chr1	945769	946034	945890	Y	CCNL2,ATAD3B	PLEKHN1,HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	ISG15	769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	956563	956812	956665	Y	UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN	HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3	NA	NA	NA	NA	AGRN	3060	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr1	1265677	1265980	1265829	Y	NA	PUSL1,ACAP3,CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1	NA	NA	NA	NA	GLTPD1	7541	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	1295535	1296332	1296026	Y	MIB2,CCNL2,C1orf70,ACAP3,MXRA8	CPSF3L,GLTPD1,DVL1,MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,MRPL20	NA	NA	NA	NA	MXRA8	378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	1456676	1456699	1456688	Y	NA	ATAD3A,TMEM240	NA	NA	NA	NA	ATAD3A	11145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	1803114	1803303	1803274	Y	NA	GNB1,TMEM52	NADK	IMR90	Hi-C	24141950	GNB1	17192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1,TMEM52	NA	NA	NA	NA	TMEM52	7877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	2221868	2222548	2222316	Y	TNFRSF14,SKI	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf86	79709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	2245775	2246116	2245876	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	75030	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,HES5,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	2574343	2574764	2574705	Y	MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1	NA	NA	NA	NA	NA	FAM213B	58413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	3420761	3421065	3420920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	104994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	3459907	3460197	3460078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF6	65862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	3581269	3581645	3581600	Y	WRAP73,TP73	RP11-46F15.2,TPRG1L,TP73,WRAP73	NA	NA	NA	NA	WRAP73	13944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	3817648	3818071	3817969	Y	LRRC47	CEP104,DFFB,C1orf174	NA	NA	NA	NA	C1orf174	2791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	4729528	4729775	4729656	Y	AJAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C1orf174	914671	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	7843556	7843653	7843585	Y	PER3	VAMP3,PER3	NA	NA	NA	NA	PER3	1176	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	52503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8154517	8154933	8154754	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,PARK7,SLC45A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	69719	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8156648	8157003	8156918	Y	VAMP3	NA	ERRFI1,RERE,SLC45A1,PARK7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-431K24.1	71850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8229904	8230047	8229996	Y	NA	NA	ERRFI1,SLC45A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-431K24.1	145106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8272041	8272390	8272277	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	103496	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8720526	8720683	8720608	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RERE	155019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	8964053	8964236	8964145	Y	ENO1	ENO1-IT1,ENO1	ENO1-AS1,ENO1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ENO1	26745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	9256119	9256636	9256459	Y	NA	RP3-510D11.2,RP3-510D11.1,H6PD	SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP3-510D11.1	4042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	9293549	9293739	9293591	Y	H6PD	RP3-510D11.1,H6PD	NA	NA	NA	NA	H6PD	715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	10804844	10805001	10804872	Y	NA	CASZ1	NA	NA	NA	NA	CASZ1	49706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	10927237	10927380	10927309	Y	CASZ1	NA	PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127	IMR90	Hi-C	24141950	CASZ1	72530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	11218028	11218196	11218080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOSC10	60090	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	11559549	11559947	11559917	Y	NA	PTCHD2	NA	NA	NA	NA	PTCHD2	22326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	11791882	11792060	11791938	Y	NA	MAD2L2,AGTRAP	AGTRAP	IMR90	Hi-C	24141950	AGTRAP	2081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	12127865	12128182	12128023	Y	MIIP,TNFRSF8	NA	NA	NA	NA	NA	MIIP	50342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	12674513	12674729	12674684	Y	NA	DHRS3	NA	NA	NA	NA	DHRS3	1008	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	15664307	15664455	15664338	Y	NA	NA	EFHD2,CTRC,CELA2A,CELA2B	IMR90	Hi-C	24141950	EFHD2	69936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	16087189	16087372	16087266	Y	EPHA2,FBLIM1	RP11-169K16.4,FBLIM1	NA	NA	NA	NA	FBLIM1	6087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16125579	16125747	16125670	Y	FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2	FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.8	26977	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN,RP11-169K16.9	NA	NA	NA	NA	RP11-169K16.9	40117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16276028	16276482	16276329	Y	CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	NA	NA	NA	NA	ZBTB17	24145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16291784	16292062	16291897	Y	CASP9,PLEKHM2,C1orf144,ZBTB17	ZBTB17	SPEN	IMR90	Hi-C	24141950	ZBTB17	8565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16470181	16470602	16470563	Y	NA	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	9104	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	16478939	16479163	16479034	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	16479299	16479465	16479382	Y	FBLIM1,EPHA2	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	RP11-276H7.2	241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	16502532	16502678	16502612	Y	C1orf64	RP11-276H7.2,EPHA2	CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPHA2	21950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	RP11-276H7.2,EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	16696032	16696399	16696223	Y	NA	FBXO42	NA	NA	NA	NA	FBXO42	19083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	PADI2	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI2	10907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	17494378	17494745	17494634	Y	NA	RP11-380J14.1	PADI2,PADI1,PADI3,PADI6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	19533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	17495208	17495390	17495300	Y	NA	RP11-380J14.1	PADI2,PADI1,PADI3,PADI6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	18888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	RP11-380J14.1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	3852	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	17518941	17519138	17519054	Y	ATP13A2,PADI3	RP11-380J14.1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	4663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	17767804	17768710	17768126	Y	NA	RCC2	NA	NA	NA	NA	RCC2	3584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	17875004	17875168	17875086	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	10674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	18200796	18200931	18200864	Y	NA	NA	ACTL8,ARHGEF10L	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF10L	336466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	19276270	19276542	19276361	Y	AKR7A2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	4638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	19324821	19325090	19324988	Y	TAS1R2,IFFO2	IFFO2	ALDH4A1,IFFO2,UBR4	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	43641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	19336477	19336714	19336579	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	55297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	19337577	19337942	19337698	Y	NA	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFFO2	56397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	19360402	19360809	19360663	Y	IFFO2	NA	UBR4,IFFO2,ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IFFO2	79222	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	20808010	20808395	20808205	Y	NA	CAMK2N1,MUL1	NA	NA	NA	NA	CAMK2N1	2318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	CDA,PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	CDA	17270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	21284001	21284025	21284019	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	114221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	21428050	21428147	21428101	Y	NA	RP11-487E1.2	NA	NA	NA	NA	RP11-487E1.2	29804	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	21476251	21476624	21476546	Y	NA	EIF4G3	NA	NA	NA	NA	EIF4G3	24753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	22266159	22266438	22266333	Y	HSPG2	RP11-26H16.1,HSPG2	NA	NA	NA	NA	HSPG2	4369	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	23429944	23430077	23430039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LUZP1	72224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	23494015	23494642	23494449	Y	NA	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	7659	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr1	23881180	23881765	23881497	Y	NA	E2F2,ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	2520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	E2F2,ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	24349340	24349488	24349411	Y	NA	RP11-4M23.7	LYPLA2,SRSF10,MYOM3,PNRC2,SRRM1,HMGCL,IL22RA1,LOC100506963,TCEB3,GALE,FUCA1,CNR2,IL28RA,C1orf201,NIPAL3,RCAN3,RCAN3AS	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-4M23.7	16331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	24732584	24732754	24732709	Y	NA	NIPAL3	NA	NA	NA	NA	NIPAL3	7530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	25051079	25051208	25051162	Y	NA	CLIC4	RUNX3,CLIC4,SRRM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CLIC4	18640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	25559638	25560067	25559796	Y	RUNX3,SYF2,C1orf63	SYF2	NA	NA	NA	NA	SYF2	2645	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	25566618	25566670	25566639	Y	NA	SYF2	SYF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SYF2	9625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	26201699	26201757	26201716	Y	SEPN1	RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1	NA	NA	NA	NA	RP1-125I3.2	17595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	26677301	26677628	26677413	Y	CATSPER4,ZNF683	UBXN11	NA	NA	NA	NA	UBXN11	34447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	26678060	26678317	26678200	Y	CNKSR1,AIM1L	UBXN11	NA	NA	NA	NA	UBXN11	35206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	26827232	26827869	26827508	Y	PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A	RP3-476K8.4,HMGN2	HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HMGN2	30291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr1	26946837	26947249	26947076	Y	CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	73275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	27024638	27025138	27024825	Y	SLC9A1,CEP85,GPN2,GPATCH3,ARID1A,PIGV	ARID1A	NA	NA	NA	NA	ARID1A	4114	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr1	27191386	27191927	27191661	Y	FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2	ZDHHC18,SFN,GPN2,NUDC,GPATCH3	NA	NA	NA	NA	SFN	3753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	27691785	27692261	27692091	Y	TMEM222,MAP3K6	TMEM222,RP11-4K3__A.5,SYTL1,MAP3K6,GPR3	NA	NA	NA	NA	MAP3K6	402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	27883449	27884140	27883881	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	44802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	27890194	27890387	27890291	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	38555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	27907931	27908052	27907995	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	20890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	27924204	27924421	27924302	Y	XKR8,AHDC1	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	4521	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	28355043	28355235	28355139	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EYA3	57972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	28389248	28389585	28389551	Y	NA	EYA3	NA	NA	NA	NA	EYA3	23622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	28573636	28574084	28573917	Y	NA	AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2	NA	NA	NA	NA	SESN2	9954	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	29451057	29451462	29451431	Y	TMEM200B,TMEM200B	TMEM200B	NA	NA	NA	NA	TMEM200B	2610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	29503706	29504118	29503928	Y	NA	SRSF4	NA	NA	NA	NA	SRSF4	2381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	31241795	31242280	31242065	Y	LAPTM5	NA	PUM1,SNORD103A,LAPTM5,MATN1,LOC100129196,SDC3	IMR90	Hi-C	24141950	SDC3	137328	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	31251287	31251533	31251452	Y	NA	NA	LAPTM5,MECR,MATN1,LOC100129196,SNORD103A,SNORD103B,PUM1,SDC3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDC3	128075	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	31643824	31643962	31643871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKAIN1	66439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	31770743	31770927	31770835	Y	NA	SNRNP40,ZCCHC17	NA	NA	NA	NA	ZCCHC17	2901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	32015159	32015590	32015321	Y	NA	TINAGL1	FABP3,SERINC2,LOC284551,PEF1,HCRTR1,NKAIN1,TINAGL1	IMR90	Hi-C	24141950	TINAGL1	24526	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	32420307	32420572	32420414	Y	TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	11850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	32966228	32966602	32966575	Y	FAM167B,MARCKSL1,KIAA1522,ZBTB8B,ZBTB8A	ZBTB8B,ZBTB8A	NA	NA	NA	NA	ZBTB8A	36426	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr1	33131314	33131452	33131383	Y	NA	ZBTB8OS,RBBP4,SYNC	NA	NA	NA	NA	RBBP4	16571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF362	84213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	36173458	36173573	36173482	Y	TEKT2,EIF2C1	C1orf216	NA	NA	NA	NA	C1orf216	9500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	36183411	36183689	36183588	Y	C1orf216	C1orf216,CLSPN	NA	NA	NA	NA	C1orf216	338	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	36555347	36555633	36555606	Y	STK40,SH3D21,EIF2C1,EIF2C3,ADPRHL2	ADPRHL2,COL8A2	NA	NA	NA	NA	ADPRHL2	2871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	36817040	36817280	36817137	Y	NA	SH3D21,STK40,LSM10	SH3D21,FAM176B	K562	ChIA-PET	22265404	STK40	32217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	36839449	36839891	36839558	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	9606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	36840093	36840535	36840445	Y	EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	8962	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	38466019	38466413	38466271	Y	NA	SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1	NA	NA	NA	NA	FHL3	2865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	38573869	38574225	38574173	Y	EPHA10,MANEAL,POU3F1	NA	NA	NA	NA	NA	POU3F1	63419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	39508832	39509204	39509012	Y	NA	NDUFS5,MACF1	NA	NA	NA	NA	NDUFS5	18842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	39596184	39596482	39596236	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	51196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	39629010	39629413	39629213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	84022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	39644229	39644606	39644401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	99241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	39657786	39658129	39657912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACF1	112798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	39736190	39736575	39736327	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	137576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	39857791	39857995	39857869	Y	NA	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	16156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	39874208	39874673	39874342	Y	KIAA0754	KIAA0754	NA	NA	NA	NA	KIAA0754	57	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	40561233	40561752	40561648	Y	SMAP2,RLF	NA	NA	NA	NA	NA	PPT1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	41040458	41040672	41040585	Y	NA	ZNF684	ZNF684,RIMS3,RLF,KCNQ4,ZNF642,NFYC	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF684	45225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	41501440	41501773	41501639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED4	175422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	41633074	41633562	41633301	Y	SCMH1,SCMH1,SCMH1	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	72264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	41826642	41826952	41826745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	120816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	41952015	41952273	41952132	Y	EDN2	NA	NA	NA	NA	NA	SCMH1	246189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	370805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr1	42204580	42205516	42204895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	294080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	42217644	42218002	42217854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	281594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	42354251	42354647	42354385	Y	RIMKLA,HIVEP3	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	144949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	42363874	42364167	42364002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	135429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	42366364	42366624	42366514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP3	132972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	43407355	43407700	43407616	Y	YBX1,ERMAP,SZT2	SLC2A1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	14830	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	43988888	43989038	43988936	Y	PTPRF	PTPRF	PTPRF	IMR90	Hi-C	24141950	PTPRF	30	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	44150815	44151139	44150977	Y	ST3GAL3,SLC6A9,IPO13	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	18356	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	44162019	44162313	44162287	Y	NA	KDM4A,ST3GAL3	NA	NA	NA	NA	ST3GAL3	7182	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	44299891	44300630	44300422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARTN	96362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	44495684	44496307	44495779	Y	NA	CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4	B4GALT2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC6A9	545	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	44950888	44951090	44950987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF220	82022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	45085192	45085548	45085380	Y	NA	NA	C1orf228,TMEM53	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM53	52679	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	46111666	46112048	46111975	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	3450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	46902512	46902655	46902542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN4	98663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	47800262	47800514	47800436	Y	NA	STIL,CMPK1	NA	NA	NA	NA	CMPK1	2793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	51312022	51312165	51312091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	111770	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	51475745	51476056	51475832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2C	51328	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	52628189	52628583	52628480	Y	NA	ZFYVE9,RP4-800M22.2	NA	NA	NA	NA	RP4-800M22.2	1491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	53168640	53169047	53168726	Y	NA	ZYG11B	SELRC1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ZYG11B	21079	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	53385696	53386052	53386029	Y	NA	ECHDC2,SCP2	NA	NA	NA	NA	ECHDC2	4832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	53559901	53560045	53560040	Y	NA	PODN	NA	NA	NA	NA	PODN	34047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	54260217	54260562	54260390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YIPF1	93845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	54695028	54695502	54695289	Y	NA	MRPL37,CYB5RL	NA	NA	NA	NA	CYB5RL	31319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	54953784	54954325	54954090	Y	SSBP3,SSBP3	NA	TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SSBP3	76632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	59050239	59050578	59050488	Y	NA	DAB1,OMA1	MYSM1,FGGY,OMA1	IMR90	Hi-C	24141950	OMA1	39765	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	59221049	59221462	59221387	Y	NA	JUN	FGGY,HSD52,LOC100131060,JUN,MIR4711	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JUN	26323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	59280773	59281281	59281052	Y	FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	32988	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	59281510	59281579	59281545	Y	JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	33725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	59281873	59282217	59282125	Y	MYSM1,FGGY,JUN	JUN	NA	NA	NA	NA	JUN	34088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	59608749	59609120	59609039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-794H19.4	124690	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	59616706	59617089	59616861	Y	NA	NA	HSD52,FGGY,JUN,LOC100131060,MIR4711	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-794H19.4	132647	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr1	59756067	59756566	59756452	Y	FGGY	FGGY	LOC100131060,HSD52,FGGY	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	3744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	60157078	60157331	60157204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	233131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	60196566	60196799	60196671	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP2J2	193663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	61707460	61707670	61707565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	378529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	65292575	65293034	65292898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAVER2	83797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	65731337	65731853	65731407	Y	DNAJC6	DNAJC6	NA	NA	NA	NA	DNAJC6	19435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	65888047	65888596	65888066	Y	LEPR,LEPROT,LEPR,LEPROT	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	3777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	65891768	65892129	65891951	Y	NA	LEPR,LEPROT	NA	NA	NA	NA	LEPROT	7498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	66930584	66930841	66930604	Y	NA	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	66225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	67029191	67029437	67029359	Y	NA	SGIP1	NA	NA	NA	NA	SGIP1	32125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	67374841	67375185	67375111	Y	SGIP1,WDR78	WDR78,MIER1	NA	NA	NA	NA	WDR78	13385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	67460593	67460710	67460683	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35D1	57072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	68084470	68084693	68084593	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90	Hi-C	24141950	GADD45A	64051	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.35073810667194
chr1	68364057	68364377	68364218	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG12	66907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	68961350	68961555	68961472	Y	NA	DEPDC1	NA	NA	NA	NA	DEPDC1	446	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr1	72750417	72750888	72750606	Y	NA	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	4000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	75445957	75446239	75446083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRYZ	248865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	77165935	77166101	77166017	Y	NA	TPI1P1	ST6GALNAC3	IMR90	Hi-C	24141950	TPI1P1	2461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	77891343	77891690	77891394	Y	AK5,AK5,ZZZ3,FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	AK5	145607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	77980165	77980378	77980255	Y	AK5	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	166726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	78026939	78027232	78027062	Y	FAM73A	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	119872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	78171350	78171363	78171357	Y	NA	ZZZ3	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	24246	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	78441093	78441406	78441347	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	1388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	78957462	78957762	78957688	Y	PTGFR	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	155719	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	79215772	79216132	79215819	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFI44	102291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	82168687	82169067	82168779	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	496434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	82172386	82172576	82172503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-445O10.1	500133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	84757421	84757614	84757534	Y	DNASE2B,DNASE2B,SAMD13,SAMD13	NA	UOX,DNASE2B	IMR90	Hi-C	24141950	RPF1	185328	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85349108	85349420	85349289	Y	LPAR3	LPAR3	NA	NA	NA	NA	LPAR3	7476	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85779776	85780132	85779838	Y	NA	BCL10	NA	NA	NA	NA	BCL10	39003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	85795855	85796291	85796120	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55082	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	85950230	85950550	85950520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	91383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85968002	85968172	85968087	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	73761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	85991291	85991622	85991523	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	50311	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	86072885	86073441	86073156	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90	Hi-C	24141950	CYR61	28441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	86077140	86077408	86077190	Y	CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	32696	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	86078461	86078819	86078680	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	34017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	87190718	87190974	87190846	Y	NA	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	SH3GLB1	22459	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	90101821	90102213	90101853	Y	ZNF326,LRRC8D,GBP4,GBP5,LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C	LRRC8C	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	5190	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	90153439	90153806	90153511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC8C	56808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	90319744	90319959	90319950	Y	NA	LRRC8D	NA	NA	NA	NA	LRRC8D	35171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	90372321	90372729	90372378	Y	LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	85151	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	90374317	90375036	90374524	Y	LRRC8B,LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	82844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	90376424	90376756	90376561	Y	LRRC8D,LRRC8D,ZNF326	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8P4	81124	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	92021775	92022091	92021979	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7,HSP90B3P,KIAA1107,RPAP2,GLMN	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	57367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	92048213	92048455	92048330	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	83805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	92202579	92202753	92202666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	167139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	92549605	92549624	92549615	Y	NA	BTBD8	NA	NA	NA	NA	BTBD8	5743	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	93170902	93171289	93171144	Y	NA	RNU4-59P	NA	NA	NA	NA	RNU4-59P	6411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94023703	94024059	94023930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	112015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	94089710	94089715	94089713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	178022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94093325	94093611	94093590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	181637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94133922	94134283	94134103	Y	FNBP1L	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	176423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr1	94158127	94158185	94158167	Y	GCLM,DNTTIP2	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	152521	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr1	94167175	94167520	94167394	Y	BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	143186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94203705	94204234	94204026	Y	NA	NA	BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2	IMR90	Hi-C	24141950	BCAR3	106472	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	94244939	94245309	94245199	Y	ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3	NA	BCAR3,MIR760,FNBP1L	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	65397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	94701813	94701865	94701839	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	RP11-148B18.1	9599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	94712051	94712193	94712123	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	587	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94712395	94712617	94712502	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.1,ARHGAP29	ABCA4,ARHGAP29,ABCD3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-148B18.1	931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	94788386	94788592	94788436	Y	ARHGAP29,F3	ARHGAP29,RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	8231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	94792807	94793133	94793077	Y	ARHGAP29	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,BCAR3,GCLM	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	3690	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	94795618	94795987	94795955	Y	NA	RP11-148B18.3	ARHGAP29,ABCA4,ABCD3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-148B18.3	836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	95003688	95004160	95004042	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	1196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	95008693	95008821	95008774	Y	NA	F3	NA	NA	NA	NA	F3	3337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	95249173	95249377	95249275	Y	NA	LINC01057	ABCD3,F3,ALG14	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	34460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	95267524	95267667	95267664	Y	NA	LINC01057	F3,ABCD3,ABCA4,CNN3,LOC729970,ALG14,SLC44A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01057	16170	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	96828119	96828533	96828302	Y	NA	NA	PTBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EEF1A1P11	81953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	352807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	97994700	97995088	97995052	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	14169	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	98373500	98373836	98373707	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	10769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	98459458	98459857	98459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	74853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	98494244	98494658	98494592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	109639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.02008243077531
chr1	98497100	98497277	98497188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	112495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	98518546	98518920	98518639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	133941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	98677142	98677181	98677162	Y	NA	RP5-1070A16.1	NA	NA	NA	NA	RP5-1070A16.1	2839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	98788970	98789228	98789135	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	114667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	98789496	98789901	98789701	Y	NA	NA	MIR137HG,MIR2682,LOC729987,DPYD	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1070A16.1	115193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	100494312	100494735	100494498	Y	CDC14A,HIAT1	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	6918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	100505302	100505632	100505358	Y	NA	HIAT1	NA	NA	NA	NA	HIAT1	3649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	101486133	101486158	101486151	Y	NA	RP11-421L21.3,DPH5	NA	NA	NA	NA	RP11-421L21.3	3276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	107877234	107877506	107877370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTNG1	196605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	109262615	109262764	109262672	Y	NA	PRPF38B,STXBP3	NA	NA	NA	NA	STXBP3	24532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	109469350	109469540	109469522	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	34566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	109933790	109934137	109934039	Y	TMEM167B,GNAI3,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	4436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	109938897	109939079	109938975	Y	TMEM167B,SORT1,SORT1	SORT1,PSMA5	NA	NA	NA	NA	SORT1	324	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	110175406	110175537	110175472	Y	NA	AMPD2,GSTM4,GSTM2	NA	NA	NA	NA	AMPD2	18680	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	110420039	110420145	110420092	Y	UBL4B	CSF1	CSF1,AHCYL1,EPS8L3,GNAI3,CYB561D1,ATXN7L2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CSF1	30719	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	110454846	110455290	110455005	Y	GSTM2,CSF1	CSF1	NA	NA	NA	NA	CSF1	3982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	112050044	112050594	112050328	Y	C1orf183,C1orf183,CEPT1,DRAM2,RAP1A,C1orf162,ADORA3	RAP1A	NA	NA	NA	NA	RAP1A	32246	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	113086746	113087141	113086830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA1	72654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	113949729	113949849	113949733	Y	NA	MAGI3,RP11-512F24.1	NA	NA	NA	NA	MAGI3	18358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	115605190	115605611	115605404	Y	BCAS2,SIKE1	TSPAN2	NA	NA	NA	NA	TSPAN2	24510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	115722074	115722498	115722181	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	91953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	116088478	116088732	116088606	Y	NA	NA	NGF,VANGL1,SYCP1	IMR90	Hi-C	24141950	VANGL1	93842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	117421623	117422020	117421974	Y	TTF2	PTGFRN	PTGFRN,TTF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PTGFRN	28659	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	119401140	119401399	119401296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-418J17.1	279620	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	120147764	120147961	120147863	Y	HSD3B1	ZNF697	NA	NA	NA	NA	ZNF697	40435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	120608824	120609208	120608880	Y	NOTCH2	NOTCH2	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	1032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	144927217	144927550	144927432	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	117473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	144988079	144988414	144988189	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	85772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	144993199	144993244	144993232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	80942	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145009158	145009716	145009503	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	64470	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145012331	145013054	145012678	Y	NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	61132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145023690	145024549	145024240	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP	NA	NA	NA	NA	PDE4DIP	49637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145065013	145065489	145065359	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	8697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	145067412	145067676	145067614	Y	NA	PDE4DIP,SEC22B	NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	PDE4DIP	6510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145090155	145090603	145090483	Y	SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,PDE4DIP,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	3617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	145092450	145092883	145092733	Y	SEC22B,PDE4DIP	PDE4DIP,SEC22B	NBPF9,LOC653513,PDE4DIP,NOTCH2NL,SEC22B,LOC728875,NBPF10	IMR90	Hi-C	24141950	SEC22B	1337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr1	145113904	145114998	145114671	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	PDE4DIP,SEC22B	NA	NA	NA	NA	SEC22B	19684	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	145226678	145226829	145226731	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NBPF10,NOTCH2NL	NOTCH2NL	NA	NA	NA	NA	NOTCH2NL	19559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145455122	145455741	145455465	Y	PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP	TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A	NA	NA	NA	NA	POLR3GL	12647	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	145640932	145641287	145641091	Y	NBPF10	POLR3C,RNF115	NA	NA	NA	NA	RNF115	31896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	147806841	147807184	147807140	Y	NA	RNU1-122P	NA	NA	NA	NA	RNU1-122P	1955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	149138053	149138113	149138087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-14N7.2	211731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	149931955	149932255	149932237	Y	NA	SV2A,SF3B4,MTMR11,OTUD7B	MTMR11,SF3B4	IMR90	Hi-C	24141950	MTMR11	25164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	150135231	150135764	150135536	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1	NA	NA	NA	NA	PLEKHO1	15858	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	150154529	150154860	150154771	Y	SV2A,MCL1	PLEKHO1	HIST2H2AB,HIST2H2BE,HIST2H2AC	MCF7	ChIA-PET	22265404	PLEKHO1	35156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	150159099	150159241	150159135	Y	PRPF3,MCL1,PLEKHO1	PLEKHO1,ANP32E,RNU2-17P	HIST2H2AC,HIST2H2BE,HIST2H2AB	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PLEKHO1	39726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	150185878	150186128	150186012	Y	HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E	ANP32E,RNU2-17P	NA	NA	NA	NA	ANP32E	20376	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	150585815	150586394	150586132	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	13694	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	150592182	150592667	150592572	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	7421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	151166314	151166527	151166421	Y	NA	SEMA6C,SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	VPS72	517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	151168916	151169086	151168995	Y	NA	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	151184646	151184728	151184696	Y	NA	LYSMD1,VPS72,PIP5K1A,PSMD4	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	16221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	151284018	151284391	151284246	Y	FAM63A,CDC42SE1,TNFAIP8L2,ZNF687,RFX5,PI4KB,PI4KB	ZNF687,PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5	NA	NA	NA	NA	PI4KB	13800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	151580936	151581099	151580976	Y	NA	SNX27,RP11-404E16.1	RIIAD1,CELF3	IMR90	Hi-C	24141950	SNX27	1442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	151961675	151962369	151962069	Y	S100A11,S100A10	S100A10,NBPF18P	NA	NA	NA	NA	S100A10	2497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	152022022	152022514	152022379	Y	SNX27,S100A10,S100A11	S100A11	THEM4	MCF7	ChIA-PET	22265404	S100A11	3639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	152140379	152140745	152140485	Y	NA	FLG-AS1	NA	NA	NA	NA	FLG-AS1	1778	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr1	152878925	152879083	152878954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IVL	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	153488459	153488748	153488622	Y	PGLYRP4,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14	S100A6,S100A3,S100A4,S100A2	NA	NA	NA	NA	S100A6	17972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	153541018	153541368	153541269	Y	PGLYRP3,S100A7L2,S100A6,S100A2,S100A16,S100A14,S100A13,S100A13,S100A13	S100A6,S100A3,S100A4,S100A2,S100A16	NA	NA	NA	NA	S100A2	2652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	153584539	153584862	153584750	Y	NA	S100A2,S100A16,CHTOP,S100A13,SNAPIN	NA	NA	NA	NA	S100A16	918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	153936554	153936861	153936642	Y	UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4	GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CREB3L4	1149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	154699087	154699216	154699140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAR	100612	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	155283531	155283932	155283776	Y	DCST1,EFNA1	HCN3,CLK2,FDPS,RUSC1	NA	NA	NA	NA	RUSC1	4755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	155443130	155443303	155443253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASH1L-AS1	86518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	155946363	155946660	155946476	Y	ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	155951073	155951535	155951364	Y	NA	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	23326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	156472693	156472952	156472780	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	156473111	156473378	156473326	Y	LMNA,C1orf182,RRNAD1	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	4491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	156474686	156475018	156474923	Y	SLC25A44,PMF1,RRNAD1,MEF2D	MEF2D	NA	NA	NA	NA	MEF2D	6066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	156864713	156865066	156864817	Y	PEAR1	PEAR1	NA	NA	NA	NA	PEAR1	3223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	157980631	157980890	157980708	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	19568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	157989414	157989935	157989469	Y	KIRREL	KIRREL	NA	NA	NA	NA	KIRREL	28351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	158119500	158119689	158119553	Y	NA	ELL2P1,CD1D	LOC646268,KIRREL,AIM2	IMR90	Hi-C	24141950	ELL2P1	25856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	158147244	158147839	158147743	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	CD1D	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	158982200	158982857	158982480	Y	AIM2,PYHIN1,IFI16	IFI16	NA	NA	NA	NA	IFI16	14442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	159961374	159961617	159961522	Y	SLAMF8,SLAMF9	SLAMF9,LINC01133,PIGM	NA	NA	NA	NA	LINC01133	32366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	160639828	160639998	160639908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	190694	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	160737478	160737714	160737604	Y	CD48,FCER1G,CD244,SLAMF7	NA	NA	NA	NA	NA	CD244	92978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	160972513	160972848	160972620	Y	SLAMF7,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	16290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	160982920	160983992	160983766	Y	CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30	F11R,TSTD1,USF1	NA	NA	NA	NA	F11R	5146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	161348767	161349231	161349047	Y	NDUFS2	NA	NA	NA	NA	NA	SDHC	66720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	161359666	161360218	161359899	Y	HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A	NA	NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	77619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	161369073	161369991	161369486	Y	NA	NA	ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SDHC	87026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	161582212	161582506	161582417	Y	HSPA6,FCGR3A	NA	NA	NA	NA	NA	HSPA6	90176	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	162508612	162508929	162508802	Y	UAP1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	20394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr1	162511455	162511984	162511719	Y	UAP1,UHMK1	UHMK1,UAP1	NA	NA	NA	NA	UAP1	17339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	162666168	162666338	162666209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDR2	67005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	162954567	162954830	162954669	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,RGS5,C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	81735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	162967342	162967569	162967443	Y	RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	NA	RGS4,C1orf110,RGS5	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	68996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	163005587	163006022	163005933	Y	UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4	RGS4	C1orf110	IMR90	Hi-C	24141950	RGS4	30543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	165797615	165798367	165798308	Y	UCK2	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	2623	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	165868061	165868423	165868295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMCO1	73069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	167424728	167425462	167425239	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	NA	NA	NA	NA	NA	CREG1	95542	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	167486210	167486705	167486392	Y	POU2F1,RCSD1,CD247	CREG1	NA	NA	NA	NA	CREG1	34299	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	167766380	167766616	167766548	Y	SFT2D2,CREG1	RP1-313L4.4	NA	NA	NA	NA	RP1-313L4.4	20870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	169834996	169835276	169835168	Y	NA	SCYL3	NA	NA	NA	NA	SCYL3	26132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	172369341	172369683	172369640	Y	NA	PIGC	NA	NA	NA	NA	PIGC	41547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172608229	172608375	172608255	Y	NA	NA	C1orf9,FASLG	IMR90	Hi-C	24141950	PIGC	196999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172872881	172872916	172872899	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	301536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172874674	172874828	172874762	Y	NA	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD47,SNORD81,GAS5,SNORD75,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,LOC100506046,SNORD77,SNORD79,SNORD78,DARS2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	299624	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	295096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172887147	172887473	172887267	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,DARS2,CENPL,SNORD77,LOC100506046,SNORD79,SNORD78,ZBTB37,SNORD80,SNORD76,SNORD44,SNORD81,SNORD75,GAS5,SNORD47	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	286979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172900674	172900969	172900756	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,DARS2,CENPL,ZBTB37,GAS5	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	273483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	172903010	172903534	172903241	Y	TNFSF18,TNFSF4	NA	TNFSF4,LOC100506023,ZBTB37,GAS5,DARS2,CENPL	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	270918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	172938789	172938985	172938853	Y	NA	NA	TNFSF4,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF4	235467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	175310296	175310302	175310299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0040	150161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	177896186	177896486	177896298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-568K15.1	108599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	181060502	181060611	181060567	Y	STX6,IER5	IER5	NA	NA	NA	NA	IER5	4864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	181104265	181104352	181104277	Y	NA	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	181122099	181122260	181122227	Y	NA	NA	STX6,KIAA1614,MR1,XPR1,ACBD6,IER5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	66461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	181998739	181999134	181998891	Y	GLUL,GLUL	NA	ZNF648	MCF7	ChIA-PET	22265404	GLUL	360207	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	182140424	182140684	182140583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLUL	218657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	182274457	182274562	182274517	Y	NA	NA	GLUL	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	GLUL	84779	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	183129116	183129507	183129296	Y	LAMC2	LAMC2	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	23866	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	183133608	183133779	183133664	Y	LAMC2	LAMC2	NA	NA	NA	NA	LAMC2	19594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	183239968	183240242	183240112	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	86595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	183241451	183241867	183241650	Y	LAMC1	NA	LAMC2	IMR90	Hi-C	24141950	LAMC2	88078	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	183248987	183249454	183249212	Y	NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1	NA	NA	NA	NA	NA	LAMC2	95614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	183877295	183877615	183877384	Y	NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	141196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	185264835	185265233	185265202	Y	NA	IVNS1ABP	NA	NA	NA	NA	IVNS1ABP	19228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	192216449	192216576	192216513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4426	466737	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	192776947	192777226	192777096	Y	TROVE2,TROVE2,CDC73,RGS1,RGS2	RGS2	NA	NA	NA	NA	RGS2	778	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	198092315	198092633	198092473	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	31460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr1	198647552	198647977	198647839	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	523459	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	198650930	198651643	198651116	Y	PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	526837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	200321353	200321596	200321470	Y	DDX59,ZNF281	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF281	55588	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	200857233	200857815	200857711	Y	KIF21B	NA	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	150547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	201139670	201140154	201139905	Y	NA	TMEM9,IGFN1	KIF21B,IGFN1,LAD1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM9	968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	201426190	201426373	201426369	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	9992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	201469668	201470038	201469853	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	4331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	201472589	201472996	201472808	Y	LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	RP11-134G8.7	1373	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	201508517	201509575	201509484	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	CSRP1	31933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CSRP1	142799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	201682596	201682901	201682784	Y	ARL8A	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	113368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	201743848	201744120	201743952	Y	CSRP1,CSRP1,NAV1	NA	NA	NA	NA	NA	IPO9	52149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	202161674	202161898	202161786	Y	NA	ARL8A	NA	NA	NA	NA	ARL8A	49805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	202765097	202765528	202765162	Y	NA	RP11-480I12.2,KDM5B,PCAT6	NA	NA	NA	NA	KDM5B	11070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	203297101	203297334	203297256	Y	LAX1,TMEM183A,TMEM183B,BTG2	BTG2,FMOD	NA	NA	NA	NA	FMOD	21283	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	203506114	203506504	203506389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRELP	63158	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	203599092	203599518	203599142	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	NA	NA	NA	NA	ATP2B4	5403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	204043987	204044379	204044133	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	3744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	204053773	204053963	204053834	Y	NA	SOX13	NA	NA	NA	NA	SOX13	13530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	204330284	204330553	204330417	Y	NA	PPP1R15B	NA	NA	NA	NA	PPP1R15B	48366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	204976101	204976640	204976291	Y	LRRN2,LRRN2,NFASC,TMEM81,TMCC2,KLHDC8A,DSTYK,CNTN2,CDK18,NFASC	NA	NA	NA	NA	NA	RBBP5	112503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	205144631	205144860	205144785	Y	NA	DSTYK	NA	NA	NA	NA	DSTYK	33867	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	205709805	205710150	205710085	Y	NA	NUCKS1,RAB7L1	NA	NA	NA	NA	NUCKS1	7254	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	206642854	206643037	206642964	Y	RASSF5,MAPKAPK2,RASSF5,IKBKE	IKBKE,RASSF5	NA	NA	NA	NA	IKBKE	1063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	206807155	206807335	206807245	Y	NA	EIF2D,DYRK3,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	DYRK3	274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	206879935	206880172	206880039	Y	NA	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	23646	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	207079196	207079569	207079501	Y	NA	IL24,RP11-564A8.4	NA	NA	NA	NA	RP11-564A8.4	232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	208021631	208021781	208021738	Y	CR1,CD46,PLXNA2,CD34	C1orf132	CD34	IMR90	Hi-C	24141950	C1orf132	18714	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	208029774	208030104	208029939	Y	NA	C1orf132	NA	NA	NA	NA	C1orf132	10391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	208136912	208137268	208137107	Y	NA	NA	CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD34	54165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	209542596	209542897	209542763	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	MIR205HG	MCF7	ChIA-PET	22265404	ATP5G2P1	103028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	209578512	209578819	209578654	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1,LOC642587	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	138944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.17938553949103
chr1	209579567	209579719	209579652	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,HSD11B1	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	139999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr1	209585617	209585757	209585708	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	NA	NA	NA	NA	ATP5G2P1	146049	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	209589374	209589797	209589586	Y	LAMB3,LAMB3,IRF6,LOC642587	NA	MIR205HG	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-272L16.1	149221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	209830400	209831026	209830727	Y	TRAF3IP3,G0S2,C1orf74,LAMB3	G0S2	NA	NA	NA	NA	G0S2	15739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	209996933	209997272	209996990	Y	NA	C1orf74,DIEXF	DIEXF,IRF6,C1orf74	K562	ChIA-PET	22265404	DIEXF	2080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	210058060	210058292	210058164	Y	LAMB3	NA	DIEXF,SYT14	IMR90	Hi-C	24141950	DIEXF	58708	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	210425971	210426288	210426079	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HHAT	73308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211688648	211688771	211688711	Y	NA	NA	NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC30A1	61313	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211837893	211837920	211837910	Y	NA	RP11-354K1.1,NEK2	NA	NA	NA	NA	NEK2	9040	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211950086	211950249	211950170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	51865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211964831	211965131	211964981	Y	NA	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	36983	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	212643548	212643711	212643612	Y	NA	NENF	ATF3	K562	ChIA-PET	22265404	NENF	39319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr1	212769584	212769966	212769788	Y	ANGEL2,PPP2R5A,ATF3,ATF3,ATF3	ATF3	NA	NA	NA	NA	ATF3	32908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	214612784	214613126	214613017	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	110666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	214619335	214619608	214619472	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	104184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	214620076	214620672	214620502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	103120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	214712809	214712848	214712830	Y	NA	PTPN14	NA	NA	NA	NA	PTPN14	10944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	KCNK2	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK2	46068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	215131172	215131425	215131280	Y	NA	KCNK2	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNK2	45693	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	215741534	215741966	215741880	Y	KCTD3	KCTD3	NA	NA	NA	NA	KCTD3	2799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	216774004	216774285	216774188	Y	ESRRG,ESRRG	NA	NA	NA	NA	NA	GPATCH2	1028139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	218382752	218383112	218382930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRP15	73517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	218523725	218524123	218523798	Y	NA	TGFB2	NA	NA	NA	NA	TGFB2	6148	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	218633382	218633612	218633512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	115805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	218636802	218637167	218637004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	119225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	218669910	218670282	218669996	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	152333	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	218847947	218848245	218848113	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGFB2	330370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	219264603	219264919	219264762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPLAL1	80267	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	221631911	221632097	221631999	Y	NA	NA	DUSP10,HHIPL2	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	281421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	222000173	222000483	222000346	Y	DUSP10,DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	86655	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	222164724	222164904	222164771	Y	DUSP10	NA	DUSP10	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP10	251206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	222638782	222639204	222638963	Y	NA	NA	DUSP10,MIA3,AIDA,BROX	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-378J18.3	121963	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	222814663	222814910	222814786	Y	NA	MIA3	NA	NA	NA	NA	MIA3	25235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	223901276	223901546	223901311	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	13981	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	223903033	223903347	223903117	Y	TP53BP2,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	15738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	223964690	223965055	223964731	Y	TP53BP2,FBXO28	NA	NA	NA	NA	NA	TP53BP2	66619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr1	224240602	224240763	224240683	Y	TP53BP2	NA	NVL	IMR90	Hi-C	24141950	FBXO28	59026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	224730441	224730985	224730669	Y	NA	NA	CNIH3	IMR90	Hi-C	24141950	WDR26	107706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	224914627	224914789	224914675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAH14	167175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	225613143	225613456	225613257	Y	LBR,LBR	LBR	NA	NA	NA	NA	LBR	1171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr1	226005413	226005573	226005512	Y	NA	SRP9,EPHX1	NA	NA	NA	NA	EPHX1	9619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	226297611	226298113	226297674	Y	NA	NA	ACBD3,C1orf55,H3F3A,LIN9	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	H3F3A	50059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	226435130	226435332	226435236	Y	PARP1,LIN9,SRP9,PYCR2,H3F3A	NA	NA	NA	NA	NA	LIN9	60238	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	226890865	226891416	226891300	Y	ITPKB	ITPKB-IT1,ITPKB	NA	NA	NA	NA	ITPKB-IT1	30097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr1	227730002	227730151	227730029	Y	NA	ZNF678	WNT9A,ZNF678	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF678	19093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	228273480	228273740	228273633	Y	ARF1,ARF1	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5119	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	228274281	228274680	228274319	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	5920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	85938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	228783266	228783899	228783495	Y	C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU	NA	NA	NA	NA	NA	RHOU	84925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr1	229692979	229693368	229693287	Y	NUP133,TAF5L,ABCB10	ABCB10	NA	NA	NA	NA	ABCB10	537	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	230282048	230282189	230282138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT2	90512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	231083969	231084208	231084171	Y	NA	TTC13,ARV1	NA	NA	NA	NA	TTC13	28413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	231944869	231945038	231944953	Y	EXOC8	NA	NA	NA	NA	NA	DISC1	184308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	233248043	233248219	233248131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTPCR	163692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234254353	234254647	234254499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC35F3	215674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234630748	234630905	234630828	Y	NA	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	17899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234630919	234631525	234631418	Y	TARBP1	TARBP1	LOC100506810,RBM34,IRF2BP2,ARID4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TARBP1	18070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234746093	234747674	234747395	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	2822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234748100	234748931	234748566	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	4829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	234749342	234749645	234749570	Y	IRF2BP2	IRF2BP2,RP4-781K5.4	LINC00184,LOC100506810,ARID4B	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BP2	6071	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	234767593	234767925	234767750	Y	TARBP1	IRF2BP2,RP4-781K5.4	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	12110	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	234792654	234793437	234793098	Y	NA	IRF2BP2,RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	12619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr1	234793934	234794239	234794125	Y	NA	RP4-781K5.4	IRF2BP2,TARBP1,LINC00184,LOC100506810	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	13899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	234857710	234858181	234857899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	77675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-781K5.4	78808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	234908151	234908764	234908277	Y	IRF2BP2	NA	IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP4-781K5.4	128116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	235110834	235111403	235111103	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	RP11-443B7.3	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-443B7.3	3148	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	235927486	235927702	235927520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG4	115432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	236022682	236022818	236022763	Y	GPR137B,LYST	LYST	NA	NA	NA	NA	LYST	22122	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	236080566	236081247	236080933	Y	LYST,GPR137B	LYST	B3GALNT2,LYST,NID1	IMR90	Hi-C	24141950	LYST	35626	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	237634251	237634535	237634324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTR	677641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	238341356	238341532	238341408	Y	NA	NA	CHRM3	IMR90	Hi-C	24141950	LINC01139	305791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	238811242	238811567	238811347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01139	163919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	240308546	240308862	240308776	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22593	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	240405898	240406270	240405998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	74443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	240967891	240968036	240967952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-467I20.3	169539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	242054721	242054907	242054820	Y	KMO	EXO1	NA	NA	NA	NA	EXO1	45452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	242609605	242610011	242609798	Y	PLD5,PLD5	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	75987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	242627058	242627162	242627110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLD5	58836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	243428005	243428394	243428166	Y	CEP170,SDCCAG8	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	10685	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr1	243431437	243431793	243431509	Y	NA	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	14117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	243487001	243487352	243487082	Y	CEP170,SDCCAG8	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	69681	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	243585242	243585384	243585313	Y	CEP170,AKT3,AKT3	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	167922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	243788022	243788404	243788357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	223977	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	243806306	243806448	243806376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	205933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	243923195	243923609	243923504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	88772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	243997018	243997244	243997154	Y	NA	AKT3	NA	NA	NA	NA	AKT3	15137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	244011895	244012034	244011933	Y	NA	AKT3	LOC339529	IMR90	Hi-C	24141950	AKT3	347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	244094600	244094786	244094718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	82219	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	244210956	244211944	244211575	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKT3	198575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	244512430	244512879	244512496	Y	ADSS	NA	C1orf100,ADSS,AKT3	IMR90	Hi-C	24141950	ADSS	100557	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr1	244517098	244517541	244517376	Y	ADSS	NA	NA	NA	NA	NA	ADSS	95895	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	244613820	244614139	244614120	Y	NA	ADSS,C1orf101	NA	NA	NA	NA	ADSS	384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	246038342	246038749	246038555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	629865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	246591935	246592203	246592010	Y	SMYD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD3	76411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr1	246749077	246749442	246749258	Y	CNST	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	21331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	246763574	246763751	246763579	Y	NA	TFB2M,CNST	NA	NA	NA	NA	CNST	35828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	247297966	247298129	247298007	Y	NA	ZNF669	NA	NA	NA	NA	ZNF669	32292	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	249117788	249118228	249118121	Y	SH3BP5L	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692	NA	NA	NA	NA	MIR3124	348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr1	249157308	249157673	249157562	Y	OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692	MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2	NA	NA	NA	NA	ZNF692	5965	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	1112826	1113160	1112997	Y	WDR37	IDI1,WDR37	NA	NA	NA	NA	WDR37	19348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3088088	3088382	3088199	Y	NA	PFKP	PFKP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PFKP	18143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3497590	3497951	3497729	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90	Hi-C	24141950	PITRM1	284587	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3510310	3510716	3510597	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PITRM1	297307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	3782727	3783283	3782915	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	42190	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3848037	3849536	3848891	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	22564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	3852273	3852886	3852712	Y	KLF6	KLF6	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	26800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	3868851	3869035	3868973	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	43378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	3870489	3871262	3871176	Y	KLF6	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	45016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3928866	3929216	3928980	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	103393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3932191	3932411	3932301	Y	NA	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	106718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	4289203	4289519	4289251	Y	NA	LINC00702	KLF6,LOC338588,LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	5099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	4685784	4686138	4685885	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	32208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	4712833	4713220	4712996	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	5126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	4713647	4713873	4713697	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	4473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr10	4855217	4855416	4855349	Y	NA	AKR1E2	KLF6,NET1	IMR90	Hi-C	24141950	AKR1E2	28396	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	5576341	5576485	5576413	Y	NET1,CALML3	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	59596	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5587810	5588190	5587923	Y	NA	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	47891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5588881	5589169	5589084	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	46912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5590010	5590295	5590293	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NA	NA	NA	NA	RP13-463N16.6	45786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5607602	5608000	5607781	Y	CALML3	RP13-463N16.6	NET1,CALML5	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP13-463N16.6	28081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	5783071	5783414	5783247	Y	NA	NA	GDI2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM208B	58270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	5986377	5986825	5986602	Y	NA	RP11-536K7.3,IL15RA	NA	NA	NA	NA	RP11-536K7.3	514	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	6206285	6206560	6206485	Y	NA	PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	21404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	6243287	6243821	6243659	Y	PFKFB3,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	58406	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	6449763	6450038	6449901	Y	PRKCQ	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	264882	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	8098940	8099487	8099174	Y	TAF3,GATA3	GATA3	NA	NA	NA	NA	GATA3	5373	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	8374227	8374893	8374382	Y	GATA3	NA	NA	NA	NA	NA	GATA3	280660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	8408171	8408387	8408297	Y	NA	NA	FLJ45983,GATA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	GATA3	314604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	10831008	10831167	10831105	Y	NA	SFTA1P	NA	NA	NA	NA	SFTA1P	3776	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	10953472	10953723	10953520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	91536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	11112343	11112864	11112373	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CELF2	67084	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	11835953	11836243	11836176	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	USP6NL	184200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	11866902	11867068	11866972	Y	C10orf47	NA	LOC219731	IMR90	Hi-C	24141950	USP6NL	215149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	11924114	11924319	11924232	Y	C10orf47	NA	NA	NA	NA	NA	UPF2	158850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	13692317	13692641	13692563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	65390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	13829023	13829481	13829176	Y	PRPF18	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	202096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	205805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	13924181	13924825	13924574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	189458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	13932168	13932481	13932420	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-397C18.2	181802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	14447046	14447458	14447244	Y	NA	NA	FRMD4A,FAM107B	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	54683	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	14518978	14519126	14519049	Y	NA	FRMD4A	FRMD4A	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD4A	16837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	14628830	14629278	14629071	Y	HSPA14	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	126689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	14647138	14647588	14647478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	144997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	15191044	15191371	15191092	Y	MEIG1,NMT2,C10orf111	NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	17321	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	15300658	15300993	15300826	Y	ACBD7,FAM171A1	NA	NA	NA	NA	NA	NMT2	91966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	17010242	17010673	17010572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	152715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	17105178	17105416	17105257	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	136637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	17390739	17391085	17390858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124N14.3	115907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	17553346	17553542	17553509	Y	NA	NA	ST8SIA6,CUBN,PTPLA	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTPLA	103834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	17569630	17569764	17569656	Y	VIM	NA	PTPLA	IMR90	Hi-C	24141950	PTPLA	87612	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	19927503	19927756	19927630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	175412	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	20292651	20293410	20292825	Y	PLXDC2	NA	NA	NA	NA	NA	PLXDC2	189483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	21390009	21390197	21390106	Y	MLLT10,MLLT10,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	NEBL	70919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	21816029	21816444	21816223	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	4650	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	21824374	21824606	21824490	Y	NA	MLLT10	NA	NA	NA	NA	MLLT10	3280	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	22026318	22026683	22026671	Y	EBLN1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP37	193389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	22629825	22629981	22629966	Y	DNAJC1	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	21685	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr10	22970665	22970972	22970902	Y	NA	PIP4K2A	NA	NA	NA	NA	PIP4K2A	30512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	26191189	26191209	26191199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	533923	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	26789137	26789225	26789181	Y	APBB1IP	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	64005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	27027283	27027887	27027754	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	42695	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	27032794	27033066	27033024	Y	NA	PDSS1	NA	NA	NA	NA	PDSS1	48206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	27531769	27532240	27532024	Y	ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5	ACBD5	NA	NA	NA	NA	ACBD5	2710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	30471622	30471929	30471877	Y	KIAA1462	NA	KIAA1462,SVIL	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	69199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	31364412	31364707	31364567	Y	NA	ZNF438	ZEB1,ARHGAP12,ZEB1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF438	45546	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	31892273	31892723	31892643	Y	NA	NA	ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ZEB1-AS1	284897	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	33250851	33251304	33251058	Y	NA	RP11-462L8.1,ITGB1	NA	NA	NA	NA	RP11-462L8.1	5078	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	33269452	33269916	33269602	Y	C10orf68	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	22804	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr10	33272272	33272613	33272373	Y	ITGB1,ITGB1,ITGB1	RP11-462L8.1,ITGB1	ITGB1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ITGB1	20107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	33422989	33423776	33423207	Y	NA	NA	ITGB1	IMR90	Hi-C	24141950	ITGB1	130269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	33537661	33538041	33537751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	85149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	33701574	33701923	33701712	Y	NA	NA	PARD3	IMR90	Hi-C	24141950	NRP1	78384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	34569605	34569879	34569742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	381150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	34816179	34816294	34816237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-8L18.3	134735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	35589038	35589427	35589190	Y	CREM,CREM,CREM,CREM,CCNY	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	55085	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	35932153	35932694	35932189	Y	FZD8	NA	NA	NA	NA	NA	CCNY	398200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	36783467	36783622	36783545	Y	NA	NAMPTL	FZD8	IMR90	Hi-C	24141950	NAMPTL	27540	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	43600895	43601120	43601049	Y	RASGEF1A	RET,CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	RET	30420	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr10	43950893	43951349	43951098	Y	NA	HNRNPF,RP11-517P14.2	NA	NA	NA	NA	RP11-517P14.2	36707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	45439361	45439737	45439549	Y	NA	RASSF4,C10orf10	NA	NA	NA	NA	RASSF4	13118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	45453721	45453921	45453864	Y	ALOX5	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	RASSF4	866	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	45464299	45464380	45464314	Y	ZNF22,C10orf25	RASSF4,C10orf10,ZNF22	NA	NA	NA	NA	C10orf10	7878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	45927566	45927962	45927775	Y	FAM21C,ANUBL1,ALOX5	NA	NA	NA	NA	NA	ALOX5	59905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	47057375	47057652	47057526	Y	NA	NA	GPRIN2,ZNF488,LOC643650,SYT15,ANTXRL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-38L15.3	107903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	47092943	47093271	47093193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	143471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	47129494	47129670	47129546	Y	SYT15,PPYR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-38L15.3	180022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	47655672	47656071	47655889	Y	NA	NA	AGAP7	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF488	696953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	48577583	48577860	48577722	Y	NA	NA	SYT15,GPRIN2	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	224559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	48591812	48592143	48591972	Y	ZNF488	NA	SYT15	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF488	238788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	49725975	49726150	49726063	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	136160	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	49784925	49785316	49785121	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	76994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	49811574	49811696	49811632	Y	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	50614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	49814847	49815442	49815148	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	46868	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	49848485	49848580	49848572	Y	NA	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	13730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	50595145	50595278	50595227	Y	C10orf128	NA	NA	NA	NA	NA	PGBD3	149808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	51488946	51489392	51489137	Y	NCOA4,NCOA4,NCOA4	RP11-109G10.2	NA	NA	NA	NA	RP11-109G10.2	41180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	52167205	52167434	52167402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	144467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	52216561	52216792	52216698	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	166131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	52261858	52262194	52262143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGMS1	120729	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	52385542	52385659	52385602	Y	NA	SGMS1	NA	NA	NA	NA	SGMS1	2619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	52751732	52752116	52752062	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	2787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	54078781	54079176	54078966	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	54203068	54203427	54203228	Y	NA	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	54203502	54203868	54203680	Y	DKK1	NA	LOC100506939,DKK1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DKK1	131446	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr10	61665210	61665415	61665365	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	63702592	63703184	63702855	Y	ARID5B	ARID5B	NA	NA	NA	NA	ARID5B	43533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	64342532	64342939	64342724	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF365	210581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	65033384	65033629	65033527	Y	NRBF2,JMJD1C	NA	NA	NA	NA	NA	NRBF2	142334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	65128612	65128923	65128710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	94799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	65930110	65930546	65930307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-170M17.2	269105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	68137896	68138170	68138033	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	1457754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	68762271	68762461	68762366	Y	LRRTM3	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC12	833463	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	69609160	69609390	69609211	Y	NA	DNAJC12,SIRT1	SIRT1	K562	ChIA-PET	22265404	DNAJC12	13236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	69778500	69778679	69778642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERC4	54426	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	69822197	69822546	69822385	Y	NA	HERC4,MYPN	NA	NA	NA	NA	HERC4	10559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4,MYPN	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MYPN	8635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr10	69913307	69913725	69913572	Y	SIRT1,PBLD,HNRNPH3	MYPN	NA	NA	NA	NA	MYPN	49395	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	69962839	69962995	69962921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYPN	98927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	70817174	70817630	70817194	Y	NA	SRGN	KIAA1279,SRGN,DDX21,VPS26A,SUPV3L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SRGN	28232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	70821151	70821852	70821361	Y	DDX21,VPS26A,SRGN	SRGN	KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1	IMR90	Hi-C	24141950	SRGN	24010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	70846057	70846170	70846083	Y	NA	SRGN,VPS26A	NA	NA	NA	NA	SRGN	195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	71145067	71145367	71145287	Y	NA	TACR2	NA	NA	NA	NA	TACR2	29256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	71198445	71198595	71198514	Y	NA	TACR2,TSPAN15	HKDC1,TSPAN15,C10orf35,HK1,TACR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSPAN15	10634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	71626507	71626840	71626632	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	66863	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	71928097	71928630	71928606	Y	NA	AIFM2,TYSND1	TYSND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SAR1A	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	72027304	72027694	72027415	Y	NA	PPA1	NA	NA	NA	NA	PPA1	35637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	72117206	72117607	72117506	Y	NA	LRRC20,EIF4EBP2	NA	NA	NA	NA	LRRC20	22775	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B,UNC5B-AS1	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	1736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73026177	73026397	73026262	Y	UNC5B	NA	NA	NA	NA	NA	UNC5B-AS1	50192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73526437	73526878	73526654	Y	CDH23,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	4377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73528339	73528873	73528813	Y	CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	2382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73531831	73532355	73532130	Y	C10orf105,CDH23,PSAP,C10orf54	C10orf54	NA	NA	NA	NA	C10orf54	576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73620184	73620641	73620392	Y	DNAJB12,DDIT4,C10orf54,PSAP	PSAP	PSAP,C10orf54,CDH23,CHST3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PSAP	11058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73725868	73726411	73726297	Y	C10orf105,CHST3	CHST3	NA	NA	NA	NA	CHST3	3745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	73986513	73986881	73986533	Y	C10orf105,C10orf54,CDH23,CDH23	ANAPC16,ASCC1,DDIT4	NA	NA	NA	NA	ASCC1	11621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	74056833	74058104	74057179	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4	NA	NA	NA	NA	DDIT4	25155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	74068319	74068595	74068530	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ASCC1,ANAPC16	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DDIT4	36641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	74079380	74080359	74079580	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	32629	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	74436264	74436425	74436399	Y	CCDC109A,ASCC1,ASCC1	HMGN2P34,MCU	MICU1,OIT3,PLA2G12B,MCU	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MCU	13464	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	74836640	74837022	74836864	Y	NA	P4HA1,NUDT13	NA	NA	NA	NA	P4HA1	17710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	74925047	74925060	74925055	Y	ANXA7,ECD	FAM149B1,ECD	NA	NA	NA	NA	FAM149B1	864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	75240023	75240096	75240089	Y	NA	RP11-137L10.6,PPP3CB	NA	NA	NA	NA	RP11-137L10.6	13187	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	75887856	75888019	75887938	Y	NA	AP3M1,ADK	NA	NA	NA	NA	AP3M1	20802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	77165098	77165501	77165301	Y	C10orf11	ZNF503	NA	NA	NA	NA	ZNF503	5434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	78192206	78192310	78192258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C10orf11	833208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	78828890	78829127	78829009	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	567226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	78886447	78886645	78886557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	509708	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	78920467	78920779	78920602	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	475574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	78923836	78924098	78923933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	472255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	78974815	78975138	78974939	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	421215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	79006844	79007202	79006984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	389151	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	79069997	79070387	79070206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	325966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	79123955	79124246	79124101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	272107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	79152642	79152983	79152827	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	243370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	79176142	79176460	79176291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	219893	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	79261142	79261358	79261250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	134995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	79291052	79291779	79291330	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	80015725	80016226	80016048	Y	RPS24	LINC00856	NA	NA	NA	NA	LINC00856	9220	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	80122259	80122477	80122368	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,LOC100132987	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00856	115754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	80734291	80734943	80734463	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	91849	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	80911539	80911799	80911619	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	84747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	80912242	80912363	80912303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	85450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	81028676	81029041	81028720	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	76184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	81077317	81078576	81077648	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	26649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	81091409	81091966	81091732	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	13259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	81159335	81159579	81159503	Y	ZCCHC24	ZCCHC24	NA	NA	NA	NA	ZCCHC24	43804	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	81959510	81960003	81959818	Y	TSPAN14,SH2D4B,ANXA11	ANXA11,EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	3325	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	82215085	82215437	82215324	Y	TSPAN14,SH2D4B	FAM213A,TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	3163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	82247433	82247863	82247773	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	35511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	82258642	82258780	82258737	Y	TSPAN14	TSPAN14	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	46720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	82290071	82290345	82290209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN14	78149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	86093705	86094297	86093848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GHITM	196509	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	86108374	86108507	86108453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3AP5	209692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	88160011	88160294	88160175	Y	NA	GRID1	WAPAL	MCF7	ChIA-PET	22265404	GRID1	35761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	88471302	88471860	88471725	Y	LDB3,LDB3,LDB3	BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	42547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	89602886	89603081	89603056	Y	NA	CFL1P1,ATAD1,PTEN	NA	NA	NA	NA	ATAD1	3786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	89934548	89934906	89934582	Y	NA	NA	PTEN,CFL1P1,KLLN,RNLS	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380G5.3	231289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	90495559	90495751	90495657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STAMBPL1	141740	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	90753757	90754132	90754032	Y	NA	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	ACTA2	4610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	91010610	91010883	91010698	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	30639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	91020368	91020477	91020401	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2	NA	NA	NA	NA	RP11-149I23.3	21045	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	91034775	91034961	91034861	Y	NA	RP11-149I23.3,IFIT2	IFIT1B,IFIT2,IFIT3,IFIT1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-149I23.3	6561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	91056885	91057091	91056998	Y	IFIT5,IFIT1,IFIT3,IFIT3,IFIT2	RP11-149I23.3,IFIT2,IFIT3	IFIT3,IFIT5,IFIT2,SLC16A12,IFIT1B,PANK1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IFIT2	2621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	91096041	91096297	91096218	Y	IFIT2,IFIT3,IFIT3,IFIT5,IFIT1	IFIT2,IFIT3	NA	NA	NA	NA	IFIT3	10390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	93432082	93432315	93432239	Y	NA	PPP1R3C	LOC100188947,HECTD2,TNKS2,RPP30,PPP1R3C	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1R3C	41271	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	93697836	93698042	93697939	Y	NA	FGFBP3,BTAF1	NA	NA	NA	NA	BTAF1	16310	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	94351391	94351691	94351485	Y	CPEB3	IDE,KIF11	NA	NA	NA	NA	KIF11	348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	95200243	95200778	95200520	Y	CYP26C1,MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	39296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	95218561	95218998	95218660	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	21076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	95224699	95224811	95224754	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	15263	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	96943397	96943661	96943560	Y	SORBS1,SORBS1	NA	C10orf129,SORBS1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	105120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	97086948	97086989	97086969	Y	NA	PDLIM1	PDLIM1	IMR90	Hi-C	24141950	PDLIM1	38167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	97809134	97809259	97809196	Y	NA	CCNJ,ENTPD1-AS1	NA	NA	NA	NA	CCNJ	7983	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101417166	101417530	101417347	Y	NA	SLC25A28,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101425049	101425416	101425233	Y	NA	SLC25A28,ENTPD7,CUTC	NA	NA	NA	NA	ENTPD7	7786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101475394	101475766	101475528	Y	NA	CUTC,COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	14091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101539519	101539906	101539726	Y	NA	COX15	NA	NA	NA	NA	COX15	49662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101543856	101543953	101543936	Y	COX15,ABCC2	NA	NA	NA	NA	NA	COX15	53999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101666342	101666477	101666411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNMBP	101199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.1834020256461
chr10	102245055	102245685	102245323	Y	NA	HIF1AN,SEC31B,NDUFB8	NA	NA	NA	NA	HIF1AN	41144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	102488726	102488983	102488821	Y	NA	PAX2	PAX2	IMR90	Hi-C	24141950	PAX2	4377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	102490692	102490976	102490862	Y	NA	PAX2	NA	NA	NA	NA	PAX2	2384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	103124623	103124787	103124739	Y	FBXW4	BTRC	DPCD,POLL	IMR90	Hi-C	24141950	BTRC	12803	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	103656859	103657173	103657045	Y	NA	NA	MGEA5,LOC100289509,KCNIP2	IMR90	Hi-C	24141950	MGEA5	80163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	103807032	103807259	103807146	Y	NA	C10orf76,HPS6	NA	NA	NA	NA	C10orf76	6691	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	104387544	104387817	104387672	Y	GBF1,CUEDC2,ACTR1A	TRIM8	NA	NA	NA	NA	TRIM8	14436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr10	104472705	104472855	104472743	Y	NA	ARL3,SFXN2	NA	NA	NA	NA	SFXN2	410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	104956992	104957240	104957082	Y	C10orf32,NT5C2	NT5C2	NA	NA	NA	NA	NT5C2	5936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	104990991	104991184	104991120	Y	NA	NT5C2	SFXN2,C10orf32-AS3MT,CYP17A1,NT5C2,CNNM2,LOC729020	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NT5C2	39935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	105419490	105419843	105419666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	193458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	105519063	105519154	105519109	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	94147	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	105610087	105610227	105610144	Y	NA	SH3PXD2A	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	3074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	105667994	105668449	105668210	Y	GSTO1,GSTO1,SLK	OBFC1	NA	NA	NA	NA	OBFC1	7514	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	106052804	106053054	106052846	Y	MEIR5,MEIR5,GSTO1	GSTO2,ITPRIP	NA	NA	NA	NA	GSTO2	26173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	106085298	106085504	106085412	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	10658	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	106087819	106088091	106087906	Y	SLK,MEIR5,MEIR5,GSTO1,GSTO1,ITPRIP,CCDC147	ITPRIP	NA	NA	NA	NA	ITPRIP	8071	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	110138864	110139232	110139127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-163F15.1	180341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	110297861	110298217	110298073	Y	NA	RP11-163F15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-163F15.1	21356	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112113245	112113632	112113326	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	50536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112117126	112117443	112117281	Y	DUSP5,MXI1	NA	SMC3,DUSP5,SMNDC1,RBM20	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMNDC1	54417	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	112158460	112158738	112158533	Y	DUSP5	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	SMNDC1	95751	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	112159079	112159451	112159258	Y	NA	NA	SMC3,DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	96145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112168008	112168205	112168118	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	87391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112170161	112170538	112170357	Y	DUSP5	NA	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	85058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	112207134	112207519	112207380	Y	NA	DUSP5	DUSP5	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP5	48077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	112259301	112259712	112259445	Y	MXI1,PDCD4,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	3705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112261043	112261328	112261185	Y	SHOC2,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	5447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	114715800	114716132	114715855	Y	NA	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	7791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	114818562	114818849	114818630	Y	HABP2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	110553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	115141716	115142302	115141804	Y	TCF7L2	NA	VTI1A,ZDHHC6,ACSL5,TCF7L2	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	294640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	118034123	118034494	118034359	Y	GFRA1,GFRA1,GFRA1	GFRA1	NA	NA	NA	NA	GFRA1	3144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr10	119028396	119028853	119028412	Y	SLC18A2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	104125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	119069713	119069747	119069730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	63231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	119294820	119294982	119294904	Y	EMX2	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD8	161842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	121030438	121030814	121030688	Y	GRK5	NA	NA	NA	NA	NA	GRK5	65337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	121417930	121418047	121417978	Y	BAG3	RP11-179H18.5,BAG3	NA	NA	NA	NA	BAG3	9048	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	121503034	121503182	121503110	Y	NA	NA	MCMBP	IMR90	Hi-C	24141950	BAG3	94152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	123539603	123539774	123539689	Y	TACC2,ATE1	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	146053	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	123626359	123626403	123626376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATE1-AS1	59424	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	123873239	123873409	123873290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	126550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	123900074	123900243	123900143	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	153385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	124133234	124133500	124133290	Y	NA	PLEKHA1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA1	1022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	124196519	124196712	124196524	Y	TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	22329	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CHST15	95524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr10	126029584	126030073	126029818	Y	CHST15	NA	HMX3	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	75472	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	126748587	126748846	126748786	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	98893	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	126749775	126749930	126749890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTBP2	97809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	127916240	127916659	127916465	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	158365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	127919956	127919968	127919963	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	155056	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	127932254	127933051	127932680	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	141973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	127936160	127936570	127936368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	138454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	128943463	128943803	128943552	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	351485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	128947297	128947480	128947351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK1	355319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	133794080	133794414	133794353	Y	NA	BNIP3	PPP2R2D	IMR90	Hi-C	24141950	BNIP3	645	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr10	134122010	134122092	134122081	Y	NA	STK32C,LRRC27	DPYSL4	IMR90	Hi-C	24141950	STK32C	21259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr10	134266616	134267060	134266753	Y	LRRC27,LRRC27,PWWP2B,INPP5A,C10orf92	NA	NA	NA	NA	NA	PWWP2B	57944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	134360968	134361428	134361255	Y	INPP5A	INPP5A	NA	NA	NA	NA	INPP5A	11644	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	134430075	134430311	134430209	Y	INPP5A	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	80751	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	134536889	134537206	134537078	Y	LRRC27,LRRC27,INPP5A,C10orf92	NA	NA	NA	NA	NA	INPP5A	187565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	135092436	135092746	135092593	Y	ADAM8,TUBGCP2	ZNF511,TUBGCP2	NA	NA	NA	NA	ZNF511	27233	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr10	135143215	135143462	135143339	Y	C10orf92	ZNF511,TUBGCP2,ECHS1,PAOX	NA	NA	NA	NA	TUBGCP2	19374	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	334344	334553	334421	Y	NA	ATHL1,IFITM2,IFITM3,B4GALNT4	NA	NA	NA	NA	IFITM3	8807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	355877	356724	356385	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3	IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	B4GALNT4	11072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr11	368352	368730	368427	Y	NA	IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR	NA	NA	NA	NA	B4GALNT4	556	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	469770	469895	469845	Y	B4GALNT4,CEND1	PTDSS2,RNH1	NA	NA	NA	NA	PTDSS2	23502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	926738	926879	926801	Y	BRSK2,CEND1,AP2A2	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	3844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	1073369	1073545	1073512	Y	DRD4,EFCAB4A	NA	NA	NA	NA	NA	AP2A2	150475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	1147842	1148157	1148045	Y	NA	NA	MUC5B	MCF7	ChIA-PET	22265404	TOLLIP	180727	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	1409546	1409852	1409608	Y	KRTAP5-1,KRTAP5-6,KRTAP5-5,KRTAP5-3	BRSK2	NA	NA	NA	NA	BRSK2	417	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	1536608	1536918	1536802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP8	54232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	1793842	1794035	1793938	Y	TOLLIP,TNNI2,LSP1,CTSD,MOB2	RP11-295K3.1,CTSD	MOB2,IFITM10,MIR4686,TH,IGF2-AS1,INS-IGF2,IGF2	IMR90,MCF7,K562,H1ESC	Hi-C,3C,ChIA-PET,5C	24141950,19890323,22265404,22955621	CTSD	10620	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	2009660	2010154	2009976	Y	IGF2,IGF2,SYT8	MRPL23	NA	NA	NA	NA	MRPL23	43152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	2913617	2913951	2913751	Y	NA	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	5000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	2919958	2920393	2920124	Y	KCNQ1	CDKN1C,SLC22A18,PHLDA2	NA	NA	NA	NA	SLC22A18	1007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	2988914	2989223	2989024	Y	MRGPRG,SLC22A18	PHLDA2,NAP1L4	NA	NA	NA	NA	NAP1L4	22384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	3742975	3743362	3743342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP2	73592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	3792611	3792742	3792677	Y	STIM1,RHOG,NUP98	PGAP2,NUP98	NA	NA	NA	NA	PGAP2	24212	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	5311058	5311280	5311161	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBD	56458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.17938553949103
chr11	6523174	6523531	6523244	Y	OR2D2	TRIM3,ARFIP2	NA	NA	NA	NA	ARFIP2	22508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	6723829	6724231	6724032	Y	NA	DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	MRPL17	21197	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	7913705	7913868	7913824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NLRP10	71105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	8273804	8274153	8274013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUB	235013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	8607763	8607778	8607771	Y	ASCL3,STK33	STK33	NA	NA	NA	NA	STK33	6058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	8723535	8723638	8723587	Y	STK33	RPL27A	NA	NA	NA	NA	RPL27A	21577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	9250767	9251109	9250945	Y	NA	DENND5A	NA	NA	NA	NA	DENND5A	33828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	9385760	9386326	9386092	Y	ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7	IPO7	ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IPO7	17843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	9635436	9636077	9635827	Y	DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70	WEE1,SWAP70	WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WEE1	42208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	9686542	9686911	9686729	Y	ZNF143,SWAP70	SWAP70	NA	NA	NA	NA	SWAP70	2918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	10246954	10247167	10247061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2	66587	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	10302186	10302573	10302380	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	SBF2	11181	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	10323282	10323617	10323398	Y	NA	SBF2,RP11-351I24.1,ADM,AMPD3	NA	NA	NA	NA	RP11-351I24.1	31	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	10681207	10681687	10681411	Y	ADM,MRVI1,MRVI1	NA	LYVE1,MRVI1-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	CTR9	88847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	11998818	11999068	11999003	Y	MICALCL	DKK3	NA	NA	NA	NA	DKK3	30248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	12065635	12065803	12065720	Y	NA	DKK3,RP13-631K18.5,MICAL2	DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	DKK3	36319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	12097914	12098716	12098251	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	7722	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12109558	12109847	12109697	Y	PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,TEAD1,MICALCL,DKK3,USP47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP13-631K18.5	3120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	12132692	12132808	12132735	Y	MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	19149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12148184	12148552	12148402	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	34641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	12197316	12197738	12197633	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	83773	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	12204138	12204505	12204342	Y	MICAL2,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	90595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12204570	12205016	12204699	Y	MICAL2	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	91027	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12306799	12307179	12306992	Y	MICAL2,PARVA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	89553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12772830	12773175	12773002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	78861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	12884715	12885004	12884787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEAD1	190746	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	13238046	13238305	13238120	Y	NA	NA	ARNTL,BTBD10,LOC100506305	IMR90	Hi-C	24141950	ARNTL	57894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	13468446	13468721	13468666	Y	NA	BTBD10	NA	NA	NA	NA	BTBD10	14123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr11	14356156	14356413	14356247	Y	NA	RRAS2	NA	NA	NA	NA	RRAS2	27639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr11	14436782	14437066	14436859	Y	NA	NA	RRAS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RRAS2	52730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	14443887	14444060	14443964	Y	RRAS2	NA	RRAS2,COPB1,SPON1	IMR90	Hi-C	24141950	RRAS2	59835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	16402637	16403029	16402964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C11orf58	229650	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	16625688	16626709	16626131	Y	SOX6,SOX6	C11orf58	SOX6	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf58	5970	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	17099866	17100401	17100030	Y	NA	RPS13	NA	NA	NA	NA	RPS13	2532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	17230717	17231092	17230803	Y	NA	PIK3C2A,NUCB2	NA	NA	NA	NA	NUCB2	3017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	17374298	17375700	17374969	Y	RPS13,B7H6	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	146598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	19649981	19650160	19650072	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	279710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	19701731	19702025	19701818	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	331460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	19736892	19737150	19737126	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	NAV2	366621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	20041538	20041793	20041666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	341438	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	20046945	20047208	20047086	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	336023	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	20134058	20134420	20134284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	248811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	22814174	22814335	22814255	Y	SVIP	RP11-17A1.3,SVIP	NA	NA	NA	NA	RP11-17A1.3	34591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27217576	27217737	27217656	Y	NA	NA	LGR4	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC34	165678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27683148	27683223	27683174	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	27725050	27725226	27725138	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	16379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27739901	27740316	27740092	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	1289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr11	27740535	27740662	27740569	Y	NA	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27948556	27948905	27948731	Y	NA	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	37976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	27955713	27956134	27955920	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	28063321	28063497	28063482	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL15	64298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	28588177	28588553	28588410	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133609	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	28778513	28778891	28778701	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	56351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	57132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	28792909	28793103	28792913	Y	NA	NA	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	70747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	28831581	28831914	28831617	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	109419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	28855204	28855664	28855372	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	133042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	28856336	28856685	28856610	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	134174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	135691	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr11	29141601	29141895	29141706	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	419439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	29207165	29207501	29207312	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	485003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	29321986	29322293	29322123	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	599824	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	29323978	29324331	29324155	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-115J23.1	601816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	31835564	31835985	31835634	Y	NA	RCN1,PAX6	NA	NA	NA	NA	PAX6	1524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	33181656	33182005	33181958	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTF3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	33342450	33342853	33342574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK3	66232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	33394151	33394320	33394196	Y	C11orf41	RP1-130L23.1	NA	NA	NA	NA	RP1-130L23.1	28442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	33427027	33427076	33427050	Y	NA	RP1-130L23.1	C11orf41,C11orf91	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-130L23.1	4265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	33711808	33712191	33712002	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	43800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr11	33713598	33714029	33713919	Y	CD59	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	41962	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	33742880	33743486	33743237	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	12505	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	34356172	34356320	34356246	Y	NA	RP1-145M24.1,ABTB2	NA	NA	NA	NA	RP1-145M24.1	622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	34675579	34675977	34675664	Y	ABTB2,CD44	NA	NA	NA	NA	NA	CAT	217107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	34931457	34931889	34931828	Y	NA	PDHX,APIP	NA	NA	NA	NA	PDHX	3487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	35103874	35105511	35104330	Y	CD44	NA	CD44,PDHX,APIP,SLC1A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-607I7.1	52068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	35188303	35189153	35188420	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	29886	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	RP4-607I7.1,CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	35575444	35575679	35575584	Y	PAMR1,FJX1	PAMR1	PAMR1,TRIM44,LDLRAD3,FJX1	IMR90	Hi-C	24141950	PAMR1	25596	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	40172483	40172568	40172526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-124G5.1	1385416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	44341406	44341701	44341459	Y	ALX4	NA	EXT2,ALX4	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXT2	226307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	44883806	44884166	44884088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	86674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr11	46258702	46259233	46258865	Y	DGKZ	CREB3L1	PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	37979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr11	46264726	46265198	46265009	Y	NA	CREB3L1	DGKZ,PHF21A,CREB3L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	32014	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	46270167	46270467	46270346	Y	CREB3L1	CREB3L1	CREB3L1,PHF21A,DGKZ	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB3L1	26745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	47173206	47173550	47173416	Y	NA	ARFGAP2,PACSIN3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP2	23126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	47421735	47422128	47421819	Y	MADD,CELF1,CELF1,CELF1,SPI1	SLC39A13,RP11-750H9.5,PSMC3	SLC39A13	IMR90	Hi-C	24141950	SLC39A13	4555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	47789923	47790126	47789984	Y	NA	FNBP4	NA	NA	NA	NA	FNBP4	2928	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	47968538	47968912	47968651	Y	CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	RP11-793I11.1,PTPRJ	PTPRJ	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPRJ	31201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	48028073	48028508	48028179	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	27960	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	48028604	48028990	48028813	Y	CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ	PTPRJ	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	28491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	48077375	48077584	48077563	Y	FNBP4,PTPRJ	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	77262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	48193627	48193663	48193645	Y	OR4X1,OR4C45,OR4B1,OR4C3,OR4X2,OR4S1	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRJ	193514	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	57224938	57225034	57225001	Y	SLC43A1,SLC43A1,SERPING1,PRG3	SLC43A3,RTN4RL2	NA	NA	NA	NA	RTN4RL2	988	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	57333685	57333973	57333758	Y	SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6	TIMM10,SERPING1	NA	NA	NA	NA	UBE2L6	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	57366352	57366685	57366510	Y	RTN4RL2,SLC43A1,SLC43A1,UBE2L6,SERPING1,SERPING1	UBE2L6,SERPING1,AP000662.4,CLP1	NA	NA	NA	NA	SERPING1	3492	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	57406709	57407290	57406997	Y	OR9I1,OR9Q1,PRG3,YPEL4,UBE2L6	SERPING1,AP000662.4,CLP1,ZDHHC5	NA	NA	NA	NA	AP000662.4	3212	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	58319737	58319877	58319834	Y	NA	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	23816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr11	59582834	59583156	59582993	Y	NA	MRPL16	NA	NA	NA	NA	MRPL16	6489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	60929738	60929978	60929839	Y	NA	VPS37C	NA	NA	NA	NA	VPS37C	2649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61065380	61065516	61065448	Y	NA	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	4484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	61074897	61075402	61075197	Y	CD6	VWCE,DAK,DDB1	NA	NA	NA	NA	VWCE	14001	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61523945	61524112	61524089	Y	INCENP,DAK,C11orf9	FEN1,FADS2	NA	NA	NA	NA	FEN1	33997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61738760	61739751	61739487	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	5628	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61746281	61746413	61746325	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	13149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	61780516	61780626	61780618	Y	NA	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61792928	61793609	61793204	Y	DAGLA,FTH1	NA	FADS3,FADS2,FTH1,BEST1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	59796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	61880097	61880151	61880125	Y	FADS2,FADS3,RAB3IL1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,DKFZP434K028,C11orf9,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	9294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr11	62312037	62312397	62312245	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	62320057	62320478	62320186	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	AHNAK	IMR90	Hi-C	24141950	AHNAK	1229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	62320979	62321244	62321106	Y	NA	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	463	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr11	62321348	62321821	62321541	Y	NA	RP11-864I4.4,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2	NA	NA	NA	NA	AHNAK	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	63334518	63335083	63334716	Y	RARRES3,OTUB1	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	32237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	63337722	63338129	63338119	Y	NA	RARRES3,PLA2G16	NA	NA	NA	NA	RARRES3	35441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	63777072	63777136	63777104	Y	NA	COX8A,AP000721.4,OTUB1	NA	NA	NA	NA	OTUB1	25747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	63949132	63949273	63949224	Y	NA	MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4	NA	NA	NA	NA	STIP1	1471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	64125464	64125650	64125510	Y	MARK2,NUDT22,FKBP2,PPP1R14B,PLCB3,BAD,ESRRA,TRMT112,PRDX5,CDC42BPG,RPS6KA4	TRMT112,PRDX5,RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	64637838	64638320	64638071	Y	RASGRP2,SF1,SF1,EHD1,ATG2A	EHD1,ATG2A,PPP2R5B	NA	NA	NA	NA	EHD1	15448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65042835	65043130	65042858	Y	EHD1,C11orf85,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2	NA	NA	NA	NA	POLA2	15602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65069384	65069573	65069479	Y	NA	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	10716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.354754592827
chr11	65246279	65246484	65246387	Y	SCYL1,LTBP3,EFEMP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	16749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	65256318	65257363	65256982	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612,POLA2,DPF2,SLC25A45,TIGD3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	5870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65263684	65264604	65263856	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	451	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.01606594462025
chr11	65273934	65274467	65274182	Y	NA	MALAT1,SCYL1,LTBP3	LTBP3,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	10701	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65323331	65323567	65323509	Y	FOSL1	SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1	NA	NA	NA	NA	LTBP3	834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65419981	65420225	65420142	Y	CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	8340	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65420425	65420654	65420491	Y	TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5	MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA	NA	NA	NA	NA	RELA	7911	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65559034	65559399	65559282	Y	NA	SNX32	NA	NA	NA	NA	SNX32	39713	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.52209067385285
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr11	65678943	65679154	65679019	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.1834020256461
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	15.8969276974552
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CATSPER1	8651	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	65894211	65894464	65894385	Y	NA	NA	RAB1B,KLC2	IMR90	Hi-C	24141950	PACS1	58377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	66494780	66495327	66494982	Y	SYT12,SYT12,PC,PC,SPTBN2	C11orf80	C11orf80	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	C11orf80	14595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	67138301	67138677	67138619	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	67139742	67140272	67140082	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr11	68049630	68050030	68049692	Y	NA	C11orf24,LRP5	NDUFS8,TCIRG1,CHKA,SUV420H1,C11orf24,LRP5,PPP6R3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C11orf24	12161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	68608164	68608616	68608368	Y	NA	CPT1A	NA	NA	NA	NA	CPT1A	1262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	68776292	68776545	68776410	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	MRGPRD	IMR90	Hi-C	24141950	MRGPRF	2332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	68778534	68778789	68778694	Y	MRGPRF	MRGPRF,TPCN2	NA	NA	NA	NA	MRGPRF	88	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	68829234	68829348	68829304	Y	NA	TPCN2	NA	NA	NA	NA	TPCN2	14869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	69067534	69068152	69067999	Y	TPCN2	IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	1122	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	69069179	69069344	69069260	Y	TPCN2	NA	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	69069522	69069665	69069598	Y	TPCN2	IFITM9P	NA	NA	NA	NA	IFITM9P	248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	69089155	69089700	69089444	Y	MRGPRD	IFITM9P	CCND1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IFITM9P	19881	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	69182957	69183170	69183095	Y	ORAOV1,CCND1,MYEOV	NA	CCND1,MYEOV	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AP000439.2	74341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	69235389	69235576	69235517	Y	NA	AP000439.2	MYEOV,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	21935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	69258094	69258432	69258217	Y	CCND1	AP000439.2	CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.35073810667194
chr11	69325355	69325496	69325426	Y	NA	NA	MYEOV,MRGPRD,ORAOV1,CCND1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP000439.2	67844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	69451342	69451588	69451394	Y	NA	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	2267	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	69452524	69453230	69453220	Y	CCND1	CCND1,ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.354754592827
chr11	69795546	69795838	69795683	Y	ANO1	NA	ANO1,ORAOV1,FGF4,FADD	IMR90	Hi-C	24141950	ANO1	126570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	70245269	70246141	70245676	Y	ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN	CTTN,AP000487.5	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	2675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	70483542	70483760	70483651	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000487.5	240948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	71769812	71769929	71769891	Y	NA	LRTOMT,NUMA1,LAMTOR1	NA	NA	NA	NA	LRTOMT	19453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	71892346	71892672	71892509	Y	NA	FOLR1,INPPL1	RNF121,NUMA1,LRTOMT,LAMTOR1,C11orf51,FOLR3,FOLR1	IMR90	Hi-C	24141950	FOLR1	5930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	72343411	72343720	72343689	Y	PDE2A	PDE2A	NA	NA	NA	NA	PDE2A	39915	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	72854261	72854849	72854638	Y	PDE2A,ARAP1,ATG16L2,RELT,RELT,FCHSD2	FCHSD2	NA	NA	NA	NA	FCHSD2	2955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	72868553	72869130	72868609	Y	NA	FCHSD2	STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17	IMR90	Hi-C	24141950	FCHSD2	17247	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	72953792	72954055	72953924	Y	NA	P2RY2	NA	NA	NA	NA	P2RY2	26449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	72968455	72968625	72968568	Y	NA	P2RY2,ARHGEF17	P2RY6	MCF7	ChIA-PET	22265404	P2RY2	41112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	73036125	73036359	73036193	Y	NA	ARHGEF17,RELT	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	18791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	73221521	73221768	73221630	Y	PLEKHB1,PLEKHB1,FAM168A	NA	NA	NA	NA	NA	FAM168A	85466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	73490470	73490918	73490608	Y	UCP2	RAB6A,MRPL48	MRPL48,CHCHD8,PAAF1,RAB6A	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MRPL48	5443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	74465903	74466299	74466070	Y	POLD3,RNF169	RP11-864N7.2,RNF169	XRRA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF169	7990	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	74609449	74609745	74609637	Y	LOC441617,XRRA1	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	74609863	74609988	74609926	Y	NA	XRRA1,SPCS2	NA	NA	NA	NA	XRRA1	48257	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	74742390	74742651	74742474	Y	ARRB1	NEU3	XRRA1,SPCS2,SLCO2B1,NEU3,OR2AT4,LOC100507050,ARRB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEU3	45211	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	75059269	75059623	75059491	Y	NA	ARRB1,RPS3	NA	NA	NA	NA	ARRB1	1250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	75265416	75265853	75265464	Y	SERPINH1	GDPD5,SERPINH1	RPS3,GDPD5,KLHL35	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINH1	5248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	75385192	75385417	75385302	Y	NA	MAP6	NA	NA	NA	NA	MAP6	7027	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	75482683	75483095	75482909	Y	UVRAG,DGAT2	DGAT2,UVRAG,RP11-535A19.2	NA	NA	NA	NA	DGAT2	14126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	75755875	75756235	75755993	Y	UVRAG	NA	NA	NA	NA	NA	WNT11	163545	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	75919893	75920246	75919996	Y	WNT11	WNT11	NA	NA	NA	NA	WNT11	113	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	KCTD14	3883	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	77898869	77899120	77899016	Y	RSF1,INTS4	USP35,KCTD21	NA	NA	NA	NA	KCTD21	1001	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	78001305	78001608	78001428	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD21	103437	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	78025089	78025245	78025191	Y	GAB2,GAB2	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	102149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	78051007	78051295	78051151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAB2	76099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	78131805	78132171	78132034	Y	GAB2,GAB2	GAB2	NA	NA	NA	NA	GAB2	4411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	78426480	78426845	78426663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	142561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	80411023	80411358	80411196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-742N3.1	1987213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	86454778	86455149	86454967	Y	PRSS23	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	44952	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	86527382	86527750	86527626	Y	FZD4,PRSS23	PRSS23	NA	NA	NA	NA	PRSS23	27281	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	86792626	86792948	86792684	Y	NA	TMEM135	NA	NA	NA	NA	TMEM135	45740	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.35073810667194
chr11	87139431	87139805	87139524	Y	NA	NA	GRM5	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	392545	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	88269213	88269357	88269284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTSC	200258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	90016507	90016673	90016590	Y	NA	RP11-121L10.3	NA	NA	NA	NA	RP11-121L10.3	2779	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr11	94440479	94440817	94440610	Y	KDM4DL	AMOTL1,RP11-867G2.8	PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	AMOTL1	2882	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	94480491	94481212	94480556	Y	AMOTL1	AMOTL1,RP11-867G2.8	AMOTL1,PIWIL4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-867G2.8	8970	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr11	95963875	95964372	95964111	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	109972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	95976157	95976737	95976478	Y	FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	97607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	95982466	95982894	95982863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	91450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	96047326	96047750	96047695	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	26594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	102189237	102189699	102189428	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC3	3022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	102216514	102216961	102216815	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	572	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	102283995	102284326	102284226	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	NA	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	54789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	102297400	102297813	102297636	Y	BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123	TMEM123	BIRC2	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM123	41302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	103316988	103317242	103317115	Y	NA	RP11-37O16.8	NA	NA	NA	NA	RP11-37O16.8	38603	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	103393636	103393708	103393672	Y	NA	NA	DYNC2H1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	115251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	103401149	103401246	103401211	Y	NA	NA	DYNC2H1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37O16.8	122764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	108741188	108741366	108741295	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX10	207436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	109965770	109966113	109965869	Y	RDX,FDX1,ZC3H12C	ZC3H12C	NA	NA	NA	NA	ZC3H12C	3683	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	111298171	111298543	111298378	Y	POU2AF1,FDXACB1	POU2AF1	POU2AF1	IMR90	Hi-C	24141950	POU2AF1	25812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	C11orf88,LAYN	NA	NA	NA	NA	LAYN	6266	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	112397478	112397666	112397572	Y	IL18	NA	NCAM1,LOC100288346	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-356J5.12	258006	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	112833069	112833192	112833175	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	3072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	112839963	112840314	112840138	Y	NCAM1	NCAM1	NA	NA	NA	NA	NCAM1	9966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	114162155	114162496	114162247	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	35646	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	114162916	114163328	114163238	Y	NA	NNMT	NA	NA	NA	NA	NNMT	36407	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	115372753	115373113	115372889	Y	CADM1	CADM1	NA	NA	NA	NA	CADM1	562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	117015877	117016035	117015996	Y	SIK3,PAFAH1B2	SIK3,PAFAH1B2,SIDT2	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B2	2894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	117882756	117883280	117883084	Y	NA	IL10RA	NA	NA	NA	NA	IL10RA	27693	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118153348	118153551	118153451	Y	NA	MPZL3	AMICA1	IMR90	Hi-C	24141950	MPZL3	32283	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118489001	118489167	118489084	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	13846	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118490168	118490609	118490335	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	15013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	118493849	118494041	118493911	Y	NA	PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	18694	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118663387	118663780	118663691	Y	NA	DDX6	NA	NA	NA	NA	DDX6	3529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118782911	118783378	118783221	Y	SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	3494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	MIR4492	4701	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	118790377	118790895	118790660	Y	NA	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	3422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	118791529	118792348	118792152	Y	PHLDB1,BCL9L	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	1969	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	118800879	118801266	118801161	Y	MLL,DDX6,VPS11,CBL,CXCR5,CXCR5,CCDC84	MIR4492,BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	6562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	119341099	119341491	119341199	Y	NA	THY1	NA	NA	NA	NA	THY1	47404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	119454963	119455433	119455083	Y	NA	KRT8P7	TRIM29,USP2,LOC100499227	IMR90	Hi-C	24141950	KRT8P7	17585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	120079363	120079802	120079708	Y	NA	POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	120083069	120083545	120083438	Y	GRIK4,ARHGEF12,OAF	OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	3594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	120089762	120089841	120089801	Y	NA	OAF,POU2F3	NA	NA	NA	NA	OAF	10287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	121353016	121353670	121353326	Y	SORL1	SORL1	NA	NA	NA	NA	SORL1	32104	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	121526040	121526695	121526415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SORL1	205128	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	121699845	121700197	121699934	Y	BLID	NA	MIR100HG,MIR125B1,BLID	IMR90	Hi-C	24141950	MIR125B1	268355	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	28202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	122527331	122527938	122527906	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	2948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	122568426	122568832	122568574	Y	UBASH3B	UBASH3B	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	44043	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	122616909	122617169	122616983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	92526	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	122949899	122950101	122950094	Y	CLMP	RPL34P23,SNORD14C,HSPA8	NA	NA	NA	NA	HSPA8	17961	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	123172454	123172607	123172529	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	108465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	123173564	123173848	123173613	Y	NA	NA	CLMP	IMR90	Hi-C	24141950	CLMP	109575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	123394284	123394590	123394437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000783.1	95226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	124668888	124669222	124669022	Y	NA	ESAM	NA	NA	NA	NA	ESAM	38702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	125696963	125697011	125697006	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HYLS1	54498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	126286483	126286630	126286572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	62948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	126780606	126781009	126780811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	90346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	127497249	127497440	127497362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIRREL3	625894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128149754	128150077	128149906	Y	NA	NA	KCNJ1,FLI1,ETS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETS1	305376	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128318387	128318699	128318622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	136754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128323342	128323695	128323510	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	131758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	128341794	128342415	128342241	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	113038	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128376227	128376457	128376317	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128377315	128377487	128377422	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	77966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128387749	128388099	128387998	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	67354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128388897	128389626	128389454	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	65827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128419505	128419554	128419521	Y	NA	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	35899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128445940	128446213	128446123	Y	FLI1,FLI1	ETS1	NA	NA	NA	NA	ETS1	9240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	128557379	128557710	128557562	Y	NA	FLI1	NA	NA	NA	NA	FLI1	2949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	129488554	129488734	129488644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFRKB	274751	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	130969081	130969230	130969156	Y	NA	NA	NTM	IMR90	Hi-C	24141950	SNX19	184677	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	131614771	131614965	131614935	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	830367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	131626814	131626930	131626871	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	842410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	131630069	131630486	131630160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	845665	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	131799015	131799372	131799184	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1014611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	131894522	131894728	131894661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1110118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	131902527	131902770	131902649	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1118123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr11	131924772	131924995	131924886	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1140368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr11	131928107	131928500	131928434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1143703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr11	131934936	131935322	131935091	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1150532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	131942118	131942474	131942248	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1157714	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1378275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	132502586	132503019	132502881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1321861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr11	132764269	132764639	132764489	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	IGSF9B	1060241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr11	134124453	134124658	134124640	Y	NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2	VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8,GLB1L3	NA	NA	NA	NA	ACAD8	3064	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1029926	1030313	1030120	Y	WNK1	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	66906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1583254	1583583	1583419	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	53474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	1584094	1584332	1584168	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	52725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	1642572	1643085	1642916	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	5515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	1689303	1689433	1689367	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	11898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1698560	1698670	1698614	Y	FBXL14	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1699844	1700200	1699934	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	1131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	1714275	1714637	1714592	Y	NA	FBXL14	FBXL14,RAD52,ERC1,WNT5B,WNK1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	12944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1717506	1717606	1717553	Y	NA	FBXL14	FBXL14,ERC1	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FBXL14	16175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	1770869	1771337	1771069	Y	LRTM2,ADIPOR2	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	24403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	2144277	2144357	2144308	Y	LRTM2	DCP1B,RP5-1096D14.6	CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1096D14.6	32445	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	2175107	2175395	2175116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	63275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	262322	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr12	2378088	2378425	2378378	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	266256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr12	2432824	2433067	2432925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	320992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	2467250	2467467	2467306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	355418	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	2467815	2468125	2467879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1096D14.6	355983	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	2749982	2750016	2749999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP4	152103	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	3326549	3326840	3326665	Y	TSPAN9	RP11-543P15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	7453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	3563518	3563854	3563701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543P15.1	244422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	3948349	3948613	3948479	Y	NA	PARP11	NA	NA	NA	NA	PARP11	31995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	4140182	4140815	4140542	Y	CCND2,PARP11	NA	CCND2	IMR90	Hi-C	24141950	PARP11	159574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	4274113	4274463	4274167	Y	CCND2	NA	NA	NA	NA	NA	CCND2	106475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	4396260	4396408	4396285	Y	NA	CCND2,C12orf5	NA	NA	NA	NA	CCND2	15322	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	5566178	5566568	5566311	Y	NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	26900	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	5915509	5915755	5915702	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	137643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	5918139	5918518	5918331	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO2	134880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	6276820	6277298	6277162	Y	VAMP1,TNFRSF1A,TAPBPL	CD9	VWF,CD9,PLEKHG6	IMR90	Hi-C	24141950	CD9	29583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	6444583	6445131	6444861	Y	CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	4149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	PLEKHG6,TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	6539566	6540029	6539921	Y	NA	CD27-AS1,TAPBPL,VAMP1	NA	NA	NA	NA	CD27-AS1	18704	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	6962211	6962407	6962304	Y	GAPDH,COPS7A,COPS7A,COPS7A,COPS7A,LEPREL2,USP5,USP5,TPI1,TPI1	GPR162,LEPREL2,CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2	NA	NA	NA	NA	USP5	2919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	7000184	7000641	7000294	Y	PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6	CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57	NA	NA	NA	NA	SPSB2	3662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	8147722	8148111	8148026	Y	NA	FOXJ2	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	35188	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	8179132	8179551	8179335	Y	NA	FOXJ2	PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOXJ2	3748	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	8840377	8840836	8840579	Y	RIMKLB	MFAP5,RIMKLB	RIMKLB	MCF7	ChIA-PET	22265404	RIMKLB	8181	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	9308932	9309318	9309073	Y	KLRB1,M6PR,KLRG1,PZP	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP4	81609	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	9804148	9804385	9804240	Y	CLECL1,CLEC7A,CLEC2B,CLEC12A,CLEC12A,CD69,KLRB1,CLEC2D,CLEC2D,CLEC2D	NA	NA	NA	NA	NA	DDX12P	205323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	9986583	9986922	9986755	Y	NA	CLEC2B	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	33813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	10220622	10220778	10220715	Y	CLEC2B,OLR1,CLEC7A,CLEC12A	NA	NA	NA	NA	NA	OLR1	101959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	10517487	10517775	10517755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABARAPL1	154430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	10794413	10794704	10794528	Y	NA	MAGOHB,STYK1	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	30191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr12	11828862	11829235	11828994	Y	NA	ETV6	NA	NA	NA	NA	ETV6	28074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	11867581	11867722	11867638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	66793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	11949422	11949819	11949574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	148634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	11962012	11962232	11962094	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	161224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	11986979	11987463	11987102	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	186191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	11987992	11988316	11988087	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	187204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	12111679	12111898	12111693	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	150199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	12162075	12162513	12162342	Y	ETV6,LOH12CR1,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-267J23.4	99584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	12872470	12873013	12872652	Y	MANSC1,LOH12CR1,DUSP16,CDKN1B,APOLD1	CDKN1B	NA	NA	NA	NA	CDKN1B	6478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	12957478	12957757	12957559	Y	GPRC5A	DDX47	NA	NA	NA	NA	DDX47	6493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr12	13034551	13034650	13034602	Y	DDX47,GPRC5A	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13049170	13049423	13049295	Y	DUSP16	RPL13AP20,GPRC5A,MIR614,RP11-392P7.6	NA	NA	NA	NA	GPRC5A	7454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13124934	13124993	13124963	Y	NA	RP11-392P7.6,HTR7P1,HEBP1	GPRC5D	IMR90	Hi-C	24141950	HTR7P1	25819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	GSG1	NA	NA	NA	NA	GSG1	72	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	13326583	13326856	13326645	Y	EMP1	EMP1	HTR7P1,EMP1,HEBP1,KIAA1467,GSG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EMP1	20794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	13332644	13332915	13332868	Y	NA	EMP1	EMP1,KIAA1467	IMR90	Hi-C	24141950	EMP1	14735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	13403402	13403764	13403583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	55752	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	13662562	13662624	13662593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMP1	314912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	14413561	14413925	14413703	Y	NA	RP11-134N1.2	ATF7IP	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-134N1.2	46037	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	15910995	15911177	15911085	Y	NA	NA	PTPRO	IMR90	Hi-C	24141950	EPS8	122086	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	16553699	16554214	16553898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	55623	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	19048962	19049238	19049131	Y	NA	NA	PIK3C2G	IMR90	Hi-C	24141950	PLEKHA5	231410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	19284166	19284563	19284310	Y	NA	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	3518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	19291558	19291779	19291581	Y	AEBP2,PLEKHA5	PLEKHA5	NA	NA	NA	NA	PLEKHA5	10910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	AEBP2	544696	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	20975224	20975562	20975349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYROXD1	612987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	22428776	22428931	22428867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	231668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	22435194	22435461	22435404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAS	238086	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	25062577	25063016	25062829	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	37377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	25099512	25100288	25099550	Y	BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	25538390	25538869	25538521	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	16493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	RNU4-67P	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-67P	15955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr12	26267263	26267811	26267415	Y	NA	SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3	NA	NA	NA	NA	SSPN	5113	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	27484254	27484540	27484416	Y	FGFR1OP2,STK38L	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	27497251	27497478	27497364	Y	MED21,ARNTL2	ARNTL2	NA	NA	NA	NA	ARNTL2	13464	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	27593588	27593602	27593594	Y	C12orf71	NA	NA	NA	NA	NA	PPFIBP1	80762	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	104297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	29487594	29487680	29487637	Y	NA	ERGIC2	NA	NA	NA	NA	ERGIC2	44442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	30945631	30945953	30945771	Y	NA	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	24	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	30949517	30949896	30949519	Y	CAPRIN2	CAPRIN2,LINC00941	NA	NA	NA	NA	LINC00941	3540	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	32263319	32263494	32263407	Y	NA	BICD1	NA	NA	NA	NA	BICD1	5550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	32405506	32405740	32405609	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	147737	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	32881013	32881116	32881065	Y	NA	YARS2	NA	NA	NA	NA	YARS2	25720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	33048688	33048837	33048763	Y	PKP2	PKP2	NA	NA	NA	NA	PKP2	914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	33741113	33741380	33741221	Y	NA	NA	SYT10,YARS2	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ALG10	431836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	39816699	39816988	39816844	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	18204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	40250890	40251201	40251046	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	209191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	40382618	40382994	40382971	Y	LRRK2	NA	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	77398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	40467954	40468269	40468112	Y	NA	RPL30P13,SLC2A13	NA	NA	NA	NA	RPL30P13	7562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	45628991	45629732	45629167	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	21167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	45638356	45638816	45638511	Y	ANO6,ANO6	ANO6,PLEKHA8P1	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	30532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	46786554	46786766	46786571	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	NA	NA	NA	NA	RP11-96H19.1	11092	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	46798246	46798498	46798428	Y	NA	SLC38A2,RP11-96H19.1	SLC38A4	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	22784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	46825426	46825886	46825665	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	49964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	46888080	46888552	46888358	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	112618	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr12	46902978	46903383	46903115	Y	NA	NA	SLC38A2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-96H19.1	127516	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	46917975	46918280	46918143	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	142513	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.84872986359441
chr12	46918651	46918824	46918737	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	143189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	46943558	46944140	46943794	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	168096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	47053760	47053887	47053821	Y	NA	NA	SLC38A2,SLC38A1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	278298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	47191369	47191677	47191464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	280057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr12	47482441	47482676	47482559	Y	NA	AMIGO2	AMIGO2	K562	ChIA-PET	22265404	AMIGO2	10707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	48395275	48395444	48395393	Y	COL2A1	TMEM106C	TMEM106C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMEM106C	39923	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	49584331	49584382	49584372	Y	CACNB3,PRPF40B,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	NA	NA	NA	NA	TUBA1A	3224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	49628278	49628526	49628405	Y	LMBR1L,TUBA1A	TUBA1C,TUBA1A	DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	47171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	49646906	49646981	49646941	Y	NA	NA	RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TUBA1A	65799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	49739970	49740063	49739997	Y	NA	TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2	NA	NA	NA	NA	DNAJC22	1270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	50020601	50020960	50020800	Y	FMNL3,PRPF40B	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF40B	60600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	50221084	50221421	50221231	Y	NCKAP5L	NCKAP5L,BCDIN3D	NA	NA	NA	NA	NCKAP5L	551	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	FAIM2	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAIM2	43326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	50784153	50784384	50784269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARP4	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	50955219	50955226	50955223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2B	58451	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	51180627	51180997	51180727	Y	SMAGP	ATF1	TMPRSS12	IMR90	Hi-C	24141950	ATF1	25134	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	52184760	52184919	52184839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACVR1B	158532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52241760	52242326	52241842	Y	SLC4A8,FIGNL2	NA	SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACVR1B	101125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	52426547	52427164	52426822	Y	NR4A1,ACVR1B,ACVR1B,GRASP	GRASP,NR4A1,C12orf44	NA	NA	NA	NA	NR4A1	11931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52539319	52539712	52539621	Y	KRT84,KRT80,KRT6A,KRT5	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	44072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	52540964	52541526	52541224	Y	KRT80,KRT7,KRT6A,KRT5,NR4A1,C12orf44	KRT80	KRT8,KRT84	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT80	42258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	6.19143499795622
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT80	25762	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT80	12992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52609215	52609817	52609526	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	14487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52624014	52624394	52624158	Y	KRT7	KRT80	NA	NA	NA	NA	KRT7	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52624687	52625139	52624914	Y	KRT7	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52629756	52630207	52629959	Y	NA	KRT80,KRT7	NA	NA	NA	NA	KRT7	5452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	52674043	52674518	52674247	Y	NR4A1,C12orf44,KRT84,KRT6A,KRT5,KRT80	KRT7,KRT81	NA	NA	NA	NA	KRT81	8800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	53265042	53265518	53265316	Y	PFDN5,KRT2	NA	KRT6B,KRT2,KRT75,LOC283404,LOC283403,KRT84,KRT85,KRT80,KRT18,KRT8,EIF4B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRT18	75137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	53267781	53268340	53268093	Y	PFDN5	NA	KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404	MCF7	ChIA-PET	22265404	KRT18	72315	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	53273269	53273433	53273418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	67222	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	53312254	53312405	53312393	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	28250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	53318665	53319069	53319016	Y	NA	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	21586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr12	53339346	53339557	53339459	Y	EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18	KRT18,KRT8	NA	NA	NA	NA	KRT18	1098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	54133160	54133497	54133297	Y	ATF7,ATP5G2	CALCOCO1	ATF7,ATP5G2,CALCOCO1,CBX5	IMR90	Hi-C	24141950	CALCOCO1	13631	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	54411861	54412590	54411908	Y	COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4	HOXC10,HOXC6,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4	NA	NA	NA	NA	HOXC8	11029	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	54589708	54589846	54589777	Y	CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84	SMUG1	SMUG1,HOXC4,HOXC9	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SMUG1	8930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	54610828	54611089	54611007	Y	NA	SMUG1	NA	NA	NA	NA	SMUG1	30050	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	54752671	54753884	54753119	Y	NCKAP1L,ITGA5,ZNF385A,GPR84	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA5	57360	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	54777021	54777369	54777117	Y	NA	ITGA5	NA	NA	NA	NA	ITGA5	33875	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	56614575	56614693	56614609	Y	NA	SMARCC2,RNF41,ANKRD52,COQ10A	NA	NA	NA	NA	RNF41	858	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr12	57162340	57162564	57162470	Y	PAN2,PAN2,APOF,SPRYD4,GLS2,RDH16,GPR182,HSD17B6	NACA,PRIM1	NA	NA	NA	NA	PRIM1	18183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	57402902	57402987	57402944	Y	NA	ZBTB39	NA	NA	NA	NA	ZBTB39	4672	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	57458942	57459239	57459094	Y	NA	TMEM194A,NAB2	TAC3,ZBTB39,MYO1A,GPR182	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM194A	20607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	57523550	57524188	57523895	Y	MBD6,DDIT3,NAB2,STAT6,STAT6,LRP1	TMEM194A,NAB2,LRP1	NA	NA	NA	NA	STAT6	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	58094555	58094631	58094593	Y	NA	OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31	NA	NA	NA	NA	OS9	8817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	58238225	58238735	58238639	Y	AGAP2,TSPAN31,CDK4,METTL1,METTL21B,TSFM,XRCC6BP1,CTDSP2	RP11-620J15.1	NA	NA	NA	NA	CTDSP2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	58758718	58759055	58758893	Y	XRCC6BP1	NA	LRIG3	IMR90	Hi-C	24141950	XRCC6BP1	425394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	63025271	63025629	63025492	Y	NA	RP11-631N16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	30739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	63086673	63087045	63086801	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	92141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	130442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	63126917	63127025	63126971	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	132385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	64310301	64310738	64310490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	74228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	64311746	64312216	64311964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	75673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	64312639	64312950	64312683	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	76566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	65037414	65037710	65037562	Y	NA	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	35121	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	65194398	65194833	65194618	Y	TBK1,RASSF3,LEMD3,GNS	GNS	TBC1D30,FLJ41278	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNS	43171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	65888975	65889352	65889198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-221N13.3	105297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	65959414	65959817	65959668	Y	NA	RP11-221N13.3	HMGA2,MSRB3,RPSAP52	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	34832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	66008791	66009141	66009009	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	14142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66025227	66025796	66025503	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	30578	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	48150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66048868	66049228	66049091	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	54219	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr12	66050300	66050400	66050342	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	55651	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66050559	66051086	66050841	Y	LEMD3	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	55910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	66051570	66051762	66051716	Y	NA	NA	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	56921	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66216365	66216749	66216512	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	HMGA2	454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	66289506	66290040	66289751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	70752	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66311039	66311339	66311117	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	92285	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66319590	66319707	66319630	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	100836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3,RBMS1P1	NA	NA	NA	NA	RBMS1P1	1278	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	68221654	68222227	68222103	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	181536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	68304216	68304460	68304338	Y	NA	NA	DYRK2	IMR90	Hi-C	24141950	DYRK2	264098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	68705850	68706149	68706026	Y	IL22,SLC35E3,NUP107,MDM2,MDM1	MDM1	NA	NA	NA	NA	MDM1	18012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	68758917	68759565	68759229	Y	IFNG,RAP1B	MDM1	RAP1B,NUP107,LOC100507250	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MDM1	34756	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr12	69401246	69401453	69401353	Y	RAP1B,SLC35E3,MDM2,CPM,LYZ,CPM	CPM	CPM	IMR90	Hi-C	24141950	CPM	37896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	69634325	69634686	69634559	Y	SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6	CPSF6	NA	NA	NA	NA	CPSF6	3008	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	70940880	70941156	70941028	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	81020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	70951536	70951916	70951606	Y	KCNMB4	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	91676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	195777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	71085208	71085379	71085280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-588H23.3	225348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	72125251	72125450	72125351	Y	NA	TMEM19,RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	21204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	72691947	72692219	72692098	Y	TPH2,TRHDE	NA	NA	NA	NA	NA	TRHDE	212901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	76337836	76338217	76338130	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	PHLDA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PHLDA1	87495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	76414095	76414311	76414227	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	11401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	76849053	76849336	76849202	Y	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	102253	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	76949947	76950382	76950258	Y	ZDHHC17,OSBPL8	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	1207	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr12	78338246	78338645	78338266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	115561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	78412779	78412965	78412883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	190094	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	79848111	79848561	79848284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	234316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	80974115	80974384	80974233	Y	MYF5	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRQ	176341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	83269676	83269939	83269806	Y	TMTC2	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	191017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	88700433	88700684	88700558	Y	NA	NA	KITLG	IMR90	Hi-C	24141950	TMTC3	166360	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	88810412	88810576	88810494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KITLG	162052	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	88810675	88811028	88810796	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KITLG	161600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	89747699	89748479	89748073	Y	NA	DUSP6	NA	NA	NA	NA	DUSP6	2651	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	90124876	90125258	90125114	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	23799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	94158186	94158524	94158355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	89035	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	94178297	94178734	94178344	Y	CRADD	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	94493473	94493774	94493548	Y	NA	PLXNC1	CRADD,LOC144481,SOCS2,MRPL42,UBE2N	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PLXNC1	46725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	95266728	95267097	95266941	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA12	128449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	95594660	95595399	95595279	Y	FGD6	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	13859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	95597894	95598075	95597980	Y	NA	FGD6,VEZT	NA	NA	NA	NA	FGD6	11183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	95680646	95681018	95680718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VEZT	71124	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96047992	96048216	96048102	Y	METAP2,LTA4H	NA	NA	NA	NA	NA	NTN4	134714	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96589359	96589977	96589479	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	3199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	96592675	96593197	96592888	Y	LTA4H,ELK3	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	6515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96593675	96593812	96593739	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	7515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96659033	96659395	96659303	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	72873	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96664847	96665248	96665048	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	78687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96794959	96795305	96795211	Y	CDK17	CDK17,RN7SKP11	NA	NA	NA	NA	CDK17	2621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96810217	96810461	96810410	Y	LTA4H,ELK3	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RN7SKP11	8803	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr12	96839212	96840356	96839676	Y	NEDD1,NEDD1,CDK17	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	19948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	96842223	96842407	96842329	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	22959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	98793447	98793582	98793503	Y	NA	RNU4-41P	NA	NA	NA	NA	RNU4-41P	16234	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	100970454	100970954	100970686	Y	NA	GAS2L3	NA	NA	NA	NA	RP11-575G13.2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	101412491	101412895	101412554	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP20	258992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	102220478	102220758	102220699	Y	NA	GNPTAB,DRAM1	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	1958	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	102250819	102251404	102251014	Y	DRAM1	GNPTAB,DRAM1	GNPTAB,DRAM1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DRAM1	17725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	104613052	104613575	104613267	Y	CHST11,TXNRD1,TXNRD1	TXNRD1,RPL18AP3	NA	NA	NA	NA	TXNRD1	5495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	104658660	104659046	104658853	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5	NA	NA	NA	NA	RPL18AP3	1604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	105620091	105620351	105620275	Y	APPL2	C12orf75,APPL2	NA	NA	NA	NA	C12orf75	6717	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	105711063	105711549	105711425	Y	C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	7246	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	105715924	105716167	105716100	Y	APPL2,C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	2628	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	105812004	105812354	105812179	Y	NA	NA	NUAK1,CKAP4,C12orf75,TCP11L2,POLR3B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-474B16.1	93209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	106515905	106516067	106515985	Y	NA	NUAK1	NA	NA	NA	NA	NUAK1	15744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	106642668	106643242	106642944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCP11L2	50465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	107363542	107363991	107363752	Y	NA	C12orf23,MTERFD3	NA	NA	NA	NA	MTERFD3	14953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	108238186	108238361	108238213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	85137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	108297283	108297694	108297638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM4	144234	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	109010746	109010939	109010889	Y	USP30,SSH1,CMKLR1,SELPLG,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	56388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	109023569	109024011	109023688	Y	SSH1,SELPLG,SELPLG	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	69211	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	109036250	109036518	109036431	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISCU	81892	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	109116964	109117579	109117192	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	110707461	110707714	110707625	Y	NA	ATP2A2	ANKRD13A,ATP2A2,C12orf76,GIT2,IFT81	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2A2	8847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	110750652	110751139	110750939	Y	NA	ATP2A2	NA	NA	NA	NA	ATP2A2	34091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	110867136	110867499	110867318	Y	NA	ANAPC7,HMGA1P3,ARPC3,RPL31P49,GPN3	NA	NA	NA	NA	HMGA1P3	1049	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	111252728	111252961	111252814	Y	NA	NA	CUX2	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CC	73984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	111904763	111905142	111904953	Y	ALDH2,ATXN2	NA	NA	NA	NA	NA	SH2B3	63011	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	112018937	112019235	112019073	Y	NA	ATXN2	NA	NA	NA	NA	ATXN2	16245	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	112529504	112529724	112529616	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	15102	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	112545862	112545946	112545885	Y	NA	NAA25,TRAFD1	NA	NA	NA	NA	NAA25	1036	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	112554455	112554606	112554536	Y	ALDH2,TRAFD1	NAA25,TRAFD1	TRAFD1,NAA25	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	TRAFD1	6699	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	112633664	112633952	112633817	Y	NA	NA	TRAFD1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAFD1	72359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	113478524	113478983	113478679	Y	OAS1,OAS3,SLC24A6,SDSL,OAS2	DTX1	OAS2,DTX1	IMR90	Hi-C	24141950	DTX1	13531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	114502448	114502456	114502452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBM19	100272	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	116661909	116662288	116662266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	50855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	116666460	116666763	116666749	Y	NA	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	46380	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	116821073	116821333	116821156	Y	NA	NA	MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MED13L	107930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	MED13L	180351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	117255942	117256291	117256058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRK	60955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	118497379	118497776	118497426	Y	NA	RFC5,WSB2	NA	NA	NA	NA	WSB2	459	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	118632324	118632442	118632383	Y	NA	RPS2P5	PEBP1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS2P5	49435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	118744725	118745093	118744968	Y	TAOK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS2P5	62848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	118745418	118745709	118745623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAOK3	63041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	118795182	118795561	118795499	Y	TAOK3	TAOK3,SUDS3	NA	NA	NA	NA	TAOK3	13189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	120426531	120426889	120426594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CIT	113436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	120668258	120668871	120668569	Y	RAB35,DYNLL1,GCN1L1,RPLP0,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN-AS1	31164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr12	120669025	120669761	120669334	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	31813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	120675783	120676003	120675893	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN-AS1,PXN,NME2P1	GCN1L1,RPLP0,LOC100506649	K562	ChIA-PET	22265404	PXN	25571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	120700086	120700381	120700233	Y	RAB35,PXN,PXN	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	1193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	120700935	120701192	120701121	Y	NA	PXN,NME2P1,RNU4-2,RNU4-1	NA	NA	NA	NA	PXN	382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr12	120906143	120906276	120906236	Y	RAB35	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	490	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3,RPL12P33	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	121714857	121715111	121714996	Y	OASL,P2RX7,P2RX4,CAMKK2	CAMKK2	NA	NA	NA	NA	CAMKK2	19000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	121838748	121839039	121838846	Y	SETD1B,RHOF,ORAI1,KDM2B,RNF34	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	2904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	121866033	121866226	121866130	Y	NA	ANAPC5,RNF34	NA	NA	NA	NA	RNF34	30189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	122020162	122020238	122020212	Y	RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	NA	NA	NA	NA	KDM2B	3242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr12	122028609	122028883	122028798	Y	RNF34,KDM2B,SETD1B,RHOF,ORAI1	RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1	KDM2B	K562	ChIA-PET	22265404	KDM2B	11689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	122067749	122067897	122067832	Y	ORAI1	ORAI1,MORN3	NA	NA	NA	NA	ORAI1	5294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	122124782	122125118	122124936	Y	P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3	MORN3,TMEM120B	MORN3,LOC338799,SETD1B	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	MORN3	16245	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	122462187	122462386	122462358	Y	BCL7A	BCL7A,AC156455.1	NA	NA	NA	NA	BCL7A	6859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	122897459	122897572	122897541	Y	NA	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	7607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	122908043	122908483	122908329	Y	ZCCHC8,DENR,CLIP1	CLIP1	NA	NA	NA	NA	CLIP1	2864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr12	123583230	123583584	123583407	Y	NA	PITPNM2	NA	NA	NA	NA	PITPNM2	48978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124716985	124717336	124717220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	261197	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124717911	124718282	124718055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	262123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124721310	124721532	124721425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM101A	265522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	124823049	124823325	124823212	Y	FAM101A	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	226810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124864827	124865003	124864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	185132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124875337	124875736	124875419	Y	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	174399	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	124926088	124926324	124926239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	124926476	124926613	124926576	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	123522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr12	124982309	124982472	124982376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	67663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	125066562	125066782	125066660	Y	FAM101A	NCOR2	NCOR2,SCARB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NCOR2	16427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	125346086	125346324	125346188	Y	NA	SCARB1	NA	NA	NA	NA	SCARB1	18890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	125404545	125404922	125404790	Y	UBC	SCARB1,UBC	NCOR2,SCARB1,UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	4631	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	125423202	125423335	125423285	Y	NA	UBC,DHX37	UBC	IMR90	Hi-C	24141950	UBC	23288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	127567979	127568114	127568034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	80558	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	127610420	127610860	127610670	Y	NA	AC079949.1	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	37812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	127715364	127715787	127715548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	66692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	127725675	127725908	127725798	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	77003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	127730069	127730271	127730149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	81397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr12	127742241	127742510	127742359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	93569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	127754808	127755172	127754990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	106136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	128823822	128824230	128823901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC15A4	482298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	130953209	130953314	130953258	Y	PIWIL1	NA	NA	NA	NA	NA	STX2	368497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr12	132293483	132293821	132293495	Y	NA	MMP17	NA	NA	NA	NA	MMP17	17117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr12	132970087	132970237	132970177	Y	CHFR,ANKLE2,FBRSL1	NA	GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT9	66152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	20644269	20644474	20644387	Y	ZMYM2,ZMYM2,ZMYM2	NA	NA	NA	NA	NA	GJA3	88714	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	20701926	20702100	20701958	Y	PSPC1,ZMYM5	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	31088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	21571909	21572149	21572029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XPO4	96722	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr13	21893563	21893874	21893643	Y	NA	MIPEPP3	ZDHHC20	IMR90	Hi-C	24141950	MIPEPP3	23285	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	23471356	23471597	23471410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTH1P7	202643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	23500406	23500844	23500578	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA1P6	205469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	24080861	24081253	24081061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNFRSF19	61256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	24133122	24133556	24133337	Y	NA	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	8953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	24697003	24697328	24697264	Y	NA	NA	SPATA13	IMR90	Hi-C	24141950	SPATA13	145059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	24835829	24835982	24835890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	248966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	24845538	24846279	24845979	Y	PARP4	NA	NA	NA	NA	NA	PARP4	238669	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	25621314	25621890	25621623	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPTE2P1	80689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	27557231	27557465	27557334	Y	USP12,RPL21,RASL11A	NA	RASL11A,USP12,RPL21,MTIF3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP12	186568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	28005406	28005795	28005597	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	GTF3A	8725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	28025291	28025563	28025486	Y	NA	GTF3A,MTIF3	NA	NA	NA	NA	MTIF3	2552	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	30867525	30867802	30867626	Y	KATNAL1	PRDX2P1,KATNAL1	NA	NA	NA	NA	PRDX2P1	482	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	31004513	31004723	31004587	Y	USPL1	LINC01058	KATNAL1,LINC00426,HMGB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01058	10139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	31264554	31264674	31264586	Y	USPL1,ALOX5AP,ALOX5AP	NA	HMGB1,USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	USPL1	74724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	31483566	31483936	31483755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSPH1	250589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	32324057	32324474	32324315	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1DP3	94504	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	32664585	32664831	32664706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRY	61148	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	32956405	32956487	32956432	Y	NA	N4BP2L1	NA	NA	NA	NA	N4BP2L1	43828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	34253090	34253722	34253494	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	136464	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	34729958	34730262	34730146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC3	339772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	36412583	36412954	36412753	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	290489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	36630888	36631287	36631099	Y	DCLK1	NA	NA	NA	NA	NA	DCLK1	72156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	38275506	38275878	38275580	Y	TRPC4	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	104525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	40450520	40450761	40450584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COG6	222756	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	41177727	41178040	41178014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO1	60694	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	42269057	42269475	42269218	Y	C13orf15,DGKH	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	385716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	42276592	42276928	42276845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	393251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	42705100	42705257	42705170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP11	139032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	43099384	43099709	43099478	Y	DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11	NA	ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	AKAP11	255095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	43570775	43570983	43570833	Y	EPSTI1	EPSTI1	EPSTI1,ENOX1	IMR90	Hi-C	24141950	EPSTI1	6368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	43632661	43632965	43632672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPSTI1	68254	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	44880536	44881091	44880742	Y	C13orf31,CCDC122,C13orf31	NA	TSC22D1,LACC1,SERP2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERP2	64710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	45496701	45496835	45496770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP1	64783	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	47128564	47128952	47128887	Y	LCP1,LRCH1	LRCH1	NA	NA	NA	NA	LRCH1	3261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	47369610	47369907	47369759	Y	NA	ESD	NA	NA	NA	NA	ESD	243	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	48526121	48526135	48526130	Y	MED4,SUCLA2	NA	NA	NA	NA	NA	NUDT15	83568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	48907859	48907955	48907897	Y	NA	RB1	NA	NA	NA	NA	RB1	31972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	50597476	50597810	50597661	Y	RCBTB1,TRIM13	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	23387	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	50602874	50603059	50603020	Y	NA	TRIM13,MIR3613,MIR16-1	NA	NA	NA	NA	MIR16-1	18138	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	51103280	51103738	51103647	Y	NA	NA	DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL34P26	169381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	51288107	51288409	51288197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2B	193405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	51800117	51800150	51800132	Y	DLEU7,FAM124A	FAM124A	NA	NA	NA	NA	FAM124A	5614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	52303239	52303556	52303323	Y	WDFY2	NA	NA	NA	NA	NA	DHRS12	72737	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	52537870	52538200	52538035	Y	UTP14C	ALG11	NA	NA	NA	NA	ALG11	46334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	52769647	52769861	52769811	Y	NA	NEK3	NA	NA	NA	NA	NEK3	37651	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	52922324	52922434	52922379	Y	THSD1	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	56195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr13	52923212	52923413	52923314	Y	NA	NA	THSD1	IMR90	Hi-C	24141950	THSD1	55216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	53336765	53337066	53336916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	111921	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	53765519	53765549	53765534	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	540675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	53775107	53775689	53775457	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUGT1	550263	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	60033102	60033487	60033176	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	702634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	60635732	60636010	60635830	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	100111	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	60679231	60679569	60679243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	56552	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	72419778	72420070	72419973	Y	DACH1	NA	NA	NA	NA	NA	H3F3BP1	172579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	74508678	74508943	74508854	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	197451	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	74708897	74709334	74709161	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	2503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr13	75939887	75940324	75940051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D4	113926	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	76269053	76269192	76269124	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	76483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	76290964	76291186	76291007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	98394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	77166796	77167041	77166918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD12	291499	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	80916096	80916414	80916232	Y	NA	SPRY2	NA	NA	NA	NA	SPRY2	3010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	81048022	81048142	81048082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY2	134936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	87776313	87776722	87776395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	4221352	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	90053531	90053928	90053634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR17HG	1944146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	94913778	94913870	94913813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	332641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	95003602	95003792	95003731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGDS	242719	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	95201580	95202169	95201893	Y	NA	TGDS,GPR180	NA	NA	NA	NA	TGDS	44342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	95620867	95621252	95621220	Y	NA	NA	CLDN10	IMR90	Hi-C	24141950	ABCC4	330435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	95854476	95854763	95854633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC4	96924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	95919951	95920261	95920073	Y	NA	ABCC4	NA	NA	NA	NA	ABCC4	31426	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	96498991	96499334	96499248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC3	171598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	96517437	96517518	96517478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGGT2	186218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	97877294	97877762	97877400	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	5606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	97890366	97890711	97890515	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	18678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	97908706	97909024	97908751	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	37018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	97912286	97912462	97912389	Y	NA	MBNL2	NA	NA	NA	NA	MBNL2	40598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	98599587	98599881	98599659	Y	NA	IPO5	NA	NA	NA	NA	IPO5	4031	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	99033515	99033578	99033537	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	194616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	99068008	99068369	99068130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK24	159825	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	99562711	99562955	99562841	Y	GPR183,STK24	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	173924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	99599525	99599781	99599653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK9	137098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	99930007	99930140	99930028	Y	GPR183	NA	NA	NA	NA	NA	H2AFZP3	63995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	101046682	101046918	101046816	Y	A2LD1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL15P18	245336	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	102105666	102105949	102105700	Y	ITGBL1	NALCN,ITGBL1	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	2700	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	102273007	102273389	102273072	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	170041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	105792553	105792815	105792695	Y	DAOA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00460	1234096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	106803810	106804031	106803901	Y	NA	NA	EFNB2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	222880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	106808885	106809142	106808998	Y	NA	NA	EFNB2,LINC00460	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00460	217769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	107182699	107183083	107182911	Y	EFNB2	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	35429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	107188808	107188962	107188940	Y	NA	ARGLU1	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	29550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	108103235	108103615	108103559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	413468	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr13	108310994	108311341	108311278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	205742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	108407171	108407488	108407466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM155A	109595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	109807507	109807975	109807755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	597640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.51004121538766
chr13	109808669	109809037	109808800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	596578	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr13	109847392	109847697	109847628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	557918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	109852673	109853050	109852860	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AL162497.1	552565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	109895773	109895899	109895836	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	509716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	109909294	109909814	109909611	Y	NA	NA	MYO16,IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	495801	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	109921804	109922211	109922051	Y	NA	NA	IRS2	IMR90	Hi-C	24141950	AL162497.1	483404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	AL162497.1,IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	110521819	110522258	110522077	Y	NA	NA	MYO16,IRS2,COL4A1	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	84904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	110664530	110664847	110664695	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	227615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	110669788	110670084	110669997	Y	NA	NA	MYO16	IMR90	Hi-C	24141950	IRS2	232873	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr13	111049993	111050394	111050073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	92497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	111564894	111565358	111565241	Y	RAB20,ING1,ING1,ARHGEF7,ANKRD10	LINC00346,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	ANKRD10	58	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	111589420	111590157	111589779	Y	NA	ANKRD10	ARHGEF7,LINC00346	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	24004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	111594578	111594832	111594693	Y	RAB20,ANKRD10	ANKRD10	ANKRD10,ARHGEF7	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	29162	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	111607450	111607830	111607755	Y	RAB20,ING1,ING1,ANKRD10	ANKRD10	ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD10	42034	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	111841497	111841815	111841671	Y	ING1,ARHGEF7	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	76591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	112726762	112727353	112726963	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	513128	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	113179985	113180373	113180107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUBGCP3	60108	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	113377120	113377559	113377252	Y	NA	ATP11A	NA	NA	NA	NA	ATP11A	34477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	113806516	113806910	113806731	Y	ATP11A,CUL4A	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	31388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr13	113808289	113808746	113808533	Y	NA	F10	PROZ	IMR90	Hi-C	24141950	F10	33161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	113828673	113828834	113828768	Y	ATP11A,DCUN1D2,CUL4A	CUL4A,PCID2	NA	NA	NA	NA	CUL4A	31718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114124603	114124675	114124639	Y	NA	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	18592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114127046	114127213	114127130	Y	GRTP1,DCUN1D2	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	16054	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114147699	114148153	114147800	Y	F7,F10,PROZ,GRTP1	DCUN1D2,TMCO3	NA	NA	NA	NA	TMCO3	4389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114556439	114556767	114556713	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	8279	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr13	114611317	114611637	114611421	Y	NA	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	46271	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr13	114770181	114770639	114770503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	125447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr13	114830489	114831626	114831334	Y	RASA3	NA	NA	NA	NA	NA	RASA3	64460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr13	114862790	114863121	114862935	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	32965	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114875113	114875384	114875282	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	20702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114884280	114884926	114884814	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	11160	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr13	114892702	114892820	114892783	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	3266	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr13	114894223	114894969	114894576	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	1117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr13	115046177	115046319	115046229	Y	RASA3	CDC16,UPF3A,CHAMP1	NA	NA	NA	NA	UPF3A	1118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	21150605	21151121	21150987	Y	TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40	RNASE4,ANG	NA	NA	NA	NA	ANG	269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	21439863	21440073	21439999	Y	NA	METTL17	NA	NA	NA	NA	METTL17	15856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	21577986	21578258	21578000	Y	NA	ARHGEF40,ZNF219	NA	NA	NA	NA	ZNF219	7105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	23307440	23308274	23307581	Y	SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	3674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	23320228	23321035	23320800	Y	RBM23,C14orf119,ACIN1,SLC7A7,SLC7A7	SLC7A7,MRPL52,MMP14,LRP10	NA	NA	NA	NA	MMP14	16462	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	23449151	23449315	23449234	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB	MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr14	23449757	23450231	23450060	Y	MRPL52,PSMB5,PSMB5,HOMEZ,PRMT5,JUB,JUB	MIR4707,HAUS4,C14orf93	NA	NA	NA	NA	AJUBA	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr14	23584186	23584501	23584299	Y	C14orf119	C14orf119,ACIN1	NA	NA	NA	NA	ACIN1	21363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	24755187	24755313	24755250	Y	DHRS4L1	TINF2,RABGGTA,DHRS1	NA	NA	NA	NA	DHRS1	11726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	29706068	29706381	29706228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL26P3	748952	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	30663023	30663420	30663280	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	3919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	31408112	31408404	31408271	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP4S1	83908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	34504920	34505230	34505078	Y	NA	NA	EGLN3	MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	424332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	34987475	34987508	34987491	Y	EAPP	EAPP,RPS19P3	NA	NA	NA	NA	EAPP	19408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35120187	35120582	35120411	Y	SNX6,SNX6	SNX6	SNX6,BAZ1A,CFL2,PPP2R3C	IMR90	Hi-C	24141950	SNX6	22798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35250371	35250766	35250653	Y	SRP54,BAZ1A	NA	NA	NA	NA	NA	CFL2	68342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35800965	35801124	35801022	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMA6	55126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35834310	35835208	35834855	Y	BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	PSMA6,SNX6,PPP2R3C,KIAA0391,NFKBIA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-561B11.1	21067	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	35865196	35865330	35865211	Y	RALGAPA1,NFKBIA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	NFKBIA	6625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	36623912	36623974	36623948	Y	NA	PTCSC3	NA	NA	NA	NA	PTCSC3	19700	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	36642326	36642612	36642534	Y	NKX2-8,NKX2-1,NKX2-1,MBIP	PTCSC3	SFTA3	IMR90	Hi-C	24141950	PTCSC3	1062	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	36644066	36644508	36644470	Y	NKX2-8,NKX2-1,NKX2-1,MBIP	PTCSC3	SFTA3	IMR90	Hi-C	24141950	PTCSC3	392	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	37465189	37465490	37465428	Y	NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A21	174581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	39559553	39559840	39559693	Y	NA	SEC23A,GEMIN2	NA	NA	NA	NA	SEC23A	17010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	45723245	45723364	45723320	Y	NA	MIS18BP1	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	2502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	46620797	46620809	46620803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18BP1	900054	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr14	50374574	50374717	50374657	Y	RPL36AL,MGAT2,C14orf182,C14orf183,ARF6	ARF6	NA	NA	NA	NA	ARF6	16764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	50527611	50528257	50527921	Y	RPL36AL,ARF6,C14orf182	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf182	55373	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	50528497	50528810	50528555	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf182	56259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	51862095	51862490	51862300	Y	FRMD6,FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	RP11-255G12.3	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-255G12.3	3789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	51909639	51909898	51909736	Y	NA	RP11-255G12.3,FRMD6	FRMD6-AS1,FRMD6,LOC283553,GNG2	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	43920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	51915852	51916182	51915957	Y	NA	FRMD6	FRMD6,LOC283553,GNG2,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	37636	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	51999901	52000168	52000035	Y	NA	FRMD6	NA	NA	NA	NA	FRMD6	46083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52064245	52064576	52064411	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	110427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	52110768	52111053	52110947	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	156950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	166118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52145900	52146294	52146052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	144619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	GNG2	127064	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	52622606	52622722	52622664	Y	NA	NA	C14orf166,NID2,PTGDR	IMR90	Hi-C	24141950	NID2	88894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	53392802	53392977	53392890	Y	NA	FERMT2	NA	NA	NA	NA	FERMT2	24176	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	55541499	55541595	55541574	Y	NA	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	25150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	55569733	55570176	55570087	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	18652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	55765939	55766288	55766115	Y	GCH1	FBXO34	NA	NA	NA	NA	FBXO34	29918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	57343255	57343511	57343375	Y	OTX2,OTX2	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC5	390215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr14	59742406	59742712	59742574	Y	DAAM1	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	89042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	59949393	59949731	59949550	Y	C14orf149	JKAMP	NA	NA	NA	NA	JKAMP	232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	60679186	60679974	60679676	Y	NA	DHRS7,PPM1A	NA	NA	NA	NA	PPM1A	30496	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	61645426	61645731	61645594	Y	NA	NA	SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4	IMR90	Hi-C	24141950	TRMT5	199350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	61938268	61939375	61939158	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	220856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	61960014	61960497	61960231	Y	PRKCH,HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	199734	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	62032593	62032996	62032785	Y	HIF1A	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	127235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	62052395	62052634	62052478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	107597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	62052734	62053075	62053015	Y	SYT16	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	107156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	62053265	62053527	62053394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	106704	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS2	3592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	62298450	62298645	62298529	Y	NA	COX4I1P1	PRKCH,FLJ22447,HIF1A-AS2,HIF1A,SNAPC1	IMR90	Hi-C	24141950	COX4I1P1	1363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	65193422	65193546	65193484	Y	ZBTB1,PLEKHG3	PLEKHG3	NA	NA	NA	NA	PLEKHG3	24602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	65469693	65469823	65469758	Y	NA	RAB15	NA	NA	NA	NA	RAB15	32199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	65705887	65706189	65706012	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAX	138474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	65749378	65749653	65749574	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8,MIR4708	IMR90	Hi-C	24141950	FUT8	125657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr14	66126309	66126626	66126333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT8	250999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	67751261	67751573	67751281	Y	RDH12,PLEKHH1,PIGH	MPP5	NA	NA	NA	NA	MPP5	45435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	68604521	68604895	68604639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	282018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	68644384	68644906	68644390	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	242007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	68699331	68699744	68699520	Y	ZFYVE26	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	187169	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	68943032	68943562	68943135	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	56119	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	69010932	69011443	69011159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	124019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	69013502	69013901	69013730	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	126589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	69014304	69014714	69014453	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	127391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr14	69014972	69015327	69015083	Y	ACTN1	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	128059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	69022058	69022216	69022137	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIAP6	135145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	69162018	69162337	69162187	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	98853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	69171648	69171749	69171699	Y	NA	NA	ZFP36L1,RAD51B	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L1	89441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	69281323	69281785	69281441	Y	DCAF5	ZFP36L1	RAD51B,ZFYVE26	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L1	20133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	69377319	69377610	69377464	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	66547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	69544472	69544808	69544638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCAF5	73059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	69618210	69618757	69618360	Y	NA	DCAF5,EXD2	NA	NA	NA	NA	DCAF5	343	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	69851262	69851639	69851451	Y	NA	SLC39A9,ERH	NA	NA	NA	NA	SLC39A9	11093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	70700911	70701061	70700986	Y	NA	RP11-486O13.2	NA	NA	NA	NA	RP11-486O13.2	49071	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	71249264	71249522	71249393	Y	NA	MAP3K9,RP6-65G23.3	NA	NA	NA	NA	MAP3K9	24729	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	72021992	72022911	72022768	Y	SIPA1L1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-261D10.2	235461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	73110081	73110359	73110171	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	248450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	73131912	73132517	73132075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	226292	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	73133487	73133748	73133630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF3	225061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	73919503	73919783	73919743	Y	NA	NUMB,C14orf169	NA	NA	NA	NA	NUMB	8565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	74208106	74208498	74208298	Y	C14orf43	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	28978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	74224982	74225468	74225101	Y	NA	PNMA1	NA	NA	NA	NA	PNMA1	45854	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	75038441	75039020	75038725	Y	NPC2,DLST	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	38286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	75040596	75041021	75040862	Y	LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	ISCA2,NPC2	IMR90	Hi-C	24141950	LTBP2	36285	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	75491919	75492089	75492033	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	24146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	75492523	75492557	75492545	Y	NA	EIF2B2,MLH3,ACYP1	NA	NA	NA	NA	MLH3	23678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	75701379	75701456	75701414	Y	FOS	FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	FOS	42021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	75761897	75762132	75762064	Y	FOS,JDP2,JDP2,JDP2,FLVCR2,FLVCR2	FOS	NA	NA	NA	NA	FOS	18420	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	76243945	76244101	76244023	Y	TGFB3	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf1	118413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	77422240	77422571	77422458	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	RP11-7F17.1	IRF2BPL,KIAA1737	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RP11-7F17.1	10455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	77503944	77504718	77504558	Y	NA	IRF2BPL	IRF2BPL	IMR90	Hi-C	24141950	IRF2BPL	10910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	79941274	79941440	79941360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1482421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	80051183	80051363	80051265	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1372498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	80161976	80161991	80161984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	1261870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	81248217	81248588	81248549	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP128	175273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	81375179	81375565	81375372	Y	STON2,CEP128	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	48296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr14	85881762	85881957	85881956	Y	FLRT2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-497E19.1	112375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	88461350	88461753	88461554	Y	GALC,GALC,GPR65	GALC,GPR65	NA	NA	NA	NA	GALC	3341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	89895882	89896217	89896119	Y	FOXN3,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	187276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	89897229	89897488	89897403	Y	FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	186005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	90083286	90083622	90083526	Y	TDP1,FOXN3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXN3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	91488828	91489143	91489063	Y	NA	C14orf159,RPS6KA5	NA	NA	NA	NA	C14orf159	35534	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	91696123	91696361	91696283	Y	RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68	NA	NA	NA	NA	NA	RPS6KA5	171143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	91730791	91731194	91731191	Y	NA	NA	GPR68	K562	ChIA-PET	22265404	CCDC88C	150994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	93030823	93030949	93030917	Y	ATXN3,LGMN	NA	NA	NA	NA	NA	RIN3	52705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	93252078	93252440	93252261	Y	MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	LGMN,GOLGA5	GOLGA5	K562	ChIA-PET	22265404	GOLGA5	6136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	93569992	93570233	93570210	Y	KIAA1409,C14orf109,C14orf109	ITPK1	NA	NA	NA	NA	ITPK1	10432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	93738394	93738720	93738557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD7	58718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	94679415	94679751	94679563	Y	SERPINA1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R4	68950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	95066800	95067322	95067074	Y	SERPINA10,SERPINA10,SERPINA6,SERPINA1,SERPINA11,SERPINA4,SERPINA5,SERPINA3	NA	NA	NA	NA	NA	GSC	167240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	95734707	95735043	95734878	Y	NA	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	49200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	95779970	95780439	95780333	Y	DICER1,CLMN	CLMN	NA	NA	NA	NA	CLMN	3804	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	99926936	99927033	99926985	Y	NA	SETD3,CCNK	NA	NA	NA	NA	SETD3	18183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	100068632	100068970	100068687	Y	NA	CCDC85C,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	100071651	100072022	100071781	Y	NA	CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1	NA	NA	NA	NA	RP11-543C4.1	2758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	100463833	100464185	100464009	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90	Hi-C	24141950	YY1	238450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	100497913	100498157	100498035	Y	NA	NA	EVL,YY1,DEGS2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	204478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	100659173	100659604	100659490	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4	DEGS2,YY1,EVL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YY1	43031	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	100751761	100751840	100751790	Y	NA	YY1,RP11-638I2.4,SLC25A29	NA	NA	NA	NA	SLC25A29	19044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	101159258	101159870	101159708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEG3	83877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr14	101454914	101455185	101454975	Y	DLK1,RTL1	SNORD114-1,SNORD114-13,SNORD114-19,SNORD114-20,SNORD114-21	NA	NA	NA	NA	SNORD114-21	8602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr14	102746257	102746658	102746398	Y	NA	MOK,ZNF839	NA	NA	NA	NA	MOK	22879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	102780583	102780765	102780709	Y	NA	MOK,ZNF839,CINP,TECPR2	MOK,DYNC1H1,HSP90AA1,WDR20,ZNF839	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ZNF839	949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr14	102971480	102971658	102971568	Y	NA	ANKRD9	NA	NA	NA	NA	ANKRD9	2478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	102993844	102994139	102994010	Y	TRAF3,RCOR1	ANKRD9	RCOR1,TECPR2,ANKRD9,CDC42BPB,MIR4309,TRAF3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANKRD9	19708	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	103051810	103052039	103051996	Y	NA	RCOR1	TECPR2,TRAF3,RCOR1,AMN	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCOR1	4959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	103112299	103112666	103112355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCOR1	55301	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	103557952	103558007	103557980	Y	NA	CDC42BPB,TNFAIP2	CDC42BPB,EXOC3L4,TNFAIP2,EIF5,LOC100131366,MARK3	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TNFAIP2	29772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	103577206	103577606	103577492	Y	C14orf153	TNFAIP2	NA	NA	NA	NA	TNFAIP2	10173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr14	104483678	104483886	104483733	Y	ZFYVE21	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf2	91072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	105433766	105434012	105433864	Y	KIAA0284,JAG2,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	8682	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	105438668	105438757	105438725	Y	KIAA0284,JAG2,CDCA4,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	AHNAK2	3937	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr14	105554572	105554923	105554752	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,AHNAK2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	69087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr14	105557924	105558306	105558075	Y	NA	NA	BTBD6,BRF1,JAG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDCA4	72439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	105947921	105948133	105948082	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	3403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr14	107252931	107253417	107253022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM121	1261991	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	24114794	24115156	24114976	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDN	184344	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	25565589	25566847	25566046	Y	SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	115281	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	25577365	25577592	25577422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	104536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	25614491	25614606	25614563	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	67522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	25623423	25623523	25623473	Y	SNURF,SNRPN	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	58605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	25624061	25624357	25624209	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	57771	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	26327449	26327665	26327505	Y	NA	NA	ATP10A,LOC100128714	IMR90	Hi-C	24141950	ATP10A	219132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	29407243	29407640	29407337	Y	FAM189A1	NA	NA	NA	NA	NA	NDNL2	152393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	29526240	29526874	29526776	Y	NA	NDNL2	NA	NA	NA	NA	NDNL2	33159	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	30213334	30213722	30213356	Y	NA	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	45346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	30216999	30217403	30217070	Y	TJP1	TJP1	TJP1,FAM189A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TJP1	41665	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	33083952	33084023	33083988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	75777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	33162710	33163027	33162926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	154535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	33418806	33419006	33418854	Y	NA	NA	FMN1,SCG5,ARHGAP11A,GREM1	IMR90	Hi-C	24141950	GREM1	410631	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	33494122	33494379	33494251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREM1	485947	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	35014105	35014549	35014217	Y	NA	NA	AQR,GJD2	IMR90	Hi-C	24141950	GOLGA8A,GOLGA8B	135401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	35590731	35591134	35590845	Y	NA	RP11-150L8.4	ATPBD4,C15orf41,CSNK1A1P1,MEIS2,LOC100507466	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150L8.4	1090	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	35650165	35650403	35650284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	60524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	35803904	35804280	35804092	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150L8.4	214263	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	39136416	39136749	39136509	Y	NA	NA	THBS1,C15orf53,FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	280640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RASGRP1	506216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	39371433	39371559	39371496	Y	NA	NA	C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	499721	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	39524753	39525004	39524927	Y	THBS1	NA	C15orf54	IMR90	Hi-C	24141950	THBS1	346276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	40162582	40162954	40162766	Y	NA	GPR176	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	48139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	40337433	40337595	40337464	Y	PLCB2,BMF,BMF,BMF	SRP14	NA	NA	NA	NA	SRP14	8044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	41139695	41139794	41139738	Y	NA	ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18	NA	NA	NA	NA	SPINT1	5479	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	41220555	41220912	41220794	Y	NUSAP1,DLL4	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	22248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	41233721	41234461	41233781	Y	C15orf57,VPS18	VPS18,CHAC1	NA	NA	NA	NA	CHAC1	8699	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	41878002	41878382	41878246	Y	NA	RPAP1,TYRO3	NA	NA	NA	NA	TYRO3	30129	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	42226071	42226526	42226165	Y	EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	36250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	42226984	42227301	42227216	Y	LTK,MGA,JMJD7,VPS39,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	35475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	42228791	42229215	42228969	Y	MGA,JMJD7,TMEM87A,EHD4	EHD4	NA	NA	NA	NA	EHD4	33561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	42232566	42232958	42232887	Y	EHD4	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	29818	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	42236399	42236774	42236695	Y	NA	EHD4	SPTBN5	IMR90	Hi-C	24141950	EHD4	26002	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	42833928	42834273	42834101	Y	NA	LRRC57,HAUS2,STARD9	NA	NA	NA	NA	LRRC57	4727	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	43356735	43357067	43356746	Y	NA	UBR1	NA	NA	NA	NA	UBR1	39244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	44186295	44186523	44186409	Y	NA	PIN4P1	NA	NA	NA	NA	PIN4P1	19853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	45746745	45747578	45747238	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	26018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	45784407	45784611	45784453	Y	C15orf48,SQRDL,PLDN	SLC30A4	NA	NA	NA	NA	SLC30A4	28394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	48847218	48847569	48847520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBN1	88477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	48963656	48963859	48963732	Y	FBN1	FBN1	SHC4,FBN1,CEP152	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	27610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	50429549	50429984	50429688	Y	USP8,GABPB1	NA	ATP8B4,GALK2,GABPB1,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	GABPB1-AS1	215541	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	51177416	51177715	51177636	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,AP4E1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AP4E1	21154	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	52024012	52024470	52024199	Y	TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2	TMOD2,LYSMD2	NA	NA	NA	NA	TMOD2	17288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	52273738	52273979	52273778	Y	NA	MAPK6,LEO1	MAPK6,GNB5,MYO5C,BCL2L10	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	LEO1	11735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	52369278	52369628	52369325	Y	MAPK6	CTD-2184D3.1	GNB5,BCL2L10,MYO5C	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2184D3.1	15864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	CTD-2184D3.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2184D3.1	274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	52545063	52545254	52545150	Y	MAPK6	MYO5C	NA	NA	NA	NA	MYO5C	40741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	55487983	55488563	55488357	Y	RAB27A,PIGB,RSL24D1	RSL24D1	NA	NA	NA	NA	RSL24D1	718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	55503902	55504218	55504040	Y	RAB27A,PIGB	RSL24D1	RSL24D1	K562	ChIA-PET	22265404	RSL24D1	16637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	55559597	55559729	55559672	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	49429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	55559739	55560363	55560096	Y	RAB27A,PIGB	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	48795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	55574844	55574949	55574897	Y	NA	PIGB,RAB27A,RP11-139H15.1	NA	NA	NA	NA	PIGB	34209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	56162319	56162688	56162565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	121256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	56201661	56201754	56201731	Y	NEDD4	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	82190	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	56419675	56420043	56419859	Y	RFX7	NA	NA	NA	NA	NA	RFX7	113440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	57844002	57844282	57844063	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	37824	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	57846695	57846878	57846787	Y	NA	GCOM1,MYZAP,POLR2M	NA	NA	NA	NA	GCOM1	35228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	58939079	58939427	58939418	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM10	100750	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	59467276	59467383	59467330	Y	ADAM10,RNF111	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	71999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	75499	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	59592534	59592835	59592690	Y	BNIP2,RNF111,MYO1E	NA	NA	NA	NA	NA	FAM81A	70057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	60699729	60699909	60699819	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	6647	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	60700608	60701055	60700809	Y	NA	ANXA2	NA	NA	NA	NA	ANXA2	7526	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	60818402	60818756	60818740	Y	RORA	NARG2,RP11-219B17.1	NA	NA	NA	NA	RP11-219B17.1	49025	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	61264927	61265345	61265257	Y	NA	NA	NARG2	IMR90	Hi-C	24141950	RORA	254173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	62684510	62685208	62684868	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	63427902	63428515	63428147	Y	USP3,RAB8B,LACTB	LACTB,RPS27L	NA	NA	NA	NA	LACTB	15903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	63795379	63795825	63795543	Y	NA	USP3	NA	NA	NA	NA	USP3	586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	63871063	63871418	63871089	Y	NA	USP3-AS1	NA	NA	NA	NA	USP3-AS1	20370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	64654607	64654901	64654754	Y	PIF1,KIAA0101	CSNK1G1,KIAA0101,TRIP4	CSNK1G1	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1G1	8165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	64995974	64996331	64996160	Y	NA	OAZ2	NA	NA	NA	NA	OAZ2	2494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65148759	65148948	65148850	Y	NA	PIF1,PLEKHO2	NA	NA	NA	NA	PLEKHO2	16671	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65176143	65176677	65176391	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	PLEKHO2,ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	25424	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65185651	65186463	65186157	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21	ANKDD1A	NA	NA	NA	NA	ANKDD1A	15638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	65245420	65245827	65245459	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16	ANKDD1A,SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	34821	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	65711297	65711582	65711440	Y	NA	IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	1828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65713781	65714189	65713985	Y	IGDCC3,IGDCC4	IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	65716164	65716565	65716475	Y	NA	IGDCC4	NA	NA	NA	NA	IGDCC4	2754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	65823475	65823857	65823545	Y	IGDCC4	DPP8,PTPLAD1	NA	NA	NA	NA	PTPLAD1	2719	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	66993287	66993569	66993487	Y	MAP2K1,SMAD6	NA	NA	NA	NA	NA	RPL4	178417	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD3	219173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67341124	67341334	67341261	Y	NA	SMAD3	SMAD3,IQCH,LOC100506686,AAGAB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMAD3	12767	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr15	67366599	67366961	67366679	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	12498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67383217	67384219	67383746	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	29116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	67399103	67399775	67399548	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	37502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	67401891	67402640	67402087	Y	SMAD3	SMAD3,RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	34637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	67440032	67440420	67440131	Y	NA	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	2755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67440675	67441024	67440815	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	3398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	RP11-342M21.2	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	5070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	67488498	67488886	67488594	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	51221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67490281	67490446	67490307	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-342M21.2	53004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	67516633	67516865	67516859	Y	NA	IQCH,AAGAB	NA	NA	NA	NA	IQCH	28273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68132387	68132778	68132514	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS1	211739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68176779	68177152	68176934	Y	NA	NA	PIAS1,CLN6,C15orf61,LOC100506686,CALML4	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	167365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68260561	68260756	68260687	Y	C15orf61	NA	PIAS1,LOC100506686,C15orf61,IQCH	IMR90	Hi-C	24141950	PIAS1	83761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68366463	68366575	68366519	Y	NA	PIAS1	NA	NA	NA	NA	PIAS1	21946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68644845	68645256	68644912	Y	PIAS1	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	76704	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	68852038	68852173	68852100	Y	NOX5,CORO2B,CORO2B	CORO2B	NA	NA	NA	NA	CORO2B	17135	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	69724089	69724530	69724231	Y	NA	KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1	NA	NA	NA	NA	RPLP1	18593	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	70391851	70392235	70392005	Y	TLE3	TLE3	NA	NA	NA	NA	TLE3	3336	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	70767457	70767783	70767604	Y	TLE3	NA	C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	286149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	70785060	70785587	70785260	Y	TLE3	NA	KIF23,LOC145837,TLE3,C15orf50,UACA	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	268345	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	71084406	71084742	71084644	Y	UACA,LARP6	UACA	UACA,LARP6,LRRC49	IMR90	Hi-C	24141950	UACA	30474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	71144876	71145062	71144944	Y	NA	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	71149072	71149436	71149201	Y	LARP6	LRRC49,LARP6,THAP10	NA	NA	NA	NA	LARP6	4574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	71336506	71336742	71336642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	153382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	71344757	71344812	71344802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	161633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.02008243077531
chr15	71373131	71373408	71373250	Y	NA	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	190007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr15	71385768	71386181	71385996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	202644	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	71408872	71409066	71408998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	225748	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	71409431	71409745	71409525	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THAP10	226307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr15	71984997	71985280	71985139	Y	SENP8	NA	NA	NA	NA	NA	SENP8	419319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	72383313	72383702	72383619	Y	CELF6,SENP8,SENP8	SENP8,MYO9A	NA	NA	NA	NA	SENP8	20897	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	74221354	74221537	74221415	Y	NA	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	5024	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	74249257	74249448	74249278	Y	NA	LOXL1,STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	LOXL1	32927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	74289381	74289564	74289454	Y	PML	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	PML	4367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	74677413	74677899	74677622	Y	SEMA7A,SEMA7A,CSK,CLK3,ARID3B	SEMA7A	SEMA7A	K562	ChIA-PET	22265404	SEMA7A	46909	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	74689389	74689592	74689450	Y	SEMA7A,SEMA7A	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	35216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	74699762	74699966	74699869	Y	LOXL1,STOML1	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	24842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	75745296	75745530	75745399	Y	PPCDC,IMP3,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	653	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	75746315	75746749	75746512	Y	PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	75959061	75959441	75959310	Y	SNX33	SNUPN,SNX33,IMP3,CSPG4	NA	NA	NA	NA	IMP3	20014	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	76050803	76051078	76050853	Y	NA	CSPG4,DNM1P35	NA	NA	NA	NA	DNM1P35	21839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	76819835	76820201	76820099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ISL2	192770	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	77710600	77710857	77710802	Y	NA	PEAK1	NA	NA	NA	NA	HMG20A	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	77711297	77711794	77711478	Y	NA	PEAK1,HMG20A	NA	NA	NA	NA	HMG20A	543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	78754081	78754185	78754133	Y	ACSBG1	IREB2	NA	NA	NA	NA	IREB2	26308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	79152508	79152900	79152703	Y	IREB2	NA	MORF4L1,ADAMTS7	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ADAMTS7	50735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	79216586	79216987	79216944	Y	RASGRF1	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	22929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	79280826	79281229	79281127	Y	CTSH	CTSH	NA	NA	NA	NA	CTSH	40910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	80211506	80211893	80211588	Y	NA	MTHFS,C15ORF37,ST20,BCL2A1	NA	NA	NA	NA	C15ORF37	1614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	80772387	80772765	80772517	Y	ARNT2,KIAA1199	RP11-210M15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-210M15.1	36894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	RP11-210M15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-210M15.1	37787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr15	80786706	80787081	80786777	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-210M15.1	51213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	80841630	80841706	80841692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-210M15.1	106137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	81315785	81316530	81316214	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC1	24490	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	81321783	81322073	81321879	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	C15orf26,IL16	IMR90	Hi-C	24141950	MESDC1	30488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	83603228	83603538	83603384	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	49123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	83605139	83605146	83605143	Y	NA	HOMER2,FAM103A1	NA	NA	NA	NA	HOMER2	47515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	83712711	83713060	83712967	Y	NA	C15orf40,BTBD1	C15orf40	IMR90	Hi-C	24141950	BTBD1	21046	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	83857531	83857848	83857643	Y	AP3B2,HDGFRP3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	83857860	83858021	83857985	Y	NA	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	16749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	83869308	83869629	83869461	Y	SH3GL3	HDGFRP3	NA	NA	NA	NA	HDGFRP3	5141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	83954950	83955303	83955151	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	3484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr15	83956370	83956763	83956596	Y	BNC1	BNC1	NA	NA	NA	NA	BNC1	4904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	84048302	84048583	84048506	Y	BNC1	NA	SH3GL3,BNC1	IMR90	Hi-C	24141950	SH3GL3	65397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	85455479	85455863	85455740	Y	SLC28A1	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	65808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	85645018	85645768	85645040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE8A	123347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	85956762	85957097	85956878	Y	AKAP13,PDE8A	AKAP13	NA	NA	NA	NA	AKAP13	34960	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	86088256	86088945	86088625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	166454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	88348186	88348352	88348346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00052	230026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	89014009	89014390	89014200	Y	NA	MRPL46,MRPS11	NA	NA	NA	NA	MRPS11	5325	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	89532902	89533939	89533555	Y	NA	NA	MFGE8,ABHD2	IMR90	Hi-C	24141950	MFGE8	78260	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	89664635	89664981	89664666	Y	NA	ABHD2	NA	NA	NA	NA	ABHD2	35945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	89795623	89795958	89795791	Y	NA	FANCI	NA	NA	NA	NA	FANCI	10443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90005846	90006063	90005954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLG	129754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90197559	90197639	90197586	Y	KIF7	KIF7,PEX11A	NA	NA	NA	NA	KIF7	877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90325168	90325324	90325249	Y	POLG,ZNF710,CIB1,ANPEP	MESP1,ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	31309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90379956	90380186	90379992	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	23323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	90394929	90395092	90395007	Y	ZNF710,CIB1,ANPEP	ANPEP,AP3S2	NA	NA	NA	NA	ANPEP	38296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90418263	90418454	90418325	Y	NA	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	17120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90547918	90548344	90548145	Y	NA	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	5294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90563245	90563669	90563337	Y	ANPEP,AP3S2,IQGAP1,CIB1,ZNF710	ZNF710	NA	NA	NA	NA	ZNF710	20621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90754464	90755447	90755260	Y	SEMA4B,SEMA4B,CIB1	CIB1,TTLL13	NA	NA	NA	NA	CIB1	19832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	90958026	90958305	90958134	Y	ZNF710,IQGAP1	IQGAP1	NA	NA	NA	NA	IQGAP1	28576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	91208661	91208996	91208948	Y	NA	BLM	NA	NA	NA	NA	BLM	49562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	91541068	91541209	91541180	Y	NA	RCCD1,PRC1,VPS33B	NA	NA	NA	NA	PRC1	4209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	92293461	92293635	92293548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO3A1	101290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	ASB9P1,FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	93458042	93458417	93458141	Y	NA	CHD2,MIR3175	NA	NA	NA	NA	MIR3175	12413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	93864881	93865242	93865107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR3175	419252	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	96867031	96867104	96867071	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2	63	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	96867848	96868085	96868000	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	505	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr15	96871345	96871608	96871517	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	2755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	96872860	96873000	96872921	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	NR2F2-AS1	4270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	96884042	96884481	96884402	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	10985	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	96890448	96891058	96890571	Y	NR2F2,NR2F2,NR2F2	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	4408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	96898438	96898666	96898552	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	2972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99091450	99092159	99091603	Y	NA	NA	IGF1R,SYNM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IGF1R	98041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	99214674	99215061	99214732	Y	NA	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	24474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99270923	99271213	99270975	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	80723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	225836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99444571	99445210	99444854	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF1R	254371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr15	99914657	99915195	99914962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEF2A	100175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	99995215	99995527	99995307	Y	MEF2A,MEF2A	MEF2A	MEF2A,LRRC28	IMR90	Hi-C	24141950	MEF2A	19843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	100914283	100914527	100914405	Y	ADAMTS17	ADAMTS17	NA	NA	NA	NA	ADAMTS17	34073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101226700	101226773	101226737	Y	NA	NA	LRRK1,ALDH1A3	IMR90	Hi-C	24141950	LINS	85265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101261855	101262549	101262221	Y	NA	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINS	120420	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr15	101265417	101265591	101265495	Y	ALDH1A3	NA	ALDH1A3,LRRK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-66B24.2	122175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr15	101499118	101499600	101499493	Y	LRRK1	LRRK1	NA	NA	NA	NA	LRRK1	41698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101667290	101667533	101667378	Y	NA	NA	CHSY1,SELS,LRRK1	IMR90	Hi-C	24141950	CHSY1	122604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101711330	101711507	101711419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHSY1	78630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr15	101745424	101745566	101745486	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	44571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	121563	121849	121614	Y	TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG	SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG	NA	NA	NA	NA	RHBDF1	2505	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	2478608	2478672	2478640	Y	RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2	CCNF,C16orf59,TBC1D24	NA	NA	NA	NA	CCNF	1213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	2582505	2583298	2582685	Y	RAB26,E4F1,SRRM2,ATP6V0C,ATP6V0C,AMDHD2,CEMP1,PDPK1	ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	PDPK1	2667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	2917931	2918273	2918246	Y	NA	FLYWCH2,FLYWCH1	PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FLYWCH2	12914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	3053798	3054225	3053960	Y	NA	KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25	NA	NA	NA	NA	TNFRSF12A	12221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	3156518	3156937	3156694	Y	PAQR4,CLUAP1,ZNF205	IL32,ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF205	3624	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr16	3200393	3200919	3200597	Y	NA	ZNF205,ZNF213	NA	NA	NA	NA	ZNF213	22615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	MTRNR2L4,ZNF174	NA	NA	NA	NA	MTRNR2L4	5046	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	3996199	3996445	3996330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREBBP	67472	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	4233647	4234082	4234013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADCY9	69461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr16	4321625	4322178	4321908	Y	ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4	TFAP4	NA	NA	NA	NA	TFAP4	549	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr16	4349200	4349352	4349284	Y	NA	TFAP4	ADCY9,TFAP4,CREBBP,VASN,CORO7-PAM16	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TFAP4	28124	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	4426208	4426420	4426289	Y	NA	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	6359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	4587360	4587817	4587427	Y	HMOX2,PPL,C16orf5,C16orf5	NMRAL1	NA	NA	NA	NA	NMRAL1	43596	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	4666118	4666710	4666381	Y	NA	MGRN1	NA	NA	NA	NA	MGRN1	1624	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr16	4818680	4818913	4818758	Y	C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI	C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI	NA	NA	NA	NA	ZNF500	3055	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	11198828	11199160	11198954	Y	LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1	NA	NA	NA	NA	NA	RMI2	142316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	11336726	11336842	11336760	Y	LITAF,LITAF	RMI2,SOCS1	NA	NA	NA	NA	RMI2	4634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	11422424	11422652	11422552	Y	NA	NA	CLEC16A,PRM2,PRM3,TNP2,RMI2,TXNDC11	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS1	74388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	11890330	11890418	11890367	Y	LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A	ZC3H7A	NA	NA	NA	NA	ZC3H7A	1207	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	11968147	11968344	11968329	Y	ZC3H7A	RSL1D1,GSPT1	RSL1D1	IMR90	Hi-C	24141950	RSL1D1	24705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	12049208	12049600	12049404	Y	NA	GSPT1,RP11-166B2.1,SNX29	SNX29	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-166B2.1	18900	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	12541943	12542343	12542144	Y	RUNDC2A	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	353531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	12556614	12556995	12556828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	338879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	12769820	12770024	12769919	Y	CPPED1	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	125850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	14402100	14402342	14402181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	238922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	14423320	14423633	14423477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	260142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	14424623	14424858	14424825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKL2	261445	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	14752031	14752218	14752119	Y	NA	PARN,BFAR	NA	NA	NA	NA	BFAR	27359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	15766632	15767024	15766843	Y	KIAA0430,NDE1,NDE1	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	31508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	15769690	15769796	15769712	Y	NA	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	NDE1	34566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	15801967	15802265	15802154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDE1	66843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	16242630	16242651	16242642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCC1	201196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	19822629	19822921	19822772	Y	NA	NA	GPRC5B	IMR90	Hi-C	24141950	GPRC5B	72568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	19843151	19843406	19843180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	52083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	19894494	19895110	19894762	Y	CCP110,GPRC5B	GPRC5B	NA	NA	NA	NA	GPRC5B	379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	20877631	20877934	20877768	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	LYRM1	31256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	20910424	20910792	20910538	Y	NA	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	20913163	20913441	20913303	Y	CRYM,DCUN1D3,LYRM1	LYRM1,ERI2,DCUN1D3	NA	NA	NA	NA	DCUN1D3	3457	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	22046502	22046742	22046619	Y	NA	C16orf52	NA	NA	NA	NA	C16orf52	29543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	22202596	22202946	22202679	Y	POLR3E,CDR2	EEF2K	UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	12657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr16	22207042	22207397	22207176	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K,C16orf52	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EEF2K	8206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	22211037	22211162	22211126	Y	NA	EEF2K	POLR3E,EEF2K	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	EEF2K	4441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	23508487	23508934	23508786	Y	GGA2	COG7,GGA2	NA	NA	NA	NA	GGA2	22382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	24863023	24863279	24863154	Y	NA	NA	ARHGAP17	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6A	124007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	25005690	25005854	25005767	Y	NA	ARHGAP17	NA	NA	NA	NA	ARHGAP17	19133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	27770598	27770827	27770713	Y	IL4R	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0556	211144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	28179891	28180117	28180009	Y	SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	41124	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	28204572	28204722	28204690	Y	CCDC101,APOBR,XPO6,SBK1	XPO6	NA	NA	NA	NA	XPO6	16519	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	29709853	29709969	29709906	Y	QPRT	SPN,QPRT	NA	NA	NA	NA	QPRT	37253	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	29796508	29796713	29796645	Y	KCTD13,C16orf92,ALDOA	KIF22,MAZ,PRRT2,MVP	NA	NA	NA	NA	KIF22	3327	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr16	30855963	30856257	30856110	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MIR4519	28387	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	31905713	31906088	31906002	Y	ZNF267	ZNF267	NA	NA	NA	NA	ZNF267	22634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	47324349	47324747	47324746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHKB	168287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	48417730	48418013	48418003	Y	N4BP1,SIAH1,SIAH1	NA	NA	NA	NA	NA	SIAH1	62300	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	50101332	50101352	50101341	Y	NA	HEATR3	NA	NA	NA	NA	HEATR3	3480	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	51188531	51188838	51188764	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYLD	414570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	52854151	52854308	52854232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-297L17.6	166935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	53086726	53087108	53087065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	53552731	53552904	53552850	Y	LOC643802,RBL2,AKTIP	AKTIP	NA	NA	NA	NA	AKTIP	16408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	56645516	56645845	56645554	Y	MT2A,MT1M,MT1E,MT1A	MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A,MT1B,MT1F	NA	NA	NA	NA	MT1L	3543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr16	56882732	56883304	56883026	Y	NA	NA	MIR138-2	IMR90	Hi-C	24141950	HERPUD1	80656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	56944688	56944705	56944692	Y	HERPUD1	HERPUD1	NA	NA	NA	NA	HERPUD1	19255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	57034523	57034824	57034736	Y	NLRC5	NLRC5	NA	NA	NA	NA	NLRC5	13126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr16	57541705	57541726	57541715	Y	NA	POLR2C,DOK4,CCDC102A	POLR2C,DOK4,COQ9,CIAPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	DOK4	22466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	57717053	57717380	57717096	Y	FAM192A,ZNF319,GPR97	NA	NA	NA	NA	NA	KATNB1	50262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66416297	66416567	66416426	Y	CDH5	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23860	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66416918	66416958	66416940	Y	NA	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	23469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66440915	66440994	66440955	Y	CMTM3,CMTM3	LINC00920,BEAN1	NA	NA	NA	NA	LINC00920	488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66587187	66587393	66587288	Y	NA	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CKLF-CMTM1	2697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66619876	66620093	66620023	Y	CKLF	TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3	NA	NA	NA	NA	CMTM3	15684	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66719308	66719396	66719350	Y	NA	CMTM4	NA	NA	NA	NA	CMTM4	9214	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	66784501	66784840	66784671	Y	NA	DYNC1LI2	NA	NA	NA	NA	DYNC1LI2	800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	68271348	68271876	68271591	Y	TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2	ESRP2,PLA2G15,SLC7A6	NA	NA	NA	NA	ESRP2	1343	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr16	68503731	68504029	68503905	Y	NA	SMPD3	PRMT7,SMPD3	IMR90	Hi-C	24141950	SMPD3	23140	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	68702238	68702569	68702370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-36P	134820	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69060339	69060481	69060445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS3	76986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69432325	69432475	69432421	Y	TERF2	TERF2,CYB5B	NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TERF2	7999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69563572	69563696	69563627	Y	NA	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	33301	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69564577	69564882	69564731	Y	WWP2	NFAT5	NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NFAT5	32115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69601109	69601332	69601245	Y	WWP2	NFAT5	NA	NA	NA	NA	NFAT5	4112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69777344	69777472	69777408	Y	NA	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	NOB1	9371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr16	70727989	70728270	70728171	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	MTSS1L	10020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	70749058	70749400	70749223	Y	NA	MTSS1L	MTSS1L,IL34	IMR90	Hi-C	24141950	MTSS1L	31089	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	70780634	70780961	70780786	Y	MTSS1L	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	52103	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	71753676	71753893	71753785	Y	HPR,PHLPP2	PHLPP2	NA	NA	NA	NA	PHLPP2	2711	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	72459158	72459630	72459377	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXNL4B	332828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	73102955	73103191	73103082	Y	ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	11358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	73104505	73104770	73104567	Y	ZFHX3,ZFHX3	ZFHX3	ZFHX3,HTA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	12908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	75034712	75035106	75034867	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	2641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	75045854	75046060	75045918	Y	TMEM170A,MLKL	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	WDR59	13783	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	75286788	75287025	75286897	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	12926	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	75294692	75295061	75294835	Y	TERF2IP,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	4890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	75411958	75412267	75412159	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFDP1	53116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	76269107	76269317	76269211	Y	NA	RPL18P13	NA	NA	NA	NA	RPL18P13	1586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	77322301	77322413	77322334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYCE1L	91007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	77619345	77619555	77619482	Y	ADAMTS18	NA	CLEC3A,ADAMTS18,VAT1L	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT7	134856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	80617475	80617786	80617637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL2	218440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	80965900	80966145	80965922	Y	NA	NA	CMC2	IMR90	Hi-C	24141950	CENPN	71958	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	81026963	81027197	81027054	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	10906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	81038389	81038511	81038494	Y	NA	CENPN,ATMIN	NA	NA	NA	NA	CENPN	286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	81560583	81561027	81560837	Y	PLCG2,CMIP,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	83808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	81659842	81660553	81660320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	110149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	81875278	81875726	81875461	Y	PLCG2	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG2	104576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	82084098	82084340	82084124	Y	NA	SDR42E1,HSD17B2	NA	NA	NA	NA	HSD17B2	17489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	82667775	82667948	82667787	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	9367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	82685978	82686417	82686161	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	27570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	82687467	82688028	82687715	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	29059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	82689057	82689347	82689181	Y	NA	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	30649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83029672	83029964	83029912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	371264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83069400	83069774	83069647	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	410992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83159856	83159879	83159868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH13	501448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83715826	83716249	83715944	Y	HSBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	123199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83777004	83777385	83777194	Y	HSDL1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	62063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	83859753	83860142	83859843	Y	HSDL1	HSBP1	NA	NA	NA	NA	HSBP1	20305	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83953538	83953937	83953606	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	MLYCD	22807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83960761	83960901	83960832	Y	NA	MLYCD,OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	18986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	83988181	83988500	83988282	Y	NA	OSGIN1,NECAB2	NA	NA	NA	NA	OSGIN1	8294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	84545075	84545257	84545139	Y	NA	NA	COTL1	MCF7	ChIA-PET	22265404	COTL1	104426	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	85037797	85037883	85037799	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	5258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	85038009	85038299	85038256	Y	NA	ZDHHC7,KIAA0513	NA	NA	NA	NA	ZDHHC7	4842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	8.53414013231803
chr16	85264175	85264500	85264259	Y	NA	NA	LOC400548,FAM92B	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA0513	204800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr16	85586938	85587370	85587020	Y	NA	NA	LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GINS2	134309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	85780154	85780247	85780189	Y	NA	C16orf74,COX4I1	GINS2	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf74	2488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	85783855	85783992	85783913	Y	NA	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	1120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr16	85785568	85785942	85785758	Y	C16orf74	C16orf74,COX4I1	NA	NA	NA	NA	C16orf74	2833	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	85950196	85950424	85950316	Y	COX4I1,IRF8	IRF8	NA	NA	NA	NA	IRF8	19787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86337289	86337465	86337447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXF1	204668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXF1	120808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr16	86609499	86609840	86609550	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	1525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86619952	86620235	86620073	Y	FOXC2	MTHFSD,FOXC2,FOXL1	NA	NA	NA	NA	FOXL1	11978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86664163	86664323	86664252	Y	NA	NA	FOXL1,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	56189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	86698129	86698417	86698281	Y	NA	NA	FOXL1,FLJ30679,MTHFSD,FOXC2,C16orf95,FBXO31	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr16	86698644	86698785	86698699	Y	FOXL1	NA	FOXL1,C16orf95,MTHFSD,FLJ30679,FOXC2	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	90670	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	167147	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	86959187	86959331	86959263	Y	FOXC2	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	351213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86962886	86963146	86962899	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	354912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	86985410	86985767	86985608	Y	FOXC2,FOXL1	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	363255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr16	87292504	87292593	87292549	Y	NA	NA	MTHFSD,FBXO31,FOXL1,FOXC2,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf95	56429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	87421939	87422407	87422148	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	1341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	87810498	87810587	87810524	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	12900	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	87811524	87811882	87811665	Y	NA	KLHDC4	ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLHDC4	13926	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	87839693	87840050	87839856	Y	SLC7A5	KLHDC4	SLC7A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLHDC4	42095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	88063556	88063600	88063578	Y	BANP,BANP,BANP	NA	NA	NA	NA	NA	BANP	82706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	88337697	88337985	88337883	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179740	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	88338212	88338634	88338285	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr16	88340379	88340720	88340472	Y	NA	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	177005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	88520905	88521327	88521137	Y	ZC3H18,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZFPM1	ZFPM1	NA	NA	NA	NA	ZFPM1	3180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	88701263	88701663	88701374	Y	SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,ZC3H18,CYBA	CYBA,MVD	NA	NA	NA	NA	CYBA	13897	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	89392350	89392997	89392648	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF778	110232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr16	89571786	89572109	89572034	Y	ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	16461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr16	89688213	89688598	89688406	Y	NA	CPNE7,CHMP1A	NA	NA	NA	NA	CHMP1A	33655	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	574639	574965	574941	Y	NA	RPS4XP17,VPS53	NA	NA	NA	NA	RPS4XP17	15852	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	594616	594984	594846	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	27973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	773525	773702	773655	Y	RNMTL1	NA	NA	NA	NA	NA	GLOD4	89944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	872760	873162	873150	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	7848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	1171565	1171808	1171610	Y	WDR81,PITPNA,ABR,ABR	ABR	NA	NA	NA	NA	ABR	41250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	1267059	1267122	1267091	Y	NA	YWHAE	NA	NA	NA	NA	YWHAE	34550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr17	1521068	1521369	1521308	Y	CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1	SLC43A2,RILP	NA	NA	NA	NA	SLC43A2	8811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	1620806	1621089	1620895	Y	PITPNA,SLC43A2,SCARF1,OVCA2,WDR81,WDR81,WDR81	PRPF8,TLCD2,WDR81,MIR22HG	NA	NA	NA	NA	MIR22HG	2338	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	1953067	1954207	1953327	Y	TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1	RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	1241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	2087949	2088276	2088112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	116401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	2095819	2096093	2095903	Y	WDR81	NA	NA	NA	NA	NA	SRR	108584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	2300026	2300553	2300288	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	1859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	2305266	2305571	2305415	Y	RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	2854	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	2627618	2628097	2628087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	133114	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	2771532	2771614	2771573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	277028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	2795960	2796135	2796054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAFAH1B1	301456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	3791812	3792145	3792008	Y	GSG2	C17orf85,CAMKK1	NA	NA	NA	NA	CAMKK1	4040	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	4244674	4245003	4244975	Y	NA	UBE2G1	NA	NA	NA	NA	UBE2G1	22920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	4737531	4737755	4737558	Y	PLD2,MINK1	PSMB6,PLD2,MINK1	NA	NA	NA	NA	MINK1	2848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	6542489	6542952	6542608	Y	NA	TXNDC17,KIAA0753,MED31,C17orf100	NA	NA	NA	NA	KIAA0753	242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	6925152	6925653	6925481	Y	PLSCR3,C17orf49,BCL6B	AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13	NA	NA	NA	NA	C17orf49	9338	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	7745337	7745870	7745591	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	13194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	7745915	7746944	7746139	Y	NA	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	12120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	8057335	8058055	8057702	Y	KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59	HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	8090038	8090540	8090163	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	1024	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	8095551	8095762	8095658	Y	KDM6B,KCNAB3,CTC1,VAMP2	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB	NA	NA	NA	NA	C17orf59	3987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	8103328	8103700	8103595	Y	NA	PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,PFAS,CTC1	NA	NA	NA	NA	AURKB	8218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	8532647	8532776	8532657	Y	KRBA2	MYH10	NA	NA	NA	NA	MYH10	568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	10220640	10220911	10220834	Y	GAS7,MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	60561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	10237288	10237551	10237420	Y	MYH4	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	77209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	13249594	13249869	13249742	Y	HS3ST3A1	NA	HS3ST3B1,HS3ST3A1	IMR90	Hi-C	24141950	HS3ST3A1	253375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	13390789	13390935	13390899	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	112309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13412933	13413137	13413069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	90107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13444400	13444811	13444590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	58433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13445928	13446299	13446210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	56945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13460367	13460669	13460622	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	42575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	13463603	13463645	13463626	Y	HS3ST3A1	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	39599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13472221	13472595	13472561	Y	NA	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	30649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	13486545	13486641	13486589	Y	NA	HS3ST3A1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	16603	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	13575065	13575361	13575332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HS3ST3A1	71821	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.84872986359441
chr17	14206970	14207459	14207274	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	4570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	14212324	14213048	14212775	Y	HS3ST3B1	HS3ST3B1	NA	NA	NA	NA	HS3ST3B1	9924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	15850564	15850918	15850801	Y	ADORA2B	ADORA2B,TTC19	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	4333	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	15923170	15923610	15923287	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,TTC19,ZSWIM7	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	22139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	15925215	15925448	15925362	Y	ZNF286A,NCOR1	TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	24184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	15959345	15959465	15959410	Y	FAM18B2,ZNF286A,NCOR1,PIGL,NCOR1,C17orf76,TTC19,ZSWIM7	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM7	58314	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	16438910	16439232	16439111	Y	NA	FAM211A,ZNF287	NA	NA	NA	NA	ZNF287	31288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	16487545	16487788	16487743	Y	NA	ZNF287,AC005822.1	NA	NA	NA	NA	ZNF287	17025	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	16944636	16944769	16944688	Y	NA	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	17597479	17598220	17598134	Y	ALKBH5,FLCN,COPS3	RAI1	NA	NA	NA	NA	RAI1	14692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	17654001	17654381	17654093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	71214	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	17725605	17725781	17725666	Y	NA	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	12544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	17743258	17743857	17743527	Y	SMCR8	SREBF1	NA	NA	NA	NA	SREBF1	4933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	17817256	17817562	17817444	Y	SREBF1	NA	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	56174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	17861466	17861608	17861562	Y	SMCR8	TOM1L2,LRRC48	NA	NA	NA	NA	TOM1L2	12128	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	19141562	19141875	19141665	Y	RNF112,EPN2	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD3D	127613	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	19656390	19656618	19656531	Y	MAPK7,MAPK7	NA	NA	NA	NA	NA	ALDH3A2	106941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr17	20690369	20690534	20690439	Y	NA	OLA1P2,SCDP1	NA	NA	NA	NA	SCDP1	4411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	21179100	21179414	21179208	Y	CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAP2K3	6570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	21272298	21272502	21272399	Y	KCNJ18	KCNJ12	C17orf51,KCNJ12	IMR90	Hi-C	24141950	KCNJ12	5007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	25620233	25620423	25620280	Y	NA	WSB1	NA	NA	NA	NA	WSB1	1131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	25672386	25672687	25672621	Y	NA	NA	KSR1,MIR4522,WSB1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	53284	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	25680632	25681097	25680982	Y	NA	NA	KSR1,WSB1,MIR4522	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WSB1	61530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	25821459	25821654	25821516	Y	NA	KSR1	NA	NA	NA	NA	KSR1	39789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	26361320	26361470	26361415	Y	NA	NLK	NA	NA	NA	NA	NLK	5293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	26718724	26718918	26718801	Y	FOXN1,C17orf63,SEBOX,SARM1	POLDIP2,TMEM199,SARM1,VTN,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	13297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	27104790	27105049	27104918	Y	SEBOX	TRAF4	NA	NA	NA	NA	TRAF4	35788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	27475765	27476166	27476073	Y	NEK8,PHF12	MYO18A	NA	NA	NA	NA	MYO18A	29264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	27568035	27568215	27568131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	50921	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	27703475	27703981	27703860	Y	TIAF1,MYO18A,GIT1,TAOK1	TAOK1,MIR4523	MYO18A,TAOK1,CORO6,SSH2,CRYBA1,GIT1,TP53I13,ABHD15,MIR4523	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TAOK1	11501	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	27966112	27966641	27966332	Y	NA	GIT1,CORO6	NA	NA	NA	NA	CORO6	18187	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	28037853	28038223	28038205	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	89928	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	28053660	28054255	28054185	Y	NUFIP2,TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	105735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	28070496	28070746	28070685	Y	SSH2,EFCAB5	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	122571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	29596751	29597032	29596911	Y	NA	EVI2B,EVI2A	NA	NA	NA	NA	EVI2B	42098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2A	229790	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	29886835	29887094	29886884	Y	EVI2A	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	EVI2A	239933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	29887922	29888057	29887990	Y	NA	NA	MIR4725,MIR365B	IMR90	Hi-C	24141950	EVI2A	241020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	30170148	30170249	30170215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP6	56535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	30823818	30823986	30823902	Y	NA	CDK5R1	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	12181	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	30907001	30907345	30907172	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK5R1	95364	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	32579434	32580053	32579676	Y	CCL8,CCL7	CCL2,CCL7	NA	NA	NA	NA	CCL2	251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2,CCL7	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	33300552	33300861	33300820	Y	NA	ZNF830,LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	LIG3	4652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	33349623	33350064	33349994	Y	SLFN5,SLFN12L,CCT6B,ZNF830,RFFL	LIG3,CCT6B	NA	NA	NA	NA	CCT6B	43526	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	33572314	33572864	33572356	Y	NA	SLFN5	NA	NA	NA	NA	SLFN5	4259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	33673458	33673662	33673550	Y	ZNF830,RFFL,SLFN14,SLFN11,SLFN5	SLFN11	NA	NA	NA	NA	SLFN11	25058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	33867743	33868178	33867841	Y	RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	AP2B1	34887	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	34225359	34225619	34225461	Y	SLFN12L,SLFN14,CCL5	CCL5,RDM1	NA	NA	NA	NA	CCL5	19562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	34476074	34476083	34476078	Y	LYZL6,CCL3,CCL4,CCL3L3,CCL3L1	NA	NA	NA	NA	NA	RDM1	220297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	34871446	34871455	34871448	Y	NA	ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2	NA	NA	NA	NA	PIGW	17392	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	35278050	35278157	35278104	Y	MRM1	AATF	LHX1,AATF	MCF7	ChIA-PET	22265404	AATF	26018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	35492690	35492856	35492817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AATF	188515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	36062721	36062883	36062777	Y	DDX52,HNF1B	NA	NA	NA	NA	NA	DDX52	61228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	36859613	36860666	36860145	Y	NA	C17orf96,CISD3,PCGF2,PSMB3	NA	NA	NA	NA	MLLT6	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	37896808	37897181	37897022	Y	GRB7,GRB7,GRB7,GRB7	PGAP3,MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	11768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	37910411	37911394	37910787	Y	FBXL20,CDK12,STARD3,WIPF2,ORMDL3,IKZF3,CASC3	MIEN1	NA	NA	NA	NA	MIEN1	25371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr17	38096378	38096540	38096465	Y	IKZF3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	14524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	38231838	38232188	38231911	Y	NA	THRA,MED24,NR1D1,MSL1	NA	NA	NA	NA	MED24	16370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	38601076	38601487	38601191	Y	GJD3,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	3374	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	38607821	38607996	38607876	Y	NA	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	10119	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	71050	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39113005	39113367	39113263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	68087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr17	39218168	39218609	39218458	Y	NA	KRTAP1-5,KRTAP4-8	NA	NA	NA	NA	KRTAP4-8	33784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr17	39536188	39536609	39536415	Y	NA	KRT33B,KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	46	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39572335	39572530	39572426	Y	NA	KRT33B,KRT34	NA	NA	NA	NA	KRT34	35680	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	39653134	39653351	39653234	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	23430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39656265	39656585	39656468	Y	KRTAP2-1,KRTAP2-2,KRTAP2-4,KRTAP9-1,KRTAP9-2,KRTAP9-9,KRT37	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT15	20196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39682585	39682843	39682821	Y	JUP,KRTAP4-11,KRT19	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	25	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	39683248	39683750	39683386	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	688	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	39686458	39686891	39686666	Y	KRT19	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	3898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39703664	39703881	39703736	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21104	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	39703962	39704520	39704217	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	21402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	39705098	39705383	39705310	Y	NA	KRT15,KRT19	NA	NA	NA	NA	KRT19	22538	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	39822130	39822941	39822323	Y	NA	EIF1	KRT19,KRT15,CCR7,SMARCE1,KRT222,KRT26,KRT25,KRT28,KRT10,TMEM99,KRT27,KRT20,KRT23,KRTAP2-2,KRTAP2-1,KRTAP2-4,LOC730755,KRTAP17-1,KRT14,LOC147093,KRT9,EIF1	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EIF1	20196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	40573451	40573881	40573544	Y	AOC3,GHDC,PLEKHH3,NAGLU,PTRF	STAT3,ATP6V0A1	NA	NA	NA	NA	PTRF	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	40670495	40670831	40670653	Y	WNK4,RAB5C,PTRF	AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX	NA	NA	NA	NA	AC067852.1	905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	40816292	40816343	40816318	Y	NA	TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1	NA	NA	NA	NA	TUBG2	6969	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	40942176	40942529	40942199	Y	NA	EZH1,RAMP2,VPS25,WNK4,PSME3,BECN1	NA	NA	NA	NA	WNK4	11480	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	41242207	41242334	41242271	Y	NA	BRCA1,NBR2	NA	NA	NA	NA	BRCA1	33166	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	41478754	41478975	41478864	Y	ARL4D	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	4427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	41656262	41656390	41656311	Y	G6PC3	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	1274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	41657407	41657423	41657415	Y	MPP2	ETV4	DHX8,MIR2117,MPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	2419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	41827198	41827473	41827372	Y	NA	DUSP3	NA	NA	NA	NA	DUSP3	26883	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	42215472	42215904	42215679	Y	C17orf53	HDAC5,C17orf53,TMUB2	C17orf53	MCF7	ChIA-PET	22265404	C17orf53	1370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.6773772964135
chr17	42404001	42404290	42404282	Y	C17orf65,TMUB2,TMUB2,UBTF,ITGA2B,SLC4A1,SLC25A39	RUNDC3A,SLC25A39,GRN,FAM171A2	NA	NA	NA	NA	SLC25A39	3763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	42619909	42620020	42619938	Y	NA	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,C17orf104,CCDC43,DBF4B,ITGA2B	IMR90	Hi-C	24141950	FZD2	12905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	42624253	42624886	42624582	Y	TMUB2,TMUB2,GRN	GPATCH8,FZD2	GPATCH8,FZD2,ITGA2B,DBF4B,C17orf104,CCDC43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FZD2	8039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	43249989	43250354	43250021	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP,DCAKD	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	13922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	43253543	43253622	43253574	Y	NA	ACBD4,PLCD3,HEXIM1,HEXIM2,FMNL1	NA	NA	NA	NA	HEXIM2	17476	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	43305165	43306978	43306453	Y	PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1	FMNL1	NA	NA	NA	NA	FMNL1	8354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	43449108	43449433	43449167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K14	56694	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	44198532	44198560	44198547	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	228784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	44240473	44240874	44240856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	270725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	44268679	44268848	44268762	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPT	298931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MAPT	374423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	44847625	44847956	44847902	Y	WNT3	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50092	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	44848199	44848613	44848371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	50666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr17	45609469	45609601	45609554	Y	NA	NPEPPS	NA	NA	NA	NA	NPEPPS	11161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	45771013	45771467	45771041	Y	NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1	KPNB1	NA	NA	NA	NA	KPNB1	46171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46101351	46101579	46101379	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	11813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46102426	46102830	46102617	Y	NA	COPZ2,NFE2L1	NA	NA	NA	NA	COPZ2	10562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	46314423	46314444	46314434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	135704	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46318516	46318700	46318601	Y	SKAP1,HOXB4	NA	NA	NA	NA	NA	SNX11	139797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	46569094	46569227	46569161	Y	CALCOCO2	HOXB-AS1	HOXB3,HOXB-AS3,HOXB6,HOXB5,SKAP1,HOXB2,HOXB4,HOXB9	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HOXB-AS1	49686	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46642274	46642589	46642562	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	12884	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46647653	46647800	46647722	Y	HOXB5,HOXB2,HOXB4,HOXB3	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	46648538	46649382	46648794	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr17	46654606	46654947	46654902	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9	NA	NA	NA	NA	HOXB4	526	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr17	46662223	46662405	46662377	Y	NA	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	6750	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr17	46662684	46663231	46662943	Y	HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5	HOXB-AS1,HOXB2,HOXB-AS3,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7	NA	NA	NA	NA	HOXB4	7211	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	46680378	46680812	46680678	Y	NA	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB6	24	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	46702579	46702749	46702606	Y	HOXB2,HOXB3,SNF8,HOXB5,HOXB6,HOXB7,HOXB8,HOXB9	HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7,RP11-357H14.17	NA	NA	NA	NA	HOXB9	740	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	47270202	47270509	47270359	Y	CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	35619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	47278932	47279253	47279189	Y	NA	PHOSPHO1	NA	NA	NA	NA	PHOSPHO1	26875	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	47425065	47425127	47425096	Y	MYST2,ZNF652,ZNF652	RP11-1079K10.3,ZNF652	NA	NA	NA	NA	RP11-1079K10.3	11400	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	47765495	47765594	47765536	Y	ABI3,GNGT2,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,PPP1R9B,MYST2,FAM117A,SPOP	SPOP,SLC35B1	NA	NA	NA	NA	SPOP	11899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	47928830	47928921	47928887	Y	FAM117A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613C6.4	58125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	48105016	48105270	48105136	Y	XYLT2,LRRC59,ITGA3	DLX3,ITGA3	LOC284080,ITGA3	MCF7	ChIA-PET	22265404	ITGA3	26062	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	48139711	48140314	48140012	Y	XYLT2,LRRC59,EPN3,ITGA3	ITGA3,PDK2	NA	NA	NA	NA	ITGA3	8379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	48228924	48229616	48229504	Y	SPATA20,SAMD14	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	2933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	48251038	48251269	48251124	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SAMD14,PPP1R9B,COL1A1	NA	NA	NA	NA	PPP1R9B	25047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	49028088	49028439	49028211	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	84749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	49031638	49031879	49031784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOB1	88299	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	53017345	53017570	53017451	Y	TOM1L1	TOM1L1,STXBP4,COX11	NA	NA	NA	NA	STXBP4	26518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	53654184	53654435	53654393	Y	NA	NA	PCTP	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM100	153047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	54263832	54264049	54263912	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOG	405011	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	54367618	54367784	54367724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NOG	301276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	54674985	54675165	54675040	Y	NA	NOG	NA	NA	NA	NA	NOG	5925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	54857276	54857441	54857296	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKE	52019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	55947370	55947506	55947438	Y	NA	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	21953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr17	56015325	56015755	56015655	Y	CUEDC1	CUEDC1,VEZF1	VEZF1,CUEDC1,SRSF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	14929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	56025910	56026308	56026041	Y	SUPT4H1	CUEDC1,VEZF1	NA	NA	NA	NA	CUEDC1	4376	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	56161643	56161969	56161895	Y	VEZF1,MTMR4	DYNLL2	NA	NA	NA	NA	DYNLL2	2867	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	56587640	56587744	56587729	Y	PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4	MTMR4,SEPT4	NA	NA	NA	NA	MTMR4	5522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	56736656	56737064	56736885	Y	MTMR4,SEPT4,SEPT4,PPM1E	RNU1-60P,RNU1-85P,RAD51C	SEPT4,C17orf47	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RNU1-60P	1990	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	57231530	57231848	57231723	Y	NA	TRIM37,SKA2,PRR11	NA	NA	NA	NA	PRR11	670	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	57841314	57841767	57841379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	58327	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57844650	57844791	57844732	Y	YPEL2	NA	NA	NA	NA	NA	PTRH2	61663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57860256	57860659	57860446	Y	DHX40,VMP1,CA4	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	55968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57863159	57864676	57863979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR21	51951	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57904186	57904344	57904253	Y	VMP1,CA4	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	12283	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57905350	57905555	57905420	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	11072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57906379	57907270	57906882	Y	RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	9357	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr17	57907420	57907736	57907558	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	8891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57908316	57908645	57908515	Y	NA	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	7982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57929068	57929265	57929192	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	12441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	57932982	57933345	57933242	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	MIR21	16355	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	58468371	58468697	58468395	Y	BCAS3,RNFT1,CA4,PPM1D,USP32	USP32	NA	NA	NA	NA	USP32	29134	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	58678620	58678973	58678714	Y	PPM1D	PPM1D	NA	NA	NA	NA	PPM1D	3076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	59488217	59488528	59488332	Y	NA	TBX2	NA	NA	NA	NA	TBX2	12960	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	60141349	60141594	60141514	Y	NACA2,MED13	MED13	INTS2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED13	706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	60729712	60730300	60729931	Y	NA	MRC2	NA	NA	NA	NA	MRC2	26950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	60856273	60856623	60856561	Y	EFCAB3	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	153511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	60868640	60868941	60868827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	60897286	60897580	60897414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	194524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	61279197	61279372	61279284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	242367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	61639369	61639739	61639552	Y	NA	KCNH6,DCAF7,TACO1	NA	NA	NA	NA	DCAF7	13547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	62612826	62613207	62613064	Y	NA	SMURF2	NA	NA	NA	NA	SMURF2	42979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	62675748	62676312	62676051	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2,LOC146880	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMURF2	19562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr17	62703261	62703596	62703473	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	47075	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	62705157	62705447	62705234	Y	SMURF2	SMURF2	SMURF2	IMR90	Hi-C	24141950	SMURF2	48971	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	62773066	62773435	62773116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1P	57837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	62985207	62985536	62985392	Y	DDX5,CEP95,GNA13	AMZ2P1	NA	NA	NA	NA	AMZ2P1	15513	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	63038886	63039290	63039133	Y	GNA13	GNA13	NA	NA	NA	NA	GNA13	11667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	63646847	63647018	63646933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	91082	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	63911055	63911226	63911141	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	274976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	64194072	64194322	64194164	Y	NA	CEP112	NA	NA	NA	NA	CEP112	7870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	64455929	64456369	64456061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	159175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	64536278	64536639	64536325	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	239524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	64544411	64544774	64544437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKCA	247657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	64708425	64708706	64708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	250320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	64714382	64714708	64714545	Y	PRKCA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG4	244318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	64961597	64961937	64961768	Y	CACNG4	CACNG4	NA	NA	NA	NA	CACNG4	2571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	65242250	65242562	65242536	Y	NA	HELZ,SNORA8	NA	NA	NA	NA	HELZ	2145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	66016045	66016315	66016119	Y	NA	C17orf58,KPNA2	BPTF,C17orf58,KPNA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KPNA2	13320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	66694330	66694724	66694542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM20A	98800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	67315191	67315526	67315500	Y	NA	ABCA5	NA	NA	NA	NA	ABCA5	5859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	67603336	67603572	67603425	Y	NA	NA	KCNJ16,KCNJ2,KCNJ2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	194497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	67757945	67758523	67758299	Y	KCNJ2	NA	KCNJ16,KCNJ2-AS1,KCNJ2,MAP2K6	IMR90	Hi-C	24141950	MAP2K6	349106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	68309642	68309948	68309717	Y	KCNJ2	NA	NA	NA	NA	NA	KCNJ2	146828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	69068010	69068257	69068112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOC124685	546862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	69617489	69617539	69617508	Y	NA	LOC124685	LOC100499467	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	2370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	69629735	69629997	69629863	Y	NA	LOC124685	LOC100499467,LINC00511	IMR90	Hi-C	24141950	LOC124685	14616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	70335121	70335458	70335290	Y	NA	NA	LOC100499467,SOX9	IMR90	Hi-C	24141950	SOX9	219960	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	70412502	70412837	70412669	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	208533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	70417215	70417683	70417549	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	203687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	70442621	70442708	70442666	Y	SOX9	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	178662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	70462396	70462597	70462589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P33	158773	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	71152430	71152655	71152530	Y	C17orf80,SSTR2	COG1	NA	NA	NA	NA	COG1	34474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	71287548	71287861	71287762	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	18453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	71301216	71301553	71301269	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	4761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	71304431	71304616	71304518	Y	NA	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	1698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	71305759	71306422	71306099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	71336325	71336719	71336454	Y	NA	CDC42EP4	CDC42EP4	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDC42EP4	30011	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	71339324	71339501	71339471	Y	SSTR2,CDC42EP4	CDC42EP4	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	33010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	71603632	71603970	71603800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	297318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	71639437	71639585	71639501	Y	SDK2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP4	333123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	72745955	72746124	72746086	Y	NA	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	SLC9A3R1	3164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	72782605	72783105	72782848	Y	CD300A,CD300LB,CD300C,CD300E,CD300LF,RAB37,RAB37,SLC9A3R1,SLC16A5,GGA3,TMEM104	SLC9A3R1,NAT9,TMEM104	NA	NA	NA	NA	TMEM104	11983	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	73009835	73009966	73009891	Y	NA	CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H	NA	NA	NA	NA	ICT1	3070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	73120387	73120767	73120528	Y	GRB2,GRB2,CD300LF,HN1,HN1,SLC16A5,NT5C	SLC16A5,ARMC7,NT5C,HN1	NA	NA	NA	NA	NT5C	5123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	73167917	73168048	73167983	Y	NA	NT5C,HN1,SUMO2,NUP85	HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HN1	5541	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	73333353	73333637	73333600	Y	H3F3B,GRB2,GRB2,GGA3	SLC25A19,AC011933.1	NA	NA	NA	NA	AC011933.1	19943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	73426423	73426691	73426652	Y	MRPS7	GRB2,KIAA0195	NA	NA	NA	NA	KIAA0195	8549	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	73696530	73696897	73696707	Y	SAP30BP,ITGB4,ITGB4	SAP30BP,RECQL5,ITGB4	NA	NA	NA	NA	ITGB4	18511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	73805010	73805399	73805102	Y	NA	GALK1,UNK,H3F3B,WBP2	NA	NA	NA	NA	H3F3B	25036	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	73850621	73850811	73850693	Y	GRB2,GRB2,SAP30BP,H3F3B,FAM100B,EVPL,ACOX1,UNC13D,WBP2,TRIM47	WBP2,TRIM47,TRIM65	NA	NA	NA	NA	WBP2	33	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	73891396	73891618	73891569	Y	NA	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38,FBF1	NA	NA	NA	NA	TRIM65	312	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	74117633	74117738	74117682	Y	NA	EXOC7	NA	NA	NA	NA	EXOC7	1976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	74189615	74189996	74189806	Y	RNF157	ATF4P3,RNF157	NA	NA	NA	NA	ATF4P3	30891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	74496062	74496568	74496378	Y	FAM100B,SPHK1,SPHK1,ST6GALNAC2,JMJD6,RHBDF2,RHBDF2	UBE2O,RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	RHBDF2	190	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	74583031	74583415	74583256	Y	NA	CYGB,SNORD1B,ST6GALNAC2	NA	NA	NA	NA	ST6GALNAC2	1993	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr17	75118026	75118235	75118074	Y	NA	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	37228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	75120383	75120864	75120582	Y	JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1	LINC00338,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	39585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	75199050	75199385	75199187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	118252	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75251434	75251777	75251766	Y	NA	NA	SEPT9,SRSF2,METTL23,MFSD11,SEC14L1,MGAT5B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00338,SEC14L1	170636	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75281264	75281453	75281354	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	200466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	201013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr17	75284936	75285118	75285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	204138	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	237408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238230	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	238872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	75402047	75402301	75402134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	321249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75461802	75462176	75461947	Y	SEC14L1,SEC14L1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00338,SEC14L1	381004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75830749	75830836	75830793	Y	TMC8,TMC6	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90	Hi-C	24141950	TNRC6C	167413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	TNRC6C	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNRC6C	43453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	8.0321318892405
chr17	76165603	76166001	76165654	Y	SYNGR2	SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5	NA	NA	NA	NA	SYNGR2	2964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76310071	76310633	76310436	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	PGS1,DNAH17,SOCS3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SOCS3	43525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	76312866	76313241	76313131	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76313584	76313890	76313792	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	SOCS3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SOCS3	40268	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76325206	76325964	76325662	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	28194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76337607	76338208	76338068	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	15950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76339301	76339497	76339364	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	14661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76348964	76349371	76349046	Y	USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	4787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76356993	76357093	76357047	Y	SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	2835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76357167	76357466	76357379	Y	NA	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	SOCS3	3009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76371853	76372298	76372087	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	SOCS3	K562	ChIA-PET	22265404	PGS1	423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	76382008	76383398	76383057	Y	USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3,PGS1	NA	NA	NA	NA	PGS1	9287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76858403	76858717	76858585	Y	PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36	USP36	NA	NA	NA	NA	USP36	22880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76879007	76879631	76879400	Y	CYTH1,ENGASE,CANT1,USP36	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	76879876	76880180	76879977	Y	NA	USP36,TIMP2	NA	NA	NA	NA	TIMP2	39289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	76929562	76929807	76929665	Y	CANT1	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	76930060	76930674	76930419	Y	NA	TIMP2,LGALS3BP	TIMP2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TIMP2	10591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	77032690	77033106	77032818	Y	CYTH1,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	15794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	77034665	77035262	77034914	Y	CYTH1,USP36,ENGASE	CANT1,C1QTNF1,ENGASE	NA	NA	NA	NA	C1QTNF1	17769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	78121490	78121818	78121740	Y	NA	GAA,EIF4A3	NA	NA	NA	NA	EIF4A3	2508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	78228476	78228940	78228764	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	3725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	78238527	78238862	78238699	Y	GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213	SLC26A11,SGSH,RNF213	NA	NA	NA	NA	RNF213	5862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr17	78524165	78524352	78524226	Y	NA	RPL32P31,RPTOR	NA	NA	NA	NA	RPTOR	7546	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	78806684	78807307	78807121	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	156091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	78962835	78962976	78962910	Y	NA	CHMP6,BAIAP2	NA	NA	NA	NA	CHMP6	422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79017666	79018027	79017910	Y	AZI1,BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	10718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr17	79018501	79018654	79018571	Y	BAIAP2	BAIAP2	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	11553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	79369574	79370687	79370597	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	102227	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79397073	79397461	79397298	Y	MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	80628	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79451287	79451558	79451462	Y	AATK,AZI1,BAHCC1	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.1	26531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79482562	79482804	79482728	Y	NA	RP13-766D20.1,RP13-766D20.2,ACTG1,C17orf70	NA	NA	NA	NA	RP13-766D20.2	3489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79698331	79698466	79698406	Y	TMEM105	HGS,ARL16,MRPL12,SLC25A10	NA	NA	NA	NA	SLC25A10	29927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	79979263	79979824	79979465	Y	NA	ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L	NA	NA	NA	NA	LRRC45	85	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	80245965	80246238	80246057	Y	MAFG,MAFG,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SECTM1	CSNK1D,SLC16A3,CCDC57,TEX19,C17orf101,SECTM1,HEXDC	IMR90	Hi-C	24141950	CSNK1D	16358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	80255299	80255755	80255478	Y	SIRT7,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7	CSNK1D,SECTM1	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	25692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	80454894	80455238	80455175	Y	LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF	C17orf62,NARF,FOXK2	NA	NA	NA	NA	FOXK2	20351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	80546229	80546455	80546368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK2	70640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	81066773	81067186	81066924	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	81067352	81067511	81067418	Y	NA	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	31785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr17	81147237	81149188	81147763	Y	METRNL	NA	METRNL,B3GNTL1,TBCD	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	111670	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr17	81150899	81151424	81151082	Y	METRNL	NA	METRNL	MCF7	ChIA-PET	22265404	METRNL	115332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	235900	236290	236249	Y	NA	THOC1	NA	NA	NA	NA	THOC1	29760	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	395862	395959	395924	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC12	102763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	494806	494991	494899	Y	NA	COLEC12	NA	NA	NA	NA	COLEC12	3731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	666183	666708	666437	Y	THOC1,YES1,ENOSF1,ENOSF1	TYMS,C18orf56,ENOSF1	NA	NA	NA	NA	C18orf56	9843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	781638	782117	782009	Y	NA	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	28430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	813044	813594	813404	Y	YES1	YES1	NA	NA	NA	NA	YES1	2497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	830446	830703	830580	Y	NA	YES1	CLUL1,ENOSF1,YES1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YES1	19899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	1192820	1193070	1192907	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YES1	382273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	2302701	2302761	2302738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL4	266747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	3250721	3251122	3250738	Y	NA	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	3594733	3596177	3595596	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	185127	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr18	3639477	3639730	3639610	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	229871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	3794813	3795294	3795021	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	385207	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr18	5463205	5463732	5463541	Y	EPB41L3	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L3	164967	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	8750933	8751304	8751068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	143490	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	9017601	9018155	9017805	Y	NA	NA	CCDC165,ANKRD12,RALBP1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	82473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	9548277	9548390	9548335	Y	ANKRD12,VAPA,RAB31,PPP4R1	NA	NA	NA	NA	NA	PPP4R1	64848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	9824351	9824715	9824532	Y	PPP4R1,VAPA,RAB31	NA	TXNDC2,VAPA	IMR90	Hi-C	24141950	VAPA	87284	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	9914998	9915501	9915128	Y	PPP4R1,RAB31,VAPA	VAPA	NA	NA	NA	NA	VAPA	2999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	11005597	11005922	11005792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAPG	481695	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	12048672	12049055	12049000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IMPA2	69648	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	8.70147621334388
chr18	12679329	12679437	12679359	Y	NA	AP005482.1,SPIRE1,PSMG2,CEP76	NA	NA	NA	NA	CEP76	21339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	12864190	12864369	12864245	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN2	63273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	19746222	19746392	19746310	Y	GATA6	GATA6	NA	NA	NA	NA	GATA6	1012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	20131932	20132167	20132050	Y	NA	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	244057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	20138967	20139156	20139093	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	237068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	20139802	20140256	20140003	Y	GATA6	NA	CTAGE1,GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	235968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr18	20254145	20254527	20254453	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	121697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	21173695	21174031	21173886	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	8833	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	21228672	21228807	21228737	Y	LAMA3,ANKRD29	ANKRD29	NA	NA	NA	NA	ANKRD29	12042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr18	21780839	21781231	21781002	Y	OSBPL1A	NA	NA	NA	NA	NA	CABYR	63897	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	23609881	23610142	23609962	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SS18	59039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	25754926	25755429	25755157	Y	CDH2	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr18	26745136	26745536	26745463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	989726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	29092491	29092685	29092630	Y	DSC3,DSC2,DSG1,DSG2	DSG2	NA	NA	NA	NA	DSG2	16485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	32239709	32239834	32239782	Y	MAPRE2,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA,DTNA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	168455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	32289089	32289403	32289194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTNA	217835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	33350438	33350641	33350529	Y	ZNF24,ZNF396,INO80C	NA	NA	NA	NA	NA	GALNT1	191357	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	33711406	33711801	33711526	Y	NA	SLC39A6,ELP2	NA	NA	NA	NA	ELP2	3999	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	38457094	38457422	38457201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3C3	1075749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	43250326	43250536	43250381	Y	EPG5	NA	NA	NA	NA	NA	SIGLEC15	152941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	43363455	43363582	43363533	Y	NA	SIGLEC15	SIGLEC15,EPG5,SLC14A1,SLC14A2	IMR90	Hi-C	24141950	SIGLEC15	39895	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	43407687	43408063	43407797	Y	PSTPIP2,EPG5	SIGLEC15	NA	NA	NA	NA	SIGLEC15	4210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	43543003	43543287	43543010	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	1953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	43582956	43583166	43583086	Y	PSTPIP2,EPG5	EPG5	NA	NA	NA	NA	EPG5	37716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	43608916	43609273	43609243	Y	PSTPIP2,EPG5	PSTPIP2	NA	NA	NA	NA	PSTPIP2	40965	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	43732950	43733330	43733193	Y	RNF165,C18orf25	C18orf25	NA	NA	NA	NA	C18orf25	18189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	44370223	44370563	44370393	Y	RNF165,PIAS2	NA	NA	NA	NA	NA	PIAS2	127560	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	45454827	45455289	45455128	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	45494348	45494736	45494572	Y	NA	SMAD2	NA	NA	NA	NA	SMAD2	38833	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	45687716	45687836	45687757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr18	45688048	45688324	45688110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD2	232533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	46066779	46067121	46067052	Y	CTIF	CTIF	NA	NA	NA	NA	CTIF	3362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr18	46254756	46255278	46254982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	191339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	46456597	46456819	46456703	Y	SMAD7,SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	393180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr18	47325286	47325511	47325399	Y	NA	ACAA2	NA	NA	NA	NA	ACAA2	12819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	52490491	52490717	52490508	Y	RAB27B	NA	RAB27B	MCF7	ChIA-PET	22265404	RAB27B	107400	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	52504794	52504822	52504808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC68	119917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	55102016	55102207	55102112	Y	ONECUT2	ONECUT2	NA	NA	NA	NA	ONECUT2	1099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	55381917	55382196	55382152	Y	NEDD4L	NA	NA	NA	NA	NA	ATP8B1	86137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	55480522	55480777	55480650	Y	NA	ATP8B1	ATP8B1,NEDD4L,LOC100505549	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP8B1	12189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	55863542	55863917	55863628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	153943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	55880754	55881007	55880894	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	55881305	55881780	55881408	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	171706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr18	55889534	55890049	55889817	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4L	179935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	56199819	56200128	56199981	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD28	65735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	56339458	56339877	56339543	Y	MALT1	ALPK2,MALT1	NA	NA	NA	NA	MALT1	2840	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr18	57386849	57386991	57386920	Y	NA	CCBE1,RPS26P54	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	CCBE1	24237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	57482239	57482409	57482315	Y	NA	NA	CCBE1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P54	55449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	57566379	57566616	57566437	Y	NA	PMAIP1	NA	NA	NA	NA	PMAIP1	1199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	59766177	59766307	59766242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PIGN	86044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	60193382	60194139	60194065	Y	KIAA1468,PHLPP1,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	5142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	60941193	60941490	60941349	Y	BCL2	BCL2	NA	NA	NA	NA	BCL2	43871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	61033511	61033750	61033687	Y	NA	BCL2,KDSR	NA	NA	NA	NA	KDSR	768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	NA	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB7	67289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	61549169	61549580	61549348	Y	VPS4B,SERPINB8,SERPINB2	SERPINB2	SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB2	12243	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	65434285	65434424	65434346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	252068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	72782580	72783607	72783115	Y	ZNF407,ZADH2,TSHZ1	NA	NA	NA	NA	NA	ZADH2	135696	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	73233894	73234003	73233962	Y	C18orf62	NA	ZNF407	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ1	313184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74162277	74162639	74162448	Y	ZNF516	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	42507	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74171783	74172228	74172071	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	32918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	74204839	74205357	74205296	Y	NA	RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74292470	74292738	74292612	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	86993	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74409297	74409534	74409399	Y	NA	NA	ZNF516	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-17M16.1	203820	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74815308	74815668	74815588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	609831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74816269	74816488	74816400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	610792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74821198	74821567	74821500	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	615721	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74829789	74830209	74830033	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	624312	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74830215	74830809	74830560	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	624738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74837664	74837983	74837939	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	632187	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	74840794	74841428	74841367	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	635317	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	75149077	75149342	75149210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	943600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	76831132	76831674	76831321	Y	NFATC1,NFATC1,ATP9B	ATP9B	NA	NA	NA	NA	ATP9B	3847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	77327843	77328066	77328013	Y	NA	NA	NFATC1,ATP9B	IMR90	Hi-C	24141950	CTDP1	109735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr18	77721815	77722347	77722078	Y	PQLC1	PQLC1,HSBP1L1	NA	NA	NA	NA	HSBP1L1	214	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr18	78004258	78004625	78004566	Y	PARD6G	PARD6G	NA	NA	NA	NA	PARD6G	829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	485856	486161	485966	Y	PALM,HCN2,FGF22,C2CD4C,SHC2	SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34	ODF3L2,SHC2	MCF7	ChIA-PET	22265404	MADCAM1	1015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	753188	753320	753238	Y	C19orf20	PALM,PTBP1,MIR4745	NA	NA	NA	NA	PTBP1	41755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	782330	783005	782707	Y	NA	PTBP1,MIR4745,MIR3187	NA	NA	NA	NA	PTBP1	12070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr19	1028160	1028923	1028240	Y	SBNO2,SBNO2,MIDN,HMHA1,CIRBP,CDC34,GZMM,RNF126,C19orf22,C19orf6,CNN2,ABCA7	WDR18,RNU6-2,CNN2,ABCA7,HMHA1	NA	NA	NA	NA	CNN2	3862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	1133542	1133865	1133752	Y	C19orf22,ARID3A,C19orf6,ABCA7,MIDN,CIRBP,HMHA1,SBNO2,SBNO2	POLR2E,GPX4,SBNO2	NA	NA	NA	NA	GPX4	31606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1161691	1161983	1161922	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	10299	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1169743	1170349	1170015	Y	NA	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	1933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	1172839	1173266	1172915	Y	CFD,ATP5D,GPX4,GPX4	SBNO2,STK11	NA	NA	NA	NA	SBNO2	557	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1213863	1214369	1213961	Y	NA	SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP	NA	NA	NA	NA	C19orf26	21657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	1240232	1240534	1240365	Y	MUM1,APC2,C19orf26	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	ATP5D	483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1260732	1261171	1260912	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	CIRBP	3348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1265810	1266064	1265967	Y	C19orf6,HMHA1,SBNO2,SBNO2,MIDN,CIRBP	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6962	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	1445282	1445452	1445336	Y	C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2	GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,REEP6	NA	NA	NA	NA	RPS15	8924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	2061356	2061737	2061654	Y	SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	12113	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	2167436	2167667	2167594	Y	CSNK1G2,GADD45B,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	4972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	2168320	2168637	2168529	Y	REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L	DOT1L,AP3D1	NA	NA	NA	NA	AP3D1	5856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	2494705	2495117	2494880	Y	DOT1L,GADD45B	LMNB2,GADD45B	NA	NA	NA	NA	GADD45B	20585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	2540691	2541097	2540881	Y	TIMM13	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	66571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	2627461	2627884	2627646	Y	DOT1L,OAZ1,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GNG7	72823	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	3035530	3035851	3035686	Y	NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2	TLE2,AES	NA	NA	NA	NA	TLE2	9782	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	3177322	3177366	3177344	Y	AES,S1PR4	NCLN	NA	NA	NA	NA	NCLN	6195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	3360183	3360356	3360294	Y	TLE2,TLE2,TLE2,AES,CELF5,CELF5,MATK,FZR1,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	2622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	3360896	3361804	3361247	Y	NA	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	3335	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	3562421	3562565	3562489	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	HMG20B	8210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	3603456	3603548	3603535	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	1290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	3607748	3607951	3607883	Y	NA	HMG20B,MFSD12,TBXA2R	NA	NA	NA	NA	TBXA2R	2910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	3655813	3656105	3655965	Y	NA	PIP5K1C	NA	NA	NA	NA	PIP5K1C	42372	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	4053092	4053572	4053301	Y	CCDC94,ZBTB7A	PIAS4,ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	11371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	4123124	4123351	4123249	Y	MATK,ZFR2,ATCAY	MAP2K2	NA	NA	NA	NA	MAP2K2	998	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	4636294	4636441	4636384	Y	ANKRD24,SH3GL1,SH3GL1,SEMA6B,TICAM1,TNFAIP8L1,TNFAIP8L1	TNFAIP8L1,C19orf10	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8L1	1089	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	4744883	4745173	4745028	Y	NA	DPP9,FEM1A	DPP9,UHRF1,MIR7-3HG,ARRDC5,PLIN3	IMR90	Hi-C	24141950	DPP9	22198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	4912030	4912419	4912247	Y	NA	PLIN3,UHRF1	NA	NA	NA	NA	UHRF1	10938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	5139337	5139604	5139434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL32P34	136141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	6071128	6071397	6071200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	94975	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	6273754	6274259	6273940	Y	VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	3700	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	6577471	6577956	6577654	Y	DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70	TNFSF9,CD70	NA	NA	NA	NA	CD70	24158	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	6802447	6802718	6802569	Y	DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1	NA	NA	NA	NA	NA	TRIP10	66511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	7197339	7197547	7197388	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INSR	94498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	7483723	7483869	7483787	Y	NA	ARHGEF18	NA	NA	NA	NA	ARHGEF18	25724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	7525376	7525563	7525475	Y	NA	C19orf45,PEX11G	NA	NA	NA	NA	C19orf45	30299	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	9758216	9758505	9758322	Y	ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF846	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF562	25271	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	9896233	9896620	9896495	Y	ZNF266,COL5A3,ZNF846	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	FBXL12	39872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	9937602	9937876	9937738	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	UBL5	1034	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	10532501	10532989	10532676	Y	ICAM1,C19orf38,TYK2,PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	20287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	10728527	10728590	10728559	Y	NA	SLC44A2,ILF3	NA	NA	NA	NA	SLC44A2	17394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	11202212	11202837	11202668	Y	ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR	LDLR	NA	NA	NA	NA	LDLR	4174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	11404382	11404791	11404593	Y	ACP5,ACP5,C19orf38,LPPR2,CCDC159	DOCK6,CCDC159	NA	NA	NA	NA	DOCK6	33225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	11449020	11449400	11449210	Y	NA	CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR	NA	NA	NA	NA	CCDC159	3960	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	11592904	11593323	11593025	Y	ZNF491,ZNF441,CCDC151,ELAVL3,ZNF653	PRKCSH,CCDC151,ZNF653,ECSIT	NA	NA	NA	NA	ZNF653	21415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	11642939	11643084	11643012	Y	CCDC159	ZNF653,ECSIT,CNN1,ELOF1,ZNF627	NA	NA	NA	NA	CNN1	4448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	11925678	11926080	11925867	Y	NA	ZNF441,ZNF491,ZNF440,ZNF439	NA	NA	NA	NA	ZNF440	2579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	12892961	12894040	12893343	Y	ZNF44,ZNF564,ZNF791,MAN2B1,C19orf43,DNASE2,JUNB	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A,MAST1	NA	NA	NA	NA	JUNB	6270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	12899457	12901460	12900777	Y	NA	PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN	NA	NA	NA	NA	JUNB	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	13123653	13124120	13123822	Y	WDR83,TNPO2,TNPO2,NFIX,CACNA1A	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	19231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	13164647	13164970	13164763	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	47005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	13166882	13167358	13167036	Y	NA	LYL1	NA	NA	NA	NA	LYL1	44617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	LYL1,TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	13273540	13274187	13273840	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	14311	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	13907523	13907866	13907763	Y	NA	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	3249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	13917794	13918010	13917903	Y	RFX1,ZSWIM4,NANOS3	MRI1,C19orf53,ZSWIM4	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	13520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	13972364	13973309	13972780	Y	CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4	CC2D1A,C19orf57	NA	NA	NA	NA	CC2D1A	41705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	14528800	14529217	14529142	Y	ZNF333,EMR2,DCAF15,RFX1,IL27RA,PKN1,DNAJB1,CD97,DDX39A	CD97,DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	DDX39A	608	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	14545712	14545849	14545765	Y	NDUFB7,PKN1	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	3847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	14545997	14546246	14546106	Y	NA	DDX39A,PKN1	NA	NA	NA	NA	PKN1	4132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	14616908	14617174	14617017	Y	GIPC1	GIPC1,TECR,DNAJB1	GIPC1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TECR	8723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	15334094	15334476	15334286	Y	SLC1A6,WIZ	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	24302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	16441306	16441578	16441415	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	7678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	16449802	16450158	16449980	Y	NA	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	16174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	16452764	16452992	16452877	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	19136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	16482225	16482879	16482589	Y	MED26,KLF2	KLF2	NA	NA	NA	NA	KLF2	48597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	17202504	17202759	17202710	Y	MED26,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	17913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	17604234	17604409	17604322	Y	NA	SLC27A1,PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	16029	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	17667126	17667426	17667289	Y	MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1	PGLS	NA	NA	NA	NA	PGLS	46688	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18133045	18133309	18133130	Y	FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	73294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	18155923	18156099	18156029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAST3	50504	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18402387	18403564	18402535	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	MIR3188	11500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	18485152	18485556	18485412	Y	ARRDC2,ARRDC2,IFI30,ELL,LRRC25	PGPEP1,GDF15,SSBP4	NA	NA	NA	NA	GDF15	1611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18526337	18526644	18526408	Y	CCDC124,IFI30,KLHL26,CRLF1,C19orf60,C19orf50,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	1030	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18527701	18528040	18527800	Y	KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	27	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	18528263	18528792	18528577	Y	UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4	GDF15,SSBP4,ISYNA1	NA	NA	NA	NA	SSBP4	589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	19078398	19078892	19078760	Y	ELL,GATAD2A,HOMER3	DDX49,HOMER3	NA	NA	NA	NA	HOMER3	28328	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	19143307	19143510	19143378	Y	DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6	ARMC6,SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SUGP2	475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	19248225	19248392	19248286	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	19248583	19248716	19248628	Y	NA	TMEM161A	NA	NA	NA	NA	TMEM161A	1261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	20606211	20606644	20606560	Y	ZNF90	ZNF826P	NA	NA	NA	NA	ZNF826P	436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	21404645	21404837	21404781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7AP10	73404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	22715195	22715609	22715437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF492	99517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	28270762	28271411	28271062	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1431037	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	28463343	28463461	28463402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	1238987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	28917737	28917979	28917845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	784469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	29109267	29109431	29109349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UQCRFS1	593017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	30447917	30448294	30448014	Y	NA	URI1	NA	NA	NA	NA	URI1	35366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	31618618	31618806	31618712	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	219647	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	31631644	31631911	31631778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	206542	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	33750621	33750673	33750623	Y	CEBPA	CEBPA	CHST8,PEPD,LOC80054,CEBPA	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPA	40797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	33789888	33790286	33790087	Y	NA	CEBPA	NA	NA	NA	NA	CEBPA	1184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	34310855	34311133	34311012	Y	NA	KCTD15	NA	NA	NA	NA	KCTD15	26017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	34396925	34397389	34397012	Y	NA	NA	KCTD15	MCF7	ChIA-PET	22265404	KCTD15	112087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	34625713	34625998	34625854	Y	PDCD2L	LSM14A	CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD	IMR90	Hi-C	24141950	LSM14A	35411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	34760936	34761338	34761013	Y	LSM14A,KIAA0355	KIAA0355,RPL29P33	NA	NA	NA	NA	KIAA0355	17494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	35643836	35643967	35643905	Y	FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4	FXYD7,FXYD5	NA	NA	NA	NA	FXYD5	203	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	35809679	35810380	35810036	Y	GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3	NA	NA	NA	NA	NA	USF2	51798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	36618643	36619171	36618835	Y	NA	TBCB,POLR2I,CAPNS1	NA	NA	NA	NA	CAPNS1	9306	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	36720266	36720641	36720459	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF260,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	14518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	36882143	36882391	36882267	Y	NA	ZFP14,ZFP82	NA	NA	NA	NA	ZFP14	14042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	37246589	37246720	37246657	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	15007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	37262228	37262609	37262419	Y	NA	ZNF850	NA	NA	NA	NA	ZNF850	501	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	38433320	38433698	38433507	Y	ZNF569,ZNF570,ZNF793,ZFP30,ZNF607,ZNF607,ZNF573,DPF1,DPF1	WDR87,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	37452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	38482400	38482784	38482644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	86532	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	38490005	38490506	38490269	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	94137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr19	38493976	38494435	38494152	Y	YIF1B,YIF1B,SPRED3,PSMD8,SIPA1L3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	98108	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	38495647	38495987	38495738	Y	SPRED3	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	99779	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	38526416	38526577	38526519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIPA1L3	130548	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	38575229	38575296	38575264	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPF1	143058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	39184148	39184440	39184342	Y	C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	47859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	39564346	39564568	39564426	Y	ZFP36,HNRNPL,NFKBIB	FBXO27,PAPL,PAK4	PAPL,SAMD4B,GMFG,LRFN1	IMR90	Hi-C	24141950	PAPL	7985	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	39831946	39832143	39832027	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29	NA	NA	NA	NA	SAMD4B	910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	39894353	39894945	39894613	Y	GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,SUPT5H,SUPT5H,PLEKHG2	PAF1,MED29,ZFP36,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H	NA	NA	NA	NA	ZFP36	508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	41108162	41108528	41108432	Y	NA	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	11373	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	41109606	41110134	41110046	Y	SERTAD1,ITPKC,EGLN2,EGLN2,C19orf54,ADCK4,SHKBP1	SHKBP1,LTBP4	NA	NA	NA	NA	LTBP4	12817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.34672162051688
chr19	41731541	41731893	41731762	Y	NA	CYP2S1,AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	8433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	41771602	41771660	41771636	Y	CEACAM4,CEACAM21,RAB4B,EGLN2,EGLN2,TMEM91,TMEM91,TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	AXL,HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	HNRNPUL1	5201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	42493914	42494230	42494205	Y	TMEM145,MEGF8,GRIK5,ATP1A3	RABAC1,ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	5419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	42784527	42784991	42784716	Y	ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8	GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8	NA	NA	NA	NA	CIC	13838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	42925830	42926271	42926103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGF8	98069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	43241725	43242137	43241944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSG1	139837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	43267088	43267316	43267247	Y	CEACAM1,PSG5	NA	NA	NA	NA	NA	PSG1	114658	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	43355116	43355369	43355287	Y	NA	PSG1	NA	NA	NA	NA	PSG1	26605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	43380742	43381113	43380927	Y	PSG5	PSG1,PSG6	PSG10P	IMR90	Hi-C	24141950	PSG1	861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	43469411	43469727	43469501	Y	NA	PSG6	PSG2	IMR90	Hi-C	24141950	PSG6	47696	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	43525971	43526126	43526036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSG6	104256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	43624762	43624964	43624855	Y	NA	NA	PSG5,PSG9	IMR90	Hi-C	24141950	PSG5	63724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	43770053	43770115	43770084	Y	NA	CEACAMP10	NA	NA	NA	NA	CEACAMP10	19255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	43835548	43835842	43835742	Y	NA	NA	TEX101	IMR90	Hi-C	24141950	CEACAMP10	84750	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	44152096	44152277	44152103	Y	ZNF222,PLAUR,KCNN4,C19orf61,IRGQ	ZNF428,CADM4,PLAUR	CADM4	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	CADM4	10105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	44269192	44269953	44269534	Y	IRGQ,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4	NA	NA	NA	NA	SMG9	12050	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	44281524	44282142	44281780	Y	IRGQ,ZNF230,ZNF222,PLAUR,C19orf61,KCNN4	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	1267	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	44288540	44288860	44288798	Y	NA	SMG9,KCNN4,ZNF283	NA	NA	NA	NA	KCNN4	5131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	45248499	45249479	45248793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	45256546	45257099	45256742	Y	ZNF296,RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	NA	NA	NA	NA	BCL3	7584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	45350775	45351289	45350997	Y	BCL3,PVRL2,RELB	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	3343	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	45393623	45393866	45393750	Y	ZNF285,ZNF180,GEMIN7,GEMIN7,CLASRP,TOMM40	PVRL2,TOMM40,APOE	NA	NA	NA	NA	TOMM40	1797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	45755637	45756189	45755812	Y	RELB,CLASRP,VASP	NA	NA	NA	NA	NA	BLOC1S3	75634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	45879605	45879880	45879744	Y	NA	KLC3,ERCC2,CD3EAP,PPP1R13L	NA	NA	NA	NA	ERCC2	7429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46011701	46012269	46011904	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	3864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46012498	46012899	46012640	Y	FBXO46,CLASRP,ZNF296,BLOC1S3,VASP	FOSB,ERCC1,PPM1N,VASP	NA	NA	NA	NA	VASP	4661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	46133845	46134220	46134022	Y	NANOS2,IGFL4,NKPD1,EXOC3L2	OPA3,EML2	NA	NA	NA	NA	EML2	12667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46361761	46362096	46361929	Y	NA	SYMPK,IRF2BP1,MYPOP	NA	NA	NA	NA	SYMPK	2452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46665382	46665717	46665592	Y	NA	IGFL3,IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	21019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	IGFL2	NA	NA	NA	NA	IGFL2	39593	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	46907328	46907649	46907570	Y	NA	CCDC8	NA	NA	NA	NA	CCDC8	7192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	47234783	47235117	47235027	Y	PTGIR,ZC3H4,PRKD2,STRN4	PRKD2,FKRP,STRN4	NA	NA	NA	NA	FKRP	12186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	47363167	47364689	47363471	Y	PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35	AP2S1	SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	AP2S1	10918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	47613231	47613789	47613256	Y	PRKD2,STRN4,NAPA,GPR77,DHX34,CCDC9,C5AR1,BBC3,ZC3H4	SAE1,ZC3H4	TMEM160,NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	SAE1	742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	47662714	47662828	47662771	Y	NA	SAE1,ZC3H4	NA	NA	NA	NA	ZC3H4	47705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9	NA	NA	NA	NA	CCDC9	19511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	48629286	48629473	48629353	Y	NA	PLA2G4C,LIG1,ZNF114	NA	NA	NA	NA	PLA2G4C	17212	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	48996099	48996379	48996219	Y	NA	GRWD1,CYTH2	NA	NA	NA	NA	CYTH2	25810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	49430301	49430612	49430410	Y	IZUMO1,PPP1R15A,FTL	NUCB1,DHDH,BAX,FTL	NA	NA	NA	NA	DHDH	4327	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	49466802	49467527	49467169	Y	IZUMO1,PPP1R15A,CD37,FTL	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	FTL	244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	49482120	49482542	49482303	Y	FUT1,C19orf73	DHDH,BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	12025	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	49493898	49494273	49494153	Y	NA	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	GYS1	294	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	49495555	49495708	49495609	Y	SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4	BAX,FTL,GYS1,RUVBL2	NA	NA	NA	NA	RUVBL2	850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	49775600	49775657	49775630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-301O7.4	66208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	50872495	50872846	50872654	Y	NA	NR1H2,POLD1	NA	NA	NA	NA	POLD1	12615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	51012062	51012382	51012222	Y	KLK6,SYT3,SHANK1	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	51059944	51060288	51060130	Y	NA	JOSD2	NA	NA	NA	NA	JOSD2	47334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	51287900	51288107	51288100	Y	NA	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	18079	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	51339255	51339614	51339393	Y	KLK14,IGLON5,LRRC4B,SYT3,SYT3	C19orf48	NA	NA	NA	NA	C19orf48	33069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	112596	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr19	52192842	52193550	52192951	Y	ZNF615,IGLON5,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	111813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	52229316	52229816	52229631	Y	HAS1	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	75547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	52641935	52642117	52642107	Y	ZNF649,ZNF610,ZNF528,ZNF836,ZNF616	ZNF432,ZNF841,ZNF616,RPL37P23,ZNF836,PPP2R1A	NA	NA	NA	NA	ZNF616	760	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	53426305	53426488	53426354	Y	ZNF765,ZNF468,ZNF816	ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816	NA	NA	NA	NA	ZNF816-ZNF321P	17366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	53592651	53593387	53593361	Y	NA	ZNF160,ZNF415	NA	NA	NA	NA	ZNF160	11302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665	NA	NA	NA	NA	ZNF665	32764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	53917190	53917573	53917346	Y	NA	ZNF765,ZNF761	NA	NA	NA	NA	ZNF761	15654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	54048513	54048640	54048574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	79524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr19	54052581	54053344	54052712	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF813	83592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	54373735	54373974	54373935	Y	VSTM1,TFPT,OSCAR,MBOAT7,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,CNOT3,ZNF765,ZNF761,ZNF813,NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM	MYADM,PRKCG,CACNG7	NA	NA	NA	NA	MYADM	6258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	54463562	54463897	54463703	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	52973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	54465243	54465494	54465291	Y	TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8	NA	NA	NA	NA	NA	CACNG7	54654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr19	54707641	54707712	54707644	Y	NA	LENG1,MBOAT7,TSEN34,RPS9,LILRA6	NA	NA	NA	NA	RPS9	5031	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55600172	55600429	55600236	Y	NA	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	RDH13	19513	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55626810	55627228	55626935	Y	ZNF865,PPP1R12C	RDH13,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C,TNNT1	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55699968	55700281	55700219	Y	NA	TNNT1	NA	NA	NA	NA	TNNT1	41246	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr19	55917170	55917359	55917333	Y	U2AF2,SUV420H2,COX6B2,UBE2S	IL11,TMEM238,RPL28,UBE2S	NA	NA	NA	NA	UBE2S	25	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55977615	55977883	55977735	Y	NLRP8,NLRP9,NLRP11,SGK110	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ISOC2,UBE2S,SSC5D,NAT14	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	ISOC2	5905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	55983917	55984059	55984005	Y	RDH13,HSPBP1,ISOC2	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	ZNF628,ISOC2	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ZNF628	1640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.52209067385285
chr19	55985101	55985287	55985184	Y	ISOC2,SSC5D	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	412	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr19	56097081	56097467	56097273	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581	SSC5D,SGK110,SBK2,ZNF579	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF579	6870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr19	56218548	56218666	56218607	Y	SUV420H2,NLRP9,U2AF2	EPN1	NA	NA	NA	NA	EPN1	33956	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	56623811	56623981	56623918	Y	ZNF865,EPN1	ZNF787,ZNF444	NA	NA	NA	NA	ZNF787	6668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	56805864	56806246	56806055	Y	NLRP11,NLRP8,NLRP5,ZSCAN5A,ZNF583,ZNF583,ZNF583	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	71222	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	56833034	56833496	56833435	Y	ZSCAN5A	ZNF542,ZSCAN5A	NA	NA	NA	NA	ZNF542	43972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58162762	58163096	58162801	Y	NA	ZNF134,ZNF211,ZNF551	NA	NA	NA	NA	ZNF211	23001	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	58315114	58315751	58315446	Y	ZNF543,ZNF549,ZNF418,ZNF135,ZNF154,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	8530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58321012	58321020	58321017	Y	VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552	ZNF586,ZNF552,ZNF587	NA	NA	NA	NA	ZNF552	3261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58398826	58399093	58399050	Y	ZNF548,ZNF772,ZNF549,ZNF134,ZSCAN4,ZNF154,ZNF671,ZNF776,ZSCAN1,ZNF606,ZNF329,ZNF256,ZNF135,ZNF418	ZNF587,ZNF814,ZNF417,ZNF418	NA	NA	NA	NA	ZNF814	384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58557282	58557656	58557471	Y	NA	CTD-2368P22.1,ZNF606	NA	NA	NA	NA	ZNF606	44565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58742086	58742094	58742090	Y	NA	ZNF274,ZNF544,ZNF8	NA	NA	NA	NA	ZNF544	4126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	SLC27A5,ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC27A5	7855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	1676691	1676995	1676843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PXDN	69629	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	1722150	1722351	1722236	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	24273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	1725053	1725311	1725239	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	21313	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	20764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	1735614	1736022	1735851	Y	PXDN	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	10602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	2617084	2617480	2617333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	762173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	2686059	2686257	2686158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSSC1	693396	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	3340825	3341028	3341010	Y	NA	TSSC1,TRAPPC12	NA	NA	NA	NA	TSSC1	38625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	3483837	3484086	3483869	Y	NA	ADI1	NA	NA	NA	NA	ADI1	37421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	3583560	3583858	3583796	Y	NA	AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7	NA	NA	NA	NA	AC108488.4	1097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	7152754	7152946	7152770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF144A	97231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	8927568	8927875	8927735	Y	NA	KIDINS220	NA	NA	NA	NA	KIDINS220	47885	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9142736	9142998	9142867	Y	NA	MBOAT2	NA	NA	NA	NA	MBOAT2	794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9347909	9348072	9347942	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	3015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9374844	9375591	9375054	Y	YWHAQ,ASAP2	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	29950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.17938553949103
chr2	9391833	9392063	9392058	Y	NA	ASAP2	NA	NA	NA	NA	ASAP2	46939	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr2	9411571	9411694	9411610	Y	ADAM17	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	66677	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9427289	9427526	9427454	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82395	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9427801	9428115	9428020	Y	YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	82907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr2	9428594	9428712	9428653	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP2	83700	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	9815627	9815977	9815711	Y	NA	YWHAQ	NA	NA	NA	NA	YWHAQ	46484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	9830441	9830702	9830552	Y	KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAQ	61298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	9893339	9893657	9893442	Y	ADAM17,KLF11,KLF11	NA	YWHAQ,ADAM17,ITGB1BP1,IAH1,RRM2,CPSF3,GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	TAF1B	87826	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr2	10075100	10075410	10075131	Y	TAF1B	GRHL1	GRHL1	IMR90	Hi-C	24141950	GRHL1	7931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	10260365	10260994	10260486	Y	ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2	CYS1	NA	NA	NA	NA	RRM2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	10274411	10274722	10274506	Y	TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48	RRM2	NA	NA	NA	NA	RRM2	13956	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	10330449	10330626	10330557	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRM2	69994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	10423423	10423670	10423576	Y	NA	HPCAL1	RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	17345	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	10425680	10425925	10425803	Y	HPCAL1	HPCAL1	HPCAL1,RRM2,C2orf48,MIR4261	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HPCAL1	15090	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	10489892	10489997	10489924	Y	HPCAL1	HPCAL1	NA	NA	NA	NA	HPCAL1	48877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	10540655	10540950	10540779	Y	KLF11,KLF11,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	NA	NA	NA	NA	ODC1	45680	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	10550434	10550795	10550555	Y	HPCAL1,HPCAL1	ODC1,RP11-320M2.1	ODC1	IMR90	Hi-C	24141950	ODC1	35835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	10950898	10951279	10951023	Y	NA	PDIA6	ATP6V1C2	IMR90	Hi-C	24141950	PDIA6	24824	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	11072089	11072388	11072239	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDIA6	95986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	11894336	11894526	11894507	Y	LPIN1	NA	NA	NA	NA	NA	LPIN1	78615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	11970305	11970612	11970555	Y	NA	AC096559.1	NA	NA	NA	NA	AC096559.1	16136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	12466136	12466597	12466183	Y	TRIB2	NA	LOC100506474,MIR4262,TRIB2,LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	388418	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	12856062	12856442	12856137	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	1047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	15309828	15310293	15310034	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBAS	389161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	15734291	15734400	15734305	Y	NBAS,MYCN,DDX1	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	DDX1	4989	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	16807698	16808010	16807940	Y	FAM49A	FAM49A	NA	NA	NA	NA	FAM49A	37589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	18481222	18481335	18481279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDH14	258611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	18807557	18807914	18807789	Y	NA	NA	OSR1	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	67611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr2	19562818	19563058	19562929	Y	NA	OSR1	NA	NA	NA	NA	OSR1	6404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	19788015	19788399	19788228	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSR1	231601	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20176136	20176469	20176303	Y	WDR35	WDR35,MATN3	NA	NA	NA	NA	WDR35	11423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A,RP11-644K8.1	NA	NA	NA	NA	RP11-644K8.1	89	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20385260	20385778	20385600	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	37416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20386283	20386578	20386422	Y	TTC32,HS1BP3	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	36616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20431248	20431615	20431535	Y	SDC1,SDC1	SDC1	NA	NA	NA	NA	SDC1	8054	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20534195	20534238	20534216	Y	NA	PUM2	NA	NA	NA	NA	PUM2	15757	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20548410	20548604	20548507	Y	NA	PUM2	HS1BP3,PUM2	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	1391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20779015	20779511	20779185	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	69338	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	20784084	20784557	20784460	Y	NA	NA	HS1BP3,RHOB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HS1BP3	64292	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	23681941	23682000	23681953	Y	KLHL29	NA	NA	NA	NA	NA	KLHL29	75853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	23901919	23902357	23902230	Y	UBXN2A	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	245627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	24047559	24047784	24047672	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAD2B	100200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	24238466	24238799	24238602	Y	NA	MFSD2B,C2orf44,FKBP1B	NA	NA	NA	NA	MFSD2B	7515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	24491972	24492409	24492370	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITSN2	89174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	24852047	24852369	24852206	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOA1	139264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	25126016	25126204	25126110	Y	NA	ADCY3	NA	NA	NA	NA	ADCY3	14504	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	25545894	25546051	25546003	Y	NA	DNMT3A	NA	NA	NA	NA	DNMT3A	17408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	26259161	26259559	26259360	Y	RAB10	RAB10	NA	NA	NA	NA	RAB10	4185	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	26328559	26328812	26328686	Y	FAM59B,RAB10	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	73583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	26352135	26352230	26352183	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB10	97159	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	26522632	26522929	26522714	Y	NA	EPT1,GPR113	NA	NA	NA	NA	EPT1	6486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	27005355	27005756	27005547	Y	NA	CENPA	NA	NA	NA	NA	CENPA	20198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	27304052	27304486	27304234	Y	CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1	AGBL5,OST4,KHK,CGREF1,ABHD1	NA	NA	NA	NA	KHK	3129	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	27543962	27544264	27544065	Y	NA	SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17	NA	NA	NA	NA	MPV17	2283	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	27629706	27629770	27629738	Y	NA	EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1	NA	NA	NA	NA	PPM1G	784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	27939397	27939784	27939607	Y	TRIM54	AC074091.13	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	2798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	27939854	27940151	27940111	Y	NA	AC074091.13	RBKS,BRE,LOC100505716,FOSL2,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	3255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	27958320	27958698	27958604	Y	NA	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC074091.13	21721	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	27960575	27961156	27960621	Y	RBKS	AC074091.13,MRPL33	BRE,PLB1,MRPL33,RBKS,LOC100505716,FOSL2	IMR90	Hi-C	24141950	AC074091.13	23976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	28021914	28022357	28022176	Y	RBKS	MRPL33	NA	NA	NA	NA	MRPL33	29330	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	28183212	28183402	28183309	Y	FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	RBKS	71247	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	28497824	28498240	28497982	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	115075	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	28519223	28519459	28519305	Y	RBKS,PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	NA	NA	NA	NA	FOSL2	93856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	28668874	28669088	28668964	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	NA	BRE,RBKS,PLB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC104695.3	53335	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	28976141	28976573	28976382	Y	FOSL2,PPP1CB,PPP1CB,TRMT61B	PPP1CB,SPDYA	SPDYA	IMR90	Hi-C	24141950	PPP1CB	3635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	29352302	29352469	29352324	Y	NA	CLIP4	NA	NA	NA	NA	CLIP4	33731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	30448125	30448425	30448217	Y	YPEL5,LBH	LBH,AC104698.1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LBH	3972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	30516276	30516651	30516416	Y	NA	AC104698.1	LCLAT1,LBH	IMR90	Hi-C	24141950	AC104698.1	37083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	30887906	30888094	30887998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLAT1	219814	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr2	30889265	30889652	30889547	Y	NA	NA	YPEL5,LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	221173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	33702756	33702976	33702846	Y	RASGRP3,RASGRP3	RASGRP3	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	43365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	36688353	36688868	36688635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	107284	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	36795570	36795942	36795825	Y	FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	75288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	36934290	36934412	36934353	Y	NA	VIT	NA	NA	NA	NA	VIT	12457	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37139828	37140219	37140054	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	51396	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37383262	37383336	37383288	Y	NA	EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	EIF2AK2	1054	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37489254	37489354	37489306	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	32398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37491311	37491687	37491498	Y	NA	CEBPZ	NA	NA	NA	NA	CEBPZ	34455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37763005	37763322	37763129	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	37763462	37763512	37763507	Y	FAM82A1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	QPCT	193745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37789550	37789826	37789587	Y	EIF2AK2,CDC42EP3	NA	CDC42EP3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	173785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37875700	37876061	37875917	Y	EIF2AK2,QPCT,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	87550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	37893644	37893973	37893812	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	69638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37897080	37897760	37897461	Y	QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	65851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr2	37940534	37940802	37940700	Y	CDC42EP3	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	22809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37993289	37993401	37993340	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	29678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	37995727	37996117	37995888	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	32116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38003207	38003253	38003231	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	39596	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38003710	38004005	38003838	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	40099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38007638	38007650	38007644	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44027	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	38008241	38008581	38008345	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3,PRKD3,QPCT	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	44630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	38219907	38219960	38219946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	115084	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38265039	38265434	38265056	Y	CDC42EP3,CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	69610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38369402	38369882	38369670	Y	NA	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	34358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	38405386	38405542	38405477	Y	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P12	51168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38552581	38552739	38552658	Y	NA	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	49688	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	38571888	38572175	38572032	Y	FAM82A1,ATL2	ATL2	NA	NA	NA	NA	ATL2	30252	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	39067812	39068014	39067913	Y	NA	DHX57,MORN2	NA	NA	NA	NA	DHX57	33061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	39665108	39665339	39665266	Y	NA	AC007246.3,MAP4K3	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	2655	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	40260196	40260378	40260267	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	255789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	40261444	40261729	40261611	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	257037	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	40326057	40326570	40326384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	321650	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	40328052	40328434	40328415	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	323645	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	40358852	40359026	40359015	Y	SLC8A1	NA	NA	NA	NA	NA	THUMPD2	354445	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	40767004	40767399	40767181	Y	NA	NA	SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	68794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	40899157	40899397	40899276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	62964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	40961979	40962343	40962119	Y	NA	NA	LOC100128590,SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	125786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42149327	42149700	42149496	Y	PKDCC	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	123460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	111143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42329971	42330163	42329978	Y	NA	NA	EML4	IMR90	Hi-C	24141950	PKDCC	56811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42368874	42369229	42369001	Y	EML4	EML4	EML4,LOC388942,C2orf91,COX7A2L	IMR90	Hi-C	24141950	EML4	25261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42412542	42412681	42412587	Y	NA	EML4	NA	NA	NA	NA	EML4	18052	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	42696554	42696964	42696742	Y	NA	COX7A2L,KCNG3,MTA3	NA	NA	NA	NA	KCNG3	22273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	19491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	43038629	43038924	43038876	Y	NA	HAAO	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO,PLEKHH2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HAAO	20896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	43265724	43265951	43265843	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	185797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	43269026	43269323	43269208	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	182425	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	43278597	43278622	43278609	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP36L2	173126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	43302253	43302513	43302383	Y	NA	NA	ZFP36L2,LOC100129726,THADA	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	149235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	43313736	43313941	43313748	Y	NA	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	137807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	43385938	43386506	43386186	Y	OXER1,ZFP36L2	NA	THADA,LOC100129726,ZFP36L2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFP36L2	65242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	43686078	43686091	43686085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THADA	135094	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	43942410	43942694	43942547	Y	PLEKHH2	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC2LI1	56484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	44212195	44212421	44212308	Y	NA	LRPPRC	NA	NA	NA	NA	LRPPRC	8723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	46294979	46295300	46295093	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPAS1	223506	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	46557036	46557117	46557077	Y	NA	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	38230	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	46561811	46562247	46561970	Y	SOCS5,SOCS5	EPAS1	NA	NA	NA	NA	EPAS1	43005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	46825586	46825695	46825639	Y	NA	CRIPT,PIGF	NA	NA	NA	NA	CRIPT	15860	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	46993562	46993962	46993767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOCS5	69471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47031260	47031826	47031474	Y	NA	NA	LOC388948,SOCS5,CRIPT,LOC100134259,MCFD2,TTC7A	IMR90	Hi-C	24141950	SOCS5	107169	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	47039745	47040099	47039914	Y	MCFD2,MCFD2,SOCS5,SOCS5	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	101197	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47075244	47075442	47075379	Y	MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	65854	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47076896	47077421	47077187	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63875	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	47077976	47078245	47078111	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	TTC7A	63051	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	47100841	47101015	47100907	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	40281	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47109327	47109734	47109459	Y	SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	31562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47195176	47195614	47195246	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	28182	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47197841	47198107	47197954	Y	RHOQ,TTC7A,MCFD2	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	30847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47270774	47271231	47270943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	103780	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47298687	47298930	47298712	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	47299215	47299677	47299496	Y	TTC7A,MCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	102063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	47418967	47419222	47419129	Y	NA	CALM2	TTC7A,C2orf61,SOCS5,MCFD2,CALM2,EPCAM	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	17227	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	47420372	47420663	47420518	Y	NA	CALM2	EPCAM,TTC7A,MCFD2,C2orf61,CALM2	IMR90	Hi-C	24141950	CALM2	18632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	47496922	47497231	47497077	Y	NA	NA	TTC7A,CALM2,C2orf61,MCFD2,SOCS5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPCAM	73066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	48709527	48709805	48709665	Y	FOXN2,KLRAQ1	PPP1R21,STON1	NA	NA	NA	NA	PPP1R21	43790	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	48718676	48719233	48718981	Y	NA	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	35289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	50631357	50631742	50631589	Y	NRXN1	NA	NA	NA	NA	NA	STON1	1876835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	54196339	54196842	54196524	Y	ASB3,ASB3,PSME4	ACYP2,PSME4	NA	NA	NA	NA	PSME4	362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	54751942	54752182	54752042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	70520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	54786900	54787386	54787056	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	105478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.6773772964135
chr2	54787503	54787764	54787623	Y	RTN4,SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	106081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr2	54799241	54799892	54799606	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	117819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EML6	102693	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	55249584	55250267	55249993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	87490	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	55320625	55320761	55320684	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,EML6,RTN4	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	16996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	55327095	55327368	55327210	Y	RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	10389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	55327778	55327923	55327859	Y	NA	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	9834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	55338983	55339153	55339057	Y	CCDC88A,RTN4,RTN4	RTN4	C2orf63,RTN4,EML6	IMR90	Hi-C	24141950	RTN4	1226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	55767070	55767336	55767332	Y	NA	CCDC104	NA	NA	NA	NA	CCDC104	22330	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	56070301	56070618	56070423	Y	NA	NA	EFEMP1	IMR90	Hi-C	24141950	EFEMP1	78656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	56099404	56099776	56099646	Y	NA	EFEMP1	NA	NA	NA	NA	EFEMP1	49498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	57600725	57600909	57600817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VRK2	531877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	60327078	60327537	60327382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU1-32P	282203	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	60776650	60777166	60776879	Y	REL,BCL11A	BCL11A	NA	NA	NA	NA	BCL11A	1536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	61034167	61034304	61034235	Y	REL,PAPOLG	NA	NA	NA	NA	NA	PAPOLG	52802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	61165363	61165465	61165452	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REL	58707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	61921641	61922071	61921953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM161A	157207	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	61991278	61991660	61991557	Y	NA	NA	XPO1,FAM161A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM161A	87618	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr2	62806044	62806443	62806244	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	69015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	63023345	63023597	63023471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHBP1	124359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	63122149	63122353	63122251	Y	EHBP1,EHBP1,OTX1	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	152839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	63129477	63129780	63129501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OTX1	145412	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	63842322	63842740	63842368	Y	UGP2	MDH1	NA	NA	NA	NA	MDH1	28579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	64879615	64879792	64879667	Y	SERTAD2	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	64978173	64978610	64978385	Y	CEP68	SERTAD2	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	2034	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	64998040	64998317	64998210	Y	NA	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	21901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	65058327	65058875	65058618	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	82188	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	65065938	65066285	65066136	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	89799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65067098	65067261	65067167	Y	SLC1A4,RAB1A	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	90959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65081925	65082185	65082093	Y	AFTPH,SERTAD2,SLC1A4,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	105786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	65085914	65086269	65086077	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	109775	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65086460	65086681	65086529	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110321	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65086968	65087262	65087080	Y	AFTPH,SERTAD2,RAB1A,ACTR2	NA	SERTAD2,LOC339807,AFTPH	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	110829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65326595	65326952	65326834	Y	NA	CEP68,RAB1A	NA	NA	NA	NA	RAB1A	28288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	65804222	65804385	65804306	Y	RAB1A	NA	ACTR2,SPRED2	IMR90	Hi-C	24141950	SPRED2	146451	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	67067097	67067512	67067390	Y	NA	AC009474.2	LOC644838,MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009474.2	38842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr2	67791335	67791436	67791382	Y	NA	NA	MEIS1	IMR90	Hi-C	24141950	ETAA1	168884	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	68099152	68099495	68099246	Y	NA	NA	MEIS1,C1D	IMR90	Hi-C	24141950	C1D	236585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	68472906	68473226	68473141	Y	PPP3R1	PPP3R1	NA	NA	NA	NA	PPP3R1	8143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	68544914	68545935	68545552	Y	CNRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	CNRIP1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	68989889	68990241	68990036	Y	PLEK,FBXO48,APLF,ARHGAP25,ARHGAP25	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	248069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	69135600	69135857	69135778	Y	NA	NA	ARHGAP25,APLF,FBXO48,BMP10	IMR90	Hi-C	24141950	ANTXR1	102453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	69241314	69241782	69241454	Y	ANTXR1	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	3004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	69250610	69250802	69250769	Y	NA	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	ANTXR1	12300	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	69533941	69534050	69534019	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	78332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	70363059	70363462	70363144	Y	MXD1,C2orf42,PCBP1	PCBP1-AS1,AC016700.4	NA	NA	NA	NA	AC016700.4	35376	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	70823463	70823663	70823562	Y	TGFA	TGFA	NA	NA	NA	NA	TGFA	44138	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	71725442	71725771	71725690	Y	DYSF	DYSF	NA	NA	NA	NA	DYSF	46590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	72058319	72058599	72058494	Y	NA	NA	EXOC6B,DYSF,CYP26B1	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	379467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	72372444	72372716	72372574	Y	CYP26B1	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	678454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	72426245	72426403	72426323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	624767	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	72748040	72748317	72748179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	302853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	72936183	72936496	72936380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	114674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	72980109	72980387	72980306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	70783	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	73402910	73403369	73403123	Y	SFXN5	RAB11FIP5,SMYD5	EMX1,RAB11FIP5,SFXN5,NOTO,PRADC1,CCT7,SMYD5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAB11FIP5	21061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	73613683	73613856	73613817	Y	DUSP11,ALMS1	ALMS1	NA	NA	NA	NA	ALMS1	2797	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	74801154	74801351	74801200	Y	DOK1	HTRA2,AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	20337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	74804828	74804964	74804881	Y	MOBKL1B,DOK1	AUP1,DOK1,LOXL3	NA	NA	NA	NA	LOXL3	24011	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	75072652	75072899	75072736	Y	HK2	HK2	NA	NA	NA	NA	HK2	13544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	75779311	75779317	75779314	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL19	92592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	75834246	75834589	75834429	Y	NA	MRPL19	FAM176A,TACR1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPL19	37320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	75912574	75912759	75912685	Y	NA	MRPL19,GCFC2	NA	NA	NA	NA	GCFC2	23356	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	79168770	79169144	79168957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC105399.2	1155262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	80371410	80371698	80371551	Y	NA	AC016716.1	NA	NA	NA	NA	AC016716.1	16563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85116002	85116322	85116077	Y	C2orf89,TMSB10	TMSB10	TMSB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	TMSB10	14427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85147093	85147556	85147171	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	16344	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr2	85154234	85154422	85154323	Y	NA	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	TMSB10	23485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	85166635	85167198	85166950	Y	KCMF1,C2orf89	TMSB10,KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	29018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85173188	85173797	85173736	Y	TMSB10	TMSB10,KCMF1	KCMF1,TMSB10	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KCMF1	22419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	85185071	85185576	85185382	Y	NA	KCMF1	TMSB10,KCMF1	IMR90	Hi-C	24141950	KCMF1	10640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85242321	85242336	85242334	Y	NA	KCMF1	NA	NA	NA	NA	KCMF1	46105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85442728	85442944	85442894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L1	84195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85492413	85492544	85492479	Y	SH2D6	NA	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	61004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85505624	85505644	85505635	Y	SH2D6	TGOLN2	NA	NA	NA	NA	TGOLN2	47904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85632531	85633066	85632892	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	10489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85664544	85665596	85664830	Y	KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6	CAPG	NA	NA	NA	NA	CAPG	20989	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	85726317	85726428	85726373	Y	CAPG,VAMP8	MAT2A	TMEM150A,USP39,SH2D6,MAT2A,LOC100630918,TGOLN2,RETSAT,GGCX,VAMP5,VAMP8,RNF181,CAPG,C2orf68	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MAT2A	37860	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	85969500	85969917	85969748	Y	VAMP5,TMEM150A,ATOH8	RNU1-38P,ATOH8	ATOH8,POLR1A,USP39,C2orf68,SFTPB,LOC284950,ST3GAL5,LOC90784,PTCD3	IMR90	Hi-C	24141950	ATOH8	6550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	86388217	86388607	86388413	Y	NA	IMMT,MRPL35	NA	NA	NA	NA	IMMT	32286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	88353539	88354148	88353800	Y	KRCC1	RNU2-63P,KRCC1	NA	NA	NA	NA	KRCC1	291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	91786584	91786786	91786661	Y	NA	NA	LOC654342	IMR90	Hi-C	24141950	RPIA	2797422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	91815826	91816191	91816014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2826664	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	91821438	91821799	91821741	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2832276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	91936197	91936406	91936290	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2947035	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	95982487	95982780	95982632	Y	TRIM43B,KCNIP3	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	83689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	96077364	96077399	96077382	Y	NA	FAHD2A	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	10895	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	96348390	96348623	96348461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAHD2A	281921	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	97151625	97152085	97151839	Y	ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	NEURL3	19761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	97204407	97205263	97204568	Y	NA	NEURL3,ARID5A	NA	NA	NA	NA	ARID5A	3927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	97291626	97292008	97291852	Y	NA	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	14516	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	97330891	97331185	97331060	Y	TMEM127,ARID5A,KIAA1310	KANSL3	NA	NA	NA	NA	KANSL3	24367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	98389575	98389609	98389594	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	111005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	98443211	98443622	98443475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTR1B	164641	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC092675.3	147261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	99072105	99072338	99072215	Y	TMEM131,MGAT4A,MGAT4A,INPP4A	INPP4A	NA	NA	NA	NA	INPP4A	12788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100036640	100036800	100036773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	67697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100104968	100105518	100105262	Y	REV1	REV1	NA	NA	NA	NA	REV1	471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100388150	100388296	100388223	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	283653	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100484034	100484497	100484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	379537	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr2	100496681	100496959	100496872	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	392184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	100498420	100498601	100498511	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	REV1	393923	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100576722	100576856	100576853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	455262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100685193	100685529	100685389	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	346589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	100937334	100937484	100937407	Y	LONRF2	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	94634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	101397207	101397582	101397418	Y	C2orf29	NPAS2	NPAS2,RPL31,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS2	37032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	102058393	102058806	102058576	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	RFX8	NA	NA	NA	NA	RFX8	30359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	102133779	102134093	102133972	Y	MAP4K4,MAP4K4	RFX8	MAP4K4,RFX8,CREG2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RFX8	44614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	102333492	102333834	102333706	Y	IL1R1,RNF149,IL1R2,MAP4K4,MAP4K4	MAP4K4	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	22180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	102383406	102383725	102383568	Y	MAP4K4,MAP4K4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K4	72094	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	105655685	105655967	105655739	Y	NA	MRPS9	NA	NA	NA	NA	MRPS9	3244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr2	106009982	106010344	106010250	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	42626	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr2	106020631	106021071	106020783	Y	FHL2,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	31899	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr2	106026144	106026496	106026333	Y	GPR45,FHL2	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	26474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	106329728	106329936	106329837	Y	NA	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	29418	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	106364522	106364900	106364611	Y	TGFBRAP1,C2orf49,NCK2	NCK2	NA	NA	NA	NA	NCK2	5168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	109210699	109211038	109210811	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	109211421	109211903	109211563	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	62564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	109228635	109228941	109228810	Y	GCC2,RANBP2,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	79778	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	109855106	109855410	109855221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC138	453893	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	110097588	110097865	110097829	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	271918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	110271705	110271931	110271836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	97852	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	110318153	110318301	110318244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT10	51482	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	110319562	110319852	110319693	Y	NA	SEPT10	NA	NA	NA	NA	SEPT10	49931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	110863536	110863928	110863763	Y	MALL	MALL	NA	NA	NA	NA	MALL	8215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	112295090	112295350	112295220	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANAPC1	344917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	112417011	112417329	112417184	Y	NA	NA	BCL2L11,ACOXL	IMR90	Hi-C	24141950	ANAPC1	222938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113058633	113059002	113058901	Y	NA	ZC3H8,ZC3H6	NA	NA	NA	NA	ZC3H6	27462	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113380153	113380493	113380323	Y	IL1A	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	20941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113384986	113385271	113385131	Y	NA	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	16163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113388786	113388926	113388836	Y	NA	CHCHD5,SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	12508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113398370	113398650	113398523	Y	NA	SLC20A1	NA	NA	NA	NA	SLC20A1	2784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113448603	113448987	113448785	Y	IL36B,IL36G,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	POLR1B,CHCHD5,SLC20A1,CKAP2L,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	47169	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113450039	113450435	113450231	Y	IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	SLC20A1	SLC20A1,FLJ42351	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC20A1	48605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113512242	113512462	113512374	Y	ZC3H6,IL36B,IL36G,PSD4,IL1RN,IL1B,IL1A	CKAP2L,IL1A	NA	NA	NA	NA	CKAP2L	7792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113569466	113569945	113569683	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	22535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113576216	113576532	113576373	Y	IL36G,PSD4,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1A,IL1B	NA	NA	NA	NA	IL1B	15948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113635122	113635394	113635287	Y	NA	IL1B	IL1B,CKAP2L,IL37,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	42642	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	113637417	113638142	113637790	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A,IL1B,IL37	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	44937	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113638257	113639193	113638961	Y	IL36B,IL36G,IL36RN,IL1RN,IL1A,IL1B	IL1B	CKAP2L,IL1A	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	45777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	113657771	113658101	113657937	Y	NA	NA	CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B	IMR90	Hi-C	24141950	IL1B	65291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	113818075	113818222	113818133	Y	IL1A,IL1B,IL36G,CBWD2,IL36B,IL36RN,IL1RN	NA	NA	NA	NA	NA	IL1B	225595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	114082449	114082815	114082523	Y	NA	NA	PAX8,LOC654433	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	256849	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	114126317	114126521	114126419	Y	IL1F10,IL1F10	NA	PAX8,LOC654433,IL1RN,PSD4	IMR90	Hi-C	24141950	WASH2P	213143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	114616401	114616618	114616536	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	ACTR3,SLC35F5	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTR3	28919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	116799018	116799370	116799278	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDX18	1770856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	118737562	118738119	118738029	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	31590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	118739522	118739775	118739730	Y	DDX18,CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	29934	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	119660312	119660603	119660477	Y	DBI	NA	NA	NA	NA	NA	STEAP3	318781	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	120971736	120972136	120971936	Y	NA	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	TMEM185B	6848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	120996274	120996566	120996498	Y	NA	TMEM185B,RALB	EPB41L5,RALB,TMEM185B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RALB	634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121011894	121012098	121011996	Y	TMEM185B,RALB	TMEM185B,RALB	NA	NA	NA	NA	RALB	16254	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121303695	121304155	121304026	Y	NA	NA	RALB,LOC84931,INHBB	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	187044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121523492	121523901	121523763	Y	GLI2	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	32293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121585967	121586372	121586071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	94768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121614859	121615272	121615044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	123660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	121955043	121955176	121955099	Y	CLASP1	NA	NA	NA	NA	NA	TFCP2L1	85607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	127841716	127842041	127841975	Y	NA	BIN1	NA	NA	NA	NA	BIN1	20890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	127975624	127975823	127975720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYP27C1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	128090505	128090721	128090714	Y	NA	ERCC3	NA	NA	NA	NA	ERCC3	40753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	128562322	128562673	128562571	Y	NA	WDR33	LIMS2	IMR90	Hi-C	24141950	WDR33	4088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	129131715	129132088	129131976	Y	NA	NA	HS6ST1	IMR90	Hi-C	24141950	HS6ST1	57564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	131149333	131149678	131149410	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	131863489	131864378	131863990	Y	PLEKHB2	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	PLEKHB2	3069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	134262685	134263066	134262922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCKAP5	60968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	134544977	134545065	134545021	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	220943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	134546051	134546253	134546153	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	222017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr2	134548741	134549106	134548974	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	224707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr2	134570885	134571181	134570989	Y	NA	NA	NCKAP5	IMR90	Hi-C	24141950	NCKAP5	246851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	134878523	134878632	134878609	Y	MGAT5	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	2969	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	134878887	134879265	134878997	Y	NA	MGAT5	NA	NA	NA	NA	MGAT5	3333	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	135062328	135062641	135062375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAT5	186774	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	139226248	139226635	139226522	Y	NA	AC097721.2,SPOPL	NA	NA	NA	NA	AC097721.2	30633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	139464660	139464674	139464668	Y	NXPH2	NA	NA	NA	NA	NA	NXPH2	71244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	145116388	145116823	145116635	Y	NA	GTDC1	ZEB2,ARHGAP15,GTDC1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GTDC1	28253	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	145821367	145821376	145821372	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL6P5	271422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	146509165	146509664	146509334	Y	NA	NA	DKFZp686O1327,ZEB2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P5	416367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	150278954	150279172	150279087	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYPD6	94455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	150440132	150440521	150440417	Y	NA	MMADHC	NA	NA	NA	NA	MMADHC	1809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	151383394	151383753	151383509	Y	RND3	RND3	RND3,RBM43	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RND3	9772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	152159553	152159620	152159604	Y	TNFAIP6	RBM43,NMI	RBM43,NMI,TNFAIP6,RIF1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NMI	14982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	153362104	153362315	153362141	Y	FMNL2	NA	NA	NA	NA	NA	FMNL2	172353	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	153599082	153599296	153599189	Y	NA	ARL6IP6,PRPF40A	NA	NA	NA	NA	PRPF40A	26571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	158067838	158068005	158067865	Y	NA	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	44105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	158102968	158103210	158103130	Y	NA	GALNT5	NR4A2,GALNT5	IMR90	Hi-C	24141950	GALNT5	8900	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	158117931	158118105	158118018	Y	GALNT5	GALNT5	NA	NA	NA	NA	GALNT5	5821	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	159354074	159354382	159354127	Y	NA	PKP4	NA	NA	NA	NA	PKP4	42598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	160646880	160647090	160646985	Y	NA	CD302	NA	NA	NA	NA	CD302	5663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	161064664	161064880	161064794	Y	NA	NA	ITGB6,RBMS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLA2R1	147543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	161071101	161071394	161071301	Y	ITGB6	NA	ITGB6,RBMS1	IMR90	Hi-C	24141950	PLA2R1	153980	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	161177458	161178011	161177649	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	84382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	161232354	161232597	161232498	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	29796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	161244338	161244737	161244615	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	17656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	161277229	161277590	161277411	Y	NA	MIR4785	NA	NA	NA	NA	MIR4785	14836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	164204698	164204962	164204800	Y	NA	NA	FIGN	IMR90	Hi-C	24141950	FIGN	385560	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	165777057	165777208	165777083	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COBLL1	78868	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	166523404	166523752	166523720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSRNP3	199247	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	166649551	166649790	166649651	Y	GALNT3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC21B	158563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	169409032	169409398	169409117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CERS6	98660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	171671285	171671753	171671591	Y	NA	AC007405.4,AC007405.6,GAD1	NA	NA	NA	NA	GAD1	3562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	171742019	171742156	171742111	Y	NA	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	40818	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	172959536	172959659	172959591	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5969	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	172960097	172960530	172960322	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	5098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr2	172961678	172962145	172962061	Y	NA	DLX1,DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	3483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	173061382	173062264	173061777	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	95754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	173113663	173113922	173113833	Y	ITGA6	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	148035	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	173114788	173114930	173114869	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	149160	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	173117910	173118399	173118084	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	152282	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	173302497	173302807	173302540	Y	NA	ITGA6	NA	NA	NA	NA	ITGA6	12415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	173908257	173908577	173908473	Y	ZAK	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	308971	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	173942556	173942831	173942720	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7	274717	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	174800246	174800560	174800554	Y	NA	SP3	NA	NA	NA	NA	SP3	27870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	175069870	175070170	175070019	Y	WIPF1,SP3,SP3	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	41256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	175085975	175086128	175086062	Y	NA	OLA1	NA	NA	NA	NA	OLA1	25298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	175248509	175248787	175248661	Y	SP3,SP3	CIR1,SCRN3	NA	NA	NA	NA	CIR1	9656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	176866139	176866392	176866261	Y	KIAA1715	KIAA1715	NA	NA	NA	NA	KIAA1715	572	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	178104644	178105169	178104872	Y	NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3	HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128	NA	NA	NA	NA	MIR3128	13569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	179864853	179864962	179864908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	262555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	180006156	180006503	180006499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SESTD1	121014	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	180625658	180625928	180625899	Y	ZNF385B	NA	NA	NA	NA	NA	CWC22	243912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	180871045	180871158	180871103	Y	NA	CWC22	NA	NA	NA	NA	CWC22	1205	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	182331950	182332387	182332122	Y	ITGA4	ITGA4	NA	NA	NA	NA	ITGA4	12021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	183877830	183878146	183878099	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	23440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	188340607	188340894	188340852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFPI	87593	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	188389811	188390126	188390006	Y	NA	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	38361	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	188404228	188404596	188404560	Y	TFPI	TFPI	NA	NA	NA	NA	TFPI	23891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	190243884	190244287	190244000	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	59872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	190276650	190276899	190276775	Y	NA	WDR75	COL5A2,GULP1,COL3A1,MIR1245B	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	27260	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	190477917	190478080	190477982	Y	NA	SLC40A1,ASNSD1	SLC40A1,WDR75,ASNSD1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SLC40A1	31433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	191324757	191324843	191324828	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFSD6	53676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	191540578	191540944	191540683	Y	NA	NAB1	NA	NA	NA	NA	NAB1	31106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	191810388	191810629	191810413	Y	GLS	AC067945.3	STAT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC067945.3	45664	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	192067598	192067966	192067844	Y	NA	MYO1B	MYO1B,STAT4	IMR90	Hi-C	24141950	MYO1B	39945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	192112527	192112680	192112632	Y	NA	MYO1B	NA	NA	NA	NA	MYO1B	4616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC098617.1	205616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	164033	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr2	192707967	192708344	192708338	Y	NA	AC098617.1,SDPR	NA	NA	NA	NA	AC098617.1	921	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	194142383	194142416	194142400	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEFF2	1083948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	194838514	194838698	194838568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC39A10	1600003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	197934286	197934620	197934500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGAP1	143766	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	198350765	198350931	198350852	Y	NA	COQ10B,HSPE1,MOB4,HSPD1	NA	NA	NA	NA	HSPE1	11787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	200800298	200800427	200800328	Y	SATB2,SATB2,SATB2,TYW5,C2orf69	AC073043.1,C2orf69,C2orf47,TYW5	NA	NA	NA	NA	C2orf47	17613	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	201167757	201168004	201167857	Y	SPATS2L,SPATS2L	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201238754	201239056	201238905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	70150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201262818	201262970	201262894	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	94214	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201270357	201270484	201270442	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	101753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	201273148	201273356	201273255	Y	CLK1,CLK1,BZW1,BZW1,BZW1	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	99375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201289842	201289940	201289893	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGOL2	82791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201411222	201411458	201411252	Y	PPIL3,NIF3L1,NIF3L1,SGOL2	SGOL2,KCTD18,AOX1	NA	NA	NA	NA	KCTD18	28715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201454959	201455229	201455094	Y	NA	AOX1	NA	NA	NA	NA	AOX1	6368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr2	201829288	201829721	201829590	Y	KCTD18,FAM126B,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP8,CASP8,CLK1,CLK1,NIF3L1,NIF3L1,ORC2	ORC2	NA	NA	NA	NA	ORC2	2885	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	201989489	201990098	201989672	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	10662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	201990242	201990732	201990460	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	11415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr2	201995421	201995893	201995513	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR,CASP10	NA	NA	NA	NA	CFLAR	16594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	NA	NA	NA	NA	NA	DAZAP2P1	165924	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	204373438	204373815	204373626	Y	NA	RAPH1	NA	NA	NA	NA	RAPH1	24318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	204448549	204448751	204448649	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,CTLA4,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	50416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	204550155	204550270	204550210	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	152022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	204551904	204552157	204552089	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	153771	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	204646981	204647288	204647136	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	248848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	204668913	204669218	204669026	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,ABI2	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	270780	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	204672850	204673169	204672900	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	274717	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	204676480	204676691	204676598	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	278347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	205530118	205530314	205530216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARD3B	121602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	206563648	206564168	206563856	Y	INO80D	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	18934	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	206564438	206564682	206564481	Y	INO80D,NRP2	NRP2	NA	NA	NA	NA	NRP2	19724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	207076453	207076789	207076513	Y	NA	GPR1	NA	NA	NA	NA	GPR1	3982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	208123048	208123437	208123243	Y	NA	AC007879.7	KLF7,CREB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	20674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208175027	208175372	208175141	Y	NA	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC007879.7	72653	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	208176046	208176541	208176319	Y	CREB1,CCNYL1	NA	KLF7,CREB1	IMR90	Hi-C	24141950	AC007879.7	73672	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	208198321	208198507	208198422	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	95947	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208200012	208200111	208200057	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	97638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	208202390	208203219	208202610	Y	NA	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	100016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208369274	208369395	208369347	Y	NA	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	23066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1,AC007879.5	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	208395422	208395980	208395659	Y	PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1	CREB1,AC007879.5	NA	NA	NA	NA	AC007879.5	2903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	210872654	210873081	210872784	Y	C2orf67	RPE	NA	NA	NA	NA	RPE	7365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	211404935	211405006	211404955	Y	CPS1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL1	64559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	214053041	214053239	214053088	Y	NA	IKZF2	NA	NA	NA	NA	IKZF2	37890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	217180784	217180970	217180877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARCH4	53780	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	217357637	217357999	217357758	Y	NA	RPL37A,AC098820.3	RPL37A	IMR90	Hi-C	24141950	RPL37A	2913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	217934616	217935002	217934772	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	376368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	217970488	217971016	217970653	Y	NA	NA	IGFBP5,DIRC3,IGFBP2,TNP1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	412240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	218714903	218715515	218715204	Y	PNKD,ARPC2,ARPC2	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC2	364302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	219270976	219271406	219271230	Y	CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	9997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	219773515	219774011	219773826	Y	USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A	CDK5R2	NA	NA	NA	NA	CDK5R2	48366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	220385870	220386219	220385945	Y	ACCN4	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	20166	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	220386924	220387263	220387141	Y	NA	GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1	NA	NA	NA	NA	TMEM198	19122	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	220553753	220554082	220553876	Y	NA	AC009502.1	DES,SLC4A3	K562	5C	22955621	AC009502.1	6236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	221000091	221000153	221000122	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	AC009502.1	452574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	221093432	221093609	221093525	Y	NA	NA	EPHA4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	AC009502.1	545915	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.51004121538766
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	EPHA4	389768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr2	224761528	224761781	224761678	Y	WDFY1	WDFY1	NA	NA	NA	NA	WDFY1	46323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	224773224	224773437	224773430	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	34667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	224808298	224808709	224808400	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	225711035	225711198	225711117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	193964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	225875465	225875930	225875836	Y	DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	29232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	225965618	225965990	225965841	Y	NA	NA	DOCK10	IMR90	Hi-C	24141950	DOCK10	60456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	226858171	226858617	226858345	Y	NA	NA	IRS1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	189470	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	227048517	227048542	227048530	Y	NA	AC068138.1	NA	NA	NA	NA	AC068138.1	430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	227292366	227292516	227292441	Y	NA	NA	IRS1,LOC646736,RHBDD1	IMR90	Hi-C	24141950	AC068138.1	244279	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	227517160	227517436	227517301	Y	IRS1	NA	IRS1,LOC646736	IMR90	Hi-C	24141950	IRS1	145039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	227656309	227656561	227656437	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	5914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	227665142	227665696	227665306	Y	IRS1	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	2667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	227665859	227666449	227665964	Y	NA	IRS1,RHBDD1	NA	NA	NA	NA	IRS1	3384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	228018054	228018265	228018160	Y	COL4A4	COL4A4,COL4A3	NA	NA	NA	NA	COL4A4	8564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	228568825	228569005	228568935	Y	SLC19A3	SLC19A3	NA	NA	NA	NA	SLC19A3	11723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	228728073	228728272	228728126	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCL20	51515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	229922941	229923063	229923002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	210938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	230309727	230309993	230309861	Y	TRIP12,PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	175726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	231922388	231922877	231922602	Y	NA	C2orf72,PSMD1	NA	NA	NA	NA	PSMD1	2810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	232229850	232230117	232229960	Y	NA	B3GNT7	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	28137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	232277113	232277443	232277206	Y	C2orf72	B3GNT7,SNORD82	NA	NA	NA	NA	B3GNT7	18859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	232478879	232479328	232479053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMA	90277	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	232530920	232531416	232531295	Y	NA	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	38189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	232545684	232546083	232545868	Y	COPS7B	PTMA	PTMA	K562	ChIA-PET	22265404	PTMA	23522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	232551717	232552221	232552147	Y	NPPC	PTMA	PTMA,PDE6D	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTMA	17384	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	233763823	233764207	233764133	Y	EFHD1,NGEF	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	43843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	233766797	233767190	233766879	Y	NA	C2orf82	NA	NA	NA	NA	C2orf82	46817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	234630754	234630813	234630784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	130399	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	234673088	234673246	234673167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HJURP	87966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	235160532	235160873	235160730	Y	NA	NA	TRPM8,AGAP1,SH3BP4,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	242824	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	235353626	235353934	235353758	Y	ARL4C	ARL4C	NA	NA	NA	NA	ARL4C	49763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	235360536	235360912	235360678	Y	NA	ARL4C	TRPM8,ARL4C,SPP2	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	42785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	235935583	235936015	235935761	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	76966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	236172421	236172477	236172436	Y	NA	NA	AGAP1	IMR90	Hi-C	24141950	AGAP1	228256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	236404372	236404974	236404689	Y	AGAP1	AGAP1	NA	NA	NA	NA	AGAP1	3639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr2	237481215	237481391	237481283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IQCA1	67030	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	237678524	237678883	237678772	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	264339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	237685373	237686074	237685499	Y	CXCR7	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IQCA1	271188	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	237721989	237722187	237722088	Y	NA	NA	IQCA1,CXCR7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COPS8	269768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	237933842	237934085	237933935	Y	NA	NA	CXCR7,IQCA1,ASB18	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	COPS8	57870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238038460	238038824	238038818	Y	NA	COPS8,AC105760.2	COPS8,COL6A3,MLPH,PRLH,RAB17,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	46000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238131951	238132217	238132070	Y	COL6A3	NA	COL6A3,PRLH,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	AC105760.2	139491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238321382	238321708	238321611	Y	COL6A3	COL6A3,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	364	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238374283	238374521	238374346	Y	COL6A3	AC112721.2,MLPH	LRRFIP1,MLPH,PRLH,COL6A3,RAB17	IMR90	Hi-C	24141950	MLPH	17550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	25097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238582267	238582825	238582560	Y	LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	48048	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238585463	238585872	238585569	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	51244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238586570	238586965	238586752	Y	MLPH,LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	52351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238595538	238595801	238595647	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	61319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	239080379	239080669	239080523	Y	NA	FAM132B,ILKAP	NA	NA	NA	NA	FAM132B	14756	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	239347857	239348510	239348285	Y	ASB1	ASB1	NA	NA	NA	NA	ASB1	14474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr2	239593183	239593431	239593307	Y	NA	NA	LOC151171	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	161242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	239772979	239773251	239773061	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	18306	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	239779123	239779526	239779330	Y	TWIST2	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	24450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	239870450	239870747	239870599	Y	NA	NA	LOC151171,TRAF3IP1,FLJ43879,MIR4786,TWIST2,HDAC4	IMR90	Hi-C	24141950	TWIST2	115777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	240196933	240197336	240197049	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	124012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	240267449	240267666	240267577	Y	HDAC4	NA	NA	NA	NA	NA	HDAC4	53682	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	241309624	241309945	241309791	Y	GPC1	NA	PP14571,GPC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPC1	63143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	242262018	242262304	242262161	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	7542	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	242300434	242300614	242300524	Y	NA	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	FARP2	6776	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	242365047	242365293	242365170	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARP2	71389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr2	242484648	242485001	242484705	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	11135	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr2	242485030	242485360	242485049	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	10776	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	247683	247718	247701	Y	NA	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1	NA	NA	NA	NA	C20orf96	21672	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	290672	290826	290757	Y	SOX12,NRSN2	C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4	NA	NA	NA	NA	SOX12	13381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	453687	453779	453733	Y	NA	TBC1D20	NA	NA	NA	NA	TBC1D20	12490	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	1258531	1258969	1258603	Y	NA	SNPH	FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	SNPH	13571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	1333597	1333845	1333762	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	37961	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	1338546	1338920	1338732	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	32886	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	1398801	1399138	1399021	Y	FKBP1A	FKBP1A	SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495	IMR90	Hi-C	24141950	FKBP1A	26995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	1744868	1745008	1744937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPG	108443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	1757222	1757297	1757260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115857	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	1757792	1758093	1758078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	115061	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	1790289	1790734	1790591	Y	NA	NA	SIRPA,STK35	IMR90	Hi-C	24141950	SIRPA	82420	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	2648841	2649036	2648938	Y	NA	NOP56,SNORD110,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4	EBF4	IMR90	Hi-C	24141950	RP4-686C3.7	5843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	2855066	2855678	2855300	Y	NA	VPS16,PTPRA	NA	NA	NA	NA	PTPRA	12236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	3156363	3156554	3156472	Y	EBF4,PTPRA,PTPRA,OXT,AVP,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	17521	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	3472887	3473113	3473000	Y	NA	ATRN	NA	NA	NA	NA	ATRN	23200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	3660633	3661051	3660900	Y	CENPB,ADAM33	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM33	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	3788108	3788452	3788409	Y	NA	C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS	NA	NA	NA	NA	CDC25B	22530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	3932717	3933076	3932937	Y	NA	NA	MIR103B2,PANK2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF24	61153	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr20	3961377	3961729	3961667	Y	PANK2,PANK2,RNF24,RNF24	RNF24,FTLP3	NA	NA	NA	NA	RNF24	32500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	4063526	4063882	4063813	Y	NA	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	35745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	4116351	4116485	4116423	Y	PANK2,PANK2,SMOX	SMOX	ADRA1D,SMOX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	16724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	4487937	4488131	4488040	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP2	120734	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	4906931	4907179	4907055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORA31	59301	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	4970261	4970448	4970382	Y	NA	SLC23A2	RASSF2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	18491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	5046140	5046913	5046758	Y	PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2	NA	SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC23A2	57201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	5512444	5512652	5512587	Y	CDS2,TRMT6,CHGB,GPCPD1	NA	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	77020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	5628590	5628895	5628813	Y	TRMT6,GPCPD1	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	38918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	5637936	5638327	5638312	Y	NA	GPCPD1	C20orf196,GPCPD1,TRMT6	IMR90	Hi-C	24141950	GPCPD1	48264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	6032121	6032454	6032230	Y	LRRN4	CRLS1,LRRN4	NA	NA	NA	NA	LRRN4	241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	6094285	6094396	6094341	Y	NA	FERMT1	NA	NA	NA	NA	FERMT1	7795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	6594261	6594618	6594466	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	151693	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	6975107	6975482	6975156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMP2	228796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	7822678	7823042	7822860	Y	NA	NA	BMP2,HAO1,FERMT1	IMR90	Hi-C	24141950	TMX4	175434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	9032235	9032553	9032394	Y	NA	PLCB4	PLCB1,PLCB4	IMR90	Hi-C	24141950	PLCB4	14857	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	9089602	9089856	9089687	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	42192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	9100209	9100421	9100248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	52799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	9384292	9384675	9384295	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	336882	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	9435541	9435717	9435640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	388131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	10471502	10471750	10471599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKS	58632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	13734374	13734725	13734663	Y	NA	ESF1	NA	NA	NA	NA	ESF1	28807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	16555525	16555956	16555640	Y	NA	KIF16B	NA	NA	NA	NA	KIF16B	3447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	17830512	17830807	17830760	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110782	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	17830949	17831353	17831268	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD17	110236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	17876337	17876490	17876431	Y	NA	NA	BANF2,BFSP1,RRBP1,DSTN,SNX5,C20orf72	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORD17	65099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	18686203	18686430	18686281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DTD1	119666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr20	19414673	19414939	19414806	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC24A3	223383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	19796265	19796476	19796342	Y	RIN2,RIN2	NA	RIN2,SLC24A3,NAA20	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	59913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	19967147	19967464	19967305	Y	NA	NAA20	NA	NA	NA	NA	NAA20	28296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	21417020	21417216	21417107	Y	NA	NA	XRN2	IMR90	Hi-C	24141950	NKX2-2	75448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr20	21490493	21490731	21490612	Y	NA	NKX2-2	NA	NA	NA	NA	NKX2-2	1933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	22744166	22744500	22744407	Y	THBD	NA	THBD,NXT1,NAPB	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	283878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	22776496	22776845	22776664	Y	NA	NA	GZF1,NXT1	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	251533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	22842612	22842915	22842803	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	THBD	185463	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	23031353	23032100	23031620	Y	GZF1,THBD,CD93	THBD	NA	NA	NA	NA	THBD	2975	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	23122999	23123199	23123050	Y	THBD,CD93,NXT1,GZF1,CST3	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	94621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	24007941	24008193	24008043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CST3	390831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	25214082	25214352	25214216	Y	ENTPD6,PYGB	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	12353	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	25291624	25291957	25291812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PYGB	64919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr20	25671297	25671837	25671511	Y	NA	ZNF337	NA	NA	NA	NA	ZNF337	3640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	30161920	30162316	30162154	Y	NA	ID1	NA	NA	NA	NA	ID1	28770	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	30183712	30184220	30184085	Y	ID1	ID1	HM13	MCF7	ChIA-PET	22265404	ID1	6866	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	30249247	30249862	30249570	Y	TTLL9	NA	NA	NA	NA	NA	ID1	58161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	30263480	30263875	30263840	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	45917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	30266315	30266710	30266574	Y	NA	BCL2L1	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	43082	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	30292336	30292785	30292516	Y	NA	BCL2L1,TPX2	COX4I2	IMR90	Hi-C	24141950	BCL2L1	17007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	30301047	30301377	30301326	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	30307720	30308274	30308104	Y	POFUT1	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	1518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr20	31170393	31170766	31170763	Y	NA	C20orf112	NA	NA	NA	NA	C20orf112	110	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	32321714	32321896	32321832	Y	NA	E2F1,PXMP4,ZNF341	NA	NA	NA	NA	ZNF341	4251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	32400902	32401106	32400958	Y	CHMP4B	CHMP4B	NA	NA	NA	NA	CHMP4B	3792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	32803033	32803441	32803244	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	94167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33064297	33064587	33064427	Y	ACSS2	FDX1P1,DYNLRB1	NA	NA	NA	NA	FDX1P1	2018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	33150860	33150919	33150894	Y	NA	DYNLRB1,MAP1LC3A	NA	NA	NA	NA	MAP1LC3A	18202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33491673	33492056	33491689	Y	TP53INP2,ACSS2	ACSS2,GGT7,GSS	NA	NA	NA	NA	GGT7	33010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33643621	33643805	33643685	Y	TP53INP2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	34869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33646463	33646512	33646488	Y	TP53INP2,MYH7B	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	32162	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33699049	33699250	33699220	Y	TRPC4AP,EDEM2	TRPC4AP	NA	NA	NA	NA	TRPC4AP	20375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33803083	33803443	33803260	Y	NA	PROCR,MT1P3,MMP24	TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6	IMR90	Hi-C	24141950	MT1P3	369	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33896147	33896435	33896303	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	25359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr20	33899361	33899545	33899443	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	28573	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33900177	33900484	33900409	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	NA	NA	NA	NA	EIF6	29389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	33906285	33906606	33906471	Y	GSS,EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	35497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	33907005	33907177	33907091	Y	EIF6,EIF6	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	33907745	33907913	33907842	Y	MMP24,GDF5	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	36957	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	33908268	33908438	33908376	Y	NA	EDEM2,EIF6	FAM83C,EIF6	HELA	5C	22955621	EIF6	37480	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr20	34303643	34304038	34303890	Y	NA	ROMO1,NFS1,RBM39	NA	NA	NA	NA	NFS1	18362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	34330989	34331372	34331294	Y	SPAG4,SCAND1,SCAND1,PHF20,RBM39	ROMO1,NFS1,RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	RBM39	2755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	34463368	34463773	34463624	Y	NFS1	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	9808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	34471781	34472424	34472101	Y	NA	RNU4-40P	NA	NA	NA	NA	RNU4-40P	1157	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	34566043	34566286	34566130	Y	RBM39	SCAND1	NA	NA	NA	NA	SCAND1	20649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	35102828	35103254	35103050	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYL9	64633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	35234952	35235695	35235080	Y	NA	TGIF2,C20orf24	NA	NA	NA	NA	C20orf24	2815	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	35464098	35464342	35464182	Y	RBL1,DSN1,DSN1	NA	NA	NA	NA	NA	DSN1	63877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr20	35490387	35490628	35490526	Y	MANBAL,KIAA0889	NA	KIAA0889	MCF7	ChIA-PET	22265404	SAMHD1	87618	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr20	35612420	35612442	35612434	Y	RBL1	SAMHD1	NA	NA	NA	NA	SAMHD1	34174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	35723463	35723698	35723601	Y	NA	RBL1	NA	NA	NA	NA	RBL1	1275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36034782	36035452	36035129	Y	C20orf132,VSTM2L,NNAT	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	36484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	36056702	36057072	36056829	Y	NA	RPL7AP14	NA	NA	NA	NA	RPL7AP14	14864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	21440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36154671	36154957	36154793	Y	BLCAP,BLCAP,BLCAP	BLCAP	NA	NA	NA	NA	BLCAP	338	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36616982	36617239	36617111	Y	NA	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	42631	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36621379	36621533	36621455	Y	NNAT,VSTM2L	TTI1,RPRD1B	NA	NA	NA	NA	TTI1	38337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	36796708	36797026	36796907	Y	CTNNBL1,RPRD1B,RALGAPB,BPI	TGM2	TGM2	MCF7	ChIA-PET	22265404	TGM2	3728	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	37229958	37230063	37230010	Y	ARHGAP40	NA	NA	NA	NA	NA	RALGAPB	130499	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	37678805	37678873	37678867	Y	SLC32A1,PPP1R16B	NA	NA	NA	NA	NA	DHX35	89863	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	38910785	38911109	38910947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFB	404771	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	39620099	39620424	39620302	Y	MAFB,TOP1	TOP1	TOP1,PLCG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOP1	35034	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	39826598	39826945	39826630	Y	CHD6	NA	NA	NA	NA	NA	PLCG1	62998	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	39878072	39878223	39878164	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZHX3	66089	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	39938508	39938643	39938544	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	5669	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	39939044	39939335	39939233	Y	NA	ZHX3,LPIN3	ZHX3,PLCG1	IMR90	Hi-C	24141950	ZHX3	4977	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	39958158	39958419	39958360	Y	NA	ZHX3,LPIN3,EMILIN3	PLCG1,ZHX3,LPIN3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LPIN3	9141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr20	40247725	40248017	40247738	Y	NA	CHD6	NA	NA	NA	NA	CHD6	2592	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	42286061	42286420	42286177	Y	SRSF6,L3MBTL1,MYBL2	MYBL2	MYBL2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	7334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr20	42379932	42380273	42380130	Y	NA	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	86178	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	42381187	42381490	42381296	Y	C20orf111	NA	TOX2	IMR90	Hi-C	24141950	MYBL2	87433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	42571412	42571561	42571487	Y	C20orf111	TOX2	NA	NA	NA	NA	TOX2	29908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	43238683	43239068	43238831	Y	NA	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	39806	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	43272652	43273023	43272879	Y	C20orf111,STK4,ADA	ADA,RP11-445H22.3	NA	NA	NA	NA	ADA	5851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	43582253	43582415	43582335	Y	NA	PABPC1L,TOMM34,STK4	NA	NA	NA	NA	TOMM34	4712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	KCNS1	NA	NA	NA	NA	KCNS1	37405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	43767332	43767709	43767669	Y	NA	KCNS1,PI3	STK4,MATN4,RBPJL	IMR90	Hi-C	24141950	PI3	33808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	43965327	43965544	43965453	Y	SDC4	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2	NA	NA	NA	NA	SDC4	9520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	44001576	44001658	44001579	Y	WFDC11,KCNS1,TP53TG5,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2,DBNDD2	SDC4,SYS1,SYS1-DBNDD2,PIGT	NA	NA	NA	NA	SYS1-DBNDD2	11736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	44410242	44410504	44410445	Y	NA	WFDC3,DNTTIP1,UBE2C,SNX21	NA	NA	NA	NA	WFDC3	8067	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	44737026	44737345	44737160	Y	ZNF335,CD40	NCOA5,RPL13P2	SLC12A5,CD40	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL13P2	10869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	45006307	45006609	45006393	Y	PCIF1,ZNF335	SLC35C2	NA	NA	NA	NA	SLC35C2	15264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	45028892	45029133	45029011	Y	CD40	SLC35C2,ELMO2	NA	NA	NA	NA	ELMO2	30571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	45215788	45216003	45215896	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF334	75590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	45870109	45870518	45870490	Y	ZMYND8,NCOA3	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	108787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	45944502	45944683	45944617	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	34622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	32824	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr20	45960088	45960376	45960270	Y	ZMYND8	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	18929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	NA	NA	NA	NA	RP4-569M23.2	16091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	45987479	45988292	45987961	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	3912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	45989347	45989834	45989660	Y	SULF2	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,NCOA3	IMR90	Hi-C	24141950	ZMYND8	5780	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	46021549	46021674	46021604	Y	NA	RP4-569M23.2,ZMYND8	ZMYND8,LOC100131496,SLC2A10,EYA2,NCOA3,PARD6B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZMYND8	37982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.51004121538766
chr20	46738403	46738420	46738411	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF2	325043	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	47547466	47547777	47547635	Y	ZNFX1,ARFGEF2	ARFGEF2	NA	NA	NA	NA	ARFGEF2	11039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	47750965	47751079	47750977	Y	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	NA	STAU1	51825	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1,SNORD12B,SNORD12	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	47961628	47961789	47961714	Y	NA	NA	B4GALT5	IMR90	Hi-C	24141950	SNORD12	66408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	48165703	48166239	48166052	Y	PTGIS	PTGIS	NA	NA	NA	NA	PTGIS	16444	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48285223	48285402	48285313	Y	SPATA2,SLC9A8	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	43013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48291121	48291501	48291391	Y	ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	36914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48293445	48293839	48293746	Y	NA	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	34576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	48316345	48316673	48316621	Y	NA	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	11742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5,SNRPFP1	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	48383666	48383949	48383788	Y	ZNFX1,B4GALT5,SNAI1,RNF114,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNRPFP1	39287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48388811	48389348	48388940	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	37902	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48391675	48392320	48391995	Y	ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SNRPFP1,SLC9A8	B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	SLC9A8	34930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	48406651	48406821	48406652	Y	B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48406938	48407203	48407095	Y	B4GALT5,SNAI1,SLC9A8	SLC9A8	KCNB1,B4GALT5,SLC9A8,SPATA2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A8	20047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48838079	48838414	48838219	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	CEBPB	PTPN1,CEBPB,LOC284751,FAM65C,MIR645	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	32703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48868757	48869061	48868987	Y	NA	NA	PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB,LOC284751,PARD6B	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	63381	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	48900220	48901229	48900600	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	PTPN1,LOC284751,PARD6B,FAM65C,MIR645,CEBPB,TMEM189-UBE2V1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CEBPB	94844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	48903106	48903611	48903352	Y	NA	NA	LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB	IMR90	Hi-C	24141950	CEBPB	97730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	49055532	49055924	49055757	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	68967	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	49057048	49057261	49057196	Y	SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1	NA	LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,PTPN1,FAM65C	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	67630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	49100027	49100544	49100221	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTPN1	24347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	49134968	49135201	49135019	Y	TMEM189,CEBPB,PTPN1	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	10077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	49157621	49157908	49157761	Y	NA	PTPN1	NA	NA	NA	NA	PTPN1	32730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	49346260	49347200	49346344	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	179	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	49350102	49350473	49350150	Y	NA	PARD6B	NA	NA	NA	NA	PARD6B	4021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	49407275	49407470	49407371	Y	MOCS3	BCAS4	ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCAS4	1961	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr20	49539044	49539098	49539071	Y	NA	RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3	NA	NA	NA	NA	RP5-914P20.5	6423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	49838536	49838841	49838768	Y	NA	NA	KCNG1	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	200870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	49947847	49948420	49948354	Y	NA	NA	KCNG1,NFATC2,ATP9A,BCAS4,DPM1,MOCS3	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	310181	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	50059094	50059263	50059179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	289809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	50072988	50073809	50073517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	275263	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	50145650	50145911	50145725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	203161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	50247670	50248383	50248096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-827A12.2	100689	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	50366772	50367203	50366881	Y	ZFP64,ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	15970	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	50383575	50384083	50383723	Y	ATP9A	RP5-827A12.2,ATP9A	NA	NA	NA	NA	ATP9A	402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	50601567	50601698	50601647	Y	NA	NA	ATP9A,SALL4,NFATC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-1112F19.2	124116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	51071156	51071538	51071347	Y	NA	NA	BCAS1,TSHZ2	IMR90	Hi-C	24141950	ZFP64	252309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	51109650	51109945	51109791	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	290803	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	51110040	51110185	51110129	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	291193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52195343	52195714	52195527	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	28732	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	52239995	52240318	52240062	Y	ZNF217	ZNF217	SUMO1P1,BMP7,BCAS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	15549	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr20	52390351	52390640	52390407	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	165905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52445816	52446339	52446069	Y	ZNF217	NA	ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	221370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr20	52483715	52484176	52483911	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF217	259269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52532315	52532889	52532591	Y	ZNF217	NA	SUMO1P1,BMP7,ZNF217	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYP24A1	255623	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	52543055	52543571	52543250	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	244941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	52749873	52750284	52750109	Y	NA	CYP24A1	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	38228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	52753645	52754029	52753762	Y	NA	CYP24A1	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	34483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	52784442	52785020	52784595	Y	PFDN4	CYP24A1,PFDN4	NA	NA	NA	NA	CYP24A1	3492	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	54997703	54998108	54997901	Y	NA	AURKA,CSTF1,CASS4	NA	NA	NA	NA	CASS4	12535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	55014874	55015273	55015037	Y	CASS4,CASS4,C20orf43	AURKA,CSTF1,CASS4	NA	NA	NA	NA	CASS4	29706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	55362710	55362938	55362792	Y	AURKA,TFAP2C	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	160352	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	55363467	55363682	55363577	Y	NA	NA	TFAP2C	MCF7	ChIA-PET	22265404	TFAP2C	161109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	55750465	55750757	55750669	Y	RAE1,RAE1,BMP7	NA	NA	NA	NA	NA	RAE1	173309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	56566291	56566641	56566399	Y	NA	NA	ZBP1,PMEPA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PMEPA1	281699	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	57228113	57228577	57228221	Y	NA	STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1	NA	NA	NA	NA	STX16-NPEPL1	3623	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	57420469	57420802	57420636	Y	NA	GNAS,GNAS-AS1,RP1-309F20.3	NA	NA	NA	NA	GNAS-AS1	3156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	57579440	57580501	57580194	Y	NA	ATP5E,SLMO2	NA	NA	NA	NA	CTSZ	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	58957250	58957289	58957270	Y	NA	NA	LOC284757	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf197	328270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	59761167	59761446	59761307	Y	NA	NA	CDH26,LOC284757,C20orf197,CDH4	IMR90	Hi-C	24141950	CDH4	64036	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	59828827	59829192	59829064	Y	CDH4	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	3345	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	59871380	59871440	59871410	Y	NA	CDH4	NA	NA	NA	NA	CDH4	45898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60095984	60096281	60096088	Y	CDH4	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	270502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60103711	60103923	60103817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH4	278229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60719468	60719634	60719593	Y	SS18L1,GTPBP5	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	2646	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	60735261	60735480	60735370	Y	NA	LSM14B,PSMA7,SS18L1	NA	NA	NA	NA	SS18L1	18439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60875997	60876347	60876165	Y	GATA5,CABLES2	ADRM1	NA	NA	NA	NA	ADRM1	848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60935306	60935741	60935523	Y	NA	LAMA5,RPS21,CABLES2	ADRM1	K562	ChIA-PET	22265404	LAMA5	4627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	60941528	60941750	60941608	Y	SLCO4A1,ADRM1,LAMA5	LAMA5,RPS21,CABLES2	NA	NA	NA	NA	LAMA5	1160	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61076779	61077313	61077048	Y	DPH3P1,OGFR,DIDO1	GATA5	NA	NA	NA	NA	GATA5	27753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61192605	61193059	61192901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	78738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61283206	61283870	61283565	Y	OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1	SLCO4A1	NA	NA	NA	NA	SLCO4A1	11409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61425509	61425950	61425706	Y	DPH3P1,DIDO1,OGFR	OGFR	NA	NA	NA	NA	OGFR	8237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr20	61555881	61556606	61556058	Y	DIDO1	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	10698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61560348	61560848	61560731	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	DIDO1	6456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	61585167	61585546	61585389	Y	NA	DIDO1,SLC17A9	NA	NA	NA	NA	SLC17A9	3115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	62085174	62085706	62085468	Y	BHLHE23,NKAIN4,CHRNA4,SRMS,UCKL1,STMN3,RTEL1,EEF1A2,KCNQ2	KCNQ2,EEF1A2	NA	NA	NA	NA	KCNQ2	16287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	62276090	62276438	62276124	Y	CHRNA4,KCNQ2,EEF1A2,ABHD16B,STMN3	GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1,TNFRSF6B	NA	NA	NA	NA	STMN3	6342	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr20	62313782	62314225	62314041	Y	NA	STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1	NA	NA	NA	NA	TNFRSF6B	11796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr20	62609214	62609358	62609321	Y	SAMD10	UCKL1,SAMD10,PRPF6	NA	NA	NA	NA	SAMD10	3	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr20	62887659	62888425	62887862	Y	SAMD10,PCMTD2	PCMTD2	NA	NA	NA	NA	PCMTD2	2565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	16222795	16222981	16222977	Y	NA	AF127936.7	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AF127936.7	29315	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	16251857	16252256	16251994	Y	SAMSN1,NRIP1	AF127936.7	NRIP1	IMR90	Hi-C	24141950	AF127936.7	40	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	16368229	16368687	16368553	Y	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NA	NRIP1	66634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	6.69344324103375
chr21	16431175	16431558	16431528	Y	NA	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	3763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr21	16435480	16435873	16435862	Y	NRIP1	NRIP1	NA	NA	NA	NA	NRIP1	159	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr21	16596629	16597038	16596898	Y	NRIP1	NA	NRIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NRIP1	161308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	17959400	17959753	17959559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	859056	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	23538013	23538045	23538029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCAM2	1169380	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	26442947	26442960	26442954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	489261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	26952057	26952278	26952105	Y	JAM2	MIR155HG,MRPL39	NA	NA	NA	NA	MIR155HG	19836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	28218728	28219247	28219071	Y	ADAMTS5,ADAMTS1	ADAMTS1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS1	3000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	28795435	28795716	28795624	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	458603	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	28796596	28796902	28796773	Y	NA	NA	ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	459764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	28942556	28942990	28942803	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	605724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	28945118	28945334	28945247	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5,MIR4759	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS5	608286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	30005077	30005224	30005162	Y	NA	NA	ADAMTS1,LINC00161	IMR90	Hi-C	24141950	N6AMT1	250469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr21	30544724	30544884	30544768	Y	USP16,BACH1,BACH1	U3,BACH1	NA	NA	NA	NA	U3	6076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	31012223	31012655	31012489	Y	BACH1,BACH1	NA	NA	NA	NA	NA	BACH1	447831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	33702310	33702533	33702421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIS18A	52930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	33893754	33894020	33893930	Y	C21orf63	NA	NA	NA	NA	NA	C21orf59	89156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	34576237	34576546	34576341	Y	SON,IL10RB,IFNGR2,IFNAR1,GART,GART,SYNJ1,SYNJ1,IFNAR2	IFNAR2	IL10RB,TMEM50B,IFNAR1,IFNGR2,IFNAR2,LOC100288432	IMR90	Hi-C	24141950	IFNAR2	23660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	35057919	35058071	35057938	Y	NA	ITSN1,CRYZL1	NA	NA	NA	NA	CRYZL1	43687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	35925582	35925949	35925790	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	59492	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	36222572	36222954	36222768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	237131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36223731	36223900	36223856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	238290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36233216	36233747	36233583	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	247775	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36234553	36234896	36234857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	249112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36254204	36254725	36254297	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	268763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36263020	36263336	36263172	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	277579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36356108	36356416	36356285	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	370667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	36418469	36418852	36418527	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36419290	36419780	36419662	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	433849	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	36423642	36423856	36423739	Y	RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	438201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36458819	36458923	36458887	Y	NA	NA	RUNX1	IMR90	Hi-C	24141950	RCAN1	473378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	36577614	36577815	36577724	Y	NA	NA	RUNX1,SETD4,CLIC6,LOC100506385	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RCAN1	592173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr21	36936186	36936505	36936342	Y	NA	NA	RUNX1,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	438460	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	37069612	37069858	37069854	Y	NA	NA	CLIC6,RUNX1,LOC100506385,SETD4	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	305107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	37712607	37712952	37712729	Y	NA	MORC3,CHAF1B	NA	NA	NA	NA	MORC3	22120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38072912	38073314	38073050	Y	SIM2	SIM2	HLCS	IMR90	Hi-C	24141950	SIM2	3479	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38232574	38232719	38232637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	104093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38282263	38282520	38282368	Y	CLDN14	NA	NA	NA	NA	NA	AP000704.5	54292	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38630405	38630786	38630710	Y	DYRK1A,DYRK1A	AP001432.14,DSCR3	NA	NA	NA	NA	DSCR3	7476	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38801876	38802213	38802018	Y	DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	65784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	38986410	38986680	38986546	Y	KCNJ6	NA	NA	NA	NA	NA	DYRK1A	250318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	39783656	39783977	39783909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS2	391254	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	40691878	40692008	40691991	Y	NA	BRWD1,HMGN1	NA	NA	NA	NA	BRWD1	393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	40753076	40753485	40753292	Y	WRB	HMGN1,WRB	NA	NA	NA	NA	WRB	2906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	40814197	40814412	40814270	Y	NA	LCA5L,SH3BGR	NA	NA	NA	NA	LCA5L	1319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	42485232	42485526	42485376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACE2	52202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr21	43062216	43062499	43062352	Y	MX1	NA	PRDM15,RIPK4	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA32	153083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	43331076	43331447	43331406	Y	NA	PRDM15,C2CD2	NA	NA	NA	NA	PRDM15	33485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	44753663	44753942	44753875	Y	NA	NA	LINC00313,HSF2BP,SIK1,LINC00319	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	91066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	44816664	44817004	44816885	Y	NA	SIK1	NA	NA	NA	NA	SIK1	28004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	44913472	44913707	44913565	Y	PDXK	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	16058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	44914466	44914931	44914660	Y	PDXK,U2AF1,SIK1	LINC00313	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B,LINC00313	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00313	17052	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.6773772964135
chr21	45117744	45118082	45118052	Y	NA	HSF2BP,RRP1B,PDXK	PDXK	IMR90	Hi-C	24141950	PDXK	18893	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	45132062	45132504	45132250	Y	HSF2BP,PDXK	PDXK	NA	NA	NA	NA	PDXK	4471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	45187861	45188442	45188176	Y	ICOSLG,PDXK,CSTB	CSTB,RRP1	NA	NA	NA	NA	CSTB	5884	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	45337582	45337952	45337767	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT3	54515	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	45573018	45573302	45573138	Y	PDXK,CSTB,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	21531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	45573584	45574271	45573954	Y	PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	22097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	45574660	45575436	45575042	Y	NA	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	23173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	45943778	45945170	45944363	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC3	70409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46294509	46294819	46294590	Y	ITGB2	PTTG1IP	NA	NA	NA	NA	PTTG1IP	2757	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46298625	46298957	46298811	Y	ITGB2	PTTG1IP	PTTG1IP	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PTTG1IP	6873	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46387960	46388437	46388173	Y	POFUT2,ITGB2	FAM207A,LINC00162	NA	NA	NA	NA	FAM207A	30035	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46437821	46438082	46437937	Y	NA	LINC00162	LINC00162,ADARB1,SSR4P1,FAM207A,LINC00163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00162	15179	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46461202	46461645	46461341	Y	ITGB2,ADARB1	LINC00162,ADARB1	ADARB1,SSR4P1	K562	ChIA-PET	22265404	ADARB1	30123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	46470710	46471152	46470922	Y	NA	LINC00162,ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	20616	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr21	46496242	46496452	46496442	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	4474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	46501791	46502122	46501857	Y	NA	ADARB1	NA	NA	NA	NA	ADARB1	10023	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46783934	46784395	46784118	Y	NA	COL18A1	ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	COL18A1	38657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr21	46891281	46891413	46891347	Y	NA	NA	SLC19A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL18A1	68229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	46937763	46937981	46937791	Y	POFUT2,SLC19A1,SLC19A1	SLC19A1	NA	NA	NA	NA	SLC19A1	24344	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	47394030	47394545	47394409	Y	LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1	COL6A1	COL6A1	K562	ChIA-PET	22265404	COL6A1	5106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	47469357	47469652	47469491	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	46359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	17306294	17306463	17306397	Y	IL17RA,CECR1	NA	NA	NA	NA	NA	TPTEP1	225517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	17652206	17652871	17652785	Y	NA	CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5	NA	NA	NA	NA	CECR5	8029	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	18155331	18155602	18155421	Y	NA	ATP6V1E1,BCL2L13	NA	NA	NA	NA	BCL2L13	45710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	18402838	18403339	18403237	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	101986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	18452405	18452779	18452681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL3	52546	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr22	19869401	19869687	19869604	Y	NA	C22orf29,GNB1L	NA	NA	NA	NA	GNB1L	28939	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	20772547	20772776	20772578	Y	PI4KA	ZNF74,SCARF2	NA	NA	NA	NA	SCARF2	17370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	20863506	20864089	20863850	Y	MED15	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	15306	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	20885626	20885829	20885752	Y	NA	KLHL22,MED15	NA	NA	NA	NA	MED15	37426	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	20923375	20923909	20923414	Y	THAP7,MED15	NA	NA	NA	NA	NA	MED15	75175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	22010846	22011267	22010978	Y	YPEL1	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	6287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	22011632	22012115	22011859	Y	NA	YDJC,SDF2L1,PPIL2	NA	NA	NA	NA	PPIL2	7073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	22205229	22205454	22205405	Y	NA	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	14516	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	22219429	22219677	22219523	Y	HIC2,MAPK1	MAPK1	NA	NA	NA	NA	MAPK1	293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	23552686	23553004	23552762	Y	NA	BCR	NA	NA	NA	NA	BCR	32795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	24255997	24256450	24256302	Y	C22orf43,CABIN1,CABIN1	MIF	NA	NA	NA	NA	MIF	21806	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	25348731	25349104	25348989	Y	NA	NA	SGSM1,KIAA1671,TMEM211	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGSM1	148495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	25354945	25355076	25355012	Y	NA	NA	KIAA1671,SGSM1,TMEM211	IMR90	Hi-C	24141950	SGSM1	154709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	25381840	25382180	25381995	Y	NA	NA	KIAA1671	IMR90	Hi-C	24141950	SGSM1	181604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	27508990	27509624	27509325	Y	NA	NA	PITPNB,MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	RP5-1172A22.1	109064	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	28114157	28114741	28114406	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	80745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	28262860	28262973	28262918	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	50391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	28536034	28536328	28536157	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	221912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	29319930	29320200	29320120	Y	NA	ZNRF3	NA	NA	NA	NA	ZNRF3	42350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	30018031	30018407	30018261	Y	NF2	NIPSNAP1,NF2	NA	NA	NA	NA	NF2	20486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	30591785	30593544	30592394	Y	NA	LIF	NA	NA	NA	NA	LIF	47296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	30601535	30602099	30601994	Y	MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF	LIF	HORMAD2,LIF,GATSL3	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	38741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	30651841	30652045	30651989	Y	RNF215	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	11001	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	30653574	30654311	30654075	Y	RNF215,GAL3ST1	LIF,GATSL3	LIF	IMR90	Hi-C	24141950	LIF	12734	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	31226011	31226350	31226247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUG1	138313	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	31298089	31298190	31298144	Y	NA	NA	MORC2,MORC2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	TUG1	66473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	31629034	31629491	31629163	Y	SMTN,RNF185,LIMK2	LIMK2	NA	NA	NA	NA	LIMK2	22809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	32446579	32447120	32446852	Y	NA	SC22CB-1E7.1	NA	NA	NA	NA	SC22CB-1E7.1	13102	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	32615051	32615519	32615197	Y	DEPDC5	RP1-90G24.10	RFPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-90G24.10	15949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	32737226	32737568	32737481	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	131095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	33252376	33252746	33252411	Y	NA	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	1674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	36325608	36325959	36325784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBFOX2	96514	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	36727482	36728450	36727733	Y	APOL3	NA	NA	NA	NA	NA	MYH9	53613	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	36753062	36753318	36753212	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	28745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	36762359	36762844	36762518	Y	APOL3,APOL3,APOL2,APOL2	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	19219	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	36763287	36763361	36763324	Y	NA	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	18702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	37275963	37276175	37276111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT27	105663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	37490501	37490532	37490517	Y	NA	KCTD17	NA	NA	NA	NA	KCTD17	44722	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	37582993	37583226	37583109	Y	NA	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	C1QTNF6	10199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	37638328	37638951	37638750	Y	SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4	C1QTNF6,Z82188.1	NA	NA	NA	NA	RAC2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr22	37897761	37897917	37897872	Y	NA	CARD10	NA	NA	NA	NA	CARD10	15632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	38139873	38139989	38139967	Y	NA	TRIOBP	H1F0,GCAT	IMR90	Hi-C	24141950	TRIOBP	48862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	38711439	38711868	38711815	Y	SUN2,SUN2,JOSD1,GTPBP1,PLA2G6,PLA2G6	TMEM184B	NA	NA	NA	NA	TMEM184B	44399	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	39572231	39572423	39572299	Y	TOMM22,PDGFB	CBX7	PDGFB,SNORD83A,RNU86,SNORD83B,RPL3	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CBX7	25552	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	39608827	39609203	39608881	Y	NA	PDGFB	NA	NA	NA	NA	PDGFB	29553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	39649567	39649736	39649595	Y	SUN2,APOBEC3A,PDGFB	PDGFB	CBX7,RNU86,RPL3,SNORD83A,PDGFB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDGFB	10811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	39801832	39802048	39801979	Y	NA	TAB1	NA	NA	NA	NA	TAB1	8086	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	39854172	39854554	39854368	Y	CBX7,SYNGR1,MGAT3,MGAT3	NA	NA	NA	NA	NA	ATF4	59146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41047729	41047883	41047796	Y	NA	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17023	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41079087	41079368	41079234	Y	MCHR1	MKL1,GAPDHP37	NA	NA	NA	NA	GAPDHP37	10632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41259898	41259909	41259904	Y	NA	SLC25A17,ST13,XPNPEP3	NA	NA	NA	NA	XPNPEP3	8817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	41346258	41346618	41346399	Y	EP300	RBX1	NA	NA	NA	NA	RBX1	907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41417973	41418366	41418067	Y	MKL1,EP300	RP11-12M9.3	ST13,RBX1,MIR1281,EP300	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-12M9.3	39690	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41684313	41684541	41684479	Y	PPPDE2,RANGAP1	RANGAP1,ZC3H7B	NA	NA	NA	NA	RANGAP1	4058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	41809427	41810696	41809981	Y	CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF	TEF,TOB2	NA	NA	NA	NA	TOB2	30331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	41844337	41844774	41844650	Y	SHISA8,TEF,TEF,TOB2	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	3310	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	42063539	42063782	42063553	Y	NA	XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	19161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	42073632	42073949	42073667	Y	TOB2	C22orf46,NHP2L1,MEI1	NA	NA	NA	NA	C22orf46	8994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	43327460	43327806	43327638	Y	NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	75348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	43369248	43369530	43369410	Y	PACSIN2,PACSIN2	PACSIN2	NA	NA	NA	NA	PACSIN2	39621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	44417424	44417686	44417555	Y	PARVB	PARVB	NA	NA	NA	NA	PARVB	24333	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	45080339	45080681	45080664	Y	PRR5	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	PARVB,KIAA1644,SAMM50	IMR90	Hi-C	24141950	PRR5-ARHGAP8	15432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	45081354	45081559	45081463	Y	NA	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	PARVB,KIAA1644,SAMM50	IMR90	Hi-C	24141950	PRR5-ARHGAP8	14554	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	45944996	45945587	45945178	Y	NA	FBLN1	NA	NA	NA	NA	FBLN1	48878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	46325366	46325760	46325504	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	45249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46374166	46374684	46374539	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3157	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46374858	46375446	46375153	Y	NA	WNT7B	NA	NA	NA	NA	WNT7B	3849	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46392166	46392677	46392532	Y	C22orf26	WNT7B	C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7B	21157	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46432742	46433091	46432929	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.3	14494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	1169	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	4143	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	46472616	46472825	46472697	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	8845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr22	46474643	46475112	46474791	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	10872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	17110	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr22	46483894	46484294	46483949	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763	NA	NA	NA	NA	RP6-109B7.4	20123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr22	46812032	46812341	46812187	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRMU	87260	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	47149923	47150411	47150155	Y	NA	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	6107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	49768624	49768992	49768711	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	450168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.68541026872363
chr22	49769098	49769971	49769308	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRD1	449189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50327730	50328489	50328002	Y	TRABD,SELO,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	17624	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	50329443	50330313	50330025	Y	TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1	CRELD2,ALG12,PIM3	NA	NA	NA	NA	ALG12	19337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50345940	50346570	50346146	Y	NA	CRELD2,ALG12,PIM3	PLXNB2	MCF7	ChIA-PET	22265404	PIM3	5591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50364350	50364715	50364589	Y	NA	PIM3	NA	NA	NA	NA	PIM3	12189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr22	50742925	50743370	50743124	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	686	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50743436	50743850	50743726	Y	PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr22	50744748	50744986	50744827	Y	PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr22	50815545	50815813	50815668	Y	MOV10L1,MOV10L1,SELO,MAPK8IP2,FAM116B	PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PPP6R2	35812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50912071	50912698	50912340	Y	NA	SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2	NA	NA	NA	NA	SBF1	617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr22	50976592	50977006	50976816	Y	PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B	LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B	NA	NA	NA	NA	ODF3B	7583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	3219649	3219829	3219819	Y	NA	CRBN	NA	NA	NA	NA	CRBN	255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	4392615	4392774	4392664	Y	ITPR1	SETMAR	NA	NA	NA	NA	SETMAR	49627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	NA	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	108002	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	5028534	5029013	5028702	Y	ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	9733	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	17769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	5059566	5059965	5059743	Y	ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	40765	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	5063521	5063694	5063575	Y	EDEM1,ARL8B,BHLHE40	BHLHE40	BHLHE40,ITPR1,EGOT	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	BHLHE40	44720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	5181258	5181597	5181446	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	EDEM1	IMR90	Hi-C	24141950	ARL8B	19353	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	5191163	5191386	5191276	Y	BHLHE40,ARL8B,EDEM1	ARL8B,AC026202.3,EDEM1	NA	NA	NA	NA	ARL8B	29258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	7393024	7393352	7393188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMCD1	1148041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	8781836	8782151	8782020	Y	NA	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	27163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	8783302	8783537	8783436	Y	NA	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	25777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	8802643	8803023	8802833	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	6291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	8911307	8911734	8911565	Y	OXTR	NA	NA	NA	NA	NA	RAD18	91723	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	9422978	9423353	9423146	Y	SETD5,RAD18,THUMPD3	THUMPD3,SRGAP3,SETD5,SETD5-AS1	NA	NA	NA	NA	SETD5	13946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	9926228	9926446	9926367	Y	LOC401052,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,CIDEC,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC	RPUSD3,JAGN1,IL17RE,IL17RC,CRELD1	IL17RE,IL17RC,JAGN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	JAGN1	3792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	10231143	10231913	10231419	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	26594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	10240691	10241307	10240999	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	36142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	10588598	10588714	10588656	Y	ATP2B2	NA	ATP2B2	IMR90	Hi-C	24141950	SEC13	227736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	11230556	11230841	11230699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	53777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	11237617	11237805	11237677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRH1	60838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	11609664	11609798	11609746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	150422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	NUP210,HDAC11,HDAC11-AS1	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	13517617	13517913	13517760	Y	NA	HDAC11,HDAC11-AS1	HDAC11	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	HDAC11	1311	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	13580930	13581161	13581030	Y	FBLN2	NA	HDAC11,FBLN2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	HDAC11-AS1	61377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	13932354	13932493	13932424	Y	NA	WNT7A	C3orf19,WNT7A,TMEM43,CHCHD4	IMR90	Hi-C	24141950	WNT7A	12736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	13936849	13937176	13936976	Y	NA	WNT7A	C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	WNT7A	17231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	14457192	14457307	14457247	Y	NA	SLC6A6	NA	NA	NA	NA	SLC6A6	15116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	15704167	15704382	15704274	Y	ANKRD28,CAPN7	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	62829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	15780032	15780074	15780052	Y	SH3BP5,EAF1	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	119204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	15813744	15814005	15813933	Y	SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	85273	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	16024262	16024670	16024542	Y	NA	NA	ANKRD28,GALNTL2,MIR563	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	124984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	16101834	16102183	16102049	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	202296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	16102393	16102705	16102619	Y	NA	NA	GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	201774	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	16324333	16324353	16324342	Y	NA	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	19627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	16474276	16474529	16474346	Y	RFTN1	NA	NA	NA	NA	NA	RFTN1	79004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	17543312	17543623	17543461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLCL2	701153	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	18140643	18140862	18140682	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	343447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr3	19993428	19993925	19993635	Y	KAT2B,RAB5A	EFHB,RAB5A	NA	NA	NA	NA	RAB5A	6857	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	20096123	20096547	20096288	Y	RAB5A	KAT2B	NA	NA	NA	NA	KAT2B	16608	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HMGB1P5	381964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	24197996	24198283	24198140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NKIRAS1	211914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	25623618	25623990	25623898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOP2B	80408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	27574847	27574895	27574871	Y	NA	NA	AZI2,SLC4A7,NEK10,EOMES	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	50936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	27585968	27586230	27586099	Y	NA	NA	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	62057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr3	29225159	29225480	29225322	Y	NA	NA	RBMS3	IMR90	Hi-C	24141950	RBMS3	94993	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	29321469	29321877	29321696	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	29365730	29366225	29365913	Y	NA	RBMS3	NA	NA	NA	NA	RBMS3	45257	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	29735360	29735534	29735491	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	414887	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	29736457	29736614	29736535	Y	RBMS3	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	415984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	30383908	30384096	30384004	Y	TGFBR2	NA	TGFBR2,GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBR2	261898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	31207703	31207815	31207739	Y	STT3B	NA	GADL1	IMR90	Hi-C	24141950	STT3B	364315	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	31690891	31691368	31691073	Y	ZNF860,OSBPL10	NA	NA	NA	NA	NA	STT3B	118761	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	32434248	32434406	32434345	Y	NA	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	3085	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	32461951	32462075	32462013	Y	CMTM7	CMTM7	NA	NA	NA	NA	CMTM7	30788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	32526070	32526309	32526138	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	16591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	32535422	32535827	32535806	Y	NA	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	7073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	32715281	32715594	32715473	Y	NA	CNOT10	DYNC1LI1,CMTM6,CMTM8,CNOT10	IMR90	Hi-C	24141950	CNOT10	9043	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	33436260	33436332	33436276	Y	CLASP2,FBXL2,FBXL2	UBP1	NA	NA	NA	NA	UBP1	44531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	33837400	33837658	33837523	Y	CLASP2,PDCD6IP	PDCD6IP	NA	NA	NA	NA	PDCD6IP	186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	37164159	37164535	37164493	Y	NA	NA	MLH1	IMR90	Hi-C	24141950	LRRFIP2	58645	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	37332823	37333208	37333001	Y	NA	AC097359.1	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	49137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	37344922	37345358	37345096	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC097359.1	61236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	37901883	37902306	37902042	Y	CTDSPL	AC093415.2,CTDSPL	NA	NA	NA	NA	CTDSPL	432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	38072885	38073008	38072928	Y	PLCD1	VILL,PLCD1	NA	NA	NA	NA	PLCD1	3632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	38207945	38208258	38208101	Y	VILL,PLCD1,DLEC1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	3365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	39403059	39403330	39403251	Y	WDR48,XIRP1,XIRP1,CCR8,SLC25A38	SLC25A38,RPSA	NA	NA	NA	NA	SLC25A38	19509	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	42922564	42922793	42922612	Y	C3orf39	ZNF662	NA	NA	NA	NA	ZNF662	22430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	43427917	43428246	43428244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	101913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	43435481	43435714	43435568	Y	SNRK,ABHD5	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	109477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	44038399	44038801	44038781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR138-1	114903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	MIR138-1	112870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	13.5542225630933
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF660,ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	45106273	45106458	45106405	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	79456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45108122	45108262	45108201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCP1	77652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45140818	45140977	45140897	Y	NA	CDCP1	NA	NA	NA	NA	CDCP1	44937	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45157727	45158120	45157925	Y	CDCP1	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	27794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	45161726	45162069	45161866	Y	TMEM158	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	23845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45165992	45166137	45166089	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	19777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	45185924	45186005	45185965	Y	NA	CDCP1,RPS24P8	NA	NA	NA	NA	CDCP1	10	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45209101	45209416	45209191	Y	LIMD1	CDCP1,RPS24P8	LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPS24P8	9434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	45240276	45240388	45240335	Y	NA	RPS24P8,AC010170.1,TMEM158	NA	NA	NA	NA	AC010170.1	25131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	46600040	46600219	46600077	Y	NA	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	19370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	46671101	46671453	46671216	Y	CCDC12,PRSS45	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC2	51512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	47879431	47879730	47879653	Y	SPINK8	DHX30	NA	NA	NA	NA	DHX30	37032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	48128782	48129302	48129029	Y	NA	MAP4,RP11-1029M24.1	NA	NA	NA	NA	MAP4	13	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	50264852	50265230	50265012	Y	TUSC2,IP6K1,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	3128	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	50274525	50274666	50274593	Y	RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B	NA	NA	NA	NA	GNAI2	12801	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	50280819	50280975	50280878	Y	RASSF1,MAPKAPK3,IP6K1,UBA7,RBM5,GNAI2,GNAI2	SLC38A3,GNAI2,SEMA3B,IFRD2	NA	NA	NA	NA	GNAI2	19095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	51377903	51378233	51378113	Y	NA	MANF,RBM15B	NA	NA	NA	NA	MANF	42245	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	52079728	52079827	52079778	Y	DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	8739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	52080287	52080923	52080751	Y	NT5DC2,TWF2,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	7643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	52088878	52089257	52089156	Y	ACY1,DUSP7	DUSP7	NA	NA	NA	NA	DUSP7	312	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	52625235	52625395	52625315	Y	DNAH1,PBRM1	NA	NA	NA	NA	NA	NT5DC2	58165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	53270281	53270430	53270371	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	17638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	55178043	55178603	55178498	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	519801	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	55224453	55224624	55224517	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	RPS15P5	566211	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	56873709	56874050	56874038	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM208A	158444	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	57955527	57955938	57955800	Y	FLNB	FLNB	FLNB,ARF4	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	36189	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	57995926	57996426	57996121	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	3799	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	58029786	58030054	58029903	Y	NA	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	37659	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	58164078	58164222	58164150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABHD6	57011	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	58400417	58400633	58400461	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	16951	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	58570984	58571306	58571233	Y	PXK,FAM107A	ACOX2	NA	NA	NA	NA	ACOX2	49938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	58859909	58860302	58860288	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	173508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	59286518	59286843	59286716	Y	NA	NA	FHIT	IMR90	Hi-C	24141950	C3orf67	252708	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	60062226	60062257	60062242	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1028416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	60064522	60064780	60064643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf67	1030712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	61667893	61667951	61667922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	58829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	62400515	62400779	62400769	Y	NA	PTPRG-AS1	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	47510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	62572991	62573174	62573036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	219986	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr3	62573493	62573782	62573553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRG-AS1	220488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	64147375	64147623	64147507	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSMD6	139717	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	66022863	66023161	66022996	Y	MAGI1	MAGI1	NA	NA	NA	NA	MAGI1	354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	66546176	66546348	66546214	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	3339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	67420914	67421310	67421112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUCLG2	281728	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71080443	71080735	71080627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	550405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71150221	71150629	71150383	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	480511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71151319	71151713	71151657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	479427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71538205	71538976	71538530	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	92164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71553174	71553740	71553492	Y	EIF4E3	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP1	77400	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	71628829	71629563	71629383	Y	EIF4E3	FOXP1	NA	NA	NA	NA	FOXP1	1577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	72059238	72059542	72059440	Y	RYBP,EIF4E3	NA	SHQ1	IMR90	Hi-C	24141950	EIF4E3	257314	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	72536556	72536893	72536709	Y	RYBP	RYBP	PPP4R2,SHQ1,LOC201617,RYBP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RYBP	42487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC75P1	467172	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	86842931	86843272	86843115	Y	VGLL3	NA	VGLL3	IMR90	Hi-C	24141950	VGLL3	194997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr3	87336210	87336427	87336319	Y	NA	NA	CGGBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CHMP2B	61789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	88211290	88211624	88211397	Y	NA	C3orf38,CGGBP1	NA	NA	NA	NA	CGGBP1	14255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	96336052	96336669	96336607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HNRNPKP4	269654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	97200440	97200579	97200496	Y	EPHA6	NA	NA	NA	NA	NA	ARL6	280786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98483541	98483706	98483644	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	134827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98504725	98505044	98504856	Y	OR5K4,ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	113489	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	98505158	98505735	98505540	Y	ST3GAL6	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	112798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98509261	98509585	98509483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	108948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98544884	98545154	98545150	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCBLD2	73379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98681428	98681771	98681644	Y	DCBLD2	LINC00973	MIR548G,COL8A1,DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	16131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	98685741	98686133	98685825	Y	NA	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	11769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	98689970	98690253	98690112	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	7649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	98691142	98691300	98691170	Y	DCBLD2	LINC00973	DCBLD2	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00973	6602	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	99262027	99262447	99262268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	92872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	99356024	99356457	99356227	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	99367111	99367532	99367193	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	11792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	99377938	99378211	99378054	Y	COL8A1	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	22619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	99381280	99381540	99381410	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	25961	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	99579229	99579736	99579484	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	223910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	99582587	99582828	99582708	Y	FILIP1L	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	227268	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	100418212	100418409	100418233	Y	GPR128	TFG	NA	NA	NA	NA	TFG	7796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	100755056	100755464	100755248	Y	NA	ABI3BP	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	44697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	100784871	100785104	100785043	Y	ABI3BP	NA	ABI3BP	IMR90	Hi-C	24141950	ABI3BP	74512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	101146332	101146443	101146386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SENP7	83642	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	101620912	101621401	101621096	Y	NFKBIZ,NFKBIZ	NA	LOC152225	IMR90	Hi-C	24141950	NFKBIZ	76077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	105072818	105073679	105072925	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	10074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	105087916	105088171	105088021	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	4163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	105722948	105723182	105723045	Y	CBLB	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	136552	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	107148837	107149015	107148915	Y	NA	NA	LOC344595,BBX,LOC100302640	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BBX	90768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	107503481	107503523	107503501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBX	263698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	107803224	107803878	107803522	Y	NA	CD47	NA	NA	NA	NA	CD47	3994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	111454124	111454225	111454190	Y	C3orf52,PHLDB2	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	4780	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	111456632	111456831	111456661	Y	NA	PHLDB2	NA	NA	NA	NA	PHLDB2	7288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	111816359	111816505	111816432	Y	C3orf52	C3orf52	NA	NA	NA	NA	C3orf52	13177	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	112069423	112069692	112069474	Y	SLC9A10	CD200	NA	NA	NA	NA	CD200	20229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	112109657	112110558	112110278	Y	CD200	NA	CD200,C3orf52,GCET2,BTLA,ATG3	IMR90	Hi-C	24141950	CD200	60463	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	112351265	112351470	112351440	Y	NA	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	14907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	112366095	112366266	112366169	Y	NA	CCDC80	CCDC80,CD200R1L,GTPBP8,CD200R1,C3orf17	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CCDC80	111	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	112370377	112370712	112370567	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC80	4000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	112395778	112395997	112395824	Y	CCDC80	CCDC80	CCDC80	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC80	29401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	113470106	113470294	113470144	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	6240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	113473473	113473635	113473557	Y	QTRTD1,KIAA2018,NAA50,ATP6V1A	NAA50,ATP6V1A	NA	NA	NA	NA	ATP6V1A	9607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	114373701	114374062	114373901	Y	ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20,ZBTB20	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	490056	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	115503263	115503751	115503546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAP43	163092	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	117632292	117632433	117632362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTMAP8	888747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	118900816	118900962	118900889	Y	UPK1B,B4GALT4	UPK1B	NA	NA	NA	NA	UPK1B	10452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	119238487	119238668	119238501	Y	NA	TIMMDC1	NA	NA	NA	NA	TIMMDC1	23108	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	119613107	119613331	119613219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSK3B	197933	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	119864415	119864682	119864534	Y	COX17,GSK3B	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-18H7.1	52673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	120277715	120278240	120277932	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	34916	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	121964741	121964940	121964825	Y	CD86,PARP9,PARP9,PARP9,PARP14,KPNA1,DTX3L,CSTA	NA	NA	NA	NA	NA	CSTA	77151	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	123304962	123305362	123305193	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	2573	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	123756806	123757178	123756992	Y	NA	NA	KALRN,CCDC14	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC14	78242	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	124708345	124708776	124708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	64026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	124770854	124771405	124771326	Y	HEG1	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	124781797	124782117	124781832	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	8995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	125053590	125053890	125053754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A8	57569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	125235229	125235600	125235483	Y	NA	SNX4	NA	NA	NA	NA	SNX4	1441	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	125709142	125709481	125709414	Y	ZXDC,CCDC37	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86JP	75679	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	125986265	125986571	125986320	Y	NA	NA	KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH1L1	71428	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	126259496	126259659	126259567	Y	ZXDC	CHST13	NA	NA	NA	NA	CHST13	18370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	126569545	126569928	126569643	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	135509	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	3346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	PLXNA1	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	PLXNA1	2213	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	PLXNA1	15639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	127404993	127405883	127405741	Y	MGLL	ABTB1	NA	NA	NA	NA	ABTB1	15215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	127453672	127453937	127453742	Y	TPRA1,TPRA1,TPRA1,MGLL,MGLL	NA	NA	NA	NA	NA	ABTB1	63894	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	128267469	128267837	128267725	Y	NA	NA	GATA2	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-475N22.4	61414	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	128327283	128327483	128327387	Y	GATA2,GATA2,GATA2	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	70435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	128589304	128589705	128589400	Y	DNAJB8,KIAA1257	ACAD9	NA	NA	NA	NA	ACAD9	6734	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	128745839	128746109	128746044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB43	93535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	129322103	129322311	129322182	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	1350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	129346331	129346490	129346427	Y	PLXND1	PLXND1	NA	NA	NA	NA	PLXND1	22670	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	129519745	129520139	129519943	Y	H1FOO	NA	NA	NA	NA	NA	TMCC1	90280	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	131854898	131855187	131855050	Y	NA	NA	CPNE4	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7P16	105922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	133289121	133289251	133289178	Y	SRPRB	CDV3	CDV3	MCF7	ChIA-PET	22265404	CDV3	1323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	134034499	134034569	134034531	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5	ANAPC13,C3orf36,SLCO2A1,AMOTL2,CEP63	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-200A1.1	4081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	134045700	134046050	134045958	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	15282	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr3	134050159	134050571	134050486	Y	AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	19741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	134067109	134067364	134067237	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RPL39P5	6039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	134082893	134083489	134083439	Y	AMOTL2	RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	AMOTL2	8832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	135615560	135615771	135615666	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP2R3A	66744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	135890782	135891068	135890882	Y	NA	MSL2	NA	NA	NA	NA	MSL2	23015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	136420425	136420819	136420623	Y	NA	STAG1	NA	NA	NA	NA	STAG1	48401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	136631651	136631818	136631718	Y	NA	IL20RB	NA	NA	NA	NA	IL20RB	31254	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	138438822	138439037	138438988	Y	PRR23C	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3CB	112743	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	138634319	138634690	138634472	Y	NA	NA	ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIK3CB	82539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	141050524	141051086	141050761	Y	NA	ZBTB38	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	9469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	141174545	141175038	141174891	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	141319185	141319480	141319327	Y	RASA2	NA	NA	NA	NA	NA	RASA2	115296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	142723898	142724007	142723903	Y	NA	U2SURP	NA	NA	NA	NA	U2SURP	42559	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	143162621	143163181	143162827	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX2P1	269494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	143319763	143319882	143319824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A9	245491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	145785304	145785639	145785521	Y	NA	RP11-274H2.3	NA	NA	NA	NA	RP11-274H2.3	332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	145883195	145883481	145883360	Y	PLOD2,PLSCR4	PLOD2	PLOD2,PLSCR4,PLSCR1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PLOD2	3755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr3	146031799	146032049	146031857	Y	PLSCR4	NA	PLOD2	IMR90	Hi-C	24141950	PLSCR4	64833	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	146259909	146260381	146260206	Y	PLSCR1	PLSCR1	NA	NA	NA	NA	PLSCR1	270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	149099928	149100323	149100052	Y	TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90	Hi-C	24141950	TM4SF1	6276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	149104739	149105065	149104981	Y	COMMD2,TM4SF1	TM4SF1	GYG1,TM4SF18,TM4SF1,TM4SF4,WWTR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TM4SF1	11087	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	149356424	149356747	149356622	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWTR1	95754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	149665014	149665210	149665089	Y	NA	ANKUB1	NA	NA	NA	NA	ANKUB1	18962	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	149865143	149865465	149865344	Y	NA	NA	RNF13,LOC646903,PFN2,TSC22D2	IMR90	Hi-C	24141950	PFN2	98568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	149966255	149966555	149966407	Y	NA	NA	TSC22D2,RNF13,PFN2,TM4SF1,TM4SF4,LOC646903,EIF2A,SERP1	IMR90	Hi-C	24141950	TSC22D2	157567	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	150066449	150066620	150066527	Y	NA	NA	PFN2,RNF13,LOC646903,TSC22D2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	57502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr3	152878171	152878732	152878352	Y	P2RY1,RAP2B	RAP2B	NA	NA	NA	NA	RAP2B	142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	153002176	153002347	153002282	Y	P2RY1,RAP2B	NA	RAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	RAP2B	124147	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	154787580	154787808	154787649	Y	NA	MME	NA	NA	NA	NA	MME	47667	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	154788699	154789128	154788815	Y	NA	MME	MME	IMR90	Hi-C	24141950	MME	48786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	156149618	156149810	156149747	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	121163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156206621	156206945	156206715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	64028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156210737	156211059	156210900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	59914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156229646	156229758	156229715	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	41215	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156252887	156253352	156253202	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	17621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156268270	156268550	156268410	Y	NA	SSR3	NA	NA	NA	NA	SSR3	2423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	156432757	156433079	156432845	Y	CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP	TIPARP,TIPARP-AS1	NA	NA	NA	NA	TIPARP-AS1	42590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	157248554	157248748	157248629	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	157249695	157249901	157249798	Y	VEPH1	VEPH1,C3orf55	C3orf55,RSRC1,SHOX2,MFSD1,VEPH1,RARRES1	IMR90	Hi-C	24141950	VEPH1	287	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	158491929	158492257	158492161	Y	NA	MFSD1,RARRES1	RARRES1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RARRES1	43444	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	159175843	159176214	159175971	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	528323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr3	159465414	159465509	159465463	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	239028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	159480182	159480541	159480238	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	223996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	162020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	159572503	159572920	159572729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	131617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	159647586	159647883	159647684	Y	NA	NA	IQCJ-SCHIP1,IL12A,IFT80,SMC4	IMR90	Hi-C	24141950	IL12A	56654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	160267928	160268193	160268163	Y	NA	SCARNA7,KPNA4	NA	NA	NA	NA	KPNA4	13183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	165215447	165215733	165215492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCHE	337527	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	165535017	165535196	165535158	Y	NA	BCHE	NA	NA	NA	NA	BCHE	18064	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	169378305	169378656	169378554	Y	NA	MECOM	NA	NA	NA	NA	MECOM	750	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170430208	170430671	170430337	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	26483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170431417	170431656	170431537	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	25498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170435342	170435619	170435400	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	21535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170442364	170442688	170442585	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	14466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.01606594462025
chr3	170446657	170446914	170446737	Y	NA	RP11-373E16.4	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	10240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170463049	170463502	170463289	Y	CLDN11	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,PRKCI,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	5895	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr3	170469010	170469069	170469037	Y	CLDN11,CLDN11,EIF5A2	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	11856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	170471340	170471726	170471533	Y	NA	RP11-373E16.4	SLC7A14,CLDN11,SKIL	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-373E16.4	14186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170527099	170527304	170527203	Y	EIF5A2	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr3	170527835	170528013	170527928	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	58259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr3	170529231	170529401	170529316	Y	NA	NA	SLC7A14,CLDN11,SKIL,PRKCI,RPL22L1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	56871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	170584649	170585013	170584680	Y	NA	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	RPL22L1	1259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170627321	170627621	170627516	Y	EIF5A2	RPL22L1,EIF5A2	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	2839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	170712510	170712744	170712722	Y	SLC2A2	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	88028	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170883066	170883220	170883212	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	EIF5A2	258584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	170975109	170975430	170975328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	200767	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	171078129	171078522	171078326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	97675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	171175851	171176236	171176082	Y	TNIK	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr3	171176900	171177208	171176991	Y	TNIK	TNIK	NA	NA	NA	NA	TNIK	703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	171592038	171592451	171592208	Y	FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	PLD1	65298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	171847438	171848726	171847798	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	92020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	171858231	171859026	171858504	Y	PLD1,FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	102813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	171870963	171871593	171871291	Y	PLD1,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	115545	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	172467147	172467552	172467259	Y	NA	NCEH1,ECT2,RNU4-4P	NCEH1,ECT2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ECT2	675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	172510084	172510259	172510171	Y	NA	ECT2,RNU4-4P	NA	NA	NA	NA	RNU4-4P	2089	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	173580437	173580663	173580550	Y	NLGN1	NA	NA	NA	NA	NA	NLGN1	468363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	173767282	173767499	173767320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	325535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	173790508	173790769	173790639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-393N4.2	302265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	176439687	176439857	176439773	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1XR1	473404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	177075253	177075542	177075439	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	161992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	177077500	177078084	177077832	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1XR1	164239	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	177623365	177623625	177623388	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	TBL1XR1	710104	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	178787910	178788066	178787991	Y	ZMAT3	ZMAT3	NA	NA	NA	NA	ZMAT3	1	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr3	182969922	182970295	182970062	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	182973152	182973434	182973425	Y	ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	4120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	183003579	183004143	183003750	Y	ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24	B3GNT5	NA	NA	NA	NA	B3GNT5	34547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	184504548	184504615	184504585	Y	NA	VPS8	VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD	IMR90	Hi-C	24141950	VPS8	23316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	185374091	185374577	185374335	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf65	53739	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	185450719	185450896	185450815	Y	NA	C3orf65	NA	NA	NA	NA	C3orf65	22403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	C3orf65	NA	NA	NA	NA	C3orf65	34913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	185948324	185948597	185948503	Y	DGKG	NA	NA	NA	NA	NA	ETV5	122217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	186901070	186901277	186901226	Y	NA	RPL39L	LOC100131635	IMR90	Hi-C	24141950	RPL39L	4374	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	110847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	113620	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	114412	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	187988232	187988684	187988401	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	118387	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	188012691	188013249	188012784	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	142846	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	188014586	188014976	188014809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	144741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	188057374	188057458	188057417	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	187529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	188155903	188156126	188156022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP-AS2	286058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	189632708	189632930	189632825	Y	TP63	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1-AS1	203823	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	190284228	190284576	190284349	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	54388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	192369931	192370325	192369972	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	263625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	192604773	192605048	192605023	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28902	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	192605604	192605670	192605648	Y	NA	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	28280	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HRASLS	83126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	194041526	194041906	194041553	Y	HES1	LRRC15	NA	NA	NA	NA	LRRC15	46566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	194247870	194248550	194248205	Y	HES1,ATP13A3	ATP13A3	ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	ATP13A3	30777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	195171713	195171904	195171805	Y	ACAP2,PPP1R2	ACAP2	ACAP2,LSG1,PPP1R2	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ACAP2	9906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	195627582	195627903	195627662	Y	ACAP2,PPP1R2,PCYT1A,TNK2,TNK2	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	179157	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	195871770	195871934	195871856	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFRC	64710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	196696811	196697020	196696957	Y	LRRC33,PIGZ	NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1	NA	NA	NA	NA	PIGZ	2880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr3	197033346	197033465	197033406	Y	DLG1	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	9175	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	197035558	197035706	197035585	Y	NA	DLG1	NA	NA	NA	NA	DLG1	11387	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr3	197121526	197121880	197121703	Y	DLG1	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1	IMR90	Hi-C	24141950	DLG1	97355	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	197190389	197190580	197190458	Y	NA	NA	DLG1,BDH1,LOC100507086,MFI2,MFI2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	107614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	197214864	197215009	197214889	Y	NA	NA	DLG1,LOC100507086,BDH1,MFI2	IMR90	Hi-C	24141950	BDH1	83185	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr3	197216995	197217339	197217145	Y	DLG1	NA	NA	NA	NA	NA	BDH1	80855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	787901	788124	788010	Y	NA	RP11-440L14.1,CPLX1	NA	NA	NA	NA	RP11-440L14.1	14264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	924714	925388	925028	Y	MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,IDUA,GAK	GAK,TMEM175	NA	NA	NA	NA	TMEM175	539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	1035263	1035607	1035280	Y	FGFRL1,FGFRL1	FGFRL1	NA	NA	NA	NA	FGFRL1	33539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	1710531	1710811	1710671	Y	NA	SLBP,TMEM129,TACC3	NA	NA	NA	NA	SLBP	1471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr4	1875191	1875366	1875328	Y	NA	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	4040	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	1972677	1973039	1972858	Y	WHSC1	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf48	68650	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	2414575	2415364	2414914	Y	HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160	ZFYVE28,RNF4	NA	NA	NA	NA	ZFYVE28	3026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	2538945	2539718	2539367	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	76998	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	2574508	2574529	2574516	Y	NA	NA	POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1	IMR90	Hi-C	24141950	RNF4	112561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	3293872	3294174	3294028	Y	NA	RGS12	RGS12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS12	1117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	3438789	3438989	3438900	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRPAP1	93297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr4	4475518	4475743	4475631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STX18-AS1	66115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	4854782	4854915	4854832	Y	NA	MSX1	MSX1	K562	ChIA-PET	22265404	MSX1	4478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	6734442	6734743	6734533	Y	KIAA0232	MRFAP1L1,KIAA0232	NA	NA	NA	NA	MRFAP1L1	24835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7807485	7807548	7807490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	132105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	93416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7972368	7972631	7972565	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	32715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7973730	7974208	7973960	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	34077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	7974971	7975417	7975298	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	35318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	7978189	7978377	7978271	Y	NA	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	38536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	8561379	8561777	8561592	Y	GPR78	CPZ	NA	NA	NA	NA	CPZ	30610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	9154755	9155069	9154900	Y	NA	FAM86KP	NA	NA	NA	NA	FAM86KP	1733	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	10116801	10117310	10116981	Y	WDR1	WDR1	NA	NA	NA	NA	WDR1	228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	10182011	10182277	10182105	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	65438	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	10182678	10183260	10182921	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	66105	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	13219623	13219635	13219629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSP90AB2P	113403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	15036867	15037072	15036952	Y	NA	CPEB2	NA	NA	NA	NA	CPEB2	34569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	15235793	15235968	15235850	Y	CPEB2,FBXL5,BST1	NA	PROM1,C1QTNF7,FBXL5,CC2D2A	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB2	233495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	15379731	15379939	15379833	Y	CD38,CPEB2,FBXL5,BST1	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	89550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	15553738	15553982	15553851	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	84249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	22791	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	16003610	16004023	16003987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FGFBP1	65247	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	17979858	17980211	17980206	Y	CLRN2,LCORL	LCORL	NA	NA	NA	NA	LCORL	41288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	21792715	21792997	21792947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNIP4	155425	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	24322640	24323331	24322979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHX15	260842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	24471602	24472014	24471897	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	112159	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	24472474	24473298	24472910	Y	NA	NA	PPARGC1A,DHX15,CCDC149,SOD3,PI4K2B,ANAPC4,LGI2,SEPSECS	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	110875	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	24660007	24660225	24660117	Y	NA	NA	CCDC149,MIR573	IMR90	Hi-C	24141950	DHX15	75834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	25175369	25175577	25175408	Y	NA	SEPSECS,PI4K2B	NA	NA	NA	NA	PI4K2B	15106	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	35022631	35023155	35023089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1220976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr4	35027106	35027343	35027234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP2	1216788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	37581972	37582372	37582240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RELL1	103626	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	38162192	38162313	38162253	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG2	202136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	38320550	38320897	38320770	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3,TBC1D1,TLR10	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF3	342920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	38525630	38525737	38525685	Y	NA	NA	FLJ13197,KLF3	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF3	138080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	39048044	39048301	39048173	Y	KLF3,TLR1,TLR6	TMEM156,KLHL5	NA	NA	NA	NA	KLHL5	3385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40186764	40186901	40186841	Y	RBM47	NA	RHOH	IMR90	Hi-C	24141950	N4BP2	130318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40294064	40294346	40294231	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP2	237618	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40578690	40579499	40579160	Y	RBM47	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	170415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	40609271	40609510	40609444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	140404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40674578	40674731	40674666	Y	RBM47	NA	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NSUN7	75183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40674929	40675349	40675137	Y	RBM47	NA	RBM47	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NSUN7	74565	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	40943410	40943552	40943502	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NSUN7	193496	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	41148833	41148910	41148907	Y	LIMCH1,LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	67821	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	41509451	41509766	41509557	Y	LIMCH1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMCH1	149827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	44712631	44712762	44712670	Y	NA	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	13850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	47464691	47464980	47464836	Y	NA	COMMD8,ATP10D	NA	NA	NA	NA	COMMD8	955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	48757987	48758274	48758261	Y	NA	FRYL,OCIAD1	NA	NA	NA	NA	FRYL	22065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	55093024	55093294	55093182	Y	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	55093767	55093987	55093860	Y	NA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	55097338	55097659	55097499	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	4074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	55100480	55100923	55100634	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	7216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	56178022	56178286	56178222	Y	TMEM165,SRD5A3	SRD5A3	KDR	IMR90	Hi-C	24141950	SRD5A3	31990	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	56323586	56323848	56323646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM165	63462	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	56419632	56419978	56419838	Y	NA	CLOCK	NA	NA	NA	NA	CLOCK	8327	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	57940962	57941225	57941094	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	32703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	61549274	61549357	61549330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-621K7.1	1090211	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	67972662	67972987	67972824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-584P21.4	336998	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	68538149	68538306	68538215	Y	NA	UBA6,UBA6-AS1	NA	NA	NA	NA	UBA6	26591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	72125321	72125676	72125518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A4	74318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	74591640	74592145	74591915	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	12078	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	74596111	74596370	74596188	Y	MTHFD2L,CXCL3,CXCL2,IL8	IL8	IL8,RASSF6,PF4V1,CXCL3,CXCL2,CXCL1,CXCL5,MTHFD2L	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	IL8	7853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	74975298	74975961	74975834	Y	CXCL1,AREG	CXCL2,MTHFD2L	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	1930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	74977575	74978125	74977847	Y	NA	CXCL2	RASSF6	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFD2L	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	75409847	75410209	75409849	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPGN	237657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	75411825	75412170	75412032	Y	NA	NA	EREG	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPGN	239635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	76623783	76624179	76623867	Y	RCHY1,G3BP2,G3BP2	G3BP2,USO1	NA	NA	NA	NA	G3BP2	23530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	77511406	77511861	77511558	Y	ANKRD56,SHROOM3	NA	NA	NA	NA	NA	SHROOM3	157153	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	77674311	77674688	77674546	Y	SEPT11	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	194168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr4	77705263	77705447	77705355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT11	163409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	78823537	78823752	78823560	Y	NA	MRPL1	NA	NA	NA	NA	MRPL1	41863	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	80958042	80958450	80958250	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	86158	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	80991308	80991698	80991476	Y	PRDM8,ANTXR2	NA	NA	NA	NA	NA	ANTXR2	52910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	81119203	81119473	81119338	Y	PRDM8,PRDM8	PRDM8	NA	NA	NA	NA	PRDM8	16170	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	81228486	81228584	81228534	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	26290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	81229160	81229644	81229481	Y	NA	FGF5,C4orf22	NA	NA	NA	NA	C4orf22	25230	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	81960750	81960835	81960793	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKG2	173383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	84241779	84242152	84241951	Y	THAP9,LIN54,PLAC8,HELQ,AGPAT9,COQ2,HPSE,HPSE,HPSE	COQ2,HPSE	COQ2	IMR90	Hi-C	24141950	HPSE	12154	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	84776291	84776536	84776414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGPAT9	321224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	85420434	85420908	85420714	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDFY3-AS2	464630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr4	86398698	86399017	86398859	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	4431	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	86435968	86436285	86436110	Y	NA	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	41701	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	86664396	86664842	86664610	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	270129	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	86684588	86684743	86684670	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	290321	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	86704673	86705059	86704806	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	310406	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	86927841	86928538	86928361	Y	MAPK10,MAPK10,MAPK10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	533574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	87849171	87849370	87849272	Y	HSD17B11	AFF1,C4orf36,TECRP1	NA	NA	NA	NA	AFF1	4784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	89099576	89099877	89099636	Y	HERC6,HERC5	NA	PKD2	IMR90	Hi-C	24141950	ABCG2	50597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	89455158	89455345	89455247	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	PIGY	14218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	95469761	95469962	95469859	Y	HPGDS,PDLIM5	NA	NA	NA	NA	NA	PDLIM5	98724	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	99443713	99444102	99443889	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	133678	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	99580316	99580421	99580372	Y	NA	TSPAN5	NA	NA	NA	NA	TSPAN5	2536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	102266716	102267419	102267189	Y	NA	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	108544740	108545114	108544927	Y	SGMS2	NA	NA	NA	NA	NA	PAPSS1	94494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	110361567	110361723	110361645	Y	NA	SEC24B,SEC24B-AS1	NA	NA	NA	NA	SEC24B-AS1	8594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	111086740	111086853	111086804	Y	NA	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	RP11-115A14.1	21210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	111114926	111115298	111115104	Y	GAR1,ELOVL6,ELOVL6	RP11-115A14.1,ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	3057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	111117471	111117868	111117585	Y	NA	ELOVL6	NA	NA	NA	NA	ELOVL6	487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	112732930	112733119	112733025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C4orf32	331434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	113067380	113067784	113067656	Y	LARP7,LARP7,TIFA,AP1AR,C4orf32	C4orf32	NA	NA	NA	NA	C4orf32	2827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	114389425	114389805	114389547	Y	NA	RNU1-138P	NA	NA	NA	NA	RNU1-138P	49946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	117474098	117474276	117474187	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	43041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	119629667	119629850	119629760	Y	NA	METTL14	NA	NA	NA	NA	METTL14	25144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	119962106	119962357	119962246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYOZ2	92582	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	120024463	120024846	120024696	Y	NA	MYOZ2	SYNPO2,USP53,MYOZ2	IMR90	Hi-C	24141950	MYOZ2	30093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	120458820	120459280	120459019	Y	PDE5A,PDE5A,PDE5A	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-33B1.1	84874	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	120962747	120963053	120963021	Y	NA	RP11-679C8.2,MAD2L1	NA	NA	NA	NA	RP11-679C8.2	23060	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	122609803	122610189	122610094	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	6079	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr4	122632771	122633033	122632919	Y	NA	ANXA5	ANXA5,BBS7,CCNA2	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ANXA5	16503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	123686146	123686329	123686228	Y	FGF2	BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	34289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	123704519	123704897	123704616	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,SPATA5	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	40966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	123719302	123719557	123719375	Y	FGF2	FGF2	FGF2,NUDT6,BBS12	IMR90	Hi-C	24141950	FGF2	26306	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	123792983	123793156	123793069	Y	NA	FGF2,NUDT6,SPATA5	NA	NA	NA	NA	FGF2	47120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	124621616	124621886	124621708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	305666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	127699482	127699754	127699681	Y	NA	NA	FAT4	IMR90	Hi-C	24141950	INTU	842672	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	129244135	129244496	129244419	Y	NA	PGRMC2,RP11-420A23.1	PGRMC2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-420A23.1	32229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	129389693	129389923	129389761	Y	NA	NA	PHF17,PGRMC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-420A23.1	177787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	138974806	138975089	138974892	Y	NA	SLC7A11-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC7A11-AS1	1529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr4	138975341	138975477	138975408	Y	NA	SLC7A11-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC7A11-AS1	1141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	139960939	139961173	139961057	Y	NAA15,CCRN4L	CCRN4L	NA	NA	NA	NA	CCRN4L	25996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	140278994	140279360	140279178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFC1	57289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	141174275	141174653	141174618	Y	NA	SCOC	MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SCOC	1787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	143072986	143072994	143072990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL15	517234	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	143206374	143206633	143206590	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	559952	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	143325385	143325488	143325414	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	441097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	143536371	143536723	143536559	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	229862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	144271294	144271615	144271412	Y	NA	GAB1	NA	NA	NA	NA	GAB1	15379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	145975837	145976119	145976108	Y	NA	ABCE1,ANAPC10	NA	NA	NA	NA	ABCE1	40965	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr4	146725275	146725660	146725360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	132127	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	149756405	149756578	149756515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NR3C2	392555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	153180278	153180573	153180364	Y	NA	NA	PET112,FAM160A1,FBXW7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXW7	274680	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	153894415	153894544	153894479	Y	NA	RP11-206F17.2	NA	NA	NA	NA	RP11-206F17.2	47817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	154154502	154154721	154154529	Y	TRIM2,TRIM2	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	109080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	154170296	154170804	154170469	Y	TIGD4,KIAA0922	NA	NA	NA	NA	NA	MND1	92997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	154580466	154580842	154580627	Y	TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	RNF175	98545	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	157863056	157863372	157863345	Y	PDGFC	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	27174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	157866755	157867028	157866930	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	23518	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	157868046	157868334	157868214	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	22212	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	157893618	157893834	157893797	Y	NA	PDGFC	NA	NA	NA	NA	PDGFC	3072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	160195976	160196239	160196029	Y	RAPGEF2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	507686	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	168818156	168818524	168818473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA10	193142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	169408175	169408648	169408311	Y	DDX60,DDX60L	PALLD,DDX60L	DDX60,DDX60L,PALLD	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PALLD	7569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	169479701	169480223	169479961	Y	NA	DDX60L	NA	NA	NA	NA	DDX60L	22764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr4	170030173	170030283	170030178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBR4	100747	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	170193381	170193745	170193612	Y	SH3RF1	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	3125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	174112212	174112389	174112298	Y	NA	GALNT7,RP11-10K16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-10K16.1	23409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	177760403	177760587	177760468	Y	NA	VEGFC	VEGFC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	VEGFC	48522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	177824075	177824477	177824359	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	112194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	177841897	177842103	177842000	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	VEGFC	130016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	183564955	183565246	183565103	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCTD	271843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr4	183826285	183826336	183826311	Y	NA	DCTD	NA	NA	NA	NA	DCTD	10753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	184319940	184320161	184319981	Y	NA	CDKN2AIP	WWC2,CLDN22,CDKN2AIP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN2AIP	43583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	185186820	185187542	185187472	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	206192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	185189434	185189785	185189717	Y	IRF2,CASP3	NA	IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IRF2	203949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	185303433	185303616	185303580	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	90118	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	185304654	185305034	185304819	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	88700	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr4	185382837	185383066	185382954	Y	NA	IRF2	NA	NA	NA	NA	IRF2	10668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	185609676	185609967	185609740	Y	NA	CASP3	NA	NA	NA	NA	CASP3	41013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr4	186227102	186227608	186227442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	87567	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	187050395	187050604	187050500	Y	SORBS2	FAM149A	SORBS2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM149A	26822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr4	187614690	187615080	187614853	Y	NA	FAT1	NA	NA	NA	NA	FAT1	30796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	392668	393182	392808	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	48076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	784651	785023	784908	Y	ZDHHC11,TPPP	NA	NA	NA	NA	NA	TPPP	93141	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr5	1930136	1931342	1930853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFS6	130622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	6.02409891693038
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	10422961	10423316	10423021	Y	NA	ROPN1L	NA	NA	NA	NA	ROPN1L	16320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	10551479	10551871	10551616	Y	NA	ANKRD33B	MARCH6,ANKRD33B,ROPN1L	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD33B	10571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	10607952	10608169	10608061	Y	MARCH6,ANKRD33B	ANKRD33B	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	45510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	10635345	10635740	10635585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRD33B	72903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14011107	14011342	14011264	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	68455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14035955	14036534	14036234	Y	TRIO	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	93303	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	14036813	14036909	14036843	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr5	14037218	14037324	14037271	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	94566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	14038478	14038912	14038655	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	95826	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	14039774	14040034	14039980	Y	NA	NA	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DNAH5	97122	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	14107708	14107995	14107845	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	33816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	14108761	14108933	14108800	Y	TRIO	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	14109130	14109647	14109337	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	32164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr5	14110836	14111023	14110985	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIO	30788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr5	14114865	14115129	14114997	Y	NA	TRIO	TRIO	IMR90	Hi-C	24141950	TRIO	26682	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	14142332	14142650	14142445	Y	NA	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	521	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	14142803	14143164	14142969	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	992	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr5	14178655	14179133	14178814	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	36844	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.51004121538766
chr5	14204877	14205144	14204973	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	63066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	14208272	14208510	14208423	Y	FAM105B	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66461	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	14208730	14209007	14208812	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	66919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14250238	14250405	14250312	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	108427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.84872986359441
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14809867	14810211	14810035	Y	FAM105A,FAM105B	RBBP4P1	NA	NA	NA	NA	RBBP4P1	13358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	14926139	14926359	14926282	Y	NA	NA	FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744	IMR90	Hi-C	24141950	ANKH	56252	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	15451801	15451916	15451863	Y	NA	FBXL7	FBXL7	IMR90	Hi-C	24141950	FBXL7	46389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	16715199	16715528	16715435	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM134B	100032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	17185868	17186222	17185997	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	28934	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	17249327	17249860	17249454	Y	NA	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	34171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	17255490	17256325	17255691	Y	BASP1	AC091878.1	NA	NA	NA	NA	AC091878.1	40334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	17282496	17282827	17282587	Y	BASP1	NA	NA	NA	NA	NA	RN7SKP133	60898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-549K20.1	721816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr5	26847119	26847280	26847167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01021	623119	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	30694167	30694547	30694365	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL19P11	357125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	33312073	33312323	33312255	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,LOC340113	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	16057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	33313222	33313474	33313360	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,TARS	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	17206	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	33789074	33789288	33789217	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	101009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	33807297	33807469	33807384	Y	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	82828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	33834348	33834761	33834680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	55536	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	33854695	33855218	33854933	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	35079	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	33892874	33893172	33893071	Y	NA	ADAMTS12	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	2577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	34564903	34565130	34565039	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14,TTC23L,RAD1,BRIX1	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	89212	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	34571432	34571721	34571601	Y	NA	NA	RAI14,TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	82621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	34586139	34586737	34586416	Y	NA	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	67605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	34587608	34588326	34587915	Y	NA	NA	RAI14	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	66016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	34715239	34715402	34715248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	60897	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	34717862	34718081	34717968	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	63520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	35853494	35854024	35853833	Y	SPEF2,IL7R	IL7R	SPEF2	IMR90	Hi-C	24141950	IL7R	2697	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	35857994	35858411	35858032	Y	IL7R	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	7197	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	35859478	35859884	35859711	Y	NA	IL7R	NA	NA	NA	NA	IL7R	8681	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	35924372	35924674	35924571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL7R	73575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	36174356	36174616	36174412	Y	SLC1A3,SLC1A3,RANBP3L,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	24265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	36657665	36658163	36657813	Y	NIPBL	NA	NA	NA	NA	NA	SLC1A3	53208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	36689194	36689678	36689532	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	33619	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	36690488	36690876	36690655	Y	NIPBL	CTD-2353F22.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2353F22.1	32421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	37102128	37102249	37102189	Y	NA	RPS4XP6	NA	NA	NA	NA	RPS4XP6	18970	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	37740558	37740859	37740716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	96929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	37771819	37772240	37771999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	65548	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	37838047	37838605	37838394	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	259	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	37838959	37839206	37839080	Y	GDNF,GDNF,GDNF	GDNF	NA	NA	NA	NA	GDNF	1171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	38446340	38446486	38446390	Y	EGFLAM	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	19955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.00803297231013
chr5	38467529	38467846	38467689	Y	NA	CTD-2263F21.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2263F21.1	1088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	38546436	38546759	38546707	Y	NA	MIR3650	NA	NA	NA	NA	MIR3650	8904	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	38660472	38660667	38660594	Y	LIFR	NA	EGFLAM,LIFR	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LIFR	54016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	38854077	38854436	38854323	Y	OSMR,OSMR	CTD-2127H9.1,OSMR	NA	NA	NA	NA	OSMR	10117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	39158114	39158488	39158278	Y	FYB	NA	NA	NA	NA	NA	RICTOR	85604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	39194499	39195200	39195005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FYB	77430	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	39395044	39395463	39395161	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	27507	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	39399549	39400018	39399831	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	22952	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	39411101	39411451	39411362	Y	NA	C9,DAB2	NA	NA	NA	NA	C9	11519	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	39543496	39543808	39543708	Y	FYB	NA	DAB2,FYB,C9,PRKAA1,TTC33,RPL37,CARD6	IMR90	Hi-C	24141950	DAB2	83094	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	40689630	40689893	40689724	Y	NA	PTGER4	NA	NA	NA	NA	PTGER4	12030	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	41845041	41845055	41845050	Y	OXCT1,FBXO4	OXCT1	NA	NA	NA	NA	OXCT1	23566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	42943717	42944113	42943855	Y	NA	NA	LOC648987	IMR90	Hi-C	24141950	SEPP1	58223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	42994649	42995346	42995172	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	21185	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	43007637	43008177	43007831	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	43008201	43008438	43008332	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	8093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	43009341	43009652	43009530	Y	ZNF131,C5orf39	CTD-2035E11.3,AC025171.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2035E11.3	6879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	43034859	43034967	43034962	Y	NA	CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3	LOC648987	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC025171.1	4710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	44821100	44821499	44821234	Y	NA	RP11-53O19.1,MRPS30	NA	NA	NA	NA	MRPS30	14073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	49719324	49719499	49719409	Y	PARP8	EMB	NA	NA	NA	NA	EMB	17583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	52319874	52320078	52320019	Y	NA	ITGA2,CTD-2175A23.1	LOC257396	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2175A23.1	35766	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	52327592	52327905	52327807	Y	ITGA2	ITGA2,CTD-2175A23.1	NA	NA	NA	NA	CTD-2175A23.1	43484	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	52627320	52627670	52627488	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST,NDUFS4	IMR90	Hi-C	24141950	FST	146569	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	52629043	52629307	52629159	Y	ITGA2,FST	NA	ARL15,FST	IMR90	Hi-C	24141950	FST	144932	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	52656733	52657108	52656801	Y	FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	117131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	52714720	52715039	52714904	Y	NA	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	59200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	52715258	52715483	52715372	Y	FST	NA	ARL15	IMR90	Hi-C	24141950	FST	58756	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	54039991	54040439	54040234	Y	SNX18,SNX18	NA	SNX18,GPX8,CDC20B	IMR90	Hi-C	24141950	SNX18	228402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	54120977	54121197	54121092	Y	NA	NA	SNX18	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	195302	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	54132867	54133361	54133072	Y	SNX18,SNX18,CDC20B	NA	SNX18,ARL15,HSPB3	IMR90	Hi-C	24141950	ESM1	183138	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr5	54472215	54472598	54472476	Y	NA	GPX8	NA	NA	NA	NA	GPX8	18269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	54729958	54730125	54730050	Y	SKIV2L2,DDX4	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	94404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	54759780	54760082	54759933	Y	NA	NA	SKIV2L2	IMR90	Hi-C	24141950	RNF138P1	64447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	55287334	55287994	55287973	Y	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	IL6ST	827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	55288370	55289209	55288952	Y	IL6ST	NA	NA	NA	NA	NA	IL6ST,CTD-2031P19.3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST,CTD-2031P19.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2031P19.3	610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	56738135	56738571	56738168	Y	ACTBL2	ACTBL2	PLK2,ACTBL2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	38065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	56784239	56784594	56784302	Y	GPBP1,ACTBL2	ACTBL2	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	7603	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	56790461	56790772	56790742	Y	NA	ACTBL2	ACTBL2,PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	13825	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	57076259	57076553	57076406	Y	NA	NA	PLK2,GPBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTBL2	299623	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	57111915	57112364	57112128	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	335279	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	57112814	57113117	57112881	Y	ACTBL2	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	336178	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr5	57117655	57118000	57117917	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	341019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	57120821	57121296	57121146	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	344185	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr5	57133445	57133721	57133581	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	356809	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	57137483	57137861	57137645	Y	NA	NA	PLK2	IMR90	Hi-C	24141950	ACTBL2	360847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr5	57758033	57758252	57758173	Y	NA	PLK2	NA	NA	NA	NA	PLK2	3946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	60526663	60526879	60526778	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	99221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	60597691	60598057	60597813	Y	NA	ZSWIM6	ZSWIM6,C5orf43	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZSWIM6	28043	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	60626678	60627139	60626902	Y	ZSWIM6	ZSWIM6	NA	NA	NA	NA	ZSWIM6	578	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	60704594	60705129	60704691	Y	NA	RPL3P6	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	18896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	60921621	60921766	60921694	Y	C5orf64	NA	NA	NA	NA	NA	RPL3P6	235923	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	63506762	63506909	63506842	Y	NA	RNF180	NA	NA	NA	NA	RNF180	47091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr5	64358648	64358799	64358710	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27	IMR90	Hi-C	24141950	CWC27	295891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	64398874	64399506	64398924	Y	NA	NA	ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CWC27	336117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	64459611	64459838	64459685	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	315909	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	64486221	64486631	64486280	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	289116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	64495957	64496049	64496027	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	279698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	64710773	64711167	64710966	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	64580	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	64755187	64755203	64755196	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	20544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	64809602	64809952	64809754	Y	NA	ADAMTS6,CENPK,PPWD1	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	33855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	65932774	65933082	65932801	Y	NA	MAST4	NA	NA	NA	NA	MAST4	42598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	67294770	67295126	67294965	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	214422	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	67875476	67875860	67875665	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-537E7.3	147168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	71659094	71659472	71659166	Y	NA	PTCD2,MRPS27	NA	NA	NA	NA	MRPS27	44621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	71686761	71687006	71686884	Y	NA	NA	PTCD2,ZNF366,TNPO1	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	72288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	71748206	71748633	71748536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	133733	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	71806748	71806963	71806875	Y	ZNF366	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	192275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	72512311	72512636	72512493	Y	FOXD1	NA	FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM171	98192	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	72670335	72670728	72670600	Y	NA	NA	FOXD1,BTF3,FCHO2,TMEM171,TMEM174	IMR90	Hi-C	24141950	FOXD1	71624	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	72934554	72934908	72934667	Y	RGNEF	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	75043	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	73330710	73331077	73330894	Y	NA	NA	FAM169A,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRA2	471199	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	73439577	73439790	73439675	Y	ENC1	NA	RGNEF,ENC1	IMR90	Hi-C	24141950	HEXB	494058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	73839049	73839165	73839086	Y	NA	NA	CTIF,RGNEF,ENC1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	19890323,24141950	HEXB	94683	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	74861939	74862072	74862007	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	55976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	74862624	74863010	74862882	Y	ANKRD31,COL4A3BP,POLK,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	56661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	74863696	74863807	74863784	Y	ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A3BP	57733	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	74997783	74997822	74997793	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	13491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77140620	77140840	77140736	Y	NA	TBCA	NA	NA	NA	NA	TBCA	21764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77792703	77793028	77792954	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	138364	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77800435	77801147	77800993	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	146096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77803150	77803526	77803443	Y	AP3B1,LHFPL2,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	148811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77814404	77814787	77814528	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	160065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77819717	77819752	77819740	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	165378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77821454	77822246	77822105	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	167115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77822722	77823939	77823093	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	168383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77826174	77826769	77826484	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	171835	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77940704	77941073	77940964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	122771	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	77974245	77974379	77974312	Y	NA	NA	SCAMP1,LHFPL2,ARSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LHFPL2	89465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	78095218	78095295	78095257	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	31374	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	78102378	78102749	78102647	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	38534	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	80898051	80898414	80898329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSBP2	147202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	81147637	81148063	81147790	Y	NA	CTD-2249K22.1	ATG10,SSBP2,ACOT12	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTD-2249K22.1	2217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	81653126	81653457	81653257	Y	RPS23	NA	ATP6AP1L,XRCC4,VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	80730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	81692717	81693105	81692928	Y	NA	NA	VCAN	IMR90	Hi-C	24141950	RPS23	120321	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	82356692	82356869	82356781	Y	NA	XRCC4,TMEM167A	NA	NA	NA	NA	XRCC4	14448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	83214867	83215139	83214962	Y	HAPLN1	NA	NA	NA	NA	NA	VCAN	449583	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	83305524	83305826	83305754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	372419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	83674189	83674553	83674373	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	3692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	83677578	83677928	83677708	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	317	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	86667091	86667409	86667357	Y	NA	CCNH	NA	NA	NA	NA	CCNH	39427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	91015868	91016069	91015978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARRDC3	338692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	92914746	92915169	92914912	Y	NR2F1	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	1874	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	92935260	92935353	92935337	Y	NA	NR2F1	NA	NA	NA	NA	NR2F1	18217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	93256507	93256894	93256879	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM172A	188510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95094861	95094991	95094889	Y	NA	RHOBTB3,CTD-2154I11.2	GLRX	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2154I11.2	28862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95113820	95114121	95113969	Y	NA	CTD-2154I11.2,GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	42588	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95157129	95157323	95157255	Y	NA	GLRX	NA	NA	NA	NA	GLRX	420	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95177682	95177989	95177809	Y	GLRX,ELL2	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	20973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95178953	95179190	95179087	Y	GLRX,ELL2	GLRX	GLRX,SPATA9,RFESD,RHOBTB3,C5orf27	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	22244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95403711	95404019	95403912	Y	ELL2	RP11-254I22.1	ELL2,CAST,MIR583,C5orf27	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-254I22.1	19892	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95416336	95416571	95416427	Y	GLRX,ELL2	RP11-254I22.1	NA	NA	NA	NA	RP11-254I22.1	32517	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95562741	95563074	95562934	Y	NA	NA	ELL2,RHOBTB3,GLRX,C5orf27,MIR583,PCSK1,SPATA9	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-254I22.1	178922	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	95873123	95873359	95873236	Y	LNPEP,CAST,CAST	CAST	ELL2,PCSK1,CAST	IMR90	Hi-C	24141950	CAST	14152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	96019190	96019368	96019302	Y	CAST,CAST	NA	NA	NA	NA	NA	ERAP1	122435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	96217415	96217751	96217602	Y	CAST,CAST	ERAP2	NA	NA	NA	NA	ERAP2	7772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	97444170	97444562	97444463	Y	NA	NA	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	227886	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.51004121538766
chr5	97446063	97446328	97446197	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226120	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	97645408	97646168	97645558	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	26280	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	97650049	97650331	97650134	Y	RGMB	CH17-12M21.1	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	22117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	97750593	97751065	97750933	Y	RGMB	NA	RGMB,FLJ35946	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	78145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	98253335	98253735	98253703	Y	CHD1	CTD-2007H13.3	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	9140	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	98262747	98263243	98263080	Y	CHD1	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2007H13.3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	99387251	99388845	99388529	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	480121	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	102788432	102788628	102788542	Y	C5orf30	NA	C5orf30	IMR90	Hi-C	24141950	NUDT12	107866	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	105733568	105733839	105733591	Y	NA	NA	EFNA5	IMR90	Hi-C	24141950	EFNA5	1270757	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	108137615	108137706	108137661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FER	56092	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	108460806	108460908	108460857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PJA2	282787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	109079577	109079706	109079642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAN2A1	56510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	110865894	110866475	110866210	Y	STARD4	STARD4	NA	NA	NA	NA	STARD4	19606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	111342511	111342737	111342622	Y	STARD4	NA	NREP,LOC100505678	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L4A-AS1	151486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	112218687	112219263	112218745	Y	APC	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	23768	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	114623111	114623418	114623265	Y	NA	PGGT1B,CCDC112	NA	NA	NA	NA	CCDC112	7110	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	114848957	114849251	114849109	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	29340	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	AC010226.4	21927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	114970299	114970641	114970577	Y	NA	AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7	NA	NA	NA	NA	TMED7	3610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	115276815	115277206	115277011	Y	LOC644100	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	101260	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	115420076	115420175	115420113	Y	LOC644100	CTD-2287O16.1,COMMD10	NA	NA	NA	NA	COMMD10	1388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	118610393	118610883	118610628	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	8006	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	118677194	118677610	118677495	Y	DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8	NA	NA	NA	NA	NA	TNFAIP8	74807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	119573403	119573585	119573488	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	224388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	119848516	119848911	119848640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	50543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	119940626	119940961	119940736	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRR16	142653	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	121402997	121403353	121403172	Y	LOX,LOX	LOX	NA	NA	NA	NA	LOX	8627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	121425326	121425585	121425567	Y	NA	LOX	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841,LOX	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	13346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	121427924	121428247	121427929	Y	NA	LOX	SRFBP1,ZNF474,LOC100505841	IMR90	Hi-C	24141950	LOX	15944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr5	121519182	121519443	121519230	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	107202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	122181959	122182300	122182177	Y	NA	SNX24	NA	NA	NA	NA	SNX24	4825	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	122690309	122690381	122690346	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP120	66905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	125690030	125690185	125690123	Y	GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	GRAMD3	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GRAMD3	3639	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	125701796	125702121	125701959	Y	GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	7972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	125782209	125782552	125782386	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	88385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	126847905	126848122	126848004	Y	NA	PRRC1	PRRC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	PRRC1	3179	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	130739357	130739526	130739407	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42SE2	160171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	131422074	131422446	131422224	Y	NA	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	14591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	131430055	131430830	131430575	Y	RAPGEF6,FNIP1,SLC22A4,IRF1	CSF2	NA	NA	NA	NA	CSF2	22572	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	131601385	131601782	131601639	Y	P4HA2	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	10021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	131629178	131629624	131629352	Y	FNIP1,IRF1,SLC22A4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	P4HA2	170	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	131830040	131830170	131830098	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	NA	NA	NA	NA	IRF1	5550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	131832561	131832909	131832704	Y	AFF4,SLC22A4,IRF1	IRF1	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	IRF1	8071	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr5	131981394	131981469	131981432	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIF3A	89861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	132844832	132844998	132844915	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C5orf15	457480	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	133801466	133801754	133801589	Y	NA	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31064	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	133802349	133802592	133802584	Y	PPP2CA,SEC24A,UBE2B	AC005355.1	PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	31947	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	133839310	133839404	133839346	Y	NA	NA	PHF15,PPP2CA,CDKL3,CDKN2AIPNL,SAR1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC005355.1	68908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	133890594	133890960	133890666	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	91519	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	134259128	134259903	134259220	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461	NA	NA	NA	NA	MTND5P11	246	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	134261311	134262635	134261858	Y	NA	PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11	NA	NA	NA	NA	MTND4P12,MIR4461	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	134475601	134475808	134475692	Y	PITX1	NA	LOC340073,PCBD2,CATSPER3,H2AFY	IMR90	Hi-C	24141950	PITX1	107098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	135347789	135348106	135347904	Y	NA	TGFBI	VTRNA2-1,TGFBI	IMR90	Hi-C	24141950	TGFBI	14478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	135416297	135416409	135416350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD5	50125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	138241399	138241693	138241546	Y	NA	NA	SIL1	IMR90	Hi-C	24141950	CTNNA1	296743	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	138436608	138436808	138436708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATR3	170633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	138620359	138620541	138620439	Y	UBE2D2,MATR3	MATR3,SIL1	NA	NA	NA	NA	SIL1	6705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	138686401	138686737	138686569	Y	NA	PAIP2	NA	NA	NA	NA	PAIP2	11125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	138838499	138838633	138838566	Y	TMEM173	ECSCR,TMEM173	NA	NA	NA	NA	ECSCR	1695	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	138841391	138841557	138841500	Y	ECSCR	ECSCR,TMEM173	NA	NA	NA	NA	ECSCR	1063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	139076374	139076603	139076510	Y	CXXC5	CTB-35F21.2	NA	NA	NA	NA	CTB-35F21.2	47205	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	139077054	139077268	139077188	Y	CXXC5	CTB-35F21.2	NA	NA	NA	NA	CTB-35F21.2	46540	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	139636160	139636260	139636251	Y	SRA1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	44446	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	139677985	139678148	139678067	Y	NA	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	2558	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	139691635	139691999	139691907	Y	HBEGF	PFDN1,HBEGF	NA	NA	NA	NA	PFDN1	10929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	12737	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-3	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-3	5115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	140420005	140420137	140420073	Y	NA	NA	PCDHA1	MCF7	ChIA-PET	22265404	PCDHB2	52090	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	140875639	140876085	140875835	Y	PCDHB16,TAF7,RELL2,DIAPH1	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	8831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	141375136	141375383	141375261	Y	NA	RNF14,GNPDA1	NA	NA	NA	NA	GNPDA1	15223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	141404371	141404781	141404694	Y	DIAPH1,FCHSD1	GNPDA1	GNPDA1,NDFIP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GNPDA1	13765	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	141736379	141736797	141736670	Y	ARHGAP26	SPRY4	NDFIP1,FGF1,SPRY4,GNPDA1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SPRY4	32359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	141824245	141824298	141824272	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	120225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	141825669	141826086	141825870	Y	SPRY4	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	121649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	141851932	141852283	141852109	Y	NA	NA	SPRY4,GNPDA1,NDFIP1,FGF1,RNF14	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	147912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	141917041	141917377	141917209	Y	NA	NA	NDFIP1,SPRY4,FGF1	IMR90	Hi-C	24141950	SPRY4	213021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	142024486	142024769	142024581	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	123180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	142361615	142361922	142361810	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	213666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	142562980	142563339	142563259	Y	NR3C1	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	146831	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	142580387	142580630	142580509	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	129540	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	142623562	142623962	142623719	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPL7P21	86208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	142916050	142916194	142916130	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	NR3C1	102973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	143267812	143268155	143268024	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	280123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	145827727	145827826	145827802	Y	NA	TCERG1	GPR151	IMR90	Hi-C	24141950	TCERG1	2853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	146915248	146915516	146915371	Y	DPYSL3	DPYSL3	DPYSL3	IMR90	Hi-C	24141950	DPYSL3	27629	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	148172345	148172765	148172447	Y	FBXO38,ADRB2	ADRB2	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	31391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	148290314	148290586	148290452	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	86158	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	148293572	148293925	148293745	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	89416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	148591795	148592037	148591918	Y	ABLIM3	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1L1	57397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	148700478	148700631	148700542	Y	NA	GRPEL2,PCYOX1L	GRPEL2,PCYOX1L	IMR90	Hi-C	24141950	GRPEL2	22362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	148832906	148833066	148832986	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSNK1A1	95941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	149110836	149111455	149111198	Y	ARHGEF37,SLC26A2,CDX1,PPARGC1B	PPARGC1B	NA	NA	NA	NA	PPARGC1B	2975	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	149379132	149379170	149379142	Y	NA	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	149422019	149422297	149422100	Y	NA	HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	TIGD6	43289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	149979570	149980059	149979818	Y	NA	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	928	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	150004824	150005027	150004948	Y	SYNPO,MYOZ3	SYNPO	NA	NA	NA	NA	SYNPO	26182	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	150161319	150161633	150161505	Y	ANXA6,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	24648	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	150169826	150170319	150169982	Y	CD74,CD74,TNIP1,CCDC69,RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62	DCTN4	NA	NA	NA	NA	DCTN4	33155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	150455023	150455538	150455407	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,SLC36A1,CCDC69,TNIP1	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	15600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	151078700	151079028	151078874	Y	ATOX1,SPARC	SPARC	SPARC,ATOX1	IMR90	Hi-C	24141950	SPARC	13974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	151119916	151120243	151119990	Y	NA	RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1	SPARC	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-54C4.1	23696	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	153809274	153809597	153809436	Y	NA	SAP30L-AS1,SAP30L,HAND1	NA	NA	NA	NA	SAP30L-AS1	13813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	154205315	154205569	154205444	Y	KIF4B,GEMIN5	CNOT8	NA	NA	NA	NA	CNOT8	29544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	154871450	154872048	154871744	Y	KIF4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGCD	423306	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr5	156814689	156815040	156814693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	69987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	156913799	156914134	156913967	Y	NA	NIPAL4	NA	NA	NA	NA	NIPAL4	28772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	156968105	156968405	156968157	Y	NA	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	32378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	157001390	157002014	157001697	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	NA	NA	NA	NA	ADAM19	607	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	157030326	157030804	157030600	Y	HAVCR2,NIPAL4,ADAM19	ADAM19	CYFIP2,FNDC9,NIPAL4,ADAM19,SOX30,C5orf52,THG1L,LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM19	29543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	157284724	157285025	157284835	Y	NIPAL4,ADAM19	CLINT1	LSM11	IMR90	Hi-C	24141950	CLINT1	541	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	158605991	158606398	158606265	Y	NA	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	28663	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	158611896	158612266	158612182	Y	IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	22795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	158632432	158632664	158632544	Y	NA	RNF145	NA	NA	NA	NA	RNF145	2397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	159451021	159451194	159451125	Y	NA	TTC1	NA	NA	NA	NA	TTC1	16901	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	159592107	159592427	159592336	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19947	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	159592617	159593055	159592885	Y	NA	PWWP2A,FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FABP6	19319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	159596316	159596619	159596472	Y	NA	FABP6	TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2,C5orf54	IMR90	Hi-C	24141950	FABP6	15755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	159934271	159934508	159934340	Y	SLU7	NA	NA	NA	NA	NA	PTTG1	87442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167066911	167067143	167066981	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	649513	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	167126470	167126930	167126675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	589726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	167157088	167157552	167157214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	559104	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	167171330	167171561	167171437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	545095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	167197574	167197786	167197665	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	518870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167224919	167225220	167225022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	491436	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr5	167241894	167242222	167242118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	474434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	167243466	167243587	167243564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	473069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167298999	167299254	167299082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	417402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167372516	167372785	167372694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	343871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	167639977	167640074	167640026	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC1	76582	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167752204	167752623	167752553	Y	PANK3	WWC1	RARS	IMR90	Hi-C	24141950	WWC1	35548	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	167961977	167962275	167962126	Y	NA	MIR103A1,PANK3	PANK3,MIR103B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR103A1	23707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	169215174	169215454	169215255	Y	DOCK2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	190290	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	169398141	169398453	169398335	Y	NA	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	7291	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	169404223	169404546	169404350	Y	FAM196B	FAM196B	NA	NA	NA	NA	FAM196B	1198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr5	170060615	170060931	170060764	Y	RANBP17	NA	NA	NA	NA	NA	FAM196B	654871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	171094849	171095086	171094946	Y	NA	NA	FBXW11,FGF18	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1	282729	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	171431879	171432256	171432181	Y	UBTD2,STK10	FBXW11	NA	NA	NA	NA	FBXW11	2	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	171529769	171530204	171529991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	83186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	171560333	171560981	171560496	Y	UBTD2,STK10	NA	NA	NA	NA	NA	STK10	52409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	171788471	171789086	171788773	Y	DUSP1,STK10,UBTD2	NA	NA	NA	NA	NA	UBTD2	79396	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	171882832	171882998	171882915	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	3305	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	172198749	172199959	172199636	Y	UBTD2,ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1	NA	NA	NA	NA	DUSP1	2551	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172205264	172205447	172205353	Y	UBTD2,C5orf41,DUSP1	DUSP1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,ATP6V0E1,RPL26L1	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP1	9066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172208951	172208972	172208964	Y	UBTD2	DUSP1	ERGIC1,DUSP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	12753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172226784	172227709	172227394	Y	ERGIC1,C5orf41,DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	30586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	172228151	172228566	172228394	Y	DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	30712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	172234136	172234644	172234380	Y	NA	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	24634	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	172262088	172262814	172262509	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	2810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172288216	172288483	172288386	Y	DUSP1,C5orf41,ERGIC1	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	28938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172314817	172315056	172314937	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	55539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr5	172463160	172463425	172463226	Y	NA	NA	C5orf41	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V0E1	54400	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172882283	172882785	172882503	Y	NA	NA	LOC285593,STC2,BOD1,NKX2-5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	127777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	172901872	172902293	172901982	Y	ATP6V0E1	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	139370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	173208911	173209406	173209234	Y	CPEB4	NA	CPEB4	IMR90	Hi-C	24141950	CPEB4	103877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	173846628	173846975	173846845	Y	NA	NA	MSX2,MIR4634	IMR90	Hi-C	24141950	MSX2	302561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	174148035	174148467	174148121	Y	MSX2	MSX2	NA	NA	NA	NA	MSX2	1069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	176972522	176972758	176972729	Y	NSD1,RAB24,GRK6,DOK3,DOK3	PDLIM7,DDX41,FAM193B,TMED9	NA	NA	NA	NA	FAM193B	6784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	177042588	177043196	177042926	Y	NSD1,FAM193B	TMED9,B4GALT7	NA	NA	NA	NA	B4GALT7	17487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	177645477	177646261	177645593	Y	NA	HNRNPAB	NA	NA	NA	NA	HNRNPAB	15969	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	178692524	178692976	178692825	Y	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	77455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	179894931	179895217	179894999	Y	NA	CTC-573N18.1,CNOT6	GFPT2,MAPK9,CNOT6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CNOT6	24195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	179967202	179967410	179967248	Y	NA	CNOT6	NA	NA	NA	NA	CNOT6	47790	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	180285670	180285966	180285744	Y	NA	MGAT1,LINC00847,ZFP62	NA	NA	NA	NA	ZFP62	320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr5	180611137	180611357	180611292	Y	MGAT1	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638	NA	NA	NA	NA	CTC-338M12.5	5567	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr5	180634441	180634803	180634658	Y	NA	CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,MIR4638,SNORD96A,CTC-338M12.4,GNB2L1	NA	NA	NA	NA	TRIM7	4148	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	501922	502087	502051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC2	189030	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	710742	711015	710979	Y	HUS1B	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	19625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	711154	711526	711478	Y	DUSP22,EXOC2	EXOC2	NA	NA	NA	NA	EXOC2	20037	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	1953013	1953362	1953197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMDS	290564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	3163246	3163428	3163368	Y	NA	BPHL,TUBB2A	NA	NA	NA	NA	TUBB2A	7486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	3209395	3209963	3209634	Y	SERPINB9	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	PSMG4	19674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	3238745	3238826	3238788	Y	NA	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	8781	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	3254273	3254642	3254472	Y	SLC22A23	PSMG4,TUBB2B	NA	NA	NA	NA	TUBB2B	24309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	4317088	4317563	4317434	Y	CDYL	NA	RPP40,CDYL,LYRM4	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	183257	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	4778036	4778769	4778420	Y	CDYL	NA	NA	NA	NA	NA	CDYL	73643	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	5660943	5661332	5661178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FARS2	401666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	6851413	6851674	6851488	Y	NA	NA	RREB1	IMR90	Hi-C	24141950	RREB1	254156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	7137966	7138068	7138020	Y	RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1	RREB1	NA	NA	NA	NA	RREB1	32136	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	9516527	9516706	9516607	Y	NA	NA	LOC100130275,TFAP2A,LINC00518	IMR90	Hi-C	24141950	TFAP2A	901186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	10403752	10404250	10404030	Y	TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A	TFAP2A	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	13642	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	11653356	11653414	11653358	Y	NA	NA	HIVEP1,EDN1,ADTRP,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM170B	117418	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	11769423	11769725	11769659	Y	HIVEP1	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	233485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	12484193	12484504	12484246	Y	EDN1	NA	EDN1,TMEM170B,HIVEP1	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	195597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	12577591	12578036	12577836	Y	NA	NA	EDN1,TMEM170B	IMR90	Hi-C	24141950	EDN1	288995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	12729754	12730156	12729835	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDN1	441158	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	13404217	13404579	13404523	Y	GFOD1	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	77402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	13636617	13636971	13636795	Y	TBC1D7,GFOD1,CD83	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	23058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	13649579	13649948	13649702	Y	NA	NOL7	NA	NA	NA	NA	NOL7	36020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	14211875	14212265	14212161	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	96003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	14713126	14713654	14713380	Y	NA	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90	Hi-C	24141950	JARID2	530873	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	16436821	16437137	16436938	Y	MYLIP,ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	200010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	16495109	16495178	16495163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	258298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	16713666	16713734	16713668	Y	ATXN1	RP1-151F17.1,ATXN1	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	45635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	16980273	16980564	16980440	Y	NA	NA	ATXN1,FLJ23152	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	220551	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	17015732	17016108	17015919	Y	FLJ23152	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	17016303	17016440	17016335	Y	NA	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	ATXN1	256581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	17280388	17280785	17280395	Y	CAP2,RBM24,RBM24,RBM24	RBM24	NA	NA	NA	NA	RBM24	811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	18308493	18308879	18308567	Y	NA	DEK	RNF144B	IMR90	Hi-C	24141950	DEK	45439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	21987708	21987959	21987863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SOX4	395736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	24313904	24313964	24313914	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	42316	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	24323980	24324360	24324286	Y	DCDC2,KAAG1,DCDC2	DCDC2	NA	NA	NA	NA	DCDC2	31920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	25992254	25993073	25992840	Y	NA	TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2	NA	NA	NA	NA	HIST1H1A	22967	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	27203038	27203420	27203229	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	26015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	27300679	27301026	27300902	Y	NA	ZNF204P,ZNF391	NA	NA	NA	NA	ZNF204P	36278	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	27655687	27656083	27655918	Y	NA	NA	LOC100507173	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HIST1H2BL	117626	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	27686942	27687278	27687069	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BL	86431	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	27807310	27807672	27807617	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H3I,HIST1H2BO,HIST1H2AM,HIST1H2AL,HIST1H1B	HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BN	2987	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	27862895	27863061	27863012	Y	ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO	NA	NA	NA	NA	HIST1H2BO	3692	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	28457225	28458028	28457315	Y	NA	ZSCAN23	NA	NA	NA	NA	ZSCAN23	47946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCAND3	128816	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	29568471	29568641	29568556	Y	MOG,GABBR1	UBD	NA	NA	NA	NA	UBD	42769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	30068638	30068845	30068662	Y	NA	ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11	NA	NA	NA	NA	PPP1R11	36152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	30737456	30737900	30737560	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3	FLOT1,IER3	DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A,MRPS18B,PPP1R10	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER3	27125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	30787859	30788252	30788206	Y	TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3	NA	FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DDR1	53946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,VWA7	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	31705604	31706142	31705906	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7	NA	NA	NA	NA	MSH5	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VWA7,VARS,LSM2,C6orf48,NEU1	NA	NA	NA	NA	C6orf48	10117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr6	32075999	32076179	32076125	Y	LY6G6C,TNXB,RNF5,EGFL8,TNXB	ATF6B,FKBPL,PPT2	NA	NA	NA	NA	ATF6B	17851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	32081652	32082042	32081917	Y	NA	ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8	NA	NA	NA	NA	ATF6B	11988	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	33581625	33581918	33581825	Y	NA	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	33590898	33591125	33590902	Y	ITPR3	BAK1,ITPR3	NA	NA	NA	NA	ITPR3	4756	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	33712309	33712484	33712432	Y	IP6K3	LEMD2	NA	NA	NA	NA	LEMD2	42429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	34191726	34192136	34191830	Y	C6orf1,HMGA1	CYCSP55,HMGA1,C6orf1,RPL35P2	RPS10-NUDT3,NUDT3,C6orf1	MCF7	ChIA-PET	22265404	CYCSP55	6510	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	34631608	34631780	34631736	Y	HMGA1	C6orf106	NA	NA	NA	NA	C6orf106	30856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	35017720	35018080	35017831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCUBE3	162110	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	36391024	36391283	36391227	Y	SRSF3,CDKN1A,CDKN1A,PXT1	KCTD20,PXT1	NA	NA	NA	NA	KCTD20	17261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	36634782	36635224	36635042	Y	MTCH1,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A,CDKN1A	RNU1-88P,CDKN1A	CDKN1A,SRSF3,MIR3925,CPNE5,PPIL1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDKN1A	7081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	36703665	36703855	36703791	Y	ETV7,ETV7,CDKN1A,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	61360	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	36737758	36737957	36737899	Y	ETV7,ETV7,PXT1,PIM1	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	95453	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	37102324	37102775	37102642	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,MIR3925,C6orf89,FGD2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	33204	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	37104908	37105418	37105405	Y	NA	PIM1	PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	30561	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	37424991	37425195	37425093	Y	NA	CCDC167	CCDC167	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC167	40503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	37673124	37673343	37673226	Y	NA	NA	MDGA1	K562	ChIA-PET	22265404	ZFAND3	111932	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	37751286	37751497	37751341	Y	NA	ZFAND3	BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,CCDC167,MDGA1	IMR90	Hi-C	24141950	ZFAND3	33778	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	38229881	38230014	38229948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD9	375910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	42409399	42409623	42409499	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	8166	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	42515662	42516014	42516002	Y	GUCA1A,MEA1,KIAA0240	UBR2	TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBR2	13786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	43295599	43295850	43295834	Y	TJAP1	ZNF318	NA	NA	NA	NA	ZNF318	39366	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	43894411	43894725	43894584	Y	NFKBIE,TJAP1,GTPBP2,MAD2L1BP	NA	NA	NA	NA	NA	RP5-1120P11.3	144925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	44230828	44231731	44231363	Y	NFKBIE	SLC29A1,HSP90AB1,SLC35B2,AARS2	NA	NA	NA	NA	NFKBIE	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	45313959	45314320	45314140	Y	NA	RUNX2,SUPT3H	NA	NA	NA	NA	RUNX2	20065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	45390987	45391259	45391097	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	47297	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	45413515	45413853	45413708	Y	RUNX2	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	69825	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	45428920	45429031	45428964	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	85230	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	45618234	45618676	45618425	Y	RUNX2	NA	RUNX2,SUPT3H,CLIC5	IMR90	Hi-C	24141950	SUPT3H	274544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	48794608	48794845	48794713	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MUT	634059	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	49521190	49521511	49521254	Y	NA	C6orf141	NA	NA	NA	NA	C6orf141	5077	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52377018	52377269	52377212	Y	GSTA5,TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	62444	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52416321	52416567	52416441	Y	NA	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	23146	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52438177	52438308	52438243	Y	NA	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	1405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52460126	52460529	52460233	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	20413	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	52522235	52522527	52522515	Y	NA	TMEM14A	NA	NA	NA	NA	TMEM14A	11380	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	53191249	53191636	53191614	Y	NA	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	20311	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	53199994	53200715	53200310	Y	FBXO9,FBXO9,FBXO9,ELOVL5	ELOVL5	NA	NA	NA	NA	ELOVL5	11232	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	53224045	53224723	53224315	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	12098	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr6	53225493	53225821	53225675	Y	NA	ELOVL5	ELOVL5	K562	ChIA-PET	22265404	ELOVL5	13546	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	53617793	53617916	53617855	Y	NA	LRRC1	LRRC1,GCLC	IMR90	Hi-C	24141950	LRRC1	39379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	54845767	54846152	54846043	Y	GFRAL	NA	NA	NA	NA	NA	FAM83B	136198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	56296413	56296568	56296543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DST	520858	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	56543882	56543906	56543894	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	273520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	56578288	56578394	56578341	Y	NA	NA	DST	IMR90	Hi-C	24141950	DST	239032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	56811664	56812033	56811848	Y	NA	DST,BEND6	BEND6,KIAA1586,ZNF451,PRIM2	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DST	5393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	57004936	57005232	57005084	Y	NA	BAG2	NA	NA	NA	NA	BAG2	29892	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	57178706	57179008	57178897	Y	RAB23	PRIM2	BAG2,ZNF451,PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	1103	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	57251417	57251660	57251585	Y	KIAA1586	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	73814	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	58778631	58779245	58778717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP4	524062	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	71906987	71907342	71907159	Y	NA	NA	OGFRL1,MIR30A	IMR90	Hi-C	24141950	OGFRL1	89164	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	72188537	72188902	72188719	Y	NA	NA	OGFRL1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00472	60065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	72294841	72295504	72295148	Y	NA	KRT19P1	RIMS1	IMR90	Hi-C	24141950	KRT19P1	2417	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	72640618	72640942	72640781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT19P1	348194	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	73354930	73355043	73354987	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	73355182	73355469	73355282	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	25662	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	73524800	73525128	73524864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	195280	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	73975471	73975797	73975634	Y	NA	RP11-398K22.12,KHDC1	NA	NA	NA	NA	RP11-398K22.12	4533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	74432369	74432753	74432573	Y	MB21D1,EEF1A1,SLC17A5,CD109,CD109	CD109	NA	NA	NA	NA	CD109	28861	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	75914223	75914620	75914578	Y	COL12A1	COL12A1,COX7A2	NA	NA	NA	NA	COL12A1	456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	79043157	79043230	79043194	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAK1BP1	531959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	81044945	81045591	81045323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	230581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	81348599	81348680	81348638	Y	NA	NA	BCKDHB	IMR90	Hi-C	24141950	BCKDHB	534235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	81550162	81550525	81550226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCKDHB	735798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	81662295	81662532	81662438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM46A	797959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	84577292	84577766	84577526	Y	CYB5R4	CYB5R4	NA	NA	NA	NA	CYB5R4	9930	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	86113432	86113601	86113525	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	44208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	88408243	88408692	88408556	Y	AKIRIN2	AKIRIN2	NA	NA	NA	NA	AKIRIN2	1235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	90856849	90857084	90856969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BACH2	147543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	91121051	91121489	91121257	Y	BACH2,BACH2	NA	BACH2,MIR4464	IMR90	Hi-C	24141950	BACH2	116424	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	99995359	99995841	99995579	Y	PNISR	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	19008	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	100002359	100002730	100002672	Y	PNISR,USP45,LOC100130890	USP45,CCNC	NA	NA	NA	NA	CCNC	12119	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	101149750	101149957	101149936	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-121G13.3	173598	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	106049296	106049799	106049571	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	200337	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	106442778	106443178	106442990	Y	PRDM1	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	ATG5	328488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	106611101	106611647	106611464	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	160019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	106611677	106612214	106611996	Y	PRDM1	NA	NA	NA	NA	NA	ATG5	159452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	111739300	111739614	111739444	Y	SLC16A10,TRAF3IP2,REV3L	NA	NA	NA	NA	NA	TRAF3IP2-AS1	63100	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	112145008	112145393	112145362	Y	REV3L,TRAF3IP2,FYN,FYN,FYN	FYN	NA	NA	NA	NA	FYN	47262	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	112523729	112524008	112523937	Y	LAMA4	NA	NA	NA	NA	NA	LAMA4	50133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	112570641	112571001	112570894	Y	LAMA4	LAMA4	NA	NA	NA	NA	LAMA4	3140	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	114176108	114176553	114176196	Y	MARCKS	NA	NA	NA	NA	NA	MARCKS	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	116469368	116469398	116469382	Y	NA	NT5DC1	NA	NA	NA	NA	NT5DC1	49356	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	117804575	117804878	117804739	Y	NA	DCBLD1	NA	NA	NA	NA	DCBLD1	31595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	117937053	117937396	117937164	Y	NA	GOPC	ROS1	IMR90	Hi-C	24141950	GOPC	15362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	118759105	118759218	118759162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP85L	270020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1,RNU4-35P	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	121843500	121843932	121843669	Y	GJA1	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-35P	70233	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	122016612	122016787	122016747	Y	NA	NA	GJA1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-35P	243345	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	125424080	125424400	125424202	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	13795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	126241150	126241321	126241235	Y	NCOA7	HINT3	NA	NA	NA	NA	HINT3	34606	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	137529	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	127980874	127981174	127981075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-403A15.1	226093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	128747260	128747445	128747404	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRK	92425	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	129250577	129251100	129251039	Y	NA	LAMA2	NA	NA	NA	NA	LAMA2	48235	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	129822485	129822770	129822701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	206600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	130001069	130001170	130001133	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	28200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	130004742	130004922	130004817	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	24448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	130029433	130029625	130029566	Y	NA	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	63	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	130922387	130922557	130922422	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	237508	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	130923561	130923822	130923693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM200A	238682	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	132406911	132407089	132407028	Y	NA	NA	CTGF,LOC100507254,ENPP1	IMR90,K562	Hi-C,5C	24141950,22955621	CTGF	136398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	132811280	132811490	132811390	Y	VNN2,VNN2,VNN2,VNN1,STX7	STX7	NA	NA	NA	NA	STX7	20847	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	133134288	133134908	133134317	Y	NA	RPS12	NA	NA	NA	NA	SNORD101	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	133890779	133890909	133890844	Y	NA	NA	MGC34034,TBPL1,SLC2A12,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TCF21	317367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	133930803	133931089	133930946	Y	NA	NA	MGC34034,TCF21	IMR90	Hi-C	24141950	TCF21	277187	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	134026254	134026532	134026380	Y	NA	NA	MGC34034	IMR90	Hi-C	24141950	TCF21	181744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	134616841	134617592	134617239	Y	SGK1,SGK1,SGK1	SGK1	NA	NA	NA	NA	SGK1	19658	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	134668918	134669336	134669288	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	31668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	134669516	134669878	134669820	Y	NA	SGK1	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	32266	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	134741718	134742020	134741875	Y	SGK1,SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104468	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	135431355	135431486	135431449	Y	HBS1L,AHI1,MYB	HBS1L	AHI1	IMR90	Hi-C	24141950	HBS1L	9161	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	135503898	135504621	135504156	Y	HBS1L,AHI1,MYB	MYB	NA	NA	NA	NA	MYB	3445	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	136336050	136336507	136336258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7B	165216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	137109342	137109643	137109396	Y	IFNGR1,BCLAF1,MAP3K5	MAP3K5,PEX7	NA	NA	NA	NA	MAP3K5	2013	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138019778	138020625	138020405	Y	IFNGR1,TNFAIP3	NA	TNFAIP3,IFNGR1,PERP	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	165726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138027517	138027801	138027604	Y	NA	NA	TNFAIP3,PERP	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	158550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138132277	138133056	138132650	Y	TNFAIP3	NA	TNFAIP3	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNFAIP3	53295	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138149499	138149821	138149637	Y	OLIG3,TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	36530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138150613	138151141	138151010	Y	OLIG3,TNFAIP3	TNFAIP3	TNFAIP3	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP3	35210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138427134	138427492	138427302	Y	PERP	PERP	NA	NA	NA	NA	PERP	486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	138552516	138552583	138552548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1244	71458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	139656661	139656994	139656829	Y	NA	CITED2	ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	36763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	139854911	139854985	139854931	Y	HECA,CITED2,CITED2,CITED2	NA	LOC100132735,CITED2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CITED2	161154	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	139860975	139861228	139861133	Y	CITED2,CITED2,CITED2	NA	CITED2,LOC100132735	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CITED2	167218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	140203387	140203540	140203467	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	509630	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	140920515	140920620	140920568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1226758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	142091291	142091499	142091406	Y	VTA1	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	374868	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	142335769	142335959	142335859	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VTA1	130408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	143154152	143154557	143154355	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	109781	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	143223836	143224147	143224035	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	40191	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	143476820	143477010	143476926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	97187	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	144066654	144067070	144066822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	95411	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	144284201	144284585	144284512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	144585551	144585700	144585606	Y	NA	NA	UTRN	IMR90	Hi-C	24141950	TPT1P4	65449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	144587251	144587368	144587331	Y	NA	NA	UTRN,STX11	IMR90	Hi-C	24141950	TPT1P4	67149	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	144931961	144932452	144932213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPT1P4	411859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	147124877	147125201	147125102	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB32	262048	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	147235645	147236230	147236149	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	287331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	148358652	148358995	148358836	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	232445	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	148685178	148685519	148685372	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	SASH1	93738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	149069640	149070024	149069807	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	3176	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	150259749	150260211	150260119	Y	NA	RAET1G,ULBP2	NA	NA	NA	NA	ULBP2	925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	151381285	151381592	151381452	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	37073	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	151392463	151392726	151392659	Y	NA	RP1-292B18.1	NA	NA	NA	NA	RP1-292B18.1	25939	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	151990047	151990437	151990162	Y	NA	ESR1	ESR1,RMND1,C6orf211,SYNE1,C6orf97	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ESR1	14221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	152085145	152085342	152085266	Y	ESR1,ESR1,ESR1,ESR1	NA	NA	NA	NA	NA	ESR1	109319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr6	157007979	157008724	157008580	Y	ARID1B	NA	MIR4466,ARID1B,NOX3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	88339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	157041058	157041538	157041248	Y	ARID1B	NA	ARID1B,MIR4466	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	ARID1B	55525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	157267788	157267851	157267817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	170725	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	157285008	157285408	157285041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	187945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	157342507	157343524	157343342	Y	ARID1B,ZDHHC14	NA	NA	NA	NA	NA	ARID1B	245444	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	157639062	157639495	157639253	Y	C6orf35	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	103138	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr6	159141436	159141829	159141621	Y	TAGAP,DYNLT1,SYTL3,C6orf99,EZR,EZR	NA	NA	NA	NA	NA	SYTL3	72390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr6	159270971	159271326	159271104	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	17645	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	159271429	159272000	159271674	Y	TAGAP,SYTL3,EZR,EZR	EZR,C6orf99	NA	NA	NA	NA	C6orf99	16971	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	160144181	160144267	160144224	Y	NA	WTAP,ACAT2,SOD2	NA	NA	NA	NA	WTAP	350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	160399624	160399885	160399732	Y	SOD2,WTAP,WTAP,MAS1	IGF2R	NA	NA	NA	NA	IGF2R	11493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	161549553	161550030	161549828	Y	AGPAT4	NA	NA	NA	NA	NA	MAP3K4	138794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	163776894	163776984	163776946	Y	NA	NA	DKFZp451B082,PACRG	IMR90	Hi-C	24141950	CAHM	56008	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	163833938	163834442	163834340	Y	NA	CAHM,QKI	NA	NA	NA	NA	QKI	906	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	167028527	167028763	167028637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	274448	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	167411045	167411413	167411177	Y	NA	RNASET2,RP1-167A14.2,FGFR1OP	NA	NA	NA	NA	FGFR1OP	375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	169308928	169309266	169309084	Y	THBS2	NA	WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	251753	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	169470702	169471012	169470790	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B,THBS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	90007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr6	169497404	169497715	169497550	Y	THBS2	NA	PHF10,THBS2,WDR27,C6orf70	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	63304	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	169568038	169568505	169568172	Y	NA	RP11-417E7.1	C6orf70,THBS2,PHF10,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	7019	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	169572627	169572772	169572742	Y	NA	RP11-417E7.1	THBS2,WDR27	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	11608	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	DLL1,FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	89354	89662	89513	Y	NA	NA	FAM20C,HEATR2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM20C	101307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	191531	191871	191582	Y	FAM20C	FAM20C,AC093627.12	NA	NA	NA	NA	AC093627.12	309	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	577876	578141	578015	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,HEATR2,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	19943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	579426	579712	579625	Y	PRKAR1B,PRKAR1B,GET4,PDGFA	PDGFA	NA	NA	NA	NA	PDGFA	21493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	1970944	1971123	1971068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	299755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	2356665	2356933	2356799	Y	NA	EIF3B,SNX8	NA	NA	NA	NA	EIF3B	34788	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	2657383	2657705	2657445	Y	IQCE,TTYH3	TTYH3	NA	NA	NA	NA	TTYH3	11880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	2903227	2903785	2903462	Y	LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12	AC006028.11,GNA12	GNA12	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNA12	21269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	2980860	2981267	2981182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GNA12	98902	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	3307587	3307977	3307629	Y	NA	SDK1	SDK1	IMR90	Hi-C	24141950	SDK1	31103	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	3528330	3528371	3528351	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	189250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	3877207	3877255	3877231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDK1	538127	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	4764796	4765177	4765030	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	83408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	4778448	4778853	4778548	Y	KIAA0415	NA	NA	NA	NA	NA	FOXK1	97060	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	5595490	5596184	5595557	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	5231	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	5609541	5610012	5609880	Y	SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1	ACTB,FSCN1	RNF216,FSCN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	8126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	5724329	5724708	5724518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FSCN1	93890	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	5787686	5787972	5787829	Y	NA	RNF216	NA	NA	NA	NA	RNF216	31398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	6682292	6682670	6682512	Y	C7orf26	ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	7339	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	7197591	7197789	7197703	Y	C1GALT1	C1GALT1	COL28A1	IMR90	Hi-C	24141950	C1GALT1	3026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	12755276	12755712	12755432	Y	VWDE,ARL4A	ARL4A	NA	NA	NA	NA	ARL4A	30795	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	18161165	18161355	18161260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	183041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	18548166	18548343	18548284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	570042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	18563504	18563902	18563528	Y	HDAC9,HDAC9,HDAC9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX13	585380	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	21254928	21255253	21254997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP4	210399	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	21928607	21928632	21928620	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDCA7L	55070	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	22757674	22758207	22757934	Y	NA	IL6	NA	NA	NA	NA	IL6	5296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	23513815	23514383	23514045	Y	NUPL2,C7orf30,IGF2BP3	IGF2BP3	MALSU1	K562	ChIA-PET	22265404	IGF2BP3	5729	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	25009429	25009748	25009721	Y	NA	OSBPL3	NA	NA	NA	NA	OSBPL3	9505	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	25068217	25068495	25068356	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90	Hi-C	24141950	OSBPL3	48964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	25980642	25980887	25980804	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFE2L3	208973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	28076890	28077172	28076964	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	140769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr7	28127846	28128022	28127898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	JAZF1-AS1	89919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	28893180	28893544	28893363	Y	CREB5	NA	CREB5	IMR90	Hi-C	24141950	CHN2	266346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	29163209	29163338	29163275	Y	NA	CHN2	NA	NA	NA	NA	CHN2	3319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	32202741	32202908	32202813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	134033	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	33316298	33316594	33316442	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BBS9	149442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	34026970	34027411	34027080	Y	BMPER	NA	NA	NA	NA	NA	BMPER	84447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	35629037	35629048	35629043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HERPUD2	104133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	36227905	36228111	36228000	Y	HERPUD2,EEPD1	EEPD1	NA	NA	NA	NA	EEPD1	37147	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	36480174	36480717	36480189	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0895	52440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	36785983	36786266	36786088	Y	AOAH	NA	AOAH	IMR90	Hi-C	24141950	NPM1P18	70298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	37221797	37222057	37221923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	365233	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	39641991	39642218	39642176	Y	RALA	YAE1D1,RALA	LINC00265	IMR90	Hi-C	24141950	RALA	18864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	40591236	40591497	40591392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	603600	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	40756959	40757193	40757114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	769323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	40961938	40962183	40962107	Y	NA	NA	C7orf10,INHBA,LOC285954	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	778523	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	41769902	41770065	41769983	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	29196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	41924805	41925034	41925028	Y	NA	NA	LOC285954,C7orf10,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	184099	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	42927750	42928726	42928340	Y	NA	C7orf25,MRPL32,PSMA2	NA	NA	NA	NA	C7orf25	21178	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	43608248	43608485	43608352	Y	NA	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	11872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43612098	43612408	43612297	Y	DBNL	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	7949	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43657815	43658085	43657951	Y	POLM,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	37458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43670120	43670185	43670135	Y	POLM,DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	49763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43683947	43684262	43684105	Y	POLM,DBNL,STK17A	NA	NA	NA	NA	NA	STK17A	63590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43801940	43802267	43802061	Y	NA	BLVRA	NA	NA	NA	NA	BLVRA	5661	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	43959007	43959429	43959215	Y	NA	URGCP,UBE2D4	NA	NA	NA	NA	URGCP	4581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	44127636	44127736	44127679	Y	YKT6,AEBP1	DBNL,POLM,POLD2	PGAM2,POLM,AEBP1,POLD2,GCK,YKT6,CAMK2B	IMR90	Hi-C	24141950	POLM	7497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	44426024	44426371	44426281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2B	53848	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	46184955	46185274	46185142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP3	225482	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47390589	47390737	47390670	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	229419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47505797	47506192	47505996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	113964	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47510195	47510559	47510444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	109597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	47518819	47519136	47519085	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	101020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47536985	47537239	47537063	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	82917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47588229	47588393	47588311	Y	NA	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	31763	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47620098	47620164	47620135	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47641076	47641289	47641172	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,LINC00525,PKD1L1,C7orf69	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	20920	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47641950	47642196	47642073	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TNS3	21794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47644474	47644665	47644612	Y	NA	TNS3	TNS3,C7orf65,C7orf69,PKD1L1,LINC00525	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	24318	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47691174	47691510	47691360	Y	C7orf69,TNS3,C7orf65	NA	TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69	IMR90	Hi-C	24141950	TNS3	71018	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	47823605	47823820	47823740	Y	TNS3	C7orf69	NA	NA	NA	NA	C7orf69	9069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	50602565	50602886	50602809	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIGNL1	86477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55131480	55131905	55131522	Y	EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	46766	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	55141624	55142112	55141893	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	56910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	55146809	55147410	55146997	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	62095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr7	55322570	55322956	55322611	Y	EGFR	NA	EGFR,SEC61G	IMR90	Hi-C	24141950	LANCL2	108185	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	55641818	55642122	55641930	Y	VOPP1	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	3137	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	63767130	63767234	63767166	Y	NA	ZNF736	NA	NA	NA	NA	ZNF736	1293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	65613460	65613645	65613556	Y	ASL,ASL	CRCP	NA	NA	NA	NA	CRCP	35869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	66206459	66206659	66206557	Y	KCTD7,C7orf42,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	NA	RABGEF1	61308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	68171287	68171584	68171440	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP4-736H5.3	1011271	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73062013	73062614	73062579	Y	BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A	WBSCR22,DNAJC30	MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A	IMR90	Hi-C	24141950	WBSCR22	32741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73132412	73132545	73132481	Y	LAT2,BCL7B	WBSCR22,DNAJC30,STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	STX1A	410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	73236868	73237278	73236968	Y	CLDN3,CLDN4	CLDN4,WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	17587	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73265870	73266203	73266092	Y	BCL7B	WBSCR27	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	11005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73547862	73548178	73548020	Y	NA	EIF4H	NA	NA	NA	NA	EIF4H	38397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	73702546	73702842	73702658	Y	NA	RFC2,CLIP2	NA	NA	NA	NA	CLIP2	741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73866647	73867033	73866768	Y	LAT2	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	527	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	73869161	73869472	73869346	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	3041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	74064444	74064957	74064539	Y	GTF2IRD2B,LAT2	GTF2I	NA	NA	NA	NA	GTF2I	5037	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	74138320	74138615	74138328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2I	68326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	75923846	75924306	75924205	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	5555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	75948116	75948327	75948250	Y	RHBDD2	HSPB1,YWHAG	NA	NA	NA	NA	HSPB1	18255	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	76009173	76009680	76009431	Y	POR	YWHAG,ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	15155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	76052692	76053023	76052931	Y	NA	ZP3	NA	NA	NA	NA	ZP3	27857	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	77177634	77177834	77177685	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	13042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	77561991	77562080	77562036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	135869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	78478233	78478612	78478564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	601586	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	78922771	78923130	78923056	Y	MAGI2	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI2-AS3	157068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	80441834	80442054	80441993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEMA3C	107621	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	81894820	81895003	81894975	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	176111	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	81927516	81927685	81927601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CACNA2D1	143429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	89975005	89975165	89975035	Y	NA	GTPBP10,CLDN12	NA	NA	NA	NA	GTPBP10	12468	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	92156983	92157235	92157087	Y	CDK6,CDK6,PEX1,FAM133B,C7orf64	PEX1,RBM48	NA	NA	NA	NA	RBM48	896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	92261903	92262272	92262087	Y	CDK6,CDK6	FAM133B	FAM133B	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM133B	44195	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	92277080	92277232	92277129	Y	ANKIB1,GATAD1,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	59372	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	92324544	92325563	92325510	Y	NA	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM133B	106836	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	92340516	92340848	92340839	Y	CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	FAM133B	122808	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	92533719	92534002	92533863	Y	SAMD9	NA	FAM133B	IMR90	Hi-C	24141950	CDK6	69811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	92745192	92745375	92745297	Y	SAMD9	SAMD9L	NA	NA	NA	NA	SAMD9	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	BET1	180994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	94003622	94003870	94003684	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	18003	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	95675299	95675632	95675466	Y	DYNC1I1,FLJ42280	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	273827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	95807779	95807791	95807785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC25A13	141668	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	97913424	97913987	97913861	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	33733	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	99684818	99685168	99684993	Y	TSC22D4,PILRB,PILRA	ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,RP11-506M12.1	NA	NA	NA	NA	COPS6	241	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	100042030	100042585	100042239	Y	COPS6,EPHB4	MEPCE,ZCWPW1,PPP1R35,TSC22D4	NA	NA	NA	NA	PPP1R35	9842	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	100743461	100743946	100743576	Y	GNB2,TRIM56	TRIM56,SERPINE1	SERPINE1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIM56	16741	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr7	100760673	100761017	100760905	Y	GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	7353	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	100765253	100766084	100765924	Y	TRIM56,SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	2286	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101372678	101373024	101372861	Y	NA	NA	CUX1,EMID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CUX1	83935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	101499743	101500539	101499888	Y	SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1	CUX1	NA	NA	NA	NA	CUX1	42784	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101525517	101525682	101525579	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	68558	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101526005	101526525	101526438	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	69046	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101678350	101678537	101678444	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	221391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101707897	101708291	101708217	Y	SH2B2,CUX1,CUX1	NA	NA	NA	NA	NA	CUX1	250938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	102452256	102452586	102452421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC10	260742	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	102516226	102516619	102516429	Y	LRRC17	NA	FAM185A	IMR90	Hi-C	24141950	ARMC10	196709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	103277543	103277794	103277680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTA-276O3.4	290495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	104585458	104586124	104585640	Y	MLL5	NA	LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC01004	65367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	105447208	105447599	105447347	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN7L1	67451	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	105705488	105705603	105705542	Y	NA	SYPL1	ATXN7L1,SYPL1,CDHR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYPL1	45419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	105984735	105985626	105985459	Y	FLJ36031,NAMPT	NA	NAMPT,CCDC71L,PIK3CG	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	NAMPT	59963	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	106358724	106358979	106358846	Y	NAMPT,PIK3CG,HBP1,FLJ36031	NA	CCDC71L,NAMPT	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP5-884M6.1	54478	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	107190959	107191312	107191306	Y	NA	DUS4L,COG5,BCAP29	NA	NA	NA	NA	DUS4L	10617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	111720320	111721594	111721184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK4	122872	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	111819433	111819596	111819575	Y	NA	DOCK4,ZNF277	NA	NA	NA	NA	DOCK4	24870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	113724652	113724941	113724845	Y	FOXP2	FOXP2	NA	NA	NA	NA	FOXP2	270	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	115955390	115955624	115955546	Y	NA	CAV2,AC073130.3	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073130.3	10326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	115957232	115957778	115957588	Y	NA	CAV2,AC073130.3	CAV1,CAV2,TES,CAPZA2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC073130.3	8172	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	116152142	116152412	116152205	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	CAV1	IMR90	Hi-C	24141950	CAV1	10427	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	AC002066.1,CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	116217100	116217359	116217210	Y	CAV1,CAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CAV1	54261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	116314942	116315351	116315128	Y	ST7,TES,CAV2,CAV2,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	4498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	116328034	116328226	116328184	Y	ST7,CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,MET	MET	NA	NA	NA	NA	MET	17590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr7	116332814	116332936	116332875	Y	CAPZA2,TES	MET	NA	NA	NA	NA	MET	22370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	116356493	116356879	116356812	Y	NA	MET	NA	NA	NA	NA	MET	46049	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	116523983	116524309	116524052	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST7	66983	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	120631722	120632107	120631938	Y	NA	ING3	NA	NA	NA	NA	ING3	42919	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	120723269	120723399	120723324	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	134466	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	120724784	120725242	120725000	Y	C7orf58	NA	NA	NA	NA	NA	ING3	135981	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	120942380	120942663	120942460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM3C	91755	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	121025846	121026096	121025939	Y	ING3	FAM3C	NA	NA	NA	NA	FAM3C	8322	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	126341155	126341491	126341268	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	728487	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	126894131	126894431	126894281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	175547	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr7	128468302	128468509	128468385	Y	FLNC	CCDC136,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	128471531	128472043	128471766	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	3100	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	128472556	128472915	128472760	Y	NA	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	129005588	129005946	129005786	Y	AHCYL2,NRF1,FAM40B,AHCYL2	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	42265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	129057225	129057410	129057318	Y	NA	RP11-305M3.2	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	9014	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	129078824	129079119	129078920	Y	NA	RP11-305M3.2,RNU1-72P	NA	NA	NA	NA	RP11-305M3.2	30613	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	129419876	129420343	129420085	Y	NA	NA	NRF1,UBE2H	MCF7	ChIA-PET	22265404	NRF1	170321	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr7	129464915	129465297	129464948	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2H	125492	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	129590044	129590333	129590306	Y	NA	UBE2H	NA	NA	NA	NA	UBE2H	456	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	129960010	129960125	129960069	Y	NA	CPA4	NA	NA	NA	NA	CPA4	29036	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	130530611	130530821	130530670	Y	NA	NA	MEST,KLHDC10,MIR29A,MIR29B1,ZC3HC1,C7orf45,CPA5,LOC646329	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	65248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	130571851	130572495	130572306	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	23574	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr7	130581597	130582393	130581985	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	13676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	130588239	130588699	130588531	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	7370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	130593505	130595916	130594870	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	153	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	130601178	130601963	130601463	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	5109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	130614674	130615489	130615212	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	18605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	130645057	130645459	130645325	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48988	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	130669444	130669692	130669631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR29A	73375	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	130873403	130873921	130873619	Y	MKLN1,MKLN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC009362.2	51428	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	132106504	132106703	132106622	Y	PLXNA4	NA	NA	NA	NA	NA	PLXNA4	224744	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	135430585	135430983	135430863	Y	FAM180A	FAM180A	NA	NA	NA	NA	FAM180A	611	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	135459124	135459310	135459189	Y	NA	FAM180A	C7orf73,SLC13A4,FAM180A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	27530	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	135771654	135771794	135771701	Y	NA	AC009784.3	NA	NA	NA	NA	AC009784.3	3879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	137211123	137211422	137211273	Y	DGKI,PTN	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	184512	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	137372806	137372951	137372895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	311862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	137379258	137379404	137379341	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	305409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	137441898	137442245	137442146	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	242568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	137457622	137457847	137457706	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	226966	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	137671053	137671416	137671301	Y	TRIM24,CREB3L2	CREB3L2	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	13397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	139366770	139367125	139366961	Y	TBXAS1	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	139367160	139367381	139367316	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	108196	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	140774728	140775101	140774915	Y	NA	RNU4-74P	NA	NA	NA	NA	RNU4-74P	24679	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	143589612	143589642	143589628	Y	OR2F1,OR2A2,OR2A25,OR2A12,TAS2R60,FAM115A,FAM115A,FAM115A	FAM115A	NA	NA	NA	NA	FAM115A	7649	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	148553939	148554320	148554152	Y	CUL1,EZH2,EZH2	EZH2	NA	NA	NA	NA	EZH2	25093	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	148638273	148638633	148638462	Y	NA	NA	EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EZH2	58860	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	148788628	148788884	148788863	Y	ZNF783,CUL1,EZH2,ZNF786,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2754	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	149745351	149745623	149745500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP6V0E2-AS1	169652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	150691752	150691942	150691795	Y	GIMAP7,GIMAP4,GIMAP6,GIMAP2,GIMAP1,GIMAP5,LOC100128542	ABCB8	NA	NA	NA	NA	ABCB8	31568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	151384772	151384923	151384848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHEB	169566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr7	151440004	151440519	151440140	Y	SMARCD3,SMARCD3,RHEB,PRKAG2,PRKAG2	NA	CRYGN,RHEB	IMR90	Hi-C	24141950	PRKAG2	131691	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	151591335	151591652	151591492	Y	NA	PRKAG2	NA	NA	NA	NA	PRKAG2	19125	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	152161348	152162014	152161594	Y	NA	FABP5P3	NA	NA	NA	NA	FABP5P3	29368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	154999343	155001070	155000829	Y	NA	NA	INSIG1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	INSIG1	86416	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	155678402	155678700	155678446	Y	NA	NA	LMBR1	IMR90	Hi-C	24141950	AC009403.2	242503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr7	158044474	158044782	158044628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPRN2	333698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	1220424	1220599	1220512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLN8	481345	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	1780723	1781665	1781560	Y	NA	ARHGEF10	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	10581	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	1837817	1838203	1838066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	67675	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	6577742	6577949	6577849	Y	NA	CTD-2541M15.1,AGPAT5	NA	NA	NA	NA	AGPAT5	13864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	8153597	8154098	8153801	Y	NA	NA	MFHAS1,SGK223,CLDN23,FLJ10661	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SGK223	87910	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	8742026	8742246	8742225	Y	NA	MFHAS1	NA	NA	NA	NA	MFHAS1	6909	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	10573649	10573859	10573801	Y	SOX7	NA	NA	NA	NA	NA	PINX1	121535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.68541026872363
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	11368445	11368737	11368558	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	38221	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	11373324	11373814	11373559	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	43100	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	11734631	11734824	11734746	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	9674	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	11735335	11735756	11735393	Y	CTSB	CTSB	CTSB,BLK,FDFT1,FAM167A	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	10378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	11749167	11749418	11749260	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTSB	24210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	11755941	11756161	11756072	Y	CTSB	CTSB	CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1	IMR90	Hi-C	24141950	CTSB	30984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	12988209	12988727	12988474	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	LONRF1	376627	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	13224231	13224684	13224410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	146483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr8	13230060	13230464	13230283	Y	DLC1	NA	NA	NA	NA	NA	DLC1	140703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	13393176	13393534	13393351	Y	DLC1	DLC1,C8orf48	DLC1	IMR90	Hi-C	24141950	DLC1	22009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	15395546	15395769	15395644	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC3	122822	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	16629867	16630175	16630011	Y	ZDHHC2	NA	TUSC3,MSR1,SGCZ,ZDHHC2	IMR90	Hi-C	24141950	ZDHHC2	381363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	16898778	16899115	16898947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZDHHC2	112423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	20126353	20126692	20126612	Y	NA	NA	DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP6V1B2	73475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	21775759	21776194	21775973	Y	PHYHIP,DOK2,NPM2	XPO7	NA	NA	NA	NA	XPO7	579	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NPM2	NA	NA	NA	NA	NPM2	11718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	22469003	22469432	22469219	Y	NA	PDLIM2,C8orf58	NA	NA	NA	NA	C8orf58	13889	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	22513437	22513754	22513670	Y	NA	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	10907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	22561043	22561327	22561142	Y	PPP3CC,PDLIM2,BIN3,TNFRSF10B,EGR3	BIN3	NA	NA	NA	NA	BIN3	36382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	22710401	22710511	22710455	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	132419	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	22858322	22858618	22858470	Y	EGR3,EGR3,RHOBTB2,RHOBTB2	RHOBTB2	NA	NA	NA	NA	RHOBTB2	15392	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	23210314	23210863	23210698	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	23211536	23211676	23211614	Y	TNFRSF10D,LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	69165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	23390028	23390384	23390041	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	5710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	23405243	23405645	23405476	Y	TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4	SLC25A37	NA	NA	NA	NA	SLC25A37	20925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	24799462	24799718	24799592	Y	NEFL	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK5	240520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	25348135	25348483	25348309	Y	CDCA2	KCTD9,CDCA2	NA	NA	NA	NA	CDCA2	33622	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	26008929	26009154	26009015	Y	NA	NA	PPP2R2A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EBF2	108016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	26305968	26306033	26305997	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	63575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	26306627	26307336	26307213	Y	NA	NA	BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PNMA2	62272	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	27517363	27517693	27517481	Y	NA	CLU,SCARA3	NA	NA	NA	NA	SCARA3	27978	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	29097584	29097960	29097935	Y	HMBOX1,HMBOX1,KIF13B	KIF13B	NA	NA	NA	NA	KIF13B	20681	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	29522725	29523096	29522814	Y	KIF13B	NA	LOC286135,DUSP4,C8orf75	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP4	316540	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	327089	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	30273402	30273800	30273435	Y	NA	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	33458	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	30280646	30281238	30280961	Y	MBOAT4	RBPMS	NA	NA	NA	NA	RBPMS	40702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	30769723	30770025	30769859	Y	NA	NA	TEX15,WRN,PPP2CB,PURG	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPP2CB	99893	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	32084575	32084724	32084674	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	NRG1	589673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	32490865	32491103	32490993	Y	NRG1,NRG1	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	837837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	32572764	32572916	32572840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUT10	756024	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	33287156	33287526	33287341	Y	NA	FUT10	NA	NA	NA	NA	FUT10	41414	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	33668021	33668356	33668148	Y	NA	RP1-273G13.1	NA	NA	NA	NA	RP1-273G13.1	47385	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	35119361	35119644	35119503	Y	UNC5D	NA	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	261637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.17938553949103
chr8	36758959	36759166	36759082	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-150O12.1	650535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	37000181	37000618	37000483	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	409083	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	37005639	37005772	37005739	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	403929	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	37376212	37376482	37376355	Y	NA	RP11-150O12.1	KCNU1,ERLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-150O12.1	33219	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	38262735	38263237	38262894	Y	TACC1,PLEKHA2,C8orf86	WHSC1L1,LETM2	NA	NA	NA	NA	LETM2	21010	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	38794203	38794537	38794324	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37450	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	38794582	38795442	38794757	Y	TACC1,PLEKHA2	PLEKHA2	NA	NA	NA	NA	PLEKHA2	37829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	38856419	38857534	38856583	Y	NA	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	4031	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	38895649	38895937	38895811	Y	TACC1,PLEKHA2,HTRA4	TM2D2,ADAM9	NA	NA	NA	NA	ADAM9	43261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	41146046	41146081	41146065	Y	SFRP1	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	18935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	41153046	41153278	41153162	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	11738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	41160567	41160649	41160637	Y	NA	SFRP1	NA	NA	NA	NA	SFRP1	4367	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	42149533	42149606	42149596	Y	NA	RP11-231D20.2,IKBKB,POLB	NA	NA	NA	NA	IKBKB	22713	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	42184337	42184357	42184347	Y	NA	POLB	NA	NA	NA	NA	POLB	9615	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	42749479	42749732	42749583	Y	NA	HOOK3,RNF170	NA	NA	NA	NA	HOOK3	343	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	48311654	48311845	48311740	Y	CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	191326	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	48424795	48425379	48425168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-697N18.2	77792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	49229155	49229573	49229245	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	65577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	49282720	49283033	49282877	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	12117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	49320367	49320668	49320511	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25217	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr8	49321087	49321473	49321210	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	25937	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	49321645	49321846	49321764	Y	NA	RPL29P19	SNAI2,MCM4,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	26495	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	49344700	49344905	49344800	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	49550	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	49611840	49612006	49611979	Y	SNAI2	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	220293	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	49701443	49701572	49701502	Y	NA	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	SNAI2	130727	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	49783004	49783154	49783067	Y	SNAI2	SNAI2	NA	NA	NA	NA	SNAI2	49145	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	50968903	50969278	50969091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	1136604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	50969485	50969741	50969613	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNAI2	1137186	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	52809491	52809887	52809877	Y	PCMTD1	NA	NA	NA	NA	NA	PCMTD1,RP11-110G21.1	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	53188453	53188874	53188470	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-110G21.1	378568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	53625473	53626379	53625848	Y	RB1CC1	RB1CC1	NA	NA	NA	NA	RB1CC1	30024	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	54798731	54798762	54798749	Y	NA	ATP6V1H,RGS20	NA	NA	NA	NA	RGS20	36363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	54884977	54885679	54885327	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	47410	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	55065365	55066496	55065716	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	MRPL15	NA	NA	NA	NA	MRPL15	19595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	55181508	55181691	55181664	Y	ATP6V1H,ATP6V1H	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL15	135738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	56756553	56757241	56756740	Y	LYN	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	33131	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	56903187	56904166	56903812	Y	LYN	NA	NA	NA	NA	NA	RPS20	80903	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	57389900	57390701	57390447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17A4.1	108243	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	59763369	59763610	59763548	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	38258	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	59768911	59769118	59769011	Y	NA	RNU4-50P	NA	NA	NA	NA	RNU4-50P	43800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	61564243	61564650	61564285	Y	CA8,CHD7	CHD7	CHD7,RAB2A	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CHD7	24687	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	61592861	61593584	61592948	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	3524	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	61626654	61626933	61626781	Y	NA	CHD7	NA	NA	NA	NA	CHD7	37317	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	62146139	62146518	62146329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	478637	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	62427686	62427987	62427837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	197168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	62445230	62445580	62445420	Y	CLVS1,ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH	179575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	62600598	62600698	62600684	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	24457	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	62606389	62606706	62606619	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	18449	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr8	62620817	62621622	62621526	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	ASPH	3533	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr8	62624516	62625412	62625017	Y	ASPH	NA	NA	NA	NA	NA	ASPH,MIR4470	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	62634023	62634407	62634126	Y	NA	ASPH,MIR4470	NA	NA	NA	NA	MIR4470	8676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr8	62679636	62680132	62679874	Y	NA	NA	ASPH,MIR4470	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MIR4470	54289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	62724421	62724682	62724552	Y	NA	NA	GGH	IMR90	Hi-C	24141950	MIR4470	99074	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	67035997	67036639	67036283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE7A	283440	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	67111122	67111254	67111199	Y	CRH	NA	NA	NA	NA	NA	RRS1	228009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	67419818	67420060	67419977	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADHFE1	79398	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	67433991	67434613	67434592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89869	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	67434763	67435122	67434951	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	89360	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr8	67435383	67435523	67435453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	88959	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	67445791	67446197	67446047	Y	ADHFE1,VCPIP1,MYBL1	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	78285	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	67447907	67448273	67448065	Y	MYBL1,C8orf45	NA	NA	NA	NA	NA	MYBL1	76209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr8	67522221	67522599	67522407	Y	ADHFE1,VCPIP1,MYBL1	MYBL1	NA	NA	NA	NA	MYBL1	1883	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	68075038	68075412	68075329	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	81020	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	68090392	68090564	68090531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	96374	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	704433	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	69837388	69837920	69837570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	538939	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	69883083	69883390	69883339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	493469	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	69904413	69904743	69904447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	472116	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	69983747	69983982	69983910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	392877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	334080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	70310732	70311124	70310931	Y	NA	NA	C8orf34	IMR90	Hi-C	24141950	SULF1	65735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	70397333	70397695	70397418	Y	NA	SULF1	NA	NA	NA	NA	SULF1	20474	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	70404093	70404306	70404271	Y	NA	SULF1	NA	NA	NA	NA	SULF1	27234	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	71303418	71303670	71303544	Y	NA	NCOA2,RP11-333A23.1	NA	NA	NA	NA	NCOA2	10370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	71522610	71523035	71522826	Y	NA	TRAM1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	3988	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	73559096	73559368	73559359	Y	KCNB2	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	359731	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	73690966	73691186	73691160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TERF1	227913	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	74276592	74276996	74276782	Y	C8orf84,RDH10	NA	STAU2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL7	70568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	74432524	74433240	74432853	Y	C8orf84,RDH10	NA	NA	NA	NA	NA	STAU2	224703	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	75179617	75179845	75179716	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDAP1	51520	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	75221301	75221616	75221459	Y	NA	GDAP1,JPH1	NA	NA	NA	NA	GDAP1	9749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	77469082	77469378	77469240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	122076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	77585675	77585844	77585753	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	5610	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr8	77590079	77590470	77590424	Y	ZFHX4	ZFHX4,ZFHX4-AS1	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	984	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	79674578	79674862	79674701	Y	NA	IL7	NA	NA	NA	NA	IL7	40896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	80705910	80706255	80706054	Y	HEY1	HEY1	HEY1,MRPS28	IMR90	Hi-C	24141950	HEY1	27812	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	81015641	81015664	81015650	Y	ZBTB10	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS28	75117	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5,RP11-363E6.3	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	90556024	90556173	90556098	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-37B2.1	211782	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	90627835	90627903	90627892	Y	NA	NA	MMP16	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-37B2.1	140052	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	91020764	91021152	91020912	Y	NA	DECR1,NBN	NA	NA	NA	NA	NBN	7308	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	91683219	91683417	91683315	Y	NA	NA	TMEM64,NECAB1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	TMEM64	118443	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	92128196	92128480	92128215	Y	NA	GS1-251I9.4,OTUD6B	NA	NA	NA	NA	OTUD6B	47772	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	94728357	94728657	94728477	Y	NA	FAM92A1,RBM12B,TMEM67	NA	NA	NA	NA	FAM92A1	19568	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	94850724	94850939	94850832	Y	GEM	PDP1	NA	NA	NA	NA	PDP1	17096	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	94892570	94892797	94892694	Y	NA	PDP1	TMEM67,PDP1,MIR378D2	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	24535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	94928107	94928427	94928252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDP1	60072	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	94971751	94971853	94971800	Y	GEM	NA	RBM12B,FAM92A1,PDP1,TMEM67,MIR378D2,RAD54B,C8orf39,LINC00535	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PDP1	103716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	95003706	95004122	95004001	Y	NA	NA	LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM	IMR90	Hi-C	24141950	PDP1	135671	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	98795675	98796209	98795739	Y	NA	LAPTM4B	NA	NA	NA	NA	LAPTM4B	10390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	99411965	99412163	99412094	Y	NIPAL2,KCNS2	NA	NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2	IMR90	Hi-C	24141950	NIPAL2	107344	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	174200	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	99485745	99486120	99486088	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	181124	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	99658802	99659210	99659171	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK3	293845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	99953302	99954000	99953407	Y	STK3,OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	247	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	101731045	101731633	101731441	Y	NA	PABPC1	NA	NA	NA	NA	PABPC1	1404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr8	101887203	101887360	101887288	Y	ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	NA	YWHAZ,ZNF706	IMR90	Hi-C	24141950	YWHAZ	76256	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	101920209	101920392	101920320	Y	PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	43224	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	101920723	101921107	101920870	Y	NA	YWHAZ	NA	NA	NA	NA	YWHAZ	42509	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	102038562	102039020	102038731	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	74946	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	102039589	102039925	102039833	Y	GRHL2	NA	ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	YWHAZ	75973	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	102171133	102171473	102171263	Y	PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706	ZNF706	ZNF706,YWHAZ,FLJ42969	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF706	44948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	103422542	103423104	103422992	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBR5	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	103549220	103549421	103549330	Y	NA	NA	UBR5,ODF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF10	116709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103669513	103669869	103669680	Y	AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3383	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103669922	103670289	103670129	Y	ATP6V1C1,KLF10,KLF10	KLF10	NA	NA	NA	NA	KLF10	3792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103741796	103742226	103742065	Y	NA	NA	KLF10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KB-1732A1.1	73519	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103801151	103801773	103801337	Y	NA	KB-1732A1.1	KLF10,UBR5,ODF1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KB-1732A1.1	13972	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103822630	103823284	103823186	Y	NA	KB-1732A1.1	NA	NA	NA	NA	KB-1732A1.1	6885	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	103922083	103922307	103922186	Y	NA	KB-1507C5.2,AZIN1	AZIN1	IMR90	Hi-C	24141950	AZIN1	17991	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	104059632	104059708	104059689	Y	NA	ATP6V1C1	NA	NA	NA	NA	ATP6V1C1	28341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	104117409	104117806	104117725	Y	KLF10,KLF10,AZIN1,ATP6V1C1,SLC25A32	BAALC	FZD6,BAALC,SLC25A32,LOC100499183,ATP6V1C1,C8orf56,DCAF13,RIMS2,CTHRC1	IMR90	Hi-C	24141950	BAALC	33132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	104196928	104197190	104197047	Y	AZIN1,DCAF13	BAALC	NA	NA	NA	NA	BAALC	45990	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	104331705	104332089	104331783	Y	RIMS2	FZD6,RP11-318M2.2,CTHRC1	NA	NA	NA	NA	RP11-318M2.2	22705	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	104406173	104406574	104406390	Y	NA	CTHRC1,DCAF13,SLC25A32	NA	NA	NA	NA	DCAF13	18368	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	105655226	105655568	105655399	Y	TM7SF4,LRP12	NA	LRP12	IMR90	Hi-C	24141950	LRP12	55974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	106290444	106290757	106290601	Y	NA	ZFPM2	ZFPM2	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM2	38163	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	106411260	106411358	106411309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	82340	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	106444510	106444790	106444650	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	115590	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	106582164	106582354	106582260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	253244	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	106671593	106671660	106671627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFPM2	342673	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	107709391	107709773	107709582	Y	NA	TAGLN2P1	NA	NA	NA	NA	TAGLN2P1	1150	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	108518171	108518318	108518239	Y	NA	ANGPT1	OXR1,ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	ANGPT1	9888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	109222483	109222836	109222544	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	222726	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	109647939	109647957	109647950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	202377	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	110248064	110248088	110248074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENY2	96465	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	110602225	110602239	110602235	Y	SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,SYBU,KCNV1	NA	NA	NA	NA	NA	EBAG9	52285	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2544L4.1	183721	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	113335798	113335971	113335885	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	1050927	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	113425784	113426043	113425914	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-709P2.1	960855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	115947625	115947931	115947832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	871968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	116507305	116507631	116507503	Y	TRPS1	NA	NA	NA	NA	NA	TRPS1	312268	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	117335974	117336137	117336042	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	440605	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	117476077	117476257	117476175	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	300485	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	118859857	118860327	118860104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	261765	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	118885059	118885357	118885328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	236735	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	119023512	119024035	119023740	Y	EXT1	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	98057	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	119317381	119317491	119317437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	195289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	119339236	119339376	119339324	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	217144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	119345117	119345386	119345219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	223025	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	119536968	119537364	119537323	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD12	94870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	119808728	119809168	119808881	Y	TNFRSF11B	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	36288	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	119917519	119917835	119917587	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	44604	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.17536905333597
chr8	119921281	119921551	119921414	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	40888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	119925422	119925588	119925448	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	36851	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	119960672	119960883	119960778	Y	NA	TNFRSF11B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF11B	1556	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	120063756	120064086	120063927	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	101317	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	120124666	120124779	120124723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAL2	50494	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	121092888	121093091	121092967	Y	DEPTOR	NA	DEPTOR,DSCC1,COL14A1,TAF2,MRPL13	IMR90	Hi-C	24141950	DEPTOR	208931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	121983173	121983551	121983380	Y	NA	NA	MTBP,HAS2,HAS2-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	159660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	122176324	122176668	122176537	Y	NA	NA	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	SNTB1	352811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	122755244	122755615	122755430	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAS2	103614	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	123117461	123117740	123117615	Y	HAS2	RP11-398G24.2	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-398G24.2	19683	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	123141624	123141882	123141720	Y	NA	RP11-398G24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-398G24.2	4201	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr8	123153192	123153266	123153235	Y	NA	RP11-398G24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-398G24.2	15769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.84069689128428
chr8	123155976	123156193	123156085	Y	NA	RP11-398G24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-398G24.2	18553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	123162712	123163031	123162926	Y	NA	RP11-398G24.2	NA	NA	NA	NA	RP11-398G24.2	25289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	124407455	124407786	124407574	Y	FAM91A1,C8orf76,ZHX1,ATAD2	ATAD2,WDYHV1	NA	NA	NA	NA	ATAD2	18804	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125617182	125617613	125617525	Y	ZNF572,RNF139	NA	NA	NA	NA	NA	TATDN1	67483	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125683084	125683301	125683193	Y	MTSS1	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	55429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125683699	125684014	125683857	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1	54716	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125698372	125698715	125698641	Y	NA	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	40015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125699655	125699932	125699872	Y	NA	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	38798	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125715093	125715423	125715328	Y	NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	23307	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125721699	125722377	125721996	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	NA	NA	NA	NA	MTSS1	16353	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	125764120	125764533	125764318	Y	ZNF572,NSMCE2,KIAA0196,RNF139,MTSS1	MTSS1	MTSS1,ZNF572,NDUFB9,TATDN1,LOC157381,SQLE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MTSS1	25390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	125878645	125879203	125878949	Y	RNF139,MTSS1,ZNF572,NSMCE2,KIAA0196	LINC00964	MTSS1,NDUFB9,TATDN1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00964	19666	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	125984707	125984742	125984718	Y	ZNF572	ZNF572,SQLE	NA	NA	NA	NA	ZNF572	1167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	126037665	126038021	126037843	Y	NA	SQLE	NA	NA	NA	NA	SQLE	28926	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	126231490	126231859	126231657	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	129408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	126317403	126317692	126317515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIB1	122871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	126441416	126441734	126441625	Y	KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	TRIB1	NA	NA	NA	NA	TRIB1	853	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128237300	128237732	128237515	Y	NA	NA	LOC727677,MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	507948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	128306934	128307283	128307196	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	438397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	128843918	128844302	128844002	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	39139	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	128910613	128910985	128910818	Y	MYC	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	105834	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128911546	128911899	128911640	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVT1	106767	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	128923296	128923609	128923453	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	97248	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	128989961	128990273	128990255	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	30584	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	129053712	129054462	129054053	Y	NA	RNU4-25P	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	32855	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	129121216	129121486	129121350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	129180743	129180870	129180780	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	159886	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	129188825	129189407	129189075	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	167968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	129195465	129196052	129195562	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	174608	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	129336748	129337038	129336807	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RNU4-25P	315891	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr8	129569050	129569202	129569118	Y	NA	NA	MYC,PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	548193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	129874065	129874230	129874161	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	RNU4-25P	853208	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130548053	130548359	130548185	Y	NA	NA	PVT1,MYC	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	479016	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130639363	130639590	130639478	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	387785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130697904	130698138	130698105	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	329237	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	130720341	130720558	130720412	Y	NA	NA	PVT1	IMR90	Hi-C	24141950	FAM49B	306817	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr8	130897837	130898360	130898140	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	129015	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	119979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130983929	130984348	130984047	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	43027	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	130996080	130996422	130996182	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	30953	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	131054431	131054834	131054758	Y	NA	FAM49B	NA	NA	NA	NA	FAM49B	27056	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	131134027	131134054	131134041	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	106652	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	131148484	131148822	131148654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	121109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	131201084	131201473	131201279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	173709	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	131245360	131245556	131245456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	208350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	131276645	131276741	131276715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	177165	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	131454495	131454885	131454765	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	589	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr8	131456841	131457348	131457080	Y	NA	ASAP1	NA	NA	NA	NA	ASAP1	2935	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	131813824	131814167	131813944	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	359918	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	132828459	132829599	132829218	Y	EFR3A	NA	ADCY8	IMR90	Hi-C	24141950	EFR3A	84736	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	132928633	132929053	132928845	Y	NA	EFR3A	NA	NA	NA	NA	EFR3A	14298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	133318227	133318435	133318380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC6	367403	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	133780870	133781061	133780972	Y	TMEM71,PHF20L1	TMEM71,PHF20L1	TMEM71,PHF20L1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHF20L1	4557	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	134122288	134122488	134122388	Y	TG	NA	NA	NA	NA	NA	WISP1	78794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	NA	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDRG1	56229	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	134387761	134388081	134387916	Y	NA	NA	TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NDRG1	75496	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	136373366	136373545	136373456	Y	NA	NA	LOC286094	IMR90	Hi-C	24141950	KHDRBS3	94155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	136424351	136424597	136424474	Y	NA	KHDRBS3	NA	NA	NA	NA	KHDRBS3	43103	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	139965234	139965366	139965265	Y	NA	COL22A1	NA	NA	NA	NA	COL22A1	40985	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	141102173	141102317	141102281	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	364361	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	141189770	141190115	141189943	Y	TRAPPC9,TRAPPC9	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	276563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	141190446	141190798	141190723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAPPC9	275880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	141474376	141475403	141474918	Y	NA	TRAPPC9,CHRAC1	TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	TRAPPC9	7698	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	141607900	141608150	141608005	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	88503	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	142036879	142037195	142037043	Y	NA	PTK2	PTK2,DENND3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTK2	26564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	142163740	142163864	142163753	Y	NA	DENND3	NA	NA	NA	NA	DENND3	38363	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr8	143353648	143353818	143353814	Y	TSNARE1,BAI1	NA	NA	NA	NA	NA	TSNARE1	128783	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	143533998	143534621	143534303	Y	LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1	NA	BAI1,TSNARE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	TSNARE1	51397	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	143897219	143897551	143897306	Y	LY6E,GLI4	NA	LY6D,LYNX1,PSCA,JRK,C8orf55,LOC100288181,SLURP1,LY6E,LOC100133669	MCF7	ChIA-PET	22265404	LY6K	117690	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	144032047	144032423	144032233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LY6E	64976	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	144107532	144108153	144107940	Y	MAFA	LY6E	NA	NA	NA	NA	LY6E	10133	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	144301806	144302247	144302025	Y	MAFA	ZFP41,GLI4	NA	NA	NA	NA	ZFP41	25033	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.34270513436181
chr8	145002494	145002937	145002709	Y	SPATC1,PLEC	PLEC	NA	NA	NA	NA	PLEC	45965	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr8	145022492	145023108	145022824	Y	PLEC,PLEC,PLEC,SPATC1,PLEC,GRINA	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	25794	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr8	145025737	145026802	145026365	Y	ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	22100	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr8	145129247	145129547	145129402	Y	GSDMD,GRINA,SPATC1,OPLAH	PARP10,OPLAH,EXOSC4,CTD-3065J16.9,GPAA1,CYC1,MAF1,SHARPIN	DGAT1,HSF1,GRINA,PARP10,PLEC,SPATC1,MAF1,SHARPIN,GPAA1,CYC1,EXOSC4,KIAA1875	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EXOSC4	1982	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	145911932	145912089	145912059	Y	SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34	ARHGAP39	ARHGAP39,ZNF251,ZNF34	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP39	2738	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr8	146058579	146058595	146058588	Y	ARHGAP39	ZNF34,RPL8,ZNF7,COMMD5	NA	NA	NA	NA	ZNF7	7730	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	677967	678108	678032	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	209676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	694779	695236	694990	Y	DOCK8,C9orf66,KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	226488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	708443	708758	708711	Y	KANK1	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	240152	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	755797	756516	755921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KANK1	287506	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	2623377	2623723	2623671	Y	NA	VLDLR	NA	NA	NA	NA	VLDLR	3543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	2875811	2876206	2875956	Y	NA	KIAA0020	NA	NA	NA	NA	KIAA0020	33570	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	4083576	4083986	4083877	Y	GLIS3,GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	262406	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	4137159	4137519	4137339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	208873	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	4293316	4293716	4293485	Y	GLIS3	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	52676	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	4738592	4738723	4738708	Y	NA	AK3	NA	NA	NA	NA	AK3	1320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5452329	5452752	5452399	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274	NA	NA	NA	NA	CD274	3826	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5459353	5459726	5459436	Y	JAK2,KIAA1432,C9orf46,CD274	CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	IMR90	Hi-C	24141950	CD274	10850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5488554	5488907	5488829	Y	NA	CD274,PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	19638	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5499914	5500215	5500099	Y	NA	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	8330	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	5509549	5510003	5509837	Y	C9orf46,CD274,PDCD1LG2	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	1004	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	5552355	5552554	5552455	Y	NA	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	43810	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5580709	5581016	5580868	Y	NA	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	46009	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	5586544	5586797	5586563	Y	C9orf46,CD274	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	40228	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	6485944	6485989	6485946	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UHRF2	74793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	6680895	6681975	6681336	Y	UHRF2,KDM4C	RP11-106A1.2,GLDC,RP11-390F4.6,KDM4C	KDM4C,UHRF2,GLDC	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	KDM4C	36888	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr9	13268477	13268830	13268663	Y	NA	MPDZ	NA	NA	NA	NA	MPDZ	8759	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	13278024	13278458	13278161	Y	NA	MPDZ	NFIB	IMR90	Hi-C	24141950	MPDZ	435	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	14147587	14147657	14147622	Y	NFIB	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	249325	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	14251419	14251628	14251514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	145354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	14320331	14320603	14320385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIB	76379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	14347993	14348154	14348106	Y	NFIB	NFIB	NA	NA	NA	NA	NFIB	48828	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	15306066	15306408	15306119	Y	NA	TTC39B	NA	NA	NA	NA	TTC39B	708	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	16203449	16203717	16203596	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	521095	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	16337405	16337786	16337534	Y	NA	NA	BNC2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	387026	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	16344409	16344763	16344480	Y	NA	NA	BNC2,C9orf93	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-62F24.2	380049	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	16869534	16869976	16869661	Y	BNC2	BNC2	NA	NA	NA	NA	BNC2	693	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	18474958	18475225	18475032	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	3066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	18490587	18490949	18490797	Y	ADAMTSL1	ADAMTSL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	18695	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	18547624	18547850	18547739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	75732	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	19184256	19184894	19184463	Y	PLIN2	PLIN2	HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2	IMR90	Hi-C	24141950	PLIN2	36968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	20793724	20794222	20793867	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	173182	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	21576231	21576644	21576439	Y	NA	MIR31HG	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	18563	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	21685022	21685416	21685227	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	127354	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	21695810	21696232	21696052	Y	NA	NA	MIR31HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR31HG	138142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	29213900	29214394	29214154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1615829	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	34588619	34588889	34588721	Y	NA	CNTFR,DCTN3,SIGMAR1	NA	NA	NA	NA	CNTFR	498	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	35490989	35491345	35491127	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	2865	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	35516545	35516820	35516591	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	28421	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	35518041	35518590	35518314	Y	CREB3,VCP,STOML2,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	29917	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	35603577	35603740	35603659	Y	RECK	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	210	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	35603992	35604628	35604112	Y	TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2	TESK1	NA	NA	NA	NA	TESK1	625	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	35769980	35770349	35770169	Y	NA	CREB3,TLN1,RGP1,GBA2,NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	NPR2	19802	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	35798752	35798996	35798852	Y	NA	NPR2,SPAG8,TMEM8B,HINT2	NA	NA	NA	NA	NPR2	8601	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	36040345	36040403	36040371	Y	NA	RECK	NA	NA	NA	NA	RECK	5915	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	36140543	36140881	36140681	Y	GLIPR2	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	GLIPR2	5811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	36232002	36232125	36232063	Y	GNE	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	42928	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	36232965	36233105	36233040	Y	NA	CLTA,GNE	NA	NA	NA	NA	GNE	41948	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	36471008	36471193	36471156	Y	NA	RNF38	RNF38,MELK	IMR90	Hi-C	24141950	RNF38	14352	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	37036641	37037011	37036829	Y	ZCCHC7,ZBTB5,PAX5	NA	NA	NA	NA	NA	ZCCHC7	81525	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	71789916	71790363	71790201	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	55707	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	71790550	71790929	71790586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	56341	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	71791709	71792066	71791753	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	57500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	71795556	71796114	71795819	Y	TJP2	NA	NA	NA	NA	NA	TJP2	61347	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	72561735	72561997	72561908	Y	NA	NA	APBA1,MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,C9orf135,TRPM3,KLF9	IMR90	Hi-C	24141950	MAMDC2	94500	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	72591131	72591428	72591305	Y	NA	NA	MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,TJP2	IMR90	Hi-C	24141950	MAMDC2	65069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	72781786	72782158	72781853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	89779	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chr9	73035561	73035945	73035863	Y	KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	8021	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	73168765	73169157	73169115	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	141225	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	73569162	73569421	73569277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRPM3	490399	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	76299237	76299618	76299309	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANXA1	534564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	80911003	80911373	80911119	Y	PSAT1	PSAT1	NA	NA	NA	NA	PSAT1	944	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	81486579	81486867	81486725	Y	NA	NA	TLE4	IMR90	Hi-C	24141950	CHCHD2P9	517352	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	81804624	81804840	81804732	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD2P9	199379	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	82185317	82185693	82185378	Y	NA	TLE4	NA	NA	NA	NA	TLE4	629	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	88329158	88329382	88329166	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	25562	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	88358353	88358730	88358394	Y	AGTPBP1	AGTPBP1	NA	NA	NA	NA	AGTPBP1	3409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	89626902	89626982	89626949	Y	NA	CDC20P1	NA	NA	NA	NA	CDC20P1	2335	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	90115567	90115708	90115625	Y	DAPK1	DAPK1,RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	DAPK1	5424	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	90182587	90182864	90182726	Y	NA	RP11-40C6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-40C6.2	44370	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	90328172	90328868	90328486	Y	DAPK1,CTSL1	NA	CTSL1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-40C6.2	189955	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	90407699	90408115	90407854	Y	DAPK1,CTSL1	NA	NA	NA	NA	NA	CDK20	179553	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	91147328	91147523	91147436	Y	NXNL2	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	493	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	91150927	91151269	91151097	Y	NA	NXNL2	NA	NA	NA	NA	NXNL2	2911	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr9	93892173	93892363	93892269	Y	NA	NA	LOC100129316,AUH	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	229832	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	93955991	93956732	93956142	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	165463	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	94614253	94614381	94614318	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROR2	96063	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	94668024	94668724	94668369	Y	ROR2	ROR2	NA	NA	NA	NA	ROR2	41720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	94872861	94873095	94872978	Y	NA	SPTLC1,LINC00475	NA	NA	NA	NA	SPTLC1	2571	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	94993084	94993195	94993158	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	60843	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	96335202	96335517	96335360	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	1172	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	96382663	96382790	96382709	Y	NA	PHF2	NA	NA	NA	NA	PHF2	45974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	96928143	96928630	96928259	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	10486	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr9	97505796	97506082	97505939	Y	NA	C9orf3	NA	NA	NA	NA	C9orf3	18813	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	97893656	97893882	97893768	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FANCC	184109	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	98527125	98527421	98527164	Y	NA	NA	LOC158435,LINC00476,C9orf102	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00476	108838	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	98768233	98768612	98768423	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00476	131974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	99106686	99107122	99106995	Y	NA	SLC35D2	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	36870	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr9	99213129	99213681	99213680	Y	ZNF510,CDC14B,HABP4	RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	HABP4	2646	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	99535821	99536158	99535990	Y	NA	ZNF510	NA	NA	NA	NA	ZNF510	2253	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100548546	100549029	100548790	Y	FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	90907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100565577	100566264	100565821	Y	CORO2A,FOXE1	NA	FOXE1,C9orf156	IMR90	Hi-C	24141950	XPA	107938	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr9	100667728	100667773	100667740	Y	NA	C9orf156	NA	NA	NA	NA	C9orf156	15079	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100772550	100772875	100772560	Y	NA	ANP32B,NANS	NANS,TRIM14	IMR90	Hi-C	24141950	ANP32B	28907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100969722	100969939	100969831	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	16800	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100981172	100981639	100981390	Y	NA	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	CORO2A	28250	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	100985595	100985973	100985751	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	29942	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	100994380	100994637	100994474	Y	TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	21278	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	101002580	101002910	101002849	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	CORO2A,TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	13005	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chr9	101015938	101016120	101016078	Y	C9orf156,NANS,TBC1D2	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	23	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	101016338	101016489	101016414	Y	NA	TBC1D2	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	423	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	101136906	101136938	101136922	Y	ANKS6	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	120991	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	101137509	101137713	101137616	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D2	121594	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	101322182	101322489	101322456	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GABBR2	146990	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	101572840	101572995	101572898	Y	GALNT12	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	4859	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr9	101573359	101573810	101573605	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	GALNT12	5378	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	107510718	107511248	107511059	Y	ABCA1,NIPSNAP3A	NIPSNAP3A,NIPSNAP3B	NA	NA	NA	NA	NIPSNAP3A	2749	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	107668768	107669725	107669153	Y	SLC44A1,OR13C3	ABCA1	NA	NA	NA	NA	ABCA1	18793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	107730510	107730878	107730708	Y	SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1	ABCA1,RP11-217B7.3	ABCA1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	21184	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	107755412	107756258	107755691	Y	ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-217B7.3	3350	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	107769025	107769996	107769532	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	RP11-217B7.3	ABCA1,SLC44A1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-217B7.3	16963	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	107950174	107950339	107950255	Y	FSD1L,FSD1L,ABCA1	NA	ABCA1,SLC44A1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC44A1	54564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	109626456	109627144	109627032	Y	NA	ZNF462	NA	NA	NA	NA	ZNF462	3078	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	110310627	110311050	110310826	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7	ChIA-PET	22265404	KLF4	59864	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	110512153	110512586	110512216	Y	KLF4	NA	KLF4	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF4	261390	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	111206149	111206336	111206243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-220D10.1	180777	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	111774521	111775173	111774726	Y	NA	CTNNAL1	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	712	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	111872786	111872983	111872905	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNAL1	98977	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	112091755	112092133	112091802	Y	PTPN3	EPB41L4B	EPB41L4B	MCF7	ChIA-PET	22265404	EPB41L4B	10511	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	112578065	112578653	112578312	Y	PALM2	PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37296	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	112791583	112792117	112791820	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	224803	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	112811971	112812606	112812251	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	204314	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	112813346	112813601	112813470	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	203319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	112831833	112832445	112832154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	184475	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	112878723	112879133	112878887	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	137787	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	113413222	113413721	113413633	Y	LPAR1	NA	LPAR1,KIAA0368,SVEP1,MUSK,OR2K2,DNAJC25-GNG10	IMR90	Hi-C	24141950	SVEP1	73062	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	113507067	113507395	113507232	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	166907	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	113515103	113515367	113515167	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SVEP1	174943	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	113570937	113571275	113571156	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	227706	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114700203	114700566	114700273	Y	DNAJC25,GNG10,SUSD1,ROD1,HSDL2	UGCG	NA	NA	NA	NA	UGCG	43157	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	5.354754592827
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	2.84471337743935
chr9	114729315	114729452	114729372	Y	NA	NA	UGCG,MIR3134,SUSD1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	UGCG	72269	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	114754924	114755117	114754987	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	97878	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114774761	114774976	114774762	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	117715	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	114783014	114783329	114783192	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UGCG	125968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114805021	114805139	114805071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	130549	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	114808602	114808743	114808666	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	126945	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	114809786	114810087	114810015	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	125601	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114811444	114811737	114811486	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123951	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr9	114812315	114812544	114812429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123144	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114812842	114813221	114813099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	122467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	114821548	114821936	114821739	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	113752	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	114823556	114823978	114823803	Y	GNG10,SUSD1	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	111710	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	114828005	114828556	114828288	Y	UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	107132	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	114835497	114835862	114835756	Y	GNG10	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	99826	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr9	114836654	114837091	114837061	Y	PTGR1,PTGR1,UGCG	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	98597	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	115031676	115032066	115031959	Y	KIAA1958	NA	NA	NA	NA	NA	PTBP3	61881	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	115606684	115606763	115606738	Y	ZFP37	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	95566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	115624285	115624808	115624606	Y	SNX30,SLC31A2,FKBP15,SLC46A2	NA	NA	NA	NA	NA	SNX30	113167	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	116385277	116385518	116385372	Y	RGS3	RP11-18B16.2	NA	NA	NA	NA	RP11-18B16.2	25718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	116728685	116728905	116728795	Y	AMBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF618	92123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	22455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	117657108	117657611	117657338	Y	DFNB31,ATP6V1G1,TNFSF15,TNFSF15,TNFSF8	NA	NA	NA	NA	NA	TNC	220925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	118435271	118435690	118435488	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478393	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	118701397	118701694	118701515	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	212389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	118706424	118707025	118706637	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	207058	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr9	118758811	118759033	118758921	Y	NA	NA	PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	155050	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	118914445	118914679	118914506	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	362	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	39173	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	118993225	118993558	118993231	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	79142	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	119025545	119025710	119025628	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	111462	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	119034263	119034570	119034504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	120180	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	119084686	119084813	119084781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	170603	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	58746	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	121571098	121571456	121571292	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	1106488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	123477335	123478104	123478033	Y	NA	MEGF9	NA	NA	NA	NA	MEGF9	2587	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	124035384	124035709	124035520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	52092	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	124040831	124041134	124040970	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	RAB14	57539	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	124125049	124125440	124125316	Y	NA	STOM	NA	NA	NA	NA	STOM	5091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	124361597	124361984	124361689	Y	NA	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	34261	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	124498744	124498978	124498839	Y	GSN	NA	NA	NA	NA	NA	DAB2IP	171408	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	125578475	125578645	125578596	Y	NA	PDCL	NA	NA	NA	NA	PDCL	10265	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	125663245	125663345	125663303	Y	NA	RC3H2,ZBTB6,ZBTB26,RABGAP1	NA	NA	NA	NA	RC3H2	2275	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	126154038	126154354	126154284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	125183	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	127018843	127019044	127018944	Y	NA	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	958	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	127044216	127044998	127044297	Y	DENND1A	NEK6	NA	NA	NA	NA	NEK6	26331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	127458498	127458770	127458741	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	39752	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	127541719	127542010	127541865	Y	NA	NR6A1,OLFML2A	NA	NA	NA	NA	OLFML2A	4282	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	128299092	128299304	128299184	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	168209	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	128395270	128395491	128395304	Y	PPP6C,HSPA5,GAPVD1	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAP1	72022	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	128592115	128592428	128592308	Y	PBX3	NA	NA	NA	NA	NA	PBX3	84491	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	129481833	129482256	129482109	Y	ZBTB43,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	83029	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	129485609	129485808	129485757	Y	FAM125B,ZBTB34	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB43	79477	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	129929259	129929425	129929350	Y	LRSAM1,RALGPS1	ANGPTL2	NA	NA	NA	NA	ANGPTL2	46097	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	130283548	130283912	130283802	Y	SH2D3C,SH2D3C,SH2D3C,PTRH1,FPGS,FPGS,FAM129B,ENG	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	55356	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chr9	130307843	130308200	130307973	Y	SLC2A8,FAM129B	FAM129B	NA	NA	NA	NA	FAM129B	31068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130329548	130329691	130329605	Y	PTRH1,FPGS,FPGS,ENG,CDK9,FAM129B,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	9577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	130336494	130336746	130336628	Y	TOR2A,FPGS,FPGS,CDK9,FAM129B	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2522	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130341922	130342377	130342071	Y	NA	FAM129B,STXBP1	NA	NA	NA	NA	FAM129B	2654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130461605	130461892	130461787	Y	GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16	MIR3911,PTRH1,TOR2A	NA	NA	NA	NA	MIR3911	10531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	130600573	130601245	130600861	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS	FPGS,ENG,AK1	NA	NA	NA	NA	ENG	13790	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	130764123	130764312	130764223	Y	FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS	FAM102A	FAM102A,DPM2,PIP5KL1,SLC25A25,NAIF1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FAM102A	23331	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130834459	130834744	130834726	Y	NA	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	5974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	130992546	130992666	130992589	Y	SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1	DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2	NA	NA	NA	NA	CIZ1	27884	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	131673839	131674187	131673982	Y	PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,LRRC8A,LRRC8A	LRRC8A,CCBL1,DOLK,NUP188	NA	NA	NA	NA	CCBL1	31066	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	131929415	131929566	131929473	Y	METTL11A,C9orf106	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8974	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	131930457	131930532	131930510	Y	PRRX2	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	8008	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	131937094	131937487	131937262	Y	PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L	IER5L	NA	NA	NA	NA	IER5L	1053	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chr9	131988173	131988389	131988342	Y	NA	IER5L	LOC100506190,IER5L,METTL11A,PPP2R4,ASB6,SH3GLB2,CRAT,C9orf106,C9orf50	IMR90,K562,HELA	Hi-C,5C	24141950,22955621	IER5L	49633	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132115283	132115797	132115318	Y	NA	RP11-65J3.1	PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A,C9orf50	MCF7,HELA,K562,IMR90	ChIA-PET,5C,Hi-C	22265404,22955621,24141950	RP11-65J3.1	22704	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132145857	132146151	132146146	Y	FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6	NA	C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT	IMR90,MCF7,K562,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	RP11-65J3.1	53278	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	132168772	132168919	132168823	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	74811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132175926	132176326	132176076	Y	NA	NA	C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LINC00963	67404	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.33868864820675
chr9	132244062	132244824	132244277	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	332	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132257886	132258547	132258348	Y	NA	LINC00963	NA	NA	NA	NA	LINC00963	14156	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	4264	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	132359283	132359664	132359324	Y	CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L,PTGES,METTL11A,ASB6	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	RP11-492E3.2	23595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	132372165	132372686	132372524	Y	NA	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	29758	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132459422	132459648	132459595	Y	NA	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	33502	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132568357	132568650	132568524	Y	TOR1B	TOR1B,TOR1A,USP20,C9orf78	NA	NA	NA	NA	TOR1B	4925	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132705367	132705623	132705495	Y	C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	97850	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	132758529	132758977	132758901	Y	FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	44496	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	133565449	133565699	133565571	Y	NA	RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1	NA	NA	NA	NA	EXOSC2	1409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	133711348	133711666	133711497	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	101007	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	134131602	134132161	134131829	Y	RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A	NA	NA	NA	NA	NA	NUP214	132654	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chr9	135197315	135197652	135197484	Y	NA	SETX	NA	NA	NA	NA	SETX	30720	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	136001171	136001330	136001249	Y	SLC2A6,RALGDS,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	35971	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	136235762	136236074	136236007	Y	NA	SURF6,MED22,RPL7A,SNORD36A,SURF2,SURF1,SURF4,C9orf96,REXO4	NA	NA	NA	NA	SURF4	4896	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	136576519	136576779	136576603	Y	SURF4	SARDH	NA	NA	NA	NA	SARDH	26298	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.84872986359441
chr9	136823955	136824162	136824035	Y	ADAMTSL2,SARDH,VAV2	VAV2	NA	NA	NA	NA	VAV2	31564	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	137494646	137494892	137494734	Y	NA	COL5A1	RXRA,COL5A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL5A1	36728	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	137535299	137535511	137535433	Y	COL5A1	COL5A1	NA	NA	NA	NA	COL5A1	3679	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	PPP1R26,MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	PPP1R26	20218	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	138818727	138819161	138818918	Y	CAMSAP1,CARD9	CAMSAP1,RP11-432J22.2,UBAC1	NA	NA	NA	NA	RP11-432J22.2	21069	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	138884665	138885093	138884961	Y	NA	UBAC1	NA	NA	NA	NA	UBAC1	33439	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	138986008	138986159	138986118	Y	NACC2	NACC2,C9orf69	NA	NA	NA	NA	NACC2	877	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	139024359	139024752	139024554	Y	NA	NACC2,C9orf69	C9orf69	MCF7	ChIA-PET	22265404	C9orf69	15628	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	139444945	139445101	139445057	Y	TMEM141,SDCCAG3	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-611D20.2	6281	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chr9	139462526	139462651	139462613	Y	C9orf69	NOTCH1,RP11-611D20.2	MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-611D20.2	23862	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140022067	140022152	140022137	Y	EHMT1,WDR85,NDOR1,ANAPC2	MAN1B1,DPP7,MIR3621	NA	NA	NA	NA	DPP7	14438	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7,MIR3621	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	7.02811540308544
chr9	140117588	140118357	140118103	Y	C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1	ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	C9orf169	501	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.17135256718091
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,RNF208,C9orf169,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140312019	140312179	140312116	Y	LCNL1,ABCA2,FAM166A,C9orf173	EXD3,NOXA1	NA	NA	NA	NA	EXD3	3535	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140388730	140388770	140388753	Y	FUT7,C9orf140,UAP1L1,DPP7,NDOR1,NOXA1	NA	NA	NA	NA	NA	MRPL41	54881	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140412995	140413413	140413155	Y	CACNA1B,ABCA2,ENTPD2,GRIN1,RNF208,PNPLA7	MRPL41	NA	NA	NA	NA	MRPL41	30238	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chr9	140689053	140689448	140689207	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EHMT1	177609	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chrX	3870962	3871082	3871022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	241313	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	4628683	4629054	4628903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-555H23.1	594115	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chrX	9320763	9320959	9320875	Y	TBL1X,TBL1X	NA	TBL1X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TBL1X	108376	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	9536624	9537203	9536862	Y	TBL1X,TBL1X	NA	NA	NA	NA	NA	TBL1X	107289	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	9979116	9979440	9979257	Y	NA	WWC3	SHROOM2,WWC3	IMR90	Hi-C	24141950	WWC3	2162	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	10079384	10079999	10079621	Y	NA	CLCN4	NA	NA	NA	NA	CLCN4	43025	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	10586151	10586408	10586285	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	263365	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	10587173	10587276	10587225	Y	MID1	NA	NA	NA	NA	NA	MID1	262497	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	11352228	11352284	11352258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HCCS	224807	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	12228582	12228906	12228588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMPD4	73997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	3.01204945846519
chrX	12968289	12968795	12968434	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	22432	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	12974184	12974672	12974538	Y	TMSB4X,TLR7,TLR8	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	16555	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	13414990	13415289	13415163	Y	NA	GPX1P1	FAM9C,TMSB4X,LOC100133123	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GPX1P1	19531	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	13665848	13666134	13665956	Y	TCEANC,RAB9A	TCEANC,RAB9A	NA	NA	NA	NA	TCEANC	3091	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	14917883	14918076	14917977	Y	PIGA,MOSPD2,MOSPD2	FANCB,MOSPD2	NA	NA	NA	NA	MOSPD2	28320	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	15852343	15852548	15852528	Y	NA	ZRSR2,AP1S2	NA	NA	NA	NA	AP1S2	18506	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	15965843	15966073	15966050	Y	NA	NA	CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	AP1S2	94789	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	16203717	16204054	16203956	Y	NA	RPL6P30	CTPS2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL6P30	11358	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	16900871	16900973	16900947	Y	TXLNG	RBBP7	RBBP7,TXLNG	MCF7,IMR90,K562	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RBBP7	14334	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	18445170	18445478	18445437	Y	NA	CDKL5	NA	NA	NA	NA	CDKL5	3467	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	18904688	18905149	18904995	Y	PHKA2	NA	NA	NA	NA	NA	PHKA2	95567	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	19774987	19775285	19775138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	128434	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	19893071	19893438	19893374	Y	NA	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	10281	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	21962010	21962116	21962060	Y	NA	SMS	NA	NA	NA	NA	SMS	5319	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	22013670	22013825	22013692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMS	56979	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	24497300	24497460	24497369	Y	ZFX,ZFX,ZFX,ZFX	PDK3	NA	NA	NA	NA	PDK3	15962	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	29678122	29678339	29678241	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	968076	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	29681325	29681360	29681343	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FTLP2	965055	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	39873339	39874259	39873676	Y	NA	NA	BCOR	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	BCOR	160323	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	39964528	39964690	39964611	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	69892	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	39965558	39965902	39965820	Y	BCOR,BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	68680	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chrX	39966584	39967157	39966963	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	67425	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	39968932	39969265	39969200	Y	BCOR	NA	NA	NA	NA	NA	BCOR	65317	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40012729	40012965	40012840	Y	BCOR,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	21617	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40014046	40014813	40014331	Y	BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	19769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40032962	40033837	40033453	Y	BCOR,CXorf38,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	745	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40034694	40035505	40035056	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2,BCOR	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	112	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40691770	40692090	40691930	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-77G22.2	73147	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40869896	40870061	40869955	Y	ATP6AP2	NA	MED14,USP9X	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	USP9X	72827	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	40943673	40944218	40943773	Y	CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X	USP9X	NA	NA	NA	NA	USP9X	785	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	41594711	41594837	41594774	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CASK	185879	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	MAOA	375123	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45374628	45375077	45374937	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	11995	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chrX	45376807	45376988	45376867	Y	NA	RP11-245M24.1	MIR221,MIR222	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	14174	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.67336081025844
chrX	45480900	45481410	45481103	Y	NA	NA	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-245M24.1	118267	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	45557008	45557128	45557058	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR221	46566	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	45568719	45568861	45568812	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	34833	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45569317	45570037	45569421	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	33657	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	45570603	45570921	45570704	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	32773	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	45626471	45627108	45626806	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	21941	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	45631125	45631239	45631172	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	26595	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45645081	45645275	45645187	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	40551	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45648299	45648762	45648585	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43769	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	45665386	45665505	45665456	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	43415	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45666059	45666529	45666404	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	42391	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	45667637	45667718	45667664	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	41202	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	45702877	45703292	45703236	Y	NA	RP5-1158E12.3	NA	NA	NA	NA	RP5-1158E12.3	5628	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	45989834	45990282	45989950	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PCNAP3	72871	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46278987	46279293	46279130	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18856	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46436763	46437171	46436936	Y	RP2,ZNF674,CHST7	ZNF674,CHST7	NA	NA	NA	NA	CHST7	5544	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46524990	46525241	46525097	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC9A7	91249	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46651969	46652131	46652053	Y	ZNF674,CHST7,RP2	SLC9A7,RP2	CHST7,ZNF674,LOC401588,SLC9A7,RP2,PHF16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC9A7	35479	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	47382833	47383145	47382966	Y	SYN1,SPACA5,CFP,CFP	ZNF41,ARAF	UBA1,ZNF41,USP11,CDK16	IMR90	Hi-C	24141950	ARAF	35371	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	48390158	48390246	48390210	Y	NA	PORCN,EBP,TBC1D25,RBM3	NA	NA	NA	NA	TBC1D25	5599	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	49012442	49012818	49012676	Y	NA	GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP	MAGIX,PLP2	IMR90	Hi-C	24141950	PLP2	13455	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	52004971	52005124	52005057	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGED1	460868	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	52964244	52964539	52964367	Y	TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	45908	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.669344324103375
chrX	53110126	53110560	53110260	Y	NA	GPR173,TSPYL2,LINC01155	NA	NA	NA	NA	TSPYL2	577	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.836680405129219
chrX	53740949	53741249	53741172	Y	KDM5C,PHF8	HUWE1	HUWE1	MCF7	ChIA-PET	22265404	HUWE1	29276	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	54665732	54666388	54666226	Y	NA	NA	ITIH6,MAGED2	MCF7	ChIA-PET	22265404	GNL3L	111088	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	57420009	57420263	57420031	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP3-323P24.3	273914	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	64255385	64255512	64255449	Y	ZC4H2	ZC4H2	NA	NA	NA	NA	ZC4H2	2792	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	64888338	64888720	64888577	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	82081	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.50602472923259
chrX	64917800	64918054	64917950	Y	MSN	NA	NA	NA	NA	NA	MSN	111543	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	67352579	67352916	67352601	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	298839	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	67905949	67906235	67906128	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	95080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	SERBP1P1,EFNB1	NA	NA	NA	NA	SERBP1P1	3040	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	70275409	70275661	70275633	Y	NA	RNU1-56P,SNX12,FOXO4	NA	NA	NA	NA	SNX12	10612	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	70401853	70402134	70401993	Y	IL2RG,MED12,TAF1,OGT,CXCR3,NONO	NA	NA	NA	NA	NA	MED12	65447	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	71164253	71164459	71164357	Y	NA	NHSL2	NA	NA	NA	NA	NHSL2	35315	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	73228588	73229157	73228689	Y	CHIC1	NA	NA	NA	NA	NA	JPX	66429	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	73755621	73755953	73755678	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	76499	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	73756739	73756964	73756863	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RLIM	75488	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	79830053	79830147	79830110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	233040	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	79918713	79919107	79919058	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BRWD3	144080	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	85278748	85279124	85278988	Y	CHM	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	21442	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	95228939	95229189	95229110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH2	708473	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	99900251	99900361	99900308	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	3036	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	99913933	99914424	99914133	Y	SYTL4,SYTL4	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	16718	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	100498384	100498730	100498494	Y	ARMCX3,ARMCX3,TMEM35,DRP2	DRP2	NA	NA	NA	NA	DRP2	25626	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	101914784	101914936	101914847	Y	BHLHB9,GPRASP1,GPRASP1	NA	NA	NA	NA	NA	GPRASP2	50168	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	106595212	106595632	106595477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147542	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	106595667	106595822	106595802	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUP62CL	147997	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	106804874	106804888	106804884	Y	NA	NA	PRPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PRPS1	64849	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	106954265	106954667	106954451	Y	TSC22D3,TSC22D3,ATG4A	NA	NA	NA	NA	NA	TSC22D3	63905	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	109487499	109487581	109487556	Y	AMMECR1	NA	NA	NA	NA	NA	AMMECR1	193880	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	114849502	114849636	114849587	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLS3	56001	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	125556519	125556645	125556582	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	48223	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	4.01606594462025
chrX	129066097	129066492	129066260	Y	NA	UTP14A,BCORL1	NA	NA	NA	NA	UTP14A	28000	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	129118011	129118370	129118054	Y	NA	BCORL1	BCORL1,UTP14A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCORL1	4928	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	129245756	129246153	129246006	Y	NA	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	3065	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	129400519	129400680	129400638	Y	NA	ZNF280C	NA	NA	NA	NA	ZNF280C	193	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	133305762	133306165	133305903	Y	PHF6,CCDC160	NA	NA	NA	NA	NA	GPC3	187840	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	133756354	133756493	133756422	Y	NA	NA	MIR450A2,MGC16121,MIR450A1,LOC100506757,MIR450B,MIR542	IMR90	Hi-C	24141950	HPRT1	164171	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	1.00401648615506
chrX	139589403	139589691	139589600	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP11C	563968	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	139847313	139847514	139847421	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	421796	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	148684727	148685116	148684922	Y	NA	TMEM185A	NA	NA	NA	NA	TMEM185A	26452	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	149533685	149533896	149533780	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	5996	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	149862815	149863170	149863006	Y	MTMR1	MTMR1	NA	NA	NA	NA	MTMR1	3380	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.502008243077531
chrX	150071678	150071798	150071740	Y	NA	CD99L2	NA	NA	NA	NA	CD99L2	6389	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	150152595	150153067	150152778	Y	NA	HMGB3,RPL19P21	NA	NA	NA	NA	HMGB3	5613	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrX	152066086	152066201	152066144	Y	NA	NA	CETN2,NSDHL	MCF7	ChIA-PET	22265404	NSDHL	68575	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrX	153755432	153755621	153755566	Y	NA	LAGE3,UBL4A,SLC10A3,FAM3A,IKBKG,G6PD	FAM3A	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	IKBKG	11793	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688
chrY	15547664	15548123	15547956	Y	TMSB4Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.167336081025844
chrY	28555183	28555400	28555298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAGE	NCI-H2052	hg19	FANTOM5	0.334672162051688