chr1 918449 918555 918505 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN NA NA NA NA HES4 14997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 936652 937138 936860 Y NA NOC2L,KLHL17,PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN C1orf170 K562 ChIA-PET 22265404 HES4 3100 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.22243801117435 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 2140151 2140337 2140252 Y C1orf86 C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 1822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 22237 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 3186377 3186508 3186443 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 182482 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 3232812 3232866 3232839 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 136124 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 3251760 3252019 3251890 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF16 116971 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 4067941 4068288 4068115 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 253084 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 6230950 6231173 6231057 Y PLEKHG5,KCNAB2,KCNAB2,CHD5 CHD5,RNF207,RPL22 NA NA NA NA CHD5 7010 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 7609389 7609632 7609504 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 219697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 10057852 10058069 10058032 Y NA RBP7,UBE4B NA NA NA NA RBP7 2588 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 10269964 10270260 10269995 Y RBP7,PGD,KIF1B KIF1B NA NA NA NA KIF1B 1101 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 10559059 10559458 10559098 Y NA PEX14,DFFA NA NA NA NA DFFA 28476 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 10960432 10960567 10960498 Y NA NA PEX14,CASZ1,C1orf127,TARDBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CASZ1 105725 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16176617 16176801 16176705 Y RSC1A1,C1orf64,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3975 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 16276028 16276482 16276329 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 24145 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16479299 16479465 16479382 Y FBLIM1,EPHA2 RP11-276H7.2,EPHA2 NA NA NA NA RP11-276H7.2 241 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16677236 16677843 16677569 Y ZBTB17,FBXO42 FBXO42 RSG1 IMR90 Hi-C 24141950 FBXO42 287 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 SDHB 140276 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 17534687 17534794 17534729 Y NA NA NA NA NA NA SDHB 156022 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 17767804 17768710 17768126 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 3584 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 6.70622507657103 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 21588176 21588724 21588522 Y ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 81273 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 22076024 22076450 22076245 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 31649 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 23076914 23077145 23077061 Y NA EPHB2 NA NA NA NA EPHB2 41582 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 23113356 23113555 23113472 Y NA NA NA NA NA NA EPHB2 78024 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 23523350 23523682 23523502 Y LUZP1,HTR1D LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 21049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 24477754 24478041 24477856 Y NA NA IL22RA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-4M23.7 144745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 24736156 24736250 24736199 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 4034 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 24970685 24970736 24970725 Y NA SRRM1 NA NA NA NA SRRM1 14478 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 25281668 25281921 25281754 Y NA RUNX3 NA NA NA NA RUNX3 7691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 25355154 25355297 25355192 Y RUNX3,SYF2,C1orf63 NA RUNX3,C1orf63,SYF2,CLIC4 IMR90 Hi-C 24141950 RUNX3 65542 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 27561705 27561803 27561716 Y NA WDTC1 NA NA NA NA WDTC1 2698 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 28050414 28050762 28050588 Y NA STX12 NA NA NA NA FAM76A 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 29565762 29566055 29565979 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 32108020 32108204 32108102 Y NA PEF1 NA NA NA NA PEF1 293 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 32166698 32166999 32166824 Y COL16A1 NA NA NA NA NA PEF1 58201 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 33225777 33226084 33225890 Y TMEM54,KIAA1522 KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 20291 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 33378487 33378646 33378567 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA TMEM54 13448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 33685276 33685676 33685470 Y NA TRIM62,ZNF362 TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF362 34470 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 ADPRHL2,COL8A2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 36616485 36616868 36616577 Y STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1 COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 2312 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 36626561 36626969 36626609 Y STK40,SH3D21,LSM10,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2,MAP7D1,THRAP3 COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA MAP7D1 7381 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 36849527 36849580 36849557 Y EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 30 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 39644229 39644606 39644401 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 99241 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 39857791 39857995 39857869 Y NA KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 16156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 41343431 41343839 41343651 Y NA CITED4 KCNQ4,CTPS,NFYC,CITED4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED4 17413 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 41495531 41495820 41495676 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 169513 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 41564044 41564297 41564171 Y NA NA NA NA NA NA SCMH1 141529 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 41828934 41829164 41829075 Y NA FOXO6 NA NA NA NA FOXO6 3340 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 13581 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 41962532 41962651 41962593 Y NA EDN2 NA NA NA NA EDN2 14188 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA EDN2 179507 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 42325828 42326208 42326056 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 173388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 42366364 42366624 42366514 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 132972 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 44950888 44951090 44950987 Y NA NA NA NA NA NA RNF220 82022 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 49186643 49186650 49186647 Y NA NA NA NA NA NA SPATA6 250798 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 59524373 59524568 59524471 Y NA NA FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 235742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 59608045 59608421 59608204 Y NA NA NA NA NA NA FGGY 151889 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 59616706 59617089 59616861 Y NA NA HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 FGGY 143221 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 65534177 65534450 65534358 Y LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1 RP4-535B20.1 AK4,DNAJC6,LEPR,JAK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP4-535B20.1 2757 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 68027599 68027762 68027652 Y NA NA GADD45A,GNG12,LOC100289178 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 120982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 8.19649731580903 chr1 68354536 68354908 68354722 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 57386 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD13C 72329 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NA NA NA NA NA ZRANB2 1204240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 77385063 77385511 77385240 Y ST6GALNAC5 NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 53937 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 77399446 77399567 77399507 Y NA NA NA NA NA NA ST6GALNAC5 68320 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA TTLL7 342019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 85779776 85780132 85779838 Y NA BCL10 NA NA NA NA BCL10 39003 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 85796595 85797055 85796822 Y CYR61 NA NA NA NA NA BCL10 55822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 86077140 86077408 86077190 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 32696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 86078461 86078819 86078680 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 34017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 87171187 87171726 87171422 Y SH3GLB1 SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 2928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 89339924 89340210 89340169 Y PKN2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 15417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA ZNF326 81915 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA GFI1 NA NA NA NA GFI1 42826 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 94127789 94128026 94127840 Y GCLM,TMED5,DNTTIP2 NA NA NA NA NA BCAR3 182680 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 94167175 94167520 94167394 Y BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 143186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 94332093 94332098 94332096 Y NA BCAR3,DNTTIP2,GCLM NA NA NA NA DNTTIP2 11376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 94788386 94788592 94788436 Y ARHGAP29,F3 ARHGAP29 ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 49762 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 95388205 95388608 95388523 Y NA CNN3,RP4-639F20.1 NA NA NA NA CNN3 2226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 96699870 96700313 96700068 Y NA NA PTBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P11 210173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 96939460 96939794 96939627 Y NA EEF1A1P11 NA NA NA NA EEF1A1P11 28974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 98494244 98494658 98494592 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 109639 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 98788970 98789228 98789135 Y NA NA MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1070A16.1 114667 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 100859593 100859940 100859621 Y HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 51009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 110160052 110160461 110160231 Y GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2 AMPD2,GSTM4 NA NA NA NA AMPD2 3326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 112901525 112901779 112901652 Y NA CTTNBP2NL ST7L,CAPZA1 IMR90 Hi-C 24141950 CTTNBP2NL 35024 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 113086746 113087141 113086830 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA1 72654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 113468568 113468671 113468620 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 NA NA NA NA SLC16A1-AS1 28366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 114997819 114998047 114997990 Y NA NA NA NA NA NA TRIM33 53734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr1 115709526 115709713 115709586 Y NA NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 79405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 115732772 115733197 115732900 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN2 102651 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 116039640 116039989 116039911 Y NA NA NGF,TSPAN2 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 142585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 116520279 116520650 116520380 Y ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15 SLC22A15 NA NA NA NA SLC22A15 3160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 116920378 116921129 116920740 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 7088 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 119450998 119451282 119451141 Y NA NA NA NA NA NA TBX15 78897 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 119506251 119506502 119506377 Y NA TBX15 NA NA NA NA TBX15 23677 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA HIST2H2BA 581054 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 143992805 143993078 143992869 Y NA NA NA NA NA NA NBPF8 151730 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 145004446 145004804 145004625 Y NA NA NA NA NA NA PDE4DIP 69382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 145032376 145032564 145032466 Y NA PDE4DIP NA NA NA NA PDE4DIP 41622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 145113904 145114998 145114671 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL PDE4DIP,SEC22B NA NA NA NA SEC22B 19684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,PEX11B NA NA NA NA PEX11B 5244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 150294873 150295138 150294978 Y PLEKHO1,MCL1,CTSS,PRPF3 C1orf51,MRPS21,PRPF3,RPRD2 NA NA NA NA PRPF3 2948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 151918898 151919222 151919024 Y S100A10 THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 38614 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr1 151961675 151962369 151962069 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 2497 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 153929776 153930098 153929954 Y NA GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CRTC2 675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 154977099 154977253 154977190 Y ADAR,ADAR,ZBTB7B,DCST1 PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 3972 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MUC1,MIR92B,MTX1,THBS3,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 155830201 155830522 155830413 Y ASH1L,MEX3A,ARHGEF2,ARHGEF2 GON4L,SYT11,RIT1 ARHGEF2,RXFP4,SNORA42,RIT1,KIAA0907 IMR90 Hi-C 24141950 SYT11 2901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 155951073 155951535 155951364 Y NA KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 23326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 156089405 156089622 156089466 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 39041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 156473111 156473378 156473326 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1 MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4491 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 156718467 156719136 156718868 Y C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 65 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 156719450 156719815 156719708 Y ETV3,ETV3,RRNAD1 CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF NA NA NA NA PRCC 1048 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 157989414 157989935 157989469 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 28351 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA NA LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 KIRREL 158437 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 158942717 158942925 158942799 Y OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1 IFI16 NA NA NA NA IFI16 24833 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 160627101 160627476 160627275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 235294 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,TSTD1,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A NA NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 77619 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA NA ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDHC 87026 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 162508612 162508929 162508802 Y UAP1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 20394 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 167766380 167766616 167766548 Y SFT2D2,CREG1 RP1-313L4.4 NA NA NA NA RP1-313L4.4 20870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 168149052 168149361 168149233 Y NA GPR161,TIPRL,SFT2D2 NA NA NA NA TIPRL 2881 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 172352690 172352912 172352801 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 58318 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 172828423 172828792 172828524 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,PRDX6,ZBTB37 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 189311 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 172870197 172870622 172870564 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 147481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 172872881 172872916 172872899 Y NA NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 145187 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 172878579 172879356 172878831 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 138747 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 172887147 172887473 172887267 Y TNFSF18 NA TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 130630 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 172938789 172938985 172938853 Y NA NA TNFSF4,TNFSF18 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF18 79118 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 173008475 173008781 173008627 Y TNFSF18 TNFSF18 NA NA NA NA TNFSF18 9322 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 173958715 173958784 173958750 Y NA RC3H1 NA NA NA NA RC3H1 30651 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 176174471 176174980 176174673 Y RFWD2 NA NA NA NA NA RFWD2,RP11-195C7.1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 180200315 180200683 180200497 Y LHX4 LHX4 NA NA NA NA LHX4 2894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 180249791 180250006 180249913 Y NA NA NA NA NA NA LHX4 52370 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 180371123 180371295 180371283 Y NA NA NA NA NA NA ACBD6 98794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 181068595 181069000 181068732 Y NA IER5 NA NA NA NA IER5 12957 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 182585205 182585710 182585424 Y NA RNASEL,RGS16 NA NA NA NA RGS16 13662 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 183133608 183133779 183133664 Y LAMC2 NA NA NA NA NA LAMC1 143013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 183577563 183577895 183577671 Y NCF2,NCF2,ARPC5 NCF2,ARPC5,RGL1 NA NA NA NA NCF2 19552 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 184810330 184810429 184810414 Y NA NA NA NA NA NA EDEM3 88283 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 198650930 198651643 198651116 Y PTPRC NA NA NA NA NA NEK7 526837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 198903935 198904934 198904858 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 449335 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 200750000 200750140 200750089 Y NA CAMSAP2 NA NA NA NA CAMSAP2 43314 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 200783735 200784105 200783920 Y NA NA NA NA NA NA CAMSAP2 77049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 200865457 200866265 200866098 Y TMEM9,IGFN1,C1orf106,C1orf106 NA NA NA NA NA KIF21B 124563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 201160901 201161255 201161022 Y IGFN1 TMEM9,IGFN1 NA NA NA NA IGFN1 2948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 201683757 201684240 201683949 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 112029 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 201742755 201743343 201743097 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 52926 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA ELF3 NA NA NA NA ELF3 28406 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3 NA NA NA NA ELF3 28811 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 202075010 202075191 202075097 Y PPP1R12B,ELF3,LGR6 ARL8A RNPEP,LGR6,NAV1,ELF3,ARL8A,GPR37L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARL8A 36678 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 NA NA NA NA NA ATP2B4 111155 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE NA NA NA NA NA ATP2B4 102204 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 203524939 203525564 203525325 Y NA NA ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 68125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 204386444 204387188 204386898 Y PPP1R15B PPP1R15B NA NA NA NA PPP1R15B 7525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 205179753 205180065 205179802 Y NA DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA DSTYK 1026 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 205265235 205265548 205265359 Y TMEM81,KLHDC8A NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 23335 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 205267691 205267999 205267801 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 20884 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 206859136 206859493 206859328 Y IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 2847 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 206959620 206960115 206959722 Y NA NA IL10,DYRK3,MAPKAPK2,IL19,FAIM3,EIF2D IMR90 Hi-C 24141950 MAPKAPK2 103331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf132 96417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 208442735 208442900 208442818 Y NA PLXNA2 PLXNA2,CD34 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA2 27070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 210058060 210058292 210058164 Y LAMB3 NA DIEXF,SYT14 IMR90 Hi-C 24141950 DIEXF 58708 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 211950086 211950249 211950170 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 51865 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 212182782 212182853 212182818 Y NA INTS7,DTL,RPL21P28 NA NA NA NA INTS7 24031 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr1 212769584 212769966 212769788 Y ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3 ATF3 NA NA NA NA ATF3 32908 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 214620076 214620672 214620502 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 103120 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 214648804 214649025 214648867 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 74767 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 1028139 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 216938634 216938811 216938777 Y NA NA NA NA NA NA GPATCH2 863613 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218375582 218375888 218375735 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 80741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218382752 218383112 218382930 Y NA NA NA NA NA NA RRP15 73517 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr1 218546684 218546887 218546789 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 29107 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218550674 218551089 218550794 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 33097 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218553747 218554148 218553928 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 36170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218647012 218647232 218647162 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 129435 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218648559 218648794 218648717 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 130982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 218649784 218650063 218649859 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 132207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218662454 218662669 218662563 Y NA NA TGFB2,LOC728463,LOC643723 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TGFB2 144877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 218669910 218670282 218669996 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 152333 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 218671989 218672275 218672071 Y NA NA TGFB2,LOC643723,LOC728463 IMR90 Hi-C 24141950 TGFB2 154412 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 219240049 219240272 219240170 Y NA NA NA NA NA NA LYPLAL1 104914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 220399770 220399931 220399853 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 24981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 220938923 220939177 220939050 Y NA MARC2,MARC1 NA NA NA NA MARC1 18924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 221968806 221968942 221968913 Y DUSP10,DUSP10 NA NA NA NA NA DUSP10 55288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 222814663 222814910 222814786 Y NA MIA3 NA NA NA NA MIA3 25235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 223903033 223903347 223903117 Y TP53BP2,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 15738 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 223904365 223904567 223904454 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 17070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 6.45784637003136 chr1 224730441 224730985 224730669 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 107706 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 224914627 224914789 224914675 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 167175 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH,RP11-145A3.1 NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 226361229 226361382 226361305 Y NA ACBD3,MIXL1 NA NA NA NA ACBD3 11049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 226841860 226842030 226841923 Y ITPKB NA NA NA NA NA ITPKB 82994 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 226848307 226848509 226848416 Y NA NA NA NA NA NA ITPKB 76515 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 228350789 228351109 228350864 Y JMJD4 GUK1,IBA57 NA NA NA NA IBA57 407 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr1 228678228 228678435 228678266 Y NA HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA RNF187 5466 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr1 228783962 228784250 228784107 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 84574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 230220475 230220731 230220560 Y NA GALNT2 NA NA NA NA GALNT2 28939 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 327540 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr1 234891292 234891478 234891345 Y IRF2BP2 NA NA NA NA NA IRF2BP2 148021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 235133014 235133422 235133155 Y NA NA LINC00184,LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 156829 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 236081357 236081630 236081401 Y NA LYST B3GALNT2,LYST,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 36417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 237029172 237029469 237029246 Y NA NA NA NA NA NA MTR 72562 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA MTR 677641 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 240476321 240476487 240476382 Y GREM2 NA NA NA NA NA ADH5P3 144866 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 242108255 242108348 242108324 Y NA NA EXO1 IMR90 Hi-C 24141950 EXO1 98986 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr1 244486299 244486688 244486462 Y AKT3,AKT3,ADSS NA SDCCAG8,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 126748 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 244763140 244763529 244763408 Y ADSS,EFCAB2 NA NA NA NA NA ADSS 149704 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr1 247325578 247326237 247325673 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 37125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 179287 179666 179475 Y NA ZMYND11 NA NA NA NA ZMYND11 882 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 500969 501047 501008 Y ZMYND11 NA NA NA NA NA DIP2C 232636 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 556579 556951 556668 Y ZMYND11,DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 176732 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 1240958 1241356 1241181 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 147480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 2256285 2256680 2256409 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 849845 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3028046 3028193 3028123 Y NA NA LINC00200 IMR90 Hi-C 24141950 PFKP 78332 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3239590 3239795 3239693 Y NA PITRM1 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 26587 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3497590 3497951 3497729 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 284587 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3598970 3599136 3599051 Y KLF6 NA NA NA NA NA KLF6 226337 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3800307 3800531 3800378 Y KLF6 KLF6 NA NA NA NA KLF6 24942 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3853393 3854169 3853583 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 27920 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3867491 3867713 3867639 Y NA KLF6 LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 42018 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3928866 3929216 3928980 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 103393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 3932191 3932411 3932301 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 106718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 4394953 4395258 4395067 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,PITRM1,LOC100507034,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 537538 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 4705159 4705783 4705486 Y NA NA NA NA NA NA AKR1C1 227013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 4812953 4813314 4813133 Y NA NA KLF6,PITRM1 IMR90 Hi-C 24141950 AKR1C1 119482 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 NET1 118302 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 10839185 10839573 10839228 Y CELF2 SFTA1P NA NA NA NA SFTA1P 4242 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 10953472 10953723 10953520 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 118529 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 11835953 11836243 11836176 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 53588 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 11917828 11918087 11917940 Y C10orf47 NA NA NA NA NA ECHDC3 135463 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 11940492 11940889 11940732 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 142280 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 12749537 12749904 12749742 Y NA NA NA NA NA NA CAMK1D 360056 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 13829023 13829481 13829176 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 202096 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 14003091 14003406 14003339 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 376164 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 14053069 14053428 14053261 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 426142 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 14099317 14099548 14099433 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 402593 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 14441741 14441971 14441846 Y NA NA FRMD4A,MIR1265 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 60170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 14446040 14446232 14446114 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 55909 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 14447046 14447458 14447244 Y NA NA FRMD4A,FAM107B IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 54683 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 14518978 14519126 14519049 Y NA FRMD4A FRMD4A IMR90 Hi-C 24141950 FRMD4A 16837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 14641847 14641963 14641950 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 139706 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 15157630 15158203 15157954 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111 NA NA NA NA C10orf111 20312 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr10 17104584 17104750 17104681 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 137303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 17390739 17391085 17390858 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124N14.3 115907 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 19943656 19943825 19943742 Y NA NA ARL5B,NSUN6 IMR90 Hi-C 24141950 PLXDC2 159343 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 20389150 20389455 20389350 Y PLXDC2 NA NA NA NA NA PLXDC2 285982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 21318909 21319293 21319209 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 141823 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr10 21390009 21390197 21390106 Y MLLT10,MLLT10,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 70919 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr10 21436057 21436346 21436225 Y C10orf113,NEBL NEBL NA NA NA NA NEBL 24770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 21703520 21703700 21703684 Y NA NA MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 MLLT10 117394 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 22628998 22629520 22629110 Y EBLN1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 20858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA BMI1 117191 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr10 22890368 22890535 22890414 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 110949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 22972039 22972536 22972328 Y NA PIP4K2A NA NA NA NA PIP4K2A 28948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 24917417 24917574 24917542 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 93023 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 25782168 25782320 25782214 Y NA NA NA NA NA NA MYO3A 438876 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr10 30073207 30073608 30073571 Y SVIL NA SVIL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIAA1462 328815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 31204241 31204373 31204282 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA NA NA NA NA ZNF438 114493 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 31289701 31290078 31290005 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 28788 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 31293680 31294164 31294019 Y ZNF438,ZNF438 ZNF438 NA NA NA NA ZNF438 24702 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 34569605 34569879 34569742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 381150 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 35421114 35421320 35421181 Y CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 7395 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 35848460 35848836 35848737 Y NA NA NA NA NA NA MIR4683 79344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 38418230 38418599 38418292 Y NA ZNF37A NA NA NA NA ZNF37A 36966 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF NA NA NA NA HNRNPF 48279 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 47128793 47129187 47128991 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 159393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA SYT15 160094 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 47137749 47138065 47137950 Y NA NA NA NA NA NA SYT15 168349 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 54203068 54203427 54203228 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 131012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 54211545 54211936 54211751 Y NA NA LOC100506939,DKK1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DKK1 139489 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 54246557 54246950 54246727 Y DKK1 NA DKK1,LOC100506939,PRKG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DKK1 174501 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 54434489 54434618 54434547 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 362433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 61632760 61633170 61633000 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 31244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 63702592 63703184 63702855 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 43533 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 63803306 63803648 63803427 Y NA NA NA NA NA NA ARID5B 144247 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 63805800 63806070 63805931 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 146741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 63814731 63815034 63814907 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 155672 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 64024468 64024613 64024559 Y ARID5B RTKN2 NA NA NA NA RTKN2 1853 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 68137896 68138170 68138033 Y NA NA NA NA NA NA SIRT1 1504257 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 68721315 68721864 68721513 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 920563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 68802540 68803252 68802892 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA SIRT1 839175 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 SIRT1 33037 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr10 70782889 70783013 70782952 Y NA KIAA1279 NA NA NA NA KIAA1279 36402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 70884620 70884824 70884718 Y DDX21,SUPV3L1,SRGN SRGN,VPS26A NA NA NA NA VPS26A 3352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 70976966 70977432 70977124 Y DDX21,SRGN,VPS26A SUPV3L1,HKDC1 NA NA NA NA HKDC1 627 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 72973788 72974249 72973953 Y UNC5B UNC5B,UNC5B-AS1 NA NA NA NA UNC5B-AS1 1736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA UNC5B-AS1 50192 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 73526437 73526878 73526654 Y CDH23,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 4377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 73531831 73532355 73532130 Y C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 576 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 74056833 74058104 74057179 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 25155 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 74080430 74080993 74080646 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 31995 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 74082335 74082540 74082412 Y DDIT4 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 30448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 74877758 74878048 74877901 Y NA P4HA1,NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA NUDT13 9541 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 75022023 75022098 75022060 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA RP11-152N13.5 11474 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 75361338 75361489 75361457 Y NA USP54 USP54,PPP3CB,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L,MYOZ1,CHCHD1,TTC18,C10orf103 IMR90 Hi-C 24141950 USP54 22222 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 75666465 75666800 75666554 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU NA NA NA NA PLAU 135 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 79005800 79005944 79005879 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 390409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 79051599 79051864 79051683 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 344489 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 79176142 79176460 79176291 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 219893 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 79268227 79268357 79268284 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 127996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 79651191 79651354 79651229 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 33024 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 80015725 80016226 80016048 Y RPS24 LINC00856 NA NA NA NA LINC00856 9220 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 80684242 80684460 80684352 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 142332 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 80685644 80685960 80685827 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 140832 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 80911539 80911799 80911619 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 84747 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr10 80912242 80912363 80912303 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 85450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 81025991 81026714 81026492 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 78511 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 81028676 81029041 81028720 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA PPIF 76184 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 81159335 81159579 81159503 Y ZCCHC24 ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 43804 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 82253401 82253904 82253623 Y NA TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 39794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 84418756 84419073 84418915 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P8 1420112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 88160011 88160294 88160175 Y NA GRID1 WAPAL MCF7 ChIA-PET 22265404 GRID1 35761 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr10 90597409 90597808 90597517 Y LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 STAMBPL1 NA NA NA NA STAMBPL1 39683 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 90753757 90754132 90754032 Y NA FAS,ACTA2 NA NA NA NA ACTA2 4610 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 92690903 92691268 92691118 Y NA ANKRD1 ANKRD1,PCGF5 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 11870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 92923893 92924265 92924064 Y NA NA RPP30,NUDT9P1,PCGF5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 53643 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 92928766 92928934 92928784 Y NA PCGF5 RPP30 IMR90 Hi-C 24141950 PCGF5 48974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 93991232 93991452 93991342 Y NA NA NA NA NA NA MARCH5 57468 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 94520397 94520594 94520523 Y NA NA EXOC6,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOC6 68341 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 95195782 95196689 95196040 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 43385 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 95198614 95198817 95198708 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 41257 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 95200243 95200778 95200520 Y CYP26C1,MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 39296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 95218561 95218998 95218660 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 21076 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 96130414 96130532 96130435 Y TBC1D12 NOC3L,TBC1D12 PLCE1,NOC3L IMR90 Hi-C 24141950 NOC3L 9698 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 97020432 97020603 97020519 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 28178 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 100993810 100993952 100993927 Y NA NA NA NA NA NA CNNM1 92904 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 101539519 101539906 101539726 Y NA COX15 NA NA NA NA COX15 49662 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr10 103699141 103699397 103699242 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 114553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 104387544 104387817 104387672 Y GBF1,CUEDC2,ACTR1A TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 14436 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 104388023 104388450 104388178 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 13803 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr10 104990991 104991184 104991120 Y NA NT5C2,INA SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NT5C2 39935 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 156759 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 106081521 106081936 106081838 Y SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147 ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 14226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 109306918 109307188 109307036 Y NA NA NA NA NA NA XPNPEP1 2374123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 112159079 112159451 112159258 Y NA NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 96145 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 112261043 112261328 112261185 Y SHOC2,DUSP5 DUSP5 NA NA NA NA DUSP5 5447 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 114847181 114847492 114847280 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 139172 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 114891441 114891844 114891554 Y TCF7L2 NA NA NA NA NA TCF7L2 183432 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 118034123 118034494 118034359 Y GFRA1,GFRA1,GFRA1 GFRA1 NA NA NA NA GFRA1 3144 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 123283349 123283529 123283438 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 NA NA NA NA NA RP11-159H3.1 392112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 126251501 126251899 126251725 Y METTL10 NA NA NA NA NA RPS10P18 74354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 127576052 127576450 127576389 Y NA DHX32,FANK1 NA NA NA NA DHX32 6555 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA FAM196A NA NA NA NA FAM196A 44942 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 129851192 129851341 129851267 Y PTPRE NA NA NA NA NA MKI67 71308 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr10 133763722 133764008 133763747 Y NA BNIP3 NA NA NA NA BNIP3 29427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr10 135092436 135092746 135092593 Y ADAM8,TUBGCP2 ADAM8,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ADAM8 4064 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 268826 269269 268945 Y TMEM80,TALDO1,SIGIRR,IRF7,IRF7,DEAF1,IFITM2,IFITM1,ATHL1 PSMD13,SIRT3,ATHL1,IFITM2,IFITM1 NA NA NA NA ATHL1 17866 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 589256 589485 589371 Y SIGIRR RASSF7,C11orf35,PHRF1,IRF7 NA NA NA NA PHRF1 14770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 1595832 1596187 1595959 Y NA DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 4682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 1751706 1752102 1751905 Y KRTAP5-1,KRTAP5-3,KRTAP5-5,KRTAP5-6 RP11-295K3.1,CTSD NA NA NA NA RP11-295K3.1 26179 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 1879618 1879880 1879749 Y NA NA NA NA NA NA RPL36AP39 67835 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 3090855 3091125 3090991 Y NA RNU1-91P,CARS NA NA NA NA CARS 14012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 3180503 3180713 3180608 Y ART1 OSBPL5 NA NA NA NA OSBPL5 5256 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2 NA NA NA NA ARFIP2 22508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 7913705 7913868 7913824 Y NA NA NA NA NA NA EIF3F 75930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 8756335 8756571 8756455 Y ST5,ASCL3 NA NA NA NA NA RPL27A 54377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 8973817 8973979 8973898 Y NA ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3 C11orf16 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM9B-AS1 10243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 11899555 11899888 11899585 Y NA USP47 NA NA NA NA USP47 38585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12065635 12065803 12065720 Y NA DKK3,MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 DKK3 36319 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12109558 12109847 12109697 Y PARVA,MICALCL,MICAL2 MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 3696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12111660 12111980 12111765 Y NA MICAL2 MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MICAL2 1563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12132692 12132808 12132735 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 12133218 12133350 12133292 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 19675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 12136145 12136580 12136313 Y MICAL2 MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 22602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12146355 12146795 12146568 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 32812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr11 12148184 12148552 12148402 Y NA MICAL2 NA NA NA NA MICAL2 34641 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12186762 12187077 12186920 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 73219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12188567 12188982 12188726 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 75024 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12197316 12197738 12197633 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 83773 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 12204570 12205016 12204699 Y MICAL2 NA NA NA NA NA MICAL2 91027 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 12821812 12822118 12821851 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 127843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 19599589 19599793 19599635 Y NAV2,NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 229318 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr11 27956455 27956618 27956527 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF RP11-1033A18.1 BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-1033A18.1 45875 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 28132530 28132826 28132694 Y NA METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 4675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA RP11-115J23.1 BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 42589 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 28776161 28776492 28776325 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 53999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 28778513 28778891 28778701 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 56351 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 28779294 28779601 28779473 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1,KIF18A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 57132 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 28792909 28793103 28792913 Y NA NA BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 70747 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 28855204 28855664 28855372 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 133042 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 28857853 28858464 28857991 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 135691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr11 29323978 29324331 29324155 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 601816 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 31819497 31819881 31819763 Y NA RCN1,PAX6 NA NA NA NA RCN1 12058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 33708893 33709097 33708996 Y NA CD59 NA NA NA NA CD59 46894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34255626 34256042 34255739 Y LMO2,LMO2,ABTB2 NA NA NA NA NA RP1-145M24.1 99508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34426692 34426969 34426750 Y ABTB2 ABTB2,CAT ABTB2,NAT10,CAT IMR90 Hi-C 24141950 CAT 31503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34675579 34675977 34675664 Y ABTB2,CD44 EHF NA NA NA NA EHF 34939 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34701753 34702028 34701891 Y NA NA NA NA NA NA EHF 61113 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34706877 34707176 34707110 Y ABTB2,EHF NA NA NA NA NA EHF 66237 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 34931457 34931889 34931828 Y NA PDHX,APIP NA NA NA NA PDHX 3487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 35643691 35643948 35643820 Y NA FJX1,TRIM44 NA NA NA NA FJX1 5956 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 36171228 36171637 36171430 Y TRAF6,COMMD9 NA NA NA NA NA COMMD9 137362 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 39183372 39183493 39183434 Y NA NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 2374491 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-430H10.1 172317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 46004522 46004898 46004712 Y NA NA NA NA NA NA GYLTL1B 63350 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 48193627 48193663 48193645 Y OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1 NA NA NA NA NA PTPRJ 193514 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 57242995 57243389 57243187 Y OR5AK2,SSRP1,BTBD18,UBE2L6 SLC43A3,RTN4RL2,SLC43A1 NA NA NA NA RTN4RL2 16973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 57549936 57550183 57550060 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 31221 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 60906916 60907198 60907057 Y NA VPS37C NA NA NA NA VPS37C 19891 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 60930012 60930347 60930224 Y SLC15A3,SDHAF2,CYBASC3,VPS37C VPS37C NA NA NA NA VPS37C 2923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 61463458 61463769 61463630 Y CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,SDHAF2,FTH1,DAGLA DAGLA NA NA NA NA DAGLA 17553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.47081671771402 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 61739990 61740514 61740301 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 6858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 62164133 62164439 62164244 Y NA NA NA NA NA NA ASRGL1 61213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr11 63858567 63858836 63858756 Y NA NA NA NA NA NA MACROD1 72742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 64637838 64638320 64638071 Y RASGRP2,SF1,SF1,EHD1,ATG2A EHD1,ATG2A,PPP2R5B NA NA NA NA EHD1 15448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65042835 65043130 65042858 Y EHD1,C11orf85,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2 NA NA NA NA POLA2 15602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 FRMD8,NEAT1,AP000769.1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 65239550 65239870 65239751 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1 TIGD3,SCYL1 K562 ChIA-PET 22265404 AP000769.1 18822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.47730189155535 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 65581703 65581968 65581801 Y CDC42EP2,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,DKFZp761E198 MUS81,CFL1 NA NA NA NA MUS81 40629 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr11 65670692 65670945 65670845 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 4648 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 6.45784637003136 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 C11orf80 14595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 67105994 67106296 67106145 Y NA SSH3,POLD4,AP003419.11 NA NA NA NA POLD4 16147 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 68714020 68714198 68714127 Y NA MRPL21,IGHMBP2 NA NA NA NA IGHMBP2 44710 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA IL18BP NA NA NA NA IL18BP 2740 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 71990969 71991411 71991180 Y NA NA NA NA NA NA INPPL1 58224 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 72194831 72195144 72194991 Y ARAP1,IL18BP,IL18BP NA PDE2A,ARAP1,NUMA1,CLPB IMR90 Hi-C 24141950 CLPB 51139 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 72447514 72448295 72447639 Y P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 54349 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 73874303 73874639 73874471 Y NA PPME1,C2CD3 NA NA NA NA PPME1 5505 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 74578028 74578161 74578096 Y OR2AT4,XRRA1,RNF169 NA NA NA NA NA XRRA1 80084 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 75186595 75186756 75186708 Y NA KLHL35 RPS3 IMR90 Hi-C 24141950 KLHL35 46921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 75748582 75748924 75748753 Y UVRAG NA NA NA NA NA WNT11 170856 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 76802149 76802401 76802277 Y NA CAPN5 NA NA NA NA CAPN5 26170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 77445522 77445800 77445629 Y NA FTH1P16 NA NA NA NA FTH1P16 1451 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 77762280 77762565 77762352 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 26346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 78002337 78002637 78002489 Y NA NA NA NA NA NA KCTD21 104469 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 78089939 78090271 78090187 Y GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 37123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 78130392 78130692 78130610 Y GAB2 GAB2 NA NA NA NA GAB2 2998 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 78298750 78298870 78298801 Y NA NARS2 NA NA NA NA NARS2 14831 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 78798308 78798462 78798392 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 312691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 79093983 79094278 79094131 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 16875 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 37352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 79794635 79795000 79794859 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 683482 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 82805889 82806270 82806080 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 24924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA CCDC90B 282552 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 85160814 85160851 85160833 Y DLG2 NA NA NA NA NA TMEM126B 176778 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 86430919 86431170 86431045 Y PRSS23 ME3 PRSS23,ME3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ME3 49241 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 86451588 86451883 86451813 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 48218 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 86452946 86453377 86453076 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 46724 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 86454484 86454767 86454607 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 45334 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 86514557 86514754 86514624 Y NA PRSS23 NA NA NA NA PRSS23 14456 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 88269213 88269357 88269284 Y NA NA NA NA NA NA CTSC 200258 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 91957038 91957557 91957289 Y NA NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 971573 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 92818375 92818514 92818426 Y SLC36A4,C11orf75 NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 110616 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 93343191 93343552 93343372 Y NA KIAA1731 NA NA NA NA KIAA1731 49253 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 95888692 95889856 95889448 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 184488 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 95990308 95990455 95990418 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 83889 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 96169745 96169924 96169835 Y NA CCDC82,JRKL ENDOD1 IMR90 Hi-C 24141950 JRKL 48592 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 99462687 99463068 99462783 Y NA NA NA NA NA NA CNTN5 573004 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 99734583 99734830 99734707 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 821554 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 100747572 100748094 100747776 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 191188 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 103491773 103492137 103491940 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 213388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 103495901 103496466 103496275 Y NA NA DYNC2H1,PDGFD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37O16.8 217516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 103504226 103504419 103504320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37O16.8 225841 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 108487361 108487672 108487557 Y EXPH5 EXPH5,DDX10 NPAT,EXPH5,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 24896 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 108741188 108741366 108741295 Y NA NA NA NA NA NA DDX10 207436 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 112723170 112723204 112723188 Y NA NA NA NA NA NA NCAM1 106793 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 113828537 113828676 113828607 Y NA NA NA NA NA NA USP28 84245 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 114152118 114152374 114152253 Y ZBTB16,NNMT NNMT NNMT IMR90 Hi-C 24141950 NNMT 25609 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 114224881 114225192 114225037 Y NA RBM7,C11orf71 FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM7 43560 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 117015877 117016035 117015996 Y SIK3,PAFAH1B2 SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 2894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 118490168 118490609 118490335 Y PHLDB1 ARCN1,IFT46,PHLDB1 NA NA NA NA PHLDB1 15013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 118788249 118788453 118788294 Y MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5864 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 118790377 118790895 118790660 Y NA MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 3422 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 118794621 118795305 118795013 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 304 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 122586167 122586342 122586202 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 61784 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 125670081 125670467 125670312 Y CHEK1,PATE4,PATE1,PATE2 NA NA NA NA NA HYLS1 81042 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 126032961 126033284 126033106 Y PATE2,PATE3 FAM118B,RPUSD4 CDON,DDX25,HYLS1,PUS3 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 46025 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 126449480 126449697 126449589 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 225945 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128323342 128323695 128323510 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 131758 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128352415 128352744 128352497 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 102709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128387749 128388099 128387998 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 67354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128445940 128446213 128446123 Y FLI1,FLI1 ETS1 NA NA NA NA ETS1 9240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128579282 128579748 128579400 Y FLI1,FLI1 FLI1 NA NA NA NA FLI1 24852 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 128605969 128606121 128606047 Y ETS1,FLI1,FLI1 NA NA NA NA NA FLI1 51539 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr11 130767627 130768066 130767878 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1428527 1428661 1428594 Y ERC1 NA NA NA NA NA WNT5B 208396 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1632900 1633084 1632977 Y NA WNT5B NA NA NA NA WNT5B 3973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1698560 1698670 1698614 Y FBXL14 FBXL14 NA NA NA NA FBXL14 2661 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 1717506 1717606 1717553 Y NA FBXL14 FBXL14,ERC1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 16175 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 2467815 2468125 2467879 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 356114 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 4274113 4274463 4274167 Y CCND2 NA NA NA NA NA CCND2 106475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 6276820 6277298 6277162 Y VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 29583 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 6311406 6311775 6311432 Y NA CD9 NA NA NA NA CD9 4525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 6616640 6616858 6616680 Y NA VAMP1,NCAPD2,MRPL51,SCARNA10,GAPDH,IFFO1 NA NA NA NA SCARNA10 530 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 7790789 7791157 7790868 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3 295714 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 9065319 9065715 9065510 Y PHC1 PHC1,M6PR M6PR IMR90 Hi-C 24141950 PHC1 827 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 10336326 10336485 10336379 Y CLEC12A,CLEC12A,GABARAPL1,CLEC7A,OLR1 OLR1,GABARAPL1 NA NA NA NA OLR1 13589 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 10337097 10337455 10337232 Y NA OLR1,GABARAPL1 NA NA NA NA OLR1 14360 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 11933482 11933754 11933622 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 132694 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 11986979 11987463 11987102 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 186191 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 12016846 12017194 12017120 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 216058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 12038206 12038369 12038301 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 223728 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 12956264 12956405 12956396 Y GPRC5A,DDX47 DDX47 NA NA NA NA DDX47 7845 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr12 13049170 13049423 13049295 Y DUSP16 RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6 NA NA NA NA GPRC5A 7454 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 13145446 13145954 13145521 Y DUSP16,EMP1 HTR7P1,HEBP1,KIAA1467 NA NA NA NA HTR7P1 4858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 25062577 25063016 25062829 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 37377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 16493 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA BHLHE41 8249 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr12 27430817 27431042 27430895 Y NA STK38L NA NA NA NA STK38L 35916 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 27931494 27931809 27931627 Y MANSC4 NA NA NA NA NA MRPS35 69788 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 28127967 28128359 28128243 Y PTHLH,PTHLH NA NA NA NA NA CCDC91 155823 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 29329938 29330173 29330068 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 29902 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 29581721 29581917 29581813 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 49599 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 31523025 31523181 31523129 Y METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A NA NA NA NA FAM60A 45033 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 31671759 31672031 31671827 Y NA NA NA NA NA NA DENND5B-AS1 68826 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 31902136 31902566 31902240 Y C12orf35,AMN1,H3F3C AMN1,H3F3C AMN1 K562 ChIA-PET 22265404 AMN1 22028 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 32881013 32881116 32881065 Y NA YARS2 NA NA NA NA YARS2 25720 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 33044985 33045279 33045082 Y NA PKP2 NA NA NA NA PKP2 2495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 33740370 33740630 33740504 Y NA NA SYT10,YARS2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SYT10 149616 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 42984702 42985091 42984897 Y GXYLT1,PRICKLE1,PRICKLE1,PRICKLE1 PRICKLE1 NA NA NA NA PRICKLE1 2545 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 43367937 43368309 43368123 Y NA NA PRICKLE1 IMR90 Hi-C 24141950 PRICKLE1 385780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 45638356 45638816 45638511 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 30532 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46614251 46614418 46614333 Y NA SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 47382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46636369 46636708 46636589 Y SCAF11,SLC38A1 SLC38A1 NA NA NA NA SLC38A1 25092 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 46824163 46824471 46824386 Y NA RP11-96H19.1 SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 48701 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46886273 46886657 46886465 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 110811 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46887386 46887956 46887679 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 111924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 46888080 46888552 46888358 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 112618 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 5.96108895695202 chr12 46942703 46943018 46942760 Y NA NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 167241 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr12 46947043 46947401 46947166 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 171581 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 46949340 46949533 46949437 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 173878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46949913 46950236 46950181 Y NA NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 174451 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 47053760 47053887 47053821 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 278298 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 47671815 47672221 47672059 Y NA NA AMIGO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AMIGO2 200081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 48215602 48215961 48215782 Y OR10AD1,RPAP3 HDAC7 NA NA NA NA HDAC7 8954 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 49370069 49370445 49370342 Y NA ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1 NA NA NA NA RP11-386G11.5 19705 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 49452736 49452852 49452791 Y NA PRKAG1,LMBR1L NA NA NA NA PRKAG1 41756 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 49508076 49508435 49508256 Y NA LMBR1L,RP11-386G11.10,TUBA1B NA NA NA NA LMBR1L 5393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 50936330 50936621 50936410 Y DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 39562 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 51765347 51765619 51765517 Y FIGNL2,GALNT6 GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 GALNT6 19032 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 42258 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.22243801117435 chr12 52542210 52542726 52542513 Y KRT80,KRT7,KRT6B,KRT6A,KRT5,C12orf44 KRT80 KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT80 41058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr12 52571070 52571435 52571234 Y NA KRT80 NA NA NA NA KRT80 12349 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 52584709 52584955 52584807 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 925 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr12 52588987 52589174 52589068 Y ACVR1B,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 5203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 52594001 52594417 52594311 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 10217 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 52596076 52596423 52596243 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12292 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr12 52596776 52597514 52597151 Y NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 12992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 52624014 52624394 52624158 Y KRT7 KRT80 NA NA NA NA KRT7 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 52624687 52625139 52624914 Y KRT7 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT7 383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 52674043 52674518 52674247 Y NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80 KRT7,KRT81 NA NA NA NA KRT81 8800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 53288883 53289427 53289224 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 51228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 NA NA NA NA NA ITGA5 57360 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 5.46433154387269 chr12 57073427 57073817 57073648 Y NA BAZ2A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 6342 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 57557421 57557508 57557464 Y NA LRP1,STAT6 NA NA NA NA STAT6 33499 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 57735992 57736374 57736348 Y NA NA R3HDM2 IMR90 Hi-C 24141950 R3HDM2 86414 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 58259163 58259391 58259220 Y TSPAN31,CDK4,METTL21B,CTDSP2 CTDSP2 CTDSP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 CTDSP2 20641 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 59434557 59434696 59434648 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A7 553152 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 59449084 59449472 59449406 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA SLC16A7 538376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 62970708 62971108 62970733 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA RP11-631N16.2 23424 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 62998747 62999127 62998791 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 3281 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 63094069 63094114 63094085 Y USP15,C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 98603 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 63118880 63119001 63118911 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 123414 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 63240359 63240641 63240456 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 86176 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr12 63242425 63242574 63242486 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 84243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 63256455 63256601 63256528 Y PPM1H NA NA NA NA NA PPM1H 70216 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr12 64310301 64310738 64310490 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 74228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 64311746 64312216 64311964 Y NA NA NA NA NA NA SRGAP1 75673 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 64312639 64312950 64312683 Y SRGAP1 NA NA NA NA NA SRGAP1 76566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 64482177 64482504 64482346 Y SRGAP1,TBK1,C12orf66 NA NA NA NA NA C12orf66 131572 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 64546689 64546709 64546700 Y NA NA NA NA NA NA C12orf66 67367 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 64855437 64855720 64855602 Y C12orf66,TBK1 TBK1 NA NA NA NA TBK1 11777 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 65065216 65065277 65065242 Y LEMD3 NA NA NA NA NA RASSF3 62923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB NA NA NA NA NA HELB 65035 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 68705850 68706149 68706026 Y IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1 MDM1 NA NA NA NA MDM1 18012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 69019747 69019936 69019838 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RP11-254B13.3 14837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr12 69446892 69447106 69446965 Y RAP1B,LYZ,CPM NA CPM,MDM2 IMR90 Hi-C 24141950 CPSF6 184211 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 70081797 70082155 70082063 Y NA RAB3IP NA NA NA NA RAB3IP 48306 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 70634012 70634396 70634290 Y RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 74668744 74669132 74668938 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L3B 260419 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 75900907 75901415 75901091 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 2001 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 76052717 76052819 76052768 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1,OSBPL8 IMR90 Hi-C 24141950 KRR1 149301 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 76849053 76849336 76849202 Y OSBPL8 NA NA NA NA NA OSBPL8 102253 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 79305344 79305659 79305351 Y NA SYT1 NA NA NA NA SYT1 49571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 79817950 79818263 79818028 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 264614 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 79848111 79848561 79848284 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 234316 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 79941021 79941361 79941199 Y PAWR NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 141516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 80219716 80220141 80220058 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R12A 107099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 80450155 80450249 80450200 Y NA RP11-244J10.1 SYT1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-244J10.1 44864 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 82155346 82155393 82155380 Y NA NA NA NA NA NA CCDC59 595191 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 84902694 84902984 84902888 Y NA NA NA NA NA NA SLC6A15 402410 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 86013160 86013354 86013263 Y NA NA NA NA NA NA LRRIQ1 585068 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 89845741 89845891 89845816 Y NA NA NA NA NA NA POC1B 71910 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 90150470 90150910 90150738 Y NA ATP2B1 LOC338758 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP2B1 49393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 90175016 90175190 90175077 Y DUSP6,POC1B,ATP2B1 NA C12orf37,LOC338758 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATP2B1 73939 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 92995849 92996628 92996444 Y EEA1,BTG1 NA LOC256021 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EEA1 324479 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 93321551 93321826 93321626 Y EEA1 EEA1 NA NA NA NA EEA1 444 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr12 95411707 95411975 95411841 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 16161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 95594660 95595399 95595279 Y FGD6 FGD6,VEZT NA NA NA NA FGD6 13859 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 98818500 98818672 98818666 Y NA RNU4-41P LOC100128191,TMPO MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU4-41P 8684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 104613052 104613575 104613267 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 5495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 104613868 104614024 104613970 Y CHST11,TXNRD1,TXNRD1 TXNRD1,RPL18AP3 NA NA NA NA TXNRD1 6311 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 104675995 104676292 104676137 Y GLT8D2,TXNRD1 RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RP11-818F20.5 3495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 105030278 105030644 105030428 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 183205 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 105064571 105065844 105065441 Y EID3,CHST11,KIAA1033 NA NA NA NA NA CHST11 217498 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 105812004 105812354 105812179 Y NA NA NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-474B16.1 93209 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 108877904 108878160 108878033 Y SSH1,SELPLG,SELPLG FICD NA NA NA NA FICD 28802 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 109117977 109118365 109118310 Y SELPLG,SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 5007 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 109209396 109209677 109209591 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 39689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 109570576 109570747 109570637 Y ACACB ALKBH2,UNG NA NA NA NA UNG 37197 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 110867136 110867499 110867318 Y NA ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3 NA NA NA NA HMGA1P3 1049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 111053049 111053390 111053220 Y NA PPTC7,TCTN1 NA NA NA NA TCTN1 3217 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 112341708 112342051 112341878 Y ATXN2,BRAP,MAPKAPK5,NAA25,C12orf51,TMEM116 NA NA NA NA NA MAPKAPK5 63926 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 115791856 115792156 115792052 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 671887 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 118263351 118263381 118263366 Y NA NA NA NA NA NA RFC5 186012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 119632995 119633391 119633197 Y TMEM233 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 18548 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA CCDC64 NA NA NA NA CCDC64 858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 120669025 120669761 120669334 Y RAB35,RNF10,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN 31813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 120906143 120906276 120906236 Y RAB35 COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1 NA NA NA NA DYNLL1 490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 121282265 121283301 121283112 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 56873 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 121581639 121581946 121581768 Y P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7 P2RX7 NA NA NA NA P2RX7 13017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr12 121583169 121583668 121583305 Y P2RX4,CAMKK2,OASL,P2RX7 P2RX7 NA NA NA NA P2RX7 14547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 121714857 121715111 121714996 Y OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2 CAMKK2 NA NA NA NA CAMKK2 19000 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 122014724 122015549 122015007 Y NA KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 1371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA MORN3 21809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 122228443 122228705 122228504 Y CAMKK2,MLXIP,SETD1B,RHOF RHOF,AC084018.1,SETD1B NA NA NA NA RHOF 10604 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 6.20946766349169 chr12 123233355 123233499 123233417 Y CLIP1,HCAR2,HCAR3 HCAR2,HCAR3,DENR CCDC62 IMR90 Hi-C 24141950 DENR 1822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124486134 124486345 124486231 Y NA ZNF664,CCDC92,FAM101A NA NA NA NA FAM101A 30346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124717911 124718282 124718055 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 262123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124721310 124721532 124721425 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 265522 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 133557 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 124985154 124985447 124985301 Y DHX37 NA NA NA NA NA NCOR2 64688 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 125028947 125029179 125029054 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 20956 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 125246325 125246717 125246520 Y UBC NA NA NA NA NA SCARB1 118497 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 125256511 125256612 125256543 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 108602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr12 125288540 125288810 125288726 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 76404 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 129725693 129725893 129725793 Y NA NA NA NA NA NA GLT1D1 389721 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 130012974 130013180 130013078 Y NA NA NA NA NA NA TMEM132D 373031 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 132221686 132221872 132221813 Y NOC4L SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 28060 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 132345340 132345736 132345589 Y SFSWAP,ULK1 MMP17,ULK1 NA NA NA NA ULK1 31460 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 132903795 132904258 132904060 Y GALNT9 NA NA NA NA NA GALNT9 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 NA NA NA NA NA ZMYM2 171116 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 22107257 22107449 22107379 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 75748 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA RPS7P10 42284 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 23500406 23500844 23500578 Y NA NA NA NA NA NA HMGA1P6 205469 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr13 23735133 23735494 23735391 Y NA HMGA1P6 NA NA NA NA HMGA1P6 28820 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 24080861 24081253 24081061 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF19 61256 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 24133122 24133556 24133337 Y NA TNFRSF19 MIPEP,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF19 8953 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 27557231 27557465 27557334 Y USP12,RPL21,RASL11A NA RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP12 186568 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 28005406 28005795 28005597 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 8725 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 29232247 29232368 29232342 Y NA POMP NA NA NA NA POMP 1006 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 30407984 30408178 30408116 Y UBL3 UBL3 NA NA NA NA UBL3 14643 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA UBE2L5P KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2L5P 17302 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 31483566 31483936 31483755 Y NA NA NA NA NA NA ALOX5AP 175921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 34069113 34069239 34069161 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 146346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 34727619 34727920 34727781 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 337433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr13 34731212 34731445 34731362 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 341026 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 38275506 38275878 38275580 Y TRPC4 NA NA NA NA NA POSTN 104525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 43570775 43570983 43570833 Y EPSTI1 EPSTI1 EPSTI1,ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 6368 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 68254 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 44379216 44379443 44379336 Y ENOX1 ENOX1 ENOX1,DNAJC15,EPSTI1,TNFSF11,CCDC122,LACC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENOX1 20172 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 44436870 44437053 44436962 Y ENOX1 LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 14367 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 44440154 44440346 44440262 Y CCDC122,C13orf31,C13orf31 LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 11074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 NA SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC122 90905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 45629728 45629998 45629866 Y KCTD4 NA NA NA NA NA GTF2F2 62652 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 45774024 45774110 45774098 Y KCTD4 KCTD4 NA NA NA NA KCTD4 849 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr13 46869807 46870189 46870040 Y ZC3H13,LCP1,C13orf18 NA NA NA NA NA LCP1 85801 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 48464437 48464519 48464469 Y NA NA HTR2A IMR90 Hi-C 24141950 NAP1L4P3 128842 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 49288768 49288781 49288774 Y NA NA NA NA NA NA RCBTB2 183399 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 49324068 49324506 49324074 Y NA NA MED4 IMR90 Hi-C 24141950 RCBTB2 218699 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 51486183 51486653 51486377 Y RNASEH2B RNASEH2B,RNASEH2B-AS1 NA NA NA NA RNASEH2B-AS1 3335 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 52572353 52572390 52572372 Y NA ATP7B,ALG11,UTP14C NA NA NA NA ATP7B 11240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 53765519 53765549 53765534 Y NA NA NA NA NA NA SUGT1 540675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr13 60736273 60736548 60736444 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 152 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 67674730 67675228 67675034 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 4764102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr13 67722025 67722418 67722226 Y PCDH9 NA NA NA NA NA DACH1 4716912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 67962999 67963167 67963083 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 4476163 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 69259676 69259922 69259838 Y NA NA NA NA NA NA DACH1 3179408 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 76279211 76279429 76279239 Y NA NA NA NA NA NA LMO7 86641 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 81048022 81048142 81048082 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 134936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 94583687 94584035 94583861 Y NA NA NA NA NA NA SNORD22 564474 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 102569627 102570054 102569972 Y NA NA NA NA NA NA NALCN 502784 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 105315212 105315547 105315380 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1820018 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 106808885 106809142 106808998 Y NA NA EFNB2,LINC00460 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 409370 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 107222796 107223196 107222998 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 4284 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 108407171 108407488 108407466 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 109595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 109807507 109807975 109807755 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 597640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr13 109808669 109809037 109808800 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 596578 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr13 109847392 109847697 109847628 Y NA NA NA NA NA NA AL162497.1 557918 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 109895773 109895899 109895836 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 509716 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 109909294 109909814 109909611 Y NA NA MYO16,IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 495801 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 AL162497.1 483404 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 AL162497.1 MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL162497.1 45982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 110664530 110664847 110664695 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 227615 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr13 110669788 110670084 110669997 Y NA NA MYO16 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 232873 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr13 110902548 110902879 110902758 Y COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA NA COL4A2 53280 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 110965035 110965206 110965124 Y COL4A1,COL4A2 COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 7539 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 110982194 110982608 110982413 Y NA COL4A2,COL4A1 NA NA NA NA COL4A1 24698 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 111863058 111863169 111863068 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 98152 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 112726762 112727353 112726963 Y NA SNORD44,SOX1 NA NA NA NA SOX1 6849 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr13 112727649 112728064 112727870 Y NA SNORD44,SOX1 NA NA NA NA SOX1 7736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr13 113377120 113377559 113377252 Y NA ATP11A NA NA NA NA ATP11A 34477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 113828673 113828834 113828768 Y ATP11A,DCUN1D2,CUL4A CUL4A,PCID2 NA NA NA NA CUL4A 31718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr13 114600157 114600520 114600358 Y GAS6 GAS6 NA NA NA NA GAS6 35111 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 21151333 21151694 21151411 Y NA RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 21577986 21578258 21578000 Y NA ARHGEF40,ZNF219 NA NA NA NA ZNF219 7105 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC7A7 2462 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 23449151 23449315 23449234 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 536 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA DHRS2 66439 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 24755187 24755313 24755250 Y DHRS4L1 TINF2,RABGGTA,DHRS1 NA NA NA NA DHRS1 11726 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 27311220 27311475 27311345 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 246260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 31400109 31400220 31400192 Y NA NA NA NA NA NA COCH 58389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 31905446 31905450 31905448 Y NA HEATR5A,RP11-176H8.1 NA NA NA NA HEATR5A 17658 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 32420109 32420203 32420156 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 123117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 32941850 32942320 32942112 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 397851 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 32976944 32977104 32977024 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 432945 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 32979007 32979394 32979291 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 435008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 33366513 33366604 33366563 Y NA NA AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5-AS1 822514 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 35250371 35250766 35250653 Y SRP54,BAZ1A NA NA NA NA NA CFL2 68342 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 35865196 35865330 35865211 Y RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 6625 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 45714299 45714525 45714379 Y NA MIS18BP1 NA NA NA NA MIS18BP1 6218 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 47696508 47696702 47696627 Y NA RPL13AP2 NA NA NA NA RPL13AP2 28201 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 47979335 47979399 47979362 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 311028 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 49979013 49979291 49979168 Y C14orf182 NA NA NA NA NA RN7SL1 72006 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 50511824 50512400 50511896 Y RPL36AL,ARF6,SOS2,C14orf182 NA C14orf182,ARF6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARF6 154014 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 52006399 52006758 52006578 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 52581 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 129928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 C14orf166 168413 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 53416335 53416646 53416599 Y GPR137C FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 507 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 57047832 57047974 57047932 Y PELI2,C14orf101 NA NA NA NA NA PELI2 465300 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 58544876 58545175 58545024 Y C14orf37 NA NA NA NA NA UBA52P3 60822 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 59742406 59742712 59742574 Y DAAM1 NA NA NA NA NA DAAM1 89042 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA PRKCH 81318 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 PRKCH SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 PRKCH 39952 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 62018127 62018466 62018303 Y HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 141765 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 62076216 62076332 62076274 Y NA NA NA NA NA NA HIF1A 83899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 65224783 65224915 65224850 Y ZBTB1,PLEKHG3 NA NA NA NA NA PLEKHG3 55963 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 65905118 65905243 65905181 Y NA FUT8 NA NA NA NA FUT8 29808 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 68613334 68613955 68613742 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 272958 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 68614207 68614598 68614344 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 272315 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 68658646 68658820 68658748 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 228093 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 68864511 68864831 68864664 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 22082 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 68925660 68925982 68925837 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 38747 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 68933312 68933746 68933512 Y NA PPIAP6 NA NA NA NA PPIAP6 46399 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 69404659 69405002 69404945 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 39155 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 69544472 69544808 69544638 Y NA NA NA NA NA NA DCAF5 73059 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 73083921 73084271 73084094 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4,RBM25 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 274538 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr14 73695241 73695452 73695329 Y ZFYVE1,PSEN1,NUMB,C14orf169 PAPLN NA NA NA NA PAPLN 6753 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 74220065 74220506 74220203 Y C14orf169,ZNF410,COQ6,COQ6,C14orf43,C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 31557 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 77384980 77385465 77385224 Y VASH1 RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 33887 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 77489818 77490087 77489881 Y NA IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 2947 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 80050129 80050354 80050306 Y NRXN3 NA NA NA NA NA DIO2 801746 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr14 80051183 80051363 80051265 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 800737 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 80052385 80052697 80052460 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 799403 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr14 80308733 80308907 80308837 Y NA NA NA NA NA NA DIO2 543193 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 80857236 80857459 80857352 Y NA DIO2 NA NA NA NA DIO2 5136 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 81397243 81397817 81397507 Y CEP128 CEP128 NA NA NA NA CEP128 26044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 81439745 81439770 81439758 Y CEP128,TSHR CEP128 NA NA NA NA CEP128 15884 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr14 88884161 88884478 88884321 Y NA SPATA7 NA NA NA NA SPATA7 34893 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 92970203 92970533 92970302 Y ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 RIN3 NA NA NA NA RIN3 7585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 93509801 93510236 93510094 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 70429 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 93510584 93510744 93510686 Y NA NA NA NA NA NA ITPK1 69921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 93552204 93552427 93552400 Y NA ITPK1 NA NA NA NA ITPK1 28238 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr14 99073187 99073437 99073313 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 871779 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr14 100497913 100498157 100498035 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 204478 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 101024059 101024421 101024266 Y WARS,WARS,WDR25,WDR25 BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 27329 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 30172 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 102340393 102340589 102340458 Y PPP2R5C,WDR20,DYNC1H1,PPP2R5C NA NA NA NA NA DYNC1H1 88276 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.96757413079335 chr14 102438747 102439113 102438818 Y PPP2R5C,DYNC1H1 DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 9882 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 102836975 102837187 102837062 Y NA CINP,TECPR2 NA NA NA NA TECPR2 9675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 103051810 103052039 103051996 Y NA RCOR1 TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 4959 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 103266656 103267057 103266785 Y NA TRAF3 CDC42BPB,AMN IMR90 Hi-C 24141950 TRAF3 24843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB,TNFAIP2 CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TNFAIP2 29772 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 103577206 103577606 103577492 Y C14orf153 TNFAIP2 NA NA NA NA TNFAIP2 10173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 105433766 105434012 105433864 Y KIAA0284,JAG2,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 8682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 105440243 105440515 105440379 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 AHNAK2 2179 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr14 105557924 105558306 105558075 Y NA NA BTBD6,BRF1,JAG2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDCA4 72439 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 3403 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 25595443 25596209 25595953 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 85919 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 30216999 30217403 30217070 Y TJP1 TJP1 TJP1,FAM189A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TJP1 41665 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 31627410 31627711 31627458 Y NA KLF13 NA NA NA NA KLF13 10352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 32962221 32962756 32962661 Y NA SCG5,GREM1,RP11-758N13.1 NA NA NA NA SCG5 30344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 33148173 33148432 33148370 Y GREM1 NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 138965 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 33153988 33154297 33154060 Y GREM1 NA NA NA NA NA RP11-758N13.1 144780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 34421770 34422050 34421910 Y NA PGBD4 NA NA NA NA PGBD4 29496 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 35983013 35983197 35983137 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 704525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 39371433 39371559 39371496 Y NA NA C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 499721 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 40200668 40200777 40200723 Y NA GPR176,EIF2AK4 NA NA NA NA GPR176 10316 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 40210900 40211252 40211013 Y GPR176 EIF2AK4 FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GPR176 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 40601054 40601299 40601247 Y BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2 ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2 PAK6 K562 ChIA-PET 22265404 PLCB2 2918 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 42220921 42221174 42221042 Y NA EHD4 NA NA NA NA EHD4 41602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 42236399 42236774 42236695 Y NA EHD4 SPTBN5 IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 26002 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76,PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 4337 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 44524937 44524986 44524960 Y NA FRMD5 CTDSPL2,WDR76,FRMD5,CASC4 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD5 39487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 27742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 48327662 48328024 48327843 Y NA NA SEMA6D,CTXN2 IMR90 Hi-C 24141950 MYEF2 140690 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 50475759 50476090 50475833 Y SLC27A2 SLC27A2 NA NA NA NA SLC27A2 3366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 51172834 51173079 51172965 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323,22265404 AP4E1 25790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 51590283 51590673 51590479 Y TNFAIP8L3,CYP19A1 NA NA NA NA NA DMXL2 322357 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 52349753 52350120 52349937 Y NA NA NA NA NA NA LEO1 87750 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 56331775 56332089 56331933 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 47831 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 56332751 56332969 56332911 Y NA NEDD4 NEDD4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEDD4 48807 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 56341448 56341541 56341527 Y NA NA NEDD4 IMR90 Hi-C 24141950 NEDD4 57504 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 56452441 56452566 56452504 Y RFX7 NA NA NA NA NA RFX7 80917 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 57792525 57792857 57792691 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 89374 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 58568513 58568584 58568545 Y NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 219481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 59461586 59461962 59461756 Y ADAM10,SLTM,RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 66309 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 60293275 60293547 60293411 Y NA FOXB1 NA NA NA NA FOXB1 874 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 60835043 60835413 60835301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 65666 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 61051185 61051571 61051320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 281808 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 62411576 62411892 62411783 Y NA NA NA NA NA NA C2CD4A 54400 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 62896766 62896914 62896838 Y NA NA TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 216041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 63142999 63143362 63143082 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 100010 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 64187573 64187676 64187624 Y DAPK2 NA NA NA NA NA HERC1 63432 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 66707547 66707736 66707571 Y MAP2K1 TIPIN,MAP2K1 RPL4,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 MAP2K1 30392 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 NA NA NA NA NA RPL4 178417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 219173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr15 67366599 67366961 67366679 Y NA SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 12498 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67413336 67413759 67413492 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 59235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67423316 67423661 67423503 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 69215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 67467751 67468085 67467918 Y NA NA NA NA NA NA AAGAB 77448 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 70289516 70289879 70289625 Y NA NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 98636 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr15 71176892 71177111 71177002 Y NA LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA THAP10 6013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 73538661 73539057 73538860 Y NEO1 NA NA NA NA NA HCN4 120548 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 74287730 74287905 74287836 Y PML STOML1,PML NA NA NA NA PML 2716 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 74332904 74333192 74333031 Y NA STOML1,PML NA NA NA NA PML 47890 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 74908840 74909023 74908946 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 19999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 75959061 75959441 75959310 Y SNX33 SNUPN,SNX33,IMP3 NA NA NA NA IMP3 20014 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 77289496 77289735 77289616 Y PSTPIP1 PSTPIP1 NA NA NA NA PSTPIP1 5796 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 78031317 78031646 78031484 Y LINGO1 NA NA NA NA NA LINGO1 79596 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 78368268 78368362 78368315 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 80841630 80841706 80841692 Y NA NA NA NA NA NA ARNT2 146938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 83722004 83722168 83722109 Y NA C15orf40,BTBD1 NA NA NA NA BTBD1 11938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 83777211 83777631 83777545 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3052 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.47730189155535 chr15 83778085 83778410 83778297 Y NA BTBD1,TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 3926 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 83869308 83869629 83869461 Y SH3GL3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 5141 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 83954950 83955303 83955151 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 3484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr15 83956370 83956763 83956596 Y BNC1 BNC1 NA NA NA NA BNC1 4904 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 89183173 89183667 89183329 Y ABHD2,ISG20 AEN,ISG20 NA NA NA NA ISG20 5789 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 90956663 90957019 90956743 Y NA IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 92486040 92486252 92486096 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA SLCO3A1 91115 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 92664917 92665299 92665108 Y NA NA NA NA NA NA NPM1P5 161772 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 93424689 93424786 93424732 Y CHD2 CHD2 NA NA NA NA CHD2 163 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 96103160 96103444 96103266 Y NA NA NR2F2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NR2F2 763723 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 96867031 96867104 96867071 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2 63 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 96872860 96873000 96872921 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 4270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 15452 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 96900508 96900866 96900583 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 31918 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 98047383 98047776 98047510 Y ARRDC4 NA NA NA NA NA ARRDC4 413008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 99408611 99408985 99408683 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 218411 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 99409255 99409515 99409377 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219055 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr15 100914283 100914527 100914405 Y ADAMTS17 ADAMTS17 NA NA NA NA ADAMTS17 34073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 101741612 101741900 101741753 Y TM2D3,CHSY1 CHSY1 NA NA NA NA CHSY1 48237 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr15 102023301 102023573 102023437 Y NA PCSK6 NA NA NA NA PCSK6 39832 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 130955 131250 131103 Y NA SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA MPG 5949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 369599 369830 369715 Y NA PDIA2,AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 30843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 575519 575832 575766 Y NHLRC4 PIGQ NA NA NA NA PIGQ 39163 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 37961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 1522812 1522824 1522818 Y MAPK8IP3,CLCN7 C16orf91,CLCN7,TELO2 NA NA NA NA CLCN7 757 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 1585533 1585949 1585726 Y NA TELO2 NA NA NA NA TELO2 44188 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 2057818 2059084 2058234 Y TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598 SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1 NA NA NA NA ZNF598,NPW 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr16 2518541 2518691 2518640 Y RAB26,E4F1,CCNF,C16orf59,TBC1D24,NTN3 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2 NA NA NA NA NTN3 809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.47730189155535 chr16 3114137 3114295 3114216 Y ZNF263,ZNF205,PRSS41,ZSCAN10 TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25,IL32,ZNF205 NA NA NA NA IL32 839 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 3156056 3156304 3156227 Y PAQR4,OR2C1,CLUAP1,OR1F1 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 4257 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr16 3207486 3207903 3207712 Y SRRM2,ZNF75A,ZNF597,ZNF200,ZNF200,ZNF200,NLRC3,MEFV ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 29708 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 3237977 3238591 3238121 Y NA ZNF200 ZNF200 K562 ChIA-PET 22265404 ZNF200 45630 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr16 3858926 3859164 3859045 Y NA NA NA NA NA NA CREBBP 69563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 4427155 4427449 4427262 Y NA PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3 NA NA NA NA VASN 7306 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 4944877 4945061 4944987 Y HMOX2,C16orf5,C16orf5,LOC342346,C16orf71,SEPT12,SEC14L5,ROGDI GLYR1 NA NA NA NA GLYR1 49534 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 4985283 4985359 4985321 Y NA PPL NA NA NA NA PPL 23383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 6353433 6353832 6353638 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 1207624 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 11198828 11199160 11198954 Y LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 NA NA NA NA NA RMI2 142316 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 11308064 11308220 11308142 Y NA RMI2,SOCS1 SOCS1,CLEC16A,PRM3,PRM2,TNP2,RMI2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RMI2 33256 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 11654480 11655021 11654741 Y ZC3H7A,TXNDC11,LITAF,LITAF NA NA NA NA NA LITAF 73216 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr16 12244428 12244806 12244617 Y NA NA NA NA NA NA SNX29 175834 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 14423689 14423899 14423743 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 260511 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 14529113 14529156 14529135 Y NA NA NA NA NA NA PARN 195429 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 15684514 15685137 15684868 Y NDE1,NDE1,KIAA0430 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA KIAA0430 49886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 15996854 15996874 15996863 Y NA MYH11,FOPNL,RPL15P20,ABCC1 MYH11,ABCC1 IMR90 Hi-C 24141950 FOPNL 16372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 17270464 17270719 17270563 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 946112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 17476901 17477384 17477246 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 1152549 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 19822629 19822921 19822772 Y NA NA GPRC5B IMR90 Hi-C 24141950 GPRC5B 72568 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr16 20913163 20913441 20913303 Y CRYM,DCUN1D3,LYRM1 LYRM1,ERI2,DCUN1D3 NA NA NA NA DCUN1D3 3457 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 21622558 21622759 21622643 Y CRYM,IGSF6,METTL9 METTL9 NA NA NA NA METTL9 16019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 22020044 22020453 22020259 Y OTOA,VWA3A C16orf52 VWA3A IMR90 Hi-C 24141950 C16orf52 3085 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 22201170 22202123 22201439 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 23463654 23463771 23463713 Y NA COG7 NA NA NA NA COG7 1153 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 23508487 23508934 23508786 Y GGA2 COG7,GGA2 NA NA NA NA GGA2 22382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 23518606 23518950 23518778 Y GGA2 GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 12366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 27149778 27150235 27150058 Y NA NA HS3ST4,ZKSCAN2,AQP8 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 127880 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 30545067 30545182 30545127 Y ZNF764 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA ZNF747 894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 20.6154326427924 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 50219057 50219422 50219113 Y NA PAPD5 NA NA NA NA PAPD5 34228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 50372721 50373321 50373026 Y PAPD5,ADCY7,CYLD,CYLD BRD7 NA NA NA NA BRD7 27524 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 51186928 51187269 51186986 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 3650 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 53946175 53946412 53946271 Y RBL2,AKTIP NA NA NA NA NA FTO 210300 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT3,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 57034523 57034824 57034736 Y NLRC5 CETP,NLRC5 NA NA NA NA NLRC5 13126 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 57350531 57350815 57350676 Y NA PLLP CIAPIN1,CCL22,CX3CL1,POLR2C,COQ9,CCL17 IMR90 Hi-C 24141950 PLLP 33932 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 NA NA NA NA NA KATNB1 50262 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 58445622 58445902 58445848 Y NA NA NA NA NA NA SETD6 101481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 58493284 58493520 58493447 Y NDRG4,NDRG4,NDRG4 NA NA NA NA NA SETD6 53863 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 66170755 66170866 66170865 Y NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 269561 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 66416297 66416567 66416426 Y CDH5 LINC00920 NA NA NA NA LINC00920 23860 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 67186810 67187094 67186952 Y NA C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,NOL3,KIAA0895L,E2F4 NA NA NA NA B3GNT9 3693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A RLTPR,ACD,PARD6A NA NA NA NA ACD 4999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 68433458 68433594 68433558 Y NA SMPD3 NA NA NA NA SMPD3 46997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 69019845 69020210 69019891 Y NA NA CHTF8,HAS3 IMR90 Hi-C 24141950 HAS3 117257 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 69564577 69564882 69564731 Y WWP2 NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 32115 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 70779915 70780216 70780046 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 52848 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 70780634 70780961 70780786 Y MTSS1L NA NA NA NA NA VAC14 52103 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 71072056 71072175 71072116 Y NA NA NA NA NA NA VAC14 238992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 71734305 71734386 71734346 Y PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 22218 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 73096616 73096908 73096789 Y NA ZFHX3 ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 5019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 73102955 73103191 73103082 Y ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 11358 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 75034413 75034614 75034514 Y FA2H,ZFP1,BCAR1,BCAR1,ZNRF1 ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 2342 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 75288221 75288577 75288338 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 11374 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 80060890 80061347 80061153 Y NA NA NA NA NA NA MAF 428279 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 80208286 80208441 80208438 Y NA NA NA NA NA NA MAF 575675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr16 80965900 80966145 80965922 Y NA NA CMC2 IMR90 Hi-C 24141950 CENPN 71958 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 81439497 81439896 81439576 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 36879 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 81560583 81561027 81560837 Y PLCG2,CMIP,CMIP NA NA NA NA NA CMIP 83808 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 81659418 81659741 81659491 Y PLCG2,CMIP NA NA NA NA NA PLCG2 110961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 81876199 81876416 81876256 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 105497 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr16 82662605 82662975 82662756 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 4197 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 82663331 82663687 82663514 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 4923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 82686651 82686853 82686732 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 28243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 28731 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr16 82693893 82694152 82693974 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 35485 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr16 82733427 82733620 82733554 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 75019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA CDH13 410992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 84641438 84641605 84641502 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 8078 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85028506 85028759 85028547 Y COTL1,CRISPLD2,ZDHHC7,KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 14382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85038009 85038299 85038256 Y NA ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA ZDHHC7 4842 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr16 85558951 85559083 85559056 Y KIAA0513,IRF8 NA KIAA0182,LOC727710 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 162596 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85678973 85679150 85679027 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 42529 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 86775121 86775409 86775225 Y NA NA FOXC2,FOXL1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 176264 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC2 386553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA MAP1LC3B 36450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 87811524 87811882 87811665 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 13926 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 87839693 87840050 87839856 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 87840547 87840941 87840913 Y SLC7A5 KLHDC4 SLC7A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 KLHDC4 42949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 88365536 88366092 88365805 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 151633 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 88366840 88367234 88367013 Y BANP,BANP,ZC3H18,CYBA NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 150491 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 88540534 88540913 88540729 Y FAM38A,CTU2,APRT,ZNF469 ZFPM1 NA NA NA NA ZFPM1 22809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr16 88700249 88701257 88700631 Y ACSF3,ZFPM1,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3,ZC3H18,CYBA CYBA,MVD NA NA NA NA CYBA 14303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr16 88921143 88921285 88921195 Y ZC3H18,CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3 APRT,TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA GALNS 93 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 654300 654699 654470 Y NA VPS53,FAM57A,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA GEMIN4 540 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr17 1492205 1492514 1492391 Y NA PITPNA,SLC43A2 NA NA NA NA PITPNA 28095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 4437372 4437692 4437444 Y NA SPNS2,MYBBP1A,SMTNL2 NA NA NA NA MYBBP1A 19234 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 5854578 5854683 5854630 Y NA NA NA NA NA NA NLRP1 333834 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 6938707 6938851 6938779 Y NA AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13 NA NA NA NA SLC16A13 1313 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 7271356 7271453 7271405 Y WRAP53,SHBG,AMAC1L3 NEURL4,KCTD11,TNK1 NA NA NA NA TNK1 10400 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 8600572 8600969 8600801 Y MYH10 NA MYH10,RPL26,RNF222 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 68493 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 8602115 8602249 8602166 Y MYH10 NA MYH10 IMR90 Hi-C 24141950 MYH10 70036 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 8850448 8850862 8850791 Y PIK3R5,PIK3R5 NA NA NA NA NA NTN1 71997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 9877746 9878167 9877897 Y GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 281912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 10029003 10029256 10029103 Y NA NA NA NA NA NA RPS27AP1 130823 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 11928413 11928725 11928507 Y NA ZNF18,MAP2K4 NA NA NA NA MAP2K4 6272 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 13460367 13460669 13460622 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 42575 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 15862469 15862773 15862614 Y ADORA2B,ZSWIM7,TTC19 ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ADORA2B 16238 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 15877316 15877536 15877426 Y NA ADORA2B,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA TTC19 23158 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 16355497 16355695 16355534 Y TTC19,PIGL NA NA NA NA NA UBB 73385 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 19630628 19631028 19630955 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 81179 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 20825818 20826196 20825887 Y NA NA USP22,SPECC1 IMR90 Hi-C 24141950 USP22 118877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 25410571 25410806 25410743 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr17 25833655 25833928 25833707 Y NA NA NA NA NA NA KSR1 51985 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 26135195 26135302 26135249 Y NA NA NA NA NA NA LGALS9 180371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 27189702 27189769 27189736 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA ERAL1 9746 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 27568035 27568215 27568131 Y NA NA NA NA NA NA NUFIP2 50921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 27918115 27918172 27918144 Y GIT1,ANKRD13B TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1 NA NA NA NA GIT1 900 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 28070496 28070746 28070685 Y SSH2,EFCAB5 NA NA NA NA NA GIT1 151424 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 29892134 29892258 29892202 Y EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 175492 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 30115229 30115607 30115424 Y NA NA RAB11FIP4,C17orf79,MIR193A,MIR4725,MIR365B IMR90 Hi-C 24141950 UTP6 111177 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA NA NA NA NA NA C17orf75 86219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 30837973 30838187 30838080 Y CDK5R1 CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 26336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 32909121 32909330 32909224 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 328817 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 33349623 33350064 33349994 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL LIG3,CCT6B NA NA NA NA CCT6B 43526 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 33373543 33373969 33373834 Y SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830 RFFL NA NA NA NA RFFL 40369 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr17 33868194 33868343 33868266 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,SLFN12L,CCL5 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34722 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 35278050 35278157 35278104 Y MRM1 RP11-445F12.1,AATF LHX1,AATF MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-445F12.1 13803 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 35519679 35519723 35519693 Y NA NA NA NA NA NA AATF 215504 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 35741498 35741507 35741502 Y NA ACACA,TADA2A NA NA NA NA ACACA 23402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 37910411 37911394 37910787 Y FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 MIEN1 NA NA NA NA MIEN1 25371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 38263317 38263642 38263602 Y NA MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 8339 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 38440755 38440955 38440855 Y NA CDC6,RARA NA NA NA NA CDC6 930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 38656717 38656888 38656754 Y KRT24,KRT10,TNS4 NA NA NA NA NA IGFBP4 59015 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 39653134 39653351 39653234 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 29209 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 39683248 39683750 39683386 Y NA KRT19 NA NA NA NA KRT19 688 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 40400517 40401003 40400833 Y EZH1,KLHL11,RAB5C,STAT3,STAT3,FAM134C,STAT5B,STAT5A STAT5B,STAT5A NA NA NA NA STAT5B 25722 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 41656262 41656390 41656311 Y G6PC3 ETV4 DHX8,MIR2117,MPP2 IMR90 Hi-C 24141950 ETV4 1274 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 NA LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP3 56868 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr17 42620579 42620851 42620665 Y GJC1,FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 12074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 42620927 42621257 42621090 Y FZD2 GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 11668 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 42624253 42624886 42624582 Y TMUB2,TMUB2,GRN GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD2 8039 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 43303050 43303852 43303644 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 6239 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 43304336 43305039 43304628 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 7525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.22243801117435 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 44268679 44268848 44268762 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 298931 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 46101351 46101579 46101379 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 11813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 46702579 46702749 46702606 Y HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9 HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB9 740 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 NA NA NA NA NA ZNF652 167326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 47913501 47913854 47913589 Y TMEM92 KAT7,FAM117A,RP11-613C6.4 NA NA NA NA RP11-613C6.4 42796 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 48105016 48105270 48105136 Y XYLT2,LRRC59,ITGA3 ITGA3 LOC284080,ITGA3 MCF7 ChIA-PET 22265404 ITGA3 26062 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 48139711 48140314 48140012 Y XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3 ITGA3,PDK2 NA NA NA NA ITGA3 8379 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 49008376 49008926 49008868 Y NA NA WFIKKN2,TOB1,LOC400604,LINC00483,ANKRD40,SPAG9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOB1 65037 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 53315618 53315983 53315841 Y HLF HLF STXBP4,HLF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HLF 24390 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 54993018 54993544 54993286 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL DGKE MCF7 ChIA-PET 22265404 TRIM25 3619 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr17 55523126 55523573 55523446 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 191914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 55951789 55952442 55952113 Y SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 26372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57833423 57834077 57833636 Y NA NA NA NA NA NA PTRH2 50436 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57860256 57860659 57860446 Y DHX40,VMP1,CA4 NA NA NA NA NA MIR21 55968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57861698 57862055 57862024 Y RNFT1 NA NA NA NA NA MIR21 54572 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr17 57862470 57862813 57862554 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 53814 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr17 57882537 57882682 57882623 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 33945 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 57906379 57907270 57906882 Y RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 9357 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr17 57929068 57929265 57929192 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA MIR21 12441 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr17 58468371 58468697 58468395 Y BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32 USP32 NA NA NA NA USP32 29134 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 59488217 59488528 59488332 Y NA TBX2 NA NA NA NA TBX2 12960 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 60707106 60707291 60707232 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 4344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MRC2 270370 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 61787185 61787371 61787278 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 10653 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 62744260 62744559 62744528 Y NA NA NA NA NA NA SMURF2 88074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 63179961 63180187 63180056 Y NA RGS9 NA NA NA NA RGS9 48412 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA RGS9 508381 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 64544411 64544774 64544437 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 247657 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 64551659 64552047 64551761 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 254905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 64796276 64796554 64796503 Y NA NA NA NA NA NA CACNG4 162472 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 64961597 64961937 64961768 Y CACNG4 CACNG4 NA NA NA NA CACNG4 2571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 67757945 67758523 67758299 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA5 436560 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 67758996 67759121 67759059 Y KCNJ2 NA KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA5 437611 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 70194547 70194569 70194559 Y NA NA LOC100499467,SOX9 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 79386 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 71287548 71287861 71287762 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 18453 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 71336325 71336719 71336454 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42EP4 30011 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr17 73685500 73685825 73685750 Y GGA3,MIF4GD,SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 24231 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 73689850 73690283 73690148 Y KIAA0195,CASKIN2,WBP2 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 25125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 73718198 73718514 73718306 Y NA ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 2790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 74341579 74341976 74341749 Y NA SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 28689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr17 74413626 74413718 74413672 Y NA SPHK1,PRPSAP1,UBE2O NA NA NA NA UBE2O 33570 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 74494294 74494838 74494393 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 1034 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 74496600 74496786 74496748 Y NA UBE2O,RHBDF2 NA NA NA NA RHBDF2 728 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 75160724 75161106 75160798 Y NA NA NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 79926 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 75278845 75279720 75279369 Y NA SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 4194 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 75281264 75281453 75281354 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 6613 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 7160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 75882477 75882802 75882634 Y TMC6,SOCS3,PGS1 RNU1-80P NA NA NA NA RNU1-80P 31378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P,TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 5.96108895695202 chr17 76154299 76154669 76154484 Y C17orf99 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID NA NA NA NA SYNGR2 7970 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 76165603 76166001 76165654 Y SYNGR2 TMC6,SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 NA NA NA NA SYNGR2 2964 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 76641957 76642289 76642128 Y SOCS3,PGS1,USP36,ENGASE,CYTH1 NA DNAH17,CYTH1 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH1 134090 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 76879007 76879631 76879400 Y CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36 USP36,TIMP2 NA NA NA NA TIMP2 39838 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 77783959 77784243 77784073 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 10477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 77815304 77815490 77815418 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 4076 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 77817686 77818105 77817998 Y NA CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX4 6458 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 77967532 77967765 77967641 Y CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 39882 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 5.46433154387269 chr17 78524165 78524352 78524226 Y NA RPTOR NA NA NA NA RPTOR 7546 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 78735331 78735538 78735429 Y NA NA NA NA NA NA RPTOR 218712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 78800697 78801105 78800867 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 162293 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 48906 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 79317785 79317948 79317891 Y FAM195B,C17orf70,ACTG1,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 50438 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr17 80068913 80069274 80069094 Y NARF,HEXDC,CCDC57 DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 14705 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 80214734 80215057 80214944 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14550 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr17 80546229 80546455 80546368 Y NA NA NA NA NA NA FOXK2 70640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 80745153 80745621 80745526 Y ZNF750 TBCD NA NA NA NA TBCD 37213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 81066773 81067186 81066924 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31206 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr17 81067352 81067511 81067418 Y NA METRNL NA NA NA NA METRNL 31785 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 2302701 2302761 2302738 Y NA NA NA NA NA NA METTL4 266747 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr18 3610673 3610894 3610785 Y DLGAP1 NA NA NA NA NA TGIF1 201067 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 3623872 3624258 3624140 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214266 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 3624841 3625119 3625035 Y MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 215235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr18 3625326 3625427 3625380 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 215720 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA L3MBTL4 1118397 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 L3MBTL4 517433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 18.3800242839354 chr18 8750933 8751304 8751068 Y NA NA NA NA NA NA RAB12 143490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 8949015 8949649 8949122 Y TWSG1 NA CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFV2 150979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr18 9604214 9604566 9604459 Y NA PPP4R1 NA NA NA NA PPP4R1 8672 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 9899069 9899359 9899167 Y NA VAPA NA NA NA NA VAPA 12640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 12092408 12092760 12092594 Y NA NA NA NA NA NA IMPA2 113384 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 12330841 12331244 12331045 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 25173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 12471098 12471401 12471374 Y PSMG2 NA NA NA NA NA SLMO1 65203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 13219877 13220140 13220009 Y C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA CEP192 230516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 25502058 25502147 25502103 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 253263 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr18 26745136 26745536 26745463 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 989726 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 29092491 29092685 29092630 Y DSC3,DSC2,DSG1,DSG2 DSG2 NA NA NA NA DSG2 16485 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 30501581 30501946 30501766 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 831763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 32239709 32239834 32239782 Y MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 168455 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 32289089 32289403 32289194 Y NA NA NA NA NA NA DTNA 217835 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr18 32906658 32906918 32906743 Y NA ZSCAN30,ZNF271,ZNF24,ZNF396 NA NA NA NA ZNF24 16528 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 37539904 37540304 37540052 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 626265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 39878451 39878679 39878560 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 345280 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 43830546 43830877 43830624 Y EPG5,PSTPIP2 NA NA NA NA NA RNF165 73895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 44394118 44394485 44394384 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL2 100970 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 46072108 46072320 46072224 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 8691 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 46074456 46074621 46074556 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 11039 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr18 46354445 46354549 46354497 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 291028 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 47785953 47786324 47786143 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 4568 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 60174225 60174375 60174334 Y NA ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 13865 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 60886280 60886709 60886627 Y BCL2 NA NA NA NA NA BCL2 98652 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 61085026 61085396 61085214 Y VPS4B VPS4B NA NA NA NA VPS4B 2320 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 68004496 68004658 68004562 Y NA NA NA NA NA NA SOCS6 50359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr18 68044126 68044452 68044254 Y NA NA RTTN IMR90 Hi-C 24141950 SOCS6 89989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NETO1 NA NA NA NA NETO1 2556 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 7.20298248965036 chr18 72916177 72916455 72916218 Y NA ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 2848 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr18 74277589 74278024 74277906 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 72112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 74556264 74556608 74556436 Y NA ZNF236 NA NA NA NA ZNF236 23701 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 74600603 74600897 74600750 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 68040 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 74774000 74774964 74774473 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 241437 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 74815308 74815668 74815588 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 282745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 75318958 75319303 75319131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 786395 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr18 77483337 77483442 77483373 Y KCNG2 CTDP1 NA NA NA NA CTDP1 45536 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 481673 481793 481759 Y PALM,HCN2,FGF22 SHC2,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA SHC2 22677 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.22243801117435 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 1262305 1262850 1262469 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 4921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 3360183 3360356 3360294 Y TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC NFIC NA NA NA NA NFIC 2622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 3670243 3670423 3670333 Y NFIC PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 28054 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 4064154 4064453 4064218 Y SEMA6B,MATK ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 4568924 4569300 4569153 Y TICAM1,KDM4B,SEMA6B NA NA NA NA NA TNFAIP8L1 68230 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA C19orf45 7486 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 7746304 7746484 7746360 Y ARHGEF18,PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,XAB2,LOC100131801,STXBP2,MAP2K7,EVI5L,RETN,C19orf59 STXBP2,TRAPPC5 NA NA NA NA TRAPPC5 2575 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 9777343 9777681 9777659 Y ZNF559,ZNF559,ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 9974094 9974487 9974263 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA PIN1 30161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 10352370 10352740 10352555 Y KRI1,ILF3,PPAN,RAVER1,MRPL4,DNMT1 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL4 7837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 10626566 10626966 10626811 Y C19orf66,ICAM3,TYK2,DNM2,S1PR5,S1PR5,CDKN2D,CDKN2D,ATG4D KEAP1,ATG4D,KRI1 NA NA NA NA S1PR5 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 11253991 11254271 11254206 Y PRKCSH,ECSIT,TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6 SPC24 NA NA NA NA SPC24 10213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 11375157 11375492 11375297 Y DOCK6 DOCK6 TSPAN16 MCF7 ChIA-PET 22265404 DOCK6 4000 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 11592904 11593323 11593025 Y ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653 PRKCSH,ZNF653,CTC-398G3.2,ECSIT NA NA NA NA ZNF653 21415 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 12131760 12131812 12131786 Y NA CTD-2006C1.2,ZNF433,ZNF878 NA NA NA NA ZNF433 12744 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr19 12892961 12894040 12893343 Y ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 6270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 12894545 12895330 12894818 Y ZNF44,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 4980 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 13143095 13143350 13143204 Y WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2 NFIX NA NA NA NA NFIX 38673 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 47005 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 13907523 13907866 13907763 Y NA MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 3249 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 14229419 14229865 14229637 Y CCDC130,ZSWIM4,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 SAMD1,PRKACA,ASF1B NA NA NA NA PRKACA 2523 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 14545712 14545849 14545765 Y NDUFB7,PKN1 DDX39A,PKN1 NA NA NA NA PKN1 3847 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 NA NA NA NA NA TPM4 227712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr19 16573693 16573897 16573763 Y HSH2D EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 6999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 NA NA NA NA NA CCDC124 91220 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr19 18162301 18162691 18162523 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R2 99277 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 18405326 18405850 18405541 Y JAK3,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,C19orf60,JUND JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA JUND 14894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 18485152 18485556 18485412 Y ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25 PGPEP1,GDF15,SSBP4 NA NA NA NA GDF15 1611 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr19 18497624 18497977 18497708 Y PDE4C,GDF15 PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14083 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 18526337 18526644 18526408 Y CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 1030 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 19005223 19006062 19005586 Y TMEM59L,KLHL26,CRTC1,SUGP2,SLC25A42,NCAN,HAPLN4,HOMER3,HOMER3,GDF1 GDF1,COPE,DDX49,HOMER3 NA NA NA NA CERS1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 19623798 19624201 19624001 Y NA NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 28231226 28231711 28231495 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1470737 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 30195599 30196138 30195979 Y NA PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 8226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 30207596 30207744 30207670 Y NA C19orf12 NA NA NA NA C19orf12 3232 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 30322162 30322300 30322231 Y C19orf2,C19orf2,POP4,PLEKHF1,C19orf12 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 21357 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 30447917 30448294 30448014 Y NA URI1 NA NA NA NA URI1 35366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 33538325 33538659 33538479 Y RHPN2,GPATCH1,NUDT19,CEP89,C19orf40 RHPN2,GPATCH1 NA NA NA NA RHPN2 15135 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 33664629 33664677 33664651 Y NA LRP3 NA NA NA NA LRP3 1832 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 33977879 33978014 33977973 Y SLC7A10 PEPD NA NA NA NA PEPD 32686 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 34664379 34664787 34664699 Y SCGBL,KIAA0355,LSM14A LSM14A NA NA NA NA LSM14A 2970 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 36449882 36450230 36450084 Y NA LRFN3,SDHAF1 NA NA NA NA LRFN3 25622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 36666444 36666524 36666464 Y NA CAPNS1,ZNF146 NA NA NA NA ZNF146 36980 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 38482400 38482784 38482644 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L3 86532 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 38491114 38491333 38491222 Y PPP1R14A NA NA NA NA NA SIPA1L3 95246 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 38493976 38494435 38494152 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 98108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 39152764 39152958 39152839 Y NA EIF3K,ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 16475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 39182594 39182977 39182723 Y PAK4,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 46305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr19 39627416 39627544 39627474 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 13006 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 8.4448760223487 chr19 39894353 39894945 39894613 Y GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2 PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H NA NA NA NA ZFP36 508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 40543471 40543758 40543711 Y SPTBN4,ZNF546,ZNF780B ZNF780B NA NA NA NA ZNF780B 16358 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 41108162 41108528 41108432 Y NA SHKBP1,LTBP4 NA NA NA NA LTBP4 11373 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 41226531 41226793 41226653 Y PLD3,SPTBN4,LTBP4,EGLN2,EGLN2,CYP2B6,ITPKC,RAB4B NUMBL,ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA NA NA NA NA ADCK4 4419 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 41729438 41729579 41729517 Y ATP5SL,ATP5SL,AXL CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 6330 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 41804006 41804567 41804366 Y TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA CCDC97 9527 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 42444727 42445027 42444981 Y NA RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16515 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 42634554 42634824 42634791 Y POU2F2 NA NA NA NA NA POU2F2 63913 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,PAFAH1B3 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 ERF 15495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,PAFAH1B3,MEGF8 NA NA NA NA PAFAH1B3 20707 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA NA TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 PSG9 63866 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 44124638 44124922 44124781 Y CADM4 XRCC1,IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4,PLAUR NA NA NA NA ZNF428 2612 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 45601584 45601804 45601678 Y FOSB ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA PPP1R37 8930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 45663964 45664347 45664315 Y NA TRAPPC6A,BLOC1S3 NA NA NA NA TRAPPC6A 15148 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 47552678 47552827 47552750 Y NA NPAS1,TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 2790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 47613231 47613789 47613256 Y PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4 SAE1,ZC3H4 TMEM160,NPAS1 IMR90 Hi-C 24141950 SAE1 742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 MIR3191,BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA C5AR1 1654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 47814150 47814595 47814332 Y ZC3H4,NAPA,DHX34,CCDC9,C5AR1,GPR77 PRR24,C5AR1,DHX34 NA NA NA NA C5AR1 22870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 48016024 48016351 48016088 Y SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 146 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 48016569 48017036 48016994 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,DHX34,GLTSCR1,NAPA KPTN,NAPA NA NA NA NA NAPA 72 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 48625125 48625566 48625247 Y NA PLA2G4C,LIG1 NA NA NA NA PLA2G4C 13051 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 50141205 50141513 50141452 Y AKT1S1,TRPM4,RCN3,AP2A1,RRAS NOSIP,PRR12,SCAF1,BCL2L12,IRF3,PRMT1 NA NA NA NA RRAS 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 51221435 51221859 51221691 Y KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 SHANK1 NA NA NA NA SHANK1 728 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 51339255 51339614 51339393 Y KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3 C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 33069 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 51626855 51627213 51626922 Y SIGLEC12,SIGLEC7,SIGLEC12,SIGLEC10,CD33,SIGLEC9 CTU1 NA NA NA NA CTU1 17228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 52194056 52194504 52194155 Y ZNF350,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 121505 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr19 52194594 52195259 52195000 Y ZNF615,ZNF350,C19orf75,IGLON5,CLDND2,SIGLEC10,FPR2,FPR2,FPR1 NA NA NA NA NA ZNF175 122043 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 52314551 52315345 52315113 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 NA NA NA NA NA ZNF649 90948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 NA NA NA NA NA PRKCG 84799 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr19 54523388 54523781 54523608 Y TARM1,VSTM1,RPS9,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LENG8,LAIR2,LAIR1,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM NA NA NA NA NA OSCAR 80219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 54548907 54549052 54548979 Y NLRP12,NLRP12,VSTM1 NA NA NA NA NA OSCAR 54948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,COX6B2,IL11,TMEM238,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr19 56729112 56729434 56729273 Y NA NA NA NA NA NA ZNF444 87144 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 58218479 58218613 58218485 Y ZNF543,ZNF304,ZNF548,ZNF17,VN1R1,ZNF772,ZNF419,ZNF773,ZNF549,ZNF416,ZIK1,ZNF134,ZSCAN4,ZNF551,ZSCAN18,ZSCAN1,ZNF814,ZNF606,ZNF418,ZNF256,ZNF135,LOC100293516,ZNF671,ZNF586,ZNF154 ZNF551,ZNF671,ZNF776 NA NA NA NA ZNF671 18379 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606 NA NA NA NA ZNF606 44565 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr19 59029635 59029989 59029796 Y NA SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M SLC27A5 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC27A5 7855 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 441684 442070 441815 Y NA NA NA NA NA NA FAM150B 154833 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 3487019 3487372 3487201 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 34135 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr2 3508183 3508316 3508315 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 13191 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 9374844 9375591 9375054 Y YWHAQ,ASAP2 ASAP2 NA NA NA NA ASAP2 29950 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 9692579 9693026 9692911 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 15199994 15200355 15200088 Y NA NA NA NA NA NA FAM84A 429184 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 15782224 15782403 15782250 Y NA NA NA NA NA NA DDX1 52922 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 15815563 15815811 15815751 Y NBAS NA NA NA NA NA DDX1 86261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 17042875 17043262 17042953 Y FAM49A NA NA NA NA NA GEN1 889863 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20252703 20252899 20252848 Y NA MATN3,LAPTM4A NA NA NA NA LAPTM4A 2914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20638245 20638508 20638456 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,GDF7 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 6327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20690620 20690861 20690695 Y NA RHOB HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOB 45785 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20779015 20779511 20779185 Y NA NA HS1BP3,RHOB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HS1BP3 69338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 20849276 20849608 20849479 Y NA HS1BP3 NA NA NA NA HS1BP3 427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 24238466 24238799 24238602 Y NA C2orf44,FKBP1B NA NA NA NA C2orf44 31646 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA CENPO 161636 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 25508945 25509154 25508991 Y DNAJC27,DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 54305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 26634949 26635470 26635230 Y RAB10 NA NA NA NA NA GPR113 67264 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 26716405 26716766 26716684 Y RAB10,FAM59B NA CCDC164 IMR90 Hi-C 24141950 GPR113 148720 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 26980806 26981182 26980970 Y C2orf18 CENPA OTOF,CENPA,C2orf70,CIB4,KCNK3,DPYSL5,MAPRE3,C2orf18 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CENPA 3975 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4 NA NA NA NA OST4 11411 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 28021914 28022357 28022176 Y RBKS MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 29330 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 28632075 28632521 28632225 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 16536 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 29331222 29331429 29331307 Y NA CLIP4 CLIP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CLIP4 12651 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr2 29339148 29339698 29339489 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 20577 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr2 29352302 29352469 29352324 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 33731 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 29485561 29485725 29485698 Y NA NA NA NA NA NA CLIP4 166990 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 30446574 30446684 30446629 Y YPEL5 LBH,AC104698.1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LBH 5713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 30644745 30644849 30644777 Y NA LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 23243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 30644994 30645276 30645103 Y LBH LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 22816 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36665586 36666219 36665918 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 84517 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36687110 36687380 36687132 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 106041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 36688353 36688868 36688635 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 107284 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36700444 36700711 36700553 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 119375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36712578 36712925 36712822 Y CRIM1,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 131509 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 36713753 36714120 36713762 Y CRIM1,VIT,FEZ2 NA NA NA NA NA CRIM1 132684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 36761840 36762400 36762263 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 108830 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36790074 36790520 36790216 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 80710 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 36934290 36934412 36934353 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 63060 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 37308622 37308977 37308800 Y NA HEATR5B NA NA NA NA HEATR5B 508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 37788822 37789049 37788928 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 174562 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 37938546 37938819 37938725 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 24792 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 37940534 37940802 37940700 Y CDC42EP3 CDC42EP3 CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 22809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 38333760 38333892 38333836 Y CDC42EP3,CYP1B1 CYP1B1 FAM82A1,CYP1B1,CYP1B1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 CYP1B1 1152 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 38405386 38405542 38405477 Y CYP1B1 NA NA NA NA NA RPL7P12 51168 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 39919692 39919788 39919740 Y TMEM178,TMEM178 NA NA NA NA NA THUMPD2 84619 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 318920 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 43746950 43747270 43747109 Y ZFP36L2 NA LOC100129726,ZFP36L2 K562 ChIA-PET 22265404 THADA 73915 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 44398343 44398537 44398440 Y NA PPM1B NA NA NA NA PPM1B 5235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA AC012354.8 NA NA NA NA AC012354.8 45006 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 46557036 46557117 46557077 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 38230 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 46928465 46928698 46928588 Y MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5 SOCS5 NA NA NA NA SOCS5 4374 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 47418967 47419222 47419129 Y NA CALM2 TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 17227 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 47420372 47420663 47420518 Y NA CALM2 EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2 IMR90 Hi-C 24141950 CALM2 18632 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 48475818 48475987 48475845 Y NA NA FOXN2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN2 63789 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 52304154 52304543 52304242 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1688386 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 53331505 53331666 53331586 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 661263 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 54799241 54799892 54799606 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 117819 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 55320625 55320761 55320684 Y RTN4 RTN4 C2orf63,EML6,RTN4 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 16996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 55327095 55327368 55327210 Y RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 10389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 55327778 55327923 55327859 Y NA RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 9834 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 56089907 56090266 56090122 Y NA NA NA NA NA NA EFEMP1 59008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 58002154 58002414 58002211 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 130372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 58271974 58272513 58272036 Y NA NA NA NA NA NA VRK2 139188 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 58336722 58337105 58336916 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 129402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 60711222 60711498 60711369 Y REL NA NA NA NA NA BCL11A 67204 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 61748471 61748954 61748828 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 14807 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA PELI1 NA NA NA NA PELI1 16815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr2 70145725 70146134 70145771 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 22905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 70363059 70363462 70363144 Y MXD1,C2orf42,PCBP1 PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 35376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 72936183 72936496 72936380 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 114674 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 85362106 85362578 85362371 Y NA LSM3P3,TCF7L1 NA NA NA NA TCF7L1 3573 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 85932755 85933081 85932924 Y SH2D6 RNU1-38P ATOH8 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 20379 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 86030361 86030633 86030487 Y SH2D6 NA LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-38P 76901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 86692253 86692485 86692369 Y NA KDM3A NA NA NA NA KDM3A 26483 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 91759872 91760090 91759934 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2770710 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 96077364 96077399 96077382 Y NA FAHD2A NA NA NA NA FAHD2A 10895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 96911483 96911666 96911570 Y DUSP2,KIAA1310,ARID5A,TMEM127 STARD7,TMEM127,CIAO1 NA NA NA NA TMEM127 18066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA TMEM131 212544 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 100496681 100496959 100496872 Y NA NA NA NA NA NA REV1 392184 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 100498420 100498601 100498511 Y AFF3 NA NA NA NA NA REV1 393923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 100630312 100630613 100630507 Y AFF3 NA NA NA NA NA LONRF2 306582 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 LONRF2 NA NA NA NA LONRF2 139 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 101197262 101197669 101197547 Y RPL31 PDCL3 NA NA NA NA PDCL3 20110 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 101884483 101884674 101884578 Y MAP4K4,MAP4K4,RNF149 TBC1D8,RNF149 NA NA NA NA TBC1D8 17155 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 106364522 106364900 106364611 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 5168 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 109210699 109211038 109210811 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 61842 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 110863536 110863928 110863763 Y MALL MALL NA NA NA NA MALL 8215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 113551784 113552157 113551927 Y IL36B,IL36G,IL1RN,IL1A,IL1B CKAP2L,IL1A CKAP2L,IL37,IL1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IL1A 11617 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 WASH2P 256849 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 114653014 114653311 114653090 Y CBWD2,ACTR3 ACTR3 NA NA NA NA ACTR3 7477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 120971736 120972136 120971936 Y NA TMEM185B,RALB NA NA NA NA TMEM185B 6848 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 120996274 120996566 120996498 Y NA TMEM185B,RALB EPB41L5,RALB,TMEM185B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RALB 634 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 128773511 128773726 128773583 Y NA SAP130 NA NA NA NA SAP130 9968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 134878523 134878632 134878609 Y MGAT5 MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 2969 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 141284265 141284563 141284414 Y NA NA NA NA NA NA NXPH2 1748347 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 141602642 141602767 141602705 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 2030300 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 151385444 151385651 151385488 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7874 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 151385999 151386295 151386059 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 7230 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 151477368 151477581 151477492 Y RND3 NA RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 83843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 152144821 152144962 152144854 Y RIF1,RIF1,RIF1,NMI RBM43,NMI NA NA NA NA NMI 250 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 152159553 152159620 152159604 Y TNFAIP6 RBM43,NMI RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NMI 14982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 153261807 153262193 153261950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 72056 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 156219806 156220106 156219936 Y NA NA NA NA NA NA NR4A2 976754 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 157190328 157191531 157191235 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 5329 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1 662369 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 160350650 160351006 160350912 Y MARCH7,CD302,BAZ2B AC009506.2 NA NA NA NA AC009506.2 32883 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 161014381 161014772 161014663 Y NA NA NA NA NA NA PLA2R1 97260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 147543 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 162770388 162770557 162770473 Y NA NA NA NA NA NA EIF3EP2 172212 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 165683192 165683287 165683237 Y NA COBLL1 NA NA NA NA COBLL1 14902 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 165777057 165777208 165777083 Y NA NA NA NA NA NA COBLL1 78868 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 172693152 172693396 172693274 Y NA NA NA NA NA NA HAT1 83562 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 172959536 172959659 172959591 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5969 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 178131060 178131559 178131324 Y NA MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 12322 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 179471296 179471384 179471314 Y TTN NA NA NA NA NA TTN-AS1 87386 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 180625658 180625928 180625899 Y ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 243912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 183626884 183626903 183626894 Y NA DNAJC10 NA NA NA NA DNAJC10 47885 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 190075572 190075716 190075672 Y DIRC1 COL5A2 COL5A2 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A2 32967 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 190235497 190235832 190235693 Y NA NA COL5A2,GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 WDR75 68327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 190324760 190324912 190324838 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 20601 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 C2orf88 NA NA NA NA C2orf88 12229 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 191876857 191877189 191877023 Y NA STAT1 NA NA NA NA STAT1 6497 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 192066963 192067214 192067088 Y STAT4,MYO1B,MYO1B MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 40697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 192503383 192503649 192503532 Y OBFC2A NA OBFC2A K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SDPR 206332 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 192531478 192531803 192531720 Y OBFC2A NA OBFC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDPR 178178 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA SDPR 164749 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA HECW2 191251 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 200839985 200840279 200840201 Y NA C2orf47,TYW5 NA NA NA NA TYW5 21526 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 201652202 201652395 201652320 Y NA BZW1 BZW1 IMR90 Hi-C 24141950 BZW1 20922 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 201991403 201992374 201991715 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 12576 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 201992378 201992654 201992500 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 13551 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 201995421 201995893 201995513 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR,CASP10 NA NA NA NA CFLAR 16594 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 NA NA NA NA NA PSMA2P3 143335 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 203176830 203176888 203176863 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 48391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 203830574 203830808 203830669 Y NA WDR12,NBEAL1 NA NA NA NA WDR12 46713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 204362935 204363240 204363075 Y NA NA NA NA NA NA ABI2 171993 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 205530118 205530314 205530216 Y NA NA NA NA NA NA PARD3B 121602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 208195614 208195873 208195761 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 93240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 208198821 208199856 208199157 Y KLF7 NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC007879.7 96447 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1 NA NA NA NA CREB1 2961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 212897670 212897774 212897723 Y NA NA NA NA NA NA AC013404.1 735756 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 213697090 213697822 213697143 Y NA NA IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 SPAG16 449291 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA NA NA NA NA NA SPAG16 93874 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 216216233 216216482 216216439 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 41693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 217214941 217215065 217215003 Y NA MARCH4 NA NA NA NA MARCH4 19685 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 217970488 217971016 217970653 Y NA NA IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 412240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr2 219194739 219194938 219194840 Y ARPC2,ARPC2,USP37,TTLL4,RQCD1,PNKD,SLC11A1 TMBIM1,AC021016.7 NA NA NA NA AC021016.7 21860 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT6,WNT10A NA NA NA NA WNT10A 17960 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 220317654 220318040 220317775 Y GMPPA,GMPPA SPEG,GMPPA NA NA NA NA SPEG 20086 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 220385870 220386219 220385945 Y ACCN4 GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 20166 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 220460061 220460205 220460133 Y NA OBSL1,STK11IP,SLC4A3 NA NA NA NA STK11IP 377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC4A3 603383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 EPHA4 389768 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 104129 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 225965618 225965990 225965841 Y NA NA DOCK10 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK10 60456 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 226859582 226859764 226859704 Y NA NA IRS1 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 188323 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 226860579 226860817 226860710 Y NA NA IRS1,LOC646736,COL4A4 IMR90 Hi-C 24141950 AC068138.1 187270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 227665142 227665696 227665306 Y IRS1 IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 2667 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 231322204 231322520 231322312 Y SP110,SP110,SP140,SP140L,CAB39,CAB39,SP100,SP100 SP100 NA NA NA NA SP100 43547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 232207003 232207399 232207160 Y NA NA NA NA NA NA B3GNT7 50855 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 90277 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 232566219 232566469 232566340 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 3136 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 234156397 234156705 234156566 Y INPP5D,DGKD ATG16L1 NA NA NA NA ATG16L1 39700 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 234630754 234630813 234630784 Y NA NA NA NA NA NA HJURP 130399 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 235872484 235872869 235872649 Y NA SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 13867 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 235935583 235936015 235935761 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 76966 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 236698901 236699175 236699041 Y NA NA NA NA NA NA AGAP1 298168 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr2 237073092 237073409 237073337 Y NA AC079135.1,GBX2 NA NA NA NA AC079135.1 681 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA GBX2 407971 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 238131951 238132217 238132070 Y COL6A3 NA COL6A3,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 139996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 238374283 238374521 238374346 Y COL6A3 AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 MLPH 17550 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 239347857 239348510 239348285 Y ASB1 ASB1 NA NA NA NA ASB1 14474 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr2 239755854 239755907 239755878 Y TWIST2 TWIST2 NA NA NA NA TWIST2 1181 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 240147854 240148066 240148024 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 173064 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 240250439 240250711 240250592 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 70419 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 241190569 241190767 241190645 Y NA NA GPC1,ANKMY1,PP14571 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYEOV2 116345 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr2 242485030 242485360 242485049 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 10776 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr2 242710043 242710405 242710079 Y NA D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 38049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 352488 352859 352625 Y SRXN1,FAM110A,RBCK1 SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA TRIB3 6402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 382514 382753 382693 Y CSNK2A1,ZCCHC3,TRIB3,RBCK1 TRIB3,RBCK1 NA NA NA NA RBCK1 3389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr20 3170247 3170648 3170474 Y NA FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA,SLC4A11 NA NA NA NA DDRGK1 12683 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 3779808 3780100 3779895 Y PANK2,PANK2,CDC25B C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 14230 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 4487937 4488131 4488040 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 RPS4XP2 120734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 9390788 9390859 9390825 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA PLCB4 343378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 10482481 10482747 10482670 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 69611 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 10492212 10492484 10492413 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 79342 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 10651368 10651598 10651475 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 26354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 10652083 10652420 10652292 Y JAG1 JAG1 NA NA NA NA JAG1 27069 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 13221839 13221847 13221843 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 395740 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 19574578 19574842 19574710 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 161510 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 21082914 21083089 21083038 Y NA PLK1S1 PLK1S1,NKX2-2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLK1S1 21535 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 21147247 21147656 21147458 Y NA PLK1S1 NA NA NA NA PLK1S1 42623 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 THBD 283878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 25218471 25218756 25218634 Y NA ENTPD6,PYGB NA NA NA NA PYGB 7949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 25229395 25229593 25229494 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 2690 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30249247 30249862 30249570 Y TTLL9 NA NA NA NA NA ID1 58161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30301047 30301377 30301326 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8415 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30307720 30308274 30308104 Y POFUT1 BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 1518 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30624710 30624829 30624798 Y PLAGL2,C20orf112,HCK NA NA NA NA NA TM9SF4 70480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30793004 30793191 30793072 Y HCK,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 403 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30793339 30793589 30793452 Y HCK,TM9SF4,PLAGL2 PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA PLAGL2 5 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 30796713 30797081 30796897 Y NA PLAGL2,POFUT1 NA NA NA NA POFUT1 3030 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 31045263 31045487 31045417 Y KIF3B NA NA NA NA NA ASXL1 101108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 31069966 31070213 31070090 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 100663 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 31410946 31411262 31411169 Y NA MAPRE1 NA NA NA NA MAPRE1 5247 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 33100877 33101215 33100990 Y NA DYNLRB1,MAP1LC3A NA NA NA NA DYNLRB1 999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 33906285 33906606 33906471 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 35497 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr20 33907005 33907177 33907091 Y EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36217 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr20 33907745 33907913 33907842 Y MMP24,GDF5 EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 36957 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 33908268 33908438 33908376 Y NA EDEM2,EIF6 FAM83C,EIF6 HELA 5C 22955621 EIF6 37480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 34379775 34380017 34379908 Y SPAG4,RBM39,PHF20 RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 21879 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 35172533 35172668 35172598 Y MYL9 MYL9,RP5-977B1.7,TGIF2 NA NA NA NA MYL9 4646 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 35234952 35235695 35235080 Y NA RP5-977B1.7,TGIF2,C20orf24 NA NA NA NA C20orf24 2815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 35976271 35976569 35976418 Y NA SRC NA NA NA NA SRC 5183 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA BLCAP NA NA NA NA BLCAP 21440 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 36374070 36374256 36374109 Y NA NA NA NA NA NA CTNNBL1 53662 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr20 36542426 36542653 36542463 Y NA VSTM2L NA NA NA NA VSTM2L 12927 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 39631777 39632207 39632178 Y NA RNU2-52P,TOP1 PLCG1,TOP1,ZHX3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU2-52P 18638 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 39661985 39662084 39662008 Y NA RNU2-52P,TOP1 NA NA NA NA TOP1 6527 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 40321359 40321668 40321514 Y NA NA CHD6 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD6 76226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 42648340 42648654 42648497 Y NA NA NA NA NA NA TOX2 106836 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 43223501 43223813 43223570 Y NA NA NA NA NA NA ADA 55061 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 43972821 43973151 43973055 Y SYS1,SDC4 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 1913 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 45753513 45753645 45753557 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1050K3.3 55009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 45944502 45944683 45944617 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 34622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 16091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr20 45987479 45988292 45987961 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 3912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 46299616 46300006 46299878 Y NCOA3,SULF2,SULF2 NA NA NA NA NA SULF2 113354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 47439402 47439940 47439658 Y ZNFX1,STAU1,PREX1 PREX1 NA NA NA NA PREX1 2480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 47796581 47796870 47796726 Y NA STAU1,DDX27 NA NA NA NA STAU1 6034 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 47961628 47961789 47961714 Y NA NA B4GALT5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD12 66408 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 48190419 48190797 48190608 Y PTGIS PTGIS KCNB1,PTGIS,SLC9A8,B4GALT5,ZNFX1-AS1,ZNFX1 IMR90 Hi-C 24141950 PTGIS 7736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48316345 48316673 48316621 Y NA B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 11742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr20 48317822 48318037 48318021 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48663510 48663968 48663673 Y NA NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAI1 65974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 CEBPB 97730 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 49057048 49057261 49057196 Y SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 67630 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 49157621 49157908 49157761 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 32730 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr20 49650336 49650514 49650422 Y NA KCNG1 KCNG1,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCNG1 12670 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 50146423 50146676 50146612 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 202396 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 50366772 50367203 50366881 Y ZFP64,ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 15970 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33530 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 50601567 50601698 50601647 Y NA NA ATP9A,SALL4,NFATC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP64 217149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 52195908 52196455 52196142 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 27991 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 52543055 52543571 52543250 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 244941 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 55976268 55976716 55976350 Y RBM38,ZBP1,PMEPA1 MTRNR2L3,RBM38 NA NA NA NA RBM38 11805 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 56323662 56324029 56323724 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 39070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 56983736 56983744 56983737 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 21558 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 57228113 57228577 57228221 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 3623 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 57557787 57558211 57558054 Y ZNF831,STX16 CTSZ,ATP5E NA NA NA NA CTSZ 22091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 59761167 59761446 59761307 Y NA NA CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4 IMR90 Hi-C 24141950 CDH4 64036 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr20 60247024 60247153 60247088 Y CDH4,SS18L1 NA NA NA NA NA TAF4 391713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 60934143 60934390 60934309 Y TAF4,PSMA7,SS18L1,RPS21,NTSR1,CABLES2,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 5978 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr20 60935306 60935741 60935523 Y NA MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 ADRM1 K562 ChIA-PET 22265404 LAMA5 4627 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 60941528 60941750 60941608 Y SLCO4A1,ADRM1,LAMA5 MIR4758,RP11-157P1.5,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 1160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 61748235 61748616 61748426 Y NA HAR1B NA NA NA NA HAR1B 16564 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 62150785 62151100 62150943 Y CHRNA4,KCNQ2,STMN3,EEF1A2 KCNQ2,EEF1A2,PPDPF NA NA NA NA PPDPF 708 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.71919542425369 chr20 62685313 62685625 62685427 Y UCKL1,SOX18,TCEA2 ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA TCEA2 6124 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 11126930 11127071 11126959 Y NA NA BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 TEKT4P2 1160345 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 15962241 15962603 15962321 Y NRIP1,SAMSN1 SAMSN1 NA NA NA NA SAMSN1 8518 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 16064365 16064765 16064448 Y HSPA13,SAMSN1,NRIP1 NA NA NA NA NA SAMSN1 110642 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 16368229 16368687 16368553 Y NRIP1 NA NA NA NA NA NRIP1 66634 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17153700 17154031 17153865 Y NA NA NA NA NA NA USP25 53356 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17264124 17264427 17264344 Y NA NA NA NA NA NA USP25 163780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17276028 17276063 17276046 Y NA NA NA NA NA NA USP25 175684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA USP25 823929 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17959400 17959753 17959559 Y NA NA NA NA NA NA USP25 859056 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA USP25 860323 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 26701473 26701861 26701653 Y NA NA NA NA NA NA MIR155HG 230360 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr21 26956680 26957339 26957242 Y NA MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 20490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 28795435 28795716 28795624 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 458603 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 28797067 28797570 28797293 Y NA NA ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS5 460235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.96757413079335 chr21 30567218 30567411 30567380 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 2826 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 30669074 30669451 30669267 Y BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 104682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 32865746 32866005 32865892 Y TIAM1 NA NA NA NA NA SOD1 163930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 34752926 34753284 34753094 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 19918 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 35575382 35575632 35575530 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 131512 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 35917479 35917977 35917777 Y KCNE1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 67464 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr21 36179679 36180279 36179996 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 194238 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 36220749 36221095 36220890 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 235308 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 36234553 36234896 36234857 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 249112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 36254204 36254725 36254297 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 268763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 36263020 36263336 36263172 Y RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 277579 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 38072912 38073314 38073050 Y SIM2 SIM2 HLCS IMR90 Hi-C 24141950 SIM2 3479 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 38189032 38189251 38189142 Y NA NA NA NA NA NA SIM2 119599 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 38232574 38232719 38232637 Y NA NA NA NA NA NA AP000704.5 104093 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr21 38235070 38235202 38235136 Y TTC3,HLCS NA NA NA NA NA AP000704.5 101610 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 39696232 39696607 39696353 Y NA NA KCNJ6,DSCR10,KCNJ15,DSCR8 IMR90 Hi-C 24141950 ETS2 478624 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 40127775 40128062 40127985 Y NA ETS2 NA NA NA NA ETS2 47169 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 40386657 40387043 40386856 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 166734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 41003318 41003469 41003395 Y NA C21orf88 NA NA NA NA C21orf88 20570 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 43657721 43658000 43657891 Y PRDM15,PRDM15,C2CD2,ZNF295,UMODL1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,UBASH3A ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 39922 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 44727448 44727599 44727495 Y PKNOX1,SIK1 NA LINC00313,SIK1,HSF2BP IMR90 Hi-C 24141950 SIK1 117409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44753663 44753942 44753875 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 91066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44867284 44867543 44867469 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 22276 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44918002 44918401 44918083 Y NA NA CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H2BFS 64669 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44937659 44937875 44937741 Y PDXK H2BFS NA NA NA NA H2BFS 45195 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 44939768 44940090 44939875 Y PDXK H2BFS NA NA NA NA H2BFS 42980 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA H2BFS NA NA NA NA H2BFS 37534 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 45023085 45023419 45023272 Y TRAPPC10,PDXK,CSTB,U2AF1 H2BFS NA NA NA NA H2BFS 40015 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 45341940 45342414 45342095 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT3 58873 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 45968847 45969150 45969078 Y NA NA NA NA NA NA LRRC3 95478 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 46470710 46471152 46470922 Y NA LINC00162,ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 20616 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr21 46495480 46495526 46495490 Y KRTAP10-12,ADARB1 ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 3712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 10563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA CECR2 NA NA NA NA CECR2 11800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 18264435 18264847 18264620 Y CECR2,ATP6V1E1,BCL2L13,USP18,BID,BID BID NA NA NA NA BID 8899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 6.20946766349169 chr22 19749283 19749521 19749403 Y NA SEPT5,GP1BB,TBX1 NA NA NA NA TBX1 7057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 19869401 19869687 19869604 Y NA C22orf29,GNB1L,AC000078.5 NA NA NA NA AC000078.5 3125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr22 19874514 19874924 19874610 Y TRMT2A,C22orf29,GNB1L C22orf29,GNB1L,AC000078.5 GNB1L MCF7 ChIA-PET 22265404 AC000078.5 1702 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 9.93514826158671 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 20885626 20885829 20885752 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 37426 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 22186398 22186549 22186531 Y NA MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 33421 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 23528251 23528416 23528284 Y BCR RTDR1,RAB36,BCR NA NA NA NA BCR 8360 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 23624437 23624690 23624563 Y BCR NA NA NA NA NA BCR 104546 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 23725705 23725832 23725738 Y NA ZDHHC8P1 NA NA NA NA ZDHHC8P1 17081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 24153288 24153648 24153392 Y RGL4,LOC391322 MMP11,CHCHD10,SMARCB1,DERL3,SLC2A11 DERL3 IMR90 Hi-C 24141950 DERL3 25667 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr22 24796747 24798216 24797446 Y GGT1 ADORA2A NA NA NA NA ADORA2A 13631 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 27054967 27055259 27055032 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 11471 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 27503626 27504166 27503976 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 114522 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 27508990 27509624 27509325 Y NA NA PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 109064 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 27526961 27527148 27527032 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 91540 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 27527504 27527688 27527616 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 91000 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 27530003 27530818 27530508 Y NA NA NA NA NA NA RP5-1172A22.1 87870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 27536268 27536462 27536385 Y NA NA MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 82226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 28314180 28314595 28314448 Y PITPNB TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA PITPNB 58 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 29705410 29705600 29705517 Y GAS2L1 EWSR1,RHBDD3,GAS2L1,RASL10A NA NA NA NA GAS2L1 4838 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 30014203 30014547 30014300 Y NA NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 16658 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 20486 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr22 30591785 30593544 30592394 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 47296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr22 30608541 30609106 30608754 Y MTMR3,TBC1D10A,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF NA NA NA NA LIF 31734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 30621962 30622192 30622089 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 18648 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 30643780 30644513 30644215 Y GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 2940 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr22 30644816 30645407 30645321 Y NA LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 3976 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 31226011 31226350 31226247 Y NA NA NA NA NA NA MORC2 135934 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 31631095 31631484 31631184 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 24870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 31689398 31689773 31689585 Y SMTN,DEPDC5 PIK3IP1 NA NA NA NA PIK3IP1 2878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 32027602 32027834 32027718 Y NA PISD NA NA NA NA PISD 28584 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 32446579 32447120 32446852 Y NA SC22CB-1E7.1 NA NA NA NA SC22CB-1E7.1 13102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 32806612 32806674 32806643 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3 NA NA NA NA NA FBXO7 61989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 34167018 34167152 34167086 Y NA NA NA NA NA NA Z98256.1 912598 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 34249918 34249944 34249938 Y NA NA NA NA NA NA Z98256.1 995498 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 35708559 35708961 35708654 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 15291 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 35767811 35768194 35767985 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 HMOX1,MCM5 NA NA NA NA HMOX1 6160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36009004 36009234 36009123 Y MB,MB,MB APOL6 NA NA NA NA APOL6 33208 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 36746983 36747265 36747123 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 34798 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36748222 36748386 36748297 Y NA MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 33677 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 36753062 36753318 36753212 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 28745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36762359 36762844 36762518 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 19219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr22 36765300 36765605 36765487 Y APOL3,NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 16458 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr22 36766615 36766810 36766723 Y NCF4,MYH9 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 15253 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36775613 36775832 36775764 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 6231 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 36858236 36858440 36858372 Y MYH9 TXN2,FOXRED2 NA NA NA NA TXN2 17637 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr22 37428831 37429188 37428927 Y CARD10,TMPRSS6,TST,MPST MPST,TST,KCTD17 KCTD17,TMPRSS6 IMR90 Hi-C 24141950 TST 15150 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 37957606 37958042 37957847 Y NA CARD10,CDC42EP1,GGA1 NA NA NA NA CDC42EP1 3152 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 38139873 38139989 38139967 Y NA TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 48862 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 38143248 38143734 38143618 Y LGALS1,TRIOBP,POLR2F NA NA NA NA NA TRIOBP 52237 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 38148564 38148886 38148725 Y CDC42EP1 NA NA NA NA NA H1F0 50228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 38614588 38614867 38614785 Y MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF MAFF,PLA2G6 NA NA NA NA PLA2G6 14891 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr22 38705287 38705445 38705426 Y NA TMEM184B NA NA NA NA TMEM184B 38247 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 39679510 39679847 39679626 Y NA PDGFB,RPL3 CBX7,PDGFB,SNORD83A,SNORD83B,RNU86,RPL3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL3 34547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 42339043 42339310 42339264 Y NA TNFRSF13C,CENPM NA NA NA NA CENPM 1858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 43100819 43101017 43100994 Y NA A4GALT NA NA NA NA A4GALT 14287 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 45543738 45543876 45543815 Y PHF21B,NUP50,NUP50 CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 13786 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 46374858 46375446 46375153 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 3849 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 46676915 46677122 46676986 Y TBC1D22A,CERK TTC38,GTSE1,TRMU NA NA NA NA GTSE1 13516 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 46924162 46924396 46924177 Y NA CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 6671 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 47250044 47250415 47250236 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 93526 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr22 48886346 48887067 48886885 Y FAM19A5 FAM19A5 NA NA NA NA FAM19A5 3074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 49001738 49001947 49001827 Y NA NA NA NA NA NA FAM19A5 118466 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50345940 50346570 50346146 Y NA CRELD2,ALG12,PIM3 PLXNB2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PIM3 5591 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50364350 50364715 50364589 Y NA PIM3 NA NA NA NA PIM3 12189 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr22 50667232 50667412 50667320 Y NA TRABD,SELO,TUBGCP6,HDAC10,MAPK12,MAPK11 NA NA NA NA TUBGCP6 14009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50742925 50743370 50743124 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 686 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50743436 50743850 50743726 Y PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 206 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CTA-384D8.31,CHKB-CPT1B NA NA NA NA CTA-384D8.31 4415 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 5239354 5239686 5239551 Y NA AC026202.3,EDEM1 NA NA NA NA EDEM1 12023 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 8807929 8808317 8808062 Y OXTR OXTR NA NA NA NA OXTR 997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 8911307 8911734 8911565 Y OXTR NA NA NA NA NA RAD18 91723 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 8978841 8979048 8978945 Y NA RAD18 NA NA NA NA RAD18 24409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 10215234 10216150 10215734 Y NA VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 10685 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 10240691 10241307 10240999 Y ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2,TATDN2 NA NA NA NA IRAK2 36142 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 10595369 10595649 10595485 Y NA NA ATP2B2 IMR90 Hi-C 24141950 SEC13 234507 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 11279893 11280094 11280011 Y NA ATG7 NA NA NA NA ATG7 31901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 11609664 11609798 11609746 Y NA NA NA NA NA NA VGLL4 150422 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 13111176 13111312 13111239 Y NUP210,IQSEC1 IQSEC1 NA NA NA NA IQSEC1 1305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr3 15105615 15105982 15105798 Y NA MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 773 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 16429150 16429271 16429247 Y RFTN1 NA NA NA NA NA RFTN1 124262 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 16440818 16441233 16441127 Y DPH3,RFTN1 NA NA NA NA NA RFTN1 112300 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 17345014 17345355 17345310 Y TBC1D5,TBC1D5 NA NA NA NA NA RFTN1 791481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 17622451 17622654 17622556 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 861655 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 610204 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 22755487 22755669 22755574 Y UBE2E2 NA NA NA NA NA HMGB1P5 334177 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA NA SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 EOMES 87236 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.47730189155535 chr3 29321469 29321877 29321696 Y NA RBMS3 NA NA NA NA RBMS3 996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 29412640 29413015 29412700 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 92167 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 248197 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 29725037 29725420 29725261 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 404564 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 29735360 29735534 29735491 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 414887 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 29736457 29736614 29736535 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 415984 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 29799751 29800074 29799882 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 479278 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 29800986 29801236 29801157 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 480513 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2 NA NA NA NA AC139452.2 32673 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 37259018 37259236 37259127 Y NA LRRFIP2,GOLGA4,AC097359.1 LRRFIP2,MLH1,EPM2AIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA4 23432 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 38207945 38208258 38208101 Y VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1 ACAA1,MYD88,OXSR1 NA NA NA NA OXSR1 3365 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14,ZNF619 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 42062353 42062651 42062504 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 9059 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 43437259 43437582 43437422 Y ZNF662,ZNF662,FAM198A NA NA NA NA NA SNRK 111255 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 45141662 45142027 45141978 Y NA CDCP1 NA NA NA NA CDCP1 43887 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 45157727 45158120 45157925 Y CDCP1 CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 27794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 45164613 45164770 45164669 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 21144 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 45165344 45165812 45165623 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 20102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 45165992 45166137 45166089 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 19777 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA CCDC12 NA NA NA NA CCDC12 18254 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 47584263 47584567 47584468 Y NA CSPG5 NA NA NA NA CSPG5 35715 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 49218772 49219051 49218909 Y NA CCDC71,KLHDC8B NA NA NA NA KLHDC8B 11728 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 52081342 52081690 52081545 Y GPR62,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 6876 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 57818713 57819025 57818868 Y NA NA NA NA NA NA SLMAP 79536 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 57937235 57937402 57937348 Y NA NA NA NA NA NA FLNB 54725 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 57945627 57945950 57945779 Y PDE12 FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 46177 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 57995926 57996426 57996121 Y NA FLNB NA NA NA NA FLNB 3799 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 58035006 58035314 58035102 Y FLNB FLNB NA NA NA NA FLNB 42879 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 59316034 59316229 59316222 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 282224 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG 828899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 71151319 71151713 71151657 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 479427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 71153323 71153512 71153422 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 477628 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R2 115837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA NA NA NA NA NA PPP4R2 653678 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 75765975 75766371 75766287 Y NA NA NA NA NA NA ZNF717 66363 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 76160921 76161072 76160934 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 320097 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 76950761 76950890 76950828 Y NA NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 469592 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 85011127 85011790 85011174 Y NA CADM2 NA NA NA NA CADM2 4995 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 85318532 85318917 85318639 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 312400 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 86842931 86843272 86843115 Y VGLL3 NA VGLL3 IMR90 Hi-C 24141950 VGLL3 194997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 87038753 87038992 87038799 Y VGLL3 VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 87914039 87914361 87914172 Y ZNF654,HTR1F NA NA NA NA NA C3orf38 282532 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 98572463 98572830 98572744 Y NA DCBLD2 NA NA NA NA DCBLD2 45703 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 98689970 98690253 98690112 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 7649 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 98691142 98691300 98691170 Y DCBLD2 LINC00973 DCBLD2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 6602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 98848000 98848317 98848116 Y DCBLD2 NA COL8A1,MIR548G IMR90 Hi-C 24141950 LINC00973 150098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 99254161 99254407 99254283 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 100912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 99262027 99262447 99262268 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 92872 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 99596957 99597300 99597045 Y TBC1D23 NA NA NA NA NA FILIP1L 234057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 99761045 99761306 99761215 Y TMEM45A NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 70051 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr3 99782957 99783256 99783070 Y NA FILIP1L TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 48101 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 100755056 100755464 100755248 Y NA ABI3BP ABI3BP IMR90 Hi-C 24141950 ABI3BP 44697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 101645465 101645839 101645546 Y NA NA FAM55C,NFKBIZ,LOC152225 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 100630 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 103522825 103523125 103522973 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-43P 646021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 105087492 105087848 105087688 Y NA ALCAM NA NA NA NA ALCAM 3739 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 105722948 105723182 105723045 Y CBLB NA NA NA NA NA CBLB 136552 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 106782352 106782425 106782408 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 LINC00883 175114 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 111583903 111584464 111583984 Y PHLDB2,PHLDB2 NA NA NA NA NA ABHD10 111393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr3 111655124 111655265 111655201 Y NA ABHD10 NA NA NA NA ABHD10 40592 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 114229118 114229529 114229296 Y ZBTB20 NA NA NA NA NA KIAA1407 455658 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 115502758 115503253 115502970 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 638640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 115503837 115504240 115504182 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639719 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 116966889 116967037 116966963 Y NA NA NA NA NA NA PTMAP8 223344 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 120167583 120167922 120167648 Y NA FSTL1 NA NA NA NA FSTL1 178 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 122400701 122401439 122401076 Y CSTA,KPNA1,PARP9,DTX3L,PARP9,PARP9,HSPBAP1,DIRC2,PARP14 PARP14 NA NA NA NA PARP14 3236 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123229622 123229815 123229688 Y NA NA NA NA NA NA ADCY5 63017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 123379811 123380137 123379976 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 77422 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123407272 123407514 123407399 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 104883 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 123602021 123602338 123602298 Y NA NA NA NA NA NA CCDC14 76226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 124773884 124774020 124773942 Y NA HEG1 NA NA NA NA HEG1 1082 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 126292509 126292856 126292714 Y NA TXNRD3NB NA NA NA NA TXNRD3NB 32542 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 126569545 126569928 126569643 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD6 148482 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 NA NA NA NA NA CHCHD6 300013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 127522578 127522702 127522699 Y TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL MGLL NA NA NA NA MGLL 17349 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 127729316 127729371 127729322 Y DNAJB8 SEC61A1 SEC61A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SEC61A1 39113 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 127831332 127831517 127831439 Y GATA2,GATA2 EEFSEC,RUVBL1 NA NA NA NA EEFSEC 38780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 128337505 128337705 128337543 Y KIAA1257,GP9 NA NA NA NA NA RPN1 60213 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 128338287 128338590 128338558 Y RAB7A NA NA NA NA NA RPN1 59328 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 129436791 129437287 129437073 Y NA NA NA NA NA NA PLXND1 113130 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 132138974 132139193 132139084 Y NA DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 4604 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 133289121 133289251 133289178 Y SRPRB CDV3 CDV3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDV3 1323 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 134045700 134046050 134045958 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 15282 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 134047160 134047394 134047241 Y ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2 RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RP11-200A1.1 16742 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 134082893 134083489 134083439 Y AMOTL2 RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA AMOTL2 8832 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 135488806 135488993 135488900 Y NA NA KY,EPHB1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R3A 193522 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 135615560 135615771 135615666 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R3A 66744 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 135689254 135689617 135689436 Y MSL2,PPP2R3A PPP2R3A NA NA NA NA PPP2R3A 6739 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 138109159 138109469 138109274 Y NA MRAS,ESYT3 NA NA NA NA ESYT3 41959 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 142723898 142724007 142723903 Y NA U2SURP NA NA NA NA U2SURP 42559 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 145883195 145883481 145883360 Y PLOD2,PLSCR4 PLOD2 PLOD2,PLSCR4,PLSCR1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLOD2 3755 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 146686002 146686397 146686202 Y NA NA NA NA NA NA PLSCR1 425351 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 149057749 149057981 149057865 Y NA TM4SF1 NA NA NA NA TM4SF1 35671 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 149297469 149297617 149297606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 87022 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 150089534 150090066 150089791 Y NA TSC22D2 TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TSC22D2 34056 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 151514227 151514622 151514246 Y NA NA NA NA NA NA SUCNR1 74809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 151582597 151582803 151582700 Y NA SUCNR1 MED12L IMR90 Hi-C 24141950 SUCNR1 6628 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 152856443 152856813 152856615 Y RAP2B RAP2B RAP2B MCF7 ChIA-PET 22265404 RAP2B 21216 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 154688654 154689001 154688833 Y MME,MME,MME,MME NA LOC100507537,MME IMR90 Hi-C 24141950 MME 50912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 155705974 155706059 155706016 Y NA NA NA NA NA NA GMPS 119649 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 156402848 156403019 156402937 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP TIPARP NA NA NA NA TIPARP 13824 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 156527707 156527883 156527795 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 1186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 156529352 156529637 156529452 Y NA PA2G4P4,LINC00886,LEKR1 NA NA NA NA PA2G4P4 2831 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 158048767 158049059 158048913 Y NA NA NA NA NA NA SHOX2 226475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 159175843 159176214 159175971 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 528323 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 159480182 159480541 159480238 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 223996 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 159493461 159493761 159493605 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 210776 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 159514256 159514624 159514440 Y NA NA NA NA NA NA IL12A 189913 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 159647586 159647883 159647684 Y NA NA IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4 IMR90 Hi-C 24141950 IL12A 56654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 159983948 159984179 159984064 Y NA NA NA NA NA NA SMC4 130883 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 161133387 161133714 161133484 Y NA NA NMD3 MCF7 ChIA-PET 22265404 B3GALNT1 312215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 167579478 167579761 167579515 Y NA NA NA NA NA NA PDCD10 128751 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 167769401 167769602 167769443 Y NA GOLIM4 NA NA NA NA GOLIM4 42161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 170431417 170431656 170431537 Y NA RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 25498 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr3 170463049 170463502 170463289 Y CLDN11 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 5895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 170469010 170469069 170469037 Y CLDN11,CLDN11,EIF5A2 RP11-373E16.4 SLC7A14,CLDN11,SKIL IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11856 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr3 170527099 170527304 170527203 Y EIF5A2 NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr3 170527835 170528013 170527928 Y NA NA SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RPL22L1 58259 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 171592038 171592451 171592208 Y FNDC3B NA NA NA NA NA PLD1 65298 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 199108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 172467147 172467552 172467259 Y NA NCEH1,ECT2,RNU4-4P NCEH1,ECT2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ECT2 675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 176776147 176776153 176776150 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 137108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 177979552 177979945 177979765 Y NA NA NA NA NA NA RP11-91K9.1 446899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 NA NA NA NA NA ZNF639 60042 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 179182237 179182507 179182372 Y NA GNB4 GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 14859 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 179309053 179309431 179309273 Y NA ACTL6A,MRPL47,NDUFB5 NA NA NA NA MRPL47 11011 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 181414061 181414442 181414162 Y SOX2 NA NA NA NA NA DNAJC19 708499 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC19 738842 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr3 183980250 183980567 183980542 Y CAMK2N2,ECE2 ALG3,ECE2,CAMK2N2,PSMD2,EIF4G1 NA NA NA NA CAMK2N2 2999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 185215412 185215562 185215482 Y NA TMEM41A NA NA NA NA TMEM41A 567 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 185450719 185450896 185450815 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 89948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 185821581 185821963 185821920 Y NA ETV5 NA NA NA NA ETV5 4144 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 186819692 186820086 186819740 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 76610 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 187912287 187912441 187912353 Y BCL6,LPP LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 42442 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 187988232 187988684 187988401 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 118387 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 188012018 188012343 188012183 Y LPP,LPP NA NA NA NA NA LPP-AS2 142173 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 188151524 188151812 188151760 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 281679 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 188506419 188506821 188506595 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 636574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 190062904 190063381 190063085 Y LEPREL1,CLDN1,CLDN16 CLDN1 LEPREL1,CLDN1,CLDN16 IMR90 Hi-C 24141950 CLDN1 24640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr3 190104242 190104447 190104367 Y NA NA NA NA NA NA CLDN1 65978 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 190251387 190251779 190251471 Y CLDN1 IL1RAP NA NA NA NA IL1RAP 21547 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr3 191049369 191049653 191049414 Y NA CCDC50 NA NA NA NA CCDC50 4503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 191620991 191621297 191621143 Y PYDC2 NA NA NA NA NA CCDC50 576125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 193807302 193807696 193807488 Y ATP13A3,HES1 HES1 HES1,LOC100131551,LOC647323 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HES1 44238 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 193858651 193858843 193858731 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 6717 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 194898663 194899282 194898930 Y NA XXYLT1-AS2 NA NA NA NA XXYLT1-AS2 32063 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 194942294 194942570 194942358 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 47326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 196758283 196758681 196758467 Y NA AC011322.1,MFI2-AS1,MFI2 NA NA NA NA MFI2 3596 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 197033346 197033465 197033406 Y DLG1 DLG1 NA NA NA NA DLG1 9175 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr3 197036480 197036785 197036693 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 12309 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr3 197216995 197217339 197217145 Y DLG1 NA NA NA NA NA BDH1 80855 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr3 197439165 197439566 197439302 Y IQCG,LRCH3,KIAA0226 MIR922,FYTTD1,KIAA0226 NA NA NA NA FYTTD1 22484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 1874737 1875082 1874826 Y WHSC1 LETM1,WHSC1 NA NA NA NA WHSC1 3586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 1968542 1968629 1968571 Y WHSC1,WHSC1 SCARNA22 NA NA NA NA SCARNA22 5734 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 2063376 2063744 2063670 Y FGFR3,NAT8L C4orf48,NAT8L NA NA NA NA NAT8L 4137 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 2389037 2389223 2389089 Y LOC402160 ZFYVE28 NA NA NA NA ZFYVE28 29167 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 3372879 3372940 3372901 Y RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 80124 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 6635412 6635534 6635472 Y NA MRFAP1,RP11-539L10.3 NA NA NA NA MRFAP1 4284 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 7830043 7830393 7830208 Y SH3TC1 NA NA NA NA NA AFAP1 109260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 7846072 7846237 7846145 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 93416 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 7858938 7859554 7859231 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 80099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 8254530 8254695 8254600 Y NA NA NA NA NA NA SH3TC1 72731 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 RAB28 438441 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 15356839 15357216 15357028 Y NA NA NA NA NA NA CC2D2A 112273 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1,CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 19658 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr4 15907638 15908044 15907859 Y FBXL5,BST1,FGFBP1 FGFBP1 BST1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFBP1 30319 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 15915213 15915572 15915412 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 22791 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 15922988 15923279 15923080 Y FGFBP1 FGFBP1 NA NA NA NA FGFBP1 15084 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 17581888 17582305 17582055 Y LAP3,MED28 LAP3,MED28 NA NA NA NA LAP3 5073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 23335645 23335866 23335720 Y NA NA NA NA NA NA PPARGC1A 567846 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 25813122 25813401 25813272 Y NA SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 49981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 27012249 27012271 27012260 Y NA NA NA NA NA NA STIM2 154949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 33064964 33065218 33065098 Y NA NA NA NA NA NA PCDH7 2344927 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 34183539 34183770 34183747 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 2060361 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 38069769 38070051 38069856 Y NA NA NA NA NA NA PTTG2 109713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 38668617 38669179 38668850 Y KLF3 KLF3 NA NA NA NA KLF3 4800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 38679741 38680082 38679809 Y NA KLF3 NA NA NA NA KLF3 15924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 38820282 38820708 38820366 Y NA FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 46590 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 39045588 39045914 39045752 Y NA TMEM156,KLHL5 NA NA NA NA KLHL5 929 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 39354929 39355678 39355646 Y NA RFC1 WDR19 IMR90 Hi-C 24141950 RFC1 10317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 39548258 39548506 39548382 Y KLHL5 UGDH-AS1,UGDH NA NA NA NA UGDH 20327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 40240312 40240963 40240621 Y RHOH,RBM47 NA NA NA NA NA N4BP2 183866 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 NA RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NSUN7 74565 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 40992630 40993044 40992776 Y APBB2 NA NA NA NA NA APBB2 223687 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr4 41000829 41000972 41000906 Y RBM47 NA NA NA NA NA APBB2 215759 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 41363966 41364137 41364015 Y LIMCH1,LIMCH1 LIMCH1 NA NA NA NA LIMCH1 4342 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 41413971 41414162 41414067 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 54347 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 41434914 41435283 41435075 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 75290 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 41541269 41541557 41541390 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 181645 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 56419632 56419978 56419838 Y NA CLOCK NA NA NA NA CLOCK 8327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 43336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 74569694 74570920 74570464 Y ANKRD17,MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 33303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 74570970 74571346 74571160 Y MTHFD2L,IL8,CXCL3,CXCL2,CXCL1 IL8 MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 IL8 32877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 74975298 74975961 74975834 Y CXCL1,AREG CXCL2,MTHFD2L RASSF6 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 1930 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 78708574 78708903 78708795 Y CNOT6L CNOT6L NA NA NA NA CNOT6L 29866 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 78979777 78980204 78980085 Y NA FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 3053 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 79473983 79474151 79474067 Y ANXA3 ANXA3 NA NA NA NA ANXA3 3310 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 88463051 88463413 88463109 Y NA NA NA NA NA NA NUDT9 121317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 88670885 88671377 88671233 Y NA NA NA NA NA NA SPP1 223442 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 97183471 97183806 97183512 Y NA NA NA NA NA NA UNC5C 715114 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 101014771 101014911 101014841 Y DNAJB14 NA PPP3CA IMR90 Hi-C 24141950 DDIT4L 95028 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 101269712 101269900 101269796 Y LAMTOR3 NA NA NA NA NA DDIT4L 159773 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 102894116 102894225 102894174 Y BANK1,BANK1 NA NA NA NA NA SLC39A8 456190 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 103360468 103360812 103360586 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 BDH2,NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10053 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 103360821 103361254 103361183 Y SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,SLC39A8,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,UBE2D3,NFKB1,MANBA SLC39A8 NFKB1,SLC9B1,UBE2D3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A8 10406 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 106324406 106324791 106324687 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 68447 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 110449545 110449722 110449703 Y SEC24B CCDC109B CCDC109B IMR90 Hi-C 24141950 CCDC109B 29639 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 110464231 110464470 110464351 Y NA CCDC109B NA NA NA NA CCDC109B 14891 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 111086740 111086853 111086804 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 31502 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 114355245 114355627 114355568 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 15766 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 114389425 114389805 114389547 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 49946 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 117474098 117474276 117474187 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 43041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 119629667 119629850 119629760 Y NA METTL14 NA NA NA NA METTL14 25144 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 119937849 119938004 119937931 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 180011 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 120130181 120130604 120130427 Y NA USP53 NA NA NA NA USP53 1138 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 121323328 121323687 121323508 Y NA NA NA NA NA NA MAD2L1 337099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 122632771 122633033 122632919 Y NA ANXA5 ANXA5,BBS7,CCNA2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ANXA5 16503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 123685251 123685615 123685333 Y FGF2 BBS12 NA NA NA NA BBS12 33394 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 123686146 123686329 123686228 Y FGF2 BBS12 NA NA NA NA BBS12 34289 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr4 123693497 123693708 123693587 Y NA BBS12 FGF2,SPATA5,NUDT6 IMR90 Hi-C 24141950 BBS12 41640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 123751494 123751575 123751556 Y FGF2 FGF2 NA NA NA NA FGF2 5631 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 123771840 123772248 123772020 Y NA FGF2 NA NA NA NA FGF2 25977 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 128059787 128060054 128059921 Y NA NA FAT4 IMR90 Hi-C 24141950 INTU 482372 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 129438976 129439122 129439055 Y NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 230992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr4 129847015 129847068 129847042 Y NA NA NA NA NA NA SCLT1 165696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 139173167 139173319 139173175 Y NA SLC7A11 SLC7A11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC7A11 11664 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 144271294 144271615 144271412 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA5 161001 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 146655718 146656086 146655845 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr4 146725275 146725660 146725360 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 132127 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr4 146726845 146727018 146726937 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 130769 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 146729401 146729770 146729628 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 128017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 146764373 146764705 146764540 Y NA NA NA NA NA NA ZNF827 93082 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 147250249 147250611 147250430 Y NA NA NA NA NA NA LSM6 155412 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 147329066 147329172 147329119 Y NA NA NA NA NA NA SLC10A7 111951 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 148752985 148753384 148753090 Y PRMT10 NA NA NA NA NA ARHGAP10 101771 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA MAB21L2 140821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 153858553 153859077 153858605 Y TRIM2,FHDC1 RP11-206F17.2,FHDC1 ARFIP1,FHDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FHDC1 3049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 39810 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 157811355 157811573 157811537 Y NA NA NA NA NA NA PDGFC 78973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 157867687 157867968 157867878 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22578 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 157868046 157868334 157868214 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 22212 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 157870715 157871133 157870964 Y NA PDGFC NA NA NA NA PDGFC 19413 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 158904600 158904766 158904702 Y NA NA NA NA NA NA RXFP1 329697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 159925060 159925429 159925240 Y FNIP2 NA NA NA NA NA FNIP2 236770 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 162808424 162808493 162808459 Y FSTL5 NA NA NA NA NA FSTL5 274694 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA NACA3P 651653 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 169371058 169372404 169371437 Y DDX60,DDX60L PALLD NA NA NA NA PALLD 43813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 169737785 169738127 169737934 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 191299 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 169752314 169752599 169752402 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 176827 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 HAND2 NA NA NA NA HAND2 5078 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 183110695 183110955 183110887 Y NA AC108142.1 NA NA NA NA AC108142.1 46293 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 183161464 183161792 183161628 Y ODZ3 NA ODZ3 IMR90 Hi-C 24141950 AC108142.1 97062 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 184916743 184916943 184916831 Y C4orf41,IRF2 RP11-739P1.2 NA NA NA NA RP11-739P1.2 9912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr4 185186820 185187542 185187472 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 206192 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr4 185609676 185609967 185609740 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 41013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 187606948 187607189 187607069 Y NA FAT1 NA NA NA NA FAT1 38687 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr4 189365489 189365865 189365533 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219G10.1 96311 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 NA LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CCDC127 162156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 400756 401055 400906 Y NA C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.22892318501568 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 1514952 1515327 1515072 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 6765 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 1521795 1522349 1522119 Y NA NA NA NA NA NA LPCAT1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 1536479 1536809 1536604 Y SLC12A7,LPCAT1 LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 14387 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 3595085 3595457 3595281 Y NA IRX1 NA NA NA NA IRX1 917 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 5026027 5026363 5026168 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 392414 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 6373242 6373393 6373318 Y NA MED10 NA NA NA NA MED10 3314 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 7.6997399027297 chr5 10371627 10371888 10371758 Y NA MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 19812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 10485180 10485474 10485337 Y NA ROPN1L,RPL30P7 NA NA NA NA RPL30P7 1458 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 14034644 14034850 14034764 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 91992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 14036813 14036909 14036843 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14037218 14037324 14037271 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14110836 14111023 14110985 Y NA TRIO TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIO 30788 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14142332 14142650 14142445 Y NA TRIO NA NA NA NA TRIO 521 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14142803 14143164 14142969 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 992 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14154284 14154671 14154327 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 12473 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14185691 14186191 14185984 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 43880 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14208730 14209007 14208812 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 66919 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 14250238 14250405 14250312 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 108427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 14489488 14489835 14489662 Y NA NA NA NA NA NA FAM105A 90049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 14926139 14926359 14926282 Y NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 56252 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 16523103 16523375 16523239 Y NA NA NA NA NA NA ZNF622 59202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 17249327 17249860 17249454 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP133 93865 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 18666600 18666904 18666810 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2023M8.1 77378 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 18745140 18745321 18745192 Y NA CTD-2023M8.1 NA NA NA NA CTD-2023M8.1 858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 23303766 23303789 23303778 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1505801 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 1100991 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA SNORD29 2037529 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 32366924 32367006 32366965 Y NA NA NA NA NA NA MTMR12 55809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 34571249 34571361 34571303 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 34571432 34571721 34571601 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82621 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 34587608 34588326 34587915 Y NA NA RAI14 IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 66016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 35859478 35859884 35859711 Y NA IL7R NA NA NA NA IL7R 8681 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 36229884 36229947 36229916 Y UGT3A1,C5orf33,C5orf33 NA NA NA NA NA SKP2 79793 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 36690488 36690876 36690655 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 86031 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 36722958 36723309 36723211 Y NIPBL NA NIPBL,LOC646719 MCF7 ChIA-PET 22265404 SLC1A3 118501 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 37272795 37272956 37272876 Y C5orf42 C5orf42 NA NA NA NA C5orf42 25265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 37771819 37772240 37771999 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 394505 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 38854077 38854436 38854323 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 10117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 38866844 38867106 38866976 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 22884 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 38872248 38872554 38872396 Y NA CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 28288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 39014770 39014929 39014863 Y NA NA NA NA NA NA RICTOR 57581 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 39519768 39520016 39519839 Y DAB2 NA DAB2 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 59366 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA AC025171.1 NA NA NA NA AC025171.1 31239 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 50263404 50263601 50263575 Y ISL1 NA NA NA NA NA ISL1 413320 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2 NA NA NA NA ITGA2 44436 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 54039991 54040439 54040234 Y SNX18,SNX18 NA SNX18,GPX8,CDC20B IMR90 Hi-C 24141950 SNX18 228402 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA PPAP2A 98753 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 54964345 54964561 54964453 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A9 102461 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 55287334 55287994 55287973 Y NA IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA IL6ST 827 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 56131312 56131556 56131415 Y GPBP1,GPBP1,GPBP1,MAP3K1 MAP3K1 NA NA NA NA MAP3K1 21911 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 57111915 57112364 57112128 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 335279 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 57112814 57113117 57112881 Y ACTBL2 NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 336178 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 344185 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 57133445 57133721 57133581 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 356809 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 57137483 57137861 57137645 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 360847 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 578199 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PLK2 605797 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA PLK2 1112383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64062074 64062237 64062149 Y NA SREK1IP1,CWC27 NA NA NA NA SREK1IP1 275 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 64486221 64486631 64486280 Y ADAMTS6 NA NA NA NA NA ADAMTS6 289116 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64710773 64711167 64710966 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS6 64580 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64727937 64728302 64728145 Y NA ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 47445 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA ADAMTS6 33855 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 66145750 66145926 66145797 Y NA NA CD180 IMR90 Hi-C 24141950 MAST4 255574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr5 71659094 71659472 71659166 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 44621 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 71896178 71896784 71896469 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNPO1 213355 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 72934554 72934908 72934667 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 75043 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 72950370 72950710 72950420 Y RGNEF NA NA NA NA NA ANKRA2 90859 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 73612322 73612454 73612340 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321394 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 74020638 74021005 74020822 Y NA NSA2,GFM2 NA NA NA NA NSA2 39812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 74862624 74863010 74862882 Y ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 56661 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr5 76086514 76086772 76086643 Y F2R F2RL1 NCRUPAR,F2R,IQGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 25986 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 77140620 77140840 77140736 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 21764 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 77892981 77893377 77893333 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 170467 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 77974245 77974379 77974312 Y NA NA SCAMP1,LHFPL2,ARSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LHFPL2 89465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 79258800 79259000 79258839 Y NA MTX3 NA NA NA NA MTX3 26082 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 79695212 79695829 79695740 Y ZFYVE16,FAM151B ZFYVE16 THBS4,ZFYVE16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFYVE16 6003 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 80260404 80260721 80260547 Y NA RASGRF2 NA NA NA NA RASGRF2 5913 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr5 80263371 80263585 80263478 Y NA RASGRF2 NA NA NA NA RASGRF2 8880 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 80898051 80898414 80898329 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 147202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA NA ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP2 102021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 82807080 82807411 82807109 Y XRCC4,VCAN NA NA NA NA NA RNU4-11P 289962 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-11P 78798 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 83214867 83215139 83214962 Y HAPLN1 NA NA NA NA NA RNU4-11P 117494 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 83545538 83546053 83545791 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 132192 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 83583813 83583994 83583988 Y EDIL3 NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 94251 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr5 83585889 83586179 83586107 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 92066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 83588624 83588917 83588807 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2269F5.1 89328 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr5 83668796 83668857 83668813 Y NA CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 9388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 83670446 83670810 83670539 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 7435 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 83674189 83674553 83674373 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 3692 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 86417249 86417398 86417310 Y CCNH,CCNH NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 144307 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 86417910 86418259 86418047 Y NA NA MIR4280 K562 ChIA-PET 22265404 RASA1 143446 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 86673186 86673474 86673330 Y CCNH,CCNH CCNH NA NA NA NA CCNH 33362 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 87985363 87985679 87985523 Y MEF2C NA LINC00461 K562 ChIA-PET 22265404 MEF2C 212243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 90597376 90597666 90597555 Y ARRDC3 RNU4-90P,LUCAT1 GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LUCAT1 10553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 95298372 95298734 95298686 Y ELL2 ELL2 NA NA NA NA ELL2 2597 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 95562741 95563074 95562934 Y NA NA ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 266966 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 95594948 95595289 95595074 Y ELL2 NA ELL2,RFESD,GLRX IMR90 Hi-C 24141950 CAST 263682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 97645408 97646168 97645558 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 26280 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 97650049 97650331 97650134 Y RGMB CH17-12M21.1 RGMB,FLJ35946 IMR90 Hi-C 24141950 CH17-12M21.1 22117 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 98197255 98197391 98197342 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 65484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 98253335 98253735 98253703 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 9140 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 98262747 98263243 98263080 Y CHD1 NA NA NA NA NA CTD-2007H13.3 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 105404906 105404960 105404933 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1599636 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 105733568 105733839 105733591 Y NA NA EFNA5 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA5 1270757 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 105752390 105752961 105752697 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1251635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 106802102 106802350 106802226 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 202246 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 106806041 106806198 106806107 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 198398 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 106837531 106838094 106837969 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 166502 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 106878561 106878904 106878854 Y EFNA5 NA NA NA NA NA EFNA5 125692 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 106901710 106902084 106901897 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 102512 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 107004755 107005118 107004922 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 108391550 108391948 108391605 Y NA NA NA NA NA NA FER 310027 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 114750887 114751289 114751050 Y NA NA FEM1C IMR90 Hi-C 24141950 CCDC112 120359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 114797286 114797501 114797397 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA NA NA NA NA FEM1C 81090 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 114913600 114913827 114913746 Y NA FEM1C,TMED7-TICAM2 NA NA NA NA FEM1C 35009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 115276815 115277206 115277011 Y LOC644100 NA NA NA NA NA ATG12 101260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 115421672 115422041 115421857 Y NA CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 2984 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 118257403 118257748 118257576 Y NA PTMAP2 NA NA NA NA PTMAP2 49743 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 119940626 119940961 119940736 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 142653 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 124085012 124085124 124085092 Y NA ZNF608 ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF608 2512 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 126149471 126149945 126149720 Y NA RP11-434D11.4,LMNB1 NA NA NA NA LMNB1 39156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 126199771 126199925 126199848 Y NA NA NA NA NA NA LMNB1 89456 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 131594769 131595694 131595371 Y PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 3405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 131795302 131795488 131795309 Y NA AC116366.5,IRF1 NA NA NA NA IRF1 29002 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr5 131833993 131834254 131834119 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 9503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA AFF4 26161 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 133290184 133290209 133290197 Y NA C5orf15,VDAC1 NA NA NA NA C5orf15 12269 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 133681629 133682059 133681927 Y NA CDKL3,UBE2B NA NA NA NA CDKL3 22679 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 135335114 135335504 135335269 Y NA TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 27080 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 137797072 137797362 137797204 Y FAM53C,ETF1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1817 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 139015811 139016118 139015905 Y MATR3,MATR3,MZB1,CXXC5 CXXC5 CXXC5 IMR90 Hi-C 24141950 CXXC5 8766 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 139031397 139032095 139031636 Y C5orf53,PSD2,NRG2,CXXC5 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 6513 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 139076374 139076603 139076510 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 51490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 139077393 139077627 139077507 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 52509 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 139090416 139090834 139090571 Y MATR3,MATR3,CXXC5 NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 65532 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 14336 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA HARS2,HARS,ZMAT2 NA NA NA NA ZMAT2 22016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 140894023 140894210 140894163 Y NA PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 40443 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 141201064 141201327 141201197 Y PCDH1 NA PCDH1,LOC729080,FCHSD1,ARAP3,KIAA0141,PCDH12,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 55484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 141209314 141209613 141209459 Y NA PCDH1 PCDH1,ARAP3,FCHSD1,LOC729080,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH1 47198 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 141407173 141407212 141407192 Y NA GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 GNPDA1 16567 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 141825669 141826086 141825870 Y SPRY4 NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 121649 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 141826368 141826739 141826520 Y NA NA NDFIP1,SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 122348 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 141851932 141852283 141852109 Y NA NA SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 147912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142315332 142315934 142315386 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 167383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142339728 142340345 142340014 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 191779 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142357164 142357537 142357332 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 209215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142504289 142504528 142504400 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 205642 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142541504 142541934 142541585 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 168236 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142623562 142623962 142623719 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 86208 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142625760 142626024 142625785 Y ARHGAP26,NR3C1,NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 84146 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142693038 142693275 142693171 Y NR3C1,NR3C1 RPL7P21 NA NA NA NA RPL7P21 16895 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 142819954 142820205 142820015 Y NA NR3C1 NA NA NA NA NR3C1 6877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 144741919 144742138 144742043 Y NA NA KCTD16,SH3RF2 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 470794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 145319403 145319467 145319435 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 5261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 145326011 145326414 145326305 Y NA SH3RF2 NA NA NA NA SH3RF2 11869 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 145499175 145499563 145499369 Y NA NA NA NA NA NA LARS 60660 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 146378574 146378711 146378699 Y NA NA NA NA NA NA STK32A 233815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 146887479 146887544 146887495 Y DPYSL3 DPYSL3 NA NA NA NA DPYSL3 75 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 147621065 147621397 147621193 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 139949 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 148292484 148292904 148292843 Y NA NA SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 88328 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 148352583 148352893 148352766 Y ADRB2 NA NA NA NA NA ADRB2 148427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 149522462 149523132 149522666 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 10303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr5 149533722 149534084 149534015 Y SYNPO,SYNPO,PDGFRB PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 287 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 149667554 149667894 149667725 Y SYNPO,SLC6A7,CAMK2A ARSI NA NA NA NA ARSI 48976 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 149696810 149697163 149696894 Y SYNPO,PDGFRB ARSI,TCOF1 SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 ARSI 19707 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 150455023 150455538 150455407 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 15600 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 150464543 150466084 150465220 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 5054 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 151119916 151120243 151119990 Y NA RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 SPARC IMR90 Hi-C 24141950 RP11-54C4.1 23696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 154313326 154313392 154313358 Y NA GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA GEMIN5 2377 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 156520687 156520959 156520827 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2 NA NA NA NA HAVCR2 46921 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 157257409 157257732 157257678 Y NA CLINT1 NA NA NA NA CLINT1 26451 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 157297918 157298287 157298172 Y NA CLINT1 CLINT1 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 13735 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr5 158632432 158632664 158632544 Y NA CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 2265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 158938695 158938959 158938847 Y EBF1 NA ADRA1B,LOC285627,TTC1 IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 250606 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 159414162 159414427 159414404 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 19693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 48187 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 159896720 159897088 159896809 Y NA PTTG1,MIR146A NA NA NA NA MIR146A 3445 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167011273 167011672 167011457 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 134696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 167126470 167126930 167126675 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 19438 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 167157088 167157552 167157214 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 10720 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 167171330 167171561 167171437 Y NA CTB-78F1.2 NA NA NA NA CTB-78F1.2 24962 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167224919 167225220 167225022 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 78551 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 167230041 167230378 167230210 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 83673 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr5 167241894 167242222 167242118 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 95526 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167243466 167243587 167243564 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 97098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167259769 167260121 167259976 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 113401 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167320595 167320600 167320598 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 174227 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167327544 167327856 167327700 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 181176 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 167343894 167343960 167343927 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 197526 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 167372516 167372785 167372694 Y NA NA NA NA NA NA CTB-78F1.2 226148 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 167558741 167558830 167558746 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 157826 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 170179191 170179549 170179383 Y GABRP NA NA NA NA NA NPM1 632571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 170878093 170878163 170878150 Y NA FGF18 NA NA NA NA FGF18 33433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 250189 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171580373 171580774 171580468 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 32616 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171681735 171682053 171681977 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 27022 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171702162 171702431 171702281 Y DUSP1,UBTD2,STK10 UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 6644 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 171788471 171789086 171788773 Y DUSP1,STK10,UBTD2 NA NA NA NA NA UBTD2 79396 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 172160417 172160946 172160788 Y ATP6V0E1 DUSP1 ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 35252 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 172222248 172222806 172222661 Y NA DUSP1,ERGIC1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 26050 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 172228151 172228566 172228394 Y DUSP1 DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 30712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr5 172313877 172314602 172314167 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 54599 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr5 172314817 172315056 172314937 Y DUSP1,C5orf41 NA NA NA NA NA ERGIC1 55539 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 172350033 172350394 172350214 Y NA RPL26L1 NA NA NA NA RPL26L1 33338 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 172370220 172370579 172370385 Y ERGIC1,ATP6V0E1 RPL26L1,ATP6V0E1 NA NA NA NA RPL26L1 13153 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 173193377 173193650 173193560 Y NA NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 119633 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 173205115 173205307 173205218 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 107976 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 303279 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 174906234 174906555 174906308 Y NA SFXN1 NA NA NA NA SFXN1 4169 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 175962179 175962700 175962413 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,HK3,HIGD2A,RNF44,CDHR2 RNF44 FAF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 RNF44 326 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 179894931 179895217 179894999 Y NA CTC-573N18.1,CNOT6 GFPT2,MAPK9,CNOT6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNOT6 24195 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr5 180672693 180672910 180672808 Y NA TRIM7,TRIM41,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1 NA NA NA NA GNB2L1 186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 1869270 1869328 1869296 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 260589 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 2767771 2767941 2767856 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 4123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3616228 3616497 3616363 Y NA NA SLC22A23,BPHL,PXDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 133763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 4990656 4990905 4990781 Y NA RPP40 NA NA NA NA RPP40 11392 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 5280343 5280601 5280557 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 21066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 5296297 5296648 5296345 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 37020 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 7058764 7058925 7058840 Y DSP RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 7544425 7544740 7544519 Y NA DSP,SNRNP48 NA NA NA NA DSP 4617 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 9503675 9503928 9503802 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 913964 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 10441526 10441791 10441655 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,GCNT2,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 23634 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 10458287 10458428 10458359 Y NA TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 40395 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 11144047 11144288 11144135 Y TMEM170B,C6orf52,NEDD9,NEDD9 ERVFRD-1 NA NA NA NA ERVFRD-1 34082 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 11650418 11650889 11650652 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 114480 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12232536 12232937 12232675 Y HIVEP1,EDN1 NA TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 55659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12242168 12242480 12242308 Y HIVEP1,EDN1 EDN1 TMEM170B,ADTRP,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 EDN1 46116 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12288471 12288892 12288524 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12324386 12324755 12324542 Y NA EDN1 EDN1 MCF7 ChIA-PET 22265404 EDN1 35790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 12546211 12546443 12546327 Y NA RPL15P3 EDN1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 33869 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12573441 12573699 12573559 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 61099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12592849 12593177 12593094 Y EDN1 NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 80507 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 12595340 12595665 12595564 Y NA NA TMEM170B,EDN1,HIVEP1,ADTRP IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 82998 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 13354550 13354809 13354680 Y NA TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 27735 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 13636617 13636971 13636795 Y TBC1D7,GFOD1,CD83 NOL7 NA NA NA NA NOL7 23058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 13766479 13766874 13766549 Y NA NA NA NA NA NA RANBP9 56683 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 14744083 14744613 14744392 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 499914 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 16588159 16588355 16588257 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 171014 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 16712557 16713382 16713252 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45987 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr6 16713666 16713734 16713668 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 16724246 16724395 16724344 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 34974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 17925685 17925969 17925835 Y NA NA NA NA NA NA KIF13A 59885 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 18263099 18263635 18263391 Y RNF144B,DEK DEK NA NA NA NA DEK 45 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 20418274 20418752 20418425 Y NA E2F3 NA NA NA NA E2F3 17876 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 21987708 21987959 21987863 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 395736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 24743523 24743742 24743610 Y TDP2,C6orf62 C6orf62,GMNN GMNN,CMAHP,C6orf62 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C6orf62 24459 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 25174209 25174610 25174347 Y C6orf62 NA CMAHP,FAM65B,LRRC16A IMR90 Hi-C 24141950 LRRC16A 102696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 25303199 25303368 25303284 Y NA LRRC16A NA NA NA NA LRRC16A 25893 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 27156271 27156423 27156401 Y NA HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2BO,HIST1H2AM,OR2B2,LOC100507173,HIST1H4J,HIST1H3J,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AH,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2BL IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 20600 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 27300679 27301026 27300902 Y NA ZNF391 NA NA NA NA ZNF391 39368 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 27513313 27513537 27513433 Y NA NA HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,HIST1H2AM,HIST1H3J,HIST1H2BO IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF184 74416 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 47946 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.47081671771402 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 30434534 30434831 30434712 Y DDR1,DDR1,DDR1,DDR1 RANP1,HLA-E PPP1R10,HLA-E,GNL1,PRR3,MRPS18B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RANP1 16886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 30716024 30716359 30716084 Y HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 5693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3,HCG20 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30737456 30737900 30737560 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3,HCG20 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 4854 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 30785907 30786494 30786279 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HCG20 53305 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 31702368 31703528 31702658 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5 NA NA NA NA CLIC1 2012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 32114130 32114430 32114186 Y GPANK1,GPANK1,LY6G5C,DOM3Z,FKBPL TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8,AGPAT1,RNF5,AGER,XXbac-BPG300A18.13,PBX2,GPSM3 NA NA NA NA PPT2 4788 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 33590898 33591125 33590902 Y ITPR3 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA ITPR3 4756 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 33602402 33602476 33602439 Y NA ITPR3 IP6K3 IMR90 Hi-C 24141950 ITPR3 16260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 35170056 35170397 35170225 Y NA SCUBE3 TCP11,ANKS1A,ZNF76,SCUBE3 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE3 9793 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 35337950 35338511 35338285 Y ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD PPARD NA NA NA NA PPARD 29615 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 37227057 37227393 37227190 Y FTSJD2,TMEM217,TBC1D22B,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TMEM217 3126 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 39171657 39171958 39171719 Y NA KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 23268 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 39393880 39394120 39394000 Y NA NA NA NA NA NA KCNK5 198654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 41608113 41608435 41608156 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 5493 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 41889955 41890338 41890119 Y FRS3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 3029 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 41938271 41938604 41938519 Y TFEB NA NA NA NA NA BYSL 51345 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 42228452 42228568 42228527 Y NA MRPS10 NA NA NA NA MRPS10 44849 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA NA NA NA NA NA UBR2 108733 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 42515662 42516014 42516002 Y GUCA1A,MEA1,KIAA0240 UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 13786 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 43692783 43693195 43692965 Y TJAP1,MAD2L1BP MRPS18A,VEGFA MRPS18A,LOC100132354,RSPH9,MRPL14,CAPN11,TMEM63B,POLH,VEGFA,XPO5,MAD2L1BP,GTPBP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPS18A 39255 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 43894411 43894725 43894584 Y NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP NA NA NA NA NA VEGFA 158490 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 82898 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA NA RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 TMEM63B 80166 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 44230828 44231731 44231363 Y NFKBIE SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2 NA NA NA NA NFKBIE 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 44887030 44887214 44887174 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 456476 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 45051436 45051642 45051539 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 292048 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 41388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 46738555 46739161 46738809 Y PLA2G7,PLA2G7 PLA2G7 NA NA NA NA PLA2G7 37125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 49521190 49521511 49521254 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 5077 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 52383934 52384018 52383972 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 55695 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 52461371 52461586 52461469 Y NA TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 21658 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 53678166 53678361 53678262 Y NA LRRC1 NA NA NA NA LRRC1 20871 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 54583648 54583812 54583730 Y NA NA FAM83B,HCRTR2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM83B 125757 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA DST 520858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr6 58776280 58777091 58777029 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 521711 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 73335940 73336259 73335964 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 6420 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 55167 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 74861347 74861685 74861516 Y NA NA COL12A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC17A5 499469 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 78014950 78015339 78015145 Y NA NA NA NA NA NA HTR1B 156151 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 80207886 80208176 80208031 Y NA LCA5 NA NA NA NA LCA5 36999 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 80663174 80663336 80663221 Y NA ELOVL4,TTK NA NA NA NA ELOVL4 7877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 80874987 80875281 80875111 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 60623 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 85834833 85835082 85834958 Y NA NA NA NA NA NA NT5E 322727 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr6 86370103 86370257 86370180 Y NA SYNCRIP,SNHG5 NA NA NA NA SNHG5 16194 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 87433521 87433927 87433716 Y NA NA NA NA NA NA RCN1P1 396479 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.47730189155535 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 90061423 90061611 90061503 Y RNGTT,SRSF12,GABRR1,UBE2J1 UBE2J1 NA NA NA NA UBE2J1 856 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 91078844 91079184 91078980 Y NA NA BACH2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K7 215580 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 95244699 95244909 95244803 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 778510 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 98633797 98633973 98633885 Y NA NA NA NA NA NA FBXL4 759876 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 99886915 99887218 99887074 Y NA COQ3,RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 15708 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 100051584 100051769 100051603 Y NA CCNC,PRDM13 NA NA NA NA PRDM13 837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 101204667 101204976 101204826 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 122272 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 106048262 106048533 106048347 Y NA NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 199303 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 106057484 106057635 106057546 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 208525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 106440406 106440671 106440473 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 ATG5 330995 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 111776910 111777281 111777179 Y NA TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA TRAF3IP2-AS1 25433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 111808995 111809308 111809091 Y REV3L,FYN,TRAF3IP2 TRAF3IP2-AS1,REV3L NA NA NA NA REV3L 6077 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 112145008 112145393 112145362 Y REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 47262 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 112163238 112163349 112163330 Y NA FYN NA NA NA NA FYN 29306 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 112192236 112192610 112192499 Y REV3L,FYN,FYN,FYN FYN NA NA NA NA FYN 45 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 114866496 114866590 114866545 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 204287 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 500961 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 116701798 116702097 116701822 Y NA NA NA NA NA NA TSPYL1 102732 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 116708579 116708861 116708730 Y ZUFSP,DSE,FAM26F NA NA NA NA NA TSPYL1 109513 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 119217591 119217640 119217616 Y NA ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 4207 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 121398601 121398951 121398918 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 355887 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 125335634 125335813 125335724 Y NA NA NA NA NA NA RNF217 53943 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 125424080 125424400 125424202 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 13795 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 126265741 126265870 126265827 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 10057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 127892310 127892704 127892511 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 137529 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 128607751 128608140 128608092 Y NA NA NA NA NA NA PTPRK 231730 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 129822485 129822770 129822701 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP18 206600 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 130030425 130030727 130030721 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 1055 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 130069572 130069764 130069691 Y NA ARHGAP18 ARHGAP18,L3MBTL3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP18 40202 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 132406911 132407089 132407028 Y NA NA CTGF,LOC100507254,ENPP1 IMR90,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 CTGF 136398 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 132812514 132812803 132812689 Y TAAR5,C6orf192,TAAR6 STX7 NA NA NA NA STX7 19534 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 133070302 133070479 133070392 Y STX7,VNN2,VNN2,VNN2 NA NA NA NA NA RPS12 63101 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 133134288 133134908 133134317 Y NA RPS12 NA NA NA NA SNORD101 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 133837061 133837238 133837150 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 277325 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 133890779 133890909 133890844 Y NA NA MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 EYA4 331043 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 133930803 133931089 133930946 Y NA NA MGC34034,TCF21 IMR90 Hi-C 24141950 TBPL1 340219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 134609640 134610343 134609803 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 26907 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 134679459 134679725 134679553 Y SGK1,SGK1 SGK1 SGK1,ALDH8A1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 42209 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 134700193 134700599 134700296 Y SGK1,SGK1 NA ALDH8A1,LOC154092,SGK1,HBS1L,MIR3662 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 62943 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 134741718 134742020 134741875 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104468 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 134742048 134742399 134742278 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 104798 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 134743944 134744382 134744175 Y SGK1,SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092,ALDH8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 106694 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 136312028 136312251 136312140 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 296738 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 138132277 138133056 138132650 Y TNFAIP3 NA TNFAIP3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFAIP3 53295 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 138225639 138226065 138225836 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 39288 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 138552516 138552583 138552548 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1244 71458 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 138914049 138914108 138914056 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97600 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 138914342 138914559 138914540 Y NA NA HEBP2,NHSL1,LOC100507462,PERP,CCDC28A,ECT2L,FLJ46906 IMR90 Hi-C 24141950 NHSL1 97149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 139854911 139854985 139854931 Y HECA,CITED2,CITED2,CITED2 NA LOC100132735,CITED2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 161154 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 140383051 140383491 140383322 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 689294 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 140762502 140762813 140762587 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CITED2 1068745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 140807335 140807614 140807478 Y NA NA LOC100132735,CITED2 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1113578 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 140858869 140859245 140859045 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1165112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr6 140893217 140893627 140893519 Y NA NA NA NA NA NA CITED2 1199460 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 140984884 140985153 140985121 Y NA NA LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 1291127 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 17.8832668708561 chr6 142698366 142698689 142698587 Y NA NA NA NA NA NA GPR126 77375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 143123144 143123510 143123441 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 140828 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 143154152 143154557 143154355 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 109781 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 143503002 143503176 143503018 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 123369 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 144585551 144585700 144585606 Y NA NA UTRN IMR90 Hi-C 24141950 STX11 115888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 147124877 147125201 147125102 Y NA NA NA NA NA NA RAB32 262048 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 147235088 147235549 147235197 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 288012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 147235645 147236230 147236149 Y RAB32,STXBP5 NA NA NA NA NA STXBP5 287331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 150176203 150176399 150176290 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 7800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 150286198 150286452 150286311 Y ULBP1 RAET1G,ULBP2,ULBP1 NA NA NA NA ULBP1 3055 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr6 151246480 151246919 151246675 Y ZBTB2 NA NA NA NA NA MTHFD1L 61795 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 151381285 151381592 151381452 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 37073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 152606341 152606739 152606594 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 350197 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 152634983 152635621 152635105 Y NA NA NA NA NA NA SYNE1 321315 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 154441744 154441825 154441785 Y OPRM1,OPRM1 NA NA NA NA NA CNKSR3 387968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 157162870 157163071 157163026 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 65807 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 158034114 158034488 158034146 Y NA NA NA NA NA NA SNX9 207808 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 158784092 158784407 158784250 Y NA NA NA NA NA NA TMEM181 171061 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 35481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr6 160144181 160144267 160144224 Y NA WTAP,ACAT2,SOD2 NA NA NA NA WTAP 350 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 160309708 160309802 160309766 Y MAS1 NA IGF2R,PNLDC1,MAS1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 78329 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 160404300 160404614 160404397 Y SOD2,WTAP,WTAP,IGF2R IGF2R NA NA NA NA IGF2R 16169 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 160425266 160425362 160425272 Y NA IGF2R NA NA NA NA IGF2R 37135 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA CAHM,QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 167411692 167411848 167411735 Y RNASET2,GPR31 RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 1022 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 251753 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 169572627 169572772 169572742 Y NA RP11-417E7.1 THBS2,WDR27 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-417E7.1 11608 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 170449336 170449548 170449442 Y NA NA DLL1 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 148013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57935 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 1573524 1573718 1573598 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,TMEM184A,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 5174 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 1709256 1709641 1709356 Y NA NA MAD1L1,KIAA1908 IMR90 Hi-C 24141950 AC074389.9 70286 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 4773446 4773760 4773608 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 92058 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 5631413 5631525 5631469 Y NA ACTB,FSCN1 RNF216 IMR90 Hi-C 24141950 FSCN1 974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 6049655 6049813 6049700 Y NA PMS2,AIMP2,EIF2AK1 NA NA NA NA AIMP2 2779 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 6682292 6682670 6682512 Y C7orf26 ZNF316 NA NA NA NA ZNF316 7339 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 13889552 13889950 13889896 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 139100 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 17315787 17316189 17315986 Y NA AHR,AC003075.4 AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 20057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 19157963 19158297 19158271 Y NA TWIST1 NA NA NA NA TWIST1 2668 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 20488630 20489286 20488971 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 RPL23P8 375659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 20838802 20838947 20838900 Y NA RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 RPL23P8 25998 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 22622740 22623204 22623070 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P6 73122 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7 NA NA NA NA TOMM7 33843 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 23904639 23904947 23904793 Y NA NA NA NA NA NA AC006026.13 186234 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 24092646 24092866 24092724 Y NPY NA NA NA NA NA NPY 228916 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 24772828 24773057 24772934 Y DFNA5,DFNA5 DFNA5 NA NA NA NA DFNA5 34187 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 27386345 27386573 27386562 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P4 79048 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1 141190 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 36776109 36776821 36776493 Y ELMO1,AOAH NA ELMO1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0895 348375 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 37221797 37222057 37221923 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 264795 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 40706026 40706047 40706035 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 718390 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 41025919 41026252 41026112 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 714454 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 41046291 41046547 41046419 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 694159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 41147789 41147992 41147892 Y NA NA LOC285954,INHBA,C7orf10 IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 592714 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 42174635 42174902 42174765 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 100567 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 44436686 44437032 44436900 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 68409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 46708141 46708157 46708149 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 299143 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 47553531 47553930 47553845 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 66226 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 47641950 47642196 47642073 Y NA TNS3 TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 21794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA NA NA NA NA NA HUS1 190582 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 50615386 50615579 50615483 Y GRB10 NA NA NA NA NA FIGNL1 99298 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 55035120 55035446 55035284 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 49268 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 55131480 55131905 55131522 Y EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 46766 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 55141624 55142112 55141893 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 56910 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 55198488 55198937 55198616 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 113774 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 56606357 56606502 56606382 Y LOC389493 NA NA NA NA NA RP4-725G10.3 377519 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.22243801117435 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr7 69963084 69963238 69963161 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 631917 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 75253450 75253956 75253637 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 97972 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR SRRM3 SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 SRRM3 33163 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3,SRCRB4D NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 78922771 78923130 78923056 Y MAGI2 NA NA NA NA NA MAGI2-AS3 157068 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 80512986 80513276 80513113 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 36399 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 83688045 83688341 83688303 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 411719 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 92261439 92261837 92261823 Y NA NA FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RBM48 105352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 138234 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 92392967 92393205 92393086 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9,CDK6,CDK6 NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 AC002454.1 70592 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 92745192 92745375 92745297 Y SAMD9 SAMD9L NA NA NA NA SAMD9 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 96644857 96645287 96645147 Y NA DLX6 NA NA NA NA DLX6 11997 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 98739351 98739615 98739543 Y NA SMURF1 NA NA NA NA SMURF1 108 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 102514621 102514825 102514690 Y NA NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 127203 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 102516226 102516619 102516429 Y LRRC17 NA FAM185A IMR90 Hi-C 24141950 FAM185A 128808 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 102941984 102942200 102942104 Y NA PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 6115 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 103277543 103277794 103277680 Y NA NA NA NA NA NA CTA-276O3.4 290495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 103628735 103629126 103629058 Y RELN RELN NA NA NA NA RELN 772 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 106065261 106066901 106065591 Y NA NA NAMPT,CCDC71L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAMPT 140489 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 106089773 106090176 106089868 Y NAMPT,PIK3CG NA NAMPT IMR90 Hi-C 24141950 NAMPT 165001 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC004917.1 89629 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 111641194 111641556 111641398 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 202910 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 111971895 111972278 111972086 Y NA NA NA NA NA NA IFRD1 88745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 114459820 114459999 114459910 Y NA NA FOXP2 IMR90 Hi-C 24141950 MDFIC 100210 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 116152142 116152412 116152205 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1 AC002066.1,CAV1 CAV1 IMR90 Hi-C 24141950 CAV1 10427 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 116504290 116504456 116504319 Y NA NA NA NA NA NA CAPZA2 55166 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 117951613 117952046 117951751 Y NA NA NA NA NA NA NAA38 129527 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 120030311 120030667 120030374 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN12 465789 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 120638134 120638217 120638176 Y NA ING3 NA NA NA NA ING3 49331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 123903491 123903761 123903674 Y NA NA GPR37,LOC154872 IMR90 Hi-C 24141950 GPR37 499920 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 126214480 126214602 126214539 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 855376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr7 128473236 128473666 128473355 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4805 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 129598516 129598781 129598654 Y NRF1,UBE2H,UBE2H UBE2H UBE2H,NRF1,AHCYL2,SMO,ZC3HC1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UBE2H 7727 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130005893 130006126 130006010 Y MEST NA NA NA NA NA CEP41 74148 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130571851 130572495 130572306 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 23574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130601178 130601963 130601463 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 5109 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130602337 130602820 130602733 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A FLJ43663 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6268 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 130645057 130645459 130645325 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 48988 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 131919616 131920007 131919874 Y PLXNA4 NA NA NA NA NA PODXL 678640 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 132607236 132607300 132607268 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 157548 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 133148039 133148314 133148177 Y NA NA NA NA NA NA EXOC4 212210 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 137387266 137387617 137387499 Y NA NA NA NA NA NA CREB3L2 297196 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 140577074 140577378 140577094 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 45186 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 149745351 149745623 149745500 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V0E2-AS1 169652 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 150075425 150075527 150075503 Y NA RARRES2,REPIN1,ZNF775 NA NA NA NA ZNF775 11546 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 151397116 151397356 151397195 Y SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2 NA NA NA NA NA PRKAG2 174854 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr7 155260612 155260850 155260792 Y CNPY1 NA NA NA NA NA INSIG1 173126 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 157071910 157072285 157071928 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53790 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 157924006 157924393 157924072 Y PTPRN2 NA NA NA NA NA PTPRN2 454087 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 158357376 158357683 158357548 Y NA PTPRN2 NA NA NA NA PTPRN2 20797 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr7 158595763 158596162 158596010 Y ESYT2 ESYT2 NA NA NA NA ESYT2 24782 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 479972 480137 480087 Y NA NA NA NA NA NA FBXO25 125544 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 671125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1332621 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 8247461 8247709 8247494 Y NA SGK223 NA NA NA NA SGK223 5453 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 9408701 9409304 9408905 Y NA TNKS NA NA NA NA TNKS 2120 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 11001237 11001609 11001584 Y NA NA NA NA NA NA XKR6 55266 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 11282611 11282836 11282801 Y FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 47388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 11314255 11315026 11314813 Y XKR6,MTMR9,FAM167A FAM167A NA NA NA NA FAM167A 15198 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 28107 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 11734631 11734824 11734746 Y CTSB CTSB CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 9674 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 13224231 13224684 13224410 Y NA NA NA NA NA NA DLC1 146483 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 16569846 16570195 16569986 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 441343 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 19028579 19029034 19028823 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 88339 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 19058200 19058838 19058472 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 110290 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 19522969 19523285 19523139 Y NA NA NA NA NA NA CSGALNACT1 90255 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 20055803 20056436 20056187 Y ATP6V1B2 ATP6V1B2 NA NA NA NA ATP6V1B2 2925 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 22439546 22439823 22439672 Y NA SORBS3,PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA PDLIM2 5754 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 22468597 22468907 22468752 Y TNFRSF10C,EGR3,PDLIM2,PDLIM2,BIN3 PDLIM2,C8orf58 NA NA NA NA C8orf58 13483 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 22636442 22636638 22636579 Y NA NA NA NA NA NA EGR3 87627 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 22710401 22710511 22710455 Y NA NA NA NA NA NA RHOBTB2 132419 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 23211536 23211676 23211614 Y TNFRSF10D,LOXL2 NA NA NA NA NA LOXL2 69165 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 23353842 23353942 23353892 Y TNFRSF10C,SLC25A37 ENTPD4,SLC25A37 NKX3-1,SLC25A37,NKX2-6 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A37 30376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 23618921 23619563 23619216 Y ENTPD4,ENTPD4 NA STC1,ENTPD4 IMR90 Hi-C 24141950 NKX3-1 80481 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 45584 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 25096912 25097126 25097024 Y DOCK5 NA NA NA NA NA DOCK5 56674 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 26429509 26429959 26429867 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 59718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr8 30358644 30358942 30358767 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 117727 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 32052985 32053085 32053036 Y NA NA NA NA NA NA NRG1 558083 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 34682233 34682421 34682327 Y NA NA NA NA NA NA RP1-84O15.1 503073 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 4.47081671771402 chr8 36136186 36136422 36136302 Y NA NA NA NA NA NA LSM12P1 754905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 550651 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 548718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 37679848 37680132 37679943 Y RAB11FIP1 GPR124,BRF2 NA NA NA NA BRF2 25290 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 37755287 37755548 37755453 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 302 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 37928414 37928535 37928451 Y ADRB3,WHSC1L1 EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 32225 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 38330883 38331237 38331060 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 6531 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 38867572 38867594 38867583 Y C8orf86 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 15184 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 38895649 38895937 38895811 Y TACC1,PLEKHA2,HTRA4 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 43261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 39976615 39976841 39976744 Y IDO1 C8orf4 C8orf4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 32148 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 40273499 40273632 40273622 Y NA NA ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 264510 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 41733569 41733873 41733722 Y NA NA NA NA NA NA KAT6A 173635 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 41908079 41908836 41908505 Y POLB,IKBKB,IKBKB,AP3M2,AGPAT6,MYST3 KAT6A NA NA NA NA KAT6A 571 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 42398083 42398473 42398470 Y NA SLC20A2 NA NA NA NA SLC20A2 3014 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 48242793 48242802 48242797 Y NA NA PRKDC IMR90 Hi-C 24141950 RPL10AP2 176052 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 48295911 48296182 48296008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 206989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 48424795 48425379 48425168 Y NA NA NA NA NA NA RP11-697N18.2 77792 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 49427546 49427722 49427633 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 132396 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 50968903 50969278 50969091 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 1136604 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 56791431 56791783 56791438 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 1059 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 59529081 59529390 59529262 Y SDCBP NSMAF NA NA NA NA NSMAF 41013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 59763369 59763610 59763548 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 38258 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 59768911 59769118 59769011 Y NA RNU4-50P NA NA NA NA RNU4-50P 43800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chr8 59949464 59949741 59949603 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 79858 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 61626654 61626933 61626781 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 61627150 61627529 61627187 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 37813 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 62606389 62606706 62606619 Y NA ASPH NA NA NA NA ASPH 18449 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 67419818 67420060 67419977 Y NA NA NA NA NA NA ADHFE1 79398 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 67445375 67445440 67445406 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 79042 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 67447907 67448273 67448065 Y MYBL1,C8orf45 NA NA NA NA NA MYBL1 76209 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 68418389 68418528 68418467 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 164477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 69833238 69833706 69833452 Y NA NA NA NA NA NA SULF1 543153 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 71084923 71085298 71085131 Y NCOA2 NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 70509 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 5100 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 75515244 75515546 75515314 Y NA RP11-730G20.2 NA NA NA NA RP11-730G20.2 765 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 77585675 77585844 77585753 Y ZFHX4 ZFHX4,ZFHX4-AS1 NA NA NA NA ZFHX4 5610 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA CPNE3 178901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 89352633 89352940 89352786 Y NA MMP16 NA NA NA NA MMP16 14379 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 90741352 90741628 90741481 Y OSGIN2,RIPK2 RP11-37B2.1,RIPK2 DECR1,RIPK2,NBN IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-37B2.1 26327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 90912887 90913271 90913166 Y NA OSGIN2 NA NA NA NA OSGIN2 800 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 92128196 92128480 92128215 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 47772 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 102110720 102110996 102110973 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA FLJ42969 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF706 105425 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 102161878 102162231 102162054 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 54190 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA KB-1732A1.1 KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1732A1.1 13972 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 105677496 105678173 105677683 Y TM7SF4,LRP12 NA LRP12 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LRP12 78244 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 110248064 110248088 110248074 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 96465 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 110324960 110325029 110324995 Y NA ENY2,NUDCD1,PKHD1L1 NA NA NA NA ENY2 19524 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 110602225 110602239 110602235 Y SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1 NA NA NA NA NA EBAG9 52285 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 113791450 113791716 113791698 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 595182 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 118885059 118885357 118885328 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 236735 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 119917519 119917835 119917587 Y NA TNFRSF11B NA NA NA NA TNFRSF11B 44604 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 121092888 121093091 121092967 Y DEPTOR COL14A1 DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13 IMR90 Hi-C 24141950 COL14A1 22869 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 124529265 124529734 124529486 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 21712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 125304968 125305098 125305033 Y NA NA NA NA NA NA TMEM65 77835 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 126268557 126268681 126268622 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0196 166475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 126286229 126286368 126286299 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154195 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 126526927 126527334 126527200 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRIB1 86364 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 127387635 127388005 127387836 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 180115 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 127447013 127447387 127447083 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 120733 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 127640965 127641019 127640992 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 72327 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 128822251 128823013 128822500 Y NA PVT1 NA NA NA NA PVT1 17472 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 128865187 128865467 128865327 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 60408 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 128879185 128879808 128879466 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 74406 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 128919831 128920544 128920233 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100313 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129047466 129047656 129047576 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 26609 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129061512 129061955 129061598 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 40655 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129180743 129180870 129180780 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 159886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129188825 129189407 129189075 Y NA NA MYC,PVT1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 167968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129195465 129196052 129195562 Y NA NA PVT1,MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 174608 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 129336748 129337038 129336807 Y NA NA PVT1,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-25P 315891 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 131218440 131218995 131218822 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 191065 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 131296023 131296343 131296248 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 157563 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 132828459 132829599 132829218 Y EFR3A NA ADCY8 IMR90 Hi-C 24141950 EFR3A 84736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 134230111 134230161 134230154 Y ST3GAL1 NA NA NA NA NA NDRG1 82104 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 134403538 134403742 134403629 Y ST3GAL1 ST13P6 TG,WISP1,PHF20L1,NDRG1,SLA IMR90 Hi-C 24141950 ST13P6 14507 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 140710203 140710577 140710390 Y KCNK9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 756101 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 141178627 141178635 141178631 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 288043 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 NA BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 51397 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 144106773 144106936 144106849 Y NA LY6E,RP11-273G15.2 NA NA NA NA RP11-273G15.2 8919 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr8 144107532 144108153 144107940 Y MAFA LY6E,RP11-273G15.2 NA NA NA NA RP11-273G15.2 9678 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 144609980 144610203 144610126 Y NA ZC3H3,GSDMD,NAPRT1 NA NA NA NA ZC3H3 11420 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 144948428 144948782 144948624 Y EPPK1 PUF60,NRBP2,EPPK1 NRBP2 IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 1850 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 144960453 144960673 144960604 Y C8orf73,TIGD5,FAM83H,PLEC,PLEC,EPPK1 NRBP2,EPPK1 PLEC IMR90 Hi-C 24141950 EPPK1 9821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 145022492 145023108 145022824 Y PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 25794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr8 145129247 145129547 145129402 Y GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOSC4 1982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 442373 442547 442460 Y NA KANK1 NA NA NA NA KANK1 25744 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 677967 678108 678032 Y DOCK8,C9orf66,KANK1 NA NA NA NA NA KANK1 209676 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 2623377 2623723 2623671 Y NA VLDLR NA NA NA NA VLDLR 3543 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 4086123 4086410 4086330 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 259982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 4099830 4100173 4099979 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 246219 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 4137159 4137519 4137339 Y NA NA NA NA NA NA GLIS3 208873 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 4293316 4293716 4293485 Y GLIS3 NA NA NA NA NA GLIS3 52676 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 4296901 4297617 4297146 Y GLIS3 GLIS3 NA NA NA NA GLIS3 48775 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 5269155 5269233 5269193 Y NA INSL4 C9orf46 IMR90 Hi-C 24141950 INSL4 39736 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 5509549 5510003 5509837 Y C9orf46,CD274,PDCD1LG2 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 1004 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 5536750 5536929 5536840 Y CD274,PDCD1LG2,KIAA1432 PDCD1LG2 NA NA NA NA PDCD1LG2 28205 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 5580709 5581016 5580868 Y NA KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 46009 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 5586544 5586797 5586563 Y C9orf46,CD274 KIAA1432 NA NA NA NA KIAA1432 40228 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 6485944 6485989 6485946 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 74793 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 6564380 6564534 6564488 Y NA NA NA NA NA NA RP11-106A1.2 72605 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.98054447847601 chr9 12818643 12818927 12818803 Y NA RP11-3L8.3 NA NA NA NA RP11-3L8.3 6299 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 13034069 13034552 13034397 Y NA NA NFIB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-3L8.3 221725 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 14347993 14348154 14348106 Y NFIB NFIB NA NA NA NA NFIB 48828 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 15306066 15306408 15306119 Y NA TTC39B NA NA NA NA TTC39B 708 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 16139034 16139449 16139363 Y NA NA C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 613353 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 NA NA NA NA NA CNTLN 263004 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 18437501 18437903 18437771 Y NA ADAMTSL1 FAM154A,ADAMTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTSL1 33989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 IFNB1 MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 IFNB1 20451 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313456 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 313041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 21832056 21832478 21832164 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 177676 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 33017262 33017602 33017524 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 APTX 5564 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 33770440 33770694 33770558 Y NA UBE2R2 NA NA NA NA UBE2R2 44871 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 35492185 35492605 35492350 Y RUSC2 RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 4061 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA RUSC2,FAM166B NA NA NA NA RUSC2 28421 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 35518041 35518590 35518314 Y CREB3,VCP,STOML2,RUSC2 RUSC2,FAM166B NA NA NA NA RUSC2 29917 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2,FAM166B NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 37.7535633940295 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 FAM166B,TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA NA NA NA NA CLTA 43149 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 37835930 37836292 37836154 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA EXOSC3 36496 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 38017265 38017614 38017440 Y SHB RP11-613M10.9,SHB NA NA NA NA RP11-613M10.9 49070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 38385905 38386302 38386104 Y ALDH1B1 ALDH1B1,IGFBPL1 NA NA NA NA ALDH1B1 4359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 72344996 72345326 72345161 Y NA PTAR1 NA NA NA NA PTAR1 27549 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 72561735 72561997 72561908 Y NA NA APBA1,MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,C9orf135,TRPM3,KLF9 IMR90 Hi-C 24141950 PTAR1 188860 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 73021440 73021667 73021582 Y NA KLF9 NA NA NA NA KLF9 5873 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.72568059809501 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 73569162 73569421 73569277 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 541622 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 81486579 81486867 81486725 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 517352 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 81586798 81586848 81586823 Y NA NA TLE4 IMR90 Hi-C 24141950 CHCHD2P9 417371 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 365973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 81641483 81641834 81641545 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 362385 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 86051693 86051979 86051837 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 268530 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 86238855 86239256 86239056 Y UBQLN1,GKAP1 NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 81253 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 88184194 88184649 88184621 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 170295 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 88358353 88358730 88358394 Y AGTPBP1 AGTPBP1 NA NA NA NA AGTPBP1 3409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 89952631 89952908 89952845 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 157235 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 90182587 90182864 90182726 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 44370 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 92042592 92043030 92042739 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 68015 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 93955243 93955725 93955362 Y SYK,SYK,NFIL3 NA NA NA NA NA AUH 166470 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA NA NA NA NA NA AUH 165463 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 94181531 94181930 94181720 Y NFIL3 NFIL3 NA NA NA NA NFIL3 2214 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 10486 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA MIRLET7D NA NA NA NA MIRLET7D 9706 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 97630074 97630491 97630387 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 143091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 97633078 97633398 97633277 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 146095 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 97685167 97685467 97685319 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 198184 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 97688379 97688667 97688436 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 201396 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 97770536 97771110 97770577 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 283553 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 98054647 98055067 98054952 Y NA FANCC NA NA NA NA FANCC 22924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 98583076 98583344 98583210 Y NA NA NA NA NA NA LINC00476 52915 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 99182775 99182932 99182834 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 4164 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 100565577 100566264 100565821 Y CORO2A,FOXE1 NA FOXE1,C9orf156 IMR90 Hi-C 24141950 XPA 107938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 100696898 100697242 100697085 Y NA C9orf156,ANP32B NA NA NA NA C9orf156 14046 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 100985595 100985973 100985751 Y TBC1D2 CORO2A,TBC1D2 NA NA NA NA TBC1D2 29942 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 102007294 102007527 102007424 Y NA ALG2,SEC61B NA NA NA NA SEC61B 24948 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1,NR4A3 NA NA NA NA NR4A3 3696 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 103173830 103174136 103174107 Y NA TMEFF1 C9orf30-TMEFF1,TEX10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEFF1 28424 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 103192373 103192745 103192675 Y C9orf30 TMEFF1 C9orf30-TMEFF1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEFF1 9815 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 103253539 103253903 103253550 Y NA NA MURC IMR90 Hi-C 24141950 TMEFF1 50979 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 104137974 104138033 104138006 Y NA MRPL50,ZNF189 NA NA NA NA MRPL50 20863 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 104248590 104248780 104248669 Y C9orf125 RNF20 NA NA NA NA RNF20 45353 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 107825868 107826462 107826154 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 137350 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 107833426 107833839 107833430 Y NA NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 144908 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 108058871 108059613 108059363 Y ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L NA NA NA NA NA SLC44A1 53968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 109655422 109655715 109655552 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 32044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 110310627 110311050 110310826 Y KLF4 RP11-438P9.1 KLF4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-438P9.1 15956 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 111773643 111773659 111773652 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 150 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 111872786 111872983 111872905 Y NA NA NA NA NA NA CTNNAL1 98977 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 112580267 112580505 112580395 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 C9orf152 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP2 39498 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114505631 114505796 114505739 Y NA NA NA NA NA NA GNG10 84016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.73216577193634 chr9 114678571 114678728 114678577 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 21525 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 114720285 114720825 114720474 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 63239 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.98702965231734 chr9 114721832 114722310 114722097 Y UGCG NA C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UGCG 64786 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114729315 114729452 114729372 Y NA NA UGCG,MIR3134,SUSD1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 UGCG 72269 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114754924 114755117 114754987 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 97878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114783014 114783329 114783192 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 125968 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114784464 114784581 114784539 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 127418 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114812842 114813221 114813099 Y NA NA NA NA NA NA SUSD1 122467 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 114823556 114823978 114823803 Y GNG10,SUSD1 NA NA NA NA NA SUSD1 111710 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 114835497 114835862 114835756 Y GNG10 NA NA NA NA NA SUSD1 99826 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 114836654 114837091 114837061 Y PTGR1,PTGR1,UGCG NA NA NA NA NA SUSD1 98597 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 115982258 115982474 115982402 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 FKBP15,SLC31A1 NA NA NA NA SLC31A1 450 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 116385277 116385518 116385372 Y RGS3 RP11-18B16.2 NA NA NA NA RP11-18B16.2 25718 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 116398496 116398888 116398553 Y C9orf43,RGS3 RP11-18B16.2 C9orf43,RGS3,BSPRY,ALAD IMR90 Hi-C 24141950 RP11-18B16.2 12348 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 117080236 117080340 117080297 Y TNFSF15,ATP6V1G1,ORM1 NA NA NA NA NA AKNA 74345 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 117152820 117152929 117152875 Y NA AKNA NA NA NA NA AKNA 1756 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 118353952 118354125 118354022 Y TNC NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 475416 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 118378080 118378500 118378342 Y NA NA PAPPA,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 499544 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 118430899 118431573 118430988 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 482510 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 118434933 118435213 118435118 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478870 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.49027223923801 chr9 118435271 118435690 118435488 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 478393 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 118496415 118496674 118496563 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA 417409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 118914445 118914679 118914506 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 362 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 119055041 119055304 119055148 Y PAPPA NA NA NA NA NA PAPPA 140958 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 123878647 123878673 123878659 Y NA CNTRL NA NA NA NA CNTRL 43506 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 125663245 125663345 125663303 Y NA RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1 NA NA NA NA RC3H2 2275 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126124461 126124723 126124613 Y NA CRB2 NA NA NA NA CRB2 8012 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126597388 126597650 126597587 Y DENND1A NA NA NA NA NA DENND1A 92781 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126644407 126644614 126644564 Y LHX2 DENND1A NA NA NA NA DENND1A 45817 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 126690123 126690365 126690192 Y DENND1A DENND1A NA NA NA NA DENND1A 66 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 127161847 127162149 127162003 Y NA PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 13574 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 127267013 127267383 127267321 Y NR5A1 NA NA NA NA NA PSMB7 91290 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 127621077 127621225 127621167 Y NA RPL35,ARPC5L,RNU4-82P NA NA NA NA RPL35 1035 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 128592115 128592428 128592308 Y PBX3 NA NA NA NA NA PBX3 84491 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 129485609 129485808 129485757 Y FAM125B,ZBTB34 NA NA NA NA NA ZBTB43 79477 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 130179463 130179679 130179569 Y NA SLC2A8,ZNF79,SNORA65,RPL12,LRSAM1 NA NA NA NA ZNF79 4982 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 130283548 130283912 130283802 Y SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG NA NA NA NA NA FAM129B 55356 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 130329548 130329691 130329605 Y PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B FAM129B,STXBP1 NA NA NA NA FAM129B 9577 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 131930457 131930532 131930510 Y PRRX2 IER5L NA NA NA NA IER5L 8008 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 131936354 131936600 131936398 Y METTL11A,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4 IER5L NA NA NA NA IER5L 1940 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr9 132114054 132114292 132114085 Y NA RP11-65J3.1 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50 MCF7,HELA,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 RP11-65J3.1 21475 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.48378706539668 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 132312044 132312247 132312152 Y NA NA DOLPP1,LOC100506190,FAM73B,IER5L,CRAT,PPP2R4,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 68314 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-483H20.4 70247 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-483H20.4 69017 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 41091 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 40833 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 30379 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA RP11-483H20.4,ASB6 NA NA NA NA RP11-483H20.4 28069 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132535885 132536300 132536143 Y FNBP1,USP20,USP20,TOR1B PTGES,TOR1B,TOR1A PRRX2,TOR1A,TOR1B,PPP2R4,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTGES 22559 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132648080 132648314 132648193 Y ASB6,TOR1B,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 51938 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132847110 132847326 132847217 Y USP20,USP20 FNBP1,GPR107 NA NA NA NA GPR107 33405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 132949592 132949704 132949653 Y C9orf78 NCS1 NA NA NA NA NCS1 16735 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 133321021 133321306 133321114 Y ASS1 ASS1 NA NA NA NA ASS1 2705 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A NA NA NA NA NA NUP214 132654 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 135279793 135280144 135280078 Y TTF1 TTF1 NA NA NA NA TTF1 65 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 135442917 135443010 135442964 Y NA NA NA NA NA NA GTF3C4 100412 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 135999727 136000118 136000091 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 37183 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136282042 136282102 136282072 Y NA SURF4,REXO4 NA NA NA NA REXO4 878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 NA NA NA NA NA SLC2A6 234260 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136738611 136738757 136738701 Y NA NA NA NA NA NA VAV2 116969 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136739075 136739598 136739373 Y VAV2 NA NA NA NA NA VAV2 116128 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chr9 136801856 136801932 136801893 Y SARDH,SARDH NA NA NA NA NA VAV2 53794 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chr9 136821729 136822115 136821856 Y NA VAV2 NA NA NA NA VAV2 33611 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136823955 136824162 136824035 Y ADAMTSL2,SARDH,VAV2 VAV2 NA NA NA NA VAV2 31564 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 137283207 137283446 137283337 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 76263 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 137288067 137288421 137288149 Y BRD3,RXRA NA NA NA NA NA RXRA 81123 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 137535299 137535511 137535433 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 3679 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 137536549 137536868 137536739 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 4929 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chr9 139081356 139081856 139081614 Y CAMSAP1,LHX3,LHX3,QSOX2 NA NA NA NA NA QSOX2 53831 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 139428258 139428617 139428423 Y NACC2,CARD9,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 9697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chr9 139433298 139433437 139433354 Y ABCA2,CARD9,SEC16A,NOTCH1 NOTCH1,RP11-611D20.2 NA NA NA NA NOTCH1 4877 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 139482600 139482784 139482692 Y NA NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163,EGFL7,SNORA43,SNHG7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 43936 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 MIR4479,FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 15.1511010989197 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 2.23540835885701 chr9 140189199 140189592 140189229 Y NA NRARP NA NA NA NA NRARP 5111 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 2719389 2719617 2719532 Y NA NA NA NA NA NA RP11-459A10.1 3619125 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 12388684 12389044 12388773 Y FRMPD4 NA NA NA NA NA FRMPD4 234099 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chrX 12390298 12390694 12390463 Y NA NA NA NA NA NA FRMPD4 235713 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chrX 12996273 12996492 12996427 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 5046 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 13097151 13097463 13097240 Y TLR7,TLR8,TMSB4X NA NA NA NA NA TMSB4X 105924 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 13416625 13416882 13416754 Y NA GPX1P1 FAM9C,TMSB4X,LOC100133123 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GPX1P1 21166 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 15383040 15383106 15383043 Y NA PIGA NA NA NA NA PIGA 31364 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 15695028 15695432 15695331 Y ZRSR2,AP1S2,PIGA CA5BP1,CA5B NA NA NA NA CA5BP1 3973 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 17395556 17395647 17395622 Y NHS NHS NA NA NA NA NHS 4013 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 112388 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 20281516 20281702 20281609 Y SH3KBP1,SH3KBP1,RPS6KA3 RPS6KA3 NA NA NA NA RPS6KA3 1821 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 22708356 22708573 22708502 Y NA NA NA NA NA NA PTCHD1 641560 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 27121185 27121461 27121323 Y NA NA NA NA NA NA RP11-268G12.1 293653 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 29496854 29497166 29496936 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 828549 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 647376 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 29681325 29681360 29681343 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 644355 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 37613614 37613928 37613771 Y NA NA NA NA NA NA XK 70602 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 39953769 39954197 39953849 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 80385 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 40030956 40031200 40030978 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 3382 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 40034377 40034649 40034428 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.993514826158671 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 41190836 41191010 41190932 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 185 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 41192009 41192079 41192030 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 1358 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 41242516 41242827 41242698 Y DDX3X NA DDX3X,USP9X MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDX3X 51865 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 41480372 41480697 41480463 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 289721 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chrX 44774748 44775132 44774822 Y NA KDM6A NA NA NA NA KDM6A 43991 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 45666059 45666529 45666404 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42391 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 46338861 46339028 46338937 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 40712 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 54207583 54207867 54207725 Y NA NA NA NA NA NA FAM120C 0 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 55355292 55355323 55355308 Y NA NA NA NA NA NA MAGEH1 121215 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA KLF8 NA NA NA NA KLF8 12989 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 57927530 57927661 57927604 Y NA NA NA NA NA NA ZXDB 311261 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 64683455 64683784 64683516 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 68871 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA DLG3 NA NA NA NA DLG3 8763 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.73865094577767 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 DLG3 NA NA NA NA DLG3 7398 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NA NA NA NA NA MED12 65447 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 73340869 73341139 73340910 Y RLIM NA NA NA NA NA USMG5P1 50586 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 73756210 73756567 73756298 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75885 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 73756739 73756964 73756863 Y NA NA NA NA NA NA RLIM 75488 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA LPAR4 92243 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 85278748 85279124 85278988 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 21442 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 1.24189353269834 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 95940743 95941133 95941025 Y DIAPH2 DIAPH2 NA NA NA NA DIAPH2 3081 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 102145649 102146020 102145835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522L3.5 94325 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 103628998 103629151 103629075 Y NA NA NA NA NA NA FAM199X 219697 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 105065481 105065866 105065484 Y NRK NA NA NA NA NA TBC1D8B 978044 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 109330355 109330526 109330451 Y NA NA NA NA NA NA TMEM164 86496 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 117487110 117487426 117487273 Y DOCK11,WDR44 WDR44 NA NA NA NA WDR44 9074 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 119385485 119385791 119385733 Y NA NKAPP1,ZBTB33 NA NA NA NA ZBTB33 2878 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 5.71271025041236 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 129307329 129307713 129307433 Y NA AIFM1,RAB33A NA NA NA NA RAB33A 3706 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.745136119619003 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 134718222 134718415 134718313 Y NA NA NA NA NA NA DDX26B 65638 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 153308447 153308946 153308655 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1 IRAK1 IRAK1,MIR718 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRAK1 25016 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 153359354 153359823 153359622 Y NA MECP2 NA NA NA NA MECP2 1389 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrX 153600469 153600779 153600667 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 227 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 DKC1 NA NA NA NA DKC1 32521 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrY 7637940 7638259 7638201 Y NA NA NA NA NA NA PRKY 497927 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668 chrY 14775457 14775545 14775476 Y NA TTTY15 NA NA NA NA TTTY15 3192 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 3.97405930463468 chrY 15547664 15548123 15547956 Y TMSB4Y UTY NA NA NA NA UTY 42430 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.496757413079335 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA EIF1AY 5819572 CAGE Mero-25 hg19 FANTOM5 0.248378706539668