NA	NA	NA	EXOC6	19949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	97166659	97166942	97166773	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM1	117878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	97239155	97239567	97239500	Y	SORBS1,SORBS1	NA	NA	NA	NA	NA	SORBS1	79604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	97313430	97313789	97313690	Y	NA	SORBS1	NA	NA	NA	NA	SORBS1	5382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	97640254	97640658	97640438	Y	ENTPD1,ENTPD1	NA	NA	NA	NA	NA	CCNJ	160493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	98432353	98432529	98432425	Y	LCOR,PIK3AP1	PIK3AP1	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	45742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	98848414	98848738	98848576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT1	94939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	98947746	98947901	98947840	Y	NA	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	4069	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	98956083	98956405	98956104	Y	C10orf62	SLIT1	NA	NA	NA	NA	SLIT1	12406	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	101026177	101026506	101026344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNNM1	60350	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	102284995	102285353	102285150	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	1476	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	103662146	103662497	103662405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP2	60469	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	103877464	103877788	103877718	Y	MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1	LDB1,PPRC1,NOLC1	NA	NA	NA	NA	LDB1	422	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	104769429	104769711	104769602	Y	INA	NA	NT5C2	IMR90	Hi-C	24141950	CNNM2	93379	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	105452274	105452407	105452303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	160894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	106065731	106065880	106065781	Y	NA	MIR4482-1,GSTO2,ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	30282	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr10	106094943	106095283	106095247	Y	NA	ITPRIP,CCDC147-AS1	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	109673400	109673693	109673480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS1	751108	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	112051912	112052490	112052119	Y	ADD3,MXI1	SMNDC1	NA	NA	NA	NA	SMNDC1	10219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	112123790	112124003	112123953	Y	MXI1	NA	SMC3,DUSP5,RBM20	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	61081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	114693939	114693964	114693952	Y	NA	TCF7L2	TCF7L2,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	14045	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	116259358	116259612	116259525	Y	C10orf118,ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	183150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	116303427	116303555	116303470	Y	ABLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM1	139207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	117021659	117021668	117021663	Y	ATRNL1	NA	NA	NA	NA	NA	ATRNL1	170535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	118034123	118034494	118034359	Y	GFRA1,GFRA1,GFRA1	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf82	393281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	118500407	118500818	118500725	Y	NA	HSPA12A	NA	NA	NA	NA	HSPA12A	322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr10	118714609	118714623	118714617	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-539I5.1	106893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	118926007	118926147	118926067	Y	VAX1	KIAA1598,VAX1	NA	NA	NA	NA	VAX1	30195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	119021882	119022152	119021944	Y	NA	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	23278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	119028396	119028853	119028412	Y	SLC18A2	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	SLC18A2	29792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	119293077	119293204	119293150	Y	NA	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2	6751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	119300827	119301053	119300919	Y	VAX1,EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2	872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	119305717	119306203	119305928	Y	EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	3138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A,LINC00867	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	121065390	121065964	121065436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	100289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	123900798	123900950	123900924	Y	TACC2	NA	NA	NA	NA	NA	NSMCE4A	168066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	123923874	123924133	123924069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSMCE4A	191142	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	125409553	125409565	125409559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	441641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	126251501	126251899	126251725	Y	METTL10	NA	NA	NA	NA	NA	LHPP	103098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	126386863	126386994	126386934	Y	FAM53B	FAM53B	NA	NA	NA	NA	FAM53B	43844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	126717665	126717735	126717700	Y	NA	NA	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-298J20.4	113953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	126773443	126773862	126773517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	73877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	128592998	128593177	128593088	Y	NA	DOCK1	NA	NA	NA	NA	DOCK1	1020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	128995351	128995518	128995467	Y	NA	FAM196A	NA	NA	NA	NA	FAM196A	2929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	129851192	129851341	129851267	Y	PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	71308	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	130440713	130441095	130440908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	518064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	131644019	131644215	131644117	Y	EBF3	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	115890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	131669190	131669455	131669323	Y	EBF3	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	90650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	131758339	131758817	131758766	Y	EBF3	EBF3	NA	NA	NA	NA	EBF3	1288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	132886948	132887038	132886980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCERG1L	220946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	134212658	134212854	134212750	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	3986	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr10	134221496	134221692	134221620	Y	PWWP2B	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	8895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	134225356	134225596	134225555	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	RP11-432J24.2	4991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr10	134235789	134236113	134236058	Y	NA	PWWP2B,RP11-432J24.2,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-432J24.2	5202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	RP11-432J24.2,C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr10	134361912	134362323	134362096	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	12588	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	134549634	134549842	134549793	Y	KNDC1,GPR123,NKX6-2	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	200310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	135191872	135192182	135191943	Y	NA	CALY,PRAP1,ECHS1,PAOX,MTG1	NA	NA	NA	NA	PAOX	1177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr10	135342737	135342867	135342819	Y	KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1	NA	NA	NA	NA	NA	MTG1	137139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	629192	629570	629436	Y	IRF7,IRF7,SCT,DRD4	IRF7,DRD4	NA	NA	NA	NA	DRD4	5723	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	655302	655449	655380	Y	SIRT3,NLRP6,CDHR5,CHID1	IRF7,DRD4,EPS8L2,TMEM80,DEAF1	NA	NA	NA	NA	DRD4	20009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1320394	1320580	1320544	Y	DUSP8,TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	8304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1331682	1331784	1331733	Y	NA	TOLLIP	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	2798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1357863	1358286	1357997	Y	TOLLIP,BRSK2	TOLLIP	TOLLIP,LOC255512	K562	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	28979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1404202	1404317	1404259	Y	IFITM10,DUSP8	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	1404403	1404794	1404637	Y	DUSP8,BRSK2	BRSK2	TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BRSK2	4335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	1412454	1412793	1412702	Y	NA	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	3325	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1568333	1568421	1568379	Y	BRSK2,KRTAP5-3,DUSP8	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	22729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	1595832	1596187	1595959	Y	NA	DUSP8	NA	NA	NA	NA	DUSP8	4682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	1773349	1773482	1773395	Y	IFITM10	CTSD	NA	NA	NA	NA	CTSD	9740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	2200082	2200579	2200535	Y	SYT8,ASCL2,IGF2,TH	IGF2	NA	NA	NA	NA	IGF2	31249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	2223798	2223980	2223871	Y	ASCL2	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2	54965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	3077664	3078057	3077925	Y	NA	CARS	NAP1L4	K562	ChIA-PET	22265404	CARS	821	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	3636003	3636160	3636055	Y	RHOG,NUP98	ART5	NA	NA	NA	NA	ART5	25386	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	3831146	3831197	3831172	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1	NA	NA	NA	NA	NUP98	14124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	4129900	4130200	4130091	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,C11orf40,OR52I1	RRM1	NA	NA	NA	NA	RRM1	15963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	5953770	5953923	5953776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	300018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	6224718	6224948	6224898	Y	TPP1,FAM160A2	FAM160A2	NA	NA	NA	NA	FAM160A2	28993	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	6667820	6668268	6668018	Y	OR6A2,DCHS1	RRP8,ILK,TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	6817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	6676048	6676412	6676073	Y	OR52W1,APBB1,APBB1,TRIM3,OR2D2,OR2D3,ZNF214,DCHS1	TAF10,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	6699628	6699937	6699850	Y	OR52W1,OR10A4,OR10A2,OR6A2,OR2AG1,OR2AG2	DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	2695	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	LMO1	NA	NA	NA	NA	LMO1	14110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	9185386	9185638	9185566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND5A	99299	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	9422844	9423055	9422950	Y	NRIP3,IPO7	IPO7,SNORA23	NA	NA	NA	NA	IPO7	18675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	9824167	9824574	9824403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SWAP70	140543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	10373965	10374241	10374089	Y	LYVE1,EIF4G2	ADM	SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104	IMR90	Hi-C	24141950	ADM	49738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	10735359	10735758	10735614	Y	AMPD3	CTR9	MRVI1,MRVI1-AS1,RNF141,AMPD3,MTRNR2L8,LYVE1	IMR90	Hi-C	24141950	CTR9	34776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	10862862	10862982	10862965	Y	NA	SNORD97,EIF4G2,ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	15361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	10955665	10956051	10955935	Y	NA	NA	EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZBED5	77322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	11547720	11547907	11547841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP47	313063	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	12352954	12352993	12352974	Y	NA	PARVA	NA	NA	NA	NA	PARVA	43739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	12701917	12702070	12702017	Y	TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	7948	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	12824175	12824668	12824395	Y	TEAD1	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	130206	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	12875265	12875499	12875382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF10	153197	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	13299973	13300299	13300022	Y	FAR1,ARNTL	ARNTL	NA	NA	NA	NA	ARNTL	3774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	15219194	15219222	15219209	Y	INSC	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	307396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	16121256	16121272	16121264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	511407	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	16357706	16357868	16357787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	274811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	KCNJ11	NA	NA	NA	NA	KCNJ11	33178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	18649925	18650050	18650045	Y	NA	UEVLD,SPTY2D1	NA	NA	NA	NA	SPTY2D1	4288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	22362163	22362363	22362263	Y	FANCF,SLC17A6	SLC17A6	NA	NA	NA	NA	SLC17A6	4520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	23142638	23142950	23142794	Y	FANCF	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	292793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	24953714	24954095	24953889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP2	437198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr11	25098156	25098313	25098276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP2	581640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	26589813	26589954	26589884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO3	380984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	26610693	26610982	26610833	Y	ANO3,BBOX1	NA	NA	NA	NA	NA	ANO3	401864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	27231187	27231325	27231258	Y	NA	NA	LIN7C,LGR4,CCDC34,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	152090	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	28128920	28129110	28128941	Y	METTL15	METTL15,KIF18A	NA	NA	NA	NA	KIF18A	1065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr11	28831581	28831914	28831617	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	703726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	30494476	30494761	30494619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	111658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	30510063	30510254	30510126	Y	FSHB,MPPED2,MPPED2	NA	NA	NA	NA	NA	MPPED2	96165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	33209856	33210115	33209986	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	27939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	33668919	33669067	33668993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD59	86924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	35341087	35341212	35341143	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A2	98398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	35840381	35840713	35840619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	122818	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	35940908	35941215	35941096	Y	NA	LDLRAD3	LDLRAD3,PAMR1,TRIM44	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAD3	22316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	35966511	35966551	35966528	Y	NA	LDLRAD3	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	2980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	36132577	36133046	36132774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDLRAD3	169046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	37350813	37350846	37350830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf74	736762	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	41471316	41471693	41471422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	86291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	43360196	43360553	43360375	Y	TTC17	API5,TTC17	NA	NA	NA	NA	TTC17	17929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	44221715	44221986	44221792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT2	106616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	44563619	44563844	44563718	Y	TSPAN18	CD82	EXT2,ACCS,ALX4,CD82,TSPAN18,PRDM11,SYT13	IMR90	Hi-C	24141950	CD82	20133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	44613702	44614051	44613788	Y	CD82	CD82	NA	NA	NA	NA	CD82	29725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	44749241	44749630	44749607	Y	TSPAN18	TSPAN18	PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN18	3226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	44963197	44963482	44963283	Y	NA	TP53I11	NA	NA	NA	NA	TP53I11	7358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT13	103265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.32189234517237
chr11	45922261	45922718	45922513	Y	DGKZ,MAPK8IP1	MAPK8IP1,PEX16,GYLTL1B	NA	NA	NA	NA	PEX16	15645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	46410888	46411787	46411136	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	10582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	46412719	46412930	46412758	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	12413	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	46619183	46619437	46619308	Y	NA	AMBRA1,ATG13,HARBI1	AMBRA1	K562	ChIA-PET	22265404	AMBRA1	5508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	47108178	47108230	47108204	Y	HARBI1	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	88446	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	48288329	48288346	48288338	Y	OR4C45,OR4B1,OR4X2,OR4X1,OR4C3,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	288216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	ZFP91	3013	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	59537612	59537828	59537719	Y	PATL1,STX3	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	38517	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	59735602	59735886	59735724	Y	MRPL16	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL16	159257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	4484	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	61463458	61463769	61463630	Y	CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	17553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61565191	61565522	61565357	Y	NA	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS2	6739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	62143612	62143665	62143638	Y	NA	ASRGL1	NA	NA	NA	NA	ASRGL1	40692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	ASRGL1	108706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	AHNAK	10314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	62625165	62625549	62625272	Y	TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2	STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	3647	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63370762	63370914	63370825	Y	RTN3,PLA2G16,PLA2G16	PLA2G16	NA	NA	NA	NA	PLA2G16	11441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63685258	63686079	63685609	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	2942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.1212506988074
chr11	63686695	63687182	63686923	Y	NA	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	4379	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr11	63687620	63687907	63687858	Y	LGALS12,RCOR2	RCOR2,NAA40	NA	NA	NA	NA	RCOR2	5304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63705603	63705837	63705685	Y	NA	RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NAA40	1172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	63744435	63744483	63744459	Y	KCNK4	NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	AP000721.4	4343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1,RP11-21A7A.2	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	5221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-21A7A.2	57125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	64102702	64102834	64102750	Y	NA	ESRRA,TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	PRDX5	19142	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	64140304	64140795	64140552	Y	RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	15684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr11	64238125	64238462	64238294	Y	NA	NA	NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,MAP4K2,SF1,EHD1	IMR90,H1ESC,HELA,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	RPS6KA4	113505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	65075657	65076292	65075967	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	3997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	65184888	65185395	65184991	Y	FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	2850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	65254949	65255610	65255242	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	7623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	12.3186841133475
chr11	65333490	65333816	65333671	Y	SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3	NA	NA	NA	NA	SSSCA1	2085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	FIBP,CCDC85B,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	66047866	66048291	66048031	Y	NA	KLC2,RAB1B,CNIH2,YIF1A,TMEM151A,CD248	NA	NA	NA	NA	CNIH2	4205	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	66118604	66119022	66118907	Y	NA	CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8,SLC29A2,RNU1-84P	NA	NA	NA	NA	RP11-867G23.8	5183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	66185542	66185902	66185739	Y	NA	SLC29A2,RNU1-84P,NPAS4,MRPL11,PELI3	NA	NA	NA	NA	NPAS4	573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	66487767	66487982	66487867	Y	NA	RBM4B,SPTBN2,C11orf80	NA	NA	NA	NA	SPTBN2	6715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	SPTBN2,C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SPTBN2	83	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr11	66511038	66511198	66511076	Y	KLC2,KLC2,KLC2,CNIH2,RBM4B,SPTBN2	SPTBN2,C11orf80	NA	NA	NA	NA	C11orf80	1116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	66632141	66632247	66632177	Y	PELI3,SPTBN2	RCE1,LRFN4	NA	NA	NA	NA	LRFN4	10023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	66882341	66882514	66882428	Y	NA	KDM2A	SYT12,KDM2A,SSH3,PC,RHOD,C11orf80	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KDM2A	2226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	68238826	68238975	68238901	Y	TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3	PPP6R3	NA	NA	NA	NA	PPP6R3	12640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	35576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	72426186	72426236	72426211	Y	ATG16L2,ARAP1	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	42551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	72808468	72808618	72808564	Y	NA	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	42688	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	72953792	72954055	72953924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	63279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	73134039	73134350	73134132	Y	RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	48730	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	73240043	73240049	73240046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	67185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	75945169	75945568	75945242	Y	NA	NA	C11orf30,MAP6,UVRAG,WNT11,PRKRIR,GUCY2E,DGAT2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRKRIR	144447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	76510532	76510646	76510589	Y	NA	TSKU,RP11-21L23.3	NA	NA	NA	NA	RP11-21L23.3	18426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	77156016	77156186	77156101	Y	PAK1	PAK1	NA	NA	NA	NA	PAK1	27494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	77958364	77958560	77958462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	60496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	78073883	78074276	78074154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	53118	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	78517286	78517620	78517422	Y	GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	233367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	78539766	78540079	78540009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	255847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	78993859	78994112	78994035	Y	ODZ4	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	709940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	79093983	79094278	79094131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	810064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	79117451	79117736	79117547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	833532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	79742394	79742706	79742544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1458475	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	79794635	79795000	79794859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	1510716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	82781050	82781223	82781203	Y	NA	RAB30	NA	NA	NA	NA	RAB30	85	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	85047149	85047448	85047300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	290181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	85419491	85419865	85419792	Y	SYTL2	CREBZF	NA	NA	NA	NA	CREBZF	27540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	85491016	85491055	85491036	Y	SYTL2,SYTL2,SYTL2	SYTL2	NA	NA	NA	NA	SYTL2	29129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	85757330	85757451	85757391	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	21473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	85854221	85854449	85854330	Y	PICALM	NA	PICALM,EED	IMR90	Hi-C	24141950	PICALM	75297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86025840	86026030	86025935	Y	NA	C11orf73	NA	NA	NA	NA	C11orf73	14587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86195168	86195425	86195393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf73	183915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86343883	86344000	86343960	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	37678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86381936	86382132	86382071	Y	NA	ME3	NA	NA	NA	NA	ME3	258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86514557	86514754	86514624	Y	NA	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	14456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	87067687	87067836	87067698	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	320801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	87871692	87871803	87871780	Y	NA	RAB38	NA	NA	NA	NA	RAB38	34832	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	88276753	88276819	88276788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	207798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	88340070	88340128	88340099	Y	GRM5	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	271115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	88447557	88447832	88447814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	378602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	91527340	91527674	91527438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	1401456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	91958948	91959142	91959077	Y	FAT3	NA	FAT3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	969988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	91979590	91979911	91979751	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	949219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	91980380	91980674	91980445	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	948456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	92083144	92083535	92083339	Y	FAT3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	845595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	92194935	92195280	92195108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC36A4	733850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	92767972	92767992	92767983	Y	NA	NA	SLC36A4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC36A4	161138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	93343191	93343552	93343372	Y	NA	KIAA1731	NA	NA	NA	NA	KIAA1731	49253	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	42894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	94987550	94987767	94987639	Y	NA	SESN3	NA	NA	NA	NA	SESN3	23845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	95525355	95525734	95525518	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	3782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	95808686	95809082	95808927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	152207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	95901866	95902123	95902033	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	172221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	96579211	96579589	96579400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JRKL	458058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	99734583	99734830	99734707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	821554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	103742967	103742991	103742981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	464582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	104917614	104917898	104917725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASP4	79451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	105516722	105517118	105516920	Y	GRIA4,GRIA4,KIAA1826	GRIA4	NA	NA	NA	NA	GRIA4	38001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	105579191	105579256	105579211	Y	KBTBD3,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA4	100470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	105674568	105674985	105674652	Y	KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826	RNU4-55P	NA	NA	NA	NA	RNU4-55P	18375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr11	106491098	106491425	106491260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUCY1A2	395825	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	107671635	107671653	107671644	Y	ACAT1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	105493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	107727726	107727971	107727842	Y	NA	RP11-832N8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-832N8.1	49175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	110002516	110002895	110002708	Y	RDX	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	40429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr11	110581726	110581943	110581819	Y	ARHGAP20	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP20	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	111191582	111191686	111191634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU2AF1	132669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	111195136	111195460	111195333	Y	C11orf93	NA	NA	NA	NA	NA	POU2AF1	128895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	111298171	111298543	111298378	Y	POU2AF1,FDXACB1	POU2AF1	POU2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	POU2AF1	25812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	111307551	111307700	111307641	Y	POU2AF1	POU2AF1	LAYN,C11orf53,C11orf92,LOC100132078,ALG9,FDX1,ARHGAP20	IMR90	Hi-C	24141950	POU2AF1	16655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr11	111560054	111560414	111560322	Y	NA	NA	PPP2R1B	IMR90	Hi-C	24141950	PPP2R1B	74737	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	112016607	112016779	112016693	Y	DIXDC1	NA	NA	NA	NA	NA	SDHD	60980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr11	112839963	112840314	112840138	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	9966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	112842081	112842529	112842265	Y	NA	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	12084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	112941331	112941794	112941502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	111334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	113020811	113021147	113020979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM1	190814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	17089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	114312879	114313299	114312892	Y	NA	RBM7,C11orf71,REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	4771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	115345794	115346124	115345959	Y	NA	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	27551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	115360673	115361056	115361024	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	12619	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	116722234	116722744	116722542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APOA5	61098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	117406578	117406797	117406688	Y	FXYD6,FXYD6,DSCAML1	NA	NA	NA	NA	NA	BACE1	221603	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	117565853	117566051	117566030	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSCAML1	120189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	117844226	117844440	117844276	Y	IL10RA	IL10RA	DSCAML1,FXYD6-FXYD2,TMPRSS13,IL10RA,LOC100526771	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL10RA	10623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	117889009	117889463	117889284	Y	IL10RA	IL10RA	NA	NA	NA	NA	IL10RA	33946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	118493108	118493651	118493460	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	17953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	30812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	10939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119239128	119239276	119239217	Y	NA	MCAM,RNF26,USP2,USP2-AS1	NA	NA	NA	NA	USP2	11160	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119377463	119377481	119377472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THY1	83768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	119554350	119554716	119554654	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	43078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119564027	119564313	119564171	Y	TRIM29,PVRL1	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	33481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119595869	119596204	119596037	Y	NA	PVRL1	NA	NA	NA	NA	PVRL1	1590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	119612950	119613345	119613188	Y	NA	PVRL1	PVRL1,TRIM29	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	15156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	121107211	121107513	121107369	Y	SC5DL,SC5DL	NA	SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	213399	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	121199399	121199704	121199552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	121208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	121337416	121337512	121337466	Y	NA	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	16504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	121593077	121593718	121593342	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1	IMR90	Hi-C	24141950	SORL1	272165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	122059856	122060218	122060121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	464165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	123013120	123013348	123013342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	81182	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	123353850	123354009	123353930	Y	NA	GRAMD1B	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD1B	40335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	123381868	123382248	123382089	Y	SCN3B,GRAMD1B	GRAMD1B	GRAMD1B	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD1B	12096	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	123414630	123415056	123414666	Y	NA	GRAMD1B	NA	NA	NA	NA	GRAMD1B	20286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	123513712	123514126	123514044	Y	NA	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	9826	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	123519920	123520232	123520133	Y	OR8D4,SCN3B	SCN3B	NA	NA	NA	NA	SCN3B	3720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	123605051	123605192	123605122	Y	NA	ZNF202,RNU1-21P	NA	NA	NA	NA	ZNF202	5191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	125985079	125985242	125985162	Y	CDON,ST3GAL4	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	53849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	125985923	125986168	125986013	Y	NA	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	54693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr11	125997963	125998111	125998066	Y	NA	NA	CDON	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	66733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	126449480	126449697	126449589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	225945	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	126790922	126791265	126791130	Y	KIRREL3	KIRREL3-AS2	NA	NA	NA	NA	KIRREL3-AS2	17377	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	126838913	126839134	126839118	Y	KIRREL3	KIRREL3-AS2,KIRREL3	NA	NA	NA	NA	KIRREL3-AS2	30271	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128172320	128172993	128172659	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	ETS1,FLI1,KCNJ1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	282460	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128346619	128346923	128346838	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	108530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	128352415	128352744	128352497	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	102709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128374504	128374665	128374585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	80788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128387749	128388099	128387998	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	67354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128422991	128423282	128423121	Y	ETS1	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	32171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	128773699	128773839	128773753	Y	KCNJ5,C11orf45	KCNJ5,TP53AIP1	NA	NA	NA	NA	KCNJ5	14448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	129013172	129013631	129013445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53AIP1	202132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	129244480	129244782	129244484	Y	NA	BARX2	NA	NA	NA	NA	BARX2	645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	129871629	129871941	129871631	Y	NA	PRDM10,TCEB2P2	NA	NA	NA	NA	PRDM10	899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	129942098	129942391	129942179	Y	PRDM10	TCEB2P2,APLP2	NA	NA	NA	NA	APLP2	4366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	130479003	130479154	130479069	Y	ADAMTS15	NA	ADAMTS15,SNX19	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB44	296422	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	130767627	130768066	130767878	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	133429641	133429673	133429657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	395207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr11	133804654	133804943	133804849	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	19937	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	133814977	133815479	133815368	Y	NCAPD3,IGSF9B	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	9401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	133825450	133825979	133825755	Y	NA	IGSF9B	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr11	133903772	133904156	133904071	Y	NA	RP11-713P17.3,JAM3	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	3605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr11	134159588	134159830	134159708	Y	NA	THYN1,ACAD8,GLB1L3,GLB1L2	NA	NA	NA	NA	GLB1L3	17449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	298364	298488	298415	Y	IQSEC3	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC3	124433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	574296	574697	574406	Y	B4GALNT3	B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	6766	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	647081	647236	647154	Y	ERC1,SLC6A12,SLC6A12,B4GALNT3	NA	NA	NA	NA	NA	B4GALNT3	79551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	685193	685500	685436	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	52557	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	723643	724040	723947	Y	NA	RP11-218M22.1,NINJ2	NA	NA	NA	NA	RP11-218M22.1	14017	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	794631	794815	794739	Y	CCDC77,KDM5A	NINJ2	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90	Hi-C	24141950	NINJ2	23686	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	860254	860664	860544	Y	RAD52,NINJ2,WNK1	WNK1	NA	NA	NA	NA	WNK1	495	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	1407863	1408257	1407945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	228800	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	1511133	1511360	1511261	Y	ERC1	NA	NA	NA	NA	NA	WNT5B	125697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	1583254	1583583	1583419	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	53474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	1951658	1951835	1951754	Y	NA	LRTM2	NA	NA	NA	NA	LRTM2	24225	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	DCP1B	32576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2161154	2161552	2161208	Y	LRTM2	DCP1B	NA	NA	NA	NA	DCP1B	49453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2364427	2364812	2364581	Y	LRTM2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	252726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2393331	2393479	2393338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	281630	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	2401865	2402116	2401991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	290164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2403977	2404382	2404036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	292276	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBX3P4	151445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	3313495	3313728	3313584	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	5368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	3340124	3340182	3340154	Y	NRIP2	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	21028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	3450642	3450947	3450795	Y	NA	PRMT8	PRMT8,EFCAB4B	IMR90	Hi-C	24141950	PRMT8	37568	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	4313058	4313407	4313227	Y	CCND2	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	CCND2	67531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	4666420	4666590	4666540	Y	NA	C12orf4,RAD51AP1,DYRK4	NA	NA	NA	NA	DYRK4	2780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	4758958	4759134	4759102	Y	NA	AKAP3,NDUFA9	NA	NA	NA	NA	NDUFA9	2697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	4880425	4880454	4880440	Y	NA	KCNA6	NA	NA	NA	NA	KCNA6	35888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	4935579	4936010	4935701	Y	KCNA1,KCNA6	KCNA6	NA	NA	NA	NA	KCNA6	19237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	5542952	5543350	5543174	Y	NTF3,NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	3674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	5566178	5566568	5566311	Y	NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	26900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	5589537	5589706	5589616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTF3	50259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	6105913	6105932	6105923	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	52515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	6250118	6250545	6250361	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL,IFFO1,CHD4	NA	VWF,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	56336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	6454526	6454970	6454793	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,LTBR,SCNN1A	NA	NA	NA	NA	LTBR	27241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	6482550	6482923	6482687	Y	SCNN1A,SCNN1A	LTBR,SCNN1A	TNFRSF1A	K562	ChIA-PET	22265404	LTBR	339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr12	6622889	6622901	6622895	Y	NA	VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH	NA	NA	NA	NA	SCARNA10	5501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr12	6873427	6873901	6873603	Y	C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162	COPS7A,PTMS,MLF2	LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5	IMR90	Hi-C	24141950	MLF2	740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr12	7040569	7040832	7040702	Y	NA	SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2	NA	NA	NA	NA	ATN1	8943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	7100414	7100432	7100423	Y	NA	RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	PHB2	22426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	LPCAT3	19454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	CD163L1	NA	NA	NA	NA	CD163L1	37696	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	8119309	8119505	8119404	Y	CLEC6A,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	NA	SLC2A3,FOXJ2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FOXJ2	63794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	9065319	9065715	9065510	Y	PHC1	PHC1,M6PR	M6PR	IMR90	Hi-C	24141950	PHC1	827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11043114	11043456	11043318	Y	TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13	NA	NA	NA	NA	NA	TAS2R14	278716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11838255	11838510	11838381	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	37467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11864651	11864937	11864724	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	63863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11884596	11884909	11884601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	83808	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	12512304	12512319	12512312	Y	NA	MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	4291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	12592534	12593034	12592768	Y	BCL2L14,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	NA	LOH12CR1	84521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	GPR19,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	GPR19,CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	13213632	13213789	13213702	Y	DUSP16	KIAA1467	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	18414	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	13247337	13247745	13247512	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	52119	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr12	15315937	15316391	15316153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRO	156940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	15409824	15410065	15409954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRO	63266	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	15724023	15724144	15724072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-6K23.1	133562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	15916950	15917280	15917185	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	115983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	19932429	19932596	19932501	Y	NA	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	57060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	20069508	20069793	20069676	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-146P	194139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	20076637	20076989	20076813	Y	PDE3A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-146P	201268	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	21666002	21666378	21666190	Y	NA	RECQL,GOLT1B,C12orf39	NA	NA	NA	NA	C12orf39	10863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	24414416	24414645	24414531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	298879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	RP11-444D3.1	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	39718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	24856555	24856996	24856898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-444D3.1	143031	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.35300707783043
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	26663094	26663473	26663334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	320658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	27031783	27031911	27031851	Y	ITPR2	ITPR2	ITPR2	IMR90	Hi-C	24141950	ITPR2	47652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	27532512	27532752	27532665	Y	C12orf71	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	48725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	27678028	27678417	27678221	Y	C12orf71	PPFIBP1	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	3664	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	28501330	28501622	28501413	Y	NA	RNU4-54P	NA	NA	NA	NA	RNU4-54P	30934	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	29089199	29089257	29089228	Y	NA	NA	KLHDC5	IMR90	Hi-C	24141950	FAR2	210779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	29489399	29489493	29489486	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	42629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	31804886	31805136	31805063	Y	NA	METTL20	NA	NA	NA	NA	METTL20	6792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.67489942300279
chr12	31902136	31902566	31902240	Y	C12orf35,AMN1,H3F3C	AMN1,H3F3C	AMN1	K562	ChIA-PET	22265404	AMN1	22028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	31972530	31972632	31972576	Y	NA	H3F3C	NA	NA	NA	NA	H3F3C	29355	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	38493611	38493806	38493706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG10B	214574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	39800065	39800203	39800134	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	34989	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	41680022	41680168	41680092	Y	PDZRN4	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN1	595778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	42537125	42537342	42537234	Y	NA	GXYLT1	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	42984702	42985091	42984897	Y	GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	2545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	44522730	44522871	44522801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM117	294960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	45241724	45241928	45241862	Y	DBX2,NELL2,NELL2,NELL2	NA	NA	NA	NA	NA	NELL2	71703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	46381876	46382270	46382256	Y	SLC38A2,SCAF11	SCAF11	NA	NA	NA	NA	SCAF11	1633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	46609835	46610258	46610179	Y	ARID2,SCAF11,SLC38A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	51542	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	46886273	46886657	46886465	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	110811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	48202856	48203019	48202950	Y	VDR,ASB8	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	21896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	49592771	49592915	49592838	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1B,PRPH,TUBA1A,TUBA1C,LMBR1L,DHH	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TUBA1A	11664	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	49595765	49596022	49595888	Y	LMBR1L	TUBA1C,TUBA1A	TUBA1A,TUBA1B	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TUBA1A	14658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	49626851	49627096	49626872	Y	NA	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	45744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr12	49822830	49822961	49822896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2	64463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	49972592	49972801	49972676	Y	NA	KCNH3,MCRS1,PRPF40B	MCRS1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRPF40B	12591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	50056796	50057319	50056974	Y	TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3	TMBIM6,FMNL3	NA	NA	NA	NA	TMBIM6	42189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	50900445	50901076	50900765	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	3677	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	50926707	50927114	50926974	Y	NA	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	29939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	51762689	51763227	51762914	Y	SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6,BIN2	SLC4A8,GALNT6	BIN2,CELA1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A8	19874	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52262826	52263308	52263216	Y	NA	ANKRD33	SCN8A,ACVR1B,SLC4A8	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33	16436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr12	52423514	52423824	52423679	Y	NA	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	NR4A1	8898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44,OR7E47P	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52512288	52512603	52512469	Y	NR4A1	OR7E47P	GRASP,NR4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OR7E47P	40808	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52542210	52542726	52542513	Y	KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	41058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr12	52545730	52546132	52545994	Y	KRT6A,C12orf44	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	37652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52594001	52594417	52594311	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	10217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	40230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	52915277	52915747	52915499	Y	C12orf44	KRT5	NA	NA	NA	NA	KRT5	2806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	53264136	53264576	53264217	Y	PFDN5	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	76079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	53270322	53270511	53270351	Y	RARG,KRT84,KRT6C,KRT6A,KRT5,KRT2,KRT1,KRT76,KRT3,KRT4,KRT78	NA	EIF4B,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	70144	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	53288883	53289427	53289224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	51228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	53301815	53302147	53302072	Y	KRT1,KRT76,KRT8	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	38508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	53795240	53795255	53795248	Y	ATP5G2,ATF7	SP1,PRR13,PCBP2	NA	NA	NA	NA	SP1	23280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54090300	54090537	54090319	Y	NA	ATP5G2,CALCOCO1	NA	NA	NA	NA	ATP5G2	21108	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr12	54372759	54373189	54372957	Y	HOXC13,HOXC12,HOXC11,HOXC10	HOXC13,HOXC12,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1	NA	NA	NA	NA	HOXC10	3660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	54391907	54392298	54392098	Y	ATP5G2,HOXC8,HOXC6,HOXC4,HOXC12,HOXC10,HOXC9	HOXC12,HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54400493	54400742	54400596	Y	HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC6,HOXC4	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC-AS1	8699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	12047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr12	54413878	54414161	54414065	Y	HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5	HOXC10,HOXC-AS3,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS2,HOXC-AS1,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC5	10476	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54610103	54610277	54610187	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	29325	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54746110	54746353	54746239	Y	PDE1B,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	36729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	54752421	54752649	54752549	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	30433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	29198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr12	54770417	54770796	54770608	Y	NA	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	12286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	5713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	54787465	54787792	54787687	Y	NCKAP1L,ITGA5,GPR84,ZNF385A	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	4383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	54804400	54804529	54804465	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	21318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF385A	27214	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	54815757	54815842	54815802	Y	GPR84,ZNF385A,ITGA5,NCKAP1L	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF385A	32675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	55374133	55374377	55374316	Y	NA	NEUROD4	NA	NA	NA	NA	NEUROD4	37352	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	55808460	55808880	55808766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S1	298940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	56147551	56147694	56147624	Y	NA	BLOC1S1,RP11-644F5.11,CD63,GDF11	NA	NA	NA	NA	GDF11	12487	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	56219844	56220081	56219962	Y	OR6C3	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	1448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	56238868	56238998	56238933	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	DNAJC14	16260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	57746067	57746152	57746110	Y	NA	NA	R3HDM2,INHBE,ARHGAP9,GLI1	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	76636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	57764553	57764898	57764725	Y	NA	NA	INHBC,R3HDM2,ARHGAP9	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	57890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	57813803	57814254	57814252	Y	NA	R3HDM2	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	8534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	58262646	58262949	58262748	Y	KIF5A,DTX3,ARHGEF25,B4GALNT1,AVIL	RP11-620J15.1,CTDSP2	CTDSP2	K562	ChIA-PET	22265404	CTDSP2	24124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr12	58283417	58283685	58283602	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,CTDSP2	CTDSP2,XRCC6BP1	CTDSP2,TSFM,AVIL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTDSP2	44895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	58337769	58337952	58337777	Y	NA	XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	4445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	62525889	62526278	62526197	Y	MON2,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	NA	USP15	125841	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	62650628	62651393	62650813	Y	C12orf61,USP15	USP15,FAM19A2	NA	NA	NA	NA	USP15	726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	62970708	62971108	62970733	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	23424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	30739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	63051832	63051994	63051914	Y	MON2,PPM1H	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	57300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	63091878	63091979	63091882	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	97346	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	64414724	64414736	64414730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	178651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	65076423	65076649	65076481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	74130	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	65093624	65093852	65093697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNS	57375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-745O10.2	479210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3	NA	NA	NA	NA	IRAK3	47633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	67274459	67274765	67274734	Y	GRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	186177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	67362694	67363196	67363004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	97746	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	67411263	67411633	67411591	Y	NA	RP11-123O10.4	NA	NA	NA	NA	RP11-123O10.4	49309	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69019747	69019936	69019838	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	14837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69220588	69221011	69220784	Y	NA	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	20632	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69593360	69593487	69593424	Y	NA	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	37830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	69797421	69797731	69797518	Y	NA	YEATS4	NA	NA	NA	NA	YEATS4	45938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	70081797	70082155	70082063	Y	NA	BEST3,RAB3IP	NA	NA	NA	NA	BEST3	9101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	70626158	70626373	70626266	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	8401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	75902459	75902855	75902619	Y	KRR1	KRR1	NA	NA	NA	NA	KRR1	561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	75955852	75956146	75955999	Y	NA	NA	OSBPL8,PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	52436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	76026406	76026738	76026572	Y	NA	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRR1	122990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	76045179	76045405	76045348	Y	PHLDA1	NA	PHLDA1,NAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	KRR1	141763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	76206207	76206725	76206399	Y	GLIPR1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	218987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	76429051	76429248	76429150	Y	NA	PHLDA1,NAP1L1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	3339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	76811286	76811641	76811626	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS10	71064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	77056574	77056895	77056735	Y	NA	NA	ZDHHC17,CSRP2	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC17	98473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	77166025	77166335	77166180	Y	NA	ZDHHC17	NA	NA	NA	NA	ZDHHC17	10657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	77251083	77251471	77251277	Y	NA	CSRP2	NA	NA	NA	NA	CSRP2	19369	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	77377580	77377874	77377727	Y	NA	NA	ZDHHC17	IMR90	Hi-C	24141950	E2F7	79486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	77425555	77425931	77425698	Y	OSBPL8	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	31429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	78134909	78135174	78135084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-34H18.1	418488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	79362065	79362430	79362066	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	SYT1	106292	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	79817704	79817772	79817737	Y	SYT1	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	265105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	79918085	79918441	79918422	Y	NA	NA	SYT1	IMR90	Hi-C	24141950	PAWR	164436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	79994209	79994302	79994256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	88575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-84G21.1	106540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	80907201	80907494	80907379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244J10.1	412088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	81699995	81700341	81700187	Y	PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2,PPFIA2	NA	NA	NA	NA	NA	LIN7A	370291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	82343590	82343965	82343731	Y	CCDC59	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIA2	192258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	82468212	82468399	82468268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	282185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	82552778	82552989	82552884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC59	197595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	83461267	83461506	83461387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P25	81604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	85674653	85675022	85674864	Y	ALX1	ALX1	NA	NA	NA	NA	ALX1	2768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	88531496	88531830	88531623	Y	NA	CEP290,TMTC3	NA	NA	NA	NA	CEP290	2163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	88703962	88704349	88704186	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	169889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	89560213	89560727	89560437	Y	POC1B,DUSP6,ATP2B1	NA	POC1B,LOC728084	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP6	184321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	90494294	90494625	90494521	Y	NA	NA	C12orf37,ATP2B1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-654D12.2	219852	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	91775053	91775433	91775292	Y	NA	NA	LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DCN	200153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	92396640	92396647	92396644	Y	CLLU1,CLLU1OS	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	140702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	92500767	92501208	92501155	Y	NA	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	36141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	RP11-796E2.4,BTG1	NA	NA	NA	NA	RP11-796E2.4	18951	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	92836682	92836892	92836798	Y	EEA1,BTG1	NA	NA	NA	NA	NA	BTG1	299009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	93890331	93890756	93890540	Y	NA	MRPL42	NA	NA	NA	NA	MRPL42	31067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	94135673	94136306	94136137	Y	NUDT4,SOCS2	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	66522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	94696122	94696451	94696433	Y	PLXNC1,TMCC3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC41	155313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	95404686	95404921	95404803	Y	NA	NDUFA12	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	9140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	96627830	96628313	96628063	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	41670	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	98934224	98934627	98934333	Y	NA	TMPO,TMPO-AS1	NA	NA	NA	NA	TMPO-AS1	26024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	101074983	101075293	101074998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	104461	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	103358686	103358916	103358881	Y	NA	ASCL1	NA	NA	NA	NA	ASCL1	9222	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	103359249	103359470	103359411	Y	NA	ASCL1	NA	NA	NA	NA	ASCL1	9785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	36793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	105031434	105031802	105031612	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	184361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	105042709	105042954	105042777	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	195636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	105486221	105486404	105486313	Y	NA	KIAA1033	ALDH1L2,TXNRD1,KIAA1033	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1033	12698	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	105900072	105900358	105900257	Y	NA	NA	NUAK1	IMR90	Hi-C	24141950	APPL2	272056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	106529993	106530447	106530148	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	1364	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	106621316	106621679	106621542	Y	TCP11L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	72028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr12	108511265	108511472	108511371	Y	NA	WSCD2	NA	NA	NA	NA	WSCD2	9776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	109083720	109083964	109083780	Y	SSH1	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	39408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	109120887	109121218	109121134	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	2154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	109167575	109167781	109167683	Y	NA	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	44203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	109300500	109300763	109300632	Y	SVOP,DAO	NA	NA	NA	NA	NA	SVOP	156282	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	110567516	110567657	110567554	Y	NA	IFT81	NA	NA	NA	NA	IFT81	7376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	110931784	110931990	110931887	Y	NA	ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29	NA	NA	NA	NA	VPS29	5932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	111473237	111473713	111473408	Y	CUX2	CUX2	NA	NA	NA	NA	CUX2	3409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112534496	112534670	112534605	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	10156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	113502885	113503086	113502986	Y	DTX1	DTX1	NA	NA	NA	NA	DTX1	10371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	113667617	113667862	113667654	Y	DTX1,IQCD,TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	10718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	113903072	113903274	113903194	Y	NA	RP11-82C23.2,LHX5	NA	NA	NA	NA	RP11-82C23.2	4534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	113910690	113910929	113910810	Y	LHX5	RP11-82C23.2,LHX5	NA	NA	NA	NA	LHX5	2605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	113911337	113912000	113911521	Y	NA	RP11-82C23.2,LHX5	NA	NA	NA	NA	LHX5	3252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	113938595	113938989	113938796	Y	NA	RP11-82C23.2,LHX5	RBM19,DTX1	IMR90	Hi-C	24141950	LHX5	30510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	LHX5	121186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr12	114842378	114842779	114842612	Y	TBX5,TBX5,TBX5	NA	NA	NA	NA	NA	TBX3	277190	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	115105863	115106455	115106375	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	13514	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr12	115107232	115107509	115107392	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	12460	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	115124772	115125182	115125089	Y	TBX3	TBX3	NA	NA	NA	NA	TBX3	4803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	115865739	115865767	115865753	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	745770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	115889491	115890073	115889778	Y	NA	NA	TBX3	IMR90	Hi-C	24141950	TBX3	769522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	116864232	116864472	116864363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-148B3.1	89191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	117871849	117872390	117872076	Y	NOS1	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	245513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	118313927	118314150	118314016	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KSR2	90638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	118497859	118498236	118498048	Y	NA	RFC5	NA	NA	NA	NA	WSB2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	118626739	118626832	118626769	Y	KSR2	NA	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	VSIG10	54908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	118815733	118815925	118815736	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	SUDS3	3548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	119646482	119646796	119646670	Y	SRRM4,CCDC60,HSPB8	HSPB8	NA	NA	NA	NA	HSPB8	32035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	119824446	119824698	119824572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPB8	209999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr12	120445148	120445418	120445237	Y	CCDC64	NA	NA	NA	NA	NA	RAB35	107888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	120639993	120640274	120640078	Y	NA	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	2899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	120956227	120956384	120956265	Y	COQ5	RNF10,COQ5	NA	NA	NA	NA	RNF10	12899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	121038763	121038810	121038786	Y	CABP1,CABP1	POP5,RPL11P5	POP5	IMR90	Hi-C	24141950	RPL11P5	8412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	121839154	121839422	121839290	Y	C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	3310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	121951651	121951880	121951735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-941N14.1	64817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr12	122020670	122020879	122020764	Y	KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3750	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	123320749	123321200	123320858	Y	NA	HIP1R	NA	NA	NA	NA	HIP1R	3749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	123557906	123558430	123558039	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	74132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	123605358	123605647	123605454	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	MPHOSPH9,PITPNM2,OGFOD2,ABCB9,ARL6IP4,LOC100507091,VPS37B,C12orf65	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	26915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	123616405	123617083	123616761	Y	ABCB9,MPHOSPH9,C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	PITPNM2,ARL6IP4,ABCB9,OGFOD2,LOC100507091,MPHOSPH9	IMR90	Hi-C	24141950	PITPNM2	15479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	123627472	123627989	123627683	Y	C12orf65,C12orf65,C12orf65	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	4573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	123916939	123917399	123917200	Y	C12orf65,SBNO1,RILPL2	SNRNP35	NA	NA	NA	NA	SNRNP35	22789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	124486134	124486345	124486231	Y	NA	ZNF664,CCDC92	NA	NA	NA	NA	CCDC92	30756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC92	452167	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125003619	125003834	125003727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	361380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	125026162	125026505	125026332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	338709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125027797	125027993	125027883	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	337221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125050536	125050830	125050706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	314384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	313839	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr12	125160747	125161145	125161022	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	204069	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125171572	125171968	125171622	Y	NA	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	SCARB1	193246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125256511	125256612	125256543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCARB1	108602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125425237	125425455	125425374	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	25323	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	129089156	129089231	129089194	Y	TMEM132C	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	217297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	129301742	129302776	129302427	Y	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4,GLT1D1	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	3752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	129325536	129325762	129325610	Y	SLC15A4	SLC15A4,GLT1D1	SLC15A4	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLT1D1	10210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	129415293	129415562	129415333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLT1D1	79321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	129871586	129871714	129871650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLT1D1	535614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	130923831	130924224	130924207	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	274602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	131111744	131112133	131112105	Y	RIMBP2	NA	RIMBP2	IMR90	Hi-C	24141950	RIMBP2,RP11-662M24.2	86693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	131117194	131117823	131117569	Y	RIMBP2	NA	NA	NA	NA	NA	RIMBP2,RP11-662M24.2	81003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	131261153	131261348	131261240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	60463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	132315038	132315239	132315115	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4100	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr12	132315862	132315946	132315904	Y	MMP17	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	4924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	132558778	132559145	132558825	Y	NA	SNORA49,EP400NL	NA	NA	NA	NA	EP400NL	7683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	133005224	133005492	133005298	Y	NA	NA	P2RX2,GALNT9,POLE,LOC100507055,EP400NL,FBRSL1	IMR90	Hi-C	24141950	FBRSL1	58645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBRSL1	41181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr12	133065143	133065512	133065289	Y	NA	FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	1006	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr12	133069115	133069562	133069360	Y	ZNF26,FBRSL1	FBRSL1	NA	NA	NA	NA	FBRSL1	4978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	133528012	133528357	133528019	Y	NA	CHFR,ZNF605	NA	NA	NA	NA	CHFR	2533	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr12	133688468	133688629	133688567	Y	NA	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	16430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr12	133701272	133701384	133701332	Y	ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10	ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268	NA	NA	NA	NA	ZNF891	3675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	20284953	20285344	20285149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSPC1	69798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	22111458	22111566	22111512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC20	79949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	22242983	22243087	22242992	Y	NA	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	22243438	22243610	22243458	Y	FGF9	RPS7P10	NA	NA	NA	NA	FGF9	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	22249294	22249707	22249608	Y	FGF9	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	5772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr13	22249979	22250230	22250030	Y	NA	RPS7P10,FGF9	NA	NA	NA	NA	FGF9	6457	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	22793744	22794084	22793906	Y	NA	NA	FGF9	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P7	474629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	23485782	23486124	23485811	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	1666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NUS1P2	NA	NA	NA	NA	NUS1P2	12616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr13	23973487	23973793	23973652	Y	NA	SACS	NA	NA	NA	NA	SACS	32048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	24289001	24289462	24289192	Y	PCOTH	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	146492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	24423021	24423155	24423076	Y	NA	C1QTNF9B-AS1,MIPEP	NA	NA	NA	NA	C1QTNF9B-AS1	37873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	26118734	26119070	26118902	Y	FAM123A,ATP8A2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8A2	174525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr13	28167075	28167372	28167253	Y	NA	LNX2,POLR1D	NA	NA	NA	NA	LNX2	25169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	29393233	29393586	29393301	Y	MTUS2	NA	FLT3,PAN3,PAN3-AS1,FLT1,SLC46A3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC46A3	102126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	29460778	29461116	29460949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC46A3	169671	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	29638535	29638553	29638543	Y	MTUS2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	240362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	29700126	29700781	29700341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP69	178134	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	30808184	30808483	30808334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	59801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	31004513	31004723	31004587	Y	USPL1	NA	KATNAL1,LINC00426,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KATNAL1	124892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	31407198	31407336	31407268	Y	HSPH1	NA	USPL1	IMR90	Hi-C	24141950	USPL1	217368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	31585731	31585921	31585826	Y	NA	NA	USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPH1	148604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	31775014	31775311	31775185	Y	HSPH1	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	2941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	31783320	31783649	31783428	Y	C13orf26,B3GALTL	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	11247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	31783730	31783901	31783816	Y	NA	HSPH1,B3GALTL	NA	NA	NA	NA	B3GALTL	11657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	32433681	32434084	32433895	Y	NA	EEF1DP3	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	14703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	32620673	32620873	32620777	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2,FRY	FRY	NA	NA	NA	NA	FRY	17236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	33051019	33051050	33051035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	50704	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	33925449	33925669	33925575	Y	NA	STARD13	NA	NA	NA	NA	STARD13	2682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	193675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr13	34217614	34217741	34217660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	172445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	36648943	36649115	36648997	Y	DCLK1,CCNA1,C13orf38	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC169	220862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	37493371	37493714	37493499	Y	C13orf36,RFXAP,SMAD9	SMAD9,LAMTOR3P1	NA	NA	NA	NA	SMAD9	469	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr13	41627549	41627939	41627788	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	ELF1,MTRF1,NAA16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WBP4	5471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	42188044	42188379	42188211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	304703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	42979877	42980186	42980020	Y	TNFSF11,TNFSF11,AKAP11	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	135588	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	DNAJC15	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	37322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	43866757	43867095	43866777	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	271418	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	44740455	44740696	44740576	Y	NA	NA	TSC22D1,SERP2,LINC00284	IMR90	Hi-C	24141950	SERP2	205105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	44765408	44765809	44765737	Y	NA	NA	SERP2,TSC22D1,LINC00284	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	179992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	45745052	45745233	45745142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	52402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	45941510	45941762	45941695	Y	COG3,TPT1	TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30	NA	NA	NA	NA	TPT1	28005	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	46244354	46244716	46244645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH3	179155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	47128078	47128394	47128310	Y	LCP1,C13orf18,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	2775	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	SUCLA2-AS1	NA	NA	NA	NA	SUCLA2-AS1	47390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	48907859	48907955	48907897	Y	NA	LINC00441,RB1	NA	NA	NA	NA	RB1	31972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	49569007	49569270	49569139	Y	NA	FNDC3A	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	20959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	49688107	49688286	49688182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	131761	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	49761885	49761908	49761899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDADC1	58139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	ARL11,EBPL	NA	NA	NA	NA	ARL11	16782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	50661413	50661685	50661628	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	7106	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	51395866	51396155	51396034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	85659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	52009334	52009441	52009388	Y	NA	RPS4XP16,INTS6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP16	16859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	52376068	52376210	52376139	Y	INTS6,WDFY2,DHRS12,DHRS12	DHRS12,RP11-327P2.5	NA	NA	NA	NA	DHRS12	83	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	53190916	53191040	53191000	Y	NA	HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1	NA	NA	NA	NA	MRPS31P4	1223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH8	354332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	59980699	59980952	59980824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	755169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	60338539	60338813	60338676	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	397308	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	60570337	60570455	60570340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	165666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	63622021	63622216	63622150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH20	1621801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	64537945	64538229	64538154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH20	2537725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	67081521	67081801	67081799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	720667	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	71905168	71905271	71905222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	341928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	72102124	72102434	72102279	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	144765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	72206339	72206570	72206525	Y	DACH1	H3F3BP1	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	40629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	72349266	72349293	72349278	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	90037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	72359501	72359862	72359720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	79468	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	72366390	72366725	72366609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	72605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	72375972	72376220	72376216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	63110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr13	72385563	72385700	72385665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	53630	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	19260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	72438548	72439003	72438895	Y	DACH1	DACH1	NA	NA	NA	NA	DACH1	327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	7.33584559558898
chr13	72439142	72439615	72439332	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	DACH1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr13	73742042	73742346	73742194	Y	NA	RNU4-10P	NA	NA	NA	NA	RNU4-10P	21319	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74184794	74185193	74184838	Y	NA	NA	PIBF1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-10P	421129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74341263	74341518	74341389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	364876	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74377303	74377556	74377430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	328838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74467154	74467532	74467385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	238862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74707257	74707359	74707330	Y	NA	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr13	74864558	74864878	74864747	Y	KLF12	NA	KLF12	IMR90	Hi-C	24141950	KLF12	158164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	76159377	76159493	76159435	Y	NA	COMMD6,UCHL3,LMO7	NA	NA	NA	NA	LMO7	33077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	77078666	77078696	77078681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	379844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	77299321	77299673	77299497	Y	NA	NA	LMO7,KCTD12	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD12	158867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	77518651	77518968	77518786	Y	KCTD12	RPL7P44,DHX9P1,CLN5	NA	NA	NA	NA	RPL7P44	35083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	78158324	78158538	78158433	Y	MYCBP2,SLAIN1,SLAIN1,EDNRB,EDNRB	NA	NA	NA	NA	NA	SLAIN1	111485	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	80267343	80267469	80267406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDFIP2	214056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	88259012	88259340	88259160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	1887389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	88384592	88384886	88384741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLITRK6	2012969	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	93870012	93870383	93870198	Y	NA	GPC6	GPC6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC6	6712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	93899040	93899272	93899121	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	21945	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	93915220	93915506	93915338	Y	NA	GPC6	NA	NA	NA	NA	GPC6	38125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	94297506	94297518	94297511	Y	GPC6	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD22	278293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	94706563	94706645	94706604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	539866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	94913778	94913870	94913813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	332641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	95932787	95933077	95933010	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	18610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	96262046	96262201	96262124	Y	DZIP1	DZIP1	NA	NA	NA	NA	DZIP1	32756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	96366031	96366158	96366093	Y	DNAJC3	DNAJC3-AS1,DNAJC3	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	38638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	96424038	96424083	96424061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	96645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	97263096	97263285	97263191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	559360	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	97274522	97274914	97274718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	570786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	97636174	97636720	97636457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL2	234968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99121203	99121258	99121231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	106936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99599525	99599781	99599653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	251183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99737310	99737596	99737454	Y	DOCK9	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	113368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99874246	99874352	99874282	Y	NA	UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	8234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99922932	99923366	99923036	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	56920	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99957911	99958107	99958020	Y	DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	91899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	99973342	99973591	99973472	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	107330	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	100614141	100614172	100614147	Y	NA	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	7991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	100620497	100620786	100620718	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC5,ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC5	1377	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	101041976	101042276	101042034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	148252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	102569627	102570054	102569972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	677299	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr13	103051676	103052522	103052411	Y	BIVM,FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	194831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	105792553	105792815	105792695	Y	DAOA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	1425697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	108153519	108153767	108153691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIG4	714949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIG4	557375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	108987608	108987753	108987666	Y	FAM155A	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD13	118881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	110521819	110522258	110522077	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84904	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	110746992	110747342	110747118	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	310077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	110789248	110789736	110789562	Y	RAB20,IRS2	NA	NA	NA	NA	NA	IRS2	352333	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	111312907	111313086	111312997	Y	NA	CARKD,ING1	NA	NA	NA	NA	CARKD	47026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	111464605	111464817	111464711	Y	NA	NA	ING1,CARS2,CARKD,RAB20,ANKRD10,LINC00346,COL4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD10	100599	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	SNORD44,SOX1	NA	NA	NA	NA	SOX1	6849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	112867754	112868133	112868015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX1	147841	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	106764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	113562235	113562531	113562394	Y	MCF2L	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	58607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	113585588	113585716	113585676	Y	CUL4A,CUL4A	MCF2L-AS1	C13orf35,ATP11A,MCF2L	GM12878,HELA,K562,H1ESC	5C	22955621	MCF2L-AS1	35422	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr13	113677034	113677374	113677296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L-AS1	55896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	113870568	113870732	113870682	Y	MCF2L,DCUN1D2,ADPRHL1,F10	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	PCID2	9539	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	18592	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr13	115078776	115079079	115078928	Y	NA	UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	CHAMP1	788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	20803011	20803143	20803077	Y	NA	TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1	NA	NA	NA	NA	CCNB1IP1	3540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr14	21288613	21288985	21288797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL17	166944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	23259673	23259774	23259709	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	OXA1L,CTD-2555K7.2,MRPL52,MMP14	NA	NA	NA	NA	CTD-2555K7.2	25902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	23358205	23358555	23358381	Y	NA	LRP10,REM2,RBM23,PRMT5	NA	NA	NA	NA	REM2	7831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	23466095	23466339	23466236	Y	CDH24,ACIN1	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	11036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	23466494	23466910	23466688	Y	CDH24,C14orf93	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5	NA	NA	NA	NA	C14orf93	10465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	24454112	24454320	24454216	Y	DHRS4L2,DHRS4L2	DHRS4,DHRS4L2	NA	NA	NA	NA	DHRS4L2	16964	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	24481106	24481351	24481229	Y	NA	DHRS4L2,LRRC16B	NA	NA	NA	NA	LRRC16B	37855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	25164584	25164990	25164642	Y	TINF2,CIDEB,LTB4R,CMA1,CTSG,GZMB	NA	NA	NA	NA	NA	SDR39U1	254473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	29227815	29227890	29227853	Y	NA	FOXG1,C14orf23	NA	NA	NA	NA	FOXG1	5160	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	29243702	29244197	29243854	Y	FOXG1	FOXG1,C14orf23	NA	NA	NA	NA	C14orf23	3792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	31101250	31101606	31101429	Y	NA	SCFD1	NA	NA	NA	NA	SCFD1	11932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	31360303	31360625	31360494	Y	NA	COCH	NA	NA	NA	NA	COCH	18583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	31478440	31478826	31478753	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	13486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	31698850	31699225	31699035	Y	STRN3	HECTD1	AP4S1,HECTD1,STRN3,HEATR5A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECTD1	23840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	32420109	32420203	32420156	Y	NA	NA	AKAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP5	123117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	32670916	32671247	32671221	Y	NA	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKAP6	125232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	32672212	32672871	32672506	Y	ARHGAP5	NA	NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AKAP6	123608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	32976944	32977104	32977024	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	24938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	33776924	33777310	33777048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	374785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	34162040	34162301	34162172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS3	759901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	34801443	34801630	34801553	Y	NA	NA	SPTSSA	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	127932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	35675118	35675537	35675232	Y	NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	70302	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	35810635	35811251	35810911	Y	BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1	PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	45024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	35855857	35856187	35856101	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	88	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr14	36073737	36073816	36073791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSM2	72489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	37119826	37119959	37119893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBIP	331944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	38052089	38052429	38052199	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	10623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	38054173	38054544	38054319	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	TTC6	8508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	38067310	38067714	38067659	Y	NA	TTC6,FOXA1	NA	NA	NA	NA	FOXA1	65	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	42075138	42075996	42075609	Y	LRFN5	LRFN5	NA	NA	NA	NA	LRFN5	365	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	42297588	42297942	42297766	Y	LRFN5	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN5	222815	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	45483090	45483569	45483224	Y	NA	KLHL28	NA	NA	NA	NA	KLHL28	25956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	NA	NA	NA	NA	NA	ATL1	70885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	51295991	51296327	51296165	Y	NA	NIN	NA	NA	NA	NA	NIN	152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	51460024	51460383	51460203	Y	TRIM9	NA	NA	NA	NA	NA	PYGL	50570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	52584121	52584359	52584179	Y	NA	NA	NID2,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	129928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf166	168413	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	53020677	53020806	53020735	Y	PTGDR,TXNDC16,GPR137C	TXNDC16,GPR137C	NA	NA	NA	NA	GPR137C	2811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr14	53209302	53209454	53209392	Y	NA	ERO1L,PSMC6,STYX,GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	STYX	14404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	53575786	53575939	53575850	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	42061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	55584452	55585250	55584591	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L,SOCS4,LGALS3,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	3578	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	55716194	55716474	55716312	Y	NA	FBXO34,RP11-665C16.6	TBPL2,FBXO34,ATG14,DLGAP5	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO34	19547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	57047832	57047974	57047932	Y	PELI2,C14orf101	NA	NA	NA	NA	NA	PELI2	465300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	57265508	57265854	57265681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	467872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	59106687	59106948	59106735	Y	NA	DACT1	NA	NA	NA	NA	DACT1	8002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr14	59654580	59654708	59654599	Y	NA	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	1216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	59742406	59742712	59742574	Y	DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	89042	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	59800555	59800809	59800631	Y	GPR135	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	147191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	60629133	60629293	60629144	Y	NA	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	5281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	61612107	61612325	61612234	Y	SIX1	PRKCH	SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	39952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	61808896	61809049	61808907	Y	PRKCH	RP11-902B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	21360	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	61865216	61865457	61865337	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	77680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	61956573	61957255	61956876	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	169037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	172478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	61960753	61960767	61960760	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	173217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	61969529	61970113	61969734	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-902B17.1	181993	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	63159002	63159168	63159087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	848924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	63829601	63829975	63829789	Y	WDR89,PPP2R5E,KCNH5,GPHB5	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	178117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	63983921	63984319	63984190	Y	NA	PPP2R5E	NA	NA	NA	NA	PPP2R5E	23773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	64320785	64320937	64320842	Y	PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2	SYNE2	NA	NA	NA	NA	SYNE2	3102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	64968114	64968655	64968380	Y	ZBTB25,ZBTB1	AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	ZBTB1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65006188	65006351	65006244	Y	NA	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36	NA	NA	NA	NA	HSPA2	5565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65172114	65172865	65172414	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	3294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65347160	65347466	65347258	Y	RAB15	SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB	SPTB	IMR90	Hi-C	24141950	SPTB	2559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	73635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65749378	65749653	65749574	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	125657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	65801624	65801887	65801778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	73423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	68005927	68006205	68006064	Y	MPP5,TMEM229B,PLEKHH1	PLEKHH1,TMEM229B	NA	NA	NA	NA	TMEM229B	7471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	68033590	68034347	68033627	Y	NA	PLEKHH1,TMEM229B,PIGH	NA	NA	NA	NA	PIGH	30657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	68161499	68161767	68161616	Y	PLEK2	VTI1B,RDH11,RDH12	NA	NA	NA	NA	RDH11	968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	68407691	68408026	68407854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	123195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	68456427	68456429	68456428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	171931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	68884830	68884917	68884875	Y	NA	PPIAP6	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	1996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	69149155	69149350	69149272	Y	ZFP36L1,DCAF5	NA	RAD51B,ZFP36L1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	111840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	70040679	70041071	70040782	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	35242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	70079600	70080000	70079702	Y	NA	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	3287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	70700911	70701061	70700986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX16	123387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	71109519	71109752	71109636	Y	MED6,TTC9	MED6,TTC9	NA	NA	NA	NA	TTC9	3015	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	11927	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	72985924	72986043	72985987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	372766	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	73026467	73026767	73026635	Y	DPF3	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	332042	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	74793012	74793450	74793309	Y	NA	ABCD4	NA	NA	NA	NA	ABCD4	25253	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	75118827	75119088	75118958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCF1	58759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	75963682	75963938	75963768	Y	C14orf1,BATF	NA	TMED10,NEK9	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-507E23.1	96611	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	76234838	76235006	76234846	Y	NA	NA	TGFB3,IFT43	IMR90	Hi-C	24141950	C14orf1	109306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	77384574	77384777	77384608	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	77386302	77386621	77386483	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr14	77386872	77387221	77387005	Y	ZDHHC22	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	35779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	77388817	77389330	77389083	Y	ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL	RP11-488C13.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	37724	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	NA	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IRF2BPL	70463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	77489818	77490087	77489881	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2947	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	77495718	77495873	77495815	Y	NA	IRF2BPL	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	2684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	77500544	77500911	77500765	Y	NA	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	7510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	77505083	77505447	77505354	Y	TMEM63C,TMED8,KIAA1737	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	12049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	77509664	77510215	77509840	Y	IRF2BPL	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	16630	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	77591216	77591790	77591612	Y	TMED8,NGB	TMEM63C,ZDHHC22	NA	NA	NA	NA	TMEM63C	10305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	78031689	78031913	78031801	Y	SPTLC2	SPTLC2	NA	NA	NA	NA	SPTLC2	49203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	78447305	78447552	78447446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCK1	182879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	78651844	78652230	78652037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	54504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	78790799	78791229	78791102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	84065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	78836271	78836672	78836374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	129537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	79502772	79503033	79502836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	796038	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	79880226	79881040	79880569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	1173492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	80027551	80027845	80027698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	1320817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	80052385	80052697	80052460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRXN3	1345651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	80156436	80156705	80156544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHR	1262628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	81458739	81459018	81458756	Y	TSHR	TSHR,CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	34878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79,DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.92060905244243
chr14	86073952	86074255	86074109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	79464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	87025819	87025837	87025829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT2	1031331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	89257931	89258017	89257974	Y	NA	EML5,TTC8	NA	NA	NA	NA	EML5	835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	89707925	89707932	89707928	Y	FOXN3	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	48006	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	89742753	89743028	89742926	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	12910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	125810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	89895882	89896217	89896119	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	139944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	89933895	89934174	89934034	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	149319	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	90049518	90049848	90049714	Y	TDP1,FOXN3	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	33645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	90167936	90168219	90168049	Y	TDP1,FOXN3,FOXN3	NA	FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN3	84443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	91423143	91423331	91423289	Y	RPS6KA5,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf159	101346	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	91511263	91511534	91511399	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	13143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	91817428	91817689	91817484	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	64499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	91869322	91869469	91869402	Y	TC2N,RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	12719	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	91926776	91927002	91926960	Y	NA	CCDC88C,SMEK1	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	44588	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	92574762	92574984	92574843	Y	NA	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	3797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	93475811	93476205	93475939	Y	RIN3,KIAA1409	NA	NA	NA	NA	NA	CHGA	88386	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	93552204	93552427	93552400	Y	NA	ITPK1,RP11-371E8.2	NA	NA	NA	NA	ITPK1	28238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	95680303	95680655	95680479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DICER1	57956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	95811424	95811694	95811563	Y	NA	CLMN	GSC,CLMN	IMR90	Hi-C	24141950	CLMN	27181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	95946356	95946810	95946552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	51030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	95947097	95947214	95947185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLRX5	50626	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	96562177	96562641	96562498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf132	58516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	96565122	96565402	96565262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf132	61461	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11B	296223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr14	99710504	99710936	99710666	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	24925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	99713000	99713727	99713367	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	22134	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	99713782	99713973	99713884	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	21888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	99734295	99735130	99734633	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	731	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	99735950	99736476	99736276	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	89	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr14	99739493	99739630	99739557	Y	BCL11B	BCL11B	NA	NA	NA	NA	BCL11B	3632	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	100205618	100205895	100205848	Y	NA	EML1	NA	NA	NA	NA	EML1	3588	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	100566376	100566553	100566536	Y	EVL	NA	NA	NA	NA	NA	DEGS2	57947	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	DEGS2,YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DEGS2	34673	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	100768169	100768349	100768287	Y	NA	SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	2535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	100952760	100952992	100952839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	98758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	101029795	101030067	101029931	Y	NA	BEGAIN	NA	NA	NA	NA	BEGAIN	21683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	BEGAIN	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BEGAIN	1893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102188292	102188876	102188640	Y	WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C	PPP2R5C	LINC00239	K562	ChIA-PET	22265404	PPP2R5C	37259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.71996740607746
chr14	102544859	102545271	102545048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR20	58569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102554875	102555215	102555129	Y	HSP90AA1	WDR20,HSP90AA1	NA	NA	NA	NA	WDR20	48625	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102868139	102868468	102868196	Y	HSP90AA1,RCOR1,TECPR2	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	40839	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	102991046	102991386	102991124	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	16910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr14	102991831	102991939	102991900	Y	NA	ANKRD9	ANKRD9,RCOR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ANKRD9	17695	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr14	103490121	103490395	103490347	Y	NA	CDC42BPB	NA	NA	NA	NA	CDC42BPB	31404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	103993761	103994083	103993826	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	104009097	104009329	104009267	Y	NA	CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P	NA	NA	NA	NA	TRMT61A	15576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	104356058	104356494	104356205	Y	TRMT61A,PPP1R13B	PPP1R13B,C14orf2	PPP1R13B,LOC145216	MCF7	ChIA-PET	22265404	C14orf2	36112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	104928387	104928555	104928492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM179	141429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr14	105144100	105144955	105144117	Y	GPR132,AKT1	INF2,ADSSL1	NA	NA	NA	NA	INF2	8988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	105327046	105327788	105327205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT1	66958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	105603404	105603554	105603490	Y	BTBD6,BRF1	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	29607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr14	105630127	105630455	105630291	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	2706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	105631701	105632085	105631796	Y	NA	JAG2,NUDT14	NA	NA	NA	NA	JAG2	1076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	105760670	105760918	105760811	Y	C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1	BTBD6,PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	PACS2	3982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr14	107253494	107254031	107253700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1262554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr14	107254436	107254688	107254673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1263496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	23841916	23842255	23842027	Y	MKRN3	MKRN3	NA	NA	NA	NA	MKRN3	33462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	25018281	25018456	25018384	Y	SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN	SNRPN	NA	NA	NA	NA	SNRPN	48338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	26864879	26864942	26864916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRA5	244568	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	27303781	27303788	27303785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABRG3	89352	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	30022522	30022814	30022806	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	TJP1	236254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr15	31597393	31597523	31597459	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	19535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	31598782	31598890	31598869	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	18168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr15	31600574	31600756	31600662	Y	NA	KLF13	OTUD7A,LOC283710,KLF13,MTMR10,TRPM1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF13	16302	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr15	31620735	31621235	31621017	Y	MTMR10,KLF13	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	3677	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	31656932	31656985	31656959	Y	NA	KLF13	NA	NA	NA	NA	KLF13	39874	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	31689645	31689781	31689725	Y	MTMR10,KLF13	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	72587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	31690304	31690476	31690390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF13	73246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	31733081	31733438	31733352	Y	MTMR10,KLF13	NA	KLF13,OTUD7A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF13	116023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	33032997	33033143	33033070	Y	GREM1	GREM1	NA	NA	NA	NA	GREM1	24822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	34807090	34807442	34807248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA8A,GOLGA8B	71262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	35384953	35385239	35385081	Y	NA	RP11-323I15.2	ATPBD4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	2271	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-323I15.2	208049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-323I15.2	267483	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	35788754	35789006	35788880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-323I15.2	406072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	37175924	37176266	37175984	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-122D10.1	NA	NA	NA	NA	RP11-122D10.1	970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	37203314	37203431	37203373	Y	NA	RP11-122D10.1	NA	NA	NA	NA	RP11-122D10.1	26078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	37396811	37397277	37397114	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	NA	NA	NA	NA	MEIS2	5307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	40192845	40193084	40192965	Y	NA	GPR176,EIF2AK4	NA	NA	NA	NA	GPR176	18009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	40361212	40361596	40361446	Y	NA	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	SRP14	31823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	40385571	40385715	40385643	Y	BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	13378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr15	40395466	40395787	40395613	Y	NA	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	3306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr15	40397293	40397725	40397605	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	40669843	40670190	40669979	Y	GPR176,PAK6,DISP2	C15orf52,DISP2,IVD	NA	NA	NA	NA	DISP2	21407	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	40728458	40728872	40728667	Y	NA	IVD,BAHD1,CHST14	NA	NA	NA	NA	BAHD1	1048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	41074954	41075332	41075143	Y	NA	GCHFR,C15orf62,ZFYVE19,DNAJC17	NA	NA	NA	NA	C15orf62	14795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	41199675	41199878	41199759	Y	DLL4	RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1	DLL4	IMR90	Hi-C	24141950	VPS18	15047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,DLL4,CHAC1	NA	NA	NA	NA	DLL4	1017	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.35300707783043
chr15	41741039	41741403	41741222	Y	NA	NDUFAF1,RTF1	NA	NA	NA	NA	RTF1	42433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	42327713	42327843	42327787	Y	MAPKBP1,PLA2G4B	NA	EHD4	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	64937	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	44319631	44319819	44319725	Y	NA	ACTBP7	NA	NA	NA	NA	ACTBP7	39249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	44431053	44431468	44431357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD5	53982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	46758762	46759114	46758953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	945757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	48023492	48023830	48023661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYEF2	444884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	50335306	50335619	50335473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	136774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	50426655	50427246	50427087	Y	USP8,GABPB1	SLC27A2	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC27A2	45147	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	50620432	50620711	50620437	Y	NA	GABPB1-AS1,GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1-AS1	24814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	51385997	51386103	51386050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	187128	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	52153526	52153874	52153708	Y	NA	TMOD3	NA	NA	NA	NA	TMOD3	33701	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	52235970	52236006	52235989	Y	DMXL2,MAPK6	MAPK6,LEO1	NA	NA	NA	NA	MAPK6	6297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	52402379	52402574	52402478	Y	BCL2L10	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	16887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	52777453	52777711	52777581	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	41536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	52851602	52851989	52851853	Y	NA	MYO5A,ARPP19	NA	NA	NA	NA	ARPP19	8091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	53077795	53078191	53078047	Y	ONECUT1	ONECUT1,RP11-209K10.2	NA	NA	NA	NA	ONECUT1	3082	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	53095650	53095970	53095786	Y	ONECUT1	ONECUT1,RP11-209K10.2	ONECUT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-209K10.2	511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	57614367	57614619	57614484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR2M	267612	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	57920264	57920408	57920336	Y	NA	POLR2M	NA	NA	NA	NA	POLR2M	38033	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	58884938	58885321	58885256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	154856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	59530226	59530327	59530289	Y	BNIP2,ADAM10,SLTM,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	132565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	59646649	59647004	59646975	Y	NA	FAM81A,MYO1E	NA	NA	NA	NA	FAM81A	15888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RORA	254173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	61340586	61340641	61340614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	178877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	61505182	61505193	61505186	Y	RORA	RORA	NA	NA	NA	NA	RORA	14325	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	62215780	62216024	62215899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	134648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	63034731	63035286	63034964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-244F12.1	208086	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	63773261	63773631	63773483	Y	LACTB,RAB8B,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	21162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	64000367	64000635	64000532	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	108579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	64185014	64185515	64185044	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	60873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr15	65713781	65714189	65713985	Y	IGDCC3,IGDCC4	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	45403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	65716164	65716565	65716475	Y	NA	IGDCC3	NA	NA	NA	NA	IGDCC3	47786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	66162838	66163256	66163114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	66163349	66163534	66163463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	80718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	66295314	66295348	66295331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DENND4A	212683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	66433661	66433831	66433761	Y	DENND4A,MAP2K1	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	110254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	66446289	66446658	66446570	Y	DIS3L,DIS3L	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	97427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr15	66464730	66464867	66464805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF11	79218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	56252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	SKOR1	NA	NA	NA	NA	SKOR1	22345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	68441418	68441688	68441529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	96901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	68564194	68564543	68564236	Y	NA	CLN6,FEM1B	FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FEM1B	3598	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	68852038	68852173	68852100	Y	NOX5,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	17135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	68907024	68907340	68907243	Y	CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	37716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	69087536	69088004	69087836	Y	NA	SPESP1,ANP32A	NA	NA	NA	NA	SPESP1	20556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	69490173	69490404	69490203	Y	NA	GLCE	NA	NA	NA	NA	GLCE	39250	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr15	70641269	70641570	70641504	Y	TLE3	NA	TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	252754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	73061587	73061861	73061724	Y	PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK	ADPGK	NA	NA	NA	NA	ADPGK	14326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74216715	74216840	74216797	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74226590	74227025	74226821	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	10260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	74283683	74283945	74283706	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	1018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74492868	74493054	74492979	Y	NA	STRA6	NA	NA	NA	NA	RP11-60L3.1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	75250602	75250974	75250783	Y	RPP25	COX5A,SCAMP5,RPP25	NA	NA	NA	NA	RPP25	2797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	75339281	75339878	75339595	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CLK3,CSK,SCAMP2,C15orf39	PPCDC	NA	NA	NA	NA	PPCDC	25385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	75470847	75471095	75470955	Y	SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,C15orf39	C15orf39	C15orf39	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C15orf39	14889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	75742568	75742962	75742713	Y	NA	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	3221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	75886318	75886335	75886327	Y	NA	PTPN9,SNUPN	NA	NA	NA	NA	PTPN9	16688	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr15	76639629	76639850	76639740	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	77049228	77049527	77049378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	146258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	77055500	77055901	77055892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAPER	139884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	77332766	77333147	77332913	Y	PSTPIP1	PSTPIP1,TSPAN3	NA	NA	NA	NA	TSPAN3	41179	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	77739736	77739821	77739778	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	28982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	78031317	78031646	78031484	Y	LINGO1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	79596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	78110975	78112297	78111796	Y	HMG20A,LINGO1,DNAJA4,ACSBG1	NA	NA	NA	NA	NA	LINGO1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr15	78347391	78347661	78347487	Y	TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	20405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	79272176	79272521	79272351	Y	NA	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	32260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	79669806	79669918	79669862	Y	NA	NA	MTHFS,ST20-MTHFS,C15orf37,KIAA1024,ZFAND6	IMR90	Hi-C	24141950	TMED3	68402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	80776414	80776800	80776607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	81722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	82170277	82170527	82170385	Y	NA	NA	EFTUD1	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	165955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr15	82340231	82340454	82340397	Y	NA	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	3749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	83231949	83232133	83232017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.4	126977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	83537231	83537313	83537271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHAMM	60851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	83680959	83681167	83681099	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	2566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	83681404	83681605	83681512	Y	NA	HOMER2,FAM103A1,C15orf40	NA	NA	NA	NA	C15orf40	3011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	83731534	83731663	83731576	Y	WHAMM,BTBD1	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	BTBD1	2443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	85458286	85458507	85458420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	63164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	85493235	85493615	85493435	Y	SLC28A1,PDE8A	PDE8A	NA	NA	NA	NA	PDE8A	28056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	85711891	85712151	85712051	Y	NA	NA	PDE8A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE8A	190220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	88021101	88021401	88021180	Y	NA	NA	NTRK3,AGBL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00052	96759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	88553503	88553782	88553643	Y	NTRK3	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK3	244217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	89027924	89028249	89027989	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	19240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	89149774	89150157	89149841	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	12370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	89156201	89156887	89156382	Y	NA	AEN,ISG20	NA	NA	NA	NA	AEN	5640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A,WDR93	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	90605290	90605500	90605324	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	38236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	90605708	90605863	90605756	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	37873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr15	90606841	90607396	90607176	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,IQGAP1,CIB1	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	36340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	90641433	90641611	90641526	Y	NA	IDH2	NA	NA	NA	NA	IDH2	2125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	90701535	90701765	90701609	Y	ZNF710,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	SEMA4B	IDH2,ZNF710,C15orf58,TTLL13,NGRN,SEMA4B,IQGAP1,CIB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	71	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	90708840	90709227	90709106	Y	NA	SEMA4B	CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SEMA4B	7004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	91373203	91373629	91373444	Y	IQGAP1,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN	NA	NA	NA	NA	CTD-3094K11.1	7325	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	91412875	91413318	91412960	Y	IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES	CTD-3094K11.1,FURIN,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FURIN	3053	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	92497568	92497970	92497770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	102643	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	92674353	92674494	92674375	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	152577	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	93354824	93354998	93354897	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	3710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	9.55044049237056
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr15	93791047	93791320	93791156	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	RGMA	160614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	95388455	95388700	95388578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP2	615688	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	9552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr15	96900187	96900329	96900243	Y	NR2F2,NR2F2	NR2F2,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	25697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	96900508	96900866	96900583	Y	NA	NR2F2,MIR1469	NA	NA	NA	NA	MIR1469	26018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	96959733	96960000	96959734	Y	NA	NA	LOC145820	IMR90	Hi-C	24141950	MIR1469	85243	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr15	97325630	97326019	97325642	Y	SPATA8	NA	NA	NA	NA	NA	MIR1469	451140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	99289288	99289563	99289444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	99088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	99396507	99396665	99396608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr15	99397047	99397167	99397105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	206847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	99708218	99708283	99708249	Y	NA	NA	SYNM	IMR90	Hi-C	24141950	SYNM	71798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	99856918	99857221	99857070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90B2P	61081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr15	101579798	101579973	101579888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRK1	122378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	130955	131250	131103	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	5949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	199321	199454	199390	Y	HBM	NPRL3,HBM,HBQ1	NPRL3	K562	ChIA-PET	22265404	HBM	2437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	643606	643989	643708	Y	SSTR5,RAB40C,RAB40C	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A	NA	NA	NA	NA	RAB40C	6249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr16	658205	658397	658303	Y	NA	PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90	NA	NA	NA	NA	RAB40C	20848	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,CCDC78	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	756470	756692	756669	Y	NA	RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,CCDC78,NARFL	NA	NA	NA	NA	FBXL16	2641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr16	802051	802260	802100	Y	NA	FBXL16,METRN,FAM173A,CCDC78,NARFL,CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	NARFL	12722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	858833	859023	858927	Y	RHBDL1,FBXL16,SOX8	CHTF18,RPUSD1	NA	NA	NA	NA	RPUSD1	22436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	1133120	1133226	1133175	Y	RAB40C,RAB40C,FAM195A,WDR90,CACNA1H,SSTR5	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	68015	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	1166792	1167154	1166886	Y	NA	CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1H	34087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	1175604	1175749	1175663	Y	RHBDL1,FBXL16,CACNA1H,BAIAP3,BAIAP3,BAIAP3,SSTR5	CACNA1H	CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CACNA1H	25492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	1209498	1209681	1209611	Y	CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	8257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	1239202	1239436	1239320	Y	BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H	CACNA1H	NA	NA	NA	NA	CACNA1H	37961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	1585533	1585949	1585726	Y	NA	TELO2,TMEM204	NA	NA	NA	NA	TMEM204	8844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	1979729	1980160	1979842	Y	TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3	NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB10	27349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	2041117	2041468	2041266	Y	MAPK8IP3,EME2,SPSB3	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2	NA	NA	NA	NA	SYNGR3	3456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	2057211	2057401	2057386	Y	NA	NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,ZNF598,NPW,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598	423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	2175102	2175363	2175212	Y	NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2	RAB26,SNORD60,TRAF7	NA	NA	NA	NA	RAB26	13441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	2518541	2518691	2518640	Y	RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	9.27361613027286
chr16	2518760	2519270	2519088	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,C16orf59,TBC1D24,NTN3	CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2	NA	NA	NA	NA	NTN3	230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr16	2537919	2538152	2538037	Y	PDPK1	C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	TBC1D24	14772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr16	3035586	3035775	3035681	Y	PAQR4	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	PKMYT1	7046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	6232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr16	3055976	3056164	3056082	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,CCDC64B	NA	NA	NA	NA	CLDN9	4293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3124961	3125268	3125099	Y	ZNF75A,ZNF434,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NAT15,MEFV,SRRM2,PRSS33,MMP25,IL32,IL32,IL32,IL32,IL32	CCDC64B,ZNF205	NA	NA	NA	NA	ZNF205	35293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.32189234517237
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr16	3858926	3859164	3859045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	69563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	3931357	3931444	3931401	Y	C16orf90	CREBBP	NA	NA	NA	NA	CREBBP	2630	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr16	4357393	4358110	4357824	Y	CORO7	TFAP4,PAM16	ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	36317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	4944877	4945061	4944987	Y	HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI	GLYR1	NA	NA	NA	NA	GLYR1	49534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr16	4993356	4993730	4993477	Y	PPL	PPL	UBN1,GLYR1,PPL,ROGDI,NUDT16L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPL	15012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	286338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	6415499	6415992	6415721	Y	RBFOX1,RBFOX1	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	348404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	7354527	7355049	7354969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	1287432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.8444263367097
chr16	7355051	7355694	7355418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	1287956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr16	7368708	7369078	7368893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX1	1301613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	7473619	7473766	7473686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL22	1239774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	9055639	9056008	9055791	Y	C16orf72,USP7	USP7	NA	NA	NA	NA	USP7	363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	9583805	9584097	9583876	Y	NA	NA	GRIN2A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf72	400300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	10672211	10672611	10672411	Y	ATF7IP2,EMP2	NA	NA	NA	NA	NA	EMP2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	10688488	10688836	10688661	Y	NA	EMP2	EMP2,TEKT5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP2	15933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	10711733	10712021	10711873	Y	NA	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	39178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	10713350	10713596	10713516	Y	NUBP1	EMP2	NA	NA	NA	NA	EMP2	40795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	11032093	11032474	11032340	Y	NA	DEXI,CLEC16A	NA	NA	NA	NA	DEXI	1843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	11666045	11666804	11666319	Y	ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,SNN,LITAF,LITAF	NA	NA	NA	NA	NA	LITAF	61433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	11960558	11960748	11960653	Y	NA	RSL1D1,GSPT1	ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RSL1D1	17116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	12790773	12790823	12790798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	105051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	13557346	13557802	13557518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	454212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	13873618	13873819	13873731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERCC4	138195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	14529113	14529156	14529135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	195429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	14621757	14621928	14621847	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	102657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	15085192	15085402	15085309	Y	C16orf45	PDXDC1	NTAN1	IMR90	Hi-C	24141950	PDXDC1	18744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	15140552	15140757	15140655	Y	NA	NTAN1	NA	NA	NA	NA	NTAN1	7164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	15670640	15671032	15670885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	63991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	16214258	16214439	16214353	Y	ABCC1	NA	ABCC6	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC1	172824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	19714468	19714843	19714656	Y	NA	IQCK	NA	NA	NA	NA	IQCK	10935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	20079556	20079735	20079646	Y	IQCK,GPRC5B	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	184067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	20910017	20910139	20910077	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	311	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	21622558	21622759	21622643	Y	CRYM,IGSF6,METTL9	METTL9	NA	NA	NA	NA	METTL9	16019	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	22020044	22020453	22020259	Y	OTOA,VWA3A	C16orf52	VWA3A	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf52	3085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	22202219	22202462	22202295	Y	NA	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	13141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	22799642	22799779	22799706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRN3P3	352606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	23291084	23291445	23291261	Y	USP31	SCNN1B	SCNN1B,SCNN1G,COG7	IMR90	Hi-C	24141950	SCNN1B	3532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr16	23419986	23420351	23420270	Y	NA	COG7	NA	NA	NA	NA	COG7	42150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	23693851	23693869	23693860	Y	NA	PALB2,DCTN5,PLK1	NA	NA	NA	NA	PLK1	6874	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	24855986	24856230	24856033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNRC6A	116970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	25025498	25025977	25025718	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27248798	27249418	27249027	Y	KIAA0556,IL4R,IL21R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	28697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27263252	27263592	27263361	Y	NA	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	14523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27533512	27533805	27533694	Y	JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	25429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27541388	27541697	27541538	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	17537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	27542863	27543251	27543051	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	15983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	27577101	27577365	27577280	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	17647	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	27763534	27763923	27763729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	204080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	28176884	28177249	28177153	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	43992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	29123369	29123519	29123389	Y	SH2B1	RRN3P2	NA	NA	NA	NA	RRN3P2	39206	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	29836551	29836761	29836656	Y	NA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP,CDIPT	NA	NA	NA	NA	MVP	6836	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	30427925	30428543	30428281	Y	HIRIP3,ZNF48	TBC1D10B,ZNF48,SEPT1,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2	NA	NA	NA	NA	SNORA42	537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	30545067	30545182	30545127	Y	ZNF764	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF747	894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.59871670727006
chr16	30726552	30726958	30726731	Y	ZNF668,ZNF646,STX4,MYST1,FUS	SRCAP,PHKG2,RNF40,C16orf93	RNF40,PHKG2,C16orf93	IMR90	Hi-C	24141950	SRCAP	19022	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	31083220	31083516	31083291	Y	NA	STX4,ZNF668,ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8	NA	NA	NA	NA	ZNF646	227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	31880759	31881790	31880862	Y	ARMC5,ZNF267	ZNF267	KIAA0664L3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF267	1289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	33509690	33509798	33509723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	1626611	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	33952793	33953560	33953111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2069714	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	34878904	34878918	34878911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	2995825	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	34956727	34956933	34956830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF267	3073648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	46776803	46777018	46776928	Y	MYLK3	NA	ORC6,VPS35	K562	ChIA-PET	22265404	ORC6	55248	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	46920520	46920743	46920636	Y	NA	GPT2	NA	NA	NA	NA	GPT2	4230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	47175603	47175949	47175815	Y	NETO2	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	47176557	47176930	47176742	Y	NETO2	NETO2	NA	NA	NA	NA	NETO2	649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	49316261	49316466	49316357	Y	CBLN1,C16orf78	CBLN1	NA	NA	NA	NA	CBLN1	2519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	49892592	49892787	49892690	Y	ZNF423	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	205065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	49893175	49893278	49893262	Y	NA	NA	ZNF423	IMR90	Hi-C	24141950	HEATR3	204574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	50219057	50219422	50219113	Y	NA	PAPD5	NA	NA	NA	NA	PAPD5	34228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	53125869	53126178	53125948	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	38924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	56150311	56150358	56150336	Y	SLC6A2,MT4	NA	NA	NA	NA	NA	GNAO1	72944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	56352339	56352494	56352417	Y	MT3,CES5A,GNAO1,BBS2	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	104956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	56406318	56406482	56406386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMFR	50968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	57654867	57655271	57654917	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	112371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	57657206	57657412	57657318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	110230	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	58555953	58556233	58556187	Y	NA	SETD6	NA	NA	NA	NA	SETD6	8570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	65036446	65036851	65036669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH11	121164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	65153548	65154160	65153979	Y	CDH11	CDH11	NA	NA	NA	NA	CDH11	3855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	66398320	66398884	66398869	Y	CDH5	NA	NA	NA	NA	NA	CDH5	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	CA7,NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	67597304	67597932	67597899	Y	THAP11,RLTPR,ACD	FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	CTCF	2994	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	67687517	67687714	67687560	Y	HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A	RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86	NA	NA	NA	NA	ACD	4999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	67891676	67892114	67891889	Y	RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11	THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,PSKH1	NA	NA	NA	NA	CENPT	11962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	68320188	68320357	68320233	Y	RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	22492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	SMPD3	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMPD3	23140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	68526458	68526774	68526616	Y	NA	SMPD3,ZFP90,RNU4-36P	SMPD3,CDH1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP90	35219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	69345968	69346332	69346034	Y	NA	VPS4A,PDF,NIP7,COG8	NA	NA	NA	NA	VPS4A	2709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	69516681	69516730	69516706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB5B	60253	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	69790083	69790481	69790284	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	3240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr16	70444676	70444732	70444694	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	26408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	70564094	70564236	70564165	Y	NA	COG4,SF3B3,SNORD111B	NA	NA	NA	NA	SNORD111B	2682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	70740989	70741599	70741286	Y	NA	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	23020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	72981236	72981554	72981364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	110043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	73088640	73089206	73088991	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	2391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	73185769	73185903	73185836	Y	NA	NA	ZFHX3,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	94172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	73579690	73579877	73579784	Y	NA	NA	ZFHX3	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	488093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	74702224	74702291	74702259	Y	NA	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	3445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	74901429	74901821	74901545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FA2H	94700	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	75454988	75455069	75455029	Y	NA	CFDP1,TMEM170A	NA	NA	NA	NA	CFDP1	10314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	75636745	75636762	75636754	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1,TERF2IP,KARS	NA	NA	NA	NA	ADAT1	18436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	77464200	77464393	77464347	Y	VAT1L,ADAMTS18	ADAMTS18	NA	NA	NA	NA	ADAMTS18	2618	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	78908280	78908607	78908407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	724004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	79414931	79415415	79415101	Y	MAF	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	MAF	217196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	79635433	79635866	79635594	Y	MAF	MAF	NA	NA	NA	NA	MAF	2822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	80060890	80061347	80061153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAF	428279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	81557764	81558419	81558110	Y	CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	80989	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	82172740	82172851	82172799	Y	SDR42E1	MPHOSPH6	NA	NA	NA	NA	MPHOSPH6	28980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	82693893	82694152	82693974	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	35485	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	83715826	83716249	83715944	Y	HSBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	123199	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	84177434	84177775	84177582	Y	NA	MBTPS1,HSDL1,DNAAF1,TAF1C	NA	NA	NA	NA	DNAAF1	569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	84305711	84305761	84305735	Y	NA	NA	ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1C	87042	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	84393830	84394115	84393945	Y	OSGIN1,CRISPLD2,COTL1	NA	ATP2C2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TAF1C	175161	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	84544701	84544717	84544711	Y	NA	NA	COTL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COTL1	104966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	84676809	84677221	84677048	Y	KIAA1609	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	84677292	84677600	84677448	Y	NA	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	2531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92B	58441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	12.0418597512498
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	120061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	85346294	85346686	85346622	Y	FAM92B	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	202180	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85398689	85398993	85398841	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	254575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85415557	85415973	85415759	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM92B	271443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85418434	85418651	85418593	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,KIAA0182,GINS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	274320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr16	85428961	85429169	85429067	Y	NA	NA	LOC727710,LINC00311,GINS2,KIAA0182,FAM92B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM92B	284847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85450092	85450367	85450166	Y	NA	NA	LOC727710,GINS2,KIAA0182,FAM92B,LOC400548,C16orf74	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	271312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85458916	85459273	85459095	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,LOC727710	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	262406	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85470615	85470779	85470696	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr16	85471045	85471389	85471119	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	250290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr16	85473143	85473232	85473181	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	248447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85496879	85497321	85497140	Y	FAM92B,KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	224358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85497347	85497685	85497518	Y	KIAA0182,GINS2	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	223994	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85498599	85498960	85498791	Y	KIAA0182	NA	KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	222719	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85591342	85591727	85591695	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	129952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85600571	85600865	85600718	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85601000	85601159	85601100	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	120520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	85606114	85606473	85606294	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	115206	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85617282	85617663	85617577	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	104016	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr16	85623714	85624085	85623926	Y	NA	NA	LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	97594	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85648720	85648939	85648787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	72740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	85878522	85878578	85878550	Y	NA	COX4I1,RP11-568J23.1	LOC400550,COX4NB,IRF8,FLJ30679,MTHFSD,LOC146513,LOC732275,FOXF1,COX4I1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-568J23.1	30380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	86018969	86019433	86019250	Y	IRF8	NA	COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	88560	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	169036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87072481	87072526	87072504	Y	NA	NA	FOXC2,FLJ30679,MTHFSD,FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MAP1LC3B	343075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87378694	87379151	87378934	Y	FBXO31	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3B	36450	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87607297	87607309	87607303	Y	NA	JPH3	MAP1LC3B,FBXO31,ZCCHC14,KLHDC4,JPH3,CA5A	IMR90	Hi-C	24141950	JPH3	26132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87756631	87757179	87757021	Y	KLHDC4	KLHDC4	NA	NA	NA	NA	KLHDC4	40419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	87957908	87958324	87958193	Y	NA	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	22526	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr16	87958916	87959287	87959164	Y	NA	BANP	NA	NA	NA	NA	BANP	21563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr16	87978906	87979489	87979213	Y	ZCCHC14,BANP,BANP	BANP	CA5A,KLHDC4	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BANP	1361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	88228373	88228428	88228401	Y	NA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	BANP	247523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	88683643	88683946	88683795	Y	NA	ZC3H18,CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	31614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89040833	89040974	89040903	Y	CBFA2T3,CBFA2T3	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89101477	89101571	89101537	Y	NA	CTD-2555A7.2	ACSF3,CBFA2T3,LOC400558,LINC00304,CDH15	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2555A7.2	15802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.56760197461201
chr16	89313669	89314138	89313993	Y	ZNF276,ZNF778	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	31551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr16	89323118	89323579	89323381	Y	NA	ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	41000	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr16	89388621	89389157	89388908	Y	ZNF276,C16orf7	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	106503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89424659	89424716	89424712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	130253	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89474257	89474602	89474526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	80367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89893816	89894170	89893993	Y	SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	11229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr16	89992380	89992810	89992683	Y	NA	MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P	NA	NA	NA	NA	TUBB3	6580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr16	90143699	90144065	90143926	Y	C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25	NA	LOC100130015,GAS8	MCF7	ChIA-PET	22265404	DBNDD1	59163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	438529	438886	438717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	119901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	508147	508415	508281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	50372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	654300	654699	654470	Y	NA	VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	DBIL5P	400	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	693293	693510	693390	Y	RNMTL1	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	9712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	698193	698349	698271	Y	NA	DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4	NA	NA	NA	NA	GLOD4	14612	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	817943	818099	818016	Y	FAM57A	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	62911	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	818912	819288	819089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NXN	61722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	881410	881576	881449	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	400	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	942821	943085	942871	Y	MYO1C	TIMM22	NA	NA	NA	NA	TIMM22	44464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	1810765	1810885	1810825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC016292.3	51025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	1864830	1864896	1864863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4RL1	61743	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	1929262	1929538	1929498	Y	NA	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	DPH1	1866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	2307434	2307709	2307574	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	5022	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	2614073	2614260	2614119	Y	KIAA0664	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	119569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	2626418	2626796	2626607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	131914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	2627139	2627523	2627311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	132635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	2757819	2758227	2758154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	263315	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	457619	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	3504662	3504760	3504711	Y	NA	SHPK,CTNS	TRPV3	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	32856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	3534813	3534835	3534825	Y	OR1A2,OR1A1,OR3A2,OR1E1,OR1E2	SHPK,CTNS,TAX1BP3	TRPV1	IMR90	Hi-C	24141950	SHPK	2781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	3641791	3642428	3642283	Y	ITGAE,ATP2A3	P2RX5,GSG2	NA	NA	NA	NA	GSG2	16580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	4704497	4704876	4704590	Y	ZNF232,KIF1C	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	PLD2	3515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	4752478	4752731	4752552	Y	ZNF232,RABEP1,CAMTA2,CAMTA2	PLD2,MINK1,C17orf107	NA	NA	NA	NA	MINK1	17795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	C17orf107,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	5000892	5001205	5000989	Y	NA	ZFP3,AC012146.7,ZNF232	NA	NA	NA	NA	AC012146.7	11558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	5412379	5412497	5412422	Y	USP6	DHX33,MIS12,DERL2	NA	NA	NA	NA	DERL2	24248	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	6399359	6399733	6399545	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM64A	53624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	6541812	6541912	6541862	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	TXNDC17	166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,MIR497HG,BCL6B,SLC16A13,SLC16A11	NA	NA	NA	NA	BCL6B	813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	7115018	7115437	7115195	Y	NA	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	3007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	7119118	7119286	7119174	Y	WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4	ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7	NA	NA	NA	NA	ACADVL	674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	7607455	7607852	7607490	Y	NA	WRAP53,TP53,EFNB3,DNAH2	NA	NA	NA	NA	EFNB3	935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	4115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	5769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	7790181	7790340	7790322	Y	POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1	NA	NA	NA	NA	LSMD1	3625	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	8029634	8030116	8029995	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107	NA	NA	NA	NA	PER1	27708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	8436852	8437236	8437053	Y	MYH10	RP11-713H12.1	NA	NA	NA	NA	RP11-713H12.1	25312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	9368693	9368815	9368742	Y	GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	STX8	109093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	12719338	12719750	12719590	Y	NA	ARHGAP44	NA	NA	NA	NA	ARHGAP44	28482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	14105008	14105251	14105153	Y	COX10,HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	97149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr17	14256459	14256625	14256586	Y	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	54059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	16249780	16250130	16249956	Y	CENPV	CENPV,UBB	NA	NA	NA	NA	CENPV	4840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	16355497	16355695	16355534	Y	TTC19,PIGL	FAM211A	NA	NA	NA	NA	FAM211A	37772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17054009	17054176	17054093	Y	ZNF624,PEMT,COPS3,FLCN	NA	NA	NA	NA	NA	PLD6	53453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17163211	17163219	17163215	Y	NA	FLCN,COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	COPS3	19388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17208754	17209324	17209000	Y	PLD6,COPS3,COPS3,NT5M	COPS3,NT5M	NA	NA	NA	NA	NT5M	4105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17596410	17596829	17596636	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	13623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	17617254	17617499	17617388	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	34467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17628792	17629315	17629145	Y	NA	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	46005	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17641556	17641857	17641643	Y	MYO15A	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	58769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	17644687	17645051	17644950	Y	TOM1L2,LRRC48,LLGL1	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	61900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	17686462	17687119	17686716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	51206	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr17	17687276	17687668	17687631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SREBF1	50657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	17838975	17839310	17839078	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	34426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	18200436	18200727	18200570	Y	SMCR8,TOP3A	FLII,TOP3A,SMCR8	NA	NA	NA	NA	TOP3A	15594	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	19913206	19913926	19913276	Y	ULK2,AKAP10	AKAP10,SPECC1	NA	NA	NA	NA	SPECC1	2549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	20755696	20755942	20755820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDP1	69738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	20943914	20944165	20944106	Y	NA	USP22,AC087393.1	NA	NA	NA	NA	USP22	908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	21002403	21002809	21002523	Y	KCNJ18	AC087393.1,DHRS7B	USP22,C17orf103	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DHRS7B	21868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	25659360	25659787	25659571	Y	LGALS9,WSB1	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	40258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	25784873	25785075	25784939	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	KSR1	MCF7	ChIA-PET	22265404	KSR1	3203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	25813907	25813958	25813933	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	32237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26307415	26307616	26307516	Y	TNFAIP1	NA	C17orf108	IMR90	Hi-C	24141950	NLK	59147	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26445565	26445699	26445591	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	78802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	19395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	26734916	26735044	26734980	Y	NA	SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	2701	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	26894495	26894823	26894797	Y	NA	UNC119,PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5	NA	NA	NA	NA	PIGS	2067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	26929593	26929935	26929764	Y	TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119	PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100	NA	NA	NA	NA	SPAG5	5296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	27118575	27118718	27118697	Y	NA	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	49573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	27367295	27367696	27367449	Y	TAOK1	SEZ6	NA	NA	NA	NA	SEZ6	35837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	27473466	27473709	27473569	Y	NA	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	31721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	27506307	27506816	27506504	Y	TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	27918115	27918172	27918144	Y	GIT1,ANKRD13B	TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	27918652	27918967	27918817	Y	GIT1,EFCAB5,ANKRD13B	TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	27919265	27919579	27919303	Y	NA	TP53I13,ANKRD13B,GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	GIT1	193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	28009923	28010244	28010118	Y	SSH2	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	61998	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	28258246	28258478	28258304	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	2952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	79002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB11FIP4	160050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	30463864	30464107	30463979	Y	NA	RHOT1,AC090616.2	RHOT1	IMR90	Hi-C	24141950	RHOT1	3366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	30593810	30594211	30593930	Y	NA	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	2615	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	30603137	30603481	30603311	Y	RHBDL3	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	11942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	30723443	30723679	30723561	Y	NA	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	45600	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	30726822	30727202	30727012	Y	NA	PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	42077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	30778136	30778420	30778202	Y	ZNF207	PSMD11,CDK5R1	NA	NA	NA	NA	PSMD11	8857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	30837973	30838187	30838080	Y	CDK5R1	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	26336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	30846365	30846870	30846526	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	34728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr17	30847234	30847756	30847477	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	35597	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	30954292	30954689	30954451	Y	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	142655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	31072918	31073214	31073077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1D	128981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	31224473	31224751	31224610	Y	NA	MYO1D,TMEM98	MYO1D,ACCN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1D	22278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	32571720	32571751	32571733	Y	CCL8,CCL7	NA	CCL11	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF830	714798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	705061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	32940308	32940705	32940417	Y	TMEM132E	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	345844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	32943181	32943574	32943349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF830	342975	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	MMP28,TAF15	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	34203240	34203349	34203295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDM1	52428	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	34838937	34839070	34839023	Y	NA	ZNHIT3,PIGW	NA	NA	NA	NA	ZNHIT3	1403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	35078576	35079010	35078700	Y	NA	NA	LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRM1	122575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	35292129	35292558	35292512	Y	ACACA,LHX1,AATF	RP11-445F12.1,AATF	NA	NA	NA	NA	RP11-445F12.1	169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	35520107	35520138	35520123	Y	ACACA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	215932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	35841037	35841412	35841225	Y	NA	DUSP14	DUSP14	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP14	6525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	36412216	36412471	36412263	Y	NA	RP11-1407O15.2,MRPL45	NA	NA	NA	NA	RP11-1407O15.2	7387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	36717036	36717303	36717215	Y	SOCS7,SRCIN1	SRCIN1	NA	NA	NA	NA	SRCIN1	42880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	36859229	36859333	36859332	Y	NA	C17orf96,MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	36899884	36899982	36899923	Y	SOCS7,FBXO47,C17orf98	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	PCGF2	4088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	36907984	36908100	36908042	Y	NA	MLLT6,CISD3,PCGF2,PSMB3,PIP4K2B	NA	NA	NA	NA	PSMB3	995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	37542274	37542291	37542284	Y	NA	FBXL20	NA	NA	NA	NA	FBXL20	14485	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	37558786	37559227	37559071	Y	NA	FBXL20,MED1	NA	NA	NA	NA	FBXL20	2010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	37831191	37831499	37831297	Y	GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2	STARD3,PNMT,PGAP3	NA	NA	NA	NA	PNMT	8957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	4628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1,GRB7	NA	NA	NA	NA	GRB7	18231	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	38226807	38227182	38226872	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	11339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	38229285	38229466	38229392	Y	GSDMB	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	13817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38231838	38232188	38231911	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	16370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38470934	38471197	38471090	Y	IKZF3,WIPF2,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	7490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38477236	38480096	38479169	Y	IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	13792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	38494493	38494615	38494527	Y	MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA	RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	31049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38646848	38646954	38646881	Y	KRT222,THRA,RAPGEFL1	IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	8895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	38648531	38648872	38648707	Y	KRT10,MSL1,TNS4	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	6977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38655848	38656036	38655907	Y	GJD3,IGFBP4,TNS4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	38680852	38681157	38680975	Y	NA	TNS4	IGFBP4,KRT42P,CCR7,TNS4,RARA,CDC6,GJD3,TOP2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS4	25003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38703564	38704159	38703879	Y	SMARCE1,MED24,CASC3,TOP2A,CCR7	TNS4	NA	NA	NA	NA	TNS4	47715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	38706778	38707153	38707073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	50929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	52208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38713026	38713386	38713205	Y	KRTAP2-1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS4	57177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	38776396	38776659	38776550	Y	WIPF2,RARA,RARA,CCR7	SMARCE1	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	26101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT15,KRT19,KRT9	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT15,KRT19,KRT9	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	39685394	39685532	39685463	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9	KRT15,KRT19,KRT9	NA	NA	NA	NA	KRT19	2834	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT15,KRT19,KRT9	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	39735892	39736012	39735959	Y	JUP,KRT36,KRT13,KRT15,KRT19,KRT9,KRT17,KRT16,KRT14	KRT9,KRT17	NA	NA	NA	NA	KRT9	9582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	39807728	39808143	39807934	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT17	28634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	39810156	39810822	39810530	Y	JUP,KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KRT17	31062	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	39811785	39812247	39811996	Y	JUP,KRT37,KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,LOC147093,RARA,EIF1,KRT24,KRT28,TMEM99,KRT10,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP2-2,KRT9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	30890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr17	39823354	39823685	39823437	Y	NA	KRT17,EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	19452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	40163251	40163440	40163343	Y	NA	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	1851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	40464466	40464885	40464704	Y	STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5A	26901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	40559988	40560462	40560227	Y	RAMP2,CNP	STAT3,PTRF,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	13073	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	41409196	41409569	41409556	Y	TMEM106A	NA	IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARL4D	64758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	41428275	41428596	41428403	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	45731	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42061095	42061375	42061233	Y	NA	TMEM101	NA	NA	NA	NA	TMEM101	37939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,ASB16,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42245888	42246083	42245988	Y	NA	HDAC5,C17orf53,ASB16,TMUB2,ATXN7L3	NA	NA	NA	NA	ASB16	73	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	ASB16,TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.18348016412352
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	42589268	42589584	42589359	Y	C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104	GPATCH8	ATXN7L3,GPATCH8	K562	ChIA-PET	22265404	GPATCH8	10470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	42861642	42861917	42861696	Y	NA	ADAM11,GJC1	NA	NA	NA	NA	ADAM11	27243	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	43053342	43053729	43053536	Y	NA	KIF18B,C1QL1	NA	NA	NA	NA	C1QL1	9903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	43221862	43221955	43221890	Y	ACBD4,HEXIM1	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2	NA	NA	NA	NA	HEXIM1	729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	CRHR1	NA	NA	NA	NA	CRHR1	36094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	44019661	44020036	44019768	Y	STH,CRHR1,MAPT	MAPT	NA	NA	NA	NA	MAPT	49913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	44113965	44114105	44114069	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	144217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	162202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	44198056	44198387	44198212	Y	STH,KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228308	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	44261899	44262225	44262045	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	292151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	44271977	44272219	44272147	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	302229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	RPRML	89541	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	45515544	45515843	45515768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	82465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	45778272	45778788	45778511	Y	SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21	TBX21	NA	NA	NA	NA	TBX21	29822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	45867525	45867625	45867557	Y	NA	OSBPL7,MRPL10,LRRC46,SCRN2	NA	NA	NA	NA	OSBPL7	29575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO,PRR15L	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46079914	46080281	46080131	Y	NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2	PRR15L,CDK5RAP3,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	36738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46080436	46080890	46080812	Y	CDK5RAP3	PRR15L,CDK5RAP3,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP3	37260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	46089554	46089940	46089788	Y	CBX1,CBX1,CDK5RAP3	CDK5RAP3,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	33751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	NFE2L1	NA	NA	NA	NA	NFE2L1	20861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46289129	46289412	46289274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	80297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	46334759	46335012	46334885	Y	OSBPL7,SKAP1	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	34697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46377133	46377263	46377218	Y	NA	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	7424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46395351	46395518	46395501	Y	NA	AC090627.1	NA	NA	NA	NA	AC090627.1	25642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	46643791	46644035	46643913	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	11438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	46644443	46644754	46644601	Y	HOXB9,HOXB8,HOXB6	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	10719	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	46648538	46649382	46648794	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	6092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	46664992	46665342	46665097	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB5	3981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB5,HOXB3,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	46823615	46823765	46823690	Y	PRAC,TTLL6	HOXB13	NA	NA	NA	NA	HOXB13	19075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47081081	47081234	47081133	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47081384	47081547	47081466	Y	NA	IGF2BP1	NA	NA	NA	NA	IGF2BP1	8610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF652	167326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	ZNF652	NA	NA	NA	NA	ZNF652	12708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47585577	47585730	47585714	Y	NA	NGFR	NA	NA	NA	NA	NGFR	14922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47647130	47647802	47647650	Y	NA	NXPH3	ZNF652,NGFR,SPOP,SLC35B1,NXPH3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NXPH3	3418	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	47816909	47817569	47817208	Y	ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	32533	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	48013600	48013625	48013613	Y	DLX4,DLX4,DLX3	DLX4	NGFR,SPOP,KAT7,ITGA3,SLC35B1,FLJ45513,TAC4,NXPH3,FAM117A,DLX4,DLX3	IMR90	Hi-C	24141950	DLX4	30709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	48206052	48206167	48206088	Y	NA	PDK2,SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	SAMD14	806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	48467638	48467952	48467795	Y	NA	XYLT2,MRPL27,EME1,LRRC59,ACSF2	NA	NA	NA	NA	LRRC59	4962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	48647987	48648149	48648104	Y	NA	SPATA20,CACNA1G	NA	NA	NA	NA	CACNA1G	11558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	48908408	48908498	48908454	Y	NA	TOB1	TOB1,LOC400604,SPAG9,LINC00483	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	34841	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	48942663	48943085	48943016	Y	NA	TOB1	NA	NA	NA	NA	TOB1	254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	48981540	48981884	48981711	Y	RSAD1	TOB1	TOB1,SPAG9,LINC00483,LOC400604,SPATA20,EPN3	IMR90	Hi-C	24141950	TOB1	38201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	NA	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOB1	53605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	48998350	48998465	48998408	Y	CHAD	NA	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOB1	55011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	88299	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	49142836	49143005	49142922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPAG9	53221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	49182545	49182921	49182907	Y	NA	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	NA	NA	NA	NA	SPAG9	13305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	49301885	49301958	49301926	Y	NA	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	33566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	49324611	49324828	49324669	Y	MBTD1	MBTD1,UTP18	NA	NA	NA	NA	MBTD1	10696	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	49774236	49774449	49774447	Y	CA10,CA10,CA10	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	438347	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	50114812	50114981	50114897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CA10	120396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CA10	326141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	50795913	50796132	50795928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CA10	560536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	53006732	53007120	53006925	Y	NA	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	TOM1L1	31984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	53171922	53172041	53171982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COX11	127776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	53494121	53494283	53494202	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	3070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	53497797	53498268	53498065	Y	NA	MMD	NA	NA	NA	NA	MMD	444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	55210991	55211279	55211077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP1	50538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55523126	55523573	55523446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	191914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55568668	55569013	55568840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	237456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55604990	55605123	55605063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSI2	273778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55628691	55629280	55629007	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	296137	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	55655246	55655454	55655378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	269963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55681566	55681740	55681592	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	243677	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55690023	55690365	55690280	Y	MSI2,MSI2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	235052	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55706775	55707069	55706919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	218348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55734748	55734863	55734779	Y	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	190554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55740175	55740776	55740501	Y	MSI2,MSI2,DYNLL2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	184641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.15236543146546
chr17	55749375	55749748	55749439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	175669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55839297	55839567	55839522	Y	MRPS23	NA	AKAP1,MSI2,MSX2P1,OR4D1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS23	85850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55860194	55860305	55860223	Y	NA	NA	MSI2,AKAP1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS23	65112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	55947370	55947506	55947438	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	21953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	55976255	55976501	55976378	Y	OR4D2	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	50838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	55978714	55978990	55978831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	51694	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	55992933	55993227	55993168	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,CUEDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUEDC1	37457	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	56012688	56013140	56012704	Y	NA	CUEDC1	VEZF1,SRSF1,CUEDC1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	17544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	56417498	56417914	56417645	Y	MTMR4,HSF5	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	10540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	56426877	56426962	56426920	Y	MTMR4,SUPT4H1	SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	1492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr17	56744054	56744558	56744332	Y	SUPT4H1	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P,RAD51C	NA	NA	NA	NA	RNU1-108P	1996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57001683	57001915	57001793	Y	SEPT4,PPM1E,GDPD1	NA	NA	NA	NA	NA	PPM1E	170453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57046055	57046358	57046140	Y	SEPT4	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM37	135924	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57200500	57200626	57200599	Y	GDPD1	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	18218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57203741	57203833	57203787	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	TRIM37	21459	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	57298532	57298798	57298672	Y	NA	SMG8,GDPD1	NA	NA	NA	NA	GDPD1	2704	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	57502587	57502904	57502671	Y	NA	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57511883	57511981	57511933	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-13P	100879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57698412	57698732	57698592	Y	YPEL2,RNFT1,VMP1	CLTC	NA	NA	NA	NA	CLTC	3193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57862470	57862813	57862554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	53814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	58212242	58212405	58212344	Y	NA	NA	C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEATR6	57950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	58471589	58471771	58471659	Y	RNFT1	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	26060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	59213347	59213460	59213422	Y	TBX4,TBX2	NA	NA	NA	NA	NA	TBX2	261797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	59449966	59450070	59450027	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	25187	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	59474585	59474918	59474715	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	12960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	59780215	59780354	59780263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACA2	113652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	59956289	59956463	59956377	Y	NA	BRIP1,INTS2	BRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	BRIP1	17407	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60250221	60250413	60250340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13	109578	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23P7	82279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60649611	60649792	60649701	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23P7	176853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60721967	60722242	60722046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	249209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	256954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60827722	60828206	60828004	Y	EFCAB3,MARCH10,MARCH10	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	354964	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	383515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	60872715	60872944	60872829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	399957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	60973132	60973339	60973182	Y	TLK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPS23P7	500374	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	478091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	61323201	61323584	61323320	Y	NA	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	198155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61352706	61353153	61352892	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	168586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61370802	61371122	61370929	Y	MAP3K3,LIMD2	NA	MIR548W	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	150617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61431510	61431613	61431567	Y	STRADA,ACE	NA	MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	90126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	KCNH6,DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	61748394	61748578	61748486	Y	NA	LIMD2	NA	NA	NA	NA	LIMD2	27954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61779039	61779508	61779383	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	2507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	61779769	61779866	61779823	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	3237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	61787185	61787371	61787278	Y	NA	LIMD2,STRADA	NA	NA	NA	NA	LIMD2	10653	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62159440	62159790	62159613	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	46389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62491373	62491767	62491605	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62773066	62773435	62773116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1P	57837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	62966198	62966382	62966326	Y	DDX5,CEP95,RGS9,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	3312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	63510856	63511230	63511043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	379307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS9	508381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	64301184	64301397	64301241	Y	NA	PRKCA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	4430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	64499082	64499411	64499095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	202328	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64524337	64524637	64524487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	227583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64646348	64646488	64646431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	182747	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64669772	64670163	64669988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	159072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64695504	64695853	64695677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	133382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64708425	64708706	64708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG5	120529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	64796276	64796554	64796503	Y	NA	CACNG5	NA	NA	NA	NA	CACNG5	32681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	65339190	65339485	65339338	Y	BPTF	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PSMD12	21258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	65485462	65485785	65485684	Y	HELZ,BPTF	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	113887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	66041204	66041633	66041268	Y	NA	KPNA2	NA	NA	NA	NA	KPNA2	11569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	66148595	66148807	66148688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMZ2	92908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	66249573	66249956	66249626	Y	BPTF	AMZ2,ARSG	NA	NA	NA	NA	ARSG	3367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	66374808	66375131	66375016	Y	SLC16A6	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	76523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	66618888	66618909	66618898	Y	NA	NA	ABCA10,ABCA8,ABCA9	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAR1A	112967	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	68291356	68291999	68291689	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	882517	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70023919	70023934	70023927	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	SOX9	91227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70374697	70374707	70374702	Y	NA	NA	SOX9,LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	RPL32P33	246663	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	70395717	70396043	70395724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	225327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70426216	70426228	70426222	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	195142	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	70464411	70464702	70464656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	156668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	70483632	70483939	70483786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	137431	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70585200	70585480	70585419	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	35890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.18348016412352
chr17	70587266	70587776	70587444	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	33594	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70628447	70628581	70628499	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	6030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33,LINC00511	NA	NA	NA	NA	LINC00511	29822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	70924179	70924389	70924230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	162462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	71152430	71152655	71152530	Y	C17orf80,SSTR2	SSTR2,COG1	NA	NA	NA	NA	SSTR2	6496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	71338137	71338558	71338458	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	31823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	71339324	71339501	71339471	Y	SSTR2,CDC42EP4	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	33010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	SDK2	NA	NA	NA	NA	SDK2	34258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72292734	72292946	72292890	Y	RAB37,RAB37,DNAI2	DNAI2,KIF19	NA	NA	NA	NA	DNAI2	24348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72426026	72426159	72426078	Y	DNAI2,GPRC5C	GPRC5C	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	7036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72470215	72470385	72470321	Y	RAB37,RAB37	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5C	51225	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72596633	72597034	72596924	Y	TTYH2,CD300A,TMEM104,CD300LF,CD300E,CD300LB,CD300C,CD300LD	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	145757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72673744	72674303	72674161	Y	KCTD2,GRIN2C,RAB37,RAB37,RAB37	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	68488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72746451	72746964	72746655	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	72804128	72804381	72804333	Y	KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C	NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	33506	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	72809186	72809552	72809426	Y	KIF19,RAB37,KCTD2,FADS6,GRIN2C	NAT9,TMEM104,GRIN2C	NA	NA	NA	NA	TMEM104	38564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	72984795	72985307	72985001	Y	RAB37,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	NA	NA	NA	NA	CDR2L	3068	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73007152	73007476	73007237	Y	RAB37,GRIN2C,C17orf28,CDR2L,SUMO2,NUP85,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	73007918	73008254	73008160	Y	RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	1153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	73337527	73337917	73337722	Y	NA	AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	24117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73351805	73351921	73351820	Y	NA	AC011933.1,GRB2	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	38395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73545364	73545732	73545559	Y	NA	CASKIN2,TSEN54,LLGL2	NA	NA	NA	NA	LLGL2	26203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73685500	73685825	73685750	Y	GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5	NA	NA	NA	NA	RECQL5	24231	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74128444	74128992	74128680	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	6388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	74134600	74134832	74134764	Y	LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1	EXOC7,FOXJ1	NA	NA	NA	NA	FOXJ1	548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	74230873	74231079	74230976	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	3375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74264426	74264836	74264522	Y	NA	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	RNF157	29972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	CYGB,ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	74696685	74696955	74696820	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	8143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr17	74785319	74785747	74785427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRSF2	53863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74836829	74837207	74837140	Y	UBE2O,MGAT5B	MGAT5B	MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9	IMR90	Hi-C	24141950	MGAT5B	25331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	74954315	74954497	74954426	Y	AANAT,MGAT5B	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5B	91777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75312591	75312808	75312697	Y	NA	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	37940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	75450694	75450827	75450755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	176043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75461366	75461740	75461543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	186715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	187151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75662697	75663098	75662732	Y	NA	NA	TNRC6C,FLJ45079,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	251082	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	75692874	75693017	75692949	Y	NA	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	221163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75796992	75797058	75797025	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	117122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75798844	75799281	75799210	Y	TNRC6C,TMEM235	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	114899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	75802285	75802305	75802295	Y	NA	NA	LOC100507351,TNRC6C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-80P	111875	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75853799	75854208	75853860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-80P	59972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	75953939	75954304	75954190	Y	TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	39759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	40213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	34.0493965380168
chr17	75955923	75956319	75956134	Y	TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C	RNU1-80P	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU1-80P	41743	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76195016	76195360	76195224	Y	TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	BIRC5	IMR90	Hi-C	24141950	BIRC5	12907	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr17	76320464	76321292	76320695	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	32866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76349549	76349649	76349633	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76649052	76649341	76649203	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH17	77576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	76669146	76669243	76669181	Y	DNAH17	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH17	97670	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	76801462	76801678	76801575	Y	DNAH17,USP36,CYTH1	CYTH1,USP36	NA	NA	NA	NA	CYTH1	25083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77025234	77025427	77025328	Y	NA	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	8338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77702456	77702572	77702532	Y	NA	CBX2	NA	NA	NA	NA	CBX2	47359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	77776510	77776898	77776679	Y	CCDC40	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	3028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	77784894	77785612	77785337	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	11412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	77787297	77787609	77787349	Y	NA	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	13815	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr17	77952311	77952542	77952488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	55105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	77959820	77960211	77960016	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	47436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77961931	77962339	77962251	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	45308	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	77990350	77990422	77990386	Y	NA	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	17225	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	78149249	78149503	78149364	Y	NA	EIF4A3,SLC26A11,SGSH	EIF4A3	MCF7	ChIA-PET	22265404	EIF4A3	30267	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	78352228	78352499	78352367	Y	GAA,RNF213	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	34466	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.53648724195395
chr17	78459744	78459968	78459843	Y	RPTOR	NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	10101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	78744627	78744900	78744734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	218498	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	78803936	78804105	78804080	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	159293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	48906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr17	79317785	79317948	79317891	Y	FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	50438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.87554106936776
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	79362745	79363068	79363048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	95398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79363961	79364269	79364114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	96614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	97713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	101443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	102227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79370754	79371569	79371407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	103407	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	102135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	79399158	79399431	79399295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79399639	79399699	79399664	Y	GCGR,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79399752	79400128	79399940	Y	NPB	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	77961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79439092	79439387	79439261	Y	PCYT2,FAM195B,C17orf90,C17orf70,ACTG1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	38702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79448388	79448678	79448571	Y	NPB,AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	29411	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	7.33584559558898
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr17	79546845	79547000	79546944	Y	PCYT2	C17orf70	NA	NA	NA	NA	C17orf70	27858	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79925685	79926075	79926048	Y	TSPAN10	SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,ASPSCR1	ASPSCR1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ASPSCR1	6608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79942701	79942868	79942785	Y	SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62	PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	10018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79949658	79950000	79949804	Y	SLC25A10,STRA13,LRRC45,FASN,DCXR,PCYT2,NOTUM,ASPSCR1	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	16975	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	79950743	79950987	79950865	Y	SLC25A10,GCGR,DCXR,PCYT2	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR	NA	NA	NA	NA	ASPSCR1	18060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.8444263367097
chr17	80066063	80066430	80066275	Y	GCGR,DCXR	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	11855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80068190	80068440	80068326	Y	NA	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	13982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80068913	80069274	80069094	Y	NARF,HEXDC,CCDC57	DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	14705	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80158664	80158910	80158860	Y	DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57	CCDC57,SLC16A3	FASN	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC57	9796	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	80215337	80215590	80215470	Y	SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	14017	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,CD7,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,CD7,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CD7	17723	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	80255798	80256475	80256187	Y	SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,CD7,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CD7	17003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	80296831	80297318	80297085	Y	NA	CD7,SECTM1,TEX19	SECTM1,CCDC57,SLC16A3,CSNK1D,CD7,TEX19,C17orf62,C17orf101,NARF,HEXDC,FOXK2,WDR45L	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SECTM1	6881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80453708	80453979	80453866	Y	LRRC45,DUS1L,FASN,UTS2R,TBCD,FOXK2	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	21610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr17	80594524	80594906	80594740	Y	UTS2R,WDR45L	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	59698	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80745153	80745621	80745526	Y	ZNF750	TBCD	NA	NA	NA	NA	TBCD	37213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	80796209	80796714	80796435	Y	METRNL,ZNF750	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF750	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80821463	80821609	80821520	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	25009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	25292	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr17	80832515	80832930	80832613	Y	NA	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	36061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr17	80840475	80841074	80840735	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	ZNF750	NA	NA	NA	NA	ZNF750	44021	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	159482	159743	159659	Y	CETN1	USP14	NA	NA	NA	NA	USP14	3099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	222573	222827	222703	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	43223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.35300707783043
chr18	668283	668526	668405	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	711356	711474	711397	Y	ENOSF1,ENOSF1	ENOSF1	NA	NA	NA	NA	ENOSF1	680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	RNU1-109P,YES1	NA	NA	NA	NA	RNU1-109P	14019	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	1888648	1888915	1888782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP72	566562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	2549022	2549121	2549072	Y	NA	METTL4,NDC80	NA	NA	NA	NA	METTL4	20387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	3508912	3509046	3509010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	3509218	3509430	3509419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	99612	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr18	3527351	3527432	3527391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	117745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	4356734	4357177	4357014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf42	838325	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	5318474	5318779	5318487	Y	ZFP161	NA	NA	NA	NA	NA	C18orf42	122972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	5895274	5895803	5895585	Y	TMEM200C	NA	L3MBTL4	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L3	266575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.56760197461201
chr18	6021141	6021623	6021376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	391613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	6187863	6188007	6187935	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	L3MBTL4	225229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	8661812	8662039	8661951	Y	NA	NA	ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	54369	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	8912604	8912903	8912754	Y	NA	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	187725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	9101793	9102110	9101852	Y	RAB12,ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	NDUFV2	1165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	9850032	9850097	9850065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAPA	61902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	10726542	10726663	10726595	Y	NAPG	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	202640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	12993260	12993605	12993433	Y	NA	SEH1L,CEP192	NA	NA	NA	NA	CEP192	3899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	13217020	13217525	13217240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	227659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr18	13219877	13220140	13220009	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	230516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13220671	13221282	13220939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP192	231310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13446691	13446974	13446907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	277685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13500609	13500835	13500766	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	223824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13568962	13569309	13569097	Y	RNMT,C18orf19,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	155350	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13616190	13616419	13616254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	108240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr18	18942831	18943125	18942978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREB1L	122628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	20072671	20072686	20072680	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	303538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	21091625	21091887	21091629	Y	C18orf8	C18orf8	NA	NA	NA	NA	C18orf8	10152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	21337339	21337459	21337412	Y	C18orf45	NA	NA	NA	NA	NA	NPC1	172477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	24537528	24537649	24537589	Y	KCTD1	NA	NA	NA	NA	NA	CHST9	225632	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	25674451	25674773	25674612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	80637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	26231611	26231936	26231774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	476201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	26852132	26852529	26852335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	1096722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	28734237	28734361	28734251	Y	DSC3,DSC1	NA	NA	NA	NA	NA	DSC2	53859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	32399644	32399985	32399810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	154907	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	32558962	32559433	32559316	Y	ZNF397,ZNF396,ZNF24,MAPRE2,MAPRE2	MAPRE2	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	4070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	32906658	32906918	32906743	Y	NA	ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396	NA	NA	NA	NA	ZNF24	16528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	33311016	33311295	33311162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	151935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	34406593	34406898	34406790	Y	NA	KIAA1328,TPGS2	NA	NA	NA	NA	KIAA1328	171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	34915511	34915689	34915620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	228311	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	34993424	34993521	34993473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	150479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	35138994	35139043	35139019	Y	CELF4	CELF4	NA	NA	NA	NA	CELF4	4957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	35143959	35144425	35144260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF4	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	37151664	37151869	37151793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP66	238025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	39878451	39878679	39878560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	345280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	41345475	41345795	41345567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYT4	489860	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	42261426	42261651	42261539	Y	NA	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	3288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	44762149	44762167	44762157	Y	PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	61404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	45121488	45121559	45121552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	333956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	45534549	45534809	45534718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	79034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46259226	46259357	46259315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	195809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46269539	46269878	46269723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	205203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46368946	46369173	46369117	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD7	105908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46451209	46451517	46451363	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	23564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	3149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	46479420	46479772	46479694	Y	NA	SMAD7	NA	NA	NA	NA	SMAD7	4339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	SMAD7	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SMAD7	27099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr18	46523478	46523814	46523611	Y	SMAD7,SMAD7	SMAD7	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD7	48397	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	46754603	46754925	46754865	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	230792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	47357197	47357543	47357370	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	18867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5B	171361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	51447036	51447236	51447153	Y	STARD6,C18orf54	NA	NA	NA	NA	NA	MBD2	301922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	51736292	51736523	51736417	Y	NA	MBD2	NA	NA	NA	NA	MBD2	12635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	51883843	51884006	51883925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	90069	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	53072982	53073437	53073370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	256581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	53074073	53074201	53074145	Y	TCF4	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	255817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	53180110	53180413	53180343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	149605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55101559	55101949	55101758	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	55108186	55108329	55108231	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7269	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	55250571	55250884	55250819	Y	FECH	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	1120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	55885380	55885802	55885524	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	450816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56096279	56096485	56096382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	240133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56359373	56359598	56359412	Y	NA	MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	22755	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56516862	56517001	56516932	Y	NA	U8,ZNF532	ZNF532	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF532	10831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56533618	56533625	56533622	Y	ZNF532	U8,ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	5786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	56672148	56672229	56672220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC11C	132480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60087446	60087621	60087533	Y	ZCCHC2	NA	PHLPP1,ZCCHC2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF11A	96926	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr18	60854025	60854354	60854177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	131007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60864948	60865713	60864996	Y	PHLPP1,VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	119648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60891499	60892086	60892002	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	93275	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	60941193	60941490	60941349	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	43871	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60973604	60973976	60973940	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	11385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	60979120	60979234	60979125	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	6127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	60984165	60984609	60984519	Y	BCL2	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	BCL2	752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	61046049	61046189	61046119	Y	NA	KDSR,VPS4B	NA	NA	NA	NA	KDSR	13306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	65751741	65751802	65751772	Y	NA	NA	LOC643542,DSEL	IMR90	Hi-C	24141950	DSEL	569524	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	66366333	66366541	66366437	Y	NA	CCDC102B,TMX3	NA	NA	NA	NA	CCDC102B	13905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	67069140	67069566	67069456	Y	DOK6	DOK6	NA	NA	NA	NA	DOK6	2849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr18	67430849	67430952	67430901	Y	DOK6,RTTN	NA	NA	NA	NA	NA	DOK6	364558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	67924186	67924498	67924352	Y	SOCS6	SOCS6	SOCS6,RTTN	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS6	29639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	68196083	68196104	68196093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	241946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	70535937	70536272	70536159	Y	NA	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	2556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.16631868188207
chr18	70536769	70537080	70536861	Y	CBLN2,NETO1,NETO1	NETO1	NA	NA	NA	NA	NETO1	3388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr18	72628834	72629114	72629049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	290189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	72919988	72920296	72920123	Y	ZADH2,TSHZ1	ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	TSHZ1	414	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74409297	74409534	74409399	Y	NA	NA	ZNF516	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF236	123029	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74754529	74754928	74754700	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	221966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74767033	74767545	74767189	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr18	74783567	74783622	74783596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	251004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74804015	74805088	74804856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	271452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	74826312	74827078	74826635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	293749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	76058031	76058292	76058162	Y	NA	NA	SALL3	IMR90	Hi-C	24141950	SALL3	679983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	76498631	76498821	76498726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	239454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	76737711	76738510	76737981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SALL3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77165685	77166189	77165921	Y	ATP9B,CTDP1,CTDP1,NFATC1,NFATC1	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NFATC1	11829	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77267133	77267456	77267187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	113277	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77269136	77269505	77269398	Y	ATP9B,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	115280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77284524	77284884	77284797	Y	ATP9B,NFATC1,CTDP1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	130668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77483337	77483442	77483373	Y	KCNG2	CTDP1	NA	NA	NA	NA	CTDP1	45536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77552344	77552827	77552464	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	114543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr18	77558494	77558673	77558529	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	120693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	77713083	77713430	77713261	Y	NA	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	PQLC1	3419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	289700	289869	289784	Y	C2CD4C,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C	PPAP2C	NA	NA	NA	NA	PPAP2C	307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	441805	442098	441996	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2,ODF3L2	C2CD4C,SHC2,MADCAM1	NA	NA	NA	NA	SHC2	16898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	461817	462164	462146	Y	NA	SHC2,MADCAM1,TPGS1	NA	NA	NA	NA	SHC2	2821	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	511222	511648	511350	Y	RNF126,GZMM	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	662216	662510	662281	Y	HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126	POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	RNF126	939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	710143	710459	710314	Y	GPX4,C2CD4C,PALM	RNF126,FSTL3,PALM	NA	NA	NA	NA	PALM	3190	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	791303	791398	791349	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	3677	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	888565	888780	888647	Y	SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7	CFD,MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	MED16	2438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	908605	908810	908775	Y	NA	MED16,RNU6-9,R3HDM4,KISS1R,ARID3A	NA	NA	NA	NA	R3HDM4	2430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1171933	1172315	1172045	Y	NA	STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1207906	1208235	1208159	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	STK11	20500	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	1252961	1253429	1253036	Y	C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	1400453	1400832	1400746	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	GAMT	884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15,APC2	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	1725719	1725877	1725796	Y	C19orf26,MUM1,APC2	NA	TCF3,C19orf25,ONECUT3,PLK5,UQCR11,ATP8B3,LOC100288123,REXO1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF3	75115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.02790650083322
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	2332363	2332647	2332580	Y	REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B	LINGO3,SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	5744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	2624614	2624929	2624757	Y	GNG7,DIRAS1	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	75778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	2888802	2889178	2888846	Y	NA	ZNF555,ZNF556,ZNF57	NA	NA	NA	NA	ZNF57	9718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	2950130	2950295	2950189	Y	NA	ZNF77,TLE6	THOP1,ZNF555,ZNF554,ZNF57,ZNF77,TLE6,AES,TLE2,GNA11,S1PR4,NCLN,GNA15,CELF5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF77	7161	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	3124672	3124910	3124852	Y	GNA15	GNA11,GNA15	NA	NA	NA	NA	GNA15	9281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3133345	3133760	3133513	Y	FZR1,GNA15	GNA11,GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	431	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	3165816	3165994	3165897	Y	GNA15,FZR1,S1PR4	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	17567	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3358221	3358724	3358471	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3387730	3388119	3388011	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	30169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	3405079	3405252	3405203	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3450938	3451227	3451079	Y	GNA15	DOHH	NA	NA	NA	NA	DOHH	47711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3520804	3521051	3520913	Y	NA	DOHH,FZR1,HMG20B	NA	NA	NA	NA	FZR1	16533	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	3683675	3684043	3683874	Y	NA	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	14434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3684195	3684491	3684434	Y	NA	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	13986	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3687832	3687894	3687862	Y	FZR1,APBA3	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	10583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	3693047	3693257	3693152	Y	RAX2	PIP5K1C,TJP3	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	5220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4014917	4015042	4014976	Y	NA	DAPK3,SNORD37,EEF2,PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	PIAS4	9273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	4067781	4068111	4067963	Y	SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4068273	4068675	4068359	Y	UBXN6,CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	3330	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4089074	4089290	4089084	Y	NA	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	4374109	4374366	4374283	Y	TICAM1,SEMA6B	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	24178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	5091674	5091892	5091780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4B	124549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	5250100	5250567	5250354	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	25178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	5287522	5287818	5287647	Y	NA	RPL32P34	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	11777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	5338459	5338816	5338637	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRS	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	5339517	5339797	5339748	Y	HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,PTPRS	PTPRS	NA	NA	NA	NA	PTPRS	703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	5989815	5989915	5989890	Y	SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	13662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr19	6066698	6067208	6066827	Y	SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	90545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	6087956	6088249	6088075	Y	PSPN,SAFB2,FUT5,RFX2	NA	RANBP3,LOC100128568	IMR90	Hi-C	24141950	RFX2	109334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6228782	6229121	6229035	Y	NA	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	RFX2	31199	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6394891	6395218	6395055	Y	NA	CLPP,ALKBH7,GTF2F1,KHSRP	NA	NA	NA	NA	GTF2F1	2899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6518032	6518368	6518308	Y	RFX2,CD70,TNFSF9	TUBB4A	TNFSF9	K562	ChIA-PET	22265404	TUBB4A	17173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6556475	6556744	6556665	Y	RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB4A	55616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	6660388	6660670	6660463	Y	TNFSF9	TNFSF14	NA	NA	NA	NA	TNFSF14	7929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	7547905	7548376	7548024	Y	STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1	PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6	NA	NA	NA	NA	PEX11G	11959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	7893818	7893973	7893891	Y	NA	EVI5L	NA	NA	NA	NA	EVI5L	699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	8060665	8061040	8060896	Y	FLJ22184,FBN3	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	7503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	8226134	8226320	8226231	Y	NA	CERS4	FBN3,TIMM44	IMR90	Hi-C	24141950	CERS4	43300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	9517572	9518021	9517955	Y	NA	ZNF266	NA	NA	NA	NA	ZNF266	26233	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	9777343	9777681	9777659	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	6095	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	9960910	9961072	9960969	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	16977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	10024468	10024837	10024779	Y	OLFM2	OLFM2	PIN1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	OLFM2	20391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	10442358	10442615	10442487	Y	NA	FDX1L,RAVER1,TYK2	NA	NA	NA	NA	RAVER1	42	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	10526573	10526793	10526623	Y	ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	14359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr19	10999263	10999360	10999313	Y	SMARCA4	CARM1,YIPF2,C19orf52	NA	NA	NA	NA	CARM1	19074	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	11205696	11206011	11205901	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	7658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ELAVL3,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ELAVL3	3043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	12844296	12844608	12844453	Y	NA	FBXW9,SNORD41,TNPO2,C19orf43,ASNA1	NA	NA	NA	NA	C19orf43	707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	12892597	12892707	12892653	Y	ZNF44,ZNF563,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,STX10,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	7603	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	13006078	13006409	13006086	Y	NA	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A	NA	NA	NA	NA	GCDH	6238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	13023589	13024232	13023881	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5	NA	NA	NA	NA	SYCE2	3858	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	13094405	13094796	13094616	Y	ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5	CALR,RAD23A,GADD45GIP1,DAND5	NA	NA	NA	NA	DAND5	20432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13153458	13153528	13153499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT1	72853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13231642	13232105	13231971	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	4725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	13274586	13275096	13274696	Y	GADD45GIP1,NACC1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	15357	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13275397	13275802	13275486	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	16168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	13324184	13324516	13324349	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	64955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13444695	13444933	13444906	Y	MAST1,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	185466	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13445795	13446271	13446068	Y	SYCE2	NA	NA	NA	NA	NA	IER2	186566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13597293	13597592	13597549	Y	C19orf57,CACNA1A	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA1A	135212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13732373	13732509	13732441	Y	NA	CACNA1A	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1A	295	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13743837	13744244	13743993	Y	NA	CACNA1A	CACNA1A	IMR90	Hi-C	24141950	CACNA1A	11033	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	13944359	13944683	13944571	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15	ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	40085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13954357	13954714	13954441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	13955108	13955589	13955298	Y	CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	50834	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	13975574	13976059	13975671	Y	CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	38955	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13976745	13977653	13977105	Y	CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	37361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr19	13995440	13995781	13995611	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	19233	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	13995889	13996057	13995977	Y	NA	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	18957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14084978	14085262	14085120	Y	NA	DCAF15,RFX1	NA	NA	NA	NA	DCAF15	23674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14097142	14097697	14097482	Y	CCDC130,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	DCAF15,RFX1,IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	18154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14274504	14274771	14274661	Y	C19orf57,RFX1,LPHN1	PRKACA,ASF1B,LPHN1	NA	NA	NA	NA	ASF1B	28736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14315596	14315828	14315635	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	597	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14320325	14320686	14320360	Y	NA	LPHN1	NA	NA	NA	NA	LPHN1	5326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	14636614	14636887	14636775	Y	OR7C2	GIPC1,TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	DNAJB1	1695	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14665322	14665552	14665478	Y	SLC1A6	TECR,DNAJB1,NDUFB7	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	15322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	15202796	15202947	15202871	Y	OR7C2	ILVBL	NA	NA	NA	NA	ILVBL	31649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3,EPHX3	NA	NA	NA	NA	EPHX3	7770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	15505627	15505808	15505718	Y	NA	AKAP8,AKAP8L	NA	NA	NA	NA	AKAP8	17018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	16477143	16477842	16477298	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	43515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	16492713	16493267	16492962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF2	59085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	16560891	16561165	16561157	Y	NA	EPS15L1,CALR3,C19orf44	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	19731	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	16779311	16779659	16779460	Y	NA	MED26,TMEM38A	NA	NA	NA	NA	TMEM38A	9373	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	17124642	17124654	17124646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAUS8	59781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	17604234	17604409	17604322	Y	NA	SLC27A1,PGLS,FAM129C	NA	NA	NA	NA	PGLS	16029	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18059806	18059879	18059816	Y	UNC13A,KCNN1	CCDC124,KCNN1	NA	NA	NA	NA	KCNN1	223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	18264934	18265291	18265179	Y	NA	PIK3R2,IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	PIK3R2	2966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	18405326	18405850	18405541	Y	JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	14439	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18498524	18498706	18498615	Y	ARRDC2,IFI30,JUND	PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	GDF15	14983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	18528819	18529396	18529072	Y	ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18606803	18607671	18607185	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,KLHL26,ELL,LRRC25	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	23266	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18760748	18761152	18761048	Y	COMP,CRLF1	TMEM59L,CRLF1,KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	KLHL26	14973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18793678	18793914	18793817	Y	PDE4C	KLHL26,CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	1191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	18811913	18812040	18811994	Y	UPF1,SLC25A42,JUND,FKBP8,UBA52,CRTC1	CRTC1	NA	NA	NA	NA	CRTC1	19426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	18874702	18875152	18875024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF1	65595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr19	19570650	19571032	19570761	Y	ZNF506,RFXANK,MAU2,GATAD2A,ZNF14,PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	53513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	20128543	20128860	20128736	Y	NA	ZNF682	NA	NA	NA	NA	ZNF682	19455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	20162886	20163252	20163139	Y	ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682	ZNF682,ZNF90	ZNF682,LOC284440	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF682	14571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	20337633	20337845	20337749	Y	ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF486	61596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	21767985	21768321	21768201	Y	ZNF708,ZNF493,ZNF429,ZNF100	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF429	90501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	23416597	23416606	23416602	Y	NA	ZNF724P	NA	NA	NA	NA	ZNF724P	14586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	23530488	23530791	23530760	Y	NA	ZNF91	NA	NA	NA	NA	ZNF91	45571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	28197525	28198373	28198039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1504075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	29096561	29096764	29096663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	605684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30131352	30131538	30131383	Y	NA	POP4	NA	NA	NA	NA	POP4	38428	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30195599	30196138	30195979	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	8226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30215159	30215467	30215313	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	10795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	30336581	30336824	30336781	Y	C19orf2,C19orf2	CCNE1	NA	NA	NA	NA	CCNE1	35776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30718140	30718340	30718240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	305589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	30752250	30752526	30752388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	339699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30864626	30864772	30864676	Y	ZNF536	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	452075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	30940722	30941004	30940861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	528171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	31041576	31041942	31041745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	629025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	31371885	31372199	31372043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	466254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	31841682	31842327	31842237	Y	NA	TSHZ3	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	3229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	33165229	33165376	33165346	Y	NA	RGS9BP,ANKRD27,NUDT19,TDRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD27	127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	33664629	33664677	33664651	Y	NA	LRP3	NA	NA	NA	NA	LRP3	1832	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	33977879	33978014	33977973	Y	SLC7A10	PEPD	NA	NA	NA	NA	PEPD	32686	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	34210649	34211032	34210767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD15	73806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	34259901	34260068	34259985	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	24770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	34850085	34850642	34850351	Y	ZNF599,ZNF302,ZNF181	GPI,PDCD2L	NA	NA	NA	NA	GPI	1700	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	35784331	35784508	35784434	Y	ZNF30,SCN1B,HPN,LGI4,FXYD1,FXYD7,MAG,ARHGAP33	LSR,USF2	NA	NA	NA	NA	USF2	26450	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	35821239	35821740	35821574	Y	USF2,ZBTB32,CD22	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	63358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36135988	36136183	36136108	Y	ARHGAP33	HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1	NA	NA	NA	NA	COX6B1	942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36345881	36346198	36346012	Y	FFAR2,TYROBP,NFKBID	KIRREL2,APLP1,NPHS1,NFKBID	NA	NA	NA	NA	KIRREL2	1118	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	36373129	36373360	36373222	Y	NA	KIRREL2,APLP1,NPHS1,NFKBID	NA	NA	NA	NA	NPHS1	14940	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	36519340	36519516	36519376	Y	ZNF565	SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62	NA	NA	NA	NA	CLIP3	2729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36666444	36666524	36666464	Y	NA	CAPNS1,ZNF146	NA	NA	NA	NA	ZNF146	36980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36879565	36879874	36879872	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	11464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	37156610	37156902	37156838	Y	ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	NA	NA	NA	NA	ZNF461	855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	2810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	37424676	37424848	37424761	Y	ZNF527,HKR1,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	19445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	38470537	38470671	38470619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	74669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	38491114	38491333	38491222	Y	PPP1R14A	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	95246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	39411140	39411539	39411467	Y	LGALS7	RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2	NA	NA	NA	NA	MRPS12	7649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	39621407	39621638	39621523	Y	NA	PAK4	NA	NA	NA	NA	PAK4	6997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	40042107	40042358	40042233	Y	NA	EID2B,EID2	DLL3,EID2,LGALS17A	IMR90	Hi-C	24141950	EID2	13237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	40283749	40284047	40283932	Y	NA	DYRK1B	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	38794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	40466097	40466407	40466254	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	8505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	41037324	41037469	41037389	Y	ZNF780B,MAP3K10,TTC9B,SPTBN4,SPTBN4	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	43288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	41267029	41267391	41267210	Y	NA	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	MIA	8162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42379575	42379860	42379642	Y	ZNF574,DEDD2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RPS19,CD79A,ARHGEF1	NA	NA	NA	NA	CD79A	385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42532310	42532673	42532485	Y	NA	ATP1A3,ZNF574	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	32661	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	42618693	42618808	42618754	Y	NA	ZNF574	NA	NA	NA	NA	ZNF574	48064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42756581	42756634	42756608	Y	ATP1A3,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	42784087	42784212	42784170	Y	CEACAM8,CEACAM3,DEDD2	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.01395325041661
chr19	42785500	42785936	42785827	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	14811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	42789863	42790090	42789919	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,DEDD2,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	14160	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	42913594	42913985	42913852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	85833	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	43770053	43770115	43770084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLDB3	236972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDB3	171245	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	44113081	44113405	44113330	Y	NA	XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4	NA	NA	NA	NA	ZNF428	8621	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	44555398	44555498	44555444	Y	ZNF155,ZNF223	ZNF222,ZNF223,ZNF284,ZNF224	NA	NA	NA	NA	ZNF223	1878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	44825986	44826083	44826035	Y	ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233	ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	18787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr19	45584780	45584791	45584786	Y	CEACAM16,NKPD1	CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	MARK4	4234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	45616872	45617353	45617125	Y	NA	ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37	NA	NA	NA	NA	PPP1R37	24218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	45905744	45905944	45905844	Y	EML2,KLC3,PPP1R13L,ERCC1,ERCC1	ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	1523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr19	45980345	45980732	45980359	Y	GIPR,FBXO46,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,FOSB,PPM1N	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	ERCC1	259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	45999277	45999601	45999579	Y	NOVA2,DMPK,RTN2,RTN2	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	RTN2	958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	46386037	46386278	46386146	Y	OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	IRF2BP1	1098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	46398825	46399093	46398978	Y	EML2,EML2	SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	MYPOP	4769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	46876247	46876539	46876393	Y	NA	PPP5C	NA	NA	NA	NA	PPP5C	27996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	46930027	46930174	46930086	Y	NA	PNMAL1	CCDC8,LOC100506012	IMR90	Hi-C	24141950	PNMAL1	42646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR,GNG8,DACT3	NA	NA	NA	NA	GNG8	6253	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.53648724195395
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM160	90655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	47742856	47743228	47743000	Y	NA	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	BBC3	8833	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr19	47886542	47886975	47886851	Y	GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	33805	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47892475	47892975	47892646	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34,MEIS3	NA	NA	NA	NA	MEIS3	27805	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47949356	47949644	47949521	Y	NA	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	23781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	47950200	47950556	47950503	Y	SLC8A2	MEIS3,SLC8A2,KPTN	NA	NA	NA	NA	SLC8A2	22869	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTSCR2	94651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48222362	48222481	48222377	Y	SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2	GLTSCR2	NA	NA	NA	NA	GLTSCR2	24298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48587136	48587233	48587185	Y	LMTK3,PLA2G4C	PLA2G4C	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	24841	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48596127	48596433	48596418	Y	NA	PLA2G4C	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	15641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48611187	48611296	48611243	Y	EMP3	PLA2G4C	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48642255	48642637	48642446	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	29223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	48896382	48896733	48896528	Y	GRIN2D	TMEM143,SYNGR4,KDELR1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	3572	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	48974873	48974967	48974920	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	4584	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	49315464	49315783	49315738	Y	NA	BCAT2	NA	NA	NA	NA	BCAT2	3178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	50323482	50323712	50323595	Y	MED25	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP	NA	NA	NA	NA	MED25	3943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr19	50362574	50362883	50362717	Y	PRRG2,MYH14,PNKP	FUZ,MED25,PTOV1,PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750	NA	NA	NA	NA	PNKP	6283	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	50414628	50414884	50414779	Y	RPS11,FCGRT,NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	PNKP,TBC1D17,AKT1S1,MIR4750,ATF5,IL4I1,NUP62	NA	NA	NA	NA	ATF5	15075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	50640094	50640250	50640214	Y	KCNC3	NA	NA	NA	NA	NA	VRK3	112891	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	50860908	50861268	50861186	Y	PNKP,VRK3,NR1H2	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	24193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	51198423	51198838	51198828	Y	KLK6,KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1	SYT3	NA	NA	NA	NA	SYT3	28772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48,KLK3	NA	NA	NA	NA	KLK3	16557	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr19	51672217	51672370	51672284	Y	SIGLEC8,SIGLEC6	NA	NA	NA	NA	NA	CTU1	62590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	51930485	51930778	51930623	Y	SIGLEC9,CD33,SIGLEC14,FPR3,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ETFB	62813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	119534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	52194056	52194504	52194155	Y	ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	121505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF175	122043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	52299371	52299818	52299543	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF577	92385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	52320046	52320281	52320149	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF577	71922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	52333546	52333919	52333739	Y	ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF577	58284	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	53145294	53145545	53145446	Y	NA	ZNF83	NA	NA	NA	NA	ZNF83	46204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	53150651	53150972	53150733	Y	NA	ZNF83	ZNF137P	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF83	40777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	53237186	53237523	53237297	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611	ZNF83,ZNF611	NA	NA	NA	NA	ZNF611	860	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	53449736	53449992	53449814	Y	ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347,ZNF83	ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	5882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	53635063	53635358	53635174	Y	ZNF160,ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF347,ZNF347	ZNF160,ZNF415,ZNF347	NA	NA	NA	NA	ZNF415	733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	53660263	53660559	53660411	Y	NA	ZNF415,ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF347	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	TMC4,MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	55619280	55619321	55619308	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	7606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	SUV420H2,COX6B2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr19	56098668	56099098	56098905	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	8457	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	56118803	56119132	56118967	Y	COX6B2	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	7467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	56169893	56170373	56169939	Y	NA	ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1	NA	NA	NA	NA	U2AF2	6381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	56603212	56603388	56603235	Y	ZSCAN5A,NLRP11,NLRP8,NLRP5	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	27261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF667,ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	57349423	57349757	57349684	Y	ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3	PEG3,ZIM2	NA	NA	NA	NA	PEG3	339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	57351144	57351414	57351350	Y	ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3	PEG3,ZIM2	NA	NA	NA	NA	ZIM2	1047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	58317986	58318160	58318072	Y	NA	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	6121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58413801	58413982	58413868	Y	ZNF154,ZNF418	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	11996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	58415823	58415990	58415970	Y	NA	ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256	NA	NA	NA	NA	ZNF417	9988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135	NA	NA	NA	NA	ZNF135	10951	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58784706	58785064	58784920	Y	NA	ZNF544,ZNF8,ERVK3-1	NA	NA	NA	NA	ZNF8	3254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr19	58824678	58824957	58824818	Y	ZNF256	ZNF8,ERVK3-1,ZSCAN22,A1BG-AS1,A1BG,ZNF497	NA	NA	NA	NA	ERVK3-1	9963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.59871670727006
chr19	59049687	59049971	59049795	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr19	59050036	59050316	59050176	Y	ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	ZBTB45	1758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr19	59058033	59058475	59058195	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	TRIM28	4575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr19	59087419	59087864	59087514	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1	NA	NA	NA	NA	MZF1	4477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	314323	314661	314512	Y	NA	SH3YL1	SNTG2	IMR90	Hi-C	24141950	SH3YL1	49925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	739928	740199	740059	Y	NA	NA	TMEM18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM18	64489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	857378	857399	857389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTG2	87155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	1858495	1858644	1858520	Y	MYT1L	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	111871	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	1999873	1999971	1999922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	253249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	2105199	2105393	2105246	Y	MYT1L	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	227639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	2468009	2468259	2468065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	134977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	284052	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.95172378510049
chr2	2850815	2851100	2850821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYT1L	517783	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	3072634	3072961	3072804	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	306692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	3106532	3106816	3106764	Y	NA	NA	MYT1L	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	272837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	3151866	3152164	3152133	Y	NA	NA	TSSC1	IMR90	Hi-C	24141950	TSSC1	227489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	14.671691191178
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	3352595	3352738	3352719	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	26915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	3699787	3700199	3700016	Y	NA	TMSB4XP2	NA	NA	NA	NA	TMSB4XP2	36440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	6912526	6912690	6912595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMPK2	92076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	7086912	7087171	7087063	Y	CMPK2,RSAD2	RNF144A	NA	NA	NA	NA	RNF144A	31389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	8872785	8872976	8872902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.7	52792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	9678248	9678641	9678477	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	15280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	10341486	10341905	10341708	Y	KLF11	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	81031	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	10549320	10549595	10549372	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	NA	NA	NA	NA	ODC1	37035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	11531800	11532088	11531893	Y	NTSR2,KCNF1,C2orf50	ROCK2	ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ROCK2	45344	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	15199994	15200355	15200088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	499099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	15481171	15481552	15481362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	217902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	15594564	15594826	15594695	Y	DDX1,NBAS	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	104628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	15966617	15966728	15966673	Y	NA	RP11-120J4.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J4.1	41335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	16831579	16831850	16831761	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	13749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	17005594	17005646	17005620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	159995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	17129381	17129602	17129494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	283782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	19766934	19767238	19767086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	299383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	19788015	19788399	19788228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	278222	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	19979815	19980059	19979937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00954	86562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	20965440	20965780	20965672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	55102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	21474623	21474859	21474741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	453741	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	21518335	21518607	21518471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C2orf43	497453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	23470334	23470602	23470561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	135486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	23840114	23840588	23840464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	234026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	24324329	24324521	24324426	Y	NA	SF3B14,TP53I3,PFN4	NA	NA	NA	NA	TP53I3	17598	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	24713346	24713697	24713476	Y	DNAJC27,ITSN2	NCOA1	CENPO,NCOA1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA1	563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	139264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	24859370	24859696	24859496	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	146587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	25084468	25084617	25084543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY3	56091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	25438901	25439135	25438983	Y	PTRHD1,ADCY3	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	124324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	25473699	25473887	25473786	Y	EFR3B	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	89572	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	25514055	25514238	25514170	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	49221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	26184450	26184595	26184522	Y	NA	KIF3C,UQCRHP2	NA	NA	NA	NA	KIF3C	19023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	26225024	26225227	26225115	Y	RAB10	KIF3C,UQCRHP2,RAB10	RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UQCRHP2	9361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27069178	27069486	27069284	Y	NA	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27072078	27072262	27072179	Y	UCN,CCDC164,OTOF,MAPRE3,DPYSL5	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	3463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	27073037	27073234	27073155	Y	NA	DPYSL5	NA	NA	NA	NA	DPYSL5	4422	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr2	27574731	27574755	27574743	Y	NA	MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3	NA	NA	NA	NA	AC074117.10	2358	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27631105	27631216	27631160	Y	C2orf16	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3	NA	NA	NA	NA	PPM1G	551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	27988549	27989353	27988873	Y	NA	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	3231	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	29026080	29026331	29026243	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	SPDYA	NA	NA	NA	NA	SPDYA	22697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	29050679	29050871	29050775	Y	NA	SPDYA,TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	40296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	29075660	29075992	29075826	Y	TRMT61B	TRMT61B,WDR43	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	15175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	29439591	29440302	29440265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLIP4	121020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	30108426	30108767	30108751	Y	ALK	ALK	NA	NA	NA	NA	ALK	33665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	30449373	30449624	30449515	Y	YPEL5	LBH,AC104698.1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	2773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	30788740	30788786	30788763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	120648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	30791728	30792075	30791902	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	123636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37116938	37117262	37117216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	74353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37432341	37432705	37432523	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	24151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37497492	37497655	37497574	Y	HEATR5B	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	40636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37815586	37815764	37815605	Y	EIF2AK2,CYP1B1,CDC42EP3	NA	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	147847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37864248	37864629	37864487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	98982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37868257	37868517	37868387	Y	EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	95094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37881606	37881960	37881783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	81651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	38265442	38265742	38265584	Y	CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	190968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	40484262	40484526	40484482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	351667	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	40676285	40676532	40676459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	159661	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	40677210	40677858	40677371	Y	NA	NA	LOC100128590	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	158335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	42360195	42360705	42360352	Y	EML4	EML4	EML4,COX7A2L,LOC388942	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	33785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	42481657	42481775	42481735	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	EML4	87167	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	42783314	42783348	42783329	Y	NA	NA	MTA3	IMR90	Hi-C	24141950	MTA3	63605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	317515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTA3	318920	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	43157114	43157487	43157153	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	294261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	43396497	43396745	43396689	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	LOC100129726,ZFP36L2,THADA	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	55003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	43530162	43530544	43530351	Y	NA	NA	LOC100129726,ZFP36L2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	78414	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	44542790	44543096	44543052	Y	SLC3A1	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	43905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	44577605	44577885	44577745	Y	NA	PREPL,CAMKMT	NA	NA	NA	NA	PREPL	9116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	45177079	45177275	45177123	Y	NA	RP11-89K21.1,SIX3,SIX3-AS1,AC012354.8	NA	NA	NA	NA	SIX3-AS1	10067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	46857387	46857788	46857588	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	PIGF	15129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	46928465	46928698	46928588	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	SOCS5	NA	NA	NA	NA	SOCS5	4374	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	47214273	47214540	47214407	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	47279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	48118003	48118146	48118074	Y	NA	FBXO11	NA	NA	NA	NA	FBXO11	12786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	35289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50198856	50199193	50199025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	855623	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50445313	50445652	50445545	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	609164	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50455904	50456240	50456115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	598576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	423074	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	50637304	50637504	50637355	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	417312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50701819	50701837	50701828	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	352979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50743315	50743645	50743480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	311171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	50778633	50778874	50778754	Y	NRXN1,NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	275942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	51011974	51012360	51012310	Y	NRXN1,NRXN1	AC007560.1	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	42456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	51065604	51065768	51065686	Y	NA	AC007560.1	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	10788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	51092337	51092826	51092639	Y	NRXN1	AC007560.1	NA	NA	NA	NA	AC007560.1	37521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	51438169	51438482	51438325	Y	NA	NA	NRXN1	IMR90	Hi-C	24141950	NRXN1	180495	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	53966054	53966447	53966241	Y	PSME4	CHAC2,ERLEC1	NA	NA	NA	NA	CHAC2	26482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	54971761	54972012	54971777	Y	NA	EML6	NA	NA	NA	NA	EML6	23125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	55193261	55193511	55193360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	144246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr2	56267618	56267636	56267627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPT1	348573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	56682750	56682916	56682833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNPT1	763705	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	58105448	58105884	58105678	Y	NA	VRK2	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	VRK2	26902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60165399	60165612	60165520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	444128	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60693527	60693793	60693660	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	83787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60694019	60694324	60694172	Y	BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	84279	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	67204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60732807	60733201	60733004	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	45501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60747849	60747913	60747881	Y	PEX13,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	30789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60756305	60756611	60756498	Y	REL	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	22091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr2	60760023	60760353	60760231	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	18349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60776650	60777166	60776879	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	1536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60778604	60778787	60778696	Y	REL,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60779041	60779656	60779263	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	60795566	60795727	60795647	Y	KIAA1841,KIAA1841,BCL11A	BCL11A	FLJ30838	IMR90	Hi-C	24141950	BCL11A	16864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	60962204	60962802	60962781	Y	NA	PAPOLG	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	18563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	RNU4-51P	NA	NA	NA	NA	RNU4-51P	28925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	61428317	61428371	61428344	Y	USP34,AHSA2	AHSA2	NA	NA	NA	NA	AHSA2	25764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	61990946	61991094	61991044	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	88184	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	62375163	62375426	62375211	Y	B3GNT2	B3GNT2	NA	NA	NA	NA	B3GNT2	45822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	63514058	63514136	63514097	Y	WDPCP	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	238866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	64957479	64957902	64957679	Y	NA	SERTAD2	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	18237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr2	65146455	65146831	65146643	Y	RAB1A,ACTR2,SLC1A4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	66780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65164955	65165343	65165268	Y	SLC1A4	SLC1A4	LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A4	48268	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65166338	65166539	65166535	Y	NA	SLC1A4	LOC400958,SLC1A4,CEP68,SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC1A4	47072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65214378	65214996	65214823	Y	NA	SLC1A4	NA	NA	NA	NA	SLC1A4	767	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65656801	65657217	65657146	Y	NA	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	66652427	66652950	66652646	Y	MEIS1	MEIS1,MEIS1-AS3	LOC644838	IMR90	Hi-C	24141950	MEIS1	5634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	66804515	66804719	66804617	Y	MEIS1	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1-AS3	145913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr2	68964261	68964640	68964319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO48	271871	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	70141198	70141461	70141241	Y	NA	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	18378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	70346022	70346119	70346054	Y	NA	PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	18339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	71228347	71228418	71228366	Y	ANKRD53	ANKRD53,TEX261	TEX261	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TEX261	8272	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	71679813	71679928	71679869	Y	NAGK,ZNF638,DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	71863629	71863881	71863809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYSF	184777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	73318348	73318566	73318457	Y	NA	SFXN5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	17601	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	73774930	73775287	73775109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALMS1	164044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	74408934	74409182	74409080	Y	NAT8B,TET3,MOBKL1B	BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MOB1A	4909	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	74647656	74647929	74647851	Y	SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81	DCTN1,C2orf81,WDR54,INO80B,WBP1,MOGS	NA	NA	NA	NA	WDR54	851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	74793766	74794164	74794010	Y	WBP1,LBX2,LOXL3,DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	12949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	74804828	74804964	74804881	Y	MOBKL1B,DOK1	AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	24011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	75043732	75043824	75043778	Y	NA	HK2	HK2,SEMA4F	IMR90	Hi-C	24141950	HK2	15284	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	78401270	78401306	78401289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	387762	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	78683398	78683574	78683486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	669890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	80371410	80371698	80371551	Y	NA	AC016716.1	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	16563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	81107061	81107275	81107187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRTM1	577187	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	RETSAT	84801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86102907	86103036	86102912	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	11101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86103135	86103528	86103332	Y	NA	ST3GAL5	NA	NA	NA	NA	ST3GAL5	10609	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86113603	86114063	86113862	Y	CAPG,GNLY,ST3GAL5	ST3GAL5	LOC284950	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	74	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	86120990	86121249	86121122	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	6853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86129642	86129982	86129887	Y	NA	ST3GAL5	ST3GAL5,POLR1A	IMR90	Hi-C	24141950	ST3GAL5	15505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86262586	86262681	86262652	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	68597	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	86262986	86263343	86263241	Y	GNLY,KDM3A,KDM3A,PTCD3	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	67935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	87014966	87015089	87014978	Y	CD8B,CD8A,KDM3A,KDM3A,RNF103,CD8A	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP3,RNF103-CHMP3	68721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	88913679	88914090	88914022	Y	EIF2AK3	EIF2AK3	NA	NA	NA	NA	EIF2AK3	11004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	91759872	91760090	91759934	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2696548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2752502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2758114	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD36BP2	2872873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	95961879	95962169	95961976	Y	TRIM43,KCNIP3	KCNIP3	NA	NA	NA	NA	KCNIP3	827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	95972113	95972447	95972295	Y	KCNIP3	KCNIP3	NA	NA	NA	NA	KCNIP3	11061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	96911483	96911666	96911570	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1	NA	NA	NA	NA	TMEM127	18066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	96922307	96922515	96922363	Y	DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127	STARD7,TMEM127,CIAO1,SNRNP200	NA	NA	NA	NA	TMEM127	7217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	96995983	96996007	96995995	Y	ITPRIPL1,ITPRIPL1	SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH	NA	NA	NA	NA	NCAPH	3518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	97206009	97206227	97206118	Y	NA	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	5529	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	97554359	97554681	97554500	Y	NA	ANKRD23,ANKRD39,SEMA4C	NA	NA	NA	NA	SEMA4C	19865	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-8P	164017	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	98598628	98598759	98598694	Y	NA	TMEM131	NA	NA	NA	NA	TMEM131	11629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	100576722	100576856	100576853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF2	360339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	LONRF2	NA	NA	NA	NA	LONRF2	139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	101669826	101670190	101670079	Y	TBC1D8	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	53649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	102327240	102327383	102327307	Y	NA	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	15928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	105430210	105430587	105430504	Y	NA	LINC01158	NA	NA	NA	NA	LINC01158	37054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	105459435	105459826	105459464	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	7815	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	105460930	105461348	105461055	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	6293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	105461382	105461873	105461636	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	5768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr2	105466558	105467231	105466773	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01158	410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	105489803	105490153	105490078	Y	GPR45,POU3F3	LINC01158,LINC01159	NA	NA	NA	NA	LINC01159	2750	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	106414093	106414226	106414159	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	54739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	106474357	106474542	106474414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	115003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	107891171	107891467	107891465	Y	ST6GAL2,ST6GAL2	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL2	389607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	109206329	109206788	109206425	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	57472	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	111829364	111829577	111829485	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	45378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	111874507	111874890	111874668	Y	NA	BCL2L11	NA	NA	NA	NA	BCL2L11	65	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	112811776	112811937	112811878	Y	ZC3H6	TMEM87B	NA	NA	NA	NA	TMEM87B	976	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	113058633	113059002	113058901	Y	NA	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H6	27462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	114644100	114644364	114644199	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	1173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	114653014	114653311	114653090	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	7477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	DPP10	NA	NA	NA	NA	DPP10	20172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	115420103	115420171	115420136	Y	DPP10,DPP10,DPP10,DPP10	NA	NA	NA	NA	NA	DPP10	222227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	115897297	115897567	115897434	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	19353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	115925055	115925428	115925242	Y	NA	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	8135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	115944602	115944633	115944617	Y	DPP10,DPP10,DPP10	DPP10-AS1	NA	NA	NA	NA	DPP10-AS1	27682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	118578074	118578451	118578195	Y	CCDC93,DDX18	DDX18	NA	NA	NA	NA	DDX18	7848	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	119067655	119067950	119067737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	125693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr2	119121251	119121438	119121319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093901.1	179289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	119698034	119698388	119698200	Y	DBI	NA	NA	NA	NA	NA	EN1	94780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	120025136	120025424	120025403	Y	DBI	STEAP3	NA	NA	NA	NA	STEAP3	45752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	121650745	121651146	121650942	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	159546	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	122226715	122226882	122226860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC	59575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	125298610	125298776	125298693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP5	517746	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	126952645	126952866	126952756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YWHAZP2	360873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	127863441	127863795	127863513	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	128470034	128470252	128470136	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	13437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	129074706	129075071	129074888	Y	NA	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	129194918	129195025	129194997	Y	HS6ST1	NA	NA	NA	NA	NA	HS6ST1	120767	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	131582042	131582382	131582235	Y	NA	ARHGEF4	ARHGEF4	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF4	10107	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	132426552	132426927	132426662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093838.4	178166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	133035126	133035421	133035327	Y	NA	NA	ANKRD30BL	IMR90	Hi-C	24141950	LYPD1	391731	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	135054765	135054954	135054860	Y	MGAT5	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	179211	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	136268329	136268541	136268430	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	ZRANB3	18265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	136314098	136314477	136314288	Y	NA	ZRANB3,R3HDM1	NA	NA	NA	NA	R3HDM1	27073	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	136783030	136783335	136783274	Y	NA	AC093391.2,DARS	NA	NA	NA	NA	DARS	41360	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	137755829	137756118	137755974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSD7B	234714	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	138845772	138845790	138845781	Y	NA	NA	HNMT	IMR90	Hi-C	24141950	AC097721.2	411478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	139198512	139198615	139198564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	58653	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	141284265	141284563	141284414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP1B	1602707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	144769205	144769351	144769311	Y	GTDC1,GTDC1	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	318784	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	145338212	145338608	145338410	Y	NA	NA	ZEB2	K562	ChIA-PET	22265404	ZEB2	58065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	148089200	148089222	148089211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	510864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	148389005	148389228	148389160	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR2A	210858	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	149017229	149017560	149017414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ORC4	240082	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr2	149634441	149634782	149634502	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	3622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	149645940	149646152	149646140	Y	KIF5C	KIF5C	NA	NA	NA	NA	KIF5C	15121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	149819679	149819759	149819686	Y	KIF5C	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6B	72862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	150222263	150222576	150222421	Y	NA	LYPD6	NA	NA	NA	NA	LYPD6	37764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	150440132	150440521	150440417	Y	NA	AC144449.1,MMADHC	NA	NA	NA	NA	AC144449.1	1189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	150644765	150645076	150644921	Y	NA	NA	RND3	IMR90	Hi-C	24141950	MMADHC	202435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	151330104	151330756	151330441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	62769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	151567491	151567674	151567620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RND3	173966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	152627978	152628361	152628290	Y	NA	NEB	NA	NA	NA	NA	NEB	38977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	153309679	153309745	153309721	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4,FMNL2,ARL6IP6	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	119928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	154442869	154442990	154442930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	109547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	154495676	154495864	154495770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPRM	162354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	156832393	156832495	156832444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	364365	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	156949297	156949674	156949418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR4A2	247186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	157257270	157257340	157257305	Y	NA	GPD2	NR4A2,GALNT5,GPD2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GPD2	32462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	157659765	157659881	157659802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD2	369963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	159855059	159855514	159855150	Y	NA	TANC1	NA	NA	NA	NA	TANC1	31913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	160106082	160106269	160106215	Y	MARCH7	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	35041	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	160350650	160351006	160350912	Y	MARCH7,CD302,BAZ2B	AC009506.2	NA	NA	NA	NA	AC009506.2	32883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	160411225	160411529	160411489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	59674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	160470388	160470776	160470715	Y	NA	BAZ2B	NA	NA	NA	NA	BAZ2B	427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	161098241	161098623	161098428	Y	ITGB6	NA	TANK,ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4785	163770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	161201536	161201707	161201641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	60686	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	162095171	162095411	162095272	Y	TBR1,SLC4A10	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD14	67138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	162932296	162932524	162932410	Y	NA	EIF3EP2	NA	NA	NA	NA	EIF3EP2	10245	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	163170742	163170802	163170773	Y	NA	IFIH1,GCA	NA	NA	NA	NA	IFIH1	2411	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	163222961	163223077	163223019	Y	KCNH7,GCA	IFIH1,GCA	NA	NA	NA	NA	GCA	49611	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	163578974	163579343	163579088	Y	KCNH7	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH7	113897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	164395243	164395443	164395343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGN	195079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	78868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	166491383	166491530	166491513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT3	157662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	166671246	166671486	166671366	Y	CSRNP3	GALNT3	NA	NA	NA	NA	GALNT3	22054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr2	166796102	166796135	166796119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	12218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	166842018	166842187	166842119	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	33665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	166982475	166982914	166982672	Y	SCN1A,SCN1A	NA	NA	NA	NA	NA	SCN1A	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	166983519	166983786	166983732	Y	NA	SCN1A	NA	NA	NA	NA	SCN1A	996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr2	168150182	168150557	168150197	Y	NA	AC074363.1	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	2501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	168263159	168263570	168263327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	115478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	168291941	168292335	168292012	Y	B3GALT1	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	144260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	168366215	168366278	168366264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074363.1	218534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	168633177	168633438	168633308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	469213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	169203110	169203445	169203278	Y	NA	NA	ABCB11,CERS6,NOSTRIN,LOC100861402	IMR90,Islet	Hi-C,4C	24141950,24413736	STK39	100459	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	169434382	169434732	169434541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	124010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	169894823	169895302	169894971	Y	DHRS9,DHRS9	NA	ABCB11	K562	ChIA-PET	22265404	SPC25	126942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	169967622	169967787	169967727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPC25	199741	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	170856738	170857087	170856755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR3	174770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	171679560	171679730	171679653	Y	NA	GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	11837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	171830049	171830396	171830113	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	47075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	173306862	173307108	173306983	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	16780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	173316258	173316587	173316571	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	26176	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	175036157	175036485	175036321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLA1	74941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	175459812	175460479	175460357	Y	CIR1,GPR155,WIPF1	AC018890.6	NA	NA	NA	NA	AC018890.6	49943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	175465107	175465494	175465405	Y	CIR1,WIPF1	NA	NA	NA	NA	NA	AC018890.6	55238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	175519164	175519290	175519227	Y	NA	WIPF1	NA	NA	NA	NA	WIPF1	26354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	175708423	175708587	175708507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRNA1	81223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	176969861	176970296	176970124	Y	HOXD13,HOXD9,HOXD8,HOXD8,HOXD3,HOXD11,HOXD10	HOXD13,HOXD11,HOXD10,HOXD9,HOXD8,HOXD3,HOXD-AS2	NA	NA	NA	NA	HOXD10	1222	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	7.19743341454013
chr2	177419249	177419407	177419328	Y	NA	NA	HOXD-AS1,HOXD1,HOXD4,MIR10B,HOXD-AS2,HOXD8	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01117	81031	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	177518737	177518933	177518835	Y	NA	LINC01117,LINC01116	HOXD10,HOXD11,HOXD8,HOXD-AS2,HOXD9,HOXD4,MIR10B	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01116	18078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	182258262	182258376	182258308	Y	ITGA4	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA4	61553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	185595976	185596316	185596146	Y	ZNF804A	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF804A	134883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	187455745	187456210	187455889	Y	NA	ITGAV	NA	NA	NA	NA	ITGAV	2953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	187601377	187601405	187601389	Y	ZSWIM2,FAM171B	FAM171B	NA	NA	NA	NA	FAM171B	44679	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	188214138	188214480	188214300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALCRL	96707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	188414787	188415077	188415012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALCRL	103600	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	190324760	190324912	190324838	Y	NA	WDR75	NA	NA	NA	NA	WDR75	20601	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	190739432	190739578	190739518	Y	NA	C2orf88	NA	NA	NA	NA	C2orf88	2757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	191447882	191447975	191447929	Y	NA	NA	TMEM194B,NAB1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	50434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	191492626	191492865	191492683	Y	INPP1,STAT1,NAB1	NAB1	MFSD6	IMR90	Hi-C	24141950	NAB1	16607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	191980034	191980494	191980355	Y	STAT4	NA	NA	NA	NA	NA	STAT1	96348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	192031058	192031440	192031249	Y	NA	NA	STAT1,MYO1B,STAT4,OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	76471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	192082382	192082563	192082473	Y	MYO1B,MYO1B	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	25348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	192482352	192482618	192482501	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	374441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	192915570	192915970	192915770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	142465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	197023417	197023933	197023871	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	15294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	197623019	197623245	197623231	Y	NA	GTF3C3	NA	NA	NA	NA	GTF3C3	39204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	197787148	197787421	197787192	Y	NA	PGAP1	NA	NA	NA	NA	PGAP1	3099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	198143933	198144271	198144067	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,PGAP1,ANKRD44	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	18098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	199736102	199736481	199736292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	583942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2-AS1	110514	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	200328743	200328999	200328976	Y	SATB2,SATB2,SATB2	SATB2-AS1,SATB2	NA	NA	NA	NA	SATB2	4990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	201397001	201397079	201397012	Y	NA	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	14494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,AC005037.3,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	202302698	202302857	202302778	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR	TRAK2	NA	NA	NA	NA	TRAK2	11445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr2	203239784	203239912	203239798	Y	NA	BMPR2	NA	NA	NA	NA	BMPR2	125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	204553496	204553837	204553643	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	ABI2	362554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	204655322	204655465	204655389	Y	NA	NA	RAPH1	IMR90	Hi-C	24141950	ABI2	464380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	206571507	206572136	206571741	Y	NRP2,INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	26793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	208175027	208175372	208175141	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF7	145036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1	NA	NA	NA	NA	CREB1	2961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	208883092	208883191	208883110	Y	PTH2R,C2orf80	PLEKHM3	NA	NA	NA	NA	PLEKHM3	5093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	210377827	210378108	210377968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	91045	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	210442932	210443275	210443104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2	156150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	212897670	212897774	212897723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERBB4	503791	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	213400949	213401339	213401014	Y	ERBB4	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	213401643	213402097	213401658	Y	NA	ERBB4	NA	NA	NA	NA	ERBB4	78	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	214053816	214053901	214053846	Y	NA	NA	IKZF2	IMR90	Hi-C	24141950	SPAG16	93212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	215735917	215736192	215736055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BARD1	63489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREG	338167	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	216865894	216866240	216866102	Y	TMEM169,PECR,MREG	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	30579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	216867934	216868318	216868147	Y	TMEM169	MREG	NA	NA	NA	NA	MREG	28501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	217487227	217487455	217487235	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	DIRC3,IGFBP2,XRCC5,RPL37A,IGFBP5,RUFY4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGFBP2	8096	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr2	217501395	217501614	217501574	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	5844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	AC007563.5	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	217557565	217558269	217557956	Y	NA	AC007563.5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	217561099	217561345	217561263	Y	NA	AC007563.5,IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	2851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	218038981	218039219	218039100	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	480733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	218701196	218701490	218701305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIRC3	81880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1,VIL1	NA	NA	NA	NA	VIL1	9441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1,PLCD4	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	219704181	219704419	219704343	Y	SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1	WNT6,WNT10A	PRKAG3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT6	18125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	219744343	219744437	219744385	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	1258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	219759139	219759434	219759370	Y	WNT6,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	219760047	219760178	219760137	Y	WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	16962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	219761045	219761550	219761369	Y	USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A	WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	WNT10A	17960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	30430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	WNT10A,CDK5R2	NA	NA	NA	NA	WNT10A	31023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	219827943	219828258	219828078	Y	USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV	CDK5R2,FEV,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	5566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr2	219844869	219844996	219844902	Y	NA	CDK5R2,FEV,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	FEV	3383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	219861860	219861953	219861873	Y	USP37,ZNF142,FEV,CRYBA2,CRYBA2	CDK5R2,FEV,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	AC097468.4	2984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr2	219862366	219862575	219862480	Y	FEV	CDK5R2,FEV,CRYBA2,AC097468.4	NA	NA	NA	NA	AC097468.4	2362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	220376290	220376386	220376338	Y	ATG9A,DNPEP,STK11IP	GMPPA,TMEM198,CHPF	NA	NA	NA	NA	GMPPA	14701	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	222356179	222356366	222356273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA4	80556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	223343104	223343424	223343264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGPP2	55868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	225621293	225621621	225621457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	173183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	225851171	225851334	225851274	Y	DOCK10	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	53828	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	225857926	225857937	225857931	Y	NA	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	47225	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	225878647	225879031	225878803	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	26131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	225880660	225880871	225880768	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	24291	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	225905656	225906528	225906251	Y	CUL3,DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr2	227666599	227666819	227666709	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	4124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	230118973	230119267	230119206	Y	NA	PID1	NA	NA	NA	NA	PID1	14734	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	230166079	230166484	230166243	Y	PID1	PID1	DNER	IMR90	Hi-C	24141950	PID1	32078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	230435730	230436079	230435905	Y	SLC16A14	NA	NA	NA	NA	NA	DNER	141195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	230736228	230736612	230736477	Y	SP110	FBXO36,TRIP12	NA	NA	NA	NA	FBXO36	48406	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232176754	232176953	232176854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	57944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD82	93034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr2	232470282	232470477	232470427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	77076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232478392	232478857	232478528	Y	DIS3L2,PTMA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr2	232479434	232479727	232479552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	86228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232485741	232486244	232485851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	83361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	232531704	232531853	232531745	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	232532385	232532510	232532473	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	37095	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	232537231	232537488	232537452	Y	DIS3L2,PTMA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	32117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	232542757	232542767	232542764	Y	NA	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	26838	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr2	232547138	232547293	232547212	Y	PTMA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	22312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.42918979356316
chr2	232548018	232548333	232548221	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	21272	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr2	232549031	232549446	232549147	Y	NA	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	20159	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	232582048	232582308	232582138	Y	NCL,PTMA	PTMA	NA	NA	NA	NA	PTMA	12443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	232840477	232840577	232840527	Y	DIS3L2	DIS3L2	NA	NA	NA	NA	DIS3L2	16522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	233367792	233368150	233367876	Y	ALPP,GIGYF2,ALPI,ECEL1,PRSS56,TIGD1	ECEL1,EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	ECEL1	17254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	233377568	233377661	233377601	Y	ECEL1,PRSS56	ECEL1,EIF4E2,TIGD1	MIR1471,ECEL1P2	IMR90	Hi-C	24141950	ECEL1	27030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	233654871	233654934	233654903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	94862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	233807501	233807636	233807561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GIGYF2	247492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	235862299	235862667	235862586	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	3682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	235905010	235905389	235905297	Y	SH3BP4	SH3BP4	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	46393	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	236552972	236553189	236553098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	152239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	236910231	236910384	236910319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	163706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237016237	237016450	237016344	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	57640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237481215	237481391	237481283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	67030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237482983	237483115	237483021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	68798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	237764752	237765407	237765371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237765492	237765769	237765631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	226186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237881431	237881780	237881646	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	110175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	237933842	237934085	237933935	Y	NA	NA	CXCR7,IQCA1,ASB18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS8	57870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	73576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	238136450	238136659	238136506	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	143990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	238968617	238969014	238968782	Y	NA	SCLY,ESPNL	NA	NA	NA	NA	SCLY	1087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	KLHL30,FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	239129575	239129683	239129630	Y	NA	ILKAP,HES6	NA	NA	NA	NA	HES6	17620	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240144176	240144295	240144274	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240207977	240208290	240208163	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	112840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240213505	240213689	240213606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	107441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240248408	240248826	240248656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	72304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240291335	240291754	240291620	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	29376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	240321591	240321797	240321685	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	HDAC4	243	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	240920223	240920529	240920311	Y	NA	NDUFA10	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	42290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	241718828	241719056	241718959	Y	NA	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	241719064	241719393	241719333	Y	KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	38332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	241719463	241720148	241720097	Y	ANKMY1,AQP12B,AQP12A,KIF1A	KIF1A	NA	NA	NA	NA	KIF1A	37577	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	241771658	241772038	241771862	Y	KIF1A	KIF1A	ANKMY1,RNPEPL1,CAPN10,KIF1A,C2orf54,SNED1,PASK,HDLBP,ANO7,PPP1R7	IMR90	Hi-C	24141950	KIF1A	13933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr2	242455386	242455795	242455485	Y	NEU4,C2orf85	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	STK25	8241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	15237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	242702443	242702859	242702736	Y	ATG4B,PDCD1,D2HGDH	D2HGDH	NA	NA	NA	NA	D2HGDH	30449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	242801923	242802843	242802016	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	18671	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr2	242833644	242833731	242833683	Y	NA	AC131097.3	NA	NA	NA	NA	AC131097.3	12130	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	290991	291448	291293	Y	C20orf54	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	12759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr20	652993	653392	653352	Y	NA	SRXN1,SCRT2	NA	NA	NA	NA	SCRT2	1431	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1,TMEM74B	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	1267390	1267580	1267486	Y	SIRPG	SNPH	LOC100507495,FKBP1A-SDCBP2	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	22430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	1372569	1372994	1372930	Y	PSMF1,SDCBP2,SIRPB2,SIRPB1	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	1757222	1757297	1757260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	1876933	1877521	1877350	Y	SIRPB2,SIRPA,SIRPA,SIRPA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	3779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	2771027	2771047	2771039	Y	NA	CPXM1,VPS16	NA	NA	NA	NA	CPXM1	8236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	2780319	2780470	2780455	Y	NA	CPXM1,VPS16	NA	NA	NA	NA	CPXM1	1036	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr20	3041356	3041698	3041528	Y	NA	MRPS26	NA	NA	NA	NA	MRPS26	16765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	4931181	4931354	4931276	Y	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	57585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	5060940	5061369	5061194	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	43903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	5155364	5155504	5155434	Y	NA	CDS2	NA	NA	NA	NA	CDS2	49932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	5748625	5748995	5748810	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	19586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	151693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	7905442	7905630	7905536	Y	HAO1	NA	NA	NA	NA	NA	TMX4	92846	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	8210701	8210953	8210827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	99877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	8412863	8413194	8412910	Y	TMX4,PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	302039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	10469146	10469624	10469385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	56276	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	12374037	12374068	12374053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD3	504666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	13678137	13678519	13678328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TASP1	60550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	13705752	13706023	13705888	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ESF1	57509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	14266623	14266907	14266765	Y	MACROD2	FLRT3	NA	NA	NA	NA	FLRT3	49355	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	184607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	15282242	15282264	15282251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLRT3	965980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	16217961	16218181	16218074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF16B	333897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	17440988	17441274	17441131	Y	PCSK2	NA	NA	NA	NA	NA	DSTN	107234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	19241410	19241666	19241515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	50120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	19816564	19816804	19816639	Y	C20orf26	RIN2	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	48361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	20343522	20343915	20343617	Y	NA	INSM1	INSM1	IMR90	Hi-C	24141950	INSM1	2850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	20344554	20345237	20344967	Y	NA	INSM1	INSM1	IMR90	Hi-C	24141950	INSM1	1528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.81331160405164
chr20	20347223	20347613	20347293	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	458	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr20	20391161	20391545	20391351	Y	NA	INSM1	NA	NA	NA	NA	INSM1	44396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	20432950	20433312	20432989	Y	C20orf26,INSM1	NA	NA	NA	NA	NA	INSM1	86185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.53648724195395
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	20724152	20724406	20724200	Y	RALGAPA2	RALGAPA2	RALGAPA2	IMR90	Hi-C	24141950	RALGAPA2	33021	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	21058164	21058497	21058329	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	NA	NA	NA	NA	LINC00237	26502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	21082914	21083089	21083038	Y	NA	LINC00237,PLK1S1	PLK1S1,NKX2-2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00237	1910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr20	21486506	21486611	21486559	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	6053	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	21489032	21489415	21489222	Y	PAX1,NKX2-2	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	3249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	21490493	21490731	21490612	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	1933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	21496280	21496657	21496603	Y	NKX2-2	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	3616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	21501213	21501475	21501344	Y	NKX2-2	NKX2-2	PLK1S1	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-2	8549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	21501663	21502213	21501986	Y	PLK1S1,NKX2-4,NKX2-2,PAX1	NKX2-2	PLK1S1	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-2	8999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	23122999	23123199	23123050	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1,CST3	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	206174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	23160683	23160807	23160718	Y	CSTL1,CST9L,CST8	NA	THBD,SSTR4,CD93,NXT1	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	168566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	24451680	24451884	24451790	Y	TMEM90B	SYNDIG1	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	3845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	24484148	24484457	24484314	Y	TMEM90B	SYNDIG1	NA	NA	NA	NA	SYNDIG1	36313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	24947572	24947946	24947787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	89670	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	24969855	24970103	24969979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSS1	67513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	29518777	29518943	29518821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1B	90914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	30175524	30175854	30175562	Y	NA	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	15232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30182515	30183026	30182914	Y	NA	ID1,COX4I2	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	8060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30190743	30190994	30190797	Y	ID1	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	92	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30191850	30192346	30192159	Y	ID1	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr20	30194967	30195344	30195216	Y	NA	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	3881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30196293	30196740	30196417	Y	ID1	ID1,COX4I2	NA	NA	NA	NA	ID1	5207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	COX4I2,BCL2L1	NA	NA	NA	NA	COX4I2	38984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30298803	30298834	30298814	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	10958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	30699679	30699866	30699769	Y	BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2	TM9SF4	NA	NA	NA	NA	TM9SF4	4370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	31126528	31126767	31126720	Y	ASXL1	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	44109	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	32782933	32783102	32782955	Y	ASIP	NA	ITCH,ASIP,AHCY	IMR90	Hi-C	24141950	EIF2S2	84795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33152713	33153029	33152857	Y	TP53INP2	MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	20055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33263826	33263865	33263846	Y	MYH7B	PIGU,TP53INP2	NA	NA	NA	NA	PIGU	916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33861234	33861630	33861491	Y	NA	MMP24,EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EDEM2	2298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	34127589	34128004	34127717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr20	34217204	34217560	34217502	Y	NA	SPAG4,CPNE1,RBM12	NA	NA	NA	NA	SPAG4	15390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	35239893	35239986	35239939	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	7756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr20	35489284	35489554	35489419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	88692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	35572677	35573004	35572914	Y	RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	35633884	35634240	35634054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	55638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	35873841	35874236	35874039	Y	NA	MANBAL	NA	NA	NA	NA	MANBAL	41805	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	35905068	35905696	35905172	Y	SAMHD1,SRC,MANBAL	MANBAL	RPN2,NNAT,BLCAP,MANBAL,GHRH,SRC,LOC100287792,VSTM2L,TTI1,RPRD1B	IMR90	Hi-C	24141950	MANBAL	10345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.95172378510049
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	36046410	36046637	36046524	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	25299	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	36298725	36299073	36298903	Y	C20orf132	CTNNBL1	VSTM2L,LOC100287792,RPN2,CTNNBL1,TTI1,LBP	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNBL1	21335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	37280609	37280856	37280791	Y	SLC32A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC32A1	70249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	37302978	37303466	37303191	Y	ACTR5,SLC32A1	SLC32A1	ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B	IMR90	Hi-C	24141950	SLC32A1	47639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr20	39051364	39051718	39051672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	264162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	RNU2-52P,TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	42118767	42119112	42118938	Y	PTPRT,TOX2,SGK2,L3MBTL1	SRSF6,L3MBTL1	SGK2	IMR90	Hi-C	24141950	L3MBTL1	15208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	42137465	42137802	42137552	Y	NA	L3MBTL1	NA	NA	NA	NA	L3MBTL1	3145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr20	42390017	42390272	42390131	Y	C20orf111,GTSF1L	NA	TOX2,JPH2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	96263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	43223501	43223813	43223570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIG	65075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	43517782	43518230	43517943	Y	NA	YWHAB,PABPC1L	PABPC1L	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAB	5465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	43540233	43540373	43540312	Y	DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L	YWHAB,PABPC1L,TOMM34	NA	NA	NA	NA	PABPC1L	3530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	43569969	43570092	43570031	Y	RBPJL,TP53TG5,STK4	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	17035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,TP53TG5,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	44658598	44659307	44659051	Y	NA	SLC12A5	NA	NA	NA	NA	SLC12A5	10242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	44935542	44935954	44935889	Y	ZNF334,SLC12A5,CDH22	CDH22	CDH22	IMR90	Hi-C	24141950	CDH22	405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45210571	45210900	45210742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF334	70373	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45526625	45526933	45526720	Y	NA	EYA2,RP11-323C15.2	NA	NA	NA	NA	RP11-323C15.2	1432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr20	45787211	45787318	45787265	Y	EYA2	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	191987	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45858819	45859007	45858915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	120298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr20	46299616	46300006	46299878	Y	NCOA3,SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	113354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	46320177	46320280	46320230	Y	SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	93080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	46370826	46370984	46370910	Y	NA	SULF2	NA	NA	NA	NA	SULF2	42376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	46523491	46523897	46523893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	110131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	47367806	47368111	47367871	Y	STAU1,PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	74309	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	47397993	47398168	47398081	Y	NA	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	44252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	47434951	47435381	47435210	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	7039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	47784409	47784640	47784548	Y	PREX1,ZNFX1	STAU1,DDX27	NA	NA	NA	NA	STAU1	18264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	48496798	48497000	48496896	Y	NA	SPATA2	NA	NA	NA	NA	SPATA2	33080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	48959759	48960001	48959883	Y	SNAI1,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,PTPN1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	154383	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	49170357	49170595	49170426	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	45466	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	50692863	50693237	50693120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	125610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	51947269	51947531	51947400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	276915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	52353948	52354213	52354172	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	129502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	52371075	52371265	52371223	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	146629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	52374184	52374569	52374228	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	149738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr20	55825592	55825967	55825782	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	13718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	55838908	55839396	55838948	Y	NA	BMP7	NA	NA	NA	NA	BMP7	289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	55965649	55965902	55965759	Y	NA	RAE1,MTRNR2L3,RBM38,RP4-800J21.3	NA	NA	NA	NA	RP4-800J21.3	216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr20	55968808	55969481	55968821	Y	ZBP1,PMEPA1	RAE1,MTRNR2L3,RBM38,RP4-800J21.3	NA	NA	NA	NA	RP4-800J21.3	2690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	56156805	56157077	56157010	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P1	94722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	56232830	56233085	56232989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	51507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	56293544	56293843	56293665	Y	NA	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	8952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	56505657	56505795	56505725	Y	NA	NA	CTCFL,ZBP1,PMEPA1	IMR90	Hi-C	24141950	PMEPA1	221065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	58639140	58639460	58639300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3D	125788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	60103711	60103923	60103817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	278229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	60529765	60530009	60529928	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	108857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	60874912	60875240	60875071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADRM1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	60940876	60941209	60940968	Y	PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	508	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	60956743	60957219	60956871	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	RPS21	2953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	61282674	61283033	61282738	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	10877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR,COL9A3	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr20	61641732	61642015	61641970	Y	DIDO1,BHLHE23	NA	NA	NA	NA	NA	DIDO1	74428	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	61764397	61764626	61764512	Y	NA	NA	LOC63930,NKAIN4,BIRC7,HAR1B,HAR1A	IMR90	Hi-C	24141950	YTHDF1	80960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	61903396	61903541	61903451	Y	NKAIN4	NKAIN4,ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	1259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	62085174	62085706	62085468	Y	BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2	KCNQ2,EEF1A2	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	16287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	62170184	62170345	62170251	Y	YTHDF1,UCKL1,SAMD10,PRPF6,PTK6,SRMS,C20orf195	EEF1A2,PPDPF,C20orf195	NA	NA	NA	NA	C20orf195	12028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	62276090	62276438	62276124	Y	CHRNA4,KCNQ2,EEF1A2,ABHD16B,STMN3	GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1	NA	NA	NA	NA	STMN3	6342	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr20	62545436	62545544	62545492	Y	NA	DNAJC5,RNU1-134P,UCKL1	NA	NA	NA	NA	RNU1-134P	7128	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr20	62793391	62793466	62793434	Y	NA	MYT1	NA	NA	NA	NA	MYT1	12247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	10701810	10702195	10702003	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	735225	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	11114307	11114424	11114412	Y	NA	NA	BAGE5	IMR90	Hi-C	24141950	TEKT4P2	1147722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	16662871	16663259	16663022	Y	NA	NA	SAMSN1,NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	227550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00478	519825	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	18147470	18147769	18147614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf37	661439	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	18886111	18886899	18886569	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	3411	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	8560	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	18919922	18920266	18920094	Y	CXADR	CXADR	NA	NA	NA	NA	CXADR	37222	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	19463041	19463055	19463048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHODL	191461	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	23121365	23121760	23121563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	752732	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	25551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr21	26956680	26957339	26957242	Y	NA	MRPL39	NA	NA	NA	NA	MRPL39	20490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	26962945	26963646	26963455	Y	NA	MRPL39,JAM2	NA	NA	NA	NA	MRPL39	14183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	27285950	27286116	27286033	Y	APP	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	179966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	27298348	27298650	27298452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5J	192364	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	27488837	27488970	27488850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APP	52476	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	28082884	28083006	28082945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	132722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	28319364	28319698	28319531	Y	CYYR1	ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	17134	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	28797067	28797570	28797293	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	460235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	28952733	28952925	28952772	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	615901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	29765694	29766009	29765812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	489684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr21	30037436	30037730	30037586	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	217963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	30276081	30276287	30276184	Y	C21orf7	N6AMT1	NA	NA	NA	NA	N6AMT1	20388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.09013596614934
chr21	32781181	32781372	32781277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000251.3	148186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	33105563	33105881	33105775	Y	SCAF4	SCAF4	NA	NA	NA	NA	SCAF4	3175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	33853478	33853730	33853567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf119	90039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	34733678	34734189	34733958	Y	OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART	IFNAR1,IFNGR2	NA	NA	NA	NA	IFNAR1	38944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	35308653	35309105	35308775	Y	NA	LINC00649,ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	22369	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	LINC00649,ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	35319562	35320491	35320153	Y	NA	LINC00649,ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	33278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	35959381	35959645	35959576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	515511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	35976444	35976765	35976605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	532574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	36638663	36638676	36638670	Y	NA	NA	RUNX1	MCF7	ChIA-PET	22265404	RUNX1	736289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	37485408	37485566	37485491	Y	NA	CBR1,SETD4,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	SETD4	35721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr21	37486095	37486219	37486157	Y	NA	CBR1,SETD4,DOPEY2	NA	NA	NA	NA	SETD4	36408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	37695369	37695803	37695437	Y	MORC3	MORC3	NA	NA	NA	NA	MORC3	4882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	38346647	38347014	38346835	Y	NA	AP000704.5,HLCS	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	9835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	38500086	38500176	38500125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC3	56560	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	38623241	38623485	38623453	Y	NA	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	14777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr21	38825760	38825986	38825873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	89668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr21	39635387	39635785	39635510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	348638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	39638764	39638897	39638765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	352015	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	39723755	39724311	39724014	Y	ETS2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ6	437006	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	40018484	40018900	40018698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	156331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	40338093	40338255	40338153	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114,PSMG1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS2	162862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	40673787	40673929	40673891	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	17556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr21	40716228	40716377	40716303	Y	NA	BRWD1,HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	HMGN1	3196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	40983593	40983719	40983659	Y	LCA5L,SH3BGR,PCP4	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	41003318	41003469	41003395	Y	NA	C21orf88	NA	NA	NA	NA	C21orf88	20570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	41048329	41048488	41048408	Y	SH3BGR	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf88	65581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr21	43181534	43181711	43181623	Y	MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	43183711	43183960	43183836	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	1306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	43641830	43642232	43641888	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	24031	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	43654635	43655282	43654967	Y	NA	ABCG1	TFF3	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG1	36836	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr21	44072717	44073208	44072832	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	971	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr21	44074543	44074777	44074593	Y	NA	PDE9A	NA	NA	NA	NA	PDE9A	2797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	44597156	44597534	44597315	Y	SIK1	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	71459	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr21	44598375	44598751	44598475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	72678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	44599156	44599262	44599209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U2AF1	73459	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	44690390	44690772	44690581	Y	NA	NA	LINC00313,SIK1,HSF2BP,LINC00319,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	154236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	44803157	44803673	44803421	Y	PKNOX1,SIK1	SIK1	HSF2BP,RRP1B,SIK1	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	41335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr21	44850435	44851222	44850996	Y	CBS	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,LINC00313,LINC00319,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	5427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr21	44876908	44877060	44877025	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	31900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr21	44936784	44937143	44936907	Y	PDXK	NA	NA	NA	NA	NA	SIK1	91776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45235037	45235392	45235184	Y	NA	CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3	NA	NA	NA	NA	RRP1	27643	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45394155	45394780	45394371	Y	AGPAT3,TRPM2,C21orf33	TRAPPC10	NA	NA	NA	NA	TRAPPC10	35420	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45441566	45441868	45441701	Y	C21orf2,TRAPPC10	TRAPPC10	PWP2,C21orf33	IMR90	Hi-C	24141950	TRAPPC10	11366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45485183	45485767	45485497	Y	TRAPPC10,C21orf2	PWP2	NA	NA	NA	NA	PWP2	39404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45543595	45544017	45543789	Y	KRTAP10-6,TRPM2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	7470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45580983	45581335	45581160	Y	NA	C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	29496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45592447	45593398	45592771	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33	PWP2,ICOSLG	IMR90	Hi-C	24141950	C21orf33	40960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45614142	45614593	45614385	Y	NA	ICOSLG	AIRE,PFKL,ICOSLG,C21orf33,PWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ICOSLG	44256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	45661962	45662435	45662161	Y	TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	3113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	46129789	46130121	46129955	Y	NA	TSPEAR	NA	NA	NA	NA	TSPEAR	294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr21	46389792	46390113	46389960	Y	POFUT2,ITGB2	FAM207A	NA	NA	NA	NA	FAM207A	31867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	46552843	46553033	46552936	Y	KRTAP10-11,KRTAP12-2,KRTAP12-1,ITGB2	NA	NA	NA	NA	NA	ADARB1	61075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	46769779	46770045	46769871	Y	NA	NA	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	53007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1,AL133493.2	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AL133493.2	863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	47167832	47168236	47167895	Y	NA	NA	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	PCBP3	106224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr21	47993556	47993894	47993723	Y	DIP2A,S100B,PRMT2	S100B	NA	NA	NA	NA	S100B	29227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	17528836	17529213	17528959	Y	NA	IL17RA	NA	NA	NA	NA	IL17RA	34631	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	17849400	17850329	17849515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005300.5	177574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	18506386	18506784	18506419	Y	MICAL3	MICAL3	NA	NA	NA	NA	MICAL3	1061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	18916909	18917370	18917163	Y	MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH	DGCR6,PRODH,DGCR5	NA	NA	NA	NA	PRODH	4696	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	19072724	19073088	19073012	Y	NA	DGCR2	NA	NA	NA	NA	DGCR2	34879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.09013596614934
chr22	19331396	19331535	19331466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLTCL1	54157	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	19378121	19378382	19378253	Y	NA	MRPL40	NA	NA	NA	NA	MRPL40	39043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	20068627	20068902	20068750	Y	COMT,DGCR8	DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	DGCR8	2872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	20142939	20143182	20143142	Y	NA	RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8	27960	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	RTN4R,XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	20848736	20849050	20848893	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	21285744	21286048	21285865	Y	NA	CRKL,LZTR1	NA	NA	NA	NA	CRKL	16030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr22	22067448	22067680	22067564	Y	YPEL1	YPEL1	NA	NA	NA	NA	YPEL1	20443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	22186398	22186549	22186531	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	33421	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	22861017	22861374	22861318	Y	ZNF280B	ZNF280B,PRAME	NA	NA	NA	NA	ZNF280B	131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	23413714	23413937	23413833	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	3174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	23415058	23415342	23415197	Y	NA	GNAZ	NA	NA	NA	NA	GNAZ	4518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	23520668	23520822	23520745	Y	NA	RTDR1,RAB36,BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	777	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC8P1	121030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr22	23888781	23888894	23888838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC8P1	145868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	24080371	24080411	24080401	Y	NA	GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1	NA	NA	NA	NA	ZNF70	10868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	24153288	24153648	24153392	Y	RGL4,LOC391322	MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11	DERL3	IMR90	Hi-C	24141950	DERL3	25667	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr22	24747750	24748005	24747878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	82884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	24948988	24949121	24949055	Y	ADORA2A	SNRPD3,FAM211B	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	350	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	25815594	25815803	25815685	Y	ADRBK2,LRP5L	LRP5L,CRYBB2P1	MYO18B,CRYBB2P1,LRP5L,SEZ6L,KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	LRP5L	16250	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	26921035	26921055	26921043	Y	TPST2	HPS4,SRRD,TFIP11,HMGB1P10	NA	NA	NA	NA	TFIP11	14564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	27038834	27039211	27039123	Y	NA	TPST2,MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	1181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	27041081	27041748	27041447	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	MIAT	689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr22	27043800	27044733	27044318	Y	SEZ6L	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	MIAT	3408	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.87554106936776
chr22	27054967	27055259	27055032	Y	SEZ6L,ASPHD2	MIAT,CTA-211A9.5	NA	NA	NA	NA	CTA-211A9.5	11471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	27488405	27488660	27488521	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-40G4P.1	206894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	27530003	27530818	27530508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-40G4P.1	248492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	79581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	28797071	28797274	28797258	Y	PITPNB,XBP1,CCDC117	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	338745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	29209751	29210048	29209892	Y	CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-292E10.6	15080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	29281576	29281858	29281717	Y	NA	ZNRF3	C22orf31,KREMEN1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNRF3	3996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	29467563	29467858	29467701	Y	NA	KREMEN1	NA	NA	NA	NA	KREMEN1	497	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr22	29605025	29605391	29605212	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	5185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	29877762	29878123	29877961	Y	NA	RFPL1S,NEFH	NA	NA	NA	NA	NEFH	3543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	30102464	30102720	30102592	Y	NA	CABP7	NA	NA	NA	NA	CABP7	11353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	30584123	30584251	30584196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATSL3	99365	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	30808332	30808723	30808528	Y	NA	SEC14L2,RNF215,MTFP1	NA	NA	NA	NA	RNF215	7037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	31291343	31291446	31291429	Y	SEC14L4,OSBP2	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	73217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	66473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr22	32048774	32049039	32049031	Y	NA	PISD	SFI1,EIF4ENIF1,DEPDC5,YWHAH,C22orf24,C22orf28,LOC339666,RFPL3-AS1,PRR14L	GM12878,K562,IMR90	5C,Hi-C	22955621,24141950	PISD	7379	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	32957010	32957396	32957188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	88347	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	34167018	34167152	34167086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYN3	714660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	35529944	35530291	35530139	Y	ISX	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	94758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	35555825	35556131	35555978	Y	NA	NA	LARGE	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-714B7.5	68918	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	35710736	35710808	35710790	Y	APOL6,TOM1,TOM1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	17468	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	35724557	35724815	35724671	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1,HMOX1	NA	NA	NA	NA	TOM1	31289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	35745535	35745614	35745571	Y	NA	HMOX1,MCM5	NA	NA	NA	NA	HMOX1	28740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	35842495	35842590	35842543	Y	NA	MCM5	NA	NA	NA	NA	MCM5	48439	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	35919751	35919972	35919862	Y	RASD2	RASD2	RASD2,MCM5	IMR90	Hi-C	24141950	RASD2	14943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr22	35998340	35998679	35998418	Y	TOM1,TOM1,HMOX1,APOL6,MB,MB	MB	NA	NA	NA	NA	MB	33319	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36149671	36149849	36149827	Y	NA	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	MB	117673	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	36172767	36172943	36172931	Y	MB,MB,RBFOX2,RBFOX2	NA	APOL5	IMR90	Hi-C	24141950	MB	140769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36245846	36246212	36246206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	176261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	36299462	36299943	36299718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	122530	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	36310688	36310985	36310744	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	111488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36343697	36344006	36343862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	78467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	36385915	36386246	36386112	Y	NA	RBFOX2	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	36227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36728624	36729163	36728912	Y	IFT27	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	52900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	36806147	36806450	36806256	Y	NA	MYH9,RP5-1119A7.14	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYH9	24084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	37731445	37731637	37731610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELFN2	89868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	37799328	37799559	37799444	Y	NA	ELFN2	NA	NA	NA	NA	ELFN2	21946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	37813025	37813137	37813082	Y	TRIOBP,PDXP,ELFN2	ELFN2	NA	NA	NA	NA	ELFN2	8368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr22	37997690	37997947	37997695	Y	GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	CYTH4,LGALS2,CDC42EP1,CARD10,MFNG,SH3BP1,PDXP,GGA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GGA1	4534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	38057516	38057596	38057556	Y	NA	SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	PDXP	4782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	38105250	38105455	38105345	Y	NA	LGALS1,NOL12,TRIOBP	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	14239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	38292237	38292573	38292408	Y	CARD10,SH3BP1,MICALL1	EIF3L,ANKRD54,MICALL1	NA	NA	NA	NA	MICALL1	7091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	38434638	38434982	38434731	Y	NA	PICK1	BAIAP2L2,LOC400927,KCNJ4,DMC1	IMR90	Hi-C	24141950	PICK1	15336	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	39154682	39154985	39154835	Y	APOBEC3G,APOBEC3D,JOSD1,SUN2,SUN2	SUN2,DNAL4	NA	NA	NA	NA	SUN2	33163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	39705997	39706111	39706064	Y	NA	RPL3,SYNGR1	NA	NA	NA	NA	RPL3	8283	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	39784774	39784929	39784841	Y	APOBEC3D,APOBEC3G,CBX7	SYNGR1,TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	8817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	40347638	40347876	40347797	Y	GRAP2	FAM83F	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	FAM83F	41077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	40575185	40575584	40575306	Y	TNRC6B,TNRC6B	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P52	74115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	40908486	40908830	40908701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL1	121876	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	40982487	40982801	40982645	Y	NA	MKL1	NA	NA	NA	NA	MKL1	47905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr22	41128851	41129054	41128911	Y	NA	NA	XPNPEP3,MKL1,MCHR1,SLC25A17	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP37	60396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr22	41418482	41418837	41418726	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.71996740607746
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	41953421	41953453	41953437	Y	SEPT3	POLR3H,CSDC2,PMM1	NA	NA	NA	NA	CSDC2	1314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	42696005	42696062	42696030	Y	SEPT3,NFAM1	NA	TCF20,NFAM1	IMR90	Hi-C	24141950	Z83851.1	67180	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	42736832	42736915	42736874	Y	SEPT3	Z83851.1	LOC100132273,NDUFA6,TCF20,CYP2D6,LOC388906	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	Z83851.1	26327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	42761561	42761693	42761627	Y	WBP2NL,TCF20,NFAM1	Z83851.1	NA	NA	NA	NA	Z83851.1	1549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	42784491	42784586	42784550	Y	SEPT3,WBP2NL	Z83851.1,CTA-126B4.7	NA	NA	NA	NA	Z83851.1	21249	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	42829562	42829963	42829808	Y	NA	CTA-126B4.7	NA	NA	NA	NA	CTA-126B4.7	2066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.50537250929589
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	CTA-126B4.7	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTA-126B4.7	7912	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	43100819	43101017	43100994	Y	NA	A4GALT	NA	NA	NA	NA	A4GALT	14287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	43269385	43269620	43269503	Y	NFAM1,ARFGAP3,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	17273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	43387243	43387305	43387274	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	21846	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	43421059	43421209	43421134	Y	NA	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	11908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	43811216	43811611	43811451	Y	SULT4A1,TTLL1,SCUBE1,MPPED1	MPPED1	NA	NA	NA	NA	MPPED1	6014	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	45015871	45016262	45016114	Y	NA	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	46331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	45016324	45016531	45016433	Y	PARVG,PARVG,PRR5	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	46062	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	45254258	45254434	45254345	Y	PHF21B	NA	NA	NA	NA	NA	PHF21B	149446	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	45543738	45543876	45543815	Y	PHF21B,NUP50,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	13786	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	45554826	45555155	45554995	Y	KIAA0930	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	CTA-217C2.1	2507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	45575306	45575472	45575328	Y	FAM118A,NUP50	CTA-217C2.1,NUP50	NA	NA	NA	NA	NUP50	17584	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	45900177	45900595	45900449	Y	FBLN1	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	4059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	46137558	46137905	46137731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	71880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	46423205	46423605	46423251	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	23980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46432742	46433091	46432929	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	14494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46455003	46455485	46455192	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	C22orf26	6979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	6311	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	46982383	46982526	46982455	Y	NA	GRAMD4	TRMU,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	12474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	46992036	46992348	46992220	Y	NA	GRAMD4	CELSR1,GRAMD4	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	22127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	47134957	47135355	47135288	Y	NA	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	CERK	2799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	49031660	49032049	49031799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A5	148388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	453587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50248429	50248807	50248623	Y	TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4	BRD1,ZBED4	NA	NA	NA	NA	ZBED4	2939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	50449135	50449422	50449263	Y	TUBGCP6,HDAC10,PIM3	NA	NA	NA	NA	NA	PIM3	96974	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50609711	50610057	50610042	Y	NA	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	2551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50629840	50630128	50630062	Y	BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	SELO	7280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50710173	50710402	50710310	Y	MLC1,MOV10L1,MOV10L1,MOV10L1,SHANK3,SBF1,PPP6R2,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,ACR,MAPK11	TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11,PLXNB2	NA	NA	NA	NA	MAPK11	2977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50784754	50785397	50785059	Y	PPP6R2	PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	5021	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	50815545	50815813	50815668	Y	MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B	PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	35812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr22	50891150	50891343	50891221	Y	MOV10L1,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2	NA	NA	NA	NA	SBF1	20111	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	50908246	50908896	50908576	Y	IL17REL,TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,CHKB,SBF1,NCAPH2	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	2558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	51026472	51026838	51026655	Y	MOV10L1,FAM116B,RABL2B,MAPK8IP2,MAPK8IP2	SYCE3,CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	CHKB-CPT1B	7078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr22	51051274	51051666	51051314	Y	NA	CHKB-CPT1B,MAPK8IP2,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	12941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	991989	992283	992135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC090044.1	416075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	2462645	2462952	2462798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTN4	324148	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	3177157	3177268	3177188	Y	CRBN	TRNT1,CRBN	NA	NA	NA	NA	TRNT1	10557	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	3854493	3854653	3854575	Y	NA	LRRN1	NA	NA	NA	NA	LRRN1	15372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	4780474	4780964	4780800	Y	EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	237837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	4863691	4864149	4863808	Y	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	154652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	5077846	5078259	5077971	Y	BHLHE40	NA	ITPR1,EGOT	IMR90	Hi-C	24141950	BHLHE40	59045	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	7888061	7888231	7888148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	653162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	9006142	9006408	9006272	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	2685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	9344109	9344331	9344220	Y	NA	NA	RAD18,SRGAP3,C3orf32,CAV3,OXTR	IMR90	Hi-C	24141950	THUMPD3	58195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	10395342	10395455	10395399	Y	NA	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	34480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	10510421	10510595	10510505	Y	ATP2B2	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13	149559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	10545766	10546079	10546034	Y	SLC6A1,ATP2B2	NA	NA	NA	NA	NA	SEC13	184904	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	11759856	11760132	11759896	Y	NA	VGLL4	NA	NA	NA	NA	VGLL4	88	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	11812040	11812191	11812115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	51820	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr3	12036535	12036797	12036666	Y	NA	SYN2	NA	NA	NA	NA	SYN2	7079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	12131259	12131529	12131269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP4	67322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	12137205	12137457	12137242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMP4	61394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	12211698	12212069	12211921	Y	PPARG,PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	12847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	12219674	12219854	12219759	Y	RAF1,PPARG,PPARG,PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	20823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	12220728	12221239	12220905	Y	NA	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	21877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr3	12222245	12222290	12222288	Y	PPARG	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	23394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	12229937	12230151	12230065	Y	RAF1	TIMP4	NA	NA	NA	NA	TIMP4	31086	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	13061201	13061436	13061325	Y	NUP210,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	51181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	13325256	13325344	13325300	Y	NA	NA	NUP210,LOC285375	IMR90	Hi-C	24141950	NUP210	134465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	13452835	13453081	13452953	Y	IQSEC1,HDAC11,HDAC11	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	6728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	13457131	13457321	13457226	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	2488	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	13920516	13920583	13920566	Y	WNT7A	WNT7A	NA	NA	NA	NA	WNT7A	898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr3	13932354	13932493	13932424	Y	NA	WNT7A	C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7A	12736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr3	14692297	14692322	14692310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	250221	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	NA	NA	NA	NA	NA	NR2C2	271895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	15443040	15443420	15443273	Y	ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	23442	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	15453852	15454017	15453935	Y	NA	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	12845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	15901875	15902313	15902310	Y	METTL6,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	260537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	16373323	16373612	16373405	Y	ANKRD28,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	68617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	16429150	16429271	16429247	Y	RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	124262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	16883940	16884363	16884096	Y	RFTN1,PLCL2,PLCL2	PLCL2	TBC1D5	IMR90	Hi-C	24141950	PLCL2	41781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr3	16890755	16891188	16890921	Y	PLCL2	PLCL2	TBC1D5,PLCL2	IMR90	Hi-C	24141950	PLCL2	48596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	17020237	17020570	17020404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	178078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17064555	17064748	17064639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	222396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17345014	17345355	17345310	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	502855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17505233	17505390	17505312	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	663074	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17650424	17650697	17650561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	808265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	18453300	18453576	18453481	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	30733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	19188369	19188866	19188531	Y	NA	KCNH8	NA	NA	NA	NA	KCNH8	423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	19399413	19399531	19399472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNH8	211467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A,RNU4-85P	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	20102910	20103147	20103006	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	23395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	20190984	20191185	20191115	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1-AS1,SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1-AS1	22551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	20205868	20206079	20206039	Y	SGOL1,SGOL1	SGOL1-AS1,SGOL1	NA	NA	NA	NA	SGOL1-AS1	7657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	22152338	22152660	22152655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	268650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	23898490	23898770	23898565	Y	NA	NA	NKIRAS1,RPL15	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2E1	53096	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	23935594	23935945	23935770	Y	NA	RPL15,NR1D2	NA	NA	NA	NA	RPL15	20091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	24340917	24341295	24341106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THRB	193478	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	24525285	24525656	24525591	Y	NA	THRB	NA	NA	NA	NA	THRB	9117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	25494741	25494759	25494749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	209639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	25796078	25796406	25796226	Y	NGLY1	OXSM,NGLY1	NA	NA	NA	NA	OXSM	26002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	28684984	28685217	28685101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00693	70702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	30203021	30203159	30203075	Y	NA	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	442835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32426467	32426762	32426639	Y	NA	CMTM7	CMTM7	IMR90	Hi-C	24141950	CMTM7	4401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32443431	32443555	32443473	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	12268	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32823053	32823413	32823146	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	AC139452.2	1725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	32857811	32858132	32857909	Y	NA	AC139452.2,TRIM71	NA	NA	NA	NA	TRIM71	301	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.46030452622122
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	34403408	34403869	34403595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	565564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	34546800	34546816	34546806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	708956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	35105790	35105810	35105799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	1267946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	35790038	35790162	35790114	Y	ARPP21	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	1242633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	36805780	36806178	36806113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPM2AIP1	226617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr3	36845883	36846216	36845972	Y	NA	NA	TRANK1	IMR90	Hi-C	24141950	EPM2AIP1	186579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	38227489	38227608	38227524	Y	NA	MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	22909	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	38497232	38497482	38497354	Y	NA	ACVR2B,EXOG	NA	NA	NA	NA	ACVR2B	3890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	39399859	39400185	39399921	Y	CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	22654	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	40491258	40491489	40491375	Y	NA	ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619	NA	NA	NA	NA	ENTPD3-AS1	1331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	40657038	40657268	40657076	Y	NA	EEF1GP3	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1GP3	20053	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	40665124	40665471	40665257	Y	ZNF619,ZNF619	EEF1GP3	ULK4	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1GP3	28139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	40964745	40964983	40964875	Y	CTNNB1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761N21.2	163709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr3	42889474	42889730	42889711	Y	CCBP2	HIGD1A	NA	NA	NA	NA	HIGD1A	45451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	43935699	43936111	43935927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	204613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	112870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	11.0729744839079
chr3	44073188	44073424	44073310	Y	NA	NA	FAM198A,ANO10,MIR138-1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	80280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	44599751	44600128	44599940	Y	ZNF167	ZNF852,ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF660	17587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	45035735	45035877	45035806	Y	ZNF660,ZNF35	EXOSC7,ZDHHC3	NA	NA	NA	NA	ZDHHC3	20058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	45165344	45165812	45165623	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	20102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	45609249	45609611	45609389	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	14363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	45657242	45657607	45657425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMD1	62356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	45930871	45931199	45931065	Y	CCR9	LZTFL1	NA	NA	NA	NA	LZTFL1	24335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	47704557	47705253	47705047	Y	SETD2	NA	NA	NA	NA	NA	CSPG5	84275	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	48469321	48469953	48469633	Y	NA	CCDC51,ATRIP,TREX1	NA	NA	NA	NA	PLXNB1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	48967045	48967316	48967140	Y	NA	SLC25A20,ARIH2	NA	NA	NA	NA	ARIH2	12791	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	49105949	49106080	49106015	Y	ARIH2	DALRD3,IMPDH2,QRICH1,QARS	NA	NA	NA	NA	QRICH1	23716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	49123301	49123671	49123633	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2	NA	NA	NA	NA	QRICH1	6125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	49171125	49171202	49171164	Y	NA	QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B	NA	NA	NA	NA	LAMB2	2574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	49696171	49696492	49696217	Y	NA	APEH,RNF123,MST1	APEH,MST1,RNF123	IMR90	Hi-C	24141950	APEH	12943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	49968490	49968553	49968522	Y	NA	MST1R,MON1A,RBM6	NA	NA	NA	NA	MON1A	2884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	50194710	50194859	50194796	Y	TUSC2,HYAL2,GMPPB,C3orf54,MST1R,MON1A,IFRD2,SEMA3F	SEMA3F,RP11-493K19.3,SLC38A3	NA	NA	NA	NA	RP11-493K19.3	3192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,ZMYND10,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	50983523	50983672	50983598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK3	272851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	51506153	51506528	51506417	Y	VPRBP,RAD54L2,GPR62	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	25482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	51720527	51720790	51720691	Y	VPRBP	TEX264,GRM2	NA	NA	NA	NA	GRM2	18296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	52168814	52168827	52168821	Y	NA	POC1A	NA	NA	NA	NA	POC1A	17879	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52502448	52502781	52502494	Y	ABHD14B,NISCH	SEMA3G,NISCH	NA	NA	NA	NA	NISCH	15314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52925773	52926018	52925896	Y	PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	3560	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	52926819	52927340	52927162	Y	PBRM1,SFMBT1,SFMBT1,PRKCD,DCP1A,TMEM110	TMEM110-MUSTN1,TMEM110	NA	NA	NA	NA	TMEM110-MUSTN1	2238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	53106812	53106929	53106871	Y	TMEM110,SFMBT1	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr3	53107324	53107487	53107433	Y	TMEM110,SFMBT1,SFMBT1,DCP1A	SFMBT1	NA	NA	NA	NA	SFMBT1	28558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr3	53136597	53136930	53136874	Y	PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD	RFT1	NA	NA	NA	NA	RFT1	25548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	55384068	55384357	55384288	Y	NA	NA	CACNA2D3,ERC2,WNT5A	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	137616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	55517501	55517653	55517577	Y	NA	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	4320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	58218436	58218533	58218485	Y	ABHD6	ABHD6	FLNB,DNASE1L3,ABHD6	IMR90	Hi-C	24141950	ABHD6	2700	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	58341032	58341142	58341087	Y	DNASE1L3	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	24425	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	59803830	59804011	59803964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	770020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	60654100	60654144	60654124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	580989	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	60994842	60995056	60994945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	240077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	62422700	62423042	62422978	Y	C3orf14,FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	69695	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr3	62427415	62427809	62427798	Y	FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	74410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	62495462	62495656	62495561	Y	FEZF2,CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	142457	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	62590443	62590784	62590607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	237438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	62780450	62780695	62780574	Y	CADPS	NA	NA	NA	NA	NA	CADPS	78359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr3	63001437	63001612	63001507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00698	67332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	63946118	63946531	63946303	Y	NA	NA	LOC100507062	IMR90	Hi-C	24141950	PSMD6	61127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	64475093	64475304	64475254	Y	NA	RP11-14D22.2	LOC100652759,LOC100287879,PRICKLE2,LOC100507062,PSMD6,ADAMTS9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-14D22.2	45941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	64626762	64626883	64626823	Y	ADAMTS9	ADAMTS9-AS2,ADAMTS9	NA	NA	NA	NA	ADAMTS9-AS2	41702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	67040750	67040873	67040812	Y	NA	KBTBD8	KBTBD8	MCF7	ChIA-PET	22265404	KBTBD8	5854	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	72862614	72863000	72862807	Y	SHQ1	SHQ1	NA	NA	NA	NA	SHQ1	46065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr3	73492361	73492586	73492474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	179505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	76605335	76605709	76605470	Y	ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	124166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	77090634	77090636	77090635	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	609465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	77129404	77129782	77129499	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	648235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	77273270	77273652	77273462	Y	ROBO2,ROBO2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-550F7.1	792101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	79245619	79245877	79245748	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	569088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	79455772	79456088	79455911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	358877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	79557050	79557111	79557081	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	257854	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	79674571	79674688	79674630	Y	ROBO1	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	140277	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	79786804	79786811	79786808	Y	NA	ROBO1	NA	NA	NA	NA	ROBO1	28154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	88208920	88209337	88209164	Y	CGGBP1,C3orf38	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	11885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	89163442	89163800	89163560	Y	NA	EPHA3	NA	NA	NA	NA	EPHA3	8768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA6	194756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr3	97211520	97211837	97211678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	269528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	97387840	97388118	97387927	Y	OR5AC2,EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	93247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	98291884	98292296	98292041	Y	OR5H6,OR5H2,CLDND1	CPOX	NA	NA	NA	NA	CPOX	18271	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	99367111	99367532	99367193	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	11792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	99579150	99579217	99579184	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	99620045	99620512	99620235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FILIP1L	210845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	99724570	99724720	99724642	Y	TBC1D23	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	FILIP1L	106637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	100077983	100078198	100078091	Y	FILIP1L	NIT2,LNP1,TOMM70A	NA	NA	NA	NA	NIT2	26438	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	105087492	105087848	105087688	Y	NA	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	3739	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	105925750	105925803	105925776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	339354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	106932717	106932735	106932725	Y	NA	LINC00883	NA	NA	NA	NA	LINC00883	24804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	107013943	107014050	107013997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00883	56404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	107318808	107318949	107318879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	79025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	107843189	107843582	107843382	Y	MYH15,CD47	CD47	CD47,IFT57,MYH15	IMR90	Hi-C	24141950	CD47	35317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	110744004	110744030	110744017	Y	NA	PVRL3	NA	NA	NA	NA	PVRL3	42888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	110800210	110800608	110800220	Y	NA	PVRL3	NA	NA	NA	NA	PVRL3	13292	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	111290434	111290797	111290713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCXD2	100726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	111721363	111721636	111721520	Y	NA	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	5852	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	111723588	111723714	111723651	Y	SLC9A10,TAGLN3,TAGLN3	ABHD10,TAGLN3	NA	NA	NA	NA	TAGLN3	8077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	112022774	112023041	112022831	Y	NA	CD200	CD200,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	26153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	112354601	112355057	112354782	Y	CCDC80	NA	NA	NA	NA	NA	ATG3	75708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	112739908	112740217	112740094	Y	CD200R1	GTPBP8,RP11-572M11.4,C3orf17	NA	NA	NA	NA	C3orf17	3200	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	112866931	112867023	112866972	Y	BOC	NA	BOC,WDR52	IMR90	Hi-C	24141950	BOC	60827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	113701770	113701838	113701802	Y	KIAA1407,DRD3,ZDHHC23	QTRTD1	NA	NA	NA	NA	QTRTD1	20842	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	114103176	114103363	114103329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	329716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	115558428	115558819	115558693	Y	GAP43	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	218257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	115918215	115918449	115918332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	578044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	115941110	115941531	115941311	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	600939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	116145742	116145918	116145863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	597627	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	116966889	116967037	116966963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	223344	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	117004639	117004922	117004781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	261094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	117441288	117441601	117441524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	272494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	117441757	117441996	117441951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAMP	272099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	117715221	117715404	117715326	Y	NA	LSAMP,RP11-384F7.2	NA	NA	NA	NA	RP11-384F7.2	782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	119230547	119230943	119230634	Y	NA	TMEM39A,POGLUT1,TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	15168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	119644387	119644860	119644721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	166404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	120065370	120065692	120065535	Y	NA	LRRC58	NA	NA	NA	NA	LRRC58	494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	120492875	120493095	120492951	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	120493479	120494008	120493729	Y	NA	GTF2E1,RABL3	NA	NA	NA	NA	RABL3	33639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	120857899	120858271	120857953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5L	232980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	121364461	121364464	121364463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLQ	101608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	121550824	121551193	121550988	Y	NA	IQCB1,EAF2	NA	NA	NA	NA	IQCB1	733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	121783086	121783706	121783373	Y	HCLS1,EAF2,PARP9,PARP9,DTX3L,CSTA,CD86,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	EAF2	231056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	123165325	123165700	123165659	Y	ADCY5	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	136332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	123756806	123757178	123756992	Y	NA	NA	KALRN,CCDC14	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	78242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	123762181	123762190	123762188	Y	NA	NA	KALRN,ROPN1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	83617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	124221645	124221997	124221821	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UMPS	225216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr3	126126680	126126867	126126779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF15	52395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr3	127416375	127416550	127416435	Y	NA	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	26597	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	127465577	127465875	127465733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLL	74176	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	127605255	127605518	127605387	Y	NA	NA	PODXL2,KBTBD12	IMR90	Hi-C	24141950	MGLL	65204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	128216520	128216923	128216625	Y	EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2	RP11-475N22.4,GATA2	GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GATA2	6492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	129245456	129245718	129245564	Y	RHO	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	77943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	131197540	131197572	131197556	Y	NA	MRPL3	NA	NA	NA	NA	MRPL3	22255	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	131742668	131742947	131742808	Y	CPNE4	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P16	218162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	132138974	132139193	132139084	Y	NA	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	4604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	132164768	132165015	132164817	Y	DNAJC13	DNAJC13	NA	NA	NA	NA	DNAJC13	30398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	132524722	132524784	132524753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPHP3	85419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	132671278	132671513	132671409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM108	83722	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	133295128	133295300	133295215	Y	NA	CDV3	NA	NA	NA	NA	CDV3	4554	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	133596347	133596652	133596615	Y	NA	RAB6B	NA	NA	NA	NA	RAB6B	16028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	133968581	133968789	133968685	Y	NA	RYK	NA	NA	NA	NA	RYK	892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	134182898	134183261	134183039	Y	AMOTL2	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	19324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	136067042	136067151	136067097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	99894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	137768870	137769254	137769106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DZIP1L	63406	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	137990064	137990319	137990141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NME9	56409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	138364761	138365360	138365102	Y	PIK3CB,ARMC8	FAIM	NA	NA	NA	NA	FAIM	39313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	NA	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIK3CB	82539	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	139064285	139064552	139064299	Y	NA	COPB2,RP11-319G6.1	NA	NA	NA	NA	COPB2	42022	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	139922309	139922336	139922321	Y	CLSTN2	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	270282	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	140814051	140814257	140814186	Y	NA	SPSB4	NA	NA	NA	NA	SPSB4	45807	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	141118771	141119120	141118811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	77716	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	141458120	141458481	141458300	Y	RASA2	RNF7	NA	NA	NA	NA	RNF7	3074	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	141610914	141611173	141610928	Y	NA	ATP1B3	NA	NA	NA	NA	ATP1B3	17948	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	142580771	142580984	142580878	Y	NA	RP11-372E1.1,PCOLCE2	NA	NA	NA	NA	PCOLCE2	25061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	RP11-372E1.6,PAQR9,U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	143705621	143705974	143705695	Y	C3orf58,C3orf58	C3orf58	NA	NA	NA	NA	C3orf58	16981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	145931100	145931141	145931121	Y	PLSCR5,PLSCR4	NA	NA	NA	NA	NA	PLOD2	51660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLOD2	152359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	148781596	148781850	148781723	Y	NA	HLTF	NA	NA	NA	NA	HLTF	20491	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	149229459	149229794	149229606	Y	NA	RP11-278L15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	19012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	26322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	150066449	150066620	150066527	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	57502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	153886362	153886734	153886548	Y	NA	ARHGEF26,ARHGEF26-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF26-AS1	49241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	156206621	156206945	156206715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	64028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	158440805	158440990	158440882	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	6997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	13133	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	SCHIP1	NA	NA	NA	NA	SCHIP1	16853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	160014353	160014630	160014494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf80	72930	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	161087231	161087661	161087620	Y	NA	SPTSSB	NA	NA	NA	NA	SPTSSB	1007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	165535017	165535196	165535158	Y	NA	BCHE	NA	NA	NA	NA	BCHE	18064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	168136003	168136042	168136023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFEM1P	170693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	168939202	168939471	168939359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	439935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	169172792	169172932	169172865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	206474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	169300300	169300658	169300540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MECOM	78748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	169379831	169380308	169379976	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	425	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	171542633	171542898	171542814	Y	FNDC3B,PLD1	PLD1	FNDC3B,PLD1,TMEM212	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLD1	15893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	172086059	172086253	172086084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	330641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	172325180	172325357	172325227	Y	NA	NA	TNFSF10	IMR90	Hi-C	24141950	NCEH1	101651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	174949841	174950235	174950187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	375032	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	175245221	175245455	175245299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-91P	79812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	176862590	176862993	176862904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	50268	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	179122098	179122379	179122239	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	44999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	179244857	179244994	179244926	Y	NA	ACTL6A	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	ACTL6A	33674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	179309053	179309431	179309273	Y	NA	ACTL6A,MRPL47,NDUFB5	NA	NA	NA	NA	MRPL47	11011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	179687230	179687579	179687379	Y	PEX5L	NA	NA	NA	NA	NA	PEX5L	65262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	180122489	180122783	180122636	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC14	195135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	180590296	180590653	180590471	Y	NA	FXR1	NA	NA	NA	NA	FXR1	6367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	181419160	181419816	181419173	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	7898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	181438058	181438556	181438099	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	10344	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	181442269	181442851	181442522	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	14555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	181444404	181445128	181444694	Y	NA	SOX2	NA	NA	NA	NA	SOX2	16690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr3	181876844	181877235	181877011	Y	NA	RP11-416O18.2	NA	NA	NA	NA	RP11-416O18.2	39172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr3	182613640	182613943	182613809	Y	MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	87798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	182928659	182929484	182928893	Y	ATP11B,DCUN1D1,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	39548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	182973593	182973879	182973736	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	182980670	182980835	182980709	Y	NA	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	11638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	183229776	183229950	183229863	Y	KLHL6	NA	NA	NA	NA	NA	MCF2L2	85210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	185448917	185448986	185448952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP2	150633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	185905496	185905742	185905693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	79389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	186819692	186820086	186819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL39L	76610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	187724632	187724970	187724785	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	827936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	189192792	189192813	189192806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPRG1-AS1	529364	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	191873125	191873377	191873252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	610176	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	191899426	191899438	191899432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	584115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	192289148	192289495	192289213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF12	194058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	193548514	193548983	193548724	Y	NA	NA	LOC100131551,LOC647323,HES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OPA1	239581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	193822220	193822536	193822295	Y	NA	HES1	LOC647323	IMR90	Hi-C	24141950	HES1	29398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	193858651	193858843	193858731	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	6717	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr3	193859199	193859624	193859359	Y	TMEM44	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	7265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr3	193876735	193877026	193876899	Y	NA	HES1	NA	NA	NA	NA	HES1	24801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	193993457	193993565	193993509	Y	NA	RP11-513G11.3	LOC647323,LOC100131551	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-513G11.3	30020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	194435877	194435987	194435931	Y	LSG1	LSG1,FAM43A	NA	NA	NA	NA	FAM43A	31255	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	194869324	194869713	194869394	Y	NA	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	2724	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	194871039	194871493	194871089	Y	FAM43A,C3orf21	XXYLT1-AS2	NA	NA	NA	NA	XXYLT1-AS2	4439	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	194981425	194981579	194981527	Y	ACAP2	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	8317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	195542423	195542578	195542499	Y	MUC20,MUC4	MUC4	NA	NA	NA	NA	MUC4	5275	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	195908745	195909032	195908753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	101685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	196437709	196437842	196437776	Y	NA	CEP19,PAK2	NA	NA	NA	NA	CEP19	545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	196635737	196635948	196635847	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5	SENP5,NCBP2	NA	NA	NA	NA	NCBP2	31520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	196855650	196855726	196855688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFI2	100963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	197247664	197248059	197247722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	50135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	197264445	197264691	197264611	Y	NA	BDH1	NA	NA	NA	NA	BDH1	33503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr3	197335598	197335855	197335727	Y	NA	BDH1,AC024560.3	NA	NA	NA	NA	AC024560.3	16922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr3	197461391	197461841	197461700	Y	IQCG,LRCH3,KIAA0226	FYTTD1,KIAA0226	NA	NA	NA	NA	FYTTD1	209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	330052	330352	330160	Y	NA	ZNF732,ZNF141	NA	NA	NA	NA	ZNF141	449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	742666	742733	742699	Y	NA	PCGF3,RP11-440L14.1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	30904	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	770204	770556	770391	Y	ZNF141	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	3081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	789468	789689	789607	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	15831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr4	867282	867339	867287	Y	NA	CPLX1	NA	NA	NA	NA	CPLX1	49296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1129933	1130282	1130090	Y	NA	RNF212	RNF212,TMED11P,KIAA1530,SPON2,CTBP1,C4orf42,MAEA,FAM53A,SLBP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF212	24583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1760039	1760352	1760159	Y	FGFR3	SLBP,TMEM129,TACC3,FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	32682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	1796551	1796852	1796752	Y	NA	FGFR3	NA	NA	NA	NA	FGFR3	3517	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1966776	1967112	1967086	Y	WHSC1,WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	7251	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	1972677	1973039	1972858	Y	WHSC1	SCARNA22	NA	NA	NA	NA	SCARNA22	1324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	3389642	3390154	3389980	Y	HTT,RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	96887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	3390647	3391111	3390815	Y	RGS12	NA	NA	NA	NA	NA	RGS12	97892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	3493312	3493795	3493528	Y	NA	LRPAP1	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	38491	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	3836768	3837443	3837153	Y	NA	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA2C	70693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	6223621	6224023	6223692	Y	PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1	JAKMIP1,WFS1	NA	NA	NA	NA	JAKMIP1	23303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr4	6592942	6593078	6593012	Y	NA	PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1	NA	NA	NA	NA	MAN2B2	18040	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	6732812	6732932	6732874	Y	TBC1D14,TBC1D14	MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	23205	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	6893983	6894399	6894044	Y	KIAA0232,TADA2B,TBC1D14,TBC1D14	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	14570	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	7510082	7510101	7510091	Y	SORCS2	NA	NA	NA	NA	NA	SORCS2	317817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	8047837	8047991	8047936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	108184	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	8074403	8074521	8074462	Y	ABLIM2	NA	NA	NA	NA	NA	ABLIM2	84038	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	10053251	10053319	10053285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR1	63254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr4	13983712	13984051	13983910	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	351489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	15297006	15297030	15297019	Y	NA	NA	C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	CC2D2A	172459	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	15651682	15652058	15651870	Y	NA	FAM200B,FBXL5	NA	NA	NA	NA	FAM200B	29227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	16003610	16004023	16003987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PROM1	79978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	16125304	16125914	16125552	Y	NA	PROM1	PROM1	IMR90	Hi-C	24141950	PROM1	41303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	17979858	17980211	17980206	Y	CLRN2,LCORL	LCORL	NA	NA	NA	NA	LCORL	41288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	20198231	20198535	20198383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT2	54348	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	20780664	20780780	20780767	Y	KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	84759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	21602576	21603408	21603328	Y	KCNIP4,KCNIP4,KCNIP4	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	345014	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	21656596	21656603	21656600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	291819	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	21678631	21679026	21678848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	269396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	22270180	22270523	22270471	Y	NA	NA	LOC100505912	IMR90	Hi-C	24141950	GPR125	245154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	23958561	23958931	23958759	Y	NA	NA	PPARGC1A	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	625242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	24913671	24913932	24913802	Y	CCDC149	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	65894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	24916004	24916032	24916018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC149	63794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	24975738	24976056	24975826	Y	DHX15,CCDC149,CCDC149	CCDC149	NA	NA	NA	NA	CCDC149	3770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	25097730	25097880	25097805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPSECS	62324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	26888311	26888739	26888468	Y	NA	STIM2,RP11-293A21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	28090	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	30718904	30719447	30718947	Y	PCDH7,PCDH7	PCDH7	NA	NA	NA	NA	PCDH7	590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	36284785	36284939	36284846	Y	ARAP2,DTHD1,DTHD1	ARAP2	NA	NA	NA	NA	ARAP2	40654	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	38159115	38159505	38159287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	199059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	38162520	38162833	38162765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	38668617	38669179	38668850	Y	KLF3	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	4113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	38671040	38671097	38671090	Y	NA	KLF3,RP11-617D20.1	NA	NA	NA	NA	RP11-617D20.1	6536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	39659267	39659273	39659270	Y	NA	RP11-539G18.2,UBE2K	LIAS,LOC401127,PDS5A,UBE2K	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-539G18.2	20507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	40285086	40285251	40285162	Y	N4BP2,RHOH	NA	N4BP2,RHOH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	N4BP2	228640	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	40620437	40620847	40620835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	129067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	40910052	40910602	40910542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	160138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	41469951	41470276	41469966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	110327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	41886373	41886653	41886561	Y	PHOX2B	LINC00682,TMEM33	PHOX2B,LIMCH1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00682	3745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	41999139	41999467	41999284	Y	NA	SLC30A9	NA	NA	NA	NA	SLC30A9	8650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	47308450	47308659	47308604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COMMD8	155077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	48532180	48532355	48532269	Y	NA	SLC10A4	NA	NA	NA	NA	SLC10A4	48820	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	53890542	53890886	53890882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	164085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	54137122	54137385	54137364	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	92857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	55574456	55574839	55574648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIT	52371	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	57132335	57132393	57132366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP31	87908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	57831930	57832208	57832081	Y	NA	POLR2B,NOA1	NA	NA	NA	NA	POLR2B	9680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	59274470	59274843	59274657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	1299919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	62068799	62069364	62069049	Y	LPHN3	LPHN3	NA	NA	NA	NA	LPHN3	3823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	66516104	66516284	66516196	Y	NA	RP11-807H7.1,EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	17395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	66533536	66533932	66533732	Y	EPHA5	EPHA5	NA	NA	NA	NA	RP11-807H7.1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	67430351	67431255	67431078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA5	896138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	67972662	67972987	67972824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	591910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	71768830	71769244	71769107	Y	DCK,MOBKL1A	MOB1B	NA	NA	NA	NA	MOB1B	2787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	72125321	72125676	72125518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	74318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	72130257	72130635	72130446	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	79254	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	72459056	72459408	72459224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	408053	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	NA	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	75859868	75860329	75860092	Y	BTC,PARM1	PARM1	NA	NA	NA	NA	PARM1	3563	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	75955084	75955470	75955277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARM1	98779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	76621405	76621540	76621497	Y	RCHY1,THAP6,NUP54,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	26169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	77173424	77173631	77173514	Y	ART3,CCDC158	SCARB2,FAM47E	NA	NA	NA	NA	FAM47E	40231	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	78656019	78656351	78656260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	82418	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	78977894	78978171	78977912	Y	FRAS1	FRAS1	NA	NA	NA	NA	FRAS1	1170	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	79264997	79265051	79265025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA3	205622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	81119203	81119473	81119338	Y	PRDM8,PRDM8	PRDM8	NA	NA	NA	NA	PRDM8	16170	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	81990935	81991080	81991055	Y	NA	BMP3	NA	NA	NA	NA	BMP3	40816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	82427003	82427499	82427111	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	292785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	82434115	82434502	82434253	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	299897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	82507814	82508135	82508051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	373596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	82566342	82566814	82566582	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	396583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	82646318	82646551	82646422	Y	RASGEF1B	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1B,RP11-689K5.3	316846	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	83205148	83205451	83205300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPD	88205	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	83681282	83681423	83681411	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	36587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	83755588	83755973	83755970	Y	NA	SCD5	NA	NA	NA	NA	SCD5	37578	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS4	76380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	84237643	84238153	84237819	Y	THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE	COQ2,HPSE	NA	NA	NA	NA	HPSE	16153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	84398625	84398990	84398638	Y	NA	HELQ,MRPS18C,FAM175A	NA	NA	NA	NA	MRPS18C	23540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	84469544	84469879	84469660	Y	PLAC8,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE,HELQ,AGPAT9	FAM175A,AGPAT9	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	14477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	84555283	84555459	84555372	Y	NA	NA	FAM175A	IMR90	Hi-C	24141950	AGPAT9	100216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	85047369	85047537	85047456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	454595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDS1	81224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr4	85868944	85869302	85869263	Y	NA	WDFY3-AS2,WDFY3	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	16236	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	86242920	86243264	86243093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3	357376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK10	584746	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	87204498	87204708	87204603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPK10	308576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	87815640	87815940	87815774	Y	NA	AFF1,C4orf36	NA	NA	NA	NA	AFF1	38214	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	87835479	87835856	87835675	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	18298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	88408034	88408084	88408060	Y	SPARCL1	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT9	66300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	88776786	88777160	88777099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-36P	142229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	89117936	89118179	89117940	Y	MEPE	NA	PKD2,ABCG2	IMR90	Hi-C	24141950	PPM1K	85742	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	89885623	89885749	89885686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	268237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	91049597	91049943	91049669	Y	FAM190A	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	292131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr4	91110369	91110717	91110466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNCA	352903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	93226746	93226922	93226838	Y	GRID2	GRID2	NA	NA	NA	NA	GRID2	3196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	99853675	99854028	99853903	Y	EIF4E,EIF4E	EIF4E	NA	NA	NA	NA	EIF4E	3887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	288765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	102113415	102113532	102113437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	153405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	102153053	102153484	102153407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	113453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	103673229	103673433	103673315	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	6718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	106362976	106363368	106363172	Y	NA	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	29870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	106390941	106391445	106391094	Y	TET2,TET2	PPA2,EEF1A1P9	NA	NA	NA	NA	PPA2	1793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	110449545	110449722	110449703	Y	SEC24B	CCDC109B	CCDC109B	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC109B	29639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	110464231	110464470	110464351	Y	NA	CCDC109B	NA	NA	NA	NA	CCDC109B	14891	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	110623287	110623426	110623357	Y	LRIT3	CASP6,PLA2G12A	NA	NA	NA	NA	CASP6	548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	111549500	111549935	111549649	Y	PITX2	PITX2	NA	NA	NA	NA	PITX2	11344	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.53648724195395
chr4	111553099	111553258	111553149	Y	PITX2,PITX2	PITX2	NA	NA	NA	NA	PITX2	8021	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	113431216	113431498	113431423	Y	ANK2,NEUROG2	NEUROG2	NA	NA	NA	NA	NEUROG2	3830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr4	113572868	113573168	113573031	Y	NA	LARP7,C4orf21	NA	NA	NA	NA	C4orf21	16717	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	113852159	113852312	113852236	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	114894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	114104327	114104616	114104364	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	234863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	114382932	114383313	114383209	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	43453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM1L1	530460	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	120437308	120437708	120437606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	63362	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	120439031	120439404	120439161	Y	PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	65085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	121323328	121323687	121323508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD2L1	337099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	121670758	121670998	121670880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM5	171027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	128449277	128449713	128449510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	92713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	128990801	128990842	128990822	Y	NA	LARP1B	NA	NA	NA	NA	LARP1B	10378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	129733811	129733921	129733891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf33	278551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	131958409	131958454	131958432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCLT1	1945645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	139645845	139645944	139645857	Y	NA	NA	LOC641365,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	288999	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	139831999	139832463	139832295	Y	NA	NA	LOC641365,SLC7A11,LOC641364	IMR90	Hi-C	24141950	CCRN4L	102480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	140096766	140097018	140096889	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2	ELF2	ELF2,NAA15	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ELF2	394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	140656765	140657105	140656839	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	71843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140667675	140667827	140667711	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	82753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140737173	140737338	140737263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	152251	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140748220	140748477	140748349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	163298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140793640	140793753	140793693	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	208718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140794594	140794926	140794812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	209672	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	140924986	140925148	140925064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	148190	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	140970177	140970718	140970535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	102620	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr4	141012548	141012827	141012747	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	60511	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	141015177	141015539	141015358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	57799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141015706	141016341	141016156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141016837	141017139	141016990	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	56199	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141164479	141164682	141164571	Y	MAML3	SCOC	MAML3,MGST2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCOC	11758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	141207513	141207988	141207940	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	31073	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	141218386	141218686	141218436	Y	MAML3,SCOC	SCOC	NA	NA	NA	NA	SCOC	41946	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr4	145570882	145571097	145570988	Y	NA	HHIP	NA	NA	NA	NA	HHIP	5709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	146101946	146102251	146102199	Y	NA	OTUD4	ABCE1	K562	ChIA-PET	22265404	OTUD4	2633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr4	146815736	146815927	146815832	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	41860	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	ZNF827	NA	NA	NA	NA	ZNF827	675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	148654665	148655045	148654996	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	3451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	148677279	148677473	148677309	Y	NA	ARHGAP10	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	26065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	148752985	148753384	148753090	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	101771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	148768906	148769305	148769088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	117692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	150667189	150667290	150667194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	1267589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	151641898	151642513	151641954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRBA	292366	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	152090134	152090652	152090546	Y	SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	71409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr4	152226044	152226315	152226216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-610P16.1	101672	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	152367520	152367754	152367585	Y	NA	RP11-610P16.1,FAM160A1	NA	NA	NA	NA	FAM160A1	39152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	153023305	153023605	153023314	Y	NA	NA	SH3D19,FBXW7,RPS3A,PET112	IMR90	Hi-C	24141950	PET112	343130	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	153858553	153859077	153858605	Y	TRIM2,FHDC1	RP11-206F17.2,FHDC1	ARFIP1,FHDC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FHDC1	3049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	153884926	153884958	153884941	Y	NA	RP11-206F17.2,FHDC1	NA	NA	NA	NA	FHDC1	29422	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	154408922	154409996	154409474	Y	NA	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	23424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	155239135	155239272	155239204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCHS2	171658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	155378623	155378919	155378786	Y	NA	DCHS2	NA	NA	NA	NA	DCHS2	32011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr4	158186667	158186917	158186738	Y	PDGFC,GLRB,GLRB	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA2	63333	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	158219771	158220072	158219781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRIA2	96437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	159103850	159104073	159103996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	487204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	159592059	159592445	159592194	Y	NA	ETFDH,C4orf46	NA	NA	NA	NA	C4orf46	652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	160424445	160424685	160424564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	736155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	NACA3P	NA	NA	NA	NA	NACA3P	19861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	166422422	166422684	166422539	Y	KLHL2,CPE	NA	NA	NA	NA	NA	CPE	142076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	169559850	169560019	169559874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX60L	102913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	169802596	169802736	169802661	Y	PALLD	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	126690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	169868186	169868202	169868194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	61224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	169992046	169992220	169992129	Y	NA	NA	SH3RF1,NEK1	IMR90	Hi-C	24141950	CBR4	62620	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	170096424	170096523	170096474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	93733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	170570348	170570457	170570384	Y	NA	NEK1,CLCN3	NA	NA	NA	NA	CLCN3	38564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	174185845	174186217	174186078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB2	68059	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	174285204	174285286	174285258	Y	NA	HMGB2,SAP30	SAP30	K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	3834	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	174337339	174338040	174337759	Y	SAP30	SAP30	HMGB2,GALNT7,SAP30	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SAP30	48219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	176922084	176922777	176922424	Y	GPM6A,WDR17,GPM6A	NA	NA	NA	NA	NA	WDR17	62208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-45P	1943725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	183161464	183161792	183161628	Y	ODZ3	NA	ODZ3	IMR90	Hi-C	24141950	AC108142.1	97062	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	183353287	183353302	183353295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	288885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	184328356	184328744	184328447	Y	CDKN2AIP	CDKN2AIP	WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	35000	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr4	184423820	184424211	184423984	Y	STOX2	NA	NA	NA	NA	NA	ING2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	184643961	184644129	184644061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC11	65541	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr4	184888585	184888733	184888700	Y	STOX2	RP11-739P1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-739P1.2	18098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	185296048	185296446	185296396	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	97288	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	185589829	185589977	185589872	Y	ACSL1,IRF2	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	21166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP2BP	87445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	186481104	186481365	186481225	Y	NA	PDLIM3	PDLIM3,SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM3	26338	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	186721569	186721813	186721702	Y	PDLIM3,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2,SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM3	266803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	187679181	187679543	187679362	Y	NA	FAT1	LOC339975,FAT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	33305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	187762182	187762435	187762391	Y	NA	NA	FAT1,LOC339975	IMR90	Hi-C	24141950	FAT1	116306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	189361062	189361328	189361166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219G10.1	91884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	190197516	190197817	190197669	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	431051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr4	190504163	190504534	190504471	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	124334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	53990	54174	54063	Y	PLEKHG4B,C5orf55	CTD-2231H16.1	LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2231H16.1	36092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr5	148457	148511	148484	Y	NA	PLEKHG4B	NA	NA	NA	NA	PLEKHG4B	10084	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr5	394851	394874	394864	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	46384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.32189234517237
chr5	448928	449328	449227	Y	NA	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7655	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	672237	672545	672500	Y	EXOC3,CEP72	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr5	759096	759567	759320	Y	TPPP	NA	SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13	IMR90	Hi-C	24141950	TPPP	67586	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	15.0869277343245
chr5	1097598	1097832	1097647	Y	NA	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	12318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	1102623	1102762	1102676	Y	TPPP,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	7388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	1200004	1200495	1200211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	89854	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	1316464	1316882	1316563	Y	TERT,SLC6A3	TERT,CLPTM1L	TERT	IMR90	Hi-C	24141950	TERT	23280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	1470037	1470319	1470275	Y	SLC12A7,LPCAT1	SLC6A3	NA	NA	NA	NA	SLC6A3	26492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	1516282	1516761	1516468	Y	SLC12A7,LPCAT1	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	5331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	2694499	2694872	2694689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf38	55373	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	2740702	2741010	2740867	Y	NA	C5orf38,IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	9235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	2750184	2750594	2750355	Y	C5orf38,IRX2	IRX2	NA	NA	NA	NA	C5orf38	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	5423578	5423857	5423693	Y	KIAA0947	KIAA0947	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	4801	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	6162553	6162867	6162710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED10	213840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	50027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	11.6266232081033
chr5	6961316	6961478	6961397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-332J15.3	197312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	7421559	7421813	7421686	Y	NA	ADCY2	NA	NA	NA	NA	ADCY2	27238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A	NA	NA	NA	NA	SEMA5A	293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	10352620	10352938	10352732	Y	NA	CMBL,MARCH6	NA	NA	NA	NA	MARCH6	805	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	10601684	10601853	10601839	Y	ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	39242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	10607952	10608169	10608061	Y	MARCH6,ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	45510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	11363744	11364010	11363991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	538145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	11591848	11592143	11592119	Y	CTNND2	NA	NA	NA	NA	NA	CTNND2	310012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	14208730	14209007	14208812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	14676546	14676758	14676685	Y	FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	13773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	14742718	14742956	14742837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	53553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	14872714	14873077	14873012	Y	NA	ANKH	NA	NA	NA	NA	ANKH	2827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	16089697	16089720	16089715	Y	MARCH11	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH11	89151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	16523103	16523375	16523239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF622	59202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	16727981	16728387	16728161	Y	FAM134B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	112814	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	16735791	16735955	16735874	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	120624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	17196578	17196835	17196707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BASP1	132871	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	17252511	17253031	17252811	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	90694	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	21396018	21396126	21396072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	56076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	21539943	21540207	21540075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	200001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	21933936	21933993	21933965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPD1P1	53242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	31459519	31459540	31459530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DROSHA	70763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	32175167	32175567	32175368	Y	NA	GOLPH3,CTD-2186M15.1	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	2711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	32283224	32283342	32283283	Y	NA	MTMR12	NA	NA	NA	NA	MTMR12	27773	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	34006520	34007060	34007033	Y	C1QTNF3,AMACR	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	300	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	34037436	34037722	34037670	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	31216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	34835599	34835693	34835610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRIX1	77788	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	34949030	34949157	34949062	Y	NA	BRIX1,RAD1,DNAJC21	NA	NA	NA	NA	DNAJC21	21332	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	35853494	35854024	35853833	Y	SPEF2,IL7R	NA	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	LMBRD2	296039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	37029618	37029862	37029736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	53296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	460733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	39072904	39073873	39073587	Y	FYB,RICTOR	RICTOR	NA	NA	NA	NA	RICTOR	394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	39721328	39721512	39721418	Y	NA	NA	TTC33,PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	RICTOR	648818	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	40410103	40410947	40410540	Y	PTGER4,PRKAA1	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	266653	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	40735267	40735522	40735406	Y	NA	TTC33	NA	NA	NA	NA	TTC33	18555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	42468582	42468751	42468671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPP1	416743	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	43010298	43010802	43010620	Y	GHR,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	5729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	43020158	43020617	43020275	Y	C5orf28,ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	3627	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	43020658	43020829	43020797	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	4127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC025171.1	4710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	43051482	43051716	43051600	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	NA	NA	NA	NA	ZNF131	11562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	43303282	43303485	43303367	Y	NA	HMGCS1	NA	NA	NA	NA	HMGCS1	8129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	43632069	43632220	43632145	Y	NA	NNT,NNT-AS1	NA	NA	NA	NA	NNT-AS1	30737	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	44663713	44663769	44663741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-53O19.1	143110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	49660016	49660402	49660209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	1016519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	50263404	50263601	50263575	Y	ISL1	NA	NA	NA	NA	NA	ISL1	413320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr5	50677492	50677845	50677668	Y	NA	ISL1	NA	NA	NA	NA	ISL1	571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr5	53358665	53359272	53358974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	245140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	53886788	53887029	53886875	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	75199	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	58232883	58233370	58233101	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	356835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr5	58816932	58817290	58817225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB3C	940884	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	60629701	60630027	60629731	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	3601	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	60710257	60710608	60710433	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	24559	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	61917589	61917885	61917879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKS1B	111280	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	64368719	64369105	64368844	Y	FAM159B	NA	ADAMTS6,CWC27	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	305962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr5	64372191	64372464	64372338	Y	FAM159B	NA	CWC27,ADAMTS6	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	309434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	64423186	64423354	64423272	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	360429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	67069285	67069755	67069460	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	439793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	67448850	67449023	67448936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	60525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	70772003	70772134	70772073	Y	NA	BDP1	NA	NA	NA	NA	BDP1	22561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	73439577	73439790	73439675	Y	ENC1	NA	RGNEF,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	HEXB	494058	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	74212679	74213001	74212847	Y	NA	CTD-2503O16.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2503O16.1	12486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	76958449	76958840	76958645	Y	NA	WDR41	NA	NA	NA	NA	WDR41	44013	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	77147501	77147797	77147637	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14807	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	77148404	77148543	77148518	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	14061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	227895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	77934857	77935090	77934974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	280518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	79405751	79406102	79405927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTX3	120669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	79428091	79428419	79428255	Y	SERINC5	NA	NA	NA	NA	NA	SERINC5	121479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	80394008	80394030	80394018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	201349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	80551638	80551938	80551834	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	43441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	81148608	81149026	81148707	Y	SSBP2	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	3188	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	82576471	82576688	82576580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	204789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	82769254	82769739	82769524	Y	VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	327634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	83305524	83305826	83305754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-11P	208151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	83668796	83668857	83668813	Y	NA	EDIL3	NA	NA	NA	NA	EDIL3	9754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	EDIL3	NA	NA	NA	NA	EDIL3	683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	86604017	86604207	86604034	Y	RASA1,RASA1	RASA1	NA	NA	NA	NA	RASA1	42312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	86617714	86617757	86617736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	56009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	86649300	86650123	86649885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	56713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	87956632	87957169	87956907	Y	MEF2C,MEF2C	CTC-467M3.1,LINC00461	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	12867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	87967371	87967797	87967486	Y	MEF2C	CTC-467M3.1,LINC00461	NA	NA	NA	NA	CTC-467M3.1	2239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	90772639	90772960	90772848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	95463	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	40958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	94033836	94034405	94034124	Y	KIAA0825,ANKRD32	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	81527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	RHOBTB3	47635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	95294794	95295285	95294896	Y	ELL2	ELL2	NA	NA	NA	NA	ELL2	490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	96902008	96902041	96902023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2278B20.1	231264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	99386410	99387139	99386777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	481827	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr5	105752390	105752961	105752697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	1251635	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	106837531	106838094	106837969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	166502	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	106862612	106863005	106862809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	141591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	106901710	106902084	106901897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFNA5	102512	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	107004755	107005118	107004922	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	159	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	110057836	110058086	110057958	Y	NA	SLC25A46,TMEM232	NA	NA	NA	NA	SLC25A46	13751	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	110563061	110563453	110563180	Y	CAMK4	AC010468.1,CAMK4	NA	NA	NA	NA	CAMK4	5710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	111742657	111742758	111742708	Y	NA	EPB41L4A	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A	10255	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	112395053	112395446	112395196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	84654	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	112425460	112425614	112425558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	115061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	112857514	112857856	112857617	Y	NA	MCC,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	10134	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	115421672	115422041	115421857	Y	NA	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	2984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	115908516	115909016	115908646	Y	SEMA6A	CTB-118N6.1,CTB-118N6.2	NA	NA	NA	NA	SEMA6A	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	121402997	121403353	121403172	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF474	59855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	123774307	123774708	123774529	Y	ZNF608	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF608	307792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	124593106	124593253	124593226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-436H11.1	450180	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-395C3.1	53916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	131757211	131757329	131757283	Y	SLC22A4,IRF1	C5orf56	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	12883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,AC010240.3,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AC010240.3	1685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	133259809	133260031	133259966	Y	NA	C5orf15	FSTL4,HSPA4	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf15	42447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	135360039	135360154	135360090	Y	NA	NA	LECT2,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD5	106380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	135373156	135373467	135373188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	93067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	137881069	137881276	137881109	Y	WNT8A,FAM53C,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	4080	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	138262166	138262549	138262196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC034243.1	175168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	139017086	139017541	139017145	Y	CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	7343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139017934	139018665	139018227	Y	MZB1,CXXC5	CXXC5	CXXC5	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	6219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139031397	139032095	139031636	Y	C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	6513	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139070074	139070356	139070181	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	45190	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139088295	139089196	139088669	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	63411	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr5	139090416	139090834	139090571	Y	MATR3,MATR3,CXXC5	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	65532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	139090940	139091124	139091019	Y	NA	NA	CXXC5	K562	ChIA-PET	22265404	CXXC5	66056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr5	139135408	139135879	139135750	Y	NA	NA	UBE2D2,CXXC5,DNAJC18,NRG2,CYSTM1	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC5	110524	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139782360	139782578	139782471	Y	NA	ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3	NA	NA	NA	NA	ANKHD1-EIF4EBP3	2867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	139933633	139933898	139933723	Y	ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3	EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3	NA	NA	NA	NA	SRA1	1997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	141222246	141222576	141222518	Y	NA	PCDH1	NA	NA	NA	NA	PCDH1	34235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	144920892	144921143	144921082	Y	NA	NA	KCTD16	IMR90	Hi-C	24141950	PRELID2	291789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	145724324	145724652	145724327	Y	GPR151,GRXCR2	POU4F3	NA	NA	NA	NA	POU4F3	7737	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr5	145808290	145808429	145808360	Y	POU4F3	TCERG1	NA	NA	NA	NA	TCERG1	16445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	146047313	146047450	146047388	Y	NA	KRT8P48	NA	NA	NA	NA	KRT8P48	37713	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	146830882	146830936	146830890	Y	PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	56683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	146834939	146835189	146835093	Y	DPYSL3,DPYSL3	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	52430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	146890135	146890280	146890247	Y	NA	DPYSL3	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	2516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	RP11-373N22.3,FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	148336270	148336420	148336344	Y	NA	NA	ADRB2,ABLIM3,SH3TC2	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	132114	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	148869266	148869383	148869317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	59624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	149838456	149838698	149838517	Y	SYNPO,ZNF300,SLC6A7	RPS14,NDST1,CTC-367J11.1	NDST1,MYOZ3,SYNPO,RPS14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS14	11137	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	149979570	149980059	149979818	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	150086779	150087134	150086956	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4	RBM22,DCTN4	MYOZ3,RBM22	IMR90	Hi-C	24141950	RBM22	8110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	154007617	154007930	154007773	Y	NA	NA	C5orf4,MFAP3,FAM114A2	IMR90	Hi-C	24141950	LARP1	82532	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	154062607	154063000	154062805	Y	GEMIN5	LARP1	LARP1,C5orf4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP1	27462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	154274946	154275114	154275030	Y	NA	CNOT8,GEMIN5,MRPL22	NA	NA	NA	NA	CNOT8	39833	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr5	155107244	155107656	155107286	Y	NA	NA	PPP1R2P3,TIMD4,SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL22	788614	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	156471573	156471840	156471835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	96040	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	156718541	156718931	156718583	Y	HAVCR2,ADAM19,CYFIP2,CYFIP2,CYFIP2	CYFIP2	NA	NA	NA	NA	CYFIP2	27452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	158245937	158246321	158246106	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	278448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	158448175	158448456	158448348	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	76313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	158491555	158491917	158491726	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	32852	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	158507046	158507207	158507202	Y	NA	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	17562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	158521683	158522288	158522053	Y	EBF1	EBF1,RP11-175K6.1	NA	NA	NA	NA	EBF1	2481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	159533500	159533764	159533742	Y	NA	PWWP2A	NA	NA	NA	NA	PWWP2A	10666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	167171330	167171561	167171437	Y	NA	CTB-78F1.2	NA	NA	NA	NA	CTB-78F1.2	24962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	168055373	168055394	168055384	Y	NA	CTC-575D19.1	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	14056	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	168232470	168232861	168232812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	191153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	170103371	170103426	170103399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	183448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	170134160	170134177	170134169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	152697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	170289548	170289859	170289780	Y	NA	RANBP17	NA	NA	NA	NA	RANBP17	2674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	170763835	170763948	170763895	Y	NA	TLX3,NPM1	KCNIP1,GABRP,RANBP17	IMR90	Hi-C	24141950	TLX3	29547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	172192263	172193766	172192583	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2432	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	173180419	173180632	173180581	Y	NA	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	132651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	173909800	173909986	173909867	Y	NA	NA	MIR4634,MSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	596517	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	174906234	174906555	174906308	Y	NA	SFXN1	NA	NA	NA	NA	SFXN1	4169	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	175960481	175960718	175960661	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2	RNF44	NA	NA	NA	NA	RNF44	2308	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	175962179	175962700	175962413	Y	UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2	RNF44	FAF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF44	326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	176424414	176424699	176424557	Y	NA	UIMC1,ZNF346	NA	NA	NA	NA	UIMC1	22935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	177542150	177542670	177542238	Y	N4BP3	RMND5B,NHP2	NA	NA	NA	NA	RMND5B	13327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	177645267	177645446	177645363	Y	N4BP3,CLK4,AGXT2L2	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	178052813	178053238	178053128	Y	AGXT2L2,CLK4	CLK4	COL23A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLK4	2378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	178598679	178598882	178598773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF354C	113263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	178985972	178986151	178986083	Y	NA	RUFY1	NA	NA	NA	NA	RUFY1	10413	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	179206190	179206408	179206299	Y	NA	MAML1,SQSTM1,MGAT4B	NA	NA	NA	NA	SQSTM1	24980	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	180600516	180600767	180600667	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	16157	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	180615864	180616079	180615972	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr5	180672693	180672910	180672808	Y	NA	TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9	NA	NA	NA	NA	GNB2L1	186	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	321888	322261	322075	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	32258	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	393896	394326	394097	Y	DUSP22,IRF4,EXOC2	IRF4	NA	NA	NA	NA	IRF4	4157	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	446897	447289	446980	Y	NA	NA	IRF4	IMR90	Hi-C	24141950	IRF4	57158	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	1311143	1311466	1311342	Y	NA	FOXQ1	NA	NA	NA	NA	FOXQ1	468	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	1609094	1609758	1609395	Y	FOXC1	FOXC1	NA	NA	NA	NA	FOXC1	413	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	2790944	2791090	2791014	Y	NA	WRNIP1	SERPINB1	IMR90	Hi-C	24141950	WRNIP1	27296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	2818084	2818421	2818253	Y	SERPINB9	NA	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	54436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3072108	3072295	3072201	Y	NA	RIPK1,BPHL	NA	NA	NA	NA	RIPK1	9883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3230738	3231042	3230747	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3259939	3260435	3260206	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	29975	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	3308463	3308483	3308477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	78499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3403581	3403822	3403689	Y	BPHL,SLC22A23	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	51434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	3426515	3426916	3426721	Y	NA	SLC22A23	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	28340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	5179288	5179492	5179391	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	79680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	5266800	5267044	5266922	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	7523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	5513756	5514022	5513872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	254479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	5724558	5724824	5724692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	465281	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	6000594	6000986	6000896	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	741317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	6662049	6662264	6662157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	443566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	6687140	6687567	6687361	Y	NA	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	418263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.35300707783043
chr6	6881907	6882296	6882232	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	223534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7052517	7053280	7052961	Y	LY86	NA	RREB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RREB1	52550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	7143191	7143555	7143322	Y	NA	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	37361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7174134	7174405	7174138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	68304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7261407	7261720	7261663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-69L16.5	76081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7505623	7505742	7505694	Y	RREB1,DSP	DSP	DSP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DSP	34066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	7544425	7544740	7544519	Y	NA	DSP,SNRNP48	NA	NA	NA	NA	DSP	4617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7591248	7591486	7591394	Y	NA	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	SNRNP48	2816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	7915829	7915944	7915887	Y	SNRNP48	NA	NA	NA	NA	NA	TXNDC5	108702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	10315279	10315501	10315368	Y	PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	102391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	10316491	10316897	10316818	Y	TFAP2A,TFAP2A	NA	LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP2A	100995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	10383571	10383981	10383824	Y	TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	33911	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	10407698	10407754	10407725	Y	PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A,LINC00518	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	10138	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	10520494	10520618	10520557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00518	87387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	10587786	10588136	10587948	Y	TMEM14B,GCNT2	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	104792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	10655946	10656230	10656081	Y	C6orf52	PAK1IP1,C6orf52	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	36698	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	10825104	10825395	10825250	Y	ELOVL2	MAK	NA	NA	NA	NA	MAK	11369	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	11243333	11243432	11243383	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	137149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	11344526	11344935	11344784	Y	TMEM170B,NEDD9	NEDD9	NA	NA	NA	NA	NEDD9	35646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	12285143	12285495	12285317	Y	NA	NA	TMEM170B,ADTRP,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL15P3	226847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	12315136	12315383	12315260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	196959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	12472967	12473281	12473124	Y	NA	RPL15P3	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	39061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P3	217412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	13059086	13059210	13059117	Y	PHACTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-11P	153078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	13354550	13354809	13354680	Y	NA	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	27735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	13527016	13527208	13527126	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1,RPS4XP7,SIRT5	GFOD1,SIRT5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS4XP7	7518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	13766479	13766874	13766549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	56683	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	14094295	14094789	14094528	Y	CD83	CD83	JARID2,DTNBP1,CCDC90A,RNF182,CD83	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	21083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	14405473	14405724	14405599	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	289601	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	14966546	14966931	14966759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JARID2	277596	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	15569583	15569742	15569685	Y	DTNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	91547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	15818301	15818443	15818372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	157012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	16205650	16206035	16205852	Y	NA	GMPR	DTNBP1,MYLIP,GMPR	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GMPR	30776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	17280388	17280785	17280395	Y	CAP2,RBM24,RBM24,RBM24	RBM24	NA	NA	NA	NA	RBM24	811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	17312081	17312238	17312192	Y	RBM24	RBM24	NA	NA	NA	NA	RBM24	32504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	17430018	17430227	17430123	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	38571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	17447404	17447614	17447509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2	55957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	18341418	18341503	18341461	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RNF144B	25276	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	18370927	18371512	18371225	Y	NA	RNF144B	RNF144B	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNF144B	4148	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	18400891	18401631	18401172	Y	KIF13A,KDM1B,RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	34112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	19691933	19692175	19692049	Y	ID4	NA	NA	NA	NA	NA	ID4	143442	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	20575670	20575691	20575681	Y	NA	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	42982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	20877706	20877968	20877723	Y	CDKAL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	345018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	21022706	21023638	21022736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	490018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	21098770	21098791	21098780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	493181	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr6	21667588	21667834	21667745	Y	SOX4	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	75616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	21738487	21738974	21738702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	146515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	21925228	21925506	21925404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	333256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	21946635	21946935	21946785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	354663	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	21997954	21998076	21998022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	405982	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	22072015	22072158	22072069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	480043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	23656570	23656900	23656609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRSN1	467450	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	24834309	24834321	24834317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMNN	61150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC16A	182565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H3A	25645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	26462244	26462270	26462257	Y	BTN2A1,BTN2A1	BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	6094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	26474010	26474599	26474187	Y	NA	BTN2A1	NA	NA	NA	NA	BTN2A1	17860	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	15427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	26533222	26533398	26533310	Y	NA	HMGN4	NA	NA	NA	NA	HMGN4	3235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27065086	27065154	27065121	Y	NA	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BJ	33387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27446506	27447382	27447356	Y	NA	ZNF184	ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF184	7609	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27655152	27655475	27655306	Y	FKSG83,ZNF391,ZNF184,ZNF192,HIST1H3H,HIST1H2BO,HIST1H2BN,HIST1H2AM	NA	LOC100507173,ZNF184	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HIST1H2BL	118234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	27706104	27706357	27706299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	67352	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	27759985	27760333	27760032	Y	ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	13376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	28080593	28080792	28080693	Y	NA	ZNF165,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	9546	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	28280351	28280639	28280495	Y	NA	PGBD1,ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	PGBD1	33037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	28299231	28299616	28299424	Y	GPX6,ZSCAN23,SCAND3,OR2B2,ZNF193,ZNF187,PGBD1	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	16075	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	28302002	28302386	28302196	Y	NA	ZKSCAN3	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN3	13305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	28414953	28415259	28415025	Y	NA	ZSCAN12,ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	5674	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	28603148	28603326	28603259	Y	NKAPL,ZNF187,ZSCAN23,SCAND3	SCAND3	NA	NA	NA	NA	SCAND3	21159	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	29933738	29934144	29933980	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	26701	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	29935319	29935652	29935489	Y	NA	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	28282	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	30182160	30182533	30182417	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	2956	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr6	30477053	30477329	30477202	Y	PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1	NA	NA	NA	NA	HLA-E	21809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	30497672	30498068	30497880	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PBMUCL1,PPP1R10,ATAT1,ATAT1	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1,ABCF1	NA	NA	NA	NA	PRR3	24595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	31326609	31326903	31326756	Y	NFKBIL1,PBMUCL1	HLA-B	NA	NA	NA	NA	HLA-B	3644	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	31334700	31334921	31334854	Y	NFKBIL1,C6orf27,ATP6V1G2	HLA-B	HCG27	MCF7	ChIA-PET	22265404	HLA-B	11735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1	NA	NA	NA	NA	ATF6B	17851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,PRRT1,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	33386765	33387072	33386901	Y	HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,HLA-DPA1,HLA-DPB1	KIFC1,PHF1,CUTA,SYNGAP1,ZBTB9	NA	NA	NA	NA	SYNGAP1	918	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	33538378	33538887	33538702	Y	LEMD2,LEMD2,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	7132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	33538911	33539356	33539169	Y	LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	BAK1	6663	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	33712309	33712484	33712432	Y	IP6K3	IP6K3,LEMD2	NA	NA	NA	NA	IP6K3	278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	34512763	34512881	34512822	Y	SPDEF	NA	NA	NA	NA	NA	PACSIN1	80847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	35026753	35026994	35026778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11	87393	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	36005886	36006030	36005958	Y	NA	SLC26A8,MAPK14	NA	NA	NA	NA	MAPK14	12398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	36321421	36321620	36321472	Y	CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7	ETV7	NA	NA	NA	NA	ETV7	32544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	ETV7,KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	36409257	36409482	36409373	Y	MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	PXT1	591	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	37051169	37051555	37051360	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FGD2	NA	CPNE5,PIM1,C6orf89,PPIL1,FGD2,TBC1D22B,MTCH1,TMEM217	IMR90	Hi-C	24141950	PIM1	84424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	37271813	37272101	37271931	Y	PIM1,TBC1D22B	TBC1D22B,TMEM217,RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	47647	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	37366071	37366087	37366081	Y	NA	RNF8	NA	NA	NA	NA	RNF8	46323	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	37464858	37465170	37465019	Y	NA	CCDC167	NA	NA	NA	NA	CCDC167	528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	37484293	37484960	37484497	Y	NA	CCDC167	CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC167	18595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	37751286	37751497	37751341	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	33778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	37892657	37892863	37892737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	107382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	38447266	38447403	38447335	Y	DNAH8,BTBD9,BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	158521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	39285225	39285328	39285279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAYSD1	204260	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	40445607	40445840	40445690	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN2	107364	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	40463742	40464103	40464095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRFN2	89101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	41008417	41008606	41008512	Y	UNC5CL,TSPO2,TSPO2	APOBEC2,NFYA	NA	NA	NA	NA	APOBEC2	10437	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	41471691	41471833	41471786	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	40331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	41472054	41472459	41472263	Y	NA	FOXP4,RP11-328M4.2	FOXP4	IMR90	Hi-C	24141950	FOXP4	39705	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	41528607	41528881	41528714	Y	TAF8,CCND3,NFYA,TFEB	FOXP4,RP11-328M4.2	NA	NA	NA	NA	RP11-328M4.2	14248	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	41608113	41608435	41608156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFEB	93562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	41612844	41613289	41612975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFEB	88708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	42228452	42228568	42228527	Y	NA	MRPS10	NA	NA	NA	NA	MRPS10	44849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	42375139	42375533	42375327	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	42256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	42738530	42739530	42738949	Y	CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226	TBCC	KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBCC	25972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr6	43001164	43001472	43001318	Y	NA	MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	KLC4	5043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	43073020	43073202	43073194	Y	NA	MRPL2,PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	31014	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	43085846	43085863	43085854	Y	NA	PTK7	NA	NA	NA	NA	PTK7	43840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	43505816	43505905	43505861	Y	ABCC10,TJAP1	POLR1C,LRRC73,YIPF3,XPO5,POLH	NA	NA	NA	NA	YIPF3	23088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	71592	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	44096308	44096658	44096594	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	MRPL14	3114	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	44184938	44185313	44184944	Y	MRPL14	HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	44185571	44185900	44185742	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	SLC29A1	329	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE,TMEM151B	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	45623562	45623937	45623654	Y	NA	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SUPT3H	279872	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	46021255	46021630	46021408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-8B1.4	73813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	46891394	46891478	46891435	Y	NA	GPR116	NA	NA	NA	NA	GPR116	29202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	47102503	47102708	47102571	Y	NA	NA	TNFRSF21	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFRSF21	172933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	50683623	50683755	50683704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	100681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	50787533	50788503	50788259	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	TFAP2B	3097	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	50818020	50818494	50818241	Y	NA	TFAP2B,RPS17P5	NA	NA	NA	NA	RPS17P5	4881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	51738790	51738977	51738878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCM3	408702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52261634	52261809	52261784	Y	EFHC1	PAQR8,EFHC1	NA	NA	NA	NA	EFHC1	21297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52339756	52339820	52339788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	56650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52416960	52417092	52417044	Y	GSTA5,PAQR8	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	22621	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52461371	52461586	52461469	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	21658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52463140	52463494	52463299	Y	NA	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	23427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	52505026	52505217	52505106	Y	NA	TMEM14A	EFHC1,TRAM2,PAQR8,LOC730101	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM14A	28690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr6	53175462	53175877	53175681	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	36070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	53205102	53205427	53205266	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	6520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr6	54056382	54056519	54056473	Y	MLIP	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC1	399087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	54583648	54583812	54583730	Y	NA	NA	FAM83B,HCRTR2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM83B	125757	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	54714400	54714688	54714559	Y	NA	FAM83B	NA	NA	NA	NA	FAM83B	4831	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	COL21A1	NA	NA	NA	NA	COL21A1	39521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	56730772	56731166	56730969	Y	NA	NA	PRIM2,BAG2,DST,BEND6	IMR90	Hi-C	24141950	BEND6	86607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	57052407	57052730	57052411	Y	NA	BAG2,RAB23	NA	NA	NA	NA	BAG2	17283	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	57389697	57390070	57389732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	212094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	58773660	58773770	58773718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	519091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	62308410	62308765	62308588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS2	685367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	62807941	62808170	62808057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KHDRBS2	185962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	64055548	64055769	64055667	Y	NA	NA	PTP4A1,EYS	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A1	173897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	64150073	64150241	64150156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	79425	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	64151294	64151779	64151706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A1	77887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	11.6266232081033
chr6	64308595	64308777	64308676	Y	NA	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	34948	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	64386722	64387357	64386973	Y	PHF3	PHF3	NA	NA	NA	NA	PHF3	42997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	69598127	69598365	69598163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BAI3	254868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	71015586	71015683	71015635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM135A	104961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	71133094	71133376	71133235	Y	NA	FAM135A	NA	NA	NA	NA	FAM135A	12450	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	71548622	71548700	71548661	Y	FAM135A	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP1	173143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	71590052	71590374	71590213	Y	FAM135A	NA	NA	NA	NA	NA	SMAP1	214573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	73355182	73355469	73355282	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	73867627	73867898	73867877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	103040	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	73987583	73987923	73987651	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	KHDC1L	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398K22.12	16645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	75997264	75997445	75997280	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	4580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	79753259	79753564	79753411	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	32389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	80013382	80013562	80013472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGN3	70976	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	80220281	80220611	80220519	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	24564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	80246020	80246303	80246162	Y	NA	LCA5	NA	NA	NA	NA	LCA5	845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	83279659	83280006	83279832	Y	NA	NA	TPBG,IBTK,UBE3D	MCF7	ChIA-PET	22265404	TPBG	208736	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	83737150	83737334	83737242	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	38051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	84761974	84762047	84762024	Y	NA	MRAP2	NA	NA	NA	NA	MRAP2	20499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	84762376	84762517	84762446	Y	NA	MRAP2	NA	NA	NA	NA	MRAP2	20901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	86377022	86377042	86377037	Y	NA	SYNCRIP,SNHG5	NA	NA	NA	NA	SNHG5	9409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	89440448	89440768	89440686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNGTT	230580	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	90031448	90031662	90031542	Y	PNRC1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	28905	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	90061423	90061611	90061503	Y	RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1	UBE2J1	NA	NA	NA	NA	UBE2J1	856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	90550185	90550523	90550354	Y	NA	MDN1,CASP8AP2	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	12572	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	90937522	90937637	90937581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	66990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	93802046	93802077	93802062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	325188	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	94127729	94128504	94127840	Y	NA	EPHA7	NA	NA	NA	NA	EPHA7	464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	94443419	94443467	94443447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPHA7	316154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	95445556	95445774	95445747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	577645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	98633797	98633973	98633885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F2	646607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	99275631	99275937	99275716	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	4643	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	99276652	99276809	99276736	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	3771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	99279577	99279776	99279667	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	99279823	99280075	99279977	Y	POU3F2	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	505	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	99280317	99280875	99280652	Y	POU3F2	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr6	99292960	99293281	99293125	Y	NA	POU3F2	NA	NA	NA	NA	POU3F2	12380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	105088715	105088857	105088855	Y	LIN28B,HACE1	NA	NA	NA	NA	NA	HACE1	216937	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	105388915	105389637	105389155	Y	HACE1	LIN28B	NA	NA	NA	NA	LIN28B	13286	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr6	106440406	106440671	106440473	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	ATG5	330995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	106768988	106769157	106769073	Y	NA	ATG5	NA	NA	NA	NA	ATG5	2509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	107014040	107014053	107014047	Y	BEND3,RTN4IP1	NA	NA	NA	NA	NA	AIM1	56310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	107150270	107150783	107150511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRSL1	74817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	107437804	107438343	107438064	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf203	90397	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	107976275	107976365	107976320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOBP	167113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	108169525	108169909	108169631	Y	NA	SCML4	NA	NA	NA	NA	SCML4	26004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	108455044	108455377	108455332	Y	NA	OSTM1	LACE1,ARMC2,NR2E1	IMR90	Hi-C	24141950	OSTM1	29681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	108574394	108574619	108574507	Y	NA	SNX3,LACE1	NA	NA	NA	NA	SNX3	5845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	108879164	108879427	108879300	Y	SESN1,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	109288163	109288636	109288487	Y	FOXO3,SMPD2,MICAL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-249L21.4	61087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	109672770	109673128	109672949	Y	NA	CD164	NA	NA	NA	NA	CD164	28634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	110456590	110456951	110456841	Y	WASF1,CDC40,C6orf186	WASF1,CDC40	NA	NA	NA	NA	WASF1	42256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	110864475	110864588	110864515	Y	CDK19	NA	RPF2,CDK19	IMR90	Hi-C	24141950	SLC22A16	68631	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111409580	111409942	111409703	Y	AMD1,AMD1,REV3L,SLC16A10	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	2799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111441165	111441538	111441348	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	SLC16A10	NA	NA	NA	NA	SLC16A10	34384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	111666861	111666999	111666959	Y	REV3L,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	88310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	68738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111776910	111777281	111777179	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	25433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	6660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111808995	111809308	111809091	Y	REV3L,FYN,TRAF3IP2	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	6077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	111946442	111946461	111946452	Y	NA	NA	TRAF3IP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	REV3L	143524	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr6	111946812	111947024	111946918	Y	NA	NA	TRAF3IP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	REV3L	143894	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112055845	112056076	112055918	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	136579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112062889	112063206	112062987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	129449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	112068361	112068832	112068769	Y	REV3L,FYN,FYN,FYN	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	123823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112110273	112110463	112110418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	82192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112110533	112110931	112110911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYN	81724	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112364338	112364486	112364397	Y	TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	WISP3,TUBE1	FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L	IMR90	Hi-C	24141950	WISP3	8789	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	112470522	112470637	112470580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	63790	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112525181	112525504	112525289	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	TUBE1	118449	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	112619942	112620186	112620045	Y	NA	NA	LAMA4	IMR90	Hi-C	24141950	TUBE1	213210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	113885832	113886201	113886017	Y	MARCKS	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	MARCKS	290340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	114147001	114147334	114147168	Y	HS3ST5	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	29207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	114167209	114167452	114167327	Y	MARCKS	MARCKS	NA	NA	NA	NA	MARCKS	9089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	114662111	114662444	114662262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	114662587	114662962	114662866	Y	NA	HS3ST5	NA	NA	NA	NA	HS3ST5	378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr6	116550472	116550927	116550585	Y	KPNA5,TSPYL4,TSPYL1	TSPYL4,RP3-486I3.4,TSPYL1	NA	NA	NA	NA	TSPYL4	22334	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	117003694	117003845	117003770	Y	TSPYL4,TSPYL1,DSE,ZUFSP,KPNA5	ZUFSP,KPNA5	NA	NA	NA	NA	KPNA5	3344	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	117761832	117762028	117761987	Y	NA	DCBLD1	DCBLD1,GOPC	IMR90	Hi-C	24141950	DCBLD1	10952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	119218988	119219366	119219177	Y	MCM9	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	5604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	119366243	119366474	119366359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM184A	102078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	119668375	119668773	119668762	Y	NA	MAN1A1	NA	NA	NA	NA	MAN1A1	153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	121398601	121398951	121398918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-35P	374316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	122769670	122769957	122769896	Y	HSF2,PKIB	SERINC1,PKIB	NA	NA	NA	NA	SERINC1	21010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	123074884	123075101	123074982	Y	NA	SMPDL3A	NA	NA	NA	NA	SMPDL3A	33214	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	124478305	124478669	124478487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN2	355019	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	125335634	125335813	125335724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF217	53943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	126068034	126068254	126068125	Y	HEY2	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	1224	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr6	126071522	126071828	126071676	Y	NA	HEY2,NCOA7	NA	NA	NA	NA	HEY2	4712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	126279126	126279509	126279187	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	3199	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	127618608	127618885	127618797	Y	NA	RNF146,ECHDC1	NA	NA	NA	NA	RNF146	32853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	127638757	127639069	127638966	Y	NA	ECHDC1	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	23685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	127792743	127793007	127792875	Y	NA	RP3-403A15.1,SOGA3	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	37962	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOGA3	142728	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	128607751	128608140	128608092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	231730	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	128637396	128637725	128637581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	202145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	128840669	128840970	128840936	Y	PTPRK,PTPRK	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	799	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	410707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	130005105	130005433	130005370	Y	L3MBTL3,ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	23937	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	130018003	130018247	130018173	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	11123	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	131527646	131527881	131527784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L2	145184	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	132387151	132387222	132387187	Y	TAAR8,TAAR9	NA	LOC100507254,ENPP1,CTGF	IMR90,HELA,GM12878,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	116638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	132787299	132787948	132787832	Y	NA	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	44389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	134395597	134395721	134395640	Y	NA	SLC2A12,HMGA1P7	TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4	IMR90	Hi-C	24141950	SLC2A12	23823	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	135344059	135344242	135344151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	77952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	136434966	136435173	136435049	Y	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	173816	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	136657752	136658013	136658001	Y	NA	BCLAF1	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	48763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	136965409	136965459	136965418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7	95452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	137244333	137244577	137244412	Y	SLC35D3	SLC35D3	NA	NA	NA	NA	SLC35D3	2931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	138131793	138132158	138131947	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	54193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	138350085	138350335	138350173	Y	PERP	NA	KIAA1244,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PERP	76313	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	138426575	138426770	138426671	Y	PERP	NA	NA	NA	NA	NA	PERP	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	138876782	138877039	138876959	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NHSL1	134669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	139348964	139349250	139349073	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	41566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	139697079	139697371	139697327	Y	NA	CITED2	NA	NA	NA	NA	CITED2	3322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	140920515	140920620	140920568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1226758	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	141873662	141873944	141873832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	592423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	143124343	143124671	143124507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	139667	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	143608872	143608912	143608892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAT2	160898	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	143770817	143770943	143770879	Y	ADAT2	ADAT2,PEX3	NA	NA	NA	NA	PEX3	873	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	144279957	144280354	144280096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	117476	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	144384858	144385125	144384924	Y	NA	SF3B5	NA	NA	NA	NA	SF3B5	29629	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	TPT1P4	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPT1P4	17211	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	149290876	149291114	149290995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UST	224412	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	149344421	149344712	149344605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAB2	193065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	150647426	150647808	150647617	Y	NA	RNU4-7P	PPP1R14C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-7P	1527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	151248402	151248558	151248480	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	63717	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	154830409	154830718	154830573	Y	CNKSR3	CNKSR3	NA	NA	NA	NA	CNKSR3	616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	154914262	154914493	154914392	Y	CNKSR3	RPS4XP8	NA	NA	NA	NA	RPS4XP8	18819	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	RP11-477D19.2,TFB1M	NA	NA	NA	NA	RP11-477D19.2	14307	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	155636183	155636317	155636271	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	2556	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157158909	157159282	157158999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	61846	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157160663	157161314	157160954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	63600	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157163922	157164341	157164233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	66859	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157168828	157169241	157169084	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	71765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157174408	157174845	157174627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	77345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157176246	157176601	157176399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	79183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157297453	157297730	157297519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	200390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	157726321	157726550	157726459	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	16083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	158784092	158784407	158784250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM181	171061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	TMEM181	NA	NA	NA	NA	TMEM181	25935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	159171374	159171393	159171384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EZR	67051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	159211450	159211647	159211549	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	26797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	159226894	159227283	159227272	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	11161	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	159234698	159235091	159235070	Y	NA	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	3353	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	159489988	159490179	159490120	Y	TAGAP	NA	NA	NA	NA	NA	RSPH3	70769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	160135538	160135989	160135680	Y	IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	8628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	160179285	160179503	160179396	Y	NA	WTAP,SOD2,TCP1,MRPL18,PNLDC1	NA	NA	NA	NA	ACAT2	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	160400282	160400543	160400410	Y	SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	12151	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	161545851	161546111	161545978	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	135092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	161571430	161571737	161571637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	121356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	162808264	162808283	162808273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRG	337881	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	163784160	163784198	163784179	Y	NA	QKI	PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	48834	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	164396601	164397000	164396801	Y	NA	NA	QKI,CAHM	IMR90	Hi-C	24141950	QKI	563569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	164520797	164520864	164520831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	687765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	166364914	166365167	166365041	Y	T	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	388912	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	166470192	166470586	166470296	Y	NA	NA	LINC00473,LOC441177	IMR90	Hi-C	24141950	SFT2D1	283493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	166754936	166755437	166755076	Y	SFT2D1	SFT2D1	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr6	167069842	167070191	167069884	Y	PRR18	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	247748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	167115544	167115618	167115576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA2	202321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	167834861	167835135	167834902	Y	NA	NA	SMOC2	IMR90	Hi-C	24141950	CCR6	311566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	790893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	169542234	169542607	169542421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR27	557552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135677	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	170461964	170462067	170462016	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135494	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	170491997	170492052	170492021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	105509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr6	170492436	170492647	170492551	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	104914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr6	170589556	170589600	170589578	Y	WDR27,TCTE3,TBP	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	DLL1	7961	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr6	170692180	170692479	170692329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120B	94389	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	875702	875833	875757	Y	SUN1,SUN1	SUN1,GET4	NA	NA	NA	NA	SUN1	22174	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1039490	1039728	1039629	Y	NA	ADAP1,COX19,GPR146	NA	NA	NA	NA	COX19	26255	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1125303	1125884	1125584	Y	GPER,GPER	GPR146	NA	NA	NA	NA	GPR146	43091	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1274384	1274791	1274446	Y	NA	UNCX	NA	NA	NA	NA	UNCX	3841	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	1282050	1282079	1282065	Y	UNCX	UNCX	NA	NA	NA	NA	UNCX	11507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1329910	1330257	1330187	Y	NA	NA	UNCX	IMR90	Hi-C	24141950	UNCX	59367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr7	1407991	1408135	1408052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	89003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1416814	1417157	1416984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICALL2	79981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1546091	1546367	1546260	Y	NA	MICALL2,INTS1,MAFK	NA	NA	NA	NA	INTS1	2602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1571273	1571500	1571366	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	2923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1706379	1706695	1706444	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908,PSMG3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PSMG3	97738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1707278	1707453	1707366	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	98637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	1708705	1709030	1708796	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	100064	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	1709256	1709641	1709356	Y	NA	NA	MAD1L1,KIAA1908	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG3	100615	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2006506	2006818	2006734	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	264060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	2106199	2106418	2106303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	164460	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	2124507	2124641	2124577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	146237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2143904	2144149	2144041	Y	LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	126729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2145561	2145831	2145692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	125047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2362962	2363263	2363259	Y	AMZ1	EIF3B,SNX8	KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B	IMR90	Hi-C	24141950	EIF3B	28458	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2366728	2366801	2366785	Y	SNX8,LFNG	EIF3B,SNX8	FTSJ2,NUDT1,SNX8,EIF3B,KIAA1908,MAD1L1,MAFK,TFAMP1,PSMG3,TMEM184A,ELFN1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF3B	24920	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2569438	2569603	2569498	Y	LFNG,LFNG,IQCE,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	19275	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2672306	2673216	2673099	Y	LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	2721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	2674160	2674375	2674212	Y	SNX8,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	4575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2773642	2774144	2773933	Y	SNX8,LFNG	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	99111	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2812534	2812892	2812775	Y	SNX8,LFNG,LFNG,GNA12	NA	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	60363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	2860040	2860490	2860319	Y	LFNG,LFNG,GNA12	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	12765	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	3053866	3054071	3053969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	171908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	3307587	3307977	3307629	Y	NA	SDK1	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	31103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	3490744	3491107	3491069	Y	SDK1	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	151664	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	3877207	3877255	3877231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	538127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	3885202	3885340	3885271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	546122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	4607963	4608203	4608083	Y	NA	NA	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXK1	73185	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr7	4723112	4724257	4723950	Y	NA	FOXK1	NA	NA	NA	NA	FOXK1	41724	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	4746884	4747018	4746986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	65496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	5039702	5040026	5039789	Y	NA	RNF216P1,RBAK	NA	NA	NA	NA	RNF216P1	28083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5379232	5379531	5379399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC29A4	67232	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5419074	5419498	5419154	Y	NA	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	43547	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5458136	5458686	5458477	Y	FBXL18,TNRC18	TNRC18	NA	NA	NA	NA	TNRC18	4359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5488496	5488516	5488506	Y	NA	TNRC18	TNRC18	MCF7	ChIA-PET	22265404	TNRC18	25451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5571351	5571818	5571666	Y	WIPI2,ACTB	FBXL18,ACTB	NA	NA	NA	NA	FBXL18	19922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.46030452622122
chr7	5635420	5636238	5635862	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	4981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5650367	5650762	5650403	Y	NA	ACTB,FSCN1	NA	NA	NA	NA	FSCN1	19928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	5787686	5787972	5787829	Y	NA	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	31398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	6049655	6049813	6049700	Y	NA	PMS2,AIMP2,EIF2AK1	NA	NA	NA	NA	AIMP2	2779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	6096315	6096609	6096412	Y	EIF2AK1	PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42	NA	NA	NA	NA	EIF2AK1	252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	6296618	6296924	6296769	Y	CCZ1	CYTH3	NA	NA	NA	NA	CYTH3	13351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	6676235	6676334	6676285	Y	NA	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	1282	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316,AC073343.13	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	AC073343.13,ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	7140103	7140511	7140281	Y	C1GALT1	NA	C1GALT1,LOC100131257,COL28A1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	C1GALT1	54054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	8300852	8301132	8300960	Y	ICA1,ICA1,ICA1	AC007009.1,ICA1	NA	NA	NA	NA	ICA1	535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	8482629	8482725	8482675	Y	NXPH1	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	182312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	9200213	9200579	9200435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ICA1	899896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	11211603	11211773	11211701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHF14	200104	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	11499121	11499331	11499225	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THSD7A	370493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	11859641	11859960	11859801	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	9864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	11860647	11861050	11860853	Y	THSD7A	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	8774	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	11867283	11867421	11867420	Y	NA	THSD7A	NA	NA	NA	NA	THSD7A	2403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	13368007	13368354	13368181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	643526	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	13797003	13797366	13797185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV1	231684	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	17162731	17163011	17162882	Y	AHR	NA	NA	NA	NA	NA	AHR	173235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	18695404	18695888	18695683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	459407	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	18828374	18828759	18828502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	326536	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	18865089	18865093	18865091	Y	HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	290202	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	19146147	19146774	19146493	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	8521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	19147118	19147950	19147488	Y	FERD3L,TWIST1	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	7345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	19746950	19747169	19747121	Y	NA	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	20239036	20239390	20239182	Y	TWISTNB	NA	NA	NA	NA	NA	RPL21P75	198690	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	20439186	20439753	20439406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP8	384752	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	20837430	20837819	20837731	Y	SP8	SP8,RPL23P8	SP8	K562	ChIA-PET	22265404	SP8	12925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	21502446	21502711	21502550	Y	SP4	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	36794	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	22403573	22403885	22403824	Y	RAPGEF5	RAPGEF5	NA	NA	NA	NA	RAPGEF5	8810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	22614875	22615270	22614981	Y	IL6	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	55274	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	22631710	22632105	22631870	Y	IL6	STEAP1B	NA	NA	NA	NA	STEAP1B	38439	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7	NA	NA	NA	NA	TOMM7	33843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	23289024	23289054	23289046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	69578	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	23348040	23348443	23348292	Y	KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	NA	NUPL2	128594	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	23411315	23411579	23411447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	96507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	23504984	23505316	23505313	Y	NA	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	23510676	23511223	23510889	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	NA	NA	NA	NA	IGF2BP3	2590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.07618271573273
chr7	24381432	24381799	24381595	Y	NPY	NA	NA	NA	NA	NA	NPY	59650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	24626460	24626850	24626473	Y	NA	MPP6	NA	NA	NA	NA	MPP6	15573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	24882463	24882674	24882596	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	75219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	24963944	24964392	24964187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	54861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	25894654	25894946	25894846	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	294914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr7	25897167	25897316	25897282	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292544	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	25901745	25902114	25902023	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	287746	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	25990725	25991211	25991018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	198649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr7	25992296	25992472	25992423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	197388	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr7	26007044	26007425	26007148	Y	HNRNPA2B1	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	182435	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	26118658	26118811	26118736	Y	NA	NA	SNX10,HOXA10-HOXA9,MIR196B,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA9,NFE2L3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	71049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	26523285	26523306	26523295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	87072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	26697823	26697978	26697927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004540.5	261610	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	27152655	27152825	27152741	Y	NA	HOTAIRM1,HOXA1,HOXA2,HOXA-AS2,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7	NA	NA	NA	NA	HOXA-AS2	7259	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	28194446	28194874	28194789	Y	NA	JAZF1-AS1,JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	23067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	28309747	28309873	28309833	Y	NA	CREB5	JAZF1,JAZF1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CREB5	27067	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	28893180	28893544	28893363	Y	CREB5	NA	CREB5	IMR90	Hi-C	24141950	TRIL	102390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	29115131	29115317	29115226	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	44573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	29464630	29464858	29464676	Y	WIPF3	NA	NA	NA	NA	NA	PRR15	136569	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	30226121	30226226	30226174	Y	ZNRF2	AC007036.5	NA	NA	NA	NA	AC007036.5	30974	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	30658764	30658962	30658863	Y	NA	GARS	NA	NA	NA	NA	GARS	26467	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	31851412	31851766	31851656	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R17	127083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPY19L2P1	147237	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	35285792	35286017	35285905	Y	TBX20	TBX20	NA	NA	NA	NA	TBX20	5741	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	127535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	36938916	36939307	36939244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	511182	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	36998037	36998382	36998290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	570303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	37023926	37024076	37024004	Y	AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	596192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	794063	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	37714252	37714421	37714336	Y	GPR141	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	501403	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	42896548	42896903	42896642	Y	NA	NA	GLI3	IMR90	Hi-C	24141950	C7orf25	53001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	42954351	42954549	42954430	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	C7orf25	K562	ChIA-PET	22265404	C7orf25	4447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	43117230	43117632	43117554	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	32566	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43676905	43677264	43677045	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	56548	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	44085815	44086626	44086335	Y	STK17A,DBNL,POLM	POLR2J4,DBNL,PGAM2,POLM	NA	NA	NA	NA	DBNL	3576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	44436686	44437032	44436900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	64510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	44616133	44616490	44616314	Y	NA	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	TMED4	3396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	44657226	44657498	44657343	Y	PURB,MYO1G,OGDH	DDX56,TMED4,OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	13055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	45497218	45497499	45497401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY1	114240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	46597190	46597387	46597291	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	SEPT7P2	790573	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	47496897	47497228	47497063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	519950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	405489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	47612587	47612873	47612749	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HUS1	404305	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	55608174	55608360	55608336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	30321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	55637465	55637727	55637601	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	56168682	56168929	56168809	Y	ZNF713	SUMF2,CHCHD2	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	3340	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	61821873	61821967	61821924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73B2.6	1562717	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	61968807	61969730	61969008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-73B2.6	1414954	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.3980750609051
chr7	64072607	64072919	64072776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF680	51123	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	64733908	64734317	64734037	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF92	102395	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	65360437	65360759	65360712	Y	NA	VKORC1L1	NA	NA	NA	NA	VKORC1L1	24183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	65878387	65878723	65878560	Y	RABGEF1,KCTD7	NA	ASL,CRCP,TPST1,LINC00174	IMR90	Hi-C	24141950	GS1-124K5.3	77830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	66152523	66152575	66152558	Y	RABGEF1,KCTD7	RP4-756H11.3,RABGEF1	KCTD7,LOC493754,RABGEF1	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	7372	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	66184244	66184571	66184390	Y	NA	RABGEF1	LOC493754,RABGEF1,LOC729156	IMR90	Hi-C	24141950	RABGEF1	39093	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	69308115	69308415	69308239	Y	AUTS2,AUTS2	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	246210	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	69409562	69409698	69409630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	347657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	70639540	70639901	70639689	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALN1	1270235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	70793641	70793961	70793647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALN1	1116175	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	72934537	72934921	72934642	Y	NA	BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	72939749	72940060	72940006	Y	BAZ1B	BAZ1B,BCL7B	NA	NA	NA	NA	BAZ1B	5141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	73002313	73002519	73002399	Y	BCL7B	BCL7B,TBL2,MLXIPL	TBL2	K562	ChIA-PET	22265404	TBL2	11192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	73153813	73154099	73154081	Y	FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	2616	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	73156679	73157033	73156789	Y	NA	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5482	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	73157180	73157738	73157420	Y	FZD9,BAZ1B,TBL2,MLXIPL,ABHD11,CLDN4,CLDN3	STX1A,ABHD11,CLDN3	NA	NA	NA	NA	ABHD11	5983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	73869724	73869891	73869863	Y	GTF2IRD1	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	75267293	75267635	75267464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	98645	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	75268782	75269322	75269061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	96958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr7	75465283	75465439	75465360	Y	MDH2	RHBDD2	STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR	IMR90	Hi-C	24141950	RHBDD2	4481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	SRRM3	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	SRRM3	33163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr7	75863113	75863500	75863373	Y	NA	SRRM3	NA	NA	NA	NA	SRRM3	33897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	75940045	75940212	75940167	Y	NA	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	10184	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr7	76627484	76628238	76628092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM185BP	121195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	77428722	77429286	77429067	Y	PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2	TMEM60,PHTF2	NA	NA	NA	NA	PHTF2	2600	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	77953225	77953430	77953328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	527103	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	78048924	78048941	78048933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	622802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	81582871	81583219	81583134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	487895	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	81584968	81585322	81585145	Y	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	485792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	81851268	81851277	81851273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	219837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	81927516	81927685	81927601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	143429	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	82004642	82004673	82004658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	66441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	82071570	82071737	82071656	Y	NA	CACNA2D1	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	82596075	82596467	82596271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCLO	193779	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	84717663	84717972	84717818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074183.4	150102	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	86534596	86534997	86534797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	152018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	86561279	86561598	86561380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	125417	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	86637666	86638039	86637853	Y	NA	KIAA1324L	NA	NA	NA	NA	KIAA1324L	48976	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	90163889	90164086	90163988	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	AC002456.2	60581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	92847144	92847362	92847311	Y	HEPACAM2	HEPACAM2,CCDC132	NA	NA	NA	NA	HEPACAM2	6475	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	93231275	93231507	93231391	Y	CCDC132	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC132	371622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	93426376	93426400	93426388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BET1	205294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	95070230	95070589	95070236	Y	PON1,PON3,PDK4	PON1,PON3,PON2	PON2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PON2	7720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	96176969	96177132	96177051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SHFM1	160071	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	96295796	96295968	96295882	Y	FLJ42280	SHFM1	NA	NA	NA	NA	SHFM1	41235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	96644857	96645287	96645147	Y	NA	DLX6,DLX6-AS1,DLX5	NA	NA	NA	NA	DLX6-AS1	3480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	98199346	98199589	98199468	Y	NA	NPTX2	NPTX2	IMR90	Hi-C	24141950	NPTX2	45020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	98990795	98991133	98991082	Y	NA	ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4	NA	NA	NA	NA	BUD31	13131	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	99020392	99020577	99020441	Y	OR2AE1,FAM200A,BUD31,ZNF789	BUD31,PDAP1,CPSF4,PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789	NA	NA	NA	NA	CPSF4	13968	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr7	99678619	99678725	99678657	Y	NA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	ZNF3	448	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	99957855	99958254	99957887	Y	NA	PILRB,PMS2P1	NA	NA	NA	NA	PMS2P1	20324	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	100144720	100144853	100144769	Y	NA	AGFG2,LRCH4	NA	NA	NA	NA	AGFG2	9886	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,LRCH4,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	LRCH4	13587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	100433472	100433773	100433685	Y	NA	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	AGFG2,MOSPD3,PCOLCE,FBXO24,LOC100129845,POP7,EPO,GIGYF1,EPHB4,ZAN,SRRT,SLC12A9,TRIP6,SERPINE1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	10351	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	100434359	100434559	100434459	Y	SAP25,EPHB4	SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT	EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHB4	11238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr7	100952176	100952182	100952179	Y	NA	RABL5	NA	NA	NA	NA	RABL5	10922	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	101678350	101678537	101678444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	221391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	101789481	101789757	101789558	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	212562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.16631868188207
chr7	101931211	101931437	101931291	Y	CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	70882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	102056938	102057102	102057040	Y	ORAI2	ORAI2,ALKBH4,LRWD1	NA	NA	NA	NA	ORAI2	14451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	102081983	102082063	102082048	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	ORAI2	10430	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	102104317	102104602	102104460	Y	NA	ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J	NA	NA	NA	NA	LRWD1	941	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	102941984	102942200	102942104	Y	NA	DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4	NA	NA	NA	NA	PMPCB	6115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	103125674	103125695	103125684	Y	SLC26A5	SLC26A5	NA	NA	NA	NA	SLC26A5	41050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	105123568	105123582	105123575	Y	NA	PUS7,RINT1	NA	NA	NA	NA	PUS7	37132	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	EFCAB10	NA	NA	NA	NA	EFCAB10	16028	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	105459888	105460220	105459903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	54830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	105856842	105857229	105857099	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	105857491	105857771	105857742	Y	NA	NA	NAMPT,CCDC71L	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPT	67001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	106808132	106808705	106808532	Y	NA	HBP1	NA	NA	NA	NA	HBP1	726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	107567788	107568066	107567911	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38373	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	107573965	107574445	107574339	Y	LAMB1	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	44550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	107594636	107594797	107594717	Y	NA	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	46903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	107784751	107785008	107784880	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAMB1	143051	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	107875663	107876003	107875815	Y	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NA	NRCAM	219158	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	108056534	108056914	108056866	Y	PNPLA8,DNAJB9	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	38247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	108060932	108061217	108061051	Y	PNPLA8,DNAJB9	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	33944	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	108095684	108095814	108095727	Y	NRCAM,NRCAM	NRCAM	NA	NA	NA	NA	NRCAM	523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	110326552	110326706	110326634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC003088.1	153741	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	110732834	110733321	110733005	Y	NA	LRRN3	NA	NA	NA	NA	LRRN3	3772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	111396932	111397360	111397129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	196359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	111755402	111755532	111755467	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	88934	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	111814530	111814935	111814850	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	29531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	112383831	112384204	112384019	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	44443	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	115804760	115804900	115804830	Y	TFEC,TES	TES	CAV1,CAPZA2,TES,MET	IMR90	Hi-C	24141950	TES	43647	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	TES	NA	NA	NA	NA	TES	38743	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	117290130	117290152	117290141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	222041	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	117472298	117472618	117472458	Y	CTTNBP2	CTTNBP2	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2	39575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	119912248	119912651	119912361	Y	KCND2	KCND2	NA	NA	NA	NA	KCND2	526	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	120288404	120288421	120288413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	208035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	120391061	120391362	120391218	Y	KCND2	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN12	105094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	123283866	123284127	123283979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5	87557	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	123387767	123387941	123387854	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	127807416	127807928	127807646	Y	LRRC4	NA	SND1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC4	137256	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	127817401	127817786	127817594	Y	NA	NA	SND1,MIR129-1,LEP	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC4	147241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.98283851775855
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	128383172	128383597	128383318	Y	NA	CALU,CCDC136	NA	NA	NA	NA	CALU	5826	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	128473236	128473666	128473355	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4805	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr7	128696279	128696583	128696469	Y	NA	TNPO3	NA	NA	NA	NA	TNPO3	3081	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	129410177	129410359	129410300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRF1	160622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.15236543146546
chr7	129420694	129421120	129420768	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	169669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	129421490	129421976	129421792	Y	FAM40B	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	UBE2H	168813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr7	129960010	129960125	129960069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM209	114400	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	130005430	130005716	130005580	Y	TMEM209	NA	NA	NA	NA	NA	CEP41	74558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr7	130151792	130152099	130151899	Y	NA	MEST,MIR335	NA	NA	NA	NA	MIR335	17840	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	131239359	131239620	131239490	Y	NA	PODXL	NA	NA	NA	NA	PODXL	1356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	132488555	132488726	132488642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	276122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	133223721	133224093	133223724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC4	287892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	134117156	134117311	134117298	Y	NA	AKR1B1	NA	NA	NA	NA	AKR1B1	24725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	134287776	134287871	134287820	Y	NA	BPGM	AKR1B1,AKR1B10,AKR1B15,BPGM	IMR90	Hi-C	24141950	BPGM	41689	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	134677531	134677740	134677636	Y	AGBL3	AGBL3	NA	NA	NA	NA	AGBL3	8272	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	135120473	135120740	135120725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT4	72135	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	137673807	137674359	137674139	Y	NA	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	10454	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	138643234	138643648	138643551	Y	TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	20416	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	138662189	138662362	138662288	Y	NA	KIAA1549	NA	NA	NA	NA	KIAA1549	1702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	139227178	139227349	139227257	Y	NA	ERHP1	NA	NA	NA	NA	ERHP1	10192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	139320693	139321014	139320839	Y	PARP12,LUC7L2	NA	NA	NA	NA	NA	ERHP1	103707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	139498127	139498170	139498155	Y	TBXAS1	HIPK2	NA	NA	NA	NA	HIPK2	22550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	140024684	140024714	140024699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC37A3	77519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	140398687	140398980	140398834	Y	NA	ADCK2,DENND2A,NDUFB2	NA	NA	NA	NA	NDUFB2	10110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	140774728	140775101	140774915	Y	NA	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	24679	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	141371952	141372250	141372100	Y	CLEC5A	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	27703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	141374630	141374958	141374810	Y	NA	KIAA1147	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	24995	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr7	141380130	141380660	141380538	Y	NA	KIAA1147,RNU1-82P	NA	NA	NA	NA	KIAA1147	19293	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	141492164	141492415	141492290	Y	TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	56043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	141501394	141501805	141501703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	65273	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	141660382	141660901	141660703	Y	CLEC5A,TAS2R38	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	224261	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	141679454	141679850	141679687	Y	OR9A4,CLEC5A,TAS2R38	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP1	243333	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	145996406	145996791	145996515	Y	CNTNAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CNTNAP2	184953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	148027495	148027904	148027865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC005229.5	247589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	RNY5	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNY5	1693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	RNY5,PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	149232526	149232604	149232565	Y	SSPO	ZNF746	NA	NA	NA	NA	ZNF746	39618	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr7	149471511	149471709	149471700	Y	ATP6V0E2,SSPO	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	2943	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	149745351	149745623	149745500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2-AS1	169652	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	150948540	150948854	150948603	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	20965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	151039447	151039627	151039551	Y	SLC4A2,AGAP3,SMARCD3,SMARCD3,NUB1	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	2662	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	151068443	151068736	151068590	Y	SMARCD3,CRYGN,WDR86	NUB1	NA	NA	NA	NA	NUB1	31658	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	66552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	152160715	152161193	152160959	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	28735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr7	152338571	152338711	152338613	Y	NA	XRCC2	NA	NA	NA	NA	XRCC2	32539	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	153645622	153645864	153645639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	1146930	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	154420857	154421050	154420896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAXIP1	371744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	155006028	155006426	155006187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSIG1	81060	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	155137693	155138087	155137815	Y	NA	NA	INSIG1,PAXIP1,LOC100132707,LOC100128264,HTR5A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INSIG1	50207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	155260612	155260850	155260792	Y	CNPY1	NA	NA	NA	NA	NA	CNPY1	63707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	155276719	155276807	155276762	Y	PAXIP1,CNPY1	CNPY1	NA	NA	NA	NA	CNPY1	47750	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr7	155383034	155383540	155383287	Y	RBM33	NA	LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM33	51605	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	156735476	156735625	156735551	Y	MNX1	NOM1	LMBR1	K562	ChIA-PET	22265404	NOM1	4792	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	156800292	156800601	156800569	Y	MNX1,MNX1	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	744	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr7	156804828	156804838	156804833	Y	NA	MNX1	NA	NA	NA	NA	MNX1	3483	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	157338058	157338440	157338352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	211983	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	157366883	157367406	157367099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	240808	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	157405982	157406183	157406105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	279907	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr7	157476988	157477433	157477353	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	350913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr7	157484684	157485043	157484866	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	358609	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr7	157644571	157644735	157644629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	518496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	157691639	157691978	157691861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	565564	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	157853709	157853980	157853845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	524500	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr7	157924006	157924393	157924072	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	454087	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	582547	582966	582856	Y	ERICH1	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	103140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	2880754	2881044	2880899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	1110612	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	4848301	4848393	4848346	Y	CSMD1	CSMD1	NA	NA	NA	NA	CSMD1	2101	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	6434406	6434611	6434443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	129119	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	8706541	8706605	8706573	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	42550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	10191869	10192038	10191953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00599	430993	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	10192260	10192787	10192448	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00599	431384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr8	10676875	10677241	10677058	Y	NA	SOX7,PINX1	NA	NA	NA	NA	SOX7	18116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	10823160	10823372	10823178	Y	PRSS55,C8orf74	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	127766	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	11032163	11032532	11032339	Y	NA	XKR6	NA	NA	NA	NA	XKR6	24343	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	13562833	13563206	13563027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf48	140481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	16504194	16504460	16504327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	507078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	17165650	17166030	17165840	Y	PDGFRL	NA	NA	NA	NA	NA	CNOT7	63263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	17463292	17463534	17463469	Y	MTMR7,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTUS1	192892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	17464056	17464363	17464257	Y	MTUS1,MTUS1,MTUS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTUS1	192063	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	18704322	18704730	18704574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	235510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	18854306	18854486	18854451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	85754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	18953463	18953695	18953605	Y	NA	PSD3	LOC100128993,CSGALNACT1,PSD3,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	PSD3	13223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	19414490	19414802	19414647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	198738	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	20064190	20064507	20064297	Y	ATP6V1B2	SLC18A1,ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	11312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	20125746	20125979	20125927	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	33495	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr8	22405052	22405624	22405355	Y	NA	SORBS3,PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	SORBS3	4553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NEFM,NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	12906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	24857844	24858008	24857898	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45220	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	24858208	24858485	24858356	Y	NA	NEFL	NA	NA	NA	NA	NEFL	45584	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	26718570	26718842	26718713	Y	PTK2B,ADRA1A	ADRA1A	NA	NA	NA	NA	ADRA1A	3948	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	27114452	27114997	27114718	Y	NA	STMN4	NA	NA	NA	NA	STMN4	515	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	28569820	28569970	28569874	Y	ZNF395,FZD3,EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	12839	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	29202154	29202365	29202273	Y	DUSP4,DUSP4	DUSP4	NA	NA	NA	NA	DUSP4	3820	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	30015593	30015700	30015665	Y	NA	RPS15AP24,DCTN6	NA	NA	NA	NA	DCTN6	3780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	PURG,WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	31500789	31500847	31500818	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	611472	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	31770088	31770106	31770098	Y	NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	880771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	32052985	32053085	32053036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	1163668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	32508172	32508500	32508337	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	820440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	32642880	32643214	32643047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	685726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	33456177	33456579	33456440	Y	DUSP26	RNF122,DUSP26	NA	NA	NA	NA	DUSP26	553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr8	37643587	37643772	37643645	Y	NA	PROSC,GPR124	NA	NA	NA	NA	GPR124	3878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	37929132	37929304	37929218	Y	NA	EIF4EBP1,ASH2L	NA	NA	NA	NA	ASH2L	31456	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	38627692	38628125	38628027	Y	LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	43988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	39797063	39797940	39797610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM18	357055	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	41680611	41680957	41680800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	226551	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	41997279	41998522	41997937	Y	NA	AP3M2	KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP3M2	9942	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr8	42748560	42748749	42748647	Y	THAP1,HOOK3	HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	HOOK3	1326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	48282787	48283030	48282901	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	208294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	48531592	48531742	48531667	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	117906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	48580617	48580970	48580793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	68678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	48746170	48746340	48746217	Y	MCM4	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	96522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	48814148	48814416	48814291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKDC	56327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	49426742	49426952	49426814	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131592	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	49835974	49836286	49836197	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	3675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	53141040	53141184	53141112	Y	ST18	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	331155	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	53243512	53243700	53243588	Y	ST18	NA	NA	NA	NA	NA	FAM150A	232367	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	56068878	56069211	56068948	Y	XKR4	NA	NA	NA	NA	NA	XKR4	55929	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	56282047	56282150	56282095	Y	XKR4	NA	NA	NA	NA	NA	XKR4	269098	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	56362318	56362387	56362358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGS1	321314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM68	60354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	57594764	57594896	57594825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	309507	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	58122731	58123025	58122849	Y	NA	NA	LOC100507632,LOC100507651,LOC286177	IMR90	Hi-C	24141950	IMPAD1	218328	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	58349607	58349625	58349616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	445204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	59974801	59974880	59974841	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-25K19.1	54719	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	60154501	60154880	60154691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOX	124734	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	RP11-91I20.2,CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	61627150	61627529	61627187	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	61657043	61657068	61657053	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	67706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	61664874	61665035	61664955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	75537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	61705362	61705819	61705615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD7	116025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	61816296	61816572	61816474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVS1	151145	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	61821464	61821801	61821596	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CLVS1	145916	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr8	61850776	61851191	61851141	Y	NA	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CLVS1	116526	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	61917184	61917283	61917226	Y	CLVS1	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CLVS1	50434	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	62534300	62534453	62534449	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	90702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	62566892	62567143	62567071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	58012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	63602684	63603084	63602782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	346646	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	63776641	63776831	63776733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGH	172899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	63934936	63935021	63934979	Y	NA	GGH	NA	NA	NA	NA	GGH	14709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	65589993	65590291	65590142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE22	99179	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	65758514	65758852	65758664	Y	NA	CYP7B1	NA	NA	NA	NA	CYP7B1	49196	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	66862327	66863132	66862741	Y	PDE7A	NA	PDE7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE7A	109770	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	67055533	67055834	67055559	Y	NA	TRIM55	CRH	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM55	18402	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	67454365	67454567	67454497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	69915	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	68499569	68499804	68499684	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	245657	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	69415890	69416035	69415963	Y	C8orf34	NA	NA	NA	NA	NA	PREX2	553537	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	71188678	71189062	71188836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA2	124978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	72628483	72628731	72628610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	125972	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	72753377	72753463	72753388	Y	NA	MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	1240	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	72769938	72770232	72770085	Y	NA	MSC	NA	NA	NA	NA	MSC	15235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	73481000	73481171	73481085	Y	KCNB2	KCNB2	NA	NA	NA	NA	KCNB2	33374	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	73492870	73493054	73492949	Y	NA	KCNB2	NA	NA	NA	NA	KCNB2	45244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	73519574	73520002	73519704	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	71948	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNB2	111470	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	227913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	73733862	73734193	73733971	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	184906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	73742215	73742578	73742518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	176521	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	73798520	73798610	73798565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	120489	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	76131324	76131607	76131526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNF4G	186542	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKIA	248204	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	80680806	80681178	80681064	Y	HEY1	HEY1	NA	NA	NA	NA	HEY1	2708	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	HEY1	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEY1	18244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	80991495	80991889	80991678	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	50971	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	81489520	81489653	81489606	Y	NA	NA	ZBTB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB10	93666	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	81639602	81640013	81639931	Y	ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	243748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr8	81699574	81699876	81699725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB10	303720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	81782792	81783006	81782996	Y	ZBTB10,ZNF704	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	239297	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	86090980	86091058	86091024	Y	E2F5,E2F5	E2F5,C8orf59	NA	NA	NA	NA	E2F5	3520	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	87484005	87484360	87484214	Y	NA	CPNE3	NA	NA	NA	NA	CPNE3	10699	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	89129707	89129875	89129814	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMP16	208379	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	90105251	90105649	90105450	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	662306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	91064955	91065319	91065136	Y	NA	CALB1	NA	NA	NA	NA	CALB1	40384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	94504789	94504812	94504801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	203977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	94507560	94507986	94507856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	200803	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr8	95132318	95132456	95132369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	80824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	95429933	95430227	95430143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	55110	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	95433210	95433488	95433370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD54B	51849	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	95896385	95896691	95896542	Y	NA	CCNE2	NA	NA	NA	NA	CCNE2	10215	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	96146998	96147210	96147103	Y	TP53INP1,PLEKHF2	PLEKHF2	NA	NA	NA	NA	PLEKHF2	2966	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	98843281	98843693	98843349	Y	POP1	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	57996	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	98865970	98866240	98866105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	80685	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr8	101427912	101428321	101428112	Y	SPAG1,SPAG1,RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81466	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	101428409	101428827	101428524	Y	RNF19A,RNF19A	NA	SPAG1,RNF19A,ANKRD46,MIR4471	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF19A	81963	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	101457496	101457930	101457593	Y	NA	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	111050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	101881903	101882335	101882088	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6	YWHAZ,ZNF706,FLJ42969	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P6	23639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	102120764	102121998	102120921	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF706	94423	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	102185716	102186115	102186035	Y	NA	ZNF706	YWHAZ,FLJ42969,ZNF706	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	30306	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	102236579	102236726	102236653	Y	NA	ZNF706	FLJ42969,ZNF706,YWHAZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	20158	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	102423654	102423774	102423714	Y	NA	NA	GRHL2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRHL2	78886	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	102505547	102505759	102505677	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	2887	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	102505982	102506363	102506168	Y	GRHL2	GRHL2	NA	NA	NA	NA	GRHL2	3322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	103486772	103487100	103486937	Y	NA	NA	ODF1	IMR90	Hi-C	24141950	UBR5	63703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	51244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	104108865	104109263	104109003	Y	NA	BAALC,C8orf56	FZD6,CTHRC1,DCAF13	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	41675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	104792192	104792465	104792329	Y	RIMS2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-5A11.1	222575	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	107598628	107599080	107598706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	109161	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	108508665	108508809	108508737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	800424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	110145929	110146072	110146000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	198481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	111109081	111109287	111109184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	407061	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	679867	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	114445563	114445724	114445576	Y	CSMD3	CSMD3	NA	NA	NA	NA	CSMD3	1604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	115322659	115322858	115322759	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSMD3	875331	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	116067507	116067816	116067663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	752083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	116660380	116660747	116660648	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	159152	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	117366472	117366785	117366629	Y	NA	NA	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	409957	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	117711370	117711748	117711590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	64994	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	117883999	117884137	117884073	Y	UTP23,RAD21	MIR3610,RAD21	NA	NA	NA	NA	MIR3610	902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	118801002	118801354	118801210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED30	270050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	118958698	118959000	118958912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	163092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	119443463	119443781	119443622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	188453	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	120232000	120232286	120232044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	56727	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	120779948	120780281	120780115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF2	62822	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	121092888	121093091	121092967	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	DEPTOR	208931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	121442839	121443137	121442988	Y	NA	MTBP,MRPL13	NA	NA	NA	NA	MTBP	12503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	122347057	122347434	122347232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL13	891415	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	123050237	123050548	123050394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	741085	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	123801301	123801636	123801353	Y	ZHX2	ZHX2	NA	NA	NA	NA	ZHX2	9668	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	123957674	123957774	123957724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	94889	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124169504	124169661	124169520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf76	81977	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124248679	124249062	124248866	Y	NA	C8orf76,ZHX1	NA	NA	NA	NA	C8orf76	2576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124363606	124363931	124363783	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2	62659	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	124529265	124529734	124529486	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	21712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	125302460	125302812	125302637	Y	TMEM65,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM65	80121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	125341304	125341312	125341308	Y	NA	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	41621	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	125367728	125368050	125367886	Y	TRMT12,TATDN1,NDUFB9	TMEM65	NA	NA	NA	NA	TMEM65	14883	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	125794770	125795104	125794917	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	NA	MTSS1,ZNF572	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF572	188436	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126187682	126188060	126187888	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	85600	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126296437	126296656	126296547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	143907	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126398156	126398380	126398244	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	42183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126398775	126398955	126398863	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	41608	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126399072	126399443	126399281	Y	NA	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	41120	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr8	126400704	126400965	126400873	Y	NA	TRIB1	TRIB1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	39598	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr8	126710957	126711330	126711190	Y	TRIB1	NA	NSMCE2,TRIB1,KIAA0196	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIB1	270394	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	127325042	127325066	127325054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	884479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	127422712	127423196	127422971	Y	NA	NA	FAM84B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	982149	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	127908732	127908971	127908856	Y	NA	NA	MYC,LOC727677,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	836709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	128048074	128048382	128048201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYC	697298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	128578179	128578386	128578271	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	167294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	128684618	128684766	128684674	Y	NA	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	60914	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	128825013	128825274	128825028	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	20234	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	129121216	129121486	129121350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	129373096	129373322	129373148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	352239	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	130433555	130433672	130433615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	593703	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	130985487	130986077	130985841	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	41298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	130996080	130996422	130996182	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30953	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	131007390	131007737	131007622	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	19638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131291188	131291588	131291505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	162318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131364558	131364729	131364627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	89177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	131519599	131519928	131519920	Y	ASAP1	NA	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	ASAP1	65693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	133257165	133257466	133257335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFR3A	342830	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	133336709	133336808	133336784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	349030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	133405004	133405160	133405099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	280678	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr8	133461387	133461544	133461488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	224294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	133562041	133562364	133562205	Y	HHLA1,KCNQ3,KCNQ3	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	123474	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	133918146	133918614	133918311	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	PHF20L1	132528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	134287657	134287800	134287798	Y	NA	NDRG1,CTC-458A3.1	NA	NA	NA	NA	NDRG1	24465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	135469388	135469911	135469674	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	253381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	135519293	135519998	135519930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	203294	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	135570853	135571245	135571049	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAT	152047	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	MIR30D	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR30D	28397	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	137493596	137493872	137493803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	740858	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chr8	137512042	137512062	137512052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	759304	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	137765888	137765903	137765896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	1013150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	139293707	139293714	139293711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	630535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	139799567	139799714	139799659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL22A1	124535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	140716297	140716707	140716660	Y	NA	KCNK9	NA	NA	NA	NA	KCNK9	2998	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	141108529	141108796	141108710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	357882	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	141108929	141109987	141109387	Y	KCNK9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	356691	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	141172181	141172567	141172375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	294111	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.32189234517237
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142046833	142047172	142047003	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	36518	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142047873	142048201	142048171	Y	PTK2	PTK2	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	37558	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142082969	142083325	142083150	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3,EIF2C2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	42052	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142128241	142128488	142128412	Y	NA	DENND3	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	2864	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	91264	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142425618	142425919	142425790	Y	NA	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	142986268	142986706	142986510	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00051	291011	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00051	75931	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	BAI1	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	BAI1	5207	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	143696778	143697162	143696893	Y	NA	ARC	NA	NA	NA	NA	ARC	1945	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr8	143809767	143809928	143809818	Y	C8orf55	JRK,LY6K,LYNX1	NA	NA	NA	NA	LY6K	30238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr8	143813380	143813410	143813405	Y	GPIHBP1	LY6K,LYNX1	NA	NA	NA	NA	LY6K	33851	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr8	144684263	144684410	144684337	Y	NA	TIGD5,EEF1D,PYCRL,TSTA3,ZNF623	NA	NA	NA	NA	EEF1D	4552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	144785317	144785390	144785376	Y	NA	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	11039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	144799188	144799437	144799334	Y	MAPK15	ZNF707,MAPK15,FAM83H,FAM83H-AS1	NA	NA	NA	NA	MAPK15	2759	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr8	145826020	145826191	145826170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf82	73504	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr8	145938520	145938651	145938564	Y	NA	ARHGAP39,ZNF251	NA	NA	NA	NA	ARHGAP39	29326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	211500	211823	211657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	836531	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	1052526	1052586	1052563	Y	DMRT2,DMRT2,DMRT2	DMRT2	NA	NA	NA	NA	DMRT2	4172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	1399713	1400108	1399911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMRT2	351359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	2241944	2242239	2242031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA2	228602	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	3578891	3579091	3578989	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-509J21.1	54168	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	NA	CD274	61046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	5569434	5569709	5569569	Y	CD274,KIAA1432	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	57316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chr9	6788210	6788382	6788241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	69347	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	7149898	7149929	7149914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4P5	326391	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	8495779	8496144	8495966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	215167	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	8576629	8576984	8576673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	134327	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	8675420	8675557	8675548	Y	NA	RP11-134K1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	35754	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	8676177	8676347	8676262	Y	NA	RP11-134K1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-134K1.2	34964	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	9758146	9758159	9758153	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P3	669270	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	10554298	10554680	10554497	Y	PTPRD	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRD	56043	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	13034069	13034552	13034397	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-3L8.3	221725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	13237438	13237544	13237492	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	40045	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	13568572	13568946	13568596	Y	NA	NA	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-536O18.1	124082	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	14147587	14147657	14147622	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	167427	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	14316018	14316353	14316263	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	934	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	14322295	14322910	14322674	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	7211	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	8.16631868188207
chr9	14343303	14343452	14343378	Y	NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	28219	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	14344703	14345053	14344877	Y	ZDHHC21,NFIB	RP11-120J1.1	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	29619	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	32909	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.90665580202582
chr9	14349817	14350014	14349895	Y	NA	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	34733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr9	14353468	14353873	14353760	Y	NFIB	RP11-120J1.1,NFIB	NA	NA	NA	NA	RP11-120J1.1	38384	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	14395378	14395755	14395567	Y	NA	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	1227	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	14437606	14437932	14437918	Y	NA	NFIB	FLJ41200,NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	NFIB	40624	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr9	14992180	14992514	14992235	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	300711	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	15999707	15999922	15999846	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	474026	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	16917257	16917516	16917383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CNTLN	215464	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	17580370	17580488	17580383	Y	NA	SH3GL2	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	3290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	17799521	17799655	17799588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3GL2	222441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	18768460	18768476	18768467	Y	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-296P7.4	256414	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	19124098	19124309	19124196	Y	ACER2,PLIN2	HAUS6,PLIN2	NA	NA	NA	NA	PLIN2	22979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	19252213	19252529	19252372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLIN2	104925	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	21984231	21984381	21984318	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	8919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	21996542	21996712	21996656	Y	MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	3242	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr9	22012524	22012846	22012594	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	2370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	22026827	22027085	22026888	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	16673	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	23639161	23639473	23639317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	184862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	23850835	23851256	23851099	Y	NA	ELAVL2	NA	NA	NA	NA	ELAVL2	26500	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	26946072	26946289	26946254	Y	PLAA,IFT74,IFT74	IFT74,PLAA	NA	NA	NA	NA	PLAA	611	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	27333351	27333416	27333383	Y	IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	194363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	111209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	28539492	28539760	28539590	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	967628	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	28649799	28650020	28649948	Y	LINGO2	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1077935	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr9	28768003	28768359	28768181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1196139	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	28932604	28932646	28932625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1360740	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	29211344	29211542	29211410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1475561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	1472709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.50537250929589
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	29940600	29940947	29940774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	746156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	32183281	32183478	32183392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACO1	199140	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	32453982	32454272	32454141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX58	70050	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	33023891	33023961	33023926	Y	NA	APTX,DNAJA1	NA	NA	NA	NA	DNAJA1	682	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	33329062	33329543	33329355	Y	NA	NFX1	NA	NA	NA	NA	NFX1	40553	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	33350411	33350624	33350531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFX1	61902	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	34016159	34016420	34016379	Y	NA	UBAP2	NA	NA	NA	NA	UBAP2	30527	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	34588619	34588889	34588721	Y	NA	CNTFR,DCTN3,SIGMAR1	NA	NA	NA	NA	CNTFR	498	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,CCL27,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr9	34986458	34986973	34986609	Y	KIAA1539,DNAJB5	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	DNAJB5	665	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,SIT1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,RNU4-53P,GNE	NA	NA	NA	NA	RNU4-53P	32675	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	36764220	36764685	36764538	Y	NA	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	193361	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	36764861	36764955	36764921	Y	RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	194002	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr9	36765862	36766252	36766147	Y	RNF38,RNF38	NA	MELK	IMR90	Hi-C	24141950	MELK	195003	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	37009861	37010203	37010032	Y	PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	21900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	37035251	37035762	37035526	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3148	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	37035783	37036025	37035954	Y	ZCCHC7,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	3680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	PAX5	NA	NA	NA	NA	PAX5	4538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	37835930	37836292	37836154	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	36496	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	37859471	37859543	37859507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	60037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	37914600	37914735	37914730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC3	115166	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	37945283	37945292	37945288	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	121392	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	38689769	38689953	38689855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD18A	114565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	44878013	44878153	44878083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD18A	6302809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	68299584	68299663	68299624	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	153712	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	68419808	68420298	68419990	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	33077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.18348016412352
chr9	71728196	71728449	71728285	Y	NA	TJP2	NA	NA	NA	NA	TJP2	5760	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	71825244	71825637	71825441	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	91035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	72344996	72345326	72345161	Y	NA	PTAR1	NA	NA	NA	NA	PTAR1	27549	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	4.56760197461201
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chr9	73196795	73197009	73196903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	169255	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	74657404	74657841	74657552	Y	TMEM2,ZFAND5	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf85	132978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	77588894	77589149	77589022	Y	NA	RP11-197P3.1,C9orf40	NA	NA	NA	NA	C9orf40	23092	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	79266452	79266571	79266515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL161626.1	81721	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	79383801	79384093	79383990	Y	PRUNE2	NA	NA	NA	NA	NA	PRUNE2	134910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	85072190	85072207	85072199	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	RASEF	603885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	85629516	85629601	85629559	Y	NA	RASEF	NA	NA	NA	NA	RASEF	46491	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	86271805	86271878	86271876	Y	NA	RP11-522I20.3,UBQLN1	NA	NA	NA	NA	RP11-522I20.3	48631	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK2	88911	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	87470234	87470516	87470442	Y	NTRK2,NTRK2,NTRK2	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK2	188768	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	89190934	89191346	89191092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC6	223565	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	89627893	89628105	89627999	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	3326	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	89699545	89699882	89699714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	74978	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	89953262	89953308	89953285	Y	NA	NA	DAPK1,LOC440173	IMR90	Hi-C	24141950	DAPK1	156835	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	90133886	90134005	90133888	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	4212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	90150698	90151032	90150841	Y	NA	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	12481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	91297054	91297070	91297062	Y	NA	NA	S1PR3,SHC3,MIR4289	IMR90	Hi-C	24141950	SPIN1	295720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	91538614	91539111	91538717	Y	SECISBP2,S1PR3,C9orf47	NA	LOC286238,S1PR3,SHC3	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR3	65251	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	NA	NA	NA	NA	NA	CKS2	128444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chr9	92218643	92218902	92218819	Y	GADD45G	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr9	92218967	92219282	92219262	Y	NA	GADD45G	NA	NA	NA	NA	GADD45G	1039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	6.36696032824704
chr9	92276961	92277319	92277054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	59033	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	93862627	93863018	93862659	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	AUH,ROR2,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-1,MIR3910-2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	259177	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	94123007	94123342	94123181	Y	NA	AUH	NA	NA	NA	NA	AUH	812	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	94660957	94661066	94661012	Y	NA	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	49378	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	95383874	95384172	95384023	Y	NA	IPPK	NA	NA	NA	NA	IPPK	46375	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	95716430	95716630	95716571	Y	SUSD3,FAM120AOS,FGD3	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF484	78126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	95731311	95731640	95731457	Y	SUSD3,FAM120AOS,FGD3	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD3	87349	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	96072126	96072271	96072199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM120A	139733	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	96377714	96377795	96377762	Y	PHF2	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	41025	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	96382663	96382790	96382709	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	45974	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	97881296	97881429	97881363	Y	FBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	196562	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	97968410	97968794	97968763	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	109197	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	97969652	97969878	97969805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	108113	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	98075518	98075673	98075591	Y	NA	FANCC	NA	NA	NA	NA	FANCC	2318	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	98262009	98262267	98262138	Y	PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	15072	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr9	98273818	98274186	98273872	Y	NA	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3153	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	98315655	98315762	98315709	Y	NA	PTCH1	C9orf102,FBP1,FANCC,LOC158434,HSD17B3	IMR90	Hi-C	24141950	PTCH1	38316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	98772080	98772357	98772164	Y	C9orf102	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	133932	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	98785059	98785265	98785221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF4BP3	121024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	100199913	100200188	100200069	Y	NA	TDRD7	NA	NA	NA	NA	TDRD7	27681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	100455337	100455352	100455343	Y	NA	XPA	NA	NA	NA	NA	XPA	2287	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	100696898	100697242	100697085	Y	NA	C9orf156,ANP32B	NA	NA	NA	NA	C9orf156	14046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	100743401	100743685	100743451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANP32B	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	100841115	100841498	100841123	Y	C9orf156	NANS,TRIM14	NA	NA	NA	NA	NANS	24094	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	102580616	102580992	102580865	Y	NA	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	RP11-554F20.1	445	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	102767343	102767551	102767505	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERP44	91771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	103173830	103174136	103174107	Y	NA	TMEFF1	C9orf30-TMEFF1,TEX10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEFF1	28424	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	104185147	104185490	104185310	Y	NA	MRPL50,ZNF189	NA	NA	NA	NA	ZNF189	25992	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1,RP11-217B7.3	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	21184	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-217B7.3	3350	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	108220808	108221168	108220887	Y	NA	FSD1L	NA	NA	NA	NA	FSD1L	12731	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	108266303	108266427	108266370	Y	FSD1L,FSD1L,TMEM38B	NA	NA	NA	NA	NA	FKTN	51984	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	109623887	109624414	109624068	Y	ZNF462	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	509	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	109627297	109627657	109627483	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3919	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	109714113	109714149	109714131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF462	90735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	110227888	110228126	110228018	Y	KLF4	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22637	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	110228422	110228558	110228470	Y	NA	KLF4	NA	NA	NA	NA	KLF4	22205	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	110802909	110803314	110803056	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	KLF4	552146	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	111034300	111034792	111034481	Y	NA	NA	KLF4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-220D10.1	352321	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	111114067	111114180	111114121	Y	NA	NA	KLF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-220D10.1	272933	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	111773643	111773659	111773652	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	150	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	112262069	112262452	112262225	Y	PTPN3	PTPN3	NA	NA	NA	NA	PTPN3	3479	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	112578065	112578653	112578312	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37296	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	112861625	112861803	112861710	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	155117	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	114678571	114678728	114678577	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	21525	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	114819352	114819642	114819392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	116046	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	115527127	115527401	115527315	Y	NA	RP11-276E15.4,SNX30	NA	NA	NA	NA	SNX30	16009	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	117351016	117351370	117351316	Y	TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1	ATP6V1G1,C9orf91	NA	NA	NA	NA	ATP6V1G1	2990	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	117481130	117481475	117481264	Y	TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	109644	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	118024698	118025071	118024956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	146162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	118453042	118453852	118453530	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	574506	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	119311432	119311888	119311785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM32	135693	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	119451109	119451442	119451274	Y	NA	TRIM32	NA	NA	NA	NA	TRIM32	3528	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	119856579	119856832	119856800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	318516	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	120162627	120162904	120162792	Y	NA	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	12444	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chr9	120175638	120175763	120175745	Y	ASTN2	ASTN2	NA	NA	NA	NA	ASTN2	290	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.18348016412352
chr9	120522424	120523171	120522785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASTN2	347076	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	121771632	121771910	121771804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1568538	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	122127885	122128245	122128065	Y	DBC1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	1212203	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	122914670	122914945	122914761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	425503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	122984020	122984078	122984028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	356370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	123477335	123478104	123478033	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	2587	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	125956755	125956816	125956769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	72039	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	126169211	126169592	126169399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	140356	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	126597388	126597650	126597587	Y	DENND1A	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1A	92781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127018843	127019044	127018944	Y	NA	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127457265	127457441	127457351	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	38519	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127519728	127520109	127519909	Y	NA	NR6A1	NA	NA	NA	NA	NR6A1	11480	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127947242	127947259	127947251	Y	NA	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	2959	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	127976903	127977044	127976974	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	16082	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	127980597	127980978	127980790	Y	NA	PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	RABEPK	19776	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	128172483	128172773	128172647	Y	NA	NA	PBX3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GAPVD1	150410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	128298527	128298744	128298662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	128908654	128909040	128908854	Y	NA	NA	PBX3	IMR90	Hi-C	24141950	PBX3	401030	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	129495309	129495335	129495322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	69950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	MIR3911,C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	130627836	130628198	130628079	Y	NA	AK1,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4	NA	NA	NA	NA	AK1	9824	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	130733540	130734011	130733863	Y	SLC25A25,NAIF1,DPM2,FAM102A,FAM102A	DPM2,FAM102A	NA	NA	NA	NA	FAM102A	6781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	131127114	131127521	131127297	Y	SLC25A25	COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	4077	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	131146179	131146470	131146339	Y	FAM102A,SLC25A25,DNM1,SPTAN1,CCBL1	SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	14581	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	132040752	132040968	132040856	Y	NA	RP11-344B5.2	C9orf106,IER5L,LOC100506190,PPP2R4,CRAT,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7,HELA,K562	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-344B5.2	1769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	132114489	132114812	132114671	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	21910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	132171147	132171349	132171255	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	72381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.53648724195395
chr9	132220495	132220692	132220545	Y	FAM73B,USP20,USP20,C9orf78,ASB6	LINC00963	PPP2R4,CRAT,ASB6,METTL11A,IER5L,C9orf106,C9orf50,LOC100506190	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	23038	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	132221518	132221749	132221614	Y	USP20,USP20,C9orf78	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	21981	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	132223086	132223659	132223410	Y	C9orf106,TOR1B	LINC00963	PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	20071	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	132249735	132250094	132249903	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	6005	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	132312044	132312247	132312152	Y	NA	NA	DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	68314	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	71020	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	132331590	132331738	132331651	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	NA	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ASB6	70706	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	132579299	132579626	132579554	Y	ASB6,USP20,USP20,C9orf78	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1A	4787	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	132705367	132705623	132705495	Y	C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	97850	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	133342925	133343088	133343007	Y	PRDM12	ASS1	NA	NA	NA	NA	ASS1	24609	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.52253399153734
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.46030452622122
chr9	134508781	134509131	134508955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	104126	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	134882586	134882673	134882600	Y	SETX,NTNG2,MED27	NA	NA	NA	NA	NA	MED27	70622	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	134950793	134951083	134950938	Y	NA	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	2212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	134953880	134954115	134953996	Y	MED27	MED27	NA	NA	NA	NA	MED27	585	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135016724	135016887	135016786	Y	NA	NTNG2	MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX	IMR90	Hi-C	24141950	NTNG2	18447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135059697	135059990	135059854	Y	NA	NTNG2	SETX	IMR90	Hi-C	24141950	NTNG2	24363	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135226317	135226646	135226576	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	1726	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135279793	135280144	135280078	Y	TTF1	TTF1,C9orf171	NA	NA	NA	NA	TTF1	65	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135436046	135436377	135436212	Y	BARHL1	BARHL1	NA	NA	NA	NA	BARHL1	19195	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135456082	135456667	135456564	Y	NA	BARHL1	NA	NA	NA	NA	BARHL1	510	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135460369	135460861	135460532	Y	NA	BARHL1	NA	NA	NA	NA	BARHL1	4797	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr9	135461043	135461484	135461053	Y	NA	BARHL1	NA	NA	NA	NA	BARHL1	5471	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135818615	135818626	135818622	Y	RALGDS,C9orf96	TSC1	NA	NA	NA	NA	TSC1	595	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	135989434	135989663	135989519	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	47638	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	135995063	135995322	135995085	Y	RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	41979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	136008698	136009031	136008833	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	28270	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	136009131	136009458	136009277	Y	GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	27843	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.66094617258618
chr9	136075454	136075720	136075558	Y	NA	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	GBGT1	38122	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chr9	136327922	136327947	136327935	Y	RALGDS,RALGDS,ADAMTSL2,SLC2A6	REXO4,SLC2A6	NA	NA	NA	NA	SLC2A6	14312	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	136475001	136475406	136475372	Y	ADAMTSL2,FAM163B	NA	C9orf96,SURF4,VAV2,TMEM8C,ADAMTSL2,DBH,SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTSL2	79715	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	136574282	136574774	136574604	Y	NA	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	28303	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chr9	136720858	136721171	136721081	Y	SLC2A6,RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	SARDH	117781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	136753303	136753756	136753577	Y	C9orf7,VAV2	NA	SARDH	IMR90	Hi-C	24141950	VAV2	101970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	136996268	136996567	136996488	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	WDR5	K562	ChIA-PET	22265404	WDR5	1920	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	137030495	137030803	137030732	Y	NA	WDR5,RNU6ATAC	NA	NA	NA	NA	RNU6ATAC	2809	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	137550194	137550363	137550309	Y	NA	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	18574	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	137837926	137838295	137837954	Y	NA	NA	LOC100130954,FCN2,LOC100506599	IMR90	Hi-C	24141950	OLFM1	126973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	138021937	138022314	138022177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OLFM1	56669	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chr9	138233554	138233668	138233594	Y	NA	NA	OLFM1	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R26	135257	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	138778583	138778765	138778659	Y	KCNT1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	18309	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	138797876	138798018	138797978	Y	CAMSAP1	CAMSAP1,RP11-432J22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	218	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139081356	139081856	139081614	Y	CAMSAP1,LHX3,LHX3,QSOX2	LHX3	NA	NA	NA	NA	LHX3	13099	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	5.3980750609051
chr9	139123667	139124081	139124003	Y	SEC16A,NOTCH1,CARD9	LHX3,QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	11606	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chr9	139136338	139136616	139136467	Y	QSOX2	LHX3,QSOX2	NA	NA	NA	NA	QSOX2	651	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	139294189	139294305	139294248	Y	TRAF2,FAM69B,INPP5E	DNLZ,CARD9,SDCCAG3,PMPCA,INPP5E	NA	NA	NA	NA	SDCCAG3	8756	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139481633	139481782	139481708	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163,EGFL7,SNORA43,SNHG7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	42969	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139482600	139482784	139482692	Y	NA	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163,EGFL7,SNORA43,SNHG7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	43936	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139513037	139513494	139513208	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7,ABCA2	NA	MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGPAT2	66381	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139539341	139539721	139539606	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,EGFL7,EGFL7	AGPAT2	SEC16A,C9orf163	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AGPAT2	40154	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139606234	139606418	139606254	Y	LCNL1,FUT7,CLIC3,C9orf142,ABCA2,KIAA1984	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	1212	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chr9	139608163	139608561	139608378	Y	EGFL7,EGFL7,NPDC1,FAM69B	AGPAT2,FAM69B,SNHG7	NA	NA	NA	NA	FAM69B	3141	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139826661	139826850	139826762	Y	NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2	MIR4479,FBXW5,PTGDS	NA	NA	NA	NA	FBXW5	10298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	139919787	139920355	139920165	Y	NA	PTGDS,C9orf142,ABCA2,NPDC1,ENTPD2,UAP1L1	NA	NA	NA	NA	ABCA2	1012	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,GRIN1,MIR3621,LRRC26	NA	NA	NA	NA	GRIN1	7238	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,GRIN1,MIR3621,LRRC26	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	GRIN1	6451	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	13.702805923836
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chr9	140132594	140132714	140132654	Y	LCN15,NPDC1,PNPLA7,ENTPD8	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	951	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chr9	140163781	140164247	140164025	Y	NA	RNF208,C9orf169,TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	30116	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140169154	140169348	140169240	Y	NA	TUBB4B,NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	25355	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.49141925887928
chr9	140189199	140189592	140189229	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	5111	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chr9	140190695	140190800	140190760	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	3903	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140199547	140199668	140199608	Y	NA	NRARP	NA	NA	NA	NA	NRARP	4844	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140301767	140302162	140302062	Y	NA	EXD3,NOXA1,ENTPD8	NA	NA	NA	NA	EXD3	13552	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chr9	140463644	140464019	140463889	Y	FAM166A,C9orf173	PNPLA7,MRPL41,ZMYND19,ARRDC1,C9orf37,EHMT1	NA	NA	NA	NA	ZMYND19	18923	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	3467093	3467466	3467182	Y	MXRA5	NA	ARSF,MXRA5	IMR90	Hi-C	24141950	PRKX	162183	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	3732525	3732707	3732561	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	102876	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.38412181048849
chrX	8698180	8698491	8698336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAL1	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	9433838	9434425	9434365	Y	TBL1X	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	4503	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	9477403	9477544	9477474	Y	FAM9B,TBL1X,LOC100288814	TBL1X	NA	NA	NA	NA	TBL1X	48068	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	SHROOM2	NA	NA	NA	NA	SHROOM2	34172	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	9978783	9979047	9978917	Y	NA	WWC3	SHROOM2,WWC3	IMR90	Hi-C	24141950	WWC3	2555	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	10161663	10162021	10162010	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	38639	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	13709946	13709989	13709968	Y	RAB9A	TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1	NA	NA	NA	NA	RAB9A	4702	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	14584256	14584543	14584400	Y	NA	GLRA2	NA	NA	NA	NA	GLRA2	38836	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7,RNU4-6P	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RNU4-6P	9481	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	20079434	20079826	20079560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP7D2	53209	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.24570962943964
chrX	20283183	20283718	20283506	Y	SH3KBP1,RPS6KA3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	20628422	20628647	20628433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA3	344899	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	23392393	23392738	23392570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX4	287641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	30675885	30676221	30676093	Y	CXorf21,GK	GK	NA	NA	NA	NA	GK	6409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	37604688	37604864	37604776	Y	CYBB	CYBB	NA	NA	NA	NA	CYBB	32400	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	38338792	38338989	38338897	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN7	79634	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	38924712	38925019	38924864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	266027	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chrX	39670526	39670931	39670833	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	25136	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	39674855	39675112	39674981	Y	NA	GAPDHP1	BCOR	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP1	29465	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	39680161	39680842	39680511	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	34771	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	39865489	39865898	39865566	Y	BCOR,BCOR	AC092198.1	NA	NA	NA	NA	AC092198.1	631	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.87554106936776
chrX	39866067	39866462	39866265	Y	BCOR,BCOR	AC092198.1	NA	NA	NA	NA	AC092198.1	67	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	39871700	39871985	39871950	Y	BCOR,BCOR	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	5171	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	5970	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	AC092198.1	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AC092198.1	6810	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chrX	39953769	39954197	39953849	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	80385	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	39961698	39961932	39961714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	72650	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	39963931	39964200	39963990	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	70382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	39964938	39965503	39965246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69079	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	3.04506798307467
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chrX	40005202	40005365	40005305	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	29217	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	40011614	40011816	40011787	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	22766	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.62983143992812
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.76824362097697
chrX	40015911	40016135	40015987	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	18447	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	40016662	40016910	40016734	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	17672	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	40017598	40017727	40017669	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	16855	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	40026389	40026850	40026635	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7732	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	2.21459489678158
chrX	40028554	40028949	40028781	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	5633	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chrX	40031344	40032243	40032130	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	2339	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.830473086293092
chrX	40034377	40034649	40034428	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	0	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.79935835363503
chrX	40633117	40633446	40633258	Y	ATP6AP2,MED14	MED14-AS1,MED14	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	MED14	40007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	40692126	40692324	40692241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	72913	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	40749971	40750359	40750172	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	RP11-77G22.2	USP9X,MED14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-77G22.2	14878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	41058503	41058566	41058535	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP9X	115615	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOB	148897	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	EFHC2	NA	NA	NA	NA	EFHC2	32007	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	44774748	44775132	44774822	Y	NA	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	43991	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	45241202	45241396	45241250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	362298	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	45488077	45488123	45488115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR221	115571	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	46316672	46316948	46316811	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18523	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	47175541	47175936	47175853	Y	NA	NA	USP11,CDK16,UBA1	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	85452	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	47180934	47181052	47180967	Y	ELK1,CDK16	NA	UBA1,USP11	IMR90	Hi-C	24141950	USP11	90845	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	47880817	47881226	47880903	Y	SYN1	ZNF182,ZNF630	NA	NA	NA	NA	ZNF182	19440	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.96888526734194
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	53172968	53173150	53172985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01155	51641	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	53285845	53286369	53286148	Y	FAM156A,RIBC1,RIBC1,IQSEC2	KDM5C	NA	NA	NA	NA	KDM5C	33241	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	53428419	53428681	53428625	Y	NA	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	RIBC1	18958	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	53467183	53467489	53467297	Y	FAM156A,TSPYL2,IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	7863	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	56756944	56757158	56757051	Y	NA	RP11-622K12.1,UQCRBP1	NA	NA	NA	NA	RP11-622K12.1	3252	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	108870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	57421884	57422193	57422039	Y	FAAH2	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	110745	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	58166848	58167361	58167174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAAH2	855709	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	67914058	67914579	67914414	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	48550	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	69386644	69386665	69386655	Y	NA	IGBP1	NA	NA	NA	NA	IGBP1	35345	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	69653784	69653948	69653832	Y	NA	DLG3	NA	NA	NA	NA	DLG3	8763	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NLGN3,GJB1	NA	NA	NA	NA	GJB1	30910	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	70640504	70640913	70640718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAF1	56390	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	71343441	71343560	71343500	Y	FLJ44635	RGAG4	NA	NA	NA	NA	RGAG4	6198	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	73237406	73237798	73237506	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	75247	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	73250242	73250558	73250399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	88083	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	73756210	73756567	73756298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75885	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	74033137	74033450	74033294	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA2022	109832	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	85294512	85294785	85294645	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	5781	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	85404728	85405017	85404880	Y	DACH2	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	104162	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	85442428	85442440	85442435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	141862	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	92479084	92479478	92479382	Y	NA	RP13-88F20.1	NA	NA	NA	NA	RP13-88F20.1	1070	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	96701855	96702106	96701982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	764193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	100111421	100111452	100111441	Y	NA	CSTF2	NA	NA	NA	NA	CSTF2	38037	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	100498384	100498730	100498494	Y	ARMCX3,ARMCX3,TMEM35,DRP2	DRP2	NA	NA	NA	NA	DRP2	25626	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	100664036	100664412	100664274	Y	NA	RPL36A,GLA,HNRNPH2,ARMCX4	NA	NA	NA	NA	HNRNPH2	2753	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	GPRASP1	NA	NA	NA	NA	GPRASP1	10490	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	106693156	106693529	106693316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPS1	176208	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	106985108	106985412	106985307	Y	TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3	TSC22D3	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	33160	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	109315579	109315956	109315731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	71720	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	109382352	109382583	109382468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM164	138493	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	AMOT	NA	NA	NA	NA	AMOT	2604	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.692060905244243
chrX	114849502	114849636	114849587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	56001	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	115004721	115004876	115004807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	78546	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	156035	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	116006387	116006717	116006592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-761E20.1	922965	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	117885861	117886125	117885896	Y	LONRF3	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK11	258000	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.93777053468388
chrX	127434305	127434453	127434370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	1221024	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	128225148	128225423	128225251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	430054	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	128364824	128364943	128364883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCA1	290534	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	128911334	128911515	128911430	Y	ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC9	64370	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	129065451	129065820	129065554	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	27354	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	129216343	129216741	129216485	Y	SASH3,ELF4,ELF4,BCORL1	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	25950	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	129966535	129966828	129966682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	68380	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	130942336	130942500	130942419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	212793	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	130952432	130952771	130952603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MST4	202522	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	131159301	131159695	131159439	Y	RAP2C,MBNL3,MST4,MST4	MST4	NA	NA	NA	NA	MST4	4008	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	131615038	131615178	131615106	Y	MST4,MST4,MBNL3	MBNL3	NA	NA	NA	NA	MBNL3	6818	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	132089755	132090160	132089782	Y	NA	HS6ST2	NA	NA	NA	NA	HS6ST2	3263	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	132400242	132400521	132400363	Y	NA	RNU1-115P	NA	NA	NA	NA	RNU1-115P	29398	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	134048475	134048529	134048502	Y	MOSPD1	MOSPD1	NA	NA	NA	NA	MOSPD1	1178	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	134138094	134138444	134138243	Y	NA	FAM127C,FAM127A,FAM127B	NA	NA	NA	NA	FAM127C	16115	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	134567184	134567298	134567231	Y	NA	LINC00086	NA	NA	NA	NA	LINC00086	13316	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	135631473	135631677	135631628	Y	HTATSF1	NA	NA	NA	NA	NA	HTATSF1	54235	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	139521736	139522104	139521978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX3	63121	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	140000500	140000988	140000725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	268322	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	147500402	147500425	147500414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	U40455.1	222004	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	148595188	148595518	148595383	Y	IDS,CXorf40A	IDS,CXorf40A,LINC00893	NA	NA	NA	NA	IDS	17952	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	149084401	149084780	149084588	Y	NA	LINC00894,CXorf40B	NA	NA	NA	NA	LINC00894	20066	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	149863384	149863571	149863479	Y	NA	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3949	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	150038626	150039000	150038814	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	26289	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	1.10729744839079
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PNMA3	95010	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.415236543146546
chrX	152742295	152742894	152742640	Y	NA	TREX2,BGN,HAUS7,ATP2B3	HAUS7,ATP2B3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TREX2	8250	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.276824362097697
chrX	153084450	153084610	153084498	Y	NA	SRPK3,SSR4,IDH3G,PDZD4,CYCSP45	NA	NA	NA	NA	PDZD4	9410	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	153144826	153145116	153145102	Y	NA	CYCSP45,L1CAM	NA	NA	NA	NA	L1CAM	27561	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	153771070	153771275	153771201	Y	IRAK1,MECP2,TEX28,TEX28,EMD,DNASE1L1,TAZ,ATP6AP1,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1,GAB3,IKBKG,IKBKG,IKBKG	FAM3A,IKBKG,G6PD	NA	NA	NA	NA	G6PD	2512	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	154023434	154023601	154023487	Y	EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1	DKC1,MPP1	NA	NA	NA	NA	MPP1	23681	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrX	154256125	154256514	154256179	Y	IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2	FUNDC2,BRCC3	NA	NA	NA	NA	FUNDC2	3870	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrY	10023047	10023682	10023281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH11Y	5156780	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrY	13488641	13488888	13488688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	3260088	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.138412181048849
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGKP1	1541535	CAGE	MS-1	hg19	FANTOM5	0.553648724195395