chr1	1004646	1004986	1004766	Y	NA	RP11-465B22.3,C1orf159	NA	NA	NA	NA	RP11-465B22.3	11532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	1143531	1144198	1143599	Y	MIB2,LOC441869,TNFRSF18,TNFRSF4	SDF4,B3GALT6	NA	NA	NA	NA	SDF4	21213	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	1186391	1186507	1186467	Y	NA	SDF4,B3GALT6,UBE2J2	NA	NA	NA	NA	UBE2J2	20758	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	1286847	1286913	1286880	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2	NA	NA	NA	NA	DVL1	4117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,TAS1R3,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	19954	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr1	2190530	2190674	2190620	Y	TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	48371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	2478276	2478817	2478474	Y	SKI,PANK4,TNFRSF14	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	6261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	3229711	3230157	3229865	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	295902	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	3251760	3252019	3251890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	274040	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	3594206	3594277	3594248	Y	MEGF6,WRAP73,TP73,TP73	TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	26881	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	7764543	7764931	7764717	Y	PER3	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	64398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr1	8571636	8571856	8571737	Y	SLC45A1,RERE	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	303846	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	8712702	8713010	8712859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	162692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	9760502	9760837	9760631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CD	50712	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	9960528	9960713	9960585	Y	NA	CTNNBIP1,LZIC,NMNAT1	NA	NA	NA	NA	CTNNBIP1	7681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	10821450	10821813	10821706	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	32894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	12243852	12244671	12244387	Y	AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D	TNFRSF1B,VPS13D	VPS13D	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1B	18792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	13949833	13950153	13949906	Y	PRDM2,PDPN	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	74540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	65352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	16175691	16176294	16176100	Y	NA	RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	3049	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	16339773	16339933	16339866	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	39146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	16364376	16364458	16364417	Y	FAM131C,C1orf64	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	63749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	49880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	19278388	19278892	19278719	Y	UBR4,IFFO2	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	51113	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	19280139	19280583	19280395	Y	UBR4,IFFO2	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH4A1	52864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	19839147	19839427	19839318	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,AKR7A2,CAPZB	CAPZB	CAPZB,C1orf151-NBL1	IMR90	Hi-C	24141950	CAPZB	29081	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	20111066	20111358	20111348	Y	NA	TMCO4	NA	NA	NA	NA	TMCO4	13080	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	22366226	22366841	22366516	Y	USP48,ZBTB40	LINC00339,CDC42	CDC42	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42	10279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25247095	25247311	25247210	Y	NA	RUNX3	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	42301	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25248726	25249062	25248981	Y	RCAN3,SRRM1,SYF2,C1orf63,RUNX3	RUNX3	CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	40550	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25281668	25281921	25281754	Y	NA	RUNX3	NA	NA	NA	NA	RUNX3	7691	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25360165	25361177	25360621	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	NA	RUNX3,CLIC4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX3	70553	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25425738	25426059	25426056	Y	NA	NA	RUNX3,IL22RA1,CLIC4,SRRM1,SYF2	IMR90	Hi-C	24141950	SYF2	130934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25566195	25566411	25566257	Y	TMEM57	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	25855984	25856012	25855998	Y	NA	LDLRAP1	MAN1C1,LDLRAP1,TMEM57,C1orf135,FAM54B,RHCE,SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	LDLRAP1	12059	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	26452850	26453250	26452988	Y	FAM54B,RPS6KA1,HMGN2,CEP85,CD52,PDIK1L	PDIK1L,ZNF593	NA	NA	NA	NA	PDIK1L	17186	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	26617206	26617304	26617268	Y	SH3BGRL3,RPS6KA1,PIGV,ARID1A,UBXN11,UBXN11	SH3BGRL3,CD52,UBXN11	NA	NA	NA	NA	SH3BGRL3	13539	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2,RPS6KA1	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS6KA1	26383	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR1976	67804	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MIR1976	68309	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	27244420	27244792	27244551	Y	NA	GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	GPATCH3	19463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	27897947	27898332	27898153	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	30610	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	28189568	28190269	28189912	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38	PPP1R8,RPA2	NA	NA	NA	NA	PPP1R8	34279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	29101544	29101853	29101799	Y	EPB41	YTHDF2	NA	NA	NA	NA	YTHDF2	40411	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	31231730	31232072	31231886	Y	NA	LAPTM5	NA	NA	NA	NA	LAPTM5	3063	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	31537719	31538012	31537814	Y	LAPTM5,PUM1	PUM1	NA	NA	NA	NA	PUM1	881	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	31602770	31603168	31602969	Y	NKAIN1	NA	PRO0611,PUM1,NKAIN1,SNRNP40	IMR90	Hi-C	24141950	PUM1	65932	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	90728	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PUM1	91382	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	31956203	31956482	31956384	Y	PEF1	RP11-439L8.3	SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-439L8.3	13359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	NA	NA	NA	NA	NA	PEF1	145150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	32354934	32355150	32354987	Y	LCK,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	NA	NA	NA	NA	NA	PTP4A2	53307	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	33515825	33516245	33515960	Y	RNF19B	AK2,ADC	AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AK2	28352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	36431149	36431388	36431272	Y	STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3	NA	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	121088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	36626561	36626969	36626609	Y	STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3	TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	7381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	38958971	38959191	38959076	Y	AKIRIN1	NA	NA	NA	NA	NA	RRAGC	364304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	39633654	39634014	39633702	Y	BMP8A	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	143664	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	BMP8B	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BMP8B	12455	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	12.2243605821923
chr1	40283075	40283206	40283146	Y	PABPC4,RLF,MFSD2A	BMP8B	MYCL1	K562	ChIA-PET	22265404	BMP8B	30542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	40295095	40295414	40295254	Y	NA	BMP8B	NA	NA	NA	NA	BMP8B	42562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	40331340	40331501	40331388	Y	PABPC4,PPIE,ZMPSTE24,RLF,PPT1,CAP1,BMP8B,TRIT1,MYCL1	TRIT1	NA	NA	NA	NA	TRIT1	15682	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	40847285	40847634	40847387	Y	NA	SMAP2	NA	NA	NA	NA	SMAP2	38763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	41178788	41178979	41178866	Y	ZMPSTE24,SMAP2,SMAP2,ZNF642,DEM1,ZNF684,CITED4,NFYC,NFYC	RIMS3,NFYC	KCNQ4	IMR90	Hi-C	24141950	NFYC	23468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	41650800	41651168	41651109	Y	KCNQ4,SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	54658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	370805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	6.35666750274
chr1	42192975	42193489	42193266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	306107	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	42204580	42205516	42204895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	294080	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	43406108	43407009	43406836	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	15521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	43666420	43666443	43666435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBNA1BP2	68164	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	43976930	43977350	43977026	Y	NA	NA	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	HYI	59270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44230271	44230532	44230402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	60776	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44299891	44300630	44300422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	96362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	44324219	44324394	44324336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	72598	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44331438	44331658	44331560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	65334	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44380893	44381202	44381004	Y	SLC6A9,B4GALT2,ARTN	ARTN,IPO13	NA	NA	NA	NA	ARTN	15790	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	SLC6A9	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	44897170	44897489	44897243	Y	NA	RNF220	NA	NA	NA	NA	RNF220	28304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	45192729	45193123	45192925	Y	NA	RNU5F-1,KIF2C,RPS8,SNORD55	KIF2C	IMR90	Hi-C	24141950	RNU5F-1	7155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	46268583	46268737	46268651	Y	NA	MAST2	NA	NA	NA	NA	MAST2	17924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	46573980	46574380	46574180	Y	TSPAN1,PIK3R3,PIK3R3	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R3	65780	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	51198410	51198537	51198468	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	225398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	53055926	53056317	53056076	Y	NA	ZCCHC11,GPX7	GPX7,ZCCHC11,ZYG11B,FAM159A,ZFYVE9,ORC1,PRPF38A,ZYG11A	IMR90	Hi-C	24141950	GPX7	9727	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	53369161	53369511	53369336	Y	SCP2,ECHDC2	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	21373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	54286238	54286401	54286368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	68006	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	54441729	54442008	54441915	Y	NA	HSPB11,LRRC42	NA	NA	NA	NA	LRRC42	31979	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	54965120	54965643	54965198	Y	NA	NA	TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A	IMR90	Hi-C	24141950	SSBP3	87968	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	55009665	55009918	55009852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP3	132513	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	55327144	55327486	55327453	Y	NA	DHCR24	NA	NA	NA	NA	DHCR24	23405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	57906316	57906442	57906379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P15	613710	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	59522982	59523218	59523118	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	237092	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	NA	NA	NA	NA	NA	CFL1P3	51985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	65421731	65422136	65422135	Y	NA	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	8051	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	66717339	66717678	66717593	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D1	498464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	66817705	66818086	66817818	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D1	398056	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	67198280	67198800	67198648	Y	PDE4B,MIER1	TCTEX1D1	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D1	17342	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	67223993	67224234	67224127	Y	MIER1,MIER1	TCTEX1D1	NA	NA	NA	NA	TCTEX1D1	7851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	69605544	69605634	69605589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	644640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	70691921	70692281	70691982	Y	ANKRD13C,LRRC40,SRSF11	LRRC40,SRSF11	NA	NA	NA	NA	SRSF11	22556	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	78132928	78133068	78133059	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	14036	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	78196845	78197195	78197020	Y	NA	ZZZ3,USP33,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	26342	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	78214350	78214750	78214605	Y	NA	USP33,FAM73A	NA	NA	NA	NA	USP33	8787	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	78386302	78386347	78386324	Y	NEXN	NA	NA	NA	NA	NA	FUBP1	56447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	84284633	84284926	84284781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPF1	658016	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	85005554	85005595	85005576	Y	NA	GNG5,CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	32568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	85038681	85038996	85038864	Y	MCOLN2,GNG5,CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	518	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	85643319	85643587	85643547	Y	NA	NA	MIR4423	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf52	79768	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	87617475	87617831	87617556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO4	174320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	88289775	88289792	88289784	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	497624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	88292387	88292883	88292561	Y	NA	NA	LMO4	IMR90	Hi-C	24141950	LMO4	500236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	90100291	90100368	90100330	Y	NA	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	3660	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	90167657	90167773	90167712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	71026	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	90190139	90190909	90190374	Y	GBP5,LRRC8B,LRRC8C,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	93508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	90223174	90223447	90223368	Y	NA	NA	LRRC8C,FLJ27354,LRRC8D	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC8D	61126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	90309838	90310280	90310072	Y	LRRC8C,ZNF326	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	25265	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF326	81915	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	91154949	91155305	91155127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-665J23.1	159902	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	92269494	92269966	92269778	Y	TGFBR3,RPAP2,GLMN	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD8	273896	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	93669062	93669462	93669176	Y	NA	CCDC18,TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	24777	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	93806739	93807078	93807070	Y	NA	DR1,RP4-717I23.3	NA	NA	NA	NA	DR1	2367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	95258204	95258621	95258355	Y	NA	NA	F3,ABCD3,LOC729970	IMR90	Hi-C	24141950	F3	252848	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	95464838	95464926	95464881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALG14	71575	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	95551114	95551338	95551185	Y	NA	ALG14	ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALG14	14613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	97199537	97199912	97199566	Y	NA	PTBP2	NA	NA	NA	NA	PTBP2	14316	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	100169951	100170218	100170031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRRS1	59969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	104105795	104105973	104105867	Y	NA	RNPC3	NA	NA	NA	NA	RNPC3	39482	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	108199393	108199592	108199493	Y	VAV3	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	306174	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	108592862	108593109	108592904	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV3	87096	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	108643279	108643407	108643343	Y	NA	NA	VAV3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A24	98064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109100040	109100237	109100058	Y	PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	474	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109127044	109127234	109127073	Y	STXBP3,PRPF38B,FAM102B	FAM102B	NA	NA	NA	NA	FAM102B	26333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109189516	109189718	109189617	Y	TMEM167B,STXBP3,PRPF38B,HENMT1	HENMT1,PRPF38B	NA	NA	NA	NA	HENMT1	12430	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109246671	109246905	109246843	Y	FAM102B,TMEM167B,PRPF38B	HENMT1,PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	PRPF38B	13726	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	SCARNA2	53090	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	110438276	110438910	110438607	Y	NA	NA	CSF1,EPS8L3,SORT1,PSMA5,GSTM3,GNAI3,GSTM4,AHCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	AHCYL1	86398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	111186366	111186880	111186713	Y	NA	KCNA3	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	KCNA3	28775	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	111191148	111191392	111191279	Y	LRIF1,CD53,KCNA3	KCNA3	NA	NA	NA	NA	KCNA3	24263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	111489179	111489247	111489213	Y	NA	LRIF1	NA	NA	NA	NA	LRIF1	15454	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	111764327	111764759	111764457	Y	CD53,CD53,RAP1A,CEPT1,CEPT1,DENND2D,CHI3L2	NA	C1orf88,DRAM2,CEPT1,RAP1A,CHI3L2,WDR77	IMR90	Hi-C	24141950	DRAM2	83489	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	112048437	112048734	112048588	Y	C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162	C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	C1orf162	34023	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	112163412	112163797	112163622	Y	C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1A	80572	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	113046545	113046667	113046606	Y	WNT2B	NA	NA	NA	NA	NA	CTTNBP2NL	109742	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	114236415	114236760	114236542	Y	MAGI3	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF1	63351	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	114566071	114566240	114566155	Y	NA	NA	SYT6	IMR90	Hi-C	24141950	HIPK1	96257	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	114950620	114950667	114950644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM33	101114	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	115046601	115046805	115046703	Y	NA	TRIM33	NA	NA	NA	NA	TRIM33	4976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	117110819	117111247	117111136	Y	NA	CD58	NA	NA	NA	NA	CD58	414	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	117359174	117359463	117359379	Y	TTF2,CD2	NA	NA	NA	NA	NA	PTGFRN	91216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	119450998	119451282	119451141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	229737	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	119506251	119506502	119506377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	174517	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	120380695	120381105	120381020	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHGDH	180274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	120525502	120525838	120525670	Y	NOTCH2,ZNF697,NBPF7	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	84402	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	121485082	121485212	121485187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCGR1B	551145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-38P	50527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	145032376	145032564	145032466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC22B	61656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	145106553	145106772	145106662	Y	NA	SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	12333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	145396760	145397198	145397044	Y	NA	RNVU1-6,TXNIP	LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNVU1-6	16003	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	146956714	146956895	146956804	Y	GPR89B	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	183723	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	147080043	147080251	147080097	Y	PRKAB2,CHD1L,BCL9	NA	NA	NA	NA	NA	ACP6	60367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	147790636	147790862	147790749	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	14024	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	148000699	148000802	148000795	Y	NA	RNVU1-13	NA	NA	NA	NA	RNVU1-13	8553	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	149029458	149029500	149029498	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	183800	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	149215297	149215704	149215586	Y	NA	RNU1-92P	NA	NA	NA	NA	RNU1-92P	1997	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	149957680	149957694	149957685	Y	NA	OTUD7B	NA	NA	NA	NA	OTUD7B	22931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	151249767	151250096	151249960	Y	FAM63A,CDC42SE1,RFX5,PI4KB,PI4KB,TNFAIP8L2,ZNF687	PSMD4,ZNF687,PI4KB	NA	NA	NA	NA	ZNF687	1998	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	151918166	151918684	151918434	Y	NA	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	37882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	151918898	151919222	151919024	Y	S100A10	THEM4,S100A10	S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THEM4	38614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	152001678	152001977	152001894	Y	S100A10,S100A11	S100A10,S100A11	NA	NA	NA	NA	S100A11	16406	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	153361312	153361704	153361428	Y	S100A9,S100A12,S100A7L2,S100A8	NA	NA	NA	NA	NA	S100A8	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	153845025	153845089	153845058	Y	NA	GATAD2B	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	48362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	154016982	154017198	154017038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-422P24.9	50874	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	154392646	154393050	154392862	Y	CRTC2,UBAP2L,C1orf43,UBAP2L,ADAR,IL6R	IL6R	NA	NA	NA	NA	IL6R	16977	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	154728745	154728994	154728977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	130270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	154910155	154910399	154910216	Y	ADAR,PBXIP1,MTX1	PMVK,PBXIP1,PYGO2,FLAD1	NA	NA	NA	NA	PMVK	2688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	156073854	156074351	156074085	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	23490	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	156095033	156095181	156095051	Y	MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA	MEX3A,LMNA,SEMA4A	NA	NA	NA	NA	SEMA4A	19976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	156426931	156427503	156427197	Y	ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	41117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	156462474	156462813	156462575	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	5807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	156464458	156464805	156464586	Y	NA	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	3815	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	157373072	157373269	157373181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV3	266806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	158253654	158254229	158253918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD1D	105917	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	158659017	158659128	158659071	Y	OR10K1,OR10Z1,OR6N1,SPTA1,OR6K3	NA	NA	NA	NA	NA	MNDA	139979	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	159880076	159880706	159880437	Y	FCRL6,DCAF8,TAGLN2	CCDC19,TAGLN2,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	CCDC19	12123	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	159887185	159887340	159887284	Y	NA	CCDC19,TAGLN2,SLAMF9	NA	NA	NA	NA	TAGLN2	6182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	160230168	160230604	160230300	Y	NA	DCAF8,PEX19	NA	NA	NA	NA	DCAF8	22316	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	160550267	160550490	160550484	Y	NA	CD84	NA	NA	NA	NA	CD84	2961	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	161037907	161038726	161038256	Y	FCGR3A,FCGR3A,CD48,CD244,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,USF1,ARHGAP30,NIT1,PFDN2	NA	NA	NA	NA	ARHGAP30	147	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	FCGR2A	108992	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	162539981	162540420	162539994	Y	C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1	UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	10658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	162659800	162660152	162659976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UAP1	130477	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	164340132	164340494	164340313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUF2	1105766	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	165345662	165345996	165345868	Y	NA	NA	LRRC52,LOC400794	IMR90	Hi-C	24141950	MGST3	252102	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	167440766	167441089	167440893	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	79915	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	167478725	167479215	167479067	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	41789	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	167586596	167587245	167587123	Y	POU2F1,POU2F1,CD247,RCSD1	RCSD1	RCSD1	IMR90	Hi-C	24141950	RCSD1	10085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	170637621	170637732	170637679	Y	PRRX1	NA	NA	NA	NA	NA	GORAB	138351	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	170794960	170795269	170795115	Y	FMO3	NA	KIFAP3,METTL11B	IMR90	Hi-C	24141950	GORAB	295690	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	171255417	171255820	171255657	Y	PRRC2C,FMO4	NA	NA	NA	NA	NA	PRRC2C	196831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	173447359	173447668	173447399	Y	PRDX6	PRDX6	NA	NA	NA	NA	PRDX6	2954	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	174132741	174133010	174132876	Y	NA	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	6193	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	174175700	174176068	174175801	Y	RC3H1	RABGAP1L	NA	NA	NA	NA	RABGAP1L	49152	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	174788416	174788807	174788447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACYBP	177493	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	175094142	175094504	175094323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS14	103581	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	175492766	175493084	175492925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-318C24.1	396027	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	176079011	176079503	176079162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFWD2	95126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	177903071	177903284	177903119	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	101801	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	178157578	178157966	178157615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	96714	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	178995927	178996290	178996175	Y	AXDND1,RALGPS2,TOR3A	FAM20B	NA	NA	NA	NA	FAM20B	2988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	179144823	179145001	179144950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOR3A	96311	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	179555221	179555646	179555325	Y	TDRD5,TDRD5,TDRD5	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P54	130771	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	180727103	180727211	180727157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPR1	127963	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	181068595	181069000	181068732	Y	NA	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	12957	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	181074349	181074924	181074645	Y	XPR1,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	18711	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	181149230	181149365	181149283	Y	NA	NA	MR1,XPR1,KIAA1614,ACBD6,STX6,IER5	IMR90	Hi-C	24141950	IER5	93592	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	182118170	182119053	182118696	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	240288	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	182228543	182228906	182228715	Y	RNASEL,GLUL,GLUL	NA	GLUL	K562	ChIA-PET	22265404	GLUL	130435	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	183576409	183576668	183576606	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NCF2,ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	NCF2	18398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	183865521	183866190	183865847	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	152621	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	184033703	184034036	184033838	Y	NA	TSEN15	NA	NA	NA	NA	TSEN15	14892	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	185109809	185110137	185110116	Y	IVNS1ABP	TRMT1L	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	14067	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	185129185	185129369	185129253	Y	NA	TRMT1L	NA	NA	NA	NA	TRMT1L	4981	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	185372140	185372184	185372162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	87679	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	186799738	186800031	186799804	Y	PTGS2,PLA2G4A	PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	3653	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	186935248	186935528	186935344	Y	PTGS2,PLA2G4A	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	139163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	192458942	192459176	192459156	Y	RGS2,RGS13,RGS1	NA	RGS1,RGS2	IMR90	Hi-C	24141950	RGS1	83681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	192691567	192691932	192691775	Y	NA	MIR4426	RGS13	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4426	8254	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	197513718	197513772	197513745	Y	CRB1,DENND1B	NA	NA	NA	NA	NA	DENND1B	229054	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	197964894	197965254	197965077	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf53	95117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	198625518	198626374	198625745	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	19717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	PTPRC	NA	NA	NA	NA	PTPRC	45129	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr1	198889384	198889935	198889528	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRC	283583	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	198979759	198979985	198979807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRC	373958	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	199730970	199731311	199731141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	645873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	200325072	200325315	200325117	Y	ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	51869	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	200481491	200481643	200481567	Y	NA	NA	NR5A2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF281	104307	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	NA	NA	NA	NA	NA	KIF21B	133013	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	201449602	201449822	201449716	Y	LAD1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	PHLDA3	IMR90	Hi-C	24141950	PHLDA3	13237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203247243	203247485	203247301	Y	RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	25134	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203258547	203259334	203258830	Y	RABIF,KLHL12,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	13285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203259429	203259985	203259729	Y	RABIF,KLHL12,ADIPOR1,ADIPOR1,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	12634	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203296328	203297068	203296686	Y	LAX1,RABIF,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2	NA	NA	NA	NA	BTG2	23709	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203598711	203598999	203598777	Y	BTG2	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5022	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	203789427	203789442	203789436	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	26645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	203794311	203794511	203794411	Y	NA	ZC3H11A,SNRPE	NA	NA	NA	NA	ZC3H11A	31529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	205410224	205410578	205410325	Y	DSTYK,TMCC2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK18	61145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	205526738	205526752	205526745	Y	NA	RNU2-19P	NA	NA	NA	NA	RNU2-19P	7092	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	206959620	206960115	206959722	Y	NA	NA	IL10,DYRK3,MAPKAPK2,IL19,FAIM3,EIF2D	IMR90	Hi-C	24141950	MAPKAPK2	103331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	207120476	207120868	207120823	Y	IL19,IL19,PIGR,FCAMR	RP11-564A8.4,FAIM3	NA	NA	NA	NA	FAIM3	25884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C1orf132	96417	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	209938931	209939742	209939534	Y	LAMB3,G0S2,TRAF3IP3,C1orf74	TRAF3IP3,C1orf74	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP3	11554	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	211423824	211424043	211423934	Y	NA	RCOR3	NA	NA	NA	NA	RCOR3	5676	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	211786767	211786829	211786805	Y	NA	SLC30A1	SLC30A1,NEK2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC30A1	36683	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	212513330	212513719	212513465	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206	RP11-384C4.3	NA	NA	NA	NA	RP11-384C4.3	32470	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	212654863	212655019	212654879	Y	ATF3,ATF3,ATF3	NA	ATF3,FAM71A,ANGEL2,NENF,BATF3,TATDN3,NSL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NENF	50634	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	214619335	214619608	214619472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	104184	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	88579	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	216938634	216938811	216938777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	863613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	219263975	219264292	219264207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	219433064	219433395	219433229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	87878	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	220427006	220427444	220427299	Y	NA	MORF4L1P1,RAB3GAP2	NA	NA	NA	NA	MORF4L1P1	2094	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	221049992	221050390	221050089	Y	HLX	HLX	NA	NA	NA	NA	HLX	293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	221219642	221220032	221219744	Y	HLX	NA	NA	NA	NA	NA	HLX	169943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	222273748	222273768	222273757	Y	NA	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	360230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	222829045	222829186	222829145	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	39617	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	223892678	223892997	223892836	Y	NA	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	5383	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	223904365	223904567	223904454	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	17070	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr1	224598124	224598418	224598271	Y	WDR26	WDR26	NA	NA	NA	NA	WDR26	24317	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	225654906	225655584	225655524	Y	TMEM63A,LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	40279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	225934674	225934968	225934833	Y	ENAH	SRP9	NA	NA	NA	NA	SRP9	28563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB	33608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	228640073	228640088	228640081	Y	NA	TRIM11,RP11-245P10.4,HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	HIST3H2A	3472	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	229074291	229074557	229074548	Y	NA	NA	RHOU	IMR90	Hi-C	24141950	RHOU	205467	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	229357329	229357959	229357668	Y	RAB4A	RP5-1061H20.4,RAB4A	RHOU,C1orf96	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1061H20.4	46816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	229473732	229474385	229474330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB4A	68910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	230203814	230204638	230204330	Y	NA	GALNT2	NA	NA	NA	NA	GALNT2	12278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	230289705	230290142	230289903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	98169	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	231038131	231038454	231038293	Y	COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	34796	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	231113054	231113423	231113208	Y	EXOC8,C1orf124,TTC13	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	ARV1	327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	231868761	231869568	231868969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	108200	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	232725638	232725888	232725699	Y	SIPA1L2	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	240045	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	232726243	232726385	232726324	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	239548	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	232735038	232735290	232735230	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	230643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr1	234534667	234535013	234534780	Y	NA	RP5-827C21.1,RP5-827C21.4	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	27328	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	234559176	234559516	234559346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827C21.4	51837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	234648411	234648687	234648551	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	35562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	234658291	234658851	234658374	Y	NA	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	45442	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	234659231	234659760	234659519	Y	IRF2BP2	TARBP1	NA	NA	NA	NA	TARBP1	46382	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	234738546	234738834	234738624	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4437	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.6	78251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	234911340	234911676	234911469	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.6	81440	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	234914073	234914641	234914410	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.6	84173	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	235068890	235069050	235068971	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	LINC00184,IRF2BP2,TARBP1,LOC100506795,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-443B7.3	45501	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	235091073	235091332	235091158	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	23219	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	235097868	235098070	235097979	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	16481	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	235106929	235107153	235107059	Y	TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	7398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	235246558	235246857	235246620	Y	ARID4B,ARID4B	TOMM20	IRF2BP2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TOMM20	43394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	235484403	235484795	235484782	Y	NA	GGPS1,ARID4B,TBCE	NA	NA	NA	NA	GGPS1	3870	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	235644219	235644255	235644237	Y	NA	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	21526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	235668656	235669018	235668830	Y	RBM34,ARID4B,ARID4B	B3GALNT2	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	2875	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	235850857	235851038	235851012	Y	LYST,ARID4B	NA	NA	NA	NA	NA	B3GALNT2	185076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	236026992	236027471	236027217	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	17469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	236041479	236041632	236041556	Y	NA	LYST	LYST,GNG4,B3GALNT2,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	3308	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	236109486	236110063	236109737	Y	LYST	NA	LYST,NID1,GNG4,B3GALNT2	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	64546	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	236323296	236323699	236323519	Y	LYST,GPR137B,LGALS8	GPR137B	NA	NA	NA	NA	GPR137B	19464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	241771916	241772216	241772151	Y	KMO	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	25016	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	241781298	241781471	241781421	Y	NA	CHML	NA	NA	NA	NA	CHML	15761	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	241790752	241791037	241791008	Y	NA	CHML,OPN3	NA	NA	NA	NA	CHML	6195	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	243451071	243451374	243451087	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	33751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	243893800	243893985	243893919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	476480	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr1	243894639	243895081	243894755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	477319	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	401492	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	244532902	244533005	244532971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	80431	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	245080504	245080636	245080561	Y	C1orf101	NA	COX20,HNRNPU,SMYD3,EFCAB2,C1orf101,PPPDE1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EFCAB2	50371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	245939665	245940062	245939864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	728552	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	245971113	245971386	245971357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	697228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	246129057	246129404	246129358	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	539210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	246749077	246749442	246749258	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	21331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	247035132	247035504	247035470	Y	CNST,ZNF669,AHCTF1	NA	NA	NA	NA	NA	AHCTF1	57776	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	247315116	247315371	247315289	Y	OR2G2,OR2G3,ZNF496,ZNF695,ZNF670,ZNF669	ZNF669,MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	47991	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	247326566	247327229	247326989	Y	NA	MIR3916	NA	NA	NA	NA	MIR3916	36133	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr1	247553531	247554143	247553893	Y	AHCTF1,NLRP3,NLRP3	NLRP3	AHCTF1,ZNF496	IMR90	Hi-C	24141950	NLRP3	23315	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	247570274	247570994	247570679	Y	AHCTF1,NLRP3,NLRP3	NLRP3	NA	NA	NA	NA	NLRP3	6464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr1	247574986	247575390	247575076	Y	AHCTF1,NLRP3,NLRP3	NLRP3	NA	NA	NA	NA	NLRP3	2068	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	179287	179666	179475	Y	NA	ZMYND11	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	307117	307186	307176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYND11	128712	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	975785	976368	976035	Y	NA	LARP4B	DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LARP4B	221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	990446	990769	990623	Y	WDR37	LARP4B,AL359878.1,GTPBP4	LARP4B,DIP2C,GTPBP4,IDI2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	14882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	1352406	1352778	1352644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	258928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	3094057	3094288	3094153	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	12237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	3509617	3509911	3509759	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	296614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	3915881	3916422	3916098	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	90408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	4375242	4375466	4375255	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF6	549769	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	5334474	5334640	5334544	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	117874	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	5336164	5336286	5336241	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	116228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	6099241	6099508	6099389	Y	IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17	RBM17	NA	NA	NA	NA	RBM17	29442	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	6110274	6110558	6110524	Y	GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,IL2RA,RBM17,RBM17	RBM17	IL2RA,LOC399715,RBM17	IMR90	Hi-C	24141950	RBM17	18392	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	6193132	6193393	6193272	Y	GDI2,IL15RA,PFKFB3,PFKFB3	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	8251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	6245814	6246792	6246043	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	60933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	6516020	6516190	6516056	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	331139	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7226649	7227021	7226812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	224429	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7227327	7227801	7227548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	223649	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7228549	7229134	7228725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	222316	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7265730	7265927	7265829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	185523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7285969	7286078	7285998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	165372	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7356268	7356516	7356367	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	94934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7362038	7362350	7362337	Y	SFMBT2,SFMBT2	NA	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	89100	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr10	7449149	7449274	7449212	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	2176	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7449887	7450154	7450051	Y	TAF3,SFMBT2,SFMBT2	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	1296	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr10	7452405	7452746	7452437	Y	NA	SFMBT2	NA	NA	NA	NA	SFMBT2	955	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7459839	7460047	7459941	Y	SFMBT2,SFMBT2	SFMBT2	PRKCQ,LOC439949	IMR90	Hi-C	24141950	SFMBT2	8389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	7518032	7518150	7518125	Y	SFMBT2,SFMBT2	RP5-1031D4.2	NA	NA	NA	NA	RP5-1031D4.2	6128	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	7902237	7902611	7902424	Y	NA	TAF3	NA	NA	NA	NA	TAF3	43770	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	10839185	10839573	10839228	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	205686	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	11217991	11218170	11218104	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	172732	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	11220579	11221039	11220795	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	175320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr10	11222222	11222709	11222492	Y	CELF2	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	176963	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	11314930	11315156	11314933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	269671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	11983561	11983569	11983563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	99600	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	12195131	12195251	12195172	Y	CAMK1D	SEC61A2,CDC123,NUDT5	NA	NA	NA	NA	SEC61A2	25495	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	12503684	12504010	12503723	Y	CAMK1D	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK1D	114203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	14438165	14438288	14438234	Y	NA	NA	FRMD4A,MIR1265	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	63853	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	14641847	14641963	14641950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	139706	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	15158719	15159034	15158939	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	C10orf111	21401	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	16810720	16810994	16810786	Y	NA	RSU1	NA	NA	NA	NA	RSU1	46533	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	17017150	17017510	17017417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	159623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	17091174	17091427	17091362	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	150626	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	17467799	17468377	17468085	Y	STAM,ST8SIA6	ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	ST8SIA6	25952	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	20203114	20203263	20203197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	99946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	20450242	20450397	20450276	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	347074	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	21386477	21386751	21386615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	434343	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	22519481	22519667	22519580	Y	BMI1,EBLN1	NA	COMMD3-BMI1,PIP4K2A,ARMC3,DNAJC1,LOC100499489	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COMMD3	83236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	22569551	22569712	22569632	Y	NA	COMMD3,BMI1	ARMC3	IMR90	Hi-C	24141950	COMMD3	33191	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	22628998	22629520	22629110	Y	EBLN1	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	2879	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1,SPAG6	NA	NA	NA	NA	SPAG6	2418	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	22887940	22888243	22888209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	113241	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	23344774	23344811	23344800	Y	NA	MSRB2	NA	NA	NA	NA	MSRB2	37624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	23932138	23932217	23932193	Y	OTUD1	NA	NA	NA	NA	NA	MSRB2	549703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	25815030	25815346	25815189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THNSL1	511443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	27147453	27147834	27147772	Y	YME1L1,MASTL,ACBD5,APBB1IP,PDSS1,ABI1	ABI1	NA	NA	NA	NA	ABI1	182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	28622853	28623578	28623396	Y	NA	NA	MPP7	IMR90	Hi-C	24141950	WAC	195844	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	28725980	28726021	28726001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WAC	93401	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	29254247	29254334	29254291	Y	NA	NA	BAMBI,LYZL1	IMR90	Hi-C	24141950	BAMBI	289976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	30742798	30743130	30743073	Y	NA	MAP3K8	NA	NA	NA	NA	MAP3K8	21932	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	31205866	31205987	31205927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF438	112879	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	31284214	31284980	31284522	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	33886	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	31289701	31290078	31290005	Y	ZNF438,ZNF438	ZNF438	NA	NA	NA	NA	ZNF438	28788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	31986198	31986456	31986355	Y	NA	RP11-472N13.3	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-472N13.3	7860	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-472N13.3	54556	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	38264185	38264489	38264470	Y	ZNF37A,ZNF248,ZNF25	ZNF25,ZNF33A	NA	NA	NA	NA	ZNF25	624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	38490067	38490220	38490144	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF37A	108803	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	43422233	43422523	43422379	Y	NA	NA	RET	IMR90	Hi-C	24141950	BMS1	145984	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	43470671	43470827	43470727	Y	NA	NA	RET	MCF7	ChIA-PET	22265404	CSGALNACT2	161107	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF	NA	NA	NA	NA	HNRNPF	48279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	44046358	44046416	44046387	Y	NA	ZNF239	NA	NA	NA	NA	ZNF239	21650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	44185196	44185271	44185205	Y	NA	ZNF32	NA	NA	NA	NA	ZNF32	42892	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	45445885	45445945	45445917	Y	RASSF4	RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25	NA	NA	NA	NA	RASSF4	6910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	50008368	50008659	50008598	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY4	117447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	50342582	50342632	50342591	Y	LRRC18,FAM170B,C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf128	51998	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	50791340	50791620	50791497	Y	NA	PGBD3,ERCC6	NA	NA	NA	NA	ERCC6	45756	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	51515594	51515677	51515640	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2,NCOA4	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	14895	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	52217733	52218081	52217894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	164842	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	54454130	54454506	54454318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556E13.1	58663	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	54774491	54774616	54774570	Y	MBL2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-556E13.1	261322	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	60820571	60821075	60820826	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICC1	549671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	62096782	62097076	62096929	Y	ANK3	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	432368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	63859069	63859192	63859131	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	RTKN2	167274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	64300187	64300318	64300222	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	262198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	64449585	64449837	64449638	Y	NRBF2,EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	112679	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	64982889	64983009	64982950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	91839	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	65053315	65053443	65053389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELID1P3	131614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	65226977	65227255	65227116	Y	NA	PRELID1P3,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	3255	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	65282188	65282459	65282345	Y	JMJD1C,JMJD1C	REEP3	NA	NA	NA	NA	REEP3	3065	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	65388414	65388608	65388512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	109291	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	65793520	65793903	65793712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	132515	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	68690818	68690961	68690956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	904963	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	69466144	69466519	69466384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	129405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70804179	70804602	70804501	Y	DDX21,SRGN	SRGN	DDX21,KIAA1279,VPS26A,SRGN,HKDC1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	41260	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70815943	70816217	70816018	Y	DDX21,SRGN	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	29645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70817174	70817630	70817194	Y	NA	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	28232	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.82359077260307
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70832840	70833011	70832951	Y	DDX21,SRGN	SRGN,VPS26A	SRGN	K562	ChIA-PET	22265404	SRGN	12851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70849672	70851282	70850023	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN,VPS26A	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	3810	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	70884620	70884824	70884718	Y	DDX21,SUPV3L1,SRGN	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	VPS26A	3352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	71840822	71841222	71841056	Y	NA	H2AFY2,AIFM2	NA	NA	NA	NA	H2AFY2	30270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	72124245	72124646	72124446	Y	NA	EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	EIF4EBP2	37489	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC29A3	102766	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	73519261	73519537	73519421	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	11718	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	73529064	73529499	73529394	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	1756	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	73627974	73628371	73628194	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	C10orf54,CDH23,PSAP,SPOCK2,DNAJB12,CHST3,ASCC1,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	PSAP	18848	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	73722643	73722971	73722767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSAP	113517	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	74014911	74015029	74015003	Y	NA	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	16649	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	74032298	74032943	74032475	Y	NA	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	620	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	74063512	74063738	74063656	Y	NA	DDIT4,DNAJB12	ANAPC16,DDIT4	IMR90	Hi-C	24141950	DDIT4	31834	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	74091661	74092150	74091920	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DNAJB12	NA	NA	NA	NA	DNAJB12	20838	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	75666465	75666800	75666554	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	NA	NA	NA	NA	PLAU	135	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	76633406	76633470	76633438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	50066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	76682814	76683108	76682864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6B	99474	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	77290134	77290404	77290261	Y	SAMD8	NA	C10orf11	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf11	68594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	77548245	77548262	77548254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	189247	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	80943996	80944377	80944135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	117204	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	81006414	81006827	81006670	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	98398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	81179342	81179695	81179519	Y	NA	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	23688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	81864199	81864479	81864400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA11	98849	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	NA	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	WAPAL	119278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	89802399	89802689	89802412	Y	NA	NA	RNLS,CFL1P1,ATAD1,KLLN,PTEN,LIPF,LIPM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-380G5.3	99140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	89822298	89822728	89822336	Y	KLLN,PTEN	NA	RNLS,KLLN,PTEN	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	119039	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	90145688	90145942	90145819	Y	LIPK	NA	NA	NA	NA	NA	RNLS	196345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	90844295	90844413	90844369	Y	NA	NA	FAS,LIPA,CH25H	IMR90	Hi-C	24141950	FAS	95881	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	91056148	91056487	91056304	Y	FAS,IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT3	29164	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	91199827	91200195	91200013	Y	NA	IFIT1,LIPA	NA	NA	NA	NA	LIPA	27513	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	91462035	91462111	91462091	Y	NA	KIF20B	NA	NA	NA	NA	KIF20B	2668	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	93301292	93301692	93301492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNKS2	254377	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	98396181	98396533	98396373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	50972	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	98464941	98465141	98465037	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	13130	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	98468328	98468564	98468493	Y	LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1	PIK3AP1,RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	9707	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	98478120	98479023	98478503	Y	LCOR,TM9SF3,PIK3AP1	RPL13AP5	NA	NA	NA	NA	PIK3AP1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	98638142	98638499	98638253	Y	NA	LCOR	NA	NA	NA	NA	LCOR	48125	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	99173709	99174019	99173866	Y	FRAT1,ZFYVE27,RRP12	RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16	PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PGAM1	9898	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	101048499	101048591	101048547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT1	139790	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	101381465	101381554	101381515	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7	NA	NA	NA	NA	SLC25A28	3099	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	101417166	101417530	101417347	Y	NA	SLC25A28,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	102130336	102130669	102130535	Y	NA	SCD,LINC00263	NA	NA	NA	NA	LINC00263	703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	104545681	104545915	104545784	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	66065	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	104556220	104556459	104556323	Y	NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf32	55521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	104953975	104954222	104954115	Y	C10orf26,C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	2919	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	219421	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	105519063	105519154	105519109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OBFC1	156809	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	105681714	105681858	105681786	Y	NA	OBFC1,SLK	NA	NA	NA	NA	OBFC1	5751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	106105805	106105951	106105869	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,CCDC147	ITPRIP	ITPRIP	K562	ChIA-PET	22265404	ITPRIP	9643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	112117126	112117443	112117281	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	54417	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	112169656	112169922	112169805	Y	SMC3	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85674	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	112432258	112432673	112432308	Y	PDCD4	NA	PDCD4,LOC282997	IMR90	Hi-C	24141950	SMC3	106809	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	114144019	114144177	114144082	Y	VTI1A,ACSL5,ACSL5	ACSL5	NA	NA	NA	NA	ACSL5	12243	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	114594508	114594817	114594706	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	113192	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr10	115082665	115082909	115082839	Y	CASP7,TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	354033	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	119686098	119686357	119686270	Y	NA	NA	CASC2	IMR90	Hi-C	24141950	CASC2	117433	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	120997743	120998072	120997908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	61398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	121075171	121075335	121075278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX3	138826	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	121153244	121153752	121153743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS10	146468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	121544240	121544543	121544312	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	MCMBP	105525	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr10	123268724	123269025	123268893	Y	FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	377487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	125162240	125162434	125162321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BUB3	250447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	126329893	126330183	126330084	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	100655	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	126336359	126336702	126336537	Y	CHST15,ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	94136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	126339460	126339914	126339618	Y	ZRANB1,FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	90924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	126349618	126349650	126349637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	81188	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	126490996	126491131	126491100	Y	NA	METTL10,FAM175B	NA	NA	NA	NA	FAM175B	2642	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	126811654	126811843	126811733	Y	NA	CTBP2,MRPS21P6	ZRANB1	IMR90	Hi-C	24141950	CTBP2	35896	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	127535706	127535819	127535763	Y	MMP21	UROS,BCCIP,DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	BCCIP	25591	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	127574091	127574564	127574346	Y	NA	DHX32,FANK1	NA	NA	NA	NA	DHX32	8441	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	127813462	127813834	127813648	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	FANK1	230354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	129893841	129894010	129893942	Y	NA	MKI67	NA	NA	NA	NA	MKI67	28639	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	131436691	131436981	131436883	Y	MGMT	NA	NA	NA	NA	NA	MGMT	173243	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	133575509	133575820	133575665	Y	NA	NA	TCERG1L	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	217615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	133836748	133836839	133836756	Y	STK32C,DPYSL4,JAKMIP3	BNIP3	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	43313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134234707	134235257	134234764	Y	STK32C,PWWP2B	PWWP2B,C10orf91	C10orf91	IMR90	Hi-C	24141950	C10orf91	20574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134260341	134260546	134260485	Y	C10orf91	C10orf91	NA	NA	NA	NA	C10orf91	4510	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	134360968	134361428	134361255	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	11644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr10	134364689	134365427	134365071	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	15365	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr10	134369255	134369540	134369399	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	19931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134388737	134389185	134389009	Y	PWWP2B,INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	39413	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134399818	134400353	134400054	Y	PWWP2B	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	50494	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134401859	134402261	134402219	Y	PWWP2B,INPP5A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	52535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	134826942	134827305	134827042	Y	NA	NA	LOC399829,INPP5A	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM8	261067	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr10	135048867	135049308	135048949	Y	TUBGCP2,ADAM8	ADAM8	NA	NA	NA	NA	ADAM8	39064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	6.84564192602769
chr10	135342737	135342867	135342819	Y	KNDC1,PRAP1,C10orf125,ECHS1,CYP2E1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-108K14.4	77305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr11	268826	269269	268945	Y	TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1	PSMD13,SIRT3,NLRP6,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1	NA	NA	NA	NA	NLRP6	7096	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	350841	351091	350968	Y	NA	IFITM2,IFITM1,IFITM3	SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM3	25304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM1,IFITM3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM3	30340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	2468354	2468468	2468407	Y	C11orf21,TSPAN32,TSSC4,KCNQ1	TSSC4,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1	4440	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	2655024	2655339	2655183	Y	TRPM5,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	63885	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	2799950	2800256	2800114	Y	KCNQ1,CDKN1C	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	80726	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	2844154	2844443	2844383	Y	TSSC4,KCNQ1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1C	60668	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	3035655	3035952	3035816	Y	MRGPRG	NAP1L4,RNU1-91P,CARS	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	24048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	3175519	3175620	3175572	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	10349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	3177599	3178263	3177693	Y	NA	OSBPL5	NA	NA	NA	NA	OSBPL5	7706	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	3443739	3443990	3443855	Y	NA	ZNF195	NA	NA	NA	NA	ZNF195	45291	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	3860220	3860837	3860518	Y	NA	PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1,AC090587.4	NA	NA	NA	NA	RHOG	7	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	4232015	4232345	4232181	Y	OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1	NA	OR52M1,TRIM68,OR52I1	IMR90	Hi-C	24141950	RRM1	118078	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	6435035	6435285	6435179	Y	NA	SMPD1,APBB1	NA	NA	NA	NA	APBB1	3359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	6564206	6564247	6564227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP8	58603	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	MRPL17,GVINP1	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	NA	NA	NA	NA	NA	RPL27A	94180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	8834179	8834314	8834219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKIP1	96372	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	8944739	8945112	8945060	Y	ASCL3	AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B	NA	NA	NA	NA	AKIP1	14053	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	9023312	9023663	9023569	Y	ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3	TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2	NA	NA	NA	NA	NRIP3	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr11	9623030	9623285	9623166	Y	ZNF143,WEE1,WEE1	WEE1	NA	NA	NA	NA	WEE1	29802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	10347188	10347587	10347388	Y	ADM	SBF2,ADM	NA	NA	NA	NA	ADM	22961	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	10541440	10541628	10541530	Y	AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5	MTRNR2L8,RNF141	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L8	12717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	10862862	10862982	10862965	Y	NA	SNORD97,EIF4G2,ZBED5	NA	NA	NA	NA	ZBED5	15361	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	11864878	11865300	11864975	Y	NA	USP47	NA	NA	NA	NA	USP47	3908	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	12063877	12064119	12063998	Y	NA	MICAL2	DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	49424	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	12218036	12218499	12218053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	104493	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	13113120	13113298	13113209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNTL	182901	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	14563953	14564333	14564143	Y	NA	COPB1,PSMA1	NA	NA	NA	NA	PSMA1	24063	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	14874249	14874576	14874405	Y	CYP2R1	CYP2R1	NA	NA	NA	NA	CYP2R1	37222	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	16457424	16457760	16457639	Y	SOX6,SOX6,SOX6	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	174919	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	16927528	16927547	16927538	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-466H18.1	67013	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	17307346	17307410	17307378	Y	NA	NA	B7H6	IMR90	Hi-C	24141950	NUCB2	79646	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	18405328	18405801	18405464	Y	HPS5,TSG101,SPTY2D1	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8134	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	23658000	23658323	23658162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVIP	808155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	32915475	32916456	32915913	Y	NA	QSER1	NA	NA	NA	NA	QSER1	2751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	33209856	33210115	33209986	Y	NA	CSTF3	NA	NA	NA	NA	CSTF3	27939	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	33933945	33934087	33934016	Y	LMO2,LMO2	LMO2	NA	NA	NA	NA	LMO2	22109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35058254	35058670	35058444	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	99747	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35061713	35062540	35061871	Y	CD44	NA	CD44,SLC1A2,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	95877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	52906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	35109319	35109885	35109545	Y	CD44	CD44	CD44,PDHX,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	48532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35257615	35257771	35257693	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	99198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35261158	35261193	35261191	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	102741	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	35309902	35310085	35310021	Y	CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CD44	151485	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	36331203	36331536	36331365	Y	PRR5L	COMMD9,PRR5L	NA	NA	NA	NA	PRR5L	15365	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	40172483	40172568	40172526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1385416	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	40472791	40472955	40472873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1085029	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	42075853	42076183	42076170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	517869	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	45067583	45067753	45067679	Y	CD82	NA	SYT13,LOC221122,TP53I11,PRDM11,TSPAN18,CHST1	IMR90	Hi-C	24141950	TP53I11	96743	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	46143609	46143973	46143928	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	2624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	NA	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	93222	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	NA	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DGKZ	87257	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	46357390	46357755	46357681	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	DGKZ	4935	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	46379063	46379180	46379102	Y	NA	DGKZ,MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	21126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	46706691	46706778	46706735	Y	NA	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ARHGAP1	13387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	46753121	46753488	46753304	Y	F2	ARHGAP1,ZNF408	NA	NA	NA	NA	ZNF408	32753	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	47168963	47169205	47169084	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	27471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	47414531	47414922	47414826	Y	MADD,MADD,MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	11761	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	47414965	47416043	47415133	Y	MADD,MADD,MADD,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SPI1,SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3	SPI1,SLC39A13	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A13	10640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	47787265	47787534	47787400	Y	SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	47939528	47939960	47939626	Y	OR4B1,OR4S1,NUP160	RP11-793I11.1	PTPRJ,NUP160	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-793I11.1	14369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	57559748	57559971	57559868	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf31	52923	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	59524471	59524655	59524596	Y	MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3	STX3	NA	NA	NA	NA	STX3	45542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	59868075	59868428	59868178	Y	MRPL16,MS4A3	MS4A3	NA	NA	NA	NA	MS4A3	46015	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	59941256	59941428	59941364	Y	NA	MS4A6A	NA	NA	NA	NA	MS4A6A	8711	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	59941614	59941716	59941665	Y	MS4A7,MS4A4A,MS4A6A,MS4A6A	MS4A6A	NA	NA	NA	NA	MS4A6A	8423	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	60677775	60678061	60677859	Y	VPS37C,CYBASC3	PRPF19,TMEM109,SLC15A3	NA	NA	NA	NA	TMEM109	1285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	60843253	60843606	60843384	Y	SLC15A3,TMEM138	NA	CD5	IMR90	Hi-C	24141950	VPS37C	83483	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	60934770	60935212	60935096	Y	SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C	VPS37C	VPS37C	K562	ChIA-PET	22265404	VPS37C	7681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	61266317	61266637	61266368	Y	LRRC10B	LRRC10B	NA	NA	NA	NA	LRRC10B	7635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	61394263	61394463	61394368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	51442	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	61484059	61484366	61484213	Y	CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,DAGLA,FTH1	DAGLA	NA	NA	NA	NA	DAGLA	38154	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	61602064	61602538	61602257	Y	INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1	FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1	NA	NA	NA	NA	FADS1	7274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	62587560	62587930	62587905	Y	NA	TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	STX5	9630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	62624183	62624258	62624224	Y	NA	STX5,WDR74,SNHG1,SLC3A2	NA	NA	NA	NA	SLC3A2	2665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	NA	NA	NA	NA	NA	LGALS12	62962	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	63775286	63775368	63775342	Y	KCNK4	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	23961	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	63795964	63796221	63796065	Y	NA	OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	44639	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.82359077260307
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	64267191	64267548	64267420	Y	RASGRP2	NA	NRXN2,RASGRP2,PYGM,SLC22A12	IMR90	Hi-C	24141950	AP003774.6	105888	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	64320859	64321220	64321040	Y	C11orf85	NA	SLC22A12,NRXN2	IMR90	Hi-C	24141950	AP003774.6	159556	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	20.0479513547954
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr11	65852297	65852657	65852298	Y	TMEM151A,CNIH2	SF3B2,PACS1	NA	NA	NA	NA	PACS1	16463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	67037275	67037527	67037373	Y	TBC1D10C,RAD9A,PITPNM1,KDM2A,ADRBK1,ANKRD13D	ADRBK1,ANKRD13D,SSH3	NA	NA	NA	NA	ADRBK1	5394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	68147876	68148306	68148095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRP5	69799	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	68596165	68596440	68596230	Y	MTL5,CPT1A	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	13438	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	68596704	68596832	68596771	Y	CPT1A	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	13046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	68623126	68623609	68623402	Y	MTL5,CPT1A	CPT1A,MRPL21,IGHMBP2	CPT1A,PPP6R3,MTL5,TPCN2,MRPL21,IGHMBP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CPT1A	13248	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	68808319	68808729	68808592	Y	IGHMBP2,TPCN2	TPCN2	MTL5,CPT1A,IGHMBP2,MRPL21,MRGPRD,MRGPRF,TPCN2,CCND1,ORAOV1	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	5636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	68921150	68921435	68921292	Y	NA	NA	ORAOV1,CCND1,FGF19	IMR90	Hi-C	24141950	TPCN2	106785	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	69197125	69197542	69197234	Y	ORAOV1,MYEOV	NA	MYEOV,CCND1	IMR90	Hi-C	24141950	IFITM9P	127851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	NA	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFITM9P	188820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	70748291	70748347	70748332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-660L16.2	409373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	71650610	71650763	71650692	Y	NA	RP11-849H4.2,RNF121	NUMA1,IL18BP	IMR90	Hi-C	24141950	RNF121	12863	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	71702677	71703050	71702869	Y	FOLR3,IL18BP,IL18BP	IL18BP	NA	NA	NA	NA	IL18BP	4537	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	71936800	71937067	71937009	Y	INPPL1	INPPL1	NA	NA	NA	NA	INPPL1	4055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	71990969	71991411	71991180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPPL1	58224	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	72452508	72452870	72452656	Y	STARD10,ATG16L2,ARAP1	ARAP1,STARD10	NA	NA	NA	NA	ARAP1	49774	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr11	72865306	72865721	72865402	Y	FCHSD2	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	14000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	72915825	72916228	72915957	Y	NA	P2RY2	FCHSD2,ATG16L2,P2RY6,ARAP1,RELT	IMR90	Hi-C	24141950	P2RY2	11115	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	73088357	73088912	73088439	Y	NA	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	3048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	73097153	73097443	73097265	Y	FCHSD2,P2RY2,P2RY2,RELT,RELT	RELT	NA	NA	NA	NA	RELT	11844	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	73490242	73490316	73490279	Y	NA	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	6045	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	73706184	73706513	73706422	Y	LIPT2,C2CD3,UCP2	UCP2	UCP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UCP2	13832	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	73729347	73729733	73729506	Y	NA	UCP2	NA	NA	NA	NA	UCP2	36995	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	74534779	74535147	74534795	Y	XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	RNF169	76866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	75061558	75062072	75061823	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	75080203	75080380	75080292	Y	ARRB1	ARRB1,RPS3,SNORD15B	RPS3,ARRB1,GDPD5,XRRA1,NEU3,SPCS2,SLCO2B1,LOC100507050,KLHL35,SERPINH1,MAP6	IMR90	Hi-C	24141950	ARRB1	19330	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	75781411	75781582	75781473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UVRAG	257199	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	76991897	76991950	76991949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1	191730	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	78002337	78002637	78002489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	104469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	78003105	78003596	78003355	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	105237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr11	78051625	78051814	78051807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	75580	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	78061236	78062132	78061949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	65262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	78298750	78298870	78298801	Y	NA	NARS2	NA	NA	NA	NA	NARS2	14831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	81299469	81299692	81299581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1098879	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	83264586	83264960	83264849	Y	DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	269136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	83668458	83668564	83668511	Y	DLG2,DLG2,DLG2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	673008	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	84179043	84179442	84179368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM126B	1158187	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	85702937	85703343	85703240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PICALM	75581	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	85862564	85862776	85862631	Y	NA	NA	PICALM,EED,CCDC83	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PICALM	83640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	NA	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ME3	69910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	94315162	94315340	94315237	Y	NA	FUT4	NA	NA	NA	NA	FUT4	40145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	94317425	94317695	94317494	Y	PANX1,ANKRD49,FUT4	FUT4	NA	NA	NA	NA	FUT4	42408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	95886290	95886343	95886317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR2	229811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	95888692	95889856	95889448	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC82	231231	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	105052298	105052756	105052424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	82140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	105061488	105061502	105061495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CARD16,CASP1	91330	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	107187292	107187599	107187573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWF19L2	138973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	109948670	109948938	109948846	Y	ZC3H12C	NA	ZC3H12C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RDX	216509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	113020811	113021147	113020979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-839D17.3	162012	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	113945404	113945849	113945581	Y	ZBTB16,ZBTB16	ZBTB16	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	17089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	114039430	114039671	114039576	Y	CLDN25,ZBTB16	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB16	111115	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	115632209	115632334	115632272	Y	NA	LINC00900	NA	NA	NA	NA	LINC00900	2864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	115927374	115927450	115927387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00900	298029	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	115945238	115945510	115945465	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00900	315893	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	116790672	116791048	116790863	Y	NA	NA	APOA4,APOA1,APOC3	IMR90	Hi-C	24141950	AP000936.1	113719	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	116802235	116802679	116802498	Y	SIK3,PCSK7	NA	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	102088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	116864339	116864649	116864442	Y	SIK3,PCSK7	AP000936.1	NA	NA	NA	NA	AP000936.1	40118	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	117848150	117848364	117848289	Y	NA	IL10RA	FXYD6-FXYD2,IL10RA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IL10RA	6699	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46	NA	NA	NA	NA	IFT46	48483	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	118763139	118763505	118763387	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	30812	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	119242685	119242777	119242731	Y	NA	RNF26,USP2	NA	NA	NA	NA	USP2	7659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	NA	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	PVRL1	142361	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	120078906	120079218	120079100	Y	NA	OAF	LOC100499227,TMEM136,POU2F3	IMR90	Hi-C	24141950	OAF	257	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	122608190	122608588	122608260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	83807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	123002865	123003144	123002952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA8	70927	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	124940571	124941111	124940841	Y	TBRG1,SLC37A2	SLC37A2,TMEM218	NA	NA	NA	NA	SLC37A2	9608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	124942192	124942648	124942569	Y	TBRG1,SLC37A2	SLC37A2,TMEM218	NA	NA	NA	NA	SLC37A2	11229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr11	126181564	126181596	126181580	Y	SRPR	FOXRED1,SRPR,TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	9351	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	126191145	126191518	126191332	Y	NA	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	18932	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	128604470	128604603	128604537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLI1	50040	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	129239352	129239433	129239393	Y	NA	NA	TMEM45B	IMR90	Hi-C	24141950	NFRKB	524052	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	129695386	129695610	129695527	Y	APLP2	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	67875	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	129920255	129920483	129920343	Y	APLP2	PRDM10,TCEB2P2,APLP2	APLP2,PRDM10,NFRKB,LINC00167,ST14	IMR90	Hi-C	24141950	APLP2	17249	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	130743628	130743895	130743754	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	40509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	131928107	131928500	131928434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1143703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr11	133620300	133620334	133620319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS26B	472205	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	811160	811375	811316	Y	RAD52,SLC6A12,NINJ2,WNK1	NINJ2,WNK1	NINJ2,WNK1,B4GALNT3	IMR90	Hi-C	24141950	NINJ2	40215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	2403977	2404382	2404036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	292276	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	4380607	4381576	4381205	Y	PARP11,CCND2	C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	4543974	4544184	4544124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf4	101490	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr12	6105913	6105932	6105923	Y	VWF	NA	NA	NA	NA	NA	CD9	200949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6250118	6250545	6250361	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL,IFFO1,CHD4	NA	VWF,CD9	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	56336	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6339954	6340271	6340062	Y	VAMP1,TAPBPL,IFFO1	CD9	NA	NA	NA	NA	CD9	33073	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6717352	6717716	6717682	Y	SCNN1A,SCNN1A,PTPN6,LRRC23,ATN1,CHD4,ACRBP	NOP2,CHD4,ACRBP	NA	NA	NA	NA	CHD4	2710	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6721904	6722326	6722186	Y	GPR162,ENO2,C12orf53	NOP2,CHD4,ACRBP,ING4	NA	NA	NA	NA	CHD4	7262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	6901890	6902092	6902006	Y	TAPBPL,IFFO1,CHD4,ING4,ZNF384,ZNF384,PTPN6,CD4,CD4	PTMS,MLF2,CD4,GPR162	NA	NA	NA	NA	CD4	7866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	9803369	9803672	9803507	Y	KLRF1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	CLEC2D	NA	NA	NA	NA	CLEC2D	11893	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	9804148	9804385	9804240	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	CLEC2D	NA	NA	NA	NA	CLEC2D	11180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11721730	11722060	11721927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	78728	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11806275	11806670	11806607	Y	BCL2L14,ETV6	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	5487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11867581	11867722	11867638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	66793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11872628	11873141	11872822	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	71840	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	11887448	11887775	11887612	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	86660	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11902953	11903896	11903427	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	102165	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	11908291	11908514	11908403	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	107503	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11918792	11919487	11919193	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118004	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11919566	11919967	11919675	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	118778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr12	11926847	11927297	11927011	Y	BCL2L14,ETV6	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	126059	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11962012	11962232	11962094	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	161224	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11966137	11966507	11966203	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	165349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	11975144	11975300	11975239	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	174356	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	12133089	12133303	12133196	Y	ETV6,BCL2L14	NA	LOC338817,ETV6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	128794	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	12883612	12883681	12883638	Y	APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	17620	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr12	14417881	14418036	14417969	Y	PLBD1	NA	ATF7IP	IMR90	Hi-C	24141950	ATF7IP	98574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	14426966	14427222	14427069	Y	PLBD1,ATF7IP	NA	NA	NA	NA	NA	ATF7IP	89388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	15105208	15105676	15105381	Y	WBP11,ARHGDIB	ARHGDIB	NA	NA	NA	NA	ARHGDIB	6986	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	15427530	15427814	15427672	Y	NA	NA	PTPRO,RERG	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGDIB	314868	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	15853599	15853765	15853693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPS8	179498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	19343816	19343915	19343891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	63168	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	24396980	24397002	24396991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00477	338100	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	24673435	24673806	24673663	Y	SOX5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00477	61296	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	24861116	24861185	24861165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00477	126014	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	136520	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.82359077260307
chr12	25539458	25539791	25539651	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137588	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPR2	716320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	27613510	27613909	27613776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	60455	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	29317763	29317994	29317897	Y	NA	FAR2	NA	NA	NA	NA	FAR2	17727	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	31523025	31523181	31523129	Y	METTL20,FAM60A,FAM60A	FAM60A	NA	NA	NA	NA	FAM60A	45033	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	31985707	31986073	31985876	Y	AMN1,H3F3C	H3F3C	NA	NA	NA	NA	H3F3C	42532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	32635235	32635487	32635321	Y	NA	NA	FGD4	IMR90	Hi-C	24141950	DNM1L	194647	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	39104065	39104215	39104143	Y	CPNE8	NA	NA	NA	NA	NA	CPNE8	195017	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC2A13	114897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	42470575	42470704	42470641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GXYLT1	65977	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	47033293	47033660	47033445	Y	NA	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	257831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	47058276	47058667	47058611	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	282814	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	48053201	48053247	48053224	Y	ASB8	RPAP3,RP1-197B17.3	NA	NA	NA	NA	RPAP3	44597	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	48282882	48283045	48282955	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	NA	NA	NA	NA	NA	VDR	51786	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	48297772	48297979	48297886	Y	ZNF641,ZNF641,ASB8,VDR	VDR	NA	NA	NA	NA	VDR	36852	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	50460197	50460562	50460363	Y	NA	RACGAP1,SMARCD1	NA	NA	NA	NA	SMARCD1	16193	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	50899744	50900179	50899947	Y	DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	2976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	50911573	50911988	50911666	Y	SLC11A2,DIP2B	DIP2B	NA	NA	NA	NA	DIP2B	14805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	51235731	51235791	51235761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL7A	79464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	51720540	51720949	51720738	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,DAZAP2,GALNT6	BIN2	NA	NA	NA	NA	BIN2	4088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	51885274	51885441	51885406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT6	100623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf44	135746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	110563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	53281915	53282052	53282044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	58603	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	53336677	53336830	53336786	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	3825	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	53765037	53765535	53765115	Y	CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13	AAAS,SP1	SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SP1	6425	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	54198975	54199124	54199050	Y	NA	NA	HOXC12,HOXC13,SMUG1,HOTAIR,HOXC11,HOXC8,HOXC9,MIR196A2,HOXC10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CALCOCO1	79446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	54698103	54698502	54698288	Y	NFE2,NFE2	CBX5,HNRNPA1,NFE2,COPZ1	NA	NA	NA	NA	COPZ1	5117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	GPR84,ZNF385A,ITGA5	NA	NA	NA	NA	ZNF385A	5713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	ZNF385A	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	54949338	54949510	54949424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP1L	59843	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	56036628	56036862	56036687	Y	NA	METTL7B	NA	NA	NA	NA	METTL7B	36468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	56218960	56219310	56218990	Y	OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14	NA	NA	NA	NA	TMEM198B	2219	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	56752579	56752932	56752841	Y	ZC3H10,RNF41,RNF41,STAT2,IL23A	CNPY2,PAN2,STAT2	NA	NA	NA	NA	STAT2	640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	56831514	56831759	56831654	Y	IKZF4	TIMELESS,SPRYD4	NA	NA	NA	NA	TIMELESS	9428	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	57026164	57026397	57026368	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	2203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr12	57077806	57078249	57078184	Y	COQ10A,PAN2,PAN2	BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA	NA	NA	NA	NA	PTGES3	1910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	57751585	57751906	57751872	Y	R3HDM2	NA	INHBC	IMR90	Hi-C	24141950	R3HDM2	70882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	57812894	57812946	57812929	Y	NA	R3HDM2,INHBE	NA	NA	NA	NA	R3HDM2	9842	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	58168960	58169095	58169042	Y	TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM	TSPAN31,AGAP2,MARCH9,CDK4,METTL21B,METTL1,TSFM	NA	NA	NA	NA	METTL1	4384	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	NA	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	58349067	58349080	58349075	Y	XRCC6BP1	RP11-620J15.3,XRCC6BP1	NA	NA	NA	NA	XRCC6BP1	15743	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	62727827	62728150	62727887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM19A2	56896	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	64546689	64546709	64546700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	67367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	65012959	65013250	65013088	Y	TBK1,RASSF3,GNS	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	10666	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	65063507	65064284	65063678	Y	C12orf66,TBK1,RASSF3,LEMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF3	61214	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	65262498	65262651	65262575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D30	89909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	65926688	65927190	65926918	Y	NA	NA	MSRB3,HMGA2,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD3	365337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	69180946	69181662	69181342	Y	NA	SLC35E3,MDM2	SLC35E3	IMR90	Hi-C	24141950	MDM2	18294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	69227269	69227544	69227345	Y	SLC35E3	MDM2	NA	NA	NA	NA	MDM2	27313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	69305634	69305702	69305668	Y	RAP1B,LYZ,CPM,CPM	NA	NA	NA	NA	NA	CPM	57648	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	69316243	69316419	69316405	Y	RAP1B,CPM,CPM	CPM	NA	NA	NA	NA	CPM	46931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	69512658	69512870	69512855	Y	NA	NA	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPSF6	118447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	70630767	70631060	70630914	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	3714	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	70634012	70634396	70634290	Y	RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	378	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	70650618	70650832	70650694	Y	NA	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-611E13.2	15478	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	72946616	72946959	72946788	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D15	715129	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	76497491	76497684	76497588	Y	NA	NAP1L1	OSBPL8,KRR1,NAP1L1,BBS10	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L1	20678	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	77771188	77771377	77771281	Y	CSRP2	NA	NA	NA	NA	NA	E2F7	313828	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	80219716	80220141	80220058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R12A	107099	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	89740427	89740813	89740638	Y	POC1B,ATP2B1,DUSP6	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	4235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	89978345	89978700	89978451	Y	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT4	60306	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	90256648	90256905	90256732	Y	POC1B,POC1B,ATP2B1	NA	LOC338758	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	155571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	90354567	90354976	90354683	Y	POC1B,ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	253490	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	93321551	93321826	93321626	Y	EEA1	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	93757893	93758168	93758031	Y	NA	NUDT4	NA	NA	NA	NA	NUDT4	11491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	94153192	94153314	94153253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	84041	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	94201755	94201874	94201816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	132604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	96685157	96685428	96685293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	98997	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	CDK17	26793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	98833710	98834204	98834052	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	23894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	102257924	102257947	102257936	Y	DRAM1	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	35208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	102909608	102909974	102909790	Y	PAH	IGF1	NA	NA	NA	NA	IGF1	37185	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	105020354	105020448	105020373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	173281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	105042709	105042954	105042777	Y	CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	195636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	105062941	105063154	105062961	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	215868	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	105101205	105101513	105101338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST11	254132	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	105114255	105114695	105114403	Y	EID3,CHST11,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf45	263393	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	105477471	105477556	105477526	Y	ALDH1L2	ALDH1L2,KIAA1033	NA	NA	NA	NA	ALDH1L2	1116	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	106682328	106682503	106682422	Y	NA	TCP11L2,CKAP4	CKAP4,NUAK1,TCP11L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TCP11L2	11204	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	107153976	107154194	107154103	Y	RFX4,RIC8B	RIC8B	NA	NA	NA	NA	RIC8B	12179	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr12	107856980	107857227	107857220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD11	146790	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	108520922	108521230	108521111	Y	NA	NA	WSCD2	K562	ChIA-PET	22265404	PRDM4	367873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	108783050	108783376	108783111	Y	NA	NA	WSCD2,CMKLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FICD	123586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	108877904	108878160	108878033	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	FICD	NA	NA	NA	NA	FICD	28802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	108994702	108995211	108994982	Y	NA	SART3,ISCU,SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	30524	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	1724	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	109061186	109061401	109061295	Y	SELPLG,SELPLG,SSH1	SELPLG	NA	NA	NA	NA	SELPLG	35451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	109083720	109083964	109083780	Y	SSH1	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	39408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	109570576	109570747	109570637	Y	ACACB	ALKBH2,UNG,RP11-968O1.5	NA	NA	NA	NA	RP11-968O1.5	23553	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	110517321	110517546	110517448	Y	ARPC3	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	7830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	110517549	110517856	110517740	Y	GIT2,RAD9B,C12orf76	C12orf76,IFT81	C12orf76	K562	ChIA-PET	22265404	C12orf76	8058	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	111043428	111043840	111043517	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1,HVCN1	PPTC7,TCTN1	GPN3,FAM216A,RAD9B,PPTC7,C12orf76,TCTN1,ARPC3,VPS29,HVCN1,PPP1CC	IMR90	Hi-C	24141950	TCTN1	5992	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	111328232	111328601	111328417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CC	149488	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	111866764	111867021	111866784	Y	ALDH2,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	25012	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	111875686	111876044	111875771	Y	BRAP,SH2B3	SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	33934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	112341708	112342051	112341878	Y	ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK5	63926	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	112759768	112760224	112759930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN11	93931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	112809864	112809925	112809895	Y	C12orf51	PTPN11,RPL6	NA	NA	NA	NA	PTPN11	44230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	113660919	113661318	113661188	Y	TPCN1	DDX54,TPCN1,IQCD	NA	NA	NA	NA	IQCD	4020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	114029271	114029455	114029396	Y	LHX5	NA	RBM19	IMR90	Hi-C	24141950	SDSL	171229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	116561417	116561596	116561452	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	151547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	116602727	116603094	116602910	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	110049	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	116762641	116762780	116762710	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	MED13L,MIR4472-2,LINC00173,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	49498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	117100450	117100717	117100699	Y	NA	RP11-497G19.1	MED13L,LINC00173,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-497G19.1	3063	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	12.2243605821923
chr12	118012695	118013095	118012896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO21	386359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	118497859	118498236	118498048	Y	NA	RFC5	NA	NA	NA	NA	WSB2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	120080327	120080462	120080395	Y	TMEM233	PRKAB1,RP11-768F21.1	NA	NA	NA	NA	PRKAB1	23096	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr12	121322345	121322363	121322358	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	17811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	122227826	122228273	122227974	Y	CAMKK2,KDM2B,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11036	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	122771781	122771848	122771815	Y	NA	VPS33A	NA	NA	NA	NA	VPS33A	22713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	123930588	123930862	123930771	Y	RILPL2	RILPL2,SNRNP35	SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNRNP35	9326	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	124951666	124951729	124951686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	98406	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125066562	125066782	125066660	Y	FAM101A	NCOR2	NCOR2,SCARB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NCOR2	16427	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125347630	125347766	125347649	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	17448	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125353523	125353887	125353860	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	SCARB1	11327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	125403508	125403991	125403767	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	3594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125412421	125412524	125412468	Y	NA	SCARB1,UBC	NA	NA	NA	NA	UBC	12507	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125424077	125424667	125424516	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	24163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	125534116	125534467	125534247	Y	NA	AACS	AACS	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AACS	13458	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	125940224	125940232	125940227	Y	TMEM132B	NA	NA	NA	NA	NA	AACS	392299	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	128442219	128442237	128442228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	793547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	132232542	132232780	132232661	Y	DDX51	SFSWAP	NA	NA	NA	NA	SFSWAP	38916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	133016189	133016370	133016267	Y	FBRSL1	MUC8,FBRSL1	GALNT9,EP400NL,POLE,P2RX2	IMR90	Hi-C	24141950	MUC8	32356	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr12	133021534	133022956	133022670	Y	POLE,DDX51,FBRSL1	MUC8,FBRSL1	LOC100507055,FBRSL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MUC8	25770	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr12	133602699	133602978	133602704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF140	51446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	ZMYM2	113459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	22135396	22135683	22135678	Y	EFHA1	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P10	65471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	22688764	22689136	22688963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGF9	445242	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	NA	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	SACS	125681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	24845538	24846279	24845979	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	238669	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	24854044	24854200	24854080	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	230748	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	26760531	26760858	26760712	Y	WASF3	RNF6	WASF3,RNF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNF6	33933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	28010544	28010826	28010685	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	11913	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	28534904	28535178	28535096	Y	LNX2,FLT3,PRHOXNB	NA	NA	NA	NA	NA	FLT3	137551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	28590066	28590364	28590253	Y	FLT3	NA	NA	NA	NA	NA	FLT3	82365	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	28615672	28615941	28615791	Y	PAN3	NA	NA	NA	NA	NA	FLT3	56788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	28621846	28622161	28622004	Y	FLT3	NA	NA	NA	NA	NA	FLT3	50568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	28672949	28673159	28673054	Y	FLT3	FLT3,PAN3-AS1,PAN3	NA	NA	NA	NA	FLT3	220	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr13	28762730	28762825	28762778	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	23825	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	28787263	28787277	28787270	Y	NA	EEF1A1P3	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P3	613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	30969684	30969817	30969776	Y	USPL1	NA	LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1	IMR90	Hi-C	24141950	KATNAL1	90063	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	31264554	31264674	31264586	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	ALOX5AP	HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX5AP	42971	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	31583300	31583599	31583486	Y	NA	NA	USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP	IMR90	Hi-C	24141950	HSPH1	150926	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	32689338	32689467	32689381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	85901	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	32691995	32692202	32692106	Y	N4BP2L2,N4BP2L2,N4BP2L1,BRCA2	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	88558	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr13	33758061	33758236	33758137	Y	STARD13	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5B	599497	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	34083894	34084135	34084032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	306051	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	34116442	34117241	34116673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	272945	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr13	36992146	36992544	36992307	Y	SPG20,SPG20	SPG20,CCNA1	NA	NA	NA	NA	CCNA1	11423	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	41468341	41468634	41468483	Y	NA	SUGT1P3	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	25276	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	41519573	41519973	41519773	Y	NA	SUGT1P3	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	25663	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	41554566	41554842	41554704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1P3	60656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	41581586	41581700	41581679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBP4	51710	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	41591294	41591779	41591504	Y	C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1	WBP4,ELF1	NA	NA	NA	NA	WBP4	41631	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	42370920	42370928	42370925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	473361	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	42849254	42849451	42849396	Y	TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11	AKAP11	NA	NA	NA	NA	AKAP11	4965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	43382131	43382356	43382244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	182051	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	43467454	43467751	43467677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	96656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	43662550	43662935	43662749	Y	EPSTI1	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC15	67211	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	44237239	44237376	44237308	Y	ENOX1,ENOX1	NA	NA	NA	NA	NA	LACC1	214044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	44542732	44543742	44543446	Y	SERP2	NA	SERP2	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC122	90905	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	44833229	44833563	44833337	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	315720	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	46095529	46095772	46095647	Y	TPT1	NA	NA	NA	NA	NA	COG3	58469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	46557145	46557532	46557508	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H13	67362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	46744966	46745134	46745049	Y	ZC3H13,C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	38872	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	46747616	46748160	46748034	Y	C13orf18,LCP1	LCP1,LRRC63	NA	NA	NA	NA	LCP1	35846	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4P3	128842	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	49074869	49075392	49075112	Y	FNDC3A,RB1,LPAR6,RCBTB2	RCBTB2	NA	NA	NA	NA	RCBTB2	29977	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	49288768	49288781	49288774	Y	NA	CYSLTR2	NA	NA	NA	NA	CYSLTR2	9817	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	50216185	50216584	50216280	Y	CAB39L,SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	ARL11,EBPL	NA	NA	NA	NA	ARL11	15750	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	50217217	50217337	50217325	Y	SETDB2,SETDB2,PHF11,PHF11,ARL11	ARL11,EBPL	NA	NA	NA	NA	ARL11	16782	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	50559366	50559533	50559450	Y	NA	TRIM13,MIR3613	NA	NA	NA	NA	TRIM13	8491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	50630657	50630910	50630784	Y	NA	MIR16-1,DLEU1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	9460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	50671086	50671325	50671206	Y	NA	MIR16-1,DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	16779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	50675373	50675756	50675618	Y	NA	DLEU1,DLEU2	NA	NA	NA	NA	DLEU1	21066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	51486183	51486653	51486377	Y	RNASEH2B	RNASEH2B	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	4369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	52218923	52219366	52219003	Y	WDFY2,DHRS12,DHRS12	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY2	62279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	60053889	60054114	60054002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	682007	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	67146891	67147210	67147207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	5099989	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	4785473	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	73982945	73982960	73982953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF5	355831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	90465670	90466055	90465862	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1532019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	91580553	91580648	91580601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	417426	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	91931030	91931288	91931161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	66786	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	92927934	92928164	92928120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4ATAC3P	217837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	94976563	94976881	94976571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	269630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	96164777	96165033	96164905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3-AS1	162146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	96427402	96427645	96427445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	100009	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	99935844	99936009	99935907	Y	GPR183	GPR18,GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	21650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	99957500	99957664	99957598	Y	DOCK9,UBAC2,GPR18,GPR183	GPR18	NA	NA	NA	NA	GPR183	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	100008605	100009044	100008755	Y	DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL	NA	NA	NA	NA	NA	GPR183	50946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr13	100374428	100374651	100374540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLYBL	117509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	100611152	100611355	100611213	Y	ZIC5,ZIC2	ZIC2	NA	NA	NA	NA	ZIC2	20671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	101075706	101076016	101075848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P47	114512	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	103249969	103250343	103250155	Y	ERCC5,TPP2	TPP2	NA	NA	NA	NA	TPP2	2616	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	110443694	110443751	110443735	Y	IRS2	IRS2	MYO16,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	6779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	111227983	111228269	111228196	Y	ING1,ING1,ANKRD10,RAB20	RAB20,CARKD	RAB20	IMR90	Hi-C	24141950	RAB20	15903	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	111278486	111278706	111278495	Y	NA	CARKD	NA	NA	NA	NA	CARKD	12605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	111699295	111699448	111699370	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGEF7	65458	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr13	113514166	113514374	113514224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11A	171523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	113928164	113928348	113928293	Y	CUL4A	LAMP1	NA	NA	NA	NA	LAMP1	21208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	114119812	114119949	114119881	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	23318	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	114445132	114445240	114445183	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6-AS1	71363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	114556439	114556767	114556713	Y	NA	GAS6-AS1,GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	8279	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr13	114810103	114810577	114810313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	85509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	21564675	21565076	21564876	Y	NA	ARHGEF40	NA	NA	NA	NA	ARHGEF40	28246	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	21995986	21996368	21996178	Y	SALL2	METTL3	NA	NA	NA	NA	METTL3	18469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	23058743	23059118	23058931	Y	REM2	DAD1,ABHD4	NA	NA	NA	NA	DAD1	2568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	23554726	23554907	23554813	Y	SLC7A7,RBM23,ACIN1	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	C14orf119	7067	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	24014427	24014724	24014635	Y	DHRS4L2,DHRS4L2,BCL2L2,BCL2L2,PABPN1,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,THTPA,JPH4	THTPA,ZFHX2,AP1G2	NA	NA	NA	NA	THTPA	8492	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	24075347	24075692	24075500	Y	NA	AP1G2	C14orf167	IMR90	Hi-C	24141950	AP1G2	40068	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	24712544	24712898	24712739	Y	DHRS4L1,DCAF11,DCAF11,PSME1,RNF31,IRF9,RIPK3,LTB4R,KHNYN,CIDEB,TINF2	TM9SF1,CHMP4A,MDP1,NEDD8-MDP1,GMPR2,NEDD8,TINF2,RABGGTA	NA	NA	NA	NA	TINF2	2664	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	31455672	31455729	31455709	Y	NA	AP4S1,STRN3	NA	NA	NA	NA	AP4S1	36583	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	34472073	34472091	34472083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTSSA	457471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	37119826	37119959	37119893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBIP	331944	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	39737909	39738305	39738022	Y	NA	CTAGE5	NA	NA	NA	NA	CTAGE5	5421	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	42286206	42286221	42286213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO33	2386502	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	43989536	43989546	43989541	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	1374952	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	45160440	45160781	45160566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf28	203717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	45592379	45592731	45592576	Y	PRPF39	PRPF39,FKBP3,FANCM	NA	NA	NA	NA	FKBP3	9791	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	45721298	45721397	45721336	Y	KLHL28,PRPF39,FANCM,MIS18BP1	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	555	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	46620797	46620809	46620803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	900054	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	167466	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	50552755	50553092	50552901	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	SOS2	143184	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	50799629	50799645	50799635	Y	NA	ATP5S,L2HGDH	NA	NA	NA	NA	L2HGDH	22363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	50926261	50926342	50926322	Y	MAP4K5,ATL1,ATL1,CDKL1	CDKL1	NA	NA	NA	NA	CDKL1	45082	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	51434779	51434836	51434798	Y	NA	PYGL	NA	NA	NA	NA	PYGL	25325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	52310933	52311192	52311144	Y	NA	GNG2	GNG2,FRMD6,C14orf166	IMR90	Hi-C	24141950	GNG2	20020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	52790756	52791260	52791155	Y	NA	PTGER2	NA	NA	NA	NA	PTGER2	11733	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	53209302	53209454	53209392	Y	NA	ERO1L,PSMC6,STYX,GNPNAT1	NA	NA	NA	NA	STYX	14404	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	53575786	53575939	53575850	Y	DDHD1	DDHD1	NA	NA	NA	NA	DDHD1	42061	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	54900763	54901015	54900977	Y	NA	CDKN3	NA	NA	NA	NA	CDKN3	39196	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	54917293	54917567	54917392	Y	GMFB,GCH1,CGRRF1	GMFB	CNIH,CGRRF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GMFB	36347	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	55731972	55732298	55732133	Y	GCH1,MAPK1IP1L,LGALS3,FBXO34,FBXO34	FBXO34,RP11-665C16.6	TBPL2,FBXO34	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FBXO34	3723	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	56472041	56472329	56472134	Y	NA	NA	PELI2	IMR90	Hi-C	24141950	PELI2	110203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	56800514	56800817	56800666	Y	NA	NA	KTN1,RPL13AP3,PELI2,LINC00520	IMR90	Hi-C	24141950	PELI2	217982	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	57343255	57343511	57343375	Y	OTX2,OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	390215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	58748134	58748542	58748422	Y	ARID4A	PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A	NA	NA	NA	NA	RP11-349A22.5	14310	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	58911911	58912089	58912000	Y	KIAA0586	KIAA0586,TIMM9	NA	NA	NA	NA	TIMM9	19579	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	60618583	60618767	60618659	Y	PPM1A,C14orf135,DHRS7	DHRS7	NA	NA	NA	NA	DHRS7	15807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr14	61570265	61570959	61570637	Y	SLC38A6	NA	NA	NA	NA	NA	TRMT5	124189	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	61946856	61947374	61946994	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	212857	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	64109095	64109326	64109156	Y	SYNE2,WDR89,WDR89	HSPE1P2,WDR89	NA	NA	NA	NA	WDR89	2516	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	64976158	64976191	64976175	Y	ZBTB25,ZBTB1	ZBTB1,ZBTB25,HSPA2	NA	NA	NA	NA	ZBTB25	6227	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	65175295	65175757	65175503	Y	SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	6475	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	65525721	65526064	65525893	Y	NA	MAX	NA	NA	NA	NA	MAX	41349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	65641048	65641253	65641171	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	73635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	66912712	66912753	66912717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPHN	59372	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	67774949	67775062	67775003	Y	PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	49652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	67809024	67809296	67809169	Y	RDH12,MPP5,PLEKHH1	EIF2S1,ATP6V1D	NA	NA	NA	NA	EIF2S1	15418	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	68431145	68431760	68431180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	146649	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	68717033	68717146	68717097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD51B	432537	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	68868650	68868995	68868704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP36L1	392195	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	69161300	69161452	69161356	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	99738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	69425235	69425583	69425528	Y	NA	ACTN1	NA	NA	NA	NA	ACTN1	18574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	69510270	69510546	69510495	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66113	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	70104251	70104682	70104439	Y	DCAF5,SRSF5,SRSF5,KIAA0247	KIAA0247	NA	NA	NA	NA	KIAA0247	27938	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	71348625	71348857	71348689	Y	MED6,PCNX	PCNX	PCNX	IMR90	Hi-C	24141950	PCNX	23265	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	71349559	71349894	71349705	Y	MED6,PCNX	PCNX	NA	NA	NA	NA	PCNX	22228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	72083404	72083762	72083537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	298238	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	72423806	72424082	72423940	Y	RGS6,RGS6	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L1	638640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	14952	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	74210197	74210586	74210513	Y	ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	12864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	74220862	74221204	74221002	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	2246	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	74228460	74228789	74228681	Y	NUMB,ZNF410,C14orf43	PNMA1,MIR4505,RP5-1021I20.1	NA	NA	NA	NA	MIR4505	5010	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	75521336	75521721	75521672	Y	MLH3,ACYP1	MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	5101	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	75741549	75742051	75741730	Y	NEK9,JDP2,FLVCR2,BATF,FOS	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	LOC731223	IMR90	Hi-C	24141950	FOS	1426	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	75768536	75769006	75768683	Y	NA	RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5	NA	NA	NA	NA	RP11-293M10.5	9429	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	76009076	76009592	76009288	Y	FOS,JDP2,BATF	BATF,FLVCR2	NA	NA	NA	NA	BATF	22308	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	76081585	76081840	76081824	Y	NA	FLVCR2,RP11-507E23.1,TTLL5,C14orf1	NA	NA	NA	NA	TTLL5	16128	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	77396429	77396646	77396562	Y	IRF2BPL	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-7F17.1	36380	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr14	77508586	77508871	77508699	Y	IRF2BPL	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	15552	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	77554689	77554897	77554781	Y	NA	NA	KIAA1737,ANGEL1,C14orf166B,IRF2BPL	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2BPL	61655	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	77591216	77591790	77591612	Y	TMED8,NGB	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BPL	98182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	144949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	78196199	78196534	78196363	Y	NA	ALKBH1,SLIRP,C14orf178,SNW1	NA	NA	NA	NA	SLIRP	23785	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	81397243	81397817	81397507	Y	CEP128	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	26044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	81588946	81589112	81589029	Y	GTF2A1,GTF2A1	RP11-114N19.3	NA	NA	NA	NA	RP11-114N19.3	45646	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	SNORA79	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	3341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	88788436	88788474	88788455	Y	SPATA7,KCNK10,KCNK10	KCNK10	NA	NA	NA	NA	KCNK10	2777	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC8	382996	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	343793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	89770346	89770725	89770409	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	312768	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr14	89881748	89882141	89882044	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	201352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	89935615	89935871	89935745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	147622	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	90055887	90056088	90056076	Y	NA	FOXN3	NA	NA	NA	NA	FOXN3	27405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	90560682	90560941	90560765	Y	KCNK13	NA	NA	NA	NA	NA	TDP1	141399	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	90761350	90761506	90761428	Y	NA	PSMC1	NA	NA	NA	NA	PSMC1	40511	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	91096658	91097052	91096895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7B	183771	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	91267745	91267886	91267834	Y	NA	TTC7B	NA	NA	NA	NA	TTC7B	12937	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	91575388	91575575	91575505	Y	SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5,C14orf159	NA	C14orf102,RPS6KA5,C14orf159,CCDC88C	IMR90	Hi-C	24141950	RPS6KA5	50408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	91814664	91814951	91814783	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	67237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	91833483	91833974	91833648	Y	RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C	CCDC88C	NA	NA	NA	NA	CCDC88C	48214	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr14	92446493	92446853	92446680	Y	SMEK1,SLC24A4,SLC24A4,ATXN3	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP11	58387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	92572132	92572295	92572249	Y	CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3	ATXN3,NDUFB1,CPSF2	NA	NA	NA	NA	ATXN3	1167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	93030823	93030949	93030917	Y	ATXN3,LGMN	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	52705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	93119846	93119961	93119893	Y	ITPK1,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	NA	NA	NA	NA	NA	GOLGA5	138615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	93540905	93541183	93541053	Y	MOAP1,KIAA1409,C14orf109,C14orf109,BTBD7,ITPK1	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	39482	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	93776910	93777138	93777024	Y	PRIMA1	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	20300	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	93842079	93842371	93842190	Y	KIAA1409	BTBD7	NA	NA	NA	NA	BTBD7	44641	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	96599113	96599472	96599314	Y	NA	NA	BDKRB2,BDKRB1	IMR90	Hi-C	24141950	ATG2B	228735	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr14	99503090	99503470	99503396	Y	CCNK	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	441746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr14	100448901	100449138	100448963	Y	NA	EVL	EML1,EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	EVL	13115	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	101024059	101024421	101024266	Y	WARS,WARS,WDR25,WDR25	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	182917	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	101049817	101049857	101049837	Y	DLK1,BEGAIN	NA	WDR25,MEG3,BEGAIN	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WARS	208675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	101143693	101144188	101144055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WARS	302551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	104583053	104583460	104583371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	190447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105536057	105536658	105536303	Y	CRIP1,GPR132	GPR132	NA	NA	NA	NA	GPR132	6275	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105536659	105537093	105536681	Y	NA	GPR132	NA	NA	NA	NA	GPR132	6877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105541748	105541955	105541831	Y	CRIP1,PLD4,GPR132	GPR132	AHNAK2,GPR132	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPR132	11966	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105760670	105760918	105760811	Y	C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1	BTBD6,PACS2,BRF1	NA	NA	NA	NA	PACS2	3982	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP1,C14orf80	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	9.29051404246615
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf80	1298739	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	23041896	23042224	23042060	Y	NA	NIPA2	NA	NA	NA	NA	NIPA2	9469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	25123469	25123644	25123557	Y	SNURF,SNRPN,C15orf2,SNRPN,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	SNRPN	56675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	25586903	25587047	25586976	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	95081	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	25595443	25596209	25595953	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	85919	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	26094944	26095277	26095056	Y	UBE3A,UBE3A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	13040	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	26106001	26106167	26106105	Y	UBE3A,ATP10A	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	2150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	26148464	26148705	26148613	Y	NA	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	40147	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	26218277	26218446	26218362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP10A	109960	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	31215782	31215951	31215851	Y	FAN1,FAN1,MTMR10	NA	NA	NA	NA	NA	MTMR10	65859	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	33502141	33502453	33502281	Y	NA	NA	TMCO5B	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP11A	596796	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr15	33650854	33651169	33650965	Y	RYR3	NA	NA	NA	NA	NA	AVEN	678208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	NA	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF770	312243	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	39261255	39261645	39261450	Y	RASGRP1,C15orf53	NA	NA	NA	NA	NA	FAM98B	516927	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	39755069	39755071	39755070	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	FSIP1	317960	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	39921500	39921920	39921800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSIP1	151111	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	40373777	40374114	40374053	Y	FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF	SRP14,BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	24979	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	40397040	40397227	40397203	Y	BUB1B,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	40397293	40397725	40397605	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	1368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr15	40414461	40414679	40414607	Y	NA	BMF,BUB1B	LOC100131089,SRP14,BMF,BUB1B	IMR90	Hi-C	24141950	BMF	15368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	40601054	40601299	40601247	Y	BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2	ANKRD63,PLCB2,C15orf52	PAK6	K562	ChIA-PET	22265404	PLCB2	2918	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	40651110	40651387	40651256	Y	PAK6,DISP2	C15orf52,IVD	NA	NA	NA	NA	C15orf52	19942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	41953918	41954236	41954127	Y	EHD4,MGA	MGA	MAPKBP1	IMR90	Hi-C	24141950	MGA	42496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr15	42083275	42083582	42083459	Y	NA	MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B	NA	NA	NA	NA	MAPKBP1	18643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	42786035	42786158	42786098	Y	SNAP23	SNAP23	NA	NA	NA	NA	SNAP23	4604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	42792289	42792533	42792361	Y	NA	SNAP23,LRRC57,HAUS2	LRRC57,HAUS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAP23	10858	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	43757406	43757566	43757505	Y	NA	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	43360	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	43803895	43804004	43803947	Y	TGM7,TP53BP1,MAP1A	TP53BP1	NA	NA	NA	NA	TP53BP1	2969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	44161980	44162105	44162047	Y	NA	MFAP1,WDR76,PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	4337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	45002253	45002823	45002529	Y	NA	SPG11,PATL2,B2M,TRIM69	NA	NA	NA	NA	B2M	578	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	45340934	45341315	45341066	Y	SPG11,B2M,SPATA5L1	SORD	NA	NA	NA	NA	SORD	27632	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5L1	55940	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	45929603	45930187	45929917	Y	C15orf48,PLDN,SQRDL	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	8257	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	47979261	47979603	47979432	Y	MYEF2	CTD-2270N23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2270N23.1	41529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	48884454	48884907	48884660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP152	216436	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	50010526	50010792	50010622	Y	NA	NA	C15orf33,GALK2,DTWD1,ATP8B4	IMR90	Hi-C	24141950	DTWD1	99349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	50140337	50140734	50140509	Y	FGF7,DTWD1	NA	NA	NA	NA	NA	DTWD1	229160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	50201915	50201939	50201930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	270454	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	50347446	50348347	50347721	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	124046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	50357050	50357264	50357080	Y	USP8,GABPB1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	115129	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	50358473	50358749	50358576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	113644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	50399831	50400157	50400014	Y	USP8,GABPB1,ATP8B4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	72236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr15	50400519	50400943	50400861	Y	ATP8B4	NA	NA	NA	NA	NA	SLC27A2	71450	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr15	50793550	50793719	50793635	Y	USP8,TRPM7	NA	NA	NA	NA	NA	USP8	78973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	51369445	51369616	51369500	Y	TRPM7,SPPL2A	NA	NA	NA	NA	NA	AP4E1	170576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	51921191	51921424	51921391	Y	NA	DMXL2	DMXL2,LYSMD2,TMOD2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DMXL2	8161	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	51921715	51922068	51922003	Y	NA	DMXL2	DMXL2,LYSMD2,TMOD2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DMXL2	8685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	52777453	52777711	52777581	Y	NA	MYO5A	NA	NA	NA	NA	MYO5A	41536	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	53063704	53063805	53063755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM214A	63690	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	55487267	55487658	55487506	Y	NA	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	2	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	55543162	55543346	55543241	Y	RAB27A,PIGB,CCPG1,CCPG1,RAB27A	NA	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	55897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	55574844	55574949	55574897	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	34209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	55986919	55987071	55986980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYX1C1	188487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	58307957	58308317	58308137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LIPC	392451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	59023904	59024166	59024035	Y	RNF111	ADAM10,FAM63B	NA	NA	NA	NA	ADAM10	16011	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	60937521	60937640	60937631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	168144	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	61505182	61505193	61505186	Y	RORA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	735805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	62574155	62574333	62574245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	106392	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	62949406	62949470	62949438	Y	LACTB	NA	NA	NA	NA	NA	TLN2	268681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	63439577	63439949	63439764	Y	NA	LACTB,RPS27L,RAB8B	NA	NA	NA	NA	RPS27L	8271	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	63486176	63486338	63486267	Y	LACTB,USP3,RAB8B	RPS27L,RAB8B	APH1B	IMR90	Hi-C	24141950	RAB8B	6508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	63771566	63772233	63772016	Y	HERC1,USP3	USP3	APH1B,RAB8B,CA12,USP3,HERC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP3	22560	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	63989218	63989619	63989416	Y	USP3,HERC1,DAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	97430	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	64188807	64189333	64189164	Y	USP3,HERC1	NA	NA	NA	NA	NA	HERC1	64666	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	64385169	64385477	64385384	Y	NA	DAPK2,FAM96A,SNX1	NA	NA	NA	NA	SNX1	847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	65148759	65148948	65148850	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	16671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	65841762	65842141	65841952	Y	PARP16	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	21006	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	66707547	66707736	66707571	Y	MAP2K1	TIPIN,MAP2K1	RPL4,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K1	30392	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	66967847	66967978	66967897	Y	NA	SMAD6	SMAD6	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	24588	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	SMAD6	NA	NA	NA	NA	SMAD6	721	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	69215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	IQCH	54692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	68078361	68078371	68078366	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP2K5	245314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	68132952	68133362	68133003	Y	PIAS1,CALML4	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	69114506	69114876	69114758	Y	NA	ANP32A	NA	NA	NA	NA	ANP32A	3270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	70641269	70641570	70641504	Y	TLE3	NA	TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	TLE3	252754	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	70755934	70756114	70756016	Y	TLE3	NA	TLE3,C15orf50,KIF23,LOC145837	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	297818	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	71615809	71616164	71615988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	432685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	71657535	71657734	71657662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	474411	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	73939698	73939908	73939794	Y	NA	NPTN,CD276	C15orf60	IMR90	Hi-C	24141950	NPTN	15223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	74289381	74289564	74289454	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	4367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	74688835	74689193	74688950	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	74834290	74834419	74834369	Y	ULK3,CSK,CLK3,ARID3B	ARID3B	NA	NA	NA	NA	ARID3B	2772	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	74908840	74909023	74908946	Y	NA	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	19999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	74930641	74931010	74930809	Y	ARID3B,CSK	CLK3	NA	NA	NA	NA	CLK3	41800	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	75018665	75019349	75018947	Y	SCAMP2,C15orf39,CYP1A1	EDC3,CYP1A1	NA	NA	NA	NA	CYP1A1	2714	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	75075558	75076065	75075775	Y	ARID3B,CLK3,CLK3,SCAMP2,C15orf39,CSK	CSK	NA	NA	NA	NA	CSK	3160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	75402190	75402344	75402306	Y	PPCDC	NA	SCAMP5,PPCDC,C15orf39	IMR90	Hi-C	24141950	C15orf39	83640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	75744907	75745094	75744993	Y	C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,ODF3L1,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	76455838	76456047	76455943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFA	145766	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	76639120	76639380	76639270	Y	NA	ETFA,ISL2	NA	NA	NA	NA	ISL2	12055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	82374943	82375242	82374985	Y	NA	MEX3B	MEX3B,EFTUD1	IMR90	Hi-C	24141950	MEX3B	38461	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	83412156	83412209	83412183	Y	NA	RP11-752G15.6	NA	NA	NA	NA	RP11-752G15.6	5107	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	83539816	83540191	83540033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WHAMM	63436	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	83761220	83761490	83761347	Y	TM6SF1	BTBD1,TM6SF1	BTBD1,MIR4515	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM6SF1	12669	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	83777211	83777631	83777545	Y	NA	BTBD1,TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	3052	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr15	83817881	83818018	83817954	Y	NA	TM6SF1	NA	NA	NA	NA	TM6SF1	43722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	85141478	85141773	85141626	Y	NA	ZSCAN2,EGLN1P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN2	444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	RP11-815J21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	32464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	86111518	86111581	86111550	Y	NA	RP11-815J21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	9828	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	86211201	86211615	86211423	Y	AKAP13,KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-815J21.2	89792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	88699675	88699741	88699708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL46	308909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	89856537	89857272	89856853	Y	NA	POLG,LINC00925	NA	NA	NA	NA	POLG	18820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	90578178	90578635	90578479	Y	ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	35554	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	90955763	90956502	90956124	Y	FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	26313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	91190174	91190180	91190177	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	68192	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	91191799	91192162	91191976	Y	UNC45A,FES,FES,FES,C15orf58,IQGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	66210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	RP11-387D10.2,BLM	NA	NA	NA	NA	RP11-387D10.2	49376	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	91417545	91417844	91417693	Y	NA	CTD-3094K11.1,FES,MAN2A2	NA	NA	NA	NA	FES	7081	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	91808048	91808189	91808119	Y	FES,FES	NA	NA	NA	NA	NA	VPS33B	244215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	92486330	92486707	92486433	Y	SLCO3A1	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	91405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD2	48928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr15	93520042	93520437	93520098	Y	CHD2	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	95516	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	1592699	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	1562118	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	97037762	97038044	97037995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC4	1422740	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr15	99259262	99259477	99259337	Y	SYNM	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	69062	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	99298945	99299364	99299005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	108745	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	99991066	99991337	99991202	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	24033	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	101102236	101102405	101102321	Y	NA	ASB7,LINS	NA	NA	NA	NA	ASB7	38334	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	130955	131250	131103	Y	NA	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	MPG	5949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	575519	575832	575766	Y	NHLRC4	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	39163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ,NHLRC4	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	1519780	1519909	1519802	Y	SEPX1,MAPK8IP3,CLCN7	C16orf91,CLCN7,TELO2	NA	NA	NA	NA	CLCN7	3672	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	1698080	1698287	1698168	Y	CLCN7	IFT140,CRAMP1L,HN1L	NA	NA	NA	NA	HN1L	27970	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	3114137	3114295	3114216	Y	ZNF263,ZNF205,PRSS41,ZSCAN10	TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25,ZNF205	NA	NA	NA	NA	MMP25	19455	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	3145997	3146167	3146082	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	14394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	3285972	3286117	3286070	Y	PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263	ZNF200,MEFV,ZNF263	NA	NA	NA	NA	ZNF200	1751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4063476	4063638	4063556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	100548	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4102835	4103049	4102865	Y	CORO7	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	61137	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	4420946	4421237	4421026	Y	NA	PAM16	NA	NA	NA	NA	PAM16	17338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4436121	4436376	4436295	Y	NA	PAM16,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	PAM16	32513	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	4713771	4714092	4713866	Y	CORO7,NAGPA,GLYR1,MGRN1	MGRN1,NUDT16L1	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	27603	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	4732185	4732598	4732284	Y	CORO7,ROGDI	NUDT16L1,ANKS3	NA	NA	NA	NA	NUDT16L1	9097	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	5666199	5666502	5666317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAGPA	584057	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	8939360	8939674	8939516	Y	USP7	TMEM186,CARHSP1	NA	NA	NA	NA	CARHSP1	21192	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	11318108	11318467	11318211	Y	NA	RMI2,SOCS1	CLEC16A,SOCS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RMI2	23009	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	11591931	11591962	11591945	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136275	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	11726508	11726794	11726693	Y	NA	LITAF,SNN	CLEC16A,LITAF,TXNDC11,SNN	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	1443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	12553349	12553483	12553416	Y	CPPED1,RUNDC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SNX29	484755	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	14379572	14379808	14379698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	216394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	14603035	14603210	14603110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARN	121375	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	17257893	17258025	17257960	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	304713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	17267039	17267537	17267379	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	295201	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17341896	17342078	17341982	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	220660	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17435762	17436100	17436052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	126638	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17436977	17437203	17437056	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	125535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17460967	17461087	17461050	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	101651	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17463561	17463824	17463658	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	98914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17474933	17475301	17475104	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	87437	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17476901	17477384	17477246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	85354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr16	17485561	17485736	17485646	Y	XYLT1	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	77002	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	17898189	17898476	17898356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	335451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	18811720	18812078	18811899	Y	SMG1,COQ7,COQ7	RPS15A,ARL6IP1	NA	NA	NA	NA	ARL6IP1	720	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	19106464	19106699	19106563	Y	NA	COQ7	NA	NA	NA	NA	COQ7	29543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	21566198	21566360	21566279	Y	DNAH3	SLC7A5P2,CTD-2547E10.2,METTL9	METTL9,IGSF6	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2547E10.2	36433	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	22349127	22349159	22349143	Y	POLR3E	POLR3E	NA	NA	NA	NA	POLR3E	42397	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	23531974	23532033	23532005	Y	NA	GGA2,UBFD1,EARS2	NA	NA	NA	NA	GGA2	658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	23874863	23875389	23875220	Y	GGA2,PRKCB	PRKCB	NA	NA	NA	NA	PRKCB	29541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	23921671	23922056	23921730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	76349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	23968296	23968621	23968461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCB	122974	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	24269313	24269595	24269474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA1	73273	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	25344649	25344994	25344822	Y	ZKSCAN2	NA	NA	NA	NA	NA	ZKSCAN2	77397	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	27254406	27254878	27254778	Y	IL4R	NSMCE1	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	23237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	27297334	27297620	27297361	Y	NA	NSMCE1,IL4R	NA	NA	NA	NA	NSMCE1	19219	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	27386500	27386691	27386620	Y	C16orf82,IL21R,IL4R	IL21R	NA	NA	NA	NA	IL21R	24792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	27620703	27620731	27620720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	61249	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	28160349	28160575	28160437	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	NA	NA	NA	NA	NA	XPO6	60666	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	28545865	28546104	28546001	Y	EIF3CL,EIF3C,SULT1A1,SPNS1,APOBR,IL27	APOBR,CLN3,CCDC101	NA	NA	NA	NA	CCDC101	17132	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	28839972	28840187	28840086	Y	CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP	ATXN2L,TUFM,SH2B1	NA	NA	NA	NA	ATXN2L	7616	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	29168403	29168702	29168538	Y	SPNS1	NA	RRN3P2	IMR90	Hi-C	24141950	LAT	174256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	30482309	30482674	30482424	Y	CORO1A,SEPT1,ITGAL	DCTPP1,SEPHS2,ITGAL	NA	NA	NA	NA	ITGAL	330	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	30579441	30579843	30579693	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689	ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF785	NA	NA	NA	NA	ZNF688	2212	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr16	30885980	30886229	30886174	Y	ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668	MIR4519,BCL7C,FBXL19,FBXL19-AS1	NA	NA	NA	NA	MIR4519	1336	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NETO2	148441	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	47669133	47669265	47669199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITFG1	173073	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	48373783	48374217	48374017	Y	LONP2,N4BP1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	LONP2	97576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	48570287	48570591	48570516	Y	N4BP1	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	81468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	50127559	50128142	50127811	Y	TMEM188,ADCY7	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	29707	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	50315764	50316400	50316123	Y	SNX20,NOD2,CYLD,CYLD,TMEM188,PAPD5,ADCY7	ADCY7	PAPD5,BRD7,ADCY7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADCY7	37716	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	50336956	50337409	50337067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY7	58908	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	50376082	50376389	50376371	Y	NA	BRD7	NA	NA	NA	NA	BRD7	24456	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	53124874	53125001	53124924	Y	NA	CHD9	NA	NA	NA	NA	CHD9	37929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	56950990	56951197	56951097	Y	NLRC5,HERPUD1	HERPUD1	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	12763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	CCDC135	NA	NA	NA	NA	CCDC135	9325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	58160772	58161211	58161024	Y	C16orf80	C16orf80	NA	NA	NA	NA	C16orf80	143	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	62009181	62009277	62009229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GOT2	3242920	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	62714655	62714827	62714741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00920	3725600	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	66557840	66558108	66558016	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1	NA	NA	NA	NA	TK2	26339	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr16	67513836	67514185	67514007	Y	C16orf70,LRRC29,LRRC29,PSMB10,ACD,FAM65A,ATP6V0D1	ATP6V0D1,FAM65A	NA	NA	NA	NA	ATP6V0D1	696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	PLA2G15	5331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr16	68320405	68320913	68320608	Y	ZFP90,SMPD3	PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P	NA	NA	NA	NA	SLC7A6OS	21936	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	68418958	68419037	68419019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-30P	57526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	SMPD3	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMPD3	23140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	69477830	69478460	69477879	Y	NA	TERF2,CYB5B	NA	NA	NA	NA	CYB5B	21402	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	69548359	69548541	69548428	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2	IMR90	Hi-C	24141950	NFAT5	48456	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr16	69865358	69865753	69865556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWP2	71149	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	70461908	70462625	70462132	Y	ST3GAL2	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	8515	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	70725776	70726100	70725941	Y	MTSS1L	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	7807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	71828659	71828769	71828714	Y	NA	AP1G1,ATXN1L,IST1	NA	NA	NA	NA	AP1G1	12335	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	71904264	71904408	71904360	Y	PHLPP2,ZNF821	ATXN1L,IST1,ZNF821	NA	NA	NA	NA	ZNF821	22831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	72237360	72237779	72237529	Y	AP1G1,ATXN1L,KIAA0174,DHX38	NA	HPR,PMFBP1,LOC100506172	IMR90	Hi-C	24141950	TXNL4B	111030	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	72965555	72965897	72965813	Y	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	839225	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	949798	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	74701397	74701877	74701440	Y	RFWD3	RFWD3,MLKL	NA	NA	NA	NA	RFWD3	2618	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	75037611	75037819	75037667	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	5540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	75109200	75109655	75109345	Y	TMEM170A,ZNRF1	LDHD	NA	NA	NA	NA	LDHD	39014	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	75628076	75628219	75628207	Y	NA	TMEM231,GABARAPL2,ADAT1	NA	NA	NA	NA	ADAT1	26979	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	77453897	77453915	77453908	Y	ADAMTS18	NA	NA	NA	NA	NA	MON1B	231165	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	79320743	79321105	79320987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	1189433	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	80648932	80649251	80648956	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLRB2	76301	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81503648	81503971	81503709	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	26873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81512608	81512902	81512703	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	35833	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81514966	81515415	81515191	Y	NA	CMIP	NA	NA	NA	NA	CMIP	38191	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81592572	81592719	81592646	Y	GAN,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	115797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81617620	81618040	81617835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	140845	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81785976	81786155	81786044	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	PLCG2	ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720	IMR90	Hi-C	24141950	PLCG2	15274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	81832236	81832757	81832339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	61534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	81856913	81857368	81857087	Y	CMIP,CMIP,PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	86211	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	769674	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	84305711	84305761	84305735	Y	NA	NA	ATP2C2,KCNG4,WFDC1,KIAA1609	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1C	87042	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	84633541	84633938	84633771	Y	NA	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	15745	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	84674948	84675055	84674964	Y	KLHL36	COTL1,KLHL36	KIAA1609,COTL1,USP10,KLHL36,ZDHHC7	IMR90	Hi-C	24141950	KLHL36	5076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	85339922	85340091	85340012	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	280547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	85343472	85343805	85343554	Y	KIAA0513	NA	KIAA0513,FAM92B,LOC400548,LINC00311,LOC727710,KIAA0182,GINS2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0513	284097	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85558951	85559083	85559056	Y	KIAA0513,IRF8	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	162596	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85569070	85569366	85569223	Y	KIAA0182,KIAA0182,GINS2,COX4NB	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	152313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85569816	85569916	85569832	Y	NA	NA	KIAA0182,LOC727710	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	151763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	85603305	85603679	85603564	Y	KIAA0182	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	118000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr16	85603902	85604423	85603949	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	117256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85604470	85605423	85604746	Y	NA	NA	LINC00311,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	GINS2	116256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85650361	85650613	85650432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GINS2	71066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85783425	85783755	85783547	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	690	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85903471	85903703	85903566	Y	NA	IRF8	IRF8,COX4I1,FOXF1,LOC400550,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	26706	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85933693	85934060	85933697	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	3284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	85965310	85965492	85965424	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	34901	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	85969764	85970393	85969905	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	39355	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr16	86012146	86012389	86012268	Y	COX4I1,IRF8	NA	COX4NB,MTHFSD,COX4I1,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	81737	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	86017264	86017415	86017335	Y	IRF8	NA	COX4NB,COX4I1,MTHFSD,LOC400550,FLJ30679,IRF8,C16orf74,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	86855	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	86029450	86029748	86029582	Y	IRF8	NA	MTHFSD,FLJ30679,IRF8,COX4I1,COX4NB,C16orf74,LOC732275,LOC400550,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	99041	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	86192413	86192513	86192490	Y	NA	NA	LOC400550,MTHFSD,FOXF1,LOC146513,LOC732275,COX4I1,COX4NB	IMR90	Hi-C	24141950	IRF8	262004	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	398569	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	87490621	87490719	87490682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO31	66873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	87812654	87813065	87812978	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	15056	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr16	87886258	87886670	87886593	Y	MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	SLC7A5	NA	NA	NA	NA	SLC7A5	14424	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	87981759	87982021	87981940	Y	ZCCHC14,BANP,BANP,BANP	BANP	CA5A	K562	ChIA-PET	22265404	BANP	909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88686245	88686708	88686493	Y	ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	28852	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD,SNAI3	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88829964	88830251	88830166	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	19368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88848168	88848452	88848343	Y	CYBA,RNF166,RNF166	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	1167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88857121	88857244	88857196	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	7502	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr16	88860126	88860280	88860179	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	CDT1	7341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88866491	88866710	88866640	Y	ACSF3,CBFA2T3	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	CDT1	911	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	88955496	88955935	88955760	Y	NA	TRAPPC2L,GALNS	NA	NA	NA	NA	GALNS	34118	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	89045543	89045751	89045645	Y	CBFA2T3	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	3931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	89048691	89049270	89049005	Y	CBFA2T3	CBFA2T3	NA	NA	NA	NA	CBFA2T3	7079	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	89181535	89182183	89181777	Y	CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,CBFA2T3,RPL13,RPL13,ACSF3	ACSF3	NA	NA	NA	NA	ACSF3	28752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr16	89451016	89451317	89451295	Y	CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD11	103652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	89555521	89555997	89555713	Y	ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	196	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	89557852	89558189	89558050	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	2527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr16	89564919	89565211	89565067	Y	NA	ANKRD11,SPG7	ANKRD11,SPG7	IMR90	Hi-C	24141950	SPG7	9594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr16	89904172	89904600	89904272	Y	MC1R,SPIRE2	FANCA,SPIRE2,TCF25	NA	NA	NA	NA	SPIRE2	21585	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	998903	999111	999033	Y	PITPNA,INPP5K,CRK,ABR	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	100546	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	1011015	1011228	1011147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TIMM22	112658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	1992717	1993096	1992933	Y	SLC43A2,SCARF1,WDR81	OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	37269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2163031	2163247	2163098	Y	SMYD4,MNT,METTL16,SMG6,SMG6	SRR,SMG6	NA	NA	NA	NA	SRR	41430	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2291927	2292298	2292113	Y	NA	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	10114	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	2718511	2718548	2718518	Y	TSR1,MNT,METTL16,RAP1GAP2	RAP1GAP2	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	40161	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2757819	2758227	2758154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	79469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	2952123	2952503	2952284	Y	ASPA,ASPA,PAFAH1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GAP2	273773	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	3641791	3642428	3642283	Y	ITGAE,ATP2A3	GSG2	NA	NA	NA	NA	GSG2	16580	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	4065011	4065373	4065306	Y	NA	ZZEF1,CYB5D2	NA	NA	NA	NA	CYB5D2	20549	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	4340340	4340644	4340492	Y	NA	SPNS3	NA	NA	NA	NA	SPNS3	5357	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	4386875	4387235	4387089	Y	NA	SPNS2	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12898	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	4412786	4412979	4412855	Y	NA	SPNS2,MYBBP1A	NA	NA	NA	NA	SPNS2	12653	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	4839784	4839936	4839857	Y	C17orf107	RNF167,SLC25A11,PFN1,SPAG7,CAMTA2	NA	NA	NA	NA	RNF167	1367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	5140050	5140412	5140231	Y	NA	ZNF594,SCIMP,RABEP1	NA	NA	NA	NA	SCIMP	3895	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	5245508	5245890	5245691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RABEP1	61950	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	6790647	6790875	6790776	Y	SLC16A11,DLG4,DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12	106509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr17	6814987	6815378	6815170	Y	DLG4	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12	82006	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	6821400	6821836	6821600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12	75548	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	6822767	6822872	6822855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12	74512	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	6822879	6823265	6823073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX12	74119	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	6829288	6829561	6829425	Y	SLC13A5,NLGN2,DLG4,ASGR2,ASGR2,ASGR1	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12	67823	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	6829755	6829811	6829784	Y	NA	NA	ALOX12P2,ASGR1	IMR90	Hi-C	24141950	ALOX12	67573	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	6839831	6840063	6839905	Y	XAF1,GPS2,GABARAP,EIF5A,ACAP1,RNASEK,C17orf49	NA	LOC100506713,ALOX12,ALOX12P2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ALOX12	57321	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	6842907	6843154	6843090	Y	NA	NA	ALOX12,LOC100506713	K562	ChIA-PET	22265404	ALOX12	54230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	6897797	6898308	6898020	Y	NA	ALOX12,AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	ALOX12	413	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	7456067	7456382	7456285	Y	ACAP1,WRAP53,CD68,CD68,TNFSF12	TNFSF13,SENP3,EIF4A1,SNORD10,CD68,MPDU1,AC113189.5	NA	NA	NA	NA	TNFSF13	3227	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	7657457	7657665	7657600	Y	NLGN2,AMAC1L3,WRAP53	NA	NA	NA	NA	NA	TP53	68601	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	7737438	7738736	7737971	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	2486	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	KDM6B	608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	NA	NA	NA	NA	NA	NDEL1	218198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8825548	8827035	8825911	Y	NDEL1,PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	39994	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8850448	8850862	8850791	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	16167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8857526	8857964	8857839	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	9065	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	8869986	8870720	8870441	Y	PIK3R5,PIK3R5	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	2957	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	9155924	9156306	9156115	Y	PIK3R5	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R5	288895	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	9916757	9917097	9916900	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	242982	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	9921805	9922130	9921895	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	237949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	9953965	9954309	9954075	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	205770	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	10039316	10039664	10039496	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	120415	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	15787021	15787553	15787332	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	58678	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	16189250	16189597	16189494	Y	NCOR1,TRPV2	NA	NA	NA	NA	NA	CENPV	65373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	16275124	16275367	16275237	Y	NA	CENPV,UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	UBB	6745	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	16319642	16320463	16320033	Y	NA	UBB,TRPV2	NA	NA	NA	NA	TRPV2	2786	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	17566702	17566984	17566789	Y	NA	RAI1	RAI1,SMCR9,PEMT,NT5M,TOM1L2,COPS3,MED9,RASD1,SMCR5,SREBF1,C17orf39,ATPAF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAI1	15803	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	19994905	19995311	19995047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1	84248	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	25816130	25816488	25816250	Y	WSB1,LGALS9	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	34460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	25859435	25859718	25859540	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	77765	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	26458610	26458889	26458687	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLK	91847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	27273335	27273648	27273499	Y	PHF12	DHRS13,PIPOX,PHF12	NA	NA	NA	NA	PIPOX	1883	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	27703475	27703981	27703860	Y	TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1	TAOK1,MIR4523	MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAOK1	11501	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	28283317	28283544	28283465	Y	NA	SSH2	NA	NA	NA	NA	SSH2	28023	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	28878844	28878974	28878919	Y	NA	SMURF2P1	CPD,GOSR1,LRRC37BP1,TMIGD1,SUZ12P	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2P1	46840	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	29115484	29115559	29115508	Y	NA	CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5	NA	NA	NA	NA	CRLF3	34235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	29637373	29637640	29637434	Y	CRLF3,EVI2A	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	1490	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	229790	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	30603137	30603481	30603311	Y	RHBDL3	RHBDL3	NA	NA	NA	NA	RHBDL3	11942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	30724674	30725107	30724769	Y	RHOT1	C17orf75,ZNF207,PSMD11	NA	NA	NA	NA	PSMD11	44172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	SLFN12L,AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	SLFN12L	4863	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	34045470	34045815	34045642	Y	NA	NA	RASL10B	IMR90	Hi-C	24141950	TAF15	88644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	34160214	34160648	34160302	Y	NA	TAF15,CCL5	NA	NA	NA	NA	TAF15	25755	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	34223301	34223445	34223399	Y	NA	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	17504	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	35608489	35608691	35608590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	156218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	35682301	35682446	35682421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACACA	82463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	36571646	36572076	36571709	Y	C17orf96	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	10586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	37323832	37324052	37323944	Y	NA	RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	30484	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	37621502	37621553	37621528	Y	NA	MED1,CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	5738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	37661852	37662117	37661985	Y	STAC2,FBXL20,MED1,CDK12	CDK12	NA	NA	NA	NA	CDK12	46088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	37936494	37936791	37936643	Y	IKZF3	NA	NA	NA	NA	NA	MIEN1	51454	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	38264417	38264842	38264667	Y	WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	MED24,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	MSL1	11709	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	38477236	38480096	38479169	Y	IKZF3,ZPBP2,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	13792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	38480180	38480741	38480429	Y	IKZF3,CASC3,WIPF2,CCR7,RARA,RARA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	RARA	16736	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	38817101	38817471	38817286	Y	NA	SMARCE1	SMARCE1	IMR90	Hi-C	24141950	SMARCE1	14341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF1	189786	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	40201052	40201290	40201078	Y	CNP	NKIRAS2,DNAJC7	HSPB9,KAT2A	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC7	29658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	40400517	40401003	40400833	Y	EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A	STAT5B,STAT5A	NA	NA	NA	NA	STAT5B	25722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	42365739	42366179	42366097	Y	UBTF,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39	SLC4A1,RUNDC3A,UBTF,SLC25A39,ATXN7L3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RUNDC3A	17602	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	42620927	42621257	42621090	Y	FZD2	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	11668	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	43061310	43061333	43061322	Y	C1QL1	KIF18B	EFTUD2,CCDC103,GFAP,KIF18B,DCAKD	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18B	38228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	43389475	43389771	43389724	Y	FMNL1,PLEKHM1,MAP3K14	MAP3K14	TEX34,LOC100133991	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K14	2643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	43660811	43661173	43660906	Y	ACBD4,FMNL1,PLEKHM1	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	151024	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP27	622163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	556659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr17	45717975	45718065	45718017	Y	NA	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	6777	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	45983662	45984115	45983847	Y	CDK5RAP3	SP2,AC003665.1,PNPO	PNPO	IMR90	Hi-C	24141950	SP2	12146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB4	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	ABI3,GNGT2	NA	NA	NA	NA	ABI3	15080	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	47467973	47468124	47468044	Y	ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A	RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	22122	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	47468290	47468719	47468487	Y	ZNF652,ZNF652	RP11-1079K10.3,ZNF652,PHB,AC004797.1	NA	NA	NA	NA	PHB	21527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	47816909	47817569	47817208	Y	ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A	SLC35B1,KAT7,FAM117A	NA	NA	NA	NA	SLC35B1	32533	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	PPP1R9B,SGCA	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT2	53639	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	48996944	48997365	48997235	Y	UTP18,RSAD1,TOB1	NA	LOC400604,TOB1,WFIKKN2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOB1	53605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr17	49008376	49008926	49008868	Y	NA	NA	WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOB1	65037	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	49210436	49210615	49210551	Y	SPAG9	SPAG9,NME1,NME1-NME2,NME2	SPAG9,NME1-NME2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPAG9	14210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	50561518	50561825	50561670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP18	1225629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	53034991	53035170	53035032	Y	NA	STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	8918	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	53315618	53315983	53315841	Y	HLF	HLF	STXBP4,HLF	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HLF	24390	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	54993018	54993544	54993286	Y	SCPEP1,TRIM25	TRIM25,COIL	DGKE	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIM25	3619	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	55952714	55953105	55953007	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	27297	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	56359005	56359460	56359241	Y	MPO	MIR142	NA	NA	NA	NA	MIR142	48409	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	56362029	56362418	56362266	Y	SRSF1,MPO,BZRAP1	MIR142,MIR4736	NA	NA	NA	NA	MIR142	45451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	56410599	56410851	56410735	Y	RAD51C,SRSF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	56413212	56413667	56413409	Y	VEZF1,MPO,MTMR4,SUPT4H1	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	1829	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr17	56417498	56417914	56417645	Y	MTMR4,HSF5	MIR142,MIR4736,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	MIR4736	6115	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	56696420	56696582	56696517	Y	NA	RNU1-60P,RNU1-108P	C17orf47,SEPT4	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-60P	38084	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	56706902	56707296	56707107	Y	MKS1,MKS1,RAD51C	RNU1-60P,RNU1-108P,RNU1-85P	SEPT4,MTMR4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	27370	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57048474	57048847	57048688	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	AC099850.1	133112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57515522	57515883	57515602	Y	YPEL2	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YPEL2	108472	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57881973	57882438	57882250	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	34189	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	C17orf64,USP32	NA	NA	NA	NA	C17orf64	581	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	58471589	58471771	58471659	Y	RNFT1	C17orf64,USP32	NA	NA	NA	NA	C17orf64	3799	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	60255991	60256253	60256151	Y	MED13	NA	NA	NA	NA	NA	INTS2	252614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	60443107	60443391	60443249	Y	EFCAB3	NA	EFCAB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-464D20.2	148737	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	60707106	60707291	60707232	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	4344	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	61431510	61431613	61431567	Y	STRADA,ACE	NA	MIR548W,MARCH10,DCAF7,TACO1,MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	90126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	61538235	61538385	61538330	Y	NA	CYB561,ACE	CYB561,ACE,MIR548W,KCNH6,DCAF7,TACO1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CYB561	16496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	62161129	62161576	62161448	Y	MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1	ERN1	NA	NA	NA	NA	ERN1	44603	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	62258830	62259200	62259015	Y	SCN4A	SNORD104	NA	NA	NA	NA	SNORD104	37387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	62339620	62339793	62339707	Y	CEP95	TEX2	NA	NA	NA	NA	TEX2	959	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	62409252	62409599	62409468	Y	ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5	NA	NA	NA	NA	NA	TEX2	70591	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	62484790	62485162	62485096	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	POLG2	5992	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	63050573	63051275	63051229	Y	NA	NA	AMZ2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GNA13	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	NA	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNA13	68292	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	63175905	63176048	63175964	Y	RGS9	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	124948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA13	588973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	102432	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	64463185	64463416	64463350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	166431	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	65389377	65389540	65389482	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	17802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	65847253	65847408	65847335	Y	NA	BPTF	NA	NA	NA	NA	BPTF	27613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	66315636	66315845	66315767	Y	BPTF,SLC16A6	NA	NA	NA	NA	NA	ARSG	62313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	68282373	68282961	68282582	Y	KCNJ2	NA	MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	873534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	70423161	70423493	70423326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	197877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	70664433	70664574	70664507	Y	NA	RPL32P33	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	43063	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	70878609	70878955	70878782	Y	CPSF4L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	207896	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	70892078	70892260	70892135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	194591	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	71087635	71087942	71087798	Y	SLC39A11	SLC39A11	NA	NA	NA	NA	SLC39A11	784	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	72564769	72564992	72564860	Y	NA	CD300C	NA	NA	NA	NA	CD300C	24487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	72734256	72734824	72734605	Y	DNAI2,CD300A,CD300LB,SLC9A3R1,CD300LF,RAB37,RAB37	CD300LF,SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	7967	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	72830385	72830471	72830428	Y	NA	FDXR	NA	NA	NA	NA	FDXR	36685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	73291742	73292218	73291951	Y	SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19	MRPS7,GGA3,MIF4GD,SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	SLC25A19	8151	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	73391809	73391943	73391876	Y	NA	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	GRB2	7847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	73854851	73855120	73855038	Y	GRB2,GRB2,C17orf109,RECQL5,RECQL5,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,ACOX1,UNC13D,WBP2	UNC13D,WBP2,TRIM65,MRPL38	UNC13D,UNK,WBP2	IMR90	Hi-C	24141950	WBP2	4263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr17	74440987	74441354	74441087	Y	NA	UBE2O	NA	NA	NA	NA	UBE2O	5934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	75134867	75135304	75135067	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	54069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	75384636	75384998	75384811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	109985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	127396	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMC8	170055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	10.2684628890415
chr17	76151038	76151473	76151368	Y	SYNGR2,TMC8	TMC8,TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	11166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	76320464	76321292	76320695	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	32866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	76339301	76339497	76339364	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	14661	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	76379911	76380778	76380428	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	7190	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	76635137	76635288	76635196	Y	SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1	NA	CYTH1,DNAH17	IMR90	Hi-C	24141950	USP36	200235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	77778056	77778248	77778123	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr17	77778301	77778701	77778443	Y	CBX2,CBX8,CBX4	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	4819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	77952311	77952542	77952488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	55105	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr17	78087852	78088239	78088062	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	GAA	14497	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	78102448	78102482	78102466	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	16500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV	NA	NA	NA	NA	ENDOV	41238	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	78992000	78992331	78992033	Y	C17orf56	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	14617	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79316253	79317268	79317090	Y	NA	SLC38A10,TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	13779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	TMEM105	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TMEM105	17338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	79363961	79364269	79364114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	61487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79365060	79367456	79365203	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	62586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79368790	79369424	79369000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	66316	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79375864	79375954	79375909	Y	DYSFIP1,BAHCC1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM105	73390	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr17	79399158	79399431	79399295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	78658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	79698331	79698466	79698406	Y	TMEM105	HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10	NA	NA	NA	NA	SLC25A10	29927	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	80079695	80079832	80079748	Y	NA	FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	25487	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr17	80817363	80817528	80817446	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109423	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr17	80817904	80818262	80818042	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	109964	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	80821463	80821609	80821520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	113523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr17	80821746	80822299	80821973	Y	HEXDC,C17orf62,C17orf62,NARF	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	113806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	80845276	80845458	80845382	Y	C17orf62,C17orf62,NARF,METRNL	NA	NA	NA	NA	NA	TBCD	137336	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	80889616	80889925	80889758	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	B3GNTL1	117761	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	81012071	81012294	81012223	Y	NA	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	B3GNTL1	4385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	81147237	81149188	81147763	Y	METRNL	NA	METRNL,B3GNTL1,TBCD	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	111670	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	221277	221425	221379	Y	THOC1,ENOSF1,ENOSF1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	44625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	228420	228816	228694	Y	THOC1	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	37234	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	667633	668016	667981	Y	THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	11293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	2797990	2798254	2798233	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	46774	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	2848392	2848824	2848619	Y	EMILIN2	EMILIN2	LPIN2	IMR90	Hi-C	24141950	EMILIN2	3364	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	2888759	2889155	2888912	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	43731	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	3704951	3705065	3705044	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,DLGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	295345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	5509992	5510526	5510282	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	118173	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	5514119	5514431	5514166	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	114268	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	5629750	5630120	5629929	Y	NA	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	1051	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	8412266	8412506	8412385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	194937	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9069766	9069999	9069872	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2	PPP4R1,ANKRD12,RALBP1,RAB12,CCDC165,NDUFV2,TWSG1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	30629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9494685	9495048	9494827	Y	ANKRD12,ANKRD12,VAPA,RAB31	RALBP1	NA	NA	NA	NA	RALBP1	21678	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9742137	9742641	9742378	Y	NA	RAB31	TXNDC2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	35975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9758210	9758472	9758414	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	RAB31	52048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9828298	9828524	9828428	Y	RALBP1,PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	83475	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	9869849	9870152	9869995	Y	VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	41847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	12306995	12307375	12307158	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	1327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	13374941	13375140	13375024	Y	C18orf1,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	349519	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	13566903	13567274	13567096	Y	RNMT,C18orf19,C18orf1	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	157385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	13616190	13616419	13616254	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	108240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	14098918	14099026	14098932	Y	NA	ZNF519	NA	NA	NA	NA	ZNF519	31463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	18512291	18512341	18512327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	177471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	18596588	18597119	18596879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROCK1	92693	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	19457629	19457900	19457765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	174711	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	20015299	20015446	20015358	Y	NA	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	360778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	22813301	22813647	22813474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPACT	808721	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	24120849	24120961	24120907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD1	114404	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	26735180	26735449	26735256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSC2	1944929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	32684186	32684352	32684206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPRE2	129294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	33057648	33057699	33057650	Y	MAPRE2,MAPRE2,ZNF24,ZNF396,INO80C	INO80C	NA	NA	NA	NA	INO80C	18256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	35066308	35066547	35066428	Y	CELF4	NA	NA	NA	NA	NA	TPGS2	659150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	39821342	39821767	39821460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	288171	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	42794877	42795253	42795143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	749987	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	43250326	43250536	43250381	Y	EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	294704	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	43266827	43267110	43266932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	278130	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr18	43593456	43593723	43593664	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	48216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	44675442	44676177	44675810	Y	NA	HDHD2,IER3IP1	NA	NA	NA	NA	HDHD2	551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	45071192	45071545	45071369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IER3IP1	370447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	46072108	46072320	46072224	Y	NA	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	8691	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	46449093	46449527	46449211	Y	SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	385676	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	46733107	46733359	46733209	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	252358	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	47548085	47548102	47548094	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACAA2	209755	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	47785953	47786324	47786143	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	NA	NA	NA	NA	CCDC11	4568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	47824396	47824519	47824438	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11	IMR90	Hi-C	24141950	CXXC1	11722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	47834061	47834491	47834223	Y	CCDC11,MBD1,MBD1	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	47834587	47834811	47834691	Y	NA	CCDC11,MBD1,CXXC1	CCDC11,CXXC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CXXC1	21913	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr18	51860775	51860976	51860876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLI	67001	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	54672062	54672240	54672149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL1	355231	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	55104670	55104954	55104730	Y	NA	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	3753	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	55105190	55105288	55105239	Y	ST8SIA3,ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	4273	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	55108837	55109086	55108936	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	7920	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	55109141	55109496	55109318	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	8224	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	55248353	55248745	55248703	Y	NA	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	3259	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	384083	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	56112868	56113176	56113006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	152687	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	56394566	56394962	56394680	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	MALT1	57948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60174225	60174375	60174334	Y	NA	ZCCHC2	ZCCHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZCCHC2	13865	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	60221448	60221638	60221488	Y	NA	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	33208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60445199	60445356	60445226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	64527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60456322	60456424	60456373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	75650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60474704	60474908	60474800	Y	ZCCHC2,PHLPP1	NA	NA	NA	NA	NA	PHLPP1	94032	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60822545	60823046	60822712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	162315	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60825008	60825274	60825179	Y	SERPINB12,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	160087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60864948	60865713	60864996	Y	PHLPP1,VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	119648	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60874386	60874946	60874584	Y	VPS4B,BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	110415	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr18	60875086	60875640	60875342	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	109721	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60886280	60886709	60886627	Y	BCL2	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	98652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	60903713	60904052	60903857	Y	VPS4B	NA	NA	NA	NA	NA	BCL2	81309	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	60939047	60939402	60939172	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	45959	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	60966877	60967061	60966974	Y	NA	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	18300	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	62655370	62655717	62655544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERPINB8	1020211	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	68196083	68196104	68196093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS6	241946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	72676291	72676559	72676424	Y	ZNF407,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	242744	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	72704413	72704615	72704528	Y	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	214688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr18	73201827	73202008	73201925	Y	NA	NA	ZNF407,TSHZ1	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ1	281117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74162277	74162639	74162448	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	42507	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74194351	74194716	74194640	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	10430	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74199867	74199923	74199879	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	5223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr18	74754529	74754928	74754700	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	221966	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74766602	74767022	74766743	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	234039	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	74767591	74768136	74768025	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	235028	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	74775208	74775557	74775363	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	242645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74804015	74805088	74804856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	271452	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74826312	74827078	74826635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	293749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	297652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	305101	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	76498631	76498821	76498726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	328464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	77153646	77154504	77153944	Y	ATP9B,NFATC1,NFATC1	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr18	77163451	77163662	77163546	Y	ATP9B,CTDP1,NFATC1,NFATC1	NFATC1	NA	NA	NA	NA	NFATC1	9595	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	77385208	77385599	77385374	Y	PQLC1,ADNP2,NFATC1,NFATC1,CTDP1	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	52202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr18	77552344	77552827	77552464	Y	NA	NA	KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	114543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	77615182	77615571	77615218	Y	KCNG2	NA	KCNG2,CTDP1,PQLC1	IMR90	Hi-C	24141950	PQLC1	94093	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr18	77723013	77723575	77723504	Y	HSBP1L1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	452	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	510583	510951	510744	Y	NA	MADCAM1,TPGS1,CDC34	NA	NA	NA	NA	TPGS1	5284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	823657	823956	823874	Y	BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1	PTBP1,MIR4745,MIR3187,AZU1,PRTN3,ELANE,CFD	NA	NA	NA	NA	AZU1	560	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	20.0479513547954
chr19	863983	864016	863999	Y	NA	AZU1,PRTN3,ELANE,CFD,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	6530	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	867005	867400	867203	Y	GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD	AZU1,PRTN3,ELANE,CFD,MED16,R3HDM4	NA	NA	NA	NA	CFD	9552	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	951651	951841	951690	Y	NA	R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	27870	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	980601	980803	980725	Y	NA	WDR18,RNU6-2,CNN2	NA	NA	NA	NA	WDR18	371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	1408835	1409120	1409078	Y	NA	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3267	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	1651371	1651730	1651556	Y	NA	UQCR11,TCF3	NA	NA	NA	NA	TCF3	767	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	14.1802582753431
chr19	1856794	1856864	1856840	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	1857160	1857480	1857446	Y	NA	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	4087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	1895445	1895653	1895520	Y	OAZ1,DOT1L,CSNK1G2	REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3,AC012615.1,CSNK1G2	BTBD2,CSNK1G2,KLF16	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCAMP4	7560	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	2165096	2165788	2165320	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	2632	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	2264561	2264657	2264590	Y	TMPRSS9,SPPL2B	SF3A2,PLEKHJ1,OAZ1,C19orf35	NA	NA	NA	NA	OAZ1	2828	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	2394369	2394570	2394516	Y	NA	TIMM13	NA	NA	NA	NA	TIMM13	31322	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	11.2464117356169
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	2629688	2630134	2629953	Y	DOT1L,OAZ1,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	70573	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	3133345	3133760	3133513	Y	FZR1,GNA15	GNA15,NCLN	NA	NA	NA	NA	GNA15	431	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	3367171	3367852	3367502	Y	NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	9610	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	3369394	3369884	3369615	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	11833	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	3387730	3388119	3388011	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	30169	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	3670243	3670423	3670333	Y	NFIC	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	28054	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4051584	4052099	4051914	Y	CCDC94	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	12844	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4057405	4058198	4058044	Y	CCDC94,ZBTB7A	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	6745	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4061996	4062359	4062178	Y	NA	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	2584	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4089506	4089868	4089573	Y	ZBTB7A	ZBTB7A,MAP2K2	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	24563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4568924	4569300	4569153	Y	TICAM1,KDM4B,SEMA6B	LRG1,SEMA6B	NA	NA	NA	NA	SEMA6B	11104	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4785303	4785662	4785510	Y	FSD1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	FEM1A	4066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4936813	4936840	4936828	Y	NA	UHRF1,KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	30285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	4976440	4976890	4976638	Y	TICAM1,KDM4B	KDM4B	NA	NA	NA	NA	KDM4B	9315	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	5141795	5142033	5141919	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	133712	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	5336072	5336705	5336347	Y	PTPRS	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	60327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	5624052	5624252	5624226	Y	VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB	SAFB,SAFB2,RPL36	NA	NA	NA	NA	SAFB2	1995	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	5940860	5941142	5941001	Y	NA	FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3	NA	NA	NA	NA	CAPS	31142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6023211	6023679	6023440	Y	RFX2	RANBP3	NA	NA	NA	NA	RANBP3	47058	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	8.80153961917845
chr19	6067299	6067617	6067410	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	91146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	6108691	6108922	6108748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88661	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6108978	6109271	6109224	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX2	88312	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr19	6238228	6238618	6238539	Y	RFX2	RFX2,MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	39341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6394891	6395218	6395055	Y	NA	CLPP,ALKBH7,GTF2F1,KHSRP	NA	NA	NA	NA	GTF2F1	2899	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6539979	6540238	6540076	Y	NA	TUBB4A,TNFSF9	NA	NA	NA	NA	TNFSF9	10969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	6587274	6587651	6587637	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	14463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6588124	6588275	6588192	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	13839	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6588388	6589226	6588715	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	12888	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	6600003	6600291	6600148	Y	NA	CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	1823	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	6802447	6802718	6802569	Y	DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1	VAV1	NA	NA	NA	NA	VAV1	31722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7266028	7266415	7266222	Y	NA	INSR	NA	NA	NA	NA	INSR	25630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7427436	7427895	7427614	Y	ZNF557,XAB2,STXBP2,PNPLA6,LOC100131801,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18,PNPLA6,MCOLN1,ZNF358,C19orf45,CD209,CLEC4G	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	30104	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	7437354	7437833	7437574	Y	ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18	ARHGEF18	INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF18	20166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7701239	7701460	7701364	Y	NA	XAB2,STXBP2,RETN,C19orf59,TRAPPC5	NA	NA	NA	NA	STXBP2	1472	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7746304	7746484	7746360	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59	STXBP2,RETN,C19orf59,TRAPPC5,FCER2	NA	NA	NA	NA	TRAPPC5	2575	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7756040	7757119	7756175	Y	ARHGEF18,FBN3,MAP2K7,FLJ22184,EVI5L,FCER2,FCER2	RETN,C19orf59,TRAPPC5,FCER2	NA	NA	NA	NA	FCER2	7913	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7770608	7770891	7770670	Y	ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,C19orf59	RETN,C19orf59,TRAPPC5,FCER2,CD209	NA	NA	NA	NA	FCER2	5576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7771510	7771603	7771546	Y	PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,LOC100131801,STXBP2,RETN,C19orf59	RETN,C19orf59,TRAPPC5,FCER2,CD209	NA	NA	NA	NA	FCER2	6478	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	7816227	7816567	7816322	Y	XAB2,FCER2	CD209	NA	NA	NA	NA	CD209	5763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	8115456	8115774	8115631	Y	PRAM1,STXBP2,C19orf59	ELAVL1	NA	NA	NA	NA	ELAVL1	46913	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	8518703	8518940	8518821	Y	NA	MARCH2,HNRNPM,PRAM1	NA	NA	NA	NA	HNRNPM	11052	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	8593443	8593633	8593538	Y	NA	PRAM1,ZNF414,MYO1F	NA	NA	NA	NA	ZNF414	16395	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	MYO1F,ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	8749433	8750038	8749788	Y	PRAM1,MYO1F	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	75813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	9684452	9684634	9684543	Y	NA	ZNF426,ZNF121,ZNF561	NA	NA	NA	NA	ZNF121	8575	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	9783821	9783976	9783959	Y	NA	ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	45	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	9919463	9919725	9919715	Y	ZNF846,FBXL12	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	16767	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	10442358	10442615	10442487	Y	NA	ICAM4,ICAM5,ZGLP1,FDX1L,RAVER1,ICAM3,TYK2	NA	NA	NA	NA	RAVER1	42	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	10519571	10519867	10519659	Y	P2RY11,ICAM3,S1PR5,C19orf38,ATG4D,TYK2,PDE4A,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	CDC37	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MIR1181	7357	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	10766466	10766790	10766534	Y	NA	ILF3,QTRT1	NA	NA	NA	NA	ILF3	3529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	11206953	11207150	11207057	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	8915	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	11269215	11269426	11269321	Y	SMARCA4,SMARCA4,C19orf39	SPC24,KANK2	NA	NA	NA	NA	SPC24	4731	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	11484314	11484469	11484411	Y	ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3	NA	NA	NA	NA	SWSAP1	953	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	12065633	12065838	12065735	Y	NA	ZNF700,ZNF763,CTD-2006C1.2	NA	NA	NA	NA	CTD-2006C1.2	30594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.82359077260307
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	12896372	12896781	12896659	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF490,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,STX10,LYL1,DNASE2,JUNB	JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	3529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr19	12901644	12901726	12901699	Y	NA	JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	1334	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	13143095	13143350	13143204	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	38673	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	6.35666750274
chr19	14115648	14116111	14115801	Y	CCDC130,ZSWIM4,PKN1,DDX39A,CD97,DCAF15,RFX1,IL27RA	IL27RA	NA	NA	NA	NA	RFX1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	14276845	14277176	14277145	Y	NA	PRKACA,ASF1B	NA	NA	NA	NA	ASF1B	31077	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	14485924	14486626	14486057	Y	NA	CD97,DDX39A	DDX39A	K562	ChIA-PET	22265404	CD97	2687	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr19	14570486	14570855	14570729	Y	OR7C2,ZNF333,IL27RA,DDX39A,PKN1	DDX39A,PKN1,PTGER1,GIPC1	NA	NA	NA	NA	PTGER1	13319	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	15202796	15202947	15202871	Y	OR7C2	ILVBL	NA	NA	NA	NA	ILVBL	31649	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NA	NA	NA	NA	NA	ILVBL	99498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	15947617	15948119	15947980	Y	AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1	NA	NA	NA	NA	NA	TPM4	227712	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	16394356	16394632	16394513	Y	NWD1,KLF2	KLF2	EPS15L1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF2	38996	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	16452764	16452992	16452877	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	19136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	16510195	16510544	16510471	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	70352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	17188668	17188879	17188834	Y	HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	4077	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17246297	17246722	17246423	Y	SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B	NA	NA	NA	NA	NA	MYO9B	61706	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17345747	17345835	17345791	Y	NA	USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1	NA	NA	NA	NA	NR2F6	8914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17570047	17570102	17570055	Y	CPAMD8,NXNL1	SLC27A1	NA	NA	NA	NA	SLC27A1	7476	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17578706	17578913	17578810	Y	NA	SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	SLC27A1	1128	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	17890338	17890582	17890537	Y	FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1	FCHO1	NA	NA	NA	NA	FCHO1	33811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	23104	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr19	18134654	18135106	18134872	Y	MAP1S,LRRC25,JUND,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1	ARRDC2	NA	NA	NA	NA	ARRDC2	24713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18160238	18160511	18160278	Y	IFI30,ARRDC2	MAST3,IL12RB1	NA	NA	NA	NA	MAST3	46092	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr19	18404099	18404539	18404373	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	13212	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18414244	18414595	18414365	Y	NA	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	17489	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18497624	18497977	18497708	Y	PDE4C,GDF15	PGPEP1,GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	LRRC25	8450	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18512599	18512849	18512719	Y	IFI30,UBA52,LRRC25	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	LRRC25	K562	ChIA-PET	22265404	LRRC25	6172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr19	18527231	18527472	18527362	Y	LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,LRRC25,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	18589714	18590055	18589946	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,ELL,LRRC25	ISYNA1,ELL	NA	NA	NA	NA	ELL	40882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18603161	18603534	18603395	Y	NA	ELL,FKBP8	NA	NA	NA	NA	ELL	27403	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18630929	18631259	18631008	Y	UPF1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,ELL	FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	18960289	18960480	18960366	Y	NA	UPF1	NA	NA	NA	NA	UPF1	19542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19432213	19432594	19432445	Y	SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	2560	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	19483893	19484092	19484012	Y	NA	GATAD2A	NA	NA	NA	NA	GATAD2A	10543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19600012	19600395	19600260	Y	RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	24150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19623798	19624201	19624001	Y	NA	NDUFA13,TSSK6,YJEFN3	NA	NA	NA	NA	NDUFA13	344	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	19711724	19712118	19712001	Y	RFXANK,GATAD2A,GMIP	PBX4,GMIP	NA	NA	NA	NA	PBX4	15607	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	27732067	27732764	27732500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1969684	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	28217479	28217822	28217621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1484626	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	28241688	28242434	28242171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1460014	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	29104448	29104951	29104611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	597497	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	30131352	30131538	30131383	Y	NA	POP4,PLEKHF1	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	22425	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	30171497	30171772	30171577	Y	C19orf2,C19orf2,PLEKHF1,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	17534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	30198391	30198719	30198555	Y	NA	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	5645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	30207596	30207744	30207670	Y	NA	C19orf12	NA	NA	NA	NA	C19orf12	3232	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	31041576	31041942	31041745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	URI1	629025	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	33740333	33740640	33740371	Y	NA	NA	CHST8,CEBPA,LOC80054,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	50830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	33745357	33745585	33745523	Y	CEBPA	CEBPA	CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	45885	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	33758042	33758138	33758096	Y	CEBPA	CEBPA	LOC80054,CEBPA,PEPD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPA	33332	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	33758723	33759220	33758755	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	CEBPA,LOC80054,PEPD,CEBPG,CHST8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CEBPA	32250	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	33759449	33759718	33759650	Y	CEBPA	CEBPA	CEBPA,LOC80054,PEPD,CEBPG,CHST8	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CEBPA	31752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	33764887	33765213	33765153	Y	CEBPG,CEBPA	CEBPA	CEBPA,LOC80054,CHST8,PEPD	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CEBPA	26257	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	33796303	33796393	33796348	Y	SLC7A9,CEBPA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	4833	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	34311417	34311691	34311576	Y	KCTD15	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26579	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA2	75456	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	35139249	35139608	35139368	Y	NA	AC020910.2,ZNF302	NA	NA	NA	NA	AC020910.2	26878	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	35466846	35467008	35466991	Y	FFAR3,FFAR2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A	GRAMD1A	GRAMD1A,LOC100128675,ZNF599,ZNF30,ZNF792,HPN,SCN1B,FXYD1,FXYD3,FXYD7,LGI4,FXYD5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GRAMD1A	16680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	35696373	35696472	35696417	Y	FFAR1,CD22,USF2	NA	NA	NA	NA	NA	FXYD5	52740	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	36013245	36013546	36013396	Y	ARHGAP33	TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	20951	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	36030863	36031038	36030900	Y	NA	TMEM147,AD000090.2	NA	NA	NA	NA	TMEM147	3459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	36193251	36193562	36193412	Y	USF2,CD22,FFAR1,HAUS5,ETV2,WDR62,HCST,ZBTB32,U2AF1L4,MLL4,IGFLR1,ARHGAP33	IGFLR1,PSENEN,U2AF1L4,LIN37	MLL4,ZBTB32	K562	ChIA-PET	22265404	IGFLR1	37792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	36400295	36400642	36400477	Y	FFAR2,MLL4,IGFLR1,U2AF1L4,NFKBID,HCST,TYROBP	NFKBID,HCST,TYROBP,LRFN3	NA	NA	NA	NA	TYROBP	3098	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr19	36891925	36892272	36892205	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP82	15286	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	37171128	37171323	37171227	Y	NA	ZNF461,AC074138.3,ZNF567	ZNF383,ZNF461,ZNF567,ZNF850	IMR90	Hi-C	24141950	AC074138.3	5028	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	37322216	37322466	37322299	Y	ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345	ZNF345,ZNF790	NA	NA	NA	NA	ZNF345	16797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	38807798	38808031	38807971	Y	MAP4K1,EIF3K,RASGRP4,FAM98C	YIF1B,KCNK6,CATSPERG	NA	NA	NA	NA	KCNK6	453	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr19	38916087	38916199	38916146	Y	RINL,NFKBIB,RASGRP4	FAM98C,RASGRP4	NA	NA	NA	NA	RASGRP4	1142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	39150238	39150530	39150365	Y	NA	MAP4K1,EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	13949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	39891902	39892845	39892340	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,RPS16,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	2608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	40466097	40466407	40466254	Y	ZNF546,FCGBP	CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546	NA	NA	NA	NA	PSMC4	8505	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1	NA	NA	NA	NA	SHKBP1	28849	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	41152132	41152466	41152220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITPKC	68542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41260796	41261188	41261093	Y	SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC	ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2	NA	NA	NA	NA	C19orf54	5338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41795419	41795640	41795447	Y	CYP2A13,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	18454	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41819266	41819494	41819482	Y	NA	CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2	NA	NA	NA	NA	CCDC97	5172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	41915515	41915996	41915671	Y	ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1	B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL,C19orf69	NA	NA	NA	NA	EXOSC5	14131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	CEACAM21	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	25521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42036742	42037668	42037272	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	CEACAM21,LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	16218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	CEACAM21	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	15573	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	10.2684628890415
chr19	42052659	42053071	42052864	Y	HNRNPUL1,CCDC97,B9D2,CEACAM21,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	CEACAM21	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAM21	815	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	42289644	42289819	42289732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS19	72169	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42419916	42420316	42420067	Y	ZNF574,GRIK5,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	ARHGEF1,RABAC1	NA	NA	NA	NA	ARHGEF1	34688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42444277	42444712	42444407	Y	POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	16830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42693167	42693275	42693248	Y	NA	POU2F2,DEDD2,ZNF526	NA	NA	NA	NA	POU2F2	5462	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42750338	42750718	42750490	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF	NA	NA	NA	NA	GSK3A	5561	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42756723	42757090	42756966	Y	NA	DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	ERF	219	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	14986	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	15495	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	ERF	17070	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	ERF	18683	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	PRR19	19259	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	42924318	42924497	42924408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	96557	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	20422	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	44178912	44179361	44178991	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61	PLAUR	PLAUR	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLAUR	6213	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	44261449	44261664	44261525	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	4307	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	44267676	44267996	44267772	Y	TEX101,LYPD3,IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	10534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	44287065	44287299	44287223	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	3656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	44780646	44780756	44780701	Y	NA	ZNF233,ZNF235	NA	NA	NA	NA	ZNF235	26443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45095975	45096232	45096112	Y	CLASRP,BCL3	PVR	CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23	IMR90	Hi-C	24141950	PVR	48866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45224647	45224919	45224783	Y	CEACAM16,CLASRP	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	24043	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45231729	45232033	45231881	Y	IGSF23,CLASRP,APOC2	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	16929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45344497	45344782	45344640	Y	CEACAM16,NKPD1,CLASRP	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	2650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOC1	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	CD3EAP	24526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45945937	45946679	45946251	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	45946690	45947113	45946759	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N	ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	FOSB	22140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45953262	45953678	45953446	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,PPM1N,FOSB	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	15575	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	45953764	45954783	45954182	Y	NA	CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2	FOSB,VASP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	14470	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	11.2464117356169
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47142195	47142976	47142503	Y	NA	CALM3,PTGIR,DACT3	NA	NA	NA	NA	PTGIR	15820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	47221635	47221817	47221775	Y	ZC3H4,PRKD2	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	PRKD2	3251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47729030	47729228	47729064	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	MIR3191	831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47765844	47766042	47765943	Y	NA	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	8607	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr19	47854917	47855115	47854986	Y	ZC3H4,BBC3,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	4379	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47867147	47867265	47867191	Y	ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,DHX34	DHX34	NA	NA	NA	NA	DHX34	16609	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	47961170	47962467	47962382	Y	SLC8A2	KPTN	NA	NA	NA	NA	KPTN	23058	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr19	48151789	48152128	48151872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLTSCR2	94651	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	48629286	48629473	48629353	Y	NA	LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	LIG1	42387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,SYNGR4,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	48927915	48927964	48927940	Y	NA	KDELR1,GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	GRWD1	19066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	49465555	49466264	49465736	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	50004159	50004640	50004502	Y	PNKP,SNRNP70,C19orf73,CD37,PRR12,IRF3,BCL2L12,ALDH16A1,FLT3LG,FLT3LG,RPL13A,RPS11	ALDH16A1,PIH1D1,RPL13A,SNORD32A,SNORD33,RPS11,SNORD35B,RCN3	NA	NA	NA	NA	SNORD35B	5182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	50426616	50426838	50426710	Y	NR1H2,IL4I1,NUP62,NUP62,NUP62,NUP62,IL4I1,ATF5	TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62,MIR4751	NA	NA	NA	NA	ATF5	3121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	50833837	50834367	50834143	Y	MYH14,GPR32,SYT3,SYT3,SHANK1,LRRC4B,ASPDH,KCNC3	NR1H2,KCNC3,NAPSB	NA	NA	NA	NA	KCNC3	405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,KCNC3,NAPSB,POLD1,SPIB	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr19	50993680	50994951	50994565	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	17659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	51224129	51224276	51224235	Y	C19orf48,C19orf48,SHANK1,CLEC11A	SHANK1,CLEC11A	NA	NA	NA	NA	CLEC11A	310	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	51640125	51640352	51640134	Y	SIGLEC12,SIGLEC10,CD33,SIGLEC9	CTU1,SIGLEC7,SIGLEC17P	NA	NA	NA	NA	SIGLEC7	3204	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	51909569	51909701	51909635	Y	NA	ETFB,NKG7,SIGLEC10	NA	NA	NA	NA	SIGLEC10	9356	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	51964450	51964623	51964544	Y	SIGLEC7,CD33,SIGLEC6,SIGLEC10,SIGLEC8	SIGLEC10,SIGLEC12	NA	NA	NA	NA	SIGLEC12	38420	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	51964906	51965339	51965118	Y	ZNF613,SIGLEC9,SIGLEC7,CD33,ZNF649,ZNF175,SIGLEC6,SIGLEC10,SIGLEC8	SIGLEC10,SIGLEC12	NA	NA	NA	NA	SIGLEC12	37704	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	51989599	51989897	51989716	Y	NA	SIGLEC12,SIGLEC6	NA	NA	NA	NA	SIGLEC12	13146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	52194594	52195259	52195000	Y	ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR2	58020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	FPR2	NA	NA	NA	NA	FPR2	23463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	52697339	52697517	52697506	Y	ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766	ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	PPP2R1A	6047	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	53444729	53445104	53444918	Y	ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	875	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	NLRP12,MYADM	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr19	54713468	54714085	54713942	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	10858	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	54885175	54886148	54885583	Y	VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRA6,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	LAIR1	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LAIR1	5010	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	54886806	54887123	54887067	Y	VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,KIR3DL3,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR2,FCAR,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1	LAIR1	PRKCG,CACNG7,CACNG6,VSTM1,TSEN34,MBOAT7,RPS9	K562,HELA	5C	22955621	LAIR1	6641	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr19	55172562	55172744	55172629	Y	PPP1R12C,LILRB3,LILRA6,LILRB2,LILRA3,LILRA3,LILRA5,LAIR1,LENG8,LAIR2,KIR3DL3,FCAR,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRB4	LILRB4,LILRP1	NA	NA	NA	NA	LILRB4	19222	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	55540419	55540558	55540460	Y	SHISA7,KIR2DL3,NCR1	RDH13	NA	NA	NA	NA	RDH13	40101	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr19	55850120	55850505	55850225	Y	KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564	TMEM150B,SUV420H2,TMEM238,RPL28	NA	NA	NA	NA	SUV420H2	899	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr19	56117286	56117783	56117722	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	5950	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	56621885	56622165	56622061	Y	NA	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	8484	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	56823857	56823998	56823922	Y	ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	NA	ZSCAN5A	53754	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	56835887	56836393	56836023	Y	ZSCAN5A	ZSCAN5A	NLRP5,ZNF787	IMR90	Hi-C	24141950	ZSCAN5A	41359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	57944833	57945004	57944919	Y	NA	ZNF548,ZNF17,ZNF749,ZNF772	NA	NA	NA	NA	ZNF749	136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	57976528	57976751	57976646	Y	NA	ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773	NA	NA	NA	NA	ZNF772	10187	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	58886804	58887095	58886950	Y	ZNF606,ZSCAN22,ZNF324B	A1BG-AS1,A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584	NA	NA	NA	NA	ZNF837	3332	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	8231020	8231604	8231329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011747.4	490318	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	8532216	8532386	8532312	Y	NA	NA	LOC100506274,LOC339788	IMR90	Hi-C	24141950	AC011747.4	189536	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	8686801	8687006	8686925	Y	ID2	AC011747.4	LOC100506274,ID2,LOC339788,LINC00299	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC011747.4	34916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB1BP1	149982	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	9686288	9686554	9686518	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	7367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	9688603	9688902	9688848	Y	ADAM17	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	5019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	9941222	9941554	9941329	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	TAF1B	YWHAQ,KLF11,CYS1,ADAM17,ODC1,RRM2,GRHL1,TAF1B,HPCAL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAF1B	39929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	9955950	9956409	9956221	Y	TAF1B,GRHL1	TAF1B	RRM2,GRHL1,TAF1B,ODC1,ADAM17,CYS1,KLF11,HPCAL1,YWHAQ	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	25074	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10261505	10261712	10261609	Y	NA	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	1050	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10418251	10419155	10418675	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	21860	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10441145	10441558	10441458	Y	KLF11	HPCAL1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	HPCAL1	130	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10522808	10523000	10522904	Y	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ODC1	63630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	16845411	16845884	16845697	Y	FAM49A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49A	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEN1	108459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	20544740	20544866	20544805	Y	NA	PUM2	PUM2,HS1BP3	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	5129	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	20624612	20624982	20624777	Y	HS1BP3	RHOB	HS1BP3,RHOB,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	RHOB	19853	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPO	161636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	25508945	25509154	25508991	Y	DNAJC27,DNMT3A	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	54305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	25781272	25781487	25781393	Y	RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	217813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	26605539	26605826	26605756	Y	RAB10	GPR113	NA	NA	NA	NA	GPR113	37854	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	27878874	27879165	27879028	Y	SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP	GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L	NA	NA	NA	NA	SLC4A1AP	5173	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28024813	28024890	28024852	Y	IFT172,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L,MRPL33	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	32229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28319174	28319559	28319300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	207209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28400759	28401210	28400868	Y	RBKS,BRE,BRE,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	212105	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28582195	28582710	28582283	Y	NA	FOSL2	NA	NA	NA	NA	FOSL2	30605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28585996	28586077	28586031	Y	NA	FOSL2	SLC4A1AP,MRPL33,RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	FOSL2	27238	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28844259	28844848	28844625	Y	FOSL2,TRMT61B,PPP1CB,PPP1CB	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1CB	127658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28939068	28939564	28939261	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB	PPP1CB	PLB1,SLC4A1AP,PPP1CB,SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	32942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28953773	28954089	28953931	Y	NA	PPP1CB,SPDYA	PLB1,PPP1CB	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	18417	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	29060448	29060640	29060540	Y	PPP1CB,PPP1CB	TRMT61B	NA	NA	NA	NA	TRMT61B	30527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	31541593	31541798	31541696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	692501	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	32166229	32166498	32166237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEMO1	67801	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	37940534	37940802	37940700	Y	CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	22809	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	37989393	37989693	37989581	Y	QPCT,CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	25782	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38049848	38050212	38050057	Y	QPCT,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,LOC100505876,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	86237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38422036	38422352	38422194	Y	FAM82A1,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	86992	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38491745	38491933	38491807	Y	NA	NA	CYP1B1-AS1,CYP1B1,FAM82A1	IMR90	Hi-C	24141950	ATL2	110494	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38571888	38572175	38572032	Y	FAM82A1,ATL2	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	30252	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38599092	38599284	38599189	Y	FAM82A1	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	3143	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38621174	38621326	38621250	Y	NA	ATL2	ATL2,HNRPLL,SRSF7,DHX57,FAM82A1,GALM	IMR90	Hi-C	24141950	ATL2	18747	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	38840461	38840529	38840511	Y	GALM	NA	GALM,HNRPLL,ATL2,SRSF7	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GALM	50523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	40264573	40264733	40264653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	260166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	41963199	41963639	41963355	Y	EML4	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	309521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43245528	43245689	43245593	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	206059	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43336478	43336881	43336648	Y	OXER1	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	114867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43354941	43355119	43354996	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	96629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43355812	43355984	43355857	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	95764	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43359752	43360119	43360054	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	91629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr2	43401535	43402035	43401733	Y	OXER1,THADA,THADA,ZFP36L2	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZFP36L2	49713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43405877	43406433	43406206	Y	OXER1	ZFP36L2	ZFP36L2,THADA,LOC100129726	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	45315	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43421229	43421631	43421263	Y	HAAO,THADA,THADA	ZFP36L2	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZFP36L2	30117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	43440136	43440508	43440361	Y	OXER1,ZFP36L2	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	11240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr2	43496273	43496611	43496398	Y	NA	ZFP36L2	NA	NA	NA	NA	ZFP36L2	44525	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	44664975	44664991	44664983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	77886	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	44718441	44718530	44718486	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMKMT	131352	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	45161073	45161475	45161220	Y	SIX3	RP11-89K21.1	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	2863	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	45225232	45225342	45225296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	60894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	45405025	45405418	45405218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-89K21.1	240687	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	46409270	46409537	46409436	Y	EPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	109269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	47194379	47194775	47194547	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	27385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	48373241	48373406	48373298	Y	FOXN2	NA	FOXN2,PPP1R21	IMR90	Hi-C	24141950	FOXN2	166370	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	48559553	48559778	48559608	Y	FOXN2	FOXN2,RNU4-49P	NA	NA	NA	NA	RNU4-49P	6187	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	58938057	58938367	58938299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCL	471550	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	59463950	59464234	59464027	Y	NA	NA	POU2F1	MCF7	ChIA-PET	19890323	FANCL	997443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	60694839	60695290	60695042	Y	PAPOLG,BCL11A	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	83412	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	60757464	60757761	60757646	Y	NA	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	20941	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	61080674	61081167	61080838	Y	REL	REL	NA	NA	NA	NA	REL	25489	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	61580039	61580318	61580309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	115586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	61586795	61586939	61586907	Y	AHSA2,USP34	NA	NA	NA	NA	NA	USP34	108965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr2	62492233	62492490	62492397	Y	B3GNT2	NA	COMMD1	IMR90	Hi-C	24141950	B3GNT2	70985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	EHBP1	93576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	63411576	63411965	63411771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	401778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	63452850	63453196	63453026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDH1	360547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	64352533	64352773	64352693	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	16815	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	64446399	64446520	64446425	Y	NA	NA	PELI1,LINC00309	IMR90	Hi-C	24141950	PELI1	76811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	64756167	64756526	64756224	Y	NA	AFTPH	NA	NA	NA	NA	AFTPH	6702	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	64836549	64836646	64836605	Y	SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH	NA	NA	NA	NA	NA	AFTPH	87084	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	65173308	65173867	65173558	Y	AFTPH,SERTAD2	SLC1A4	SERTAD2,AFTPH,LOC339807,LOC400958,SLC1A4,CEP68,ACTR2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC1A4	39744	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr2	65328578	65328848	65328754	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	26392	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	65849750	65849939	65849914	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	191979	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	66721852	66722243	66721943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEIS1	63268	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	68263709	68263719	68263714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1D	72361	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	68428934	68429266	68429100	Y	NA	WDR92,PNO1	NA	NA	NA	NA	PNO1	45958	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	68499892	68500037	68499965	Y	NA	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	18523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	68593534	68593956	68593557	Y	C1D,PPP3R1,FBXO48,ARHGAP25,ARHGAP25,APLF,PLEK	PLEK	NA	NA	NA	NA	PLEK	3229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	69036777	69036835	69036806	Y	ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP25	132044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	69536922	69537085	69537004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	75297	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	69851897	69852398	69852223	Y	NA	ANXA4,AAK1	NA	NA	NA	NA	ANXA4	17159	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	70226911	70227071	70226991	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	ASPRV1	NA	NA	NA	NA	ASPRV1	39514	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	70823866	70823963	70823915	Y	TGFA	NA	NA	NA	NA	NA	ADD2	169394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	72849954	72850312	72850133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	200858	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	74408934	74409182	74409080	Y	NAT8B,TET3,MOBKL1B	BOLA3,BOLA3-AS1,MOB1A,MTHFD2	NA	NA	NA	NA	MOB1A	4909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	20337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	74968770	74968998	74968973	Y	TLX2,HK2	AC007387.2	HK2,SEMA4F	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007387.2	10948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	75894065	75894458	75894192	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	22156	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	75903279	75903482	75903481	Y	C2orf3,C2orf3	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	MRPL19	31370	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	RETSAT	84801	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	85764802	85765239	85764815	Y	SH2D6,USP39	MAT2A,GGCX,VAMP8	NA	NA	NA	NA	MAT2A	514	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	86226191	86226620	86226368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	104658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	86722014	86722392	86722297	Y	RMND5A	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	56244	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC096579.7	2772544	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	48395	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	98364129	98364314	98364298	Y	TMEM131,ZAP70,ZAP70	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	85559	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	98465985	98466159	98466067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	144229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	99173119	99173416	99173284	Y	INPP4A	COA5,UNC50	UNC50,COA5	IMR90	Hi-C	24141950	COA5	49562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	100412009	100412328	100412169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	307512	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	100576722	100576856	100576853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFF3	180345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	100650880	100650932	100650906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFF3	106269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	101712877	101712902	101712892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL31	96700	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	102380179	102380656	102380455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	68867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	102492851	102493221	102493042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	181539	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	106416912	106417146	106416970	Y	C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	57558	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	106417583	106417937	106417755	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NA	NA	NA	NA	NA	NCK2	58229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	109228635	109228941	109228810	Y	GCC2,RANBP2,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	79778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	113550957	113551489	113551296	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1B	CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CKAP2L	30703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	65291	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	114132430	114132930	114132660	Y	IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2	NA	PAX8,IL1RN,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	206734	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr2	114634434	114634643	114634539	Y	NA	ACTR3	ACTR3	IMR90	Hi-C	24141950	ACTR3	10894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	115177421	115177704	115177562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR3	531884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	119667637	119667656	119667647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	311728	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	127844543	127844919	127844728	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	18012	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128165400	128165641	128165534	Y	NA	MAP3K2	NA	NA	NA	NA	MAP3K2	21359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128207199	128207568	128207384	Y	NA	RNU4-48P	NA	NA	NA	NA	RNU4-48P	20242	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128469057	128469300	128469179	Y	NA	SFT2D3	NA	NA	NA	NA	SFT2D3	12460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	128651321	128651407	128651347	Y	PROC,LIMS2,AMMECR1L	POLR2D	SAP130	IMR90	Hi-C	24141950	POLR2D	37590	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	130201021	130201117	130201085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079776.4	494673	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr2	133304410	133304432	133304421	Y	NA	NA	LYPD1	IMR90	Hi-C	24141950	AC093838.4	1056024	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093838.4	1185329	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	135691118	135691392	135691265	Y	TMEM163,ACMSD,CCNT2	CCNT2	NA	NA	NA	NA	CCNT2	17313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	135701216	135701448	135701313	Y	NA	CCNT2	NA	NA	NA	NA	CCNT2	27411	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	136632932	136633416	136633308	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	MCM6	NA	NA	NA	NA	MCM6	936	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	136816831	136817220	136816922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXCR4	56515	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	136880226	136880532	136880413	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	NA	NA	NA	NA	CXCR4	6491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	136893434	136894485	136893919	Y	UBXN4,CXCR4,CXCR4	CXCR4	NA	NA	NA	NA	CXCR4	19699	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	138765071	138765376	138765123	Y	NA	HNMT	NA	NA	NA	NA	HNMT	45481	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	144754	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	140168949	140169074	140169000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	911578	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	10.2684628890415
chr2	141813454	141813825	141813640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	1819242	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	143580379	143580549	143580472	Y	KYNU	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	52518	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	143695947	143696225	143696015	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	62880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	143699726	143700104	143699915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KYNU	66659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	144160000	144160383	144160097	Y	ARHGAP15	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP15	313069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	145214152	145214623	145214350	Y	GTDC1,GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2-AS1	59041	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	145215157	145215664	145215657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2-AS1	58000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	145423698	145423921	145423827	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	143551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	145431100	145431323	145431229	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	150953	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	145439912	145440212	145440023	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	159765	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	145444229	145444926	145444607	Y	ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	164082	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	145459514	145460320	145459781	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	179367	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	148318690	148318914	148318854	Y	ACVR2A	NA	NA	NA	NA	NA	MBD5	457666	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	149371983	149372154	149372046	Y	EPC2	EPC2	KIF5C	IMR90	Hi-C	24141950	EPC2	27855	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	149403654	149404182	149403820	Y	NA	EPC2	NA	NA	NA	NA	EPC2	3645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	152144821	152144962	152144854	Y	RIF1,RIF1,RIF1,NMI	RBM43,NMI	NA	NA	NA	NA	NMI	250	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	152627978	152628361	152628290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	54645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	152757130	152757527	152757465	Y	CACNB4,CACNB4,CACNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ARL5A	74124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	157191997	157192231	157192220	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	4629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	158277241	158277773	158277564	Y	CYTIP	NA	NA	NA	NA	NA	CYTIP	65700	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	158323410	158323576	158323494	Y	ACVR1C,CYTIP	CYTIP	NA	NA	NA	NA	CYTIP	19897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	158325372	158325693	158325539	Y	CYTIP	CYTIP	NA	NA	NA	NA	CYTIP	17780	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	158325907	158326296	158326106	Y	CYTIP	CYTIP	NA	NA	NA	NA	CYTIP	17177	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	158719491	158719881	158719651	Y	ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	10493	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	160097747	160098072	160097910	Y	TANC1	WDSUB1	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	43238	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	160491864	160492115	160492090	Y	NA	AC009506.1,BAZ2B	BAZ2B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BAZ2B	20661	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	11.7353861589046
chr2	161431402	161431575	161431468	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS1	83097	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	165430240	165430431	165430256	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	1377922	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	166161416	166161745	166161474	Y	SCN2A,SCN2A	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	646608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	166462925	166463090	166463060	Y	TTC21B,SCN3A,SCN2A,CSRNP3,CSRNP3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	345263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	166631165	166631444	166631305	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	176909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	166778122	166778316	166778220	Y	NA	TTC21B	NA	NA	NA	NA	TTC21B	30037	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	168822360	168822564	168822456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	280087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	169347640	169347834	169347737	Y	NA	CERS6	NA	NA	NA	NA	CERS6	37268	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	172649817	172649933	172649875	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2	107898	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	173116941	173117298	173117012	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	151313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	174007383	174007707	174007544	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	209841	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	174016358	174016802	174016556	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	200746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	179471296	179471384	179471314	Y	TTN	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	87386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	182437511	182437525	182437518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERKL	105867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	186832070	186832214	186832142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	516669	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	187263813	187264095	187263899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZC3H15	84788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	188464486	188464724	188464607	Y	NA	NA	GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGAV	1011694	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	191075616	191075973	191075872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP1	130223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	191281859	191282262	191281977	Y	MFSD6	MFSD6	NA	NA	NA	NA	MFSD6	10778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	191406346	191406617	191406448	Y	NA	TMEM194B	INPP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194B	8898	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	192531478	192531803	192531720	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYO1B	423567	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1B	2034472	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	196427017	196427173	196427106	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	11528	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	196439142	196439289	196439263	Y	NA	SLC39A10	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	441	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	196515239	196515508	196515373	Y	NA	NA	SLC39A10	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC39A10	76538	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	196531201	196531576	196531334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	92500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	197075977	197076359	197076177	Y	STK17B	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	36750	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	197271750	197271952	197271866	Y	HECW2	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC150	230326	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	198029302	198029554	198029323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P3	96281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	198158784	198159350	198159060	Y	SF3B1,MOBKL3,MOBKL3,MOBKL3,COQ10B,ANKRD44	ATP5G2P3,ANKRD44	NA	NA	NA	NA	ANKRD44	14547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	201777095	201777270	201777183	Y	FAM126B,CFLAR,CFLAR	CLK1,PPIL3,NIF3L1,ORC2	NA	NA	NA	NA	NIF3L1	25045	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	201830040	201830326	201830203	Y	KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	3637	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	202752724	202752776	202752749	Y	ALS2	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P11	65453	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	202802147	202802175	202802161	Y	NA	NA	ALS2,CDK15,FZD7,NOP58	IMR90	Hi-C	24141950	UBE2V1P11	114876	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	206569997	206570271	206570078	Y	NA	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	25283	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	206948392	206948813	206948647	Y	NA	AC007383.3,INO80D	NA	NA	NA	NA	INO80D	214	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	208348288	208348659	208348648	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5	IMR90	Hi-C	24141950	CREB1	43802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	208656928	208657357	208657034	Y	FZD5	FZD5	PLEKHM3,CCNYL1,FZD5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD5	24641	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	215964526	215964926	215964726	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATIC	209614	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	216614389	216614747	216614614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PECR	330931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	216869710	216869915	216869809	Y	MREG	NA	NA	NA	NA	NA	PECR	75763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP2	592647	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	218953176	218953511	218953344	Y	NA	CXCR2P1,CXCR2	NA	NA	NA	NA	CXCR2P1	24724	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	199947	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	219774108	219774202	219774159	Y	USP37,TTLL4,NHEJ1,ANKZF1,ANKZF1	NA	NA	NA	NA	NA	TTLL4	200540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	FARSB	691645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	223462160	223462364	223462326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARSB	56692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	223709158	223709348	223709234	Y	SGPP2	ACSL3	ACSL3,MOGAT1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACSL3	14304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	223776983	223777159	223777060	Y	SGPP2	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL3	53331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225392496	225392764	225392746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUL3	55346	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225734569	225734902	225734735	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	170260	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225841174	225841410	225841405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	63752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225857926	225857937	225857931	Y	NA	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	47225	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225878647	225879031	225878803	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	26131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	225905656	225906528	225906251	Y	CUL3,DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	494	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	RHBDD1	NA	NA	NA	NA	RHBDD1	41736	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	231276384	231276790	231276706	Y	NA	SP100	NA	NA	NA	NA	SP100	1867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	231532055	231532298	231532144	Y	GPR55,SP100,SP100,CAB39	CAB39	CAB39	IMR90	Hi-C	24141950	CAB39	43262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	231815227	231815438	231815333	Y	NA	NA	ITM2C,LOC151484,GPR55,LOC348761,SPATA3,CAB39,C2orf72	IMR90	Hi-C	24141950	ITM2C	87873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	232106599	232106881	232106746	Y	B3GNT7	ARMC9,AC018738.2	NA	NA	NA	NA	AC018738.2	11929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	232227027	232227168	232227070	Y	PTMA,NMUR1	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	31086	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	232256793	232257091	232256822	Y	PTMA,NMUR1,B3GNT7	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	1163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	75682	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	12.71333500548
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMUR1	85673	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	232507409	232507767	232507481	Y	NA	NA	PDE6D	IMR90	Hi-C	24141950	PTMA	61838	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	233946973	233947142	233947080	Y	INPP5D	INPP5D	NA	NA	NA	NA	INPP5D	24296	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	234139975	234140056	234140022	Y	INPP5D,DGKD,ATG16L1	ATG16L1,SCARNA5	GIGYF2,KCNJ13,C2orf82,NGEF,INPP5D,ATG16L1	IMR90	Hi-C	24141950	ATG16L1	23278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	235199266	235199754	235199416	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	203943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	235331545	235331768	235331722	Y	ARL4C	NA	SPP2,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	71929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	235392262	235392984	235392812	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	10713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	237485035	237485347	237485185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS8	506608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	238191599	238191938	238191660	Y	NA	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	199644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	238382776	238383011	238382901	Y	LRRFIP1	NA	LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRFIP1	151208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	238421741	238422134	238421894	Y	MLPH	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	112085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	238583352	238583931	238583637	Y	UBE2F,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	49133	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr2	238611190	238611575	238611206	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	76971	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	240144687	240145031	240144830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	176099	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	240291335	240291754	240291620	Y	HDAC4	AC062017.1,HDAC4	NA	NA	NA	NA	AC062017.1	29376	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr2	240744258	240744435	240744345	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA10	218384	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	241585712	241586190	241585819	Y	DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2	GPR35	NA	NA	NA	NA	GPR35	42864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	242480531	242480899	242480752	Y	NA	STK25	NA	NA	NA	NA	STK25	33386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr2	243028160	243028467	243028224	Y	ATG4B	AC093642.5	NA	NA	NA	NA	AC093642.5	317	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	268547	268840	268655	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,SOX12	NA	NA	NA	NA	C20orf96	550	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	353974	354548	354311	Y	SRXN1,FAM110A	SOX12,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1	NA	NA	NA	NA	TRIB3	4713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	625872	626198	626085	Y	NA	SRXN1	NA	NA	NA	NA	SRXN1	5816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	1119535	1119804	1119673	Y	NA	PSMF1	NA	NA	NA	NA	PSMF1	27629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	NA	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	112837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	1470188	1470635	1470521	Y	SDCBP2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA,NSFL1C,SIRPB2	NSFL1C	NA	NA	NA	NA	SIRPB2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	1873360	1873375	1873370	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	206	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	3188788	3188839	3188809	Y	NA	UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	1274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	3411453	3411609	3411534	Y	C20orf194,PANK2	C20orf194,ATRN	ATRN,C20orf194	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf194	25181	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	3909447	3909819	3909642	Y	RNF24,RNF24,PANK2	PANK2	NA	NA	NA	NA	PANK2	41961	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	4070458	4070670	4070629	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	28957	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	4742297	4742542	4742380	Y	PRNP,PRNP,SLC23A2,RASSF2	NA	NA	NA	NA	NA	RASSF2	59749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	4942791	4943059	4943002	Y	RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2	SLC23A2	NA	NA	NA	NA	SLC23A2	45880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	5037420	5037933	5037775	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	SLC23A2	SLC23A2,C20orf30	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	48481	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	5060940	5061369	5061194	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	PCNA,CDS2	NA	NA	NA	NA	PCNA	43903	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr20	5639559	5639832	5639740	Y	PROKR2,GPCPD1,TRMT6	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	49887	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	5739573	5739619	5739595	Y	PROKR2	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	10534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	5741425	5741673	5741600	Y	NA	C20orf196	NA	NA	NA	NA	C20orf196	12386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	10197196	10197344	10197281	Y	SNAP25	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	215526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	10486121	10486184	10486148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	73251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	14769224	14769434	14769329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD2	795209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	17946136	17946538	17946496	Y	SNX5,SNX5	SNORD17,SNX5	NA	NA	NA	NA	SNX5	1085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	19804713	19804972	19804782	Y	NA	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RIN2	60193	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	19895665	19896589	19896325	Y	NA	RIN2	NA	NA	NA	NA	RIN2	30500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	20586775	20587103	20586803	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	104028	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	20590950	20591282	20591151	Y	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	99849	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	20652620	20652826	20652771	Y	NA	RALGAPA2	NA	NA	NA	NA	RALGAPA2	38305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	20724152	20724406	20724200	Y	RALGAPA2	RALGAPA2	RALGAPA2	IMR90	Hi-C	24141950	RALGAPA2	33021	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	22501465	22501665	22501547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	526713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	23067626	23068166	23067924	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	39248	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	23206035	23206305	23206209	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	THBD,CD93	IMR90	Hi-C	24141950	NXT1	123068	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	25267859	25268242	25268026	Y	NA	PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	41154	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	25305115	25305524	25305270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD12	64095	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	29647996	29648434	29648295	Y	DEFB121,DEFB116	FRG1B	NA	NA	NA	NA	FRG1B	38139	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	30262675	30263005	30262853	Y	HCK,BCL2L1	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	46787	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr20	30628092	30628575	30628310	Y	TM9SF4,PLAGL2,C20orf112,HCK	HCK	NA	NA	NA	NA	HCK	9416	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	30646515	30646916	30646613	Y	BCL2L1,PLAGL2,C20orf112,HCK	HCK,TM9SF4	NA	NA	NA	NA	HCK	8524	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	30793339	30793589	30793452	Y	HCK,TM9SF4,PLAGL2	PLAGL2,POFUT1	NA	NA	NA	NA	PLAGL2	5	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	31044923	31045080	31044970	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASXL1	100768	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	31410946	31411262	31411169	Y	NA	MAPRE1	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	5247	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	32093960	32094027	32093984	Y	NA	CBFA2T2	NA	NA	NA	NA	CBFA2T2	18079	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	33100877	33101215	33100990	Y	NA	FDX1P1,DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	DYNLRB1	999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	NA	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SCAND1	107196	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	35212579	35212832	35212706	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	TGIF2	12688	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	35258337	35258631	35258590	Y	RBL1,SLA2	C20orf24,SLA2	NA	NA	NA	NA	SLA2	13988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	35290523	35290606	35290565	Y	DLGAP4	SLA2	SLA2,TGIF2-C20ORF24	IMR90	Hi-C	24141950	SLA2	17904	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	35583660	35583902	35583783	Y	TGIF2,TGIF2,TGIF2	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	5414	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	35964748	35965459	35965134	Y	NA	MANBAL,SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	5629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36008343	36008504	36008424	Y	SAMHD1,MANBAL,SRC	SRC	NA	NA	NA	NA	SRC	37255	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36040566	36040861	36040811	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	31075	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36135409	36135682	36135567	Y	NA	NNAT,BLCAP	NA	NA	NA	NA	NNAT	11935	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36693519	36693713	36693616	Y	RPRD1B	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	33571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36722822	36723019	36722924	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	NA	NA	NA	NA	NA	RPRD1B	62874	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	36831796	36832119	36831958	Y	NA	TGM2	NA	NA	NA	NA	TGM2	38816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	37437739	37437969	37437791	Y	RALGAPB,DHX35,ACTR5,PPP1R16B	PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	PPP1R16B	5391	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	37484889	37485200	37485044	Y	SLC32A1,ACTR5,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R16B	52541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	38908222	38908337	38908279	Y	MAFB	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	407543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	39620099	39620424	39620302	Y	MAFB,TOP1	TOP1	TOP1,PLCG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	35034	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	39661985	39662084	39662008	Y	NA	TOP1	NA	NA	NA	NA	TOP1	6527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	40321359	40321668	40321514	Y	NA	NA	CHD6	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD6	76226	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	42379932	42380273	42380130	Y	NA	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	86178	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	42390017	42390272	42390131	Y	C20orf111,GTSF1L	NA	TOX2,JPH2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	96263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	43062949	43062981	43062965	Y	NA	RPL37AP1,TTPAL	NA	NA	NA	NA	RPL37AP1	30501	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	44736745	44736801	44736774	Y	ZNF335,CD40	NCOA5,RPL13P2	SLC12A5,CD40	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL13P2	10588	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	44737653	44737771	44737721	Y	WFDC3,C20orf165	NCOA5,RPL13P2	SLC12A5,CD40	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL13P2	11496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	46115894	46116142	46116064	Y	NCOA3	NCOA3	NCOA3,ZMYND8,EYA2	IMR90	Hi-C	24141950	NCOA3	12459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	46356086	46356757	46356412	Y	SULF2,SULF2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA3	227485	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	46627599	46627830	46627732	Y	NCOA3	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NCOA3	498998	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	NCOA3	525271	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	47339273	47339687	47339536	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	102733	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr20	47379085	47379213	47379130	Y	PREX1	NA	NA	NA	NA	NA	PREX1	63207	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	47400245	47400718	47400585	Y	ZNFX1,PREX1	PREX1	NA	NA	NA	NA	PREX1	41702	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	47463345	47463685	47463577	Y	ZNFX1	PREX1	PREX1	IMR90	Hi-C	24141950	PREX1	20925	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1,SNORD12B,SNORD12	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48316345	48316673	48316621	Y	NA	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	11742	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48317219	48317517	48317348	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	10898	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48367008	48367399	48367310	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	B4GALT5,SNRPFP1	B4GALT5	IMR90	Hi-C	24141950	SNRPFP1	22629	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48402411	48402524	48402488	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	24726	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48406651	48406821	48406652	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20429	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	48726581	48727101	48726820	Y	SPATA2,SPATA2	UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189	NA	NA	NA	NA	UBE2V1	3395	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	49067387	49067853	49067497	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90	Hi-C	24141950	PTPN1	57038	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	49072488	49072605	49072528	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C,MIR645,PARD6B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	52286	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	49967560	49968079	49967777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFATC2	209291	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	50141744	50142683	50142582	Y	NA	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	34687	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr20	50151529	50151841	50151712	Y	NFATC2	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NFATC2	25529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	50416703	50416783	50416765	Y	ZFP64,SALL4	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	67631	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	52195908	52196455	52196142	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27991	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	52196593	52196861	52196746	Y	TSHZ2,ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	27585	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	52356771	52357178	52357063	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	132325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	52480421	52480878	52480693	Y	ZNF217,PFDN4	SUMO1P1	NA	NA	NA	NA	SUMO1P1	9218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	52738263	52738706	52738357	Y	NA	NA	DOK5,SULF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFDN4	83680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	55379556	55380011	55379738	Y	TFAP2C	NA	TFAP2C	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CASS4	394388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	56255217	56255759	56255498	Y	ZBP1,PMEPA1	PMEPA1	NA	NA	NA	NA	PMEPA1	28833	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	56577898	56577909	56577904	Y	NA	NA	PMEPA1,C20orf85,ZBP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PMEPA1	293306	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	57270107	57270808	57270490	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	NPEPL1	7920	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	57670365	57670649	57670522	Y	NA	NA	ZNF831	IMR90	Hi-C	24141950	SLMO2	54401	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	58677979	58678143	58678083	Y	NA	C20orf197	C20orf197	MCF7	ChIA-PET	22265404	C20orf197	48999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	58680257	58680439	58680367	Y	PPP1R3D,C20orf177,CDH26,C20orf197	NA	C20orf197	MCF7	ChIA-PET	22265404	C20orf197	51277	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	58784200	58784511	58784424	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf197	155220	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	58803424	58803657	58803451	Y	PPP1R3D,C20orf177,C20orf197	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf197	174444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	58836675	58836957	58836817	Y	CDH26	NA	NA	NA	NA	NA	C20orf197	207695	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	60256764	60257074	60256889	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	TAF4	381792	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	61200879	61201219	61201079	Y	NA	NA	RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20	IMR90	Hi-C	24141950	SLCO4A1	70578	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr20	61903396	61903541	61903451	Y	NKAIN4	ARFGAP1	NA	NA	NA	NA	ARFGAP1	1259	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	62434819	62434987	62434973	Y	RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5	ZBTB46	NA	NA	NA	NA	ZBTB46	25610	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr20	62435328	62435422	62435366	Y	PRIC285,PRIC285,GMEB2,ZGPAT,ZGPAT,RGS19,RGS19,OPRL1,DNAJC5,TPD52L2	ZBTB46	NA	NA	NA	NA	ZBTB46	25175	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	16129964	16130277	16130229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMSN1	176241	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	16241159	16241535	16241312	Y	NRIP1	NA	NRIP1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NRIP1	193786	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	18891260	18891546	18891459	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTG3	91719	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	19156173	19156308	19156241	Y	C21orf91	C21orf91	NA	NA	NA	NA	C21orf91	33395	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	23793949	23794126	23794048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	985322	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	23855769	23855794	23855782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBAP	923654	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	26795177	26795760	26795474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	136461	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	26932540	26932977	26932658	Y	NA	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	319	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr21	30451583	30451905	30451778	Y	USP16,BACH1,BACH1,C21orf7	CCT8	NA	NA	NA	NA	CCT8	7465	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	30580486	30581464	30581071	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	BACH1	16094	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	30684361	30684712	30684409	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	119969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	32531402	32531778	32531665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOD1	498157	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	34431694	34432299	34432033	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2,OLIG1	NA	OLIG1	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	167907	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	34451074	34451134	34451104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFNAR2	149072	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	34571192	34571326	34571223	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,OLIG2,OLIG1,IFNAR2	IFNAR2	GCFC1-AS1,GCFC1,IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,C21orf54,GART,CRYZL1	IMR90,H1ESC,GM12878,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IFNAR2	28880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	34588402	34588745	34588581	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2	IFNAR2,IL10RB	IFNAR2,TMEM50B,IFNGR2	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	11461	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	35310348	35310699	35310436	Y	GART,GART,SON	ATP5O	NA	NA	NA	NA	ATP5O	24064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	35508184	35508396	35508291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC5A3	64314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	35917479	35917977	35917777	Y	KCNE1,RUNX1	KCNE1	NA	NA	NA	NA	KCNE1	34906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36214787	36216208	36215152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	332214	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36220332	36220721	36220527	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	337759	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	371631	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	375338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36326686	36327019	36326981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	444113	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	536717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNE1	541069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	37009808	37010026	37009922	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,LINC00160,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	364939	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	39236235	39236462	39236338	Y	DYRK1A,KCNJ15	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	500143	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	40176258	40176616	40176368	Y	NA	ETS2	NA	NA	NA	NA	ETS2	1027	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	40357559	40358114	40357780	Y	ETS2	NA	ETS2,WRB,LINC00114	IMR90,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	ETS2	182328	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	40376938	40377126	40376993	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	176651	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	40451581	40451961	40451677	Y	ETS2	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	101816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	40742482	40742667	40742571	Y	NA	HMGN1,WRB	BRWD1,BRWD1-IT2,WRB	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WRB	7503	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	41524041	41524191	41524116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BGR	708260	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	43885293	43886049	43885531	Y	ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A	SLC37A1	NA	NA	NA	NA	SLC37A1	28069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	44166782	44167013	44166806	Y	UBASH3A,PKNOX1	NA	NA	NA	NA	NA	WDR4	130665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	44395922	44396228	44396080	Y	WDR4,U2AF1,CBS	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	3302	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	44799670	44799851	44799743	Y	SIK1	SIK1	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90	Hi-C	24141950	SIK1	45157	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	44988675	44988868	44988840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	88506	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	45557942	45558217	45558021	Y	AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33,AP001056.1	NA	NA	NA	NA	C21orf33	6455	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33,AP001056.1	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	45577373	45578052	45577512	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	C21orf33,AP001056.1	NA	NA	NA	NA	AP001056.1	15320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr21	46294509	46294819	46294590	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	2757	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	13485	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	47008132	47008435	47008135	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027	IMR90	Hi-C	24141950	SLC19A1	45807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	47010467	47010705	47010586	Y	NA	SLC19A1	PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC19A1	48142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	47266684	47266899	47266840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	132752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	47312098	47312312	47312190	Y	SLC19A1,SLC19A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL6A1	87339	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr21	47935050	47935239	47935141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2A	58238	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr22	19930770	19931097	19930953	Y	ZDHHC8,COMT	COMT,TXNRD2	NA	NA	NA	NA	TXNRD2	3429	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	20287043	20287283	20287165	Y	NA	XXbac-B444P24.10,DGCR6L	NA	NA	NA	NA	XXbac-B444P24.10	1760	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	20848736	20849050	20848893	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	536	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	20850844	20851071	20850923	Y	PI4KA,AIFM3,AIFM3	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	2644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr22	22170870	22171333	22171102	Y	HIC2,PPM1F,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	48637	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	22417614	22417915	22417690	Y	PPM1F	NA	TOP3B,LOC96610	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TOP3B	82401	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	22478098	22478432	22478244	Y	CCDC116,YPEL1,ZNF280B	NA	NA	NA	NA	NA	TOP3B	142885	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr22	23226163	23226651	23226399	Y	IGLL5	NA	NA	NA	NA	NA	BCR	293240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	23285622	23285920	23285770	Y	IGLL5	NA	RTDR1,GNAZ,IGLL5,BCR	IMR90	Hi-C	24141950	BCR	233971	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	23863943	23864332	23864232	Y	GNAZ,RTDR1,BCR	NA	ZDHHC8P1	IMR90	Hi-C	24141950	GUSBP11	193211	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr22	24536526	24536664	24536595	Y	LOC391322,C22orf13	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L	128122	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr22	24752898	24753006	24752951	Y	UPB1	NA	NA	NA	NA	NA	ADORA2A	58841	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	24907169	24907526	24907423	Y	GGT1	SNRPD3	NA	NA	NA	NA	SNRPD3	41945	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	27131212	27131584	27131334	Y	NA	NA	MN1,PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	64482	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	28066220	28066571	28066325	Y	PITPNB,MN1	NA	MIAT,MN1	IMR90	Hi-C	24141950	TTC28-AS1	246793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	28115717	28115905	28115775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	197459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	28549378	28549438	28549411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	235256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr22	28837872	28838192	28838073	Y	TTC28	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	297827	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr22	28956104	28956479	28956470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSCB	179540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	29206791	29206989	29206921	Y	EMID1,CCDC117,XBP1	CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6	XBP1	K562	ChIA-PET	22265404	CTA-292E10.6	12120	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	29280564	29280869	29280661	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	2984	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	29598879	29599169	29599017	Y	EMID1	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	29601085	29601300	29601289	Y	NA	EMID1	NA	NA	NA	NA	EMID1	1245	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	29640757	29640993	29640832	Y	NA	EMID1,EWSR1,RHBDD3	NA	NA	NA	NA	EWSR1	21005	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	NA	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSM	58730	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	OSM	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	OSM	8784	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	66473	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	RP1-90G24.10	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-90G24.10	15949	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	36821515	36821891	36821703	Y	IFT27	MYH9	MYH9,FOXRED2,TXN2	IMR90	Hi-C	24141950	MYH9	39452	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	37258335	37258758	37258531	Y	RAC2,CYTH4,NCF4,CSF2RB	NCF4,CSF2RB	NA	NA	NA	NA	NCF4	3305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr22	37558444	37558999	37558665	Y	SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB	IL2RB	NA	NA	NA	NA	IL2RB	10095	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	Z82188.1,CYTH4	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr22	37663226	37663580	37663275	Y	MFNG,MFNG,NCF4,RAC2	Z82188.1,RAC2,CYTH4	CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2	IMR90	Hi-C	24141950	CYTH4	12488	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr22	37986436	37986718	37986607	Y	CYTH4,SH3BP1,EIF3L,LGALS2,GGA1,GGA1	CDC42EP1,GGA1,SH3BP1	NA	NA	NA	NA	GGA1	15763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	39253318	39253463	39253391	Y	KCNJ4,LOC646851	NPTXR,CBX6	NA	NA	NA	NA	CBX6	12856	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	39838942	39839059	39838998	Y	APOBEC3D	TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	45196	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	40347638	40347876	40347797	Y	GRAP2	NA	FAM83F	IMR90	Hi-C	24141950	UQCRFS1P1	78345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr22	41259898	41259909	41259904	Y	NA	SLC25A17,ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	8817	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr22	41460471	41460696	41460583	Y	NA	RP11-12M9.3,EP300	RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-12M9.3	2415	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr22	41776948	41777130	41776981	Y	NA	TEF	NA	NA	NA	NA	TEF	15611	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	42062739	42062953	42062873	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19990	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	42839941	42840323	42840234	Y	POLDIP3,C22orf32,TCF20,RRP7A,NFAM1	NFAM1	MEI1,TCF20,NDUFA6,LOC100132273,C22orf32,CYP2D6,NFAM1,WBP2NL,RNU12,POLDIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAM1	13540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	43327845	43328148	43328016	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	75733	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	45012617	45012993	45012776	Y	NA	PRR5	NA	NA	NA	NA	PRR5	49600	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	45553376	45553664	45553597	Y	NA	NUP50	NA	NA	NA	NA	NUP50	4058	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	45624322	45624510	45624404	Y	KIAA0930	KIAA0930	NA	NA	NA	NA	KIAA0930	10140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	46928379	46928595	46928487	Y	NA	GRAMD4	NA	NA	NA	NA	GRAMD4	41314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	46989093	46989561	46989508	Y	TBC1D22A,CERK,GRAMD4	GRAMD4	GRAMD4,CELSR1	IMR90	Hi-C	24141950	GRAMD4	19184	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr22	47250044	47250415	47250236	Y	CERK,TBC1D22A	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	93526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr22	47848340	47848433	47848387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	691822	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	48883958	48884244	48884181	Y	FAM19A5	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	1164946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	49765184	49765573	49765231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	283617	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C22orf34	280198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr22	50154074	50154212	50154143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	64948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50242140	50242406	50242374	Y	MLC1,HDAC10	BRD1,ZBED4	ZBED4,BRD1	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBED4	3084	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr22	50248429	50248807	50248623	Y	TUBGCP6,TRABD,SELO,PIM3,MOV10L1,HDAC10,BRD1,ZBED4	BRD1,ZBED4	NA	NA	NA	NA	ZBED4	2939	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50622526	50622601	50622565	Y	NA	TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	TRABD	182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50629840	50630128	50630062	Y	BRD1,ZBED4,PIM3,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TRABD,TUBGCP6,SELO,HDAC10	TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	SELO	7280	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,XX-C283C717.1,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr22	51060079	51060266	51060136	Y	TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,PPP6R2,SBF1,NCAPH2,CHKB,ARSA	CHKB-CPT1B,CHKB,ARSA	NA	NA	NA	NA	ARSA	4341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	2815094	2815396	2815245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRNT1	351204	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	4516473	4516898	4516756	Y	NA	SUMF1,ITPR1-AS1,ITPR1	SUMF1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	SUMF1	9508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	4561829	4562207	4561897	Y	BHLHE40,ITPR1	ITPR1-AS1,ITPR1	NA	NA	NA	NA	ITPR1	28797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	5067974	5068590	5068209	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	49173	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	5239354	5239686	5239551	Y	NA	EDEM1	NA	NA	NA	NA	EDEM1	12023	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	8335682	8335807	8335745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	205586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	10395342	10395455	10395399	Y	NA	SEC13	NA	NA	NA	NA	SEC13	34480	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	11324850	11325078	11324951	Y	HRH1,ATG7	ATG7	NA	NA	NA	NA	ATG7	12855	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	11612359	11612503	11612424	Y	HRH1,ATG7	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	147717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	11688028	11688035	11688032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	72185	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	13452835	13453081	13452953	Y	IQSEC1,HDAC11,HDAC11	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	6728	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	13455554	13455885	13455702	Y	NUP210	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	3924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	13460446	13460799	13460651	Y	NA	NUP210	NA	NA	NA	NA	NUP210	637	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	14692297	14692322	14692310	Y	NA	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	22284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	14715115	14715196	14715168	Y	NR2C2,C3orf20	C3orf20	NA	NA	NA	NA	C3orf20	509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15352253	15352542	15352441	Y	NA	SH3BP5	NA	NA	NA	NA	SH3BP5	28333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15450643	15451124	15450971	Y	ANKRD28,NR2C2,CAPN7,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5	EAF1,METTL6	NA	NA	NA	NA	EAF1	15738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15582631	15583012	15582735	Y	ANKRD28,SH3BP5,METTL6,EAF1,COLQ	COLQ	NA	NA	NA	NA	COLQ	21373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15695837	15696119	15696028	Y	HACL1	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	54499	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	15835826	15836097	15835987	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD28	63181	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	16352603	16353027	16352777	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	47897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	16489627	16489868	16489748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	63665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	17307041	17307245	17307143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	753508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	17404652	17404912	17404782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	851119	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	17506581	17506846	17506713	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	953048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	940686	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18005686	18005921	18005797	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	478388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18013789	18014053	18013921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	470256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18022713	18023080	18023018	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	461229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18024656	18024931	18024818	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	459378	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18060236	18060629	18060433	Y	TBC1D5,TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	423680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18210791	18210985	18210888	Y	TBC1D5,TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	273324	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr3	18237686	18238028	18237782	Y	TBC1D5	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	246281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18252681	18253057	18252788	Y	TBC1D5,SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	231252	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	6.84564192602769
chr3	18278854	18279224	18279039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	205085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18366679	18366900	18366790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	117409	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18399008	18399057	18399033	Y	SATB1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	85252	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18403160	18403568	18403352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	80741	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18409984	18410150	18410103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	74159	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr3	18415394	18415659	18415606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	68650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18423285	18423595	18423440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	60714	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18430720	18430774	18430747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	53535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18485117	18485365	18485120	Y	NA	TBC1D5,AC144521.1,SATB1	NA	NA	NA	NA	SATB1	37	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18571233	18571621	18571333	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	6544	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	18598150	18598373	18598222	Y	SATB1	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	19985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	20145803	20146135	20145937	Y	KAT2B	NA	NA	NA	NA	NA	KAT2B	66288	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	22755487	22755669	22755574	Y	UBE2E2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	334177	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-96P	121245	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	29983920	29984245	29984164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR2	661749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	31268600	31269021	31268879	Y	NA	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	303109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	32002546	32002801	32002555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPD1L	142380	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	32549205	32549429	32549313	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	6305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	32557705	32558097	32557882	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	14805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	33638872	33639200	33639124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	118648	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	33639579	33639904	33639592	Y	CLASP2	NA	NA	NA	NA	NA	CLASP2	117944	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	35105790	35105810	35105799	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	1267946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	38144034	38144304	38144167	Y	VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88	ACAA1,MYD88	NA	NA	NA	NA	ACAA1	32429	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	39222162	39222653	39222434	Y	NA	CSRNP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	28109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	40491258	40491489	40491375	Y	NA	ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619	NA	NA	NA	NA	ENTPD3-AS1	1331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	43368782	43368949	43368860	Y	NA	SNRK	NA	NA	NA	NA	SNRK	42778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	45208648	45208845	45208728	Y	LIMD1	RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	8981	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	45609249	45609611	45609389	Y	LIMD1	LIMD1	NA	NA	NA	NA	LIMD1	14363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	46135224	46135371	46135312	Y	CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1	NA	CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	FYCO1	99908	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	46332561	46332856	46332710	Y	NA	NA	CCR3	IMR90	Hi-C	24141950	CCR2	60369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.40076980958923
chr3	46341741	46342039	46341904	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR2	NA	SLC6A20,CCR9,CCR3,CCR5,LOC100132146,FYCO1	IMR90	Hi-C	24141950	CCR2	51186	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	46363058	46363374	46363232	Y	CCR1,CCR5,CCRL2,CCRL2	CCR2,CCR5	CCRL2	IMR90	Hi-C	24141950	CCR2	29851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	46397850	46397950	46397901	Y	CCR1,CCRL2,CCRL2,CCR3,CCR2	CCR2,CCR5,CCRL2	NA	NA	NA	NA	CCR2	4625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	46591078	46591347	46591239	Y	CCR2	NA	NA	NA	NA	NA	ALS2CL	141847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	47002825	47003246	47003204	Y	NA	NBEAL2,CCDC12	NA	NA	NA	NA	NBEAL2	15927	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	47204029	47204492	47204291	Y	NA	SETD2,KIF9-AS1	NA	NA	NA	NA	KIF9-AS1	42	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	49286239	49286578	49286497	Y	ARIH2,DALRD3,NDUFAF3,RHOA,USP4	NA	NA	NA	NA	NA	KLHDC8B	79195	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	49358291	49358883	49358713	Y	ARIH2,C3orf71,NDUFAF3,DALRD3,QRICH1,USP19,UBA7,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	17262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	49382516	49382833	49382703	Y	ARIH2,DALRD3,UBA7,RHOA,IP6K1,USP4	USP4,GPX1	NA	NA	NA	NA	USP4	6371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	49425171	49425361	49425266	Y	ARIH2,QRICH1,USP4,UBA7	USP4,GPX1,TCTA,RHOA,NICN1	NA	NA	NA	NA	TCTA	22278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	GNAI2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	50370591	50370860	50370724	Y	RBM6,SEMA3B,RASSF1	IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115	NA	NA	NA	NA	RASSF1	5551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	50629910	50630235	50630098	Y	MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	16716	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	50639346	50639782	50639525	Y	C3orf18,HEMK1,MAPKAPK3,CISH	HEMK1,C3orf18,MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK3	7169	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	52091161	52091675	52091445	Y	TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	2595	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	52121101	52121264	52121190	Y	NA	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	32535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	52531917	52532418	52532268	Y	TWF2,PPM1M,PPM1M,WDR82,GLYCTK,PBRM1,PBRM1,STAB1	NISCH,STAB1,NT5DC2	NA	NA	NA	NA	STAB1	4563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	52704686	52705129	52704984	Y	WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1	GNL3,PBRM1,SPCS1,GLT8D1	NA	NA	NA	NA	GNL3	8043	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	53283824	53284319	53284192	Y	PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	3749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	56818012	56818198	56818042	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	102747	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr3	56822055	56822193	56822075	Y	CCDC66,C3orf63,ARHGEF3	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	106790	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57555554	57555589	57555572	Y	FAM116A,PDE12	PDE12,ARF4	NA	NA	NA	NA	PDE12	15551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57637831	57638080	57637955	Y	SLMAP,FAM116A,PDE12	NA	NA	NA	NA	NA	ARF4	55884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57639210	57639572	57639391	Y	SLMAP,FAM116A	NA	NA	NA	NA	NA	ARF4	57263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57874517	57874643	57874579	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FLNB	117484	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57963451	57963815	57963633	Y	NA	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	28312	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	57968397	57968639	57968468	Y	PDE12,PXK	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	23488	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	58341032	58341142	58341087	Y	DNASE1L3	RPP14,PXK	NA	NA	NA	NA	PXK	24425	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	58411955	58412199	58412053	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	5385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	59851860	59851984	59851945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	818050	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	62052710	62052952	62052831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	249696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	64200446	64200649	64200513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	192788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	67455058	67455415	67455236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	247623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	68183215	68183532	68183374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	480177	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	69131956	69132274	69132164	Y	TMF1,ARL6IP5	TMF1,UBA3	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71136796	71137147	71137136	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493993	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71137411	71137566	71137489	Y	FOXP1	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	493574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71149356	71149810	71149695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	481330	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71267437	71267786	71267612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	363354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71439009	71439199	71439166	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	191941	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71465988	71466289	71466193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	164851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71493467	71493739	71493621	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	137401	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71535859	71536392	71536211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	94748	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	71588104	71588187	71588146	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	42953	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr3	71634476	71634568	71634542	Y	NA	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	3336	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	73159773	73160145	73159855	Y	EBLN2	NA	PDZRN3,CACNA1D	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CCDC75P1	70297	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	75199894	75200047	75199971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	282214	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	75229755	75230024	75229900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86DP	252237	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr3	78867121	78867519	78867219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	947446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	81766105	81766391	81766248	Y	NA	GBE1	NA	NA	NA	NA	GBE1	42921	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	85120525	85120655	85120534	Y	CADM2	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	2153766	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP2B	275121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	1144696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr3	98273466	98273625	98273512	Y	GPR15	CLDND1,CPOX	NA	NA	NA	NA	CLDND1	33556	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	98291884	98292296	98292041	Y	OR5H6,OR5H2,CLDND1	CPOX	NA	NA	NA	NA	CPOX	18271	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	98497288	98497481	98497360	Y	ST3GAL6	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	48208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL6	55645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	99614794	99615242	99614937	Y	TBC1D23	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D23	362602	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	99764609	99765000	99764644	Y	FILIP1L,C3orf26	NA	TMEM30C	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	212844	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	101403455	101403770	101403678	Y	SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24	ZBTB11,CEP97	NA	NA	NA	NA	RPL24	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	101645465	101645839	101645546	Y	NA	NA	FAM55C,NFKBIZ,LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	100630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	105088270	105088514	105088471	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4517	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	105486064	105486421	105486242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	99975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	105626736	105626952	105626872	Y	NA	CBLB	NA	NA	NA	NA	CBLB	40340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	107376610	107376921	107376801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	136827	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	107705661	107706042	107705959	Y	CD47	NA	MYH15,IFT57,CD47,LOC285205	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD47	101830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	111877933	111878040	111878010	Y	SLC9A10	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD10	182076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	112994855	112995215	112995035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPICE1	236819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	114229118	114229529	114229296	Y	ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	455658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	114349924	114350199	114350024	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	576464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	114374818	114375057	114374945	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	601358	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	114724447	114724794	114724621	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1407	950987	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	119019675	119019984	119019904	Y	ARHGAP31,ADPRH	ARHGAP31-AS1	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31-AS1	19623	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	119514057	119514298	119514132	Y	NR1I2,NR1I2	NA	NA	NA	NA	NA	COX17	119756	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	121374377	121374548	121374517	Y	EAF2,HCLS1,GOLGB1	HCLS1	NA	NA	NA	NA	HCLS1	3226	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	121717719	121718002	121717892	Y	EAF2,CSTA,CD86	NA	NA	NA	NA	NA	CD86	54211	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	121807586	121807708	121807647	Y	NA	CD86	NA	NA	NA	NA	CD86	35373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	122074989	122075000	122074995	Y	NA	CSTA,CCDC58,FAM162A	NA	NA	NA	NA	CCDC58	25078	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	122201925	122202222	122202174	Y	NA	KPNA1	NA	NA	NA	NA	KPNA1	29570	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	122400701	122401439	122401076	Y	CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14	PARP14	NA	NA	NA	NA	PARP14	3236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	123241172	123241525	123241376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPLB	60507	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	123263878	123263964	123263921	Y	ADCY5,ADCY5	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPLB	38068	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N2.1	91582	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	126249002	126249358	126249248	Y	ZXDC,UROC1,CHST13	NA	NA	NA	NA	NA	ZXDC	56240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	126391611	126391660	126391640	Y	NA	CHCHD6	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	29403	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128337505	128337705	128337543	Y	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	60213	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128475272	128475670	128475352	Y	RAB7A,ISY1,CNBP	RAB7A,FTH1P4	NA	NA	NA	NA	FTH1P4	6191	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	128564550	128565114	128564776	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	31325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.8676930794523
chr3	128565439	128565717	128565506	Y	KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	30722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128573463	128573773	128573618	Y	DNAJB8,C3orf27	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	22666	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	KIAA1257,GP9	NA	NA	NA	NA	KIAA1257	26306	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	128957834	128958071	128957930	Y	NA	NA	KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNBP	57069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	129180710	129180864	129180787	Y	IFT122	MBD4,IFT122	NA	NA	NA	NA	IFT122	23742	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	129655699	129655849	129655774	Y	NA	TMCC1	TMCC1,TRH,IFT122,MBD4,LOC100507032	IMR90	Hi-C	24141950	TMCC1	45280	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	131168625	131168945	131168770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL3	50882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	133537876	133537890	133537883	Y	NA	SRPRB	NA	NA	NA	NA	SRPRB	36999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	136067042	136067151	136067097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	99894	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	136153802	136154197	136154172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCCB	186654	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	136448168	136448437	136448423	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	20783	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	137938227	137938395	137938336	Y	ARMC8	DBR1,ARMC8	NA	NA	NA	NA	ARMC8	34118	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	138582294	138582582	138582441	Y	MRPS22	PIK3CB	PIK3CB	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3CB	30514	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	139271371	139271598	139271484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NMNAT3	123261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	141102647	141102881	141102782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	101008	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	141397804	141398070	141397938	Y	NA	NA	RASA2,ATP1B3,GRK7	IMR90	Hi-C	24141950	RNF7	56976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	146224364	146224853	146224698	Y	NA	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	35798	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	147742029	147742238	147742134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P20	140847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	149499134	149499345	149499187	Y	NA	COMMD2,RNF13	COMMD2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF13	29150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	149657313	149657850	149657694	Y	TSC22D2,RNF13	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	128818	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	149665230	149665637	149665395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF13	136735	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	150983738	150984063	150983889	Y	P2RY14	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	182254	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151066126	151066377	151066226	Y	MED12L,GPR87,P2RY12	NA	NA	NA	NA	NA	MED12L	264642	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151914650	151914811	151914728	Y	NA	MBNL1	MBNL1	IMR90	Hi-C	24141950	MBNL1	44806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151918966	151919116	151919042	Y	NA	MBNL1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	40501	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151923088	151923367	151923343	Y	MBNL1	MBNL1	MBNL1,LOC401093	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MBNL1	36250	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.82359077260307
chr3	151970606	151970904	151970617	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	10989	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	151971438	151971777	151971516	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1	11821	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151974707	151975007	151974858	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	10337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151975130	151975682	151975593	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	9662	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151976173	151976628	151976408	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8716	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	151978363	151978615	151978373	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	6729	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	151993494	151994006	151993570	Y	NA	MBNL1,MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	8150	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr3	152026905	152027295	152026911	Y	NA	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	41561	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr3	152120876	152121103	152120983	Y	MBNL1	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	135532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	156442773	156442811	156442792	Y	TIPARP,TIPARP,TIPARP	NA	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	52606	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	158226530	158226854	158226539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLF1	60098	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	158440805	158440990	158440882	Y	MFSD1	MFSD1	NA	NA	NA	NA	MFSD1	6997	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	158528713	158528852	158528755	Y	MFSD1	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD1	80726	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	167181640	167181820	167181812	Y	SERPINI2	NA	NA	NA	NA	NA	WDR49	187951	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	167243322	167243651	167243487	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR49	126120	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	167369160	167369394	167369277	Y	NA	WDR49	NA	NA	NA	NA	WDR49	377	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	168606249	168606616	168606433	Y	NA	NA	EGFEM1P	IMR90	Hi-C	24141950	GOLIM4	794486	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	169482089	169482431	169482154	Y	NA	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	TERC	1241	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	169502698	169502873	169502785	Y	GPR160,MYNN,LRRC34	TERC,MYNN,LRRC34	NA	NA	NA	NA	MYNN	14079	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	169872442	169872609	169872497	Y	NA	PHC3	NA	NA	NA	NA	PHC3	24928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	170073991	170074311	170074218	Y	SKIL,SKIL	SKIL	NA	NA	NA	NA	SKIL	525	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr3	170979718	170979982	170979850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	355236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	171792323	171792831	171792493	Y	PLD1,FNDC3B	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	36905	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	171816708	171816982	171816800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	61290	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	171903822	171903993	171903901	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	148404	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	199108	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	172264557	172265002	172264759	Y	NA	TNFSF10	TNFSF10,NCEH1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF10	25260	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	176776147	176776153	176776150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	137108	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	176912879	176913389	176913098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	LRRFIP1P1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1P1	1287	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	179122098	179122379	179122239	Y	NA	GNB4	NA	NA	NA	NA	GNB4	44999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	181564319	181564507	181564413	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC19	858757	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	183231092	183231442	183231267	Y	B3GNT5,KLHL6,KLHL24	KLHL6	NA	NA	NA	NA	KLHL6	40035	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	184727770	184727947	184727859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS8	199839	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	185339016	185339200	185339107	Y	NA	SENP2	NA	NA	NA	NA	SENP2	40732	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	77293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	185533882	185534105	185533994	Y	NA	IGF2BP2	SENP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGF2BP2	6739	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	186244233	186244290	186244262	Y	ST6GAL1	DNAJB11,TBCCD1	NA	NA	NA	NA	DNAJB11	38902	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	186490704	186490868	186490793	Y	ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2	EIF4A2,RFC4	NA	NA	NA	NA	EIF4A2	8126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	186715660	186715959	186715816	Y	RTP1,ST6GAL1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	69386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	186746012	186746360	186746185	Y	RTP1,ST6GAL1	NA	NA	NA	NA	NA	ST6GAL1	99738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	187495200	187495392	187495316	Y	RTP4,BCL6,BCL6,BCL6	BCL6	BCL6,LPP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCL6	33685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	187686706	187686977	187686870	Y	BCL6,BCL6	NA	BCL6,LPP,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	182095	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	188149383	188149832	188149544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	279538	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	188223633	188224028	188223838	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	353788	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	188666473	188667138	188666837	Y	NA	NA	LPP,BCL6,LPP-AS2	IMR90	Hi-C	24141950	LPP-AS2	796628	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPA1	435145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	194261428	194261556	194261501	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3,TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208,TMEM44	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	41184	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr3	194973636	194973680	194973658	Y	NA	XXYLT1	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	16216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	195430866	195431240	195430948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R2	162657	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	195627582	195627903	195627662	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	TNK2-AS1	NA	NA	NA	NA	TNK2-AS1	5044	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	195921077	195921299	195921227	Y	UBXN7,RNF168,LRRC33,TM4SF19,PCYT1A	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	91529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	195946209	195946432	195946330	Y	UBXN7,RNF168,CEP19,TNK2,PCYT1A,ZDHHC19	NA	NA	NA	NA	NA	PCYT1A	66396	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196347011	196347384	196347194	Y	PCYT1A,RNF168,SENP5,LRRC33	PIGX	WDR53,FBXO45,SENP5,UBXN7,LRRC33	IMR90	Hi-C	24141950	PIGX	17262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196351343	196351605	196351435	Y	LRRC33	PIGX	WDR53,FBXO45,SENP5,UBXN7,LRRC33	IMR90	Hi-C	24141950	PIGX	13041	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196352325	196352506	196352427	Y	SENP5,LRRC33	PIGX	SENP5,FBXO45,C3orf43,PAK2	IMR90	Hi-C	24141950	PIGX	12140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196389876	196389952	196389914	Y	LRRC33	PIGX,CEP19	NA	NA	NA	NA	PIGX	25230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196694427	196694825	196694642	Y	NA	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	693278	693552	693364	Y	GAK,MFSD7,PCGF3	MYL5,ATP5I,PCGF3	NA	NA	NA	NA	PCGF3	3985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	1968542	1968629	1968571	Y	WHSC1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	73060	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	RNF4	NA	NA	NA	NA	RNF4	46583	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	3085381	3085754	3085447	Y	NA	HTT	NA	NA	NA	NA	HTT	10973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	3127770	3127782	3127776	Y	RGS12,SH3BP2	NA	NA	NA	NA	NA	HTT	53362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	3709851	3710272	3710103	Y	NA	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	LRPAP1	177565	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	3829713	3829948	3829819	Y	ADRA2C	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	FAM86EP	125198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	4542716	4543043	4542880	Y	ZBTB49,STX18	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	6754865	6755056	6754928	Y	NA	MRFAP1L1,KIAA0232	LOC100129931,TADA2B,KIAA0232,TBC1D14	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KIAA0232	26046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	6785099	6785509	6785391	Y	TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232	KIAA0232	NA	NA	NA	NA	KIAA0232	3997	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	6887984	6888235	6888115	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	20734	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr4	6941693	6941980	6941913	Y	NA	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	32724	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	6959680	6959690	6959685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D14	50711	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	7981410	7981607	7981517	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	41757	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	RAB28	438441	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	15775826	15776085	15775905	Y	FGFBP2	RP11-115L11.1,CD38	CC2D2A,CD38	IMR90	Hi-C	24141950	CD38	1813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	17853657	17853735	17853696	Y	NA	DCAF16,NCAPG	NA	NA	NA	NA	NCAPG	43132	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	20627000	20627372	20627197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PACRGL	68533	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	25808541	25808922	25808732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEL1L3	54460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	26123354	26123506	26123386	Y	NA	RBPJ	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	39571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	26219568	26220289	26219918	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ,STIM2	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	56491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr4	26289394	26289659	26289610	Y	RBPJ,RBPJ	NA	RBPJ	IMR90	Hi-C	24141950	RBPJ	126317	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	26994323	26994529	26994430	Y	STIM2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	134102	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	37759790	37760114	37760015	Y	RELL1,TBC1D1	NA	RELL1	IMR90	Hi-C	24141950	PGM2	66141	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	38665008	38665204	38665059	Y	TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3	KLF3	NA	NA	NA	NA	KLF3	1191	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	TLR1,TLR6,FAM114A1	NA	NA	NA	NA	TLR1,TLR6	2696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	39813102	39813401	39813252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2K	115438	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	39908966	39909133	39909103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDS5A	68443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	40056293	40056591	40056356	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	40240312	40240963	40240621	Y	RHOH,RBM47	RHOH	NA	NA	NA	NA	RHOH	49639	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	44712631	44712762	44712670	Y	NA	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	13850	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	48125578	48125743	48125738	Y	TEC	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	144138	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	48131569	48131907	48131778	Y	TXK	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	137974	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	48195485	48195896	48195611	Y	SLAIN2	NA	NA	NA	NA	NA	TEC	73985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr4	48229621	48229933	48229743	Y	CNGA1	TEC	NA	NA	NA	NA	TEC	39948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	48851417	48851730	48851443	Y	ZAR1,FRYL	OCIAD1	NA	NA	NA	NA	OCIAD1	46188	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	53890542	53890886	53890882	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	164085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	53921700	53922021	53921911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASL11B	195243	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	55574456	55574839	55574648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIT	52371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	58192382	58192585	58192405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	217831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	68266370	68266649	68266476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA6	298248	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	70697485	70697758	70697651	Y	SULT1B1	NA	NA	NA	NA	NA	UTP3	854438	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	71677284	71677574	71677429	Y	NA	GRSF1	NA	NA	NA	NA	GRSF1	26088	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	74055104	74055142	74055123	Y	ANKRD17,ALB,AFM	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD17	67373	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	74600882	74601361	74601097	Y	ANKRD17,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	NA	IL8,PF4V1,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,PPBPL2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTHFD2L	376530	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	75539265	75539284	75539274	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTHFD2L	561374	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	77869398	77869850	77869619	Y	SEPT11	SEPT11	NA	NA	NA	NA	SEPT11	542	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	78014068	78014466	78014356	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	18910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	78711096	78711128	78711114	Y	NA	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	27641	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	78842671	78842943	78842808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL1	60997	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	80900549	80900754	80900650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	143854	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	80979830	80980309	80980136	Y	ANTXR2	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	64299	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr4	83383009	83383387	83383198	Y	NA	ENOPH1	NA	NA	NA	NA	ENOPH1	33294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	83912303	83912539	83912423	Y	NA	LIN54,COPS4	NA	NA	NA	NA	LIN54	19540	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	83986763	83986874	83986796	Y	NA	COPS4	NA	NA	NA	NA	COPS4	33163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	84029980	84030193	84029996	Y	NA	PLAC8	NA	NA	NA	NA	PLAC8	26035	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	84153273	84153480	84153394	Y	THAP9,PLAC8,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2	NA	PLAC8,COPS4	IMR90	Hi-C	24141950	COQ2	50587	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	87177601	87177837	87177745	Y	MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	AFF1	676317	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	87882810	87883321	87882982	Y	KLHL8,AFF1,AFF1	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	13534	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	87894121	87894618	87894307	Y	NA	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	TECRP1	24845	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	89747458	89747948	89747469	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	130072	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	90850750	90851156	90851023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAP1L5	1233364	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	93748552	93748577	93748565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCAD1	1378185	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	96133625	96133991	96133679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5C	334366	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	96351676	96352072	96351938	Y	UNC5C	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5C	116285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	96466701	96466894	96466857	Y	NA	UNC5C	NA	NA	NA	NA	UNC5C	1463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	99319477	99319794	99319573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAP1GDS1	138942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	99984592	99984944	99984751	Y	NA	ADH5	NA	NA	NA	NA	ADH5	23008	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	100731573	100731850	100731699	Y	NA	DAPP1	RG9MTD2,LOC256880,DNAJB14,H2AFZ	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DAPP1	4140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	101502580	101502805	101502658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZ	633035	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	103608721	103609347	103609253	Y	NHEDC1,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	NA	NA	NA	NA	NA	MANBA	70804	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	103673229	103673433	103673315	Y	NHEDC1,NFKB1,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,MANBA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	6718	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	103678847	103679008	103678977	Y	NA	MANBA	NA	NA	NA	NA	MANBA	1143	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	103937289	103937350	103937320	Y	NA	SLC9B1	NA	NA	NA	NA	SLC9B1	1546	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	106628155	106628490	106628322	Y	NA	GSTCD	NA	NA	NA	NA	GSTCD	220	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	106841550	106841937	106841687	Y	TBCK,LOC100507096	INTS12	NA	NA	NA	NA	INTS12	26407	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	108758517	108758852	108758585	Y	SGMS2,SGMS2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	118909	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	114366444	114366711	114366574	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	26965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	115371462	115371746	115371604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	690379	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	NA	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	BBS12	67445	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	124538169	124538584	124538401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATA5	695940	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	127487763	127488061	127487932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTU	1054365	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	139300997	139301320	139301159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC7A11	139494	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	140003738	140004448	140004114	Y	CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2	NA	CCRN4L	K562	ChIA-PET	22265404	CCRN4L	68795	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	140331152	140331480	140331316	Y	NA	RAB33B	NA	NA	NA	NA	RAB33B	40906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	140656102	140656508	140656327	Y	MAML3	NA	NA	NA	NA	NA	MGST2	71180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	140891718	140892054	140891918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	181284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	140986447	140986603	140986580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML3	86735	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	141071159	141071540	141071326	Y	NA	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	1798	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	141071687	141072625	141072041	Y	MAML3	MAML3	NA	NA	NA	NA	MAML3	713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	143276364	143276478	143276442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP38	827592	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	146024258	146024314	146024286	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ANAPC10	6565	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	146856855	146857112	146856936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM6	237725	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	152650918	152651090	152650938	Y	NA	PET112	NA	NA	NA	NA	PET112	29085	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	153445736	153446128	153446118	Y	NA	MIR4453	NA	NA	NA	NA	MIR4453	9288	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	154408922	154409996	154409474	Y	NA	KIAA0922	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	23424	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr4	154463481	154463580	154463534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0922	77983	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	154562795	154563024	154562959	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	57628	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	164464203	164464350	164464219	Y	NPY1R,NPY5R,MARCH1	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	378130	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	164465601	164465786	164465694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAF1	379528	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	RP11-366M4.2,NACA3P,TRIM61	NA	NA	NA	NA	TRIM61	14196	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	174210504	174211007	174210885	Y	GALNT7	HMGB2	NA	NA	NA	NA	HMGB2	43269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	180979740	180980372	180979835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	2618083	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	181045421	181045488	181045454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGA	2683764	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr4	181279045	181279446	181279246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	2557643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	185115354	185115759	185115584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	277975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	186823839	186824139	186824048	Y	CCDC110,SORBS2	NA	NA	NA	NA	NA	CYP4V2	286535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	190485123	190485226	190485156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	143642	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	190504163	190504534	190504471	Y	FRG1	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	124334	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr4	190708637	190708848	190708802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-51P	79769	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr4	190936592	190936699	190936668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRG1	76649	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	360822	360962	360952	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	80296	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	372694	372970	372922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	68288	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	373392	373627	373429	Y	EXOC3,C5orf55,PDCD6	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67631	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr5	373695	374160	373984	Y	EXOC3	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf55	67098	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	13.6912838520554
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	11.2464117356169
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	402925	403258	403130	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	38000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr5	424842	424963	424905	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	C5orf55	16295	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	448605	448866	448667	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	EXOC3	7332	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	486422	486571	486496	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5	NA	NA	NA	NA	CTD-2228K2.5	15209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	656184	656577	656381	Y	SLC9A3,ZDHHC11,TPPP	CEP72,TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	34933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	672861	673336	673024	Y	NA	TPPP	NA	NA	NA	NA	TPPP	18174	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr5	963791	964176	964051	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	31247	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr5	964244	964536	964396	Y	NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	30887	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	13.2023094287677
chr5	964858	965249	965055	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	SLC12A7,TRIP13,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	30174	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	1022145	1022187	1022166	Y	SLC6A18,NKD2	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	15201	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	1041596	1043550	1041859	Y	NA	RP11-43F13.3,NKD2	NA	NA	NA	NA	NKD2	34652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr5	1108916	1109348	1109069	Y	LPCAT1,SLC12A7	SLC12A7	NA	NA	NA	NA	SLC12A7	802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	2740702	2741010	2740867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	941188	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	3188206	3188572	3188389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	1388692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	5026027	5026363	5026168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	392414	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	5351586	5351742	5351664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0947	67035	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr5	9345635	9345646	9345641	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM173B	902363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	10743646	10743952	10743932	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	15432	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	14545472	14545570	14545529	Y	NA	FAM105A	FAM105A,TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	FAM105A	34314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	16819706	16820004	16819855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-55B8.1	80746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	17317191	17317354	17317270	Y	NA	RN7SKP133	BASP1,LOC285696,LOC401177	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP133	26371	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr5	34037436	34037722	34037670	Y	NA	AMACR	NA	NA	NA	NA	AMACR	31216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR70	363244	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	39215442	39215743	39215646	Y	RICTOR,FYB	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	56887	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	40442487	40442716	40442609	Y	PTGER4,PRKAA1	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	234884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	40486540	40486993	40486708	Y	PTGER4,CARD6	NA	PTGER4	IMR90	Hi-C	24141950	PTGER4	190607	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	41465247	41465490	41465440	Y	PLCXD3	NA	NA	NA	NA	NA	OXCT1	403131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	43480579	43480813	43480696	Y	NA	C5orf28,C5orf34	NA	NA	NA	NA	C5orf28	1182	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	49918361	49918461	49918412	Y	NA	PARP8	NA	NA	NA	NA	PARP8	41272	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	49989954	49990143	49990051	Y	EMB,PARP8	PARP8	NA	NA	NA	NA	PARP8	30221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	50036304	50036403	50036354	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP8	76571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	52333334	52333832	52333660	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOCS2	70061	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	309388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	54622279	54622499	54622328	Y	NA	DHX29,SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	20691	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	54722913	54723133	54723024	Y	SKIV2L2	NA	NA	NA	NA	NA	SKIV2L2	121325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	55711184	55711637	55711363	Y	MAP3K1	NA	MAP3K1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC022431.1	87262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	56131312	56131556	56131415	Y	GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1	MAP3K1	NA	NA	NA	NA	MAP3K1	21911	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	58156479	58156810	58156634	Y	GAPT,PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	PLK2	402392	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	59086263	59086677	59086406	Y	PDE4D	NA	NA	NA	NA	NA	DEPDC1B	907340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	60239574	60239836	60239702	Y	ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8	ERCC8	NA	NA	NA	NA	ERCC8	674	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	64372561	64372759	64372749	Y	FAM159B	NA	CWC27,ADAMTS6	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	309804	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	64755187	64755203	64755196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	101795	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CENPK	78260	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	65918246	65918267	65918259	Y	MAST4	NA	NA	NA	NA	NA	SREK1	484447	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	67663192	67663439	67663285	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	153644	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	67806918	67806931	67806925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	297370	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	68338463	68338878	68338699	Y	NA	SLC30A5	NA	NA	NA	NA	SLC30A5	48595	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	70991073	70991448	70991288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCCC2	109958	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	74163639	74163858	74163748	Y	NA	NA	GFM2	IMR90	Hi-C	24141950	GFM2	102443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	74805918	74806308	74805968	Y	NA	POLK	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	75034241	75034569	75034405	Y	NA	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	22928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	75206184	75206581	75206350	Y	IQGAP2,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP	NA	SV2C	IMR90	Hi-C	24141950	POC5	194871	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	76977025	76977227	76977132	Y	OTP	NA	NA	NA	NA	NA	WDR41	62589	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	77765293	77765351	77765322	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	110954	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	77882234	77882399	77882291	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	181445	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	78204289	78204572	78204406	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARSB	75338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	78857059	78857243	78857149	Y	PAPD4	HOMER1,PAPD4	NA	NA	NA	NA	PAPD4	48700	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	79553045	79553765	79553579	Y	NA	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	3147	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	80394008	80394030	80394018	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	201349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	80579237	80579431	80579394	Y	NA	CKMT2-AS1,ZCCHC9	NA	NA	NA	NA	CKMT2-AS1	15948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	80989989	80990372	80990282	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	55244	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	NA	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP2	102021	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	82769870	82770125	82769934	Y	TMEM167A,VCAN	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	398188	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	83588624	83588917	83588807	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM167A	1216942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	86653612	86653965	86653789	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNH	52871	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88063737	88063896	88063817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	113249	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88109262	88109325	88109294	Y	MEF2C,MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	67820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88120689	88121105	88120942	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	56040	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88125046	88125161	88125149	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	51984	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88182731	88182852	88182759	Y	MEF2C,MEF2C	MEF2C-AS1,MEF2C	NA	NA	NA	NA	MEF2C-AS1	5586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	88597488	88597631	88597603	Y	MEF2C	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2C	399566	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	92958001	92958327	92958133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P27	59046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	94038768	94039036	94038830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	86459	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	94052096	94052474	94052285	Y	KIAA0825	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0825	99787	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	94363177	94363338	94363238	Y	MCTP1	NA	NA	NA	NA	NA	MCTP1	254941	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	101404486	101404751	101404619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAM	682934	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	111110231	111110436	111110341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD4	263943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	112383528	112383665	112383560	Y	DCP2,YTHDC2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP2	73129	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	113754554	113754720	113754637	Y	KCNN2,KCNN2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNN2	59912	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	115794810	115794877	115794844	Y	COMMD10,SEMA6A	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-118N6.1	101381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	118165526	118165828	118165677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP2	141663	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	118677194	118677610	118677495	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	74807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	118703348	118703546	118703439	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	82592	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	119079822	119079988	119079905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSD17B4	293684	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	125773418	125773804	125773609	Y	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	79594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	126015927	126016326	126016055	Y	LMNB1,LMNB1	NA	LMNB1,MEGF10	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-395C3.1	53916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	131108111	131108375	131108174	Y	NA	FNIP1	NA	NA	NA	NA	FNIP1	22335	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	131802496	131802987	131802660	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.5,AC116366.6,IRF1	NA	NA	NA	NA	AC116366.6	3748	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	AC116366.6,IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	133432825	133433199	133433076	Y	PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7	TCF7	TCF7,SKP1	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7	15203	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	NA	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIPNL	55877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	CTC-276P9.1	101864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	134729736	134729896	134729816	Y	NA	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	3708	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	134733668	134734080	134733976	Y	H2AFY	H2AFY	NA	NA	NA	NA	H2AFY	64	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	134791969	134792408	134792068	Y	H2AFY	TIFAB	H2AFY	K562	ChIA-PET	22265404	TIFAB	5880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr5	136900041	136900222	136900186	Y	NA	SPOCK1	TRPC7	IMR90	Hi-C	24141950	SPOCK1	31846	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	137800317	137800564	137800421	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1	EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	1138	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	138058227	138058591	138058405	Y	NA	NA	CTNNA1,SIL1,MATR3,LRRTM2	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	113571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	138325344	138325620	138325482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	281821	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	138838499	138838633	138838566	Y	TMEM173	TMEM173	NA	NA	NA	NA	TMEM173	21887	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	138965572	138965797	138965632	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXXC5	59087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	139040519	139041115	139040855	Y	PAIP2	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	15635	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	34929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	140893513	140893891	140893828	Y	PCDH12,KIAA0141,DIAPH1	PCDHGC3	NA	NA	NA	NA	PCDHGC3	39933	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	141444983	141445199	141445045	Y	NA	NDFIP1	FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1	IMR90	Hi-C	24141950	NDFIP1	40871	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	142182965	142183820	142183151	Y	ARHGAP26	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	35016	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	142219370	142219769	142219465	Y	ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	71421	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	142321536	142321658	142321563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	173587	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	142357164	142357537	142357332	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	209215	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	142930383	142930535	142930459	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	CTB-57H20.1	52658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	143702129	143702425	143702277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF5	153851	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	147248632	147248939	147248760	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO38	512559	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	148187476	148187823	148187533	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	16333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	148668144	148668260	148668168	Y	AFAP1L1	NA	NA	NA	NA	NA	GRPEL2	54733	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	149284540	149284708	149284614	Y	CSNK1A1,SLC26A2,HMGXB3	NA	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	53592	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	149317888	149318128	149317985	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	20172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	149456060	149456090	149456075	Y	NA	CSF1R	NA	NA	NA	NA	CSF1R	34845	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	149667554	149667894	149667725	Y	SYNPO,SLC6A7,CAMK2A	NA	NA	NA	NA	NA	TCOF1	67308	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	150159490	150160262	150159991	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	22819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.8676930794523
chr5	150161319	150161633	150161505	Y	ANXA6,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	24648	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	150163031	150163501	150163387	Y	TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	26360	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	150461516	150462400	150461744	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	8738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	151108065	151108456	151108379	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	NA	NA	NA	NA	RP11-54C4.1	35483	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	151213355	151213633	151213423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	63262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	153569046	153569266	153569156	Y	NA	GALNT10	NA	NA	NA	NA	GALNT10	756	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL22	552820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	156503614	156503701	156503659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	64179	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	159414162	159414427	159414404	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	19693	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	159927852	159928388	159928094	Y	PWWP2A,SLU7	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	81023	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	159934271	159934508	159934340	Y	SLU7	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	87442	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	163184649	163184740	163184695	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	256529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	163321722	163321949	163321817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAT2B	393602	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	167343894	167343960	167343927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	372696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	167741798	167742197	167741960	Y	WWC1	WWC1	NA	NA	NA	NA	WWC1	25142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	169262270	169262286	169262278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	200019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	169301637	169301901	169301769	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	239386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	169308907	169309212	169309070	Y	DOCK2,LCP2	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK2	246656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	169717491	169717845	169717740	Y	NA	LCP2	NA	NA	NA	NA	LCP2	5386	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	225943	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	170134160	170134177	170134169	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP17	152697	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	171039588	171039891	171039740	Y	NA	NA	FBXW11	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	227468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	171577546	171577959	171577717	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	35431	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	171602273	171602685	171602548	Y	STK10	STK10	NA	NA	NA	NA	STK10	10705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	171839597	171840252	171839919	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	130522	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr5	172915268	172915394	172915342	Y	NA	NA	STC2	IMR90	Hi-C	24141950	BOD1	126269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	173205115	173205307	173205218	Y	CPEB4	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	107976	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	175116445	175116962	175116612	Y	HRH2	HRH2	NA	NA	NA	NA	HRH2	33412	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	175118111	175118311	175118228	Y	HRH2	HRH2	NA	NA	NA	NA	HRH2	35078	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.8676930794523
chr5	175121597	175121899	175121773	Y	HRH2	HRH2	NA	NA	NA	NA	HRH2	38564	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	176699119	176699281	176699198	Y	NSD1	RAB24,PRELID1,MXD3	NA	NA	NA	NA	RAB24	29464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	176782864	176783054	176782988	Y	NA	MXD3,LMAN2,RGS14,GRK6	NA	NA	NA	NA	RGS14	26	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	177739679	177740143	177740040	Y	CLK4	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	110171	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	177812572	177812778	177812666	Y	CLK4	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	183064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	177904382	177904800	177904603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL23A1	110756	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr5	177910614	177910888	177910852	Y	AGXT2L2,COL23A1,CLK4	NA	NA	NA	NA	NA	COL23A1	104668	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr5	177913220	177913638	177913531	Y	COL23A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL23A1	101918	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	177933093	177933334	177933266	Y	NHP2,HNRNPAB,COL23A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL23A1	82222	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	179350502	179350731	179350619	Y	RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130	TBC1D9B	RNF130	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D9B	17643	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	179434619	179435010	179434852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF130	62108	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	179575752	179576029	179575891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASGEF1C	58124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr5	179604412	179604725	179604569	Y	RASGEF1C	RASGEF1C	NA	NA	NA	NA	RASGEF1C	29428	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr5	180615428	180615595	180615512	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM41	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	1329	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	293338	293822	293579	Y	NA	DUSP22	NA	NA	NA	NA	DUSP22	3708	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	501922	502087	502051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF4	112183	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	2081468	2081822	2081645	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	162104	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	2763022	2763072	2763047	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	576	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	2763251	2763536	2763387	Y	NA	WRNIP1	NA	NA	NA	NA	WRNIP1	112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	2818912	2819151	2819031	Y	SERPINB1	SERPINB1	NA	NA	NA	NA	SERPINB1	21089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	3072108	3072295	3072201	Y	NA	RIPK1,BPHL	NA	NA	NA	NA	RIPK1	9883	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	3987035	3987350	3987158	Y	NA	PRPF4B	SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194	IMR90	Hi-C	24141950	PRPF4B	32151	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	5190782	5191184	5190977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYRM4	67988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	5266800	5267044	5266922	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	7523	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	5296297	5296648	5296345	Y	NA	LYRM4,FARS2	NA	NA	NA	NA	FARS2	37020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	5671479	5671687	5671530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	412202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	5724236	5724398	5724319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	464959	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6005714	6006036	6005928	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	313210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6008887	6009261	6009138	Y	NRN1	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	309985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6407628	6407920	6407729	Y	LY86	NA	NA	NA	NA	NA	F13A1	88382	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6627704	6627959	6627832	Y	NA	LY86	NA	NA	NA	NA	LY86	41363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6707572	6707761	6707694	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1,SSR1,SNRNP48	IMR90	Hi-C	24141950	LY86	121231	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	6717376	6717439	6717378	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	LY86	131035	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6858872	6859247	6858991	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	246583	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	6885637	6886125	6885854	Y	LY86,RREB1,RREB1	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	219705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	7112981	7113125	7113000	Y	RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	7151	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	7130548	7130794	7130662	Y	RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	24718	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	7202193	7202713	7202370	Y	RIOK1,SSR1,RREB1,RREB1	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	96363	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	10458287	10458428	10458359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAK1IP1	234500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	10719904	10720278	10720060	Y	NA	PAK1IP1,C6orf52,TMEM14C,TMEM14B,SYCP2L	NA	NA	NA	NA	TMEM14C	870	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	11072389	11072644	11072517	Y	NA	NA	C6orf228	IMR90	Hi-C	24141950	MAK	235625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	216926	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13396164	13396432	13396321	Y	TBC1D7,GFOD1,GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	69349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	13454706	13455038	13454979	Y	RANBP9,TBC1D7,GFOD1,GFOD1	GFOD1	NA	NA	NA	NA	GFOD1	30856	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13597663	13598060	13597862	Y	NA	SIRT5,NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	15499	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13630387	13630831	13630754	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	16828	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	13762938	13763200	13763069	Y	RNF182	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP9	53142	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	14638705	14639298	14639002	Y	NA	NA	JARID2	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	522833	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	14657070	14657479	14657115	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CD83	541198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr6	15580663	15580900	15580755	Y	JARID2	NA	NA	NA	NA	NA	DTNBP1	80389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	16684658	16685097	16684682	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	74625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	16687739	16687973	16687884	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	71749	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	16699529	16700051	16699938	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN1	59671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	17925685	17925969	17925835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF13A	59885	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	20811412	20811642	20811580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKAL1	278724	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	21273280	21273316	21273298	Y	SOX4	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	318656	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	21587723	21589288	21589205	Y	SOX4	SOX4	LINC00340,CDKAL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	SOX4	2684	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	24951869	24952437	24952321	Y	ALDH5A1,KIAA0319,KIAA0319,TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	22210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	25006784	25007291	25007025	Y	TDP2,C6orf62	PPIAP29	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	32137	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	25043414	25043566	25043497	Y	TDP2,C6orf62	NA	FAM65B	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	68767	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	25168126	25168486	25168327	Y	C6orf62	NA	CMAHP,FAM65B,LRRC16A	IMR90	Hi-C	24141950	PPIAP29	193479	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	25815535	25815661	25815655	Y	SLC17A3,SLC17A1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM38	145369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr6	26026306	26026795	26026679	Y	HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	826	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	26304989	26305345	26305268	Y	NA	HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H	HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIST1H4H	21227	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	26521003	26521206	26521108	Y	HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	927	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	26521444	26521777	26521577	Y	NA	HCG11,HMGN4	NA	NA	NA	NA	HCG11	1368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	26550694	26551000	26550826	Y	NA	HCG11,HMGN4,ABT1	NA	NA	NA	NA	HMGN4	14061	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	28072476	28072872	28072543	Y	HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192	ZNF165,ZSCAN16	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	17466	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr6	29932777	29932958	29932802	Y	HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A	HLA-K,HLA-A	NA	NA	NA	NA	HLA-A	25740	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	30069810	30070038	30069951	Y	HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	37324	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	30477053	30477329	30477202	Y	PPP1R11,TRIM40,TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,HLA-E,PRR3	RANP1,HLA-E,PRR3,GNL1	NA	NA	NA	NA	HLA-E	21809	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	32427743	32428120	32427936	Y	PRRT1	HLA-DRA	NA	NA	NA	NA	HLA-DRA	22124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	32802290	32802518	32802510	Y	NA	TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1	NA	NA	NA	NA	TAP2	2039	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	33792376	33792455	33792405	Y	CUTA,C6orf1	LEMD2	IP6K3,GRM4,RPS10-NUDT3,C6orf106,LEMD2,LOC100507584,MIR1275	IMR90	Hi-C	24141950	LEMD2	37463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	34150537	34150894	34150814	Y	HMGA1	CYCSP55	C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYCSP55	34322	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	34358644	34359014	34358829	Y	NA	NUDT3,RPS10	NA	NA	NA	NA	NUDT3	193	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	34631608	34631780	34631736	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	30856	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	36204828	36205160	36205000	Y	BRPF3,SRSF3,PXT1,KCTD20,CDKN1A,CDKN1A	BRPF3,RP1-179N16.6	NA	NA	NA	NA	RP1-179N16.6	41846	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	36975377	36975678	36975474	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,PIM1,FTSJD2,FGD2	MTCH1,FGD2	NA	NA	NA	NA	FGD2	3955	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	38447266	38447403	38447335	Y	DNAH8,BTBD9,BTBD9	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	158521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	40964511	40964818	40964666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFYA	73866	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	41153851	41154204	41154120	Y	TREML4,TREM1,NFYA	TREM2,TREML2	NA	NA	NA	NA	TREML2	12728	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	41686086	41686432	41686391	Y	NA	TFEB	NA	NA	NA	NA	TFEB	15565	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	41889955	41890338	41890119	Y	FRS3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	3029	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	41907242	41907431	41907365	Y	TAF8,TFEB,CCND3	USP49,MED20,BYSL	NA	NA	NA	NA	BYSL	20316	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	42259187	42259201	42259195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS10	75584	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	42361651	42361664	42361659	Y	TRERF1	NA	NA	NA	NA	NA	TRERF1	56125	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	43084087	43084410	43084171	Y	PTK7	NA	NA	NA	NA	NA	SRF	52627	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	43692783	43693195	43692965	Y	TJAP1,MAD2L1BP	MRPS18A,VEGFA	MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS18A	39255	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	43769637	43769823	43769746	Y	NFKBIE,TJAP1	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	33716	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	43774176	43774478	43774332	Y	NA	VEGFA	NA	NA	NA	NA	VEGFA	38255	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	43878497	43878687	43878563	Y	GTPBP2,MRPS18A	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf223	87630	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	43945734	43945924	43945799	Y	NFKBIE	C6orf223	LOC100132354,POLH,MAD2L1BP,RSPH9,GTPBP2,VEGFA,C6orf223,MRPS18A	IMR90	Hi-C	24141950	C6orf223	20393	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	44070488	44070804	44070651	Y	NA	TMEM63B,MRPL14	NA	NA	NA	NA	TMEM63B	21847	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	44205272	44205504	44205346	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	7320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	44205807	44206020	44205896	Y	NA	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE	NA	NA	NA	NA	HSP90AB1	6804	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	44594803	44595107	44595003	Y	AARS2	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	241541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	44595651	44596101	44596012	Y	NA	NA	CLIC5,SUPT3H,RUNX2	IMR90	Hi-C	24141950	CDC5L	242389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45335233	45335541	45335303	Y	NA	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	8149	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45392235	45392572	45392528	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48545	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45409618	45409900	45409810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	65928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45503403	45503548	45503462	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	159713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	45649659	45650055	45649841	Y	NA	NA	RUNX2,CDC5L	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	305969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	47263537	47263554	47263549	Y	NA	TNFRSF21	NA	NA	NA	NA	TNFRSF21	12087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	47831581	47831627	47831604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD2AP	388056	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	49138743	49138828	49138786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	290076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	49302208	49302375	49302292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	126529	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	51084563	51084693	51084631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-437C15.1	188642	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	52345672	52345732	52345729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC1	62566	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	52376478	52376751	52376615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62962	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1586	612779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	58776280	58777091	58777029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	521711	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	58777244	58778438	58777771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	522675	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	64398084	64398491	64398303	Y	PHF3	NA	NA	NA	NA	NA	PHF3	54359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	74186150	74186447	74186193	Y	MTO1	MB21D1,MTO1,EEF1A1	NA	NA	NA	NA	MTO1	16849	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	75997264	75997445	75997280	Y	NA	COX7A2,TMEM30A	NA	NA	NA	NA	TMEM30A	4580	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr6	77981127	77981489	77981308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	1593700	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	79758680	79758772	79758726	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	27181	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	82307017	82307238	82307128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	153253	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	83737150	83737334	83737242	Y	NA	DOPEY1	NA	NA	NA	NA	DOPEY1	38051	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	84931248	84931348	84931298	Y	NA	KIAA1009	NA	NA	NA	NA	KIAA1009	4005	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	87881047	87881581	87881092	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	20496	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	87897430	87897787	87897609	Y	NA	ZNF292	NA	NA	NA	NA	ZNF292	36879	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	88213981	88214157	88214070	Y	GJB7	SLC35A1	NA	NA	NA	NA	SLC35A1	35640	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	88401154	88401337	88401278	Y	NA	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	8590	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	94860177	94860339	94860258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MANEA	1163080	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	96546026	96546326	96546099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UFL1	421145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	105743987	105744339	105744163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PREP	104620	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	106611101	106611647	106611464	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM1	78906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	106768988	106769157	106769073	Y	NA	ATG5	NA	NA	NA	NA	ATG5	2509	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	108239964	108240066	108240015	Y	NA	SEC63	NA	NA	NA	NA	SEC63	37327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	108879521	108879931	108879808	Y	SESN1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	483	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	108951509	108952142	108951722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO3	72471	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	111049772	111049981	111049963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK19	85180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	111180623	111180918	111180752	Y	CDK19,SLC16A10,AMD1,AMD1	CDK19,AMD1	CDK19,AMD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AMD1	13055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	111265873	111266130	111266017	Y	SLC16A10,AMD1,AMD1	GTF3C6,RPF2	CDK19,AMD1,SLC22A16	IMR90	Hi-C	24141950	GTF3C6	11633	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	111560758	111560946	111560852	Y	AMD1,AMD1,SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	17605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	111733320	111733976	111733973	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV3L	68942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	111795712	111796054	111795883	Y	NA	REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	6864	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	113388033	113388045	113388040	Y	NA	NA	FLJ34503,MARCKS	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-399L15.3	900820	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	116778152	116778369	116778268	Y	ZUFSP,DSE,FAM26F	FAM26F	NA	NA	NA	NA	FAM26F	2164	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	119210409	119210579	119210468	Y	NA	ASF1A,MCM9	NA	NA	NA	NA	ASF1A	2805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	126265741	126265870	126265827	Y	NCOA7	HINT3,TRMT11	NA	NA	NA	NA	HINT3	10057	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	127618608	127618885	127618797	Y	NA	RNF146,ECHDC1	NA	NA	NA	NA	RNF146	32853	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	129984721	129985008	129984794	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	44362	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	129994496	129994751	129994657	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	34619	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	131929733	131930009	131929873	Y	NA	MED23,RNU4-18P	NA	NA	NA	NA	MED23	17360	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr6	135601929	135602188	135602098	Y	MYB	NA	NA	NA	NA	NA	MYB	101476	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	136716338	136716450	136716395	Y	MAP7,MAP7,MAP7	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	107349	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	137181238	137181571	137181404	Y	PEX7	PEX7	NA	NA	NA	NA	PEX7	39521	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	137227679	137227915	137227797	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PEX7	85962	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	137493736	137494019	137493819	Y	NA	IFNGR1	NA	NA	NA	NA	IFNGR1	44567	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	139947909	139948079	139947994	Y	NA	NA	CITED2	K562	ChIA-PET	22265404	CITED2	254152	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	140893217	140893627	140893519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1199460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	143023506	143024108	143023806	Y	HIVEP2	NA	AIG1,ADAT2,LOC100507489,HIVEP2,LOC153910,PEX3	IMR90	Hi-C	24141950	AIG1	355525	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	143204143	143204540	143204474	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	175093	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	144537313	144537754	144537668	Y	NA	NA	STX11,SF3B5	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	UTRN	67083	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	147643373	147644201	147643793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1P1	81824	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr6	149453610	149453783	149453668	Y	ZC3H12D,TAB2,SUMO4	NA	ZC3H12D,TAB2,UST	IMR90	Hi-C	24141950	TAB2	83994	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	149802219	149802342	149802288	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,SUMO4,ZC3H12D	ZC3H12D	NA	NA	NA	NA	ZC3H12D	1855	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	149803455	149803649	149803509	Y	LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,ZC3H12D	ZC3H12D	NA	NA	NA	NA	ZC3H12D	548	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	150010989	150011176	150011138	Y	NA	KATNA1,LATS1	NA	NA	NA	NA	LATS1	26216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	151730569	151730753	151730690	Y	NA	ZBTB2,RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	ZBTB2	19886	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	151815811	151815987	151815867	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1,C6orf97	RMND1,C6orf211	NA	NA	NA	NA	C6orf211	44389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	152497154	152497169	152497162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C6orf211	725732	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	154676071	154676546	154676403	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4XP8	218897	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	155590165	155590417	155590245	Y	NA	TFB1M	NA	NA	NA	NA	TFB1M	43210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	157096939	157097165	157097038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	157101566	157102083	157101700	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	4503	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr6	157110744	157110907	157110826	Y	NA	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	13681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	157137665	157137911	157137871	Y	ARID1B	ARID1B	NA	NA	NA	NA	ARID1B	40602	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	157162870	157163071	157163026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	65807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	157738321	157738749	157738506	Y	NA	TMEM242	NA	NA	NA	NA	TMEM242	3884	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	158481547	158481708	158481650	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	80659	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR	NA	NA	NA	NA	EZR	32527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	159434370	159434675	159434475	Y	TAGAP	RSPH3,TAGAP	NA	NA	NA	NA	RSPH3	15151	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	159484779	159485166	159484982	Y	TAGAP	TAGAP	NA	NA	NA	NA	TAGAP	20595	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	159542385	159542836	159542696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAGAP	78201	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	21.0259002013708
chr6	160141572	160141909	160141740	Y	MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP	WTAP,ACAT2,SOD2	LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WTAP	2708	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	160402732	160403272	160403091	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1,IGF2R	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	14601	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	161607618	161607817	161607715	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	85276	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	161780500	161780874	161780600	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT4	87407	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	163775171	163775345	163775277	Y	QKI	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	57687	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	163833338	163833600	163833428	Y	QKI	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	306	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr6	164137885	164138154	164138024	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QKI	304853	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	166422302	166422862	166422743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	331217	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	166672303	166672771	166672615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	81308	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	167411692	167411848	167411735	Y	RNASET2,GPR31	RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	1022	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	167506323	167506574	167506340	Y	RNASET2,CCR6	CCR6	NA	NA	NA	NA	CCR6	16721	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	167566314	167566582	167566478	Y	RNASET2,GPR31	CCR6	NA	NA	NA	NA	CCR6	43019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	SMOC2	469097	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	169368330	169368547	169368455	Y	NA	NA	TCTE3,WDR27,C6orf70,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	SMOC2	528499	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr6	169475360	169475647	169475438	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR27	624512	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	170364764	170365251	170365177	Y	NA	NA	DLL1	IMR90	Hi-C	24141950	TCTE3	215109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	170403251	170403438	170403365	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	194123	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr6	170461603	170461884	170461744	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135677	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	170461964	170462067	170462016	Y	NA	NA	LINC00574,LOC154449	IMR90	Hi-C	24141950	DLL1	135494	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr6	170467648	170467815	170467737	Y	TCTE3,FAM120B	NA	NA	NA	NA	NA	DLL1	129746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	119028	119765	119436	Y	NA	AC093627.10	FAM20C	IMR90	Hi-C	24141950	AC093627.10	27832	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	129626	129879	129753	Y	NA	AC093627.10	NA	NA	NA	NA	AC093627.10	17718	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	650155	650947	650502	Y	COX19	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	92222	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	949613	949923	949864	Y	NA	GET4,ADAP1	NA	NA	NA	NA	GET4	35424	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	968255	968622	968448	Y	ZFAND2A,COX19,ADAP1	ADAP1,COX19	NA	NA	NA	NA	ADAP1	24421	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	1883097	1883273	1883258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	103170	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr7	1978042	1978502	1978293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC074389.9	198115	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2101889	2102279	2102085	Y	ELFN1	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	168599	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2301325	2301581	2301357	Y	LFNG,SNX8	MAD1L1,FTSJ2,NUDT1	NA	NA	NA	NA	NUDT1	21468	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2548551	2548955	2548724	Y	LFNG,LFNG	LFNG,BRAT1,IQCE	LFNG	K562	ChIA-PET	22265404	LFNG	1208	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr7	2550421	2551074	2550672	Y	LFNG,LFNG,BRAT1	LFNG,BRAT1,IQCE	NA	NA	NA	NA	LFNG	258	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2681143	2681305	2681209	Y	SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11558	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2836098	2836460	2836342	Y	SNX8,LFNG	AC006028.11,GNA12	NA	NA	NA	NA	AC006028.11	36795	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	4681329	4681565	4681443	Y	MMD2	NA	SDK1,FOXK1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXK1	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	4755132	4755354	4755253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	73744	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	4913549	4913687	4913618	Y	NA	AC092610.12,RADIL	NA	NA	NA	NA	RADIL	7663	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	5471668	5472052	5471860	Y	NA	NA	WIPI2,SLC29A4,TNRC18,RNF216	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL18	79377	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	5594554	5594977	5594837	Y	WIPI2	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	6438	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	5731889	5732558	5731976	Y	CCZ1	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	86812	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	5739659	5740040	5739772	Y	USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	79330	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	6473446	6473633	6473567	Y	DAGLB	DAGLB,KDELR2	NA	NA	NA	NA	DAGLB	48188	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	6741580	6741996	6741754	Y	C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12	ZNF12,PMS2CL	NA	NA	NA	NA	ZNF12	2558	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	7605671	7605858	7605804	Y	NA	MIOS	NA	NA	NA	NA	MIOS	1168	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr7	8215934	8216623	8216095	Y	GLCCI1	NA	NA	NA	NA	NA	AC007009.1	83240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	12758831	12759023	12758905	Y	ARL4A	ARL4A	ARL4A	K562	ChIA-PET	22265404	ARL4A	34350	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	13372875	13373192	13373034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4A	648394	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	17409796	17409963	17409863	Y	AHR	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	72815	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	17564000	17564574	17564249	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	AC003075.4	227019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	19024350	19024628	19024489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWISTNB	722082	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	21417349	21417477	21417448	Y	NA	SP4	NA	NA	NA	NA	SP4	48175	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	24229401	24229422	24229412	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC006026.13	510996	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	24860577	24860798	24860662	Y	C7orf31,DFNA5	NA	NA	NA	NA	NA	DFNA5	53333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	25896515	25897081	25896801	Y	NA	NA	HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFE2L3	292779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	26140883	26141586	26141235	Y	SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1	NFE2L3	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	48274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr7	26317891	26318244	26318068	Y	NA	AC010677.5,SNX10	HNRNPA2B1,CBX3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	AC010677.5	4076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	27907829	27908035	27907932	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC004549.6	129815	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	30224515	30225078	30224817	Y	ZNRF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNRF2	96845	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	30369303	30369603	30369448	Y	NA	ZNRF2,AC006978.6	NA	NA	NA	NA	AC006978.6	39384	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	32133021	32133498	32133272	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	399397	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	32264519	32264896	32264708	Y	PDE1C	NA	NA	NA	NA	NA	LSM5	267999	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	32929600	32929824	32929751	Y	NA	KBTBD2	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	1919	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	32944853	32945232	32945065	Y	KBTBD2	KBTBD2,RP9P,FKBP9	NA	NA	NA	NA	KBTBD2	13110	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	35075861	35076697	35076367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBX20	215061	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	36301055	36301385	36301112	Y	AOAH,SEPT7,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	EEPD1	110297	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	36555269	36555573	36555424	Y	ELMO1,AOAH,EEPD1	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	127854	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	AOAH	81186	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	37023926	37024076	37024004	Y	AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	AOAH	261772	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	37156989	37157298	37157171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	329554	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	37399595	37399701	37399648	Y	GPR141,ELMO1,ELMO1,ELMO1	NA	NA	NA	NA	NA	ELMO1	87151	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38272460	38272983	38272698	Y	TARP	NA	NA	NA	NA	NA	STARD3NL	56636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	38282478	38282707	38282629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRGV10	55216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38285257	38285450	38285342	Y	TARP	NA	NA	NA	NA	NA	TRGV10	52473	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38320391	38320829	38320534	Y	TARP	TRGV10	NA	NA	NA	NA	TRGV10	17094	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38350123	38350385	38350204	Y	STARD3NL,TARP	TRGV10,TRGV3	LOC100506776	IMR90	Hi-C	24141950	TRGV10	12200	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38354761	38355072	38354915	Y	TARP	TRGV10,TRGV3	NA	NA	NA	NA	TRGV10	16838	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	38371416	38371642	38371578	Y	STARD3NL,TARP	TRGV10,TRGV3	NA	NA	NA	NA	TRGV3	25121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	38750267	38750277	38750273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS41	219717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	39661947	39662014	39661981	Y	NA	RALA	NA	NA	NA	NA	RALA	865	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	40138099	40138142	40138120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	150463	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	40952368	40952631	40952468	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	788075	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	41800026	41800177	41800090	Y	INHBA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	59320	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	41909567	41909969	41909883	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	168861	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	41921124	41921832	41921468	Y	INHBA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	180418	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr7	42026442	42026777	42026611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INHBA	285736	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	43658377	43658532	43658408	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	38020	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	43793010	43793349	43793220	Y	NA	BLVRA	BLVRA	IMR90	Hi-C	24141950	BLVRA	2930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	44297372	44297806	44297600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YKT6	58805	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	44678622	44679047	44678972	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	NA	NA	NA	NA	OGDH	34451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	47302239	47302434	47302368	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	317722	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	50306514	50306844	50306594	Y	IKZF1,FIGNL1	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	34876	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	50321209	50321522	50321293	Y	NA	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	20198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	50322940	50323157	50323049	Y	NA	IKZF1	NA	NA	NA	NA	IKZF1	18563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	50615386	50615579	50615483	Y	GRB10	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	99298	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	50666851	50666964	50666921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	150763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	55575892	55576055	55575968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	62626	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	56243524	56243790	56243559	Y	LOC389493	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2	71255	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	63775449	63776053	63775748	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	9612	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	63924105	63924304	63924148	Y	NA	HNRNPCP7	NA	NA	NA	NA	HNRNPCP7	34899	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	68555899	68555934	68555915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	1790005	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	68721718	68722081	68721900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P4	1955824	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	73625323	73625613	73625399	Y	LIMK1,LAT2	EIF4H,LAT2,RFC2	NA	NA	NA	NA	LAT2	13341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	75253450	75253956	75253637	Y	POR	NA	NA	NA	NA	NA	PMS2P3	97972	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	75354773	75355120	75354947	Y	NA	HIP1	NA	NA	NA	NA	HIP1	11160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	75795833	75796053	75795969	Y	RHBDD2,POR	NA	SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1	IMR90	Hi-C	24141950	MDH2	120464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	75947305	75947626	75947472	Y	RHBDD2,SRRM3	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	17444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr7	76874732	76875015	76874923	Y	NA	FGL2	NA	NA	NA	NA	FGL2	47589	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	GNAI1	838141	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	86283403	86283799	86283516	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DMTF1	495878	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	92261439	92261837	92261823	Y	NA	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	43731	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	92273770	92274019	92273895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	56062	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	92279692	92280069	92279965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	61984	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	92437286	92437617	92437517	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	26180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	92459714	92460134	92460069	Y	SAMD9	AC002454.1,CDK6	NA	NA	NA	NA	AC002454.1	3663	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	92463754	92464079	92463922	Y	CDK6,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1,CDK6	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	99551289	99551506	99551376	Y	ZCWPW1,PILRA,MEPCE,C7orf59,ZNF655,ZNF655	TRIM4	NA	NA	NA	NA	TRIM4	36066	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	99969754	99970252	99970079	Y	OR2AE1,C7orf59,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA	PILRB,PMS2P1,PILRA	NA	NA	NA	NA	PILRA	6601	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr7	100167857	100168189	100168134	Y	NA	AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,MOSPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-44M6.3	2103	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	100514077	100514183	100514130	Y	NA	SRRT,UFSP1	MUC12,MUC17	IMR90	Hi-C	24141950	UFSP1	28738	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	101361034	101362207	101361111	Y	CUX1,CUX1	NA	CUX1,EMID2,SH2B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	94752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	101672273	101672589	101672281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	215314	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	101929501	101929660	101929574	Y	CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2	SH2B2	NA	NA	NA	NA	SH2B2	3096	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	SH2B2	NA	NA	NA	NA	SH2B2	3573	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	12.71333500548
chr7	104584670	104585063	104584938	Y	MLL5	RP11-325F22.2	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-325F22.2	5160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	RP11-325F22.2	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	18121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	104608110	104608364	104608281	Y	NA	RP11-325F22.2,LINC01004	NA	NA	NA	NA	RP11-325F22.2	28600	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	104854124	104854334	104854271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	183421	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	104960256	104960357	104960307	Y	MLL5,SRPK2	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	77398	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	104980501	104980737	104980707	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	57018	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	105223133	105223294	105223281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RINT1	52601	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	105711914	105712310	105712244	Y	NA	SYPL1	NA	NA	NA	NA	SYPL1	38712	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	105954417	105954898	105954654	Y	FLJ36031,NAMPT	NAMPT	NAMPT,CCDC71L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NAMPT	29645	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	105988057	105988433	105988164	Y	FLJ36031,NAMPT	NA	NAMPT,CCDC71L,PIK3CG	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NAMPT	63285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	106664370	106664701	106664536	Y	NA	PRKAR2B	PIK3CG,PRKAR2B	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAR2B	18393	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	106901302	106901364	106901333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBP1	93896	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	107026511	107026865	107026723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	175064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	110874557	110874601	110874588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	325972	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	110956734	110956926	110956906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMMP2L	243647	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	111745442	111745761	111745634	Y	ZNF277,IFRD1,IFRD1,IFRD1,DOCK4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF277	98882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	112383831	112384204	112384019	Y	NA	TMEM168	NA	NA	NA	NA	TMEM168	44443	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	113692267	113692309	113692288	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	32073	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	113724652	113724941	113724845	Y	FOXP2	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr7	113772890	113773070	113772980	Y	NA	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	48508	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	114018736	114018896	114018817	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	294354	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	114571864	114572137	114571962	Y	MDFIC	MDFIC	NA	NA	NA	NA	MDFIC	11655	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	115887290	115887609	115887434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFEC	89340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	92245	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	120532080	120532359	120532220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	56444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	120638134	120638217	120638176	Y	NA	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	49331	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	121069872	121070160	121070016	Y	NA	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	35454	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	122466235	122466438	122466337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P31	146891	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	123284312	123284364	123284338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5	88003	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	123558914	123558958	123558950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WASL	171793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr7	129005588	129005946	129005786	Y	AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-72P	116399	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	129014301	129014725	129014533	Y	AHCYL2,FAM40B,AHCYL2	NA	FAM40B	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-72P	107620	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	130633473	130633870	130633858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLN1	158985	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	130923142	130923337	130923228	Y	MKLN1,MKLN1	AC009362.2	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	2012	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	131348420	131348477	131348449	Y	NA	NA	PODXL	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	107444	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	131589581	131589949	131589748	Y	NA	NA	PLXNA4	IMR90	Hi-C	24141950	PODXL	348605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	132660683	132660693	132660688	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD3	104155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	134836004	134836265	134836096	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	C7orf49	NA	NA	NA	NA	C7orf49	17282	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	134845913	134846266	134846037	Y	WDR91,CNOT4,TMEM140	C7orf49,WDR91	NA	NA	NA	NA	C7orf49	7281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	NA	NA	NA	NA	NA	C7orf73	85341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	138249829	138249954	138249896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM24	106750	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	139430911	139431484	139431231	Y	TBXAS1,JHDM1D,LUC7L2	TBXAS1,HIPK2	NA	NA	NA	NA	TBXAS1	43366	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	139588015	139588387	139588262	Y	JHDM1D,TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	112438	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	139952632	139953094	139952865	Y	TBXAS1,JHDM1D	NA	JHDM1D	IMR90	Hi-C	24141950	PARP12	191111	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	142823985	142823994	142823990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSTK1	115192	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	144539515	144539760	144539575	Y	TPK1	TPK1	TPK1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TPK1	8027	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	148680544	148680840	148680694	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	42893	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	149468740	149469267	149468803	Y	NA	ZNF467	NA	NA	NA	NA	ZNF467	172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	150484830	150485185	150484873	Y	GIMAP8,GIMAP2,GIMAP5,LOC100128542,SMARCD3,SMARCD3,SLC4A2,AGAP3,TMEM176B	TMEM176B	NA	NA	NA	NA	TMEM176B	11263	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	150691752	150691942	150691795	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542	ABCB8	NA	NA	NA	NA	ABCB8	31568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	150968947	150969398	150969287	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	SMARCD3	3584	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	151479942	151479960	151479953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKAG2-AS1	92167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	151620751	151620976	151620906	Y	RHEB,PRKAG2,PRKAG2	PRKAG2-AS1,PRKAG2	LOC100505483,PRKAG2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PRKAG2	48541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	152105895	152106094	152106005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	265156	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	152123020	152123275	152123182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	247975	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	209236	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	155383034	155383540	155383287	Y	RBM33	NA	LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM33	51605	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr7	156932490	156932855	156932681	Y	NA	UBE3C	NA	NA	NA	NA	UBE3C	2883	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	157034052	157034373	157034213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-814D15.2	50990	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	157067817	157068138	157067978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	57937	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	157334866	157335140	157335002	Y	DNAJB6,DNAJB6	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB6	208791	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	157868351	157868544	157868461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC011899.9	223130	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	157924006	157924393	157924072	Y	PTPRN2	NA	NA	NA	NA	NA	AC011899.9	278785	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr7	158500449	158500649	158500582	Y	NA	NCAPG2	NA	NA	NA	NA	NCAPG2	4929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr7	158613624	158614053	158613981	Y	ESYT2	ESYT2,WDR60	NA	NA	NA	NA	ESYT2	6891	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	1060714	1060735	1060723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERICH1	374608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	1220424	1220599	1220512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	481345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	1897074	1897760	1897667	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	22284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	11.7353861589046
chr8	1898205	1898424	1898394	Y	NA	KBTBD11	NA	NA	NA	NA	KBTBD11	21620	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	2130952	2131237	2131101	Y	CLN8	NA	NA	NA	NA	NA	MYOM2	139797	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	2591169	2591450	2591225	Y	NA	GS1-57L11.1	NA	NA	NA	NA	GS1-57L11.1	8311	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	3552666	3552917	3552915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GS1-57L11.1	969808	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	6490542	6490767	6490601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2541M15.1	72963	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	8203793	8204189	8204138	Y	NA	SGK223	NA	NA	NA	NA	SGK223	37819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	8852577	8852777	8852697	Y	PPP1R3B	ERI1	MFHAS1,SGK223,FLJ10661,CLDN23	IMR90	Hi-C	24141950	ERI1	4880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	9408701	9409304	9408905	Y	NA	TNKS	NA	NA	NA	NA	TNKS	2120	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	9764051	9764441	9764391	Y	MSRA	LINC00599	NA	NA	NA	NA	LINC00599	3175	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	9.77948846575384
chr8	9978890	9979101	9978960	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	69112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	10079596	10079605	10079601	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	169818	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	10170975	10171338	10171157	Y	MSRA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	261197	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	10228323	10228440	10228417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRA	318545	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	10922710	10923064	10922845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XKR6	133811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	11735335	11735756	11735393	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	10378	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr8	16476986	16477261	16477122	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37A	624819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	16489924	16490119	16489983	Y	MSR1	NA	NA	NA	NA	NA	VPS37A	611961	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	16609902	16609923	16609912	Y	VPS37A	NA	TUSC3,MSR1	IMR90	Hi-C	24141950	VPS37A	492157	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	19058200	19058838	19058472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	613813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	19293000	19293226	19293113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INTS10	379425	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	19555269	19555638	19555536	Y	NA	NA	CSGALNACT1,SH2D4A	IMR90	Hi-C	24141950	INTS10	117013	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	20055803	20056436	20056187	Y	ATP6V1B2	ATP6V1B2	NA	NA	NA	NA	ATP6V1B2	2925	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	LZTS1	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	LZTS1	32782	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	22403598	22403975	22403915	Y	NA	SORBS3	NA	NA	NA	NA	SORBS3	3099	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	22516346	22516607	22516450	Y	NA	BIN3,EGR3	NA	NA	NA	NA	BIN3	8054	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	23418368	23418748	23418630	Y	TNFRSF10B,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37,RNU4-71P	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	34050	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	25356816	25356840	25356828	Y	NA	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	42303	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	26123466	26123833	26123529	Y	NA	PPP2R2A	PPP2R2A	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2R2A	23174	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	26324913	26325141	26325047	Y	NA	DPYSL2	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	44650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	26429509	26429959	26429867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	59718	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	8.31256519589076
chr8	27192227	27192436	27192262	Y	PTK2B,PTK2B	TRIM35,PTK2B	NA	NA	NA	NA	PTK2B	25228	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	27251047	27251329	27251099	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2B	84048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	27261537	27262078	27261765	Y	PTK2B,PTK2B	NA	NA	NA	NA	NA	EPHX2	84218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	28565617	28566294	28565942	Y	EXTL3	EXTL3-AS1	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	8636	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	28634516	28634595	28634556	Y	KIF13B	NA	NA	NA	NA	NA	EXTL3-AS1	77535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	29914930	29915195	29915084	Y	NA	TMEM66,LEPROTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM66	23528	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	29946002	29946367	29946215	Y	TMEM66,LEPROTL1	TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24	NA	NA	NA	NA	LEPROTL1	4547	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30015593	30015700	30015665	Y	NA	RPS15AP24,DCTN6	NA	NA	NA	NA	DCTN6	3780	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS-AS1	NA	NA	NA	NA	RBPMS-AS1	39729	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30666266	30666462	30666364	Y	NA	PPP2CB	NA	NA	NA	NA	PPP2CB	3368	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30820542	30820686	30820610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	68631	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30820960	30821235	30821098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WRN	68082	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	30892240	30892587	30892393	Y	UBXN8	WRN	NA	NA	NA	NA	WRN	2923	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	33422539	33422669	33422567	Y	RNF122	NA	NA	NA	NA	NA	RNF122	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	1667067	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr8	37656576	37656905	37656741	Y	GOT1L1	PROSC,GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	GPR124	16867	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	37678678	37679141	37678937	Y	RAB11FIP1	GPR124,BRF2	NA	NA	NA	NA	BRF2	26281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	37739186	37739703	37739509	Y	RAB11FIP1	BRF2,RAB11FIP1	GPR124,BRF2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB11FIP1	15282	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr8	37992032	37992208	37992120	Y	NA	ASH2L,STAR,BAG4,LSM1	NA	NA	NA	NA	STAR	14575	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	38627692	38628125	38628027	Y	LETM2,LETM2,C8orf86,PLEKHA2,TACC1	TACC1	NA	NA	NA	NA	TACC1	43988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	39957250	39957527	39957387	Y	NA	NA	C8orf4	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM9	1104862	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD65	121525	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	41674575	41674631	41674603	Y	ANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KAT6A	232877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	41908079	41908836	41908505	Y	POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3	KAT6A	NA	NA	NA	NA	KAT6A	571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	42149533	42149606	42149596	Y	NA	RP11-231D20.2,IKBKB,POLB	NA	NA	NA	NA	IKBKB	22713	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	42377318	42377512	42377415	Y	NA	SLC20A2	NA	NA	NA	NA	SLC20A2	17557	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	46856094	46856491	46856295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	1210250	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	48282787	48283030	48282901	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP2	216046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	224269	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	48523756	48523912	48523831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	125736	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	49430601	49430974	49430806	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	135451	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-10H3.1	377526	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	52747281	52747589	52747434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1	62146	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	53607875	53608327	53608179	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	48076	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr8	55088607	55088824	55088716	Y	NA	MRPL15	NA	NA	NA	NA	MRPL15	42837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	33131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56798106	56798776	56798363	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	7734	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56885324	56886256	56885536	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	LYN	94952	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56887750	56888682	56888353	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	95778	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56903187	56904166	56903812	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	80294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56916302	56916441	56916350	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	68019	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	56919174	56919348	56919316	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD54	65112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	58360177	58360428	58360261	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPAD1	455774	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	59476129	59476409	59476167	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	12646	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	59491466	59491801	59491581	Y	UBXN2B,SDCBP	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	27983	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	59529081	59529390	59529262	Y	SDCBP	NSMAF	NA	NA	NA	NA	NSMAF	41013	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	61821464	61821801	61821596	Y	CHD7	NA	NA	NA	NA	NA	CLVS1	145916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	61824212	61824789	61824465	Y	CHD7	NA	CHD7	IMR90	Hi-C	24141950	CLVS1	142928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	61838303	61838580	61838376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLVS1	129137	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	62385898	62385985	62385942	Y	CLVS1	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	239170	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	62647717	62647991	62647767	Y	NA	ASPH	NA	NA	NA	NA	ASPH	22562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	64082499	64082747	64082682	Y	YTHDF3	YTHDF3	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	3387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr8	66863902	66864441	66863992	Y	RRS1,PDE7A	NA	PDE7A	MCF7	ChIA-PET	22265404	PDE7A	111345	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	66934530	66934705	66934628	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	181973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	66935018	66935363	66935175	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	182461	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	67626224	67626609	67626278	Y	SGK3,VCPIP1,SGK3	VCPIP1,C8orf44,SGK3	NA	NA	NA	NA	SGK3	3571	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	71124105	71124438	71124275	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	109691	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	71149519	71149670	71149631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-152C15.1	135105	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	71459765	71459799	71459782	Y	NA	NA	NCOA2	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM1	58823	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	71522610	71523035	71522826	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	3988	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	71569342	71569635	71569535	Y	NA	LACTB2	NA	NA	NA	NA	LACTB2	9774	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	75576382	75576715	75576543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-730G20.2	61903	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	80696342	80696550	80696513	Y	HEY1	NA	MRPS28,HEY1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPS28	243974	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	80859511	80859794	80859653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	80730	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	81034251	81034528	81034390	Y	ZBTB10,TPD52	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	93727	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	81893837	81894122	81894063	Y	PAG1	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	128181	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	81933989	81934508	81934361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAG1	87795	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	82042673	82043029	82042906	Y	PAG1	PAG1	PAG1	IMR90	Hi-C	24141950	PAG1	20370	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	90849173	90849652	90849503	Y	RIPK2,OSGIN2	NA	OSGIN2,NBN,RIPK2,DECR1	IMR90	Hi-C	24141950	OSGIN2	62435	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	90899646	90899998	90899819	Y	RIPK2,OSGIN2	OSGIN2	OSGIN2,RIPK2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	OSGIN2	12089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	92112003	92112264	92112167	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	31579	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	93154253	93154609	93154431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	1073829	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	19568	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	95222452	95222635	95222544	Y	NA	KB-1247B1.1,GEM	NA	NA	NA	NA	KB-1247B1.1	9172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	97866979	97867264	97866987	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	363400	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	97991385	97991967	97991693	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	487806	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	98001253	98001769	98001454	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	SDC2	497674	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr8	98454033	98454434	98454234	Y	NA	NA	PTDSS1,SDC2,CPQ,TSPYL5	IMR90	Hi-C	24141950	MTDH	199973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	181124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	99643221	99643590	99643555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	309465	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	101450289	101450675	101450373	Y	RNF19A	NA	SPAG1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF19A	103843	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	101774635	101775034	101774843	Y	RNF19A,YWHAZ	PABPC1	PABPC1,SNX31	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PABPC1	41598	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	101898300	101898593	101898349	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6	ZNF706,PABPC1,YWHAZ	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P6	7381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	RPS26P6,YWHAZ	NA	NA	NA	NA	RPS26P6	14235	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	102191448	102191797	102191796	Y	NA	ZNF706	NA	NA	NA	NA	ZNF706	24624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103126233	103126356	103126297	Y	UBR5,NCALD	NCALD	NA	NA	NA	NA	NCALD	8779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103401606	103401938	103401841	Y	NA	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	21131	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103411260	103411483	103411351	Y	UBR5	UBR5	NA	NA	NA	NA	UBR5	11586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103639654	103639717	103639685	Y	NA	KLF10	UBR5,ODF1,AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	KLF10	26413	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103858397	103858789	103858587	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	NA	NA	NA	NA	KB-1507C5.2	15739	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	103998014	103998369	103998120	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	ATP6V1C1,AZIN1,CTHRC1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1C1	32922	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	104043647	104043928	104043793	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	12356	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	104093090	104093280	104093223	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32,DCAF13	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	61799	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	104198945	104199161	104199050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD6	109500	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	105598029	105598284	105598149	Y	TM7SF4,LRP12	LRP12	NA	NA	NA	NA	LRP12	968	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	107614798	107614912	107614855	Y	OXR1,OXR1	NA	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	93329	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	107740443	107740789	107740616	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	32202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	111848565	111848912	111848739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	1298625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	113558737	113559137	113558937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	827761	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	114257291	114257677	114257549	Y	CSMD3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	129221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	114266349	114266595	114266472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	120303	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	114445563	114445724	114445576	Y	CSMD3	CSMD3	NA	NA	NA	NA	CSMD3	1604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	116112760	116113320	116112846	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	1663422	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	117366472	117366785	117366629	Y	NA	NA	LINC00536	IMR90	Hi-C	24141950	UTP23	409957	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	118524766	118524786	118524776	Y	NA	MED30	NA	NA	NA	NA	MED30	6166	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	120656261	120656532	120656398	Y	NA	ENPP2	ENPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ENPP2	27161	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	121092888	121093091	121092967	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	DEPTOR	208931	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	121649803	121649981	121649892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	173532	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	121737162	121737328	121737239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNTB1	86185	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	122499627	122499835	122499731	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-369K17.1	576322	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	123756740	123756952	123756848	Y	NA	ZHX2	ZHX2,DERL1,WDR67	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX2	34681	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX2	116536	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	124050911	124051177	124051044	Y	NA	DERL1	NA	NA	NA	NA	DERL1	1486	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	124524433	124524792	124524749	Y	FBXO32,FBXO32	FBXO32	NA	NA	NA	NA	FBXO32	26654	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	125513273	125513673	125513472	Y	NA	RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1	NA	NA	NA	NA	RNF139	28294	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	126195292	126195668	126195512	Y	TRIB1,KIAA0196,NSMCE2	NA	TRIB1	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0196	93210	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	126398156	126398380	126398244	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	42183	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	126984156	126984525	126984411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	543593	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	127422712	127423196	127422971	Y	NA	NA	FAM84B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TRIB1	982149	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128264964	128265070	128265034	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	480610	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128575770	128576030	128575897	Y	NA	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	169650	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128678694	128678799	128678726	Y	MYC	NA	MYC,PVT1	MCF7	ChIA-PET	22265404	MYC	66881	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	128821272	128821652	128821500	Y	MYC	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	16493	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128888391	128888698	128888485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	83612	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128926432	128926732	128926619	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	94125	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	128988975	128989172	128989023	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	31685	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	129061512	129061955	129061598	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	40655	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	129114844	129115073	129114937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	93987	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	129129719	129130040	129129840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	108862	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	129942288	129942645	129942469	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	921431	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130284402	130285105	130284786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	742270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130315048	130315337	130315217	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	712038	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130490796	130491097	130490948	Y	FAM49B	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	536278	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130503275	130503416	130503346	Y	NA	NA	MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	523959	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130557757	130558027	130557844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	469348	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130558328	130558659	130558367	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	468716	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130559153	130559435	130559226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	467940	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	130560066	130560288	130560191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	467087	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	130566236	130566665	130566321	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	460710	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	130566808	130567296	130566886	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	460079	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr8	130594185	130594451	130594334	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	432924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	130595168	130595596	130595537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	431779	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130604361	130604767	130604632	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	422608	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130605679	130605945	130605781	Y	FAM49B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	421430	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	130678534	130678960	130678774	Y	FAM49B	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	348415	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	131027030	131027189	131027125	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	186	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	131058084	131058195	131058140	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30709	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	131477918	131478265	131477983	Y	NA	NA	ASAP1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	450543	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	133463688	133463896	133463792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	221942	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	134105467	134105714	134105585	Y	TG,SLA	SLA	NA	NA	NA	NA	SLA	7584	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	134162340	134163262	134162815	Y	ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1	SLA	NA	NA	NA	NA	SLA	49042	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	134510785	134510981	134510865	Y	SLA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL1	71202	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	134664147	134664493	134664336	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST3GAL1	81964	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	134902873	134903347	134903149	Y	ST3GAL1	NA	ST3GAL1,ZFAT	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST3GAL1	320690	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	137512042	137512062	137512052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-35P	759304	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	139299523	139299711	139299616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNK9	1413588	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141179581	141179847	141179769	Y	EIF2C2,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	286831	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141189770	141190115	141189943	Y	TRAPPC9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	276563	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141606825	141607480	141607253	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	87428	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	142096370	142097040	142096464	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3,RP11-809O17.1	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	28337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	142099604	142099791	142099736	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3,RP11-809O17.1	PTK2,DENND3	IMR90	Hi-C	24141950	DENND3	25586	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	142099799	142100197	142100108	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3,RP11-809O17.1	PTK2,DENND3	IMR90	Hi-C	24141950	DENND3	25180	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	142105625	142105840	142105724	Y	EIF2C2,SLC45A4,PTP4A3,DENND3	DENND3,RP11-809O17.1	PTK2,DENND3	IMR90	Hi-C	24141950	DENND3	19537	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	142129714	142130013	142129874	Y	EIF2C2,SLC45A4,DENND3	DENND3,RP11-809O17.1	PTK2,DENND3,SLC45A4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DENND3	4337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	142216641	142216829	142216751	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-809O17.1	78581	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	142403963	142404243	142404183	Y	PTP4A3	GPR20,PTP4A3	FLJ43860,PSCA,JRK,PTP4A3	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	3870	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	142411426	142411896	142411690	Y	DENND3,SLC45A4,PTP4A3	GPR20,PTP4A3	PTP4A3,FLJ43860	IMR90	Hi-C	24141950	PTP4A3	11333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	142426003	142426250	142426062	Y	PTP4A3	PTP4A3,HNRNPA1P38	NA	NA	NA	NA	PTP4A3	25910	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	142741264	142741485	142741355	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	HNRNPA1P38	274089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	143049473	143049646	143049554	Y	NA	NA	TSNARE1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00051	228071	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr8	143758809	143759081	143758941	Y	NA	JRK	NA	NA	NA	NA	JRK	2305	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	143869768	143870087	143870041	Y	PSCA,SLURP1,LYNX1,LY6D	LYNX1	NA	NA	NA	NA	LYNX1	12128	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	144272609	144273113	144272936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP41	54167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr8	145129247	145129547	145129402	Y	GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH	SPATC1,PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOSC4	1982	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr8	146125688	146125902	146125777	Y	ZNF250	COMMD5,ZNF250,ZNF16	NA	NA	NA	NA	ZNF250	135	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	225416	225914	225497	Y	NA	DOCK8	NA	NA	NA	NA	DOCK8	12562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	278768	279182	278781	Y	DOCK8,DOCK8	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	65914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	297155	297330	297225	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK8	84301	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	2465114	2465154	2465134	Y	NA	NA	VLDLR,FLJ35024	IMR90	Hi-C	24141950	VLDLR	154680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	2663518	2663568	2663543	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	43684	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	3470131	3470258	3470195	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFX3	53746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	4992033	4992419	4992226	Y	NA	JAK2	NA	NA	NA	NA	JAK2	9000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	5086081	5086478	5086137	Y	CD274,CDC37L1,INSL6,JAK2	NA	NA	NA	NA	NA	JAK2	103048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	5777401	5777564	5777483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ERMP1	53553	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	6384866	6385180	6385056	Y	NA	UHRF2	NA	NA	NA	NA	UHRF2	25971	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr9	6958089	6958102	6958095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM4C	239226	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	14233168	14233395	14233282	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC21	458074	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	15300887	15301166	15301002	Y	TTC39B	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	4192	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	16025511	16025884	16025698	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93,CNTLN	IMR90	Hi-C	24141950	FTH1P12	499830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	19557640	19557719	19557680	Y	ACER2,SLC24A2	NA	NA	NA	NA	NA	ACER2	150715	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	104310	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	21696521	21696698	21696606	Y	IFNA6,IFNA1	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MTAP	103844	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	21836477	21836868	21836612	Y	NA	MTAP	NA	NA	NA	NA	MTAP	35935	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	21996110	21996456	21996153	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	CDKN2A	2810	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	22482961	22483350	22483156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	472807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	22815363	22815696	22815663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	805209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	24920693	24920988	24920699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	755868	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	27338196	27338452	27338297	Y	IFT74,IFT74,C9orf72,C9orf72	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	189327	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	27365157	27365383	27365271	Y	MOBKL2B	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	162396	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MOB3B	111209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	27564116	27564302	27564198	Y	C9orf72,C9orf72	MOB3B,C9orf72	NA	NA	NA	NA	C9orf72	7562	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	28813062	28813251	28813159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf72	1241198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	29825337	29825639	29825488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	861464	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMXP2	860725	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	33159697	33160189	33160012	Y	NA	B4GALT1	NA	NA	NA	NA	B4GALT1	5165	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	33942829	33943199	33943013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAP2	103748	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	34986458	34986973	34986609	Y	KIAA1539,DNAJB5	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	DNAJB5	665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	35232989	35233276	35233133	Y	DNAJB5	NA	NA	NA	NA	NA	UNC13B	72990	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1,CD72	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr9	36037997	36038326	36038187	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	3567	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	37197241	37197478	37197431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	78705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	68417391	68418146	68417579	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	35229	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	71321592	71321773	71321683	Y	NA	PIP5K1B	NA	NA	NA	NA	PIP5K1B	3017	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	72101775	72101805	72101790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBA1	183417	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	73021440	73021667	73021582	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	73178223	73178568	73178449	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	150683	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	73202028	73202554	73202277	Y	TRPM3	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	174488	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	74511654	74511799	74511765	Y	NA	C9orf85	NA	NA	NA	NA	C9orf85	12627	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	75747117	75747734	75747349	Y	ANXA1	ANXA1	ANXA1	IMR90	Hi-C	24141950	ANXA1	16939	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr9	77765912	77766310	77766149	Y	OSTF1	NA	NA	NA	NA	NA	OSTF1	64453	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr9	80559906	80560072	80560021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNAQ	84302	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	80637884	80638322	80638164	Y	NA	GNAQ	NA	NA	NA	NA	GNAQ	6052	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMI1	776751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	88346951	88347024	88346988	Y	NA	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	7920	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	88598937	88598983	88598960	Y	NA	NAA35	NA	NA	NA	NA	NAA35	44876	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	88861908	88862149	88862029	Y	NA	ISCA1	NA	NA	NA	NA	ISCA1	33527	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	89422548	89422732	89422697	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-276H19.1	138882	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	145397	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	91152717	91153030	91152890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	151383	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	91538614	91539111	91538717	Y	SECISBP2,S1PR3,C9orf47	NA	LOC286238,S1PR3,SHC3	IMR90	Hi-C	24141950	S1PR3	65251	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	4.88974423287692
chr9	92004867	92005103	92005008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	73446	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	92015404	92015642	92015537	Y	SECISBP2	NA	NA	NA	NA	NA	SECISBP2	83983	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	92140722	92140921	92140852	Y	NA	SEMA4D	SECISBP2,SEMA4D	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA4D	29677	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	92325659	92326013	92325803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45G	107731	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	RP11-305L7.3	NA	NA	NA	NA	RP11-305L7.3	32622	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	95732704	95733017	95732861	Y	NINJ1,C9orf89,FGD3	FGD3	NA	NA	NA	NA	FGD3	24971	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	95826654	95827012	95826884	Y	FGD3,FAM120AOS,SUSD3	SUSD3,C9orf89	NA	NA	NA	NA	SUSD3	7665	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	95882095	95882646	95882428	Y	IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1	C9orf89,NINJ1	NA	NA	NA	NA	NINJ1	11924	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90963	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF169	90183	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	98273012	98273438	98273114	Y	C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1	PTCH1	NA	NA	NA	NA	PTCH1	3901	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	100747732	100748046	100747912	Y	NA	ANP32B	NA	NA	NA	NA	ANP32B	4089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	100880203	100880431	100880317	Y	C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14	TRIM14	NA	NA	NA	NA	TRIM14	709	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	101322182	101322489	101322456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKS6	234758	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	102355761	102356150	102356096	Y	NR4A3	NA	NR4A3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554F20.1	224021	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	102391260	102391441	102391334	Y	ERP44,NR4A3	NA	SEC61B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-554F20.1	188730	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	103544281	103544296	103544289	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEX10	431060	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	107640582	107640899	107640765	Y	NA	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	47619	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	108623002	108623305	108623152	Y	FSD1L,FSD1L,TAL2	NA	MIR548Q,ZNF462	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM38B	168177	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	109655422	109655715	109655552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD23B	387703	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	RP11-438P9.1	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	RP11-438P9.1	15956	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	111759404	111759745	111759575	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	14064	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	112173287	112173639	112173503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PALM2-AKAP2	366950	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	RP11-151F5.2	NA	NA	NA	NA	RP11-151F5.2	26333	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	113044793	113045024	113044909	Y	NA	TXN	NA	NA	NA	NA	TXN	27873	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114700203	114700566	114700273	Y	DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	43157	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	114705587	114705765	114705623	Y	NA	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	48541	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114707434	114708001	114707643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	50388	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	114732038	114732216	114732127	Y	NA	NA	UGCG,MIR3134,SUSD1	IMR90	Hi-C	24141950	UGCG	74992	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114790932	114791388	114791198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	133886	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114792518	114792641	114792625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	135472	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	114812842	114813221	114813099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	122467	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	114831912	114832228	114831995	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	103460	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	115067475	115067560	115067518	Y	SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2	PTBP3	NA	NA	NA	NA	PTBP3	26387	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	115614204	115614389	115614297	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	103086	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	115624285	115624808	115624606	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	113167	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	115982258	115982474	115982402	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	FKBP15,SLC31A1	NA	NA	NA	NA	SLC31A1	450	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	117667327	117667721	117667524	Y	TNFSF15	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf91	295841	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	119018286	119018486	119018325	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	1446124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	120522424	120523171	120522785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	57814	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	123251976	123252022	123252001	Y	CDK5RAP2	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5RAP2	88426	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	123455501	123455738	123455670	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	19010	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	123478444	123478636	123478538	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	3696	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	123546044	123546305	123546215	Y	TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2	FBXW2,PSMD5-AS1	NA	NA	NA	NA	FBXW2	7385	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	123640419	123640826	123640772	Y	NA	PSMD5,PHF19	NA	NA	NA	NA	PHF19	2813	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	123834049	123834395	123834258	Y	TRAF1,TRAF1,CNTRL	CNTRL	CNTRL,TRAF1	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	746	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	124260871	124261375	124261091	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	STOM	130340	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	126683805	126684169	126683927	Y	NA	DENND1A	NA	NA	NA	NA	DENND1A	6262	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	126959399	126959957	126959825	Y	DENND1A	NA	DENND1A,NEK6	IMR90	Hi-C	24141950	NEK6	57928	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	127161847	127162149	127162003	Y	NA	PSMB7	NA	NA	NA	NA	PSMB7	13574	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	39752	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	127944437	127944756	127944696	Y	NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1	SCAI,PPP6C,RABEPK	NA	NA	NA	NA	PPP6C	5462	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	129232894	129233686	129233447	Y	ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	331599	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	129484571	129485188	129484881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	80097	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	C9orf117,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	C9orf117	5376	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	130543227	130543280	130543253	Y	TOR2A,SH2D3C	TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS	NA	NA	NA	NA	CDK9	2678	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	130545388	130545786	130545583	Y	NA	TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS	NA	NA	NA	NA	CDK9	172	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	130597952	130598640	130598378	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG	NA	NA	NA	NA	ENG	16395	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	130624524	130625072	130624605	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,SLC25A25,CDK9	ENG,ST6GALNAC6	NA	NA	NA	NA	ENG	9489	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	130627836	130628198	130628079	Y	NA	ENG,ST6GALNAC6,ST6GALNAC4	NA	NA	NA	NA	ENG	12801	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	131146179	131146470	131146339	Y	FAM102A,SLC25A25,DNM1,SPTAN1,CCBL1	SLC27A4,URM1,CERCAM	NA	NA	NA	NA	URM1	14581	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	131660472	131660616	131660545	Y	NA	LRRC8A,CCBL1,DOLK,NUP188	NA	NA	NA	NA	CCBL1	17699	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.8676930794523
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	132646480	132646964	132646831	Y	ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	50338	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	132648080	132648314	132648193	Y	ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	C9orf78	51938	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	132728744	132729115	132728930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	74358	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	132807262	132807460	132807345	Y	USP20,USP20	FNBP1,GPR107	NA	NA	NA	NA	FNBP1	3789	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	132814142	132814504	132814316	Y	TOR1B	FNBP1,GPR107	NCS1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR107	437	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	133619181	133619471	133619230	Y	NA	ABL1	NA	NA	NA	NA	ABL1	31848	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	134114047	134114338	134114158	Y	NA	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	35596	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134128008	134128436	134128111	Y	RAPGEF1,QRFP,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	21498	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.93384653972615
chr9	134131602	134132161	134131829	Y	RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A	FAM78A,PPAPDC3	NA	NA	NA	NA	FAM78A	17773	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134508781	134509131	134508955	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UCK1	104126	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134583176	134583545	134583248	Y	RAPGEF1	RAPGEF1	PRRC2B,UCK1,POMT1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPGEF1	29916	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134603973	134604163	134604103	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	9298	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134608249	134608835	134608704	Y	FAM78A,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	4626	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134609553	134609906	134609765	Y	FAM78A,PRRC2B,RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	3555	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134613837	134614689	134614350	Y	RAPGEF1,RAPGEF1	RAPGEF1	NA	NA	NA	NA	RAPGEF1	376	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	134619507	134619884	134619596	Y	FAM78A,RAPGEF1	RAPGEF1	RAPGEF1	K562	ChIA-PET	22265404	RAPGEF1	6046	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	135999727	136000118	136000091	Y	SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	37183	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	136284309	136284583	136284382	Y	C9orf96	SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	REXO4	3145	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	136738611	136738757	136738701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	116969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	136800116	136800268	136800192	Y	C9orf7	NA	NA	NA	NA	NA	VAV2	55458	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	137040428	137040559	137040494	Y	SARDH,SARDH,RXRA	WDR5	NA	NA	NA	NA	WDR5	41941	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	137264490	137265116	137264820	Y	RXRA	NA	NA	NA	NA	NA	RXRA	57546	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	138666183	138666357	138666270	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP1	130717	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	139433298	139433437	139433354	Y	ABCA2,CARD9,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	4877	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	139434156	139434495	139434364	Y	FUT7,NACC2,SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	NA	NA	NA	NA	NOTCH1	3819	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	139445894	139446087	139445949	Y	SEC16A,NOTCH1	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	7230	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	139513037	139513494	139513208	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7,ABCA2	NA	MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGPAT2	66381	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chr9	139514178	139514562	139514471	Y	CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7	NA	MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AGPAT2	65313	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	139591698	139592004	139591952	Y	C8G	AGPAT2,SNHG7	NA	NA	NA	NA	AGPAT2	11823	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	17.6030792383569
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.42282096301384
chr9	140312019	140312179	140312116	Y	LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	3535	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	PNPLA7	54216	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	2719389	2719617	2719532	Y	NA	GYG2	NA	NA	NA	NA	GYG2	25212	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	9424803	9424966	9424870	Y	TBL1X	TBL1X	TBL1X	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1X	4369	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	9701264	9701389	9701313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-98L4.1	84120	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	12969061	12969258	12969197	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	21969	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chrX	12974854	12975280	12975169	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	15947	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	12991564	12992257	12991938	Y	NA	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	337	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	13105363	13105695	13105563	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	TMSB4X,FAM9C	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMSB4X	114136	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	13108157	13108758	13108452	Y	TLR7,TLR8,TMSB4X	NA	TMSB4X	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB4X	116930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	15787454	15787695	15787561	Y	NA	ZRSR2	NA	NA	NA	NA	ZRSR2	18900	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	19643767	19644028	19643952	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	259691	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	19792866	19793266	19793149	Y	RPS6KA3,SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	110453	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	22335637	22335944	22335762	Y	NA	NA	PHEX	IMR90	Hi-C	24141950	SMS	378946	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	30585503	30585905	30585867	Y	NA	CXorf21	NA	NA	NA	NA	CXorf21	8056	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	30592460	30592673	30592598	Y	GK,CXorf21	CXorf21	NA	NA	NA	NA	CXorf21	1288	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	30615830	30616021	30615866	Y	GK,CXorf21	CXorf21,FTLP2	NA	NA	NA	NA	CXorf21	21869	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	2.44487211643846
chrX	30630746	30631092	30631067	Y	GK,CXorf21	CXorf21,FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	15323	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	30631397	30631710	30631444	Y	GK,CXorf21	CXorf21,FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	14705	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	7.33461634931538
chrX	30631885	30632229	30631971	Y	GK,CXorf21	CXorf21,FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	14186	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chrX	30639363	30639574	30639470	Y	GK,CXorf21	CXorf21,FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	6841	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	30646047	30646125	30646067	Y	GK,CXorf21	FTLP2,GK	NA	NA	NA	NA	FTLP2	290	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	37604688	37604864	37604776	Y	CYBB	CYBB	NA	NA	NA	NA	CYBB	32400	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	38130522	38130869	38130628	Y	CYBB,RPGR	NA	NA	NA	NA	NA	RPGR	53948	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	38728448	38728818	38728662	Y	MID1IP1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1IP1	69763	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	39286892	39287116	39286999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	358274	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chrX	39872499	39873023	39872596	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	161559	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	39953251	39953461	39953335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	81121	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.46692326986308
chrX	39968308	39968728	39968376	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65854	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chrX	40013089	40013254	40013186	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21328	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	40026864	40027458	40027209	Y	NA	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	7124	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	40132742	40132979	40132844	Y	ATP6AP2	NA	BCOR	K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	98160	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	40869399	40869667	40869505	Y	USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	73221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	41304581	41304641	41304611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3X	113930	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	EFHC2	311830	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	44834978	44835378	44835063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM6A	104221	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	45480900	45481410	45481103	Y	NA	NA	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	122284	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	46573129	46573518	46573302	Y	SLC9A7	SLC9A7	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	42972	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	47415526	47415793	47415667	Y	NA	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	2723	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	47423323	47423681	47423373	Y	CDK16,CFP,CFP,ARAF	ARAF,TIMP1	NA	NA	NA	NA	ARAF	4807	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	48646841	48647202	48647168	Y	GATA1	HDAC6	NA	NA	NA	NA	HDAC6	10582	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	48748801	48749222	48749175	Y	NA	PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2	NA	NA	NA	NA	PQBP1	3973	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	53155305	53155690	53155322	Y	XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2	TSPYL2,LINC01155	KDM5C	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01155	33978	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	53467837	53468052	53468003	Y	KDM5C	SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	8517	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	53740949	53741249	53741172	Y	KDM5C,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29276	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	53741584	53742291	53741941	Y	KDM5C,SMC1A,HUWE1,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29911	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	3.91179538630154
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	273914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	58292059	58292236	58292148	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	1145964	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	64815346	64815780	64815481	Y	MSN	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	9089	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	64818518	64818695	64818582	Y	NA	MSN	MSN	IMR90	Hi-C	24141950	MSN	12261	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chrX	65207808	65208088	65207980	Y	MSN	MIR223	NA	NA	NA	NA	MIR223	28624	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	65214786	65214961	65214865	Y	MSN	MIR223	NA	NA	NA	NA	MIR223	21751	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	65217824	65218221	65218055	Y	MSN	MIR223	MSN	K562	ChIA-PET	22265404	MIR223	18491	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	65225187	65225542	65225503	Y	NA	MIR223	NA	NA	NA	NA	MIR223	11170	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	67905691	67905742	67905716	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40183	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40441	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	68776201	68776510	68776416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA1	392565	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	69654278	69654566	69654417	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	145914	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	RP5-1091N2.9	NA	NA	NA	NA	RP5-1091N2.9	13891	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	70415917	70416007	70415951	Y	IL2RG,MED12,TAF1,CXCR3	RP5-1091N2.9	NA	NA	NA	NA	RP5-1091N2.9	18	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	71635914	71636037	71635976	Y	HDAC8	NA	NA	NA	NA	NA	RPS4X	140764	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	71761722	71762003	71761864	Y	NA	HDAC8	NA	NA	NA	NA	HDAC8	28950	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	FTX	170270	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UPRT	468902	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	77306835	77307068	77306952	Y	NA	PGK1	NA	NA	NA	NA	PGK1	11617	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	77908831	77908963	77908901	Y	CYSLTR1	NA	NA	NA	NA	NA	CYSLTR1	327783	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	13.6912838520554
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	708473	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	106917022	106917635	106917444	Y	NA	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	47285	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	1.95589769315077
chrX	106917807	106918338	106918010	Y	TSC22D3,TSC22D3	PRPS1	TSC22D3,PRPS1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	48070	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	5.37871865616461
chrX	107313303	107313469	107313386	Y	NA	PSMD10,ATG4A	NA	NA	NA	NA	PSMD10	19379	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	112084647	112084962	112084847	Y	AMOT,AMOT	NA	NA	NA	NA	NA	ALG13	1177604	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	115239457	115239782	115239623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1GP5	304326	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	117487110	117487426	117487273	Y	DOCK11,WDR44	WDR44	NA	NA	NA	NA	WDR44	9074	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	118890270	118890420	118890345	Y	SEPT6,ZBTB33,ZBTB33,RNF113A	SOWAHD,RPL39	SEPT6	IMR90	Hi-C	24141950	SOWAHD	156	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	119385485	119385791	119385733	Y	NA	NKAPP1,ZBTB33	NA	NA	NA	NA	ZBTB33	2878	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	119619289	119619732	119619620	Y	ZBTB33,ZBTB33	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18069	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	119619980	119620335	119620161	Y	NA	LAMP2	LAMP2	K562	ChIA-PET	22265404	LAMP2	18760	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	122898767	122899176	122898998	Y	NA	THOC2	NA	NA	NA	NA	THOC2	33861	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	122943908	122944167	122944003	Y	NA	XIAP	STAG2	K562	5C	22955621	XIAP	47407	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CXorf64	344632	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	128911334	128911515	128911430	Y	ELF4,ELF4,BCORL1,SASH3	SASH3	NA	NA	NA	NA	SASH3	440	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	129226171	129226435	129226352	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	16256	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	129307329	129307713	129307433	Y	NA	AIFM1,RAB33A	NA	NA	NA	NA	RAB33A	3706	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	133952675	133952993	133952834	Y	NA	FAM122C,FAM122B	NA	NA	NA	NA	FAM122B	23413	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	134718222	134718415	134718313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX26B	65638	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	149737740	149738101	149737940	Y	MTMR1,MTM1	MTM1	NA	NA	NA	NA	MTM1	2671	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	150018859	150019330	150019048	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	45959	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	152127371	152127756	152127434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSDHL	129860	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	153250067	153250295	153250176	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TAZ,MECP2,DNASE1L1,TMEM187	RENBP,HCFC1,TMEM187,IRAK1	NA	NA	NA	NA	TMEM187	14289	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.977948846575384
chrX	153306272	153306572	153306565	Y	ABCD1,ARHGAP4,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1	IRAK1	NA	NA	NA	NA	IRAK1	22841	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrX	153359354	153359823	153359622	Y	NA	MECP2	NA	NA	NA	NA	MECP2	1389	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrY	2817706	2817951	2817827	Y	NA	ZFY	NA	NA	NA	NA	ZFY	16594	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrY	7144356	7144569	7144462	Y	NA	PRKY	NA	NA	NA	NA	PRKY	4343	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrY	13470203	13470486	13470410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	1543533	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692
chrY	15207344	15207441	15207401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX3Y	193325	CAGE	MV-4-11	hg19	FANTOM5	0.488974423287692