chr1 856539 856757 856714 Y NA SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 1503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 858256 858648 858448 Y SAMD11 NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 945769 946034 945890 Y CCNL2,ATAD3B PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA ISG15 769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 1014834 1015095 1014859 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 RNF223 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 RP11-465B22.3 21720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 1136075 1136463 1136398 Y HES4,ISG15 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28948 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 1136667 1137146 1136877 Y HES4,MIB2 SDF4,B3GALT6 NA NA NA NA SDF4 28265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 1283060 1283625 1283139 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 1286847 1286913 1286880 Y NA PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2 NA NA NA NA DVL1 4117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 1295535 1296332 1296026 Y MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8 CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20 NA NA NA NA MXRA8 378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20,ANKRD65,TMEM88B,VWA1 NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 1706859 1707124 1707007 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 2772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 1744250 1744609 1744432 Y NA NADK NA NA NA NA NADK 34354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 1793829 1793862 1793845 Y CDK11B,CDK11A GNB1 NA NA NA NA GNB1 26633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 1803114 1803303 1803274 Y NA GNB1,TMEM52 NADK IMR90 Hi-C 24141950 GNB1 17192 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr1 1978731 1978937 1978887 Y NADK,PRKCZ C1orf222 NA NA NA NA C1orf222 45455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 2253622 2253773 2253699 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 67373 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 2477415 2477971 2477660 Y NA PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 21376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 2478276 2478817 2478474 Y SKI,PANK4,TNFRSF14 PANK4,FAM213B NA NA NA NA PANK4 22237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 2574079 2574144 2574101 Y NA NA NA NA NA NA FAM213B 58149 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 3309990 3310261 3310127 Y PRDM16 NA NA NA NA NA ARHGEF16 58729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 3634737 3634863 3634787 Y WRAP73,TP73 TP73-AS1 NA NA NA NA TP73-AS1 27037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 3817648 3818071 3817969 Y LRRC47 CEP104,DFFB,C1orf174 NA NA NA NA C1orf174 2791 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 5957166 5957512 5957348 Y KCNAB2,KCNAB2,CHD5 NA NA NA NA NA NPHP4 93021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 6321567 6321961 6321896 Y THAP3,THAP3,GPR153 ICMT,HES3,GPR153 NA NA NA NA GPR153 2532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 6943772 6944262 6943813 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 100388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 7177733 7177848 7177794 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 334349 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 7289758 7290075 7289881 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 446374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 7538871 7539273 7539100 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 290056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 7728673 7728970 7728748 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 100359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 7729547 7729971 7729640 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 99358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.37135816754079 chr1 7843556 7843653 7843585 Y PER3 VAMP3,PER3 NA NA NA NA PER3 1176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8076289 8076986 8076888 Y NA ERRFI1 NA NA NA NA ERRFI1 7382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8262223 8262541 8262360 Y ERRFI1 RNU1-7P ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-7P 2116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8469706 8470061 8470001 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 93820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 8571636 8571856 8571737 Y SLC45A1,RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 195750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8712702 8713010 8712859 Y NA NA NA NA NA NA RERE 162692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8762126 8762475 8762428 Y NA NA NA NA NA NA RERE 113227 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 8810273 8810466 8810370 Y NA NA NA NA NA NA RERE 65236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 8849339 8849636 8849462 Y NA RERE NA NA NA NA RERE 26066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 8933581 8933925 8933847 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1-IT1 2141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 8971325 8971721 8971517 Y NA ENO1-IT1,ENO1 ENO1-AS1,ENO1,CA6,SLC2A7,SLC2A5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ENO1 34017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9030064 9030418 9030295 Y NA NA SLC2A7 IMR90 Hi-C 24141950 ENO1 92756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9225492 9225752 9225745 Y NA GPR157 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 GPR157 38263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9355493 9355709 9355601 Y NA SPSB1 NA NA NA NA SPSB1 4554 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr1 9504221 9504505 9504342 Y SPSB1 NA SPSB1,H6PD,MIR34A,SLC25A33,TMEM201,PIK3CD IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 93036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9689223 9689588 9689280 Y PIK3CD TMEM201,PIK3CD NA NA NA NA PIK3CD 20202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 9889535 9889880 9889709 Y KIF1B CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 6951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 9912448 9912800 9912669 Y KIF1B,CLSTN1 CLSTN1 NA NA NA NA CLSTN1 29864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 11040299 11040592 11040356 Y NA TARDBP NA NA NA NA TARDBP 29822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 11761755 11762049 11761783 Y PTCHD2,FBXO44,FBXO44,MAD2L2,C1orf187 FBXO44,FBXO2,FBXO6,MAD2L2,AGTRAP NA NA NA NA MAD2L2 12048 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 12046023 12046196 12046108 Y FBXO6,AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,MFN2 MFN2,MIIP NA NA NA NA MFN2 7785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 12127865 12128182 12128023 Y MIIP,TNFRSF8 TNFRSF8 NA NA NA NA TNFRSF8 6431 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 12579035 12579403 12579221 Y NA NA NA NA NA NA DHRS3 96334 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA DHRS3 NA NA NA NA DHRS3 1008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 12675687 12675874 12675779 Y VPS13D NA NA NA NA NA DHRS3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 13917058 13917313 13917229 Y PRDM2,PDPN PDPN NA NA NA NA PDPN 9098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 13949833 13950153 13949906 Y PRDM2,PDPN PDPN NA NA NA NA PDPN 41873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 14881549 14881921 14881735 Y NA KAZN KAZN IMR90 Hi-C 24141950 KAZN 41279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15041115 15041310 15041140 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 117915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15059594 15059681 15059648 Y KAZN NA NA NA NA NA KAZN 136394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15111272 15111486 15111395 Y NA NA NA NA NA NA KAZN 188072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15144272 15144506 15144389 Y KAZN NA NA NA NA NA KAZN 221072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15499033 15499473 15499185 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 22005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15519488 15519688 15519655 Y NA TMEM51 NA NA NA NA TMEM51 42460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15616896 15617243 15617144 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9,TMEM51,TMEM51 FHAD1 NA NA NA NA FHAD1 45128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15649550 15649749 15649647 Y PLEKHM2,EFHD2,CASP9 NA EFHD2 IMR90 Hi-C 24141950 FHAD1 77782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 15743639 15744318 15744205 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 9248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 15762061 15762268 15762214 Y NA EFHD2 NA NA NA NA EFHD2 27670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16030221 16030623 16030258 Y NA PLEKHM2,TMEM82 NA NA NA NA PLEKHM2 21394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 TMEM82,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 16156384 16156536 16156435 Y EFHD2,CASP9,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 3660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16158409 16158760 16158690 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 5685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.31780874018429 chr1 16227810 16227873 16227842 Y C1orf64,SPEN NA NA NA NA NA RP11-169K16.9 55168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16291784 16292062 16291897 Y CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 8565 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 16292565 16293101 16292653 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 SPEN IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB17 7526 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 4493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 16339773 16339933 16339866 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,ZBTB17 ZBTB17,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 4156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 16553276 16553594 16553536 Y NA RSG1 NA NA NA NA RSG1 8063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 16616866 16617180 16617023 Y NA NA NA NA NA NA RSG1 55209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16669074 16669169 16669123 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 7780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 16770590 16770683 16770636 Y NA NECAP2 NA NA NA NA NECAP2 5423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.53026253763293 chr1 17019394 17019738 17019426 Y SPATA21,NBPF1 EIF1AXP1,CROCC NA NA NA NA EIF1AXP1 8844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 17027024 17027386 17027173 Y NA EIF1AXP1,CROCC NA NA NA NA EIF1AXP1 16474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.26600322480514 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr1 17253207 17253541 17253218 Y NA RP11-108M9.4 NA NA NA NA RP11-108M9.4 39063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 17353741 17353845 17353793 Y NA MFAP2,ATP13A2,SDHB ATP13A2 K562 ChIA-PET 22265404 ATP13A2 17318 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 17425016 17425355 17425116 Y PADI4,PADI2 SDHB,PADI2 NA NA NA NA PADI2 18593 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 17518941 17519138 17519054 Y ATP13A2,PADI3 NA NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3 IMR90 Hi-C 24141950 PADI3 54455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 17557386 17557571 17557478 Y NA PADI3 NA NA NA NA PADI3 16022 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 17746173 17746585 17746297 Y NA RCC2 NA NA NA NA RCC2 17635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 17796675 17796982 17796736 Y NA RCC2 RCC2,ARHGEF10L IMR90 Hi-C 24141950 RCC2 32455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 17867253 17867735 17867370 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 2923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 18186786 18187057 18186877 Y NA NA ARHGEF10L,ACTL8 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL8 106978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 18884159 18884499 18884233 Y NA RP1-8B22.1 NA NA NA NA RP1-8B22.1 46547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 19277155 19277462 19277361 Y UBR4,IFFO2 ALDH4A1,IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 3718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 19701557 19701789 19701674 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 64737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 19762527 19762798 19762680 Y NBL1,NBL1,NBL1,NBL1 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 47268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 19778785 19779174 19779108 Y NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 30892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 19794978 19795283 19795050 Y PLA2G2E,UBR4 CAPZB NA NA NA NA CAPZB 14783 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 20692088 20692242 20692160 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2N1 118471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 20693127 20693202 20693146 Y KIF17,PINK1 NA NA NA NA NA CAMK2N1 117511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 21149682 21149798 21149749 Y CAMK2N1,EIF4G3 HP1BP3 NA NA NA NA HP1BP3 37866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 21194399 21194490 21194445 Y NA NA NA NA NA NA HP1BP3 82583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 21611199 21611583 21611510 Y EIF4G3,ECE1,ALPL,EIF4G3,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 58414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 21670382 21670956 21670695 Y NA ECE1 NA NA NA NA ECE1 385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 22066009 22066225 22066117 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 41874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 22089036 22089375 22089206 Y NA USP48 RAP1GAP IMR90 Hi-C 24141950 USP48 18724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 22236410 22236692 22236686 Y NA RP11-26H16.1,HSPG2 NA NA NA NA RP11-26H16.1 3819 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 22366226 22366841 22366516 Y USP48,ZBTB40 LINC00339,CDC42 CDC42 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42 10279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 22829217 22829453 22829426 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB40 52873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 23357547 23357765 23357628 Y NA KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 13606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 23387479 23387794 23387637 Y ZNF436 KDM1A LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 KDM1A 43538 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 23542417 23542518 23542468 Y HTR1D LUZP1 KDM1A,LUZP1 IMR90 Hi-C 24141950 LUZP1 40116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 23669506 23669991 23669712 Y NA HNRNPR,C1orf213,ZNF436 NA NA NA NA HNRNPR 677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 23721090 23721462 23721458 Y ZNF436 C1orf213,ZNF436,TCEA3 HNRNPR,ZNF436 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF436 27155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 23748973 23749126 23749052 Y NA TCEA3 NA NA NA NA TCEA3 107 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr1 24349340 24349488 24349411 Y NA RP11-4M23.7 LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-4M23.7 16331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 24680333 24680598 24680466 Y NA GRHL3 NA NA NA NA GRHL3 36521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 GRHL3,NIPAL3 NA NA NA NA GRHL3 48021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 24831610 24831804 24831717 Y NA RCAN3 NA NA NA NA RCAN3 4223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 25051079 25051208 25051162 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 18640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 25051605 25051987 25051744 Y NA CLIC4 RUNX3,CLIC4,SRRM1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIC4 17861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 25237083 25237520 25237460 Y NA NA NA NA NA NA RUNX3 52092 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 25566195 25566411 25566257 Y TMEM57 SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 25566618 25566670 25566639 Y NA SYF2 SYF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SYF2 9625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 25942744 25943208 25942998 Y EXTL1,MAN1C1 NA NA NA NA NA LDLRAP1 74673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 26249033 26249281 26249192 Y EXTL1,STMN1,STMN1,STMN1 MIR3917,STMN1 STMN1,PAFAH2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STMN1 17551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 26337765 26338024 26337895 Y PAQR7,ZNF683 PAFAH2,EXTL1 PAQR7,STMN1,EXTL1 IMR90 Hi-C 24141950 EXTL1 6351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 26490998 26491259 26491133 Y NA ZNF593,CNKSR1 NA NA NA NA ZNF593 3103 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 26735858 26736255 26735942 Y NA LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA LIN28A 589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 26738740 26738942 26738863 Y NA LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA LIN28A 3471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 26739065 26739644 26739183 Y NA LIN28A,DHDDS,RP3-476K8.4 NA NA NA NA LIN28A 3796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 27021406 27021810 27021509 Y NA ARID1A NA NA NA NA ARID1A 882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 27024638 27025138 27024825 Y SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV ARID1A NA NA NA NA ARID1A 4114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA SFN 3753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 27336678 27336931 27336804 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 27337570 27337809 27337727 Y NA RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B NA NA NA NA FAM46B 243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 27353661 27353962 27353706 Y TMEM222,MAP3K6,TRNP1 RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46B 16334 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 27561705 27561803 27561716 Y NA WDTC1 NA NA NA NA WDTC1 2698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 27625914 27626081 27626007 Y TRNP1,MAP3K6,TMEM222 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1 NA NA NA NA TMEM222 20570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 27863218 27863465 27863342 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 48549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 27907931 27908052 27907995 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 20890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 28152962 28153213 28153036 Y NA PPP1R8 NA NA NA NA PPP1R8 2076 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 28216942 28217199 28217071 Y NA RPA2,SMPDL3B NA NA NA NA RPA2 22058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 28431716 28431884 28431798 Y FGR,FGR,FGR,STX12,C1orf38,SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3 EYA3 PTAFR,EYA3,FAM76A,LOC653566,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EYA3 18509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr1 28576012 28576248 28576109 Y STX12,C1orf38,EYA3,PTAFR,PTAFR,GMEB1,SESN2,MED18 DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 7790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29370205 29370321 29370263 Y NA NA NA NA NA NA RP4-604A21.1 63085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B TMEM200B NA NA NA NA TMEM200B 2610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 29503706 29504118 29503928 Y NA SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29504261 29504387 29504317 Y YTHDF2,YTHDF2,YTHDF2,EPB41,SRSF4 SRSF4 NA NA NA NA SRSF4 2112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29565515 29565732 29565598 Y SRSF4,PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 4487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 29598339 29598546 29598399 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 37311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 31360609 31360977 31360897 Y NA SDC3 NA NA NA NA SDC3 18631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 31517703 31518005 31517854 Y NA PUM1 NA NA NA NA PUM1 18833 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 31537719 31538012 31537814 Y LAPTM5,PUM1 PUM1 NA NA NA NA PUM1 881 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 82443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.63736139234592 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NKAIN1 81944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 31643824 31643962 31643871 Y NA NA NA NA NA NA NKAIN1 66439 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 31737918 31737951 31737935 Y NA NKAIN1,SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA NKAIN1 27517 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 31772172 31772177 31772175 Y NA SNRNP40,ZCCHC17 NA NA NA NA ZCCHC17 4330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 32180603 32180986 32180867 Y PEF1,SPOCD1,COL16A1 BAI2 PEF1,COL16A1 IMR90 Hi-C 24141950 BAI2 47508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 32250836 32250955 32250895 Y IQCC BAI2 NA NA NA NA BAI2 22342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 32966228 32966602 32966575 Y FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A ZBTB8B,ZBTB8A NA NA NA NA ZBTB8A 36426 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33089029 33089046 33089038 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 25458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33182280 33182513 33182368 Y KIAA1522 SYNC,KIAA1522 SYNC,S100PBP,BSDC1,ZBTB8B,RBBP4,KIAA1522,YARS IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYNC 15083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33232248 33232565 33232367 Y NA KIAA1522,S100PBP,YARS NA NA NA NA KIAA1522 26762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 33457914 33458607 33458311 Y RNF19B RNF19B NA NA NA NA RNF19B 29628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33500817 33500865 33500842 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA AK2 43732 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33645848 33646140 33645995 Y HPCA,PHC2,TRIM62 TRIM62 NA NA NA NA TRIM62 188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 33829513 33829825 33829684 Y FNDC5,ZSCAN20 NA NA NA NA NA PHC2 64828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 34130973 34131088 34131031 Y ZNF362 NA NA NA NA NA ZSCAN20 194727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 35892196 35892421 35892350 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 128653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36173458 36173573 36173482 Y TEKT2,EIF2C1 C1orf216 NA NA NA NA C1orf216 9500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36183411 36183689 36183588 Y C1orf216 C1orf216,CLSPN NA NA NA NA C1orf216 338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 36351655 36352020 36351717 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 118087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36431149 36431388 36431272 Y STK40,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3 NA NA NA NA NA TEKT2 116288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36555347 36555633 36555606 Y STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2 TEKT2,ADPRHL2 NA NA NA NA ADPRHL2 2871 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 36592352 36592554 36592389 Y NA TEKT2,ADPRHL2,TRAPPC3,MAP7D1 NA NA NA NA TRAPPC3 20544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 36721428 36721771 36721600 Y NA THRAP3,SH3D21 NA NA NA NA THRAP3 33411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36815580 36815775 36815719 Y NA SH3D21,STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 33722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36853020 36853462 36853143 Y NA STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 3523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 37169397 37169618 37169483 Y OSCP1,GRIK3 NA NA NA NA NA MRPS15 241359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 37195884 37196007 37195923 Y OSCP1 NA GRIK3 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS15 267846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 38311465 38311868 38311723 Y ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1 C1orf122,YRDC,MTF1 NA NA NA NA MTF1 11424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 38391752 38391859 38391812 Y NA INPP5B NA NA NA NA INPP5B 18870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 38573869 38574225 38574173 Y EPHA10,MANEAL,POU3F1 NA NA NA NA NA POU3F1 63419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 38739267 38739533 38739400 Y NA NA POU3F1 IMR90 Hi-C 24141950 POU3F1 228817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 39193613 39193736 39193672 Y NA NA NA NA NA NA RRAGC 129759 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 39327096 39327575 39327204 Y NA RRAGC,RP5-864K19.4,MYCBP NA NA NA NA RP5-864K19.4 3424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39508832 39509204 39509012 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 18842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39598673 39599090 39598722 Y MACF1 NA NA NA NA NA MACF1 53685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39651405 39651741 39651429 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 106417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39657786 39658129 39657912 Y NA NA NA NA NA NA MACF1 112798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39791626 39791706 39791638 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0754 82445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 40005546 40005959 40005647 Y NA PABPC4 NA NA NA NA PABPC4 34503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 40561233 40561752 40561648 Y SMAP2,RLF NA NA NA NA NA PPT1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 40841336 40841595 40841379 Y RLF,SMAP2,SMAP2,SMAP2,SMAP2 SMAP2 ZNF643 IMR90 Hi-C 24141950 SMAP2 32814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 41633074 41633562 41633301 Y SCMH1,SCMH1,SCMH1 NA NA NA NA NA SCMH1 72264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 41961925 41962146 41962029 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 136331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 41981831 41982007 41981926 Y SLFNL1,SLFNL1 NA NA NA NA NA FOXO6 156237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 43388597 43388971 43388887 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 33559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 43405621 43405821 43405630 Y CCDC30,CCDC23,ERMAP,SZT2,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 16709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 43406108 43407009 43406836 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 15521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 43427522 43427762 43427666 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 4802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 43428386 43429108 43428580 Y CLDN19,CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 5666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 43429290 43429917 43429491 Y CCDC23,ERMAP,SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 6570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 43471435 43471828 43471543 Y SLC2A1 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 48715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 43473183 43473398 43473279 Y C1orf210,C1orf210,SLC2A1 NA NA NA NA NA SLC2A1-AS1 50463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 43524188 43524462 43524346 Y NA NA SLC2A1,FLJ32224,LOC100129924,C1orf50,LEPRE1,ERMAP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A1-AS1 101468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 43839359 43839523 43839441 Y NA RP1-92O14.3,CDC20,ELOVL1,MED8,SZT2 NA NA NA NA ELOVL1 7663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44015731 44016125 44016031 Y CCDC24,WDR65,C1orf210,C1orf210,PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 26873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44150815 44151139 44150977 Y ST3GAL3,SLC6A9,IPO13 KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 18356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44162019 44162313 44162287 Y NA KDM4A,ST3GAL3 NA NA NA NA ST3GAL3 7182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44354357 44354471 44354414 Y SZT2,KDM4A,ST3GAL3,IPO13 NA NA NA NA NA IPO13 56140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44689979 44690114 44690071 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 12852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 44703858 44704161 44704010 Y NA DMAP1 NA NA NA NA DMAP1 26731 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 45057924 45058133 45058042 Y C1orf228,RNF220 NA NA NA NA NA TMEM53 80094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 45746932 45746947 45746939 Y NA HPDL ZSWIM5,UROD,HECTD3 IMR90 Hi-C 24141950 HPDL 43598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 45787067 45787234 45787139 Y NA HPDL,TOE1,MUTYH NA NA NA NA HPDL 3311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 46102450 46102810 46102714 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 12688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 46689426 46689696 46689549 Y FAAH,C1orf190 PIK3R3,POMGNT1,RAD54L NA NA NA NA POMGNT1 5449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 47055088 47055141 47055115 Y NA MKNK1 NA NA NA NA MKNK1 25374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 47102400 47102701 47102616 Y NA MKNK1,ATPAF1 NA NA NA NA MKNK1 21885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 47718105 47718425 47718265 Y NA TAL1 TAL1 IMR90 Hi-C 24141950 TAL1 22213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 47800262 47800514 47800436 Y NA STIL,CMPK1 NA NA NA NA CMPK1 2793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 49061851 49062028 49061979 Y NA NA NA NA NA NA SPATA6 126006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 49250651 49250822 49250750 Y NA BEND5 NA NA NA NA BEND5 10010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 49397467 49397500 49397484 Y BEND5 NA NA NA NA NA BEND5 156826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 50619908 50620155 50620032 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 108222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 50798792 50798875 50798836 Y NA NA AGBL4 IMR90 Hi-C 24141950 ELAVL4 287106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 50902653 50903020 50902837 Y NA NA NA NA NA NA ELAVL4 390967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 51261727 51261870 51261800 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 162065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 51703075 51703494 51703244 Y OSBPL9 RNF11 NA NA NA NA RNF11 3132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 51823993 51824400 51824363 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 15205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 51935246 51935592 51935567 Y NA RP11-191G24.1,EPS15 NA NA NA NA RP11-191G24.1 46389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 52341008 52341095 52341052 Y CC2D1B,OSBPL9 NRD1 NA NA NA NA NRD1 1382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 52507951 52508154 52508101 Y NA KTI12,BTF3L4,TXNDC12 NA NA NA NA KTI12 10463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 53128711 53128834 53128721 Y NA NA NA NA NA NA ZYG11B 61292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr1 53168640 53169047 53168726 Y NA ZYG11B SELRC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ZYG11B 21079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 53403571 53403705 53403636 Y NA ECHDC2,SCP2 NA NA NA NA SCP2 12670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 53703343 53703361 53703351 Y NA CPT2,C1orf123,MAGOH NA NA NA NA MAGOH 1061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54260217 54260562 54260390 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54261078 54261111 54261098 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 93296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 54286238 54286401 54286368 Y NA NA NA NA NA NA YIPF1 68006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 54695028 54695502 54695289 Y NA MRPL37,CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 31319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54873075 54873515 54873406 Y SSBP3,SSBP3 SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 3637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 54875187 54875373 54875227 Y NA SSBP3 NA NA NA NA SSBP3 1779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 54964078 54964274 54964180 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 86926 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 54965893 54966212 54966053 Y NA NA TCEANC2,SSBP3,MRPL37,CYB5RL,CDCP2,YIPF1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4,ACOT11,FAM151A IMR90 Hi-C 24141950 SSBP3 88741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 55327144 55327486 55327453 Y NA RP11-67L3.5,DHCR24 NA NA NA NA RP11-67L3.5 23062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 55413962 55414227 55414092 Y USP24 NA DHCR24,TMEM61,BSND,HEATR8-TTC4,USP24,C1orf177,PCSK9,TTC22 IMR90 Hi-C 24141950 DHCR24 63071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 55594097 55594408 55594328 Y NA NA PCSK9 IMR90 Hi-C 24141950 USP24 84378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 55650535 55650650 55650593 Y NA USP24 NA NA NA NA USP24 28136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 56680724 56680992 56680925 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 427982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 56919158 56919299 56919214 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 189675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 5.37310207951813 chr1 56976994 56977444 56977213 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 131530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 56991269 56991531 56991390 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 117443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 56992489 56992799 56992673 Y NA NA NA NA NA NA PPAP2B 116175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 57854194 57854446 57854303 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 745199 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 57854714 57855055 57855051 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 745719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 57887813 57887926 57887901 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 778818 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 58002362 58002542 58002370 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 893367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 58303464 58303533 58303499 Y DAB1 NA NA NA NA NA DAB1 706873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 58627790 58628022 58627831 Y NA NA NA NA NA NA DAB1 382384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 59479443 59479773 59479608 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,LOC100131060,JUN,HSD52,MIR4711 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 4286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 59758328 59758666 59758447 Y FGGY FGGY NA NA NA NA FGGY 1644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 60144543 60144796 60144669 Y FGGY NA NA NA NA NA HOOK1 133662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr1 61369297 61369400 61369351 Y NA NFIA NA NA NA NA NFIA 40366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 61543611 61543877 61543752 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 214680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 61549054 61549253 61549232 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 220123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 61579491 61579639 61579512 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 250560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 61583915 61584228 61583999 Y NA NA NA NA NA NA NFIA 254984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 61918819 61919182 61919004 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA TM2D1 269913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 62609116 62609459 62609128 Y NA L1TD1 NA NA NA NA L1TD1 49044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 62698531 62698618 62698572 Y USP1,USP1,KANK4,L1TD1 L1TD1 NA NA NA NA L1TD1 40028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 64127998 64128504 64128154 Y ROR1 NA NA NA NA NA ITGB3BP 70606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 64254998 64255371 64255034 Y ROR1 ROR1 NA NA NA NA ROR1 17305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 64417224 64417447 64417336 Y ROR1 NA NA NA NA NA CFL1P3 109868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 64558632 64559006 64558819 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 251276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 65292575 65293034 65292898 Y NA NA NA NA NA NA RAVER2 83797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65389011 65389411 65389276 Y NA JAK1 NA NA NA NA JAK1 40776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65503279 65503645 65503490 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 27775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65510370 65510451 65510413 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 20969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65517662 65517702 65517682 Y NA RP4-535B20.1 NA NA NA NA RP4-535B20.1 13718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65527577 65527856 65527728 Y NA RP4-535B20.1 AK4 K562 ChIA-PET 22265404 RP4-535B20.1 3564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 65731337 65731853 65731407 Y DNAJC6 DNAJC6 NA NA NA NA DNAJC6 19435 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65775838 65775991 65775933 Y PDE4B,DNAJC6 NA NA NA NA NA DNAJC6 63936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65891768 65892129 65891951 Y NA LEPR,LEPROT NA NA NA NA LEPROT 7498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 65946781 65947169 65947001 Y NA NA NA NA NA NA LEPROT 62511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 67374841 67375185 67375111 Y SGIP1,WDR78 WDR78,MIER1 NA NA NA NA WDR78 13385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 67867795 67868154 67868057 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 25944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 68118588 68118809 68118774 Y GADD45A GADD45A GADD45A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GADD45A 29935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 68257818 68258216 68258148 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 38934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 68354536 68354908 68354722 Y NA NA NA NA NA NA GNG12 57386 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 68961350 68961555 68961472 Y NA DEPDC1 NA NA NA NA DEPDC1 446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 69441381 69441536 69441435 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1 480477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 70691921 70692281 70691982 Y ANKRD13C,LRRC40,SRSF11 LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 7215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 70733839 70734223 70734057 Y NA RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 49133 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 70745994 70746088 70746040 Y NA NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 61288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 70746826 70747040 70746993 Y ANKRD13C NA NA NA NA NA RP4-677H15.4 62120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 70807938 70808237 70808103 Y NA ANKRD13C,HHLA3 NA NA NA NA ANKRD13C 10180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 71399907 71400234 71400028 Y NA NA NA NA NA NA PTGER3 111257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NA NA NA NA NA KRT8P21 818684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 72813657 72813669 72813663 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P21 754806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 74970988 74971139 74971082 Y NA NA NA NA NA NA TYW3 225697 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 75168986 75169131 75169081 Y NA TYW3,CRYZ NA NA NA NA TYW3 27705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 75540470 75540780 75540625 Y NA NA NA NA NA NA LHX8 51339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 76080205 76080672 76080321 Y NA SLC44A5 NA NA NA NA SLC44A5 5404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 76231463 76231678 76231570 Y NA ACADM,RABGGTB,SNORD45A NA NA NA NA RABGGTB 18201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 76250721 76250813 76250769 Y ACADM,RABGGTB RABGGTB,SNORD45A NA NA NA NA SNORD45A 761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 78008083 78008322 78008203 Y NA NA ZZZ3 IMR90 Hi-C 24141950 ZZZ3 138782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 78026939 78027232 78027062 Y FAM73A NA NA NA NA NA ZZZ3 119872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 78067790 78068312 78068066 Y NA NA NA NA NA NA ZZZ3 78792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 78240205 78240392 78240373 Y NA USP33,RP4-706L14.2,FAM73A USP33,ZZZ3,FAM73A IMR90 Hi-C 24141950 RP4-706L14.2 1656 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 78386302 78386347 78386324 Y NEXN NEXN NA NA NA NA NEXN 34104 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 78404062 78404594 78404354 Y NA FUBP1,DNAJB4,GIPC2 NA NA NA NA FUBP1 38200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA GIPC2 114120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44L 132165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 80973840 80974001 80973921 Y NA NA NA NA NA NA RP3-445O10.1 698252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 81968642 81968976 81968811 Y NA NA NA NA NA NA LPHN2 198797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 82146044 82146302 82146156 Y NA ST13P20 NA NA NA NA ST13P20 39076 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 82268420 82269588 82268555 Y LPHN2 NA NA NA NA NA ST13P20 83042 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 83153203 83153587 83153396 Y NA NA NA NA NA NA ST13P20 967825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 83269398 83269776 83269625 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 1054930 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 83530346 83530531 83530439 Y NA NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 794175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 84757421 84757614 84757534 Y DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13 NA UOX,DNASE2B IMR90 Hi-C 24141950 RPF1 185328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 84971050 84971209 84971115 Y MCOLN2,GNG5 RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 85241214 85241288 85241250 Y SAMD13,DNASE2B,DNASE2B,SSX2IP,SSX2IP,LPAR3 NA SSX2IP,GNG5,TTLL7,UOX,MCOLN2,C1orf180,PRKACB,LPAR3,MCOLN3 IMR90 Hi-C 24141950 SSX2IP 86728 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 85313015 85313206 85313127 Y GNG5,MCOLN2,LPAR3,C1orf52,BCL10 LPAR3 NA NA NA NA LPAR3 43690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 86071867 86071976 86071922 Y NA DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61,ZNHIT6 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 27423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 86072885 86073441 86073156 Y CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90 Hi-C 24141950 CYR61 28441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 87203929 87204214 87204072 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 35670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 87799623 87799998 87799801 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 7472 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 88694004 88694059 88694042 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 453846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 88907516 88907759 88907638 Y NA NA NA NA NA NA PKN2 240146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 89167079 89167239 89167155 Y GTF2B,GBP4,GBP3,GBP2,GBP1 PKN2 NA NA NA NA PKN2 19174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 89358212 89358439 89358316 Y PKN2,CCBL2 GTF2B NA NA NA NA GTF2B 2585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 89475726 89475778 89475752 Y NA CCBL2,RBMXL1,GBP3 NA NA NA NA GBP3 10799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 89942348 89942369 89942360 Y NA LRRC8B NA NA NA NA LRRC8B 46026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 90100291 90100368 90100330 Y NA LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 3660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 90137741 90138074 90137909 Y ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 41110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 90204490 90205244 90205062 Y LRRC8C,ZNF326,LRRC8D NA NA NA NA NA LRRC8D 79329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 91183313 91183764 91183661 Y BARHL2 NA NA NA NA NA RP4-665J23.1 131443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 91472225 91472812 91472773 Y NA ZNF644 NA NA NA NA ZNF644 13017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 92086791 92087194 92086992 Y NA RP11-91I11.1 TGFBR3,HSP90B3P,CDC7 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-91I11.1 23063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA RP11-91I11.1 119515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 92725087 92725311 92725273 Y RPAP2,GLMN RPAP2,GLMN NA NA NA NA RPAP2 37211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 92907492 92907607 92907552 Y NA GFI1 NA NA NA NA GFI1 42826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chr1 93003662 93004045 93003868 Y RPAP2,GLMN,RPL5,GFI1 NA NA NA NA NA GFI1 53229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 93270252 93270588 93270467 Y NA EVI5,RPL5 EVI5 IMR90 Hi-C 24141950 EVI5 14291 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 93427945 93428408 93428079 Y MTF2,DR1,FAM69A FAM69A NA NA NA NA FAM69A 2888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 93660433 93660767 93660600 Y NA CCDC18,TMED5 NA NA NA NA TMED5 16148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 93694062 93694249 93694102 Y MTF2,CCDC18 TMED5 NA NA NA NA TMED5 49777 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 93773027 93773315 93773230 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 36130 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 93806739 93807078 93807070 Y NA DR1,RP4-717I23.3 NA NA NA NA DR1 2367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 93914812 93914954 93914881 Y FNBP1L FNBP1L NA NA NA NA FNBP1L 3124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 94007993 94008357 94008092 Y FNBP1L,BCAR3 NA NA NA NA NA FNBP1L 96305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCAR3 65397 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 94309612 94309956 94309784 Y NA BCAR3,DNTTIP2 NA NA NA NA BCAR3 750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 95107584 95108052 95107918 Y F3,SLC44A3,SLC44A3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 102228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 95113814 95114327 95114013 Y F3 NA F3,ABCD3,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 F3 108458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 95263833 95264301 95264195 Y NA LINC01057,SLC44A3 F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01057 19536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 95551114 95551338 95551185 Y NA ALG14,TMEM56 ALG14,TMEM56-RWDD3,SLC44A3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ALG14 14613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 96984329 96984523 96984426 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS5P2 63767 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 97199537 97199912 97199566 Y NA PTBP2 NA NA NA NA PTBP2 14316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 98606055 98606462 98606113 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 221450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 100169951 100170218 100170031 Y NA NA NA NA NA NA FRRS1 59969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 100424556 100424788 100424649 Y NA SLC35A3,RP5-884G6.2 SLC35A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC35A3 8557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 100828525 100828922 100828611 Y SASS6 CDC14A NA NA NA NA CDC14A 19941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 100858865 100858991 100858930 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 50281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 100918231 100918546 100918401 Y SLC35A3,HIAT1,CDC14A NA NA NA NA NA CDC14A 109647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 101392986 101393260 101393033 Y S1PR1,SLC30A7,SLC30A7 EXTL2,SLC30A7 NA NA NA NA SLC30A7 33354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 101469727 101469819 101469773 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 19615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 104525002 104525023 104525013 Y NA NA NA NA NA NA RNPC3 458689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 107731970 107732212 107732091 Y NTNG1,NTNG1 NA NA NA NA NA NTNG1 51341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 108231996 108232161 108232053 Y NA NA NA NA NA NA VAV3 273605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 108650339 108650754 108650436 Y FAM102B,VAV3 NA NA NA NA NA SLC25A24 90717 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 108673419 108673672 108673564 Y FAM102B NA NA NA NA NA SLC25A24 67799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 109104473 109104583 109104556 Y PRPF38B,FAM102B FAM102B NA NA NA NA FAM102B 3762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 109784080 109784425 109784202 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 CELSR2 IMR90 Hi-C 24141950 CELSR2 6216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 109797001 109797635 109797309 Y NA SARS,CELSR2,PSRC1 NA NA NA NA CELSR2 6360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 109937534 109937767 109937651 Y GSTM3,WDR47,CELSR2,PSRC1,SORT1,SORT1 SORT1,PSMA5 NA NA NA NA SORT1 806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 109981518 109981703 109981616 Y NA SORT1,PSMA5,ATXN7L2 CELSR2,SORT1,PSMA5,SYPL2,CYB561D1,MYBPHL,ATXN7L2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PSMA5 14456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 110160052 110160461 110160231 Y GNAI3,FAM40A,AMPD2,AMPD2,AMPD2 AMPD2,GSTM4,GSTM2 NA NA NA NA AMPD2 3326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 110320163 110320291 110320225 Y NA GSTM3 CSF1,AHCYL1,CYB561D1,ATXN7L2,GPR61,GNAI3,AMIGO1,AMPD2,GNAT2,GSTM4,GSTM5,EPS8L3,FAM40A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 37779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 110334849 110335164 110334977 Y NA NA CSF1,FAM40A,GSTM4,AHCYL1,EPS8L3,CYB561D1,GPR61,GNAI3,AMIGO1,GNAT2,AMPD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GSTM3 52465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 111178912 111179243 111179089 Y RBM15,CD53 NA KCNA2 K562 ChIA-PET 22265404 SLC16A4 247208 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 111745467 111745610 111745539 Y CD53,CEPT1,DRAM2,CHI3L2 NA NA NA NA NA DRAM2 64629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA OVGP1,ATP5F1,WDR77,C1orf162 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 111996023 111996307 111996190 Y NA OVGP1,ATP5F1,WDR77,C1orf162 NA NA NA NA WDR77 6025 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 112276731 112276883 112276807 Y C1orf162,RAP1A,C1orf183,C1orf183 DDX20,FAM212B NA NA NA NA DDX20 18984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 113072370 113072489 113072380 Y NA NA NA NA NA NA WNT2B 65207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 113339084 113339400 113339242 Y NA NA FAM19A3,RHOC,PPM1J,AKR7A2P1,SLC16A1 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1J 82985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 113369203 113369427 113369274 Y SLC16A1,SLC16A1 NA RHOC,PPM1J,FAM19A3,LRIG2 IMR90 Hi-C 24141950 PPM1J 113104 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 113394964 113395159 113395070 Y NA NA FAM19A3,PPM1J IMR90 Hi-C 24141950 SLC16A1-AS1 101878 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 113468568 113468671 113468620 Y NA SLC16A1-AS1,SLC16A1 NA NA NA NA SLC16A1-AS1 28366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 113932415 113932748 113932683 Y NA MAGI3 NA NA NA NA MAGI3 1044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 113949729 113949849 113949733 Y NA MAGI3,RP11-512F24.1 NA NA NA NA MAGI3 18358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 114236415 114236760 114236542 Y MAGI3 NA NA NA NA NA PHTF1 63351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 114258659 114258989 114258824 Y NA PHTF1 NA NA NA NA PHTF1 41122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 114566071 114566240 114566155 Y NA OLFML3 SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 46008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 114575620 114575801 114575630 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 55557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 114575988 114576152 114576061 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 55925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 114577619 114577844 114577743 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 57556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 114665635 114666029 114665832 Y NA SYT6 NA NA NA NA SYT6 28512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 115025085 115025405 115025244 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 26376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 115445129 115445499 115445208 Y NA NA NA NA NA NA SIKE1 123823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr1 115615204 115615232 115615217 Y NA TSPAN2 NA NA NA NA TSPAN2 14889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 116191587 116191760 116191750 Y NA VANGL1 NA NA NA NA VANGL1 9013 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 116588429 116588746 116588471 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 71310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 116694646 116694883 116694753 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A15 177527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 116918317 116918655 116918398 Y NA ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 116918925 116919548 116919274 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 5635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 117100772 117101124 117100940 Y CD101,ATP1A1,ATP1A1,CD58 CD58 NA NA NA NA CD58 10537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 117169735 117170114 117169931 Y ATP1A1 IGSF3 NA NA NA NA IGSF3 38261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 117422443 117422644 117422485 Y NA PTGFRN PTGFRN,TTF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 PTGFRN 28035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 120180868 120181132 120181082 Y NBPF7,ZNF697 GAPDHP33,ZNF697,PHGDH NA NA NA NA ZNF697 7264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 120275491 120275880 120275569 Y ADAM30 NA NA NA NA NA PHGDH 75070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 120525502 120525838 120525670 Y NOTCH2,ZNF697,NBPF7 NA NA NA NA NA NOTCH2 84402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 120608824 120609208 120608880 Y NOTCH2 NOTCH2 NA NA NA NA NOTCH2 1032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 121485082 121485212 121485187 Y NA NA NA NA NA NA EMBP1 225939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 144533627 144534178 144533764 Y PDE4DIP RNU1-59P PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,HIST2H2AB,HIST2H2AC,HIST2H2BE K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU1-59P 1589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 144908806 144909147 144908897 Y PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10 RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 33525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 144988079 144988414 144988189 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 45407 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145000077 145000849 145000623 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 57405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 145004446 145004804 145004625 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 61774 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145005016 145005394 145005195 Y NA NA NA NA NA NA RNU2-38P 62344 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145012331 145013054 145012678 Y NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP NA NA NA NA NA PDE4DIP 61132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145054975 145055306 145055182 Y SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,LOC728875,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDE4DIP 18880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145067412 145067676 145067614 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 6510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 145640932 145641287 145641091 Y NBPF10 POLR3C,RNF115 NA NA NA NA RNF115 31896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 146753566 146753835 146753733 Y NA CHD1L,FMO5 NA NA NA NA FMO5 40866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 146999335 146999532 146999436 Y NA BCL9 BCL9 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 11650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 147011538 147012039 147011713 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 147012349 147012550 147012481 Y NA BCL9 ACP6 IMR90 Hi-C 24141950 BCL9 1167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 147029048 147029203 147029126 Y NA BCL9 NA NA NA NA BCL9 17866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 147072641 147072971 147072883 Y NA NA NA NA NA NA BCL9 61459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 147080043 147080251 147080097 Y PRKAB2,CHD1L,BCL9 NA NA NA NA NA ACP6 60367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.10709885471299 chr1 147104963 147105320 147105142 Y NA ACP6 NA NA NA NA ACP6 35298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 147775754 147775884 147775851 Y NBPF14 RNU1-120P,RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 29002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.53200644961027 chr1 147825273 147825748 147825617 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 20387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 148000699 148000802 148000795 Y NA RNVU1-13 NA NA NA NA RNVU1-13 8553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 7.90162070517372 chr1 149215297 149215704 149215586 Y NA RNVU1-17,RNU1-92P,RP11-403I13.5 NA NA NA NA RNU1-92P 1997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 149910900 149911536 149911461 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11 NA NA NA NA MTMR11 4109 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 149931955 149932255 149932237 Y NA SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B MTMR11,SF3B4 IMR90 Hi-C 24141950 MTMR11 25164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 149957680 149957694 149957685 Y NA OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 22931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 149981648 149981889 149981683 Y ANP32E,OTUD7B OTUD7B NA NA NA NA OTUD7B 1023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 150134154 150134397 150134243 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 14781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 150135231 150135764 150135536 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1 NA NA NA NA PLEKHO1 15858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 150154529 150154860 150154771 Y SV2A,MCL1 PLEKHO1 HIST2H2AB,HIST2H2BE,HIST2H2AC MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 35156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 150159099 150159241 150159135 Y PRPF3,MCL1,PLEKHO1 PLEKHO1,ANP32E,RNU2-17P HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 PLEKHO1 39726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P,CA14 NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 150539630 150541082 150540777 Y NA ADAMTSL4,MCL1 NA NA NA NA MCL1 8984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 150577042 150577503 150577391 Y CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 22585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 150600412 150600701 150600561 Y CDC42SE1,BNIPL,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1 ENSA NA NA NA NA ENSA 324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 150668096 150668276 150668180 Y NA GOLPH3L,HORMAD1 NA NA NA NA GOLPH3L 466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 151168916 151169086 151168995 Y NA SCNM1,LYSMD1,TMOD4,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 151172142 151172526 151172243 Y FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4 SCNM1,LYSMD1,TMOD4,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 3717 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 151172620 151173197 151172669 Y TMOD4 SCNM1,LYSMD1,TMOD4,VPS72,PIP5K1A NA NA NA NA PIP5K1A 4195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 151184646 151184728 151184696 Y NA LYSMD1,TMOD4,VPS72,PIP5K1A,PSMD4 NA NA NA NA PIP5K1A 16221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 151418157 151418544 151418397 Y NA PSMB4,POGZ NA NA NA NA POGZ 11397 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 151580936 151581099 151580976 Y NA SNX27,RP11-404E16.1 RIIAD1,CELF3 IMR90 Hi-C 24141950 SNX27 1442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 151696469 151696693 151696535 Y NA CELF3,MRPL9 NA NA NA NA CELF3 9179 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 151877533 151877895 151877666 Y THEM4 THEM4 NA NA NA NA THEM4 2389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr1 151945504 151945625 151945562 Y NA S100A10 NA NA NA NA S100A10 19241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 152006910 152007460 152006991 Y SNX27,S100A11 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 152007615 152008057 152007721 Y THEM4 S100A10,S100A11 NA NA NA NA S100A11 10326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153488459 153488748 153488622 Y PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14 S100A3,S100A4 NA NA NA NA S100A3 31100 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153510895 153511054 153510975 Y NA S100A3,S100A4 NA NA NA NA S100A3 8794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153541018 153541368 153541269 Y PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13 S100A3,S100A4,S100A16,S100A14 NA NA NA NA S100A4 20406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153584539 153584862 153584750 Y NA S100A16,S100A14,S100A1,CHTOP,S100A13,SNAPIN NA NA NA NA S100A16 918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153670755 153671012 153670885 Y S100A9,S100A12 SNAPIN,ILF2,NPR1,INTS3 NA NA NA NA NPR1 21642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153767353 153767730 153767624 Y NA SLC27A3 NA NA NA NA SLC27A3 22523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 153818420 153818667 153818544 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A3 73590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153929776 153930098 153929954 Y NA GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CRTC2 675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr1 154016982 154017198 154017038 Y NA NA NA NA NA NA RP11-422P24.9 50874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr1 154166147 154166533 154166338 Y NUP210L,TDRD10,CHRNB2,C1orf189 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 1023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154302207 154302441 154302288 Y CHRNB2,ATP8B2 ATP8B2 NA NA NA NA ATP8B2 6178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154380711 154381076 154380883 Y NA IL6R SHE IMR90 Hi-C 24141950 IL6R 5042 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154577703 154577929 154577737 Y NA UBE2Q1,CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 20546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154584095 154584221 154584156 Y NA CHRNB2,ADAR NA NA NA NA ADAR 14254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154728745 154728994 154728977 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 111762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154783587 154784004 154783794 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 56752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 154972628 154972915 154972668 Y CLK2,DPM3,DPM3,PYGO2,FLAD1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 154973036 154973200 154973120 Y CLK2,ADAR,ADAR,PYGO2,CKS1B,ZBTB7B,DCST1 PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 154973335 154973935 154973656 Y ADAR,ADAR,MTX1,SHC1,ZBTB7B PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15 NA NA NA NA ZBTB7B 208 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 154997722 154998120 154997917 Y NA FLAD1,LENEP,ZBTB7B,ADAM15,EFNA4,EFNA3 NA NA NA NA ADAM15 22922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155064132 155064186 155064153 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 NA NA NA NA EFNA3 29908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 155066604 155066635 155066620 Y NA ADAM15,EFNA4,EFNA3,EFNA1,SLC50A1,DPM3 DPM3,KRTCAP2,EFNA1,TRIM46,SLC50A1 IMR90 Hi-C 24141950 EFNA1 31301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr1 155283531 155283932 155283776 Y DCST1,EFNA1 HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1 NA NA NA NA RUSC1 4755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 155443130 155443303 155443253 Y NA POU5F1P4 NA NA NA NA POU5F1P4 42161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155484519 155484611 155484545 Y KRTCAP2,GBA,SCAMP3,CLK2,RUSC1,RUSC1,RUSC1-AS1,RUSC1 ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 45210 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155496665 155497012 155496914 Y DCST1,HCN3,YY1AP1,ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L NA NA NA NA ASH1L-AS1 32809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 155535083 155535193 155535176 Y HCN3 ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6 NA NA NA NA ASH1L 4485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 155568911 155569221 155569066 Y ASH1L ASH1L-AS1,ASH1L,RP11-29H23.6 FDPS,RUSC1,ASH1L,RUSC1-AS1,SCAMP3,CLK2,FAM189B,HCN3,POU5F1P4,LOC645676 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-29H23.6 9858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 155703696 155704096 155703788 Y NA DAP3,YY1AP1 NA NA NA NA YY1AP1 46905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155757099 155757186 155757142 Y NA NA NA NA NA NA GON4L 70005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155944562 155945214 155944815 Y C1orf182,C1orf61,SYT11,PAQR6,PAQR6 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 NA NA NA NA ARHGEF2 29647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 155945743 155946196 155946108 Y C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28665 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 155946363 155946660 155946476 Y ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2 KIAA0907,ARHGEF2,SSR2 RXFP4,KIAA0907 K562 ChIA-PET 22265404 ARHGEF2 28201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156067665 156067930 156067834 Y NA UBQLN4,LAMTOR2,RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,MEX3A K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 LMNA 17301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 156072500 156072641 156072571 Y NA LAMTOR2,RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3 IMR90 Hi-C 24141950 LMNA 22136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 156074715 156075305 156075042 Y YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA RAB25,MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 24351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 156461502 156461819 156461755 Y MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156474686 156475018 156474923 Y SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 6066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156480721 156480806 156480764 Y NA MEF2D NA NA NA NA MEF2D 12101 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156629760 156630406 156629967 Y PAQR6,PAQR6,C1orf182,CCT3,ISG20L2,GPATCH4,HAPLN2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA RP11-284F21.7 544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156645551 156645913 156645806 Y NES RP11-284F21.7,NES,CRABP2 NA NA NA NA NES 362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156662788 156663099 156662881 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24 BCAN,NES IMR90 Hi-C 24141950 CRABP2 10509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 156677217 156677612 156677436 Y NA RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 3609 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr1 156966343 156966626 156966486 Y NA ARHGEF11 NA NA NA NA ARHGEF11 46536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 157248443 157248858 157248567 Y FCRL3 NA NA NA NA NA ETV3 142177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 157966753 157967127 157966789 Y NA KIRREL NA NA NA NA KIRREL 5690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 158075201 158075434 158075415 Y NA NA NA NA NA NA CD1D 72303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA RP11-404O13.5 NA NA NA NA CD1D 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 158942717 158942925 158942799 Y OR10J1,OR10R2,OR6P1,OR10X1,OR10Z1,OR6K3,OR6N1,OR6N2,FCER1A,PYHIN1 IFI16 NA NA NA NA IFI16 24833 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 158970513 158970716 158970581 Y AIM2,IFI16 IFI16 NA NA NA NA IFI16 2755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 158982200 158982857 158982480 Y AIM2,PYHIN1,IFI16 IFI16 NA NA NA NA IFI16 14442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 159158093 159158524 159158429 Y NA CADM3 NA NA NA NA CADM3 18694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 160202735 160202981 160202855 Y SLAMF6,CD48,FCRL6,DCAF8 PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 26553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 160203977 160204039 160204035 Y NA PEA15,RP11-574F21.2,DCAF8 NA NA NA NA RP11-574F21.2 25495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 160332348 160332525 160332392 Y SLAMF7,IGSF9,NHLH1,VANGL2 NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA COPA 21158 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 160345693 160345986 160345917 Y NA NCSTN,COPA,VANGL2 NA NA NA NA VANGL2 22390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 160510042 160510238 160510216 Y DCAF8,SLAMF1,CD48,SLAMF6 NA NA NA NA NA VANGL2 141666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 160639828 160639998 160639908 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 222772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 160684087 160684458 160684273 Y NA NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 178312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 160696081 160696317 160696161 Y CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7 NA NA NA NA NA RP11-312J18.5 166453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr1 160989381 160990254 160990012 Y NDUFS2,ADAMTS4,F11R F11R,USF1 NA NA NA NA F11R 243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr1 161170260 161170636 161170567 Y PCP4L1,ADAMTS4,NDUFS2 UFC1,USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L NA NA NA NA ADAMTS4 3414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A C1orf192 NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 24002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA C1orf192 ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 33409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 161500608 161500899 161500816 Y USF1,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A,ATF6,HSPA6,FCGR3B,FCGR3A,FCGR3A HSPA6 NA NA NA NA HSPA6 8572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 161973588 161973892 161973770 Y FCGR2A,FCGR3A,OLFML2B OLFML2B NA NA NA NA OLFML2B 17752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 162511455 162511984 162511719 Y UAP1,UHMK1 UHMK1,UAP1 NA NA NA NA UAP1 17339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 164686304 164686686 164686418 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 163483 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 165323712 165323885 165323804 Y NA NA NA NA NA NA RXRG 88548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 165635693 165636148 165635824 Y NA MGST3,ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 29952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 165674774 165675083 165674866 Y NA ALDH9A1 NA NA NA NA ALDH9A1 8674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 165823413 165823808 165823568 Y NA UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 28421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 166954369 166954473 166954424 Y ILDR2,MAEL NA ILDR2,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP27 106809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 167035961 167036358 167035977 Y NA DUSP27 NA NA NA NA DUSP27 24924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 167191021 167191933 167191618 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 2955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 167192959 167193266 167193111 Y NA POU2F1 NA NA NA NA POU2F1 4893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 167434195 167434584 167434555 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 86420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 168337258 168337475 168337348 Y NA NA LOC100505918,MIR557 IMR90 Hi-C 24141950 TBX19 88980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 168382983 168383105 168383068 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 134705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 168409627 168409736 168409651 Y NA NA F5 IMR90 Hi-C 24141950 XCL1 133975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 168483874 168484202 168483927 Y NA NA C1orf114,BLZF1 IMR90 Hi-C 24141950 XCL1 59509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 168526950 168527356 168527080 Y NA XCL1 NA NA NA NA XCL1 16355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 168531443 168531650 168531547 Y NA XCL1 LOC100505918,NME7 IMR90 Hi-C 24141950 XCL1 12061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 169443033 169443373 169443298 Y NA SLC19A2,AL021068.1 NA NA NA NA SLC19A2 9868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 169661915 169662500 169662311 Y METTL11B,KIFAP3,SCYL3,METTL18,SELL C1orf112 NA NA NA NA C1orf112 32670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 169834996 169835276 169835168 Y NA SCYL3 NA NA NA NA SCYL3 26132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 170042588 170042670 170042627 Y C1orf112 KIFAP3 NA NA NA NA KIFAP3 9679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 171189238 171189444 171189341 Y NA NA NA NA NA NA FMO4 91903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 171404934 171405057 171404984 Y FMO4,PRRC2C PRRC2C PRRC2C IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2C 47594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 171712214 171712716 171712399 Y FMO4,PRRC2C VAMP4,METTL13 NA NA NA NA VAMP4 2827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 171832189 171832290 171832196 Y DNM3 DNM3 NA NA NA NA DNM3 23568 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 172327558 172328156 172327708 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 83074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 173328578 173328674 173328661 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 115731 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 173379915 173380349 173380194 Y TNFSF4,KLHL20 NA NA NA NA NA PRDX6 64056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 173382392 173382663 173382522 Y NA NA NA NA NA NA PRDX6 61742 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 173958715 173958784 173958750 Y NA RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 30651 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 175145439 175145838 175145619 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 14297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 175159885 175160247 175160001 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 175160901 175161109 175161018 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 766 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 175891419 175891824 175891531 Y NA RP11-318C24.1 RFWD2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-318C24.1 2308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr1 175902819 175902853 175902836 Y NA RP11-318C24.1 NA NA NA NA RP11-318C24.1 13708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 176079011 176079503 176079162 Y NA NA NA NA NA NA RFWD2 95126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 178157578 178157966 178157615 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 96714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 178231351 178231525 178231428 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 170487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 178235815 178236162 178236004 Y NA NA NA NA NA NA RASAL2 174951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 178379281 178379736 178379396 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 130151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 178414274 178414285 178414280 Y NA NA NA NA NA NA C1orf220 95602 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 179153644 179153909 179153868 Y NA ABL2 NA NA NA NA ABL2 42910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 179555221 179555646 179555325 Y TDRD5,TDRD5,TDRD5 NA NA NA NA NA HNRNPA1P54 130771 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 179606990 179607135 179607063 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPA1P54 182540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 180921044 180921090 180921069 Y NA NA NA NA NA NA STX6 68957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 181998739 181999134 181998891 Y GLUL,GLUL NA ZNF648 MCF7 ChIA-PET 22265404 GLUL 360207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 182682922 182683008 182682965 Y DHX9 NA RGS8,RNASEL IMR90 Hi-C 24141950 NPL 73420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 182998797 182999044 182998924 Y NA LAMC1 NA NA NA NA LAMC1 8202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 183241451 183241867 183241650 Y LAMC1 NA LAMC2 IMR90 Hi-C 24141950 LAMC2 88078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 183310808 183311127 183310994 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT2 74610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 183526698 183527308 183526965 Y SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5 NA NA NA NA NA ARPC5 75584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 183836661 183836955 183836765 Y RGL1,GLT25D2 NA NA NA NA NA TSEN15 181856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 183912062 183912419 183912241 Y NA NA NA NA NA NA TSEN15 106392 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 184607018 184607429 184607184 Y RNF2,FAM129A,EDEM3 NA NA NA NA NA EDEM3 114618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 184700299 184700688 184700567 Y NA EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 21359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 185109809 185110137 185110116 Y IVNS1ABP TRMT1L,SWT1 NA NA NA NA TRMT1L 14067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 185298342 185298619 185298496 Y FAM129A,RNF2,TRMT1L,SWT1,TRMT1L,SWT1,IVNS1ABP IVNS1ABP IVNS1ABP MCF7 ChIA-PET 22265404 IVNS1ABP 13881 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 185615541 185615870 185615591 Y NA NA SWT1,LOC100288079,IVNS1ABP IMR90 Hi-C 24141950 IVNS1ABP 331080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 190157636 190157874 190157755 Y FAM5C NA NA NA NA NA RP11-373J16.2 1057213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 192216449 192216576 192216513 Y NA NA NA NA NA NA RGS1 326281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 192500254 192500504 192500353 Y RGS1 RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 42353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 192507991 192508486 192508241 Y NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 34371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 192508796 192509150 192509060 Y NA RGS1 UCHL5,RGS1 IMR90 Hi-C 24141950 RGS1 33707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 192873637 192874003 192873741 Y TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 RN7SKP126 RGS2 IMR90 Hi-C 24141950 RN7SKP126 30522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 192914637 192914772 192914747 Y TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2 NA NA NA NA NA RN7SKP126 71522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 192915458 192915787 192915575 Y NA NA NA NA NA NA RN7SKP126 72343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 193073509 193073815 193073644 Y NA TROVE2,UCHL5,GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 193080839 193080969 193080896 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA GLRX2 7595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 193090447 193090464 193090456 Y NA GLRX2,CDC73 NA NA NA NA CDC73 1300 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 193726401 193726456 193726429 Y NA NA NA NA NA NA CDC73 637254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 197747792 197747875 197747834 Y NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 4966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 198128112 198128944 198128293 Y PTPRC,DENND1B NEK7 NA NA NA NA NEK7 4019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 198901469 198901869 198901786 Y PTPRC NA NA NA NA NA RP11-104D3.2 452400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 200457893 200457983 200457938 Y NA NA C1orf98,NR5A2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF281 80709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 200715755 200716027 200715890 Y NA NA NA NA NA NA DDX59 78658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 201613549 201613726 201613638 Y NA NAV1 NAV1,CSRP1,RPS10P7,IPO9 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAV1 23138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 201618983 201619286 201619160 Y NA NAV1 NA NA NA NA NAV1 28572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 201619383 201619798 201619705 Y SHISA4,GPR37L1,NAV1 NAV1 NA NA NA NA NAV1 28972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 201709797 201710423 201710148 Y NA NA NA NA NA NA IPO9 85846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 201768733 201769083 201768901 Y NA IPO9,IPO9-AS1 IPO9 IMR90 Hi-C 24141950 IPO9 27186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 201864045 201864232 201864194 Y NA SHISA4,LMOD1 NA NA NA NA SHISA4 8237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 202003884 202004146 202004054 Y NA ELF3 NA NA NA NA ELF3 28811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 202737599 202737762 202737681 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA RP11-480I12.2 3053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 202765097 202765528 202765162 Y NA RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6 NA NA NA NA KDM5B 11070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 202872285 202872308 202872297 Y NA RP11-480I12.5,RABIF,HNRNPA1P59,KLHL12 RABIF MCF7 ChIA-PET 22265404 HNRNPA1P59 6632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 202997835 202998093 202998001 Y NA TMEM183A,PPFIA4 NA NA NA NA PPFIA4 4209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 203417736 203417980 203417842 Y NA PRELP PRELP,FMOD,PPFIA4,CYB5R1,ATP2B4,BTG2,LOC730227 IMR90 Hi-C 24141950 PRELP 24976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr1 203541292 203541507 203541407 Y NA NA ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1 IMR90 Hi-C 24141950 ATP2B4 52182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 203598711 203598999 203598777 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 5022 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 203624863 203625211 203625050 Y BTG2 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 31174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 204043987 204044379 204044133 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 3744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 204044571 204044810 204044641 Y NA SOX13 NA NA NA NA SOX13 4328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 204049581 204049822 204049645 Y LAX1,PIK3C2B,SOX13 SOX13 NA NA NA NA SOX13 9338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 204653343 204653636 204653438 Y PLEKHA6,TMEM81,NFASC,NFASC,LRRN2,LRRN2 LRRN2 NA NA NA NA LRRN2 482 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 204684045 204684323 204684297 Y NA LRRN2 NFASC,LRRN2 IMR90 Hi-C 24141950 LRRN2 31184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 205090261 205090406 205090392 Y NA RBBP5 CNTN2 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP5 1118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205199524 205199884 205199765 Y NA DSTYK,TMCC2 NA NA NA NA TMCC2 4220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205253892 205254222 205253971 Y NUAK2 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 34661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205254805 205255191 205255039 Y RAB7L1,RBBP5,NUAK2,DSTYK NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 33692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205262860 205263030 205262955 Y CNTN2,CDK18 NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 25853 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 205263599 205264019 205263855 Y NA NUAK2 NA NA NA NA NUAK2 24864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205410224 205410578 205410325 Y DSTYK,TMCC2 LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 12504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205415918 205416307 205416148 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 6775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205420910 205421289 205421224 Y NA LEMD1 NA NA NA NA LEMD1 1793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 205709805 205710150 205710085 Y NA NUCKS1,RAB7L1 NA NA NA NA NUCKS1 7254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 206828330 206828510 206828373 Y NA EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2 NA NA NA NA DYRK3 21449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 206897147 206897463 206897235 Y RASSF5,MAPKAPK2 MAPKAPK2 NA NA NA NA MAPKAPK2 40858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 208415648 208415868 208415811 Y NA NA NA NA NA NA PLXNA2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 208442735 208442900 208442818 Y NA PLXNA2 PLXNA2,CD34 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA2 27070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209331001 209331148 209331080 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P1 108420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209528830 209529176 209528970 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 NA MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 70989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209556903 209557123 209556922 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 43042 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209562668 209562976 209562782 Y LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587 MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 37189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209570810 209570947 209570869 Y NA MIR205HG MIR205HG MCF7 ChIA-PET 22265404 MIR205HG 29218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 209601291 209601611 209601405 Y NA MIR205HG NA NA NA NA MIR205HG 1126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 209822403 209823008 209822758 Y TRAF3IP3,G0S2,LAMB3 G0S2 CAMK1G IMR90 Hi-C 24141950 G0S2 23757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 210468396 210468551 210468467 Y HHAT HHAT SYT14,DIEXF,C1orf133,SERTAD4,HHAT IMR90 Hi-C 24141950 HHAT 31045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 211349385 211349483 211349480 Y NA RP11-543B16.1 HHAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-543B16.1 4566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 211500826 211501119 211501083 Y TRAF5,TRAF5 TRAF5 NA NA NA NA TRAF5 2869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 211590216 211590571 211590445 Y NA LINC00467 NA NA NA NA LINC00467 36071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 211712804 211713120 211712963 Y NA RD3,SLC30A1 NEK2,RD3,SLC30A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 36964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212256975 212257253 212257095 Y DTL,INTS7 RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 33604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212315044 212315217 212315131 Y NA NA TMEM206,DTL,PPP2R5A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL21P28 91673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212458080 212458253 212458113 Y INTS7,PPP2R5A,PPP2R5A PPP2R5A,RP11-384C4.3 NA NA NA NA PPP2R5A 1201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 212513330 212513719 212513465 Y PPP2R5A,PPP2R5A,TMEM206,TMEM206 RP11-384C4.3 NA NA NA NA RP11-384C4.3 32470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212661846 212662402 212662104 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 57617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 212811770 212812141 212812009 Y NA NA NA NA NA NA BATF3 59186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 212923712 212923837 212923822 Y NA NSL1,TATDN3 NA NA NA NA NSL1 39287 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 212993371 212993544 212993485 Y NA NSL1,TATDN3,FLVCR1-AS1,FLVCR1 NA NA NA NA TATDN3 30201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 213083359 213083697 213083526 Y FLVCR1 VASH2 NA NA NA NA VASH2 38165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 213088240 213088359 213088300 Y VASH2 VASH2 NA NA NA NA VASH2 33503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 213088828 213089171 213088880 Y VASH2,FLVCR1 VASH2 NA NA NA NA VASH2 32691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr1 213090277 213090696 213090331 Y VASH2,FLVCR1 VASH2 NA NA NA NA VASH2 31166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.47671311027643 chr1 213101984 213102303 213102117 Y VASH2 VASH2 FLVCR1,VASH2,TATDN3,NSL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 VASH2 19559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 213152730 213153023 213152876 Y BATF3,TATDN3,VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA VASH2 30868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 213160414 213160619 213160568 Y VASH2 VASH2,ANGEL2 NA NA NA NA ANGEL2 26549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr1 214614073 214614284 214614198 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 214619335 214619608 214619472 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 104184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 215741534 215741966 215741880 Y KCTD3 KCTD3 NA NA NA NA KCTD3 2799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA ESRRG 534812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 217105953 217106090 217106023 Y NA NA NA NA NA NA ESRRG 203007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 218633382 218633612 218633512 Y NA NA NA NA NA NA TGFB2 115805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 219497639 219497836 219497817 Y NA NA TGFB2,LOC728463,RRP15 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 152453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 220443411 220443639 220443413 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA RAB3GAP2 157 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 221048646 221048850 221048821 Y NA NA NA NA NA NA MARC1 90545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 221612801 221613016 221612980 Y DUSP10,DUSP10 NA C1orf140,HLX,MIA3 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 300502 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 221869897 221870257 221870077 Y NA DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 43261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 221882292 221882723 221882499 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 30795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 221955945 221956219 221956110 Y NA DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 42427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 222156808 222157129 222156969 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP10 243290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 222638782 222639204 222638963 Y NA NA DUSP10,MIA3,AIDA,BROX IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHIPL2 80241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 223203713 223203863 223203798 Y NA NA FAM177B IMR90 Hi-C 24141950 DISP1 217307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 223204032 223204174 223204104 Y NA NA FAM177B IMR90 Hi-C 24141950 DISP1 217626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 224012866 224013246 224013103 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 18428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 224026476 224026743 224026681 Y NA TP53BP2 NA NA NA NA TP53BP2 4931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 8.84981518979456 chr1 224545542 224546006 224545661 Y FBXO28,CNIH4 NVL,CNIH4 NA NA NA NA CNIH4 2990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 224690718 224691054 224690869 Y WDR26 NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 67983 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 224719534 224719550 224719542 Y NA NA CNIH3 IMR90 Hi-C 24141950 WDR26 96799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 225654906 225655584 225655524 Y TMEM63A,LBR,LBR LBR,RP11-496N12.6 NA NA NA NA RP11-496N12.6 3861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 225778250 225778416 225778333 Y ENAH NA NA NA NA NA ENAH 60428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 225843222 225843438 225843341 Y NA ENAH NA NA NA NA ENAH 4378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226063760 226064118 226063778 Y NA TMEM63A,LEFTY1,PYCR2 NA NA NA NA TMEM63A 3951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226163769 226163979 226163848 Y NA LEFTY2 NA NA NA NA LEFTY2 36580 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226190534 226190731 226190643 Y H3F3A,C1orf55 NA NA NA NA NA H3F3A 56821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226219862 226220210 226220014 Y H3F3A,C1orf55 H3F3A H3F3A,C1orf55 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 27342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226288544 226288864 226288784 Y C1orf55,H3F3A H3F3A C1orf55,H3F3A,ACBD3 IMR90 Hi-C 24141950 H3F3A 40992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226297611 226298113 226297674 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 50059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 226298813 226299157 226299132 Y NA NA ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 H3F3A 51261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226315308 226315548 226315420 Y PARP1 NA NA NA NA NA ACBD3 56883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 226315631 226315825 226315781 Y PARP1,LIN9,PYCR2 NA NA NA NA NA ACBD3 56606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 226435130 226435332 226435236 Y PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A NA NA NA NA NA LIN9 60238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 226867580 226868182 226867972 Y ITPKB ITPKB-IT1 NA NA NA NA ITPKB-IT1 6812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226890098 226890374 226890232 Y NA ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 29330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB-IT1,ITPKB NA NA NA NA ITPKB-IT1 30097 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 226911425 226911742 226911463 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 13282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 227730002 227730151 227730029 Y NA ZNF678 WNT9A,ZNF678 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF678 19093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 228073191 228073261 228073226 Y WNT9A NA NA NA NA NA WNT9A 60338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228124828 228124930 228124870 Y ARF1,ARF1 WNT9A NA NA NA NA WNT9A 8669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228272073 228272409 228272248 Y NA ARF1,C1orf35,MRPL55 NA NA NA NA ARF1 3712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228633222 228633907 228633608 Y TRIM11,TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228634060 228634141 228634103 Y TRIM17,HIST3H2A TRIM11,RP11-245P10.4,TRIM17,HIST3H3,HIST3H2A,HIST3H2BB,HIST3H2BA,RNF187 NA NA NA NA HIST3H2A 9419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 228945464 228945740 228945561 Y RHOU NA RHOU,NUP133,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RHOU 76640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 228961848 228962129 228962045 Y RHOU NA NA NA NA NA RHOU 93024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 229335784 229335916 229335795 Y RHOU,C1orf96 NA RHOU,NUP133,RAB4A IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 68859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 229388898 229389111 229388968 Y URB2,TAF5L,NUP133,RAB4A,C1orf96 RP5-1061H20.4,RAB4A RHOU,NUP133,ABCB10 IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1061H20.4 15664 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 229546837 229547142 229546975 Y C1orf96,ACTA1 ACTA1 NA NA NA NA ACTA1 20703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 229570562 229570652 229570607 Y NA ACTA1 NA NA NA NA ACTA1 2717 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 229896669 229897041 229896855 Y NA NA GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 136688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr1 230563874 230563977 230563915 Y NA NA NA NA NA NA COG2 212258 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 230889321 230889962 230889601 Y NA NA NA NA NA NA COG2 113086 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 231038131 231038454 231038293 Y COG2,TTC13,GNPAT,C1orf131 C1orf198 NA NA NA NA C1orf198 34796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 231083969 231084208 231084171 Y NA TTC13,ARV1 NA NA NA NA TTC13 28413 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 231531776 231531955 231531804 Y NA EGLN1 NA NA NA NA EGLN1 26835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 231750755 231751033 231750894 Y NA DISC1 NA NA NA NA DISC1 9528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 108200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 232266092 232266412 232266252 Y NA NA PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 505531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 232352813 232352880 232352847 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 592252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 232356410 232356670 232356613 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 595849 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 232362022 232362384 232362201 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 DISC1 601461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.21245379744864 chr1 232428903 232429197 232429192 Y NA NA TSNAX-DISC1,SIPA1L2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 536736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 232714427 232714703 232714513 Y NA NA SIPA1L2,TSNAX-DISC1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 251230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 18.9638896924169 chr1 233472763 233473058 233472911 Y NA RPS7P3,PCNXL2 NA NA NA NA PCNXL2 43304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 233809261 233809638 233809364 Y KCNK1 NA NA NA NA NA KCNK1 61511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 233856724 233857076 233856900 Y NA NA NA NA NA NA KCNK1 108974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234559176 234559516 234559346 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.4 51837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234625475 234625843 234625700 Y TARBP1 TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,TARBP1,ARID4B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 12626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234639993 234640263 234640100 Y NA TARBP1 LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TARBP1 27144 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234659231 234659760 234659519 Y IRF2BP2 TARBP1 NA NA NA NA TARBP1 46382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234746093 234747674 234747395 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 2822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234812067 234812214 234812141 Y NA LINC01132 LOC100506810,IRF2BP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01132 45575 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234858843 234859287 234859154 Y NA LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 1054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234862200 234862535 234862470 Y NA LINC01132 NA NA NA NA LINC01132 4411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 234907393 234907835 234907495 Y IRF2BP2 LINC01132 IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 LINC01132 49604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235106929 235107153 235107059 Y TARBP1,IRF2BP2,ARID4B,ARID4B NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 183098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 235122652 235122939 235122843 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TOMM20 167312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 235126160 235126371 235126266 Y NA NA IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 163880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235186710 235186949 235186846 Y ARID4B NA LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 TOMM20 103302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TOMM20 47687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235246558 235246857 235246620 Y ARID4B,ARID4B TOMM20 IRF2BP2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TOMM20 43394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235468267 235468477 235468372 Y NA GGPS1,ARID4B NA NA NA NA GGPS1 20188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235668656 235669018 235668830 Y RBM34,ARID4B,ARID4B B3GALNT2 NA NA NA NA B3GALNT2 2875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 235805098 235806119 235805875 Y LYST,RBM34,ARID4B,ARID4B GNG4 NA NA NA NA GNG4 5935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 236431064 236431243 236431072 Y LGALS8,ERO1LB ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 12076 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 237007861 237008154 237008008 Y NA NA NA NA NA NA MTR 51251 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 237206585 237207004 237206623 Y ACTN2,RYR2 RYR2 NA NA NA NA RYR2 3080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 240306165 240306375 240306208 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 25080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr1 240307621 240308162 240308005 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 240437557 240437954 240437680 Y FMN2 NA NA NA NA NA ADH5P3 106102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 240562823 240563040 240562931 Y GREM2 NA NA NA NA NA GREM2 210409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 243923195 243923609 243923504 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 88772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 243995795 243995860 243995825 Y NA AKT3 NA NA NA NA AKT3 16521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 244094600 244094786 244094718 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 82219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr1 244215508 244215901 244215527 Y AKT3,ZNF238,ZNF238 NA NA NA NA NA AKT3 203127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 244525463 244525578 244525509 Y NA NA NA NA NA NA ADSS 87858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS NA NA NA NA ADSS 384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 245958364 245958743 245958685 Y NA NA NA NA NA NA KIF26B 642077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr1 246323685 246324051 246324002 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 344563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 246456441 246456840 246456713 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 211774 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 246469940 246470214 246470139 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 198400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 247123303 247123617 247123430 Y NLRP3,NLRP3,AHCTF1 AHCTF1,ZNF695 NA NA NA NA AHCTF1 30023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 247206107 247206337 247206222 Y NA ZNF695,ZNF670 NA NA NA NA ZNF670 33776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 247326566 247327229 247326989 Y NA MIR3916 NA NA NA NA MIR3916 36133 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr1 247540028 247540387 247540122 Y NA ZNF496 AHCTF1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF496 46880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 652657 652929 652820 Y DIP2C NA NA NA NA NA DIP2C 80754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 958233 958518 958406 Y NA LARP4B DIP2C,GTPBP4,LARP4B IMR90 Hi-C 24141950 LARP4B 17046 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 975785 976368 976035 Y NA LARP4B DIP2C,LARP4B,GTPBP4,IDI1,IDI2-AS1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LARP4B 221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 1100843 1101035 1100898 Y NA IDI1,WDR37 NA NA NA NA WDR37 7365 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 1281519 1281707 1281658 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 188041 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 1336083 1336245 1336171 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 242605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 1352406 1352778 1352644 Y NA NA NA NA NA NA WDR37 258928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 1390281 1390451 1390366 Y ADARB2 NA NA NA NA NA WDR37 296803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 2675804 2676168 2675986 Y NA NA NA NA NA NA PFKP 430357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 3216614 3216797 3216708 Y NA PITRM1 NA NA NA NA PITRM1 3611 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 3239590 3239795 3239693 Y NA PITRM1 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 26587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 3306287 3306665 3306477 Y NA NA LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 93284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 4170248 4170427 4170324 Y NA NA KLF6 MCF7 ChIA-PET 22265404 LINC00702 113677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 5577499 5577735 5577573 Y NA NA NA NA NA NA NET1 124985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 6056574 6056729 6056635 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA NA NA NA NA NA RBM17 72221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 6087449 6087900 6087764 Y IL15RA,PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA RBM17 NA NA NA NA RBM17 41050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 6243287 6243821 6243659 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 58406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRKCQ 176551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 6836289 6836715 6836468 Y NA NA NA NA NA NA PRKCQ 216026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 7277177 7277507 7277289 Y ITIH2 NA NA NA NA NA ITIH5 429454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 7449887 7450154 7450051 Y TAF3,SFMBT2,SFMBT2 NA NA NA NA NA ITIH5 256807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 7583205 7583490 7583242 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 123471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 7583796 7584039 7583868 Y NA NA NA NA NA NA ITIH5 122922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 8662161 8662543 8662250 Y NA NA NA NA NA NA GATA3 568594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA NA NA NA NA NA SFTA1P 182895 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 12002775 12003103 12002939 Y NA NA NA NA NA NA UPF2 80066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 12195131 12195251 12195172 Y CAMK1D SEC61A2,CDC123,NUDT5 NA NA NA NA SEC61A2 25495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 12283843 12284276 12283949 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D CDC123,NUDT5 NA NA NA NA NUDT5 47700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 12306536 12306777 12306588 Y UPF2,UPF2,SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA NUDT5 70393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 12976673 12977075 12976876 Y NA NA NA NA NA NA OPTN 162374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 13391797 13392252 13392084 Y SEPHS1 PHYH,SEPHS1 NA NA NA NA SEPHS1 3500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 13831161 13831325 13831243 Y PRPF18 NA NA NA NA NA PRPF18 204234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 13924181 13924825 13924574 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 297254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 14931162 14931541 14931180 Y NA SUV39H2 NA NA NA NA SUV39H2 12343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 14955590 14955884 14955736 Y HSPA14,SUV39H2,SUV39H2,SUV39H2 SUV39H2,DCLRE1C,MEIG1 NA NA NA NA SUV39H2 36771 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 15178441 15178844 15178745 Y NA ACBD7,RPP38,C10orf111,NMT2 NA NA NA NA NMT2 29848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 15278281 15278573 15278465 Y NA NA NA NA NA NA NMT2 69589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 15300658 15300993 15300826 Y ACBD7,FAM171A1 NA NA NA NA NA NMT2 91966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 16548527 16548808 16548668 Y NA RNU2-18P NA NA NA NA RNU2-18P 32525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 16557217 16557368 16557293 Y NA RNU2-18P NA NA NA NA RNU2-18P 41215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 17028207 17028677 17028581 Y NA NA NA NA NA NA RSU1 170680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 17470783 17471060 17470983 Y TRDMT1,STAM,ST8SIA6 ST8SIA6-AS1,ST8SIA6 NA NA NA NA ST8SIA6 23269 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 17652629 17652974 17652802 Y NA PTPLA,STAM NA NA NA NA PTPLA 4402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 17755362 17755412 17755398 Y SLC39A12 NA NA NA NA NA STAM 71238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 18583664 18583897 18583754 Y NSUN6,ARL5B NA NA NA NA NA CACNB2 156058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 18860767 18861138 18861132 Y NA RP11-499P20.2 NA NA NA NA RP11-499P20.2 28187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 20114711 20115092 20114787 Y PLXDC2 PLXDC2 NA NA NA NA PLXDC2 11543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 20219970 20220256 20220113 Y NA NA NA NA NA NA PLXDC2 116802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 20841595 20841995 20841796 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 619121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 21210288 21210394 21210343 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 250722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 21333319 21333508 21333415 Y NEBL,C10orf113 NA NA NA NA NA NEBL 127608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 120572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr10 21582810 21582927 21582873 Y NA NA C10orf114,C10orf140,PIP4K2A,MLLT10 IMR90 Hi-C 24141950 NEBL 121694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 21795346 21795467 21795386 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 25627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 21798958 21799135 21799012 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 21959 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 21809167 21809536 21809441 Y C10orf114,C10orf140 MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 11558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr10 22039558 22039808 22039651 Y MLLT10,MLLT10 NA NA NA NA NA RN7SKP37 180264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 22265792 22265961 22265887 Y NA RN7SKP37,DNAJC1 NA NA NA NA DNAJC1 24737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 22555688 22555894 22555791 Y NA COMMD3 NA NA NA NA COMMD3 47009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 22625615 22626028 22625937 Y DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6 COMMD3,BMI1,SPAG6 NA NA NA NA SPAG6 6371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 22725331 22726270 22725901 Y NA NA NA NA NA NA SPAG6 92932 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr10 22887940 22888243 22888209 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 113241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 22932460 22932672 22932594 Y NA NA NA NA NA NA PIP4K2A 68812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 23344774 23344811 23344800 Y NA MSRB2 NA NA NA NA MSRB2 37624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr10 23569380 23569726 23569528 Y NA NA NA NA NA NA OTUD1 156472 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 24417752 24418035 24417894 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1217 436077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 24754185 24754590 24754306 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP21 256007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 24996902 24997348 24997071 Y NA ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 13249 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 25079717 25079892 25079827 Y THNSL1,PRTFDC1,GPR158,ARHGAP21 NA ENKUR IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP21 69120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 25190845 25191315 25190947 Y NA PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 48218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 25240272 25240935 25240716 Y ARHGAP21,THNSL1,GPR158,PRTFDC1 PRTFDC1 NA NA NA NA PRTFDC1 739 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr10 26191189 26191209 26191199 Y NA MYO3A NA NA NA NA MYO3A 29987 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 27028326 27028583 27028339 Y MASTL,PDSS1,ABI1 PDSS1 NA NA NA NA PDSS1 43738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 27354652 27354729 27354695 Y NA ANKRD26 NA NA NA NA ANKRD26 32692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 28957755 28957993 28957831 Y BAMBI BAMBI BAMBI K562 ChIA-PET 22265404 BAMBI 6278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr10 29010919 29011116 29010957 Y NA BAMBI LYZL1,BAMBI IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 46648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 29228333 29228416 29228371 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 29228763 29229094 29228981 Y NA NA BAMBI,LOC100507605,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 264492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr10 29421778 29421876 29421872 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605,WAC IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 457507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 29543500 29543829 29543664 Y NA NA BAMBI,LYZL1,LOC100507605 IMR90 Hi-C 24141950 SVIL 479881 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 29922205 29922549 29922392 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 101161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 29944854 29945090 29945003 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 78620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 29948331 29948643 29948337 Y NA NA NA NA NA NA SVIL 75067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 30441068 30441357 30441150 Y NA KIAA1462 MTPAP,KIAA1462 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 38645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 30720407 30720642 30720475 Y MAP3K8 MAP3K8 NA NA NA NA MAP3K8 224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 30778206 30778683 30778387 Y MAP3K8 NA MAP3K8 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K8 57340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 30842081 30842302 30842110 Y NA NA MAP3K8,LOC729668,KIAA1462,MTPAP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP3K8 121215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 30892195 30892389 30892321 Y MAP3K8,ZNF438,ZNF438 NA NA NA NA NA MAP3K8 171329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 32047879 32048374 32048138 Y ZEB1 NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 167368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.21245379744864 chr10 32218329 32218518 32218508 Y NA ARHGAP12 NA NA NA NA ARHGAP12 2587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 32301568 32301771 32301670 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 41588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 32335843 32336217 32336161 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 7142 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 32668626 32668988 32668673 Y EPC1,C10orf68 EPC1 EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 EPC1 2900 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr10 32735821 32736068 32735865 Y NA CCDC7 C10orf68 MCF7 ChIA-PET 22265404 CCDC7 2753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr10 33269452 33269916 33269602 Y C10orf68 ITGB1 ITGB1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB1 22804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 33625950 33626342 33626167 Y NA NRP1 NA NA NA NA NRP1 2760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 33773823 33773922 33773871 Y NA NA NRP1 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 150633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 33798158 33798349 33798267 Y NA NA PARD3 IMR90 Hi-C 24141950 NRP1 174968 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 34062820 34062980 34062937 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 439630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35028968 35029134 35029048 Y NA NA NA NA NA NA PARD3 73119 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35102675 35103059 35102787 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35421114 35421320 35421181 Y CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 7395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 35424812 35424825 35424819 Y CCNY CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35425292 35425645 35425387 Y CUL2,CUL2,CCNY,CREM,CREM CUL2,CREM NA NA NA NA CREM 11573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35431185 35431238 35431212 Y NA CREM NA NA NA NA CREM 17466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35640077 35640405 35640144 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 106124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35717658 35717859 35717796 Y NA NA NA NA NA NA CCNY 183705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 35932153 35932694 35932189 Y FZD8 MIR4683,FZD8 NA NA NA NA FZD8 3791 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 42737855 42738010 42737875 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 227678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 42798094 42798242 42798168 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 167446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 42799437 42799735 42799586 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 165953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 42817169 42817557 42817529 Y NA NA NA NA NA NA CCNYL2 148131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 43600895 43601120 43601049 Y RASGEF1A RET,CSGALNACT2 NA NA NA NA RET 30420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 43761301 43761565 43761418 Y RASGEF1A RASGEF1A NA NA NA NA RASGEF1A 934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 43817898 43817965 43817923 Y NA FXYD4 ZNF487P IMR90 Hi-C 24141950 FXYD4 47125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF NA NA NA NA HNRNPF 48279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 44185196 44185271 44185205 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 42892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 45441757 45442014 45441853 Y ALOX5 RASSF4,C10orf10 NA NA NA NA RASSF4 10841 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 45914844 45915133 45915015 Y NA ALOX5 NA NA NA NA ALOX5 47183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 47655672 47656071 47655889 Y NA NA AGAP7 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-463P17.1 674126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 48323344 48323752 48323648 Y NA RP11-463P17.1,ZNF488 SYT15,GPRIN2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-463P17.1 6445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 49564940 49565014 49564977 Y NA NA ARHGAP22 IMR90 Hi-C 24141950 MAPK8 52242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 49811574 49811696 49811632 Y ARHGAP22 NA NA NA NA NA ARHGAP22 50614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 50508434 50508798 50508651 Y C10orf71 NA NA NA NA NA PGBD3 236288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 51488946 51489392 51489137 Y NCOA4,NCOA4,NCOA4 RP11-109G10.2 NA NA NA NA RP11-109G10.2 41180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 52083762 52084193 52084054 Y FAM21A NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 61024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 52167205 52167434 52167402 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2P1 144467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 52374532 52374543 52374538 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 8380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 52385542 52385659 52385602 Y NA SGMS1 NA NA NA NA SGMS1 2619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr10 53798976 53799363 53799139 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 272693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 399361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 55358740 55359098 55358883 Y NA NA NA NA NA NA DKK1 1286684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 59388391 59388635 59388513 Y NA NA NA NA NA NA IPMK 637059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 60026015 60026385 60026202 Y UBE2D1,IPMK IPMK,CISD1 NA NA NA NA IPMK 321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 61024836 61025127 61024964 Y PHYHIPL,PHYHIPL,SLC16A9,FAM13C,FAM13C NA NA NA NA NA FAM13C 95812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 61645173 61645419 61645305 Y NA CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 18995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 61664562 61664999 61664893 Y CCDC6 CCDC6 NA NA NA NA CCDC6 148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 63778860 63779091 63779011 Y ARID5B NA NA NA NA NA ARID5B 119801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 63913852 63914076 63913964 Y NA NA RTKN2,ARID5B,ZNF365 IMR90 Hi-C 24141950 RTKN2 112390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 65026237 65026642 65026597 Y NA NA NA NA NA NA NRBF2 135187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 65097775 65098183 65098051 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 86874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 65269177 65269730 65269542 Y NA JMJD1C,REEP3 REEP3,JMJD1C,LOC84989 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 REEP3 9393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 68010262 68010544 68010403 Y NA NA NA NA NA NA ANXA2P3 1426933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 68720281 68720686 68720475 Y LRRTM3 NA NA NA NA NA DNAJC12 875238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr10 69621525 69621936 69621738 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1,MYPN,HERC4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIRT1 20491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 69658139 69658146 69658142 Y HNRNPH3,SIRT1,SIRT1 SIRT1 HERC4 IMR90 Hi-C 24141950 SIRT1 15712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 69796463 69796828 69796573 Y HERC4 HERC4 NA NA NA NA HERC4 36277 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 70846057 70846170 70846083 Y NA VPS26A NA NA NA NA VPS26A 35098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 71827466 71827672 71827569 Y NA H2AFY2 NA NA NA NA H2AFY2 16914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 72082681 72083053 72082867 Y NA NA NA NA NA NA LRRC20 57329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 72165059 72165574 72165379 Y NA LRRC20,EIF4EBP2,NODAL NA NA NA NA EIF4EBP2 2924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 72253805 72253950 72253868 Y NA NODAL NA NA NA NA NODAL 48098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 72424506 72424875 72424691 Y ADAMTS14 ADAMTS14 KIAA1274,PRF1,ADAMTS14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADAMTS14 5684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 73026177 73026397 73026262 Y UNC5B NA NA NA NA NA SLC29A3 50618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 73398011 73398245 73398040 Y NA NA NA NA NA NA C10orf54 133010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 73568339 73568950 73568859 Y NA C10orf54,PSAP NA NA NA NA C10orf54 37084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 73599936 73600188 73600059 Y NA PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 8938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 73620184 73620641 73620392 Y DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP PSAP PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PSAP 11058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 73744363 73744592 73744410 Y NA NA NA NA NA NA PSAP 135237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 73986513 73986881 73986533 Y C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23 ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA ASCC1 11621 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 74032298 74032943 74032475 Y NA DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 74079380 74080359 74079580 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DDIT4,DNAJB12 DDIT4,ANAPC16 IMR90 Hi-C 24141950 DNAJB12 32629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 74091661 74092150 74091920 Y PSAP,DDIT4,DNAJB12 DNAJB12 NA NA NA NA DNAJB12 20838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 74917588 74917679 74917634 Y NA NUDT13,FAM149B1,ECD NA NA NA NA FAM149B1 8245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 74990824 74990933 74990931 Y NA DNAJC9,MRPS16,RP11-152N13.5 NA NA NA NA DNAJC9 15687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 75179357 75179732 75179545 Y ZMYND17 ANXA7,RP11-345K20.2 NA NA NA NA RP11-345K20.2 722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 75211378 75211476 75211427 Y NA ANXA7,RP11-345K20.2,RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-345K20.2 30924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 75348138 75348289 75348214 Y NA USP54 FAM149B1,PPP3CB,USP54,BMS1P4,SEC24C,SYNPO2L IMR90 Hi-C 24141950 USP54 35422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 75648556 75649146 75648996 Y ANXA7,NDST2 CAMK2G,PLAU SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK IMR90 Hi-C 24141950 CAMK2G 16213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 76866248 76866511 76866390 Y NA SAMD8,DUSP13 NA NA NA NA DUSP13 468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 79596032 79596523 79596221 Y NA NA NA NA NA NA DLG5 87855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 79670022 79670276 79670149 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 14102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 80122259 80122477 80122368 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 330741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 80684242 80684460 80684352 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 142332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 80830818 80831199 80831077 Y ZMIZ1 ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 4026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 80912242 80912363 80912303 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 85450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 80917330 80917751 80917473 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 90538 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 80990068 80990387 80990161 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 114838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 81001444 81002226 81001825 Y NA NA NA NA NA NA PPIF 102999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 81158970 81159167 81159085 Y NA ZCCHC24 NA NA NA NA ZCCHC24 44216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 82224459 82224735 82224582 Y NA TSPAN14 NA NA NA NA TSPAN14 12537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr10 82482092 82482104 82482098 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN14 270170 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 85937530 85937952 85937586 Y NA GHITM,CDHR1 NA NA NA NA CDHR1 14458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 88470805 88471213 88471023 Y NA LDB3,BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 43194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 88517208 88517667 88517486 Y GLUD1,BMPR1A BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 2801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 88631620 88631813 88631713 Y NA NA NA NA NA NA SNCG 84562 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 89508472 89508835 89508628 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P1 66850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 90598595 90599037 90598933 Y LIPN,IFIT3,IFIT3,IFIT2,ANKRD22 STAMBPL1 NA NA NA NA STAMBPL1 38454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 91010610 91010883 91010698 Y NA IFIT2 NA NA NA NA IFIT2 48829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 91020368 91020477 91020401 Y IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2 IFIT2 NA NA NA NA IFIT2 39235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 91837693 91837713 91837703 Y NA NA NA NA NA NA SNRPD2P1 101219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr10 93643606 93643969 93643849 Y NA FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 23271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr10 93647022 93647304 93647153 Y FGFBP3 FGFBP3,BTAF1 NA NA NA NA FGFBP3 19936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 95081157 95081194 95081175 Y O3FAR1 RP11-624L12.1 NA NA NA NA RP11-624L12.1 38842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 95195782 95196689 95196040 Y MYOF MYOF NA NA NA NA MYOF 43385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 95675431 95675709 95675545 Y NA SLC35G1 NA NA NA NA SLC35G1 23701 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 95766976 95767368 95767096 Y NA PLCE1 NA NA NA NA PLCE1 15230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 95873448 95873628 95873536 Y NA NA NA NA NA NA PLCE1 121702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 96943397 96943661 96943560 Y SORBS1,SORBS1 NA C10orf129,SORBS1 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM1 105120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 97024100 97024800 97024493 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 23981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 97026412 97026787 97026670 Y NA PDLIM1 NA NA NA NA PDLIM1 21994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 97168692 97169197 97168969 Y NA NA NA NA NA NA PDLIM1 119911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98308552 98308827 98308687 Y LCOR,C10orf12,ZNF518A,PIK3AP1,TM9SF3 TLL2,TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 36382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98332019 98332237 98332217 Y NA TM9SF3 NA NA NA NA TM9SF3 12972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98455139 98455586 98455510 Y LCOR,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1 NA NA NA NA PIK3AP1 22685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98468328 98468564 98468493 Y LCOR,C10orf12,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 9707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98476098 98476599 98476394 Y LCOR,TM9SF3,PIK3AP1 PIK3AP1,RPL13AP5 NA NA NA NA PIK3AP1 1672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98507799 98508110 98507962 Y LCOR,PIK3AP1 PIK3AP1 PIK3AP1,SLIT1 IMR90 Hi-C 24141950 RPL13AP5 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98638142 98638499 98638253 Y NA LCOR NA NA NA NA LCOR 48125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 98955508 98955686 98955604 Y C10orf62 SLIT1 NA NA NA NA SLIT1 11831 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 99096745 99096901 99096835 Y NA ARHGAP19,FRAT1,RP11-452K12.4,FRAT2 NA NA NA NA FRAT2 4287 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 99173709 99174019 99173866 Y FRAT1,ZFYVE27,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 PGAM1,RRP12,ZDHHC16,EXOSC1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 99174702 99174858 99174830 Y ZFYVE27,PI4K2A,RRP12 RRP12,PGAM1,EXOSC1,ZDHHC16 RRP12 K562 ChIA-PET 22265404 PGAM1 9059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 100993810 100993952 100993927 Y NA HPSE2 NA NA NA NA HPSE2 191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 101048499 101048591 101048547 Y NA CNNM1 NA NA NA NA CNNM1 38265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 101475394 101475766 101475528 Y NA CUTC,COX15 NA NA NA NA COX15 14091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 102030171 102030375 102030254 Y SEC31B CHUK,RP11-316M21.6,SNORA12,CWF19L1,BLOC1S2 NA NA NA NA CWF19L1 4734 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 102284995 102285353 102285150 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103124623 103124787 103124739 Y FBXW4 BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 103124787 103125187 103124970 Y NA BTRC DPCD,POLL IMR90 Hi-C 24141950 BTRC 12967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103453403 103453880 103453587 Y LDB1,BTRC,MGEA5 FBXW4 NA NA NA NA FBXW4 351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103656859 103657173 103657045 Y NA NA MGEA5,LOC100289509,KCNIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MGEA5 80163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103708018 103708327 103708173 Y NA NA NA NA NA NA C10orf76 105623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103877464 103877788 103877718 Y MGEA5,TMEM180,SUFU,PSD,FBXL15,C10orf76,LDB1 LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 103878662 103879287 103878814 Y NA LDB1,PPRC1,NOLC1 NA NA NA NA LDB1 452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 104683249 104683568 104683410 Y NA CNNM2 NA NA NA NA CNNM2 7199 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 104964563 104964973 104964825 Y NA NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 13507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 105208274 105208534 105208404 Y NA NA NA NA NA NA PDCD11 53869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105230970 105231363 105231243 Y NT5C2,CALHM2 NA CALHM2,PDCD11,CALHM1,USMG5 IMR90 Hi-C 24141950 PDCD11 76565 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105456300 105456542 105456434 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 156759 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105519063 105519154 105519109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 94147 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 81090 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105725440 105725838 105725745 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA SLK 481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 105805832 105806162 105806026 Y NA NA NA NA NA NA SFR1 73654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 106065731 106065880 106065781 Y NA GSTO2,ITPRIP NA NA NA NA ITPRIP 30282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 108349452 108349469 108349463 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 572823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 108496360 108496741 108496551 Y SORCS1 NA NA NA NA NA SORCS1 425551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 108852638 108852656 108852648 Y SORCS1 NA NA NA NA NA SORCS1 69636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 109673400 109673693 109673480 Y NA NA NA NA NA NA SORCS1 751108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr10 111694003 111694304 111694154 Y NA XPNPEP1 NA NA NA NA XPNPEP1 12692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 111971920 111972386 111972091 Y ADD3,MXI1,SMNDC1 MXI1 NA NA NA NA MXI1 6557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 112168008 112168205 112168118 Y DUSP5 NA DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP5 87391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 112402938 112403137 112402952 Y NA RBM20 NA NA NA NA RBM20 783 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 112466316 112466772 112466606 Y NA NA NA NA NA NA RBM20 64161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 112668159 112668425 112668161 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 8607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 112674359 112675211 112674854 Y NA PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6 NA NA NA NA BBIP1 1821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 114745782 114746117 114745950 Y TCF7L2 TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 37773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 114818562 114818849 114818630 Y HABP2 NA NA NA NA NA TCF7L2 110553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 114823270 114823456 114823363 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L2 115261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 115022033 115022434 115022235 Y NA NA VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 314024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 116255200 116255589 116255576 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1L2 92685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 116582671 116583074 116582920 Y NA FAM160B1 NA NA NA NA FAM160B1 3168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 120850460 120850786 120850708 Y NA EIF3A,FAM45A EIF3A,PRDX3,SFXN4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM45A 10812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 121030438 121030814 121030688 Y GRK5 NA NA NA NA NA PRDX3 94093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 121161203 121161864 121161442 Y EIF3A NA NA NA NA NA RGS10 138356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 121446860 121447228 121446967 Y NA BAG3,INPP5F NA NA NA NA INPP5F 36381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 121682284 121682432 121682358 Y NA MCMBP,SEC23IP NA NA NA NA SEC23IP 32061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 123268724 123269025 123268893 Y FGFR2,FGFR2,FGFR2,FGFR2 NA NA NA NA NA FGFR2 86947 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 123873239 123873409 123873290 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 126550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 123914446 123914761 123914722 Y NA NA NA NA NA NA TACC2 167757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 125730230 125730378 125730329 Y NA CPXM2 NA NA NA NA CPXM2 32447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 125954943 125955282 125955134 Y CHST15 NA CHST15 IMR90 Hi-C 24141950 CHST15 103737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 126748587 126748846 126748786 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 98893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 126768245 126768621 126768433 Y NA NA NA NA NA NA CTBP2 79118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 2683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 127751937 127752037 127751987 Y MMP21 NA NA NA NA NA FANK1 168829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 128595349 128595449 128595411 Y DOCK1 DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 3371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 129948422 129948582 129948473 Y NA MKI67 FAM196A,DOCK1,CLRN3,PTPRE,MKI67,GLRX3 IMR90 Hi-C 24141950 MKI67 25773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr10 129985931 129986341 129986216 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 63282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 130339551 130339892 130339738 Y NA NA NA NA NA NA MKI67 416902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 131669190 131669455 131669323 Y EBF3 NA NA NA NA NA EBF3 90650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 133793049 133793425 133793362 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 10 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 134043390 134043516 134043464 Y JAKMIP3 DPYSL4 NA NA NA NA DPYSL4 44986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 134260341 134260546 134260485 Y C10orf91 C10orf91 NA NA NA NA C10orf91 4510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr10 134349556 134349919 134349753 Y JAKMIP3,NKX6-2,C10orf92,INPP5A RP11-432J24.5,INPP5A NA NA NA NA INPP5A 232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr10 135092117 135092276 135092147 Y ADAM8,TUBGCP2 VENTX,ZNF511,TUBGCP2 NA NA NA NA ZNF511 27703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 316246 316608 316492 Y TALDO1,SIGIRR,DEAF1,ATHL1,IFITM2,IFITM1 ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3 NA NA NA NA IFITM1 4740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 334344 334553 334421 Y NA ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4 NA NA NA NA IFITM3 8807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr11 350841 351091 350968 Y NA IFITM2,IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 SIRT3,RIC8A,SCGB1C1,ODF3,BET1L,PSMD13,NLRP6,ATHL1,IFITM1,SIGIRR,ANO9,PKP3,IFITM2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 B4GALNT4 16705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 944711 944765 944751 Y NA CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 21817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 1089762 1090061 1089912 Y NA NA NA NA NA NA AP2A2 166868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 1793842 1794035 1793938 Y TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2 RP11-295K3.1,CTSD MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2 IMR90,MCF7,K562,H1ESC Hi-C,3C,ChIA-PET,5C 24141950,19890323,22265404,22955621 CTSD 10620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 23329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2643075 2643474 2643317 Y NA NA NA NA NA NA KCNQ1OT1 75750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2669931 2670236 2670070 Y INS,ASCL2,TRPM5 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 48988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 2714612 2714953 2714746 Y NA KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 4271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2847272 2847432 2847347 Y NA NA NA NA NA NA CDKN1C 57679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2883658 2883963 2883768 Y NA CDKN1C,SLC22A18 NA NA NA NA CDKN1C 21148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 2951529 2951649 2951619 Y KCNQ1,PHLDA2 CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2 NA NA NA NA PHLDA2 2844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 3077664 3078057 3077925 Y NA RNU1-91P,CARS NAP1L4 K562 ChIA-PET 22265404 CARS 821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 3090855 3091125 3090991 Y NA RNU1-91P,CARS NA NA NA NA CARS 14012 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 3443739 3443990 3443855 Y NA ZNF195,TSSC2 NA NA NA NA TSSC2 43548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 3833340 3833454 3833393 Y RRM1,NUP98,PGAP2,PGAP2,RHOG PGAP2,NUP98,RHOG,STIM1 NA NA NA NA NUP98 16318 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 3972663 3972822 3972742 Y STIM1 NA NA NA NA NA STIM1 98906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 6290237 6290402 6290320 Y NA FAM160A2,CCKBR,PRKCDBP NA NA NA NA CCKBR 11271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 6489893 6490567 6490471 Y OR56A4,OR56A1,OR56B4,OR52W1,OR2AG1,OR2AG2,OR10A5,OR10A4,OR10A2,OR6A2,DCHS1 TRIM3,ARFIP2,DNHD1 NA NA NA NA TRIM3 3122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 6523174 6523531 6523244 Y OR2D2 TRIM3,ARFIP2,DNHD1 NA NA NA NA DNHD1 6684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 6564206 6564247 6564227 Y NA DNHD1 NA NA NA NA DNHD1 47716 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 8723535 8723638 8723587 Y STK33 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 21577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 8730669 8730993 8730843 Y NA RPL27A NA NA NA NA RPL27A 28711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 8857868 8857938 8857900 Y NA NA NA NA NA NA ST5 72560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 8944739 8945112 8945060 Y ASCL3 ST5,AKIP1,TMEM9B-AS1,TMEM9B NA NA NA NA AKIP1 14053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 8988846 8989081 8988967 Y ZNF143,DENND5A,TMEM9B,NRIP3 TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2 NA NA NA NA TMEM9B 4288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 9018976 9019300 9019138 Y NA TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 4296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 9023312 9023663 9023569 Y ZNF143,IPO7,DENND5A,TMEM9B,NRIP3 TMEM9B-AS1,TMEM9B,RP11-467K18.2 NA NA NA NA NRIP3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 9250767 9251109 9250945 Y NA DENND5A NA NA NA NA DENND5A 33828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.21245379744864 chr11 9556408 9556424 9556416 Y NA WEE1 NA NA NA NA WEE1 36804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 9686542 9686911 9686729 Y ZNF143,SWAP70 SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 2918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 9697347 9697585 9697499 Y NA SWAP70 NA NA NA NA SWAP70 13723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr11 9732058 9732249 9732166 Y NA SWAP70,SBF2-AS1 NA NA NA NA SBF2-AS1 45590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 9907928 9908258 9908093 Y NA NA SWAP70,LOC440028,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2-AS1 130089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 9997247 9997641 9997474 Y AMPD3 NA NA NA NA NA SBF2-AS1 219408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 10003812 10004242 10004040 Y ADM NA NA NA NA NA SBF2-AS1 225973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 10373282 10373523 10373408 Y ADM,AMPD3 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 10373965 10374241 10374089 Y LYVE1,EIF4G2 ADM SBF2,MRVI1,MRVI1-AS1,ADM,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 49738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr11 10397619 10397698 10397657 Y AMPD3 NA SBF2,SWAP70,LOC283104,ADM,LOC440028,AMPD3,RNF141,MRVI1-AS1,MRVI1,CTR9,MTRNR2L8 IMR90 Hi-C 24141950 ADM 73392 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 10404161 10404389 10404339 Y ADM NA SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM IMR90 Hi-C 24141950 ADM 79934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 10735359 10735758 10735614 Y AMPD3 CTR9 MRVI1,MRVI1-AS1,RNF141,AMPD3,MTRNR2L8,LYVE1 IMR90 Hi-C 24141950 CTR9 34776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 10862862 10862982 10862965 Y NA SNORD97,EIF4G2,ZBED5 NA NA NA NA ZBED5 15361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 10935638 10935889 10935764 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 NA EIF4G2,LOC729013,ZBED5,USP47,DKK3,CTR9 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZBED5 57295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 10955517 10955651 10955533 Y NA NA EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZBED5 77174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 11713463 11713705 11713516 Y NA NA NA NA NA NA USP47 147265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 12698857 12698926 12698896 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 4888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA RASSF10 143692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA RASSF10 55073 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 13327996 13328024 13328011 Y NA ARNTL NA NA NA NA ARNTL 31797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 13598009 13598366 13598274 Y NA NA NA NA NA NA FAR1 89851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 14635727 14635946 14635944 Y NA PDE3B NA NA NA NA PDE3B 27323 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 15219194 15219222 15219209 Y INSC NA NA NA NA NA CYP2R1 307396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 16893238 16893541 16893423 Y NA NA NA NA NA NA RP11-466H18.1 101019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 17164162 17164523 17164517 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C2A 63007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 17183931 17184277 17184104 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA PIK3C2A 43253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 17230717 17231092 17230803 Y NA PIK3C2A,NUCB2 NA NA NA NA NUCB2 3017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr11 18426412 18426598 18426470 Y NA LDHA NA NA NA NA LDHA 12477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 19736892 19737150 19737126 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 366621 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 19748565 19748818 19748690 Y NA NA NA NA NA NA NAV2 378294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 20046945 20047208 20047086 Y NA NA NA NA NA NA DBX1 132951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 20072115 20072502 20072253 Y NA NA NA NA NA NA DBX1 107657 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 20134058 20134420 20134284 Y NA DBX1 NA NA NA NA DBX1 45739 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 22362163 22362363 22362263 Y FANCF,SLC17A6 NA NA NA NA NA ANO5 149441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 27140468 27140646 27140558 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 242769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 27419147 27419279 27419213 Y NA CCDC34 NA NA NA NA CCDC34 35732 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 27739901 27740316 27740092 Y BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF BDNF NA NA NA NA BDNF 1289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 27740535 27740662 27740569 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 31819497 31819881 31819763 Y NA RCN1 NA NA NA NA RCN1 12058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 32915475 32916456 32915913 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 2751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr11 33012698 33013071 33012885 Y NA DEPDC7,TCP11L1 NA NA NA NA DEPDC7 22339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 33209856 33210115 33209986 Y NA CSTF3 NA NA NA NA CSTF3 27939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 33778086 33778269 33778178 Y FBXO3 CD59,FBXO3 NA NA NA NA FBXO3 15820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 35109319 35109885 35109545 Y CD44 CD44 CD44,PDHX,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 CD44 48532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 35840381 35840713 35840619 Y NA NA NA NA NA NA LDLRAD3 122818 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 36331203 36331536 36331365 Y PRR5L COMMD9,PRR5L NA NA NA NA PRR5L 15365 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 36521882 36522155 36522112 Y NA TRAF6 NA NA NA NA TRAF6 7667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 37978500 37978723 37978612 Y NA NA NA NA NA NA C11orf74 1364449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 39959706 39959874 39959789 Y LRRC4C NA NA NA NA NA RP11-124G5.1 1598110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 44749241 44749630 44749607 Y TSPAN18 TSPAN18 PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 3226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 44882780 44883083 44882907 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 87757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 44883806 44884166 44884088 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 86674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 44903953 44904102 44903996 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 66738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 45047638 45048022 45047830 Y TSPAN18 NA NA NA NA NA TP53I11 76798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 45167156 45167357 45167300 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 138513 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 46004522 46004898 46004712 Y NA NA NA NA NA NA GYLTL1B 63350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 46077131 46077462 46077208 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 63523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 46143609 46143973 46143928 Y NA PHF21A,RP11-702F3.3 NA NA NA NA PHF21A 2624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr11 46275806 46275990 46275914 Y NA CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 21222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 47108178 47108230 47108204 Y HARBI1 NA NA NA NA NA ARFGAP2 88446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 47125777 47126225 47125967 Y NA NA NA NA NA NA ARFGAP2 70451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 47208524 47208884 47208580 Y PACSIN3,PACSIN3,NR1H3 ARFGAP2,PACSIN3,DDB2 NA NA NA NA PACSIN3 2530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 47421735 47422128 47421819 Y MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1 SLC39A13,PSMC3 SLC39A13 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A13 4555 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 47531687 47531996 47531879 Y SPI1,PTPRJ,FNBP4,CELF1,CELF1,CELF1 NA RAPSN IMR90 Hi-C 24141950 NDUFS3 52892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4,C1QTNF4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 47965488 47965599 47965552 Y NA RP11-793I11.1,PTPRJ PTPRJ IMR90 Hi-C 24141950 PTPRJ 34514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 48077375 48077584 48077563 Y FNBP4,PTPRJ NA NA NA NA NA PTPRJ 77262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 56980843 56981208 56981026 Y NA APLNR NA NA NA NA APLNR 21501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 57083068 57083441 57083322 Y NA TNKS1BP1,SSRP1 NA NA NA NA TNKS1BP1 6985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 57406709 57407290 57406997 Y OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6 SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5 NA NA NA NA AP000662.4 3212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 57559748 57559971 57559868 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,UBE2L6,CLP1,ZDHHC5 CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 41033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 58965379 58965764 58965549 Y PATL1,FAM111A,MPEG1 DTX4 NA NA NA NA DTX4 28476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 59524471 59524655 59524596 Y MS4A6A,MS4A6A,OSBP,PATL1,STX3 STX3 NA NA NA NA STX3 45542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 59582834 59583156 59582993 Y NA MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 6489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 59651741 59651793 59651768 Y NA NA NA NA NA NA MRPL16 75396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 60532534 60532714 60532624 Y MS4A1,MS4A13 NA NA NA NA NA CCDC86 74830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 60753567 60754105 60753691 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 63632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 60789194 60789499 60789348 Y SDHAF2,CD5,CD6 NA NA NA NA NA TMEM132A 99259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 60929738 60929978 60929839 Y NA VPS37C,PGA3 NA NA NA NA VPS37C 2649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 60934770 60935212 60935096 Y SLC15A3,TMEM138,SDHAF2,CYBASC3,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,VPS37C VPS37C,PGA3 VPS37C K562 ChIA-PET 22265404 VPS37C 7681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 61074897 61075402 61075197 Y CD6 VWCE,DAK,DDB1 NA NA NA NA VWCE 14001 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,TMEM258,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62143612 62143665 62143638 Y NA ASRGL1,RCC2P6 NA NA NA NA RCC2P6 6994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RCC2P6 75008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62226637 62226898 62226739 Y FTH1,WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 84573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62413039 62413428 62413234 Y NA MTA2,ROM1,EML3,B3GAT3,GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1 NA NA NA NA GANAB 935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,SNORA57,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62587560 62587930 62587905 Y NA TMEM179B,TMEM223,NXF1,STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA STX5 9630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 62624183 62624258 62624224 Y NA STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 2665 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 62625165 62625549 62625272 Y TUT1,METTL12,HNRNPUL2,SLC3A2 STX5,RP11-727F15.9,WDR74,SNHG1,SLC3A2 NA NA NA NA SLC3A2 3647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 HRASLS5,LGALS12,RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 63337722 63338129 63338119 Y NA RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 35441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 63496405 63496421 63496415 Y NAA40 RTN3,C11orf95 NA NA NA NA C11orf95 37692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 63685258 63686079 63685609 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 2942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr11 63687620 63687907 63687858 Y LGALS12,RCOR2 RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 5304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 64147622 64147982 64147957 Y NA RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 23002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 64238125 64238462 64238294 Y NA NA NRXN2,SLC22A12,RASGRP2,MAP4K2,SF1,EHD1 IMR90,H1ESC,HELA,K562 Hi-C,5C 24141950,22955621 RPS6KA4 113505 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65058176 65058598 65058417 Y EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 21691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65059026 65059409 65059335 Y EHD1,BATF2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2 NA NA NA NA CDC42EP2 20880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65185589 65187086 65186338 Y NA SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 1159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 65187297 65188198 65187553 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 SLC25A45,FRMD8,NEAT1 NEAT1 IMR90 Hi-C 24141950 NEAT1 47 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.31780874018429 chr11 65252951 65253044 65253026 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 7.79626576243807 chr11 65273934 65274467 65274182 Y NA MALAT1,SCYL1 LTBP3,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 10701 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65333490 65333816 65333671 Y SLC25A45,SIPA1,SIPA1,EIF1AD,CTSW,PCNXL3 SCYL1,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA SSSCA1 2085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65342581 65342818 65342732 Y TIGD3,SIPA1,SIPA1,DKFZp761E198,KCNK7,MAP3K11,EHBP1L1 SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1,MAP3K11,PCNXL3 NA NA NA NA EHBP1L1 1072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 66494780 66495327 66494982 Y SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2 SPTBN2,C11orf80 C11orf80 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SPTBN2 83 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 66717584 66717809 66717709 Y CLCF1,ADRBK1 PC NA NA NA NA PC 6038 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 66738286 66738892 66738415 Y POLD4,CLCF1,CLCF1,KDM2A,ADRBK1 PC PC,SYT12,RHOD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PC 14439 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 66882341 66882514 66882428 Y NA KDM2A SYT12,KDM2A,SSH3,PC,RHOD,C11orf80 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KDM2A 2226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 67388322 67388349 67388342 Y NA GSTP1,NDUFV1,NUDT8 NA NA NA NA NUDT8 7052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 67827034 67827402 67827396 Y PPP6R3,ACY3,SUV420H1,CHKA NDUFS8,TCIRG1 NA NA NA NA TCIRG1 22551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 68238826 68238975 68238901 Y TCIRG1,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,IGHMBP2,PPP6R3 PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 12640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 68273880 68274272 68274031 Y NA PPP6R3 NA NA NA NA PPP6R3 47694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 68611298 68611611 68611498 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 68722813 68723020 68722901 Y TPCN2 NA NA NA NA NA IGHMBP2 53503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 68921150 68921435 68921292 Y NA NA ORAOV1,CCND1,FGF19 IMR90 Hi-C 24141950 TPCN2 106785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 NA CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFITM9P 188820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 69451342 69451588 69451394 Y NA CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 2267 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 69452524 69453230 69453220 Y CCND1 CCND1,ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 69453520 69454472 69453912 Y NA ORAOV1 NA NA NA NA CCND1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 69586936 69586990 69586963 Y FGF4 FGF4 NA NA NA NA FGF4 1181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 70413927 70414164 70414002 Y NA NA NA NA NA NA AP000487.5 171333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 71404196 71404321 71404259 Y KRTAP5-11,FOLR1,FOLR1 NA NA NA NA NA FAM86C1 92235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 72003135 72003262 72003223 Y NA PHOX2A NA NA NA NA PHOX2A 48427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 72426186 72426236 72426211 Y ATG16L2,ARAP1 NA NA NA NA NA ARAP1 76408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 73014768 73014913 73014905 Y NA ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 2421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 73221521 73221768 73221630 Y PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A NA NA NA NA NA FAM168A 85466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 73490242 73490316 73490279 Y NA RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 6045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 73490470 73490918 73490608 Y UCP2 RAB6A,MRPL48 MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL48 5443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr11 73549407 73549618 73549556 Y PLEKHB1 PAAF1 NA NA NA NA PAAF1 36126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 74608675 74608873 74608772 Y NA XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 49372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 74857404 74857707 74857556 Y SLCO2B1 NA NA NA NA NA NEU3 160225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75041361 75041638 75041486 Y ARRB1 ARRB1 NA NA NA NA ARRB1 19235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75060875 75061139 75061045 Y UVRAG,SPCS2,NEU3,DGAT2,ARRB1 ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 2 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75186595 75186756 75186708 Y NA GDPD5 RPS3 IMR90 Hi-C 24141950 GDPD5 48192 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75265416 75265853 75265464 Y SERPINH1 GDPD5,SERPINH1 RPS3,GDPD5,KLHL35 IMR90 Hi-C 24141950 SERPINH1 5248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75794523 75794905 75794797 Y NA NA NA NA NA NA WNT11 124875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 76166443 76166917 76166638 Y NA RP11-111M22.3,C11orf30 NA NA NA NA C11orf30 12476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 76721586 76721786 76721728 Y ACER3 NA NA NA NA NA CAPN5 54193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 76883031 76883248 76883107 Y NA MYO7A NA NA NA NA MYO7A 45721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA NDUFC2-KCTD14 37557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 77938673 77938848 77938785 Y NA USP35,KCTD21 NA NA NA NA KCTD21 40805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr11 78025089 78025245 78025191 Y GAB2,GAB2 NA NA NA NA NA GAB2 102149 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 78060066 78060579 78060413 Y NA NA NA NA NA NA GAB2 66815 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 79148505 79148822 79148543 Y NA MIR708 NA NA NA NA MIR708 37352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 80411023 80411358 80411196 Y NA NA NA NA NA NA MIR708 1299870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 82961020 82961401 82961211 Y NA RP11-727A23.1,CCDC90B NA NA NA NA CCDC90B 34049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 111746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 84093911 84093923 84093916 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 927655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 86178922 86179317 86178974 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 167669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 86451588 86451883 86451813 Y NA PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 48218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 86792626 86792948 86792684 Y NA TMEM135 NA NA NA NA TMEM135 45740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 87043104 87043447 87043253 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 296218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 88041244 88041443 88041379 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 27512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 90171328 90171529 90171499 Y NA NA NA NA NA NA RP11-121L10.3 157600 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 91958948 91959142 91959077 Y FAT3 NA FAT3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 969988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 92767972 92767992 92767983 Y NA NA SLC36A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC36A4 161138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 94987550 94987767 94987639 Y NA SESN3 NA NA NA NA SESN3 23845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 95525355 95525734 95525518 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 3782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 95778897 95779169 95779022 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MTMR2 122418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 95987343 95987574 95987537 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 86770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 95995362 95995593 95995538 Y FAM76B,MAML2 NA NA NA NA NA MAML2 78751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 96024131 96024308 96024240 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 50036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 100590591 100590889 100590693 Y NA ARHGAP42 NA NA NA NA ARHGAP42 34207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 102462991 102463039 102463015 Y BIRC3,BIRC2,MMP20 NA NA NA NA NA MMP7 63507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 102956908 102957200 102957055 Y NA DCUN1D5,DYNC2H1 NA NA NA NA DCUN1D5 3744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 103281581 103281752 103281672 Y NA RP11-37O16.8 NA NA NA NA RP11-37O16.8 3196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 105516722 105517118 105516920 Y GRIA4,GRIA4,KIAA1826 NA NA NA NA NA RNU4-55P 176242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 105674568 105674985 105674652 Y KBTBD3,AASDHPPT,GRIA4,GRIA4,KIAA1826 RNU4-55P NA NA NA NA RNU4-55P 18375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 107727726 107727971 107727842 Y NA RP11-832N8.1 NA NA NA NA RP11-832N8.1 49175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 107966906 107967320 107967120 Y NA ACAT1 ACAT1 IMR90 Hi-C 24141950 ACAT1 22923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 109961258 109961641 109961417 Y ZC3H12C ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 109990513 109990553 109990536 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 28426 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 110002516 110002895 110002708 Y RDX ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 40429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr11 110182497 110182806 110182740 Y NA RDX,RP11-347E10.1 RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 17050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 110361694 110361932 110361872 Y ZC3H12C,RDX,FDX1 NA NA NA NA NA FDX1 63087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 111560054 111560414 111560322 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 PPP2R1B 74737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 111603895 111604265 111603971 Y NA PPP2R1B NA NA NA NA PPP2R1B 30886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 111849134 111849433 111849303 Y SIK2,CRYAB,DIXDC1,DIXDC1 DLAT NA NA NA NA DLAT 44105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 111853928 111854208 111854100 Y NA DLAT NA NA NA NA DLAT 39330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 112016607 112016779 112016693 Y DIXDC1 IL18 NA NA NA NA IL18 16061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 112655698 112656077 112655902 Y NA NA NCAM1 IMR90 Hi-C 24141950 NCAM1 173920 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 112839963 112840314 112840138 Y NCAM1 NCAM1 NA NA NA NA NCAM1 9966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 113708252 113709087 113708915 Y CLDN25 USP28 NA NA NA NA USP28 35205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 113962751 113963246 113962839 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 163263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 114037766 114038216 114037805 Y NA NA NA NA NA NA NNMT 88293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 114162916 114163328 114163238 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 36407 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 114288977 114289308 114289144 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 18800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 116061103 116061309 116061204 Y NA NA CADM1,FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 LINC00900 431758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 116271769 116271780 116271773 Y NA NA NA NA NA NA BUD13 369924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 116462532 116462616 116462574 Y NA NA FAM55B IMR90 Hi-C 24141950 BUD13 179088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 116723326 116723638 116723620 Y SIK3 NA NA NA NA NA ZNF259 66560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 116790672 116791048 116790863 Y NA NA APOA4,APOA1,APOC3 IMR90 Hi-C 24141950 AP000936.1 113719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 116867531 116867975 116867966 Y NA AP000936.1 NA NA NA NA AP000936.1 36792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 117016262 117016599 117016456 Y NA SIK3,PAFAH1B2,SIDT2 NA NA NA NA PAFAH1B2 3279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 117745558 117745882 117745720 Y DSCAML1,SCN4B,SCN2B,FXYD6,FXYD6 FXYD6-FXYD2,FXYD6 NA NA NA NA FXYD6-FXYD2 176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 118187372 118187677 118187544 Y DDX6,UBE4A,MLL,MPZL3,CD3E,CD3G,CD3D UBE4A NA NA NA NA UBE4A 40623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 118663387 118663780 118663691 Y NA DDX6 NA NA NA NA DDX6 3529 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,UPK2,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 119239128 119239276 119239217 Y NA MCAM,RNF26,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2-AS1 11212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA KRT8P7 TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 KRT8P7 17585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr11 119540378 119540644 119540511 Y NA NA NA NA NA NA PVRL1 57150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 119598046 119598312 119598172 Y USP2 PVRL1 NA NA NA NA PVRL1 252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 119612950 119613345 119613188 Y NA PVRL1 PVRL1,TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 15156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 119703414 119703632 119703459 Y NA NA TRIM29 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 105620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 120083069 120083545 120083438 Y GRIK4,ARHGEF12,OAF OAF,POU2F3 NA NA NA NA OAF 3594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 120895811 120895984 120895886 Y GRIK4,TBCEL,TBCEL,TECTA TBCEL NA NA NA NA TBCEL 3030 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 121289334 121289764 121289479 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 31148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 121593077 121593718 121593342 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 272165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 121712728 121712747 121712738 Y NA NA MIR125B1,MIR100HG IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 272284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 122100461 122100655 122100524 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 115430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 122100877 122101142 122101009 Y NA NA MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-166D19.1 115846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 122311334 122311672 122311591 Y NA RP11-820L6.1 SC5DL,MIR100HG,MIR125B1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-820L6.1 19755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 122596029 122596361 122596043 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 71646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 122608190 122608588 122608260 Y NA NA NA NA NA NA UBASH3B 83807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 122888881 122889273 122889127 Y NA RPL34P23,SNORD14D,SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA RPL34P23 15302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 123350505 123350682 123350594 Y NA NA CLMP,MIR4493,GRAMD1B IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 51447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 123353850 123354009 123353930 Y NA NA CLMP IMR90 Hi-C 24141950 AP000783.1 54792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 123407861 123408201 123408031 Y NA NA NA NA NA NA AP000783.1 108803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 123414630 123415056 123414666 Y NA NA NA NA NA NA SCN3B 108896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 123613222 123613605 123613414 Y NA ZNF202,RNU1-21P NA NA NA NA ZNF202 2839 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 123613702 123613859 123613783 Y OR4D5,OR10G4,OR8D4,OR10S1,OR8G2,OR6T1,OR10G7,OR6X1,OR6M1 ZNF202,RNU1-21P NA NA NA NA ZNF202 3319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr11 123945702 123946055 123945778 Y OR8B12,VWA5A VWA5A VWA5A,OR8G1,OR8D2 IMR90 Hi-C 24141950 VWA5A 38014 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125037243 125037532 125037366 Y NA PKNOX2 NA NA NA NA PKNOX2 4660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125146411 125146772 125146529 Y NA NA NA NA NA NA PKNOX2 113828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125246008 125246410 125246210 Y NA NA NA NA NA NA FEZ1 117803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125937888 125938141 125938004 Y NA CDON NA NA NA NA CDON 6658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125974412 125974829 125974525 Y NA CDON HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 43182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 126029421 126029682 126029619 Y NA FAM118B,RPUSD4 HYLS1,CDON IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 49627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr11 126210041 126210184 126210131 Y NA DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4 NA NA NA NA ST3GAL4 13351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 130743628 130743895 130743754 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 40509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 131300322 131300556 131300481 Y NA NA NA NA NA NA NTM 61949 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 131996641 131997035 131996986 Y NTM NA NA NA NA NA NTM 758268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 132409803 132410133 132410132 Y NA NA NA NA NA NA OPCML 990281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 132940132 132940357 132940242 Y OPCML NA NA NA NA NA OPCML 460057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr11 133919324 133919581 133919497 Y IGSF9B JAM3 NA NA NA NA JAM3 17239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr11 133920876 133920983 133920947 Y B3GAT1,SPATA19,JAM3 JAM3 NA NA NA NA JAM3 15837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8,GLB1L3 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr11 134708086 134708460 134708277 Y NA NA LOC283177 IMR90 Hi-C 24141950 B3GAT1 428274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr11 134863685 134863877 134863782 Y NA NA NA NA NA NA B3GAT1 583873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 298364 298488 298415 Y IQSEC3 NA NA NA NA NA CCDC77 197951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 680187 680377 680237 Y NA NA NA NA NA NA RP11-218M22.1 57680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 1026879 1027238 1027070 Y NA NA NA NA NA NA RAD52 69981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA FBXL14 293074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 1532185 1532472 1532256 Y ERC1 NA NA NA NA NA FBXL14 168859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 1714275 1714637 1714592 Y NA FBXL14 FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FBXL14 12944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 1770869 1771337 1771069 Y LRTM2,ADIPOR2 ADIPOR2 NA NA NA NA ADIPOR2 24403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 2026044 2026229 2026139 Y CACNA2D4 NA NA NA NA NA CACNA1C 51723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 4027276 4027298 4027287 Y FGF23 PARP11 CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 46668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 4131276 4131377 4131327 Y CCND2 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 150668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 4140182 4140815 4140542 Y CCND2,PARP11 NA CCND2 IMR90 Hi-C 24141950 PARP11 159574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 4448343 4448720 4448381 Y PARP11,CCND2,C12orf5 C12orf5 NA NA NA NA C12orf5 19972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 4666420 4666590 4666540 Y NA C12orf4,RAD51AP1,DYRK4 NA NA NA NA DYRK4 2780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 4770172 4770413 4770176 Y NA AKAP3,NDUFA9 NA NA NA NA NDUFA9 13911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 4880425 4880454 4880440 Y NA KCNA6 NA NA NA NA KCNA6 35888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 4935579 4936010 4935701 Y KCNA1,KCNA6 KCNA6 NA NA NA NA KCNA6 19237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 5589537 5589706 5589616 Y NA NA NA NA NA NA NTF3 50259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6187612 6187773 6187703 Y NA NA NA NA NA NA CD9 119108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 6276499 6276627 6276569 Y VAMP1,TNFRSF1A CD9 VWF,CD9,PLEKHG6 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 30254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9,RP1-96H9.5 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA RP1-96H9.5,PLEKHG6 VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-96H9.5 10231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA RP1-96H9.5,PLEKHG6,TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHG6 12935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6432315 6432644 6432443 Y NA PLEKHG6,TNFRSF1A NA NA NA NA PLEKHG6 14713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6445143 6445640 6445507 Y VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A PLEKHG6,TNFRSF1A,SCNN1A NA NA NA NA TNFRSF1A 3640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 6663248 6663743 6663420 Y GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1 SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2 NA NA NA NA IFFO1 9 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 6873427 6873901 6873603 Y C12orf53,ENO2,CLSTN3,ATN1,PTMS,GPR162 COPS7A,PTMS,MLF2,CD4 LEPREL2,CDCA3,TPI1,CD4,GPR162,SPSB2,GNB3,USP5 IMR90 Hi-C 24141950 MLF2 740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 6962211 6962407 6962304 Y GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1 GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2 NA NA NA NA USP5 2919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 7040569 7040832 7040702 Y NA SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 8943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 7058563 7058923 7058712 Y PEX5,VAMP1,CD4,CD4,PTPN6 ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S NA NA NA NA RNU7-1 7584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 7104040 7104360 7104246 Y NA EMG1,U47924.27,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3 NA NA NA NA C1S 9689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.63736139234592 chr12 7790789 7791157 7790868 Y NA NA NA NA NA NA GDF3 55215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 7792912 7793287 7793081 Y PEX5,PEX5,NANOG,DPPA3,SLC2A14,GDF3 NA NA NA NA NA GDF3 53085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr12 8013004 8013217 8013212 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A3 73654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 8112195 8112747 8112462 Y NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3 K562 ChIA-PET 22265404 SLC2A3 25324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 15.6978864676118 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 8797579 8797828 8797667 Y NA SCARNA11,RIMKLB NA NA NA NA RIMKLB 34368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 8840377 8840836 8840579 Y RIMKLB RIMKLB RIMKLB MCF7 ChIA-PET 22265404 RIMKLB 8181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr12 8966613 8966834 8966743 Y CLEC6A,CLEC4E,PHC1,M6PR A2ML1-AS1 A2ML1 IMR90 Hi-C 24141950 A2ML1-AS1 14709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 8971788 8972170 8971968 Y NA A2ML1-AS1 A2ML1 IMR90 Hi-C 24141950 A2ML1-AS1 9373 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 9059535 9059596 9059566 Y PHC1 PHC1,M6PR NA NA NA NA PHC1 4896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 9060195 9060360 9060254 Y PHC1 PHC1,M6PR NA NA NA NA PHC1 4132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr12 9064281 9064821 9064606 Y NA M6PR M6PR IMR90 Hi-C 24141950 PHC1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 9065319 9065715 9065510 Y PHC1 PHC1,M6PR M6PR IMR90 Hi-C 24141950 PHC1 827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 9986583 9986922 9986755 Y NA NA NA NA NA NA RP11-705C15.4 187978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr12 10272963 10273373 10273241 Y NA OLR1 NA NA NA NA OLR1 49364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 10306018 10306454 10306037 Y NA OLR1 NA NA NA NA OLR1 16283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 10517487 10517775 10517755 Y NA NA NA NA NA NA GABARAPL1 154430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 10538589 10538605 10538596 Y KLRC4-KLRK1,KLRK1,KLRC4 NA NA NA NA NA GABARAPL1 175532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 10666685 10666858 10666772 Y NA NA NA NA NA NA MAGOHB 97364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11221356 11221421 11221389 Y NA NA NA NA NA NA TAS2R14 100751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11755379 11755464 11755421 Y NA ETV6 ETV6 IMR90 Hi-C 24141950 ETV6 45324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11828862 11829235 11828994 Y NA ETV6 NA NA NA NA ETV6 28074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11864651 11864937 11864724 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 63863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11919566 11919967 11919675 Y BCL2L14,ETV6 NA NA NA NA NA ETV6 118778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 11949422 11949819 11949574 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 148634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11966137 11966507 11966203 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 165349 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 11987992 11988316 11988087 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 187204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12032964 12033203 12033084 Y BCL2L14 NA NA NA NA NA RP11-267J23.4 228894 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12111679 12111898 12111693 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-267J23.4 150199 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12185852 12185959 12185898 Y ETV6,BCL2L14 NA ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-267J23.4 76138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12711175 12711335 12711320 Y NA DUSP16 NA NA NA NA DUSP16 1982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12711400 12711706 12711553 Y BCL2L14,DUSP16 DUSP16 LOH12CR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 DUSP16 1611 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 12766295 12766634 12766503 Y DUSP16,CREBL2 CREBL2 NA NA NA NA CREBL2 3534 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 13251023 13251431 13251083 Y EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 55805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 13408937 13409175 13409167 Y NA NA HTR7P1,HEBP1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 61287 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 15951437 15951560 15951539 Y NA NA EPS8,PTPRO MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPS8 81703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 16899142 16899376 16899259 Y NA NA NA NA NA NA LMO3 137614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 19260911 19261231 19261176 Y NA PLEKHA5 PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 19417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 19291558 19291779 19291581 Y AEBP2,PLEKHA5 PLEKHA5 NA NA NA NA PLEKHA5 10910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 19496981 19496995 19496989 Y NA NA NA NA NA NA AEBP2 57984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 19557871 19558201 19558036 Y NA AEBP2 AEBP2 IMR90 Hi-C 24141950 AEBP2 2892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2,EEF1A1P4 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20004635 20004650 20004642 Y NA NA PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 87805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20061866 20062155 20061952 Y NA RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 30300 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20069508 20069793 20069676 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 22662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20099675 20099840 20099742 Y PDE3A RP11-405A12.1 LOC100506393,PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 7220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20124309 20124606 20124452 Y PDE3A RP11-405A12.1 PDE3A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-405A12.1 31854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 20780077 20780376 20780084 Y LST-3TM12,PDE3A NA NA NA NA NA PDE3A 259898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 21428924 21429039 21428982 Y SLCO1B3,SLCO1B1,SLCO1A2,KCNJ8,GYS2,SLCO1A2 NA NA NA NA NA PYROXD1 159510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 23779855 23779927 23779875 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 322039 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 23934001 23934216 23934209 Y SOX5 NA NA NA NA NA SOX5 167750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 25008843 25009219 25009048 Y NA NA NA NA NA NA BCAT1 91174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 25053045 25053436 25053335 Y KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 46957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 25075175 25075409 25075293 Y KRAS,BCAT1,BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 24984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr12 25402760 25403150 25403054 Y LRMP,CASC1,KRAS KRAS NA NA NA NA KRAS 890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 25538390 25538869 25538521 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 16493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA RNU4-67P BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-67P 15955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.52851862565559 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA BHLHE41 246476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 27174273 27174510 27174392 Y C12orf71 TM7SF3,MED21 NA NA NA NA MED21 794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 27532512 27532752 27532665 Y C12orf71 ARNTL2 NA NA NA NA ARNTL2 48725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 28024037 28024193 28024103 Y NA NA MRPS35,PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 MRPS35 162331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 28141959 28142165 28142081 Y NA NA PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 142017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 28275745 28275985 28275876 Y NA CCDC91 PTHLH IMR90 Hi-C 24141950 CCDC91 8197 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 29903685 29903894 29903854 Y NA TMTC1 NA NA NA NA TMTC1 31798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 30975226 30975478 30975347 Y NA LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 29249 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 31464460 31464546 31464537 Y NA FAM60A NA NA NA NA FAM60A 13446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 31523933 31524084 31523973 Y DDX11,METTL20,FAM60A,FAM60A FAM60A NA NA NA NA FAM60A 45941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 31754010 31754391 31754188 Y DENND5B,METTL20 DENND5B-AS1,DENND5B,METTL20 DENND5B IMR90 Hi-C 24141950 DENND5B 11979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 31804886 31805136 31805063 Y NA METTL20 NA NA NA NA METTL20 6792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.84807127781722 chr12 32380941 32381343 32381040 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 123172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 32426821 32426960 32426892 Y NA NA NA NA NA NA BICD1 169052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 32465088 32465196 32465142 Y FGD4,BICD1 NA NA NA NA NA BICD1 207319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 32559552 32559716 32559634 Y BICD1 NA BICD1,FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 270418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 32635235 32635487 32635321 Y NA NA FGD4 IMR90 Hi-C 24141950 DNM1L 194647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 32738766 32738845 32738790 Y NA NA NA NA NA NA DNM1L 91289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 33741113 33741380 33741221 Y NA NA SYT10,YARS2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ALG10 431836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 34846341 34846449 34846401 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 445925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr12 38493611 38493806 38493706 Y NA NA NA NA NA NA ALG10B 214574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 39766876 39767120 39766998 Y NA NA NA NA NA NA KIF21A 68072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 40382618 40382994 40382971 Y LRRK2 NA NA NA NA NA SLC2A13 114897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 40467954 40468269 40468112 Y NA SLC2A13 NA NA NA NA SLC2A13 29622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 40596989 40597248 40597051 Y NA NA NA NA NA NA SLC2A13 99098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 42734111 42734478 42734288 Y NA ZCRB1 NA NA NA NA ZCRB1 16191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 42825856 42826146 42826103 Y YAF2,YAF2,YAF2 NA NA NA NA NA ZCRB1 107936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr12 43666196 43666292 43666244 Y NA NA PRICKLE1,YAF2 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS20 277432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 44104293 44104449 44104371 Y NA PUS7L,IRAK4 NA NA NA NA PUS7L 46171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 44386878 44387178 44387042 Y NA NA NA NA NA NA TMEM117 159108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 46832663 46832984 46832824 Y NA NA SLC38A2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 57201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 46918651 46918824 46918737 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 143189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 46942703 46943018 46942760 Y NA NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 167241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 47612205 47612473 47612375 Y FAM113B NA NA NA NA NA RPAP3 485371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,CCDC65 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC65 18267 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49380850 49380994 49380918 Y DHH,CCDC65 ARF3,RP11-386G11.5,PRKAG1 NA NA NA NA RP11-386G11.5 9156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49508076 49508435 49508256 Y NA RHEBL1,LMBR1L,RP11-386G11.10,TUBA1B NA NA NA NA LMBR1L 5393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49595765 49596022 49595888 Y LMBR1L TUBA1C,TUBA1A TUBA1A,TUBA1B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TUBA1A 14658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,SPATS2 NA NA NA NA SPATS2 18304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 49866902 49867154 49867028 Y PRPF40B,PRPF40B NA NA NA NA NA KCNH3 63786 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 50221084 50221421 50221231 Y NCKAP5L NCKAP5L,BCDIN3D NA NA NA NA NCKAP5L 551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 50900445 50901076 50900765 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 3677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 50911573 50911988 50911666 Y SLC11A2,DIP2B DIP2B NA NA NA NA DIP2B 14805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 50913232 50913640 50913328 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 16464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 50931365 50931732 50931390 Y NA DIP2B NA NA NA NA DIP2B 34597 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 51035200 51035582 51035391 Y NA NA NA NA NA NA ATF1 119911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 51057988 51058419 51058261 Y NA NA NA NA NA NA ATF1 97074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 51608031 51608240 51608135 Y BIN2 TFCP2,POU6F1,DAZAP2 NA NA NA NA POU6F1 1237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 51768324 51768713 51768389 Y NA SLC4A8,GALNT6 BIN2,CELA1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC4A8 14388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 51786511 51786834 51786676 Y SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,BIN2,GALNT6 SLC4A8,GALNT6 NA NA NA NA GALNT6 1860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 52146424 52146626 52146525 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD33 133118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 52241099 52241559 52241297 Y NA ANKRD33 SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 38185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 ANKRD33 SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 37418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr12 52242460 52242886 52242778 Y SLC4A8,ANKRD33 ANKRD33 SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 36858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 52243040 52243117 52243080 Y SCN8A,ACVRL1,FIGNL2 ANKRD33 SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 36627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 52249721 52249808 52249784 Y SLC4A8,FIGNL2 ANKRD33 BIN2,SCN8A,SLC4A8,ANKRD33,ACVR1B,GALNT6,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 29936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 52257333 52257459 52257384 Y NA ANKRD33 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 22285 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 52257879 52258204 52258030 Y NA ANKRD33 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 21540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA ANKRD33 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD33 16436 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 52418719 52418897 52418793 Y NR4A1,ACVRL1,GRASP,NR4A1 GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 4103 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 52423514 52423824 52423679 Y NA GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 8898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 52426547 52427164 52426822 Y NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP GRASP,NR4A1,C12orf44 NA NA NA NA NR4A1 11931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 52540964 52541526 52541224 Y KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44 NA KRT8,KRT84 MCF7 ChIA-PET 22265404 C12orf44 79934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53312254 53312405 53312393 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 28250 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53336677 53336830 53336786 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 3825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53368339 53368600 53368386 Y NA KRT18,KRT8,EIF4B KRT8,EIF4B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT8 26601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53398446 53398634 53398511 Y NA EIF4B,TENC1 NA NA NA NA EIF4B 504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 53765037 53765535 53765115 Y CSAD,ITGB7,PFDN5,SP1,SP1,PRR13 AAAS,SP1 SP1,AAAS,SP7,PCBP2,PRR13,AMHR2,LOC100652999,MAP3K12,TARBP2,NPFF,ATF7 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP1 6425 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 54090300 54090537 54090319 Y NA ATP5G2,CALCOCO1 NA NA NA NA ATP5G2 21108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 54133160 54133497 54133297 Y ATF7,ATP5G2 CALCOCO1,SNORD81 ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5 IMR90 Hi-C 24141950 CALCOCO1 13631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr12 54563652 54563918 54563802 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 16860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 54610828 54611089 54611007 Y NA SMUG1 NA NA NA NA SMUG1 30050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 54745877 54746035 54745904 Y NA ZNF385A NA NA NA NA ZNF385A 37047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 54752671 54753884 54753119 Y NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84 ZNF385A NA NA NA NA ZNF385A 29198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 54949338 54949510 54949424 Y NA PPP1R1A NA NA NA NA PPP1R1A 30933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 55806634 55807051 55806823 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 266279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 55807914 55808439 55808095 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 56147551 56147694 56147624 Y NA BLOC1S1,RP11-644F5.10,ITGA7,RP11-644F5.11,CD63,GDF11 NA NA NA NA GDF11 12487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 56218960 56219310 56218990 Y OR6C3,OR6C65,OR6C2,OR6C4,OR10P1,IKZF4 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P NA NA NA NA TMEM198B 2219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 56219844 56220081 56219962 Y OR6C3 SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,RNU1-69P NA NA NA NA TMEM198B 1448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 56275045 56275257 56275151 Y OR6C65,OR6C76,OR6C2,OR6C4,OR10P1 RNU1-69P,DGKA,WIBG NA NA NA NA RNU1-69P 8583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 56294124 56294208 56294164 Y NA RNU1-69P,DGKA,WIBG NA NA NA NA DGKA 24895 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 56614575 56614693 56614609 Y NA SMARCC2,RP11-977G19.5,RNF41,ANKRD52,COQ10A NA NA NA NA RNF41 858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 56831514 56831759 56831654 Y IKZF4 TIMELESS,SPRYD4,GLS2 NA NA NA NA TIMELESS 9428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 56877461 56877501 56877482 Y NA TIMELESS,SPRYD4,GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA GLS2 2697 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,SNORD59A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr12 57077806 57078249 57078184 Y COQ10A,PAN2,PAN2 BAZ2A,SNORD59A,ATP5B,PTGES3,NACA NA NA NA NA PTGES3 1910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 57094657 57094840 57094721 Y STAT2,STAT6,NAB2 PTGES3,NACA,PRIM1 NA NA NA NA PTGES3 14498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31,AGAP2 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 58238225 58238735 58238639 Y AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2 NA NA NA NA NA CTDSP2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 58819259 58819609 58819396 Y LRIG3,LRIG3 NA NA NA NA NA XRCC6BP1 485935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 62396688 62396737 62396702 Y FAM19A2 NA NA NA NA NA USP15 255382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 62772980 62773240 62773147 Y MON2,USP15 NA NA NA NA NA MON2 85357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 62796049 62796447 62796072 Y NA NA NA NA NA NA MON2 62150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 63026443 63026842 63026744 Y NA RP11-631N16.2,MIRLET7I NA NA NA NA MIRLET7I 30977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 63096618 63097002 63096657 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 101152 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 63126917 63127025 63126971 Y C12orf61 NA NA NA NA NA MIRLET7I 131451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 63149457 63149757 63149616 Y NA NA NA NA NA NA MIRLET7I 153991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 63179567 63180349 63179723 Y NA NA NA NA NA NA PPM1H 146468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 65019058 65019979 65019210 Y TBK1,RASSF3,GNS RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 16765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 65077868 65077886 65077879 Y RASSF3,LEMD3 NA NA NA NA NA GNS 73341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 65176068 65176517 65176160 Y TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS GNS NA NA NA NA GNS 24841 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66012877 66013074 66012996 Y NA NA RPSAP52,HMGA2,MSRB3 IMR90 Hi-C 24141950 HMGA2 202837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66135126 66135637 66135353 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 80274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66216365 66216749 66216512 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 66242690 66243107 66242729 Y HMGA2 HMGA2 NA NA NA NA HMGA2 26779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 66285844 66286273 66285967 Y IRAK3 NA NA NA NA NA HMGA2 69933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66316992 66317322 66317175 Y IRAK3 NA NA NA NA NA HMGA2 101081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 67404997 67405349 67405173 Y NA NA NA NA NA NA CAND1 255712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 68166573 68166761 68166704 Y NA NA NA NA NA NA DYRK2 126455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 68752517 68752875 68752786 Y NA MDM1 RAP1B,SNORA70G,LOC100507250,NUP107,MDM2,MDM1,SLC35E3 IMR90 Hi-C 24141950 MDM1 28356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 68832634 68832995 68832815 Y NA RP11-81H14.2 RAP1B,SNORA70G IMR90 Hi-C 24141950 RP11-81H14.2 10448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 68932536 68932735 68932704 Y NA NA MDM1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1B 69884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 69006143 69006530 69006154 Y CPM,IFNG,RAP1B RAP1B,RP11-254B13.3 NA NA NA NA RAP1B 3524 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 69686526 69686874 69686654 Y NA NA NA NA NA NA CPSF6 55209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 69868200 69868446 69868430 Y CPSF6,YEATS4,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2 FRS2 NA NA NA NA FRS2 6071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 70327018 70327311 70327165 Y NA NA PTPRB,PTPRR,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3IP 196557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 70644560 70644959 70644584 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 9420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 70937766 70937789 70937778 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 77906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 71039604 71039990 71039715 Y NA NA NA NA NA NA RP11-588H23.3 179744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 72125908 72126059 72125950 Y NA TMEM19,RAB21 NA NA NA NA RAB21 20595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 73660341 73660575 73660458 Y NA NA NA NA NA NA TRHDE-AS1 993654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 76206207 76206725 76206399 Y GLIPR1 NA NA NA NA NA PHLDA1 218987 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 76283192 76283327 76283260 Y NA NA PHLDA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PHLDA1 142385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 76338350 76338647 76338468 Y GLIPR1,PHLDA1 NA PHLDA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PHLDA1 87065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 76414369 76415079 76414685 Y NA PHLDA1 NA NA NA NA PHLDA1 10633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 76429051 76429248 76429150 Y NA PHLDA1,NAP1L1 NA NA NA NA PHLDA1 3339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 76919848 76920276 76920185 Y ZDHHC17,OSBPL8 OSBPL8 NA NA NA NA OSBPL8 31313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 77156465 77156658 77156516 Y NA ZDHHC17 NA NA NA NA ZDHHC17 1097 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 77670807 77670928 77670868 Y NA RP1-34H18.1 NA NA NA NA RP1-34H18.1 45493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 77747953 77748163 77748058 Y CSRP2 RP1-34H18.1 NA NA NA NA RP1-34H18.1 31532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 78412779 78412965 78412883 Y NA NA NA NA NA NA RP1-34H18.1 696358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 79325321 79325633 79325477 Y SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 69548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 79444921 79445122 79445022 Y NA NA NA NA NA NA SYT1 189148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 79526323 79526826 79526502 Y SYT1 NA NA NA NA NA SYT1 270550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 79817704 79817772 79817737 Y SYT1 NA NA NA NA NA PAWR 265105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 79943391 79943637 79943513 Y NA NA SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 139240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 80032366 80032529 80032417 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 50348 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 80098707 80098999 80098853 Y NA PAWR SYT1,PPP1R12A,PAWR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 15830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 80133375 80133617 80133496 Y NA NA SYT1,PAWR,PPP1R12A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAWR 50498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 80305277 80305475 80305376 Y NA RP11-84G21.1,PPP1R12A NA NA NA NA RP11-84G21.1 21206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 80757444 80757599 80757522 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244J10.1 262331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 82155346 82155393 82155380 Y NA NA NA NA NA NA CCDC59 595191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 83134280 83134513 83134356 Y NA NA NA NA NA NA TMTC2 55621 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 85793012 85793355 85793084 Y NA NA NA NA NA NA ALX1 121127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 88527986 88528043 88528042 Y NA CEP290,TMTC3 NA NA NA NA CEP290 5950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 88968059 88968366 88968242 Y NA KITLG NA NA NA NA KITLG 4262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 90256648 90256905 90256732 Y POC1B,POC1B,ATP2B1 RP11-654D12.2 LOC338758 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-654D12.2 17537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 91775053 91775433 91775292 Y NA NA LOC256021,C12orf12,EPYC,DCN,CLLU1OS,CLLU1,C12orf74 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DCN 200153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA RP11-796E2.4 18951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 93277124 93277496 93277306 Y NA EEA1 NA NA NA NA EEA1 43611 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr12 93474339 93474443 93474391 Y NA AC138123.2 NA NA NA NA AC138123.2 1008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 93770329 93770575 93770474 Y NUDT4 NUDT4 NA NA NA NA NUDT4 670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 93890331 93890756 93890540 Y NA MRPL42 NA NA NA NA MRPL42 31067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 94495978 94496358 94496187 Y NA PLXNC1 CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PLXNC1 44141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 94678246 94678308 94678278 Y PLXNC1,TMCC3 NA NA NA NA NA PLXNC1 137747 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 94773845 94774167 94774046 Y PLXNC1,TMCC3 RBMS2P1 NA NA NA NA RBMS2P1 42578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 94827148 94827488 94827330 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 10403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 94954640 94954945 94954835 Y NA NA NA NA NA NA TMCC3 87393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 95411707 95411975 95411841 Y NA NDUFA12 NA NA NA NA NDUFA12 16161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 95477787 95477978 95477880 Y NA NR2C1 NR2C1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR2C1 12308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 95680646 95681018 95680718 Y NA NA NA NA NA NA VEZT 71124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 95939436 95939751 95939594 Y NA USP44 NA NA NA NA USP44 3515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 96438108 96438277 96438222 Y ELK3,LTA4H LTA4H NA NA NA NA LTA4H 2810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 96593675 96593812 96593739 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 7515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 96752607 96752772 96752695 Y CDK17 CDK17 NA NA NA NA CDK17 39566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 98793447 98793582 98793503 Y NA RNU4-41P NA NA NA NA RNU4-41P 16234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 99103586 99103986 99103782 Y NA NA NA NA NA NA APAF1 66667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 99532172 99532427 99532300 Y ANKS1B,ANKS1B,ANKS1B NA NA NA NA NA APAF1 495253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 100596885 100596960 100596910 Y NA ACTR6,RP11-175P13.3 NA NA NA NA RP11-175P13.3 5324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr12 101985490 101985520 101985505 Y NA NA NA NA NA NA CHPT1 103205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 102734344 102734692 102734517 Y NA NA IGF1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF1 137731 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 102909608 102909974 102909790 Y PAH IGF1 NA NA NA NA IGF1 37185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 104963305 104963849 104963618 Y CHST11 NA NA NA NA NA CHST11 116232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 105477471 105477556 105477526 Y ALDH1L2 ALDH1L2,KIAA1033 NA NA NA NA ALDH1L2 1116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 106529993 106530447 106530148 Y NA NUAK1 NA NA NA NA NUAK1 1364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 106664099 106664223 106664175 Y NA CKAP4 NUAK1,CKAP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CKAP4 31834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 107363542 107363991 107363752 Y NA C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 14953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 108103294 108103307 108103300 Y PRDM4 PWP1,PRDM4 NA NA NA NA PWP1 25785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr12 109036250 109036518 109036431 Y NA TMEM119 NA NA NA NA TMEM119 46154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 109083720 109083964 109083780 Y SSH1 CORO1C NA NA NA NA CORO1C 39408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 109249958 109250678 109250397 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 109899131 109899209 109899162 Y TRPV4,TRPV4,TRPV4 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 13998 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 109900993 109901418 109901152 Y KCTD10 UBE3B,KCTD10 NA NA NA NA UBE3B 11789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 110618684 110618848 110618757 Y NA NA NA NA NA NA IFT81 58544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 110931784 110931990 110931887 Y NA ARPC3,RPL31P49,GPN3,VPS29 NA NA NA NA VPS29 5932 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 111847615 111848064 111847953 Y ALDH2,FAM109A,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 112464061 112464211 112464136 Y NA TMEM116,ERP29 NA NA NA NA ERP29 14941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 112529504 112529724 112529616 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA NAA25 15102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 112554455 112554606 112554536 Y ALDH2,TRAFD1 NAA25,TRAFD1 TRAFD1,NAA25 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TRAFD1 6699 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 112566952 112567278 112567115 Y NA NAA25,TRAFD1 NA NA NA NA TRAFD1 5647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 112759768 112760224 112759930 Y NA NA NA NA NA NA PTPN11 93931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 112920682 112921011 112920993 Y NA NA NA NA NA NA RPL6 66040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 113417741 113417850 113417751 Y NA NA NA NA NA NA OAS1 75159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 113741046 113741165 113741159 Y NA NA NA NA NA NA PLBD2 53206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 114029271 114029455 114029396 Y LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 SDSL 171229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr12 114101859 114102314 114102079 Y NA NA NA NA NA NA RP11-438N16.1 107174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 114200256 114200532 114200390 Y NA RP11-438N16.1 NA NA NA NA RP11-438N16.1 8956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 114833369 114833814 114833717 Y TBX5,TBX5 NA NA NA NA NA TBX3 286155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 115172990 115173109 115173029 Y NA NA NA NA NA NA TBX3 53021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 115582684 115583082 115582883 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 462715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116193913 116194329 116194111 Y NA NA TBX3,RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 518814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 116530359 116530538 116530483 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 182605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116661909 116662288 116662266 Y NA NA NA NA NA NA MED13L 50855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116718485 116718754 116718617 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L MED13L,MIR4472-2,LINC00173,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 MED13L 5342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116872632 116872752 116872692 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 96475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 116946088 116946451 116946189 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr12 116946674 116946880 116946778 Y NA LINC00173 LINC00173,MED13L,MAP1LC3B2 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 22347 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 117173952 117174265 117174216 Y MED13L,MAP1LC3B2 C12orf49 NA NA NA NA RNFT2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 117255942 117256291 117256058 Y NA NA NA NA NA NA HRK 60955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 117375665 117375672 117375669 Y NA FBXW8 NA NA NA NA FBXW8 28904 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 117988619 117988948 117988784 Y NOS1,NOS1 NA NA NA NA NA FBXO21 362283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 118815733 118815925 118815736 Y TAOK3 TAOK3,SUDS3 NA NA NA NA SUDS3 3548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 119618645 119618705 119618687 Y HSPB8 HSPB8 NA NA NA NA HSPB8 4198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 120426531 120426889 120426594 Y NA NA NA NA NA NA CIT 113436 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 120524802 120525368 120525019 Y CCDC64 RAB35 NA NA NA NA RAB35 27938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 120639993 120640274 120640078 Y NA GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1 NA NA NA NA PXN-AS1 2899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 120668258 120668871 120668569 Y RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1 NA NA NA NA PXN-AS1 31164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 120728531 120728703 120728617 Y NA PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1 PXN,GCN1L1,LOC100506649,RPLP0,RAB35,SIRT4,CCDC64,DYNLL1,SRSF9,RNF10,COX6A1,PLA2G1B,MSI1,LOC100506668,COQ5,TRIAP1,GATC IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-1 337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 120851941 120852093 120852022 Y NA MSI1,RPS27P25,COX6A1,TRIAP1,GATC PLA2G1B,MSI1,GATC,COX6A1,TRIAP1,SRSF9,DYNLL1 IMR90 Hi-C 24141950 COX6A1 21800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 121019899 121020145 121020000 Y NA COQ5,POP5,RPL11P5 NA NA NA NA POP5 2698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121268399 121268878 121268839 Y NA NA NA NA NA NA SPPL3 71296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121310801 121311113 121311060 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 29061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121838748 121839039 121838846 Y SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 2904 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121839154 121839422 121839290 Y C12orf43,RHOF,KDM2B,RNF34 ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 3310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121864200 121864449 121864234 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 28356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 121866033 121866226 121866130 Y NA ANAPC5,RNF34 NA NA NA NA RNF34 30189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 121888305 121888670 121888535 Y NA NA NA NA NA NA RNF34 52461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 122014724 122015549 122015007 Y NA KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 1371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.84632736583988 chr12 122020670 122020879 122020764 Y KDM2B,KDM2B KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 122028609 122028883 122028798 Y RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1 KDM2B,ORAI1 KDM2B K562 ChIA-PET 22265404 KDM2B 11689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr12 122086492 122086728 122086610 Y KDM2B,SETD1B,ORAI1 ORAI1,MORN3 NA NA NA NA MORN3 21809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 122186812 122187117 122186965 Y NA TMEM120B NA NA NA NA TMEM120B 38154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 122462187 122462386 122462358 Y BCL7A BCL7A,AC156455.1 NA NA NA NA BCL7A 6859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.53026253763293 chr12 123362987 123363145 123363088 Y NA HIP1R,VPS37B NA NA NA NA VPS37B 15846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr12 123367402 123367963 123367875 Y VPS37B VPS37B NA NA NA NA VPS37B 11028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 123930588 123930862 123930771 Y RILPL2 RILPL2,SNRNP35 SNRNP35,SBNO1,SETD8,RILPL1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SNRNP35 9326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA FAM101A 451757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr12 124951666 124951729 124951686 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 413485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125008756 125009019 125008888 Y NA NA NA NA NA NA SCARB1 356195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 337221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NA NA NA NA NA SCARB1 313839 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr12 125117108 125117622 125117163 Y NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 247592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125218943 125219209 125219142 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 146005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125230587 125231048 125230629 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 134166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125347630 125347766 125347649 Y NA SCARB1 NA NA NA NA SCARB1 17448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125353523 125353887 125353860 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA SCARB1 11327 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125400956 125401141 125401046 Y UBC SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 1042 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125403508 125403991 125403767 Y UBC SCARB1,UBC NCOR2,SCARB1,UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 3594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 125534116 125534467 125534247 Y NA AACS AACS K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AACS 13458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 129054843 129055190 129054997 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 251338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr12 129341873 129342419 129342112 Y SLC15A4,GLT1D1 SLC15A4,GLT1D1 NA NA NA NA GLT1D1 5901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 129454249 129454601 129454432 Y NA NA NA NA NA NA GLT1D1 118277 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 129871586 129871714 129871650 Y NA NA NA NA NA NA TMEM132D 514497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 130388949 130389448 130389259 Y NA TMEM132D NA NA NA NA TMEM132D 2738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 131119964 131120312 131120238 Y NA NA NA NA NA NA STX2 201499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 131249995 131250369 131250318 Y NA NA NA NA NA NA STX2 71442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 131272601 131272867 131272734 Y NA STX2 NA NA NA NA STX2 48944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 131702988 131703123 131703024 Y NA NA NA NA NA NA GPR133 266536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 133528012 133528357 133528019 Y NA CHFR,ZNF605 NA NA NA NA CHFR 2533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr12 133701272 133701384 133701332 Y ZNF605,ZNF605,ZNF26,ZNF84,ZNF84,ZNF268,ZNF268,ZNF10 ZNF140,ZNF891,ZNF10,ZNF268 NA NA NA NA ZNF891 3675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 20271500 20271544 20271543 Y NA NA NA NA NA NA MPHOSPH8 65712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 20644269 20644474 20644387 Y ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2 NA NA NA NA NA GJA3 88714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 21405905 21405971 21405953 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 59808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 21748962 21749145 21749040 Y NA SAP18,SKA3,MRP63 NA NA NA NA MRP63 178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 21939171 21939396 21939283 Y NA NA NA NA NA NA MIPEPP3 68893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 22107257 22107449 22107379 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC20 75748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 22243438 22243610 22243458 Y FGF9 RPS7P10 NA NA NA NA RPS7P10 42284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 22545143 22545315 22545232 Y NA NA FGF9 IMR90 Hi-C 24141950 RPS7P10 343989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 23458655 23458830 23458775 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 28960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 23471356 23471597 23471410 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 16193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 23485782 23486124 23485811 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 1666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 23500406 23500844 23500578 Y NA NUS1P2 NA NA NA NA NUS1P2 12616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 24697003 24697328 24697264 Y NA NA SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 145059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 25082319 25082682 25082572 Y PARP4 PARP4 NA NA NA NA PARP4 2266 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 25621314 25621890 25621623 Y NA NA NA NA NA NA TPTE2P1 80689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr13 26551633 26551678 26551661 Y NA NA NA NA NA NA RNF6 243113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr13 27142181 27142413 27142195 Y NA WASF3 NA NA NA NA WASF3 12341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 27166168 27166184 27166175 Y GPR12,WASF3 WASF3 NA NA NA NA WASF3 36328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 27198783 27198789 27198786 Y NA NA NA NA NA NA WASF3 68943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 27706563 27707017 27706898 Y NA USP12 NA NA NA NA USP12 37016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 27843033 27843378 27843206 Y NA RPL21,SNORD102,RASL11A NA NA NA NA RASL11A 569 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 27957593 27957812 27957644 Y RASL11A,GTF3A GTF3A CDX2,GSX1 IMR90 Hi-C 24141950 GTF3A 38869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 28006253 28006341 28006297 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA GTF3A 9572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 28010544 28010826 28010685 Y NA GTF3A,MTIF3 NA NA NA NA MTIF3 11913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 28932180 28932593 28932335 Y POMP NA NA NA NA NA FLT1 134672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 29024743 29024974 29024943 Y NA FLT1 NA NA NA NA FLT1 42291 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 29232247 29232368 29232342 Y NA POMP NA NA NA NA POMP 1006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 30407984 30408178 30408116 Y UBL3 UBL3 NA NA NA NA UBL3 14643 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 30415465 30415864 30415857 Y NA UBL3 NA NA NA NA UBL3 6957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 30625878 30626131 30625964 Y NA NA UBL3,LOC440131 IMR90 Hi-C 24141950 UBL3 203057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 30812389 30812594 30812492 Y NA NA NA NA NA NA KATNAL1 67027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 30969684 30969817 30969776 Y USPL1 LINC01058 LINC00426,KATNAL1,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01058 24557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 30982567 30982782 30982669 Y NA LINC01058 KATNAL1,LINC00426,USPL1,UBL3,HMGB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01058 11592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA USPL1 254727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 31447062 31447451 31447297 Y NA NA NA NA NA NA USPL1 257232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 31585731 31585921 31585826 Y NA NA USPL1,C13orf33,TEX26-AS1,KATNAL1,TEX26,ALOX5AP IMR90 Hi-C 24141950 HSPH1 148604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr13 32470605 32470630 32470618 Y NA NA NA NA NA NA EEF1DP3 51627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 32664585 32664831 32664706 Y NA NA NA NA NA NA FRY 61148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 34069113 34069239 34069161 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 146346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr13 35574872 35575244 35575038 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 60448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 35804956 35805119 35805031 Y NBEA,MAB21L1 NA NA NA NA NA NBEA 290532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 36853236 36853259 36853249 Y CCNA1,C13orf38 CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2 NA NA NA NA CCDC169 16718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr13 40139698 40140018 40139948 Y NA LHFP NA NA NA NA LHFP 35647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 40677084 40677323 40677230 Y NA NA NA NA NA NA COG6 449320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 40918553 40918852 40918807 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 319882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 41173351 41173594 41173358 Y NA NA NA NA NA NA FOXO1 65140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 41234261 41234650 41234508 Y NA FOXO1 NA NA NA NA FOXO1 4084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 41591294 41591779 41591504 Y C13orf15,NAA16,ELF1,ELF1 WBP4,ELF1 NA NA NA NA WBP4 41631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 41651625 41651882 41651685 Y NA WBP4,ELF1 NA NA NA NA ELF1 18049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 42121895 42122099 42121973 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 238554 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 42143744 42143800 42143772 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 260403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 42534426 42534531 42534479 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 309758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 42849254 42849451 42849396 Y TNFSF11,TNFSF11,DGKH,AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 4965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 42855017 42855240 42855076 Y AKAP11 AKAP11 NA NA NA NA AKAP11 10728 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43378134 43378246 43378162 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 186161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43410663 43410880 43410773 Y NA NA CCDC122,ENOX1,TNFSF11,EPSTI1,DNAJC15 IMR90 Hi-C 24141950 EPSTI1 153527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr13 43451053 43451467 43451346 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA EPSTI1 112940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43451555 43451845 43451701 Y NA NA NA NA NA NA EPSTI1 112562 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr13 43617981 43618110 43618046 Y TNFSF11 DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 22642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43629039 43630063 43629103 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 33700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43632661 43632965 43632672 Y NA DNAJC15 NA NA NA NA DNAJC15 37322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 43662550 43662935 43662749 Y EPSTI1 NA NA NA NA NA DNAJC15 67211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43796435 43796650 43796543 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC15 201096 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 43866757 43867095 43866777 Y ENOX1,ENOX1 NA NA NA NA NA DNAJC15 271418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 44228781 44229127 44228818 Y NA NA NA NA NA NA ENOX1 129917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 44446151 44446617 44446342 Y NA LACC1,CCDC122 NA NA NA NA LACC1 4803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 DGKZP1 SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 2172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr13 44765408 44765809 44765737 Y NA NA SERP2,TSC22D1,LINC00284 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DGKZP1 224848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 44924960 44925274 44925109 Y NA NA SERP2,TSC22D1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 224009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 44978399 44978598 44978577 Y NA NA NA NA NA NA TSC22D1 170685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 45038641 45038649 45038645 Y NA NA NA NA NA NA TSC22D1 110634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 45333095 45333256 45333140 Y NA NA TSC22D1,TSC22D1-AS1,NUFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSC22D1 183812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 45745052 45745233 45745142 Y NA NA NA NA NA NA GTF2F2 52402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 45783444 45783799 45783571 Y TPT1,COG3 NA NA NA NA NA GTF2F2 90794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 45846557 45846941 45846749 Y NA NA NA NA NA NA TPT1-AS1 66539 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 45941510 45941762 45941695 Y COG3,TPT1 TPT1-AS1,TPT1,SLC25A30 NA NA NA NA TPT1 28005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 46557145 46557532 46557508 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H13 67362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 47149300 47149814 47149489 Y NA LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 23997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 47369610 47369907 47369759 Y NA ESD NA NA NA NA ESD 243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 49757640 49757959 49757800 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 62088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 50209681 50209984 50209832 Y SETDB2,ARL11 NA NA NA NA NA RCBTB1 51962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 50413145 50413317 50413231 Y NA KPNA3 EBPL,KPNA3 IMR90 Hi-C 24141950 KPNA3 48088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 50597476 50597810 50597661 Y RCBTB1,TRIM13 TRIM13,MIR16-1 NA NA NA NA MIR16-1 23387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 51168515 51168827 51168588 Y RNASEH2B NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 234616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 51176389 51176436 51176413 Y NA NA DLEU2,DLEU1,DLEU7 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 242490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 51743934 51744340 51744171 Y NA NA NA NA NA NA FAM124A 50163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr13 51800117 51800150 51800132 Y DLEU7,FAM124A FAM124A NA NA NA NA FAM124A 5614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 52406665 52407091 52406817 Y NA DHRS12,RP11-327P2.5 NA NA NA NA RP11-327P2.5 30232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 53190916 53191040 53191000 Y NA HNRNPA1L2,MRPS31P4,SUGT1 NA NA NA NA MRPS31P4 1223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 53336765 53337066 53336916 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 83709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 53765519 53765549 53765534 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 344744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr13 67722025 67722418 67722226 Y PCDH9 NA NA NA NA NA H3F3BP1 4524781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 68432225 68432272 68432254 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 3814927 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 71340580 71340843 71340601 Y NA NA NA NA NA NA H3F3BP1 906356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 72419778 72420070 72419973 Y DACH1 DACH1 NA NA NA NA DACH1 19260 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 74339681 74339964 74339912 Y KLF12 NA NA NA NA NA KLF12 366430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 74864558 74864878 74864747 Y KLF12 NA KLF12 IMR90 Hi-C 24141950 KLF12 158164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 75933518 75933672 75933595 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 120578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 75965393 75965547 75965541 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D4 88703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 79232403 79232753 79232546 Y NA RNF219 NA NA NA NA RNF219 1089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr13 80916096 80916414 80916232 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 80916799 80917232 80917156 Y NA SPRY2 NA NA NA NA SPRY2 3713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr13 80936113 80936309 80936180 Y NA SPRY2 SPRY2 K562 ChIA-PET 22265404 SPRY2 23027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 91931030 91931288 91931161 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 66786 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 95128334 95128746 95128451 Y DCT NA NA NA NA NA TGDS 117765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 95201580 95202169 95201893 Y NA TGDS,GPR180 NA NA NA NA TGDS 44342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 95620867 95621252 95621220 Y NA NA CLDN10 IMR90 Hi-C 24141950 SOX21-AS1 257897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 96517437 96517518 96517478 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 186218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 97188079 97188190 97188135 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 484343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 99033515 99033578 99033537 Y NA NA NA NA NA NA STK24 194616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 99403586 99403810 99403698 Y SLC15A1 SLC15A1 NA NA NA NA SLC15A1 678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 99867739 99867834 99867779 Y DOCK9,GPR18,CLYBL,UBAC2,UBAC2 UBAC2-AS1,UBAC2 NA NA NA NA UBAC2 16711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 99991522 99991909 99991574 Y NA NA NA NA NA NA UBAC2 140494 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 100013491 100013836 100013585 Y DOCK9,UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183,CLYBL NA NA NA NA NA TM9SF2 137835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 100154383 100154610 100154487 Y GPR183 TM9SF2 NA NA NA NA TM9SF2 2712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 100314131 100314374 100314299 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 57212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 100339200 100339671 100339308 Y NA NA NA NA NA NA CLYBL 82281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 100611152 100611355 100611213 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5,ZIC2 NA NA NA NA ZIC5 10808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 102926292 102926685 102926630 Y NA NA NA NA NA NA FGF14-IT1 118184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 106753025 106753272 106753030 Y ARGLU1 NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 465240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr13 106777477 106777605 106777541 Y NA NA EFNB2 IMR90 Hi-C 24141950 ARGLU1 440907 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 107225813 107226005 107225909 Y NA ARGLU1 NA NA NA NA ARGLU1 7301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 107448247 107448283 107448269 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G1P5 134462 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr13 108310994 108311341 108311278 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 205742 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 108428526 108428615 108428535 Y NA NA NA NA NA NA FAM155A 88468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 109852673 109853050 109852860 Y NA NA NA NA NA NA IRS2 583865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 109921804 109922211 109922051 Y NA NA IRS2 IMR90 Hi-C 24141950 IRS2 514704 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 110359460 110359633 110359542 Y IRS2 NA MYO16,IRS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRS2 77282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 110426988 110427362 110427201 Y NA IRS2 NA NA NA NA IRS2 9553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 110439676 110440079 110439929 Y IRS2 IRS2 NA NA NA NA IRS2 2761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 110789248 110789736 110789562 Y RAB20,IRS2 NA NA NA NA NA COL4A2 166423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 111544033 111544176 111544105 Y ING1,ING1 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 21240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 111560939 111561133 111561094 Y NA LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 4283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 111564894 111565358 111565241 Y RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA ANKRD10 58 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.68742299574773 chr13 111819312 111819589 111819392 Y ING1,ING1,ING1,ANKRD10,ARHGEF7,ARHGEF7 NA NA NA NA NA ARHGEF7 54406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 111863058 111863169 111863068 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF7 98152 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 113422543 113422856 113422607 Y ATP11A NA NA NA NA NA ATP11A 79900 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 113434951 113435188 113435090 Y NA NA NA NA NA NA ATP11A 92308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr13 113549464 113549664 113549543 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 71474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 113585588 113585716 113585676 Y CUL4A,CUL4A MCF2L-AS1 C13orf35,ATP11A,MCF2L GM12878,HELA,K562,H1ESC 5C 22955621 MCF2L-AS1 35422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 113677034 113677374 113677296 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 55896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr13 113982391 113982456 113982424 Y NA LAMP1,GRTP1 NA NA NA NA LAMP1 32835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 114119812 114119949 114119881 Y NA DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 23318 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 114127046 114127213 114127130 Y GRTP1,DCUN1D2 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA DCUN1D2 16054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 114830489 114831626 114831334 Y RASA3 NA NA NA NA NA RASA3 64460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr13 115078776 115079079 115078928 Y NA UPF3A,CHAMP1 NA NA NA NA CHAMP1 788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 21288613 21288985 21288797 Y NA RNASE6,RNASE1 NA NA NA NA RNASE1 19176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 21660147 21660368 21660311 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPC 75285 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 21749950 21750343 21750147 Y NA HNRNPC,RPGRIP1 RPGRIP1,SUPT16H IMR90 Hi-C 24141950 RPGRIP1 3755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 23449757 23450231 23450060 Y MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB MIR4707,HAUS4,C14orf93 NA NA NA NA AJUBA 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 23554726 23554907 23554813 Y SLC7A7,RBM23,ACIN1 CDH24,C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA C14orf119 7067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 24008139 24008541 24008214 Y DHRS4L2,DHRS4L2,SLC22A17,SLC22A17,CMTM5,ZFHX2,JPH4 THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 14675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 24018554 24018930 24018908 Y NA THTPA,ZFHX2,AP1G2,JPH4 NA NA NA NA THTPA 4286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 24861663 24861718 24861669 Y IPO4,RABGGTA,RABGGTA NYNRIN,KHNYN,SDR39U1 NA NA NA NA NYNRIN 4274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 27997396 27997715 27997579 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 932436 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr14 27998275 27998515 27998360 Y NA NA NA NA NA NA NOVA1 933315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 28061472 28061526 28061498 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 895590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 28591045 28591340 28591192 Y NA NA NA NA NA NA RPL26P3 365776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 30739803 30740140 30739972 Y PRKD1 NA NA NA NA NA PRKD1 80699 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 31165114 31165442 31165278 Y NA NA NA NA NA NA SCFD1 75796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 32483231 32483453 32483448 Y NA NA NUBPL IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP5 59867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr14 33402784 33403168 33402896 Y NPAS3 NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 450778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 34407631 34407737 34407684 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 34801443 34801630 34801553 Y NA NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127932 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 35628271 35628433 35628369 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA KIAA0391 38516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 35810635 35811251 35810911 Y BAZ1A,FAM177A1,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1 PPP2R3C,KIAA0391,PSMA6,NFKBIA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-561B11.1 45024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 35839188 35839529 35839227 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NFKBIA K562 ChIA-PET 22265404 RP11-561B11.1 16746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 35869907 35870271 35870165 Y FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 1684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 35875293 35875611 35875452 Y NA RP11-561B11.1,NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 3338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 35886115 35886382 35886280 Y FAM177A1,PPP2R3C,RALGAPA1,BRMS1L,NFKBIA RP11-561B11.1,NFKBIA PSMA6,NFKBIA,KIAA0391,PPP2R3C,FAM177A1 IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIA 14160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 38614811 38615058 38614936 Y NA CTD-2142D14.1 NA NA NA NA CTD-2142D14.1 43130 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 39559553 39559840 39559693 Y NA SEC23A,GEMIN2 NA NA NA NA SEC23A 17010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 39637578 39637824 39637713 Y NA PNN NA NA NA NA TRAPPC6B 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 41662407 41662459 41662451 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1762703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2175434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 43420114 43420297 43420206 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1944201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 44072704 44073040 44072872 Y NA NA NA NA NA NA C14orf28 1291458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 48184413 48184780 48184597 Y NA NA NA NA NA NA RPL13AP2 516106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 NA NA NA NA NA SOS2 168019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 51367871 51368235 51368053 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 41219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 51410207 51410388 51410282 Y NIN,PYGL PYGL NA NA NA NA PYGL 753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 51434779 51434836 51434798 Y NA PYGL NA NA NA NA PYGL 25325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 51460024 51460383 51460203 Y TRIM9 NA NA NA NA NA PYGL 50570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 51865642 51865984 51865869 Y FRMD6 NA LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 FRMD6 87834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 52336144 52336756 52336579 Y PTGER2,GNG2 GNG2 NA NA NA NA GNG2 45231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 52389104 52389259 52389151 Y NA NA NA NA NA NA C14orf166 64934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 53302326 53302477 53302407 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 45940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 53533673 53533892 53533783 Y NA NA NA NA NA NA DDHD1 84108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 54444458 54444658 54444588 Y NA BMP4 BMP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 BMP4 20979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 54573774 54574066 54573953 Y NA NA NA NA NA NA BMP4 150295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr14 54902274 54902529 54902415 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 40707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 54954614 54954684 54954648 Y NA GMFB,CGRRF1 NA NA NA NA GMFB 700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr14 55541499 55541595 55541574 Y NA WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 25150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 55544097 55544118 55544108 Y NA MAPK1IP1L,LGALS3 NA NA NA NA MAPK1IP1L 27748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 57038446 57038723 57038585 Y NA NA C14orf101 K562 ChIA-PET 22265404 OTX2 236474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 57366705 57367109 57366773 Y NA NA NA NA NA NA OTX2-AS1 88804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 57372112 57372414 57372261 Y OTX2 NA NA NA NA NA OTX2-AS1 94211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 58637905 58638297 58638125 Y NA UBA52P3,ACTR10 NA NA NA NA ACTR10 26501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 58911911 58912089 58912000 Y KIAA0586 KIAA0586,TIMM9 NA NA NA NA TIMM9 19579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 59002332 59002438 59002384 Y NA NA NA NA NA NA DACT1 96247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 60392621 60392966 60392669 Y NA NA NA NA NA NA RTN1 56937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 60679186 60679974 60679676 Y NA DHRS7,PPM1A,CTD-2184C24.2 NA NA NA NA PPM1A 30496 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr14 61969529 61970113 61969734 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA HIF1A 190118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 64109095 64109326 64109156 Y SYNE2,WDR89,WDR89 HSPE1P2,WDR89 NA NA NA NA WDR89 2516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 64170371 64170528 64170450 Y NA SGPP1 NA NA NA NA SGPP1 22229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 64324216 64324732 64324422 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 6533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 64342094 64342269 64342170 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 24411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 64358003 64358294 64358235 Y NA SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 40320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 65347160 65347466 65347258 Y RAB15 SPTB,CHURC1,CHURC1-FNTB,FNTB SPTB IMR90 Hi-C 24141950 SPTB 2559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 65525721 65526064 65525893 Y NA MAX NA NA NA NA MAX 41349 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 65641048 65641253 65641171 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 MAX 73635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 65691594 65691779 65691731 Y NA NA FUT8,LOC645431,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 124181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 65748716 65749124 65748896 Y FNTB NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 126186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 66104549 66104610 66104580 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 229239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 67735210 67735475 67735304 Y NA MPP5 NA NA NA NA MPP5 29384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 67774949 67775062 67775003 Y PLEKHH1 EIF2S1,ATP6V1D NA NA NA NA EIF2S1 49652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 68161499 68161767 68161616 Y PLEK2 VTI1B,RDH11,RDH12 NA NA NA NA RDH11 968 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr14 68408350 68408505 68408421 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 123854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 68555905 68556402 68556038 Y PIGH NA NA NA NA NA RAD51B 271409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 68666573 68666719 68666628 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 220194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr14 68831089 68831428 68831316 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 55485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 69396600 69396876 69396795 Y ZFP36L1,DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 47281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 69400981 69401191 69401073 Y ZFP36L1,DCAF5 ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 42966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 70803999 70804244 70804143 Y NA COX16 NA NA NA NA COX16 20204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 72050156 72050543 72050232 Y NA NA NA NA NA NA SIPA1L1 264990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 75592667 75593037 75593004 Y NA RP11-950C14.7,NEK9,TMED10 NA NA NA NA NEK9 620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 75761897 75762132 75762064 Y FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2 RP11-293M10.2,FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 2790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 75777354 75777713 75777592 Y NA FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 18247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 76334268 76334588 76334390 Y NA IFT43 NA NA NA NA IFT43 31891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 76513976 76514095 76514005 Y NA NA NA NA NA NA TGFB3 66642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA TGFB3 286938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 77300761 77300827 77300798 Y ESRRB,C14orf166B ANGEL1 NA NA NA NA ANGEL1 10172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 77388817 77389330 77389083 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 37724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 77428060 77428442 77428341 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 4584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 77431067 77431579 77431238 Y NA RP11-7F17.1 IRF2BPL MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-7F17.1 1447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 78121399 78121579 78121501 Y NA SPTLC2 NA NA NA NA SPTLC2 40283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr14 81867255 81867616 81867435 Y GTF2A1,GTF2A1,STON2 STON2 NA NA NA NA STON2 33193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 85398952 85399308 85399126 Y NA NA NA NA NA NA RP11-497E19.1 595024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 86053629 86053936 86053651 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 59141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 86066316 86066619 86066414 Y NA NA NA NA NA NA FLRT2 71828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 87706742 87707121 87707003 Y NA NA NA NA NA NA GALC 750888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 89887223 89887427 89887324 Y NA NA NA NA NA NA RP11-356K23.1 72594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 89895882 89896217 89896119 Y FOXN3,FOXN3 NA NA NA NA NA RP11-356K23.1 81253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 89959649 89959712 89959681 Y TDP1,FOXN3 NA NA NA NA NA FOXN3 123781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 90083771 90084428 90084236 Y TDP1,FOXN3 FOXN3 NA NA NA NA FOXN3 278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 90465200 90465384 90465297 Y NA EFCAB11,TDP1 NA NA NA NA TDP1 45917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 91694873 91695058 91694948 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68 NA NA NA NA NA RPS6KA5 169893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 91730791 91731194 91731191 Y NA NA GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 CCDC88C 150994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 91752749 91752962 91752855 Y NA NA NA NA NA NA CCDC88C 129226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 91926776 91927002 91926960 Y NA CCDC88C,SMEK1 NA NA NA NA CCDC88C 44588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 92572132 92572295 92572249 Y CATSPERB,SLC24A4,SLC24A4,RIN3,ATXN3 ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 1167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 92574762 92574984 92574843 Y NA ATXN3,NDUFB1,CPSF2 NA NA NA NA ATXN3 3797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 93044640 93044810 93044725 Y NA NA NA NA NA NA RIN3 66522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 93697718 93697880 93697787 Y ITPK1,MOAP1 MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 93698124 93698181 93698153 Y NA MOAP1,RP11-371E8.4,UBR7,C14orf142 NA NA NA NA C14orf142 26685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 93810327 93810406 93810360 Y NA BTBD7 NA NA NA NA BTBD7 12889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 94360342 94360641 94360452 Y NA NA NA NA NA NA PRIMA1 107515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 94851152 94851609 94851362 Y SERPINA1 NA NA NA NA NA SERPINA11 65518 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 95239496 95239653 95239575 Y SERPINA12 NA NA NA NA NA SERPINA5 213717 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 95596986 95597082 95597060 Y NA DICER1 NA NA NA NA DICER1 25265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 95680303 95680655 95680479 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 57956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 95734707 95735043 95734878 Y NA CLMN NA NA NA NA CLMN 49200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 96086261 96086587 96086424 Y NA RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 1010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr14 96097186 96097458 96097322 Y NA RP11-1070N10.5 NA NA NA NA RP11-1070N10.5 11935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 97043507 97043643 97043575 Y NA NA NA NA NA NA PAPOLA 77737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr14 99735950 99736476 99736276 Y BCL11B NA NA NA NA NA SETD3 208740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 117542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 100040610 100041006 100040947 Y SETD3,CCDC85C CCDC85C,RP11-543C4.1 NA NA NA NA CCDC85C 27357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 100196933 100197043 100196991 Y NA CYP46A1,EML1 NA NA NA NA EML1 4987 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 100205618 100205895 100205848 Y NA EML1 NA NA NA NA EML1 3588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 100463833 100464185 100464009 Y NA NA EVL,YY1,DEGS2 IMR90 Hi-C 24141950 YY1 238450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 100751761 100751840 100751790 Y NA YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29 NA NA NA NA SLC25A29 19044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA NA NA NA NA NA LINC00523 91520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 101370822 101370975 101370899 Y BEGAIN,RTL1 NA NA NA NA NA AL132709.1 171272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102173765 102174142 102173896 Y NA NA PPP2R5C,DYNC1H1,LINC00239 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2R5C 51993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr14 102415545 102415736 102415629 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102780583 102780765 102780709 Y NA MOK,ZNF839,CINP,TECPR2 MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF839 949 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102977207 102977381 102977329 Y AMN ANKRD9 NA NA NA NA ANKRD9 3071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 102997284 102997579 102997375 Y TRAF3,RCOR1 ANKRD9 MIR4309,RCOR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 23148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 103051810 103052039 103051996 Y NA RCOR1 TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RCOR1 4959 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 103541337 103541574 103541446 Y NA CDC42BPB CDC42BPB,EIF5 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42BPB 19538 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 103557952 103558007 103557980 Y NA CDC42BPB CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CDC42BPB 36153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 103954462 103954719 103954539 Y MARK3,KLC1 CKB,TRMT61A NA NA NA NA CKB 32729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 104009097 104009329 104009267 Y NA CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P NA NA NA NA TRMT61A 15576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr14 104016804 104017118 104016961 Y CKB CKB,TRMT61A,KLC1,BAG5,APOPT1,RNU4-68P NA NA NA NA KLC1 9115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 104601589 104601707 104601649 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 1353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 104616017 104616378 104616259 Y NA KIF26A NA NA NA NA KIF26A 12957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 104928387 104928555 104928492 Y NA NA NA NA NA NA TMEM179 141429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr14 105265888 105266206 105266005 Y NA SIVA1,AKT1 NA NA NA NA AKT1 5800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 105439556 105439771 105439692 Y INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2 C14orf79,CDCA4 PLD4 MCF7 ChIA-PET 22265404 C14orf79 10341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 105500263 105500628 105500453 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 14778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr14 105533738 105533893 105533826 Y NA CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 48253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA CRIP1 2511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr14 107253494 107254031 107253700 Y NA NA NA NA NA NA TMEM121 1262554 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 22897960 22898211 22898128 Y CYFIP1,CYFIP1 CYFIP1 NIPA2 IMR90 Hi-C 24141950 CYFIP1 7955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 22908894 22909338 22909142 Y NA CYFIP1 NA NA NA NA CYFIP1 18889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 24114794 24115156 24114976 Y NA NA NA NA NA NA NDN 184344 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 25209245 25209272 25209252 Y NA SNURF,SNHG14,SNORD64,SNORD108 NA NA NA NA SNURF 11064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 25565589 25566847 25566046 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 115281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 25577365 25577592 25577422 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 104536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 25634776 25635000 25634877 Y SNURF,SNRPN UBE3A NA NA NA NA UBE3A 47128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 25889400 25889660 25889527 Y NA NA LOC503519 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 207272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 26091537 26091912 26091608 Y NA ATP10A NA NA NA NA ATP10A 16405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 ATP10A 219132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr15 26332554 26332834 26332747 Y NA NA NA NA NA NA ATP10A 224237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 26416756 26416952 26416854 Y NA NA NA NA NA NA ATP10A 308439 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 26487850 26488175 26488017 Y NA NA NA NA NA NA ATP10A 379533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 26914563 26914637 26914600 Y GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5,GABRB3 NA NA NA NA NA GABRA5 194873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 26935746 26936096 26935922 Y GABRB3,GABRB3 NA NA NA NA NA GABRA5 173414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 28342283 28342646 28342468 Y OCA2 NA NA NA NA NA OCA2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 29277250 29277459 29277367 Y NDNL2,APBA2 NA NA NA NA NA APBA2 149621 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 29407243 29407640 29407337 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA NDNL2 152393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 29526240 29526874 29526776 Y NA NDNL2 NA NA NA NA NDNL2 33159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31372759 31373034 31372889 Y MTMR10 NA NA NA NA NA MTMR10 90949 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31495213 31495478 31495342 Y NA RP11-16E12.1,RP11-16E12.2 NA NA NA NA RP11-16E12.1 10745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31620735 31621235 31621017 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 3677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31653483 31654056 31653579 Y MTMR10,KLF13 KLF13 NA NA NA NA KLF13 36425 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31656932 31656985 31656959 Y NA KLF13 NA NA NA NA KLF13 39874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31689645 31689781 31689725 Y MTMR10,KLF13 NA NA NA NA NA KLF13 72587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 31690304 31690476 31690390 Y NA NA NA NA NA NA KLF13 73246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 33418806 33419006 33418854 Y NA NA FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1 IMR90 Hi-C 24141950 FMN1 65891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 33746972 33747043 33747010 Y NA NA NA NA NA NA FMN1 262075 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 34290038 34290177 34290053 Y NA AVEN NA NA NA NA AVEN 39200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 34807090 34807442 34807248 Y NA NA NA NA NA NA GOLGA8A,GOLGA8B 71262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 35014105 35014549 35014217 Y NA NA AQR,GJD2 IMR90 Hi-C 24141950 GOLGA8A,GOLGA8B 135401 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 35354346 35354732 35354466 Y NA NA ATPBD4,ZNF770 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 75858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 35376835 35377041 35376987 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 98347 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA NA ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 106465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr15 35502627 35502996 35502807 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 224139 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 35590731 35591134 35590845 Y NA NA ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF770 312243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr15 35840171 35840395 35840294 Y NA NA NA NA NA NA ZNF770 561683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr15 36897694 36898088 36897999 Y C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 27882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 36910960 36911073 36911017 Y MEIS2,C15orf41 C15orf41 NA NA NA NA C15orf41 41148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 37046763 37047120 37046943 Y C15orf41 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 61540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 37175924 37176266 37175984 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 67264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 37207397 37207450 37207424 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 NA NA NA NA NA CSNK1A1P1 98737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 37396811 37397277 37397114 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 5307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 37398990 37399302 37399145 Y C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 NA NA NA NA MEIS2 7486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 RP11-128A17.1,MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 38342742 38343194 38342929 Y NA NA SPRED1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED1 199333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 38546643 38547172 38546943 Y NA SPRED1 NA NA NA NA SPRED1 4116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 38987694 38987941 38987780 Y SPRED1,RASGRP1,C15orf53 NA NA NA NA NA RASGRP1 131918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39432291 39432412 39432368 Y THBS1 NA THBS1,C15orf53,FSIP1,RASGRP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 438868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39563210 39563560 39563357 Y THBS1 NA NA NA NA NA THBS1 307720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39575623 39576160 39575979 Y THBS1 NA C15orf53,THBS1,FSIP1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 295120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39593792 39594300 39594108 Y THBS1 NA FSIP1,C15orf53,THBS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THBS1 276980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39629434 39629748 39629535 Y NA NA C15orf53,THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 241532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39673743 39674138 39673898 Y NA NA THBS1 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 197142 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 39916943 39917393 39917178 Y NA THBS1 NA NA NA NA THBS1 45663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40346483 40347151 40346778 Y NA SRP14 NA NA NA NA SRP14 17094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40361212 40361596 40361446 Y NA SRP14,BMF NA NA NA NA SRP14 31823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40460566 40460976 40460804 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 9342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40463815 40464014 40463832 Y NA BUB1B NA NA NA NA BUB1B 12591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 40728458 40728872 40728667 Y NA IVD,BAHD1,CHST14 NA NA NA NA BAHD1 1048 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 40730551 40730903 40730713 Y NA IVD,BAHD1,CHST14 NA NA NA NA BAHD1 631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 41203373 41203552 41203463 Y NA RHOV,VPS18,DLL4,CHAC1 DLL4 IMR90 Hi-C 24141950 DLL4 15986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 41219895 41220240 41219942 Y NA VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 41220555 41220912 41220794 Y NUSAP1,DLL4 VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 1017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 41254301 41254691 41254494 Y NA DLL4,CHAC1 NA NA NA NA CHAC1 11141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA MGA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 MGA 42496 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr15 42228791 42229215 42228969 Y MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 33561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 42260184 42260317 42260307 Y EHD4 EHD4 NA NA NA NA EHD4 2459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 42349424 42349982 42349743 Y MGA,JMJD7,EHD4,VPS39,TMEM87A,SNAP23 NA PLA2G4E IMR90 Hi-C 24141950 EHD4 86648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 42535686 42535733 42535710 Y NA VPS39,GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 27698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 42549506 42549513 42549508 Y PLA2G4E GANC,TMEM87A NA NA NA NA GANC 13918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 42723209 42723609 42723409 Y NA NA NA NA NA NA SNAP23 57822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 42788912 42789178 42789135 Y TTBK2 SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA SNAP23 7481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 42814906 42815063 42814960 Y NA SNAP23,LRRC57,HAUS2 NA NA NA NA LRRC57 23937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 43152474 43152861 43152772 Y STARD9,TTBK2 NA NA NA NA NA TTBK2 58146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,RPS3AP47,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 43462121 43462322 43462222 Y NA TMEM62,CCNDBP1 NA NA NA NA CCNDBP1 12994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 44161980 44162105 44162047 Y NA MFAP1,WDR76,PIN4P1 NA NA NA NA PIN4P1 4337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 44837233 44837387 44837300 Y CTDSPL2,PATL2 EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 9978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 44954800 44955080 44954968 Y CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11 SPG11,PATL2,B2M NA NA NA NA SPG11 924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 45002253 45002823 45002529 Y NA SPG11,PATL2,B2M,TRIM69 NA NA NA NA B2M 578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 45746745 45747578 45747238 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN C15orf48 NA NA NA NA C15orf48 26018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 45892726 45892758 45892742 Y NA SQRDL NA NA NA NA SQRDL 28588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 46545564 46545905 46545872 Y NA NA NA NA NA NA SQRDL 624218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 49598906 49599159 49599033 Y NA NA NA NA NA NA COPS2 153048 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 50225696 50225893 50225801 Y NA NA NA NA NA NA SLC27A2 246500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 50634288 50634665 50634477 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 10860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 50995097 50995499 50995351 Y SPPL2A TRPM7 NA NA NA NA TRPM7 18085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 51177416 51177715 51177636 Y USP8,TRPM7,SPPL2A AP4E1 TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP4E1 21154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 51358266 51358334 51358300 Y GLDN NA NA NA NA NA AP4E1 159397 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 51369900 51370046 51369953 Y NA NA NA NA NA NA AP4E1 171031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 51413367 51413627 51413497 Y NA NA TNFAIP8L3,AP4E1,GLDN IMR90 Hi-C 24141950 AP4E1 214498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 51479240 51479465 51479382 Y SPPL2A,DMXL2 NA NA NA NA NA AP4E1 280371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 51560081 51560206 51560144 Y NA NA NA NA NA NA DMXL2 352824 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 51878196 51878692 51878342 Y TMOD3,MAPK6,LYSMD2,DMXL2 DMXL2 NA NA NA NA DMXL2 34338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 52024012 52024470 52024199 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 17288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 52228372 52228625 52228515 Y NA MAPK6,LEO1 NA NA NA NA MAPK6 13678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr15 52684587 52684775 52684686 Y NA NA NA NA NA NA MYO5C 98592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 52851602 52851989 52851853 Y NA MYO5A,ARPP19 NA NA NA NA ARPP19 8091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 53804819 53805218 53805019 Y NA NA NA NA NA NA WDR72 247857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 55463152 55463211 55463182 Y NA RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 24054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 55487983 55488563 55488357 Y RAB27A,PIGB,RSL24D1 RSL24D1 NA NA NA NA RSL24D1 718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 55559597 55559729 55559672 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 49429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 55574844 55574949 55574897 Y NA PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1 NA NA NA NA PIGB 34209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 55928441 55928509 55928475 Y NA NA NA NA NA NA PRTG 104779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 56029665 56029817 56029741 Y NA PRTG NA NA NA NA PRTG 3471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 56063154 56063228 56063198 Y NA PRTG NEDD4,PRTG IMR90 Hi-C 24141950 PRTG 29866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 57261737 57262096 57261746 Y NA NA NA NA NA NA TCF12 52916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 57465140 57465369 57465208 Y ZNF280D,TCF12 NA LOC283663 IMR90 Hi-C 24141950 CGNL1 200796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 57529031 57529296 57529123 Y NA NA NA NA NA NA CGNL1 136869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 57946197 57946519 57946360 Y NA NA NA NA NA NA POLR2M 63966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 58568513 58568584 58568545 Y NA NA LIPC,ADAM10,FAM63B,SLTM IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A2 219481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 58884938 58885321 58885256 Y NA NA NA NA NA NA ALDH1A2 96873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 58939079 58939427 58939418 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 100750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59085961 59086460 59086218 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA FAM63B 24570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 59138361 59138756 59138559 Y NA RNF111 NA NA NA NA RNF111 16618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59158498 59158653 59158597 Y ADAM10,RNF111,SLTM RNF111 NA NA NA NA RNF111 3124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59464671 59464805 59464738 Y RNF111 NA NA NA NA NA CCNB2 69394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59642348 59642705 59642508 Y BNIP2,RNF111 FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 20187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59646072 59646468 59646249 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 16424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 59646649 59647004 59646975 Y NA FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 15888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 60368921 60369293 60369107 Y NA NA NA NA NA NA FOXB1 74500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 60860287 60860764 60860653 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 90910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 60861865 60862603 60862448 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 92488 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 60937521 60937640 60937631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 168144 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 61091060 61091341 61091119 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 321683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 61264927 61265345 61265257 Y NA NA NARG2 IMR90 Hi-C 24141950 RORA 254173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 62683990 62684402 62684060 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 62684510 62685208 62684868 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 3785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 62685382 62685737 62685634 Y NA TLN2 TLN2,MGC15885 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 4657 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 62896766 62896914 62896838 Y NA NA TLN2 IMR90 Hi-C 24141950 TLN2 216041 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 63034731 63035286 63034964 Y NA NA NA NA NA NA RP11-244F12.1 208086 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 63189821 63190186 63190004 Y NA NA TPM1,TLN2,RAB8B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-244F12.1 53186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 63524700 63525054 63524766 Y LACTB,USP3,RAB8B RAB8B,APH1B NA NA NA NA APH1B 41163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 63539312 63539664 63539446 Y LACTB,USP3,RAB8B APH1B APH1B IMR90 Hi-C 24141950 APH1B 26553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 64601637 64601745 64601727 Y NA CSNK1G1 NA NA NA NA CSNK1G1 44697 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 64654607 64654901 64654754 Y PIF1,KIAA0101 CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4 CSNK1G1 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G1 8165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 64754012 64754177 64754162 Y NA ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 3071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 64920832 64921228 64921023 Y ZNF609,OAZ2 NA NA NA NA NA OAZ2 72252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 64960104 64960464 64960341 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 33016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.73922851112689 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 65713781 65714189 65713985 Y IGDCC3,IGDCC4 IGDCC3,IGDCC4 NA NA NA NA IGDCC4 371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 65823475 65823857 65823545 Y IGDCC4 DPP8,PTPLAD1 NA NA NA NA PTPLAD1 2719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 65831867 65832220 65831871 Y NA DPP8,PTPLAD1 C15orf44 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD1 11111 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 66060795 66060948 66060877 Y NA RAB11A,DENND4A NA NA NA NA DENND4A 21683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 66162838 66163256 66163114 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 66163349 66163534 66163463 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 80718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 66177095 66177419 66177152 Y NA NA NA NA NA NA DENND4A 94464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 66464730 66464867 66464805 Y NA NA NA NA NA NA MEGF11 79218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 67348530 67348587 67348559 Y NA SMAD3 SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB IMR90 Hi-C 24141950 SMAD3 5514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr15 68207456 68207574 68207516 Y NA NA CALML4,CLN6,PIAS1,LOC100506686,IQCH IMR90 Hi-C 24141950 PIAS1 136943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 68366463 68366575 68366519 Y NA PIAS1 NA NA NA NA PIAS1 21946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 68441418 68441688 68441529 Y NA NA NA NA NA NA PIAS1 96901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 68588456 68588855 68588647 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 20315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 68852038 68852173 68852100 Y NOX5,CORO2B,CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 17135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 68852393 68852527 68852460 Y CORO2B CORO2B NA NA NA NA CORO2B 16781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 69087536 69088004 69087836 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 20556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 69090153 69090340 69090256 Y NA SPESP1,ANP32A NA NA NA NA SPESP1 18220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr15 70827382 70827642 70827515 Y NA NA TLE3,LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 226290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 70877631 70877741 70877691 Y NA NA UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 176191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 72003894 72004173 72003980 Y NA NA NA NA NA NA NR2E3 78804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 72041767 72041974 72041871 Y SENP8 NR2E3 NA NA NA NA NR2E3 41003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 72198564 72199008 72198773 Y PARP6,MYO9A,CELF6,CELF6,CELF6 NA NA NA NA NA NR2E3 115587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 72265573 72265641 72265607 Y NA NA NA NA NA NA SENP8 138958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 73611065 73611428 73611349 Y C15orf60,HCN4 HCN4 NA NA NA NA HCN4 48177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 ISLR2 NA NA NA NA ISLR2 22341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 74536866 74536980 74536923 Y NA RP11-60L3.1,STRA6 NA NA NA NA STRA6 34258 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 74828638 74828659 74828649 Y ISLR2,ISLR2 ARID3B ARID3B MCF7 ChIA-PET 22265404 ARID3B 2859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 74834290 74834419 74834369 Y ULK3,CSK,CLK3,ARID3B ARID3B NA NA NA NA ARID3B 2772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 75250602 75250974 75250783 Y RPP25 COX5A,SCAMP5,RPP25 NA NA NA NA RPP25 2797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 75288966 75289325 75289146 Y CPLX3,ULK3,SCAMP5 SCAMP5,RPP25,PPCDC NA NA NA NA PPCDC 24571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 75742568 75742962 75742713 Y NA SIN3A NA NA NA NA SIN3A 3221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 75744907 75745094 75744993 Y C15orf39,ODF3L1,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr15 75745296 75745530 75745399 Y PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr15 75820261 75820616 75820439 Y NA PTPN9 NA NA NA NA PTPN9 49014 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 75867013 75867354 75867182 Y C15orf39,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,UBE2Q2,ODF3L1 PTPN9,SNUPN NA NA NA NA PTPN9 2276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr15 76543637 76543996 76543963 Y NA NA C15orf27 IMR90 Hi-C 24141950 ETFA 57817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 77340153 77340443 77340173 Y PSTPIP1 TSPAN3 NA NA NA NA TSPAN3 33883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 78339251 78339773 78339544 Y TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 28293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 78364826 78365348 78365071 Y DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B TBC1D2B,SNORA63 NA NA NA NA TBC1D2B 2718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 78535918 78535943 78535931 Y NA DNAJA4 NA NA NA NA DNAJA4 18485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 79152508 79152900 79152703 Y IREB2 RPL21P116 MORF4L1,ADAMTS7 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RPL21P116 1171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 80149264 80149318 80149291 Y ST20,ST20-MTHFS,ST20,MTHFS,MTHFS MTHFS NA NA NA NA MTHFS 38403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr15 80211933 80212232 80212185 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS NA NA NA NA C15ORF37 1275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 80828578 80828783 80828681 Y ZFAND6 NA NA NA NA NA KIAA1199 240901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 81219891 81220152 81220022 Y STARD5 NA NA NA NA NA MESDC2 60067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 81315785 81316530 81316214 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC1 24490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 82050341 82050360 82050353 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 286122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr15 82274392 82274506 82274449 Y FAM154B NA MEX3B IMR90 Hi-C 24141950 MEX3B 61976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 82339167 82339811 82339478 Y MEX3B MEX3B NA NA NA NA MEX3B 2685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 82340231 82340454 82340397 Y NA MEX3B NA NA NA NA MEX3B 3749 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 83376680 83377056 83376874 Y NA RP11-752G15.4,AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA AP3B2 14 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 83412156 83412209 83412183 Y NA AP3B2,RP11-752G15.6 NA NA NA NA RP11-752G15.6 5107 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 83680959 83681167 83681099 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 2566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 83681404 83681605 83681512 Y NA HOMER2,FAM103A1,C15orf40 NA NA NA NA C15orf40 3011 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 83815089 83815145 83815117 Y NA TM6SF1 NA NA NA NA TM6SF1 40930 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 85290443 85290837 85290532 Y PDE8A,ZNF592 SEC11A,ZNF592 NA NA NA NA ZNF592 577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 85458286 85458507 85458420 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 63164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 85547085 85547484 85547285 Y NA PDE8A NA NA NA NA PDE8A 25414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 86126699 86127744 86127307 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 204897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 86131454 86131632 86131493 Y AKAP13 NA NA NA NA NA KLHL25 204629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 86165783 86166027 86165915 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 170234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 86192682 86192944 86192801 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 143317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 86315137 86315409 86315289 Y KLHL25 KLHL25 NA NA NA NA KLHL25 20852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 88250109 88250470 88250290 Y NA RP11-648K4.2 AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-648K4.2 5026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 89014009 89014390 89014200 Y NA MRPL46,MRPS11 NA NA NA NA MRPS11 5325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 89672226 89672631 89672291 Y ABHD2 ABHD2,HMGB1P8 NA NA NA NA HMGB1P8 5095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 89923171 89923194 89923182 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 47079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 90005846 90006063 90005954 Y NA NA NA NA NA NA POLG 129754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr15 90197559 90197639 90197586 Y KIF7 KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA KIF7 877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90394929 90395092 90395007 Y ZNF710,CIB1,ANPEP ANPEP,AP3S2 NA NA NA NA ANPEP 38296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90418263 90418454 90418325 Y NA AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 17120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90441878 90442278 90442169 Y C15orf38 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 6304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90571687 90571922 90571811 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 29063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90581471 90581912 90581727 Y AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 38847 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90669829 90670140 90669985 Y NA IDH2,SEMA4B IQGAP1,IDH2,MESP1,SEMA4B,C15orf58,CIB1,NGRN,TTLL13,ZNF710,C15orf38-AP3S2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IDH2 26093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr15 90708840 90709227 90709106 Y NA SEMA4B CIB1,C15orf58,SEMA4B,ZNF710,IDH2,TTLL13,NGRN IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SEMA4B 7004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 90957340 90957730 90957416 Y FES,ZNF710,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 27890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA CTD-3094K11.1 NA NA NA NA CTD-3094K11.1 49218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 91412875 91413318 91412960 Y IQGAP1,FURIN,UNC45A,FES,FES,FES CTD-3094K11.1,FURIN,FES,MAN2A2 NA NA NA NA FURIN 3053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 91541068 91541209 91541180 Y NA RCCD1,PRC1,VPS33B,AC068831.10 NA NA NA NA PRC1 4209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr15 92293461 92293635 92293548 Y NA NA NA NA NA NA SLCO3A1 101290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 92674353 92674494 92674375 Y SLCO3A1 NA NA NA NA NA NPM1P5 152577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 92935805 92935988 92935945 Y NA ST8SIA2 NA NA NA NA ST8SIA2 747 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93130741 93130751 93130746 Y NA NA NA NA NA NA HMGN1P38 122226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93131436 93131762 93131609 Y RGMA,C15orf32,FAM174B NA NA NA NA NA HMGN1P38 121215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93354824 93354998 93354897 Y CHD2 FAM174B NA NA NA NA FAM174B 3710 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 93424689 93424786 93424732 Y CHD2 CHD2 NA NA NA NA CHD2 163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93425040 93425223 93425112 Y C15orf32 CHD2 NA NA NA NA CHD2 514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA RGMA 87773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93611936 93612095 93612013 Y RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA RGMA NA NA NA NA RGMA 18338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93779330 93779873 93779589 Y CHD2 NA NA NA NA NA RP11-266O8.1 73913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93820840 93821077 93820958 Y RGMA RP11-266O8.1 NA NA NA NA RP11-266O8.1 32709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 93864881 93865242 93865107 Y NA RP11-266O8.1 NA NA NA NA RP11-266O8.1 11095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 96884042 96884481 96884402 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 15452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1 NA NA NA NA NR2F2-AS1 31597 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99090927 99091248 99091140 Y NA NA IGF1R,SYNM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGF1R 98952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99186701 99186900 99186850 Y NA IGF1R FAM169B,IGF1R IMR90 Hi-C 24141950 IGF1R 3300 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr15 99214674 99215061 99214732 Y NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 24474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr15 99223373 99223476 99223421 Y NA IGF1R NA NA NA NA IGF1R 33173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99318481 99318879 99318554 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 128281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99366453 99366700 99366460 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 176253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 99708218 99708283 99708249 Y NA NA SYNM IMR90 Hi-C 24141950 SYNM 71798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr15 102202329 102202647 102202484 Y OR4F15 TM2D3 NA NA NA NA TM2D3 11735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 369599 369830 369715 Y NA RGS11,PDIA2,AXIN1,MRPL28 NA NA NA NA AXIN1 30843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 389816 389946 389892 Y NA AXIN1,MRPL28,TMEM8A NA NA NA NA AXIN1 10727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 507891 508134 507965 Y NHLRC4 RAB11FIP3 NA NA NA NA RAB11FIP3 34272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 615969 616302 616108 Y RGS11,NHLRC4 PIGQ,RAB40C NA NA NA NA PIGQ 974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,RAB40C,C16orf13,FAM195A NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 756470 756692 756669 Y NA RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL,NARFL NA NA NA NA METRN 6423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 1239202 1239436 1239320 Y BAIAP3,BAIAP3,CACNA1H CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 37961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 2175102 2175363 2175212 Y NME3,NUBP2,TBL3,GFER,SLC9A3R2,MLST8,MLST8,DNASE1L2,NTHL1,TSC2 RAB26,SNORD60,TRAF7 NA NA NA NA RAB26 13441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr16 2657653 2657823 2657765 Y NA NA NA NA NA NA ERVK13-1 63622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 3031604 3031823 3031757 Y PAQR4 KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1 NA NA NA NA PKMYT1 3064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,CLDN9,TNFRSF12A,CLDN6,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA CLDN9 6232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZSCAN10,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr16 3221173 3221513 3221502 Y NA ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 43395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 3512084 3512361 3512129 Y OR1F1,TIGD7,OR2C1,CLUAP1 ZNF597,NAA60,LA16c-306E5.1,CLUAP1 NA NA NA NA NAA60 20473 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr16 5085449 5085725 5085546 Y NA ALG1,NAGPA NA NA NA NA NAGPA 3307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 5666199 5666502 5666317 Y NA NA NA NA NA NA FAM86A 520390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 5920372 5920634 5920563 Y RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 774563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 6422300 6423402 6422643 Y RBFOX1,RBFOX1 NA NA NA NA NA FAM86A 1276491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 7354527 7355049 7354969 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 1358491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 7725716 7726034 7725879 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 987506 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 8633872 8634074 8633933 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 79466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 9147014 9147397 9147240 Y ABAT C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 36108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 9237080 9237205 9237143 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 53575 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 9774012 9774199 9774105 Y NA NA NA NA NA NA C16orf72 590507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 10133348 10133947 10133667 Y NA NA NA NA NA NA ATF7IP2 284344 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 10688488 10688836 10688661 Y NA EMP2 EMP2,TEKT5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EMP2 15933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 10710369 10710537 10710438 Y NA EMP2 NA NA NA NA EMP2 37814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 10956294 10956664 10956435 Y NUBP1,CIITA NA CIITA IMR90 Hi-C 24141950 DEXI 77653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 11012685 11013009 11012730 Y TEKT5,FAM18A,CIITA,CLEC16A DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 21308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 11336726 11336842 11336760 Y LITAF,LITAF RMI2,SOCS1 NA NA NA NA RMI2 4634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 11422424 11422652 11422552 Y NA NA CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11 IMR90 Hi-C 24141950 SOCS1 74388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 11960558 11960748 11960653 Y NA RSL1D1,GSPT1 ZC3H7A,RSL1D1,BCAR4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RSL1D1 17116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr16 12071486 12071797 12071761 Y NA RP11-166B2.1,SNX29 NA NA NA NA SNX29 2892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 13557346 13557802 13557518 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 454212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 14379572 14379808 14379698 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 216394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 14397958 14398068 14398015 Y NA NA NA NA NA NA MKL2 234780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 15169609 15169763 15169686 Y NA NTAN1 NA NA NA NA NTAN1 21688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 15670640 15671032 15670885 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0430 63991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 16115976 16116215 16116101 Y NA NA NA NA NA NA ABCC1 74542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 17454631 17455096 17454854 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 107642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 17463561 17463824 17463658 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 98914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 17510902 17511071 17510985 Y XYLT1 NA NA NA NA NA XYLT1 51667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 17542654 17543047 17542953 Y XYLT1 XYLT1 NA NA NA NA XYLT1 19691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 19302824 19302976 19302897 Y NA NA NA NA NA NA SYT17 125531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 19714468 19714843 19714656 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 10935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 19893504 19893863 19893602 Y NA GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 1626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 19894494 19895110 19894762 Y CCP110,GPRC5B GPRC5B NA NA NA NA GPRC5B 379 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 21295163 21295477 21295440 Y NA CRYM-AS1,CRYM NA NA NA NA CRYM-AS1 14693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 21313038 21313456 21313158 Y NA CRYM-AS1,CRYM NA NA NA NA CRYM 634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 22202219 22202462 22202295 Y NA EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 13141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 22206155 22206271 22206214 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,UQCRC2,PDZD9,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 9332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA CDR2 24595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 24077587 24077959 24077773 Y PRKCB NA NA NA NA NA PRKCB 232265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 25069852 25070174 25070015 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 44865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 25104411 25104695 25104554 Y NA LCMT1 SLC5A11,ARHGAP17,LCMT1,LOC100506655 IMR90 Hi-C 24141950 LCMT1 16355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 26016185 26016314 26016250 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST4 314838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 26407533 26407848 26407539 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST4 706186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 27278659 27278775 27278715 Y JMJD5 NSMCE1,IL4R NA NA NA NA NSMCE1 544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 28543579 28543953 28543732 Y EIF3CL,EIF3C,SPNS1,IL27 CLN3,NUPR1,CCDC101 IL27 IMR90 Hi-C 24141950 NUPR1 4542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 28839972 28840187 28840086 Y CCDC101,LAT,LAT,SH2B1,SH2B1,SH2B1,NFATC2IP ATXN2L,TUFM,SH2B1 NA NA NA NA ATXN2L 7616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 29168403 29168702 29168538 Y SPNS1 NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 SPNS1 184861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT QPRT NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 29713855 29714040 29713926 Y CORO1A,C16orf54 QPRT NA NA NA NA QPRT 41255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 29749958 29750047 29750034 Y NA KIF22 NA NA NA NA KIF22 49993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 29796508 29796713 29796645 Y KCTD13,C16orf92,ALDOA KIF22,MAZ,PRRT2,MVP NA NA NA NA KIF22 3327 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 30427925 30428543 30428281 Y HIRIP3,ZNF48 TBC1D10B,ZNF48,ZNF771,SNORA42,DCTPP1,SEPHS2 NA NA NA NA SNORA42 537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.84458345386254 chr16 30876491 30876606 30876548 Y NA MIR4519,BCL7C,CTF1 NA NA NA NA MIR4519 8038 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 30994228 30994553 30994360 Y VKORC1,HSD3B7 ORAI3,SETD1A,STX1B,STX4 NA NA NA NA HSD3B7 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM NA NA NA NA NA PYCARD 52214 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr16 33952235 33952334 33952272 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 33952793 33953560 33953111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 2069714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 34956727 34956933 34956830 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3073648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 34979653 34980053 34979874 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 3096574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 46780849 46781142 46780994 Y MYLK3 MYLK3 NA NA NA NA MYLK3 41177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 46791398 46792001 46791737 Y C16orf87,ORC6 MYLK3 MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 MYLK3 30318 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 46792369 46792477 46792422 Y MYLK3 MYLK3 MYLK3,C16orf87 IMR90 Hi-C 24141950 MYLK3 29842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA MYLK3,C16orf87 NA NA NA NA MYLK3 1464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr16 46839113 46839505 46839309 Y NA MYLK3,C16orf87 NA NA NA NA MYLK3 16794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 46863838 46864241 46863904 Y NA MYLK3,C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 48373783 48374217 48374017 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA LONP2 97576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 48593216 48593689 48593553 Y NA NA NA NA NA NA N4BP1 58370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 48645394 48646040 48645807 Y SIAH1,N4BP1 N4BP1 NA NA NA NA N4BP1 6019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 49316261 49316466 49316357 Y CBLN1,C16orf78 CBLN1 NA NA NA NA CBLN1 2519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 49542422 49542557 49542490 Y ZNF423 NA NA NA NA NA CBLN1 228680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 49734501 49734890 49734846 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 362962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 49810158 49810260 49810209 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 287592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 49874457 49874672 49874565 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 223180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 49882114 49882389 49882252 Y NA NA NA NA NA NA HEATR3 215463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 49888231 49888307 49888269 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 209545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 49893175 49893278 49893262 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 204574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 49910498 49910724 49910573 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 187128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA NA NA NA NA NA PAPD5 52052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 50376082 50376389 50376371 Y NA BRD7 NA NA NA NA BRD7 24456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 51183106 51183414 51183179 Y SALL1,SALL1 NA NA NA NA NA SALL1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 2763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr16 51186928 51187269 51186986 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 3650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 51187930 51188326 51188194 Y NA SALL1 NA NA NA NA SALL1 4652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 51795949 51796284 51796182 Y NA NA SALL1,CYLD,LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 118282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 51797343 51797505 51797414 Y NA NA SALL1,CYLD,LOC388276 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 119676 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 51909181 51909528 51909355 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 231514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 53075249 53075847 53075790 Y NA CHD9 CHD9 IMR90 Hi-C 24141950 CHD9 11098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 53089565 53089820 53089729 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 2620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 53124874 53125001 53124924 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 37929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 53802432 53802770 53802659 Y NA NA NA NA NA NA FTO 66557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 56246770 56247072 56246869 Y NA GNAO1 NA NA NA NA GNAO1 23468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 56458239 56458402 56458321 Y NA AMFR,OGFOD1,NUDT21 NA NA NA NA AMFR 789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 56581201 56581558 56581471 Y MT3,GNAO1,BBS2 BBS2,MT3 MT1X,MT4,MT1B,NUP93,MT2A,MT1IP,MT1G,MT1H,OGFOD1,BBS2,MT3,AMFR,NUDT21,MT1A,MT1DP IMR90 Hi-C 24141950 BBS2 29006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr16 57294233 57294672 57294611 Y CPNE2,GPR56 ARL2BP,PLLP NA NA NA NA ARL2BP 17223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 57488914 57489209 57489062 Y NA COQ9,CIAPIN1,POLR2C,DOK4 NA NA NA NA POLR2C 5090 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 57564039 57564411 57564096 Y ZNF319,GPR114 DOK4,CCDC102A NA NA NA NA CCDC102A 4100 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 9.16588001800151 chr16 57841964 57842337 57842236 Y NA NA NA NA NA NA KIFC3 52620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 58061325 58061443 58061395 Y NA MMP15 NA NA NA NA MMP15 3855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 62499972 62500105 62500039 Y NA NA NA NA NA NA CDH8 431033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 65047832 65047877 65047854 Y NA NA NA NA NA NA CDH11 110138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 65153548 65154160 65153979 Y CDH11 CDH11 NA NA NA NA CDH11 3855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 66170755 66170866 66170865 Y NA NA CDH11,LOC283867 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00920 269561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 67689330 67689673 67689514 Y NA RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 3040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 67867011 67867153 67867060 Y TPPP3,CENPT RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L NA NA NA NA THAP11 7060 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 67891676 67892114 67891889 Y RLTPR,ACD,PSMB10,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA CENPT 11962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 67892470 67892795 67892734 Y RLTPR,ACD,NFATC3,EDC4,THAP11 THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4,NRN1L,PSKH1 NA NA NA NA EDC4 12131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 68268995 68269119 68269015 Y NA ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 ESRP2,PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA ESRP2 1343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr16 68320188 68320357 68320233 Y RANBP10,THAP11,EDC4,PSMB10,DPEP2,NFATC3,ZFP90,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 22492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 68320405 68320913 68320608 Y ZFP90,SMPD3 PLA2G15,SLC7A6,SLC7A6OS,PRMT7,RNU4-30P NA NA NA NA SLC7A6OS 21936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 68418958 68419037 68419019 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-30P 57526 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 68765918 68766309 68765994 Y NA CDH1 CDH3,CDH1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDH1 2819 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69060339 69060481 69060445 Y NA NA NA NA NA NA HAS3 76986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69225511 69225823 69225667 Y HAS3 SNTB2 NA NA NA NA SNTB2 6479 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69345968 69346332 69346034 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 2709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 69477830 69478460 69477879 Y NA TERF2,CYB5B NA NA NA NA CYB5B 21402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69601109 69601332 69601245 Y WWP2 NFAT5 NA NA NA NA NFAT5 4112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69777344 69777472 69777408 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 9371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69790083 69790481 69790284 Y NA NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NOB1 3240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 7.37484599149547 chr16 69819174 69819469 69819322 Y NA NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 24965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 70444676 70444732 70444694 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 26408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 70461908 70462625 70462132 Y ST3GAL2 ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 8515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 71734305 71734386 71734346 Y PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 22218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 71931018 71931097 71931057 Y DHX38,ATXN1L,KIAA0174 ZNF821 NA NA NA NA ZNF821 3779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 114857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 73846352 73846469 73846405 Y NA NA LOC100506172,ZFHX3 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD7 482204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 74356396 74356719 74356558 Y NA PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 27723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 74701397 74701877 74701440 Y RFWD3 RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 2618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3 NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 75045854 75046060 75045918 Y TMEM170A,MLKL ZNRF1,WDR59 NA NA NA NA WDR59 13783 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 75411958 75412267 75412159 Y NA NA NA NA NA NA CFDP1 53116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 75618166 75618518 75618190 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA GABARAPL2 19917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 77979179 77979195 77979185 Y VAT1L,WWOX NA NA NA NA NA WWOX 152115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 78498317 78498699 78498508 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 367007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 78564720 78564924 78564822 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 433410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 79041696 79041799 79041748 Y NA NA NA NA NA NA MAF 590812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 79617410 79617524 79617513 Y NA MAF NA NA NA NA MAF 15087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 79619926 79620106 79620016 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 12505 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 79635433 79635866 79635594 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 2822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 81693209 81693442 81693326 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 77260 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 81701284 81701528 81701406 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 69174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 81763852 81764387 81764185 Y NA PLCG2 NA NA NA NA PLCG2 6315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 81877175 81877498 81877479 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 106473 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 82172740 82172851 82172799 Y SDR42E1 MPHOSPH6 NA NA NA NA MPHOSPH6 28980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr16 83069400 83069774 83069647 Y NA NA NA NA NA NA HSBP1 769674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 83953538 83953937 83953606 Y NA MLYCD,OSGIN1,NECAB2 NA NA NA NA MLYCD 22807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 84544701 84544717 84544711 Y NA NA COTL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 COTL1 104966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 84633108 84633501 84633306 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 16182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 84704578 84704887 84704734 Y NA KLHL36,USP10 NA NA NA NA KLHL36 24447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85080631 85081139 85080973 Y KIAA0513 ZDHHC7,KIAA0513 NA NA NA NA KIAA0513 21256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.21594162140332 chr16 85264175 85264500 85264259 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 204800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 85395325 85395548 85395434 Y NA NA LOC727710,LOC400548,KIAA0182,GINS2,FAM92B,LINC00311 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 326131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85458916 85459273 85459095 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,LOC727710 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 262406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85473143 85473232 85473181 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 248447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 85496879 85497321 85497140 Y FAM92B,KIAA0182 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 224358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85497347 85497685 85497518 Y KIAA0182,GINS2 NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,ZDHHC7,LOC400548 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 223994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 85586399 85586765 85586561 Y KIAA0182,KIAA0182,GINS2 NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr16 85591342 85591727 85591695 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 129952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 85603305 85603679 85603564 Y KIAA0182 NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 118000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85603902 85604423 85603949 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 117256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85606114 85606473 85606294 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 115206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85617282 85617663 85617577 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 104016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr16 85672210 85672324 85672267 Y NA GINS2 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 49355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85751381 85751721 85751674 Y NA GINS2,C16orf74 NA NA NA NA GINS2 29702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85758517 85758802 85758746 Y NA GINS2,C16orf74 GINS2,KIAA0182 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 23933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 85783425 85783755 85783547 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 86962886 86963146 86962899 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFSD 376045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87378694 87379151 87378934 Y FBXO31 MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA MAP1LC3B 36450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr16 87421939 87422407 87422148 Y NA MAP1LC3B,FBXO31 NA NA NA NA FBXO31 1341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87773499 87773902 87773849 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 87774219 87774566 87774531 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 23032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87781357 87781475 87781397 Y C16orf95 KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87812654 87813065 87812978 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 15056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 87978906 87979489 87979213 Y ZCCHC14,BANP,BANP BANP CA5A,KLHDC4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BANP 1361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 87988913 87989737 87989395 Y ZCCHC14,BANP,BANP,BANP BANP NA NA NA NA BANP 8063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 88837093 88837695 88837443 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 11924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.21245379744864 chr16 89370103 89370259 89370211 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 87985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89396771 89397135 89396953 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 114653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89468980 89469266 89469225 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD11 85703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89488709 89489334 89489046 Y ZNF276,TCF25,SPATA2L,C16orf7,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 65635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr16 89564919 89565211 89565067 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7 IMR90 Hi-C 24141950 SPG7 9594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89568763 89569125 89568979 Y NA ANKRD11,SPG7 ANKRD11,SPG7,LOC100287036,RPL13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPG7 13438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr16 89601012 89601134 89601078 Y ZNF276,ZNF276,SPATA2L ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68,CPNE7 NA NA NA NA RPL13 23931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89893816 89894170 89893993 Y SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 11229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr16 90024486 90024764 90024610 Y NA MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA DEF8 12153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr16 90143699 90144065 90143926 Y C16orf55,SPATA2L,ZNF276,C16orf7,ZNF276,TCF25 NA LOC100130015,GAS8 MCF7 ChIA-PET 22265404 DBNDD1 59163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 818912 819288 819089 Y NA NA NA NA NA NA NXN 61722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 851603 851932 851829 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 29078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 872760 873162 873150 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 881812 881896 881869 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 1171565 1171808 1171610 Y WDR81,PITPNA,ABR,ABR ABR NA NA NA NA ABR 41250 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 1523946 1524301 1524043 Y NA SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 5879 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1620806 1621089 1620895 Y PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81 PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG,SERPINF1 NA NA NA NA MIR22HG 2338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 1773985 1774184 1774050 Y SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,WDR81,WDR81,SMYD4 RPA1,SMYD4,AC016292.3 NA NA NA NA AC016292.3 14245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1833747 1833959 1833853 Y NA NA NA NA NA NA AC016292.3 74007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1864830 1864896 1864863 Y NA NA NA NA NA NA RTN4RL1 61743 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1926126 1926449 1926286 Y NA RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA RTN4RL1 190 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 9740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 1979194 1979509 1979218 Y NA DPH1,OVCA2 NA NA NA NA OVCA2 35867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 1994416 1994643 1994603 Y HIC1,HIC1 NA NA NA NA NA OVCA2 51089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA OVCA2 82688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2198811 2198924 2198868 Y NA SRR,SMG6,SGSM2,TSR1 NA NA NA NA SRR 5753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 2307434 2307709 2307574 Y NA MNT NA NA NA NA MNT 5022 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2307798 2307958 2307865 Y PAFAH1B1 MNT NA NA NA NA MNT 5386 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2612424 2612524 2612493 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 117920 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 132635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 133114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2751152 2751369 2751257 Y PAFAH1B1,RAP1GAP2 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 256648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2771532 2771614 2771573 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 277028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2795960 2796135 2796054 Y NA NA NA NA NA NA PAFAH1B1 301456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA PAFAH1B1 457619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 4064613 4064785 4064717 Y NA ZZEF1,CYB5D2 NA NA NA NA CYB5D2 20151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 4204226 4204625 4204419 Y CAMKK1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 38952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 4233037 4233303 4233170 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 34620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 4244674 4245003 4244975 Y NA UBE2G1 NA NA NA NA UBE2G1 22920 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 4737531 4737755 4737558 Y PLD2,MINK1 GLTPD2,PSMB6,PLD2,MINK1 NA NA NA NA MINK1 2848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA RNF167 29261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 5412379 5412497 5412422 Y USP6 DHX33,MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 24248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 5623535 5623758 5623647 Y NA WSCD1 LOC339166,AIPL1 IMR90 Hi-C 24141950 WSCD1 49796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 6396224 6396493 6396421 Y NA NA NA NA NA NA FAM64A 50489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 NA NA NA NA NA AC027763.2 122793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 7119118 7119286 7119174 Y WRAP53,EFNB3,AMAC1L3,NLGN2,NEURL4,DLG4 ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1,CLDN7 NA NA NA NA ACADVL 674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 7233457 7233867 7233744 Y WRAP53,POLR2A,DNAH2,DLG4,EIF5A YBX2,EIF5A,GPS2,NEURL4,KCTD11,TNK1 NA NA NA NA NEURL4 2745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 7381310 7382154 7381844 Y KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4 TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA ZBTB4 3428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.10709885471299 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.52851862565559 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,TMEM88,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,KCNAB3,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA PER1 27708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 8041932 8042438 8042328 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 15386 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 8090795 8091158 8090849 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB NA NA NA NA C17orf59 406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 8517371 8517653 8517512 Y NA MYH10 NA NA NA NA MYH10 14426 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 8532647 8532776 8532657 Y KRBA2 MYH10 NA NA NA NA MYH10 568 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 9155924 9156306 9156115 Y PIK3R5 NA NA NA NA NA NTN1 233065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 9267283 9267598 9267441 Y NA NA NA NA NA NA STX8 210310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 10029620 10029815 10029718 Y MYH4 NA NA NA NA NA RPS27AP1 130264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 10658369 10658680 10658526 Y SHISA6,TMEM220,PIRT TMEM220,RP11-963H4.2 ZNF18,SHISA6,PIRT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-963H4.2 10509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 11493725 11493965 11493845 Y DNAH9 NA SHISA6 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF18 404862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 13288916 13289223 13288974 Y NA NA HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 214021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 13390789 13390935 13390899 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 112309 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 13412933 13413137 13413069 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 90107 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 13445928 13446299 13446210 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 56945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 13463603 13463645 13463626 Y HS3ST3A1 HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 39599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 13486545 13486641 13486589 Y NA HS3ST3A1 NA NA NA NA HS3ST3A1 16603 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 13575065 13575361 13575332 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST3A1 71821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 14212324 14213048 14212775 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 9924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 14736627 14737029 14736827 Y NA NA HS3ST3B1,HS3ST3A1 IMR90 Hi-C 24141950 RPS18P12 129776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15141283 15141756 15141580 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 24887 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15153959 15154348 15154277 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 12295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15368147 15368483 15368202 Y NA NA NA NA NA NA SNORA74 106850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15393997 15394379 15394217 Y PMP22,FAM18B2 NA NA NA NA NA SNORA74 80954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15787021 15787553 15787332 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B NA NA NA NA NA ADORA2B 58678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15923170 15923610 15923287 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 22139 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 15959345 15959465 15959410 Y FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA NA ZSWIM7 58314 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16035892 16036125 16036009 Y NA NA NA NA NA NA PIGL 82380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16281558 16281769 16281590 Y NA CENPV,UBB,TRPV2 NA NA NA NA UBB 343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16310492 16310776 16310647 Y NA UBB,TRPV2 TRPV2,C17orf76-AS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TRPV2 6080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16374519 16374788 16374546 Y NA NA NA NA NA NA TRPV2 57663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 16375722 16375971 16375775 Y TTC19,ZSWIM7,NCOR1,PIGL,ZNF624,ZNF287,CENPV NA NA NA NA NA TRPV2 58866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16388389 16388725 16388555 Y NA NA NA NA NA NA TRPV2 71533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr17 16440164 16440317 16440266 Y ZNF624,CCDC144A ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 30203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 16487545 16487788 16487743 Y NA ZNF287,AC005822.1 NA NA NA NA ZNF287 17025 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 16944636 16944769 16944688 Y NA MPRIP NA NA NA NA MPRIP 777 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17204544 17204774 17204670 Y NA COPS3 NA NA NA NA NT5M 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 17208754 17209324 17209000 Y PLD6,COPS3,COPS3,NT5M COPS3,NT5M NA NA NA NA NT5M 4105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17470517 17470759 17470631 Y LRRC48 PEMT RASD1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PEMT 22263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17484274 17484547 17484424 Y NA PEMT NA NA NA NA PEMT 8475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17493657 17493822 17493814 Y RASD1,SREBF1,PEMT,PEMT PEMT NA NA NA NA PEMT 635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr17 17686462 17687119 17686716 Y NA NA NA NA NA NA SREBF1 51206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17766830 17766899 17766864 Y LLGL1 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 28505 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 17831776 17831833 17831804 Y NA TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 41903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 18128078 18128354 18128155 Y NA ALKBH5,LLGL1,FLII NA NA NA NA LLGL1 1177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 18242712 18242812 18242762 Y FBXW10,SHMT1 TOP3A,SMCR8,SHMT1 NA NA NA NA SHMT1 22044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 18820621 18820763 18820720 Y NA NA NA NA NA NA PRPSAP2 79223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 19398359 19398685 19398615 Y NA AC004448.5,SLC47A1 SLC47A2,B9D1,EPN2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 1661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr17 19411188 19411542 19411351 Y NA AC004448.5,SLC47A1 EPN2,SLC47A2,B9D1,ALDH3A2,ALDH3A1,ULK2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC47A1 14490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 19883392 19883621 19883525 Y NA AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA AKAP10 3736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 19913206 19913926 19913276 Y ULK2,AKAP10 AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA SPECC1 2549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 19967569 19967807 19967644 Y NA NA NA NA NA NA SPECC1 56912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 20204150 20204477 20204216 Y NA NA NA NA NA NA MEIS3P2 285894 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 21002403 21002809 21002523 Y KCNJ18 AC087393.1,DHRS7B USP22,C17orf103 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DHRS7B 21868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA KCNJ12 NA NA NA NA KCNJ12 36757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 21908682 21908761 21908685 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 432960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 25415234 25415538 25415430 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 25620233 25620423 25620280 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 1131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 25672386 25672687 25672621 Y NA NA KSR1,MIR4522,WSB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 53284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 5.58381196498943 chr17 25784873 25785075 25784939 Y WSB1,LGALS9 KSR1 KSR1 MCF7 ChIA-PET 22265404 KSR1 3203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 25805507 25805777 25805623 Y NA KSR1 NA NA NA NA KSR1 23837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 25858035 25858294 25858209 Y WSB1,LGALS9 NA NA NA NA NA KSR1 76365 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 25891638 25891876 25891756 Y NA NA NA NA NA NA LGALS9 62948 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 26929593 26929935 26929764 Y TIAF1,PHF12,FLOT2,UNC119 PIGS,ALDOC,SPAG5-AS1,SPAG5,KIAA0100 NA NA NA NA SPAG5 5296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,SNORD4B,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 27100910 27101180 27101019 Y NA NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 31908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27116093 27116114 27116106 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 47091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27118575 27118718 27118697 Y NA TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 49573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 27220048 27220212 27220121 Y NA ERAL1,FLOT2,DHRS13 NA NA NA NA FLOT2 2485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 27814311 27814661 27814484 Y NA NA NA NA NA NA TP53I13 76409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27824938 27824945 27824941 Y TIAF1,MYO18A,TAOK1,EFCAB5,ANKRD13B NA NA NA NA NA TP53I13 66125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 27919265 27919579 27919303 Y NA TP53I13,ABHD15,ANKRD13B,GIT1,CORO6 NA NA NA NA GIT1 193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 28009923 28010244 28010118 Y SSH2 NA NA NA NA NA CORO6 61998 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 28258246 28258478 28258304 Y NA SSH2 NA NA NA NA SSH2 2952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 28431711 28432027 28431733 Y NA NSRP1 NA NA NA NA NSRP1 8512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 29115484 29115559 29115508 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 34235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29136069 29136242 29136166 Y CRLF3 CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA CRLF3 13552 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29210096 29210162 29210129 Y NA ADAP2,TEFM NA NA NA NA ADAP2 21200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29212303 29212381 29212342 Y OMG,NF1,C17orf42 ADAP2,TEFM NA NA NA NA ADAP2 18981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29637373 29637640 29637434 Y CRLF3,EVI2A NA NA NA NA NA RAB11FIP4 79002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29717293 29717639 29717335 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 651 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 29720046 29720299 29720173 Y OMG,RAB11FIP4 RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 3404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 29759240 29759393 29759318 Y NA RAB11FIP4 NA NA NA NA RAB11FIP4 42598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 29787763 29788137 29787829 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 71121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 2372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 30593810 30594211 30593930 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 2615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 30778136 30778420 30778202 Y ZNF207 PSMD11,CDK5R1 NA NA NA NA PSMD11 8857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 30847234 30847756 30847477 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 35597 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 30923806 30924081 30923942 Y NA NA NA NA NA NA CDK5R1 112169 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 31150044 31150344 31150182 Y NA NA NA NA NA NA MYO1D 51851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 31598855 31599016 31598936 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 345927 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 31733043 31733261 31733152 Y NA NA NA NA NA NA TMEM98 480115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 32365538 32365912 32365713 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 214392 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 32395680 32396045 32395863 Y NA NA NA NA NA NA CCL2 184259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 32576443 32576937 32576727 Y CCL8,CCL7 CCL2 CCL2,CCL11,CCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 3367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 33572314 33572864 33572356 Y NA SLFN5 NA NA NA NA SLFN5 4259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 33640144 33640597 33640233 Y CCT6B,ZNF830,SLFN12L,SLFN5 NA PEX12,SLFN14,SLC35G3,SLFN12L,SLFN12,SNORD7,AP2B1 IMR90 Hi-C 24141950 SLFN5 72089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 33868194 33868343 33868266 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,SLFN12L,CCL5 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 33923571 33923796 33923685 Y NA AP2B1,PEX12 NA NA NA NA PEX12 19689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 34160214 34160648 34160302 Y NA TAF15,CCL5 NA NA NA NA TAF15 25755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 34948982 34949076 34949029 Y DHRS11 DHRS11,MRM1 NA NA NA NA DHRS11 2754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF AATF NA NA NA NA AATF 11617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 35519679 35519723 35519693 Y NA NA NA NA NA NA AATF 215504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 35520107 35520138 35520123 Y ACACA NA NA NA NA NA AATF 215932 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 36149249 36149375 36149312 Y HNF1B NA HNF1B,DDX52,SYNRG,LOC284100,DUSP14 IMR90 Hi-C 24141950 DDX52 147756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr17 36480536 36480738 36480637 Y NA MRPL45,SOCS7 NA NA NA NA SOCS7 25373 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 36571646 36572076 36571709 Y C17orf96 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 10586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 36853458 36853679 36853598 Y NA C17orf96,MLLT6,CISD3 NA NA NA NA MLLT6 6116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 36859613 36860666 36860145 Y NA C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3 NA NA NA NA MLLT6 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 37027781 37027987 37027914 Y FBXO47,CWC25 CWC25,MIR4727,SNORA21,RPL23,RPS20P35,LASP1 NA NA NA NA LASP1 3669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 37249276 37249451 37249365 Y MLLT6,CWC25,FBXL20,CDK12 NA NA NA NA NA PLXDC1 59196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 37323832 37324052 37323944 Y NA PLXDC1,CACNB1,RPL19 NA NA NA NA PLXDC1 15185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 37558786 37559227 37559071 Y NA FBXL20,MED1 NA NA NA NA FBXL20 2010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 37661852 37662117 37661985 Y STAC2,FBXL20,MED1,CDK12 CDK12 NA NA NA NA CDK12 46088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 37975658 37975828 37975774 Y FBXL20,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3 NA NA NA NA NA GRB7 83478 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38231838 38232188 38231911 Y NA THRA,MED24,NR1D1,MSL1 NA NA NA NA MED24 16370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38263317 38263642 38263602 Y NA MED24,NR1D1,MSL1,CASC3 NA NA NA NA NR1D1 8339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38488015 38488253 38488146 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA CDC6,RARA NA NA NA NA RARA 24571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38619282 38619695 38619581 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,KRT23,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 21580 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38655848 38656036 38655907 Y GJD3,IGFBP4,TNS4 NA NA NA NA NA IGFBP4 58146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 38674878 38675250 38674921 Y TMEM99,TMEM99,TMEM99,CDC6,TOP2A,TNS4 NA IGFBP4,KRT42P,CCR7,RARA,GJD3,TOP2A,TNS4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP4 77176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 39822130 39822941 39822323 Y NA EIF1 KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EIF1 20196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 39956975 39957353 39957171 Y KRT15,KRT19,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA LEPREL4 9503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 40155760 40155995 40155877 Y STAT5A CNP,NKIRAS2,DNAJC7 NA NA NA NA NKIRAS2 5405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 40671173 40671319 40671240 Y PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 41198878 41199234 41199056 Y NA IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA RND2 23620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 41409196 41409569 41409556 Y TMEM106A TMEM106A IFI35,RND2,BRCA1,VAT1,NBR2,NBR1,TMEM106A,LOC100130581 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM106A 47342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 41421158 41421352 41421255 Y NA NA NBR1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4D 52975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 41796772 41797488 41797204 Y TMUB2,TMEM106A,DHX8,DUSP3 SOST LOC100130581,MPP3,DUSP3,DHX8,ETV4,MEOX1,C17orf105,SOST,CD300LG,HDAC5 IMR90 Hi-C 24141950 SOST 36668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 42173050 42173151 42173101 Y TMEM101,G6PC3 LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr17 42215472 42215904 42215679 Y C17orf53 HDAC5,C17orf53,TMUB2 C17orf53 MCF7 ChIA-PET 22265404 C17orf53 1370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 42245888 42246083 42245988 Y NA HDAC5,C17orf53,TMUB2,ATXN7L3 NA NA NA NA TMUB2 16255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr17 42404001 42404290 42404282 Y C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39 SLC25A39,GRN,FAM171A2 NA NA NA NA SLC25A39 3763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 42589268 42589584 42589359 Y C17orf53,GJC1,DBF4B,CCDC43,C17orf104 GPATCH8,FZD2 ATXN7L3,GPATCH8 K562 ChIA-PET 22265404 GPATCH8 10470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr17 42619291 42619496 42619449 Y NA GPATCH8,FZD2 GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B IMR90 Hi-C 24141950 FZD2 13429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 42706147 42706421 42706320 Y NA C17orf104 GPATCH8,C17orf104,RUNDC3A,CCDC43,DBF4B,ITGA2B,FZD2 IMR90 Hi-C 24141950 C17orf104 25341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 43305165 43306978 43306453 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 8354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 43660811 43661173 43660906 Y ACBD4,FMNL1,PLEKHM1 NA NA NA NA NA PLEKHM1 94696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 44131950 44132178 44132002 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 162202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 44155479 44155559 44155517 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 185731 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 44234299 44234706 44234578 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 264551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 44240473 44240874 44240856 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 270725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 44848199 44848613 44848371 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 50666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 45778272 45778788 45778511 Y SNX11,SNX11,ITGB3,C17orf57,NPEPPS,SP2,OSBPL7,CDK5RAP3,TBKBP1,TBX21 NA NA NA NA NA KPNB1 53430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 110410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 46291488 46291927 46291575 Y NA NA NA NA NA NA SNX11 112769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 47048763 47048955 47048859 Y NA SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 23819 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 47098330 47098693 47098445 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 25556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 47099859 47100181 47099940 Y PRAC,IGF2BP1 IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 27085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 47113510 47113580 47113552 Y NA IGF2BP1 NA NA NA NA IGF2BP1 40736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 ABI3,GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA ABI3 15080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr17 48287695 48288075 48287880 Y XYLT2,LRRC59,COL1A1 COL1A1 PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2 IMR90 Hi-C 24141950 COL1A1 10702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 48504874 48504976 48504927 Y NA LRRC59,ACSF2,RSAD1 NA NA NA NA ACSF2 3355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 50795913 50796132 50795928 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 1037099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA RPS2P48 994723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 53006732 53007120 53006925 Y NA TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA TOM1L1 31984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 53017345 53017570 53017451 Y TOM1L1 TOM1L1,STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 26518 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 53034991 53035170 53035032 Y NA STXBP4,COX11 NA NA NA NA STXBP4 8918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 53497797 53498268 53498065 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 55056156 55056413 55056229 Y NA COIL,SCPEP1 NA NA NA NA SCPEP1 2690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 55690023 55690365 55690280 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MRPS23 235052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 55912487 55912699 55912681 Y NA MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 12718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 55993641 55993992 55993778 Y NA CUEDC1 VEZF1,CUEDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CUEDC1 36692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 56014018 56014160 56014055 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 16524 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56025910 56026308 56026041 Y SUPT4H1 CUEDC1,VEZF1 NA NA NA NA CUEDC1 4376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56064193 56064677 56064258 Y NA CUEDC1,VEZF1,SRSF1 NA NA NA NA VEZF1 573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 56391648 56391970 56391957 Y NA SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 36484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56600012 56600151 56600118 Y DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 6746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56705180 56705300 56705276 Y NA RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4 K562 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 29366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56706902 56707296 56707107 Y MKS1,MKS1,RAD51C RNU1-60P,RNU1-85P SEPT4,MTMR4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 27370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 56736656 56737064 56736885 Y MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C SEPT4,C17orf47 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RNU1-60P 1990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 57200500 57200626 57200599 Y GDPD1 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 18218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 57203741 57203833 57203787 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA TRIM37 21459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57231102 57231481 57231293 Y C17orf71 AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 57276702 57276986 57276911 Y NA SKA2,PRR11,SMG8,GDPD1 NA NA NA NA SMG8 7775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57298532 57298798 57298672 Y NA SMG8,GDPD1 NA NA NA NA GDPD1 2704 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57450893 57451089 57451033 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 43843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57518143 57518390 57518285 Y YPEL2 NA YPEL2,GDPD1,SMG8,CLTC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-13P 94470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57902814 57903248 57902913 Y YPEL2,VMP1,RNFT1 MIR21 NA NA NA NA MIR21 13379 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57904186 57904344 57904253 Y VMP1,CA4 MIR21 NA NA NA NA MIR21 12283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57907420 57907736 57907558 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 8891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 57962596 57962816 57962625 Y NA MIR21,TUBD1,RPS6KB1 NA NA NA NA TUBD1 5488 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA CA4 C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CA4 12892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 58678620 58678973 58678714 Y PPM1D PPM1D NA NA NA NA PPM1D 3076 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 58977545 58977928 58977702 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 224731 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 59391895 59392060 59391978 Y NA NA NA NA NA NA NACA2 274503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 59784149 59784411 59784258 Y BRIP1 NA NA NA NA NA NACA2 117586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 59956289 59956463 59956377 Y NA BRIP1,INTS2 BRIP1 IMR90 Hi-C 24141950 BRIP1 17407 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 60058924 60058941 60058933 Y NA NA NA NA NA NA INTS2 55547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60443107 60443391 60443249 Y EFCAB3 RPS23P7 EFCAB3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23P7 29367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60557252 60557333 60557299 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 34795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60649611 60649792 60649701 Y NA NA MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 MRC2 52970 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60721967 60722242 60722046 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 19205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr17 60780424 60780717 60780568 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 77662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 60877951 60878269 60878188 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 175189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 60973132 60973339 60973182 Y TLK2 NA NA NA NA NA MRC2 270370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 61514078 61514307 61514301 Y SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561 CYB561,ACE NA NA NA NA CYB561 7432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 61639369 61639739 61639552 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 13547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 61920991 61921115 61921104 Y NA PSMC5,FTSJ3,SMARCD2,TCAM1P NA NA NA NA SMARCD2 2566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62004883 62005036 62004961 Y CD79B CD79B NA NA NA NA CD79B 2678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62159440 62159790 62159613 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,CEP95,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 46389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62161129 62161576 62161448 Y MAP3K3,LIMD2,ICAM2,PECAM1,DDX5,ERN1 ERN1 NA NA NA NA ERN1 44603 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62257655 62257782 62257719 Y DDX5,ERN1 SNORD104 NA NA NA NA SNORD104 36212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62487438 62487665 62487534 Y ICAM2 POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA POLG2 3489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 62534383 62534677 62534525 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 32066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 NA RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNA13 68292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 63996608 63996849 63996729 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 189353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 64301184 64301397 64301241 Y NA PRKCA NA NA NA NA PRKCA 4430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 64518890 64518971 64518949 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 222136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 64690651 64690854 64690753 Y PRKCA,CACNG4 NA NA NA NA NA CACNG5 138381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 64708077 64708220 64708107 Y NA NA NA NA NA NA CACNG5 121015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65318264 65318584 65318454 Y NA PSMD12 NA NA NA NA PSMD12 42159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 65386872 65387224 65386898 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 15297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65389377 65389540 65389482 Y HELZ,BPTF,PITPNC1 PSMD12,PITPNC1 NA NA NA NA PITPNC1 17802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65470400 65470556 65470469 Y NA NA NA NA NA NA PITPNC1 98825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65505765 65506408 65506331 Y HELZ,PSMD12,BPTF NA NOL11 IMR90 Hi-C 24141950 PITPNC1 134190 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65619223 65619512 65619368 Y NA NA NA NA NA NA NOL11 92437 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 65823373 65823579 65823476 Y SLC16A6,PITPNC1,BPTF BPTF NA NA NA NA BPTF 3733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr17 66030294 66030564 66030453 Y NA C17orf58,KPNA2 NA NA NA NA KPNA2 659 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 66148595 66148807 66148688 Y NA NA NA NA NA NA AMZ2 92908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66282999 66283385 66283192 Y NA AMZ2,ARSG NA NA NA NA ARSG 29676 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66452519 66452682 66452605 Y SLC16A6,WIPI1 WIPI1 NA NA NA NA WIPI1 865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66595732 66596064 66595787 Y NA FAM20A NA NA NA NA FAM20A 202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66597881 66598319 66598164 Y FAM20A FAM20A NA NA NA NA FAM20A 2351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 66599244 66599673 66599435 Y NA FAM20A NA NA NA NA FAM20A 3714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 67463547 67463710 67463574 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 54708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 68153518 68153744 68153613 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K6 744679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 70167914 70168310 70168112 Y NA NA LOC100499467 IMR90 Hi-C 24141950 SOX9 52753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 70442621 70442708 70442666 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 178662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 70892078 70892260 70892135 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A11 194591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 71339324 71339501 71339471 Y SSTR2,CDC42EP4 CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 33010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 71496173 71496542 71496358 Y NA NA NA NA NA NA SDK2 141686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 72780618 72780981 72780928 Y GPR142 SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA TMEM104 9996 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr17 73087456 73087829 73087515 Y NA ATP5H,SLC16A5,ARMC7,NT5C NA NA NA NA SLC16A5 5634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73319762 73319905 73319788 Y SAP30BP,H3F3B,GRB2,GRB2,SLC16A5,GGA3,SLC25A19 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 6352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73333353 73333637 73333600 Y H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3 SLC25A19,AC011933.1 NA NA NA NA AC011933.1 19943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73684314 73684419 73684412 Y NA SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA RECQL5 23045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73719261 73719909 73719549 Y MRPS7,LLGL2,LOC100130933,EVPL,ITGB4,ITGB4 ITGB4,GALK1 NA NA NA NA ITGB4 3853 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 73891396 73891618 73891569 Y NA WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1 NA NA NA NA TRIM65 312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 74025620 74025914 74025713 Y H3F3B,TRIM47,EVPL CDK3,SRP68 NA NA NA NA CDK3 30633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 74134600 74134832 74134764 Y LOC100130933,RECQL5,RECQL5,PRPSAP1,ZACN,FOXJ1 EXOC7,FOXJ1 NA NA NA NA FOXJ1 548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 74264426 74264836 74264522 Y NA ATF4P3,RNF157 NA NA NA NA RNF157 29972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 74304435 74304789 74304685 Y NA NA NA NA NA NA SPHK1 65876 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 74359249 74359572 74359412 Y RHBDF2,SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 PRPSAP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SPHK1 11093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 74440987 74441354 74441087 Y NA UBE2O NA NA NA NA UBE2O 5934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 74723995 74724371 74724344 Y FAM100B,UBE2O,METTL23,SRSF2,MFSD11 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA METTL23 3083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr17 74836829 74837207 74837140 Y UBE2O,MGAT5B MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 25331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 75431413 75431687 75431621 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 156762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75461802 75462176 75461947 Y SEC14L1,SEC14L1 NA NA NA NA NA SEPT9 187151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75802285 75802305 75802295 Y NA NA LOC100507351,TNRC6C IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-80P 111875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75953939 75954304 75954190 Y TMEM235,TMC8,TMC6,TMC6,SOCS3,PGS1,TNRC6C RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 39759 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA RNU1-80P TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU1-80P 40213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 22.2298929172221 chr17 76247000 76247249 76247129 Y TMEM235 BIRC5 NA NA NA NA BIRC5 38733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 76310071 76310633 76310436 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3 PGS1,DNAH17,SOCS3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SOCS3 43525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 76357167 76357466 76357379 Y NA SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 3009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 76379911 76380778 76380428 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA PGS1 7190 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 76669540 76669658 76669599 Y NA NA NA NA NA NA CYTH1 106721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 77178893 77179196 77179046 Y NA NA NA NA NA NA ENGASE 109872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 77216681 77217055 77216976 Y RBFOX3 NA NA NA NA NA ENGASE 147660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 77702456 77702572 77702532 Y NA CBX2 NA NA NA NA CBX2 47359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 77979653 77979899 77979776 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 27748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 77990350 77990422 77990386 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 17225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78023284 78023378 78023331 Y NA TBC1D16,CCDC40,GAA NA NA NA NA CCDC40 14849 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78087852 78088239 78088062 Y NA GAA,EIF4A3 NA NA NA NA GAA 14497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78134790 78135293 78135090 Y NA EIF4A3 EIF4A3,CARD14,SGSH,SLC26A11 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A3 15808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV NA NA NA NA ENDOV 41238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr17 78744627 78744900 78744734 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 218498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 78810006 78810317 78810174 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 153081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 LINC00482 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00482 38764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA LINC00482 89706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 79451287 79451558 79451462 Y AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 26531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 79925685 79926075 79926048 Y TSPAN10 SIRT7,MAFG,MAFG-AS1,PYCR1,NOTUM,ASPSCR1 ASPSCR1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ASPSCR1 6608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,NOTUM,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80029941 80030069 80030002 Y HEXDC STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA DUS1L 8178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr17 80060759 80061000 80060880 Y NA DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 6551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80079695 80079832 80079748 Y NA FASN NA NA NA NA FASN 25487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80158664 80158910 80158860 Y DUS1L,NARF,HEXDC,CD7,CCDC57 CCDC57,SLC16A3 FASN K562 ChIA-PET 22265404 CCDC57 9796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr17 80215337 80215590 80215470 Y SIRT7,WDR45L,NARF,CSNK1D,CD7,C17orf62,C17orf62,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80342594 80342740 80342634 Y NA TEX19,HEXDC NA NA NA NA TEX19 27471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr17 80494129 80494268 80494139 Y NA FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 18540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80546229 80546455 80546368 Y NA NA NA NA NA NA FOXK2 70640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80712796 80713169 80712899 Y ZNF750,TBCD FN3KRP,FN3K,TBCD NA NA NA NA TBCD 4856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80794045 80794420 80794166 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 86105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80829054 80829460 80829235 Y HEXDC,C17orf62,C17orf62 NA NA NA NA NA TBCD 121114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 126103 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 10894 11221 11019 Y NA NA NA NA NA NA USP14 145162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chr18 228420 228816 228694 Y THOC1 THOC1 NA NA NA NA THOC1 37234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 666183 666708 666437 Y THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 9843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr18 711356 711474 711397 Y ENOSF1,ENOSF1 ENOSF1 NA NA NA NA ENOSF1 680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr18 781638 782117 782009 Y NA YES1 NA NA NA NA YES1 28430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 813044 813594 813404 Y YES1 YES1 NA NA NA NA YES1 2497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr18 999057 999295 999176 Y NA NA NA NA NA NA YES1 188510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 2656589 2657177 2656999 Y NA CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 2852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 2658254 2658560 2658346 Y METTL4,LPIN2,EMILIN2,SMCHD1 CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA SMCHD1 4517 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 3250721 3251122 3250738 Y NA MYOM1,MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 3251422 3251674 3251471 Y MYOM1 MYOM1,MYL12A,MYL12B NA NA NA NA MYL12A 5943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 3383416 3383792 3383691 Y TGIF1,TGIF1 TGIF1 TGIF1 K562 ChIA-PET 22265404 TGIF1 25814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr18 3527351 3527432 3527391 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 117745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 3594733 3596177 3595596 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 185127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 3676188 3676369 3676278 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 266582 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 4368151 4368526 4368370 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 958545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 5294371 5294839 5294435 Y ZFP161 NA NA NA NA NA EPB41L3 333860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 5629750 5630120 5629929 Y NA EPB41L3 NA NA NA NA EPB41L3 1051 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 6416928 6417109 6417051 Y L3MBTL4 L3MBTL4,RPL6P27 NA NA NA NA L3MBTL4 3692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 8661812 8662039 8661951 Y NA NA ANKRD12,CCDC165,TWSG1,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 54369 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr18 8801229 8801479 8801315 Y CCDC165 NA NA NA NA NA RAB12 193786 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 9434302 9434537 9434470 Y NA RALBP1 ANKRD12,TWSG1,CCDC165 IMR90 Hi-C 24141950 RALBP1 38470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 9548277 9548390 9548335 Y ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1 NA NA NA NA NA PPP4R1 64848 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 9742137 9742641 9742378 Y NA RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 35975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 9877272 9877635 9877453 Y VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 34364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 10528233 10528593 10528264 Y NA NAPG NA NA NA NA NAPG 4331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 10708268 10708433 10708298 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 184366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 11733869 11734165 11734017 Y NA GNAL MPPE1 IMR90 Hi-C 24141950 GNAL 46914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 11947272 11947721 11947412 Y CHMP1B MPPE1,IMPA2 IMPA2,GNAL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IMPA2 31303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr18 12336380 12336603 12336512 Y NA TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA TUBB6 30712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 12347442 12347507 12347473 Y CEP76,AFG3L2 TUBB6,AFG3L2 NA NA NA NA AFG3L2 27806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr18 12763760 12763785 12763774 Y CEP192,C18orf1 NA PTPN2 IMR90 Hi-C 24141950 CEP76 62984 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 12993260 12993605 12993433 Y NA SEH1L,CEP192 NA NA NA NA CEP192 3899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 13594708 13595078 13594794 Y C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 129581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 13824016 13824345 13824089 Y MC5R NA NA NA NA NA FAM210A 99354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 14111961 14112330 14112146 Y NA ZNF519 NA NA NA NA ZNF519 18159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 18596588 18597119 18596879 Y NA NA NA NA NA NA ROCK1 92693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 19415827 19415836 19415832 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 132909 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 19453532 19453543 19453538 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 170614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 19904686 19904949 19904805 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 157282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 20138967 20139156 20139093 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 237068 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 20402088 20402300 20402139 Y NA RBBP8 RBBP8,CABLES1,RIOK3,GATA6,TMEM241 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 25864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 20855209 20855599 20855401 Y NA NA NA NA NA NA CABLES1 142681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 20913960 20914007 20913982 Y NA NA NA NA NA NA TMEM241 101918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr18 22865478 22865571 22865525 Y NA NA NA NA NA NA ZNF521 64583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 22929287 22929693 22929350 Y NA ZNF521 NA NA NA NA ZNF521 461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 23609881 23610142 23609962 Y NA NA NA NA NA NA SS18 59039 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 24357818 24357909 24357863 Y AQP4 NA NA NA NA NA KCTD1 122453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 25754926 25755429 25755157 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 26231611 26231936 26231774 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 476201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 29092491 29092685 29092630 Y DSC3,DSC2,DSG1,DSG2 DSG2 NA NA NA NA DSG2 16485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 29232383 29232901 29232639 Y NA B4GALT6 NA NA NA NA B4GALT6 30898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 29542474 29542964 29542885 Y RNF138 TRAPPC8 NA NA NA NA TRAPPC8 11375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr18 31140777 31140968 31140873 Y NA NA NA NA NA NA KLHL14 789752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 32291109 32291369 32291156 Y MAPRE2,NOL4,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA NA NA NA NA NA DTNA 219855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 32424641 32425032 32424811 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE2 129860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 32829674 32829781 32829775 Y ZNF397,ZSCAN30 ZNF397,ZSCAN30,ZNF271 NA NA NA NA ZNF397 10680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 33042221 33042422 33042327 Y NA INO80C NA NA NA NA INO80C 33533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 33275532 33275916 33275719 Y NA NA NA NA NA NA GALNT1 116451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 33407474 33407836 33407618 Y ZNF24,ZNF396,INO80C NA NA NA NA NA C18orf21 142210 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 34048220 34048446 34048313 Y NA NA NA NA NA NA FHOD3 172543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 34215471 34215669 34215572 Y FHOD3 NA NA NA NA NA KIAA1328 191400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 34406593 34406898 34406790 Y NA KIAA1328,TPGS2 NA NA NA NA KIAA1328 171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 34915511 34915689 34915620 Y NA NA NA NA NA NA TPGS2 508353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 37101421 37101610 37101545 Y NA NA NA NA NA NA RPL7AP66 187782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 38923845 38924195 38924020 Y NA NA NA NA NA NA PIK3C3 608976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 42262294 42262512 42262376 Y SETBP1,SETBP1 SETBP1 NA NA NA NA SETBP1 4156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 43536054 43536394 43536224 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 8846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 45194435 45194569 45194509 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 260946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46072108 46072320 46072224 Y NA CTIF NA NA NA NA CTIF 8691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46242460 46242735 46242629 Y SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 179043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46349762 46350033 46349891 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 286345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 393180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46465508 46465942 46465798 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 NA NA NA NA NA CTIF 402091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46473942 46474323 46474293 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 410525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46479420 46479772 46479694 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 416003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 NA SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTIF 438763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr18 46733107 46733359 46733209 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 252358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 46754603 46754925 46754865 Y DYM NA NA NA NA NA DYM 230792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 48301659 48301815 48301762 Y NA MRO NA NA NA NA MRO 47957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 8.53375036158761 chr18 48462357 48462700 48462360 Y ME2 ELAC1,SMAD4 NA NA NA NA ELAC1 29661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 48721492 48722312 48721913 Y SMAD4,MEX3C MEX3C NA NA NA NA MEX3C 20362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 51773425 51773767 51773527 Y NA MBD2,POLI POLI MCF7 ChIA-PET 22265404 POLI 20007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 53041931 53042230 53042160 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 287788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 53060777 53060994 53060923 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 269024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 53204965 53205096 53205075 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 124922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 54327448 54327828 54327638 Y NA WDR7,TXNL1 NA NA NA NA TXNL1 10617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 54439234 54439547 54439439 Y WDR7 NA NA NA NA NA TXNL1 122403 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 55102016 55102207 55102112 Y ONECUT2 ONECUT2 NA NA NA NA ONECUT2 1099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 55872819 55873190 55873005 Y NEDD4L,NEDD4L NA NA NA NA NA NEDD4L 163220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 55885380 55885802 55885524 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 175781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 55893671 55893850 55893725 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 184072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 56193191 56193601 56193321 Y MALT1 NA NA NA NA NA SNORD28 72262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 56292416 56292423 56292420 Y ALPK2 SNORD28,MALT1 NA NA NA NA SNORD28 26553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 56631378 56631745 56631564 Y NA NA NA NA NA NA ZNF532 103546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 56633214 56633485 56633410 Y ZNF532 NA NA NA NA NA ZNF532 105382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 57566379 57566616 57566437 Y NA PMAIP1 NA NA NA NA PMAIP1 1199 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 59766177 59766307 59766242 Y NA NA NA NA NA NA PIGN 86044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 60193382 60194139 60194065 Y KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 5142 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr18 60445199 60445356 60445226 Y NA NA NA NA NA NA PHLPP1 64527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 60864948 60865713 60864996 Y PHLPP1,VPS4B NA NA NA NA NA BCL2 119648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 63445505 63445788 63445646 Y CDH7 CDH7 NA NA NA NA CDH7 30017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 64670306 64670530 64670418 Y NA NA NA NA NA NA DSEL 511687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 65945074 65945279 65945262 Y NA NA LOC643542 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC102B 435167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 70998412 70998732 70998572 Y NA NA NA NA NA NA NETO1 465031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 71010965 71011298 71011132 Y NA NA NA NA NA NA NETO1 477584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 72837213 72837401 72837237 Y NA NA ZNF407 IMR90 Hi-C 24141950 ZADH2 81902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 73118858 73118990 73118932 Y NA NA NA NA NA NA TSHZ1 198148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 74088486 74089010 74088832 Y NA NA NA NA NA NA ZNF516 116136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 74204839 74205357 74205296 Y NA RP11-17M16.1 NA NA NA NA ZNF516 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr18 74205649 74206020 74205889 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr18 74237245 74237630 74237448 Y NA ZNF516,RP11-17M16.1 NA NA NA NA RP11-17M16.1 31768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 74556264 74556608 74556436 Y NA ZNF236 NA NA NA NA ZNF236 23701 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 74755425 74755811 74755618 Y MBP,MBP NA NA NA NA NA ZNF236 222862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 74773141 74773504 74773389 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 240578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 275811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr18 74830215 74830809 74830560 Y MBP NA NA NA NA NA ZNF236 297652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 75149077 75149342 75149210 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 616514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 75318958 75319303 75319131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF236 786395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 76737711 76738510 76737981 Y NA NA NA NA NA NA SALL3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 76831132 76831674 76831321 Y NFATC1,NFATC1,ATP9B ATP9B NA NA NA NA ATP9B 3847 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr18 77016280 77016404 77016342 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 137452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr18 78004258 78004625 78004566 Y PARD6G PARD6G NA NA NA NA PARD6G 829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 461817 462164 462146 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1 NA NA NA NA SHC2 2821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 510583 510951 510744 Y NA MADCAM1,TPGS1,CDC34 NA NA NA NA TPGS1 5284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 662216 662510 662281 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,C19orf22,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.84458345386254 chr19 789308 789721 789469 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 5354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 CFD,MED16,R3HDM4,KISS1R,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 980601 980803 980725 Y NA WDR18,RNU6-2,CNN2 NA NA NA NA WDR18 371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1028160 1028923 1028240 Y SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7 WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1 NA NA NA NA CNN2 3862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1171027 1171165 1171096 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 1252961 1253429 1253036 Y C19orf22,ARID3A,CNN2,ABCA7,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 1651371 1651730 1651556 Y NA UQCR11,TCF3 NA NA NA NA TCF3 767 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 1855247 1855761 1855485 Y SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3 ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3 NA NA NA NA KLF16 5806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 2049976 2050209 2050080 Y OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MOBKL2A,MKNK2 BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 2332363 2332647 2332580 Y REXO1,CSNK1G2,MKNK2,GNG7,SPPL2B SPPL2B,LSM7 NA NA NA NA LSM7 5744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 2524971 2525260 2525066 Y NA NA NA NA NA NA GADD45B 50851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 2599036 2599584 2599134 Y DOT1L,GADD45B NA NA NA NA NA GNG7 101123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 2624614 2624929 2624757 Y GNG7,DIRAS1 NA NA NA NA NA GNG7 75778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 3231384 3231772 3231576 Y ZNF555,ZNF77,TLE2,C19orf29,CELF5,CELF5 NCLN NA NA NA NA NCLN 47823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 3314117 3314647 3314306 Y NA NFIC NA NA NA NA NFIC 42914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 3607748 3607951 3607883 Y NA HMG20B,MFSD12,TBXA2R NA NA NA NA TBXA2R 2910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 3868053 3868449 3868082 Y NA ZFR2,ATCAY NA NA NA NA ZFR2 1023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 3923611 3923782 3923733 Y ITGB1BP3 ATCAY,DAPK3 NA NA NA NA DAPK3 45339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4051584 4052099 4051914 Y CCDC94 PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 12844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4053092 4053572 4053301 Y CCDC94,ZBTB7A PIAS4,ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 11371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4064475 4064868 4064603 Y SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6 ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 75 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4089074 4089290 4089084 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4089506 4089868 4089573 Y ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 24563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4379386 4379764 4379673 Y NA STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A NA NA NA NA SH3GL1 18780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4456035 4456301 4456168 Y NA UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4567148 4567365 4567215 Y TICAM1,SEMA6B PLIN5,LRG1 NA NA NA NA LRG1 28662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4634649 4634985 4634807 Y CCDC94,SEMA6B,TICAM1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 2545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 4636294 4636441 4636384 Y ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1 TNFAIP8L1,C19orf10 NA NA NA NA TNFAIP8L1 1089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5250100 5250567 5250354 Y NA RPL32P34 NA NA NA NA RPL32P34 25178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5336072 5336705 5336347 Y PTPRS PTPRS NA NA NA NA PTPRS 2109 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5338459 5338816 5338637 Y PTPRS NA NA NA NA NA PTPRS 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5357360 5357663 5357512 Y NA PTPRS PTPRS,ZNRF4,KDM4B,SAFB2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPRS 18546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5536566 5536826 5536635 Y NA NA PTPRS,ZNRF4,PLAC2 IMR90 Hi-C 24141950 SAFB 84220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5804044 5804378 5804211 Y NA DUS3L NDUFA11,DUS3L,NRTN,LONP1,CATSPERD,RANBP3,LOC100128568,FUT6,VMAC,PRR22,FUT3,RFX2,FUT5,CAPS K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DUS3L 14795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 5966194 5966581 5966386 Y CAPS RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 9572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6189136 6189412 6189274 Y NA RFX2 NA NA NA NA RFX2 8171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6394891 6395218 6395055 Y NA CLPP,ALKBH7,GTF2F1,KHSRP NA NA NA NA GTF2F1 2899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6556475 6556744 6556665 Y RFX2,TNFSF9,VAV1,EMR1,TNFSF14 TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 27465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6659886 6659977 6659931 Y TNFSF9,TNFSF14 NA NA NA NA NA GPR108 75637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 6708735 6709024 6708902 Y C3 GPR108,TRIP10 NA NA NA NA GPR108 26590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 7266028 7266415 7266222 Y NA INSR NA NA NA NA INSR 25630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 7437354 7437833 7437574 Y ZNF557,STXBP2,PNPLA6,PEX11G,LOC100131801,EVI5L,ARHGEF18 ARHGEF18 INSR,ARHGEF18,C19orf45,PEX11G,CLEC4G,CLEC4M,CD209,CLEC4GP1 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF18 20166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 8115456 8115774 8115631 Y PRAM1,STXBP2,C19orf59 ELAVL1 NA NA NA NA ELAVL1 46913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 8638437 8638868 8638608 Y RAB11B,PRAM1,MYO1F MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA MYO1F 1593 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 9747838 9748099 9747855 Y ZNF559,ZNF559,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 17763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 9758216 9758505 9758322 Y ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 25271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 9776683 9777096 9776903 Y OR7D4,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF121,ZNF846,OLFM2 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF562 6680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 9896233 9896620 9896495 Y ZNF266,COL5A3,ZNF846 FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 39872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 9903168 9903577 9903239 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 32915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 10349944 10350302 10350123 Y NA S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4,ICAM5 MRPL4,ICAM1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT1 9982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 10513154 10513331 10513243 Y ICAM1,DNM2,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 10766466 10766790 10766534 Y NA ILF3,QTRT1 NA NA NA NA ILF3 3529 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 10949257 10949551 10949405 Y CDC37,KEAP1,KRI1,ILF3,QTRT1,DNM2,SPC24,SMARCA4,SMARCA4 TMED1,CARM1 NA NA NA NA TMED1 4263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 10988040 10988081 10988060 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 7851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 10992105 10992492 10992295 Y NA TMED1,CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 11916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 10999263 10999360 10999313 Y SMARCA4 CARM1,YIPF2,C19orf52 NA NA NA NA CARM1 19074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 11044199 11044446 11044323 Y NA YIPF2,C19orf52,SMARCA4 NA NA NA NA C19orf52 6790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 11404382 11404791 11404593 Y ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159 DOCK6,CCDC159 NA NA NA NA DOCK6 33225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 11691804 11692141 11691953 Y CCDC159,ACP5,ACP5 CNN1,ELOF1,ZNF627 NA NA NA NA ZNF627 23615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 13006078 13006409 13006086 Y NA HOOK2,DNASE2,GCDH,FARSA,CALR,RAD23A NA NA NA NA GCDH 6238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 13048278 13048689 13048364 Y MAN2B1 GCDH,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA CALR 886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 13238145 13238217 13238180 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA NACC1 11228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 13274586 13275096 13274696 Y GADD45GIP1,NACC1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 15357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 13275397 13275802 13275486 Y NA TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 16168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 13324184 13324516 13324349 Y MAST1,CACNA1A NA NA NA NA NA IER2 64955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 13944359 13944683 13944571 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 40085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14089228 14089566 14089336 Y CCDC130,PKN1,CD97,RFX1 DCAF15,RFX1 NA NA NA NA RFX1 26285 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr19 14274504 14274771 14274661 Y C19orf57,RFX1,LPHN1 PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 28736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 14276845 14277176 14277145 Y NA PRKACA,ASF1B,LPHN1 NA NA NA NA ASF1B 31077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14400310 14400612 14400461 Y EMR2,DNAJB1 NA NA NA NA NA LPHN1 85311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14404408 14404769 14404597 Y NA NA NA NA NA NA CD97 84544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 14467223 14467368 14467308 Y ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,DDX39A,CD97 CD97 LPHN1,ASF1B,LOC100507373,DDX39A,CD97 IMR90 Hi-C 24141950 CD97 21945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14474119 14474280 14474154 Y ZNF333,RFX1,PKN1,CD97 CD97 CD97,DDX39A K562 ChIA-PET 22265404 CD97 15033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14617819 14618098 14617969 Y IL27RA,DDX39A,PKN1,DNAJB1 GIPC1,TECR,DNAJB1 GIPC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TECR 7799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14661096 14661426 14661346 Y NA TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 19448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 14869692 14869911 14869839 Y NA EMR2,AC005255.3 NA NA NA NA EMR2 17442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 15310768 15311119 15311001 Y NA NOTCH3,EPHX3 NA NA NA NA NOTCH3 976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 15333627 15333747 15333631 Y SYDE1,NOTCH3 NOTCH3,EPHX3 NA NA NA NA EPHX3 8499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3,EPHX3 NA NA NA NA EPHX3 7770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 16452764 16452992 16452877 Y MED26,KLF2 KLF2 NA NA NA NA KLF2 19136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 16462018 16462188 16462137 Y CIB3 KLF2 NA NA NA NA KLF2 28390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 17200078 17200517 17200217 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 17225282 17225997 17225467 Y SIN3B,CPAMD8 HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 40691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 17345747 17345835 17345791 Y NA USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1 NA NA NA NA NR2F6 8914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 17371801 17372164 17371849 Y NXNL1,GTPBP3 USE1,OCEL1,NR2F6,BABAM1,ANKLE1,USHBP1,MRPL34,DDA1,ABHD8 NR2F6 K562 ChIA-PET 22265404 BABAM1 3995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr19 18162301 18162691 18162523 Y NA MAST3 NA NA NA NA MAST3 43912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18211545 18211814 18211678 Y NA MAST3 NA NA NA NA MAST3 4942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18315989 18316123 18316056 Y NA IFI30,MPV17L2,RAB3A NA NA NA NA RAB3A 3105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 11500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18404099 18404539 18404373 Y NA KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA MIR3188 13212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 18415031 18416060 18415513 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 16024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 18429185 18429358 18429231 Y JAK3,CCDC124,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,LRRC25,ELL,JUND KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA LSM4 2726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18498524 18498706 18498615 Y ARRDC2,IFI30,JUND PGPEP1,GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA GDF15 14983 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 18793678 18793914 18793817 Y PDE4C KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 1191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr19 19248583 19248716 19248628 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 1261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 19573019 19573301 19573248 Y MAU2,GATAD2A,GMIP NA NA NA NA NA NDUFA13 51244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 19705357 19705479 19705434 Y NA PBX4,LPAR2,GMIP NA NA NA NA PBX4 22246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 19977247 19977754 19977315 Y PBX4,LPAR2,ZNF101,ZNF14,ZNF682,ZNF682,ZNF506,ZNF253 ZNF506,ZNF253,ZNF93 NA NA NA NA ZNF253 2552 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 20110963 20111092 20111018 Y TSSK6 ZNF682 NA NA NA NA ZNF682 37223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 20162886 20163252 20163139 Y ZNF506,ZNF253,ZNF682,ZNF682 ZNF682,ZNF90,AC006539.2 ZNF682,LOC284440 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF682 14571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 20337633 20337845 20337749 Y ZNF93,ZNF682,ZNF682,ZNF90,ZNF486 NA NA NA NA NA ZNF486 61596 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 20606211 20606644 20606560 Y ZNF90 ZNF826P NA NA NA NA ZNF826P 436 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 21511296 21511520 21511376 Y NA ZNF708,ZNF738 NA NA NA NA ZNF708 1069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 21689202 21689645 21689487 Y ZNF430,ZNF708,ZNF493,ZNF100,ZNF429 ZNF429 NA NA NA NA ZNF429 11718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 21882044 21882358 21882227 Y ZNF676,ZNF208 NA NA NA NA NA ZNF100 66072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 22715195 22715609 22715437 Y NA ZNF98 NA NA NA NA ZNF98 1908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 23310606 23310980 23310793 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 54594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 23530488 23530791 23530760 Y NA ZNF91 NA NA NA NA ZNF91 45571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 23971294 23971621 23971458 Y NA ZNF681,RPSAP58 NA NA NA NA RPSAP58 27487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 27732067 27732764 27732500 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1969684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 27734782 27735200 27734996 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1967248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 28219787 28220540 28220091 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1481908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 28225585 28226223 28225838 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1476225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 28334161 28334293 28334227 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1368155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 29011348 29011742 29011545 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 690706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 32863977 32864267 32864121 Y NA ZNF507,DPY19L3 NA NA NA NA ZNF507 29477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 33664629 33664677 33664651 Y NA LRP3 NA NA NA NA LRP3 1832 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 33750621 33750673 33750623 Y CEBPA CEBPA CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA IMR90 Hi-C 24141950 CEBPA 40797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 34311417 34311691 34311576 Y KCTD15 KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr19 34398114 34398257 34398186 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 113276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 34992713 34992833 34992773 Y NA WTIP NA NA NA NA WTIP 22839 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 35491833 35492367 35492256 Y FFAR3,FFAR2,USF2,FXYD5,FXYD5,FXYD5,GRAMD1A GRAMD1A,HPN NA NA NA NA GRAMD1A 8145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 35696373 35696472 35696417 Y FFAR1,CD22,USF2 LSR NA NA NA NA LSR 40761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 36135988 36136183 36136108 Y ARHGAP33 HAUS5,RBM42,ETV2,COX6B1,UPK1A-AS1 NA NA NA NA COX6B1 942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 36519340 36519516 36519376 Y ZNF565 SDHAF1,ALKBH6,CLIP3,THAP8,WDR62 NA NA NA NA CLIP3 2729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 36648389 36648571 36648491 Y NA TBCB,POLR2I,CAPNS1 NA NA NA NA CAPNS1 19912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 36748454 36748637 36748519 Y ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565 ZNF146,ZNF565 NA NA NA NA ZNF565 13295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr19 36879565 36879874 36879872 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 11464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 36891925 36892272 36892205 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP82 15286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 37262228 37262609 37262419 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 37408041 37408149 37408081 Y ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 2810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.53026253763293 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 37953316 37953327 37953324 Y NA ZNF570,ZNF569,ZNF793 NA NA NA NA ZNF570 3160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 38186506 38186731 38186619 Y ZNF527,ZNF793,ZNF540,ZFP30,ZNF781,ZNF607,ZNF573 ZNF781,ZFP30,ZNF607 NA NA NA NA ZFP30 5268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 38433320 38433698 38433507 Y ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1 SIPA1L3 NA NA NA NA SIPA1L3 37452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 38490005 38490506 38490269 Y YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 94137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 38495647 38495987 38495738 Y SPRED3 NA NA NA NA NA SIPA1L3 99779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 38674383 38674545 38674477 Y ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1 DPF1 NA NA NA NA DPF1 43809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 38717073 38717581 38717079 Y NA DPF1,SPINT2,PPP1R14A NA NA NA NA DPF1 773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 39167742 39168127 39167771 Y NA ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 31453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 39411140 39411539 39411467 Y LGALS7 RINL,NFKBIB,SIRT2,MRPS12,SARS2 NA NA NA NA MRPS12 7649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 39627416 39627544 39627474 Y NA PAK4 NA NA NA NA PAK4 13006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 39755176 39755398 39755266 Y ZFP36 NA NA NA NA NA SAMD4B 75638 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 39831946 39832143 39832027 Y NA SAMD4B,PAF1,MED29 NA NA NA NA SAMD4B 910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 40473949 40474218 40474067 Y ZNF546,FCGBP CTC-471F3.4,PSMC4,ZNF546 NA NA NA NA PSMC4 694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 40823184 40823546 40823487 Y NA AKT2,PLD3,C19orf47 NA NA NA NA PLD3 28817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 40930264 40930817 40930514 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD1 332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 40951707 40952008 40951966 Y NA PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 3095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 41260796 41261188 41261093 Y SERTAD1,CYP2A13,CYP2B6,CYP2A6,ADCK4,ITPKC ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA C19orf54 5338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 41267029 41267391 41267210 Y NA ITPKC,ADCK4,SNRPA,C19orf54,MIA,RAB4B,EGLN2 NA NA NA NA MIA 8162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 41680959 41681276 41681150 Y NA CYP2S1,AXL CYP2A13,CYP2B7P1,HNRNPUL1,AXL,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2S1 15678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 41681944 41682199 41682187 Y NA CYP2S1,AXL CYP2B7P1,HNRNPUL1,CYP2A13,CYP2F1,CCDC97,BCKDHA,B3GNT8 IMR90 Hi-C 24141950 CYP2S1 14755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr19 41731541 41731893 41731762 Y NA CYP2S1,AXL,HNRNPUL1 NA NA NA NA AXL 8433 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 41771602 41771660 41771636 Y CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1 AXL,HNRNPUL1,CCDC97 NA NA NA NA HNRNPUL1 5201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 41816681 41817091 41817051 Y NA CCDC97,TMEM91,TGFB1 NA NA NA NA CCDC97 2587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 41827649 41828097 41827915 Y HNRNPUL1,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 NA NA NA NA CCDC97 13555 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42027706 42027846 42027786 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42432096 42432209 42432128 Y NA ARHGEF1,RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 29333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42493914 42494230 42494205 Y TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3 RABAC1,ATP1A3 NA NA NA NA ATP1A3 5419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 42532310 42532673 42532485 Y NA ATP1A3,ZNF574 NA NA NA NA ATP1A3 32661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr19 42693167 42693275 42693248 Y NA POU2F2,DEDD2,ZNF526 NA NA NA NA POU2F2 5462 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42756723 42757090 42756966 Y NA DEDD2,ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3 NA NA NA NA ERF 219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 42784087 42784212 42784170 Y CEACAM8,CEACAM3,DEDD2 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 42902919 42903213 42903066 Y TMEM145 CNFN CNFN MCF7 ChIA-PET 22265404 CNFN 10480 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 42948068 42948265 42948167 Y NA NA NA NA NA NA CNFN 55629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 44139252 44139636 44139395 Y ZNF575,ZNF284,ZNF225,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,IRGQ,CADM4 IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,CADM4 NA NA NA NA CADM4 2355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 44616064 44616441 44616271 Y KCNN4,ZNF283,ZNF404,ZNF45,ZNF221,ZNF222,ZNF233,ZNF233,ZNF229,ZNF284 ZNF284,ZNF224,ZNF225,ZNF234 NA NA NA NA ZNF225 1730 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 44824668 44825027 44825022 Y NA ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 17469 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 44825986 44826083 44826035 Y ZNF221,ZNF284,ZNF285,ZNF233,ZNF233 ZNF235 NA NA NA NA ZNF235 18787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 45100230 45100376 45100298 Y NA PVR CEACAM16,TOMM40,PVR,MIR4531,IGSF23 IMR90 Hi-C 24141950 PVR 44722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA CBLC NA NA NA NA BCL3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr19 45352107 45352544 45352311 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 4675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 45352951 45353140 45353112 Y NA BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 5519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 45393623 45393866 45393750 Y ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40 PVRL2,TOMM40,APOE,APOC1 NA NA NA NA TOMM40 1797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 45584780 45584791 45584786 Y CEACAM16,NKPD1 CLASRP,ZNF296,GEMIN7,MARK4,PPP1R37 NA NA NA NA MARK4 4234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 45803954 45804164 45804074 Y NA KLC3 NA NA NA NA KLC3 30528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 45945937 45946679 45946251 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 46012498 46012899 46012640 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 4661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 46361761 46362096 46361929 Y NA SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA SYMPK 2452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 46386037 46386278 46386146 Y OPA3,GIPR,FBXO46,SYMPK,FOXA3 SYMPK,FOXA3,IRF2BP1,MYPOP NA NA NA NA IRF2BP1 1098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 46854568 46854669 46854639 Y PPP5C PPP5C NA NA NA NA PPP5C 6317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 46975956 46976146 46976053 Y NA PNMAL1 NA NA NA NA PNMAL1 3136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47033456 47033629 47033471 Y NA GAPDHP38 NA NA NA NA GAPDHP38 26269 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,DACT3 NA NA NA NA DACT3 19419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 47269374 47269772 47269575 Y LOC100506012,SLC1A5,SLC1A5 FKRP,STRN4,SLC1A5 NA NA NA NA SLC1A5 20079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr19 47367294 47367354 47367334 Y NA AP2S1 SLC1A5,ARHGAP35,ZC3H4 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 15045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47552678 47552827 47552750 Y NA NPAS1,TMEM160 NA NA NA NA TMEM160 2790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47689758 47690163 47690151 Y GLTSCR1,BBC3 BBC3 NA NA NA NA BBC3 43860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47744387 47744529 47744512 Y SLC8A2 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA BBC3 10364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24 NA NA NA NA PRR24 16792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 47867637 47867786 47867679 Y ZC3H4,C5AR1,NAPA,DHX34 DHX34 NA NA NA NA DHX34 17099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 47874632 47874802 47874721 Y GLTSCR2,ZC3H4,CCDC9,C5AR1,GPR77,NAPA,GLTSCR1,DHX34 DHX34,MEIS3 NA NA NA NA DHX34 24094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48101913 48102072 48101991 Y NA NA SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NAPA 85416 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr19 48166987 48167048 48167018 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 47552 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 48167427 48167718 48167620 Y NA EHD2 NA NA NA NA EHD2 46882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48222362 48222481 48222377 Y SEPW1,PLA2G4C,MEIS3,SLC8A2 EHD2,GLTSCR2 NA NA NA NA EHD2 7762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48293591 48293754 48293716 Y CABP5,CRX GLTSCR2,SEPW1,RPL23AP80,CRX NA NA NA NA RPL23AP80 2393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48896382 48896733 48896528 Y GRIN2D TMEM143,SYNGR4,KDELR1 NA NA NA NA KDELR1 3572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18 NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 49465555 49466264 49465736 Y IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA FTL 294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 49924099 49924476 49924276 Y TBC1D17,RRAS,RCN3,PRR12,NOSIP,AP2A1 ALDH16A1,PIH1D1 NA NA NA NA ALDH16A1 29950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 50205874 50206272 50205974 Y NA BCL2L12,IRF3,PRMT1,CPT1C NA NA NA NA CPT1C 13719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 50888786 50889179 50888984 Y ACPT,LOC342918 POLD1,SPIB,MYBPC2 NA NA NA NA POLD1 3325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 51287900 51288107 51288100 Y NA C19orf48 NA NA NA NA C19orf48 18079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 NA NA NA NA NA ZNF175 119534 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 52641935 52642117 52642107 Y ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616 ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA ZNF616 760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr19 52697339 52697517 52697506 Y ZNF350,ZNF432,ZNF836,ZNF83,ZNF808,ZNF766 ZNF836,PPP2R1A NA NA NA NA PPP2R1A 6047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 52996616 52996734 52996658 Y NA ZNF578,ZNF808 NA NA NA NA ZNF808 32171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 53128477 53128840 53128754 Y NA NA NA NA NA NA ZNF83 62909 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 53129559 53129725 53129643 Y ZNF160,ZNF616,ZNF766,ZNF808,ZNF701,ZNF611,ZNF611,ZNF83 NA NA NA NA NA ZNF83 62024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 53237186 53237523 53237297 Y ZNF665,ZNF415,ZNF415,ZNF160,ZNF610,ZNF528,ZNF808,ZNF83,ZNF611,ZNF611 ZNF83,ZNF611 NA NA NA NA ZNF611 860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 53239075 53239317 53239102 Y NA ZNF83,ZNF611,ZNF600 NA NA NA NA ZNF611 2749 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 53425304 53425713 53425359 Y ERVV-1,ZNF320 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 18141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ERVV-2,ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr19 54707641 54707712 54707644 Y NA LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 5031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 55387041 55387235 55387157 Y TMEM150B,PPP6R1,PPP1R12C,LENG8,LILRA2,LILRA1,LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR NA NA NA NA NA NLRP2 75263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 55540419 55540558 55540460 Y SHISA7,KIR2DL3,NCR1 RDH13 NA NA NA NA RDH13 40101 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 55626810 55627228 55626935 Y ZNF865,PPP1R12C RDH13 NA NA NA NA PPP1R12C 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,FAM71E2,IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr19 55976006 55976393 55976362 Y NA ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ISOC2 4296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 55988531 55988605 55988568 Y NAT14 ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D NA NA NA NA ZNF628 2832 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56097081 56097467 56097273 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 6870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56098668 56099098 56098905 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581 SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF579 8457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr19 56148080 56148375 56148228 Y ZNF580 ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1 NA NA NA NA CCDC106 2053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56169893 56170373 56169939 Y NA ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2,EPN1 NA NA NA NA U2AF2 6381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56218548 56218666 56218607 Y SUV420H2,NLRP9,U2AF2 EPN1 NA NA NA NA EPN1 33956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56621885 56622165 56622061 Y NA ZNF787,ZNF444 NA NA NA NA ZNF787 8484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 56698517 56698525 56698522 Y NA NA NA NA NA NA ZNF444 56549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56807694 56808027 56807709 Y NLRP13,ZSCAN5A NA NA NA NA NA ZNF542 69441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 56833034 56833496 56833435 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 43972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 57349423 57349757 57349684 Y ZNF543,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZNF470,ZNF71,LOC147670,ZNF835,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA PEG3 339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 57351144 57351414 57351350 Y ZNF543,AURKC,AURKC,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF471,ZFP28,ZNF470,LOC147670,ZNF835,PEG3,ZIM2,PEG3 PEG3,ZIM2 NA NA NA NA ZIM2 1047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 57467725 57468111 57467918 Y NA NA NLRP13 IMR90 Hi-C 24141950 ZIM2 117628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 57965552 57965851 57965609 Y NA ZNF17,ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF749 20855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 57976528 57976751 57976646 Y NA ZNF749,ZNF772,ZNF419,ZNF773 NA NA NA NA ZNF772 10187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 58315114 58315751 58315446 Y ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 8530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 58317986 58318160 58318072 Y NA ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 6121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 58398826 58399093 58399050 Y ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418 ZNF587,ZNF814,ZNF417,ZNF418 NA NA NA NA ZNF814 384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 58413801 58413982 58413868 Y ZNF154,ZNF418 ZNF814,ZNF417,ZNF418,ZNF256 NA NA NA NA ZNF417 11996 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 58715620 58715769 58715675 Y LOC100293516,C19orf18 ZNF274,ZNF544 NA NA NA NA ZNF544 22191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 58781089 58781297 58781193 Y NA ZNF544,ZNF8,ERVK3-1 ZNF8 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF8 7021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr19 59049687 59049971 59049795 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF544,ZNF8,ZNF497,ZNF324B,ZNF324,UBE2M,TRIM28 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr19 59050036 59050316 59050176 Y ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,ZNF132,ZNF324B,ZNF324,TRIM28,MZF1 SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA ZBTB45 1758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 393939 394227 394175 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 131799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 739928 740199 740059 Y NA NA TMEM18 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM18 64489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr2 1659182 1659769 1659438 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 86855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 2850815 2851100 2850821 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 528553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr2 3106532 3106816 3106764 Y NA NA MYT1L IMR90 Hi-C 24141950 TSSC1 272837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.84458345386254 chr2 3172486 3172640 3172538 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 207013 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 3340825 3341028 3341010 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 38625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 3359907 3360169 3360140 Y NA TSSC1,TRAPPC12 NA NA NA NA TSSC1 19484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 3483837 3484086 3483869 Y NA ADI1 NA NA NA NA ADI1 37421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 3699787 3700199 3700016 Y NA TMSB4XP2 NA NA NA NA TMSB4XP2 36440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 7571177 7571382 7571249 Y NA NA NA NA NA NA RNF144A 515654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 7935930 7936061 7935999 Y NA NA LOC339788,LINC00299 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 785861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 8019339 8019650 8019528 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.4 702272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 8453183 8453334 8453274 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 268588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 8456047 8456179 8456122 Y ID2 NA NA NA NA NA AC011747.4 265743 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 8532216 8532386 8532312 Y NA NA LOC100506274,LOC339788 IMR90 Hi-C 24141950 AC011747.4 189536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 8799689 8799929 8799811 Y ID2 ID2,AC011747.7 LOC339788,LINC00299,ID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ID2 17046 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.7 52792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 9678248 9678641 9678477 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 15280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 9894353 9894610 9894569 Y ADAM17,KLF11,KLF11,GRHL1 NA YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1,KLF11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAF1B 86873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 10075100 10075410 10075131 Y TAF1B GRHL1 GRHL1 IMR90 Hi-C 24141950 GRHL1 7931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 10330449 10330626 10330557 Y NA NA NA NA NA NA RRM2 69994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 10489892 10489997 10489924 Y HPCAL1 HPCAL1 NA NA NA NA HPCAL1 48877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 10986356 10986538 10986463 Y KCNF1,C2orf50 PDIA6 C2orf50,PQLC3,ROCK2,E2F6,GREB1,FLJ33534 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PDIA6 10253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 11352501 11352895 11352887 Y NA NA NA NA NA NA PQLC3 59177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 11624930 11625118 11625003 Y ROCK2,GREB1,GREB1,GREB1 E2F6 NTSR2,GREB1,MIR4429,FLJ33534,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 E2F6 20633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 11634636 11634845 11634741 Y NA E2F6 GREB1,MIR4429 IMR90 Hi-C 24141950 E2F6 30339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 11970136 11970284 11970210 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 11970305 11970612 11970555 Y NA AC096559.1 NA NA NA NA AC096559.1 16136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 12417696 12417905 12417812 Y TRIB2 NA LOC100506474 IMR90 Hi-C 24141950 AC096559.1 430948 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 13069256 13069287 13069272 Y NA NA TRIB2,LPIN1,MIR4262 IMR90 Hi-C 24141950 TRIB2 214241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 15068559 15068799 15068679 Y NA NA RSRC1 MCF7 ChIA-PET 19890323 NBAS 630655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 15154959 15155388 15155298 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 544066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 15481171 15481552 15481362 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 217902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 15629690 15629929 15629800 Y NA NA NA NA NA NA NBAS 69525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 15949825 15950073 15949883 Y NBAS NA NA NA NA NA RP11-120J4.1 57990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 16219682 16220075 16219855 Y NA NA NA NA NA NA MYCNOS 139311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 16243100 16243429 16243303 Y NA NA NA NA NA NA MYCNOS 162729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 16489272 16489649 16489463 Y NA NA NA NA NA NA FAM49A 355950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 16831579 16831850 16831761 Y FAM49A FAM49A NA NA NA NA FAM49A 13749 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 19464609 19464927 19464768 Y NA NA NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00954 601694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 19547126 19547267 19547173 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 519354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 19788015 19788399 19788228 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 278222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20176136 20176469 20176303 Y WDR35 WDR35,MATN3 NA NA NA NA WDR35 11423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20249984 20250622 20250147 Y TTC32,PUM2 MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1 NA NA NA NA RP11-644K8.1 89 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20356621 20356779 20356666 Y NA NA SDC1,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-644K8.1 106726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20491517 20491908 20491876 Y NA NA SDC1 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 58087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20544740 20544866 20544805 Y NA PUM2 PUM2,HS1BP3 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 5129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20548410 20548604 20548507 Y NA PUM2 HS1BP3,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 PUM2 1391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 20965440 20965780 20965672 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 55102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 23609943 23610311 23610250 Y KLHL29 KLHL29 NA NA NA NA KLHL29 3855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 23901919 23902357 23902230 Y UBXN2A NA NA NA NA NA ATAD2B 245627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 24047559 24047784 24047672 Y NA NA NA NA NA NA ATAD2B 100200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 24324329 24324521 24324426 Y NA SF3B14,TP53I3,PFN4 NA NA NA NA TP53I3 17598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 24491623 24491942 24491630 Y ATAD2B,NCOA1,ITSN2 NA NA NA NA NA ITSN2 89641 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 24491972 24492409 24492370 Y NA NA NA NA NA NA ITSN2 89174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 24852047 24852369 24852206 Y NA NA NA NA NA NA NCOA1 139264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25021346 25021618 25021482 Y NA CENPO,PTRHD1 NA NA NA NA PTRHD1 7095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 25352140 25352468 25352150 Y DNAJC27,EFR3B,DNMT3A,DNMT3A NA NA NA NA NA EFR3B 89141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25438901 25439135 25438983 Y PTRHD1,ADCY3 NA NA NA NA NA DNMT3A 124324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr2 25457688 25458068 25457878 Y DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 105391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25473699 25473887 25473786 Y EFR3B NA NA NA NA NA DNMT3A 89572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 25482494 25482888 25482692 Y DNMT3A NA NA NA NA NA DNMT3A 80571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25499637 25500641 25499751 Y DNAJC27 NA NA NA NA NA DNMT3A 62818 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25545894 25546051 25546003 Y NA DNMT3A NA NA NA NA DNMT3A 17408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 25646148 25646487 25646318 Y NA NA NA NA NA NA DNMT3A 82689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 26225625 26225771 26225674 Y RAB10 KIF3C,UQCRHP2,RAB10 RAB10,KIF3C,FAM59B,ASXL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UQCRHP2 9962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 26328559 26328812 26328686 Y FAM59B,RAB10 NA NA NA NA NA RAB10 73583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 26522632 26522929 26522714 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 6486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 26975869 26975889 26975879 Y NA CENPA C2orf70,CIB4,KCNK3,OTOF IMR90 Hi-C 24141950 CENPA 9268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 27005355 27005756 27005547 Y NA CENPA NA NA NA NA CENPA 20198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27072078 27072262 27072179 Y UCN,CCDC164,OTOF,MAPRE3,DPYSL5 DPYSL5 NA NA NA NA DPYSL5 3463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 27574731 27574755 27574743 Y NA MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3 NA NA NA NA AC074117.10 2358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27629706 27629770 27629738 Y NA EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1,KRTCAP3 NA NA NA NA PPM1G 784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27877424 27877712 27877568 Y NA GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 6626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27878874 27879165 27879028 Y SLC5A6,GTF3C2,NRBP1,IFT172,BRE,BRE,ZNF512,GPN1,CCDC121,GPN1,CCDC121,SUPT7L,SLC4A1AP GPN1,CCDC121,SLC4A1AP,SUPT7L NA NA NA NA SLC4A1AP 5173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRPL33 33886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 27988549 27989353 27988873 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 3231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 28003613 28003725 28003670 Y NA MRPL33 NA NA NA NA MRPL33 11029 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 28492364 28492732 28492561 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 28519223 28519459 28519305 Y RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 NA NA NA NA NA FOSL2 93856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB,SPDYA NA NA NA NA SPDYA 6313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 29050679 29050871 29050775 Y NA SPDYA,TRMT61B NA NA NA NA TRMT61B 40296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 29173330 29173730 29173529 Y PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B,WDR43 NA NA NA NA NA WDR43 57821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 29174818 29175149 29175047 Y NA NA NA NA NA NA WDR43 59309 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 29349196 29349466 29349333 Y NA CLIP4 NA NA NA NA CLIP4 30625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 30644745 30644849 30644777 Y NA LCLAT1 LBH,LCLAT1 IMR90 Hi-C 24141950 LCLAT1 23243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 30704285 30704557 30704478 Y NA LCLAT1 NA NA NA NA LCLAT1 36193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 30788740 30788786 30788763 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 120648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 30807812 30808169 30807846 Y NA NA NA NA NA NA LCLAT1 139720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 33863068 33863290 33863179 Y NA FAM98A NA NA NA NA FAM98A 40619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 36665586 36666219 36665918 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 84517 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 36790527 36791707 36791646 Y NA NA NA NA NA NA FEZ2 79523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 37432341 37432705 37432523 Y NA AC007390.4,CEBPZ NA NA NA NA AC007390.4 12461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 37497492 37497655 37497574 Y HEATR5B CEBPZ NA NA NA NA CEBPZ 40636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 37576725 37576898 37576775 Y STRN,HEATR5B,PRKD3,QPCT PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 7008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 37760471 37760598 37760536 Y SULT6B1,FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 190754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 37763005 37763322 37763129 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 37763462 37763512 37763507 Y FAM82A1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA QPCT 193745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 37847073 37847432 37847190 Y EIF2AK2,EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA CDC42EP3 IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 116179 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 37995727 37996117 37995888 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 32116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 38417790 38418062 38417924 Y CYP1B1 RPL7P12 NA NA NA NA RPL7P12 38648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 39334876 39335293 39335230 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 14193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 39338546 39339120 39338978 Y ARHGEF33 SOS1 NA NA NA NA SOS1 10366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 39340813 39341200 39341198 Y NA SOS1 NA NA NA NA SOS1 8286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 39665108 39665339 39665266 Y NA AC007246.3,MAP4K3 NA NA NA NA MAP4K3 2655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 39722003 39722381 39722147 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K3 59550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 40608600 40608944 40608858 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 227249 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 41997270 41997551 41997541 Y PKDCC NA NA NA NA NA PKDCC 275609 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 42068299 42068635 42068587 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 204525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 42224568 42224788 42224773 Y NA PKDCC LOC388942,C2orf91 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 48372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 42278314 42278459 42278342 Y NA PKDCC NA NA NA NA PKDCC 5154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 42696554 42696964 42696742 Y NA COX7A2L,KCNG3,MTA3 NA NA NA NA KCNG3 22273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 42952930 42953056 42952997 Y NA NA NA NA NA NA HAAO 64677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 19491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 43038629 43038924 43038876 Y NA HAAO THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 20896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43151826 43152270 43152066 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 134093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43152648 43152978 43152751 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 134915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43153788 43153898 43153799 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 136055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43155191 43155549 43155370 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 137458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43157114 43157487 43157153 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HAAO 139381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 43273834 43273859 43273847 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 177889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43327979 43328013 43327996 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 123735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 43421229 43421631 43421263 Y HAAO,THADA,THADA ZFP36L2 ZFP36L2,LOC100129726,THADA K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 30117 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43530162 43530544 43530351 Y NA NA LOC100129726,ZFP36L2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZFP36L2 78414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43635676 43636063 43635871 Y NA NA NA NA NA NA ZFP36L2 183928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43672480 43672679 43672609 Y NA NA NA NA NA NA THADA 148506 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43686078 43686091 43686085 Y NA NA NA NA NA NA THADA 135094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 43762812 43762910 43762862 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726 MCF7 ChIA-PET 22265404 THADA 58275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 44212195 44212421 44212308 Y NA LRPPRC NA NA NA NA LRPPRC 8723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 44849210 44849529 44849370 Y NA NA NA NA NA NA CAMKMT 262121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 45017050 45017056 45017053 Y NA NA NA NA NA NA SIX3 149846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 45176497 45176546 45176522 Y NA SIX3,AC012354.8 NA NA NA NA SIX3 9595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 46554101 46554217 46554159 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 35295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 46857387 46857788 46857588 Y NA CRIPT,PIGF NA NA NA NA PIGF 15129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 47206692 47207332 47207009 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 39698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 47463585 47463776 47463681 Y NA NA CALM2,TTC7A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CALM2 61845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 47795442 47795451 47795448 Y MSH2,MSH6,FBXO11,KCNK12 KCNK12 NA NA NA NA KCNK12 627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 47796567 47796699 47796698 Y NA KCNK12 NA NA NA NA KCNK12 489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 48709527 48709805 48709665 Y FOXN2,KLRAQ1 PPP1R21,STON1 NA NA NA NA PPP1R21 43790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 48718676 48719233 48718981 Y NA STON1 NA NA NA NA STON1 35289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 48941628 48941642 48941634 Y STON1-GTF2A1L,STON1,STON1-GTF2A1L,LHCGR LHCGR NA NA NA NA LHCGR 39238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 53966054 53966447 53966241 Y PSME4 CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA CHAC2 26482 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 54022416 54022710 54022562 Y NA CHAC2,ERLEC1 NA NA NA NA ERLEC1 10235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr2 54796924 54797237 54797074 Y SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 115502 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 55193261 55193511 55193360 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 144246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 55345905 55346166 55346036 Y NA RTN4 RTN4,EML6,C2orf63 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 8148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 55360803 55361407 55361172 Y SMEK2,CCDC88A,RTN4 RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 23046 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 58334895 58335527 58335141 Y VRK2,VRK2,VRK2 NA NA NA NA NA FANCL 130980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 58384642 58384701 58384672 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 81806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 58707948 58708183 58708069 Y NA NA NA NA NA NA FANCL 241441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60643557 60643999 60643668 Y REL RNU1-32P MIR4432,BCL11A IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-32P 33817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60661623 60661756 60661690 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-32P 51883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60693527 60693793 60693660 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 83787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60694019 60694324 60694172 Y BCL11A NA NA NA NA NA RNU1-32P 84279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60694839 60695290 60695042 Y PAPOLG,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 83412 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 60712095 60712413 60712305 Y NA NA NA NA NA NA BCL11A 66289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60747849 60747913 60747881 Y PEX13,BCL11A BCL11A NA NA NA NA BCL11A 30789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60757464 60757761 60757646 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 20941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60760023 60760353 60760231 Y NA BCL11A NA NA NA NA BCL11A 18349 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 60778604 60778787 60778696 Y REL,BCL11A NA NA NA NA NA BCL11A 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 61034167 61034304 61034235 Y REL,PAPOLG NA NA NA NA NA PAPOLG 52802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 61353902 61353922 61353912 Y NA C2orf74,AHSA2 NA NA NA NA C2orf74 16321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 61757728 61758222 61758112 Y NA XPO1 NA NA NA NA XPO1 5539 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr2 62689007 62689250 62689129 Y NA TMEM17 EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 47779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 62693263 62693492 62693331 Y NA TMEM17 EHBP1,COMMD1,OTX1,LOC100132215,TMEM17 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM17 43537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 63411576 63411965 63411771 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 136384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 63446182 63446204 63446197 Y NA NA NA NA NA NA OTX1 170990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 63840549 63840673 63840604 Y NA MDH1 NA NA NA NA MDH1 26806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr2 63991794 63992008 63991901 Y NA NA UGP2 IMR90 Hi-C 24141950 WDPCP 60969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64239166 64239247 64239208 Y PELI1 VPS54 NA NA NA NA VPS54 4959 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64364775 64365257 64365170 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 3116 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64367846 64368162 64368149 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64420784 64420892 64420861 Y AFTPH,PELI1 NA NA NA NA NA PELI1 51196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64500610 64500974 64500772 Y NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 131022 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 64504356 64504878 64504479 Y NA NA PELI1,LINC00309 IMR90 Hi-C 24141950 PELI1 134768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64540204 64540217 64540210 Y NA NA LINC00309,PELI1,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 138886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 64836549 64836646 64836605 Y SLC1A4,PELI1,SERTAD2,AFTPH NA NA NA NA NA AFTPH 87084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 66804515 66804719 66804617 Y MEIS1 AC007392.3 NA NA NA NA AC007392.3 5353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 67517733 67518064 67517835 Y NA NA MEIS1,ETAA1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 104387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr2 68263709 68263719 68263714 Y NA NA NA NA NA NA C1D 72361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 69533941 69534050 69534019 Y ANTXR1 NA NA NA NA NA GFPT1 78332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 69536922 69537085 69537004 Y NA NA NA NA NA NA GFPT1 75297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70000495 70000634 70000556 Y MXD1 NA NA NA NA NA GMCL1 54140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70057532 70057914 70057667 Y C2orf42,AAK1,GMCL1 GMCL1 NA NA NA NA GMCL1 2758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70141198 70141461 70141241 Y NA SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 18378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 70154281 70154743 70154417 Y PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1 SNRNP27,MXD1,ASPRV1 NA NA NA NA MXD1 31461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70294861 70295138 70295000 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA PCBP1 17447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70331843 70331986 70331900 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 4160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 70346022 70346119 70346054 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 18339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 70350372 70350687 70350608 Y NA PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 22689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 70847317 70847463 70847388 Y FIGLA,ADD2,ADD2 NA NA NA NA NA TGFA 67992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 71228347 71228418 71228366 Y ANKRD53 ANKRD53,TEX261 TEX261 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TEX261 8272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 72980109 72980387 72980306 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 70783 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 73233755 73233809 73233782 Y NA NA EMX1 IMR90 Hi-C 24141950 SFXN5 66938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 73318348 73318566 73318457 Y NA SFXN5 NA NA NA NA SFXN5 17601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 74647656 74647929 74647851 Y SLC4A5,SLC4A5,DCTN1,C2orf81 DCTN1,C2orf81,WDR54,RTKN,INO80B,WBP1,MOGS NA NA NA NA WDR54 851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 74722835 74723021 74722928 Y NA INO80B,WBP1,MOGS,MRPL53,TTC31,CCDC142,LBX2,PCGF1,HTRA2,AUP1 NA NA NA NA LBX2 5422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 75836166 75836348 75836343 Y NA MRPL19 FAM176A,TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 MRPL19 35561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 75903279 75903482 75903481 Y C2orf3,C2orf3 MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA MRPL19 31370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 75912574 75912759 75912685 Y NA MRPL19,GCFC2 NA NA NA NA GCFC2 23356 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 77317962 77318191 77318070 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM4 500254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 78055629 78055831 78055731 Y NA AC105399.2 NA NA NA NA AC105399.2 42121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 78401270 78401306 78401289 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 387762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 78478830 78479153 78479031 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 465322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 78525487 78525634 78525561 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 511979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 78683398 78683574 78683486 Y NA NA NA NA NA NA AC105399.2 669890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 79739044 79739283 79739164 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA2 328687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 80023471 80023583 80023507 Y NA NA NA NA NA NA AC016716.1 364678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85066726 85066734 85066730 Y NA NA NA NA NA NA TMSB10 64015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85173188 85173797 85173736 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 KCMF1,TMSB10 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KCMF1 22419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85185071 85185576 85185382 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 10640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85186958 85187334 85187145 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 8882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85362106 85362578 85362371 Y NA LSM3P3,TCF7L1 NA NA NA NA TCF7L1 3573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr2 85404303 85404456 85404381 Y NA TCF7L1 NA NA NA NA TCF7L1 45770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 85442728 85442944 85442894 Y NA NA NA NA NA NA TCF7L1 84195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 CAPG NA NA NA NA CAPG 20989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P NA NA NA NA RNU1-38P 40102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 86722974 86723324 86723287 Y NA NA NA NA NA NA KDM3A 57204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 88629818 88629863 88629841 Y NA NA NA NA NA NA FOXI3 120268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2826510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr2 91821438 91821799 91821741 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2832276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 91936197 91936406 91936290 Y NA NA NA NA NA NA RPIA 2947035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 96782666 96782871 96782861 Y NA ADRA2B NA NA NA NA ADRA2B 2682 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 96995983 96996007 96995995 Y ITPRIPL1,ITPRIPL1 SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 3518 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 97012594 97012961 97012778 Y ASTL SNRNP200,ITPRIPL1,NCAPH NA NA NA NA NCAPH 13069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr2 98443211 98443622 98443475 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-8P 164017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 98822932 98823207 98823080 Y NA NA NA NA NA NA VWA3B 121353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 99081402 99081780 99081544 Y TMEM131,UNC50,MGAT4A,INPP4A INPP4A UNC50,COA5 IMR90 Hi-C 24141950 INPP4A 22085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 99118904 99119212 99119061 Y NA NA NA NA NA NA INPP4A 59587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 99213145 99213306 99213215 Y INPP4A COA5,UNC50 NA NA NA NA COA5 9672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 99250910 99251133 99251091 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 27868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 99268200 99268767 99268592 Y NA COA5,UNC50 NA NA NA NA UNC50 45158 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 100323852 100324185 100324151 Y NA NA NA NA NA NA REV1 219355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 100908504 100908788 100908727 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 123330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 100937334 100937484 100937407 Y LONRF2 NA NA NA NA NA CHST10 94634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 101712877 101712902 101712892 Y NA NA NA NA NA NA RPL31 96700 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 101922226 101922443 101922331 Y NA SNORD89,RNF149 NA NA NA NA RNF149 720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 101923239 101923757 101923472 Y RPL31,MAP4K4,MAP4K4,RNF149 SNORD89,RNF149 NA NA NA NA RNF149 76 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 102380179 102380656 102380455 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 68867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 102383406 102383725 102383568 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 72094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 102478902 102479140 102479043 Y MAP4K4,MAP4K4 NA NA NA NA NA MAP4K4 167590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 102492851 102493221 102493042 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 181539 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 102844003 102844653 102844435 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL1R1 164999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 104643293 104643309 104643301 Y NA NA NA NA NA NA AC018880.2 405205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 106417583 106417937 106417755 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NA NA NA NA NA NCK2 58229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 107652241 107652475 107652358 Y NA NA NA NA NA NA AC114755.2 748732 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 109206329 109206788 109206425 Y LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1 NA NA NA NA NA LIMS1 57472 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 109686360 109686496 109686432 Y NA NA MALL,SEPT10,SH3RF3,EDAR IMR90 Hi-C 24141950 CCDC138 285147 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 109934621 109934818 109934675 Y NA NA NA NA NA NA SEPT10 434965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 110319562 110319852 110319693 Y NA SEPT10 NA NA NA NA SEPT10 49931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 112463608 112463919 112463793 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 176348 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 112811776 112811937 112811878 Y ZC3H6 TMEM87B NA NA NA NA TMEM87B 976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 113448371 113448563 113448450 Y IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A SLC20A1 SLC20A1,FLJ42351,POLR1B,CHCHD5,CKAP2L MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC20A1 46937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 113573367 113573750 113573559 Y IL1A IL1A NA NA NA NA IL1A 33200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 113576216 113576532 113576373 Y IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B IL1A NA NA NA NA IL1A 36049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1A 117604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 113847761 113847860 113847813 Y IL1A,IL1B,IL37,IL36G,CBWD2,IL36B,IL1F10,IL1RN NA NA NA NA NA IL1A 307594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 RABL2A 249876 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 114469366 114469830 114469722 Y SLC35F5 MIR4782,SLC35F5 NA NA NA NA MIR4782 7115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 115420103 115420171 115420136 Y DPP10,DPP10,DPP10,DPP10 NA NA NA NA NA DPP10 222227 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 115944602 115944633 115944617 Y DPP10,DPP10,DPP10 DPP10-AS1 NA NA NA NA DPP10-AS1 27682 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 115983015 115983392 115983035 Y NA NA NA NA NA NA DPP10-AS1 66095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 116027244 116027630 116027326 Y NA NA NA NA NA NA DPP10-AS1 110324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 118309015 118309417 118309218 Y NA NA NA NA NA NA DDX18 260809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 118739522 118739775 118739730 Y DDX18,CCDC93 CCDC93 NA NA NA NA CCDC93 29934 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 118847045 118847263 118847087 Y INSIG2 INSIG2 NA NA NA NA INSIG2 3017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.31780874018429 chr2 119076927 119077186 119077054 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 134965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 119121251 119121438 119121319 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 179289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 119989660 119989833 119989766 Y NA STEAP3 NA NA NA NA STEAP3 10276 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 121200367 121200763 121200697 Y NA NA NA NA NA NA INHBB 98648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 121480209 121480601 121480371 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 10598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 121495235 121495636 121495561 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 121495919 121496279 121496111 Y NA GLI2 GLI2 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 4720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 121585967 121586372 121586071 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 94768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 121614859 121615272 121615044 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 123660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 121650745 121651146 121650942 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 159546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 122405703 122406017 122405860 Y NA CLASP1,NIFK-AS1 NA NA NA NA NIFK-AS1 477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 122480192 122480543 122480332 Y NA TSN NA NA NA NA TSN 12136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 125531573 125531803 125531688 Y NA NA NA NA NA NA YWHAZP2 1781936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 128090505 128090721 128090714 Y NA ERCC3 NA NA NA NA ERCC3 40753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128119420 128119722 128119576 Y NA MAP3K2 IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 24319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128152529 128152667 128152598 Y SFT2D3,MAP3K2 MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 8488 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128165400 128165641 128165534 Y NA MAP3K2 NA NA NA NA MAP3K2 21359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128258405 128258697 128258648 Y NA RNU4-48P,IWS1 NA NA NA NA IWS1 23765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128283052 128283292 128283172 Y MAP3K2,SFT2D3,AMMECR1L IWS1 NA NA NA NA IWS1 590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 128470034 128470252 128470136 Y NA SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 13437 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 128562322 128562673 128562571 Y NA WDR33 LIMS2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR33 4088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 128587553 128587803 128587688 Y MAP3K2,WDR33 WDR33,POLR2D NA NA NA NA WDR33 20792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 129073927 129074235 129074112 Y NA NA NA NA NA NA HS6ST1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 130928401 130928722 130928538 Y NA MZT2B,SMPD4 NA NA NA NA MZT2B 8588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 131148815 131149203 131148908 Y FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18 PTPN18 NA NA NA NA PTPN18 37235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 131485043 131485533 131485339 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF4 106956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr2 132182653 132182963 132182773 Y NA NA NA NA NA NA MZT2A 65353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 133025188 133025675 133025588 Y NA NA GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR39 146472 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 133433715 133433886 133433800 Y NA LYPD1 NA NA NA NA LYPD1 6563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 134098730 134098873 134098801 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP5 225161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 134570885 134571181 134570989 Y NA NA NCKAP5 IMR90 Hi-C 24141950 NCKAP5 246851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 134878887 134879265 134878997 Y NA MGAT5 NA NA NA NA MGAT5 3333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 135931129 135931440 135931285 Y NA NA NA NA NA NA RAB3GAP1 123294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 136404449 136404849 136404497 Y R3HDM1 NA NA NA NA NA UBXN4 92340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 136632932 136633416 136633308 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 MCM6 NA NA NA NA MCM6 936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 136783030 136783335 136783274 Y NA AC093391.2,DARS NA NA NA NA DARS 41360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 136887149 136887816 136887360 Y UBXN4,CXCR4,CXCR4 CXCR4 CXCR4 K562 ChIA-PET 22265404 CXCR4 13414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 137003597 137004126 137003957 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA CXCR4 129862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 137755829 137756118 137755974 Y NA NA NA NA NA NA THSD7B 234714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 138909425 138909801 138909599 Y NA NA NA NA NA NA HNMT 189835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 139198512 139198615 139198564 Y NA NA NA NA NA NA AC097721.2 58653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 139226248 139226635 139226522 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA AC097721.2 30633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 139260506 139260990 139260920 Y SPOPL AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 3135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 142862944 142863276 142863110 Y NA LRP1B NA NA NA NA LRP1B 23994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 144019688 144020135 144019849 Y KYNU,ARHGAP15 NA NA NA NA NA GTDC1 1068000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 144499811 144499873 144499842 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 588262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 144991861 144992184 144991938 Y NA NA NA NA NA NA GTDC1 95951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 145078226 145078371 145078292 Y ZEB2,GTDC1,GTDC1,GTDC1 GTDC1 NA NA NA NA GTDC1 9764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145116388 145116823 145116635 Y NA GTDC1 ZEB2,ARHGAP15,GTDC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GTDC1 28253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 145170356 145170596 145170411 Y GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA GTDC1 82221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145212298 145212826 145212615 Y GTDC1,GTDC1,GTDC1,ZEB2 NA NA NA NA NA ZEB2 67321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145350126 145350524 145350325 Y NA NA NA NA NA NA ZEB2 69979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145785805 145786034 145785921 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 306764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145821367 145821376 145821372 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 271422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 145866626 145866907 145866723 Y NA NA NA NA NA NA RPL6P5 225891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 149017229 149017560 149017414 Y NA NA NA NA NA NA ORC4 240082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 149267026 149267240 149267133 Y EPC2 NA NA NA NA NA EPC2 132769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 149403654 149404182 149403820 Y NA EPC2 NA NA NA NA EPC2 3645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 149571188 149571523 149571357 Y NA NA KIF5C IMR90 Hi-C 24141950 KIF5C 59296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 149634441 149634782 149634502 Y KIF5C KIF5C NA NA NA NA KIF5C 3622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 149819679 149819759 149819686 Y KIF5C NA NA NA NA NA LYPD6B 72862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 150222263 150222576 150222421 Y NA LYPD6 NA NA NA NA LYPD6 37764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 151389498 151389697 151389616 Y NA RND3 RBM43,RND3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 3828 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 152356804 152357129 152357077 Y NEB NA NA NA NA NA RIF1 92407 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 152789657 152790028 152790018 Y FMNL2 NA NA NA NA NA ARL5A 106651 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 153263916 153264284 153263950 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 74165 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 153354098 153354480 153354204 Y NA NA NA NA NA NA FMNL2 164347 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 154335936 154336181 154336134 Y RPRM RPRM NA NA NA NA RPRM 2614 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.31955265216163 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA RPRM NA NA NA NA RPRM 45878 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 154442869 154442990 154442930 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 4811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 154446220 154446391 154446306 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 1410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 154495676 154495864 154495770 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 47875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 157038752 157038990 157038871 Y NR4A2 NA NR4A2 MCF7 ChIA-PET 22265404 NR4A2 157870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 157659765 157659881 157659802 Y NA NA NA NA NA NA GPD2 369963 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 158309744 158310453 158309937 Y CYTIP NA NA NA NA NA ERMN 127519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 159354074 159354382 159354127 Y NA PKP4 NA NA NA NA PKP4 42598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 159853491 159853713 159853657 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 30345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 160371940 160372153 160372033 Y MARCH7,LY75,CD302,BAZ2B NA NA NA NA NA AC009506.2 54173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 160470388 160470776 160470715 Y NA AC009506.1,BAZ2B NA NA NA NA BAZ2B 427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 161078300 161078513 161078433 Y ITGB6 ITGB6 RBMS1,ITGB6,TANK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB6 47886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 161141907 161142179 161141926 Y NA ITGB6 NA NA NA NA ITGB6 15508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 161348201 161348679 161348535 Y RBMS1 NA NA NA NA NA RBMS1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 162095171 162095411 162095272 Y TBR1,SLC4A10 NA NA NA NA NA PSMD14 67138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 162481875 162482596 162482291 Y NA NA NA NA NA NA AC009299.5 286038 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 164486140 164486494 164486462 Y NA NA NA NA NA NA FIGN 104028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 164553215 164553632 164553445 Y NA FIGN NA NA NA NA FIGN 36890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 165430240 165430431 165430256 Y NA GRB14 NA NA NA NA GRB14 45927 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 165924693 165924835 165924764 Y SCN3A,SCN2A,SCN2A,CSRNP3 NA NA NA NA NA CSRNP3 399322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 166491383 166491530 166491513 Y NA NA NA NA NA NA GALNT3 157662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 166523404 166523752 166523720 Y NA NA NA NA NA NA GALNT3 125440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 166734901 166734996 166734949 Y NA NA NA NA NA NA TTC21B 73357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 166946411 166946569 166946490 Y NA SCN1A NA NA NA NA SCN1A 35954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 168150182 168150557 168150197 Y NA AC074363.1 NA NA NA NA AC074363.1 2501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 168858571 168859104 168858832 Y NA NA NA NA NA NA STK39 243547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 168977927 168978148 168978038 Y NA NA NA NA NA NA STK39 124503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 169347125 169347251 169347173 Y NA CERS6 NA NA NA NA CERS6 36753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 170219794 170220267 170220091 Y LRP2 LRP2 NA NA NA NA LRP2 2599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 170221024 170221462 170221353 Y NA LRP2 NA NA NA NA LRP2 3829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 170777121 170777463 170777246 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 95153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 171093453 171093713 171093583 Y NA NA NA NA NA NA UBR3 411485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 171623254 171623407 171623331 Y NA EIF2S2P4,AC007405.4,AC007405.6,GAD1 NA NA NA NA AC007405.4 1869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 171679560 171679730 171679653 Y NA GAD1 NA NA NA NA GAD1 11837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 171830049 171830396 171830113 Y NA GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 47075 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 172747551 172747817 172747684 Y NA HAT1 NA NA NA NA HAT1 29141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 173044114 173044391 173044220 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 78486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 173302497 173302807 173302540 Y NA ITGA6 NA NA NA NA ITGA6 12415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 174896632 174897390 174896767 Y SP3,SP3 NA SP3,OLA1,CDCA7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SP3 68202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 175085975 175086128 175086062 Y NA OLA1 NA NA NA NA OLA1 25298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 175700542 175700958 175700833 Y CHRNA1 NA NA NA NA NA CHRNA1 73342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr2 175708773 175709382 175709264 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 175762241 175762347 175762322 Y NA NA NA NA NA NA CHN1 105750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 175831323 175831425 175831374 Y NA CHN1 CHRNA1 IMR90 Hi-C 24141950 CHN1 36672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 176846427 176846539 176846507 Y NA KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 19028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 178116726 178117036 178116927 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128,AC079305.10 NA NA NA NA MIR3128 1702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 179056084 179056225 179056143 Y NA OSBPL6 MIR548N IMR90 Hi-C 24141950 OSBPL6 983 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 179083118 179083236 179083178 Y OSBPL6 OSBPL6 NA NA NA NA OSBPL6 25910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 179487942 179488336 179488251 Y NA NA NA NA NA NA TTN-AS1 104032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 180044911 180045098 180045020 Y SESTD1 NA NA NA NA NA SESTD1 82419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 180579667 180579746 180579673 Y ZNF385B,ZNF385B NA NA NA NA NA CWC22 290094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 182132889 182133300 182132992 Y NA NA CERKL IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E3 302914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 186616540 186616923 186616825 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 731960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 186785756 186786079 186786020 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 562804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 187390995 187391341 187391159 Y NA ZC3H15 NA NA NA NA ZC3H15 42112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 188340607 188340894 188340852 Y NA CALCRL NA NA NA NA CALCRL 29420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 188463858 188463880 188463868 Y TFPI TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 188464486 188464724 188464607 Y NA TFPI GULP1 IMR90 Hi-C 24141950 TFPI 35999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 190043432 190043827 190043588 Y DIRC1,COL3A1,COL5A2 COL5A2 NA NA NA NA COL5A2 827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 190324760 190324912 190324838 Y NA WDR75 NA NA NA NA WDR75 20601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 190729809 190730106 190729887 Y OSGEPL1,PMS1 NA NA NA NA NA PMS1 82702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 190741113 190741271 190741187 Y NA NA NA NA NA NA PMS1 94006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 191406346 191406617 191406448 Y NA TMEM194B INPP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM194B 8898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 191810388 191810629 191810413 Y GLS AC067945.3 STAT1 IMR90 Hi-C 24141950 AC067945.3 45664 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 191814146 191814507 191814301 Y STAT1 AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 41786 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 191815156 191815612 191815322 Y GLS AC067945.3 NA NA NA NA AC067945.3 40681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 194142383 194142416 194142400 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 1083948 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 194428592 194428916 194428605 Y NA NA NA NA NA NA TMEFF2 1370157 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 196278119 196278504 196278172 Y NA NA SLC39A10 IMR90 Hi-C 24141950 SLC39A10 160197 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 196896695 196897089 196896891 Y NA DNAH7 NA NA NA NA DNAH7 34447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 197264939 197265165 197265058 Y STK17B NA NA NA NA NA STK17B 225712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 198029302 198029554 198029323 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 96281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 199736102 199736481 199736292 Y NA NA NA NA NA NA FTCDNL1 977415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 200328214 200328741 200328463 Y SATB2,SATB2,SATB2 NA NA NA NA NA FTCDNL1 385155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 200446933 200447042 200447037 Y NA NA NA NA NA NA FTCDNL1 266854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 200800298 200800427 200800328 Y SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69 AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5 NA NA NA NA C2orf47 17613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 201167757 201168004 201167857 Y SPATS2L,SPATS2L SPATS2L NA NA NA NA SPATS2L 600 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201270357 201270484 201270442 Y CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1 NA NA NA NA NA SPATS2L 101753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201411222 201411458 201411252 Y PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2 SGOL2,KCTD18,AOX1 NA NA NA NA KCTD18 28715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 201829288 201829721 201829590 Y KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2 ORC2 NA NA NA NA ORC2 2885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201989489 201990098 201989672 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 10662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201990242 201990732 201990460 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 11415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 201991403 201992374 201991715 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 AC007272.3,CFLAR NA NA NA NA CFLAR 12576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 202078581 202078959 202078777 Y CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 32977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 202079360 202079680 202079556 Y CLK1,CLK1,CFLAR,CASP10 CASP10 NA NA NA NA CASP10 33756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 202302698 202302857 202302778 Y FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR TRAK2 NA NA NA NA TRAK2 11445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 202723656 202723936 202723797 Y NA NA NA NA NA NA ALS2 79744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 202837575 202837889 202837743 Y NA NA CDK15,NOP58,ALS2,SUMO1,FZD7 IMR90 Hi-C 24141950 FZD7 59421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 202897639 202898135 202897874 Y FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 8.00697564790936 chr2 203131534 203131826 203131673 Y FAM117B,NOP58 SUMO1,NOP58 NA NA NA NA NOP58 3095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 203159775 203160145 203159798 Y NA NOP58 NA NA NA NA NOP58 31336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 203292079 203292309 203292231 Y NA NA NA NA NA NA BMPR2 52420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 205037741 205037858 205037800 Y NA NA PARD3B IMR90 Hi-C 24141950 PARD3B 370658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 206439575 206439768 206439663 Y NA NA NA NA NA NA NRP2 104946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 206944485 206944991 206944704 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 2338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 206948392 206948813 206948647 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA INO80D 214 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.58206805301208 chr2 207076453 207076789 207076513 Y NA GPR1 NA NA NA NA GPR1 3982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 207348794 207348941 207348896 Y NA ADAM23 NA NA NA NA ADAM23 42531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208028732 208029438 208029179 Y METTL21A,CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208123048 208123437 208123243 Y NA NA KLF7,CREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 93057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208153315 208153645 208153471 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 123324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208154070 208154333 208154202 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 124079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 208200012 208200111 208200057 Y NA NA KLF7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF7 170021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208348288 208348659 208348648 Y NA CREB1,AC007879.5 KLF7,CCNYL1,FASTKD2,METTL21A,CREB1,FZD5 IMR90 Hi-C 24141950 CREB1 43802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208472249 208472458 208472354 Y NA METTL21A NA NA NA NA METTL21A 16194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 208602415 208602802 208602609 Y NA CCNYL1,FZD5 NA NA NA NA CCNYL1 28151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208656928 208657357 208657034 Y FZD5 FZD5 PLEKHM3,CCNYL1,FZD5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FZD5 24641 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208839036 208839224 208839180 Y CREB1,FZD5,PIKFYVE,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 49060 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208839891 208840047 208839969 Y CREB1,PLEKHM3 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 48237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208883092 208883191 208883110 Y PTH2R,C2orf80 PLEKHM3 NA NA NA NA PLEKHM3 5093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 208942960 208943012 208942996 Y NA NA FZD5,CCNYL1,PLEKHM3,FASTKD2,METTL21A IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHM3 54676 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 210547424 210547820 210547680 Y MAP2,MAP2,UNC80 NA NA NA NA NA MAP2 260642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 210937153 210937376 210937265 Y NA NA NA NA NA NA RPE 71864 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 211404935 211405006 211404955 Y CPS1 NA NA NA NA NA LANCL1 64559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 211470804 211470937 211470808 Y NA NA NA NA NA NA LANCL1 130428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 213168681 213168967 213168824 Y NA NA NA NA NA NA ERBB4 232598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 214053041 214053239 214053088 Y NA IKZF2 NA NA NA NA IKZF2 37890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 214053816 214053901 214053846 Y NA IKZF2 IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 38665 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 214054270 214054576 214054510 Y NA IKZF2 IKZF2 IMR90 Hi-C 24141950 IKZF2 39119 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 216558345 216558652 216558547 Y NA AC093850.2 NA NA NA NA AC093850.2 22114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 216563363 216563707 216563549 Y NA AC093850.2 NA NA NA NA AC093850.2 17059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 216865894 216866240 216866102 Y TMEM169,PECR,MREG MREG NA NA NA NA MREG 30579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 216870818 216871425 216871006 Y NA MREG NA NA NA NA MREG 25394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 217204686 217204947 217204817 Y MARCH4 NA NA NA NA NA SMARCAL1 70190 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 217357637 217357999 217357758 Y NA RPL37A,AC098820.3 RPL37A IMR90 Hi-C 24141950 RPL37A 2913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 217500633 217500954 217500700 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 217501395 217501614 217501574 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 217797120 217797464 217797294 Y NA NA DIRC3,TNP1,IGFBP5 IMR90 Hi-C 24141950 TNP1 74333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr2 218142226 218142611 218142295 Y NA NA NA NA NA NA TNP1 419439 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 218278062 218278387 218278165 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 340929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 218549825 218550302 218550107 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 69014 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 218701196 218701490 218701305 Y NA NA NA NA NA NA DIRC3 81880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 218782937 218783199 218783125 Y NA NA NA NA NA NA TNS1 82519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr2 219271996 219272374 219272308 Y USP37 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 11017 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 219584291 219584413 219584352 Y NA STK36,RNF25,TTLL4 NA NA NA NA TTLL4 10723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A NA NA NA NA NA CYP27A1 129043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 220374836 220375176 220374958 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF NA NA NA NA GMPPA 13247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 220386924 220387263 220387141 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 19122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 222435699 222436339 222436058 Y EPHA4 EPHA4 NA NA NA NA EPHA4 583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr2 222890722 222890987 222890846 Y NA NA NA NA NA NA PAX3 270728 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr2 223429708 223429962 223429836 Y FARSB NA NA NA NA NA FARSB 89094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 223447202 223447309 223447256 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 71747 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 223462160 223462364 223462326 Y NA NA NA NA NA NA FARSB 56692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 224477772 224478078 224477872 Y NA NA AP1S3,KCNE4,SCG2 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 222666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 AP1S3 131064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 224591304 224591516 224591410 Y NA NA AP1S3 MCF7 ChIA-PET 22265404 AP1S3 109228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 224773224 224773437 224773430 Y WDFY1 WDFY1,MRPL44 NA NA NA NA WDFY1 34667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 225325353 225325370 225325362 Y NA NA NA NA NA NA CUL3 122740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 225792499 225793034 225792841 Y CUL3,DOCK10 NA NA NA NA NA CUL3 344389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 227514922 227515156 227515015 Y NA NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 147319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 227665859 227666449 227665964 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 3384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 227822351 227822632 227822559 Y NA NA NA NA NA NA RHBDD1 124054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 228578021 228578290 228578242 Y NA SLC19A3 NA NA NA NA SLC19A3 2438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 229407284 229407450 229407381 Y NA NA NA NA NA NA PID1 726551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 231523854 231524330 231524235 Y GPR55,SP110,SP140,SP140L,CAB39 NA CAB39 K562 ChIA-PET 22265404 CAB39 51230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 231636017 231636396 231636213 Y NA BANF1P3 NA NA NA NA BANF1P3 47899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 231649547 231649844 231649697 Y NA NA NA NA NA NA BANF1P3 61429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 231901045 231901225 231901135 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA C2orf72 840 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 232207003 232207399 232207160 Y NA NA NA NA NA NA B3GNT7 50855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 232330093 232330255 232330170 Y NA SNORD82,NCL,LINC00471 NA NA NA NA SNORD82 6942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr2 232478392 232478857 232478528 Y DIS3L2,PTMA NA NA NA NA NA NMUR1 85186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 232479434 232479727 232479552 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 86228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 232485741 232486244 232485851 Y NA NA NA NA NA NA PTMA 83361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 232536483 232536778 232536606 Y DIS3L2,PTMA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 32827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 232537656 232538064 232537748 Y NA PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 31541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr2 232546670 232546982 232546826 Y NA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 232547138 232547293 232547212 Y PTMA PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 22312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 232551717 232552221 232552147 Y NPPC PTMA PTMA,PDE6D K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PTMA 17384 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr2 232580827 232581056 232580891 Y NA PTMA NA NA NA NA PTMA 11222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 233096331 233096791 233096507 Y NA NA NA NA NA NA ALPPL2 172762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 233250431 233250842 233250658 Y NA ALPPL2 NA NA NA NA ALPPL2 18711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 233279498 233279714 233279606 Y NA ALPPL2 NA NA NA NA ALPPL2 9945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 233283707 233283952 233283753 Y ALPPL2 ALPPL2 NA NA NA NA ALPPL2 14154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr2 235336071 235336661 235336603 Y ARL4C NA SPP2,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 ARL4C 67036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 235702224 235702360 235702292 Y NA NA NA NA NA NA SH3BP4 156257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 235732390 235732720 235732555 Y NA NA SH3BP4,TRPM8 IMR90 Hi-C 24141950 SH3BP4 125897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 235862299 235862667 235862586 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 3682 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 235863329 235863490 235863430 Y SH3BP4 SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 4712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 235872484 235872869 235872649 Y NA SH3BP4 NA NA NA NA SH3BP4 13867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 237485035 237485347 237485185 Y NA NA NA NA NA NA IQCA1 70850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 237884627 237885186 237884982 Y NA NA IQCA1,CXCR7 IMR90 Hi-C 24141950 COPS8 106769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 238038460 238038824 238038818 Y NA COPS8,AC105760.2 COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 46000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 238066036 238066584 238066320 Y MLPH,COL6A3 NA COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 73576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 238832423 238832667 238832502 Y NA UBE2F NA NA NA NA UBE2F 40802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 239330884 239331265 239331162 Y NA ASB1 NA NA NA NA ASB1 2118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 239755854 239755907 239755878 Y TWIST2 NA NA NA NA NA ASB1 422471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 240080723 240081253 240081085 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 239877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 240144687 240145031 240144830 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 176099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 240207977 240208290 240208163 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 112840 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 240213505 240213689 240213606 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 107441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 240267449 240267666 240267577 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 53464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr2 240854377 240854983 240854483 Y NA NA LOC150935,MIR4786 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFA10 107836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 240917886 240918180 240918030 Y NA NDUFA10 NA NA NA NA NDUFA10 44639 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 242171569 242171970 242171814 Y AGXT ANO7 NA NA NA NA ANO7 45645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 242425566 242425726 242425646 Y NA STK25 NA NA NA NA STK25 21419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr2 242549642 242550327 242549774 Y ATG4B ATG4B,THAP4 NA NA NA NA ATG4B 24301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr2 242710043 242710405 242710079 Y NA D2HGDH NA NA NA NA D2HGDH 38049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr2 242911452 242911734 242911512 Y NA NA LOC728323 IMR90 Hi-C 24141950 AC131097.3 89938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 268547 268840 268655 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12 NA NA NA NA C20orf96 550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 1792448 1792844 1792660 Y NA NA STK35,SIRPA,LOC100507495,SNPH,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 80310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 3156363 3156554 3156472 Y EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194 FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA NA NA NA NA UBOX5 17521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 3472887 3473113 3473000 Y NA ATRN NA NA NA NA ATRN 23200 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 4072203 4072410 4072307 Y NA SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 27217 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 4674724 4674919 4674762 Y NA PRNP NA NA NA NA PRNP 9842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 4931181 4931354 4931276 Y SLC23A2 NA NA NA NA NA SLC23A2 57585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 5127563 5128387 5127720 Y GPCPD1,PRNP,PRNP,SLC23A2 PCNA,CDS2 NA NA NA NA CDS2 22131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 5900000 5900262 5900165 Y GPCPD1,TRMT6 RNU1-55P,CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA CHGB 9924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 5927973 5928389 5928216 Y GPCPD1,TRMT6 CHGB,TRMT6,MCM8 NA NA NA NA TRMT6 793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 6889340 6889532 6889436 Y NA NA HAO1 IMR90 Hi-C 24141950 BMP2 143029 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 7479812 7480195 7480004 Y NA NA NA NA NA NA TMX4 518281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 8408277 8408546 8408511 Y TMX4 NA NA NA NA NA PLCB1 297453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 8435134 8435511 8435284 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 324310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 8464613 8464952 8464618 Y PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 353789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 10447085 10447351 10447236 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 34215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 10451023 10451290 10451134 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 38153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 10455990 10456132 10456072 Y NA MKKS NA NA NA NA MKKS 43120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 10466571 10466854 10466711 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 53701 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 10471502 10471750 10471599 Y NA NA NA NA NA NA MKKS 58632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 10585324 10585599 10585462 Y NA JAG1 NA NA NA NA JAG1 39415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 12734495 12734674 12734580 Y NA NA NA NA NA NA ISM1 465744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 13434936 13435260 13435184 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 182327 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 13473886 13474103 13473974 Y NA NA NA NA NA NA TASP1 143484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 13734374 13734725 13734663 Y NA ESF1 NA NA NA NA ESF1 28807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 14036151 14036406 14036253 Y NA NA NA NA NA NA MACROD2 62136 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 14697041 14697213 14697128 Y NA NA NA NA NA NA FLRT3 380779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 16555525 16555956 16555640 Y NA KIF16B NA NA NA NA KIF16B 3447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 17824958 17825344 17825106 Y ZNF133,CSRP2BP NA BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD17 116245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 18276093 18276447 18276109 Y CSRP2BP ZNF133 NA NA NA NA ZNF133 8972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 18565876 18566072 18565973 Y CSRP2BP,ZNF133,POLR3F,SEC23B,SEC23B,SEC23B,DTD1 LINC00493,DTD1 NA NA NA NA DTD1 465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 19783112 19783320 19783290 Y NA RP1-122P22.2 RIN2,SLC24A3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-122P22.2 46760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 20347223 20347613 20347293 Y NA INSM1 NA NA NA NA INSM1 458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 20391161 20391545 20391351 Y NA INSM1 NA NA NA NA INSM1 44396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA INSM1 86185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr20 25267859 25268242 25268026 Y NA PYGB NA NA NA NA PYGB 41154 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 25838960 25839094 25839045 Y ZNF337 NA NA NA NA NA ZNF337 163483 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 29649919 29650288 29650100 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 30104625 30104737 30104681 Y HM13 HM13 NA NA NA NA HM13 4394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 30182515 30183026 30182914 Y NA ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 8060 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 30292336 30292785 30292516 Y NA BCL2L1,TPX2 COX4I2 IMR90 Hi-C 24141950 BCL2L1 17007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 30699679 30699866 30699769 Y BCL2L1,HCK,C20orf112,TM9SF4,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 4370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 31044923 31045080 31044970 Y NA NA NA NA NA NA ASXL1 100768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 31170393 31170766 31170763 Y NA C20orf112 NA NA NA NA C20orf112 110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 31339575 31339797 31339687 Y NA COMMD7,DNMT3B COMMD7,DNMT3B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 DNMT3B 8394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 31350973 31351317 31351235 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 2782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr20 31352490 31352753 31352633 Y C20orf203,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 4299 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 32321714 32321896 32321832 Y NA E2F1,PXMP4,ZNF341 NA NA NA NA ZNF341 4251 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 32782933 32783102 32782955 Y ASIP NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74657 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr20 32783228 32783544 32783386 Y NA NA ITCH,ASIP,AHCY IMR90 Hi-C 24141950 RPS2P1 74952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 32803033 32803441 32803244 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 94167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 32826582 32826856 32826719 Y TP53INP2 NA EIF2S2,AHCY,ASIP,ITCH,DYNLRB1,PIGU IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 70752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 32989671 32989803 32989744 Y NA ITCH NA NA NA NA ITCH 40630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 FDX1P1,DYNLRB1 NA NA NA NA FDX1P1 2018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 33653192 33653349 33653271 Y NA TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 25325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 33699049 33699250 33699220 Y TRPC4AP,EDEM2 TRPC4AP NA NA NA NA TRPC4AP 20375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 33900177 33900484 33900409 Y GSS,EIF6,EIF6 EDEM2,EIF6 NA NA NA NA EIF6 29389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 34127589 34128004 34127717 Y NA NA NA NA NA NA ERGIC3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 34217204 34217560 34217502 Y NA SPAG4,CPNE1,RBM12 NA NA NA NA SPAG4 15390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,RPF2P1,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 34658286 34658599 34658390 Y EPB41L1 NA LOC647979,C20orf152,EPB41L1,PHF20 IMR90 Hi-C 24141950 SCAND1 112892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35583660 35583902 35583783 Y TGIF2,TGIF2,TGIF2 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35821029 35821195 35821110 Y NA RPN2 GHRH IMR90 Hi-C 24141950 RPN2 16216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 35880247 35880630 35880494 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 35411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35887668 35888008 35887942 Y NA MANBAL NA NA NA NA MANBAL 28033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35922737 35923093 35922847 Y SAMHD1,CTNNBL1,MANBAL,SRC MANBAL,SRC NA NA NA NA MANBAL 6696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 35947612 35947897 35947800 Y NA MANBAL,SRC NA NA NA NA SRC 23191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 36132626 36132893 36132840 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 14724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 36135409 36135682 36135567 Y NA NNAT,BLCAP NA NA NA NA NNAT 11935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP NNAT,BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr20 36298725 36299073 36298903 Y C20orf132 CTNNBL1 VSTM2L,LOC100287792,RPN2,CTNNBL1,TTI1,LBP IMR90 Hi-C 24141950 CTNNBL1 21335 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 38490582 38490913 38490748 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 824967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 38647723 38647728 38647726 Y NA NA NA NA NA NA MAFB 668152 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 38908222 38908337 38908279 Y MAFB NA NA NA NA NA MAFB 407543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 39939044 39939335 39939233 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 4977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 41675493 41675534 41675514 Y NA NA NA NA NA NA SRSF6 409034 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 42137465 42137802 42137552 Y NA L3MBTL1 NA NA NA NA L3MBTL1 3145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.10709885471299 chr20 42390017 42390272 42390131 Y C20orf111,GTSF1L NA TOX2,JPH2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 96263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 42648340 42648654 42648497 Y NA NA NA NA NA NA TOX2 106836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43517782 43518230 43517943 Y NA YWHAB,PABPC1L PABPC1L IMR90 Hi-C 24141950 YWHAB 5465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43540233 43540373 43540312 Y DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,PABPC1L YWHAB,PABPC1L,TOMM34 NA NA NA NA PABPC1L 3530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr20 43582253 43582415 43582335 Y NA PABPC1L,TOMM34,STK4 NA NA NA NA TOMM34 4712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43689990 43690348 43690045 Y NA NA NA NA NA NA STK4 96875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43709360 43709760 43709560 Y NA NA NA NA NA NA STK4 116245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 43972131 43972359 43972259 Y NA SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2 NA NA NA NA SDC4 2705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 44001576 44001658 44001579 Y WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2 SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT NA NA NA NA SYS1-DBNDD2 11736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 44062032 44062200 44062120 Y KCNS1,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,WFDC11,WFDC6 PIGT NA NA NA NA PIGT 19315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 44393897 44394275 44394207 Y NA DNTTIP1,UBE2C NA NA NA NA DNTTIP1 24301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 44604057 44604097 44604095 Y NA PCIF1,ZNF335,MMP9,SLC12A5 NA NA NA NA ZNF335 5224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA CDH22 79521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 45006307 45006609 45006393 Y PCIF1,ZNF335 SLC35C2 NA NA NA NA SLC35C2 15264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 45180548 45180762 45180742 Y CD40,C20orf123 ZNF334 NA NA NA NA ZNF334 40350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr20 45946049 45946481 45946179 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 32824 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 45960088 45960376 45960270 Y ZMYND8 RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 18929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr20 46067997 46068157 46068096 Y NCOA3 NA NCOA3,ZMYND8 IMR90 Hi-C 24141950 NCOA3 60444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 47773105 47773432 47773269 Y NA STAU1 NA NA NA NA STAU1 29472 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48388811 48389348 48388940 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC9A8 37902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48663510 48663968 48663673 Y NA NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAI1 65974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 48753681 48754062 48753956 Y B4GALT5,SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,PTPN1,CEBPB UBE2V1,TMEM189-UBE2V1,TMEM189,RP11-112L6.4 NA NA NA NA TMEM189-UBE2V1 14112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48885650 48885800 48885698 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB NA PARD6B,CEBPB,PTPN1,LOC284751,FAM65C,MIR645 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 80274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48902426 48902799 48902722 Y CEBPB NA LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CEBPB 97050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 NA NA NA NA NA CEBPB 119514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48951795 48951969 48951898 Y NA NA NA NA NA NA CEBPB 146419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 48990561 48990720 48990640 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 134171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 49134968 49135201 49135019 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 10077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 49378305 49378754 49378413 Y DPM1,PARD6B,BCAS4 PARD6B,BCAS4 NA NA NA NA BCAS4 30677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 49487134 49487591 49487436 Y NA NA NA NA NA NA RP5-914P20.5 57930 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 49539044 49539098 49539071 Y NA RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA RP5-914P20.5 6423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 49598879 49599145 49599015 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 25516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 49838536 49838841 49838768 Y NA NA KCNG1 IMR90 Hi-C 24141950 KCNG1 200870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr20 49947847 49948420 49948354 Y NA NA KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3 IMR90 Hi-C 24141950 NFATC2 228950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA NFATC2 75345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A,SALL4 NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 50416342 50416699 50416509 Y NA ATP9A,SALL4 NA NA NA NA SALL4 360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 50416861 50417288 50417180 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA SALL4 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 50527143 50527170 50527154 Y NA NA ZFP64,SALL4,ATP9A IMR90 Hi-C 24141950 SALL4 110084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 52213211 52213282 52213247 Y NA ZNF217 BMP7,SUMO1P1,BCAS1,CYP24A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF217 11164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52238527 52238650 52238555 Y NA ZNF217 SUMO1P1,BMP7,ZNF217,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 14081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52239995 52240318 52240062 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BMP7,BCAS1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 15549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr20 52268867 52269118 52269044 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 44421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52271592 52271787 52271702 Y ZNF217 ZNF217 SUMO1P1,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 47146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr20 52380425 52380741 52380578 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 155979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52480421 52480878 52480693 Y ZNF217,PFDN4 NA NA NA NA NA ZNF217 255975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 52483715 52484176 52483911 Y NA NA NA NA NA NA ZNF217 259269 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 53716299 53716500 53716400 Y NA RPL12P4 NA NA NA NA RPL12P4 27144 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 55264382 55264603 55264519 Y NA PTMAP6 BMP7,TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 9967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 55311396 55311684 55311475 Y NA PTMAP6 TFAP2C MCF7 ChIA-PET 22265404 PTMAP6 36826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 55379556 55380011 55379738 Y TFAP2C NA TFAP2C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMAP6 104986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 55825592 55825967 55825782 Y NA BMP7 NA NA NA NA BMP7 13718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 56255217 56255759 56255498 Y ZBP1,PMEPA1 PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 28833 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 56421025 56421156 56421091 Y NA NA PMEPA1 IMR90 Hi-C 24141950 PMEPA1 136433 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 56950925 56951211 56951109 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 10967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 56983736 56983744 56983737 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 21558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 57236406 57236742 57236622 Y RAB22A,STX16 STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 11916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 57420469 57420802 57420636 Y NA GNAS,GNAS-AS1,RP1-309F20.3 NA NA NA NA GNAS-AS1 3156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 57585788 57586041 57585915 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 60011356 60011607 60011563 Y CDH4 NA NA NA NA NA CDH4 185874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 60103711 60103923 60103817 Y NA NA NA NA NA NA CDH4 278229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60247024 60247153 60247088 Y CDH4,SS18L1 NA NA NA NA NA TAF4 391713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 60803093 60803442 60803179 Y NA OSBPL2 NA NA NA NA OSBPL2 8138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60940876 60941209 60940968 Y PSMA7,SLCO4A1,RPS21,NTSR1,C20orf20,C20orf151,ADRM1,LAMA5 MIR4758,LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA LAMA5 508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60956313 60956720 60956445 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 3452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 60956743 60957219 60956871 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA RPS21 2953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 61506279 61506510 61506352 Y BHLHE23,TCFL5,DIDO1,C20orf11 TCFL5 TCFL5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TCFL5 15164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 61620731 61620885 61620812 Y OGFR,DPH3P1 NA NA NA NA NA DIDO1 53427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr20 62820558 62820833 62820696 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD2 64261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr21 15449757 15449894 15449826 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 15853891 15854146 15854069 Y SAMSN1,HSPA13 NA NA NA NA NA HSPA13 100086 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 16129964 16130277 16130229 Y NA NA NA NA NA NA NRIP1 305044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 16235978 16236341 16236284 Y SAMSN1,NRIP1 NA NRIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRIP1 198980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17054611 17055027 17054700 Y USP25 USP25 USP25 IMR90 Hi-C 24141950 USP25 45317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17103695 17103792 17103750 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 3351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17444153 17444342 17444293 Y NA LINC00478 NA NA NA NA LINC00478 3311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17652343 17653123 17652644 Y NA SNORD74 NA NA NA NA SNORD74 1966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17745935 17746301 17746052 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 90846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 17924273 17924626 17924451 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 269184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr21 17960667 17961305 17960883 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 305578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 18210216 18210502 18210396 Y NA NA NA NA NA NA SNORD74 555127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 18266996 18267114 18267057 Y NA NA NA NA NA NA C21orf37 542094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 18886111 18886899 18886569 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 3411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr21 18891260 18891546 18891459 Y NA CXADR NA NA NA NA CXADR 8560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 18919922 18920266 18920094 Y CXADR CXADR NA NA NA NA CXADR 37222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr21 26952450 26952820 26952600 Y NA MRPL39 NA NA NA NA MRPL39 25009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr21 26980548 26980842 26980671 Y NA MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 2719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 27298348 27298650 27298452 Y NA NA NA NA NA NA ATP5J 192364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 27353741 27354048 27353953 Y APP NA NA NA NA NA APP 187398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 27855729 27855767 27855735 Y CYYR1 NA NA NA NA NA CYYR1 87836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 28336800 28337144 28336952 Y ADAMTS1,ADAMTS5 NA NA NA NA NA ADAMTS5 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 29476694 29476903 29476871 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT1 778790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30005077 30005224 30005162 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 250469 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30005401 30005714 30005479 Y NA NA ADAMTS1,LINC00161 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 249979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30133752 30133937 30133845 Y C21orf7,USP16,N6AMT1 NA LINC00113,ADAMTS1,ADAMTS5 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 121756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.00348782395468 chr21 30567218 30567411 30567380 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 2826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30590117 30590529 30590261 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 25725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30591516 30591874 30591674 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 27124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30607939 30608477 30608249 Y USP16,BACH1,BACH1 LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 43547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30617454 30617803 30617527 Y USP16,BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 53062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 30631059 30631204 30631132 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 66667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30754427 30754628 30754578 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 190035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 30967382 30967686 30967533 Y GRIK1 NA NA NA NA NA BACH1 402990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 31455603 31455795 31455698 Y NA NA NA NA NA NA KRTAP19-5 416640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr21 32532795 32532952 32532925 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 396606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 32553780 32554124 32553993 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 375434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 32662959 32662987 32662974 Y NA NA NA NA NA NA AP000251.3 266571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 32926891 32927175 32926925 Y NA AP000251.3,TIAM1 NA NA NA NA AP000251.3 2383 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 32929453 32930069 32929726 Y TIAM1 TIAM1 NA NA NA NA AP000251.3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 33104933 33105321 33105127 Y NA SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 2545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 35057919 35058071 35057938 Y NA ITSN1,CRYZL1 NA NA NA NA CRYZL1 43687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr21 35099909 35100119 35099917 Y NA NA NA NA NA NA CRYZL1 85677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 35395270 35395520 35395430 Y GART,GART,SON MRPS6,SLC5A3 MRPS6,ATP5O,LOC100506334 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 48004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 35397758 35397925 35397838 Y NA MRPS6,SLC5A3 MRPS6,LOC100506334,LINC00310,FAM165B,KCNE2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS6 45599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 104283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 36222572 36222954 36222768 Y NA NA NA NA NA NA CLIC6 182884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 36599466 36599950 36599803 Y NA NA RUNX1 IMR90 Hi-C 24141950 CLIC6 559778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 37529889 37530052 37529971 Y DOPEY2 CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA DOPEY2 2809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 38346647 38347014 38346835 Y NA AP000704.5,HLCS NA NA NA NA AP000704.5 9835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr21 38590434 38590491 38590485 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA AP001432.14 1229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 38629602 38630247 38630025 Y NA AP001432.14,DSCR3 NA NA NA NA DSCR3 8015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.73922851112689 chr21 38936686 38937128 38936852 Y DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 200594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 39189154 39189496 39189325 Y NA NA NA NA NA NA KCNJ6 97253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 39430494 39430871 39430698 Y DSCR4 NA NA NA NA NA DSCR4 60583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 39593313 39593902 39593631 Y NA NA NA NA NA NA DSCR8 101768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 40182920 40183779 40183392 Y ETS2 ETS2 NA NA NA NA ETS2 7689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 40277371 40277733 40277541 Y NA NA ETS2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ETS2 102140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 40689481 40689668 40689601 Y BRWD1 BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 1817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 40860443 40860729 40860586 Y NA LCA5L,SH3BGR NA NA NA NA SH3BGR 44662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 41048329 41048488 41048408 Y SH3BGR NA NA NA NA NA B3GALT5 121960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 42122707 42122949 42122828 Y DSCAM NA NA NA NA NA BACE2 414779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 43944597 43944892 43944856 Y NA SLC37A1 NA NA NA NA SLC37A1 30479 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44072717 44073208 44072832 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 971 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44074543 44074777 44074593 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 2797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44087083 44087334 44087223 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 15337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44091107 44091303 44091206 Y NA PDE9A NA NA NA NA PDE9A 19361 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44355985 44356328 44356154 Y NA ERVH48-1,PKNOX1 U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 ERVH48-1 12229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44395482 44395891 44395810 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 2862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 44395922 44396228 44396080 Y WDR4,U2AF1,CBS PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 3302 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr21 44469974 44470172 44470008 Y CBS CBS NA NA NA NA CBS 24881 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44529146 44529448 44529286 Y U2AF1 CBS,U2AF1 NA NA NA NA U2AF1 3449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr21 44582937 44583304 44583126 Y NA CRYAA HSF2BP,LINC00313,U2AF1 IMR90 Hi-C 24141950 CRYAA 3814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44597156 44597534 44597315 Y SIK1 CRYAA NA NA NA NA CRYAA 10038 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44758836 44759116 44758976 Y NA NA LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SIK1 85892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 44816664 44817004 44816885 Y NA SIK1 NA NA NA NA SIK1 28004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 45117744 45118082 45118052 Y NA HSF2BP,RRP1B,PDXK PDXK IMR90 Hi-C 24141950 PDXK 18893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45132062 45132504 45132250 Y HSF2BP,PDXK PDXK NA NA NA NA PDXK 4471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45235037 45235392 45235184 Y NA CSTB,RRP1,MYL6P1,AGPAT3 NA NA NA NA RRP1 27643 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45394155 45394780 45394371 Y AGPAT3,TRPM2,C21orf33 TRAPPC10 NA NA NA NA TRAPPC10 35420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45426552 45426831 45426638 Y NA TRAPPC10,H2AFZP1 NA NA NA NA TRAPPC10 3369 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45557942 45558217 45558021 Y AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 6455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45558236 45558599 45558477 Y PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 6749 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45566076 45566451 45566257 Y TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2 PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 14589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45573018 45573302 45573138 Y PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 21531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45661962 45662435 45662161 Y TRAPPC10,PWP2,C21orf2,ICOSLG ICOSLG,DNMT3L NA NA NA NA ICOSLG 3113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45683777 45683905 45683814 Y KRTAP10-6,KRTAP10-11,KRTAP12-4,KRTAP10-12,KRTAP12-2,KRTAP12-1,KRTAP10-8,DNMT3L,AIRE,AIRE ICOSLG,DNMT3L,PFKL NA NA NA NA DNMT3L 3678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 45943778 45945170 45944363 Y NA AP001065.15,C21orf90 NA NA NA NA C21orf90 8679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 31919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 46122910 46123100 46123005 Y NA TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 6395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 46124045 46124372 46124063 Y DNMT3L,AIRE,AIRE,TSPEAR TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 5123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 46127419 46127576 46127516 Y NA TSPEAR NA NA NA NA TSPEAR 1919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 46437821 46438082 46437937 Y NA NA LINC00162,ADARB1,SSR4P1,FAM207A,LINC00163 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ADARB1 53686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 46549530 46549961 46549631 Y NA NA NA NA NA NA ADARB1 57762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 46831544 46831752 46831652 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 8492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 46894520 46894647 46894596 Y COL18A1 NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 67678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr21 47008132 47008435 47008135 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027 IMR90 Hi-C 24141950 AL133493.2 3133 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 217 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 47365117 47365541 47365289 Y NA COL6A1 NA NA NA NA COL6A1 34110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 47554885 47555152 47555043 Y FTCD COL6A2 NA NA NA NA COL6A2 38874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 47651317 47651563 47651562 Y NA LSS,MCM3AP-AS1 NA NA NA NA MCM3AP-AS1 4186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr21 47935050 47935239 47935141 Y NA NA NA NA NA NA DIP2A 58238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 17745323 17745619 17745476 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 73497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 17784917 17785039 17784962 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 113091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 17849400 17850329 17849515 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 177574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 17850637 17851018 17850672 Y NA NA NA NA NA NA AC005300.5 178811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 18916909 18917370 18917163 Y MICAL3,TUBA8,DGCR6,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 4696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr22 18921428 18921794 18921531 Y MICAL3,PRODH,PRODH DGCR6,PRODH,DGCR5 NA NA NA NA PRODH 272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19074552 19074704 19074618 Y NA DGCR2 NA NA NA NA DGCR2 33263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.16064828206949 chr22 19337870 19338225 19337898 Y NA NA NA NA NA NA CLTCL1 60631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19378121 19378382 19378253 Y NA MRPL40 NA NA NA NA MRPL40 39043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19427862 19428165 19428014 Y NA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39,UFD1L,CDC45 NA NA NA NA HIRA 5059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19930770 19931097 19930953 Y ZDHHC8,COMT COMT,TXNRD2 NA NA NA NA TXNRD2 3429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 19983834 19983932 19983883 Y NA ARVCF NA NA NA NA ARVCF 18399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 20068627 20068902 20068750 Y COMT,DGCR8 DGCR8,RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA DGCR8 2872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 20848736 20849050 20848893 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 20850844 20851071 20850923 Y PI4KA,AIFM3,AIFM3 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 2644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 20863506 20864089 20863850 Y MED15 KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 15306 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 20886351 20886470 20886411 Y NA KLHL22,MED15 NA NA NA NA MED15 38151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 21132162 21132336 21132252 Y NA NA NA NA NA NA SNAP29 78935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr22 22861017 22861374 22861318 Y ZNF280B ZNF280B,ZNF280A NA NA NA NA ZNF280B 131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr22 23888781 23888894 23888838 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC8P1 145868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 24080371 24080411 24080401 Y NA GUSBP11,ZNF70,MMP11,CHCHD10,SMARCB1 NA NA NA NA ZNF70 10868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 25082452 25082825 25082629 Y ADORA2A,GGT1 CRIP1P4 PIWIL3 IMR90 Hi-C 24141950 CRIP1P4 23434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 25365957 25366157 25366057 Y NA NA KIAA1671 IMR90 Hi-C 24141950 SNORD56 70776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 25844657 25845002 25844694 Y NA LRP5L,CRYBB2P1 NA NA NA NA CRYBB2P1 2585 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 26016184 26016597 26016397 Y NA NA NA NA NA NA ADRBK2 57368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 26967025 26967265 26967145 Y TFIP11 TPST2,CRYBB1 NA NA NA NA TPST2 23416 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 27038834 27039211 27039123 Y NA TPST2,CRYBB1,MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA MIAT 1181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CRYBB1,MIAT,CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 MIAT 689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr22 27043800 27044733 27044318 Y SEZ6L CRYBB1,MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA MIAT 3408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 27054967 27055259 27055032 Y SEZ6L,ASPHD2 CRYBB1,MIAT,CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 11471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 27131212 27131584 27131334 Y NA NA MN1,PITPNB,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 64482 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 28066220 28066571 28066325 Y PITPNB,MN1 NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 128915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 28106286 28106571 28106415 Y NA NA MIAT,MN1 IMR90 Hi-C 24141950 MN1 88915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 28372624 28372939 28372782 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 58502 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 28549378 28549438 28549411 Y NA NA NA NA NA NA PITPNB 235256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 28837872 28838192 28838073 Y TTC28 NA NA NA NA NA HSCB 297827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 28956104 28956479 28956470 Y NA NA NA NA NA NA HSCB 179540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 29209751 29210048 29209892 Y CCDC117,XBP1 CCDC117,XBP1,CTA-292E10.6 CHEK2,HSCB,C22orf31,ZNRF3,KREMEN1,TTC28,TTC28-AS1,EMID1,CCDC117,XBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTA-292E10.6 15080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 29548210 29548510 29548260 Y KREMEN1 NA NA NA NA NA EMID1 51330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 29548778 29549084 29549009 Y XBP1,KREMEN1 NA NA NA NA NA EMID1 50756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 29605025 29605391 29605212 Y EMID1 EMID1 NA NA NA NA EMID1 5185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 29877762 29878123 29877961 Y NA NEFH NA NA NA NA NEFH 3543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 30279863 30280214 30279898 Y NA ASCC2,MTMR3 NA NA NA NA MTMR3 2719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 30555266 30555411 30555352 Y LIF NA NA NA NA NA CTA-85E5.10 80797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 30671576 30671914 30671807 Y NA GATSL3,TBC1D10A LIF,OSM IMR90 Hi-C 24141950 GATSL3 11702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 31005316 31005631 31005442 Y SMTN,OSM,TBC1D10A,CCDC157,SF3A1,DUSP18,SLC35E4 TCN2,PES1,SLC35E4,CTA-963H5.5 NA NA NA NA PES1 4246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 MORC2 64094 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr22 32042427 32042918 32042716 Y RNF185,LIMK2 PISD NA NA NA NA PISD 13500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 32983251 32983414 32983333 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 114588 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 33023085 33023421 33023227 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3 NA NA NA NA NA FBXO7 154422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33045580 33045773 33045677 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 176917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33052745 33052826 33052803 Y RFPL2,RFPL3,TIMP3,SYN3 NA NA NA NA NA FBXO7 184082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33091404 33091880 33091552 Y TIMP3,SYN3 NA NA NA NA NA FBXO7 222741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33130002 33130222 33130145 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 261339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33164513 33164882 33164796 Y BPIL2,SYN3,SYN3 NA NA NA NA NA SYN3 287476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33176423 33176673 33176603 Y NA NA NA NA NA NA SYN3 275685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33202022 33202333 33202121 Y NA NA NA NA NA NA SYN3 250025 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 33238776 33239102 33239072 Y SYN3,SYN3 NA NA NA NA NA SYN3 213256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr22 33243745 33243918 33243862 Y NA NA NA NA NA NA SYN3 208440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33252376 33252746 33252411 Y NA NA NA NA NA NA SYN3 199612 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33291094 33291121 33291108 Y TIMP3 NA NA NA NA NA SYN3 161237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 33446975 33447060 33447003 Y NA SYN3 NA NA NA NA SYN3 5298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 34062900 34062913 34062907 Y NA SNORA76 NA NA NA NA SNORA76 35993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 34682646 34682665 34682656 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 583740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 35238816 35239159 35238991 Y NA NA NA NA NA NA CTA-714B7.5 385890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 36310688 36310985 36310744 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 111488 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 36343697 36344006 36343862 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 78467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 36759233 36759313 36759256 Y APOL3,APOL3,APOL2,APOL2,NCF4 MYH9 NA NA NA NA MYH9 22750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 36806147 36806450 36806256 Y NA MYH9,RP5-1119A7.14 MYH9,FOXRED2,TXN2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYH9 24084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr22 36855477 36855678 36855599 Y NA RP5-1119A7.14,TXN2 NA NA NA NA RP5-1119A7.14 6486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 37490501 37490532 37490517 Y NA KCTD17 NA NA NA NA KCTD17 44722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 37655075 37655389 37655235 Y NA RAC2 CARD10,C1QTNF6,CYTH4,ELFN2 IMR90 Hi-C 24141950 RAC2 16587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 37703985 37704250 37704217 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,IL2RB,RAC2,CYTH4 NA NA NA NA NA RAC2 65497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38057516 38057596 38057556 Y NA SH3BP1,PDXP,LGALS1,NOL12,TRIOBP NA NA NA NA PDXP 4782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38137969 38138286 38138127 Y TRIOBP TRIOBP H1F0,GCAT IMR90 Hi-C 24141950 TRIOBP 46958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38142899 38142964 38142949 Y CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54 NA NA NA NA NA TRIOBP 51888 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38199242 38199532 38199401 Y NA H1F0,GCAT,MIR658,EIF3L,ANKRD54 NA NA NA NA H1F0 128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38351215 38351232 38351224 Y NA POLR2F,C22orf23 NA NA NA NA C22orf23 3539 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38423455 38423805 38423739 Y NA PICK1 SOX10,POLR2F,PICK1,MAFF IMR90 Hi-C 24141950 PICK1 26513 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 38859370 38859653 38859488 Y NA KDELR3,DDX17 NA NA NA NA KDELR3 2414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39323218 39323415 39323317 Y NA NA CBX7,PDGFB,NPTXR,APOBEC3G,APOBEC3H,RNU86,SNORD83A,RPL3,APOBEC3A,SUN2,GTPBP1,DNAL4,CBX6,APOBEC3C,APOBEC3D,MGAT3 IMR90 Hi-C 24141950 APOBEC3B 52937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39462955 39463374 39463017 Y NA APOBEC3F,APOBEC3G NA NA NA NA APOBEC3G 28031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 39570081 39570473 39570178 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7 ChIA-PET 22265404 CBX7 23402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39570711 39571096 39570941 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,PDGFB,APOBEC3G,APOBEC3H CBX7 PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CBX7 24032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr22 39610460 39610820 39610697 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 27936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39695935 39696099 39695991 Y ATF4,APOBEC3A RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 18295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 39784258 39784471 39784339 Y MGAT3,MGAT3,CBX7,SYNGR1 SYNGR1,TAB1 NA NA NA NA TAB1 9275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 40309233 40309614 40309424 Y CACNA1I,GRAP2 UQCRFS1P1 FAM83F IMR90 Hi-C 24141950 UQCRFS1P1 39940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 40323368 40324104 40323679 Y GRAP2 NA NA NA NA NA UQCRFS1P1 54075 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 40573139 40573276 40573210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 72069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 40575185 40575584 40575306 Y TNRC6B,TNRC6B NA NA NA NA NA RPL7P52 74115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 40840291 40840428 40840373 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 75696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 40885973 40886127 40886071 Y NA NA NA NA NA NA SGSM3 121378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 41047729 41047883 41047796 Y NA MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37,MCHR1 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 41080878 41081122 41080979 Y NA GAPDHP37,MCHR1 NA NA NA NA MCHR1 8124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,RP11-12M9.4,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr22 41844337 41844774 41844650 Y SHISA8,TEF,TEF,TOB2 TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 3310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 42062739 42062953 42062873 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 42096331 42096684 42096508 Y CHADL,WBP2NL,MEI1 C22orf46,NHP2L1 NA NA NA NA NHP2L1 11823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 43116155 43116318 43116237 Y CYB5R3,A4GALT A4GALT NA NA NA NA A4GALT 851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 43144166 43144283 43144173 Y NA A4GALT CYB5R3,ARFGAP3,PACSIN2,A4GALT IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 28862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 44321391 44321759 44321599 Y PNPLA3 PNPLA3,SAMM50,RP4-796I17.5 NA NA NA NA PNPLA3 3772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 44542524 44542650 44542613 Y NA NA NA NA NA NA RP4-796I17.5 191617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 45016324 45016531 45016433 Y PARVG,PARVG,PRR5 PRR5 NA NA NA NA PRR5 46062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 45403389 45403735 45403573 Y KIAA0930,PHF21B,PHF21B,PHF21B PHF21B NA NA NA NA PHF21B 145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 45553376 45553664 45553597 Y NA CTA-217C2.1,NUP50 NA NA NA NA CTA-217C2.1 3998 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 45899980 45900171 45900075 Y NA FBLN1 NA NA NA NA FBLN1 3862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46028588 46028889 46028879 Y WNT7B ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 36789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr22 46041491 46041960 46041628 Y NA ATXN10 ATXN10,WNT7B,FAM118A,SMC1B,FBLN1,LOC730668,LOC100271722,MIRLET7BHG IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ATXN10 23718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46374166 46374684 46374539 Y NA NA NA NA NA NA PPARA 169740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46393370 46393721 46393470 Y C22orf26 NA C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPARA 150703 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 46970983 46971382 46971054 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 1074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 47126357 47126654 47126612 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 5504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 47338470 47338938 47338889 Y CERK,TBC1D22A NA NA NA NA NA TBC1D22A 181952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 47498045 47498267 47498202 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D22A 341527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 47848340 47848433 47848387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 176990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 49768624 49768992 49768711 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 280198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr22 49843892 49843993 49843957 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 205197 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr22 50272789 50273094 50272966 Y NA ZBED4,CRELD2,ALG12 NA NA NA NA ZBED4 27299 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr22 50979060 50979802 50979496 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 10051 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 3219649 3219829 3219819 Y NA CRBN NA NA NA NA CRBN 255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 3854493 3854653 3854575 Y NA LRRN1 NA NA NA NA LRRN1 15372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 3975411 3975745 3975578 Y NA NA NA NA NA NA LRRN1 136290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 4392615 4392774 4392664 Y ITPR1 SETMAR NA NA NA NA SETMAR 49627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 4468384 4468713 4468579 Y NA SUMF1 NA NA NA NA SUMF1 38252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 4780474 4780964 4780800 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 10310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 4783422 4783695 4783523 Y EDEM1,BHLHE40,ARL8B EGOT NA NA NA NA EGOT 7579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 4851245 4851552 4851399 Y NA NA NA NA NA NA EGOT 59971 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40 NA NA NA NA BHLHE40 9733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 5145575 5145674 5145603 Y NA ARL8B ITPR1,EGOT IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 16231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 5181258 5181597 5181446 Y BHLHE40,ARL8B,EDEM1 ARL8B,AC026202.3,EDEM1 EDEM1 IMR90 Hi-C 24141950 ARL8B 19353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 5934139 5934433 5934284 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 706808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 6573697 6574039 6573711 Y NA NA NA NA NA NA EDEM1 1346366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 7015968 7016152 7016014 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 1525241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 8335682 8335807 8335745 Y NA NA NA NA NA NA LMCD1 205586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 9721492 9721576 9721535 Y IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC MTMR14,BRPF1 NA NA NA NA MTMR14 32375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 11336940 11337150 11337065 Y HRH1,ATG7 ATG7 NA NA NA NA ATG7 24945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 11632872 11633201 11633091 Y SYN2,VGLL4 NA NA NA NA NA VGLL4 127019 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 12036535 12036797 12036666 Y NA SYN2 NA NA NA NA SYN2 7079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 12137205 12137457 12137242 Y NA NA NA NA NA NA TIMP4 61394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr3 13040844 13041238 13041111 Y RAF1 NA NA NA NA NA IQSEC1 71379 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 13045680 13046084 13045881 Y NA NA NA NA NA NA IQSEC1 66533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 13325256 13325344 13325300 Y NA NA NUP210,LOC285375 IMR90 Hi-C 24141950 NUP210 134465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr3 13740118 13740248 13740188 Y NA NA NA NA NA NA FBLN2 168294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 14257734 14258042 14257871 Y NA LSM3,XPC NA NA NA NA XPC 39451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr3 14466133 14466429 14466346 Y C3orf19,XPC,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 24057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 14475699 14476221 14476090 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 33623 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 15105615 15105982 15105798 Y NA MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 15285479 15285699 15285585 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 39820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15443040 15443420 15443273 Y ANKRD28,METTL6,EAF1,COLQ,SH3BP5,SH3BP5 EAF1,METTL6 NA NA NA NA EAF1 23442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15677848 15678314 15678139 Y ANKRD28,SH3BP5,SH3BP5,EAF1 BTD,HACL1 NA NA NA NA HACL1 36510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15780032 15780074 15780052 Y SH3BP5,EAF1 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 119204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 15901875 15902313 15902310 Y METTL6,ANKRD28 ANKRD28 NA NA NA NA ANKRD28 2597 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 16352603 16353027 16352777 Y RFTN1,OXNAD1 DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 47897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 16373323 16373612 16373405 Y ANKRD28,OXNAD1 NA NA NA NA NA OXNAD1 68617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 16508881 16509222 16509075 Y PLCL2,DPH3,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 44311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 16550067 16550455 16550405 Y PLCL2,OXNAD1,RFTN1 RFTN1 NA NA NA NA RFTN1 3078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 17441926 17442172 17442040 Y PLCL2 NA NA NA NA NA PLCL2 599767 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 17506581 17506846 17506713 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA PLCL2 664422 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 701153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 17650424 17650697 17650561 Y NA NA NA NA NA NA PLCL2 808265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18237686 18238028 18237782 Y TBC1D5 NA NA NA NA NA TBC1D5 246281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18252681 18253057 18252788 Y TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 231252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 18366679 18366900 18366790 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 117409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 18399008 18399057 18399033 Y SATB1 NA NA NA NA NA TBC1D5 85252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18453300 18453576 18453481 Y NA TBC1D5,SATB1 NA NA NA NA TBC1D5 30733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 18624230 18624279 18624270 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 46065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18728828 18729189 18728942 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 150663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 18933064 18933626 18933337 Y NA NA NA NA NA NA KCNH8 254320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA KCNH8 NA NA NA NA KCNH8 423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 19379484 19379512 19379499 Y KCNH8 NA NA NA NA NA KCNH8 191538 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 19993428 19993925 19993635 Y KAT2B,RAB5A EFHB,RAB5A NA NA NA NA RAB5A 6857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 20190984 20191185 20191115 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 34599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr3 21623868 21623880 21623874 Y NA ZNF385D-AS1 NA NA NA NA ZNF385D-AS1 41560 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 21654380 21654503 21654471 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D-AS1 72072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr3 21722785 21723001 21722895 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D-AS1 140477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 22039046 22039346 22039196 Y NA NA NA NA NA NA ZNF385D 373466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 23431263 23431479 23431424 Y NA NA NA NA NA NA UBE2E2 188752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 23752138 23752437 23752199 Y NA NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 92957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 23787915 23788432 23788117 Y UBE2E1 NA UBE2E1,UBE2E2 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 56962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr3 23935594 23935945 23935770 Y NA RPL15,NR1D2 NA NA NA NA RPL15 20091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 24506233 24506581 24506477 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28192 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7,RNU1-96P NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr3 27707886 27708022 27707939 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 35419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 27984483 27984771 27984759 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA EOMES 222277 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 28029513 28029820 28029667 Y NA NA NA NA NA NA CMC1 251255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 28050894 28051260 28051082 Y EOMES,CMC1 NA NA NA NA NA CMC1 229815 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 28078428 28078736 28078583 Y ZCWPW2,EOMES NA NA NA NA NA CMC1 202339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 28534381 28534544 28534465 Y ZCWPW2 NA NA NA NA NA ZCWPW2 145744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 29568670 29568984 29568828 Y RBMS3 NA NA NA NA NA RBMS3 248197 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 31690891 31691368 31691073 Y ZNF860,OSBPL10 NA NA NA NA NA STT3B 118761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 31737462 31737733 31737598 Y NA NA NA NA NA NA STT3B 165332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 32002546 32002801 32002555 Y NA ZNF860 NA NA NA NA ZNF860 18462 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 32339022 32339260 32339142 Y NA NA NA NA NA NA CMTM8 60851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 32443431 32443555 32443473 Y CMTM7 CMTM7 NA NA NA NA CMTM7 12268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 32490271 32490322 32490297 Y NA NA NA NA NA NA CMTM6 52578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 32506024 32506133 32506068 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 36767 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 32822383 32822764 32822428 Y TRIM71 AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 2374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 32823053 32823413 32823146 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 1725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr3 32836613 32836654 32836634 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA AC139452.2 11475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 32857811 32858132 32857909 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.47671311027643 chr3 32863625 32863886 32863704 Y NA AC139452.2,TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 6115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 32877551 32877785 32877669 Y NA TRIM71 NA NA NA NA TRIM71 20041 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 33086079 33086426 33086309 Y CCR4 SEC13P1,TMPPE NA NA NA NA SEC13P1 12724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 33190938 33191178 33190994 Y NA CRTAP NA NA NA NA CRTAP 37467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 33436260 33436332 33436276 Y CLASP2,FBXL2,FBXL2 UBP1 NA NA NA NA UBP1 44531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 33590851 33591213 33591209 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 109988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 33619018 33619340 33619189 Y CLASP2 NA NA NA NA NA UBP1 138155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 36805780 36806178 36806113 Y NA NA NA NA NA NA EPM2AIP1 226617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 36999426 36999810 36999630 Y LRRFIP2,MLH1,MLH1,EPM2AIP1 EPM2AIP1,MLH1 EPM2AIP1,MLH1 K562 ChIA-PET 22265404 EPM2AIP1 32985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 37344922 37345358 37345096 Y NA NA NA NA NA NA AC097359.1 61236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 37733982 37734042 37734012 Y C3orf35,ITGA9 NA NA NA NA NA AC093415.2 167229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 37805955 37806276 37805982 Y ITGA9 NA NA NA NA NA AC093415.2 94995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 38144034 38144304 38144167 Y VILL,SLC22A14,OXSR1,MYD88 ACAA1,MYD88 NA NA NA NA ACAA1 32429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1 NA NA NA NA CSRNP1 28109 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 39446360 39446713 39446516 Y NA RPSA NA NA NA NA RPSA 180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 40491258 40491489 40491375 Y NA ENTPD3-AS1,RPL14 NA NA NA NA ENTPD3-AS1 1331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 40657038 40657268 40657076 Y NA EEF1GP3 ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 EEF1GP3 20053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 41757851 41758229 41758040 Y NA NA NA NA NA NA ULK4 243693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 42067110 42067525 42067205 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 13816 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 42078040 42078206 42078049 Y ULK4 TRAK1 TRAK1 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 24746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 42113196 42113588 42113376 Y CCK NA NA NA NA NA TRAK1 59902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 42220925 42221235 42221114 Y TRAK1 NA NA NA NA NA TRAK1 167631 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 42346278 42346550 42346414 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219I21.1 162582 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 42922564 42922793 42922612 Y C3orf39 NA NA NA NA NA HIGD1A 78541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 43458781 43458976 43458878 Y NA NA NA NA NA NA RP11-353H3.1 66396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 43557114 43557210 43557162 Y NA RP11-353H3.1 NA NA NA NA RP11-353H3.1 31742 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 44039694 44039852 44039755 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 MIR138-1 113852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 MIR138-1 112870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.42490759489728 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 44643970 44644223 44644141 Y ZNF445,ZNF660,ZNF35,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 19590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 45068504 45068742 45068611 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC3 52827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 45315271 45315676 45315515 Y SACM1L TMEM158 LARS2,CLEC3B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM158 49501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 46139244 46140413 46139465 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 NA CXCR6,FYCO1,CCR5,SACM1L,SLC6A20,CCR1,CCR3,CCRL2 IMR90 Hi-C 24141950 FYCO1 103928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 46224873 46225198 46225066 Y CCR5,CCRL2,CCRL2,CCR1 CCR1 NA NA NA NA CCR1 22689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA TDGF1,LRRC2 NA NA NA NA TDGF1 13826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 46671101 46671453 46671216 Y CCDC12,PRSS45 NA NA NA NA NA LRRC2 51512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47201175 47201471 47201342 Y CSPG5,SETD2 SETD2 NA NA NA NA SETD2 1986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47327082 47327178 47327130 Y NA KLHL18,KIF9 NA NA NA NA KIF9 4141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47466111 47466297 47466204 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 45610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 47845454 47845505 47845480 Y DHX30 SMARCC1,DHX30 NA NA NA NA DHX30 3055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 47991974 47992099 47992083 Y CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A NA NA NA NA NA MAP4 136670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr3 48128782 48129302 48129029 Y NA MAP4,RP11-1029M24.1 NA NA NA NA MAP4 13 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 48330483 48330839 48330661 Y PLXNB1 ZNF589,NME6 NA NA NA NA NME6 10336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 49123301 49123671 49123633 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2 NA NA NA NA QRICH1 6125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 49968490 49968553 49968522 Y NA MST1R,MON1A,RBM6 NA NA NA NA MON1A 2884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 50264852 50265230 50265012 Y TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 3128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 50370591 50370860 50370724 Y RBM6,SEMA3B,RASSF1 IFRD2,NAT6,HYAL3,HYAL1,HYAL2,TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA RASSF1 5551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 50411624 50411893 50411737 Y NA TUSC2,RASSF1,CYB561D2,NPRL2,TMEM115 NA NA NA NA TMEM115 16583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 51140543 51140838 51140691 Y NA NA NA NA NA NA MANF 279640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 51628881 51628909 51628894 Y GPR62 NA NA NA NA NA TEX264 65800 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52088878 52089257 52089156 Y ACY1,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52121101 52121264 52121190 Y NA DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 32535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52502448 52502781 52502494 Y ABHD14B,NISCH SEMA3G,TNNC1,NISCH NA NA NA NA NISCH 15314 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52590623 52590962 52590793 Y NA NT5DC2 NA NA NA NA NT5DC2 23553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 52704686 52705129 52704984 Y WDR82,GLYCTK,TMEM110,PRKCD,PBRM1 GNL3,PBRM1,SNORD69,SPCS1,GLT8D1 NA NA NA NA GNL3 8043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 53136597 53136930 53136874 Y PBRM1,PBRM1,TMEM110,DCP1A,PRKCD RFT1 NA NA NA NA RFT1 25548 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 53286308 53286764 53286678 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 1304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 53380883 53380907 53380896 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A DCP1A NA NA NA NA DCP1A 1229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 54461915 54462253 54462055 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 195989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 54662584 54662919 54662752 Y NA RPS15P5 NA NA NA NA RPS15P5 4342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 54675181 54675533 54675345 Y NA RPS15P5 NA NA NA NA RPS15P5 16939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 54725134 54725214 54725174 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 66892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 54734224 54734587 54734407 Y NA NA NA NA NA NA RPS15P5 75982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 55401949 55401987 55401976 Y NA NA CACNA2D3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS15P5 743707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 56665346 56665542 56665444 Y C3orf63 FAM208A NA NA NA NA FAM208A 49723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 56957686 56958168 56958064 Y CCDC66,C3orf63,ARHGEF3 NA NA NA NA NA ARHGEF3 153189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 57150916 57150929 57150923 Y NA ARHGEF3,RP11-157F20.1 NA NA NA NA RP11-157F20.1 15241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 57164609 57165207 57164899 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA RP11-157F20.1 963 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 57779621 57779638 57779630 Y FAM116A,SLMAP SLMAP NA NA NA NA SLMAP 40444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 57955527 57955938 57955800 Y FLNB FLNB FLNB,ARF4 IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 36189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 58163548 58163776 58163593 Y NA NA NA NA NA NA ABHD6 57457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 58411955 58412199 58412053 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 5385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 58469083 58469272 58469182 Y NA KCTD6 NA NA NA NA KCTD6 6569 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 58570984 58571306 58571233 Y PXK,FAM107A NA NA NA NA NA KCTD6 95143 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 59316034 59316229 59316222 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 282224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 59371498 59371574 59371525 Y NA NA FHIT IMR90 Hi-C 24141950 C3orf67 337688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 60360991 60361355 60361182 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 873778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 60654100 60654144 60654124 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 580989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 60715683 60716344 60716091 Y NA NA NA NA NA NA FHIT 518789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 61667893 61667951 61667922 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP6 58829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 62052710 62052952 62052831 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 249696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 62214246 62214436 62214339 Y NA NA NA NA NA NA C3orf14 88212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 62926615 62926793 62926705 Y CADPS LINC00698 NA NA NA NA LINC00698 7312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 63001437 63001612 63001507 Y NA NA NA NA NA NA LINC00698 67332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 63942094 63942115 63942105 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 65543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 64033481 64033828 64033688 Y NA PSMD6 PRICKLE2,LOC100652759,LOC100287879 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 25823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 64200446 64200649 64200513 Y NA NA NA NA NA NA PSMD6 192788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 64626762 64626883 64626823 Y ADAMTS9 ADAMTS9-AS2,ADAMTS9 NA NA NA NA ADAMTS9-AS2 41702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr3 65016570 65016819 65016695 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 344894 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 65744738 65744801 65744770 Y NA NA NA NA NA NA MAGI1 277708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 66021951 66022397 66022084 Y NA MAGI1 NA NA NA NA MAGI1 112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 66352729 66353141 66352903 Y SLC25A26 NA NA NA NA NA LRIG1 196546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 66467141 66467203 66467172 Y LRIG1 NA NA NA NA NA LRIG1 82484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 66546176 66546348 66546214 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 3339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 66549724 66550124 66549864 Y NA LRIG1 NA NA NA NA LRIG1 37 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 69135158 69135511 69135504 Y NA TMF1,UBA3,ARL6IP5 NA NA NA NA ARL6IP5 3063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 71293394 71293605 71293527 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 337535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 71465988 71466289 71466193 Y NA NA NA NA NA NA FOXP1 164851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 71664332 71664660 71664495 Y EIF4E3 FOXP1 FOXP1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP1 33192 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 71772738 71773033 71772981 Y PROK2,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3 GPR27,EIF4E3 NA NA NA NA GPR27 28168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 72322807 72323018 72322913 Y NA LINC00877 RYBP,SHQ1,LOC201617 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00877 33091 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 72386025 72386536 72386317 Y NA NA SHQ1,GXYLT2,RYBP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00877 96309 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 72742209 72742242 72742224 Y NA NA LOC201617,PROK2,RYBP IMR90 Hi-C 24141950 SHQ1 166823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 72862614 72863000 72862807 Y SHQ1 SHQ1 NA NA NA NA SHQ1 46065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 72977666 72978074 72977791 Y RYBP GXYLT2,FTH1P23 NA NA NA NA FTH1P23 1471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 77239163 77239286 77239225 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 757994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 77273270 77273652 77273462 Y ROBO2,ROBO2 NA NA NA NA NA RP11-550F7.1 792101 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 78934560 78934824 78934693 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 880141 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 79013956 79013976 79013966 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 800989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 85120525 85120655 85120534 Y CADM2 NA NA NA NA NA CADM2 114393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 85318532 85318917 85318639 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 312400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 85930839 85930993 85930916 Y NA NA NA NA NA NA CADM2 924707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 87101402 87101690 87101545 Y NA NA NA NA NA NA VGLL3 63133 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 88255753 88255858 88255769 Y HTR1F NA NA NA NA NA CGGBP1 58718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 88367245 88367614 88367269 Y NA ABCF2P1 NA NA NA NA ABCF2P1 2939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 89163442 89163800 89163560 Y NA EPHA3 NA NA NA NA EPHA3 8768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA EPHA6 194756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 99749892 99750279 99749982 Y NA NA NA NA NA NA FILIP1L 81078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 99764609 99765000 99764644 Y FILIP1L,C3orf26 NA TMEM30C IMR90 Hi-C 24141950 FILIP1L 66357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 100054250 100054545 100054496 Y NA NIT2 NA NA NA NA NIT2 2705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr3 100244695 100244934 100244873 Y NA TMEM45A NA NA NA NA TMEM45A 35232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 101424395 101424716 101424556 Y NA ZBTB11,RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 16053 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 101444542 101444901 101444615 Y FAM55C,FAM55C,CEP97 RPL24,CEP97 NA NA NA NA CEP97 3773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 101592355 101592794 101592687 Y NFKBIZ,NFKBIZ NFKBIZ NA NA NA NA NFKBIZ 47520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 104155776 104156155 104156140 Y NA NA NA NA NA NA ALCAM 927598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 105072818 105073679 105072925 Y ALCAM ALCAM NA NA NA NA ALCAM 10074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 106984184 106984525 106984343 Y NA LINC00883 NA NA NA NA LINC00883 26645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 107348544 107348833 107348648 Y NA NA NA NA NA NA BBX 108761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 107503481 107503523 107503501 Y NA NA NA NA NA NA BBX 263698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 107504411 107504731 107504449 Y NA NA NA NA NA NA BBX 264628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 107711874 107712477 107712307 Y CD47 NA MYH15,CD47,LOC285205,IFT57,HHLA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 95395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 107803224 107803878 107803522 Y NA CD47 NA NA NA NA CD47 3994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 109074614 109074989 109074804 Y NA DPPA4 NA NA NA NA DPPA4 20195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 111289781 111290083 111289847 Y CD96 NA NA NA NA NA PLCXD2 101440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 111454124 111454225 111454190 Y C3orf52,PHLDB2 PHLDB2 NA NA NA NA PHLDB2 4780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112022774 112023041 112022831 Y NA RP11-90K6.1,CD200 CD200,BTLA,ATG3,SLC35A5,C3orf52 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-90K6.1 3449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 112258715 112258936 112258847 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 19620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112351265 112351470 112351440 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 14907 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112362530 112362627 112362586 Y NA CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 3750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112390838 112391135 112390988 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 24461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 112404368 112404581 112404378 Y CCDC80 CCDC80 NA NA NA NA CCDC80 37991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112436805 112436974 112436889 Y NA NA CD200R1 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC80 70428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 112866931 112867023 112866972 Y BOC NA BOC,WDR52 IMR90 Hi-C 24141950 BOC 60827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 112960908 112961353 112961141 Y NA BOC NA NA NA NA BOC 33058 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 113078924 113079182 113079053 Y NA NA NA NA NA NA BOC 151074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 113254837 113255012 113254902 Y NA SPICE1 NA NA NA NA SPICE1 22803 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 113416036 113416177 113416128 Y SIDT1 KIAA2018,NAA50,ATP6V1A NA NA NA NA KIAA2018 2543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 113701770 113701838 113701802 Y KIAA1407,DRD3,ZDHHC23 QTRTD1 NA NA NA NA QTRTD1 20842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 115231466 115231705 115231586 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 108466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 115345321 115345682 115345589 Y GAP43 GAP43 NA NA NA NA GAP43 5150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 163092 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 115831620 115831831 115831726 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 491449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 115843003 115843038 115843021 Y NA NA NA NA NA NA GAP43 502832 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 118626838 118627009 118626961 Y NA NA NA NA NA NA IGSF11 235906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 119147570 119147724 119147648 Y NA TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 37953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 119237356 119237846 119237595 Y ARHGAP31,COX17,CD80,ADPRH,TMEM39A,POGLUT1 TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 21977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 119238487 119238668 119238501 Y NA TIMMDC1 NA NA NA NA TIMMDC1 23108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 119315385 119315520 119315495 Y TMEM39A,POGLUT1,CD80,ADPRH,COX17 ADPRH,RP11-190C22.1 NA NA NA NA ADPRH 19270 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 120277715 120278240 120277932 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 34916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 120279186 120279582 120279384 Y NA NDUFB4 FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB4 33574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 120397505 120397688 120397597 Y NA HGD NA NA NA NA HGD 1730 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 120463141 120463503 120463258 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 3301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 120493479 120494008 120493729 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33639 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA RPL7AP11,POLQ,ARGFX NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 121450275 121450346 121450335 Y NA GOLGB1 NA NA NA NA GOLGB1 16256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 121520314 121520680 121520641 Y NA IQCB1,EAF2 NA NA NA NA IQCB1 31246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 121798487 121798500 121798494 Y PARP9,PARP9,PARP9,DTX3L,CD86,CD86 NA NA NA NA NA CSTA 243591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18214 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 122787344 122787648 122787385 Y SEMA5B,PDIA5 SEMA5B,PDIA5 NA NA NA NA PDIA5 3435 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 123241172 123241525 123241376 Y NA NA NA NA NA NA PTPLB 60507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 123263878 123263964 123263921 Y ADCY5,ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA PTPLB 38068 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 123304962 123305362 123305193 Y PTPLB PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 2573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 123355394 123355731 123355464 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 53005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 123358215 123358608 123358268 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 55826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 123372011 123372488 123372368 Y MYLK NA NA NA NA NA MYLK-AS1 69622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 123662416 123662605 123662519 Y NA CCDC14 NA NA NA NA CCDC14 15959 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 124188163 124188429 124188181 Y NA NA NA NA NA NA UMPS 258784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 124405648 124406018 124405665 Y NA UMPS UMPS IMR90 Hi-C 24141950 UMPS 41195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 125200225 125200611 125200423 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 36430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 125235229 125235600 125235483 Y NA SNX4 NA NA NA NA SNX4 1441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 125709142 125709481 125709414 Y ZXDC,CCDC37 NA NA NA NA NA FAM86JP 75679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr3 125712652 125712829 125712741 Y NA NA NA NA NA NA FAM86JP 79189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 126074775 126075511 126074965 Y ALDH1L1,UROC1,CCDC37,KLF15 KLF15 NA NA NA NA KLF15 490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 126108107 126108472 126108304 Y NA KLF15 KLF15,CCDC37,ALDH1L1 IMR90 Hi-C 24141950 KLF15 33822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 126702933 126703224 126703109 Y NA NA CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CHCHD6 281870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 127266508 127266786 127266647 Y KBTBD12 MCM2,TPRA1 CHCHD6 IMR90 Hi-C 24141950 MCM2 48280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 128446542 128446927 128446583 Y NA RPN1,RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA RAB7A 3577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 128573463 128573773 128573618 Y DNAJB8,C3orf27 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 22666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 128589304 128589705 128589400 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 6734 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA KIAA1257 NA NA NA NA KIAA1257 26306 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr3 128831103 128831496 128831287 Y NA RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 8148 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 128837764 128838022 128837873 Y MBD4,H1FX,C3orf37,C3orf37,KIAA1257,ISY1,CNBP,RAB43,RAB43,RAB43,RAB43 RAB43,ISY1-RAB43,ISY1 NA NA NA NA RAB43 1622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 128958880 128959235 128959095 Y H1FOO NA KIAA1257,CCDC48,GP9,ISY1-RAB43,CNBP,COPG1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CNBP 58115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 129245456 129245718 129245564 Y RHO NA NA NA NA NA PLXND1 77943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 129346331 129346490 129346427 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 22670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 129690304 129690667 129690526 Y H1FOO TRH NA NA NA NA TRH 481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 130073130 130073578 130073320 Y ATP2C1 NA NA NA NA NA ALG1L2 274456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 130637982 130638444 130638066 Y NA NA NA NA NA NA ATP2C1 70543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 131056791 131057139 131056963 Y NA NUDT16P1,NUDT16 NA NA NA NA NUDT16P1 21603 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 132164768 132165015 132164817 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 30398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 133596347 133596652 133596615 Y NA RAB6B NA NA NA NA RAB6B 16028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 133686653 133686998 133686826 Y SLCO2A1,C3orf36 NA NA NA NA NA RAB6B 73973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 134181248 134181600 134181434 Y NA CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 20985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 134182898 134183261 134183039 Y AMOTL2 CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 19324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 135827453 135827844 135827484 Y PPP2R3A NA NA NA NA NA MSL2 86239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 135890782 135891068 135890882 Y NA MSL2 NA NA NA NA MSL2 23015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 136327517 136327655 136327647 Y NA NA NA NA NA NA STAG1 141565 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 136631651 136631818 136631718 Y NA IL20RB NA NA NA NA IL20RB 31254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 138581550 138581663 138581597 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 138581757 138582253 138582041 Y NA PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 29977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 138582294 138582582 138582441 Y MRPS22 PIK3CB PIK3CB IMR90 Hi-C 24141950 PIK3CB 30514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr3 140814051 140814257 140814186 Y NA SPSB4 NA NA NA NA SPSB4 45807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 141230074 141230471 141230125 Y NA RASA2 NA NA NA NA RASA2 26185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 141482175 141482451 141482314 Y NA RNF7 NA NA NA NA RNF7 27129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 141746457 141746834 141746789 Y NA RP11-343B5.1 NA NA NA NA RP11-343B5.1 14206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 146224364 146224853 146224698 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 35798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 148704982 148705163 148705084 Y NA GYG1 HLTF,GYG1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GYG1 1965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 149151278 149151442 149151363 Y NA NA GYG1,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TM4SF1 57626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 149356424 149356747 149356622 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 95754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr3 149665014 149665210 149665089 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 18962 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 149668313 149668642 149668480 Y NA ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 15530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 149865143 149865465 149865344 Y NA NA RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2 IMR90 Hi-C 24141950 PFN2 98568 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 149933925 149934322 149934006 Y NA NA PFN2,RNF13,TSC22D2,LOC646903,ANKUB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFN2 167350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 150329194 150329427 150329421 Y NA SELT,SERP1 NA NA NA NA SERP1 10179 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 150901273 150901442 150901358 Y GPR171 NA NA NA NA NA MED12L 99789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 151016558 151016712 151016648 Y MED12L,P2RY12,GPR87 NA NA NA NA NA MED12L 215074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 151064162 151064557 151064224 Y P2RY14,P2RY13 NA NA NA NA NA MED12L 262678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 152026905 152027295 152026911 Y NA MBNL1-AS1 NA NA NA NA MBNL1-AS1 41561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 154995929 154996300 154996117 Y NA PABPC1P10 NA NA NA NA PABPC1P10 29296 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 156442773 156442811 156442792 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 52606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 156822906 156823344 156823241 Y NA NA NA NA NA NA CCNL1 53205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 157248921 157249245 157249148 Y NA NA C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1 IMR90 Hi-C 24141950 PTX3 96343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 158226530 158226854 158226539 Y NA NA NA NA NA NA MLF1 60098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 158447066 158447110 158447086 Y NA MFSD1 NA NA NA NA MFSD1 877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 158528713 158528852 158528755 Y MFSD1 NA NA NA NA NA MFSD1 80726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 160949185 160949470 160949344 Y OTOL1 NA NA NA NA NA B3GALNT1 128013 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 167699117 167699438 167699278 Y NA NA NA NA NA NA GOLIM4 112325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 168939202 168939471 168939359 Y NA NA NA NA NA NA MECOM 439935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 169376858 169377055 169376957 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 2351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 169377431 169377952 169377740 Y NA MECOM NA NA NA NA MECOM 1454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 169379063 169379412 169379208 Y MECOM NA NA NA NA NA MECOM 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 171816708 171816982 171816800 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 61290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 171856568 171857271 171856877 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 101150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 171897555 171897878 171897648 Y NA NA NA NA NA NA FNDC3B 142137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 171948409 171948713 171948561 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 192991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 172418207 172418359 172418236 Y NA NCEH1,ECT2 NA NA NA NA NCEH1 8649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 173650294 173650720 173650491 Y NA NA NA NA NA NA RP11-393N4.2 442314 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 176774167 176774584 176774367 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 138677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 176862590 176862993 176862904 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 50268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 176912879 176913389 176913098 Y NA NA NA NA NA NA TBL1XR1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr3 177038616 177038888 177038742 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 125355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 177076157 177076922 177076435 Y TBL1XR1 NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 162896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 177077500 177078084 177077832 Y NA NA TBL1XR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBL1XR1 164239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 177234134 177234201 177234168 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 320873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 177472457 177472684 177472465 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 559196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 177623981 177624160 177624047 Y NA NA TBL1XR1 IMR90 Hi-C 24141950 TBL1XR1 710720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 178532692 178532946 178532777 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT3 255121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 179049621 179049719 179049674 Y NA ZNF639,MFN1 NA NA NA NA ZNF639 10842 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 179122098 179122379 179122239 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 44999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 179182237 179182507 179182372 Y NA GNB4 GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 GNB4 14859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 179244857 179244994 179244926 Y NA ACTL6A GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 33674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 179372057 179372188 179372123 Y NA USP13 NA NA NA NA USP13 3514 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 180351499 180351797 180351692 Y NA TTC14 NA NA NA NA TTC14 33581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 180475891 180475917 180475905 Y NA NA NA NA NA NA FXR1 108012 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 181035769 181036114 181035791 Y SOX2,DNAJC19,DNAJC19 NA NA NA NA NA DNAJC19 330207 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 181329651 181329904 181329778 Y NA NA NA NA NA NA SOX2 97810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 181367894 181368046 181367970 Y SOX2 NA NA NA NA NA SOX2 59668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 181414061 181414442 181414162 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 13272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 181418145 181418802 181418404 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 8912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 181419160 181419816 181419173 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 7898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr3 181442269 181442851 181442522 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 14555 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.11058667866767 chr3 181443678 181444149 181443742 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 15964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 181444404 181445128 181444694 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 16690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.95342622055287 chr3 181456298 181456477 181456331 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 28584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 181473928 181474194 181474085 Y NA SOX2 NA NA NA NA SOX2 46214 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 181474374 181474552 181474521 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 46660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 181474625 181474969 181474797 Y SOX2 SOX2 NA NA NA NA SOX2 46911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 182285595 182285736 182285666 Y NA NA NA NA NA NA ATP11B 223552 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 182550667 182550775 182550721 Y ATP11B ATP11B NA NA NA NA ATP11B 41379 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 182825824 182825958 182825903 Y NA MCCC1 NA NA NA NA MCCC1 5905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 183079075 183079309 183079198 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L2 65257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 183250743 183250943 183250799 Y HTR3D,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 100413 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr3 183251473 183251828 183251763 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 99528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 183252064 183252271 183252179 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA KLHL24 99085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 183540580 183540709 183540668 Y MCF2L2,ECE2,CAMK2N2,ABCC5,MAP6D1 MAP6D1 NA NA NA NA MAP6D1 673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 184560038 184560430 184560098 Y VPS8 VPS8 NA NA NA NA VPS8 32107 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 184727770 184727947 184727859 Y NA NA NA NA NA NA C3orf70 140855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 185463229 185463551 185463382 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 77293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 185482318 185482647 185482554 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP2 58197 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 186606472 186606663 186606569 Y ST6GAL1,RTP4 RPS20P14,ST6GAL1 NA NA NA NA RPS20P14 9324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 186745346 186745889 186745388 Y TBCCD1,EIF4A2,RTP4,ST6GAL1 NA NA NA NA NA ST6GAL1 99072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 186784569 186784773 186784671 Y NA NA NA NA NA NA RPL39L 111923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 186884514 186884521 186884518 Y RTP1 RPL39L NA NA NA NA RPL39L 12175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 186892076 186892095 186892086 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 4601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 186901070 186901277 186901226 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 4374 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr3 186903601 186903921 186903764 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 6905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 186926447 186926523 186926484 Y NA RPL39L NA NA NA NA RPL39L 29751 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 187004502 187004623 187004526 Y MASP1 NA NA NA NA NA RPL39L 107806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 187467867 187468249 187468141 Y BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 6352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr3 187891343 187891657 187891500 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 21498 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 187901313 187901616 187901372 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 31468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 187984257 187984703 187984570 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 114412 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 188065570 188065751 188065619 Y NA NA NA NA NA NA LPP-AS2 195725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 188291512 188291633 188291575 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 371795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 188953015 188953026 188953020 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 289587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 189134489 189134632 189134561 Y TP63 NA NA NA NA NA TP63 212573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 189508534 189508810 189508672 Y TP63 NA NA NA NA NA TP63 161329 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 189524070 189524362 189524216 Y NA NA NA NA NA NA TP63 176865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 189794828 189795104 189794939 Y NA LEPREL1 NA NA NA NA LEPREL1 43122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 190956161 190956506 190956333 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 88360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 191620991 191621297 191621143 Y PYDC2 NA NA NA NA NA CCDC50 576125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 191873125 191873377 191873252 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 760573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 191884950 191884967 191884959 Y FGF12 NA NA NA NA NA MB21D2 748983 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194210438 194211060 194210799 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 NA NA NA NA ATP13A3 6033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194360985 194361172 194361065 Y NA TMEM44,LSG1,FAM43A NA NA NA NA TMEM44 8567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194706106 194706403 194706255 Y NA NA LOC100507391,XXYLT1,LSG1,PPP1R2,FAM43A,ACAP2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 XXYLT1 283493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194820742 194820949 194820800 Y PPP1R2,ACAP2 NA NA NA NA NA XXYLT1 168947 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 194826238 194826399 194826316 Y FAM43A NA NA NA NA NA XXYLT1 163497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 194882926 194883249 194883145 Y FAM43A NA NA NA NA NA XXYLT1 106647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 195034615 195034891 195034753 Y NA XXYLT1 NA NA NA NA XXYLT1 44719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 195633702 195634304 195633876 Y ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2 TNK2 NA NA NA NA TNK2 2512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 195906363 195907075 195906446 Y UBXN7,RNF168,LRRC33,TNK2,PCYT1A NA NA NA NA NA TFRC 99303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 196208308 196208582 196208445 Y NA RNF168 NA NA NA NA RNF168 20057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 196347011 196347384 196347194 Y PCYT1A,RNF168,SENP5,LRRC33 LINC01063,PIGX WDR53,FBXO45,SENP5,UBXN7,LRRC33 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01063 10074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr3 196635737 196635948 196635847 Y UBXN7,RNF168,CEP19,PIGX,PAK2,SENP5 SENP5,NCBP2 NA NA NA NA NCBP2 31520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr3 197247664 197248059 197247722 Y NA NA NA NA NA NA BDH1 50135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr3 197478210 197478491 197478305 Y IQCG,KIAA0226,FYTTD1,FYTTD1,LRCH3 FYTTD1,KIAA0226,LRCH3 NA NA NA NA KIAA0226 3612 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 257243 257573 257339 Y PDE6B ZNF732 NA NA NA NA ZNF732 39537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 330052 330352 330160 Y NA ZNF732,ZNF141 NA NA NA NA ZNF141 449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 751950 752022 752014 Y NA RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 21615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 1237849 1238004 1237927 Y NA SPON2,CTBP1,MAEA NA NA NA NA CTBP1 3737 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 1339592 1340250 1339850 Y NA NA NA NA NA NA MAEA 57953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 1843900 1844033 1843967 Y NA LETM1,WHSC1 NA NA NA NA LETM1 11941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 2415721 2415975 2415729 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 2415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 2538945 2539718 2539367 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 76998 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr4 2764467 2764789 2764630 Y LOC402160 TNIP2,SH3BP2 TNIP2,NOP14-AS1,NOP14,MFSD10 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TNIP2 8364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 3228357 3228568 3228469 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,RGS12 NA NA NA NA NA RGS12 64187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 3357519 3357800 3357660 Y NA NA NA NA NA NA RGS12 64764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 3391112 3391254 3391201 Y RGS12 NA NA NA NA NA DOK7 71779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 3931557 3931999 3931672 Y NA FAM86EP NA NA NA NA FAM86EP 23147 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 4272259 4272533 4272507 Y ZBTB49 TMEM128,LYAR,ZBTB49 NA NA NA NA LYAR 17363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 4577048 4577566 4577357 Y NA STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 34975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 4692859 4693117 4692937 Y NA NA NA NA NA NA STX18 150786 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 JAKMIP1,WFS1 NA NA NA NA JAKMIP1 23303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA PPP2R2C,MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 6785099 6785509 6785391 Y TBC1D14,TBC1D14,TADA2B,KIAA0232 KIAA0232 NA NA NA NA KIAA0232 3997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr4 6909761 6910075 6909918 Y NA TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 6920106 6920340 6920183 Y MAN2B2,S100P,KIAA0232,TADA2B,GRPEL1,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 11137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 6928884 6929127 6929009 Y KIAA0232,TBC1D14,TBC1D14 TBC1D14 NA NA NA NA TBC1D14 19915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 7315145 7315541 7315360 Y SORCS2 NA NA NA NA NA SORCS2 122880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 7877911 7878253 7878055 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 61400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 7962509 7962775 7962724 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 22856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 7973730 7974208 7973960 Y NA AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 34077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 8119010 8119317 8119178 Y ABLIM2 ABLIM2 NA NA NA NA ABLIM2 39242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 9154755 9155069 9154900 Y NA FAM86KP NA NA NA NA FAM86KP 1733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr4 9693091 9693174 9693121 Y NA NA NA NA NA NA WDR1 423399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 10182011 10182277 10182105 Y WDR1 NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 65438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 11198457 11198540 11198499 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 169911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 12642016 12642195 12642111 Y NA RP11-352E6.2 NA NA NA NA RP11-352E6.2 1755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 13250215 13250573 13250395 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 82465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 13282552 13282692 13282688 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AB2P 50346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 13484540 13485001 13484899 Y NA RAB28 NA NA NA NA RAB28 551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 13486596 13486918 13486821 Y BOD1L,RAB28 RAB28 NA NA NA NA RAB28 2607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 15297006 15297030 15297019 Y NA NA C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 CC2D2A 172459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 15485746 15486124 15486037 Y CC2D2A CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 16257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 15488697 15488958 15488934 Y NA CC2D2A NA NA NA NA CC2D2A 19208 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 15594702 15595080 15594956 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 86205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 15596739 15596980 15596942 Y NA NA NA NA NA NA FAM200B 84305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 16003610 16004023 16003987 Y NA FGFBP2 NA NA NA NA FGFBP2 34678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr4 16750260 16750546 16750403 Y LDB2 NA NA NA NA NA LDB2 147886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 16892563 16892848 16892840 Y LDB2 LDB2 NA NA NA NA LDB2 5584 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 16898557 16898776 16898740 Y NA LDB2 NA NA NA NA LDB2 125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 17483580 17483992 17483821 Y QDPR,CLRN2 QDPR NA NA NA NA QDPR 27865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 20627000 20627372 20627197 Y NA NA NA NA NA NA PACRGL 68533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 23879721 23879980 23879976 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 23732 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 24079320 24079729 24079712 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 175608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 24227575 24227894 24227795 Y NA NA PPARGC1A IMR90 Hi-C 24141950 PPARGC1A 323863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 24332761 24333117 24332939 Y NA NA NA NA NA NA DHX15 251056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 24471602 24472014 24471897 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 112159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 24472474 24473298 24472910 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 110875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 24474307 24474984 24474891 Y NA NA PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS IMR90 Hi-C 24141950 DHX15 109189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 24579124 24579339 24579231 Y NA DHX15 NA NA NA NA DHX15 4834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 24660007 24660225 24660117 Y NA ATP5LP3 CCDC149,MIR573 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5LP3 2009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 25175369 25175577 25175408 Y NA SEPSECS,PI4K2B NA NA NA NA PI4K2B 15106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 25881877 25882168 25881954 Y RBPJ,SLC34A2,SEL1L3 SEL1L3 C4orf52,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 18495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 25972032 25972237 25972135 Y NA NA RBPJ,C4orf52,TBC1D19,STIM2,SEL1L3 IMR90 Hi-C 24141950 SEL1L3 108650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 26031795 26032283 26031985 Y NA NA RBPJ,TBC1D19,STIM2 IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 130794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 26240784 26241159 26240972 Y NA NA RBPJ IMR90 Hi-C 24141950 RBPJ 77707 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 26278028 26278101 26278065 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 114951 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 26338276 26338542 26338322 Y NA NA NA NA NA NA RBPJ 175199 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 28621646 28621809 28621725 Y NA NA NA NA NA NA RP11-293A21.1 1761425 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 30718904 30719447 30718947 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 30719661 30720023 30719741 Y PCDH7,PCDH7 PCDH7 NA NA NA NA PCDH7 14 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 36270620 36271063 36270847 Y ARAP2,DTHD1,DTHD1 NA NA NA NA NA C4orf19 1182500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 38525630 38525737 38525685 Y NA NA FLJ13197,KLF3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF3 138080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 38607589 38607693 38607690 Y NA NA NA NA NA NA KLF3 56124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 7536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 39894546 39894889 39894718 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 82687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40050527 40050740 40050634 Y NA N4BP2 NA NA NA NA N4BP2 5706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40056293 40056591 40056356 Y NA NA NA NA NA NA N4BP2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40564357 40564512 40564451 Y RBM47 NA NA NA NA NA RBM47 66380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40628320 40628499 40628391 Y NA RBM47 NA NA NA NA RBM47 2393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40674578 40674731 40674666 Y RBM47 RBM47 RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 43686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 40674929 40675349 40675137 Y RBM47 RBM47 RBM47 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM47 44037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40765283 40765623 40765452 Y RBM47 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 15369 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 40943410 40943552 40943502 Y NA NA NA NA NA NA NSUN7 193496 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 41434914 41435283 41435075 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 75290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 54568898 54569145 54569018 Y CHIC2 RP11-317M11.1 SCFD2,LNX1,PDGFRA,FIP1L1,RPL21P44,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-317M11.1 45523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 54871626 54871896 54871863 Y NA NA NA NA NA NA CHIC2 56961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 55080110 55080272 55080192 Y CHIC2 PDGFRA SCFD2,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2,PDGFRA IMR90 Hi-C 24141950 PDGFRA 12992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 55405838 55406147 55405887 Y KIT NA NA NA NA NA KIT 115938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 55501453 55501772 55501575 Y KIT KIT NA NA NA NA KIT 20313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 56453376 56453745 56453528 Y NA CLOCK,NMU NA NA NA NA CLOCK 42071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 57254661 57255026 57254688 Y CEP135 RPL7AP31,AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA AASDH 2995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 57459098 57459424 57459263 Y NA NA NA NA NA NA RPL17P20 114802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 57740482 57740676 57740556 Y PPAT,REST REST THEGL,SPINK2 IMR90 Hi-C 24141950 REST 31399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr4 57940962 57941225 57941094 Y NA IGFBP7 NA NA NA NA IGFBP7 33326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 62495437 62495478 62495458 Y NA NA NA NA NA NA RP11-621K7.1 144090 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 62617840 62617863 62617852 Y NA RP11-621K7.1 NA NA NA NA RP11-621K7.1 21705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr4 65475793 65476032 65475913 Y NA NA NA NA NA NA RP11-204H9.2 181166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 68266370 68266649 68266476 Y NA RP11-584P21.4 NA NA NA NA RP11-584P21.4 43336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 68487662 68488005 68487834 Y NA NA NA NA NA NA UBA6 76892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 69271604 69271998 69271802 Y NA TMPRSS11E NA NA NA NA TMPRSS11E 39169 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 71677284 71677574 71677429 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 26088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 71695000 71695080 71695041 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 8582 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 73673744 73673875 73673808 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS3 241228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 74982637 74982975 74982882 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L MTHFD2L RASSF6,IL8,CXCL3,MTHFD2L,PF4,PPBPL2 IMR90 Hi-C 24141950 MTHFD2L 4746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 75096380 75097063 75096677 Y IL8,CXCL3,CXCL2,EREG,MTHFD2L NA NA NA NA NA MTHFD2L 118489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 75556698 75556816 75556809 Y EREG NA EREG,MTHFD2L IMR90 Hi-C 24141950 PARM1 299489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 75945312 75945392 75945352 Y PARM1 NA NA NA NA NA PARM1 89007 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 76487136 76487403 76487267 Y NA THAP6,RCHY1,C4orf26 NA NA NA NA C4orf26 7878 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 77041502 77041599 77041551 Y NA NUP54 NA NA NA NA NUP54 26069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 77366246 77366349 77366298 Y NA SHROOM3 NA NA NA NA SHROOM3 11993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 77468225 77468282 77468244 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 113972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 77500789 77501039 77500904 Y NA NA NA NA NA NA SHROOM3 146536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 77511406 77511861 77511558 Y ANKRD56,SHROOM3 NA NA NA NA NA SHROOM3 157153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr4 77665499 77665596 77665548 Y STBD1,SEPT11 NA NA NA NA NA SEPT11 203260 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 78842671 78842943 78842808 Y NA NA NA NA NA NA MRPL1 60997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 78977894 78978171 78977912 Y FRAS1 FRAS1 NA NA NA NA FRAS1 1170 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 79859042 79859275 79859190 Y PAQR3 PAQR3 NA NA NA NA PAQR3 450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 83755588 83755973 83755970 Y NA SCD5 NA NA NA NA SCD5 37578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 84140527 84140710 84140595 Y THAP9,HPSE,HPSE,HPSE,COQ2,AGPAT9,PLAC8 NA PLAC8,COPS4,COQ2 IMR90 Hi-C 24141950 COQ2 63357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 84773321 84773491 84773400 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 318254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 84934181 84934545 84934426 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT9 479114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr4 85799806 85800014 85799906 Y NA NA NA NA NA NA WDFY3-AS2 85524 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 85868944 85869302 85869263 Y NA WDFY3-AS2,WDFY3 NA NA NA NA WDFY3-AS2 16236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 87247978 87248308 87248143 Y MAPK10 NA NA NA NA NA MAPK10 264976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 87882810 87883321 87882982 Y KLHL8,AFF1,AFF1 AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 13534 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 87920181 87920277 87920229 Y NA NA NA NA NA NA TECRP1 50905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 87932880 87932928 87932888 Y AFF1,AFF1 NA NA NA NA NA TECRP1 63604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr4 88441557 88441872 88441810 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 99823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 88899947 88900287 88900059 Y NA SPP1,RNU1-36P,PKD2 NA NA NA NA SPP1 5128 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 89377235 89377564 89377513 Y HERC6,HERC5 HERC5 NA NA NA NA HERC5 967 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 89747458 89747948 89747469 Y NA NA NA NA NA NA FAM13A 282601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 91049597 91049943 91049669 Y FAM190A NA NA NA NA NA SNCA 292131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 91453996 91454262 91454133 Y NA NA NA NA NA NA SNCA 696530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr4 93104192 93104578 93104286 Y NA NA NA NA NA NA GRID2 118972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 93226334 93226694 93226354 Y GRID2 GRID2 NA NA NA NA GRID2 2784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 93226746 93226922 93226838 Y GRID2 GRID2 NA NA NA NA GRID2 3196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.52851862565559 chr4 93681530 93681802 93681581 Y NA NA NA NA NA NA GRID2 457980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr4 93695522 93695754 93695563 Y GRID2 NA NA NA NA NA GRID2 471972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 95373822 95374139 95373960 Y PDLIM5 PDLIM5 NA NA NA NA PDLIM5 2785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 99124941 99125231 99125094 Y RAP1GDS1 NA RAP1GDS1 IMR90 Hi-C 24141950 RAP1GDS1 55304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 99319477 99319794 99319573 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GDS1 138942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 99937707 99938078 99937893 Y NA METAP1 NA NA NA NA METAP1 22936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 103788773 103788886 103788830 Y NA RP11-10L12.4,UBE2D3,CISD2 NA NA NA NA CISD2 638 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 103937289 103937350 103937320 Y NA NA NA NA NA NA SLC9B2 67636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 104302340 104302484 104302413 Y NA NA NA NA NA NA CENPE 184774 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 107780277 107780572 107780473 Y NA NA NA NA NA NA TBCK 539625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 108126643 108126821 108126718 Y NA NA NA NA NA NA PAPSS1 512787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 109276862 109276989 109276899 Y CYP2U1,LEF1,LEF1 NA LOC641518 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34-AS1 262627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 109318263 109318610 109318312 Y NA NA NA NA NA NA RPL34-AS1 221006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 111114926 111115298 111115104 Y GAR1,ELOVL6,ELOVL6 RP11-115A14.1,ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 3057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr4 111116750 111117174 111116883 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 1181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr4 112814304 112814659 112814583 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 249894 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 113181018 113181306 113181029 Y AP1AR,TIFA AP1AR,ALPK1,TIFA NA NA NA NA ALPK1 23359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 113572868 113573168 113573031 Y NA LARP7,C4orf21,MIR302A,MIR302C,MIR302B NA NA NA NA MIR302B 3661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 9.69265473167976 chr4 113668186 113668486 113668348 Y NA RP11-148B6.2,RP11-119H12.1,RPL7AP30 NA NA NA NA RP11-119H12.1 10358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 113797634 113797869 113797752 Y NEUROG2,ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 60369 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 113985460 113985726 113985592 Y NA NA NA NA NA NA ANK2 248195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 114023484 114023505 114023495 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA ANK2 286219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 114104327 114104616 114104364 Y ANK2,ANK2 NA NA NA NA NA RNU1-138P 234863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 114369024 114369155 114369101 Y NA RNU1-138P NA NA NA NA RNU1-138P 29545 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 115371462 115371746 115371604 Y NA NA NA NA NA NA UGT8 145865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 119115424 119115493 119115457 Y NA NA NA NA NA NA SNHG8 82371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 132804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 120458820 120459280 120459019 Y PDE5A,PDE5A,PDE5A NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 84874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 121812608 121812671 121812657 Y NA PRDM5 NA NA NA NA PRDM5 29354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 122609803 122610189 122610094 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 6079 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 123074024 123074337 123074286 Y KIAA1109,IL21,IL2 KIAA1109 KIAA1109 K562 ChIA-PET 22265404 KIAA1109 2536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 123704519 123704897 123704616 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40966 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 123705556 123705703 123705648 Y NA FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 124621616 124621886 124621708 Y NA NA NA NA NA NA SPRY1 305666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 127966730 127967007 127966867 Y NA NA NA NA NA NA INTU 575419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 128894970 128895372 128895225 Y NA C4orf29,MFSD8 NA NA NA NA MFSD8 9820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 128990801 128990842 128990822 Y NA LARP1B NA NA NA NA LARP1B 10378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 129275726 129275798 129275762 Y NA NA PHF17,LARP1B,SCLT1,C4orf33,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-420A23.1 63820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 129438976 129439122 129439055 Y NA NA PHF17,LARP1B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-184M15.1 50564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 129605409 129605648 129605529 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184M15.1 115723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 129609627 129610025 129609830 Y NA NA PHF17 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-184M15.1 119941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 129733811 129733921 129733891 Y NA NA NA NA NA NA RP11-184M15.1 244125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 129965980 129966229 129966106 Y NA C4orf33,SCLT1 NA NA NA NA C4orf33 46243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 139156559 139157143 139156950 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 4360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 139158628 139158837 139158817 Y SLC7A11 SLC7A11 NA NA NA NA SLC7A11 2666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 139831999 139832463 139832295 Y NA NA LOC641365,SLC7A11,LOC641364 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 102480 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 139960939 139961173 139961057 Y NAA15,CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25996 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 140035787 140036142 140035958 Y NA NA NA NA NA NA ELF2 60230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 140074901 140075184 140075104 Y NA ELF2 CCRN4L,ELF2,NAA15,NDUFC1 IMR90 Hi-C 24141950 ELF2 21188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 140096766 140097018 140096889 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2 ELF2 ELF2,NAA15 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ELF2 394 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr4 140331152 140331480 140331316 Y NA RAB33B NA NA NA NA RAB33B 40906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 140696118 140696274 140696196 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 111196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 140748220 140748477 140748349 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 163298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 140794594 140794926 140794812 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 209672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 140967961 140968185 140967999 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 105153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 140982751 140983079 140982915 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 90259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 143162001 143162155 143162078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-362F19.1 910229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 145975837 145976119 145976108 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ABCE1 40965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 146815736 146815927 146815832 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 41860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 146856855 146857112 146856936 Y NA ZNF827 NA NA NA NA ZNF827 675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 148374725 148374999 148374823 Y TMEM184C EDNRA TMEM184C IMR90 Hi-C 24141950 EDNRA 25070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 151314417 151314500 151314459 Y NA NA NA NA NA NA DCLK2 316991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 151641898 151642513 151641954 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 292366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 151681778 151681989 151681952 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 252890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 151873741 151873900 151873783 Y NA NA NA NA NA NA LRBA 60979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 152143714 152143771 152143743 Y SH3D19 NA NA NA NA NA RPS3A 124989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 152226044 152226315 152226216 Y NA NA NA NA NA NA RP11-610P16.1 101672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr4 152582106 152582499 152582283 Y NA NA NA NA NA NA PET112 97676 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 153599392 153599746 153599719 Y FBXW7,ARFIP1,TMEM154 TMEM154 NA NA NA NA TMEM154 75 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 154170296 154170804 154170469 Y TIGD4,KIAA0922 NA NA NA NA NA MND1 92997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 154179244 154179424 154179333 Y NA NA NA NA NA NA MND1 84377 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 154248193 154248592 154248328 Y TRIM2,TRIM2,RNF175 MND1 NA NA NA NA MND1 15209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 154408922 154409996 154409474 Y NA KIAA0922 NA NA NA NA KIAA0922 23424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 154548347 154548481 154548383 Y KIAA0922,TLR2 NA NA NA NA NA RNF175 130906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 159493065 159493294 159493179 Y NA NA NA NA NA NA ETFDH 97983 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 159592059 159592445 159592194 Y NA ETFDH,C4orf46 NA NA NA NA C4orf46 652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 159728927 159729240 159728972 Y PPID,RAPGEF2,FNIP2 FNIP2 NA NA NA NA FNIP2 40637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 160195976 160196239 160196029 Y RAPGEF2 NA NA NA NA NA FNIP2 507686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 161769764 161769816 161769790 Y NA NA NA NA NA NA FNIP2 2081474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 164583865 164584289 164584179 Y MARCH1 NA NA NA NA NA NAF1 497792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 164688247 164688444 164688347 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 602174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 164876357 164876532 164876526 Y NA NA NA NA NA NA NAF1 790284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 165210734 165210789 165210744 Y NA NA NA NA NA NA RP11-366M4.3 585367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr4 165882303 165882624 165882495 Y CPE,C4orf39 RP11-366M4.2,NACA3P,TRIM61 NA NA NA NA TRIM61 14196 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr4 169559850 169560019 169559874 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 102913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 169595912 169596309 169596196 Y NA NA NA NA NA NA DDX60L 138975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 169718415 169718594 169718475 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA CBR4 210832 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 169853850 169854103 169853858 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 75323 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 170547481 170547627 170547562 Y CLCN3 NEK1,CLCN3 C4orf27 IMR90 Hi-C 24141950 CLCN3 15697 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 174337339 174338040 174337759 Y SAP30 SAP30 HMGB2,GALNT7,SAP30 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 48219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 174443845 174444302 174443959 Y HAND2 NA NA NA NA NA RANP6 109220 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 175263937 175264166 175264013 Y CEP44,CEP44,FBXO8 NA NA NA NA NA FBXO8 60522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 178362238 178362457 178362307 Y NA AGA,RP11-130F10.1 NA NA NA NA AGA 581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 180091376 180091711 180091538 Y NA NA NA NA NA NA RP11-130F10.1 1727243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 182230221 182230632 182230434 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 833770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 183536176 183536411 183536208 Y NA NA NA NA NA NA DCTD 300678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.10709885471299 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 184423820 184424211 184423984 Y STOX2 NA NA NA NA NA ING2 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 184643961 184644129 184644061 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC11 65541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 185115354 185115759 185115584 Y NA NA NA NA NA NA RP11-739P1.2 208523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 185205400 185205552 185205478 Y NA NA IRF2,CCDC111,MLF1IP,LOC728175,CASP3 IMR90 Hi-C 24141950 IRF2 188182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 185573558 185573933 185573744 Y NA CASP3 NA NA NA NA CASP3 4895 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 186227102 186227608 186227442 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD37 87567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 186481104 186481365 186481225 Y NA PDLIM3 PDLIM3,SORBS2 IMR90 Hi-C 24141950 PDLIM3 26338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr4 186760271 186760668 186760511 Y NA NA NA NA NA NA SORBS2 115138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 187810272 187810501 187810328 Y NA NA FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 164396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr4 189029344 189029687 189029466 Y ZFP42,TRIML2 TRIML2 FAT1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIML2 587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr4 190936592 190936699 190936668 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 76649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 148457 148511 148484 Y NA PLEKHG4B NA NA NA NA PLEKHG4B 10084 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 175502 175522 175512 Y NA PLEKHG4B,CCDC127,SDHA NA NA NA NA PLEKHG4B 37129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 333938 334337 334088 Y NA NA NA NA NA NA PDCD6 64202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 448928 449328 449227 Y NA C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72 NA NA NA NA CEP72 45797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 672237 672545 672500 Y EXOC3,CEP72 NA NA NA NA NA CEP72 61850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 672861 673336 673024 Y NA NA NA NA NA NA CEP72 62474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TRIP13 131191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TRIP13 105735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr5 1041596 1043550 1041859 Y NA RP11-43F13.3,NKD2 NA NA NA NA NKD2 34652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 1102623 1102762 1102676 Y TPPP,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 7388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 1111223 1111556 1111501 Y LPCAT1,SLC12A7 SLC12A7 NA NA NA NA SLC12A7 1073 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 1468056 1468058 1468057 Y NA SLC6A3 NA NA NA NA SLC6A3 24511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 1478329 1478968 1478499 Y LPCAT1 SLC6A3,LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC6A3 34784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 1485196 1485502 1485375 Y SLC12A7,LPCAT1 SLC6A3,LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 36590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 1506387 1506607 1506390 Y NA LPCAT1 SLC6A3 IMR90 Hi-C 24141950 LPCAT1 15485 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 1514952 1515327 1515072 Y NA LPCAT1 NA NA NA NA LPCAT1 6765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 1521795 1522349 1522119 Y NA NA NA NA NA NA LPCAT1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 2580576 2580893 2580736 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 169352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 2750184 2750594 2750355 Y C5orf38,IRX2 IRX2 NA NA NA NA C5orf38 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 7.26949104875982 chr5 2758153 2758545 2758351 Y NA C5orf38,IRX2 NA NA NA NA IRX2 7184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA IRX1 289537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 4565513 4565575 4565544 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2297D10.2 572592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 5311411 5311643 5311527 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 107134 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 5376440 5376820 5376639 Y NA KIAA0947 NA NA NA NA KIAA0947 41957 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 5.16239219404683 chr5 7397224 7397590 7397441 Y C5orf49,ADCY2 ADCY2 NA NA NA NA ADCY2 2903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 7824130 7824491 7824311 Y ADCY2,C5orf49 MTRR,C5orf49,FASTKD3 NA NA NA NA MTRR 24808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 9456049 9456295 9456139 Y NA NA NA NA NA NA SEMA5A 87892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 10229611 10229778 10229690 Y NA FAM173B,CCT5 NA NA NA NA FAM173B 18231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 10352620 10352938 10352732 Y NA CMBL,MARCH6 NA NA NA NA MARCH6 805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA NA NA NA NA NA RPL30P7 63616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 10601684 10601853 10601839 Y ANKRD33B ANKRD33B NA NA NA NA ANKRD33B 39242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 10733059 10733302 10733226 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 26082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 10759548 10759882 10759715 Y NA DAP NA NA NA NA DAP 164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 11283783 11284165 11283974 Y NA NA NA NA NA NA DAP 524399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 12658501 12658830 12658774 Y NA NA NA NA NA NA CTNND2 756346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 14011107 14011342 14011264 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 68455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 14036813 14036909 14036843 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 14639692 14640047 14639871 Y NA EEF1A1P13,FAM105B TRIO,FAM105A IMR90 Hi-C 24141950 EEF1A1P13 11391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 15451801 15451916 15451863 Y NA FBXL7 FBXL7 IMR90 Hi-C 24141950 FBXL7 46389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16539355 16539674 16539525 Y FAM134B NA NA NA NA NA ZNF622 75454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 16723637 16724009 16723823 Y BASP1 NA NA NA NA NA FAM134B 108470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16733521 16733894 16733888 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 118354 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16736297 16736738 16736539 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 121130 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16740893 16741285 16741194 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 125726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.21419770942598 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 16898106 16898497 16898302 Y MYO10 CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 2253 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 17184758 17185051 17184904 Y BASP1 AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 30105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 17224986 17225514 17225115 Y BASP1 AC091878.1 NA NA NA NA AC091878.1 9830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 17401080 17401430 17401245 Y BASP1 FTH1P10,RP11-321E2.3 BASP1,LOC285696 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-321E2.3 698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 21539943 21540207 21540075 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP1 200001 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 23303766 23303789 23303778 Y NA NA NA NA NA NA CDH10 1339298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 25438068 25438428 25438198 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 249303 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 25443137 25443499 25443483 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 254372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chr5 26847119 26847280 26847167 Y NA NA NA NA NA NA CDH9 271977 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 31511930 31511946 31511938 Y NA DROSHA,C5orf22 NA NA NA NA DROSHA 18357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 32175167 32175567 32175368 Y NA GOLPH3,CTD-2186M15.1 NA NA NA NA GOLPH3 2711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 32283224 32283342 32283283 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 27773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 32952083 32952240 32952162 Y NA NA NA NA NA NA RP11-36C20.1 208045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 33442170 33442454 33442303 Y NA CTD-2203K17.1,TARS NA NA NA NA TARS 3368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 33781524 33781664 33781594 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 108633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 34048471 34048803 34048799 Y NA AMACR NA NA NA NA AMACR 42251 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 34571432 34571721 34571601 Y NA NA RAI14,TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 82621 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 34949030 34949157 34949062 Y NA BRIX1,RAD1,DNAJC21 NA NA NA NA DNAJC21 21332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 36657665 36658163 36657813 Y NIPBL NA NA NA NA NA SLC1A3 53208 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 38672702 38672722 38672712 Y NA NA EGFLAM,LIFR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 66246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 39177066 39177486 39177327 Y RICTOR NA NA NA NA NA RICTOR 104556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 40263385 40263650 40263545 Y NA NA PTGER4,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 490427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 40447095 40447379 40447222 Y PTGER4,CARD6 NA PTGER4 IMR90 Hi-C 24141950 TTC33 306698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 40796420 40796758 40796693 Y NA TTC33,RPL37,CARD6 NA NA NA NA PRKAA1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 41084074 41084331 41084322 Y NA NA NA NA NA NA CARD6 244788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 41465247 41465490 41465440 Y PLCXD3 NA NA NA NA NA OXCT1 403131 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 41509799 41509858 41509829 Y PLCXD3 NA NA NA NA NA OXCT1 358763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr5 42999523 42999876 42999700 Y NA CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 16655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 43008201 43008438 43008332 Y NA CTD-2035E11.3 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 43061828 43062062 43061945 Y NA CTD-2035E11.3,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 1216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 43480579 43480813 43480696 Y NA C5orf28,RP11-159F24.3,C5orf34 NA NA NA NA C5orf28 1182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 49660016 49660402 49660209 Y NA NA NA NA NA NA EMB 76680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 52023689 52023809 52023721 Y NA NA NA NA NA NA ITGA1 57921 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 53317506 53317866 53317808 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 286546 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 53848607 53848967 53848787 Y NA SNX18 NA NA NA NA SNX18 37018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 54715918 54716192 54716055 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 108337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 54729958 54730125 54730050 Y SKIV2L2,DDX4 NA NA NA NA NA RNF138P1 94404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 54731133 54731267 54731160 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 93262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 54751142 54751459 54751301 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 73070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 54886412 54886788 54886737 Y PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 57534 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 55471391 55471677 55471521 Y IL6ST NA NA NA NA NA CTD-2031P19.3 182396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 56025254 56025318 56025310 Y MAP3K1,GPBP1,GPBP1 NA NA NA NA NA MAP3K1 84083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 56862650 56862941 56862783 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 GPBP1 394875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 57120821 57121296 57121146 Y NA NA PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 PLK2 632791 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58134614 58134758 58134713 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 258566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58165920 58166304 58166218 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 289872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58232883 58233370 58233101 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 356835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 17.1728556659109 chr5 58243768 58244167 58243981 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 367720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 58255899 58256231 58256006 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 379851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 58314415 58314788 58314579 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 438367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58317891 58318186 58317997 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 441843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 58332286 58332474 58332297 Y PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 456238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 483836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58418380 58418697 58418552 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 542332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58423311 58423752 58423511 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 547263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58575824 58576193 58576112 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 699776 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 941134 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 60239574 60239836 60239702 Y ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8 ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 60626678 60627139 60626902 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 578 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 60930420 60930711 60930566 Y NA NA NA NA NA NA RPL3P6 244722 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 61661747 61661797 61661772 Y NA DIMT1,IPO11 NA NA NA NA DIMT1 35969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 64796548 64796879 64796719 Y PPWD1,CENPK ADAMTS6 NA NA NA NA ADAMTS6 20801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 64809602 64809952 64809754 Y NA ADAMTS6,CENPK,PPWD1 NA NA NA NA ADAMTS6 33855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 65220429 65221204 65220462 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 65898344 65898352 65898348 Y MAST4 MAST4 NA NA NA NA MAST4 8168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA SLC30A5 NA NA NA NA SLC30A5 48595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr5 70772003 70772134 70772073 Y NA BDP1 NA NA NA NA BDP1 22561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 71404360 71404518 71404455 Y MAP1B MAP1B NA NA NA NA MAP1B 3299 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 71462643 71462861 71462688 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 61582 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 71748206 71748633 71748536 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 133733 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 74212679 74213001 74212847 Y NA CTD-2503O16.1 NA NA NA NA CTD-2503O16.1 12486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 74883919 74884208 74884013 Y NA NA NA NA NA NA COL4A3BP 77956 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 75034241 75034569 75034405 Y NA POC5 NA NA NA NA POC5 22928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 75763076 75763442 75763238 Y IQGAP2,S100Z NA NA NA NA NA IQGAP2 66002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 75817951 75818026 75817987 Y NA NA NA NA NA NA IQGAP2 120877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 76103019 76103387 76103332 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 9371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 76103961 76104259 76104075 Y NA F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 8499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 77147501 77147797 77147637 Y NA TBCA NA NA NA NA TBCA 14807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 77177525 77177937 77177812 Y OTP TBCA NA NA NA NA TBCA 14921 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 77819717 77819752 77819740 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 165378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 78744780 78744887 78744834 Y NA NA NA NA NA NA HOMER1 63153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 79458255 79458620 79458438 Y MSH3,SERINC5 NA NA NA NA NA SERINC5 91278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr5 80707651 80707683 80707665 Y SSBP2 NA NA NA NA NA ZCCHC9 112242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.10709885471299 chr5 81148608 81149026 81148707 Y SSBP2 CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 3188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 81655341 81655441 81655346 Y NA NA VCAN,ATP6AP1L,XRCC4 IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 82945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 81692717 81693105 81692928 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 120321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 81934356 81934439 81934367 Y NA NA VCAN IMR90 Hi-C 24141950 RPS23 361960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 82224684 82224708 82224696 Y NA NA NA NA NA NA XRCC4 146609 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 82768408 82768816 82768560 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 3124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 82769254 82769739 82769524 Y VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 3970 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 82769870 82770125 82769934 Y TMEM167A,VCAN VCAN NA NA NA NA VCAN 4586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 83018086 83018575 83018426 Y NA HAPLN1 NA NA NA NA HAPLN1 2654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 83677578 83677928 83677708 Y EDIL3 CTD-2269F5.1,EDIL3 NA NA NA NA CTD-2269F5.1 317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 86604017 86604207 86604034 Y RASA1,RASA1 RASA1 NA NA NA NA RASA1 42312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 86629389 86629577 86629451 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 67684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 87117594 87117745 87117670 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 410758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 87214641 87214647 87214644 Y NA NA NA NA NA NA TMEM161B-AS1 348065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 87851521 87851656 87851586 Y MEF2C NA NA NA NA NA LINC00461 133202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C LINC00461 NA NA NA NA LINC00461 27689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 26466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 89219373 89219748 89219561 Y NA NA NA NA NA NA CETN3 483855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 89259292 89259660 89259475 Y NA NA NA NA NA NA CETN3 443943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 90514939 90515247 90515096 Y ARRDC3 RNU4-90P ARRDC3,LOC100129716,GPR98 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNU4-90P 49297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 90673049 90673245 90673226 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 3931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 90679835 90680013 90679955 Y ARRDC3 ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 2659 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 92593669 92593984 92593827 Y NA NA FLJ42709 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F1 323059 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 93900444 93900820 93900632 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD32 51232 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 95419074 95419624 95419399 Y ELL2 NA NA NA NA NA ELL2 123299 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 95507678 95508048 95507916 Y NA NA ELL2,MIR583 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2 211903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 96152147 96152486 96152312 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 10344 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 98269147 98269595 98269253 Y CHD1 CTD-2007H13.3 NA NA NA NA CTD-2007H13.3 6272 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 99386410 99387139 99386777 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 481827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 99387251 99388845 99388529 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 480121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 100720192 100720438 100720315 Y NA NA NA NA NA NA ST8SIA4 483222 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 101404486 101404751 101404619 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4C1 225502 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 103465253 103465580 103465434 Y NA NA NA NA NA NA NUDT12 568759 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 106810286 106811182 106810589 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 193414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 106906858 106907181 106907119 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 106907307 106907511 106907485 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 97085 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 106967635 106967784 106967710 Y NA EFNA5 NA NA NA NA EFNA5 36812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 108022286 108022631 108022483 Y NA NA NA NA NA NA FER 58892 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr5 109079577 109079706 109079642 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 56510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 109763228 109763435 109763276 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 308402 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 109870902 109871116 109871008 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A46 200721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 111018976 111019194 111019085 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 172688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 112218687 112219263 112218745 Y APC SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 23768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 112219334 112219897 112219506 Y NA SRP19,REEP5 NA NA NA NA SRP19 24415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 112314594 112314663 112314629 Y NA DCP2 NA NA NA NA DCP2 4195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 114623111 114623418 114623265 Y NA PGGT1B,CCDC112 NA NA NA NA CCDC112 7110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 114755701 114755980 114755870 Y PGGT1B,TICAM2,FEM1C NA FEM1C,TMED7-TICAM2 IMR90 Hi-C 24141950 FEM1C 122611 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA TMED7-TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.21245379744864 chr5 115420076 115420175 115420113 Y LOC644100 CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 1388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 115794810 115794877 115794844 Y COMMD10,SEMA6A NA NA NA NA NA CTB-118N6.1 101381 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 115860298 115860305 115860302 Y SEMA6A CTB-118N6.1,SEMA6A NA NA NA NA CTB-118N6.1 35953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 115908516 115909016 115908646 Y SEMA6A CTB-118N6.1 NA NA NA NA SEMA6A 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr5 115911792 115912152 115911976 Y SEMA6A CTB-118N6.1,SEMA6A NA NA NA NA SEMA6A 3162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 117227650 117227952 117227802 Y NA NA NA NA NA NA LINC00992 478445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA CTB-161M19.4,RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 118592872 118593203 118593036 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 9184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 118605337 118605637 118605457 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 2950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 118626064 118626362 118626186 Y DMXL1,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 23677 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 118627745 118627943 118627845 Y NA TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 25358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 119848516 119848911 119848640 Y NA NA NA NA NA NA PRR16 50543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 122087226 122087448 122087366 Y NA SNX2 PRDM6 IMR90 Hi-C 24141950 SNX2 21243 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 122177778 122177931 122177816 Y NA SNX24 NA NA NA NA SNX24 644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 123211449 123211701 123211673 Y NA NA ZNF608 IMR90 Hi-C 24141950 CSNK1G3 365656 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 123774307 123774708 123774529 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 307792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 123996464 123996708 123996619 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 85792 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 124006979 124007355 124007057 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 75145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 124029260 124029627 124029444 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 52873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 124042490 124042759 124042619 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 39741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 124047399 124047512 124047455 Y NA ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 34988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 124077955 124078154 124078062 Y ZNF608 ZNF608 NA NA NA NA ZNF608 4346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 124178131 124178310 124178211 Y NA RP11-436H11.1 NA NA NA NA RP11-436H11.1 35205 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 124593106 124593253 124593226 Y NA NA NA NA NA NA RP11-436H11.1 450180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 126015927 126016326 126016055 Y LMNB1,LMNB1 NA LMNB1,MEGF10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-395C3.1 53916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 126181513 126181654 126181594 Y MARCH3 NA NA NA NA NA LMNB1 71198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA MARCH3 114379 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 127211761 127211779 127211769 Y NA NA SLC12A2,FLJ33630,PRRC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC12A2 205679 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 129060395 129060594 129060495 Y NA NA NA NA NA NA CHSY3 177571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 130715394 130715800 130715520 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 136208 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 131015627 131015946 131015841 Y FNIP1,CDC42SE2 RAPGEF6 RAPGEF6 IMR90 Hi-C 24141950 RAPGEF6 46698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 131641002 131641297 131641050 Y NA PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 11994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 132581339 132581487 132581431 Y ANKRD43 NA NA NA NA NA HSPA4 195685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 133435759 133436442 133436277 Y PPP2CA,PHF15,CDKL3,TCF7,TCF7 TCF7 TCF7,SKP1 IMR90 Hi-C 24141950 TCF7 11960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 133455254 133455613 133455348 Y NA TCF7 NA NA NA NA TCF7 6852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 133763329 133763680 133763576 Y NA CDKN2AIPNL CDKN2AIPNL MCF7 ChIA-PET 22265404 CDKN2AIPNL 17740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 55877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 133802349 133802592 133802584 Y PPP2CA,SEC24A,UBE2B NA PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 56760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 133839310 133839404 133839346 Y NA NA PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIPNL 93721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 133890161 133890536 133890268 Y TCF7,PPP2CA,CDKL3,UBE2B,SEC24A,CAMLG,PHF15 NA NA NA NA NA SEC24A 91943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 133891612 133892163 133891823 Y PPP2CA,UBE2B,SEC24A NA NA NA NA NA SEC24A 90316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 134729736 134729896 134729816 Y NA H2AFY NA NA NA NA H2AFY 3708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 135405259 135405482 135405390 Y NA TGFBI NA NA NA NA TGFBI 42675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 135416297 135416409 135416350 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 50125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 135579364 135579371 135579368 Y NA NA NA NA NA NA SMAD5 112830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 135955852 135956149 135955964 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 235168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 136374592 136374995 136374792 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 183275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 136940488 136940640 136940554 Y NA SPOCK1 NA NA NA NA SPOCK1 8420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 137075973 137076263 137076118 Y NA KLHL3,HNRNPA0 NA NA NA NA KLHL3 6194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 137810438 137810840 137810496 Y NA REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 11259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 137868208 137868538 137868536 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 8451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 137881069 137881276 137881109 Y WNT8A,FAM53C,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 4080 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 137908044 137908328 137908223 Y NA ETF1,HSPA9,CTNNA1 NA NA NA NA HSPA9 805 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA CTNNA1 182646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 138786651 138786712 138786682 Y NA SPATA24,DNAJC18 NA NA NA NA DNAJC18 8471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 139090416 139090834 139090571 Y MATR3,MATR3,CXXC5 NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 65532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 139638984 139639383 139639269 Y C5orf32,ZMAT2,SRA1,IK,HARS2,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 41323 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 139641396 139641769 139641570 Y SRA1,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 38937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 139782360 139782578 139782471 Y NA RNU4-14P,ANKHD1,ANKHD1-EIF4EBP3 NA NA NA NA ANKHD1-EIF4EBP3 2867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 139933633 139933898 139933723 Y ANKHD1,ZMAT2,IK,HARS2,CD14,CD14,SRA1,APBB3 EIF4EBP3,SRA1,SLC35A4,APBB3 NA NA NA NA SRA1 1997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 140098281 140098628 140098472 Y NA DND1,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-3 5115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 140420005 140420137 140420073 Y NA NA PCDHA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 52090 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 140888509 140888855 140888756 Y PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 34929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 140893513 140893891 140893828 Y PCDH12,KIAA0141,DIAPH1 PCDHGC3 NA NA NA NA PCDHGC3 39933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 140910138 140910894 140910494 Y NA NA NA NA NA NA PCDHGC3 56558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 140985133 140985553 140985464 Y TAF7,PCDH12,KIAA0141,ARAP3,DIAPH1 DIAPH1,HDAC3,RELL2,FCHSD1 NA NA NA NA DIAPH1 11069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 141404371 141404781 141404694 Y DIAPH1,FCHSD1 GNPDA1 GNPDA1,NDFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GNPDA1 13765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 141443513 141443887 141443583 Y NA NDFIP1 FGF1,NDFIP1,GNPDA1,ARAP3,FCHSD1 IMR90 Hi-C 24141950 NDFIP1 42183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 141659754 141659954 141659854 Y NA AC005592.2,SPRY4 SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 AC005592.2 42904 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 141706626 141706892 141706857 Y NA AC005592.2,SPRY4 NA NA NA NA SPRY4 2606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 141736379 141736797 141736670 Y ARHGAP26 AC005592.2,SPRY4 NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPRY4 32359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 141769483 141770003 141769555 Y NA NA SPRY4,FGF1 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY4 65463 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 142157420 142157683 142157517 Y NA ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 9471 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 142174275 142174448 142174377 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 26326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 142535933 142536319 142536126 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P21 173851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 143569314 143569909 143569557 Y KCTD16 YIPF5 NA NA NA NA YIPF5 21036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 144920892 144921143 144921082 Y NA NA KCTD16 IMR90 Hi-C 24141950 PRELID2 291789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 145827727 145827826 145827802 Y NA TCERG1 GPR151 IMR90 Hi-C 24141950 TCERG1 2853 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 146200379 146200464 146200463 Y PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 115216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 146242419 146242610 146242553 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P48 157256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 146268013 146268084 146268061 Y STK32A,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B,PPP2R2B NA NA NA NA NA KRT8P48 182850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr5 146334529 146334918 146334843 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R2B 127429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 146751772 146751865 146751838 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 135754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 146783633 146784144 146783972 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 103475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 146830882 146830936 146830890 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 56683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 146831561 146831956 146831686 Y PPP2R2B,JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr5 146832241 146832308 146832261 Y JAKMIP2,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 55311 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 146834939 146835189 146835093 Y DPYSL3,DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 52430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr5 146940926 146941225 146941075 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL3 53307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 146947412 146947925 146947557 Y DPYSL3 NA NA NA NA NA DPYSL3 59793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 147160341 147160727 147160571 Y NA JAKMIP2 NA NA NA NA JAKMIP2 3 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 147234496 147234684 147234590 Y JAKMIP2 C5orf46 SPINK1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf46 49417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 147237260 147237328 147237294 Y NA C5orf46 SPINK1 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf46 46773 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 147248632 147248939 147248760 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 35162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 15.0657568111979 chr5 147253882 147254078 147253986 Y NA C5orf46 NA NA NA NA C5orf46 30023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 9.27123496073716 chr5 147364399 147364757 147364579 Y NA NA NA NA NA NA C5orf46 80298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA C5orf46 179727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 147572374 147572821 147572603 Y FBXO38 NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 188525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 147605275 147606051 147605859 Y NA NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 155295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 147777538 147777934 147777556 Y NA RP11-373N22.3,FBXO38 NA NA NA NA FBXO38 16040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 148700478 148700631 148700542 Y NA GRPEL2,PCYOX1L GRPEL2,PCYOX1L IMR90 Hi-C 24141950 GRPEL2 22362 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 148760371 148760619 148760464 Y NA GRPEL2,PCYOX1L NA NA NA NA PCYOX1L 24801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 149110836 149111455 149111198 Y ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr5 149111581 149111664 149111645 Y NA PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 3720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 149921548 149921861 149921663 Y NA NA NA NA NA NA SYNPO 56781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 150461516 150462400 150461744 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,SLC36A1,CCDC69,TNIP1 TNIP1 NA NA NA NA TNIP1 8738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 150505089 150505277 150505181 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,TNIP1,CCDC69,ANXA6 TNIP1,ANXA6 TNIP1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA6 30166 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 150938646 150939048 150938843 Y NA FAT2 NA NA NA NA FAT2 7457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 151213355 151213633 151213423 Y NA NA NA NA NA NA ATOX1 63262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 153743049 153743076 153743063 Y NA NA NA NA NA NA SAP30L-AS1 80334 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153809274 153809597 153809436 Y NA SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA SAP30L-AS1 13813 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153855980 153856061 153856023 Y HAND1 SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA HAND1 156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153896784 153897165 153896975 Y NA HAND1 SAP30L,HAND1 IMR90 Hi-C 24141950 HAND1 40960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153903267 153903411 153903357 Y HAND1 HAND1 NA NA NA NA HAND1 47443 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153939934 153940118 153940082 Y NA NA FAM114A2,MFAP3,SAP30L IMR90 Hi-C 24141950 HAND1 84110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 153963327 153963532 153963423 Y MRPL22,SAP30L,HAND1 NA NA NA NA NA HAND1 107503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 154071115 154071211 154071188 Y NA LARP1 LARP1,C5orf4 IMR90 Hi-C 24141950 LARP1 19251 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr5 156540141 156540423 156540353 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2,MED7 NA NA NA NA HAVCR2 27457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 157284724 157285025 157284835 Y NIPAL4,ADAM19 CLINT1 LSM11 IMR90 Hi-C 24141950 CLINT1 541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 158366953 158367057 158367005 Y NA NA NA NA NA NA EBF1 157712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 158385170 158385443 158385354 Y RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,IL12B NA NA NA NA NA EBF1 139326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 158829827 158830139 158829983 Y IL12B NA ADRA1B IMR90 Hi-C 24141950 UBLCP1 141738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr5 159471418 159471693 159471487 Y SLU7 TTC1 NA NA NA NA TTC1 37298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159586814 159587463 159587155 Y PWWP2A,FABP6 PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 24911 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159592617 159593055 159592885 Y NA PWWP2A,FABP6 TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FABP6 19319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159720972 159721325 159721087 Y PWWP2A,SLU7,CCNJL RP11-34P1.2,CCNJL FABP6 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-34P1.2 37712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159837617 159837836 159837727 Y NA C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA SLU7 8882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159933720 159933957 159933888 Y PWWP2A,SLU7 NA NA NA NA NA PTTG1 86891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 159951614 159951766 159951649 Y FABP6 NA NA NA NA NA PTTG1 104785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 160965564 160965836 160965831 Y NA GABRB2 NA NA NA NA GABRB2 8214 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 162428835 162428856 162428847 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 433476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 167088894 167089267 167088997 Y NA NA NA NA NA NA WWC1 627389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 167744761 167745078 167744891 Y WWC1 WWC1 NA NA NA NA WWC1 28105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 168232470 168232861 168232812 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 191153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 168302839 168303219 168303163 Y NA NA NA NA NA NA CTC-575D19.1 261522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 169733349 169733836 169733608 Y NA KCNIP1 LCP2,KCNIP1,C5orf58 IMR90 Hi-C 24141950 KCNIP1 44655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 169784990 169785480 169785059 Y LCP2,KCNMB1 KCNIP1 NA NA NA NA KCNIP1 6499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 170024399 170024639 170024519 Y NA NA NA NA NA NA GABRP 163715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA GABRP 127423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 170174489 170174734 170174652 Y GABRP GABRP NA NA NA NA GABRP 13620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 170378492 170378604 170378547 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 91618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 170662332 170662346 170662338 Y NA NA NA NA NA NA NPM1 149774 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 171094849 171095086 171094946 Y NA NA FBXW11,FGF18 IMR90 Hi-C 24141950 FGF18 250189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 171431879 171432256 171432181 Y UBTD2,STK10 FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 2 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr5 171580373 171580774 171580468 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 32616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 171601698 171602038 171601921 Y NA STK10 NA NA NA NA STK10 11352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 171709316 171709633 171709569 Y NA UBTD2 NA NA NA NA UBTD2 241 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 171879589 171880295 171879961 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 62 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 172192263 172193766 172192583 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 172198749 172199959 172199636 Y UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1 DUSP1 NA NA NA NA DUSP1 2551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 172328085 172328386 172328247 Y DUSP1 NA NA NA NA NA RPL26L1 55346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 172710965 172711353 172711102 Y NA STC2 ATP6V0E1,BNIP1,LOC285593,NKX2-5,NEURL1B,RPL26L1,STC2,C5orf41 IMR90 Hi-C 24141950 STC2 43153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 173031200 173031306 173031275 Y NA BOD1 NA NA NA NA BOD1 10357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 173199242 173199802 173199475 Y CPEB4 CTB-43E15.3 CPEB4 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTB-43E15.3 28028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 173391394 173391777 173391587 Y CPEB4 C5orf47 NA NA NA NA C5orf47 7005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 173764742 173765021 173764892 Y NA NA HMP19,MIR4634,MSX2,FLJ16171 IMR90 Hi-C 24141950 C5orf47 365960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 173846140 173846257 173846227 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 303279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 173956576 173956772 173956664 Y HMP19 NA MSX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 192764 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 175111905 175112078 175111992 Y NA HRH2 NA NA NA NA HRH2 28872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 175118111 175118311 175118228 Y HRH2 HRH2 NA NA NA NA HRH2 35078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 175302369 175302773 175302579 Y DRD1,CPLX2,C5orf25,CPLX2 NA NA NA NA NA HRH2 219336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 175347355 175347516 175347492 Y NA NA CPLX2 IMR90 Hi-C 24141950 HRH2 264322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 175960481 175960718 175960661 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,RNF44,CDHR2 RNF44 NA NA NA NA RNF44 2308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 176250127 176250448 176250189 Y GPRIN1,SNCB,EIF4E1B,NSD1,UNC5A UNC5A NA NA NA NA UNC5A 14649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 176359562 176359884 176359876 Y RNF44,UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,GRK6 NA NA NA NA NA UIMC1 87750 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 176973275 176973657 176973542 Y NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3 DDX41,FAM193B,TMED9 NA NA NA NA FAM193B 5885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 177541057 177541427 177541157 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 2613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 177542150 177542670 177542238 Y N4BP3 N4BP3,RMND5B,NHP2 NA NA NA NA N4BP3 3706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr5 177784112 177784688 177784252 Y AGXT2L2 NA NA NA NA NA HNRNPAB 154604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 177804102 177804255 177804157 Y CLK4 NA NA NA NA NA HNRNPAB 174594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 178052813 178053238 178053128 Y AGXT2L2,CLK4 COL23A1,CLK4 COL23A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLK4 2378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 178729378 178729778 178729559 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 40653 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 178985972 178986151 178986083 Y NA RUFY1 NA NA NA NA RUFY1 10413 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 179159137 179159324 179159233 Y RNF130,RUFY1,SQSTM1,HNRNPH1,MAML1 MAML1 NA NA NA NA MAML1 1286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 179188972 179189165 179189138 Y NA MAML1,SQSTM1,MGAT4B NA NA NA NA MAML1 31121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 179398044 179398477 179398178 Y RUFY1,HNRNPH1,MAML1,SQSTM1,RNF130 NA NA NA NA NA TBC1D9B 65185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 179770152 179770325 179770205 Y NA GFPT2 NA NA NA NA GFPT2 8062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 179967202 179967410 179967248 Y NA CNOT6 NA NA NA NA CNOT6 47790 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 180077252 180077460 180077391 Y NA NA NA NA NA NA CNOT6 157840 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 180472837 180473231 180473040 Y BTNL9 NA NA NA NA NA CTC-338M12.5 143693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr5 180615864 180616079 180615972 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638 NA NA NA NA CTC-338M12.5 845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr5 180634441 180634803 180634658 Y NA CTC-338M12.5,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM41 12696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr5 180672693 180672910 180672808 Y NA TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1,TRIM52,TRIM52-AS1,CTC-338M12.9 NA NA NA NA GNB2L1 186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 286457 287090 286788 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 2540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 290595 290748 290658 Y IRF4,DUSP22 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 965 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 317745 318083 317920 Y DUSP22,IRF4 DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 28115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 322947 323248 323077 Y NA DUSP22 NA NA NA NA DUSP22 33317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 542839 543066 543064 Y NA NA NA NA NA NA EXOC2 148051 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 1379891 1379916 1379904 Y NA NA LOC285768,FOXF2,EXOC2 IMR90 Hi-C 24141950 FOXC1 228765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 1869270 1869328 1869296 Y NA NA NA NA NA NA FOXC1 260589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 2543068 2543554 2543252 Y SERPINB1 NA GMDS,LOC100508120,C6orf195 IMR90 Hi-C 24141950 C6orf195 89283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 2726588 2726793 2726728 Y SERPINB9,SERPINB1,RIPK1,NQO2 WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 36855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 2738073 2738511 2738408 Y NA WRNIP1 NA NA NA NA WRNIP1 25137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 2849123 2849376 2849246 Y SERPINB9,RIPK1,NQO2,SERPINB1 SERPINB1 NA NA NA NA SERPINB1 8883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 2877769 2878087 2877933 Y SERPINB9,NQO2,SERPINB1 SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB9 23427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 3072108 3072295 3072201 Y NA RIPK1,BPHL NA NA NA NA RIPK1 9883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr6 3209395 3209963 3209634 Y SERPINB9 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA PSMG4 19674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 3238745 3238826 3238788 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 8781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 3259939 3260435 3260206 Y NA PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 29975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 3317564 3317616 3317590 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 87600 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA SLC22A23 98507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 3426515 3426916 3426721 Y NA SLC22A23 NA NA NA NA SLC22A23 28340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 3987035 3987350 3987158 Y NA PRPF4B SLC22A23,FAM50B,PXDC1,TUBB2B,BPHL,LOC100507194 IMR90 Hi-C 24141950 PRPF4B 32151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 4189159 4189278 4189216 Y C6orf201,C6orf146 RP3-400B16.2 CDYL IMR90 Hi-C 24141950 RP3-400B16.2 1809 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 4266051 4266219 4266148 Y NA NA CDYL,PRPF4B,FAM217A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-400B16.2 78701 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 5204719 5205035 5204877 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 54137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 5206171 5206360 5206265 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 52812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 5287917 5288162 5288028 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 28640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 5671479 5671687 5671530 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 333513 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 6662049 6662264 6662157 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 443566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.63387356839124 chr6 6892535 6892715 6892637 Y LY86,RREB1,RREB1 NA RREB1 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 213115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7052517 7053280 7052961 Y LY86 NA RREB1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RREB1 52550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7058764 7058925 7058840 Y DSP RREB1 RREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RREB1 46905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7074033 7074425 7074227 Y LY86,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 31405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7112981 7113125 7113000 Y RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 7151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7157997 7158379 7158000 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 52167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7174134 7174405 7174138 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 68304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7445365 7445655 7445467 Y NA NA DSP,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 CAGE1 57389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 7673327 7673604 7673437 Y NA NA MUTED-TXNDC5,BMP6 IMR90 Hi-C 24141950 SNRNP48 84895 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 9516527 9516706 9516607 Y NA NA LOC100130275,TFAP2A,LINC00518 IMR90 Hi-C 24141950 TFAP2A 901186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 9710906 9711148 9711028 Y NA NA NA NA NA NA TFAP2A 706744 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10315279 10315501 10315368 Y PAK1IP1,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 102391 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10316491 10316897 10316818 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 100995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10407698 10407754 10407725 Y PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 10138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 10587786 10588136 10587948 Y TMEM14B,GCNT2 NA NA NA NA NA GCNT2 97330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 10589491 10589864 10589781 Y NA NA NA NA NA NA GCNT2 99035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10592093 10592386 10592236 Y TFAP2A,TFAP2A NA NA NA NA NA PAK1IP1 100542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10771427 10771996 10771700 Y ELOVL2,MAK TMEM14B,SYCP2L NA NA NA NA SYCP2L 25400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 10970926 10971179 10971053 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 71368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 167522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr6 11277425 11277816 11277607 Y NA NA NA NA NA NA NEDD9 102765 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11299498 11299626 11299552 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 80955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11318376 11319012 11318732 Y TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 61569 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11460602 11460937 11460641 Y LOC221710,ERVFRD-1,NEDD9 NA NEDD9,C6orf228,ERVFRD-1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 75001 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11643512 11643697 11643605 Y NA NA EDN1,HIVEP1 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 107574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11653356 11653414 11653358 Y NA NA HIVEP1,EDN1,ADTRP,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 TMEM170B 117418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 11921182 11921467 11921322 Y NA NA ADTRP,HIVEP1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIVEP1 85528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 12113688 12114092 12113700 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP1 106693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 12371691 12372070 12371982 Y NA NA NA NA NA NA EDN1 83095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 12577591 12578036 12577836 Y NA NA EDN1,TMEM170B IMR90 Hi-C 24141950 RPL15P3 65249 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 13107797 13107872 13107835 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-11P 104416 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 14211875 14212265 14212161 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 96003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14295530 14295570 14295550 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 179658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14381564 14381859 14381670 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 265692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14587491 14587822 14587657 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 471619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14640701 14640843 14640773 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 524829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr6 14642464 14642575 14642557 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 526592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14661271 14661715 14661503 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CD83 545399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 14711169 14711813 14711625 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 532714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14716675 14716945 14716802 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 527582 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 14721191 14721587 14721406 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 522940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14724933 14725069 14724986 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 519458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14735052 14735658 14735282 Y NA NA DTNBP1,JARID2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 JARID2 508869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14766593 14766865 14766789 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 477662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 14777704 14777964 14777898 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 466563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr6 14837546 14837947 14837747 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 406580 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14884214 14884345 14884265 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 360182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14929648 14930020 14929845 Y JARID2 NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 314507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 14945973 14946248 14946214 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 298279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 14966546 14966931 14966759 Y NA NA NA NA NA NA JARID2 277596 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 14984607 14984854 14984731 Y NA NA JARID2,DTNBP1 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 259673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 15021707 15021883 15021795 Y NA NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 15022090 15022421 15022413 Y JARID2 NA JARID2 IMR90 Hi-C 24141950 JARID2 222106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.31955265216163 chr6 15078356 15078482 15078419 Y NA NA JARID2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 JARID2 166045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 15365610 15365867 15365688 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 118745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 15436683 15436898 15436793 Y JARID2 NA NA NA NA NA JARID2-AS1 189818 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 15541251 15541598 15541282 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 119691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 15555860 15556076 15555941 Y JARID2,DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 105213 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 16322882 16323237 16323091 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 86071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 16668776 16668955 16668866 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 90414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 16747394 16747788 16747685 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 11581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 17280388 17280785 17280395 Y CAP2,RBM24,RBM24,RBM24 RBM24 NA NA NA NA RBM24 811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 17496190 17496270 17496230 Y NA RPL7P26 NA NA NA NA RPL7P26 33613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 17614611 17614952 17614695 Y KIF13A,NUP153,FAM8A1 FAM8A1 NA NA NA NA FAM8A1 16025 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 17712711 17712926 17712817 Y NA NUP153 FAM8A1,NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 8055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 18016545 18016825 18016604 Y NA KIF13A TPMT,NHLRC1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF13A 30691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 18022998 18023444 18023299 Y NA KIF13A KIF13A,NHLRC1,TPMT IMR90 Hi-C 24141950 KIF13A 37144 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 18330565 18331115 18330847 Y KIF13A,KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 35664 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 19691933 19692175 19692049 Y ID4 NA NA NA NA NA RP4-625H18.2 110808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 20211469 20211688 20211565 Y NA MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 20404913 20405227 20404970 Y MBOAT1 E2F3 NA NA NA NA E2F3 4515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 20811412 20811642 20811580 Y NA NA NA NA NA NA CDKAL1 278724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 21098770 21098791 21098780 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 493181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 21258987 21259049 21259040 Y NA NA CDKAL1 IMR90 Hi-C 24141950 SOX4 332923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 21589338 21589711 21589681 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 22222867 22222924 22222901 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 630895 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 24659946 24660207 24660006 Y TDP2,C6orf62 TDP2,ACOT13 NA NA NA NA TDP2 5054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 24799813 24800204 24799968 Y DCDC2,GPLD1,GPLD1,ALDH5A1 GMNN NA NA NA NA GMNN 26654 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB NA NA NA NA HIST1H3A 25645 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.52851862565559 chr6 26006419 26006453 26006436 Y NA TRIM38,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3A 12265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 26029019 26029363 26029242 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H3B 925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 26034352 26034599 26034546 Y NA HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H2AB 2556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 26219063 26219301 26219164 Y NA HIST1H2BE,HIST1H4D,HIST1H2AD,HIST1H3D,HIST1H2BF,HIST1H4E,HIST1H2BG,HIST1H2AE,HIST1H3E,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH NA NA NA NA HIST1H2AE 3898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 26283996 26284379 26284279 Y NA HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H NA NA NA NA HIST1H4H 234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 26521444 26521777 26521577 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 1368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26533222 26533398 26533310 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 3235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26536966 26537248 26536997 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26537641 26538043 26537718 Y NA HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HMGN4 1008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 26550694 26551000 26550826 Y NA HCG11,HMGN4,ABT1 NA NA NA NA HMGN4 14061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 27143830 27144149 27143885 Y NA HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 NA NA NA NA HIST1H2AH 30969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 27145729 27146130 27146023 Y ZNF184 HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 30893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr6 27745629 27745723 27745700 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 27986 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 27798416 27798741 27798578 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H4K 1111 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 27807310 27807672 27807617 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L NA NA NA NA HIST1H2BN 2987 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN16 17466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 28101066 28101269 28101177 Y OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16 ZSCAN16,ZNF192P1 NA NA NA NA ZSCAN16 10728 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 28188130 28188520 28188276 Y ZNF193 ZKSCAN4 NA NA NA NA ZKSCAN4 36491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23,COX11P1 NA NA NA NA COX11P1 2203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 28457225 28458028 28457315 Y NA ZSCAN23,COX11P1 NA NA NA NA COX11P1 44475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 93748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 28715387 28715696 28715451 Y NA NA NA NA NA NA XXbac-BPG308K3.5 89087 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 29447385 29447671 29447510 Y NA NA NA NA NA NA GABBR1 152082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30010922 30011054 30010960 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 13622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30019374 30019509 30019439 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA ZNRD1 5167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30453844 30454132 30453996 Y ZNRD1,TUBB RANP1,HLA-E HLA-E MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HLA-E 1112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 30649746 30650798 30650074 Y TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949 C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB NA NA NA NA PPP1R18 2874 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 30731781 30732171 30732168 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 21450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 30910531 30910726 30910623 Y NA GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 36512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 31140737 31140986 31140881 Y NA CCHCR1,TCF19,POU5F1,HCG27 NA NA NA NA POU5F1 5522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 31352932 31353063 31352998 Y MCCD1,HSPA1L,GPANK1,BAG6,CCHCR1,CCHCR1 HLA-B,MICA NA NA NA NA MICA 16293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 31789098 31789184 31789146 Y TNF,HSPA1L,HSPA1A,NEU1,HSPA1B VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 4328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA ATF6B 11988 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 33396313 33396709 33396628 Y SYNGAP1 KIFC1,PHF1,CUTA,ZBTB9 NA NA NA NA CUTA 12219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 33546480 33546561 33546538 Y LEMD2,B3GALT4,RGL2,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 461 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 33818239 33818267 33818253 Y NA MLN GRM4,MLN,IP6K3,LINC00336,BAK1,GGNBP1,LEMD2,LOC100507584,MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 MLN 48451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 33872168 33872571 33872419 Y PHF1,ZBTB9,LEMD2 NA NA NA NA NA MLN 102380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 34099261 34099385 34099317 Y GRM4 NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 85831 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 34191726 34192136 34191830 Y C6orf1,HMGA1 CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1 MCF7 ChIA-PET 22265404 CYCSP55 6510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 34202925 34203288 34202990 Y NA CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2 NA NA NA NA HMGA1 275 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 34358644 34359014 34358829 Y NA NUDT3,RPS10 NA NA NA NA NUDT3 193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 34631608 34631780 34631736 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 30856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 34663389 34663600 34663462 Y NA C6orf106,RP3-375P9.2 NA NA NA NA C6orf106 753 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 35201491 35201602 35201547 Y NA SCUBE3,ZNF76 NA NA NA NA SCUBE3 21301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 35457906 35458213 35458053 Y TEAD3 FANCE,RPL10A,TEAD3 NA NA NA NA TEAD3 4640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 35568316 35568651 35568441 Y NA RP3-340B19.2 NA NA NA NA RP3-340B19.2 46666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 36391024 36391283 36391227 Y SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 17261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 36409257 36409482 36409373 Y MAPK14,BRPF3,STK38,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,ETV7,ETV7,PXT1,KCTD20 KCTD20 NA NA NA NA KCTD20 713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 36628616 36629003 36628769 Y ETV7,ETV7,KCTD20,SRSF3,CDKN1A,CDKN1A RNU1-88P,LAP3P2,CDKN1A CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1 IMR90 Hi-C 24141950 LAP3P2 10591 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CDKN1A 95453 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 37093441 37093739 37093580 Y NA PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 42240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 37094186 37094408 37094276 Y PPIL1 PIM1 PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 41571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 37104071 37104158 37104105 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 31821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 37190361 37190574 37190538 Y NA TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 32974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 37271813 37272101 37271931 Y PIM1,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA RNF8 47647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 37464858 37465170 37465019 Y NA CCDC167 NA NA NA NA CCDC167 528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 37673638 37673745 37673684 Y NA NA MDGA1 K562 ChIA-PET 22265404 ZFAND3 111530 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 37892657 37892863 37892737 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 107382 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 38177110 38177509 38177276 Y NA NA NA NA NA NA ZFAND3 391835 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 38185251 38185625 38185371 Y BTBD9 NA NA NA NA NA ZFAND3 399976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 38265340 38265548 38265422 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 340376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 38450593 38450822 38450666 Y BTBD9 NA NA NA NA NA BTBD9 155102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 39886697 39886822 39886760 Y NA MOCS1,RP1-278E11.3 NA NA NA NA MOCS1 13468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 40964017 40964029 40964023 Y NA NA UNC5CL,APOBEC2,C6orf130 IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 74655 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 40964511 40964818 40964666 Y NA NA NA NA NA NA NFYA 73866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA TREM1 89271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 41471691 41471833 41471786 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 40331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 41528607 41528881 41528714 Y TAF8,CCND3,NFYA,TFEB FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA RP11-328M4.2 14248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 41546441 41546593 41546496 Y FRS3 FOXP4,RP11-328M4.2 NA NA NA NA RP11-328M4.2 32082 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 41623844 41623904 41623860 Y NA MDFI NA NA NA NA MDFI 21224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 41661673 41661892 41661771 Y FRS3 TFEB NA NA NA NA TFEB 40105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 41672440 41672821 41672622 Y TFEB TFEB NA NA NA NA TFEB 29176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 41907242 41907431 41907365 Y TAF8,TFEB,CCND3 USP49,MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 20316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42086253 42086632 42086383 Y NA C6orf132 NA NA NA NA C6orf132 21725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42255073 42255501 42255249 Y NA NA NA NA NA NA MRPS10 71470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42390239 42390257 42390249 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 27532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 42421408 42421762 42421484 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 3619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42537614 42537689 42537648 Y TRERF1,CNPY3,UBR2 UBR2 NA NA NA NA UBR2 7814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 42738530 42739530 42738949 Y CUL9,TRERF1,UBR2,TBCC,CNPY3,C6orf226 ATP6V0CP3,TBCC KIAA0240,GUCA1A,UBR2,ATP6V0CP3,PRPH2,RPL7L1,TBCC,C6orf226,TRERF1,PTCRA,PPP2R5D IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 25972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 43001164 43001472 43001318 Y NA MEA1,KLHDC3,RRP36,KLC4,CUL7,MRPL2,PTK7 NA NA NA NA KLC4 5043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 43085846 43085863 43085854 Y NA PTK7 NA NA NA NA PTK7 43840 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 43229544 43229904 43229724 Y TTBK1 TTBK1,CRIP3 CRIP3,ZNF318,SLC22A7 IMR90 Hi-C 24141950 TTBK1 20126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 43295599 43295850 43295834 Y TJAP1 CRIP3,ZNF318 NA NA NA NA CRIP3 21064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 43635973 43636240 43636108 Y NA GTPBP2,MAD2L1BP,RSPH9,MRPS18A NA NA NA NA MRPS18A 17288 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 28510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 44044328 44044673 44044418 Y C6orf223,NFKBIE RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 POLH,GTPBP2,LOC100132354,RSPH9,MAD2L1BP,VEGFA,HSP90AB1,XPO5,MRPS18A,C6orf223,CAPN11,TMEM63B IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP5-1120P11.1 3939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44070488 44070804 44070651 Y NA RP5-1120P11.1,TMEM63B,MRPL14 NA NA NA NA TMEM63B 21847 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44184938 44185313 44184944 Y MRPL14 HSP90AB1,MIR4647,SLC35B2,NFKBIE NA NA NA NA SLC29A1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 44396303 44396427 44396307 Y NA CDC5L NA NA NA NA CDC5L 43041 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44443307 44443732 44443616 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 90045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 44598266 44598445 44598361 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 245004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44924205 44924374 44924290 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 369520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 44949602 44949944 44949774 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 343950 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45297606 45298153 45297881 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 3712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45298832 45299186 45298935 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 4938 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45302184 45302302 45302245 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 8290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 45306825 45307168 45307007 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 12931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45319946 45320392 45320176 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 23298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45372080 45372159 45372107 Y NA SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 28390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 47074438 47074572 47074520 Y NA NA TNFRSF21 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF21 201069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 47637505 47637670 47637588 Y OPN5,GPR111 GPR111 GPR115 IMR90 Hi-C 24141950 GPR111 15333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 49524322 49524464 49524384 Y NA C6orf141 NA NA NA NA C6orf141 8209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 50683623 50683755 50683704 Y NA NA NA NA NA NA RPS17P5 139620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 51275260 51275721 51275608 Y NA RP3-437C15.1 NA NA NA NA RP3-437C15.1 1925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 51738790 51738977 51738878 Y NA NA NA NA NA NA MCM3 408702 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 52460126 52460529 52460233 Y TRAM2 TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 20413 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA COL21A1 NA NA NA NA COL21A1 39521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr6 57046105 57046302 57046204 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 10981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 57052407 57052730 57052411 Y NA BAG2,RAB23 NA NA NA NA BAG2 17283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 57251417 57251660 57251585 Y KIAA1586 NA NA NA NA NA PRIM2 73814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 57267458 57267955 57267680 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 89855 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 57288314 57288720 57288442 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 110711 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 57325457 57325813 57325552 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 147854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 58777244 58778438 58777771 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 522675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 64386722 64387357 64386973 Y PHF3 PHF3 NA NA NA NA PHF3 42997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 70479579 70479974 70479889 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 25029 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 70808594 70808991 70808795 Y NA NA NA NA NA NA COL9A1 201795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 71184425 71184878 71184622 Y NA NA NA NA NA NA FAM135A 63781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA KHDC1L 65595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 73975471 73975797 73975634 Y NA KHDC1L,RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 4533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 73981759 73981798 73981779 Y NA KHDC1L,RP11-398K22.12,KHDC1 NA NA NA NA RP11-398K22.12 10821 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 74194767 74195136 74194952 Y NA MB21D1,MTO1,EEF1A1,RP11-505P4.5 NA NA NA NA MTO1 25466 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 55167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 74295823 74296227 74295840 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA RP11-505P4.5 61221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 74779845 74780097 74779933 Y NA NA COL12A1,CD109 IMR90 Hi-C 24141950 CD109 376337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 75791624 75791955 75791790 Y NA NA NA NA NA NA COL12A1 121812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 79773928 79774085 79774072 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 11868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 79862008 79862376 79862212 Y NA NA NA NA NA NA PHIP 76055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 80487784 80488033 80487927 Y NA NA NA NA NA NA SH3BGRL2 148784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 81048044 81048318 81048128 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 233680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 81197510 81197656 81197595 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 383146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 82422345 82422435 82422390 Y NA FAM46A NA NA NA NA FAM46A 38056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 83194805 83194910 83194858 Y NA NA NA NA NA NA TPBG 123882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 83521076 83521456 83521266 Y NA NA NA NA NA NA DOPEY1 253929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 83737150 83737334 83737242 Y NA DOPEY1 NA NA NA NA DOPEY1 38051 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 83931407 83931579 83931543 Y UBE2CBP,PRSS35,RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 RWDD2A,PGM3 IMR90 Hi-C 24141950 PGM3 29752 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 84877511 84877669 84877594 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1009 57684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 84917634 84917758 84917696 Y NA KIAA1009 NA NA NA NA KIAA1009 17595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 85258714 85258725 85258720 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 213512 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 85334002 85334301 85334152 Y NA NA NA NA NA NA TBX18 137936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 88401154 88401337 88401278 Y NA AKIRIN2 NA NA NA NA AKIRIN2 8590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 89090505 89090612 89090559 Y CNR1 NA NA NA NA NA ACTBP8 105797 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 89758081 89758394 89758222 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PNRC1 30076 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 90527291 90527624 90527395 Y NA CASP8AP2 NA NA NA NA MDN1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 90856849 90857084 90856969 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 147543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 90994076 90994276 90994132 Y MDN1,BACH2,BACH2 BACH2 NA NA NA NA BACH2 10351 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 91121051 91121489 91121257 Y BACH2,BACH2 NA BACH2,MIR4464 IMR90 Hi-C 24141950 BACH2 116424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 91655857 91655883 91655870 Y MAP3K7,MAP3K7 NA NA NA NA NA MAP3K7 361093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 91881447 91881774 91881612 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K7 586683 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 325188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 94037616 94037704 94037660 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 89561 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 94502513 94502885 94502788 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 375248 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 94545083 94545465 94545274 Y NA NA NA NA NA NA EPHA7 417818 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 95244699 95244909 95244803 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 778510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 97632369 97632997 97632691 Y NA NA NA NA NA NA MMS22L 96096 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 97681036 97681361 97681334 Y NA MMS22L NA NA NA NA MMS22L 47732 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 99280317 99280875 99280652 Y POU3F2 NA NA NA NA NA FBXL4 112974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 100002359 100002730 100002672 Y PNISR,USP45,LOC100130890 USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 12119 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 100584000 100584312 100584155 Y NA NA SIM1,ASCC3 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 391840 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 100676865 100677032 100676949 Y NA NA SIM1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-121G13.3 299120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 101593141 101593339 101593267 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 265893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 102948586 102948935 102948701 Y NA NA NA NA NA NA ASCC3 1621338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 LIN28B NA NA NA NA LIN28B 13286 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr6 105401566 105401766 105401705 Y LIN28B LIN28B NA NA NA NA LIN28B 1157 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr6 105403500 105403904 105403556 Y NA LIN28B NA NA NA NA LIN28B 577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 105443315 105443377 105443346 Y HACE1,LIN28B LIN28B NA NA NA NA LIN28B 40392 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 105540278 105540291 105540285 Y HACE1,LIN28B BVES NA NA NA NA BVES 42758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 106320025 106320545 106320363 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PRDM1 211650 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 106768988 106769157 106769073 Y NA ATG5 NA NA NA NA ATG5 2509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 107014040 107014053 107014047 Y BEND3,RTN4IP1 NA NA NA NA NA RTN4IP1 61320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 107047078 107047343 107047210 Y BEND3 RTN4IP1,QRSL1 NA NA NA NA RTN4IP1 28030 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 107437804 107438343 107438064 Y NA NA NA NA NA NA C6orf203 90397 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 108169525 108169909 108169631 Y NA NA NA NA NA NA SEC63 107484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 108324190 108324471 108324239 Y NA SEC63,RPL3P7 NA NA NA NA RPL3P7 301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 108440032 108440340 108440122 Y NA OSTM1 LACE1,NR2E1,ARMC2,SESN1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 44718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 108455044 108455377 108455332 Y NA OSTM1 LACE1,ARMC2,NR2E1 IMR90 Hi-C 24141950 OSTM1 29681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 108879164 108879427 108879300 Y SESN1,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 108879521 108879931 108879808 Y SESN1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 483 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr6 108883670 108884545 108884024 Y OSTM1,FOXO3,FOXO3 FOXO3 NA NA NA NA FOXO3 4632 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 109102631 109102946 109102736 Y NA NA NA NA NA NA ARMC2 64673 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 109217323 109217611 109217483 Y FOXO3,CD164 ARMC2,RP11-249L21.4 NA NA NA NA RP11-249L21.4 9465 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 109805021 109805195 109805086 Y SESN1,SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 SMPD2,PPIL6,MICAL1,ZBTB24 NA NA NA NA ZBTB24 2581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 110858540 110858785 110858603 Y NA NA AMD1,RPF2,GTF3C6,CDK19,SLC16A10 IMR90 Hi-C 24141950 CDK19 276376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 111049772 111049981 111049963 Y NA NA NA NA NA NA CDK19 85180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 111666861 111666999 111666959 Y REV3L,FYN NA NA NA NA NA KIAA1919 88310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 111873587 111873978 111873729 Y NA NA NA NA NA NA TRAF3IP2 51503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 112055845 112056076 112055918 Y REV3L,FYN,FYN,FYN NA NA NA NA NA TRAF3IP2 130364 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 112062889 112063206 112062987 Y NA NA NA NA NA NA FYN 129449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 112364338 112364486 112364397 Y TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN TUBE1 FYN,TRAF3IP2-AS1,TRAF3IP2,REV3L IMR90 Hi-C 24141950 TUBE1 42246 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 112824431 112824764 112824616 Y NA NA FLJ34503 IMR90 Hi-C 24141950 LAMA4 250290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 113885832 113886201 113886017 Y MARCKS NA FLJ34503,MARCKS IMR90 Hi-C 24141950 MARCKS 290340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 114005806 114006016 114005966 Y NA NA NA NA NA NA MARCKS 170525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 114176108 114176553 114176196 Y MARCKS NA NA NA NA NA MARCKS 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 114478315 114478345 114478330 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 147843 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 114662111 114662444 114662262 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 114662587 114662962 114662866 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 378 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 114664746 114665107 114665068 Y NA HS3ST5 NA NA NA NA HS3ST5 2537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 115064151 115064163 115064157 Y NA NA NA NA NA NA HS3ST5 401942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 116767554 116767785 116767590 Y ZUFSP,DSE,FAM26F FAM26F NA NA NA NA FAM26F 12748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 116988703 116988966 116988944 Y DSE,ZUFSP,KPNA5 ZUFSP,KPNA5 NA NA NA NA ZUFSP 746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 118239349 118239524 118239437 Y NA SLC35F1 NA NA NA NA SLC35F1 12660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 118241546 118241910 118241839 Y NA SLC35F1 NA NA NA NA SLC35F1 14857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 119151345 119151482 119151449 Y MCM9 NA NA NA NA NA ASF1A 61902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 119218988 119219366 119219177 Y MCM9 ASF1A,MCM9 NA NA NA NA ASF1A 5604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 119606195 119606320 119606258 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 62606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 121530032 121530291 121530288 Y NA NA NA NA NA NA GJA1 224547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 121758280 121758805 121758450 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 3442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr6 121759226 121759877 121759689 Y GJA1 GJA1,RNU4-35P NA NA NA NA GJA1 4388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 121940262 121940519 121940410 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-35P 166995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 123013285 123013516 123013365 Y NA NA NA NA NA NA FABP7 85104 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 123017987 123018416 123018219 Y NA NA NA NA NA NA FABP7 80204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 125420389 125420754 125420652 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 17441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 125622252 125622475 125622321 Y NA HDDC2 NA NA NA NA HDDC2 970 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 126068034 126068254 126068125 Y HEY2 HEY2,NCOA7 NA NA NA NA HEY2 1224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr6 126108316 126108682 126108499 Y NA HEY2,NCOA7 NA NA NA NA NCOA7 8009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 126241150 126241321 126241235 Y NCOA7 HINT3 NA NA NA NA HINT3 34606 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 127638757 127639069 127638966 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 23685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 127653585 127653894 127653740 Y NA ECHDC1 NA NA NA NA ECHDC1 8860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 127958949 127959282 127959100 Y C6orf174 NA C6orf58,THEMIS IMR90 Hi-C 24141950 RP3-403A15.1 204168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 127980874 127981174 127981075 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA RP3-403A15.1 226557 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 129250577 129251100 129251039 Y NA LAMA2 NA NA NA NA LAMA2 48235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 129994496 129994751 129994657 Y ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 34619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 130005105 130005433 130005370 Y L3MBTL3,ARHGAP18 ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 23937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 130342212 130342458 130342393 Y SAMD3,SAMD3,L3MBTL3 L3MBTL3 NA NA NA NA L3MBTL3 9368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 130513480 130513753 130513616 Y NA NA NA NA NA NA TMEM200A 171126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 131375294 131375442 131375382 Y NA EPB41L2 NA NA NA NA EPB41L2 7020 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 131594186 131594488 131594335 Y AKAP7,MED23,AKAP7 NA NA NA NA NA AKAP7 139380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 131595636 131595766 131595737 Y MED23,AKAP7 NA NA NA NA NA AKAP7 140830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 131616361 131616694 131616406 Y NA NA NA NA NA NA AKAP7 161555 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 131644422 131644782 131644602 Y NA NA NA NA NA NA AKAP7 189616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr6 131961253 131961437 131961342 Y NA MED23,RNU4-18P NA NA NA NA RNU4-18P 669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 132274150 132274356 132274277 Y NA CTGF NA NA NA NA CTGF 3637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 132297518 132297793 132297656 Y NA CTGF CTGF,ENPP1,MOXD1 IMR90,H1ESC,HELA Hi-C,5C 24141950,22955621 CTGF 27005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 132787299 132787948 132787832 Y NA STX7 NA NA NA NA STX7 44389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 132812514 132812803 132812689 Y TAAR5,C6orf192,TAAR6 STX7 NA NA NA NA STX7 19534 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 134395597 134395721 134395640 Y NA SLC2A12 TBPL1,SLC2A12,HBS1L,EYA4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC2A12 23823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 134616841 134617592 134617239 Y SGK1,SGK1,SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 19658 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 134622486 134622615 134622584 Y SGK1 SGK1 NA NA NA NA SGK1 14635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 134736049 134736297 134736186 Y SGK1,SGK1 NA SGK1,LOC154092 IMR90 Hi-C 24141950 SGK1 98799 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 135346100 135346282 135346249 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 75912 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 135491546 135491834 135491743 Y NA MYB AHI1,BCLAF1,MYB IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MYB 8619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 135503898 135504621 135504156 Y HBS1L,AHI1,MYB MYB NA NA NA NA MYB 3445 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 135804002 135804049 135804028 Y NA LINC00271,AHI1 NA NA NA NA LINC00271 12440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 136174498 136174747 136174644 Y PDE7B PDE7B NA NA NA NA PDE7B 3664 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 136492327 136492682 136492505 Y NA NA NA NA NA NA BCLAF1 116307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 137181238 137181571 137181404 Y PEX7 PEX7 NA NA NA NA PEX7 39521 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 137244333 137244577 137244412 Y SLC35D3 SLC35D3 NA NA NA NA SLC35D3 2931 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 137310723 137310892 137310775 Y IL20RA,SLC35D3 NA NA NA NA NA SLC35D3 69321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 137517813 137517908 137517861 Y NA IFNGR1 NA NA NA NA IFNGR1 20678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 138194322 138194912 138194642 Y TNFAIP3 TNFAIP3 NA NA NA NA TNFAIP3 7971 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 138427134 138427492 138427302 Y PERP PERP NA NA NA NA PERP 486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr6 138821349 138821443 138821380 Y REPS1,NHSL1 NA NA NA NA NA HEBP2 98681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 7.90162070517372 chr6 139304978 139305148 139305081 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 2250 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 139348964 139349250 139349073 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 41566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 139909356 139909574 139909434 Y NA NA CITED2,LOC645434,LOC100132735,MIR3668 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CITED2 215599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 140075983 140076182 140076083 Y NA NA TXLNB,CITED2,LOC645434 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 382226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 140210036 140210207 140210122 Y NA NA CITED2,LOC100132735 IMR90 Hi-C 24141950 CITED2 516279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 141765105 141765268 141765171 Y NA NA NA NA NA NA VTA1 701099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 142091291 142091499 142091406 Y VTA1 NA NA NA NA NA VTA1 374868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr6 143150171 143150307 143150239 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP2 114031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 143163714 143164598 143164218 Y HIVEP2 NA NA NA NA NA HIVEP2 99740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 143476820 143477010 143476926 Y NA NA NA NA NA NA AIG1 97187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 143770817 143770943 143770879 Y ADAT2 ADAT2,PEX3 NA NA NA NA PEX3 873 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 147217441 147217852 147217780 Y NA NA NA NA NA NA STXBP5 305709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 148715468 148715705 148715580 Y SASH1 NA NA NA NA NA SASH1 124028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 149069640 149070024 149069807 Y UST UST NA NA NA NA UST 3176 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 149080716 149081059 149080880 Y NA UST NA NA NA NA UST 14252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 149319075 149319427 149319219 Y NA RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 32282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 149344421 149344712 149344605 Y NA RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 6997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 149352415 149352625 149352483 Y ZC3H12D,TAB2,SUMO4 RP11-162J8.3 NA NA NA NA RP11-162J8.3 706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151074633 151074860 151074746 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1L 109825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151246480 151246919 151246675 Y ZBTB2 NA NA NA NA NA MTHFD1L 61795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151248402 151248558 151248480 Y NA NA NA NA NA NA MTHFD1L 63717 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151392463 151392726 151392659 Y NA RP1-292B18.1 NA NA NA NA RP1-292B18.1 25939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151701197 151701769 151701451 Y C6orf97,ZBTB2 ZBTB2 NA NA NA NA ZBTB2 8914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151730569 151730753 151730690 Y NA ZBTB2,RMND1,C6orf211 NA NA NA NA ZBTB2 19886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 151770191 151770744 151770510 Y NA RMND1,C6orf211 NA NA NA NA RMND1 515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151803039 151803196 151803122 Y ZBTB2 RMND1,C6orf211 NA NA NA NA C6orf211 31617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 151820828 151820963 151820895 Y ZBTB2 RMND1,C6orf211 NA NA NA NA C6orf211 49406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 152085145 152085342 152085266 Y ESR1,ESR1,ESR1,ESR1 NA NA NA NA NA C6orf211 313723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 153358098 153358156 153358117 Y SYNE1,RGS17 MTRF1L NA NA NA NA MTRF1L 36278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 154505237 154505477 154505359 Y NA NA NA NA NA NA IPCEF1 170449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 154578208 154578409 154578338 Y SCAF8 NA NA NA NA NA IPCEF1 97517 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 154664890 154665258 154665161 Y IPCEF1 IPCEF1 NA NA NA NA IPCEF1 10668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr6 154800404 154800771 154800746 Y NA CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 29022 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 154830409 154830718 154830573 Y CNKSR3 CNKSR3 NA NA NA NA CNKSR3 616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr6 155593046 155593119 155593050 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 17188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 155636183 155636317 155636271 Y NA TFB1M NA NA NA NA TFB1M 2556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 156659234 156659631 156659433 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 437432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 157096939 157097165 157097038 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 157101566 157102083 157101700 Y ARID1B ARID1B NA NA NA NA ARID1B 4503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr6 157110744 157110907 157110826 Y NA ARID1B NA NA NA NA ARID1B 13681 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 157158909 157159282 157158999 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 61846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 157174408 157174845 157174627 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 77345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 157297453 157297730 157297519 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 200390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 157695432 157695688 157695582 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 46945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 158136804 158137189 158136890 Y NA NA TMEM242,SNX9,ZDHHC14 IMR90 Hi-C 24141950 SNX9 105107 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 158189433 158189765 158189601 Y SNX9 NA SNX9,SYNJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNX9 52531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 158808734 158809093 158808911 Y TMEM181 NA NA NA NA NA TMEM181 146375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 158981403 158981866 158981661 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 25935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 158982051 158982465 158982168 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 26583 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 158987674 158988091 158987879 Y NA TMEM181 NA NA NA NA TMEM181 32206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159226894 159227283 159227272 Y NA EZR NA NA NA NA EZR 11161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159271429 159272000 159271674 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159273925 159274893 159274526 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 35481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 159315379 159315577 159315478 Y NA NA NA NA NA NA EZR 76935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159360638 159360649 159360643 Y TAGAP NA EZR IMR90 Hi-C 24141950 RSPH3 58570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159495451 159495612 159495554 Y SYTL3,TAGAP TAGAP TAGAP IMR90 Hi-C 24141950 TAGAP 31267 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159525207 159525384 159525309 Y EZR,EZR,TAGAP NA TAGAP,RSPH3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TAGAP 61023 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 159624411 159624633 159624508 Y NA FNDC1 NA NA NA NA FNDC1 35982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 160141572 160141909 160141740 Y MAS1,IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 2708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr6 160532967 160533203 160533063 Y NA NA SLC22A1 IMR90 Hi-C 24141950 IGF2R 144836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 161620136 161620467 161620302 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 72626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 163107728 163108018 163107873 Y PARK2,PACRG PARK2 NA NA NA NA PARK2 38785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 163606625 163606682 163606645 Y QKI NA NA NA NA NA QKI 226350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 163817744 163818245 163818151 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 14787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 163840967 163841346 163841003 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 7935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 163950759 163951099 163950781 Y NA NA NA NA NA NA QKI 117727 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA PDE10A NA NA NA NA PDE10A 24211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 166901571 166901917 166901742 Y SFT2D1,RNASET2 NA NA NA NA NA SFT2D1 147492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 166959684 166959988 166959836 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 205605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 167234873 167234954 167234914 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 82985 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 167395299 167395692 167395496 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA RP1-167A14.2 14861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr6 167411045 167411413 167411177 Y NA RP11-514O12.4,RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP NA NA NA NA FGFR1OP 375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 167576774 167577183 167576967 Y NA NA NA NA NA NA CCR6 53479 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 167650169 167650392 167650279 Y NA UNC93A NA NA NA NA UNC93A 32265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr6 167834861 167835135 167834902 Y NA NA SMOC2 IMR90 Hi-C 24141950 UNC93A 152204 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 168250541 168251043 168250675 Y NA MLLT4 NA NA NA NA MLLT4 24939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 168356861 168357132 168356996 Y NA NA NA NA NA NA MLLT4 131259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 168558082 168558596 168558447 Y NA NA NA NA NA NA DACT2 159838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 169314330 169314429 169314380 Y NA NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 337710 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 170461964 170462067 170462016 Y NA NA LINC00574,LOC154449 IMR90 Hi-C 24141950 DLL1 135494 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr6 170467648 170467815 170467737 Y TCTE3,FAM120B NA NA NA NA NA DLL1 129746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 90518 90816 90667 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM20C 100153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 191531 191871 191582 Y FAM20C FAM20C,AC093627.12 NA NA NA NA AC093627.12 309 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 556288 556672 556400 Y LOC100288524,PDGFA PDGFA NA NA NA NA PDGFA 1261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 NA NA NA NA NA PDGFA 94709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 949613 949923 949864 Y NA GET4,ADAP1 NA NA NA NA GET4 35424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 1039490 1039728 1039629 Y NA ADAP1,COX19,GPR146 NA NA NA NA COX19 26255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 1066965 1067028 1066969 Y NA GPR146 NA NA NA NA GPR146 15184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 1198505 1198792 1198744 Y NA C7orf50,AC091729.9,ZFAND2A NA NA NA NA ZFAND2A 110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 1546091 1546367 1546260 Y NA MICALL2,AC102953.4,INTS1,MAFK NA NA NA NA INTS1 2602 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 1616013 1616182 1616098 Y ELFN1 MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 TFAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG3 7372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2063741 2064015 2063879 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 206863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2145561 2145831 2145692 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 125047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2178123 2178459 2178160 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 92419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2356665 2356933 2356799 Y NA EIF3B,SNX8 NA NA NA NA EIF3B 34788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2362962 2363263 2363259 Y AMZ1 EIF3B,SNX8 KIAA1908,PSMG3,TFAMP1,ELFN1,MAD1L1,SNX8,FTSJ2,NUDT1,EIF3B IMR90 Hi-C 24141950 EIF3B 28458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 2672306 2673216 2673099 Y LFNG,TTYH3 TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 2721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 2773642 2774144 2773933 Y SNX8,LFNG NA NA NA NA NA AMZ1 56486 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2797465 2798227 2798113 Y SNX8,LFNG,GNA12 NA NA NA NA NA AC006028.11 75028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2875013 2875360 2875015 Y NA AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 1758 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 2980860 2981267 2981182 Y NA NA NA NA NA NA GNA12 98902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 3453682 3454067 3453904 Y SDK1 NA NA NA NA NA SDK1 114602 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 4747693 4747769 4747737 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 66305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 5388439 5388783 5388611 Y NA NA NA NA NA NA TNRC18 74262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 5571351 5571818 5571666 Y WIPI2,ACTB FBXL18,ACTB NA NA NA NA FBXL18 19922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 5595490 5596184 5595557 Y CCZ1,ACTB FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 5231 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 5609221 5609424 5609333 Y FBXL18 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 7806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 5638553 5639025 5638653 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 8114 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 5718052 5718263 5718155 Y USP42 NA NA NA NA NA FSCN1 87613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 5733172 5733453 5733321 Y CCZ1,USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 85917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 5739659 5740040 5739772 Y USP42,RNF216 NA NA NA NA NA RNF216 79330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 6096315 6096609 6096412 Y EIF2AK1 PMS2,AIMP2,EIF2AK1,AC004895.4,USP42 NA NA NA NA EIF2AK1 252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 6425136 6425343 6425226 Y CCZ1,USP42 RAC1 NA NA NA NA RAC1 12982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 6467944 6468137 6468104 Y NA NA NA NA NA NA DAGLB 53684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 6473446 6473633 6473567 Y DAGLB DAGLB,KDELR2 NA NA NA NA DAGLB 48188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 6677371 6677641 6677424 Y DAGLB,ZNF12,C7orf26 C7orf26,ZNF316,AC073343.13 NA NA NA NA ZNF316 2418 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 6741580 6741996 6741754 Y C7orf26,ZNF853,C7orf28B,ZNF12 AC073343.13,ZNF12,PMS2CL NA NA NA NA ZNF12 2558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 7140103 7140511 7140281 Y C1GALT1 NA C1GALT1,LOC100131257,COL28A1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 C1GALT1 54054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 7216835 7216977 7216903 Y NA C1GALT1 C1GALT1 MCF7 ChIA-PET 22265404 C1GALT1 22270 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 7249464 7249811 7249639 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 54899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 7346319 7346471 7346390 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1 151754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 7605671 7605858 7605804 Y NA MIOS NA NA NA NA MIOS 1168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 11293871 11294115 11293993 Y NA NA NA NA NA NA PHF14 282372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 11745887 11746284 11746085 Y NA NA NA NA NA NA THSD7A 123540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 12463736 12464090 12463948 Y NA VWDE NA NA NA NA VWDE 22169 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 12755276 12755712 12755432 Y VWDE,ARL4A ARL4A NA NA NA NA ARL4A 30795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 13694099 13694114 13694107 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 334936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 13700759 13700990 13700876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 328060 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 13758700 13759051 13758876 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 269999 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 13818689 13818849 13818801 Y ETV1 NA NA NA NA NA ETV1 210201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 16095120 16095542 16095311 Y NA NA NA NA NA NA ISPD 363405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 16961680 16961908 16961842 Y NA NA AGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSPAN13 170520 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 17082630 17082968 17082726 Y AHR NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AHR 253278 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 17701568 17701856 17701681 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 SNX13 276268 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 20006905 20007156 20007031 Y TMEM196 RPL21P75 NA NA NA NA RPL21P75 33190 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 20123446 20123761 20123595 Y TWISTNB,ITGB8 NA NA NA NA NA AC005062.2 54315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 20160280 20160875 20160444 Y NA AC005062.2 NA NA NA NA AC005062.2 17201 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 20163699 20164108 20163996 Y NA AC005062.2 NA NA NA NA AC005062.2 13968 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr7 20191913 20192270 20192088 Y TWISTNB AC005062.2 NA NA NA NA AC005062.2 13837 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA NA TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MACC1 91787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8,LINC01162 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 21120779 21120894 21120878 Y NA NA NA NA NA NA LINC01162 247729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr7 21502446 21502711 21502550 Y SP4 SP4 NA NA NA NA SP4 36794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 22122992 22123068 22123014 Y NA NA RAPGEF5 IMR90 Hi-C 24141950 CDCA7L 139290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 22258487 22259062 22258816 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 274785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 22851635 22851773 22851763 Y NA TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA TOMM7 8697 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 22894313 22894860 22894668 Y STEAP1B,TOMM7 TOMM7,AC005682.5 NA NA NA NA AC005682.5 2516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 23168039 23168122 23168081 Y NA KLHL7-AS1,KLHL7 NA NA NA NA KLHL7 24686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 23348040 23348443 23348292 Y KLHL7,KLHL7,NUPL2,IGF2BP3 NA NA NA NA NA GPNMB 74454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 23411315 23411579 23411447 Y NA NA NA NA NA NA IGF2BP3 96507 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 23501559 23501943 23501874 Y NUPL2,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 6143 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 23504984 23505316 23505313 Y NA IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.74097242310423 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.94993839659819 chr7 23904639 23904947 23904793 Y NA NA NA NA NA NA AC006026.13 186234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 24626460 24626850 24626473 Y NA MPP6 NA NA NA NA MPP6 15573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 24875802 24875986 24875894 Y NA NA NA NA NA NA DFNA5 68558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 25872655 25872829 25872766 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 317031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 25892049 25892317 25892170 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2 IMR90 Hi-C 24141950 NFE2L3 297543 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 25894654 25894946 25894846 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 294914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 25980642 25980887 25980804 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 208973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 25992296 25992472 25992423 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 197388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 26118658 26118811 26118736 Y NA NA SNX10,HOXA10-HOXA9,MIR196B,HNRNPA2B1,CBX3,HOXA9,NFE2L3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 71049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 26140883 26141586 26141235 Y SNX10,SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3 NA NA NA NA NFE2L3 48274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 26193570 26193972 26193862 Y SNX10,SNX10,HNRNPA2B1 NFE2L3,CBX3,HNRNPA2B1 NA NA NA NA NFE2L3 3710 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 28172246 28172388 28172317 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 45553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 28194446 28194874 28194789 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 23067 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 29115131 29115317 29115226 Y NA CHN2 NA NA NA NA CHN2 44573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 29217860 29218383 29218096 Y CHN2,CPVL CPVL CHN2 IMR90 Hi-C 24141950 CPVL 14684 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 29382815 29383281 29382928 Y NA NA NA NA NA NA CPVL 149748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 29835746 29835982 29835865 Y NA WIPF3 NA NA NA NA WIPF3 8120 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 30005426 30005693 30005606 Y NA AC007285.6,SCRN1 NA NA NA NA AC007285.6 20523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 30387689 30388072 30387783 Y NOD1,ZNRF2 AC006978.6 NA NA NA NA AC006978.6 20915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 30636092 30636194 30636111 Y NA GGCT,GARS NA NA NA NA GARS 3795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 30658764 30658962 30658863 Y NA GARS NA NA NA NA GARS 26467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA PPP1R17 302526 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 32337399 32337512 32337422 Y PDE1C NA NA NA NA NA LSM5 195383 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 32531348 32531711 32531530 Y PDE1C,PDE1C,PDE1C LSM5,AVL9 NA NA NA NA LSM5 1184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 32929600 32929824 32929751 Y NA KBTBD2 NA NA NA NA KBTBD2 1919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr7 33079333 33079582 33079400 Y NA NA NA NA NA NA RP9 67431 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 34481286 34481294 34481290 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 538763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 36157611 36157822 36157717 Y NA EEPD1 EEPD1,KIAA0895 IMR90 Hi-C 24141950 EEPD1 32936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 36555269 36555573 36555424 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 127535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 37287550 37288249 37288116 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 198603 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 37429930 37430114 37430020 Y GPR141 NA NA NA NA NA ELMO1 56738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 37733102 37733367 37733236 Y NA GPR141,EPDR1 NA NA NA NA EPDR1 11656 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 37775903 37776023 37775962 Y ELMO1,ELMO1,TXNDC3,GPR141 NA NA NA NA NA EPDR1 54457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 39438073 39438438 39438256 Y NA NA NA NA NA NA YAE1D1 165537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 39454182 39454306 39454268 Y POU6F2 NA NA NA NA NA YAE1D1 149669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 39661364 39661771 39661496 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 282 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 39661947 39662014 39661981 Y NA RALA NA NA NA NA RALA 865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 40580986 40581112 40581049 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 593350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 40867151 40867518 40867335 Y NA NA NA NA NA NA INHBA 873188 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 40938770 40939089 40938937 Y NA NA C7orf10,LOC285954,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 801617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 42047614 42048012 42047844 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 227457 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 42118085 42118260 42118176 Y NA NA NA NA NA NA GLI3 157209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 42533163 42533415 42533331 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 257694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 42927750 42928726 42928340 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 NA NA NA NA C7orf25 21178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr7 42954351 42954549 42954430 Y NA C7orf25,MRPL32,PSMA2 C7orf25 K562 ChIA-PET 22265404 C7orf25 4447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43115932 43116315 43116148 Y NA HECW1 HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 HECW1 33883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43117230 43117632 43117554 Y NA HECW1 HECW1,MRPL32,PSMA2 IMR90 Hi-C 24141950 HECW1 32566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 5.26774713678248 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43732901 43733056 43732913 Y DBNL,STK17A NA NA NA NA NA BLVRA 63223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43740255 43740653 43740556 Y GCK NA NA NA NA NA BLVRA 55626 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 43996825 43996925 43996859 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA UBE2D4 32788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 44085815 44086626 44086335 Y STK17A,DBNL,POLM POLR2J4,DBNL,POLM NA NA NA NA DBNL 3576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 44435204 44435581 44435393 Y NA NA NA NA NA NA AC004453.8 69860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 44616133 44616490 44616314 Y NA NPC1L1,DDX56,TMED4,OGDH NA NA NA NA TMED4 3396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 44679392 44679514 44679453 Y ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH OGDH NA NA NA NA OGDH 35221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 47515604 47515892 47515680 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 104264 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47517591 47517776 47517700 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 102380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47536985 47537239 47537063 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 82917 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47575600 47575737 47575669 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 44419 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47604317 47604552 47604435 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 15604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1,C7orf57 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 48220744 48220923 48220871 Y NA NA NA NA NA NA UPP1 94519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 50682806 50683075 50682899 Y DDC NA NA NA NA NA FIGNL1 166718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 50859334 50859716 50859525 Y NA GRB10 NA NA NA NA GRB10 175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 51370562 51370701 51370648 Y COBL COBL NA NA NA NA COBL 11814 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 55063666 55063958 55063856 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 20756 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 55146809 55147410 55146997 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 62095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 55542922 55542955 55542935 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 56168682 56168929 56168809 Y ZNF713 SUMF2,CHCHD2 NA NA NA NA CHCHD2 3340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 64072607 64072919 64072776 Y NA NA NA NA NA NA ZNF680 51123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 64196878 64197130 64197096 Y NA NA NA NA NA NA ZNF138 55636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 64295695 64295915 64295830 Y ZNF680 ZNF138,ZNF273 NA NA NA NA ZNF273 32635 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 64733908 64734317 64734037 Y NA NA NA NA NA NA ZNF92 102395 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 65360437 65360759 65360712 Y NA VKORC1L1 NA NA NA NA VKORC1L1 24183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 65790150 65790379 65790243 Y RABGEF1,KCTD7,TPST1 NA LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 TPST1 121964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 66096553 66096745 66096681 Y NA KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA KCTD7 4685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 66152523 66152575 66152558 Y RABGEF1,KCTD7 RP4-756H11.3,RABGEF1 KCTD7,LOC493754,RABGEF1 IMR90 Hi-C 24141950 RABGEF1 7372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 66343310 66343680 66343495 Y NA NA C7orf42 IMR90 Hi-C 24141950 TYW1 114480 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 66783772 66783944 66783858 Y NA STAG3L4,PMS2P4 NA NA NA NA PMS2P4 17878 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 69091011 69091330 69091153 Y NA AUTS2 NA NA NA NA AUTS2 29106 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 69308115 69308415 69308239 Y AUTS2,AUTS2 NA NA NA NA NA AUTS2 246210 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 69643869 69644054 69643961 Y NA NA NA NA NA NA AUTS2 581964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 70146101 70146417 70146317 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 448738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 70160459 70160922 70160898 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 434233 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 70204788 70204872 70204831 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 390283 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 70206735 70207047 70206891 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 388108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 70253382 70253537 70253463 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 341618 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 70358448 70358664 70358566 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 236491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 70359236 70359526 70359309 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 235629 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 70931578 70931697 70931638 Y NA NA NA NA NA NA WBSCR17 336423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 72934537 72934921 72934642 Y NA BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 73153813 73154099 73154081 Y FZD9,STX1A,ABHD11,CLDN4,CLDN3 STX1A,ABHD11,CLDN3 NA NA NA NA ABHD11 2616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 73702546 73702842 73702658 Y NA RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 73785571 73785673 73785623 Y CLIP2 NA NA NA NA NA GTF2IRD1 80447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 74074203 74074528 74074318 Y LAT2,GTF2I GTF2I NA NA NA NA GTF2I 4209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 75546128 75546229 75546156 Y NA POR STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 POR 19610 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 75573320 75573489 75573400 Y POR POR,TMEM120A NA NA NA NA POR 46802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 75601289 75601466 75601374 Y NA TMEM120A NA NA NA NA TMEM120A 20511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr7 75993825 75994303 75994024 Y NA YWHAG,ZP3,SRCRB4D YWHAG MCF7 ChIA-PET 22265404 YWHAG 7477 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 77037268 77037509 77037460 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 127083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 77199277 77199536 77199359 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 34685 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 77201219 77201434 77201295 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 36627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 77428722 77429286 77429067 Y PION,PTPN12,RSBN1L,PHTF2,PHTF2 TMEM60,PHTF2 NA NA NA NA PHTF2 2600 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 78207984 78208362 78208197 Y NA NA NA NA NA NA PHTF2 781862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 79776985 79777288 79777110 Y NA GNAI1 NA NA NA NA GNAI1 15714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 80512986 80513276 80513113 Y NA SEMA3C NA NA NA NA SEMA3C 36399 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 82071570 82071737 82071656 Y NA CACNA2D1 NA NA NA NA CACNA2D1 456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 83081582 83081807 83081725 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 194519 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 83089748 83090034 83089772 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 186292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.26600322480514 chr7 83092459 83092603 83092529 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3E 183723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr7 86121271 86121385 86121277 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 565630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 86563227 86563622 86563425 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1324L 123393 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 89853540 89853813 89853643 Y NA NA NA NA NA NA GTPBP10 108724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 90236421 90236455 90236438 Y NA AC002456.2 CDK14 IMR90 Hi-C 24141950 AC002456.2 11754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 91142488 91142502 91142497 Y MTERF NA NA NA NA NA FZD1 250705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 92217809 92218139 92217980 Y NA FAM133B NA NA NA NA FAM133B 101 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92260832 92261202 92261012 Y NA FAM133B FAM133B K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM133B 43124 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92290698 92291011 92290856 Y NA NA NA NA NA NA FAM133B 72990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92361219 92361296 92361260 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 102501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 92459714 92460134 92460069 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 3663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 93426376 93426400 93426388 Y NA NA NA NA NA NA TFPI2 91903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 93807342 93807859 93807675 Y NA NA GNG11,TFPI2,GNGT1,BET1 IMR90 Hi-C 24141950 BET1 175648 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 94286949 94287416 94287082 Y PPP1R9A,PPP1R9A,CASD1,PEG10,PEG10 SGCE,PEG10,RPS3AP25 NA NA NA NA PEG10 3312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON2 NA NA NA NA PON2 32135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 95645399 95645785 95645516 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I1 245533 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 95674465 95674690 95674578 Y DYNC1I1,FLJ42280 NA NA NA NA NA DYNC1I1 274599 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 95747900 95748043 95747945 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 201416 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 95913909 95914253 95914081 Y SLC25A13 SLC25A13 NA NA NA NA SLC25A13 35206 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 96646199 96646417 96646378 Y DLX6,DLX5 DLX6,DLX5 NA NA NA NA DLX5 5992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 97994295 97994325 97994312 Y BAIAP2L1 RPS3AP26,BAIAP2L1 BRI3 IMR90 Hi-C 24141950 RPS3AP26 19571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 98907896 98908116 98908033 Y ZKSCAN5,LOC100289187 ARPC1A ARPC1A IMR90 Hi-C 24141950 ARPC1A 13405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 98970307 98970479 98970399 Y PTCD1,CPSF4 ARPC1A,ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 435 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 99000499 99000617 99000560 Y NA ARPC1B,BUD31,PDAP1,CPSF4 NA NA NA NA BUD31 3647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 99178135 99178365 99178354 Y ZNF789 ZNF655,FAM200A NA NA NA NA FAM200A 23976 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99291105 99291222 99291169 Y PTCD1,CYP3A43,CYP3A4,AZGP1,CYP3A5 NA NA NA NA NA FAM200A 136946 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99962576 99962959 99962740 Y MCM7,C7orf43,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 25045 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99965993 99966135 99966041 Y C7orf59,C7orf43,ZCWPW1,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,GIGYF1,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 28462 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 99966641 99967146 99966944 Y C7orf59,ZCWPW1,TSC22D4,SLC12A9,MEPCE,LRCH4,GNB2,PILRB,PILRA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 29110 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 100140069 100140501 100140294 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 5235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,PCOLCE,PCOLCE-AS1,MOSPD3 NA NA NA NA RP11-44M6.3 2103 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 100434359 100434559 100434459 Y SAP25,EPHB4 SLC12A9,EPHB4,RP11-126L15.4,TRIP6,SRRT EPHB4,ZAN,POP7,TRIP6,SLC12A9,LOC100129845,FBXO24,PCOLCE,MOSPD3 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHB4 11238 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 100743461 100743946 100743576 Y GNB2,TRIM56 TRIM56,SERPINE1 SERPINE1 IMR90 Hi-C 24141950 TRIM56 16741 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101062164 101062286 101062177 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 99060 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101245696 101245932 101245814 Y MOGAT3 NA NA NA NA NA CUX1 211027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101526005 101526525 101526438 Y SH2B2,CUX1,CUX1 NA NA NA NA NA CUX1 69046 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101566593 101566799 101566736 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 109634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101567515 101567769 101567671 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 110556 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101579917 101580029 101579973 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 122958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101672273 101672589 101672281 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 215314 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101690848 101690892 101690861 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 233889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 8.32304047611631 chr7 101930729 101931104 101930861 Y NA NA NA NA NA NA PRKRIP1 71215 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 101931211 101931437 101931291 Y CUX1,CUX1,CUX1,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 70882 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 102081983 102082063 102082048 Y NA ORAI2,ALKBH4,LRWD1,POLR2J NA NA NA NA ORAI2 10430 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 102958965 102959200 102958983 Y NA DPY19L2P2,PMPCB,PSMC2,DNAJC2,CTA-276O3.4 NA NA NA NA PMPCB 23096 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104008526 104008908 104008623 Y NA NA NA NA NA NA ORC5 162031 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 NA LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01004 65367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 104597631 104597869 104597756 Y MLL5 NA NA NA NA NA LINC01004 53622 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104608110 104608364 104608281 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 43127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104612836 104613032 104612935 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 38459 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104960256 104960357 104960307 Y MLL5,SRPK2 NA NA NA NA NA SRPK2 77398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 104980501 104980737 104980707 Y NA NA NA NA NA NA SRPK2 57018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 105329677 105330033 105329813 Y NA NA NA NA NA NA EFCAB10 90355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 105714803 105715079 105714993 Y NA SYPL1 NA NA NA NA SYPL1 35943 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 105766301 105766504 105766403 Y NA SYPL1 CDHR3,ATXN7L1,SYPL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SYPL1 15279 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 106209189 106209713 106209400 Y NAMPT NA CCDC71L,NAMPT,ATXN7L1,PIK3CG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC71L 89729 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 106706392 106706759 106706607 Y GPR22 PRKAR2B NA NA NA NA PRKAR2B 23298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 106901302 106901364 106901333 Y NA NA NA NA NA NA HBP1 93896 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107079032 107079264 107079148 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 122665 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107109276 107109645 107109473 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 92284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107190959 107191312 107191306 Y NA DUS4L,COG5,BCAP29 NA NA NA NA DUS4L 10617 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 107567511 107567568 107567540 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38096 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107567788 107568066 107567911 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38373 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107784751 107785008 107784880 Y NA NA NA NA NA NA LAMB1 143051 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 107923246 107923634 107923440 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 171527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107935130 107935280 107935250 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 159881 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 107952376 107952906 107952758 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 142255 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 107999064 107999449 107999339 Y NA NA NA NA NA NA NRCAM 95712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 108095684 108095814 108095727 Y NRCAM,NRCAM NRCAM NA NA NA NA NRCAM 523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 110753766 110754103 110753883 Y LRRN3 LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 24704 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 110874557 110874601 110874588 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 145495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 111627684 111628038 111627735 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 216428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 111721905 111722337 111722086 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 122129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 111832262 111832632 111832471 Y NA DOCK4,ZNF277 NA NA NA NA DOCK4 11834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 114677768 114677789 114677777 Y MDFIC NA NA NA NA NA MDFIC 117559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 116793573 116793925 116793605 Y NA NA NA NA NA NA ST7-AS1 201185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 116930307 116930575 116930441 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 173263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 117290130 117290152 117290141 Y NA NA NA NA NA NA CFTR 186292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 117472298 117472618 117472458 Y CTTNBP2 CTTNBP2 NA NA NA NA CTTNBP2 39575 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 119283625 119284006 119283817 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 261423 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 119342265 119342557 119342442 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 202872 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 119435371 119435694 119435534 Y NA NA NA NA NA NA RP11-328J2.1 109735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 121008996 121009049 121009023 Y NA FAM3C NA NA NA NA FAM3C 25369 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 121783025 121783385 121783205 Y PTPRZ1,AASS AASS NA NA NA NA AASS 691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 121874177 121874561 121874390 Y NA NA NA NA NA NA FEZF1 74184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 121955120 121955496 121955197 Y NA FEZF1 NA NA NA NA FEZF1 6375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 123387168 123387479 123387315 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 47 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 123387767 123387941 123387854 Y NA WASL NA NA NA NA WASL 646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr7 126341155 126341491 126341268 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 728487 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 126606621 126606816 126606719 Y NA NA NA NA NA NA ZNF800 463162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 128094514 128094949 128094639 Y LEP,C7orf68 IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B NA NA NA NA RP11-155G14.6 523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 3.05529333933384 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 128383172 128383597 128383318 Y NA FAM71F1,CALU,CCDC136 NA NA NA NA CALU 5826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 128471531 128472043 128471766 Y FLNC CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 3100 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr7 128472556 128472915 128472760 Y NA CCDC136,FLNC,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 4125 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 128549999 128550078 128550039 Y NA ATP6V1F,KCP NA NA NA NA KCP 1226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr7 128574660 128575408 128574748 Y ATP6V1F,IRF5,IRF5,IRF5 KCP NA NA NA NA KCP 25887 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 128696279 128696583 128696469 Y NA TNPO3 NA NA NA NA TNPO3 3081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 128958632 128958719 128958676 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 89492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 129419118 129419176 129419138 Y NA NA UBE2H,NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 169563 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr7 129420694 129421120 129420768 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 UBE2H 169669 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 129589680 129589810 129589737 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 129590044 129590333 129590306 Y NA UBE2H NA NA NA NA UBE2H 456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 129609674 129609888 129609791 Y NA UBE2H AHCYL2,ZC3HC1,SMO,UBE2H IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2H 18885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 130735932 130736596 130736429 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 56259 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 130741821 130742227 130742136 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 50628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 130799789 130800044 130799917 Y NA MKLN1,LINC-PINT NA NA NA NA LINC-PINT 6854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 131166569 131166943 131166757 Y PODXL NA NA NA NA NA PODXL 74033 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 131271012 131271384 131271093 Y NA PODXL NA NA NA NA PODXL 30036 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 131290113 131290454 131290336 Y NA PODXL PODXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PODXL 49137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 131314351 131314532 131314442 Y NA NA PODXL,MKLN1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PODXL 73375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 131581821 131581890 131581855 Y NA AC009518.4 PLXNA4 IMR90 Hi-C 24141950 AC009518.4 1421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 132212296 132212381 132212340 Y PLXNA4,PLXNA4 NA NA NA NA NA CHCHD3 552467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 132656149 132656423 132656408 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD3 108425 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 133092941 133093104 133093022 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 94774 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 133223721 133224093 133223724 Y NA NA NA NA NA NA AC083875.2 225554 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 133706471 133706698 133706584 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B4 293105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 135120473 135120740 135120725 Y NA NA NA NA NA NA CNOT4 72135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 135443440 135443607 135443468 Y FAM180A SLC13A4 C7orf73,SLC13A4 IMR90 Hi-C 24141950 SLC13A4 31434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 5.79452185046072 chr7 136495640 136495742 136495691 Y NA NA NA NA NA NA PTN 530869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 136582219 136582518 136582369 Y NA NA NA NA NA NA PTN 444093 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 137854250 137854558 137854387 Y TRIM24 NA ATP6V0A4 IMR90 Hi-C 24141950 AC008155.2 126671 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 137928273 137928746 137928445 Y AKR1D1,TRIM24 NA NA NA NA NA AC008155.2 52483 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr7 138143570 138143814 138143720 Y NA TRIM24 NA NA NA NA TRIM24 491 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 138588804 138589334 138589100 Y TRIM24,SVOPL,UBN2,LUC7L2,KIAA1549 NA NA NA NA NA KIAA1549 74730 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 138755461 138755819 138755643 Y SVOPL,ZC3HAV1 ZC3HAV1 NA NA NA NA ZC3HAV1 36646 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 138778060 138778462 138778282 Y NA ZC3HAV1,TTC26 NA NA NA NA ZC3HAV1 14003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 139358057 139358402 139358214 Y NA NA NA NA NA NA HIPK2 117175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 139366770 139367125 139366961 Y TBXAS1 NA NA NA NA NA HIPK2 108452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 139865327 139865485 139865448 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 103806 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 139929659 139930294 139929953 Y TBXAS1,RAB19,JHDM1D NA JHDM1D,LOC100134229 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP12 168138 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 139930411 139930852 139930521 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 168890 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 139930863 139931473 139931211 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 169342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 140188165 140188433 140188299 Y NA MKRN1 NA NA NA NA MKRN1 10796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 140262789 140263047 140262916 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 85420 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 140271542 140271796 140271668 Y NA NA NA NA NA NA MKRN1 94173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 140375225 140375407 140375313 Y BRAF,JHDM1D ADCK2,DENND2A,NDUFB2 NA NA NA NA DENND2A 3432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 140613036 140613224 140613135 Y NA BRAF NA NA NA NA BRAF 9340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 141492164 141492415 141492290 Y TAS2R38,OR9A4,TAS2R3,TAS2R4,TAS2R5 NA NA NA NA NA SSBP1 56043 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 141679454 141679850 141679687 Y OR9A4,CLEC5A,TAS2R38 NA NA NA NA NA SSBP1 243333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 143589612 143589642 143589628 Y OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A FAM115A NA NA NA NA FAM115A 7649 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 145925339 145925571 145925397 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1393851 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 145932628 145933064 145932806 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1401140 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 145933200 145933594 145933373 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1401712 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 145934224 145934573 145934546 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1402736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 145940282 145940834 145940467 Y NA NA NA NA NA NA TPK1 1408794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 145943025 145943194 145943108 Y CNTNAP2 NA NA NA NA NA TPK1 1411537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 148334506 148334940 148334775 Y NA NA NA NA NA NA CUL1 58066 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 148637842 148638122 148637883 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA RNY5 EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RNY5 1693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr7 148680544 148680840 148680694 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 42893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA RNY5,PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr7 148788414 148788490 148788418 Y CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 148788628 148788884 148788863 Y ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398 ZNF786,ZNF425,ZNF398 NA NA NA NA ZNF786 2754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 149112304 149112563 149112312 Y ZNF862 NA NA NA NA NA ZNF746 80345 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 149266694 149267035 149266833 Y NA NA NA NA NA NA ZNF767 52808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 150063162 150063570 150063276 Y GIMAP2 LRRC61,ACTR3C,ZNF775,RP4-584D14.6 NA NA NA NA REPIN1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 WDR86 51247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 151193551 151193826 151193799 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21380 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 151236196 151236396 151236297 Y SMARCD3,PRKAG2 RHEB NA NA NA NA RHEB 20990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 151384772 151384923 151384848 Y NA NA NA NA NA NA RHEB 169566 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 151806252 151806472 151806362 Y NA NA NA NA NA NA GALNT11 85493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 152065077 152065428 152065152 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 305822 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr7 152123020 152123275 152123182 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 247975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr7 152219127 152219295 152219254 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 151955 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 152338571 152338711 152338613 Y NA XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 32539 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 152365221 152365384 152365303 Y MLL3 XRCC2 NA NA NA NA XRCC2 5866 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 153962360 153962659 153962529 Y NA NA NA NA NA NA DPP6 380178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 154450186 154450380 154450283 Y HTR5A NA NA NA NA NA PAXIP1 342414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 155752755 155752934 155752845 Y SHH NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC009403.2 316856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157067817 157068138 157067978 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 57937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157112606 157112849 157112710 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 13226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr7 157131379 157131690 157131421 Y NA DNAJB6 NA NA NA NA DNAJB6 5304 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157225296 157225625 157225465 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 99221 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157485564 157486050 157485938 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 359489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157644571 157644735 157644629 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 518496 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr7 157809172 157809538 157809355 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 683097 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 157840945 157841296 157841083 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 654224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 158054533 158054880 158054707 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 440640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 158110398 158110735 158110581 Y NA NA NA NA NA NA NCAPG2 384785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 158603982 158604371 158604316 Y NA ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 16573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 158765978 158766170 158766074 Y NA NA NCAPG2 IMR90 Hi-C 24141950 WDR60 118709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr7 158905033 158905150 158905046 Y NA VIPR2 NA NA NA NA VIPR2 30499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1-AS1,ERICH1 NA NA NA NA ERICH1-AS1 47062 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 673804 674182 673973 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1-AS1,ERICH1 NA NA NA NA ERICH1-AS1 11469 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 841612 841879 841708 Y C8orf42 NA NA NA NA NA ERICH1 155506 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chr8 1321281 1321540 1321454 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLN8 380404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 1765271 1765682 1765322 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 4460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 1780723 1781665 1781560 Y NA ARHGEF10 NA NA NA NA ARHGEF10 10581 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 1837817 1838203 1838066 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF10 67675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 1960083 1960443 1960148 Y KBTBD11 KBTBD11,RP11-439C15.4 NA NA NA NA RP11-439C15.4 39280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 2263330 2263439 2263406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439C15.4 342527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA RP11-439C15.4 670366 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr8 6605896 6606328 6606048 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA AGPAT5 42018 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 8648502 8648712 8648579 Y NA NA NA NA NA NA CLDN23 91054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 8706541 8706605 8706573 Y NA MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 42550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 8746516 8746997 8746809 Y CLDN23 MFHAS1 NA NA NA NA MFHAS1 2158 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 8935191 8935379 8935249 Y NA NA ERI1,PPP1R3B,TNKS IMR90 Hi-C 24141950 PPP1R3B 71705 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 9040807 9041224 9041065 Y NA PPP1R3B NA NA NA NA PPP1R3B 33723 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr8 10192260 10192787 10192448 Y MSRA NA NA NA NA NA MSRA 282482 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 10764620 10764860 10764740 Y NA NA NA NA NA NA PINX1 69226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 11032163 11032532 11032339 Y NA XKR6 NA NA NA NA XKR6 24343 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 11036366 11036550 11036458 Y MTMR9,XKR6 XKR6 NA NA NA NA XKR6 20325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 12728574 12728753 12728653 Y KIAA1456 NA KIAA1456 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1456 72398 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 12834183 12834569 12834376 Y KIAA1456 KIAA1456 NA NA NA NA KIAA1456 33032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 13393176 13393534 13393351 Y DLC1 DLC1,C8orf48 DLC1 IMR90 Hi-C 24141950 DLC1 22009 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 16157966 16158245 16158150 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 853293 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 16304872 16305090 16304981 Y NA NA TUSC3 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC2 706448 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 16476986 16477261 16477122 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC2 534277 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 16965727 16966045 16965748 Y NA ZDHHC2 NA NA NA NA ZDHHC2 45493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 17769259 17769486 17769373 Y NAT1 PCM1 MTUS1,FGL1,MTMR7 IMR90 Hi-C 24141950 PCM1 8863 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 18244410 18244774 18244528 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 218424 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 18424432 18424631 18424532 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 398446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 18704322 18704730 18704574 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 235510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 19236420 19236600 19236592 Y NA NA NA NA NA NA SH2D4A 67292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 19436473 19436611 19436572 Y NA NA NA NA NA NA INTS10 236040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 19797796 19798054 19797934 Y LPL NA NA NA NA NA INTS10 125145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 20126353 20126692 20126612 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 32782 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 22778460 22778609 22778534 Y CHMP7 NA NA NA NA NA RHOBTB2 64321 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 6.11058667866767 chr8 23016406 23016568 23016458 Y ENTPD4,ENTPD4,BIN3,TNFRSF10C TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 2975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 23405243 23405645 23405476 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 20925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFL NA NA NA NA NEFL 12906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 24861094 24861317 24861155 Y NA NEFL NA NA NA NA NEFL 48470 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 26232086 26232281 26232177 Y NA BNIP3L,SDAD1P1 NA NA NA NA BNIP3L 6133 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 27464961 27465271 27465267 Y NA CLU,SCARA3 NA NA NA NA CLU 5277 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 27972693 27972953 27972823 Y NA ELP3 NA NA NA NA ELP3 27503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 28004860 28005043 28004968 Y NA NA NA NA NA NA ELP3 59670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr8 28320295 28320574 28320435 Y NA FBXO16,FZD3 NA NA NA NA FBXO16 25261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 28565617 28566294 28565942 Y EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 8636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 28569820 28569970 28569874 Y ZNF395,FZD3,EXTL3 EXTL3-AS1 NA NA NA NA EXTL3-AS1 12839 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 29848421 29848809 29848732 Y MBOAT4 NA DUSP4,C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM66 89914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 29946002 29946367 29946215 Y TMEM66,LEPROTL1 TMEM66,LEPROTL1,RPS15AP24 NA NA NA NA LEPROTL1 4547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 30262933 30263230 30262977 Y NA RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 22016 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 30326016 30326344 30326193 Y NA NA NA NA NA NA RBPMS-AS1 85099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 30580467 30580796 30580574 Y GSR GSR,UBXN8 NA NA NA NA GSR 2647 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 PURG,WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 30892930 30893420 30892948 Y NA PURG,WRN NA NA NA NA WRN 3613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 32491615 32491938 32491677 Y NRG1 NA NA NA NA NA FUT10 837002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 34682233 34682421 34682327 Y NA NA NA NA NA NA UNC5D 408554 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.74097242310423 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF703 548718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37376212 37376482 37376355 Y NA NA KCNU1,ERLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF703 174787 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37738160 37738666 37738484 Y RAB11FIP1 BRF2,RAB11FIP1 GPR124,BRF2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB11FIP1 16319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 37751458 37752024 37751766 Y NA BRF2,RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37757888 37758317 37758017 Y WHSC1L1,RAB11FIP1 RAB11FIP1 NA NA NA NA RAB11FIP1 2903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37889292 37889604 37889448 Y NA EIF4EBP1 NA NA NA NA EIF4EBP1 3433 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37929132 37929304 37929218 Y NA EIF4EBP1,ASH2L NA NA NA NA ASH2L 31456 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 37961561 37961954 37961758 Y NA ASH2L,STAR NA NA NA NA ASH2L 801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 38035023 38035257 38035173 Y WHSC1L1,LETM2,LETM2,BAG4 STAR,BAG4,LSM1,DDHD2 NA NA NA NA LSM1 2775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38312135 38312514 38312441 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 11838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr8 38313401 38313535 38313485 Y NA FGFR1 NA NA NA NA FGFR1 10817 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr8 38404543 38404848 38404696 Y FGFR1 NA FGFR1,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 80191 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 38406722 38407104 38406913 Y NA NA FGFR1,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 82370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38422408 38422610 38422509 Y NA NA LETM2,FGFR1,C8orf86,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 98056 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38433561 38433907 38433734 Y NA NA FGFR1,LETM2,RNF5P1 IMR90 Hi-C 24141950 FGFR1 109209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38770998 38771507 38771224 Y NA PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 14245 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38794203 38794537 38794324 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 38794582 38795442 38794757 Y TACC1,PLEKHA2 PLEKHA2 NA NA NA NA PLEKHA2 37829 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 40590362 40590383 40590373 Y NA NA NA NA NA NA ZMAT4 162969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41649689 41649828 41649744 Y NKX6-3 NA NA NA NA NA RP11-360L9.4 215802 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41819161 41819283 41819222 Y POLB NA NA NA NA NA KAT6A 88225 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41894654 41895622 41895417 Y NA KAT6A NA NA NA NA KAT6A 11886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 42009513 42009865 42009727 Y NA AP3M2 NA NA NA NA AP3M2 1049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 42184337 42184357 42184347 Y NA POLB NA NA NA NA POLB 9615 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 42567868 42568024 42567945 Y IKBKB,IKBKB NA NA NA NA NA THAP1 128444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 47903412 47903538 47903475 Y NA NA NA NA NA NA RPL10AP2 163203 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 48504387 48504764 48504567 Y CEBPD RP11-697N18.2 NA NA NA NA RP11-697N18.2 1216 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 48580617 48580970 48580793 Y NA NA NA NA NA NA CEBPD 68678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 48746170 48746340 48746217 Y MCM4 NA NA NA NA NA CEBPD 96522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 48853752 48854057 48853918 Y NA PRKDC,MCM4 NA NA NA NA PRKDC 16686 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 49430601 49430974 49430806 Y NA NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 135451 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 49448389 49448771 49448580 Y NA NA SNAI2,MCM4,UBE2V2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 153239 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 49467466 49467648 49467542 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 172316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 50653553 50653944 50653741 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 821254 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 50993951 50994039 50993995 Y NA NA NA NA NA NA SNAI2 1161652 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 52747281 52747589 52747434 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD1 62146 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 53188453 53188874 53188470 Y NA NA NA NA NA NA RP11-110G21.1 378568 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 54636276 54636450 54636366 Y NA NA NA NA NA NA ATP6V1H 117668 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 54798731 54798762 54798749 Y NA ATP6V1H,RGS20 NA NA NA NA RGS20 36363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 54884595 54884649 54884642 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 48440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 54884977 54885679 54885327 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 47410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 56068878 56069211 56068948 Y XKR4 NA NA NA NA NA TGS1 614490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 56744320 56744391 56744354 Y TGS1 LYN NA NA NA NA LYN 45981 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 56832047 56832488 56832183 Y LYN LYN NA NA NA NA LYN 41675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 57122742 57122884 57122813 Y NA PLAG1,CHCHD7 NA NA NA NA CHCHD7 497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 59878188 59878486 59878337 Y NA NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 151113 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 59959496 59959676 59959637 Y TOX NA NA NA NA NA RP11-25K19.1 69923 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 59980234 59980420 59980383 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 49179 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 60010619 60010999 60010857 Y NA RP11-25K19.1,TOX NA NA NA NA RP11-25K19.1 18600 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 60158285 60158455 60158370 Y TOX NA NA NA NA NA TOX 128518 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 61511489 61511770 61511631 Y NA NA NA NA NA NA CHD7 77567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 61592861 61593584 61592948 Y NA CHD7 NA NA NA NA CHD7 3524 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 61657043 61657068 61657053 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 67706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 61821464 61821801 61821596 Y CHD7 NA NA NA NA NA CHD7 232127 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 61835199 61835395 61835305 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 245862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr8 61917184 61917283 61917226 Y CLVS1 NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 327847 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 62427686 62427987 62427837 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 197168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 62566892 62567143 62567071 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 58012 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 62724421 62724682 62724552 Y NA NA GGH IMR90 Hi-C 24141950 MIR4470 99074 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 64908546 64908816 64908686 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE22 581998 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 65282966 65283235 65283141 Y NA NA NA NA NA NA BHLHE22 207579 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 65684237 65684466 65684340 Y BHLHE22,CYP7B1 CYP7B1 NA NA NA NA CYP7B1 24852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 67454365 67454567 67454497 Y NA NA NA NA NA NA MYBL1 69915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 70042378 70042779 70042585 Y NA NA NA NA NA NA RP11-159H10.3 701567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 70982774 70982831 70982803 Y PRDM14 PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA PRDM14 846 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr8 70985003 70985175 70985161 Y NA PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA PRDM14 3075 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr8 71031909 71031920 71031915 Y NA PRDM14,RNU1-101P,RP11-152C15.1 NA NA NA NA RP11-152C15.1 17495 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 71149519 71149670 71149631 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 135105 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1,RP11-382J12.1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 72585850 72585920 72585905 Y NA RP11-1144P22.1 NA NA NA NA RP11-1144P22.1 315 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 72628483 72628731 72628610 Y NA RP11-1144P22.1 NA NA NA NA RP11-1144P22.1 42948 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 72668111 72668208 72668160 Y NA NA NA NA NA NA RP11-1144P22.1 82576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr8 72745133 72745517 72745318 Y MSC MSC NA NA NA NA MSC 9186 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 72753377 72753463 72753388 Y NA MSC NA NA NA NA MSC 1240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 72922675 72922996 72922837 Y NA NA NA NA NA NA MSC 167972 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 73008234 73008433 73008334 Y NA NA TRPA1,LOC100132891 IMR90 Hi-C 24141950 MSC 253531 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 73559096 73559368 73559359 Y KCNB2 NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 232607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 73605435 73605486 73605461 Y KCNB2,TERF1 NA NA NA NA NA RP11-1145L24.1 186489 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 75221301 75221616 75221459 Y NA GDAP1,JPH1 NA NA NA NA GDAP1 9749 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 75605656 75605872 75605764 Y NA NA NA NA NA NA RP11-730G20.2 91177 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 75748881 75749089 75748985 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 145661 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 76035291 76035498 76035400 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 140541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 76131324 76131607 76131526 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 236574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr8 76148779 76148868 76148824 Y NA NA NA NA NA NA CRISPLD1 254029 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 80696342 80696550 80696513 Y HEY1 HEY1 MRPS28,HEY1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEY1 18244 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 80859511 80859794 80859653 Y NA NA NA NA NA NA MRPS28 80730 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 81041762 81041917 81041834 Y TPD52 NA NA NA NA NA TPD52 99550 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 81695028 81695405 81695288 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB10 299174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 81893837 81894122 81894063 Y PAG1 NA NA NA NA NA PAG1 128181 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 82167350 82167604 82167486 Y NA FABP5,RP11-363E6.3 ZNF704,PAG1,FABP12 IMR90 Hi-C 24141950 FABP5 22994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 87475103 87475472 87475288 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 19587 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 88655608 88655638 88655622 Y NA NA NA NA NA NA MMP16 682616 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 90479154 90479488 90479317 Y NA NA NA NA NA NA RP11-37B2.1 288467 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 90899646 90899998 90899819 Y RIPK2,OSGIN2 OSGIN2 OSGIN2,RIPK2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 OSGIN2 12089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 95433210 95433488 95433370 Y NA NA NA NA NA NA RAD54B 51849 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 96197025 96197314 96197170 Y NA NA PLEKHF2,C8orf69 IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHF2 52993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 97866979 97867264 97866987 Y PGCP NA NA NA NA NA SDC2 363400 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 98304769 98305167 98304968 Y NA NA PTDSS1,CPQ,TSPYL5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTDH 349240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 98795675 98796209 98795739 Y NA LAPTM4B NA NA NA NA LAPTM4B 10390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 98841899 98841938 98841919 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 33344 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 98843281 98843693 98843349 Y POP1 RPS23P1,MATN2 NA NA NA NA RPS23P1 31589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3 NA NA NA NA STK3 247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 101773934 101774280 101774106 Y NA PABPC1 SNX31,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 40897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr8 101927731 101928052 101928034 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 35564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 102149452 102149813 102149564 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 66608 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 102373140 102373427 102373201 Y NA NACAP1 GRHL2,NACAP1,NCALD IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NACAP1 1118 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 102478937 102479163 102479080 Y NA GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 23497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 102505547 102505759 102505677 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 2887 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 102505982 102506363 102506168 Y GRHL2 GRHL2 NA NA NA NA GRHL2 3322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 103549220 103549421 103549330 Y NA NA UBR5,ODF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF10 116709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 103743323 103743460 103743418 Y NA NA KLF10 IMR90 Hi-C 24141950 KLF10 77193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 103858397 103858789 103858587 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 NA NA NA NA KB-1507C5.2 15739 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 103918538 103918841 103918687 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90 Hi-C 24141950 AZIN1 14446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 104331705 104332089 104331783 Y RIMS2 FZD6,CTHRC1 NA NA NA NA FZD6 23044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 104553511 104553813 104553575 Y NA RP11-1C8.4,RP11-5A11.1 NA NA NA NA RP11-5A11.1 15804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 105342972 105343307 105343226 Y NA NA DPYS IMR90 Hi-C 24141950 LRP12 255945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 107709391 107709773 107709582 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 1150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 108508143 108508403 108508294 Y ANGPT1 NA NA NA NA NA TAGLN2P1 799902 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 109222483 109222836 109222544 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 222726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 109230205 109230491 109230349 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 215071 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 113119329 113119491 113119407 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 1267407 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 115707569 115707650 115707588 Y NA NA NA NA NA NA RP11-267L5.1 415273 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 116678291 116678885 116678654 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 141014 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 117378539 117378781 117378660 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 397961 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 117711370 117711748 117711590 Y NA NA NA NA NA NA UTP23 64994 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 118743302 118743393 118743321 Y NA NA EXT1,MED30,SAMD12 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 212350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 120575715 120576057 120575886 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 107636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 120591382 120591641 120591509 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 92052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 120609076 120609341 120609202 Y NA NA NA NA NA NA ENPP2 74352 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 120995010 120995163 120995088 Y DEPTOR NA NA NA NA NA COL14A1 74856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 122499627 122499835 122499731 Y NA NA HAS2 IMR90 Hi-C 24141950 HAS2 151795 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 124478396 124478824 124478461 Y NA NA FBXO32,ANXA13,FAM91A1 IMR90 Hi-C 24141950 WDYHV1 51431 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 125367728 125368050 125367886 Y TRMT12,TATDN1,NDUFB9 TMEM65 NA NA NA NA TMEM65 14883 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr8 125513273 125513673 125513472 Y NA RNF139-AS1,RNF139,NDUFB9,TATDN1 NA NA NA NA RNF139 28294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126037665 126038021 126037843 Y NA SQLE NA NA NA NA SQLE 28926 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126354343 126354802 126354718 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 85761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 126441416 126441734 126441625 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 TRIB1 NA NA NA NA TRIB1 853 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 127391569 127391909 127391842 Y NA NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 176211 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 127422712 127423196 127422971 Y NA NA FAM84B MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-89K10.1 144924 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 127489107 127489187 127489147 Y FAM84B NA NA NA NA NA RP11-89K10.1 78933 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 127837362 127837443 127837401 Y FAM84B NA PVT1,MYC,LOC727677 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM84B 268724 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 127938432 127938773 127938643 Y NA NA NA NA NA NA FAM84B 369794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 128099457 128099542 128099514 Y NA NA NA NA NA NA POU5F1B 324993 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr8 128112845 128113195 128113019 Y NA NA NA NA NA NA POU5F1B 311340 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 128353206 128353555 128353361 Y NA NA LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 POU5F1B 70980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 128734724 128735010 128734826 Y NA MYC NA NA NA NA MYC 10670 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 128888391 128888698 128888485 Y NA NA NA NA NA NA PVT1 83612 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 129002909 129003328 129003001 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 17529 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 129614909 129615287 129615035 Y NA NA MYC IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-25P 594052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 130527330 130527562 130527488 Y NA NA PVT1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM49B 499813 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 130897837 130898360 130898140 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 129015 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 130983929 130984348 130984047 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 43027 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 130996080 130996422 130996182 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30953 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131058084 131058195 131058140 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 30709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131089372 131089764 131089568 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 61997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131232940 131233341 131233190 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 205565 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131289962 131290145 131290029 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 163761 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131454495 131454885 131454765 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 589 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131456841 131457348 131457080 Y NA ASAP1 NA NA NA NA ASAP1 2935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 131495645 131495684 131495664 Y NA ASAP1 ASAP1 IMR90 Hi-C 24141950 ASAP1 41739 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr8 132616158 132616501 132616166 Y NA NA NA NA NA NA EFR3A 297834 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 134387761 134388081 134387916 Y NA ST13P6 TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P6 30168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 135628946 135629314 135629008 Y NA NA NA NA NA NA ZFAT 93978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 136623331 136623657 136623494 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 129081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 141707505 141707982 141707957 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 188108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 142082969 142083325 142083150 Y NA DENND3 PTK2,DENND3,EIF2C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND3 42052 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr8 142413850 142414371 142414167 Y DENND3,SLC45A4 GPR20,PTP4A3 PTP4A3,FLJ43860 IMR90 Hi-C 24141950 PTP4A3 13757 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 142424633 142425265 142424919 Y NA GPR20,PTP4A3,HNRNPA1P38 NA NA NA NA PTP4A3 24540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 143405050 143405259 143405133 Y TSNARE1 NA NA NA NA NA TSNARE1 77342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 NA BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 51397 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 144328155 144328364 144328211 Y NA ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA ZFP41 875 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr8 144843026 144843252 144843141 Y NA MAPK15,FAM83H SCRIB,PUF60 IMR90 Hi-C 24141950 FAM83H 29055 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 145129247 145129547 145129402 Y GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EXOSC4 1982 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 2241493 2241738 2241696 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 228151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 2279055 2279418 2279226 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA2 265713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 4605042 4605137 4605069 Y NA NA NA NA NA NA PPAPDC2 55161 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr9 4656742 4656927 4656747 Y PPAPDC2,CDC37L1,C9orf68 PPAPDC2,CDC37L1 NA NA NA NA PPAPDC2 3371 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chr9 4738592 4738723 4738708 Y NA AK3 NA NA NA NA AK3 1320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 4829866 4830028 4829909 Y NA RCL1 NA NA NA NA RCL1 38997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 5451547 5451984 5451704 Y JAK2,KIAA1432,CD274 CD274 NA NA NA NA CD274 3044 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 5879621 5879741 5879699 Y NA ERMP1 ERMP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ERMP1 48504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 6384866 6385180 6385056 Y NA UHRF2 NA NA NA NA UHRF2 25971 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 6603497 6603679 6603588 Y KDM4C RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6 NA NA NA NA RP11-106A1.2 33460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 8495779 8496144 8495966 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 215167 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 8576629 8576984 8576673 Y NA NA NA NA NA NA RP11-134K1.2 134327 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 8675420 8675557 8675548 Y NA RP11-134K1.2 NA NA NA NA RP11-134K1.2 35754 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 9469595 9469625 9469608 Y NA NA NA NA NA NA RPS26P3 380719 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 12421960 12422048 12422006 Y NA NA NA NA NA NA MPDZ 855541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA ZDHHC21 368559 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr9 15513029 15513231 15513175 Y NA PSIP1,FTH1P12 NA NA NA NA PSIP1 4012 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 16515842 16516452 16516406 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 208360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chr9 16521914 16522385 16522163 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 202427 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 16729817 16729878 16729869 Y BNC2 RP11-62F24.2 NA NA NA NA RP11-62F24.2 5005 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 16869534 16869976 16869661 Y BNC2 BNC2 NA NA NA NA BNC2 693 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 16985936 16986021 16986007 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 BNC2 117095 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 17520540 17520838 17520658 Y NA NA NA NA NA NA SH3GL2 56242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 17580370 17580488 17580383 Y NA SH3GL2 NA NA NA NA SH3GL2 3290 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 18768460 18768476 18768467 Y ADAMTSL1 NA NA NA NA NA RP11-296P7.4 256414 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 19252213 19252529 19252372 Y NA NA NA NA NA NA PLIN2 104925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr9 19642332 19642566 19642449 Y SLC24A2 NA NA NA NA NA SLC24A2 142360 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 20356496 20357005 20356641 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 263537 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 20793724 20794222 20793867 Y NA NA NA NA NA NA MLLT3 173182 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 21809706 21810111 21809856 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 9164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 23850835 23851256 23851099 Y NA ELAVL2 NA NA NA NA ELAVL2 26500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 27333351 27333416 27333383 Y IFT74,IFT74,MOBKL2B,C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA MOB3B 194363 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 27365157 27365383 27365271 Y MOBKL2B NA NA NA NA NA MOB3B 162396 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 27518919 27519184 27519052 Y NA MOB3B NA NA NA NA MOB3B 8595 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 27733799 27733931 27733865 Y C9orf72,C9orf72 NA NA NA NA NA C9orf72 161935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 28649799 28650020 28649948 Y LINGO2 NA NA NA NA NA C9orf72 1077935 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 29213900 29214394 29214154 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 1472709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 29825337 29825639 29825488 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 861464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 29826048 29826378 29826215 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860725 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33017262 33017602 33017524 Y NA APTX,DNAJA1 DNAJA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 APTX 5564 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33028063 33028460 33028077 Y NA APTX,DNAJA1,SMU1 NA NA NA NA DNAJA1 4854 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33268680 33268843 33268732 Y NA BAG1,CHMP5,NFX1 NA NA NA NA CHMP5 5740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33329062 33329543 33329355 Y NA NFX1 NA NA NA NA NFX1 40553 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33445339 33445789 33445589 Y AQP3 NOL6 NA NA NA NA AQP3 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 33953868 33954185 33954034 Y UBE2R2,UBAP1 NA NA NA NA NA UBAP2 92762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 34158490 34158839 34158617 Y NA DCAF12,UBAP1,AL353662.2 DCAF12,UBAP1,KIF24,NUDT2,PRSS3,UBAP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBAP1 18164 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 34233080 34233513 34233116 Y NA AL353662.2,RP11-571F15.3 NA NA NA NA RP11-571F15.3 10454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 34394792 34394981 34394887 Y NA KIAA1161 NA NA NA NA KIAA1161 19941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 34577617 34577859 34577738 Y ARID3C,DNAJB5,DNAJB5,CNTFR,CNTFR CNTFR,DCTN3 NA NA NA NA CNTFR 10262 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 35116905 35117142 35117025 Y NA VCP,FANCG,PIGO,STOML2,FAM214B,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 2567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 35490989 35491345 35491127 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 2865 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 FAM166B,TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chr9 35726275 35726587 35726326 Y NA TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2 NA NA NA NA CREB3 3745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 35769980 35770349 35770169 Y NA CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,SPAG8,TMEM8B,HINT2 NA NA NA NA GBA2 21997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 35971862 35972364 35972237 Y NA YBX1P10 C9orf128,HRCT1,LOC158376,FP588,RECK IMR90 Hi-C 24141950 YBX1P10 1547 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 36037997 36038326 36038187 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 3567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36154326 36154976 36154382 Y TLN1,GLIPR2 GLIPR2,CLTA NA NA NA NA GLIPR2 19594 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36621370 36621719 36621545 Y NA NA NA NA NA NA MELK 50511 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 36764861 36764955 36764921 Y RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 194002 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 36765862 36766252 36766147 Y RNF38,RNF38 NA MELK IMR90 Hi-C 24141950 MELK 195003 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 36924974 36925090 36925030 Y MELK NA NA NA NA NA ZCCHC7 193446 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 37295997 37296383 37296038 Y PAX5,ZCCHC7,FRMPD1 NA NA NA NA NA GRHPR 124280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 37771609 37771892 37771762 Y NA DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 26607 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 37859471 37859543 37859507 Y NA NA NA NA NA NA EXOSC3 60037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 38016375 38016730 38016641 Y NA RP11-613M10.9 NA NA NA NA RP11-613M10.9 49954 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 38689769 38689953 38689855 Y NA NA NA NA NA NA ANKRD18A 114565 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 68417391 68418146 68417579 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 35229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 68419808 68420298 68419990 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 33077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 68429583 68429926 68429755 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 23449 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chr9 71734977 71735184 71735061 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 71922503 71922965 71922747 Y NA NA FAM189A2 IMR90 Hi-C 24141950 TJP2 188294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 73701762 73702162 73701962 Y TRPM3 NA NA NA NA NA RPL35AP21 500355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 74371995 74372048 74372016 Y NA NA NA NA NA NA TMEM2 57558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 74581601 74581796 74581711 Y NA NA NA NA NA NA C9orf85 57175 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 75125387 75125400 75125394 Y TMC1 NA TMC1,ZFAND5 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND5 147224 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 75821701 75822084 75821998 Y ANXA1 NA RORB IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 57028 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 79018113 79018533 79018297 Y NA RFK,GCNT1 NA NA NA NA RFK 10680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 79207752 79208113 79207774 Y NA AL161626.1 NA NA NA NA AL161626.1 23021 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 79266452 79266571 79266515 Y NA NA NA NA NA NA AL161626.1 81721 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 80911003 80911373 80911119 Y PSAT1 PSAT1 NA NA NA NA PSAT1 944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 81131124 81131152 81131138 Y CEP78 NA NA NA NA NA PSAT1 221065 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 81977149 81977423 81977213 Y NA CHCHD2P9 NA NA NA NA CHCHD2P9 26796 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 82213229 82213622 82213243 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 28541 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 85378567 85378941 85378719 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 297151 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 85478657 85478918 85478814 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 197174 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 85498647 85499068 85498841 Y NA NA NA NA NA NA RASEF 177024 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 86239584 86239974 86239757 Y NA NA NA NA NA NA RP11-522I20.3 80535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 86911270 86911583 86911478 Y NA NA NA NA NA NA RMI1 317644 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 88264467 88264715 88264594 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 90229 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 88286391 88286647 88286519 Y NA NA NA NA NA NA AGTPBP1 68297 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 88298792 88299000 88298900 Y AGTPBP1 NA NA NA NA NA AGTPBP1 55944 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 88902044 88902242 88902143 Y NA ISCA1 NA NA NA NA ISCA1 6368 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 89422548 89422732 89422697 Y NA NA NA NA NA NA GAS1 137372 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 89627893 89628105 89627999 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 3326 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 89952631 89952908 89952845 Y NA NA DAPK1,LOC440173 IMR90 Hi-C 24141950 DAPK1 157235 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90166692 90166955 90166778 Y NA RP11-40C6.2 NA NA NA NA RP11-40C6.2 28475 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90195086 90195422 90195273 Y DAPK1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 56869 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90279667 90279982 90279701 Y NA NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 141450 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90300483 90300753 90300664 Y CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 162266 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90337110 90337856 90337443 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA RP11-40C6.2 198893 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90386290 90386442 90386322 Y NA NA NA NA NA NA CDK20 201226 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 90408310 90408593 90408480 Y DAPK1,CTSL1 NA NA NA NA NA CDK20 179075 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 90728260 90728622 90728394 Y NA NA NA NA NA NA CDK20 140592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 91147328 91147523 91147436 Y NXNL2 NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 493 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 NA NA NA NA NA CKS2 128444 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr9 91841165 91841448 91841286 Y NA NA SHC3,LOC286238 IMR90 Hi-C 24141950 CKS2 82665 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 92050487 92050811 92050719 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 60234 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 92057683 92058183 92058056 Y NA NA NA NA NA NA SEMA4D 52862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 92218643 92218902 92218819 Y GADD45G GADD45G NA NA NA NA GADD45G 715 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 92218967 92219282 92219262 Y NA GADD45G NA NA NA NA GADD45G 1039 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 94123007 94123342 94123181 Y NA AUH NA NA NA NA AUH 812 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 94440822 94441006 94440914 Y NA NA SYK,AUH,LOC100129316,NFIL3,MIR3910-2,MIR3910-1,ROR2 IMR90 Hi-C 24141950 NFIL3 256678 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 94872861 94873095 94872978 Y NA SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 2571 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 95055002 95055331 95055316 Y IPPK IARS,CENPP,NOL8 NA NA NA NA IARS 964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 95452860 95453088 95452974 Y NA IPPK NA NA NA NA IPPK 22313 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 95845794 95846166 95845981 Y NINJ1,C9orf89 SUSD3,C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 10334 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 96044305 96044695 96044445 Y NA NA NA NA NA NA NINJ1 149735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 96057122 96057472 96057169 Y ZNF484,ZNF484,WNK2 NA NA NA NA NA FAM120A 154532 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90963 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90183 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.15890437009214 chr9 97631649 97631973 97631839 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 144666 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 97699905 97700054 97699963 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 212922 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 97839686 97839862 97839737 Y PTCH1 NA NA NA NA NA FANCC 238129 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 98173547 98173783 98173614 Y NA RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 13295 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 98210362 98210561 98210462 Y PTCH1 RP11-435O5.2 NA NA NA NA RP11-435O5.2 23284 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 98273012 98273438 98273114 Y C9orf102,FANCC,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 3901 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 98315655 98315762 98315709 Y NA PTCH1 C9orf102,FBP1,FANCC,LOC158434,HSD17B3 IMR90 Hi-C 24141950 PTCH1 38316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 98527125 98527421 98527164 Y NA NA LOC158435,LINC00476,C9orf102 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00476 108838 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 98823604 98823957 98823737 Y NA NA PTCH1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 82332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 98931605 98932004 98931930 Y NA EIF4BP3 FBP1,FANCC,LOC158435,LOC100507346,PTCH1,LOC158434 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4BP3 25316 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 99976780 99977107 99976893 Y NA ZNF322P1,RP11-498P14.5 NA NA NA NA ZNF322P1 16870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 100860253 100860371 100860321 Y C9orf156 NANS,TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 19123 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 100880203 100880431 100880317 Y C9orf156,HEMGN,TRIM14,TRIM14 TRIM14 NA NA NA NA TRIM14 709 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 101572840 101572995 101572898 Y GALNT12 ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA GALNT12 4859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 102585833 102586368 102586147 Y ERP44,NR4A3 RP11-554F20.1 NA NA NA NA RP11-554F20.1 5662 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 102908427 102908826 102908633 Y NA ERP44,INVS NA NA NA NA INVS 48889 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr9 103029299 103029483 103029391 Y NA NA NA NA NA NA TEX10 83738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 103253539 103253903 103253550 Y NA NA MURC IMR90 Hi-C 24141950 TMEFF1 50979 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 103317087 103317229 103317158 Y C9orf30-TMEFF1,TMEFF1,LPPR1 NA NA NA NA NA TMEFF1 114527 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 107755412 107756258 107755691 Y ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ABCA1 66894 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr9 107825868 107826462 107826154 Y FSD1L,FSD1L,ABCA1 NA ABCA1,SLC44A1 IMR90 Hi-C 24141950 ABCA1 137350 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 108005367 108005618 108005429 Y NA SLC44A1 NA NA NA NA SLC44A1 464 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 108816875 108817079 108816977 Y TAL2 NA NA NA NA NA TMEM38B 362050 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 109623887 109624414 109624068 Y ZNF462 ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 509 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 109627297 109627657 109627483 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 109655091 109655246 109655169 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 31713 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 109714113 109714149 109714131 Y NA NA NA NA NA NA ZNF462 90735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 109933165 109933377 109933258 Y KLF4 NA ZNF462,MIR548Q,RAD23B IMR90 Hi-C 24141950 RAD23B 110041 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 110512153 110512586 110512216 Y KLF4 NA KLF4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-438P9.1 217482 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr9 111003656 111003963 111003923 Y NA NA KLF4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-220D10.1 383150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 111482488 111482546 111482517 Y NA NA NA NA NA NA RP11-220D10.1 95375 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 112547899 112548110 112547990 Y NA PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 7130 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 112569081 112569243 112569086 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 28312 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 26333 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 112827825 112828236 112827913 Y AKAP2 RP11-151F5.2 NA NA NA NA RP11-151F5.2 42187 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 112903621 112903940 112903708 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 112980 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 113014576 113014999 113014920 Y AKAP2,TXN TXN NA NA NA NA TXN 1921 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 114292075 114292469 114292256 Y NA KIAA0368,ZNF483 NA NA NA NA ZNF483 6636 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 115067475 115067560 115067518 Y SNX30,ROD1,KIAA1958,HSDL2 PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 26387 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 115071018 115071139 115071076 Y NA PTBP3 NA NA NA NA PTBP3 22808 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 115110736 115110930 115110781 Y NA PTBP3,HSDL2 NA NA NA NA PTBP3 16789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 115440529 115440762 115440646 Y NA NA NA NA NA NA RP11-276E15.4 69974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 116918999 116919461 116919193 Y NA COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 3159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 117134599 117134885 117134873 Y NA NA NA NA NA NA DFNB31 130845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 117171817 117171955 117171874 Y TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 NA NA NA NA NA DFNB31 93775 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 117176279 117176545 117176480 Y TNFSF15,TNFSF15,DFNB31,ATP6V1G1 NA NA NA NA NA DFNB31 89185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 117345821 117345927 117345874 Y NA ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2099 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 117351016 117351370 117351316 Y TNFSF8,AKNA,DFNB31,DFNB31,ATP6V1G1 ATP6V1G1,C9orf91 NA NA NA NA ATP6V1G1 2990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 117770700 117771226 117771039 Y ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF8 NA NA NA NA NA TNC 107310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 117942308 117942603 117942434 Y NA NA NA NA NA NA TNC 63772 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 118496415 118496674 118496563 Y NA NA NA NA NA NA TNC 617879 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 119034263 119034570 119034504 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 413011 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 119066427 119066819 119066625 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 380762 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 119084686 119084813 119084781 Y NA NA NA NA NA NA TRIM32 362768 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 120523356 120523735 120523438 Y NA NA NA NA NA NA ASTN2 348008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 123640419 123640826 123640772 Y NA PHF19 NA NA NA NA PHF19 2813 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 123983385 123983622 123983510 Y TRAF1,TRAF1,GSN GSN,RAB14 GSN,GGTA1P IMR90 Hi-C 24141950 RAB14 93 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chr9 124383753 124383935 124383823 Y DAB2IP NA NA NA NA NA DAB2IP 56417 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 124498744 124498978 124498839 Y GSN NA NA NA NA NA DAB2IP 171408 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chr9 124499221 124499709 124499392 Y NA NA NA NA NA NA DAB2IP 171885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.36961425556344 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 125956223 125956395 125956307 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72460 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 125956755 125956816 125956769 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 72039 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 126002195 126002288 126002252 Y OR1L6,RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,GPR21,STRBP,STRBP STRBP NA NA NA NA STRBP 26567 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 126302696 126302988 126302896 Y LHX2 NA NA NA NA NA CRB2 186247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 126632279 126632299 126632291 Y NA NA NA NA NA NA DENND1A 58132 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 126780358 126780798 126780587 Y NA LHX2 NA NA NA NA LHX2 18409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 127356039 127356231 127356145 Y NA NA NA NA NA NA MIR181A2HG 62515 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 127433186 127433516 127433351 Y NR6A1 MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 14440 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 128172483 128172773 128172647 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 150410 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 128211957 128212104 128212028 Y NA NA NA NA NA NA GAPVD1 189884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 128651913 128652195 128652163 Y FAM125B NA NA NA NA NA PBX3 144289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 129263295 129263658 129263477 Y FAM125B,RALGPS1,RALGPS1,LMX1B NA NA NA NA NA ZBTB43 301627 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 129590383 129590427 129590410 Y ZBTB43 ZBTB43,ZBTB34 NA NA NA NA ZBTB43 25098 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 129892046 129892350 129892198 Y LRSAM1,RALGPS1,RALGPS1 ANGPTL2 NA NA NA NA ANGPTL2 8884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 130736209 130736450 130736330 Y NA DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 4342 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 130743802 130743907 130743855 Y FAM102A DPM2,FAM102A NA NA NA NA FAM102A 3010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 130764123 130764312 130764223 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS FAM102A FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM102A 23331 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 131127114 131127521 131127297 Y SLC25A25 COQ4,TRUB2,SLC27A4,URM1,CERCAM NA NA NA NA URM1 4077 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 131929415 131929566 131929473 Y METTL11A,C9orf106 IER5L NA NA NA NA IER5L 8974 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132114489 132114812 132114671 Y NA RP11-65J3.1 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50 MCF7,HELA,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 RP11-65J3.1 21910 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132115283 132115797 132115318 Y NA RP11-65J3.1 PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50 MCF7,HELA,K562,IMR90 ChIA-PET,5C,Hi-C 22265404,22955621,24141950 RP11-65J3.1 22704 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chr9 132244062 132244824 132244277 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 332 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132257886 132258547 132258348 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 14156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chr9 132319720 132320056 132319894 Y DOLPP1 NA FAM73B,DOLPP1,IER5L,LOC100506190,METTL11A,PPP2R4,C9orf106,C9orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 75990 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132330057 132330508 132330201 Y NA NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71936 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 132349858 132350089 132350073 Y NA NA LOC100506190,IER5L,C9orf50 MCF7 ChIA-PET 22265404 ASB6 52355 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132359283 132359664 132359324 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6 ASB6 NA NA NA NA ASB6 42780 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132373475 132373922 132373518 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 28522 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132646480 132646964 132646831 Y ASB6,C9orf78,USP20,USP20,FNBP1 NA NA NA NA NA C9orf78 50338 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 132712659 132713039 132713009 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 90434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 133001906 133002144 133002026 Y NA HMCN2 NA NA NA NA HMCN2 42738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 133736245 133736518 133736410 Y ABL1 NA NA NA NA NA FIBCD1 76155 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.95168230857553 chr9 134498956 134499243 134499097 Y NA NA NA NA NA NA UCK1 94301 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 134613837 134614689 134614350 Y RAPGEF1,RAPGEF1 RAPGEF1 NA NA NA NA RAPGEF1 376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 135016724 135016887 135016786 Y NA NTNG2 MED27,RAPGEF1,NTNG2,SETX IMR90 Hi-C 24141950 NTNG2 18447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 135197315 135197652 135197484 Y NA SETX NA NA NA NA SETX 30720 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 135407168 135407533 135407169 Y C9orf171,C9orf9,AK8 NA NA NA NA NA TTF1 126959 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 135989897 135990476 135990426 Y SLC2A6,RPL7A,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 46825 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 136284309 136284583 136284382 Y C9orf96 SURF4,C9orf96,REXO4 NA NA NA NA REXO4 3145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 137231518 137231916 137231717 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 24574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 137302036 137302210 137302202 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 95092 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 137550194 137550363 137550309 Y NA COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 18574 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 137837926 137838295 137837954 Y NA NA LOC100130954,FCN2,LOC100506599 IMR90 Hi-C 24141950 OLFM1 126973 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 138852334 138852387 138852361 Y CARD9 UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 1108 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 138986008 138986159 138986118 Y NACC2 NACC2,C9orf69 NA NA NA NA NACC2 877 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 139237317 139237472 139237398 Y GPSM1 GPSM1,DNLZ,CARD9 NA NA NA NA GPSM1 17385 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 139481633 139481782 139481708 Y NA NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163,EGFL7,SNORA43,SNHG7 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 42969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 4.31955265216163 chr9 140101916 140102100 140102008 Y C9orf172,FUT7 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA NDOR1 3769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA C9orf169 501 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,C9orf169,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 140301516 140301688 140301630 Y CACNA1B,NRARP EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 14026 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 140301767 140302162 140302062 Y NA EXD3,NOXA1 NA NA NA NA EXD3 13552 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chr9 140565381 140565755 140565635 Y NRARP NA NA NA NA NA EHMT1 53937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 2719389 2719617 2719532 Y NA GYG2 NA NA NA NA GYG2 25212 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 2845714 2845991 2845779 Y NA ARSD,ARSE NA NA NA NA ARSD 322 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chrX 6137776 6138094 6138031 Y NLGN4X,NLGN4X NLGN4X NA NA NA NA NLGN4X 6810 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 8698180 8698491 8698336 Y NA NA NA NA NA NA KAL1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 9477403 9477544 9477474 Y FAM9B,TBL1X,LOC100288814 TBL1X NA NA NA NA TBL1X 48068 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 9786668 9786951 9786810 Y NA SHROOM2,RP11-98L4.1 NA NA NA NA RP11-98L4.1 1159 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 9896256 9896650 9896356 Y NA NA NA NA NA NA WWC3 84952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 9979116 9979440 9979257 Y NA WWC3 SHROOM2,WWC3 IMR90 Hi-C 24141950 WWC3 2162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 10540681 10540690 10540686 Y NA NA NA NA NA NA MID1 309083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 10585706 10585772 10585735 Y NA NA NA NA NA NA MID1 264001 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 10587173 10587276 10587225 Y MID1 NA NA NA NA NA MID1 262497 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 10851081 10851118 10851099 Y NA MID1 NA NA NA NA MID1 1308 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 11061735 11061767 11061751 Y NA NA NA NA NA NA RP11-120D5.1 65494 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 12968289 12968795 12968434 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 22432 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 12991564 12992257 12991938 Y NA TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 337 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 13711501 13711681 13711616 Y ATXN3L,RAB9A TCEANC,RAB9A,TRAPPC2,OFD1 NA NA NA NA RAB9A 6257 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 13809735 13809880 13809737 Y NA NA NA NA NA NA OFD1 58903 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 14040371 14040544 14040433 Y NA GEMIN8 NA NA NA NA GEMIN8 5468 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 14262210 14262757 14262259 Y NA NA NA NA NA NA GEMIN8 216198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 15787454 15787695 15787561 Y NA ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 18900 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 15852343 15852548 15852528 Y NA ZRSR2,AP1S2 NA NA NA NA AP1S2 18506 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 16680488 16680840 16680664 Y NA CTPS2 NA NA NA NA CTPS2 48219 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 18637228 18637392 18637280 Y NA NA NA NA NA NA CDKL5 195525 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 18693104 18693424 18693141 Y PHKA2,CDKL5 NA NA NA NA NA CDKL5 251401 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 19407416 19407434 19407425 Y NA PDHA1 NA NA NA NA PDHA1 47405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 19643767 19644028 19643952 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA MAP3K15 112388 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 19774987 19775285 19775138 Y NA NA NA NA NA NA SH3KBP1 128434 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 19874693 19875106 19874808 Y SH3KBP1 SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 28613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 21945015 21945333 21945248 Y NA SMS SMS,MBTPS2 IMR90 Hi-C 24141950 SMS 11358 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 21962010 21962116 21962060 Y NA SMS NA NA NA NA SMS 5319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 23320949 23320962 23320957 Y NA PTCHD1 NA NA NA NA PTCHD1 29171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 23800091 23800377 23800148 Y NA ACOT9,SAT1 NA NA NA NA SAT1 801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 23922308 23922544 23922448 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 1513 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 23971140 23971524 23971479 Y NA APOO NA NA NA NA APOO 47083 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 28961310 28961674 28961353 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 357794 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 28999435 28999810 28999466 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAPL1 395919 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 30319869 30320142 30320108 Y NA NR0B1 NA NA NA NA NR0B1 5573 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 30717069 30717144 30717107 Y CXorf21,GK GK NA NA NA NA GK 47593 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 38041179 38041192 38041186 Y SYTL5 SRPX NA NA NA NA SRPX 37504 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 38079037 38079366 38079180 Y SRPX SRPX NA NA NA NA SRPX 341 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 38338792 38338989 38338897 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN7 79634 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39646201 39646652 39646229 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 811 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 39949495 39949781 39949700 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 84801 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chrX 39950207 39950578 39950448 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 84004 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39953251 39953461 39953335 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 81121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39958407 39958722 39958627 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 75860 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 39963356 39963613 39963579 Y NA NA NA NA NA NA BCOR 70969 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 39966584 39967157 39966963 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 67425 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40011614 40011816 40011787 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 22766 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40013089 40013254 40013186 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 21328 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40014046 40014813 40014331 Y BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 19769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chrX 40015911 40016135 40015987 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 18447 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 40016662 40016910 40016734 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 17672 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 40028554 40028949 40028781 Y NA BCOR NA NA NA NA BCOR 5633 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40031344 40032243 40032130 Y BCOR,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 2339 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 40034694 40035505 40035056 Y BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 112 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40841745 40842012 40841881 Y NA NA MED14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-77G22.2 76508 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 41413588 41413590 41413589 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 222937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 41759638 41759871 41759773 Y NA CASK NA NA NA NA CASK 20845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 42574181 42574201 42574191 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P4 617755 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA MAOB 148897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA NA NA NA NA NA FUNDC1 231336 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 44733657 44734406 44734027 Y KDM6A KDM6A NA NA NA NA KDM6A 2900 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 45375128 45375452 45375290 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 228242 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45376807 45376988 45376867 Y NA NA MIR221,MIR222 IMR90 Hi-C 24141950 MIR221 226706 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45626471 45627108 45626806 Y NA MIR221,MIR222 MIR222,MIR221 IMR90 Hi-C 24141950 MIR222 21941 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45645081 45645275 45645187 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 40551 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 45648299 45648762 45648585 Y NA MIR221,MIR222 NA NA NA NA MIR222 43769 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45665386 45665505 45665456 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 43415 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45666628 45666834 45666726 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42086 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45667637 45667718 45667664 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 41202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 45668056 45668432 45668257 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 40488 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 45702877 45703292 45703236 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 5628 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 46125056 46125409 46125233 Y NA NA NA NA NA NA RP1-30G7.2 59671 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 46278987 46279293 46279130 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18856 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 46316672 46316948 46316811 Y NA GAPDHP65 NA NA NA NA GAPDHP65 18523 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 46435390 46435934 46435628 Y RP2,ZNF674,CHST7 ZNF674,CHST7 NA NA NA NA CHST7 4171 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 46496839 46496883 46496861 Y NA NA NA NA NA NA CHST7 65620 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 47175541 47175936 47175853 Y NA NA USP11,CDK16,UBA1 IMR90 Hi-C 24141950 USP11 85452 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chrX 47180934 47181052 47180967 Y ELK1,CDK16 NA UBA1,USP11 IMR90 Hi-C 24141950 USP11 90845 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 47221453 47221809 47221639 Y USP11,ZNF81,SYN1 NA UBA1,USP11 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZNF41 118536 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 48777238 48777933 48777700 Y TBC1D25,WAS,PQBP1,PPP1R3F,PIM2,OTUD5,OTUD5,GRIPAP1 PQBP1,TIMM17B,SLC35A2,PIM2,OTUD5,KCND1 NA NA NA NA PIM2 2937 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 48938465 48938570 48938518 Y NA TFE3,CCDC120,PRAF2,WDR45,GPKOW NA NA NA NA PRAF2 8735 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 49011448 49011844 49011738 Y GATA1,HDAC6,MAGIX GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 14429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 49108550 49108714 49108667 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 CACNA1F,HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 15592 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 50229435 50229583 50229509 Y SHROOM4 DGKK NA NA NA NA DGKK 17698 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 51633926 51634124 51634025 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 89823 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 52004971 52005124 52005057 Y NA NA NA NA NA NA MAGED1 460868 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 52949996 52950343 52950129 Y TSPYL2,KDM5C,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 31660 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.58032414103474 chrX 53110126 53110560 53110260 Y NA GPR173,TSPYL2,LINC01155 NA NA NA NA TSPYL2 577 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 53172968 53173150 53172985 Y NA NA NA NA NA NA LINC01155 51641 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 53505172 53505424 53505298 Y NA HSD17B10 IQSEC2,HSD17B10,RIBC1,SMC1A IMR90 Hi-C 24141950 HSD17B10 45852 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 54207583 54207867 54207725 Y NA NA NA NA NA NA FAM120C 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 54665732 54666388 54666226 Y NA NA ITIH6,MAGED2 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNL3L 111088 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 55844311 55844333 55844322 Y NA NA NA NA NA NA RP13-188A5.1 88223 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 56269843 56269989 56269918 Y NA KLF8 NA NA NA NA KLF8 12989 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 56756944 56757158 56757051 Y NA RP11-622K12.1,UQCRBP1 NA NA NA NA RP11-622K12.1 3252 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 57848162 57848728 57848334 Y NA NA NA NA NA NA KRT8P17 160392 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 63554308 63554471 63554461 Y MTMR8 NA NA NA NA NA MTMR8 58862 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 64148338 64148413 64148376 Y NA NA NA NA NA NA ZC4H2 104180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 64520324 64520642 64520384 Y NA NA NA NA NA NA LAS1L 232013 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 64627187 64627345 64627245 Y MSN NA NA NA NA NA LAS1L 125310 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 64815346 64815780 64815481 Y MSN MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9089 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 64816232 64816499 64816342 Y NA MSN MSN IMR90 Hi-C 24141950 MSN 9975 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 64888338 64888720 64888577 Y MSN NA NA NA NA NA MSN 82081 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 67624994 67625390 67625192 Y NA OPHN1 NA NA NA NA OPHN1 26365 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 67728770 67728923 67728861 Y NA YIPF6 NA NA NA NA YIPF6 12605 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.42316368291994 chrX 68776201 68776510 68776416 Y NA NA NA NA NA NA EDA 57401 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 68851851 68852116 68851941 Y PJA1,EDA EDA NA NA NA NA EDA 17940 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 GDPD2,DLG3 NA NA NA NA DLG3 8145 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 70275409 70275661 70275633 Y NA RNU1-56P,SNX12,FOXO4 NA NA NA NA SNX12 10612 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 70401853 70402134 70401993 Y IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO NLGN3 NA NA NA NA NLGN3 39172 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.52851862565559 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 71343441 71343560 71343500 Y FLJ44635 RGAG4 NA NA NA NA RGAG4 6198 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 71402877 71403170 71402921 Y NA PIN4 NA NA NA NA PIN4 3674 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 72786594 72786762 72786676 Y NAP1L2,CDX4,CHIC1 CHIC1 NA NA NA NA CHIC1 5558 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 73228588 73229157 73228689 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 66429 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 73236075 73236382 73236224 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 73916 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 73237406 73237798 73237506 Y CHIC1 NA NA NA NA NA JPX 75247 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 73340869 73341139 73340910 Y RLIM NA NA NA NA NA USMG5P1 50586 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 73352212 73352497 73352336 Y NA USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 39228 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.68567908377039 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chrX 73510244 73510542 73510484 Y RLIM FTX NA NA NA NA FTX 867 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chrX 73755621 73755953 73755678 Y RLIM NA NA NA NA NA RLIM 76499 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 73791399 73791714 73791557 Y RLIM RLIM NA NA NA NA RLIM 40738 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 74958533 74958836 74958643 Y ZDHHC15,MAGEE2 TTC3P1,MAGEE2 NA NA NA NA TTC3P1 5913 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 79827525 79827860 79827693 Y NA NA NA NA NA NA BRWD3 235327 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 79965324 79965547 79965436 Y BRWD3 NA NA NA NA NA BRWD3 97640 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 81977522 81977903 81977713 Y NA NA NA NA NA NA ATG4AP1 273804 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 83998682 83998698 83998690 Y NA NA NA NA NA NA HDX 243195 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 84475648 84475726 84475688 Y NA ZNF711 NA NA NA NA ZNF711 21271 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 85145367 85145588 85145476 Y NA NA NA NA NA NA CHM 154978 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 85294512 85294785 85294645 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 5781 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.31780874018429 chrX 87351155 87351521 87351339 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 929 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 87351546 87351899 87351791 Y NA RP3-452M16.1 NA NA NA NA RP3-452M16.1 1320 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 96737764 96737861 96737813 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 800102 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 97535019 97535198 97535109 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 1597357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 99672872 99672953 99672909 Y NA PCDH19 NA NA NA NA PCDH19 9601 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 99903962 99904188 99904076 Y SRPX2 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 6747 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 100111421 100111452 100111441 Y NA CSTF2 NA NA NA NA CSTF2 38037 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 100498384 100498730 100498494 Y ARMCX3,ARMCX3,TMEM35,DRP2 NA NA NA NA NA TIMM8A 103454 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA ARMCX1 NA NA NA NA ARMCX1 9960 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 101914784 101914936 101914847 Y BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1 GPRASP1 NA NA NA NA GPRASP1 10490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chrX 102063503 102063615 102063509 Y NA NA NA NA NA NA BHLHB9 89887 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 103019589 103020004 103019883 Y NA PLP1 LOC340544,MORF4L2,GLRA4,TMEM31,PLP1 IMR90 Hi-C 24141950 PLP1 6643 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chrX 105065481 105065866 105065484 Y NRK NRK NA NA NA NA NRK 945 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 106247149 106247504 106247327 Y CLDN2 MORC4 MORC4 IMR90 Hi-C 24141950 MORC4 5675 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147542 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA NUP62CL 147997 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 106985108 106985412 106985307 Y TSC22D3,TSC22D3,TSC22D3 TSC22D3 NA NA NA NA TSC22D3 33160 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA KCNE1L NA NA NA NA KCNE1L 17150 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 109003262 109003404 109003333 Y ACSL4 ACSL4 NA NA NA NA ACSL4 28630 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 109073937 109074572 109074260 Y NXT2,NXT2 NA ACSL4 IMR90 Hi-C 24141950 ACSL4 99305 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 110566693 110566855 110566742 Y PAK3,DCX,DCX,DCX NA NA NA NA NA CAPN6 54942 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 110688240 110688423 110688331 Y NA DCX NA NA NA NA DCX 34637 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 110786502 110786820 110786661 Y NA NA NA NA NA NA EIF4BP7 75897 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.47496919829909 chrX 111866747 111867081 111866914 Y NA NA NA NA NA NA LHFPL1 54294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 111949700 111949719 111949710 Y NA LHFPL1 NA NA NA NA LHFPL1 28325 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.842839541885196 chrX 112465306 112465313 112465310 Y NA NA NA NA NA NA AMOT 383263 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 113170298 113170599 113170449 Y NA NA NA NA NA NA SSU72P1 452528 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 113218682 113218918 113218800 Y NA NA NA NA NA NA SSU72P1 404209 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 113281621 113281947 113281758 Y NA NA NA NA NA NA SSU72P1 341180 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 113761667 113761873 113761772 Y NA NA NA NA NA NA SSU72P1 138540 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chrX 114849502 114849636 114849587 Y NA NA NA NA NA NA PLS3 56001 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 114925070 114925398 114925234 Y NA RP1-241P17.1 NA NA NA NA RP1-241P17.1 29899 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 114948087 114948383 114948235 Y NA RP1-241P17.1 NA NA NA NA RP1-241P17.1 6914 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 114956184 114956305 114956232 Y NA RP1-241P17.1 NA NA NA NA RP1-241P17.1 887 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 115083189 115083554 115083375 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 115239457 115239782 115239623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 156035 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 117499894 117500112 117500003 Y NA WDR44 NA NA NA NA WDR44 21858 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 117654579 117654738 117654653 Y LONRF3 DOCK11 NA NA NA NA DOCK11 26718 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 117832906 117833107 117833025 Y DOCK11,LONRF3,IL13RA1 IL13RA1 NA NA NA NA IL13RA1 26428 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 118407628 118408020 118407835 Y NA PGRMC1 NA NA NA NA PGRMC1 39412 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chrX 118903267 118903661 118903468 Y RHOXF1,AKAP14 SOWAHD,RPL39 NA NA NA NA SOWAHD 12691 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 119619289 119619732 119619620 Y ZBTB33,ZBTB33 LAMP2 LAMP2 K562 ChIA-PET 22265404 LAMP2 18069 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 120337126 120337342 120337247 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 575121 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 123350562 123350843 123350703 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 258500 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 123351438 123351580 123351505 Y SH2D1A NA NA NA NA NA STAG2 259376 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 124339178 124339332 124339255 Y NA RP1-161N10.1 NA NA NA NA RP1-161N10.1 2991 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 124340013 124340052 124340037 Y NA RP1-161N10.1 NA NA NA NA RP1-161N10.1 3826 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 124519544 124519689 124519658 Y NA NA NA NA NA NA RP1-161N10.1 183357 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrX 125406399 125406559 125406479 Y NA NA NA NA NA NA DCAF12L2 108319 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 125489807 125490070 125489939 Y NA NA NA NA NA NA MTND4P24 114798 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chrX 128225148 128225423 128225251 Y NA NA NA NA NA NA SMARCA1 430054 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 128656237 128656454 128656444 Y NA SMARCA1,OCRL NA NA NA NA SMARCA1 760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.632129656413897 chrX 129226171 129226435 129226352 Y NA ELF4 NA NA NA NA ELF4 16256 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.948194484620846 chrX 129848088 129848429 129848259 Y NA NA NA NA NA NA ENOX2 186779 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 130201514 130201626 130201527 Y NA ARHGAP36 NA NA NA NA ARHGAP36 11298 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 130698816 130699203 130699008 Y NA NA NA NA NA NA IGSF1 167139 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 131159301 131159695 131159439 Y RAP2C,MBNL3,MST4,MST4 MST4 NA NA NA NA MST4 4008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.89638896924169 chrX 132323332 132323559 132323446 Y HS6ST2,USP26,GPC4 RNU1-115P NA NA NA NA RNU1-115P 47285 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.737484599149547 chrX 132780282 132780629 132780529 Y NA RP3-417G15.1 NA NA NA NA RP3-417G15.1 22370 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 132987009 132987182 132987097 Y GPC3 NA NA NA NA NA GPC3 130740 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 133282434 133282722 133282577 Y NA MIR363 NA NA NA NA MIR363 18760 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 MIR363 NA NA NA NA MIR363 4280 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chrX 133307362 133307774 133307418 Y PHF6,CCDC160 MIR363 NA NA NA NA MIR363 5880 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 133309031 133309218 133309079 Y NA MIR363 NA NA NA NA MIR363 7549 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.526774713678248 chrX 133320992 133321049 133321007 Y NA MIR363,CCDC160 NA NA NA NA MIR363 19510 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 133509019 133509280 133509152 Y PHF6 PHF6 NA NA NA NA PHF6 3736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 133756354 133756493 133756422 Y NA NA MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-44P 135885 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 133847905 133848292 133848163 Y NA RNU4-44P LOC100506757,FAM122B,PLAC1,MIR450A1,MGC16121,MIR542,MIR450A2,MIR450B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNU4-44P 44086 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 134096434 134096824 134096629 Y NA MOSPD1 FAM127C IMR90 Hi-C 24141950 MOSPD1 49137 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.316064828206949 chrX 134485580 134485626 134485601 Y ZNF449,CT45A6 ZNF75D,ZNF449 NA NA NA NA ZNF449 8859 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 136632347 136632538 136632444 Y ZIC3 RP1-137H15.2,ZIC3 NA NA NA NA RP1-137H15.2 12008 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 2.00174391197734 chrX 136647486 136647742 136647575 Y NA RP1-137H15.2,ZIC3 NA NA NA NA ZIC3 1185 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chrX 138007531 138007947 138007713 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 294992 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 139855409 139855570 139855490 Y NA NA NA NA NA NA SOX3 270184 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA SOX3 273289 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 147498488 147498733 147498611 Y NA NA NA NA NA NA AFF2 81406 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 147500402 147500425 147500414 Y NA NA NA NA NA NA AFF2 79714 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 148595188 148595518 148595383 Y IDS,CXorf40A IDS,CXorf40A,LINC00893 NA NA NA NA IDS 17952 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 149201039 149201275 149201132 Y NA NA NA NA NA NA CXorf40B 96010 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 149533685 149533896 149533780 Y MAMLD1 NA NA NA NA NA MTM1 201173 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 149534295 149534593 149534360 Y MAMLD1 NA NA NA NA NA MTM1 200476 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 149863588 149863865 149863755 Y MTM1,MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 4153 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 150071015 150071211 150071113 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 5726 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.79103402650604 chrX 150347417 150347568 150347539 Y GPR50 GPR50 NA NA NA NA GPR50 4292 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.26425931282779 chrX 152075667 152076216 152075921 Y GABRQ NA NA NA NA NA NSDHL 78156 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 152951257 152951653 152951455 Y NA DUSP9,RPL18AP16,PNCK,BCAP31,ABCD1 NA NA NA NA SLC6A8 0 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 153304167 153304640 153304272 Y ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1 IRAK1 NA NA NA NA IRAK1 20736 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 153359354 153359823 153359622 Y NA MECP2 NA NA NA NA MECP2 1389 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 1.0535494273565 chrX 153755432 153755621 153755566 Y NA LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD FAM3A MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 IKBKG 11793 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 154029933 154030114 154030065 Y EMD,DNASE1L1,TAZ,IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,F8A2,F8A1,LOC100132963,MPP1 DKC1,MPP1 NA NA NA NA MPP1 17168 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrX 154256125 154256514 154256179 Y IKBKG,IKBKG,IKBKG,GAB3,MPP1,LOC100132963,F8A1,F8A2 FUNDC2,BRCC3 NA NA NA NA FUNDC2 3870 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrY 10023047 10023682 10023281 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 6725294 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.210709885471299 chrY 13470203 13470486 13470410 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 3278490 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.421419770942598 chrY 21664138 21664302 21664220 Y KDM5D NA NA NA NA NA AGKP1 4915162 CAGE NCC-IT-A3 hg19 FANTOM5 0.10535494273565